ES2304787T3 - Vesiculovirus recombinantes y sus usos. - Google Patents
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Abstract
LA PRESENTE INVENCION DESCRIBE VESICULOVIRUS REPLICABLES RECOMBINANTES. LA INVENCION DESCRIBE UN PROCEDIMIENTO MEDIANTE EL CUAL, POR PRIMERA VEZ, SE LOGRA CON EXITO LA PRODUCCION Y LA RECUPERACION DE VESICULOVIRUS REPLICABLES, ASI COMO VESICULOVIRUS REPLICABLES RECOMBINANTES, A PARTIR DE ADN CLONADO, MEDIANTE UN PROCEDIMIENTO QUE IMPLICA LA EXPRESION DE ARN ANTIGENOMICO DE VESICULOVIRUS DE CADENA POSITIVA DE LONGITUD COMPLETA, EN CELULAS HUESPED. LOS VESICULOVIRUS RECOMBINANTES NO PROVOCAN PATOLOGIAS GRAVES EN HUMANOS, PUEDEN OBTENERSE CON ELEVADAS VALORACIONES Y PRESENTAN UN USO COMO VACUNAS. LOS VESICULOVIRUS RECOMBINANTES TAMBIEN PUEDE SER INACTIVADOS PARA SER UTILIZADOS COMO VACUNAS DE ORGANISMOS MUERTOS.
Description
Vesiculovirus recombinantes y sus usos.
La presente invención se refiere a vesiculovirus
recombinantes replicables y que pueden expresar ácido nucleico
extraño contenido en su genoma. También se proporcionan formas
inactivadas de los virus recombinantes. Los vesiculovirus son
útiles en formulaciones de vacuna para prevenir o tratar diversas
enfermedades y trastornos.
\vskip1.000000\baselineskip
Los rabdovirus son virus envueltos con membrana
que se distribuyen ampliamente en la naturaleza en la que infectan
a vertebrados, invertebrados y plantas. Existen dos géneros
distintos dentro de los rabdovirus, el género Lyssavirus y
el género Vesiculovirus. Los rabdovirus tienen genomas de ARN
sencillo, de cadena negativa de 11-12.000
nucleótidos (Rose y Schubert, 1987, Rhabdovirus genomes and their
products, en The Viruses: The Rhabdoviruses, Plenum Publishing
Corp., NY, págs. 129-166). Las partículas de virus
contienen un núcleo helicoidal de nucleocápsida compuesto por el
ARN genómico y proteína. Generalmente, se encuentra que tres
proteínas, denominadas N (nucleocápsida), P (denominada
anteriormente NS, que indicaba originalmente no estructural) y L
(grande ("large")) están asociadas con la nucleocápsida. Dentro
de la envuelta de la membrana se encuentra una proteína de matriz
(M) adicional, que interacciona quizá tanto con la membrana como con
el núcleo de la nucleocápsida. Una única especie de glicoproteína
(G) se extiende desde la membrana y forma las espículas sobre la
superficie de la partícula de virus. Debido a que el genoma es de
sentido negativo (es decir, complementario a la secuencia de ARN
(sentido positivo) que funciona como ARNm para producir directamente
la proteína codificada), los rabdovirus deben codificar y
empaquetar una ARN polimerasa dependiente de ARN en el virión
(Baltimore et al., 1970, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 66:
572-576), compuesta por las proteínas P y L. Esta
enzima transcribe el ARN genómico para preparar ARNm subgenómicos
que codifican las 5-6 proteínas virales y también
replica los ARN de sentido positivo y negativo de longitud completa.
Los genes se transcriben secuencialmente, comenzando en el extremo
3' de los genomas. Se emplea también el mismo sistema genético
básico por los paramixovirus y filovirus.
El rabdovirus prototipo, el virus de la
estomatitis vesicular (VEV), crece hasta títulos muy altos en la
mayoría de las células animales y puede prepararse en grandes
cantidades. Como resultado, se ha usado ampliamente VEV como
sistema modelo para estudiar la replicación y ensamblaje de virus de
ARN envueltos. El estudio de VEV y virus de cadena negativa
relacionados ha estado limitado por no poder realizar la
manipulación genética directa de los virus usando tecnología de ADN
recombinante. La dificultad en la generación de VEV a partir de ADN
es que ni los ARN genómicos ni los ARN antigenómicos de longitud
completa son infecciosos. La unidad infecciosa mínima es el ARN
genómico unido fuertemente a 1.250 subunidades de la proteína (N) de
la nucleocápsida (Thomas et al., 1985, J. Virol. 54:
598-607) y cantidades más pequeñas de las dos
subunidades de la polimerasa codificadas viralmente, L y P. Para
reconstituir virus infecciosos a partir del ARN viral, es necesario
en primer lugar ensamblar el complejo proteína
N-ARN que sirve como molde para la transcripción y
replicación mediante la polimerasa de VEV. Aunque pueden
empaquetarse segmentos de ARN de cadena negativa más pequeños del
genoma del virus de la gripe dentro de nucleocápsidas in
vitro y luego rescatarse en células infectadas con virus de la
gripe (Enami et al., 1990, Proc. Natl. Acad. Sci. USA
87:3802-3805; Luytjes et al., 1989, Cell
59:1107-1113), no están aún disponibles sistemas
para empaquetar los ARN genómicos de rabdovirus mucho más
grandes.
Recientemente, se han descrito sistemas para la
replicación y transcripción de minigenomas derivados de ADN o ARN
defectuosos pequeños a partir de rabdovirus (Conzelmann y Schnell,
1994, J. Virol. 68:713-719; Pattnaik et al.,
1992, Cell 69:1011-1120) y paramixovirus (Calain
et al., 1992, Virology 191:62-71; Collins
et al., 1991, Proc. Natl. Acad. Sci. USA
88:9663-9667; Collins et al., 1993, Virology
195:252-256; De y Banerjee, 1993, Virology
196:344-348; Dimock y Collins, 1993, J. Virol.
67:2772-2778; Park et al., 1991, Proc. Natl.
Acad. Sci. USA 88:5537-5541). En estos sistemas, se
ensamblan ARN en nucleocápsidas dentro de células que expresan la
proteína N viral y proteínas de polimerasa. Aunque estos sistemas
han sido muy útiles, no permiten la manipulación genética del
genoma de longitud completa de virus infecciosos.
Se publicó recientemente la recuperación de
virus de la rabia a partir de un clon de ADNc completo (Schnell
et al., 1994, EMBO J. 13:4195-4203). El ciclo
infeccioso se inició expresando el ARN antigenómico (cadena
positiva de longitud completa) en células que expresan las proteínas
N, P y L virales. Aunque el virus de la rabia es un rabdovirus, es
estructural y funcionalmente diferente de los vesiculovirus. El
virus de la rabia es un Lyssavirus, no un vesiculovirus. Los
Lyssavirus invaden el sistema nervioso central. Los
vesiculovirus invaden las células epiteliales, predominantemente las
de la lengua, para producir vesículas. El virus de la rabia provoca
encefalitis en una variedad de animales y en seres humanos, mientras
que VEV provoca una enfermedad epidémica pero autolimitativa en el
ganado. En contraste marcado con células infectadas por VEV, el
virus de la rabia produce poco o ningún efecto citopático en
cultivos celulares infectados, se replica de manera menos eficaz
que VEV en cultivo celular y provoca poca disminución de la síntesis
celular de ADN, ARN o proteínas en cultivos celulares infectados
(véase Baer et al., 1990, en Virology, 2ª ed., Fields et
al. (eds.), Raven Press, Ltd., NY, págs. 883, 887). De hecho, no
se observa hibridación cruzada entre los genomas del virus de la
rabia y VEV, y puede discernirse generalmente homología de secuencia
entre los dos genomas sólo con la ayuda de programas de homología
ejecutables por ordenador.
Palese (Trends in microbiology vol. 3, nº 4,
páginas 123-125, 4 de abril de 1995) notifica el
rescate de VEV infeccioso a partir de un clon de ADN de longitud
completa, sin embargo, el VEV recombinante estaba etiquetado
genéticamente y no expresó péptidos o proteínas extrañas.
Se ha intentado, sin éxito, la recuperación de
virus del sarampión infeccioso, otro virus de ARN de cadena
negativa, a partir de ADNc clonado (véase Ballart et al.,
1990, EMBO J. 9(2):379-384 y la retractación
del mismo por Eschle et al., 1991, EMBO J.
10(11):3558).
El desarrollo de vacunas para la prevención de
enfermedades virales, bacterianas o parásitas es el centro de un
gran esfuerzo de investigación.
Las formas tradicionales de preparación de
vacunas incluyen el uso de patógenos inactivados o atenuados. Una
inactivación adecuada del microorganismo patógeno lo convierte en
inofensivo como agente biológico pero no destruye su
inmunogenicidad. La inyección de estas partículas "destruidas"
en un huésped provocará entonces una respuesta inmunitaria que
puede prevenir una infección futura con un microorganismo vivo. Sin
embargo, un problema importante en el uso de vacunas inactivadas
(que usan un patógeno inactivado) es no poder inactivar todas las
partículas de microorganismo. Incluso cuando esto se consigue, dado
que los patógenos destruidos no se multiplican en su huésped, o por
otras razones desconocidas, la inmunidad lograda es a menudo
incompleta, de vida corta y requiere múltiples inmunizaciones.
Finalmente, el procedimiento de inactivación puede alterar los
antígenos del microorganismo, convirtiéndolos en menos eficaces como
inmunógenos.
Atenuación se refiere a la producción de cepas
de microorganismos patógenos que han perdido esencialmente su
capacidad de producir la enfermedad. Una forma de conseguir esto es
someter al microorganismo a condiciones de crecimiento poco comunes
y/o pases frecuentes en cultivo celular. Entonces se seleccionan
mutantes que han perdido la virulencia pero que aún pueden provocar
una respuesta inmunitaria. Los patógenos atenuados a menudo son
buenos inmunógenos ya que se replican realmente en la célula huésped
y provocan inmunidad de larga duración. Sin embargo, se encuentran
varios problemas con el uso de vacunas activadas, siendo el más
preocupante la atenuación insuficiente y el riesgo de reversión a la
virulencia.
Una alternativa a los procedimientos anteriores
es el uso de vacunas de subunidades. Esto implica la inmunización
sólo con aquellos componentes que contengan el material inmunológico
relevante.
A menudo, las vacunas se formulan e inoculan con
diversos adyuvantes. Los adyuvantes ayudan a alcanzar un nivel más
duradero y superior de inmunidad usando pequeñas cantidades de
antígeno o dosis inferiores que si se administrase el inmunógeno
solo. El mecanismo de la acción del adyuvante es complejo y no se
entiende completamente. Sin embargo, puede implicar la estimulación
de la producción de citocinas, fagocitosis y otras actividades del
sistema reticuloendotelial así como una liberación y degradación
retrasada del antígeno. Los ejemplos de adyuvantes incluyen
adyuvante de Freund (completo o incompleto), adyuvante 65 (que
contiene aceite de cacahuete, monooleato de manida y monoestearato
de aluminio), el poliol plurónico L-121, avridina y
geles minerales tales como hidróxido de aluminio, fosfato de
aluminio, etc. El adyuvante de Freund ya no se usa en formulaciones
de vacuna para seres humano porque contiene aceite mineral no
metabolizable y es un carcinógeno potencial.
La presente invención proporciona vesiculovirus
replicables recombinantes. La técnica anterior ha intentado de
manera no satisfactoria producir vesiculovirus replicables a partir
de ADN clonado. En cambio, la invención proporciona un
procedimiento que, por primera vez, ha permitido de manera
satisfactoria la producción y recuperación de vesiculovirus
replicables, así como vesiculovirus replicables recombinantes, a
partir de ADN clonado.
Los vesiculovirus de la invención se producen
proporcionando en una célula huésped apropiada: (a) ADN que puede
transcribirse para dar (codificar) ARN (+) antigenómico de
vesiculovirus (complementario al genoma del vesiculovirus), (b) una
fuente recombinante de proteína N de vesiculovirus, (c) una fuente
recombinante de proteína P de vesiculovirus y (d) una fuente
recombinante de proteína L de vesiculovirus; en condiciones tales
que el ADN se transcribe para producir el ARN antigenómico, y se
produce un vesiculovirus que contiene ARN genómico complementario
al ARN antigenómico producido a partir del ADN.
La invención proporciona un vesiculovirus
recombinante infeccioso que puede replicarse en un animal dentro
del que se introduce el vesiculovirus recombinante, en el que el
genoma del vesiculovirus comprende ARN extraño que no es una parte
de manera natural del genoma del vesiculovirus. El vesiculovirus
recombinante se forma produciendo vesiculovirus según el
procedimiento de la invención, en el que regiones del ADN que
codifican ARN (+) antigenómico de vesiculovirus que no son
esenciales para la replicación viral se han insertado dentro o
sustituido por ADN
extraño.
extraño.
El ARN extraño contenido dentro del genoma del
vesiculovirus recombinante (codificado originalmente por el ADN
extraño), tras la expresión en una célula huésped apropiada, produce
una proteína o péptido que es antigénico o inmunogénico.
Los vesiculovirus recombinantes de la invención
se usan como vacunas. En una realización, en la que el ARN extraño
dirige la producción de un antígeno que induce una respuesta
inmunitaria contra un patógeno, las vacunas de la invención se usan
en el tratamiento o prevención de infecciones por un patógeno de
este tipo (particularmente un microorganismo patógeno) y sus
manifestaciones clínicas, es decir, una enfermedad infecciosa. En
una realización preferida, un antígeno de este tipo presenta la
antigenicidad o inmunogenicidad de una glicoproteína de la envuelta
de un virus diferente de vesiculovirus y el antígeno se incorpora en
la envuelta del vesiculovirus. Los vesiculovirus recombinantes
también se usan en el diagnóstico y monitorización de la progresión
de trastornos infecciosos, incluyendo la respuesta frente a
vacunación y/o terapia.
En otra realización, en la que el ARN extraño
dirige la producción de un antígeno que induce una respuesta
inmunitaria contra un tumor, los virus recombinantes de la invención
se usan en la inmunoprofilaxis, inmunoterapia y diagnóstico del
cáncer, y en la monitorización de la progresión o regresión del
tumor.
Los vesiculovirus recombinantes pueden usarse
como vacunas activadas o pueden inactivarse para su uso como
vacunas inactivadas. Los virus recombinantes también pueden usarse
para producir grandes cantidades de antígeno fácilmente purificado,
por ejemplo, para su uso en vacunas de subunidades.
La invención también proporciona formulaciones
de vacuna, kits y células huésped recombinantes.
\vskip1.000000\baselineskip
Figura 1. Secuencia de nucleótidos del plásmido
pVSVFL(+), que muestra la secuencia de ADN completa que se
transcribe para producir ARN (+) antigenómico de VEV y las
secuencias pronosticadas de las proteínas de VEV codificadas.
[Proteína N: SEC ID NO: 2; proteína P: SEC ID NO: 3; proteína M: SEC
ID NO: 4; proteína G: SEC ID NO: 5; proteína L: SEC ID NO: 6].
Pueden observarse las regiones no codificante e intergénica. La
línea superior de la secuencia (SEC ID NO: 1) es la cadena positiva
antigenómica de VEV; línea inferior = SEC ID NO: 7. Se indican los
sitios de restricción. También se indican los dominios transmembrana
y citoplasmático de la proteína G. Se muestran las secuencias del
primer promotor de la ARN polimerasa de T7 (SEC ID NO: 8), del
segundo promotor de la ARN polimerasa de T7 (SEC ID NO: 9); la
secuencia líder (SEC ID NO: 10), la señal de terminación de la
transcripción de la ARN polimerasa de T7 (SEC ID NO: 11) y la
secuencia que se transcribe para producir la ribozima de VHD (SEC
ID NO: 12).
Figura 2. Secuencia de nucleótidos de una parte
del plásmido pVSVSS1, que muestra el inserto de ADN sintético que
contiene la región de poliligador insertada entre las regiones que
codifican G y L (3' de G y 5' de L) que contienen sitios de
reconocimiento de enzimas de restricción únicos, concretamente,
XmaI, NotI y SmaI. Línea superior de la secuencia: SEC ID NO: 13;
línea inferior de la secuencia: SEC ID NO: 14.
Figura 3. Uniones génicas de VEV. Se muestran
las secuencias de nucleótidos en el extremo 3' del ARN líder y los
extremos 5' y 3' de cada ARNm junto con las correspondientes
secuencias genómicas (ARNv) (SEC ID NO: 15-31). Se
indican los dinucleótidos intergénicos en negrita. De Rose y
Schubert, 1987, en The Viruses: The Rhabdoviruses, Plenum Press,
NY, págs. 129-166, en la pág. 136.
Figura 4. Construcción de ADN de plásmido. A. El
diagrama ilustra la secuencia genómica de VEV clonada y los cuatro
fragmentos de ADN (numerados 1-4) que se usaron para
generar el plásmido pVSVFL(+). Las flechas horizontales representan
cebadores de PCR usados para generar los fragmentos 1 y 3. B.
Diagrama del plásmido pVSVFL(+) que da origen a VEV infeccioso. Se
muestran las ubicaciones de los genes de VEV que codifican las cinco
proteínas N, P, M, G y L. La región punteada desde Sac I hasta Xho
I representa la secuencia del vector pBSSK^{+} y los segmentos
sombreados representan las regiones del genoma de VEV generadas
mediante PCR. La transcripción a partir del promotor de T7 genera
el ARN de VEV de cadena (+) completo.
Figura 5. Proteínas presentes en VEV de tipo
natural y recombinantes. Se separaron mediante
SDS-PAGE (acrilamida al 10%) proteínas a partir del
1% del virus recuperado de aproximadamente 5 x 10^{6} células BHK
infectadas y se visualizaron mediante tinción con azul brillante de
Coomassie. Se indican las posiciones de las cinco proteínas de
VEV.
Figura 6. Identificación de una secuencia de
reconocimiento de enzimas de restricción en el VEV recombinante. Se
amplificó un segmento de 620 nucleótidos aislado de ARN genómico a
partir de VEV de tipo natural y recombinante mediante transcripción
inversa y PCR usando los cebadores
5'-CATTCAAGACGCTGCTTCGCAACTTCC (SEC ID NO: 32) y
5'-CATGAATGTTAACATCTCAAGA (SEC ID NO: 33). Se
indican controles en los que se omitió la transcriptasa inversa de
la reacción. Se digirieron muestras de ADN con Nhe I o bien se
dejaron sin digerir antes de la electroforesis en un gel de
poliacrilamida al 6% tal como se indicó. Se detectó el ADN mediante
tinción con bromuro de etidio. Se indican a la izquierda los
tamaños de los marcadores de ADN.
Figura 7. Autorradiograma que muestra la
secuencia de ARN genómico de VEV recombinante. Se secuenció ARN
preparado a partir de VEV recombinante mediante el procedimiento de
didesoxi usando transcriptasa inversa. La secuencia escrita
corresponde a los nucleótidos 1563-1593 en el ARNm
de G (Rose y Gallione, 1981, J. Virol. 39:519-528).
La secuencia subrayada representa los cuatro nucleótidos que se
cambiaron para generar el sitio Nhe I.
Figura 8. Análisis de proteínas de VEV
recombinante que expresa la glicoproteína del serotipo New Jersey.
Se separaron mediante SDS-PAGE (acrilamida al 10%)
proteínas a partir del 1% del virus sedimentado del medio de
aproximadamente 5 x 10^{6} células BHK infectadas durante 24 horas
con VEV_{1} de tipo natural (carril 1), VEV_{1/NJG}
recombinante (carril 2) o VEV_{NJ} de tipo natural (carril 3). Se
visualizaron las proteínas mediante tinción con azul brillante de
Coomassie. Se indican las posiciones de las proteínas virales.
La presente invención proporciona vesiculovirus
replicables recombinantes que tienen una inserción de una secuencia
de ARN extraño que codifica un péptido o una proteína que inducirá
una respuesta inmunitaria cuando se expresa en un huésped adecuado.
La expresión del ARN de vesiculovirus de cadena positiva de longitud
completa en células huésped ha permitido de manera satisfactoria la
generación de vesiculovirus recombinantes a partir de ADN,
proporcionando virus recombinantes que no provocan patología grave
en seres humanos y que pueden obtenerse en altos títulos, que se
usan como vacunas.
Los vesiculovirus de la invención se producen
proporcionando en una célula huésped apropiada: (a) ADN que puede
transcribirse para dar (codificar) ARN (+) antigenómico de
vesiculovirus (complementario al genoma del vesiculovirus) y que
tiene una inserción de una secuencia de ARN extraño que codifica un
péptido o una proteína que inducirá una respuesta inmunitaria
cuando se expresa en un huésped adecuado y (b) una fuente
recombinante de proteína N de vesiculovirus, (c) una fuente
recombinante de proteína P de vesiculovirus y (d) una fuente
recombinante de proteína L de vesiculovirus; en condiciones tales
que el ADN se transcribe para producir el ARN antigenómico, y se
produce un vesiculovirus que contiene ARN genómico complementario al
ARN antigenómico producido a partir del ADN.
La invención proporciona un vesiculovirus
recombinante infeccioso que puede replicarse en un animal dentro
del que se introduce el vesiculovirus recombinante, en el que el
genoma del vesiculovirus comprende ARN extraño que no es una parte
de manera natural del genoma del vesiculovirus. El vesiculovirus
recombinante se forma produciendo vesiculovirus según el
procedimiento de la invención, en el que regiones del ADN que
codifican ARN (+) antigenómico de vesiculovirus que no son
esenciales para la replicación viral se han insertado dentro o
sustituido por ADN extraño.
Dado que los virus son replicables (es decir, no
defectuosos en la replicación), codifican toda la maquinaria de
vesiculovirus necesaria para la replicación en una célula tras la
infección por el virus.
En una realización preferida, el vesiculovirus
recombinante es un virus de la estomatitis vesicular recombinante
(VEV).
El ARN extraño contenido dentro del genoma del
vesiculovirus recombinante (codificado originalmente por el ADN
extraño), tras la expresión en una célula huésped apropiada, produce
una proteína o un péptido que es antigénico o inmunogénico. Una
proteína o un péptido antigénico o inmunogénico de este tipo cuya
expresión se dirige mediante el ARN extraño (presente en sentido
negativo) dentro del genoma del vesiculovirus (mediante expresión a
partir del mensaje antigenómico (+)) se denominará a continuación en
el presente documento "antígeno". Los antígenos apropiados
incluyen pero no se limitan a antígenos conocidos de microorganismos
patógenos o de tumores, así como fragmentos o derivados de tales
antígenos que presentan la antigenicidad o inmunogenicidad de tales
antígenos. Una proteína presenta la antigenicidad de un antígeno
cuando la proteína puede unirse inmunoespecíficamente mediante un
anticuerpo al antígeno. Una proteína presenta la inmunogenicidad de
un antígeno cuando provoca una respuesta inmunitaria frente al
antígeno (por ejemplo, cuando la inmunización con la proteína
provoca la producción de un anticuerpo que se une
inmunoespecíficamente al antígeno o provoca una respuesta
inmunitaria mediada por células dirigida contra el antígeno).
Los vesiculovirus recombinantes de la invención
se usan como vacunas. Cuando el ARN extraño dirige la producción de
un antígeno (codificado originalmente por el ADN extraño usado para
producir el vesiculovirus recombinante o su predecesor) que induce
una respuesta inmunitaria contra un patógeno, las vacunas de la
invención se usan en el tratamiento o prevención de infecciones por
un patógeno de este tipo (particularmente un microorganismo
patógeno) y sus manifestaciones clínicas, es decir, una enfermedad
infecciosa. Por tanto, la invención proporciona procedimientos de
prevención o tratamiento de la infección y enfermedad infecciosa que
comprende administrar a un sujeto en el que se desea tal
tratamiento o prevención uno o más de los vesiculovirus
recombinantes de la invención. Los vesiculovirus recombinantes
también se usan en diagnóstico y monitorización de la progresión de
trastornos infecciosos, incluyendo respuestas a la vacunación y/o
terapia.
En otra realización, en la que el antígeno
induce una respuesta inmunitaria contra un tumor, los virus
recombinantes de la invención tienen usos en la inmunoprofilaxis,
inmunoterapia y diagnóstico del cáncer y en la monitorización de la
progresión o regresión del tumor.
Los vesiculovirus recombinantes pueden usarse
como vacunas activadas o pueden inactivarse para su uso como
vacunas inactivadas. Los virus recombinantes también pueden usarse
para producir grandes cantidades de antígeno fácilmente purificado,
por ejemplo, para su uso en vacunas de subunidades.
En una realización específica, el ADN extraño
usado inicialmente para la producción de los vesiculovirus
recombinantes también puede comprender una secuencia que codifica
un marcador detectable, por ejemplo
\beta-galactosidasa,
\beta-glucuronidasa, \beta-geo
(Friedrich & Soriano, 1991, Genes Dev.
5:1513-1523).
En otra realización específica, el ADN extraño
también puede comprender una secuencia que codifica una citocina
que puede estimular una respuesta inmunitaria. Tales citocinas
incluyen pero no se limitan a interleucina-2,
interleucina-6, interleucina-12,
interferones y factores estimulantes de colonias de granulocitos y
macrófagos.
En un aspecto preferido, tras la infección con
un vesiculovirus recombinante de la invención, el antígeno se
expresa como una proteína no de fusión. En una realización menos
preferida, el antígeno se expresa como una proteína de fusión, por
ejemplo con la proteína G viral. "Proteína de fusión", tal como
se usa en el presente documento, se refiere a una proteína que
comprende una secuencia de aminoácidos de una primera proteína unida
covalentemente mediante un enlace peptídico en su extremo carboxilo
terminal con el extremo amino terminal de una secuencia de
aminoácidos de una segunda proteína diferente.
En una realización, una formulación de vacuna de
la invención contiene un único tipo de vesiculovirus recombinante
de la invención. En otra realización, una formulación de vacuna
comprende una mezcla de dos o más virus recombinantes de la
invención.
Las formulaciones de vacuna de la invención
proporcionan uno o más de los siguientes beneficios: estabilidad
durante largos periodos sin refrigeración; facilidad de producción;
bajo coste y alto título de producción; capacidad de administrarse
por empleados locales sin preparación médica avanzada; e implicación
de la administración de un microorganismo que se sabe que no
provoca enfermedad grave en seres humanos.
La presente invención también proporciona una
célula huésped infectada con un vesiculovirus recombinante que
puede replicarse. En una realización, la célula huésped es una
célula de mamífero. Preferiblemente, la célula de mamífero es una
célula de riñón de hámster.
Se conocen en la técnica muchos vesiculovirus y
pueden hacerse recombinantes según los procedimientos de la
invención. Se enumeran ejemplos de tales vesiculovirus en la tabla
I.
Cualquier ADN que pueda transcribirse para
producir ARN (+) antigenómico de vesiculovirus (complementario al
genoma de VEV) puede usarse para la construcción de un ADN
recombinante que contiene ADN extraño que codifica un antígeno,
para su uso en la producción de los vesiculovirus recombinantes de
la invención. Está disponible en la técnica y/o puede obtenerse
mediante procedimientos convencionales ADN que puede transcribirse
para producir ARN (+) antigenómico de vesiculovirus (tal como ADN
que se denomina en el presente documento ``ADN (-) de
vesiculovirus). En particular, el plásmido pVSVFL(+), que contiene
ADN (-) de VEV que se prefiere para su uso en la presente
invención, se ha depositado en la ATCC y se le ha asignado el número
de acceso 97134. En un aspecto preferido, se usa ADN que puede
transcribirse para producir ARN (+) de VEV, (es decir, ADN (-) de
VEV). Puede usarse ADN (-) de VEV para cualquier serotipo o cepa
conocida en la técnica, por ejemplo, los serotipos New Jersey o
VEV. Se conoce la secuencia de proteína deducida y la secuencia de
nucleótidos completa del genoma de VEV y está disponible como
Genbank VSVCG, número de acceso J02428; NCBI SEC ID 335873; y está
publicada en Rose y Schubert, 1987, en The Viruses: The
Rhabdoviruses, Plenum Press, NY, págs. 129-166. Se
han publicado secuencias parciales de otros genomas de vesiculovirus
y están disponibles en la técnica. La secuencia completa del ADN
(-) de VEV que se usa en una realización preferida está contenida en
el plásmido pVSVFL(+) y se muestra en la figura 1; también se
muestran las secuencias pronosticadas de las proteínas de VEV (esta
secuencia contiene varias correcciones de secuencia en relación con
la obtenible de GenBank). El ADN (-) de vesiculovirus, si no está
todavía disponible, puede prepararse mediante procedimientos
convencionales, tal como sigue: si no está todavía disponible ADNc
de vesiculovirus, puede purificarse ARN genómico de vesiculovirus a
partir de preparaciones de virus, y usarse transcripción inversa con
reacción en cadena de la polimerasa a larga distancia para generar
el ADN (-) de vesiculovirus. Como alternativa, tras la purificación
del ARN genómico, puede sintetizarse in vitro ARNm de VEV y
prepararse ADNc mediante procedimientos convencionales, seguido por
inserción en vectores de clonación (véase, por ejemplo, Rose y
Gallione, 1981, J. Virol. 39(2):519-528).
Pueden unirse clones de ADNc individuales de ARN de vesiculovirus
mediante el uso de fragmentos de ADN pequeños que cubren las
uniones génicas, generados mediante el uso de transcripción inversa
y reacción en cadena de la polimerasa (RT-PCR)
(Mullis y Faloona, 1987, Meth. Enzymol. 155:335-350)
a partir de ARN genómico de VEV (véase la sección 6, a
continuación). Están disponibles vesiculovirus en la técnica. Por
ejemplo, puede obtenerse VEV de la Colección Americana de Cultivos
Tipo.
En una realización preferida, se introducen uno
o más, preferiblemente un único sitio de restricción (por ejemplo,
en un poliligador) dentro del ADN (-) de vesiculovirus, en regiones
intergénicas, o en 5' con respecto a la secuencia complementaria al
extremo 3' del genoma del vesiculovirus, o en 3' con respecto a la
secuencia complementaria al extremo 5' del genoma del
vesiculovirus, para facilitar la inversión del ADN extraño.
En un procedimiento preferido de la invención,
se construye el ADN (-) de vesiculovirus de manera que tenga un
promotor operativamente unido al mismo. El promotor debe poder
iniciar la transcripción del ADN (-) en una célula animal o de
insecto en la que se desea producir el vesiculovirus recombinante.
Los promotores que pueden usarse incluyen, pero no se limitan a la
región promotora temprana de SV40 (Bernoist y Chambon, 1981, Nature
290:304-310), el promotor contenido en la repetición
terminal larga 3' del virus del sarcoma de Rous (Yamamoto, et
al., 1980, Cell 22:787-797), el promotor de la
timidina cinasa de herpes (Wagner et al., 1981, Proc. Natl.
Acad. Sci. U.S.A. 78:1441-1445), las secuencias
reguladoras del gen de la metalotioneína (Brinster et al.,
1982, Nature 296:39-42); promotores de choque
térmico (por ejemplo, hsp70 para su uso en células S2 de
Drosophila); el promotor de la ADC (alcohol deshidrogenasa),
el promotor de la PGK (fosfoglicerol cinasa), el promotor de la
fosfatasa alcalina y las siguientes regiones de control
transcripcional animales, que muestran especificidad de tejido y se
han utilizado en animales transgénicos: región de control del gen
de la elastasa I que es activa en células acinares pancreáticas
(Swift et al., 1984, Cell 38:639-646; Ornitz
et al., 1986, Cold Spring Harbor Symp. Quant. Biol.
50:399-409; MacDonald, 1987, Hepatology 7:
425-515); región de control del gen de la insulina
que es activa en células beta pancreáticas (Hanahan, 1985, Nature
315:115-122), región de control de genes de
inmunoglobulinas que es activa en células linfoides (Grosschedl
et al., 1984, Cell 38:647-658; Adames et
al., 1985, Nature 318:533-538; Alexander et
al., 1987, Mol. Cell. Biol. 7:1436-1444),
región de control del virus de tumor mamario de ratón que es activa
en células testiculares, de mama, linfoides y mastocitos (Leder
et al., 1986, Cell 45:485-495), región de
control del gen de la albúmina que es activa en el hígado (Pinkert
et al., 1987, Genes y Devel. 1:268-276),
región de control del gen de la alfa-fetoproteína
que es activa en el hígado (Krumlauf et al., 1985, Mol. Cell.
Biol. 5:1639-1648; Hammer et al., 1987,
Science 235:53-58); región de control del gen de la
alfa 1-antitripsina que es activa en el hígado
(Kelsey et al., 1987, Genes y Devel. 1:
161-171), región de control del gen de la
beta-globina que es activa en células mieloides
(Mogram et al., 1985, Nature 315:338-340;
Kollias et al., 1986, Cell 46:89-94); región
de control del gen de la proteína básica de la mielina que es activa
en células oligodendrocíticas del cerebro (Readhead et al.,
1987, Cell 48:703-712) y región de control del gen
de la cadena 2 ligera de la miosina que es activa en el músculo
esquelético (Sani, 1985, Nature 314:283-286).
Preferiblemente, el promotor es un promotor de la ARN polimerasa,
preferiblemente un promotor de la ARN polimerasa de bacteriófago,
viral o de insectos, incluyendo pero sin limitarse a los promotores
de la ARN polimerasa de T7, la ARN polimerasa de SP6 y la ARN
polimerasa de T3. Si se usa un promotor de la ARN polimerasa en el
que la ARN polimerasa no se produce de manera endógena por la célula
huésped en la que se desea producir el vesiculovirus recombinante,
también debe proporcionarse una fuente recombinante de la ARN
polimerasa en la célula huésped.
El ADN (-) de vesiculovirus puede unirse
operativamente a un promotor antes o tras la inserción de ARN
extraño que codifica un antígeno. Preferiblemente, se sitúa un
terminador transcripcional en sentido 3' con respecto al ADN (-)
del vesiculovirus.
En otra realización preferida, se sitúa una
secuencia de ADN que puede transcribirse para producir una secuencia
de ribozima en el extremo 3' inmediato del ADN (-) de
vesiculovirus, antes de la señal de terminación transcripcional, de
modo que tras la transcripción se produce una secuencia de ribozima
autorrompible en el extremo 3' del ARN antigenómico, secuencia de
ribozima que romperá de manera autocatalítica (tras un U) este
transcrito de fusión para liberar el extremo 3' exacto del ARN (+)
antigenómico de vesiculovirus. Puede usarse cualquier secuencia de
ribozima conocida en la técnica, siempre que se reconozca y se rompa
la secuencia correcta. (Se observa que la ribozima de cabeza de
martillo no es probablemente adecuada para su uso). En un aspecto
preferido, se usa la ribozima del virus de la hepatitis delta (VHD)
(Perrotta y Been, 1991, Nature 350:434-436; Pattnaik
et al., 1992, Cell 69: 1011-1020).
Un ADN (-) de VEV preferido para su uso, para la
inserción de ADN extraño, es el mostrado en la figura 1 y contenido
en el plásmido pVSVFL(+), en el que está presente un promotor de la
ARN polimerasa de T7 en 5' con respecto a la secuencia
complementaria al extremo 3' del genoma de VEV. Por tanto, el
plásmido pVSVFL(+) comprende (en el orden 5' a 3') los siguientes
componentes operativamente unidos: el promotor de la ARN polimerasa
de T7, ADN (-) de VEV, una secuencia de ADN que se transcribe para
producir una secuencia de ribozima de VHD (inmediatamente en
sentido 3' con respecto al ADN (-) de VEV) y un sitio de terminación
de la transcripción de la ARN polimerasa de T7. Un plásmido que
puede usarse también es el plásmido pVSVSS1, del que se muestra una
parte de la secuencia en la figura 2, en la que se ha insertado un
poliligador de ADN sintético, que facilita la inserción de ADN
extraño, en pVSVFL(+) entre las regiones que codifican G y L. Se
sintetizó el poliligador en un sintetizador de ADN de manera que
tiene extremos compatibles para la ligación en un sitio NheI y
contiene los sitios de reconocimiento de enzimas de restricción
únicos XmaI, SmaI, y NotI, que facilitan la inserción de ADN
extraño generado mediante rotura con una de estas enzima o ligado a
un poliligador que contiene un sitio de reconocimiento para una de
estas enzimas (que se somete luego a rotura antes de la
inserción).
El ADN extraño que codifica un antígeno se
inserta en cualquier región, o sustituye a cualquier región del ADN
(-) de vesiculovirus que no es esencial para la replicación del
vesiculovirus. Por tanto, en una realización preferida, se inserta
el ADN extraño en una región intergénica, o una parte del ADN (-) de
vesiculovirus que se transcribe para formar la región no
codificante de un ARNm viral. En una realización preferida, la
invención proporciona un ácido nucleico que comprende la secuencia
de ADN del plásmido pVSVFL(+) tal como se representa en la figura 1
de los números de nucleótido 623-12088 (una parte de
SEC ID NO: 1), en la que a una región no esencial para la
replicación del vesiculovirus se le ha insertado dentro o sustituido
por ADN extraño.
Los vesiculovirus tienen una estructura
intergénica definida. Se encuentran homologías frecuentes alrededor
de los dinucleótidos intergénicos (figura 3). Estas regiones tienen
la estructura común (3') AUACUUUUUUUNAUUGUCN
NUAG(5') (SEC ID NO: 34), en la que N indica cualquier nucleótido (por tanto, están presentes tres posiciones variables) y el dinucleótido intergénico está subrayado. Estos espaciadores de dinucleótido son GA, excepto en la unión NS-M, en la que el dinucleótido es CA. Los primeros 11 nucleótidos de la secuencia común son complementarios a la secuencia (5') ... UAUGAAAAAAA ... (3') (SEC ID NO: 35) que se produce en la unión ARNm-poliadenilato[poli(A)] en cada ARN incluyendo L. El copiado reiterativo de los residuos de U por la polimerasa de VEV genera presumiblemente la cola de poli(A) en cada ARNm (McGeoch, 1979, Cell 17:3199; Rose, 1980, Cell 19:415; Schubert et al., 1980, J. Virol. 34:550). La secuencia complementaria al extremo 5' del ARNm sigue al dinucleótido intergénico. El ARNm de L también termina con la secuencia UAUG-poli(A) codificada por la secuencia (3')AUACUUUUUUU (SEC ID NO: 36) y presumiblemente se poliadenila también mediante un mecanismo de "deslizamiento" de la polimerasa (Schubert et al., 1980, J. Virol. 34:550; Schubert y Lazarini, 1981, J. Virol. 38:256).
NUAG(5') (SEC ID NO: 34), en la que N indica cualquier nucleótido (por tanto, están presentes tres posiciones variables) y el dinucleótido intergénico está subrayado. Estos espaciadores de dinucleótido son GA, excepto en la unión NS-M, en la que el dinucleótido es CA. Los primeros 11 nucleótidos de la secuencia común son complementarios a la secuencia (5') ... UAUGAAAAAAA ... (3') (SEC ID NO: 35) que se produce en la unión ARNm-poliadenilato[poli(A)] en cada ARN incluyendo L. El copiado reiterativo de los residuos de U por la polimerasa de VEV genera presumiblemente la cola de poli(A) en cada ARNm (McGeoch, 1979, Cell 17:3199; Rose, 1980, Cell 19:415; Schubert et al., 1980, J. Virol. 34:550). La secuencia complementaria al extremo 5' del ARNm sigue al dinucleótido intergénico. El ARNm de L también termina con la secuencia UAUG-poli(A) codificada por la secuencia (3')AUACUUUUUUU (SEC ID NO: 36) y presumiblemente se poliadenila también mediante un mecanismo de "deslizamiento" de la polimerasa (Schubert et al., 1980, J. Virol. 34:550; Schubert y Lazarini, 1981, J. Virol. 38:256).
Por tanto, las regiones intergénicas en el ADN
(-) de vesiculovirus consisten en tres partes, que desencadenan la
terminación y reiniciación transcripcional presentes tanto en 5'
como en 3' en cada gen (presentadas como la secuencia 5' a 3' de la
cadena con sentido positivo del ADN (-) de vesiculovirus: (a)
TATGAAAAAAA (SEC ID NO: 37), seguida por (b) el dinucleótido GT o
CT, seguido por (c) AACAG. Por tanto, en un aspecto preferido, el
ADN extraño que codifica un antígeno puede expresarse fácilmente
como una proteína no de fusión a partir de regiones intergénicas,
simplemente garantizando que esta región intergénica de tres partes
se reconstituye, es decir, que esta región intergénica aparece en
5' y en 3' en el ADN extraño y también en 5' y en 3' en los genes
adyacentes. Por ejemplo, en una realización preferida, se inserta
ADN que consiste en (a) esta región intergénica de tres partes,
fusionada con (b) ADN extraño que codifica un antígeno deseado (que
incluye preferiblemente los codones de inicio y de parada nativos
del gen del antígeno para la iniciación), dentro de una parte del
ADN (-) de vesiculovirus que se transcribe para formar la región no
codificante 3' de cualquier ARNm de vesiculovirus. En un aspecto
particularmente preferido, se inserta el ADN extraño en la región no
codificante entre G y L.
En una realización alternativa, el ADN extraño
puede insertarse dentro del gen de G, de manera que codifica una
proteína de fusión con G, para la presentación en superficie
resultante del antígeno sobre la partícula de vesiculovirus. Debe
emprenderse la selección para garantizar que la inserción de ADN
extraño no deteriore la función de la proteína G.
En una realización preferida, un antígeno
expresado por un vesiculovirus recombinante es toda o parte de una
glicoproteína de la envuelta de un virus diferente de vesiculovirus.
Un antígeno de este tipo puede sustituir a la proteína G de
vesiculovirus endógena en el vesiculovirus, o puede expresarse como
una fusión con la proteína G endógena, o puede expresarse además de
la proteína G endógena o bien como una proteína de fusión o bien
como una proteína no de fusión. En una realización específica, un
antígeno de este tipo forma una parte de la envuelta del
vesiculovirus y por tanto se presenta en la superficie de la
partícula de vesiculovirus. A modo de ejemplo, el antígeno puede
ser gp160 o un fragmento de la misma del virus de la
inmunodeficiencia humana, que se rompe para producir gp120 y gp41
(véase Owens y Rose, 1993, J. Virol.
67(1):360-365). En una realización
específica, el gen de G de VEV en el ADN (-) de VEV del plásmido
pVSVFL(+) puede quitarse y sustituirse, mediante rotura en los
sitios NheI y MluI que flanquean al gen de G e inserción de la
secuencia deseada. En otra realización específica, el antígeno es
una glicoproteína de la envuelta extraña o una parte de la misma
que se expresa como una proteína de fusión que comprende el dominio
citoplasmático (y, opcionalmente, también la región transmembrana)
de la proteína G de vesiculovirus nativa (véase Owens y Rose, 1993,
J. Virol. 67(1): 360-365). Tal proteína de
fusión puede sustituirse o expresarse además de la proteína G de
vesiculovirus endógena. Tal como se muestra a modo de ejemplo en la
sección 6 a continuación, puede sustituirse la secuencia que
codifica una G nativa completa por una secuencia codificante de una
G diferente para producir vesiculovirus replicables recombinantes
que expresan una glicoproteína no nativa. Aunque pueden usarse
vesiculovirus recombinantes que expresan y presentan
epítopo(s) de las glicoproteínas de la envuelta de otros
virus como vacunas activadas, tales vesiculovirus también son
particularmente útiles como vacunas inactivadas, así como en la
producción de vacunas de subunidades que contienen la proteína
producida por el vesiculovirus que comprende tal/es
epítopo(s).
En una realización específica, un vesiculovirus
recombinante de la invención expresa en un huésped al que se
administra uno o más antígenos. En una realización, se expresa una
multiplicidad de antígenos, que presentan cada uno diferente
antigenicidad o inmunogenicidad.
\vskip1.000000\baselineskip
La invención proporciona vesiculovirus
recombinantes que pueden replicarse que tienen una secuencia de ARN
extraño insertada dentro o que sustituye a un sitio del genoma no
esencial para la replicación, en la que la secuencia de ARN extraño
(que es de sentido negativo) dirige la producción de un antígeno que
puede expresarse en un huésped infectado por el virus recombinante.
Este genoma recombinante se produce originalmente mediante
inserción de ADN extraño que codifica el antígeno en el ADN (-) de
vesiculovirus. Cualquier secuencia de ADN que codifica un antígeno
inmunogénico (que puede provocar una respuesta inmunitaria), que
produce inmunidad profiláctica o terapéutica contra una enfermedad
o trastornos, cuando se expresa como una proteína de fusión o,
preferiblemente, como una proteína no de fusión en un vesiculovirus
recombinante de la invención, solo o en combinación con otros
antígenos expresados por el mismo o un vesiculovirus recombinante
diferente, puede aislarse para su uso en las formulaciones de la
presente invención.
En una realización preferida, la expresión de un
antígeno mediante un vesiculovirus recombinante induce una
respuesta inmunitaria contra un microorganismo patógeno. Por
ejemplo, un antígeno puede presentar la inmunogenicidad o
antigenicidad de un antígeno encontrado en bacterias, parásitos,
virus u hongos que son agentes causantes de enfermedades y
trastornos. En una realización preferida, se usan antígenos que
presentan la antigenicidad o inmunogenicidad de antígenos de virus
animales de importancia veterinaria (por ejemplo, que provocan
enfermedades o trastornos en animales no humanos tales como
animales domésticos o de granja, por ejemplo, vacas, pollos,
caballos, perros, gatos, etc.). En otra realización, se usan
antígenos que presentan la antigenicidad o inmunogenicidad de un
antígeno de un patógeno humano.
Para determinar la inmunogenicidad o
antigenicidad detectando la unión a anticuerpo, pueden usarse
diversos inmunoensayos conocidos en la técnica, incluyendo pero sin
limitarse a sistemas de ensayo competitivos y no competitivos que
usan técnicas tales como radioinmunoensayos, ELISA (ensayo
inmunoabsorbente ligado a enzimas), inmunoensayos tipo
"sándwich", ensayos inmunorradiométricos, reacciones de
precipitina por difusión en gel, ensayos de inmunodifusión,
inmunoensayos in situ (usando marcadores de oro coloidal,
enzimáticos o de radioisótopos, por ejemplo), inmunotransferencias
de tipo Western, reacciones de inmunoprecipitación, ensayos de
aglutinación (por ejemplo, ensayos de aglutinación en gel, ensayos
de hemaglutinación), ensayos de fijación al complemento, ensayos de
inmunofluorescencia, ensayos de proteína A y ensayos de
inmunoelectroforesis, etc. En una realización, se detecta la unión
a anticuerpo detectando un marcador sobre el anticuerpo primario.
En otra realización, se detecta el anticuerpo primario detectando la
unión de un anticuerpo o reactivo secundario al anticuerpo
primario. En una realización adicional, el anticuerpo secundario
está marcado. Se conocen en la técnica muchos medios para detectar
la unión en un radioinmunoensayo y se prevé su uso. En una
realización para detectar la inmunogenicidad, pueden someterse a
ensayo las respuestas mediadas por células T mediante
procedimientos convencionales, por ejemplo ensayos de citotoxicidad
in vitro o ensayos de hipersensibilidad de tipo retrasada
in vivo.
Los parásitos y bacterias que expresan epítopos
(determinantes antigénicos) que pueden expresarse mediante
vesiculovirus recombinantes (en los que el ARN extraño dirige la
producción de un antígeno del parásito o bacterias o un derivado
del mismo que contiene un epítopo del mismo) incluyen pero no se
limitan a los enumerados en la tabla II.
En otra realización, el antígeno comprende un
epítopo de un antígeno de un nematodo, para proteger contra
trastornos provocados por tales gusanos.
En otra realización específica, cualquier
secuencia de ADN que codifica un epítopo de Plasmodium, que
cuando se expresa por un vesiculovirus recombinante es inmunogénico
en un huésped vertebrado, puede aislarse para su inserción en el
ADN (-) de vesiculovirus según la presente invención. Las especies
de Plasmodium que pueden servir como fuentes de ADN incluyen
pero no se limitan a los parásitos de malaria humana P.
falciparum, P. malariae, P. ovale, P. vivax y los parásitos de
malaria animal P. berghei, P. yoelii, P. knowlesi, y P.
cynomolgi. En una realización particular, el epítopo que va a
expresarse es un epítopo de la proteína circumsporozoito (CS) de
una especie de Plasmodium (Miller et al., 1986,
Science 234:1349).
Aún en otra realización, el antígeno comprende
un péptido de la subunidad \beta de la toxina del cólera (Jacob
et al., 1983, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 80:7611).
Los virus que expresan epítopos (determinantes
antigénicos) que pueden expresarse mediante vesiculovirus
recombinantes (en los que el ARN extraño dirige la producción de un
antígeno del virus o un derivado del mismo que comprende un epítopo
del mismo) incluyen pero no se limitan a los enumerados en la tabla
III, que enumera tales virus por la familia para fines de comodidad
y no de limitación (véase 1990, Fields Virology, 2ª ed., Fields y
Knipe (eds.), Raven Press, NY).
En realizaciones específicas, el antígeno
codificado por las secuencias extrañas que se expresa tras la
infección de un huésped por el vesiculovirus recombinante presenta
la antigenicidad o inmunogenicidad de una hemaglutinina del virus
de la gripe (número de acceso de GenBank JO2132; Air, 1981, Proc.
Natl. Acad. Sci. USA 78:7639-7643; Newton et
al., 1983, Virology 128:495-501); la
glicoproteína G del virus respiratorio sincitial humano (número de
acceso de GenBank Z33429; Garcia et al., 1994, J. Virol.;
Collins et al., 1984, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 81:7683);
la proteína del núcleo, la proteína de la matriz u otra proteína del
virus del Dengue (número de acceso de GenBank M19197; Hahn et
al., 1988, Virology 162:167-180), la
hemaglutinina del virus del sarampión (número de acceso de GenBank
M81899; Rota et al., 1992, Virology
188:135-142); y glicoproteína gB del virus del
herpes simple tipo 2 (número de acceso de GenBank M14923; Bzik et
al., 1986, Virology 155:322-333).
En otra realización, pueden expresarse uno o más
epítopos de la proteína de fusión del virus respiratorio sincitial
(VRS) como un antígeno.
Otros antígenos que pueden expresarse mediante
un vesiculovirus recombinante incluyen pero no se limitan a los que
presentan la antigenicidad o inmunogenicidad de los siguientes
antígenos: VP1 de poliovirus (Emini et al., 1983, Nature
304: 699); glicoproteínas de la envuelta de VIH I (Putney et
al., 1986, Science 234:1392-1395); antígeno de
superficie de la hepatitis B (Itoh et al., 1986, Nature
308:19; Neurath et al., 1986, Vaccine 4:34); toxina de la
difteria (Audibert et al., 1981, Nature 289:543); epítopo 24M
de estreptococos (Beachey, 1985, Adv. Exp. Med. Biol. 185:193) y
pilina gonocócica (Rothbard y Schoolnik, 1985, Adv. Exp. Med. Biol.
185:247).
En otras realizaciones, el antígeno expresado
por el vesiculovirus recombinante presenta la antigenicidad o
inmunogenicidad del virus g50 de la pseudorrabia (gpD), virus II de
la pseudorrabia (gpB), virus gIll de la pseudorrabia (gpC),
glicoproteína H del virus de la pseudorrabia, glicoproteína E del
virus de la pseudorrabia, glicoproteína 195 de gastroenteritis
transmisible, proteína de la matriz de gastroenteritis transmisible,
glicoproteína 38 del rotavirus porcino, proteína de la cápsida del
parvovirus porcino, antígeno protector contra Serpulina
hydodysenteriae, glicoproteína 55 de la diarrea viral bovina,
hemaglutinina-neuraminidasa de la enfermedad de
Newcastle, hemaglutinina de la gripe porcina o neuraminidasa de la
gripe porcina.
En diversas realizaciones, el antígeno expresado
por el vesiculovirus recombinante presenta la antigenicidad o
inmunogenicidad de un antígeno derivado de Serpulina
hyodysenteriae, virus de la enfermedad de pie y boca, virus del
cólera del cerdo, virus de la gripe porcina, virus de la fiebre
porcina africana, Mycoplasma hyopneumoniae, virus de la
rinotraqueitis bovina infecciosa (por ejemplo, glicoproteína E o
glicoproteína G del virus de la rinotraqueitis bovina infecciosa) o
virus de la laringotraqueitis infecciosa (por ejemplo,
glicoproteína G o glicoproteína I del virus de la laringotraqueitis
infecciosa).
En otra realización, el antígeno presenta la
antigenicidad o inmunogenicidad de una glicoproteína del virus de
La Crosse (Gonzales-Scarano et al., 1982,
Virology 120:42), virus de la diarrea de terneros neonatal (Matsuno
y Inouye, 1983, Infección y Immunity 39:155), virus de la
encefalitis equina venezolana (Mathews y Roehrig, 1982, J. Immunol.
129:2763), virus Punta Toro (Dalrymple et al., 1981, en
Replication of Negative Strand Virus, Bishop y Compans (eds.),
Elsevier, NY, p. 167), virus de la leucemia murina (Steeves et
al., 1974, J. Virol. 14:187) o virus de tumor mamario de ratón
(Massey y Schochetman, 1981, Virology 115:20).
En otra realización, el antígeno presenta la
antigenicidad o inmunogenicidad de un antígeno de un patógeno
humano, incluyendo pero sin limitarse a herpesvirus humano, virus 1
de herpes simple, virus 2 de herpes simple, citomegalovirus humano,
virus de Epstein-Barr, virus de la
varicela-zóster, herpesvirus humano 6, herpesvirus
humano 7, virus de la gripe humana, virus de la inmunodeficiencia
humana, virus de la rabia, virus del sarampión, virus de la
hepatitis B, virus de la hepatitis C, Plasmodium falciparum y
Bordetella pertussis.
En una realización específica de la invención,
un vesiculovirus recombinante expresa la proteína del núcleo del
virus de la hepatitis B y/o el antígeno de superficie del virus de
la hepatitis B o un fragmento o derivado de los mismos (véase, por
ejemplo, la publicación de patente del R.U. número GB 2034323A
publicada el 4 de junio de 1980; Ganem y Varmus, 1987, Ann. Rev.
Biochem. 56:651-693; Tiollais et al., 1985,
Nature 317:489-495). El genoma del VHB (subtipo
adw) está contenido en el plásmido pAM6 (Moriarty et al.,
1981, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 78:2606-2610,
disponible de la Colección Americana de Cultivos Tipo (ATCC), número
de acceso 45020), un vector basado en pBR322 que es replicable en
E. coli.
En otra realización, el antígeno expresado por
el vesiculovirus recombinante presenta la antigenicidad o
inmunogenicidad de un antígeno del virus de la gripe equina o
herpesvirus equino. Los ejemplos de tales antígenos son
neuraminidasa Alaska 91 del virus de la gripe equina de tipo A,
neuraminidasa Miami 63 del virus de la gripe equina de tipo A,
neuraminidasa Kentucky 81 del virus de la gripe equina de tipo A,
glicoproteína B del herpesvirus equino de tipo 1 y glicoproteína D
del herpesvirus equino de tipo 1.
En otra realización, el antígeno presenta la
antigenicidad o inmunogenicidad de un antígeno del virus
respiratorio sincitial bovino o del virus parainfluenza bovino. Por
ejemplo, tales antígenos incluyen pero no se limitan a la proteína
de unión del virus sincitial respiratorio bovino (VRSB G), la
proteína de fusión del virus respiratorio sincitial bovino (VRSB
G), la proteína de la nucleocápsida del virus respiratorio sincitial
bovino (VRSB N) la proteína de fusión del virus parainfluenza
bovino de tipo 3 y la hemaglutinina-neuraminidasa
del virus parainfluenza de tipo 3.
En otra realización, el antígeno presenta la
antigenicidad o inmunogenicidad de la glicoproteína 48 o la
glicoproteína 53 del virus de la diarrea viral bovina.
En otra realización, el antígeno presenta la
antigenicidad o inmunogenicidad de un antígeno del virus de la
bursitis infecciosa. Los ejemplos de tales antígenos con la
poliproteína y VP2 del virus de la bursitis infecciosa.
Pueden identificarse antígenos potencialmente
útiles o derivados de los mismos para su uso como antígenos
expresados mediante vesiculovirus recombinantes mediante diversos
criterios, tales como la implicación del antígeno en la
neutralización de la infectividad del patógeno (Norrby, 1985,
Summary, en Vaccines 85, Lerner et al. (eds.), Cold Spring
Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, Nueva York, págs.
388-389), la especificidad de tipo o grupo, el
reconocimiento por antisueros o células inmunitarias de los
pacientes y/o la demostración de los efectos protectores de
antisueros o células inmunitarias específicas para el antígeno.
Además, el epítopo codificado del antígeno no debe presentar o
presentar preferiblemente una pequeña variación antigénica con el
tiempo o entre diferentes aislados del mismo patógeno.
En una realización preferida, el ADN extraño
insertado dentro del ADN (-) de vesiculovirus codifica un epítopo
dominante inmunopotente de un patógeno. El ADN extraño que codifica
epítopos que son reactivos con el anticuerpo aunque no pueden
provocar respuestas inmunitarias, tiene todavía usos potenciales en
inmunoensayos (véase la sección 5.8, a continuación).
En otra realización, el ARN extraño del
vesiculovirus recombinante dirige la producción de un antígeno que
comprende un epítopo, que cuando se introduce el vesiculovirus
recombinante en un huésped deseado, induce una respuesta
inmunitaria que protege contra una afección o trastorno provocado
por una entidad que contiene el epítopo. Por ejemplo, el antígeno
puede ser un antígeno específico de tumor o un antígeno asociado a
tumor, para la inducción de una respuesta inmunitaria protectora
contra un tumor (por ejemplo, un tumor maligno). Tales antígenos
específicos de tumor o asociados a tumor incluyen pero no se limitan
a antígeno de pan-carcinoma KS 1/4 (Perez y Walker,
1990, J. Immunol. 142:3662-3667; Bumal, 1988,
Hybridoma 7(4): 407-415); antígeno de
carcinoma de ovario (CA125) (Yu et al., 1991, Cancer Res.
51(2):468-475); fosfato ácido prostático
(Tailor et al., 1990, Nucl. Acids Res. 18(16):4928);
antígeno específico de próstata (Henttu y Vihko, 1989, Biochem.
Biophys. Res. Comm. 160(2):903-910; Israeli
et al., 1993, Cancer Res. 53:227-230);
antígeno p97 asociado a melanoma (Estin et al., 1989, J.
Natl. Cancer Instit. 81(6):445-446); antígeno
gp75 de melanoma (Vijayasardahl et al., 1990, J. Exp. Med.
171 (4):1375-1380); antígeno de melanoma de alto
peso molecular (Natali et al., 1987, Cancer
59:55-63) y antígeno de membrana específico de
próstata.
En otra realización de la invención, el antígeno
expresado por el vesiculovirus recombinante comprende grandes
regiones de proteína que contienen varios epítopos de células B (es
decir, epítopos que pueden atraer una respuesta inmunitaria
humoral) y epítopos de células T (es decir, epítopos que pueden
inducir una respuesta inmunitaria mediada por células).
Pueden usarse péptidos o proteínas que se sabe
que contienen determinantes antigénicos como antígeno. Si se
desconocen los antígenos deseados específicos, puede llevarse a cabo
la identificación y caracterización de las secuencias
inmunorreactivas. Una forma por la que lograr esto es a través del
uso de anticuerpos monoclonales generados en la superficie u otras
moléculas de un patógeno o tumor, como puede ser el caso. Las
secuencias peptídicas que pueden reconocerse por los anticuerpos
son epítopos definidos. Como alternativa, pueden someterse a prueba
pequeños péptidos sintéticos conjugados con moléculas vehículo para
la generación de anticuerpos monoclonales que se unen a los sitios
correspondientes en el péptido, sobre la molécula intacta (véase,
por ejemplo, Wilson et al., 1984, Cell 37:767).
En una realización específica, pueden
identificarse antígenos apropiados, incluyendo fragmentos o
derivados de antígenos conocidos, en virtud de su hidrofilicidad,
llevando a cabo un análisis de hidrofilicidad (Hopp y Woods, 1981,
Proc. Natl. Acad. Sci. USA 78:3824) para generar un perfil de
hidrofilicidad. Puede usarse un perfil de hidrofilicidad para
identificar las regiones hidrófobas e hidrófilas de una proteína y
las correspondientes regiones de la secuencia génica que codifican
tales proteínas. Se pronostica que las regiones hidrófilas son
inmunogénicas/antigénicas. Otros procedimientos conocidos en la
técnica que pueden emplearse para la identificación y
caracterización de determinantes antigénicos están también dentro
del alcance de la invención.
El ADN extraño que codifica el antígeno, que se
inserta dentro de un sitio no esencial del ADN (-) de vesiculovirus,
puede comprender además opcionalmente una secuencia de ADN extraño
que codifica una citocina que puede expresarse y estimular una
respuesta inmunitaria en un huésped infectado por el vesiculovirus
recombinante. Por ejemplo, tales citocinas incluyen pero no se
limitan a interleucina 2, interleucina 6, interleucina 12,
interferones, factores estimulantes de colonias de granulocitos y
macrófagos y receptores de interleucinas.
El ADN extraño puede comprender además
opcionalmente una secuencia que codifica y puede expresar un
marcador detectable (por ejemplo,
B-galactosidasa).
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Para la producción inicial de un vesiculovirus
recombinante, el ADN extraño que comprende una secuencia que
codifica el antígeno deseado se inserta dentro y/o sustituye a una
región del ADN (-) de vesiculovirus no esencial para la
replicación. Pueden usarse muchas estrategias conocidas en la
técnica para la construcción del ADN (-) de vesiculovirus que
contiene el ADN extraño. Por ejemplo, las secuencias relevantes del
ADN extraño y del ADN (-) de vesiculovirus pueden romperse,
mediante técnicas conocidas en la técnica, en sitios apropiados con
endonucleasa(s) de restricción, aislarse y ligarse in
vitro. Si se generan extremos cohesivos mediante digestión con
endonucleasas de restricción, puede no necesitarse más modificación
del ADN antes de la ligación. Sin embargo, si no están disponibles
extremos cohesivos del ADN para la generación mediante digestión con
endonucleasas de restricción o se prefieren sitios diferentes
distintos de los disponibles, puede usarse cualquiera de las
numerosas técnicas conocidas en la técnica para conseguir la
ligación del ADN heterólogo en los sitios deseados. En una
realización preferida, se introduce fácilmente un sitio de enzima de
restricción deseada en el ADN deseado mediante amplificación del
ADN mediante el uso de PCR con cebadores que contienen el sitio de
enzima de restricción. A modo de otro ejemplo, a la rotura con una
enzima de restricción le puede seguir la modificación para crear
extremos romos digiriendo de nuevo o rellenando los extremos de ADN
monocatenario antes de la ligación. Como alternativa, los extremos
rotos del ADN (-) de vesiculovirus o el ADN extraño pueden
"digerirse de nuevo" ("chewed back") usando una nucleasa
tal como la nucleasa Bal 31, la exonucleasa III, la exonucleasa
lambda, la nucleasa mung bean o la actividad exonucleasa de la ADN
polimerasa de T4, por nombrar sólo unas pocas, con el fin de
eliminar partes de la secuencia.
Para facilitar la inserción del ADN extraño,
puede insertarse una secuencia de oligonucleótido (un ligador) que
codifica uno o más sitios de restricción en una región del ADN (-)
de vesiculovirus (véase, por ejemplo, el poliligador en pVSVSS1,
figura 2) mediante ligación a los extremos del ADN. También puede
usarse un ligador para generar sitios de restricción adecuados en
la secuencia de ADN extraño.
Adicionalmente, pueden mutarse in vitro o
in vivo secuencias de ADN (-) de vesiculovirus o de ADN
extraño con el fin de formar nuevos sitios de endonucleasas de
restricción o destruir los preexistentes, para facilitar los
procedimientos de ligación in vitro. Puede usarse cualquier
técnica para la mutagénesis conocida en la técnica, incluyendo pero
sin limitarse a mutagénesis dirigida al sitio in vitro
(Hutchinson et al., 1978, J. Biol. Chem. 253:6551),
mutagénesis química, etc.
Si se desea, pueden "almacenarse"
secuencias del ADN (-) de vesiculovirus que se han modificado de
manera no deseable mediante tales manipulaciones in vitro,
mediante la introducción de secuencias apropiadas en los sitios
deseados.
La estrategia particular para insertar el ADN
extraño dependerá del sitio del ADN (-) de vesiculovirus específico
que va a sustituirse o insertarse dentro, así como del ADN extraño
que va a insertarse.
Las secuencias que codifican los péptidos o
proteínas inmunogénicas están presentes preferiblemente en copias
únicas, pero también pueden estar presentes en múltiples copias
dentro del genoma del virus.
Puede confirmarse la formación del ADN (-) de
vesiculovirus que contiene el ADN extraño mediante procedimientos
convencionales tales como análisis de la secuencia de ADN, análisis
de hibridación y/o mapeo de restricción, usando procedimientos bien
conocidos en la técnica.
El ADN extraño que codifica un antígeno deseado
puede obtenerse a partir de cualquiera de las numerosas fuentes
tales como ADN clonado, ADN genómico o ADNc preparado a partir de
ARN del patógeno o tumor deseado, como puede ser el caso, o ADN
sintetizado químicamente y manipulado mediante metodología de ADN
recombinante bien conocida en la técnica (véase Sambrook et
al., 1991, Molecular Cloning, A Laboratory Manual, 2ª ed., Cold
Spring Harbor Laboratory Press, Nueva York). En una realización
preferida, se usa la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) para
amplificar el fragmento deseado de ADN extraño de entre una
preparación en bruto de ADN o una muestra pequeña del ADN, mediante
procedimientos convencionales. Pueden deducirse fácilmente cebadores
apropiados para su uso en la PCR basándose en secuencias
publicadas.
Con el fin de generar fragmentos de ADN
apropiados, puede romperse el ADN (por ejemplo del patógeno o tumor
de interés) en sitios específicos usando diversas enzimas de
restricción. Como alternativa, puede usarse ADNasaI en presencia de
manganeso, o nucleasa mung bean (McCutchan et al., 1984,
Science 225:626) para fragmentar el ADN, o el ADN puede cortarse
físicamente, como por ejemplo, mediante sonicación. Entonces, los
fragmentos de ADN lineal pueden separarse según el tamaño mediante
técnicas convencionales, incluyendo, pero sin limitarse a,
electroforesis en gel de agarosa y poliacrilamida y cromatografía en
columna.
Lo más preferiblemente, se lleva a cabo la
amplificación por PCR de fragmentos de ADN que contienen el/los
epítopo(s) deseados, en la que los cebadores de PCR contienen
y por tanto introducen en el ADN amplificado un sitio de
reconocimiento de enzimas de restricción deseado. Como alternativa,
puede usarse cualquier enzima o combinación de enzimas de
restricción para generar fragmento(s) de ADN que contienen
el/los epítopo(s) deseados, siempre que las enzimas no
destruyan la inmunopotencia del producto codificado. En
consecuencia, pueden usarse muchas combinaciones de enzimas de
restricción para generar fragmentos de ADN que, cuando se insertan
dentro del ADN (-) de vesiculovirus, pueden producir vesiculovirus
recombinantes que dirigen la producción del péptido que contiene
el/los epítopo(s).
Una vez que se generan los fragmentos de ADN,
puede conseguirse la identificación del fragmento específico que
contiene la secuencia deseada de varias formas. Por ejemplo, si está
disponible previamente una pequeña cantidad de la secuencia de ADN
deseada o una secuencia homóloga, puede usarse como una sonda
marcada (por ejemplo, traducida por mellas) para detectar el
fragmento de ADN que contiene la secuencia deseada, mediante
hibridación con ácido nucleico. Como alternativa, si se conoce la
secuencia del gen o fragmento génico derivado, pueden secuenciarse
los fragmentos aislados o partes de los mismos mediante
procedimientos conocidos en la técnica, e identificarse mediante
una comparación de la secuencia derivada con la de la secuencia de
la proteína o de ADN conocida. Como alternativa, puede
identificarse el fragmento deseado mediante técnicas que incluyen
pero no se limitan a selección de ARNm, fabricando ADNc con el ARNm
identificado, sintetizando químicamente la secuencia génica
(siempre que se conozca la secuencia) o selección basándose en la
expresión de la proteína codificada (por ejemplo, mediante unión a
anticuerpos) tras la "clonación en perdigonada" de diversos
fragmentos de ADN en un sistema de expresión.
Las secuencias que codifican péptidos que van a
expresarse en vesiculovirus recombinantes según la presente
invención, ya se produzcan mediante procedimientos de ADN
recombinante, síntesis química o técnicas de purificación, incluyen
pero no se limitan a secuencias que codifican toda o parte
(fragmentos) de las secuencias de aminoácidos de antígenos
específicos de patógeno y específicos de tumor, así como otros
derivados y análogos de los mismos que presentan la antigenicidad o
inmunogenicidad de los mismos. Pueden someterse a prueba derivados o
análogos de antígenos para detectar la actividad deseada mediante
procedimientos conocidos en la técnica, incluyendo pero sin
limitarse a inmunoensayos convencionales.
En particular, pueden prepararse derivados de
antígenos alterando las secuencias de nucleótidos que codifican los
antígenos mediante sustituciones, adiciones o deleciones que no
destruyen la antigenicidad o inmunogenicidad del antígeno. Por
ejemplo, debido a la degeneración de la secuencias codificantes de
nucleótidos, pueden usarse en la práctica de la presente invención
otras secuencias de ADN que codifican sustancialmente la misma
secuencia de aminoácidos que un gen de antígeno nativo o parte del
mismo. Otros ejemplos pueden incluir pero no se limitan a
secuencias de nucleótidos que comprenden todo o parte de los genes o
ADNc que están alterados mediante la sustitución de diferentes
codones que codifican un residuo de aminoácido funcionalmente
equivalente dentro de la secuencia, produciendo así un cambio
silencioso. Por ejemplo, pueden sustituirse uno o más residuos de
aminoácido dentro de la secuencia por otro aminoácido de una
polaridad similar que actúa como un equivalente funcional, dando
como resultado una alteración silenciosa. Pueden seleccionarse
sustitutos para un aminoácido dentro de la secuencia a partir de
otros miembros de la clase a la que pertenece el aminoácido. Por
ejemplo, los aminoácidos no polares (hidrófobos) incluyen alanina,
leucina, isoleucina, valina, prolina, fenilalanina, triptófano y
metionina. Los aminoácidos neutros polares incluyen glicina, serina,
treonina, cisteína, tirosina, asparagina y glutamina. Los
aminoácidos cargados positivamente (básicos) incluyen arginina,
lisina e histidina. Los aminoácidos cargados negativamente (ácidos)
incluyen ácido aspártico y glutámico.
Los derivados y análogos de antígenos pueden
producirse mediante diversos procedimientos conocidos en la técnica.
Por ejemplo, puede modificarse una secuencia génica clonada
mediante cualquiera de numerosas estrategias conocidas en la
técnica (Sambrook et al., 1989, Molecular Cloning, A
Laboratory Manual, 2ª Ed., Cold Spring Harbor Laboratory, Cold
Spring Harbor, Nueva York).
La secuencia puede romperse en sitios apropiados
con endonucleasa(s) de restricción, seguido por modificación
enzimática adicional si se desea, aislarse y ligarse in
vitro. En la producción del gen que codifica un derivado o
análogo de un antígeno, debe tenerse cuidado para garantizar que el
gen modificado permanece dentro del mismo marco de lectura
traduccional que el antígeno, ininterrumpido mediante señales de
parada de la traducción, en la región génica en la que se
codifica(n) el/los epítopo(s) deseado(s).
Adicionalmente, la secuencia de ácido nucleico
que codifica el antígeno puede mutarse in vitro o in
vivo, para crear y/o destruir secuencias de traducción,
iniciación y/o terminación, o para crear variaciones en regiones
codificantes y/o formar nuevos sitios de endonucleasas de
restricción o destruir los preexistentes, para facilitar la
modificación in vitro adicional. Puede usarse cualquier
técnica para la mutagénesis conocida en la técnica, incluyendo pero
sin limitarse a, mutagénesis dirigida al sitio in vitro
(Hutchinson, C., et al., 1978, J. Biol. Chem 253:6551), uso
de ligadores TAB® (Pharmacia), etc.
En otra realización específica, el derivado de
antígeno codificado es una proteína quimérica o de fusión que
comprende una primera proteína o fragmento de la misma fusionada con
una segunda secuencia de aminoácidos diferente. Tal proteína
quimérica está codificada por un ácido nucleico quimérico en el que
las dos secuencias codificantes están unidas en marco. Puede
prepararse un producto quimérico de este tipo ligando las secuencias
de ácido nucleico apropiadas que codifican las secuencias de
aminoácidos deseadas entre sí mediante procedimientos conocidos en
la técnica, en el marco codificante apropiado. En una realización
específica, se produce una proteína de fusión en la que la primera
secuencia de proteína contiene un epítopo de un antígeno y la
segunda secuencia de proteína contiene un epítopo de un antígeno
diferente.
Pueden someterse a prueba fácilmente derivados y
fragmentos de antígenos conocidos mediante técnicas de inmunoensayo
convencionales para determinar si presentan la inmunogenicidad o
antigenicidad deseada, convirtiendo una secuencia de ADN que
codifica tal fragmento o derivado en adecuada para su inserción en
el ADN (-) de vesiculovirus.
Una secuencia de ADN que codifica un epítopo que
es un hapteno, es decir, una molécula que es antigénica porque
puede reaccionar selectivamente con anticuerpos análogos, pero no
inmunogénica porque no puede provocar una respuesta inmunitaria
cuando se administra sin adyuvantes o proteínas vehículo, también
puede aislarse para su uso, ya que se prevé que, en realizaciones
particulares, la presentación mediante los vesiculovirus de la
invención puede conferir inmunogenicidad al hapteno expresado por el
virus.
Una vez identificado y aislado, el ADN extraño
que contiene la(s) secuencia(s) de interés se inserta
entonces dentro del ADN (-) de vesiculovirus, para la producción de
un vesiculovirus recombinante.
Los vesiculovirus recombinantes de la invención
se producen proporcionando en una célula huésped apropiada: ADN (-)
de vesiculovirus, en el que regiones no esenciales para la
replicación se han insertado dentro o sustituido por ADN extraño
que comprende una secuencia que codifica un antígeno, y fuentes
recombinantes de proteína N, proteína P y proteína L de
vesiculovirus. La producción es preferiblemente in vitro, en
cultivo celular.
La célula huésped usada para la producción de
vesiculovirus recombinante puede ser cualquier célula en la que
crezcan los vesiculovirus, por ejemplo, células de mamífero y
algunas células de insecto (por ejemplo, Drosophila). Pueden
usarse células primarias, o más preferiblemente, líneas celulares.
Están disponibles para su uso un vasto número de líneas celulares
conocidas comúnmente en la técnica. A modo de ejemplo, tales líneas
celulares incluyen pero no se limitan a células BHK (riñón de crías
de hámster), células CHO (ovario de hámster chino), células HeLA
(humanas), células L de ratón, células Vero (mono), células
ESK-4, PK-15, EMSK, células MDCK
(riñón canino Madin-Darby), células MDBK (riñón
bovino Madin-Darby), células 293 (humanas) y
células Hep-2.
Las fuentes de proteínas N, P y L pueden ser
el/los mismo(s) o diferente(s) ácido(s)
nucleico(s) recombinante(s), que codifican y pueden
expresar las proteínas N, P y L en la célula huésped en la que se
desea producir vesiculovirus recombinantes.
Los ácidos nucleicos que codifican las proteínas
N, P y L se obtienen mediante cualquier medio disponible en la
técnica. Las secuencias de ácido nucleico de N, P y L se han dado a
conocer y pueden usarse. Por ejemplo, véase el número de acceso de
GenBank J02428; Rose y Schubert, 1987, en The Viruses: The
Rhabdoviruses, Plenum Press, NY, págs. 129-166.
También pueden obtenerse las secuencias que codifican los genes de
N, P y L a partir del plásmido pVSVFL(+), depositado en la ATCC y
al que se le asignó el número de acceso 97134, por ejemplo mediante
amplificación por PCR del gen deseado (PCR; patentes estadounidenses
números 4.683.202, 4.683.195 y 4.889.818; Gyllenstein et
al., 1988, Proc. Natl. Acad. Sci. USA
85:7652-7656; Ochman et al., 1988, Genetics
120:621-623; Loh et al., 1989, Science
243:217-220). Si no está todavía disponible un clon
de ácido nucleico de cualquiera de los genes de N, P o L, el clon
puede obtenerse mediante el uso de metodología de ADN recombinante
convencional. Por ejemplo, el ADN puede obtenerse mediante
procedimientos convencionales conocidos en la técnica mediante
purificación de ARN a partir de vesiculovirus seguido por
transcripción inversa y reacción en cadena de la polimerasa (Mullis
y Faloona, 1987, Methods in Enzymology 155:335-350).
Las alternativas al aislamiento de un gen de N, P o L incluyen,
pero no se limitan a sintetizar químicamente la propia secuencia
génica. Son posibles otros procedimientos y están dentro del alcance
de la invención.
Si se desea, el gen identificado y aislado puede
insertarse entonces óptimamente en un vector de clonación apropiado
antes de transferirse a un vector de expresión.
Los ácidos nucleicos que codifican derivados
(incluyendo fragmentos) y análogos de genes de N, P y L nativos,
así como derivados y análogos del ADN (-) de vesiculovirus, también
pueden usarse en la presente invención, siempre que tales derivados
y análogos conserven su función, tal como se ejemplifica mediante la
capacidad cuando se usan según la invención para producir un
vesiculovirus replicable que contiene un ARN genómico que contiene
ARN extraño. En particular, pueden prepararse derivados alterando
secuencias mediante sustituciones, adiciones o deleciones que
proporcionan moléculas funcionalmente activas. Además, debido a la
degeneración inherente de las secuencias codificantes de
nucleótidos, pueden usarse otras secuencias de ADN que codifican
sustancialmente la misma secuencia de aminoácidos o una
funcionalmente equivalente en la puesta en práctica de los
procedimientos de la invención. Pueden realizarse sustituciones de
aminoácidos basándose en la similitud en polaridad, carga,
solubilidad, hidrofobicidad, hidrofilicidad y/o la naturaleza
anfipática de los residuos implicados.
El ácido nucleico que codifica N/P/L deseado se
inserta entonces preferiblemente en un vector de expresión
apropiado, es decir, un vector que contiene los elementos necesarios
para la transcripción y traducción de la secuencia que codifica la
proteína insertada en el huésped en el que se desea producir el
vesiculovirus recombinante, para crear un vector que funciona para
dirigir la síntesis de la proteína N/P/L que se ensamblará
posteriormente con el ARN genómico de vesiculovirus que contiene la
secuencia extraña (producida en la célula huésped a partir de ARN
(+) de vesiculovirus antigenómico producido mediante la
transcripción del ADN (-) de vesiculovirus). Puede utilizarse una
variedad de sistemas de vector para expresar las secuencias que
codifican N, P y L, así como para transcribir el ADN (-) de
vesiculovirus que contiene el ADN extraño, siempre que el vector
sea funcional en el huésped y compatible con cualquier otro vector
presente. Tales vectores incluyen pero no se limitan a
bacteriófagos, plásmidos o cósmidos. En un aspecto preferido, se usa
un vector de expresión de plásmido. Los elementos de expresión de
vectores varían en sus potencias y especificidades. Puede usarse
uno cualquiera de varios elementos de transcripción y traducción
adecuados, siempre que sean funcionales en el huésped.
Pueden usarse procedimientos de ADN recombinante
convencionales para construir vectores de expresión que contienen
ADN que codifica las proteínas N, P y L, y el ADN (-) de
vesiculovirus que contiene el ADN extraño, que comprende señales de
control transcripcional/traduccional apropiadas (véase, por ejemplo,
Sambrook et al., 1989, citado anteriormente, y
procedimientos descritos a continuación en el presente documento).
(No se necesitan señales de control traduccional para la
transcripción del ADN (-) de vesiculovirus, y por tanto pueden
omitirse de un vector que contiene el ADN (-) de vesiculovirus,
aunque tales señales pueden estar presentes en el vector y
operativamente unidas a otras secuencias que codifican una proteína
que se desea expresar). La expresión puede controlarse mediante
cualquier elemento promotor/potenciador conocido en la técnica. Los
promotores que pueden usarse para controlar la expresión pueden ser
constitutivos o inducibles. En una realización específica, el
promotor es un promotor de la ARN polimerasa.
También se incluyen preferiblemente señales de
terminación de la transcripción (en sentido 3' respecto al gen) y
marcadores seleccionables en un vector de expresión de plásmido.
Además de las secuencias promotoras, los vectores de expresión para
las proteínas N, P y L contienen preferiblemente señales de
iniciación específicas para la traducción eficaz de secuencias de
N/P/L insertadas, por ejemplo, un sitio de unión a ribosomas.
Se requieren señales de iniciación específicas
para la traducción eficaz de secuencias que codifican proteínas
insertadas. Estas señales incluyen el codón de iniciación ATG y
secuencias adyacentes. En casos en los que el gen de N, P o L
completo incluyendo su propio codón de iniciación y secuencias
adyacentes se insertan en los vectores apropiados, pueden no
necesitarse señales de control traduccional adicionales. Sin
embargo, en casos en los que sólo se inserta una parte de la
secuencia génica, deben proporcionarse señales de control
traduccional exógenas, incluyendo el codón de iniciación ATG.
Además, el codón de iniciación debe estar en fase con el marco de
lectura de las secuencias que codifican la proteína para garantizar
la traducción del inserto completo. Estas señales de control
traduccional exógenas y codones de iniciación pueden ser de una
variedad de orígenes, tanto naturales como sintéticos.
En una realización específica, un vector de
expresión recombinante proporcionado por la invención, que codifica
una proteína N, P y/o L o derivado funcional de la misma, comprende
los siguientes componentes operativamente unidos: un promotor que
controla la expresión de la proteína N, P o L o derivado funcional
de la misma, una señal de iniciación de la traducción, una
secuencia de ADN que codifica la proteína N, P o L o derivado
funcional de la misma y una señal de terminación de la
transcripción. En un aspecto preferido, los componentes anteriores
están presentes en orden 5' a 3' tal como se enumeraron
anteriormente.
En otra realización específica, el gen que
codifica la proteína N, P o L se inserta en sentido 3' respecto al
promotor de la ARN polimerasa de T7 del gen 10 del fago T7, situado
con una A en la posición -3. También se incluyen en el vector de
expresión un terminador de la ARN polimerasa de T7 y un replicón. En
esta realización, se proporciona una ARN polimerasa de T7 para
transcribir la secuencia de N/P/L. La ARN polimerasa de T7 puede
producirse a partir de una secuencia integrada cromosómicamente o de
manera episomal, y se proporciona lo más preferiblemente mediante
expresión intracelular a partir de un virus vaccinia recombinante
que codifica la ARN polimerasa de T7 (véase a continuación).
Preferiblemente, las proteínas N, P y L se codifican cada una
mediante una secuencia de ADN operativamente unida a un promotor en
un plásmido de expresión, que contiene las señales reguladoras
necesarias para la transcripción y traducción de las proteínas N, P
y L. Un plásmido de expresión de este tipo incluye preferiblemente
un promotor, la secuencia codificante y una señal de terminación de
la transcripción/poliadenilación, y opcionalmente, un marcador
seleccionable (por ejemplo, \beta-galactosidasa).
Las proteínas N, P y L pueden codificarse mediante los mismos o
diferentes plásmidos, o una combinación de los mismos, y están
preferiblemente en diferentes plásmidos. Menos preferiblemente,
pueden expresarse una o más de las proteínas N, P y L de manera
intracromosómica.
Las secuencias clonadas que comprenden el ADN
(-) de vesiculovirus que contiene el ADN extraño, y las secuencias
clonadas que comprenden secuencias que codifican las proteínas N, P
y L, pueden introducirse en la célula huésped deseada mediante
cualquier procedimiento conocido en la técnica, por ejemplo,
transfección, electroporación, infección (cuando las secuencias
están contenidas, por ejemplo, en un vector viral), microinyección,
etc.
En una realización preferida, ADN que comprende
ADN (-) de vesiculovirus que contiene ADN extraño que codifica un
antígeno, operativamente unido a un promotor de la ARN polimerasa
(preferiblemente un promotor de la ARN polimerasa de bacteriófago);
ADN que codifica N, operativamente unido al mismo promotor de la ARN
polimerasa; ADN que codifica P, operativamente unido al mismo
promotor de la polimerasa; y ADN que codifica L, operativamente
unido al mismo promotor de la polimerasa; se introducen todos
(preferiblemente mediante transfección) en la misma célula huésped,
célula huésped en la que se ha proporcionado la ARN polimerasa de
manera citoplasmática. La ARN polimerasa se proporciona de manera
citoplasmática preferiblemente mediante expresión a partir de un
virus recombinante que se replica en el citoplasma y expresa la ARN
polimerasa, lo más preferiblemente un virus vaccinia (véase la
sección a continuación en el presente documento), que se ha
introducido (por ejemplo, mediante infección) en la misma célula
huésped. Se prefiere la provisión citoplasmática de ARN polimerasa,
dado que esto dará como resultado la transcripción y el
procesamiento citoplasmáticos del ADN (-) de VEV que comprende el
ADN extraño y de las proteínas N, P y L, evitando el mecanismo de
corte y empalme en el núcleo celular, y maximizando así el
procesamiento y la producción apropiados de las proteínas N, P y L y
dando como resultado el ensamblaje del vesiculovirus recombinante.
Por ejemplo, el virus vaccinia proporciona también de manera
citoplasmática enzimas para el procesamiento (ocupación de extremos
y poliadenilación) de ARNm, facilitando la traducción apropiada. En
un aspecto más preferido, se emplean promotores de la ARN polimerasa
de T7, y se proporciona una fuente citoplasmática de la ARN
polimerasa de T7 introduciendo también en la célula huésped un
virus vaccinia recombinante que codifica la ARN polimerasa de T7 en
la célula huésped. Tales virus vaccinia puede obtenerse mediante
procedimientos bien conocidos (véase la sección 5.5, a
continuación). En un aspecto preferido, puede usarse un virus
vaccinia recombinante tal como vTF7-3 (Fuerst et
al., 1986, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.
83:8122-8126). En un aspecto más preferido, el ADN
que comprende ADN (-) de vesiculovirus que contiene ADN extraño es
el plásmido pVSVSS1 en el que se ha insertado ADN extraño en la
región de poliligador.
Como alternativa, pero menos preferiblemente,
puede proporcionarse la ARN polimerasa (por ejemplo, la ARN
polimerasa de T7) mediante el uso de una célula huésped que expresa
la ARN polimerasa de T7 a partir de una secuencia integrada
cromosómicamente (por ejemplo, insertada originalmente en el
cromosoma mediante recombinación homóloga), preferiblemente de
manera constitutiva, o que expresa la ARN polimerasa de T7 de manera
episomal, a partir de un plásmido.
En otra realización menos preferida, el ADN (-)
de VEV que codifica un antígeno, operativamente unido a un
promotor, puede transfectarse en una célula huésped que expresa de
manera recombinante y estable las proteínas N, P y L a partir de
secuencias integradas cromosómicamente.
Se cultivan las células y se recupera el
vesiculovirus recombinante, mediante procedimientos convencionales.
Por ejemplo, y no como limitación, tras aproximadamente 24 horas, se
recogen las células y el medio, se
congelan-descongelan y se clarifican los lisados
para producir preparaciones de virus. Como alternativa, se recogen
las células y el medio y se clarifican simplemente las células y
los desechos mediante centrifugación a baja velocidad.
Entonces, se lleva a cabo preferiblemente la
confirmación de que está presente la secuencia extraña apropiada en
el genoma del vesiculovirus recombinante y dirige la producción de
la(s) proteína(s) deseada(s) en una célula
infectada. Pueden usarse para este fin procedimientos convencionales
conocidos en la técnica. Por ejemplo, se obtiene ARN genómico a
partir del vesiculovirus mediante extracción con SDS fenol de
preparaciones de virus, y puede someterse a transcripción inversa
(y PCR, si se desea) seguido por secuenciación, hibridación de tipo
Southern usando una sonda específica para el ADN extraño o mapeo con
enzimas de restricción, etc. El virus puede usarse para infectar
células huésped, que entonces pueden someterse a ensayo para
detectar la expresión de la proteína deseada mediante técnicas de
inmunoensayo convencionales usando un anticuerpo frente a la
proteína, o mediante ensayos basados en la actividad funcional de
la proteína. En la técnica se conocen y pueden usarse otras
técnicas.
La invención también proporciona kits para la
producción de vesiculovirus recombinantes. En una realización, el
kit comprende en uno o más recipientes (y lo más preferiblemente, en
recipientes separados): (a) un primer ADN recombinante que puede
transcribirse en una célula huésped adecuada para producir un ARN
(+) antigenómico de vesiculovirus en el que a una parte del ARN no
esencial para la replicación del vesiculovirus se le ha insertado
dentro o sustituido por una secuencia de ARN extraño; (b) un segundo
ADN recombinante que comprende una secuencia que codifica una
proteína N de vesiculovirus; (c) un tercer ADN recombinante que
comprende una secuencia que codifica una proteína L de
vesiculovirus; y (d) un cuarto ADN recombinante que comprende una
secuencia que codifica una proteína P de vesiculovirus. El segundo,
tercero y cuarto ADN recombinantes pueden ser parte de las mismas y
diferentes moléculas de ADN. En una realización preferida, las
secuencias que codifican las proteínas N, L y P están cada una
operativamente unidas a un promotor que controla la expresión de las
proteínas N, L y P, respectivamente, en la célula huésped adecuada.
En diversas realizaciones, el kit puede contener los diversos
ácidos nucleicos, por ejemplo, vectores de expresión de plásmido,
descritos anteriormente en el presente documento, para su uso en la
producción de vesiculovirus recombinantes.
En otra realización, un kit de la invención
comprende (a) un primer ADN recombinante que puede transcribirse en
una célula huésped adecuada para producir un ADN antigenómico de
vesiculovirus en el que a una parte del ARN no esencial para la
replicación del vesiculovirus se le ha insertado dentro o se ha
sustituido por una secuencia de ARN extraño; y (b) una célula
huésped que expresa de manera recombinante las proteínas N, P y L
de vesiculovirus.
En una realización preferida, un kit de la
invención comprende en recipientes separados:
(a) un primer plásmido que comprende los
siguientes componentes operativamente unidos: (i) un promotor de la
ARN polimerasa de bacteriófago, (ii) un ADN que comprende una
secuencia que puede transcribirse en una célula huésped apropiada
para producir una molécula de ARN que comprende un ARN antigenómico
de vesiculovirus en el que a una parte del ARN no esencial para la
replicación del vesiculovirus se le ha insertado dentro o
sustituido por una secuencia de ARN extraño, y en el que el extremo
3' del ARN antigenómico es inmediatamente adyacente a una secuencia
de ribozima que rompe en el extremo 3' del ARN antigenómico, y (iii)
una señal de terminación de la transcripción para la ARN polimerasa
de bacteriófago; y
(b) un segundo plásmido que comprende los
siguientes componentes operativamente unidos: (i) el promotor de la
ARN polimerasa de bacteriófago, (ii) un ADN que comprende una
secuencia que codifica la proteína N de vesiculovirus y (ii) una
señal de terminación de la transcripción para la ARN polimerasa de
bacteriófago; y
(c) un tercer plásmido que comprende los
siguientes componentes operativamente unidos: (i) el promotor de la
ARN polimerasa de bacteriófago, (ii) un ADN que comprende una
secuencia que codifica la proteína P de vesiculovirus y (ii) una
señal de terminación de la transcripción para la ARN polimerasa de
bacteriófago; y
(d) un cuarto plásmido que comprende los
siguientes componentes operativamente unidos: (i) el promotor de la
ARN polimerasa de bacteriófago, (ii) un ADN que comprende una
secuencia que codifica la proteína L de vesiculovirus y (ii) una
señal de terminación de la transcripción para la ARN polimerasa de
bacteriófago.
En otra realización, un kit de la invención
comprende además en un recipiente separado un virus vaccinia
recombinante que codifica y puede expresar la ARN polimerasa de
bacteriófago.
En una realización preferida, los componentes de
los recipientes están en forma purificada.
\vskip1.000000\baselineskip
En un aspecto preferido de la invención, la
transcripción del ADN (-) de vesiculovirus que contiene el ADN
extraño que codifica un antígeno y/o la transcripción del ADN que
codifica las proteínas N, P y L en la célula huésped, está
controlada mediante un promotor de la ARN polimerasa
(preferiblemente uno en el que la ARN polimerasa no es endógena
para la célula huésped), y la ARN polimerasa (que inicia la
transcripción a partir del promotor) se proporciona de manera
recombinante en la célula huésped mediante la expresión a partir de
un virus vaccinia recombinante. Las secuencias de ADN que codifican
ARN polimerasas se conocen bien y están disponibles en la técnica y
pueden usarse. Por ejemplo, puede obtenerse ADN de fago y usarse PCR
para amplificar el gen de la polimerasa deseado.
La inserción de la secuencia de ADN recombinante
deseada que codifica y que puede expresar la ARN polimerasa en un
virus vaccinia para su expresión por el virus vaccinia se consigue
preferiblemente insertando en primer lugar la secuencia de ADN en
un vector de plásmido que puede transferirse posteriormente a un
genoma de virus vaccinia mediante recombinación homóloga. Por
tanto, en un aspecto preferido de la invención para construir los
virus vaccinia recombinantes, se inserta la secuencia de ADN deseada
que codifica la polimerasa, usando metodología de ADN recombinante
(véase Sambrook et al., 1989, Molecular Cloning, A Laboratory
Manual, 2ª ed., Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor,
Nueva York) en un vector de inserción (preferiblemente, un
plásmido) flanqueado por (preferiblemente) secuencias de ADN de
vaccinia no esenciales, proporcionando así la transferencia
posterior de su(s) gene(s) quimérico(s) en
virus vaccinia mediante recombinación homóloga. Las secuencias se
colocan en el vector de modo que pueden expresarse bajo el control
de un promotor funcional en virus vaccinia.
La expresión de ADN extraño en virus vaccinia
recombinantes requiere el posicionamiento de promotores funcionales
en vaccinia de manera que dirijan la expresión de las secuencias de
ADN de polimerasa que codifican la proteína. Se han construido
vectores de inserción de plásmido para insertar genes quiméricos en
virus vaccinia para su expresión en los mismos. Se describen
ejemplos de tales vectores por Mackett (Mackett et al., 1984.
J. Virol. 49:857-864). Se inserta el ADN que
codifica la polimerasa en un sitio de clonación de endonucleasas de
restricción adecuado. Además de los vectores de inserción de
plásmido, pueden usarse vectores de inserción basados en ADN de
bacteriófago M13 monocatenario (Wilson et al., 1986, Gene
49:207-213).
El ADN de polimerasa insertado no debe contener
preferiblemente intrones, y la inserción debe ser preferiblemente
de manera que coloque las secuencias codificantes en proximidad
estrecha con el promotor, sin otros codones de iniciación entre el
iniciador ATG y el extremo 5' del transcrito.
El vector de inserción de plásmido debe contener
elementos reguladores transcripcionales y traduccionales que sean
activos en virus vaccinia. El plásmido debe configurarse de modo que
las secuencias de polimerasa estén bajo el control de un promotor
activo en virus vaccinia. Los promotores que pueden usarse en los
vectores de inserción incluyen pero no se limitan al promotor de la
timidina quinasa (TK) del virus vaccinia, el promotor 7.5K (Cochran
et al., 1985, J. Virol. 54:30-37), el
promotor 11K (publicación de patente europea 0198328), el promotor
F (Paoletti et al., 1984, Proc. Natl. Acad. Sci. USA
81:193-197) y diversos promotores de vaccinia
tempranos y tardíos (véase Moss, 1990, Virology, 2ª Ed., cap. 74,
Fields et al., eds., Raven Press, Ltd., Nueva York, págs.
2079-2111).
En una realización específica, el vector de
inserción de plásmido contiene (para la transferencia final en
virus vaccinia) una secuencia que codifica la ARN polimerasa de T7
bajo el control de un promotor activo en virus vaccinia. En otra
realización específica, un vector de inserción de plásmido contiene
un sistema de expresión conjunta constituido por promotores
orientados de manera divergente, uno que dirige la transcripción de
las secuencias de polimerasa, dirigiendo el otro la transcripción de
un gen indicador o marcador seleccionable, para facilitar la
detección o selección del virus vaccinia recombinante final (véase,
por ejemplo, Fuerst et al., 1987, Mol. Cell. Biol.
5:1918-1924).
Tal como se describió anteriormente, el vector
de inserción de plásmido contiene al menos un conjunto de secuencias
que codifican polimerasa operativamente unidas a un promotor,
flanqueadas por secuencias preferiblemente no esenciales para la
replicación viral de vaccinia. Tales secuencias no esenciales
incluyen pero no se limitan al gen de la TK (Mackett et al.,
1984, J. Virol. 49:857-864), el fragmento de ADN
HindIII-F de vaccinia (Paoletti et al.,
1984, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 81:193-197), el gen
del factor de crecimiento de vaccinia situado dentro de ambas
repeticiones terminales (Buller et al., 1988, J. Virol.
62:866-874), los genes N2 y M1 (Tamin et
al., 1988, Virology 165:141-150), la subunidad
M1 del gen de la ribonucleótido reductasa en el fragmento de ADN
HindIII-I de vaccinia (Child et al., 1990,
Virology 174:625-629), la hemaglutinina de vaccinia
(Shida et al., 1988, J. Virol. 62:4474-4480),
el gen de la proteína de fusión de 14 kD de vaccinia (Rodriguez
et al., 1989, Proc. Natl. Acad. Sci. USA
86:1287-1291), etc. (véase también Buller y
Palumbo, 1991, Microbiol. Rev. 55(1):80-122).
Se prefieren para su uso las secuencias de TK; el uso de tales
secuencias da como resultado la generación de virus recombinantes
TK^{-}.
Los virus vaccinia recombinantes se producen
preferiblemente mediante transfección de los vectores de inserción
recombinantes que contiene las secuencias de polimerasa en células
infectadas previamente con virus vaccinia. Como alternativa, la
transfección puede tener lugar antes de la infección con el virus
vaccinia. La recombinación homóloga tiene lugar dentro de las
células infectadas y da como resultado la inserción del gen extraño
en el genoma viral, en la región correspondiente a las regiones que
flanquean al vector de inserción. Las células infectadas pueden
examinarse usando una variedad de procedimientos tales como técnicas
inmunológicas, hibridación en placa de ADN o selección genética de
virus recombinantes que posteriormente pueden aislarse. Estos
recombinantes de vaccinia conservan preferiblemente su infectividad
y funciones esenciales y pueden construirse para que acomoden hasta
aproximadamente 35 kilobases de ADN extraño.
Las transfecciones pueden realizarse mediante
procedimientos conocidos en la técnica, por ejemplo un procedimiento
mediado por cloruro de calcio (Mackett et al., 1985, The
construction and characterization of vaccinia virus recombinants
expressing foreign genes, en DNA Cloning, Vol. II, Rickwood y Hames
(eds.), IRL Press, Oxford-Washington, D.C.) o un
procedimiento mediado por liposomas (Rose et al., 1991,
Biotechniques 10:520-525).
Cuando, tal como se prefiere, se usan secuencias
de TK flanqueantes para promover la recombinación homóloga, los
virus recombinantes resultantes tienen así una región de TK
deteriorada, que les permite crecer en una línea celular huésped
TK^{-} tal como Rat2 (número de acceso de la ATCC CRL 1764) en
presencia de
5-bromo-2'-desoxiuridina
(BUDR), en condiciones en las que no crecerán virus no
recombinantes (TK^{+}).
En otra realización, pueden prepararse virus
vaccinia recombinantes de la invención mediante clonación in
vitro, y luego empaquetarse con un poxvirus sensible a una
condición de selección, en lugar de mediante recombinación homóloga
(véase la publicación internacional número WO 94/12617 con fecha del
9 de 1994). Por ejemplo, pueden insertarse las secuencias de ADN
del VHB en el ADN genómico de vaccinia usando técnicas de ADN
recombinante convencionales in vitro; este ADN recombinante
puede empaquetarse entonces en presencia de un poxvirus
"auxiliar" tal como un mutante de virus vaccinia sensible a la
temperatura o un virus de la viruela aviar que puede seleccionarse
en las condiciones apropiadas.
Pueden usarse diversas cepas de virus vaccinia
conocidas en la técnica para generar los virus recombinantes de la
invención. Un virus vaccinia preferido es la cepa de los
laboratorios del Departamento de Sanidad de la ciudad de Nueva York
("New York City Department of Health Laboratories"), preparada
por Wyeth (disponible de la Colección Americana de Cultivos Tipo
(ATCC), número de acceso VR-325). Otras cepas de
vaccinia incluyen pero no se limitan a las cepas Elstree y Moscow,
la cepa de Rivers (CV-1 y CV-2), y
la cepa LC16m8 de Hashizume.
La selección del virus vaccinia recombinante
puede ser mediante cualquier método conocido en la técnica,
incluyendo técnicas de hibridación (por ejemplo, usando secuencias
de ADN de polimerasa como sonda de hibridación), técnicas
inmunológicas (por ejemplo, ensayo para detectar la unión a
anticuerpos que reconocen el/los epítopo(s) de polimerasa
codificado(s)), etc. En un aspecto preferido en el que se
usan secuencias flanqueantes de TK en el vector de inserción, la
selección es para detectar recombinantes TK^{-}, tal como se
describió anteriormente; entonces puede llevarse a cabo el examen
para seleccionar el recombinante correcto mediante análisis
moleculares convencionales. En muchos aspectos preferidos, el
método de elección para la selección lo dicta el marcador
seleccionable en un vector de inserción usado para generar los virus
recombinantes.
Entonces, el virus vaccinia recombinante
seleccionado se purifica generalmente por placas, y se somete
preferiblemente a análisis de proteínas y ácidos nucleicos
convencionales para verificar su identidad y pureza, y la expresión
de la polimerasa insertada.
El vesiculovirus recombinante recuperado, tras
la purificación por placas, puede hacerse crecer entonces en
grandes números, a modo de ejemplo, tal como sigue. Se recupera
virus a partir de una única placa (\sim10^{6} ufp) y se usa
para infectar \sim10^{7} células (por ejemplo, células BHK) para
producir, normalmente, 10 ml a un título de
10^{9}-10^{10} ufp/ml para un total de
aproximadamente 10^{11} ufp. Entonces, puede llevarse a cabo la
infección de \sim10^{12} células (con una multiplicidad de
infección de 0,1), y las células pueden hacerse crecer en cultivo
en suspensión, placas grandes o frascos rotativos mediante
procedimientos convencionales.
Se observa que los vesiculovirus recombinantes
que ya no expresan más la región extracelular de la proteína G de
vesiculovirus (que determina el rango de huésped) y que, en su
lugar, expresan una glicoproteína de la envuelta de un virus
diferente, necesitará hacerse crecer en células que son susceptibles
a la infección mediante el virus diferente (y células que expresan
así un receptor que promueve la infección por un virus que expresa
la glicoproteína de la envuelta del virus diferente). Por tanto, por
ejemplo, cuando el vesiculovirus recombinante expresa la
glicoproteína de la envuelta de VIH, el virus se hace crecer en
células CD4^{+} (por ejemplo, células linfoides CD4^{+}).
Entonces, pueden recogerse virus para
preparaciones de vacuna de sobrenadantes de cultivo, y clarificarse
los sobrenadantes para eliminar los desechos celulares. Si se desea,
un procedimiento de aislamiento y concentración del virus que puede
emplearse es mediante el pase del sobrenadante a través de una
concentración de membrana de flujo tangencial. Además puede
reducirse el volumen de la recogida mediante sedimentación a través
de un cojín de glicerol y mediante concentración en un gradiente
escalonado de sacarosa. Un procedimiento alternativo de
concentración es la purificación en columna de afinidad (Daniel
et al., 1988, Int. J. Cancer 41:601-608).
Sin embargo, también pueden usarse otros procedimiento para la
purificación (véase, por ejemplo Arthur et al., 1986, J.
Cell. Biochem. Suppl. 10A:226), y el experto en la técnica
reconocerá fácilmente cualquier modificación posible del
procedimiento anterior. La purificación debe ser tan suave como sea
posible, de manera que se mantenga la integridad de la partícula
del virus.
En una realización de la invención, se usan los
vesiculovirus replicables recombinantes que expresan un antígeno
inmunogénico como vacunas activadas.
Preferiblemente, los vesiculovirus recombinantes
para su uso como vacunas activadas terapéuticas o profilácticas
según la invención están algo atenuados. Las cepas más disponibles,
por ejemplo cepas de laboratorio de VEV, pueden estar lo
suficientemente atenuadas para su uso. Si se desea atenuación
adicional, por ejemplo, basándose en pruebas de patogenicidad en
animales, la atenuación se logra lo más preferiblemente de manera
sencilla mediante el pase en laboratorio del vesiculovirus
recombinante (por ejemplo, en BHK o cualquier otra línea celular
adecuada). Generalmente, pueden obtenerse virus atenuados mediante
numerosos procedimientos conocidos en la técnica incluyendo pero
sin limitarse a mutagénesis química, inserción genética, deleción
(Miller, 1972, Experiments in Molecular Genetics, Cold Spring
Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, NY) o recombinación usando
metodología de ADN recombinante (Maniatis et al., 1982,
Molecular Cloning, A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor
Laboratory, Cold Spring Harbor, NY), selección en laboratorio de
mutantes naturales, etc.
En esta realización de la invención, se formula
una vacuna en la que el inmunógeno es uno o varios vesiculovirus
recombinante(s), en los que el ARN extraño en el genoma
dirige la producción de un antígeno en un huésped de manera que se
provoca una respuesta inmunitaria (humoral y/o mediada por células)
en el huésped que es profiláctica o terapéutica. En una realización
en la que el antígeno presenta la antigenicidad o inmunogenicidad
de un antígeno de un patógeno, se lleva a cabo la administración de
la vacuna para prevenir o tratar una infección por el patógeno y/o
el trastorno infeccioso resultante y/u otros correlatos no deseables
de la infección. En una realización en la que el antígeno en un
antígeno tumoral, se lleva a cabo la administración de la vacuna
para prevenir o tratar tumores (particularmente, cáncer).
En una realización específica preferida, los
vesiculovirus recombinantes se administran profilácticamente para
prevenir/proteger contra una infección y/o enfermedades infecciosas
o formación de tumores (por ejemplo, cáncer).
En una realización específica dirigida a
productos terapéuticos, los vesiculovirus recombinantes de la
invención, que codifican epítopo(s) inmunogénico(s),
se administran terapéuticamente para el tratamiento de infección o
formación de tumores. Puede usarse la administración de tales virus,
por ejemplo, a neonatos y otros sujetos humanos como un
procedimiento de inmunoestimulación, para reforzar el sistema
inmunitario del huésped, potenciar la inmunidad humoral y/o mediada
por células y facilitar el aclaramiento de agentes infecciosos o
tumores. Los virus de la invención pueden administrarse solos o en
combinación con otras terapias (ejemplos de terapias antivirales,
incluyen pero no se limitan a \alpha-interferón y
fosfato de vidarabina; ejemplos de terapia tumoral incluyendo pero
sin limitarse a radiación y quimioterapia de cáncer).
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En una realización específica, los vesiculovirus
replicables recombinantes de la invención se inactivan (es decir,
destruidos, convertidos en no replicables) antes de su uso en
vacunas, para proporcionar una vacuna inactivada. Dado que la
envuelta del vesiculovirus es sumamente inmunogénica, en una
realización en la que se incorpora una o más proteínas extrañas
(por ejemplo, una glicoproteína de la envuelta de un virus distinto
de un vesiculovirus) en la envuelta del vesiculovirus, un virus de
este tipo, incluso en forma destruida, puede ser eficaz para
proporcionar una respuesta inmunitaria contra dicha(s)
proteína(s) extraña(s) en un huésped al que se le
administra. En una realización específica, está presente en la
partícula de vesiculovirus recombinante una multiplicidad de
antígenos, que presenta cada uno la inmunogenicidad o antigenicidad
de una glicoproteína de la envuelta de un virus diferente.
Los virus recombinantes inactivados de la
invención difieren de las partículas interferentes defectuosas en
que, antes de la inactivación, el virus es replicable (es decir,
codifica todas las proteínas de vesiculovirus necesarias para
permitirle replicarse en una célula infectada). Por tanto, dado que
el virus está originalmente en un estado replicable, puede
propagarse y hacerse crecer fácilmente en grandes cantidades antes
de la inactivación, para proporcionar una gran cantidad de virus
destruidos para su uso en vacunas, o para la expresión del antígeno
expresado para su uso en una vacuna de subunidades (véase la sección
5.8, a continuación).
Se conocen en la técnica diversos procedimientos
y pueden usarse para inactivar los vesiculovirus replicables
recombinantes de la invención, para su uso como vacunas inactivadas.
Tales procedimientos incluyen pero no se limitan a inactivación
mediante el uso de formalina, betapropiolactona, irradiación gamma y
psoraleno más luz ultravioleta.
En una realización específica, pueden
inactivarse fácilmente vesiculovirus recombinantes mediante
resuspensión de viriones purificados en una concentración adecuada
de formaldehído. Aunque puede ser suficiente 0,8 formaldehído, la
verificación de la concentración óptima de formaldehído puede
determinarse fácilmente para un virus particular mediante
titulación de diluciones en serie de formaldehído con virus
infeccioso para determinar la curva de inactivación de formalina
para ese virus. Esta técnica se ha descrito con detalle por Salk y
Gori, 1960, Ann. N.Y. Acad. Sci. 83:609-637).
Mediante extrapolación hasta cero, puede estimarse la concentración
esperada para inactivar la última partícula infecciosa. Utilizando
una concentración sustancialmente superior, por ejemplo 4 veces
mayor que la concentración estimada, puede garantizarse la
inactivación completa.
Aunque se ha demostrado que la inactivación con
formalina sola es eficaz, puede ser deseable, para fines de
seguridad y reguladores, destruir el virus dos o más veces, usando
uno o más de los otros numerosos procedimientos conocidos
actualmente para la inactivación de virus. Por tanto, aunque no es
esencial, se contempla que el virus usado en la formulación final
estará a menudo inactivado mediante un segundo agente tras el
tratamiento con formalina.
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Dado que los vesiculovirus recombinantes de la
invención pueden propagarse y hacerse crecer en grandes cantidades,
cuando los vesiculovirus recombinantes expresan un antígeno, el
crecimiento de tales vesiculovirus proporciona un procedimiento
para la producción y purificación fácil a gran escala del antígeno
expresado, particularmente cuando el antígeno se incorpora en la
envuelta del vesiculovirus recombinante. En una realización
específica, el antígeno es toda o una parte de una glicoproteína de
la envuelta de otro virus, por ejemplo, gp160 de VIH, expresada
como una proteína no de fusión, o expresada como una fusión con el
dominio citoplasmático de una proteína G de vesiculovirus.
Los antígenos así producidos y purificados se
usan en vacunas de subunidades.
Los vesiculovirus recombinantes que expresan
también pueden usarse para producir de manera recombinante el
antígeno en células infectadas in vitro, para proporcionar
una fuente de antígeno para su uso en inmunoensayos, por ejemplo,
para detectar o medir en una muestra de fluido corporal de un sujeto
vacunado la presencia de anticuerpos frente al antígeno, y
diagnosticar así la infección o la presencia de un tumor y/o
controlar la respuesta inmunitaria del sujeto tras la
vacunación.
Puede determinarse la inmunopotencia de uno o
más antígeno(s) en su formulación de vacuna de vesiculovirus
activado o inactivado, o en su formulación de vacuna de subunidades,
controlando la respuesta inmunitaria de animales de prueba tras la
inmunización con el/los vesiculovirus recombinante(s) que
expresan el/los antígeno(s) o con la vacuna de subunidades
que contiene el antígeno, mediante el uso de cualquier inmunoensayo
conocido en la técnica. Puede tomarse la generación de una
respuesta humoral (anticuerpos) y/o inmunidad mediada por células
como una indicación de una respuesta inmunitaria. Los animales de
prueba pueden incluir ratones, hámsteres, perros, gatos, monos,
conejos, chimpancés, etc. y finalmente sujetos humanos.
Los procedimientos de introducción de la vacuna
pueden incluir la vía oral, intracerebral, intradérmica,
intramuscular, intraperitoneal, intravenosa, subcutánea, intranasal
o cualquier otras vías convencionales de inmunización. La respuesta
inmunitaria de los sujetos de prueba puede analizarse mediante
diversos enfoques tales como: la reactividad del suero inmunitario
resultante frente al antígeno, tal como se somete a ensayo mediante
técnicas conocidas, por ejemplo, ensayo inmunoabsorbente ligado a
enzimas (ELISA), inmunotransferencias, radioinmunoprecipitaciones,
etc.; o, en el caso en el que el antígeno presenta la antigenicidad
o inmunogenicidad de un antígeno de un patógeno, mediante
protección de huéspedes inmunizados frente a la infección mediante
el patógeno y/o atenuación de los síntomas debidos a la infección
por el patógeno en huéspedes inmunizados; o, en el caso en el que el
antígeno presenta la antigenicidad o inmunogenicidad de un antígeno
tumoral, mediante la prevención de la formación de tumores o la
prevención de la metástasis, o mediante la regresión, o mediante la
inhibición de la progresión tumoral, en huéspedes inmunizados.
Como un ejemplo de pruebas en animales adecuadas
de una vacuna activada, pueden someterse a prueba las vacunas
activadas de la invención en conejos para determinar la capacidad de
inducir una respuesta de anticuerpos frente a los antígenos. Pueden
usarse conejos New Zealand White adultos jóvenes machos libres de
patógenos específicos (SPF). Cada grupo de prueba de conejos recibe
aproximadamente 5 x 10^{8} ufp (unidades formadoras de placa) de
la vacuna. Un grupo control de conejos recibe una inyección en
Tris-HCl 1 mM pH 9,0 de un vesiculovirus no
recombinante o de un vesiculovirus recombinante que no expresa el
mismo antígeno.
Pueden extraerse muestras de sangre de los
conejos cada una o dos semanas y analizarse el suero para detectar
anticuerpos frente al/a los antígeno(s). Puede someterse a
ensayo la presencia de anticuerpos específicos para el/los
antígeno(s), por ejemplo, usando un ELISA.
También pueden usarse animales para someter a
prueba la eficacia de la vacuna (por ejemplo, experimentos de
exposición). Por ejemplo, en una realización específica referente a
una formulación de vacuna activada, cada mono recibe por vía
intradérmica aproximadamente 5 x 10^{8} ufp de vesiculovirus
recombinante. Un mono control recibe (control) virus no
recombinante por vía intradérmica. Se extrae sangre semanalmente
durante 12 semanas y se analiza el suero para detectar anticuerpos
frente al/a los antígeno(s).
Las vacunas de la invención pueden ser
multivalentes o univalentes. Las vacunas multivalentes se preparan
a partir de virus recombinantes que dirigen la expresión de más de
un antígeno, de los mismos o diferentes virus recombinantes.
Pueden usarse muchos procedimientos para
introducir las formulaciones de vacuna de la invención; estos
incluyen pero no se limitan a la vía oral, intradérmica,
intramuscular, intraperitoneal, intravenosa, subcutánea, intranasal
y mediante escarificación (raspando las capas superiores de la piel,
por ejemplo, usando una aguja bifurcada).
El paciente al que se le administra la vacuna es
preferiblemente un mamífero, lo más preferiblemente un ser humano,
pero también puede ser un animal no humano incluyendo pero sin
limitarse a vacas, caballos, ovejas, cerdos, aves de corral (por
ejemplo, pollos), cabras, perros, gatos, hámsteres, ratones y ratas.
Al usar una vacuna de vesiculovirus activado, el paciente puede ser
cualquier animal en el que se replique el vesiculovirus (por
ejemplo, los animales enumerados anteriormente).
Las formulaciones de vacuna de virus de la
invención comprenden una cantidad inmunizante eficaz de uno o más
vesiculovirus recombinantes (activados o inactivados, como puede ser
el caso) y un vehículo o excipiente farmacéuticamente aceptable.
Las vacunas de subunidades comprenden una cantidad inmunizante
eficaz de uno o más antígenos y un vehículo o excipiente
farmacéuticamente aceptable. Se conocen en la técnica vehículos
farmacéuticamente aceptables e incluyen pero no se limitan a
solución salina, solución salina tamponada, dextrosa, agua,
glicerol, tampón acuoso isotónico estéril y combinaciones de los
mismos. Un ejemplo de un vehículo aceptable de este tipo es un
medio de cultivo fisiológicamente equilibrado que contiene uno o más
agentes estabilizadores tales como proteínas estabilizadas,
hidrolizadas, lactosa, etc. El vehículo es preferiblemente estéril.
La formulación debe adecuarse al modo de administración.
La composición, si se desea, también puede
contener cantidades minoritarias de agentes humectantes o
emulsionantes, o agentes de tamponamiento del pH. La composición
puede ser una disolución líquida, suspensión, emulsión, comprimido,
píldora, cápsula, formulación de liberación sostenida o polvo. La
formulación oral puede incluir vehículos convencionales tales como
calidades farmacéuticas de manitol, lactosa, almidón, estearato de
magnesio, sacarina sódica, celulosa, carbonato de magnesio,
etc.
Generalmente, los ingredientes se suministran o
bien por separado o bien se mezclan juntos en forma de dosificación
unitaria, por ejemplo, como un polvo liofilizado seco o concentrado
libre de agua en un recipiente herméticamente sellado tal como una
ampolla o un sobre que indica la cantidad de principio activo.
Cuando la composición se administra mediante inyección, puede
proporcionarse una ampolla de diluyente estéril de modo que los
ingredientes puedan mezclarse antes de la administración.
En una realización específica, se proporciona un
vesiculovirus recombinante liofilizado de la invención en un primer
recipiente; un segundo recipiente comprende diluyente constituido
por una disolución acuosa de glicerina al 50%, fenol al 0,25% y un
antiséptico (por ejemplo, verde brillante al 0,005%).
La dosis precisa de virus, o vacuna de
subunidades, que va a emplearse en la formulación también dependerá
de la vía de administración y de la naturaleza del paciente, y debe
decidirse según la evaluación del médico y las circunstancias de
cada paciente según técnicas clínicas convencionales. Una cantidad
inmunizante eficaz es aquella cantidad suficiente para producir una
respuesta inmunitaria frente al antígeno en el huésped al que se le
administra el vesiculovirus recombinante o la vacuna de
subunidades.
En una realización específica, una cantidad
inmunizante eficaz de un vesiculovirus recombinante vivo de la
presente invención está dentro del intervalo de 10^{3} a 10^{9}
ufp/dosis, más preferiblemente de 10^{6} a 10^{9} ufp/dosis. Es
posible el refuerzo pero no se prefiere. Si se desea el refuerzo,
puede reforzarse opcionalmente con el antígeno en forma purificada
en lugar de usar un vesiculovirus recombinante de la invención.
Para vacunas de vesiculovirus recombinante
inactivado, la formulación de vacuna comprende una cantidad
inmunizante eficaz del virus inactivado, preferiblemente en
combinación con un inmunoestimulante; y un vehículo
farmacéuticamente aceptable. Tal como se usa en el presente
contexto, "inmunoestimulante" pretende abarcar cualquier
compuesto o composición que tiene la capacidad de potenciar la
actividad del sistema inmunitario, ya sea un efecto potenciador
específico en combinación con un antígeno específico, o simplemente
un efecto independiente tras la actividad de uno o más elementos de
la respuesta inmunitaria. Algunos de los compuestos
inmunoestimulantes más comúnmente utilizados en composiciones de
vacuna son los adyuvantes alumbre o muramildipéptido de (MDP) y sus
análogos. Se conocen en la técnica procedimientos de utilización de
estos materiales, y está dentro de la capacidad del experto
determinar una cantidad óptima de estimulante para una vacuna de
virus dada. También puede desearse usar más de un inmunoestimulante
en una formulación dada.
La cantidad exacta de virus inactivado utilizada
en una preparación dada no es crítica, siempre que se administre la
cantidad mínima de virus necesaria para provocar una respuesta
inmunitaria. Se contempla un intervalo de dosificación de tan sólo
aproximadamente 10 \mug, hasta una cantidad de un miligramo o más.
Como un ejemplo, en una realización específica, las dosificaciones
individuales pueden oscilar entre aproximadamente
50-650 \mug por inmunización.
Puede llevarse a cabo el uso de antígenos
purificados como vacunas de subunidades mediante procedimientos
convencionales. Por ejemplo, la(s) proteína(s)
purificada(s) deben ajustarse a una concentración apropiada,
formularse con cualquier adyuvante de vacuna adecuado y envasarse
para su uso. Los adyuvantes adecuados pueden incluir, pero no se
limitan a: geles minerales, por ejemplo, hidróxido de aluminio;
sustancias tensioactivas tales como lisolecitina, polioles
plurónicos; polianiones; péptidos; emulsiones de aceite; alumbre y
MDP. El inmunógeno también puede incorporarse en liposomas, o
conjugarse con polisacáridos y/u otros polímeros para su uso en una
formulación de vacuna. En casos en los que el antígeno recombinante
es un hapteno, es decir, una molécula que es antigénica porque
puede reaccionar selectivamente con anticuerpos análogos, pero no
inmunogénica porque no puede provocar una respuesta inmunitaria, el
hapteno puede unirse covalentemente a un vehículo o molécula
inmunogénica; por ejemplo, una proteína grande tal como seroalbúmina
conferirá inmunogenicidad al hapteno acoplado a la misma. El
hapteno-vehículo puede formularse para su uso como
vacuna.
Las dosis eficaces (cantidades inmunizantes) de
las vacunas de la invención también pueden extrapolarse a partir de
las curvas de dosis-respuesta derivadas de sistemas
de prueba en modelos animales.
La invención también proporciona un envase o kit
farmacéutico que comprende uno o más recipientes que comprenden uno
o más de los ingredientes de las formulaciones de vacuna de la
invención. Asociada con tal(es) recipien-
te(s), puede haber una notificación en la forma prescrita por una agencia gubernamental que regula la fabricación, el uso o la venta de productos farmacéuticos o productos biológicos, notificación que refleja la aprobación por la agencia de la fabricación, el uso o la venta para administración a seres humanos.
te(s), puede haber una notificación en la forma prescrita por una agencia gubernamental que regula la fabricación, el uso o la venta de productos farmacéuticos o productos biológicos, notificación que refleja la aprobación por la agencia de la fabricación, el uso o la venta para administración a seres humanos.
La presente invención proporciona por tanto un
procedimiento de inmunización de un animal, o tratamiento o
prevención de diversas enfermedades o trastornos en un animal, que
comprende administrar al animal una dosis inmunizante eficaz de una
vacuna de la presente invención.
Los anticuerpos generados contra el antígeno
mediante inmunización con los virus recombinantes de la presente
invención también tienen usos potenciales en inmunoensayos de
diagnóstico, inmunoterapia pasiva y generación de anticuerpos
antiidiopáticos.
Los anticuerpos generados pueden aislarse
mediante técnicas convencionales conocidas en la técnica (por
ejemplo, cromatografía de inmunoafinidad, centrifugación,
precipitación, etc.) y usarse en inmunoensayos de diagnóstico. Los
anticuerpos también pueden usarse para controlar el tratamiento y/o
la progresión de la enfermedad. Puede usarse para este fin
cualquier sistema de inmunoensayo conocido en la técnica, tal como
los enumerados anteriormente, incluyendo pero sin limitarse a
sistemas de ensayo competitivo y no competitivo usando técnicas
tales como radioinmunoensayos, ELISA (ensayos inmunoabsorbentes
ligados a enzimas), inmunoensayos de tipo "sándwich",
reacciones de precipitina, reacciones de precipitina por difusión en
gel, ensayos de inmunodifusión, ensayos de aglutinación, ensayos de
fijación al complemento, ensayos inmunorradiométricos, inmunoensayos
de fluorescencia, inmunoensayos de proteína A y ensayos de
inmunoelectroforesis, por nombrar sólo unos pocos.
Las formulaciones de vacuna de la presente
invención también pueden usarse para producir anticuerpos para su
uso en inmunoterapia pasiva, en la que se logra protección a corto
plazo de un huésped mediante la administración de anticuerpos
formados previamente dirigidos contra un organismo heterólogo.
Los anticuerpos generados por las formulaciones
de vacuna de la presente invención también pueden usarse en la
producción de anticuerpo antiidiopático. Entonces, el anticuerpo
antiidiopático puede usarse a su vez para la inmunización, con el
fin de producir una subpoblación de anticuerpos que se unen al
antígeno inicial del microorganismo patógeno (Jerne, 1974, Ann.
Immunol. (París) 125c:373; Jerne, et al., 1982, EMBO J.
1:234).
Se ensambló un clon de ADN que contenía la
secuencia de 11.161 nucleótidos del rabdovirus prototipo, virus de
estomatitis vesicular (VEV), de modo que podía transcribirse por la
ARN polimerasa de bacteriófago T7 dando un ARN de cadena positiva
de longitud completa complementario al genoma del VEV. La expresión
de este ARN en células que expresan también la proteína de la
nucleocápsida del VEV y las dos subunidades de polimerasa de VEV
dio como resultado la producción de VEV con las características de
crecimiento del VEV de tipo natural. Se verificó la recuperación de
virus a partir de ADN mediante: 1) la presencia de dos etiquetas
genéticas que generaban nuevos sitios de restricción en ADN
derivado del genoma; 2) la secuenciación directa del ARN genómico
del virus recuperado, y 3), la producción de un VEV recombinante en
el que la glicoproteína se derivaba de un segundo serotipo. La
capacidad para generar VEV a partir de ADN abre numerosas
posibilidades para el análisis genético de la replicación del VEV.
Además, debido a que VEV puede hacerse crecer hasta títulos muy
altos y en grandes cantidades con relativa facilidad, pueden
modificarse mediante ingeniería genética los VEV recombinantes que
presentan antígenos novedosos. Tales virus modificados pueden usarse
como vacunas que confieren protección frente a otros virus o
microorganismos patógenos, o para producir inmunidad en general
frente a un antígeno extraño codificado.
Construcción de plásmidos. Se construyó
el plásmido pVSVFL(+) que expresa la secuencia de ARN del VEV
(antigenómico) de cadena positiva de 11.161 nucleótidos a partir de
cuatro fragmentos de ADN clonados en pBluescript SK^{+}
(Stratagene). El plásmido de partida para la construcción,
pVSVFL(-), expresó el ARN genómico de VEV de sentido negativo
completo (serotipo Indiana) a partir de un promotor T7. Se generó
este plásmido en un procedimiento de clonación de nueve etapas que
implicaba unir los cinco clones de ADNc originales de los ARNm de
VEV (Gallione et al., 1981, J. Virol.
39:529-535; Rose y Gallione, 1981, J. Virol.
39:519-528; Schubert et al., 1985, Proc.
Natl. Acad. Sci. USA 82:7984-7988) con fragmentos de
unión génica y fragmentos terminales. Se generaron estos fragmentos
mediante transcripción inversa y reacción en cadena de la polimerasa
(RT-PCR) (Mullis y Faloona, 1987, Methods in
Enzymology 155:335-350) a partir de ARN genómico de
VEV (M.A. Whitt, R. Burdine, E.A. Stillman y J.K. Rose, original en
preparación). Para facilitar la modificación mediante ingeniería
genética del genoma de VEV y proporcionar etiquetas genéticas, se
introdujeron sitios únicos de enzima de restricción Mlu I y Nhe I
mediante mutagénesis dirigida por oligonucleótidos en las regiones
no codificantes 5' y 3' que flanquean el gen de glicoproteína de
VEV antes de la construcción del genoma de cadena completa.
En la etapa inicial de construcción de pVSVFL(+)
se usaron los cebadores (5'CCGGCTCGAGTTGTAATAC
GACTCACTATAGGGACGAAGACAAACAAACCATTATTAT C-3') (SEC ID NO:38) y (5'GAACTCTCCTCTA
GATGAGAAC-3') (SEC ID NO:39) para amplificar (Mullis y Faloona, 1987, Methods in Enzymology 155:335-350) un fragmento de 2.124 nucleótidos a partir de pVSVFL(-) (nº 1, figura 4A). Este fragmento corresponde al extremo 3' del genoma del VEV. El primer cebador introdujo un sitio Xho I y un promotor de T7 (subrayado) precediendo inmediatamente la secuencia complementaria al extremo 3' del genoma del VEV. El segundo cebador cubrió un sitio Xba I único presente en el gen de P de VEV. Se digirió el producto de PCR con Xho I y Xba I y se clonó en pBluescript SK^{+} (Stratagene) que se había digerido con Xho I y Xba I. El plásmido resultante que portaba la secuencia correspondiente al extremo 3' del genoma del VEV precedido por un promotor de T7 se designó pBSXX. Obsérvese que también está presente un promotor de T7 adicional en sentido 5' del sitio Xho I en el vector. A continuación se generó la secuencia correspondiente al extremo 5' del genoma del VEV y parte de la ribozima del virus de hepatitis delta (VHD) (Pattnaik et al., 1992, Cell 69:1011-1120; Perrotta y Been, 1991, Nature 350:434-436). Se amplificó un producto de PCR de 147 nucleótidos (nº 3, figura 4A) a partir de pVSVFL(-) con los cebadores (5'AGGTCGGACCGCGAGGAGGTGGA
GATGCCATGCCGACCCACGAAGACCACAAAACCAG -3') (SEC ID NO:40) y (5'ATGTTGAAGAGTGACCTA
CACG-3') (SEC ID NO:41). El primer cebador contenía 39 nucleótidos de la secuencia que codificaba la ribozima del VHD (subrayado) seguida por 19 nucleótidos complementarios al extremo 3' terminal del ARN antigenómico de VEV. El segundo cebador se hibridaba dentro del gen L (figura 4A). Se digirió el producto de PCR con Afl II y Rsr II y se ligó el fragmento de Afl II-Rsr II de 80 nucleótidos a un fragmento de Rsr II-Sac I de 225 nucleótidos (nº 4, figura 4A) derivado de un plásmido designado pBS-GMG (Stillman et al., original presentado). El fragmento 4 contenía la secuencia de terminación de T7 y el parte restante de la secuencia que codificaba la ribozima de VHD. Se digirieron los productos ligados con Afl II y Sac I y se clonó el producto de Afl II-Sac I de 305 nucleótidos en los sitios Afl II y Sac I de un vector pBSXX modificado que contenía un sitio Afl II insertado en el sitio Not I único dentro del poliligador. Este plásmido que contenía el fragmento de Afl II-Sac I se designó pBXXAS. Para completar la construcción, se insertó un fragmento de Bst 1107 I a Afl II de 10.077 nucleótidos (nº 2, figura 4A) que contenía el 90% de las secuencias del VEV a partir del pVSVFL(-) en los sitios Bst 1107 I y AflII únicos de pBXXAS. El plásmido final se designó pVSVFL(+). Se determinaron las secuencias en este plásmido generadas mediante PCR (secuencias sombreadas, figura 4B) y no contenían ningún error. También se preparó un plásmido en el que la secuencia del gen de G del serotipo Indiana de VEV (MluI-NheI) se sustituyó por el gen de G del serotipo New Jersey de VEV (Gallione y Rose,
1983, J. Virol. 46:162-169). Este plásmido se denomina pVSVFL(+)_{I/NJG} y tiene solamente un único promotor de T7.
GACTCACTATAGGGACGAAGACAAACAAACCATTATTAT C-3') (SEC ID NO:38) y (5'GAACTCTCCTCTA
GATGAGAAC-3') (SEC ID NO:39) para amplificar (Mullis y Faloona, 1987, Methods in Enzymology 155:335-350) un fragmento de 2.124 nucleótidos a partir de pVSVFL(-) (nº 1, figura 4A). Este fragmento corresponde al extremo 3' del genoma del VEV. El primer cebador introdujo un sitio Xho I y un promotor de T7 (subrayado) precediendo inmediatamente la secuencia complementaria al extremo 3' del genoma del VEV. El segundo cebador cubrió un sitio Xba I único presente en el gen de P de VEV. Se digirió el producto de PCR con Xho I y Xba I y se clonó en pBluescript SK^{+} (Stratagene) que se había digerido con Xho I y Xba I. El plásmido resultante que portaba la secuencia correspondiente al extremo 3' del genoma del VEV precedido por un promotor de T7 se designó pBSXX. Obsérvese que también está presente un promotor de T7 adicional en sentido 5' del sitio Xho I en el vector. A continuación se generó la secuencia correspondiente al extremo 5' del genoma del VEV y parte de la ribozima del virus de hepatitis delta (VHD) (Pattnaik et al., 1992, Cell 69:1011-1120; Perrotta y Been, 1991, Nature 350:434-436). Se amplificó un producto de PCR de 147 nucleótidos (nº 3, figura 4A) a partir de pVSVFL(-) con los cebadores (5'AGGTCGGACCGCGAGGAGGTGGA
GATGCCATGCCGACCCACGAAGACCACAAAACCAG -3') (SEC ID NO:40) y (5'ATGTTGAAGAGTGACCTA
CACG-3') (SEC ID NO:41). El primer cebador contenía 39 nucleótidos de la secuencia que codificaba la ribozima del VHD (subrayado) seguida por 19 nucleótidos complementarios al extremo 3' terminal del ARN antigenómico de VEV. El segundo cebador se hibridaba dentro del gen L (figura 4A). Se digirió el producto de PCR con Afl II y Rsr II y se ligó el fragmento de Afl II-Rsr II de 80 nucleótidos a un fragmento de Rsr II-Sac I de 225 nucleótidos (nº 4, figura 4A) derivado de un plásmido designado pBS-GMG (Stillman et al., original presentado). El fragmento 4 contenía la secuencia de terminación de T7 y el parte restante de la secuencia que codificaba la ribozima de VHD. Se digirieron los productos ligados con Afl II y Sac I y se clonó el producto de Afl II-Sac I de 305 nucleótidos en los sitios Afl II y Sac I de un vector pBSXX modificado que contenía un sitio Afl II insertado en el sitio Not I único dentro del poliligador. Este plásmido que contenía el fragmento de Afl II-Sac I se designó pBXXAS. Para completar la construcción, se insertó un fragmento de Bst 1107 I a Afl II de 10.077 nucleótidos (nº 2, figura 4A) que contenía el 90% de las secuencias del VEV a partir del pVSVFL(-) en los sitios Bst 1107 I y AflII únicos de pBXXAS. El plásmido final se designó pVSVFL(+). Se determinaron las secuencias en este plásmido generadas mediante PCR (secuencias sombreadas, figura 4B) y no contenían ningún error. También se preparó un plásmido en el que la secuencia del gen de G del serotipo Indiana de VEV (MluI-NheI) se sustituyó por el gen de G del serotipo New Jersey de VEV (Gallione y Rose,
1983, J. Virol. 46:162-169). Este plásmido se denomina pVSVFL(+)_{I/NJG} y tiene solamente un único promotor de T7.
Transfección y recuperación de VEV
recombinante. Se mantuvieron células de riñón de cría de hámster
(BHK-21, ATCC) en DME (medio de Eagle modificado
por Dulbecco) complementado con suero bovino fetal al 5% (FBS). Se
infectaron las células en placas de 10 cm (confluencia del
^{-}70%) a una multiplicidad de 10 con vTF7-3
(Fuerst et al., 1986, Proc. Natl. Acad. Sci. USA
83:8122-8126). Tras 30 min., se transfectaron
plásmidos que codifican el ARN antigenómico de VEV y las proteínas
N, P y L en las células usando un kit de transfección de fosfato de
calcio según las direcciones suministradas (Stratagene). Se
expresaron cada una de las regiones codificantes para las proteínas
N, P y L en pBluescript SK(+) a partir del promotor de T7. Las
cantidades de plásmido fueron 10 \mug de pVSVFL(+), 5 \mug de
pBS-N, 4 \mug de pBS-P y 2 \mug
de pBS-L. Tras 24-48 h de
incubación a 37ºC en CO_{2} al 3%, se rasparon las células de la
placa y se sometieron a tres series de
congelación-descongelación (-70ºC, 37ºC) para
liberar el virus asociado a las células. Se sedimentó el desecho de
los lisados celulares mediante centrifugación a 1.250 x g durante 5
min. Se añadieron cinco ml de este lisado a aproximadamente
10^{6} células BHK sobre una placa de 10 cm en 10 ml de DME + FBS
al 5%. Tras 48 h se clarificó el medio mediante centrifugación a
1.250 x g durante 10 min. y se pasó a través de un filtro para
eliminar la mayor parte del virus vaccinia (tamaño de poro de 0,2
\mum, Gelman Sciences). Entonces se añadió directamente un ml a
las células BHK que se habían sembrado en placa sobre un
cubreobjetos en una placa de 35 mm. Tras cuatro horas, se fijaron
las células en paraformaldehído al 3% y se tiñeron con anticuerpo
monoclonal I1 frente a la proteína G_{I} de VEV (Lefrancois y
Lyles, 1982, Virology 121:168-174) o 9B5 (Bricker
et al., 1987, Virology 161:533-540) frente a
la proteína G_{NJ} de VEV seguido de anticuerpo conjugado con
rodamina de cabra anti-ratón (Jackson Research).
Entonces se examinaron las células mediante inmunofluorescencia
indirecta usando un microscopio Microphot-FX de
Nikon equipado con un objetivo Planapochromat 40x. Si la
recuperación de VEV era satisfactoria, el 100% de las células
mostraban la tinción brillante típica para la proteína G
característica de una infección con VEV.
Preparación y análisis de proteína y ARN de
VEV. Se usaron VEV recombinante y VEV de tipo natural aislado
de placas individuales (\sim10^{5} unidades formadoras de placa)
para infectar una monocapa de células BHK (confluencia de
\sim80%) sobre una placa de 10 cm en 10 ml de DME más FBS al 5%.
Tras 24 h, se eliminaron los desechos celulares y los núcleos
mediante centrifugación a 1.250 x g durante 5 min., y entonces se
sedimentó el virus a partir del medio a 35.000 RPM en un rotor
Beckman SW41 durante una hora. Se resuspendieron los sedimentos de
virus en 0,5 ml Tris-HCl 10 mM, pH 7,4 para el
análisis de proteínas. Para el aislamiento del ARN, se resuspendió
el virus en 0,2 ml de SDS 0,5% /acetato de sodio 0,2 M, pH 8,0,
seguido de extracción con fenol/CHCl_{3}. Se precipitó el ARN con
etanol al 95% y 5 \mug de ARNt portador. Se sedimentó el ARN
mediante centrifugación a 12.000 x g durante 15 min. y se
resuspendió en agua con 1 unidad de RNasin (Promega). Para el
análisis de ARN mediante RT-PCR, se usaron parejas
de cebadores que flanqueaban los sitios novedosos Nhe I o bien Mlu
I. Se llevó a cabo la reacción de síntesis de la primera cadena ADN
en 50 \mul de tampón para PCR (Promega) que contenía MgCl_{2} 5
mM, dNTPs 1 mM, 1 unidad de ARN en (Promega), 1 unidad de
transcriptasa inversa del virus de mieloblastosis aviar (AMV RT;
Promega) cebador 0,75 \muM y aproximadamente 0,25 \mug de ARN
genómico de VEV. La incubación fue a 42ºC durante 15 min. seguido de
5 min. a 99ºC y 5 min. a 5ºC. Se llevó a cabo la PCR mediante la
adición de Taq polimerasa 0,5 U, el ajuste de la concentración de
MgCl_{2} a 1,25 mM y la adición del segundo cebador (0,75
\muM). Se sometió la reacción a 20 ciclos térmicos: 95ºC, 1 min.;
60ºC 1,5 min. Entonces se incubó la reacción a 60ºC durante 7
min.
Se realizó la secuenciación directa del ARN
genómico de VEV según un protocolo descrito previamente basado en
el procedimiento de terminación de cadena didesoxi (Mierendorf y
Pfeffer, 1987, Methods in Enzymology 152:563-566)
excepto en que se usó [\alpha-^{33}P]dATP
(Amersham, Inc.). Cada reacción incluía aproximadamente 0,25 \mug
de ARN genómico de VEV.
Para construir un clon de ADNc que codifica todo
el genoma del VEV 11.161, se unieron individualmente clones de ADNc
de los ARNm de VEV usando fragmentos pequeños de ADN generados
mediante RT-PCR que cubrían las cuatro uniones
génicas. También se generaron secuencias terminales genómicas
correctas mediante RT-PCR del genoma del VEV, y
éstas se unieron a otros ADN usando sitios de restricción. Se
construyó este clon inicial con un promotor de T7 que dirigía la
síntesis del ARN de VEV de cadena negativa de longitud completa. A
pesar de los numerosos intentos, no se pudo recuperar VEV de las
células que expresaban el ARN genómico de VEV y las proteínas N, P
y L de VEV. Por tanto se rediseñó el VEV construido para expresar el
ADN antigenómico de VEV. La estrategia de construcción se describe
en Materiales y Procedimientos y en las figuras
4A-B. Se clonó la secuencia de VEV entera así como
un promotor de T7, secuencia de terminación y de ribozima de VHD en
pBluescript SK+ entre los sitios Xho I y Sac I (figura 4B; figura
1). También está presente un promotor adicional de T7 en sentido 5'
del sitio Xho I en el plásmido. Se usó una estrategia de clonación
ligeramente diferente para generar plásmidos que carecían del
promotor de T7 en sentido 5' y también se ha recuperado VEV a partir
de estos constructos.
Recuperación de VEV a partir de ADN. Para
determinar si se podía recuperar VEV a partir de ADN de plásmido,
se infectaron células con vaccinia, vTF7-3 (Fuerst
et al., 1986, Proc. Natl. Acad. Sci. USA
83:8122-8126) proporcionando ARN polimerasa de T7
citoplasmático. Entonces se transfectaron estas células con
pVSVFL(+), que expresa el ARN de VEV antigenómico a partir de un
promotor de T7, y los tres otros plásmidos que expresan las
proteínas N, P y L de VEV. Se requirió la expresión de la proteína N
para ensamblar el ARN antigenómico de VEV naciente en
nucleocápsidas. Una vez formados, estas nucleocápsidas deben servir
como moldes para la síntesis de ARN de cadena negativa mediante el
complejo de L/P polimerasa. Entonces, el ARN de cadena negativa en
la cápsida debe ser un molde para la transcripción, iniciando el
ciclo infeccioso del VEV.
El experimento de recuperación inicial empleó
dos placas de 10 cm de células BHK (\sim5 x 10^{6} células cada
una). A las 24 horas tras la infección con vTF7-3 y
transfección con los cuatro plásmidos, se congelaron y
descongelaron las células y el medio para liberar cualquier VEV
asociado a las células, y se añadieron los lisados clarificados a
células BHK nuevas. Tras 48 horas, amblas placas mostraron graves
efectos citopáticos que podrían haberse debido al virus vaccinia o
bien al VEV recuperado. Entonces se añadió un ml de cada
sobrenadante a placas pequeñas de células BHK sobre cubreobjetos.
Tras dos horas, uno de estos cubreobjetos mostraba células
redondeadas características de una infección por VEV, mientras que
la otra no lo hacía. Tras 4 horas, se fijaron células sobre ambos
cubreobjetos, se tiñeron con los anticuerpos apropiados y se
examinaron mediante microscopía de inmunofluorescencia indirecta
para detectar la proteína G de VEV. Todas las células sobre el
cubreobjeto que mostraba células redondeadas revelaban una
fluorescencia intensa característica de la expresión de la proteína
G durante la infección por VEV (datos no mostrados). Los pases y
análisis siguientes descritos a continuación mostraron que se había
recuperado VEV a partir de la transfección. El otro cubreobjetos no
mostró expresión de G, y no pudo recuperarse VEV tras pases.
Basándose en la frecuencia con la que se
recuperaron los minigenomas del virus de la rabia (Schnell et
al., 1994, EMBO J. 13:4195-4203) y del VEV
(Stillman et al., original presentado), se anticipó que la
recuperación del VEV completo, si podía obtenerse, sería un
acontecimiento poco frecuente. La recuperación inicial de VEV a
partir de sólo una de dos transfecciones sugirió la posibilidad de
que el título inicial en el lisado positivo fuera muy bajo. Para
examinar este título, se infectaron células BHK sobre cubreobjetos
con una décima parte del lisado (1 ml) derivada de cada
transfección inicial. Tras ocho horas, se examinaron las células
para determinar la expresión de la proteína G mediante
inmunofluorescencia indirecta. Un barrido de todo el cubreobjetos no
reveló infección por VEV del lisado negativo, y sólo cinco zonas
pequeñas de infección (2-6 células cada una) del
lisado que dieron lugar a expresión de G de VEV en pases
posteriores. El título inicial fue por tanto muy bajo tal como se
sospechaba, y posiblemente representó un total de aproximadamente 50
partículas infecciosas, derivadas probablemente de una infección
por VEV iniciada en sólo una célula de 2 x 10^{7} transfectadas.
Esta baja tasa de recuperación de VEV infecciosa es típica de la
observada en varios experimentos.
Análisis de proteínas virales. Los pases
y ensayos en placa posteriores de VEV recuperado en tres
experimentos independientes revelaron placas que eran detectables
en menos de 16 horas y títulos de hasta 2 x 10^{9} ufp/ml
característicos de VEV. Para una verificación adicional de que se
había recuperado VEV, se examinaron las proteínas en el virus
sedimentado mediante electroforesis en gel de
SDS-poliacrilamida (PAGE). La figura 5 muestra el
gel teñido con Coomassie de proteínas de VEV recuperadas a partir de
ADN recombinante (VEVr) y VEV de tipo natural. Las movilidades y
las cantidades relativas de las cinco proteínas virales eran
indistinguibles en virus de tipo natural y recombinante.
Identificación de etiquetas de secuencia.
En pVSVFL(+), se alteró la secuencia de nucleótidos de VEV mediante
mutagénesis dirigida por oligonucleótidos para generar sitios únicos
de enzima de restricción Mlu I y Nhe I en las regiones no
codificantes 5' y 3' del gen de glicoproteína. Para verificar que
estos sitios estaban presentes en el virus recuperado, se llevó a
cabo la transcripción inversa del ARN genómico purificado a partir
de viriones recombinantes o de tipo natural usando cebadores en
sentido de 5' de cada sitio de restricción. Entonces se
amplificaron los productos de la transcripción inversa mediante PCR
usando un cebador adicional en el sentido de 5' de cada sitio de
restricción. Se verificó la presencia de la etiqueta genética en el
virus recombinante mediante la digestión de los productos de PCR
con las enzimas de restricción apropiadas. Usando este método, se
verificó la presencia de las secuencias tanto de Mlu I como de Nhe I
en el ARN del virus recuperado ARN, y en la figura 6 se muestran
los resultados para el sitio Nhe I. Se amplificaron en paralelo las
secuencias del VEV de tipo natural y del VEV recombinante y se
obtuvo un fragmento de 620 nucleótidos en ambos casos (carriles 3 y
5). No se obtuvo ningún producto cuando se omitió la transcriptasa
inversa de las reacciones antes de la PCR (carriles 1 y 2), lo que
indicaba que el producto de PCR se derivaba del ARN, no del ADN
contaminante. Tras la digestión con Nhe I, se obtuvieron los
fragmentos esperados de 273 y 347 pares de bases a partir del ARN
de VEV recombinante, mientras que el ADN derivado del ARN de tipo
natural permaneció sin digerir (carriles 4 y 6).
Secuenciación directa de ARN genómico
etiquetado. La presencia de nuevos sitios de restricción en el
ADN generado mediante PCR proporcionó pruebas fuertes de que se
había recuperado VEV a partir del ADN. Para garantizar que la
identificación de las etiquetas genéticas mediante PCR no había
resultado de una contaminación inadvertida por el ADN de plásmido,
se llevó a cabo un análisis de secuencia directo del ARN genómico
usando transcriptasa inversa y un cebador que hibrida en sentido 5'
respecto al sitio Nhe I. La secuencia del autorradiograma mostrado
en la figura 7 está completamente de acuerdo con la secuencia
publicada del ARNm de G de VEV (Rose y Gallione, 1981, J. Virol.
39:519-528) excepto en que están presentes los
cambios de cuatro nucleótidos usados para generar el sitio Nhe I
(GCACAA a GCTAGC). Estos resultados muestran
inequívocamente que la etiqueta de secuencia está presente en el
ARN genómico.
Virus VEV Indiana recombinante que porta la
glicoproteína del serotipo New Jersey. Existen dos serotipos de
VEV designados Indiana y New Jersey. Las glicoproteínas de los dos
serotipos comparten aproximadamente un 50% de identidad de
secuencia (Gallione y Rose, 1983, J. Virol.
46:162-169). En estudios anteriores se encontró que
la glicoproteína del serotipo New Jersey podía complementar a un
mutante del serotipo VEV_{I} que hace a una glicoproteína
defectuosa (Whitt et al., 1989, J. Virol.
63:3569-3578). Por tanto, parece posible que un VEV
recombinante en el que el gen de glicoproteína Indiana (G_{I}) se
sustituyó por el gen de glicoproteína New Jersey (G_{NJ}) sería
viable a pesar de la extensa divergencia de secuencia. Para generar
un recombinante tal, se amplificó el ADNc de G_{NJ} mediante PCR
usando cebadores que introdujeron sitios Mlu I y Nhe I en las
regiones no codificantes 5' y 3' a cada extremo del gen. Se clonó el
ADN amplificado en pBluescript y se expresó la proteína G_{NJ} en
células BHK usando el sistema de vaccinia-T7. Se
demostró que la proteína expresada tenía actividad de fusión de
membrana por debajo de pH 6,0, lo que indicaba que era funcional
(datos no mostrados). Entonces se clonó el ADNc de G_{NJ} en los
sitios Mlu I y Nhe I únicos del constructo de longitud completa
tras la eliminación de las secuencias que codifican G_{I}. Se
recuperó VEV recombinante esencialmente tal como se describió
anteriormente excepto en que se dejó continuar la transfección
inicial durante 48 horas antes de la etapa de
congelación-descongelación. Tras el primer pase, se
verificó la expresión de la proteína G_{NJ} mediante
inmunofluorescencia indirecta usando un anticuerpo monoclonal
específico frente a G_{NJ} (Bricker et al., 1987, Virology
161:533-540). Entonces se purificó en placa el virus
y se hizo crecer. Para examinar las proteínas presentes en el virus
recombinante, se analizaron el virus recuperado de células
infectadas con VEV_{I} , VEV_{NJ}, y el VEV_{I/NJG}
recombinante mediante SDS-PAGE seguido de tinción
con Coomassie. Cada una de las proteínas G, N, P y M de VEV_{I}
tienen movilidades distintas de sus homólogos de VEV_{NJ} (figura
8, carriles 1 y 3). El VEV_{I/NJG} muestra la diferencia de
movilidad en sólo la proteína G tal como se esperaba (carril 2).
También se verificó la presencia de los sitios Nhe I y Mlu I
novedosos en el recombinante (datos no mostrados).
Los resultados presentados en el presente
documento establecen que VEV infeccioso puede recuperarse a partir
del ADN recombinante. Se cree que la expresión del ARN antigenómico,
cadena positiva, en presencia de las proteínas N, P y L era crítica
para el éxito porque no se ha recuperado virus partiendo de un
constructo equivalente que codifica el ARN genómico.
¿Por qué es tan poco frecuente el acontecimiento
inicial de generar VEV, que se produce aparentemente en sólo 1 en
10^{7} a 10^{8} células transfectadas? Una posibilidad es que
este clon contenga una secuencia errónea que no se corrige sólo
mediante un acontecimiento mutacional poco frecuente. Se cree que
éste no es el caso porque el clon estaba completamente secuenciado
antes de ensamblar y se corrigieron las diferencias con respecto a
las secuencias publicadas, o se demostró que las proteínas eran
funcionales en ensayos de complementación. Además, la frecuencia de
recuperación es en realidad mayor de lo esperado basándose en las
observaciones con minigenomas que codifican una o dos proteínas de
VEV (Stillman et al., original presentado). En estos casos
se encontró que se recuperaba un minigenoma de transcripción y
replicación (ARN \sim2kb) en aproximadamente 1 en 10^{2}
células transfectadas que expresan el ARN con las proteínas N, P y
L. La adición de un segundo cistrón (ARN adicional de 0,85 kb) que
codifica la proteína M disminuyó la tasa de recuperación hasta
aproximadamente 1 en 10^{3} células transfectadas. Si existe una
disminución de diez veces en la tasa de recuperación para cada
kilobase adicional de ARN añadido, puede pensarse fácilmente una
frecuencia incluso menor de recuperación para el genoma de 11.161
kb del observado. Aunque estos minigenomas codifican ARN de sentido
negativo, la comparación de la frecuencia de recuperación con la de
la longitud completa más el constructo es probablemente válida
porque la expresión de los ARNm N, P y L no generarían ARNm
complementarios al minigenoma.
Aunque la etapa limitativa de la velocidad en la
generación de VEV infeccioso no se conoce, es posible que esté al
nivel de la síntesis y encapsidación del ARN antigenómico grande,
que debe producirse antes de la replicación y transcripción. La
encapsidación completa con la proteína N probablemente tiene que
producirse en el ARN naciente para protegerle de la degradación, y
las células en las que esto se produce también deben producir
cantidades apropiadas de proteínas L y P para iniciar la
replicación. Sin embargo, una vez que se ha producido esto, la
transcripción y traducción del genoma deben generar proteínas N, P y
L adicionales así como las proteínas G y M requeridas para el brote
de virus infeccioso.
La recuperación de VEV a partir de ADN abre
numerosos aspectos del ciclo de vida viral al análisis genético.
Los estudios de las señales genéticas implicadas en la transcripción
y replicación se han limitado hasta la fecha al análisis de ARN
defectuosos que no codifican proteínas virales (Pattnaik et
al., 1992, Cell 69:1011-1120; Wertz et
al., 1994, Proc. Natl. Acad. Sci. USA
91:8587-8591). Estas y otras señales pueden
examinarse ahora en el contexto de una infección por VEV que se
produce en ausencia de una infección por virus vaccinia. El sistema
que se ha descrito también proporciona una oportunidad para estudiar
los papeles de dominios proteicos virales individuales y las
modificaciones en el ensamblaje y replicación virales. Previamente,
estos análisis se han limitado a sistemas in vitro o al
análisis empleando la complementación de mutantes que se producen
en la naturaleza en los que la síntesis de la proteína mutante puede
complicar el análisis.
Quizá incluso más apasionante es la capacidad de
usar VEV como vector para expresar otras proteínas. El experimento
en el que se recuperó VEV Indiana que portaba la glicoproteína del
serotipo New Jersey (figura 8) ilustra que pueden prepararse
recombinantes viables. Por motivos que no están claros, los títulos
del virus recombinante fueron al menos diez veces inferiores que
los obtenidos con cualquier virus original. El título inferior no
resultó aparentemente de un defecto en el ensamblaje viral porque
las cantidades de proteínas en los viriones recombinantes y de tipo
natural al final de la infección fueron comparables (figura 8). Los
experimentos previos mostraron que podría incorporarse una
glicoproteína extraña que porta la señal de cola citoplasmática
apropiada en la envuelta de VEV (Owens y Rose, 1993, J. Virol.
67:360-365). Esto sugiere que pueden generarse VEV
recombinantes que portan proteínas novedosas en sus envueltas. Si
estos están atenuados de manera apropiada, pueden usarse como
vacunas contra otras enfermedades virales.
Los genomas truncados de partículas
interferentes defectuosas se replican y empaquetan muy bien, por
tanto, se sospecha que habrá flexibilidad también en la longitud
máxima del genoma que puede empaquetarse. Presumiblemente, puede
empaquetarse una nucleocápsida más larga como una partícula con
forma de bala más larga. Debido a la naturaleza modular del genoma
de VEV, con secuencias de iniciación y final de genes conservados en
las uniones génicas (Rose y Schubert, 1987, en The Virus: The
Rhabdoviruses, Plenum Publishing Corp., NY, págs.
129-166), debe ser relativamente fácil diseñar por
ingeniería genética genes adicionales en VEV.
\vskip1.000000\baselineskip
Se depositó el plásmido pVSVFL(+) el 2 de mayo
de 1995 en la Colección Americana de Cultivos Tipo (ATCC), 1201
Parklawn Drive, Rockville, Maryland 20852, según las disposiciones
del Tratado de Budapest sobre el reconocimiento internacional del
depósito de microorganismos para fines de procedimientos de patente,
y se le asignó el numero de registro 97134.
El alcance de la presente invención no está
limitado por el microorganismo depositado o las realizaciones
específicas descritas en el presente documento. De hecho, resultarán
evidentes para el experto en la técnica diversas modificaciones de
la invención además de las descritas en el presente documento a
partir de la descripción anterior y las figuras adjuntas. Tales
modificaciones están definidas por el alcance de las
reivindicaciones adjuntas.
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(Tabla pasa a página
siguiente)
(1) INFORMACIÓN GENERAL:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- SOLICITANTE: Rose, John K.
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TÍTULO DE LA INVENCIÓN: VESICULOVIRUS RECOMBINANTES Y SUS USOS
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- NÚMERO DE SECUENCIAS: 41
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- DIRECCIÓN DE CORRESPONDENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- DESTINATARIO: PENNIE & EDMONDS
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CALLE: 1155 Avenue of the Americas
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CIUDAD: Nueva York
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- ESTADO: Nueva York
\vskip0.500000\baselineskip
- (E)
- PAÍS: EE.UU.
\vskip0.500000\baselineskip
- (F)
- CÓDIGO POSTAL: 10036-2711
\vskip0.800000\baselineskip
- (v)
- FORMA LEGIBLE POR ORDENADOR:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- TIPO DE MEDIO: Disco flexible
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- ORDENADOR: PC compatible IBM
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- SISTEMA OPERATIVO: PC-DOS/MS-DOS
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- PROGRAMA: PatentIn Release nº 1.0, versión nº 1.30
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- DATOS DE LA SOLICITUD ACTUAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NÚMERO DE SOLICITUD: Por asignar
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- FECHA DE PRESENTACIÓN: en la misma fecha que el presente documento
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CLASIFICACIÓN:
\vskip0.800000\baselineskip
- (viii)
- INFORMACIÓN DEL APODERADO/AGENTE:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE: Misrock, S. Leslie
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- NÚMERO DE REGISTRO: 18.872
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- NÚMERO DE REFERENCIA/EXPEDIENTE: 6523-009-228
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- INFORMACIÓN DE TELECOMUNICACIONES:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- TELÉFONO: (212) 790-9090
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TELEFAX: (212) 869-9741/8864
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TELEX: 66141 PENNIE
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID NO: 1:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 14311 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- RASGO:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- UBICACIÓN: 760..2025
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- RASGO:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- UBICACIÓN: 2092..2886
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- RASGO:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- UBICACIÓN: 2946..3632
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- RASGO:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- UBICACIÓN: 3774..5306
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- RASGO:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- UBICACIÓN: 5429..11755
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEC ID NO: 1:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID NO: 2:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 422 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEC ID NO: 2:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID NO: 3:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 265 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEC ID NO: 3:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID NO: 4:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 229 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEC ID NO: 4:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID NO: 5:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 511 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEC ID NO: 5:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID NO: 6:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 2109 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEC ID NO: 6:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID NO: 7:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 14311 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEC ID NO: 7:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID NO: 8:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 23 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEC ID NO: 8:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTTGTAATACG ACTCACTATA GGG
\hfill23
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID NO: 9:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 23 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEC ID NO: 9:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTTGTAATACG ACTCACTATA GGG
\hfill23
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID NO: 10:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 50 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEC ID NO: 10:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipACGAAGACAA ACAAACCATT ATTATCATTA AAAGGCTCAG GAGAAACTTT
\hfill50
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID NO: 11:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 136 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEC ID NO: 11:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID NO: 12:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 83 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEC ID NO: 12:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID NO: 13:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 630 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEC ID NO: 13:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID NO: 14:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 630 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEC ID NO: 14:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID NO: 15:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 11 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: desconocida
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ARN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEC ID NO: 15:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipUCAGGAGAAA C
\hfill11
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID NO: 16:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 10 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: desconocida
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ARN
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- RASGO:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: 5' Gppp
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- UBICACIÓN: 1
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEC ID NO: 16:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipAACAGUAAUC
\hfill10
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID NO: 17:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 24 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: desconocida
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ARN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEC ID NO: 17:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGAUUACUGUU AAAGUUUCUC CUGA
\hfill24
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID NO: 18:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 10 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: desconocida
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ARN
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- RASGO:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: polyA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- UBICACIÓN: 10
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEC ID NO: 18:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGCUACAUAUG
\hfill10
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID NO: 19:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 10 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: desconocida
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ARN
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- RASGO:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: 5' Gppp
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- UBICACIÓN: 1
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEC ID NO: 19:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipAACAGAUAUC
\hfill10
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID NO: 20:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 29 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: desconocida
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ARN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEC ID NO: 20:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGAUAUCUGUU AGUUUUUUUC AUAUGUAGC
\hfill29
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID NO: 21:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 10 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: desconocida
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ARN
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- RASGO:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: polyA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- UBICACIÓN: 10
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEC ID NO: 21:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGUAGACUAUG
\hfill10
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID NO: 22:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 10 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: desconocida
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ARN
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- RASGO:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: 5' Gppp
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- UBICACIÓN: 1
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEC ID NO: 22:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipAACAGAUAUC
\hfill10
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID NO: 23:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 29 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: desconocida
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ARN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEC ID NO: 23:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGAUAUCUGUU ACUUUUUUUC AUAGUCUAC
\hfill29
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID NO: 24:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 10 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico.
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: desconocida
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ARN
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- RASGO:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: polyA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- UBICACIÓN: 10
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEC ID NO: 24:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipUAUCCCUAUG
\hfill10
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID NO: 25:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 10 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: desconocida
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ARN
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- RASGO:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: 5' Gppp
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- UBICACIÓN: 1
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEC ID NO: 25:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipAACAGAGAUC
\hfill10
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID NO: 26:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 29 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: desconocida
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ARN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEC ID NO: 26:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGAUCUCUGW AGUUUUUUUC AUAGGGAUA
\hfill29
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID NO: 27:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 10 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ARN
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- RASGO:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: polyA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- UBICACIÓN: 10
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEC ID NO: 27:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipAAUUUUUAUG
\hfill10
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID NO: 28:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 10 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ARN
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- RASGO:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: 5' Gppp
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- UBICACIÓN: 1
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEC ID NO: 28:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipAACAGCAAUC
\hfill10
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID NO: 29:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 29 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: desconocida
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ARN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEC ID NO: 29:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGAWGCUGW AGUUUUUUUC AUAAAAAUU
\hfill29
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID NO: 30:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 10 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: desconocida
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ARN
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- RASGO:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: polyA
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- UBICACIÓN: 10
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEC ID NO: 30:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipUUUAAGUAUG
\hfill10
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID NO: 31:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 27 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: desconocida
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ARN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEC ID NO: 31:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipAGGAUCAAAG UUUUUUUCAU ACUUAAA
\hfill27
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID NO: 32:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 27 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEC ID NO: 32:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCATTCAAGAC GCTGCTTCGC AACTTCC
\hfill27
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID NO: 33:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 22 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEC ID NO: 33:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCATGAATGTT AACATCTCAA GA
\hfill22
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID NO: 34:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 23 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ARN
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- RASGO:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: rasgo misceláneo
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- UBICACIÓN: 11..12
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: dinucleótido intergénico
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEC ID NO: 34:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGAUNNCUGUU ANUUUUUUUC AUA
\hfill23
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID NO: 35:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 11 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: desconocida
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ARN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEC ID NO: 35:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipUAUGAAAAAA A
\hfill11
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID NO: 36:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 11 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: desconocida
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ARN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEC ID NO: 36:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipUUUUUUUCAU A
\hfill11
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID NO: 37:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 11 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: desconocida
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEC ID NO: 37:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTATGAAAAAA A
\hfill11
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID NO: 38:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 59 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEC ID NO: 38:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCCGGCTCGAG TTGTAATACG ACTCACTATA GGGACGAAGA CAAACAAACC ATTATTATC
\hfill59
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID NO: 39:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 22 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEC ID NO: 39:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGAACTCTCCT CTAGATGAGA AC
\hfill22
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID NO: 40:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 58 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEC ID NO: 40:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipAGGTCGGACC GCGAGGAGGT GGAGATGCCA TGCCGACCCA CGAAGACCAC AAAACCAG
\hfill58
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID NO: 41:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 22 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEC ID NO: 41:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipATGTTGAAGA GTGACCTACA CG
\hfill22
Claims (62)
1. Un vesiculovirus replicable recombinante, que
comprende las proteínas N, P y L de vesiculovirus y un ARN genómico
de sentido (-) de vesiculorivus replicable, en el que dicho ARN
genómico de sentido (-) se modifica mediante:
(a) la inserción de una secuencia de ARN extraño
en una parte no esencial de dicho ARN genómico de sentido (-) de
vesiculovirus replicable; o
(b) la sustitución de una parte no esencial de
dicho ARN genómico de sentido (-) de vesiculovirus replicable por
una secuencia de ARN extraño, en el que una secuencia de ARN
complementaria a dicha secuencia de ARN extraño codifica un péptido
o una proteína que inducirá una respuesta inmunitaria frente a dicho
péptido o proteína cuando se expresa en un huésped adecuado
infectado con dicho vesiculovirus replicable recombinante
modificado.
2. El vesiculovirus según la reivindicación 1,
en el que el péptido o la proteína puede unirse
inmunoespecíficamente mediante un anticuerpo a, o provocar una
respuesta inmunitaria frente a, un antígeno de un microorganismo
patógeno.
3. El vesiculovirus según la reivindicación 2,
en el que el microorganismo patógeno es un virus.
4. El vesiculovirus según la reivindicación 2,
en el que el microorganismo patógeno es una bacteria.
5. El vesiculovirus según la reivindicación 2,
en el que el microorganismo patógeno es un parásito.
6. El vesiculovirus según la reivindicación 2,
en el que el microorganismo patógeno es un patógeno humano.
7. El vesiculovirus según la reivindicación 2,
en el que el microorganismo patógeno es un patógeno no humano.
8. El vesiculovirus según la reivindicación 1,
en el que el péptido o proteína puede unirse inmunoespecíficamente
mediante un anticuerpo a, o provocar una respuesta inmunitaria
frente a, un antígeno específico de tumor o asociado a tumor.
9. El vesiculovirus según una cualquiera de las
reivindicaciones 1 a 8 que es un virus de estomatitis vesicular.
10. El vesiculovirus según la reivindicación 2,
en el que el péptido o la proteína puede unirse
inmunoespecíficamente mediante un anticuerpo a, o provocar una
respuesta inmunitaria frente a, una glicoproteína de la envuelta de
un virus diferente del vesiculovirus.
11. El vesiculovirus según la reivindicación 10,
en el que la glicoproteína de la envuelta es una glicoproteína de
la envuelta de un virus de la inmunodeficiencia humana.
12. El vesiculovirus según la reivindicación 10,
en el que el péptido o la proteína se incorpora en la envuelta del
vesiculovirus.
13. El vesiculovirus según la reivindicación 10,
en el que el péptido o la proteína se expresa como una proteína de
fusión que comprende el dominio citoplasmático de una proteína G de
vesiculovirus.
14. El vesiculovirus según la reivindicación 10,
en el que también se expresa la proteína G endógena del
vesiculovirus.
15. El vesiculovirus según una cualquiera de
las reivindicaciones 1 a 9, en el que una segunda secuencia de ARN
complementaria a dicha secuencia de ARN extraño codifica un segundo
péptido o proteína que se expresa en el huésped adecuado, en el que
el primer péptido o proteína y el segundo péptido o proteína pueden
unirse inmunoespecíficamente mediante anticuerpos a diferentes
antígenos o provocar una respuesta inmunitaria frente a diferentes
antígenos.
16. Una célula huésped que contiene el
vesiculovirus recombinante según una cualquiera de las
reivindicaciones 1 a 15.
17. La célula huésped según la reivindicación
16, que produce el vesiculovirus replicable recombinante modificado,
conteniendo dicha célula huésped (a) un ácido nucleico recombinante
que puede transcribirse para producir una molécula de ARN que
comprende un ARN antigenómico (+) de vesiculovirus que contiene el
promotor de vesiculovirus para la replicación, en el que una región
del ARN no esencial para la replicación del vesiculovirus se ha
insertado, o sustituido por, dicha secuencia de ARN extraño; (b) un
segundo ácido nucleico recombinante que codifica una proteína N de
vesiculovirus; (c) un tercer ácido nucleico recombinante que
codifica una proteína L de vesiculovirus; y (d) un cuarto ácido
nucleico recombinante que codifica una proteína P de
vesiculovirus.
18. La célula huésped según la reivindicación
16, que produce el vesiculovirus replicable recombinante modificado,
conteniendo dicha célula huésped:
(a) un primer vector de plásmido de ADN que
comprende los siguientes componentes operativamente unidos:
- (i)
- un promotor de la ARN polimerasa de bacteriófago;
- (ii)
- una primera secuencia de ADN que se transcribe en la célula para producir una molécula de ARN que comprende (A) un ARN antigenómico (+) de vesiculovirus en el que una región del ARN no esencial para la replicación del vesiculovirus se ha insertado, o sustituido por, dicha secuencia de ARN extraño, y (B) una secuencia de ribozima inmediatamente en sentido descendente con respecto a dicho ARN antigenómico (+), que rompe en el extremo 3' terminal del ARN antigenómico; y
- (iii)
- una señal de terminación de la transcripción para la ARN polimerasa
(b) un segundo vector de plásmido de ADN que
comprende los siguientes componentes operativamente unidos:
- (i)
- el promotor de la ARN polimerasa de bacteriófago;
- (ii)
- una segunda secuencia de ADN que codifica una proteína N del vesiculovirus; y
- (iii)
- una segunda señal de terminación de la transcripción para la ARN polimerasa;
(c) un tercer vector de plásmido de ADN que
comprende los siguientes componentes operativamente unidos:
- (i)
- el promotor de la ARN polimerasa de bacteriófago;
- (ii)
- una tercera secuencia de ADN que codifica una proteína P del vesiculovirus; y
- (iii)
- una tercera señal de terminación de la transcripción para la ARN polimerasa;
(d) un cuarto vector de plásmido de ADN que
comprende los siguientes componentes operativamente unidos:
- (i)
- el promotor de la ARN polimerasa de bacteriófago;
- (ii)
- una cuarta secuencia de ADN que codifica una proteína L del vesiculovirus; y
- (iii)
- una cuarta señal de terminación de la transcripción para la ARN polimerasa; y
(e) un virus vaccinia recombinante que
comprende una secuencia que codifica la ARN polimerasa de
bacteriófago; mediante lo cual en dicha célula se transcribe la
primera secuencia de ADN para producir dicha molécula de ARN, se
expresan las proteínas N, P y L y la ARN polimerasa de bacteriófago,
y se produce el vesiculovirus replicable recombinante modificado
que tiene un genoma que es el complemento de dicho ARN antigenómico
que comprende dicha secuencia de ARN extraño.
19. Una formulación de vacuna que comprende una
cantidad del vesiculovirus según una cualquiera de las
reivindicaciones 1 a 15, eficaz para inducir una respuesta
inmunitaria contra el péptido o proteína; y un vehículo
farmacéuticamente aceptable.
20. Un vesiculovirus según una cualquiera de las
reivindicaciones 1 a 15, para su uso como medicamento.
21. Un vesiculovirus según la reivindicación 20,
para su uso en el tratamiento o prevención de una enfermedad o un
trastorno en un sujeto.
22. Un vesiculovirus según la reivindicación 21,
en el que la enfermedad o el trastorno es una enfermedad o un
trastorno provocado por un microorganismo patógeno.
23. Un vesiculovirus según la reivindicación
21, en el que la enfermedad o trastorno es un tumor.
24. Un vesiculovirus según una cualquiera de las
reivindicaciones 21 a 23, en el que el sujeto es un ser humano.
25. Un vesiculovirus según una cualquiera de las
reivindicaciones 21 a 23, en el que el sujeto es un animal no
humano.
26. El uso de una cantidad inmunizante eficaz de
un vesiculovirus según una cualquiera de las reivindicaciones 1 a
15, para la fabricación de un medicamento para tratar o prevenir
una enfermedad o un trastorno en un sujeto provocado por un
microorganismo patógeno.
27. El uso de una cantidad inmunizante eficaz de
un vesiculovirus según una cualquiera de las reivindicaciones 1 a
15, para la fabricación de un medicamento para tratar o prevenir un
tumor en un sujeto.
28. El uso según la reivindicación 26 ó 27, en
el que el sujeto es un ser humano.
29. El uso según la reivindicación 26 ó 27, en
el que el sujeto es un animal no humano.
30. Un kit que comprende una cantidad del
vesiculovirus según una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 15,
eficaz para inducir una respuesta inmunitaria contra el péptido o la
proteína.
31. Un procedimiento de producción de un
vesiculovirus replicable recombinante que comprende cultivar una
célula que contiene
(a) un primer ácido nucleico recombinante que
puede transcribirse para producir una molécula de ARN que comprende
(A) un ARN (+) antigenómico de vesiculovirus y (B) una secuencia de
ribozima inmediatamente en sentido descendente con respecto a dicho
ARN (+) antigenómico, que rompe en el extremo 3' terminal del ARN
(+) antigenómico, en el que una secuencia de ARN extraño se inserta
dentro o sustituye a una región del ARN no esencial para la
replicación del vesiculovirus, teniendo dicho primer ácido nucleico
recombinante los siguientes componentes operativamente unidos:
- (i)
- un primer promotor;
- (ii)
- una primera secuencia de ADN que puede transcribirse bajo el control del primer promotor en la célula para producir dicha molécula de ARN; y
- (iii)
- una primera señal de terminación de la transcripción;
(b) un segundo ácido nucleico recombinante que
codifica una proteína N de vesiculovirus y que tiene los siguientes
componentes operativamente unidos:
- (i)
- un segundo promotor que controla la expresión de la proteína N;
- (ii)
- una primera señal de iniciación de la traducción;
- (iii)
- una segunda secuencia de ADN que codifica la proteína N; y
- (iv)
- una segunda señal de terminación de la transcripción;
(c) un tercer ácido nucleico recombinante que
codifica una proteína L de vesiculovirus y que tiene los siguientes
componentes operativamente unidos:
- (i)
- un tercer promotor que controla la expresión de la proteína L;
- (ii)
- una segunda señal de iniciación de la traducción;
- (iii)
- una tercera secuencia de ADN que codifica la proteína L; y
- (iv)
- una tercera señal de terminación de la transcripción;
(d) un cuarto ácido nucleico recombinante que
codifica una proteína P de vesiculovirus y que tiene los siguientes
componentes operativamente unidos:
- (i)
- un cuarto promotor que controla la expresión de la proteína P;
- (ii)
- una tercera señal de iniciación de la traducción;
- (iii)
- una cuarta secuencia de ADN que codifica la proteína P; y
- (iv)
- una cuarta señal de terminación de la transcripción;
mediante lo cual se transcribe el primer ácido
nucleico recombinante en la célula para producir dicha molécula de
ARN y se expresan las proteínas N, L y P en la célula, y se produce
un vesiculovirus replicable recombinante que tiene un genoma que es
el complemento de dicho ARN antigenómico que comprende dicha
secuencia de ARN extraño, en el que dicha secuencia de ARN extraño
codifica un péptido o una proteína que se expresa e induce una
respuesta inmunitaria frente a dicho péptido o proteína en un
huésped adecuado infectado por el vesiculovirus.
32. El procedimiento según la reivindicación 31,
en el que la célula es una célula de mamífero.
33. El procedimiento según la reivindicación
31, en el que el primer ácido nucleico recombinante es un vector de
plásmido de ADN.
34. El procedimiento según la reivindicación 31
ó 33, en el que el segundo ácido nucleico recombinante es un vector
de plásmido de ADN; y en el que el tercer ácido nucleico
recombinante es un vector de plásmido de ADN; y en el que el cuarto
ácido nucleico recombinante es un vector de plásmido de ADN.
35. El procedimiento según la reivindicación
34, en el que el primer ácido nucleico recombinante, el segundo
ácido nucleico recombinante, el tercer ácido nucleico recombinante
y el cuarto ácido nucleico recombinante comprenden cada uno además
un marcador seleccionable.
36. El procedimiento según la reivindicación 31,
en el que el segundo, tercero y cuarto ácidos nucleicos
recombinantes forman parte de un único ácido nucleico recombinante
que no contiene tampoco dicho primer ácido nucleico
recombinante.
37. El procedimiento según la reivindicación 31,
en el que la primera, segunda, tercera y cuarta secuencias
promotoras son secuencias promotoras de la ARN polimerasa para la
misma ARN polimerasa, y en el que la célula también contiene una
fuente citoplasmática de dicha ARN polimerasa.
38. El procedimiento según la reivindicación 37,
en el que la fuente citoplasmática de dicha ARN polimerasa es un
virus vaccinia recombinante que expresa dicha ARN polimerasa en la
célula.
39. Un procedimiento de producción de un
vesiculovirus replicable recombinante que comprende cultivar una
célula de mamífero que contiene:
(a) un primer vector de plásmido de ADN que
comprende los siguientes componentes operativamente unidos:
- (i)
- un promotor de la ARN polimerasa de bacteriófago;
- (ii)
- una primera secuencia de ADN que se transcribe en la célula para producir una molécula de ARN que comprende (A) un ARN (+) antigenómico de vesiculovirus, en la que una secuencia de ARN extraño se inserta dentro o sustituye a una región del ARN no esencial para la replicación del vesiculovirus, y (B) una secuencia de ribozima inmediatamente en sentido descendente con respecto a dicho ARN (+) antigenómico, que rompe en el extremo 3' terminal del ARN antigenómico; y
- (iii)
- una señal de terminación de la transcripción para la ARN polimerasa;
(b) un segundo vector de plásmido de ADN que
comprende los siguientes componentes operativamente unidos:
- (i)
- el promotor de la ARN polimerasa de bacteriófago;
- (ii)
- una segunda secuencia de ADN que codifica una proteína N del vesiculovirus; y
- (iii)
- una segunda señal de terminación de la transcripción para la ARN polimerasa;
(c) un tercer vector de plásmido de ADN que
comprende los siguientes componentes operativamente unidos:
- (i)
- el promotor de la ARN polimerasa de bacteriófago;
- (ii)
- una tercera secuencia de ADN que codifica una proteína P del vesiculovirus; y
- (iii)
- una tercera señal de terminación de la transcripción para la ARN polimerasa;
(d) un cuarto vector de plásmido de ADN que
comprende los siguientes componentes operativamente unidos:
- (i)
- el promotor de la ARN polimerasa de bacteriófago;
- (ii)
- una cuarta secuencia de ADN que codifica una proteína L del vesiculovirus; y
- (iii)
- una cuarta señal de terminación de la transcripción para la ARN polimerasa; y
(e) un virus vaccinia recombinante que comprende
una secuencia que codifica la ARN polimerasa de bacteriófago;
mediante lo cual se transcribe en dicha célula la primera secuencia
de ADN para producir dicha molécula de ARN, se expresan las
proteínas N, P y L y la ARN polimerasa de bacteriófago, y se produce
un vesiculovirus replicable recombinante que tiene un genoma que es
el complemento de dicho ARN antigenómico que comprende dicha
secuencia de ARN extraño, en el que dicha secuencia de ARN extraño
codifica un péptido o una proteína que se expresa e induce una
respuesta inmunitaria frente a dicho péptido o proteína en un
huésped adecuado infectado por el vesiculovirus.
40. El procedimiento según la reivindicación 39,
en el que la secuencia de ribozima es la secuencia de la ribozima
del virus de la hepatitis delta y la ARN polimerasa de bacteriófago
es la ARN polimerasa de T7.
41. El procedimiento según la reivindicación 31
ó 39, en el que la proteína o el péptido puede unirse
inmunoespecíficamente mediante un anticuerpo a, o provocar una
respuesta inmunitaria frente a, un antígeno de un microorganismo
patógeno.
42. El procedimiento según la reivindicación 31
ó 39, en el que la proteína o el péptido puede unirse
inmunoespecíficamente mediante un anticuerpo a, o provocar una
respuesta inmunitaria frente a, un antígeno específico de tumor.
43. El procedimiento según la reivindicación 39,
que comprende además antes de la etapa (a) la etapa de introducir
dicho primer, segundo, tercer y cuarto vectores de plásmido y dicho
virus vaccinia recombinante en dicha célula.
44. Un vesiculovirus recombinante inactivado que
es el producto de un procedimiento que comprende inactivar un
vesiculovirus replicable recombinante, comprendiendo dicho
vesiculovirus replicable recombinante las proteína N, P y L de
vesiculovirus y un ARN genómico de sentido (-) de vesiculovirus
replicable, en el que dicho ARN genómico de sentido (-) se modifica
mediante:
(a) la inserción de una secuencia de ARN extraño
en una parte no esencial de dicho ARN genómico de sentido (-) de
vesiculovirus replicable; o
(b) la sustitución de una parte no esencial de
dicho ARN genómico de sentido (-) de vesiculovirus replicable por
una secuencia de ARN extraño, en el que una secuencia de ARN
complementaria a dicha secuencia de ARN extraño codifica un péptido
o una proteína que inducirá una respuesta inmunitaria frente a dicho
péptido o proteína cuando se expresa en un huésped adecuado
infectado con dicho vesiculovirus replicable recombinante.
45. El vesiculovirus según la reivindicación 44,
en el que el péptido o la proteína puede unirse
inmunoespecíficamente mediante un anticuerpo a, o provocar una
respuesta inmunitaria frente a un antígeno de un microorganismo
patógeno.
46. El vesiculovirus según la reivindicación 44,
en el que el péptido o la proteína puede unirse
inmunoespecíficamente mediante un anticuerpo a, o provocar una
respuesta inmunitaria frente a un antígeno asociado a tumor o
específico de tumor.
47. El vesiculovirus según la reivindicación 44,
en el que una segunda secuencia de ARN complementaria a dicha
secuencia de ARN extraño codifica un segundo péptido o proteína que
se expresa en el huésped adecuado, en el que el primer péptido o
proteína y el segundo péptido o proteína pueden unirse
inmunoespecíficamente mediante anticuerpos a diferentes antígenos o
provocar una respuesta inmunitaria frente a diferentes
antígenos.
48. El vesiculovirus según la reivindicación 44,
en el que el péptido o la proteína puede unirse
inmunoespecíficamente mediante un anticuerpo a, o provocar una
respuesta inmunitaria frente a una glicoproteína de la envuelta de
un virus diferente de un vesiculovirus.
49. El vesiculovirus según la reivindicación 48,
en el que la glicoproteína de la envuelta es una glicoproteína de
la envuelta de un virus de la inmunodeficiencia humana.
50. El vesiculovirus según la reivindicación
48, en el que el péptido o la proteína se expresa como una proteína
de fusión que comprende el dominio citoplasmático de una proteína G
de vesiculovirus.
51. Una composición inmunogénica que comprende
una cantidad del vesiculovirus según una cualquiera de las
reivindicaciones 44 a 50, eficaz para inducir una respuesta
inmunitaria contra el péptido o la proteína en un mamífero; y un
vehículo farmacéuticamente aceptable.
52. Un kit que comprende en un recipiente una
cantidad del vesiculovirus según una cualquiera de las
reivindicaciones 44 a 50, eficaz para inducir una respuesta
inmunitaria contra el péptido o la proteína en un mamífero.
53. Un vesiculovirus según una cualquiera de las
reivindicaciones 44 a 50, para su uso como medicamento.
54. Un vesiculovirus según la reivindicación 53,
para su uso en el tratamiento o prevención de una enfermedad o un
trastorno en un sujeto.
55. Un vesiculovirus según la reivindicación 54,
en el que la enfermedad o el trastorno es una enfermedad o un
trastorno provocado por un microorganismo patógeno.
56. Un vesiculovirus según la reivindicación 54,
en el que la enfermedad o el trastorno es un tumor.
57. Un vesiculovirus según una cualquiera de las
reivindicaciones 54 a 56, en el que el sujeto es un ser humano.
58. Un vesiculovirus según una cualquiera de las
reivindicaciones 54 a 56, en el que el sujeto es un animal no
humano.
59. El uso de una cantidad inmunizante eficaz de
un vesiculovirus según una cualquiera de las reivindicaciones 44 a
50, para la fabricación de un medicamento para tratar o prevenir
una enfermedad o un trastorno en un sujeto provocado por un
microorganismo patógeno.
60. El uso de una cantidad inmunizante eficaz de
un vesiculovirus según una cualquiera de las reivindicaciones 44 a
50, para la fabricación de un medicamento para tratar o prevenir un
tumor en un sujeto.
61. El uso según la reivindicación 59 ó 60, en
el que el sujeto es un ser humano.
62. El uso según la reivindicación 59 ó 60, en
el que el sujeto es un animal no humano.
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