EA035353B1 - Способ получения l-аспарагиновой кислоты и рекомбинантный штамм-продуцент аспартазы escherichia coli - Google Patents

Способ получения l-аспарагиновой кислоты и рекомбинантный штамм-продуцент аспартазы escherichia coli Download PDF

Info

Publication number
EA035353B1
EA035353B1 EA201700163A EA201700163A EA035353B1 EA 035353 B1 EA035353 B1 EA 035353B1 EA 201700163 A EA201700163 A EA 201700163A EA 201700163 A EA201700163 A EA 201700163A EA 035353 B1 EA035353 B1 EA 035353B1
Authority
EA
Eurasian Patent Office
Prior art keywords
strain
coli
cells
aspartase
biocatalyst
Prior art date
Application number
EA201700163A
Other languages
English (en)
Other versions
EA201700163A1 (ru
Inventor
Максим Константинович СИНОЛИЦКИЙ
Стэлла Владимировна СИНОЛИЦКАЯ
Сергей Петрович ВОРОНИН
Владимир Георгиевич ДЕБАБОВ
Андрей Дмитриевич НОВИКОВ
Александр Степанович ЯНЕНКО
Original Assignee
Акционерное Общество "Биоамид"
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Акционерное Общество "Биоамид" filed Critical Акционерное Общество "Биоамид"
Priority to EA201700163A priority Critical patent/EA035353B1/ru
Priority to EP18761555.4A priority patent/EP3591034A4/en
Priority to PCT/RU2018/050006 priority patent/WO2018160103A1/ru
Publication of EA201700163A1 publication Critical patent/EA201700163A1/ru
Publication of EA035353B1 publication Critical patent/EA035353B1/ru

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12PFERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
    • C12P13/00Preparation of nitrogen-containing organic compounds
    • C12P13/04Alpha- or beta- amino acids
    • C12P13/20Aspartic acid; Asparagine
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/88Lyases (4.)
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N1/00Microorganisms, e.g. protozoa; Compositions thereof; Processes of propagating, maintaining or preserving microorganisms or compositions thereof; Processes of preparing or isolating a composition containing a microorganism; Culture media therefor
    • C12N1/20Bacteria; Culture media therefor
    • C12N1/205Bacterial isolates
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N11/00Carrier-bound or immobilised enzymes; Carrier-bound or immobilised microbial cells; Preparation thereof
    • C12N11/02Enzymes or microbial cells immobilised on or in an organic carrier
    • C12N11/08Enzymes or microbial cells immobilised on or in an organic carrier the carrier being a synthetic polymer
    • C12N11/089Enzymes or microbial cells immobilised on or in an organic carrier the carrier being a synthetic polymer obtained otherwise than by reactions only involving carbon-to-carbon unsaturated bonds
    • C12N11/091Phenol resins; Amino resins
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12YENZYMES
    • C12Y403/00Carbon-nitrogen lyases (4.3)
    • C12Y403/01Ammonia-lyases (4.3.1)
    • C12Y403/01001Aspartate ammonia-lyase (4.3.1.1), i.e. aspartase
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12RINDEXING SCHEME ASSOCIATED WITH SUBCLASSES C12C - C12Q, RELATING TO MICROORGANISMS
    • C12R2001/00Microorganisms ; Processes using microorganisms
    • C12R2001/01Bacteria or Actinomycetales ; using bacteria or Actinomycetales
    • C12R2001/185Escherichia
    • C12R2001/19Escherichia coli

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Tropical Medicine & Parasitology (AREA)
  • Virology (AREA)
  • Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Immobilizing And Processing Of Enzymes And Microorganisms (AREA)

Abstract

Изобретение относится к биотехнологии и касается способа получения L-аспарагиновой кислоты. Для этого сконструирован рекомбинантный штамм Escherichia coli ВКПМ В-11745, продуцент аспартазы, путем введения в штамм E. coli ВКПМ 7188 рекомбинантной плазмиды, содержащей ген aspA под контролем лактозного промотора lacUV5. Получение L-аспарагиновой кислоты заключается в биотрансформации фумарата аммония с помощью биокатализатора на основе клеток рекомбинантного штамма E. coli ВКПМ В-11745 и выделении целевого продукта известными способами. В качестве биокатализатора используют свободные или иммобилизованные клетки штамма E. coli. Рекомбинантный штамм E. coli позволяет получать высокий уровень аспартазной активности без использования изопропилтиогалактозида в качестве индуктора в составе питательной среды.

Description

Область техники
Изобретение относится к биотехнологии и касается способа получения L-аспарагиновой кислоты, которая находит применение в фармацевтической, пищевой, микробиологической промышленности и в кормопроизводстве.
Уровень техники
Известны способы получения L-аспарагиновой кислоты биокаталитической трансформацией фумарата аммония в L-аспарагинат аммония с использованием микроорганизмов, синтезирующих фермент аспартат-аммоний лиазу (аспартазу). Наиболее перспективным и технически легко осуществимым в процессе биотрансформации фумарата аммония в L-аспарагинат является использование иммобилизованных бактериальных клеток. Иммобилизованными клетками заполняется проточный реактор, и раствор фумарата аммония насосом прокачивают через слой биокатализатора, на выходе из реактора образуется раствор моноаммонийной соли аспарагиновой кислоты.
Используются природные (дикие), мутантные и рекомбинантные штаммы продуценты аспартазы, относящиеся к различным родам, например роду Escherichia (SU 659611). В указанном изобретении использован природный штамм. Основной недостаток данного способа - низкая активность аспартазы. В изобретении по патенту ЕР 0110422 использованы мутантные штаммы. Основные недостатки данного способа - это высокий уровень побочной активности фумаратгидратазы и невысокая активность аспартазы. По роду Serratia (EP 0111293) был получен рекомбинантный штамм. Основные недостатки данного способа - отсутствие селектирующего фактора при культивировании штамма и быстрая утеря плазмиды. Что касается родов Pseudomonas, Bacillus, Brevibacterium и др. (ЕР 0752476), основные недостатки способа - трудоемкость, многостадийность и невысокая целевая активность.
Известен способ получения L-аспарагиновой кислоты с использованием природного штамма Escherichia coli (ВКПМ В-7188) (RU 2174558). Однако данный способ является недостаточно эффективным из-за низкой аспартазной активности штамма.
Известен способ получения аспарагиновой кислоты, описанный в патенте US 4692409. В нем описан рекомбинантный штамм Escherichia coli TA-5004, с высокой аспартазной активностью и биокатализатор на основе биомассы клеток этого штамма, включенных в гель полисахарида, каппа-каррагинана. Основные недостатки указанного способа - это отсутствие селектирующего фактора при культивировании штамма, быстрая утеря плазмиды, а также диффузионные ограничения матрицы геля каррагинана, которые при увеличении удельной аспартазной активности клеток не позволяют существенно увеличить удельную активность биокатализатора.
Также известен способ получения аспарагиновой кислоты с использованием иммобилизованных клеток, обладающих аспартазной активностью на поверхности частиц ионообменных смол или неорганических материалов с помощью полиазетидина (US 4436813). Известен способ получения аспарагиновой кислоты, в котором используют биокатализатор на основе клеток, обладающих аспартазной активностью, иммобилизованных на частицах вермикулита с помощью сшивающих агентов, в том числе глутарового альдегида в присутствии полиэтиленимина (US 4504582). Недостатком данного способа является низкая эффективность получаемого биокатализатора.
Наиболее близким к заявленному способу является способ получения L-аспарагиновой кислоты, описанный в патенте US 6214589. В данном способе использовали биокатализатор на основе клеток рекомбинантного штамма Escherichia coli. Штамм содержит плазмиду pUC19 с вставкой гена аспартазы под лактозным промотором. Способ предусматривает пропускание раствора фумарата аммония через колонку, заполненную частицами биокатализатора, с последующим выделением L-аспарагиновой кислоты из реакционного раствора. Биокатализатор получают иммобилизацией бактериальных клеток на ионообменной смоле с использованием полимеров, изменяющих растворимость в зависимости от величины рН среды.
Недостатком способа является высокая стоимость компонентов среды, в частности необходимость добавки дорогостоящего индуктора лактозного оперона, изопропил-1-тио-в-О-галактозида (ИПТГ), который индуцирует экспрессию аспартазы. Это соединение широко используется для индукции экспрессии рекомбинантных генов в экспрессионных векторах, сконструированных на основе промотора lacоперона. Необходимость добавки этого дорогостоящего вещества снижает экономическую эффективность процесса культивирования клеток Е. coli, получения биокатализатора и, как следствие, всего процесса получения L-аспарагиновой кислоты. Кроме того, недостатком данного способа является труднодоступность полимеров и использование сложного оборудования для иммобилизации.
Раскрытие изобретения
Задачей настоящего изобретения является повышение эффективности процесса получения Lаспарагиновой кислоты за счет снижения трудоёмкости и удешевления процесса, связанного с применением более эффективного биокатализатора.
Задача решается путем:
конструирования рекомбинантного штамма Escherichia coli, продуцента аспартазы, путем введения в штамм Е. coli ВКПМ 7188 рекомбинантной плазмиды, содержащей ген aspA под контролем лактозного промотора lacUV5;
- 1 035353 в некоторых вариантах изобретения задача решается путем получения рекомбинантного штамма, депонированного во Всероссийской Коллекции Промышленных Микроорганизмов под номером Е. coli ВКПМ В-11745;
разработки способа получения L-аспарагиновой кислоты путем биотрансформации фумарата аммония с помощью биокатализатора на основе клеток рекомбинантного штамма Е. coli;
в некоторых вариантах изобретения задача решается путем разработки способа получения Lаспарагиновой кислоты с использованием в качестве биокатализатора свободных или иммобилизованных клеток штамма Е. coli;
в некоторых частных вариантах изобретения задача решается путем разработки способа иммобилизации клеток штамма Е coli в матрице полиэтиленимина, ковалентно сшитой глутаровым альдегидом;
в некоторых частных вариантах изобретения задача решается путем разработки способа иммобилизации клеток штамма Е. coli, отличающегося тем, что весовое соотношение полиэтиленимина и глутарового альдегида составляет от 1:1 до 3:1.
в некоторых частных вариантах изобретения задача решается путем разработки способа иммобилизации клеток штамма Е. coli, отличающегося тем, что весовое соотношение компонентов полиэтиленимина и глутарового альдегида к биомассе Е. coli составляет от 0,25:1 до 3:1.
В результате осуществления изобретения достигаются следующие технические результаты:
получена рекомбинантная плазмида pAsp 116-5 для создания высокопродуктивных штаммов E.coli;
получены рекомбинантные штаммы Е. coli, в том числе штамм Е. coli ВКПМ В-11745, обладающие высокой аспартазной активностью;
снижение трудоемкости, упрощение и удешевление процесса получения L-аспарагиновой кислоты; увеличение аспартазной активности биокатализатора на основе рекомбинантного штамма E.coli;
повышение ферментативной активности биокатализатора без внесения в среду дорогостоящего индуктора (ИПТГ);
исключение необходимости использования дорогостоящих питательных сред, больших объемов культивирования и малодоступных компонентов для иммобилизации клеток;
разработан способ иммобилизации клеток рекомбинантного штамма Е. coli;
разработан способ получения L-аспарагиновой кислоты с помощью биокатализатора на основе свободных и иммобилизованных клеток E. coli;
разработан способ иммобилизации E. coli в матрице полиэтиленимина, ковалентно сшитой глутаровым альдегидом;
разработан способ непрерывной биотрансформации фумарата аммония иммобилизованными клетками.
Описание рисунков
На рисунке - схема плазмиды pAsp 116-5.
На рисунке: Amp - ген устойчивости к ампициллину, rep (рМВ1) - репликон, f1 (IG) - фрагмент ДНК профага f1, Asp - ген L-аспартат аммоний лиазы, prom - промоторная область LacUV5.
Подробное описание изобретения
Предлагаемое изобретение направлено на повышение эффективности процесса получения Lаспарагиновой кислоты за счет снижения трудоемкости и удешевления процесса, связанного с применением более эффективного биокатализатора на основе нового рекомбинантного штамма E. coli, иммобилизованного с помощью полиэтиленимина сшитого глутаровым диальдегидом.
Заявленный способ заключается в обеспечении высокой аспартазной активности биокатализатора на основе клеток нового рекомбинантного штамма E. coli без использования дорогостоящего индуктора ИПТГ в процессе его культивирования и получении высокоэффективного биокатализатора на основе клеток штамма E. coli.
Предлагаемый способ получения L-аспарагиновой кислоты путем биотрансформации фумарата аммония в аспарагинат аммония с помощью биокатализатора на основе микробных клеток Е. coli с последующим выделением целевого продукта предусматривает использование в процессе биотрансформации высокоактивного биокатализатора на основе нового рекомбинантного штамма E. coli, выращенного на питательной среде без добавления индуктора ИПТГ.
При осуществлении изобретения штамм может быть в использован как в свободном виде, так и иммобилизованном с использованием приемов, известных в данной области, например, в полиакриламидном геле, в каррагинане и другими способами, в частности штамм может быть иммобилизован в ковалентно сшитую глутаровым альдегидом матрицу полиэтиленимина.
Полиэтиленимин и глутаровый альдегид являются доступными и хорошо изученными соединениями, широко применяемыми для иммобилизации ферментов (см., например, R. Bahulekar et. al., Polyethyleneimine in immobilization of biocatalysts // Enzyme and Microb. Technol., 1991. - V. 13(11) - P.858-868.; US 4504582). Шиффовы основания, образуемые в процессе совместной сшивки аминогрупп бактериальных клеток и полиэтиленимина считаются не очень прочными соединениями. Однако в щелочных условиях функционирования аспартазы, а также в водных растворах с концентрацией солей выше 20% данный тип соединений достаточно устойчив. Кроме того, образуемая полимерная матрица имеет достаточно широ
- 2 035353 кие поры, чтобы не оказывать существенных диффузионных ограничений при размере частиц от 0,5 до 1,0 мм.
Способ осуществляют следующим образом.
Производится конструирование рекомбинантного штамма.
В одном из вариантов осуществления изобретения под рекомбинантным штаммом понимается линия микроорганизмов производных Escherichia coli ВКПМ В-11745, сохраняющих основные мутации и генно-инженерные модификации, обеспечивающие высокую продукцию фермента аспартазы. Рекомбинантный штамм E. coli ВКПМ В-11745 конструируется путем трансформации штамма E. coli ВКПМ В-7188 плазмидой pAsp 116-5. Выбор в качестве реципиента при конструировании заявляемого штамма именно штамма E. coli ВКПМ В-7188 связан с тем, что, несмотря на низкий уровень продукции аспартазы, он соответствует большинству требований, предъявляемых реципиентам для экспрессии, т.е. генетически маркирован, позволяет получить высокую эффективность при трансформации и не продуцирует токсичных метаболитов.
Штамм Escherichia coli ВКПМ В-7188 получается из дикого штамма посредством обработки мутагеном (нитрозогуанидином), с последующим отбором мутантов на аналоге глюкозы альфа-метил-Dглюкопиранозид (RU2174558).
Плазмида pAsp 116-5 получается на основе вектора pUC19 и содержит ген L-аспартат-аммоний лиазы из Е. coli В-7188 под лактозным промотором lacUV5 и ген устойчивости к антибиотикам пенициллинового ряда. Схема плазмиды представлена на рисунке, где Amp - ген устойчивости к ампициллину, rep (рМВ1) - репликон, f1 (IG) - фрагмент ДНК профага f1, Asp - ген L-аспартат аммоний лиазы, prom - промоторная область LacUV5.
Штамм E.coli ВКПМ В-11745 характеризуется всеми признаками, обычными для E.coli, включая, в том числе, культурально-морфологические признаки. Культура представлена грамотрицательными, факультативно анаэробными палочковидными клетками, со слегка закруглёнными концами размером 0,40,8х1-3 мкм. Клетки хорошо растут на простых богатых питательных средах. Колонии на мясопептонном агаре (МПА) и среде Лурия-Бертани (LB) - беловатые блестящие, размером 2-3 мм, края ровные, спор не образуют.
После трансформации клеток штамма Е. coli ВКПМ В-7188 - ДНК pAsp 116-5, в процессе выделения штаммов-трансформантов был получен спонтанный мутант, поддерживающий высокий уровень синтеза аспартазы в отсутствие индуктора ИПТГ. В таблице представлено влияние добавления индуктора ИПТГ в количестве 1 мМ в ферментационную среду.
Влияние индуктора ИПТГ на аспартазную активность.
Показатель Без ИПТГ ИПТГ1 мМ
Удельная аспартазная активность ед/ ед.ОП 25701120 24701140
Общая аспартазная активность ед/ мл КЖ (культуральной жидкости) 5386015200 4792014300
Полученный штамм Е. coli 7188 (pAsp116-5) депонирован во Всероссийской коллекции промышленных микроорганизмов и имеет регистрационный номер ВКПМ В-11745. Данный штамм при выращивании на ферментационной среде в ферментере способен продуцировать L-аспартат-аммоний лиазу в количестве не менее 40000 ед/мл.
Удельную аспартазную активность клеток определяли следующим образом.
К 4,5 мл 1,5 М раствора фумарата аммония добавляли 0,5 мл суспензии предварительно активированных микробных клеток с оптической плотностью 5 ед. и инкубировали смесь при перемешивании 1 ч при 30°C. Количество образовавшейся аспарагиновой кислоты определяли методом высокоэффективной жидкостной хроматографии (ВЭЖХ). За единицу активности принято образование одного микромоля аспарагиновой кислоты за 1 ч. Оптическую плотность клеточной суспензии определяли при длине волны 540 нм и оптическом пути 5 мм.
Получение иммобилизованных клеток осуществляли, смешивая суспензию клеток с раствором гомополимера полиэтиленимина (Polymin-P, BASF), после чего добавляли раствор глутарового альдегида, перемешивали и оставляли для завершения процессов сшивки. Количество раствора гомополимера полиэтиленимина выбирали таким образом, чтобы конечная концентрация полиэтиленимина составляла от 10 до 50% в расчете на 100% вещество. Количество раствора глутарового альдегида выбирали таким образом, чтобы конечная концентрация глутарового альдегида составляла от 5 до 30% в расчете на 100% вещество. Количество биомассы клеток E. coli выбирали таким образом, чтобы конечная концентрация биомассы клеток составляла от 25 до 65% в расчете сухой вес. Соотношение полиэтиленимина и глутарового альдегида составляет от 1:1 до 3:1. А весовое соотношение компонентов полиэтиленимина и глутарового альдегида к биомассе Е. coli составляет от 0,25:1 до 3:1, где полиэтиленимин и глутаровый альдегид в расчете на 100% вещество, а биомасса в расчете на сухой вес.
Затем полученную массу измельчали, подсушивали до остаточной влажности от 65 до 75%, отсеи
- 3 035353 вали фракции менее 0,5 мм и более 1,5 мм, выдерживали в растворе ацетата аммония с концентрацией от 200 до 250 г/л не менее 24 ч.
Способ иммобилизации обеспечивает получение иммобилизованных клеток с удельной аспартазной активностью от 90000 до 210000 ед./ч на грамм влажного биокатализатора. Данный биокатализатор, помещенный в проточный реактор, обеспечивает при 25°C биотрансформацию раствора фумарата аммония с концентрацией 200 г/л (по фумаровой кислоте) со скоростью от 3 до 5 объемов/ч биокатализатора, находящегося в реакторе с эффективностью 99%.
Получение и культивирование штамма Escherichia coli ВКПМ В-11745, получение иммобилизованных клеток штамма E. coli ВКПМ В-11745, проведение биотрансформации фумарата аммония и получение L-аспарагиновой кислоты с использованием иммобилизованных клеток штамма E. coli ВКПМ В11745 подтверждены следующими примерами конкретного исполнения.
Следует понимать, что эти и все приведенные в материалах заявки примеры не являются ограничивающими и приведены только для иллюстрации настоящего изобретения.
Пример 1. Получение плазмиды pAsp 116-5.
Для получения плазмиды pAsp 116-5 использовали последовательность гена AspA из Escherichia coli, представляющую собой ген L-аспартат-аммоний лиазы без регуляторной промоторной области.
Последовательность aspA получали методом ПЦР, используя в качестве матрицы геномную ДНК, выделенную из штамма E.coli ВКПМ В-7188.
Геномную ДНК выделяли с помощью Набора для выделения геномной ДНК согласно рекомендациям изготовителя (Genomic DNA Purification Kit, # K0512, Thermo Fisher Scientific Biosciences Inc.).
ПЦР продукт получали с помощью следующей пары праймеров:
Ittt gta taa gaa aat gag agg g (SEQ ID NO: 1) и aaa gga tcc tgt acg att act gtt cgc ttt cat cag tat age (SEQ ID NO: 2)
Фрагменты ДНК получали с использованием Pfu полимеразы.
В работе использовали праймеры-олигонуклеотиды, синтезированные ЦКП ФГУП ГосНИИгенетика и ферменты Thermo Fisher Scientific Biosciences Inc.
Для реакции амплификации использовали приблизительно 100 нмолей каждого праймера. Фрагмент амплифицированной ДНК после электрофореза в 1% агарозном геле очищали методом экстракции с помощью набора для выделения ДНК из геля согласно рекомендациям изготовителя (GeneJET Gel Extraction Kit, # K0691, Thermo Fisher Scientific Biosciences Inc.).
Очищенный фрагмент ДНК в количестве 0,5 мкг лигировали с 0,2 мкг ДНК плазмиды pUC19, расщепленной рестриктазой SmaI. Лигирование производили с помощью реактивов Thermo Fisher Scientific Biosciences Inc. согласно рекомендациям изготовителя. Полученную плазмиду трансформировали в E.coli XL1-Blue методом электропорации согласно методике, описанной в источнике (Sambrook et al., Molecular Cloning, second edition Cold Spring Harbor Laboratory, Plainview, N.Y. ,1989). Клоны, содержащие искомую вставку ДНК, отбирали на чашках с агаризованной средой LB с ампициллином и стандартному тесту на отсутствие активности β-галактозидазы, как описано в вышеуказанном источнике. Плазмидную ДНК, выделенную из отобранных клонов, проверяли методом ПЦР на наличие вставки, с использованием указанных выше праймеров. Клоны с подтвержденной вставкой проверяли на наличие аспартазной активности. В клонах с подтвержденной аспартазной активностью проверяли нуклеотидную последовательность гена методом секвенирования.
Плазмидную ДНК, выделенную из отобранных клонов, подтвержденного размера, подтвержденной нуклеотидной последовательности, обеспечивающую экспрессию L-аспартат-аммоний лиазы в штамме E.coli/XL1-Blue, обозначали далее как pAsp 116-5.
Пример 2. Получение штамма E.coli ВКПМ В-11745.
Штамм Escherichia coli ВКПМ В-7188 для трансформации использовали для приготовления электрокомпетентной культуры, как описано в источнике (Sambrook et al., Molecular Cloning, second edition Cold Spring Harbor Laboratory, Plainview, N.Y., 1989).
В качестве ДНК для трансформации штамма Escherichia coli ВКПМ В-7188 использовали плазмидную ДНК pAsp 116-5, полученную в соответствии с описанием в примере 1.
Селекцию трансформантов проводили на агаризованной среде LB с ампициллином. Отобранные трансформанты проверяли на наличие аспартазной активности. Фенотип трансформантов поддерживали рассевом на той же среде.
Десять клонов, показавших наибольшую аспартазную активность, проверяли на наличие L-аспартат-аммоний лиазной активности в ацетатной ферментационной среде, как описано далее в примере 3.
По результатам культивирования отбирали наиболее активный клон. Отобранный клон, обладающий наибольшей аспартазной активностью, являющийся трансформантом E.coli ВКПМ В-7188 (pAsp 116-5) и при культивировании в пробирках позволяющий получать активность L-аспартат-аммоний лиазы не менее 10000 ед/мл, обозначали далее как E.coli/ВКПМ В-11745.
Пример 3. Культивирование штамма E.coli ВКПМ В-11745 в колбах.
Штамм предварительно выращивали при 37°C в течение ночи на агаризованной среде LB с 100 мг/л
- 4 035353 ампициллина.
Свежую культуру пересевали с чашек бактериологической петлей в пробирки с 10 мл жидкой среды LB с ампициллином и культивировали на термостатируемом шейкере при 37°C, 300 об/мин, в течение не менее 15 ч.
Полученный посевной материал пересевали в пробирки с 10 мл жидкой среды LB с ампициллином, разбавляя в 100 раз (100 мкл культуры на 10 мл среды). Культивировали на термостатируемом шейкере при 37°C, 300 об/мин, в течение не менее 2 ч до ОП600 ~ 0,6-0,8. Полученный посевной материал пересевали в колбы со 100 мл жидкой ферментационной среды следующего состава (г/л): Na2HPO.1-12H2O 15,0; KH2PO4 - 2,0; CH3COONa - 7; дрожжевой экстракт - 20; MgSO4-7H2O - 0,25; рН - 6,5-7,0, с ампициллином - 100 мг/л. Культивировали на термостатируемом шейкере при 37°C, 300 об/мин, в течение не менее 2 ч до ОП600 ~ 0,6-0,8. После этого снижали температуру культивирования до 30°C и культивировали еще не менее 7 ч до достижения максимальной активности культуры. При культивировании штамма E.coli ВКПМ В-11745 продукция аспартазы составляла не менее 10000 ед/мл.
Пример 4. Культивирование штамма E.coli ВКПМ В-11745 в лабораторном ферментере.
Штамм предварительно выращивали при 37°C в течение ночи на агаризованной среде LB с 100 мг/л ампициллина.
Свежую культуру пересевали с чашек бактериологической петлей в две колбы с 50 мл жидкой среды LB с ампициллином и культивировали на термостатируемом шейкере при 37°C, 300 об/мин в течение не менее 15 ч.
Полученный посевной материал переносили в трехлитровый ферментер, содержащий 2 л питательной ферментационной среды следующего состава (г/л): KH2PO4 - 2,0; CH3COONa - 13,8; дрожжевой экстракт - 50; MgSO4-7H2O - 0,25; рН - 6,8-7,2, ампициллин - 100 мг/л. Условия культивирования: температура 30°C, аэрация - 2 л/мин, перемешивание - 600 об/мин, рН 7.8. Система автоматического поддержания рН осуществляет дозировку раствора уксусной кислоты. Время культивирования 15-18 ч. Оптическая плотность культуральной жидкости на сливе 30,0 ед. ОП. Удельная аспартазная активность 2400 Ед.акт./ед. ОП. Общая аспартазная активность - 72000 Ед.акт./мл. Клетки отделяли центрифугированием и промывали физиологическим раствором. Количество собранных влажных клеток в виде пасты составило 171 г.
Пример 5. Получение иммобилизованных клеток.
Биомассу клеток штамма E.coli B-11745 из примера 4 в количестве 10 г помещали в стеклянный стакан, в который предварительно вносили 11 г 1% раствора хлористого натрия и перемешивали. Затем, продолжая перемешивание, добавляли 5 г 20%-ного раствора гомополимера полиэтиленимина (PolyminP, BASF), предварительно нейтрализованного соляной кислотой до рН 7,5, и далее, продолжая перемешивание, добавляли 3 г 25% раствора глутарового альдегида (Panreac). Смесь начинала быстро отверждаться. Ее оставляли на 30 мин для завершения протекающих реакций, после чего измельчали и подсушивали до остаточной влажности 65-75%. Полученные иммобилизованные клетки просеивали через сито, оставляя фракцию 0,5-1,5 мм, которую помещали в 20%-й раствор ацетата аммония и оставляли не менее, чем на 24 ч при температуре 5°C.
Полученный биокатализатор имел удельную активность 180900 ед./г влажного биокатализатора.
Пример 6. Непрерывная биотрансформация фумарата аммония иммобилизованными клетками.
Биокатализатором, полученным по примеру 5, в количестве 5 г (по влажному весу) заполняли стеклянную колонку с рубашкой (1x12,7 см, 10 мл). В рубашку подавали теплоноситель с температурой 25°C. Перистальтическим насосом прокачивали через слой биокатализатора раствор фумарат аммония, с концентрацией 200 г/л (по фумаровой кислоте), рН 8,5 и с добавлением 1 мМ MgSO4. Скорость подачи раствора 50 мл/ч. Раствор, выходящий из колонки, содержал менее 1,5 г/л фумарата аммония (в расчете на фумаровую кислоту), что соответствует конверсии более 99%. Степень конверсии оставалась более 99% в продолжение непрерывного процесса биотрансформации фумарата аммония в течение трех месяцев и более.
Пример 7. Получение L-аспарагиновой кислоты из реакционных растворов после биотрансформации.
В 2-х литровую колбу с обратным холодильником вносили 1600 мл реакционного раствора после биотрансформации по примеру 6. Колбу помещали на магнитную мешалку с нагревом и раствор нагревали при перемешивании до 90-98°C. Не прекращая перемешивание, в колбу вносили 150 г кристаллической фумаровой кислоты. Нагрев и поддержание температуры в пределах 90-95°C продолжали еще 30 мин. Затем отключали нагрев и продолжали перемешивать суспензию выпадающих кристаллов аспарагиновой кислоты. Раствор охлаждали до 25°C, выдерживали при этой температуре 30 мин и кристаллы отделяли фильтрацией. Кристаллы промывали на фильтре обессоленной водой и сушили при 80°C. Было получено 269,8 г кристаллической L-аспарагиновой кислоты. Удельный угол вращения в 5 н HCl: [a]D20=+24,9. Примесь фумаровой кислоты 0,34%. Маточник и промывные воды упаривали под вакуумом до объема 1,3 л. К полученному концентрату добавляли 90 г фумаровой кислоты, 25%-й водный аммиак до значения рН раствора 8,5 и обессоленную воду до объема 1,6 л. Полученный раствор вновь
- 5 035353 направляли на биотрансформацию.
Предлагаемый способ обеспечивает более эффективное получение L-аспарагиновой кислоты за счет удешевления и упрощения процесса. При этом исключается необходимость использования дорогостоящих питательных сред, больших объемов культивирования и малодоступных компонентов для иммобилизации клеток.
Таким образом, предлагаемой способ получения L-аспарагиновой кислоты позволяет обеспечить высокую аспартазную активность биокатализатора, существенно снизить трудоёмкость и стоимость технологического процесса.
Несмотря на то, что изобретение описано со ссылкой на раскрываемые варианты воплощения, для специалистов в данной области должно быть очевидно, что конкретные подробно описанные эксперименты приведены лишь в целях иллюстрирования настоящего изобретения, и их не следует рассматривать как каким-либо образом ограничивающие объем изобретения. Должно быть понятно, что возможно осуществление различных модификаций без отступления от сути настоящего изобретения.

Claims (6)

  1. ФОРМУЛА ИЗОБРЕТЕНИЯ
    1. Рекомбинантный штамм Escherichia coli ВКПМ В-11745, продуцент аспартазы, полученный путем введения в штамм Е. coli ВКПМ 7188 рекомбинантной плазмиды, содержащей ген aspA под контролем лактозного промотора lacUV5.
  2. 2. Способ получения L-аспарагиновой кислоты путем биотрансформации фумарата аммония с помощью биокатализатора на основе клеток Е. coli по п.1.
  3. 3. Способ по п.2, отличающийся тем, что в качестве биокатализатора используют свободные или иммобилизованные клетки штамма Е. coli.
  4. 4. Способ по п.3, отличающийся тем, что иммобилизацию клеток штамма Е. coli осуществляют в матрице полиэтиленимина, ковалентно сшитой глутаровым альдегидом.
  5. 5. Способ по п.4, отличающийся тем, что весовое соотношение полиэтиленимина и глутарового альдегида составляет от 1:1 до 3:1.
  6. 6. Способ по п.4, отличающийся тем, что весовое соотношение суммы компонентов полиэтиленимина и глутарового альдегида к биомассе Е. coli составляет от 0,25:1 до 3:1.
EA201700163A 2017-02-28 2017-02-28 Способ получения l-аспарагиновой кислоты и рекомбинантный штамм-продуцент аспартазы escherichia coli EA035353B1 (ru)

Priority Applications (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
EA201700163A EA035353B1 (ru) 2017-02-28 2017-02-28 Способ получения l-аспарагиновой кислоты и рекомбинантный штамм-продуцент аспартазы escherichia coli
EP18761555.4A EP3591034A4 (en) 2017-02-28 2018-02-02 ASPARTIC ACID MANUFACTURING PROCESS
PCT/RU2018/050006 WO2018160103A1 (ru) 2017-02-28 2018-02-02 Способ получения l-аспарагиновой кислоты

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
EA201700163A EA035353B1 (ru) 2017-02-28 2017-02-28 Способ получения l-аспарагиновой кислоты и рекомбинантный штамм-продуцент аспартазы escherichia coli

Publications (2)

Publication Number Publication Date
EA201700163A1 EA201700163A1 (ru) 2018-08-31
EA035353B1 true EA035353B1 (ru) 2020-06-01

Family

ID=63287021

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
EA201700163A EA035353B1 (ru) 2017-02-28 2017-02-28 Способ получения l-аспарагиновой кислоты и рекомбинантный штамм-продуцент аспартазы escherichia coli

Country Status (3)

Country Link
EP (1) EP3591034A4 (ru)
EA (1) EA035353B1 (ru)
WO (1) WO2018160103A1 (ru)

Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2546239C1 (ru) * 2013-12-12 2015-04-10 Федеральное государственное унитарное предприятие "Государственный научно-исследовательский институт генетики и селекции промышленных микроорганизмов" (ФГУП "ГосНИИгенетика" РЕКОМБИНАНТНЫЙ ШТАММ Escherichia coli, ОБЛАДАЮЩИЙ КОНСТИТУТИВНОЙ АСПАРТАЗНОЙ АКТИВНОСТЬЮ И СПОСОБ СИНТЕЗА L-АСПАРАГИНОВОЙ КИСЛОТЫ С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ ЭТОГО ШТАММА В КАЧЕСТВЕ БИОКАТАЛИЗАТОРА

Family Cites Families (11)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
SU659611A1 (ru) 1977-02-09 1979-04-30 Московский государственный университет им. М.В.Ломоносова Способ получени -аспарагиновой кислоты
US4355105A (en) * 1981-03-30 1982-10-19 Miles Laboratories, Inc. Glutaraldehyde/polyethylenimine immobilization of whole microbial cells
US4436813A (en) 1982-03-16 1984-03-13 Purification Engineering, Inc. Immobilized microbial cell composition for making L-aspartic acid
US4504582A (en) 1982-07-20 1985-03-12 Genex Corporation Vermiculite as a carrier support for immobilized biological materials
JPS59113895A (ja) 1982-12-03 1984-06-30 Tanabe Seiyaku Co Ltd L−アスパラギン酸の製法
JPS59113887A (ja) 1982-12-08 1984-06-30 Tanabe Seiyaku Co Ltd L−アスパラギン酸の製法
JPS59232088A (ja) * 1983-06-15 1984-12-26 Tanabe Seiyaku Co Ltd L−アスパラギン酸の製法
KR960023076A (ko) 1994-12-09 1996-07-18 미우라 아끼라 L-아스파르트산의 제조 방법
DE69927315T2 (de) 1998-02-13 2006-07-06 Nippon Shokubai Co. Ltd. Verfahren zur Herstellung von L-Asparaginsäure
RU2174558C1 (ru) 2000-12-07 2001-10-10 Закрытое акционерное общество "Биоамид" Способ получения l-аспарагиновой кислоты
EP2468869B1 (en) * 2007-01-31 2015-03-18 Pfenex Inc. Bacterial leader sequences for increased expression

Patent Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2546239C1 (ru) * 2013-12-12 2015-04-10 Федеральное государственное унитарное предприятие "Государственный научно-исследовательский институт генетики и селекции промышленных микроорганизмов" (ФГУП "ГосНИИгенетика" РЕКОМБИНАНТНЫЙ ШТАММ Escherichia coli, ОБЛАДАЮЩИЙ КОНСТИТУТИВНОЙ АСПАРТАЗНОЙ АКТИВНОСТЬЮ И СПОСОБ СИНТЕЗА L-АСПАРАГИНОВОЙ КИСЛОТЫ С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ ЭТОГО ШТАММА В КАЧЕСТВЕ БИОКАТАЛИЗАТОРА

Non-Patent Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
AKIN Cavit. Biocatalysis with immobilized cells. Biotechnology anf Genetic Engineering Reviews, Vol. 5, Septembers 1987, c. 319-320, 335, 358 *
FULLER Forrest. A family of cloning vectors containing the lacUV5 promoter. Gene, 19 (1982) 43-54, реферат *

Also Published As

Publication number Publication date
EA201700163A1 (ru) 2018-08-31
EP3591034A1 (en) 2020-01-08
EP3591034A4 (en) 2020-12-16
WO2018160103A1 (ru) 2018-09-07

Similar Documents

Publication Publication Date Title
TWI308594B (en) Method for producing l-amino acid
US20200157152A1 (en) Expression of klebsiella oxytoca polypeptides involved in lysine decarboxylation, and methods and applications thereof
JP4108766B2 (ja) 改良されたトランスアミナーゼ生物学的変換方法
CN109153966A (zh) 生产丙烯酰胺的生物技术方法及相关新菌株
CN102770550A (zh) 尸胺的制备方法
CN107164361B (zh) 一种固定化L-天冬氨酸-α-脱羧酶及其制备方法与应用
WO2011138966A1 (ja) 微生物触媒を用いたアクリルアミドの製造方法
CN104894043B (zh) 一种产γ-氨基丁酸的工程菌及其构建和应用
CN107287144B (zh) 一种代谢改造的枯草芽孢杆菌生物转化细胞及其制备方法与应用
RU2546239C1 (ru) РЕКОМБИНАНТНЫЙ ШТАММ Escherichia coli, ОБЛАДАЮЩИЙ КОНСТИТУТИВНОЙ АСПАРТАЗНОЙ АКТИВНОСТЬЮ И СПОСОБ СИНТЕЗА L-АСПАРАГИНОВОЙ КИСЛОТЫ С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ ЭТОГО ШТАММА В КАЧЕСТВЕ БИОКАТАЛИЗАТОРА
WO2004081216A1 (ja) 酢酸菌のアルコール脱水素酵素遺伝子
CN100406553C (zh) 生产D-N-氨基甲酰基-α-氨基酸的方法
CN114854659B (zh) 一种麦角硫因生产工艺及其应用
EP1144656A2 (en) Method for the isolation of ccc plasmid dna
WO2002072841A1 (fr) Adn codant pour une hydantoinase, adn codant pour une hydrolase d'acide amine l carbamyle, adn recombinant, cellules transformees, procede de production de proteine et procede de production d'acide amine optiquement actif
EA035353B1 (ru) Способ получения l-аспарагиновой кислоты и рекомбинантный штамм-продуцент аспартазы escherichia coli
Chibata et al. Immobilized cells: Historical background
CN111518851B (zh) 一种固定化酶连续制备[14/15n]-l-瓜氨酸的方法
RU2174558C1 (ru) Способ получения l-аспарагиновой кислоты
RU2339699C2 (ru) РЕКОМБИНАНТНАЯ ПЛАЗМИДА pT7ΔpckA::loxpcat ОБЕСПЕЧИВАЮЩАЯ СИНТЕЗ L-ТРЕОНИНА В КЛЕТКАХ Escherichia coli, И РЕКОМБИНАНТНЫЙ ШТАММ Escherichia coli FTR2717 (KCCM-10475) - ПРОДУЦЕНТ L-ТРЕОНИНА
RU2143002C1 (ru) СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ γ-АМИНОМАСЛЯНОЙ КИСЛОТЫ
RU2222596C1 (ru) Способ получения l-аминокислот, штамм escherichia coli - продуцент l-аминокислоты (варианты)
CN114921432B (zh) 一种转氨酶突变体及其工程菌与应用
CN111334445B (zh) 长链二元酸生产菌株及其制备方法和应用
CN101892228A (zh) 一种高丙烯酰胺和丙烯腈耐受性产腈水合酶工程菌及应用

Legal Events

Date Code Title Description
QB4A Registration of a licence in a contracting state
MM4A Lapse of a eurasian patent due to non-payment of renewal fees within the time limit in the following designated state(s)

Designated state(s): AM AZ KG TJ TM