EA035353B1 - Способ получения l-аспарагиновой кислоты и рекомбинантный штамм-продуцент аспартазы escherichia coli - Google Patents
Способ получения l-аспарагиновой кислоты и рекомбинантный штамм-продуцент аспартазы escherichia coli Download PDFInfo
- Publication number
- EA035353B1 EA035353B1 EA201700163A EA201700163A EA035353B1 EA 035353 B1 EA035353 B1 EA 035353B1 EA 201700163 A EA201700163 A EA 201700163A EA 201700163 A EA201700163 A EA 201700163A EA 035353 B1 EA035353 B1 EA 035353B1
- Authority
- EA
- Eurasian Patent Office
- Prior art keywords
- strain
- coli
- cells
- aspartase
- biocatalyst
- Prior art date
Links
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12P—FERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
- C12P13/00—Preparation of nitrogen-containing organic compounds
- C12P13/04—Alpha- or beta- amino acids
- C12P13/20—Aspartic acid; Asparagine
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/88—Lyases (4.)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N1/00—Microorganisms, e.g. protozoa; Compositions thereof; Processes of propagating, maintaining or preserving microorganisms or compositions thereof; Processes of preparing or isolating a composition containing a microorganism; Culture media therefor
- C12N1/20—Bacteria; Culture media therefor
- C12N1/205—Bacterial isolates
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N11/00—Carrier-bound or immobilised enzymes; Carrier-bound or immobilised microbial cells; Preparation thereof
- C12N11/02—Enzymes or microbial cells immobilised on or in an organic carrier
- C12N11/08—Enzymes or microbial cells immobilised on or in an organic carrier the carrier being a synthetic polymer
- C12N11/089—Enzymes or microbial cells immobilised on or in an organic carrier the carrier being a synthetic polymer obtained otherwise than by reactions only involving carbon-to-carbon unsaturated bonds
- C12N11/091—Phenol resins; Amino resins
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Y—ENZYMES
- C12Y403/00—Carbon-nitrogen lyases (4.3)
- C12Y403/01—Ammonia-lyases (4.3.1)
- C12Y403/01001—Aspartate ammonia-lyase (4.3.1.1), i.e. aspartase
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12R—INDEXING SCHEME ASSOCIATED WITH SUBCLASSES C12C - C12Q, RELATING TO MICROORGANISMS
- C12R2001/00—Microorganisms ; Processes using microorganisms
- C12R2001/01—Bacteria or Actinomycetales ; using bacteria or Actinomycetales
- C12R2001/185—Escherichia
- C12R2001/19—Escherichia coli
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Zoology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Tropical Medicine & Parasitology (AREA)
- Virology (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- Immobilizing And Processing Of Enzymes And Microorganisms (AREA)
Abstract
Изобретение относится к биотехнологии и касается способа получения L-аспарагиновой кислоты. Для этого сконструирован рекомбинантный штамм Escherichia coli ВКПМ В-11745, продуцент аспартазы, путем введения в штамм E. coli ВКПМ 7188 рекомбинантной плазмиды, содержащей ген aspA под контролем лактозного промотора lacUV5. Получение L-аспарагиновой кислоты заключается в биотрансформации фумарата аммония с помощью биокатализатора на основе клеток рекомбинантного штамма E. coli ВКПМ В-11745 и выделении целевого продукта известными способами. В качестве биокатализатора используют свободные или иммобилизованные клетки штамма E. coli. Рекомбинантный штамм E. coli позволяет получать высокий уровень аспартазной активности без использования изопропилтиогалактозида в качестве индуктора в составе питательной среды.
Description
Область техники
Изобретение относится к биотехнологии и касается способа получения L-аспарагиновой кислоты, которая находит применение в фармацевтической, пищевой, микробиологической промышленности и в кормопроизводстве.
Уровень техники
Известны способы получения L-аспарагиновой кислоты биокаталитической трансформацией фумарата аммония в L-аспарагинат аммония с использованием микроорганизмов, синтезирующих фермент аспартат-аммоний лиазу (аспартазу). Наиболее перспективным и технически легко осуществимым в процессе биотрансформации фумарата аммония в L-аспарагинат является использование иммобилизованных бактериальных клеток. Иммобилизованными клетками заполняется проточный реактор, и раствор фумарата аммония насосом прокачивают через слой биокатализатора, на выходе из реактора образуется раствор моноаммонийной соли аспарагиновой кислоты.
Используются природные (дикие), мутантные и рекомбинантные штаммы продуценты аспартазы, относящиеся к различным родам, например роду Escherichia (SU 659611). В указанном изобретении использован природный штамм. Основной недостаток данного способа - низкая активность аспартазы. В изобретении по патенту ЕР 0110422 использованы мутантные штаммы. Основные недостатки данного способа - это высокий уровень побочной активности фумаратгидратазы и невысокая активность аспартазы. По роду Serratia (EP 0111293) был получен рекомбинантный штамм. Основные недостатки данного способа - отсутствие селектирующего фактора при культивировании штамма и быстрая утеря плазмиды. Что касается родов Pseudomonas, Bacillus, Brevibacterium и др. (ЕР 0752476), основные недостатки способа - трудоемкость, многостадийность и невысокая целевая активность.
Известен способ получения L-аспарагиновой кислоты с использованием природного штамма Escherichia coli (ВКПМ В-7188) (RU 2174558). Однако данный способ является недостаточно эффективным из-за низкой аспартазной активности штамма.
Известен способ получения аспарагиновой кислоты, описанный в патенте US 4692409. В нем описан рекомбинантный штамм Escherichia coli TA-5004, с высокой аспартазной активностью и биокатализатор на основе биомассы клеток этого штамма, включенных в гель полисахарида, каппа-каррагинана. Основные недостатки указанного способа - это отсутствие селектирующего фактора при культивировании штамма, быстрая утеря плазмиды, а также диффузионные ограничения матрицы геля каррагинана, которые при увеличении удельной аспартазной активности клеток не позволяют существенно увеличить удельную активность биокатализатора.
Также известен способ получения аспарагиновой кислоты с использованием иммобилизованных клеток, обладающих аспартазной активностью на поверхности частиц ионообменных смол или неорганических материалов с помощью полиазетидина (US 4436813). Известен способ получения аспарагиновой кислоты, в котором используют биокатализатор на основе клеток, обладающих аспартазной активностью, иммобилизованных на частицах вермикулита с помощью сшивающих агентов, в том числе глутарового альдегида в присутствии полиэтиленимина (US 4504582). Недостатком данного способа является низкая эффективность получаемого биокатализатора.
Наиболее близким к заявленному способу является способ получения L-аспарагиновой кислоты, описанный в патенте US 6214589. В данном способе использовали биокатализатор на основе клеток рекомбинантного штамма Escherichia coli. Штамм содержит плазмиду pUC19 с вставкой гена аспартазы под лактозным промотором. Способ предусматривает пропускание раствора фумарата аммония через колонку, заполненную частицами биокатализатора, с последующим выделением L-аспарагиновой кислоты из реакционного раствора. Биокатализатор получают иммобилизацией бактериальных клеток на ионообменной смоле с использованием полимеров, изменяющих растворимость в зависимости от величины рН среды.
Недостатком способа является высокая стоимость компонентов среды, в частности необходимость добавки дорогостоящего индуктора лактозного оперона, изопропил-1-тио-в-О-галактозида (ИПТГ), который индуцирует экспрессию аспартазы. Это соединение широко используется для индукции экспрессии рекомбинантных генов в экспрессионных векторах, сконструированных на основе промотора lacоперона. Необходимость добавки этого дорогостоящего вещества снижает экономическую эффективность процесса культивирования клеток Е. coli, получения биокатализатора и, как следствие, всего процесса получения L-аспарагиновой кислоты. Кроме того, недостатком данного способа является труднодоступность полимеров и использование сложного оборудования для иммобилизации.
Раскрытие изобретения
Задачей настоящего изобретения является повышение эффективности процесса получения Lаспарагиновой кислоты за счет снижения трудоёмкости и удешевления процесса, связанного с применением более эффективного биокатализатора.
Задача решается путем:
конструирования рекомбинантного штамма Escherichia coli, продуцента аспартазы, путем введения в штамм Е. coli ВКПМ 7188 рекомбинантной плазмиды, содержащей ген aspA под контролем лактозного промотора lacUV5;
- 1 035353 в некоторых вариантах изобретения задача решается путем получения рекомбинантного штамма, депонированного во Всероссийской Коллекции Промышленных Микроорганизмов под номером Е. coli ВКПМ В-11745;
разработки способа получения L-аспарагиновой кислоты путем биотрансформации фумарата аммония с помощью биокатализатора на основе клеток рекомбинантного штамма Е. coli;
в некоторых вариантах изобретения задача решается путем разработки способа получения Lаспарагиновой кислоты с использованием в качестве биокатализатора свободных или иммобилизованных клеток штамма Е. coli;
в некоторых частных вариантах изобретения задача решается путем разработки способа иммобилизации клеток штамма Е coli в матрице полиэтиленимина, ковалентно сшитой глутаровым альдегидом;
в некоторых частных вариантах изобретения задача решается путем разработки способа иммобилизации клеток штамма Е. coli, отличающегося тем, что весовое соотношение полиэтиленимина и глутарового альдегида составляет от 1:1 до 3:1.
в некоторых частных вариантах изобретения задача решается путем разработки способа иммобилизации клеток штамма Е. coli, отличающегося тем, что весовое соотношение компонентов полиэтиленимина и глутарового альдегида к биомассе Е. coli составляет от 0,25:1 до 3:1.
В результате осуществления изобретения достигаются следующие технические результаты:
получена рекомбинантная плазмида pAsp 116-5 для создания высокопродуктивных штаммов E.coli;
получены рекомбинантные штаммы Е. coli, в том числе штамм Е. coli ВКПМ В-11745, обладающие высокой аспартазной активностью;
снижение трудоемкости, упрощение и удешевление процесса получения L-аспарагиновой кислоты; увеличение аспартазной активности биокатализатора на основе рекомбинантного штамма E.coli;
повышение ферментативной активности биокатализатора без внесения в среду дорогостоящего индуктора (ИПТГ);
исключение необходимости использования дорогостоящих питательных сред, больших объемов культивирования и малодоступных компонентов для иммобилизации клеток;
разработан способ иммобилизации клеток рекомбинантного штамма Е. coli;
разработан способ получения L-аспарагиновой кислоты с помощью биокатализатора на основе свободных и иммобилизованных клеток E. coli;
разработан способ иммобилизации E. coli в матрице полиэтиленимина, ковалентно сшитой глутаровым альдегидом;
разработан способ непрерывной биотрансформации фумарата аммония иммобилизованными клетками.
Описание рисунков
На рисунке - схема плазмиды pAsp 116-5.
На рисунке: Amp - ген устойчивости к ампициллину, rep (рМВ1) - репликон, f1 (IG) - фрагмент ДНК профага f1, Asp - ген L-аспартат аммоний лиазы, prom - промоторная область LacUV5.
Подробное описание изобретения
Предлагаемое изобретение направлено на повышение эффективности процесса получения Lаспарагиновой кислоты за счет снижения трудоемкости и удешевления процесса, связанного с применением более эффективного биокатализатора на основе нового рекомбинантного штамма E. coli, иммобилизованного с помощью полиэтиленимина сшитого глутаровым диальдегидом.
Заявленный способ заключается в обеспечении высокой аспартазной активности биокатализатора на основе клеток нового рекомбинантного штамма E. coli без использования дорогостоящего индуктора ИПТГ в процессе его культивирования и получении высокоэффективного биокатализатора на основе клеток штамма E. coli.
Предлагаемый способ получения L-аспарагиновой кислоты путем биотрансформации фумарата аммония в аспарагинат аммония с помощью биокатализатора на основе микробных клеток Е. coli с последующим выделением целевого продукта предусматривает использование в процессе биотрансформации высокоактивного биокатализатора на основе нового рекомбинантного штамма E. coli, выращенного на питательной среде без добавления индуктора ИПТГ.
При осуществлении изобретения штамм может быть в использован как в свободном виде, так и иммобилизованном с использованием приемов, известных в данной области, например, в полиакриламидном геле, в каррагинане и другими способами, в частности штамм может быть иммобилизован в ковалентно сшитую глутаровым альдегидом матрицу полиэтиленимина.
Полиэтиленимин и глутаровый альдегид являются доступными и хорошо изученными соединениями, широко применяемыми для иммобилизации ферментов (см., например, R. Bahulekar et. al., Polyethyleneimine in immobilization of biocatalysts // Enzyme and Microb. Technol., 1991. - V. 13(11) - P.858-868.; US 4504582). Шиффовы основания, образуемые в процессе совместной сшивки аминогрупп бактериальных клеток и полиэтиленимина считаются не очень прочными соединениями. Однако в щелочных условиях функционирования аспартазы, а также в водных растворах с концентрацией солей выше 20% данный тип соединений достаточно устойчив. Кроме того, образуемая полимерная матрица имеет достаточно широ
- 2 035353 кие поры, чтобы не оказывать существенных диффузионных ограничений при размере частиц от 0,5 до 1,0 мм.
Способ осуществляют следующим образом.
Производится конструирование рекомбинантного штамма.
В одном из вариантов осуществления изобретения под рекомбинантным штаммом понимается линия микроорганизмов производных Escherichia coli ВКПМ В-11745, сохраняющих основные мутации и генно-инженерные модификации, обеспечивающие высокую продукцию фермента аспартазы. Рекомбинантный штамм E. coli ВКПМ В-11745 конструируется путем трансформации штамма E. coli ВКПМ В-7188 плазмидой pAsp 116-5. Выбор в качестве реципиента при конструировании заявляемого штамма именно штамма E. coli ВКПМ В-7188 связан с тем, что, несмотря на низкий уровень продукции аспартазы, он соответствует большинству требований, предъявляемых реципиентам для экспрессии, т.е. генетически маркирован, позволяет получить высокую эффективность при трансформации и не продуцирует токсичных метаболитов.
Штамм Escherichia coli ВКПМ В-7188 получается из дикого штамма посредством обработки мутагеном (нитрозогуанидином), с последующим отбором мутантов на аналоге глюкозы альфа-метил-Dглюкопиранозид (RU2174558).
Плазмида pAsp 116-5 получается на основе вектора pUC19 и содержит ген L-аспартат-аммоний лиазы из Е. coli В-7188 под лактозным промотором lacUV5 и ген устойчивости к антибиотикам пенициллинового ряда. Схема плазмиды представлена на рисунке, где Amp - ген устойчивости к ампициллину, rep (рМВ1) - репликон, f1 (IG) - фрагмент ДНК профага f1, Asp - ген L-аспартат аммоний лиазы, prom - промоторная область LacUV5.
Штамм E.coli ВКПМ В-11745 характеризуется всеми признаками, обычными для E.coli, включая, в том числе, культурально-морфологические признаки. Культура представлена грамотрицательными, факультативно анаэробными палочковидными клетками, со слегка закруглёнными концами размером 0,40,8х1-3 мкм. Клетки хорошо растут на простых богатых питательных средах. Колонии на мясопептонном агаре (МПА) и среде Лурия-Бертани (LB) - беловатые блестящие, размером 2-3 мм, края ровные, спор не образуют.
После трансформации клеток штамма Е. coli ВКПМ В-7188 - ДНК pAsp 116-5, в процессе выделения штаммов-трансформантов был получен спонтанный мутант, поддерживающий высокий уровень синтеза аспартазы в отсутствие индуктора ИПТГ. В таблице представлено влияние добавления индуктора ИПТГ в количестве 1 мМ в ферментационную среду.
Влияние индуктора ИПТГ на аспартазную активность.
Показатель | Без ИПТГ | ИПТГ1 мМ |
Удельная аспартазная активность ед/ ед.ОП | 25701120 | 24701140 |
Общая аспартазная активность ед/ мл КЖ (культуральной жидкости) | 5386015200 | 4792014300 |
Полученный штамм Е. coli 7188 (pAsp116-5) депонирован во Всероссийской коллекции промышленных микроорганизмов и имеет регистрационный номер ВКПМ В-11745. Данный штамм при выращивании на ферментационной среде в ферментере способен продуцировать L-аспартат-аммоний лиазу в количестве не менее 40000 ед/мл.
Удельную аспартазную активность клеток определяли следующим образом.
К 4,5 мл 1,5 М раствора фумарата аммония добавляли 0,5 мл суспензии предварительно активированных микробных клеток с оптической плотностью 5 ед. и инкубировали смесь при перемешивании 1 ч при 30°C. Количество образовавшейся аспарагиновой кислоты определяли методом высокоэффективной жидкостной хроматографии (ВЭЖХ). За единицу активности принято образование одного микромоля аспарагиновой кислоты за 1 ч. Оптическую плотность клеточной суспензии определяли при длине волны 540 нм и оптическом пути 5 мм.
Получение иммобилизованных клеток осуществляли, смешивая суспензию клеток с раствором гомополимера полиэтиленимина (Polymin-P, BASF), после чего добавляли раствор глутарового альдегида, перемешивали и оставляли для завершения процессов сшивки. Количество раствора гомополимера полиэтиленимина выбирали таким образом, чтобы конечная концентрация полиэтиленимина составляла от 10 до 50% в расчете на 100% вещество. Количество раствора глутарового альдегида выбирали таким образом, чтобы конечная концентрация глутарового альдегида составляла от 5 до 30% в расчете на 100% вещество. Количество биомассы клеток E. coli выбирали таким образом, чтобы конечная концентрация биомассы клеток составляла от 25 до 65% в расчете сухой вес. Соотношение полиэтиленимина и глутарового альдегида составляет от 1:1 до 3:1. А весовое соотношение компонентов полиэтиленимина и глутарового альдегида к биомассе Е. coli составляет от 0,25:1 до 3:1, где полиэтиленимин и глутаровый альдегид в расчете на 100% вещество, а биомасса в расчете на сухой вес.
Затем полученную массу измельчали, подсушивали до остаточной влажности от 65 до 75%, отсеи
- 3 035353 вали фракции менее 0,5 мм и более 1,5 мм, выдерживали в растворе ацетата аммония с концентрацией от 200 до 250 г/л не менее 24 ч.
Способ иммобилизации обеспечивает получение иммобилизованных клеток с удельной аспартазной активностью от 90000 до 210000 ед./ч на грамм влажного биокатализатора. Данный биокатализатор, помещенный в проточный реактор, обеспечивает при 25°C биотрансформацию раствора фумарата аммония с концентрацией 200 г/л (по фумаровой кислоте) со скоростью от 3 до 5 объемов/ч биокатализатора, находящегося в реакторе с эффективностью 99%.
Получение и культивирование штамма Escherichia coli ВКПМ В-11745, получение иммобилизованных клеток штамма E. coli ВКПМ В-11745, проведение биотрансформации фумарата аммония и получение L-аспарагиновой кислоты с использованием иммобилизованных клеток штамма E. coli ВКПМ В11745 подтверждены следующими примерами конкретного исполнения.
Следует понимать, что эти и все приведенные в материалах заявки примеры не являются ограничивающими и приведены только для иллюстрации настоящего изобретения.
Пример 1. Получение плазмиды pAsp 116-5.
Для получения плазмиды pAsp 116-5 использовали последовательность гена AspA из Escherichia coli, представляющую собой ген L-аспартат-аммоний лиазы без регуляторной промоторной области.
Последовательность aspA получали методом ПЦР, используя в качестве матрицы геномную ДНК, выделенную из штамма E.coli ВКПМ В-7188.
Геномную ДНК выделяли с помощью Набора для выделения геномной ДНК согласно рекомендациям изготовителя (Genomic DNA Purification Kit, # K0512, Thermo Fisher Scientific Biosciences Inc.).
ПЦР продукт получали с помощью следующей пары праймеров:
Ittt gta taa gaa aat gag agg g (SEQ ID NO: 1) и aaa gga tcc tgt acg att act gtt cgc ttt cat cag tat age (SEQ ID NO: 2)
Фрагменты ДНК получали с использованием Pfu полимеразы.
В работе использовали праймеры-олигонуклеотиды, синтезированные ЦКП ФГУП ГосНИИгенетика и ферменты Thermo Fisher Scientific Biosciences Inc.
Для реакции амплификации использовали приблизительно 100 нмолей каждого праймера. Фрагмент амплифицированной ДНК после электрофореза в 1% агарозном геле очищали методом экстракции с помощью набора для выделения ДНК из геля согласно рекомендациям изготовителя (GeneJET Gel Extraction Kit, # K0691, Thermo Fisher Scientific Biosciences Inc.).
Очищенный фрагмент ДНК в количестве 0,5 мкг лигировали с 0,2 мкг ДНК плазмиды pUC19, расщепленной рестриктазой SmaI. Лигирование производили с помощью реактивов Thermo Fisher Scientific Biosciences Inc. согласно рекомендациям изготовителя. Полученную плазмиду трансформировали в E.coli XL1-Blue методом электропорации согласно методике, описанной в источнике (Sambrook et al., Molecular Cloning, second edition Cold Spring Harbor Laboratory, Plainview, N.Y. ,1989). Клоны, содержащие искомую вставку ДНК, отбирали на чашках с агаризованной средой LB с ампициллином и стандартному тесту на отсутствие активности β-галактозидазы, как описано в вышеуказанном источнике. Плазмидную ДНК, выделенную из отобранных клонов, проверяли методом ПЦР на наличие вставки, с использованием указанных выше праймеров. Клоны с подтвержденной вставкой проверяли на наличие аспартазной активности. В клонах с подтвержденной аспартазной активностью проверяли нуклеотидную последовательность гена методом секвенирования.
Плазмидную ДНК, выделенную из отобранных клонов, подтвержденного размера, подтвержденной нуклеотидной последовательности, обеспечивающую экспрессию L-аспартат-аммоний лиазы в штамме E.coli/XL1-Blue, обозначали далее как pAsp 116-5.
Пример 2. Получение штамма E.coli ВКПМ В-11745.
Штамм Escherichia coli ВКПМ В-7188 для трансформации использовали для приготовления электрокомпетентной культуры, как описано в источнике (Sambrook et al., Molecular Cloning, second edition Cold Spring Harbor Laboratory, Plainview, N.Y., 1989).
В качестве ДНК для трансформации штамма Escherichia coli ВКПМ В-7188 использовали плазмидную ДНК pAsp 116-5, полученную в соответствии с описанием в примере 1.
Селекцию трансформантов проводили на агаризованной среде LB с ампициллином. Отобранные трансформанты проверяли на наличие аспартазной активности. Фенотип трансформантов поддерживали рассевом на той же среде.
Десять клонов, показавших наибольшую аспартазную активность, проверяли на наличие L-аспартат-аммоний лиазной активности в ацетатной ферментационной среде, как описано далее в примере 3.
По результатам культивирования отбирали наиболее активный клон. Отобранный клон, обладающий наибольшей аспартазной активностью, являющийся трансформантом E.coli ВКПМ В-7188 (pAsp 116-5) и при культивировании в пробирках позволяющий получать активность L-аспартат-аммоний лиазы не менее 10000 ед/мл, обозначали далее как E.coli/ВКПМ В-11745.
Пример 3. Культивирование штамма E.coli ВКПМ В-11745 в колбах.
Штамм предварительно выращивали при 37°C в течение ночи на агаризованной среде LB с 100 мг/л
- 4 035353 ампициллина.
Свежую культуру пересевали с чашек бактериологической петлей в пробирки с 10 мл жидкой среды LB с ампициллином и культивировали на термостатируемом шейкере при 37°C, 300 об/мин, в течение не менее 15 ч.
Полученный посевной материал пересевали в пробирки с 10 мл жидкой среды LB с ампициллином, разбавляя в 100 раз (100 мкл культуры на 10 мл среды). Культивировали на термостатируемом шейкере при 37°C, 300 об/мин, в течение не менее 2 ч до ОП600 ~ 0,6-0,8. Полученный посевной материал пересевали в колбы со 100 мл жидкой ферментационной среды следующего состава (г/л): Na2HPO.1-12H2O 15,0; KH2PO4 - 2,0; CH3COONa - 7; дрожжевой экстракт - 20; MgSO4-7H2O - 0,25; рН - 6,5-7,0, с ампициллином - 100 мг/л. Культивировали на термостатируемом шейкере при 37°C, 300 об/мин, в течение не менее 2 ч до ОП600 ~ 0,6-0,8. После этого снижали температуру культивирования до 30°C и культивировали еще не менее 7 ч до достижения максимальной активности культуры. При культивировании штамма E.coli ВКПМ В-11745 продукция аспартазы составляла не менее 10000 ед/мл.
Пример 4. Культивирование штамма E.coli ВКПМ В-11745 в лабораторном ферментере.
Штамм предварительно выращивали при 37°C в течение ночи на агаризованной среде LB с 100 мг/л ампициллина.
Свежую культуру пересевали с чашек бактериологической петлей в две колбы с 50 мл жидкой среды LB с ампициллином и культивировали на термостатируемом шейкере при 37°C, 300 об/мин в течение не менее 15 ч.
Полученный посевной материал переносили в трехлитровый ферментер, содержащий 2 л питательной ферментационной среды следующего состава (г/л): KH2PO4 - 2,0; CH3COONa - 13,8; дрожжевой экстракт - 50; MgSO4-7H2O - 0,25; рН - 6,8-7,2, ампициллин - 100 мг/л. Условия культивирования: температура 30°C, аэрация - 2 л/мин, перемешивание - 600 об/мин, рН 7.8. Система автоматического поддержания рН осуществляет дозировку раствора уксусной кислоты. Время культивирования 15-18 ч. Оптическая плотность культуральной жидкости на сливе 30,0 ед. ОП. Удельная аспартазная активность 2400 Ед.акт./ед. ОП. Общая аспартазная активность - 72000 Ед.акт./мл. Клетки отделяли центрифугированием и промывали физиологическим раствором. Количество собранных влажных клеток в виде пасты составило 171 г.
Пример 5. Получение иммобилизованных клеток.
Биомассу клеток штамма E.coli B-11745 из примера 4 в количестве 10 г помещали в стеклянный стакан, в который предварительно вносили 11 г 1% раствора хлористого натрия и перемешивали. Затем, продолжая перемешивание, добавляли 5 г 20%-ного раствора гомополимера полиэтиленимина (PolyminP, BASF), предварительно нейтрализованного соляной кислотой до рН 7,5, и далее, продолжая перемешивание, добавляли 3 г 25% раствора глутарового альдегида (Panreac). Смесь начинала быстро отверждаться. Ее оставляли на 30 мин для завершения протекающих реакций, после чего измельчали и подсушивали до остаточной влажности 65-75%. Полученные иммобилизованные клетки просеивали через сито, оставляя фракцию 0,5-1,5 мм, которую помещали в 20%-й раствор ацетата аммония и оставляли не менее, чем на 24 ч при температуре 5°C.
Полученный биокатализатор имел удельную активность 180900 ед./г влажного биокатализатора.
Пример 6. Непрерывная биотрансформация фумарата аммония иммобилизованными клетками.
Биокатализатором, полученным по примеру 5, в количестве 5 г (по влажному весу) заполняли стеклянную колонку с рубашкой (1x12,7 см, 10 мл). В рубашку подавали теплоноситель с температурой 25°C. Перистальтическим насосом прокачивали через слой биокатализатора раствор фумарат аммония, с концентрацией 200 г/л (по фумаровой кислоте), рН 8,5 и с добавлением 1 мМ MgSO4. Скорость подачи раствора 50 мл/ч. Раствор, выходящий из колонки, содержал менее 1,5 г/л фумарата аммония (в расчете на фумаровую кислоту), что соответствует конверсии более 99%. Степень конверсии оставалась более 99% в продолжение непрерывного процесса биотрансформации фумарата аммония в течение трех месяцев и более.
Пример 7. Получение L-аспарагиновой кислоты из реакционных растворов после биотрансформации.
В 2-х литровую колбу с обратным холодильником вносили 1600 мл реакционного раствора после биотрансформации по примеру 6. Колбу помещали на магнитную мешалку с нагревом и раствор нагревали при перемешивании до 90-98°C. Не прекращая перемешивание, в колбу вносили 150 г кристаллической фумаровой кислоты. Нагрев и поддержание температуры в пределах 90-95°C продолжали еще 30 мин. Затем отключали нагрев и продолжали перемешивать суспензию выпадающих кристаллов аспарагиновой кислоты. Раствор охлаждали до 25°C, выдерживали при этой температуре 30 мин и кристаллы отделяли фильтрацией. Кристаллы промывали на фильтре обессоленной водой и сушили при 80°C. Было получено 269,8 г кристаллической L-аспарагиновой кислоты. Удельный угол вращения в 5 н HCl: [a]D20=+24,9. Примесь фумаровой кислоты 0,34%. Маточник и промывные воды упаривали под вакуумом до объема 1,3 л. К полученному концентрату добавляли 90 г фумаровой кислоты, 25%-й водный аммиак до значения рН раствора 8,5 и обессоленную воду до объема 1,6 л. Полученный раствор вновь
- 5 035353 направляли на биотрансформацию.
Предлагаемый способ обеспечивает более эффективное получение L-аспарагиновой кислоты за счет удешевления и упрощения процесса. При этом исключается необходимость использования дорогостоящих питательных сред, больших объемов культивирования и малодоступных компонентов для иммобилизации клеток.
Таким образом, предлагаемой способ получения L-аспарагиновой кислоты позволяет обеспечить высокую аспартазную активность биокатализатора, существенно снизить трудоёмкость и стоимость технологического процесса.
Несмотря на то, что изобретение описано со ссылкой на раскрываемые варианты воплощения, для специалистов в данной области должно быть очевидно, что конкретные подробно описанные эксперименты приведены лишь в целях иллюстрирования настоящего изобретения, и их не следует рассматривать как каким-либо образом ограничивающие объем изобретения. Должно быть понятно, что возможно осуществление различных модификаций без отступления от сути настоящего изобретения.
Claims (6)
- ФОРМУЛА ИЗОБРЕТЕНИЯ1. Рекомбинантный штамм Escherichia coli ВКПМ В-11745, продуцент аспартазы, полученный путем введения в штамм Е. coli ВКПМ 7188 рекомбинантной плазмиды, содержащей ген aspA под контролем лактозного промотора lacUV5.
- 2. Способ получения L-аспарагиновой кислоты путем биотрансформации фумарата аммония с помощью биокатализатора на основе клеток Е. coli по п.1.
- 3. Способ по п.2, отличающийся тем, что в качестве биокатализатора используют свободные или иммобилизованные клетки штамма Е. coli.
- 4. Способ по п.3, отличающийся тем, что иммобилизацию клеток штамма Е. coli осуществляют в матрице полиэтиленимина, ковалентно сшитой глутаровым альдегидом.
- 5. Способ по п.4, отличающийся тем, что весовое соотношение полиэтиленимина и глутарового альдегида составляет от 1:1 до 3:1.
- 6. Способ по п.4, отличающийся тем, что весовое соотношение суммы компонентов полиэтиленимина и глутарового альдегида к биомассе Е. coli составляет от 0,25:1 до 3:1.
Priority Applications (3)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
EA201700163A EA035353B1 (ru) | 2017-02-28 | 2017-02-28 | Способ получения l-аспарагиновой кислоты и рекомбинантный штамм-продуцент аспартазы escherichia coli |
EP18761555.4A EP3591034A4 (en) | 2017-02-28 | 2018-02-02 | ASPARTIC ACID MANUFACTURING PROCESS |
PCT/RU2018/050006 WO2018160103A1 (ru) | 2017-02-28 | 2018-02-02 | Способ получения l-аспарагиновой кислоты |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
EA201700163A EA035353B1 (ru) | 2017-02-28 | 2017-02-28 | Способ получения l-аспарагиновой кислоты и рекомбинантный штамм-продуцент аспартазы escherichia coli |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
EA201700163A1 EA201700163A1 (ru) | 2018-08-31 |
EA035353B1 true EA035353B1 (ru) | 2020-06-01 |
Family
ID=63287021
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
EA201700163A EA035353B1 (ru) | 2017-02-28 | 2017-02-28 | Способ получения l-аспарагиновой кислоты и рекомбинантный штамм-продуцент аспартазы escherichia coli |
Country Status (3)
Country | Link |
---|---|
EP (1) | EP3591034A4 (ru) |
EA (1) | EA035353B1 (ru) |
WO (1) | WO2018160103A1 (ru) |
Citations (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
RU2546239C1 (ru) * | 2013-12-12 | 2015-04-10 | Федеральное государственное унитарное предприятие "Государственный научно-исследовательский институт генетики и селекции промышленных микроорганизмов" (ФГУП "ГосНИИгенетика" | РЕКОМБИНАНТНЫЙ ШТАММ Escherichia coli, ОБЛАДАЮЩИЙ КОНСТИТУТИВНОЙ АСПАРТАЗНОЙ АКТИВНОСТЬЮ И СПОСОБ СИНТЕЗА L-АСПАРАГИНОВОЙ КИСЛОТЫ С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ ЭТОГО ШТАММА В КАЧЕСТВЕ БИОКАТАЛИЗАТОРА |
Family Cites Families (11)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
SU659611A1 (ru) | 1977-02-09 | 1979-04-30 | Московский государственный университет им. М.В.Ломоносова | Способ получени -аспарагиновой кислоты |
US4355105A (en) * | 1981-03-30 | 1982-10-19 | Miles Laboratories, Inc. | Glutaraldehyde/polyethylenimine immobilization of whole microbial cells |
US4436813A (en) | 1982-03-16 | 1984-03-13 | Purification Engineering, Inc. | Immobilized microbial cell composition for making L-aspartic acid |
US4504582A (en) | 1982-07-20 | 1985-03-12 | Genex Corporation | Vermiculite as a carrier support for immobilized biological materials |
JPS59113895A (ja) | 1982-12-03 | 1984-06-30 | Tanabe Seiyaku Co Ltd | L−アスパラギン酸の製法 |
JPS59113887A (ja) | 1982-12-08 | 1984-06-30 | Tanabe Seiyaku Co Ltd | L−アスパラギン酸の製法 |
JPS59232088A (ja) * | 1983-06-15 | 1984-12-26 | Tanabe Seiyaku Co Ltd | L−アスパラギン酸の製法 |
KR960023076A (ko) | 1994-12-09 | 1996-07-18 | 미우라 아끼라 | L-아스파르트산의 제조 방법 |
DE69927315T2 (de) | 1998-02-13 | 2006-07-06 | Nippon Shokubai Co. Ltd. | Verfahren zur Herstellung von L-Asparaginsäure |
RU2174558C1 (ru) | 2000-12-07 | 2001-10-10 | Закрытое акционерное общество "Биоамид" | Способ получения l-аспарагиновой кислоты |
EP2468869B1 (en) * | 2007-01-31 | 2015-03-18 | Pfenex Inc. | Bacterial leader sequences for increased expression |
-
2017
- 2017-02-28 EA EA201700163A patent/EA035353B1/ru not_active IP Right Cessation
-
2018
- 2018-02-02 EP EP18761555.4A patent/EP3591034A4/en not_active Withdrawn
- 2018-02-02 WO PCT/RU2018/050006 patent/WO2018160103A1/ru unknown
Patent Citations (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
RU2546239C1 (ru) * | 2013-12-12 | 2015-04-10 | Федеральное государственное унитарное предприятие "Государственный научно-исследовательский институт генетики и селекции промышленных микроорганизмов" (ФГУП "ГосНИИгенетика" | РЕКОМБИНАНТНЫЙ ШТАММ Escherichia coli, ОБЛАДАЮЩИЙ КОНСТИТУТИВНОЙ АСПАРТАЗНОЙ АКТИВНОСТЬЮ И СПОСОБ СИНТЕЗА L-АСПАРАГИНОВОЙ КИСЛОТЫ С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ ЭТОГО ШТАММА В КАЧЕСТВЕ БИОКАТАЛИЗАТОРА |
Non-Patent Citations (2)
Title |
---|
AKIN Cavit. Biocatalysis with immobilized cells. Biotechnology anf Genetic Engineering Reviews, Vol. 5, Septembers 1987, c. 319-320, 335, 358 * |
FULLER Forrest. A family of cloning vectors containing the lacUV5 promoter. Gene, 19 (1982) 43-54, реферат * |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
EA201700163A1 (ru) | 2018-08-31 |
EP3591034A1 (en) | 2020-01-08 |
EP3591034A4 (en) | 2020-12-16 |
WO2018160103A1 (ru) | 2018-09-07 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
TWI308594B (en) | Method for producing l-amino acid | |
US20200157152A1 (en) | Expression of klebsiella oxytoca polypeptides involved in lysine decarboxylation, and methods and applications thereof | |
JP4108766B2 (ja) | 改良されたトランスアミナーゼ生物学的変換方法 | |
CN109153966A (zh) | 生产丙烯酰胺的生物技术方法及相关新菌株 | |
CN102770550A (zh) | 尸胺的制备方法 | |
CN107164361B (zh) | 一种固定化L-天冬氨酸-α-脱羧酶及其制备方法与应用 | |
WO2011138966A1 (ja) | 微生物触媒を用いたアクリルアミドの製造方法 | |
CN104894043B (zh) | 一种产γ-氨基丁酸的工程菌及其构建和应用 | |
CN107287144B (zh) | 一种代谢改造的枯草芽孢杆菌生物转化细胞及其制备方法与应用 | |
RU2546239C1 (ru) | РЕКОМБИНАНТНЫЙ ШТАММ Escherichia coli, ОБЛАДАЮЩИЙ КОНСТИТУТИВНОЙ АСПАРТАЗНОЙ АКТИВНОСТЬЮ И СПОСОБ СИНТЕЗА L-АСПАРАГИНОВОЙ КИСЛОТЫ С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ ЭТОГО ШТАММА В КАЧЕСТВЕ БИОКАТАЛИЗАТОРА | |
WO2004081216A1 (ja) | 酢酸菌のアルコール脱水素酵素遺伝子 | |
CN100406553C (zh) | 生产D-N-氨基甲酰基-α-氨基酸的方法 | |
CN114854659B (zh) | 一种麦角硫因生产工艺及其应用 | |
EP1144656A2 (en) | Method for the isolation of ccc plasmid dna | |
WO2002072841A1 (fr) | Adn codant pour une hydantoinase, adn codant pour une hydrolase d'acide amine l carbamyle, adn recombinant, cellules transformees, procede de production de proteine et procede de production d'acide amine optiquement actif | |
EA035353B1 (ru) | Способ получения l-аспарагиновой кислоты и рекомбинантный штамм-продуцент аспартазы escherichia coli | |
Chibata et al. | Immobilized cells: Historical background | |
CN111518851B (zh) | 一种固定化酶连续制备[14/15n]-l-瓜氨酸的方法 | |
RU2174558C1 (ru) | Способ получения l-аспарагиновой кислоты | |
RU2339699C2 (ru) | РЕКОМБИНАНТНАЯ ПЛАЗМИДА pT7ΔpckA::loxpcat ОБЕСПЕЧИВАЮЩАЯ СИНТЕЗ L-ТРЕОНИНА В КЛЕТКАХ Escherichia coli, И РЕКОМБИНАНТНЫЙ ШТАММ Escherichia coli FTR2717 (KCCM-10475) - ПРОДУЦЕНТ L-ТРЕОНИНА | |
RU2143002C1 (ru) | СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ γ-АМИНОМАСЛЯНОЙ КИСЛОТЫ | |
RU2222596C1 (ru) | Способ получения l-аминокислот, штамм escherichia coli - продуцент l-аминокислоты (варианты) | |
CN114921432B (zh) | 一种转氨酶突变体及其工程菌与应用 | |
CN111334445B (zh) | 长链二元酸生产菌株及其制备方法和应用 | |
CN101892228A (zh) | 一种高丙烯酰胺和丙烯腈耐受性产腈水合酶工程菌及应用 |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
QB4A | Registration of a licence in a contracting state | ||
MM4A | Lapse of a eurasian patent due to non-payment of renewal fees within the time limit in the following designated state(s) |
Designated state(s): AM AZ KG TJ TM |