DE102007011913A1 - Fluoreszenz-basiertes Assay zum Erkennen von Verbindungen zum Modulieren des Natrium-Calcium-Austauschers (NCX) im "Vorwärtsmodus" - Google Patents

Fluoreszenz-basiertes Assay zum Erkennen von Verbindungen zum Modulieren des Natrium-Calcium-Austauschers (NCX) im "Vorwärtsmodus" Download PDF

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    • G01N2500/10Screening for compounds of potential therapeutic value involving cells

Abstract

Transporteure sind eine aufstrebende Zielfamilie mit enormem Potential, welche wissenschaftliche und wirtschaftliche Möglichkeiten bieten. Der Natrium/Calcium-Austauscher ist ein wichtiger Mechanismus für das Entfernen von Ca<SUP>2+</SUP> aus diversen Zellen. Im Herz extrudiert er Ca<SUP>2+</SUP>, welches durch Ca<SUP>2+</SUP>-Kanäle zum Initiieren von Kontraktion eingetreten ist, während Na<SUP>+</SUP> in die Herzzelle eintritt. Es ist von erheblichem Interesse, Verbindungen zu identifizieren, welche die Aktivität des Natrium-Calcium-Austauschers modulieren. Die vorliegende Erfindung ist ausgerichtet auf ein Fluoreszenz-basiertes Assay für das Erkennen von Verbindungen zum Modulieren des NCX im "Vorwärtsmodus". Sie betrifft ferner einen Teilesatz, umfassend Zellen, welche NCX exprimieren, und die Verwendung des Teilesatzes zum Testen einer Verbindung auf die Aktivität als ein Agonist oder Antagonist von NCX.

Description

  • GEBIET DER ERFINDUNG
  • Die vorliegende Erfindung betrifft Natrium-Calcium-Austauscher (NCX) und Verfahren zum Bestimmen ihrer Aktivität. Insbesondere betrifft die Erfindung ein Fluoreszenz-basiertes Assay zum Erkennen von Verbindungen zum Modulieren des NCX im „Vorwärtsmodus". Sie betrifft ferner einen Teilesatz, welcher Zellen umfasst, die NCX exprimieren, und die Verwendung des Teilesatzes.
  • ALLGEMEINER STAND DER TECHNIK
  • Eine Grundvoraussetzung für das Leben ist die Kompartimentierung – wobei biologische Membranen das Werkzeug der Natur sind, um dieses Prinzip umzusetzen. Jedoch ist eine Lipiddoppelschicht – die Struktur, welche der Zellmembran unterliegt – für die meisten Ionen und Verbindungen undurchlässig, deren Transport essentiell für das Beibehalten der Vitalfunktionen in Zellen und Organismen ist. Die Antwort auf dieses Paradoxon liegt in der semipermeablen Natur der Zellmembran – gelöste Stoffe, welche die Membran durchqueren müssen, werden durch spezifische Membranproteine transportiert. Diese Transporteure sind verantwortlich für die Erzeugung und Aufrechterhaltung von Ionengradienten, die Aufnahme von Nährstoffen, den Transport von Metaboliten, die Wiederaufnahme von Signalgebungsmolekülen und die Entsorgung von Gift- und Abfallverbindungen. Daher sind Transporteure potentielle Arzneimittelziele, welche direkten Einfluss auf erkrankungsbezogene Anomalitäten in diesem Kontext zulassen.
  • Der Natrium/Calcium-Austauscher ist ein wichtiger Mechanismus für das Entfernen von Ca2+ aus diversen Zellen. Im Herz extrudiert er Ca2+, welches durch Ca2+-Kanäle zum Initiieren von Kontraktion eingetreten ist, während Na+ in die Herzzelle eintritt. Seine Relevanz bei kardiovaskulären Erkrankungen ist z. B. veranschaulicht in Hobai, JA & O'Rourke, B (2004) Expert Opin. Investig. Drugs, 13, 653–664. Daher hat die pharmazeutische Industrie Verbindungen entwickelt, welche den NCX hemmen, wie z. B. beschrieben in Iwamoto, T. et al. (2004) J. Biol. Chem., 279, 7544-7553. Der Na+/Ca2+-Austauscher transportiert elektrogenisch drei bis vier Na+ für jedes Ca2+, welches sich in die entgegengesetzte Richtung bewegt, wie z. B. gezeigt durch elektrophysiologische Mittel in Hinata, M. et al. (2002) J. Physiol. 545, 453–461. Der NCX ist in der Lage, die Zytoplasma-Ca2+-Konzentration ([Ca2+] ein) drei bis vier Größenordnungen unter der extrazellulären Ca2+-Konzentration ([Ca2+] aus) aufrechtzuerhalten. Nichtsdestotrotz ist die Richtung des Netto-Ca2+-Transports abhängig vom elektrochemischen Gradienten des Na+. Simultane und konsekutive Transportmodelle wurden für Na+- und Ca2+-Translokationen vorgeschlagen, und eine Menge an Belegen spricht für Letztgenannte.
  • Transporteure sind eine aufstrebende Zielfamilie mit enormem Potential, die wissenschaftliche und wirtschaftliche Möglichkeiten bieten. Andererseits sind Transporteure eine schwierige Zielklasse im Hinblick auf Arzneimittel-Entdeckungstechnologien.
  • Es ist von erheblichem Interesse, Verbindungen zu identifizieren, welche Kanalaktivität modulieren, zum Beispiel durch das Blockieren des Calciumflusses und/oder das Hemmen der Aktivierung von Calciumkanälen. Ein Standardverfahren, dies zu erreichen, ist die Verwendung von Patch-Clamp-Experimenten. Bei diesen Experimenten müssen Zellen einzeln und in Sequenz durch hochgeschulte Bediener bewertet werden, durch Messung des Calciumstromes durch die Zellmembran hindurch als Reaktion auf Veränderungen des Membranpotentials und/oder die Anwendung von Testverbindungen. Die Wirkung von Sea0400, einem neuen spezifischen Inhibitor von NCX, auf das Wirkpotential im Hunde-Ventrikelpapillarmuskel wurde untersucht und offenbart durch K. Acsai während des „ESC Congress 2004" in München auf Poster Nr. 2886 (Titel: Effect of a specific sodium-calcium exchanger blocker Sea0400 an the ventricular action potential and triggered activity in dog ventricular muscle and Purkinje fiber) und durch C. Lee et al. (The journal of pharmacology and experimental therapeutics; Vol. 311: 748-757, 2004; Titel: Inhibitory Profile of SEA0400 [2-[4-[(2,5-Difluorophenyl)methoxy]phenoxy]-5-ethoxyaniline] assessed an the cardiac Na+/Ca2+ exchanger, NCX1.1).
  • Unter Verwendung einer Ionenselektiv-Elektrodentechnik zum Quantifizieren von Ionenflüssen in Riesenpatches wurde gezeigt, dass der kardiale Na+/Ca2 +-Austauscher mehrere Transportmodi aufweist (Tong Mook Kang & Donald W. Hilgemann; Nature; Vol. 427, 5. Februar 2004; Titel: Multiple transport modes of the cardiac Na+/Ca2+ exchanger).
  • Diese Experimente sind, während sie gültig und informativ sind, sehr zeitaufwändig und nicht für Assays mit hohem Durchsatz für Verbindungen anpassbar, welche die Calciumianenkanal-Aktivität modulieren.
  • Es wurden verschiedene Techniken als Alternativen zu Standardverfahren der Elektrophysiologe entwickelt. Zum Beispiel wurden radioaktive Fluss-Assays verwendet, bei denen Zellen mit einem radioaktiven Tracer (z. B. 45Ca) versehen werden, und der Fluss des radioaktiv markierten Ca wird überwacht. Zellen beladen mit dem Tracer werden Verbindungen ausgesetzt, und diese Verbindungen, welche den Ausfluss des Tracers entweder verstärken oder verringern, werden als mögliche Aktivatoren oder Hemmer von lonenkanälen in den Zellmembranen identifiziert. Ein spezifisches Beispiel ist eingeschlossen in T. Kuramochi et al.; Bioorganic & Medical Chemistry; 12 (2004) 5039-5056; Titel: Synthesis and structure-activity relationships of phenoxypyridine derivates as novel inhibitors of the sodium-calcium exchanger. EP 1 031 556 offenbart ein Verfahren, bei dem die Na+/Ca2 +-Austauscheraktivität mit Hilfe von Sarkolemmvesikeln gemessen wird, wobei die Konzentration der Ca2 +-Aufnahme in den Sarkolemmvesikeln durch Messung der 45Ca-Radioaktivität bestimmt wird.
  • Viele radioaktive Ionentransporteur-Assays weisen eingeschränkte Empfindlichkeit und daher unzureichende Datenqualität auf. Außerdem sind die Kosten und Sicherheitsfragen in Zusammenhang mit der radioaktiven Screening-Technologie Hürden, welche eine breitere Anwendung verhindern.
  • Unter den obengenannten Arzneimittel-Entdeckungstechnologien ist die Verwendung von radioaktiven Fluss-Assays zum Identifizieren von Verbindungen, welche die Aktivität von Ionenkanälen und Ionentransporteuren modulieren, der nächste Stand der Technik zur vorliegenden Erfindung, da es sich hierbei um eine Technik handelt, bei der eine Testverbindung durch Überwachung des Flusses von Ca2+ aus den Zellen als möglicher Aktivator oder Hemmer identifiziert werden kann. Das Hauptproblem für die radioaktiven Assays basiert auf der Schwierigkeit der Erkennung des eingeschränkten Umsatzes von Ionentransporteuren von etwa 1 bis 1.000 Molekülen pro Sekunde – etwa 104 Mal weniger als die meisten Ionenkanäle.
  • Das Problem, welches sich aus dem Stand der Technik ergibt, ist daher das Identifizieren eines robusten Assays mit einer sehr guten Empfindlichkeit und Brauchbarkeit für das Screening mit hohem Durchsatz und das Profiling von NCX-Modulatoren. Die Lösung dieses Problems wird durch die vorliegende Erfindung bereitgestellt.
  • KURZDARSTELLUNG DER ERFINDUNG
  • Ein Gegenstand der vorliegenden Erfindung betrifft ein Assay für das Bestimmen der Aktivität von NCX-Protein, wobei:
    • a) Zellen, welche NCX exprimieren, bereitgestellt werden;
    • b) eine farbige Substanz zum Bestimmen des intrazellulären Calciums bereitgestellt wird;
    • c) Zellen mit einem NCX-Aktivitätsaktivator in Kontakt gebracht werden; und
    • d) die durch Calcium vermittelte Veränderung in dem Lumineszenzsignal von der farbigen Substanz verglichen wird mit einem Lumineszenzsignal erzeugt bei einem Kontrollexperiment.
  • Ein weiterer Gegenstand der vorliegenden Erfindung betrifft ein Assay für das Bestimmen der Aktivität von NCX-Protein als Reaktion auf die Zugabe einer Verbindung, wobei:
    • a) Zellen, welche NCX exprimieren, bereitgestellt werden;
    • b) eine farbige Substanz zum Bestimmen des intrazellulären Calciums bereitgestellt wird;
    • c) Zellen mit einer Verbindung in Kontakt gebracht werden, wobei die Zellen vor der Behandlung mit der Verbindung mit einem NCX-Aktivitätsaktivator behandelt wurden; und
    • d) die durch Calcium vermittelte Veränderung in dem Lumineszenzsignal von der farbigen Substanz verglichen wird mit einem Lumineszenzsignal erzeugt bei einem Kontrollexperiment.
  • Im Allgemeinen stammte das verwendete NCX-Protein von einem Säugetier, und insbesondere von einem Menschen. Das NCX-Protein ist ausgewählt aus NCX1, NCX2, NCX3, NCX4, NCX5, NCX6 und/oder NCX7, insbesondere NCX1, NCX2 und/oder NCX3.
  • Im Allgemeinen können die bei dem Assay der vorliegenden Erfindung verwendeten Zellen von jedem eukaryotischen Organismus abgeleitet sein.
  • Bei einer bevorzugten Ausführungsform sind die Zellen Säugetierzellen. Bei einer bevorzugteren Ausführungsform sind die Zellen CHO (CCL-61), HEK (CCL-1573), COS7 (CRL-1651) und/oder JURKAT (CRL-1990) – Zellen.
  • Insbesondere ist der beim Assay der vorliegenden Erfindung verwendete NCX-Aktivitätsaktivator Ionomycin.
  • Bei einer bevorzugten Ausführungsform wird die farbige Substanz als ein Farbstoffvorläufer zu den Zellen zugegeben, welcher in der Lage ist, in die Zellen einzutreten und zu einem Farbstoff hydrolysiert zu werden, wodurch der Farbstoff in den Zellen einen Komplex mit Calcium bildet und ein Lumineszenzsignal bereitstellt. Ferner kann der Farbstoffvorläufer bevorzugt ein Acetoxymethylester-Derivat sein und der Farbstoff kann bevorzugt der Calcium-empfindliche Fluoreszenzfarbstoff Fluo-4 sein. Bei einer bevorzugteren Ausführungsform ist das Lumineszenzsignal Fluoreszenz und der Überwachungsschritt c) verwendet ein FLIPR-Gerät.
  • Die Erfindung betrifft ferner die Verwendung eines Assays wie zuvor erwähnt zum Testen einer Verbindung auf die Aktivität als ein Agonist oder Antagonist von NCX. Bei einer weiteren bevorzugten Ausführungsform betrifft die Erfindung die Verwendung eines Assays wie zuvor erwähnt für die Diagnose einer Erkrankung in Zusammenhang mit einer NCX-veränderten Expression.
  • Die Erfindung betrifft ferner einen Teilesatz, welcher Folgendes umfasst:
    • a) lyophilisierte Zellen, welche NCX-Protein exprimieren;
    • b) eine farbige Substanz;
    • c) einen Verbindungspuffer; und
    • d) einen farbigen Substanzpuffer.
  • Bei einer bevorzugten Ausführungsform des Teilesatzes der vorliegenden Erfindung ist die farbige Substanz der Calcium-empfindliche Fluoreszenzfarbstoff Fluo-4. Bei einer weiteren bevorzugten Ausführungsform stammte das verwendete NCX-Protein von einem Säugetier, und insbesondere von einem Menschen. Das NCX-Protein ist ausgewählt aus NCX1, NCX2, NCX3, NCX4, NCX5, NCX6 und/oder NCX7, insbesondere NCX1, NCX2 und/oder NCX3.
  • Die Erfindung betrifft ferner die Verwendung eines Teilesatzes wie zuvor erwähnt zum Testen einer Verbindung auf die Aktivität als ein Agonist oder Antagonist von NCX. Bei einer weiteren bevorzugten Ausführungsform betrifft die Erfindung die Verwendung eines Teilesatzes wie zuvor erwähnt für die Diagnose einer Erkrankung in Zusammenhang mit einer NCX-veränderten Expression.
  • DETAILLIERTE BESCHREIBUNG DER ERFINDUNG
  • Der Begriff „Assay" betrifft ein Verfahren, bei dem eine Eigenschaft eines Systems oder Objektes gemessen wird. Assay ist eine Abkürzung üblicherweise verwendet für biologisches Assay und ist eine Art in vitro Experiment. Assays werden normalerweise zum Messen der Auswirkungen einer Substanz auf einen lebenden Organismus durchgeführt. Assays können qualitativ oder quantitativ sein und sie sind essentiell bei der Entwicklung neuer Arzneimittel.
  • Das gegenständliche Assay stellt einen breiten dynamischen Bereich bereit, so dass die Aktivität eines NCX-Proteins bestimmt werden kann. Insbesondere stellt die vorliegende Erfindung ein schnelles, effektives Assay für das Screening und Profiling pharmazeutisch wirksamer Verbindungen bereit, welche spezifisch mit der Aktivität eines NCX-Proteins interagieren und diese modulieren.
  • Der Begriff „NCX-Protein" oder „NCX" soll im Kontext der vorliegenden Erfindung für eines aus der Liste der folgenden Na+/Ca2+-Austauscherproteine entweder allein oder in Kombination miteinander stehen: NCX1, NCX2, NCX3, NCX4, NCX5, NCX6, NCX7.
  • Besonders bevorzugt sind NCX1, NCX2 und/oder NCX3, deren Aminosäuresequenzen jeweils SEQ. ID. NR. 1, SEQ. ID. NR. 2 und SEQ. ID. NR. 3 entsprechen.
  • Ein solches NCX-Protein könnte abgeleitet sein von irgendeinem Wirbeltier und insbesondere Säugetierspezies (z. B. Hund, Pferd, Rind, Maus, Ratte, Huhn, Anthropoid, Mensch oder andere). Der NCX könnte aus Gewebeproben solcher Wirbeltierorganismen isoliert sein oder mit Hilfe von rekombinantem biologischem Material hergestellt werden, welches in der Lage ist, das NCX-Protein zu exprimieren.
  • Der Begriff „NCX-Protein" betrifft Polypeptide, polymorphe Varianten, Mutanten und Interspezies-Homologa, welche eine Aminosäuresequenz aufweisen, welche eine Aminosäuresequenzidentität, die größer ist als etwa 80%, 85%, 90%, bevorzugt eine Aminosäuresequenzidentität von 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% oder 99% oder höher, bevorzugt über eine Region von mindestens etwa 25, 50, 100, 200 oder 500 oder mehr Aminosäuren zu einer Aminosäuresequenz codiert durch die Nukleinsäuresequenz enthalten in SEQ. ID. NR. 1, SEQ, ID. NR. 2 und SEQ. ID. NR. 3 aufweist.
  • Der Begriff „biologisches Material" steht für jedes Material, welches genetische Informationen enthält und in der Lage ist, sich selbst zu reproduzieren oder in einem biologischen System reproduziert zu werden. Rekombinantes biologisches Material ist jedes biologische Material, das mit Hilfe rekombinanter Techniken, die einem Fachmann auf dem Gebiet bekannt sind, hergestellt, verändert oder modifiziert wurde.
  • Die folgenden Referenzen sind Beispiele des Klonens bestimmter NCX-Proteine. Der Hunde-Na+/Ca2+-Austauscher NCX1 wurde durch Nicoll, DA. et al. (Science, 250 (4980): 562–5, 1990; Titel: Molecular cloning and functional expression of the cardiac sarcolemmal Na(+)-Ca2+ exchanger) geklont. Der menschliche Na+/Ca2+-Austauscher NCX1 wurde durch Komuro, I., et al. (Proc. Natl. Acad. Sci. USA 89 (10), 4769–4773, 1992; Titel: Molecular cloning and characterization of the human cardiac Na+/Ca2+ exchanger cDNA) und durch Kofuji, P. et al. (Am. J. Physiol. 263 (Cell Physiol. 32): C1241–C1249, 1992; Titel: Expression of the Na-Ca exchanger in diverse tissues: a study using the cloned human cardiac Na-Ca exchanger) geklont. Der menschliche Na+/Ca2+-Austauscher NCX2 wurde durch Li, Z. et al. (J. Biol. Chem. 269(26): 17434-9, 1994; Titel: Cloning of the NCX2 isoform of the plasma membrane (Na(+)-Ca2+ exchanger) geklont. Der Ratten-Na+/Ca2+-Austauscher NCX3 wurde durch Nicoll, DA. et al. (J. Biol. Chem. 271(40): 24914-21, 1996; Titel: Cloning of a third mammalian Na+/Ca2+ exchanger, NCX3) geklont. Der menschliche Na+/Ca2+-Austauscher NCX3 wurde durch Gabellini, N. et al. (Gene, 298: 1–7, 2002; Titel: The human SLC8A3 gene and the tissue-specific Na+/Ca2+ exchanger 3 isoforms) geklont.
  • Die Begriffe „Polypeptid", „Peptid" und „Protein" werden hierin austauschbar verwendet zur Bezugnahme auf ein Polymer von Aminosäureresten.
  • Die Begriffe gelten für Aminosäurepolymere, in denen ein oder mehr Aminosäurereste ein künstlicher chemischer Nachahmer einer entsprechenden natürlich vorkommenden Aminosäure ist, sowie für natürlich vorkommende Aminosäurepolymere und nicht natürlich vorkommende Aminosäurepolymere.
  • Der Begriff „Aktivität von NCX-Protein" betrifft den Mechanismus des Entfernens von intrazellulärem Ca2+ aus einer Zelle. Im Herz extrudiert er Ca2+, welches durch Ca2+-Kanäle zum Initiieren von Kontraktion eingetreten ist, während Na+ in die Herzzelle eintritt. Seine Relevanz bei kardiovaskulären Erkrankungen ist z. B. veranschaulicht in Hobai, JA & O'Rourke, B (2004) Expert Opin. Investig. Drugs, 13, 653–664. Daher hat die pharmazeutische Industrie Verbindungen entwickelt, welche den NCX hemmen, wie z. B. beschrieben in Iwamoto, T. et al. (2004) J. Biol. Chem., 279, 7544–7553. Der Na+/Ca2+-Austauscher transportiert elektrogenisch drei bis vier Na+ für jedes Ca2+, welches sich in die entgegengesetzte Richtung bewegt, wie z. B. gezeigt durch elektrophysiologische Mittel in Hinata, M. et al. (2002) J. Physiol. 545, 453–461. Der NCX ist in der Lage, die Zytoplasma-Ca2+-Konzentration ([Ca2+] ein) drei bis vier Größenordnungen unter der extrazellulären Ca2 +-Konzentration ([Ca2 +] aus) aufrechtzuerhalten. Nichtsdestotrotz ist die Richtung des Netto-Ca2 +-Transports abhängig vom elektrochemischen Gradienten des Na+. Simultane und konsekutive Transportmodelle wurden für Na+- und Ca2 +-Translokationen vorgeschlagen, und eine Menge an Belegen spricht für Letztgenannte. Die Aktivität von NCX-Protein wird bestimmt durch die Messung der verstärkten Lumineszenz, welche aus einer geeigneten farbigen Substanz, die mit Calcium einen Komplex bildet, resultiert.
  • Der Begriff „Zellen, welche NCX exprimieren" betrifft Zellen, welche den Austauscher von Interesse endogen exprimieren oder rekombinante Zellen. Der Begriff „rekombinant", wenn er unter Bezugnahme z. B. auf eine Zelle oder Nukleinsäure, ein Protein oder einen Vektor verwendet wird, gibt an, dass die Zelle, Nukleinsäure, das Protein oder der Vektor durch das Einführen einer/s heterologen Nukleinsäure oder Proteins oder die Veränderung einer/s nativen Nukleinsäure oder Proteins modifiziert wurde, oder dass die Zelle abgeleitet ist von einer so modifizierten Zelle. So exprimieren rekombinante Zellen zum Beispiel Gene, welche sich nicht in der nativen (nicht-rekombinanten) Form der Zelle finden, oder sie exprimieren native Gene, welche sonst anomal exprimiert, unterexprimiert oder überhaupt nicht exprimiert werden. In der vorliegenden Erfindung betrifft dies normalerweise Zellen, welche mit Nukleinsäuresequenzen transfiziert wurden, die NCX-Proteine codieren.
  • Das Assay wird einfach durch das Züchten der Zellen in einem geeigneten Behälter mit einem geeigneten Kulturmedium durchgeführt. Die Zelle kann eine natürlich vorkommende Zelle, eine native Zelle, eine etablierte Zelllinie, eine handelsübliche Zelle, eine genetisch modifizierte Zelle usw. sein, solange die Zelle in der Lage ist, während des Assays aufrechterhalten zu werden und in einem Kulturmedium wünschenswert zu wachsen.
  • Zu geeigneten Zellen für das Erzeugen des gegenständlichen Assays zählen Prokaryoten, Hefe oder höhere eukaryotische Zellen, besonders Säugetierzellen. Zu Prokaryoten zählen Gram-negative und Gram-positive Organismen. Die Zellen sind normalerweise Säugetierzellen, wie menschliche Zellen, Mauszellen, Rattenzellen, chinesische Hamsterzellen usw. Zu Zellen, welche sich als geeignet erwiesen haben, zählen CHO-, COS7-, JURKAT-, HeLa-, HEKs-, MDCK- und HEK293-Zellen.
  • Zellen lassen sich mit den bekannten Verfahren herstellen (Current protocols in cell biology, John Wiley & Sons Inc., ISBN: 0471241059) oder können erworben werden (Invitrogen Corp., Sigma-Aldrich Corp., Stratagene).
  • Der Begriff „farbige Substanz" betrifft insbesondere einen Calcium-empfindlichen Fluoreszenzfarbstoff. Der Farbstoffvorläufer ist dadurch gekennzeichnet, dass er unter den Bedingungen des Assays nicht lumineszent ist; jedoch handelt es sich um einen Ester, der in der Lage ist, in die Zellen einzutreten und der intrazellulär zu der lumineszenten Oxyverbindung hydrolysiert, wodurch bei der Komplexbildung mit Calcium verstärkte Lumineszenz bereitgestellt wird. Die Ester werden so ausgewählt, dass sie empfänglich für die Hydrolyse durch intrazelluläre Hydrolasen sind.
  • Der Begriff „in der Lage, in die Zellen einzutreten" steht dafür, dass die Vorläufer in der Lage sind, die zelluläre Membran zu durchqueren und in den Zellen hydrolysiert zu werden; der Farbstoffvorläufer tritt unter spezifischen Bedingungen des pH, der Temperatur usw. in die Zelle ein, tritt mit unterschiedlichen Geschwindigkeiten in die Zelle ein oder tritt unter spezifischen Bedingungen nicht in die Zelle ein.
  • Die farbige Substanz wird mittels der bekannten Protokolle (Current protocols in cell biology, John Wiley & Sons Inc., ISBN: 0471241059) zu den Zellen zugegeben.
  • Die Verwendung einer farbigen Substanz ist konventionell, und es können handelsübliche Reagenzien (Invitrogen Corp.) sowie im Labor synthetisierte Reagenzien verwendet werden.
  • Eine Reihe handelsüblicher Farbstoffe, welche die obigen Anforderungen erfüllen, sind bekannt. Fluoreszenzfarbstoffe für die Überwachung des Ca2+ sind bekannt und in Abschnitt 20.1–20.4 des Katalogs Molecular Probes, 9. Edition detailliert beschrieben. Sie weisen üblicherweise zwei Bis-carboxymethylaminogruppen angehaftet an einem fluoreszenten Nukleus wie Fluorescin, Rhodamin, Coumarin, Aminophenylindol und andere auf. Größtenteils sind die Verbindungen 3,6-Dioxy-substituierte Xanthene, wobei im Vorläufer die Oxygruppen substituiert sind und im lumineszenten Farbstoff sind sie unsubstituiert. Üblicherweise sind Acetoxymethylgruppen vorhanden, welche die Phenole und Säuren schützen. Siehe zum Beispiel Fluo3/4, Fura2/3, Calceingrün usw. Die Hydrolyse der Acetylgruppen resultiert in dem lumineszenten Produkt. Die Vorläufer sind in der Lage, die zelluläre Membran zu durchqueren und in der Zelle hydrolysiert zu werden.
  • Der Begriff „Lumineszenz" betrifft ein „kaltes Licht", Licht aus anderen Energiequellen, was bei normalen und niedrigeren Temperaturen stattfinden kann. Bei der Lumineszenz verdrängt eine Energiequelle ein Elektron eines Atoms von seinem „Grund" (Niedrigstenergie)-Status in einen „angeregten" (Höherenergie) Status; dann gibt das Elektron die Energie in Form von Licht zurück, so dass in seinen „Grund"-Zustand zurückkehren kann. Es gibt mehrere Varietäten von Lumineszenz, jede jeweils danach benannt, was die Energiequelle ist oder was der Auslöser für die Lumineszenz ist.
  • Der Begriff „Fluoreszenz" betrifft eine Lumineszenz, welche sich hauptsächlich als ein optisches Phänomen bei kalten Körpern findet, bei denen die molekulare Absorption eines Photons die Emission eines anderen Photons mit einer längeren Wellenlänge auslöst. Der Energieunterschied zwischen dem absorbierten und emittierten Photon endet als Molekülschwingungen oder Wärme. Üblicherweise liegt das absorbierte Photon im ultravioletten Bereich und das emittierte Licht liegt im sichtbaren Bereich, dies ist jedoch abhängig von der Absorbanzkurve und der Stokes-Verschiebung des bestimmten Fluorophors. Fluoreszenz ist benannt nach dem Mineral Fluorit, zusammengesetzt aus Calciumfluorid, welches häufig dieses Phänomen zeigt.
  • Fluoreszenz von den Indikatorfarbstoffen kann mit einem Luminometer oder einem Fluoreszenz-Imager gemessen werden. Ein bevorzugtes Erkennungsinstrument ist der Fluorometric Imaging Plate Reader (FLIPR) (Molecular Devices, Sunnyvale, Calif.). Der FLIPR ist gut geeignet für das Screening mit hohem Durchsatz unter Verwendung der Verfahren der vorliegenden Erfindung, da er integriertes Flüssigkeitshandling, welches in der Lage ist, gleichzeitig in 96 oder 384 Wells einer Mikrotiterplatte zu pipettieren, und die schnelle kinetische Erkennung unter Verwendung eines Argon-Lasers gekoppelt an eine ladungsgekoppelte Schaltungs-Imagingkamera einschließt.
  • Eine Alternative zur Verwendung von Calciumindikatorfarbstoffen ist die Verwendung des Aequorinsystems. Das Aequorinsystem verwendet das Protein Apoaequorin, welches an den lipophilen Chromophor Coelenterazin bindet, wodurch eine Kombination aus Apoaequorin und Coelenterazin gebildet wird, die als Aequorin bekannt ist. Apoaequorin weist drei Calciumbindungsstellen auf, und bei der Calciumbindung ändert der Apoaequorinanteil des Aequorins seine Konformation. Diese Veränderung in der Konformation veranlasst, dass das Coelenterazin zu Coelenteramid, CO2 und einem Photon von blauem Licht (466 nm) oxidiert. Dieses Photon kann mit geeigneter Instrumentierung erkannt werden.
  • Für eine Revision der Verwendung von Aequorin, siehe Créton et al., 1999, Microscopy Research and Technique 46: 390–397; Brini et al., 1995, J. Biol. Chem. 270: 9896–9903; Knight & Knight, 1995, Meth. Cell. Biol. 49: 201–216. Außerdem von Interesse kann US-Patentschrift Nr. 5,714,666 sein, welches Verfahren der Messung intrazellulären Calciums in Säugetierzellen durch die Zugabe von Coelenterazin-Co-Faktoren zu Säugetierzellen, die Apoaequorin exprimieren, beschreibt.
  • „Hemmer", „Aktivatoren" und „Modulatoren" von NCX-Polynukleotid- und -Polypeptidsequenzen werden verwendet, um auf die aktivierenden, hemmenden oder modulierenden Moleküle Bezug zu nehmen, welche mit Hilfe der zellbasierten Assays von NCX-Polynukleotid- und -Polypeptidsequenzen identifiziert werden.
  • „Hemmer" sind Verbindungen, welche z. B. an NCX-Proteine, z. B. Antagonisten, binden, deren Aktivität teilweise oder komplett blockieren, ihre Aktivierung verringern, verhindern oder verzögern oder deren Aktivität oder Expression deaktivieren, desensibilisieren oder nach unten regulieren.
  • „Aktivatoren" sind Verbindungen, welche die Aktivierung der NCX-Protein aktivität erhöhen, öffnen, aktivieren, vereinfachen oder verstärken und die NCX-Proteinaktivität sensibilisieren, agonisieren oder nach oben regulieren. Ein bevorzugter NCX-Aktivator ist Ionomycin, ein Ionophor, der von Streptomyces conglobatus stammt.
  • Zu Hemmern, Aktivatoren oder Modulatoren zählen auch genetisch modifizierte Versionen von NCX-Proteinen, z. B. Versionen mit veränderter Aktivität sowie natürlich vorkommende und synthetische Liganden, Antagonisten, Agonisten, Peptide, cyclische Peptide, Nukleinsäuren, Antikörper, Antisense-Moleküle, Ribozyme, kleine organische Moleküle und ähnliche.
  • Der Begriff „Verbindung" oder „Testverbindung" oder „Testkandidat" oder grammatische Äquivalente davon beschreibt jedes Molekül, entweder natürlich vorkommend oder synthetisch, z. B. Protein, Oligopeptid, kleines organisches Molekül, Polysaccharid, Lipid, Fettsäure, Polynukleotid, Oligonukleotid usw. zum Testen auf die Kapazität zum Modulieren der NCX-Aktivität (Current protocols in molecular biology, John Wiley & Sons Inc., ISBN: 0471250961). Die Testverbindung kann in Form einer Bibliothek von Testverbindungen vorliegen, wie eine kombinatorische oder randomisierte Bibliothek, welche einen ausreichenden Diversitätsbereich bereitstellt (Current protocols in molecular biology, John Wiley & Sons Inc., ISBN: 0471250937). Testverbindungen sind wahlweise verbunden mit einem Fusionspartner, z. B. Targeting-Verbindungen, Rettungsverbindungen, Dimerisationsverbindungen, Stabilisierungsverbindungen, adressierbare Verbindungen und weitere funktionale Komponenten. Herkömmlich werden neue chemische Einheiten mit nützlichen Eigenschaften durch Identifikation einer Testverbindung (eine „Führungsverbindung" genannt) mit einer wünschenswerten Eigenschaft oder Aktivität erzeugt, z. B. Verstärkung der Aktivität, Erzeugung von Varianten der Führungsverbindung und Auswertung der Eigenschaft und Aktivität dieser Variantenverbindungen. Bevorzugt werden Screening-Verfahren mit hohem Durchsatz (HTS) für solche Analysen eingesetzt.
  • Die Hemmer-, Aktivator- und Testverbindung kann durch Injektion in das Kulturmedium zu den Zellen zugegeben werden, nachdem die Zellen gewachsen sind, oder sie können vor dem Zellwachstum in dem Kulturmedium vorliegen (Current protocols in cell biology, John Wiley & Sons Inc., ISBN: 0471241059).
  • Die Zellen können auf der Hemmer-, Aktivator und/oder Testverbindung auf eine geeignete Zahl gezüchtet werden, oder sie können darauf aufgebracht und ohne weiteres Wachstum verwendet werden. Die Zellen können an die Hemmer-, Aktivator- und/oder Testverbindung angehaftet werden, oder, bei den Ausführungsformen, bei denen die Zellen in Wells positioniert oder gezüchtet werden, können die Zellen Suspensionszellen sein, welche in dem Fluid in den Wells suspendiert sind.
  • Der Begriff „Kontrollexperiment" betrifft unterschiedliche Arten von Experimenten, die zusammen durchgeführt werden sollten. Der Fachmann wird erkennen, dass es im Allgemeinen von Vorteil ist, Kontrollen zusammen mit den hierin beschriebenen Verfahren durchzuführen.
  • Zum Beispiel ist es üblicherweise hilfreich, eine Kontrolle für das Assay für die Bestimmung der Aktivität von NCX-Protein zu haben, bei der die Zellen bevorzugt im Wesentlichen identisch mit den Zellen sind, die in dem Assay verwendet werden, außer dass diese Zellen das NCX-Protein von Interesse nicht exprimieren würden. Außerdem ist es üblicherweise hilfreich, eine Kontrolle für das Assay für die Bestimmung der Aktivität von NCX-Protein als Reaktion auf die Zugabe einer Verbindung zu haben, bei der die Verbindungen in dem Assay der Erfindung gegen Zellen getestet werden, die bevorzugt im Wesentlichen identisch mit den Zellen sind, die in dem Assay verwendet werden, außer dass diese Zellen das NCX-Protein von Interesse nicht exprimieren würden. Auf diese Art und Weise kann bestimmt werden, dass Verbindungen, welche durch das Assay identifiziert werden, ihre Wirkungen wirklich durch das NCX-Protein von Interesse ausüben, anstatt durch einen unerwarteten nichtspezifischen Mechanismus. Eine Möglichkeit für solche Kontrollzellen wäre die Verwendung nicht-rekombinanter Elternzellen, wobei die Zellen des tatsächlichen Experimentes das NCX-Protein von Interesse exprimieren.
  • Weitere Kontrollen für das Assay zum Bestimmen der Aktivität von NCX-Protein als Reaktion auf die Zugabe einer Verbindung wären das Durchführen des Assays ohne die Zugabe der Testverbindung (niedrige Kontrolle) und das Durchführen des Assays mit einer hohen Konzentration der Testverbindung (hohe Kontrolle). Weitere Arten von Kontrollen beinhalten das Hernehmen von Verbindungen, welche durch das Assay der vorliegenden Erfindung als Agonisten oder Antagonisten von NCX-Proteinen von Interesse identifiziert werden und das Testen dieser Verbindungen mit den Verfahren des Standes der Technik zur Bestätigung dessen, dass diese Verbindungen auch Agonisten oder Antagonisten sind, wenn sie mit diesen Verfahren des Standes der Technik getestet werden.
  • Außerdem dürfte ein Fachmann auf dem Gebiet wissen, dass es auch wünschenswert wäre, statistische Analysen durchzuführen, indem Assay Werte mit Standardwerten verglichen werden.
  • Die Begriffe „Agonist" und „Antagonist" betreffen Rezeptor-Effektor-Moleküle, welche die Signaltransduktion über einen Rezeptor modulieren. Rezeptor-Effektor-Moleküle sind in der Lage an den Rezeptor zu binden, jedoch nicht notwendigerweise an der Bindungsstelle des natürlichen Liganden. Rezeptor-Effektoren können die Signaltransduktion modulieren, wenn sie allein verwendet werden, d. h. sie können Ersatzliganden sein, oder sie können die Signaltransduktion in Gegenwart des natürlichen Liganden verändern, entweder zum Verstärkern oder Hemmen der Signalgebung durch den natürlichen Liganden. Zum Beispiel sind „Antagonisten" Moleküle, welche die Signaltransduktionsaktivität des Rezeptors blockieren oder verringern, z. B. können sie konkurrierend, nichtkonkurrierend und/oder allosterisch die Signaltransduktion von dem Rezeptor hemmen, wohingegen „Agonisten" die Signaltransduktionsaktivität eines Rezeptors potenzieren, induzieren oder anderweitig verstärken.
  • Der Begriff „Erkrankung in Zusammenhang mit einer NCX-veränderten Expression" betrifft dilatierte Kardiomyopathie, Koronarherzerkrankung, Arrhythmie, Herzversagen usw.
  • Der Verbraucherfreundlichkeit halber können die farbige Substanz und andere Komponenten des Assays in Sätzen bereitgestellt sein, wobei die farbige Substanz als ein rekonstituierbares Pulver oder als eine gekühlte Lösung auf Eis, in einem Puffer vorliegen kann. Der Satz kann auch den Puffer, Aktivator, Hemmer, die Testverbindung, Zellen, welche NCX-Protein exprimieren, usw. enthalten. Zellen können als lyophilisierte Zellen vorliegen. Der Teilesatz kann als ein diagnostischer Satz für das Diagnostizieren von dilatierter Kardiomyopathie, Koronarherzerkrankung, Arrhythmie, Herzversagen usw. verwendet werden.
  • Die folgenden Figuren und Beispiele beschreiben die Erfindung detaillierter durch die Beschreibung der typischen Resultate des Fluoreszenz-basierten zellulären NCX-Assays, ohne dabei den Schutzumfang einzuschränken.
  • BEISPIELE
  • 1. Assay-Verfahren
  • 1.1 Assay-Reagenzien
  • Die folgenden chemischen Zusammensetzungen werden als Reagenzien für das Assay verwendet:
    Reagenz Chemikalien Bemerkungen
    Assay-Puffer 3,5 mM CaCl2 133,8 mM NaCl 4,7 mM KCl 1,25 mM MgCl2 0,01% Pluronic F-127 10 mM Hepes/NaOH pH 7,5 5 mM Glucose 2,5 mM Probenecid Probenecid wird zugegeben am Tag der Verwendung aus einer frisch hergestellten 1 M Lösung in 1 N NaOH.
    Farbstoffauftragspuffer Assay-Puffer enthaltend 2 μM Fluo-4/AM 0,1% BSA Fluo-4/AM wird zugegeben aus einer 1 mM Stammlösung in DMSO
    Verbindungspuffer Assay-Puffer Verschiedene Verbindungskonzentrationen Verbindungen werden zugegeben aus einer 10 mM Stammlösung in DMSO
    Ionophor-Lösung Assay-Puffer enthaltend 0,3% BSA 6 μM Ionomycin Ionomycin wird zugegeben aus einer 10 mM Stammlösung in DMSO
    Positive Kontrollpuffer Niedrig) Ionophor-Lösung A000135933 wird zugegeben aus einer 10 mM Stammlösung in DMSO
    Hoch) Assay-Puffer 15–45 μM A0001135933
  • 1.2 Assay-Verfahren
    • 1] 20 bis 24 Stunden vor dem Experiment werden Zellen in Wachstumsmedium suspendiert (Nutrient Mixture F12 (HAM) Invitrogen, Karlsruhe, 5% FCS, Biochrom, Berlin), ohne Antibiotika, und in schwarzen 96-Well-Klarbodenplatten (25.000 Zellen/Well in 100 μl) kultiviert.
    • 2] Das Medium wird entsorgt und anschließend werden 100 μl Farbstoffauftragspuffer zugegeben, und die Platten werden im Dunkeln für 75 Min. bei RT inkubiert.
    • 3] Der Farbstoffauftragspuffer wird durch dreimaliges Waschen mit 100 μl Assay-Puffer entfernt. Der Puffer wird entsorgt.
    • 4] 80 μl aus den Verbindungsplatten werden zugegeben und die Platten für 30 Min. bei 16°C aufbewahrt.
    • 5] Die Platten werden in den FLIPR übertragen und unter Verwendung des folgenden Protokolls (einschließlich 40 μl Zugabe aus der Ionophor-Platte) untersucht:
  • 1.1 FLIPR-Experiment-Setup-Parameter
    Aussetzung 0,5 Sek. (bei 1,2 W)
    F-Stopp F/2
    Filter 1
    1.1.1 Diagramm-Setup
    Subtrahieren der Vorspannung basierend auf der Probe: aus
    Räumliche Uniformitätskorrektur: aus
    Negative Kontrollkorrektur: aus
    1.1.2 Erste Sequenz
    Anfangszeitraum 2 Sek.
    Anfangszählung 100 Frames
    Zugabe nach Frame 5
    Zugabehöhe 70 μl
    Zugabegeschwindigkeit 40 μl/Sek.
    Zugabevolumen 40 μl
    Mischung 1 × 40 μl
    Statistik
    Statistik 1 Summe 25–45 (Vorspannung aus)
  • 1.3 Datenanalyse
  • Inhibitorische Aktivität der Testverbindungen in NCX-Zellen:
  • Berechnung der Hemmung:
  • Die Berechnungen basieren auf dem Statistikexport. Rohdaten werden für die Hemmung gemäß folgender Gleichung umgewandelt:
    Figure 00170001
  • Das Mittel der hohen Kontrolle ist abgeleitet aus der durchschnittlichen Differenz von acht gepaarten Proben von 10 oder 30 μM A000135933 mit Ionomycin. Das Mittel der unteren Kontrolle ist abgeleitet aus den Ionomycin-Kontrollen. Verbindungen, welche die basale Fluoreszenz mehr als 1,3fach erhöhen, werden entsorgt.
  • 2. Assay-Beispiele
  • 2.1 Reaktion der hohen und niedrigen Kontrollen
  • Die typische Fluoreszenzreaktion der hohen und niedrigen Kontrollen nach Zugabe von 2 μM Ionomycin ist in 2 gezeigt und ist Folgende: Wenn der NCX1 aktiv ist (niedrige Kontrolle), wird Calcium, welches nach der Ionomycin-Zugabe in die Zelle eintritt, aus der Zelle heraustransportiert. Nach ein paar Sekunden ist die Anfangscalciumbeladung der Zellen wiederhergestellt. Die Hemmung von NCX1 führt zu einer Fluoreszenzerhöhung nach der Ionomycin-Zugabe aufgrund einer Erhöhung des cytosolischen Calciums (hohe Kontrolle, 30 μM A000135933).
  • 2.2 Werkzeugsubstanz: A000135933
  • Der neue NCX1-Hemmer A000135933 fand sich im ersten HTS-Screen. 3, 4 und 5 zeigen eine typische dosisabhängige Reaktion auf unterschiedliche Konzentrationen von A000135933. A000135933 war ein guter NCX1-Hemmer mit einem mittleren IC50 von 5,9 μM und seit dieser Zeit wird er als eine Werkzeugsubstanz bei den Assays verwendet. Ein IC50 dieser Verbindung wird auf jeder Platte als Kontrolle zugegeben. Das S/B-Verhältnis und der z'-Wert für dieses Beispiel waren sehr gut. Zusammen mit dem IC50 von A000135933 wurden diese Parameter verwendet, um eine gute Assay-Leistung für jede Platte anzuzeigen:
    • 1. S/B größer als zwei.
    • 2. z'-Wert zwischen 0,5 und 0,7.
    • 3. IC50 der Werkzeugverbindung A000135933 muss um das Mittel von 5,9 μM liegen.
  • 2.3 Werkzeugsubstanz: Assay-Beispiel
  • Ein Assay wurde mit vier Verbindungen in doppelter Ausführung durchgeführt (6). Die vier Verbindungen sind aus der gleichen Verbindungsklasse. Eine Verbindung war ein guter NCX1-Hemmer (A000135933), zwei Verbindungen zeigen moderate Hemmung (A000136648, A000104243) und eine war nicht aktiv im Konzentrationsbereich (A000103746). Dieses Beispiel zeigt, dass das Assay geeignet ist, NCX1-Hemmer zu screenen und Strukturaktivitätsbeziehungen zu etablieren.
  • 2.4 Korrelation mit Elektrophysiologie
  • Der Vergleich der Daten abgeleitet aus dem Fluoreszenz-basierten Assay mit einem direkten Elektrophysiologieverfahren (longate's SURFE2R-Technologie) ist die beste Möglichkeit zum Einschätzen der Leistung dieses Assays. Die Korrelation dieser beiden sehr unterschiedlichen Techniken ist recht gut (7).
  • Die mit SURFE2R gemessene Hemmung war höher (im Mittel 14%), außer bei einer Verbindung, als die Hemmung abgeleitet aus dem indirekten FLIPR-Assay.
  • BESCHREIBUNG DER FIGUREN
  • 1: 1a zeigt die Polynukleotidsequenz von NCX1 dargestellt durch SEQ. ID. NR. 1. 1b zeigt die Polynukleotidsequenz von NCX2 dargestellt durch SEQ. ID. NR. 2. 1c zeigt die Polynukleotidsequenz von NCX3 dargestellt durch SEQ. ID. NR. 3.
  • 2: Fluoreszenzsignal der CHO-NCX1-Zellen nach Ionomycin-Zugabe. Hemmung von NCX1 (hohe Kontrolle, 30 μM A000135933, rot) führt zu einer Fluoreszenzerhöhung aufgrund einer Erhöhung des cytosolischen Calciums. Aktives NCX1 stellt die Anfangscalciumbeladung nach wenigen Sekunden wieder her (niedrige Kontrolle, schwarz).
  • 3: Rohdaten: Die Kinetik der Fluoreszenz ändert sich nach Ionomycin-Zugabe für unterschiedliche Konzentrationen von A000135933. Die Summe der Fluoreszenzwerte von 50 bis 90 Sek. wurde verwendet, um die prozentualen Fluoreszenzänderungen im Vergleich zu den Kontrollen zu berechnen. Die Ergebnisse sind in 4 gezeigt.
  • 4: Assay-Statistik für eine 96-Well-Platte mit hohen und niedrigen Kontrollen und unterschiedlichen Konzentrationen von A000135933. Das berechnete Signal-zu-Hintergrund-Verhältnis (S/B), z' und die Erhöhung der Fluoreszenz zwischen 50 und 90 Sekunden verschiedener Konzentrationen von A000135933 sind aufgelistet (siehe auch 2). Bei diesem Beispiel betrug der berechnete IC50 von A000135933 7,16 μM (mittlerer IC50: 5,9 μM).
  • 5: Veranschaulichung der prozentualen Fluoreszenzerhöhung im Vergleich zur Verbindungskonzentration von A000135933 und die entsprechende Passkurve. Bei diesem Beispiel betrug der berechnete IC50 von A000135933 7,16 μM (mittlerer IC50: 5,9 μM).
  • 6: zeigt den Rohdatenausdruck aus dem FLIPR.
  • 7: Korrelation zwischen dem NCX1-Fluoreszenz-basierten FLIPR-Assay mit der Elektrophysiologie-basierten SURFE2R-Technologie einer Verbindungsklasse. Die Hemmung von NCX1 wurde in beiden Fällen mit 10 μM gemessen.
  • Anwendungsprojekt
    Figure 00200001
  • Figure 00210001
  • ZITATE ENTHALTEN IN DER BESCHREIBUNG
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Claims (27)

  1. Assay zum Bestimmen der Aktivität von NCX-Protein, welches Folgendes umfasst: e) das Bereitstellen von Zellen, welche NCX exprimieren; f) das Bereitstellen einer farbigen Substanz zum Bestimmen des intrazellulären Calciums; g) das in Kontakt bringen von Zellen mit einem NCX-Aktivitätsaktivator; und h) das Vergleichen der durch Calcium vermittelten Veränderung in dem Lumineszenzsignal von der farbigen Substanz mit einem Lumineszenzsignal erzeugt bei einem Kontrollexperiment.
  2. Assay nach Anspruch 1, wobei das NCX-Protein ein NCX-Protein aus folgender Liste ist: NCX1, NCX2, NCX3.
  3. Assay nach Anspruch 1, wobei das NCX-Protein von einem Säugetier stammt, bevorzugt von Ratte, Maus, Hund, Rind, Schwein, Affe oder Mensch.
  4. Assay nach Anspruch 1, wobei die Zellen ausgewählt sind aus der Gruppe bestehend aus: CHO-, HEK-, COS7- und JURKAT-Zellen.
  5. Assay nach Anspruch 1, wobei die farbige Substanz als ein Farbstoffvorläufer zu den Zellen zugegeben wird, der in der Lage ist, in die Zellen einzutreten und zu einem Farbstoff hydrolysiert zu werden, wodurch der Farbstoff in den Zellen einen Komplex mit Calcium bildet und ein Lumineszenzsignal bereitstellt.
  6. Assay nach Anspruch 1 und 5, wobei das Lumineszenzsignal Fluoreszenz ist und der Überwachungsschritt c) ein FLIPR-Gerät verwendet.
  7. Assay nach Anspruch 5, wobei der Farbstoffvorläufe ein Acetoxymethylester-Derivat ist.
  8. Assay nach Anspruch 5, wobei der Farbstoff der Calcium-empfindliche Fluoreszenzfarbstoff Fluo-4 ist.
  9. Assay nach Anspruch 1 bis 8, wobei der NCX-Aktivitätsaktivator Ionomycin ist.
  10. Verwendung des Assays nach Anspruch 1 bis 9 zum Testen einer Verbindung auf die Aktivität als ein Agonist oder Antagonist des NCX.
  11. Verwendung des Assays nach Anspruch 1 bis 9 für die Diagnose einer Erkrankung in Zusammenhang mit einer NCX-veränderten Expression.
  12. Assay zum Bestimmen der Aktivität von NCX-Protein als Reaktion auf die Zugabe einer Verbindung, welches Folgendes umfasst: a) das Bereitstellen von Zellen, welche NCX exprimieren; b) das Bereitstellen einer farbigen Substanz zum Bestimmen des intrazellulären Calciums; c) das in Kontakt bringen von Zellen mit einer Verbindung, wobei die Zellen vor der Behandlung mit der Verbindung mit einem NCX-Aktivitätsaktivator behandelt wurden; und d) das Vergleichen der durch Calcium vermittelten Veränderung in dem Lumineszenzsignal von der farbigen Substanz mit einem Lumineszenzsignal erzeugt bei einem Kontrollexperiment.
  13. Assay nach Anspruch 12, wobei das NCX-Protein ein NCX-Protein aus folgender Liste ist: NCX1, NCX2, NCX3.
  14. Assay nach Anspruch 12, wobei das NCX-Protein von einem Säugetier stammt, bevorzugt von Ratte, Maus, Hund, Rind, Schwein, Affe oder Mensch.
  15. Assay nach Anspruch 12, wobei die Zellen ausgewählt sind aus der Gruppe bestehend aus: CHO-, HEK-, COS7- und JURKAT-Zellen.
  16. Assay nach Anspruch 12, wobei die farbige Substanz als ein Farbstoffvorläufer zu den Zellen zugegeben wird, der in der Lage ist, in die Zellen einzutreten und zu einem Farbstoff hydrolysiert zu werden, wodurch der Farbstoff in den Zellen einen Komplex mit Calcium bildet und ein Lumineszenzsignal bereitstellt.
  17. Assay nach Anspruch 12 und 16, wobei das Lumineszenzsignal Fluoreszenz ist und der Überwachungsschritt c) ein FLIPR-Gerät verwendet.
  18. Assay nach Anspruch 16, wobei der Farbstoffvorläufer ein Acetoxymethylester-Derivat ist.
  19. Assay nach Anspruch 16, wobei der Farbstoff der Calcium-empfindliche Fluoreszenzfarbstoff Fluo-4 ist.
  20. Assay nach Anspruch 12 bis 19, wobei die Verbindung ein NCX-Antagonist ist.
  21. Assay nach Anspruch 12 bis 19, wobei der NCX-Aktivator Ionomycin ist.
  22. Teilesatz, welcher Folgendes umfasst: a) lyophilisierte Zellen, welche NCX-Protein exprimieren; b) eine farbige Substanz; c) einen Verbindungspuffer; und d) einen farbigen Substanzpuffer.
  23. Teilesatz nach Anspruch 22, wobei die farbige Substanz der Calcium-empfindliche Fluoreszenzfarbstoff Fluo-4 ist.
  24. Teilesatz nach Anspruch 22 und 23, wobei das NCX-Protein ein NCX-Protein aus folgender Liste ist: NCX1, NCX2, NCX3.
  25. Teilesatz nach Anspruch 22 und 23, wobei das NCX-Protein von einem Säugetier stammt, bevorzugt von Ratte, Maus, Hund, Rind, Schwein, Affe oder Mensch.
  26. Verwendung eines Teilesatzes nach Anspruch 22 bis 25 zum Testen einer Verbindung auf die Aktivität als ein Agonist oder Antagonist von NCX.
  27. Verwendung eines Teilesatzes nach Anspruch 22 bis 25 für die Diagnose einer Erkrankung in Zusammenhang mit einer NCX-veränderten Expression.
DE102007011913A 2007-03-13 2007-03-13 Fluoreszenz-basiertes Assay zum Erkennen von Verbindungen zum Modulieren des Natrium-Calcium-Austauschers (NCX) im "Vorwärtsmodus" Withdrawn DE102007011913A1 (de)

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