CZ2003480A3 - Sloučeniny a způsoby léčení a diagnózy chlamydiální infekce - Google Patents
Sloučeniny a způsoby léčení a diagnózy chlamydiální infekce Download PDFInfo
- Publication number
- CZ2003480A3 CZ2003480A3 CZ2003480A CZ2003480A CZ2003480A3 CZ 2003480 A3 CZ2003480 A3 CZ 2003480A3 CZ 2003480 A CZ2003480 A CZ 2003480A CZ 2003480 A CZ2003480 A CZ 2003480A CZ 2003480 A3 CZ2003480 A3 CZ 2003480A3
- Authority
- CZ
- Czechia
- Prior art keywords
- seq
- trachomatis
- sequence
- amino acid
- polypeptide
- Prior art date
Links
- 206010061041 Chlamydial infection Diseases 0.000 title claims abstract description 43
- 201000000902 chlamydia Diseases 0.000 title claims abstract description 34
- 208000012538 chlamydia trachomatis infectious disease Diseases 0.000 title claims abstract description 34
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 title claims abstract description 21
- 238000011282 treatment Methods 0.000 title abstract description 10
- 238000002405 diagnostic procedure Methods 0.000 title description 5
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 claims abstract description 409
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 claims abstract description 288
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 claims abstract description 254
- 239000000427 antigen Substances 0.000 claims abstract description 153
- 108091007433 antigens Proteins 0.000 claims abstract description 153
- 102000036639 antigens Human genes 0.000 claims abstract description 153
- 238000000034 method Methods 0.000 claims abstract description 130
- 241000606161 Chlamydia Species 0.000 claims abstract description 53
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 claims abstract description 28
- 238000001514 detection method Methods 0.000 claims abstract description 23
- 239000012472 biological sample Substances 0.000 claims abstract description 21
- 238000009007 Diagnostic Kit Methods 0.000 claims abstract description 6
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims description 343
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 claims description 316
- 210000001744 T-lymphocyte Anatomy 0.000 claims description 166
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 claims description 145
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 claims description 129
- 102000040430 polynucleotide Human genes 0.000 claims description 110
- 108091033319 polynucleotide Proteins 0.000 claims description 110
- 239000002157 polynucleotide Substances 0.000 claims description 110
- 241000498849 Chlamydiales Species 0.000 claims description 83
- 239000013598 vector Substances 0.000 claims description 74
- 102000037865 fusion proteins Human genes 0.000 claims description 71
- 108020001507 fusion proteins Proteins 0.000 claims description 71
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 claims description 62
- 239000000203 mixture Substances 0.000 claims description 50
- 101150077194 CAP1 gene Proteins 0.000 claims description 47
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 claims description 46
- 230000002163 immunogen Effects 0.000 claims description 46
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 claims description 45
- 239000000523 sample Substances 0.000 claims description 44
- 239000012634 fragment Substances 0.000 claims description 43
- 239000013604 expression vector Substances 0.000 claims description 42
- 101100245221 Mus musculus Prss8 gene Proteins 0.000 claims description 34
- 210000000612 antigen-presenting cell Anatomy 0.000 claims description 30
- 230000027455 binding Effects 0.000 claims description 28
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 claims description 26
- 230000028993 immune response Effects 0.000 claims description 26
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 claims description 18
- 239000011230 binding agent Substances 0.000 claims description 18
- 230000004936 stimulating effect Effects 0.000 claims description 16
- 125000006853 reporter group Chemical group 0.000 claims description 15
- 239000000969 carrier Substances 0.000 claims description 13
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 claims description 13
- 230000003308 immunostimulating effect Effects 0.000 claims description 12
- 230000000638 stimulation Effects 0.000 claims description 11
- 230000005867 T cell response Effects 0.000 claims description 10
- 230000003612 virological effect Effects 0.000 claims description 10
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 claims description 9
- 241000700618 Vaccinia virus Species 0.000 claims description 6
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 claims description 5
- 230000002401 inhibitory effect Effects 0.000 claims description 5
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 abstract description 332
- 229960005486 vaccine Drugs 0.000 abstract description 54
- 239000008194 pharmaceutical composition Substances 0.000 abstract description 21
- 230000000890 antigenic effect Effects 0.000 abstract description 4
- 238000003745 diagnosis Methods 0.000 abstract description 4
- 241000606153 Chlamydia trachomatis Species 0.000 description 561
- 241001647372 Chlamydia pneumoniae Species 0.000 description 196
- 229940038705 chlamydia trachomatis Drugs 0.000 description 142
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 description 135
- 239000013615 primer Substances 0.000 description 102
- 108700026244 Open Reading Frames Proteins 0.000 description 99
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 58
- 210000004443 dendritic cell Anatomy 0.000 description 44
- 238000010367 cloning Methods 0.000 description 43
- 235000001014 amino acid Nutrition 0.000 description 42
- 238000003556 assay Methods 0.000 description 41
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 description 40
- 229940024606 amino acid Drugs 0.000 description 39
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 description 34
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 description 34
- 102100035954 Choline transporter-like protein 2 Human genes 0.000 description 31
- 101000948115 Homo sapiens Choline transporter-like protein 2 Proteins 0.000 description 31
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 31
- 238000003752 polymerase chain reaction Methods 0.000 description 31
- 230000004044 response Effects 0.000 description 31
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 31
- 108010074328 Interferon-gamma Proteins 0.000 description 29
- 239000002671 adjuvant Substances 0.000 description 27
- 101150106828 pmpD gene Proteins 0.000 description 26
- 102100037850 Interferon gamma Human genes 0.000 description 25
- 210000002966 serum Anatomy 0.000 description 25
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 description 23
- 230000004927 fusion Effects 0.000 description 23
- 125000005647 linker group Chemical group 0.000 description 23
- 241000699670 Mus sp. Species 0.000 description 22
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 22
- 241000282414 Homo sapiens Species 0.000 description 21
- 101000956368 Trittame loki CRISP/Allergen/PR-1 Proteins 0.000 description 21
- 230000000692 anti-sense effect Effects 0.000 description 21
- 230000036961 partial effect Effects 0.000 description 21
- 239000002299 complementary DNA Substances 0.000 description 20
- LOKCTEFSRHRXRJ-UHFFFAOYSA-I dipotassium trisodium dihydrogen phosphate hydrogen phosphate dichloride Chemical compound P(=O)(O)(O)[O-].[K+].P(=O)(O)([O-])[O-].[Na+].[Na+].[Cl-].[K+].[Cl-].[Na+] LOKCTEFSRHRXRJ-UHFFFAOYSA-I 0.000 description 20
- 239000002953 phosphate buffered saline Substances 0.000 description 20
- 101150050161 pmpC gene Proteins 0.000 description 20
- 210000003819 peripheral blood mononuclear cell Anatomy 0.000 description 19
- 238000002965 ELISA Methods 0.000 description 18
- 230000009696 proliferative response Effects 0.000 description 18
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 17
- 108010076504 Protein Sorting Signals Proteins 0.000 description 16
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 description 16
- 210000004379 membrane Anatomy 0.000 description 16
- 210000001616 monocyte Anatomy 0.000 description 16
- 230000035755 proliferation Effects 0.000 description 16
- 239000007787 solid Substances 0.000 description 16
- 241000700605 Viruses Species 0.000 description 14
- 230000003053 immunization Effects 0.000 description 14
- 238000001727 in vivo Methods 0.000 description 14
- 239000002609 medium Substances 0.000 description 14
- 101150059608 pmpE gene Proteins 0.000 description 14
- 102000004127 Cytokines Human genes 0.000 description 13
- 108090000695 Cytokines Proteins 0.000 description 13
- 206010035664 Pneumonia Diseases 0.000 description 13
- 102100034922 T-cell surface glycoprotein CD8 alpha chain Human genes 0.000 description 13
- 239000012636 effector Substances 0.000 description 13
- 238000002649 immunization Methods 0.000 description 13
- 230000006698 induction Effects 0.000 description 13
- 125000002924 primary amino group Chemical group [H]N([H])* 0.000 description 13
- IQFYYKKMVGJFEH-XLPZGREQSA-N Thymidine Chemical compound O=C1NC(=O)C(C)=CN1[C@@H]1O[C@H](CO)[C@@H](O)C1 IQFYYKKMVGJFEH-XLPZGREQSA-N 0.000 description 12
- JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N [3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-hydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl [5-(6-aminopurin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] hydrogen phosphate Polymers Cc1cn(C2CC(OP(O)(=O)OCC3OC(CC3OP(O)(=O)OCC3OC(CC3O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)C(COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3CO)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)O2)c(=O)[nH]c1=O JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 12
- 230000003321 amplification Effects 0.000 description 12
- 230000001900 immune effect Effects 0.000 description 12
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 description 12
- 230000001681 protective effect Effects 0.000 description 12
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 12
- 238000007792 addition Methods 0.000 description 11
- 238000011534 incubation Methods 0.000 description 11
- 230000001177 retroviral effect Effects 0.000 description 11
- COLNVLDHVKWLRT-QMMMGPOBSA-N L-phenylalanine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 COLNVLDHVKWLRT-QMMMGPOBSA-N 0.000 description 10
- 241000283973 Oryctolagus cuniculus Species 0.000 description 10
- COYHRQWNJDJCNA-NUJDXYNKSA-N Thr-Thr-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O COYHRQWNJDJCNA-NUJDXYNKSA-N 0.000 description 10
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 description 10
- 230000009089 cytolysis Effects 0.000 description 10
- 238000012217 deletion Methods 0.000 description 10
- 230000037430 deletion Effects 0.000 description 10
- 239000003814 drug Substances 0.000 description 10
- 238000009169 immunotherapy Methods 0.000 description 10
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 description 10
- -1 rRNA Proteins 0.000 description 10
- 230000009257 reactivity Effects 0.000 description 10
- 210000004989 spleen cell Anatomy 0.000 description 10
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 description 10
- 102000053602 DNA Human genes 0.000 description 9
- 101100462201 Mus musculus Opn4 gene Proteins 0.000 description 9
- 108010008281 Recombinant Fusion Proteins Proteins 0.000 description 9
- 102000007056 Recombinant Fusion Proteins Human genes 0.000 description 9
- 108091081024 Start codon Proteins 0.000 description 9
- 125000000539 amino acid group Chemical group 0.000 description 9
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 9
- 230000005847 immunogenicity Effects 0.000 description 9
- 238000013507 mapping Methods 0.000 description 9
- 101150067195 pmpB gene Proteins 0.000 description 9
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 9
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 9
- 230000002441 reversible effect Effects 0.000 description 9
- 238000012216 screening Methods 0.000 description 9
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 9
- MTCFGRXMJLQNBG-REOHCLBHSA-N (2S)-2-Amino-3-hydroxypropansäure Chemical compound OC[C@H](N)C(O)=O MTCFGRXMJLQNBG-REOHCLBHSA-N 0.000 description 8
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 description 8
- 239000003155 DNA primer Substances 0.000 description 8
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 description 8
- 239000008280 blood Substances 0.000 description 8
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 8
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 8
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 description 8
- 239000004005 microsphere Substances 0.000 description 8
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 description 8
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 description 8
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 description 8
- 239000000047 product Substances 0.000 description 8
- 238000010561 standard procedure Methods 0.000 description 8
- 229940104230 thymidine Drugs 0.000 description 8
- WQZGKKKJIJFFOK-QTVWNMPRSA-N D-mannopyranose Chemical compound OC[C@H]1OC(O)[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-QTVWNMPRSA-N 0.000 description 7
- 108010028127 Dihydrolipoamide Dehydrogenase Proteins 0.000 description 7
- XUJNEKJLAYXESH-REOHCLBHSA-N L-Cysteine Chemical compound SC[C@H](N)C(O)=O XUJNEKJLAYXESH-REOHCLBHSA-N 0.000 description 7
- AYFVYJQAPQTCCC-GBXIJSLDSA-N L-threonine Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(O)=O AYFVYJQAPQTCCC-GBXIJSLDSA-N 0.000 description 7
- 102000002278 Ribosomal Proteins Human genes 0.000 description 7
- 108010000605 Ribosomal Proteins Proteins 0.000 description 7
- 230000006052 T cell proliferation Effects 0.000 description 7
- 102100036011 T-cell surface glycoprotein CD4 Human genes 0.000 description 7
- 238000001042 affinity chromatography Methods 0.000 description 7
- 230000001358 anti-chlamydial effect Effects 0.000 description 7
- 210000004899 c-terminal region Anatomy 0.000 description 7
- 239000011651 chromium Substances 0.000 description 7
- 238000003780 insertion Methods 0.000 description 7
- 230000037431 insertion Effects 0.000 description 7
- 101150053615 pmpG gene Proteins 0.000 description 7
- DWRXFEITVBNRMK-UHFFFAOYSA-N Beta-D-1-Arabinofuranosylthymine Natural products O=C1NC(=O)C(C)=CN1C1C(O)C(O)C(CO)O1 DWRXFEITVBNRMK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 102000004163 DNA-directed RNA polymerases Human genes 0.000 description 6
- 108090000626 DNA-directed RNA polymerases Proteins 0.000 description 6
- DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N Glycine Chemical compound NCC(O)=O DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 241000699666 Mus <mouse, genus> Species 0.000 description 6
- DTQVDTLACAAQTR-UHFFFAOYSA-N Trifluoroacetic acid Chemical compound OC(=O)C(F)(F)F DTQVDTLACAAQTR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 239000011324 bead Substances 0.000 description 6
- 230000008901 benefit Effects 0.000 description 6
- IQFYYKKMVGJFEH-UHFFFAOYSA-N beta-L-thymidine Natural products O=C1NC(=O)C(C)=CN1C1OC(CO)C(O)C1 IQFYYKKMVGJFEH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 125000003178 carboxy group Chemical group [H]OC(*)=O 0.000 description 6
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 6
- 230000036039 immunity Effects 0.000 description 6
- 239000002502 liposome Substances 0.000 description 6
- 210000004698 lymphocyte Anatomy 0.000 description 6
- 210000004962 mammalian cell Anatomy 0.000 description 6
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 6
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 6
- 239000013642 negative control Substances 0.000 description 6
- 230000008569 process Effects 0.000 description 6
- 230000001225 therapeutic effect Effects 0.000 description 6
- BYXHQQCXAJARLQ-ZLUOBGJFSA-N Ala-Ala-Ala Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O BYXHQQCXAJARLQ-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 5
- RLMISHABBKUNFO-WHFBIAKZSA-N Ala-Ala-Gly Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)NCC(O)=O RLMISHABBKUNFO-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 5
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 description 5
- 101100438368 Caenorhabditis elegans cap-1 gene Proteins 0.000 description 5
- 101100494773 Caenorhabditis elegans ctl-2 gene Proteins 0.000 description 5
- 108091026890 Coding region Proteins 0.000 description 5
- 108020004705 Codon Proteins 0.000 description 5
- 238000012286 ELISA Assay Methods 0.000 description 5
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 5
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 5
- 241000713673 Human foamy virus Species 0.000 description 5
- 238000012408 PCR amplification Methods 0.000 description 5
- 108090000792 Ribosomal protein L1 Proteins 0.000 description 5
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 5
- 239000012228 culture supernatant Substances 0.000 description 5
- 238000010790 dilution Methods 0.000 description 5
- 239000012895 dilution Substances 0.000 description 5
- 229940079593 drug Drugs 0.000 description 5
- 229940088598 enzyme Drugs 0.000 description 5
- 238000003114 enzyme-linked immunosorbent spot assay Methods 0.000 description 5
- 230000012010 growth Effects 0.000 description 5
- 238000003018 immunoassay Methods 0.000 description 5
- 229940127121 immunoconjugate Drugs 0.000 description 5
- 230000002458 infectious effect Effects 0.000 description 5
- BPHPUYQFMNQIOC-NXRLNHOXSA-N isopropyl beta-D-thiogalactopyranoside Chemical compound CC(C)S[C@@H]1O[C@H](CO)[C@H](O)[C@H](O)[C@H]1O BPHPUYQFMNQIOC-NXRLNHOXSA-N 0.000 description 5
- 210000002540 macrophage Anatomy 0.000 description 5
- 239000011159 matrix material Substances 0.000 description 5
- 108020004999 messenger RNA Proteins 0.000 description 5
- 230000010076 replication Effects 0.000 description 5
- 210000003705 ribosome Anatomy 0.000 description 5
- 210000004988 splenocyte Anatomy 0.000 description 5
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 5
- 229940124597 therapeutic agent Drugs 0.000 description 5
- 238000013518 transcription Methods 0.000 description 5
- 230000035897 transcription Effects 0.000 description 5
- 238000001890 transfection Methods 0.000 description 5
- 238000012546 transfer Methods 0.000 description 5
- 238000013519 translation Methods 0.000 description 5
- 241000701161 unidentified adenovirus Species 0.000 description 5
- 239000003981 vehicle Substances 0.000 description 5
- YBJHBAHKTGYVGT-ZKWXMUAHSA-N (+)-Biotin Chemical compound N1C(=O)N[C@@H]2[C@H](CCCCC(=O)O)SC[C@@H]21 YBJHBAHKTGYVGT-ZKWXMUAHSA-N 0.000 description 4
- 241000023308 Acca Species 0.000 description 4
- 108700028369 Alleles Proteins 0.000 description 4
- 238000011735 C3H mouse Methods 0.000 description 4
- 102000028526 Dihydrolipoamide Dehydrogenase Human genes 0.000 description 4
- WHUUTDBJXJRKMK-UHFFFAOYSA-N Glutamic acid Natural products OC(=O)C(N)CCC(O)=O WHUUTDBJXJRKMK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 102100034349 Integrase Human genes 0.000 description 4
- 102000008070 Interferon-gamma Human genes 0.000 description 4
- 108010002350 Interleukin-2 Proteins 0.000 description 4
- 102000000588 Interleukin-2 Human genes 0.000 description 4
- QNAYBMKLOCPYGJ-REOHCLBHSA-N L-alanine Chemical compound C[C@H](N)C(O)=O QNAYBMKLOCPYGJ-REOHCLBHSA-N 0.000 description 4
- CKLJMWTZIZZHCS-REOHCLBHSA-N L-aspartic acid Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O CKLJMWTZIZZHCS-REOHCLBHSA-N 0.000 description 4
- WHUUTDBJXJRKMK-VKHMYHEASA-N L-glutamic acid Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O WHUUTDBJXJRKMK-VKHMYHEASA-N 0.000 description 4
- 108010052285 Membrane Proteins Proteins 0.000 description 4
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 description 4
- 208000029082 Pelvic Inflammatory Disease Diseases 0.000 description 4
- 229920001213 Polysorbate 20 Polymers 0.000 description 4
- 239000004365 Protease Substances 0.000 description 4
- 108010092799 RNA-directed DNA polymerase Proteins 0.000 description 4
- 108020004511 Recombinant DNA Proteins 0.000 description 4
- 206010057190 Respiratory tract infections Diseases 0.000 description 4
- 102000004191 Ribosomal protein L1 Human genes 0.000 description 4
- MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N Serine Natural products OCC(N)C(O)=O MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- QAOWNCQODCNURD-UHFFFAOYSA-N Sulfuric acid Chemical compound OS(O)(=O)=O QAOWNCQODCNURD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 230000024932 T cell mediated immunity Effects 0.000 description 4
- 101710183681 Uncharacterized protein 7 Proteins 0.000 description 4
- 239000002253 acid Substances 0.000 description 4
- 229960003767 alanine Drugs 0.000 description 4
- 235000004279 alanine Nutrition 0.000 description 4
- 210000003719 b-lymphocyte Anatomy 0.000 description 4
- 238000004113 cell culture Methods 0.000 description 4
- 238000003776 cleavage reaction Methods 0.000 description 4
- 235000018417 cysteine Nutrition 0.000 description 4
- XUJNEKJLAYXESH-UHFFFAOYSA-N cysteine Natural products SCC(N)C(O)=O XUJNEKJLAYXESH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 4
- 239000003623 enhancer Substances 0.000 description 4
- 101150008469 flhA gene Proteins 0.000 description 4
- 239000001963 growth medium Substances 0.000 description 4
- 238000011065 in-situ storage Methods 0.000 description 4
- 101150077178 infC gene Proteins 0.000 description 4
- 229960003130 interferon gamma Drugs 0.000 description 4
- 238000002955 isolation Methods 0.000 description 4
- HQKMJHAJHXVSDF-UHFFFAOYSA-L magnesium stearate Chemical compound [Mg+2].CCCCCCCCCCCCCCCCCC([O-])=O.CCCCCCCCCCCCCCCCCC([O-])=O HQKMJHAJHXVSDF-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 4
- 229940035032 monophosphoryl lipid a Drugs 0.000 description 4
- 101150067482 msbA gene Proteins 0.000 description 4
- 239000002751 oligonucleotide probe Substances 0.000 description 4
- 210000005259 peripheral blood Anatomy 0.000 description 4
- 239000011886 peripheral blood Substances 0.000 description 4
- 239000000256 polyoxyethylene sorbitan monolaurate Substances 0.000 description 4
- 235000010486 polyoxyethylene sorbitan monolaurate Nutrition 0.000 description 4
- 239000002987 primer (paints) Substances 0.000 description 4
- 230000002062 proliferating effect Effects 0.000 description 4
- 108091008146 restriction endonucleases Proteins 0.000 description 4
- 238000012552 review Methods 0.000 description 4
- 230000007017 scission Effects 0.000 description 4
- 235000020183 skimmed milk Nutrition 0.000 description 4
- 239000006228 supernatant Substances 0.000 description 4
- 238000013268 sustained release Methods 0.000 description 4
- 239000012730 sustained-release form Substances 0.000 description 4
- 238000002560 therapeutic procedure Methods 0.000 description 4
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 4
- 208000000143 urethritis Diseases 0.000 description 4
- IQFYYKKMVGJFEH-OFKYTIFKSA-N 1-[(2r,4s,5r)-4-hydroxy-5-(tritiooxymethyl)oxolan-2-yl]-5-methylpyrimidine-2,4-dione Chemical compound C1[C@H](O)[C@@H](CO[3H])O[C@H]1N1C(=O)NC(=O)C(C)=C1 IQFYYKKMVGJFEH-OFKYTIFKSA-N 0.000 description 3
- WEVYAHXRMPXWCK-UHFFFAOYSA-N Acetonitrile Chemical compound CC#N WEVYAHXRMPXWCK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 229920000936 Agarose Polymers 0.000 description 3
- 241000710929 Alphavirus Species 0.000 description 3
- 101100130895 Bacillus subtilis (strain 168) mntA gene Proteins 0.000 description 3
- 101100087825 Bacillus subtilis (strain 168) nrdE gene Proteins 0.000 description 3
- 108091003079 Bovine Serum Albumin Proteins 0.000 description 3
- 101100439426 Bradyrhizobium diazoefficiens (strain JCM 10833 / BCRC 13528 / IAM 13628 / NBRC 14792 / USDA 110) groEL4 gene Proteins 0.000 description 3
- 241000283707 Capra Species 0.000 description 3
- 208000007190 Chlamydia Infections Diseases 0.000 description 3
- 241001647378 Chlamydia psittaci Species 0.000 description 3
- 102000009016 Cholera Toxin Human genes 0.000 description 3
- 108010049048 Cholera Toxin Proteins 0.000 description 3
- VYZAMTAEIAYCRO-UHFFFAOYSA-N Chromium Chemical compound [Cr] VYZAMTAEIAYCRO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 241000759568 Corixa Species 0.000 description 3
- FBPFZTCFMRRESA-KVTDHHQDSA-N D-Mannitol Chemical compound OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O)CO FBPFZTCFMRRESA-KVTDHHQDSA-N 0.000 description 3
- 102100037840 Dehydrogenase/reductase SDR family member 2, mitochondrial Human genes 0.000 description 3
- 238000011510 Elispot assay Methods 0.000 description 3
- 102100038132 Endogenous retrovirus group K member 6 Pro protein Human genes 0.000 description 3
- 206010048461 Genital infection Diseases 0.000 description 3
- CEAZRRDELHUEMR-URQXQFDESA-N Gentamicin Chemical compound O1[C@H](C(C)NC)CC[C@@H](N)[C@H]1O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O[C@@H]2[C@@H]([C@@H](NC)[C@@](C)(O)CO2)O)[C@H](N)C[C@@H]1N CEAZRRDELHUEMR-URQXQFDESA-N 0.000 description 3
- 229930182566 Gentamicin Natural products 0.000 description 3
- WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N Glucose Natural products OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N 0.000 description 3
- 108010017213 Granulocyte-Macrophage Colony-Stimulating Factor Proteins 0.000 description 3
- 102100039620 Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor Human genes 0.000 description 3
- 101000599940 Homo sapiens Interferon gamma Proteins 0.000 description 3
- 108010001336 Horseradish Peroxidase Proteins 0.000 description 3
- 241000725303 Human immunodeficiency virus Species 0.000 description 3
- 108060003951 Immunoglobulin Proteins 0.000 description 3
- 102000001706 Immunoglobulin Fab Fragments Human genes 0.000 description 3
- 108010054477 Immunoglobulin Fab Fragments Proteins 0.000 description 3
- 108090000978 Interleukin-4 Proteins 0.000 description 3
- 108091092195 Intron Proteins 0.000 description 3
- DCXYFEDJOCDNAF-REOHCLBHSA-N L-asparagine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC(N)=O DCXYFEDJOCDNAF-REOHCLBHSA-N 0.000 description 3
- FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N L-methionine Chemical compound CSCC[C@H](N)C(O)=O FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 3
- 229930195725 Mannitol Natural products 0.000 description 3
- OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N Methanol Chemical compound OC OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 241000187479 Mycobacterium tuberculosis Species 0.000 description 3
- PXHVJJICTQNCMI-UHFFFAOYSA-N Nickel Chemical compound [Ni] PXHVJJICTQNCMI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 108020005187 Oligonucleotide Probes Proteins 0.000 description 3
- 108091005804 Peptidases Proteins 0.000 description 3
- 206010035226 Plasma cell myeloma Diseases 0.000 description 3
- 206010036790 Productive cough Diseases 0.000 description 3
- 101710188053 Protein D Proteins 0.000 description 3
- 239000012980 RPMI-1640 medium Substances 0.000 description 3
- 101710132893 Resolvase Proteins 0.000 description 3
- 241000714474 Rous sarcoma virus Species 0.000 description 3
- 229920002472 Starch Polymers 0.000 description 3
- 101100443856 Streptococcus pyogenes serotype M18 (strain MGAS8232) polC gene Proteins 0.000 description 3
- 229930006000 Sucrose Natural products 0.000 description 3
- CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N Sucrose Chemical compound O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@@]1(CO)O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1 CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N 0.000 description 3
- 101150109085 TSA gene Proteins 0.000 description 3
- 108060008682 Tumor Necrosis Factor Proteins 0.000 description 3
- 102000000852 Tumor Necrosis Factor-alpha Human genes 0.000 description 3
- 101710117021 Tyrosine-protein phosphatase YopH Proteins 0.000 description 3
- 150000007513 acids Chemical class 0.000 description 3
- 230000004913 activation Effects 0.000 description 3
- WNROFYMDJYEPJX-UHFFFAOYSA-K aluminium hydroxide Chemical compound [OH-].[OH-].[OH-].[Al+3] WNROFYMDJYEPJX-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 3
- 125000003277 amino group Chemical group 0.000 description 3
- 230000005875 antibody response Effects 0.000 description 3
- 238000013459 approach Methods 0.000 description 3
- WQZGKKKJIJFFOK-VFUOTHLCSA-N beta-D-glucose Chemical compound OC[C@H]1O[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-VFUOTHLCSA-N 0.000 description 3
- 229940098773 bovine serum albumin Drugs 0.000 description 3
- 201000011510 cancer Diseases 0.000 description 3
- 150000001720 carbohydrates Chemical class 0.000 description 3
- 238000001516 cell proliferation assay Methods 0.000 description 3
- 239000001913 cellulose Substances 0.000 description 3
- 229920002678 cellulose Polymers 0.000 description 3
- 238000012512 characterization method Methods 0.000 description 3
- 208000028512 chlamydia infectious disease Diseases 0.000 description 3
- 238000004587 chromatography analysis Methods 0.000 description 3
- 229910052804 chromium Inorganic materials 0.000 description 3
- 239000011248 coating agent Substances 0.000 description 3
- 238000000576 coating method Methods 0.000 description 3
- 230000001186 cumulative effect Effects 0.000 description 3
- 238000011161 development Methods 0.000 description 3
- 230000018109 developmental process Effects 0.000 description 3
- 230000004069 differentiation Effects 0.000 description 3
- 101150008507 dnaE gene Proteins 0.000 description 3
- 101150035285 dnaE1 gene Proteins 0.000 description 3
- 101150003155 dnaG gene Proteins 0.000 description 3
- 101150052825 dnaK gene Proteins 0.000 description 3
- 108010030074 endodeoxyribonuclease MluI Proteins 0.000 description 3
- 230000002708 enhancing effect Effects 0.000 description 3
- 238000001400 expression cloning Methods 0.000 description 3
- 125000000524 functional group Chemical group 0.000 description 3
- 239000007789 gas Substances 0.000 description 3
- 238000001415 gene therapy Methods 0.000 description 3
- 239000008103 glucose Substances 0.000 description 3
- 150000004676 glycans Chemical class 0.000 description 3
- 101150077981 groEL gene Proteins 0.000 description 3
- 235000014304 histidine Nutrition 0.000 description 3
- 210000004408 hybridoma Anatomy 0.000 description 3
- 210000000987 immune system Anatomy 0.000 description 3
- 102000018358 immunoglobulin Human genes 0.000 description 3
- 238000010348 incorporation Methods 0.000 description 3
- 230000003834 intracellular effect Effects 0.000 description 3
- 150000002632 lipids Chemical class 0.000 description 3
- 230000007774 longterm Effects 0.000 description 3
- 239000000594 mannitol Substances 0.000 description 3
- 235000010355 mannitol Nutrition 0.000 description 3
- 239000000463 material Substances 0.000 description 3
- 230000001404 mediated effect Effects 0.000 description 3
- 101150106833 metG gene Proteins 0.000 description 3
- 101150062025 metG1 gene Proteins 0.000 description 3
- 229930182817 methionine Natural products 0.000 description 3
- 238000002703 mutagenesis Methods 0.000 description 3
- 231100000350 mutagenesis Toxicity 0.000 description 3
- 201000000050 myeloid neoplasm Diseases 0.000 description 3
- 101150101723 nrdA gene Proteins 0.000 description 3
- 239000002245 particle Substances 0.000 description 3
- 108030002458 peroxiredoxin Proteins 0.000 description 3
- 210000002381 plasma Anatomy 0.000 description 3
- 229920001282 polysaccharide Polymers 0.000 description 3
- 239000005017 polysaccharide Substances 0.000 description 3
- 239000000843 powder Substances 0.000 description 3
- 210000004986 primary T-cell Anatomy 0.000 description 3
- 230000000069 prophylactic effect Effects 0.000 description 3
- 235000019419 proteases Nutrition 0.000 description 3
- 108020003175 receptors Proteins 0.000 description 3
- 102000005962 receptors Human genes 0.000 description 3
- 230000002829 reductive effect Effects 0.000 description 3
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 description 3
- 150000003839 salts Chemical class 0.000 description 3
- 230000035945 sensitivity Effects 0.000 description 3
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 description 3
- 238000002741 site-directed mutagenesis Methods 0.000 description 3
- 238000010532 solid phase synthesis reaction Methods 0.000 description 3
- 238000001179 sorption measurement Methods 0.000 description 3
- 210000000952 spleen Anatomy 0.000 description 3
- 210000003802 sputum Anatomy 0.000 description 3
- 208000024794 sputum Diseases 0.000 description 3
- 239000008107 starch Substances 0.000 description 3
- 235000019698 starch Nutrition 0.000 description 3
- 125000001424 substituent group Chemical group 0.000 description 3
- 239000005720 sucrose Substances 0.000 description 3
- 230000014621 translational initiation Effects 0.000 description 3
- 241000701447 unidentified baculovirus Species 0.000 description 3
- 241001430294 unidentified retrovirus Species 0.000 description 3
- 210000002700 urine Anatomy 0.000 description 3
- 101150111539 ytgA gene Proteins 0.000 description 3
- UAIUNKRWKOVEES-UHFFFAOYSA-N 3,3',5,5'-tetramethylbenzidine Chemical compound CC1=C(N)C(C)=CC(C=2C=C(C)C(N)=C(C)C=2)=C1 UAIUNKRWKOVEES-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 102100038222 60 kDa heat shock protein, mitochondrial Human genes 0.000 description 2
- 101000787132 Acidithiobacillus ferridurans Uncharacterized 8.2 kDa protein in mobL 3'region Proteins 0.000 description 2
- 101000827262 Acidithiobacillus ferrooxidans Uncharacterized 18.9 kDa protein in mobE 3'region Proteins 0.000 description 2
- GUBGYTABKSRVRQ-XLOQQCSPSA-N Alpha-Lactose Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1O[C@@H]1[C@@H](CO)O[C@H](O)[C@H](O)[C@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-XLOQQCSPSA-N 0.000 description 2
- 108700023418 Amidases Proteins 0.000 description 2
- 108091093088 Amplicon Proteins 0.000 description 2
- 108020005544 Antisense RNA Proteins 0.000 description 2
- 101000811747 Antithamnion sp. UPF0051 protein in atpA 3'region Proteins 0.000 description 2
- IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N Atomic nitrogen Chemical compound N#N IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 101000827607 Bacillus phage SPP1 Uncharacterized 8.5 kDa protein in GP2-GP6 intergenic region Proteins 0.000 description 2
- 101000961975 Bacillus thuringiensis Uncharacterized 13.4 kDa protein Proteins 0.000 description 2
- 101000653197 Beet necrotic yellow vein virus (isolate Japan/S) Movement protein TGB3 Proteins 0.000 description 2
- 101000609456 Beet necrotic yellow vein virus (isolate Japan/S) Protein P26 Proteins 0.000 description 2
- FERIUCNNQQJTOY-UHFFFAOYSA-N Butyric acid Chemical compound CCCC(O)=O FERIUCNNQQJTOY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- OYPRJOBELJOOCE-UHFFFAOYSA-N Calcium Chemical compound [Ca] OYPRJOBELJOOCE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 101000964407 Caldicellulosiruptor saccharolyticus Uncharacterized 10.7 kDa protein in xynB 3'region Proteins 0.000 description 2
- 108010058432 Chaperonin 60 Proteins 0.000 description 2
- 241001227713 Chiron Species 0.000 description 2
- 241001185363 Chlamydiae Species 0.000 description 2
- ACTIUHUUMQJHFO-UHFFFAOYSA-N Coenzym Q10 Natural products COC1=C(OC)C(=O)C(CC=C(C)CCC=C(C)CCC=C(C)CCC=C(C)CCC=C(C)CCC=C(C)CCC=C(C)CCC=C(C)CCC=C(C)CCC=C(C)C)=C(C)C1=O ACTIUHUUMQJHFO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 102100031725 Cortactin-binding protein 2 Human genes 0.000 description 2
- 241000557626 Corvus corax Species 0.000 description 2
- 101710088194 Dehydrogenase Proteins 0.000 description 2
- 229920002307 Dextran Polymers 0.000 description 2
- 101100087840 Dictyostelium discoideum rnrB-2 gene Proteins 0.000 description 2
- KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N EDTA Chemical compound OC(=O)CN(CC(O)=O)CCN(CC(O)=O)CC(O)=O KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241000710188 Encephalomyocarditis virus Species 0.000 description 2
- 241000672609 Escherichia coli BL21 Species 0.000 description 2
- LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N Ethanol Chemical compound CCO LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108010015514 Glutamate-tRNA ligase Proteins 0.000 description 2
- 239000004471 Glycine Substances 0.000 description 2
- 229920002527 Glycogen Polymers 0.000 description 2
- 101000768777 Haloferax lucentense (strain DSM 14919 / JCM 9276 / NCIMB 13854 / Aa 2.2) Uncharacterized 50.6 kDa protein in the 5'region of gyrA and gyrB Proteins 0.000 description 2
- 241000282412 Homo Species 0.000 description 2
- 101001057156 Homo sapiens Melanoma-associated antigen C2 Proteins 0.000 description 2
- 108090000604 Hydrolases Proteins 0.000 description 2
- 102000018071 Immunoglobulin Fc Fragments Human genes 0.000 description 2
- 108010091135 Immunoglobulin Fc Fragments Proteins 0.000 description 2
- 101000607404 Infectious laryngotracheitis virus (strain Thorne V882) Protein UL24 homolog Proteins 0.000 description 2
- 108010065805 Interleukin-12 Proteins 0.000 description 2
- 102000013462 Interleukin-12 Human genes 0.000 description 2
- XEEYBQQBJWHFJM-UHFFFAOYSA-N Iron Chemical compound [Fe] XEEYBQQBJWHFJM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 101000735632 Klebsiella pneumoniae Uncharacterized 8.8 kDa protein in aacA4 3'region Proteins 0.000 description 2
- OUYCCCASQSFEME-QMMMGPOBSA-N L-tyrosine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 OUYCCCASQSFEME-QMMMGPOBSA-N 0.000 description 2
- GUBGYTABKSRVRQ-QKKXKWKRSA-N Lactose Natural products OC[C@H]1O[C@@H](O[C@H]2[C@H](O)[C@@H](O)C(O)O[C@@H]2CO)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-QKKXKWKRSA-N 0.000 description 2
- 241000713666 Lentivirus Species 0.000 description 2
- KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N Lysine Natural products NCCCCC(N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 102100027252 Melanoma-associated antigen C2 Human genes 0.000 description 2
- 102000018697 Membrane Proteins Human genes 0.000 description 2
- BZLVMXJERCGZMT-UHFFFAOYSA-N Methyl tert-butyl ether Chemical compound COC(C)(C)C BZLVMXJERCGZMT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241001467552 Mycobacterium bovis BCG Species 0.000 description 2
- 125000001429 N-terminal alpha-amino-acid group Chemical group 0.000 description 2
- 239000000020 Nitrocellulose Substances 0.000 description 2
- 101100278084 Nostoc sp. (strain PCC 7120 / SAG 25.82 / UTEX 2576) dnaK1 gene Proteins 0.000 description 2
- 101710116435 Outer membrane protein Proteins 0.000 description 2
- 241001494479 Pecora Species 0.000 description 2
- 102000007456 Peroxiredoxin Human genes 0.000 description 2
- ISWSIDIOOBJBQZ-UHFFFAOYSA-N Phenol Chemical compound OC1=CC=CC=C1 ISWSIDIOOBJBQZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000004793 Polystyrene Substances 0.000 description 2
- 101710197985 Probable protein Rev Proteins 0.000 description 2
- 102100026126 Proline-tRNA ligase Human genes 0.000 description 2
- 240000004808 Saccharomyces cerevisiae Species 0.000 description 2
- 101100428373 Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) POR1 gene Proteins 0.000 description 2
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- 101000818100 Spirochaeta aurantia Uncharacterized 12.7 kDa protein in trpE 5'region Proteins 0.000 description 2
- 101001037658 Streptomyces coelicolor (strain ATCC BAA-471 / A3(2) / M145) Glucokinase Proteins 0.000 description 2
- 101001120268 Streptomyces griseus Protein Y Proteins 0.000 description 2
- 101100117145 Synechocystis sp. (strain PCC 6803 / Kazusa) dnaK2 gene Proteins 0.000 description 2
- 230000006044 T cell activation Effects 0.000 description 2
- 108091008874 T cell receptors Proteins 0.000 description 2
- 102000016266 T-Cell Antigen Receptors Human genes 0.000 description 2
- AYFVYJQAPQTCCC-UHFFFAOYSA-N Threonine Natural products CC(O)C(N)C(O)=O AYFVYJQAPQTCCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000004473 Threonine Substances 0.000 description 2
- DRTQHJPVMGBUCF-XVFCMESISA-N Uridine Chemical compound O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1N1C(=O)NC(=O)C=C1 DRTQHJPVMGBUCF-XVFCMESISA-N 0.000 description 2
- 238000002835 absorbance Methods 0.000 description 2
- AZDRQVAHHNSJOQ-UHFFFAOYSA-N alumane Chemical class [AlH3] AZDRQVAHHNSJOQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 102000005922 amidase Human genes 0.000 description 2
- 229960000190 bacillus calmette–guérin vaccine Drugs 0.000 description 2
- 230000001588 bifunctional effect Effects 0.000 description 2
- 230000004071 biological effect Effects 0.000 description 2
- 229960002685 biotin Drugs 0.000 description 2
- 235000020958 biotin Nutrition 0.000 description 2
- 239000011616 biotin Substances 0.000 description 2
- 210000001185 bone marrow Anatomy 0.000 description 2
- 210000004900 c-terminal fragment Anatomy 0.000 description 2
- 239000011575 calcium Substances 0.000 description 2
- 229910052791 calcium Inorganic materials 0.000 description 2
- 235000014633 carbohydrates Nutrition 0.000 description 2
- 239000013553 cell monolayer Substances 0.000 description 2
- 230000030570 cellular localization Effects 0.000 description 2
- 210000001175 cerebrospinal fluid Anatomy 0.000 description 2
- 230000008859 change Effects 0.000 description 2
- HVYWMOMLDIMFJA-DPAQBDIFSA-N cholesterol Chemical compound C1C=C2C[C@@H](O)CC[C@]2(C)[C@@H]2[C@@H]1[C@@H]1CC[C@H]([C@H](C)CCCC(C)C)[C@@]1(C)CC2 HVYWMOMLDIMFJA-DPAQBDIFSA-N 0.000 description 2
- 101150096566 clpX gene Proteins 0.000 description 2
- 235000017471 coenzyme Q10 Nutrition 0.000 description 2
- ACTIUHUUMQJHFO-UPTCCGCDSA-N coenzyme Q10 Chemical compound COC1=C(OC)C(=O)C(C\C=C(/C)CC\C=C(/C)CC\C=C(/C)CC\C=C(/C)CC\C=C(/C)CC\C=C(/C)CC\C=C(/C)CC\C=C(/C)CC\C=C(/C)CCC=C(C)C)=C(C)C1=O ACTIUHUUMQJHFO-UPTCCGCDSA-N 0.000 description 2
- 238000012875 competitive assay Methods 0.000 description 2
- 239000003184 complementary RNA Substances 0.000 description 2
- 230000009918 complex formation Effects 0.000 description 2
- 230000001276 controlling effect Effects 0.000 description 2
- 230000009260 cross reactivity Effects 0.000 description 2
- YPHMISFOHDHNIV-FSZOTQKASA-N cycloheximide Chemical compound C1[C@@H](C)C[C@H](C)C(=O)[C@@H]1[C@H](O)CC1CC(=O)NC(=O)C1 YPHMISFOHDHNIV-FSZOTQKASA-N 0.000 description 2
- 210000000172 cytosol Anatomy 0.000 description 2
- GVJHHUAWPYXKBD-UHFFFAOYSA-N d-alpha-tocopherol Natural products OC1=C(C)C(C)=C2OC(CCCC(C)CCCC(C)CCCC(C)C)(C)CCC2=C1C GVJHHUAWPYXKBD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000002950 deficient Effects 0.000 description 2
- 230000002939 deleterious effect Effects 0.000 description 2
- 230000029087 digestion Effects 0.000 description 2
- 238000009826 distribution Methods 0.000 description 2
- 239000000975 dye Substances 0.000 description 2
- 239000000839 emulsion Substances 0.000 description 2
- 108700004025 env Genes Proteins 0.000 description 2
- 101150030339 env gene Proteins 0.000 description 2
- 210000004700 fetal blood Anatomy 0.000 description 2
- MHMNJMPURVTYEJ-UHFFFAOYSA-N fluorescein-5-isothiocyanate Chemical compound O1C(=O)C2=CC(N=C=S)=CC=C2C21C1=CC=C(O)C=C1OC1=CC(O)=CC=C21 MHMNJMPURVTYEJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000006870 function Effects 0.000 description 2
- 210000004392 genitalia Anatomy 0.000 description 2
- 239000011521 glass Substances 0.000 description 2
- RWSXRVCMGQZWBV-WDSKDSINSA-N glutathione Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCC(=O)N[C@@H](CS)C(=O)NCC(O)=O RWSXRVCMGQZWBV-WDSKDSINSA-N 0.000 description 2
- 229940096919 glycogen Drugs 0.000 description 2
- UYTPUPDQBNUYGX-UHFFFAOYSA-N guanine Chemical compound O=C1NC(N)=NC2=C1N=CN2 UYTPUPDQBNUYGX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 150000004820 halides Chemical class 0.000 description 2
- HNDVDQJCIGZPNO-UHFFFAOYSA-N histidine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CN=CN1 HNDVDQJCIGZPNO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000028996 humoral immune response Effects 0.000 description 2
- 230000007062 hydrolysis Effects 0.000 description 2
- 238000006460 hydrolysis reaction Methods 0.000 description 2
- FDGQSTZJBFJUBT-UHFFFAOYSA-N hypoxanthine Chemical compound O=C1NC=NC2=C1NC=N2 FDGQSTZJBFJUBT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000002513 implantation Methods 0.000 description 2
- 230000001976 improved effect Effects 0.000 description 2
- 230000006872 improvement Effects 0.000 description 2
- 230000001965 increasing effect Effects 0.000 description 2
- 239000000411 inducer Substances 0.000 description 2
- 230000001939 inductive effect Effects 0.000 description 2
- 208000000509 infertility Diseases 0.000 description 2
- 230000036512 infertility Effects 0.000 description 2
- 231100000535 infertility Toxicity 0.000 description 2
- 238000002347 injection Methods 0.000 description 2
- 239000007924 injection Substances 0.000 description 2
- 230000014828 interferon-gamma production Effects 0.000 description 2
- 238000007918 intramuscular administration Methods 0.000 description 2
- 238000002372 labelling Methods 0.000 description 2
- 239000008101 lactose Substances 0.000 description 2
- 239000004816 latex Substances 0.000 description 2
- 229920000126 latex Polymers 0.000 description 2
- 208000032839 leukemia Diseases 0.000 description 2
- 239000003446 ligand Substances 0.000 description 2
- 230000000670 limiting effect Effects 0.000 description 2
- 210000004185 liver Anatomy 0.000 description 2
- 238000011068 loading method Methods 0.000 description 2
- ZLNQQNXFFQJAID-UHFFFAOYSA-L magnesium carbonate Chemical compound [Mg+2].[O-]C([O-])=O ZLNQQNXFFQJAID-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 2
- 239000001095 magnesium carbonate Substances 0.000 description 2
- 229910000021 magnesium carbonate Inorganic materials 0.000 description 2
- 235000019359 magnesium stearate Nutrition 0.000 description 2
- 101150019727 malQ gene Proteins 0.000 description 2
- 239000000693 micelle Substances 0.000 description 2
- 238000010369 molecular cloning Methods 0.000 description 2
- 229940126619 mouse monoclonal antibody Drugs 0.000 description 2
- 208000031225 myocardial ischemia Diseases 0.000 description 2
- 230000007935 neutral effect Effects 0.000 description 2
- 229910052759 nickel Inorganic materials 0.000 description 2
- 229920001220 nitrocellulos Polymers 0.000 description 2
- 101150037566 nrdB gene Proteins 0.000 description 2
- 101150087557 omcB gene Proteins 0.000 description 2
- 230000003287 optical effect Effects 0.000 description 2
- 238000004806 packaging method and process Methods 0.000 description 2
- 238000007911 parenteral administration Methods 0.000 description 2
- 230000001717 pathogenic effect Effects 0.000 description 2
- 239000013600 plasmid vector Substances 0.000 description 2
- 239000004033 plastic Substances 0.000 description 2
- 229920003023 plastic Polymers 0.000 description 2
- 101150037202 pmp20 gene Proteins 0.000 description 2
- 101150095517 pmpH gene Proteins 0.000 description 2
- 229920002223 polystyrene Polymers 0.000 description 2
- 239000004800 polyvinyl chloride Substances 0.000 description 2
- 229920000915 polyvinyl chloride Polymers 0.000 description 2
- 239000013641 positive control Substances 0.000 description 2
- 230000000644 propagated effect Effects 0.000 description 2
- 230000002285 radioactive effect Effects 0.000 description 2
- 101150079601 recA gene Proteins 0.000 description 2
- NPCOQXAVBJJZBQ-UHFFFAOYSA-N reduced coenzyme Q9 Natural products COC1=C(O)C(C)=C(CC=C(C)CCC=C(C)CCC=C(C)CCC=C(C)CCC=C(C)CCC=C(C)CCC=C(C)CCC=C(C)CCC=C(C)C)C(O)=C1OC NPCOQXAVBJJZBQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000011160 research Methods 0.000 description 2
- 238000004007 reversed phase HPLC Methods 0.000 description 2
- CVHZOJJKTDOEJC-UHFFFAOYSA-N saccharin Chemical compound C1=CC=C2C(=O)NS(=O)(=O)C2=C1 CVHZOJJKTDOEJC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 210000003296 saliva Anatomy 0.000 description 2
- 230000003248 secreting effect Effects 0.000 description 2
- 230000011664 signaling Effects 0.000 description 2
- 150000003384 small molecules Chemical class 0.000 description 2
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 2
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 2
- 238000010186 staining Methods 0.000 description 2
- 210000000130 stem cell Anatomy 0.000 description 2
- 238000007920 subcutaneous administration Methods 0.000 description 2
- 238000010254 subcutaneous injection Methods 0.000 description 2
- 239000007929 subcutaneous injection Substances 0.000 description 2
- 239000000758 substrate Substances 0.000 description 2
- 239000000725 suspension Substances 0.000 description 2
- 239000000454 talc Substances 0.000 description 2
- 229910052623 talc Inorganic materials 0.000 description 2
- 125000003396 thiol group Chemical group [H]S* 0.000 description 2
- 150000003573 thiols Chemical class 0.000 description 2
- 239000011732 tocopherol Substances 0.000 description 2
- 229960001295 tocopherol Drugs 0.000 description 2
- 229930003799 tocopherol Natural products 0.000 description 2
- 235000010384 tocopherol Nutrition 0.000 description 2
- 239000003053 toxin Substances 0.000 description 2
- 231100000765 toxin Toxicity 0.000 description 2
- 108700012359 toxins Proteins 0.000 description 2
- 201000008827 tuberculosis Diseases 0.000 description 2
- 229940035936 ubiquinone Drugs 0.000 description 2
- 238000002255 vaccination Methods 0.000 description 2
- 238000005406 washing Methods 0.000 description 2
- GVJHHUAWPYXKBD-IEOSBIPESA-N α-tocopherol Chemical compound OC1=C(C)C(C)=C2O[C@@](CCC[C@H](C)CCC[C@H](C)CCCC(C)C)(C)CCC2=C1C GVJHHUAWPYXKBD-IEOSBIPESA-N 0.000 description 2
- OCUSNPIJIZCRSZ-ZTZWCFDHSA-N (2s)-2-amino-3-methylbutanoic acid;(2s)-2-amino-4-methylpentanoic acid;(2s,3s)-2-amino-3-methylpentanoic acid Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(O)=O.CC[C@H](C)[C@H](N)C(O)=O.CC(C)C[C@H](N)C(O)=O OCUSNPIJIZCRSZ-ZTZWCFDHSA-N 0.000 description 1
- MZOFCQQQCNRIBI-VMXHOPILSA-N (3s)-4-[[(2s)-1-[[(2s)-1-[[(1s)-1-carboxy-2-hydroxyethyl]amino]-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]amino]-5-(diaminomethylideneamino)-1-oxopentan-2-yl]amino]-3-[[2-[[(2s)-2,6-diaminohexanoyl]amino]acetyl]amino]-4-oxobutanoic acid Chemical compound OC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)CCCCN MZOFCQQQCNRIBI-VMXHOPILSA-N 0.000 description 1
- 125000003088 (fluoren-9-ylmethoxy)carbonyl group Chemical group 0.000 description 1
- 102000040650 (ribonucleotides)n+m Human genes 0.000 description 1
- DHBXNPKRAUYBTH-UHFFFAOYSA-N 1,1-ethanedithiol Chemical compound CC(S)S DHBXNPKRAUYBTH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- NWUYHJFMYQTDRP-UHFFFAOYSA-N 1,2-bis(ethenyl)benzene;1-ethenyl-2-ethylbenzene;styrene Chemical compound C=CC1=CC=CC=C1.CCC1=CC=CC=C1C=C.C=CC1=CC=CC=C1C=C NWUYHJFMYQTDRP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- AZQWKYJCGOJGHM-UHFFFAOYSA-N 1,4-benzoquinone Chemical compound O=C1C=CC(=O)C=C1 AZQWKYJCGOJGHM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- UHDGCWIWMRVCDJ-UHFFFAOYSA-N 1-beta-D-Xylofuranosyl-NH-Cytosine Natural products O=C1N=C(N)C=CN1C1C(O)C(O)C(CO)O1 UHDGCWIWMRVCDJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- NHBKXEKEPDILRR-UHFFFAOYSA-N 2,3-bis(butanoylsulfanyl)propyl butanoate Chemical compound CCCC(=O)OCC(SC(=O)CCC)CSC(=O)CCC NHBKXEKEPDILRR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- OTLLEIBWKHEHGU-UHFFFAOYSA-N 2-[5-[[5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methoxy]-3,4-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]oxy-3,5-dihydroxy-4-phosphonooxyhexanedioic acid Chemical compound C1=NC=2C(N)=NC=NC=2N1C(C(C1O)O)OC1COC1C(CO)OC(OC(C(O)C(OP(O)(O)=O)C(O)C(O)=O)C(O)=O)C(O)C1O OTLLEIBWKHEHGU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- BFSVOASYOCHEOV-UHFFFAOYSA-N 2-diethylaminoethanol Chemical compound CCN(CC)CCO BFSVOASYOCHEOV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000010600 3H thymidine incorporation assay Methods 0.000 description 1
- FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 4-amino-1-[(2r)-6-amino-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-amino-3-phenylpropanoyl]amino]-3-phenylpropanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]hexanoyl]piperidine-4-carboxylic acid Chemical compound C([C@H](C(=O)N[C@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](CCCCN)C(=O)N1CCC(N)(CC1)C(O)=O)NC(=O)[C@H](N)CC=1C=CC=CC=1)C1=CC=CC=C1 FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 0.000 description 1
- TVZGACDUOSZQKY-LBPRGKRZSA-N 4-aminofolic acid Chemical compound C1=NC2=NC(N)=NC(N)=C2N=C1CNC1=CC=C(C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O)C=C1 TVZGACDUOSZQKY-LBPRGKRZSA-N 0.000 description 1
- 101710117373 92 kDa protein Proteins 0.000 description 1
- 108010066676 Abrin Proteins 0.000 description 1
- 229930024421 Adenine Natural products 0.000 description 1
- GFFGJBXGBJISGV-UHFFFAOYSA-N Adenine Chemical compound NC1=NC=NC2=C1N=CN2 GFFGJBXGBJISGV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010088751 Albumins Proteins 0.000 description 1
- 102000009027 Albumins Human genes 0.000 description 1
- QGZKDVFQNNGYKY-UHFFFAOYSA-O Ammonium Chemical compound [NH4+] QGZKDVFQNNGYKY-UHFFFAOYSA-O 0.000 description 1
- 241000024188 Andala Species 0.000 description 1
- 241000272478 Aquila Species 0.000 description 1
- 239000004475 Arginine Substances 0.000 description 1
- 206010003445 Ascites Diseases 0.000 description 1
- DCXYFEDJOCDNAF-UHFFFAOYSA-N Asparagine Natural products OC(=O)C(N)CC(N)=O DCXYFEDJOCDNAF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 201000001320 Atherosclerosis Diseases 0.000 description 1
- 241000271566 Aves Species 0.000 description 1
- 108090001008 Avidin Proteins 0.000 description 1
- 208000004926 Bacterial Vaginosis Diseases 0.000 description 1
- 201000004569 Blindness Diseases 0.000 description 1
- 241000588832 Bordetella pertussis Species 0.000 description 1
- 241000283690 Bos taurus Species 0.000 description 1
- 206010006187 Breast cancer Diseases 0.000 description 1
- 108010029697 CD40 Ligand Proteins 0.000 description 1
- 101150013553 CD40 gene Proteins 0.000 description 1
- 102100032937 CD40 ligand Human genes 0.000 description 1
- 241000282693 Cercopithecidae Species 0.000 description 1
- 102000009410 Chemokine receptor Human genes 0.000 description 1
- 108050000299 Chemokine receptor Proteins 0.000 description 1
- 102100032368 Coiled-coil domain-containing protein 110 Human genes 0.000 description 1
- 108020004635 Complementary DNA Proteins 0.000 description 1
- 108091029430 CpG site Proteins 0.000 description 1
- UHDGCWIWMRVCDJ-PSQAKQOGSA-N Cytidine Natural products O=C1N=C(N)C=CN1[C@@H]1[C@@H](O)[C@@H](O)[C@H](CO)O1 UHDGCWIWMRVCDJ-PSQAKQOGSA-N 0.000 description 1
- YVGGHNCTFXOJCH-UHFFFAOYSA-N DDT Chemical compound C1=CC(Cl)=CC=C1C(C(Cl)(Cl)Cl)C1=CC=C(Cl)C=C1 YVGGHNCTFXOJCH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000003298 DNA probe Substances 0.000 description 1
- 238000001712 DNA sequencing Methods 0.000 description 1
- 102000016607 Diphtheria Toxin Human genes 0.000 description 1
- 108010053187 Diphtheria Toxin Proteins 0.000 description 1
- 208000004145 Endometritis Diseases 0.000 description 1
- 241000701959 Escherichia virus Lambda Species 0.000 description 1
- 208000001860 Eye Infections Diseases 0.000 description 1
- 206010065789 Fallopian tube obstruction Diseases 0.000 description 1
- 241000282324 Felis Species 0.000 description 1
- 208000000666 Fowlpox Diseases 0.000 description 1
- 108700004714 Gelonium multiflorum GEL Proteins 0.000 description 1
- 208000022555 Genital disease Diseases 0.000 description 1
- 108010024636 Glutathione Proteins 0.000 description 1
- CEXINUGNTZFNRY-BYPYZUCNSA-N Gly-Cys-Gly Chemical group [NH3+]CC(=O)N[C@@H](CS)C(=O)NCC([O-])=O CEXINUGNTZFNRY-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- 108010043121 Green Fluorescent Proteins Proteins 0.000 description 1
- 102000004144 Green Fluorescent Proteins Human genes 0.000 description 1
- 241000606768 Haemophilus influenzae Species 0.000 description 1
- 101710154606 Hemagglutinin Proteins 0.000 description 1
- 102100031573 Hematopoietic progenitor cell antigen CD34 Human genes 0.000 description 1
- 241000238631 Hexapoda Species 0.000 description 1
- 101000868824 Homo sapiens Coiled-coil domain-containing protein 110 Proteins 0.000 description 1
- 101000777663 Homo sapiens Hematopoietic progenitor cell antigen CD34 Proteins 0.000 description 1
- 101000599852 Homo sapiens Intercellular adhesion molecule 1 Proteins 0.000 description 1
- 101001033279 Homo sapiens Interleukin-3 Proteins 0.000 description 1
- 101000914484 Homo sapiens T-lymphocyte activation antigen CD80 Proteins 0.000 description 1
- UFHFLCQGNIYNRP-UHFFFAOYSA-N Hydrogen Chemical compound [H][H] UFHFLCQGNIYNRP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- UGQMRVRMYYASKQ-UHFFFAOYSA-N Hypoxanthine nucleoside Natural products OC1C(O)C(CO)OC1N1C(NC=NC2=O)=C2N=C1 UGQMRVRMYYASKQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 101150017040 I gene Proteins 0.000 description 1
- 102000009490 IgG Receptors Human genes 0.000 description 1
- 108010073807 IgG Receptors Proteins 0.000 description 1
- DGAQECJNVWCQMB-PUAWFVPOSA-M Ilexoside XXIX Chemical compound C[C@@H]1CC[C@@]2(CC[C@@]3(C(=CC[C@H]4[C@]3(CC[C@@H]5[C@@]4(CC[C@@H](C5(C)C)OS(=O)(=O)[O-])C)C)[C@@H]2[C@]1(C)O)C)C(=O)O[C@H]6[C@@H]([C@H]([C@@H]([C@H](O6)CO)O)O)O.[Na+] DGAQECJNVWCQMB-PUAWFVPOSA-M 0.000 description 1
- 206010061598 Immunodeficiency Diseases 0.000 description 1
- 208000029462 Immunodeficiency disease Diseases 0.000 description 1
- 206010061218 Inflammation Diseases 0.000 description 1
- 229930010555 Inosine Natural products 0.000 description 1
- UGQMRVRMYYASKQ-KQYNXXCUSA-N Inosine Chemical compound O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1N1C2=NC=NC(O)=C2N=C1 UGQMRVRMYYASKQ-KQYNXXCUSA-N 0.000 description 1
- 102100037877 Intercellular adhesion molecule 1 Human genes 0.000 description 1
- 108090000174 Interleukin-10 Proteins 0.000 description 1
- 108090000176 Interleukin-13 Proteins 0.000 description 1
- 102100039064 Interleukin-3 Human genes 0.000 description 1
- 108010002616 Interleukin-5 Proteins 0.000 description 1
- 108090001005 Interleukin-6 Proteins 0.000 description 1
- 108010002586 Interleukin-7 Proteins 0.000 description 1
- 102000000704 Interleukin-7 Human genes 0.000 description 1
- 206010056254 Intrauterine infection Diseases 0.000 description 1
- 125000000998 L-alanino group Chemical group [H]N([*])[C@](C([H])([H])[H])([H])C(=O)O[H] 0.000 description 1
- ZDXPYRJPNDTMRX-VKHMYHEASA-N L-glutamine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCC(N)=O ZDXPYRJPNDTMRX-VKHMYHEASA-N 0.000 description 1
- FBOZXECLQNJBKD-ZDUSSCGKSA-N L-methotrexate Chemical compound C=1N=C2N=C(N)N=C(N)C2=NC=1CN(C)C1=CC=C(C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O)C=C1 FBOZXECLQNJBKD-ZDUSSCGKSA-N 0.000 description 1
- 125000000174 L-prolyl group Chemical group [H]N1C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])[C@@]1([H])C(*)=O 0.000 description 1
- 125000000773 L-serino group Chemical group [H]OC(=O)[C@@]([H])(N([H])*)C([H])([H])O[H] 0.000 description 1
- 101100521429 Lactococcus lactis subsp. lactis (strain IL1403) prsA gene Proteins 0.000 description 1
- 108090001090 Lectins Proteins 0.000 description 1
- 102000004856 Lectins Human genes 0.000 description 1
- 108090001030 Lipoproteins Proteins 0.000 description 1
- 102000004895 Lipoproteins Human genes 0.000 description 1
- WHXSMMKQMYFTQS-UHFFFAOYSA-N Lithium Chemical compound [Li] WHXSMMKQMYFTQS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000004472 Lysine Substances 0.000 description 1
- 102000043129 MHC class I family Human genes 0.000 description 1
- 108091054437 MHC class I family Proteins 0.000 description 1
- 102000043131 MHC class II family Human genes 0.000 description 1
- 108091054438 MHC class II family Proteins 0.000 description 1
- 208000007466 Male Infertility Diseases 0.000 description 1
- 241000124008 Mammalia Species 0.000 description 1
- 108010031099 Mannose Receptor Proteins 0.000 description 1
- 108060004795 Methyltransferase Proteins 0.000 description 1
- 102000016397 Methyltransferase Human genes 0.000 description 1
- 102000003979 Mineralocorticoid Receptors Human genes 0.000 description 1
- 108090000375 Mineralocorticoid Receptors Proteins 0.000 description 1
- MSFSPUZXLOGKHJ-UHFFFAOYSA-N Muraminsaeure Natural products OC(=O)C(C)OC1C(N)C(O)OC(CO)C1O MSFSPUZXLOGKHJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241001529936 Murinae Species 0.000 description 1
- 108010062010 N-Acetylmuramoyl-L-alanine Amidase Proteins 0.000 description 1
- KTHDTJVBEPMMGL-VKHMYHEASA-N N-acetyl-L-alanine Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(C)=O KTHDTJVBEPMMGL-VKHMYHEASA-N 0.000 description 1
- KTHDTJVBEPMMGL-UHFFFAOYSA-N N-acetyl-L-alanine Natural products OC(=O)C(C)NC(C)=O KTHDTJVBEPMMGL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- QIVLXDXPYZOGPQ-UHFFFAOYSA-N NC(CCC(=O)O)(CCC(=O)O)N Chemical compound NC(CCC(=O)O)(CCC(=O)O)N QIVLXDXPYZOGPQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108020004711 Nucleic Acid Probes Proteins 0.000 description 1
- 108700001237 Nucleic Acid-Based Vaccines Proteins 0.000 description 1
- 108091005461 Nucleic proteins Proteins 0.000 description 1
- 101710093908 Outer capsid protein VP4 Proteins 0.000 description 1
- 101710135467 Outer capsid protein sigma-1 Proteins 0.000 description 1
- 108010058846 Ovalbumin Proteins 0.000 description 1
- 238000009004 PCR Kit Methods 0.000 description 1
- 229910019142 PO4 Inorganic materials 0.000 description 1
- 108090000526 Papain Proteins 0.000 description 1
- 108010013639 Peptidoglycan Proteins 0.000 description 1
- NHHZWPNMYQUNEH-ACRUOGEOSA-N Phe-Tyr-His Chemical compound C1=CC=C(C=C1)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC2=CC=C(C=C2)O)C(=O)N[C@@H](CC3=CN=CN3)C(=O)O)N NHHZWPNMYQUNEH-ACRUOGEOSA-N 0.000 description 1
- 102000004861 Phosphoric Diester Hydrolases Human genes 0.000 description 1
- 241000276498 Pollachius virens Species 0.000 description 1
- ZLMJMSJWJFRBEC-UHFFFAOYSA-N Potassium Chemical compound [K] ZLMJMSJWJFRBEC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 101710176177 Protein A56 Proteins 0.000 description 1
- 208000003251 Pruritus Diseases 0.000 description 1
- 108010007131 Pulmonary Surfactant-Associated Protein B Proteins 0.000 description 1
- 102100032617 Pulmonary surfactant-associated protein B Human genes 0.000 description 1
- CZPWVGJYEJSRLH-UHFFFAOYSA-N Pyrimidine Chemical compound C1=CN=CN=C1 CZPWVGJYEJSRLH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 208000007313 Reproductive Tract Infections Diseases 0.000 description 1
- 101710137010 Retinol-binding protein 3 Proteins 0.000 description 1
- 102100038247 Retinol-binding protein 3 Human genes 0.000 description 1
- 241000712907 Retroviridae Species 0.000 description 1
- 108091028664 Ribonucleotide Proteins 0.000 description 1
- 108010039491 Ricin Proteins 0.000 description 1
- 239000006146 Roswell Park Memorial Institute medium Substances 0.000 description 1
- 208000007893 Salpingitis Diseases 0.000 description 1
- 206010070834 Sensitisation Diseases 0.000 description 1
- 102000012479 Serine Proteases Human genes 0.000 description 1
- 108010022999 Serine Proteases Proteins 0.000 description 1
- 208000019802 Sexually transmitted disease Diseases 0.000 description 1
- 108010079723 Shiga Toxin Proteins 0.000 description 1
- 241000193998 Streptococcus pneumoniae Species 0.000 description 1
- 101710172711 Structural protein Proteins 0.000 description 1
- 101150057615 Syn gene Proteins 0.000 description 1
- 102100027222 T-lymphocyte activation antigen CD80 Human genes 0.000 description 1
- 101710137500 T7 RNA polymerase Proteins 0.000 description 1
- 206010043376 Tetanus Diseases 0.000 description 1
- 101100310092 Thauera selenatis serD gene Proteins 0.000 description 1
- 241000906446 Theraps Species 0.000 description 1
- 108010046722 Thrombospondin 1 Proteins 0.000 description 1
- 102100036034 Thrombospondin-1 Human genes 0.000 description 1
- 101710120037 Toxin CcdB Proteins 0.000 description 1
- 108700009124 Transcription Initiation Site Proteins 0.000 description 1
- 108091023040 Transcription factor Proteins 0.000 description 1
- 102000040945 Transcription factor Human genes 0.000 description 1
- 102100040245 Tumor necrosis factor receptor superfamily member 5 Human genes 0.000 description 1
- 208000025865 Ulcer Diseases 0.000 description 1
- 241000251539 Vertebrata <Metazoa> Species 0.000 description 1
- 241000711975 Vesicular stomatitis virus Species 0.000 description 1
- UZQJVUCHXGYFLQ-AYDHOLPZSA-N [(2s,3r,4s,5r,6r)-4-[(2s,3r,4s,5r,6r)-4-[(2r,3r,4s,5r,6r)-4-[(2s,3r,4s,5r,6r)-3,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)-4-[(2s,3r,4s,5s,6r)-3,4,5-trihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]oxyoxan-2-yl]oxy-3,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]oxy-3,5-dihydroxy-6-(hy Chemical compound O([C@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]([C@@H]1O)O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]([C@@H]1O)O[C@H]1CC[C@]2(C)[C@H]3CC=C4[C@@]([C@@]3(CC[C@H]2[C@@]1(C=O)C)C)(C)CC(O)[C@]1(CCC(CC14)(C)C)C(=O)O[C@H]1[C@@H]([C@@H](O[C@H]2[C@@H]([C@@H](O[C@H]3[C@@H]([C@@H](O[C@H]4[C@@H]([C@@H](O[C@H]5[C@@H]([C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O5)O)[C@H](O)[C@@H](CO)O4)O)[C@H](O)[C@@H](CO)O3)O)[C@H](O)[C@@H](CO)O2)O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1)O)[C@@H]1O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H]1O UZQJVUCHXGYFLQ-AYDHOLPZSA-N 0.000 description 1
- FHICGHSMIPIAPL-HDYAAECPSA-N [2-[3-[6-[3-[(5R,6aS,6bR,12aR)-10-[6-[2-[2-[4,5-dihydroxy-3-(3,4,5-trihydroxyoxan-2-yl)oxyoxan-2-yl]ethoxy]ethyl]-3,4,5-trihydroxyoxan-2-yl]oxy-5-hydroxy-2,2,6a,6b,9,9,12a-heptamethyl-1,3,4,5,6,6a,7,8,8a,10,11,12,13,14b-tetradecahydropicene-4a-carbonyl]peroxypropyl]-5-[[5-[8-[3,5-dihydroxy-4-(3,4,5-trihydroxyoxan-2-yl)oxyoxan-2-yl]octoxy]-3,4-dihydroxy-6-methyloxan-2-yl]methoxy]-3,4-dihydroxyoxan-2-yl]propoxymethyl]-5-hydroxy-3-[(6S)-6-hydroxy-2,6-dimethylocta-2,7-dienoyl]oxy-6-methyloxan-4-yl] (2E,6S)-6-hydroxy-2-(hydroxymethyl)-6-methylocta-2,7-dienoate Chemical compound C=C[C@@](C)(O)CCC=C(C)C(=O)OC1C(OC(=O)C(\CO)=C\CC[C@](C)(O)C=C)C(O)C(C)OC1COCCCC1C(O)C(O)C(OCC2C(C(O)C(OCCCCCCCCC3C(C(OC4C(C(O)C(O)CO4)O)C(O)CO3)O)C(C)O2)O)C(CCCOOC(=O)C23C(CC(C)(C)CC2)C=2[C@@]([C@]4(C)CCC5C(C)(C)C(OC6C(C(O)C(O)C(CCOCCC7C(C(O)C(O)CO7)OC7C(C(O)C(O)CO7)O)O6)O)CC[C@]5(C)C4CC=2)(C)C[C@H]3O)O1 FHICGHSMIPIAPL-HDYAAECPSA-N 0.000 description 1
- 230000002159 abnormal effect Effects 0.000 description 1
- 238000009825 accumulation Methods 0.000 description 1
- 238000005903 acid hydrolysis reaction Methods 0.000 description 1
- 239000004480 active ingredient Substances 0.000 description 1
- 229960000643 adenine Drugs 0.000 description 1
- 125000003172 aldehyde group Chemical group 0.000 description 1
- 125000000217 alkyl group Chemical group 0.000 description 1
- 230000000735 allogeneic effect Effects 0.000 description 1
- 229940037003 alum Drugs 0.000 description 1
- ILRRQNADMUWWFW-UHFFFAOYSA-K aluminium phosphate Chemical compound O1[Al]2OP1(=O)O2 ILRRQNADMUWWFW-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 1
- 150000001412 amines Chemical class 0.000 description 1
- 125000004103 aminoalkyl group Chemical group 0.000 description 1
- 229960003896 aminopterin Drugs 0.000 description 1
- 239000002269 analeptic agent Substances 0.000 description 1
- 150000008064 anhydrides Chemical class 0.000 description 1
- 125000000129 anionic group Chemical group 0.000 description 1
- 230000005809 anti-tumor immunity Effects 0.000 description 1
- 230000000840 anti-viral effect Effects 0.000 description 1
- 230000030741 antigen processing and presentation Effects 0.000 description 1
- 230000008350 antigen-specific antibody response Effects 0.000 description 1
- 239000003963 antioxidant agent Substances 0.000 description 1
- 235000006708 antioxidants Nutrition 0.000 description 1
- ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N arginine Natural products OC(=O)C(N)CCCNC(N)=N ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000000823 artificial membrane Substances 0.000 description 1
- 235000009582 asparagine Nutrition 0.000 description 1
- 229960001230 asparagine Drugs 0.000 description 1
- 235000003704 aspartic acid Nutrition 0.000 description 1
- 238000002820 assay format Methods 0.000 description 1
- 125000004429 atom Chemical group 0.000 description 1
- 230000002238 attenuated effect Effects 0.000 description 1
- 244000052616 bacterial pathogen Species 0.000 description 1
- WQZGKKKJIJFFOK-FPRJBGLDSA-N beta-D-galactose Chemical compound OC[C@H]1O[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-FPRJBGLDSA-N 0.000 description 1
- 108010005774 beta-Galactosidase Proteins 0.000 description 1
- DRTQHJPVMGBUCF-PSQAKQOGSA-N beta-L-uridine Natural products O[C@H]1[C@@H](O)[C@H](CO)O[C@@H]1N1C(=O)NC(=O)C=C1 DRTQHJPVMGBUCF-PSQAKQOGSA-N 0.000 description 1
- OQFSQFPPLPISGP-UHFFFAOYSA-N beta-carboxyaspartic acid Natural products OC(=O)C(N)C(C(O)=O)C(O)=O OQFSQFPPLPISGP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000003124 biologic agent Substances 0.000 description 1
- 239000013060 biological fluid Substances 0.000 description 1
- 229960000074 biopharmaceutical Drugs 0.000 description 1
- 238000001574 biopsy Methods 0.000 description 1
- 239000002981 blocking agent Substances 0.000 description 1
- 230000037396 body weight Effects 0.000 description 1
- 238000009835 boiling Methods 0.000 description 1
- 210000000481 breast Anatomy 0.000 description 1
- 239000007975 buffered saline Substances 0.000 description 1
- 239000002775 capsule Substances 0.000 description 1
- 229910002091 carbon monoxide Inorganic materials 0.000 description 1
- 125000002915 carbonyl group Chemical group [*:2]C([*:1])=O 0.000 description 1
- 230000015556 catabolic process Effects 0.000 description 1
- 125000002091 cationic group Chemical group 0.000 description 1
- 238000010370 cell cloning Methods 0.000 description 1
- 230000004663 cell proliferation Effects 0.000 description 1
- 230000005859 cell recognition Effects 0.000 description 1
- 239000006285 cell suspension Substances 0.000 description 1
- 239000013522 chelant Substances 0.000 description 1
- 239000002738 chelating agent Substances 0.000 description 1
- 239000007795 chemical reaction product Substances 0.000 description 1
- 210000000991 chicken egg Anatomy 0.000 description 1
- 235000012000 cholesterol Nutrition 0.000 description 1
- 229960001231 choline Drugs 0.000 description 1
- OEYIOHPDSNJKLS-UHFFFAOYSA-N choline Chemical compound C[N+](C)(C)CCO OEYIOHPDSNJKLS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 101150043719 clpP1 gene Proteins 0.000 description 1
- 238000001246 colloidal dispersion Methods 0.000 description 1
- 239000000084 colloidal system Substances 0.000 description 1
- 239000012141 concentrate Substances 0.000 description 1
- 230000001268 conjugating effect Effects 0.000 description 1
- 230000021615 conjugation Effects 0.000 description 1
- 238000011109 contamination Methods 0.000 description 1
- 238000007796 conventional method Methods 0.000 description 1
- 230000008878 coupling Effects 0.000 description 1
- 238000010168 coupling process Methods 0.000 description 1
- 238000005859 coupling reaction Methods 0.000 description 1
- 239000003431 cross linking reagent Substances 0.000 description 1
- 238000012258 culturing Methods 0.000 description 1
- UHDGCWIWMRVCDJ-ZAKLUEHWSA-N cytidine Chemical compound O=C1N=C(N)C=CN1[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](CO)O1 UHDGCWIWMRVCDJ-ZAKLUEHWSA-N 0.000 description 1
- 230000016396 cytokine production Effects 0.000 description 1
- 230000000120 cytopathologic effect Effects 0.000 description 1
- 230000001086 cytosolic effect Effects 0.000 description 1
- 231100000433 cytotoxic Toxicity 0.000 description 1
- 210000001151 cytotoxic T lymphocyte Anatomy 0.000 description 1
- 230000001472 cytotoxic effect Effects 0.000 description 1
- 231100000135 cytotoxicity Toxicity 0.000 description 1
- 230000003013 cytotoxicity Effects 0.000 description 1
- 230000003247 decreasing effect Effects 0.000 description 1
- 238000006731 degradation reaction Methods 0.000 description 1
- 210000001787 dendrite Anatomy 0.000 description 1
- 230000004041 dendritic cell maturation Effects 0.000 description 1
- 239000005547 deoxyribonucleotide Substances 0.000 description 1
- 125000002637 deoxyribonucleotide group Chemical group 0.000 description 1
- 230000001419 dependent effect Effects 0.000 description 1
- 238000013461 design Methods 0.000 description 1
- 239000003599 detergent Substances 0.000 description 1
- 239000000032 diagnostic agent Substances 0.000 description 1
- 229940039227 diagnostic agent Drugs 0.000 description 1
- 239000003085 diluting agent Substances 0.000 description 1
- 230000003292 diminished effect Effects 0.000 description 1
- 239000003937 drug carrier Substances 0.000 description 1
- 238000004520 electroporation Methods 0.000 description 1
- 238000002330 electrospray ionisation mass spectrometry Methods 0.000 description 1
- 230000008030 elimination Effects 0.000 description 1
- 238000003379 elimination reaction Methods 0.000 description 1
- 238000005538 encapsulation Methods 0.000 description 1
- 230000008029 eradication Effects 0.000 description 1
- 210000003527 eukaryotic cell Anatomy 0.000 description 1
- 238000011156 evaluation Methods 0.000 description 1
- 210000001808 exosome Anatomy 0.000 description 1
- 231100000776 exotoxin Toxicity 0.000 description 1
- 239000002095 exotoxin Substances 0.000 description 1
- 239000013613 expression plasmid Substances 0.000 description 1
- 238000000605 extraction Methods 0.000 description 1
- 208000011323 eye infectious disease Diseases 0.000 description 1
- 210000002950 fibroblast Anatomy 0.000 description 1
- 108700014844 flt3 ligand Proteins 0.000 description 1
- 239000012530 fluid Substances 0.000 description 1
- 238000009472 formulation Methods 0.000 description 1
- 238000004108 freeze drying Methods 0.000 description 1
- 229940083124 ganglion-blocking antiadrenergic secondary and tertiary amines Drugs 0.000 description 1
- 238000001502 gel electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 238000002523 gelfiltration Methods 0.000 description 1
- 238000001476 gene delivery Methods 0.000 description 1
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 description 1
- 238000010353 genetic engineering Methods 0.000 description 1
- 102000054766 genetic haplotypes Human genes 0.000 description 1
- 239000003365 glass fiber Substances 0.000 description 1
- 235000013922 glutamic acid Nutrition 0.000 description 1
- 239000004220 glutamic acid Substances 0.000 description 1
- ZDXPYRJPNDTMRX-UHFFFAOYSA-N glutamine Natural products OC(=O)C(N)CCC(N)=O ZDXPYRJPNDTMRX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229960003180 glutathione Drugs 0.000 description 1
- 125000003630 glycyl group Chemical group [H]N([H])C([H])([H])C(*)=O 0.000 description 1
- 239000005090 green fluorescent protein Substances 0.000 description 1
- 101150107092 had gene Proteins 0.000 description 1
- 229940047650 haemophilus influenzae Drugs 0.000 description 1
- 230000005802 health problem Effects 0.000 description 1
- 239000000185 hemagglutinin Substances 0.000 description 1
- 208000006454 hepatitis Diseases 0.000 description 1
- 231100000283 hepatitis Toxicity 0.000 description 1
- 150000002411 histidines Chemical class 0.000 description 1
- 125000000487 histidyl group Chemical group [H]N([H])C(C(=O)O*)C([H])([H])C1=C([H])N([H])C([H])=N1 0.000 description 1
- 210000005260 human cell Anatomy 0.000 description 1
- 230000008348 humoral response Effects 0.000 description 1
- 210000004754 hybrid cell Anatomy 0.000 description 1
- 239000001257 hydrogen Substances 0.000 description 1
- 229910052739 hydrogen Inorganic materials 0.000 description 1
- 230000002209 hydrophobic effect Effects 0.000 description 1
- 208000030843 hydrosalpinx Diseases 0.000 description 1
- 125000002887 hydroxy group Chemical group [H]O* 0.000 description 1
- 238000003384 imaging method Methods 0.000 description 1
- 230000036737 immune function Effects 0.000 description 1
- 238000003365 immunocytochemistry Methods 0.000 description 1
- 230000007813 immunodeficiency Effects 0.000 description 1
- 229940072221 immunoglobulins Drugs 0.000 description 1
- 230000006054 immunological memory Effects 0.000 description 1
- 230000001771 impaired effect Effects 0.000 description 1
- 201000001371 inclusion conjunctivitis Diseases 0.000 description 1
- 230000004054 inflammatory process Effects 0.000 description 1
- 239000003112 inhibitor Substances 0.000 description 1
- 238000011081 inoculation Methods 0.000 description 1
- 150000007529 inorganic bases Chemical class 0.000 description 1
- 229960003786 inosine Drugs 0.000 description 1
- 230000010354 integration Effects 0.000 description 1
- 230000000968 intestinal effect Effects 0.000 description 1
- 238000007917 intracranial administration Methods 0.000 description 1
- 238000007912 intraperitoneal administration Methods 0.000 description 1
- 238000001990 intravenous administration Methods 0.000 description 1
- 238000007852 inverse PCR Methods 0.000 description 1
- 238000011835 investigation Methods 0.000 description 1
- 239000003456 ion exchange resin Substances 0.000 description 1
- 229920003303 ion-exchange polymer Polymers 0.000 description 1
- 229910052742 iron Inorganic materials 0.000 description 1
- 230000002427 irreversible effect Effects 0.000 description 1
- 230000007803 itching Effects 0.000 description 1
- 210000003292 kidney cell Anatomy 0.000 description 1
- 239000010410 layer Substances 0.000 description 1
- 239000002523 lectin Substances 0.000 description 1
- GZQKNULLWNGMCW-PWQABINMSA-N lipid A (E. coli) Chemical compound O1[C@H](CO)[C@@H](OP(O)(O)=O)[C@H](OC(=O)C[C@@H](CCCCCCCCCCC)OC(=O)CCCCCCCCCCCCC)[C@@H](NC(=O)C[C@@H](CCCCCCCCCCC)OC(=O)CCCCCCCCCCC)[C@@H]1OC[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](OC(=O)C[C@H](O)CCCCCCCCCCC)[C@@H](NC(=O)C[C@H](O)CCCCCCCCCCC)[C@@H](OP(O)(O)=O)O1 GZQKNULLWNGMCW-PWQABINMSA-N 0.000 description 1
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 1
- 229910052744 lithium Inorganic materials 0.000 description 1
- 230000004807 localization Effects 0.000 description 1
- 210000004072 lung Anatomy 0.000 description 1
- 210000001165 lymph node Anatomy 0.000 description 1
- 230000000527 lymphocytic effect Effects 0.000 description 1
- 239000006166 lysate Substances 0.000 description 1
- 230000002934 lysing effect Effects 0.000 description 1
- 230000002101 lytic effect Effects 0.000 description 1
- 159000000003 magnesium salts Chemical class 0.000 description 1
- 239000006249 magnetic particle Substances 0.000 description 1
- 239000003550 marker Substances 0.000 description 1
- 230000007246 mechanism Effects 0.000 description 1
- 229910052751 metal Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000002184 metal Substances 0.000 description 1
- 229910044991 metal oxide Inorganic materials 0.000 description 1
- 150000004706 metal oxides Chemical class 0.000 description 1
- 229960000485 methotrexate Drugs 0.000 description 1
- 238000002493 microarray Methods 0.000 description 1
- 239000011859 microparticle Substances 0.000 description 1
- 238000002156 mixing Methods 0.000 description 1
- 238000010172 mouse model Methods 0.000 description 1
- 230000016379 mucosal immune response Effects 0.000 description 1
- 238000006452 multicomponent reaction Methods 0.000 description 1
- 238000002887 multiple sequence alignment Methods 0.000 description 1
- 210000003205 muscle Anatomy 0.000 description 1
- 230000035772 mutation Effects 0.000 description 1
- 210000004296 naive t lymphocyte Anatomy 0.000 description 1
- 239000002088 nanocapsule Substances 0.000 description 1
- 210000002850 nasal mucosa Anatomy 0.000 description 1
- 238000011392 neighbor-joining method Methods 0.000 description 1
- 229910052757 nitrogen Inorganic materials 0.000 description 1
- 231100000252 nontoxic Toxicity 0.000 description 1
- 230000003000 nontoxic effect Effects 0.000 description 1
- 239000002853 nucleic acid probe Substances 0.000 description 1
- 230000000269 nucleophilic effect Effects 0.000 description 1
- 239000007764 o/w emulsion Substances 0.000 description 1
- 229920001542 oligosaccharide Polymers 0.000 description 1
- 150000002482 oligosaccharides Chemical class 0.000 description 1
- 239000013307 optical fiber Substances 0.000 description 1
- 210000000056 organ Anatomy 0.000 description 1
- 150000007530 organic bases Chemical class 0.000 description 1
- 230000003204 osmotic effect Effects 0.000 description 1
- 229940092253 ovalbumin Drugs 0.000 description 1
- 229940055729 papain Drugs 0.000 description 1
- 235000019834 papain Nutrition 0.000 description 1
- 230000008506 pathogenesis Effects 0.000 description 1
- 239000008188 pellet Substances 0.000 description 1
- 210000003200 peritoneal cavity Anatomy 0.000 description 1
- 239000000546 pharmaceutical excipient Substances 0.000 description 1
- 239000012071 phase Substances 0.000 description 1
- COLNVLDHVKWLRT-UHFFFAOYSA-N phenylalanine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CC=CC=C1 COLNVLDHVKWLRT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 150000004633 phorbol derivatives Chemical class 0.000 description 1
- 239000002644 phorbol ester Substances 0.000 description 1
- 150000003904 phospholipids Chemical class 0.000 description 1
- 150000008300 phosphoramidites Chemical class 0.000 description 1
- 101150010607 pmpA gene Proteins 0.000 description 1
- 101150116202 pmpF gene Proteins 0.000 description 1
- 229920001606 poly(lactic acid-co-glycolic acid) Polymers 0.000 description 1
- 229920000058 polyacrylate Polymers 0.000 description 1
- 230000008488 polyadenylation Effects 0.000 description 1
- 229920000642 polymer Polymers 0.000 description 1
- 108010005636 polypeptide C Proteins 0.000 description 1
- 239000011148 porous material Substances 0.000 description 1
- 239000011591 potassium Substances 0.000 description 1
- 229910052700 potassium Inorganic materials 0.000 description 1
- 230000003389 potentiating effect Effects 0.000 description 1
- 238000001556 precipitation Methods 0.000 description 1
- 239000003755 preservative agent Substances 0.000 description 1
- 230000002265 prevention Effects 0.000 description 1
- 150000003141 primary amines Chemical class 0.000 description 1
- 238000012545 processing Methods 0.000 description 1
- 210000001236 prokaryotic cell Anatomy 0.000 description 1
- 210000002307 prostate Anatomy 0.000 description 1
- 238000002731 protein assay Methods 0.000 description 1
- 238000001742 protein purification Methods 0.000 description 1
- 150000003212 purines Chemical class 0.000 description 1
- 239000001397 quillaja saponaria molina bark Substances 0.000 description 1
- 150000003248 quinolines Chemical class 0.000 description 1
- 230000000601 reactogenic effect Effects 0.000 description 1
- 238000003259 recombinant expression Methods 0.000 description 1
- 230000000717 retained effect Effects 0.000 description 1
- 230000002207 retinal effect Effects 0.000 description 1
- 239000002336 ribonucleotide Substances 0.000 description 1
- 125000002652 ribonucleotide group Chemical group 0.000 description 1
- 229930182490 saponin Natural products 0.000 description 1
- 150000007949 saponins Chemical group 0.000 description 1
- 238000007423 screening assay Methods 0.000 description 1
- 239000006152 selective media Substances 0.000 description 1
- 230000008313 sensitization Effects 0.000 description 1
- 238000002864 sequence alignment Methods 0.000 description 1
- 238000013207 serial dilution Methods 0.000 description 1
- 230000000405 serological effect Effects 0.000 description 1
- 230000035939 shock Effects 0.000 description 1
- 210000003491 skin Anatomy 0.000 description 1
- 210000001626 skin fibroblast Anatomy 0.000 description 1
- 239000011734 sodium Substances 0.000 description 1
- 229910052708 sodium Inorganic materials 0.000 description 1
- 238000002415 sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 125000006850 spacer group Chemical group 0.000 description 1
- 238000011895 specific detection Methods 0.000 description 1
- 238000004611 spectroscopical analysis Methods 0.000 description 1
- 238000012289 standard assay Methods 0.000 description 1
- 229940031000 streptococcus pneumoniae Drugs 0.000 description 1
- 125000004434 sulfur atom Chemical group 0.000 description 1
- 230000004083 survival effect Effects 0.000 description 1
- 208000024891 symptom Diseases 0.000 description 1
- 230000009885 systemic effect Effects 0.000 description 1
- 230000008685 targeting Effects 0.000 description 1
- WROMPOXWARCANT-UHFFFAOYSA-N tfa trifluoroacetic acid Chemical compound OC(=O)C(F)(F)F.OC(=O)C(F)(F)F WROMPOXWARCANT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- HNKJADCVZUBCPG-UHFFFAOYSA-N thioanisole Chemical compound CSC1=CC=CC=C1 HNKJADCVZUBCPG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- RYYWUUFWQRZTIU-UHFFFAOYSA-K thiophosphate Chemical compound [O-]P([O-])([O-])=S RYYWUUFWQRZTIU-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 1
- 230000036962 time dependent Effects 0.000 description 1
- 238000012090 tissue culture technique Methods 0.000 description 1
- 230000000699 topical effect Effects 0.000 description 1
- 206010044325 trachoma Diseases 0.000 description 1
- 230000005030 transcription termination Effects 0.000 description 1
- 230000002103 transcriptional effect Effects 0.000 description 1
- 230000009261 transgenic effect Effects 0.000 description 1
- 238000003146 transient transfection Methods 0.000 description 1
- 238000002054 transplantation Methods 0.000 description 1
- 238000011269 treatment regimen Methods 0.000 description 1
- OUYCCCASQSFEME-UHFFFAOYSA-N tyrosine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CC=C(O)C=C1 OUYCCCASQSFEME-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 150000003668 tyrosines Chemical class 0.000 description 1
- 231100000397 ulcer Toxicity 0.000 description 1
- 241000712461 unidentified influenza virus Species 0.000 description 1
- 241001515965 unidentified phage Species 0.000 description 1
- 238000011144 upstream manufacturing Methods 0.000 description 1
- DRTQHJPVMGBUCF-UHFFFAOYSA-N uracil arabinoside Natural products OC1C(O)C(CO)OC1N1C(=O)NC(=O)C=C1 DRTQHJPVMGBUCF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229940045145 uridine Drugs 0.000 description 1
- 229940125575 vaccine candidate Drugs 0.000 description 1
- 210000001215 vagina Anatomy 0.000 description 1
- 229940126580 vector vaccine Drugs 0.000 description 1
- 239000013603 viral vector Substances 0.000 description 1
- 210000002845 virion Anatomy 0.000 description 1
- 238000001262 western blot Methods 0.000 description 1
- QAOHCFGKCWTBGC-QHOAOGIMSA-N wybutosine Chemical compound C1=NC=2C(=O)N3C(CC[C@H](NC(=O)OC)C(=O)OC)=C(C)N=C3N(C)C=2N1[C@@H]1O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@H]1O QAOHCFGKCWTBGC-QHOAOGIMSA-N 0.000 description 1
- QAOHCFGKCWTBGC-UHFFFAOYSA-N wybutosine Natural products C1=NC=2C(=O)N3C(CCC(NC(=O)OC)C(=O)OC)=C(C)N=C3N(C)C=2N1C1OC(CO)C(O)C1O QAOHCFGKCWTBGC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 210000005253 yeast cell Anatomy 0.000 description 1
- 150000003751 zinc Chemical class 0.000 description 1
Classifications
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
- A61K38/16—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/195—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from bacteria
- C07K14/295—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from bacteria from Chlamydiales (O)
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
- A61K39/46—Cellular immunotherapy
- A61K39/461—Cellular immunotherapy characterised by the cell type used
- A61K39/4611—T-cells, e.g. tumor infiltrating lymphocytes [TIL], lymphokine-activated killer cells [LAK] or regulatory T cells [Treg]
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
- A61K39/46—Cellular immunotherapy
- A61K39/461—Cellular immunotherapy characterised by the cell type used
- A61K39/4615—Dendritic cells
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
- A61K39/46—Cellular immunotherapy
- A61K39/462—Cellular immunotherapy characterized by the effect or the function of the cells
- A61K39/4622—Antigen presenting cells
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
- A61K39/46—Cellular immunotherapy
- A61K39/464—Cellular immunotherapy characterised by the antigen targeted or presented
- A61K39/4648—Bacterial antigens
- A61K39/464835—Chlamydiaceae, e.g. Chlamydia trachomatis or Chlamydia psittaci
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
- A61P31/04—Antibacterial agents
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P37/00—Drugs for immunological or allergic disorders
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P37/00—Drugs for immunological or allergic disorders
- A61P37/02—Immunomodulators
- A61P37/04—Immunostimulants
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P43/00—Drugs for specific purposes, not provided for in groups A61P1/00-A61P41/00
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
- A61K2039/505—Medicinal preparations containing antigens or antibodies comprising antibodies
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
- A61K2039/51—Medicinal preparations containing antigens or antibodies comprising whole cells, viruses or DNA/RNA
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
- A61K2039/51—Medicinal preparations containing antigens or antibodies comprising whole cells, viruses or DNA/RNA
- A61K2039/515—Animal cells
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
- A61K2039/51—Medicinal preparations containing antigens or antibodies comprising whole cells, viruses or DNA/RNA
- A61K2039/515—Animal cells
- A61K2039/5154—Antigen presenting cells [APCs], e.g. dendritic cells or macrophages
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
- A61K2039/51—Medicinal preparations containing antigens or antibodies comprising whole cells, viruses or DNA/RNA
- A61K2039/53—DNA (RNA) vaccination
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K48/00—Medicinal preparations containing genetic material which is inserted into cells of the living body to treat genetic diseases; Gene therapy
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K2319/00—Fusion polypeptide
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- Public Health (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Immunology (AREA)
- Epidemiology (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Mycology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Oncology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Communicable Diseases (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Medicines Containing Antibodies Or Antigens For Use As Internal Diagnostic Agents (AREA)
- Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
- Nitrogen And Oxygen Or Sulfur-Condensed Heterocyclic Ring Systems (AREA)
Description
Sloučeniny a způsoby léčení a diagnózy chlamydiální infekce
Oblast techniky
Předkládaný vynález se týká obecně detekce a léčby chlamydiových infekcí. Přesněji se vynálnz^týká-prú^^pg-ptl-důobsahujících chlamydiový antigen a použití takových polypeptidů pro serodiagnostiku a léčbu chlamydiových infekcí.
Dosavadní stav techniky
Chlamydie jsou intracelulární bakteriální patogeny, které jsou odpovědné za mnoho významných lidských a živočišných infekcí. Chlamydia trachomatis je jednou z nejčastějších příčin sexuálně přenosných nemocí a může vést k zánětlivému onemocnění pánve (PID), které vede k obstrukci vejcovodů a neplodnosti. Chlamydia trachomatis může mít také úlohu v neplodnosti mužů. V roce 1990 byly náklady na léčbu PID v USA přibližně 4 biliony dolarů. Trachom, který je způsobený oční infekcí Chlamydia trachomatis, je hlavní příčinou slepoty ve světě. Chlamydia pneumoniae je významnou příčinou akutních infekcí respiračního traktu u člověka a také se předpokládá, že má úlohu v patogenesi atherosklerosy a, zejména, ischemické choroby srdeční. Bylo prokázáno, že jedinci s vysokým titrem protilátek proti Chlamydia pneumoniae mají alespoň dvojnásobné riziko vzniku ischemické choroby srdeční než seronegativní jedinci. Chlamydiové infekce tak tvoří značný zdravotnický problém v USA a jinde ve světě.
Chlamydiové infekce jsou často asymptomatické. Například, v době, kdy ženy vyhledají lékaře pro PID, již často došlo k ireverzibilnímu postižení vedoucímu k neplodnosti. Proto existuje potřeba lepších vakcín a farmaceutických prostředků pro léčbu a prevenci Chlamydiových infekcí. Předkládaný vynález splňuje tuto
• · · · • · · · potřebu a poskytuje další související výhody.
Podstata vynálezu
Předkládaný vynález poskytuje prostředky a způsoby pro diagnostiku a terapii Chlamydiových infekcí. V jednom aspektu vynález poskytuje polypeptidy obsahující imunogenní část chlamydiového antigenu, nebo varianty takového antigenu. Některé části a jiné varianty jsou imunogenní, takže schopnost varianty reagovat s antisérem specifickým pro antigen není významným způsobem narušena. V některých provedeních obsahuje polypeptid aminokyselinové sekvence kódované polynukleotidovou sekvencí vybranou ze skupiny zahrnující (a) sekvence SEQ ID NO-.358-361, 366-385, 406-430, 455-489, 516-517, 523-559 a 582-596; (b) sekvence komplementární k sekvencím uvedeným v (a) ; a (c) sekvence, které hybridízují na sekvence (a) nebo (b) za středně přísných podmínek. Ve specifickém provedení obsahují polypeptidy podle předkládaného vynálezu alespoň část chlamydiového proteinu, který obsahuje aminokyselinovou sekvenci vybranou ze skupiny zahrnující sekvence uvedené v SEQ ID NO: 362-365, 386-405,
431-454, 490-515, 518-522, 560-581 a 597-599, a jejich varianty.
Předkládaný vynález dále poskytuje polynukleotidy, které kódují polypeptid popsaný výše nebo jeho část (jako je část kódující alespoň 15 aminokyselinových zbytků chlamydiového proteinu), expresní vektory obsahující takové polynukleotidy a hostitelské buňky transformované nebo transfektované takovými expresními vektory.
V příbuzném aspektu vynález poskytuje polynukleotidové sekvence kódující výše uvedené polypeptidy, rekombinantní expresní vektory obsahující jednu nebo více těchto polynukleotidových sekvencí a hostitelské buňky transformované nebo transfektované takovými • · · · · • ··· expresními vektory..
V jiném aspektu vynález poskytuje fúzní proteiny obsahující polypeptid podle předkládaného vynálezu nebo, alternativně, polypeptid podle předkládaného vynálezu a známý chlamydiový antigen, stejně jako polynukleotidy kódující takové fúzní proteiny, v kombinaci s fyziologicky přijatelným nosičem nebo imunostimulačním činidlem pro použití jako farmaceutické prostředky nebo vakcíny.
Předkládaný vynález dále poskytuje farmaceutické prostředky, které obsahují: (a) protilátku, monoklonální nebo polyklonální, nebo její vazebný fragment pro antigen, která se specificky váže na chlamydiový protein; a (b) fyziologicky přijatelný nosič. V jiném aspektu vynález poskytuje farmaceutické prostředky, které obsahují jeden nebo více chlamydiových polypeptidů podle předkládaného vynálezu, například polypeptidů podle SEQ ID NO: 362-365, 386-405, 431-454, 490-515, 518-522, 560-581 a 597-599, nebo polynukleotidovou molekulu kódující takový polypeptid, jako je polynukleotidová molekula podle SEQ ID NO:358-361, 366-385, 406-430, 455-489, 516-517, 523-559 a 582-596, a fyziologicky přijatelný nosič. Vynález také poskytuje vakcíny pro profylaktické a terapeutické účely obsahující jeden nebo více popsaných polypeptidů a imunostimulační činidlo, jak je zde definováno, společně s vakcínami obsahujícími jednu nebo více polynukleotidových sekvencí kódujících takové polypeptidy, a imunostimulační činidlo.
V ještě jiném aspektu vynález poskytuje způsoby pro indukci protektivní imunity u pacienta, při kterých je pacientovi podáno účinné množství jednoho nebo více výše uvedených farmaceutických prostředků nebo vakcín.
V ještě dalším aspektu vynález poskytuje způsoby pro léčbu chlamydiových infekcí u pacienta, které zahrnují získání mononukleámích buněk periferní krve (PBMC) od pacienta, inkubaci PBMC s polypeptidem podle předkládaného vynálezu (nebo s polynukleotidem kódujícím takový polypeptid) za zisku inkubovaných T-lymfocytů a podání inkubovaných T-lymfocytů pacientovi. Předkládaný vynález dále poskytuje způsoby pro léčbu chlamydiových infekcí, které zahrnují inkubaci buněk prezentujících antigen s polypeptidem podle předkládaného vynálezu (nebo s polynukleotidem kódujícím takový polypeptid) za zisku inkubovaných buněk prezentujících antigen a podání inkubovaných buněk prezentujících antigen pacientovi. Proliferované buňky mohou, ale nemusí, být před podáním pacientovi klonovány. V některých provedeních jsou buňky prezentující antigen vybrány ze skupiny zahrnující dendritické buňky, makrofágy, monocyty, B-lymfocyty a fibroblasty. Vynález také poskytuje prostředky pro léčbu chlamydiových infekcí obsahující T-lymfocyty nebo buňky prezentující antigen, které byly inkubovány s polypeptidem nebo polynukleotidem podle předkládaného vynálezu. V příbuzném aspektu vynález poskytuje vakcíny, které obsahují: (a) buňku prezentující antigen, která exprimuje polypeptid popsaný výše; a (b) imunostimulační činidlo.
Předkládaný vynález dále poskytuje, v dalších aspektech, způsoby pro odstranění buněk infikovaných chlamydiemi z biologického vzorku, které zahrnují kontaktování biologického vzorku s T-lymfocyty, které specificky reagují s chlamydiovým proteinem, kde toto kontaktování je provedeno za podmínek a po dobu dostatečnou pro odstranění buněk exprimujících protein ze vzorku.
V příbuzných aspektech vynález poskytuje způsoby pro inhibici vývoje chlamydiové infekce u pacienta, při kterých je pacientovi podán biologický vzorek zpracovaný způsobem uvedeným výše. V ·· ···· • · ··· · • ··· dalších aspektech vynález poskytuje způsoby a diagnostické kity pro detekci chlamydiové infekce u pacienta. V jednom provedení způsob zahrnuje: (a) kontaktování biologického vzorku s alespoň jedním polypeptidem nebo fúzním proteinem podle předkládaného vynálezu; a (b) detekci přítomnosti vazebného činidla, které se váže na polypeptid nebo na fúzní protein, ve vzorku, a tím detekci chlamydiové infekce v biologickém vzorku. Vhodnými biologickými vzorky jsou například plná krev, sputum, sérum, plasma, sliny, mozkomíšní mok a moč. V jednom provedení diagnostické kity obsahují jeden nebo více polypeptidů nebo fúzních proteinů podle předkládaného vynálezu v kombinaci s detekčním činidlem. V jiném provedení obsahuje diagnostický kit monoklonální protilátku nebo polyklonální protilátku, která se váže na polypeptid podle předkládaného vynálezu.
Předkládaný vynález také poskytuje způsoby pro detekci chlamydiové infekce, které zahrnují: (a) získání biologického vzorku od pacienta; (b) kontaktování vzorku s alespoň dvěma polynukleotidovými primery v polymerasové řetězové reakci, kde alespoň jeden oligonukleotidový primer je specifický pro polynukleotidovou sekvenci podle předkládaného vynálezu; a (c) detekci polynukleotidové sekvence ve vzorku, která se amplifikuje za přítomnosti oligonukleotidového primerů. V jednom provedení obsahuje oligonukleotidový primer alespoň 10 kontinuálních nukleotidů polynukleotidové sekvence podle předkládaného vynálezu, nebo sekvence, která hybridizuje na tuto sekvenci.
Předkládaný vynález také poskytuje způsoby pro detekci chlamydiové infekce u pacienta, které zahrnují: (a) získání biologického vzorku od pacienta; (b) kontaktování vzorku s oligonukleotidovou sondou specifickou pro polynukleotidovou sekvenci podle předkládaného vynálezu; a (c) detekci polynukleotidové sekvence ve vzorku, která hybridizuje na
I* lí • ··« ···· ··>
• · · • · ··· • · · • ·
oligonukleotidovou sekvenci. V jednom provedení obsahuje oligonukleotidová sonda alespoň 15 kontinuálních nukleotidů polynukleotidové sekvence podle předkládaného vynálezu, nebo sekvence, která hybridizuje na tuto sekvenci.
Tyto a další aspekty předkládaného vynálezu budou jasné z následujícího podrobného popisu. Všechny citace jsou zde uvedeny j ako odkazy ve své úplnosti.
Popis sekvencí
SEQ ID NO: 1 je určená DNA sekvence pro C. trachomatis klon 1-B1-66.
SEQ ID NO: 2 je určená DNA sekvence pro C. trachomatis klon
4-D7-28.
SEQ ID NO: 3 je určená DNA sekvence pro C. trachomatis 3 klon
3- G3-10.
SEQ ID NO: 4 je určená DNA sekvence pro C. trachomatis klon I0-C10-31.
SEQ ID NO: 5 je předpokládaná aminokyselinová sekvence pro l-Bl-66.
SEQ ID NO: 6 je předpokládaná aminokyselinová sekvence pro
4- D7-28.
SEQ ID NO: 7 je první předpokládaná aminokyselinová sekvence pro
3-G3-10.
SEQ ID NO: 8 je druhá předpokládaná aminokyselinová sekvence pro
3-G3-10.
SEQ ID NO: 9 je třetí předpokládaná aminokyselinová sekvence pro
3-G3-10.
SEQ ID NO: 10 je čtvrtá předpokládaná aminokyselinová sekvence pro 3-G3-10.
SEQ ID NO: 11 je pátá předpokládaná aminokyselinová sekvence pro
3-G3-10.
·« ·♦·· ·· ., * · · ’ ..
• ··· ♦ Λ ...
• · . . . .
···· ·«« *,.* ·,, 7
SEQ ID NO: 12 10-C10-31.
SEQ ID NO: 13 1-B1-66/48-67 SEQ ID NO: 14 je předpokládaná aminokyselinová sekvence pro je aminokyselinová sekvence syntetického peptidů je aminokyselinová sekvence syntetického peptidů
1-B1-66/58-77.
SEQ ID NO: 15 je určená DNA. sekvence pro C. trachomatis serovar LGV II, klon 2C7-8.
SEQ ID NO: 16 je DNA sekvence domnělého otevřeného čtecího rámce z regionu genomu C. trachomatis serovaru D, kam se mapuje 2C7-8. SEQ ID NO: 17 je předpokládaná aminokyselinová sekvence kódovaná DNA sekvencí SEQ ID NO: 16.
SEQ ID NO: 18 je aminokyselinová sekvence syntetického peptidů
CtC7.8-12.
SEQ ID NO: CtC7.8-13. SEQ ID NO:
je aminokyselinová sekvence syntetického peptidů je předpokládaná aminokyselinová sekvence kódovaná druhým domnělým otevřeným čtecím rámcem C. trachomatis serovaru
D.
SEQ ID NO: 21 je určená DNA sekvence pro klon 4C9-18
C.trachomatis LGV II.
SEQ ID NO: 22 je určená DNA sekvence homologická s lipoamid-dehydrogenasou z C. trachomatis LGV II
SEQ ID NO: 23 je určená DNA sekvence homologická s hypotetickým proteinem C. trachomatis LGV II
SEQ ID NO: 24 je určená DNA sekvence homologická s ubichinon-mehtyltransferasou C. trachomatis LGV II
SEQ ID NO: 25 je určená DNA sekvence pro klon 4C9-18-2 BL21 pLysS C. trachomatis LGV II
SEQ ID NO: 26 je předpokládaná aminokyselinová sekvence pro 4C9-182 C. trachomatis LGV II
SEQ ID NO: 27 je určená DNA sekvence pro Cp-SWIB C. pneumonia kmene TWAR • « · • ··· ·* • · · • ·
• · · ·· «4
SEQ ID NO: 28 je předpokládaná aminokyselinová sekvence pro Cp-SWIB C. pneumonia kmene TWAR
SEQ ID NO: 29 je určená DNA sekvence pro Cp-S13 (CT509) C. pneumonia kmene TWAR
SEQ ID NO: 30 je předpokládaná aminokyselinová sekvence pro Cp-S13 C. pneumonia kmene TWAR
SEQ ID NO: 31 je aminokyselinová sekvence pro a 10-měrový konvenční peptid z CtC7.8-12 a CtC7.8-13
SEQ ID NO: 32 je předpokládaná aminokyselinová sekvence pro klon 2C7-8 C. trachomatis LGV II
SEQ ID NO: 33 je DNA sekvence odpovídající nukleotidům
597304-597145 genomu C. trachomatis serovaru D {NCBI, BLASTN prohledávání), která vykazuje homologii s klonem 2C7-8 SEQ ID NO: 34 je předpokládaná aminokyselinová sekvence kódovaná sekvencí SEQ ID NO: 33
SEQ ID NO: 35 je DNA sekvence pro C.p. SWIB Nde (5' primer) C. pneumonia
SEQ ID NO: 36 je DNA sekvence pro C.p. SWIB EcoRI (3' primer) C. pneumonia
SEQ ID NO : 37 je DNA sekvence pro C.p. S13 Nde {5’ primer) C. pneumonia
SEQ ID NO: 38 je DNA sekvence pro C.p. 813 EcoRI (3' primer) C. pneumonia
SEQ ID NO: 39 je aminokyselinová sekvence pro CtSwib 52-67 peptid C. trachomatis LGV II
SEQ ID NO: 40 je aminokyselinová sekvence pro CpSwib 53-68 peptid C. pneumonia
SEQ ID NO: 41 je aminokyselinová sekvence pro HuSwib 288-302 peptid lidské SWI domény
SEQ ID NO: 42 je aminokyselinová sekvence pro CtSWI-T 822-837 peptid z fúze topoisomerasa-SWIB C. trachomatis SEQ ID NO: 43 je aminokyselinová sekvence pro CpSWI-T 828-842 peptid z fúze topoisomeras-SWIB C. pneumonia • · · · ···· ··· ·· ·· ·· ··
SEQ ID NO: 44 je první určená DNA sekvence pro C. trachomatis LGV II klon 19783.3,jen.seq(l>509)CTL2#ll-3' , představující 3' konec. SEQ ID NO: 45 je druhá určená DNA sekvence pro C. trachomatis LGV II klon 19783.4jen.seq<l>481)CTL2#ll-5', představující 5' konec. SEQ ID NO: 46 je určená DNA sekvence pro C. trachomatis LGV -II klon 19784CTL2_1 2consensus.seq(1>427)CTL2#12.
SEQ ID NO: 47 je určená DNA sekvence pro C. trachomatis LGV II klon 19785.4,jen.seq(l>600)CTL2#l6-5 ' , představující 5' konec.
SEQ ID NO: 48 je první určená DNA sekvence pro C. trachomatis LGV II klon 19786.3,jen.seq(l>600)CTL2#18-3' , představující 3' konec. SEQ ID NO: 49 je druhá určená DNA sekvence pro C. trachomatis LGV II klon 19786.4,jen.seq(l>600)CTL2#l8-5' , představující 5' konec. SEQ ID NO: 50 je určená DNA sekvence pro C. trachomatis LGV II klon 19788CTL2_21 consensus.seq(1 >406)CTL21121.
SEQ ID NO: 51 je určená DNA sekvence pro C. trachomatis LGV II klon 19790CTL2_23consensus.seq{l>602)CTL2#23.
SEQ ID NO: 52 je určená DNA sekvence pro C. trachomatis LGV II klon 19791CTL2_24consensus.seq(1>145)CTL21124.
| SEQ ID NO: 53 | ΐθ | určená | DNA | sekvence | pro | C. | trachomatis | LGV | II |
| klon CTL2II4. | |||||||||
| SEQ ID NO: 54 | je | určená | DNA | sekvence | pro | C. | trachomatis | LGV | II |
| klon CTL2#8b. | |||||||||
| SEQ ID NO: 55 | je | určená | DNA | sekvence | pro | C. | trachomatis | LGV | II |
| klonl5-Gl-89, | vykazující homologii s | 1ipoamid-dehydrogenasovým | |||||||
| genem CT557. | |||||||||
| SEQ ID NO: 56 | je | určená | DNA | sekvence | pro | C. | trachomatis | LGV | II |
| klon 14-H 1-4, | vykazující homologii í | 3 thiol | specifickým | ||||||
| ant ioxidačním | genem CT603. | ||||||||
| SEQ ID NO: 57 | je | určená | DNA | sekvence | pro | C. | trachomatis | LGV | II |
klon 12-G3-83, vykazující homologii s hypotetickým proteinem CT622.
SEQ ID NO: 58 je určená DNA sekvence pro C. trachomatis LGV II klon 12-B3-95, vykazující homologii s lipoamid- dehydrogenasovým •Λ genem CT5 5 7 .
SEQ ID NO: 59 je určená DNA sekvence pro C. trachomatis LGV II klon 11-H4-28, vykazující homologii s dnaK genem CT396.
SEQ ID NO: 60 je určená DNA sekvence pro C. trachomatis LGV II klon 11-H3-68, vykazující částečnou homologii s POP6-D proteinem virulence a LI ribosomálním genem CT318.
SEQ ID NO: 61 je určená DNA sekvence pro C. trachomatis LGV II klon 11-01-34, vykazující částečnou homologii s malatdehydrogenasovým genem CT376 a s glykogen-hydrolasovým genem CT042.
SEQ ID NO: 62 je určená DNA sekvence pro C. trachomatis LGV II klon 11-01046, vykazující homologii s hypotetickým proteinem CT61O.
SEQ ID NO: 63 je určená DNA sekvence pro C. trachomatis LGV II klon 11-C 12-91, vykazující homologii s OMIP2 genem CT443.
SEQ ID NO: 64 je určená DNA sekvence pro C. trachomatis LGV II klon 11-A3-93, vykazující homologii s genem HAD superrodiny CT103.
SEQ ID NO: 65 je určená aminokyselinová sekvence pro C.
trachomatis LGV 11 klon 14-H1-4, vykazující homologii s thiol-specifickým antioxidačním genem CT603.
| SEQ ID NO: 66 klon CtL2119. | je | určená | DNA | sekvence | pro | C. | trachomatis | LGV | II |
| SEQ ID NO: 67 klon CtL2#7. | je | určená | DNA | sekvence | pro | C. | trachomatis | LGV | II |
| SEQ ID NO: 68 klon CtL2#6. | je | určená | DNA | sekvence | pro | C. | trachomatis | LGV | II |
| SEQ ID NO: 69 klon CtL2#5. | je | určená | DNA | sekvence | pro | C. | trachomatis | LGV | II |
| SEQ ID NO: 70 klon CtL2#2. | je | určená | DNA | sekvence | pro | C. | trachomatis | LGV | II |
| SEQ ID NO: 71 | je | určená | DNA | sekvence | pro | C. | trachomatis | LGV' | I |
klon CtL21.
SEQ ID NO: 72 je první určená DNA sekvence pro C. trachomatis LGV II klon 23509.2CtL2#3-5', představující 5' konec.
SEQ ID NO: 73 je druhá určená DNA sekvence pro C. trachomatis LGV II klon 23509.1 CtL2#3-3', představující 3' konec.
SEQ ID NO: 74 je první určená DNA sekvence pro C. trachomatis LGV II klon 22121.2CIL2#10-51, představující 5' konec.
SEQ ID NO: 75 je druhá určená DNA sekvence pro C. trachomatis LGV II klon 22121.lCtL2#10-3', představující 3' konec.
SEQ ID NO: 76 je určená DNA sekvence pro C. trachomatis LGV II klon 19787.6CtL2#19-5', představující 5' konec.
SEQ ID NO: 77 je určená DNA sekvence pro C. pneumoniae LGV II klon
CpS 13-His.
SEQ ID NO: 78 je určená DNA sekvence pro C. pneumoniae LGV II klon Cp_SWIB-His.
SEQ ID NO: 79 je určená DNA sekvence pro C. trachomatis LGV II klon 23-07-68, vykazující částečnou homologii s Lil, L10 a Ll ribosomálním proteinem.
SEQ ID NO: 80 je určená DNA sekvence pro C. trachomatis LGV II klon 22-F8-91, vykazující homologii s pmpC genem.
SEQ ID NO: 81 je určená DNA sekvence pro C. trachomatis LGV II klon 21-E8-95, vykazující homologii s CT610-CT613 geny.
SEQ ID NO: 82 je určená DNA sekvence pro C. trachomatis LGV II klon 19-F12-57, vykazující homologii s CT858 a recA geny.
SEQ ID NO: 83 je určená DNA sekvence pro C. trachomatis LGV II klon 19-F12-53, vykazující homologii s CT445 genem kódujícím glutamyl tRNA synthetasu.
SEQ ID NO: 84 je určená DNA sekvence pro C. trachomatis LGV II klon 19-A5-54, vykazující homologii s kryptickým plasmidovým genem.
SEQ ID NO: 85 je určená DNA sekvence pro C. trachomatis LGV II klon 17-E1 1-72, vykazující částečnou homologii s OppC2 a pmpD geny.
SEQ ID NO:
je určená DNA sekvence pro C. trachomatis LGV II
A ·:»'<£·
klon 17-C1-77, vykazující částečnou homologii s CT857 a CT858 otevřeným čtecím rámcem.
SEQ ID NO: 87 je určená DNA sekvence pro C. trachomatis LGV II klon 15-H2-76, vykazující částečnou homologii s pmpD a SycE geny, a s CT089 ORF.
SEQ ID NO: 88 je určená DNA sekvence pro C. trachomatis LGV II klon 15-A3-26, vykazující homologii s CT858 ORF.
SEQ ID NO: 89 je určená aminokyselinová sekvence pro C. pnuemoniae klon CpSWIB-His.
SEQ ID NO: 90 je určená aminokyselinová sekvence pro C. trachomatis LGV' II klon CtL2_LPDA_FL.
SEQ ID NO: 91 je určená aminokyselinová sekvence pro C. pnuemoniae klon CpS 13-His.
SEQ ID NO: 92 je určená aminokyselinová sekvence pro C. trachomatis LGV II klon CtL2_TSA_FL.
SEQ ID NO: 93 je aminokyselinová sekvence pro Ct-Swib 43-61 peptid C. trachomatis LGV II.
SEQ ID NO: 94 je aminokyselinová sekvence pro Ct-Swib 48-67 peptid C. trachomatis LGV II.
SEQ ID NO: 95 je aminokyselinová sekvence pro Ct-Swib 52-71 peptid C. trachomatis LGV II.
SEQ ID NO: 96 je aminokyselinová sekvence pro Ct-Swib 58-77 peptid C. trachomatis LGV II.
SEQ ID NO: 97 je aminokyselinová sekvence pro Ct-Swib 63-82 peptid C. trachomatis LGV II.
SEQ ID NO: 98 je aminokyselinová sekvence pro Ct-Swib 51-66 peptid C. trachomatis LGV II.
SEQ ID NO: 99 je aminokyselinová sekvence pro Ct-Swib 52-67 peptid C. pneumoniae.
SEQ ID NO: 100 je aminokyselinová sekvence pro Cp-Swib 37-51 peptid C. pneumonia.
SEQ ID NO: 101 je aminokyselinová sekvence pro Cp-Swib 32-51 peptid C. pneumonia.
β • ···
SEQ ID NO: 102 je aminokyselinová sekvence pro Cp-Swib 37-56 peptid C. pneumonia.
SEQ ID NO: 103 je aminokyselinová sekvence pro Ct-Swib 36-50 peptid C. trachomatis.
SEQ ID NO: 104 je aminokyselinová sekvence pro Ct-S13 46-65 peptid C. trachomatis.
SEQ ID NO: 105 je aminokyselinová sekvence pro Ct-S13 60-80 peptid C. trachomatis.
SEQ ID NO: 106 je aminokyselinová sekvence pro Ct-S13 1-20 peptid C. trachomatis.
SEQ ID NO: 107 je aminokyselinová sekvence pro Ct-S13 46-65 peptid C. trachomatis.
SEQ ID NO: 108 je aminokyselinová sekvence pro Ct-S13 56-75 peptid C. trachomatis.
SEQ ID NO: 109 je aminokyselinová sekvence pro Cp-S13 56-75 peptid C. pneumoniae.
SEQ ID NO: 110 je určená DNA sekvence pro C. trachomatis LGV' II klon 2 1-012-60, obsahující částečné otevřené čtecí rámce pro hypotetické protein CT87S, CT229 a CT228.
SEQ ID NO: lil je určená DNA sekvence pro C. trachomatis LGV II klon 22-B3-53, vykazující homologii s CT110 ORF GroEL.
SEQ ID NO: 112 je určená DNA sekvence pro C. trachomatis LGV II klon 22-A1-49, vykazující částečnou homologii s CT660 a CT659
ORF.
SEQ ID NO: 113 je určená DNA sekvence pro C. trachomatis LGV II klon 17-E2-9, vykazující částečnou homologii s CT611 a CT 610 ORF.
SEQ ID NO: 114 je určená DNA sekvence pro C. trachomatis LGV II klon 17-CIO-31, vykazující částečnou homologii s CT858 ORF.
SEQ ID NO: 115 je určená DNA sekvence pro C. trachomatis LGV' II klon 2I-C7-8, vykazující homologii s dnaK-like genem.
SEQ ID NO: 116 je určená DNA sekvence pro C. trachomatis LGV' II klon 20-0345, obsahující part část pmpB genu CT413.
*5·« • ···
SEQ ID NO: 117 je určená DNA sekvence pro C. trachomatis LGV' II klon 1 8-C5-2, vykazující homologii s ORF S1 ribosomálního proteinu.
SEQ ID NO: 118 je určená DNA sekvence pro C. trachomatis LGV II klon 17-C5-I9, obsahující část ORF pro CT431 a CT430.
SEQ ID NO: 119 je určená DNA sekvence pro C. trachomatis LGV II klon 16-D4-22, obsahující částečné sekvence ORF3 a 0RF4 plasmidu pro růst v savčích buňkách
SEQ ID NO: 120 je určená kompletní DNA sekvence pro C.
trachomatis serovar LGV II Čapl gen CT529.
SEQ ID NO: 121 je předpokládaná kompletní aminokyselinová sekvence pro C. trachomatis serovar LGV II Čapl gen CT529.
SEQ ID NO: 122 je určená kompletní DNA sekvence pro C. trachomatis serovar E Čapl gen CT529.
SEQ ID NO: 123 je předpokládaná kompletní aminokyselinová sekvence pro C. trachomatis serovar E Čapl gen CT529.
SEQ ID NO: 124 je určená kompletní DNA sekvence pro C. trachomatis serovar IA Čapl gen CT529.
SEQ ID NO: 125 je předpokládaná kompletní aminokyselinová sekvence pro C. trachomatis serovar IA Čapl gen CT529.
SEQ ID NO: 126 je určená kompletní DNA sekvence pro C. trachomatis serovar G Čapl gen CT529.
SEQ ID NO: 127 je předpokládaná kompletní aminokyselinová sekvence pro C. trachomatis serovar G Čapl gen CT529.
SEQ ID NO: 128 je určená kompletní DNA sekvence pro C. trachomatis serovar F1 Nil Čapl gen CT529.
SEQ ID NO: 129 je předpokládaná kompletní aminokyselinová sekvence pro C. trachomatis serovar Fl Nil Čapl gen CT529.
SEQ ID NO: 130 je určená kompletní DNA sekvence pro C. trachomatis serovar LI Čapl, gen CT529.
SEQ ID NO: 131 je předpokládaná kompletní aminokyselinová sekvence pro C. trachomatis serovar LI Čapl, gen CT529.
SEQ ID NO: 132 je určená kompletní DNA sekvence pro C.
·· ····
trachomatis serovar L3 Čapl, gen CT529.
SEQ ID NO: 133 je předpokládaná kompletní aminokyselinová sekvence pro C. trachomatis serovar L3, Čapl gen CT529.
SEQ ID NO: 134 je určená kompletní DNA sekvence pro C. trachomatis serovar Ba Čapl, gen CT529.
SEQ ID NO: 135 je předpokládaná kompletní aminokyselinová sekvence pro C. trachomatis serovar Ba Čapl, gen CT529.
SEQ ID NO: 136 je určená kompletní DNA sekvence pro C. trachomatis serovar MOPN Čapl, gen CT529.
SEQ ID NO: 137 je předpokládaná kompletní aminokyselinová sekvence pro C. trachomatis serovar MOPN Čapl, gen CT529.
SEQ ID NO: 138 je určená aminokyselinová sekvence pro Čapl CT529 ORF peptid 11124-139 C. trachomatis, serovar L2.
SEQ ID NO: 139 je určená aminokyselinová sekvence pro Čapl CT529 ORF peptid 11132-147 C. trachomatis serovar L2.
SEQ ID. NO: 140 je určená aminokyselinová sekvence pro Čapl CT529 ORF peptid 11138-155 C. trachomatis, serovar L2.
SEQ ID NO: 141 je určená aminokyselinová sekvence pro Čapl CT529 ORF peptid 11146-163 C. trachomatis serovar L2.
SEQ ID NO: 142 je určená aminokyselinová sekvence pro Čapl CT529 ORF peptid 11154-171 C. trachomatis, serovar L2.
SEQ ID NO: 143 je určená aminokyselinová sekvence pro Čapl CT529 ORF peptid #162-178 C- trachomatis, serovar L2.
SEQ ID NO: 144 je určená aminokyselinová sekvence pro Čapl CT529 ORF peptid #138-147 C. trachomatis, serovar L2.
SEQ ID NO: 145 je určená aminokyselinová sekvence pro Čapl CT529 ORF peptid #139-147 C. trachomatis, serovar L2.
SEQ ID NO: 146 je určená aminokyselinová sekvence pro Čapl CT529 ORF peptid 11 140-147 C. trachomatis, serovar L2.
SEQ ID NO: 147 je určená aminokyselinová sekvence pro Čapl CT529 ORF peptid #138-146 C. trachomatis, serovar L2.
SEQ ID NO: 148 je určená aminokyselinová sekvence pro Čapl CT529 ORF peptid #138-145 C. trachomatis, serovar L2.
ř’i φφ φφφφ • · φ ΦΦΦ
ΦΦ ·1 • φ · • φφφφ »φ ΦΦΦ·
SEQ ID ΝΟ: 149 je určená aminokyselinová sekvence pro Čapl CT529 ORF peptid F14O->I C. trachomatis, serovar L2.
SEQ ID NO: 150 je určená aminokyselinová sekvence pro Čapl CT529 ORF peptid 11 #S139>Ga C. trachomatis, serovar L2.
SEQ ID NO: 151 je určená aminokyselinová sekvence pro Čapl CT529 ORF peptid 111151 39>Gb C. trachomatis, serovar L2.
SEQ ID NO: 152 je určená aminokyselinová sekvence pro peptid #2 C7.8-6 2l6aa ORF C. trachomatis, serovar L2.
SEQ ID NO: 153 je určená aminokyselinová sekvence pro 216 aa ORF peptidu 112C7.8-7 C. trachomatis, serovar L2.
SEQ ID NO: 154 je určená aminokyselinová sekvence pro 216 aa ORF peptidu #2 C7.8-8 C. trachomatis, serovar L2.
SEQ ID NO: 155 je určená aminokyselinová sekvence pro 216 aa ORF peptidu # 2 C7.8-9 C. trachomatis, serovar L2.
SEQ ID NO: 156 je určená aminokyselinová sekvence pro 216 aa ORF peptidu #2 C7.8-10 ORF C. trachomatis, serovar L2.
SEQ ID NO: 157 je určená aminokyselinová sekvence pro 53 aminokyselinových zbytků 216aa ORF peptidu v klonu 2C7.8 C. trachomatis, serovar L2.
SEQ ID NO: 158 je určená aminokyselinová sekvence pro 52 aminokyselinových zbytků ORF peptidu CT529 v klonu 2C7.8 C. trachomatis, serovar L2.
SEQ ID NO: 159 je určená DNA sekvence pro 5’ (kódující) primer pro klonování kompletního CT529 serovaru L2.
SEQ ID NO: 160 je určená DNA sekvence pro 5' (reversní) primer pro klonování kompletního CT529 serovaru L2.
SEQ ID NO: 161 je určená DNA sekvence pro 5’ (kódující) primer pro klonování kompletního CT529 pro serovary jiné než L2 a MOPN. SEQ ID NO: 162 je určená DNA sekvence pro 5' (reversní) primer pro klonování kompletních CT529 serovarů jiných než L2 a MOPN. SEQ ID NO: 163 je určená DNA sekvence pro 5' (kódující) primer pro klonování kompletního CT529 serovaru MOPN.
SEQ ID NO: 164 je určená DNA sekvence pro 5' (reversní) primer ·* ···· 9 · • 999 ·· ·· • 9 • 99«
9« 9999 pro klonování kompletního CT529 serovaru MOPN.
SEQ ID NO: 165 je určená DNA sekvence pro 5' (kódující) primer pro pBIB-KS.
SEQ ID NO: 166 je určená DNA sekvence pro 5’ (reversní) primer pro pBIB-KS.
SEQ ID NO: 167 je určená aminokyselinová sekvence pro 9-měrový epitop peptidú Capl#139-147 ze serovaru L2.
SEQ ID NO: 168 je určená aminokyselinová sekvence pro 9-měrový epitop peptidú Capll39-147 ze serovaru D.
SEQ ID NO: 169 je určená kompletní DNA sekvence pro C. trachomatis pmpl (CT874) gen.
SEQ ID NO: 170 je určená kompletní DNA sekvence pro C. trachomatis pmpG gen.
SEQ ID NO: 171 je určená kompletní DNA sekvence pro C. trachomatis pmpE gen.
SEQ ID NO: 172 je určená kompletní DNA sekvence pro C. trachomatis pmpD gen.
SEQ ID NO: 173 je určená kompletní DNA sekvence pro C. trachomatis pmpC gen.
SEQ ID NO: 174 je určená kompletní DNA sekvence pro C. trachomatis pmpB gen.
SEQ ID NO: 175 je předpokládaná kompletní aminokyselinová sekvence pro C. trachomatis pmpl gen.
SEQ ID NO: 176 je předpokládaná kompletní aminokyselinová sekvence pro C. trachomatis pmpO gen.
SEQ ID NO: 177 je předpokládaná kompletní aminokyselinová sekvence pro C. trachomatis pmpE gen.
SEQ ID NO: 178 je předpokládaná kompletní aminokyselinová sekvence pro C. trachomatis pmpD gen.
SEQ ID NO: 179 je předpokládaná kompletní aminokyselinová sekvence pro C. trachomatis pmpC gen.
SEQ ID NO: 180 je předpokládaná kompletní aminokyselinová sekvence pro C. trachomatis pmpB gen.
F • 9 99*9 • * ♦ ·99 • 9 99 • 9 9 • »999 _ · » 9 · * · · 9 9 9
9999 999 ««
SEQ ID NO: 181 je určená DNA sekvence minus signální sekvence pro C. trachomatis pmpl gen.
SEQ ID NO: 182 je poté určené kompletní DNA sekvence pro C. trachomatis pmpG gen.
SEQ ID NO: 183 je určená DNA sekvence minus signální sekvence pro C. trachomatis pmpE gen.
SEQ ID NO: 184 je první určená DNA sekvence představující karboxy konec C. trachomatis pmpD genu.
SEQ ID NO: 185 je druhá určená DNA sekvence představující amino konec minus signální sekvence pro C. trachomatis pmpD gen.
SEQ ID NO: 186 je první určená DNA sekvence představující karboxy konec pro C. trachomatis pmpC gen.
SEQ ID NO: 187 je druhá určená DNA sekvence představující amino konec minus signální sekvence pro C. trachomatis pmpC gen.
SEQ ID NO: 188 je určená DNA sekvence představující pmp gen C. pneumoniae serovaru MOMPS ve fúzi s Ral2 .
SEQ ID NO: 189 je předpokládaná aminokyselinová sekvence minus signální sekvence pro C. trachomatis pmpl gen.
SEQ ID NO: 190 je předpokládaná aminokyselinová sekvence pro C. trachomatis pmpG gen.
SEQ ID NO: 191 je předpokládaná aminokyselinová sekvence minus signální sekvence pro C. trachomatis pmpE gen.
SEQ ID NO: 192 je první předpokládaná aminokyselinová sekvence představující karboxy konec pro C. trachomatis pmpD gen.
SEQ ID NO: 193 je druhá předpokládaná aminokyselinová sekvence představující Amino konec minus signální sekvence pro C. trachomatis pmpD gen.
SEQ ID NO: 194 je první předpokládaná aminokyselinová sekvence představující karboxy konec pro C. trachomatis pmpC gen.
SEQ ID NO: 195 je druhá předpokládaná aminokyselinová sekvence představující amino konec pro C. trachomatis pmpC gen.
SEQ ID NO: 196 je předpokládaná aminokyselinová sekvence představující pmp gen C. pneumoniae serovaru MOMPS pmp gen ve ·· ···· • · · • ··· • · • * ······· • · · • * ··« • · · · • · · a ·♦ ··
9999 • 9 9 • 9 Λ
9 · • · * · ·* ·· fúzi s Ral2.
SEQ ID NO: 197 je určená DNA sekvence pro 5' oligo primer pro klonování C. trachomatis pmpC genu v SKB vakcinačním vektoru. SEQ ID NO: 198 je určená DNA sekvence pro 3' oligo primer pro klonování C. trachomatis pmpC genu v SKB vakcinačním vektoru. SEQ ID NO: 199 je určená DNA sekvence pro inserční sekvenci pro klonování C. trachomatis pmpC genu v SKB vakcinačním vektoru. SEQ ID NO: 200 je určená DNA sekvence pro 5' oligo primer pro klonování C. trachomatis pmpD genu v SKB vakcinačním vektoru. SEQ ID NO: 201 je určená DNA sekvence pro 3' oligo primer pro klonování C. trachomatis pmpD gen v SKB vakcinačním vektoru.
SÉQ ID NO: 202 je určená DNA sekvence pro inserční sekvenci pro klonování C. trachomatis pmpD gen v SKB vakcinačním vektoru.
SEQ ID NO: 203 je určená DNA sekvence pro 5' oligo primer pro klonování C. trachomatis pmpE genu v SKB vakcinačním vektoru. SEQ ID NO: 204 je určená DNA sekvence pro 3' oligo primer pro klonování C. trachomatis pmpE genu v SKB vakcinačním vektoru. SEQ ID NO: 205 je určená DNA sekvence pro 5' oligo primer pro klonování C. trachomatis pmpG genu v SKB vakcinačním vektoru. SEQ ID NO: 206 je určená DNA sekvence pro 3' oligo primer pro klonování C. trachomatis pmpO gen v SKB vakcinačním vektoru.
SEQ ID NO: 207 je určená DNA sekvence pro 5' oligo primer pro klonování amino-konecinální části C. trachomatis pmpC genu v pETl7b vektoru.
SEQ ID NO: 208 je určená DNA sekvence pro 3' oligo primer pro klonování amino terminální části C. trachomatis pmpC genu v pET17b vektoru.
SEQ ID NO: 209 je určená DNA sekvence pro 5' oligo primer pro klonování karboxy terminální části C. trachomatis pmpC genu v pET17b vektoru.
SEQ ID NO: 210 je určená DNA sekvence pro 3' oligo primer pro klonování karboxy terminální části C. trachomatis pmpC genu v pETl7b vektoru.
• · · · · · • · • · ··
20*
SEQ ID NO: 211 je určená DNA sekvence pro 5’ oligo primer pro klonování amino terminální části C. trachomatis pmpD genu v pET17b vektoru.
SEQ ID NO: 212 je určená DNA sekvence pro 3' oligo primer pro klonování amino terminální části C. trachomatis pmpD gen pETITh vektoru.
SEQ ID NO: 213 je určená DNA sekvence pro 5’ oligo primer pro klonování karboxy terminální části C. trachomatis pmpD genu v pET17b vektoru.
SEQ ID NO: 214 je určená DNA sekvence pro 3' oligo primer pro klonování karboxy terminální části C. trachomatis pmpD genu v pETITh vektoru.
SEQ ID NO: 215 je určená DNA sekvence pro primer pro klonování C trachomatis pmpE genu v pETITh vektoru.
SEQ ID NO: 216 je určená DNA sekvence pro primer pro klonování C trachomatis pmpE genu v pET17b vektoru.
SEQ ID NO: 217 je určená DNA sekvence pro klonování C. trachomatis pmpE genu v pET17b vektoru.
SEQ ID NO: 218 je aminokyselinová sekvence pro inserci sekvence pro klonování C'. trachomatis pmpE genu v pETl7b vektoru.
SEQ ID NO: 219 je určená DNA sekvence pro 5' oligo primer pro klonování C. trachomatis pmpG genu v pET17b vektoru.
SEQ ID NO: 220 je určená DNA sekvence pro 3’ oligo primer pro klonování C. trachomatis pmpO genu v pET17b vektoru.
SEQ ID NO: 221 je aminokyselinová sekvence pro inserci sekvence pro klonování C. trachomatis pmpO genu v pET17b vektoru.
SEQ ID NO: 222 je určená DNA sekvence pro primer pro klonování C trachomatis pmpl genu v pBT17b vektoru.
SEQ ID NO: 223 je určená DNA sekvence pro primer pro klonování C trachomatis pmpl genu v pET17b vektoru.
SEQ ID NO: 224 je určená aminokyselinová sekvence pro C. pneumoniae Swib peptid 1-20.
SEQ ID NO: 225 je určená aminokyselinová sekvence pro C.
• · ··· · • ·
pneumoniae Swib peptid 6-25.
SEQ ID NO: 226 je určená aminokyselinová sekvence pro
C.pneumoniae Swib peptid 12-31.
SEQ ID NO: 227 je určená aminokyselinová sekvence pro C.
pneumoniae Swib peptid 17-36.
je určená aminokyselinová sekvence pro C. je určená aminokyselinová sekvence pro C je určená aminokyselinová sekvence pro C.
SEQ ID NO: 228 je určená aminokyselinová sekvence pro C.
pneumoniae Swib peptid 22-41.
SEQ ID NO: 229 je určená aminokyselinová sekvence pro C.
pneumoniae Swib peptid 27-46.
SEQ ID NO: 230 je určená aminokyselinová sekvence pro C.
pneumoniae Swib peptid 42-61.
SEQ ID NO: 231 je určená aminokyselinová sekvence pro C.
pneumoniae Swib peptid 46-65.
SEQ ID NO: 232 je určená aminokyselinová sekvence pro C.
pneumoniae Swib peptid 51-70.
SEQ ID NO: 233 je určená aminokyselinová sekvence pro C.
pneumoniae Swib peptid 56-75.
SEQ ID NO: 234 je určená aminokyselinová sekvence pro C.
pneumoniae Swib peptid 61-80.
SEQ ID NO: 235 je určená aminokyselinová sekvence pro C.
pneumoniae Swib peptid 66-87.
SEQ ID NO: 236 je určená aminokyselinová sekvence pro C.
trachomatis OMCB peptid 1103-122.
SEQ ID NO: 237 je určená aminokyselinová sekvence pro C.
trachomatis OMCB peptid 108-127.
SEQ ID NO: 238 je určená aminokyselinová sekvence pro C.
trachomatis OMCB peptid 113-132.
SEQ ID NO: 239 je určená aminokyselinová sekvence pro C.
trachomatis OMCB peptid 118-137.
SEQ ID NO: 240 je určená aminokyselinová sekvence pro C.
·· · · • · » · · · ·
| trachomatis OMCB peptid 123-143. |
| SEQ ID NO: 241 je určená aminokyselinová sekvence pro C |
| trachomatis OMCB peptid 128-147. |
| SEQ ID NO: 242 je určená aminokyselinová sekvence pro C |
| trachomatis OMCB peptid 133-152. |
| SEQ ID NO: 243 je určená aminokyselinová sekvence pro C |
| trachomatis OMCB peptid 137-156. |
| SEQ ID NO: 244 je určená aminokyselinová sekvence pro C |
| trachomatis OMCB peptid 142-161. |
| SEQ ID NO: 245 je určená aminokyselinová sekvence pro C |
| trachomatis OMCB peptid 147-166. |
| SEQ ID NO: 246 je určená aminokyselinová sekvence pro C |
| trachomatis OMCB peptid 152-171. |
| SEQ ID NO: 247 je určená aminokyselinová sekvence pro C |
| trachomatis OMCB peptid 157-176. |
| SEQ ID NO: 248 je určená aminokyselinová sekvence pro C |
| trachomatis OMCB peptid 162-181. |
| SEQ ID NO: 249 je určená aminokyselinová sekvence pro C |
| trachomatis OMCB peptid 167-186. |
| SEQ ID NO: 250 je určená aminokyselinová sekvence pro C |
| trachomatis OMCB peptid 171-190. |
| SEQ ID NO: 251 je určená aminokyselinová sekvence pro C |
| trachomatis OMCB peptid 171-186. |
| SEQ ID NO: 252 je určená aminokyselinová sekvence pro C |
| trachomatis OMCB peptid 175-186. |
| SEQ ID NO: 252 je určená aminokyselinová sekvence pro C |
| trachomatis OMCB peptid 175-186. |
| SEQ ID NO: 253 je určená aminokyselinová sekvence pro C |
| pneumoniae OMCB peptid 185-198. |
| SEQ ID NO: 254 je určená aminokyselinová sekvence pro C |
| trachomatis TSA peptid 96-115. |
| SEQ ID NO: 255 je určená aminokyselinová sekvence pro C |
trachomatis TSA peptid 101-120.
• ·
SEQ ID NO: 256 je určená aminokyselinová sekvence pro C. trachomatis TSA peptid 106-125.
SEQ ID NO: 257 je určená aminokyselinová sekvence pro C. trachomatis TSA peptid 111-130.
SEQ ID NO: 258 je určená aminokyselinová sekvence pro C. trachomatis TSA peptid 116-135.
SEQ ID NO: 259 je určená aminokyselinová sekvence pro C. trachomatis TSA peptid 121-140.
SEQ ID NO: 260 je určená aminokyselinová sekvence pro C. trachomatis TSA peptid 126-145.
SEQ ID NO: 261 je určená aminokyselinová sekvence pro C. trachomatis TSA peptid 131-150.
SEQ ID NO: 262 je určená aminokyselinová sekvence pro C. trachomatis TSA peptid 136-155.
SEQ ID NO: 263 je určená kompletní DNA sekvence pro C.
trachomatis CT529/Capl gen, serovar I.
SEQ ID NO: 264 je předpokládaná kompletní aminokyselinová sekvence pro C. trachomatis CT529/Cap 1 gen, serovar I.
SEQ ID NO: 265 je určená kompletní DNA sekvence pro C. trachomatis CT529/Cap 1 gen, serovar K.
SEQ ID NO: 266 je předpokládaná kompletní amino sekvence pro C. trachomatis CT529/Cap 1 gen, serovar K.
SEQ ID NO: 267 je určená DNA sekvence pro C. trachomatis klon 17-04-36 vykazující homologii s částí ORF DNA-řízené RNA polymerasy, beta podjednotky- CT315 v serD.
SEQ ID NO: 268 je určená DNA sekvence pro částečnou sekvenci C. trachomatis CT016 genu v klonu 2E1O.
SEQ ID NO: 269 je určená DNA sekvence pro částečnou sekvenci C. trachomatis tRNA syntasového genu v klonu 2E10.
SEQ ID NO: 270 je určená DNA sekvence pro částečnou sekvenci pro C. trachomatis clpX genu v klonu 2E10.
SEQ ID NO: 271 je první určená DNA sekvence pro C. trachomatis klon CtL2gam-30 představující 5'-konec.
• ···
SEQ ID NO: 272 je druhá určená DNA sekvence pro C. trachomatis klon CtL2gam-30 představující 3'konec.
| SEQ ID NO: CtL2gam-28 | 273 | je | určená DNA sekvence pro C. trachomatis klon | |||||
| SEQ ID NO: | 274 | je | určená | DNA | sekvence | pro | C.trachomatis ' | klon |
| CtL2gam-27 | • | |||||||
| SEQ ID NO: | 275 | je | určená | DNA | sekvence | pro | C. trachomatis | klon |
CtL2gam-26.
| SEQ ID NO: | 276 | je | určená | DNA | sekvence | pro | C. | trachomatis | klon |
| CtL2gam-24 | • | ||||||||
| SEQ ID NO: | 277 | je | určená | DNA | sekvence | pro | C. | trachomatis | klon |
| CtL2gam-23 | • | ||||||||
| SEQ ID NO: | 278 | je | určená | DNA | sekvence | pro | C. | trachomatis | klon |
CtL2gam-21.
| SEQ ID NO: | 279 | je | určená | DNA | sekvence | pro | C. trachomatis klon |
| CtL2gam-18. | |||||||
| SEQ ID NO: | 280 | je | určená | DNA | sekvence | pro | C.trachomatis klon |
CtL2gamn-17.
SEQ ID NO: 281 je první určená DNA sekvence pro C. trachomatis klon CtL2gam-15 představující 5' konec.
SEQ ID NO: 282 je druhá určená DNA sekvence pro C. trachomatis klon CtL2gam-15 představující 3' konec.
| SEQ ID NO: | 283 | je | určená | DNA | sekvence | pro | C. | trachomatis | klon |
| CtL2gam-13 | • | ||||||||
| SEQ ID NO: | 284 | je | určená | DNA | sekvence | pro | C. | trachomatis | klon |
| CtL2gam-lO | - | ||||||||
| SEQ ID NO: | 285 | je | určená | DNA | sekvence | pro | C. | trachomatis | klon |
CtL2gam-8.
SEQ ID NO: 286 je první určená DNA sekvence pro C. trachomatis klon CtL2gam-6 představující 5' konec.
SEQ 1ID NO: 287 je druhá určená DNA sekvence pro C. trachomatis klon CtL2gam-6 představující 3' konec.
SEQ ID NO: 288 je určená DNA sekvence pro C. trachomatis klon
CtL2gam-5.
| SEQ ID NO: | 289 | je | určená | DNA sekvence pro C. | trachomatis klon |
| CtL2gam-2. SEQ ID NO: | 290 | je | určená | DNA sekvence pro C. | trachomatis klon |
| Ctt2gam-1. SEQ ID NO: | 291 | je | určená | kompletní DNA sekvence pro C. pneumoniae |
homolog CT529 genu.
SEQ ID NO: 292 je předpokládaná kompletní aminokyselinová sekvence pro C. pneumoniae homologu CT529 genu.
SEQ ID NO: 293 je určená DNA sekvence pro inserci sekvence pro klonování C. trachomatis pmpO genu v SKB vakcinačním vektoru. SEQ ID NO: 294 je aminokyselinová sekvence otevřeného čtecího rámce klonu CT603.
SEQ ID NO: 295 je aminokyselinová sekvence prvního otevřeného čtecího rámce klonu CT875.
SEQ ID NO: 296 je aminokyselinová sekvence druhého otevřeného čtecího rámce klonu CT875.
SEQ ID NO: 297 je aminokyselinová sekvence prvního otevřeného čtecího rámce klonu CT858.
SEQ ID NO: 298 je aminokyselinová sekvence druhého otevřeného čtecího rámce klonu CT858.
SEQ ID NO: 299 je aminokyselinová sekvence otevřeného čtecího rámce klonu CT622.
SEQ ID NO: 300 je aminokyselinová sekvence otevřeného čtecího rámce klonu CT61O.
SEQ ID NO: 301 je aminokyselinová sekvence otevřeného čtecího rámce klonu CT396.
SEQ ID NO: 302 je aminokyselinová sekvence otevřeného čtecího rámce klonu CT318.
SEQ ID NO: 304 je aminokyselinová sekvence pro C. trachomatis, serovar L2 rCt529cl-125, majíc modifikovanou N-konecinální sekvenci {6-His koncovku).
SEQ ID NO: 305 je aminokyselinová sekvence pro C. trachomatis,
serovar L2rCt529cl-125.
SEQ ID NO: 306 je kódující primer použitý v syntéze
PmpA(N-konce) fúzního proteinu.
SEQ ID NO: 307 je protismyslný primer použitý v syntéze
PmpA(N-konec) fúzního proteinu.
SEQ ID NO: 308 je DNA sekvence kódující PmpA (N-konec) fúzního proteinu.
SEQ ID NO: 309 je aminokyselinová sekvence PmpA(N-konec) fúzního proteinu.
SEQ ID NO: 310 je kódující primer použitý při syntéze
PmpA(C-konec) fúzního proteinu.
SEQ ID NO: 311 je protismyslný primer použitý při syntéze PmpA(C-konec) fúzního proteinu.
SEQ ID NO: 312 je DNA sekvence kódující PmpA(C-konec) fúzní protein.
SEQ ID NO: 313 je aminokyselinová sekvence PmpA(C-konec) fúzního proteinu.
SEQ ID NO: 314 je kódující primer použitý při syntéze
PmpF(N-konec) fúzního proteinu.
SEQ ID NO: 315 je protismyslný primer použitý při syntéze PmpF(N-konec) fúzního proteinu.
SEQ ID NO: 316 je DNA sekvence kódující PmpF (N-konec) fúzní protein.
SEQ ID NO: 317 je aminokyselinová sekvence PmpF (N-konec) fúzního proteinu.
SEQ ID NO: 318 je kódující primer použitý při syntéze
PmpF(C-konec) fúzního proteinu.
SEQ ID NO: 319 je protismyslný primer použitý při syntéze PmpF(C-konec) fúzního proteinu.
SEQ ID NO: 320 je DNA sekvence kódující PmpF (C-konec) fúzního proteinu.
SEQ ID NO: 321 je aminokyselinová sekvence PmpF(C-konec) fúzního proteinu.
• *··
SEQ ID NO: 322 je kódující primer použitý při syntéze PmpH (CT412) (N-konec) fúzního proteinu.
SEQ ID NO: 323 je protismyslný primer použitý při syntéze PmpH(N-konec) fúzního proteinu.
SEQ ID NO: 324 je DNA sekvence kódující PmpH(N-konec) fúzního proteinu.
SEQ ID NO: 325 je aminokyselinová sekvence pro PmpH(N-konec) fúzního proteinu.
SEQ ID NO: 326 je kódující primer použitý při syntéze
PmpH(C-konec) fúzního proteinu.
SEQ ID NO: 327 je protismyslný primer použitý při syntéze PmpH(C-konec) fúzního proteinu.
SEQ ID NO: 328 je DNA sekvence kódující PmpH(C-konec) fúzního proteinu.
:SEQ ID NO: 329 je aminokyselinová sekvence PmpH(C-konec) fúzního proteinu.
SEQ ID NO: 330 je kódující primer použitý při syntéze PmpB(l) fúzního proteinu.
SEQ ID NO: 331 je protismyslný primer použitý při syntéze PmpB(l) fúzního proteinu.
SEQ ID NO: 332 je DNA sekvence kódující PmpB(l) fúzní protein. SEQ ID NO: 333 je aminokyselinová sekvence PmpB(l) fúzního proteinu.
SEQ ID NO: 334 je kódující primer použitý při syntéze PmpB(2) fúzního proteinu.
SEQ ID NO: 335 je protismyslný primer použitý při syntéze PmpB(2) fúzního proteinu.
SEQ ID NO: 336 je DNA sekvence kódující PmpB(2) fúzní protein. SEQ ID NO: 337 je aminokyselinová sekvence PmpB(2) fúzního proteinu.
SEQ ID NO: 338 je kódující primer použitý při syntéze PmpB(3) fúzního proteinu.
SEQ ID NO: 339 je protismyslný primer použitý při syntéze • ··· • ···
PmpB(3) fúzního proteinu.
SEQ ID NO: 340 je DNA sekvence kódující PmpB(3) fúzní protein. SEQ ID NO: 341 je aminokyselinová sekvence PmpB(3) fúzního proteinu.
SEQ ID NO: 342 je kódující primer použitý při syntéze PmpB(4) fúzního proteinu.
SEQ ID NO: 343 je protismyslný primer použitý při syntéze PmpB(4) fúzního proteinu.
SEQ ID NO: 344 je DNA sekvence kódující PmpB(4) fúzní protein. SEQ ID NO: 345 je aminokyselinová sekvence PmpB(4) fúzního proteinu.
SEQ ID NO: 346 je kódující primer použitý při syntéze PmpC(l) fúzního proteinu.
(SEQ ID NO: 347 je protismyslný primer použitý při syntéze PmpC(l) fúzního proteinu.
SEQ ID NO: 348 je DNA sekvence kódující PmpC(l) fúzní protein. SEQ ID NO: 349 je aminokyselinová sekvence PmpC(I) fúzního proteinu.
SEQ ID NO: 350 je kódující primer použitý při syntéze PmpC(2) fúzního proteinu.
SEQ ID NO: 351 je protismyslný primer použitý při syntéze PmpC(2) fúzního proteinu.
SEQ ID NO: 352 je DNA sekvence kódující PmpC{2) fúzní protein. SEQ ID NO: 353 je aminokyselinová sekvence PmpC(2) fúzního proteinu.
SEQ ID NO: 354 je kódující primer použitý při syntéze PmpC(3) fúzního proteinu.
SEQ ID NO: 355 je protismyslný primer použitý při syntéze PmpC(3) fúzního proteinu.
SEQ ID NO: 356 je DNA sekvence kódující PmpC(3) fúzního proteinu SEQ ID NO: 357 je aminokyselinová sekvence PmpC{3) fúzního proteinu.
SEQ ID NO: 358 je DNA sekvence oppAl proteinu, bez první .-¼.
999 t ransmembránové domény.
| SEQ | ID | NO: | 359 | 3θ | kompletní | DNA | sekvence | CTI39 . |
| SEQ | ID | NO: | 360 | je | kompletní | DNA | sekvence | ORF-3 . |
| SEQ | ID | NO: | 361 | je | kompletní | DNA | sekvence | CT611. |
SEQ ID NO: 362 je aminokyselinová sekvence oppAl od aminokyseliny 22 .
SEQ ID NO: 363 je aminokyselinová sekvence CT139.
SEQ ID NO: 364 je aminokyselinová sekvence ORF-3.
SEQ ID NO: 365 je aminokyselinová sekvence CT611.
SEQ ID NO: 366 je DNA sekvence pro Chlamydia pneumoniae homolog,
CPnO275, Chlamydia trachomatis genu CT190.
SEQ ID NO: 367 je DNA sekvence pro Chlamydia pneumoniae bomolog, CPn04O7, Chlamydia trachomatis genu CT1O3.
SEQ ID NO: 368 je DNA sekvence pro Chlamydia pneumoniae homolog, CPn072O, Chlamydia trachomatis genu CT659.
SEQ ID NO: 369 je DNA sekvence pro Chlamydia pneumoniae homolog, CPnO716, Chlamydia trachomatis genu CT660.
SEQ ID NO: 370 je DNA sekvence pro Chlamydia pneumoniae homolog, CPnO519, Chlamydia trachomatis genu CT430.
SEQ ID NO: 371 je DNA sekvence pro Chlamydia pneumoniae homolog, CPn052O, Chlamydia trachomatis genu CT431:
SEQ ID NO: 372 je DNA sekvence pro Chlamydia pneumoniae homolog, CPn0078, Chlamydia trachomatis genu CT318.
SEQ ID NO: 373 je DNA sekvence pro Chlamydia pneumoniae homolog, CPnO628, Chlamydia trachomatis genu CT509.
SEQ ID NO: 374 je DNA sekvence pro Chlamydia pneumoniae homolog, CPn054O, Chlamydia trachomatis genu CT414.
SEQ ID NO: 375 je DNA sekvence pro Chlamydia pneumoniae homolog, pmp20, Chlamydia trachomatis genu CT413.
SEQ ID NO: 376 je DNA sekvence pro Chlamydia pneumoniae homolog, CPn0081, Chlamydia trachomatis genu CT315SEQ ID NO: 377 je DNA sekvence pro Chlamydia pneumoniae homolog, CPnO761, Chlamydia trachomatis genu CT610.
• · • ··
SEQ ID NO: 378 je DNA sekvence pro Chlamydia pneumoniae homolog, CPn0557, Chlamydia trachomatis genu CT443.
SEQ ID NO: 379 je DNA sekvence pro Chlamydia pneumoniae homolog, CPnO833, Chlamydia trachomatis genu CT557.
SEQ ID NO: 380 je DNA sekvence pro Chlainydia pneumoniae homolog, CPnO134, Chlamydia trachomatis genu CT604.
SEQ ID NO: 381 je DNA sekvence pro Chlamydia pneumoniae homolog, CPnO388, Chlamydia trachomatis genu CT042.
SEQ ID NO: 382 je DNA sekvence pro Chlamydia pneumoniae homolog, Cpnl028, Chlamydia trachomatis genu CT376.
SEQ ID NO: 383 je DNA sekvence pro Chlamydia pneumoniae homolog, CPnO875, Chlamydia trachomatis genu CT734.
SEQ ID NO: 384 je DNA sekvence pro Chlamydia pneumoniae homolog, CPn0908, Chlamydia trachomatis genu CT764.
SEQ ID NO: 385 je DNA sekvence pro Chlamydia pneumoniae homolog, CPnO728, Chlamydia trachomatis genu CT622.
SEQ ID NO: 386 je aminokyselinová sekvence pro Chlamydia pneumoniae homolog, CPnO275, Chlamydia trachomatis genu CT19O. SEQ ID NO: 387 je aminokyselinová sekvence pro Chlamydia pneumoniae homolog, CPn04O7, Chlamydia trachomatis,genu CTI 03. SEQ ID NO: 388 je aminokyselinová sekvence pro Chlamydia pneumoniae homolog, CPn072O, Chlamydia trachomatis genu CT659. SEQ ID NO: 389 je aminokyselinová sekvence pro Chlamydia pneumoniae homolog, CPnO716, Chlamydia trachomatis genu CT660. SEQ ID NO: 390 je aminokyselinová sekvence pro Chlamydia pneumoniae homolog, CPnO519, Chlamydia trachomatis genu CT430. SEQ ID NO: 391 je aminokyselinová sekvence pro Chlamydia pneumoniae homolog, CPn0520, Chlamydia trachomatis genu CT431. SEQ ID NO: 392 je aminokyselinová sekvence pro Chlamydia pneumoniae homolog, CPn0O78, Chlamydia trachomatis genu CT318. SEQ ID NO: 393 je aminokyselinová sekvence pro Chlamydia pneumoniae homolog, CPnO628, Chlamydia trachomatis genu CT509. SEQ ID NO: 394 je aminokyselinová sekvence pro Chlamydia * * * · ♦ · * φ «φ φ φ 4 9 · ··.· · φ φ · · · Β· ΙΦΦ · · Φ·Φ « · · • · · · · · · · φ · ··*· ♦·* ΦΦ ΦΦ ΦΦ «· pneumoniae homolog, CPn0540, Chlamydia trachomatis genu CT414. SEQ ID NO: 395 je aminokyselinová sekvence pro Chlamydia pneumoniae homolog, pmp20, Chlamydia trachomnatis genu CT413.
SEQ ID NO: 396 je aminokyselinová sekvence pro Chlamydia pneumoniae homolog, CPn0081, Chlamydia trachomatis genu CT315. SEQ ID NO: 397 je aminokyselinová sekvence pro Chlamydia pneumoniae homolog, CPnO761, Chlamydia trachomatis genu CT610. SEQ ID NO: 398 je aminokyselinová sekvence pro Chlamydia pneumoniae homolog, CPnO557, Chlamydia trachomatis genu CT443. SEQ ID NO: 399 je aminokyselinová sekvence pro Chlamydia pneumoniae homolog, CPnO833, Chlamydia trachomatis genu CT557. SEQ ID NO: 400 je aminokyselinová sekvence pro Chlamydia pneumoniae homolog, CPnO134, Chlamydia trachomatis genu CT604. SEQ ID NO: 401 je aminokyselinová sekvence pro Chlamydia pnemnnoniae homolog, CPnO3 88, Chlamydia trachomatis genu CT042. SEQ ID NO: 402 je aminokyselinová sekvence pro Chlamydia pneumoniae homolog, CPnlO28, Chlamydia trachomatis genu CT376. SEQ ID NO: 403 je aminokyselinová sekvence pro Chlamydia pneumoniae homolog, CPnO875, Chlamydia trachomatis genu CT734. SEQ ID NO: 404 je aminokyselinová sekvence, pro Chlamydia pneumoniae, homolog, CPn09O8, Chlamydia trachomatis genu CT764. SEQ ID NO: 405 je aminokyselinová sekvence pro Chlamydia pneumoniae homolog, CPnO728, Chlamydia trachomatis genu CT622. SEQ ID NO: 406 je kompletní DNA sekvence pro Chlamydia trachomatis, serovar D, gen CT287.
SEQ ID NO: 407 je kompletní DNA sekvence pro Chlamydia trachomatis, serovar D, gen CT858.
SEQ ID NO: 408 je kompletní DNA sekvence pro Chlamydia trachomatis, serovar D, gen CT764.
SEQ ID NO: 409 je kompletní DNA sekvence pro Chlamydia trachomatis, serovar D, gen CT734.
SEQ ID NO: 410 je kompletní DNA sekvence pro Chlamydia trachomatis, serovar D, gen CT660.
99«9 • 9 c ·«· • « • · ···· ·*» ·· 99 * · 9 • · ··* ♦ ♦ · 9 · • · 9 9
A 9
9· *♦··
9 .9 • · 9 • 9 9 &
• 9 9 · » Λ 9 9
SEQ ID NO: 411 je kompletní DNA sekvence pro Chlamydia trachomatis, serovar D, gen CT659.
SEQ ID NO: 412 je kompletní DNA sekvence pro Chlamydia trachomatis, serovar D, gen CT622.
SEQ ID NO: 413 je kompletní DNA sekvence pro Chlamydia trachomatis, serovar D, gen CT610.
SEQ ID NO: 414 je kompletní DNA sekvence pro Chlamydia trachomatis, serovar D, gen CT604.
SEQ ID NO: 415 je kompletní DNA sekvence pro Chlamydia trachomatis, serovar D, gen CT557.
SEQ ID NO: 416 je kompletní DNA sekvence pro Chlamydia trachomatis, serovar D, gen CT509.
SEQ ID NO: 417 je kompletní DNA sekvence pro Chlamydia trachomatis, serovar D, gen CT443,
SEQ ID NO: 418 je kompletní DNA sekvence pro Chlamydia trachomatis, serovar D, gen CT431.
SEQ ID NO: 419 je kompletní DNA sekvence pro Chlamydia trachomatis, serovar D, gen CT430.
SEQ 1ID NO: 420 je kompletní DNA sekvence pro Chlamydia trachomatis, serovar D, gen CT414.
SEQ IĎ NO: 421 je kompletní ĎNA sekvence pro Chlamydia trachomatis, serovar D, gen CT413.
SEQ I] ) NO: 422 je kompletní DNA sekvence pro Chlamydia trachomatis, serovar D, gen CT396.
SEQ ID NO: 423 je kompletní DNA sekvence pro Chlamydia trachomatis, serovar D, gen CT376.
SEQ ID NO: 424 je kompletní DNA sekvence pro Chlamydia trachomatis, serovar D, gen CT318.
SEQ ID NO: 425 je kompletní DNA sekvence pro Chlamydia trachomatis, serovar D, gen CT315.
SEQ ID NO: 426 je kompletní DNA sekvence pro Chlamydia trachomatis, serovar D, gen CT104.
SEQ ID NO: 427 je kompletní DNA sekvence pro Chlamydia • · ······· ·· ·· ·* ·· trachomatis, serovar D, gen CT103.
SEQ ID NO: 428 je kompletní DNA sekvence pro Chlamydia trachomatis, serovar D, gen CT102.
SEQ ID NO: 429 je kompletní DNA sekvence pro Chlamydia trachomatis, serovar D, gen CT098.
SEQ ID NO: 430 je kompletní DNA sekvence pro Chlamydia trachomatis, serovar D, gen CT042.
SEQ ID NO: 431 je kompletní aminokyselinová sekvence pro Chlamydia trachomatis, serovar D, gen CT858.
SEQ ID NO: 432 je kompletní aminokyselinová sekvence pro Chlamydia trachomatis, serovar D, gen CT764.
SEQ ID NO: 433 je kompletní aminokyselinová sekvence pro Chlamydia trachomatis, serovar D, gen CT734.
SEQ ID NO: 434 je kompletní aminokyselinová sekvence pro Chlamydia trachomatis, serovar D, gen CT660.
SEQ ID NO: 435 je kompletní aminokyselinová sekvence pro Chlamydia trachomatis, serovar D, gen CT659.
SEQ ID NO: 436 je kompletní aminokyselinová sekvence pro Chlamydia trachomatis, serovar D, gen CT622.
SEQ ID NO: 437 je kompletní aminokyselinová sekvence pro Chlamydia trachomatis, serovar D, gen CT610.
SEQ ID NO: 438 je kompletní aminokyselinová sekvence pro Chlamydia trachomatis, serovar D, gen CT604.
SEQ ID NO: 439 je kompletní aminokyselinová sekvence pro Chlamydia trachomatis, serovar D, gen CT557.
SEQ ID NO: 440 je kompletní aminokyselinová sekvence pro Chlamydia trachomatis, serovar D, gen CT509.
SEQ ID NO: 441 je kompletní aminokyselinová sekvence pro Chlamydia trachomatis, serovar D, gen CT443.
SEQ ID NO: 442 je kompletní aminokyselinová sekvence pro Chlamydia trachomatis, serovar D, gen CT431.
SEQ ID NO: 443 je kompletní aminokyselinová sekvence pro Chlamydia trachomatis, serovar D, gen CT430.
• · · · · « • · ··· · · ·
SEQ ID NO: 444 je kompletní aminokyselinová sekvence pro Chlamydia trachomatis, serovar D, gen CT414.
SEQ ID NO: 445 je kompletní aminokyselinová sekvence pro Chlamydia trachomatis, serovar D, gen CT413.
SEQ ID NO: 446 je kompletní aminokyselinová sekvence pro Chlamydia trachomatis, serovar D, gen CT396.
SEQ ID NO: 447 je kompletní aminokyselinová sekvence pro Chlamydia trachomatis, serovar D, gen CT376.
SEQ ID NO: 448 je kompletní aminokyselinová sekvence pro Chlamydia trachomatis, serovar D, gen CT318.
SEQ ID NO: 449 je kompletní aminokyselinová sekvence pro Chlamydia trachomatis, serovar D, gen CT315.
SEQ ID NO: 450 je kompletní aminokyselinová sekvence pro Chlamydia trachomatis, serovar D, gen CT104.
SEQ ID NO: 451 je kompletní aminokyselinová sekvence pro Chlamydia trachomatis, serovar D, gen CT103.
SEQ ID NO: 452 je kompletní aminokyselinová sekvence pro Chlamydia trachomatis, serovar D, gěn CT102.
SEQ ID NO: 453 je kompletní aminokyselinová sekvence pro Chlamydia trachomatis, serovar D, gen CT098.
SEQ ID NO: 454 je kompletní aminokyselinová sekvence pro Chlamydia trachomatis, serovar D, gen CT042.
SEQ ID NO: 455 odpovídá DNA sekvenci CPnO894, což je CP homolog CT751 (amn), který byl identifikován v klonech CTL2-1 a CTL2-5. SEQ ID NO: 456 odpovídá DNA sekvenci CPn0074, což je CP homolog CT322 (tuf), který byl identifikován v klonu CTL2-2.
SEQ ID NO: 457 odpovídá DNA sekvenci CPnO122, což je CP homolog CT032 (metG), který byl identifikován v klonech CTL2gam2,
CTL2-3(5') a CTL2-4.
SEQ ID NO: 458 odpovídá DNA sekvenci CPnO121, což je CP homolog CT031, který byl identifikován v klonu CTL2-3{5')(3') SEQ ID NO: 459 odpovídá DNA sekvenci CPn0120, což je CP homolog CT030 (gmK), který byl identifikován v klonech CTL2-3(3’)
• · ·· a CTL2-21.
SEQ ID NO: 460 odpovídá DNA sekvenci CPnO359, což je CP homolog CT064 (lepA), který byl identifikován v klonu CTL2gam5.
SEQ ID NO: 461 odpovídá DNA sekvenci CPnO414, což je CP homolog CT265 (acCA), který byl identifikován v klonu CTL2-6.
SEQ ID NO: 462 odpovídá DNA sekvenci CPnO413, což je CP homolog CT264 (msbA), který byl identifikován v klonu CTL2-6.
SEQ ID NO: 463 odpovídá DNA sekvenci CPnO394, což je CP homolog CT256 který byl identifikován v klonech CTL2gam6(5') a CTL2-11(5 ’) .
SEQ ID NO: 464 odpovídá DNA sekvenci CPnO395, což je CP homolog CT257 který byl identifikován v klonech CTL2gam6(5') a CTL2-11(5').
SEQ ID NO: 465 odpovídá DNA sekvenci CPnO487, což je CP homolog CT384, který byl identifikován v klonech CTL2gam6 {3') a CTL2-11(3’).
SEQ ID NO: 466 odpovídá DNA sekvenci CPnO592, což je CP homolog CT473, který byl identifikován v klonu CTL2-8b.
SEQ ID NO: 467 odpovídá DNA sekvenci CPnO593, což je CP homolog CT474, který byl identifikován v klonu CTL2-8b.
SEQ ID NO: 468 odpovídá DNA sekvenci CPnO197, což je CP homolog
CT139 (oppAl), který byl identifikován v klonu CTL28b.
SEQ ID NO: 469 odpovídá DNA sekvenci CPnO363, což je CP homolog CT060 (flhA), který byl identifikován v klonu CTL2-8b.
SEQ ID NO: 470 odpovídá DNA sekvenci CPn0301, což je CP homolog CT242, který byl identifikován v klonu CTL2gam8.
SEQ ID NO: 471 odpovídá DNA sekvenci CPn03O2, což je CP homolog CT243 (lpxD), který byl identifikován v klonu CTL2gam8.
SEQ ID NO: 472 odpovídá DNA sekvenci CPnO324, což je CP homolog CT089 (lcrE), který byl identifikován v klonech CTL2-9, CTL2gaml, CTL2gaml7 a CTL2-19{5').
SEQ ID NO: 473 odpovídá DNA sekvenci CPnO761, což je CP homolog • ·· ·
CT610, který byl identifikován v klonu CTL2-10(5')(3'}.
SEQ ID NO: 474 odpovídá DNA sekvenci CPn0760, což je CP homolog CT611, který byl identifikován v klonu CTL2-10(5').
SEQ ID NO: 475 odpovídá DNA sekvenci CPnO329, což je CP homolog CT154, který byl identifikován v klonech CTh2gamlO a CTL2gam21. SEQ ID NO: 476 odpovídá DNA sekvenci CPn0990, což je CP homolog CT833 (infC), který byl identifikován v klonu CTL2-12.
SEQ ID NO: 477 odpovídá DNA sekvenci CPnO984, což je CP homolog CT827 (nrdA), který byl identifikován v klonech CTL2-16(3') a CTL2gaml5(3’).
SEQ ID NO: 478 odpovídá DNA sekvenci CPnO985, což je CP homolog CT828 (nrdl3), který byl identifikován v klonech CTL2-16(3') CTL2gaml5(3').
SEQ ID NO: 479 odpovídá DNA sekvenci CPnO349, což je CP homolog CT067 (ytgA), který byl identifikován v klonu CTL2gaml8.
SEQ ID NO: 480 odpovídá DNA sekvenci CPnO325, což je CP homolog CT088 (sycE), který byl identifikován v klonu CTL2-19(5').
SEQ ID NO: 481 odpovídá DNA sekvenci CPnO326, což je CP homolog CT087 (malQ) , který byl identifikován v klonu CTL2-19(5').
SEQ ID NO: 482 odpovídá DNA sekvenci CPnO793, což je CP homolog CT588 (rbsu), který byl identifikován v klonu CTL2gam23.
SEQ ID NO: 483 odpovídá DNA sekvenci CPnO 199, which P homolog CT199 (oppBl), který byl identifikován v klonu CTL2gam24 SEQ ID NO: 484 odpovídá DNA sekvenci CPnO666, což je CP homolog CT545 (dnaE), který byl identifikován v klonu CTL2-24.
SEQ ID NO: 485 odpovídá DNA sekvenci CPn0065, což je CP homolog CT288, který byl identifikován v klonu CTL2gam27.
SEQ ID NO: 486 odpovídá DNA sekvenci CPnO444, což je CP homolog CT413 (pmpB), který byl identifikován v klonu CTL2gam30(5 )(3 ). SEQ ID NO: 487 odpovídá DNA sekvenci CPn-ORF5, což je CP homolog CT-0RE3, který byl identifikován v klonech CTL2gaml5(5'), CTL2-116{5’), CTh2-18(5'), aCTL2-23.
SEQ ID NO: 488 odpovídá DNA sekvenci CPn-ORF6, což je CP homolog
4*
4·
• ···
CT-0RF4, který byl identifikován v klonu CTL2- 18(3')SEQ ID NO: 489 odpovídá DNA sekvenci CP-ORF7, což je CP homolog CT-ORFS, který byl identifikován v klonu CTL2-18{3').
SEQ ID NO: 490 odpovídá aminokyselinová sekvenci CPnO894, což je CP bomolog CT751 (aran), který byl identifikován v klonech CTL2-1 a CTL2-5.
SEQ ID NO: 491 odpovídá aminokyselinová sekvence CPn0O74, což je CP homolog CT332 (tuf), který byl identifikován v klonu CTL2-2. SEQ ID NO: 492 odpovídá aminokyselinová sekvence CPnO122, což je CP homolog CT032 (metG), který byl identifikován v klonech CTh2gam2, CTL2-3{5’) aCTL2-4.
SEQ ID NO: 493 odpovídá aminokyselinová sekvence CPnO121, což je CP homolog CT031, který byl identifikován v klonu CTL2-3(5')(31) SEQ ID NO: 494 odpovídá aminokyselinová sekvence CPn0120, což je CP homolog CT030 (gmK), který byl identifikován v klonech CTL2-3 (3') a CTL2-21.
SEQ ID NO: 495 odpovídá aminokyselinová sekvence CPnO359, což je CP homolog CT064 (lepA), který byl identifikován v klonu CTh2gamS.
SEQ ID NO: 496 odpovídá aminokyselinová sekvence CPnO414, což je CP homolog CT265 (accA), který byl identifikován v klonu CTL2-6. SEQ ID NO: 497 odpovídá aminokyselinová sekvence CPnO413, což je CP homolog CT264 (msbA), který byl identifikován v klonu CTL2-6. SEQ ID NO: 498 odpovídá aminokyselinová sekvence CPnO394, což je CP homolog CT256, který byl identifikován v klonech CTL2gam6(5') a CTL2-11(5').
SEQ ID NO: 499 odpovídá aminokyselinová sekvence CPnO395, což je CP homolog CT257, který byl identifikován v klonech CTL2gam6(5') a CTL2-11(5*).
SEQ ID NO: 500 odpovídá aminokyselinová sekvence CPnO487, což je CP homolog CT384, který byl identifikován v klonech CTL2gam6(3') a CTL2-1 1(3').
SEQ ID NO: 501 odpovídá aminokyselinová sekvence CPnO592, což je ···· · · · · · · · ·
CP homolog CT473, který byl identifikován v klonu CTL2-8b.
SEQ ID NO: 502 odpovídá aminokyselinová sekvence CPnO593, což je CP homolog CT474, který byl identifikován v klonu CTL2-8b.
SEQ ID NO: 503 odpovídá aminokyselinová sekvence CPnO197, což je CP homolog CT139 (oppAl), který byl identifikován v klonu CTL2-8b.
SEQ ID NO: 504 odpovídá aminokyselinová sekvence CPnO363, což je CP homolog CTO6O (flhA), který byl identifikován v klonu CTL2-8b SEQ ID NO: 505 odpovídá aminokyselinová sekvence CPn03Ol, což je CP homolog CT242, který byl identifikován v klonu CTL2garnS.
SEQ ID NO: 506 odpovídá aminokyselinová sekvence CPn03O2, což je CP homolog CT243 (lpxD), který byl identifikován v klonu CTh2gam8.
SEQ ID NO: 507 odpovídá aminokyselinová sekvence CPn0324, což je CP homolog CT089 (IcrE), který byl identifikován v klonech CTL2-9, CTL2garnl, CTh2gaml7 a CTL2-Í9(5’).
SEQ ID NO: 508 odpovídá aminokyselinová sekvence CPnO76I, což je CP homolog CT610, který byl identifikován v klonu CTL2-10{5') (3*) ·
SEQ ID NO: 509 odpovídá aminokyselinová sekvence CPn0760, což je CP homolog CT611, který byl identifikován v klonu CTL2-10(5'). SEQ ID NO: 510 odpovídá aminokyselinová sekvence CPnO329, což je CP homolog CT154, který byl identifikován v klonech CTL2gamlO a CTL2gam21.
SEQ ID NO: 511 odpovídá aminokyselinová sekvence CPn0990, což je CP homolog CT833 (infC), který byl identifikován v klonu CTL2-12 SEQ ID NO: 512 odpovídá aminokyselinová sekvence CPn-ORF5, což j CP homolog CT 0RF3, který byl identifikován v klonech
CTL2gaml5(5'), CTL2-16(5'), CTL2-18(5'), a CTL2-23.
SEQ ID NO: 513 odpovídá aminokyselinová sekvence CPnO9S4, což je CP homolog CT827 (nrdA) který byl identifikován v klonech CTL2-16{3’) a CTL2gaml5{3’).
SEQ ID NO: 514 odpovídá aminokyselinová sekvence CPnO985, což je
• · · · • to··
CP homolog CT828 (nrdB) který byl identifikován v klonech CTh2-16(3') CTL2gaml5(3').
SEQ ID NO: 515 odpovídá aminokyselinová sekvence CPnO349, což je CP homolog CT067 (ytgA), který byl identifikován v klonu CTL2gaml8.
SEQ ID NO: 516 odpovídá DNA sekvenci CPn-ORF6, což je CP homolog CT-0RF4, který byl identifikován v klonu CTL2-18{3').
SEQ ID NO: 517 odpovídá DNA sekvenci CP-ORF7, což je CP homolog CT-0RF5, který byl identifikován v klonu CTL2-18(3').
SEQ ID NO: 518 odpovídá aminokyselinová sekvence CPnO326, což je CP homolog CT087 (malQ), který byl identifikován v klonu CTL2-19(5')·
SEQ ID NO: 519 odpovídá aminokyselinová sekvence CPnO325, což je CP homolog CT088 (sycE), který byl identifikován v klonu CTL2-19{5')SEQ ID NO: 520 odpovídá aminokyselinová sekvence CPnO793, což je CP homolog CT588 (rbsu), který byl identifikován v klonu CTL2gam23.
SEQ ID NO: 521 odpovídá aminokyselinová sekvence CPnO199, což je CP homolog CT199 (oppBl), který byl identifikován v klonu CTL2gam24.
SEQ ID NO: 522 odpovídá aminokyselinová sekvence CPnO666, což je CP homolog CT545 (dna,E) , který byl identifikován v klonu CTL2-24. SEQ ID NO: 523 odpovídá DNA sekvenci CPn0065, což je CP homolog CT288, který byl identifikován v klonu CTL2gam27.
SEQ ID NO: 524 odpovídá DNA sekvenci CPn0444, což je CP homolog CT413 (pmpB), který byl identifikován v klonu CTL2gam30 (5 1) (3') SEQ ID NO: 525 je kompletní C. trachomatis, serovar D, DNA sekvence homologická s C. trachomatis LGV II sekvencí pro CT75 1 (amn) identifikovanou z klonů CTL2-1 a CTh2-5.
SEQ ID NO: 526 je kompletní C. trachomatis serovar D DNA sekvence homologická s C. trachomatis LGV II sekvencí pro CT322 (tuft) identifikovanou z klonu CTL2-2.
• ··· • ···
SEQ ID NO: 527 je kompletní C. trachomatis serovar D DNA sekvence homologická s C. trachomatis LGV II sekvencí pro CT032 (metG) identifikovanou z klonů CTL2gam2, CTL2-3{5') a CTL2-4.
SEQ ID NO: 528 je kompletní C. trachomatis serovar D DNA sekvence homologická s C. trachomatis LGV IL sekvencí pro CTO3 1 identifikovanou z klonu CTL2-3(5')(3').
SEQ ID NO: 529 je kompletní C. trachomatis serovar D DNA sekvence homologická s C. trachomatis LGV II sekvencí pro CT030 (gmK) identifikovanou z klonů CTL2-3(3') a CTL2-21.
SEQ ID NO: 530 je kompletní C. trachomatis serovar D DNA sekvence homologická s C. trachomatis LGV II sekvencí pro CT064 (lepA) identifikovanou z klonu CTL2gam5.
SEQ ID NO: 531 je kompletní C. trachomatis serovar D DNA sekvence homologická s C. trachomatis LGV II sekvencí pro CT265 (accA) identifikovanou z klonu CTL2-6.
SEQ ID NO: 532 je kompletní C. trachomatis serovar D DNA sekvence homologická s C. trachomatis LGV 11 sekvencí pro CT624 {msbA) identifikovanou z klonů CTL2-6.
SEQ ID NO: 533 je kompletní C. trachomatis serovar D DNA sekvence homologická s C. trachomatis LGV II sekvencí pro CT256 identifikovanou z klonů CTL2gam6{5’) a CTL2-1Í(5’).
SEQ ID NO: 534 je kompletní C. trachomatis serovar D DNA sekvence homologická s C. trachomatis LGV II sekvencí pro CT257 identifikovanou z klonů CTL2gam6{5') a CTL2-11{5').
SEQ ID NO: 535 je kompletní C. trachomatis serovar D DNA sekvence homologická s C. trachomatis LGV II sekvencí pro CT384 identifikovanou z klonů CTL2gam6{3') a CTL2-11{3').
SEQ ID NO: 536 je kompletní C. trachomatis serovar D DNA sekvence homologická s C. trachomatis LGV II sekvencí pro CT473 identifikovanou z klonu CTL2-8b.
SEQ ID NO: 537 je kompletní C. trachomatis serovar D DNA sekvence homologická s C. trachomatis LGV II sekvencí pro CT474 identifikovanou z klonů CTL2-8b.
• · · · · · ·· ·<, ··' »···>
• · · · · · · · · • ··· · · ··· · · · • ···%···«· · • · · ·· · · ·· · »·····* ·· ·· ·· ··
SEQ ID NO: 538 je kompletní C. trachomatis serovar D DNA sekvence homologická s C. trachomatis LGV II sekvencí pro CT139 (oppAl) identifikovanou z klonů CTL2-Sb.
SEQ ID NO: 539 je kompletní C. trachomatis serovar D DNA sekvence homologická s C. trachomatis LGV II sekvencí pro CT060 (flhA) identifikovanou z klonu CTL2-8b.
SEQ ID NO: 540 je kompletní C. trachomatis serovar D DNA sekvence homologická s C. trachomatis LGV II sekvencí pro CT242 identifikovanou z klonu CTL2gam8.
SEQ ID NO: 541 je kompletní C. trachomatis serovar D DNA sekvence homologická s C. trachomatis LGV II sekvencí pro CT243 (lpxD) identifikovanou z klonu CTL2gam8.
SEQ ID NO: 542 je kompletní C. trachomatis serovar D DNA sekvence homologická s C. trachomatis LGV II sekvencí pro CT089 identifikovanou z klonů CTL2-9, CTL2gaml, CTL2gaml7, a CTL2-19{5')·
SEQ ID NO: 543 je kompletní C. trachomatis serovar D DNA sekvence homologická s C. trachomatis LGV II sekvencí pro CT610 identifikovanou z klonu CTL2-10 (5’) {3')·
SEQ ID NO: 544 je kompletní C. trachomatis serovar D DNA sekvence homologická s C. trachomatis LGV II sekvencí pro CT611 identifikovanou z klonu CTL2-10(5')SEQ ID NO: 545 je kompletní C. trachomatis serovar D DNA sekvence homologická s C. trachomatis LGV II sekvencí pro CT154 identifikovanou z klonů CTL2gamlO a CTL2gam21.
SEQ ID NO: 546 je kompletní C. trachomatis serovar D DNA sekvence homologická s C. trachomatis LGV II sekvencí pro CT833 (infC) identifikovanou z klonu CTL2-12.
SEQ ID NO: 547 je kompletní C. trachomatis serovar D DNA sekvence homologická s C. trachomatis LGV II sekvencí pro CT827 (nrdA) identifikovanou z klonů CTL2-16{3') a CTL2gaml5(3!)SEQ ID NO: 548 je kompletní C. trachomatis serovar D DNA sekvence homologická s C. trachomatis LGV II sekvencí pro CT828 (nrdB)
···· ··· ·· ·· ·· ·· identifikovanou z klonů CTh2-16{3') a CTL2gaml5(31).
SEQ ID NO: 549 je kompletní C. trachomatis serovar D DNA sekvence homologická s C. trachomatis LGV II sekvencí pro CT067 (ytgA) identifikovanou z klonu CTL2gaml8.
SEQ ID NO: 550 je kompletní C. trachomatis serovar D DNA sekvence homologická s C. trachomatis LGV II sekvencí pro CT088 (sycE) identifikovanou z klonů CTL2-19(5').
SEQ ID NO: 551 je kompletní C. trachomatis serovar D DNA sekvence homologická s C. trachomatis LGV II sekvencí pro CT087 identifikovanou z klonu CTL2-19(5').
SEQ ID NO: 552 je kompletní C. trachomatis serovar D DNA sekvence homologická s C. trachomatis LGV II sekvencí pro CT588 (rsbu) identifikovanou z klonu CTL2gam23.
SEQ ID NO: 553 je kompletní C. trachomatis serovar D DNA sekvence homologická s C. trachomatis LGV II sekvencí pro CT 199 (oppBl) identifikovanou z klonu CTL2gam24.
SEQ ID NO: 554 je kompletní C. trachomatis serovar D DNA sekvence homologická s C. trachomatis LGV II sekvencí pro CT545 (dnaE) identifikovanou z klonu CTL2-4.
SEQ ID NO: 555 je kompletní C. trachomatis serovar D DNA sekvence homologická s C. trachomatis LGV II sekvencí pro CT288 identifikovanou z klonů CTL2gam27.
SEQ ID NO: 556 je kompletní C. trachomatis serovar D DNA sekvence homologická s C. trachomatis LGV II sekvencí pro CT413 (pmpB) identifikovanou z klonu CTL2gam30(51)(31)SEQ ID NO: 557 je kompletní C. trachomatis serovar D DNA sekvence homologická s C. trachomatis LGV II sekvencí pro CT-ORF3 identifikovanou z klonů CTL2gaml5{5'), CTL2-16(5'), CTL2-18(5') a CTL2-23.
SEQ ID NO: 558 je kompletní C. trachomatis serovar D DNA sekvence homologická s C. trachomnatis LGV II sekvencí pro pCTORF4 identifikovanou z klonu CTL2-18(3').
SEQ ID NO: 559 je kompletní C. trachomatis serovar D DNA sekvence • ··· • ··· • · · · ·· homologická s C. trachomatis LGV II sekvencí pro CT-0RF5 identifikovanou z klonů CTL2-18(3').
SEQ ID NO: 560 je kompletní C. trachomatis serovar D aminokyselinová sekvence homologická s C. trachomatis LGV II sekvencí pro CT751 (amn) identifikovanou z klonů CTL2-1 a CTL2-5. SEQ ID NO: 561 je kompletní C. trachomatis serovar D aminokyselinová sekvenci homologická s C. trachomatis LGV II sekvencí pro CT322 (tuff) identifikovanou z klonu CTL2-2.
SEQ ID NO: 562 je kompletní C. trachomatis serovar D aminokyselinová sekvence homologická s C. trachomatis LGV II sekvencí pro CT032 (metO) identifikovanou z klonů CTL2gam2,
CTL2-3(5') a CTh2-4.
SEQ ID NO: 563 je kompletní C. trachomatis serovar
D aminokyselinová sekvence homologická s C. trachomatis LGV II sekvencí pro CT031 identifikovanou z klonu CTL2-3(5’)(3')SEQ ID NO: 564 je kompletní C. trachomatis serovar D aminokyselinová sekvence homologická s C. trachomatis LGV II sekvencí pro CT030 (gmK) identifikovanou z klonů CTL2-3(3') a CTL2-21.
SEQ ID NO: 565 je kompletní C. trachomatis serovar
D aminokyselinová sekvence homologická s C. trachomatis LGV II sekvencí pro CT064 (lepA) identifikovanou z klonu CTL2gam5.
SEQ ID NO: 566 je kompletní C. trachomatis serovar D aminokyselinová sekvence homologická s C. trachomatis LGV II sekvencí pro CT265 (accA) identifikovanou z klonu CTL2-6.
SEQ ID NO: 567 je kompletní C. trachomatis serovar D aminokyselinová sekvence homologická s C. trachomatis LGV II sekvencí pro CT624 (msbA) identifikovanou z klonů CTL2-6.
SEQ ID NO: 568 je kompletní C. trachomatis serovar D aminokyselinová sekvence homologická s C. trachomatis LGV II sekvencí pro CT256 identifikovanou z klonů CTL2gam6(5') a CTL2-ll<5’).
SEQ ID NO: 569 je kompletní C. trachomatis serovar » ···« • · ·»·«
D aminokyselinová sekvence homologická s C. trachomatis LGV II sekvencí pro CT257 identifikovanou z klonů CTL2gam6(5') a CTL2-11{5').
SEQ ID NO: 570 je kompletní C. trachomatis serovar
D aminokyselinová sekvence homologická s C. trachomatis LGV II sekvencí pro CT384 identifikovanou z klonů CTL2gam6(3') a CTL2-11(3’).
SEQ ID NO: 571 je kompletní C. trachomatis serovar
D aminokyselinová sekvence homologická s C. trachomatis LGV II sekvencí pro CT473 identifikovanou z klonu CTL2-8b.
SEQ ID NO: 572 je kompletní C. trachomatis serovar D aminokyselinová sekvence homologická s C. trachomatis LGV II sekvencí pro CT474 identifikovanou z klonů CTL2-Sb.
SEQ ID NO: 573 je kompletní C. trachomatis serovar D aminokyselinová sekvence homologická s C. trachomatis LGV II sekvencí pro CT139 (oppAl) identifikovanou z klonů CTL2-8b.
SEQ ID NO: 574 je kompletní C. trachomatis serovar D aminokyselinová sekvence homologická s C. trachomatis LGV II sekvencí pro CT060 (flhA) identifikovanou z klonu CTL2-8b.
SEQ ID NO: 575 je kompletní C. trachomatis serovar D aminokyselinová sekvence homologická s C. trachomatis LGV II sekvencí pro CT242 identifikovanou z klonu CTL2gam8.
SEQ ID NO: 576 je kompletní C. trachomatis serovar D aminokyselinová sekvence homologická s C. trachomatis LGV II sekvencí pro CT243 (lpxD) identifikovanou z klonu CTh2gam8.
SEQ ID NO: 577 je kompletní C. trachomatis serovar D aminokyselinová sekvence homologická s C. trachomatis LGV II sekvencí pro CT089 identifikovanou z klonů CTL2-9, CTL2gaml, CTh2gaml7, a CTL2-19(5').
SEQ ID NO: 578 je kompletní C. trachomatis serovar
D aminokyselinová sekvence homologická s C. trachomatis LGV H sekvencí pro CT610 identifikovanou z klonu CTL2-10(5')(3'). SEQ ID NO: 579 je kompletní C. trachomatis serovar • ···
D aminokyselinová sekvence homologická s C. trachomatis LGV II sekvencí pro CT611 identifikovanou z klonu CTh2-10(5')SEQ ID NO: 580 je kompletní C. trachomatis serovar D aminokyselinová sekvence homologická s C. trachomatis LGV II sekvencí pro CT154 identifikovanou z klonů CTL2gamlO a CTL2gam21. SEQ ID NO: 581 je kompletní C. trachomatis serovar D aminokyselinová sekvence homologická s C. trachomatis LGV II sekvencí pro CT833 (infC) identifikovanou z klonu CTL2-12.
SEQ ID NO: 582 je kompletní C. trachomatis serovar D DNA sekvence homologická s C. trachomatis LGV IL sekvencí pro CT-ORF3 identifikovanou z klonů CTL2gaml5(5') , CTL2-16{5'), CTL2-18(5') a CTL2-23.
SEQ ID NO: 583 je kompletní C. trachomatis serovar D DNA sekvence homologická s C. trachomatis LGV II sekvencí (nrdA) identifikovanou z klonů CTL2-16(3’) a CTL2gaml5{3').
SEQ ID NO: 584 je kompletní C. trachomatis serovar D DNA sekvence homologická s C. trachomatis LGV II sekvencí (nrdB) identifikovanou z klonů CTL2-16(3') a CTL2gaml5(3').
SEQ ID NO: 585 je kompletní C. trachomatis serovar D DNA sekvence homologická s C. trachomatis LGV II sekvencí (ytgA) identifikovanou z klonu CTL2gaml8.
SEQ ID NO: 586 je kompletní C. trachomatis serovar D sekvence homologická s C. trachonmatis LGV II sekvencí pro CTORF4 identifikovanou z klonu CTL2-18(3')
SEQ ID NO: 587 je kompletní C. trachomatis serovar D sekvence homologická s C. trachomatis LGV II sekvencí pro CT-ORF5 identifikovanou z klonů CTL2-18{3’)SEQ ID NO: 588 je kompletní C. trachomatis serovar D DNA sekvence homologická s C. trachomatis LGV II sekvencí pro CT087 identifikovanou z klonu CTL2-19(5').
SEQ ID NO: 589 je kompletní C. trachomatis DNA sekvence homologická s C. trachomatis LGV II sekvencí pro CT088 (sycE) identifikovanou z klonů CTL2-19(5').
··
SEQ ID NO: 590 je kompletní C. trachomatis serovar D sekvence homologická s C. trachomatis LGV II sekvencí pro CT588 identifikovanou z klonu CTL2gam23.
SEQ ID NO: 591 je kompletní C. trachomatis serovar D DNA sekvence homologická s C. trachomatis LGV II sekvencí pro CT199 (oppBl) identifikovanou z klonu CTL2gam24.
SEQ ID NO: 592 je kompletní C. trachomatis serovar D DNA sekvence homologická s C. trachomatis LGV II sekvencí pro CT545 (dnaE) identifikovanou z klonu.CTL2-4.
SEQ ID NO: 593 je kompletní C. trachomatis serovar D DNA sekvence homologická s C. trachomatis LGV II sekvencí pro CT288 identifikovanou z klonů CTL2gam27.
SEQ ID NO: 594 je kompletní C. trachomatis serovar D DNA sekvence homologická s C. trachomatis LGV II sekvencí pro CT413 (pmpB) identifikovanou z klonu CTL2gam30(5’)(3’).
SEQ ID NO: 595 je DNA sekvencí pro Chlamydia pneumoniae homolog, CPn0406, Chlamydia trachomatis genu CT102.
SEQ ID NO: 596 je DNA sekvencí pro Chlamydia pneumoniae homolog, CPnO315, Chlamydia trachomatis genu CT098.
SEQ ID NO: 597 je aminokyselinová sekvence pro Chlamydia pneumoniae homolog, CPn04O6, Chlamydia trachomatis genu ČT102.
SEQ ID NO: 598 je aminokyselinová sekvence pro Chlamydia pneumoniae homolog, CPnO315, Chlamydia trachomatis genu CT098.
SEQ ID NO: 599 je aminokyselinová sekvence pro Chlamydia trachomatis serovar D CT287 protein.
Popis obrázků na připojených výkresech
Obr. 1 ilustruje indukci produkce IFN-gamma linií T-lymfocytů specifických pro Chlamydie aktivovanou cílovými buňkami exprimujxcími klon 4C9-18#2.
Obr. 2 ilustruje retrovirově vektory pBIB-KSl,2,3 modifikované ·* ·<<· φ φ • φφφ tak, aby obsahovaly Kosakovo translační iniciační místo a stop kodony.
Obr. 3 ukazuje specifickou lýzu v testu uvolňování chrómu provedeném na P815 buňkách pulsovaných chlamydiovými peptidy CtC7.8-12 {SEQ ID NO: 18) a CtC7.8-13 (SEQ ID NO: 19).
Obr. 4 ukazuje titry izotypů protilátek u C57B1/6 myší imunizovaných C. trachomatis SWIB proteinem.
Obr. 5 ukazuje proliferativní reakci T-lymfocytň specifických pro Chlamydie ve splenocytech od C3H myší imunizovaných C. trachomatis SWIB proteinem.
Obr. 6 ukazuje sekvence 5' a 3' primerů, které byly odvozeny od C. pneumoniae a které byly použity pro izolaci SWIB a S13 genů z C. pneumoniae.
Obr. 7A a 7B ukazují indukci IFN-gamma z lidské anti-chlamydiové T-lymfocytární linie (TCL-8) schopné zkříženě reagovat s C. trachomatis a C. pneumoniae po aktivaci dendritickými buňkami odvozenými od mónocytů exprimujícími chlamydiové proteiny.
Obr. 8 ukazuje identifikaci epitopů pro T-lymfocyty v chlamydiovém ribosomálním S13 proteinu za použití T-lymfocytární linie TCL 8 EB/DC.
Obr. 9 ukazuje proliferativní reakci CP-21 T-lymfocytů připravených proti dendritickým buňkám infikovaným C. pneumoniae na rekombinantní SWIB protein C. pneumoniae, ale ne na C. trachomatis SWIB protein.
Obr. 10 ukazuje proliferativní reakci primární T-lymfocytární ·· >···· ·· ···· • ·*· • e e linie (TCT-10 EB) od asymptomatického dárce specifickou pro SWIB C. trachomatis.
Obr. 11 ukazuje identifikaci epitopu pro T-lymfocyty na C. trachomatis SWIB za použití T-lymfocytární linie specifické pro antigen (TCL-10 EB).
Obr. 12 ukazuje proliferativní odpověď primární T-lymfocytární buněčné linie generované od dvou pacientů proti CT specifickým antigenům CT622, CT875 a CT EB.
Podrobný popis předkládaného vynálezu
Jak bylo uvedeno výše, je předkládaný vynález obecně zaměřen na prostředky a způsoby pro diagnostiku a terapii chlamydiových infekcí. V jednom aspektu obsahuje prostředek podle předkládaného vynálezu polypeptidy, které obsahují alespoň jednu imunogenní část chlamydiového antigenu, nebo jeho varianty.
Ve specifických provedeních popisuje předkládaný vynález polypeptidy obsahujících imunogenní část chlamydiového antigenu, kde chlamydiový antigen obsahuje aminokyselinovou sekvenci kódovanou polynukleotidovou molekulou podle předkládaného vynálezu, sekvencí komplementární k uvedeným nukleotidovým sekvencím a nebo variantou takových sekvencí.
Termín polypeptid, jak je zde použit, označuje aminokyselinový řetězec jakékoliv délky, včetně kompletních proteinů (t.j. antigenů), ve kterém jsou aminokyselinové zbytky vázány peptidovými vazbami. Termín polypeptid tedy zahrnuje imunogenní část jakéhokoliv antigenu podle předkládaného vynálezu samotnou nebo obsahující další sekvence. Další sekvence mohou být ·· ···· '·· ·· • 9 9 • 9 999 odvozeny od přirozeného chlamydiového antigenů nebo mohou být heterologní a takové sekvence mohou (ale nemusí) být imunogenní.
Termín polynukleotid, jak je zde použit, označuje jednořetězcový nebo dvouřetězcový polymer deoxyribonukleotidových nebo ribonukleotidových baží a označuje DNA a příslušné RNA molekuly, včetně HnRNA a mRNA molekul, kódující a protismyslné řetězce a cDNA, genomovou DNA a rekombinantní DNA, stejně jako zcela nebo částečně syntetické polynukleotidy. HnRNA molekula obsahuje introny a odpovídá DNA molekule jedna ku jedné. mRNA molekula odpovídá HnRNA a DNA molekule, ze kterých byly excidovány introny. Polynukleotid se může skládat z celého genu nebo z jakékoliv jeho části. Operabilní protismyslné polynukleotidy mohou obsahovat fragment příslušného polynukleotidu a výraz polynukleotid proto zahrnuje všechny takové operabilní protismyslné fragmenty.
Imunogenní část antigenů je část, která je schopná reagovat se sérem získaným od jedinců infikovaných Chlamydiemi (t.j. generuje absorbanci při testování séra od infikovaného jedince, která je o alespoň tři standardní odchylky vyšší než absorbance získaná při testování séra od rieinfikovaného jedince v ELISA testu podle předkládaného vynálezu). Takové imunogenní části obvykle obsahují alespoň 5 aminokyselinových zbytků, lépe alespoň 10 a ještě lépe alespoň 20 aminokyselinových zbytků. Způsoby pro přípravu imunogenních částí antigenů známých sekvencí j sou dobře známé a jsou shrnuty v Paul, Fundamental Immunology, 3. vydání, 243-247 (Raven Press, 1993) a odkazech zde citovaných. Mezi takové techniky patří vyšetřování polypeptidů na schopnost reagovat s protilátkami, antisérem a/nebo T-lymfocytárními liniemi nebo klony specifickými pro antigen. Antisérum a protilátky jsou specifické pro antigen tehdy, když se specificky váží na antigen (t.j. když reagují s proteinem v ELISA nebo v jiných imunotestech ··« · '·· »··· • 9 9 • ·· a nereagují detekovatělně s nepříbuznými proteiny). Takové antisérum a protilátky mohou být připraveny zde popsaným způsobem a za použití dobře známých technik. Imunogenní část přirozeného chlamydiového proteinu je část, která reaguje s takovým antisérem a/nebo T-lymfocyty v úrovni, která není významně nižší než reaktivita s kompletním polypeptidem (například v ELISA a/nebo testu reaktivity T-lymfocytů). Takové imunogenní části mohou reagovat v takových testech v úrovni reaktivity, která je stejná nebo vyšší než úroveň reaktivity s kompletním proteinem. Taková vyšetření mohou být provedena za použití metod dobře známých v oboru, jako jsou metody popsané v Harlow and Lané, Antibodies:
A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory, 1988.
Například může být polypeptid imobilizován na pevném nosiči a může být kontaktován se sérem pacienta pro umožnění vazby protilátek v séru na imobílizovaný polypeptid. Nenavázané sérum může být potom odstraněno a navázané protilátky mohou být detekovány za použití, například, 125I-značeného Proteinu A.
Příklady imunogenních částí antigenů podle předkládaného vynálezu zahrnují, například, stimulační epitopy pro T-lymfocyty uvedené v SEQ ID NO: 9, 10, 18, 19, 31, 39, 93-96, 100-102, 106, 108, 138-140, 158, 167, 168, 246, 247 a 254-256. Polypeptidy obsahující alespoň imunogenní část jednoho nebo více chlamydiových antigenů podle předkládaného vynálezu mohou být použity, samostatně nebo v kombinaci, pro detekci chlamydiové infekce u pacienta.
Prostředky a způsoby podle předkládaného vynálezu mohou také obsahovat varianty výše uvedených polypeptidových a polynukleotidových molekul. Takové varianty zahrnují, například, přirozené alelové varianty sekvencí podle předkládaného vynálezu. Konkrétně, varianty zahrnují jiné serovary Chlamydií, jako jsou serovary D, E a F, stejně jako několik LGV serovarů, které
• ,· · • · • ·· · « · vykazují homologii s polypeptidovými a polynukleotidovými molekulami podle předkládaného vynálezu. Výhodně mají serovarové homology 95-99% homologii s příslušnými polypeptidovými sekvencemi podle předkládaného vynálezu.
Termín varianta polypeptidu, jak je zde použit, označuje polypeptid, který se liší od uvedeného polypeptidu pouze v jedné konzervativní substituci a/nebo modifikaci, takže jsou zachovány antigenní vlastnosti polypeptidu. Ve výhodném provedení se varianta polypeptidu liší od identifikované sekvence substitucí, delecí nebo adicí pěti nebo méně aminokyselin. Takové varianty mohou být obecně identifikovány modifikací jedné z výše uvedených polypeptidových sekvencí a hodnocením antigenních vlastností modifikovaného polypeptidu za použití například, zde popsaných způsobů. Jinými slovy, schopnost varianty reagovat s antisérem specifickým pro antigen může být zvýšena nebo nezměněna ve srovnání s přirozeným proteinem, nebo může být snížena o méně než 50% a výhodně o méně než 20% ve srovnání s přirozeným proteinem. Takové varianty mohou být obecně identifikovány modifikací jedné z výše uvedených polypeptidových sekvencí a hodnocením reaktivity modifikovaného polypeptidu s protilátkami nebo antisérem specifickým pro antigen, jak je zde popsáno. Výhodnými variantami jsou ty, ve kterých je odstraněna jedna nebo více částí, jako například N-koncová vedoucí sekvence nebo transmembránová doména. Dalšími výhodnými variantami jsou ty, ve kterých byla z N- a/nebo C-konce zralého proteinu odstraněna malá část (například 1-30 aminokyselin, lépe 5-15 aminokyselin).
Konzervativní substituce je taková, při které je aminokyselina substituována za jinou aminokyselinu, která má podobné vlastnosti, takže se předpokládá, že sekundární struktura a hydropatický charakter polypeptidu zůstane v podstatě nezměněn. Aminokyselinové substituce mohou být provedeny na základě podobnosti v polaritě, • 9 9999 ·» 99 • 99 999 • ··· 9 · 999
9 9 9 9 9
9 9 9 ·
999 9 9 99 9 9 C<?
• 9 99 náboji, rozpustnosti, hydrofobnosti, hydrofilnosti a/nebo amfipatického charakteru zbytků. Například, mezi aminokyseliny s negativním nábojem patří kyselina glutamová a kyselina asparagová; mezi aminokyseliny s pozitivním nábojem patří lysin a arginin; a mezi aminokyseliny s nepolárními skupinami mající podobné hodnoty hydrofnosti patří leucin, isoleucin a valin; glycin a alanin; asparagin a glutamin; a serin, threonin, fenylalanin a tyrosin. Jiné skupiny aminokyselin, které mohou představovat konzervativní změny, jsou: (1) ala, pro, gly, glu, asp, gin, asn, ser, thr; (2) cys, ser, tyr, thr; (3) val, ile, leu, met, ala, phe; (4) lys, arg, his; a (5) phe, tyr, trp, his. Varianta může také, nebo alternativně, obsahovat nekonzervativní změny. Ve výhodném provedení se varianta polypeptidu liší od přirozené sekvence substitucí, delecí nebo adicí pěti nebo méně aminokyselin. Varianty mohou být také (nebo alternativně) modifikovány například delecí nebo adicí aminokyselin, které mají minimální vliv na imunogenicitu, sekundární strukturu a hydropatický charakter polypeptidu. Varianty mohou také (nebo alternativně) obsahovat další modifikace, včetně delecí nebo adicí aminokyselin, které mají minimální vliv na imunogenicitu, sekundární strukturu a hydropatický charakter polypeptidu. Například může být polypeptid konjugován na signální (nebo vedoucíú sekvenci na N-konci proteinu, kde tato sekvence ko-translačně nebo post-translačnš řídí transport proteinu. Polypeptid může být také konjugován na spojovací nebo jinou sekvenci pro usnadnění syntézy, přečištění nebo identifikace polypeptidu (například na póly-His) nebo pro zvýšení vazby polypeptidu na pevný nosič. Například může být polypeptid konjugován na Fc region imunoglobulinu.
Varianta polynukleotidu je sekvence, která se liší od uvedené nukleotidové sekvence v tom, že obsahuje jednu nebo více nukleotidových delecí, substitucí nebo adicí takových, že ·· ···« ·· ·· tr ««·· • · · · · · «· · • ··» · · ··· · · · • ·*·····»· · • · · · · · · · · · ··* 66 ββ 6fe ·Φ imunogenicita kódovaného polypeptidu není snížena, ve srovnání s přirozeným proteinem. Vliv na imunogenicitu kódovaného polypeptidu může být hodnocen způsobem, který je zde popsán. Takové modifikace mohou být snadno připraveny za použití standardních technik pro mutagenesi, jako je oligonukleotidy řízená místně specifická mutagenbese (viz, například, Adelman et al., DNA 2: 183, 1983). Nukleotidové varianty mohou být přirozené alelické varianty nebo přirozeně se nevyskytující varianty. Polypeptidy podle předkládaného vynálezu také zahrnují varianty, které jsou kódované polynukleotidovými sekvencemi, které jsou v podstatě homologní s jednou nebo více uvedenými polynukleotidovými sekvencemi. Termín v podstatě homologní znamená, že polynukleotidové sekvence jsou schopné hybridizovat za středně přísných podmínek. Vhodné středně přísné podmínky jsou předpromytí v roztoku 5xSSC, 0,5%
SDS, 1,0 mM EDTA <pH 8); hybridizace při 50 °C - 65 °C, 5 x SSC přes noc, nebo v případě mezidruhové homologie, při 45 ° C s 0,5 x SSC; a potom promývání dvakrát po dobu 20 minut při 65 °C ve 2x, 0,5x a 0,2xSC obsahujícím 0,1% SDS. Takové hybridizující polynukleotidové sekvence také spadají do rozsahu předkládaného vynálezu, stejně jako nukleotidové sekvence, které v důsledku degenerace genetického kódu kódují polypepťid, který je stejný jako polypeptid podle předkládaného vynálezu.
Dvě nukleotidové nebo polypeptidové sekvence jsou identické, pokud je sekvence nukleotidů nebo aminokyselinových zbytků ve dvou sekvencích stejná, pokud jsou tyto sekvence přiřazeny tak, aby si maximálně odpovídaly. Srovnání dvou sekvencí je obvykle provedeno ve srovnávacím oknu za účelem identifikace a srovnání lokálních regionů podobnosti sekvence. Termín srovnávací okno, jak je zde použit, označuje segment alespoň 20 následujících pozic, obvykle 35 až 75 nebo 40 až 50, ve kterých může být sekvece srovnávána s referenční sekvencí o stejném počtu pozic po optimálním přiřazení dvou sekvencí.
Optimální přiřazení dvou sekvencí pro srovnání může být provedeno, například, za použití Megalign programu v Lasergene bioinformatickém softwaru (DNASTAR, lne., Madison, WI), za použití chybových parametrů. Tento program provádí několik schémat přiřazení, které jsou popsány v následujících odkazech: Dayhoff, M.O. (1978) A model of evolutionar change in proteins - Matrices for detecting distant relationships, v Dayhoff, M.O. (ed.) Atlas of Protein Sequence and Structure, National Biomedical Research Foundation, Washington D.C., svazek 5, Suppl. 3, str. 345-358;
Hein J. (1990) Unified Approach to Alignment and Phylogenes, str. 626-645, Methods in Enzymology, svazek 183, Academie Press, lne., San Diego, CA; Higgins, D.G. and Sharp, P.M., (1989), Fast and sensitive multiple sequence alignments on a microcomputer CABIOS 5: 151153; Myers, E.W. and Muller, W. (1988), Optimal alignments in linear space CABIOS, 4: 11-17; Robinson, E.D. (1971) Comb. theor. 11: 105; Santou, N., Nes, M. (1987), The neighbor joining method. A new method for reconstructing phylogenetic trees. Mol. Biol. Evol. 4: 406-425; Sneatht, P.H.A. and Sokal, R.R. (1973), Numerical Taxonomy - the Principles and Practise of Numerical Taxonomy, Freeman Press, San Francisko, CA; Wilbur, W.J., and Lipman, D.J., 1983, Rapid similarity searches of nucleic acid and protein data banks, Proč. Nati. Acad. Sci. USA 80: 726-730.
Alternativně může být optimální seřazení sekvencí pro srovnání provedeno za použití algoritmu lokální identity podle Smitha a Watermana (1981) Add. APL Math. 2:482, algoritmu identity seřazení (Needleman and Wunsch (1970) J. Mol. Biol. 48: 443, vyhledávání podobnosti za použití způsobů dle Pearsona a Lipmana (1988) Proč. Nati. Acad. Sci. USA 85: 2444, počítačových programů využívajících těchto algoritmů (GAP, BESTFIT, BLAST, FASTA a TFASTA ve Wisconsin Genetics Software Package, Genetics Computer Group (GCG), 575 Science Dr., Madison, WI), nebo prohlížením.
• ·
Jedním ilustrativní příkladem algoritmů, které jsou vhodné pro stanovení procenta identity sekvence a podobnosti sekvence jsou BLAST a BLAST 2.0 algoritmy, které jsou popsány v Altschul et al., (1977) Nuc. Acids Res. 25: 3389-3402; a Altschul et al., (1990) J.
Mol. Biol. 215: 403-410, v příslušném pořadí. BLAST a BLAST 2.0 mohou být použity, například se zde uvedenými parametry, pro stanovení procenta identity sekvence pro polynukleotidy a polypeptidy podle předkládaného vynálezu. Software pro BLAST analýzu je veřejně dostupný přes National Center for Biotechnology Information (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/). V jednom ilustrativním případu mohou být kumulativní skóre vypočtena za použit - pro nukleotidové sekvence - parametru M (reward skoré pro párování odpovídajících zbytků; vždy > 0) a N (penále za chybně spárované zbytky; vždy < 0). Pro aminokyselinové sekvence může být skórovací matrice použita pro výpočet kumulativního skóre. Prodlužování výrazů v každém směru se zastaví, když: kumulativní skóre poklesne na 0 nebo méně, v důsledku akumulace jednoho nebo více přiřazení zbytků s negativním skóre; nebo po dosažení konce sekvence. Parametry BLAST algoritmu W, T a X určují sensitivitu a rychlost přiřazení. BLASTN program (pro nukleotidové sekvence) používá jako chybu délku výrazu (W) =11, a předpoklad (E) =10, a
BLOSUM62 skórovací matrici (viz Henikoff and Henikoff (1989) Proč. Nati. Acad. Sci USA 89: 10915), (B) = 50, předpoklad (E) = 10,
M = 5, N = 4 a srovnání obou řetězců.
Výhodně je procento identity sekvencí určeno srovnáním dvou optimálně přiřazených sekvencí ve srovnávacím okénku velikosti alespoň 20 pozic, kde část polynukleotidová nebo polypeptidové sekvence v okénku může obsahovat adice nebo delece (t.j. mezery) z 20% nebo méně, obvykle z 5 až 15%, nebo 10 až 12%, vzhledem k referenční sekvenci (která neobsahuje adice ani delece).
Procento identity může být vypočteno určením počtu pozic, ve kterých se vyskytují identické baze nebo aminokyseliny v obou sekvencích za zisku počtu odpovídajících pozic, dělením počtu odpovídajících pozic celkovým počtem pozic v referenční sekvenci (t.j. velikostí okna) a násobením výsledku 100 za zisku procenta identity sekvencí.
Proto předkládaný vynález zahrnuje polynukleotidové a polypeptidové sekvence mající významnou identitu se sekvencemi podle předkládaného vynálezu, například ty sekvence, které mají alespoň 50% nebo vyšší identitu sekvence, výhodně alespoň 55%,
60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98% nebo 99% nebo vyšší identitu sekvence ve srovnání s polynukleotidovými nebo polypeptidovými sekvencemi podle předkládaného vynálezu, při použití zde popsaných způsobů (například BLAST analýzy za použití standardních parametrů, jak jsou popsány dále). Odborníkům v oboru bude jasné, že tyto hodnoty mohou být vhodným způsobem upraveny pro určení identity proteinů kódovaných dvěma polynukleotidovými sekvencemi, když se bere v úvahu degenerace kodonů, podobnost aminokyselin, pozice čtecího rámce a podobně.
V dalších provedeních předkládaný vynález poskytuje izolované polynukleotidy nebo polypeptidy obsahující různě dlouhé kontinuální řetězce sekvence identické k nebo komplementární k jedné nebo více sekvencím podle předkládaného -vynálezu. Například mohou polynukleotidy a polypeptidy podle předkládaného vynálezu obsahovat alespoň 15, 20, 30, 40, 50, 75, 100, 150, 200, 300, 400, 500 nebo 1000 nebo více sousedních nukleotidů jedné nebo více popsaných sekvencí, stejně jako všechny délky v uvedeném rozmezí. Je třeba si uvědomit, že mezi tyto délky patří 16, 17, 18, 19 atd.; 21, 22, 23, atd.; 30, 31, 32 atd.; 50, 51, 52, 53 atd.; 100, 101, 102, 103 atd.; 150, 151, 152, 153 atd.; včetně celých čísel mezi 200-500, 500-1000 a podobně.
Polynukleotidy podle předkládaného vynálezu, nebo jejich
4 fragmenty, bez ohledu na délku kódující sekvence samotné, mohou být kombinovány s jinými DNA sekvencemi, jako jsou promotory, polyadenylační signály, další místa pro restrikční enzymy, klonovací místa, jiné kódující segmenty, a podobně, takže jejich celková délka může být velmi různá. Proto se předpokládá, že mohou být použity fragmenty nukleových kyselin téměř jakékoliv délky, kde celková délka je výhodně limitována snadností přípravy a použitím v daném rekombinantním DNA protokolu. Například DNA segmenty délky přibližné 10000, přibližně 5000, přibližně 3000, přibližně 2000, přibližně 1000, přibližně 500, přibližně 200, přibližně 100, přibližně 50 párů baží, a podobně (včetně délekm v uvedeném rozmezí) se považují za segmenty použitelné v mnoha aspektech předkládaného vynálezu.
Předkládaný vynález dále zahrnuje alely genů kódující popsané nukleotidové sekvence. Termín alela nebo alelická sekvence označuje alternativní formu genu, která může vzniknout alespoň jednou mutací sekvence nukleové kyseliny. Alely mohou vést ke vzniku pozměněných mRNA nebo polypeptidů, jejichž struktura nebo funkce nemusí být pozměněna. Jakýkoliv daný gen může, ale nemusí, mít alelické formy. Mezi běžné změny, které způsobují vznik alel, patří přirozené delece, adice nebo substituce nukleotidů. Každá taková změna se může vyskytovat samostatně nebo v kombinaci, jednou nebo vícekrát v dané sekvenci.
Ve specifických provedeních popisuje vynález polypeptidy obsahující alespoň imunogenní část chlamydiového antigenů (nebo varianty takového antigenů), která obsahuje jednu nebo více aminokyselinových sekvencí kódovaných (a) polynukleotidovou sekvencí vybranou ze skupiny zahrnující SEQ ID NO: 358-361, 407-430, 525-559, 582-598; (b) sekvencí komplementární k takovým sekvencím; nebo (c) DNA sekvencí v podstatě homologní k sekvencím (a) nebo (b). Jak je popsáno dále v příkladech, několik chlamydiových antigenů podle předkládaného vynálezu je • · • · · · • · · · · · • ··· · · ··· * · · · · · • · · · · ···· ··» ·· ·· 58 rozpoznáváno T-lymfocytárními liniemi, které rozpoznávají dendritické buňky odvozené od monocytů infikované jak Chlamydia trachomatis, tak Chlamydia pneumoniae, což naznačuje, že se může jednat o antigeny představující imunoreaktivní epitopy vlastní jak Chlamydia trachomatis, tak Chlamydia pneumoniae. Tyto antigeny mohou být tedy využity ve vakcíně jak proti infekcím genitálního traktu C. trachomatis, tak proti infekcím C. pneumoniae. Další charakterizace těchto chlamydiových antigenů od Chlamydia trachomatis a Chlamydia pneumoniae pro určení rozsahu zkřížené reaktivity je uvedena v příkladu 6. Dále, příklad 4 popisuje cDNA fragmenty (SEQ ID NO: 15, 16 a 33) izolované od C. trachomatis, které kódují proteiny (SEQ ID NO: 17-19 a 32), které stimulují myší CD8+ T-lymfocytární linie specifické pro Chlamydie.
Obecně, chlamydiové antigeny a polynukleotidové sekvence kódující takové antigeny mohou být připraveny mnoha technikami. Například, polynukleotidové molekuly kódující chlamydiové antigeny mohou být izolovány z chlamydiové genomové nebo cDNA expresní knihovny pomocí skríningu T-lymf ocytární linií specifickou pro Chlamydie, jak je popsán dále, a tyto molekuly mohou být sekvencovány za použiti technik známých odborníkům v oboru. Dále může být polynukleotid identifikován, jak je podrobněji popsáno dále, skríningem mikročipů cDNA na expresi asociovanou s Chlamydiemi (t.j. na expresi, která je alespoň dvakrát vyšší v buňkách infikovaných Chlamidiemi než v kontrolních buňkách, jak se určí representativním testem, který je zde popsán). Taková vyšetření mohou být provedena za použití Synteni mikročipů (Palo Alto, CA) podle návodu výrobce (a v podstatě tak, jak je popsáno v Schena et al., Proč. Nati. Acad. Sci. USA, 93: 10614-10619,
1996, a Heller et al., Proč. Nati. Acad. Sci. USA , 94:
2150-2155, 1997). Alternativně mohou být polynukleotidy amplifikovány z cDNA připravené z buněk exprimujících zde popsané proteiny. Takové polynukleotidy mohou být amplifikovány • · • · « • · polymerasovou řetězovou reakcí (PCR). V tomto způsobu mohou být primery specifické pro sekvenci navrženy podle zde uvedených sekvencí a mohou být zakoupeny nebo syntetizovány.
Antigeny mohou být produkovány rekombinantně, jak je popsáno dále, insercí polynukleotidové sekvence kódující antigen do expresního vektoru a expresí antigenů ve vhodném hostitely. Antigeny mohou být hodnoceny požadované vlastnosti, jako je schopnost reagovat se sérem získaným od jedinců infikovaných Chlamydiemi, jak je zde popsáno, a mohou být sekvencovány za použití, například, tradičních Edmanových čindel. Viz Edman and Berg, Eur. J. Biochem. 80: 116-132, 1967.
Polynukleotidové sekvence kódující antigeny mohou být také získány vyšetřováním vhodných chlamydiových cDNA nebo genomových DNA knihoven na polynukleotidové sekvence, které hybridizují na degenerované oligonukleotidy odvozené z částečných aminokyselinových sekvencí izolovaných antigenů. Degenerované oligonukleotidové sekvence pro použití v takových vyšetřeních mohou být navrženy a syntetizovány a vyšetřování může být provedeno, například, způsobem popsaným v Sambrook et al., Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratories, Cold Spring Harbor, NY, (a odkazech zde citovaných). polymerasová řetězová reakce (PCR) může být také použita, za použití výše uvedených oligonukleotidů v metodách dobře známých v oboru, pro izolaci nukleokyselinových sond z cDNA nebo genomové knihovny. Vyšetřování knihovny může být potom provedeno za použití izolované sondy.
Amplifikovaná část může být použita pro izolaci kompletního genu z vhodné knihovny (například knihovny Chlamydiové cDNA) za použití dobře známých technik. V takových postupech je knihovna (cDNA nebo genomová) vyšetřována za použití jedné nebo více • · e
polynukleotidových sond nebo primerů vhodných pro amplifikaci. Výhodně zahrnuje knihovna větší molekuly. Náhodně sondované knihovny mohou být také výhodě pro identifikaci 5' a předcházejících regionů genů. Genomové knihovny jsou výhodné pro získání intronů a 5' přesahujících sekvencí.
Pro hybridizačni techniky může být částečná sekvence značená (například nick-translací nebo na konci 32P) za použití dobře známých technik. Bakteriální nebo bakteriofágová knihovna se potom vyšetřuje hybridizací filtrů obsahujícími denaturované bakteriální kolonie (nebo deskách obsahujících plaky fágů) pomocí značené sondy (viz Sambrook et al., Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratories, Cold Spring Harbor, NY, 1989). Hybridizující kolonie nebo plaky se selektují a expandují a DNA se z nich izoluje pro další analýzu. cDNA klony mohou být analyzovány pro určení množství dalších sekvencí například pomocí PCR za použití primerů z částečné sekvence a primerů z vektoru.
Pro identifikaci jednoho nebo více překrývajících se klonů mohou být připraveny restrikční mapy. Kompletní sekvence může být potom určena pomocí standardních technik, které mohou zahrnovat tvorbu serie delečních klonů. Získané překrývající se sekvence se potom sestaví do jedné kontinuální sekvence. Kompletní cDNA molekula může být připravena ligací vhodných fragmentů, za použití dobře známých technik.
Alternativně, existuje mnoho amplifikačních technik pro získání kompletní kódující sekvence z částečné cDNA sekvence. V takových technikách se amplifikace obvykle provádí pomocí PCR. Pro provedení amplifikace může být použit jakýkoliv z mnoha komerčně dostupných kitů. Primery mohou být navrženy, například, za použití technik známých v oboru (viz například Mullis et al., Cold Spring Harbor Symp. Quant. Biol. 51: 263, 1987; Erlich ed., PCR Technology, Stocton Press, NY, 1989) a může být použit software • ··· • · dobře známý v oboru. Primery mají výhodně délku 22-30 nukleotidů, obsah GC alespoň 50% a tepelně se váží na cílovou sekvenci při teplotě přibližně 68 °C až 72 °C. Amplifikovaný region může být sekvencován způsobem popsaným výše a překrývající se sekvence mohou být sestaveny do kontinuální sekvence.
Jednou takovou amplifikační technikou je inverzní PCR (viz Triglia et al., Nucl. Acids Res. 16:8186, 1988), která využívá restrikčních enzymů pro generování fragmentu ve známém regionu genu. Fragment se potom cirkularizuje intramolekulovou ligací a použije se jako templát pro PCR s divergentními primery odvozenými od známého regionu genu. V alternativním postupu může být sekvence sousedící s částečnou sekvencí získána amplifikací s primerem pro spojovací sekvenci a s primerem specifickým pro známý region. Amplifikované sekvence jsou obvykle zpracovány ve druhém kole amplifikace se stejným spojovacím primerem a s druhým primerem specifickým pro známý region. Variace tohoto postupu, která využívá dva primery, které iniciují prodloužení v opačných směrech ze známé sekvence, je popsána ve WO 96/38591. Další technikou je záchytná PCR (Lagerstrom et al. , PCR Methods Applic. 1: 111-19, 1991); a procházecí PCR (Parker et al., Nucl. Acids. Res. 19: 3055-60, 1991). Transkripcí-zprostředkovaná amplifikace, neboli TMA, je další metodou, která může být použita pro amplifikací DNA, rRNA nebo mRNA, a je popsáno v patentu č. PCT/US91/03184. Tato autokatalytická a isotermická metoda nezávislá na PCR využívá dva primery a dva enzymy: RNA polymerasu a reverzní transkriptasu. Jeden primer obsahuje promotorovou sekvenci pro RNA polymerasu. V první amplifikací promotor-primer hybridizuje na cílovou rRNA v definovaném místě. Reverzní transkriptasa vytváří DNA kopii cílové rRNA prodloužením z 3 * konce promotoru-primeru. RNA ve vzniklém komplexu se degraduje a druhý primer se naváže na DNA kopii. Nový řetězec DNA se syntetizuje z konce primeru reverzní transkriptasou vytvářející «« • · © β c ···· ··· ·· dvouřetězcovou DNA. RNA polymerasa rozpoznává promotorovou sekvenci v DNA templátu a iniciuje transkripci. Každý nově syntetizovaný RNA amplikon znovu vstupuje do TMA procesu a slouží jako templát pro nové kolo replikace vedoucí k exponenciálnímu namnožení RNA amplikonu. Další metody využívající amplifikace mohou být také použity pro získání kompletní cDNA sekvence.
V některých případech je možno získat kompletní cDNA sekvenci analýzou sekvence uvedené v databázy exprimovaných koncovek sekvencí (EST), která je dostupná od GenBank. Vyhledávání překrývajících se EST může být provedeno pomocí známých programů (například NCBI BLAST prohledávání) a takové EST mohou být použity pro generování kontinuální kompletní sekvence. Kompletní cDNA sekvence mohou být získány také analýzou genomových fragmentů.
Varianty polynukleotidů mohou být připraveny jakoukoliv metodou známou v oboru, včetně chemické syntézy, napříkad včetně fosforoamiditové syntézy na pevné fázi. Modifikace polynukleotidové sekvence mohou být také připraveny standardními technikami mutagenese, jako je oligonukleotidy řízená místně cílená mutagenese (viz Adelman et al., DNA 2: 183, 1983) . Alternativně mohou být RNA molekuly generovány in vitro nebo in vivo transkripcí DNA sekvencí kódujících chlamydiový protein, nebo jeho část, s podmínkou, že DNA je inkorporována do vektoru s vhodným RNA polymerasovým promotorem (jako je T7 nebo SP6) . Některé části mohou být použity pro přípravu kódovaného polypeptidů, jak je zde popsáno. Dále nebo alternativně může být část podána pacientovi tak, že kódovaný polypeptid je generován in vivo (například pomocí transfekce buněk prezentujících antigen, jako jsou dendritické buňky, cDNA konstruktem kódujícím chlamydiový polypeptid, a podáním transfektováných buněk pacientovi).
• ·
• · e e » ·· ·<
Část sekvence komplementární ke kódující sekvenci (t.j. protismyslný polynukleotid) může být také použita jako sonda nebo pro modulování genové exprese. cDNA konstrukty, které mohou být transkribovány do protismyslné RNA, mohou být také vloženy do buněk nebo tkání pro usnadnění produkce protismyslné RNA. Protismyslný polynukleotid může být použit, jak je zde popsáno, pro inhibici exprese chlamydiového proteinu. Protismyslná technologie může být použita pro kontrolu genové exprese prostřednictvím tvorby troj šroubovíce, která narušuje schopnost dostatečného otevření dvoušroubovice pro umožnění vazby polymeras, transkripčních faktorů nebo regulačních molekul {viz Gee et al., v Huber and Carr, Molecular and Immunologic Approaches, Futura Publishing Co. (Mt. Kisko, NY; 1994) . Alternativně může být protismyslná molekula navržena tak, aby hybridizovala na kontrolní region genu (například na promotor, zesilovač transkripce nebo transkripční iniciační místo) a blokovala transkripci genu; nebo aby blokovala translaci inhibici vazby transkriptu na ribozomy.
Část kódující sekvence, nebo komplementární sekvence, může být také použita jako sonda nebo primer pro detekci exprese genu.
Sondy mohou být značeny různými reportérovými skupinami, jako jsou radionuklidy nebo enzymy, a mají výhodně délku alespoň 10 nukleotidů, lépe alespoň 20 nukleotidů a ještě lépe alespoň 30 nukleotidů. Primery mají, jak bylo uvedeno výše, délku výhodně 22-30 nukleotidů.
Jakýkoliv polynukleotid může být dále modifikován pro zvýšení stability in vivo. Možnými modifikacemi jsou, například, přidání sousedních sekvencí na 5' a/nebo 3' konce; použití fosforothioatových nebo 2' O-methylových vazeb místo fosfodiesterasových vazeb ve skeletu; a/nebo použití netradičních baží, jako je inosin, quenosin a wybutosin, stejně jako acetyl-, methyl-, thio- a jiné modifikované formy adeninu, cytidinu, guaninu, thymidinu a uridinu.
·· ··»· *· ·· • · ;· · · ’· ·
4 4 4 4 4 ,4 · φ 4 • 4 · · · '4 4 «> 4
4 4 4 β e '9 • · · · 4 4 4 · · 4 »
Nukleotidové sekvence, jak jsou zde popsány, mohou být navázány na různé další nukleotidové sekvence za použití zavedených technik rekombinantní DNA. Mapříklad může být polynukleotid klonován do různých klonovacích vektorů, včetně plasmidů, fágemidů, derivátů fágu lambda a kosmidů. Zejména výhodné jsou expresní vektory, replikační vektory, vektory pro generování sond a sekvencovací vektory. Vektor obvykle obsahuje sekvenci rozpoznávající počátek replikace funkční v alespoň jednom organismu, běžná místa pro restrikční endonukleasy a jeden nebo více selektovatelných markérů. Další prvky závisí na zamýšleném použití a jsou zřejmé odborníkům v oboru.
Syntetické polypeptidy mající méně než přibližně 100 aminokyselin, a obecně méně než přibližně 50 aminokyselin, mohou být také připraveny za použití technik dobře známých odborníkům v oboru. Například mohou být takové polypeptidy syntetizovány za použití jakékoliv komerčně dostupné techniky syntézy na pevné fázi, jako je Merrifieldova technika syntézy na pevné fázi, ve které jsou aminokyseliny postupně přidávány k rostoucímu aminokyselinovému řetězci. Viz Merrifield, J. Am. Chem, Soc. 85: 2149-2146, 1963. Vybavení pro automatickou syntézu polypeptidů je komerčně dostupné od dodavatelů jako jsou Applied Biosystems, lne. (Foster City, CA) a může být použito podle návodu výrobce.
Jak bylo uvedeno výše, imunogenní části chlamydiových antigenů mohou být připraveny a identifikovány za použití dobře známých technik, jako jsou techniky uvedené v Paul, Fundament al Immunology, 3. vydání, 243-247 {Raven Press, 1993) a odkazech zde citovaných. Mezi takové techniky patří vyšetřování polypeptidových částí přirozeného antigenů na imunogenní vlastnosti. V těchto vyšetřováních mohou být použity ELISA testy, které jsou zde popsány. Imunogenní část polypeptidu je část, která v takových |Í f, · ť
0* ► ·γ· ι ····
Β · ·· · · · testech generuje signál, který je v podstatě stejný jakosignál generovaný kompletním antigenem. Jinými slovy, imunogenní část chlamydiového antigenu generuje alespoň přibližně 20% a výhodně alespoň 100% signál ve srovnání se signálem indukovaným kompletním antigenem v modelovém ELISA testu, jak je zde popsán.
Části a jiné varianty chlamydiových antigenů mohou být připraveny synteticky nebo rekombinantně. Varianty přirozeného antigenu mohou být připraveny za použití standardních technik mutagenese, jako je oligonukleotidy řízená místně cílená mutagenese. Pro přípravu zkrácených polypeptidů mohou být také za použití standardních technik odstraněny části polynukleotídové sekvence.
Rekombínantní polypeptidy obsahující části a/nebo varianty přirozeného antigenu mohou být snadno připraveny z polynukleotídové sekvence kódující polypeptid za použití mnoha technik známých odborníkům v oboru. Například, supernatanty z vhodných systémů hostitel/vektor, které secernují rekombínantní protein nebo polypeptid do kultivačního media, mohou být nejprve koncentrovány za použití komerčně dostupného filtru. Po koncentrování může být koncentrát aplikován na vhodnou přečišťovací matrici, jako je afinitní matrice nebo iontoměničová pryskyřice. Pro další přečištění rekombinantního polypeptidů může být nakonec použito jednoho nebo více stupňů HPLC s reverzní fází.
Jakýkoliv z mnoha expresních vektorů známých v oboru může být použit pro expresi rekombinantních polypeptidů podle předkládaného vynálezu. Exprese může být provedena v jakýchkoliv vhodných hostitelských buňkách, které mohou být transformovány nebo transfektovány expresním vektorem obsahujícím polynukleotidovou molekulu kódující rekombínantní polypeptid. Vhodnými hostitelskými buňkami jsou prokaryotické buňky, kvasinky a vyšší eukaryotické
9» '99 9 · e« e« • 9' #9 9 ·' · <9 9 9 9 9 '9 9 9
9 9 9 9 9 ·' ' 9 ' 9 '9 buňky. Výhodně jsou použitými hostitelskými buňkami E. coli, kvasinky nebo savčí buněčné linie jako je COS nebo CHO. DNA sekvence exprimované tímto způsobem mohou kódovat přirozené antigeny, části přirozených antigenů nebo jejich varianty.
Obecně, bez ohledu na způsob přípravy, jsou polypeptidy podle předkládaného vynálezu připraveny v izolované, v podstatě čisté formě. Výhodně mají polypeptidy alespoň 80% čistotu, lépe alespoň 90% čistotu a nejlépe alespoň 99% čistotu.
V některých specifických provedeních může být polypeptid fúzní protein, který obsahuje více polypeptidů, jak jsou zde popsány, nebo který obsahuje alespoň jeden zde popsaný polypeptid a nepříbuznou sekvenci, jako je známý chlamydiový protein. Fúzní partner může, například, napomáhat v poskytnutí epitopů pro T-pomocné lymfocyty (pak se jedná o imunologický fúzní partner), výhodně epitopy pro T-pomocné lymfocyty rozpoznávané člověkem, nebo může napomáhat při expresi proteinu (pak se jedná o zesilovač exprese) a vést k zisku většího výtěžku přirozeného rekombinantního proteinu. Některé výhodné fúzní partnery jsou jak imunologickými fúzními partnery, tak fúzními partnery zesilujícími expresi. Další fúzní partnery mohou být vybrány tak, aby zvyšovaly rozpustnost proteinu nebo aby umožňovaly cílený přesun proteinu do vybraných intracelulárních kompartmentů. Ještě dalšími fúzními partnery jsou afinitní koncovky, které usnadňují přečištění proteinu. DNA sekvence kódující fúzní protein podle předkládaného vynálezu mohou být připraveny za použití známých technik rekombinantní DNA pro sestavení samostatných DNA sekvencí kódujících, například, první a druhé polypeptidy, do vhodného expresního vektoru. 3' konec DNA sekvence kóduj ící první polypeptid je ligován, s nebo bez peptidové spojovací sekvence, na 5' konec DNA sekvence kódující druhý polypeptid tak, že čtecí rámce sekvencí jsou ve fázi, což umožňuje mRNA translaci dvou DNA • ··· · · $·· e · · sekvencí do jediného fúzního proteinu, který si zachovává biologickou aktivitu obou polypeptidových složek.
Peptidová spojovací sekvence může být použita pro separování první a druhé polypeptidové složky takovou vzdáleností, že každý polypeptid se skládá do svých správných sekundárních a terciárních struktur. Taková peptidová spojovací sekvence je inkorporována do fúzního proteinu za použití standardních technik, které jsou dobře známé v oboru. Vhodné peptidové spojovací sekvence mohou být vybrány podle následujících vlastností: (1) jejich schopnosti přijímat flexibilní konformaci; (2) jejich neschopnosti přijímat takovou sekundární strukturu, která by mohla interagovat s funkčními epitopy na prvním a druhém polypeptidu; a (3) chybění hydrofobních nebo nabitých zbytků, které by mohly reagovat s.funkčními epitopy polypeptidu. Výhodné peptidové spojovací sekvence obsahují Gly, Asn a Ser zbytky. Ve spojovacích sekvencích mohou být také použity další téměř neutrální aminokyseliny, jako je Thr a Ala. Mezi aminokyselinové sekvence, které mohou být použity jako spojovací sekvence, patří ty, které jsou popsány v Maratea et al., Gene, 40: 39-46, 1985; Murphy et al., Proč.
Nati. Acad. Sci. USA, 83: 8258-8262; US patent č. 4935233 a US patent č. 4751180. Spojovací sekvence mohou mít délku od 1 do přibližně 50 aminokyselin. Alternativně k peptidovým spojovacím sekvencím {pokud je to žádoucí) je možno využít neesenciálních N-koncových aminokyselinových regionů (když jsou přítomny) na prvním a druhém polypeptidu pro separování funkčních domén a pro zabránění sterické interference.
Ligované DNA sekvence jsou operativně navázané na vhodné transkripční nebo translační regulační elementy. Regulační elementy odpovědné za expresi DNA jsou umístěny pouze 5’ k DNA sekvenci kódující první polypeptid. Podobně, stop kodony nutné pro ukončení translace a transkripční terminační signály jsou
Λ .
__< ΐ '.ji»·.
ř · · • · • ··· ·· '···· '·'··· ··· ·· ·· ·· ·· přítomny pouze 3’ k DNA sekvenci kódující druhý polypeptid.
Vynález také poskytuje fúzní proteiny, které obsahují polypeptid podle předkládaného vynálezu společně s nepříbuzným imunogenním proteinem. Výhodně může imunogenní protein vyvolat recall odpověď. Příklady takových proteinů zahrnují proteiny tetanu, tuberkulosy a hepatitidy (viz například Stoute et al., New England J. Med. 336: 86-91, 1997).
Ve výhodných provedeních je imunologický fúzní partner odvozen od proteinu D, povrchového proteinu gram-negativní bakterie Haemophilus influenzae B (WO 91/18926). Výhodně obsahuje derivát proteinu D přibližně první třetinu proteinu (například prvních 100-110 aminokyselin) a derivát proteinu D může být lipidovaný. V některých výhodných provedeních je prvních 109 zbytků lipoproteinu D obsaženo na N-konci a tyto zbytky dodávají další exogenní T-lymfocytární epitop a zesilují expresi v E. coli (a tak účinkují jako zesilovače exprese). Lipidová koncovka zajišťuje optimální prezentaci antigenů buňkám prezentujícím antigen. Dalšími fúzními partnery jsou nestrukturální protein chřipkového viru, NS 1 (hemaglutinin). Obvykle se použije N-koncových 81 aminokyselin, ačkoliv mohou být použity i jiné fragmenty obsahující epitopy pro T-helper lymfocyty.
V jiném provedení je imunologickým fúzním partnerem protein známý jako LYTA nebo jeho část (výhodně C-koncová část). LYTA je odvozen od Streptococcus pneumoniae, který syntetizuje
N-acetyl-L-alanin amidasu známou jako amidasa LYTA (kódovanou LytA genem; Gene 43: 265-292, 1986). LYTA je autolysin, který specificky degraduje některé vazby v peptidoglykanovém skeletu. C-koncová doména LYTA proteinu je odpovědná za afinitu k cholinu nebo některým analogům cholinu, jako je DEAE. Tato vlastnost byla využita pro vývoj E. coli plasmidů exprimujících C-LYTA
• 9·· t ·· • >···· • ·· · využitelných pro expresi fúzních proteinů. Přečištění hybridních proteinů obsahujících C-LYTA fragment na amino konci bylo popsáno (viz Biotechnology 10: 795-798, 1992) . Ve výhodném provedení může fúzní protein obsahovat opakující se část LYTA. Opakující se část se v C-LYTA nachází v C-koncovém regionu od zbytku 178. Zejména výhodná opakující se část obsahuje zbytky 188-305.
V jiném provedení je polynukleotid Ral2 z Mycobacterium tuberculosis navázán na alespoň imunogenní část polynukleotidu podle předkládaného vynálezu. Prostředky obsahující Ral2 způsoby pro použití Ral2 pro zesílení exprese heterologních polynukleotidových sekvencí jsou popsány v US patentové přihlášce 60/158585, která je zde uvedena jako odkaz ve své úplnosti. Stručně, Ral2 označuje polynukleotidový region, který je subsekvencí nukleové kyseliny MTB32A Mycobacterium tuberculosis. MTB32A je serin proteasa molekulové hmotnosti 32 kD kódovaná genem ve virulentních a avirulentních kmenech M. tuberculosis. Nukleotidová sekvence MTB32A byly popsány (US patentová přihláška 60/158585; viz též Skeiky et al., Infection and Immun. (1999) 67: 3988-4007, zde uvedeno jako odkaz). V jednom provedení Ral2 polypeptid použitý při produkci fúzních polypeptidů obsahuje C-koncový fragment kódující sekvence MTB32A, který je účinný při zesílení exprese a/nebo imunogenicity heterologních chlamydiových antigenních polypeptidů, se kterými je fúzován. V jiném provedení odpovídá Rai2 polypeptid přibližně 14 kD C-koncovému fragmentu MTB3A obsahujícímu některé nebo všechny aminokyselinové zbytky MTB32A.
Rekombinantní nukleové kyseliny, které kódují fúzní polypeptid obsahující Ral2 polypeptid a daný heterologní chlamydiový polypeptid, mohou být snadno konstruovány běžnými technikami genového inženýrství. Rekombinantní nukleové kyseliny jsou konstruovány tak, že je sekvence Ral2 polynukleotidu umístěna 5' k /·««· ·« ·♦ ·· ···· • W· « ·'· » · · ·»»· · 9 >9 99 9 9 '· • · '· · ·, '· ♦ » · · · β 4 β β ’’· · β β ♦ » ······· ·· ·« *· ·· vybrané heterologní chlamydiové polynukleotidové sekvenci. Může být také vhodné umístit Ral2 polynukleotidovou sekvenci 3' na vybranou heterologní polynukleotidovou sekvenci nebo insertovat heterologní polynukleotidovou sekvenci do místa v Ral2 polynukleotidové sekvenci.
Dále, jakékoliv vhodné polynukleotidy, které kódují Ral2 nebo jeho část nebo variantu, mohou být použity pro konstrukci rekombinantních fúzních polynukleotidů obsahujících Ral2 a jeden nebo více zde popsaných chlamydiových polynukleotidů. Výhodné Ral2 polynukleotidy obvykle obsahují alespoň přibližně 15 sousedních nukleotidů, alespoň přibližně 30 sousedních nukleotidů, alespoň přibližně 60 sousedních nukleotidů, alespoň přibližně 100 sousedních nukleotidů, alespoň přibližně 200 sousedních nukleotidů, nebo alespoň přibližně 300 sousedních nukleotidů, které kódují část Ral2 polypeptidu.
Ral2 polynukleotidy mohou obsahovat přirozené sekvence (t.j. endogenní sekvence kódující Ral2 polypeptid nebo jeho část), nebo mohou obsahovat variantu takové sekvence. Varianty Ral2 polynukleotidů mohou obsahovat jednu nebo více substitucí, delecí, adicí a/nebo inserci, které jsou takové, že biologická aktivita kódovaného fúzního polypeptidu není významně snížena, ve srovnání s fúzním polypeptidem obsahujícím přirozený Ral2 polypeptid. Varianty výhodně vykazují alespoň přibližně 90% identitu s polynukleotidovou sekvencí, která kóduje přirozený Ral2 polypeptid nebo jeho část.
V jiném aspektu poskytuje předkládaný vynález způsoby pro použití jednoho nebo více z výše uvedených polypeptidů nebo fúzních proteinů (nebo polynukleotidů kódujících takové polypeptidy nebo fúzní proteiny) pro indukci protektivní imunity proti chlamydiové infekci u pacienta. Termín pacient, jak je zde ·· «φφφ • ·. φ • φφφ • · • φ .γ. ...
φ · · « ·· φφφφ φ φ φ φ · • φφφ · · · φ φ φ φ φ φ φ φφ φφ φφ φφ použit, označuje teplokrevného živočicha, výhodně člověka. Pacient může být postižený onemocněním, nebo nemusí mít detekovatelné onemocnění a/nebo infekci. Jinými slovy, protektivní imunita může být indukována pro prevenci nebo léčbu chlamydiové infekce.
V tomto aspektu je polypeptid, fúzní protein nebo polynukleotid obvykle přítomen ve farmaceutickém prostředku nebo vakcíně. Farmaceutické prostředky mohou obsahovat jeden nebo více polypeptidů, kde každý z nich může obsahovat jednu nebo více výše uvedených sekvencí (nebo jejich variant) a fyziologicky přijatelný nosič. Vakcíny mohou obsahovat jeden nebo více výše uvedených polypeptidů a imunostimulační činidlo, jako je adjuvans nebo liposom (do kterého je polypeptid inkorporován). Takové farmaceutické prostředky a vakcíny mohou také obsahovat další chlamydiové antigeny, buď zapracované do polypeptidu nebo přítomné jako samostatné polypeptidy.
Alternativně může vakcína obsahovat polynukleotid kódující jeden nebo více polypeptidů popsaných výše tak, že takový polypeptid je generován in šitu. V takových vakcínách může být polynukleotid přítomen v jakémkoli z mnoha systému pro podání známých odborníkům v oboru, včetně systémů pro expresi nukleových kyselin, bakteriálních a virových expresních systémů. Vhodné systémy pro expresi nukleových kyselin obsahují polynukleotidové sekvence nutné pro expresi u pacienta (jako jsou vhodné promotory a terminační signály). Bakteriální systémy vyžadují podání bakterie (jako je Bacillus Calmette-Gueriinové) , která exprimuje na svém povrchu imunogenní část polypeptidu. Ve výhodném provedení mohou být polynukleotidy vloženy pomocí virového expresního systému (například viru vakcinie nebo jiného pox viru, retrovirů nebo adenovirů), což může vyžadovat použití nepatogenního (defektního) viru schopného replikace. Techniky pro inkorporaci polynukleotidů do takových expresních systémů jsou dobře známé «·4· 4« «4 » '· : * 4 · · • ··· 4 4 444 · '· * 4 4 • 4 4 4 4 • 444 4 44 44 44 odborníkům v oboru. Polynukleotidy mohou být také podány jako holé plasmidové vektory, jak je popsáno v, například, Ulmer et al.. Science 259: 1745-1749, 1993 a přehled těchto technik je uveden v Cohen, Science 259: 1691-1692, 1993. Techniky pro inkorporaci DNA do takových vektorů jsou dobře známé odborníkům v oboru. Retrovirový vektor může dále přenášet nebo obsahovat gen pro selektovatelný markér (za účelem identifikace nebo selekce transformovaných buněk) a/nebo zaměřovači skupinu, jako je gen kódující ligand pro receptor na specifických cílových buňkách, který udílý vektoru specificitu. Specificita vektoru může být také dosažena pomocí protilátky, za použití metod dobře známých odborníkům v oboru.
Dalšími prostředky pro terapeutické účely jsou koloidní disperzní systémy, jako jsou makromolekulové komplexy, nanokapsle, mikrosféry, korálky a systémy na bázi lipidů, včetně emulzí olej-ve-vodě, micel a směsných micel a liposomů. Výhodný koloidní systém pro použití jako přepravní vehikulum in vitro a in vivo jsou liposomy (t.j. artificiální membránové vesikuly). Vychytávání holé DNA může být zvýšeno potažením DNA na biodegradovatelné korálky, které jsou účinně transportovány do buněk.Příprava a použití takových systémů je dobře známá v oboru.
V souvisejícím aspektu může být polynukleotidové vakcína popsaná výše podána simultáně nebo sekvenčně s polypeptidem podle předkládaného vynálezu nebo se známým chlamydiovým antigenem. Například, po podání polynukleotidu kódujícího polypeptid podle předkládaného vynálezu může následovat podání antigenu za účelem zesílení protektivního účinku vakcíny.
Polypeptidy a polynukleotidy podle předkládaného vynálezu mohou být také použity v adoptivní imunoterapii pro léčbu chlamydiové infekce. Adoptivní imunoterapie může být obecně rozdělena na ·» ···· »· ···· «* ·· '··· · · · ·· · « «·· · · »·· · · · « ··*···!«·« φ • · · · · Φ · .· · · .···« ·«· .·· ·· ·· ·· 73 aktivní a pasivní imunoterapii. V aktivní imunoterapii spočívá léčba v in vivo stimulaci endogenního imunitního systému hostitele pomocí podání činidla modifikujícího imunitní reakci (například vakcín, bakteriální adjuvans a/nebo cytokinů).
V pasivní imunoterapii léčba spočívá v podání biologických činidel majících danou imunoreaktivitu (jako jsou efektorové buňky nebo protilátky), která mohou přímo nebo nepřímo zprostředkovat anti-Chlamydiové účinky a nejsou závislá nutně na intaktním imunitním systému hostitele. Příklady efektorových buněk jsou T-lymfocyty (například CD8+ cytotoxické T-lymfocyty a CD4+
T-helper lymfocyty), zabíječi (jako jsou přirození zabíječi a zabíječi aktivovaní lymfokiny), B-lymfocyty a buňky prezentující antigen (jako jsou dendritické buňky a makrofágy) exprimující popsané antigeny. Polypeptidy podle předkládaného vynálezu mohou být také použity pro generování protilátek nebo anti-idiotypových protilátek (jak je popsáno například v US patentu č. 4918164) pro pasivní imunoterapii.
Hlavní metodou pro produkci adekvátního počtu T-lymfocytů pro adoptivní imunoterapii je kultivace imunitních T-lymfocytů in vitro. Kultivační podmínky pro namnožení jediného T-lymfocytu specifického pro antigen na počet několika milionů za zachování rozpoznávání antigenu in vivo jsou dobře známé v oboru. Takové in vitro kultivační podmínky obvykle využívají intermitentní stimulace antigenem, často za přítomnosti cytokinů (jako je IL-2) a nedělících se podpůrných buněk. Jak bylo uvedeno výše, imunoreaktivní polypeptidy podle předkládaného vynálezu mohou být použity pro rychlou expanzi kultur T-lymfocytů specifických pro antigen za účelem získání dostatečného počtu buněk pro imunoterapii. Konkrétně, buňky prezentující antigen, jako jsou dendritické buňky, makrofágy nebo B-lymfocyty, mohou být pulsovány imunoreaktivními polypeptidy nebo mohou být polynukleotidové
4444 44 44 • 4 4 4*4 »4 4
444 4 4 444 4 4 4 • · 4 4 4 4 4 '4 4 4 4
4 4 4 4 4 4 4 4 4
44 4(4 4 4 4 44 4 4 4 4
4 »44 4 sekvence vloženy do buněk prezentujících antigen, za použití standardních technik známých v oboru. Například mohou být buňky prezentující antigen transfektovány polynukleotidem, který obsahuje promotor vhodný pro zvýšení exprese v rekombinantním viru nebo v jiném expresním systému. Několik virových vektorů může být použito pro transfekci buněk prezentujících antigen, včetně pox viru, viru vakcinie a adenoviru; buňky prezentující antigen mohou být také transfektovány polynukleotidovými sekvencemi podle předkládaného vynálezu za použití různých technik, včetně techniky genového děla, přenosu zprostředkovaného lipidy, elektroporace, osmotického šoku a přenosu pomocí částic, kde tyto techniky vedou k účinné expresi v přijatelné úrovni, jak je určena odborníky v oboru. Kultivované T-lymfocyty pro použití v terapii musí být schopny růstu a distribuce a musí dlouhodobě přežívat in vivo. Studie prokázaly, že růstu a dlouhodobého přežívání kultivovaných T-lymfocytů může být in vivo dosaženo opakovanou stimulací antigenem společně s IL-2 (viz například Cheever, M. et al., Therapy with Cultured T Cells: Principles Revisited, Immunological Reviews 157: 177, 1997).
Polypeptidy podle předkládaného vynálezu mohou být také použity pro generování a/nebo izolování T-lymfocytů reaktivních s chlamydiemi, které mohou být potom podány pacientovi. V jedné technice mohou být T-lymfocytární linie specifické pro antigen generovány in vivo imunizací krátkými peptidy odpovídajícími imunogenním částím popsaných polypeptidů. Vzniklé CD8+ nebo CD4+ T-lymfocytární klony specifické pro antigen mohou být potom izolovány od pacienta, namnoženy za použití standardních technik tkáňové kultivace a navráceny pacientovi.
Alternativně mohou být peptidy odpovídající imunogenním částím polypeptidů použity pro přípravu T-lymfocytů reaktivních s Chlamydiemi pomocí selektivní stimulace in vitro a expanze ·» »··β «9 ·« «·«· • * · · 9 9 9 9 *
999 · « ··» · · 9
9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 · · · · 9 9 9 9 9
9999 999 9 9 9 9 9 9 9 9 autologních T-lymfocytů za zisku T-lymfocytů specifických pro antigen, které mohou být potom podány pacientovi, jak je popsáno, například, v Chang et al., {Crit. Rev. Oncol. Hematol. 22(3): 213 (1996)). Buňky imunitního systému, jako jsou T-lymfocyty, mohou být izolovány z periferní krve pacienta za použití komerčně dostupných systémů pro izolaci buněk, jako je Isolex™ Systém od Nexell Therapeutic, lne., Irvine, CA. Separované buňky mohou být stimulovány jedním nebo více polypeptidem obsaženým v transportním vehikulu, jako je mikrosféra, za zisku T-lymfocytů specifických pro antigen. Populace T-lymfocytů specifických pro antigen se potom expanduje za použití standardních technik a buňky se podají zpět pacientovi.
V jiném provedení mohou být T-lymfocyty a/nebo protilátkové receptory specifické pro antigen klonovány, expandovány a přeneseny do jiných vektorů nebo efektorových buněk pro použití v adoptivní imunoterapii. Konkrétně, T-lymfocyty mohou být transfektovány vhodnými geny tak, aby exprimovaly variabilní domény monoklonálních protilátek specifických pro čhlamydie jako extracelulární rozpoznávací prvky, které mohou být navázány na signální řetězce receptorů T-lymfocytů, což vede k aktivaci T-lymfocytů, specifické lýze a uvolnění cytokinů. Toto umožňuje přesměrování specificity T-lymfocytů nezávisle na MHC. Viz například Eshhar, Z., Cancer Immunol. Immunother. 45(3-4): 131-6; a Hwu, P. et al., Cancer Res. 55(15): 3369-73, 1995. Jiné provedení využívá transfekci alfa a beta řetězců receptorů T-lymfocytů specifických pro antigen do jiných T-lymfocytů, jak je popsáno v Cole, D.J., et al., Cancer Res. 55(4): 748-52, 1995.
V dalším provedení mohou být syngenní nebo autologní dendritické buňky pulsovány peptidy odpovídajícími alespoň imunogenní části polypeptidů podle předkládaného vynálezu. Výsledné dendritické buňky specifické pro antigen mohou být buď
A' ·© ©··· • · · • · ·· • « © ·
76* M ·· ·· • · · • · ··· © © © e ·· ·· ·· ···· • · · • · · © ©9 © • fc ·· přeneseny do pacienta, nebo mohou být použity pro stimulaci T-lymfocytů za účelem přípravy T-lymfocytů specifických pro antigen, které mohou být potom podány pacientovi. Použití peptidem pulsovaných dendritických buněk pro přípravu T-lyrafocytů specifických pro antigen a následné použití takových T-lymfocytů specifických pro antigen pro eradikaci onemocnění v myším modelu bylo popsáno v Cheever et al., Immunological Reviews, 157: 177, 1997. Dále, vektory exprimující popsané polynukleotidy mohou být vloženy do kmenových buněk odebraných od pacienta, které mohu být klonálně propagovány in vitro pro autologní transplantaci zpět stejnému pacientovi.
V některých aspektech mohou být polypeptidy, polynukleotidy, vazebná činidla a/nebo T-lymfocyty, jak jsou zde popsány, inkorporovány do farmaceutických prostředků nebo imunogenních prostředků (t.j. vakcín). Aletrnativně může farmaceutický prostředek obsahovat buňky prezentující antigen (například dendritické buňky) transfektovaná chlamydiovým polynukleotidem tak, že na svém povrchu exprimují chlamydiový polypeptid. Farmaceutické prostředky obsahují jednu nebo více takových sloučenin a fyziologicky přijatelný nosič. Vakcíny mohou obsahovat jednu nebo více takových sloučenin a imunostimulační činidlo. Imunostilačním činidlem může být jakákoliv substance, která zesiluje nebo potencuje imunitní reakci na exogenní antigen. Příklady imunostimulačních činidel zahrnují adjuvans, biodegradovatelné mikrosféry (například polylaktidgalaktid) a liposomy (do kterých je zapracována sloučenina; viz například Fullerton, US patent č. 4235877). Příprava vakcín je obecně popsána například ve M.F. Powell and M.J. Newman, ed., Vaccine Design (the subunit and adjuvant approach), Plenům Press (NY, 1995) . Farmaceutické prostředky a vakcíny podle předkládaného vynálezu mohou také obsahovat další sloučeniny, které mohou být biologicky aktivní nebo inaktivní. Například mohou prostředky nebo * ··· • ··· vakcíny obsahovat jednu nebo více imunogenních částí jiných chlamydiových antigenů, buď ve formě fúzního polypeptidu, nebo jako samostatnou sloučeninu.
Farmaceutický prostředek nebo vakcína může obsahovat DNA kódující jeden nebo více polypeptid popsaných výše tak, že takový polypeptid je generován in šitu. Jak bylo uvedeno výše, může být DNA přítomna v jakémkoli z mnoha systému pro podání známých odborníkům v oboru, včetně systémů pro expresi nukleových kyselin, bakteriálních a virových expresních systémů. V oboru je známo mnoho technik pro přenos genů a tyto techniky jsou popsány například v Rolland, Crit. Rev. Therap. Drug Carrier Systems 15: 143-198, 1998 a v odkazech zde citovaných. Vhodné systémy pro expresi nukleových kyselin obsahují DNA sekvence nutné pro expresi u pacienta {jako jsou vhodné promotory a terminační signály). Bakteriální systémy vyžadují podání bakterie (jako je Bacillus Calmette-Gueriinové), která exprimuje na svém povrchu imunogenní část polypeptidu nebo secernuje takový epitop.
Ve výhodném provedení může být DNA vložena pomocí virového expresního systému (například viru vakcinie nebo jiného pox viru, retroviru nebo adenoviru), což může vyžadovat použití nepatogenního (defektního) viru schopného replikace.
Například, mnoho virových expresních vektorů je odvozeno od virů čeledi retroviridae. Tato čeleď zahrnuje viry myší leukemie, viry myších nádorů mléčné žlázy, lidský foamy virus, virus Rousova sarkomu a viry imunodeficience, včetně lidské, opičí a kočičí. Popis toho, kdy použít retrovirové expresní vektory, je uveden v Comstock et al. , 1997.
Vynikající virové expresní vektory na bázi viru myší leukemie (MLV) vyvinuli Kim et al. (1998). Při tvorbě MLV vektorů Kim et • · ·· • · · ·
al. zjistili, že celá gag sekvence, spolu s bezprostředně předcházejícím regionem, může být deletována bez významného ovlivnění sbalování viru nebo genové exprese. Dále zjistili, že téměř celý U3 region může být nahrazen okamžitým-časným promotorem lidského cytomegaliviru bez škodlivých účinků. Dále mohou být přidány bez škodlivých účinů MCR a vnitřní ribosomální vstupní místa (IRES). Podle těchto výsledků navrhli Kim et al. sérii expresních vektorů na bázi MLV majících jednu nebo více vlastností popsaných výše.
Při studiu lidského foamy viru (HFV) byly objeveny charakteristiky HFV, které jsou výhodné pro jeho použití jako expresního vektoru. Mezi tyto charakteristiky patří exprese pol pomocí sestřihu a startu translace v definovaném iniciačním kodonu. Další aspekty HFV virových expresních vektorů jsou uvedeny v Bodem et al., 1997.
Murakami et al. (1997) popsali ptačí retrovirové vektory schopné replikace na bázi viru Rousova sarkomu (RSV) IR1 a IR2 určené pro expresi genů ve vysoké úrovni. V těchto vektorech je IRES z viru enčephalomyokarditidy (EMČV) insertováno mezi env gen a heterologní gen. IR1 vektor si zachovává sestřižené akceptorové místo, které je přítomné za env genem, zatímco IR2 vektor jej nemá. Murakami et al. prokázali vysokou úroveň exprese několika různých heterologních genů za použití těchto vektorů.
Nedávno byly vyvinuty retrovirové expresní vektory na bázi lentiviru. Kafri et al. (1997) prokázaly dlouhodobou expresi genů dopravených přímo do jater a svalu pomocí expresního vektoru na bázi viru lidské imunodeficience (HIV). Jednou z výhod tohoto systému je vlastní schopnost HIV transdukovat nedělící se buňky. Protože jsou viry podle Kafriho et al. pseudotypovány glykoproteinem G viru vesikulární stomatitidy (VSVG), mohou transdukovat různé tkáně a typy buněk.
Byl vyvinut velký počet expresních vektorů na bázi adenoviru, hlavně z důvodu výhod těchto vektorů v aplikacích genové terapie. Adenovirové expresní vektory a způsoby použití takových vektorů jsou předmětem mnoha US patentů, včetně US patentu č. 5698202, US patentu č. 5616326, US patentu č. 5585362 a US patentu č. 5518913, které jsou zde uvedeny jako odkazy.
Další adenovirové konstrukty jsou popsány v Khatri et al.
(1997) a Tomamin et al. (1997) . Khatri et al. popisují nové ovčí adenovirové expresní vektory a jejich schopnost infikovat hovězí buěky nosní sliznice a buňky králičí ledviny, stejně jako různé typy lidských buněk, včetně plicních a kožních fibroblastů, jaterních, prostatických, prsních, střevních a retinálních linií. Tomanin et al. popisují adenovirové expresní vektory obsahující gen pro T7 RNA polymerasu. Po vložení do buněk obsahujících heterologní gen operativně navázaný na T7 promotor byly vektory schopné řízení exprese genu z T7 promotoru. Autoři naznačují, že tento systém může být užitečný pro klonování a expresi genů kódujících cytotoxické proteiny.
Poxviry jsou používány pro expresi heterologní ch genů v savčích buňkách. Během let byly vektory vylepšeny tak, aby umožňovaly vysokou úroveň exprese heterologního genu a aby byly zjednodušena integrace více heterologních genů do jediné molekuly. Ve snaze o snížení cytopatických účinků a zlepšení bezpečnosti se hlavní pozornost věnuje mutantnímu viru vakcinie a dalším poxvirům, které způsobují abortivní infekci savčích buněk (Oertli et al., 1997). Použití poxvirů jako expresních vektorů je uvedeno v Carroll and Moss (1997).
Togavirové expresní vektory, mezi které patří alfavirové • · • ··· expresní vektory, se používají pro studium struktury a funkce proteinů a pro produkci proteinů. Atraktivní vlastností togavirových expresních vektorů je rychlá a účinná genová exprese, široká škála hostitelů a RNA genom (Huang, 1996). Dále bylo prokázáno, že rekombinantní vakcíny na bázi alfavirových expresních vektorů indukuj í silnou humorální a buněčnou imunitní reakci s dobrou imunologickou pamětí a protektivními účinky (Tubulekas et al., 1997). Alfavirové expresní vektory a jejich použití je popsáno, například, v Lundstrom (1997).
V jedné studii použili Li a Garoff (1996) Semliki Forest virové (SFV) expresní vektory pro expresi retrovirových genů a produkci retrovirových částic c BHK-21 buňkách. Částice produkované tímto způsobem měly proteasovou a reverzní transkriptasovou aktivitu a byly infekční. Dále, v v zásobě viru nebyly detekovány žádné pomocné viry. Proto má tento systém vlastnosti, které jsou atraktivní pro použití v protokolech genové terapie.
Bakulovirové expresní vektory byly tradičně používány pro expresi heterologních proteinů v hmyzích buňkách. Příklady proteinů jsou savčí chemokinové receptory (Wang et al., 1997), reportérové proteiny, jako je zelený fluorescentní protein (Wu et al.,1997) a FLAG fúzní proteiny (Wu et al., 1997; Koh et al.,
1997). Nové pokroky v technologii bakulovirových expresních vektorů, včetně jejich použití ve virionových zobrazovacích vektorech a exprese v savčích buňkách, jsou popsané v Possee (1997) . Další přehled týkající se bakulovirových expresních vektorů je popsán v Jones a Morikawa (1996) a O'Reilly (1997).
Další vhodné systémy jsou popsány, například, ve Fisher-Hoch et al., PNAS 86: 317-321, 1989; Flexner et al., Ann. N.Y. Acad. Sci. 569: 86-103, 1989; Flexner et al., Vaccine 8: 17-21, 1990; US patentech č. 4603112, 4769330 a 5017487; WO 89/01973; US patentu • · · ·
Č. 4777127; GB 2200651; EP 0345242; WO 91/02805; Berkner,
Biotechniques 6: 616-627, 1988; Rosenfeld et al., Science 252: 431-434, 1991; Kolls et al., PNAS 91: 215-219, 1994; Kass-Eisler et al., PNAS 90: 11498-11502, 1993; Guzman et al., Circulation 88: 2838-2848, 1993; a Guzman et al., Cir. Res. 73: 1202-1207, 1993. Techniky pro inkorporaci DNA do takových expresních systémů jsou dobře známé odborníkům v oboru. DNA může být také holá, jak je popsáno v, například, Ulmer et al., Science 259: 1745-1749,
1993 a přehled těchto technik je uveden v Cohen, Science 259: 1691-1692, 1993. Vychytávání holé DNA může být zvýšeno potažením DNA na biodegradovatelné korálky, které jsou účinně transportovány do buněk.
Je jasné, že vakcína může obsahovat polynukleotidovou a/nebo polypeptidovou složku, podle potřeby. Je také jasné, že vakcína může obsahovat farmaceuticky přijatelné soli polynukleotidů a/nebo polypeptidů podle předkládaného vynálezu. Takové soli mohou být připraveny z farmaceuticky přijatelných netoxických baží, včetně organických baží (například solí primárních, sekundárních a terciárních aminů a bazických aminokyselin) a anorganických baží (například sodných, draselných, lithných, ammoných, vápenatých a horečnatých solí). Jakýkoliv nosič známý odborníkům v oboru může být použit ve farmaceutických prostředcích podle předkládaného vynálezu a typ nosiče závisí na způsobu podání. Prostředky podle předkládaného vynálezu mohou být připraveny pro jakýkoliv způsob podání, včetně například lokálního, orálního, nasálního, intrákraniálního, intraperitoneálního, podkožního nebo intramuskulámího. Pro parenterální podání, jako je podání podkožní injekcí, je nosičem obvykle voda, salinický roztok, alkohol, tuk, vosk nebo pufr. Pro orální podání může být použit jakýkoliv z výše uvedených nosičů a nebo pevný nosič, jako je manitol, laktosa, škrob, stearan horečnatý, sacharin sodný, talek, celulosa, glukosa, sacharosa a uhličitan horečnatý.
• ···
Biodegradovatelné mikrosféry (například polylaktatpolyglykolat) mohou být také použity jako nosiče pro farmaceutické prostředky podle předkládaného vynálezu. Vhodné biodegradovatelné mikrosféry jsou popsány, například, v US patentech č. 4897268 a 5075109.
Takové prostředky mohou také obsahovat pufry (například neutrální pufrovaný salinický roztok nebo fosfátem pufrovaný salinický roztok), uhlovodany (napříkad glukosu, mannosu, sacharosu nebo dextrany), manitol, proteiny, polypeptidy nebo aminokyseliny jako je glycin, antioxidační činidla, chelatační činidla jako je EDTA neo glutathion, adujuvans (například hydroxid hlinitý) a/nebo konzervační činidla. Alternativně může být prostředek podle předkládaného vynálezu připraven jako lyofilizovaný prostředek. Sloučeniny mohou být také obaleny v liposomech, za použití dobře známé technologie.
Ve vakcínách podle předkládaného vynálezu mohou být použity jakékoliv z mnoha imunostimulačních činidel. Například může být použito adjuvans. Většina adjuvans obsahuje substance navržené pro chráněni antigenu před rychlou degradací, jako je hydroxid hlinitný nebo anorganický olej, a činidlo stimulující imunitní odpověď, jako je lipid A nebo proteiny odvozené od Bordetella pertussis nebo Mycobacterium tuberculosis. Vhodná adjuvans jsou komerčně dostupná, jako například Freundovo nekompletní a kompletní adjuvans (Difco Laboratories, Detroit, MI), Merck adjuvans 65 (Merck and Company, lne., Rahway, NJ), soli hliníku, jako je hydroxid hlinitý ve formě gelu (kamenec) nebo fosforečnan hlinitý; soli vápníku, železa a nebo zinku; nerozpustná suspenze acylovaného tyrosinu; acylované sacharidy; kationtové nebo aniontové derivátizované polysacharidy; biodegradovatelné mikrosféry; monofosforyl lipid A a quil A. Jako adjuvans mohou být také použity cytokiny, jako je interleukin-2, -7 nebo -12 nebo GM-CSF.
e e ββββ
Ve vakcínách podle předkládaného vynálezu může být - za určitých okolností - složení adjuvans takové, aby indukovalo imunitní odpověď především Thi typu nebo Th2 typu. Vysoké koncentrace cytokinů Thi typu (například IFN-gamma, TNF-alfa,
IL-2 a IL-12) indukují převážně buněčnou imunitní reakci na podaný antigen. Naopak, vysoké koncetrace cytokinů Th2-typu (například IL-4, IL-5, IL-6 a IL-10) upřednostňují indukci humorální imunitní reakce. Po aplikaci vakcíny podle předkládaného vynálezu dojde u pacienta k imunitní reakci, která zahrnuje reakci Thi- a Th-2 typu. Ve výhodném provedení je reakce převážně Thl-typu a koncentrace cytokinů Thl-typu se zvyšuje více než koncentrace cytokinů Th2-typu. Koncentrace těchto cytokinů mohou být hodnoceny za použití standardních testů. Pro přehled skupin cytokinů viz Mosmann and Cofman, Ann. Rev. Immunol. 7: 145-173, 1989.
Výhodnými adjuvans pro vyvolání odpovědi převážně Thl-typu jsou, například, kombinace monofosforyllipidu A, výhodně
3-de-0-acetyl-monofosforyl-lipidu A (3D-MPL) a soli hliníku. MPL adjuvans jsou dostupná od Corixa Corporation (Seattle, WA; viz US patenty č. 4436727; 4877611; 4866034; á 4912094). Oligonukleotidy obsahující CpG (ve kterých je CpG dinukleotid nemethylováný) také indukují přednostně Thi odpověď. Takové oligonukleotidy jsou dobře známé a jsou popsány, například, ve WO 96/02555 a WO 99/33488. Imunostimulační DNA sekvence jsou také popsány například v Sáto et al., Science 273: 352, 1996). Jiným výhodným adjuvans je saponin, výhodně QS21 (Aquila Biopharmaceuticals lne., Framingham, MA) , který může být použit samostatně nebo v kombinaci s jinými adjuvans. Účinným systémem je například kombinace monofosforyl-lipidu A a saponinového derivátu, jako je kombinace QS21 a 3D-MPL, jak je popsána ve WO 94/00153, nebo méně reaktogenní prostředek, ve kterém je QS21 oslaben cholesterolem, jak je popsána ve WO 96/33739. Dalšími výhodnými prostředky » · · · · • · • ·66 ββ ββββ
999 « β obsahují emulze olej-ve-vodě a tokoferol. Zejména účinný adjuvantní prostředek obsahuje QS21, 3D-MPL a tokoferol v emulzi olej-ve-vodě, jak je popsáno ve WO 95/17210.
Dalšími výhodnými adjuvans jsou Montanide ISA 720 (Seppic, France), SAF (Chiron, California, US), ISCOMS (CSL), MF-59 (Chiron), SBAS série adjuvans (například SBAS-2 nebo SBAS-4 od SmithKline Beecham, Rixensart, Belgium), Detox (Corixa Corporation; Seattle, WA) , RC-529 (Corixa Corporation; Seattle,
WA) a jiné aminoalkyl-glukosaminid-4-fosfáty (AGP), jako jsoou ty, které jsou popsány v projednávané US patentové přihlášce pořadové č. 08/853826 a 09/074720, které jsou zde uvedeny jako odkazy.
Jakákoliv zde popsaná vakcína může být připravena za použití dobře známých technik, které vedou ke smísení antigenu, zesilovače imunitní odpovědi a vhodného nosiče nebo přísady. Prostředky podle předkládaného vynálezu mohou být podány jako součást prostředku s prodlouženým uvolňováním (t.j. prostředku jako je kapsle nebo porézní materiál, který po aplikaci pomalu uvolňuje sloučeninu). Takové prostředky mohou být připraveny dobře známými technikami (viz Coombes et al., Vaccine 14: 1429-1438, 1996) a jsou podány orálně, rektálně nebo podkožní implantací, nebo implantací do daného cílového místa. Prostředky s prodlouženým uvolňováním mohou obsahovat polypeptid, polynukleotíd nebo protilátku obsaženou v matrici a/nebo obsaženou v zásobníku ohraničeném membránou kontrolující rychlost uvolňování.
Nosiče pro použití v takových prostředcích jsou biokompatibilní a mohou být také bíodegradovatelné; výhodně poskytuje prostředek relativně konstantní rychlost uvolňování aktivní složky. Mezi takové nosiče patří mikročástice póly(laktid-ko-glykolidu), stejně jako polyakrylát, latex, škrob, celulosa a dextran. Mezi další nosiče s oddáleným uvolňováním patří supramolekulové biovektory, * ··· které obsahují nekapalné hydrofilní jádro (například zesítěný polysacharid nebo oligosacharid), a případně zevní vrstvu obsahující amfifilní sloučeninu, jako je fosfolipid (viz například Us patent č. 5151254 a PCT přihlášky WO 94/20078, WO 94/23701 a WO 96/06638). Množství aktivní sloučeniny obsažené v prostředku s prodlouženým uvolňováním závisí na místě implantace, rychlosti a předpokládaném trvání uvolňování a na typu léčeného onemocnění.
Jakékoliv z mnoha známých přepravních vehikul může být použito ve farmaceutických prostředcích a vakcínách pro usnadnění produkce imunitní reakce specifické pro antigen, která je namířena proti buňkám infikovaným Chlamydiemi. Mezi přepravní vehikula patří buňky prezentující antigen (APC), jako jsou dendritické buňky, makrofágy, B-lymfocyty a jiné buňky, které mohou být upraveny tak, aby bylý účinnými APC. Takové buňky mohou být, ale nemusí, geneticky modifikovány za účelem zvýšení kapacity pro prezentaci antigenů, pro zlepšení aktivace a/nebo udržování aktivity
T-lymfocytů, pro to, aby měly sami o sobě anti-Chlamydiový účinek a/nebo pro to, aby byly imunologicky kompatibilní s příjemcem (například aby měly odpovídající HLA haplotyp). APC mohou být izolovány z různých biologických kapalin a orgánů a mohou být autologní, allogenní, syngenní nebo xenogenní.
Některá výhodná provedení předkládaného vynálezu využívají dendritických buněk nebo jejich progenitorů jako buněk prezentujících antigen. Dendritické buňky jsou výkonými APC (Bamcherau and Steinman, Nátuře 392: 245-251) a bylo prokázáno, že jsou účinné jako fyziologické adjuvans pro vyvolání profylaktické nebo terapeutické protinádorové imunity (viz Timmerman and Levý, Ann. Rev. Med. 50: 507-529, 1999). Obecně, dendritické buňky mohou být identifikovány podle svého typického tvaru (hvězdicovitý in šitu, s vyznačenými cytoplasmatickými výběžky (dendrity) viditelnými in vitro) a podle jejich schopnosti vychytávat, i·
• e ββo · » · · • · ·· • ··· zpracovávat a prezentovat antigeny s vysokou účinností a podle jejich schopnosti aktivovat naivní T-lymfocyty. Dendritické buňky mohou být samozřejmě zpracovány tak, aby exprimovaly na svém povrchu specifické receptory nebo ligandy, které se nevyskytují běžně na dendritických buňkách in vivo nebo ex vivo, a takové modifikované dendritické buňky spadají do rozsahu předkládaného vynálezu. Alternativně k dendritickým buňkám mohou být ve vakcínách použity secernované vesikuly dendritických buněk naplněné antigenem (nazývané exosomy) (viz Zitvogel et al., Nátuře Med. 4: 594-600, 1998).
Dendritické buňky a jejich progenitory mohou být získány z periferní krve, kostní dřeně, lymfatických uzlin, sleziny, kůže, pupečníkové krve nebo z jakékoliv vhodné tkáně nebo tekutiny. Dendritické buňky mohou být například diferencovány ex vivo přidáním kombinace cytokinů, jako je GM-CSF, IL4, IL-13 a/nebo TNFalfa, do kultury monocytů získaných z periferní krve.
Alternativně mohou být CD34 pozitivní buňky získáné z periferní krve, pupečníkové krve nebo kostní dřeně diferencovány na dedndritické buňky přidáním kombinace GM-CSF, IL3, TNFalfa, CD40 ligandu, LPS, flt3 ligandu a/nebo jiných sloučenin, které indukují zrání a proliferaci dendritických buněk, do kultivačního media.
Dendritické buňky jsou obecně děleny na nezralé a zralé buňky, což odlišuje dva dobře charakterizované fenotypy. Nicméně, toto rozdělení by nemělo vylučovat všechny možné mezistupně diferenciace. Nezralé dendritické buňky jsou charakterizovány jako APC s vysokou kapacitou pro vychytávání antigenů a jeho zpracování, což koreluje s vysokou expresí Fc-gamma receptorů a mannosového receptorů. Zralý fenotyp je charakterizován nižší expresí těchto markérů, ale vysokou expresí povrchových molekul odpovědných za aktivaci T-lymfocytů, jako jsou MHC třídy I a II, adhesní molekuly (například CD54 a CDU) a ko-stimulační molekuly ·· ···9
(například CD40, CD80, CD86 a 4-1BB).
APC mohou být transfektovány polynukleotidem kódujícím chlamydiovový protein (nebo jeho část nebo variantu) tak, že chlamydiový polypeptid, nebo jeho imunogenní část, je exprimován na povrchu buněk. Taková transfekce může proběhnout ex vivo a prostředky nebo vakcíny obsahuj ící takové transfektováné buňky mohou být potom použity pro terapeutické účely, jak je zde popsáno. Alternativně může být vehikulum pro přenos genu, které je zaměřeno na dendritické buňky nebo na jiné buňky prezentujícía antigen, podáno pacientovi, což vede k transfekci, která probíhá in vivo. In vivo a ex vivo transfekce dendritických buněk může být provedena, například, za použití jakýchkoliv metod známých v oboru, jako jsou metody popsané ve WO 97/24447, nebo technika genového děla popsaná v Mahvi et al., Immunology and Cell Biology, 75: 456-460, 1997. Naplnění dendritických buněk antigenem může být dosaženo inkubací dendritických buněk nebo progenitořových buněk s chlamydiovým polypeptidem, DNA (holou nebo v plasmidovém vektoru) nebo RNA; nebo s rekombinantní bakterií nebo virem (například virem vakcinie, drůbežích neštovic, adenovirem nebo lentivirem) exprimujícim antigen. Před naplněním může být polypeptid kovalentně konjugován na imunologický partner, který napomáhá T-lymfocytům (například nosič) . Alternativně mohou být dendritické buňky pulsovány nekonjugovaným imunologickým partnerem, samostatně nebo za přítomnosti polypeptidu.
Způsoby a frekvence podání farmaceutických prostředků a vakcín, stejně jako dávkování, se velmi liší mezi jedinci. Obecně, farmaceutické prostředky a vakcíny mohou být podány injekčně (například podkožně, intrakutáně, intramuskulárně nebo intravenosně) , intranasálně (například aspirací) nebo orálně. 1-3 dávky se mohou podat během 1-36 týdnů. Výhodně se podají 3 dávky, v intervalu 3-4 měsíců, a potom mohou být periodicky aplikovány 'Ϊ.
·· ··*· • · · • ··· • · • · 88.......
t ee e e e <
• · * · <
• ··· · · · dosycovací vakcinace. Jiné protokoly mohou být vhodné pro jednotlivé pacienty. Vhodná dávka je množství polypeptidu nebo DNA, které při podání výše uvedenými způsoby vyvolá imunitní reakci u imunizovaného pacienta, která je dostatečná pro ochranu pacienta před Chlamydiovou infekcí po dobu alespoň 1-2 let.
Obecně, množství polypeptidu v dávce (nebo produkované in šitu DNA v dávce) je v rozmezí od přibližně l pg do přibližně 100 mg na kg tělesného hmotnosti pacienta, obvykle od přibližně 10 pg do přibližně 1 mg a výhodně od přibližně 100 pg do přibližně l,ug. Vhodné dávky se liší podle velikosti pacienta, ale obvykle jsou v rozmezí od přibližně 0,1 ml do přibližně 5 ml.
Jakýkoliv nosič známý odborníkům v oboru může být použit ve farmaceutických prostředcích podle předkládaného vynálezu a typ nosiče závisí na způsobu podání. Pro parenterální podání, jako je podání podkožní injekcí, je nosičem obvykle voda, salinický roztok, alkohol, tuk, vosk nebo pufr. Pro orální podání může být použit jakýkoliv z výše uvedených nosičů a nebo pevný nosič, jako je manitol, laktosa, škrob, stearan hořečnatý, sacharin sodný, talek, celulosa, glukosa, sacharosa a uhličitan hořečnatý. Biodegradovatelné mikrosféry (například polylaktatpolyglykolat) mohou být také použity jako nosiče pro farmaceutické prostředky podle předkládaného vynálezu. Vhodné biodegradovatelné mikrosféry jsou popsány, například, v US patentech č. 4897268 a 5075109.
Obecně, vhodný dávkovači a léčebný režim dodává aktivní sloučeninu v množství dostatečném pro dosažení terapeutického a/nebo profylaktického přínosu. Taková odpověď může být monitorována podle zlepšení klinického stavu u léčených pacientů ve srovnání s neléčenými pacienty. Zvýšení preexistující imunitní reakce na chlamydiový protein obvykle koreluje se zlepšeným klinickým stavem. Takové imunitní reakce mohou být hodnoceny pomocí standardních testů na proliferaci, cytotoxicitu nebo produkci cytokinů, které mohou být provedeny na vzorcích získaných ’·· β β β β β * β β • φ· · φ · • φ φ φ φ ·· φ · • ·φ φ φ φ φ • φφφ·
ΦΦ φφ od pacienta před a po léčbě.
V jiném aspektu -vynález poskytuje způsoby pro použití polypeptidů popsaných výše pro diagnostiku chlamydiové infekce. V tomto aspektu vynález poskytuje způsoby pro detekci chlamydiové infekce v biologickém vzorku, za použití jednoho nebo více z výše uvedených polypeptidů, samostatně nebo v kombinaci. Termín polypeptid je použit při popisu specifických provedení diagnostických metod podle předkládaného vynálezu. Nicméně, odborníkům v oboru bude jasné, že v takových způsobech mohou být také použity fúzní proteiny podle předkládaného vynálezu.
Termín biologický vzorek, jak je zde použit, je jakýkoliv vzorek obsahující protilátky získaný od pacienta. Výhodně je vzorkem plná krev, sputum, sérum, plasma, sliny, mozkomíšní mok nebo moč. Lépe je vzorkem krev, sérum nebo plasma získaná od pacienta. Polypeptidy jsou použity v testech popsaných dále pro určení přítomnosti nebo nepřítomnosti protilátek k polypeptidu ve vzorku, ve srovnání s předem určenou hraniční hodnotou. Přítomnost takových protilátek ukazuje na předchozí senzibilizaci chlamydiovými antigeny, což může ukazovat na chlamydiovóu infekci.
V provedeních, ve kterých je použito více než jednoho polypeptidu, jsou použité polypeptidy komplementární (t.j. jeden polypeptid detekuje infekci ve vzorku, kterou nedetekuje druhý polypeptid). Komplementární polypeptidy mohou být identifikovány za použití každého polypeptidu samostatně pro hodnocení vzorků séra získaných od pacientů, o kterých je známo, že mají Chlamydiovou infekci. Po určení toho, který vzorek je pozitivní za použití jednotlivých polypeptidů mohou být vybrány kombinace dvou nebo více polypeptidů, které mohou detekovat infekci ve většině, nebo všech, testovaných vzorcích.
• · '4444 «« 4 · 4 4 4 4 4 4
4·· 44 4 44 4
444 · · 444 4 4 4
444 44 4···· 4 · 4444 4 4 44
Odborníci v oboru znají mnoho testovacích formátů, které mohou být použity pro pro detekci protilátek ve vzorku pomocí jednoho nebo více polypeptidů. Viz například Harlow and Lané, Antibodies:
A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory, 1988. Ve výhodném provedení test obsahuje použití polypeptidu imobilizovaného na pevném nosiči pro vazbu a odstranění protilátky ze vzorku. Navázaná protilátka může být potom detekována pomocí detekčního činidla, které obsahuje reportérovou skupinu. Vhodným detekčním činidlem jsou protilátky, které se váží na komplex polypeptid/protilátka a volné polypeptidy značené reportérovou skupinou (např. v semi-kompetitivním testu). Alternativně může být použit kompetitivní test, ve kterém je protilátka, která se váže na polypeptid, značena reportérovou skupinou a váže se na imobilizovaný antigen po inkubaci antigenu se vzorkem. Rozsah, ve kterém složky vzorku inhibují vazbu značené protilátky na polypeptid, ukazuje na reaktivitu vzorku s imobilizovaným polypeptidem.
Pevným nosičem může být jakýkoliv materiál známý odborníkům v oboru, na který může být navázán antigen. Například může být pevným nosičem testovací jamka v mikrotitrační plotně nebo nitrocelulosová nebo jiná vhodná membrána. Alternativně může být nosičem korálek nebo disk, jako je skleněný, latexový plastový materiál, jako je polystyren nebo polyvinylchlorid, nebo materiál ze skelného vlákna. Nosičem může být také magnetická částice nebo sensor optického vlákna, jak je popsáno, například, v US patentu č. 5359681.
Polypeptidy mohou být navázány na pevném nosiči za použití různých technik známých odborníkům v oboru. V předkládaném vynálezu označuje termín navázání jak nekovalentní asociaci, jako je adsorpce, tak kovalentní navázání (které může být přímou vazbou mezi antigenem a funkčními skupinami na nosiči, tak vazbou «**· ·9 · « · e · ·.·
999 « 9 '99 • · * 9 9 9 • ·999
prostřednictvím zesilovacího činidla). Výhodné je navázání adsorpcí na jamku mikrotitrační plotny nebo na membránu.
V takových případech může být adsorpce dosažena kontaktováním polypeptidu, ve vhodném pufru, s pevným nosičem po dostatečně dlouhou dobu. Doba kontaktu se liší podle teploty, ale obvykle je v rozmězí mezi přibližně 1 hodinou a přibližně 1 dnem. Obecně, kontaktování jamky plastové mikrotitrační plotny (například polystyrénové nebo polyvinylchloridové) s množstvím polypeptidu v rozmezí od přibližně 10 ng do přibližně l ug, a lépe přibližně 100 ng, je dostatečné pro navázání adekvátního množství antigenů.
Kovalentní navázání polypeptidu na pevný nosič může být provedeno nejprve reakcí nosiče s bifunkčním činidlem, které reaguje jak s nosičem, tak s funkčními skupinami, jako je hydroxylová a amino skupina, na polypeptidu. Například může být polypeptid kovalentně navázán na nosiče mající vhodný polymerový potah za použití benzochinonu nebo kondenzací aldehydové skupiny na nosiči s aminem a aktivním vodíkem na polypeptidu (viz například Pierce Immunotechnology Catalog and Handbook, 1991, A12-A13).
V některých provedeních je testem imunosorbentní test využívající navázaného enzymu (ELISA). Tento test může být proveden nejprve kontaktováním polypeptidového antigenů, který byl imobilizován na pevném nosiči, obvykle na jamce mikrotitrační plotny, se vzorkem tak, že protilátky k polypeptidu se mohou vázat na imobílizovaný polypeptid. Nenavázaný vzorek se potom odstraní od imobilizovaného polypeptidu a přidá se detekční činidlo, které se váže na imobílizovaný komplex protilátka - polypeptid. Množství detekčního činidla, které zůstává navázané na pevný nosič, se potom určí za použití metody vhodné pro specifické detekční činidlo.
·· ·«·· • · • ·*· ·· β* • · · · • *’»·· ·
Přesněji, když je polypeptid imobilizován na nosiči způsobem popsaným výše, tak jsou zbývající vazebná místa pro proteiny na nosiči obvykle blokována. Může být použito jakékoliv blokovací činidlo známé odborníkům v oboru, jako je hovězí sérový albumin (BSA) nebo Tween 20™ (Sigma Chemical Co., St. Louis, MO). Imobilizovaný polypeptid se potom inkubuje se vzorkem a protilátka se nechá navázat na antigen. Vzorek může být před inkubací naředěn vhodným ředidlem, jako je fosfátem pufrovaný salinický roztok (PBS). Obecně, vhodná doba kontaktu (t.j. inkubační čas) je doba, která je dostatečná pro detekci přítomnosti protilátky ve vzorku infikovaném HGE. Výhodně je kontaktní doba dostatečná pro dosažení úrovně vazby, která je alespoň 95% vzhledem k rovnováze mezi navázanou a nenavázanou protilátkou. Odborníkům v oboru bude jasné, že doba nutná pro dosažení rovnováhy může být snadno určena testováním vazby v závislosti na čase. Při teplotě místnosti je obvykle dostatečná doba přibližně 30 minut.
Nenavázaný vzorek může být potom odstraněn promytím pevného nosiče vhodným pufrem, jako je PBS obsahující 0,1% Tween 20™. Potom může být k pevnému nosiči přidáno detekční činidlo. Vhodným detekčním čindilem je jakákoliv sloučenina, která se váže na imobilizovaný komplex protilátka-polypeptid a která může být detekována různými způsoby známými v oboru. Výhodně obsahuje detekční činidlo vazebné činidlo (jako je, například, protein A, protein G, imunoglobulin, lektin nebo volný antigen) konjugované na reportérovou skupinu. Výhodnými reportérovými skupinami jsou enzymy (jako je křenová peroxidasa), substráty, kofaktory, inhibitory, barviva, radionuklidy, luminiscentní skupiny, fluorescentní skupiny a biotin. Konjugace vazebného činidla na reportérovou skupinu může být provedena standardními metodami známými odborníkům v oboru. Běžná vazebná činidla mohou být také zakoupena již konjugovaná na různé reportérové skupiny z mnoha komerčních zdrojů (například Zymed Laboratories, San Francisko,
Oř · Λ ♦ 4 4 4 4 4 · 4 « • «·· · |«4· · · · • eee »·· ··· · « φ β « β e · fe β e ···· ··* ·· ·· «· »·
CA, a Pierce, Rockford, II).
Detekční činidlo se potom inkubuje s imobilizovaným komplexem polypeptid-protilátka po dobu dostatečnou pro detekci navázané protilátky. Vhodná doba se obvykle určí podle návodu výrobce nebo hodnocením závislosti vazba-čas. Nenavázané detekční činidlo se potom odstraní a navázané detekční činidlo se detekuje pomocí reportérové skupiny. Způsob použitý pro detekci reportérové skupiny závisí na charakteru použité reportérové skupiny. Pro radioaktivní skupiny jsou obvykle vhodné scintilační nebo autoradiografické metody. Spektroskopické metody mohou být použity pro detekci barviv, luminiscentních skupin a fluorescentních skupin. Biotin může být detekován pomocí avidinu, navázaného na různé reportérové skupiny (obvykle radioaktivní nebo fluorescentní skupiny nbeo enzym). Enzymové reportérové skupiny mohou být detekovány adicí substrátu (obvykle na určitou dobu) a potom spektroskopickou nebo jinou analýzou reakčních produktů.
Pro stanovení přítomnosti nebo nepřítomnosti anti-chlamydiových protilátek ve vzorku je signál detekovaný z reportérové skupiny, která zůstává navázaná na pevný nosič, obvykle srovnáván se signálem korespondujícím s předem určenou hraniční hodnotou. V jednom -výhodném provedení je hraniční hodnota průměrný signál získaný tehdy, když je imobilizovaný antigen inkubován se vzorky od neinfikovaných pacientů. Obecně, vzorek generující signál, který je o tři standardní odchylky vyšší než předem určená hraniční hodnota, je považován za pozitivní z hlediska chlamydiové infekce. V alternativním provedení je hraniční hodnota určena za použití Receiver Operátor Curve, podle metody popsané v Sackett et al., Clinical Epidemiology: A Basic Science for Clinical Medicine, Little Brown and Co., 1985, str. 106-107. Stručně, v tomto provedení může být hraniční hodnota určena z grafu párů správně pozitivních výsledků (t.j.
·« ···» ·· 9« ·» ···« < · · 9 9 · · · · « ··· · · ··· · · · • V········ · • · 9 9 9 9 9 9 9 9 ···· ·»Λ *· ·· ·· ·· sensitivity) a falešně pozitivních výsledků (100% specificita), které korespondují každé možné hraniční hodnotě pro výsledek diagnostického testu. Hraniční hodnota v grafu, která je nejvíce v levém horním rohu (t.j. hodnota, která ohraničuje největší plochu) je nejpřesnější hraniční hodnotou, a vzorek generující signál, který je vyšší než hraniční hodnota určená tímto způsobem, může být považován za pozitivní. Alternativně může být hraniční hodnota v grafu posunuta doleva, což minimalizuje falešně pozitivní výsledky, nebo doprava, což minimalizuje falešně negativní výsledky. Obecně, vzorek generující signál, který je vyšší než hraniční hodnota určená tímto způsobem, může být považován za pozitivní z hlediska chlamydiové infekce.
V příbuzném provedení je test proveden v průtokovém nebo proužkovém testovacím formátu, ve kterém je antigen imobilizován na membráně, jako je nitrocelulosová membrána. V průtokovém testu se protilátky ve vzorku váží na imobilizované polypeptidy při průchodu vzorku membránou. Detekční činidlo (například protein A-koloidní zlato) se potom váže na komplex protilátka-polypeptid při průtoku roztoku obsahujícího detekční činidlo membránou. Detekce navázaného detekčního činidla může být provedena způsobem popsaným výše. V proužkovém testovacím formátu je jeden konec membrány, na který je navázán polypeptid, ponořen do roztoku osbahujícího vzorek. Vzorek migruje membránou skrz region obsahující vazebné činidlo a do oblasti obsahující imobiiizovaný polypeptid. Koncentrování detekčního činidla v oblasti polypeptidu ukazuje na přítomnost anti-chlamydiových protilátek ve vzorku. Obvykle vyvolává koncentrování detekčního činidla v tomto místě jev, jako je proužek, který může být snadno detekován vizuálně. Nepřítomnost takového jevu ukazuje na negativní výsledek. Obecně, množství polypeptidu imobilizovaného na membráně je vybráno tak, aby byl generován vizuálně odlišitelný efekt tehdy, když biologický vzorek obsahuje takové množství protilátek, které bude β e β β • · β βββ «β e ο ββ ··· ··· ·· · • ··· · ···· · · ·
dostatečné pro generování pozitivního signálu v ELISA testu, jak byl popsán výše. Výhodně je množství polypeptidů imobilizovaného na membráně v rozmezí od přibližně 25 ng do přibližně 1 ug, a lépe od přibližně 50 ng do přibližně 500 ng. Takové testy mohou být obvykle provedeny na velmi malém vzorku (například jedné kapce) krve nebo séra od pacienta.
Samozřejmě, že existuje mnoho jiných testovacích protokolů, které jsou vhodné pro použití s polypeptidy podle předkládaného vynálezu. Výše uvedený popis je pouze příkladný. Jedním příkladem alternativního testovacího protokolu, který může být použit v takových metodách, je westernový přenos, při kterém jsou proteiny přítomné v biologickém vzorku separovány na gelu před tím, než jsou vystaveny působení vazebného činidla. Takové techniky jsou dobře známé odborníkům v oboru.
Předkládaný vynález dále poskytuje činidla, jako jsou protilátky nebo jejich vazebné fragmenty pro antigen, které se specificky váží na chlamýdiový protein. Protilátka nebo její vazebný fragment pro antigen se specificky váže na chlamýdiový protein tehdy, když reaguje detekovatelně (například v ELISA) s chlamydiovým proteinem, a nereaguje detekovatelně s nepříbuznými proteiny za podobných podmínek. Termín vazba označuje nekovalentní asociaci mezi dvěma separovanými molekulami, při které vzniká komplex. Schopnost vazby může být hodnocena, například, určením vazebné konstanty pro tvorbu komplexu. Vazebná konstanta je hodnota získaná při dělení koncentrace komplexu koncentracemi složek. Obecně, v kontextu předkládaného vynálezu se dvě sloučeniny váží tehdy, když vazebná konstanta pro tvorbu komplexu přesahuje přibližně 103 1/mol. Vazebná konstanta může být určena metodami dobře známými v oboru.
Vazebná činidla mohou dále rozlišovat pacienty s a bez • ··· • · ·· chlamydiové infekce, za použití reprezentativních testů podle předkládaného vynálezu. Jinými slovy, protilátky nebo jiná vazebná činidla, která se váží na chlamydiový protein, budou generovat signál ukazující na přítomnost chlamydiové infekce u alespoň 20% pacientů s onemocněním, a budou generovat signál ukazující na nepřítomnost onemocnění u alespoň 90% jedinců bez onemocnění. Pro stanovení toho, zda vazebné činidlo splňuje tyto požadavky, mohou být biologické vzorky {například krve, séra, sputa, moči a/nebo tkáňových biopsií) od pacientů s a bez chlamydiové infekce (jak je určeno standardními klinickými testy) testovány na přítomnost polypeptidů, které se váží na vazebná činidla. Je jasné, že by měl být testován statisticky významný počet vzorků s a bez onemocnění. Každé vazebné činidlo by mělo splňovat tato kriteria; nicméně, odborníkům v oboru bude jasné, že vazebná činidla mohou být použita v kombinaci pro zvýšení sensitivity.
Jakékoliv činidlo splňující výše uvedené požadavky může být vazebným činidlem. Například může být vazebným činidlem ribosom, s nebo bez peptidové složky, RNA molekula nebo polypeptid. Ve výhodném provedení je vazebným činidlem protilátka nebo její vazebný fragment pro antigen. Protilátky mohou být připraveny jakoukoliv technikou známou odborníkům v oboru. Viz například Harlow and Lané, Antibodies: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory, 1988. Obecně, protilátky mohou být produkovány v buněčných kulturách, včetně výroby monoklonálních protilátek, jak je zde popsána, nebo transfekci genů pro protilátky do vhodných bakteriálních nebo savčích hostitelských buněk, za produkce rekombinantních protilátek. V jedné technice je imunogen obsahující polypeptid nejprve injikován různým savcům (například myším, králíkům, ovcím nebo kozám). V tomto kroku může polypeptid podle předkládaného vynálezu sloužit jako imunogen bez modifikací. Alternativně, zejména pro relativně krátké polypeptidy, může být lepší imunitní reakce vyvolána tehdy, je-li polypeptid navázán na
99 9 • ··· poteinovy nosič, jako je hovězí sérový albumin nebo přílipkový hemokyanin. Imunogen se injekčně aplikuje zvířecímu hostiteli, výhodně podle před určeného protokolu zahrnujícího jednu nebo více dosycovacích imunizací, a zvířeti se periodicky odebírá krev. Polyklonální protilátky specifické pro polypeptid mohou být potom přečištěny z takového antiséra pomocí, například, afinitní chromatografie za použití polypeptidu navázaného na vhodný pevný nosič.
Monoklonální protilátky specifické pro daný antigenní polypeptid mohou být připraveny, například, za použití techniky podle Kohlera a Milsteina, Eur. J. Immunology 6: 511-519, 1976, a jejích vylepšení. Stručně, tato metoda vyžaduje přípravu imortalizované buněčné linie schopné produkce protilátek majících požadovanou specificitu (t.j. reaktivitu s daným polypeptidem). Takové buněčné linie mohou být produkovány, například, z buněk sleziny získaných od zvířat imunizovaných způsobem popsaným výše. Buňky sleziny jsou potom imortalizovány, například, fúzí s myelomovými buňkami, výhodně takovými, které jsou syngenní s imunizovaným zvířetem. Mohou být použity různé fúzní techniky. Například mohou být buňky sleziny a myelomové buňky kombinovány v neiontovém detergentním činidle po dobu několika minut a potom mohou být umístěny v nízké hustotě na selektivní medium, které podporuje růst hybridních buněk, ale ne myelomových buněk. Výhodnou selekční technikou je použití HAT {hypoxantin, aminopterin, thymidin) selekce. Po dostatečné době, obvykle po 1 až 2 týdnech, se pozorují kolonie hybridů. Vyberou se jednotlivé kolonie a supernatanty jejich kultur se testují na vazebnou aktivitu proti polypeptidu. Výhodné jsou hybridomy s vysokou reaktivitou a specificitou.
Monoklonální protilátky mohou být izolovány ze supernatantů kultivovaných kolonií hybridomů. Dále, různé techniky mohou být • ··· • ··· použity pro zvýšení výtěžku, jako je injekce hybridomových buněk do peritoneální dutiny vhodného obratlovce, jako je myš. Monoklonální protilátky mohou být získány z ascitu nebo z krve. Kontaminace může být odstraněna od protilátek běžnými technikami, jako je chromatografie, gelová filtrace, srážení a extrakce. Polypeptidy podle předkládaného vynálezu mohou být použity v přečišúovacím procesu například ve stupni afinitní chromatografie.
V některých provedeních může být výhodné použití vazebných fragmentů protilátek pro antigen. Mezi takové fragmenty patří Fab fragmenty, které mohou být připraveny standardními technikami. Stručně, imunoglobuliny mohou být přečištěny z králičího séra afinitní chromatografií na kolonách s protein A korálky (Harlow and Lané, Antibodies: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory, 1988) a mohou být tráveny papainem za zisku Fab a Fc fragmentů. Fab a Fc fragmenty mohou být separovány afinitní chromatografií na kolonách obsahujících protein A korálky.
Monoklonální protilátky podle předkládaného vynálezu mohou být navázány na jedno nebo více terapeutických činidel. Takovými vhodnými terapeutickými činidly jsou radionuklidy, induktory diferenciace, léky, toxiny a jejich deriváty. Výhodnými radionuklidy jsou 9OY, X23I, X2SI, X3XI, xasRe, 2XXAt a 2X2Bi. Výhodnými léky jsou methotrexat a analogy pyrimidinu a purinu. Výhodnými induktory diferenciace jsou estery forbolu a kyselina máselná. Výhodnými toxiny jsou ricin, abrin, difterický toxin, cholera toxin, gelonin, Pseudomonadový exotoxin, Shigella toxin a antivirový protein líčidla amerického.
Terapeutické činidlo může být navázáno (například kovalentně) na vhodnou monoklonální protilátku bud' přímo, nebo nepřímo (například prostřednictvím spojovací skupiny). Přímá reakce mezi • ··· • ··· činidlem a protilátkou je možná tehdy, když každý z nich obsahuje vhodný substituent schopný reakce s jiným substituentem.
Například, nukleofilní skupina, jako je amino- nebo sulfhydrylová skupina, na jedné složce může reagovat se skupinou obsahující karbonyl, jako je anhydrid nebo halogenid kyseliny, nebo s alkylovou skupinou obsahující dobře odštěpitelnou skupinu (například halogenid) na druhé složce.
Alternativně může být žádoucí navázání terapeutického činidla a protilátky prostřednictvím spojovací skupiny. Spojovací skupina může působit jako oddělovací skupina pro oddělení protilátky od činidla z toho důvodu, aby se zabránilo interferenci s vazebnou schopností. Spojovací skupina může také sloužit pro zvýšení chemické reaktivity substituentu na činidle nebo protilátce a tak může zvyšovat účinnost vazby. Zvýšení chemické reaktivity může také usnadnit použití činidel, nebo funkčních skupin na činidlech, které by jinak nebylo možno použít.
Odborníkům v oboru bude jasné, že jako spojovací skupiny mohou být použity různá bifunkční nebo polyfunkční činidla, jak homo-, tak hetero-bifunkční (jako jsou činidla popsaná v katalogu Pierce Chemical Co., Rockford, IL). Vazba může být provedena, například prostřednictvím amino skupin, karboxylových skupin, sulfhydrylových skupin nebo oxidovaných karbohydrátových zbytků. Existuje mnoho odkazů popisujících takové techniky, například US patent č. 4671985 (Rodwell et al.).
Když je terapeutické činidlo účinnější tehdy, není-li navázáno na protilátkovou část imunokonjugátu podle předkládaného vynálezu, může být žádoucí použití spojovací skupiny, která se štěpí během nebo po internalizaci do buněk. Bylo popsáno mnoho různých štěpitelných spojovacích skupin. Mechanismy pro intracelulární uvolnění činidel z těchto spojovacích skupin zahrnují štěpení • · • ···
100 redukcí disulfidové vazby (například US patent č. 4489710,
Spitler), ozáření fotolabilní vazby (například US patent č. 4625014, Senter et al.), hydrolýzu derivatizovaných aminokyselinových vedlejších řetězců (například US patent č. 4638045, Kohn et al.), hydrolýzu zprostředkovanou sérovým komplementem (například US patent č. 4671958, Rodwell et al.) a hydrolýzu katalyzovanou kyselinou (například US patent č. 4569789, Blatter et al.).
Může být žádoucí navázat na protilátku více než jedno činidlo.
V jednom provedení je na jednu molekulu protilátky navázáno více molekul činidla. V jiném provedení je na jednu protilátku navázáno více typů činidel. Bez ohledu na konkrétní provedení mohou být imunokonjugáty s více než jedním činidlem připraveny různými způsoby. Například, více než jedno činidlo může být navázáno přímo na molekulu protilátky, nebo může být použita spojovací skupina poskytující více míst pro navázání. Alternativně může být použit nosič.
Nosič může nést činidla různými způsoby, včetně kovalentní vazby, buď přímé nebo prostřednictvím spojovací skupiny. Vhodnými nosiči jsou albuminy (např. US patent č. 4507234, Kato et al.) , peptidy a polysacharidy jako je aminodextran (např. US patent č. 4699784, Shih et al.) . Nosič může přenášet činidlo také nekovalentní vazbou nebo prostřednictvím enkapsulace, jak je tomu například v liposomech (např. US patenty č. 4429008 a 4873088). Nosiče specifické pro radionuklidová činidla zahrnují radiohalogenované malé molekuly a chelatační sloučeniny. Například US patent č. 4735792 popisuje representativní radiohalogenované malé molekuly a jejich syntézu. Radionuklidový chelát může být připraven z chelatačních sloučenin, mezi které patří ty, které obsahují atomy dusíku a síry jako donorové atomy pro vazbu kovu, nebo oxidu kovu, radionuklidu. Například US patent č. 4673562, • ···
101
Davison et al., popisuje representativní chelatační sloučeniny a jejich syntézu.
Pro protilátky a imunokonjugáty mohou být použity různé způsoby podání. Obvykle je podání intravenosní, intramuskulární, podkožní nebo do určitého regionu. Je jasné, že přesná dávka protilátky/imunokonjugátu závisí na použité protilátce, hustotě antigenu a na rychlosti eliminace protilátky.
Protilátky mohou být použity v diagnostických testech pro detekci přítomnosti chlamydiových antigenů za použití testů podobných již popsaným testům a za použití jiných technik dobře známých odborníkům v oboru, což poskytuje metodu pro detekci chlamydiové infekce u pacienta.
Diagnostická činidla podle předkládaného vynálezu mohou také obsahovat DNA sekvence kódující jeden nebo více polypeptidů uvedených výše, nebo jejich částí. Například, alespoň dva oligonukleotidové primery mohou být použity v testu na bázi polymerasové řetězové reakce (PCR) pro amplifikaci cDNA specifické pro Chlamydie v biologickém vzorku, kde alespoň jeden oligonukleotidový primer je specifický pro DNA molekulu kódující polypeptid podle předkládaného vynálezu. Přítomnost amplifikované cDNA se potom detekuje za použití technik dobře známých v oboru, jako je gelová elektroforesa. Obdobně, oligonukleotidové sondy specifické pro DNA molekulu kódující polypeptid podle předkládaného vynálezu mohou být použity v hybridizačním testu pro detekci přítomnosti polypeptidu podle předkládaného vynálezu v biologickém vzorku.
Termín oligonukleotidový primer/sonda specifický pro DNA molekulu, jak je zde použit, označuje oligonukleotidovou sekvenci, která má alespoň 80%, lépe alespoň 90% a nejlépe alespoň > · ··· • · • ··· • ···
102
95% identitu s danou DNA molekulou. Oligonukleotidové primery a/nebo sondy, které mohou být použity v diagnostických metodách podle předkládaného vynálezu, mají délku alespoň 10-40 nukleotidů Ve výhodném provedení obsahují oligonukleotidové primery alespoň kontinuálních oligonukleotidů DNA molekuly kódující jeden z polypeptidů podle předkládaného vynálezu. Výhodně obsahují oligonukleotidové primery pro použití v diagnostických metodách podle předkládaného vynálezu alespoň 15 kontinuálních oligonukleotidů DNA molekuly kódující jeden z polypeptidů podle předkládaného vynálezu. Techniky pro testy na bázi PCR a pro hybridizační testy jsou dobře známé v oboru (viz například Mullis et al., tamtéž; Erlich, tamtéž). Primery nebo sondy mohou být takto použity pro detekci sekvencí specifických pro Chlamydie v biologických vzorcích. DNA sondy nebo primery obsahující oligonukleotidové sekvence popsané výše mohou být použity samostatně nebo v kombinaci.
Následující příklady jsou pouze ilustrativní a nijak neomezují rozsah předkládaného vynálezu.
Příklady provedení vynálezu
Příklad l: Izolace DNA sekvencí kódujících chlamydiové antigeny
Chlamydiové antigeny podle předkládaného vynálezu byly izolovány expresí knihovny genomové DNA Chlamydia trachomatis LGV způsobem popsaným v Sanderson et al. (J. Exp. Med., 1995, 182:
1751-1757) a bylo prokázáno, že indukují proliferaci PBMC a IFN-gamma v imunoreaktivní T-lymfocytární linii.
T-lymfocytární linie specifická pro Chlamydie byla generována stimulací PBMC od normálního dárce bez anamnesy chlamydiové genitální infekce elementárními tělísky Chlamydia trachomatis LGV ·· ····
103
II. Bylo zjištěno, že tato T-lymfocytámí linie, označená jako TCL-8, rozpoznává dendritické buňky odvozené od monocytů infikované jak Chlamydia trachomatis, tak Chlamydia pneumoniae.
Náhodně štěpená genomová knihovna Chlamydia trachomatis LGV II byla připravena v Lambda ZAP (Stratagene, La Jolla, CA) a amplifikovaná knihovna byla umístěna v 96-jamkové mikrotitrační plotně v hustotě 30 klonů/jamku. Bakterie byly indukovány k expresi rekombinantního proteinu za přítomnosti 2 mM IPTG po dobu 3 hodin a potom byly peletovány a resuspendovány ve 200 ul RPMI a 10% FBS. 10 ul indukované bakteriální suspenze se přeneslo do 96-jamkových ploten obsahujících autologní dendritické buňky odvozené od monocytů. Po 2 hodinové inkubaci se dendritické buňky promyly pro odstranění volné E. coli a přidaly se T-lymfocyty specifické pro Chlamydie. Pozitivní E. coli soubory se identifikovaly podle produkce IFN-gamma a podle proliferace T-lymfocytů v reakci na soubory.
Identifikovaly se čtyři pozitivní klony, které se rozdělily na čtyři čisté klony (označené 1-B1-66, 4-D7-28, 3-G3-10 a 10-C10-31), s velikostí insertu 481 bp, 183 bp, 110 bp a 1400 bp, v příslušném pořadí. Určené DNA sekvence pro 1-B1-66, 4-D7-28,
3-G3-10 a 10-C10-31 jsou uvedeny v SEQ ID NO: 1-4, v příslušném pořadí. Klon 1-B1-66 je přibližně v regionu 536690 genomu C.trachomatis (NCBI C.trachomatis databáze). V klonu 1-B1-66 byl identifikován otevřený čtecí rámec (ORF) (nukleotidy 115-375), který kóduje dříve identifikovaný 9 kDa protein (Stephens et al., GenBank přírůstkové č. AE001320), jehož sekvence je uvedena v SEQ ID NO: 5). Klon 4-D7-28 je menší region stejného ORF (aminokyseliny 22-82 1-B1-66). Klon 3-G3-10 je přibližně v regionu 74559 genomu C.trachomatis. Insert je klonován v protismyslné orientaci vzhledem k jeho orientaci v genomu. Klon 10-C10-31 obsahuje otevřený čtecí rámec, který odpovídí dříve publikované ·· ··«· ♦· ·«··
104 * · · · · · •·· ·· ··· t · • ···· · · . ΐ ··♦ ·· ·· ·· ·· sekvenci pro S13 ribosomální protein od Chlamydia trachomatis (Gu, L. et al., J. Bacteriology 177: 2594-2601, 1995). Předpokládané proteinové sekvence pro 4-D7-28 a 10-C10-31 jsou uvedeny v SEQ ID NO: 6 a 12, v příslušném pořadí. Předpokládané proteinové sekvence pro 3-G3-10 jsou uvedeny v SEQ ID NO: 7-11.
V příbuzné sérii skríningových testů byla další T-lymfocytární linie použita pro vyšetřování knihovny genomové DNA Chlamydia trachomatis LGV II popsané výše. T-lymfocytární linie specifická pro chlamydie (TCT-1) byla získána od pacientů s chlamydiovou genitální infekcí stimulací PBMC autologiními dendritickými buňkami odvozenými od monocytů infikovanými elementárními tělísky Chlamydia trachomatis LGV II. Jeden klon, 4C9-18 (SEQ ID NO: 21), obsahující 1256 bp insert, vyvolává specifickou imunitní odpověď, jak bylo měřeno standardními proliferačními testy, u T-lymfocytární linie TCT-1 specifické pro chlamydie. Další analýza ukázala, že tento klon obsahuje tři známé sekvence: lipoamid dehydrogenasu (GenBank přírůstkové č. AE001326), popsanou v SEQ ID NO: 22; hypotetický protein CT429 (GenBank přírůstkové č. AE001316), popsaný v SEQ ID NO: 23; a část otevřeného čtecího rámce ubichinon-methyltransferasy CT428 (GenBank přírůstkové č. AE001316) , popsanou v SEQ ID NO: 24.
V dalších pokusech s klonem 4C9-18 (SEQ ID NO: 21) byla kompletní aminokyselinová sekvence pro lipoamid-dehydrogenasu (SEQ ID NO: 22) z Chlamydia trachomatis (LGV II) exprimována v klonu CtL2-LPDA-FL, který je popsán v SEQ ID NO: 90.
Pro další charakterizaci otevřeného čtecího rámce obsahujícího stimulační epitop pro T-lymfocyty byl cDNA fragment obsahující nukleotidy 1-695 klonu 4C9-18 s cDNA sekvencí kódující 6X-histidinovou koncovku na amino-konci subklonován do Ndel/EcoRI místa pET17b vektoru (Novagen, Madison, WI) a vzniklý klon byl
105
«* «9 • · · • 9 · ·· • · · označen jako 4C9-18#2 BL21 pLysS (SEQ ID NO: 25, S příslušnou aminokyselinovou sekvencí popsanou v SEQ ID NO: 26) a tento klon byl transformován do E. coli. Selektivní indukce trasformované E. coli 2 mM IPTG po dobu 3 hodin vedla k expresi 26 kDa proteinu z klonu 4C9-18#2 BL21 pLysS, jak bylo potvrzeno SDS-PAGE s barvením Coomasie modří. Pro stanovení imunogenicity proteinu kódovaného klonem 4C9-18#2 BL21 pLysS byly E. coli exprimující 26 kDa protein titrovány na 1 x 104 dendritických buněk odvozených od monocytů a provedla se inkubace po dobu 2 hodin. Kultury dendritických buněk se promyly a přidalo se 2,5 x 104 T-lymfocytů (TCT-1) a provedla se inkubace po dobu dalších 72 hodin a potom se koncentrace IFN-gamma v supernatantu kultury určila ELISA. Jak je uvedeno na obr. 1, bylo zjištěno, že T-lymfocytární linie TCT-1 reaguje na indukované kultury, jak je měřeno podle koncentrace IFN-gamma, což ukazuje na T-lymfocytární odpověď na sekvece lipoamid dehydrogenasy specifickou pro Chlamydie. Podobně bylo zjištěno, že protein kódovaný klonem 4C9-18#2 BL21 pLysS stimuluje TCT-1 T-lymfocytární linii ve standardních proliferačních testech.
Další testy pro identifikaci dalších antigenů Chlamydia trachomatis za použití výše popsané klonovací techniky na CD4+ T-lymfocytech vedly k zisku dalších klonů. TCT-1 a TCL-8 T-lymfocytární linie specifické pro Chlamydie, stejně jako TCP-21 T-lymfocytární linie, byly použity pro vyšetřování genomové knihovny Chlamydia trachomatis LGVII. TCP-21 T-lymfocytární linie byla získaná od pacientů s humorální reakcí na Chlamydia pneumoniae. TCT-1 buněčná linie identifikovala 37 pozitivních souborů, TCT-3 buněčná linie identifikovala 41 pozitivních souborů a TCP-21 buněčná linie identifikovala 2 pozitivní soubory. Z těchto 10 pozitivních souborů byly identifikovány následující klony. Klon 11-A3-93 (SEQ ID NO: 64), identifikovaný TCP-21 buněčnou linií, je 1339 bp genomový fragment vykazující homologii s HAD superrodinou (CT103). Druhý insert ve stejném klonu vykazuje ·· ···· * 9 • ·44
106
4
4·44 444 •4 ♦··· • e 4 • 4 4 • · · 4 4 44 4 ·· 44 44 ♦· • 4 ·
9 444 homologii s fab I genem (CT104) přítomném na komplementárním řetězci. Klon 11-C12-91 (SEQ ID NO: 63), identifikovaný TCP-21 buněčnou linií, obsahuje 269 bp insert, který je částí OMP2 genu (CT443) a vykazuje homologii s 60 kDa proteinem vnitřní membrány bohatým na cystein v C. pneumoniae.
Klon 11-G10-46 (SEQ ID NO: 62), identifikovaný TCT-3 buněčnou linií, obsahuje 688 bp insert vykazující homologii s hypotetickým proteinem CT610. Klon 11-G1-34 (SEQ ID NO: 61), identifikovaný TCT-3 buněčnou linií, obsahuje dva částečné otevřené čtecí rámce (ORF) s velikostí insertu 1215 bp. Jeden ORF vykazuje homologii s genem pro malat-dehydrogenasu {(CT376)) a druhý ORF vykazuje homologii s genem pro glykogen-hydrolasu (CT042). Klon 11-H3-68 (SEQ ID NO: 60), identifikovaný TCT-3 buněčnou linií, obsahuje dva ORF s celkovou velikostí insertu 1180 bp. Jeden částečný ORF kóduje plasmidem kódovaný PGP6-D protein virulence a druhý ORF je kompletní ORF pro LI ribosomální gen (CT318). Klon 11-H4-28 (SEQ ID NO: 59), identifikovaný TCT-3 buněčnou linií, má velikost insertu 552 bp a je součástí ORF pro dnaK gen (CT396). Klon 12-B3-95 (SEQ ID NO: 58), identifikovaný TCT-1 buněčnou linií, má velikost insertu 463 bp a je součástí ORF pro gen pro lipoamid-dehydrogenasu (CT557). Klony 15-G1-89 a 12-B3-95 (SEQ ID NO: 55 a SEQ ID NO: 58, v příslušném pořadí) jsou identické, jsou identifikované TCT-1 buněčnou linií, a mají velikost insertu 463 bp a jsou součástí ORF pro gen pro lipoamid-dehydrogenasu (CT557). Klon 12-G3-83 (SEQ ID NO: 57), identifikovaný TCT-1 buněčnou linií, má velikost insertu 1537 bp a je součástí ORF pro gen pro hypotetický protein (CT662).
Klon 23-G7-68 (SEQ ID NO: 79), identifikovaný TCT-3 buněčnou linií, obsahuje 950 bp insert a obsahuje malou část Lil ribosomálního ORF, celý ORF pro LI ribosomální protein a část ORF pro L10 ribosomální protein. Klon 22-F8-91 (SEQ ID NO: 80), • · · ·
Y07
identifikovaný TCT-1 buněčnou linií, obsahuje 395 bp insert, který obsahuje část pmpC ORF na komplementárním řetězci klonu. Klon 21-E8-95 (SEQ ID NO: 81), identifikovaný TCT-3 buněčnou linií, obsahuje 2085 bp insert, který obsahuje část CT613 ORF, kompletní ORF pro CT612, kompletní ORF pro CT611 a část ORF pro CT610. Klon 19-F12-57 (SEQ ID NO: 82), identifikovaný TCT-3 buněčnou linií, obsahuje 405 bp insert, který obsahuje část CT858 ORF a malou část recA ORF. Klon 19-F12-53 (SEQ ID NO: 83), identifikovaný TCT-3 buněčnou linií, obsahuje 379 bp insert, který je součástí ORF pro CT455 kódující glutamyl tRNA syntethasu. Klon 19-A5-54 (SEQ ID NO: 84), identifikovaný TCT-3 buněčnou linií, obsahuje 715 bp insert, který je součástí ORF3 (komplementárního řetězce klonu) kryptického plasmidů. Klon 17-E11-72 (SEQ ID NO: 85), identifikovaný TCT-1 buněčnou linií, obsahuje 476 bp insert, který je součástí ORF pro Opp_2 a pmpD. pmpD region tohoto klonu je pokryt pmpD regionem klonu 15-H2-76, Klon 17-C1-77 (SEQ ID NO:
86), identifikovaný TCT-3 buněčnou linií, obsahuje 1551 bp insert, který je součástí CT857 ORF, stejně jako CT858 ORF. Klon 15-H2-17 (SEQ ID NO: 87), identifikovaný TCT-1 buněčnou linií, obsahuje 3031 bp insert, který obsahuje větší část pmpD ORF, část CT089 ORF, stejně jako část ORF pro SycE. Klon 15-A3-26 (SEQ ID NO: 88), obsahuje 976 bp insert, který obsahuje část CT858 ORF. Klon 17-G4-36 (SEQ ID NO: 267), identifikovaný TCT-10 buněčnou linií, obsahuje 680 bp insert, který je ve čtecím rámci s beta-gal v plasmidů a vykazuje homologii s částí ORF pro beta-podjednotku DNA-řízené RNA polymerasy (CT315 v SerD).
Několik klonů popsaných výše vykazuje homologii s různými polymorfními membránovými proteiny. Genomová sekvence Chlamydia trachomatis obsahuje rodinu devíti polymorfních membránových proteinů, která je označena jako pmp. Tyto geny jsou označeny pmpA, pmpB, pmpC, pmpD, pmpE, pmpF, pmpG, pmpH a pmpl. Předpokládá se, že proteiny exprimované z těchto genů jsou biologicky významné ee β«ββ • · • · · · *íó*8**‘ v generování protektivní imunitní reakce při chlamidiové infekci. Konkrétně, pmpC, pmpD, pmpE a pmpl obsahují pravděpodobné signální peptidy, což naznačuje, že se jedná o proteiny zevní membrány a proto potenciální imunologické cíle.
Podle sekvence Chlamydia trachomatis LGVII serovaru byly navrženy páry primerů pro PCR amplifikaci kompletních fragmentů pmpC, pmpD, pmpE, pmpG, pmpH a pmpl. Získané fragmenty byly subklonovány do DNA vakcinačních vektorů JA4304 nebo JAL, což je JA4304 modifikovaný spojovací sekvencí (SmithKline Beecham,
London, England). Přesněji, PmpC byl subklonován do JAL vektoru za použití 5' oligonukleotidu GAT AGG CGC GCC GCA ATC ATG AAA TTT ATG TCA GCT ACT GCT G a 3' oligonukleotidu CAG AAC GCG TTT AGA ATG TCA TAC GAG CAC CGC A, jak jsou uvedeny v SEQ ID NO: 197 a 198, v příslušném pořadí. PCR amplifikace genu za podmínek dobře známých v oboru a ligace do 5' ASCI/3' Mlul míst vektoru JAL byla dokončena po inserci krátké nukleotidové sekvence GCAATC (SEQ ID NO: 199) před ATG za vzniku sekvence podobné Kozákově sekvenci. Vzniklý expresní vektor obsahoval kompletní pmpC gen obsahující 5325 nukleotidů (SEQ ID NO: 173) obsahující hypotetickou signální sekvenci, který kóduje 187 kDa protein (SEQ ID NO: 179). PmpD gen byl subklonován do JA4304 vakcinačního vektoru po PCR amplifikaci genu za použití následujících oligonukleotidů: 5' oligonukleotidu TGC AAT CAT GAG TTC GCA GAA AGA TAT AAA AAG C (SEQ ID NO: 200) a 3' oligonukleotidu CAG AGC TAG CTT AAA AGA TCA ATC GCA ATC CAG TAT TC (SEQ ID NO: 201). Gen byl ligován do 5'-lepivého HIII/3' Mlul místa JA4304 vakcinačního vektoru za použití technik dobře známých v oboru. CAATC (SEQ ID NO: 202) sekvence byla insertována před ATG za vzniku sekvence podobné Kozákově sékvenci. Tento klon je jedinečný v tom, že poslední threonin HindlII místa chybí z důvodů procesu navázání, stejně jako poslední glycin sekvence podobné Kozákově sekvenci. Insert, 4593 nukleotidový fragment (SEQ ID NO: 172) je kompletní gen pro pmpD obsahující hypotetickou signální
9
999
109
sekvenci, která kóduje 161 kDa protein (SEQ ID NO: 178). PmpE gen byl subklonován do JA4304 vakcinačního vektoru za použití následujících oligonukleotidů: 5' oligonukleotidu TGA AAT CAT GAA AAA AGC GTT TTT CTT TTT C (SEQ ID NO: 203) a 3' oligonukleotidu CAG AAC GCG TCT AGA ATC GCA GAG CAA TTT C (SEQ ID NO: 204) . Po PCR amplifikací byl gen ligován do 5'-lepivého HIII/3' Mlul místa JA4304. Pro usnadnění této ligace byla krátká nukleotidová sekvence, TGCAATC (SEQ ID NO: 293), insertována před iniciační kodon za vzniku sekvence podobné Kozákově sekvenci a pro rekonstrukci HindlII místa. Insert je kompletní pmpE gen (SEQ ID NO: 171) obsahující hypotetickou signální sekvenci. PmpE gen kóduje 105 kDa protein (SEQ ID NO: 177). PmpG gen byl PCR amplifikován za použití 5' oligonukleotidu GTG CAA TCA TGA TTC CTC AAG GAA TTT ACG (SEQ ID NO: 205) a 3' oligonukleotidu CAG AAC GCG TTT AGA ACC GGA CTT TAC TTC C (SEQ ID NO: 206) a byl subklonován do JA4304 vektoru. Podobné klonovací strategie byly použity pro pmpl a pmpK geny. Dále byly navrženy páry primerů pro PCR amplifikací kompletních a překrývajících se fragmentů pmp genů, které byly potom subklonovány pro expresi proteinu v pET17b vektoru (Novagen, Madison, WI) a byly transfektovány do E. coli BL21 pLysS pro expresi a následné přečištění za použití histidinové-niklové chromatografické metody od Novagen. Několik těchto genů kódujících rekombinantní proteiny, jak jsou popsány dále, postrádá přirozené signální sekvence pro usnadnění exprese proteinu. Exprese kompletního pmpC proteinu byla provedena pomocí exprese dvou překrývajících se fragmentů, které představují aminoa karboxylový konec. Subklonování pmpC-amino-koncové části, která postrádá signální sekvenci (SEQ ID NO: 187, s příslušnou aminokyselinovou sekvencí uvedenou v SEQ ID NO: 195) , bylo provedeno za použití 5' oligonukleotidu CAG ACA TAT GCA TCA CCA TCA CCA TCA CGAGGC GAG CTC GAT CCA AGA TC (SEQ ID NO: 207) a 3' oligonukleotidu CAG AGG TAC CTC AGA TAG CAC TCT CTC CTA TTA AAG TAG G (SEQ ID NO: 208) do 5' NdeI/3' KPN klonovacího místa » ···« • · • · ·· ··· · · · ·
110 • ··· • · « • · « vektoru. Karboxy-koncová část genu, pmpC-karboxy-koncový fragment (SEQ ID NO: 186, s příslušnou aminokyselinovou sekvencí uvedenou v SEQ ID NO: 194), byl subklonován do 5' NheI/3' KPN klonovacího místa expresního vektoru za použití následujících primerů: 5' oligonukleotidu CAG AGC TAG CAT GCA TCA CCA TCA CCA TCA CGT TAA GAT TGA GAA CTT CTC TGG C (SEQ ID NO: 209), a 3' oligonukleotidu CAG AGG TAC CTT AGA ATG TCA TAC GAG CAC CGC AG (SEQ ID NO: 210) . PmpD byl také exprimován jako dva přesahující proteiny.
Amino-koncová část pmpD, která postrádá signální sekvenci (SEQ ID NO: 185, s příslušnou aminokyselinovou sekvencí uvedenou v SEQ ID NO: 193), obsahuje iniciační kodon pET17b a je exprimována jako 80 kDa protein. Pro expresi proteinu a přečištění následuje po iniciačním kodonu koncovka tvořená 6 histidiny a je fúzovaná na 28. aminokyselinu (nukleotid 84) genu. Následující primery (5' oligonukleotid CAG ACA TAT GCA TCA CCA TCA CCA TCA CGG GTT AGC (SEQ ID NO: 211) a 3' oligonukleotid CAG AGG TAC CTC AGC TCC TCC AGC ACA CTC TCT TC (SEQ ID NO: 212) pro vložení do 5' NdeI/3' KPN klonovacího místa vektoru. Karboxy-koncová část pmpD (SEQ ID NO: 184) byla exprimována jako 92 kda protein (SEQ ID NO: 192). Pro expresi a následné přečištění byly přidány další methionin, alanin a serin, které představují iniciační kodon a první dvě aminokyseliny z pET17b vektoru. Koncovka tvořená šesti histidiny za methioninem, alaninem a serinem je fúzovaná na 691. aminokyselinu (nukleotid 2073) genu. Následující oligonukleotidy (5' oligonukleotid CAG AGC TAG CCA TCA CCA TCA CCA TCA CGG TGC TAT TTC TTG CTT ACG TGG (SEQ ID NO: 213) a 3' oligonukleotid CAG AGG TAC TTn AAA AGA TCA ATC GCA ATC CAG TAT TCG (SEQ ID NO: 214) byly použity pro subklonování insertu do 5' NdeI/3' KPN klonovacího místa expresního vektoru. PmpE gen byl exprimován jako 106 kDa protein (SEQ ID NO: 183 s příslušnou aminokyselinovou sekvencí uvedenou v SEQ ID NO: 191). PmpE insert také postrádá přirozenou signální sekvenci. PCR amplifikace genu za podmínek dobře známých v oboru byla provedena za použití následujících
111 oligonukleotidových primerů: 5' oligonukleotidu CAG AGG ATC CAC ATC ACC ATC ACC ATC ACG GAC TAG CTA GAG AGG TTC (SEQ ID NO: 215) a 3' oligonukleotidu CAG AGA ATT CCT AGA ATC GCA GAG CAA TTT C (SEQ ID NO: 216) a amplifikovaný insert byl ligován do 5'
BamHI/3' EcoRI místa JA4304. Krátká nukleotidová sekvence, která je uvedena v SEQ ID NO: 217, byla isertována před iniciační kodon pro vytvoření sekvence podobné Kozákově sekvenci a pro znovuvytvoření HindiII místa. Exprimovaný protein obsahoval iniciační kodon a následujících 21 aminokyselin z pET17b expresního vektoru, t.j. MASMTGGQQMGRDSSLVPSSDP (SEQ ID NO: 218). Dále, před sekvencí uvedenou výše byla obsažena šesti-histidinová koncovka, která byla fúzovaná na 28. aminokyselinu (nukleotid 84) genu, což eliminuje hypotetický signální peptid. Sekvence uvedená v SEQ ID NO: 183 s příslušnou aminokyselinovou sekvencí uvedenou v SEQ ID NO: 191 neobsahují tyto další sekvence. PmpG gen (SEQ ID NO: 182, s příslušnou aminokyselinovou sekvencí uvedenou v SEQ ID NO; 190), byl PCR amplifikován za podmínek dobře známých v oboru za použití následujících oligonukleotidových primerů: 5' oligonukleotidu CAG AGG TAC CGC ATC ACC ATC ACC ATC ACA TGA TTC CTC AAG GAA TTT ACG (SEQ ID NO: 219) a 3' oligonukleotidu CAG AGC GGC CGC TTA GAA CCG GAC TTT ACT TCC (SEQ ID NO: 220) a byl ligován do 5' KPN/3' Notl místa expresního vektoru. Exprimovaný protein obsahoval další aminokyselinovou sekvenci na amino- konci, konkrétně MASMTGGQQNGRDSSLVPHHHHHH (SEQ ID NO: 221), která obsahuje iniciační kodon a další sekvenci z pET17b expresního vektoru. Pmpl gen (SEQ ID NO: 181, s příslušnou aminokyselinovou sekvencí uvedenou v SEQ ID NO: 189), byl PCR amplifikován za podmínek dobře známých v oboru za použití následujících oligonukleotidových primerů: 5' oligonukleotidu CAG AGC TAG CCA TCA CCA TCA CCA TCA CCT CTT TGG CCA GGA TCC C (SEQ ID NO: 222) a 3' oligonukleotidu CAG AAC TAG TCT AGA ACC TGT AAG TGG TCC (SEQ ID NO: 223) a byl ligován do 5' NheI/3' Spěl místa expresního vektoru. Exprimovaný protein velikosti 95 kDa obsahoval další β O 9 99 9
112
iniciační kodon a další alanin a serin z pET17b vektoru na aminokonci proteinu. Dále, na 21. aminokyseliny byla fúzovaná koncovka tvořená šesti histidiny, která eliminuje hypotetický signální peptid.
Klon 14H1-4 (SEQ ID NO: 56), identifikovaný za použití TCT-3 buněčné linie, obsahuje kompletní ORF pro TSA gen, thiol specifický arttioxidant - CT603 (CT603 ORF je homolog CPnO778 z C. pneumoniae). TSA otevřený čtecí rámec v klonu 14-H1-4 byl amplifikován tak, že exprimovaný protein obsahoval další methionin a koncovku tvořenou šesti histidiny (na amino-konci). Tento amplifikovaný insert byl subklonován do Nde/EcoRI míst pET17b vektoru. Po indukci tohoto klonu IPTG byl 22,6 kDa protein přečištěn Ni-NTA agarosovou afinitní chromatografií. Určená aminokyselinová sekvence pro 195 aminokyselinový ORF klonu 14-H1-4 kódující TSA gen je uvedena v SEQ ID NO: 65. Další analýza vedla k zisku kompletního klonu pro TSA gen, který byl označen jako CTL2-TSA-FL, s kompletní aminokyselinovou sekvencí uvedenou v SEQ ID NO: 92 .
Další pokusy vedly k zisku 10 dalších klonů, které byly identifikovány pomocí TCT-1 a TCT-3 T-lymfocytárních linií, jak je popsáno výše. Klony identifikované TCT-1 linií jsou: 16-D4-22, 17-C5-19, 18-C5-2, 20-G3-45 a 21-C7-66; klony identifikované TCT-3 linií jsou: 17-C10-31, 17-E2-9, 22-A1-49 a 22-B3-53. Klon
21-G12-60 byl rozpoznáván oběma T-lymfocytárními liniemi. Klon 16-D4-22 (SEQ ID NO: 119), identifikovaný pomocí TCT-1 linie, obsahuje 953 bp insert obsahující dva geny, části otevřeného čtecího rámce 3 (ORF3) a 0RF4 C.trachomatis plasmidu pro růst v savčích buňkách. Klon 17-C5-19 {{SEQ ID NO: 118) obsahuje 951 bp insert obsahující část ORF pro DT431, kódující clpP_l proteasu a část ORF pro CT430 (diaminopimelat epimerasu). Klon 18-C5-2 (SEQ ID NO: 117) je část ORF pro SI ribosomální protein s 446 bp • ···
113
insertem, který byl identifikován pomocí TCT-1 buněčné linie. Klon
20- G3-45 (SEQ ID NO: 116), identifikovaný pomocí TCT-1 linie, obsahuje 437 bp insert, který je částí pmpB genu (CT413). Klon
21- C7-66 (SEQ ID NO: 115), identifikovaný pomocí TCT-1 linie, obsahuje 995 bp insert, který kóduje část dnaK-like proteinu. Insert tohoto klonu se nepřekrývá s insertem TCT-3 klonu 11-H4-28 (SEQ ID NO: SEQ ID NO: 59)), který je částí dnaK genu CT396. Klon 17-C10-31 (SEQ ID NO: 114), identifikovaný pomocí TCT-3 linie, obsahuje 976 bp insert. Tento klon obsahuje část ORF pro CT858, proteasu obsahující IRBP a DHR domény. Klon 17-E2-9 (SEQ ID NO: 113) obsahuje část ORF dvou genů, CT611 a CT610, které jsou obsaženy v 1142 bp insertu. Klon 22-A1-49 (SEQ ID NO: 112) , identifikovaný pomocí TCT-3 linie, také obsahuje dva geny v 698 bp insertu. Část ORF pro CT660 (DNA gyrasa(gyrA_2)) je přítomen na horním řetězci, a kompletní ORF pro hypotetický protein
CT659 je přítomen na komplementáním řetězci. Klon 22-B3-53 (SEQ ID NO: 111), identifikovaný pomocí TCT-1 linie, obsahuje 267 bp insert, který k=oduje část ORF pro GroEL (CT110) . Klon 21-G12-60 (SEQ ID NO: 110), identifikovaný pomocí TCT-1 i TCT-3 buněčné linie, obsahuje 1461 bp insert, který obsahuje části ORF pro hypotetické proteiny CT875, CT229 a CT228.
Další chlamydiové antigeny byly získány vyšetřováním genomové expresní knihovny Chlamydia trachomatis (serovar LGV II) v Lambda-Screen-l vektoru (Novagen, Madison, WI) se s=rem shromážděným od jedinců infikovaných Chlamydiemi za použití technik dobře známých v oboru. Byly identifikovány následující imunoreaktivní klony a inserty obsahující chlamydiové geny byly sekvencovány: CTL2#1 (SEQ ID NO: 71); CTL2#2 (SEQ ID NO: 70); CTL2#3-5' (SEQ ID NO: 72; první určená genomová sekvence představující 5’ konec); CTL2#3-3' (SEQ ID NO: 73; druhá určená genomová sekvence představující 3' konec); CTL2#4 (SEQ ID NO: 53); CTL2#5 (SEQ ID NO: 69); CTL2#6 (SEQ ID NO: 68); CTL2#7 (SEQ ID NO:
• ··· • ··· ···· ··<
114
67); CTL2#8b (SEQ ID NO: 54); CTL2#9 (SEQ ID NO: 66); CTL2#10-5' (SEQ ID NO: 74; první určená genomová sekvence představující 5' konec); CTL2#10-3' (SEQ ID NO: 75; druhá určená genomová sekvence představující 3' konec); CTL2#ll-5' (SEQ ID NO: 45; první určená genomová sekvence představující 5’ konec); CTL2#ll-3' (SEQ ID NO: 4; druhá určená genomová sekvence představující 3' konec);
CTL2#12 (SEQ ID NO: 46); CTL2#16-5' (SEQ ID NO: 47); CTL2#18-5' (SEQ ID NO: 49; první určená genomová sekvence představující 5' konec); CTL2#18-3' (SEQ ID NO: 48; druhá určená genomová sekvence představující 3' konec); CTL2#19-5' (SEQ ID NO: 76; určená genomová sekvence představující 5' konec); CTL2#21 (SEQ ID NO:
50); CTL2#23 (SEQ ID NO: 51); a CTL2#24 (SEQ ID NO: 52).
Další antigeny Chlamydia trachomatis byly identifikovány serologickým expresním klonováním. Tyto pokusy využily séra shromážděného od několika jedinců infikovaných Chlamydiemi, jak bylo popsáno výše, ale kromě IgA protilátek byly jako sekundární protilátky použity také IgA a IgM protilátky. Klony získané tímto způsobem zesílily detekci antigenů rozpoznávaných v časné imunitní reakci na chlamydiovou infekci, t.j. ve slizniční imunitní reakci. Byly identifikovány následující imunoreaktivní klony a inserty obsahující chlamydiové geny byly sekvencovány: CTL2gam-l (SEQ ID NO: 290); CTL2gam-2 (SEQ ID NO: 289); CTL2gam-5 (SEQ ID NO: 288); CTL2gam-6-3' (SEQ ID NO: 287; druhá určená genomová sekvence představující 3’ konec); CTL2gam-6-5' (SEQ ID NO: 286; první určená genomová sekvence představující 5' konec); CTL2gam-8 (SEQ ID NO: 285); CTL2gam-10 (SEQ ID NO: 284); CTL2gam-13 (SEQ ID NO: 283); CTL2gam-15-5’ (SEQ ID NO: 282 druhá určená genomová sekvence představující 3' konec); CTL2gam-15-5' (SEQ ID NO: 281; první určená genomová sekvence představující 5' konec); CTL2gam-17 (SEQ ID NO: 280) ; CTL2gam-18 (SEQ ID NO: 279) ; CTL2gam-21 (SEQ ID NO: 278); CTL2gam-23 (SEQ ID NO: 277); CTL2gam-26 (SEQ ID NO: 275); CTL2gam-27 (SEQ ID NO: 274); CTL2gam-28 (SEQ ID NO: 273);
»· ·« • ·
Φ ΦΦΦ
115
CTL2gam-30-5' (SEQ ID NO: 272 druhá určená genomová sekvence představující 3’ konec); CTL2gam-30-5’ (SEQ ID NO: 271; první určená genomová sekvence představující 5’ konec).
Příklad 2: Indukce proliferace T-lymfocytů a produkce interferonu-gamma antigeny Chlamydia trachomatis
Schopnost rekombinantních antigenů Chlamydia trachomatis indukovat proliferaci T-lymfocytů a produkci interferonu gamma byla určena následujícím způsobem.
Proteiny se indukovaly IPTG a přečistily se afinitní chromatografií na Ni-NTA agarose (Webb et al., J. Immunology 157: 5034-5041, 1996). Přečištěné polypeptidy se potom vyšetřovaly na schopnost indukovat proliferaci T-lymfocytů v přípravcích PBMC. PBMC od pacientů s C.trachomatis, stejně jako od normálních dárců, o kterých je známo, že jejich T-lymfocyty proliferují v reakci na chlamydiové antigeny, se kultivovaly v mediu obsahujícím RPMI 1640 doplněné 10% lidským sérem a 50 ug/ml gentamycinu. Přečištěné polypeptidy se přidaly dvojmo v koncentracích 0,5 až 10 ug/ml. Po 6 dnech kultivace v 96-jamkových plotnách s oblým dnem v objemu 200 ul se z každé jamky odebralo 50 ul media za účelem stanovení koncentrace IFN-gamma, jak je popsáno dále. Plotny se potom pulsovaly 1 uCi/jamku tritiovaného thymidinu po dalších 18 hodin a potom se vyhodnocovalo vychytávání thymidinu za použití plynového scintilačního detektoru. Frakce, které vedly k proliferaci - v obou provedeních - vyšší než trojnásobné než je proliferace pozorovaná u buněk kultivovaných v samotném mediu, se považovaly za pozitivní.
Interferon gamma se měřil pomocí ELISA. ELISA plotny se potáhly myší monoklonální protilátkou namířenou proti lidskému IFN-gamma (PharMingen, San Diego, CA) v PBS během 4 hodin při teplotě f ,
6 «· · • » • ·· ·
116 místnosti. Jamky se potom blokovaly PBS obsahujícím 5% (hmot./obj.) odtučněného mléka během 1 hodiny při teplotě místnosti. Plotny se potom šestkrát promyly v PBS/0,2% Tween 20 a vzorky se naředily 1:2 v kultivačním mediu a v ELISA plotně se inkubovaly přes noc při teplotě místnosti. Plotny se znovu promyly a do každé jamky se přidalo polyklonální králičí sérum proti lidskému IFN-gamma naředěné 1:3000 v PBS/10% normálním kozím séru. Plotny se potom inkubovaly po dobu 2 hodin při teplotě místnosti, promyly se a přidal se anti-králičí IgG konjugovaný na křenovou peroxidasu (Sigma Chemical Co, St. Louis, MO) v ředění 1:2000 v PBS/5% odtučněném sušeném mléku. Po dalších 2 hodinách inkubace při teplotě místnosti se plotny promyly a přidal se TMB substrát. Reakce se ukončila za 20 minut přidáním IN kyseliny sírové.
Optická densita se určila při 450 nm za použití 570 nm jako referenční vlnové délky. Frakce, které v obou provedeních dávaly OD dvakrát vyšší než je průměrná OD pro buňky kultivované pouze v mediu, plus 3 standardní odchylky, byly považovány za pozitivní.
Za použití výše uvedeného způsobu bylo zjištěno, že rekombinantní 1B1-66 protein (SEQ ID NO: 5), stejně jako dva syntetické peptidy odpovídající aminokyselinovým zbytkům 48-67 (SEQ ID NO: 13; označená jako 1-B1-66/48-67) a 58-77 (SEQ ID NO: 14, označená jako 1B1-66/58-77), v příslušném pořadí, SEQ ID NO:
5, indukují proliferaci a produkci IFN-gamma v T-lymfocytární linii specifické pro Chlamydie použité při vyšetřování genomové knihovny C. trachomatis LGV II.
Další pokusy odhalily epitop C. trachomatis specifický pro T-lymfocyty v ribosomálním S13 proteinu. Za použití standardní techniky mapování epitopů dobře známé v oboru byly dva T-lymfocytární epitopy v ribosomálním S13 proteinu (rS13) identifikovány v T-lymfocytární linie specifické pro Chlamydie od dárce CL-8 (T-lymfocytární linie TCL-8 EB/DC). Obr. 8 ukazuje, že íe ·βββ 9 9 ·
117 první peptid, rS13 1-20 (SEQ ID NO: 106) je 100% identický s příslušnou sekvencí C. pneumoniae, což vysvětluje zkříženou reaktivitu T-lymfocytární linie k rekombinantní C. trachomatis a C. pneumoniae-rS13. Odpověď na druhý peptid rS13-56-77 (SEQ ID NO: 108) je specifická pro C. trachomatis, což naznačuje, že odpověď na rS13 u tohoto asymptomatického zdravého dárce byla vyvolána expozicí C. trachomatis a nikoliv C. pneumoniae nebo jakýmkoliv j iným mikrobem.
Jak je popsáno v příkladu 1, klon 11-C12-91 (SEQ ID NO: 63) identifikovaný za použití TCP-21 buněčné linie, obsahuje 269 bp insert, který je součástí OMP2 genu (CT443) a vykazuje homologii s 60 kDa proteinem zevní membrány bohatým na cystein od C. pneumoniae, který se označuej jako OMCB. Pro další definování reaktivních epitopů se provedlo epitopové mapování za použití série překrývajících se peptidú a imunotestu popsaného výše. Stručně, proliferační odpovědi byly stanoveny stimulací 2,5 x 104 TCP-21 T-lymfocytů za přítomnosti 1 x 104 dendritických buněk odvozených od monocytů buď neinfekčními elementárními tělísky od C.. trachomatis a C. pneumoniae, nebo peptidy odvozené od proteinové sekvence C. trachomatis nebo C. pneumoniae OMCB peptidú (0,1 ug/ml). TCP-21 T-lymfocyty odpovídají na epitopy
CT-OMCB#167-186, CT-OMCB#171-190, CT-OMCB#171-186 a v menším rozsahu na CT-OMCB#175-186 (SEQ ID NO: 249-252, v příslušném pořadí). Významné je, že TCP-21 T-lymfocytární linie také proliferuje v reakci na homologní peptid C. pneumoniae CP-OMCB#171-186 (SEQ ID NO: 253), kde tato proliferace je stejná nebo lepší než proliferace v reakci na peptidy C. trachomatis. Aminokyselinová substituce v pozici 2, t.j. Asp za Glu, a v pozici 4, t.j. Cys za Ser, nemění proliferativní reakce T-lymfocytů a tak dokazuje, že tento epitop je zkříženě reaktivní epitop mezi C. trachomatis a C. pneumoniae.
9 » «φ β 6 fc β * · · · · ·
Pro další definování epitopu popsaného výše byla další T-lymfocytární linie, TCT-3, použita v pokusech o mapování epitopů. Imunotesty byly provedeny způsobem popsaným výše s tou výjimkou, že byly testovány pouze epitopy C. trachomatis. T-lymfocyty proliferovaly v reakci na dva peptidy, CT-OMCB#152-171 a CT-OMCB#157-176 (SEQ ID NO: 246 a 247, v příslušném pořadí), což definovalo další imunogenní epitop v proteinu zevní membrány bohatém na cystein C. trachomatis.
Klon 14-H1-4 (SEQ ID NO: 56, s odpovídající úplnou aminokyselinovou sekvencí uvedenou v SEQ ID NO: 92) , byl identifikován pomocí TCT-3 buněčné linie v CD4 T-lymfocytárním expresním klonovacím systému popsaném výše a bylo prokázáno, že obsahuje kompletní ORF genu pro thiol-specifické antioxidační činidlo (CT603), označované jako TSA. Byly provedeny imunotesty pro epitopové mapování, jak byly popsány výše, za účelem dalšího definování epitopu. TCT-3 T-lymfocytární linie vykazovala silnou proliferaci v reakci na překrývající se peptidy CT-TSA#96-115, CT-TSA#101-120 a CT-TSA#106-125 (SEQ ID NO: 254-256, v příslušném pořadí) , což prokázalo imunoreaktivní epitop v genu pro thiol-specifické antioxidační činidlo C. trachomatis serovaru LGV II.
Příklad 3: Příprava syntetických polypeptidů.
Polypeptidy mohou být syntetizovány na Millipore 9050 peptidovém syntezátoru za použití FMOC chemikálií s HPTU (O-benzotriazol-Ν,Ν,Ν1 ,N' -tetramethyluroniumhexafluorfosfatové) aktivace. Gly-Cys-Gly sekvence může být navázána na amino- konec peptidu za zisku způsobu pro konjugování nebo značení peptidu. Štěpení peptidu z pevného nosiče může být provedeno za použití následující štěpící směsi: kyselina trifluoroctová: ethandithiol: thioanisol: voda: fenol (40:1:2:2:3) Po štěpení po dobu 2 hodin r « -119 mohou být peptidy vysráženy chladným methyl-terč.butyl-etherem. Peptidové pelety mohou být potom rozpuštěny ve vodě obsahující 0,1% kyselinu trifluoroctovou (TFA) a mohou být lyofilizovány před přečištěním na C18 HPLC s reverzní fází. Gradient 0-60% acetonitrilu (obsahující 0,1% TFA) ve vodě (obsahující 0,1% TFA) může být použit pro eluci peptidů. Po lyofilizaci čistých frakcí mohou být peptidy charakterizovány pomocí hmotnostní spektrometrie s elektrosprayem a aminokyselinovou analýzou.
Příklad 4: Izolace a charakterizace DNA sekvencí kódujících chlamydiové antigeny za použití retrovirových expresních systémů a následné imunologické analýzy
Genomová knihovna Chlamydia trachomatis LGV II byla připravena omezeným trávením za použití BamHI, BglII, BstYi a Mbol restrikčních enzymů. Fragmenty získané restrikčním trávením byly potom ligovány do BamHI místa retrovirových vektorů pBIB-KSl,2,3. Tato sada vektorů byla modifikována tak, aby obsahovala Kosakovo translační iniciační místo a stop kodony pro umožnění exprese proteinů z krátkých fragmentů genomové DNA, jak je uvedeno na obr. 2. Byly připraveny DNA soubory z 80 klonů a byly transfektovány do retrovirově sbalovací linie Phoenix-Ampho, jak je popsáno v Pear, W.S., Scott, M.L. a Nolan, G.P., Generation of High Titre, Hepler free Retroviruses by Transient Transfection. Methods in Molecular Medicine: Gene Therapy Protocols, Humana Press, Totowa,, NJ, str. 41-57. Chlamydiová knihovna v retrovirově formě byla potom přenesena do P815 buněk exprimujících H2-Ld, které byly potom použity jako cílové buňky pro stimulaci T-lymfocytární buněčné linie specifické pro antigen.
Pro Chlamydie-specifická, myší H2° restrihovaná CD8+ T-lymfocytární linie byla expandována v kultuře opakovanými stimulacemi pomocí ozářených J774 buněk infikovaných chlamydiemi a • · ··«· ·« » · · —· · · »* ·»··
120 ozářených syngenních buněk sleziny, jak je popsáno ve Starnbach,
Μ. , J. Immunol. 153: 5183, 1994. Tato T-lymfocytární linie specifická pro chlamydie byla použitapro vyšetřování chlamydiové genomové expresní knihovny exprimované retrovirem-transdukovanými P815 buňkami. Pozitivní DNA soubory byly identifikovány detekcí produkce IFN-gamma za použití ELISPOT analýzy (viz Lalvani et al., J. Experimental Medicine 186: 859-865, 1997).
Dva pozitivní soubory, označené jako 2C7 a 2E10, byly identifikovány IFN-gamma ELISPOT testem. Stabilní transduktanty P815 buněk ze souboru 2C7 byly klonovány limitním ředěním a jednotlivé klony byly selektovány podle jejich kapacity vyvolat produkci CTL linie specifické pro Chlamydie. Z tohoto
Skríningového procesu byly selektovány čtyři pozitivní klony, označené jako 2C7-8, 2C7-9, 2C7-19 a 2C7-21. Podobně byl dále vyšetřován pozitivní soubor 2E10, což vedlo k zisku dalšího pozitivního klonu, který obashuje tři inserty. Tři inserty jsou fragmenty CT016, tRNA synthasy a clpX genů (SEQ ID NO: 268-270, v příslušném pořadí).
Transgenní DNA z těchto čtyř pozitivních 2C7.8 klonů byly amplifikovány PCR za použití pBIB-KS specifických primerů pro selektivní amplifikaci insertu chlamydiové DNA. Amplifikované fragmenty byly přečištěny na gelu a sekvencovány. Jeden imunoreaktivní klon, 2C7-8 (SEQ ID NO: 15, s předpokládanou aminokyselinovou sekvencí uvedenou v SEQ ID NO: 32), je 160 bp fragment s homologií k nukleotidům 597304-597145 Chlamydia trachomatis, serovaru D (NCBI, BLAST vyhledávání; SEQ ID NO: 33, s předpokládanou aminokyselinovou sekvencí uvedenou v SEQ ID NO:
34). Sekvence klonu 2C7-8 se mapuje do dvou domnělých otevřených čtecích rámců z regionu s vysokou homologií popsanou bezprostředně výše, a konkrétně, jeden z těchto dvou domnělých otevřených čtecích rámců, který se skládá z 298 aminokyselinového fragmentu • φ φ « φ φ • ··· ·· ·* » φ φ • ·Φ· » ·· ·
121 (SEQ ID ΝΟ: 16, s předpokládanou aminokyselinovou sekvencí uvedenou v SEQ ID NO: 17) vykazoval imunologickou aktivitu.
Kompletní klonování 298 aminokyselinového fragmentu {označeného jako CT529 a/nebo Čapl gen) ze serovaru L2 bylo získáno PCR amplifikací za použití 5'-ttttgaagcaggtaggtgaatatg (kódující) (SEQ ID NO: 159) a 5'-ttaagaaatttaaaaaatccctta (reverzní) (SEQ ID NO: 160) primerů, a za použití přečištěné L2 genomové DNA C. trachomatis jako templátu. Tento PCR produkt byl přečištěn na gelu, byl klonován do pCRBlunt (Invitrogen, Carlsbad, CA) pro sekvencování a potom byl subklonován do EcoRI místa pBIB-KMS, derivátu pBIB-KS pro expresi. Homolog CT529 Chlamydia pneumoniae je uveden v SEQ ID NO: 291, s příslušnou aminokyselinovou sekvencí uvedenou v SEQ ID NO: 292.
Kompletní DNA kódující různé CT529 serovary byly amplifikovány z bakteriálních lyzátů obsahujících 105 IFU, za použití popsaného způsobu (Denamur, E., C. Sayada, A. Souriau, J. Orfila, A. Rodolakis, and J. Elion, 1991, J. Gen. Microbiol. 137: 2525). Následující serovary byly amplifikovány popsaným způsobem: Ba (SEQ ID NO: 134, s příslušnou aminokyselinovou sekvencí uvedenou v SEQ ID NO: 135); E (BOUŘ) a E(MTW447) (SEQ ID NO: 122, s příslušnou aminokyselinovou sekvencí uvedenou v SEQ ID NO: 123); F(NI1) (SEQ ID NO: 128, s příslušnou předpokládanou aminokyselinovou sekvencí uvedenou v SEQ ID NO: 129); G (SEQ ID NO: 126, s příslušnou předpokládanou aminokyselinovou sekvencí uvedenou v SEQ ID NO:
127); Ia (SEQ ID NO: 124, s příslušnou předpokládanou aminokyselinovou sekvencí uvedenou v SEQ ID NO: 125) ; LI (SEQ ID NO: 130, s příslušnou předpokládanou aminokyselinovou sekvencí uvedenou v SEQ ID NO: 131); L3 (SEQ ID NO: 132, s příslušnou předpokládanou aminokyselinovou sekvencí uvedenou v SEQ ID NO:
133); I (SEQ ID NO: 263, s příslušnou předpokládanou aminokyselinovou sekvencí uvedenou v SEQ ID NO: 264) ; K (SEQ ID φφ ·«« « φ φ β íft* φ
φ ····«··
122 ♦♦ φφ φ φ φ * φφφφ
• ·
ΝΟ: 265, s příslušnou předpokládanou aminokyselinovou sekvencí uvedenou v SEQ ID NO: 266); a MoPn (SEQ ID NO: 136, s příslušnou předpokládanou aminokyselinovou sekvencí uvedenou v SEQ ID NO:
137) . PCR reakce byly provedeny s Advantage Genomic PCR kitem (Clontech, Palo Alto, CA) za použití primerů specifických pro DNA serovaru L2 (externí k ORF) . Sekvence primerů byly
5'-ggtataatatctctctaaattttg (kódující - SEQ ID NO: 161) a
5'-agataaaaaaggctgtttg' (reverzní - SEQ ID NO: 162), s výjimkou MoPn, který vyžadoval 5'-ttttgaagcaggtaggtgaatatg (kódující - SEQ ID NO: 163) a 51-tttacaataagaaaagctaagcactttgt (reverzní - SEQ ID NO: 164). DNA amplifikovaná PCR byla přečištěna Qiaquick PCR purufication kitem (Qiagen, Valencia, CA) a byla klonována do pCR2.1 (Invitrogen, Carlsbad, CA) pro sekvencování.
Sekvencování DNA získané z insertů amplifikovaných PCR od imunoreaktivních klonů bylo provedeno na automatizovaném sekvenátoru (ABI 337) za použití pBIB-KS specifického kódujícího primerů 5’-ccttacacagtcctgctgac (SEQ ID NO: 165) a reverzního primerů 3'-gtttccgggccctcacattg (SEQ ID NO: 166). PCRBlunt klonovaná DNA kódující CT529 serovaru L2 a pCR2.1 klonovaná DNA kódující CT529 serovaru Ba, E(BOUR), E(MTW447), F (Nil), G, la, K, LI, L3 a MoPn byly sekvencovány za použití T7 promotoru primerů a univerzálních M13 kódujících a M13 reverzních primerů.
Pro stanovení toho, zda tyto domnělé otevřené čtecí rámce (SEQ ID NO: 16 as 20) kódují protein s imunologickou funkcí, byly syntetizovány překrývající se peptidy (délky 17-20 aminokyselin) pokrývající délku dvou otevřených čtecích rámců, jak je popsáno vpříkladu 3. Standardní test uvolňování chrómu byl použit pro stanovení procenta specifické lýzy peptidem pulsovaných H2a restrihovaných cílových buněk. V tomto testu byly podíly P815 buněk (H2Ů) značeny při teplotě 37 °C po dobu jedné hodiny 100 uCi 5XCr za přítomnosti nebo nepřítomnosti 1 ug/ml uvedeného peptidu.
·· ·♦
9*9 <9 9 9 · ·
123
Po této inkubaci byly značené P815 buňky promyty pro odstranění nadbytku slCr a peptidů a potom byly umístěny dvojmo na mikrokultivační plotny v koncentraci 1000 buněk/jamku. Efektorové CTL (CD8 T-lymfocyty specifické pro Chlamydie) byly přidány v uvedených poměrech efektor:cíl. Po 4 hodinové inkubaci byly odebrány supernatanty a gamma kamerou bylo měřeno uvolňování 51Cr do supernatantu. Dva překrývající se peptidy z 298 aminokyselinového otevřeného čtecího rámce specificky stimulovaly CTL linii. Peptidy uvedené v SEQ ID NO: 138-156 byly syntetizovány a představují translaci L2 homologu otevřeného čtecího rámce pro CT529 (Čapl gen) serovaru D a 216 aminokyselinový otevřený čtecí rámec, jak je uvedeno na obr. 3, peptidy CtC7.8-12 (SEQ ID NO: 18, též označovaný jako Capl#132-147, SEQ ID NO: 139) a CtC7.8-13 (SEQ ID NO: 19, též označovaný jako Capl#138-155, SEQ ID NO: 140), byly schopné vyvolat 38 až 52% specifickou lýzu, v příslušném pořadí, při poměru efektor:cíl 10:1. Významné je, že přesah mezi těmito dvěma peptidy obsahoval předpokládaný H2Ů (Ků a L'1) vazebný peptid. 10 aminokyselinový peptid byl syntetizován tak, aby odpovídal této přesahující sekvenci (SEQ ID NO: 31) a bylo zjištěno, že generuje silnou imunitní odpověď v anti-chlamydiové CTL linii v Elispot testu. Významné je to, že prohledávání nejnovější GenBank databáze neodhalilo žádné proteiny, které by byly dříve přisouzeny tomuto genu. Proto domnělý otevřený čtecí rámec kódující klon 2C7-8 (SEQ ID NO: 15) definuje gen, který zahrnuje antigen od Chlamydie, který je schopný stimulovat CD8+ T-lymfocyty specifické pro antigen MHC-I restrihovaným způsobem, což dokazuje, že tento antigen může být použit pro vývoj vakcíny proti Chlamydiím.
Pro potvrzení těchto výsledků a pro další mapování epitopů byly připraveny zkrácené peptidy (SEQ ID NO: 138-156) a byly testovány na rozpoznávání T-lymfocyty v IFN-gamma ELISPOT testu. Zkrácení Serl39 (Capl#140-147, SEQ ID NO: 146) nebo Leu 147 (Capl#138-146,
124
SEQ ID NO: 147) rušilo rozpoznávání T-lymfocyty. Tyto výsledky naznačují, že 9-merový peptid Capl#139-147 (SFIGGITYL, SEQ ID NO: 145) je minimální epitop rozpoznávaný T-lymfocyty specifickými pro Chlamydie.
Srovnání sekvencí Čapl (TC529) od vybraných serovarů C. trachomatis (SEQ ID NO: 121, 123, 125, 127, 129, 131, 133, 137 a 139) ukázalo, že jedna aminokyselinová odlišnost se nachází v pozici 2 navrženého epitopu. Homologický peptid serovarů D je SIIGGITYL (SEQ ID NO: 168). Byla srovnávána schopnost SFIGGITYL a SIIGGITYL umožnit rozpoznávání cílových buněk T-lymfocyty specifickými pro Chlamydie. Sériová ředění každého peptidů byla inkubována s P815 buňkami a byla testována na rozpoznávání T-lymfocyty v testu uvolňování slCr, jak byl popsán výše. T-lymfocyty specifické pro Chlamydie rozpoznávají peptid serovarů L2 při minimální koncetraci 1 nM a peptid serovarů D při minimální koncentraci 10 nM.
Další pokusy prokázaly, že Capl#139-147 specifický T-lymfocytární klon rozpoznává buňky infikované C. trachomatis.
Pro potvrzení toho, že Capli3g_i47 je přítomen na povrchu buněk infikovaných Chlamydiemi byly Balb-3T3 (H-2^) buňky infikovány C. trachomatis serovarů L2 a byly testovány pro určení toho, zda jsou tyto buňky rozpoznávány CD8+ T-lymfocytárním klonem specifickým pro Capl#139-147 epitop (SEQ ID NO: 145). T-lymfocytární klon specifický pro Capl#139-147 epitop byl získán limitním ředěním T-lymfocytární linie 69. T-lymfocytární klon specificky rozpoznává buňky infikované Chlamydiemi. V těchto pokusech byly cílovými buňkami buňky infikované Chlamydiemi (pozitivní kontrola) nebo neinfikované Balb/3T3 buňky, vykazující 45%, 36% a 30% specifickou lýzu při poměrech efektorových a cílových buněk 30:1, 10:1 a 3:1, v příslušném pořadí; nebo buňky P815 potažené Capl#139-147 epitopem (SEQ ID NO: 145) nebo neošetřené P815 buňky, vykazující '99 «9··
9 '9 ,· ·9·· 9 • ' · .9 9 • · 9
V· · · · Λ· .9 9
9 • 9 9
9,u9 · ·......—
9 •
9 9 9
9
9 MM
125
83%, 75% a 58% specifickou lýzu při poměrech efektorových a cílových buněk 30:1, 10:1 a 3:1, v příslušném pořadí (negativní kontroly vykazovaly menší než 5% lýzu ve všech případech). Tato data naznačují, že epitop je přítomen během infekce.
Pokusy in vivo prokázaly, že T-lymfocyty specifické pro Capl#139-147 epitop jsou aktivovány během infekce myši C. tachomatis. Pro stanovení toho, zda C. tachomatis aktivuje odpověď T-lymfocytů specifických pro Capl#139-147 epitop, byly myši infikovány i.p. 10θ IFU C. tachomatis serovaru L2 . 2 týdny po i nfekci byly myši utraceny a buňky sleziny byly stimulovány na ozářených syngenních buňkách sleziny pulsovaných Capl#139-147 peptidovým epitopem. Po 5 dnech inkubace byly kultury použity ve standardním testu uvolňování SiCr pro určení toho, zda byly v kultuře přítomny T-lymfocyty specifické pro Capl#139-147 epitop. Konkrétně, buňky sleziny od myši imunizované C. trachomatis serovaru L2 nebo od kontrolní myši, které byl injekčně podán PBS, po 5 dnech kultivace se syngenními buňkami sleziny potaženými Capl#139-147 peptidem a CD8+ T-lymfocyty schopnými specificky rozpoznávat Capl#139-147 epitop, dávaly 73%, 60% a 32% specifickou lýzu při poměru efektorových a cílových buněk 30:1, 10:1 a 3:1, v příslušném pořadí. Kontrolní myši měly procento lýzy přibližně 10% při poměru cílových a efektorových buněk přibližně 30:1 a tato lýza se rovnoměrně snižovala při snižování poměru efektorových a cílových buněk. Cílové buňky byly P815 buňky potažené Capl#139-147 peptidem nebo nepotažené P815 buňky. Tato data naznačují, že T-lymfocyty specifické pro Capl#139-147 peptid jsou aktivovány během infekce,myši C. trachomatis.
Lokalizace Ct529
Byly provedeny pokusy demonstrující to, že Ct529 (zde označovaný jako Cap-1) se lokalizuje do inklusní membrány buněk ’·· «99« · ♦ • 9·· • · 1 ·' • 9 '·>· · ·*« • 9 '· 9 · 9 ···· < 9*9 ’ΐ · • 99 9 9 ··· ·· ·· ·« ·«
126 infikovaných C. trachomatis a není asociován s elementárními tělísky nebo retikulačními tělísky. Jak bylo popsáno výše, byl Cap-1 identifikován jako produkt Chlamydií, které stimulují CD8+ CTI. Tyto CTL jsou protektivní v myším modelu infekce, což činí z Cap-1 dobrý kandidát na vakcínu. Dále, protože jsou tyto CTL MHC restrihované, musí mít Cap-1 gen přístup do cytosolu infikovaných buněk, což může být jedinečnou charakteristikou specifických chlamydiových genových produktů. Proto může být určení buněčné lokalizace genových produktů užitečné pro charakterizaci Cap-1 jako kandidáta pro vakcinaci. Pro detekci intracelulární lokalizace Cap-1 se králičí polyklonální protilátky namířené proti rekombinantnímu polypeptidu obsahujícímu N-koncových 125 aminokyselin Cap-1 (SEQ ID NO: 305, s aminokyselinovou sekvencí zahrnující N-koncovou 6-His koncovku uvedenou v SEQ ID NO: 304) použity pro barvení McCoy buněk infikovaných Chlamyidií.
Králičí anti-Cap-1 polyklonální protilátky byly získány hyperimunizací králíků rekombinantním polypeptidem, rCt529cl-125 (SEQ ID NO: 305) obsahujícím N-koncovou část Cap-1. Rekombinantní rCt529el-125 protein byl získán z E. coli transformované pET expresním plasmidem (jak je popsáno výše) kódujícím nukleotidy 1-375 kódující N-koncové aminokyseliny 1-125 Cap-1. Rekombinantní protein byl přečištěn Ni-NTA za použití technik dobře známých v oboru. Jako pozitivní kontrolní antisérum se použilo polyklonální antisérum namířené proti elementárním tělískům připravené imunizací králíků přečištěnými elementárními tělísky C. trachomatis (Biodesign, Sacco, Maine). Pre-imunní sérum získané od králíků před imunizací Cap-1 polypeptidem se použilo jako negativní kontrola.
Imunocytochemické vyšetření se provedlo na monovrstvách McCoy buněk kultivovaných na skleněných krycích sklíčkách inokulovaných buď C. trachomatis serovarem L2, nebo C. psitacci kmenem 6BC, v ··. ···* ·· ·· »· ···· • Ι4· .. . « ___,. .........
127 koncentraci ΙΟ6 IFU (jednotek vytvářejících inkluse) na ml. Po 2 hodinách se medium aspirovalo a nahradilo se čerstvím RP-10 ediem doplněným cykloheximidem (1.0 ug/ml). Infikované buňky se inkubovaly v 7% CO2 po dobu 24 hodin a fixovaly se aspirací media, vypláchnutím buněk jednou PBS a fixací v methanolu po dobu 5 minut. Pro barvení na antigen se fixovaná monovrstva buněk promyla PBS a provedla se inkubace při 37 °C po dobu 2 hodin s 1:100 ředěními specifického nebo kontrolního antiséra. Buňky se propláchly PBS a inkubovaly se po dobu 1 hodiny s fluoresceinem isothiokyanatanem (FITC)-značeným anti-králičím IgG (KPL, Gaithersburg) a barvily se Evansovou modří (0,05%) v PBS. Fluorescence se pozorovala za použití 100X objektivu (Zeiss epifluorescenční mikroskop) a vyfotografovala se (Nikon UFX-11A kamera).
Výsledky tohoto pokusu ukazují, že Cap-1 se lokalizuje do inklusní membrány buněk infikovaných C. trachomatis. Protilátka specifická pro Cap-1 značkovala inklusní membrány buněk infikovaných C. trachomatis, ale ne chlamydiové elementární tělíska obsažaná v těchto inklusích nebo uvolněná během procesu fixace. Naopak, protilátka proti elementárním tělískům jasně značila bakteriální tělíska, nejen v inklusích, ale i ta, která byla uvolněna během procesu fixace. Specificita anti-Cap-1 protilátky je demonstrována skutečností, že nebarví buňky infikovaná C. psittaci. Specificita Cap-1 značení je také prokázána nepřítomností reaktivity v preimuním séru. Tyto výsledky naznačují, že Cap-1 je uvolňována z bakterií a asociuje se s chlamydiovou inklusní membránou. Proto je Cap-1 genový produkt, který může být užitečný pro stimulaci CD8+ T-lymfocyt při vývoji vakcíny proti infekcím způsobeným chlamydiemi.
Význam Cap-1 genu jako potenciálního CTL antigenů ve vakcíně proti chlamydiovým infekcím je dále ilustrován dvěma dalšími
9999 9 · • 44· • · >·····>
99
99
-9 ···· • · 4 4 ·· ·· »«·· • 9 9 * * — ·.....
·· 4 '· · · 4
4·
128 sériemi pokusů. Nejprve bylo prokázáno, že CTL specifické pro MHC-I epitop Cap-1 CT529#138-147 peptid C. trachomatis (SEQ ID NO: 144) jsou indukovány na vysokou frekvenci během přirozené infekce. Konkrétně, Balb/C myši byly naočkovány 106 IFU C. trachomatis, serovaru L2. Po 2 týdnech se odebraly sleziny a provedla se kvantifikace pomocí Elispot analýzy na počet buněk secernujících IFn-gamma v reakci na buňky prezentující antigen pulsované Cap-I#138-147 peptidem. Ve dvou pokusech byl počet buněk secernujících IFN-gama v 10s splenocytů přibližně 1% všech CD8+ T-lymfocytů. Tato vysoká frekvence CD8+ CTL odpovídajících na MHC-1 epitop (Cap-1 CT529#138-147 peptid) naznačuje, že Cap-1 je při infekci vysoce imunogenní.
Výsledky z druhé série pokusů ukazují, že Cap-1 protein je po infekci téměř okamžitě detekovatelný v cytosolu hostitelské buňky. Toto je ukázáno na časovém průběhu prezentace Cap-1 CT529#138-147 peptidu. Stručně, 3T3 buňky se infikovaly C. trachomatis serovaru L2 po různou dobu a potom se testovaly na rozpoznávání CTL specifickými pro Cap-1 CT529#138-147 peptid. Výsledky ukazují, že 3T3 buňky infikované C. trachomatis jsou cílem rozpoznávání CTL specifickými pro antigen již za 2 hodiny po infekci. Tyto výsledky ukazují, že Cap-1 je časný protein syntetizovaný při -vývoji elementárních tělísek C. trachomatis na retikulární tělíska. CD8+ CTL imunitní reakce namířená proti genovému produktu exprimovanému časně při infekci může být účinná ve vakcíně proti chlamydiovým infekcím.
Příklad 5: Vyvolání protilátkové a T-lymfocytámí odpovědi u myší imunizovaných chlamydiovými antigeny
Testy imunogenicity byly provedeny pro stanovení protilátkové a CD4+ T-lymfocytární odpovědi u myší imunizovaných buď přečištěným SWIB, nebo S13 proteinem připravenými s Montanide adjuvans, nebo
• · • · · · • · · ·· ····
DNA imunizací pcDNA-3 expresními vektory obsahujícími DNA sekvence pro SWIB nebo S13. SWIB je také označován jako klon 1-B1-66 (SEQ ID NO: 1, s odpovídající aminokyselinovou sekvencí uvedenou v SEQ ID NO: 5), a S13 ribosomální protein je také označován jako klon 10-C10-31 (SEQ ID NO: 4, s odpovídající aminokyselinovou sekvencí uvedenou v SEQ ID NO: 12) . V prvním pokusu byly skupiny tří C57BL/6 myší imunizovány dvakrát a byla sledována protilátková a CD4+ T-lymfocytární odpověď. DNA imunizace byla provedena intradermálně na bázi ocasu a polypeptidové imunizace byly provedeny podkožně. Výsledky standardního testu inkorporace 3H v buňkách sleziny od imunizovaných myší ukázaly silnou proliferativní odpověď ve skupině imunizované přečištěným rekombinantním SWIB polypeptidem (SEQ ID NO: 5). Další analýzy v testech na indukci cytokínů, jak byly popsány výše, prokázaly, že skupina imunizovaná SWB polypeptidem produkovala měřitelné IFN-gamma a IL-4 odpovědi. Potom byly provedeny ELISA testy pro určení převládajícího izotypu v protilátkové odpovědi ve skupině imunizované SWIB polypeptidem. Obr. 4 ilustruje to, že skupina imunizovaná SWIB měla protilátkovou odpověď především IgGl.
Ve druhém pokusu byly C3H myši imunizované třikrát 10 ug přečištěného SWIB proteinu (který je označován také jako klon 1-B1-66, SEQ ID NO: 5), který byl připraven buď v PBS nebo Montanide, ve 3 týdenních intervalech, a odběry byly provedeny dva týdny po třetí imunizaci. Titry protilátek proti SWIB proteinu byly určeny standardním ELISA testem známým v oboru a bylo zjištěno, že SWIB protein připravený s Montanide adjuvans indukoval silnou protilátkovou odpověď. Proliferační reakce T-lymfocytů byla určena pomocí XTT testu (Scudiero et al., Cancer Research, 1988, 48: 4827). Jak je uvedeno na obr. 5, splenocyty od myší imunizovaných SWIB polypeptidem plus Montanide indukovaly proliferační odpověď specifickou pro antigen. Dále, kapacita splenocytů od imunizovaných myší secernovat IFN-gamma v reakci na β β β βββ φ φφφ
130 rozpustný rekombinantní SWIB polypeptid byla určena za použití testu indukce cytokinů, jak byl popsán dříve. Splenocyty od všech zvířa ve skupině imunizované SWIB polypeptidem připraveným s Montanide adjuvans secernovaly IFN-gamma v reakci na expozici SWIB antigenu od Chlamydie, což dokazuje imunitní reakci specifickou pro Chlamydie.
V dalším pokusu byly C3H myši imunizované ve třech dobách na bázi ocasu 10 ug SWIB nebo S13 proteinu (C. trachomatis, SWIB protein, klon 1-B1-66, SEQ ID NO: 5; a S13 protein, klon 10-C10-31, SEQ ID NO: 4), který byl připraven s SBAS2 adjuvans (SmithKline Beecham, London, England). Titry protilátek specifických pro antigen byly měřeny ELISA a ukázalo se, že oba polypeptidy indukovaly silnou IgG odpověď, v rozmezí titrů lxlO”4 do lxlO-5. IgGl a IgG2a složky této odpovědi byly přítomné v téměř stejných množstvích, proliferační odpovědi T-lymfocytů specifické pro antigen, které byly určeny standardními testy inkorporace 3H na buňkách sleziny izolovaných od imunizovaných myší, byly dosti silné pro SWIB (o 50000 cpm vyšší než pro negativní kontrolu) a ještě silnější pro S13 {o 100000 cpm než pro negativní kontrolu). Produkce IFN-gamma byla testována standardním ELISA testem ze supernatantu proliferující kultury. In vitro restimulace kultury S13 proteinem indukovala vysokou produkci IFN-gamma, přibližně 25 ng/ml versus 2 ng/ml pro negativní kontrolu. Restimulace SWIB proteinem také indukovala produkci IFN-gamma, i když v menším rozsahu.
V podobném pokusu byly C3H myši imunizované ve teřch dobách na bázi ocasu 10 ug SWIB nebo S13 proteinu (C. trachomatis, SWIB protein, klon 1-B1-66, SEQ ID NO: 5; a S13 protein, klon 10-C10-31, SEQ ID NO: 4), který byl připraven s 10 ug cholera-toxinu. Slizniční imunizace byla provedena intranasální inokulací. Antigen-specifická protilátková odpověď byla měřena
131 standardní ELISA technikou. Antigen-specifické IgG protilátky byly přítomny v krvi myší imunizovaných SWIB, s titry v rozmezí lxlO-3 až lxlO-4, ale žádné nebyly detekovatelné u zvířat imunizovaných S13. T-lymfocytární reakce specifické pro antigen, jak jsou měřeny podle produkce IFN-gamma, dávaly podobné výsledky, jako jsou výsledky popsané výše pro systémovou imunizaci.
Pokus na zvířatech byl proveden pro určení imunogenicity CT52 9 serovaru LGV II CTL epitopu, který je definován CT529 10-merovým konvenčním peptidem (CSFIGGITYL - SEQ ID NO: 31), o kterém bylo zjištěno, že je restrihovaným H2-Kd CTL epitopem. BALB/c myši (3 myši na skupinu) byly imunizované třikrát 25 ug peptidů spoleu s různými adjuvans. Peptid byl podáván systémově na bázi ocasu buď v SKB aduvantním systému SBAS-2'1, SBAS-7 (SmithKline Beecham, London, England) nebo v Montanide. Peptid byl také podáván intranasálně v kombinaci s 10 ug cholera-toxinu (CT). Naivní myši byly použity jako kontroly. 4 týdny po 3. imunizaci byly buňky sleziny restimulovány LPS-blasty pulsovanými 10 ug/ml CT529 10-měrového konvenčního peptidů při třech různých poměrech efektorových buněk ku LPS-blastům: 6, 1,5 a 0,4 při 1x10® buňkách/ml. Po 2 restimulacích byly efektorové buňky testovány na svou schopnost lyžovat peptidem pulsované P815 buňky pomocí standardního testu uvolňování chrómu. Nepříbuzný peptid z kuřecího vaječného ovalbuminu byl použit jako negativní kontrola. Výsledky dokazují, že signifikantní imunitní odpověď byla vyvolána proti CT529 10-měrovému konvenčnímu peptidů a že T-lymfocyty specifické pro antigen schopné lyžovat peptidem pulsované cíle byly indukovány imunizací peptidem. Přesněji, lytické aktivity specifické pro antigen byly zjištěny u skupin s SBAS-7 a CT adjuvans, zatímco SBAS-2'' a Montanide selhaly v indukci imunizace CTL epitopem.
Příklad 6: Exprese a charakterizace genů Chlamydia pneumoniae • Φ ΦΦΦ· *· • · · · · • ··· · Φ
132
Lidská T-lymfocytární linie, TCL-8, popsaná v příkladu 1, rozpoznává dendritické buňky odvozené od monocytů infikované Chlamydia trachomatis, stejně jako Chlamydia pneumoniae, což naznačuje, že Chlamydia pneumoniae a Chlamydia trachomatis mohou obsahovat zkříženě reaktivní T-lymfocytární epitopy. Pro izolování genů Chlamydia pneumoniae homologních s geny Chlamydia trachomatis LGV II klony 1-B1-66, které jsou také označovány jako SWIB (SEQ ID NO: 1) a klonem 10-C10-31, který je též označován jako S13 ribosomální protein (SEQ ID NO: 4) , byly HeLa 229 buňky infikovány C. pneumoniae kmene TWAR (CDC/CWL-029). Po třech dnech inkubace byly HeLa buňky infikované C. pneumoniae sklízeny, promyty a resuspendovány ve 200 ul vody a zahřívaly se ve vroucí vodní lázni po dobu 20 minut. 10 ul suspenze rozrušených buněk se použilo jako templát pro PCR.
Primery specifické pro C. pneumoniae byly navrženy pro klony l-Bl-66 a 10-CIO-31 tak, že 5' konec obsahoval 6x-histidinovou koncovku a Ndel místo a 3' konec obsahoval stop kodon a BamHl místo (obr. 6). PCR produkty byly amplifikovány a sekvencovány za použití standardních technik dobře známých v oboru. Produkty PCR specifické pro C. pneumoniae byly klonovány do expresního vektoru pETl7B (Novagen, Madison, WI) a byly transfektovány do E. coli BL21 pLysS pro expresi a následné přečištění za použití histidin-niklové chromatografické metody od Novagen. Takto byly připraveny dva proteiny C. pneumoniae, 10-11 kDa protein označený jako CpSWIB (SEQ ID NO: 27 a SEQ ID NO: 78 obsahující 6xHis koncovku, s příslušnou aminokyselinovou sekvencí uvedenou v SEQ ID NO: 28), a 15 kDa protein označený jako CpS13 (SEQ ID NO: 29 a SEQ ID NO: 77 obsahující 6xHis koncovku, s příslušnou aminokyselinovou sekvencí uvedenou v SEQ ID NO: 30 a 91, v příslušném pořadí).
133 ·♦ 9999
9 * ··· • 9
9 • 99
9
Příklad 7: Indukce proliferace T-lymfocytů a produkce interferonu-gamma antigeny Chlamydia pneumoniae
Schopnost rekombinantních antigenů Chlamydia pneumoniae indukovat proliferaci T-lymfocytů a produkci interferonu gamma byla určena následujícím způsobem.
Proteiny se indukovaly IPTG a přečistily se afinitní chromatografií na Ni-NTA agarose (Webb et al., J. Immunology 157: 5034-5041, 1996) . Přečištěné polypeptidy se potom vyšetřovaly na schopnost indukovat proliferaci T-lymfocytů v přípravcích PBMC. PBMC od pacientů s C. pneumoniae, stejně jako od normálních dárců, o kterých je známo, že jejich T-lymfocyty proliferují v reakci na chlamydiové antigeny, se kultivovaly v mediu bsahujícím RPMI 1640 doplněné 10% lidským sérem a 50 ug/ml gentamycinu. Přečištěné polypeptidy se přidaly dvojmo v koncentracích 0,5 až 10 ug/ml. Po 6 dnech kultivace v 96-jamkových plotnách s oblým dnem v objemu 200 ul se z každé jamky odebralo 50 ul media za účelem stanovení koncentrace IFN-garnma, jak je popsáno dále. Plotny se potom pulsovaly 1 uCi/jamku tritiovaného thymidinu po dalších 18 hodin a potom se vyhodnocovalo vychytávání thymidinu za použití plynového scintilačního detektoru. Frakce, které vedly k proliferaci - v obou provedeních - vyšší než trojnásobné než je proliferace pozorovaná u buněk kultivovaných v samotném mediu, se považovaly za pozitivní.
Interferon gamma se měřil pomocí ELISA. ELISA plotny se potáhly myší monoklonální protilátkou namířenou proti lidskému IFN-garama (PharMingen, San Diego, CA) v PBS během 4 hodin při teplotě místnosti. Jamky se potom blokovaly PBS obsahujícím 5% (hmot./obj.) odtučněného sušeného mléka během 1 hodiny při teplotě místnosti. Plotny se potom šestkrát promyly v PBS/0,2% Tween 20 a vzorky se naředily 1:2 v kultivačním mediu a v ELISA plotně se inkubovaly přes noc při teplotě místnosti. Plotny se znovu promyly a do každé jamky se přidalo polyklonální králičí sérum proti lidskému IFN-gamma naředěné 1:3000 v PBS/10% normálním kozím séru. Plotny se potom inkubovaly po dobu 2 hodin při teplotě místnosti, promyly se a přidal se anti-králičí IgG konjugovaný na křenovou peroxidasu (Sigma Chemical Co, St. Louis, MO) v ředění 1:2000 v PBS/5% odtučněném sušeném mléku. Po dalších 2 hodinách inkubace při teplotě místnosti se plotny promyly a přidal se TMB substrát. Reakce se ukončila za 20 minut přidáním IN kyseliny sírové.
Optická densita se určila při 450 nm za použití 570 nm jako referenční vlnové délky. Frakce, které v obou provedeních dávaly OD dvakrát vyšší než je průměrná OD pro buňky kultivované pouze v mediu, plus 3 standardní odchylky, byly považovány za pozitivní.
Lidská anti-chlamydiová T-lymfocytární linie (TCL-8) zkříženě reagující s C. trachomatis a C. pneumoniae byla použita pro stanovení toho, zda exprimované proteiny popsané v předešlém příkladu (CpSWIB, SEQ ID NO: 27 a SEQ ID NO: 78 obsahující 6xHis koncovku, s příslušnou aminokyselinovou sekvencí uvedenou v SEQ ID NO: 28, a 15 kDa protein označený jako CpS13, SEQ ID NO: 29 a SEQ ID NO: 77 obsahující 6xHis koncovku, s příslušnou aminokyselinovou sekvencí uvedenou v SEQ ID NO: 30 a 91, v příslušném pořadí) obsahují T-lymfocytární epitopy společné C. trachomatis a C. pneumoniae. Stručně, E. coli exprimující chlamydiové proteiny se titrovaly na lxlO4 dendritických buněk odvozených od monocytů. Po dvou hodinách se kultury dendritických buněk promyly a přidalo se
2,5 x 104 T-lymfocytů (TCL-8) a inkubace pokračovala po dobu dalších 72 hodin. Množství IFN-gamma v supernatantu kultury se určilo ELISA. Jak je uvedeno na obr. 7A a 7B, TCL-8 T-lymfocytární linie specificky rozpoznávala S13 ribosomální protein od C. trachomatis i od C. pneumoniae, jak je dokázáno antigenněspecifickou indukcí IFN-gamma, zatímco tyto T-lymfocyty rozpoznávaly pouze SWIB protein od C. trachomatis. Pro ověření e ·
135
těchto výsledků byl T-lymfocytární epitop C. trachomatis SWIB identifikován epitopovým mapováním za použití cílových buněk pulsovaných sérií překrývajících se peptidů a T-lymfocytární linie TCL-8. Testy inkorporace 3H-thymidinu prokázaly, že peptid, označený jako C.t.SWIB 52-67, SEQ ID NO: 39, vyvolává nejsilnější proliferaci TCL-8 linie. Homologní peptidy odpovídající sekvenci SWIB C. pneumoniae {SEQ ID NO: 40), fúzi topoizomerasa-SWIB C. pneumoniae {SEQ ID NO: 43) a C. trachomatis {SEQ ID NO: 42), stejně jako lidská SWI doména (SEQ ID NO: 41) byly syntetizovány a byly testovány v tomto testu. T-lymfocytární linie TCL-8 rozpoznávala pouze C. trachomatis peptid SEQ ID NO: 39 a nikoliv příslušný peptid C. pneumoniae {SEQ ID NO: 40) ani jiné příslušné peptidy uvedené výše (SEQ ID NO: 41-43).
T-lymfocytární linie specifické pro chlamydie byly připraveny od dárce CP-21 s pozitivním titrem séra proti C. pneumoniae stimulací PBMC od dárce dendritickými buňkami odvozenými od monocytů infikovanými bud' C. trachomatis, nebo C. pneumoniae, v příslušném pořadí. T-lymfocyty připravené proti C. pneumoniae odpovídaly na rekombinantní C. pneumoniae-SWIB, ale ne na C. trachomatis-SWIB, zatímco T-lymfocyty připravené proti C. trachomatis neodpovídaly na C. trachomatis ani na C. pneumoniae-SWIB (viz obr. 9) . Imunitní odpověď dárce CP-21 specifická pro C. pneumoniae-SWIB potvrdila infekci C. pneumoniae a naznačila indukci T-lymfocytů specifických pro C. pneumoniae-SWIB behem infekce C. pneumoniae in vivo.
Epitopové mapování T-lymfocytární reakce na C. pneumoniae-SWIB ukázalo, že Cp-SWIB-specifické T-lymfocyty odpovídají na překrývající se peptidy Cp-SWIB 32-51 (SEQ ID NO: 101) a Cp-SWIB 37-56 (SEQ ID NO: 102), což ukazuje na C. pneumoniae-SWIB specifický T-lymfocytární epitop Cp-SWIB 37-51 (SEQ ID NO: 100) .
·· ·· • · · · · · » * Μ· · · · • ·· · · · · · ···· ···· ·· «· ·· ··
136
V dalších pokusech byly T-lymfocytární linie připraveny od dárce CPI, též C. pneumoniae seropozitivního dárce, stimulací PBMC neinfekčními elementáními tělísky od C. trachomatis a C.
pneumoniae, v příslušném pořadí. Konkrétně, proliferaění reakce byly určeny stimulací 2,5 x 104 T-lymfocytů za přítomnosti 1 x 104 dendritických buněk odvozených od makrofágů a neinfekčních elementárních tělísek odvozených od C. trachomatis a C.
pneumoniae, nebo jedním z rekombinantních C. trachomatis nebo C. pneumoniae SWIB proteinů. T-lymfocytární reakce na SWIB napodobovala data získaná pro T-lymfocytární linii od CP-21 v tom, že C. pneumoniae-SWIB, ale nikoliv C. trachomatis-SWIB, vyvolávaly odpověď u C. pneumoniae T-lymfocytární linie. Dále, C- trachomatis T-lymfocytární linie neproliferovala v reakci ani na C. trachomatis, ani na C. pneumoniae SWIB, ačkoliv proliferovala v reakci na CT i na CP elementární tělíska. Jak je popsáno v příkladu 1, klon 11-C12-91 (SEQ ID NO: 63), identifikovaný za použití TCP-21 buněčné linie, obsahuje 269 bp insert, který je součástí 0MP2 genu (CT443) a vykazuje homologii s 60 kDa proteinem zevním membrány bohatým na cystein od C. pneumoniae, který se označuje jako OMCB. Pro další definování reaktivních epitopů se provedlo epitopové mapování za použití série překrývajících se peptidů a imunotestu popsaného výše. Stručně, proliferační odpovědi byly stanoveny stimulací 2,5 x 104 TCP-21 T-lymfocytů za přítomnosti 1 x 104 dendritických buněk odvozených od monocytů s buď neinfekčními elementárními tělísky od C. trachomatis a C. pneumoniae, nebo peptidy odvozené od proteinové sekvence C. trachomatis nebo C. pneumoniae OMCB peptidů (0,1 ug/ml). TCP-21 T-lymfocyty odpovídají na epitopy CT-OMCB#167-186,
CT-OMCB#171-190, CT-OMCB#171-186 a v menším rozsahu na CT-OMCB#175-186 (SEQ ID NO: 249-252, v příslušném pořadí).
Významné je, že TCP-21 T-lymfocytární linie také proliferuje v reakci na homologní peptid C. pneumoniae CP-OMCB#171-186 (SEQ ID NO: 253), kde tato proliferace je stejná nebo lepší než ♦ · • · · ·
137 proliferace v reakci na peptidy C. trachomatis. Aminokyselinová substituce v pozici 2, t.j. Asp za Glu, a v pozici 4, t.j. Cys za Ser, nemění proliferativní reakce T-lymfocytů a tak dokazuje, že tento epitop je zkříženě reaktivní epitop mezi C. trachomatis a C. pneumoniae.
Příklad 8: Imunitní reakce lidských PBMC a T-lymfocytárních linií na chlamydiové antigeny
Uvedené příklady naznačují, že v populaci existuje podskupina zdravých dárců, kteří byly infikováni C. trachomatis a vyvinula se u nich protektivní imunita kontrolující infekci C. trachomatis. Tito dárci zůstávají klinicky asymptomatiční a seronegativní pro C„. trachomatis. Pro charakterizování imunitních reakcí normálních dárců na chlamydiové antigeny, které byly identifikovány CD4 expresním klonováním, byly PBMC získané od 12 zdravých dárců testovány proti panelu rekombinantních chlamydiových antigenů včetně C. trachomatis-, C. pneumoniae-SWIB a C. trachomatis-, C. pneumoniae-S13. Data jsou shrnuta v následující tabulce 1. Všichni dárci byly seronegativní na C. trachomatis, zatímco 6/12 mělo pozitivní titr pro C. pneumoniae. Za použití stimulačního indexu >4 jako pozitivní reakce odpovídalo 11/12 jedinců na elementární tělíska C. trachomatis a 12/12 na elementární tělíska C.
pneumoniae. Jeden jedinec, AD104, reagoval na rekombinantní S13 protein C. pneumoniae, ale ne na rekombinantní protein S13 C. trachomatis, což ukazuje na reakci specifickou pro C. pneumoniae. Tři z 12 dárců vykazovaly odpověď specifickou pro C. trachomatis-SWIB, ale ne C. pneumoniae-SWIB, což potvrzuje infekci C. trachomatis. C. trachomatis- a C. pneumoniae-S13 vyvolal odpověď u 8/12 jedinců, což ukazuje na chlamydiovou infekci. Tato data dokazují schopnost SWIB a S13 vyvolat T-lymfocytární reakci v PBMC u normálních pokusných jedinců.
138 *· ··
Tabulka 1: Imunitní reakce normální pokusných jedinců na Chlamydie
| Donor | Pohlaví | Titr Chlam.IgG | CT EB | CP EB | CT Swib | CP Swib | CT S13 | CP S13 | CT lpdA | CP ts; |
| AD100 | muž | negativní | + + | + + + | + | - | + + | + + | - | nt |
| AD104 | žena | negativní | + + + | + + | - | - | - | + + | - | nt |
| AD108 | muž | CP 1:256 | + + | + + | + | + | + | + | nt | |
| AD112 | žena | negativní | + + | + + | + | - | + | - | nt | |
| AD120 | muž | negativní | - | + | - | - | - | - | - | nt |
| AD124 | žena | CP 1:128 | + + | + + | - | - | - | - | - | nt |
| AD128 | muž | CP 1:512 | + | + + | - | - | ++ | + | + + | - |
| AD132 | žena | negativní | + + | + + | - | - | + | + | - | - |
| ÁD136 | žena | CP 1:128 | + | + + | - | - | - | - | - | |
| AD140 | muž | CP 1:256 | + + | + + | - | - | + | + | - | - |
| AD142 | žena | CP 1:512 | + + | ++ | - | - | + | + | + | - |
| AD146 | žena | negativní | + + | + + | - | - | + + | + | + |
CT = Chlamydia trachomatis; CP = Chlamydia pneumoniae; EB = chlamydiová elementární tělíska; SWIB = rekombinantní chlamydiový SWIB protein; S13 = rekombinantní chlamydiový S13 protein; lpdA = rekombinantní chlamydiový lpdA protein; TSA = rekombinantní chlamydiový TSA protein. Hodnoty představují výsledky ze standardních proliferačních testů. Proliferační odpovědi byly určeny stimulací 3 x 10s PBMC 1 x 104 dendritických buněk odvozených od monocytů, které byly preinkubovány s příslušnými rekombinantní mi antigeny nebo elementárními tělísky (EB) . Testy byly hodnoceny po 6 dnech s alespoň 18 hodinovým pulsem 3 H-thymidinem.
SI: Stimulační index : SI přibl. 4; +: SI > 4; ++: SI = 10-30; +++: SI > 30.
• 9 · 9 9 99 «99 9 9··
139 ·♦ ·'· 9 9 9 • 9 9··
0··
V první sérii pokusů byla T-lymfocytární linie připravena od zdravé ženy (CT-10) s anamnesou genitální infekce C. trachomatis pomocí stimulace T-lymfocytů elementárními tělísky C. trachomatis LGV II, jak bylo popsáno výše. Ačkoliv měl jedinec anamnesu infekce C. trachomatis, neserokonvertoval a neměl klinické příznaky, což naznačuje, že měl protektivní imunitu proti C. trachomatis. Jak je uvedeno na obr. 10, primární T-lymfocytární linie specifická pro chlamydie získaná od CT10 reagovala na C. trachomatis-SWIB, ale ne na C. pneumoniae-SWIB rekombínantní proteiny, což potvrzuje infekci CT-10 C. trachomatis. Epitopové mapování T-lymfocytární odpovědi na C. trachomatis-SWIB ukázalo, že tento jedinec odpovídal na stejný epitop Ct-SWIB 52-67 (SEQ ID NO: 39) jako T-lymfocytární linie TCL-8, jak je uvedeno na obr. 11.
Další T-lymfocytární linie byly připraveny způsobem popsaným výše pro různé pacienty s infekcí C. trachomatis. Souhrn klinického profilu pacientů a proliferačních reakcí na různá elementární tělíska C. trachomatis a C. pneumoniae a na rekombínantní proteiny je uveden v tabulce 2.
«'·· · · · ·
140
Tabulka 2: Proliterativní odpověď pacientů s infekcí C. trachomatis
| Pacient | Klinický proj ev | Titr igG | CT EB | CP EB | CT Swib | CP Swib | CT S13 | CP S13 | CT lpdA | CT TSA |
| CT-l | NGU | negat. | + | + | - | - | + + | + + | ++ | + |
| CT-2 | NGU | negat. | + + | ++ | - | - | + | - | - | |
| CT-3 | asymptomat. měl Eb Dx byl HPV | Cti:512 Cpi:1024 Cpsl:256 | 4- | + | + | + | ||||
| CT-4 | asymptomat. měl Eb | Cti:1024 | + | + | ||||||
| CT-5 | BV | Ctl:256 Ctl:256 | + + | + + | - | — | + | |||
| CT-6 | perineální exantem | Cpi :1024 | + | + | ||||||
| CT-7 | BV vřed na genitálu | Cti:512 Cpi :1024 | + | + | + | + | + | |||
| CT-8 | neznámo | netest. | + + | + + | - | - | - | - | - | - |
| CT-9 | asymptomat. | Cti:128 Cpi:128 | ++ + | 4-4- | + + | 4- | 4- | |||
| CT-10 | Svědění v obl. pochvy | negat. | ++ | ++ | ||||||
| CT-11 | BV abnormální PAP | Ctl:512 | +++ | +++ | +++ | ++ | + | |||
| CTI 2 | asymptomat. | Cti:512 | + + | ++ | - | - | + + | + | + | - |
NGU = negonokoková urethritis; BV = bakteriální vaginitis; CT = Chlamydia trachomatis; CP = Chlamydia pneumoniae; EB = chlamydiová elementární tělíska; SWIB = rekombinantní chlamydiový SWIB protein; S13 = rekombinantní chlamydiový S13 protein; lpdA =
141 rekombinantní chlamydiový lpdA protein; TSA = rekombinantní chlamydiový TSA protein. Hodnoty představují výsledky ze standardních prolíferačních testů. Proliferační odpovědi byly určeny stimulací 3 x 105 PBMC 1 x 104 dendritických buněk odvozených od monocytů, které byly preinkubovány s příslušnými rekombinantními antigeny nebo elementárními tělísky (EB). Testy byly hodnocceny po 6 drnech s alespoň 18 hodinovým pulsem 3H-thymidinem.
SI: Stimulační index : SI přibl. 4; +: SI > 4; ++: SI = 10-30; +++: SI > 30.
Za použití panelu asymptomatických (jak byly definováni výše) pokusných jedinců a pacientů s infekcí C. trachomatis, jak jsou shrnuti v tabulkách 1 a 2, byl proveden pokus pro určení imunitních odpovědí PBMC získaných od těchto dvou skupin jedinců. Stručně, PBMC od pacentů s infekcí C. pneumoniae, stejně jako od normálních jedinců, se kultivovaly v mediu obsahujícím RPMI 1640 doplněné 10% lidským sérem a 50 ug/ml gentamycinu. Přečištěné polypeptidy, panel rekombinantních chlamydiových antigenů včetně C. trachomatis-, C. pneumoniae-SWIB a S13, stejně jako C. trachomatis lpdA a TSA, se přidaly dvojmo v koncentracích 0,5 až 10 ug/ml. Po 6 dnech kultivace v 96-jamkových plotnách s oblým dnem v objemu 200 ul se z každé jamky odebralo 50 ul media za účelem stanovení koncentrace IFN-gamma, jak je popsáno dále.
Plotny se potom pulsovaly 1 uCi/jamku tritiovaného thymidinu po dalších 18 hodin a potom se vyhodnocovalo vychytávání thymidinu za použití plynového scintilačního detektoru. Frakce, které vedly k proliferaci - v obou provedeních - vyšší než trojnásobné, než je proliferace pozorovaná u buněk kultivovaných v samotném mediu, se považovaly za pozitivní.
Proliferační odpovědi na rekombinantní chlamydiové antigeny prokázaly, že většina asymptomatických jedinců a jedinců s infekcí C. trachomatis rozpoznává S13 antigen C. trachomatis (8/12) a
142 • 4 ·· • · ► c e«e • · « ’ · · « *· ·· většina pacientů s infekcí C. trachomatis rozpoznává S13 antigen C. pneumoniae (8/12), a 4/12 asymptomatických jedinců také rozpoznávaly S13 antigen C. pneumoniae. 6/12 pacientů s infekcí C. trachomatis a 4/12 asymptomatických jedinců měly proliferační reakci na lpdA antigen C. trachomatis. Tyto výsledky prokazují, že S13 antigen C. trachomatis a C. pneumoniae, Swib antigen C. trachomatis a lpdA antigen C. trachomatis jsou rozpoznávány u asymptomattických jedinců, což naznačuje, že tyto antigeny byly rozpoznány během infekce chlamydiemi a že byla proti nim indukována imunitní reakce. Toto naznačuje, že tyto antigeny mohou mít úlohu v indukci protektivní imunity u člověka. Dále, S13 antigen C. trachomatis a C. pneumoniae je rozpoznáván stejně dobře u pacientů s infekcí C. trachomatis, což naznačuje, že v S13 proteinu mohou existovat společné epitopy u C. trachomatis a C. pneumoniae. Tabulka 3 shrnuje výsledky těchto pokusů.
Tabulka 3
| Antigen | Normální jedinci | C.t. pacienti |
| C. t.-Swib | 3/12 | 0/12 |
| C.p.-Swib | 0/12 | 0/12 |
| C.t.-S13 | 8/12 | 8/12 |
| C.p.-S13 | 4/12 | 8/12 |
| lpdA | 4/12 | 6/12 |
| TSA | 0/12 | 2/12 |
Byla zahájena série pokusů pro určení buněčné imunitní reakce na krátkodobé T-lymfocytární linie připravené od asymptomatických dárců a od pacientů s infekcí C. trachomatis. Buněčné imunitní odpovědi byly měřeny standardními testy proliferace a produkce IFN-gamma, jak byly popsány v příklad 7. Přesněji, většina antigenů byla ve formě jednotlivých E. coli klonů exprimujících • ···
143 chlamydiové antigeny, ačkoliv byly v testu použity také některé rekombinantní proteiny. Jednotlivé E. coli klony byly titrovány na lxlO4 dendritických buňkách odvozených od monocytů a po dvou hodinách byla kultura promyta a přidalo se 2,5 x 104 T-lymfocytů. Test za použití rekombinantních proteinů se provedl způsobem popsaným dříve. Proliferace byla určena po 4 dnech se standardním pulsem 3h thymidinem po dobu alespoň 18 hodin. Indukce IFN-gamma byla určena ze supernatantů kultur získaných po 4 dnech za použití ELISA testu, jak je popsáno výše. Výsledky ukazují, že všechny testované antigeny C. trachomatis, s výjimkou C.t. Swib, vyvolávaly proliferativní reakci u jedné nebo více různých T-lymfocytárních linií připravených od pacientů s infekcí C. trachomatis. Proliferativní reakce byly indukovány pro pacienty s infekcí C. trachomatis i pro asymptomatické jedince pro následující chlamydiové geny, CT622, groEL, pmpD, CT610 a rS13.
Klon 12-G3-83 také obsahuje kromě sekvence CT622 také sekvence CT734 a CT764 a proto mohou obsahovat tyto sekvence také imunoreaktivní epitopy. Obdobně, klon 21-G12-60 obsahuje sekvence ke egnům pro hypotetické proteiny CT229 a CT228, kromě CT875; a 15-H2-76 také obsahuje sekvence z CT812 a CT088, a také vykazuje homologii se sycE genem. Klon 11-H3-61 také obsahuje sekvence vykazující homologii s PGP6-D proteinem virulence.
• · ♦ · ·*· ·
144
Tabulka 4
| Klon | C.t. | TCL od | TCL Od | SEQ ID NO: |
| Antigen | asympt. | pacientů | ||
| (domnělý*) | dárců | s C. | ||
| 1B1-66 {E. coli) | Swib | 2/2 | 0/4 | 5 |
| 1B1-66 (protein) | Swib | 2/2 | 0/4 | 5 |
| 12G3-83 (E. coli) | CT622* | 2/2 | 4/4 | 57 |
| 22B3-53 (E. coli) | groEL | 1/2 | 4/4 | 111 |
| 22B3-53 (protein) | groEL | 1/2 | 4/4 | 111 |
| 15H2-76 (E. coli) | PmpD* | 1/2 | 3/4 | 87 |
| 11H3-61 (E. coli) | rLl* | 0/2 | 3/4 | 60 |
| 14H1-4 (E. coli) | TSA | 0/2 | 3/4 | 56 |
| 14H1-4 (protein) | TSA | 0/2 | 3/4 | 56 |
| 11G10-46 (E. coli) | CT610 | 1/2 | 1/4 | 62 |
| 10C10-17 (E. coli) | rS13 | 1/2 | 1/4 | 62 |
| 10C10-17 (protein) | rS13 | 1/2 | 1/4 | 62 |
| 12G12-60 (E. coli) | CT875* | 0/2 | 2/4 | 110 |
| 11H4-32 (E. coli) | dnaK | 0/2 | 2/4 | 59 |
| 21C7-8 (E. coli) | dnaK | 0/2 | 2/4 | 115 |
| 17C10-31 (E. coli) | CT858 | 0/2 | 2/4 | 114 |
Příklad 9: Protektivní pokusy za použití chlamydiových antigenů
1. SWIB
Protektivní studie byly provedeny na myši za účelem stanovení toho, zda může mít imunizace chlamydiovými antigeny vliv na onemocnění genitálu způsobené chlamydiovou infekcí. Byly použity dva modely; model intravaginální infekce, který využívá
145 lidský izolát obsahující kmen Chlamydia psittaci (MTW 447), a model intrauterinní infekce, který využívá lidský izolát identifikovaný jako Chlamydia trachomatis, serovar F (kmen Nil). Oba kmeny indukují zánět horního genitálu, který napodobuje endometritis a salpingitis způsobenou Chlamydia trachomatis u žen.
V prvním pokusu byly C3H myši (4 myši na skupinu) imunizovány třikrát 100 ug pcDNA-3 expresního vektoru osbahujícího C. trachomatis SWIB DNA (SEQ ID NO: 1, s příslušnou aminokyselinovou sekvencí uvedenou v SEQ ID NO: 5). Inokulace byly provedeny na bázi ocasu systémově. Dva týdny po poslední imunizaci byla zvířata ošetřena progesteronem a infikována, bud' vagínou nebo injekcí inokula do dělohy. Dva týdny po infikování byly myši utraceny a genitální trakty byly vyjmuty, barveny a histopatologicky vyšetřeny. Byla vyhodnocena úroveň zánětu (+ pro slabý až +++++ pro velmi těžký). Skóre přidělená každému vejcovodu/vaječníku byla sečtena a dělena počtem vyšetřených orgánů za zisku průměrného skóre zánětu pro skupinu. V modelu uterinní inokulace byl u negativních kontrolních imunizovaných zvířat, kterým byl podán prázdný vektor, pozorován zánět s průměrným zánětlivým skóre pro vaječník/vejcovod 6,12, oproti 2,62 pro skupinu imunizovanou DNA.
V modelu vaginální inokulace a následné ascendentní infekce byl u negativních kontrolních imunizovaných zvířat, kterým byl podán prázdný vektor, pozorován zánět s průměrným zánětlivým skóre pro vaječník/vejcovod 8,37, oproti 5,00 pro skupinu imunizovanou DNA. Také v tomto posledním uvedeném modelu avkcinované myši nevykazovaly známky okluse vejcovodu, zatímco ve skupině vakcinované negativní kontrolou byly přítomny zánětlivé buňky v lumen vej covodu.
Ve druhém pokusu byly C3H myši (4 myši na skupinu) imunizovány třikrát 50 ug pcDNA-3 expresního vektoru osbahujícího C. trachomatis SWIB DNA (SEQ ID NO: 1, s příslušnou aminokyselinovou sekvencí uvedenou v SEQ ID NO: 5), který byl enkapsulován * · · ě ··· ·«»· ··«
146 • · · • β ··· • · · • ·· · ♦ · ·· v Polylaktid-ko-glykolidových mikrosférách (PLG); inokulace byly provedeny intraperitoneálně. Dva týdny po poslední imunizaci byla zvířata ošetřena progesteronem.a infikována inokulací C. psittaci do vaginy. Dva týdny po infikování byly myši utraceny a genitální trakty byly vyjmuty, barveny a histopatologicky vyšetřeny. Byla vyhodnocena úroveň zánětu za použití skóre uvedeného výše. Skóre přidělená každému vejcovodu/vaječníku byla sečtena a dělena počtem vyšetřených orgánů za zisku průměrného skóre zánětu pro skupinu. Negativní kontrolou imunizovaná zvířata, kterým byl podán prázdný vektor enkapsulovaný v PLG, měla zánět s průměrným zánětlivým skóre pro vaječník/vejcovod 7,28, oproti 5,71 pro skupinu imunizovanou DNA enkapsulovanou v PLG. Zánět v peritoneu byl 1,75 pro vakcinovanou skupinu a 3,75 pro kontrolní skupinu.
Ve třetím pokusu byly C3H myši {4 myši na skupinu) imunizovány třikrát 10 ug přečištěného rekombinantního proteinu, buď SWIB (SEQ ID NO: 1, s příslušnou aminokyselinovou sekvencí uvedenou v SEQ ID NO: 5), nebo S13 (SEQ ID NO: 4, s příslušnou aminokyselinovou sekvencí uvedenou v SEQ ID NO: 12) ve směsi s cholera-toxinem (CT); přípravek byl podán intranasálně za anestesie v objemu 20 ul. Dva týdny po poslední imunizaci byla zvířata ošetřena progesteronem a infikována, buď vaginální inokulací C. psittaci, nebo injekcí C. trachomatis serovaru F do dělohy. Dva týdny po infikování byly myši utraceny a genitální trakty byly vyjmuty, barveny a histopatologicky vyšetřeny. Úroveň zánětu byla hodnocena způsobem uvedeným výše. Skóre přidělená každému vejcovodu/vaječníku byla sečtena a dělena počtem vyšetřených orgánů za zisku průměrného skóre zánětu pro skupinu. V modelu uterinní inokulace byl u negativní kontrolou imunizovaných zvířat, kterým byl podán samotný cholera-toxin, pozorován zánět s průměrným zánětlivým skóre pro vaječník/vejcovod 4,25 (analyzovány byly pouze 2 myši, zbylé 2 uhynuly) oproti 5,00 pro skupinu imunizovanou sl3 + cholera-toxinem, a 1,00 pro SWIB +
147 ·♦ í ·· • % • ··· ♦ · ♦·
cholera-toxin. Neléčená infikovaná zvířata měla průměrné zánětlivé skóre pro vejcovod/vaječník 7. V modelu vaginální inokulace a následné ascendentní infekce byl u negativní kontrolou imunizovaných zvířat pozorován zánět s průměrným zánětlivým skóre pro vaječník/vejcovod 7,37, oproti 6,75 pro skupinu imunizovanou sl3 + cholera-toxinem a 5,37 pro skupinu imunizovanou SWIB + cholera-toxinem. Neléčená infikovaná zvířata měla průměrné zánětlivé skóre pro vejcovod/vaječník 8.
Tři pokusy uvedené výše naznačují, že je možno dosáhnout ochrany specifické pro SWIB. Tento ochranný účinek je více vyznačen v modelu homologní infekce, ale je stále ještě přítomen při heterologní infekci C. psittaci.
2. CT529/Capl
CT529/Capl byl dříve identifikován jako chlamydiový produkt, který stimuluje CD8+ CTL. V tomto příkladu jsme chtěli potvrdit to, že imunizace Čapl může být protektivní ve zvířecím modelu chlamydiové infekce.
Pro generování rekombinantního vakciniového viru pro podání Čapl imunogenního fragmentu se DNA fragment obsahující modifikovanou Kozákovu sekvenci a páry baží 319-530 čapl genu (CT529) amplifikoval z C. trachomatis L2 genomové DNA za použití PCR™ a ligoval se do pSCllss (Earl, PL, Koenig S, Moss B (1991) Biological and immunological properties of human immunodeficienci virus type 1 envelope glycoprotein: analysis of proteins with truncations and deletions expressed by recombinant vaccinia viruses, J. virol 65: 31-41). DNA se trávila Sáli a Stul. Část čapl genu ligovaná do pSCllss kódovala aminokyseliny 107-176 Čapl proteinu, obsahující dříve identifikovaný CTL epitop aminokyselin 139-147. Získaný plasmid se použil pro transfekci CV-1 buněk (ATCC
.. .. • 4¼
148
CCL-70; Jensen et al., (1964) Infection of human and simian tissue cultures with Rous Sarcoma Virus. Proč. Nati. Acad. Sci. USA 52: 53-59), které se potom infikovaly přirozeným virem vakcinie, Homologní rekombinace mezi přirozeným virem a plasmidovou DNA vedlo k vzniku rekombinantních virů vakcinie, které se selektovaly podle exprese beta-galaktosidasy a podle inaktivace thymidinkinasy, jak bylo popsáno dříve (Chakrabarti et al., Mol Cell Biol. 1985, 5(12): 3409-9). Rekombinantní virus se třikrát přečistil na plakách a titroval se po kultivaci na lidských TK-143B buňkách. Přípravky viru se ošetřily stejným objemem 0,25 mg/ml trypsinu během 30 minut při 37 °C a naředil se před imunizací myší v PBS. Pro všechny pokusné a kontrolní skupiny se použilo po 5 myších. Data uvedená dále jsou data pro tři nezávislé pokusy.
Skupina myší se imunizovala 10® rekombinantních virů vakcinie i.p. a nechala se zotavit po dobu 3 týdnů. Negativní kontrolní skupiny se imunizovaly buď pufrem, nebo přirozeným virem vakcinie. Jako pozitivní kontrola se skupina myší infikovala i.v. 10® ifu C. trachomatis. Počet organismů podaný pozitivní kontrolní skupině byl v předešlém pokusu eliminován během 2 týdnů. Po 3 týdnech se zvířata v každé skupině infikovala i.v. 10® ifu C. trachomatis.
Tři dny po infekci se myši utratily a určil se počet ifu na slezinu.
Průměrný počet organismů zjištěných ve slezinách zvířat imunizovaných virem vakcinie exprimující Čapl (7.1 x 104) byl
2.6-krát nižší (p < 0.01; Wilcoxon Rank Sum analýza) než u zvířat v kontrolních skupinách imunizovaných buď pufrem (1.8 x 105) nebo přirozeným virem vakcinie (1.9 x 105). Zvířata v pozitivní skupině měla 77-krát méně organismů (2.4 x 103) na slezinu než zvířata v negativních kontrolních skupinách (p < 0.01; Wilcoxon Rank Sum analýza). Tato data dokazují, že imunizace immunogenním fragmentem Čapl může vést k statisticky signifikantní obraně před infekcí C.
'9 9 · • 9 99
9 ·' · • 99 · ·«·
149 · '9 • 9 999 · '9 · 9
99
trachomatis.
Příklad 10: PMP/Ral2 fúzní proteiny
Různé PMP/Ral2 fúzní konstrukty se připravily nejprve syntetizováním PCR fragmentů Pnrp genu za použití primerů obsahujících Notl restrikční místo. Každý PCR fragment byl potom ligován do Notl restrikčního místa pCRXl. pCRXl vektor obsahuje 6HisRal2 část fúze. Ral2 část fúzního konstruktu kóduje polypeptid odpovídající aminokyselinovým zbytkům 192-323 Mycobacterium tuberculosis MTB32A, jak je popsán v US patentové přihlášce 60/158585, která je zde uvedena jako odkaz. Správná orientace každého insertu byla určena podle charakteru restrikčního trávení a jeho sekvence byla verifikována. Byly připraveny fúzní konstrukty pro PmpA, PmpB, PmpC, PmpF a PmpH, jak jsou popsány dále:
PmpA fúzní proteiny
PmpA je 107 kD protein obsahující 982 aminokyselin a byl klonován ze serovaru E. PmpA protein byl rozdělen na 2 překrývající se fragmenty, PmpA (N-koncovou) a (C-koncovou) část.
PmpA (N-konec) byl amplifikován za použití kódujících a protismyslných primerů:
GAGAGCGGCCGCTCATGTTTATAACAAAGGAACTTATG (SEQ ID NO: 306) GAGAGCGGCCGCTTACTTAGGTGAGAAGAAGGGAGTTTC (SEQ ID NO: 307) v příslušném pořadí. Výsledný fúzní konstrukt měl DNA sekvenci uvedenou v SEQ ID NO: 308, kódující 66 kD protein (619 aa) exprimující segment 1-473 aa PmpA. Aminokyselinová sekvence »·· «« to 'to' to • .· • ••to to to/to to • '· ·' to toto
150 ·· ···· .* ♦ · '· · · ’ *· *· « · · * · · to ···· ♦ · ·· ·· ·» fúzního proteinu je uvedena v SEQ ID NO: 309.
PmpA (C-konec) byl amplifikován za použití kódujících a protismyslných primerů:
GAGAGCGGCCGCTCCATTCTATTCATTTCTTTGATCCTG (SEQ ID NO: 310) GAGAGCGGCCGCTTAGAAGCCAACATAGCCTCC (SEQ ID NO: 311) v příslušném pořadí. Výsledný fúzní konstrukt měl DNA sekvenci uvedenou v SEQ ID NO: 312, kódující 74 kD protein (691 aa) exprimující segment 438-982 aa PmpA. Aminokyselinová sekvence fúzního proteinu je uvedena v SEQ ID NO: 313.
PmpF fúzní proteiny
PmpF je 112 kD protein obsahující 1034 aminokyselin a byl klonován ze serovaru E. PmpF protein byl rozdělen na 2 překrývající se fragmenty, PmpF (N-koncovou) a (C-koncovou) část
PmpF (N-konec) byl amplifikován za použití kódujících a protismyslných primerů:
GAGAGCGGCCGCTCATGATTAAAAGAACTTCTCTATCC (SEQ ID NO: 314) ř
GAGAGCGGCCGCTTATAATTCTGCATCATCTTCTATGGC (SEQ ID NO: 315) v příslušném pořadí. Výsledný fúzní konstrukt měl DNA sekvenci uvedenou v SEQ ID NO: 316, kódující 69 kD protein (646 aa) exprimující segment 1-499 aa PmpF. Aminokyselinová sekvence fúzního proteinu je uvedena v SEQ ID NO: 317.
PmpF (C-konec) byl amplifikován za použití kódujících a protismyslných primerů:
, · 9 '· ·« 0 9
9,9 · · ·· '· 9 • 9
-9:9 9 9 ···
151 ·· • · • 999
GAGAGCGGCCGCTCGACATACGAACTCTGATGGG (SEQ ID NO: 318) GAGAGCGGCCGCTTAAAAGACCAGAGCTCCTCC (SEQ ID NO: 319) v příslušném pořadí. Výsledný fúzní konstrukt měl DNA sekvenci uvedenou v SEQ ID NO: 320, kódující 77 kD protein (715 aa) exprimující segment 466-1034 aa PmpF. Aminokyselinová sekvence fúzního proteinu je uvedena v SEQ ID NO: 321.
PmpH fúzní proteiny
PmpH je 108 kD protein obsahující 1016 aminokyselin a byl klonován ze serovaru E. PmpH protein byl rozdělen na 2 překrývající se fragmenty, PmpH (N-koncovou) a (C-koncovou) část
PmpH (N-konec) byl amplifikován za použití kódujících a protismyslných primerů:
GAGAGCGGCCGCTCATGCCTTTTTCTTTGAGATCTAC (SEQ ID NO: 322) GAGAGCGGCCGCTTACACAGATCCATTACCGGACTG (SEQ ID NO: 323) v příslušném pořadí. Výsledný fúzní konstrukt měl DNA sekvenci uvedenou v SEQ ID NO: 324, kódující 64 kD protein (631 aa) exprimující segment 1-484 aa PmpH. Aminokyselinová sekvence fúzního proteinu je uvedena v SEQ ID NO: 325. Bylo zjištěno, že linie od dárce CHH037 je reaktivní s tímto proteinem.
PmpH (C-konec) byl amplifikován za použití kódujících a protismyslných primerů:
GAGAGCGGCCGCTCGATCCTGTAGTACAAAATAATTCAGC (SEQ ID NO: 326) GAGAGCGGCCGCTTAAAAGATTCTATTCAAGCC (SEQ ID NO: 327) ♦4 »444 * *,·
41 4 · · ’4 • 444
4:4·· 4«
152 '44 444 4 • · 4 » « 4 » · · » · 4 4
4 .4 4 v příslušném pořadí. Výsledný fúzní konstrukt měl DNA sekvenci uvedenou v SEQ ID NO: 328, kódující 77 kD protein (715 aa) exprimující segment 449-1016 aa PmpH. Aminokyselinová sekvence fúzního proteinu je uvedena v SEQ ID NO: 329. Linie od pacienta CT12 byla reaktivní s tímto proteinem.
PmpB fúzní proteiny
PmpB je 183 kD protein obsahující 1750 aminokyselin a byl klonován ze serovaru E. PmpB protein byl rozdělen na 4 překrývající se fragmenty, PmpB(l), (2), (3) a (4).
PmpB(l) byl amplifikován za použití kódujících a protismyslných primerů:
GAGAGCGGCCGCTCATGAAATGGCTGTCAGCTACTGCG (SEQ ID NO: 330) GAGAGCGGCCGCTTACTTAATGCGAATTTCTTCAAG (SEQ ID NO: 331) v příslušném pořadí. Výsledný fúzní konstrukt měl DNA sekvenci uvedenou v SEQ ID NO: 332, a kodoval 53 kD protein (518 aa) exprimující segment 1-372 aa PmpB. Aminokyselinová sekvence fúzního proteinu je uvedena v SEQ ID NO: 333.
PmpB(2) byl amplifikován za použití kódujících a protismyslných primerů:
GAGAGCGGCCGCTCGGTGACCTCTCAATTCAATCTTC (SEQ ID NO: 334) GAGAGCGGCCGCTTAGTTCTCTGTTACAGATAAGGAGAC (SEQ ID NO: 335) ···· 9.9« ~
153
99
9··
9 9 999
9 9
9 Μ
v příslušném pořadí. Výsledný fúzní konstrukt měl DNA sekvenci uvedenou v SEQ ID NO: 336, a kodoval 60 kD protein (585 aa) exprimující segment 330-767 aa PmpB. Aminokyselinová sekvence fúzního proteinu je uvedena v SEQ ID NO: 337. Buněčné linie od paceintů CTI, CT3 a CT4 reagovaly na tento rekombinantní pmpB protein.
PmpB(3) byl amplifikován za použití kódujících a protismyslných primerů:
GAGAGCGGCCGCTCGACCAACTGAATATCTCTGAGAAC (SEQ ID NO: 338)
GAGCGGCCGCTTAAGAGACTACGTGGAGTTCTG (SEQ ID NO: 339) v příslušném pořadí. Výsledný fúzní konstrukt měl DNA sekvenci uvedenou v SEQ ID NO: 340, a kodoval 67 kD protein (654 aa) exprimující segment 732-1236 aa PmpB. Aminokyselinová sekvence fúzního proteinu je uvedena v SEQ ID NO: 341.
PmpB(4) byl amplifikován za použití kódujících a protismyslných primerů:
GAGAGCGGCCGCTCGGAACTATTGTGTTCTCTTCTG (SEQ ID NO: 342) GAGAGCGGCCGCTTAGAAGATCATGCGAGCACCGC (SEQ ID NO: 343) v příslušném pořadí. Výsledný fúzní konstrukt měl DNA sekvenci uvedenou v SEQ ID NO: 344, a kodoval 76 kD protein (700 aa) exprimující segment 1160-1750 aa PmpB. Aminokyselinová sekvence fúzního proteinu je uvedena v SEQ ID NO: 345.
PmpC fúzní proteiny
PmpC je 187 kD protein obsahující 1774 aminokyselin a byl klonován ze serovaru E/L2. PmpC protein byl rozdělen na 3 překrývající se fragmenty, PmpC(l), (2) a (3) .
**«·
I····· ·,··
154 ·· ·· • · · · ·|«
4 · · • 4 4 4 • 4 .··
PmpC{l) byl amplifikován za použití kódujících a protismyslných primerů:
GAGAGCGGCCGCTCATGAAATTTATGTCAGCTACTGC (SEQ ED NO: 346) GAGAGCGGCCGCTTACCCTGTAATTCCAGTGATGGTC (SEQ ID NO: 347) v příslušném pořadí. Výsledný fúzní konstrukt měl DNA sekvenci uvedenou v SEQ ID NO: 348, a kodoval 51 kD protein (487 aa) exprimující segment 1-340 aa PmpC. Aminokyselinová sekvence fúzního proteinu je uvedena v SEQ ID NO: 349.
PmpC(2) byl amplifikován za použití kódujících a protismyslných primerů:
GAGAGCGGCCGCTCGATACACAAGTATCAGAATCACC (SEQ ID NO: 350) GAGAGCGGCCGCTTAAGAGGACGATGAGACACTCTCG (SEQ ID NO: 351) v příslušném pořadí. Výsledný fúzní konstrukt měl DNA sekvenci uvedenou v SEQ ID NO: 352, a kodoval 60 kD protein (583 aa) exprimující segment 305-741 aa PmpC. Aminokyselinová sekvence fúzního proteinu je uvedena v SEQ ID NO: 353.
PmpC(3) byl amplifikován za použití kódujících a protismyslných primerů:
GAGAGCGGCCGCTCGATCAATCTAACGAAAACACAGACG (SEQ ID NO: 354) GAGAGCGGCCGCTTAGACCAAAGCTCCATCAGCAAC (SEQEDNO: 355) v příslušném pořadí. Výsledný fúzní konstrukt měl DNA sekvenci uvedenou v SEQ ID NO: 356, a kodoval 70 kD protein (683 aa) exprimující segment 714-1250 aa PmpC. Aminokyselinová sekvence «· 9999 • 9 9 • 9 9 9 • · ·
9 <9999 9,99
155
357.
fúzního proteinu je uvedena v SEQ ID NO:
Příklad 11: Imunogenicita CT622
T-lymfocytární buněčné linie specifické pro chlamydie se připravily od dvou pacientů s chlamydiovou infekcí a linie se označily CTI a CT13. T-lymfocytární linie se generovaly buď proti dendritickým buňkám odvozeným od monocytů infikovaných C. tarchomatis serovarem E po dobu 72 hodin (CTI-ERB), nebo proti elementárním tělískům z mrtvého serovaru E (EB) (CT12-EEB). Po generování se linie testovaly proti rekombinantnímu proteinu specifickému pro chlamydie, CT622, v proliferačním testu. Proliferační testy se provedly stimulací 2,5xl04 T-lymfocytů za přítomnosti lxlO4 dendritických buněk odvozených od monocytů za použití buď rekombinantních CT antigenů (2 ug/ml) nebo chlamydiových EB (1 ug/ml). Testy se provedly za použití inkubace po dobu 4 dnů s 3H thymidinovým pulsem po dobu posledních 18 hodin.
Buněčná linie CT1-ERB vykazovala proliferativní odpověď významně vyšší než kontrolní medium při stimulaci CT622, CT875 a CT EB. Buněčná linie CT1-EEB vykazovala proliferativní odpověď významně vyšší než kontrolní medium při stimulaci CT622, CT875 a CT EB (viz obr. 12).
Příklad 12: Klonování a exprese kompletních genů CT611, 0RF3 a OppAl Chlamydia trachomatis
Exprese rekombinantního proteinu kompletních čtecích rámců se provedla pro klony obsahující geny CT611, ORF-3 a oppAl. Klony obsahující požadované geny byly CtL2-8 (SEQ ID NO: 285) kódující 4 ORF (CT474, CT473, CT060 a CT139), CtL2-10 (SEQ ID NO: 284) kódující ORF CT610 a CT611, a klony 16CtL2-16 (SEQ ID NO: 47), 16-D4-22 (SEQ ID NO:119) a 19-A5-54 (SEQ ID NO: 84), které všechny ·♦ v··· • 9 9 • ··· «· • 9 .
• · 99 9 • · · 9 • · 9 9 ·· 99
156 obsahují sekvence příbuzné k ORF-3. Sekvence v CtL2-10 (Ct-610) a CtL2-16 (ORF-3) byly také nezávisle identifikovány postupem T-lymfocytárního expresního klonování. Klon CtL2-8 byl zkoumán dále, protože tento klon stimuloval proliferativní reakce a produkci IFN-gamma ve dvou T-lymfocytárních liniích generovaných proti serovaru E.
Klonování a exprese sekvencí klonu
Bylo zjištěno, že CtL2-lO kóduje dva otevřené čtecí rámce (ORF), CT610 a CT611, a tyto jsou v genomovém klonu ve vzájemném sousedství. Kompletní ORF CT610 (obsahující doménu PQQ syntasy) se exprimovala dříve a bylo zjištěno, že stimuluje proliferativní odpověď T-lymfocytárních linií proti chlamydiím. Pro určení toho, zda druhý ORF, CT611, je také rozpoznáván T-lymfocyty se kompletní sekvence CT611 amplifikovala PCR a upravila se pro proteinovou expresi. Nukleotidové sekvence je popsána v SEQ ID NO: 361 a příslušná aminokyselinová sekvence je popsána v SEQ ID NO: 365.
Druhý serologický klon, CtL2-8, obsahuje 4 ORF (CT474, CT473, CT060 a CT139). Překrývající se peptidy ke třem nejmenším předpokládaným ORF (CT474, CT473 a CT060) nestimulují proliferativní odpověď T-lymfocytárních buněčných linií. Toto naznačuje, že imunostimulační antigen je lokalizován ve čtvrtém ORF, CT139. ORF pro CT139 má délku přibližně 450 nukleotidů. Kompletní nukleotidové sekvence je popsána v SEQ ID NO: 359 a kompletní aminokyselinová sekvence je popsána v SEQ ID NO: 363. Srovnání aminokyselinové sekvence se sekvencemi v GenBank ukázalo, že se jedná o oligo-peptidový vazebný protein (oppA)> který náleží do rodiny ABC transportérů. Tento protein má délku 462 aminokyselin a předpokládanou velikost 48,3 kDa a zřejmě obsahuje 2 transmembránové domény.
• · · .··.:··· • ··· • ·
157 ·*.....* • ··· • · >
• · • 9 ·« navrhly
Pro expresi kompletní sekvence oppAl se oligonukleotidy, které specificky amplifikují sekvence od aminokyselinového zbytku 22 (bez první transmembranové domény), kde tato nukleotidová sekvence je popsána v SEQ ID NO: 358 a aminokyselinová sekvence je popsána v SEQ ID NO: 362. Takto byl protein exprimován v E. coli.
Také se provedlo kompletní klonování a exprese rekombinantního proteinu pro ORF-3. Nukleotidová a aminokyselinová sekvence jsou popsány v SEQ ID NO: 360 a 364, v příslušném pořadí.
Příklad 13: Rekombinantní chlamydiové antigeny rozpoznávané T-lymfocytárními liniemi
T-lymfocytární linie od pacientů se připravily od následujících pacentů: CTI, CT2, CT3, CT4, CT5, CT6, CT7, CT8, CT9, CT10, CT11, CT12, CT13, CT14, CT15 a CT16, z nichž někteří jsou uvedeni výše. Podrobnosti jsou uvedeny v tabulce V.
Tabulka 5: Pacienti s infekcí C. trachomatis
| Pacient Pohlaví | Věk | Klinické příznaky | Serovar | Titr Více IgG infekcí | ||
| CTI | M | 27 | NGU | LCR | negat. | ne |
| CT2 | M | 24 | NGU | D | negat. | E |
| CT3 | M | 43 | Asympt. zároveň Eb Dx byl HPV | J | Ct 1:512 Cp 1:1024 Cps 1:256 | ne |
| CT4 | Z | 25 | Asympt. zároveň Eb | J | Cp 1:1024 | ano |
| CT5 | Z | 27 | BV | LCR | Ct 1:256 | F/F |
Cp 1:256
| • · · · · · • · · • · · · 158 : · | • · ·· · · ···· • · · · · · • · · · · · · · • · · · · ·· · ·· · · ·· ·· | |||||
| CT6 | M | 26 | perineální svědění, nepříjemné pocity, dysurie | G | Cp 1:1024 | N |
| CT7 | F | 29 | BV genit. vřed | E | Ct 1:512 Cp 1:1024 | N NA |
| CT8 | F | 24 | neznámé | LCR | netestován | N |
| CT9 | M | 24 | Asympt. | LCR | Ct 1:128 Cp 1:128 | N |
| CT10 | F | 20 | svědění vulvy | negat. | negat. | 12/1/ 98 |
| CT11 | F | 21 | BV Abnorm. PAP ster | J | Ct 1:512 F/F/J/E/E PID 6/96 | |
| CTI 2 | M | 20 | Asympt. | LCR | Cp 1:512 | N |
| CTI 3 | F | 18 | BV, gonorrhea, ct vagín., nepříjemný pocit dysurie | G | Ct 1:1024 | N |
| CT14 | M | 24 | NGU | LCR | Ct 1:256 Cp 1:256 | N |
| CTI 5 | F | 21 | muko-purulentní cervicitis, bolesti pochvy | kultura | Ct 1:256 CtlgM 1:320 Cp 1:64 | N |
| CT16 | M | 26 | Asympt./kontakt | LCR | NA | N |
| Cl 8 | M | 38 | Bez klinické anam. | negativní negat. | N |
onemocnění
NGU = negonokoková uretritida; BV = bakteriální vaginosa; CT = Chlamydia trachomatis; Cp = Chlamydia pneumoniae; Eb = Chlamydiové elementární tělíska; HPV = lidský papiloma virus; Dx = diagnosa; PID = zánětlivé onemocnění pánve; LCR = ligasová řetězová reakce
9··
1553 ·· ·
PBMC se získaly od druhé série dárců a T-lymfocytární linie se získaly z podskupiny těchto PBMC. Podrobnosti pro tyto tři T-lymfocytární linie jsou uvedeny v následující tabulce.
Tabulka VI - normální dárci
| Dárce | Pohlaví | Věk | Titr CT IgG | Titr CP IgG |
| CHH011 | Z | 49 | 1:64 | 1:16 |
| CHH037 | Z | 22 | 0 | 0 |
| CHH042 | Z | 25 | 0 | 1:16 |
| Dárce | CHH001 je | zdravá | 49 létá žena | seronegativní na C. |
trachomatis. PBMC produkovaly vysoké kvantity IFN-gamma v reakci na elementární tělíska C. trachomatis ve srovnání s elementárními tělísky C. pneumoniae, což ukazuje na reakci specifickou pro C. trachomatis. Dárce CHH037 je 22-letá zdravá žena seronegativní na C. trachomatis. PBMC produkovaly vysoké kvantity IFN-gamma v reakci na elementární tělíska C. trachomatis ve srovnání s elementárními tělísky C. pneumoniae, což ukazuje na reakci specifickou pro C. trachomatis. Dárce CHH042 je 25-letá zdravá žena s titrem IgG k C. pneumoniae 1:16. PBMC produkovaly vysoké kvantity IFN-gamma v reakci na elementární tělíska C. trachomatis ve srovnání s elementárními tělísky C. pneumoniae, což ukazuje na reakci specifickou pro C. trachomatis.
Rekombinantní proteiny pro několik genů C. trachomatis se generovaly způsobem popsaným výše. Sekvence pro MOMP se získala ze serovaru P. Geny CT875, CT622, pmpB2, pmpA a CT529 se získaly ze serovaru E a sekvence pro geny gro-EL, Swib, pmpD, pmpG, TSA, CT610, pmpC, pmpE, S13, lpdA, pmpl a pmpH-C se získaly ze Lil.
Několik linií od pacientů a dárců popsaných výše se testovalo proti rekombinantním Chlamydiovým proteinům. Tabulka IV shrnuje výsledky reakce T lymfocytů na tyto rekombinantní Chlamydiové • · • · • ·
16Ό proteiny.
Tabulka VII: Rekombinantní Chlamidiové T-lymfocytárními liniemi antigeny rozpoznávané
| Asiigea | Sem- • var | fof bitš | c L£ 12 | CT 10 E | CTI Έ | CT3 E | CT4 í ČT5 j | CT lí E | cr 12 ** X- | CT 13 E | CH H- 011 E | CH H- 037 E | |
| L2 | E i | ||||||||||||
| (CTI 10) | L2 | 10 | 4 | 4 | + | + | 4 | 4- | 4 | 4 | 4* | 4 | |
| MorapF (CT681) | F | 10 | 4 | 4- | 4- | 4 | 4 | 4- | 4- | 4 | 4 | 4 | |
| ČT875 | E | s | - | 4 | _X | - | 4 | 4~ | 4 | 4 | 4“ | - | 4 |
| SWIB - (CT4ÓG) | L2 | s 1 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4- | i + | 4 | 4 | |||
| pxnpĎ : (CTS12) | L2 _ | 15 | -l· | '4 | A* | -V | 4 | i 4 | _ |
| pmpG (CT871) | L2 | 6 | - | 4 | 4 | - | -l· | 4 | nt | — | 4 | 4 | |
| TSA (CT603) | L2 | 6 | — | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | ||||
| CT622 | E | 3 | - | - | 4- | - | 4 | - | - | - | 4 | - | - - |
| CT610 | L2 | 3 | - | 4 | - | 4 | - | - | - | 4 | - | - | - |
| pmpB-2 (CT413) | E | 3 | 4 | 4 | 4- |
• · ··
161
| pmpC (CT414) | L2 | 4 | + | — | + | - | + | — | - | + | |||
| pmpE (CT869) | L2 | 3 | + | + | - | + | — | ||||||
| S13 (CT509) | L2 | 2 | + | + | — | — | |||||||
| IpdA (CT557) | L2 | 3 | — | + | + | — | - | - | + | ||||
| pmpl (CTS74) | L2 | 2 | — | + | — | — | + | ||||||
| pmpH-C (CT872) | L2 | 1 | — | ||||||||||
| pmpA (CT412) | E | 0 | — | — | · | — | |||||||
| CT529 | E | 0 |
Ačkoliv byl předkládaný vynález popsán podrobně v popisu a příkladech, existují modifikace a změny, které se neodchylují od rozsahu předkládaného vynálezu, jehož rozsah je omezen pouze připojenými patentovými nároky.
162 a ·163......
Seznam sekvencí <110> Corixa Corporation Fling, Steve Skeiky, Yasir Probst, Peter Bhatia, Ajay <120> Sloučeniny a způsoby pro léčbu a diagnostiku infekcí způsobených Chlamydiemi <130> 210121.469Q2PC <140> PCT <141> 2001-07-20 <160> 599 <170> FastSEQ pro Windows verze 3.0/4.0 <210> i <211> 481 <212> DNA <213> Chlamydia trachomatis <400> 1 ctgaagactt ggctatgttt tttattttga cgataaacct agttaaggca taaaagágtt 60 gcgaaggaag agccctcaac ttttcttatc.accttcttta actaggagtc atccatgagt 120 .caaaataaga actctgcttt catgcagcct gtgaacgtat ccgctgattt agctgccatc 180 gttggtgcag gacctatgcc tcgcacagag atcattaaga aaatgtggga ttacattaag 240 gagaatagtc ttcaagatcc tacaaacaaa cgtaatatca atcccgatga taaattggct 300 aaagtttttg gaactgaaaa acctatcgat atgttccaaa tgacaaaaat ggtttctcaa 360 cacatcatta aataaaatág aaattgactc acgtgttcct cgtctttaag atgaggaact 420 agttcattct ttttgttcgt ttttgtgggt attactgtat ctttaacaac tatcttagca 480 g 481 <210> 2 <211> 183 <212> DNA <213> Chlamydia trachomatis <400> 2 atcgttggtg caggacctat gcctcgcaca gagatcatta agaaaatgtg ggattacatt 60 aaggagaata gtcttcaaga tcctacaaac aaacgtaata tcaatcccga tgataaattg 120. gctaaagttt ttggaactga aaaacctatc gatatgttcc aaatgacaaa aatggtttct 180 caa 183 <210> 3 <211> 110 <212> DNA <213> Chlamydia trachomatis <400> 3 gctgcgacat catgcgagct tgcaaaccaa catggacatc tccaatttcc ccttctaact 60 cgctctttgg aactaatgct gctaccgagt caatcacaat cacatcgacc 110 <210> 4 <211> 555
• 9·· • 9·· ···· ··· ·· ·· ·· ··
164 <212> DNA <213> Chlamydia trachomatis <400> 4 cggcacgagc ctaagatgct tatactactt taagggaggc ccttcgtatg ccgcgcatca ttggaataga tattcctgcg aaaaagaaat taaaaataag tcttacatat atttatggaa tagggccagc tctttctaaa gagattattg ctagattgca gttgaatccc gaagctagag ctgcagagtt gactgaggaa gaggttggtc gactaaacgc tcttttacag tcggattacg ttgttgaagg ggatttgcgc cgtcgtgtgc aatctgatat caaacgtctg attactatcc atgcttatcg tggacaaaga catagacttt ctttgcctgt tcgtggtcag agaacaaaaa caaattctcg cacgcgtaag ggtaaacgta aaactattgc aggtaagaag aaataataat ttttaggaga gagtgttttg gttaaaaatc aagcgcaaaa aagaggcgta aaaagaaaac aagtaaaaaa cattccttcg ggcgttgtcc atgttaaggc tacttttaat aatacaattg taaccataac agacc <210> 5 <211> 86 <212> PRT <213> Chlamydia trachomatis <400> 5
120
180
240
300
360
420
480
540
555
| Met | Ser Gin Asn Lys | Asn | Ser | Ala | Phe Met Gin | Pro | Val | Asn | Val | Ser |
| 1 | 5 | 10 | 15 | |||||||
| Ala | Asp Leu Ala Ala | Ile | Val | Gly | Ala Gly Pro | Met | Pro | Arg | Thr | Glu |
| 20 | 25 | 30 | ||||||||
| Ile | Ile Lys Lys Met | Trp | Asp | Tyr | Ile Lys Glu | Asn | Ser | Leu | Gin | Asp |
| ' 35 | 40 | 45 | ||||||||
| Pro | Thr Asn Lys Arg | Asn | Ile | Asn | Pro Asp Asp | Lys | Leu | Ala | Lys | Val |
| 50 | 55 | 60 | ||||||||
| Phe | Gly Thr Glu Lys | Pro | Ile | Asp | Met Phe Gin | Met | Thr | Lys | Met | Val |
| 65 | 70 | 75 | 80 | |||||||
| Ser | Gin His Ile Ile | Lys | ||||||||
| 85 | ||||||||||
| <210> 6 | ||||||||||
| <211> 61 | ||||||||||
| <212> PRT | ||||||||||
| <213> Chlamydia trachomatis | ||||||||||
| . <400> 6 | ||||||||||
| Ile | Val Gly Ala Gly | Pro | Met | Pro | Arg Thr Glu | Ile | Ile | Lys | Lys | Met |
| 1 | 5 | 10 | 15 | |||||||
| Trp | Asp Tyr Ile Lys | Glu | Asn | Ser | Leu Gin Asp | Pro | Thr | Asn | Lys | Arg |
| 20 | 25 | 30 | ||||||||
| Asn | Ile Asn Pro Asp | Asp | Lys | Leu | Ala Lys Val | Phe | Gly | Thr | Glu | Lys |
| 35 | 40 | 45 | ||||||||
| Pro | Ile Asp Met Phe | Gin | Met | Thr | Lys Met Val | Ser | Gin | |||
| 50 | 55 | 60 | ||||||||
| <210> 7 | ||||||||||
| <211> 36 | ||||||||||
| <212> PRT | ||||||||||
| <213> Chlamyida trachomatis | ||||||||||
| <400> 7 | ||||||||||
| Ala | Ala Thr Ser Cys | Glu | Leu | Ala | Asn Gin His | Gly | His | Leu | Gin | Phe |
| 1 | 5 | 10 | 15 | |||||||
| Pro | Leu Leu Thr Arg | Ser | Leu | Glu | Leu Met Leu | Leu | Pro | Ser | Gin | Ser |
| 20 | 25 | 30 |
Gin Ser His Arg 35
@003
165 <210> B <211> 18 <212> PSÍ <213> Chlamydia trachomatis <40Q> 8
Leu Arg His His Ala Ser Leu Gin Thr Asn Met Asp Ile Ser As-χ Phe 1 5 10 15
Pro Phe <210> 9 <211> 5 <212 > PRT <213> Chlamydia trachomatis <400> 9
Leu Ala Leu Trp Asn 1 5 <210> IQ <211> 11 <212> PRT <213> Chlamydia trachomatis <400> 10
Cys Cys Tyr Arg Val Asn His Asn His Ile Asp 1 5 10 <21O> 11 <211> 36 <212> PRT <213> Chlamydia trachomatis <400> 11
| Val | Asp | Val | Ile | Val | Ile Asp Eer Val | Ala | Ala | Leu. | Val | Pro | Lys Sar |
| 1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||
| Glu | Leu | Glu | Gly | Glu | Ile Gly Asp Val | His | Val | Gly | Leu | Gin | Ala Arg |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||
| Met | Met | Ser | Gin | ||||||||
| 35 |
<21O> 12 <21I> 122 <212> PRT <213> Chlamydia trachomatis <40ú> 12
| Met | Pro | Arg | Ile | Ile | Gly | Ile | Asp | Ile | Pro | Ala | Lys | Lys | Lys | Leu | Lys |
| 1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
| Ile | Ser | Leu | Thr | Tyr | Ile | Tyr | Gly | Ile | Gly | Pro | Ala | Leu | Ser | Lys | G-U |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| ne | Ile | Ala | Arg | Leu | Gin | Leu | Asn | Pro | Glu | Ala | Arg | Ala | Ala | Glu | Leu |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Thr | Glu | Glu | Glu | Val | Gly | Arg | Leu | Asn | Ala | Leu | Leu | Gin | Ser | Asp | Tyr |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Val | Val | Glu | Gly | Asp | Leu | Arg | Arg | Arg | Val | Gin | Ser | Asp | Ile | Lys | Ατς |
| 85 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Leu | Ile | Thr | Ile | His | Ala | TyE | Arg | Gly | Gin | Arg | His | Arg | Leu | Ser | Leu |
| 05 | 90 | 95 |
• 4
4 • ···
166
| Pro Val Arg -Gly Gin Arg Thr Lys Thr Asn Ser Arg Thr Arg | ||||||
| Lys Arg' Lys 115 | 100 105 Thr Ile Ala Gly Lys Lys Lys 120 | 110 | ||||
| <210> | 13 | |||||
| <211> | 20 | |||||
| <212> | PRT | |||||
| <213> | Chlamydia trachomatis | |||||
| <400> | 13 | |||||
| Asp | Pro Thr | Asn Lys Arg Asn Ile Asn | Pro | Asp | Asp | Lys Leu |
| 1 | 5 | 10 | ||||
| Val | Phe Gly | Thr | ||||
| 20 | l | |||||
| <210> | 14 | |||||
| <211> | 20 | |||||
| <212> | PRT | |||||
| <213> | Chlamydia trachoma.tis | |||||
| <400> | 14 | |||||
| Asp | Asp Lys | Leu Ala Lys Val Phe Gly | Thr | Glu | Lys | Pro Ile |
| 1 | 5 | 10 | ||||
| Phe | Gin Met | Thr | ||||
| 20 | ||||||
| <210> | 15 | |||||
| <211> | 161 | |||||
| . <212> | DNA | |||||
| <213> | Chlamydia trachomatis | |||||
| <400> | 15 |
Lys Gly
Ala Lys 15
Asp Met 15 atctttgtgt gtctcataag cgcagagcgg ctgcggctgt ctgtagcttc ttacctacct cgcgacattc ggagctatcc gtccgattct gtttgtcaac cgcaaccgtt tctttcttcc caaactaaag caaatatggg a <210> 16 <211> 897 <212> DNA <213> Chlymidia trachomatis <400> 16 atggcttcta tatgcggacg tttagggtct ggtacaggga atgctctaaa acacagccca acaataaaat ggcaagggta gtaaataaga cgaagggaat attaaggttg ccaagtctgc tgccgaattg accgcaaata ttttggaaca gcgggctctt ccgcacacat tacagcttcc caagtgtcca aaggattagg actgttgtcg ctttagggaa tgcctttaac ggagcgttgc caggaacagt caaagcttct tctctcacat gaaagctgct agtcagaaaa cgcaagaagg ctcacagcag atctttgtgt gtctcataag cgcagagcgg ctgcggctgt atcggaggaa ttacctacct cgcgacattc ggagctatcc gtccgattct aaaatgctgg caaaaccgtt tctttcttcc caaactaaag caaatatggg agctatatta tggcggctaa ccatgcagcg tctgtggtgg gtgctggact gcggaaagag cagattgcga agcccgctgc gctcgtattg cgagagaaga gaagtgccgg gagaggaaaa tgcttgcgag aagaaagtcg ctggagagaa ttcacgcgca tcaagtatgc actcctcact atgctcgaga agtttttgga gacgttttca aattggtgcc gctgcctatt acaatgggta ttcgtgcgat ggatgtacgt tcacttctgc aattattgga ttgtgcactt tctgcgccag atcggaggaa aaaatgctgg
120
161 agcttttttt ggataagact agctggaggc ggatgcgaga tcaaagtgcg ggatgagggg ctgtagcatc gtttgtcaac atcttctgtt cgctatcagt gtcgttactc agccaagacg atgcgttgcc tgtggctgct agcataa
120
180
240
300
360
420
480
540
600
660
720
780
840
897 <210> 17 <211> 298 • · · · ·· · · • · · · • ··· · • ··· τι ν νώ/νυχ.υ ι
167 <212> PRT <213> Chlamydia trachomatis <400> 17
| Met | Ala | Ser | Ile | Cys | Gly | Arg | Leu | Gly | Ser | Gly | Thr | Gly | Asn | Ala | Leu |
| 1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
| Lys | Ala | Phe | Phe | Thr | Gin | Pro | Asn | Asn | Lys | Met | Ala | Arg | Val | Val | Asn |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Lys | Thr | Lys | Gly | Met | Asp | Lys | Thr | Ile | Lys | Val | Ala | Lys | Ser | Ala | Ala |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Glu | Leu | Thr | Ala | Asn | Ile | Leu | Glu | Gin | Ala | Gly | Gly | Ala | Gly | Ser | Ser |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Ala | His | Ile | Thr | Ala | Ser | Gin | Val | Ser | Lys | Gly | Leu | Gly | Asp | Ala | Arg |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Thr | Val | Val | Ala | Leu | Gly | Asn | Ala | Phe | Asn | Gly | Ala | Leu | Pro | Gly | Thr |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Val | Gin | Ser | Ala | Gin | Ser | Phe | Phe | Ser | His | Met | Lys | Ala | Ala | Ser | Gin |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Lys | Thr | Gin | Glu | Gly | Asp | Glu | Gly | Leu | Thr | Ala | Asp | Leu | Cys | Val | Ser |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| His | Lys | Arg | Arg | Ala | Ala | Ala | Ala | Val | Cys | Ser | Ile | Ile | Gly | Gly | Ile |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Thr | Tyr | Leu | Ala | Thr | Phe | Gly | Ala | Ile | Arg | Pro | Ile | Leu | Phe | Val | Asn |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Lys | Met | Leu | Ala | Lys | Pro | Phe | Leu | Ser | Ser | Gin | Thr | Lys | Ala | Asn | Met |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Gly | Ser | Ser | Val | Ser | Tyr | Ile | Met | Ala | Ala | Asn | His | Ala | Ala | Ser | Val |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Val | Gly | Ala | Gly | Leu | Ala | Ile | Ser | Ala | Glu | Arg | Ala | Asp | Cys | Glu | Ala |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Arg | Cys | Ala | Arg | Ile | Ala | Arg | Glu | Glu | Ser | Leu | Leu | Glu | Val | Pro | Gly |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Glu | Glu | Asn | Ala | Cys | Glu | Lys | Lys | Val | Ala | Gly | Glu | Lys | Ala | Lys | Thr |
| 225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
| Phe | Thr | Arg | Ile | Lys | Tyr | Ala | Leu | Leu | Thr | Met | Leu | Glu | Lys | Phe | Leu |
| 245 | 250 | 255 | |||||||||||||
| Glu | Cys | Val | Ala | Asp | Val | Phe | Lys | Leu | Val | Pro | Leu | Pro | Ile | Thr | Met |
| 260 | 265 | 270 | |||||||||||||
| Gly | Ile | Arg | Ala | Ile | Val | Ala | Ala | Gly | Cys | Thr | Phe | Thr | Ser | Ala | Ile |
| 275 | 280 | 285 | |||||||||||||
| Ile | Gly | Leu | Cys | Thr | Phe | Cys | Ala | Arg | Ala | ||||||
| 290 | 295 |
<210> 18<211> 18 <212> PRT <213> Chlamydia trachomatis <400> 18
Arg Ala Ala Ala Ala Ala Ala Val Cys Ser Phe Ile Gly Gly Ile Thr 1 5 10 15
Tyr Leu <210> 19 <211> 18 <212> PRT <213> Chlamydia trachomatis <400> 19
Cys Ser Phe Ile Gly Gly Ile Thr Tyr Leu Ala Thr Phe Gly Ala Ile • ··· • ···
168
Arg Pro <210> 20 <211> 216 <212> PRT <213> Chlamydia trachomatis <400> 20 '
Met Arg Gly Ser Gin Gin Ile Phe Val Cys Leu Ile Ser Ala Glu Arg 1 5 10 15
Leu Arg Leu Ser Val Ala Ser Ser Glu Glu Leu Pro Thr Ser Arg His 20 25 30
Ser Glu Leu Ser Val Arg Phe Cys Leu Ser Thr Lys Cys Trp Gin Asn 35 40 45
Arg Phe Phe Leu Pro Lys Leu Lys Gin Ile Trp Asp Leu Leu Leu Ala 50 55 60
Ile Leu Trp Arg Leu Thr Met Gin Arg Leu Trp Trp Val Leu Asp Ser
70 75 80
Leu Ser Val Arg Lys Glu Gin Ile Ala Lys Pro Ala Ala Leu Val Leu
90 95
Arg Glu Lys Ser Arg Tyr Ser Lys Cys Arg Glu Arg Lys Met Leu Ala 100 105 110
Arg Arg Lys Ser Leu Glu Arg Lys Pro Arg Arg Ser Arg Ala Ser Ser 115 120 125
Met His Ser Ser Leu Cys Ser Arg Ser Phe Trp Asn Ala Leu Pro Thr 130 135 140
Phe Ser- Asn Trp Cys Arg Cys Leu Leu Gin Trp Val Phe Val Arg Leu
145 150 155 160
Trp Leu Leu Asp Val Arg Ser Leu Leu Gin Leu Leu Asp Cys Ala Leu
165 170 175
SeriAla Pro Glu His Lys Gly Phe Phe Lys Phe Leu Lys Lys Lys Ala .180 185 190
Val Ser Lys Lys Lys Gin Pro Phe Leu Ser Thr Lys Cys Leu Ala Phe
195 200 205
Leu Ile Val Lys Ile Val Phe Leu
210 · 215 <210> 21 <211> 1256 <212> DNA <213> Chlamydia trachomatis <400> 21 ctcgtgccgg cacgagcaaa gaaatccctc aaaaaatggc cattattggc ggtggtgtga 60 tcggttgcga attcgcttcc ttattccata 'cgttaggctc cgaagtttct gtgatcgaag 120 caagctctca aatccttgct ttgaataatc cagatatttc aaaaaccatg ttcgataaat 180 tcacccgaca aggactccgt ttcgtactag aagcctctgt atcaaatatt gaggatatag 240 • gagatcgcgt tcggttaact. atcaatggga atgtcgaaga atacgattac gttctcgtat 300 ctataggacg ccgtttgaat acagaaaata ttggcttgga taaagctggt gttatttgtg 360 atgaacgcgg agtcatccct accgatgcca caatgcgcac aaacgtacct aacatttatg 420 ctattggaga tatcacagga aaatggcaac ttgcccatgt agcttctcat caaggaatca 480 ttgcagcacg gaatataggt ggccataaag aggaaatcga ttactctgct gtcccttctg 540 tgatctttac cttccctgaa gtcgcttcag taggcctctc cccaacagca gctcaacaac 600 atctccttct tcgcttactt tttctgaaaa atttgataca gaagaagaat tcctcgcaca 660 cttgcgagga ggagggcgtc tggaagacca gttgaattta gctaagtttt ctgagcgttt 720 tgattctttg cgagaattat ccgctaagct tggttacgat agcgatggag agactgggga 780 tttcttcaac gaggagtacg acgacgaaga agaggaaatc aaaccgaaga aaactacgaa 840 acgtggacgt aagaagagcc gttcataagc cttgctttta aggtttggta gttttacttc 900 tctaaaatcc aaatggttgc tgtgccaaaa agtagtttgc gtttccggat agggcgtaaa 960 »· ·*··. ·« • · · · • ··· · • ··<
169 tgcgctgcat gaaagattgc ttcgagagcg gcatcgcgtg ggagatcccg gatactttct 1020 ttcagatacg aataagcata gctgttccca gaataaaaac ggccgacgct aggaacaaca 1080 agatttagat agagcttgtg tagcaggtaa actgggttat atgttgctgg gcgtgttagt 1140 tctagaatac ccaagtgtcc tccaggttgt aatactcgat acacttccct aagagcctct 1200 aatggatagg ataagttccg taatccatag gccatagaag ctaaacgaaa cgtatt 1256 <210> 22 <211> 601 <212> DNA <213> Chlamydia trachomatis <400> 22 ctcgtgccgg cacgagcaaa gaaatccctc aaaaaatggc cattattggc ggtggtgtga 60 tcggttgcga attcgcttcc ttattccata cgttaggctc cgaagtttct gtgatcgaag 120 caagctctca aatccttgct ttgaataatc cagatatttc aaaaaccatg ttcgataaat 180 tcacccgaca aggactccgt ttcgtactag aagcctctgt atcaaatatt gaggatatag 240 gagatcgcgt tcggttaact atcaatggga atgtcgaaga atacgattac gttctcgtat 300 ctataggacg ccgtttgaat acagaaaata ttggcttgga taaagctggt gttatttgtg 360 atgaacgcgg agtcatccct accgatgcca caatgcgcac aaacgtacct aacatttatg 420 ctattggaga tatcacagga aaatggcaac ttgcccatgt agcttctcat caaggaatca 480 ttgcagcacg gaatataggt ggceataaag aggaaatcga ttactctgct gtCccttctg 540 tgatctttac cttccctgaa gtcgcttcag taggcctctc cccaacagca gctcaacaac 600 a 601'.
<210> 23 <211> 270 <212> DNA <213> Chlamydia trachomatis <400> 23 acatctcctt cttcgcttac tttttctgaa aaatttgata cagaagaaga attcctcgca 60 cacttgcgag gaggagggcg tctggaagac cagttgaatt tagctaagtt ttctgagcgt 120 tttgattctt tgcgagaatt atccgctaag cttggttacg atagcgatgg agagactggg 180 gatttcttca acgaggagta cgacgacgaa gaagaggaaa tcaaaccgaa gaaaactacg 240 aaacgtggac gtaagaagag ccgttcataa 270 <210> 24 <211> 363 <212> DNA <213> Chlamydia trachomatis <400> 24 ttacttctct aaaatccaaa tggttgctgt gccaaaaagt agtttgcgtt tccggatagg 60 gcgtaaatgc gctgcatgaa agattgcttc gagagcggca tcgcgtggga gatcccggat 120 actttctttc agatacgaat aagcatagct gttcccagaa taaaaacggc cgacgctagg 180 aacaacaaga tttagataga gcttgtgtag caggtaaact gggttatatg ttgctgggcg 240 tgttagttct agaataccca agtgtcctcc aggttgtaat actcgataca cttccctaag 300 agcctctaat ggataggata agttccgtaa tccataggcc atagaagcta aacgaaacgt 360 att 363 <210> 25 <211> 696 <212> DNA <213> Chlamydia trachomatis <400> 25 gctcgtgccg gcacgagcaa agaaatccct caaaaaatgg ccattattgg cggtggtgtg 60 atcggttgcg aattcgcttc cttattccat acgttaggct ccgaagtttc tgtgatcgaa 120 gcaagctctc aaatccttgc tttgaataat ccagatattt caaaaaccat gttcgataaa 180 ttcacccgac aaggactccg tttcgtacta gaagcctctg tatcaaatat tgaggatata 240 ggagatcgcg ttcggttaac tatcaatggg aatgtcgaag aatacgatta cgttctcgta 300 • ·
170 tctataggac gccgtttgaa tacagaaaat attggcttgg ataaagctgg tgttatttgt 360 gatgaacgcg gagtcatccc taccgatgcc acaatgcgca caaacgtacc taacatttat 420 gctattggag atatcacagg aaaatggcaa cttgcccatg tagcttctca tcaaggaatc 480 attgcagcac ggaatatagg tggccataaa gaggaaatcg attactctgc tgtcccttct 540 gtgatcttta ccttccctga agtcgcttca gtaggcctct ccccaacagc agctcaacaa 600 catctccttc ttcgcttact ttttctgaaa aatttgatac agaagaagaa ttcctcgcac 660 acttgcgagg aggagggcgt ctggaagacc agttga 696 <210> 26 <211> 231 <212> PRT <213> Chlamydia trachomatis <400> 26
| Ala | Arg | Ala | Gly | Thr | Ser | Lys | Glu | Ile | Pro | Gin | Lys | Met | Ala | Ile | Ile |
| 1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
| Gly | Gly | Gly | Val | Ile | Gly | Cys | Glu | Phe | Ala | Ser | Leu | Phe | His | Thr | Leu |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Gly | Ser | Glu | Val | Ser | Val | Ile | Glu | Ala | Ser | Ser | Gin | Ile | Leu | Ala | Leu |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Asn | Asn | Pro | Asp | Ile | Ser | Lys | Thr | Met | Phe | Asp | Lys | Phe | Thr | Arg | Gin |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Gly | Leu | Arg | Phe | Val | Leu | Glu | Ala | Ser | Val | Ser | Asn | Ile | Glu | Asp | Ile |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Gly | Asp | Arg | Val | Arg | Leu | Thr | Ile | Asn | Gly | Asn | Val | Glu | Glu | Tyr | Asp |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Tyr | Val | Leu | Val | Ser | Ile | Gly | Arg | Arg | Leu | Asn | Thr | Glu | Asn | Ile | Gly |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Leu | Asp | Lys | Ala | Gly | Val | Ile | Cys | Asp | Glu | Arg | Gly | Val | Ile | Pro | Thr |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Asp | Ala | Thr | Met | Arg | Thr | Asn | Val | Pro | Asn | Ile | Tyr | Ala | Ile | Gly | Asp |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Ile | Thr | Gly | Lys | Trp | Gin | Leu | Ala | His | Val | Ala | Ser | His | Gin | Gly | Ile |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Ile | Ala | Ala | Arg | Asn | Ile | Gly | Gly | His | Lys | Glu | Glu | Ile | Asp | Tyr | Ser |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Ala | Val | Pro | Ser | Val | Ile | Phe | Thr | Phe | Pro | Glu | Val | Ala | Ser | Val | Gly |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Leu | Ser | Pro | Thr | Ala | Ala | Gin | Gin | His | Leu | Leu | Leu | Arg | Leu | Leu | Phe |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Leu | Lys | Asn | Leu | Ile | Gin | Lys | Lys | Asn | Ser | Ser | His | Thr | Cys | Glu | Glu |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Glu | Gly | Val | Trp | Lys | Thr | Ser | |||||||||
| 225 | 230 |
<210> 27 <211> 264 <212> DNA <213> Chlamydia pneumoniae <400> 27 atgagtcaaa aaaataaaaa ctctgctttt atgcatcccg tgaatatttc cacagattta 60 gcagttatag ttggcaaggg acctatgccc agaaccgaaa ttgtaaagaa agtttgggaa 120 tacattaaaa aacacaactg tcaggatcaa aaaaataaac gtaatatcct tcccgatgcg 180 aatcttgcca aagtctttgg ctctagtgat cctatcgaca tgttccaaat gaccaaagcc 240 ctttccaaac atattgtaaa ataa 264 <21O> 28 <211> 87 <212> PRT <213> Chlamydia pneumoniae • 9 ► 9*99 • 9 9 99 9
9 • 9 99
9 « . .. v»/ νσ1<υ /
171
| <400> | 28 | ||||||||||||||
| Met | Ser | Gin | Lys | Asn | Lys | Asn | Ser | Ala | Phe | Met | His | Pro | Val | Asn | Ile |
| 1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
| Ser | Thr | Asp | Leu | Ala | Val | Ile | Val | Gly | Lys | Gly | Pro | Met | Pro | Arg | Thr |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Glu | Ile | Val | Lys | Lys | Val | Trp | Glu | Tyr | Ile | Lys | Lys | His | Asn | Cys | Gin |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Asp | Gin | Lys | Asn | Lys | Arg | Asn | Ile | Leu | Pro | Asp | Ala | Asn | Leu | Ala | Lys |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Val | Phe | Gly | Ser | Ser | Asp | Pro | Ile | Asp | Met | Phe | Gin | Met | Thr | Lys | Ala |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Leu | Ser | Lys | His | Ile | Val | Lys | |||||||||
| 85 |
<210> 29 <211> 369 <212> DNA <213> Chlamydia pneumoniae <400> 29 · atgccacgca tcattggaat tgatattcct gcaaagaaaa agttaaaaat aagtctgaca tatatttatg gaataggatc agctcgttct gatgaaatca ttaaaaagtt gaagttagat cctgaggcaa gagcctctga attaactgaa gaagaagtag gacgactgaa ctctctgcta caatcagaat ataccgtaga aggggatttg cgacgtcgtg ttcaatcgga tatcaaaaga ttgatcgcca tccattctta tcgaggtcag agacatagac tttctttacc agtaagagga caacgtacaa aaactaattc tcgtactcga aaaggtaaaa gaaaaacagt cgcaggtaag aagaaataa <210> 30 <211> 122 <212> PRT <213> Chlamydia pneumoniae
120
180
240
300
360
369 <400> 30
| Met | Pro | Arg | Ile | Ile | Gly | Ile | Asp | Ile | Pro | Ala | Lys | Lys | Lys | Leu | Lys |
| 1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
| Ile | Ser | Leu | Thr | Tyr | Ile | Tyr | Gly | Ile | Gly | Ser | Ala | Arg | Ser | Asp | Glu |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Ile | Ile | Lys | Lys | Leu | Lys | Leu | Asp | Pro | Glu | Ala | Arg | Ala | Ser | Glu | Leu |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Thr | Glu | Glu | Glu | Val | Gly | Arg | Leu | Asn | Ser | Leu | Leu | Gin | Ser | Glu | Tyr |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Thr | Val | Glu | Gly | Asp | Leu | Arg | Arg Arg | Val | Gin | Ser | Asp | Ile | Lys | Arg | |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Leu | Ile | Ala | Ile | His | Ser | Tyr | Arg | Gly | Gin | Arg | His | Arg | Leu | Ser | Leu |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Pro | Val | Arg | Gly | Gin | Arg | Thr | Lys | Thr | Asn | Ser | Arg | Thr | Arg | Lys | Gly |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Lys | Arg | Lys | Thr | Val | Ala | Gly | Lys | Lys | Lys | ||||||
| 115 | 120 |
<210> 31 <211> 10 <212> PRT < 213 > Artifíciální sekvence; <220>
<223> Vyrobeno v laboratoři <400> 31 ·· ···· ··' ·· ·« ·»·· · ·· ··· «· · • ft «« · ·«·« « · · • · «« ·· · « · · .
• · ···· · · · · ··««.··· ·« «· ·· ·«
Kl,.
172
Cys Ser Phe Ile Gly Gly Ile Thr Tyr Leu 1 5 10 <210> 32 <211> 53 <212> PRT <213> Chlamydia trachomatis <400> 32
| Leu | Cys | Val | Ser | His | Lys | Arg | Arg | Ala | Ala | Ala | Ala | Val | Cys | Ser | Phe |
| 1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
| Ile | Gly | Gly | Ile | Thr | Tyr | Leu | Ala | Thr | Phe | Gly | Ala | Ile | Arg | Pro | Ile |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Leu | Phe | Val | Asn | Lys | Met | Leu | Ala | Gin | Pro | Phe | Leu | Ser | Ser | Gin | Thr |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Lys | Ala | Asn | Met | Gly |
<210> 33 <211> 161 <212> DNA <213> Chlamydia trachomatis <400> 33 atctttgtgt gtctcataag cgcagagcgg ctgcggctgt ctgtagcatc atcggaggaa 60 ttacctacct cgcgacattc ggagctatcc gtccgattct gtttgtcaac aaaatgctgg 120 óaaaaccgtt tctttcttcc caaactaaag caaatatggg a 161 <210> 34 <211> 53 <212> PRT <213> Chlamydia trachomatis <400> 34
| Leu | Cys | Val | Ser | His | Lys | Arg | Arg | Ala | Ala | Ala | Ala | Val | Cys | Ser | Ile |
| 1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
| Ile | Gly | Gly | Ile | Thr | Tyr | Leu | Ala | Thr | Phe | Gly | Ala | Ile | Arg | Pro | Ile |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Leu | Phe | Val | Asn | Lys | Met | Leu | Ala | Lys | Pro | Phe | Leu | Ser | Ser | Gin | Thr |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Lys | Ala | Asn | Met | Gly | |||||||||||
| 50 |
<210> 35 <211> 55 · <212> DNA <213> Chlamydia pneumoniae <400> 35 gatatacata tgcatcacca tcaccatcac atgagtcaaa aaaaataaaa actct 55 <210> 36 <211> 33 <212> DNA <213> Chlamydia pneumoniae <400> 36 ctcgaggaat tcttatttta caatatgttt gga 33 <210> 37 <211> 53 •9 ··<· » « • ··* ♦ · 999 9
173 <212> DNA <213> Chlamydia pneumoniae <400> 37 gatatacata tgcatcacca tcaccatcac atgccacgca tcattggaat gat 53 <210> 38 <211> 30 <212> DNA <213> Chlamydia pneumoniae <400> 38 ctcgaggaat tcttatttct tcttacctgc 30 <210> 39 <211> 16 <212> PRT <213> .Artificiální sekvence ;e <220>
<223> Vyrobeno v laboratoři <400> 39
Lys Arg Asn Ile Asn Pro Asp Asp Lys Leu Ala Lys Val Phe Gly Thr 1.5 10 15 <210> 40 <211> 16 <212> PRT <213> Artificiální sekvence ce <220>
<223> Vyrobeno v laboratoři <400> 40
Lys Arg Asn Ile Leu Pro Asp Ala Asn Leu Ala Lys Val Phe Gly Ser 1 5 10 15 <210> 41 <211> 15 <212> PRT <2i3> Artificiální sekvencece <220> v. · <223> Vyrobeno v laboratoři <400> 41
Lys Glu Tyr Ile Asn Gly Asp Lys Tyr Phe Gin Gin Ile Phe Asp 15 10 15 <210> 42 <211> 16 <212> PRT <213> Artificiální sekvence e <220>
<223> Vyrobeno v laboratoři <400> 42
Lys Lys Ile Ile Ile Pro Asp Ser Lys Leu Gin Gly Val Ile Gly Ala
9« ··*·
• ·
·· ···· • 9 · • ··« « © « ··* • 9 • · ©· ··'
174 <210> 43 <211> 15 <212> PRT <213> Artificiální sekvencece <220>
<223> Vyrobeno v laboratoři <400> 43
Lys Lys Leu Leu Val Pro Asp Asn Asn Leu Ala Thr Ile Ile Gly 15 10 15 <210> 44 <211> 509 <212> DNA <213> Chlamydia <400> 44 ggagctcgaa ttcggcacga gagtgcctat tgttttgcag gctttgtctg atgatagcga 60 .taccgtacgt gagattgctg tacaagtagc tgttatgtat ggttctagtt gcttactgcg 120 cgccgtgggc gatttagcga aaaatgattc ttctáttcaa gtacgcatca ctgettatcg 180 tgctgcagcc gtgttggaga tacaagatct tgtgcctcat ttacgagttg tagtccaaaa' 240 tacacaatta gatggaacgg aaagaagaga agcttggaga tctttatgtg ttcttactcg .300 gcctcatagt ggtgtattaa ctggcataga tcaagcttta atgacctgtg agatgttaaa 360 ggaatatcct gaaaagtgta cggaagaaca gattcgtaca ttattggctg cagatcatcc 420 agaagtgcag gtagctactt tacagatcat tctgagagga ggtagagtat tccggtcatc 480 ttctataatg gaatcggttc tcgtgccgg 509 <210> 45 <211> 481 <212> DNA <213> Chlamydia <220>
<22i> různé vlastnosti <222> 23 <223> n=A,T,C or G <400> 45 gatccgaatt cggcacgagg cantatttac tcccaacatt acggttccaa ataagcgata 60 aggtcttcta ataaggaagt taatgtaaga ggctttttta ttgcttttcg taaggtagta 120 ttgcaaccgc acgcgattga atgatacgca agccatttcc atcatggaaa agaacccttg 180 gacaaaaata caaaggaggt tcactcctaa ccagaaaaag ggagagttag tttccatggg 240 ttttccttat atacacccgt ttcacacaat taggagccgc gtctagtatt tggaatacaa 300 attgtcccca agcgaatttt gttcctgttt cagggatttc tcctaattgt tctgtcagcc 360 atccgcctat ggtaacgcaa ttagctgtag taggaagatc aactccaaac aggtcataga 420 aatcagaaag ctcataggtg cctgcagcaa taacaacatt cttgtctgag tgagcgaatt 480 g 481 <210> 46 <211> 427 <212> DNA <213> Chlamydia <220>
<2 21 > různé vlastnosti <222> 20 <223> n=A,T,C or G
175 <400> 46 gatccgaatt cggcacgagn tttttcctgt tttttcttag tttttagtgt tcccggagca 60 ataacacaga tcaaagaacg gccattcagt ttaggctctg actcaacaaa acctatgtcc 120 tctaagccct gacacattct ttgaacaacc ttatgcccgt gttcgggata agccaactct 180 cgcccccgaa acatacaaga aacctttact ttatttcctt tctcaataaa ggctctagct 240 tgctttgctt tcgtaagaaa gtcgťtatca tcgatattag gcttaagctt aacctctttg 300 atacgcactt ggtgctgtgc tttcttacta tctttttctt ttttagttat gtcgtaacga 360 tacttcccgt agtccatgat tttgcacaca ggaggctctg agtttgaagc aacctcgtgc 420 cgaattc 427 <210> 47 <211> 600 <212> DNA <213> Chlamydia <220> „ <22i> různé vlastnosti <222> 522 <223> n=A,tzc nebo G <400> 47 gatccgaatt cggcacgaga tgcttctatt acaattggtt tggatgcgga aaaagcttac 60 cagcttattc tagaaaagtt gggagatcaa attcttggtg gaattgctga tactattgtt 120 gatagtacag tccaagatat tttagacaaa atcacaacag acccttctct aggtttgttg 180 aaagctttta acaactttcc aatcactaat aaaattcaat gcaacgggtt attcactccc 240 aggaacattg aaactttatt aggaggaact gaaataggaa aattcacagt cacacccaaa 300 agctctggga .gcatgttctt agtctcagca gatattattg catcaagaat ggaaggcggc 360 gttgttctag ctttggtacg agaaggtgat tctaagccct acgcgattag ttatggatac 420 tcatcaggcg ttcctaattt atgtagtcta agaaccagaa ttattaatac aggattgact 480 ccgacaacgt attcattacg tgtaggcggt ttagaaagcg gngtggtatg ggttaatgcc 540 ctttctaatg gcaatgatat tttaggaata acaaatcttc taatgtatct tttttggagg 600 <210> 48 <2ll> 600 <212> DNA <213> Chlamydia <400> 48 ggagctcgaa ttcggcacga gctctatgaa tatccaattc tctaaactgt tcggataaaa 60 atgatgcagg aattaggtcc acactatctt tttttgtttc gcaaatgatt gattttaaat 120 cgtttgatgt gtatactatg tcgtgtaagc ctttttggtt acttctgaca ctagccccca 180 atccagaaga taaattggat tgcgggtcta ggtcagcaag taacactttt ttccctaaaa 240 attgggccaa gttgcatccc acgtttagag aaagtgttgt ttttccagtt cctcccttaa 300 aagagcaaaa aactaaggtg tgcaaatcaa ctccaacgtt agagtaagtt atctattcag 360 ccttggaaaa catgtctttt ctagacaaga taagcataat caaagccttt tttagcttta 420 aactgttatc ctctaatttt tcaagaacag gagagtctgg gaataatcct aaagagtttt 480 ctatttgttg aagcagtcct agaattagtg agacactttt atggtagagt tctaagggag 540 aatttaagaa agttactttt tccttgttta ctcgtatttt taggtctaat tcggggaaat 600 <210> 49 <211> 600 <212> DNA <213> Chlamydia <400> 49 gatccgaatt cggcacgaga tgcttctatt acaattggtt tggatgcgga aaaagcttac 60 cagcttattc tagaaaagtt gggagatcaa attcttggtg gaattgctga tactattgtt 120 gatagtacag tccaagatat tttagacaaa atcacaacag acccttctct aggtttgttg 180 aaagctttta acaactttcc aatcactaat aaaattcaat gcaacgggtt attcactccc 240 aggaacattg aaactttatt aggaggaact gaaataggaa aattcacagt cacacccaaa 300 agctctggga gcatgttctt agtctcagca gatattattg catcaagaat ggaaggcggc 360 • ·
176 gttgttctag ctttggtacg agaaggtgat tctaagccct tcatcaggcg ttcctaattt atgtagtcta agaaccagaa ccgacaacgt attcattacg tgtaggcggt ttagaaagcg ctttctaatg gcaatgatat tttaggaata acaaatactt <210> 50 <211> 406 <212> DNA <213> Chlamydia <400> 50 , ’ gatccgaatt cggcacgagt tcttagcttg cttaattacg gctatcaaat agcttattca gtctttcatt agttaaacga tcctatgttc ttcagctata aaaatacttc ttaaaacttg cattaaccac aacataatca aattcgctag cggcagcaat atctttcttt cttctggaaa tctttctctg aatcccgagc cttcttgaga gggagcttga ataaaaatgt gactgccggc agctccttgt acatcaatca cggctatgca gtctcgtgcc acgcgattag ttattaatac gtgtggtatg ctaatgtatc taattaacca tcttttctag atatgctgta ttcgacagcg attcaaacgg atttgcttct gaattc ttatggatac aggattgact ggttaatgcc ttttttggag aactaaaggg ccatgactca atcaaatcat ctatgctcta cgctcaagtt tcagagccaa
420
480
540
600
120
180
240
300
360
406
| <210> | 51 |
| <211> | 602 |
| <212> | DNA |
| <213> | Chlamydia |
| <400> | 51 |
gatccgaatt cggcacgaga tattttagac aaaatcacaa ttgaaagctt ttaacaactt tccaatcact aataaaattc cccaggaaca ttgaaacttt attaggagga actgaaatag aaaagctctg ggagcatgtt čttagtctca gcagatatta ggcgttgttc tagctttggt acgagaaggt gattctaagc tactcatcag gcgttcctaa tttatgtagt ctaagaacca actccgacaa cgtattcatt acgtgtaggc ggtttagaaa gccctttcta atggcaatga tattttagga ataacaaata gaggtaatac ctcaaacaaa cgcttaaaca atttttattg tatttagaga aaaaagttcg aattacgggg tttgttatgc tc <210> 52 <211> 145 <212> DNA <213> Chlamydia <400> 52 gatccgaatt cggcacgagc tcgtgccgat gtgttcaaca caaatatact ccaagtaatt ctttttctct tttcaacaac aacattttca gctcgtgccg aattc cagacccttc aatgcaacgg gaaaattcac ttgcatcaag cctacgcgat gaattattaa gcggtgtggt cttctaatgt gatttttctt aaaataaact gcatccatag tccttaggag
| <210> | 53 |
| <211> | 450 |
| <212> | DNA |
| <213> | Chlamydia |
| <400> | 53 |
gatccgaatt cggcacgagg taatcggcac cgcactgctg gatcaaaccc acacttggga caagtaccta caacataacg cttcctcaga atacagctgt tcggtcacct gattctctac ttcgatagaa atcttgcaca atagcaggat gataagcgtt ctacagaaat tcccaatttc ttgaaggtat ctttatgaag attcttgata ccccatgcct gccaactctg cattaagggt cagaaccaca aatatacaaa acctctttgc cttgtagtct ctgcaggcaa ataagcctcg tgccgaattc tctaggtttg gttattcact agtcacaccc aatggaaggc tagttatgga tacaggattg átgggttaat atcttttttg ataggtttta cgtgccgaat acactcatct gtccgctaaa cagtccgcgt cgtagttctg cttatgatac aattgcgatt ctgaaaacgc gatgggcagt agcgttggat cctcgagctc aacttccctt tcctgcaagt gaaaagaaat atgtcgacat ccgtattcat gcataaacat
120
180
240
300
360
420
480
540
600
602
120
145
120
180
240
300
360
42Ó
450 • o
177
| <210> 54 <211> 716 <212> DNA <213> Chlamydia | |
| <400> | 54 |
gatcgaaatt cggcacgagc ggcacgagtt ttctgatagc gatttacaat cctttattca 60 acttttgcct agagaggcac actatactaa gaagtttctt gggtgtgtgg cacagtcctg 120 tcgtcagggg attctgctag aggggtaggg gaaaaaaccc ttattactat gaccatgcgc 180 atgtggaatt acattccata gactttcgca tcattcccaa catttacaca gctctacacc 240 tcttaagaag aggtgacgtg gattgggtgg ggcagccttg gcaccaaggg attccttttg 300 agcttcggac tacctctgct ctctacaccc attaccctgt agatggcaca ttctggctta 360 ttcttaatcc caaagatcct gtactttcct ctctatctaa tcgtcagcga ttgattgctg 420 ccatccaaaa ggaaaaactg gtgaagcaag ctttaggaac acaatatcga gtagctgaaa 480 gctctccatc tccagaggga atcatagctc atcaagaagc ttctactcct tttcctggga 540 aaattacttt gatatatccc aataatatta cgcgctgtca gcgtttggcc gaggtatcca 600 aaaaatgatc gacaaggagc acgctaaatt tgtacatacc ccaaaatcaa tcagccatct 660 aggcaaatgg aatatcaaag taaacagtat acaactgggg atctcgtgcc gaattc 716 <210> 55 <211> 463 <212> DNA <213> Chlamydia trachomatis <400> 55 tctcaaatcc ttgctttgaa taatccagat atttcaaaaa ccatgttcga taaattcacc 60 cgacaaggac tccgtttcgt actagaagcc tctgtatcaa atattgagga tataggagat 120 cgcgttcggt taactatcaa tgggaatgtc gaagaatacg attacgttct cgtatctata 180 ggacgccgtt tgaatacaga aaatattggc ttggataaag ctggtgttat ttgtgatgaa 240 cgcggagtca tccctaccga tgccacaatg cgcacaaacg tacctaacat ttatgctatt 300 ggagatatca caggaaaatg gcaacttgcc catgtagctt ctcatcaagg aatcattgca 360 gcacggaata taggtggcca taaagaggaa atcgattact ctgctgtccc ttctgtgatc 420 tttaccttcc ctgaagtcgc ttcagtaggc ctctccccaa cag 463 <210> 56 <211> 829 <212> DNA <213> Chlamydia trachomatis <400> 56 gtáctatggg atcattagtt ggaagacagg ctccggattt ttctggtaaa gccgttgttt 60 gtggagaaga gaaagaaatc tctctagcag actttcgtgg taagtatgta gtgctcttct 120 tttatcctaa agattttacc tatgtttgtc ctacagaatt acatgctttt caagatagat 180 tggtagattt tgaagagcat ggtgcagtcg tccttggttg ctccgttgac gacattgaga 240 cacattctcg ttggctcact gtagcgagag atgcaggagg gatagaggga acagaatatc 300 ctctgttagc agacccctct tttaaaatat cagaagcttt tggtgttttg aatcctgaag 360 gatcgctcgc tttaagagct actttcctta tcgataaaca tggggttatt cgtcatgcgg 420 ttatcaatga tcttccttta gggcgttcca ttgacgagga attgcgtatt ttagattcat 480 tgatcttctt tgagaaccac ggaatggttt gtccagctaa ctggcgttct ggagagcgtg 540 gaatggtgcc ttctgaagag ggattaaaag aatacttcca gacgatggat taagcatctt 600 tgaaagtaag aaagtcgtac agatcttgat ctgaaaagag aágaaggctt tttaattttc 660 tgcagagagc cagcgaggct tcaataatgt tgaagtctcc gacaccaggc aatgctaagg 720 cgacgatatt agttagtgaa gtctgagtat taaggaaatg aaggccaaag aaatagctat 780 caataaagaa gccttcttcc ttgactctaa agaatagtat gtcgtatcc 829 <210> 57 <211> 1537 <212> DNA <2l3> Chlamydia trachomatis • · ·
178 <400> 57 acatcaagaa atagcggact cgcctttagt gaaaaaagct gaggagcaga acaacaagat attcaaacga tcacacctag tggtttggat attcctatcg tgggtcagct gcttccgcag gaagtgcggc aggagcgttg aaatcctcta aagaatttcc ttgttgcttg atgatgtaga caatgaaatg gcagcgattg ttttcgatct atgatcgaac aatttaatgt aaacaatcct gcaacagcta agctatggag gctcagctga ctgcgatgtc agatcaactg gttggtgcgg cccagccgaa atacaagcaa tcaaagatgc tcttgcgcaa gctttgaaac agatggttta gctacagcta tgggacaagt ggcttttgca gctgccaagg ctccgcagga acagctggča ctgtccagat gaatgtaaaa cagctttaca ttcttcgact tcttccagct cttatgcagc agcactttcc gatggatatt aacactgaac tctttatatt ccgaaagcag aagcggcgtg cagtcagcta tgcaaatccc gcgctttcca gaagcgtttc tcgttctggc atagaaagtc tgcagatgct agccaaagag cagcagaaac tattgtcaga gatagccaaa tgtatatagc cgcttacagg ttctggattc tttgatgtct acgattgtga agcaaatcaa gaagagatta tgcagaagct cacggcatct attagcaaag tgggtatcct gctgttcaga attctgtgga tagcttgcag aagtttgctg aagagagttt gttgatgggg aacgtagtct cgcagaatct caagagaatg acagcccgct ttcattcaac aggtgttggt aaacattgct tctctattct ttcttaacgt gtgattgaag tttgtgaatt gagggggagc caaaaaagaa ggctcttttt tcttttcaaa ggaatctcgt gtčtacagaa gtcttttcaa ttagttccaa aagaagaaaa tatataaaag aaaaa.actcc taattcattt cggcagactt cgtggaaaat gtctgtaaag ctggagggga atcagcagaa tatccgagaa aaaaggctca ggctcgtgcc gaattcggca cgagactacg cttttctttc ggaatctgtc attggatctg cgtaagactt aaagttcggc ctgtcttctc tttaggtttc ttgcgcgaga aaaattttct caagtaacaa ttttacagcc ggcatecggc ttctcgcgaa gtataac <210> 58 <211> 463 <212> DNA <213> Chlamydia trachomatis <400> 58 tctcaaatcc ttgctttgaa taatccagat atttcaaaaa ccatgttcga cgacaaggac tccgtttcgt actagaagcc tctgtatcaa atattgagga cgcgttcggt taactatcaa tgggaatgtc gaagaatacg attacgttct ggacgccgtt tgaatacaga aaatattggc ťtggataaag ctggtgttat cgcggagtca tccctaccga tgccacaatg cgcacaaacg tacctaacat ggagatatca caggaaaatg gcaacttgcc catgtagctt ctcatcaagg gcacggaata taggtggcca taaagaggaa atcgattact ctgctgtccc tttaccttcc ctgaagtcgc ttcagtaggc ctctccccaa cag ttaatcaagc ttggtccgag acaattcagg caatgcaagg aagagctaca atggcgagct aaccatcagc ttggaggagg agacagcgtt ctgcttacaa ttagtcaaac aaggacgcag cgttaggtga gcaatccgca ctccacaatt cacaattgga cgtttagaaa ctggttatct tttctttttt taataagttc aaaaagtgct agatgcaaga aaagaaaggt aacacaggct gaagatttct
120
180
240
300
360
420
480
540
600
660
720
780
840
900
960
1020
1080
1140
1200
1260
1320
1380
1440
1500
1537 taaattcacc tataggagat cgtatctata ttgtgatgaa ttatgctatt aatcattgca ttctgtgatc
120
180
240
300
360
420
463 <210> 59 <211> 552 <212> DNA <213> Chlamydia trachomatis <400> 59 acattcctcc tgctcctcgc ggccatccac aaattgaggt acggaatttt acacgtttct gctaaagatg ctgctagtgg ttgaagcaag ctctggatta aaagaagatg aaattcaaca ttcataaaga ggaagacaaa caacgaaaag aagcttctga gaatgatctt tagagccgaa aaagctgtga aagattacca ttgttaaaga aattgaagag catattgaga aagtacgcca ccacaacagc tatcaaagca gcttctgatg agttgagtac aagctatgca ggctcaatcc gcatccgcag cagcatcttc ggccaaacat taactccgaa gatctgaaaa aacatagttt gaggaagcgc ct aaccttcgat acgcgaacaa aatgatccgc tgtgaaaaat cgacaaaatt agcaatcaaa tcgtatgcaa tgcagcgaat cagcacacga attgatgcca aaaatccgta gatgcagagc gaagccgatg cctgcagaac gaagatgctt aaaatcggag gctcaaggag cctccagcag
120
180
240
300
360
420
480
540
552 <210> 60 • II
179 <211> 1180 <212> DNA <213> Chlamydia trachomatis <400> 60 atcctagcgg taaaactgct tactggtcag ataaaatcca tacagaagca acacgtactt 60 cttttaggag aaaaaateta taatgctaga aaaatcctga gtaaggatca cttctcctca 120 acaacttttt catcttggat agagttagtt tttagaacta agtcttctgc ttacaatgct 180 cttgcatatt acgagctttt tataaacctc cccaaccaaa ctctacaaaa agagtttcaa 240 tcgatcccct ataaatccgc atatattttg gccgctagaa aaggcgattt aaaaaccaag 300 gtcgatgtga tagggaaagt atgtggaatc tcgtgccgaa ttcggcacga gcggcacgag 360 gatgťagagt aattagttaa agagctgcat aattatgaca aagcatggaa aacgcattcg 420 tggtatccaa gagacttacg atttagctaa gtcgtattct ttgggtgaag cgatagatat 480 tttaaaacag tgtcctactg tgcgtttcga tcaaacggtt gatgtgtctg ttaaattagg 540 gatcgatcca agaaagagtg atcagcaaat tcgtggttcg gtttctttac ctcacggtac 600 aggtaaagtt ttgcgaattt tagtttttgc tgctggagat aaggctgcag aggctattga 660 agcaggagcg gactttgttg gtagcgacga cttggtagaa aaaatcaaag gtggatgggt 720 tgacttcgat gttgcggttg ccactcccga tatgatgaqa gaggtcggaa agctaggaaa 780 agttttaggt ccáagaaacc ttatgcctac gcctaaagcc ggaactgtaa caacagatgt 840 ggttaaaact attgcggaac tgcgaaaagg taaaattgaa tttaaagctg atcgagctgg 900 tgtatgcaac gtcggagttg cgaagctttc tttcgatagt gcgcaaatca aagaaaatgt 960 'tgaagcgttg tgtgcagcct tagttaaagc taagcccgca actgctaaag gacaatattt 1020 agttaatttc actatttcct cgaccatggg gccaggggtt accgtggata ctagggagtt 1080 gattgcgtta taattctaag tttaaagagg aaaaatgaaa gaagagaaaa agttgctgct 1140 tcgcgaggtt gaagaaaaga taaccgcttc tcggcacgag 1180 <210> 61 <211> 1215 <212> DNA <213> Chlamydia trachomatis <400> 61 attacagcgt gtgcaggtaa cgacatcatt gcatgatgct tttgatggca ttgatgcggc 60 attccttata gggtcagttc ctagaggccc aggaatggag agaagagatc ttctaaagaa 120 aaatggggag attgttgcta cgcaaggaaa agctttgaac acaacagcca agcgggatgc 180 aaagattttt gttgttggga accctgtgaa taccaattgc tggatagcaa tgaatcatgc 240 tcccagatta ttgagaaaga actttcatgc gatgctacga ttggaccaga atcgtatgca 300 tagcatgtta tcgcatagag cagaagtacc tttatcggct gtatcacaag ttgtggtttg 360 gggaaatcac tccgccaaac aagtgcctga ttttacgcaa gctctgatta atgaccgtcc 420 tatcgcagag acgatagcgg atcgtgattg gttagagaat attatggtgc cttctgtaca 480 gagtcgtggt agtgcagtaa ttgaagcacg agggaagtct tcggcagctt ctgcagcacg 540 agctttagca gaggctgctc gatcaatata tcagccaaaa gaaggactcg tgccgaattc 600 ggcacgagta tcgaaattgc aggcatttct agtgaatggt cgtatgctta taaactacgt 660 ggtacagact tgagctctca aaagtttgct acagattctt acatcgcaga cccttattct 720 aagaatatct actcccctca actatttgga tcccctaaac aagaaaagga ttacgcattt 780 agttacctga aatatgagga ttttgactgg gaaggcgaca ctcctttgca ccttccaaaa 840 gaaaattact tcatttatga aatgcatgtt cggtcattca cccgagatcc gtcttcccag 900 gtttcccatc ctggaacttt ccttggtatc atcgaaaaaa tagaccacct caaacaacta 960 ggcgttcatg cagttgaact ccttcctatt ttcgaattcg atgaaaccgt ccatccattt 1020 aaaaatcagg acttccccca cctgtgtaac tattgggggt attcttcggt gaattttttc 1080 tgcccctctc gccgttatac ttatggggca gacccttgcg ctccggcccg agagttcaag 1140 actcttgtca aagcgttaca ccgtgcggga atcgaagtca ttctcgatgt cgttttcaat 1200 catacaggct ttgaa 1215 <210> 62 <211> 688 <212> DNA <213> Chlamydia trachomatis <400> 62 .gtggatccaa aaaagaatct aaaaagccat acaaagattg cgttacttct tgcgatgcct 60
180 ctaacacttt atcagcgtca tctttgagaa gcatctcaat gagcgctttt tcttctctag 120 catgccgcac atccgcttct tcatgttctg tgaaatatgc atagtcttca ggattggaaa 180 atccaaagta ctcagtcaat ccacgaattt tctctctagc gatacgtgga atttgactct 240 cataagaata caaagcagcc actcctgcag ctaaagaatc tcctgtacac caccgcatga 300 aagtagctac tttcgctttt gctgcttcac taggctcatg agcctctaac tcttctggag 360 taactcctag agcaaacaca aactgcttcc acaaatcaat atgattaggg taaccgttct 420 cttcatccat caagttatct aacaataact tacgcgcctc taaatcatcg caacgactat 480 gaatcgcaga taaatattta ggaaaggctt tgatatgtaa ataatagtct ttggcacgag 540 cctgtaattg ctctttagta agctccccct tcgaccattt cacataaaac gtgtgttcta 600 gcatatgctt attttgaata attaaatcta actgatctaa aaaattcata aacacctcca 660 tcatttcttt tcttgactcc acgtaacc 688 <210> 63 <211> 269 <212> DNA <213> Chlamydia trachomatis <400> 63 atgttgaaat cacacaagct gttcctaaat atgctacggt aggatctccc tatcctgttg 60 aaattactgc tacaggtaaa agggattgtg ttgatgttat cattactcag caattaccat 120 gtgaagcaga gttcgtacgc agtgatccag cgacaactcc tactgctgat ggtaagctag 180 tttggaaaat tgaccgctta ggacaaggcg aaaagagtaa aattactgta tgggtaaaac 240 ctcttaaaga aggttgctgc tttacagct . 269 <210> 64 <211> 1339 <212> DNA <213> Chlamydia trachomatis <400> 64 cttttattat ggcttctggg gatgatgtca acgatatcga cctgctatct cgaggagatt 60 ttaaaattgt tatacagacg gctccagagg agatgcatgg attagcggac tttttggctc 120 ccccggcgaa ggatcttggt attctctccg cctgggaagc tggtgagctg cgttacaaac 180 agctagttaa tccttaggaa acatttctgg acctatgccc atcacattgg ctccgtgatc 240 cacatagaga gtttctcccg taattgcgct agctagggga gagactaaga aggctgctgc 300 tgcgcctact tgctcagctt ccattggaga aggtagtgga gcccagtctt ggtagtaatc 360 caccattctc tcaataaatc caatagcttt tcctgcacgg ctagctaatg gccctgccga 420 gatagtattc actcggactc cccaacgtcg gccggcttcc caagccagta cttttgtatc 480 actttctaaa gcagcttttg ctgcgttcat tcctccgcca taccctggaa cagcacgcat 540 ggaagcaaga taagttagag agatggtgct agctcctgca ttcataattg ggccaaaatg 600 agagagaagg ctgataaagg agtagctgga tgtacttaag gcggcaagat agcctttacg 660 agaggtatca agtaatggtt tagcaatttc cggactgttt gctaaagagt gaacaagaat 720 atcaatgtgt ccaaaatctt ttttcacctg ttctacaact tcggatacag tgtacccaga 780 aagatctttg taacgtttat tttccaaaat ttcctgagga atatcttctg gggtgtcgaa 840 actggcatcc atgggataga ttttagcgaa agttagcaat tctccattgg agagttcacg 900 agatgcattg aattttccta actcccaaga ttgagagaaa attttataga taggaaccca 960 ggtccccaca agtatggttg cgcctgcttc tgctaacatt ttggcaatgc cccagccata 1020 cccgttatca tcgcctatgc cggctatgaa agcaattttt cctgttaaat caattttcaa 1080 catgagctaa ccccattttg tcttcttgag agaggagagt agcagattct ttattattga 1140 gaaacgggcc tcataataca taaggagtag attcactggc tggatccagg tttctagagt 1200 aaagagtttc cttgtcaaat tcttatatgg gtagagttaa tcaactgttt tcaagtgatt 1260 tatgtttatt ttaaaataat ttgttttaac aactgtttaa tagttttaat ttttaaagtg 1320 tgaaaaacag gttttatat 1339 <210> 65 <211> 195 <212> PRT <213> Chlamydia trachomatis <400> 65
Met Gly Ser Leu Val Gly Arg Gin Ala Pro Asp. Phe Ser Gly Lys Ala
181
10 15
| Val | Val | Cys | Gly ' 20 | Glu | Glu | Lys | Glu | Ile 25 | Ser | Leu | Ala | Asp | Phe 30 | Arg | Gly |
| Lys | Tyr | Val 35 | Val | Leu | Phe | Phe | Tyr 40 | Pro | Lys Asp | Phe | Thr 45 | Tyr | Val | Cys | |
| Pro | Thr 50 | Glu | Leu | His | Ala | Phe 55 | Gin | Asp | Arg | Leu | Val 60 | Asp | Phe | Glu | Glu |
| His 65 | Gly | Ala | Val | Val | Leu 70 | Gly | Cys | Ser | Val | Asp 75 | Asp | Ile | Glu | Thr | His 80 |
| Ser | Arg | Trp | Leu | Thr 85 | Val | Ala | Arg | Asp | Ala 90 | Gly | Gly | Ile | Glu | Gly 95 | Thr |
| Glu | Tyr | Pro | Leu 100 | Leu | Ala | Asp | Pro | Ser 105 | Phe | Lys | Ile | Ser | Glu 110 | Ala | Phe |
| Gly | Val | Leu 115 | Asn | Pro | Glu | Gly | Ser 120 | Leu | Ala | Leu | Arg | Ala 125 | Thr | Phe | Leu |
| Ile | Asp 130 | Lys | His | Gly | Val | Ile 135 | Arg | His | Ala | Val | Ile 140 | Asn | Asp | Leu | Pro |
| Leu 145 | Gly | Arg | Ser | Ile | Asp 150 | Glu | Glu | Leu | Arg | Ile 155 | Leu | Asp | Ser | Leu | Ile 160 |
| Phe | Phe | Glu | Asn | His 165 | Gly | Met | Val | Cys | Pro 170 | Ala | Asn | Trp | Arg | Ser 175 | Gly |
| Glu | Arg | Gly | Met | Val | Pro | Ser | Glu | Glu | Gly | Leu | Lys | Glu | Tyr | Phe | Gin |
180 185 190
Thr Met Asp 195 <210> 66 <211> 520 <212> DNA <213> Chlamydia <400> 66 gatccgaatt cggcacgagg aggaatggaa gggccctccg attttaaatc tgctaccatg 60 ccattcacta gaaactccat aacagcggtt ttctctgatg gcgagtaaga agcaagcatt 120 tgatgtaaat tagcgcaatt agagggggat gaggttactt ggaaatataa ggagcgaagc 180 gatgaaggag atgtatttgc tctggaagca aaggtttctg aagctaacag aacattgcgt 240 cctccaacaa tcgcctgagg attctggctc atcagttgat gctttgcctg aatgagagcg 300 gacttaagtt tcccatcaga gggagctatt tgaattagat aatcaagagc tagatccttt 360 attgtgggat cagaaaattt acttgtgagc gcatcgagaa tttcgtcaga agaagaatca 420 tcatcgaacg aatttttcaa tcctcgaaaa tcttctccag agacttcgga aagatcttct 480 gtgaaacgat cttcaagagg agtatcgcct ttttcctctg 520
| <210> | 67 |
| <211> | 276 |
| <212> | DNA |
| <213> | Chlamydia |
| <400> | 67 |
182 gatccgaatt cggcacgagg tattgaagga gaaggatctg actcgatcta tgaaatcatg 60 atgcctatct atgaagttat gaatatggat ctagaaacac .gaagatcttt tgcggtacag 120 caagggcact atcaggaccc aagagcttca gattatgacc tcccacgtgc tagcgactat 180 gatttgccta gaagcccata tcctactcca cctttgcctt ctagatatca gctacagaat 240 atggatgtag aagcagggtt ccgtgaggca gtttat 276 <210> 68 <211> 248 <212> DNA <213> Chlamydia <400> 68 gatccgaatt cggcacgagg tgttcaagaa tatgtccttc aagaatgggt taaattgaaa 60 gatctaccgg tagaagagtt gctagaaaaa cgatatcaga aattccgaac gataggtcta 120 tatgaaactt cttctgaaag cgattctgag gcataagaag catttagttt tattcggttt 180 ttctctttta tccatattag ggctaacgat aacgtctcaa gcagaaattt tttctctagg 240 tcttattg 248 <210> 69 <211> 715 <212> DNA <213> Chlamydia <220>
< 2 21 > různé vlastnosti <222> 34 <223> n=A,T,C nebo G <400> 69 gatccgaatt cggcacgaga aggtagatcc gatntcagca aaagtgctcc taaaggaaga 60 ttccttcggt atcctgcagc aaataaggtg gcacactcca tctcggacag tttgagcttt 120 attttcatat agttttcgac ggaactcttt attaaactcc caaaaccgaa tgttagtcgt 180 gtgggtgatg cctatatggt aagggaggtt tttggcttcg agaatattgg tgatcatttt 240 ttgtacgaca aaattagcta atgcagggac ctctgggggg aagtatgcat ctgatgttcc 300 atcttttcgg atgctagcaa cagggacaaa ataatctcct atttggtagt gggatcttaa 360 gcctccgcac atgcccaaca tgatcgctgc tgtagcattg ggaaggaaag aacacagatc 420 tacggtaaga gctgctcctg gagagcctaa tttaaaatcg atgattgagg tgtgaatttg 480 aggcgcatgc gctgccgaaa acatggatcc tcgagaaaca gggacctgat agatttcagc 540 gaaaacatcc acggtaatac ccmaaattag taagaaggag atagggctgg aactcttgaa 600 tggtagagcc ggtatagcgc tctagcatgt cacaggcgat tgtttcttcg ctgatttttt 660 tatgttgatg ggtcataaat cacagatatt ataatggtta gagaatcttt ttttc 715 <210> 70 <211> 323 <212> DNA <213> Chlamydia <400> 70 gatccgaatt cggcacgagc agaacgtaaa cagcacactt aaaccgtgta tgaggtttaa 60 cactgtttgg caagcaaaca accattcctc tttccacatc gttcttacca atacctctga 120 ggagcaatcc aacattctct cctgcacgac cttctgggag ttettttctg aacatttcaa 180 ccccagtaac aatcgtttct ttagtatctc taagaccgac caactgaact ttatcggaaa 240 ctttaacaat tccacgctca atacgtccag ttactacagt tcctcgtccg gagatagaga 300 aeacgtcctc aatgggcatt aag 323 <210> 71 <211> 715 <212> DNA <213> Chlamydia <400> 71 • ···» ·· «· . ··-···· * · ···. to · to • ··» « to ··· · · i • .'··· · · · · « · · • · ' · · · · · w ·
183 gatccgaatt cggcacgagg aaaaaaagat tctctaacca ttataatatc tgtgatttat 60 gacccatcaa cataaaaaaa tcagcgaaga aacaatcgcc tgtgacatgc tagagcggct 120 ataccggctc taccattcaa gagttccagc cctatctcct tcttactaat tttgggtatt 180 acgtggatgt tttcgctgaa atctatcagg tccctgtttc tcgaggatcc atgttttcgg 240 gcagcgcatg cgcctcaaat tcacacctca atcatcgatt ttaaattagg ctctccagga 300 gcagctctta ccgtagatct gtgttctttc cttcccaatg ctacagcagc gatcatgttg 360 ggcatgtgcg gaggcttaag atcccactac caaataggag attattttgt ccctgttgct 420 agcatccgaa aagatggaac atcagatgca tacttccccc cagaggtccc tgcattagct 480 aattttgtcg tacaaaaaat gatcaccaat attctcgaag ccaaaaacct cccttaccat 540 ataggcatca cccacacgac taacattcgg ttttgggagt ttaataaaga gttccgtcga 600 aaactatatg aaaataaagc tcaaactgtc gagatggagt gtgccacctt atttgctgca 660 ggataccgaa ggaatcttcc tttaggagca cttttgctga tatcggatct acctt 715 <210> 72 <211> 641 <212> DNA <213> Chlamydia <220> „ , <22i> nizne vlastnosti <222> 550,559,575,583,634,638 <223> n=A, T,C nebo θ <400> 72 gatccgaatt cggcacgaga tctcctcgag ctcgatcaaa cccacacttg ggacaagtac 60 ctacaacata acggtccgct aaaaacttcc cttcttcctc agaatacagc tgttcggtca 120 cctgattctc taccagtccg cgttcctgca agtttcgata gaaatcttgc acaatagcag 180 gatgataagc gttcgtagtt ctggaaaaga aatctacaga aattcccaat ttcttgaagg 24Ď tatctttatg aagcttatga tacatgtcga catattcttg ataccccatg cctgccaact 300 ctgcattaag ggtáattgcg attccgtatt catcagaacc acaaatatac aaaacctctt 360 tgccttgtag tctctgaaaa cgcgcataaa catctgcagg caaataagca ccggtaatat 420 gtccaaaatg caaaggacca tttgcgtaag gcaacgcaga agtaataaga atacgggaag 480 ahtccactat ttcacgtcgč tccagttgta cagagaagga tcttttcttc tggatgttcc 540 gaaaccttgn tctcttcgnc tctctcctgt agcanacaaa tgnctctctc gacatctctt 600 tcagcgtatt cggactgatg ccctaaagat cccnggangt t 641 <210> 73 · ' <211> 584 <212> DNA <213> Chlamydia <220>
<221> různé vlastnosti <222> 460,523,541,546 <223> n=A,T,C neboQ <400> 73 gaattcggca cgagacattt ctagaatgga accggcaaca aacaaaaact ttgtatctga 60 agatgacttt aagcaatctt tagataggga agattttttg gaatgggtct ttttatttgg 120 gacttattac ggaacgagta aggcggagat ttctagagtt ctgcaaaagg gtaagcactg 180 catagccgtg attgatgtac aaggagcttt ggctctgaag aagcaaatgc cggcagtcac 240 tatttttatt caagctccct ctcaagaaga acttgagcgc cgtttgaatg ctcgggattc 300 agagaaagat ttccagaaga aagaaagatt agagcatagc gctgtcgaaa ttgctgccgc 360 tagcgaattt gattatgttg tggttaatga tgatttgatt acagcatatc aagttttaag 420 aagtattttt atagctgaag aacataggat gagtcatggn tagaaaagat cgtttaacta 480 atgaaagact gaataagcta tttgatagcc cctttagttt ggntaattac gtaattaagc 540 nagctnagaa caaaattgct agaggagatg ttcgttcttc taac 584 <210> 74 <211> 465 <212> DNA • · · · · · · « '· ·· <· · • · ·· · • · · · • · » • · ··
184 <213> Chlamydia <400> 74 gatccgaatt cggcacgagc tcgtgccgtt tgggatcgtg taatcgcatc ggagaatggt 60 taagaaatta ttttcgagtg aaagagctag gcgtaatcat tacagatagc catactactc 120 caatgcggcg tggagtactg ggtatcgggc tgtgttggta tggattttct ccattacaca 180 actatatagg atcgctagat tgtttcggtc gtcccttaca gatgacgcaa agtaatcttg 240 tagatgcctt agcagttgcg gctgttgttt gtatgggaga ggggaatgag caaacaccgt 300 tagcggtgat agagcaggca cctaatatgg tctaccattc atatcctact tctcgagaag 360 agtattgttc tttgcgcata gatgaaacag aggacttata cggacctttt ttgcaagcgg 420' ttaccgtgga gtcaagaaaa gaaatgatgg aggtgtttat gaatt 465
| <210> | 75 |
| <211> | 545 |
| <212> | DNA |
| <213> | Chlamydia |
| <400> | 75 |
gaattcggca cgagatgaaa agttagcgtc acaggggatt ctcctaccaa agaattccga 60 aaagttttct tccaaaaacc tcttcctctc ttgattagtg atccctctgc aactacttta 120 ctatatgttc tgtgaaatat gcatagtctt caggattgga aaatccaaag tactcagtca 180 atccacgaat tttctctcta gcgatacgtg gaatttgact ctcataagaa tacaaagcag 240 čcactcctgc agctaaagaa tctcctgtac accaccgcat gaaagtagct actttcgctt 300 ttgctgcttc actaggctca tgagcctcta actcttctgg agtaactcct agagcaaaca 360 caaactgctt ccacaaatca atatgattag ggtaaccgtt ctcttcatcc atcaagttat 420 ctaacaataa cttacgcgcc tctaaatcat cgcaacgačt atgaatcgca gataaatatt 480 taggaaaggc tttgatatgt aaataatagt ctttggcata cgcctgtaat tgctctttag 540 taagc 545 <210> 76 <211> 797 <212> DNA <213> Chlamydia <220>
<22i> různé vlastnosti <222> 788,789 <223> n=A,T,c nebo G <4 00> 76 ...
gatccgaatt cggcacgaga tacgctagat gcgataaatg cggataatga ggattatcct 60 aaaccaggtg acttcccacg atcttccttc tctagtacgc ctcctcatgc tccagtacct 120 caatctgaga ttccaacgtc acctacctca acacagcctc catcacccta acttgtaaaa 180 actgtaataa aaagagcgcg cttcctttat gcaaaatcaa tttgaacaac tccttactga 240 attagggact caaatcaaca gccctcttac tcctgattcc aataatgcct gtatagttcg 300 ctttggatac aacaatgttg ctgtacaaat tgaagaggat ggtaattcag gatttttagt 360 tgctggagtc atgcttggaa aacttccaga gaataccttt agacaaaaaa ttttcaaagc 420 tgctttgtct atcaatggat ctccgcaatc taatattaaa ggcactctag gatacggtga 480 aatctctaac caactctatc tctgtgatcg gcttaacatg acctatctaa atggagaaaa 540 gctcgcccgt tacttagttc ttttttcgca gcatgccaat atctggatgc aatctatctc 600 aaaaggagaa cttccagatt tacatgctct aggtatgtat cacctgtaaa ttatgccgtc 660 attatcccaa tcccgacgta tcatccagca atcttccatt cgaaagattt ggaatcagat 720 agatacttct cctaagcatg ggggtatgcg taccggttat ttttctcttc atactcaaaa 780 aaagttgnng gggaata 797 <210> 77 <211> 399 <212> DNA <213> Chlamydia <400> 77
185 catatgcatc accatcacca tcacatgcca cgcatcattg aaaaagttaa aaataagtct gacatatatt tatggaatag atcattaaaa agttgaagtt agatcctgag gcaagagcct gtaggacgac tgaactctct gctacaatca gaatataccg cgtgttcaat cggatatcaa aagattgatc gccatccatt agactttctt taccagtaag aggacaacgt acaaaaacta aaaagaaaaa cagtcgcagg taagaagaaa taagaattc
| <210> | 78 |
| <211> | 285 |
| <212> | DNA |
| <213> | Chlamydia |
| <400> | 78 |
atgcatcacc atcaccatca catgagtcaa aáaaataaaa gtgaatattt ccacagattt agcagttata gttggcaagg attgtaaaga aagtttggga atacattaaa aaacacaact cgtaatatcc ttcccgatgc gaatcttgcc aaagtctttg atgttccaaa tgaccaaagc cctttccaaa catattgtaa
| <210> | 79 |
| <211> | 950 |
| <212> | DNA |
| <213> | Chlamydia |
| <400> | 79 |
aaattaactc gagcacaaat tacggcaatt gctgagcaaa gttcttttag agtccgccga gagaatggtt gaagggactg gtagagtaat tagttaaaga gctgcataat tatgacaaag tatccaagag acttacgatt tagctaagtc gtattctttg aaaacagtgt cctactgtgc gtttcgatca aacggttgat cgatccaaga aagagtgatc agcaaattcg tggttcggtt taaagttttg cgaattttag tttttgctgc tggagataag aggagcggač tttgttggta gcgácgactt ggtagaaaaa cttcgatgtt gcggttgcca ctcccgatat gatgagagag tttaggtcca agaaacctta tgcctacgcc táaagccgga taaaactatt gcggaactgc gaáaaggtaa aattgaattt atgcaacgtc ggagttgcga agctttcttt cgatagtgcg agcgttgtgt gcagccttag ttaaagctaa gcccgcaact taatttcact atttcctcga ccatggggcc aggggttacc tgcgttataa ttctaagttt aaagaggaaa aatgaaagaa cgaggttgaa gaaaagataa ócgcttctca aggttttatt
| <210> | 80 |
| <211> | 395 |
| <212> | DNA |
| <213> | Chlamydia |
| <4 00> | 80 |
tttcaaggat tttgttttcc cgatcatctt actaaatgca ggctggttta gcatctaagg caacagaagc tcctctgctg agtaggtgtt cctacttgcg atagcatcgt tcctagtcct gctaacttca tcaaagcgag ctagattcat tttatcgttg gaccattgac atttgagatc ccagaatcga gttcgcatag ataagcccat tgtctataag agtcaaattt ccagagcgct ttgatcagga tccagagtga gtgttcctgt atatc <210> 81 <211> 2085 <212> DNA <213> Chlamydia ► · 9 99
9>9 9 999 gaattgatat gatcagctcg ctgaattaac tagaagggga cttatcgagg attctcgtac actctgcttt gacctatgcc gtcaggatca gctctagtga aataa agatgaagga cccgaagcat catggaaaac ggtgaagcga gtgtctgtta tctttacctc gctgcagagg atcaaaggtg gtcggaaagc actgtaacaa aaagctgatc caaatcaaag gctaaaggac gtggatacta gagaaaaagt ttgttgagat tcctgcaaag ttctgatgaa tgaagaagaa tttgcgacgt tcagagacat tcgaaaaggt gctccaacaa taataagtga gatatccaca agcaagcctt aaatgattqt gagatcgttc tatgcatccc cagaaccgaa aaaaaataaa tcctatcgac catggatgtc gggtgtagat gcattcgtgg tagatatttt aattagggat acggtacagg ctattgaagc gatgggttga taggaaaagt cagatgtggt gagctggtgt aaaatgttga aatatttagt gggagttgat tgctgcttcg tcacatcatg attcttcaga ggttgttata gtttgactgt ctctaggtac cattttgtag
120
180
240
300
360
399
120
180
240
285
120 180 240 300 360 420 4 80 540 600 660 720 780 840 900 950
120
180
240
300
360
395 • · ·
186 <400> 81 atttggcgaa ggagtttggg ctacggctat taataaatca ttcgtgttcg ctgcctccaa 60 gaccagattg tqtactttct tatgaagaat ctcctattga gcaaatgttg cgttggggag 120 agtctcagtt agaacaatťt gctcaagtag gtttagatac aagttggcaa gttgttttcg 180 atccaggaat aggatttggg aagactcccg ttcagtcgat gttattgatg gatggagtaa 240 agcagtttaa acgtgtttta gagtgtcctg tattaatagg ccattctaga aaatcgtgtt 300 tgagtatgtt gggccgattt aatagtgacg atcgtgattg ggaaacgatc ggctgttctg 360 tatctcttca tgatcgagga gttgattatc tacgtgtgca tcaggttgaa ggtaacagac 420 gtgccttagc cgctgctgct tgggctggta tgtttgtatg atccaagcaa caggtatcgt 480 tgctattgat cccagaggag tgatgggagc tttaggcaag ctcccttgga gttatcccga 540 agatctacgt ttttttgcag aaaccattcg aaatcatccc atcattatgg gacgaaagac 600 ttgggagtct cttccagaca agtataagca tgggcgggat atcgttgtct tttctcgcag 660 gatgcatcca ccacaatgca taggagtttc ttcctttgca gagtatggga cactatcttt 720 gaatcatccg tttttaattg ggggagcgga gctctttgaa agttttttcc aacaaaacct 780 tctgaaagct tgťtttgtca cacatatcaa aaagaaatat tggggcgata etttcttccc 840 tatcacgcga ttatcaggat ggaagaagga atgtatttgt aatacagagg atttcagtat 900 ttattattat gaaaataact ccgatcaaaa cacgtaaagt atttgcacat gattcgcttc 960 aagagatctt gcaagaggct ttgccgcctc tgcaagaacg gagtgtggta gttgtctctt 1020 caaagattgt gagtttatgt gaaggcgctg tcgctgatgc aagaatgtgc aaagcagagt .1080 tgataaaaaa agaagcggat gcttatttgt tttgtgagaa aagcgggata tatctaacga 1140 aaaaagaagg tattttgatt ccttctgcag ggattgatga atcgaatacg gaccagcctt 1200 ttgttttata tcctaaagat attttgggat cgtgtaatcg catcggagaa tggttaagaa 1260 attattttcg agtgaaagag ctaggcgtaa tcattacaga tagccatact actccaatgc 1320 ggcgtggagt actgggtatc gggctgtgtt ggtatggatt ttctccatta cacaactata 1380 taggatcgct agattgtttc ggtcgtccct tacagatgac gcaaagtaat cttgtagatg 1440 ccttagcagt tgcggctgtt gtttgtatgg gagaggggaa tgagcaaaca ccgttagcgg 1500 tgatagagca ggcacctaat atggtctacc attcatatcc tacttctcga gaagagtatt 1560 gttctttgcg catagatgaa acagaggact tatacggacc ttttttgcaa gcggttacgt 1620 ggagtcaaga aaagaaatga tggaggtgtt tatgaatttt ttagatcagt tagatttaat 1680 tattcaaaat aagcatatgc tagaacacac gttttatgtg aaatggtcga agggggagct 1740 tactaaagag caattacagg cgtatgccaa agactattat ttacatatca aagcctttcc 1800 taaatattta tctgcgattc atagtcgttg cgatgattta gaggcgcgta agttattgtt 1860 agataacttg atggatgaag agaacggtta ccctaatcat attgatttgt ggaagcagtt 1920 tgtgtttgct ctaggagtta ctccagaaga gttagaggct catgagccta gtgaagcagc 1980 aaaagcgaaa gtagctactt tcatgcggtg gtgtacagga gattctttag ctgcaggagt 2040 ggctgctttg tattcttatg agagtcaaat tccacgtatc gcctc 2085
| <210> | 82 |
| <211> | 405 |
| <212> | DNA |
| <213> | Chlamydia |
| <400> | 82 |
ttcatcggtc tagttcgcta ttctactctc caatggttcc gcatttttgg gcagagcttc 60 gcaatcatta tgcaacgagt ggtttgaaaa gcgggtacaa tattgggagt accgatgggt 120 ttctccctgt cattgggcct gttatatggg agtcggaggg tcttttccgc gcttatattt 180 cttcggtgac tgatggggat ggtaagagcc ataaagtagg atttctaaga attcctacat 240 atagttggca ggacatggaa gattttgatc cttcaggacc gcctccttgg gaagaattgt 300 attggctcca taaagggagg agaaaacttc gatataggga atcgtatcaa ggtgaaagta 360 gcaaaaaata aattagctcc tccattccga actgcagaat ttgat 405
| <210> | 83 |
| <211> | 379 |
| <212> | DNA |
| <213> | Chlamydia |
| <400> | 83 |
tataccattc gtttgaaagt gcctttgacg ggagaaagtg tttttgaaga tcaatgcaaa 60. ggtcgtgtcg ttttcccttg ggcagatgtt gacgatcaag ttttggttaa atcagacggg 120 ttccctacgt atcactttgc taatgtagtt gatgatcatt tgatggggat tacccatgtg 180
187 ttgcgagggg aagagtggtt aagttctaca cctaaacacc ttcttcttta caaagctttt 240
999tgggagc ctccgcagtt tttccatatg ccgcttcttc taaatcctga tggaagtaag 300 ctttccaaga gaaagaatcc tacttctatt ttttactatc gggatgctgg atacaaaaaa 360 gaagcgttca tgaatttcc 379 <210> 84 <211> 715 <212> DNA <213> Chlamydia <400> 84 tcaatcctgt attaataatt ctggttctta gactacataa attaggaacg cctgatgagt 60 atccataact aatcgcgtag ggcttagaat caccttctcg taccaaagct agaacaacgc 120 cgccttccat tcttgatgca ataatatctg ctgagactaa gaacatgctc ccagagcttt 180 tgggtgtgac tgtgaatttt cctatttcag ttcctcctaa taaagtttca atgttcctgg 240 gagtgaataa cccgttgcat tgaattttat tagtgattgg aaagttgtta aaagctttca 300 acaaacctag agaagggtct gttgtgattt tgtctaaaat atcttggact gtactatcaa 360 caatagtatc agcaattcca ccaagaattt gatctcccaa cttttctaga ataagctggt 420 aagctttttc cgcatccaaa ccaattgtaa tagaagcatt ggttgatgga ttattggaga 480 ctgttaaaga tattccatca gaagctgtca ttttggctgc gacaggtgtt gatgttgtcc 540 caaggattat ttgctggtcc ttgagcggct ctgtcatttg cccaactttg atattatcag 600 caaagacgca gttttgagtg ttatacaaat aaaaaccaga atttcccatt ttaaaactct 660 tttttatttt gagctttaaa taaattaggt ttttagtttc aagtttgcta ttaat 715 <210> 85 <211> 476 <212> DNA <213> Chlamydia <400> 85 ctcgtgccgc tcgtgccgct cgtgccggtc ttttagaaga gcgtgaagct ttaaataatt 60 cgattacgtt tatcatggat aagcgtaatt ggatagaaac cgagtctgaa caggtacaag 120 tggttttcag agatagtaca gcttgcttag gaggaggcgc tattgcagct caagaaattg 180 tttctattca gaacaatcag gctgggattt ccttcgaggg aggtaaggct agtttcggag 240 gaggtattgc gtgtggatct ttttcttccg caggcggtgc ttctgtttta gggactattg 300 atatttcgaa gaatttaggc gcgatttcgt tctctcgtac tttatgtacg acctcagatt 360 taggacaaat ggagtaccag ggaggaggag ctctatttgg tgaaaatatt tctctttctg 420 agaatgctgg tgtgctcacc tttaaagaca acattgtgaa gacttttgct tcgaat 476 <210> 86 <211> 1551 <212> DNA <213> Chlamydia .
<400> 86 gcgtatcgat atttcttctg ttacattctt tatagggatt ctgttggctg ttaatgcgct 60 aacctactct catgtattac gggatttatc tgtgagtatg gatgcgctgt tttctcgtaa 120 cacgcttgct gttcttttag gtttagtctc tagcgtttta gataatgtgc cattagtcgc 180 tgcaacaata ggtatgtatg acttacctat gaacgatcct ctttggaaac tcattgccta 240 tacagcaggc acagggggaa gtattctcat cattggatcc gctgcaggtg ttgcctacat 300 gggaatggaa aaagtgagtt tcggctggta tgtcaaacac gcttcttgga ttgctttagc 360 cagttatttt ggaggtctag cagtctattt tctaatggaa aattgtgtga atttgttcgt 420 ttgaggtagt cagtatggca gagtttcttt aaaaattctt ttaataaaag ggttctctgc 480 ctattctagg cccctttttg aatggaaaaa tgggtttttg gagaacatcg attatgaaaa 540 tgaataggat ttggctatta ctgcttacct tttcttctgc catacattct cctgtacgag 600 gagaaagctt ggtttgcaag aatgctcttc aagatttgag ttttttagag catttattac 660 aggttaaata tgctcctaaa acatggaaag agcaatactt aggatgggat cttgttcaaa 720 gctccgtttc tgcacagcag aagcttcgta cacaagaaaa tccatcaaca agtttttgcc 780 agcaggtcct tgctgatttt atcggaggat taaatgactt tcacgctgga gtaactttct 840 ttgcgataga aagtgcťtac cttccttata ccgtacaaaa aagtagtgac ggccgtttct 900 actttgtaga tatcatgact ttttcttcag agatccgtgť tggagatgag ttgctagagg 960
9» 9·9'9 ♦ 9 f· f·· ·
188 tggatggggc gcctgtccaa gatgtgctcg ctactctata tggaagcaat cacaaaggga 1020 ctgcagctga agagtcggct gctttaagaa cactattttc tcgcatggcc tctttagggc 1080 acaaagtacc ttctgggcgc actactttaa agattcgtcg tccttttggt actacgagag 1140 aagttcgtgt gaaatggcgt tatgttcctg aaggtgtagg agatttggct accatagctc 1200 cttctatcag ggctccacag ttacagaaat cgatgagaag čtttttccct aagaaagatg 1260 atgcgtttca tcggtctagt tcgctattct actctccaat ggttccgcat ttttgggeag 1320 agcttcgcaa tcattatgca acgagtggtt tgaaaagcgg gtacaatatt gggagtaccg 1380 atgggtttct ccctgtcatt gggcctgtta tatgggagtc ggagggtctt ttccgcgctt 1440 atatttcttc ggtgactgat ggggatggta agagccataa agtaggattt ctaagaattc 1500:
ctacatatag ttggcaggac atggaagatt ttgatccttc aggaccgcct c 155Γ <210> 87 <211> 3031 , <212> DNA <213> Chlamydia <400> 87 atgtaggccc tcaagcggtt ttattgttag accaaattcg agatctattc gttgggtcta 60 aagatagtca ggctgaagga cagtataggt taattgtagg agatccaagt tctttccaag 120 agaaagatgc agatactctt cccgggaagg tagagcaaag tactttgttc tcagtaacca 180 atcccgtggt tttccaaggt gtggaccaac aggatcaagt ctcttcccaa gggttaattt 240 gtagttttac gagcagcaac cttgattctc cccgtgacgg agaatctttt ttaggtattg 300 cttttgttgg ggatagtagt aaggctggaa tcacattaac tgacgtgaaa gcttctttgt 360 ctggagcggc tttatattct acagaagatc ttatctttga aaagattaag ggtggattgg 420 aatttgcatc atgttcttct etagaacagg ggggagcttg tgcagctcaa agtattttga 480 ttcatgattg tcaaggattg caggttaaac actgtactac agccgtgaat gctgaggggt 540 ctagtgcgaa tgatcatctt ggatttggag gaggcgcttt ctttgttacg ggttctcttt 600 ctggagagaa aagtctctat atgcctgcag gagatatggt agttgcgaat tgtgatgggg 660 ctatatcttt tgaaggaaac agcgcgaact ttgctaatgg aggagcgatt gctgcctctg 720 ggaaagtgct ttttgtcgct aatgataaaa agacttcttt tatagagaac cgagctttgt 780 ctggaggagc gattgcagcc tcttctgata ttgcctttca aaactgcgca gaactagttt 840 tcaaaggcaa ttgtgcaatt ggaacagagg ataaaggttc tttaggtgga ggggctatat 900 cttctctagg caccgttctt ttgcaaggga atcacgggat aacttgtgat aataatgagt 960 ctgcttcgca aggaggcgcc atttttggca aaaattgtca gatttctgac aacgaggggc 1020 cagtggtttt cagagatagt acagcttgct taggaggagg cgctattgca gctcaagaaa 1080 ttgtttctat tcagaacaat caggctggga tttccttcga gggaggtaag gctagtttcg 1140 gaggaggtat tgcgtgtgga tctttttctt ccgcaggcgg tgcttctgtt ttagggacta 1200 ttgatatttc gaagaattta ggcgcgattt cgttctctcg tactttatgt acgacctcag 1260 atttaggaca aatggagtac cagggaggag gagctctatt tggtgaaaat atttctcttt 1320 ctgagaatgc tggtgtgctc acctttaaag acaacattgt gaagactttt gcttcgaatg 1380 ggaaaattct gggaggagga gcgattttag ctactggtaa ggtggaaatt accaataatt 1440 ccggaggaat ttcttttaca ggaaatgcga gagctccaca agctcttcca actcaagagg 1500 agtttccttt attcagcaaa aaagaagggc gaccactctc ttcaggatat tctgggggag 1560 gagcgatttt aggaagagaa gtagctattc tccacaacgc tgcagtagta tttgagcaaa 1620 atcgtttgca gtgcagcgaa gaagaagcga cattattagg ttgttgtgga ggaggcgctg 1680 ttcatgggat ggatagcact tcgattgttg gcaactcttc agtaagattt ggtaataatt 1740 acgcaatggg acaaggagtc tcaggaggag ctcttttatc taaaacagtg cagttagctg 1800 gaaatggaag cgtcgatttt tctcgaaata ttgctagttt gggaggacgc aatgttctgt 1860 tagcttcaga aacctttgct tccagagcaa atacatctcc ttcatcgctt cgctccttat 1920 atttccaagt aacctcatcc ccctctaatt gcgctaattt acatcaaatg cttgcttctt 1980 actcgccatc agagaaaacc gctgttatgg agtttctagť gaatggcatg gtagcagatt 2040 taaaatcgga gggcccttcc attcctcctg caaaattgca agtatatatg acggaactaa 2100 gcaatctcca agccttacac tctgtagata gcttttttga tagaaatatt gggaacttgg 2160 aaaatagctt aaagcatgaa ggacatgccc ctattccatc cttaacgacaggaaatttaa 2220 ctaaaacctt cttacaatta gtagaagata aattcccttc ctcttccaaa gctcaaaagg 2280 cattaaatga actggtaggc ccagatactg gtcctcaaac tgaagtttta aacttattct 2340 tccgcgctct taatggctgt tcgcctagaa tattctctgg agctgaaaaa aaacagcagc 2400 tggcatcggt tatcacaaat acgctagatg cgataaatgc ggataatgag gattatccta 2460 aaccaggtga cttcccacga tcttccttct ctagtacgcc tcctcatgct ccagtácctc 2520 aatctgagat tccaacgtca cctacctcaa cacagcctcc atcaccctaa cttgtaaaaa 2580 ctgtaataaa aagagcgcgc ttcctttatg caaaatcaat- ttgaacaact ccttactgaa 2640
V wx
189 k ·' ·'· • ··· • · ·
··«· 999
999 9 · ' · « ·* ttsgggactc aaateaacag ccctcttact cctgattcca ataatgcctg tatagttcgc 2700 tttggataca acaatgttgc tgtacaaatt gaagaggatg gtaattcagg atttttagtt 2760 gctggagtca tgcttggaaa acttacagag aataccttta gacaaaaaat ttrcaaaget 2020 gctttgtcta teaatggatc tccgcaatct aatattaaag gcactctagg atacggtgaa 2880 atctctaacc aactctatct ctgtgatcgg cttaaeatga cctatctaaa tcgagaaaag 2940 ctcgcccgtt acttagttct tttttogcag catgccaata tctggatgca atčtatctca 3000 aaaggagaac ttccagattt acatgctcta g 3031 <210? 88 <211> 976 <2I2> DHA <213> Chlamydia <400> 88 aggtggatgg ggcgccfegtc caagatgtgc tcgctactct atatggaagc eascacassg 60 ggactgcagc tgaagagtcg gctgctttaa gaacactatt ttctegcatg gcetctttag 120 ggcacaaagt acctfcetggg cgcaetactt taaagattcg tcgtectttt gg-tsctacga 180 gagaagttcg tgtgaaatgg cgttatgttc ctgaaggtgt aggagatttg gctaecatag 240 etccttctat cagggctcca cagttacaga aatcgatgag aagctttttc cct.aagaasg 300 atgatgcgtt tcatcggtct agttcgctat tctartctcc aatggttccg catrtfctggg 360 cagagettcg caateattat gcaacgagtg gtttgaaaag cgggtacaat attgggagta «20 ecgatgggtt tctccctgtc attgggcctg ttatatggga gtcggagggt cttttccgcg 480 cťtatatttc ttcggtgact gatggggatg gtaagagcca taaagtagga tttctaagaa 540 ttcctacata tagttggcag gacatggaag attttgatcc tteaggaceg cctccttggg 600 aagaatttgc taagattatt caagtatttt ettctaatac agaagctttg attatcgaec 660 aaacgaacaa cccaggtggt agtgtccttt atctttatgc aotqetfctcc &tgt.tgacag 720 accgtccttt agaacttcct aaacatagaa tgattctgac tcaggatgaa gtgettgatg 780 ctttagattg gttaaccctg ttggaaaacg tagacacaaa cgtggagtct Cgccittgctc 840 tgggagaeaa eatggaagga tatactgtgg atctacaggt tgccgagtat ttasaaagct 900 ttggacgtaa agtattgaat tgttggagta aaggggatat egagttatea acacctattc 9G0 ctetttttgg ttttga 97 6 <210> 89 <2ll> 94 <212? PRT <213> Chlamydia
| <400> 89 | Met Ser Gin Lys Asn Lys Asn Ser | Ala | |||||||||||||
| Mat His | His His | His 5 | His | His | |||||||||||
| 10 | 15 | ||||||||||||||
| Phe | Met | His | Pro 20 | val | Asn | Ile | Ser | Thr • 25 | Asp Len | Ala | Val | Ile 30 | val | Gly | |
| Lys | Gly. | Pro 35 | Met | Pro | Arg | Thr | Gin 40 | Ile | Val | Lys | Lys | Val 45 | Trp | Glu | Tyr |
| Ile | Lys 50 | Lys | His | Asn | Cys | Gin 55 | Asp | Gin | Lys | Asn | Lys 60 | Arg | Asn | Ile | Leu |
| Pro 65 | Asp | Ala | Asn | Leu | Ala 70 | Lys | Val | Phe | Gly | Ser 75 | Ser | Asp | Pro | Ile | Asp 80 |
| Met | Phe | Gin | Met | Thr 85 | Lys | Ala | Len | Ser | Lys 90 | His | Ile | Val | Lys |
<210> 90 <211> 474 <212> PSI <213> Chlamydia
99 • ··· · 9 ··· · · · • · · · 9 9 · · · · .
9 9 9 9 9 9 9 9
9999 999 99 -99 99 99
190 <400> 90
| Met Ala | Ser His | His 5 | His | His | His | His | Met Asn Glu Ala Phe Asp Cys | ||||||||
| 10 | 15 | ||||||||||||||
| Val | Val | He | Gly | Ala | Gly | Pro | Gly | Gly | Tyr | Val | Ala | Ala | Ile | Thr | Ala |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Ala | Gin | Ala | Gly | Leu | Lys | Thr | Ala | Leu | Ile | Glu | Lys | Arg | Glu | Ala | Gly |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Gly | Thr | Cys | Leu | Asn | Arg | Gly | Cys | Ile | Pro | Ser | Lys | Ala | Leu | Leu | Ala |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Gly | Ala | Glu | Val | Val | Thr | Gin | Ile | Arg | His | Ala | Asp | Gin | Phe | Gly | Ile |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| His | Val | Glu | Gly | Phe | Ser | Ile | Asn | Tyr | Pro | Ala | Met | Val | Gin | Arg | Lys |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Asp | Ser | Val | Val | Arg | Ser | Ile | Arg | Asp | Gly | Leu | Asn | Gly | Leu | Ile | Arg |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Ser | Asn | Lys | He | Thr | Val | Phe | Ser | Gly | Arg | Gly | Ser | Leu | Ile | Ser | Ser |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Thr | Glu | Val | Lys | Ile | Leu | Gly | Glu | Asn | Pro | Ser | Val | Ile | Lys | Ala | His |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Ser | Ile | Ile | Leu | Ala | Thr | Gly | Ser | Glu | Pro | Arg | Ala | Phe | Pro | Gly | Ile |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Pro | Phe | Ser | Ala | Glu | Ser | Pro | Arg | Ile | Leu | Cys | Ser | Thr | Gly | Val | Leu |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Asn | Leu | Lys | Glu | Ile | Pro | Gin | Lys | Met | Ala | He | Ile | Gly | Gly | Gly | Val |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Ile | Gly | Cys | Glu | Phe | Ala | Ser | Leu | Phe | His | Thr | Leu | Gly | Ser | Glu | Val |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Ser | Val | Ile | Glu | Ala | Ser | Ser | Gin | Ile | Leu | Ala | Leu | Asn | Asn | Pro | Asp |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Ile | Ser | Lys | Thr | Met | Phe | Asp | Lys | Phe | Thr | Arg | Gin | Gly | Leu | Arg | Phe |
| 225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
| Val | Leu | Glu | Ala | Ser | Val | Ser | Asn | Ile | Glu | Asp | Ile | Gly | Asp | Arg | Val |
| 245 | 250 | 255 | |||||||||||||
| Arg | Leu | Thr | Ile | Asn | Gly | Asn | Val | Glu | Glu | Tyr | Asp | Tyr | Val | Leu | Val |
| 260 | 265 | 270 | |||||||||||||
| Ser | Ile | Gly | Arg | Arg | Leu | Asn | Thr | Glu | Asn | Ile | Gly | Leu | Asp | Lys | Ala |
| 275 | 280 | 285 | |||||||||||||
| Gly | Val | Ile | Cys | Asp | Glu | Arg | Gly | Val | Ile | Pro | Thr | Asp | Ala | Thr | Met |
| 290 | 295 | 300 | |||||||||||||
| Arg | Thr | Asn | Val | Pro | Asn | Ile | Tyr | Ala | Ile | Gly | Asp | Ile | Thr | Gly | Lys |
| 305 | 310 | 315 | 320 |
191
| Trp | Gin Leu | Ala | His 325 | Val | Ala | Ser | His | Gin 330 | Gly Ile | Ile | Ala | Ala 335 | Arg |
| Asn. | Ile Gly | Gly | His | Lys | Glu | Glu | Ile | Asp | Tyr Ser | Ala | Val | Pro | Ser |
| 340 | 345 | 350 | |||||||||||
| Val | Ile Phe | Thr | Phe | Pro | Glu | Val | Ala | Ser | Val Gly | Leu | Ser | Pro | Thr |
| 355 | 360 | 365 | |||||||||||
| Ala | Ala Gin | Gin | Gin | Lys | Ile | Pro | Val | Lys | Val Thr | Lys | Phe | Pro | Phe |
| 370 | 375 | 380 | |||||||||||
| Arg | Ala Ile | Gly | Lys | Ala | Val | Ala | Met | Gly | Glu Ala | Asp | Gly | Phe | Ala |
| 385 | 390 | 395 | 400 | ||||||||||
| Ala | Ile Ile | Ser | His | Glu | Thr | Thr | Gin | Gin | Ile Leu | Gly | Ala | Tyr | Val |
| 405 | 410 | 415 | |||||||||||
| Ile | Gly Pro | His | Ala | Ser | Ser | Leu | Ile | Ser | Glu Ile | Thr | Leu | Ala | Val |
| 420 | 425 | 430 | |||||||||||
| Arg | Asn Glu | Leu | Thr | Leu | Pro | Cys | Ile | Tyr | Glu Thr | Ile | His | Ala | His |
| 4 35 | 440 | 445 | |||||||||||
| Pro | Thr Leu | Ala | Glu | Val | Trp | Ala | Glu | Ser | Ala Leu | Leu | Ala | Val | Asp |
| 450 | 455 | 460 | |||||||||||
| Thr | Pro Leu | His | Met | Pro | Pro | Ala | Lys | Lys | |||||
| 465 | 470 | ||||||||||||
| <210> | 91 | ||||||||||||
| <211> | 129 | ||||||||||||
| <212> | PRT | ||||||||||||
| <213> | Chlamydia | ||||||||||||
| <4 00> | 91 | ||||||||||||
| Met | His His | His | His | His | His | Met | Pro | Arg | Ile Ile | Gly | Ile | Asp | Ile |
| 5 | 10 | 15 | |||||||||||
| Pro | Ala Lys | Lys | Lys | Leu | Lys | Ile | Ser | Leu | Thr Tyr | Ile | Tyr | Gly | Ile |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||
| Gly | Ser Ala | Arg | Ser | Asp | Glu | Ile | Ile | Lys | Lys Leu | Lys | Leu | Asp | Pro |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||
| Glu | Ala Arg | Ala | Ser | Glu | Leu | Thr | Glu | Glu | Glu Val | Gly | Arg | Leu | Asn |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||
| Ser | Leu Leu | Gin | Ser | Glu | Tyr | Thr | Val | Glu | Gly Asp | Leu | Arg | Arg | Arg |
| 65 | 70 | 75 | .80 | ||||||||||
| Val | Gin Ser | Asp | Ile | Lys | Arg | Leu | Ile | Ala | Ile His | Ser | Tyr | Arg | Gly |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||
| Gin | Arg His | Arg | Leu | Ser | Leu | Pro | Val | Arg | Gly Gin | Arg | Thr | Lys | Thr |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||
| Asn | Ser Arg | Thr | Arg | Lys | Gly | Lys | Arg | Lys | Thr Val | Ala | Gly | Lys | Lys |
115 120 125
Lys
192 ·· ΦΦΦ'· ίφ . »‘φ • ··· • φ φ • φ • Φ ΦΦΦ φ φ • φ φ
ΦΦ φφ <210> 92 <211> 202 <212> PRT <213> Chlamydia <400> 92
| Met | His | His | His | His His 5 | His Met | Gly Ser Leu Val Gly Arg Gin Ala | |||||||||
| 10 | 15 | ||||||||||||||
| Pro | Asp | Phe | Ser | Gly | Lys | Ala | Val | Val | Cys | Gly | Glu | Glu | Lys | Glu | Ile |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Ser | Leu | Ala | Asp | Phe | Arg | Gly | Lys | Tyr | Val | Val | Leu | Phe | Phe | Tyr | Pro |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Lys | Asp | Phe | Thr | Tyr | Val | Cys | Pro | Thr | Glu | Leu | His | Ala | Phe | Gin | Asp |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Arg | Leu | Val | Asp | Phe | Glu | Glu | His | Gly | Ala | Val | Val | Leu | Gly | Cys | Ser |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Val | Asp | Asp | Ile | Glu | Thr | His | Ser | Arg | Trp | Leu | Thr | Val | Ala | Arg | Asp |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Ala | Gly | Gly | Ile | Glu | Gly | Thr | Glu | Tyr | Pro | Leu | Leu | Ala | Asp | Pro | Ser |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Phe | Lys | Ile | Ser | Glu | Ala | Phe | Gly | Val | Leu | Asn | Pro | Glu | Gly | Ser | Leu |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Ala | Leu | Arg | Ala | Thr | Phe | Leu | Ile | Asp | Lys | His | Gly | Val | Ile | Arg | His |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Ala | Val | Ile | Asn | Asp | Leu | Pro | Leu | Gly | Arg | Ser | Ile | Asp | Glu | Glu | Leu |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Arg | Ile | Leu | Asp | Ser | Leu | Ile | Phe | Phe | Glu | Asn | His | Gly | Met | Val | Cys |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Pro | Ala | Asn | Trp | Arg | Ser | Gly | Glu | Arg | Gly | Met | Val | Pro | Ser | Glu | Glu |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Gly | Leu | Lys | Glu | Tyr | Phe | Gin | Thr | Met | Asp |
195 200 <210> 93 <211> 19 prt icial Sequence <220>
<223> Vyrobeno v laboratoři <400> 93 '· >κ· · -· · '· ··· · · ··· • · · · '· · • · · · · :···· ·«· ·· *« ····
193
Glu Asn Ser Leu Gin Asp Pro Thr Asn Lys Arg Asn Ile Asn Pro Asp 1 5 10 15 .
Asp Lys Leu <210> 94 <211> 20 <212> PRT <213> Artificiální sekvence =e <220>
<223> Vyrobeno v laboratoři <400> 94 '
Asp Pro Thr Asn Lys Arg Asn Ile Asn Pro Asp Asp Lys Leu Ala Lys 1 5 10 15
Val Phe Gly Thr 20 <210> 95 <211> 20 <212> PRT <213> Artificiální sekvence 0® <220>
<223> Vyrobeno v laboratoři <400> 95
Lys Arg Asn Ile Asn Pro Asp Asp Lys Leu Ala Lys Val Phe Gly Thr 1 5 10 15
Glu Lys Pro Ile 20 <210> 96 / <211> 20 <212> PRT <213> Artificiální sekvencece <220> , <223> Vyrobeno v laboratoři <400> 96
Asp Asp Lys Leu Ala Lys Val Phe Gly Thr Glu Lys Pro Ile Asp Met 1 5 10 15
Phe Gin Met Thr 20 <210> 97 <211> 20 <212> PRT <213> Artificiální sekvence ;e <220>
<223> Vyrobeno v laboratoři <400> 97
Lys Val Phe Gly Thr Glu Lys Pro Ile Asp Met Phe Gin Met Thr Lys 1 5 10 15
Met Val Ser Gin 20 » ·4*« ···
194 <210> 98 <211> 20 <212> PRT <213> Artificiální sekvence <220>
<223> Vyrobeno v laboratoři <400> 98
Asn Lys Arg Asn Ile Asn Pro Asp Asp Lys Leu Ala Lys Val Phe Gly 1 5 10 15
Thr Glu Lys Pro 20 <210> 99 <211> 16 <212> PRT <213> Artificiální sekvence1 <220>
<22 3> Vyrobeno v laboratoři <400> 99
Asn Lys Arg Asn Ile Leu Pro Asp Ala Asn Leu Ala Lys Val Phe Gly 1 5 10 15 <210> 100 <211> 15 <212> PRT <213> Artificiální sekvence5 <220>
<223> Vyrobeno v laboratoři <400> 100
Lys Met Trp Asp Tyr Ile Lys Glu Asn Ser Leu Gin Asp Pro Thr 1 5 10 15 <210> 101 <211> 20 <212> PRT <213> Artificiální sekvencece <220>
<223> Vyrobeno v laboratoři <400> 101
Thr Glu Ile Val Lys Lys Val Trp Glu Tyr Ile Lys Lys His Asn Cys 1 5 10 15
Gin Asp Gin Lys 20 <210> 102 <211> 20 <212> PRT.
<213> Artificiální sekvencej <220>
<223> Vyrobeno v laboratoři <400> 102 ·<«· ► ·4'· · ·«· ·· ·· » · ·
D 4 4 «· » ·4 « •4 «··· > · · » · · I ·· ··
195
Lys Val Trp Glu Tyr Ile Lys Lys His Asn Cys Gin Asp Gin Lys Asn 1 5 10 15
Lys Arg Asn Ile 20 <210> 103 <211> 15 <212> PRT <213> Artificiální sekvence <220> ’ <223> Vyrobeno v laboratoři <400> 103
Lys Val Trp Glu Tyr Ile Lys Lys His Asn Cys Gin Asp Gin Lys 1 5 10 15 <210> 104 <211> 20 <212> PRT <213> Artificiální sekvence-e <220>
<223> Vyrobeno v laboratoři <400> 104
Ala Glu Leu Thr Glu Glu Glu Val Gly Arg Leu Asn Ala Leu Leu Gin 1 5 10 15
Ser Asp Tyr Val 20 <210> 105 <2H> 21 <212> PRT <213> Artificiální sekvence 5 <220>
<223> Vyrobeno v laboratoři <400> 105
Leu Gin Ser Asp Tyr Val Val Glu Gly Asp Leu Arg Arg Arg Val Gin 1 5 10 15
Ser Asp Ile Lys Arg 20 <2Í0> 106 <211> 20 <212> PRT <213> Artificiální sekvence ce <220>
<223> Vyrobeno v laboratoři <400> 106
Met Pro Arg Ile Ile Gly Ile Asp Ile Pro Ala Lys Lys Lys Leu Lys 1 5 10 15
Ile Ser Leu Thr 20 <210> 107 <211> 20
*· Φ*Φ· • * · • ··· » φ ·
·. φ
196 <212> PRT <213> Artificiální sekvence s <220>
<223> Vyrobeno v laboratoři <400> 107
Ala Glu Leu Thr Glu Glu Glu Val Gly Arg Leu Asn Ala Leu Leu Gin 1 5 10 15
Ser Asp Tyr Val <210> 108 <211> 20 <212> PRT <213> Artificiální sekvence^ <220>
<223> Vyrobeno v laboratoři <400> 108
Leu Asn Ala Leu Leu Gin Ser Asp Tyr Val Val Glu Gly Asp Leu Arg 1 5 10 15
Arg.Arg Val Gin <210> 109 <211> 20 <212> PRT <213> Artificiální sekveneece <220>
<223> Vyrobeno v laboratoři <400> 109
Leu Asn Ser Leu Leu Gin Ser Glu Tyr Thr Val Glu Gly Asp Leu Arg 15 10 15
Arg Arg Val Gin <210> 110 <211> 1461 <212> DNA <213> Chlamydia <400> 110 ctatctatga agttatgaat atggatctag aaacacgaag atcttttgcg gtacagcaag 60 ggcactatca ggacccaaga gcttcagatt atgacctccc acgtgctagc gactatgatt 120 tgcctagaag cccatatcct actccacctt tgccttctag atatcagcta cagaatatgg 180 atgtagaagc agggttccgt gaggcagttt atgcttcttt tgtagcagga atgtacaatt 240 atgtagtgac acagccgcaa gagcgtattc ccaatagtca gcaggtggaa gggattctgc 300 gtgatatgct taccaacggg 'tcacagacat ttagcaacct gatgcagcgt tgggatagag 360 aagtcgatag ggaataaact ggtatctacc ataggtttgt atcaaaaaac taagcccacc 420 aagaagaaat tctctttggt gggcttcttt ttttattcaa aaaagaaagc cctcttcaag 480 attatctcgt gccgctcgtg ccgaattcgg cacgagcggc acgaggagct gtaagtaagt 540 attgccaaga gttggaagaa aaaatattag atttgtgtaa gcgtcatgcc gcaacaattt 600 gctccattga ggaggatgct aaacaagaaa ttcgtcatca gacagaaagg tttaaacagc 660 ggttgcaaca aaatcagaac acttgcagtc aattaacagc agagttgtgt aaattgagat 720 ctgagaataa ggcattatcg gagcggctgc aggtgcaggc atcccgtcgt aaaaaataat 780 taaagactcc tcagatattg catctgagag ttaggggttc cttttgctta cggcgcttta 840 gttctgcatg ttgcggattt atagtgattt gcgagtaaag cgccgttctg atacagtttt 900.
·····’·*· .·*.···· • ·*· · · ··» · » «* • ··· «· ·>· a .
• · · · · · · · · Z ···· ··· ·· ·· «β
197 tccgctttaa aaataaaaag gtggaaaaat gagtactact attagcggag acgcttcttc 960 tttaccgttg ccaacagctt cctgcgtaga gacaaaatct acttcgtctt caacaaaagg 1020 gaatacttgt tccaaaattt tggatatagc tttagctatc gtaggcgctt tagttgttgt 1080 cgctggggta ttagctttgg ttttgtgcgc tagcaatgtc atatttactg taataggtat 1140 tcctgcatta attattggat ctgcttgtgt gggtgcggga atatctcgtc ttatgtatcg 1200 atcctcttat gctagcttag aagcaaaaaa tgttttggct gagcaacgtt tgcgtaatct 1260 ttcagaagag aaggacgctt tggcctccgt ctctttcatt aataagatgt ttctgcgagg 1320 tcttacggac gatctccaag ctttggaagc taaggtaatg gaatttgaga ttgattgttt 1380 ggacagatta gagaaaaatg agcaagcttt attgtccgat gtgcgcttag ttttatctag 1440 ctacacaaga tggttggata g 1461
| <210> | 111 |
| <211> | 267 |
| <212> | DNA |
| <213> | Chlamydia |
| <400> | 111 |
gtcctcttct tattatagca gaagacattg aaggcgaagc tttagctact ttggtcgtga 60 acagaattcg tggaggattc cgggtttgcg cagttaaagc tccaggcttt ggagatagaa 120 gaaaágctat gttggaagac atcgctatct taactggcgg tcaactcatt agcgaagagt 180 tgggcatgaa attagaaaac gctaacttag ctatgttagg taaagctaaa aaagttatcg 240 tttctaaaga agacacgacc atcgtcg 267 <210> 112 <211> 698 <212> DNA <213> Chlamydia <400> 112 tgataagcaa gcaaccgctc aactagcagc tctaačtatt aaaaaaatcc tctgttttga 60 tgaaaattcc tacgagaagg agctggcatg cttagaaaag aaacgcagta gcgtacaaaa 120 agatctgagc caactgaaaa aatacacagt tctctacatc aagaagctgc tcgaaaccta 180 cagacaactc gggcatcgaa agacaaaaat tgcaaaattt gatgacctac ctaccgagag 240 agtctccgct cataagaaag caaaagaact-cgctgcgctc gatcaagaag agaacttcta 300 aaacgtgact cggcccttga gatccttaaa ctctcgggcc aaaaagacta cagtcttctc 360 gagaagaaaa acggtgttag aaaatacgcg cgctaagact ttctctaaca atgactcaaa 420 aagctgtaaa cgtatacgtt taccgctctt ccataatttc taggctgact ttcacattat 480 ctcgacttgc tacggaaacc aataaagtac ggatagcctt aatagtgcgt ccttctttac 540 cgataatttt accgatatct cccttagcaa cagtcaattc gtagataatc gtattggttc 600 cctgcacctc tttcagatgc acttcctctg gcttatcaac aagatttttt acaatgtacg 660
| ctaaaaactc tttcatgcga agcaaatcct acacaagc | 698 | |
| <210> | 113 | |
| <211> | 1142 | |
| <212> | DNA | |
| <213> | Chlamydia | |
| <400> | 113 |
ctcttcaaag attgtgagtt tatgtgaagg cgctgtcgct gatgcaagaa tgtgcaaagc 60 agagttgata aaaaaagaag cggatgctta tttgttttgt gagaaaagcg ggatatatct 120 aacgaaaaaa gaaggtattt tgattccttc tgcagggatt gatgaatcga atacggacca 180 gccttttgtt ttatatccta aagatatttt gggatcgtgt aatcgcatcg gagaatggtt 240 aagaaattat tttcgagtga aagagctagg cgtaatcatt acagatagcc atactactcc 300 aatgcggcgt ggagtactgg gtatcgggct gtgttggtat ggattttctc cattacacaa 360 ctatatagga tcgctagatt gtttcggtcg tcccttacag atgacgcaaa gtaatcttgt 420 agatgcctta gcagttgcgg ctgttgtttg tatgggagag gggaatgagc aaacaccgtt 480 agcggtgata gagcaggcac ctaatatggt ctaccattca tatcctactt ctcgagaaga 540 gtattgttct ttgcgcatag atgaaacaga ggacttatac ggaccttttt tgcaagcggt 600 tacgtggagt caagaaaaga aatgatggag gtgtttatga attttttaga tcagttagat 660 ttaattattc aaaataagca tatgctagaa cacacgtttt atgtgaaatg gtcgaagggg 720 gagcttacta aagagcaatt acaggcgtat gccaaagact attatttaca tatcaaagcc 780 ·· ···· • · · • ··· • · · • · ···· ··· • · · • · ··· • · · φ • · φ · ·· ·Φ ·· ···« • ·
198 tttcctaaat atttatctgc gattcatagt cgttgcgatg atttagaggc gcgtaagtta 840 ttgttagata acttgatgga tgaagagaac ggttacccta atcatattga tttgtggaag 900 cagtttgtgt ttgctctagg agttactcca gaagagttag aggctcatga gcctagtgaa 960 gcagcaaaag cgaaagtagc tactttcatg cggtggtgta caggagattc tttagctgca 1020 ggagtggctg ctttgtattc ttatgagagt caaattccac gtatcgctag agagaaaatt 1080 cgtggattga ctgagtactt tggattttcc aatcctgaag actatgcata tttcacagaa 1140 ca 1142 <210> 114 <211> 976 <212> DNA <213> Chlamydia <400> 114 aggtggatgg ggcgcctgtc caágatgtgc tcgctactct atatggaagc aatcacaaag 60 ggactgcagc tgaagagtcg gctgctttaa gaacactatt ttctcgcatg gcctctttág 120 ggcacaaagt accttctggg cgcactactt taaagattcg tcgtcctttt ggtactacga 180 gagaagttcg tgtgaaatgg cgttatgttc ctgaaggtgt aggagatttg gctaccatag 240 ctccttctat cagggctcca cagttacaga aatcgatgag aagctttttc cctaagaaag 300 atgatgcgtt tcatcggtct agttcgctat tctactctcc aatggttccg catttttggg 360 cagágcttcg caatcattat gcaacgagtg gtttgaaaag cgggtacaat attgggagta 420 ccgatgggtt tctccctgtc attgggcctg ttatatggga gtcggagggt cttttccgcg 480 cttatatttc ttcggtgact gatggggatg gtaagagcca taaagtagga tttctaagaa 540 ttcctacata tagttggcag gacatggaag attttgatcc ttcaggaccg cctccttggg 600 aagaatttgc taagattatt caagtatttt cttctaatac agaagctttg attatcgacc 660 aaacgaacaa cccaggtggt agtgtccttt atctttatgc actgctttcc atgttgacag 720 accgtccttt agaacttcct aaacatagaa tgattctgac tcággatgaa gtggttgatg 780 ctttagattg gttaaccctg ttggaaaacg tagacacaaa cgtggagtct cgccttgctc 840 tgggagacaa catggaagga tatactgtgg atctacaggt tgccgagtat ttaaaaagct 900 ttggacgtca agtattgaat tgttggagta aaggggatat cgagttatca acacctáttc 960 ctctttttgg ttttga 976 <210> 115 <211> 995 <212> DNA <213> Chlamydia <400> 115 ttatcctaga aatttggtgt tcaatatgag cgaaaaaaga aagtctaaca aaattattgg 60 tatcgaccta gggacgacca actcttgcgt ctctgttatg gaaggtggcc aaectaaagt 120 tattgcctct tctgaaggaa ctcgtactac tccttctatc gttgctttta aaggtggcga 180 aactcttgtt ggaattcctg caaaacgtca ggcagtaacc aatcctgaaa aaacattggc 240 ttctactaag cgattcatcg gtagaaaatt ctctgaagtc gaatctgaaa ttaaaacagt 300 cccctacaaa gttgctccta actcgaaagg agatgcggtc tttgatgtgg aacaaaaact 360 gtacactcca gaagaaatcg gcgctcagat cctcatgaag atgaaggaaa ctgctgaggc 420 ttatctcgga gaaacagtaa cggaagcagt cattaccgta ccagcttact ttaacgattc 480 tcaaagagct tctacaaaag atgctggacg tatcgcagga ttagatgtta aacgcattat 540 tcctgaacca acagcggccg ctcttgctta tggtattgat aaggaaggag ataaaaaaat 600 cgccgtcttc gacttaggag gaggaacttt cgatatttct atcttggaaa tcggtgacgg 660 agtttttgaa gttctctcaa ccaacgggga tactcacttg ggaggagacg acttcgacgg 720 agtcatcatc aactggatgc ttgatgaatt caaaaaacaa gaaggcattg atctaagcaa 780 agataacatg gctttgcaaa gattgaaaga tgctgctgaa aaagcaaaaa tagaattgtc 840 tggtgtatcg tctactgaaa tcaatcagcc attcatcact atcgacgcta atggacctaa 900 acatttggct ttaactctaa ctcgcgctca attcgaacac ctagcttcct ctctcattga 960
| gcgaaccaaa caaccttgtg ctcaggcttt aaaag | 995 |
| <210> 116 <211> 437 <212> DNA <213> Chlamydia |
• · · ·
199 <400> 116 gtcacagcta aaggcggtgg gctttatact gataagaatc tttcgattac taacatcaca 60 ggaattatcg aaattgcaaa taacaaagcg acagatgttg gaggtggtgc ttacgtaaaa 120 ggaaccctta cttgtaaaaa ctctcaccgt ctacaatttt tgaaaaactc ttccgataaa 180 caaggtggag gaatctacgg agaagacaac atcaccctat ctaatttgac agggaagact 240 ctattccaag agaatactgc caaaaaagag ggcggtggac tcttcataaa aggtacagat 300 aaagctctta caatgacagg actggatagt ttctgtttaa ttaataacac atcagaaaaa 360 catggtggtg gagcctttgt taccaaagaa atctctcaga cttacacctc tgatgtggaa 420 acaattccag gaatcac 437 <210> 117 <211> 446 <212> DNA <213> Chlamydia <400> 117 aagtttacct agaccaaact gaagatgacg aaggaaaagt tgttttatcc agagaaaaag 60 caacaagaca acgacaatgg gaatacattc ttgctcactg cgaggaaggt tctattgtta 120 agggacaaat tacccgaaaa gttaagggtg gtttgatcgt agatattggt atggaagcct 180 tccttccagg atcccaaata gacaataaga agatcaagaa cttagatgat tacgtaggca 240 aggtttgtga gttcaaaatt ctcaaaatca acgtggatcg tcggaacgtt gttgtatcta 300 gaagagaact tctcgaagct gaacgcattt ctaagaaagc agagttgatc gagcaaatca 360 ctatcggtga acgtcgcaaa ggtatcgtta agaatatcac agatttcgga gtattcttgg 420 atcttgatgg cattgacggc ctactc 446 <210> 118 <211> 951 <212> DNA <213> Chlamydia <400> 118 agtattgcga aatattactg tgagaagcaa tgctgagagc ggttctagta aaagtgaggg 60 gagagctgtc agaagggatc gctcaggaag cgagacaacg tgtggctgat ttattaggaa 120 gattccctct ttatcctgaa atcgatctgg aaacgctagt ttagtgggag actctatgcc 180 tgaaggggaa atgatgcata agttgcaaga tgtcatagat agaaagttgt tggattctcg 240 tcgtattttc ttctccgaac ctgtáacgga gaaaagtgct gcagaagcca tcaaaaagct 300 ttggtatttg gaactcacca atcctgggca gccaattgta tttgtcatta atagccctgg 360 agggtctgtt gatgctgggt ttgctgtttg ggaccaaatt aaaatgatct cttctccttt 420 gactacagtt gttacaggtt tagcagcatc tatgggatct gtattgagtt tgtgtgctgt 480 tccaggaaga cgttttgcta cgcctcatgc gcgcattatg attcaccagc cttctattgg 540 aggaaccatt actggtcaag ccacggactt ggatattcat gctcgtgaaa ttttaaaaac 600 aaaagcacgc attattgatg tgtatgtcga ggcaactgga caatctccag aggtgataga 660 gaaagctatc gatcgagata tgtggatgag tgcaaatgaa gcaatggagt ttggactgtt 720 agatgggatt ctcttctctt ttaacgactt gtagatatct tttatattct ggagcaggaa 780 acagtttcat tttgggagaa tcgatgcctt ctcttgagga tgttctgttt ttatgccagg 840 aagagatggt tgatgggttt ttatgtgtag agtcttctga aatagcagat gctaaactca 900 ctgtttttaa tagtgatgga tctatcgcgt ctatgtgcgg gaatgggttg c 951 <210> 119 <211> 953 <212> DNA <213> Chlamydia <400> 119 atatcaaagt tgggcaaatg acagagccgc tcaaggacca gcaaataatc cttgggacaa 60 catcaacacc tgtcgcagcc aaaatgacag cttctgatgg aatatcttta acagtctcca 120 ataatccatc aaccaatgct tctattacaa ttggtttgga tgcggaaaaa gcttaccagc 180 ttattctaga aaagttggga gatcaaattc ttggtggaat tgctgatact attgttgata 240 gtacagtcca agatatttta gacaaaatca caacagaccc ťtctctaggt ttgttgaaag 300 cttttaacaa ctttccaatc actaataaaa ttcaatgcaa cgggttattc actcccagga 360 acattgaaac tttattagga ggaactgaaa taggaaaatt· cacagtcaca cccaaaagct 420 • · • · · · • · · ·
480
540
600
660
720
780
840
900
953
200 ctgggagcat ttctagcttt caggcgttcc caacgtattc ctaatggcaa tacctcaaac agaaaaaagt ttattaaaat tacaacctat gttcttagtc ggtacgagaa taatttatgt attacgtgta tgatatttta aaacgcttaa tcgaattacg tgttaaagat taatttcccc tcagcagata ggtgattcta agtctaagaa ggcggtttag ggaataacaa acaattttta gggtttgtta tcctggtatc tcgtcaaaaa ttattgcatc agccctacgc ccagaattat aaagcggtgt atacttctaa ttggattttt tgcaaaataa ggtctgcgat taaggttatc aagaatggaa gattagttat taatacagga ggtatgggtt tgtatctttt cttataggtt aagcaaagtg tccgactcgt aagtgagaaa ggcggcgttg ggatactcat ttgactccga aatgcccttt ttggaggtaa ttatatttag agggacgatt ccaacatcaa tca <210> 120 ' <211> 897 <212> DNA <213> Chlamydia <220>
<22l> různé vlastnosti <222> 395 <400;
atggcttcta acacagccca gttaaggtcg gcgggctctt actgttctcg caaagcttct ctcgtagcag atcggaggaa aaaatgctgg agctatatta gcggaaagag gaattgtcgg ttcacgcgca gacgttttca ggatgtacgt n — A, T, C
120 tatgcggacg gcaataaaat ccaagtctgc ccgcacacat ctttagggaa tctcttacat atctttgtgt ttacctacct cgcaaccgtt tggcggctaa cagattgcga gagaggaaaa tcaagtatgc aattggtgcc tcacttctgc nebo G tttagggtct ggcaagggta tgccgaattg tacagcttcc tgcctttaac gaaagctgct gtctcataag cgcgacattc tctttcttcc ccatgcagcg agcccgctgc tgcttgcgag actcctcact gttgcctatt agttattgga ggtacaggga gtaaataaga accgcaaata caagtgtcca ggagcgttgc agtcagaaac cgcanagcgg ggagctatcc caaattaaag tttgtggtgg gctcgtattg aggagagtcg atgctcgaga acaatgggta ttgtggactt atgctctaaa cgaagggaat ttttggaaca aaggattagg caggaacagt cgcaagaagg ctgcggctgt gtccgattct caaatatggg gttctggact cgagagaaga ctggagagaa agtttttgga ttcgtgcaat tctgcgccag agcttttttt ggataagact agctggaggc ggatgcgaga tcaaagtgcg ggatgagggg ctgtagcttc gtttgtcaac atcttctgtt cgctatcagt gtcgtcactc agccaagacg atgcgttgcc tgtggctgcg agcataa
120 180 240 300 360 420 480 540 600 660 720 780 840 8 97 <210> 121 <211> 298 <212> PRT <213> Chlamydia
| <400> | 121 | ||||||||||||||
| Met | Ala | Ser | Ile | Cys | Gly | Arg | Leu | Gly | Ser | Gly | Thr | Gly | Asn | Ala | Leu |
| 1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
| Lys | Ala | Phe | Phe | Thr | Glri | Pro | Ser | Asn | Lys | Met | Ala | Arg | Val | Val | Asn |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Lys | Thr | Lys | Gly | Met | Asp | Lys | Thr | Val | Lys | Val | Ala | Lys | Ser | Ala | Ala |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Glu | Leu | Thr | Ala | Asn | Ile | Leu | Glu | Gin | Ala | Gly | Gly | Ala | Gly | Ser | Ser |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Ala | His | Ile | Thr | Ala | Ser | Gin | Val | Ser | Lys | Gly | Leu | Gly | Asp | Ala | Arg |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Thr | Val | Leu | Ala | Leu | Gly | Asn | Ala | Phe | Asn | Gly | Ala | Leu | Pro | Gly | Thr |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Val | Gin | Ser | Ala | Gin | Ser | Phe | Phe | Ser | Tyr | Met | Lys | Ala | Ala | Ser | Gin |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Lys | Pro | Gin | Glu | Gly | Asp | Glu | Gly | Leu | Val | Ala | Asp | Leu | Cys | Val | Ser |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| His | Lys | Arg | Arg | Ala | Ala | Ala | Ala | Val | Cys | Ser | Phe | Ile | Gly | Gly | Ile |
• · • · · · · · · · *··· 0 · ··· · · · • ·······«· « · · ·· · · ·· ·
201
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Thr | Tyr | Leu | Ala | Thr | Phe | Gly | Ala | Ile | Arg | Pro | Ile | Leu | Phe | Val | Asn |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Lys | Met | Leu | Ala | Gin | Pro | Phe | Leu | Ser | Ser | Gin | Ile | Lys | Ala | Asn | Met |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Gly | Ser | Ser | Val | Ser | Tyr | Ile | Met | Ma | Ala | Asn | His | Ala | Tkla | Phe | Val |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Val | Gly | Ser | Gly | Leu | Ala | Ile | Ser | Ala | Glu | Arg | Ala | Asp | Cys | Glu | Ala |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Arg | Cys | Ala | Arg | Ile | Ala | Arg | Glu | Glu | Ser | Ser | Leu | Glu | Leu | Ser | Gly |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Glu | Glu | Asn | Ala | Cys | Glu | Arg | Arg | Val | Ala | Gly | Glu | Lys | Ala | Lys | Thr |
| 225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
| Phe | Thr | Arg | Ile | Lys | Tyr | Ala | Leu | Leu | Thr | Met | Leu | Glu | Lys | Phe | Leu |
| 245 | 250 | 255 | |||||||||||||
| Glu | Cys | Val | Ala | Asp | Val | Phe | Lys | Leu | Val | Pro | Leu | Pro | Ile | Thr | Met |
| 260 | 265 | 270 | |||||||||||||
| Gly | Ile | Arg | Ala | Ile | Val | Ala | Ala | Gly | Cys | Thr | Phe | Thr | Ser | Ala | Val |
| 275 | 280 | 285 | |||||||||||||
| Ile | Gly | Leu | Trp | Thr | Phe | Cys | Ala | Arg | Ala | ||||||
| 290 | 295 |
<210> 122 <211> 897 <212> DNA <213> Chlamydia <400> 122 atggcttcta tatgcggacg tttagggtct ggtacaggga atgctctaaa agcttttttt acacagccca gcaataaaat ggcaagggta gtaaataaga cgaagggaat ggataagact gttaaggtcg ccaagtctgc tgccgaattg accgcaaata ttttggaaca agčtggaggc gcgggctctt ccgcacacat tacagcttcc caagtgtcca aaggattagg ggatacgaga actgttgtcg ctttagggaa tgcctttaac ggagcgttgc caggaacagt tcaaagtgcg caaagcttct tctctcacat gaaagctgct agtcagaaaa cgcaagaagg ggatgagggg ctcacagcag atctttgtgt gtctcataag cgcagagcgg ctgcggctgt ctgtggcttc atcggaggaa ttacctacct cgcgacattc ggagttatcc gtccgattct gtttgtcaac áaaatgctgg tgaacccgtt tctttcttcc caaactaaag caaatatggg atcttctgtt agctatatta tggcggctaa ccatgcagcg tctgtggtgg gtgctggact cgctatcagt gcggaaagag cagattgcga agcccgctgc gctcgtattg cgagagaaga gtcgttactc gaagtgtcgg gagaggaaaa tgcttgcgag aagagagtcg ctggagagaa agccaagacg ttcacgcgca tcaágtatgc actcctcact atgctcgaga agtttttgga atgcgttgcc gacgttttca aattggtgcc gctgcctatt acaatgggta ttcgtgcgat tgtggctgct ggatgtacgt tcacttctgc aattattgga ttgtgcactt tctgcgccag agcataa <210> 123 <211> 298 <212> PRT <213> Chlamydia
120 180 240 300 360 4 20 480 540 600 660 720 780 840 897
| <400> | 123 | ||||||||||||||
| Met | Ala | Ser | Ile | Cys | Gly | Arg | Leu | Gly | Ser | Gly | Thr | Gly | Asn | Ala | Leu |
| 1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
| Lys | Ala | Phe | Phe | Thr | Gin | Pro | Ser | Asn | Lys | Met | Ala | Arg | Val | Val | Asn |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Lys | Thr | Lys | Gly | Met | Asp | Lys | Thr | Val | Lys | Val | Ala | Lys | Ser | Ala- | Ala |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Glu | Leu | Thr | Ala | Asn | Ile | Leu | Glu | Gin | Ala | Gly | Gly | Ala | Gly | Ser | Ser |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Ala | His | Ile | Thr | Ala | Ser | Gin | Val | Ser | Lys | Gly | Leu | Gly | Asp | Thr | Arg |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Thr | Val | Val | Ala | Leu | Gly | Asn | Ala | Phe | Asn | GLy | Ala | Leu | Pro | Gly | Thr |
• ···
202
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Val | Gin | Ser | Ala | Gin | Ser | Phe | Phe | Ser | His | Met | Lys | Ala | Ala | Sér | Gin |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Lys | Thr | Gin | Glu | Gly | Asp | Glu | Gly | Leu | Thr | Ala | Asp | Leu | Cys | Val | Ser |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| His | Lys | Arg | Arg | Ala | Ala | Ala | Ala | Val | Cys | Gly | Phe | Ile | Gly | Gly | Ile |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Thr | Tyr | Leu | Ala | Thr | Phe | Gly | Val | Ile | Arg | Pro | Ile | Leu | Phe | Val | Asn |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Lys | Met | Leu | Val | Asn | Pro | Phe | Leu | Ser | Ser | Gin | Thr | Lys | Ala | Asn | Met |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Gly | Ser | Ser | Val | Ser | Tyr | Ile | Met | Ala | Ala | Asn | His | Ala | Ala | Ser | Val |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Val | Gly | Ala | Gly | Leu | Ala | Ile | Ser | Ala | Glu | Arg | Ala | Asp | Cys | Glu | Ala |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Arg | Cys | Ala | Arg | Ile | Ala | Arg | Glu | Glu | Ser | Leu | Leu | Glu | Val | Ser | Gly |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Glu | Glu | Asn | Ala | Cys | Glu | Lys | Arg | Val | Ala' | Gly | Glu | Lys | Ala | Lys | Thr |
| 225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
| Phe | Thr | Arg | Ile | Lys | Tyr | Ala | Leu | Leu | Thr | Met | Leu | Glu | Lys | Phe | Leu |
| 245 | 250 | 255 | |||||||||||||
| Glu | Cys | Val | Ala | Asp | Val | Phe | Lys | Leu | Val | Pro | Leu | Pro | Ile | Thr | Met |
| 260 | 265 | 270 | |||||||||||||
| Gly | Ile | Arg | Ala | Ile | Val | Ala | Ala | Gly | Cys | Thr | Phe | Thr | Ser | Ala | Ile |
| 275 | 280 | 285 | |||||||||||||
| Ile | Gly | Leu | Cys | Thr | Phe | Cys | Ala | Arg | Ala | ||||||
| 290 | 295 |
<210> 124 <211> 897 <212> DNA <213> Chlamydia <400> 124 atggcttcta tatgcggacg tttagggtct ggtacaggga atgctctaaa agcttttttt 60 acacagccca acaataaaat ggcaagggta gtaaataaga cgaagggaat ggataagact 120 attaaggttg ccaagtctgc tgccgaattg accgcaaata ttttggaaca agctggaggc 180 gcgggctctt ccgcacacat tacagcttcc caagtgtcca aaggattagg ggatgcgaga 240 actgttgtcg ctttagggaa tgcctttaac ggagcgttgc caggaacagt tcaaagtgcg 300 caaagcttct tctctcacat gaaagctgct agtcagaaaa cgcaagaagg ggatgagggg 360 ctcacagcag atctttgtgt gtctcataag cgcagagcgg ctgcggctgt ctgtagcatc 420 atcggaggaa ttacctacct cgcgacattc ggagctatcc gtccgattct gtttgtcaac 480 aaaatgctgg caaaaccgtt tctttcttcc caaactaaag caaatatggg atcttctgtt 540 agctatatta tggcggctaa ccatgcagcg tctgtggtgg gtgctggact cgctatcagt 600 gcggaaagag cagattgcga agcccgctgc gctcgtattg cgagagaaga gtcgttactc 660 gaagtgccgg gagaggaaaa tgcttgcgag aagaaagtcg ctggagagaa agccaagacg 720 ttcacgcgca tcaagtatgc actcctcact atgctcgaga agtttttgga atgcgttgcc 780 gacgttttca aattggtgcc gctgcctatt acaatgggta ttcgtgcgat tgtggctgct 840 ggatgtacgt tcacttctgc· aattattgga ttgtgcactt tctgcgccag agcataa 897 <210> 125 <211> 298 <212> PRT <213> Chlamydia
| Met | <400> Ala Ser | 125 Ile | Cys | Gly | Arg | Leu | |
| 1 Lys | Ala | Phe | Phe | 5 Thr | Gin | Pro | Asn |
| Lys | Thr | Lys | 20 Gly | Met | Asp | Lys | Thr |
| Gly | Ser 10 | Gly | Thr | Gly | Asn | Ala 15 | Leu |
| Asn 25 | Lys | Met | Ala | Arg | Val 30 | Val | Asn |
| Ile | Lys | Va-1 | Ala | Lys | Ser | Ala | Ala |
203
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Glu | Leu | Thr | Ala | Asn | Ile | Leu | Glu | Gin | Ala | Gly | Gly | Ala | Gly | Ser | Ser |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Ala | His | Ile | Thr | Ala | Ser | Gin | Val | Ser | Lys | Gly | Leu | Gly | Asp | Ala | Arg |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Thr | Val | Val | Ala | Leu | Gly | Asn | Ala | Phe | Asn | Gly | Ala | Leu | Pro | Gly | Thr |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Val | Gin | Ser | Ala | Gin | Ser | Phe | Phe | Ser | His | Met | Lys | Ala | Ala | Ser | Gin |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Lys | Thr | Gin | Glu | Gly | Asp | Glu | Gly | Leu | Thr | Ala | Asp | Leu | Cys | Val | Ser |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| His | Lys | Arg | Arg | Ala | Ala | Ala | Ala | Val | Cys | Ser | Ile | Ile | Gly | Gly | Ile |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Thr | Tyr | Leu | Ala | Thr | Phe | Gly | Ala | Ile | Arg | Pro | Ile | Leu | Phe | Val | Asn |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Lys | Met | Leu | Ala | Lys | Pro | Phe | Leu | Ser | Ser | Gin | Thr | Lys | Ala | Asn | Met |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Gly | Ser | Ser | Val | Ser | Tyr | Ile | Met | Ala | Ala | Asn | His | Ala | Ala | Ser | Val |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Val | Gly | Ala | Gly | Leu | Ala | Ile | Ser | Ala | Glu | Arg | Ala | Asp | Cys | Glu | Ala |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Arg | Cys | Ala | Arg | Ile | Ala | Arg | Glu | Glu | . Ser | Leu | Leu | Glu | Val | Pro | Gly |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Glu | Glu | Asn | Ala | Cys | Glu | Lys | Lys | Val | Ala | Gly | Glu | Lys | Ala | Lys | Thr |
| 225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
| Phe | Thr | Arg | Ile | Lys | Tyr | Ala | Leu | Leu | Thr | Met | Leu | Glu | Lys | Phe | Leu |
| 245 | 250 | 255 | |||||||||||||
| Glu | Cys | Val | Ala | Asp | Val | Phe | Lys | Leu | Val | Pro | Leu | Pro | Ile | Thr | Met |
| 260 | 265 | 270 | |||||||||||||
| Gly | Ile | Arg | Ala | Ile | Val | Ala | Ala | Gly | Cys | Thr | Phe | Thr | Ser | Ala | Ile |
| 275 | 280 | 285 | |||||||||||||
| Ile | Gly | Leu | Cys | Thr | Phe | Cys | Ala | Arg | Ala | ||||||
| 290 | 295 |
<210> 126 <211> 897 <212> DNA <213> Chlamydia <400> 126 atggcttcta tatgcggacg tttagggtct ggtacaggga atgctctaaa agcttttttt acacagccca acaataaaat ggcaagggta gtaaataaga cgaagggaat ggataagact attaaggttg ccaagtctgc tgccgaattg accgcaaata ttttggaaca agctggaggc gcgggctctt ccqcacacat tacagcttcc caagtgtcca aaggattagg ggatgcgaga actgttgtcg ctttagggaa tgcctttaac ggagcgttgc caggaacagt tcaaagtgcg caaagcttct tctctcacat gaaagctgct agtcagaaaa cgcaagaagg ggatgagggg ctcacagcag atctttgtgt gtctcataag cgcagagcgg ctgcggctgt ctgtagcatc atcggaggaa ttacctacct cgcgacattc ggagctatcc gtccgattct gtttgtcaac aaaatgctgg caaaaccgtt tctttcttcc caaactaaag caaatatggg atcttctgtt agctatatta tggcggctaa ccatgcagcg tctgtggtgg gtgctggact cgctatcagt gcggaaagag cagattgcga agcccgctgc gctcgtattg cgagagaaga gtcgttactc gaagtgccgg gagaggaaaa tgcttgcgag aagaaagtcg ctggagagaa agccaagacg ttcacgcgca tcaagtatgc actcctcact atgctcgaga agtttttgga atgcgttgcc gacgttttca aattggtgcc gctgcctatt acaatgggta ttcgtgcgat tgtggctgct ggatgtacgt tcacttctgc aattattgga ttgtgcactt tctgcgccag agcataa <210> 127 <211> 298 <212> PRT <213> Chlamydia
120
180
240
300
360
420
480
540
600
660
720
780
840
897 • · · · • · * 9 β © · β
20½
| <400> | 127 | ||||||||||||||
| Met | Ala | Ser | Ile | Cys | Gly | Arg | Leu | Gly | Ser | Gly | Thr | Gly | Asn | Ala | Leu |
| 1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
| Lys | Ala | Phe | Phe | Thr | Gin | Pro | Asn | Asn | Lys | Met | Ala | Arg | Val | Val | Asn |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Lys | Thr | Lys | Gly | Met | Asp | Lys | Thr | Ile | Lys | Val | Ala | Lys | Ser | Ala | Ala |
| 35 | 40' | 45 | |||||||||||||
| Glu | Leu | Thr | Ala | Asn | Ile | Leu | Glu | Gin | Ala | Gly | Gly | Ala | Gly | Ser | Ser |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Ala | His | Ile | Thr | Ala | Ser | Gin | Val | Ser | Lys | Gly | Leu | Gly | Asp | Ala | Arg |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Thr | Val | Val | Ala | Leu | Gly | Asn | Ala | Phe | Asn | Gly | Ala | Leu | Pro | Gly | Thr |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Val | Gin | Ser | Ala | Gin | Ser | Phe | Phe | Ser | His | Met | Lys | Ala | Ala | Ser | Gin |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Lys | Thr | Gin | Glu | Gly | Asp | Glu | Gly | Leu | Thr | Ala | Asp | Leu | Cys | Val | Ser |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| His | Lys | Arg | Arg | Ala | Ala | Ala | Ala | Val | Cys | Ser | Ile | Ile | Gly | Gly | Ile |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Thr | Tyr | Leu | Ala | Thr | Phe | Gly | Ala | Ile | Arg | Pro | Ile | Leu | Phe | Val | Asn |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Lys | Met | Leu | Ala | Lys | Pro | Phe | Leu | Ser | Ser | Gin | Thr | Lys | Ala | Asn | Met |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Gly | Ser | Ser | Val | Ser | Tyr | Ile | Met | Ala | Ala | Asn | His | Ala | Ala | Ser | Val |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Val | Gly | Ala | Gly | Leu | Ala | Ile | Ser | Ala | Glu | Arg | Ala | Asp | Cys | Glu | Ala |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Arg | Cys | Ala | Arg | Ile | Ala | Arg | Glu | Glu | Ser | Leu | Leu | Glu | Val | Pro | Gly |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Glu | Glu | Asn | Ala | Cys | Glu | Lys | Lys | Val | Ala | Gly | Glu | Lys | Ala | Lys | Thr |
| 225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
| Phe | Thr | Arg | Ile | Lys | Tyr | Ala | Leu | Leu | Thr | Met | Leu | Glu | Lys | Phe | Leu |
| 245 | 250 | 255 | |||||||||||||
| Glu | Cys | Val | Ala | Asp | Val | Phe | Lys | Leu | Val | Pro | Leu | Pro | Ile | Thr | Met |
| 260 | 265 | 270 | |||||||||||||
| Gly | Ile | Arg | Ala | Ile | Val | Ala | Ala | Gly | Cys | Thr | Phe | Thr | Ser | Ala | Ile |
| 275 | 280 | 285 | |||||||||||||
| Ile | Gly | Leu | Cys | Thr | Phe | Cys | Ala | Arg | Ala | ||||||
| 290 | 295 | ||||||||||||||
| <210> | 128 | ||||||||||||||
| <211> | 897 | ||||||||||||||
| <212> | DNA |
<213> Chlamydia <400> 128 atggcttcta tatgtggacg tttagggtct ggtacaggga atgctctaaa agcttttttt acacagccca gcaataaaat ggcaagggta gtaaataaga cgaagggaat ggataagact gttaaggtcg ccaagtctgc tgccgaattg accgcaaata ttttggaaca agctggaggc gcgggctctt ccgcacacat tacagcttcc caagtgtcca aaggattagg ggatacgaga actgttgtcg ctttagggaa tgcctttaac ggagcgttgc caggaacagt tcaaagtgcg caaagcttct tctctcacat gaaagctgct agtcagaaaa cgcáagaagg ggatgagggg ctcacagcag atctttgtgt gtctcataag cgcagagcgg ctgcggctgt ctgtggcttc atcggaggaa ttacctacct cgčgacattc ggagttatcc gtccgattct gtttgtcaac aaaatgctgg tgaacccgtt tctttcttcc caaactaaag caaatatggg atcttctgtt agctatatta tggcggctaa ccatgcagcg tctgtggtgg gtgctggact cgctatcagt gcggaaagag cagattgcga agcccgctgc gctcgtattg cgagagaaga gtcgttactc gaagtgtcgg gagaggaaaa tgcttgcgag aagagagtcg ctggagagaa agccaagacg ttcacgcgca tcaagtatgc actcctcact atgctcgaga agtttttgga atgcgttgcc gacgttttca aattggtgcc gctgcctatt acaatgggta ttcgtgcgat tgtggctgct ggatgtacgt tcacttctgc aattattgga ttgtgcact-t tctgcgccag agcataa
120
180
240
300
360
420
480
540
600
660
720
780
840
897
205 <210> 129 <211> 298 <212> PRT <213> Chlamydia
| <400> | 129 | ||||||||||||||
| Met | Ala | Ser | Ile | Cys | Gly | Arg | Leu | Gly | Ser | Gly | Thr | Gly | Asn | Ala | Leu |
| 1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
| Lys | Ala | Phe | Phe | Thr | Gin | Pro | Ser | Asn | Lys | Met | Ala | Arg | Val | Val | Asn |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Lys | Thr | Lys | Gly | Met | Asp | Lys | Thr | Val | Lys | Val | Ala | Lys | Ser | Ala | Ala |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Glu | Leu | Thr | Ala | Asn | Ile | Leu | Glu | Gin | Ala | Gly | Gly | Ala | Gly | Ser | Ser |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Ala | His | Ile | Thr | Ala | Ser | Gin | Val | Ser | Lys | Gly | Leu | Gly Asp | Thr | Arg | |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Thr | Val | Val | Ala | Leu | Gly | Asn | Ala | Phe | Asn | Gly | Ala | Leu | Pro | Gly | Thr |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Val | Gin | Ser | Ala | Gin | Ser | Phe | Phe | Ser | His | Met | Lys | Ala | Ala | Ser | Gin |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Lys | Thr | Gin | Glu | Gly | Asp | Glu | Gly | Leu | Thr | Ala | Asp | Leu | Cys | Val | Ser |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| His | Lys | Arg | Arg | Ala | Ala | Ala | Ala | Val | Cys | Gly | Phe | Ile | Gly | Gly | Ile |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Thr | Tyr | Leu | Ala | Thr | Phe | Gly | Val | Ile | Arg | Pro | Ile | Leu | Phe | Val | Asn |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Lys | Met | Leu | Val | Asn | Pro | Phe | Leu | Ser | Ser | Gin | Thr | Lys | Ala | Asn | Met |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Gly | Ser | Ser | Val | Ser | Tyr | Ile | Met | Ala | Ala | Asn | His | Ala | Ala | Ser | Val |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Val | Gly | Ala | Gly | Leu | Ala | Ile | Ser | Ala | Glu | Arg | Ala | Asp | Cys | Glu | Ala |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Arg | Cys | Ala | Arg | Ile | Ala | Arg | Glu | Glu | Ser | Leu | Leu | Glu | Val | Ser | Gly |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Glu | Glu | Asn | Ala | Cys | Glu | Lys | Arg | Val | Ala | Gly | Glu | Lys | Ala | Lys | Thr |
| 225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
| Phe | Thr | Arg | Ile | Lys | Tyr | Ala | Leu | Leu | Thr | Met | Leu | Glu | Lys | Phe | Leu |
| 245 | 250 | 255 | |||||||||||||
| Glu | Cys | Val | Ala | Asp | Val | Phe | Lys | Leu | Val | Pro | Leu | Pro | Ile | Thr | Met |
| 260 | 265 | 270 | |||||||||||||
| Gly | Ile | Arg | Ala | Ile | Val | Ala | Ala | Gly | Cys | Thr | Phe | Thr | Ser | Ala | Ile |
| 275 | 280 | 285 | |||||||||||||
| Ile | Gly | Leu | Cys | Thr | Phe | Cys | Ala | Arg | Ala |
290 295 <210> 130 <211> 897 <212> DNA <213> Chlamydia atggctgcta acacagccca gttaaggtcg gcgggctctt actgttctcg caaagcttct ctcgtagcag atcggaggaa aaaatgctgg <400> 130 tatgtggacg gcaataaaat ccaagtctgc ccgcacacat ctttagggaa tctcttacat atctttgtgt ttacctacct cgcaaccgtt tttagggtct ggtacaggga atgctctaaa agcttttttt ggcaagggta gtaaataaga cgaagggaat ggataagact tgccgaattg accgcaaata ttttggaaca agctggaggc tacagcttcc caagtgtcca aaggattagg ggatgcgaga tgcctttaac ggagcgttgc caggaacagt tcaaagtgcg gaaagctgct agtcagaaac cgcaagaagg ggatgagggg gtctcataag cgcagagcgg ctgcggctgt ctgtagcttc cgcgacattc ggagctatcc gtccgattct gtttgtcaac tctttcttcc caaactaaag caaatatggg atcttctgtt
120
180
240
300
360
420
480
540
206
agctatatta gcggaaagag gaattgtcgg ttcacgcgca gacgttttca ggatgtacgt tggcggctaa cagattgcga gagaggaaaa tcaagtatgc aattggtgcc tcacttctgc ccatgcagcg tttgtggtgg gttctggact cgctatcagt agcccgctgc gctcgtattg cgagagaaga gtcgtcactc tgcttgcgag aggggagtcg ctggagagaa agccaagacg actcctcact atgctcgaga agtttttgga atgcgttgcc gttgcctatt acaatgggta ttcgtgcaat tgtggctgcg agttattgga ttgtggactt tctgcaacag agtataa
600
660
720
780
840
897 <210> 131 <211> 298 <212> PRT <213> Chlamydia <400> 131
| Met | Ala | Ala | Ile | Cys | Gly Arg | Leu | Gly | Ser | Gly | Thr | Gly | Asn | Ala | Leu | |
| 1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
| Lys | Ala | Phe | Phe | Thr | Gin | Pro | Ser | Asn | Lys | Met | Ala | Arg | Val | Val | Asn |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Lys | Thr | Lys | Gly | Met | Asp | Lys | Thr | Val | Lys | Val | Ala | Lys | Ser | Ala | Ala |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Glu | Leu | Thr | Ala | Asn | Ile' | Leu | Glu | Gin | Ala | Gly | Gly | Sila | Gly | Ser | Ser |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Ala | His | Ile | Thr | Ala | Ser | Gin | Val | Ser | Lys | Gly | Leu | Gly | Asp | Ala | Arg |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Thr | Val | Leu | Ala | Leu | Gly | Asn | Ala | Phe | Asn | Gly | Ala | Leu | Pro | Gly | Thr |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Val | Gin | Ser | Ala | Gin | Ser | Phe | Phe | Ser | Tyr | Met | Lys | Ala | Ala | Ser | Gin |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Lys | Pro | Gin | Glu | Gly | Asp | Glu | Gly | Leu | Val | Ala | Asp | Leu | Cys | Val | Ser |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| His | Lys | Arg | Arg | Ala | Ala | Ala | Ala | Val | Cys | Ser | Phe | Ile | Gly | Gly | Ile |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Thr | Tyr | Leu | Ala | Thr | Phe | Gly | Ala | Ile | Arg | Pro | Ile | Leu | Phe | Val | Asn |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Lys | Met | Leu | Ala | Gin | Pro | Phe | Leu | Ser | Ser | Gin | Thr | Lys | Ala | Asn | Met |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Gly | Ser | Ser | Val | Ser | Tyr | Ile | Met | Ala | Ala | Asn | His | Ala | Ala | Phe | Val |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Val | Gly | Ser | Gly | Leu | Ala | Ile | Ser | Ala | Glu | Arg | Ala | Asp | Cys | Glu | Ala |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Arg | Cys | Ala | Arg | Ile | Ala | Arg | Glu | Glu | Ser | Ser | Leu | Glu | Leu | Ser | Gly |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Glu | Glu | Asn | Ala | Cys | Glu | Arg | Gly | Val | Ala | Gly | Glu | Lys | Ala | Lys | Thr |
| 225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
| Phe | Thr | Arg | Ile | Lys | Tyr | Ala | Leu | Leu | Thr | Met | Leu | Glu | Lys | Phe | Leu |
| 245 | 250 | 255 | |||||||||||||
| Glu | Cys | Val | Ala | Asp | Val | Phe | Lys | Leu | Val | Pro | Leu | Pro | Ile | Thr | Met |
| 260 | 265 | 270 | |||||||||||||
| Gly | Ile | Arg | Ala | Ile | Val | Ala | Ala | Gly | Cys | Thr | Phe | Thr | Ser | Ala | Val |
| 275 | 280 | 285 | |||||||||||||
| Ile | Gly | Leu | Trp | Thr | Phe | Cys | Asn | Arg | Val |
290 295 <210> 132 <211> 897 <212> DNA <213> Chlamydia <400> 132 atggctgcta tatgcggacg acacagccca gcaaťaaaat gttaaggtcg.ccaagtctgc ggtacaggga gtaaataaga accgcaaata atgctctaaa cgaagggaat ttttggaaca agcttttttt ggataagact agctggaggc
120
180 tttagggtct ggcaagggta tgccgaattg
207
J gcgggctctt ccgcacacat tacagcttcc caagtgtcca aaggattagg ggatgcgaga actgttctcg ctttagggaa tgcctttaac ggagcgttgc caggaacagt tcaaagtgcg caaagcttct tctcttacat gaaagctgct agtcagaaac cgcaagaagg ggatgagggg ctcgtagcag atctttgtgt gtctcatáag cgcagagcgg ctgcggctgt ctgtagcttc atcggaggaa ttacctacct cgcgacáttc ggagctatcc gtccgattct gtttgtcaac aaaatgctgg cgcaaccgtt tctttcttcc caaactaaag caaatatggg atcttctgtt agctatatta tggcggctaa ccatgcagcg tttgtggtgg gttctggact cgctatcagt gcggaaagag cagattgcga agcccgctgc gctcgtattg -cgagagaaga gtcgtcactc gaattgtcgg gagaggaaaa tgcttgtgag aggagagtcg ctggagagaa agccaagacg ttcacgcgca tcaagtatgc actcctcact atgctcgaga agtttttgga atgcgttgcc gacgttttca aattggtgcc gttgcctatt acaatgggta ttcgtgcaat tgtggctgcg ggatgtacgt tcacttctgc agttattgga ttgtggactt tctgcaacag agtataa <210> 133 <211> 298 <212> PRT <213> Chlamydia
240
300
360
420
480
540
600
660
720
780
840
897
| <4 | ;00> | 133 | |||||||||||||
| Met | Ala | Ala | Ile | Cys | Gly | Arg | Leu | Gly | Ser | Gly | Thr | Gly | Asn | Ala | Leu |
| 1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
| Lys | Ala | Phe | Phe | Thr | Gin | Pro | Ser | Asn | Lys | Met | Ala | Arg | Val | Val | Asn |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Lys | Thr | Lys | Gly | Met | Asp | Lys | Thr | Val | Lys | Val | Ala | Lys | Ser | Ala | Ala |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Glu | Leu | Thr | Ala | Asn | Ile | Leu | Glu | Gin | Ala | Gly | Gly | Ala | Gly | Ser | Ser |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Ala | His | Ile | Thr | Ala | Ser | Gin | Val | Ser | Lys | Gly | Leu | Gly | Asp | Ala | Arg |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Thr | Val | Leu | Ala | Leu | Gly | Asn | Ala | Phe | Asn | Gly | Ala | Leu | Pro | Gly | Thr |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Val | Gin | Ser | Ala | Gin | Ser | Phe | Phe | Ser | Tyr | Met | Lys | Ala | Ala | Ser | Gin |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Lys | Pro | Gin | Glu | Gly | Asp | Glu | Gly | Leu | Val | Ala | Asp | Leu | Cys | Val | Ser |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| His | Lys | Arg | Arg | Ala | Ala | Ala | Ala | Val | Cys | Ser | Phe | Ile | Gly | Gly | Ile |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Thr | Tyr | Leu | Ala | Thr | Phe | Gly | Ala | Ile | Arg | Pro | Ile | Leu | Phe | Val | Asn |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Lys | Met | Leu | Ala | Gin | Pro | Phe | Leu | Ser | Ser | Gin | Thr | Lys | Ala | Asn | Met |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Gly | Ser | Ser | Val | Ser | Tyr | Ile | Met | Ala | Ala | Asn | His | Ala | Ala | Phe | Val |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Val | Gly | Ser | Gly | Leu | Ala | Ile | Ser | Ala | Glu | Arg | Ala | Asp | Cys | Glu | Ala |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Arg | Cys | Ala | Arg | Ile | Ala | Arg | Glu | Glu | Ser | Ser | Leu | Glu | Leu | Ser | Gly |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Glu | Glu | Asn | Ala | Cys | Glu | Arg | Arg | Val | Ala | Gly | Glu | Lys | Ala | Lys | Thr |
| 225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
| Phe | Thr | Arg | Ile | Lys | Tyr | Ala | Leu | Leu | Thr | Met | Leu | Glu | Lys | Phe | Leu |
| 245 | 250 | 255 | |||||||||||||
| Glu | Cys | Val | Ala | Asp | Val | Phe | Lys | Leu | Val | Pro | Leu | Pro | Ile | Thr | Met |
| 260 | 265 | 270 | |||||||||||||
| Gly | Ile | Arg | Ala | Ile | Val | Ala | Ala | Gly | Cys | Thr | Phe | Thr | Ser | Ala | Val |
| 275 | 280 | 285 | |||||||||||||
| Ile | Gly | Leu | Trp | Thr | Phe | Cys | Asn | Arg | Val | ||||||
| 290 | 295 |
<210> 134 <211> 897 <212> DNA
208 <213> Chlamydia <400> 134 atggcttcta tatgcggacg tttagggtct ggtacaggga atgctctaaa agcttttttt acacagccca acaataaaat ggcaagggta gtaaataaga cgaagggaat ggataagact attaaggttq ccaagtctgc tgccgaattg accgcaaata ttttggaaca agctggaggc gcgggctctt ccgcacacat tacagcttcc caagtgtcca aaggattagg ggatgcgaga actgttgtcg ctttagggaa tgcctttaac ggagcgttgc caggaacagt tcaaagtgcg caaagcttct tctctcacat gaaagctgct agtcagaaaa cgcaagaagg ggatgagggg ctcacagcag atctttgtgt gtctcataag cgcagagcgg ctgcggctgt ctgtagcatc atcggaggaa ttacctacct cgcgacattc ggagctatcc gtccgattct gtttgtcaac aaaatgctgg caaaaccgtt tctttcttcc caaactaaag caaatatggg atcttctgtt agctatatta tggcggctaa ccatgcagcg tctgtggtgg gtgctggact cgctatcagt gcggaaagag cagattgcga agcccgctgc gctcgtattg cgagagaaga gtcgttactc gaaatgccgg gagaggaaaa tgcttgcgag aagaaagtcg ctggagagaa agccaagacg ttcacgcgca tcaagtatgc actcctcact atgctcgaga agtttttgga atgcgttgcc gacgttttca aattggtgcc gctgcctatt acaatgggta ttcgtgcgat tgtggctgct ggatgtacgt tcacttctgc aattattgga ttgtgcactt tctgcgccag agcataa <210> 135 <211> 298 <212> PRT <213> Chlamydia
120 180 24Ó 300' 360 420 480 540 600 660 720 780 84 0 897
| <4 | 00> | 135 | |||||||||||||
| Met | Ala | Ser | Ile | Cys | Gly | Arg | Leu | Gly | Ser | Gly | Thr | Gly | Asn | Ala | Leu. |
| 1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
| Lys | Ala | Phe | Phe | Thr | Gin | Pro | Asn | Asn | Lys | Met | Ala | Arg | Val | Val | Asn |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Lys | Thr | Lys | Gly | Met | Asp | Lys | Thr | Ile | Lys | Val | Ala | Lys | Ser | Ala | Tkla |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Glu | Leu | Thr | Ala | Asn | Ile | Leu | Glu | Gin | Ala | Gly | Gly | Ala | Gly | Ser | Ser |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Ala | His | Ile | Thr | Ala | Ser | Gin | Val | Ser | Lys | Gly | Leu | Gly | Asp | Ala | Arg |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Thr | Val | Val | Ala | Leu | Gly | Asn | Ala | Phe | Asn | Gly | Ala | Leu | Pro | Gly | Thr |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Val | Gin | Ser | Ala | Gin | Ser | Phe | Phe | Ser | His | Met | Lys | Ala | Ala | Ser | Gin |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Lys | Thr | Gin | Glu | Gly | Asp | Glu | Gly | Leu | Thr | Ala | Asp | Leu | Cys | Val | Ser |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| His | Lys | Arg | Arg | Ala | Ala | Ala | Ala | Val | Cys | Ser | Ile | Ile | Gly | Gly | Ile |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Thr | Tyr | Leu | Ala | Thr | Phe | Gly | Ala | Ile | Arg | Pro | Ile | Leu | Phe | Val | Asn ' |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Lys | Met | Leu | Ala | Lys | Pro | Phe | Léu | Ser | Ser | Gin | Thr | Lys | Ala | Asn | Met |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Gly | Ser | Ser | Val | Ser | Tyr | Ile | Met | Ala | Ala | Asn | His | Ala | Ala | Ser | Val |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Val | Gly | Ala | Gly | Leu | Ala | Ile | Ser | Ala | Glu | Arg | Ala | Asp | Cys | Glu | Ala |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Arg | Cys | Ala | Arg | Ile | Ala | Arg | Glu | Glu | Ser | Leu | Leu | Glu | Met | Pro | Gly |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Glu | Glu | Asn | Ala | Cys | Glu | Lys | Lys | Val | Ala | Gly | Glu | Lys | Ala | Lys | Thr |
| 225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
| Phe | Thr | Arg | Ile | Lys | Tyr | Ala | Leu | Leu | Thr | Met | Leu | Glu | Lys | Phe | Leu |
| 245 | 250 | 255 | |||||||||||||
| Glu | Cys | Val | Ala | Asp | Val | Phe | Lys | Leu | Val | Pro | Leu | Pro | Ile | Thr | Met |
| 260 | 265 | 270 | |||||||||||||
| Gly | Ile | Arg | Ala | Ile | Val | Ala | Ala | Gly | Cys | Thr | Phe | Thr | Ser | Ala | Ile |
| 275 | 280 | 285 |
209
Ile Gly Leu Cys Thr Phe Cys Ala Arg Ala 290 295
| <210> | 136 |
| <211> | 882 |
| <212> | DNA |
| <213> | Chlamydia |
| <400> | 136 |
atggcttctg tatgtgggcg attaagtgct ggggtgggga acagatttaa cgcatttttc acgcgtcccg gtaacaagct atcacggttt gtaaatagcg caaaaggatt agacagatca ataaaggttg ggaagtctgc tgctgaatta acggcgagta ttttagagca aactgggggg gcagggactg atgcacatgt tacggcggcc aaggtgtcta aagcacttgg ggacgcgcga acagtaatgg ctctagggaa tgtcttcaat gggtctgtgc cagcaaccat tcaaagtgcg cgaagctgtc tcgcccattt acgagcggcc ggcaaagaag aagaaacatg ctccaaggtg aaagatctct gtgtttctca tagacgaaga gctgcggctg aggcttgtaa tgttattgga ggagcaactt atattacaac tttcggagcg attcgtccga cattactcgt taacaagctt cttgccaaac cattcctttc ctcccaagcc aaagaagggt tgggagcttc tgttggttat atcatggcag cgaaccatgc ggcatctgtg cttgggtctg ctttaagtat tagcgcagaa agagcagact gtgaagagcg gtgtgatcgc attcgatgta gtgaggatgg tgaaatttgc gaaggcaata aattaacagc tatttcggaa gagaacjgcta gatcatggac tctcattaag tacagattcc ttactatgat agaaaaacta tttgagatgg tggcggatat cttcaagtta attcctttgc caatttcgca tggaattcgt gctattgttg ctgcgggatg tacgttgact tctgcagtta ttggcttagg tactttttgg tctagagcat aa <210> 137 <211> 293 <212> PRT <213> Chlamydia
120
180
240
300
360
420
480
540
600
660
720
780
840
882
| <400> | 137 | ||||||||||||||
| Met | Ala | Ser | Val | Cys | Gly | Arg | Leu | Ser | Ala | Gly | Val | Gly | Asn | Arg | Phe |
| 1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
| Asn | Ala | Phe | Phe | Thr | Arg | Pro | Gly | Asn | Lys | Leu | Ser | Arg | Phe | Val | Asn |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Ser | Ala | Lys | Gly | Leu | Asp | Arg | Ser | Ile | Lys | Val | Gly | Lys | Ser | Ala | Ala |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Glu | Leu | Thr | Ala | Ser | Ile | Leu | Glu | Gin | Thr | Gly | Gly | Ala | Gly | Thr | Asp |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Ala | His | Val | Thr | Ala | Ala | Lys | Val | Ser | Lys | Ala | Leu | Gly | Asp | Ala | Arg |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Thr | Val | Met | Ala | Leu | Gly | Asn | Val | Phe | Asn | Gly | Ser | Val | Pro | Ala | Thr |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Ile | Gin | Ser | Ala | Arg | Ser | Cys | Leu | Ala | His | Leu | Arg | Ala | Ala | Gly | Lys |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Glu | Glu | Glu | Thr | Cys | Ser | Lys | Val | Lys | Asp | Leu | Cys | Val | Ser | His | Arg |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Arg | Arg | Ala | Ala | Ala | Glu | Ala | Cys | Asn | Val | Ile | Gly | Gly | Ala | Thr | Tyr |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Ile | Thr | Thr | Phe | Gly | Ala | Ile | Arg | Pro | Thr | Leu | Leu | Val | Asn | Lys | Leu |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Leu | Ala | Lys | Pro | Phe | Leu | Ser | Ser | Gin | Ala | Lys | Glu | Gly | Leu | Gly | Ala |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Ser | Val | Gly | Tyr | Ile | Met | Ala | Ala | Asn | His | Ala | Ala | Ser | Val | Leu | Gly |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Ser | Ala | Leu | Ser | Ile | Ser | Ala | Glu | Arg | Ala | Asp | Cys | Glu | Glu | Arg | Cys |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Asp | Arg | Ile | Arg | Cys | Ser | Glu | Asp | Gly | Glu | Ue | Cys | Glu | Gly | Asn | Lys |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Leu | Thr | Ala | Ile | Ser | Glu | Glu | Lys | Ala | Arg | Ser | Trp | Thr | Leu | Ile | Lys |
| 225 | 230 | 235 | 240 |
210 ·· ·· ··<· ·· ··· ··<’ ♦· ···· · ·' · · · · · • ··» ·· ««· · · • · · · · · ···· ···· ··· ·· ·· ·· ·· ·· ···*
| Tyr | Arg Phe | Leu | Thr Met 245 | Ile Glu Lys | Leu Phe Glu Met Val Ala | Asp | |||||||||
| 250 | 255 | ||||||||||||||
| Ile | Phe | Lys | Leu | Ile | Pro | Leu | Pro | Ile | Ser | His | Gly | Ile | Arg | Ala | Ile |
| 260 | 265 | 270 | |||||||||||||
| Val | Ala | Ala | Gly | Cys | Thr | Leu | Thr | Ser | Ala | Val | Ile | Gly | Leu | Gly | Thr |
| 275 | 280 | •285 | |||||||||||||
| Phe | Trp | Ser | Arg | Ala | |||||||||||
| 290 |
<210> 138 <211> 16 <212> PRT <213> Artificiální sekvence 2 <220>
<223> Vyrobeno v laboratoři <400> 138
Asp Leu Cys Val Ser His Lys Arg Arg Ala Ala Ala Ala Val Cys Ser 1 5 10 15 <210> 139 <211> 16 <212> PRT <213> Artificiální sekvence ce <220>
<223> Vyrobeno v laboratoři <400> 139
Arg Ala Ala Ala Ala Val Cys Ser Phe Ile Gly Gly Ile Thr Tyr Leu 1.5 10 15 <210> 140 <211> 18 <212> PD,p <213> A Artificiální sekvence θ <220>
<2 2 3 > Vyrobeno v laboratoři <400> 140
Cys Ser Phe Ile Gly Gly Ile Thr Tyr Leu Ala Thr Phe Gly Ala Ile 1 5 10 15
Arg Pro <210> 141 <211> 18 * <212> PRT <213> } Artificiální sekvence ' <220>
<223> Vyrobeno v laboratoři <400> 141
Tyr Leu Ala Thr Phe Gly Ala Ile Arg Pro Ile Leu Phe Val Asn Lys 15 10 15
Met Leu ·· ··«« a t ·
211 <210> 142 <211> 18 <212> PRT <213> Artificiální sekvence S <220>
<223> Vyrobeno v laboraton <400> 142
Arg Pro Ile Leu Phe Val Asn Lys Met Leu Ala Gin Pro Phe Leu Ser 1 5 10 15
Ser Gin .
<210> 143 <211> 17 <212> PRT <213> Artificiální sekvence e <220>
<223> Vyrobeno v laboratoři <400> 143
Met Leu Ala Gin Pro Phe Leu Ser Ser Gin Thr Lys Ala Asn Met Gly 15 10 15
Ser <210> 144 <211> 10 <212>·PRT <213> Artificiální sekvenceice <220>
<223> Vyrobeno v laboraton <400> 144
Cys Ser Phe Ile Gly Gly Ile Thr Tyr Leu 15 .10 <210> 145 <211> 9 <212> PRT <2i3> Artificiální sekvencece <220>
<223> Vyrobeno v laboratoři
Ser <400> 145
Phe Ile Gly Gly Ile Thr Tyr Leu 5 <210> 146 <211> 8 <212> PRT <213> Artificiální sekvence e <220>
<223> Vyrobeno v laboratoři <400> 146
I,
212 ·* ···« 4 · · • ·«· « · • · ···· ··· • 4 • ··· • · « • · « ► 44 ·*♦ ·*·· • · · * * * • » · • 9 9 ·
1* ·«
| Phe 1 | Ile Gly | Gly Ile Thr Tyr Leu .5 |
| <210> | 147 | |
| <211> | 9 | |
| <212> | PRT | |
| <213> | Artificiální sekvence>ce | |
| <220> | ||
| <223> | Vyrobeno v laboratoři | |
| <400> | 147 | |
| Cys | Ser Phe | Ile Gly Gly Ile Thr |
| . 1 | 5 | |
| <210> | 148 | |
| <211> | 8 | |
| <212> | PRT | |
| <213> | Artificiální sekvence1Ge | |
| <220> | ||
| <223> | Vyrobeno v laboratoři | |
| <400> | 148 | |
| Cys | Ser Phe | Ile Gly Gly Ile Thr |
| 1 | 5 | |
| <210> | 149 | |
| <211> | 10 | |
| <212> | PRT | |
| <213> | Artificiální sekvence e | |
| <220> | ||
| <223> | Vyrobeno v laboratoři | |
| <400> | 149 | |
| Cys | Ser Ile | Ile Gly Gly Ile Thr |
| 1 | 5 | |
| <210> | 150 | |
| <211> | 10 | |
| <212> | PRT | |
| <213> | - A 1 ' 1 r i δ | |
| -cnuiivituni seKvence | ||
| <220> | ||
| <223> | Vyrobeno v laboratoři | |
| <400> | 150 | |
| Cys | Gly Phe | Ile Gly Gly Ile Thr |
| 1 | 5 | |
| <210> | 151 | |
| <211> | 9 | |
| <212> | PRT | |
| <213> | Artificiální sekvence ce | |
| <220> | ||
| <223> | Vyrobeno v laboratoři | |
| <400> | 151 | |
| Gly | Phe Ile | Gly Gly Ile Thr Tyr |
213 • ···
| 1 | 5 | |
| <210> | 152 | |
| <211> | 20 | |
| <212> | PRT | |
| <213> <220> | Artificiální sekvence | |
| <223> Vyrobeno v laboratoři | ||
| <400> | 152 | |
| Gin | Ile Phe | Val Cys Leu Ile Ser |
| 1 | 5 | |
| Ser | Val Ala | Ser 20 |
| <210> | 153 | |
| <211> | 20 | |
| <212> | PRT | |
| <213> <220> | Artificiální sekvence | |
| <223> | Vyrobeno v laboratoři | |
| <400> | 153 | |
| Glu | Arg Leu | Arg Leu Arg Leu Ser |
| 1 | 5 | |
| Thr | Ser Arg | His 20 |
| <210> | 154 | |
| <211> | 20 | |
| <212> | PRT | |
| <213> <220> | Artificiální sekvence - | |
| <223> | Vyrobeno v laboratoři | |
| <400> | 154 | |
| Ala | Ser Ser | Glu Glu Leu Pro Thr |
| 1 | 5 | |
| Arg | Phe Cys | Leu 20 |
| <210> | 155 | |
| <211> | 20 | |
| <212> | PRT | |
| <213> <220> | Artificiální sekvence1' | |
| <223> | Vyrobeno v laboratoři | |
| <400> | 155 | |
| Arg | His Ser | Glu Leu Ser Val Arg |
| 1 | 5 | |
| Arg | Asn Arg | Phe 20 |
| <210> | 156 | |
| <211> | 20 | |
| <212> | PRT |
Ala Glu Arg Leu Arg Leu Arg Leu 10 15
Val Ala Ser Ser Glu Glu Leu Pro 10 15
Ser Arg His Ser Glu Leu Ser Val 10 15
Phe Cys Leu Ser Thr Lys Cys Trp 10 15
214 <213> Artifíciální sekvence:
<220>
<223> íVyrobeno v laboratoři <400> 156
Leu. Ser Thr Lys Cys Trp Arg Asn Arg Phe Phe Leu Pro Lys Leu Lys 1 5 10 15
Gin Ile Trp Asp 20 <210> 157 <211> 53 <212> PRT <213> Artifíciální sekvence: <220>
<223> Vyrobeno v laboratoři
| . <400> | 157 | 1 | |||||||||
| Ile | Phe Val | Cys | Leu Ile Ser Ala | Glu | Arg | Leu | Arg | Leu | Ser | Val | Ala |
| 1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||
| Ser | Ser Glu | Glu | Leu Pro Thr Ser | Arg | His | Ser | Glu | Leu | Ser | Val | Arg |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||
| Phe | Cys Leu | Ser | Thr Lys Cys Trp | Arg | Asn | Arg | Phe | Phe | Leu | Pro | Lys |
| 35 | 4.0 | 45 | |||||||||
| Leu | Lys Gin 50 | Ile | Trp | ||||||||
| <210> | 158 | ||||||||||
| <211> | 52 | ||||||||||
| <212> | PRT | ||||||||||
| <213> | Artifíciální sekvence | ||||||||||
| <220> | |||||||||||
| <223> | Vyrobeno v laboratoři | ||||||||||
| <400> | 158 | ||||||||||
| Leu | Cys Val | Ser | His Lys Arg Arg | Ala | Ala | Ala | Ala | Val | Cys | Ser | Phe |
| 1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||
| Ile | Gly Gly | Ile | Thr Tyr Leu Ala | Thr | Phe | Gly | Ala | Ile | Arg | Pro | Ile |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||
| Leu | Phe Val | Asn | Lys Met Leu Ala | Gin | Pro | Phe | Leu | Ser | Ser | Gin | Ile |
4 0 4 5
Lys Ala Asn Met 50 <210> 159 <211> 24 <212> DNA <213> Chlamydia <400> 159 ttttgaagca ggtaggtgaa tatg
| <210> | 160 |
| <211> | 24 |
| <212> | DNA |
| <213> | Chlamydia |
| <4 00> | 160 |
215 »· ···· ·· ·· . ·· · ···· • · ··· ·· · ···· · · ··· · · . · .
• ········· · » · ···· ···· ttaagaaatt taaaaaatcc ctta
| <210> | 161 |
| <211> | 24 |
| <212> | DNA |
| <213> | Chlamydia |
| <400> | 161 |
| ggtataatat ctctctaaat tttg | |
| <210> | 162 |
| <211> | 19 |
| <212> | DNA |
| <213> | Chlamydia |
| <4 00> | 162 |
| agataaaaaa ggctgtttc | |
| <210> | 163 |
| <211> | 24 |
| <212> | DNA |
| <213> | Chlamydia |
| <400> | 163 |
| ttttgaagca ggtaggtgaa tatg | |
| <210> | 164 |
| <211> | 29 |
| <212> | DNA |
| <213> | Chlamydia |
| <400> | 164 |
| tttacaataa gaaaagctaa gcactttgt | |
| <210> | 165 |
| <211> | 20 |
| <212> | DNA |
| <213> | Chlamydia |
| <400> | 165 |
| ccttacacag tcctgctgac | |
| <210> | 166 |
| <211> | 20 |
| <212> | DNA |
| <213> | Chlamydia |
| <400> | 166 |
| gtttccgggc < | cctcacattg |
| <210> | 167 |
| <211> | .9 |
| <212> | PRT |
| <213> | .Artificiální sekvence^ |
| <220> | |
| <223> | Vyrobeno v laboratoři |
| <400> | 167 |
| Ser Phe Ile | Gly Gly Ile Thr Tyr |
| 1 | 5 |
Leu
216 <210> 168 <211> 9 <212> PRT <213> Artificiální sekvence <220>
<223> Vyrobeno v laboratoři <400> 168
Ser Ile Ile Gly Gly Ile Thr Tyr Leu 1 5 <210> 169 <211> 2643 <212> DNA <213> Chlamydia <400> 169 gcaatcatgc gacctgatca tatgaacttc tgttgtctat gtgctgctat tttgtcatcc 60 acagcggtcc tctttggcca ggatccctta ggtgaaaccg ccctcctcac taaaaatcct 120 aatcatgtcg tctgtacatt ttttgaggac tgtaccatgg agagcctctt tcctgctctt 180 tgtgctcatg catcacaaga cgatcctttg tatgtacttg gaaattccta ctgttggttc 240 gtatctaaac tccatatcac ggaccccaaa gaggctcttt ttaaagaaaa aggagatctt 300 tccattcaaa actttcgctt cctttccttc acagattgct cttccaagga aagctctcct 360 tctattattc atcaaaagaa tggtcagtta tccttgcgca ataatggtag catgagtttc 420 tgtcgaaatc atgctgaagg ctctggagga gccatctctg cggatgcctt ttctctacag 480 cacaactatc ttttcacagc ttttgaagag aattcttcta aaggaaatgg cggagccatt 540 caggctcaaa ccttctcttt atctagaaat gtgtcgccta tttctttcgc ccgtaatcgt 600 gcggatttaa atggcggcgc tatttgctgt agtaatctta tttgttcagg gaatgtaaac 660 cctctctttt tcactggaaa ctccgccacg aatggaggcg ctatttgttg tatcagcgat 720 ctaaacacct Cagaaaaagg ctctctctct cttgcttgta accaagaaac gctatttgca 780 agcaattctg ctaaagaaaa aggcggggct atttatgcca agcacatggt attgcgttat 840 aacggtcctg tttccttcat taacaacagc gctaaaatag gtggagctat cgccatccag 900 tccggaggga gtctctctat ccttgcaggt gaaggatctgttctgttcca gaataactcc 960 caacgcacct ccgaccaagg tctagtaaga aacgccatct acttaragaa agatgcgatt 1020 ctttcttcct tagaagctcg caacggagat attcttttct ttgatcctat tgtacaagaa 1080 agtagcagca aagaatcgcc tcttccctcc tctttgcaag ccagcgtgac ttctcccacc 1140 ccagccaccg catctccttt agttattcag acaagtgcaa accgttcagt gattttctcg 1200 agcgaacgtc tttctgaaga agaaaaaact cctgataacc tcacttccca actacagcag 1260 cctatcgaac tgaaatccgg acgcttagtt ttaaaagatc gcgctgtcct ttccgcgcct 1320 tctctctctc aggatcctca agčt-ctcctc attatggaag cgggaacttc tttaaaaact 1380 tcctctgatt tgaagttagc tacgctaagt attccccttc attccttaga tactgaaaaa 1440 agcgtaacta tccacgcccc taatctttct atccaaaaga tcttcctctc taactctgga 1500 gatgagaatt tttatgaaaa tgtagagctt ctcagtaaag agcaaaacaa tattcctctc 1560 cttactctcc ctaaagagca atctcattta catcttcctg atgggaacct ctcttctcac 1620 tttggatatc aaggagattg gactttttct tggaaagatt ctgatgaagg gcattctctg 1680 attgctaatt ggacgcctaa aaactatgtg cctcatccag aacgtcaatc tacactcgtt 1740 gcgaacactc tttggaacac ctattccgat atgcaagctg tgcagtcgat gattaataca 1800 acagcgcacg gaggagccta tctatttgga acgtggggat ctgctgtttc taatttattc 1860 tatgttcacg acagctctgg gaaacctatc gataattggc atčatagaag ccttggctac 1920 ctattcggta tcagtactca cagtttagat gaccattctt tctgcttggc tgcaggacaa 1980 ttactcggga aatcgtccga ttcctttatt acgtctacag aaacgacctc ctatatagct .2040 actgtacaag cgcaactcgc tacctctcta atgaaaatct ctgcacaggc atgctacaat 2100 gaaagtatcc atgagctaaa aacaaaatat cgctccttct ctaaagaagg attcggatcc 2160 tggcaťagcg ttgcagtatc cggagaagtg tgcgcatcga ttcctattgt atccaatggt 2220 tccggactgt tcagctcctt ctctattttc tctaaactgc aaggattttc aggaacacag 2280 gacggttttg aggagagttc gggagagatt cggtcctttt ctgccagctc tttcagaaat 2340 atttcacttc ctataggaat aacatttgaa aaaaaatccc aaaaaacacg aacctactat 2400 tactttctag gagcctacat ccaagacctg aaacgtgatg tggaatcggg acctgtagtg 2460 ttactcaaaa atgccgtctc ctgggatgct cctatggcga acttggattc acgagcctac 2520 • · · ·
217 atgttccggc ttacgaatca aagagctcta cacagacttc agacgctgtt aaatgtgtct 2580 tgtgtgctgc gtgggcaaag ccatagttac tccctggatc tggggaccac ttacaggttc 2640 tag 2643 <210> 170 <211> 2949 <212> DNA <213> Chlamydia <400> 170 atgattcctc aaggaattta cgatggggag acgttaactg tatcatttcc ctatactgtt 60 ataggagatc cgagtgggac tactgttttt tctgcaggag agttaacatt aaaaaatctt 120 gacaattcta ttgcagcttt gcctttaagt tgttttggga acttattagg gagttttact 180 gttttaggga gaggacactc gttgactttc gagaacatac ggacttctac aaatggggca 240 gctctaagta atagcgctgc tgatggactg tttactattg agggttttaa agaattatcc 300 ttttccaatt gcaattcatt aCttgccgta ctgčctgctg caacgactaa taagggtagc 360 cagactccga cgacaacatc tacaccgtct aatggtacta tttattctaa aacagatctt 420 ttgttactca ataatgagaa gttctcattc tatagtaatt tagtctctgg agatggggga 480 gctatagatg ctaagagctt aacggttcaa ggaattagca agctttgtgt cttccaagaa 540 aatactgctc aagctgatgg gggagcttgt caagtagtca ccagtttctc tgctatggct 600 aacgaggctc ctattgcctt tgtagcgaat gttgcaggag taagaggggg agggattgct 660 gctgttcagg atgggcagca gggagtgtca tcatctactt caacagaaga tccagtagta 720; agtttttcca gaaatactgc ggtagagttt gatgggaacg tagcccgagt aggaggaggg 780 atttactcct acgggaacgt tgctttcctg aataatggaa aaaccttgtt tctcaacaat 840. gttgcttctc ctgtttacat tgctgctaag caaccaacaa gtggacaggc ttctaatacg 900 agtaataatt acggagatgg aggagctatc ttctgtaaga atggtgcgca agcaggatcc 960 aataactctg gatcágtttc ctttgatgga gagggagtag ttttctttag tagcaatgta 1020 gctgctggga aagggggagc tatttatgcc aaaaagctct cggttgctaa ctgtggccct 1080 gtacaatttt taaggaatat cgctaatgat ggtggagcga tttatttagg agaatctgga 1140 gagctcagtt tatctgctga ttatggagat attattttcg atgggaatct taaaagaaca 1200 gccaaagaga atgctgccga tgttaatggc gtaactgtgt cctcacaagc catttcgatg 1260 ggatcgggag ggaaaataac gacattaaga gctaaagcag ggcatcagat tctctttaat 1320 gatcccatcg agatggcaaa cggaaataac cagccagcgc agtcttccaa acttctaaaa 1380 attaacgatg gtgaaggata cacaggggat attgtttttg ctaatggaag cagtactttg 1440 taccaaaatg ttacgataga gcaaggaagg attgttcttc gtgaaaaggc aaaattatca 1500 gtgaattctc taagtcagac aggtgggagt ctgtatatgg aagctgggag tacattggat 1560 tttgtaactc cacaaccacc acaacagcct cctgccgcta atcagttgat cacgctttcc 1620 aatctgcatt tgtctctttc ttctttgtta gcaaacaatg cagttacgaa tcctcctacc 1680 aatcctccag cgcaagattc tcatcctgca gtcattggta gcacaactgc tggttctgtt 1740 acaattagtg ggcctatctt ttttgaggat ttggatgata cagcttatga taggtatgat 1800 tggctaggtt ctaatcaaaa aatcaatgtc ctgaaattac agttagggac taagccccca 1860 gctaatgccc catcagattt gactctaggg aatgagatgc ctaagtatgg ctatcaagga 1920 agctggaagc ttgcgtggga tcctaataca gcaaataatg gtccttatac tctgaaagct 1980 acatggacta aaactgggta taaicctggg cctgagcgag tagcttcttt ggttccaaat 2040 agtttatggg gatccatttt agatatacga tctgcgcatt cagcaattca agcaagtgtg 2100 gatgggcgct cttattgtcg aggattatgg gtttctggag tttcgaattt cttctatcat 2160 gaccgcgatg ctttaggtca gggatatcgg tatattagtg ggggttattc cttaggagca 2220 aactcctact ttggatcatc gatgtttggt ctagcattta ccgaagtatt tggtagatct 2280 aaagattatg tagtgtgtcg ttccaatcat catgcttgca taggatccgt ttatctatct 2340 acccaacaag ctttatgtgg atcctatttg ttcggagatg cgtttatccg tgctagctac 2400 gggtttggga atcagcatat gaaaacctca tatacatttg cagaggagag cgatgttcgt 2460 tgggataata actgtctggc tggagagatt ggagcgggat taccgattgt gattactcca 2520 tctaagctct atttgaatga gttgcgtcct ttcgtgcaag ctgagttttc ttatgccgat 2580 catgaatctt ttacagagga aggcgatcaa gctcgggcat tcaagagcgg acatctccta 2640 aatctatcag ttcctgttgg agtgaagttt gatcgatgtt ctagtacaca tcctaataaa 2700 tatagcttta tggcggctta tatctgtgat gcttatcgca ccatctctgg tactgagaca 2760 acgctcctat cccatcaaga gacatggaca acagatgcct ttcatttagc aagacatgga 2820 gttgtggtta gaggatctat gtatgcttct ctaacaagta atatagaagt atatggccat 2880 ggaagatatg agtatcgaga tgcttctcga ggctatggtt tgagtgcagg magtaaagtc 2940 yggttctaa 2949 • **· • 4·· ···· ··· ·· ·· ·· ··
218 <210> 171 <211> 2895 <212> DNA <213> Chlamydia <400> 171 atgaaaaaag cgtttttctt tttccttatc ggaaactccc tatcaggact agctagagag 60 gttccttcta gaatctttct tatgcccaac tcagttccag atcctacgaa agagtcgcta 120 tcaaataaaa ttagtttgac aggagacact cacaatctca ctaactgcta tctcgataac 180 ctacgctaca tactggctat tctacaaaaa actcccaatg aaggagctgc tgtcacaáta 240 acagattacc taagcttttt tgatacacaa aaagaaggta tttattttgc aaaaaatctc 300 acccctgaaa gtggtggtgc gattggttat gcgagtccca attctcctac cgtggagatt 360 cgtgatacaa taggtcctgt aatctttgaa aataatactt gttgcagact atttacatgg 420 agaaatcctt atgctgctga taaaataaga gaaggcggag ccattcatgc tcaaaatctt 480 tacataaatc ataatcatga tgtggtcgga tttatgaaga acttttctta tgtccaagga 540 ggagccatta gtaccgctaa tacctttgtt gtgagcgaga atcagtcttg ttttctcttt 600 atggacaaca tctgtattca aactaataca gcaggaaaag gtggcgctat ctatgctgga 660 acgagcaatt cttttgagag taataactgc gatctcttct tcatcaataa cgcctgttgt 720 gcaggaggag cgatcttctc ccctatctgt tctctaacag gaaatcgtgg taacatcgtt 780 ttctataaca atcgctgctt taaaaatgta gaaacagctt cttcagaagc ttctgatgga 840 ggagcaatta aagtaactac tcgcctagat gttacaggca atcgtggtag gatctttttt 900 agtgacaata tcacaaaaaa ttatggcgga gctatttacg ctcctgtagt taccctagtg 960 gataatggcc ctacctactt tataaacaat atcgccaata ataagggggg cgctatctat 1020 atagacggaa ccagtaactc caaaatttct gccgaccgcc atgctattat ttttaatgaa 1080 aatattgtga ctaatgtaac taatgcaaat ggtaccagta cgtcagctaa tcctcctaga 1140 agaaatgcaa taacagtagc aagctcctct ggtgaaattc tattaggagc agggagtagc 1200 caaaatttaa ttttttatga tcctattgaa gttagcaatg caggggtctc tgtgtccttc 1260 aataaggaag ctgatcaaac aggctctgta gtattttcag gagctactgt taattctgca 1320 gattttcatc aacgcaattt acaaacaaaa acacctgcac cccttactct cagtaatggt 1380 tttctatgta tcgaagatca tgctcagctt acagtgaatc gattcacaca aactgggggt 1440 gttgtttctc ttgggaatgg agcagttctg agttgctata aaaatggtac aggagattct 1500 gctagcaatg cctctataac actgaagcat attggattga atctttcttc cattctgaaa 1560 agtggtgctg agattccttt attgtgggta gagcctacaa ataacagcaa taactataca' 1620 gcagatactg cagctacctt ttcattaagt gatgtaaaac tctcactcat tgatgactac 1680 gggaactctc cttatgaatc cacagatctg acccatgctc tgtcatcaca gcctatgcta 1740 tctatttctg aagctagcga taaccagcta caatcagaaa atatagattt ttcgggacta 1800 aatgtccctc attatggatg gcaaggactt tggacttggg gctgggcaaa aactcaagat 1860 ccagaaccag catcttcagc aacaatcact gatccacaaa aagccaatag atttcataga 1920 accttactac taacatggct tcctgccggg tatgttccta gcccaaaaca cagaagtccc 1980 ctcatagcta acaccttatg ggggaatatg ctgcttgcaa cagaaagctt aaaaaatagt 2040 gcagagctga cacctagtgg tcatcctttc tggggaatta caggaggagg actaggcatg 2100 atggtttacc aagatcctcg agaaaatcat cctggattcc atatgcgctc ttccggatac 2160 tctgcgggga tgatagcagg gcagacacac accttctcat tgaaattcag tcagacctac 2220 accaaactca atgagcgtta cgcaaaaaac aacgtatctt ctaaaaatta ctcatgccaa 2280 ggagaaatgc tcttctcatt gcaagaaggt ttcttgctga ctaaattagt tgggctttac 2340 agctatggag accataactg tcaccatttc tatactcaag gagaaaatct aacatctcaa 2400 gggacgttcc gcagtcaaac gatgggaggt gctgtctttt ttgatctccc tatgaaaccc 2460 tttggatcaa cgcatatact gacagctCcc tttttaggtg ctcttggtat ttattctagc 2520 ctgtctcact ttactgaggt gggagcctat ccgcgaagct tttctacaaa gactcctttg 2580 atcaatgtcc tagtccctat tggagttaaa ggtagcttta tgaatgctac ccacagacct 2640 caagcctgga ctgtagaatt ggcataccaa cccgttctgt atagacaaga accagggatc 2700 gcgacccagc tcctagccag taaaggtatt tggtttggta gtggaagccc ctcatcgcgt 2760 catgccatgt cctataaaat ctčačagcaa acacaacctt tgagttggtt aactctccat 2820 ttccagtatc atggattcta ctcctcttca accttctgta attatctcaa tggggaaatt 2880 gctctgcgat tctag 2895 <210> 172 <211> 4593 <212> DNA <213> Chlamydia •9 9999
9999
999 999 *·
999 9 9 ··· · · ·
9 99φ· ··
9999 999 99 99 99 * *«
219 <400> 172 atgagttccg agaaagatat aaaaagcacc tgttctaagt tttctttgtc tgtagtagca 60 gctatccttg cctctgttag cgggttagct agttgcgtag atcttcatgc tggaggacag 120 tctgtaaatg agctggtata tgtaggccct caagcggttt tattgttaga ccaaattcga 180 gatctattcg ttgggtctaa agatagtcag gctgaaggac agtataggtt aattgtagga 240 gatccaagtt ctttccaaga gaaagatgca gatactcttc ccgggaaggt agagcaaagt 300 actttgttct cagtaaccaa tcccgtggtt ttccaaggtg tggaccaaca ggatcaagtc 360 tcttcccaag ggttaatttg tagttttacg agcagcaacc ttgattctcc ccgtgacgga 420 gaatcttttt taggtattgc ttttgttggg gatagtagta aggctggaat cacattaact 480 gacgtgaaag cttctttgtc tggagcggct ttatattcta cagaagatct tatctttgaa 540 aagattaagg gtggattgga atttgcatca tgttcttctc tagaacaggg gggagcttgt 600 gcagctcaaa gtattttgat tcatgattgt caaggattgc aggttaaaca ctgtactaca 660 gccgtgaatg ctgaggggtc tagtgcgaat gatcatcttg gatttggagg aggcgctttc 720 tttgttacgg gttctctttc tggagagaaa agtctctata tgcctgcagg agatatggta 780 gttgcgaatt gtgatggggc tatatctttt gaaggaaaca gcgcgaactt tgctaatgga 840 ggagcgattg ctgcctctgg gaaagtgctt tttgtcgcta atgataaaaa gacttctttt 900 atagagaacc gagctttgtc tggaggagcg attgcagcct cttctgatat tgcctttcaa 960 aactgcgcag aactagtttt caaaggcaat tgtgcaattg gaacagagga taaaggttct 1020 ttaggtggag gggctatatc ttctctaggc accgttcttt tgcaagggaa tcacgggata 1080 acttgtgata agaatgagtc tgcttcgcaa ggaggcgcca tttttggcaa aaattgtcag 1140 atttctgaca acgaggggcc agtggttttc agagatagta cagcttgctt aggaggaggc 1200 gctattgcag ctcaagaaat tgtttctatt cagaacaatc aggctgggat ttccttcgag 1260 ggaggtaagg ctagtttcgg aggaggtatt gcgtgtggat ctttttcttc cgcaggcggt 1320 gcttctgttt tagggactat tgatatttcg aagaatttag gcgcgatttc gttctctcgt 1380 actttatgta cgačctcaga tttaggacaa atggagtacc agggaggagg agctctattt 1440 ggtgaaaata tttctctttc tgagaatgct ggtgtgctca cctttaaaga caacattgtg 1500 aagacttttg cttcgaatgg gaaaattctg ggaggaggag cgattttagc tactggtaag 1560 gtggaaatta ccaataattc cggaggaatt tcttttacag gaaatgcgag agctccacaa 1620 gctcttccaa ctcaagagga gtttccttta ttcagcaaaa aagaagggcg accactctct 1680 tcaggatatt ctgggggagg agcgatttta ggaagagaag tagctattct ccacaacgct 1740 gcagtagtat ttgagcaaaa tcgtttgcag tgcagcgaag aagaagcgac attattaggt 1800 tgttgtggag gaggcgctgt tcatgggatg gatagcactt cgattgttgg caactcttca 1860 gtaagatttg gtaataatta cgcaatggga caaggagtct caggaggagc tcttttatct 1920 aaaacagtgc agttagctgg aaatggaagc gtcgattttt ctcgaaatat tgctagtttg 1980 ggaggaggag ctcttcaagc ttctgaagga aattgtgagc tagttgataa cggctatgtg 2040 ctattcagag ataatcgagg gagggtttat gggggtgcta tttcttgctt'acgtggagat 2100, gťagtcattt ctggaaacaa gggtagagtt gaatttaaag acaacatagc aacacgtctt 2160 tatgtggaag aaactgtaga aaaggttgaa gaggtagagc cagctcctga gcaaaaagac 2220 aataatgagc tttctttctt agggagtgta gaacagagtt ttattactgc agctaatcaa 2280 gctcttttcg catctgaaga tggggattta tcacctgagt catccatttc ttctgaagaa 2340 cttgcgaaaa gaagagagtg tgctggagga gctatttttg caaaacgggt tcgtattgta 2400 gaťaaccaag aggccgttgt attctcgaat aacttctctg atatttatgg cggcgccatt 2460 tttacaggtt ctcttcgaga agaggataag ttagatgggc aaatccctga agtcttgatc 2520 tcaggcaatg caggggatyt tgtttťttcc ggaaattcct cgaagcgtga tgagcatctt 2580 cctcatacag gtgggggagc catttgtact caaaatttga cgatttctca gaatacaggg 2640 aatgťtctgt tttataacaa cgtggcctgt tcgggaggag ctgttcgtat agaggatcat 2700 ggtaatgttc ttttagaagc ttttggagga gatattgttt ttaaaggaaa ttcttctttc 2760 agagcacaag gatccgatgc tatctatttt gcaggtaaag aatcgcatat tacagccctg 2820 aatgctacgg aaggacatgc tattgttttc cacgacgcat tagtttttga aaatctaaaa 2880 gaaaggaaat ctgctgaagt attgttaatc aatagtcgag aaaatccagg ttacactgga 2940 tctattcgat ttttagaagc agaaagtaaa gttcctcaat gtattcatgt acaacaagga 3000 agccttgagt tgctaaatgg agctacatta tgtagttatg gttttaaaca agatgctgga 3060 gctaagttgg tattggctgc tggatctaaa ctgaagattt tagattcagg aactcctgta 3120 caagggcatg ctatcagtaa acctgaagca gaaatcgagt catcttctga accagagggt 3180 gcacattctc tttggattgc gaagaatgct caaacaacag ttcctatggt tgatatccat 3240 actatttctg tagatttagc ctccttctct tctagtcaac aggaggggac agtagaagct 3300 cctcaggtta ttgttcctgg aggaagttat gttcgatctg gagagcttaa tttggagtta 3360 gttaacacaa caggtactgg ttatgaaaat catgctttgt tgaagaatga ggctaaagtt 3420 ccattgatgt ctttcgttgc ttctagtgat gaagcttcag ccgaaatcag taacttgtcg 3480 gtttctgatt tacagattca tgtagcaact ccagagattg aagaagacac atacggccat 3540 atgggagatt ggtctgaggc taaaattcaa gatggaactc·.ttgtcattaa ttggaatcct 3600
220 ·· ··«· ·· ·· -·· ···· ··· · · · · · · • ··· · · ··· · · ·
actggatatc gattagatcc tcaaaaagca ggggctttag tatttaatgc attatgggaa 3660 gaaggggctg tcttgtctgc tctgaaaaat gcacgctttg ctcataatct cactgctcag 3720 cgtatggaat tcgattattc tacaaatgtg tggggattcg cctttggtgg tttccgaact 3780 ctatctgcag agaatctggt tgctattgat ggatacaaag gagcttatgg tggtgcttct 3840 gctggagtcg atatt.caatt gatggaagat tttgttctag gagttagtgg agctgctttc 3900 ctaggtaaaa tggatagtca gaagtttgat gcggaggttt ctcggaaggg agttgttggt 3960 tctgtatata caggattttt agctggatcc tggttcttca aaggacaata tagccttgga 4020 gaaacacaga acgatatgaa aacgcgttat ggagtactag gagagtcgag tgcttcttgg 4080 acatctcgag gagtactggc agatgcttta gttgaatacc gaagtttagt tggtcctgtg 4140 agaectactt tttatgcttt gcatttcaat ccttatgtcg aagtatctta tgcttctatg 4200 aaattccctg gctttacaga acaaggaaga gaagcgcgtt cttttgaaga cgcttccctt 4260 accaatatca ccattccttt agggatgaag tttgaattgg cgttcataaa aggacagttt 4320 tcagaggtga actctttggg aataagttat gcatgggaag cttatcgaaa agtagaagga 4380 ggcgcggtgc agcttttaga agctgggttt gattgggagg gagctccaat ggatcttcct 4440 agacaggagc tgcgtgtcgc tctggaaaat aatacggaat ggagttctta cttcagcaca 4500 gtcttaggat taacagcttt ttgtggagga tttacttcta cagatagtaa actaggatat 4560 gaggcgaata ctggattgcg attgatcttt taa 4593 <210> 173 <211> 5331 <212> DNA <213> Chlamydia <400> 173 gcaatcatga aatttatgtc agctactgct gtatttgctg cagtactctc ctccgttact 60 gaggcgagct cgatccaaga tcaaataaag aataccgact gcaatgttag caaagtagga 120 tattcaactt ctcaagcatt tactgatatg atgctagcag acaacacaga gtatcgagct 180 gctgatagtg tttcattcta tgacttttcg acatcttccg gattacctag aaaacatctt '240 agtagtagta gtgaagcttc tccaacgaca gaaggagtgt cttcatcttc atctggagaa 300 aatactgaga attcacaaga ttcagctccc tcttctggag aaactgataa gaaaacagaa 360 gaagaactag acaatggcgg aatcatttat gctagagaga aactaactat ctcagaatct 420 caggactctc tctctaatcc aagcatagaa ctccatgaca atagtttttt cttcggagaa 480 ggtgaagtta tctttgatca cagagttgcc ctcaaaaacg gaggagctat ttatggagag 540 aaagaggtag tctttgaaaa cataaaatct ctactagtag aagtaaatat ctcggtcgag 600 aaagggggta gcgtctatgc aaaagaacga gtatctttag aaaatgttac cgaagcaacc 660 ttctcctcca atggtgggga acaaggtggt ggtggaatct attcagaaca agatatgtta 720 atcagtgatt gcaacaatgt acatttccaa gggaatgctg caggagcaac agcagtaaaa 780 caatgtctgg atgaagaaat gatcgtattg ctcacagaat gcgttgatag cttatccgaa 840 gatacactgg atagcactcc agaaacggaa cagactaagt caaatggaaa tcaagatggt 900 tcgtctgaaa caaaagatac acaagtatca gaatcaccag. aatcaactcč tagccccgac 960 gatgttttag gtaaaggtgg tggtatctat acagaaaaat ctttgaccat cactggaatt 1020 acagggacta tagattttgt cagtaacata gctaccgatt ctggagcagg tgtattcact 1080 aaagaaaact tgtcttgcac caacacgaat agcctacagt ttttgaaaaa ctcggcaggt 1140 caacatggag gaggageeta cgttacteaa accatgtctg ttactaatac aactagtgaa 1200 agtataacta ctccccctct cgtaggagaa gtgattttct ctgaaaatac agctaaaggg 1260 cacggtggtg gtatctgcac taacaaactt tctttatcta atttaáaaac ggtgactctc 1320 actaaaaact ctgcaáagga gtctggagga gctattttta cagatctagc gtctatacca 1380 acaacagata ccccagagtc ttctaccccc tcttcctcct cgcctgcaag cactcccgaa 1440 gtagttgctt ctgctaaaat aaatcgattc tttgcctcta cggcagaacc ggcagcccct 1500 tctctaacag aggctgagtc tgatcaaacg gatcaaacag aaacttctga tactaatagc 1560 gatatagacg tgtcgattga gaacattttg aatgtcgcta tcaatcaaaa cacttctgcg 1620 aaaaaaggag gggctattta cgggaaaaaa gctaaacttt cccgtattaa caatcttgaa 1680 ctttcaggga attcatccca ggatgtagga ggaggtctct gtttaactga aagcgtagaa 1740 tttgatgcaa ttggatcgct cttatcccac tataactctg ctgctaaaga aggtggggtt 1800 attcattcta aaacggttac tctatctaac ctcaagtcta ccttcacttt tgcagataac 1860 actgttaaag caatagtaga aagcactcct gaagctccag aagagattcc tccagtagaa 1920 ggagaagagt ctacagcaac agaaaatccg aattctaata cagaaggaag ttcggctaac 1980 actaaccttg aaggatctca aggggatact gctgatacag ggactggtgt tgttaacaat 2040 gagtctcaag .acacatcaga tactggaaac gctgaatctg gagaacaact acaagattct 2100 acacaatcta atgaagaaaa tacccttccc aatagtagta ttgatcaatc taacgaaaac 2160 acagacgaat catctgatag ccacactgag gaaataactg acgagagtgt ctcatcgtcc 2220
221
9 9· tctaaaagtg gatcatctac tcctcaagat ggaggagcag cttcttcagg ggctccctca 2280 ggagatcaat ctatctctgc aaacgcttgt ttagctaaaa gctatgctgc gagtactgat 2340 agctcccctg tatctaattc ttcaggttca gacgttactg catcttctga taatccagac 2400 tcttcctcat ctggagatag cgctggagac tctgaaggac cgactgagcc agaagctggt 2460 tctacaacag aaactcctac tttaatagga ggaggtgcta tctatggaga aactgttaag 2520 attgagaact tctctggcca aggaatattt tctggaaaca aagctatcga taacaccaca 2580 gaaggctcct cttccaaatc taacgtcctc ggaggtgcgg tctatgctaa aacattgttt 2640 aatctcgata gcgggagctc tagacgaact gtcaccttct ccgggaatac tgtctcttct 2700 caatctacaa caggtcaggt tgctggagga gctatctact ctcctactgt aaccattgct 2760 actcctgtag tattttctaa aaactctgca acaaacaatg ctaataacgc tacagatact 2820 cagagaaaag acacctttgg aggagctatc ggagctactt ctgctgtttc tctatcagga 2880 ggggctcatt tcttagaaaa cgttgctgac ctcggatctg ctattgggtt ggtgccagac 2940 acacaaaata cagaaacagt gaaattagag tctggctcct actactttga aaaaaataaa 3000 gctttaaaac gagctactat ttacgcacct gtcgtttcca ttaaagccta tactgcgaca 3060 tttaaccaaa acagatctct agaagaagga agcgcgattt actttacaaa agaagcatct 3120 attgagtctt taggctctgt tctcttcaca ggaaacttag taaccccaac gctaagcaca 318Ó actacagaag gcacaccagc cacaacctca ggagatgtaa caaaatatgg tgctgctatc 3240 tttggacaaa tagcaagctc aaacggatct cagacggata accttcccct gaaactcatt 3300 gcttcaggag gaaaťatttg tttccgaaac aatgaatacc gtcctacttc ttctgatacc 3360 ggaacctcta ctttctgtag tattgcggga gatgttaaat taaccatgca agctgcaaaa 3420 gggaaaacga tcagtttctt tgatgcaatc cggacctcta ctaagaaaac aggtacacag 3480 gcaactgcct acgatactct cgatattaat aaatctgagg attcagaaac tgtaaactct 3540 gcgtttacag gaacgattet gttctcctct gaattacatg aaaataaatc ctatattcca 3600 caaaacgtag ttctacacag tggatctctt gtattgaagc caaataccga gcttcatgtc 3660 atttcttttg agcagaaaga aggctcttct ctcgttatga cacctggatc tgttctttcg 3720 aaccagactg ttgctgatgg agctttggtc ataaataaca tgaccattga tttatccagc 3780 gtagagaaaa atggtattgc tgaaggaaat atctttactc ctccagaatt gagaatcata 3840 gacactacta caagtggaag cggtggaacc ccatctacag atagtgaaag taaccagaat 3900 agtgatgata ccaaggagca aaataataat gacgcctcga atcaaggaga aagcgcgaat 3960 ggatcgtctt ctcctgcagt agctgctgca cacacatctc gtacaagaaa ctttgccgct 4020 gcagctacag ccacacctac gacaacacca acggctacaa ctacaacaag caaccaagta 4080 atcctaggag gagaaatcaa actcatcgat cctaatggga ccttcttcca gaaccctgca 4140 ttaagatccg accaacaaat ctccttgtta gtgctcccta cagactcatc aaáaatgcaa 4200 gctcagaaaa tagtactgac gggtgatatt gctcctcaga aaggatatac aggaacactc 4260 actctggatc ctgatcaact acaaaatgga acgatctcag cgctctggaa atttgactct 4320 tatagacaat gggcttatgt acctagagac aatcatttct atgcgaactc gattctggga 4380 tctcaaatgt caatggtcac agtcaaacaa ggcttgctca acgataaaat gaatctagct 4440 cgctttgatg aagttagcta taacaacctg tggatatcag gactaggaác gatgctatcg 4500 caagtaggaa cacctacttc tgaagaattc acttattaca gcagaggagc ttctgttgcc 4560 ttagatgcta aaccagccca tgatgtgatt gttggagctg catttagtaa gatgatcggg 4620 aaaacaaaat ccttgaaaag agagaataac tacactcaca aaggatccga atattcttac 4680 caagcatcgg tatacggagg caaaccattc cactttgtaa tcaataaaaa aacggaaaaa 4740 tcgctaccgc tattgttaca aggagtcatc tcttacggat atatcaaaca tgatacagtg 4800 actcactatc caacgatccy tgaacgaaac caaggagaat gggaagactt aggatggctg 4860 acagctctcc gtgtctcctc tgtcttaaga actcctgcac aaggggatac taaacgtatc 4920 actgtttacg gagaattgga atactccagt atccgtcaga aacaattcac aga.aacagaa 4 980 tacgatcctc gttacttcga caactgcacc tatagaaact tagcaattcc tatggggtta 5040 gcattcgaag gagagctctc tggtaacgat attttgatgt acaacagatt ctctgtagca 5100 tacatgccat caatctatcg aaattctcca acatgcaaat accaagtgct ctcttcagga 5160 gaaggcggag aaattatttg tggagtaccg acaagaaact cagctcgcgg agaatacagc 5220 acgcagctgt acccgggacc tttgtggact ctgtatggat cctacacgat agaagcagac 5280 gcacatacac tagctcatat gatgaactgc ggtgctcgta tgacattcta a 5331 <210> 174 <211> 5265 <212> DNA <213> Chlamydia <400> 174
222 φ φ φφφφ *· φ φ · φ ΦΦΦ φ · ··· · · gcaatcatga aatggctgtc agctactgcg gtgtttgctg ctgttctccc ctcagtttca 60 gggttttgct tcccagaacc taaagaatta aatttctctc gcgtagaaac ttcttcctct 120 accactttta ctgaaacaat tggagaagct ggggcagaat atatcgtctc tggtaacgca 180 tctttcacaa aatttaccaa cattcctact accgatacaa caactcccac gaactcaaac 240 tcctctagct ctagcggaga aactgcttcc gtttctgagg atagtgactc tacaacaacg 300 actcctgatc ctaaaggtgg cggcgccttt tataacgčgc actccggagt tttgtccttt 360 atgacacgat caggaacaga aggttcctta actctgtctg agataaaaat gactggtgaa 420 ggcggtgcta tcttctctca aggagagctg ctatttacag atctgacaag tctaaccatc 480 caaaataact tatcccagct atccggagga gcgatttttg gaggatctac aatctcccta 540 tcagggatta ctaaagcgac tttctcctgc aactctgcag aagttcctgc tcctgttaag 600 aaacctacag aacctaaagc tcaaacagca agcgaaacgt cgggttctag tagttctagc 660 ggaaatgatt cggtgtcttc ccccagttcc agtagagctg aacccgcagc agctaatctt 720 caaagtcact ttatttgtgc tacagctact cctgctgctc aaaccgatac agaaacatca 780 actccctctc ataagccagg atctggggga gctatctatg ctaaaggcga ccttactatc 840 gcagactctc aagaggtact attctcaata aataaagcta ctaaagatgg aggagcgatc 900 tttgctgaga aagatgtttc tttcgagaat attacatcat taaaagtaca aactaacggt 960 gctgaagaaa agggaggagc tatctatgct aaaggtgacc tctcaattca atcttctaaa 1020 cagagtcttt ttaattctaa ctacagtaaa caaggtgggg gggctctata tgttgaagga 1080 ggtataaact tccaagatct tgaagaaatt cgcattaagt acaataaagc tggaacgttc 1140 gaaacaaaaa aaatcacttt accttcttta aaagctcaag catctgcagg aaatgcagat 1200 gcttgggcct cttcctctcc tcaatctggt tctggagcaa ctacagtctc cgactcagga 1260 gactctagct ctggctcaga ctcggatacc tcagaaacag ttccagtcac agctaaaggc 1320 ggtgggcťtt atactgataa gaatctttcg attactaaca tcacaggaat tatcgaaatt 1380 gcaaataaca aagcgacaga tgttggaggt ggtgcttacg taaaaggaac ccttacttgt 1440 gaaaactctc accgtctaca atttttgaaa aactcttccg ataaacaagg tggaggaatc -1500 tacggagaag acáacatcac cctatctaat ttgacaggga agactctatt ccaagagaat 1560 actgccaaag aagagggcgg tggactcttc ataaaaggta cagataaagc tcttacaatg 1620 acaggactgg atagtttctg tttaattaat aacacatcag aaaaacatgg tggtggagcc 1680 tttgttacca aagaaatctc tcagacttac acctctgatg tggaaacaat tccaggaatc 1740 aegcctgtac atggtgaaac agtcattact ggcaataaat ctacaggagg taatggtgga 1800 ggcgtgtgta caaaacgtct tgccttatct aaccttcaaa gcatttctat atccgggaat 1860 tctgcagcag aaaatggtgg tggagcccac acatgcccag atagcttccc aacggcggat 1920 actgcagaac agcccgcagc agcttctgcc gcgacgtcta ctcccaaatc tgccccggtc 1980 tcaactgctc taagcacacc ttcatcttct accgtctctt cattaacctt actagcagcc 2040 tcttcacaag cctctcctgc aacctctaat aaggaaactc aagatcctaa tgctgataca 2100 gacttattga tčgattatgt agttgatacg actatcagca aaaacactgc taagaaaggc 2160 ggtggaatct atgctaaaaa agccaagátg tcccgcatag accaactgaa tatctctgag 2220 aactccgcta cagagatagg tggaggtatc tgctgtaaag aatctttaga actagatgct 2280 ctagtctcct tatctgtaac agagaacctt gttgggaaag aaggtggagg cttacatgct 2340 aaaactgtaa atatttctaa tctgaaatca ggcttctctt tctcgaacaa caaagcaaac 2400 tcctcatcca caggagtcgc aacaacagct tcagcacctg ctgcagctgc tgcttcccta 2460 caagcagccg cagcagccgc accatcatct ccagéaacac caacttattc aggtgtagta 2520 ggaggagcta tctatggaga aaaggttaca ttctctcaat gtagcgggac ttgtcagttc 2580 tetgggaacc aagctatcga taacaatccc tcccaatcat cgttgaacgt acaaggagga 2640 gccatctatg ccaaaacctc tttgtctatt ggatcttccg atgctggaac ctcctatatt 2700 ttctcgggga acagtgtctc cactgggaaa tctcaaacaa cagggcaaat agcgggagga 2760 gcgatctact cccctactgt tacattgaat tgtcctgcga cattctctaa caatacagcc 2820 tctatagcta caccgaagac ttcttctgaa gatggatcct caggaaattc tattaaagat 2880 accattggag gagccattgc agggacagcc attaccctat ctggagtctc tcgattttca 2940 gggaatacgg ctgatttagg agctgcaata ggaactctag ctaatgcaaa tacacccagt 3000 gcaactagcg gatctcaaaa tagcattaca gaaaaaatta ctttagaaaa cggttctttt 3060 atttttgaaa gaaaccaagc taataaacgt ggagcgattt actctcctag cgtttccatt 3120 aaaggg.aata atattacctt caatcaaaat acatccactc atgatggaag cgctatctac 3180 tttacaaaag atgctacgat tgagtcttta ggatctgttc tttttacagg aaataacgtt 3240 acagctacac aagctagttc tgcaacatct ggacaaaata caaatactgc caactatggg 3300 gcagccatct ttggagatcc aggaaccact caatcgtctc aaacagatgc cattttaacc 3360 cttcttgctt cttctggaaa cattactttt agcaacaaca gtttacagaa taaccaaggt 3420 gátactcccg ctagcaagtt ttgtagtatt gcaggatacg tcaaactctc tctacaagcc 3480 gctaaaggga agactattag ctttttcgat tgtgtgcaca cctctaccaa aaaaacaggt 3540 tcaacacaaa acgtttatga aactttagat attaataaag aagagaacag taatccatat 3600 ácaggaacta ttgtgttctc ttctgaatta catgaaaaca- aatcttacat cccacagaat 3660 ·· 9999
9*99
9 9 » 9 · *· «99 · 9 999 9 9 • 9·· «9 9·9 · • 9 999· 99 • 999 949 99 ·9 99
J . 223 gcaatccttc acaacggaac tttagttctt aaagagaaaa cagaactcca cgtagtctct tttgagcaga aagaagggtc taaattaatt atggaacccg gagctgtgtt atctaaccaa aacatagcta acggagctct agctatcaat gggttaacga ttgatctttc cagtatgggg actcctcaag caggggaaat cttctctcct ccagaattac gtatcgttgc cacgacctct agtgcatccg gaggaagcgg ggtcagcagt agtataccaa caaatcctaa aaggatttct gcagcagtgc cttcaggttc tgccgcaact actccaacta tgagcgagaa caaagttttc ctaacaggag accttacttt aatagatcct aatggaaact tttaccaaaa ccctatgtta ggaagcgatc tagatgtacc actaattaag cttccgacta acacaagtga cgtccaagtc tatgatttaa ctttatctgg ggatcttttc cctcagaaag ggtacatggg aacctggaca ttagattcta atccacaaac agggaaactt caagccagat ggacattcga tacctatcgt cgctgggtat acatacctag ggataatcat ttttatgcga actctatctt aggctcccaa aactcaatga ttgttgtgaa gcaagggctt atcaacaača tgttgaataa tgcccgcttc gatgatatcg cttacaataa cttctgggtt tcaggagtag gaactttctt agctcaacaa ggaactcctc tttccgaaga attcagttac tacagccgcg gaacttcagt tgccatcgat gccaaaccta gacaagattt tatcctagga gctgcattta gtaagatagt ggggaaaacc aaagccatca aaaaaatgca taattacttc cataagggct ctgagtactc ttaccaagct tctgtctatg gaggtaaatt cctgtatttc ttgctcaata agcaacatgg ttgggcactt cctttcctaa tacaaggagt cgtgtcctat ggacatatta aacatgatac aacaacactt tacccttcta tccatgaaag aaataaagga gattgggaag atttaggatg gttagcggat cttcgtatct ctatggatct taaagaacct tctaaagatt cttctaaacg gatcactgtc tatggggaac tcgagtattc cagcattcgc cagaaacagt tcacagaaat cgattacgat ccaagacact tcgatgattg tgcttacaga aatctgtcgc ttcctgtggg atgcgctgtc gaaggagcta tcatgaactg taatattctt atgtataata agcttgcatt agcctacatg ccttctatct acagaaataa tcctgtctgt aaatatcggg tattgtcttc gaatgaagct ggtcaagtta -tctgcggagt gccaactaga acctctgcta gagcagaata cagtactcaa ctatatcttg gtcccttctg gactctctac ggaaactata ctatcgatgt aggcatgtat acgctatcgc aaatgactag ctgcggtgct cgcatgatct tctaa
3720 3780 3840 3900 3960 4 020 4080 4140 4200 4260 4320 4 380 4440 4500 4560 4620 4680 4740 4800 4 860 4920 4980 5040 5100 5160 5220 5265 <210> 175 <211> 880 <212> PRT <213> Chlamydia <220>
<221> VARIANT <222> 336 <223> Xaa = jakákoliv aminokyselina <400> 175
| Ala | Ile | Met | Arg | Pro | Asp | His | Met | Asn | Phe | Cys | Cys | Leu | Cys | Ala | Ala |
| 1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
| Ile | Leu | Ser | Ser | Thr | Ala | Val | Leu | Phe | Γ' 1 . » οχ y | Gin | Asp | Pro | Leu | Gly | Glu |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Thr | Ala | Leu | Leu | Thr | Lys | Asn | Pro | Asn | His | Val | Val | Cys | Thr | Phe | Phe |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Glu | Asp | Cys | Thr | Met | Glu | Ser | Leu | Phe | Pro | Ala | Leu | Cys | Ala | His | Ala |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Ser | Gin | Asp | Asp | Pro | Leu | Tyr | Val | Leu | Gly | Asn | Ser | Tyr | Cys | Trp | Phe |
| 65 | t | 70. .· | ·. | 75 | 80 | ||||||||||
| Val | Ser | Lys | Leu | His | Ile | Thr | Asp | Pro | Lys | Glu | Ala | Leu | Phe | Lys | Glu |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Lys | Gly | Asp | Leu | Ser | Ile | Gin | Asn | Phe | Arg | Phe | Leu | Ser | Phe | Thr | Asp |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Cys | Ser | Ser | Lys | Glu | Ser | Ser | Pro | Ser | Ile | Ile | His | Gin | Lys | Asn | Gly |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Gin | Leu | Ser | Leu | Arg | Asn | Asn | Gly | Ser | Met | Ser | Phe | Cys | Arg | Asn | His |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Ala | Glu | Gly | Ser | Gly | Gly | Ala | Ile | Ser | Ala | Asp | Ala | Phe | Ser | Leu | Gin |
| 145 | 150 | 155 | 160 |
• 9
224
9999 β · ·*·
9* ·9 « » · · 9
Β 9··· 9
Β « 9 4 9«
Β 9 · · 9 ·9
| His | Asn | Tyr | Leu Phe 165 | Thr | Ala | Phe | Glu | Glu Asn Ser Ser Lys Gly Asn | |||||||
| 170 | 175 | ||||||||||||||
| Gly | Gly | Ala | Ile | Gin | Ala | Gin | Thr. | Phe | Ser | Leu | Ser | Arg | Asn | Val | Ser |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Pro | Ile | Ser | Phe | Ala | Arg | Asn | Arg | Ala | Asp | Leu | Asn | Gly | Gly | Ala | Ile |
| 195. | 200 | 205 | |||||||||||||
| Cys | Cys | Ser | Asn | Leu | Ile | Cys | Ser | Gly Asn | Val | Asn | Pro | Leu | Phe | Phe | |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Thr | Gly | Asn | Ser | Ala | Thr | Asn | Gly | Gly | Ala | Ile | Cys | Cys | Ile | Ser | Asp |
| 225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
| Leu | Asn | Thr | Ser | Glu | Lys | Gly | Ser | Leu | Ser | Leu | Ala | Cys | Asn | Gin | Glu |
| 245 | 250 | 255 | |||||||||||||
| Thr | Leu | Phe | Ala | Ser | Asn | Ser | Ala | Lys | Glu | Lys | Gly | Gly | Ala | Ile | Tyr |
| 260 | 265 | 270 | |||||||||||||
| Ala | Lys | His | Met | Val | Leu | Arg | Tyr | Asn | Gly | Pro | Val | Ser | Phe | Ile | Asn |
| 275 | 280 | 285 | |||||||||||||
| Asn | Ser | Ala | Lys | Ile | Gly | Gly | Ala | Ile | Ala | Ile | Gin | Ser | Gly | Gly | Ser |
| 290 | 295 | 300 | |||||||||||||
| Leu | Ser | Ile | Leu | Ala | Gly | Glu | Gly | Ser | Val | Leu | Phe | Gin | Asn | Asn | Ser |
| 305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
| Gin | Arg | Thr | Ser | Asp | Gin | Gly. | Leu | Val | Arg | Asn | Ala | Ile | Tyr | Leu | Xaa |
| 325 | 330 | 335 | |||||||||||||
| Lys | Asp | Ala | Ile | Leu | Ser | Ser | Leu | Glu | Ala | Arg | Asn | Gly | Asp | Ile | Leu |
| 340 | 345 | 350 | |||||||||||||
| Phe | Phe | Asp | Pro | Ile | Val | Gin | Glu | Ser | Ser | Ser | Lys | Glu | Ser | Pro | Leu |
| 355 | 360 | 365 | |||||||||||||
| Pro | Ser | Ser | Leu | Gin | Ala | Ser | Val | Thr | Ser | Pro | Thr | Pro | Ala | Thr | Ala |
| 370 | 375 | 380 | 1 | ||||||||||||
| Ser | Pro | Leu | Val | Ile | Gin | Thr | Ser | Ala | Asn | Arg | Ser | Val | Ile | Phe | Ser |
| 385 | 390 | 395 | 400 | ||||||||||||
| Ser | Glu | Arg | Leu | Ser | Glu | Glu | Glu | Lys | Thr | Pro | Asp | Asn | Leu | Thr | Ser |
| 405 | 410 | 415 | |||||||||||||
| Gin | Leu | Gin | Gin | Pro | Ile | Glu | Leu | Lys | Ser | Gly | Arg | Leu | Val | Leu | Lys |
| 420 | 425 | 430 | |||||||||||||
| Asp | Arg | Ala | Val | Leu | Ser | Ala | Pro | Ser | Leu | Ser | Gin | Asp | Pro | Gin | Ala |
| 435 | 440 | 445 | |||||||||||||
| Leu | Leu | Ile | Met | Glu | Ala | Gly | Thr | Ser | Leu | Lys | Thr | Ser | Ser | Asp | Leu |
| 450 | 455 | 460 | |||||||||||||
| Lys | Leu | Ala | Thr | Leu | Ser | Ile | Pro | Leu | His | Ser | Leu | Asp | Thr | Glu | Lys |
| 465 | 470 | 475 | 4 80 | ||||||||||||
| Ser | Val | Thr | Ile | His | Ala | Pro | Asn | Leu | Ser | Ile | Gin | Lys | Ile | Phe | Leu |
| 485 | 4 90 | 495 | |||||||||||||
| Ser | Asn | Ser | Gly | Asp | Glu | Asn | Phe | Tyr | Glu | Asn | Val | Glu | Leu | Leu | Ser |
| 500 | 505 | 510 | |||||||||||||
| Lys | Glu | Gin | Asn | Asn | Ile | Pro | Leu | Leu | Thr | Leu | Pro | Lys | Glu | Gin | Ser |
| 515 | 520 | 525 | |||||||||||||
| His | Leu | His | Leu | Pro | Asp | Gly | Asn | Leu | Ser | Ser | His | Phe | Gly | Tyr | Gin |
| 530 | 535 | 540 | |||||||||||||
| Gly | Asp | Trp | Thr | Phe | Ser | Trp | Lys | Asp | Ser | Asp | Glu | Gly | His | Ser | Leu |
| 545 | 550 | 555 | 560 | ||||||||||||
| Ile | Ala | Asn | Trp | Thr | Pro | Lys | Asn | Tyr | Val | Pro | His | Pro | Glu | Arg | Gin |
| 565 | 570 | 575 | |||||||||||||
| Ser | Thr | Leu | Val | Ala | Asn | Thr | Leu | Trp | Asn | Thr | Tyr | Ser | Asp | Met | Gin |
| 580 | 585 | 590 | |||||||||||||
| Ala | Val | Gin | Ser | Met | Ile | Asn | Thr | Thr | Ala | His | Gly | Gly | Ala | Tyr | Leu |
| 595 | 600 | 605 | |||||||||||||
| Phe | Gly | Thr | Trp | Gly | Ser | Ala | Val | Ser | Asn | Leu | Phe | Tyr | Val | His | Asp |
| 610 | 615 | 620 | |||||||||||||
| Ser | Ser | Gly | Lys | Pro | Ile | Asp | Asn | Trp | His | His | Arg | Ser | Leu | Gly | Tyr |
| 625 | 630 | 635 | 640 | ||||||||||||
| Leu | Phe | Gly | Ile | Ser | Thr | His | Ser | Leu | Asp | Asp | His | Ser | Phe | Cys | Leu |
• · · ·
225 • · · · · · • ··· · · ···
| 645 | 650 | 655 | |||||||||||||
| Ala | Ala | Gly | Gin | Leu | Leu | Gly | Lys | Ser | Ser | Asp | Ser | Phe | Ile | Thr | Ser |
| 660 | 665 | 670 | |||||||||||||
| Thr | Glu | Thr | Thr | Ser | Tyr | Ile | Ma | Thr | Val | Gin | Ala | Gin | Leu | Ala | Thr |
| 675 | 680 | 685 | |||||||||||||
| Ser | Leu | Met | Lys | Ile | Ser | Ala | Gin | Ala | Cys | Tyr | Asn | Glu | Ser | Ile | His |
| 690 | 695 | 700 | |||||||||||||
| Glu | Leu | Lys | Thr | Lys | Tyr | Arg | Ser | Phe | Ser | Lys | Glu | Gly | Phe | Gly | Ser |
| 705 | 710 | 715 | 720 | ||||||||||||
| Trp | His | •Ser | Val | Ala | Val | Ser | Gly | Glu | Val | Cys | Ala | Ser | Ile | Pro | Ile |
| 725 | 730 | 735 | |||||||||||||
| Val | Ser | Asn | Gly | Ser | Gly | Leu | Phe | Ser | Ser | Phe | Ser | Ile | Phe | Ser | Lys |
| 740 | 745 | 750 | |||||||||||||
| Leu | Gin | Gly | Phe | Ser | Gly | Thr | Gin | Asp | Gly | Phe | Glu | Glu | Ser | Ser | Gly |
| 755 | 760 | 765 | |||||||||||||
| Glu | Ile | Arg | Ser | Phe | Ser | Ala | Ser | Ser | Phe | Arg | Asn | Ile | Ser | Leu | Pro |
| 770 | 775 | 780 | |||||||||||||
| Ile | Gly | Ile | Thr | Phe | Glu | Lys | Lys | Ser | Gin | Lys | Thr | Arg | Thr | Tyr | Tyr |
| 785 | 790 | 795 | 800 | ||||||||||||
| Tyr | Phe | Leu | Gly | Ala | Tyr | Ile | Gin | Asp | Leu | Lys | Arg | Asp | Val | Glu | Ser |
| 805 | 810 | 815 | |||||||||||||
| Gly | Pro | Val | Val | Leu | Leu | Lys | Asn | Ala | Val | Ser | Trp | Asp | Ala | Pro | Met |
| 820 | 825 | 830 | |||||||||||||
| Ala | Asn | Leu | Asp | Ser | Arg | Ala | Tyr | Met | Phe | Arg | Leu | Thr | Asn | Gin | Arg |
| 835 | 840 | 845 | |||||||||||||
| Ala | Leu | His | Arg | Leu | Gin | Thr | Leu | Leu | Asn | Val | Ser | Cys | Val | Leu | Arg |
| 850 | 855 | 860 | |||||||||||||
| .Gly | Gin | Ser | His | Ser | Tyr | Ser | Leu | Asp | Leu | Gly | Thr | Thr | Tyr | Arg | Phe |
| 865 | 870 | 875 | 880 |
<210> 176 <211> 982 <212> PRT <213> Chlamydia <220>
<221> VARIANT <222> 981 <2 2 3> Xaa = jakáko li v aminokyselina <400> 176
| Met 1 | Ile | Pro | Gin | Gly 5 | Ile | Tyr | Asp | Gly | Glu 10 | Thr | Leu | Thr | Val | Ser 15 | Phe |
| Thr | T.7-Z Ί | T 1 | 7\ | Pro | Q — — | mv- | mi,_ | TT-. Ί | ___ | Λ *J _ | |||||
| »dj. 20 | J. J-C | OJ. y | OCX 25 | oxy | -LUX | XilX | ναι | nit; 30 | |||||||
| Gly | Glu | Leu 35 | Thr | Leu | Lys | Asn | Leu 40 | Asp | Asn | Ser | Ile | Ala 45 | Ala | Leu | Pro |
| Leu | Ser 50 | Cys | Phe | Gly | Asn | Leu 55 | Leu | Gly | Ser | Phe | Thr 60 | Val | Leu | Gly | Arg |
| Gly 65 | His | Ser | Leu | Thr | Phe 70 | Glu | Asn | Ile | Arg | Thr 75 | Ser | Thr | Asn | Gly | Ala 80 |
| Ala | Leu | Ser | Asn | Ser 85 | Ala | Ala | Asp | Gly | Leu 90 | Phe | Thr | Ile | Glu | Gly 95 | Phe |
| Lys | Glu | Leu | Ser 100 | Phe | Ser | Asn | Cys | Asn 105 | Ser | Leu | Leu | Ala | Val- 110 | Leu | Pro |
| Ala | Ala | Thr 115 | Thr | Asn | Lys | Gly | Ser 120 | Gin | Thr | Pro | Thr | Thr 125 | Thr | Ser | Thr |
| Pro | Ser 130 | Asn | Gly | Thr | Ile | Tyr 135 | Ser | Lys | Thr | Asp | Leu 140 | Leu | Leu | Leu | Asn |
| Asn 145 | Glu | Lys | Phe | Ser | Phe 150 | Tyr | Ser | Asn | Leu | Val 15S | Ser | Gly | Asp | Gly Gly 160 |
• · · · · · • · • ·
| 226 | |||||||||||||||
| Ala | Ile | Asp | Ala | Lys | Ser | Leu | Thr | Val | Gin | Gly | Ile | Ser | Lys | Leu | Cys |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Val | Phe | Gin | Glu | Asn | Thr | Ala | Gin | Ala | Asp | Gly | Gly | Ala | Cys | Gin | Val |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Val | Thr | Ser | Phe | Ser | Ala | Met | Ala | Asn | Glu | Ala | Pro | Ile | Ala | Phe | Val |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Ala | Asn | Val | Ala | Gly | Val | Arg | Gly | Gly Gly | Ile | Ala | Ala | Val | Gin | Asp | |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Gly | Gin | Gin | Gly | Val | Ser | Ser | Ser | Thr | Ser | Thr | Glu | Asp | Pro | Val | Val |
| 225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
| Ser | Phe | Ser | Arg | Asn | Thr | Ala | Val | Glu | Phe | Asp | Gly | Asn | Val | Ala | Arg |
| 245 | 250 | 255 | |||||||||||||
| Val | Gly | Gly | Gly | Ile | Tyr | Ser | Tyr | Gly | Asn | Val | Ala | Phe | Leu | Asn | Asn |
| 260 | 265 | 270 | |||||||||||||
| Gly | Lys | Thr | Leu | Phe | Leu | Asn | Asn | Val | Ala | Ser | Pro | Val | Tyr | Ile | Ala |
| 275 | 280 | 285 | |||||||||||||
| Ala | Lys | Gin | Pro | Thr | Ser | Gly | Gin | Ala | Ser | Asn | Thr | Ser | Asn | Asn | Tyr |
| 290 | 295 | 300 | |||||||||||||
| Gly | Asp | Gly | Gly | Ala | Ile | Phe | Cys | Lys | Asn | Gly | Ala | Gin | Ala | Gly | Ser |
| 305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
| Asn | Asn | Ser | Gly | Ser | Val | Ser | Phe | Asp | Gly | Glu | Gly | Val | Val | Phe | Phe |
| 325 | 330 | 335 | |||||||||||||
| Ser | Ser | Asn | Val | Ala | Ala | Gly | Lys | Gly | Gly | Ala | Ile | Tyr | Ala | Lys | Lys |
| 340 | 345 | 350 | |||||||||||||
| Leu | Ser | Val | Ala | Asn | Cys | Gly | Pro | Val | Gin | Phe | Leu | Arg | Asn | Ile | Ala |
| 355 | 360 | 365 | |||||||||||||
| Asn | Asp | Gly Gly | Ala | Ile | Tyr | Leu | Gly | Glu | Ser | Gly | Glu | Leu | Ser | Leu | |
| 370 | 375 | 380 | |||||||||||||
| Ser | Ala | Asp | Tyr | Gly | Asp | Ile | Ile | Phe | Asp | Gly | Asn | Leu | Lys | Arg | Thr |
| 385 | 390 | 395 | 400 | ||||||||||||
| Ala | Lys | Glu | Asn | Tkla | Ala | Asp | Val | Asn | Gly | Val | Thr | Val | Ser | Ser | Gin |
| 405 | 410 | 415 | |||||||||||||
| Ala | Ile | Ser | Met | Gly | Ser | Gly | Gly | Lys | Ile | Thr | Thr | Leu | Arg | Ala | Lys |
| 420 | 425 | 430 | |||||||||||||
| Ala | Gly | His | Gin | Ile | Leu | Phe | Asn | Asp | Pro | Ile | Glu | Met | Ala | Asn | Gly |
| 435 | 440 | 445 | |||||||||||||
| Asn | Asn. | Gin | Pro | Ala | Gin | Ser | Ser | Lys | Leu | Leu | Lys | Ile | Asn | Asp | Gly |
| 450 | 455 | 460 | |||||||||||||
| Glu | Gly | Tyr | Thr | Gly | Asp | Ile | Val | Phe | Ala | Asn | Gly | Ser | Ser | Thr | Leu |
| 465 | 470 | 475 | 480 | ||||||||||||
| Tyr | Gin | Asn | Val | Thr | Ile | Glu | Gin | Gly | Arg | Ile | Val | Leu | Arg | Glu | Lys |
| 485 | 4 90 | 495 | |||||||||||||
| Ala | Lys | Leu | Ser | Val | Asn | Ser | Leu | Ser | Gin | Thr | Gly | Gly | Ser | Leu | Tyr |
| 500 | 505. | 510 | |||||||||||||
| Met | Glu | Ala | Gly | Ser | Thr | Leu | Asp | Phe | Val | Thr | Pro | Gin | Pro | Pro | Gin |
| 515 | 520 | 525 | |||||||||||||
| Gin | Pro | Pro | Ala | Ala | Asn | Gin | Leu | Ile | Thr | Leu | Ser | Asn | Leu | His | Leu |
| 530 | 535 | 540 | |||||||||||||
| Ser | Leu | Ser | Ser | Leu | Leu | Ala | Asn | Asn | Ala | Val | Thr | Asn | Pro | Pro | Thr |
| 545 | 550 | 555 | 560 | ||||||||||||
| Asn | Pro | Pro | Ala | Gin | Asp | Ser | His | Pro | Ala | Val | Ile | Gly | Ser | Thr | Thr |
| 565 | 570 | 575 | |||||||||||||
| Ala | Gly | Ser | Val | Thr | Ile | Ser | Gly | Pro | Ile | Phe | Phe | Glu | Asp | Leu | Asp |
| 580 | 585 | 590 | |||||||||||||
| Asp | Thr | Ala | Tyr | Asp | Arg | Tyr | Asp | Trp | Leu | Gly | Ser | Asn | Gin | Lys | Ile |
| 595 | 600 | 605 | |||||||||||||
| Asn | Val | Leu | Lys | Leu | Gin | Leu | Gly | Thr | Lys | Pro | Pro | Ala | Asn | Ala | Pro |
| 610 | 615 | 620 | |||||||||||||
| Ser | Asp | Leu | Thr | Leu | Gly | Asn | Glu | Met | Pro | Lys | Tyr | Gly | Tyr | Gin | Gly |
| 625 | 630 | 635 | 640 | ||||||||||||
| Ser | Trp | Lys | Leu | Ala | Trp | Asp | Pro | Asn | Thr | Ala | Asn | Asn | Gly | Pro | Tyr |
• to toto toto··
227
| Thr | Leu | Lys | Ala | 645 Thr | Trp | Thr | Lys | Thr | 650 Gly | Tyr | Asn | Pro | Gly | 655 Pro | Glu |
| Arg | Val | Ala | 660 Ser | Leu | Val | Pro | Asn | 665 Ser | Leu | Trp | Gly | Ser | 670 Ile | Leu | Asp |
| Ile | Arg | 675 Ser. | Ala | His | Ser | Ala | 680 Ile | Gin | Ala | Ser | Val | 685 Asp | Gly | Arg | Ser |
| Tyr | 690 Cys | Arg | Gly | Leu | Trp | 695 Val | Ser | Gly | Val | Ser | 700 Asn | Phe | Phe | Tyr | His |
| 705 Asp | Arg | Asp | Ada | Leu | 710 Gly | Gin | Gly | Tyr | Arg | 715 Tyr | Ile | Ser. | Gly | Gly | 720 Tyr |
| Ser | Leu | Gly | Ala | 725 Asn | Ser | Tyr | Phe | Gly | 730 Ser | Ser | Met | Phe | Gly | 735 Leu | Ala |
| Phe | Thr | Glu | 740 Val | Phe | Gly | Arg | Ser | 745 Lys | Asp | Tyr | Val | Val | 750 Cys | Arg | Ser |
| Asn | His | 755 His | Ala | Cys | Ile | Gly | 760 Ser | Val | Tyr | Leu | Ser | 765 Thr | Gin | Gin | Ala |
| Leu | 770 Cys Gly | Ser | Tyr | Leu | 775 Phe | Gly Asp | Ala | Phe | 780 Ile | Arg | Ala | Ser | Tyr | ||
| 785 Gly | Phe | Gly | Asn | Gin | 790 His | Met | Lys | Thr | Ser | 795 Tyr | Thr | Phe | Ala | Glu | 800 Glu |
| Ser | Asp | Val | Arg | 805 Trp | Asp | Asn | Asn | Cys | 810 Leu | Ala | Gly | Glu | Ile | 815 Gly | Ala |
| Gly | Leu | Pro | 820 Ile | Val | Tle | Thr | Pro | 825 Ser | Lys | Leu | Tyr | Leu | 830 Asn | Glu | Leu |
| Arg | Pro | 835 Phe | Val | Gin | Ala | Glu | 840 Phe | Ser | Tyr | Ala | Asp | 845 His | Glu | Ser | Phe |
| Thr | 850 Glu | Glu | Gly | Asp | Gin | 855 Ala | Arg | Ala | Phe | Lys | 860 Ser | Gly | His | Leu | Leu |
| 865 Asn | Leu | Ser | Val | Pro | 870 Val | Gly | Val | Lys | Phe | 875 Asp | Arg | Cys | Ser | Ser | 880 Thr |
| His | Pro | Asn | Lys | 885 Tyr | Ser | Phe | Met | Ala | 890 Ala | Tyr | Ile | Cys | Asp | 895 Ala | Tyr |
| Arg | Thr | Ile | 900 Ser | Gly | Thr | Glu | Thr | 905 Thr | Leu | Leu | Ser | His | 910 Gin | Glu | Thr |
| Trp | Thr | 915 Thr | Asp | Ala | Phe | His | 920 Leu | Ala | Arg | His | Gly | 925 Val | Val | Val | Arg |
| Gly | 930 Ser | Met | Tyr | Ala | Ser | 935 Leu | Thr | Ser | Asn | Ile | 940 Glu | Val | Tyr | Gly | His |
| 945 Gly | Arg | Tyr | Glu | Tyr | 950 Arg | Asp | Ala | Ser | Arg | 955 Gly | Tyr | Gly | Leu | Ser | 960 Ala |
| Gly | Ser | Lys | .Val | 965 Xaa | Phe | 970 | 975 |
980 <210> 177 <211> 964 <212> PRT <213> Chlamydia <400> 177
| Met | Lys | Lys | Ala | Phe | Phe | Phe | Phe | Leu | Ile | Gly. | Asn | Ser | Leu | Ser | Gly |
| 1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
| Leu | Ala | Arg | Glu | Val | Pro | Ser | Arg | Ile | Phe | Leu | Met | Pro | Asn | Ser | Val |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Pro | Asp | Pro | Thr | Lys | Glu | Ser | Leu | Ser | Asn | Lys | •Ile | Ser | Leu | Thr | Gly |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Asp | Thr | His | Asn | Leu | Thr | Asn | Cys | Tyr | Leu | Asp | Asn | Leu | Arg | Tyr | Ile |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Leu | Ala | Ile | Leu | Gin | Lys | Thr | Pro | Asn | Glu | Gly | Ala | Ala | Val | Thr | Ile |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Thr | Asp | Tyr | Leu | Ser | Phe | Phe | Asp | Thr | Gin | Lys. | Glu | Gly | Ile | Tyr | Phe |
228
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Ala | Lys | Asn | Leu | Thr | Pro | Glu | Ser | Gly | Gly | Ala | Ile | Gly | Tyr | Tkla | Ser |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Pro | Asn | Ser | Pro | Thr | Val | Glu | Ile | Arg | Asp | Thr | Ile | Gly | Pro | Val | Ile |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Phe | Glu | Asn | Asn | Thr | Cys | Cys | Arg | Leu | Phe | Thr | Trp | Arg | Asn | Pro | Tyr |
| 130 | 135 | 140. | |||||||||||||
| Ala | Ala | Asp | Lys | Ile | Arg | Glu | Gly | Gly | Ma | Ile | His | Ala | G-ln | Asn | Leu |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Tyr | Ile | Asn | His | Asn | His | Asp | Val | Val | Gly | Phe | Met | Lys | Asn | Phe | Ser |
| 165 | t- | 170 | 175 | ||||||||||||
| Tyr | Val | Gin | Gly | Gly | Ala | Ile | Ser | Thr | Ala | Asn | Thr | Phe | Val | Val | Ser |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Glu | Asn | Gin | Ser | Cys | Phe | Leu | Phe | Met | Asp | Asn | Ile | Cys | Ile | Gin | Thr |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Asn | Thr | Ala | Gly | Lys | Gly | Gly | Ala | Ile | Tyr | Ala | Gly | Thr | Ser | Asn | Ser |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Phe | Glu | Ser | Asn | Asn | Cys | Asp | Leu | Phe | Phe | Ile | Asn | Asn | Ala | Cys | Cys |
| 225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
| Ala | Gly | Gly | Ala | Ile | Phe | Ser | Pro | Ile | Cys | Ser | Leu | Thr | Gly | Asn | Arg |
| 245 | 250 | 255 | |||||||||||||
| Gly | Asn | Ile | Val | Phe | Tyr | Asn | Asn | Arg | Cys | Phe | Lys | Asn | Val | Glu | Thr |
| 260 | 265 | 270 | |||||||||||||
| Ala | Ser | Ser | Glu | Ala | Ser | Asp | Gly | Gly | Ala | Ile | Lys | Val | Thr, | Thr | Arg |
| 275 | 280 | 285 | |||||||||||||
| Leu | Asp | Val | Thr | Gly | Asn | Arg | Gly | Arg | Ile | Phe | Phe | Ser | Asp | Asn | Ile |
| 290 | 295 | 300 | |||||||||||||
| Thr | Lys | Asn | Tyr | Gly | Gly | Ala | Ile | Tyr | Ala | Pro | Val | Val | Thr | Leu | Val |
| 305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
| Asp | Asn | Gly | Pro | Thr | Tyr | Phe | Ile | Asn | Asn | Ile | Ala | Asn | Asn | Lys | Gly |
| 325 | 330 | 335 | |||||||||||||
| Gly | Ala | Ile | Tyr | Ile | Asp | Gly | Thr | Ser | Asn | Ser | Lys | Ile | Ser | Ala | Asp |
| 340 | 345 | 350 | |||||||||||||
| Arg | His | Ala | Ile | Ile | Phe | Asn | Glu | Asn | Ile | Val | Thr | Asn | Val | Thr | Asn |
| 355 | 360 | 365 | |||||||||||||
| Ala | Asn | Gly | Thr | Ser | Thr | Ser | Ala | Asn | Pro | Pro | Arg | Arg | Asn | Ala | Ile |
| 370 | 375 | 380 | |||||||||||||
| Thr | Val | Ala | Ser | Ser | Ser | Gly | Glu | Ile | Leu | Leu | Gly | Ala | Gly | Ser | Ser |
| 385 | 390 | 395 | 400 | ||||||||||||
| Gin | Asn | Leu | Ile | Phe | Tyr | Asp | Pro | Ile | Glu | Val | Ser | Asn | Ala | Gly | Val |
| 405 | 410 | 415 | |||||||||||||
| Ser | Val | Ser | Phe | Asn | Lys | Glu | Ala | Asp | Gin | Thr | Gly | Ser | Val | Val | Phe |
| 420 | 425 | 430 | |||||||||||||
| Ser | Gly | Ala | Thr | Val | Asn | Ser | Ala | Asp | Phe | His | Gin | Arg | Asn | Leu | Gin |
| 435 | 440 | 445 | |||||||||||||
| Thr | Lys | Thr | Pro | Ala | Pro | Leu | Thr | Leu | Ser | Asn | Gly | Phe | Leu | Cys | Ile |
| 450 | 455 | 4 60 | |||||||||||||
| Glu | Asp | His | Ala | Gin | Leu | Thr | Val | Asn | Arg | Phe | Thr | Gin | Thr | Gly | Gly |
| 465 | 470 | 475 | 480 | ||||||||||||
| Val | Val | Ser | Leu | Gly | Asn | Gly | Ala | Val | Leu | Ser | Cys | Tyr | Lys | Asn | Gly |
| 485 | 490 | 495 | |||||||||||||
| Thr | Gly | Asp | Ser | Ala | Ser | Asn | Ala | Ser | Ile | Thr | Leu | Lys | His | Ile | Gly |
| 500 | 505 | 510 | |||||||||||||
| Leu | Asn | Leu | Ser | Ser | Ile | Leu | Lys | Ser | Gly | Ala | Glu | Ile | Pro | Leu | Leu |
| 515 | 520 | 525 | |||||||||||||
| Trp | Val | Glu | Pro | Thr | Asn | Asn | Ser | Asn | Asn | Tyr | Thr | Ala | Asp | Thr | Ala |
| 530 | 535 | 540 | |||||||||||||
| Ala | Thr | Phe | Ser | Leu | Ser | Asp | Val | Lys | Leu | Ser | Leu | Ile | Asp | Asp | Tyr |
| 545 | 550 | 555 | 560 | ||||||||||||
| Gly | Asn | Ser | Pro | Tyr | Glu | Ser | Thr | Asp | Leu | Thr | His | Ala | Leu | Ser | Ser |
| 565 | 570 | 575 |
····
229
| Gin | Pro | Met | Leu 580 | Ser | Ile | Ser | Glu Ala Ser 585 | Asp Asn | Gin | Leu 590 | Gin | Ser | |||
| Glu | Asn | Ile | Asp | Phe | Ser | Gly | Leu | Asn | Val | Pro | His | Tyr | Gly | Trp | Gin |
| 595 | 600 | 605 | |||||||||||||
| Gly | Leu | Trp | Thr | Trp | Gly | Trp | Ala | Lys | Thr | Gin | Asp | Pro | Glu | Pro | Ala |
| 610 | 615 | 620 | |||||||||||||
| Ser | Ser | Ala | Thr | Ile | Thr | Asp | Pro | Gin | Lys | Ala | Asn | Arg | Phe | His | Arg |
| 625 | 630 | 635 | 640 | ||||||||||||
| Thr | Leu | Leu | Leu | Thr | Trp | Leu | Pro | Ala | Gly | Tyr | Val | Pro | Ser | Pro | Lys |
| 645 | 650 | 655 | |||||||||||||
| His | Arg | Ser | Pro | Leu | Ile | Ala | Asn | Thr | Leu | Trp | Gly | Asn | Met | Leu | Leu, |
| 660 | 665 | 670 | |||||||||||||
| Ala | Thr | Glu | Ser | Leu | Lys | Asn | Ser | Ala | Glu | Leu | Thr | Pro | Ser | Gly | His |
| 675 | 680 | 685 | |||||||||||||
| Pro | Phe | Trp | Gly | Ile | Thr | Gly | Gly | Gly | Leu | Gly | Met | Met | Val | -Tyr | Gin |
| 690 | 695 | 700 | |||||||||||||
| Asp | Pro | Arg | Glu | Asn | His | Pro | Gly | Phe | His | Met | Arg | Ser | Ser | Gly | Tyr |
| 705 | 710 | 715 | 720 | ||||||||||||
| Ser' | Ala | Gly | Met | Ile | Ala | Gly | Gin | Thr | His | Thr | Phe | Ser | Leu | Lys | Phe |
| 725 | 730 | 735 | |||||||||||||
| Ser | Gin | Thr | Tyr | Thr | Lys | Leu | Asn | Glu | Arg | Tyr | Ala | Lys | Asn | Asn | Val |
| 740 | 745 | 750 | |||||||||||||
| Ser | Ser | Lys | Asn | Tyr | Ser | Cys | Gin | Gly | Glu | Met | Leu | Phe | Ser | Leu | Gin |
| 755 | 760 | 765 | |||||||||||||
| Glu | Gly | Phe | Leu | Leu | Thr | Lys | Leu | Val | Gly | Leu | Tyr | Ser | Tyr | Gly | Asp |
| 770 | 775 | 780 | |||||||||||||
| His | Asn | Cys | His | His | Phe | Tyr | Thr | Gin | Gly | Glu | Asn | Leu | Thr | Ser | Gin |
| 785 | 790 | 795 | 800 | ||||||||||||
| Gly | Thr | Phe | Arg | Ser | Gin | Thr | Met | Gly | Gly | Ala | Val | Phe | Phe | Asp | Leu |
| 805 | 810 | 815 | |||||||||||||
| Pro | Met | Lys | Pro | Phe | Gly | Ser | Thr | His | Ile | Leu | Thr | Ala | Pro | Phe | Leu |
| 820 | 825 | 830 | |||||||||||||
| Gly | Ala | Leu | Gly | Ile | Tyr | Ser | Ser | Leu | Ser | His | Phe | Thr | Glu | Val | Gly |
| 835 | 840 | 845 | |||||||||||||
| Ala | Tyr | Pro | Arg | Ser | Phe | Ser | Thr | Lys | Thr | Pro | Leu | Ile | Asn | Val | Leu |
| 850 | 855 | 860 | |||||||||||||
| Val | Pro | Ile | Gly | Val | Lys | Gly | Ser | Phe | Met | Asn | Ala | Thr | His | Arg | Pro |
| 865 | 870 | 875 | 880 | ||||||||||||
| Gin | Ala | Trp | Thr | Val | Glu | Leu | Ala | Tyr | Gin | Pro | Val | Leu | Tyr | Arg | Gin' |
| 885 | 890 | 895 | |||||||||||||
| Glu | Pro | Gly | Ile | Ala | Thr | Gin | Leu | Leu | Ala | Ser | Lys | Gly | Ile | Trp | Phe |
| 900 | 905 | 910 | |||||||||||||
| Gly | Ser | Gly | Ser | Pro | Ser | Ser | Arg | His | Ala | Met | Ser | Tyr | Lys | Ile | Ser |
| 915 | 920 | 925 | |||||||||||||
| Gin | Gin | Thr | Gin | Pro | Leu | Ser | Trp | Leu | Thr | Leu | His | Phe | Gin | Tyr | His |
| 930 | 935 | 940 | |||||||||||||
| Gly | Phe | Tyr | Ser | Ser | Ser | Thr | Phe | Cys | Asn | Tyr | Leu | Asn | Gly | Glu | Ile |
| 945 | 950 | 955 | 960 | ||||||||||||
| Ala | Leu | Arg | Phe |
<210> 178 <211> 1530 <212> PRT <213> Chlamydia <400> 178
| Met | Ser | Ser | Glu | Lys | Asp | Ile | Lys | Ser | Thr | Cys | Ser | Lys | Phe | Ser | Leu |
| 1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
| Ser | Val | Val | Ala | Ala | Ile | Leu | Ala | Ser | Val | Ser | Gly | Leu | Ala | Ser | Cys |
| 20 | 25 | 30 |
·· ·· . .. /
230
| Val | Asp | Leu 35 | His | Ala | Gly | Gly | Gin 40 | Ser | Val | Asn | Glu | Leu 45 | Val | Tyr | Val |
| Gly | Pro 50 | Gin | Ala | Val | Leu | Leu 55 | Leu | Asp | Gin | Ile | Arg 60 | Asp | Leu | Phe | Val |
| Gly 65 | Ser | Lys | Asp | Ser | Gin 70 | Ala | Glu | Gly | Gin | Tyr 75 | Arg | Leu | Ile | Val | Gly 80 |
| Asp | Pro | Ser | Ser | Phe 85 | Gin | Glu | Lys | Asp | Ala 90 | Asp | Thr | Leu | Pro | Gly 95 | Lys |
| Val | Glu | Gin | Ser 100 | Thr | Leu | Phe | Ser | Val 105 | Thr | Asn | Pro | Val | Val 110 | Phe | Gin |
| Gly | Val | Asp 115 | Gin | Gin | Asp | Gin | Val 120 | Ser | Ser | Gin | Gly | Leu 125 | Ile | Cys | Ser |
| Phe | Thr 130 | Ser | Ser | Asn | Leu | Asp 135 | Ser | Pro | Arg | Asp | Gly 140 | Glu | Ser | Phe | Leu |
| Gly 145 | He | Ala | Phe | Val | Gly 150 | Asp | Ser | Ser | Lys | Ala 155 | Gly | Ile | Thr | Leu | Thr 160 |
| Asp | Val | Lys | Ala | Ser 165 | Leu | Ser | Gly | Ala | Ala 170 | Leu | Tyr | Ser | Thr | Glu 175 | Asp |
| Leu | Ile | Phe | Glu 180 | Lys | Ile | Lys | Gly | Gly 185 | Leu | Glu | Phe | Ala | Ser 190 | Cys | Ser. |
| Ser | Leu | Glu 195 | Gin | Gly | Gly | Ala | Cys 200 | Ala | Ala | Gin | Ser | Ile 205 | Leu | Ile | His |
| Asp | Cys 210 | Gin | Gly | Leu | Gin | Val 215 | Lys | His | Cys | Thr | Thr 220 | Ala | Val | Asn | Tkla |
| Glu 225 | Gly | Ser | Ser | Ala | Asn 230 | Asp | His | Leu | Gly | Phe 235 | Gly | Gly | Gly | Ala | Phe 2'4 0 |
| Phe | Val | Thr | Gly | Ser 245 | Leu | Ser | Gly | Glu | Lys 250 | Ser | Leu | Tyr | Met | Pro 255 | Ala |
| Gly | Asp | Met | Val 260 | Val | Ala | Asn | Cys | Asp 265 | Gly | Ala | Ile | Ser | Phe 270 | Glu | Gly |
| Asn | Ser | Ala 275 | Asn | Phe | Ala | Asn | Gly Gly 280 | Ala | Ile | Ala | Ala 285 | Ser | Gly | Lys | |
| Val | Leu 290 | Phe | Val | Ala | Asn | Asp 295 | Lys | Lys | Thr | Ser | Phe 300 | Ile | Glu | Asn | Arg |
| Ala 305 | Leu | Ser | Gly | Gly | Ala 310 | Ile | Ala | Ala | Ser | Ser 315 | Asp | Ile | Ala | Phe | Gin 320 |
| Asn | Cys | Ala | Glu | Leu 325 | Val | Phe | Lys | Gly | Asn 330 | Cys | Ala | Ile | Gly | Thr 335 | Glu |
| Asp | Lys | Gly | Ser 340 | Leu | Gly | Gly | Gly | Ala 345 | Ile | Ser | Ser | Leu | Gly 350 | Thr | Val |
| Leu | Leu | Gin 355 | Gly | Asn | His | Gly | Ile 360 | Thr | Cys | Asp | Lys | Asn 365 | Glu | Ser | Ala |
| Ser | Gin 370 | Gly | Gly | Ala | Ile | Phe 375 | Gly | Lys | Asn | Cys | Gin 380 | Ile | Ser | Asp | Asn |
| Glu 385 | Gly | Pro | Val | Val | Phe 390 | Arg | Asp | Ser | Thr | Ala 395- | Cys | Leu | Gly | Gly | Gly 400 |
| Ala | Ile | Ala | Ala | Gin 405 | Glu | Ile | Val | Ser | Ile 410 | Gin | Asn | Asn | Gin | Ala 415 | Gly |
| Ile | Ser | Phe | Glu 420 | Gly | Gly | Lys | Ala | Ser 425 | Phe | Gly | Gly | Gly | Ile 430 | Ala | Cys |
| Gly | Ser | Phe 435 | Ser | Ser | Ala | Gly | Gly 440 | Ala | Ser | Val | Leu | Gly 445 | Thr | Ile | Asp |
| Ile | Ser 450 | Lys | Asn | Leu | Gly | Ala 455 | Ile | Ser | Phe | Ser | Arg 4 60 | Thr | Leu | Cys | Thr |
| Thr 4 65 | Ser | Asp | Leu | Gly | Gin 470 | Met | Glu | Tyr | Gin | Gly 475 | Gly | Gly | Ala | Leu | Phe 480 |
| Gly | Glu | Asn | Ile | Ser 485 | Leu | Ser | Glu | Asn | Ala 4 90 | Gly | Val | Leu | Thr | Phe 495 | Lys |
| Asp | Asn | Ile | Val 500 | Lys | Thr | Phe | Ala | Ser 505 | Asn | Gly | Lys | Ile | Leu 510 | Gly | Gly |
| Gly | Ala | Ile | Leu | Ala | Thr | Gly | Lys | Val | Glu | Ile. | Thr | Asn | Asn | Ser | Gly |
9· 9999
231
515 520 525
| Gly | Ile 530 | Ser | Phe | Thr | Gly | Asn Ala Arg Ala 535 | Pro | Gin 540 | Ala | Leu | Pro | Thr |
| Gin 545 | Glu | Glu | Phe | Pro | Leu 550 | Phe Ser Lys Lys | Glu 555 | Gly | Arg | Pro | Leu | Ser 560 |
| Ser | Gly | Tyr | Ser | Gly 565 | Gly | Gly Ala Ile Leu 570 | Gly | Arg | Glu | Val | Ala 575 | He |
| Leu | His | Asn | Ala 580 | Ala | Val | Val Phe Glu Gin 585 | Asn | Arg | Leu | Gin 590 | Cys | Ser |
| Glu | Glu | Glu 595 | Ala | Thr | Leu | Leu Gly Cys Cys 600 | Gly | Gly | Gly 605 | Ala | Val | His |
| Gly | Met 610 | Asp | Ser | Thr | Ser | Ile Val Gly Asn 615 | Ser | Ser 620 | Val | Arg | Phe | Gly |
| Asn 625 | Asn | Tyr | Ala | Met | Gly 630. | Gin Gly Val Ser | Gly 635 | Gly | Ala | Leu | Leu | Ser 640 |
| Lys | Thr | Val | Gin | Leu 645 | Ala | Gly Asn Gly Ser 650 | Val | Asp | Phe | Ser | Arg 655 | Asn |
| Ile | Ala | Ser | Leu 660 | Gly | Gly | Gly Ala Leu Gin 665 | Ala | Ser | Glu | Gly 670 | Asn | Cys |
| Glu | Leu | Val 675 | Asp | Asn | Gly | Tyr Val Leu Phe 680 | Arg | Asp | Asn 685 | Arg | Gly | Arg |
| Val | Tyr 690 | Gly | Gly | Ala | Ile | Ser Cys Leu Arg 695 | Gly | Asp 700 | Val | Val | Ile | Ser |
| Gly 705 | Asn | Lys | Gly | Arg | Val 710 | Glu Phe Lys Asp | Asn 715 | Ile | Ala | Thr | Arg | Leu 720 |
| Tyr | Val | Glu | Glu | Thr 725 | Val | Glu Lys Val Glu 730 | Glu | Val | Glu | Pro | .Ala 735 | Pro |
| Glu | Gin | Lys | Asp 740 | Asn | Asn | Glu Leu Ser Phe 745 | Leu | Gly | Ser | Val 750 | Glu | Gin |
| Ser | Phe | Ile 755 | Thr | Ala | Ala | Asn Gin Ala Leu 760 | Phe | Ala | Ser 765 | Glu | Asp | Gly |
| Asp | Leu 770 | Ser | Pro | Glu | Ser | Ser Ile Ser Ser 775 | Glu | Glu 780 | Leu | Ala | Lys | Arg |
| Arg 785 | Glu | Cys | Ala | Gly | Gly 790 | Ala Ile Phe Ala | Lys 795 | Arg | Val | Arg | Ile | Val 800 |
| Asp | Asn | Gin | Glu | Ala 805 | Val | Val Phe Ser Asn 810 | Asn | Phe | Ser | Asp | Ile 815 | Tyr |
| Gly | Gly | Ala | Ile 820 | Phe | Thr | Gly Ser Leu Arg 825 | Glu | Glu | Asp | Lys 830 | Leu | Asp |
| Gly | Gin | Ile 835 | Pro | Glu | Val | Leu Ile Ser Gly 840 | Asn | Ala | Gly 845 | Asp | Val | Val |
| Phe | Ser 850 | Gly | Asn | Ser | Ser | Lys Arg Asp Glu 855 | His | Leu 860 | Pro | His | Thr | Gly |
| Gly 865 | Gly | Ala | Ile | Cys | Thr 870 | Gin Asn Leu Thr | Ile 875 | Ser | Gin | Asn | Thr | Gly 880 |
| Asn | Val | Leu | Phe | Tyr 885 | Asn | Asn Val Ala Cys 8 90 | Ser | Gly | Gly | Ala | Val 895 | Arg |
| Ile | Glu | Asp | His 900 | Gly | Asn | Val Leu Leu Glu 905 | Ala | Phe | Gly | Gly 910 | Asp | Ile |
| Val | Phe | Lys 915 | Gly | Asn | Ser | Ser Phe Arg Ala 920 | Gin | Gly | Ser 925 | Asp | Ala | Ile |
| Tyr | Phe 930 | Ala | Gly | Lys | Glu | Ser His Ile Thr 935 | Ala | Leu 940 | Asn | Ala | Thr | Glu |
| Gly 945 | His | Ala | Ile | Val | Phe 950 | His Asp Ala Leu | Val 955 | Phe | Glu | Asn | Leu | Lys 960 |
| Glu | Arg | Lys | Ser | Ala 965 | Glu | Val Leu Leu Ile 970 | Asn | Ser | Arg | Glu | Asn 975 | Pro |
| Gly | Tyr | Thr | Gly 980 | Ser | Ile | Arg Phe Leu Glu 985 | Ala | Glu | Ser | Lys 990 | Val | Pro |
| Gin | Cys | Ile 995 | His | Val | Gin | Gin Gly Ser Leu 1000 | Glu | Leu | Leu Asn 1005 | Gly | Ala |
·· ···· • · ···· ··· ·'·'· · · · ···· · ···· · · * • ······.··· · • · * · · · · · · · ··«· ··· ·· ·· ·· ·· . .. ν !
232
| Thr | Leu Cys 1010 | Ser | Tyr | Gly Phe Lys 1015 | Gin | Asp Ala Gly Ala Lys 1020 | Leu | Val |
| Leu | Ala Ala | Gly | Ser | Lys Leu Lys | Ile | Leu Asp Ser Gly Thr | Pro | Val |
| 1025 | 1030 | 1035 | 1040 | |||||
| Gin | Gly His | Ala | Ile | Ser Lys Pro | Glu | Ala Glu Ile Glu Ser | Ser | Ser |
| 1045 | 1050 | 1055 | ||||||
| Glu | Pro Glu | Gly | Ala | His Ser Leu | Trp | Ile Ala Lys Asn Ala | Gin | Thr |
| 1060 | 1065 1070 | |||||||
| Thr | Val Pro | Met | Val | Asp Ile His | Thr | Ile Ser Val Asp Leu | Ala | Ser |
| 1075 | 1080 | 1085 | ||||||
| Phe | Ser Ser | Ser | Gin | Gin Glu Gly | Thr | Val Glu Ala Pro Gin | Val | Ile |
| 1090. | 1095 | 1100 | ||||||
| Val | Pro Gly | Gly | Ser | Tyr Val Arg | Ser | Gly Glu Leu Asn Leu | Glu | Leu |
| 1105 | 1110 | 1115 | 1120 | |||||
| Val | Asn Thr | Thr | Gly | Thr Gly Tyr. | Glu | Asn His Ala Leu Leu | Lys | Asn |
| 1125 | 1130 | 1135 | ||||||
| Glu | Ala Lys | Val | Pro | Leu Met Ser | Phe | Val Ala Ser Ser Asp | Glu | Ala |
| 1140 | 1145 1150 | |||||||
| Ser | Ala Glu | Ile | Ser | Asn Leu Ser | Val | Ser Asp Leu Gin Ile | His | Val |
| 1155 | 1160 | 1165 | ||||||
| Ala | Thr Pro | Glu | Ile | Glu Glu Asp | Thr | Tyr Gly His Met Gly | Asp | Trp |
| 1170 | 1175 | 1180 | ||||||
| Ser | Glu Ala | Lys | Ile | Gin Asp Gly | Thr | Leu Val Ile Asn Trp | Asn | Pro |
| 1185 | 1190 | 1195 | 1200 | |||||
| Thr | Gly Tyr | Arg | Leu | Asp Pro Gin | Lys | Ala Gly Ala Leu Val | Phe | Asn |
| 1205 | 1210 | 1215 | ||||||
| Ala | Leu Trp | Glu | Glu | Gly Ala Val | Leu | Ser Ala Leu Lys Asn | Ala | Arg |
| 1220 | 1225 1230 | |||||||
| Phe | Ala His | Asn | Leu | Thr Ala Gin | Arg | Met Glu Phe Asp Tyr | Ser | Thr |
| 1235 | 1240 | 1245 | ||||||
| Asn | Val Trp | Gly | Phe | Ala Phe Gly | Gly | Phe Arg Thr Leu Ser | Ala | Glu |
| 1250 | 1255 | 1260 | ||||||
| Asn | Leu Val | Ala | Ile | Asp Gly Tyr | Lys | Gly Ala Tyr Gly Gly | Ala | Ser |
| 1265 | 1270 | 1275 | 1280 | |||||
| Ala | Gly Val | Asp | Ile | Gin Leu Met | Glu | Asp Phe Val Leu Gly | Val | Ser |
| 1285 | 1290 | 1295 | ||||||
| Gly | Ala Ala | Phe | Leu | Gly Lys'Met | Asp | Ser Gin Lys Phe Asp | Ala | Glu |
| 1300 | 1305 1310 | |||||||
| Val | Ser Arg | Lys | Gly | Val Val Gly | Ser | Val Tyr Thr Gly Phe | Leu | Ala |
| 1315 | 1320 | 1325 | ||||||
| Gly | Ser Trp | Phe | Phe | Lys Gly Gin | Tyr | Ser Leu Gly Glu Thr | Gin | Asn |
| 1330 | 1335 | 1340 | ||||||
| Asp | Met Lys | Thr | Arg | Tyr Gly Val | Leu | Gly Glu Ser Ser Ala | Ser | Trp |
| 1345 | 1350 | 1355 | 1360 | |||||
| Thr | Ser Arg | Gly | Val | Leu Ala Asp | Ala | Leu Val Glu Tyr Arg | Ser | Leu |
| 1365 | 1370 | 1375 | ||||||
| Val | Gly Pro | Val | Arg | Pro Thr Phe | Tyr | Ala Leu His Phe Asn | Pro | Tyr |
| 1380 | 1385 1390 | |||||||
| Val | Glu Val | Ser | Tyr | Ala Ser Met | Lys | Phe Pro Gly Phe Thr | Glu | Gin |
| 1395 | 1400 | 1405 | ||||||
| Gly | Arg Glu | Ala | Arg | Ser Phe Glu | Asp | Ala Ser Leu Thr Asn | Ile | Thr |
| 1410 | 1415 . | 1420 | ||||||
| Ile | Pro Leu | Gly | Met | Lys Phe Glu | Leu | Ala Phe Ile Lys Gly | Gin | Phe |
| 1425 | 1430 | 1435 | 1440 | |||||
| Ser | Glu Val | Asn | Ser | Leu Gly Ile | Ser | Tyr Ala Trp Glu Ala | Tyr | Arg |
| 1445 | 1450 | 1455 | ||||||
| Lys | Val Glu | Gly | Gly | Ala Val Gin | Leu | Leu Glu Ala Gly Phe | Asp | Trp |
| 1460 | 1465 ' 1470 | |||||||
| Glu | Gly Ala | Pro | Met | Asp Leu Pro | Arg | Gin Glu Leu Arg Val | Ala | Leu |
| 1475 | 1480 | 1485 | ||||||
| Glu | Asn Asn | Thr | Glu | Trp Ser Ser | Tyr | Phe Ser- Thr Val Leu | Gly | Leu |
• ···
233
1490 1495 1500
Thr Ala Phe Cys Gly Gly Phe Thr Ser Thr Asp Ser Lys Leu Gly Tyr 1505 1510 1515 1520
Glu Ala Asn Thr Gly Leu Arg Leu Ile Phe
1525 1530 <21O> 179 <211> 1776 <212> PRT <213> Chlamydia <400> 179
| Ala | Ile | Met | Lys | Phe | Met | Ser | Ala | Thr | Ala | Val | Phe | Ala | Ala | Val | Leu |
| 1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
| Ser | Ser | Val | Thr | Glu | Ala | Ser | Ser | Ile | Gin | Asp | Gin | Ile | Lys | Asn | Thr |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Asp | Cys | Asn' | Val | Ser | Lys | Val | Gly | Tyr | Ser | Thr | Ser | Gin | Ala | Phe | Thr |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Asp | Met | Met | Leu | Ala | Asp | Asn | Thr | Glu | Tyr | Arg | Ala | Ala | Asp | Ser | Val |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Ser | Phe | Tyr | Asp | Phe | Ser | Thr | Ser | Ser | Gly | Leu | Pro | Arg | Lys | His | Leu |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Ser | Ser | Ser | Ser | Glu | Ala | Ser | Pro | Thr | Thr | Glu | Gly | Val | Ser | Ser | Ser |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Ser | Ser | Gly | Glu | Asn | Thr | Glu | Asn | Ser | Gin | Asp | Ser | Ala | Pro | Ser | Ser |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Gly | Glu | Thr | Asp | Lys | Lys | Thr | Glu | Glu | Glu | Leu | Asp | Asn | Gly | Gly | Ile |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Ile | Tyr | Ala | Arg | Glu | Lys | Leu | Thr | Ile | Ser | Glu | Ser | Gin | Asp | Ser | Leu |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Ser | Asn | Pro | Ser | Ile | Glu | Leu | His | Asp | Asn | Ser | Phe | Phe | Phe | Gly | Glu |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Gly | Glu | Val | Ile | Phe | Asp | His | Arg | Val | Ala | Leu | Lys | Asn | Gly | Gly | Ala |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Ile | Tyr | Gly | Glu | Lys | Glu | Val | Val | Phe | Glu | Asn | Ile | Lys | Ser | Leu | Leu |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Val | Glu | Val | Asn | Ile | Ser | Val | Glu | Lys | Gly | Gly | Ser | Val | Tyr | Ala | Lys' |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Glu | Arg | Val | Ser | Leu | Glu | Asn | Val | Thr | Glu | Ala | Thr | Phe | Ser | Ser | Asn |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Gly | Gly | Glu | Gin | Gly | Gly | Gly | Gly | Ile | Tyr | Ser | Glu | Gin | Asp | Met | Leu |
| 225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
| Ile | Ser | Asp | Cys | Asn | Asn | Val | His | Phe | Gin | Gly | Asn | Ala | Ala | Glv | Ala |
| 245 | 250 | .255 | |||||||||||||
| Thr | Ala | Val | Lys | Gin | Cys | Leu | Asp | Glu | Glu | Met | Ile | Val | Leu | Leu | Thr |
| 260 | 265 | 270 | |||||||||||||
| Glu | Cys | Val | Asp | Ser | Leu | Ser | Glu | Asp | Thr | Leu | Asp | Ser | Thr | Pro | Glu |
| 275 | 280 | 285 | |||||||||||||
| Thr | Glu | Gin | Thr | Lys | Ser | Asn | Gly | Asn | Gin | Asp | Gly | Ser | Ser | Glu | Thr |
| 290 | 295 | 300 | |||||||||||||
| Lys | Asp | Thr | Gin | Val | Ser | Glu | Ser | Pro | Glu | Ser | Thr | Pro | Ser | Pro | Asp |
| 305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
| Asp | Val | Leu | Gly | Lys | Gly | Gly | Gly | Ile | Tyr | Thr | Glu | Lys | Ser | Leu | Thr |
| 325 | 330 | 335 | |||||||||||||
| Ile | Thr | Gly | Ile | Thr | Gly | Thr | Ile | Asp | Phe | Val | Ser | Asn | Ile | Ala | Thr |
| 340 | 345 | 350 | |||||||||||||
| Asp | Ser | Gly | Ala | Gly | Val | Phe | Thr | Lys | Glu | Asn | Leu | Ser | Cys | Thr | Asn |
| 355 | 360 | 365 | |||||||||||||
| Thr | Asn | Ser | Leu | Gin | Phe | Leu | Lys | Asn | Ser | Ala | Gly | Gin | His | Gly | Gly |
| 370 | 375 | 380 | |||||||||||||
| Gly | Ala | Tyr | Val | Thr | Gin | Thr | Met | Ser | Val | Thr- | Asn | Thr | Thr | Ser | Glu |
234 • to
385
390
395
00
| Ser | Ile | Thr | Thr | Pro 405 | Pro | Leu | Val | Gly | Glu 410 | Val | Ile | Phe | Ser | Glu 415 | Asn |
| Thr | Ala | Lys | Gly 420 | His | Gly | Gly | Gly | Ile 425 | Cys | Thr | Asn | Lys | Leu 430 | Ser | Leu |
| Ser | Asn | Leu 435 | Lys | Thr | Val | Thr | Leu 440 | Thr | Lys | Asn | Ser | Ala 445 | Lys | Glu | Ser |
| Gly | Gly 450 | Ala | Ile | Phe | Thr | Asp 455 | Leu | Ala | Ser | Ile | Pro 4 60 | Thr | Thr | Asp | Thr |
| Pro 465 | Glu | Ser | Ser | Thr | Pro 470 | Ser | Ser | Ser | Ser | Pro 475 | Ala | Ser | Thr | Pro | Glu 480 |
| Val | Val | Ala | Ser | Ala 485 | Lys | Ile | Asn | Arg | Phe 490 | Phe | Ala | Ser | Thr | Ala 495 | Glu |
| Pro | Ala | Ala | Pro 500 | Ser | Leu | Thr | Glu | Ala 505 | Glu | Ser | Asp | Gin | Thr 510 | Asp | Gin |
| Thr | Glu | Thr 515 | Ser | Asp | Thr | Asn | Ser 520 | Asp | Ile | Asp | Val | Ser 525 | Ile | Glu | Asn |
| Ile | Leu 530 | Asn | Val | Ala | Ile | Asn 535 | Gin | Asn | Thr | Ser | Ala 540 | Lys | Lys | Gly | Gly |
| Ala 545 | Ile | Tyr | Gly | Lys | Lys 550 | Ala | Lys | Leu | Ser | Arg 555 | Ile | Asn | Asn | Leu | Glu 560 |
| Leu | Ser | Gly | Asn | Ser 565 | Ser | Gin | Asp | Val | Gly 570 | Gly | Gly | Leu | Cys | Leu 575 | Thr |
| Glu | Ser | Val | Glu 580 | Phe | Asp | Ala | Ile | Gly 585 | Ser | Leu | Leu | Ser | His 590 | Tyr | Asn |
| Ser | Ala | Ala 595 | Lys | Glu | Gly | Gly | Val 600 | Ile | His | Ser | Lys | Thr 605 | Val | Thr | Leu |
| Ser | Asn 610 | Leu | Lys | Ser | Thr | Phe 615 | Thr | Phe | Ala | Asp | Asn 620 | Thr | Val | Lys | Ala |
| Ile 625 | Val | Glu | Ser | Thr | Pro 630 | Glu | Ala | Pro | Glu | Glu 635 | Ile | Pro | Pro | Val | Glu 640 |
| Gly | Glu | Glu | Ser | Thr 645 | Ala | Thr | Glu | Asn | Pro 650 | Asn | Ser | Asn | Thr | Glu 655 | Gly |
| Ser | Ser | Ala | Asn 660 | Thr | Asn | Leu | Glu | Gly 665 | Ser | Gin | Gly | Aáp | Thr 670 | Ala | Asp |
| Thr | Gly | Thr 675 | Gly | Val | Val | Asn | Asn 680 | Glu | Ser | Gin | Asp | Thr 685 | Ser | Asp | Thr |
| Gly | Asn 690 | Ala | Glu | Ser | Gly Glu 695 | Gin | Leu | Gin | Asp | Ser 700 | Thr | Gin | Ser | Asn | |
| Glu 705 | Glu | Asn | Thr | Leu | Pro 710 | Asn | Ser | Ser | Ile | Asp 715 | Gin | Ser | Asn | Glu | Asn 720 |
| Thr | Asp | Glu | Ser | Ser 725 | Asp | Ser | His | Thr | Glu 730 | Glu | Ile | Thr | Asp | Glu 735 | Ser |
| Val | Ser | Ser | Ser 740 | Ser | Lys | Ser | Gly | Ser 745 | Ser | Thr | Pro | Gin | Asp 750 | Gly | Gly |
| Ala | Ala | Ser 755 | Ser | Gly | Ala | Pro | Ser 760 | Gly | Asp | Gin | Ser | Ile 765 | Ser | Ala | Asn |
| Ala | Cys 770 | Leu | Ala | Lys | Ser | Tyr 775 | Ala | Ala | Ser | Thr | Asp 780 | Ser | Ser | Pro | Val |
| Ser 785 | Asn | Ser | Ser | Gly | Ser 790 | Asp | Val | Thr | Ala | Ser 795 | Ser | Asp | Asn | Pro | Asp 800 |
| Ser | Ser | Ser | Ser | Gly 805 | Asp | Ser | Tkla | Gly | Asp 810 | Ser | Glu | Gly | Pro | Thr 815 | Glu |
| Pro | Glu | Ala | Gly 820 | Ser | Thr | Thr | Glu | Thr 825 | Pro | Thr | Leu | Ile | Gly 830 | Gly | Gly |
| Ala | Ile | Tyr 835 | Gly | Glu | Thr | Val | Lys 840 | Ile | Glu | Asn | Phe | Ser 845 | Gly | Gin | Gly |
| Ile | Phe 850 | Ser | Gly | Asn | Lys | Ala 855 | Ile | Asp | Asn | Thr | Thr 8 60 | Glu | Gly | Ser | Ser |
| Ser 865 | Lys | Ser | Asn | Val | Leu 870 | Gly | Gly | Ala | Val | Tyr Ala 875 | Lys | Thr | Leu | Phe 880 |
235
| Asn Leu Asp | Ser Gly 885 | Ser | Ser | Arg Arg | Thr 890 | Val | Thr | Phe | Ser | Gly 895 | Asn |
| Thr Val Ser | Ser Gin | Ser | Thr | Thr Gly | Gin | Val | Ala | Gly | Gly | Ala | Ile |
| 900 | 905 | 910· | |||||||||
| Tyr Ser Pro | Thr Val | Thr | Ile | Ala Thr | Pro | Val | Val | Phe | Ser | Lys | Asn |
| 915 | 920 | 925 | |||||||||
| Ser Ala Thr | Asn Asn | Ala | Asn | Asn Ala | Thr | Asp | Thr | Gin | Arg | Lys | Asp |
| 930 | 935 | 940 | |||||||||
| Thr Phe Gly | Gly Ala | Ile | Gly | Ala Thr | Ser | Ala | Val | Ser | Leu | Ser | Gly |
| 945 | 950 | 955 | 960 | ||||||||
| Gly Ala His | Phe Leu | Glu | Asn | Val Ala | Asp | Leu | Gly | Ser | Ala | Ile | Gly |
| 965 | 970 | 975 | |||||||||
| Leu Val Pro | Asp Thr | Gin | Asn | Thr Glu | Thr | Val | Lys | Leu | Glu | Ser | Gly |
| 980 | 985 | 990 | |||||||||
| Ser Tyr Tyr | Phe Glu | Lys | Asn | Lys Ala | Leu | Lys | Arg | Ala | Thr | Ile | Tyr |
| 995 | 1000 | 1005 | |||||||||
| Ala Pro Val | Val Ser | Ile | Lys | Ala Tyr | Thr | Ala | Thr | Phe | Asn | Gin | Asn |
| 1010 | 1015 | 1020 | |||||||||
| Arg Ser Leu | Glu Glu | Gly | Ser | Ala Ile | Tyr | Phe | Thr | Lys | Glu | Ala | Ser |
| 1025 | 1030 . | 1035 | 1040 | ||||||||
| Ile Glu Ser | Leu Gly | Ser | Val | Leu Phe | Thr | Gly | Asn | Leu | Val | Thr | Pro |
| 1045 | 1050 | 1055 | |||||||||
| Thr Leu Ser | Thr Thr | Thr | Glu | Gly Thr | Pro | Ala | Thr | Thr | Ser | Gly | Asp |
| 1060 | 1065 | 1070 | |||||||||
| Val Thr Lys | Tyr Gly | Ala | Ala | Ile Phe | Gly | Gin | Ile | Ala | Ser | Ser | Asn |
| 1075 | 1080 | 1085 | |||||||||
| Gly Ser Gin | Thr Asp | Asn | Leu | Pro Leu | Lys | Leu | Ile | Ala | Ser | Gly | Gly |
| 1090 | 1095 | 1100 | |||||||||
| Asn Ile Cys | Phe Arg | Asn | Asn | Glu Tyr | Arg | Pro | Thr | Ser | Ser | Asp | Thr |
| 1105 | 1110 | 1115 | 1120 | ||||||||
| Gly Thr Ser | Thr Phe | Cys | Ser | Ile Ala | Gly | Asp | Val | Lys | Leu | Thr | Met |
| 1125 | 1130 | 1135 | |||||||||
| Gin Ala Ala | Lys Gly | Lys | Thr | Ile Ser | Phe | Phe | Asp | Ala | Ile | Arg | Thr |
| 1140 | 1145 | 1150 | |||||||||
| Ser Thr Lys | Lys Thr | Gly | Thr | Gin Ala | Thr | Ala | Tyr | Asp | Thr | Leu | Asp |
| 1155 | 1160 | 1165 | |||||||||
| Ile Asn Lys | Ser Glu | Asp | Ser | Glu Thr | Val | Asn | Ser | Ala | Phe | Thr | Gly |
| 1170 | 1175 | 1180 | |||||||||
| Thr Ile Leu | Phe Ser | Ser | Glu | Leu His | Glu | Asn | Lys | Ser | Tyr | Ile | Pro |
| 1185 | 1190 | 1195 | 1200 | ||||||||
| Gin Asn Val | Val Leu | His | Ser | Gly Ser | Leu | Val | Leu | Lys | Pro | Asn | Thr |
| 1205 | 1210 | 1215 | |||||||||
| Glu Leu His | Val Ile | Ser | Phe | Glu Gin | Lys | Glu | Gly | Ser | Ser | Leu | Val |
| 1220 | 1225 | 1230 | |||||||||
| Met Thr Pro | Gly Ser | Val | Leu | Ser Asn | Gin | Thr | Val | Ala | Asp | Gly | Ala |
| 1235 | 1240 | 1245 | |||||||||
| Leu Val Ile | Asn Asn | Met | Thr | Ile Asp | Leu | Ser | Ser | Val | Glu | Lys | Asn |
| 1250 | 1255 | 1260 | |||||||||
| Gly Ile Ala | Glu Gly | Asn | Ile | Phe Thr | Pro | Pro | Glu | Leu | Arg | Ile | Ile |
| 1265 | 1270 | 1275 | 1280 | ||||||||
| Asp Thr Thr | Thr Ser | Gly | Ser | Gly Gly | Thr | Pro | Ser | Thr | Asp | Ser | Glu |
| 1285 | 1290 | 1295 | |||||||||
| Ser Asn Gin | Asn Ser | Asp | Asp | Thr Lys | Glu | Gin | Asn | Asn | Asn | Asp | Ala |
| 1300 | 1305 | 1310 | |||||||||
| Ser Asn Gin | Gly Glu | Ser | Ala | Asn Gly | Ser | Ser | Ser | Pro | Ala | Val | Ala |
| 1315 | 1320 | 1325 | |||||||||
| Ala Ala His | Thr Ser | Arg | Thr | Arg Asn | Phe | Ala | Ala | Ala | Ala | Thr | Ala |
| 1330 | 1335 | 1340 | |||||||||
| Thr Pro Thr | Thr Thr | Pro | Thr | Ala Thr | Thr | Thr | Thr | Ser | Asn | Gin | Val |
| 1345 | 1350 | 1355 | 1360 | ||||||||
| Ile Leu Gly | Gly Glu | Ile | Lys | Leu Ile | Asp | Pro | Asn Gly | Thr | Phe | Phe |
···· ···
9 9 99«
236
| 1365 | 137Ό | 1375 | |
| Gin Asn Pro Ala | Leu Arg Ser Asp Gin | Gin Ile Ser | Leu Leu Val Leu |
| . 1380 | i 1385 | 1390 | |
| Pro Thr Asp Ser | Ser Lys Met Gin Ala | Gin Lys Ile | Val Leu Thr Gly |
| 1395 | 1400 | 14 05 | |
| Asp Ile Ala Pro | Gin Lys Gly Tyr Thr | Gly Thr Leu | Thr Leu Asp Pro |
| 1410 | 1415 | 1420 | |
| Asp Gin Leu Gin | Asn Gly Thr Ile Ser | Ala Leu Trp | Lys Phe Asp Ser |
| 1425 | 1430 | 1435 | 1440 |
| Tyr Arg Gin Trp | Ala Tyr Val Pro Arg | Asp Asn His | Phe Tyr Ala Asn |
| 1445 | 1450 | 1455 | |
| Ser Ile Leu Gly | Ser Gin Met Ser Met | Val Thr Val | Lys Gin Gly Leu |
| 146C | i 1465 | 1470 | |
| Leu Asn Asp Lys | Met Asn Leu Ala Arg | Phe Asp Glu | Val Ser Tyr Asn |
| 1475 | 1480 | 1485 | |
| Asn Leu Trp Ile | Ser Gly Leu Gly Thr | Met Leu Ser | Gin Val Gly Thr |
| 1490 | 1495 | 1500 | |
| Pro Thr Ser Glu | Glu Phe Thr Tyr Tyr | Ser Arg Gly | Ala Ser Val Ala |
| 1505 | 1510 | 1515 | 1520 |
| Leu Asp Ala Lys | Pro Ala His Asp Val | Ile Val Gly | Ala Ala Phe Ser |
| 1525 | 1530 | 1535 | |
| Lys Met Ile Gly | Lys Thr Lys Ser Leu | Lys Arg Glu | Asn Asn Tyr Thr |
| 1540 1545 | 1550 | ||
| His Lys Gly Ser | Glu Tyr Ser Tyr Gin | Ala Ser Val | Tyr Gly Gly Lys |
| 1555 | 1560 | 1565 | |
| Pro Phe His Phe | Val Ile Asn Lys Lys | Thr Glu Lys | Ser Leu Pro Leu |
| 1570 | 1575 | 1580 | |
| Leu Leu Gin Gly | Val Ile Ser Tyr Gly | Tyr Ile Lys | His Asp Thr Val |
| 1585 | 1590 | 1595 | 1600 |
| Thr His Tyr Pro | Thr Ile Arg Glu Arg | Asn Gin Gly | Glu Trp Glu Asp |
| 1605 | 1610 | 1615 | |
| Leu Gly Trp Leu | Thr Ala Leu Arg Val | Ser Ser Val | Leu Arg Thr Pro |
| 1620 1625 | 1630 | ||
| Ala Gin Gly Asp | Thr Lys Arg Ile Thr | Val Tyr Gly | Glu Leu Glu Tyr |
| 1635 | 1640 | 1645 | |
| Ser Ser Ile Arg | Gin Lys Gin Phe Thr | Glu Thr Glu | Tyr Asp Pro Arg |
| 1650 | 1655 . | 1660 | |
| Tyr Phe Asp Asn | Cys Thr Tyr Arg Asn | Leu Ala Ile | Pro Met Gly Leu |
| 1665 | 1670 | 1675 | 1680 |
| Ala Phe Glu Gly | Glu Leu Ser Gly Asn | Asp Ile Leu | Met Tyr Asn Arg |
| 1685 | 1690 | 1695 | |
| Phe Ser Val Ala | Tyr Met Pro Ser Ile | Tyr Arg Asn | Ser Pro Thr Cys |
| 1700 1705 | 1710 | ||
| Lys Tyr Gin Val | Leu Ser Ser Gly Glu | Gly Gly Glu | Ile Ile Cys Gly |
| 1715 | 1720 | 1725 | |
| Val Pro Thr Arg | Asn Ser Ala Arg Gly | Glu Tyr Ser | Thr Gin Leu Tyr |
| 1730 | 1735 . | 1740 | |
| Pro Gly Pro Leu | Trp Thr Leu Tyr Gly | Ser Tyr Thr | Ile Glu Ala Asp |
| 1745 | 1750 | 1755 | 1760 |
| Ala His Thr Leu | Ala His Met Met Asn | Cys Gly Ala | Arg Met Thr Phe |
1765 1770 1775 <210> 180 <211> 1752 <212> PRT <213> Chlamydia <400> 180
| Met T | Lys | Trp | Leu | Ser 5 | Ala | Thr | Ala | Val | Phe 10 | Ala | Ala | Val | Leu | Pro 15 | Ser |
| Val | Ser | Gly | Phe | Cys | Phe | Pro | Glu | Pro | Lys | Glu. | Leu | Asn | Phe | Ser | Arg |
237 ·· ··
25 30
| Val | Glu | Thr 35 | Ser | Ser | Ser | Thr | Thr 40 | Phe | Thr | Glu | Thr | Ile 45 | Gly | Glu | Ala |
| Gly | Ala 50 | Glu | Tyr | Ile | Val | Ser 55 | Gly | Asn | Ala | Ser | Phe 60 | Thr | Lys | Phe | Thr |
| Asn 65 | Ile | Pro | Thr | Thr | Asp 70 | Thr | Thr | Thr | Pro | Thr 75 | Asn | Ser | Asn | Ser | Ser 80 |
| Ser | Ser | Ser | Gly | Glu 85 | Thr | Ala | Ser | Val | Ser 90 | Glu | Asp | Ser | Asp | Ser 95 | Thr |
| Thr | Thr | Thr | Pro 100 | Asp | Pro | Lys | Gly | Gly 105 | Gly | Ala | Phe | Tyr | Asn 110 | Ala | His |
| Ser | Gly | Val 115 | Leu | Ser | Phe | Met | Thr 120 | Arg | Ser | Gly | Thr | Glu 125 | Gly | Ser | Leu |
| Thr | Leu 130 | Ser | Glu | Ile | Lys | Met 135 | Thr | Gly | Glu | Gly | Gly 140 | Ala | Ile | Phe | Ser |
| Gin 145 | Gly | Glu | Leu | Leu | Phe 150 | Thr | Asp | Leu | Thr | Ser 155 | Leu | Thr | Ile | Gin | Asn 160 |
| Asn | Leu | Ser | Gin | Leu 165 | Ser | Gly | Gly | Ala | Ile 170 | Phe | Gly | Gly | Ser | Thr 175 | Ile |
| Ser | Leu | Ser | Gly 180 | Ile | Thr | Lys | Ala | Thr 185 | Phe | Ser | Cys | Asn | Ser 190 | Ala | Glu |
| Val | Pro | Ala 195 | Pro | Val | Lys | Lys | Pro 200 | Thr | Glu | Pro | Lys | Ala 205 | Gin | Thr | Ala |
| Ser | Glu 210 | Thr | Ser | Gly | Ser | Ser 215 | Ser | Ser | Ser | Gly | Asn 220 | Asp | Ser | Val | Ser |
| Ser 225 | Pro | Ser | Ser | Ser | Arg 230 | Ala | Glu | Pro | Ala | Ala 235 | Ala | Asn | Leu | Gin | Ser 240 |
| His | Phe | Ile | Cys | Ala 245 | Thr | Ala | Thr | Pro | Ala 250 | Ala | Gin | Thr | Asp | Thr 255 | Glu |
| Thr | Ser | Thr | Pro 260 | Ser | His | Lys | Pro | Gly 265 | Ser | Gly | Gly | Ala | Ile 270 | Tyr | Ala |
| Lys | Gly | Asp 275 | Leu | Thr | Ile | Ala | Asp 280 | Ser | Gin | Glu | Val | Leu 285 | Phe | Ser | Ile |
| Asn | Lys 290 | Ala | Thr | Lys | Asp | Gly 295 | Gly | Ala | Ile | Phe | Ala 300 | Glu | Lys | Asp | Val |
| Ser 305 | Phe | Glu | Asn | Ile | Thr 310 | Ser | Leu | Lys | Val | Gin 315 | Thr | Asn | Gly | Ala | Glu 320 |
| Glu | Lys | Gly | Gly | Ala 325 | Ile | Tyr | Ala | Lys | Gly 330 | Asp | Leu | Ser | Ile | Gin 335 | Ser |
| Ser | Lys | Gin | Ser 340 | Leu | Phe | Asn | Ser | Asn 345 | Tyr | Ser | Lys | Gin | Gly 350 | Gly | Gly |
| Ala | Leu | Tyr 355 | Val | Glu | Gly | Gly | Ile 360 | Asn | Phe | Gin | Asp | Leu 365 | Glu | Glu | Ile |
| Arg | Ile 370 | Lys | Tyr | Asn | Lys | Ala 375 | Gly | Thr | Phe | Glu | Thr 380 | Lys | Lys | Ile | Thr |
| Leu 385 | Pro | Ser | Leu | Lys | Ala 390 | Gin | Ala | Ser | Ala | Gly 395 | Asn | Ala | Asp | Ala | Trp 400 |
| Ala | Ser | Ser | Ser | Pro 405 | Gin | Ser | Gly | Ser | Gly 410 | Ala | Thr | Thr | Val | Ser 415 | Asp |
| Ser | Gly | Asp | Ser 420 | Ser | Ser | Gly | Ser | Asp 425 | Ser | Asp | Thr | Ser | Glu 430 | Thr | Val |
| Pro | Val | Thr 435 | Ala | Lys | Gly | Gly | Gly 440 | Leu | Tyr | Thr | Asp | Lys 445 | Asn | Leu | Ser |
| Ile | Thr 450 | Asn | Ile | Thr | Gly | Ile 4 55 | Ile | Glu | Ile | Ala | Asn 4 60 | Asn | Lys | Ala | Thr |
| Asp 4 65 | Val | Gly | Gly | Gly | Ala 470 | Tyr | Val | Lys | Gly | Thr 475 | Leu | Thr | Cys | Glu | Asn 4 80 |
| Ser | His | Arg | Leu | Gin 485 | Phe | Leu | Lyš | Asn | Ser 4 90 | Ser | Asp | Lys | Gin | Gly 495 | Gly |
| Gly | Ile | Tyr | Gly 500 | Glu | Asp | Asn | Ile | Thr 505 | Leu | . Ser | Asn | Leu | Thr 510 | Gly | Lys |
···· ·· ···· • · • · · · · · ···· ···· «·· Φ· ·· ·· ··
238
| Thr | Leu | Phe 515 | Gin | Glu Asn Thr Ala Lys 520 | Glu | Glu | Gly Gly 525 | Gly | Leu | Phe | |||||
| Ile | Lys | Gly | Thr | Asp | Lys | Ala | Leu | Thr | Met | Thr | Gly | Leu | Asp | Ser | Phe |
| 530 | 535 | 540 | |||||||||||||
| Cys | Leu | Ile | Asn | Asn | Thr | Ser | Glu | Lys | His | Gly | Gly | Gly | Ala | Phe | Vál |
| 545 | 550 | 555 | - | 560 | |||||||||||
| Thr | Lys · | Glu | Ile | Ser | Gin | Thr | Tyr | Thr | Ser | Asp | Val | Glu | Thr | Ile | Pro |
| 565 | 570 | 575 | |||||||||||||
| Gly | Ile | Thr | Pro | Val | His | Gly | Glu | Thr | Val | Ile | Thr | Gly | Asn | Lys | Ser |
| 580 | 585 | 590 | |||||||||||||
| Thr | Gly | Gly | Asn | Gly | Gly | Gly | Val | Cys | Thr | Lys | Arg | Leu | Ala | Leu | Ser |
| 595 | 600 | 605 | |||||||||||||
| Asn | Leu | Gin | Šer | Ile | Ser | Ile | Ser | Gly | Asn | Ser | Ala | Ala | Glu | Asn | Gly |
| 610 | 615 | 620 | |||||||||||||
| Gly | Gly | Ala | His | Thr | Cys | Pro | Asp | Ser | Phe | Pro | Thr | Ala | Asp | Thr | Ala |
| 625 | 630 | 635 | 64 0 | ||||||||||||
| Glu | Gin | Pro | Ala | Ala | Ala | Ser | Ala | Ala | Thr | Ser | Thr | Pro | Lys | Ser | Ala |
| 645 | 650 | 655 | |||||||||||||
| Pro | Val | Ser | Thr | Ala | Leu | Ser | Thr | Pro | Ser | Ser | Ser | Thr | Val | Ser | Ser |
| 660 | 665 | 670 | |||||||||||||
| Leu | Thr | Leu | Leu | Ala | Ala | Ser | Ser | Gin | Ala | Ser | Pro | Ala | Thr | Sér | Asn |
| 675 | 680 | 685 | |||||||||||||
| Lys | Glu | Thr | Gin | Asp | Pro | Asn | Ala | Asp | Thr | Asp | Leu | Leu | Ile | Asp | Tyr |
| 690 | 695 | 700 | |||||||||||||
| Val | Val | Ašp | Thr | Thr | Ile | Ser | Lys | Asn | Thr | Ala | Lys | Lys | Gly | Gly | Gly |
| 705 | 710 | 715 | 720 | ||||||||||||
| Ile | Tyr | Ala | Lys | Lys | Ala | Lys | Met. | Ser | Arg | Ile | Asp | Gin | Leu | Asn | Ile |
| 725 | 730 | 735 | |||||||||||||
| Ser | Glu | Asn | Ser | Ala | Thr | Glu | Ile | Gly | Gly | Gly | Ile | Cys | Cys | Lys | Glu |
| 740 | 745 | 750 | |||||||||||||
| Ser | Leu | Glu | Leu | Asp | Ala | Leu | Val | Ser | Leu | Ser | Val | Thr | Glu | Asn | Leu |
| 755 | 760 | 765 | |||||||||||||
| Val | Gly | Lys | Glu | Gly | Gly | Gly | Leu | His | Ala | Lys | Thr | Val | Asn | Ile | Ser |
| 770 | 775 | 780 | |||||||||||||
| Asn | Leu | Lys | Ser | Gly | Phe | Ser | Phe | Ser | Asn | Asn | Lys | Ala | Asn | Ser | Ser |
| 785 | 790 | 795 | 800 | ||||||||||||
| Ser | Thr | Gly | Val | Ala | Thr | Thr | Ala | Ser | Ala | Pro | Ala | Ala | Ala | Ala | Ala |
| 805 | 810 | 815 | |||||||||||||
| Ser | Leu | Gin | Ala | Ala | Ala | Ala | Ala | Ala | Pro | Ser | Ser | Pro | Ala | Thr | Pro |
| 820 | 825 | 830 | |||||||||||||
| Thr | Tyr | Ser | Gly | Val | Val | Gly | Gly | Ala | Ile | Tyr | Gly | Glu | Lys | Val | Thr |
| 835 | 840 | 845 | |||||||||||||
| Phe | Ser | Gin | Cys | Ser | Gly | Thr | Cys | Gin | Phe | Ser | Gly | Asn | Gin | Ala | Ile |
| 850 | 855 | 860 | |||||||||||||
| Asp | Asn | Asn | Pro | Ser | Gin | Ser | Ser | Leu | Asn | Val | Gin | Gly | Gly | Ala | Ile |
| 865 | 870 | 875 | 880 | ||||||||||||
| Tyr | Ala | Lys | Thr | Ser | Leu | Ser | Ile | Gly | Ser | Ser | Asp | Ala | Gly | Thr | Ser |
| 885 | 890 | 895 | |||||||||||||
| Tyr | Ile | Phe | Ser | Gly | Asn | Ser | Val | Ser | Thr | Gly | Lys | Ser | Gin | Thr | Thr |
| 900 | 905 | 910 | |||||||||||||
| Gly | Gin | Ile | Ala | Gly | Gly | Tkla | Ile | Tyr | Ser | Pro | Thr | Val | Thr | Leu | Asn |
| 915 | 920 | 925 | |||||||||||||
| Cys | Pro | Ala | Thr | Phe | Ser | Asn | Asn | Thr | Ala | Ser | Ile | Ala | Thr | Pro | Lys |
| 930 | 935 | 940 | |||||||||||||
| Thr | Ser | Ser | Glu | Asp | Gly | Ser | Ser | Gly | Asn | Ser | Ile | Lys | Asp | Thr | Ile |
| 945 | 950 | 955 | 960 | ||||||||||||
| Gly | Gly | Ala | Ile | Ala | Gly | Thr | Ala | Ile | Thr | Leu | Ser | Gly | Val | Ser | Arg |
| 965 | 970 | 975 | |||||||||||||
| Phe | Ser | Gly | Asn | Thr | Ala | Asp | Leu | Gly | Ala | Ala | Ile | Gly | Thr | Leu | Ala |
| 980 | 985 | 990 | |||||||||||||
| Asn | Ala | Asn | Thr | Pro | Ser | Ala | Thr | Ser | Gly | Ser | Gin | Asn | Ser | Ile | Thr |
• ·
239
995 1000 1005
| Glu Lys | Ile | Thr Leu | Glu Asn Gly Ser 1015 | Phe | Ile | Phe Glu Arg Asn 1020 | Gin | |
| 1010 | ||||||||
| Ala | Asn | Lys | Arg Gly | Ala Ile Tyr Ser | Pro | Ser | Val Ser Ile Lys | Gly |
| 1025 | 1030 | 1035 | 1040 | |||||
| Asn | Asn | Ile | Thr Phe | Asn Gin Asn Thr | Ser | Thr | His Asp Gly Ser | Ala |
| 1045 | 1050 | 1055 | ||||||
| Ile | Tyr | Phe | Thr Lys | Asp Ala Thr Ile | Glu | Ser | Leu Gly Ser Val | Leu |
| 1060 | 1065 | 1070 | ||||||
| Phe | Thr | Gly | Asn Asn | Val Thr Ala Thr | Gin | Ala | Ser Ser Ala Thr | Ser |
| 1075 | 1080 | 1085 | ||||||
| Gly | Gin | Asn | Thr Asn | Thr Ala Asn Tyr | Gly | Ala | Tkla Ile Phe Gly | Asp |
| 1090 | 1095 | 1100 | ||||||
| Pro | Gly | Thr | Thr Gin | Ser Ser Gin Thr | Asp | Ala | Ile Leu Thr Leu | Leu |
| 1105 | 1110 | 1115 | 1120 | |||||
| Ala | Ser | Ser | Gly Asn | Ile Thr Phe Ser | Asn | Asn | Ser Leu Gin Asn | Asn |
| 1125 | 1130 | 1135 | ||||||
| Gin | Gly | Asp | Thr Pro | Ala Ser Lys Phe | Cys | Ser | Ile Ala Gly Tyr | Val |
| 1140 | 1145 | 1150 | ||||||
| Lys | Leu | Ser | Leu Gin | Ala Ala Lys Gly | Lys | Thr | Ile Ser Phe Phe | Asp |
| 1155 | 1160 | 1165 | ||||||
| Cys | Val | His | Thr Ser | Thr Lys Lys Thr | Gly | Ser | Thr Glň Asn Val | Tyr |
| 1170 | 1175 | 1180 | ||||||
| Glu | Thr | Leu | Asp Ile | Asn Lys Glu Glu | Asn | Ser | Asn Pro Tyr Thr | Gly |
| 1185 | 1190 | 1195 | 1200 | |||||
| Thr | Ile | Val | Phe Ser | Ser Glu Lěu His | Glu | Asn | Lys Ser Tyr Ile | Pro |
| 1205 | 1210 | 1215 | ||||||
| Gin | Asn | Ala | Ile Leu | His Asn Gly Thr | Leu | Val | Leu Lys Glu Lys | Thr |
| 1220 | 1225 | 1230 | ||||||
| Glu | Leu | His | Val Val | Ser Phe Glu Gin | Lys | Glu | Gly Ser Lys Leu | Ile |
| 1235 | 1240 | 1245 | ||||||
| Met | Glu | Pro | Gly Ala | Val Leu Ser Asn | Gin | Asn | Ile Ala Asn Gly | Ala |
| 1250 | 1255 | 1260 | ||||||
| Leu | Ala | Ile | Asn Gly | Leu Thr Ile Asp | Leu | Ser | Ser Met Gly Thr | Pro |
| 1265· | 1270 | 1275 | 1280 | |||||
| Gin | Ala | Gly ,Glu Ile | Phe Ser Pro Pro | Glu | Leu | Arg Ile Val Ala | Thr | |
| 1285 | 1290 | 1295 | ||||||
| Thr | Ser | Ser | Ala Ser | Gly Gly Ser Gly | Val | Ser | Ser Ser Ile Pro | Thr |
| 1300 | 1305 | 1310 | ||||||
| Asn | . Pro | Lys | Arg Ile | Ser Ala Ala Val | Pro | Ser | Gly Ser Ala Ala | Thr |
| 1315 | 1320 | 1325 | ||||||
| Thr | Pro | Thr | Met Ser | Glu Asn Lys Val | Phe | Leu | Thr Gly Asp Leu | Thr |
| 1330 | 1335 | 1340 | ||||||
| Leu | T > - X Xtí | Asp | Pro Asn | Gly Asn Phe Tyr | Gin | Asn | Pro Met Leu Gly | Ser |
| 1345 | 1350 | 1355 | 1360 | |||||
| Asp | Leu | Asp | Val Pro | Leu Ile Lys Leu | Pro | Thr | Asn Thr Ser Asp | Val |
| 1365 | 1370 | 1375 | ||||||
| Gin | Val | Tyr | Asp Leu | Thr Leu Ser Gly | Asp | Leu | Phe Pro Gin Lys | Gly |
| 1380 | 1385 | 1390 | ||||||
| Tyr | Met | Gly | Thr Trp | Thr Leu Asp Ser | Asn | Pro | Gin Thr Gly Lys | Leu |
| 1395 | 1400 | 1405 | ||||||
| Gin | Ala | Arg | Trp Thr | Phe Asp Thr Tyr | Arg | Arg | Trp Val Tyr Ile | Pro |
| 1410 | 1415 | 1420 | ||||||
| Arg | Asp | Asn | His Phe | Tyr Ala Asn Ser | Ile | Leu | Gly Ser Gin Asn | Ser |
| 1425 | 1430 | 1435 | 1440 | |||||
| Met | Ile | Val | Val Lys | Gin Gly Leu Ile | Asn | Asn | Met Leu Asn Asn | Ala |
| 1445 | 1450 | 1455 | ||||||
| Arg | Phe | Asp | Asp Ile | Ala Tyr Asn Asn | Phe | Trp | Val Ser Gly Val | Gly |
| 1460 | 1465 | 1470 | ||||||
| Thr | Phe | Leu | Ala Gin | Gin Gly Thr Pro | Leu | Ser | Glu Glu Phe Ser Tyr | |
| 1475 | 1480 | 1485 |
240 ·· «·«· ·· ·· ·· ·♦·< » · · · · · * · <
• ··« « <··· * · · • ········· 4 • · · · · 4» · · · 4
| Tyr Ser Arg Gly Thr Ser Val Ala | Ile | Asp Ala Lys Pro Arg 1500 | Gin | Asp | ||
| 1490 | 1495 | |||||
| Phe | Ile Leu Gly Ala Ala | Phe Ser | Lys | Ile Val Gly Lys Thr | Lys | Ala |
| 1505 | i 1510 | 1515 | 1520 | |||
| Ile | Lys Lys Met His Asn | Tyr Phe | His | Lys Gly Ser Glu Tyr | Ser | Tyr |
| 1525 | 1530 | 1535 | ||||
| Gin | Ala Ser Val Tyr Gly | Gly Lys | Phe | Leu Tyr Phe Leu Leu | Asn | Lys |
| 1540 | 1545 | i 1550 | ||||
| Gin | His Gly Trp Ala Leu | Pro Phe | Leu | Ile Gin Gly Val Val | Ser | Tyr |
| 1555 | 1560 | 1565 | ||||
| Gly | His Ile Lys His Asp | Thr Thr | Thr | Leu Tyr Pro Ser Ile | His | Glu |
| 1570 | 1575 | 1580 | ||||
| Arg | Asn Lys Gly Asp Trp | Glu Asp | Leu | Gly Trp Leu Ala Asp | Leu | Arg |
| 1585 1590 | 1595 | 1600 | ||||
| Ile | Ser Met Asp Leu Lys | Glu Pro | Ser | Lys Asp Ser Ser Lys | Arg | Ile |
| 1605 | 1610 | 1615 | ||||
| Thr | Val Tyr Gly Glu Leu | Glu Tyr | Ser | Ser Ile Arg Gin Lys | Gin | Phe |
| 1620 | 1625 1630 | |||||
| Thr | Glu Ile Asp Tyr Asp | Pro Arg | His | Phe Asp Asp Cys Ala | Tyr | Arg |
| 1635 | 1640 | 1645 | ||||
| Asn | Leu Ser Leu Pro Val | Gly Cys | Ala | Val Glu Gly Ala Ile | Met | Asn |
| 1650 | 1655 | 1660 | ||||
| Cys | Asn Ile Leu Met Tyr | Asn Lys | Leu | Ala Leu Ala Tyr Met | Pro | Ser |
| 1665 1670 | 1675 | 1680 | ||||
| Ile | Tyr Arg Asn Asn Pro | Val Cys | Lys | Tyr Arg Val Leu Ser | Ser | Asn |
| 1685 | 1690 | 1695 | ||||
| Glu | Ala Gly Gin Val Ile | Cys Gly | Val | Pro Thr Arg Thr Ser | Ala | Arg |
| 1700 | 1705 1710 | |||||
| Ala | Glu Tyr Ser Thr Gin | Leu Tyr | Leu | Gly Pro Phe Trp Thr | Leu | Tyr |
| 1715 | 1720 | 1725 | ||||
| Gly | Asn Tyr Thr Ile Asp | Val Gly Met | Tyr Thr Leu Ser Gin | Met | Thr . |
1730 1735 1740
Ser Cys Gly Ala Arg Met Ile Phe 1745 1750 <210> 181 <211> 2601 <212> DNA <213> Chlamydia <400> 181 atggctagcc atcaccatca ccatcacctc tttggccagg atcccttagg tgaaaccgcc ctcctcacta aaaatcctaa tcatgtcgtc tgtacatttt ttgaggactg taccatggag agcctctttc ctgctctttg tgctcatgca tcacaagacg atcctttgta tgtacttgga aattcctact gttggttcgt atctaaactc catatcacgg accccaaaga ggctcttttt aaagaaaaag gagatctttc cattcaaaac tttcgcttcc tttccttcac agattgctct tccaaggaaa gctctccttc tattattcat caaaagaatg gtcagttatc cttgcgcaat aatggtagca tgagtttctg tcgaaatcat gctgaaggct ctggaggagc catctctgcg gatgcctttt ctctacagca caactatctt ttcacagctt ttgaagagaa ttcttctaaa ggaaatggcg gagccattca ggctcaaacc ttctctttat ctagaaatgt gtcgcctatt tctttcgccc gtaatcgtgc ggatttaaat ggcggcgcta tttgctgtag taatcttatt tgttcaggga atgtaaaccc tctctttttc actggaaact ccgccacraa tggaggcsct atttgttgta tcagcgatct aaacacctca gaaaaaggct ctctctctct tgcttgtaac caaraaacgc tatttgcaag caattctgct aaagaaaaag gcggggctat ttatgccaag cacatggtat tgcgttataa cggtcctgtt tccttcatta acaacagcgc taaaataggt ggagctatcg ccatccagtc cggagggagt ctctctatcc ttgcaggtga aggatctgtt ctgttccaga ataactccca acgcacctcc gaccaaggtc tagtaagaaa cgccatctac ttagagaaag atgcgattct ttcttcctta gaagctcgca acggagatat tcttttcttt gatcctattg tacaagaaag tagcagcaaa gaatcgcctc ttccctcctc tttgcaagcc agcgtgactt ctcccacccc agccaccgca tctcctttag ttattcagac aagtgcaaac cgttcagtga ttttctcgag cgaacgtctt tctgaagaag aaaaaactcc tgataacctc
120
180
240
300
360
420
480
540
600
660
720
780
840
900
960
1020
1080
1140
1200
241
4* »444 ·· 4444 44 **
4 4 4 ·
444 « 4444 4 4 acttcccaac tacagcagcc tatcgaactg aaatccggac gcttagtttt aaaagatcgc 1260 gctgtccttt ccgsgccttc tctctctcag gatcctcaag ctctcctcat tatggaagcg 1320 ggaacttctt taaaaacttc ctytgatttg aagttagsta cgstaagtat tccccttcat 1380 tccttagata ctgaaaaaag cgtaactatc cacgccccta atctttctat ccaaaagatc · 14 40 ttcctctcta actctggaga tgagaatttt tatgaaaatg tagagcttct cagtaaagag 1500 caaaacaata ttcctctcct tactctccct aaagagcaat ctcatttaca tcttcctgat 1560 gggaacctct cttctcactt tggatatcaa ggagattgga ctttttcttg gaaagattct 1620 gatgaagggc attctctgat tgctaattgg acgcctaaaa actatgtgcc tcatccagaa 1680 cgtcaatcta cactcgttgc gaacactctt tggaacacct attccgatat gcaagctgtg 1740 cagtcgatga ttaatacaac agcgcacgga ggagcctatc tatttggaac gtggggatct 1800 gctgtttcta atttattcta tgttcacgac agctctggga aacctatcga taattggcat 1860 catagaagcc ttggctacct attcggtatc agtactcaca gtttagatga ccattctttc 1920 tgcttggctg caggacaatt actcgggaaa tcgtccgatt cctttattac gtctacagaa 1980 acgacctcct atatagctác tgtacaagcg caactcgcta cctctctaat gaaaatctct 2040 gcacaggcat gctacaatga aagtatccat gagctaaaaa caaaatatcg ctccttctct 2100 aaagaaggat tcggatcctg gcatagcgtt gcagtatccg gagaagtgtg cgcatcgatt 2160 cctattgtat ccaatggttc cggactgttc agctccttct ctattttctc taaactgcaa 2220 ggattttcag gaacacagga cggttttgag gagagttcgg gagagattcg gtccttttct 2280 gccagctctt tcagaaatat ttcacttcct ataggaataa catttgaaaa aaaatcccaa 2340 aaaacacgaa cctactatta ctttctagga gcctacatcc aagacctgaa acgtgatgtg ’ 2400 gaatcgggac ctgtagtgtt actcaaaaat gccgtctcet gggatgctcc tatggcgaac 2460 ttggattcac gagcctacat gttccggctt acgaatcaaa gagctctaca cagacttcag 2520 acgctgttaa atgtgtcttg tgtgctgcgt gggcaaagcc atagttactc cctggatctg 2580 gggaccactt acaggttcta g 2601 <210> 182 <211> 3021 <212> DNA <213> Chlamydia <400> 182 atggctagca tgactggtgg acagcaaatg ggtcgggatt caagcttggt accgcatcac 60 catcaccatc acatgattcc tcaaggaatt tacgatgggg agacgttaac tgtatcattt 120 ccctatactg ttataggaga tccgagtggg actactgttt tttctgcagg agagttaaca 180 ttaaaaaatc ttgacaattc tattgcagct ttgcctttaa gttgttttgg gaacttatta 240 gggagtttta ctgttttagg gagaggacac tcgttgactt tcgagaacat acggacttct 300 acaaatgggg cagctctaag taatagcgct gctgatggac tgtttactat tgagggtttt 360 aaagaattat ccttttccaa ttgcaattca ttacttgccg tactgcctgc tgcaacgact 420 aataagggta gccagactcc gacgacaaca tctacaccgt ctaatggtac tatttattct 480 aaaacagatc ttttgttact caataatgag aagttctcat tctatagtaa tttagtctct 540 ggagatgggg gagctataga tgctaagagc ttaacggttc aaggaattag caagctttgt 600 gtcttccaag aaaatactgc tcaagctgat gggggagctt gtcaagtagt caccagtttc 660 tctgctatgg ctaacgaggc tcctattgcc tttgtagcga atgttgcagg agtaagaggg 720 ggagggattg ctgctgttca ggatgggcag cagggagtgt catcatctac ttcaacagaa 780 gatccagtag taagtttttc cagaaatact gcggtagagt ttgatgggaa cgtagcccga 840 gtaggaggag ggatttactc ctacgggaac gttgctttcc tgaataatgg aaaaaccttg 900 tttctcaaca atgttgcttc tcctgtttac attgctgcta agcaaccaac aagtggacag 960 gcttctaata cgagtaataa ttacggagat ggaggagcta tcttctgtaa gaatggtgcg 1020 caagcaggat ccaataactc tggatcagtt tcctttgatg gagagggagt agttttcttt 1080 agtagcaatg tagctgctgg gaaaggggga gctatttatg ccaaaaagct ctcggttgct 1140 aactgtggcc ctgtacaatt tttaaggaat atcgctaatg atggtggagc gatttattta 1200 ggagaatctg gagagctcag tttatctgct gattatggag atattatttt cgatgggaat 1260 cttaaaagaa cagccaaaga gaatgctgcc gatgttaatg gcgtaactgt gtcctcacaa 1320 gccatttcga tgggatcggg agggaaaata acgacattaa gagctaaagc agggcatcag 1380 attctcttta atgatcccat cgagatggca aacggaaata accagccagc gcagtcttcc 1440 aaacttctaa aaattaacga tggtgaagga tacacagggg atattgtttt tgctaatgga 1500 agcagtactt tgtaccaaaa tgttacgata gagcaaggaa ggattgttct tcgtgaaaag 1560 gcaaaattat cagtgaattc tctaagtcag acaggtggga gtctgtatat ggaagctggg 1620 agtacattgg attttgtaac tccacaacca ccacaacagc ctcctgccgc taatcagttg 1680 atcacgcttt ccaatctgca tttgtctctt tcttctttgt tagcaaacaa tgcagttacg 1740 aatcctccta ccaatcctcc agcgcaagat tctcatcctg cagtcattgg tagcacaact 1800 • 9 ·99· 99 ·· ** ·»··
9« 9 · ♦ 99 9 • 999 9 9 999 9 9 9 • ·»······· · • · 9 · 9 9 9 «99 • 999 ·99 99 ·» 9« 9«
242 gctggttctg ttacaattag tgggcctatc ttttttgagg atttggatga tacagcttat 1860 gataggtatg attggctagg ttctaatcaa aaaatcaatg tcctgaaatt acagttaggg 1920 actaagcccc cagctaatgc cccatcagat ttgactctag ggaatgagat gcctaagtat 1980 ggctatcaag gaagctggaa gcttgcgtgg gatcctaata cagcaaataa tggtccttat 2040 actctgaaag ctacatggac taaaactggg tataatcctg ggcctgagcg agtagcttct 2100 ttggttccaa atagtttatg gggatccatt ttagatatac gatctgcgca ttcagcaatt 2160 caagcaagtg tggatgggcg ctcttattgt cgaggattat gggtttctgg agtttcgaat 2220 ttcttctatc atgaccgcga tgctttaggt cagggatatc ggtatattag tgggggttat 2280 tccttaggag caaactccta ctttggatca tcgatgtttg gtctagcatt taccgaagta 2340 tttggtagat ctaaagatta tgtagtgtgt cgttccaatc atcatgcttg cataggatcc 2400 gtttatctat ctacccaaca agctttatgt ggatcctatt tgttcggaga tgcgtttatc 2460 cgtgctagct acgggtttgg gaatcagcat atgaaaacct catatacatt tgcagaggag 2520 agcgatgttc gttgggataa.taactgtctg gctggagaga ttggagcggg attaccgatt 2580 gtgattačtc catctaagct ctatttgaat gagttgcgtc ctttcgtgca agctgagttt 2640 tcttatgccg atcatgaatc ttttacagag gaaggcgatc aagctcgggc attcaagagc 2700 ggacatctcc taaatctatc agttcctgtt ggagtgaagt ttgatcgatg ttctagtaca 2760 catcctaata aatatagctt tatggcggct tatatctgtg atgcťtatcg caccatctct 2820 ggtactgaga caacgctcct atcccatcaa gagacatgga caacagatgc ctttcattta 2880 gcaagacatg gagttgtggt tagaggatct atgtatgctt ctctaacaag taatatagaa 2940 gtatatggcc atggaagata tgagtatcga gatgcttctc gaggctatgg tttgagtgca 3000 ggaagtaaag tccggttcta a 3021 <210> 183 <211> 2934 <212> DNA <213> Chlamydia <400> 183 atggctagca tgactggtgg acagcaaatg ggtcgggatt caagcttggt accgagctcg 60 gatccacatc accatcacca tcacggacta gctagagagg ttccttctag aatctttctt 120 atgcccaact cagttccaga tcctacgaaa gagtcgctat caaataaaat tagtttgaca 180 ggagacactc acaatctcac taactgctat ctcgataacc tacgctacat actggctatt 240 ctacaaaaaa ctcccaatga aggagctgct gtcacaataa cagattacct aagctttttt 300 gatacacaaa aagaaggtat ttattttgca aaaaatctca cccctgaaag tggtggtgcg 360 attggttatg cgagtcccaa ttctcctacc gtggagattc gtgatacaat aggtcctgta 420 atctttgaaa ataatacttg ttgcagacta tttacatgga gaaatcctta tgctgctgat 480 aaaataagag aaggcggagc cattcatgct caaaatcttt acataaatca taatcatgat 540 gtggtcggat ttatgaagaa cttttcttat gtccaaggag gagccattag taccgctaat 600 acctttgttg tgagcgagaa tcagtcttgt tttctcttta tggacaacat ctgtattcaa 660 actaatacag caggaaaagg tggcgctatc tatgctggaa cgagcaattc ttttgagagt 720 aataactgcg atctcttctt catcaataac gcctgttgtg caggaggagc gatcttctcc 780 cctatctgtt ctctaacagg aaatcgtggt aacatcgttt tctataacaa tcgctgcttt 840 aaaaatgtag aaačagcttc ttcagaagct tctgatggag gagcaattaa agtaactact 900 cgcctagatg ttacaggcaa tcgtggtagg atctttttta gtgacaatat cacaaaaaat 960 tatggcggag ctatttacgc tcctgtagtt accctagtgg ataatggccc tacctacttt 1020 ataaacaata tcgccaataa taaggggggc gctatctata tagacggaac cagtaactcc 1080 aaaatttctg ccgaccgcca tgctattatt tttaatgaaa atattgtgac taatgtaact 1140 aatgcaaatg gtaccagtac gtcagctaat cctcctagaa gaaatgcaat aacagtagca 1200 agctcctctg gtgaaattct attaggagca gggagtagcc aaaatttaat tttttatgat 1260 cctattgaag ttagcaatgc aggggtctct gtgtccttca ataaggaagc tgatcaaaca 1320 ggctctgtag tattttcagg agctactgtt aattctgcag attttcatca acgcaattta 1380 caaacaaaaa cacctgcacc ccttactctc agtaatggtt ttctatgtat cgaagatcat 1440 gctcagctta cagtgaatcg attcacacaa actgggggtg ttgtttctct tgggaatgga 1500 gcagttctga gttgctataa aaatggtaca ggagattctg ctagcaatgc ctctataaca 1560 ctgaagcata ttggattgaa tctttcttcc attctgaaaa gtggtgctga gattccttta 1620 ttgtgggtag agcctacaáa taacagcaat aactatacag cagatactgc agctaccttt 1680 tcattaagtg atgtaaaact ctcactcatt gatgactacg ggaactctcc ttatgaatcc 1740 acagatctga cccatgctct gtcatcacag cctatgctat ctatttctga agctagcgat 1800 aaccagctac aatcagaaaa tatagatttt tcgggactaa atgtccctca ttatggatgg 1860 caaggacttt ggacttgggg ctgggcaaaa actcaagatc cagaaccagc atcttcagca 1920 acaatcactg atccacaaaa agccaataga tttcatagaa· ccttactact aacatggctt 1980
243 • · cctgccgggt atgttcctag cccaaaacac agaagtcccc tcatagctaa gggaatatgc tgcttgcaac agaaagctta aaaaatagtg cagagctgac catcctttct ggggaattac aggaggagga ctaggcatga tggtttacca gaaaatcatc ctggattcca tatgcgctct tccggatact ctgcggggat cagacacaca ccttctcatt gaaattcagt cagacctaca ccaaactcaa gcaaaaaaca acgtatcttc taaaaattac tcatgccaag gagaaatgct caagaaggtt tcttgctgac taaattagtt gggctttaca gctatggaga caccatttct atactcaagg agaaaatcta acatctcaag ggacgttecg atgggaggtg ctgtcttttt tgatctccct atgaaaccct ttggatcaac acagctccct ttttaggtgc tcttggtatt tattctagcc tgtctcactt ggagcctatc cgcgaagctt ttctacaaag actcctttga tcaatgtcct ggagttaaag gtagctttat gaatgctacc cacagacctc aagcctggac gcataccaac ccgttctgta tagacaagaa ccagggatcg cgacccagct aaaggtattt ggtttggtag tggaagcccc tcatcgcgtc atgccatgtc tcacagcaaa cacaaccttt gagttggtta actctccatt tccagtatca tcctcttcaa ccttctgtaa ttatctcaat ggggaaattg ctctgcgatt <210> 184 <211> 2547 <212> DNA <213> Chlamydia <400> 184 atggctagcc atcaccatca ccatcacggt gctatttctt gcttacgtgg atttctggaa acaagggtag agttgaattt aaagacaaca tagcaacacg gaagaaactg tagaaaaggt tgaagaggta gagccagctc ctgagcaaaa gagctttctt tcttagggag tgtagaacag agttttatta ctgcagctaa ttcgcatctg aagatgggga tttatcacct gagtcatcca tttcttctga aaaagaagag agtgtgctgg aggagctatt tttgcaaaac gggttcgtat caagaggccg ttgtattctc gaataacttc tctgatattt atggcggcgc ggttctcttc gagaagagga taagttagat gggcaaatCc ctgaagtctt aatgcagggg atgttgtttt ttccggaaat tcctcgaagc gtgatgagca acaggtgggg gagccatttg tactcaaaat ttgacgattt ctcagaatac ctgttttata acaacgtggc ctgttcggga ggagctgttc gtatagagga gttcttttag aagcttttgg aggagatatt gtttttaaag gaaattcttc caaggatccg atgctatcta ttttgcaggt aaagaatcgc atattacagc acggaaggac atgctattgt tttccacgac gcattagttt ttgaaaatct aaatctgctg aagtattgtt aatcaatagt cgagaaaatc caggttacac cgatttttag aagcagaaag taaagttcct · caatgtattc atgtacaaca gagttgctaa atggagctac attatgtagt tatggtttta aacaagatgc ttggtattgg ctgctggatc taaactgaag attttagatt caggaactcc catgctatca gtaaacctga agcagaaatc gagtcatctt ctgaaccaga tctctttgga ttgcgaagaa tgctcaaaca acagttccta tggttgatat tctgtagatt tagcctcctt ctcttctagt caacaggagg ggacagtaga gttattgttc ctggaggaag ttatgttcga tctggagagc ttaatttgga acaacaggta ctggttatga aaatcatgct ttgttgaaga atgaggctaa atgtctttcg ttgcttctag tgatgaagct tcagccgaaa tcagtaactt gatttacaga ttcatgtagc aactccagag attgaagaag acacatacgg gattggtctg aggctaaaat tcaagatgga actcttgtca ttaattggaa tatcgattag atcctcaaaa agcaggggct ttagtattta atgcattatg gctgtcttgt ctgctctgaa aaatgcacgc tttgctcata atctcactgc gaattcgatt attctacaaa tgtgtgggga ttcgcctttg gtggtttccg gcagagaatc tggttgctat tgatggatac aaaggagctt' atggtggtgc gtcgatattc aattgatgga agattttgtt ctaggagtta gtggagctgc aaaatggata gtcagaagtt tgatgcggag gtttctcgga agggagttgt tatacaggat ttttagctgg atcctggttc ttcaaaggac aatatagcct cagaacgata tgaaaacgcg ttatggagta ctaggagagt cgagtgcttc cgaggagtac tggcagatgc tttagttgaa taccgaagtt tagttggtcc actttttatg ctttgcattt caatccttat gtcgaagtat cttatgcttc cctggcttta cagaacaagg aagagaagcg cgttcttttg aagacgcttc atcaccattc ctttagggat gaagtttgaa ttggcgttca taaaaggaca caccttatgg acctagtggt agatcctcga gatagcaggg tgagcgttac cttctcattg ccataactgt cagtcaaacg gcatatactg tactgaggtg agtccctatt tgtagaattg cctagccagt ctataaaatc tggattctac ctag
2040 2100 2160 2220 2280 2340 2400 24 60 2520 2580 2640 2700 2760 2820 2880 2934 agatgtagtc tctťtatgtg agacaataat tcaagctctt agaacttgcg tgtagataac catttttaca gatctcaggc tcttcctcat agggaatgtt tcatggtaat tttcagagca cctgaatgct aaaagaaagg tggatcťatt aggaagcctt tggagctaag tgtacaaggg gggtgcacat ccatactatt agctcctcag gttagttaac agttccattg gtcggtttct ccatatggga tcctactgga ggaagaaggg tcagcgtatg aactctatct ttctgctgga tttcctaggt tggttctgta tggagaaaca ttggacatct tgtgagacct tatgaaattc ccttaccaat gttttcagag
120
180
240
300
360
420
480
540
600
660
720
780
840
900
960
1020
1080
1140
1200
1260
1320
1380
1440
1500
1560
1620
1680
1740
1800
1860
1920
1980
2040
2100
2160
2220
2280
244 gtgaactctt tgggaataag ttatgcatgg gaagcttatc gaaaagtaga aggaggcgcg 2340 gtgcagcttt tagaagctgg gtttgattgg gagggagctc caatggatct tcctagacag 2400 gagctgcgtg tcgctctgga aaataatacg gaatggagtt cttacttcag cacagtctta 2460 ggattaacag ctttttgtgg aggatttact tctacagata gtaaactagg atatgaggcg 2520 aataetggat tgcgattgat cttttaa 2547
<210> 185 <211> 2337 <212> DNA <213> Chlamydia <400> 185 atgcatcacc atcaccatca cgggttagct agttgcgtag atcttcatgc tggaggacag 60 tctgtaaatg agcťggtata tgtaggccct caagcggttt tattgttaga ccaaattcga 120 gatctattcg ttgggtctaa agatagtcag gctgaaggac agtataggtt aattgtagga 180 gatccaagtt ctttccaaga gaaagatgca gatactcttc ccgggaaggt agagcaaagt 240 actttgttct cagtaaccaa tcccgtggtt ttccaaggtg tggaccaaca ggatcaagtc 300 tcttcccaag ggttaatttg tagttttacg agcagcaacc ttgattctcc ccgtgacgga 360 gaatcttttt taggtattgc ttttgttggg gatagtagta aggctggaat cacattaact 420 gacgtgaaag cttctttgtc tggagcggct ttatattcta cagaagatct tatctttgaa 480 aagattaagg gtggattgga atttgcatca tgttcttctc tagaacaggg gggagcttgt 540 gcagctcaaa gtattttgat tcatgattgt caaggattgc aggttaaaca ctgtactaca 600 gccgtgaatg ctgaggggtc tagtgcgaat gatcatcttg gatttggagg aggcgctttc 660 tttgttacgg gttctctttc tggagagaaa agtctctata tgcctgcagg agatatggta 720 gttgcgaatt gtgatggggc tatatctttt gaaggaaaca gcgcgaactt tgctaatgga 780 ggagcgattg ctgcctctgg gaaagtgctt tttgtcgcta atgataaaaa gacttctttt 840 atagagaacc gagctttgtc tggaggagcg attgcagcct cttctgatat tgcctttcaa 900 aactgcgcag aactagtttt caaaggcaat tgtgcaattg gaacagagga taaaggttct 960 ttaggtggag gggctatatc ttctctaggc accgttcttt tgcaagggaa tcacgggata 1020 acttgtgata agaatgagtc tgcttcgcaa ggaggcgcca tttttggcaa aaattgtcag 1080 atttctgaca acgaggggcc agtggttttc agagatagta cagcttgctt aggaggaggc 1140 gctattgcag ctcaagaaat tgtttctatt cagaacaatc aggctgggat ttccttcgag 1200 ggaggtaagg ctagtttcgg aggaggtatt gcgtgtggat ctttttcttc cgcaggcggt 1260 gcttctgttt tagggactat tgatatttcg aagaatttag gcgcgatttc gttctctcgt 1320 actttatgta cgacctcaga tttaggacaa atggagtacc agggaggagg agctctattt 1380 ggtgaaaata tttctctttc tgagaatgct ggtgtgctca cctttaaaga caacattgtg 1440 aagacttttg cttcgaatgg gaaaattctg ggaggaggag cgattttagc tactggtaag 1500 gtggaaatta ccaataattc cggaggaatt tcttttacag gaaatgcgag agctccacaa 1560 gctcttccaa ctcaagagga gtttčcttta ttcagcaaaa aagaagggcg accactctct 1620 tcaggatatt ctgggggagg agcgatttta ggaagagaag tagctattct ccacaacgct 1680 gcagtagtat ttgagcaaaa tcgtttgcag tgcagcgaag aagaagcgac attattaggt 1740 tgttgtggag gaggcgctgt tcatgggatg gatagcactt cgattgttgg caactcttca 1800 gtaagatttg gtaataatta cgcaatggga caaggagtct caggaggagc tcttttatct 1860 aaaacagtgc agttagctgg aaatggaagc gtcgattttt ctcgaaatat tgctagtttg 1920 ggaggaggag ctcttcaagc ttctgaagga aattgtgagc tagttgataa cggctatgtg 1980 ctattcagag ataatcgagg gagggtttat gggggtgcta tttcttgctt acgtggagat 2040 gtagtcattt ctggaaacaa gggtagagtt gaatttaaag acaacatagc aacacgtctt 2100 tatgtggaag aaactgtaga aaaggttgaa gaggtagagc cagctcctga gcaaaaagac 2160 aataatgagc tttctttctt agggagtgta gaacagagtt ttattactgc agctaatcaa 2220 gctcttttcg catctgaaga tggggattta tcacctgagt catccatttc ttctgaagaa 2280 cttgcgaaaa gaagagagtg tgctggagga gctgactcga gcagatccgg ctgctaa 2337 <210> 186 <211> 2847 <212> DNA , <213> Chlamydia <400> 186 atggctagca tgcatcacca tcaccatcac gttaagattg agaacttctc tggccaagga 60 atattttctg gaaacaaagc tatcgataac.accacagaag gctcctcttc caaatctaac 120 gtcctcggag gtgcggtcta tgctaaaaca ttgtttaatc tcgatagcgg gagctctaga 180
245 cgaactgtca ccttctccgg gaatactgtc tcttctcaat ctacaacagg tcaggttgct ggaggagcta tctactctcc tactgtaacc attgctactc ctgtagtatt ttctaaaaac tctgcaacaa acaatgctaa taacgctaca gatactcaga gaaaagacac ctttggagga gctatcggag ctacttctgc tgtttctcta tcaggagggg ctcatttctt agaaaacgtt gctgacctcg gatctgctat tgggttggtg ccagacacac aaaatacaga aacagtgaaa ttagagtctg gctcctacta ctttgaaaaa aataaagctt taaaacgagc tactatttac gcacctgtcg tttccattaa agcctatact gcgacattt-a accaaaacag atctctagaa gaaggaagcg cgatttactt tacaaaagaa gcatctattg agtctttagg ctctgttctc ttcacaggaa acttagtaac cccaacgcta agcacaacta cagaaggcac accagccaca acctcaggag atgtaacaaa atatggtgct gctatctttg gacaaatagc aagcťcaaac ggatctcaga cggataacct tcccctgaaa ctcattgctt caggaggaaa tatttgtttc cgaaacaatg aataccgtcc tacttcttct gataccggaa cctctacttt ctgtagtatt gcgggagatg ttaaattaac catgcaagct gcaaaaggga aaacgatcag tttctttgat gcaatccgga cctctactaa gaaaacaggt acacaggcaa ctgcctacga tactctcgat attaataaat ctgaggattc agaaactgta aactctgcgt ttacaggaac gattctgttc tcctctgaat tacatgaaaa taaatcctat attccacaaa acgtagttct acacagtgga tctcttgtat tgaagccaaa taccgagctt catgtcattt cttttgagca gaaagaaggc tcttctctcg ttatgacacc tggatctgtt ctttcgaacc agactgttgc tgatggagct ttggtcataa ataacatgac cattgattta tccagcgtag agaaaaatgg tattgctgaa ggaaatatct ttactcctcc ágaattgaga atcatagaca ctactacaag tggaagcggt ggaaccccat ctacagatag tgaaagtaac cagaatagtg atgataccaa ggagcaaaat aataatgacg cctcgaatca aggagaaagc gcgaatggat cgtcttctcc tgcagtagct gctgčacaca catctcgtac aagaaacttt gccgctgcag ctacagccac acctacgaca acaccaacgg Ctacaactac aacaagcaac caagtaatcc taggaggaga aatcaaactc atcgatccta atgggacctt cttccagaac cctgcattaa gatccgacca acaaatctcc ttgttagtgc tccctacaga ctcatcaaaa atgcaagctc agaaaatagt actgacgggt gatattgctc ctcagaaagg atatacagga acactcactc tggatcctga tcaactacaa aatggaacga tctcagcgct ctggaaattt gactcttata gacaatgggc ttatgtacct agagacaatc atttctatgc gaactcgatt ctgggatctc aaatgtcaat ggtcacagtc aaacaaggct tgctcaacga taaaatgaat ctagctcgct ttgatgaagt tagctataac aacctgtgga tatcaggact aggaacgatg ctatcgcaag taggaacacc tacttctgaa gaattcactt attacagcag aggagcttct gttgccttag atgctaaacc agcccatgat gtgattgttg gagctgcatt tagtaagatg atcgggaaaa caaaatcctt gaaaagagag aataactaca ctcacaaagg atccgaatat tcttaccaag catcggtata cggaggcaaa ccattccact ttgtaatcaa taaaaaaacg gaaaaatcgc taccgctatt gttacaagga gtcatctctt acggatatat caaacatgat acagtgactc actatccaac gatccgtgaa cgaaaccaag gagaatggga agacttagga tggctgacag ctctccgtgt ctcctctgtc ttaagaactc ctgcacaagg ggatactaaa cgtatcactg tttacggaga attggaatac tccagtatcc gtcagaaaca attcacagaa acagaatacg atcctcgtta cttcgacaac tgcacctata gaaacttagc aattcctatg gggttagcat tcgaaggaga gctctctggt aacgatattt tgatgtacaa cagattctct gtagcataca tgccatcaat ctatcgaaat tctccaacat gcaaatacca agtgctctct tcaggagaag gcqqaqaaat tatttqtgqa gtaccgacaa gaaactcagc tcgcggagaa tacagcacgc agctgtaccc gggacctttg tggactctgt atggatccta cacgatagaa gcagacgcac atacactagC tcatatgatg aactgcggtg ctcgtatgac attctaa <210> 187 <211> 2466 <212> DNA <213> Chlamydia <400> 187 atgcatcacc atcaccatca cgaggcgagc tcgatccaag atcaaataaa gaataccgac tgcaatgtta gcaaagtagg atattcaact tctcaagcat ttactgatat gatgctagca gacaacacag agtatcgagc tgctgatagt gtttcattct atgacttttc gacatcttcc ggattaccta gaaaacatct tagtagtagt agtgaagctt ctccaacgac agaaggagtg tcttcatctt catctggaga aaátactgag aattcacaag attcagctcc ctcttctgga gaaactgata agaaaacaga agaagaacta gacaatggcg gaatcattta tgctagagag aaactaacta tctcagaatc tcaggactct ctctctaatc caagcataga actccatgac aatagttttt tcttcggaga aggtgaagtt atctttgatc acagagttgc cctcaaaaac ggaggagcta tttatggaga gaaagaggta gtctttgaaa· acataaaatc tctactagta
240 300 360 420 480 540 600 660 720 780 840 900 960 1020 1080 1140 1200 1260 1320 1380 1440 1500 1560 1620 1680 174 0 1800 1860 1920 1980 2040 2100 2160 2220 2280 2340 2400 2460 2520 2580 2640 2700 2760 2820 2847
120
180
240
300
360
420
480
540 • ·· ·
246 gaagtaaata tctcggtcga gaaagggggt agcgtctatg caaaagaacg gaaaatgtta ccgaagcaac cttctcctcc aatggtgggg aacaaggtgg tattcagaac aagatatgtt aatcagtgat tgcaacaatg tacatttcca gcaggagcaa cagcagtaaa acaatgtctg gatgaagaaa tgatcgtatt tgcgttgata gcttatccga agatacactg gatagcactc cagaaacgga tcaaatggaa atcaagatgg ttcgtctgaa acaaaagata cacaagtatc gaatcaactc ctagccccga cgátgtttta ggtaaaggtg gtggtatcta tctttgacca tcactggaat tacagggact atagattttg tcagtaacat tctggagcag gtgtattcac taaagaaaac ttgtcttgca ccaacacgaa tttttgaaaa actcggcagg tcaacatgga ggaggagcct acgttactca gttactaata caactagtga aagtataact actccccctc tcgtaggaga tctgaaaata cagctaaagg gcacggtggt ggtatctgca ctaacaaact aatttaaaaa cggtgactct c.actaaaaac tctgcaaagg agtctggagg acagatctag cgtctatacc aacaacagat accccagagt cttctacccc tcgcctgcaa gcactcccga agtagttgct tctgctaaaa taaatcgatt acggcagaac cggcagcccc ttctctaaca gaggctgagt ctgatcaaac gaaacttctg atactaatag cgatatagac gtgtcgattg agaacatttt atcaatcaaa acacttctgc gaaaaaagga ggggctattt acgggaaaaa tcccgtatta acaatcttga actttcaggg aattcatccc aggatgtagg tgtttaactg aaagcgtaga atttgatgca attggatcgc tcttatccca gctgctaaag aaggtggggt tattcattct aaaacggtta ctctatctaa accttcactt ttgcagataa cactgttaaa gcaatagtag aaagcactcc gaagagattc Ctccagtaga aggagaagag tctacagcaa cagaaaatcc acagaaggaa gttcggctaa cactaacctt gaaggatctc aaggggatac gggactggtg ttgttaacaa tgagtctcaa gacacatcag atactggaaa ggagaacaac tacaagattc tacacaatct aatgaagaaa atacccttcc attgatcaat ctaacgaaaa cacagacgaa tcatctgata gccacactga gacgagagtg tctcatcgtc ctctaaaagt ggatcatcta ctcctcaaga gcttcttcag gggctccctc aggagatcaa tctatctctg caaacgcttg agctatgctg cgagtactga tagctcccct gtatctaatt cttcaggttč gcatcttctg ataatccaga ctcttcctca tctggagata gcgctggaga ccgactgagc cagaagctgg ttctacaaca gaaactccta ctttaatagg atctga <210> 188 <211> 1578 <212> DNA <213> Chlamydia <400> 188 atgcatcacc atcaccatca cacggccgcg tccgataact tccagctgtc cagggattcg ccattccgat cgggcaggcg atggcgatcg cgggccagat accgttcata tcgggcctac cgccttcctc ggcttgggtg ttgtcgacaa ggcgcacgag tccaacgcgt ggtcgggagc gctccggcgg caagtctcgg ggcgacgtga tcaccgcggt cgacggcgct ccgatcaact cggccaccgc gcgcttaacg ggcatcatcc cggtgacgtc atctcggtga cctggcaaac ggcacgcgta cagggaacgt gacattggcc gagggacccc cggccgaatt cctagaggtt caccgctgcc tgtggggaat ccagctgaac caagtttatt actatgtggg aaggtgcttc aggagatcct tgcgatcctt gcgctacttg attagcatcc gcgcaggata ctacggagat tatgttttcg atcgtgtatt gtgaataaaa cttttagcgg catggctgca actcctacgc aggctatagg aatactaatc agccagaagc aaatggcaga ccgaacatcg cttacggaag gatgcagagt ggttttcaaa tgcagccttc ctagccttaa acatttggga attttctgca ccttaggggc atccaatgga tacttcaaag caagttcggc ttggttgggt taatagggtt ttcagctgca agctcaatct ctaccgatct cttcctaacg taggcattac ccaaggtgtt gtggaatttt atacagacac tggagcgtag gtgcacgtgg agctttatgg gaatgtggtt gtgcaacttt ttccaatacg ctcaatctaa tcctaagatt gagatgctca acgtcacttc caatttgtga ttcacaaacc aagaggctat aaaggagcta gctcgaattt ataacggctg gaacaacaga agctacagac accaaatcag ctacaattaa tggcaagtag gcctcgccct gtcttacaga ttgaatatgc ttgttccata agtatcttta tggtggaatc agggaatgct gctcacagaa acagactaag agaatcacca tacagaaaaa agctaccgat tagcctacag aaccatgtct agtgattttc ttctttatct agctattttt ctcttcctcc ctttgcctct ggatcaaaca gaatgtcgct agctaaactt aggaggtctc ctataactct cctcaagtct tgaagctcca gaattctaat tgctgataca cgctgaatct caatagtagt ggaaataact tggaggagca tttagctaaa agacgttact ctctgaagga aggaggtgct
600 660 720 780 84 0 900 960 1020 1080 1140 1200 1260 1320 1380 1440 1500 1560 1620 1680 1740 1800 1860 1920 1980 2040 2100 2160 2220 2280 2340 2400 2460 2466 ccagggtggg C 33-^-C11C C C caacggcaac catctccacc gatggcggac caagtcgggc cccgctagta aatcgatggc gtgtgacgcc aaaagttgat taacgcaagt gcatatgcaa tcgcttcgac tgcattcaac tccaatgcaa atcattttct aggagctgag aagcccagca tcctttacet ataccatgaa tattggcgta
120
180
240
300
360
420
480
540
600
660
720
780
840
900
960
1020
1080
1140
1200
1260 ·· ···· ···
247 taaattaaaa cactgctttg gattcagatc aatcgacgct tcacatgaat
1320
1380
1440
1500
1560
1578 aactggtcaa tcggagattc cccaataata aacaaaatga gacaaatggt gcacaattcc gagcaacttt ttaacattac gtggtaagga agtctagaaa caatcactgg gcttctaa tgatgctgat tacatggaac tgttctatct agcttgtggt tgaagcacgc actatccgca ccaagcctta gatgtcttgc gtagctgttg ttaatcaatg ttgctcaacc taggatcaac aaattgcttc gtgcaacgtt aaagagctgc <210> 189 <211> 866 <212> PRT <213> Chlamydia <220>
<221> VARIANT <222> 220, 242, 425, 448, 453, 455 <223> — jakákoliv aminokyselina <400> 189
| Met 1 | Ala | Ser | His | His 5 | His | His | His | His | Leu 10 | Phe | Gly | Gin | Asp | Pro 15 | Leu |
| Gly | Glu | Thr | Ala 20 | Leu | Leu | Thr | Lys | Asn 25 | Pro | Asn | His | Val | Val 30 | Cys | Thr |
| Phe | Phe | Glu 35 | Asp | Cys | Thr | Met | Glu 40 | Ser | Leu | Phe | Pro | Ala 45 | Leu | Cys | Ala |
| His | Ala 50 | Ser | Gin | Asp | Asp | Pro 55 | Leu | Tyr | Val | Leu | Gly 60 | Asn | Ser | Tyr | Cys |
| Trp 65 | Phe | Val | Ser | Lys | Leu 70 | His | Ile | Thr | Asp | Pro 75 | Lys | Glu | Ala | Leu | Phe 80 |
| Lys | Glu | Lys | Gly | Asp 85 | Leu | Ser | Ile | Gin | Asn 90 | Phe | Arg | Phe | Leu | Ser 95 | Phe |
| Thr | Asp | Cys | Ser 100 | Ser | Lys | Glu | Ser | Ser 105 | Pro | Ser | Ile | Ile | His 110 | Gin | Lys |
| Asn | Gly | Gin 115 | Leu | Ser | Leu | Arg | Asn 120 | Asn | Gly | Ser | Met | Ser 125 | Phe | Cys | Arg |
| Asn | His 130 | Ala | Glu | Gly | Ser | Gly 135 | Gly | Ala | Ile | Ser | Ala 140 | Asp | Ala | Phe | Ser |
| Leu 145 | Gin | His | Asn | Tyr | Leu 150 | Phe | Thr | Ala | Phe | Glu 155 | Glu | Asn | Ser | Ser | Lys 160 |
| Gly | Asn | Gly | Gly | Ala 165 | Ile | Gin | Ala | Gin | Thr 170 | Phe | Ser | Leu | Ser | Arg 175 | Asn |
| Val | Ser | Pro | Ile 180 | Ser | Phe | Ala | Arg | Asn 1 O c X O | Arg | Ala | Asp | Leu | Asn π r\ r\ X27U | Gly | Gly |
| Ala | Ile | Cys 195 | Cys | Ser | Asn | Leu | Ile 200 | Cys | Ser | Gly | Asn | Val 205 | Asn | Pro | Leu |
| Phe | Phe 210 | Thr | Gly | Asn | Ser | Ala 215 | Thr | Asn | Gly | Gly | Xaa 220 | Ile | Cys | Cys | Ile |
| Ser 225 | Asp | Leu | Asn | Thr | Ser 230 | Glu | Lys | Gly | Ser | Leu 235 | Ser | Leu | Ala | Cys | Asn 240 |
| Gin | Xaa | Thr | Leu | Phe 245 | Ala | Ser | Ásn | Ser | Ala 250 | Lys | Glu | Lys | Gly | Gly 255 | Ala |
| Ile | Tyr | Ala | Lys 260 | His | Met | Val | Leu | Arg 265 | Tyr Asn | Gly | Pro | Val 270 | Ser | Phe | |
| Ile | Asn | Asn 275 | Ser | Ala | Lys | Ile | Gly 280 | Gly | Ala | Ile | Ala | Ile 285 | Gin | Ser | Gly |
| Gly | Ser 290 | Leu | Ser | Ile | Leu | Ala 295 | Giy | Glu | Gly | Ser | Val 300 | Leu | Phe | Gin | Asn |
| Asn 305 | Ser | Gin | Arg | Thr | Ser 310 | Asp | Gin | Gly | Leu | Val 315 | Arg | Asn | Ala | Ile | Tyr 320 |
| Leu | Glu | Lys | Asp | Ala 325 | Ile | Leu | Ser | Ser | Leu 330 | Glu | Ala | Arg | Asn | Gly 335 | Asp |
| Ile | Leu | Phe | Phe | Asp | Pro | Ile | Val | Gin | Glu | Ser | • Ser | Ser | Lys | Glu | Ser |
9« «
248
9999
99 • 999 Z · ♦ >·· ··« .. · · · ·· »· ·» ··
| 340 | 345 | 350 | |||||||||||||
| Pro | Leu | Pro | Ser | Ser | Leu | Gin | Ala | Ser | Val | Thr | Ser | Pro | Thr | Pro | Ala |
| 355 | 360 | 365 | |||||||||||||
| Thr | Ala | Ser | Pro | Leu | Val | Ile | Gin | Thr | Ser | Ala | Asn | Arg | Ser | Val | Ile |
| 370 | 375 | 380 | |||||||||||||
| Phe | Ser | Ser | Glu | Arg | Leu | Ser | Glu | Glu | Glu | Lys | Thr | Pro | Asp | Asn | Leu |
| 385 | 390 | 395 | 400 | ||||||||||||
| Thr | Ser | Gin | Leu | Gin | Gin | Pro | Ile | Glu | Leu | Lys | Ser | Gly | Arg | Leu | Val |
| 405 | 410 | 415 | |||||||||||||
| Leu | Lys | Asp | Arg | Ala | Val | Leu | Ser | Xaa | Pro | Ser | Leu | Ser | Gin | Asp | Pro |
| 420 | 425 | 430 | |||||||||||||
| Gin | Ala | Leu | Leu | Ile | Met | Glu | Ala | Gly | Thr | Ser | Leu | Lys | Thr | Ser | Xaa |
| 435 | 440 | 445 | |||||||||||||
| Asp | Leu | Lys | Leu | Xaa | Thr | Xaa | Ser | Ile | Pro | Leu | His | Ser | Leu | Asp | Thr |
| 450 | 455 | 4 60 | |||||||||||||
| Glu | Lys | Ser | Val | Thr | Ile | His | Ala | Pro | Asn | Leu | Ser | Ile | Gin | Lys | Ile |
| 4 65 | 470 | 475 | 480 | ||||||||||||
| Phe | Leu | Ser | Asn | Ser | Gly | Asp | Glu | Asn | Phe | Tyr | Glu | Asn | Val | Glu | Leu |
| 4 85 | 490 | 495 | |||||||||||||
| Leu | Ser | Lys | Glu | Gin | Asn | Asn | Ue | Pro | Leu | Leu | Thr | Leu | Pro | Lys | Glu |
| 500 | 505 | 510 | |||||||||||||
| Gin | Ser | His | Leu | His | Leu | Pro | Asp | Gly | Asn | Leu | Ser | Ser | His | Phe | Gly |
| 515 | 520 | 525 | |||||||||||||
| Tyr | Gin | Gly | Asp | Trp | Thr | Phe | Ser | Trp | Lys | Asp | Ser | Asp | Glu | Gly | His |
| 530 | 535 | 540 | |||||||||||||
| Ser | Leu | Ile | Ala | Asn | Trp | Thr | Pro | Lys | Asn | Tyr | Val | Pro | His | Pro | Glu |
| 545 | 550 | 555 | 560 | ||||||||||||
| Arg | Gin | Ser | Thr | Leu | Val | Ala | Asn | Thr | Leu | Trp | Asn | Thr | Tyr | Ser | Asp |
| 565 | 570 | 57 5 | |||||||||||||
| Met | Gin | Ala | Val | Gin | Ser | Met | Ile | Asn | Thr | Thr | Ala | His | Gly | Gly | Ala |
| 580 | 585 | 590 | |||||||||||||
| Tyr | Leu | Phe | Gly | Thr | Trp | Gly | Ser | Ala | Val | Ser | Asn | Leu | Phe | Tyr | Val |
| 595 | 600 | 605 | |||||||||||||
| His | Asp | Ser | Ser | Gly | Lys | Pro | Ile | Asp | Asn | Trp | His | His | Arg | Ser | Leu |
| 610 | 615 | 620 | |||||||||||||
| Gly | Tyr | Leu | Phe | Gly | Ile | Ser | Thr | His | Ser | Leu | Asp | Asp | His | Ser | Phe |
| 625 | 630 | 635 | 640 | ||||||||||||
| Cys | Leu | Ala | Ala | Gly | Gin | Leu | Leu | Gly | Lys | Ser | Ser | Asp | Ser | Phe | Ile |
| 645 | 650 | 655 | |||||||||||||
| Thr | Ser | Thr | Glu | Thr | Thr | Ser | Tyr | Ile | Ala | Thr | Val | Gin | Ala | Gin | Leu |
| 660 | 665 | 670 | |||||||||||||
| Ala | Thr | Ser | Leu | Met | Lys | Ile | Ser | Ala | Gin | Ala | PvO '“'J | * J | Asn | Glu | Sex |
| 675 | 680 | 685 | |||||||||||||
| Ile | His | Glu | Leu | Lys | Thr | Lys | Tyr | Arg | Ser | Phe | Ser | Lys | Glu | Gly | Phe |
| 690 | 695 | 700 | |||||||||||||
| Gly | Ser | Trp | His | Ser | Val | Ala | Val | Ser | Gly | Glu | Val | Cys | Ala | Ser | Ile |
| 705 | 710 | 715 | 720 | ||||||||||||
| Pro | Ile | Val | Ser | Asn | Gly | Ser | Gly | Leu | Phe | Ser | Ser | Phe | Ser | Ile | Phe |
| 725 | 730 | 735 | |||||||||||||
| Ser | Lys | Leu | Gin | Gly | Phe | Ser | Gly | Thr | Gin | Asp | Gly | Phe | Glu | Glu | Ser |
| 740 | 745 | 750 | |||||||||||||
| Ser | Gly | Glu | Ile | Arg | Ser | Phe | Ser | Ala | Ser | Ser | Phe | Arg | Asn | Ile | Ser |
| 755 | 7 60 | 7 65 | |||||||||||||
| Leu | Pro | Ile | Gly | Ile | Thr | Phe | Glu | Lys | Lys | Ser | Gin | Lys | Thr | Arg | Thr |
| 770 | 775 | 780 | |||||||||||||
| Tyr | Tyr | Tyr | Phe | Leu | Gly | Ala | Tyr | Ile | Gin | Asp | Leu | Lys | Arg | Asp | Val |
| 785 | 790 | 795 | 800 | ||||||||||||
| Glu | Ser | Gly | Pro | Val | Val | Leu | Leu | Lys | Asn | Ala | Val | Ser | Trp | Asp | Ala |
| 805 | 810 | 815 | |||||||||||||
| Pro | Met | Ala | Asn | Leu | Asp | Ser | Arg | Ala | Tyr. | Met | Phe | Arg | Leu | Thr | Asn |
| 820 | 825 | 830 |
»« ♦··. ..
»· »···
....... ,···..· ·..··..·
249
| Gin | Arg | Ala Leu His Arg Leu 835 | Gin 840 | Thr Leu | Leu | Asn | Val 845 | Ser | Cys | Val | |||||
| Leu | Arg | Gly | Gin | Ser | His | Ser | Tyr | Ser | Leu | Asp | Leu | Gly | Thr | Thr | Tyr |
| 850 | 855 | 860 | |||||||||||||
| Arg | Phe | ||||||||||||||
| 865 |
<210> 190 <211> 1006 <212> PRT <213> Chlamydia <400> 190
| Met | Ala | Ser | Met | Thr | Gly | Gly | Gin | Gin | Met | Gly | Arg | Asp | Ser | Ser | Leu |
| 1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
| Val | Pro | His | His | His | His | His | His | Met | Ile | Pro | Gin | Gly | Ile | Tyr | Asp |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Gly | Glu | Thr | Leu | Thr | Val | Ser | Phe | Pro | Tyr | Thr | Val | Ile | Gly | Asp | Pro |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Ser | Gly | Thr | Thr | Val | Phe | Ser | Ala | Gly | Glu | Leu | Thr | Leu | Lys | Asn | Leu |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Asp | Asn | Ser | Ile | Ala | Ala | Leu | Pro | Leu | Ser | Cys | Phe | Gly | Asn | Leu | Leu |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Gly | Ser | Phe | Thr | Val | Leu | Gly | Arg | Gly | His | Ser | Leu | Thr | Phe | Glu | Asn |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Ile | Arg | Thr | Ser | Thr | Asn | Gly | Ala | Ala | Leu | Ser | Asn | Ser | Ala | Ala | Asp |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Gly | Leu | Phe | Thr | Ile | Glu | Gly | Phe | Lys | Glu | Leu | Ser | Phe | Ser | Asn | Cys |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Asn | Ser | Leu | Leu | Ala | Val | Leu | Pro | Ala | Ala | Thr | Ťhr | Asn | Lys | Gly | Ser |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Gin | Thr | Pro | Thr | Thr | Thr | Ser | Thr | Pro | Ser | Asn | Gly | Thr | Ile | Tyr | Ser |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Lys | Thr | Asp | Leu | Leu | Leu | Leu | Asn | Asn | Glu | Lys | Phe | Ser | Phe | Tyr | Ser |
| 165 | 170 | .175 | |||||||||||||
| Asn | Leu | Val | Ser | Gly | Asp | Gly | Gly | Ala | Ile | Asp | Ala | Lys | Ser | Leu | Thr |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Val | Gin | Gly | Ile | Ser | Lys | Leu | Cys | Val | Phe | Gin | Glu | Asn | Thr | Ala | Gin |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Ala | Asp | Gly | Gly | Ala | Cys | Gin | Val | Val | Thr | Ser | Phe | Ser | Ala | Met | Ala |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Asn | Glu | Ala | Pxo | Ile | Ala | Phe | Val | 7\1 £S.J-CL | Asn | Val | 7» I _ M-LCI | Gly | Val | Arg | Gly |
| 225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
| Gly | Gly | Ile | Ala | Ala | Val | Gin | Asp | Gly | Gin | Gin | Gly | Val | Ser | Ser | Ser |
| 245 | 250 | 255 | |||||||||||||
| Thr | Ser | Thr | Glu | Asp | Pro | Val | Val | Ser | Phe | Ser | Arg | Asn | Thr | Ala | Val |
| 260 | 265 | 270 | |||||||||||||
| Glu | Phe | Asp | Gly | Asn | Val | Ala | Arg | Val | Gly | Gly | Gly | Ile | Tyr | Ser | Tyr |
| 275 | 280 | 285 | |||||||||||||
| Gly | Asn | Val | Ala | Phe | Leu | Asn | Asn | Gly | Lys | Thr | Leu | Phe | Leu | Asn | Asn |
| 290 | 295 | 300 | |||||||||||||
| Val | Ala | Ser | Pro | Val | Tyr | Ile | Ala | Tkla | Lys | Gin | Pro | Thr | Ser | Gly | Gin |
| 305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
| Ala | Ser | Asn | Thr | Ser | Asn | Asn | Tyr | Gly | Asp | Gly | Gly | Ala | Ile | Phe | Cys |
| 325 | 330 | 335 | |||||||||||||
| Lys | Asn | Gly | Ala | Gin | Ala | Gly | Ser | Asn | Asn | Ser | Gly | Ser | Val | Ser | Phe |
| 340 | 345 | 350 | |||||||||||||
| Asp Gly | Glu | Gly | Val | Val | Phe | Phe | Ser | Ser | Asn | Val | Ala | Ala | Gly | Lys | |
| 355 | 360 | 365 | |||||||||||||
| Gly | Gly | Ala | Ile | Tyr | Ala | Lys | Lys | Leu | Ser | Val | Ala | Asn | Cys | Gly | Pro |
| 370 | 375 | 380 |
• * • · ··· · .· * • · · ··· · ·
250
| Val | Gin | Phe | Leu | Arg | Asn | Ile | Ala | Asn | Asp | Gly | Gly | Ala | Ile | Tyr | Leu |
| 385 | 390 | 395 | 400 | ||||||||||||
| Gly | Glu | Ser | Gly | Glu | Leu | Ser | Leu | Ser | Ala | Asp | Tyr | Gly | Asp | Ile | Ile |
| 405 | 410 | 415 | |||||||||||||
| Phe | Asp | Gly | Asn | Leu | Lys | Arg | Thr | Ala | Lys | Glu | Asn | Ala | Ala | Asp | Val |
| 420 | 425 | 430 | |||||||||||||
| Asn | Gly | Val | Thr | Val | Ser | Ser | Gin | Ala | Ile | Ser | Met | Gly | Ser | Gly | Gly |
| 435 | 440 | 445 | |||||||||||||
| Lys | Ile | Thr | Thr | Leu | Arg | Ala | Lys | Ala | Gly | His | Gin | Ile | Leu | Phe | Asn |
| 450 | 455 | 4 60 | |||||||||||||
| Asp | Pro | Ile | Glu | Met | Ala | Asn | Gly | Asn | Asn | Gin | Pro | Ala | Gin | Ser | Ser |
| 465 | 470 | 475 | 480 | ||||||||||||
| Lys | Leu | Leu | Lys | Ile | Asn | Asp | Gly | Glu | Gly | Tyr | Thr | Gly | Asp | Ile | Val |
| 485 | 4 90 | 495 | |||||||||||||
| Phe | Ala | Asn | Gly | Ser | Ser | Thr | Leu | Tyr | Gin | Asn | Val | Thr | Ile | Glu | Gin |
| 500 | 505 | 510 | |||||||||||||
| Gly | Arg | Ile | Val | Leu | Arg | Glu | Lys | Ala | Lys | Leu | Ser | Val | Asn | Ser | Leu |
| 515 | 520 | 525 | |||||||||||||
| Ser | Gin | Thr | Gly | Gly | Ser | Leu | Tyr | Met | Glu | Ala | Gly | Ser | Thr | Leu | Asp |
| 530 | 535 | 540 | |||||||||||||
| Phe | Val | Thr | Pro | Gin | Pro | Pro | Gin | Gin | Pro | Pro | Ala | Ala | Asn | Gin | Leu |
| 545 | 550 | 555 | 560 | ||||||||||||
| Ile | Thr | Leu | Ser | Asn | Leu | His | Leu | Ser | Leu | Ser | Ser | Leu | Leu | Ala | Asn |
| 565 | 570 | 575 | |||||||||||||
| Asn | Ala | Val | Thr | Asn | Pro | Pro | Thr | Asn | Pro | Pro | Ala | Gin | Asp | Ser | His |
| 580 | 585 | 590 | |||||||||||||
| Pro | Ala | Val | Ile | Gly | Ser | Thr | Thr | Ala | Gly | Ser | Val | Thr | Ile | Ser | Gly |
| 595 | 600 | 605 | |||||||||||||
| Pro | Ile | Phe | -Phe | Glu | Asp | Leu | Asp | Asp | Thr | Ala | Tyr | Asp | Arg | Tyr | Asp |
| 610 | 615 | 620 | |||||||||||||
| Trp | Leu | Gly | Ser | Asn | Gin | Lys | Ile | Asn | Val | Leu | Lys | Leu | Gin | Leu | Gly |
| 625 | 630 | 635 | 640 | ||||||||||||
| Thr | Lys | Pro | Pro | Ala | Asn | Ala | Pro | Ser | Asp | Leu | Thr | Leu | Gly | Asn | Glu |
| 645 | 650 | 655 | |||||||||||||
| Met | Pro | Lys | Tyr | Gly | Tyr | Gin | Gly | Ser | Trp | Lys | Leu | Ala | Trp Asp | Pro | |
| 660 | 665 | 67 0 | |||||||||||||
| Asn | Thr | Ala | Asn | Asn | Gly | Pro | Tyr | Thr | Leu | Lys | Ala | Thr | Trp | Thr | Lys |
| 675 | 680 | 685 | |||||||||||||
| Thr | Gly | Tyr | Asn | Pro | Gly | Pro | Glu | Arg | Val | Ala | Ser | Leu | Val | Pro | Asn |
| 690 | 695 | 700 | |||||||||||||
| Ser | Leu | Trp | Gly | Ser | Ile | Leu | Asp | Ile | Arg | Ser | Ala | His | Ser | Ala | Ile |
| 7Ó5 | 710 | 715 | 720 | ||||||||||||
| Gin | Ala | Ser | Val | Asp | Gly | Arg | Ser | Tyr | Cys | Arg | Gly | Leu | Trp | Val | Ser |
| 725 | 730 | 735 | |||||||||||||
| Gly | Val | Ser | Asn | Phe | Phe | Tyr | His | Asp | Arg | Asp | Ala | Leu | Gly | Gin | Gly |
| 740 | 745 | 750 | |||||||||||||
| Tyr | Arg | Tyr | Ile | Ser | Gly | Gly | Tyr | Ser | Leu | Gly | Ala | Asn | Ser | Tyr | Phe |
| 755 | 760 | 765 | |||||||||||||
| Gly | Ser | Ser | Met | Phe | Gly | Leu | Ala | Phe | Thr | Glu | Val | Phe | Gly | Arg | Ser |
| 770 | 775 | 780 | |||||||||||||
| Lys | Asp | Tyr | Val | Val | Cys | Arg | Ser | Asn | His | His | Ala | Cys | Ile | Gly | Ser |
| 785 | 790 | 795 | 800 | ||||||||||||
| Val | Tyr | Leu | Ser | Thr | Gin | Gin | Ala | Leu | Cys | Gly | Ser | Tyr | Leu | Phe | Gly |
| 805 | 810 | 815 | |||||||||||||
| Asp | Ala | Phe | Ile | Arg | Ala | Ser | Tyr | Gly | Phe | Gly | Asn | Gin | His | Met | Lys |
| . 820 | 825 | 830 | |||||||||||||
| Thr | Ser | Tyr | Thr | Phe | Ala | Glu | Glu | Ser | Asp | Val | Arg | .Trp | Asp | Asn | Asn |
| 835 | 840 | 845 | |||||||||||||
| Cys | Leu | Ala | Gly | Glu | Ile | Gly | Ala | Gly | Leu | Pro | Ile | Val | Ile | Thr | Pro |
| 850 | 855 | 860 | |||||||||||||
| Ser | Lys | Leu | Tyr | Leu | Asn | Glu | Leu | Arg | Pro | Phe. | Val | Gin | Ala | Glu | Phe |
• · · · · ·
251
| 865 | 870 | 875 | 880 | ||||||||||||
| Ser | Tyr | Ala | Asp | His | Glu | Ser | Phe | Thr | Glu | Glu | Gly | Asp | Gin | Ala | Arg |
| 885 | 890 | 895 | |||||||||||||
| Ala | Phe | Lys | Ser | Gly | His | Leu | Leu | Asn | Leu | Ser | Val | Pro | Val | Gly | Val |
| 900 | 905 | 910 | |||||||||||||
| Lys | Phe | Asp | Arg | Cys | Ser | Ser | Thr | His | Pro | Asn | Lys | Tyr | Ser | Phe | Met |
| 915 | 920 | 925 | |||||||||||||
| Ala | Ala | Tyr | Ile | Cys | Asp | Ala | Tyr | Arg | Thr | Ile | Ser | Gly | Thr | Glu | Thr |
| 930 | 935 | 940 | |||||||||||||
| Thr | Leu | Leu | Ser | His | Gin | Glu | Thr | Trp | Thr | Thr | Asp | Ala | Phe | His | Leu |
| 945 | 950 | 955 | 960 | ||||||||||||
| Ala | Arg | His | Gly | Val | Val | Val | Arg | Gly | Ser | Met | Tyr | Ala | Ser | Leu | Thr |
| 965 | 970 | 975 | |||||||||||||
| Ser | Asn | Ile | Glu | Val | Tyr | Gly | His | Gly | Arg | Tyr | Glu | Tyr | Arg | Asp | Ala |
| 980 | 985 | 990 | |||||||||||||
| Ser | Arg | Gly | Tyr | Gly | Leu | Ser | Ala | Gly | Ser | Lys | Val | Arg | Phe |
995 1000 1005 <210> 191 <211> 977 <212> PRT <213> Chlamydia <400> 191
| Met | Ala | Ser | Met | Thr | Gly | Gly | Gin | Gin | Met | Gly | Arg | Asp | Ser | Ser | Leu |
| 1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
| Val | Pro | Ser | Ser | Asp | Pro | His | His | His | His | His | His | Gly | Leu | Ala | Arg |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Glu | Val | Pro | Ser | Arg | Ile | Phe | Leu | Met | Pro | Asn | Ser | Val | Pro | Asp | Pro |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Thr | Lys | Glu | Ser | Leu | Ser | Asn | Lys | Ile | Ser | Leu | Thr | Gly Asp | Thr | His | |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Asn | Leu | Thr | Asn | Cys | Tyr | Leu | Asp | Asn | Leu | Arg | Tyr | Ile | Leu | Ala | Ile |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Leu | Gin | Lys | Thr | Pro | Asn | Glu | Gly | Ala | Ala | Val | Thr | Ile | Thr | Asp | Tyr |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Leu | Ser | Phe | Phe | Asp | Thr | Gin | Lys | Glu | Gly | Ile | Tyr | Phe | Ala | Lys | Asn |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Leu | Thr | Pro | Glu | Ser | Gly | Gly | Ala | Ile | Gly | Tyr | Ala | Ser | Pro | Asn | Ser |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Pro | Thr | Val | Glu | Ile | Arg | Asp | Thr | Ile | Gly | Pro | Val | Ile | Phe | Glu | Asn |
| 130 | 135 | τ a r\ X V | |||||||||||||
| Asn | Thr | Cys | Cys | Arg | Leu | Phe | Thr | Trp | Arg | Asn | Pro | Tyr | Ala | Ala | Asp |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Lys | Ile | Arg | Glu | Gly | Gly | Ala | Ile | His | Ala | Gin | Asn | Leu | Tyr | Ile | Asn |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| His | Asn | His | Asp | Val | Val | Gly | Phe | Met | Lys | Asn | Phe | Ser | Tyr | Val | Gin |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Gly | Gly | Ala | Ile | Ser | Thr | Ala | Asn | Thr | Phe | Val | Val | Ser | Glu | Asn | Gin |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Ser | Cys | Phe | Leu | Phe | Met | Asp | Asn | Ile | Cys | Ile | Gin | Thr | Asn | Thr | Ala |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Gly Lys | Gly | Gly | Ala | Ile | Tyr | Ala | Gly | Thr | Ser | Asn | Ser | Phe | Glu | Ser | |
| 225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
| Asn | Asn | Cys | Asp | Leu | Phe | Phe | Ile | Asn | Asn | Ala | Cys | Cys | Ala | Gly | Gly |
| 245 | 250 | 255 | |||||||||||||
| Ala | Ile | Phe | Ser | Pro | Ile | Cys | Ser | Leu | Thr | Gly | Asn | Arg | Gly | Asn | Ile |
| 260 | 265 | 270 | |||||||||||||
| Val | Phe | Tyr | Asn | Asn | Arg | Cys | Phe | Lys | Asn | Val | Glu | Thr | Ala | Ser | Ser |
| 275 | 280 | 285 | |||||||||||||
| Glu | Ala | Ser | Asp | Gly | Gly | Ala | Ile | Lys | Val | Thr | Thr | Arg | Leu | Asp | Val |
• ·
252
| 290 | 295 | 300 | |||||||||||||
| Thr | Gly | Asn | Arg | Gly | Arg | Ile | Phe | Phe | Ser | Asp | Asn | Ile | Thr | Lys | Asn |
| 305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
| Tyr | Gly | Gly | Ala | Ile | Tyr | Ala | Pro | Val | Val | Thr | Leu | Val | Asp | Asn | Gly |
| 325 | 330 | 335 | |||||||||||||
| Pro | Thr | Tyr | Phe | Ile | Asn | Asn | Ile | Ala | Asn | Asn | Lys | Gly | Gly | Ala | Ile |
| 340 | 345 | 350 | |||||||||||||
| Tyr | Ile | Asp | Gly | Thr | Ser | Asn | Ser | Lys | Ile | Ser | Ala | Asp | Arg | His | Ala |
| 355 | 360 | 365 | |||||||||||||
| Ile | Ile | Phe | Asn | Glu | Asn | Ile | Val | Thr | Asn | Val | Thr | Asn | Ala | Asn | Gly |
| 370 | 375 | 380 | |||||||||||||
| Thr | Ser | Thr | Ser | Ala | Asn | Pro | Pro | Arg | Arg | Asn | Ala | Ile | Thr | Val | Ala |
| 385 | 390 | 395 | 400 | ||||||||||||
| Ser | Ser | Ser | Gly | Glu | Ile | Leu | Leu | Gly | Ala | Gly | Ser | Ser | Gin | Asn | Leu |
| Ile | 405 | 410 | 415 | ||||||||||||
| Phe | Tyr | Asp | Pro | Ile | Glu | Val | Ser | Asn | Ala | Gly | Val | Ser | Val | Ser | |
| 420 | 425 | 430 | |||||||||||||
| Phe | Asn | Lys | Glu | Ala | Asp | Gin | Thr | Gly | Ser | Val | Val | Phe | Ser | Gly | Ala |
| 435 | 440 | 445 | |||||||||||||
| Thr | Val | Asn | Ser | Ala | Asp | Phe | His | Gin | Arg | Asn | Leu | Gin | Thr | Lys | Thr |
| 450 | 455 | 4 60 | |||||||||||||
| Pro | Ala | Pro | Leu | Thr | Leu | Ser | Asn | Gly | Phe | Leu | Cys | Ile | Glu | Asp | His |
| 465 | 470 | 475 | 480 | ||||||||||||
| Ala | Gin | Leu | Thr | Val | Asn | Arg | Phe | Thr | Gin | Thr | Gly | Gly | Val | Val | Ser |
| 4 85 | 490 | 4 95 | |||||||||||||
| Leu | Gly | Asn | Gly | Ala | Val | Leu | Ser | Cys | Tyr | Lys | Asn | Gly | Thr | Gly | Asp |
| 500 | 505 | 510 | |||||||||||||
| Ser | Ala | Ser | Asn | Ala | Ser | Ile | Thr | Leu | Lys | His | Ile | Gly | Leu | Asn | Leu |
| 515 | 520 | 525 | |||||||||||||
| Ser | Ser | Ile | Leu | Lys | Ser | Gly | Ala | Glu | Ile | Pro | Leu | Leu | Trp | Val | Glu |
| 530 | 535 | 540 | |||||||||||||
| Pro | Thr | Asn | Asn | Ser | Asn | Asn | Tyr | Thr | Ala | Asp | Thr | Ala | Ala | Thr | Phe |
| 545 | 550 | 555 | 560 | ||||||||||||
| Ser | Leu | Ser | Asp | Val | Lys | Leu | Ser | Leu | Ile | Asp | Asp | Tyr | Gly | Asn | Ser |
| 565 | 570 | 575 | |||||||||||||
| Pro | Tyr | Glu | Ser | Thr | Asp | Leu | Thr | His | Ala | Leu | Ser | Ser | Gin | Pro | Met |
| 580 | 585 | 590 | |||||||||||||
| Leu | Ser | Ile | Ser | Glu | Ala | Ser | Asp | Asn | Gin | Leu | Gin | Ser | Glu | Asn | Ile |
| 595 | 600 | 605 | |||||||||||||
| Asp | Phe | Ser | Gly | Leu | Asn | Val | Pro | His | Tyr | Gly | Trp | Gin | Gly | Leu | Trp |
| 610 | 615 | 620 | |||||||||||||
| Thr | Trp | Cl v | Trn --xr | Ala | Thr | Gin | Asp | Glu | Pro | 7\ 1 nj-ca | Ser | Ser | Ala | ||
| 625 | 630 | 635 | 640 | ||||||||||||
| Thr | Ile | Thr | Asp | Pro | Gin | Lys | Ala | Asn | Arg | Phe | His | Arg | Thr | Leu | Leu |
| 645 | 650 | 655 | |||||||||||||
| Leu | Thr | Trp | Leu | Pro | Ala | Gly | Tyr | Val | Pro | Ser | Pro | Lys | His | Arg | Ser |
| 660 | 665 | 670 | |||||||||||||
| Pro | Leu | Ile | Ala | Asn | Thr | Leu | Trp | Gly | Asn | Met | Leu | Leu | Ala | Thr | Glu |
| 675 | 680 | 685 | |||||||||||||
| Sér | Leu | Lys | Asn | Ser | Ala | Glu | Leu | Thr | Pro | Ser | Gly | His | Pro | Phe | Trp |
| 690 | 695 | 700 | |||||||||||||
| Gly | Ile | Thr | Gly | Gly | Gly | Leu | Gly | Met | Met | Val | Tyr | Gin | Asp | Pro | Arg |
| 705 | 710 | 715 | 720 | ||||||||||||
| Glu | Asn | His | Pro | Gly | Phe | His | Met | Arg | Ser | Ser | Gly | Tyr | Ser | Ala | Gly |
| 725 | 730 | 735 | |||||||||||||
| Met | Ile | Ala | Gly | Gin | Thr | His | Thr | Phe | Ser | Leu | Lys | Phe | Ser | Gin | Thr |
| 740 | 745 | 750 | |||||||||||||
| Tyr | Thr | Lys | Leu | Asn | Glu | Arg | Tyr | Ala | Lys | Asn | Asn | Val | Ser | Ser | Lys |
| 755 | 760 | 765 | |||||||||||||
| Asn | Tyr | Ser | Cys | Gin | Gly | Glu | Met | Leu | Phe | Ser | Leu | Gin | Glu | Gly | Phe |
| 770 | 775 | 780 |
• *·· • » '· · • ···
253
| Leu | Leu | Thr | Lys | Leu | Val | Gly | Leu | Tyr | Ser | Tyr | Gly | Asp | His | Asn | Cys |
| 785 | 790 | 795 | 800 | ||||||||||||
| His | His | Phe | Tyr | Thr | Gin | Gly | Glu | Asn | Leu | Thr | Ser | Gin | Gly | Thr | Phe |
| 805 | 810 | 815 | |||||||||||||
| Arg | Ser | Gin | Thr | Met | Gly | Gly | Ala | Val | Phe | Phe | Asp | Leu | Pro | Met | Lys |
| 820 | 825 | 830 | |||||||||||||
| Pro | Phe | Gly | Ser | Thr | His | Ile | Leu | Thr | Ala | Pro | Phe | Leu | Gly | Ala | Leu |
| 835 | 84 0 | 845 | |||||||||||||
| Gly | Ile | Tyr | Ser | Ser | Leu | Ser | His | Phe | Thr | Glu | Val | Gly | Ala | Tyr | Pro |
| 850 | 855 | 8 60 | |||||||||||||
| Arg | Ser | Phe | Ser | Thr | Lys | Thr | Pro | Leu | Ile | Asn | Val | Leu | Val | Pro | Ile |
| 8 65 | 870 | 875 | 880 | ||||||||||||
| Gly | Val | Lys | Gly | Ser | Phe | Met | Asn | Ala | Thr | His | Arg | Pro | Gin | Ala | Trp |
| 885 | 890 | 895 | |||||||||||||
| Thr | Val | Glu | Leu | Ala | Tyr | Gin | Pro | Val | Leu | Tyr | Arg | Gin | Glu | Pro | Gly |
| 900 | 905 | 910 | |||||||||||||
| Ile | Ala | Thr | Gin | Leu | Leu | Ala | Ser | Lys | Gly | Ile | Trp | Phe | Gly | Ser | Gly |
| 915 | 920 | 925 | |||||||||||||
| Ser | Pro | Ser | Ser | Arg | His | Ala | Met | Ser | Tyr | Lys | Ile | Ser | Gin | Gin | Thr |
| 930 | 935 | 940 | |||||||||||||
| Gin | Pro | Leu | Ser | Trp | Leu | Thr | Leu | His | Phe | Gin | Tyr | His | Gly | Phe | Tyr |
| 94 5 | 950 | 955 | 960 | ||||||||||||
| Ser | Ser | Ser | Thr | Phe | Cys | Asn | Tyr | Leu | Asn | Gly | Glu | Ile | Ala | Leu | Arg |
| 965 | 970 | 975 | |||||||||||||
| Phe |
<210> 192 <211> 848 <212> PRT <213> Chlamydia <400> 192
| Met 1 | Ala | Ser | His | His 5 | His | His | His | His | Gly 10 | Ala | Ile | Ser | Cys | Leu 15 | Arg |
| Gly | Asp | Val | Val 20 | Ile | Ser | Gly | Asn | Lys 25 | Gly | Arg | Val | Glu | Phe 30 | Lys | Asp |
| Asn | Ile | Ala 35 | Thr | Arg | Leu | Tyr | Val 4 0 | Glu | Glu | Thr | Val | Glu 45 | Lys | Val | Glu |
| Glu | Val 50 | Glu | Pro | Ala | Pro | Glu 55 | Gin | Lys | Asp | Asn | Asn 60 | Glu | Leu | Ser | Phe |
| Leu 65 | Gly | Ser | Val | Glu | GÍn 70 | Sex* | Phe | Ile | TFv ± lix | Τι 1 Cl 75 | 71 Ί — Λχα | Asn | Gin | Ala | Leu 80 |
| Phe | Ala | Ser | Glu | Asp 85 | Gly | Asp | Leu | Ser | Pro 90 | Glu | Ser | Ser | Ile | Ser 95 | Ser |
| Glu | Glu | Leu | Ala 100 | Lys | Arg | Arg | Glu | Cys 105 | Ala | Gly | Gly | Ala | Ile 110 | Phe | Ala |
| Lys | Arg | Val 115 | Arg | Ile | Val | Asp | Asn 120 | Gin | Glu | Ala | Val | Val 125 | Phe | Ser | Asn |
| Asn | Phe 130 | Ser | Asp | Ile | Tyr | Gly 135 | Gly | Ala | Ile | Phe | Thr 140 | Gly | Ser | Leu | Arg |
| Glu 145 | Glu | Asp | Lys | Leu | Asp 150 | Gly | Gin | Ile | Pro | Glu 155 | Val | Leu | Ile | Ser | Gly 160 |
| Asn | Ala | Gly | Asp | Val 165 | Val | Phe | Ser | Gly | Asn 170 | Ser | Ser | Lys | Arg | Asp 175 | Glu |
| His | Leu | Pro | His 180 | Thr | Gly | Gly | Gly | Ala 185 | Ile | Cys | Thr | Gin | Asn 190 | Leu | Thr |
| He | Ser | Gin 195 | Asn | Thr | Gly | Asn | Val 200 | Leu | Phe | Tyr | Asn | Asn 205 | Val | Ala | Cys |
| Ser | Gly 210 | Gly | Ala | Val | Arg | Ile 215 | Glu | Asp | His | Gly | Asn 220 | Val | Leu | Leu | Glu |
·'* ·
254
| Ala 225 | Phe | Gly | Gly | Asp | Ile 230 | Val | Phe | Lys | Gly | Asn 235 | Ser | Ser | Phe | Arg | Ala 240 |
| Gin | Gly | Ser | Asp | Ala 245 | Ile | Tyr | Phe | Ala | Gly 250 | Lys | Glu | Ser | His | Ile 255 | Thr |
| Ala | Leu | Asn | Ma 260 | Thr | Glu | Gly | His | Ala 265 | Ile | Val | Phe | His | Asp 270 | Ala | Leu |
| Val | Phe | Glu 275 | Asn | Leu | Lys | Glu | Arg 280 | Lys | Ser | Ala | Glu | Val 285 | Leu | Leu | Ile |
| Asn | Ser 290 | Arg | Glu | Asn | Pro | Gly 295 | Tyr | Thr | Gly | Ser | Ile 300 | Arg | Phe | Leu | Glu |
| Ala 305 | Glu | Ser | Lys | Val | Pro 310 | Gin | Cys | Ile | His | Val 315 | Gin | Gin | Gly | Ser | Leu 320 |
| Glu | Leu | Leu | Asn | Gly 325 | Ala | Thr | Leu | Cys | Ser 330 | Tyf Gly | Phe | Lys | Gin 335 | Asp | |
| Ala | Gly | Ala | Lys 340 | Leu | Val | Leu | Ala | Ala 345 | Gly | Ser | Lys | Leu | Lys 350 | Ile | Leu |
| Asp | Ser | Gly 355 | Thr | Pro | Val | Gin | Gly 360 | His | Ala | Ile | Ser | Lys 365 | Pro | Glu | Ala |
| Glu | Ile 370 | Glu | Ser | Ser | Ser | Glu 375 | Pro | Glu | Gly | Ala | His 380 | Ser | Leu | Trp | Ile |
| Ala 385 | Lys | Asn | Ala | Gin | Thr 390 | Thr | Val | Pro | Met | Val 395 | Asp | Ile | His | Thr | Ile 400 |
| Ser | Val | Asp | Leu | Ala 405 | Ser | Phe | Ser | Ser | Šer 410 | Gin | Gin | Glu | Gly | Thr 415 | Val |
| Glu | Ala | Pro | Gin 420 | Val | Ile | Val | Pro | Gly 425 | Gly | Ser | Tyr | Val | Arg 430 | Ser | Gly |
| Glu | Leu | Asn 435 | Leu | Glu | Leu | Val | Asn 440 | Thr | Thr | Gly | Thr | Gly 445 | Tyr | Glu | Asn |
| His | Ala 450 | Leu | Leu | Lys | Asn | Glu 455 | Ala | Lys | Val | Pro | Leu 460 | Met | Ser | Phe | Val |
| Ala 4 65 | Ser | Ser | Asp | Glu | Ala 470 | Ser | Ala | Glu | Ile | Ser 4 75 | Asn | Leu | Ser | Val | Ser 480 |
| Asp | Leu | Gin | Ile | His 485 | Val | Ala | Thr | Pro | Glu 490 | Ile | Glu | Glu | Asp | Thr 4 95 | Tyr |
| Gly | His | Met | Gly 500 | Asp | Trp | Ser | Glu | Ala 505 | Lys | Ile | Gin | Asp | Gly 510 | Thr | Leu |
| Val’ | Ile | Asn 515 | Trp | Asn | Pro | Thr | Gly 520 | Tyr | Arg | Leu | Asp | Pro 525 | Gin | Lys | Ala |
| Gly | Ala 530 | Leu | Val | Phe | Asn | Ala 535 | Leu | Trp | Glu | Glu | Gly 540 | Ala | Val | Leu | Ser |
| Ala 545 | Leu | Lys | Asn | Ala | Arg 550 | Phe | Ala | His | Asn | Leu 555 | Thr | Ala | Gin | Arg | Met 560 |
| Glu | Phe | Asp | Tyr | Ser 565 | Thr | Asn | Val | Trp | Gly 570 | Phe | Ala | Phe | Gly | Gly 575 | Phe |
| Arg | Thr | Leu | Ser 580 | Ala | Glu | Asn | Leu | Val 585 | Ala | Ile | Asp | Gly | Tyr 590 | Lys | Gly |
| Ala | Tyr | Gly 595 | Gly | Ala | Ser | Ala | Gly 600 | Val | Asp | Ile | Gin | Leu 605 | Met | Glu | Asp |
| Phe | Val 610 | Leu | Gly | Val | Ser | Gly 615 | Ala | Ala | Phe | Leu | Gly 620 | Lys | Met | Asp | Ser |
| Gin 625 | Lys | Phe | Asp | Ala | Glu 630 | Val | Ser | Arg | Lys | Gly 635 | Val | Val | Gly | Ser | Val 640 |
| Tyr | Thr | Gly Phe | Leu 645 | Ala | Gly | Ser | Trp | Phe 650 | Phe | Lys | Gly | Gin | Tyr 655 | Ser | |
| Leu | Gly | Glu | Thr 660 | Gin | Asn | Asp | Met | Lys 665 | Thr | Arg | Tyr | Gly | Val 670 | Leu | Gly |
| Glu | Ser | Ser 675 | Ala | Ser | Trp | Thr | Ser 680 | Arg | Gly | Val | Leu | Ala 685 | Asp | Ala | Leu |
| Val | Glu 690 | Tyr | Arg | Ser | Leu | Val 695 | Gly | Pro | Val | Arg | Pro 700 | Thr | Phe | Tyr | Ala |
| Leu | His | Phe | Asn | Pro | Tyr | Val | Glu | Val | Ser | Tyr | . Ala | Ser | Met | Lys | Phe |
255
| 705 | 710 | 715 | 720 | ||||||||||||
| Pro | Gly | Phe | Thr | Glu | Gin | Gly | Arg | Glu | Ala | Arg | Ser | Phe | Glu | Asp | Ala |
| 725 | 730 | 735 | |||||||||||||
| Ser | Leu | Thr | Asn | Ile | Thr | Ile | Pro | Leu | Gly | Met | Lys | Phe | Glu | Leu | Ala |
| 740 | 745 | 750 | |||||||||||||
| Phe | Ile | Lys | Gly | Gin | Phe | Ser | Glu | Val | Asn | Ser | Leu | Gly | Ile | Ser | Tyr |
| 755 | 760 | 765 | |||||||||||||
| Ala | Trp | Glu | Ala | Tyr | Arg | Lys | Val | Glu | Gly | Gly | Ala | Val | Gin | Leu | Leu |
| 770 | 775 | 780 | |||||||||||||
| Glu | Ala | Gly | Phe | Asp | Trp | Glu | Gly | Ala | Pro | Met | Asp | Leu | Pro | Arg | Gin |
| 785 | 790 | 795 | 800 | ||||||||||||
| Glu | Leu | Arg | Val | Ala | Leu | Glu | Asn | Asn | Thr | Glu | Trp | Ser | Ser | Tyr | Phe |
| 805 | 810 | 815 | |||||||||||||
| Ser | Thr | Val | Leu | Gly | Leu | Thr | Ala | Phe | Cys | Gly | Gly | Phe | Thr | Ser | Thr |
| 820 | 825 | 830 | |||||||||||||
| Asp | Ser | Lys | Leu | Gly | Tyr | Glu | Ala | Asn | Thr | Gly | Leu | Arg | Leu | Ile. | Phe |
| 8-35 | 840 | 845 |
<210> 193 <211> 778 <212> PRT <213> Chlamydia <4 00> 193
| Met | His | His | His | His | His | His | Gly | Leu | Ala | Ser | Cys | Val | Asp | Leu | His |
| 1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
| Ala | Gly | Gly | Gin | Ser | Val | Asn | Glu | Leu | Val | Tyr | Val | Gly | Pro | Gin | Ala |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Val | Leu | Leu | Leu | Asp | Gin | Ile | Arg | Asp | Leu | Phe | Val | Gly | Ser | Lys | Asp |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Ser | Gin | Ala | Glu | Gly | Gin | Tyr | Arg | Leu | Ile | Val | Gly | Asp | Pro | Ser | Ser |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Phe | Gin | Glu | Lys | Asp | Ala | Asp | Thr | Leu | Pro | Gly Lys | Val | Glu | Gin | Ser | |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Thr | Leu | Phe | Ser | Val | Thr | Asn | Pro | Val | Val | Phe | Gin | Gly | Val | Asp | Gin |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Gin | Asp | Gin | Val | Ser | Ser | Gin | Gly | Leu | Ile | Cys | Ser | Phe | Thr | Ser | Ser |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Asn | Leu | Asp | Ser | Pro | Arg | Asp | Gly | Glu | Ser | Phe | Leu | Gly | Ile | Ala | Phe |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Val | Gly | Asp | Ser | Ser | Lys | Ala | Gly | Ile | Thr | Leu | Thr | Asp | Val | Lys | Ala |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Ser | Leu | Ser | Gly | Ala | Ala | Leu | Tyr | Ser | Thr | Glu | Asp | Leu | Ile | Phe | Glu |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Lys | Ile | Lys | Gly | Gly | Leu | Glu | Phe | Ala | Ser | Cys | Ser | Ser | Leu | Glu | Gin |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Gly | Gly | Ala | Cys | Ala | Ala | Gin | Ser | Ile | Leu | Ile | His | Asp | Cys | Gin | Gly |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Leu | Gin | Val | Lys | His | Cys | Thr | Thr | Ala | Val | Asn | Ala | Glu | Gly | Ser | Ser |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Ala | Asn | Asp | His | Leu | Gly | Phe | Gly | Gly | Gly | Ala | Phe | Phe | Val | Thr | Gly |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Ser | Leu | Ser | Gly | Glu | Lys | Ser | Leu | Tyr | Met | Pro | Ala | Gly | Asp | Met | Val |
| 225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
| Val | Ala | Asn | Cys | Asp | Gly | Ala | Ile | Ser | Phe | Glu | Gly | Asn | Ser | Ala | Asn |
| 245 | 250 | 255 | |||||||||||||
| Phe | Ala | Asn | Gly | Gly | Ala | Ile | Ala | Ala | Ser | Gly | Lys | Val | Leu | Phe | Val |
| 260 | 265 | 270 | |||||||||||||
| Ala | Asn | Asp | Lys | Lys | Thr | Ser | Phe | Ile | Glu | Asn | Arg | Ala | Leu | Ser | Gly |
| 275 | 280 | 285 | |||||||||||||
| Gly | Ala | Ile | Ala | Ala | Ser | Ser | Asp | Ile | Ala | Phe | Gin | Asn | Cys | Ala | Glu |
• ·
256
| 290 | 295 | 300 | |||||||||||||
| Leu | Val | Phe | Lys | Gly | Asn | Cys | Ala | Ile | Gly | Thr | Glu | Asp | Lys | Gly | Ser |
| 305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
| Leu | Gly | Gly | Gly | Ala | Ile | Ser | Ser | Leu | Gly | Thr | Val | Leu | Leu | Gin | Gly |
| 325 | 330 | 335 | |||||||||||||
| Asn | His | Gly | Ile | Thr | Gys | Asp | Lys | Asn | Glu | Ser | Ala | Ser' | Gin | Gly | Gly |
| 340 | 345 | 350 | |||||||||||||
| Ala | Ile | Phe | Gly | Lys | Asn | Cys | Gin | Ile | Ser | Asp | Asn | Glu | Gly | Pro | Val |
| 355 | 360 | 365 | |||||||||||||
| Val | Phe | Arg | Asp | Ser | Thr | Ala | Cys | Leu | Gly | Gly | Gly | Ala | Ile | Ala | Ala |
| 370. | 375 | 380 | |||||||||||||
| Gin | Glu | Ile | Val | Ser | Ile | Gin | Asn | Asn | Gin | Ala | Gly | Ile | Ser | Phe | Glu |
| 385 | 390 | 395 | 400 | ||||||||||||
| Gly | Gly | Lys | Ala | Ser | Phe | Gly | Gly | Gly | Ile | Ala | Cys | Gly | Ser | Phe | Ser |
| Ser | 405 | 410 | 415 | ||||||||||||
| Ala | Gly | Gly | Ala | Ser | Val | Leu | Gly | Thr | Ile | Asp | Ile | Ser | Lys | Asn | |
| 420 | 425 | 430 | |||||||||||||
| Leu | Gly | Ala | Ile | Ser | Phe | Ser | Arg | Thr | Leu | Cys | Thr | Thr | Ser | Asp | Leu |
| 435 | 440 | 445 | |||||||||||||
| Gly | Gin | Met | Glu | Tyr | Gin | Gly | Gly | Gly | Ala | Leu | Phe | Gly | Glu | Asn | Ile |
| 450 | 455 | 4 60 | |||||||||||||
| Ser | Leu | Ser | Glu | Asn | Ala | Gly | Val | Leu | Thr | Phe | Lys | Asp | Asn | Ile | Val |
| 465 | 470 | 475 | 480 | ||||||||||||
| Lys | Thr | Phe | Ala | Ser | Asn | Gly | Lys | Ile | Leu | Gly | Gly | Gly | Ala | Ile | Leu |
| 485 | 490 | 4 95 | |||||||||||||
| Ala | Thr | Gly | Lys | Val | Glu | Ile | Thr | Asn | Asn | Ser | Gly | Gly | Ile | Ser | Phe |
| 500 | 505 | 510 | |||||||||||||
| Thr | Gly | Asn | Ala | Arg | Ala | Pro | Gin | Ala | Leu | Pro | Thr | Gin | Glu | Glu | Phe |
| 515 | 520 | 525 | |||||||||||||
| Pro | Leu | Phe | Ser | Lys | Lys | Glu | Gly | Arg | Pro | Leu | Ser | Ser | Gly | Tyr | Ser |
| 530 | 535 | 540 | |||||||||||||
| Gly | Gly | Gly | Ala | Ile | Leu | Gly | Arg | Glu | Val | Ala | Ile | Leu | His | Asn | Ala |
| 545 | 550 | 555 | 560 | ||||||||||||
| Ala | Val | Val | Phe | Glu | Gin | Asn | Arg | Leu | Gin | Cys | Ser | Glu | Glu | Glu | Ala |
| 565 | 570 | 575 | |||||||||||||
| Thr | Leu | Leu | Gly | Cys | Cys | Gly | Gly | Gly | Ala | Val | His | Gly | Met | Asp | Ser |
| 580 | 585 | 590 | |||||||||||||
| Thr | Ser | Ile | Val | Gly | Asn | Ser | Ser | Val | Arg | Phe | Gly | Asn | Asn | Tyr | Ala |
| 595 | 600 | 605 | |||||||||||||
| Met | Gly | Gin | Gly | Val | Ser | Gly | Gly | Ala | Leu | Leu | Ser | Lys | Thr | Val | Gin |
| 610 | 615 | 620 | |||||||||||||
| Leu | Ala | Gly | Asn | Gly | Ser | Val | Asp | Phe | Ser | Arg | Asn | Ile | Ala | Ser | Leu |
| 625 | 630 | 635 | 640 | ||||||||||||
| Gly | Gly | Gly | Ala | Leu | Gin | Tkla | Ser | Glu | Gly | Asn | Cys | Glu | Leu | Val | Asp |
| 645 | 650 | 655 | |||||||||||||
| Asn | Gly | Tyr | Val | Leu | Phe | Arg | Asp | Asn Arg | Gly | Arg | Val | Tyr | Gly | Gly | |
| 660 | 665 | 670 | |||||||||||||
| Ala | Ile | Ser | Cys | Leu | Arg | Gly | Asp | Val | Val | Ile | Ser | Gly | Asn | Lys | Gly |
| 675 | 680 | 685 | |||||||||||||
| Arg | Val | Glu | Phe | Lys | Asp | Asn | Ile | Ala | Thr | Arg | Leu | Tyr | Val | Glu | Glu |
| 690 | 695 | 700 | |||||||||||||
| Thr | Val | Glu | Lys | Val | Glu | Glu | Val | Glu | Pro | Ala | Pro | Glu | Gin | Lys | Asp |
| 705 | 710 | 715 | 720 | ||||||||||||
| Asn | Asn | Glu | Leu | Ser | Phe | Leu | Gly | Ser | Val | Glu | Gin | Ser | Phe | Ile | Thr |
| 725 | 730 | 735 | |||||||||||||
| Ala | Ala | Asn | Gin | Ala | Leu | Phe | Ala | Ser | Glu | Asp | Gly | Asp | Leu | Ser | Pro |
| 740 | 745 | 750 | |||||||||||||
| Glu | Ser | Ser | Ile | Ser | Ser | Glu | Glu | Leu | Ala | Lys | Arg | Arg | Glu | Cys | Ala |
| 755 | 760 | 765 | |||||||||||||
| Gly | Gly | Ala | Asp | Ser | Ser | Arg | Ser | Gly | Cys |
770 775 ·· ···· ·· • · · · • '· · ·
257 <210> 194 <211> 948 <212> PRT <213> Chlamydia <400> 194
| Met 1 | Ala | Ser | Met | His 5 | His | His | His | His | His 10 | Val | Lys | Ile | Glu | Asn 15 | Phe |
| Ser | Gly | Gin | Gly 20 | Ile | Phe | Ser | Gly | Asn 25 | Lys | Ala | Ile | Asp | Asn 30 | Thr | Thr |
| Glu | Gly | Ser 35 | Ser | Ser | Lys | Ser | Asn 40 | Val | Leu | Gly | Gly | Ala 4'5 | Val | Tyr | Ala |
| Lys | Thr 50 | Leu | Phe | Asn | Leu | Asp 55 | Ser | Gly | Ser | Ser | Arg 60 | Arg | Thr | Val | Thr |
| Phe 65 | Ser | Gly | Asn | Thr | Val 70 | Ser | Ser | Gin | Ser | Thr 75 | Thr | Gly | Gin | Val | Ala 80 |
| Gly | Gly | Ala | Ile | Tyr 85 | Ser | Pro | Thr | Val | Thr 90 | Ile | Ala | Thr | Pro | Val 95 | Val |
| Phe | Ser | Lys | Asn 100 | Ser | Ala | Thr | Asn | Asn 105 | Ala | Asn | Asn | Ala | Thr 110 | Asp | Thr |
| Gin | Arg | Lys 115 | Asp | Thr | Phe | Gly | Gly 120 | Ala | He | Gly | Ala | Thr 125 | Šer | Ala | Val |
| Ser | Leu 130 | Ser | Gly | Gly | Ala | His 135 | Phe | Leu | Glu | Asn | Val 140 | Ala | Asp | Leu | Gly |
| Ser 14 5 | Ala | Ile | Gly | Leu | Val 150 | Pro | Asp | Thr | Gin | Asn 155 | Thr | Glu | Thr | Val | Lys 160 |
| Leu | Glu | Ser | Gly | Ser 165 | Tyr | Tyr | Phe | Glu | Lys 170 | Asn | Lys | Ala | Leu | Lys 175 | Arg |
| Ala | Thr | Ile | Tyr 180 | Ala | Pro | Val | Val | Ser 185 | Ile | Lys | Ala | Tyr | Thr 190 | Ala | Thr |
| Phe | Asn | Gin 195 | Asn | Arg | Ser | Leu | Glu 200 | Glu | Gly | Ser | Ala | Ile 205 | Tyr | Phe | Thr |
| Lys | Glu 210 | Ala | Ser | Ile | Glu | Ser 215 | Leu | Cly | Ser | Val | Leu 220 | Phe | Thr | Gly | Asn |
| Leu 225 | Val | Thr | Pro | Thr | Leu 230 | Ser | Thr | Thr | Thr | Glu 235 | Gly | Thr | Pro | Ala | Thr 240 |
| Thr | Ser | Gly | Asp | Val 24 5 | Thr | Lys | Tyr | Gly | Ala 250 | Ala | Ile | Phe | Gly | Gin 255 | Ile |
| Ala | Ser | Ser | Asn 260 | Gly | Ser | Gin | Thr | Asp 265 | Asn | Leu | Pro | Leu | Lys 270 | Leu | Ile |
| Ala | Ser | Gly 275 | Gly | Asn | Ile | Cys | Phe 280 | Arg | Asn | Asn | Glu | Tvr 285 | Arg | Pro | Thr |
| Ser | Ser 290 | Asp | Thr | Gly | Thr | Ser 295 | Thr | Phe | Cys | Ser | Ile 300 | Ala | Gly | Asp | Val |
| Lys, 305 | Leu | Thr | Met | Gin | Ala 310 | Ala | Lys | Gly | Lys | Thr 315 | Ile | Ser | Phe | Phe | Asp 320 |
| Ala | Ile | Arg | Thr | Ser 325 | Thr | Lys | Lys | Thr | Gly 330 | Thr | Gin | Ala | Thr | Ala 335 | Tyr |
| Asp | Thr | Leu | Asp 340 | Ile | Asn | Lys | Ser | Glu 345 | Asp | Ser | Glu | Thr | Val 350 | Asn | Ser |
| Ala | Phe | Thr 355 | Gly | Thr | Ile | Leu | Phe 360 | Ser | Ser | Glu | Leu | His 365 | Glu | Asn | Lys |
| Ser | Tyr 370 | Ile | Pro | Gin | Asn | Val 375 | Val | Leu | His | Ser | Gly 380 | Ser | Leu | Val | Leu |
| Lys 385 | Pro | Asn | Thr | Glu | Leu 390 | His | Val | Ile | Ser | Phe 395 | Glu | Gin | Lys | Glu | Gly 400 |
| Ser | Ser | Leu | Val | Met 405 | Thr | Pro | Gly | Ser | Val 410 | Leu | Ser | Asn | Gin | Thr 415 | Val |
| Ala | Asp | Gly | Ala 420 | Leu | Val | Ile | Asn | Asn 425 | Met | Thr | Ile | Asp | Leu 430 | Ser | Ser |
·· ···· ·< ·· ·· ···· • · · · · · · · · • · · · · · ·'··· » · ·
258
| Val | Glu | Lys 435 | Asn | Gly | Ile | Ala | Glu 440 | Gly | Asn | Ile | Phe | Thr 445 | Pro | Pro | Glu |
| Leu | Arg 450 | Ile | Ile | Asp | Thr | Thr 4 55 | Thr | Ser | Gly | Ser | Gly 460 | Gly | Thr | Pro | Ser |
| Thr 465 | Asp | Ser | Glu | Ser | Asn 470 | Gin | Asn | Ser | Asp | Asp 475 | Thr | Lys | Glu | Gin | Asn 480 |
| Asn | Asn . | Asp | Ala | Ser 485 | Asn | Gin | Gly | Glu | Ser 490 | Ala | Asn | Gly | Ser | Ser 495 | Ser |
| Pro | Ala | Val | Ala 500 | Ala | Ala | His | Thr | Ser 505 | Arg | Thr | Arg | Asn | Phe 510 | Ala | Ala |
| Ala | Ala | Thr 515 | Ala | Thr | Pro | Thr | Thr 520 | Thr | Pro | Thr | Ala | Thr 525 | Thr | Thr | Thr |
| Ser | Asn 530 | Gin | Val | Ile | Leu | Gly 535 | Gly | Glu | Ile | Lys | Leu 540 | Ile | Asp | Pro | Asn |
| Gly 545 | Thr | Phe | Phe | Gin | Asn 550 | Pro | Ala | Leu | Arg | Sér 555 | Asp | Gin | Gin | Ile | Ser 560 |
| Leu | Leu | Val | Leu | Pro 565 | Thr | Asp | Ser | Ser | Lys 570 | Met | Gin | Ala | Gin | Lys 575 | Ile |
| Val | Leu | Thr | Gly 580 | Asp | Ile | Ala | Pro | Gin 585 | Lys | Gly | Tyr | Thr | Gly 590 | Thr | Leu |
| Thr | Leu | Asp 595 | Pro | Asp | Gin | Leu | Gin 600 | Asn | Gly | Thr | Ile | Ser 605 | Ala | Leu | Trp |
| Lys | Phe 610 | Asp | Ser | Tyr | Arg | Gin 615 | Trp | Ala | Tyr | Val | Pro 620 | Arg | Asp | Asn | His |
| Phe 625 | Tyr | Ala | Asn | Ser | Ile 630 | Leu | Gly | Ser | Gin | Met 635 | Ser | Met | Val | Thr | Val 640 |
| Lys | Gin | Gly | Leu | Leu 645 | Asn | Asp | Lys | Met | Asn 650 | Leu | Ala | Arg | Phe | Asp 655 | Glu |
| Val | Ser | Tyr | Asn 660 | Asn | Leu | Trp | Ile | Ser 665 | Gly | Leu | Gly | Thr | Met 670 | Leu | Ser |
| Gin | Val | Gly 675 | Thr | Pro | Thr | Ser | Glu 680 | Glu | Phe | Thr | Tyr | Tyr 685 | Ser | Arg | Gly |
| Ala | Ser 690 | Val | Ala | Leu | Asp | Ala 695 | Lys | Pro | Ala | His | Asp 700 | Val | Ile | Val | Gly |
| Ala 705 | Ala | Phe | Ser | Lys | Met 710 | Ile | Gly | Lys | Thr | Lys 715 | Ser | Leu | Lys | Arg | Glu 720 |
| Asn | Asn | Tyr | Thr | His 725 | Lys | Gly | Ser | Glu | Tyr 730 | Ser | Tyr | Gin | Ala | Ser 735 | Val |
| Tyr | Gly | Gly | Lys 740 | Pro | Phe | His | Phe | Val 745 | Ile | Asn | Lys | Lys | Thr 750 | Glu | Lys |
| Ser | Leu | Pro 755 | Leu | Leu | Leu | Gin | Gly 7 60 | Val | Ile | Ser | Tyr | Gly 765 | Tyr | Ile | Lys |
| His | Asp 770 | Thr | Val | Thr | . His | Tyr 775 | Pro | Thr | Ile | Arg | Glu 780 | Arg | Asn | Gin | Gly |
| Glu 785 | Trp | Glu | Asp | Leu | Gly 790 | Trp | Leu | Thr | Ala | Leu 795 | Arg | Val | Ser | Ser | Val 800 |
| Leu | Arg | Thr | Pro | Ala 805 | Gin | Gly | Asp | Thr | Lys 810 | Arg | Ile | Thr | Val | Tyr 815 | Gly |
| Glu | Leu | Glu | Tyr 820 | Ser | Ser | Ile | Arg | Gin 825 | Lys | Gin | Phe | Thr | Glu 830 | Thr | Glu |
| Tyr | Asp | Pro 835 | Arg | Tyr | Phe | Asp | Asn 840 | Cys | Thr | Tyr | Arg | Asn 845 | Leu | Ala | Ile |
| Pro | Met 850 | Gly | Leu | Ala | Phe | Glu 855 | Gly | Glu | Leu | Ser | Gly 860 | Asn | Asp | Ile | Leu |
| Met 865 | Tyr | Asn | Arg | Phe | Ser 870 | Val | Ala | Tyr | Met | Pro 875 | Ser | Ile | Tyr | Arg | Asn 880 |
| Ser | Pro | Thr | Cys | Lys 885 | Tyr | Gin | Val | Leu | Ser 890 | Ser | Gly | Glu | Gly | Gly 895 | Glu |
| Ile | Ile | Cys | Gly 900 | Val | Pro | Thr | Arg | Asn 905 | Ser | Ala | Arg | Gly | Glu 910 | Tyr | Ser |
| Thr | Gin | Leu | Tyr | Pro | Gly | Pro | Leu | Trp | Thr | Leu | Tyr | Gly | Ser | Tyr | Thr |
» «ΦΦΦ φφ φφ ·· φ φ ΦΦΦ · · φφφφ · ·' · ·φ · · β se ο ο φ φ
259
915 920 925
Ile Glu Ala Asp Ala His Thr Leu Ala His Met Met Asn Cys Gly Ala
930 935 940
Arg Met Thr Phe 945 <210> 195 <211> 821 <212> PRT <213> Chlamydia <400> 195
| Met 1 | His | His | His His 5 | His | His | Glu | Ala | Ser 10 | Ser | Ile | Gin | Asp | Gin 15 | Ile | |
| Lys | Asn | Thr | Asp | Cys | Asn | Val | Ser | Lys | Val | Gly | Tyr | Ser | Thr | Ser | Gin |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Ala | Phe | Thr | Asp | Met | Met | Leu | Ala | Asp | Asn | Thr | Glu | Tyr | Arg | Ala | Ala |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Asp | Ser | Val | Ser | Phe | Tyr | Asp | Phe | Ser | Thr | Ser | Ser | Gly | Leu | Pro | Arg. |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Lys | His | Leu | Ser | Ser | Ser | Ser | Glu | Ala | Ser | Pro | Thr | Thr | Glu | Gly | Val |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Ser | Ser | Ser | Ser | Ser | Gly | Glu | Asn | Thr | Glu | Asn | Ser | Gin | Asp | Ser | Ala |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Pro | Ser | Ser | Gly | Glu | Thr | Asp | Lys | Lys | Thr | Glu | Glu | Glu | Leu | Asp | Asn |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Gly | Gly | Ile | Ile | Tyr | Ala | Arg | Glu | Lys | Leu | Thr | Ile | Ser | Glu | Ser | Gin |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Asp | Ser | Leu | Ser | Asn | Pro | Ser | Ile | Glu | Leu | His | Asp | Asn | Ser | Phe | Phe |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Phe | Gly | Glu | Gly | Glu | Val | Ile | Phe | Asp | His | Arg | Val | Ala | Leu | Lys | Asn |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Gly | Gly | Ala | Ile | Tyr | Gly | Glu | Lys | Glu | Val | Val | Phe | Glu | Asn | Ile | Lys |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Ser | Leu | Leu | Val | Glu | Val | Asn | Ile | Ser | Val | Glu | Lys | Gly | Gly | Ser | Val |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Tyr | Ala | Lys | Glu | Arg | Val | Ser | Leu | Glu | Asn | Val | Thr | Glu | Ala | Thr | Phe |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Ser | Ser | Asn | Gly | Gly | Glu | Gin | Gly | Gly | Gly | Gly | Ile | Tyr | Ser | Glu | Gin |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Asp | Met | Leu | Ile | Ser | Asp | Cys | Asri | Asn | Val | His | Phe | Gin | Gly | Asn | Ala |
| 225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
| Ala | Gly | Ala | Thr | Ala | Val | Lys | Gin | Cys | Leu | Asp | Glu | Glu | Met | Ile | Val |
| 245 | 250 | 255 | |||||||||||||
| Leu | Leu | Thr | Glu | Cys | Val | Asp | Ser | Leu | Ser | Glu | Asp | Thr | Leu | Asp | Ser |
| 260 | 265 | 270 | |||||||||||||
| Thr | Pro | Glu | Thr | Glu | Gin | Thr | Lys | Ser | Asn | Gly | Asn | Gin | Asp | Gly | Ser |
| 275 | 280 | 285 | |||||||||||||
| Ser | Glu | Thr | Lys | Asp | Thr | Gin | Val | Ser | Glu | Ser | Pro | Glu | Ser | Thr | Pro |
| 290 | 295 | 300 | |||||||||||||
| Ser | Pro | Asp | Asp | Val | Leu | Gly | Lys | Gly | Gly | Gly | Ile | Tyr | Thr | Glu | Lys |
| 305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
| Ser | Leu | Thr | Ile | Thr | Gly | Ile | Thr | Gly | Thr | Ile | Asp | Phe | Val | Ser | Asn |
| 325 | 330 | 335 | |||||||||||||
| Ile | Ala | Thr | Asp | Ser | Gly | Ala | Gly | Val | Phe | Thr | Lys | Glu | Asn | Leu | Ser |
| 340 | 345 | 350 | |||||||||||||
| Cys | Thr | Asn | Thr | Asn | Ser | Leu | Gin | Phe | Leu | Lys | Asn | Ser | Ala | Gly | Gin |
| 355 | 360 | 365 | |||||||||||||
| His | Gly. | Gly Gly | Ala | Tyr | Val | Thr | Gin | Thr | Met | Ser | Val | Thr | Asn | Thr | |
| 370 | 375 | I | 380 | ||||||||||||
| Thr | Ser | Glu | Ser | Ile | Thr | Thr | Pro | Pro | Leu | Val | Gly | Glu | Val | Ile | Phe |
Τΐχ-,ητ’ Γ»Ύί-« λ 260
| 385 | 390 | 395 | 400 | ||||||||||||
| Ser | Glu | Asn | Thr | Ala. | Lys | Gly | His | Gly | Gly | Gly | Ile | Cys | Thr | Asn | Lys |
| 405 | 410 | 415 | |||||||||||||
| Leu | Ser | Leu | Ser | Asn | Leu | Lys | Thr | Val | Thr | Leu | Thr | Lys | Asn | Ser | Ala |
| 420 | 425 | 430 | |||||||||||||
| Lys | Glu | Ser | Gly | Gly | Ala | Ile | Phe | Thr | Asp | Leu | Ala | Ser | Ile | Pro | Thr |
| 435 | 440 | 445 | |||||||||||||
| Thr | Asp | Thr | Pro | Glu | Ser | Ser | Thr | Pro | Ser | Ser | Ser | Ser | Pro | Ala | Ser |
| 450 | 455 | 460 | |||||||||||||
| Thr | Pro | Glu | Val | Val | Ala | Ser | Ala | Lys | Ile | Asn | Arg | Phe | Phe | Ala | Ser |
| 465 | 470 | 475 | 480 | ||||||||||||
| Thr | Ala | Glu | Pro | Ala | Ala | Pro | Ser | Leu | Thr | Glu | Ala | Glu | Ser | Asp | Gin |
| 485 | 490 | 4 95 | |||||||||||||
| Thr | Asp | Gin | Thr | Glu | Thr | Ser | Asp | Thr | Asn | Ser | Asp | Ile | Asp | Val | Ser |
| 500 | 505 | 510 | |||||||||||||
| Ile | Glu | Asn | Ile | Leu | Asn | Val | Ala | Ile | Asn | Gin | Asn | Thr | Ser | Ala | Lys |
| 515 | 520 | 525 | |||||||||||||
| Lys | Gly | Gly | Ala | Ile | Tyr | Gly | Lys | Lys | Ala | Lys | Leu | Ser | Arg | Ile | Asn |
| 530 | 535 | 540 | |||||||||||||
| Asn | Leu | Glu | Leu | Ser | Gly | Asn | Ser | Ser | Gin | Asp | Val | Gly | Gly | Gly | Leu |
| 545 | 550 | 555 | 560 | ||||||||||||
| Cys | Leu | Thr | Glu | Ser | Val | Glu | Phe | Asp | Ala | Ile | Gly | Ser | Leu | Leu | Ser |
| 565 | 570 | 575 | |||||||||||||
| His | Tyr | Asn | Ser | Ala | Ala | Lys | Glu | Gly | Gly | Val | Ile | His | Ser | Lys | Thr |
| 580 | 585 | 590 | |||||||||||||
| Val | Thr | Leu | Ser | Asn | Leu | Lys | Ser | Thr | Phe | Thr | Phe | Ala | Asp | Asn | Thr |
| 595 | 600 | 605 | |||||||||||||
| Val | Lys | Ala | Ile | Val | Glu | Ser | Thr | Pro | Glu | Ala | Pro | Glu | Glu | Ile | Pro |
| 610 | 615 | 620 | |||||||||||||
| Pro | Val | Glu | Gly | Glu | Glu | Ser | Thr | Ala | Thr | Glu | Asn | Pro | Asn | Ser | Asn |
| 625 | 630 | 635 | 640 | ||||||||||||
| Thr | Glu | Gly | Ser | Ser | Ala | Asn | Thr | Asn | Leu | Glu | Gly | Ser | Gin | Gly | Asp |
| 645 | 650 | 655 | |||||||||||||
| Thr | Ala | Asp | Thr | Gly | Thr | Gly | Val | Val | Asn | Asn | Glu | Ser | Gin | Asp | Thr |
| 660 | 665 | 670 | |||||||||||||
| Ser | Asp | Thr | Gly | Asn | Ala | Glu | Ser | Gly | Glu | Gin | Leu | Gin | Asp | Ser | Thr |
| 675 | 680 | 685 | |||||||||||||
| Gin | Ser | Asn | Glu | Glu | Asn | Thr | Leu | Pro | Asn | Ser | Ser | Ile | Asp | Gin | Ser |
| 690 | 695 | 700 | |||||||||||||
| Asri | Glu | Asn | Thr | Asp | Glu | Ser | Ser | Asp | Ser | His | Thr | Glu | Glu | Ile | Thr |
| 705 | 710 | 715 | 720 | ||||||||||||
| Asp | Glu | Ser | Val | Ser | Ser | Ser | Ser | Lys | Ser | Gly | Ser | Ser | Thr | Pro | Gin |
| 725 | 730 | 735 | |||||||||||||
| Asp | Gly | Gly | Ala | Ala | Ser | Ser | Gly | Ala | Pro | Ser | Gly | Asp | Gin | Ser | Ile |
| 740 | 745 | 750 | |||||||||||||
| Ser | Tkla | Asn | Ala | Cys | Leu | Ala | Lys | Ser | Tyr | Ala | Ala | Ser | Thr | Asp | Ser |
| 755 | 760 | 765 | |||||||||||||
| Ser | Pro | Val | Ser | Asn | Ser | Ser | Gly | Ser | Asp | Val | Thr | Ala | Ser | Ser | Asp |
| 770 | 775 | 780 | |||||||||||||
| Asn | Pro | Asp | Ser | Ser | Ser | Ser | Gly | Asp | Ser | Ala | Gly | Asp | Ser | Glu | Gly |
| 785 | 790 | 795 | 800 | ||||||||||||
| Pro | Thr | Glu | Pro | Glu | Ala | Gly | Ser | Thr | Thr- | Glu | Thr | Pro | Thr | Leu | Ile |
| 805 | 810 | 815 | |||||||||||||
| Gly | Gly | Gly | Ala | Ile | |||||||||||
| 820 |
<210> 196 <211> 525 <212> PRT <213> Chlamydia ·· ·99· ·· 99 ·· - ···· • · 9 « ·.« · 9 · 9 • ··· 9 9 999 · · · • · · · · 9 ' · 9 9 9' 9
9 9 » 9 9 9999 _ vOiO /
261 <400> 196
| Met 1 | His | His | His | His 5 | His | His | Thr | Ala | Ala 10 | Ser | Asp | Asn | Phe | Gin 15 | Leu |
| Ser | Gin | Gly | Gly 20 | Gin | Gly | Phe | Ala | Ile 25 | Pro | Ile | Gly | Gin | Ala 30 | Met- | Ala |
| Ile | Ala | Gly 35 | Gin | Ile | Lys | Leu | Pro 40 | Thr | Val | His | Ile | Gly 45 | Pro | Thr | Ala |
| Phe | Leu 50 | Gly | Leu | Gly | Val | Val 55 | Asp | Asn | Asn | Gly | Asn 60 | Gly | Ala | Arg | Val |
| Gin 65 | Arg | Val | Val | Gly | Ser 70 | Ala | Pro | Ala | Ala | Ser 75 | Leu | Gly | Ile | Ser | Thr 80 |
| Gly | Asp | Val | Ile | Thr 85 | Ala | Val | Asp | Gly | Ala 90 | Pro | Ile | Asn | Ser | Ala 95 | Thr |
| Ála | Met | Ala | Asp 100 | Ala | Leu | Asn | Gly | His 105 | His | Pro | Gly | Asp | Val 110 | Ile | Ser |
| Val | Thr | Trp 115 | Gin | Thr | Lys | Ser | Gly 120 | Gly | Thr | Arg | Thr | Gly 125 | Asn | Val | Thr |
| Leu | Ala 130 | Glu | Gly | Pro | Pro | Ala 135 | Glu | Phe | Pro | Leu | Val 140 | Pro | Arg | Gly | Ser |
| Pro 145 | Leu | Pro | Val | Gly | Asn 150 | Pro | Ala | Glu | Pro | Ser 155 | Leu | Leu | Ile | Asp | Gly 160 |
| Thr | Met | Trp | Glu | Gly 165 | Ala | Ser | Gly | Asp | Pro 170 | Cys | Asp | Pro | Cys | Ala 175 | Thr |
| Trp | Cys | Asp | Ala 180 | Ile | Ser | Ile | Arg | Ala 185 | Gly | Tyr | Tyr | Gly | Asp 190 | Tyr | Val |
| Phe | Asp | Arg 195 | Val | Leu | Lys | Val | Asp 200 | Val | Asn | Lys | Thr | Phe 205 | Ser | Gly | Met |
| Ala | Alá 210 | Thr | Pro | Thr | Gin | Ala 215 | Ile | Gly | Asn | Ala | Ser 220 | Asn | Thr | Asn | Gin |
| Pro 225 | Glu | Ala | Asn | Gly | Arg 230 | Pro | Asn | Ile | Ala | Tyr 235 | Gly | Arg | His | Met | Gin 240 |
| Asp | Ala | Glu | Trp | Phe 245 | Ser | Asn | Ala | Ala | Phe 250 | Leu | Ala | Leu | Asn | Ile 255 | Trp |
| Asp | Arg | Phe | Asp 260 | Ile | Phe | Cys | Thr | Leu 265 | Gly | Ala | Ser | Asn | Gly 270 | Tyr | Phe |
| Lys | Ala | Ser 275 | Ser | Ala | Ala | Phe | Asn 280 | Leu | Val | Gly | Leu | Ile 285 | Gly | Phe | Ser |
| Ala | Ala 290 | Ser | Ser | Ile | Ser | Thr 295 | Asp | Leu | Pro | Met | Gin 300 | Leu | Pro | Asn | Val |
| Gly 305 | Ile | Thr | Gin | Gly | Val 310 | Val | Glu | Phe | Tyr | Thr 315 | Asp | Thr | Ser | Phe | Ser 320 |
| Trp | Ser | Val | Gly | Ala 325 | Arg | Gly | Ala | Leu | Trp 330 | Glu | Cys | Gly | Cys | Ala 335 | Thr |
| Leu | Gly | Ala | Glu 340 | Phe | Gin | Tyr | Ala | Gin 345 | Ser | Asn | Pro | Lys | Ile 350 | Glu | Met |
| Leu | Asn | Val 355 | Thr | Ser | Ser | Pro | Ala 360 | Gin | Phe | Val | Ile | His 365 | Lys | Pro | Arg |
| Gly | Tyr 370 | Lys | Gly | Ala | Ser | Ser 375 | Asn | Phe | Pro | Leu | Pro 380 | Ile | Thr | Ala | Gly |
| Thr 385 | Thr | Glu | Ala | Thr | Asp 390 | Thr | Lys | Ser | Ala | Thr 395 | Ile | Lys | Tyr | His | Glu 400 |
| Trp | Gin | Val | Gly | Leu 405 | Ala | Leu | Ser | Tyr | Arg 410 | Leu | Asn | Met | Leu | Val 415 | Pro |
| Tyr | Ile | Gly | Val 420 | Asn | Trp | Ser | Arg | Ala 425 | Thr | Phe | Asp | Ala | Asp 430 | Thr | Ue. |
| Arg | Ile | Ala 435 | Gin | Pro | Lys | Leu | Lys 440 | Ser | Glu | Ile | Leu | Asn 445 | Ile | Thr | Thr |
| Trp | Asn 450 | Pro | Ser | Leu | Ile | Gly 455 | Ser | Thr | Thr | Ala | Leu 4 60 | Pro | Asn | Asn | Ser |
| Gly 4 65 | Lys | Asp | Val | Leu | Ser 470 | Asp | Val | Leu | Gin | Ile 475 | Ala | Ser | Ile | Gin | Ile 480 |
Φ· ·««· ·Φ ' φ φ φ φ φ ΦΦ· φ φ
262
| Asn | Lys | Met | Lys | Ser Arg Lys Ala Cys Gly Val Ala Val Gly Ala | Thr | ||||||||||
| 485 | 490 | 495 | |||||||||||||
| Leu | Ile | Asp | Ala | Asp | Lys | Trp | Ser | Ile | Thr | Gly | Glu | Ala | Arg | Leu | Ile |
| 500 | 505 | 510 | |||||||||||||
| Asn | Glu | Arg | Ala | Ala | His | Met | Asn | Ala | Gin | Phe | Arg | Phe | |||
| 515 | 520 | 525 |
<210> 197 <211> 43 <212> DNA <213> Chlamydia <400> 197 gataggcgcg ccgcaatcat gaaatttatg tcagctactg ctg 43 <210> 198 <211> 34 <212> DNA <213> Chlamydia <400> 198 .
cagaacgcgt ttagaatgtc atacgagcac cgca 34 <210> 199 <211> 6 <212> DNA <213> Chlamydia · <400> 199 gcaatc 6 <210> 200 <211> 34 <212> DNA <213> Chlamydia <400> 200 tgcaatcatg agttcgcaga aagatataaa aagc 34 <210> 201 <211> 38 <212> DNA <213> Chlamydia <400> 201 .
cagagctagc ttaaaagatc aatcgcaatc cagtatte 38 <210> 202 <211-> 5 <212> DNA <213> Chlamydia <400> 202 caatc 5 <210> 203 <211> 31 <212> DNA <213> Chlamydia <400> 203
263
4*4 ·1 '9 « 4 444 44 4
444 4- 4 4 444 · 4 4 • 4 ♦ 4 4 4 4 s4 * 4 4 4 · 444« 4 444
4944 944 4« 44 44 44 tgcaatcatg aaaaaagcgt ttttcttttt c <210> 204 <211> 31 <212> DNA <213> Chlamydia <400> 204 cagaacgcgt ctagaatcgc agagcaattt c <210> 205 <211> 30 <212> DNA <213> Chlamydia <400> 205 gtgcaatcat gattcctcaa ggaatttacg
| <210> | 206 |
| <211> | 31 |
| <212> | DNA |
| <213> | Chlamydia |
| <400> | 206 |
cagaacgcgt ttagaaccgg actttacttc c <210> 207 <211> 50 <212> DNA <213> Chlamydia <400> 207 cagacatatg catcaccatc accatcacga ggcgagctcg atccaagatc
| <210> | 208 |
| <211> | 40 |
| <212> | DNA |
| <213> | Chlamydia |
| <400> | 208 |
cagaggtacc tcagatagca ctctctccta ttaaagtagg <210> 209 <211> 55 <212> DNA <213> Chlamydia <400> 209 cagagctagc atgcatcacc atcaccatca cgttaagatt gagaacttct ctggc <210> 210 <211> 35 <212> DNA <213> Chlamydia <400> 210 cagaggtacc ttagaatgtc atacgagcac cgcag <210> 211 <211> 36 <212> DNA
9999 « 9 « 999 .9 · 9 '9
9999 99* • fe «9
9 9 • 9 999 '
9 9 · 9
9 9 9 ·· 99 «9 9*99
264 <213> Chlamydia <400> 211 cagacatatg catcaccatc accatcacgg gttagc 36 <210> 212 <211> 35 <212> DNA <213> Chlamydia <400> 212 cagaggtacc tcagctcctc cagcacactc tcttc 35 <210> 213 <211> 51 <212> DNA <213> Chlamydia <400> 213 cagagctagc catcaccatc accatcacgg tgctatttct tgcttacgtg g 51 <210> 214 <211> 38 <212> DNA <213> Chlamydia <400> 214 scagaggtact taaaagatca atcgcaatcc agtattcg 38 <210> 215 <211> 48 <212> DNA <213> Chlamydia <400> 215 cagaggatcc acatcaccat caccatcacg gactagctag agaggttc 48 <210> 216 <211> 31 <212> DNA <213> Chlamydia <400> 216 cagagaattc ctagaatcgc agagcaattt c 31 <210> 217 <211> 7 <212> DNA <213> Chlamydia <400> 217 tgcaatc 7 <210> 218 <211> 22 <212> PRT <213> Chlamydia <400> 218
Met Ala Ser Met Thr Gly Gly Gin Gin Met Gly Arg Asp Ser Ser Leu 1 5 10 - 15 ’
265
Val Pro Ser Ser Asp Pro 20 <210> 219 <211> 51 <212> DNA <213> Chlamydia <400> 219 cagaggtacc gcatcaccat caccatcaca tgattcctca aggaatttac g 51 <210> 220 <211> 33 <212> DNA <213> Chlamydia <400> 220 cagagcggcc gcttagaacc ggactttact tcc . 33 <210> 221 <211> 24 <212> PRT <213> Chlamydia <400> 221
| Met | Ala | Ser | Met | Thr | Gly | Gly | Gin | Gin Asn Gly Arg Asp | Ser Ser Leu |
| 1 | 5 | 10 | 15 | ||||||
| Val | Pro | His | His | His | His | His | His | ||
| 20. |
<210> 222 <211> 46 <212> DNA <213> Chlamydia <400> 222 cagagctagc catcaccatc accatcacct ctttggccag gatccc · · 46
| <210> | 223 |
| <211> | 30 |
| <212> | DNA |
| <213> | Chlamydia |
| <400> | 223 |
cagaactagt ctagaacctg taagtggtcc 30 <210> 224 <211> 20 <212> PRT <213> Artificiální sekvence-e <220>
<223> Vyrobeno v laboratoři <400> 224
Met Ser Gin Lys Asn Lys Asn Ser Ala Phe Met His Pro Val Asn Ile 1 5 10 15
Ser Thr Asp Leu 20 <210> 225
266
<211> 20 <212> PRT <213> Artificiální sekvence‘ce <220>
<223> Vyrobeno v laboratoři <400> 225
Lys Asn Ser Ala Phe Met His Pro Val Asn Ile Ser Thr Asp Leu Ala 1 5 10 15
Val Ile Val Gly 20 <210> 226 <211> 20 <212> PRT <213> Artifici --.ce <220>
<223> Vyrobeno v laboratoři <400> 226
His Pro Val Asn Ile Ser Thr Asp Leu Ala Val Ile Val Gly Lys Gly 1 5 10 15
Pro Met Pro Arg 20 <210> 227 <211> 20 <212> PRT <213> Artificiální sekvenceice <220>
<223> Vyrobeno v laboratoři <400> 227
Ser Thr Asp Leu Ala Val Ile Val Gly Lys Gly Pro Met Pro Arg Thr 1 5 10 15
Glu Ile Val Lys ✓ m η-κ o o o •χ x. x x u <211> 20 <212> PRT <213> Artificiální sekvence ~e <220>
<223> Vyrobeno v laboratoři <400> 228
Val Ile Val Gly Lys Gly Pro Met Pro Arg Thr Glu Ile Val Lys Lys 1 5 10 15
Val Trp Glu Tyr <210> 229 <211> 2,0 <212> PRT <2i3>Artificiální sekvence nce <220>
267
<2 23> vyrobeno v laboratoři <400> 229
Gly Pro Met Pro Arg Thr Glu Ile Val Lys Lys Val Trp Glu Tyr Ile 1 5 10 15
Lys Lys His Asn 20 <210> 230 <211> 20 <212> PRT <213> Artificiální sekvence >e <220> , , <223> vyrobeno v laboratoři <400> 230
Ile Lys Lys His Asn Cys Gin Asp Gin Lys Asn Lys Arg Asn Ile; Leu 1 5 10 15
Pro Asp Ala Asn 20 <210> 231 <211> 20 <212> PRT <213> Artificia e <220>
<223> vyrobeno v laboratoři <400> 231
Asn Cys Gin Asp Gin Lys Asn Lys Arg Asn Ile Leu Pro Asp Ala Asn 1 5 10 15
Leu Ala Lys Val 20 <210> 232 <211> 20 <212> PRT <213> Artificiální sekvencece <220>
<223> vyrobeno v laboratoři <400> 232
Lys Asn Lys Arg Asn Ile Leu Pro Asp Ala Asn Leu Ala Lys Val Phe 1 5 10 15
Gly Ser Ser Asp 20 <210> 233 <211> 20 <212> PRT <213> Artificiální sekvence ce <220>
<223> vyrobeno v laboratoři <400> 233
Ile Leu Pro Asp Ala Asn Leu Ala Lys Val Phe Gly Ser Ser Asp Pro 1 5 10 15 • · · ·
268
Ile Asp Met Phe 20 <210> 234 <211> 20 <212> PRT <213> Artificiální sekvence íce <223> vyrobeno v laboratoři <400> 234
Asn Leu Ala Lys Val Phe Gly Ser Ser Asp Pro Ile Asp Met Phe Gin 1 5 - 10 15
Met Thr Lys Ala 20 <210> 235 <211> 22 <212> PRT <213> Artificiální sekvence ® <220>
| <223> Made in a lab | ||||
| <400> 235 Phe Gly Ser Ser | Asp | Pro Ile Asp Met | Phe | Gin Met Thr Lys Ala Leu |
| 1 | 5 | 10 | 15 | |
| Ser Lys His Ile | Val | Lys | ||
| 20 |
<210> 236 <211> 20 <212> PRT <213> 7 Artificiální sekvencese <220>
<223> pvyrobeno v laboratoři <400> 236
Val Glu Ile Thr Gin Ala Val Pro Lys Tyr Ala Thr Val Gly Ser Pro 1 5 10 15 :
Tyr Pro Val Glu 20 <210> 237 <211> 20 <212> PRT <213> Artificiální sekvencelCe <220>
<223> t vyrobeno v laboratoři <400> 237
Ala Val Pro Lys Tyr Ala Thr Val Gly Ser Pro Tyr Pro Val Glu Ile 1 5 10 15
Thr Ala Thr Gly 20 <210> 238 <211> 20 • · · ·
269 <212> PRT <213> Artificiální sekvence ce <220>
<223> vyrobeno v laboratoři <400> 238
Ala Thr Val Gly Ser Pro Tyr Pro Val Glu Ile Thr Ala Thr Gly Lys 1 5 10 15
Arg Asp Cys Val 20 <210> 239 <211> 20 <212> PRT <213> i Artificiální sekvence e <220>
<2 2 3> . vyrobeno v laboraton <400> 239
Pro Tyr Pro Val Glu Ile Thr Ala Thr Gly Lys Arg Asp Cys Val Asp 1 5 10 15
Val Ile Ile Thr 20 <210> 240 <211> 21 <212> PRT <213> Artificiální sekvence-e <220>
<223> lvyrobeno v laboraton <400> 240
Ile Thr Ala Thr Gly Lys Arg Asp Cys Val Asp Val Ile Ile Thr Gin 1 5 10 15
Gin.Leu Pro Cys Glu 20 <210> 241 <211> 20 <212> PRT <213> Artificiální sekvence10® <220>
<223> vyrobeno v laboratoři <400> 241
Lys Arg Asp Cys Val Asp Val Ile Ile Thr Gin Gin Leu Pro Cys Glu 1 5 10 15
Ala Glu Phe Val 20 <210> 242 <211> 20 <212> PRT <213> : Artificiální sekvence'e <220> .
<2 2 3> i vyrobeno v laboraton
270 • ·· • <· · • ··· <400> 242
Asp Val Ile Ile Thr Gin Gin Leu Pro Cys Glu Ala Glu Phe Val Arg 1 5 10 15
Ser Asp Pro Ala 20 <21O> 243 <211> 20 <212> PRT <213> Artificiální sekvence ce <220>
<223> vyrobeno v laboratoři <400> 243
Thr Gin Gin Leu Pro Cys Glu Ala Glu Phe Val Arg Ser Asp Pro Ala 1 5 10 15
Thr Thr Pro Thr 20 <210> 244 <211> 20 <212> PRT <2i3> Artificiální sekvence ce <223> vyrobeno v laboratoři <400> 244
Cys Glu Ala Glu Phe Val Arg Ser Asp Pro Ala Thr Thr Pro Thr Ala 1 5 10 15
Asp Gly Lys Leu 20 <210> 245 <211> 20 <212> PRT <213> Artificiální sekvencece <220>
<223> vyrobeno v laboratoři <400> 245
Val Arg Ser Asp Pro Ala Thr Thr Pro Thr Ala Asp Gly Lys Leu Val 1 5 io 15
Trp Lys Ile Asp 20 <210> 246 <211> 20 <212> PRT <213> Artificiální sekvencece <220>
<223> vyrobeno v laboratoři <400> 246
Ala Thr Thr Pro Thr Ala Asp Gly Lys Leu Val Trp Lys Ile Asp Arq 1 5 io . 15
Leu Gly Gin Gly • ···
271 <210> 247 <211> 20 <212> PRT <213> /Artificiální sekvence<220>
<223> vyrobeno v laboratoři <400> 247
| Ala Asp Gly Lys Leu Val | Trp | Lys Ile Asp Arg Leu Gly Gin Gly Glu | |||||||||
| 1 Lys Sc | 5 sr Lys Ile 20 | 10 | 15 | ||||||||
| <210> | 248 | ||||||||||
| <211> | 20 | ||||||||||
| <212> | PRT | ||||||||||
| <213> | Artificiální sekvence: | :e | |||||||||
| <220> <223> | vyrobeno v laboratoři | ||||||||||
| <400> | 248 | ||||||||||
| Val Trp Lys Ile Asp Arg | Leu | Gly | Gin | Gly | Glu | Lys | Ser | Lys | Ile | Thr | |
| 1 | 5 | 10 | 15 |
Val Trp Val Lys
| 20 | |||
| <210> 249 <211> 20 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> vyrobeno v laboratoři <400> 249 Arg Leu Gly Gin Gly Glu Lys Ser Lys | Ile Thr Val | Trp Val Lys Pro | |
| 1 | 5 | 10 | 15 |
| T.An T.v«í CT η ΡΊ \t —--- j |
<210> 250 <211> 20 <212> PRT <213> Artificiální sekvence ce <220>
<223> vyrobeno v laboratoři <400> 250
Gly Glu Lys Ser Lys Ile Thr Val Trp Val Lys Pro Leu Lys Glu Gly 1 5 10 15
Cys Cys Phe Thr 20 <210> 251 <211> 16 <212> PRT
9 . 9 * · ·
99 9
272 .· ··· <213> Artificiální sekvenceice <220>
< 2 2 3 > vyrobeno v laboratoři <400> 251
Gly Glu Lys Ser Lys Ile Thr Val 1 5 <210> 252 <211> 12 <212> PRT <213> Artificiální sekvenceíce <2°0>
<223> i vyrobeno v laboratoři <400> 252
Lys Ile Thr Val Trp Val Lys Pro 1 5 <210> 253 <2I1> 16 <212> PRT <213> Artificiální sekvence ce <220>
<223> vyrobeno v laboratoři <400> 253
Gly Asp Lys Cys Lys Ile Thr Val 1 5 <210> 254 <211> 20 <212> PRT <213> Artificial S <220>
<223> r vyrobeno v laboratoři <400> 254
Thr Glu Tyr Pro Leu Leu Ala Asp 1 5
Phe Gly Val Leu 20 <210> 255 <211> 20 <212> PRT <213> Artificiální sekvence0® <220>
<223> ivyrobeno v laboratoři <400> 255
Leu Ala Asp Pro Ser Phe Lys Ile 1 5
Pro Glu Gly Ser 20
Trp Val Lys Pro Leu Lys Glu Gly 10 15
Leu Lys Glu Gly 10
Trp Val Lys Pro Leu Lys Glu Gly 10 15
Pro Ser Phe Lys Ile Ser Glu Ala 10 15
Ser Glu Ala Phe Gly Val Leu Asn 10 15
273 ·· ·«·· • · · • ♦·· ·· ···· • · ·· • · · • · · · • · · * <210> 256 <211> 20 <212> PRT <2ΐ3> Artificiální sekvence ;e <220>
<223> i vyrobeno v laboratoři <400> 256
Phe Lys Ile Ser Glu Ala Phe Gly Val Leu Asn Pro Glu Gly Ser Leu 1 5 10 15
Ala Leu Arg Ala 20 <210> 257 <211> 20 <212> PRT <213> Artificiální sekvencece <220>
<223> vyrobeno v laboratoři <400> 257
Ala Phe Gly Val Leu Asn Pro Glu Gly Ser Leu Ala Leu Arg Ala Thr 1 5 10 15
Phe Leu Ile Asp 20 <210> 258 <211> 20 <212> PRT <213> Artificiální sekvencece <220>
<223> vyrobeno v laboratoři <400> 258
Asn Pro Glu Gly Ser Leu Ala Leu Arg Ala Thr Phe Leu Ile Asp Lys 1 5 10 15
His Gly Val Ile 20 <210> 259 <211> 20 <212> PRT <213> Artificiální sekvence:e <220>
v<223> vyrobeno v laboratoři <400> 259
Leu Ala Leu Arg Ala Thr Phe Leu Ile Asp Lys His Gly Val Ile Arg 1 5 10 15
His Ala Val Ile 20 <210> 260 <211> 20 <212> PRT <213> Artificial Sequence
274 ·♦<« • · ·
999 9 9
9999 999
9 9 9 9 9 « · 999 9 9 9
9 9 9 9 9 9 9
9 9 9 9 9 9 9
99 99 99 <220>
<223> Made in a lab <400> 260
| Thr Phe Leu Ile Asp Lys | His | Gly Val Ile 10 | Arg His Ala Val | Ile Asn 15 | |||||||
| 1 Asp Le | 5 su Pro Leu 20 | ||||||||||
| <210> | 261 | ||||||||||
| <211> | 20 | ||||||||||
| <212> | PRT | ||||||||||
| <213> | Artificiální sekvence; | :e | |||||||||
| <220> <223> | vyrobeno v laboratoři | ||||||||||
| <400> | 261 | ||||||||||
| Lys His Gly Val Ile Arg | His | Ala | Val | Ile | Asn | Asp | Leu | Pro | Leu | Gly | |
| 1 | 5 | 10 | 15 |
ce.
Arg Ser Ile Asp 20 <210> 262 <211> 20 · <212> PRT <213> Artificiální sekvence·ce <220>
<223> vyrobeno v laboratoři <400> 262
Arg His Ala Val Ile Asn Asp Leu Pro Leu Gly Arg Ser Ile Asp Glu 1 5 10 15
Glu Leu Arg Ile 20 <210> 263 <211> 897 <212> DNA <213> Chlamydia <220> . . <221> různé vlastnosti <222> 604 <223> n = A, t,c neboG <400> 263 .
atggcttcta tatgcggacg tttagggtct ggtacaggga atgctctaaa agcttttttt 60 acacagccca acaataaaat ggcaagggta gtaaataaga cgaagggagt ggataagact 120 attaaggttg ccaagtctgc tgccgaattg accgcaaata ttttggaaca agctggaggc 180 gcgggctctt ccgcacacat tacagcttcc caagtgtcca aaggattagg ggatgcgaga 240 actgttgtcg ctttagggaa tgcctttaac ggagcgttgc caggaacagt tcaaagtgcg 300 caaagcttct tctctcacat gaaagctgct agtcagaaaa cgcaagaagg ggatgagggg 360 ctcacagcag atctttgtgt gtctcataag cgcagagcgg ctgcggctgt ctgtagcatc 420 atcggaggaa ttacctacct cgcgacattc ggagctatcc gtccgattct gtttgtcaac 480 aaaatgctgg caaaaccgtt tctttcttcc caaactaaag caaatatggg atcttctgtt 540 agctatatta tggcggctaa ccatgcagcg tctgtggtgg gtgctggact cgctatcagt 600 gcgnaaagag cagattgcga agcccgctgc gctcgtattg cgagagaaga gtcgttactc 660 gaagtgccgg gagaggaaaa tgcttgcgag aagaaagtcg ctggagagaa agccaagacg 720 ttcacgcgca tcaagtatgc actcctcact atgctcgaga- agtttttgga atgcgttgcc 780 «· ·*«· « 9 9, • ··· • · * ♦ · · + ·· ··· tr 9 · • · ··* » 9 9 9
4 9 ·
99 ·«··
4
4 9
4 9 9
9 9 9 • 4t ··
275 gacgttttca aattggtgcc gctgcctatt acaatgggta ttcgtgcgat tgtggctgct 840 ggatgtacgt tcacttctgc aattattgga ttgtgcactt tctgcgccag agcataa 897 <210> 264 <211> 298 <212> PRT <213> Chlamydia <220>
<221> VARIANT <222> 202
Xaa - jakákoliv aminokyselina <400> 264
| Met | Ala | Ser | Ile | Cys | Gly | Arg Leu Gly Ser | Gly Thr | Gly Asn | Ala | Leu | |||||
| 1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
| Lys | Ala | Phe | Phe | Thr | Gin | Pro | Asn | Asn | Lys | Met | Ala | Arg | Val | Val | Asn |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Lys | Thr | Lys | Gly | Val | Asp | Lys | Thr | Ile | Lys | Val | Ala | Lys | Ser | Ala | Ala |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Glu | Leu | Thr | Ala | Asn | Ile | Leu | Glu | Gin | Ala | Gly | Gly | Ala | Gly | Ser | Ser |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Ala | His | Ile | Thr | Ala | Ser | Gin | Val | Ser | Lys | Gly | Leu | Gly | Asp | Ala | Arg |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Thr | Val | Val | Ala | Leu | Gly | Asn | Ala | Phé | Asn | Gly | Ala | Leu | Pro | Gly | Thr |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Val | Gin | Ser | Ala | Gin | Ser | Phe | Phe | Ser | His | Met | Lys | Ala | Ala | Ser | Gin |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Lys | Thr | Gin | Glu | Gly | Asp | Glu | Gly | Leu | Thr | Ala | Asp | Leu | Cys | Val | Ser |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| His | Lys | Arg | Arg | Ala | Ala | Ala | Ala | Val | Cys | Ser | Ile | Ile | Gly | Gly | Ile |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Thr | Tyr | Leu | Ala | Thr | Phe | Gly | Ala | Ile | Arg | Pro | Ile | Leu | Phe | Val | Asn |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Lys | Met | Leu | Ala | Lys | Pro | Phe | Leu | Ser | Ser | Gin | Thr | Lys | Ala | Asn | Met |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Gly | Ser | Ser | Val | Ser | Tyr | Ile | Met | Ala | Ala | Asn | His | Ala | Tkla | Ser | Val |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Val | Gly | Ala | Gly | Leu | Ala | Ile | Ser | Ala | Xaa | Arg | Ala | Asp | Cys | Glu | Ala |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Arg | Cys | Ala | Arg | Ile | Ala | Arg | Glu | Glu | Ser | Leu | Leu | Glu | Val | Pro | Gly |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Clu | Glu | Asn | Ala | Cys | Glu | Lys | Lys | Val | Ala | Gly | Glu | Lys | Ala | Lys | Thr |
| 225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
| Phe | Thr | Arg | Ile | Lys | Tyr | Ala | Leu | Leu | Thr | Met | Leu | Glu | Lys | Phe | Leu |
| 245 | 250 | 255 | |||||||||||||
| Glu | Cys | Val | Ala | Asp | Val | Phe | Lys | Leu | Val | Pro | Leu | Pro | Ile | Thr | Met |
| 260 | 265 | 270 | |||||||||||||
| Gly | Ile | Arg | Ala | He | Val | Ala | Ala | Gly | Cys | Thr | Phe | Thr | Ser | Ala | Ile |
| 275 | 280 | 285 | |||||||||||||
| Ile | Gly | Leu | Cys | Thr | Phe | Cys | Ala | Arg | Ala | ||||||
| 290 | 295 |
<210> 265 <211> 897 <212> DNA <213> Chlamydia <220>
<22i> různé vlastnosti • ···
276 <222> 604 <223> n = A,T,C nebo G <400> 265 atggcttcta tatgcggacg tttagggtct ggtacaggga atgctctaaa agcttttttt 60 acacagccca acaataaaat ggcaagggta gtaaataaga cgaagggaat ggataagact 120 attaaggttg ccaagtctgc tgccgaattg accgcaaata ttttggaaca agctggaggc 180 gcgggctctt ccgcacacat tacagcttcc caagtgtcca aaggattagg ggatgcgaga 240 actgttgtcg ctttagggaa tgcctttaac ggagcgttgc caggaacagt tcaaagtgcg 300 caaagcttct tctctcacat gaaagctgct agtcagaaaa cgcaagaagg ggatgagggg 360 ctcacagcag atctttgtgt gtctcataag cgcagagcgg ctgcggctgt ctgtagcatc 420 atcggaggaa ttacctacct cgcgacattc ggagctatcc gtccgattct gtttgťcaac 480 aaaatgctgg caaaaccgtt tctttcttcc caaactaaag caaatatggg atcttctgtt 540 agctatatta tggcggctaa ccatgcagcg tctgtggtgg gtgctggact cgctatcagt 600 gcgnaaagag cagattgcga agcccgctgc gctcgtattg cgagagaaga gtcgttactc 660 gaagtgccgg gagaggaaaa tgcttgcgag aagaaagtcg ctggagagaa agccaagacg 720 ttcacgcgca tcaagtatgc actcctcact atgctcgaga agtttttgga atgcgttgcc 780 gacgttttca aattggtgcc gctgcctatt acaatgggta ttcgtgcgat tgtggctgct 840 ggatgtacgt tcacttctgc aattattgga ttgtgcactt tctgcgccag agcataa 897 <210> 266 <211> 298 <212> PRT <213> Chlamydia <220>
<221> VARIANT <222> 202 <223> Xaa = jakákoliv aminokyselina <400> 266
| Met | Ala | Ser | Ile | Cys | Gly | Arg | Leu | Gly | Ser | Gly | Thr | Gly | Asn | Ala | Leu |
| 1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
| Lys | Ala | Phe | Phe | Thr | Gin | Pro | Asn | Asn | Lys | Met | Ala | Arg | Val | Val | Asn |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Lys | Thr | Lys | Gly | Met | Asp | Lys | Thr | Ile | Lys | Val | Ala | Lys | Ser | Ala | Ala |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Glu | Leu | Thr | Ala | Asn | Ile | Leu | Glu | Gin | Ala | Gly | Gly | Ala | Gly | Ser | Ser |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Ala | His | Ile | Thr | Ala | Ser | Gin | Val | Ser | Lys | Gly | Leu | Gly | Asp | Ala | Arg |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Thr | Val | Val | Ala | Leu | Gly | Asn | Ala | Phe | Asn | Gly | Ala | Leu | Pro | Gly | Thr |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Val | Gin | Ser | Ala | Gin | Ser | Phe | Phe | Ser | His | Met | Lys | Ala | Ala | Ser | Gin |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Lys | Thr | Gin | Glu | Gly | Asp | Glu | Gly | Leu | Thr | Ala | Asp | Leu | Cys | Val | Ser |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| His | Lys | Arg | Arg | Ala | Ala | Ala | Ala | Val | Cys | Ser | Ile | Ile | Gly Gly | Ile | |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Thr | Tyr | Leu | Ala | Thr | Phe | Gly | Ala | Ile | Arg | Pro | Ile | Leu | Phe | Val | Asn |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Lys | Met | Leu | Ala | Lys | Pro | Phe | Leu | Ser | Ser | Gin | Thr | Lys | Ala | Asn | Met |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Gly | Ser | Ser | Val | Ser | Tyr | Ile | Met | Ala | Ala | Asn | His | Ala | Ala | Ser | Val |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Val | Gly | Ala | Gly | Leu | Ala | Ile | Ser | Ala | Xaa | Arg | Ala | Asp | Cys | Glu | Ala |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Arg | Cys | Ala | Arg | Ile | Ala | Arg | Glu | Glu | Ser | Leu | Leu | Glu | Val | Pro | Gly |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Glu | Glu | Asn | Ala | Cys | Glu | Lys | Lys | Val | Ala | Gly | Glu | Lys | Ala | Lys | Thr |
| 225 | 230 | 235. | 240 |
• · · · • · · ·
277
| Phe Thr | Arg | Ile Lys 245 | Tyr | Ala Leu Leu | Thr Met 250 | Leu Glu | Lys | Phe 255 | Leu | ||||||
| Glu | Cys | Val | Ala | Asp | Val | Phe | Lys | Leu | Val | Pro | Leu | Pro | Ile | Thr | Met |
| 260 | 265 | 270 | |||||||||||||
| Gly | Ile | Arg | Ala | Ile | Val | Ala | Ala | Gly | Cys | Thr | Phe | Thr | Ser | Ala | Ile |
| 275 | 280 | 285 | |||||||||||||
| Ile | Gly | Leu | Cys | Thr | Phe | Cys | Ala | Arg | Ala | ||||||
| 290 | 295 |
<210> 267 <211> 680 <212> DNA <213> Chlamydia <400> 267 tctatatcca gagctttagg gttccttacg tagttgatgc tgctaaaacg aaaatcaccc ttaaagattt ccacaattat ataaattaaa tgagaaaaga agaagacatc aactaattca tattgatagg atattcaaca ttcagagaag ggattcttca catcttagat aattattaag ttatcgcaga gcgtttattc taaaaaatta agatgttatc tatcgatgat gaatcactgt aaaaaacgtc gatgcagata gattttgtcg ttagtttacg acgggagtcc atgctcgcaa ttacgaccag ttcgatgcta ggcttcccat ggcgcgttga attgaccatt gcagaaagat ttattgaaga cgttagttgg ggaaagctgg aatctttgaa aagatcctac gagagcctgc aacgttataa tagacgacga aatatttgat tggcaaaccg tttagctatg gttcttttct taaagtttta agagaagcta gattgctgtt ggattcttac aactttagct tttaggccgc aacattatct tcgtttgcga acgagttcgc acgtttatcc gtagaggagc gctgataacg agtactgcta ggcgcagatg gaagctgctc aatgctčgat gttggacgtt caagtgactt atgggcgatg tctgttggag
120
180
240
300
360
420
480
540
600
660
680 <210> 268 <Z11> 359 <212> DNA <213> Chlamydia <400> 268 cttatgttct agaaaccaag agctcctaac taaatatagc agagactgtc atcačaagac ggagaatgtt cccttttgag aaagagctaa aagtgctctt tctccatcaa tctatgaaag gcaacaacat aaaaaacctg ttttttcctc ggaacacctc ttaaatggag ctatctgatt attaatcgaa tacttcgcat ttccttgttt atcaacaatc tttcaaagta ccatcgagca ccagctcctc cctttagcca ttctgaggcg gcttgtccta atatcccctt gaaatgtatg ctagtaacat tttgttgaat ctgtggactc gattaggtat ccgtccctcc gggaaatac
120
180
240
300
359 <210> 269
Π O Λ XZť*± <212> DNA <213> Chlamydia’ <400> 269 gatcgaatca attgagggag ggaataacaa gaaataggta ggtt <210> 270 <211> 219 <212> DNA <213> Chlamydia ctcattaaca atcggtacca agaatagctg ttgatagaac cagtttcttt gaacacgaca gcgttcttct aatcgcagaa
120
124 <400> 270 gatcctgttg ataagagcac cgctcttgtc ctcagacttg ggcctagtaa ggatacgctt caatgacata ttggagagct gatttcccat tagacggcaa tggcgtttga gttgcgatc.
aactcacttg ccgaaatcgt tttctttagg tttatcctgc ttttttcgcg ggttaacact
120
180
219 taatacgttg atagtggtta agagtcgatg tgtggaagat
278 <210> 271 <211> 511 <212> DNA <213> Chlamydia <220> ο , . <22ΐ> ruzne vlastnosti <222> 447 <223> η = A,t,c nebo G <400> 271 ggatccgaat acaaagaggt tgttatcgat cctgttctcc atggtgcggc ttgttgcgac tcagattaga tctctgttac cctccaccta tcggcacgag tttggcatag agcttggttc atagatagct tgctgcggct tcctgtggat aatatttaca agataaggag tctctgtagc gagaaaatat atggctcctc ccagagaact cctcctacta gcttgtaggg gaggagtttg gttttagcat actagangca ggagttctca aggaggttcc cttgtacgtt gacaagtccc cacctgaata aagcagcagc ctttgttgtt gtaagcctcc tctagtttta akcatcggaa caacgatgat gctacattga agttggtgtt tgcagcaggt cgagaaaqag accttctttc aagatťtttt gatctaatag tgggagggat gagaatgtaa gctggagatg gctgaagctg aagcctgat-t ccaacaaggt acagcagata
120
180
240
300
360
420
480
511 <210> 272 <211> 598 <212> DNA <213> Chlamydia <400> 272 ctcttcctct ctctggctca ttatactgat caaagcgaca tcaccgtcta agacaacatc aaaagagggc ggatagtttc ccaaagaaat gtacatggtg <210> 273 <211> 126 <212> DNA <213^ Chlamydia <400> 273 ggatccgaat tcggcacgag atgagcctta tagtttaaca aaagcttctc acattccttc gatagctttt tattagccgt ttttagcatc ctaatgagat ctcctcgttc gtaacaaata cgagag <210> 274 <211> 264 <212> DNA <213> Chlamydia <400> 274 ggatccgaat tcggcacgag ctcttttaaa tcttaattac aaaaagacaa attaattcaa tttttcaaaa aagaatttaa acattaattg ttgtaaaaaa acaatattta ttctaaaata ataaccatag ttacggggga atctctttca tggtttattt tagagctcat caacctaggc atacgcctaa aacatttcct ttgaaagttc accattcgtt ctccgataag catcctcaaa ttgctaaagc tatgtggatt acgg cctcaatcta aactcggata aagaatcttt gatgttggag caatttttga accctatcta ggtggactct tgtttaatta ctctcagact aaacagtcat gttctggagc cctcaaaaac cgattactaa gtggtgctta aaaactcttc atttgacagg tcataaaagg ataacacatc tacacctctt tactggcaat aactacagtc agttccagtc catcacagga cgtaaaagga cgataaacaa gaagactcta tacagataaa agaaaaacat gatgtggaaa aaatctacag tccgactcag acagctaaag attatcgaaa acccttactt ggtggaggaa ttccaagaga gctcttacaa ggtggtggga caattccagg gaggtaatgg gagactctag gcggtgggct ttgcaaataa gtaaaaactc tctacggaga atactgccaa tgacaggact gcctttgtta aatcacgcct tggagggc
120
180
240
300
360
420
480
540
598
120
126
120
180
240
264 • · · ·
279 <210> 275 <211> 359 <212> DNA <213> Chlamydia <400> 275 ggatccgaat tcggcacgag ataaaacctg aaccacaaca aagatctaaa acttcttgat 60 tttcagctgc aaattctttt agataaatat caaccatttc ttcagtttca tatcttggaa 120 ttaaaacttg ttctcttaaa ttaattctag tatttaagta ttcaacatag cccattatta 180 attgaattgg ataattttgc cttaataatt cacattcttt ttcagtaatt ttaggttcta 240 aaccgtaccg ctttttttct aaaattaatg tttcttcatt attcatttta taagccactt 300 tcctttattt tttgattttg ttcttctgtt agtaatgctt caataatagt taataattt 359 <210> 276 <211> 357 <212> DNA <213> Chlamydia <400> 276 aaaacaattg atataatttt ttttttcata acttccagac tcctttctag aaaagtcttt 60 atgggtagta gtgactctaa cgttttttat tattaagacg atccccggag atccttttaa 120 tgatgaaaac ggaaacatcc tttcgccaga aactttagca ctattaaaga atcgttacgg 180 gttagataag cctttattca cccagtatct tatcťatttg aaatgtctgc taacactaga 240 tttcggggaa tctcttatct acaaagatcg aaatctcagc attattgctg ccgctcttcc 300 atcttccgct attcttggac ttgaaagctt gtgtttactc gtgccgaatt cggatcc 357 <210> 277 <211> 505 <212> DNA <213> Chlamydia <400> 277 ggatccgaat tcggcacgag ctcgtgccga ttgcttgctt cagtcacccc atcggtatag 60 agcactaaaa gagactcctc ttcaagaacg agagtgtaag cagggtgagg aggaacttca 120 ggtaaaaatc ctaaggccat accaggatgc gacaggaaag agatatctcc attaggagct 180 cggagacacg ctgggttgtg gccacaagaa tagtattcta gttctcgtgt tgcgtaatga 240 taacaataaa tgcatagtgt tacáaacatc ccagattcag ctgtctgttg atagaagaga 300 gcagctgttt gttgaacggc ttcttgaata gaggagagct cactcaaaaa ggtatgtaac 360 atgtttttca ggaataagga gtaggcgcac gcattgactc ctttcccgga agcatcagca 420 acgattagaa agagtttagc ttggggacct tcgcctataa caaagatatc aaagaaatct 480 cctcctaccg taactgcagg aatat 505 <210> 278 <211> 407 <212> DNA <213> Chlamydia <400> 278 ggatccgaat tcggcacgag aactactgag caaattgggt atccaacttc ctctttacga 60 aagaaaaaca gaaggcattc tccataccaa gatttgttgc atcgacaata aaactccaat 120 ctttggctct gctaactgga gcggtgctgg tatgattaaa aactttgaag acctattcat 180 ccttcgccca attacagaga cacagcttca ggcctttatg gacgtctggt ctcttctaga 240 aacaaatagc tcctatctgt ccccagagag cgtgcttacg gcccctactc cttcaagtag 300 acctactcaa caagatacag attctgatga cgaacaaccg agtaccagcc agcaagctat 360 ccgtatgaga aaataggatt agggaaacaa aacgacagca aaccaca 407 <210> 279 <211> 351 <212> DNA <213> Chlamydia • ·
W Μ i
280 <400> 279 ctcgtgccgc ttacaggagg cttgtatcct ttaaaataga gtttttctta tgaccccatg 60 tggcgatagg ccgggtctag cgccgatagt agaaatatcg .gttggttttt gtccttgagg 120 ggatcgtata ctttttcaaa gtatggtccc cgtatcgatt atctggaggc tcttatgtct 180 ttttttcata ctagaaaata taagcttatc ctcagaggac tcttgtgttt agcaggctgt 240 ttcttaatga acagctgttc ctctagtcga ggaaatcaac ccgctgatga gagcatctat 300 gtcttgtcta tgaatcgcat gatttgtgat tctcgtgccg aattcggatc c 351 <210> 280 <211> 522 <212> DNA <213> Chlamydia <400> 280 ggatccgaat tcggcacgag cagaggaaaa aggcgatact cctcttgaag atcgtttcac 60 agaagatctt tccgaagtct ctggagaaga ttttcgagga ttgaaaaatt cgttcgatga 120 tgattcttct tctgacgaaa ttctcgatgc gctcacaagt aaattttctg atcccacaat 180 aaaggatcta gctcttgatt atctaattca aatagctccc tctgatggga aacttaagtc 240 cgctctcatt caggcaaagc atcaactgat gagccagaat cctcaggcga ttgttggagg 300 acgcaatgtt ctgttagctt cagaaacctt tgcttccaga gcaaatacat ctccttcatc 360 gcttcgctcc ttatatttcc aagtaacctc atccccctct aattgcgcta atttacatca 420 aatgcttgct tcttactcgc catcagagaa aaccgctgtt atggagtttc tagtgaatgg 480 catggtagca gatttaaaat cggagggccc ttccáttcct cc 522 <210> 281 <211> 577 <212> DNA <213> Chlamydia <400> 281 ggatccgaat tcggcacgag atgcttctat tacaattggt ttggatgcgg aaaaagctta 60 ccagcttatt ctagaaaagt tgggagatca aattcttggt ggaattgctg atactattgt 120 tgatagtaca gtccaagata ttttagacaa aatcacaaca gacccttctc taggtttgtt 180 gaaagctttt aacaactttc caatcactaa taaaattcaa tgcaacgggt tattcactcc' 240 caggaacatt gaaactttat taggaggaac tgaaatagga aaattcacag tcacačccaa 300 aagctctggg agcatgttct tagtctcagc agatattatt gcatcaagaa tggaaggcgg 360 cgttgttcta gctttggtac gagaaggtga ttctaagccc tacgcgatta gttatggata 420 ctcatcaggc gttcctaatt tatgtagtct aagaaccaga attattaata caggattgac 480 tccgacaacg tattcattac gtgtaggcgg tttagaaagc ggtgtggtat gggttaatgc 540 cctttctaat ggcaatgata ttttaggaat aacaaat 577 <210> 282
-i -x. cm X.Z.-L J.--' UU / <212> DNA <213> Chlamydia <400> 282 actmatcttc cccgggctcg agtgcggccg caagcttgtc gacggagctc gatacaaaaa 60 tgtgtgcgtg tgaaccgctt cttcaaaagc ttgtcttaaa agatattgtc tcgcttccgg 120 attagttaca tgtttaaaaa ttgctagaac aatattattc ccaaccaagc tctctgcggt 180 gctgaaaaaa cctaaattca aaagaatgac tcgccgctca tcttcagaaa gacgatccga 240 cttccataat tcgatgtctt tccccatggg gatctctgta gggagccagt tatttgcgca 300 gccattcaaa taatgttccc aagcccattt gtacttaata ggaacaagtt ggttgacatc 360 gacctggttg cagttcacta gacgcttgct atttagatta acgcgtttct gttttccatc 420 taaaatatct gcttgcataa gaaccgttaa ttttattgtt aatttatatg attaattact 480 gacatgcttc acacccttct tccaaagaac agacaggtgc tttcttcgct ctttcaacaa 540 taattcctgc cgaagcagac ttattcttca tccaacgagg ctgaattcct ctcttattaa 600 tatctac 607 <210> 283 ' <211> 1077 • · · · • φ · · φ φφφ
281 <212> DNA <213> Chlamydia <400> 283 ggatccgaat tcggcacgag aagttaacga tgacgatttg ttcctttggt agagaaggag 60 caatcgaaac taaatgtgcg agagcatgtg aagactccaa tgcaggaata atcccctcat 120 ttctagtaag caggaaaaaa gctcgtaacg cctcttcatc ggtggctaat gtataaaagg 180 ctcgtcctga ctcatgcatt tcggcatgat ctggcccaac tgaaggataa tctaatccag 240 cggaaatgga gtgagtttgt aatacttgtc catcgtcatc ttgaagaaga tacgaataaa 300 atccgtggaa tactccaggt cgccctgttg caaaacgtgc tgcatgtttt cctgaagaaa 360 tgcccagtcc tcccccttcc actccaatta attggacttt tggattcggg ataaaatgat 420 ggaaaaatcc aatagcgttg gagccacctc cgatacatgc aatcagaata tcaggatctc 480 ttcctgcaac tgcatggatt tgctctttca cttcagcgct tataacagac tgaaaaaatc 540 gaacgatatc gggataaggt aaaggtccta aggccgatcc taagcaatag tgagtaaatg - 600 agtgtgttgt tgcccaatct tgtagagctt gattaactgc atctttgagt ccacaagatc 660 cttttgttac agaaacgact tcagcaccta aaaagcgcat tttctctaca tttggtttct 720 gtcgttccac atcttttgct cccatgtata ctacacaatc taatcctaga taagcacacg 780 ctgttgctgt tgctactcca tgttgtcccg cacctgtttc agctacaaca cgtgttttcc 840 caagatattt agcaagcaaa cactgaccaa gagcattatt cagtttatgt gctcctgtat 900 gcaaaagatc ttcgcgttta agaaatactc tagggccatc aatagctcga gcaaaattct 960 taacttcagt cagaggagtt tgtctccccg catagttttt caaaatacaa tctagttcag 1020 ataaaaaact ttgctgagtt ttgagaatct cccattccgc ttttagattc tgtatag 1077 <210> 284 <211> 407 <212> DNA <213> Chlamydia <400> 284 ggatccgaat tcggcacgag aactactgag caaattgggt atccaacttc ctctttacga 60 aagaaaaaca gaaggcattc tccátaccaa gatttgttgc atcgacaata aaactccaat 120 ctttggctct gctaactgga gcggtgctgg tatgattaaa aactttgaag acctattcat 180 ccttcgccca attacagaga cacagcttca ggcctttatg gacgtctggt ctcttctaga 240 aacaaatagc tcctatctgt ccccagagag cgtgcttacg gcccctactc cttcaagtag 300 acctactcaa caagatacag attctgatga cgaacaaccg agtaccagcc agcaagctat 360 ccgtatgaga aaataggatt agggaaacaa aacgacagca aaccaca 407 <210> 285 <211> 802 <212> DNA <213> Chlamydia <400> 285 ggatccgaat tcggcacgag ttagcttaat gtctttgtca tctctaccta catttgcagc 60 taattctaca ggcacaattg gaatcgttaa tttacgtcgc tgcctagaag agtctgctct 120 tgggaaaaaa gaatctgctg aattcgaaaa gatgaaaaac caattctcta acagcatggg 180 gaagatggag gaagaactgt cttctatcta ttccaagctc caagacgacg attacatgga 240 aggtctatcc.gagaccgcag ctgccgaatt aagaaaaaaa ttcgaagatc tatctgcaga 300 atacaacaca gctcaagggc agtattacca aatattaaac caaagtaatc tcaagcgcat 360 gcaaaagatt atggaagaag.tgaaaaaagc ttctgaaact gtgcgtattc aagaaggctt 420 gtcagtcctt cttaacgaag atattgtctt atctatcgat agttcggcag ataaaaccga 480 tgctgttatt aaagttcttg atgattcttt tcaaaataat taacatgcga agctagccga 540 ggagtgccgt atgtctcaat ccacttattc tcttgaacaa ttagctgatt ttttgaaagt 600 cgagtttcaa ggaaatggag ctactcttct ttccggagtt gaagagatcg aggaagcaaa 660 aacggcacac atcacattct tagataatga aaaatatgct aaacatttaa aatcatcgga 720 agctggcgct atcatcatat ctcgaacaca gtttcaaaaa tatcgagact tgaataaaaa 780 ctttcttatc acttctgagt ct 802 <210> 286 <211> 588 <212> DNA
282 <213> Chlamydia <400> 286 ggatccgaat tcggcacgag gcaatattta ctcccaacat tacggttcca aataagcgat 60 aaggtcttct aataaggaag' ttaatgtaag aggctttttt attgcttttc gtaaggtagt 120 attgcaaccg cacgcgattg aatgatacgc aagccatttc catcatggaa aagaaccctt 180 ggacaaaaat acaaaggagg ttcactccta accagaaaaa gggagagtta gtttccatgg 240 gttttcctta tatacacccg tttcacacaa ttaggagccg cgtctagtat ttggaataca 300 aattgtcccc aagcgaattt tgttcctgtt tcagggattt ctcctaattg ttctgtcagc 360 catccgccta tggtaacgca attagctgta gtaggaagat caactccaaa caggtcatag 420 aaatcagaaa gctcataggt gcctgcagca ataacaacat tcttgtctga gtgagcgaat 480 tgtttaaaag atgggcgatt atgagctacc tcatcagaga ctattttaaa tagatcattt 540 tgggtaatca atccttctat agacCcatat tcatcaatga taatctcg 588 <210> 287 <211> 489 <212> DNA <213> Chlamydia <220>
<221> různévlastnosti <222> 488 <223> n = A,T,cneboG <400> 287 agtgcctatt gttttgcagg ctttgtctga tgatagcgat accgtacgtg agattgctgt 60 acaagtagct gttatgtatg gttctagttg cttactgcgc gccgtgggcg atttagcgaa 120 aaatgattct tctattcaag tacgcatcac tgcttatcgt gctgcagccg tgttggagat 180 acaagatctt gtgcctcatt tacgagttgt agtccaaaat acacaattag atggaacgga 240 aagaagagaa gcttggagat ctttatgtgt tcttactcgg cctcatagtg gtgtattaac 300 tggcatagat caagctttaa tgacctgtga gatgttaaag gaatatcctg aaaagtgtac 360 ggaagaacag attcgtacat tattggctgc agatcatcca gaagtgcagg tagctacttt 420 acagatcatt ctgagaggag gtagagtatt ccggtcatct tctataatgg aatcggttct 480 cgtgccgnt · 489 <210> 288 <211> 191 <212> DNA <213> Chlamydia <400> 288 ggatccgaat tcaggatatg ctgttgggtt atcaataaaa agggttttgc cattttttaa 60 gacgactttg tagataacgc taggagctgt agcaataata tcgagatcaa attctctaga 120 gattctctca aagatgattt ctaagtgcag cagtcctaaa aatccacagc ggaacccaaa 180 tccgagagag t 191 <210> 289 <211> 515 <212> DNA <213> Chlamydia <400> 289 ggatccgaat tcggcacgag gagcgacgtg aaatagtgga atcttcccgt attcttatta 60 cttctgcgtt gccttacgca aatggtcctt tgcattttgg acatattacc ggtgcttatt 120 tgcctgcaga tgtttatgcg cgttttcaga gactacaagg caaagaggtt ttgtatattt 180 gtggttctga tgaatácgga atcgcaatta cccttaatgc agagttggca ggcatggggt 240 atcaagaata tgtcgacatg tatcataagc ttcataaaga taccttcaag aaattgggaa 300 tttctgtaga tttcttttcc agaactacga acgcttatca tcctgctatt gtgcaagatt 360 tctatcgaaa cttgcaggaa cgcggactgg tagagaatca ggtgaccgaa cagctgtatt 420 ctgaggaaga agggaagttt ttagcggacc gttatgttgt aggtacttgt cccaagtgtg 480 ggtttgatcg agctcgagga gatgagtgtc. agcag 515 . » V VO^U / > Ά-Χ Λ. I
283 ·· ···· ·· ·· ·* ···· ·· · · · · · · • ··· · · ··· · · .· <210> 290 <2ll> 522 <212> DNA <213> Chlamydia <4 00> 290 ggatccgaat tcggcacgag ggaggaatgg aagggccctc cgattktama tctgctacca tgccattcac tagaaactcc ataacagcgg ttttctctga tggcgagtaa gaagcaagca tttgatgtaa attagcgcaa ttagaggggg atgaggttac ttggaaatat aaggagcgaa gcgatgaagg agatgtattt gctctggaag caaaggtttc tgaagctaac agaacattgc gtcctccaac aatcgcctga ggattctggc tcatcagttg atgctttgcc tgaatgagag cggacttaag tttcccatca gagggagcta tttgaattag ataatcaaga gctagatcct ttattgtggg atcagaaaat ttacttgtga gcgcatcgag aatttcgtca gaagaagaat catcatcgaa cgaatttttc aatcctcgaa aatcttctcc agagacttcg gaaagatctt ctgtgaaacg atcttcaaga ggagtatcgc ctttttccyc tg <210> 291 <211> 1002 <212> DNA <213> Chlamydia <400> 291 atggcgacta acgcaattag atcggcagga agtgcagcaa gtaagatgct gctgccagtt gccaaagaac cagcggctgt cagctccttt gctcagaaag ggatttattg tattcaacaa ttttttacaa accctgggaa taagttagca aagtttgtag gggcaacaaa aagtttagat aaatgcttta agctaagtaa ggcggtttct gactgtgtcg taggatcgct ggaagaggcg ggátgcacag gggacgcatt gacctccgcg agaaacgccc agggtatgtt aaaaacaact cgagaagttg ttgccttagc taatgtgctc aatggagctg ttccatctat cgttaactcg actcagaggt gttaccaata cacacgtcaa gccttcgagt taggaagcaa gacaaaagaa agaaaaacgc ctggggagta tagtaaaatg ctattaactc gaggtgatta cctattggca gcttccaggg aagcttgtac ggcagtcggt gcaacgactt actcagcgac attcggtgtt ttacgtccgt taatgttaat caataaactc acagcaaaac cattcttaga caaagcgact gtaggcaatt ttggcacggc tgttgctgga attatgacca ttaatcatat ggcaggagtt gctggtgctg ttggcggaat cgcattagaa caaaagctgt tcaaacgtgc gaaggáatcc ctatacaatg agagatgtgc cttagaaaac caacaatctc agttgagtgg ggacgtgatt ctaagcgcgg aaagggcatt acgtaaagaa eacgttgcta ctctaaaaag aaatgtttta actcttcttg aaaáagcttt agagttggta gtggatggag tcaaactcat tcctttaccg attacagtgg cttgctccgc tgcaatttct ggagccttga cggcagcatc cgcaggaatt ggcttatata gcatatggca gaaaacaaag tctggcaaat aa <210> 292 <211> 333 .
<212> PRT <213> Chlamydia
120
180
240
300
360
420
480
522
120
180
240
300
360
420
480
540
600
660
720
780
840
900
960
1002 <400> 292
| Met | Ala | Thr | Asn | Ala | Ile | Arg | Ser | Ala | Gly | Ser | Ala | Ala | Ser | Lys | Met |
| 1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
| Leu | Leu | Pro | Val | Ala | Lys | Glu | Pro | Ala | Ala | Val | Ser | Ser | Phe | Ala | Gin |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Lys | Gly | Ile | Tyr | Cys | Ile | Gin | Gin | Phe | Phe | Thr | Asn | Pro | Gly | Asn | Lys |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Leu | Ala | Lys | Phe | Val | Gly | Ala | Thr | Lys | Ser | Leu | Asp | Lys | Cys | Phe | Lys |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Leu | Ser | Lys | Ala | Val | Ser | Asp | Cys | Val | Val | Gly | Ser | Leu | Glu | Glu | Ala |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Gly | Cys | Thr | Gly | Asp | Ala | Leu | Thr | Ser | Ala | Arg | Asn | Ala | Gin | Gly | Met |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Leu | Lys | Thr | Thr | Arg | Glu | Val | Val | Ala | Leu | Ala | Asn | Val | Leu | Asn | Gly |
| 100 | 105 | 110 |
I ««· ·· ·· ·· » · · · · · »·· · · ··· · ·
284
| Ala | Val | Pro | Ser | Ile | Val | Asn | Ser | Thr | Gin | Arg | Cys | Tyr | Gin | Tyr | Thr |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Arg | Gin | Ala | Phe | Glu | Leu | Gly | Ser | Lys | Thr | Lys | Glu | Arg | Lys | Thr | Pro |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Gly | Glu | Tyr | Ser | Lys | Met | Leu | Leu | Thr | Arg | Gly | Asp | Tyr | Leu | Leu | Ala |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Ala | Ser | Arg | Glu | Ala | Cys | Thr | Ala | Val | Gly | Ala | Thr | Thr | Tyr | Ser | Ala |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Thr | Phe | Gly | Val | Leu | Arg | Pro | Leu | Met | Leu | Ile | Asn | Lys | Leu | Thr | Ala |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Lys | Pro | Phe | Leu | Asp | Lys | Ala | Thr | Val | Gly | Asn | Phe | Gly | Thr | Ala | Val |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Ala | Gly | Ile | Met | Thr | Ile | Asn | His | Met | Ala | Gly | Val | Ala | Gly | Ala | Val |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Gly | Gly | Ile | Ala | Leu | Glu | Gin | Lys | Leu | Phe | Lys | Arg | Ala | Lys | Glu | Ser |
| 225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
| Leu | Tyr | Asn | Glu | Arg | Cys | Ala | Leu | Glu | Asn | Gin | Gin | Ser | Gin | Leu | Ser |
| 245 | 250 | 255 | |||||||||||||
| Gly | Asp | Val | Ile | Leu | Ser | Ala | Glu | Arg | Ala | Leu | Arg | Lys | Glu | His | Val |
| 260 | 265 | 270 | |||||||||||||
| Ala | Thr | Leu | Lys | Arg | Asn | Val | Leu | Thr | Leu | Leu | Glu | Lys | Ala | Leu | Glu |
| 275 | 280 | 285 | |||||||||||||
| Leu | Val | Val | Asp | Gly | Val | Lys | Leu | Ile | Pro | Leu | Pro | Ile | Thr | Val | Ala |
| < | 290 | 295 | 300 | ||||||||||||
| Cys | Ser | Ala | Ala | Ile | Ser | Gly | Ala | Leu | Thr | Ala | Ala | Ser | Ala | Gly | Ile |
| 305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
| Gly | Leu | Tyr | Ser | Ile | Trp | Gin | Lys | Thr | Lys | Ser | Gly | Lys | |||
| 325 | 330 | ||||||||||||||
| <210> 293 | |||||||||||||||
| <211> 7 | |||||||||||||||
| <212> DNA | |||||||||||||||
| <213> Chlamydia | |||||||||||||||
| <400> 293 | |||||||||||||||
| tgcaatc | |||||||||||||||
| <210> 294 | |||||||||||||||
| <211> 196 | |||||||||||||||
| <212> PRT | |||||||||||||||
| <213> Chlamydia | |||||||||||||||
| S A ΠΠ'χ 0 0.3 | |||||||||||||||
| -x *3 A_/ ~S~2 | |||||||||||||||
| Thr | Met | Gly | Ser | Leu | Val | Gly | Arg | Gin | Ala | Pro | Asp | Phe | Ser | Gly | Lys |
| 5 | 10 | 15 | |||||||||||||
| Ala | Val | Val | Cys | Gly | Glu | Glu | Lys | Glu | Ile | Ser | Leu | Ala | Asp | Phe | Arg |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Gly | Lys | Tyr | Val | Val | Leu | Phe | Phe | Tyr | Pro | Lys | Asp | Phe | Thr | Tyr | Val |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Cys | Pro | Thr | Glu | Leu | His | Ala | Phe | Gin | Asp | Arg | Leu | Val | Asp | Phe | Glu |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Glu | His | Gly | Ala | Val | Val | Leu | Gly | Cys | Ser | Val | Asp | Asp | Ile | Glu | Thr |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| His | Ser | Arg | Trp | Leu | Thr | Val | Ala | Arg | Asp | Ala | Gly | Gly | Ile | Glu-Gly | |
| 85 | 90 | 95 |
·· ·«*· ·· ·· • · « · · , · · • ··· · · ··· ·' · · ·· ··· ·
285
| Thr Glu Tyr | Pro Leu 100 | Leu Ala Asp Pro Ser Phe Lys 105 | Ile | Ser 110 | Glu | Ala | |||||||||
| Phe | Gly | Val | Leu | Asn | Pro | Glu | Gly | Ser | Leu | Ala | Leu | Arg | Ala | Thr | Phe |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Leu | Ile | Asp | Lys | His | Gly | Val | Ile | Arg | His | Ala | Val | Ile | Asn | Asp | Leu |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Pro | Leu | Gly | Arg | Ser | Ile | Asp | Glu | Glu | Leu | Arg | Ile | Leu | Asp | Ser | Leu |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Ile | Phe | Phe | Glu | Asn | His | Gly | Met | Val | Cys | Pro | Ala | Asn | Trp | Arg | Ser |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Gly | Glu | Arg | Gly | Met | Val | Pro | Ser | Glu | Glu | Gly | Leu | Lys | Glu | Tyr | Phe |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Gin | Thr | Met | Asp |
195 <210> 295 <211> 181 <212> PRT <213> Chlamydia <400> 295
| Lys | Gly | Gly | Lys | Met 5 | Ser | Thr | Thr | Ile | Ser 10 | Gly | Asp | Ala' | Ser | Ser 15 | Leu |
| Pro | Leu | Pro | Thr 20 | Ala | Ser | Cys | Val | Glu 25 | Thr | Lys | Ser | Thr | Ser 30 | Ser | Ser |
| Thr | Lys | Gly 35 | Asn | Thr | Cys | Ser | Lys 40 | Ile | Leu | Asp | Ile | Ala 45 | Leu | Ala | Ile |
| Val | Gly 50 | Ala | Leu | Val | Val | Val 55 | Ala | Gly | Val | Leu | Ala 60 | Leu | Val | Leu | Cys |
| Ala 65 | Ser | Asn | Val | Ile | Phe 70 | Thr | Val | Ile | Gly | ile 75 | Pro | Ala | Leu | Ile | Ile 80 |
| Gly | Sér | Ala | Cyš‘ | ’tVal | Gly | Ala | Gly | Ile | Ser 90 | Arg | Leu | Met | Tyr | Arg 95 | Ser |
| Ser | Tyr | Ala | Ser 100 | Leu | Glu | Ala | Lys | Asn 105 | Val | Leu | Ala | Glu | Gin 110 | Arg | Leu |
| Arg | Asn | Leu 115 | Ser | Glu | Glu | Lys | Asp 120 | Ala | Leu | Ala | Ser | Val 125 | Ser | Phe | Ile |
| Asn | Lys 130 | Met | Phe | Leu | Arg | Gly 135 | Leu | Thr | Asp | Asp | Leu 140 | Gin | Ala | Leu | Glu |
| Ala 145 | Lys | Val | Met | Glu | Phe 150 | Glu | .Ile | Asp | Cys | Leu 155 | Asp | Arg | Leu | Glu | Lys 160 |
| Asn | Glu | Gin | Ala | Leu | Leu | Ser Asp | Val | Arg | Leu | Val | Leu | Ser | Ser | Tyr |
165 170 175
9999
9· 9 9 · 99 9 9 •9 99
9 9 . 9 999
286
| Thr Arg Trp | Leu 180 | Asp | |||||||||||
| <210> 296 <211> 124 <212> PRT <213> Chlamydia | |||||||||||||
| <400> 296 Ile Tyr Glu | Val | Met 5 | Asn | Met | Asp | Leu | Glu 10 | Thr | Arg | Arg | Ser | Phe 15 | Ala |
| Val Gin Gin. | Gly 20 | His | Tyr | Gin | Asp | Pro 25 | Arg | Ala | Ser | Asp | Tyr 30 | Asp | Leu |
| Pro Arg Ala 35 | Ser | Asp | Tyr | Asp | Leu 40 | Pro | Arg | Ser | Pro | Tyr 45 | Pro | Thr | Pro |
| Pro Leu Pro 50 | Ser | Arg | Tyr | Gin 55 | Leu | Gin | Asn | Met | Asp 60 | Val | Glu | Ala | Gly |
| Phe Arg Glu '65 | Ala | Val | Tyr 70 | Ala | Ser | Phe | Val | Ala 75 | Gly | Met | Tyr | Asn | Tyr 80 |
| Val Val Thr | Gin | Pro 85 | Gin | Glu | Arg | Ile | Pro 90 | Asn | Ser | Gin | Gin | Val 95 | Glu |
| Gly Ile Leu | Arg 100 | Asp | Met | Leu | Thr | Asn 105 | Gly | Ser | Gin | Thr | Phe 110 | Ser | Asn |
| Leu Met Gin | Arg | Trp | Asp | Arg | Glu | Val | Asp | Arg | Glu |
115 120 <210> 297 <211> 488 <212> PRT <213> Chlamydia <400> 297
| Lys | Gly | Ser | Leu | Pro 5 | Ile | Leu | Gly | Pro | -Phe 10 | Leu | Asn | Gly | Lys | Met 15 | Gly |
| Phe | Trp | Arg | Thr 20 | Ser | Ile' | Met | Lys | Met 25 | Asn | Arg | Ile | Trp | Leu 30 | Leu | Leu |
| Leu | Thr | Phe 35 | Ser | Ser | Ala | Ile | His 40 | Ser | Pro | Val | Arg | Gly 45 | Glu | Ser | Leu |
| Val | Cys 50 | Lys | Asn | Ala | Leu | Gin 55 | Asp | Leu | Ser | Phe | Leu 60 | Glu | His | Leu | Leu |
| Gin 65 | Val | Lys | Tyr | Ala | Pro 70 | Lys | Thr | Trp | Lys | Glu 75 | Gin | Tyr | Leu | Gly | Trp 80 |
| Asp | Leu | Val | Gin | Ser 85 | Ser | Val | Ser | Ala | Gin 90 | Gin | Lys | Leu | Arg | Thr 95 | Gin |
| Glu | Asn | Pro | Ser | Thr | Ser | Phe | Cys | Gin | Gin | Val | Leu | Ala | Asp | Phe | Ile |
100 105 HO ·· to to·* to -toto • to ·· • * • to
• · to w · to
287
| Gly | Gly | Leu 115 | Asn | Asp | Phe | His | Ala 120 | Gly | Val | Thr | Phe | Phe 125 | Ala | Ile | Glu |
| Ser | Ala 130 | Tyr | Leu | Pro | Tyr | Thr 135 | Val | Gin | Lys | Ser | Ser 140 | Asp | Gly | Arg | Phe |
| Tyr 145 | Phe | Val | Asp | Ile | Met 150 | Thr | Phe | Ser | Ser | Glu 155 | Ile | Arg | Val | Gly | Asp 160 |
| Glu | Leu | Leu | Glu | Val 165 | Asp | Gly | Ala | Pro | Val 170 | Gin | Asp | Val | Leu | Ala 175 | Thr |
| Leu | Tyr | Gly | Ser 180 | Asn | His | Lys | Gly | Thr 185 | Ala | Ala | Glu | Glu | Ser 190 | Ala | Ala |
| Leu | Arg | Thr 195 | Leu | Phe | Ser | Arg | Met 200 | Ala | Ser | Leu | Gly | His 205 | Lys | Val | Pro |
| Ser | Gly 210 | Arg | Thr | Thr | Leu | Lys 215 | .Ile | Arg | Arg | Pro | Phe 220 | Gly | Thr | Thr | Arg |
| Glu 225 | Val | Arg | Val | Lys | Trp 230 | Arg | Tyr | Val | Pro | Glu 235 | Gly | Val | Gly | Asp | Leu 240 |
| Ala | Thr | Ile | Ala | Pro 245 | Ser | Ile | Arg | Ala | Pro 250 | Gin | Leu | Gin | Lys | Ser 255 | Met |
| Arg | Ser | Phe | Phe 260 | Pro | Lys | Lys | Asp | Asp Ala 265 | Phe | His | Arg | Ser 270 | Ser | Ser | |
| Leu | Phe | Tyr 275 | Ser | Pro | Met | Val | Pro 280 | His | Phe | Trp | Ala | Glu 285 | Leu | Arg | Asn |
| His | Tyr 290 | Ala | Thr | Ser | Gly | Leu 295 | Lys | Ser | Gly | Tyr | Asn 300 | Ile | Gly | Ser | Thr |
| Asp 305 | Gly | Phe | Leu | Pro | Val 310 | Ile | Gly | Pro | Val | Ile 315 | Trp | Glu | Ser | Glu | Gly 320 |
| Leu | Phe | Arg | Ala | Tyr 325 | Ile | Ser | Ser | Val | Thr 330 | Asp | Gly | Asp | Gly | Lys 335 | Ser |
| His | Lys | Val | Gly 340 | Phe | Leu | Arg | Ile | Pro 345 | Thr | Tyr | Ser | Trp | Gin 350 | Asp | Met |
| Glu | Asp | Phe 355 | Asp | Pro | Ser | Gly | Pro 360 | Pro | Pro | Trp | Glu | Glu 365 | Phe | Ala | Lys |
| Ile | Ile 370 | Gin | Val | Phe | Ser | Ser 375 | Asn | Thr | Glu | Ala | Leu 380 | Ile | Ile | Asp | Gin |
| Thr 385 | Asn | Asn | Pro | Gly | Gly 390 | Ser | Val | Leu | Tyr | Leu 395 | Tyr | Ala | Leu | Leu | Ser 4Ό0 |
| Met | Leu | Thr | Asp | Arg 405 | Pro | Leu | Glu | Leu | Pro 410 | Lys | His | Arg | Met | Ile 415 | Leu |
| Thr | Gin | Asp | Glu 420 | Val | Val | Asp | Ala | Leu 425 | Asp | Trp | Leu | Thr | Leu 430 | Leu | Glu |
• 0 »000 • · • 00»
0» 00 0 0« 0
0 ·0· 0 • « * «9 « • 0 0 0 *
0» 00 • 0 ···<
' 0
288
| Asn | Val | Asp 435 | Thr | Asn | Val | Glu | Ser 440 | Arg | Leu | Ala | Leu | Gly 445 | Asp | Asn | Met |
| Glu | Gly 450 | Tyr | Thr | Val | Asp | Leu 455 | Gin | Val | Ala | Glu | Tyr 460 | Leu | Lys | Ser | Phe |
| Gly 465 | Arg | Gin | Val | Leu | Asn 470 | Cys | Trp | Ser | Lys | Gly 475 | Asp | Ile | Glu | Leu | Ser 480 |
| Thr | Pro | Ile | Pro | Leu | Phe | Gly | Phe |
485 <210> 298 <211> 140 <212> PRT <213> Chlamydia
| <400> 298 | • | ||||||||||||||
| Arg | Ile | Asp | Ile | Ser. | Ser | Val | Thr | Phe | Phe | Ile | Gly | Ile | Leu | Leu | Ala |
| 5 | 10 | 15 | |||||||||||||
| Val | Asn | Ala | Leu | Thr | Tyr | Ser | His | Val | Leu | Arg | Asp | Leu | Ser | Val | Ser |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Met | Asp | Ala | Leu | Phe | Ser | Arg | Asn | Thr | Leu | Ala | Val | Leu | Leu | Gly | Leu |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Val | Ser | Ser | Val | Leu | Asp | Asn | Val | Pro | Leu | Val | Ala | Ala | Thr | Ile | Gly |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Met | Tyr | Asp | Leu | Pro | Met | Asn | Asp | Pro | Leu | Trp | Lys | Leu | Ile | Ala | Tyr |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Thr | Ala | Gly | Thr | Gly | Gly | Ser | Ile | Leu | Ile | Ile | Gly | Ser | Ala | Ala | Gly |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Val | Ala | Tyr | Met | Gly | Met | Glu | Lys | Val | Ser | Phe | Gly | Trp | Tyr | Val | Lys |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| His | Ala | Ser | Trp | Ile | Ala | Leu | Ala | Ser | Tyr | Phe | Gly | Gly | Leu | Ala | . Val |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Tyr | Phe | Leu | Met | Glu | Asn | Cys | Val | Asn | Leu | Phe | Val |
130 135 140 <210> 299 <211> 361 <212> PRT <213> Chlamydia
| <400> 299 | ||||||||||||||
| His | Gin Glu | Ile | Ala | Asp | Ser. | Pro | Leu | Val | Lys | Lys | Ala | Glu | Glu | Gin |
| 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
| Ile | Asn Gin | Ala | Gin | Gin | Asp | Ile | Gin | Thr | Ile | Thr | Pro | Ser | Gly | Leu |
| 20 | 25 | 30 | ||||||||||||
| Asp | Ile Pro | Ile | Val | Gly | Pro | Ser | Gly | Ser | Ala | Ala | Ser | Ala | Gly | Ser |
| 35 | 40 | 45 |
289
| Ala | Ala 50 | Gly | Ala | Leu | Lys | Ser 55 | Ser Asn Asn | Ser Gly. Arg 60 | Ile | Ser | Leu |
| Leu | Leu | Asp | Asp | Val | Asp | Asn | Glu Met Ala | Ala Ile Ala | Met | Gin | Gly |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||
| Phe | Arg | Ser | Met | Ile | Glu | Gin | Phe Asn Val | Asn Asn Pro | Ala | Thr | Ala |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||
| Lys | Glu | Leu | Gin | Ala | Met | Glu | Ala Gin Leu | Thr Ala Met | Ser | Asp | Gin |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||
| Leu | Val | Gly | Ala | Asp | Gly | Glu | Leu Pro Ala | Glu Ile Gin | Ala | Ile | Lys |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||
| Asp | Ala | Leu | Ala | Gin | Ala | Leu | Lys Gin Pro | Ser Ala Asp | Gly | Leu | Ala |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||
| Thr | Ala | Met | Gly | Gin | Val | Ala | Phe Ala Ala | Ala Lys Val | Gly | Gly | Gly |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||
| Ser | Ala | Gly | Thr | Ala | Gly | Thr | Val Gin Met | Asn Val Lys | Gin | Leu | Tyr |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||
| Lys | Thr | Ala | Phe | Ser | Ser | Thr | Ser Ser Ser | Ser Tyr Ala | Ala | Ala | Leu |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||
| Ser | Asp | Gly | Tyr | Ser | Ala | Tyr | Lys Thr Leu | Asn Ser Leu | Tyr | Ser | Glu |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||
| Ser | Arg | Ser | Gly | Val | Gin | Ser | Ala Ile Ser | Gin Thr Ala | Asn | Pro | Ala |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||
| Leu | Ser | Arg | Ser | Val | Ser | Arg | Ser Gly Ile | Glu Ser Gin | Gly Arg | Ser | |
| 225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||
| Ala | Asp | Ala | Ser | Gin | Arg | Ala | Ala Glu Thr | Ile Val Arg | Asp | Ser | Gin |
| 245 | 250 | 255 | |||||||||
| Thr | Leu | Gly | Asp | Val | Tyr | Ser | Arg Leu Gin | Val Leu Asp | Ser | Leu | Met |
| 260 | 265 | 270 | |||||||||
| Ser | Thr | Ile | Val | Ser | Asn | Pro | Gin Ala Asn | Gin Glu Glu | Ile | Met | Gin |
| 275 | 280 | 285 | |||||||||
| Lys | . Leu | Thr | Ala | Ser | Ile | Ser | Lys Ala Pro | Gin Phe Gly | Tyr | Pro | Ala |
| 290 | 295 | 300 | |||||||||
| Val | Gin | Asn | Ser | Val | Asp | Ser | Leu Gin Lys | Phe Ala Ala | Gin | Leu | Glu |
| 305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||
| Arg | Glu | Phe | Val | Asp | Gly | Glu | Arg Ser Leu | Ala Glu Ser | Gin | Glu | Asn |
| 325 | 330 | 335 | |||||||||
| Ala | Phe | Arg | Lys | Gin | Pro | Ala | Phe Ile Gin | Gin Val Leu | Val | Asn | Ile |
| 340 | 345 | 350 | |||||||||
| Ala | Ser | Leu | Phe | Ser | Gly | Tyr | Leu Ser |
355 360
29ο <210> 300 <211> 207 <212> PRT
| <213> Chlamydia | |||||||||||||||
| <400> 300 | |||||||||||||||
| Ser | Ser | Lys | Ile | Val | Ser | Leu | Cys | Glu | Gly | Ala | Val | Ala | Asp | Ala | Arg |
| 5 | 10 | 15 | |||||||||||||
| Met | Cys | Lys | Ala | Glu | Leu | Ile | Lys | Lys | Glu | Ala | Asp | Ala | Tyr | Leu | Phe |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Cys | Glu | Lys | Ser | Gly | Ile | Tyr | Leu | Thr· | Lys | Lys | Glu | Gly | Ile | Leu | Ile |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Pro | Ser | Ala | Gly | Ile | Asp | Glu | Ser | Asn | Thr | Asp | Gin | Pro | Phe | Val | Leu |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Tyr | Pro | Lys | Asp | Ile | Leu | Gly | Ser | Cys | Asn Arg | Ile | Gly | Glu | Trp | Leu | |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Arg | Asn | Tyr | Phe | Arg | Val | Lys | Glu | Leu | Gly | Val | Ile | Ile | Thr | Asp | Ser |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| His | Thr | Thr | Pro | Met | Arg | Arg | Gly | Val | Leu | Gly | Ile | Gly | Leu | Cys | Trp |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Tyr | Gly | Phe | Ser | Pro | Leu | His | Asn | Tyr | Ile | Gly | Ser | Leu | Asp | Cys | Phe |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Gly | Arg | Pro | Leu | Gin | Met | Thr | Gin | Ser | Asn | Leu | Vál | Asp | Ala | Leu | Ala |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Val | Ala | Ala | Val | Val | Cys | Met | Gly | Glu | Gly | Asn | Glu | Gin | Thr | Pro | Leu |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Ala | Val | Ile | Glu | Gin | Ala | Pro | Asn | Met | Val | Tyr | His | Ser | Tyr | Pro | Thr |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Ser | Arg | Glu | Glu | Tyr | Cys | Ser | Leu | Arg | Ile | Asp | Glu | Thr | Glu | Asp | Leu |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Tyr | Gly | Pro | Phe | Leu | Gin | Ala | Val | Thr | Trp | Ser | Gin | Glu | Lys | Lys | |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| <210> 301 | |||||||||||||||
| <211> 183 | |||||||||||||||
| <212> PRT | |||||||||||||||
| <213> Chlamydia | |||||||||||||||
| <400> 301 | |||||||||||||||
| Ile | Pro | Pro | Ala | Pro | Arg | Gly | His | Pro | Gin | Ile | Glu | Val | Thr | Phe | Asp |
| 5 | 10 | 15 | |||||||||||||
| Ile | Asp | Ala | Asn | Gly | Ile | Leu | His | Val | Ser | Ala | Lys | Asp | Ala | Ala | Ser |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Gly | Arg | Glu | Gin | Lys | Ile | Arg | Ile | Glu | Ala | Ser | Ser | Gly | Leu | Lys | Glu |
40 45 • ·
291
| Asp Glu | Ile | Gin | Gin | Met Ile 55 | Arg | Asp | Ala | Glu | Leu 60 | His | Lys | Glu | Glu | ||
| 50 | |||||||||||||||
| Asp | Lys | Gin | Arg | Lys | Glu | Ala | Ser | Asp | Val | Lys | Asn | Glu | Ala | Asp | Gly |
| 65' | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Met | Ile | Phe | Arg | Ala | Glu | Lys | Ala | Val | Lys | Asp | Tyr | His | Asp | Lys | Ile |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Pro | Ala | Glu | Leu | Val | Lys | Glu | Ile | Glu | Glu | His | Ile | Glu | Lys | Val | Arg |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Gin | Ala | Ile | Lys | Glu | Asp | Ala | Ser | Thr | Thr | Ala | Ile | Lys | Ala | Ala | Ser |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Asp | Glu | Leu | Ser | Thr | Arg | Met | Gin | Lys | Ile | Gly | Glu | Ala | Met | Gin | Ala |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Gin | Ser | Ala | Ser | Ala | Ala | Ala | Ser | Ser | Ala | Ala | Asn | Ala | Gin | Gly | Gly |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Pro | Asn | Ile | Asn | Ser | Glu | Asp | Leu | Lys | Lys | His | Ser | Phe | Ser. | Thr | Arg |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Pro | Pro | Ala | Gly | Gly | Ser | Ala |
180 <210> 302 <211> 232 <212> PRT <213> Chlamydia <400> 302
| Met | Thr | Lys | His | Gly 5 | Lys | Arg | Ile | Arg | Gly 10 | Ile | Gin | Glu | Thr | Tyr 15 | Asp |
| Leu | Ala | Lys | Ser 20 | Tyr | Ser | Leu | Gly | Glu 25 | Ala | Ile | Ásp | Ile | Leu 30 | Lys | Gin |
| Cys | Pro | Thr 35 | Val | Arg | Phe | Asp | Gin 40 | Thr | Val | Asp | Val | Ser 45 | Val. | Lys | Leu |
| Gly | Ile 50 | Asp | Pro | Arg | Lys | Ser 55 | Asp | Gin | Gin | Ile | Arg 60 | Gly | Ser | Val | Ser |
| Leu 65 | Pro | His | Gly Thr | Gly 70 | Lys | Val | Leu | Arg | Ile 75 | Leu | Val | Phe | Ala | Ala 80 | |
| Gly | Asp | Lys | Ala | Ala 85 | Glu | Ala | Ile | Glu | Ala 90 | Gly | Ala | Asp | Phe | Val 95 | Gly |
| Ser | Asp | Asp | Leu 100 | Val | Glu | Lys | Ile | Lys 105 | Gly | Gly Trp | Val | Asp 110 | Phe | Asp | |
| Val | Ala | Val 115 | Ala | Thr | Pro | Asp | Met 120 | Met | Arg | Glu | Val | Gly 125 | Lys | Leu | Gly |
| Lys | Val 130 | Leu | Gly | Pro | Arg | Asn 135 | Leu | Met | Pro | Thr | Pro 140 | Lys | Ala | Gly | Thr |
• ·
1292
| Val | Thr | Thr | Asp | Val | Val | Lys | Thr | Ile | Ala | Glu | Leu | Arg | Lys | Gly | Lys |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Ile | Glu | Phe | Lys | Ala | Asp | Arg | Ala | Gly | Val | Cys | Asn | Val | Gly | Val | Ala |
| 165 | 17 0 | 175 | |||||||||||||
| Lys | Leu | Ser | Phe | Asp | Ser | Ala | Gin | Ile | Lys | Glu | Asn | Val | Glu | Ala | Leu |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Cys | Ala | Ala | Leu | Val | Lys | Ala | Lys | Pro | Ala | Thr | Ala | Lys | Gly | Gin | Tyr |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Leu | Val | Asn | Phe | Thr | Ile | Ser | Ser | Thr | Met | Gly | Pro | Gly | Val | Thr | Val |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Asp | Thr | Arg | Glu | Leu | Ile | Ala | Leu | / |
225 230 <210> 303 <2ll> 238 <'212> PRT <213> chlamydia <400> 303
| Ile | Asn | Ser | Lys | Leu 5 | Glu | Thr | Lys | Asn | Leu 10 | Ile | Tyr | Leu | Lys | Leu 15 | Lys |
| Ile | Lys | Lys | Ser 20 | Phe | Lys | Met | Gly | Asn 25 | Ser | Gly | Phe | Tyr | Leu 30 | Tyr | Asn |
| Thr | Gin | Asn 35 | Cys | Val | Phe | Ala | Asp 40 | Asn | Ile | Lys | Val | Gly 45 | Gin | Met | Thr |
| Glu | Pro 50 | Leu | Lys | Asp | Gin | Gin 55 | Ile | Ile | Leu | Gly | Thr 60 | Thr | Ser | Thr | Pro |
| Val 65 | Ala | Ala | Lys | Met | Thr 70 | Ala | Ser | Asp | Gly | Ile 75 | Ser | Leu | Thr | Val | Ser 80 |
| Asn | Asn | Pro | Ser | Thr 85 | Asn | Ala | Ser | Ile | Thr 90 | Ile | Glv | Leu | Asp | Ala 95 | Glu |
| Lys | Ala | Tyr | Gin 100 | Leu | Ile | Leu | Glu | Lys 105 | Leu | Gly | Asp | Gin | Ile 110 | Leu | Gly |
| Gly | Ile | Ala 115 | Asp | Thr | Ile | Val | Ašp 120 | Ser | Thr | Val | Gin | Asp 125 | Ile | Leu | Asp |
| Lys | Ile 130 | Thr | Thr | Asp | Pro | Ser 135 | Leu | Gly | Leu | Leu | Lys 140 | Ala | Phe | Asn | Asn |
| Phe 145 | Pro | Ile | Thr | Asn | Lys 150 | Ile | Gin | Cys | Asn | Gly 155 | Leu | Phe | Thr | Pro | Arg 160 |
| Asn | Ile | Glu | Thr | Leu 165 | Leu | Gly | Gly | Thr | Glu 170 | Ile | Gly | Lys | Phe | Thr 175 | Val |
| Thr | Pro | Lys | Ser | Ser | Gly | Ser | Met | Phe | Leu | Val | Ser | Ala | Asp | Ile | Ile |
180 185 190
293 • ···
| Ala Ser Arg Met Glu Gly Gly Val Val | |
| 195 | 200 |
| Asp Ser Lys Pro Tyr | Ala Ile Ser Tyr |
| 210 | 215 |
| Asn Leu Cys Ser Leu | Arg Thr Arg Ile |
| 225 | 230 |
| Leu | Ala | Leu | Val 205 | Arg | Glu | Gly |
| Gly | Tyr | Ser 220 | Ser | Gly | Val | Pro |
| Ile | Asn 235 | Thr | Gly | Leu |
<210> 304 <211> 133 <212> PRT <213> Chlamydia
| <400> 304 | His 5 | His | His | His | Met Ala Ser 10 | Ile | Cys | Gly | Arg 15 | Leu | |||||
| His | Met | His | His | ||||||||||||
| Gly | Ser | Gly | Thr 20 | Gly | Asn | Ala | Leu | Lys 25 | Ala | Phe | Phe | Thr | Gin 30 | Pro | Ser |
| Asn | Lys | Met 35 | Ala | Arg | Val | Val | Asn 40 | Lys | Thr | Lys | Gly | Met 45 | Asp | Lys | Thr |
| Val | Lys 50 | Val | Ala | Lys | Ser | Ala 55 | Ala | Glu | Leu | Thr | Ala 60 | Asn | Ile | Leu | Glu |
| Gin 65 | Ala | Gly | Gly | Ala | Gly 70 | Ser | Ser | Ala | His | Ile 75 | Thr | Ala | Ser | Gin | Val 80 |
| Ser | Lys | Gly | Leu | Gly 85 | Asp | Thr | Arg | Thr | Val 90 | Val | Ala | Leu | Gly | Asn 95 | Ala |
| Phe | Asn | Gly | Ala 100 | Leu | Pro | Gly | Thr | Val 105 | Gin | Ser | Ala | Gin | Ser 110 | Phe | Phe |
| Ser | His | Met 115 | Lys | Ala | Ala | Ser | Gin 120 | Lys | Thr | Gin | Glu | Gly Asp 125 | Glu | Gly | |
| Leu | Thr | Ala | Asp | Leu |
130 <210> 305 <211> 125 <212> PRT <213> Chlamydia
| <400> 305 | |||||||||||||||
| Met | Ala | Ser | Ile | Cys 5 | Gly | Arg | Leu | Gly | Ser 10 | Gly | Thr | Gly | Asn | Ala 15 | Leu |
| Lys | Ala | Phe | Phe 20 | Thr | Gin | Pro | Ser | Asn 25 | Lys | Met | Ala | Arg | Val 30 | Val | Asn |
| Lys | Thr | Lys 35 | Gly | Met | Asp | Lys | Thr 40 | Val | Lys | Val | Ala | Lys 45 | Ser | Ala | Ala |
| Glu | Leu 50 | Thr | Ala | Asn | Ile | Leu 55 | Glu | Gin | Ala | Gly | Gly 60 | Ala | Gly | Ser | Ser |
• ·· · • 94 9
294
| Ala 65 | His | Ile | Thr | Ala | Ser 70 | Gin | Val | Ser | Lys | Gly 75 | Leu | Gly | Asp | Thr | Arg 80 |
| Thr | Val | Val | Ala | Leu 85 | Gly | Asn | Ala | Phe | Asn 90 | Gly | Ala | Leu | Pro | Gly 95 | Thr |
| Val | Gin | Ser | Ala 100 | Gin | Ser | Phe | Phe | Ser 105 | His | Met | Lys | Ala | Ala 110 | Ser | Gin |
| Lys | Thr | Gin 115 | Glu | Gly | Asp | Glu | Gly 120 | Leu | Thr | Ala | Asp | Leu 125 |
<210> 306 <211> 38 <212> DNA <213> Chlamydia trachomatis <400> 306 gagagcggcc gctcatgttt ataacaaagg aacttatg 38 <210> 307 <211> 39 <212> DNA <213> Chlamydia trachomatis <400> 307 gagagcggcc gcttacttag gtgagaagaa gggagtttc 39 <210> 308 <211> 1860 <212> DNA <213> Chlamydia trachomatis <400> 308 atgcatcacc atcaccatca cacggccgcg tccgataact tccagctgtc ccagggtggg 60 cagggattcg ccattccgat cgggcaggcg atggcgatcg cgggccagat caagcttccc 120 accgttcata tcgggcctac cgccttcctc ggcttgggtg ttgtcgacaa caacggcaac 180 ggcgcacgag tccaacgcgt ggtcgggagc gctccggcgg caagtctcgg catctccacc 240 ggcgacgtga tcaccgcggt cgacggcgct ccgatcaact cggccaccgc qatqqcggac 300 gcgcttaacg ggcatcatcc cggtgacgtc atctcggtga cctggcaaac caagtcgggc 360 ggcacgcgta cagggaacgt gacattggcc gagggacccc cggccgaatt ctgcagatat 420 ccatcacact ggcggccgct catgtttata acaaaggaac ttatgaatcg agttatagaa 480 atccatgctc actacgatca aagacaactt tctcaatctc caaatacaaa cttcttagta 540 catcatcctt atcttactct tattcccaag tttctactag gagctctaat cgtctatgct 600 ccttattcgt ttgcagaaat ggaattagct atttctggac ataaacaagg taaagatcga 660 gataccttta ccatgatctc ttcctgtcct gaaggcacta attacatcat caatcgcaaa 720 ctcatactca gtgatttctc gttactaaat aaagtttcat cagggggagc ctttcggaat 780 ctagcaggga aaatttcctt cttaggaaaa aattcttctg cgtccattca ttttaaacac 840 attaatatca atggttttgg agccggagtc ttttctgaat cctctattga atttactgat 900 ttacgaaaac ttgttgcttt tggatctgaa ágcacaggag gaatttttac tgcgaaagag 960 gacatctctt ttaaaaacaa ccaccacatt gccttccgca ataatatcac caaagggaat 1020 ggtggcgtta tccagctcca aggagatatg aaaggaagcg tatcctttgt agatcaacgt 1080 ggagctatca tctttaccaa taaccaagct gtaacttctt catcaatgaa acatagtggt 1140 cgtggaggag caattagcgg tgacttcgca ggatccagaa ttctttttct taataaccaá 1200 caaattactt tcgaaggcaa tagcgctgtg catggaggtg ctatctacaa taagaatggc 1260 cttgtcgagt tcttaggaaa tgcaggacct cttgccttta aagagaacac aacaatagct 1320 aacgggggag ctatatacac aagtaatttc aaagcgaatc aacaaacatc ccccattcta 1380 ttctctcaaa atcatgcgaa taagaaaggc ggagcgattt acgcgcaata tgtgaactta 1440
295
1500
1560
1620
1680
1740
1800
1860
gaacagaatc aagatactat tcgctttgaa aaaaataccg ctaaagaagg cggtggagcc atcacctctt ctcaatgctc aattactgct cataatacca tcactttttc cgataatgct gccggagatc ttggaggagg agcaattctt ctagaaggga aaaaaccttc tctaaccttg attgctcata gtggtaatat tgcatttagc ggcaatacca tgcttcatat caccaaaaaa gcttccctag atcgacacaa ttctatctta atcaaagaag ctccctataa aatccaactt gcagcgaaca aaaaccattc tattcatttc tttgatcctg tcatggcatt gtcagcatca tcttccccta tacaáatcaa tgctcctgag tatgaaactc ccttcttctc acctáagtaa <21O> 309 <211> 619 <212> PRT <213> Chlamydia trachomatis <400> 309
| Met 1 | His | His | Hid | His 5 | His | His | Thr | Ala | Ala 10 | Ser | Asp | Asn | Phe | Gin 15 | Leu |
| Ser | Gin | Gly | Gly 20 | Gin | Gly | Phe | Ala | Ile 25 | Pro | Ile | Gly | Gin | Ala 30 | Met | Ala |
| Ile | Ala | Gly 35 | Gin | Ile | Lys | Leu | Pro 40 | Thr | Val | His | Ile | Gly 45 | Pro | Thr | Ala |
| :Phe | Leu 50 | Gly | Leu | Gly | Val | Val 55 | Asp | Asn | Asn | Gly | Asn 60 | Gly | Ala | Arg | Val |
| Gin 65 | Arg | Val | Val | Gly | Ser 70 | Ala | Pro | Ala | Ala | Ser 75 | Leu | Gly | Ile | Ser | Thr 80 |
| Gly | Asp | Val | Ile | Thr 85 | Ala | Val | Asp | Gly | Ala 90 | Pro | Ile | Asn | Ser | Ala 95 | Thr |
| Ala | Met | Ala | Asp 100 | Ala | Leu | Asn | Gly | His 105 | His | Pro | Gly | Asp | Val 110 | Ile | Ser |
| Val | Thr | Trp 115 | Gin | Thr | Lys | Ser | Gly 120 | Gly | Thr | Arg | Thr | Gly 125 | Asn | Val | Thr |
| Leu | Ala 130 | Glu | Gly | Pro | Pro | Ala 135 | Glu | Phe | Cys | Arg | Tyr 140 | Pro | Ser | His | Trp |
| Arg 145 | Pro | Leu | Met | Phe | Ile 150 | Thr | Lys | Glu | Leu | Met 155 | Asn | Arg | Val | Ile | Glu 160 |
| Ile | His | Ala | His | Tyr 165 | Asp | Gin | Arg | Gin | Leu 170 | Ser | Gin | Ser | Pro | Asn 175 | Thr |
| Asn | Phe | Leu | Val 180 | His | His | Pro | Tyr | Leu 185 | Thr | Leu | Ile | Pro | Lys 190 | Phe | Leu |
| Leu | Gly | Ala 195 | Leu | Ile | Val | Tyr | Ala 200 | Pro | Tyr | Ser | Phe | Ala 205 | Glu | Met | Glu |
| Leu | Ala 210 | Ile | Ser | Gly | His | Lys 215 | Gin | Gly | Lys | Asp | Arg Asp 220 | Thr | Phe | Thr | |
| Met 225 | Ile | Ser | Ser | Cys | Pro 230 | Glu | Gly | Thr | Asn | Tyr 235 | Ile | Ile | Asn | Arg | Lys 240 |
| Leu | Ile | Leu | Ser | Asp 245 | Phe | Ser | Leu | Leu | Asn 250 | Lys | Val | Ser | Ser | Gly 255 | Gly |
| Ala | Phe | Arg | Asn 260 | Leu | Tkla | Gly | Lys | Ile 265 | Ser | Phe | Leu | Gly | Lys 270 | Asn | Ser |
| Ser | Ala | Ser 275 | Ile | His | Phe | Lys | His 280 | Ile | Asn | Ile | Asn | Gly 285 | Phe | Gly | Ala |
| Gly | Val 290 | Phe | Ser | Glu | Ser | Ser 295 | Ile | Glu | Phe | Thr | Asp 300 | Leu | Arg | Lys | Leu |
| Val 305 | Ala | Phe | Gly | Ser | Glu 310 | Ser | Thr | Gly | Gly | Ile 315 | Phe | Thr | Ala | Lys | Glu 320 |
| As_p | Ile | Ser | Phe | Lys 325 | Asn | Asn | His | His | Ile 330 | Ala | Phe | Arg | Asn | Asn 335 | Ile |
| Thr | Lys | Gly | Asn 340 | Gly | Gly | Val | Ile | Gin 345 | Leu | Gin | Gly Asp | Met 350 | Lys | Gly | |
| Ser | Val | Ser 355 | Phe | Val | Asp | Gin | Arg 360 | Gly | Ala | Ile | Ile | Phe 365 | Thr | Asn | Asn |
| Gin | Ala | Val | Thr | Ser | Ser | Ser | Met | Lys | His | Ser | Gly Arg | Gly | Gly | Ala |
• *· ·
296
| 37Q | 375 | 380 | |||||||||||||
| Ile | Ser | Gly | Asp | Phe | Ala | Gly | Ser | Arg | Ile | Leu | Phe | Leu | Asn | Asn | Gin |
| 385 | 390 | 395 | 400 | ||||||||||||
| Gin | Ile | Thr | Phe | Glu | Gly | Asn | Ser | Ala | Val | His | Gly | Gly | Ala | Ile | Tyr |
| 405 | 410 | 415 | |||||||||||||
| Asn | Lys | Asn | Gly | Leu | Val | Glu | Phe | Leu | Gly | Asn | Ala | Gly | Pro | Leu | Ala |
| 420 | 425 | 430 | |||||||||||||
| Phe | Lys | Glu | Asn | Thr | Thr | Ile | Ala | Asn | Gly | Gly | Ala | Ile | Tyr | Thr | Ser |
| 435 | 440 | 445 | |||||||||||||
| Asn | Phe | Lys | Ala | Asn | Gin | Gin | Thr | Ser | Pro | Ile | Leu | Phe | Ser | Gin | Asn |
| 450 | 455 | 4 60 | |||||||||||||
| His | Ala | Asn | Lys | Lys | Gly | Gly | Ala | Ile | Tyr | Ala | Gin | Tyr | Val | Asn | Leu |
| 4 65 | 470 | 475 | 480 | ||||||||||||
| Glu | Gin | Asn | Gin | Asp | Thr | Ile | Arg | Phe | Glu | Lys | Asn | Thr | Ala | Lys | Glu |
| 485 | 490 | 495 | |||||||||||||
| Gly | Gly | Gly | Ala | Ile | Thr | Ser | Ser | Gin | Cys | Ser | Ile | Thr | Ala | His | Asn |
| 500 | 505 | 510 | |||||||||||||
| Thr | Ile | Thr | Phe | Ser | Asp | Asn | Ala | Ala | Gly | Asp | Leu | Gly | Gly | Gly | Ala |
| 515 | 520 | 525 | |||||||||||||
| Ile | Leu | Leu | Glu | Gly | Lys | Lys | Pro | Ser | Leu | Thr | Leu | Ile | Ala | His | Ser |
| 530 | 535 | 540 | |||||||||||||
| Gly | Asn | Ile | Ala | Phe | Ser | Gly | Asn | Thr | Met | Leu | His | Ile | Thr | Lys | Lys |
| 545 | 550 | 555 | 560 | ||||||||||||
| Ala | Ser | Leu | Asp | Arg | His | Asn | Ser | Ile | Leu | Ile | Lys | Glu | Ala | Pro | Tyr |
| 565 | 570 | 575 | |||||||||||||
| Lys | Ile | Gin | Leu | Ala | Ala | Asn | Lys | Asn | His | Ser | Ile | His | Phe | Phe | Asp |
| 580 | 585 | 590 | |||||||||||||
| Pro | Val | Met | Ala | Leu | Ser | Ala | Ser | Ser | Ser | Pro | Ile | Gin | Ile | Asn | Ala |
| 595 | 600 | 605 | - | ||||||||||||
| Pro | Glu | Tyr | Glu | Thr | Pro | Phe | Phe | Ser | Pro | Lys | |||||
| 610 | 615 |
<210> 310 <211> 39 <212> DNA <213> Chlamydia trachomatis <400> 310 gagagcggcc gctccattct attcatttct ttgatcctg 39 <210> 311 <211> 33 <212> DNA <213> Chlamydia trachomatis <400> 311 gagagcggcc gcttagaagc caacatagcc tcc 33 <210> 312 <211> 2076 <212> DNA <213> Chlamydia trachomatis <400> 312 atgcatcacc atcaccatca cacggccgcg tccgataact tccagctgtc ccagggtggg 60 cagggattcg ccattccgat cgggcaggcg atggcgatcg cgggccagat caagcttccc 120 accgttcata tcgggcctac cgccttcctc ggcttgggtg ttgtcgacaa caacggcaač 180 ggcgcacgag tccaacgcgt ggtcgggagc gctccggcgg caagtctcgg catctccacc 240 ggcgacgtga tcaccgcggt cgacggcgct ccgatcaact cggccaccgc gatggcggac 300 gcgcttaacg ggcatcatcc cggtgacgtc atctcggtga cctggcaaac caagtcgggc 360 ggcacgcgta cagggaacgt gacattggcc gagggacccc cggccgaatt ctgcagatat 420
297
ccatcacact ggcggccgct ccattctatt catttctttg atcctgtcat ggcattgtca gcatcatctt cccctataca aatcaatgct cctgagtatg aaactccctt cttctcacct aagggtatga tcgttttctc gggtgcgaat cttttagatg atgctaggga agatgttgca aatagaacat cgatttttaa ccaacccgtt catctatata atggcaccct atctatcgaa aatggagccc atctgattgt ccaaagcttc aaacagaccg gaggacgtat cagtttatct ccaggatcct ccttggctct atacacgatg aactcgttct tccatggcaa catatccagc aaagaacccc tagaaattaa tggtttaagc tttggagtag atatctctcc ttctaatctt caagcagaga tccgtgccgg caacgctcct ttacgattat ccggatcccc atctatccat gatcctgaag gattattcta cgaaaatcgc gatactgcag catcaccata ccaaatggaa atcttgctca cctctgataa aactgtagat atctccaaat ttactactga ttctctagtt acgaacaaac aatcaggatt ccaaggagcc tggcatttta gctggcagcc aaatactata aacaatacta aacaaaaaat attaagagct tcttggctcc caacaggaga atatgtcctt gaatccaatc gagtggggcg tgccgttcct aattccttat ggagcacatt tttactttta cagacagcct ctcataactt aggcgatcat ctatgtaata atcgatctct tattcctact tcatacttcg gagttttaat tggaggaact ggagcagaaa tgtctaccca ctcctcagaa gaagaaagct ttatatctcg ttťaggagct acaggaacct ctatcatacg cttaactccc tccctgacac tctctggagg aggctcacat atgttcggag attcgttcgt tgcagactta ccagaacaca tcacttcaga aggaattgtt cagaatgtcg gtttaaccca tgtctgggga ccccttactg tcaattctac attatgtgca gccttagatc acaacgcgat ggtccgcata tgctccaaaa aagatcacac ctatgggaaa tgggatacat tcggtatgcg aggaacatta ggagcctctt atacattcct agaatatgat caaactatgc gcgtattctc attcgccaac atcgaagcca caaatatctt gcaaagagct tttactgaaa caggctataa cccaagaagt ttttccaaga caaaacttct aaacatcgcc atccccatag ggattggtta tgaattctgc ttagggaata gctcttttgc tctactaggt aagggatcca tcggttactc tcgagatatt aaacgagaaa acccatccac tcttgctcac ctggctatga atgattttgc ttggactacc aatggctgtt cagttccaac ctccgcacac acattggcaa atcaattgat tcttcgctat aaagcatgtt ccttatacat cacggcatat actatcaacc gtgaagggaa gaacctctcc aatagcttat cctgcggagg ctatgttggc ttctaa <210> 313 <211> 691 <212> PRT <213> Chlamydia trachomatis
480
540
600
660
720
780
840
900
960
1020
1080
1140
1200
1260
1320
1380
1440
1500
1560
1620
1680
1740
1800
1860
1920
1980
2040
2076 <400> 313
| Met | His | His | His | His | His | His Thr | Ala | Ala | Ser | Asp | Asn | Phe | Gin | Leu | |
| 1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
| Ser | Gin | Gly | Gly | Gin | Gly | Phe | Ala | ile | Pro | Ile | Gly | Gin | Ala | Met | Ala |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Ile | Ala | Gly | Gin | Ile | Lys | Leu | Pro | Thr | Val | His | Ile | Gly | Pro | Thr | Ala |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Phe | Leu | m „ V-J-J | Leu | Cl „ 1 | Val | Val | 2i en | Asn | Asn | m v --u | Asn | (hv --a | Ala | Arg | Val |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Gin | Arg | Val | Val | Gly | Ser | Ala | Pro | Ala | Ala | Ser | Leu | Gly | Ile | Ser | Thr |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Gly | Asp | Val | Ile | Thr | Ala | Val | Asp | Gly | Ala | Pro | Ile | Asn | Ser | Ala | Thr |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Ala | Met | Ala | Asp | Ala | Leu | Asn | Gly | His | His | Pro | Gly | Asp | Val | Ile | Ser |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Val | Thr | Trp | Gin | Thr | Lys | Ser | Gly | Gly | Thr | Arg | Thr | Gly | Asn | Val | Thr |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Leu | Ala | Glu | Gly | Pro | Pro | Ala | Glu | Phe | Cys | Arg | Tyr | Pro | Ser | His | Trp |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Arg | Pro | Leu | His | Ser | Ile | His | Phe | Phe | Asp | Pro | Val | Met | Ala | Leu | Ser |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Ala | Ser | Ser | Ser | Pro | Ile | Gin | Ile | Asn | Ala | Pro | Glu | Tyr | Glu | Thr | Pro |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Phe | Phe | Ser | Pro | Lys | Gly | Met | Ile | Val | Phe | Ser | Gly | Ala | Asn | Leu | Leu |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Asp | Asp | Ala | Arg | Glu | Asp | Val | Ala | Asn | Arg | . Thr | Ser | Ile | Phe | Asn | Gin |
| 195 | 200 | 205 |
«4·· • 9 · · * · ' · · · • 999 9 · ··* · · · • 9 9 9 9 9 9 .4 « · 4
4 9944 9999 ····944 99 44 ·· 94
298
| Pro | Val 210 | His | Leu | Tyr Asn | Gly Thr Leu 215 | Ser | Ile | Glu 220 | Asn | Gly | Ala | His | |||
| Leu | Ile | Val | Gin | Ser | Phe | Lys | Gin | Thr | Gly | Gly | Arg | Ile | Ser | Leu | Ser |
| 225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
| Pro | Gly | Ser | Ser | Leu | Ala | Leu | Tyr | Thr | Met | Asn | Ser | Phe | Phe | His | Gly |
| 245 | 250 | 255 | |||||||||||||
| Asn | Ile | Ser | Ser | Lys | Glu | Pro | Leu | Glu | Ile | Asn | Gly | Leu | Ser | Phe | Gly |
| 260 | 265 | 270 | |||||||||||||
| Val | Asp | Ile | Ser | Pro | Ser | Asn | Leu | Gin | Ala | Glu | Ile | Arg | Ala | Gly | Asn |
| 275 | 280 | 285 | |||||||||||||
| Ala | Pro | Leu | Arg | Leu | Ser | Gly | Ser | Pro | Ser | Ile | His | Asp | Pro | Glu | Gly |
| 290 | 295 | 300 | |||||||||||||
| Leu | Phe | Tyr | Glu | Asn | Arg | Asp | Thr | Ala | Ala | Ser | Pro | Tyr | Gin | Met | Glu |
| 305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
| Ile | Leu | Leu | Thr | Ser | Asp | Lys | Thr | Val | Asp | Ile | Ser | Lys | Phe | Thr | Thr |
| 325 | 330 | 335 | |||||||||||||
| Asp | Ser | Leu | Val | Thr | Asn | Lys | Gin | Ser | Gly | Phe | Gin | Gly | Ala | Trp | His |
| 340 | 345 | 350 | |||||||||||||
| Phe | Ser | Trp | Gin | Pro | Asn | Thr | Ile | Asn | Asn | Thr | Lys | Gin | Lys | Ile | Leu |
| 355 | 360 | 365 | |||||||||||||
| Arg | Ala | Ser | Trp | Leu | Pro | Thr | Gly | Glu | Tyr | Val | Leu | Glu | Ser | Asn | Arg |
| 370 | 375 | 380 | |||||||||||||
| Val | Gly | Arg | Ala | Val | Pro | Asn | Ser | Leu | Trp | Ser | Thr | Phe | Leu | Leu | Leu |
| 385 | 390 | 395 | 400 | ||||||||||||
| Gin | Thr | Ala | Ser | His | Asn | Leu | Gly | Asp | His | Leu | Cys | Asn | Asn | Arg | Ser |
| 405 | 410 | 415 | - | ||||||||||||
| Leu | Ile | Pro | Thr | Ser | Tyr | Phe | Gly | Val | Leu | Ile | Gly | Gly | Thr | Gly | Ala |
| 420 | 425 | 430 | |||||||||||||
| Glu | Met | Ser | Thr | His | Ser | Ser | Glu | Glu | Glu | Ser | Phe | Ile | Ser | Arg | Leu |
| 435 | 440 | 445 | |||||||||||||
| Gly | Ala | Thr | Gly | Thr | Ser | Ile | Ile | Arg | Leu | Thr | Pro | Ser | Leu | Thr | Leu |
| 450 | 455 | 4 60 | |||||||||||||
| Ser | Gly | Gly | Gly | Ser | His | Met | Phe | Gly | Asp | Ser | Phe | Val | Ala | Asp | Leu |
| 4 65 | 470 | 475 | 480 | ||||||||||||
| Pro | Glu | His | Ile | Thr | Ser | Glu | Gly | Ile | Val | Gin | Asn | Val | Gly | Leu | Thr |
| 485 | 490 | 4 95 | |||||||||||||
| His | Val | Trp | Gly | Pro | Leu | Thr | Val | Asn | Ser | Thr | Leu | Cys | Ala | Ala | Leu |
| 500 | 505 | 510 | |||||||||||||
| Asp | His | Asn | Ala | Met | Val | Arg | Ile | Cys | Ser | Lys | Lys | Asp | His | Thr | Tyr |
| 515 | 520 | 525 | |||||||||||||
| Gly | Lys | Trp | Asp | Thr | Phe | Gly | Met | Arg | Gly | Thr | Leu | Gly | Ala | Ser | Tyr |
| 530 | 535 | 540 | |||||||||||||
| Thr | Phe | Leu | Glu | Tyr | Asp | Gin | Thr | Met | Arg | Val | Phe | Ser | Phe | Ala | Asn |
| 545 | 550 | 555 | 560 | ||||||||||||
| Ile | Glu | Ala | Thr | Asn | Ile | Leu | Gin | Arg | Ala | Phe | Thr | Glu | Thr | Gly | Tyr |
| 565 | 57 0 | 575 | |||||||||||||
| Asn | Pro | Arg | Ser | Phe | Ser | Lys | Thr | Lys | Leu | Leu | Asn | Ile | Ala | Ile | Pro |
| 580 | 585 | 590 | |||||||||||||
| Ile | Gly | Ile | Gly | Tyr | Glu | Phe | Cys | Leu | Gly | Asn | Ser | Ser | Phe | Ala | Leu |
| 595 | 600 | 605 | |||||||||||||
| Leu | Gly | Lys | Gly | Ser | Ile | Gly | Tyr | Ser | Arg | Asp | Ile | Lys | Arg | Glu | Asn |
| 610 | 615 | 620 | |||||||||||||
| Pro | Ser | Thr | Leu | Ala | His | Leu | Ala | Met | Asn | Asp | Phe | Ala | Trp | Thr | Thr |
| 625 | 630 | 635 | 640 | ||||||||||||
| Asn | Gly | Cys | Ser | Val | Pro | Thr | Ser | Ala | His | Thr | Leu | Ala | Asn | Gin | Leu |
| 645 | 650 | 655 | |||||||||||||
| Ile | Leu | Arg | Tyr | Lys | Ala | Cys | Ser | Leu | Tyr | Ile | Thr | Ala | Tyr | Thr | Ile |
| 660 | 665 | 670 | |||||||||||||
| Asn | Arg | Glu | Gly | Lys | Asn | Leu | Ser | Asn | Ser | Leu | Ser | Cys | Gly | Gly | Tyr |
| 675 | 680 | 685 | |||||||||||||
| Val | Gly | Phe |
299 ·* ΦΦ·· φ · · φ ·Φ· φ Φ· · •«•Φ ··<
690 <210> 314 <211> 38 <212> DNA <213> Chlamydia trachomatis <400> 314 gagagcggcc gctcatgatt aaaagaactt ctctatcc 38 <210> 315 <211> 36 <212> DNA <213> Chlamydia trachomatis <400> 315 agcggccgct tataattctg catcatcttc tatggc <210> 316 <211> 1941 <212> DNA <213> Chlamydia trachomatis <400> 316 atgcatcacc atcaccatca cacggccgcg tccgataact tccagctgtc ccagggtggg 60 cagggattcg ccattccgat cgggcaggcg atggcgatcg cgggccagat caagcttccc 120 accgttcata tcgggcctac cgccttcctc ggcttgggtg ttgtcgacaa caacggcaac 180 ggcgcacgag tccaacgcgt ggtcgggagc gctccggcgg caagtctcgg catctccacc 240 ggcgacgtga tcaccgcggt cgacggcgct ccgatcaact cggccaccgc gatggcggac 300 gcgcttaacg ggcatcatcc cggtgacgtc atctcggtga cctggcaaac caagtcgggc 360 ggcacgcgta cagggaacgt gacattggcc gagggacccc cggccgaatt ctgcagatat 420 ccatcacact ggcggccgct catgattaaa agaacttctc tatcctttgc ttgcctcagt 480 tttttttatc tttcaactát atccattttg caagctaatg aaacggatac gctacagttc 540 cggcgattta ctttttcgga tagagagatt cagttcgtcc tagatcccgc ctctttaatt 600 accgcccaaa acatcgtttt atctaattta cagtcaaacg gaaccggagc ctgtaccatt 660 tcaggcaata cgcaaactca aatcttttct aattccgtta acaccaccgc agattctggt 720 ggagcctttg atatggttac tacctcattc acggcctctg ataatgctaa tctactcttc 780 tgcaacaact actgcacaca taataaággc ggaggagcta ttcgttccgg aggacctatt 840 cgattcttaa ataatcaaga cgtgcttttt tataataaca tatcggcagg ggctaaatat 900 gttggaacag gagatcacaa cgaaaaaaat aggggcggtg cgctttatgc aactactatc 960 actttgacag ggaatcgaac tcttgccttt attaacaata tgtctggaga ctgcggtgga 1020 gccatctctg ctgacactca aatatcaata actgataccg ttaaaggaat tttatttgaa 1080 aacaatcaca cgctcaatca tataccgtac acgcaagctg aaaatatggc acgaggagga 1140 gcaatctgta gtagaagaga cttgtgctca atcagcaata attctggtcc cátagttttt 1200 aactataacc aaggcgggaa aggťggagct attagcgcta cccgatgtgt tattgacaat 1260 aacaaagaaa gaatcatctt ttcaaacaat agttccctgg gatggagcca atcttcttct 1320 gcaagtaacg gaggagccat'tcaaacgaca caaggattta ctttacgaaa taataaaggc 1380 tctatctact tcgacagcaa cactgctaca cacgccgggg gagccattaa ctgtggttac 1440 attgacatcc gagataacgg acccgtctat tttctaaata actctgctgc ctggggagcg 1500 gcctttaatt tatcgaaacc acgttcagcg acaaattata tccatacagg gacaggcgat 1560 attgttttta ataataacgt tgtctttact cttgacggta atttattagg gaaacggaaa 1620 ctttttcata ttaataataa tgagataaca ccatatacat tgtctctcgg cgctaaaaaa 1680 gatactcgta tctattttta tgatcttttc caatgggagc gtgttaaaga aaatactagc 1740 aataacccac catctcctac cagtagaaac accattaccg ttaacccgga aacagagttt 1800 tctggagctg ttgtgttctc ctacaatcaa atgtctagtg acatacgaac tctgatgggt 1860 aaagaacaca attacattaa agaagcccca actactttaa aattcggaac gctagccata 1920 gaagatgatg cagaattata a 1941 <210> 317 <211> 646 <212> PRT
300
9· *··· • * · • ··» • « 4
4 β· 44 ♦ 4
4, · 4 4 · > 4 4 4 * 4 4 4 • 4 44
4··4 « · 4 · β 4 4
4* 4
4 4 4 • 4 44 <213> Chlamydia trachomatis <400> 317
| Met 1 | His | His | His | His 5 | His | His | Thr Ala | Ala 10 | Ser Asp Asn Phe | Gin 15 | Leu | ||||
| Ser | Gin | Gly | Gly | Gin | Gly | Phe | Ala | Ile | Pro | Ile | Gly | Gin | Ala | Met | Ala |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Ile | Ala | Gly | Gin | Ile | Lys | Leu | Pro | Thr | Val | His | Ile | Gly | Pro | Thr | Ala |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Phe | Leu | Gly | Leu | Gly | Val | Val | Asp | Asn | Asn | Gly | Asn | Gly | Ala | Arg | Val |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Gin | Arg | Val | Val | Gly | Ser | Ala | Pro | Ala | Ala | Ser | Leu | Gly | Ile | Ser | Thr |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Gly | Asp | Val | Ile | Thr | Ala | Val | Asp | Gly | Ala | Pro | Ile | Asn | Ser | Ala | Thr |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Ala | Met | Ala | Asp | Ala | Leu | Asn | Gly | His | His | Pro | Gly | Asp | Val | Ile | Ser |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Val | Thr | Trp | Gin | Thr | Lys | Ser | Gly | Gly | Thr | Arg | Thr | Gly | Asn | Val | Thr |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Leu | Ala | Glu | Gly | Pro | Pro | Ala | Glu | Phe | Cys | Arg | Tyr | Pro | Ser | His | Trp |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Arg | Pro | Leu | Met | Ile | Lys | Arg | Thr | Ser | Leu | Ser | Phe | Ala | Cys | Leu | Ser |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Phe | Phe | Tyr | Leu | Ser | Thr | Ile | Ser | Ile | Leu | Gin | Ala | Asn | Glu | Thr | Asp |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Thr | Leu | Gin | Phe | Arg | Arg | Phe | Thr | Phe | Ser | Asp | Arg | Glu | Ile | Gin | Phe |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Val | Leu | Asp | Pro | Ala | Ser | Leu | Ile | Thr | Ala | Gin | Asn | Ile | Val | Leu | Ser |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Asn | Leu | Gin | Ser | Asn | Gly | Thr | Gly | Ala | Cys | Thr | Ile | Ser | Gly | Asn | Thr |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Gin | Thr | Gin | Ile | Phe | Ser | Asn | Ser | Val | Asn | Thr | Thr | Ala | Asp | Ser | Gly |
| 225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
| Gly | Ala | Phe | Asp | Met | Val | Thr | Thr | Ser | Phe | Thr | Ala | Ser | Asp | Asn | Ala |
| 245 | 250 | 255 | |||||||||||||
| Asn | Leu | Leu | Phe | Cys | Asn | Asn | Tyr | Cys | Thr | His | Asn | Lys | Gly | Gly | Gly |
| 260 | 265 | 270 | |||||||||||||
| Ala | Ile | Arg | Ser | Gly | Gly | Pro | Ile | Arg | Phe | Leu | Asn | Asn | Gin | Asp | Val |
| 275 | 280 | 285 | |||||||||||||
| Leu | Phe | Tyr | Asn | Asn | Ile | Ser | Ala | Gly | Ala | Lys | Tyr | Val | Gly | Thr | Gly |
| 290 | 295 | 300 | |||||||||||||
| Asp | His | Asn | Glu | Lys | Asn | Ar g | vr.a.j | Gly | Ala | Leu | σ’,,ν i j, a- | Ala | Thr | Thr | Ile |
| 305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
| Thr | Leu | Thr | Gly | Asn | Arg | Thr | Leu | Ala | Phe | Ile | Asn | Asn | Met | Ser | Gly |
| 325 | 330 | 335 | |||||||||||||
| Asp | Cys | Gly | Gly | Ala | Ile | Ser | Ala | Asp | Thr | Gin | Ile | Ser | Ile | Thr | Asp |
| 340 | 345 | 350 | |||||||||||||
| Thr | Val | Lys | Gly | Ile | Leu | Phe | Glu | Asn | Asn | His | Thr | Leu | Asn | His | Ile |
| 355 | 360 | 365 | |||||||||||||
| Pro | Tyr | Thr | Gin | Ala | Glu | Asn | Met | Ala | Arg Gly | Gly | Ala | Ile | Cys | Ser | |
| 370 | 375 | 380 | |||||||||||||
| Arg | Arg | Asp | Leu | Cys | Ser | Ile | Ser | Asn | Asn | Ser | Gly | Pro | Ile | Val | Phe |
| 385 | 390 | 395 | 400 | ||||||||||||
| Asn | Tyr | Asn | Gin | Gly | Gly | Lys | Gly | Gly | Ala | Ile | Ser | Ala | Thr | Arg | Cys |
| 405 | 410 | 415 | |||||||||||||
| Val | Ile | Asp | Asn | Asn | Lys | Glu | Arg | Ile | Ile | Phe | Ser | Asn | Asn | Ser | Ser |
| 420 | 425 | 430 | |||||||||||||
| Leu | Gly | Trp | Ser | Gin | Ser | Ser | Ser | Ala | Ser | Asn | Gly | Gly | Ala | Ile | Gin |
| 435 | 440 | 445 | |||||||||||||
| Thr | Thr | Gin | Gly | Phe | Thr | Leu | Arg | Asn | Asn | Lys | Gly | Ser | Ile | Tyr | Phe |
| 450 | 455 | 4 60 |
501 • · • ··· • ·
| Asp | Ser | Asn | Thr | Ala | Thr | His | Ala | Gly | Gly | Ala | Ile | Asn | Cys | Gly | Tyr |
| 465 | 470 | 475 | 480 | ||||||||||||
| Ile | Asp | Ile | Arg | Asp | Asn | Gly | Pro | Val | Tyr | Phe | Leu | Asn | Asn. | Ser | Ala |
| 485 | 490 | 495 | |||||||||||||
| Ala | Trp | Gly | Ala | Ala | Phe | Asn | Leu | Ser | Lys | Pro | Arg | Ser | Ala | Thr | Asn |
| 500 | 505 | 510 | |||||||||||||
| Tyr | Ile | His | Thr | Gly | Thr | Gly | Asp | Ile | Val | Phe | Asn | Asn | Asn | Val | Val |
| 515 | 520 | 525 | |||||||||||||
| Phe | Thr | Leu | Asp. | Gly | Asn | Leu | Leu | Gly | Lys | Arg | Lys | Leu | Phe | His | Ile |
| 530 | 535 | 540 | |||||||||||||
| Asn | Asn | Asn | Glu | Ile | Thr | Pro | Tyr | Thr | Leu | Ser | Leu | Gly | Ala | Lys | Lys |
| 545 | 550 | 555 | 560 | ||||||||||||
| Asp | Thr | Arg | Ile | Tyr | Phe | Tyr | Asp | Leu | Phe | Gin | Trp | Glu | Arg | Val | Lys |
| 565 | 570 | 575 | |||||||||||||
| Glu | Asn | Thr | Ser | Asn | Asn | Pro | Pro | Ser | Pro | Thr | Ser | Arg | Asn | Thr | Ile |
| '580 | 585 | 590 | |||||||||||||
| Thr | Val | Asn | Pro | Glu | Thr | Glu | Phe | Ser | Gly | Ala | Val | Val | Phe | Ser | Tyr |
| 595 | 600 | 605 | |||||||||||||
| Asn | Gin | Met | Ser | Ser | Asp | Ile | Arg | Thr | Leu | Met | Gly | Lys | Glu | His | Asn |
| 610 | 615 | 620 | |||||||||||||
| Tyr | Ile | Lys | Glu | Ala | Pro | Thr | Thr | Leu | Lys | Phe | Gly | Thr | Leu | Ala | Ile |
| 625 | 630 | 635 | 640 | ||||||||||||
| Glu | Asp | Asp | Ala | Glu | Leu |
645 <210> 318 <211> 34 <212> DNA <213> Chlamydia trachomatis <400> 318 gagagcggcc gctcgacata cgaactctga tggg <210> 319 <211> 33 <212> DNA •<213> Chlamydia trachomatis <400> 319 gagagcggcc gcttaaaaga ccagagctcc <210> 320 <211> 2148 <212> DNA i <213> Chlamydia trachomatis tcc <400> 320 atgcatcacc cagggattcg accgttcata ggčgcacgag ggcgacgtga gcgcttaacg ggcacgcgta ccatcacact aaagaagccc gaaatcttca gctacgctga cccattattc acccaaaata attatcttta atcaccatca ccattccgat tcgggcctac tccaacgcgt tcaccgcggt ggcatcatc.c cagggaacgt ggcggccgct caactacttt atatcccgtt ctgttggaaa tcaaagaggg ctggtaccgg atgggcgcct cacggccgcg cgggcaggcg cgccttcctc ggtcgggagc cgacggcgct cggtgacgtc gacattggcc cgacatacga aaaattcgga tacccaaaat gcacggtaag gaagagtccg ccaaactcca ctcaattgta tccgataact atggcgatcg ggcttgggtg gctccggcgg ccgatcaact atctcggtga gagggacccc actctgatgg acgctagcca ccgactagcc ctcaatatta ccttgtattc tcaagcacaa gacgaaaatt tccagctgtc cgggccagat ttgtcgacaa caagtctcgg cggccaccgc cctggcaaac cggccgaatt gtaaagaaca tagaagatga ttcttgcttt caaatcttgg gcgtcaaccc gtagtataag atgaatcagt ccagggtggg caagcťtccc caacggcaac catctccacc gatggcggac caagtcgggc ctgcagatat caattacatt tgcagaatta aggaagcggc tgttatttta acaagatatg cactccaatg ctacgacagt
120 180 24 0 300 360 420 480 540 600 660 720 780 840 • · · ·
302 atggacctct ccagagggaa agcagaacaa ctaattctat ccatagaaac cactaatgat 900 gggcaattag actccaattg gcaaagttct ctgaatactt ctctactctc tcctccacac 960 tatggctatc aaggtctatg gactcctaat tggataacaa caacctatac catcacgctt 1020 aataataatt cttcagctcc aacatctgct acctccatcg cťgagcagaa aaaaactagt 1080 gaaactttta ctcctagtaa cacaactaca gctagtatcc ctaatattaa agcttccgca 1140 ggatcaggct ctggatcggc ttccaattca ggagaagtta cgattaccaa acataccctt 1200 gttgtaaact gggcaccagt cggctacata gtagatccta ttcgtagagg agatctgata 1260 gccaatagct tagtacattc aggaagaaac atgaccatgg gcttacgatc attactcccg 1320 gataactctt ggtttgcttt gcaaggagct gcaacaacat tatttacaaa acaacaaaaa 1380 cgtttgagtt atcatggcta ctcttctgca tcaaaggggt ataccgtctc ttctcaagca 1440 tcaggagctc atggtcataa gtttcttctt tccttctccc agtcatctga taagatgaaa 1500 gaaaaagaaa caaataaccg cctttcttct cgttactatc tttctgcttt atgtttcgaa 1560 catcctatgt ttgatcgcat tgctcttatc ggagcagcag cttgcaatta tggaacacat 1620 aacatgcgga gtttctatgg aactaaaaaa tcttctaaag ggaaatttca ctctacaacc 1680 ttaggagctt ctcttcgctg tgaactacgc gatagtatgc ctttacgatc aataatgctc 1740 accccatttg ctcaggcttt attctctCga acagaaccag cttctatccg agaaagcggt 1800 gatctagcta gattatttac attagagcaa gcccatactg ccgttgtctc tccaatagga 1860 atcaaaggag cttattcttc tgatacatgg ccaacactct cttgggaaat ggaactagct 1920 taccaaccca ccctctactg gaaacgtcct ctactcaaca cactattaat ccaaaataac 1980 ggttcttggg tcaccacaaa taccccatta gctaaacatt ccttttatgg gagaggttct 2040 cactccctca aattttctca tctgaaacta tttgctaact atcaagcaga agtggctact 2100 tccactgtct cacactacat caatgcagga ggagctctgg tcttttaa 2148 <210> 321 <211> 715 <212> PRT <213> Chlamydia trachomatis <400> 321
| Met | His | His | His | His | His | His | Thr | Ala | Ala | Ser | Asp | Asn | Phe | Gin | Leu |
| 1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
| Ser | Gin | Gly | Gly | Gin | Gly | Phe | Ala | Ile | Pro | Ile | Gly | Gin | Ala | Met | Ala |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Ile | Ala | Gly | Gin | Ile | Lys | Leu | Pro | Thr | Val | His | Ile | Gly | Pro | Thr | Ala |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Phe | Leu | Gly | Leu | Gly | Val | Val | Asp | Asn | Asn | Gly | Asn | Gly | Ala | Arg | Val |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Gin | Arg | Val | Val | Gly | Ser | Ala | Pro | Ala | Ala | Ser | Leu | Gly | Ile | Ser | Thr |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Gly | Asp | Val | Ile | Thr | Ala | Val | Asp | Gly | Ala | Pro | He | Asn | Ser | Ala | Thr |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Ala | Met | Ala | Asp | Ala | Leu | Asn | Gly | His | His | Pro | Gly | Asp | Val | Ile | Ser |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Val | Thr | Trp | Gin | Thr | Lys | Ser | Gly | Gly | Thr | Arg | Thr | Gly | Asn | Val | Thr |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Leu | Ala | Glu | Gly | Pro | Pro | Ala | Glu | Phe | Cys | Arg | Tyr | Pro | Ser | His | Trp |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Arg | Pro | Leu | Asp | Ile | Arg | Thr | Leu | Met | Gly | Lys | Glu | His. | Asn | Tyr | Ile |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Lys | Glu | Ala | Pro | Thr | Thr | Leu | Lys | Phe | Gly | Thr | Leu | Ala | Ile | Glu | Asp |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Asp | Ala | Glu | Leu | Glu | Ile | Phe | Asn | Ile | Pro | Phe | Thr | Gin | Asn | Pro | Thr |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Ser | Leu | Leu | Ala | Leu | Gly | Ser | Gly | Ala | Thr | Leu | Thr | Val | Gly | Lys | His |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Gly | Lys | Leu | Asn | Ile | Thr | Asn | Leu | Gly | Val | Ile | Leu | Pro | Ile | Ile | Leu |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Lys | Glu | Gly | Lys | Ser | Pro | Pro | Cys | Ile | Arg | Val | Asn | Pro | Gin | Asp | Met |
| 225 | .230 | 235 | 240 | ||||||||||||
| Thr | Gin | Asn | Thr | Gly | Thr | Gly | Gin | Thr | Pro | Ser | Ser | Thr | Ser | Ser | Ile |
| 245 | 250 | 255 |
- · · ·· = · · · ·
303 • · · · 9 9 ···· ··· ··· ·· ·· ·· ··
| Ser | Thr | Pro | Met Ile 260 | Ile | Phe Asn Gly Arg Leu '265 | Ser | Ile | Val 270 | Asp | GlU | |||||
| Asn | Tyr | Glu | Ser | Val | Tyr | Asp | Ser | Met | Asp | Leu | Ser | Arg | Gly | Lys | Ala |
| 275 | 280 | 285 | |||||||||||||
| Glu | Gin | Leu | Ile | Leu | Ser | Ile· | Glu | Thr | Thr | Asn | Asp | Gly | Gin | Leu | Asp |
| 290 | 295 | 300 | |||||||||||||
| Ser | Asn | Trp | Gin | Ser | Ser | Leu | Asn | Thr | Ser | Leu | Leu | Ser | Pro | Pro | His |
| 305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
| Tyr | Gly | Tyr | Gin | Gly | Leu | Trp | Thr | Pro | Asn | Trp | Ile | Thr | Thr | Thr | Tyr |
| 325 | 330 | 335 | |||||||||||||
| Thr | Ile | Thr | Leu | Asn | Asn | Asn | Ser | Ser | Ala | Pro | Thr | Ser | Ala | Thr | Ser |
| 340 | 345 | 350 | |||||||||||||
| Ile | Ala | Glu | Gin | Lys | Lys | Thr | Ser | Glu | Thr | Phe | Thr | Pro | Ser | Asn | Thr |
| 355 | 360 | 365 | |||||||||||||
| Thr | Thr | Ala | Ser | Ile | Pro | Asn | Ile | Lys | Ala | Ser | Ala | Gly | Ser | Gly | Ser |
| 370 | 375 | 380 | |||||||||||||
| Gly | Ser | Ala | Ser | Asn | Ser | Gly | Glu | Val | Thr | Ile | Thr | Lys | His | Thr | Leu |
| 385 | 390 | 395 | 400 | ||||||||||||
| Val | Val | Asn | Trp | Ala | Pro | Val | Gly | Tyr | Ile | Val | Asp | Pro | Ile | Arg | Arg |
| 405 | 410 | 415 | |||||||||||||
| Gly | Asp | Leu | Ile | Ala | Asn | Ser | Leu | Val | His | Ser | Gly | Arg | Asn | Met | Thr |
| 420 | 425 | 430 | |||||||||||||
| Met | Gly | Leu | Arg | Ser | Leu | Leu | Pro | Asp | Asn | Ser | Trp | Phe | Ala | Leu | Gin |
| 435 | 440 | 445 | |||||||||||||
| Gly | Ala | Ala | Thr | Thr | Leu | Phe | Thr | Lys | Gin | Gin | Lys | Arg | Leu | Ser | Tyr |
| 450 | 455 | 460 | |||||||||||||
| His | Gly | Tyr | Ser | Ser | Ala | Ser | Lys | Gly | Tyr | Thr | Val | Ser | Ser | Gin | Ala |
| 465 | 470 | 475 | 480 | ||||||||||||
| Ser | Gly | •Ala | His | Gly | His | Lys | Phe | Leu | Leu | Ser | Phe | Ser | Gin | Ser | Ser |
| 485 | 490 | 4 95 | |||||||||||||
| Asp | Lys | Met | Lys | Glu | Lys | Glu | Thr | Asn | Asn | Arg | Leu | Ser | Ser | Arg | Tyr |
| 500 | 505 | 510 | |||||||||||||
| Tyr | Leu | Ser | Ala | Leu | Cys | Phe | Glu | His | Pro | Met | Phe | Asp | Arg | Ile | Ala |
| 515 | 520 | 525 | |||||||||||||
| Leu | Ile | Gly | Ala | Ala | Ala | Cys | Asn | Tyr | Gly | Thr | His | Asn | Met | Arg | Ser |
| 530 | 535 | 540 | |||||||||||||
| Phe | Tyr | Gly | Thr | Lys | Lys | Ser | Ser | Lys | Gly | Lys | Phe | His | Ser | Thr | Thr |
| 545 | 550 | 555 | 560 | ||||||||||||
| Leu | Gly | Ala | Ser | Leu | Arg | Cys | Glu | Leu | Arg | Asp | Ser | Met | Pro | Leu | Arg |
| 565 | 570 | 575 | |||||||||||||
| Ser | Ile | Met | Leu | Thr | Pro | Phe | Ala | Gin | Tkla | Leu | Phe | Ser | Arg | Thr | Glu |
| 580 | 585 | 590 | |||||||||||||
| Pro | Ala | Ser | Ile | Arg | Glu | Ser | Gly | Asp | Leu | Ala | Arg | Leu | Phe | Thr | Leu |
| 595 | 600 | 605 | |||||||||||||
| Glu | Gin | Ala | His | Thr | Ala | Val | Val | Ser | Pro | Ile | Gly | Ile | Lys | Gly | Ala |
| 610 | 615 | 620 | |||||||||||||
| Tyr | Ser | Ser | Asp | Thr | Trp | Pro | Thr | Leu | Ser | Trp | Glu | Met | Glu | Leu | Ala |
| 625 | 630 | 635 | 640 | ||||||||||||
| Tyr | Gin | Pro | Thr | Leu | Tyr | Trp | Lys | Arg | Pro | Leu | Leu | Asn | Thr | Leu | Leu |
| 645 | 650 | 655 | |||||||||||||
| Ile | Gin | Asn | Asn | Gly | Ser | Trp | Val | Thr | Thr | Asn | Thr | Pro | Leu | Ala | Lys |
| 660 | 665 | 670 | |||||||||||||
| His | Ser | Phe | Tyr | Gly | Arg | Gly | Ser | His | Ser | Leu | Lys | Phe | Ser | His | Leu |
| 675 | 680 | 685 | |||||||||||||
| Lys | Leu | Phe | Ala | Asn | Tyr | Gin | Ala | Glu | Val | Ala | Thr | Ser | Thr | Val | Ser |
| 690 | 695 | 700 | |||||||||||||
| His | Tyr | Ile | Asn | Ala | Gly | Gly | Ala | Leu | Val | Phe | |||||
| 705 | 710 | 715 |
<210> 322 <2H> 37 • ·
304 <212> DNA <213> Chlamydia trachomatis <400> 322 gagagcggcc gctcatgcct ttttctttga gatctac 37 <210> 323 <211> 36 <212> DNA <213> Chlamydia trachomatis <400> 323 gagagcggcc gcttacacag atccattacc ggactg 36 <210> 324 <211> 1896 <212> DNA <213> Chlamydia trachomatis <400> 324 atgcatcacc atcaccatca cacggccgcg tccgataact tccagctgtc ccagggtggg 60 cagggattcg ccattccgat cgggcaggcg atggcgatcg·cgggccagat caagcttccc 120 accgttcata tcgggcctac cgccttcctc ggcttgggtg ttgtcgacaa caacggcaac 180 ggcgcacgag tccaacgcgt ggtcgggagc gctccggcgg caagtctcgg catctccacc 240 ggcgacgtga tCaccgcggt cgacggcgct ccgatcaact cggccaccgc gatggcggac 300 gcgcttaacg ggcatcatcc cggtgacgtc atctcggtga cctggcaaac caagtcgggc 360 ggcacgcgta cagggaacgt gacattggcc gagggacccc cggccgaatt ctgcagatat 420 ccatcacact ggcggccgct catgcctttt tctttgagat ctacatcatt ttgtttttta 480 gcttgtttgt gttcctattc gtatggattc gcgagctctc ctcaagtgtt aacacctaat 540 gtaaccactc.cttttaaggg ggacgatgtt tacttgaatg gagactgcgc ttttgtcaat 600 gtctatgcag gggcagagaa cggctcaatt atctcagcta atggcgacaa tttaacgatt 660 accggacaaa accatacatt atcatttaca gattctcaag ggccagttct tcaaaattat 720 gccttcattt cagcaggaga gacacttact ctgaaagatt tttcgagttt gatgttctcg 780 aaaaatgttt cttgcggaga aaagggaatg atctcaggga aaaccgtgag tafttccgga 840 gcaggcgaag tgattttttg ggataactct gťggggtatt ctcctttgtc tattgtgcca 900 gcatcgactc caactcctcc agcáccagca ccagctcctg ctgcttcaag ctctttatct 960 ccaacagtta gtgatgctcg gaaagggtct attttttctg tagagactag tttggagatc 1020 tcaggcgtca aaaaaggggt catgttcgat aataatgccg ggaattttgg aacagttttt 1080 cgaggtaata gtaataataa tgctggtagt gggggtagtg ggtctgčtac aacaccaagt 1140 tttacagtta aaaactgtaa agggaaagtt tctttcacag ataacgtagc ctcctgtgga 1200 ggcggagtag tctacaaagg aactgtgctt ttcaaagaca atgaaggagg catattcttc 1260 caagggaaca cagcatacga tgatttaggg attcttgctg ctactagtcg ggatcaaaat 1320 acggagacag gaggcggtgg aggagttatt tgctctccag atgattctgt aaagtttgaa 1380 ggcaataaag gttctattgt ttttgattac aactttgcaa aaggcagagg cggaagcatc 1440 ctaacgaaag aattctctct tgtagcagat gattčggttg tctttagtaa caatacagca 1500 gaaaaaggcg gtggagctat ttatgctcct actatcgata taagcacgaa tggaggatcg 1560 attctgtttg aaagaaaccg agctgcagaa ggaggcgcca tctgcgtgag tgaagcaagc 1620 tctggttcaa ctggaaatct tactttaagc gcttctgatg gggatattgt tttttctggg 1680 aatatgacga gtgatcgtcc tggagagcgc agcgcagcaa gaatcttaag tgatggaacg 1740 actgtttctt taaatgcttc cggactatcg aagctgatct tttatgatcc tgtagtacaa 1800 aataattcag cagcgggtgc atcgacacca tcaccatctt cttcttctat gcctggtgct 1860 gtcacgatta atcagtccgg taatggatct gtgtaa 1896 <210> 325 <211> 631 <212> PRT <213> Chlamydia trachomatis <400> 325
Met His His His His His His Thr Ala Ala Ser Asp Asn Phe Gin Leu 1 5 10 - 15 • ·
305
| Ser | Gin | Gly | Gly 20 | Gin | Gly | Phe | Ala | Ile 25 | Pro | Ile | Gly | Gin | Ala 30 | Met | Ala |
| Ile | Ala | Gly 35 | Gin | Ile | Lys | Leu | Pro 4 0 | Thr | Val | His | Ile | Gly 45 | Pro | Thr | Ala |
| Phe | Leu 50 | Gly | Leu | Gly | Val | Val 55 | Asp | Asn | Asn | Gly | Asn 60 | Gly | Ala | Arg | Val |
| Gin 65 | Arg | Val | Val | Gly | Ser 70 | Ala | Pro | Ala | Ala | Ser 75 | Leu | Gly | Ile | Ser | Thr 80 |
| Gly | Asp | Val | Ile | Thr 85 | Ala | Val | Asp | Gly | Ala 90 | Pro | Ile | Asn | Ser | Ala 95 | Thr |
| Ala | Met | Ala | Asp 100 | Ala | Leu | Asn | Gly | His 105 | His | Pro | Gly | Asp | Val 110 | He | Ser |
| Val | Thr | Trp 115 | Gin | Thr | Lys | Ser | Gly 120 | Gly | Thr | Arg | Thr | Gly 125 | Asn | Val | Thr |
| Leu | Ala 130 | Glu | Gly | Pro | Pro | Ala 135 | Glu | Phe | Cys | Arg | Tyr 140 | Pro | Ser | His | Trp |
| Arg 145 | Pro | Leu | Met | Pro | Phe 150 | Ser | Leu | Arg | Ser | Thr 155 | Ser | Phe | Cys | Phe | Leu 160 |
| Ala | Cys | Leu | Cys | Ser 165 | Tyr | Ser | Tyr | Gly | Phe 170 | Ala | Ser | Ser | Pro | Gin 175 | Val |
| Leu | Thr | Pro | Asn 180 | Val | Thr | Thr | Pro | Phe 185 | Lys | Gly | Asp Asp | Val 190 | Tyr | Leu | |
| Asn | Gly | Asp 195 | Cys | Ala | Phe | Val | Asn 200 | Val | Tyr | Ala | Gly | Ala 205 | Glu | Asn | Gly |
| Ser | Ile 210 | Ile | Ser | Ala | Asn | Gly 215 | Asp | Asn | Leu | Thr | Ile 220 | Thr | Gly | Gin | Asn |
| His 225 | Thr | Leu | Ser | Phe | Thr 230 | Asp | Ser | Gin | Gly | Pro 235 | Val | Leu | Gin | Asn | Tyr 240 |
| Ala | Phe | Ile | Ser | Ala 245 | Gly | Glu | Thr | Leu | Thr 250 | Leu | Lys | Asp | Phe | Ser 255 | Ser |
| Leu | Met | Phe | Ser 260 | Lys | Asn | Val | Ser | Cys 265 | Gly | Glu | Lys | Gly | Met 270 | Ile | Ser |
| Gly | Lys | Thr 275 | Val | Ser | Ile | Ser | Gly 280 | Ala | Gly | Glu | Val | Ile 285 | Phe | Trp | Asp |
| Asn | Ser 290 | Val | Gly | Tyr | Ser | Pro 295 | Leu | Ser | Ile | Val | Pro 300 | Ala | Ser | Thr | Pro |
| Thr 305 | Pro | Pro | Ala | Pro | Ala 310 | Pro | Ala | Pro | Ala | Ala 315 | Ser | Ser | Ser | Leu | Ser 320 |
| Pro | Thr | Val | Ser | Asp 325 | Ala | Arg | Lys | Gly | Ser 330 | Ile | Phe | Ser | Val | Glu 335 | Thr |
| Ser | Leu | Glu | Ile 340 | Ser | Gly | Val | Lys | Lys 345 | Gly | Val | Met | Phe | Asp 350 | Asn | Asn |
| Ala | Gly | Asn 355 | Phe | Gly | Thr | Val | Phe 360 | Arg | Gly | Asn | Ser | Asn 365 | Asn | Asn | Ala |
| Gly | Ser 370 | Gly | Gly | Ser | Gly | Ser 375 | Ala | Thr | Thr | Pro | Ser 380 | Phe | Thr | Val | Lys |
| Asn 385 | Cys | Lys | Gly | Lys | Val 390 | Ser | Phe | Thr | Asp | Asn 395 | Val | Ala | Ser | Cys | Gly 400 |
| Gly | Gly | Val | Val | Tyr 405 | Lys | Gly | Thr | Val | Leu 410 | Phe | Lys | Asp | Asn | Glu 415 | Gly |
| Gly | Ile | Phe | Phe 420 | Arg | Gly | Asn | Thr | Ala 425 | Tyr | Asp | Asp | Leu | Gly 430 | Ile | Leu |
| Ala | Ala | Thr 435 | Ser | Arg | Asp | Gin | Asn 440 | Thr | Glu | Thr | Gly | Gly 445 | Gly | Gly | Gly |
| Val | Ile 450 | Cys | Ser | Pro | Asp | Asp 455 | Ser | Val | Lys | Phe | Glu 4 60 | Gly | Asn | Lys | Gly |
| Ser 4 65 | Ile | Val | Phe | Asp | Tyr 470 | Asn | Phe | Ala | Lys | Gly 475 | Arg | Gly | Gly | Ser | Ile 480 |
| Leu | Thr | Lys | Glu | Phe 485 | Ser | Leu | Val | Ala | Asp 490 | Asp | Ser | Val | Val | Phe 495 | Ser |
| Asn | Asn | Thr | Ala | Glu | Lys | Gly | Gly | Gly | Ala | Ile | Tyr | Ala | Pro | Thr | Ilě |
306
| 500 | 505 | 510 | |||||||||||||
| Asp | Ile | Ser | Thr | Asn | Gly | Gly | Ser | Ile | Leu | Phe | Glu | Arg | Asn | Arg | Ala |
| 515 | 520 | 525 | |||||||||||||
| Ala | Glu | Gly | Gly | Ala | Ile | Cys | Val | Ser | Glu | Ala | Ser | Ser | Gly | Ser | Thr |
| 530 | 535 | 540 | |||||||||||||
| Gly | Asn | Leu | Thr | Leu | Ser | Ala | Ser | Asp | Gly | Asp | Ile | Val | Phe | Ser | Gly |
| 545 | 550 | 555 | 560 | ||||||||||||
| Asn | Met | Thr | Ser | Asp. Arg | Pro | Gly | Glu | Arg | Ser | Ala | Ala | Arg | Ile | Leu | |
| 565 | 570 | 575 | |||||||||||||
| Ser | Asp | Gly | Thr | Thr | Val | Ser | Leu | Asn | Ala | Ser | Gly | Leu | Ser | Lys | Leu |
| 580 | 585 | 590 | |||||||||||||
| Ile | Phe | Tyr | Asp | Pro | Val | Val | Gin | Asn | Asn | Ser | Ala | Ala | Gly | Ala | Ser |
| 595 | 600 | 605 | |||||||||||||
| Thr | Pro | Ser | Pro | Ser | Ser | Ser | Ser | Met | Pro | Gly | Ala | Val | Thr | Ile | Asn |
| 610 | 615 | 620 | |||||||||||||
| Gin | Ser | Gly | Asn | Gly | Ser | Val | |||||||||
| 625 | 630 |
<210> 326 <211> 40 <212> DNA <213> Chlamydia trachomatis <400> 326 gagagcggcc gctcgatcct gtagtacaaa ataattcagc <210> 327 <211> 33 <212> DNA <213> Chlamydia trachomatis <400> 327 gagagcggcc gcttaaaaga ttctattcaa gcc <210> 328 <211> 2148 <212> DNA <213> Chlymadia trachomatis <400> 328 atgcatcacc atcaccatca cacggccgcg ťccgataact tccagctgtc ccagggtggg cagggattcg ccattccgat cgggcayycg atggcgatcg cgggccagat caagcttccc accgttcata tcgggcctac cgccttcctc ggcttgggtg ttgtcgacaa caacggcaac ggcgcacgag tccaacgcgt ggtcgggagc gctccggcgg caagtctcgg catctccacc ggcgacgtga tcaccgcggt cgacggcgct ccgatcaact cggccaccgc gatggcggac gcgcttaacg ggcatcatcc cggtgacgtc atctcggtga cctggcaaac caagtcgggc ggcacgcgta cagggaacgt gacattggcc gagggacccc cggccgaatt ctgcagatat ccatcacact ggcggccgct cgatcctgta gtacaaaata attcagcagc gggtgcatcg acaccatcac catcttcttc ttctatgcct ggtgctgtca cgattaatca gtccggtaat ggatctgtga tttttaccgc cgagtcattg actccttcag aaaaacttca agttcttaac tctacttcta acttcccagg agctctgact gtgtcaggag gggagttggt tgtgacggaa ggagctacct taactactgg gacčattaca gccacctctg gacgagtgac tttaggatcc ggagcttcgt tgtctgccgt tgcaggtgct gcaaataata attatacttg tacagtatct aagttgggga ttgatttaga atccttttta actcctaact ataagacggc catactgggt gcggatggaa cagttactgt taacagcggc tctactttag acctagtgat ggagaatgag gcagaggtct atgataatcc gctttttgtg ggatcgctga caattccttt tgttactcta tcttctagta gtgctagtaa cggagttaca aaaaattctg tcactattaa tgatgcagac gctgcgcact atgggtatca aggctcttgg tctgcagatt ggacgaaacc gcctctggct cctgatgcta aggggatggt acctcctaat accaataaca ctctgtatct gacatggaga cctgcttcga attacggtga atatcgactg gatcctcaga gaaagggaga actagtaccc aactctcttt gggtagcggg atctgcatta agaaccttta ctaatggttt gaaagaacac
120
180
240
300
360
420
480
540
600
660
720
780
840
900
960
1020
1080
1140
1200
1260
307
tatgtttcta gagatgttgg atttgtagca tctctgcatg ctctcgggga ttatattctq aattatacgc aagatgatcg ggatggcttt ttagctagat atgggggatt ccaggcgacc gcagcctccc attatgaaaa tgggtcaata tttggagtgg cttttggaca actctatggt cagacaaaga gcagaatgta ttactctaaa gatgctggga acatgacgat gttgtcctgt ttcggaagaa gttacgtaga tattaaagga acagaaactg ttatgtattg ggagacggct tatggctatt ctgtgcacag aatgcatacg cagtatttta atgacaaaac gcagaagttc gatcattcga aatgtcattg gcacaacaat aactattatg cgtttgtagg tgccgagcat aatttcttag agtactgcat tcctactcgt cagttagcta gagattatga gcttacaggg tttatgcgtt ttgaaatggc cggaggatgg tccagtteta cacgagaaac tggctcccta actagatatt tcgctcgcgg gtcagggcat aatatgtcgc ttccaatagg aattgtagct catgcagttt ctcatgtgcg aagatctcct ccttctaaac tgacactaaa tatgggatat agaccagaca tttggcgtgt cactccacat tgcaatatgg aaattattgc taacggagtg aagacaccta tacaaggatc cccgctggca cggcatgcct tcttcttaga agtgcatgat actttgtata ttcatcattt tggaagagcc tatatgaact attcattaga tgctcgtcgt cgacaaaccg cacattttgt atctatgggc ttgaatagaa tcttttaa <210> 329 <211> 715 <212> PRT <213> Chlamydia trachomatis
1320
1380
1440
1500
1560
1620
1680
1740
1800
1860
1920
1980
2040
2100
2148 <400> 329
| Met | His | His | His | His | His | His | Thr | Ala | Ala | Ser | Asp | Asn | Phe | Gin | Leu |
| 1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
| Ser | Gin | Gly | Gly | Gin | Gly | Phe | Ala | Ile | Pro | Ile | Gly | Gin | Ala | Met | Ala |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Ile | Ala | Gly | Gin | Ile | Lys | Leu | Pro | Thr | Val | His | Ile | Gly | Pro | Thr | Ala |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Phe | Leu | Gly | Leu | Gly | Val | Val | Asp | Asn | Asn | Gly | Asn | Gly | Ala | Arg | Val |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Gin | Arg | Val | Val | Gly | Ser | Ala | Pro | Ala | Ala | Ser | Leu | Gly | Ile | Ser | Thr |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Gly | Asp | Val | Ile | Thr | Ala | Val | Asp | Gly | Ala | Pro | Ile | Asn | Ser | Ala | Thr |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Ala | Met | Ala | Asp' | Ala | Leu | Asn | Gly | His | His | Pro | Gly | Asp | Val | Ile | Ser |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Val | Thr | Trp | Gin | Thr | Lys | Ser | Gly | Gly | Thr | Arg | Thr | Gly | Asn | Val | Thr |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Leu | Ala | Glu | Gly | Pro | Pro | Ala | Glu | Phe | Cys | Arg | Tyr | Pro | Ser | His | Trp |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Arg | Pro | Leu | ASp | Pro | Val | Val | Gin | Asn | Asn | Ser | Ala | Ala | Gly | Ala | Ser |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Thr | Pro | Ser | Pro | Ser | Ser | Ser | Ser | Met | Pro | Gly | Ala | Val | Thr | Ile | Asn |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Gin | Ser | Gly | Asn | Gly | Ser | Val | Ile | Phe | Thr | Ala | Glu | Ser | Leu | Thr | Pro |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Ser | Glu | Lys | Leu | Gin | Val | Leu | Asn | Ser | Thr | Ser | Asn | Phe | Pro | Gly | Ala |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Leu | Thr | Val | Ser | Gly | Gly | Glu | Leu | Val | Val | Thr | Glu | Gly | Ala | Thr | Leu |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Thr | Thr | Gly | Thr | Ile | Thr | Ala | Thr | Ser | Gly Arg | Val | Thr | Leu | Gly | Ser | |
| 225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
| Gly | Ala | Ser | Leu | Ser | Ala | Val | Ala | Gly | Ala | Ala | Asn | Asn | Asn | Tyr | Thr |
| 245 | 250 | 255 | |||||||||||||
| Cys | Thr | Val | Ser | Lys | Leu | Gly | Ile | Asp | Leu | Glu | Ser | Phe | Leu | Thr | Pro |
| 260 | 265 | 270 | |||||||||||||
| Asn | Tyr | Lys | Thr | Ala | Ile | Leu | Gly | Ala | Asp | Gly | Thr | Val | Thr | Val | Asn |
| 275 | 280 | 285 | |||||||||||||
| Ser | Gly | Ser | Thr | Leu | Asp | Leu | Val | Met | Glu | Asn | Glu | Ala | Glu | Val | Tyr |
| 290 | 295 | 300 | |||||||||||||
| Asp | Asn | Pro | Leu | Phe | Val | Gly | Ser | Leu | Thr | Ile- | Pro | Phe | Val | Thr | Leu |
308 • · · · · · · · • ··· · · ··· · · · • ········· · • · · ·· · · · · · ··· ··· ·· ·· ·· ··
| 305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
| Ser | Ser | Ser | Ser | Ala | Ser | Asn | Gly | Val | Thr | Lys | Asn | Ser | Val | Thr | Ile |
| 325 | 330 | 335 | |||||||||||||
| Asn | Asp | Ala | Asp | Ala | Ala | His | Tyr | Gly | Tyr | Gin | Gly | Ser | Trp | Ser | Ala |
| 340 | 345 | 350 | |||||||||||||
| Asp | Trp | Thr | Lys | Pro | Pro | Leu | Ala | Pro | Asp | Ala | Lys | Gly | Met | Val | Pro |
| 355 | 360 | 365 | |||||||||||||
| Pro | Asn | Thr | Asn | Asn | Thr | Leu | Tyr | Leu | Thr | Trp | Arg | Pro | Ala | Ser | Asn |
| 370 | 375 | 380 | |||||||||||||
| Tyr | Gly | Glu | Tyr | Arg | Leu | Asp | Pro | Gin | Arg | Lys | Gly | Glu | Leu | Val | Pro |
| 385 | 390 | 395 | 400 | ||||||||||||
| Asn | Ser | Leu | Trp | Val | Ala | Gly | Ser | Ala | Leu | Arg | Thr | Phe | Thr | Asn | Gly |
| 405 | 410 | 415 | |||||||||||||
| Leu | Lys | Glu | His | Tyr | Val | Ser | Arg | Asp | Val | Gly | Phe | Val | Ala | Ser | Leu |
| 420 | 425 | 430 | |||||||||||||
| His | Ala | Leu | Gly | Asp | Tyr | Ile | .Leu | Asn | Tyr | Thr | Gin | Asp | Asp | Arg | Asp |
| 435 | 440 | 445 | |||||||||||||
| Gly | Phe | Leu | Ala | Arg | Tyr | Gly | Gly | Phe | Gin | Ala | Thr | Ala | Ala | Ser | His |
| 450 | 455 | 4 60 | |||||||||||||
| Tyr | Glu | Asn | Gly | Ser | Ile | Phe | Gly | Val | Ala | Phe | Gly | Gin | Leu | Tyr | Gly |
| 4 65 | 470 | 475 | 480 | ||||||||||||
| Gin | Thr | Lys | Ser | Arg | Met | Tyr | Tyr | Ser | Lys | Asp | Ala | Gly | Asn | Met | Thr |
| 485 | 490 | 495 | |||||||||||||
| Met | Leu | Ser | Cys | Phe | Gly | Arg | Ser | Tyr | Val | Asp | Ile | Lys | Gly | Thr | Glu |
| 500 | 505 | 510 | |||||||||||||
| Thr | Val | Met | Tyr | Trp | Glu | Thr | Ala | Tyr | Gly | Tyr | Ser | Val | His | Arg | Met |
| 515 | 520 | 525 | |||||||||||||
| His | Thr | Gin | Tyr | Phe | Asn | Asp | Lys | Thr | Gin | Lys | Phe | Asp | His | Ser | Lys |
| 530 | 535 | 540 | |||||||||||||
| Cys | His | Trp | His | Asn | Asn | Asn | Tyr | Tyr | Ala | Phe | Val | Gly | Ala | Glu | His |
| 545 | 550 | 555 | 560 | ||||||||||||
| Asn | Phe | Leu | Glu | Tyr | Cys | Ile | Pro | Thr | Arg | Gin | Leu | Ala | Arg | Asp | Tyr |
| 565 | 570 | 57 5 | |||||||||||||
| Glu | Leu | Thr | Gly | Phe | Met | Arg | Phe | Glu | Met | Ala | Gly | Gly | Trp | Ser | Ser |
| 580 | 585 | 590 | |||||||||||||
| Ser | Thr | Arg | Glu | Thr | Gly | Ser | Leu | Thr | Arg | Tyr | Phe | Ala | Arg | Gly | Ser |
| 595 | 600 | 605 | |||||||||||||
| Gly | His | Asn | Met | Ser | Leu | Pro | Ile | Gly | Ile | Val | Ala | His | Ala | Val | Ser |
| 610 | 615 | 620 | |||||||||||||
| His | Val | Arg | Arg | Ser | Pro | Pro | Ser | Lys | Leu | Thr | Leu | Asn | Met | Gly | Tyr |
| 625 | 630 | 635 | 640 | ||||||||||||
| Arg | Pro | Asp | Ile | Trn * — c | Arg | Val | Thr | Pro | His | Cys | Asn | Met | Glu | Ile | Ile |
| 645 | 650 | 655 | |||||||||||||
| Ala | Asn | Gly | Val | Lys | Thr | Pro | Ile | Gin | Gly | Ser | Pro | Leu | Ala | Arg | His |
| 660 | 665 | 670 | |||||||||||||
| Ala | Phe | Phe | Leu | Glu | Val | His | Asp | Thr | Leu | Tyr | Ile | His | His | Phe | Gly |
| 675 | 680 | 685 | |||||||||||||
| Arg | Ala | Tyr | Met | Asn | Tyr | Ser | Leu | Asp | Ala | Arg | Arg | Arg | Gin | Thr | Ala |
| 690 | 695 | 700 | |||||||||||||
| His | Phe | Val | Ser | Met | Gly | Leu | Asn | Arg | Ile | Phe |
705 710 715 <210> 330 <211> 38 <212> DNA <213> Chlymadia trachomatis <400> 330 gagagcggcc gctcatgaaa tggctgtcag ctactgcg <210> 331
309
<211> 34 <212> DNA <213> Chlymadia trachomatis <4 00> 331 gagcggccgc ttacttaatg cgaatttctt caag 34 <210> 332 <211> 1557 <212> DNA <213> Chlymadia trachomatis <400> 332 · atgcatcacc atcaccatca cacggccgcg tccgataact tccagctgtc ccagggtggg 60 cagggattcg ccattccgat cgggcaggcg atggcgatcg cgggccagat caagcttccc 120 accgttcata tcgggcctac cgccttcctc ggcttgggtg ttgtcgacaa caacggcaac 180 ggcgcacgag tccaacgcgt ggtcgggagc gctccggcgg caagtctcgg catctccacc 240 ggcgacgtga tcaccgcggt cgacggcgct ccgatcaact cggccaccgc gatggcggac 300 gcgcttaacg ggcatcatcc cggtgacgtc atctcggtga cctggcaaac caagtcgggc 360 ggcacgcgta cagggaacgt gacattggcc gagggacccc cggccgaatt ctgcagatat 420 ccatcacact ggcggccgct catgaaatgg ctgtcagcta ctgcggtgtt tgctgctgtt 480 ctcccctcag tttcagggtt ttgcttccca gaacctaaag aattaaattt ctctcgcgta 540 gaaacttctt cctctaccac ttttactgáa acaattggag aagctggggc agaatatatc 600 gtctctggta acgcatcttt cacaaaattt accaacattc ctactaccga tacaacaact 660 cccacgaact caaactcctc tagctctagc ggagaaactg cttccgtttc tgaggatagt 720 gactctacaa caacgactcc tgatcctaaa ggtggcggcg ccttttataa cgcgcactcc 780 ggagttttgt cctttatgac acgatcagga acagaaggtt ccttaactct qtctgagata 840 aaaatgactg gtgaaggcgg tgctatcttc tctcaaggag agctgctatt tacagatctg 900 acaagtctaa ccatccaaaa taacttatcc cagctatccg gaggagcgat ttttggagga 960 tctacaatct ccctatcagg gattactaaa gcgactttct cctgcaactc tgcagaagtt 1020 cctgctcctg ttaagaaacc tacagaacct aaagctcaaa cagcaagcga aacgtcgggt 1080 tctagtagtt ctagcggaaa tgattcggtg tcttccccca gttccagtag agctgaaccc 1140 gcagcagcta atcttcaaag tcactttatt tgtgctacag ctactcctgc tgctcaaacc 1200 gatacagaaa catcaactcc ctctcataag ccaggatctg ggggagctat ctatgctaaa 1260 ggcgacctta ctatcgcaga ctctcaagag gtactattct caataaataa agctactaaa 1320 gatggaggag cgatctttgc tgagaaagat gtttctttcg agaatattac atcattaaaa 1380 gtacaaacta acggtgctga agaaaaggga ggagctatct atgctaaagg tgacctctca 1440 attcaatctt ctaaacagag tctttttaat tctaactaca gtaaacaagg tgggggggct 1500 ctatatgttg aaggaggtat aaacttccaa gatcttgaag aaattcgcat taagtaa 1557 «i <210> 333 <211> 518 <212> PRT <213> Chlymadia trachomatis <400> 333
| Met | His | His | His | His | His | His | Thr | Ala | Ala | Ser | Asp | Asn | Phe | Gin | Leu |
| 1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
| Ser | Gin | Gly | Gly | Gin | Gly | Phe | Ala | Ile | Pro | Ile | Gly | Gin | 7Lla | Met | Ala |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Ile | Ala | Gly | Gin | Ile | Lys | Leu | Pro | Thr | Val | His | Ile | Gly | Pro | Thr | Ala |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Phe | Leu | Gly | Leu | Gly | Val | Val | Asp | Asn | Asn | Gly | Asn | Gly | Ala | Arg | Val |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Gin | Arg | Val | Val | Gly | Ser | Ala | Pro | Ala | Ala | Ser | Leu | Gly | Ile | Ser | Thr |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Gly | Asp | Val | Ile | Thr | Ala | Val | Asp | Gly | Ala | Pro | Ile | Asn | Ser | Ala | Thr |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Ala | Met | Ala | Asp | Ala | Leu | Asn | Gly | His | His | Pro | Gly | Asp | Val | Ile | Ser |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Val | Thr | Trp | Gin | Thr | Lys | Ser | Gly | Gly | Thr | Arg- | Thr | Gly | Asn | Val | Thr |
310 ·· ··«· ·· ·· ·· · · · · · · · · ···· · ·· · · ·· · ·
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Leu | Ala | Glu | Gly | Pro | Pro | Ala | Glu | Phe | Cys | Arg | Tyr | Pro | Ser | His | Trp |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Arg | Pro | Leu | Met | Lys | Trp | Leu | Ser | Ala | Thr | Ala | Val | Phe | Ala | Ala | Val |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Leu | Pro | Ser | Val | Ser | Gly | Phe | Cys | Phe | Pro | Glu | Pro | Lýs | Glu | Leu | Asn |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Phe | Ser | Arg | Val | Glu | Thr | Ser | Ser | Ser | Thr | Thr | Phe | Thr | Glu | Thr | Ile |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Gly | Glu | Ala | Gly | Ala | Glu | Tyr | Ile | Val | Ser | Gly | Asn | Ala | Ser | Phe | Thr |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Lys | Phe | Thr | Asn | Ile | Pro | Thr | Thr | Asp | Thr | Thr | Thr | Pro | Thr | Asn | Ser |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Asn | Ser | Ser | Ser | Ser | Ser | Gly | Glu | Thr | Ala | Ser | Val | Ser | Glu | Asp | Ser |
| 225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
| Asp | Ser | Thr | Thr | Thr | Thr | Pro | Asp | Pro | Lys | Gly | Gly | Gly | Ala | Phe | Tyr |
| 245 | 250 | 255 | |||||||||||||
| Asn | Ala | His | Ser | Gly | Val | Leu | Ser | Phe | Met | Thr | Arg | Ser | Gly | Thr | Glu |
| 260 | 265 | 270 | |||||||||||||
| Gly | Ser | Leu | Thr | Leu | Ser | Glu | Ile | Lys | Met | Thr | Gly | Glu | Gly | Gly | Ala |
| 275 | 280 | 285 | |||||||||||||
| Ile | Phe | Ser | Gin | Gly | Glu | Leu | Leu | Phe | Thr | Asp | Leu | Thr | Ser | Leu | Thr |
| 290 | 295 | 300 | |||||||||||||
| Ile | Gin | Asn | Asn | Leu | Ser | Gin | Leu | Ser | Gly | Gly | Ala | Ile | Phe | Gly | Gly |
| 305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
| Ser | Thr | Ile | Ser | Leu | Ser | Gly | Ile | Thr | Lys | Ala | Thr | Phe | Ser | Cys | Asn |
| 325 | 330 | 335 | |||||||||||||
| Ser | Ala | Glu | Val | Pro | Ala | Pro | Val | Lys | Lys | Pro | Thr | Glu | Pro | Lys | Ala |
| 340 | 345 | 350 | |||||||||||||
| Gin | Thr | Ala | Ser | Glu | Thr | Ser | Gly | Ser | Ser | Ser | Ser | Ser | Gly | Asn | Asp |
| 355 | 360 | 365 | |||||||||||||
| Ser | Val | Ser | Ser | Pro | Ser | Ser | Ser | Arg | Ala | Glu | Pro | Ala | Ala | Ala | Asn |
| 370 | 375 | 380 | |||||||||||||
| Leu | Gin | Ser | His | Phe | Ile | Cys | Ala | Thr | Ala | Thr | Pro | Ala | Ala | Gin | Thr |
| 385 | 390 | 395 | 400 | ||||||||||||
| Asp | Thr | Glu | Thr | Ser | Thr | Pro | Ser | His | Lys | Pro | Gly | Ser | Gly | Gly | Ala |
| 405 | 410 | 415 | |||||||||||||
| Ile | Tyr | Ala | Lys | Gly | Asp | Leu | Thr | Ile | Ala | Asp | Ser | Gin | Glu | Val | Leu |
| 420 | 425 | 430 | |||||||||||||
| Phe | Ser | Ile | Asn | Lys | Ala | Thr | Lys | Asp | Gly | Gly | Ala | Ile | Phe | Ala | Glu |
| 435 | 440 | 445 | |||||||||||||
| T.VC jr —» | Δ C73 | Val | Ser | Phe | Glu | Asn | Ile | Thr | Ser | T.VC —'J | Val | Gin | Thr | Asn | |
| 450 | 455 | 460 | |||||||||||||
| Gly | Tkla | Glu | Glu | Lys | Gly | Gly | Ala | Ile | Tyr | Ala | Lys | Gly | Asp | Leu | Ser |
| 465 | 470 | 475 | 480 | ||||||||||||
| Ile | Gin | Ser | Ser | Lys | Gin | Ser | Leu | Phe | Asn | Ser | Asn | Tyr | Ser Lys | Gin | |
| 485 | 490 | 4 95 | |||||||||||||
| Gly | Gly | Gly | Ala | Leu | Tyr | Val | Glu | Gly Gly | Ile | Asn | Phe | Gin Asp | Leu | ||
| 500 | 505 | 510 | |||||||||||||
| Glu | Glu | Ile | Arg | Ile | Lys |
515 <210> 334 <211> 37 <212> DNA <213> Chlymadia trachomatis <400> 334 gagagcggcc gctcggtgac ctctcaattc aatcttc <210> 335 ····
311 • · • · ·· • ··· • ··· • · I <211> 39 <212> DNA <213> Chlamydia trachomatis <400> 335 gagagcggcc gcttagttct ctgttacagá <210> 336 <211> 1758 <212> DNA <213> Chlymadia trachomatis taaggagac <400> 336 atgcatcacc cagggattcg accgttcata ggcgcacgag ggcgacgtga gcgcttaacg ggcacgcgta ccatcacact aattctaact caagatcttg atcactttac tcctctcctc ggctcagact actgataaga gcgacagatg cgtctacaat aacatcaccc gagggcggtg agtttctgtt gaaatctctc ggtgaaacag aaacgtcttg aatggtggtg cccgcagcag agcacacctt tctcctgcaa gattatgtag gctaaaaaag g a 9 a t a cj g t g tctgtaacag atcaccatca ccattccgat tcgggcctac tccaacgcgt tcaccgcggt ggcatcatcc cagggaacgt ggcggccgct acagtaaaca aagaaattcg cttctttaaa aatctggttc cggatacctc atctttcgat ttggaggtgg ttttgaaaaa tatctaattt gactcttcat taattaataa agactťacac tcattactgg ccttatctaa gagcccacac cttctgccgc catcttctac cctctaataa ttgatacgac ccaagatgtc gaggtatctg agaactaa cacggccgcg cgggcaggcg cgccttcctc ggtcgggagc cgacggcgct cggtgacgtc gacattggcc cggtgacctc aggtgggggg cattaagtac agctcaagca tggagcaact agaaacagtt tactaacatc tgcttacgta ctcttccgat gacagggaag aaaaggtaca cacatcagaa ctctgatgtg caataaatct ccttcaaagc atgcccagat gacgtctact cgtctcttca ggaaactcaa tatcagcaaa ccgcatagac ctgtaaagaa tccgataact atggcgatcg ggcttgggtg gctccggcgg ccgatcaact atctcggtga gagggacccc tcaattcaat gctctatatg aataaagctg tctgcaggaa acagtctccg ccagtcacag acaggaatta aaaggaaccc aaacaaggtg actctattcc gataaagctc aaacatggtg gaaacaattc acaggaggta atttctatat agcttcccaa cccaaatctg ttaaccttac gatcctaatg aacactgcta caactgaata ť F ť O c 5 tccagctgtc cgggccagat ttgtcgacaa
Caagtctcgg cggccaccgc cctggcaaac cggccgaatt cttctaaaca ttgaaggagg gaacgttcga atgdagatgc actcaggaga ctaaaggcgg tcgaaattgc ttacttgtga gaggaatcta aagagaatac ttacaatgac gtggagcctt caggaatcac atggtggagg ccgggaattc cggcggatac ccccggtctc tagcagcctc ctgatacaga agaaaggcgg tctctgagaa ccagggtggg caagcttccc caacggcaac catctccacc gatggcggac caagtcgggc ctgcagatat gagtcttttt tataaacttc aacaaaaáaa ttgggcctct ctctagctct tgggctttat aaataacaaa aaactctcac cggagaagac tgccaaagaa aggactggat tgttaccaaa gcctgtacat cgtgtgtaca tgcagcagaa tgcagaacag aactgctcta ttcačaagcc cttattgatc tggaatctat ctccgctaca
-X rx+- ^.4- 4- -X ayuc u ta
120
180
240
300
360
420
480
540
600
660
720
780
840
900
960
1020
1080
1140
1200
1260
1320
1380
1440
1500
1560
1620
1680
-i -f λ n x / v
1758 <210> 337 <211> 585 <212> PRT <213> Chlamydia trachomatis <400> 337
| Met | His | His | His | His | His | His | Thr | Ala | Ala | Ser | Asp | Asn | Phe | Gin | Leu |
| 1 | Gly | 5 | 10 | 15 | |||||||||||
| Ser | Gin | Gly | Gin | Gly | Phe | Ala | Ile | Pro | Ile | Gly | Gin | Ala | Met | Ala | |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Ile | Ala | Gly | Gin | Ile | Lys | Leu | Pro | Thr | Val | His | Ile | Gly | Pro | Thr | Ala |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Pbe | Leu | Gly | Leu | Gly | Val | Val | Asp | Asn | Asn | Gly | Asn | Gly | Ala | Arg | Val |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Gin | Arg | Val | Val | Gly | Ser | Ala | Pro | Ala | Ala | Ser | Leu | Gly | Ile | Ser | Thr |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Gly | Asp | Val | Ile | Thr | Ala | Val | Asp | Gly | Ala | Pro | Ile | Asn | Ser | Ala | Thr |
312 ·· ««·· ·· «· ·· ·»·· ··· · · · · '· * • ··· 9- 9 999 9 · 9
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Ala | Met | Ala | Asp | Ala | Leu | Asn | Gly | His | His | Pro | Gly | Asp | Val | Ile | Ser |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Val | Thr | Trp | Gin | Thr | Lys | Ser | Gly | Gly | Thr | Arg | Thr | Gly | Asn | Val | Thr |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Leu | Ala | Glu | Gly | Pro | Pro | Ala | Glu | Phe | Cys | Arg | Tyr | Pro | Ser | His | Trp |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Arg | Pro | Leu | Gly | Asp | Leu | Ser | Ile | Gin | Ser | Ser | Lys | Gin | Ser | Leu | Phe |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Asn | Ser | Asn | Tyr | Ser | Lys | Gin | Gly | Gly | Gly | Ala | Leu | Tyr | Val | Glu | Gly |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Gly | Ile | Asn | Phe | Gin | Asp | Leu | Glu | Glu | Ile | Arg | Ile | Lys | Tyr | Asn | Lys |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Ala | Gly | Thr | Phe | Glu | Thr | Lys | Lys | Ile | Thr | Leu | Pro | Ser | Leu | Lys | Ala |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Gin | Ala | Ser | Ala | Gly | Asn | Ala | Asp | Ala | Třp | Ala | Ser | Ser | Ser | Pro | Gin |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Ser | Gly | Ser | Gly | Ala | Thr | Thr | Val | Ser | Asp | Ser | Gly | Asp | Ser | Ser | Ser |
| 225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
| Gly | Ser | Asp | Ser | Asp | Thr | Ser | Glu | Thr | Val | Pro | Val | Thr | Ala | Lys | Gly |
| 245 | 250 | 255 | |||||||||||||
| Gly | Gly | Leu | Tyr | Thr | Asp | Lys | Asn | Leu | Ser | Ile | Thr | Asn | Ile | Thr | Gly |
| 260 | 265 | 270 | |||||||||||||
| Ile | Ile | Glu | Ile | Ala | Asn | Asn | Lys | Ala | Thr | Asp | Val | Gly | Gly | Gly | Ala |
| 275 | 280 | 285 | |||||||||||||
| Tyr | Val | Lys | Gly | Thr | Leu | Thr | Cys | Glu | Asn | Ser | His | Arg | Leu | Gin | Phe |
| 290 | 295 | 300 | |||||||||||||
| Leu | Lys | Asn | Ser | Ser | Asp | Lys | Gin | Gly | Gly | Gly | Ile | Tyr | Gly | Glu | Asp |
| 305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
| Asn | Ile | Thr | Leu | Ser | Asn | Leu | Thr' | Gly | Lys | Thr | Leu | Phe | Gin | Glu | Asn |
| 325 | 330 | 335 | |||||||||||||
| Thr | Ala | Lys | Glu | Glu | Gly | Gly Gly | Leu | Phe | Ile | Lys | Gly | Thr | Asp | Lys | |
| 340 | 345 | 350 | |||||||||||||
| Ala | Leu | Thr | Met | Thr | Gly | Leu | Asp | Ser | Phe | Cys | Leu | Ile | Asn | Asn | Thr |
| 355 | 360 | 365 | |||||||||||||
| Ser | Glu | Lys | His | Gly | Gly | Gly | Ala | Phe | Val | Thr | Lys | Glu | Ile | Ser | Gin |
| 370 | 375 | 380 | |||||||||||||
| Thr | Tyr | Thr | Ser | Asp | Val | Glu | Thr | Ile | Pro | Gly | Ile | Thr | Pro | Val | His |
| 385 | 390 | 395 | 400 | ||||||||||||
| Gly | Glu | Thr | Val | Ile | Thr | Gly | Asn | Lys | Ser | Thr | Gly | Gly | Asn | Gly | Gly |
| 405 | 410 | 415 | |||||||||||||
| Gly | •Val | Cys | Thr | Lys | Arg | Leu | Ala | Leu | Ser | Asn | Leu | Gin | Ser | Ile | Ser |
| 420 | 425 | 430 | |||||||||||||
| Ile | Ser | Gly | Asn | Ser | Ala | Ala | Glu | Asn | Gly | Gly | Gly | Ala | His | Thr | Cys |
| 435 | 440 | 445 | |||||||||||||
| Pro | Asp | Ser | Phe | Pro | Thr | Ala | Asp | Thr | Ala | Glu | Gin | Pro | Ala | Ala | Ala |
| 450 | 455 | 460 | |||||||||||||
| Ser | Ala | Ala | Thr | Ser | Thr | Pro | Lys | Ser | Ala | Pro | Val | Ser | Thr | Ala | Leu |
| 465 | 470 | 475 | 480 | ||||||||||||
| Ser | Thr | Pro | Ser | Ser | Ser | Thr | Val | Ser | Ser | Leu | Thr | Leu | Leu | Ala | Ala |
| 485 | 4 90 | 4 95 | |||||||||||||
| Ser | Ser | Gin | Ala | Ser | Pro | Ala | Thr | Ser | Asn | Lys | Glu | Thr | Gin | Asp | Pro |
| 500 | 505 | 510 | |||||||||||||
| Asn | Ala | Asp | Thr | Asp | Leu | Leu | Ile | Asp | Tyr | Val | Val | Asp | Thr | Thr | Ile |
| 515 | 520 | 525 | |||||||||||||
| Ser | Lys | Asn | Thr | Ala | Lys | Lys | Gly | Gly | Gly | Ile | Tyr | Ala | Lys | Lys | Ala |
| 530 | 535 | 540 | |||||||||||||
| Lys | Met | Ser | Arg | Ile | Asp | Gin | Leu | Asn | Ile | Ser | Glu | Asn | Ser | Ala | Thr |
| 545 | 550 | 555 | 560 | ||||||||||||
| Glu | Ile | Gly | Gly | Gly | Ile | Cys | Cys | Lys | Glu | Ser | Leu | Glu | Leu | Asp | Ala |
| 565 | 570 | 575 |
313 .·· ♦«·»· «* ·* *· ·»·· • · « · · « e · *
Β « · · · · Β«» · * · ·«· ·· · Λ · · · • · · · · · · · · » ··«« ·*· ·* «· ·* ··
Leu Val Ser Leu Ser Val Thr Glu Asn 580 585 <210> 338 <211> 38 <212> DNA <213> Chlamydai trachomatis <400> 338 gagagcggcc gctcgaccaa ctgaatatct ctgagaac 38 <210> 339 <211> 35 <212> DNA <213> Chlamydia trachomatis <400> 339 gagagcggcc gcttaagaga ctacgtggag ttctg 35 <210> 340 <211> 1965 <212> DNA <213> Chlamydia trachomatis <400> 340 atgcatcacc atcaccatca cacggccgcg tccgataact tccagctgtc ccagggtggg 60 cagggattcg ccattccgat. cgggcaggcg atggcgatcg cgggccagat caagcttccc 120 accgttcata tcgggcctac cgccttcctc ggcttgggtg ttgtcgacaa caacggcaac 180 ggcgcacgag tccaacgcgt ggtcgggagc gctccggcgg caagtctcgg catctccacc 240 ggcgacgtga tcaccgcggt cgacggcgct ccgatcaact cggccaccgc gatggcggac 300 gcgcttaacg ggcatcatcc cggtgacgtc atctcggtga cctggcaaac caagtcgggc 360 ggcacgcgta cagggaacgt gacattggcc gagggacccc cggccgaatt ctgcagatat 420 ccatcacact ggcggccgct cgaccaactg aatatctctg agaactccgc tacagagata 480 ggtggaggta tctgctgtaa agaatcttta gaactagatg ctctagtctc cttatctgta 540 acagagaacc ttgttgggaa agaaggtgga ggcttacatg ctaaaactgt aaatatttct 600 aatctgaaat caggcttctc tttctcgaac aacaaagcaa actcctcatc cacaggagtc 660 gcaacaacag cttcagcacc tgctgcagct gctgcttccc tacaagcagc cgcagcagcc 720 gcaccatcat ctccagcaac accaacttat tcaggtgtag taggaggagc tatctatgga 780 gaaaaggtta cattctctca atgtagcggg acttgtcagt tctctgggaa ccaagctatc 840 gataacaatc cctcccaatc atcgttgaac gtacaaggag gagccatcta tgccaaaacc 900 tctttgtcta ttggatcttc cgatgctgga acctcctata ttttctcggg gaacagtgtc 960 tccactggga aatctcaaac aacagggcaa atagcgggag gagcgatcta ctcccctact 1020 gttacattga attgtcctgc gacattctct aacaatacag cctctatagc tacaccgaag 1080 acttcttctg aagatggatc ctcaggaaat tctattaaag ataccattgg aggagccatt 1140 gcagggacag ccattaccct atctggagtc tctcgatttt cagggaatac ggctgattta 1200 ggagctgcaa taggaactct agctaatgca aatacaccca gtgcaactag cggatctcaa 1260 aatagcatta cagaaaaaat tactttagaa aacggttctt ttatttttga aagaaaccaa 1320 gctaataaac gtggagcgat ttactctcct agcgtttcca ttaaagggaa taatattacc 1380 ttcaatcaaa atacatccac tcatgatgga agcgctatct actttacaaa agatgctacg 1440 attgagtctt taggatctgt tctttttaca ggaaataacg ttacagctac acaagctagt 1500 tctgcaacat ctggacaaaa tacaaatact gccaactatg gggcagccat ctttggagat 1560 ccaggaacca ctcaatcgtc tcaaacagat gccattttaa cccttcttgc ttcttctgga 1620 aacattactt ttagcaacaa cagtttacag aataaccaag gtgatactcc cgctagcaag 1680 ttttgtagta ttgcaggata cgtcaaactc tctctacaag ccgctaaagg gaagactatt 1740 agctttttcg attgtgtgca cacctctacc aaaaaaacag gttcaacaca aaacgtttat 1800 gaaactttag atattaataa agaagagaac agtaatccat atacaggaac tattgtgttc . 1860 tcttctgaat tacatgaaaa caaatčttac atcccacaga atgcaatcct tcacaacgga 1920 actttagttc. ttaaagagaa aacagaactc cacgtagtct cttaa 1965 <210> 341 <211> 654
314
9999
9 ·
999 9 9
9
9·· 9 · 9 9 • 9 ©
• ·9
9,'**9 * 9 9 • 9 9
9·9 9
9 9 9 «9 99 <212> PRT <213> Chlamydia trachomatis <400> 341
| Met 1 | His | His | His | His 5 | His | His | Thr | Ala | Ala 10 | Ser | Asp | Asn | Phe | Gin 15 | Leu |
| Ser | Gin | Gly | Gly | Gin | Gly | Phe | Ala | Ile | Pro | Ile | Gly | Gin | Ala | Met | Ala |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Ile | Ala | Gly | Gin | Ile | Lys | Leu | Pro | Thr | Val | His | Ile | Gly | Pro | Thr | Ala |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Phe | Leu | Gly | Leu | Gly | Val | Val | Asp | Asn | Asn | Gly | Asn | Gly | Ala | Arg | Val |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Gin | Arg | Val | Val | Gly | Ser | Ala | Pro | Ala | Ala | Ser | Leu | Gly | Ile | Ser | Thr |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Gly | Asp | Val | Ile | Thr | Ala | Val | Asp | Gly | Ala | Pro | Ile | Asn | Ser | Ala | Thr |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Ala | Met | Ala | Asp | Ala | Leu | Asn | Gly | His | His | Pro | Gly | Asp | Val | Ile | Ser |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Val | Thr | Trp | Gin | Thr | Lys | Ser | Gly | Gly | Thr | Arg | Thr | Gly | Asn | Val | Thr |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Leu | Ala | Glu | Gly | Pro | Pro | Ala | Glu | Phe | Cys | Arg | Tyr | Pro | Ser | His | Trp |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Arg | Pro | Leu | Asp | Gin | Leu | Asn | Ile | Ser | Glu | Asn | Ser | Ala’ | Thr | Glu | Ile |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Gly | Gly | Gly | Ile | Cys | Cys | Lys | Glu | Ser | Leu | Glu | Leu | Asp | Ala | Leu | Val |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Ser | Leu | Ser | Val | Thr | Glu | Asn | Leu | Val | Gly | Lys | Glu | Gly | Gly | Gly | Leu |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| His | Ala | Lys | Thr | Val | Asn | Ile | Ser | Asn | Leu | Lys | Ser | Gly | Phe | Ser | Phe |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Ser | Asn | Asn | Lys | Ala | Asn | Ser | Ser | Ser | Thr | Gly | Val | Ala | Thr | Thr | Ala |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Ser | Ala | Pro | Ala | Ala | Ala | Ala | Ala | Ser | Leu | Gin | Ala | Ala | Ala | Ala | Ala |
| 225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
| Ala | Pro | Ser | Ser | Pro | Ala | Thr | Pro | Thr | Tyr | Ser | Gly | Val | Val | Gly | Gly |
| 245 | 250 | 255 | |||||||||||||
| Ala | Ile | Tyr | Gly | Glu | Lys | Val | Thr | Phe | Ser | Gin | Cys | Ser | Gly | Thr | Cys |
| 260 | 265 | 270 | |||||||||||||
| Gin | Phe | Ser | Gly | Asn | Gin | Ala | Ile | Asp | Asn | Asn | Pro | Ser | Gin | Ser | Ser |
| 275 | 280 | 285 | |||||||||||||
| Leu | Asn | Val | Gin | Gly | Gly | Ala | Ile | Tyr | Ala | Lys | Thr | Ser | Leu | Ser | Ile |
| O ΟΛ | 295 | 300 | |||||||||||||
| Gly | Ser | Ser | Asp | Ala | Gly | Thr | Ser | Tyr | Ile | Phe | Ser | Gly | Asn | Ser | Val |
| 305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
| Ser | Thr | Gly | Lys | Ser | Gin | Thr | Thr | Gly | Gin | Ile | Ala | Gly | Gly | Ala | Ile |
| 325 | 330 | 335 | |||||||||||||
| Tyr | Ser | Pro | Thr | Val | Thr | Leu | Asn | Cys | Pro | Ala | Thr | Phe | Ser | Asn | Asn |
| 340 | 345 | 350 | |||||||||||||
| Thr | Ala | Ser | Ile | Ala | Thr | Pro | Lys | Thr | Ser | Ser | Glu | Asp | Gly | Ser | Ser |
| 355 | 360 | 365 | |||||||||||||
| Gly | Asn | Ser | Ile | Lys | Asp | Thr | Ile | Gly | Gly | Ala | Ile | Ala | Gly | Thr | Ala |
| 370 | 375 | 380 | |||||||||||||
| Ile | Thr | Leu | Ser | Gly | Val | Ser | Arg | Phe | Ser | Gly | Asn | Thr | Ala | Asp | Leu |
| 385 | 390 | 395 | 400 | ||||||||||||
| Gly | Ala | Ala | Ile | Gly | Thr | Leu | Ala | Asn | Ala | Asn | Thr | Pro | Ser | Ala | Thr |
| 405 | 410 | 415 | |||||||||||||
| Ser | Gly | Ser | Gin | Asn | Ser | Ile | Thr | Glu | Lys | Ile | Thr | Leu | Glu | Asn | Gly |
| 420 | 425 | 430 | |||||||||||||
| Ser | Phe | Ile | Phe | Glu | Arg | Asn | Gin | Ala | Asn | Lys | Arg | Gly | Ala | Ile | Tyr |
| 435 | 440 | 445 | |||||||||||||
| Ser | Pro | Ser | Val | Ser | Ile | Lys | Gly | Asn | Asn | Ile | Thr | Phe | Asn | Gin | Asn |
• · · ·
315
| 4 50 | 455 | 460 | |||||||||||||
| Thr | Ser | Thr | His | Asp | Gly | Ser | Ala | Ile | Tyr | Phe | Thr | Lys | Asp | Ala | Thr |
| 4 65 | 470 | 475 | 480 | ||||||||||||
| Ile | Glu | Ser | Leu | Gly | Ser | Val | Leu | Phe | Thr | Gly | Asn | Asn | Val | Thr | Ala |
| 485 | 490 | 495 | |||||||||||||
| Thr | Gin | Ala | Ser | Ser | Ala | Thr | Ser | Gly | Gin | Asn | Thr | Asn | Thr | Ala | Asn |
| 500 | 505 | 510 | |||||||||||||
| Tyr | Gly | Ala | Ala | Ile | Phe | Gly | Asp | Pro | Gly | Thr | Thr | Gin | Ser | Ser | Gin |
| 515 | 520 | 525 | |||||||||||||
| Thr | Asp | Ala | Ile | Leu | Thr | Leu | Leu | Ala | Ser | Ser | Gly | Asn | Ile | Thr | Phe |
| 530 | 535 | 540 | |||||||||||||
| Ser | Asn | Asn | Ser | Leu | Gin | Asn | Asn | Gin | Gly | Asp | Thr | Pro | Ala | Ser | Lys |
| 545 | 550 | 555 | 560 | ||||||||||||
| Phe | Cys | Ser | Ile | Ala | Gly | Tyr | Val | Lys | Leu | Ser | Leu | Gin | Ala | Ala | Lys |
| 565 | 570 | 575 | |||||||||||||
| Gly | Lys | Thr | Ile | Ser | Phe | Phe | Asp | Cys | Val | His | Thr | Ser | Thr | Lys | Lys |
| 580 | 585 | 590 | |||||||||||||
| Thr | Gly | Ser | Thr | Gin | Asn. | Val | Tyr | Glu | Thr | Leu | Asp | Ile | Asn | Lys | Glu |
| 595 | 600 | 605 | |||||||||||||
| Glu | Asn | Ser | Asn | Pro | Tyr | Thr | Gly | Thr | Ile | Val | Phe | Ser | Ser | Glu | Leu |
| 610 | 615 | 620 | |||||||||||||
| His | Glu | Asn | Lys | Ser | Tyr | Ile | Pro | Gin | Asn | Ala | Ile | Leu | His | Asn | Gly |
| 625 | 630 | 635 | 640 | ||||||||||||
| Thr | Leu | Val | Leu | Lys | Glu | Lys | Thr | Glu | Leu | His | Val | Val | Ser | ||
| 645 | 650 |
<210> 342 <211> 36 <212> DNA <213> Chlamydia trachomatis <400> 342 gagagcggcc gctcggaact attgtgttcť cttctg 36 <210> 343 <211> 35 <212> DNA <213> Chlamydia trachomatis <400> 343 gagagcggcc gcttagaaga tcatgcgagc accgc 35 <210> 344 <211> 2103 <212> DNA <213> Chlamydia trachomatis <400> 344 atgcatcacc atcaccatca cacggccgcg tccgataact tccagctgtc ccagggtggg 60 cagggattcg ccattccgat cgggcaggcg atggcgatcg cgggccagat caagcttccc 120 accgttcata tcgggcctac cgccttcctc ggcttgggtg ttgtcgacaa caacggcaac 180 ggcgcacgag tccaacgcgt ggtcgggagc gctccggcgg caagtctcgg catctccacc 240 ggcgacgtga tcaccgcggt cgacggcgct ccgatcaact cggccaccgc gatggcggac 300 gcgcttaacg ggcatcatcc cggtgacgtc atctcggtga cctggcaaac caagtcgggc 360 ggcacgcgta cagggaacgt gacattggcc gagggacccc cggccgaatt ctgcagatat 420 ccatcacact ggcggccgct cggaactatt gtgttctctt ctgaattaca tgaaaacaaa 480 tcttacatcc cacagaatgc aatccttcac aacggaactt tagttcttaa agagaaaaca 540 gaactccacg tagtctcttt tgagcagaaa gaagggtcta aattaattat ggaacccgga 600 gctgtgttat ctaaccaaaa catagctaac ggagctctag ctatcaatgg gttaacgatt 660 gatctttcca gtatggggac tcctcaagca ggggaaatct tctctcctcc agaattacgt 720 atcgttgcca cgacctctag tgcatccgga ggaagcgggg tcagcagtag tataccaaca 780 • ··· • · · ·
316 aatcctaaaa ggatttctgc agcagtgcct tcaggttctg ccgcaactac tccaactatg 840 agcgagaaca aagttttcct aacaggagac cttactttaa tagatcctaa tggaaacttt 900 taccaaaacc ctatgttagg aagcgatcta gatgtaccac taattaagct tccgactaac 960 acaagtgacg tccaagtcta tgatttaact ttatctgggg atcttttccc tcagaaaggg 1020 tacatgggaa cctggacatt agattctaat ccacaaacag ggaaacttca agccagatgg 1080 acattcgata cctatcgtcg ctgggtatac atacctaggg ataatcattt ttatgcgaac 1140 tctatcttag gcťcccaaaa ctcaatgatt gttgtgaagc aagggcttat caacaacatg 1200 ttgaataatg cccgcttcga tgatatcgct tacaataact tctgggtttc aggagtagga 1260 actttcttag ctcaacaagg aactcctctt tccgaagaat tcagttacta cagccgcgga 1320 acttcagttg ccatcgatgc caaacctaga caagatttta tcctaggagc tgcatttagt 1380 aagatagtgg ggaaaaccaa agccatcaaa aaaatgcata attacttcca taagggctct 1440 gagtactctt accaagcttc tgtctatgga ggtaaattcc tgtatttctt gčtcaataag 1500 caacatggtt gggcacttcc tttcctaata caaggagtcg tgtcctatgg acatattaaa 1560 catgatacaa caacacttta cccttctatc catgaaagaa ataaaggaga ttgggaagat 1620 ttaggatggt tagcggatct tcgtatctct atggatctta aagaaccttc taaagattct 1680 tctaaacgga tcactgtcta tggggaactc gagtattcca gcattcgcca gaaacagttc 1740 acagaaatcg attacgatcc aagacacttc gatgattgtg cttacagaaa tctgtcgctt 1800 cctgtgggat gcgctgtcga aggagctatc atgaactgta atattcttat gtataataag 1860 cttgcattag cctacatgcc ttctatctac agaaataatc ctgtctgtaa atatcgggta 1920 ttgtcttcga atgaagctgg tcaagttatc tgcggagtgc caactagaac ctctgctaga 1980 gcagaataca gtactcaact atatcttggt cccttctgga ctctctacgg aaactatact 2040 atcgatgtag gcatgtatac gctatcgcaa atgactagct gcggtgctcg catgatcttc 2100 taa 2103 <210> 345 <211> 700 <212> PRT <213> Chlamydia trachomatis <400> 345
| Met | His | His | His | His | His | His | Thr Ala | Ala | Ser | Asp | Asn | Phe | Gin | Leu | |
| 1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
| Ser | Gin | Gly | Gly | Gin | Gly | Phe | Ala | Ile | Pro | Ile | Gly | Gin | Ala | Met | Ala |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Ile | Ala | Gly | Gin | Ile | Lys | Leu | Pro | Thr | Val | His | Ile | Gly | Pro | Thr | Ala |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Phe | Leu | Gly | Leu | Gly | Val | Val | Asp | Asn | Asn | Gly | Asn | Gly | Ala | Arg | Val |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Gin | Arg | Val | Val | Glý | Ser | Ala | Pro | Ala | Ala | Ser | Leu | Gly | Ile | Ser | Thr |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Gly | Asp | Val | Ile | Thr | Ala | Val | Asp | Gly | Ala | Pro | Ile | Asn | Ser | Ala | Thr |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Ala | Met | Ala | Asp | Ala | Leu | Asn | Gly | His | His | Pro | Gly | Asp | Val | Ile | Ser |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Val | Thr | Trp | Gin | Thr | Lys | Ser | Gly | Gly | Thr | Arg | Thr | Gly | Asn | Val | Thr |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Leu | Ala | Glu | Gly | Pro | Pro | Ala | Glu | Phe | Cys | Arg | Tyr | Pro | Ser | His | Trp |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Arg | Pro | Leu | Gly | Thr | Ile | Val | Phe | Ser | Ser | Glu | Leu | His | Glu | Asn | Lys |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Ser | Tyr | Ile | Pro | Gin | Asn | Ala | Ile | Leu | His | Asn | Gly | Thr | Leu | Val | Leu |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Lys | Glu | Lys | Thr | Glu | Leu | His | Val | Val | Ser | Phe | Glu | Gin | Lys | Glu | Gly |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Ser | Lys | Leu | Ile | Met | Glu | Pro | Gly | Ala | Val | Leu | Ser | Asn | Gin | Asn | Ile |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Ala | Asn | Gly | Ala | Leu | Ala | Ile | Asn | Gly | Leu | Thr | Ile | Asp | Leu | Ser | Ser |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Met | Gly | Thr | Pro | Gin | Ala | Gly | Glu | Ile | Phe | Ser | Pro | Pro | Glu | Leu | Arg |
| 225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
| Ile | Val | Ala | Thr | Thr | Ser | Ser | Ala | Ser | Gly | Gly | Ser | Gly | Val | Ser | Ser |
• · ·· .317
| 245 | 250 | 255 | |||||||||||||
| Ser | Ile | Pro | Thr | Asn | Pro | Lys | Arg | Ile | Ser | Ala | Ala | Val | Pro | Ser | Gly |
| 260 | 265 | 270 | |||||||||||||
| Ser | Ala | Ala | Thr | Thr | Pro | Thr | Met | Ser | Glu | Asn | Lys | Val | Phe | Leu | Thr |
| 275 | 280 | 285 | |||||||||||||
| Gly | Asp | Leu | Thr | Leu | Ile | Asp | Pro | Asn | Gly | Asn | Phe | Tyr | Gin | Asn | Pro |
| 290 | 295 | 300 | |||||||||||||
| M.et | Leu | Gly | Ser | Asp | Leu | Asp | Val | Pro | Leu | Ile | Lys | Leu | Pro | Thr | Asn |
| 305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
| Thr | Ser | Asp | Val | Gin | Val | Tyr | Asp | Leu | Thr | Leu | Ser | Gly | Asp | Leu | Phe |
| 325 | 330 | 335 | |||||||||||||
| Pro | Gin | Lys | Gly | Tyr | Met | Gly | Thr | Trp | Thr | Leu | Asp | Ser | Asn | Pro | Gin |
| 340 | 345 | 350 | |||||||||||||
| Thr | Gly | Lys | Leu | Gin | Ala | Arg | Trp | Thr | Phe | Asp | Thr | Tyr | Arg | Arg | Trp |
| 355 | 360 | 365 | |||||||||||||
| Val | Tyr | Ile | Pro | Arg | Asp | Asn | His | Phe | Tyr | Ala | Asn | Ser | Ile | Leu | Gly |
| 370 | 375 | 380 | |||||||||||||
| Ser | Gin | Asn | Ser | Met | Ile | Val | Val | Lys | Gin | Gly | Leu | Ile | Asn | Asn | Met |
| 385 | 390 | 395 | 400 | ||||||||||||
| Leu | Asn | Asn | Ala | Arg | Phe | Asp | Asp | Ile | Ala | Tyr | Asn | Asn | Phe | Trp | Val |
| 405 | 410 | 415 | |||||||||||||
| Ser | Gly | Val | Gly | Thr | Phe | Leu | Ala | Gin | Gin | Gly | Thr | Pro | Leu | Ser | Glu |
| 420 | 425 | 430 | |||||||||||||
| Glu | Phe | Ser | Tyr | Tyr | Ser | Arg | Gly | Thr | Ser | Val | Ala | Ile | Asp | Ala | Lys |
| 435 | 4 40 | 44 5 | |||||||||||||
| Pro | Arg | Gin | Asp | Phe | Ile | Leu | Gly | Ala | Ala | Phe | Ser | Lys | Ile | Val | Gly |
| 450 | 4 55 | 460 | |||||||||||||
| Lys | Thr | Lys | Ala | Ile | Lys | Lys | Met | His | Asn | Tyr | Phe | His | Lys | Gly | Ser |
| 465 | 470 | 475 | - | 480 | |||||||||||
| Glu | Tyr | Ser | Tyr | Gin | Ala | Ser | Val | Tyr | Gly | Gly | Lys | Phe | Leu | Tyr | Phe |
| 485 | 4 90 | 495 | |||||||||||||
| Leu | Leu | Asn | Lys | Gin | His | Gly | Trp | Ala | Leu | Pro | Phe | Leu | Ile | Gin | Gly |
| 500 | 505 | 510 | |||||||||||||
| Val | Val | Ser | Tyr | Gly | His | Ile | Lys | His | Asp | Thr | Thr | Thr | Leu | Tyr | Pro |
| 515 | 520 | 525 | |||||||||||||
| Ser | Ile | His | Glu | Arg | Asn | Lys | Gly | Asp | Trp | Glu | Asp | Leu | Gly | Trp | Leu |
| 530 | 535 | 540 | |||||||||||||
| Ala | Asp | Leu | Arg | Ile | Ser | Met | Asp | Leu | Lys | Glu | Pro | Ser | Lys | Asp | Ser |
| 545 | 550 | 555 | 560 | ||||||||||||
| Ser | Lys | Arg | Ile | Thr | Val | Tyr | Gly | Glu | Leu | Glu | Tyr | Ser | Ser | Ile | Arg |
| 565 | 570 | 575 | |||||||||||||
| Gin | Lys | Gin | Phe | Thr | Glu | Ile | Asp | Tyr | Asp | Pro | Arg | His | Phe | Asp | Asp |
| 580 | 585 | 590 | |||||||||||||
| Cys | Ala | Tyr | Arg | Asn | Leu | Ser | Leu | Pro | Val | Gly | Cys | Ala | Val | Glu | Gly |
| 595 | 600 | 605 | |||||||||||||
| Ala | Ile | Met | Asn | Cys | Asn | Ile | Leu | Met | Tyr | Asn | Lys | Leu | Ala | Leu | Ala |
| 610 | 615 | 620 | |||||||||||||
| Tyr | Met | Pro | Ser | Ile | Tyr | Arg | Asn | Asn | Pro | Val | Cys | Lys | Tyr | Arg | Val |
| 625 | 630 | 635 | 640 | ||||||||||||
| Leu | Ser | Ser | Asn | Glu | Ala | Gly | Gin | Val | Ile | Cys | Gly | Val | Pro | Thr | Arg |
| 64 5 | 650 | 655 | • | ||||||||||||
| Thr | Ser | Ala | Arg | Ala | Glu | Tyr | Ser | Thr | Gin | Leu | Tyr | Leu | Gly | Pro | Phe |
| 660 | 665 | 670 | |||||||||||||
| Trp | Thr | Leu | Tyr | Gly | Asn | Tyr | Thr | Ile | Asp | Val | Gly | Met | Tyr | Thr | Leu |
| 675 | 680 | 685 | |||||||||||||
| Ser | Gin | Met | Thr | Ser | Cys | Gly | Ala | Arg | Met | Ile | Phe | ||||
| 690 | 695 | 700 |
<210> 346 <211> 37 <212> DNA • · · ·
318 • · ·β • 444 <213> Chlamydia trachomatis <400> 346 gagagcggcc gctcatgaaa tttatgtcag ctactgc · 37 <210> 347 <211> 37 <212> DNA <213> Chlamydia trachomatis <400> 347 gagagcggcc gcttaccctg taattccagt gatggtc 37 <210> 348 <211> 1464 <212> DNA <213> Chlamydia trachomatis <400> 348 atgcatcacc atcaccatca cacggccgcg tccgataact tccagctgtc ccagggtggg 60 cagggattcg ccattccgat cgggcaggcg atggcgatcg cgggccagat caagcttccc 120 accgttcata tcgggcctac cgccttcctc ggcttgggtg ttgtcgacaa caacggcaac 180 ggcgcacgag tccaacgcgt ggtcgggagc gctccggcgg caagtctcgg catctccacc 240 ggcgacgtga tcaccgcggt cgacggcgct ccgatcaact cggccaccgc gatggcggac 300 gcgcttaacg ggcatcatcc cggtgacgtc atctcggtga cctggcaaac caagtcgggc 360 ggcacgcgta cagggaacgt gacattggcc gagggacccc cggccgaatt ctgcagatat 420 ccatcacact ggcggccgct catgaaattt atgtcagcta ctgctgtatt tgctgcagta 480 ctctcctccg ttactgaggc gagctcgatc caagatcaaa taaagaatac cgactgCaat 540 gttagcaaag taggatattc aacttctcaa gcatttactg atatgatgct agcagacaac 600 acagagtatc gagctgctga tagtgtttca ttctatgact tttcgacatc ttccggatta 660 cctagaaaac atcttagtag tagtagtgaa gcttctccaa cgacagaagg agtgtcttca 720 tcttcatctg gagaaaatac tgagaattca caagattcag ctcčctcttc tggagaaact 780 gataagaaaa cagaagaaga actagacaat ggcggaatca tttatgctag agagaaacta 840 actatctcag aatctcagga ctctctcťct aatccaagca tagaactcca tgacaatagt 900 tttttctťcg gagaaggtga agttatcttt gatcacagag ttgccctcaa aaacggagga 960 gctatttatg gagagaaaga ggtagtcttt gaaaacataa aatctctact agtagaagta 1020 aatatctcgg tcgagaaagg gggtagcgtc tatgcaaaag aacgagtaťc tttagaaaat 1080 gttaccgaag caaccttctg ctccaatggt ggggaacaag gtggtggtgg aatctattca 1140 gaacaagata tgttaatcag tgattgcaac aatgtacatt tccaagggaa tgctgcagga 1200 gcaacagcag taaaacaatg tctggatgaa gaaatgatcg tattgctcac agaatgcgtt 1260 gatagcttat ccgaágatac actggatagc actccagaaa cggaacagac taagtcaaat 1320 qqaaatcaag atqqttcgtc tgaaacaaaa gatacacaag tatcagaatc accagaatca 1380 actcctagcc ccgacgatgt tttaggtaaa ggtggtggta tctatacaga aaaatctttg ' 1440 accatcactg gaattacagg gtaa 1464 <210> 349 <211> 487 <212> PRT <213> Chlamydia trachomatis <400> 349
| Met | His | His | His | His | His | His | Thr | Ala | Ala | Ser | Asp | Asn | Phe | Gin | Leu |
| 1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
| Ser | Gin | Gly | Gly | Gin | Gly | Phe | Ala | Ile | Pro | Ile | Gly | Gin | Ala | Met | Ala |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Ile | Ala | Gly | Gin | Ile | Lys | Leu | Pro | Thr | Val | His | Ile | Gly | Pro | Thr | Ala |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Phe | Leu | Gly | Leu | Gly | Val | Val | Asp | Asn | Asn | Gly | Asn | Gly | Ala | Arg | Val |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Gin | Arg | Val | Val | Gly | Ser | Ala | Pro | Ala | Ala | Ser | Leu | Gly | Ile | Ser | Thr |
| 65 | 70 | 75 . | 80 |
• · · · • ·
319
]
| Gly Asp Val | Ile | Thr 85 | Ala | Val Asp | Gly | Ala 90 | Pro | Ile | Asn | Ser | Ala 95 | Thr | |||
| Ala | Met | Ala | Asp | Ala | Leu | Asn | Gly | His | His | Pro | Gly | Asp | Val | Ile | Ser |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Val | Thr | Trp | Gin | Thr | Lys | Ser | Gly | Gly | Thr | Arg | Thr | Gly | Asn | Val | Thr |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Leu | Ala | Glu | Gly | Pro | Pro | Ala | Glu | Phe | Cys | Arg | Tyr | Pro | Ser | His | Trp |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Arg | Pro | Leu | Met | Lys | Phe | Met | Ser | Ala | Thr | Ala | Val | Phe | Ala | Ala | Val |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Leu | Ser | Ser | Val | Thr | Glu | Ala | Ser | Ser | Ile | Gin | Asp | Gin ' | Ile | Lys | Asn |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Thr | Asp | Cys | Asn | Val | Ser | Lys | Val | Gly | Tyr | Ser | Thr | Ser | Gin | Ala | Phe |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Thr | Asp | Met | Met | Leu | Ala | Asp | Asn | Thr | Glu | Tyr | Arg | Ala | Ala | Asp | Ser |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Val | Ser | Phe | Tyr | Asp | Phe | Ser | Thr | Ser | Ser | Gly | Leu | Pro | Arg | Lys | His |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Leu | Ser | Ser | Ser | Ser | Glu | Ala | Ser | Pro | Thr | Thr | Glu | Gly | Val | Ser | Ser |
| 225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
| Ser | Ser | Ser | Gly | Glu | Asn | Thr | Glu | Asn | Ser | Gin | Asp | Ser | Ala | Pro | Ser |
| 245 | 250 | 255 | |||||||||||||
| Ser | Gly | Glu | Thr | Asp | Lys | Lys | Thr | Glu | Glu | Glu | Leu | Asp | Asn | Gly | Gly |
| 260 | 265 | 270 | |||||||||||||
| Ile | Ile | Tyr | Ala | Arg | Glu | Lys | Leu | Thr | Ile | Ser | Glu | Ser | Gin | Asp | Ser |
| 275 | 280 | 285 | |||||||||||||
| Leu | Ser | Asn | Pro | Ser | Ile | Glu | Leu | His | Asp | Asn | Ser | Phe | Phe | Phe | Gly |
| 290 | 295 | 300 | |||||||||||||
| Glu | Gly | Glu | Val | Ile | Phe | Asp | His | Arg | Val | Ala | Leu | Lys | Asn | Gly | Gly |
| 305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
| Ala | Ile | Tyr | Gly | Glu | Lys | Glu | Val | Val | Phe | Glu | Asn | Ile | Lys | Ser | Leu |
| 325 | 330 | 335 | |||||||||||||
| Leu | Val | Glu | Val | Asn | Ile | Ser | Val | Glu | Lys | Gly | Gly | Ser | Val | Tyr | Ala |
| 340 | 345 | 350 | |||||||||||||
| Lys | Glu | Arg | Val | Ser | Leu | Glu | Asn | Val | Thr | Glu | Ala | Thr | Phe | Ser | Ser |
| 355 | 360 | 365 | |||||||||||||
| Asn | Gly | Gly | Glu | Gin | Gly | Gly | Gly | Gly | Ile | Tyr | Ser | Glu | Gin | Asp | Met |
| 370 | 375 | 380 | |||||||||||||
| Leu | Ile | Ser | Asp | Cys | Asn | Asn | Val | His | Phe | Gin | Gly | Asn | Ala | Ala | Gly |
| 385 | 390 | 395 | 400 | ||||||||||||
| Ala | Thr | Ala | Val | Lys | Gin | Cys | Leu | Asp | Glu | Glu | Met | Ile | Val | Leu | Leu |
| 405 | 410 | 415 | |||||||||||||
| Thr | Glu | Cys | Val | Asp | Ser | Leu | Ser | Glu | Asp | Thr | Leu | Asp | Ser | Thr | Pro |
| 420 | 425 | 430 | |||||||||||||
| Glu | Thr | Glu | Gin | Thr | Lys | Ser | Asn | Gly | Asn | Gin | Asp | Gly | Ser | Ser | Glu |
| 435 | 440 | 445 | |||||||||||||
| Thr | Lys | Asp | Thr | Gin | Val | Ser | Glu | Ser | Pro | Glu | Ser | Thr | Pro | Ser | Pro |
| 450 | 455 | 4 60 | |||||||||||||
| Asp | Asp | Val | Leu | Gly | Lys | Gly | Gly | Gly | Ile | Tyr | Thr | Glu | Lys | Ser | Leu |
| 4 65 | 470 | 475 | 480 | ||||||||||||
| Thr | Ile | Thr | Gly | Ile | Thr | Gly | |||||||||
| 485 |
<210> 350 <211> 37 <212> DNA <213> Chlamydia trachomatis <400> 350 gagagcggcc gctcgataca caagtatcag aatcacc • · • · · ·
320
| <210> | 351 |
| <211> | 37 |
| <212> | DNA |
| <213> | Chlamydia trachomatis |
<400> 351 gagagcggcc gcttaagagg acgatgagac actctcg
| <210> | 352 |
| <211> | 1752 |
| <212> | DNA |
| <213> | Chlamydia trachomatis |
| <400> | 352 |
atgcatcacc atcaccatca cacggccgcg tccgataact tccagctgtc ccagggtggg cagggattcg ccattccgat cgggcaggcg atggcgatcg cgggccagat caagcttccc accgttcata tcgggcctac cgccttcctc ggcttgggtg ttgtcgacaa caacggcaac ggcgcacgag tccaacgcgt ggtcgggagc gctccggcgg caagtctcgg catctccacc ggcgacgtga tcaccgcggt cgacggcgct ccgatcaact cggccaccgc gatggcggac gcgcttaacg ggcatcatcc cggtgacgtc atctcggtga cctggcaaac caagtcgggc ggcacgcgta cagggaacgt gacattggcc gagggacccc cggccgaatt ctgcagatat ccatcacact ggcggccgct cgatacacaa gtatcagaat caccagaatc aactcctagc cccgacgatg ttttaggtaa aggtggtggt atctatacag aaaaatcttt gaccatcact ggaattacag ggactataga ttttgtcagt aacatagcta ccgattctgg agcaggtgta ttcactaaag aaaacttgtc ttgcaccaac acgaatagcc tacagttttt gaaaaactcg gcaggtcaac atggaggagg agcctacgtt actcaaacca tgtctgttac taatacaact agtgaaagta taactactcc ccctctcgta ggagaagtga ttttctctga aaatacagct aaagggcacg gtggtggtat ctgcactaac aaactttctt tatctaattt aaaaacggtg actctcacta aaaactctgc aaaggagtct ggaggagcta tttttacaga tctagcgtct ataccaacaa cagatacccc agagtcttct accccctctt cctcctcgcc tgcaagcact cccgaagtág ttgcttctgc taaaataaat cgattctttg cctctacggc agaaccggca gccccttctc taacagaggc tgagtctgat caaacggatc aaacagaaac ttctgatact aatagcgata tagacgtgtc gattgagaac attttgaatg tcgctatcaa tcaaaacact tctgcgaaaa aaggaggggc tatttacggg aaaaaagcta aactttcccg ťattaacaat cttgaacttt cagggaattc atcccaggat gtaggaggag gtctctgttt aactgaaagc gtagaatttg atgcaattgg atcgctctta tcccactata actctgctgc taaagaaggt ggggttattc attctaaaac ggttactcta tctaacctca agtctacctt cacttttgca gataacactg ttaaagcaat agtagaaagc actcctgaag ctccagaaga gattcctcca gtagaaggag aagagtctac agcaacagaa aatccgaatt ctaatacaga aggaagttcg gctaacacta accttgaagg atctcaaggg gatactgctg atacagggac tggtgttgtt aacaatgagt ctcaagacac atcagatact ggaaacgctg aatctggaga acaactacaa gattctacac aatctaatga agaaaatacc cttcccaata qtagtattaa tcaatctaac gaaaacacag acgaatcatc tgatagccac actgaggaaa taactgacga gagtgtctca tcgtcctctt aa <210> 353 <211> 583 <212> PRT <213> Chlamydia trachomatis
120
180
240
300
360
420
480
540
600
660
720
780
840
900
960
1020
1080
1140
1200
1260
1320
1380
1440
1500
1560
1620
1680
1740
1752 <400> 353
| Met 1 | His | His | His | His 5 | His His | Thr | Ala | Ala 10 | Ser Asp | Asn Phe | Gin Leu 15 | ||||
| Ser | Gin | Gly | Gly | Gin | Gly | Phe | Ala | Ile | Pro | Ile | Gly | Gin | Ala | Met | Ala |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Ile | Ala | Gly | Gin | Ile | Lys | Leu | Pro | Thr | Val | His | Ile | Gly | Pro | Thr | Ala |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Phe | Leu | Gly | Leu | Gly | Val | Val | Asp | Asn | Asn | Gly | Asn | Gly | Ala | Arg | Val |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Gin | Arg | Val | Val | Gly | Ser | Ala | Pro | Ala | Ala | Ser | Leu | Gly | Ile | Ser | Thr |
| 65 | 70 | 75 - | 80 |
• · 9 9 9 9.
321 • · · · · · .9· «
..9 999 ·. 9 ·9·9 · · 9
99 99 ··
| Gly | Asp | Val | Ile | Thr 85 | Ala | Val | Asp | cly | Ala 90 | Pro | Ile | Asn | Ser | Ala 95 | Thr |
| Ala | Met | Ala | Asp 100 | Ala | Leu | Asn | Gly | His 105 | His | Pro | Gly | Asp | Val 110 | Ile | Ser |
| Val | Thr | Trp 115 | Gin | Thr | Lys | Ser | Gly 120 | Gly | Thr | Arg | Thr | Gly 125 | Asn | Val | Thr |
| Leu | Ala 130 | Glu | Gly | Pro | Pro | Ala 135 | Glu | Phe | Cys | Arg | Tyr 140 | Pro | Ser | His | Trp |
| Arg 145 | Pro | Leu | Asp | Thr | Gin 150 | Val | Ser | Glu | Ser | Pro 155 | Glu | Ser | Thr | Pro | Ser 160 |
| Pro | Asp | Asp | Val | Leu 165 | Gly | Lys | Gly | Gly | Gly 170 | Ile | Tyr | Thr | Glu | Lys 175 | Ser |
| Leu | Thr | Ile | Thr 180 | Gly | Ile | Thr | Gly | Thr 185 | Ile | Asp | Phe | Val | Ser 190 | Asn | Ile |
| Ala | Thr | Asp 195 | Ser | Gly | Ala | Gly | Val 200 | Phe | Thr | Lys | Glu | Asn 205 | Leu | Ser | Cys |
| Thr | Asn 210 | Thr | Asn | Ser | Leu | Gin 215 | Phe | Leu | Lys | Asn | Ser 220 | Ala | Gly | Gin | His |
| Gly 225 | Gly | Gly | Ala | Tyr | Val 230 | Thr | Gin | Thr | Met | Ser 235 | Val | Thr | Asn | Thr | Thr 240 |
| Ser | Glu | Ser | Ile | Thr 24 5 | Thr | Pro | Pro | Leu | Val 250 | Gly | Glu | Val | Ile | Phe 255 | Ser |
| Glu | Asn | Thr | Ala 260 | Lys | Gly | His | Gly | Gly 265 | Gly | Ile | Cys | Thr | Asn 270 | Lys | Leu |
| Ser | Leu | Ser 275 | Asn | Leu | Lys | Thr | Val 280 | Thr | Leu | Thr | Lys | Asn 285 | Ser | Ala | Lys |
| Glu | Ser 2 90 | Gly | Gly | Ala | Ile | Phe 295 | Thr | Asp | Leu | Ala | Ser 300 | Ile | Pro | Thr | Thr |
| Asp 305 | Thr | Pro | Glu | Ser | Ser 310 | Thr | Pro | Ser | Ser | Ser 315 | Ser | Pro | Ala | Ser | Thr 320 |
| Pro | Glu | Val | Val | Ala 325 | Ser | Ala | Lys | Ile | ASn 330 | Arg | Phe | Phe | Ala | Ser 335 | Thr |
| Ala | Glu | Pro | Ala 340 | Ala | Pro | Ser | Leu | Thr 345 | Glu | Ala | Glu | Ser | Asp 350 | Gin | Thr |
| Asp | Gin | Thr 355 | Glu | Thr | Ser | Asp | Thr 360 | Asn | Ser | Asp | Ile | Asp 365 | Val | Ser | Ile |
| Glu 1 | Asn 370 | Ile | Leu | Asn | Val | Ala 375 | Ile | Asn | Gin | Asn | Thr 380 | Ser | Ala | Lys | Lys |
| Gly 385 | Gly | Ala | Ile | Tyr | Gly 390 | Lys | Lys | Ala | Lys | Leu 395 | Ser | Arg | Ile | Asn | Asn 400 |
| Leu | Glu | Leu | Ser | Gly 4 05 | Asn | Ser | Ser | Gin | Asp 410 | Val | Gly | Gly | Gly | Leu 415 | Cys |
| Leu | Thr | Glu | Ser 420 | Val | Glu | Phe | Asp | Ala 425 | Ile | Gly | Ser | Leu | Leu 430 | Ser | His |
| Tyr | Asn | Ser 435 | Ala | Ala | Lys | Glu | Gly 440 | Gly | Val | Ile | His | Ser 445 | Lys | Thr | Val |
| Thr | Leu 450 | Ser | Asn | Leu | Lys | Ser 455 | Thr | Phe | Thr | Phe | Ala 4 60 | Asp | Asn | Thr | Val |
| Lys 4 65 | Ala | Ile | Val | Glu | Ser 470 | Thr | Pro | Glu | Ala | Pro 475 | Glu | Glu | Ile | Pro | Pro 480 |
| Val | Glu | Gly | Glu | Glu 485 | Ser | Thr | Ala | Thr | Glu 4 90 | Asn | Pro | Asn | Ser | Asn 495 | Thr |
| Glu | Gly | Ser | Ser 500 | Ala | Asn | Thr | Asn | Leu 505 | Glu | Gly | Ser | Gin | Gly 510 | Asp | Thr |
| Ala | Asp | Thr 515 | Gly | Thr | Gly | Val | Val 520 | Asn | Asn | Glu | Ser | Gin 525 | Asp | Thr | Ser |
| Asp | Thr 530 | Gly | Asn | Ala | Glu | Ser 535 | Gly | Glu | Gin | Leu | Gin 540 | Asp | Ser | Thr | Gin |
| Ser 545 | Asn | Glu | Glu | Asn | Thr 550 | Leu | Pro | Asn | Ser | Ser 555 | Ile | Asp | Gin | Ser | Asn 560 |
| Glu | Asn | Thr | Asp | Glu | Ser | Ser | Asp | Ser | His | Thr | Glu | Glu | Ile | Thr | Asp |
• 9
322
565
Glu Ser Val Ser Ser Ser Ser 580 <210> 354 <211> 39 <212> DNA <213> Chlamydia trachomatis <400> 354 gagagcggcc gctcgatcaa tctaacgaaa <210> 355 <211> 36 <212> DNA <213> Chlamydia trachomatis <400> 355 :
gagagcggcc gcttagacca aagctccatc <210> 356 <211> 2052 <212> DNA <213> Chlamydia trachomatis
570
575 acacagacg agcaac <400> 356 atgcatcacc cagggattcg accgttcata ggcgcacgag ggcgacgtga gcgcttaacg ggcacgcgta ccatcacact cacactgagg cctcaagatg aacgcttgtt tcaggttcag gctggagact ttaataggag ggaatatttt λ r^rrf· Γ'Γ'τ Γ'Π v- - —-J agacgaactg gctggaggag aactctgcaa ggagctatcg gttgctgacc aaattagagt tacgcacctg gaagaaggaa ctcttcacag acaacctcag aacggatctc ttccgaaaca attgcgggag gatgcaatcc gatattaata ttctcctctg ggatctcttg ggctcttctc gctttggtct atcaccatca ccattccgat tcgggcctac tccaacgcgt tcaccgcggt ggcatcatcc cagggaacgt ggcggccgct aaataactga gaggagcagc tagctaaaag acgttactgc ctgaaggacc gaggwgctat ctggaaacaa y
tcaccttctc ctatctactc caaacaatgc gagctacttc tcggatctgc ctggctccta tcgtttccat gcgcgattta gaaacttagt gagatgtaac agacggataa atgaataccg atgttaaatt ggacctctac aatctgagga aattacatga tattgaagcc tcgttatgac aa cacggccgcg cgggcaggcg cgccttcctc ggtcgggagc cgacggcgct cggtgacgtc gacattggcc cgatcaatct cgagagtgtc ttcttcaggg ctatgctgcg atcttctgat gactgagcca ctatggagaa agctatcgat Ct 31 CjCt233 cgggaatact tcctactgta taataacgct tgctgtttct tattgggttg ctactttgaa taaagcctat ctttacaaaa aaccccaacg aaaatatggt ccttcccctg tcctacttct aaccatgcaa taagaaaaca ttcagaaact aaataaatcc aaataccgag acctggatct tccgataact atggcgatcg ggcttgggtg gctccggcgg ccgatcaact atctcggtga gagggacccc aacgaaaaca tcatcgtcct gctccctcag agtactgata aatccagact gaagctggtt actgttaaga aacaccacag a + f· r-r-4* +- 4- a gtctcttctc accattgcta acagatactc ctatcaggag gtgccagaca aaaaataaag actgcgacat gaagcatcta ctaagcacaa gctgctatct aaactcattg tctgataccg gctgcaaaag ggtacacagg gtaaactctg tatattccac cttcatgtca gttctttcga tccagctgtc cgggccagat ttgtcgacaa caagtctcgg cggccaccgc cctggcaaac cggccgaatt cagacgaatc ctaaaagtgg gagatcaatc gctcccctgt cttcctcatc ctacaacaga ttgagaactt aaggctcctc □ ί Γ>+· 4- zi rr aatctacaac ctcctgtagt agagaaaaga gggctcattt cacaaaatac ctttaaaacg ttaaccaaaa ttgagtcttt ctacagaagg ttggacaaat cttcaggagg gaacctctac ggaaaacgat caactgccta cgtttacagg aaaacgtagt tttcttttga accagactgt ccagggtggg caagcttccc caacggcaac catctccacc gatggcggac caagtcgggc ctgcagatat atctgatagc atcatctact tatctctgca atctaattct tggagatagc aactcctact ctctggccaa ttccaaatct nrTrrnu /-»4- r>4aggtcaggtt attttctaaa cacctttgga cttagaaaac agaaacagtg agctactatt cagatctcta aggctctgtt cacaccagcc agcaagctca aaatatttgt tttctgtagt cagtttcttt cgatactctc aacgattctg tctacacagt gcagaaagaa tgctgatgga
120
180
240
300
360
420
480
540
600
660
720
780
840
900 ocn
-z vz v/ 1020 1080 1140 1200 1260 1320 1380 1440 1500 1560 1620 1680 1740 1800 1860 1920 1980 2040 2052
323
• · <210> 357 <211> 683 <212> PRT <213> Chlamydia trachomatis <400> 357
| Met | His His | His | His | His | His | Thr Ala Ala Ser Asp | Asn | Phe | Gin | Leu |
| 1 | 5 | 10 | 15 | |||||||
| Ser | Gin Gly | Gly 20 | Gin | Gly | Phe | Ala Ile Pro Ile Gly 25 | Gin | Ala 30 | Met | Ala |
| Ile | Ala Gly 35 | Gin | Ile | Lys | Leu | Pro Thr Val His Ile 40 | Gly 45 | Pro | Thr | Ala |
| Phe | Leu Gly 50 | Leu | Gly | Val | Val 55 | Asp Asn Asn Gly Asn 60 | Gly | Ala | Arg | Val |
| Gin 65 | Arg Val | Val | Gly | Ser 70 | Ala | Pro Ala Ala Ser Leu 75 | Gly | Ile | Ser | Thr 80 |
| Gly | Asp Val | Ile | Thr 85 | Ala | Val | Asp Gly Ala Pro Ile 90 | Asn | Ser | Ala 95 | Thr |
| Ala | Met Ala | Asp 100 | Ala | Leu | Asn | Gly His His Pro Gly 105 | Asp | Val 110 | Ile | Ser |
| Val | Thr Trp 115 | Gin | Thr | Lys | Ser | Gly Gly Thr Arg Thr 120 | Gly 125 | Asn | Val | Thr |
| Leu | Ala Glu 130 | Gly | Pro | Pro | Ala 135 | Glu Phe Cys Arg Tyr 140 | Pro | Ser | His | Trp |
| Arg 145 | Pro Leu | Asp | Gin | Ser 150 | Asn | Glu ASn Thr Asp Glu 155 | Ser | Ser | Asp | Ser 160 |
| His | Thr Glu | Glu | Ile 165 | Thr | Asp | Glu Ser Val Ser Ser 170 | Ser | Ser | Lys 175 | Ser |
| Gly | Ser Ser | Thr 180 | Pro | Gin | Asp | Gly Gly Ala Ala Ser 185 | Ser | Gly 190 | Ala | Pro |
| Ser | Gly Asp 195 | Gin | Ser | Ile | Ser | Ala Asn Ala Cys Leu 200 | Ala 205 | Lys | Ser | Tyr |
| Ala | Ala Ser 210 | Thr | Asp | Ser | Ser 215 | Pro Val Ser Asn Ser 220 | Ser | Gly | Ser | Asp |
| Val 225 | Thr Ala | Ser | Ser | Asp 230 | Asn | Pro Asp Ser Ser Ser 235 | Ser | Gly | Asp | Ser 240 |
| Ala | Gly Asp | Ser | Glu 245 | Gly | Pro | Thr Glu Pro Glu Ala 250 | Gly | Ser | Thr 255 | Thr |
| Glu | .Thr Pro | Thr .260 | Leu | Ile | Gly | Gly Gly Ala Ile Tyr 265 | Gly | Glu 270 | Ťhr | Val |
| Lys | Ile Glu 275 | Asn | Phe | Ser | Gly | Gin Gly Ile Phe Ser 280 | Gly 285 | Asn | Lys | Ala |
| Ile | Asp Asn 290 | Thr | Thr | Glu | Gly 295 | Ser Ser Ser Lys Ser 300 | Asn | Val | Leu | Gly |
| Gly 305 | Ala Val | Tyr | Ala | Lys 310 | Thr | Leu Phe Asn Leu Asp 315 | Ser | Gly | Ser | Ser •320 |
| Arg | Arg Thr | Val | Thr 325 | Phe | Ser | Gly Asn Thr Val Ser 330 | Ser | Gin | Ser 335 | Thr |
| Thr | Gly Gin | Val 340 | Ala | Gly | Gly | Ala Ile Tyr Ser Pro 345 | Thr | Val 350 | Thr | Ile |
| Ala | Thr Pro 355 | Val | Val | Phe | Ser | Lys Asn Ser Ala Thr 360 | Asn 365 | Asn | Ala | Asn |
| Asn | Ala Thr 370 | Asp | Thr | Gin | Arg 375 | Lys Asp Thr Phe Gly 380 | Gly | Ala | Ile | Gly |
| Ala 385 | Thr Ser | Ala | Val | Ser 390 | Leu | Ser Gly Gly Ala His 395 | Phe | Leu | Glu | Asn 400 |
| Val | Ala Asp | Leu | Gly 405 | Ser | Ala | Ile Gly Leu Val Pro 410 | Asp | Thr | Gin 415 | Asn |
| Thr | Glu Thr | Val 420 | Lys | Leu | Glu | Ser Gly Ser Tyr Tyr 425 | Phe | Glu 430 | Lys | Asn |
324
| Lys | Ala | Leu Lys Arg 435 | Ala | Thr | Ile 440 | Tyr Ala | Pro | Val Val 445 | Ser | Ile | Lys | ||||
| Ala | Tyr | Thr | Ala | Thr | Phe | Asn | Gin | Asn | Arg | Ser | Leu | Glu | Glu | Gly | Ser |
| 450 | 455 | 4 60 | |||||||||||||
| Ala | Ile | Tyr | Phe | Thr | Lys | Glu | Ala | Ser | Ile | Glu | Ser | Leu | Gly | Ser | Val |
| 465 | 470 | 475 | 480 | ||||||||||||
| Leu | Phe | Thr | Gly | Asn | Leu | Val | Thr | Pro | Thr | Leu | Ser | Thr | Thr | Thr | Glu |
| 485 | 490 | 495 | |||||||||||||
| Gly | Thr | Pro | Ala | Thr | Thr | Ser | Gly Asp | Val | Thr | Lys | Tyr | Gly | Ala | Ala | |
| 500 | 505 | 510 | |||||||||||||
| Ile | Phe | Gly | Gin | Ile | Ala | Ser | Ser | Asn | Gly | Ser | Gin | Thr | Asp | Asn | Leu |
| 515 | 520 | 525 | |||||||||||||
| Pro | Leu | Lys | Leu | Ile | Ala | Ser | Gly | Gly | Asn | Ile | Cys | Phe | Arg | Asn | Asn |
| 530 | 535 | 540 | |||||||||||||
| Glu | Tyr | Arg | Pro | Thr | Ser | Ser | Asp | Thr | Gly | Thr | Ser | Thr | Phe | Cys | Ser |
| 545 | 550 | 555 | 560 | ||||||||||||
| Ile | Ala | Gly | Asp | Val | Lys | Leu | Thr | Met | Gin | Ala | Ala | Lys | Gly | Lys | Thr |
| 565 | 570 | 575 | |||||||||||||
| Ile | Ser | Phe | Phe | Asp | Ala | Ile | Arg | Thr | Ser | Thr | Lys | Lys | Thr | Gly | Thr |
| 580 | 585 | 590 | |||||||||||||
| Gin | Ala | Thr | Ala | Tyr | Asp | Thr | Leu | Asp | Ile | Asn | Lys | Ser | Glu | Asp | Ser |
| 595 | 600 | 605 | |||||||||||||
| Glu | Thr | Val | Asn | Ser | Ala | Phe | Thr | Gly | Thr | Ile | Leu | Phe | Ser | Ser | Glu |
| 610 | 615 | 620 | |||||||||||||
| Leu | His | Glu | Asn | Lys | Ser | Tyr | Ile | Pro | Gin | Asn | Val | Val | Leu | His | Ser. |
| 625 | 630 | 635 | 640 | ||||||||||||
| Gly | Ser | Leu | Val | Leu | Lys | Pro | Asn | Thr | Glu | Leu | His | Val | Ile | Ser | Phe |
| 645 | 650 | 655 | |||||||||||||
| Glu | Gin | Lys | Glu | Gly | Ser | Ser | Leu | Val | Met | Thr | Pro | Gly | Ser | Val | Leu |
| 660 | 665 | 670 | |||||||||||||
| Ser | Asn | Gin | Thr | Val | Ala | Asp | Gly | Ala | Leu | Val | |||||
| 675 | 680 |
<210> 358 <211> 1248 <212> DNA <213> Chlamydia <400> 358 catatgcatc accatcacca tcaccctčca gaatcgggct taatcatagc cattcacgat 60 gatcctcgct ctctttctcc agaaaaagga gaaaatgctt tccatttttc tttgiccaag 120 gctttatttg ctactctctt cagagaagag ctctctggat taacccctgc tctggtctcc 180 tcctatcaag tttcggaaga cgggcggttt tatcgttttt qtattcgtaa agatgctaag 240 tggagtgacg gctctctttt acttgcagaa gatgtaatag ctgcttggga acacactaaa 300 caagctgggc gatattccct actttttgaa aagctatctt ttcgagcctc ttcttcttcg 360 gaaatcctta ttgaactcaa agaacccgag cctcaactat tggcgatatt agcctctccg 420 ttttttgctg tgtatcgtcc agaaaatcct tttctttctt ctggaccttt tatgccaaaa 480 acctatgtgc aagggcaaac gctcgttcta caaaaaaacc cttattacta tgaccatgcg 540 catgtggaat tacattccat agactttcgc atcattccca acatttacac agctctacac 600 ctcttaagaa gaggtgacgt ggattgggtg gggcagcctt ggcaccaagg gattcctttt 660 gagcttcgga ctacctctgc tctctacacc cattaccctg tagatggcac attctggctt 720 · attcttaatc ccaaagatcc tgtactttcc tctctatcta atcgtcagcg attgattgct 780 gccatccaaa aggaaaaact ggtgaagcaa gctttaggaa cacaatatcg agtagctgaa 840 agctctccat ctccagaggg aatcatagct catcaagaag cttctactcc ttttcctggg 900 aaaattactt tgatatatcc caataatatt acgcgctgtc agcgtttggc cgaggtattg 960 caagaacaat gccgagacgc aggtatccag ctgactcttg aaggactcga ataccatgtá 1020 tttgttcaaa aacgagccac tcaagatttc tctgtctcca cagcaacttc tatagctttc 1080 catccccttg ctaaatctaa gttcgatcaa acggctctag acaatttcac ttgtctgccc 1140 ttgtaccaca tagaatatga ttatattttg agcagaccgc tagatcaaat tgttcactat 1200 ccttcaggta gtgttgattt gacctatgca cactttcact aggaattc 1248
325 ·· ···· ·· ·· ·· ···· • · · ··· · · · • ··♦ » · ·»· · · · • ·'·····.··· · • · · · · · · · · 9
9999 999 ·· 99 99 99 <210> 359 <211> 1311 <212> DNA <213> Chlamydia <400> 359 catatgcatc accatcacca tcacatgtat gttcgctcta tcttttttag tattatcgcc 60 ttcctaacgg tcggatgctc cttttctcct ccagaatcgg gcttaatcat agccattcac 120 gatgatcctc gctctctttc tccagaaaaa ggagaaaatg ctttccattt ttctttgtcc 180 aaggctttat ttgctactct cttcagagaa gagctctctg gattaacccc tgctctggtc 240 tcctcctatc aagtttcgga agacgggcgg ttttatcgtt tttgtattcg taaagatgct 300 aagtggagtg acgqctctct tttacttgca gaagatgtaa tagctgcttg ggaacacact 360 aaacaagctg ggcgatattc cctacttttt gaaaagctat cttttcgagc ctcttcttct 420 tcggaaatcc ttattgaact caaagaaccc gagcctcaac tattggcgat attagcctct 480 ccgttttttg ctgtgtatcg tccagaaaat ccttttcttt cttctggacc ttttatgcča 540 aaaacctatg tgcaagggca aacgctcgtt ctacaaaaaa acccttatta ctatgaccat 600 gcgcatgtgg aattacattc catagacttt cgcatcattc ccaacattta cacagctcta 660 cacctcttaa gaagaggtga cgtggattgg gtggggcagc cttggcacca agggattcct 720 tttgagcttc ggactacctc tgctctctac acccattacc ctgtagatgg cacattctgg 780 cttattctta atcccaaaga tcctgtactt tcctctctat ctaatcgtca gcgattgatt 840 gctgccatcc aaaaggaaaa actggtgaag caagctttag gaacacaata tcgagtagct 900 gaaagctctc catctccaga gggaatcata gctcatcaag aagcttctac tccttttcct 960 gggaaaatta ctttgatata tcccaataat attacgcgct gtcagcgttt ggccgaggta 1020 ttgcaagaac aatgccgaga cgcaggtatc cagctgactc ttgaaggact cgaataccat 1080 gtatttgttc aaaaacgagc cactcaagat ttctctgtct ccacagcaac ttctatagct 1140 ttccatcccc ttgctaaatc taagttcgat caaacggctc tagacaattt cacttgtctg 1200 cccttgtacc acatagaata tgattatatt ttgagcagac cgctagatca aattgttcac 1260 tatccttcag gtagtgttga tttgacctat gcacactttc actaggaatt c 1311 <210> 360 <211> 813 <212> DNA <213> Chlamydia <400> 360 atgcatcacc atcaccatca cggaaattct ggtttttatt tgtataacac tcaaaactgc 60 gtctttgctg ataatatcaa agttgggcaa atgacagagc cgctcaagga ccagcaaata 120 atccttggga caacatcaac acctgtcgca gccaaaatga cagcttctga tggaatatct 180 ttaacagtct ccaataatcc atcaaccaat gcttctatta caattggttt ggatgcggaa 240 aaagcttacc agcttattct agaaaagttg ggagatcaaa ttcttggtgg aattgctgat 300 actatťgttg atagtacagt ccaagatatt ttagacaaáa tcacaacaga cccttctcta 360 ggtttgttga aagcttttaa caactttcca atcactaata aaattcaatg caacgggtta 420 ttcactccca ggaacattga aactttatta ggaggaactg aaataggaaa attcacagtc 480 acacccaaaa gctctgggag catgttctta gtctcagcag atattattgc atcaagaatg 540 gaaggcggcg ttgttctagc tttggtacga gaaggtgatt ctaagcccta cgcgattagt 600 tatggatact catcaggcgt tcctaattta tgtagtctaa gaaccagaat tattaataca 66tí ggattgactc cgacaacgta ttcattacgt gtaggcggtt tagaaagcgg tgtggtatgg 720 gttaatgccc tttctaatgg caatgatatt ttaggaataa caaatacttc taatgtatct 780 tttttggagg taatacctca aacaaacgct taa 813 <2-10> 361 <211> 750 <212> DNA <213> Chlamydia <400> 361 atgcatcacc atcaccatca caaaataact ccgatcaaaa cacgtaaagt atttgcacat 60 gattcgcttc aagagatctt gcaagaggct ttgccgcctc tgcaagaacg gagtgtggta 120 gttgtctctt caaagattgt gagtttatgt gaaggcgctg tcgctgatgc aagaatgtgc 180 aaagcagagt tgataaaaaa agaagcggat gcttatttgt tttgtgagaa aagcgggata 240 ·· ··*· ΦΦ ·« 9· ΦΦΦΦ ··· ··· ' Φ - Φ φ • · · Φ Λ Φ φ φ'φ · ' · φ • ······,··· · • · Φ ΦΦ Φ Φ Φφ · • ΦΦΦ ΦΦΦ ΦΦ . φφ ΦΦ Φ·
6 tatctaacga aaaaagaagg tattttgatt ccttctgcag ggattgatga atcgaatacg 300 gaccagcctt ttgttttata tcctaaagat attttgggat cgtgtaatcg catcggagaa 360 tggttaagaa attattttcg agtgaaagag ctaggcgtaa tcattacaga tagccatact 420 actccaatgc ggcgtggagt actgggtatc gggctgtgtt ggtatggatt ttctccatta 480 cacaactata taggatcgct agattgtttc ggtcgtccct tacagatgac gcaaagtaat 540 cttgtagatg ccttagcagt tgcggctgtt gtťtgtatgg gagaggggaa tgagcaaaca 600 ccgttagcgg tgatagagca ggcacctaat atggtctacc attcatatcc tacttctcga 660 gaagagtatt gttctttgcg catagatgaa acagaggact tatacggacc ttttttgcaa 720 gcggttacgt ggagtcaaga aaagaaatag 750 <210> 362 <211> 412 <212> PRT <213> Chlamydia <400> 362
| Met | His | His | His | His 5 | His | His | Pro | Pro | Glu 10 | Ser Gly Leu | Ile | Ile 15 | Ala | ||
| Ile | His | Asp | Asp | Pro | Arg | Ser | Leu | Ser | Pro | Glu | Lys | Gly | Glu | Asn | Ala |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Phe | His | Phe | Ser | Leu | Ser | Lys | Ala | Leu | Phe | Ala | Thr | Leu | Phe | Arg | Glu |
| 35 | 4 0 | 45 | |||||||||||||
| Glu: | Leu | Ser | Gly | Leu | Thr | Pro | Ala | Leu | Val | Ser | Ser | Tyr | Gin | Val | Ser |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Glu | Asp | Gly | Arg | Phe | Tyr | Arg | Phe | Cys | Ile | Arg | Lys | Asp | Ala | Lys | Trp |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Ser | Asp | Gly | Ser | Leu | Leu | Leu | Ala | Glu | Asp | Val | Ile | Ala | Ala | Trp | Glu |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| His | Thr | Lys | Gin | Ala | Gly | Arg | Tyr | Ser | Leu | Leu | Phe | Glu | Lys | Leu | Ser |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Phe | Arg | Ala | Ser | Ser | Ser | Ser | Glu | Ile | Leu | Ile | Glu | Leu | Lys | Glu | Pro |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Glu | Prd | Gin | Leu | Leu | Ala | Ile | Leu | Tkla | Ser | Pro | Phe | Phe | Ala | Val | Tyr |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Arg | Pro | Glu | Asn | Pro | Phe | Leu | Ser | Ser | Gly | Pro | Phe | Met | Pro | Lys | Thr |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Tyr | Val | Gin | Gly | Gin | Thr | Leu | Val | Leu | Gin | Lys | Asn | Pro | Tyr | Tyr | Tyr |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Asp | His | Ala | His | Val | Glu | Leu | His | Ser | Ile | Asp | Phe | Arg | Ile | Ile | Pro |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Asn | Ile | Tyr | Thr | Ala | Leu | His | Leu | Leu | Arg | Arg | Gly | Asp | Val | Asp | Trp |
| 1 OR JU _/ _/ | ddn z. w | 205 | |||||||||||||
| Val | Gly | Gin | Pro | Trp | His | Gin | Gly | Ile | Pro | Phe | Glu | Leu | Arg | Thr | Thr |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Ser | Ala | Leu | Tyr | Thr | His | Tyr | Pro | Val | Asp | Gly | Thr | Phe | Trp | Leu | Ile |
| 225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
| Leu | Asn | Pro | Lys | Asp | Pro | Val | Leu | Ser | Ser | Leu | Ser | Asn | Arg | Gin | Arg |
| 245 | 250 | 255 | |||||||||||||
| Leu | Ile | Ala | Ala | Ile | Gin | Lys | Glu | Lys | Leu | Val | Lys | Gin | Ala | Leu | Gly |
| 260 | 265 | 270 | |||||||||||||
| Thr | Gin | Tyr | Arg | Val | Ala | Glu | Ser | Ser | Pro | Ser | Pro | Glu | Gly | Ile | Ile |
| 275 | 280 | 285 | |||||||||||||
| Ala | His | Gin | Glu | Ala | Ser | Thr | Pro | Phe | Pro | Gly | Lys | Ile | Thr | Leu | Ile |
| 290 | 295 | 300 | |||||||||||||
| Tyr | Pro | Asn | Asn | Ile | Thr | Arg | Cys | Gin | Arg | Leu | Ala | Glu | Val | Leu | Gin |
| 305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
| Glu | Gin | Cys | Arg | Asp | Ala | Gly | Ile | Gin | Leu | Thr | Leu | Glu | Gly | Leu | Glu |
| 325 | 330 | 335 | |||||||||||||
| Tyr | His | Val | Phe | Val | Gin | Lys | Arg | Ala | Thr | Gin | Asp | Phe | Ser | Val | Ser |
| 340 | 345 | 350 | |||||||||||||
| Thr | Ala | Thr | Ser | Ile | Ala | Phe | His | Pro | Leu | Ala | Lys | Ser | Lys | Phe | Asp |
··
-9 ·
327
355 360 365
| Gin Thr Ala | Leu | Asp | Asn Phe Thr 375 | Cys | Leu Pro Leu 380 | Tyr | His | Ile | Glu | ||||||
| 370 | |||||||||||||||
| Tyr | Asp | Tyr | Ile | Leu | Ser | Arg | Pro | Leu | Asp | Gin | Ile | Val | His | Tyr | Pro |
| 385 | 390 | 395 | 400 | ||||||||||||
| Ser | Gly | Ser | Val | Asp | Leu | Thr | Tyr | Ala | His | Phe | His | ||||
| 405 | 410 |
| <210> 363 <211> 433 <212> PRT <213> Chlamydia | |||||||||||||||
| <400> 363 | |||||||||||||||
| Met | His | His | His | His | His | His | Met | Tyr | Val | Arg | Ser | Ile | Phe | Phe | Ser |
| 5 | 10 | 15 | |||||||||||||
| Ile | Ile | Ala | Phe | Leu | Thr | Val | Gly | Cys | Ser | Phe | Ser | Pro | Pro | Glu | Ser |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Gly | Leu | Ile | Ile | Ala | Ile | His | Asp | Asp | Pro | Arg | Ser | Leu | Ser | Pro | Glu |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Lys | Gly | Glu | Asn | Ala | Phe | His | Phe | Ser | Leu | Ser | Lys | Ala | Leu | Phe | Ala |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Thr | Leu | Phe | Arg | Glu | Glu | Leu | Ser | Gly | Leu | Thr | Pro | Ala | Leu | Val | Ser |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Ser | Tyr | Gin | Val | Ser | Glu | Asp | Gly | Arg | Phe | Tyr | Arg | Phe | Cys | Ile | Arg |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Lys | Asp | Ala | Lys | Trp | Ser | Asp | Gly | Ser | Leu | Leu | Leu | Ala | Glu | Asp | Val |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Ile | Ala | Ala | Trp | Glu | His | Thr | Lys | Gin | Ala | Gly | Arg | Tyr | Ser | Leu | Leu |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Phe | Glu | Lys | Leu | Ser | Phe | Arg | Ala | Ser | Ser | Ser | Ser | Glu | Ile | Leu | Ile |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Glu | Leu | Lys | Glu | Pro | Glu | Pro | Gin | Leu | Leu | Ala | Ile | Leu | Ala | Ser | Pro |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Phe | Phe | Ala | Val | Tyr | Arg | Pro | Glu | Asn | Pro | Phe | Leu | Ser | Ser | Gly | Pro |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Phe | Met | Pro | Lys | Thr | Tyr | Val | Gin | Gly | Gin | Thr | Leu | Val | Leu | Gin | Lys |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Asn | Pro | Tyr | Tyr | Tyr | Asp | His | Ala | His | Val | Glu | Leu | His | Ser | Ile | Asp |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Phe | Arg | Ile | Ile | Pro | Asn | Ile | Tyr | Thr | Ala | Leu | His | Τ.ΟΊΛ | Leu | Arg | Arg |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Gly | Asp | Val | Asp | Trp | Val | Gly | Gin | Pro | Trp | His | Gin | Gly | Ile | Pro | Phe |
| 225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
| Glu | Leu | Arg | Thr | Thr | Ser | Ala | Leu | Tyr | Thr | His | Tyr | Pro | Val | Asp | Gly |
| 245 | 250 | 255 | |||||||||||||
| Thr | Phe | Trp | Leu | Ile | Leu | Asn | Pro | Lys | Asp | Pro | Val | Leu | Ser | Ser | Leu |
| 2 60 | 265 | 270 | |||||||||||||
| Ser | Asn | Arg | Gin | Arg | Leu | Ile | Ala | Ala | Ile | Gin | Lys | Glu | Lys | Leu | Val |
| 275 | 280 | 285 | |||||||||||||
| Lys | Gin | Ala | Leu | Gly | Thr | Gin | Tyr | Arg | Val | Ala | Glu | Ser | Ser | Pro | Ser |
| 290 | 295 | 300 | |||||||||||||
| Pro | Glu | Gly | Ile | Ile | Ala | His | Gin | Glu | Ala | Ser | Thr | Pro | Phe | Pro | Gly |
| 305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
| Lys | Ile | Thr | Leu | Ile | Tyr | Pro | Asn | Asn | Ile | Thr | Arg | Cys | Gin | Arg | Leu |
| 325 | 330 | 335 | |||||||||||||
| Ala | Glu | Val | Leu | Gin | Glu | Gin | Cys | Arg | Asp | Ala | Gly | Ile | Gin | Leu | Thr |
| 340 | 345 | 350 | |||||||||||||
| Leu | Glu | Gly | Leu | Glu | Tyr | His | Val | Phe | Val | Gin | Lys | Arg | Ala | Thr | Gin |
| 355 | 360 | 365 |
328 ·« ···· • · • »·· • 9 • ··«
| Asp Phe | Ser Val | Ser | Thr | Ala Thr 375 | Ser | Ile Ala | Phe 380 | His | Pro | Leu | Ala | ||||
| 370 | |||||||||||||||
| Lys | Ser | Lys | Phe | Asp | Gin | Thr | Ala | Leu | Asp | Asn | Phe | Thr | Cys | Leu | Pro |
| 385 | ‘390 | 395 | 4 00 | ||||||||||||
| Leu | Tyr | His | Ile | Glu | Tyr | Asp | Tyr | Ile | Leu | Ser | Arg | Pro | Leu | Asp | Gin |
| 405 | 410 | 415 | |||||||||||||
| Ile | Val | His | Tyr | Pro | Ser | Gly | Ser | Val | Asp | Leu | Thr | Tyr | Ala | His | Phe |
| 4 20 | 425 | 430 | |||||||||||||
| His |
| <21O> 364 <211> 264 <212> PRT <213> Chlamydia | |||||||||||||||
| <400> 364 | |||||||||||||||
| Met | Gly | Asn | Sei | Gly | Phe | Tyr | Leu | Tyr | Asn | Thr | Gin | Asn | Cys | Val | Phe |
| 5 | 10 | 15 | |||||||||||||
| Ala | Asp | Asn | Ile | Lys | Val | Gly | Gin | Met | Thr | Glu | Pro | Leu | Lys | Asp | Gin |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Gin | Ile | Ile | Leu | Gly | Thr | Thr | Ser | Thr | Pro | Val | Ala | Ala | Lys | Met | Thr |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Ala | Ser | Asp | Gly | Ile | Ser | Leu | Thr | Val | Ser | Asn | Asn | Pro | Ser | Thr | Asn |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Ala | Ser | Ile | Thr | Ile | Gly | Leu | Asp | Ala | Glu | Lys | Ala | Tyr | Gin | Leu | Ile |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Leu | Glu | Lys | Leu | Gly | Asp | Gin | Ile | Leu | Gly | Gly | Ile | Ala | Asp | Thr | Ile |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Val | Asp | Ser | Thr | Val | Gin | Asp | Ile | Leu | Asp | Lys | Ile | Thr | Thr | Asp | Pro |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Ser | Leu | Gly | Leu | Leu | Lys | Ala | Phe | Asn | Asn | Phe | Pro | Ile | Thr | Asn | Lys |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Ile | Gin | Cys | Asn | Gly | Leu | Phe | Thr | Pro | Arg | Asn | Ile | Glu | Thr | Leu | Leu |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Gly | Gly | Thr | Glu | Ile | Gly | Lys | Phe | Thr | Val | Thr | Pro | Lys | Ser | Ser | Gly |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Ser | Met | Phe | Leu | Val | Ser | Ala | Asp | Ile | Ile | Ala | Ser | Arg | Met | Glu | Gly |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Gly | Val | Val | Leu | Ala | Leu | Val | Arg | Glu | Gly | Asp | Ser | Lys | Pro | Tyr | Ala |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Ile | Ser | Tvr - j | m Λ. j | ·* J -- | Ser | Se 2Γ | ΓΊ . . | Val | Pro | Asn | Leu | Cys | Ser | Leu | Arg |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Thr | Arg | Ile | Ile | Asn | Thr | Gly | Leu | Thr | Pro | Thr | Thr | Tyr | Ser | Leu | Arg |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Val | Gly | Gly | Leu | Glu | Ser | Gly | Val | Val | Trp | Val | Asn | Ala | Leu | Ser | Asn |
| 225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
| Gly | Asn | Asp | Ile | Leu | Gly | Ile | Thr | Asn | Thr | Ser | Asn | Val | Ser | Phe | Leu |
| 245 | 250 | 255 | |||||||||||||
| Glu | Val | Ile | Pro | Gin | Thr | Asn | Ala | ||||||||
| 260 |
| <210> 365 <211> 249 <212> PRT <213> Chlamydia | |||
| <400> 365 Met His His His | His His | His Lys Ile Thr Pro | Ile Lys Thr Arg Lys |
| 5 | 10 | 15 |
• · · ·
J
329
| Val | Phe | Ala | His 20 | Asp | Ser | Leu | Gin | Glu 25 | Ile Leu Gin Glu Ala 30 | Leu | Pro | ||||
| Pro | Leu | Gin | Glu | Arg | Ser | Val | Val | Val | Val | Ser | Ser | Lys | Ile | Val | Ser |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Leu | Cys | Glu | Gly | Ala | Val | Ala | Asp | Ala | Arg | Met | Cys | Lys | Ala | Glu | Leu |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Ile | Lys | Lys | Glu | Ala | Asp | Ala | Tyr | Leu | Phe | Cys | Glu | Lys | Ser | Gly | Ile |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Tyr | Leu | Thr | Lys | Lys | Glu | Gly | Ile | Leu | Ile | Pro | Ser | Ala | Gly | Ile | Asp |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Glu | Ser | Asn | Thr | Asp | Gin | Pro | Phe | Val | Leu | Tyr | Pro | Lys | Asp | Ile | Leu |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Gly | Ser | Cys | Asn | Arg | Ile | Gly | Glu | Trp | Leu | Arg | Asn | Tyr | Phe | Arg | Val |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Lys | Glu | Leu | Gly | Val | Ile | Ile | Thr | Asp | Ser | His | Thr | Thr | Pro | Met | Arg |
| 130 | 135 | 14 0 | |||||||||||||
| Arg | Gly | Val | Leu | Gly | Ile | Gly | Leu | Cys | Trp | Tyr | Gly | Phe | Ser | Pro | Leu |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| His | Asn | Tyr | Ile | Gly | Ser | Leu | Asp | Cys | Phe | Gly | Arg | Pro | Leu | Gin | Met |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Thr | Gin | Ser | Asn | Leu | Val | Asp | Ala | Leu | Ala | Val | Ala | Ala | Val | Val | Cys |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Met | Gly | Glu | Gly | Asn | Glu | Gin | Thr | Pro | Leu | Ala | Val | Ile | Glu | Gin | Ala |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Pro | Asn | Met | Val | Tyr | His | Ser | Tyr | Pro | Thr | Ser | Arg | Glu | Glu | Tyr | Cys |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Ser | Leu | Arg | Ile | Asp | Glu | Thr | Glu | Asp | Leu | Tyr | Gly | Pro | Phe | Leu | Gin |
| 225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
| Ala | Val | Thr | Trp | Ser | Gin | Glu | Lys | Lys | |||||||
| 245 |
<210> 366 <211> 2418 <212> DNA <213> Chlamydia pneumoniae <400> 366 atggacccaa aagaaaaaaa ttacgatgca tccgctatta ctgttttaga agggctacaa 60 gctgttcgtg agcgccccgg gatgtacatt ggagatacgg gaatcacggg tcttcatcat 120 ctagtctatg aggttgtaga caacagcatt gacgaagcca tggcaggtta ttgctctagg 180 attgatgttc gcattttaga ggacgggggt attgtcatcg tagataatgg ccgaggaatc 240 cctatagaag ttcacgaaag agagtctgca aaacaaggta gagaggtetc tgctttagaa 300 gtggttttaa cagtccttca tgctggagga aaattcgata aggatagcta taaagtatcc 360 ggaggcttgc acggagttgg ggtttcttgc gttaatgctc tttcggagaa attagttgcc 420 acggtcttta aagataagaa gtgttatcaa atggagttct ctaggggaat tcctgtaact 480 ccattgcagt atgtaagtgt tagtgatcgg cagggaacag aaatcgtttt ctaócctgat 540 cctaaaatat tttcgacttg tacttttgat cgctctattt taatgaaacg cttgcgagag 600 cttgctttct taaatcgtgg gatcacaata gtctttgaag atgatcgaga tgttagcttt 660 gacaaggtta ccttctttta tgagggaggg attcaatctt ttgtaagtta cctgaatcaa 720 aataaagaaa gccttttctc tgaaccgatt tatatttgtg gaactcgagt aggagatgat 780 ggagaaatcg agtttgaagc agccttacaa tggaattcag ggtattctga acttgtttat 840 tcctatgcca ataatattcc tacacgccaa ggaggaacgc atcttacagg gttttctacc 900 gcgcttacta gggtaatcaa tacgtatatt aaagctcata accttgcgaa gaataataag 960 cttgcattaa ccggagaaga tattcgagaa ggtctgacag ctgtgatttc tgtaaaggtc 1020 ccaaatccac aatttgaagg gcaaacaaaa cagaaattag gaaacagtga tgttagctca 1080 gtggctcaac aggttgtagg ggaagctctg acaatctttt ttgaagagaa tcctcaaatt 1140 gctaggatga ttgttgataa ggtttttgtt gcagcgcaag ctagagaagc tgcaaaaaaa 1200 gctcgagaat tgactttaag gaaaagtgct ttagatagcg cacgcttacc tggaaáacta 1260 attgattgtt tagaaaaaga tcccgaaaag tgtgagatgt acattgtgga gggggattct 1320 gctggaggat ctgcgaaaca aggtagagat cgaagatttc' aagcaattct gcctattcga 1380 • ··· • · ·’· <·λ67
330 ggtaaaattc ggaaccatca ttacgctata accctacttc tatattgctc tcagagaaag tttaaatcta ttagatgtag ttagagatgt atgcagggag gaaactcata aatcaactca attgtgattg gtcattaact cttggagaga ctcattcatg ggggaagaag aataatttag tgaacgtaga tagcagcttt gacgtatcat tcacattctt aacctccttt aaatggacag cggaaagaga agagctttat ataaagaggg ggcgctatct agtttaaaat aagaatatgg gaaatgaaga atcttaaaaa tgaatgcega tgtcattgaa tccctccaag atatttag aaaagctcgt aggctgtggc tatcatgaca ctatcgtcat atacaaggtg ctatttgctc attacgtgga aaacactctt gataggctat ttattctgat catagagctt tttagatatt ttccccaagc tcttggaaga ccagctttgg ggatgccgta aagagaattc ctacagaaaa ttttccaaaa ccaagagata 1440 ataggtgctg ataattttaa tctcagtaaa 1500 gatgctgacg tggacggttc tcatattcgt 1560 atgacagcgc ttattgaaaa tgaatgtgtt 1620 agtaagaaaa aagacttccg ttatattctt 1680 atgttaggca cgaatgagag ctccattctc 1740 gaggctttag agagttttat caacgtcatt 1800 gagaaaaaag cgattccctt ctctgaattt 1860 cctttgtact atcttgctcc ggcaactgga 1920 gaggaaaaag aagaagcttt agctcaagaa 1980 tataaagttg ctgtgttcgt agatattcaa 2040 tctagctatc ttatccctca gaaaaacgag 2100 tgtaactata gctgctatac cttggaagaa 2160 aaaggcatag aaattcagag gtataaaggt 2220 gatactacta tgaatcctga gcagagaaca 2280 gaagcagacc atattttcac tatgttgatg 2340 atagaaagtc atgctttgtc cattaggata 2400
2418 <210> 367 <211> 888 <212> DNA <213> Chlamydia pneumoniae <4OO> 367 atggaaaagt gataaaaagg ttgacgggaa ttattaggat tctaaaagtt gctctttttt actcctatag gaaagagaga gctgcagcaa cgccaagaag cgctatgcca gttgtcaata aatgatctcg
YJ d «-4. u. y <_*. y gcttgggaag tactagtgac tgtatgagcg ggtattataa gccaaaacgg taccctcaga ccgtggaatc ctcaagattt tcctatttga aagtctttgg cactgacttc tcttgttttt tactttatga atcttattga ttcatgcgga ctggtgtccg tgatattgac gctctatgcg atatgctgca cgcttctgta tttattatgt aggagctcct acacgaatat aacgcgctct actgcgagat agtcgcgacg aacagataaa tggaaagaaa gagaggagat r-.+- — -__.+ctattatgac ggtacaatta cccatcaatc tcatcattta 60 ctgcaccaag ctggttggaa gttgtttttc 120 cgcttgtttt ctgattttga tgctccatat 180 tggtcttcaa catcatcaaa tcttctctat 240 attttacaag attgtatgga gggggcaacg 300 tacggggatc actactatcg cttttcaccg 360 gtagatccta ggtactttcc taatgctaag 420 ttaaaagacg actatgcttt tcctagtttt 480 gaggtcatca gaattcaaaa ggagctggaa 540 atgacgttaa tgcgctggcc ctttgacttt 600 agcgtctcta aaggcaaagc cttagatcgt 660 ccctttgtca tggcttcagg agatgatgct 720 tttaaaattg tgatgagttc cgcacctgaa 780 cccccagcay ataagaatgg cattctthca 840 gaccttatga gtctttag 888 <210>
<211>
<212>
<213>
368
237
DNA
Chlamydia pneumoniae <400> 368 atgaaagaat attaaagaag atcgggaaga tctgtagcaa ttttagccta ttcaggggac tcattggcaa gcaggaacaa tatcattaag tcacacgatt agaaggccgt tgtaagggtc aatctagtgg accgccctga agaagtccgt 60 atttatgaac taagtgtagc taaacctgat 120 acgatcaaag cgattcgtac tcttetggtt 180 agtttagaaa ttatggaaga aaagtag 237 <210> 369 <211> 1437 <212> DNA <213> Chlamydia pneumoniae <400> 369 ···· • ·
331 atgcgtgacg ttagagagag tggactttat actatggctc aataaaggct cacgctgctg aataccgact ttaectgcaa accacgaaaa aatgataaaa gagtatcaag aaaacgcttg atagagaacg gatgtccctc ttgttattcg gagaataagc caggggtatc cataaaacct ctagccataa gagccctggc tcactaacga gccatagaaa gtcaagtacc atcacaaact tttcagagct cgattcctca tccttatgga tccatcccca acctcatcga cccgttatat tgatagcttt agctccccgt ttttccctca aattcactgt atggattggg tagtgaaaca cagcaaaacg acattgaaat agcatactga ctgtagaatg ttgaaaaaga tagaatacat acaagaaaat ttcatgagct ttaagaaaat áaaaacaagc tcaaaggact ttaagacggc ttttcgaaca tattcttgat cgacgggaaa tggcgatgcc cacgcaagga agaagcacga tcatgactct gcttttactt caattttgca gtttcctgac atcgattaca aatttgtcct tggcacaatt taagctgcca atgccaggtg ttcgatatcc acttttgttg ctttattaaa ttctgctgat tgcaactccc cctttgcttt agcgatacaa tttagaacgc aaagacatct cattttatgc attacgcgtc ttacgtaatt 60 ggcttaaaac cggtgcagcg tcgacttcta 120 atgcataaag ttgccaatat tgcaggaaga 180 cctattgttg aagctcttgt tgtcttagca 240 aacttcggaa atccccttac gggagatcct 300 ctcagtcctt tagctcgaga aacgctcttt 360 tatgatggaa gagaaaaaga acctgatatt 420 catggtgtgg acgggattgc tgtggggatg 480 gaacttttga aagcgcaaat tgcaatttta 540 tttccttcgg gaggattgat ggatccctcg 600 ctgcgtgcat ctatagacat tattaatgat 660 caatctacga ctgagacttt gatccgttct 720 aaaatcgata ccatccaaga cttctctaca 780 aaaggctctc gagccaaaga gatgcttccc 840 attctctatt ctaagcccac agtcatttac 900 gagattctca aactgcatac tacagctcta 960 ctccaagaac aacttacttt ggaccattat 1020 cataagctct atgattctgt ccgagaagtc 1080 gacctacatc aageagtgct ccatgctctg 1140 gttacaaaac aagacacctc tcaacttgct 1200 aatgaagagg catgcactaa ggaactgcta 1260 aaagatcttg gaagaataaa agaagtcacc 1320 catggacact taggagagag aaaaacacag 1380 atcttgaaac aacaaacctt aatttaa 1437 <210> 370 <211> 774 <212> DNA <213> Chlamydia pneumoniae <400> 370 atggcatttt cgtttccttc acgagggttg atttttaatt gctcacttag tattcaggat agagcttctg atccatacgg tctatcttag aattttgttc gaaggggaaa tcctatggat agtcaaaata attctccttc ttggtgaaac atggtttttt ccgatggatc cttctcagaa atttttattc ttcatcgatt gagtgcctca gtccttttct agatactggg
4- 4- ~
v. u y v· a'y <- u y ggaaggagtc ggggacgggt aacgatctct acttcctgag atatttaaag acgtccaacg gggaaaatcg ttgggatcgt ggagtcgcgt tgctgtcgta tcgctatcat acattgccag tggaacaggg gatccaaatc atatcttcag aaatatttta tctattctgg agcaggaaat 60 gttgaagatg ttcggttctt atgccaagag 120 ccctcttctt gtgctgatgc gcaactcatt 180 atgtgtggta acggcttgcg ttgtgcgatt 240 gacatctctg tatctacgga tagtggtcta 300 gtgcttgtag atatgactct cgcagattgg 360 cctgatcctc ttcccaaaga ggtcgtttgt 420 attcttcctg agatttctac tttagatctt 480 cagaccttct ctccagatgg ggtgaatgtc 540 ttgcgcgttc gtacttacga acgtggagtc 600 gctctagctt ctgctcttgt tqtgtcaaac 660 catacttggg gtggagagct tatgactgtg 720 ggctctgtaa ctagagattt ataa 774 <210> 371 <211> 576 <212> DNA <213> Chlamydia pneumoniae <400> 371 atggcagacg cgcagagtat ctttggtatt gggggatctg gtcactactg gctcctggaa ggtggaccga acaaaagctc gaaaaggcta ttggatggca gggaagttca ttttctcaga tggaattaaa tggacgcagg ttgtgacagg ggagatttgc ttaccggtca gcattataga tcgatagaga ttttattctc taaattacgt gcctgtaaca agatcctgga ttttgctgtt gttggcagct aactcctcat ggcaaccgat tgtctatgta tatgtggatg cttcaacgat gatattatag aaaaagagtt attggaagcg 60 gagaaaagtg cttccgatgc aattaaaaag 120 aagcctatag tttttgtgat caatagtcct 180 tgggatcaaa ttaaaatgtt aacctcaccc 240 tctatgggct cggtattgag tttatgtgca 300 tctagaatta tgattcatca accttcaata 360 ttagacattc atgcgagaga gattttaaaa 420 gaggcgacaa atcaacctcg agatatcata 480 acagccaacg aagctaagga ttttggttta 540 ctctaa 576 ·· ··«·
332 <210> 372 <213 > 699 <212> DNA <213> Chlamydia pneumoniae <400> 372 atgacaaaac atggaaaacg tatacgaggc atcttaaaga actatgattt ctcaaaatca 60 tattctttgc gggaggctat agatatttta aaacaatgtc ctccagtacg cttcgatcaa 120 actgtagatg tatctatcaa gttagggata gatcctaaaa agagcgacca acaaattcgt 180 ggagccgttt ttttacctaa tggtacagga aaaactttaa gaattttggt ttttgcttca 240 gggaacaaag tcaaagaagc tgttgaagcg ggcgcagact ttatgggaag cgacgatctt 300 gttgaaaaaa ttaaatccgg gtggctggaa ttcgatgttg ctgtcgctac cccagatatg 360 atgcgtgaag taggaaaatt aggaaaagtc ttaggaccta gaaatctaat gcctacacct 420 aaaacaggaa cggtaaccac agacgttgct aaagcaatct ccgaattgcg taaaggaaaa 480 attgaattta aagcagaccg cgcaggcgta tgtaatgtag gcgtaggtaa gttgtctttt 540 gaaagcagtc aaatcaaaga aaatattgaa gctctaagtt ctgctttaat taaggccaaa 600 Cctcctgcag ctaaaggtca atatttagtc tcattcacta tttcttccac tatggggcct 660 ggtatttcta tagatactag agaattaatg- gcatcttaa 699 <210> 373 <211> 369 <212> DNA <213> Chlamydia pneumoniae <400> 373 atgccacgca tcattggaat tgatattcct gcaaagaaaa agttaaaaat aagtctgaca 60 tatatttatg gaataggatc agctcgttct gatgaaatca ttaaaaagtt gaagttagat 120 cctgaggcaa gagcctctga attaactgaa gaagaagtag gacgactgaa ctctctgcta 180 caatcagaat ataccgtaga aggggatttg cgacgtcgtg ttcaatcgga tatcaaaaga 240 ttgatcgcca tecattctta tcgaggtcag agacatagac tttctttacc agtaagagga 300 caacgtacaa aaactaattc tcgtactcga aaaggtaaaa gaaaaacagt cgcaggtaag 360 aagaaataa 369 <210> 374 <211> 5172 <212> DNA <213> Chlamydia pneumoniae <400> 374 atgaagtggc taccagctac aqctgttttt gctgccgtac tccccgcact aacagccttc 60 ggagatcccg cgtctgttga aataagtacc agccatacag gatccgggga tcctacaagc 120 gacgctgcct taacaggatt tacacaaagt tccacagaaa ctgacggtac tacctatacc 180 attgtcggtg atatcacctt ctctactttt acgaatattc ctgttcccgt agtaactcca 240 gacgccaacg atagttccag caatagctct aaaggaggaa gtagcagtag tggagctaca 300 tctctaatcc gatcctcaaa cctacactcc gattttgatt ttacaaaaga tagcgtgtta 360 gacctctatc accttttctt tccttcagct tcaaatactc tcaatcctgc actcctttct 420 tccagtagca gcggtggatc ctcgagcagc agtagctcct catcatctgg aagtgcatct 480 gctgttgttg ctgcggaccc aaaaggaggc gctgcctttt atagtaacga ggctaacgga 540 actttaacct tcactacaga ctctggaaat cccggctccc tgactcttca gaatcttaaa 600 atgaccggag atggagccgc catctactcg aagggtcctc tagtatttac tggtttaaaa 660 aatctaacct ttacaggaaa tgaatctcag aaatctggag gtgctgccta tactgaaggc 720 gcactcacaa cacaagcaat cgttgaagcc gtaactttta ctggcaacac ctcggcaggg 780 caaggaggcg ctatctatgt taaagaagct accctattca atgctctaga cagcctcaaa 840 tttgaaaaaa acacttctgg gcaagctggt ggtggaatct atacagagtc tacgctcaca 900 atctcgaaca tcacaaaatc tattgaattt atctctaata aagcttctgt ccctgccccc 960 gctcctgagc ccacctctcc ggctccaagt agcttaataa attctacaac gatcgatacc 1020 tcgactctcc aaacccgagc agcatccgca actccagcag tggctcctgt tgctgccgta 1080 actccaacac caatctctac tcaagagacc gcaggaaatg gaggcgctat ctatgctaaa 1140 caaggtattt cgatatccac gtttaaagat ctgaccttca agtctaactc tgcatcggta 1200 • 9 999« ·< ·♦ · · · « « <
• ·99 9 · «·« • ·*···<
• · 9 « · • 999 9·« *· ·»
333 gatgccaccc gcagactcta aataagtctg ctgaagatga ttaactatca ggtggggcta agtaaaaata cctgtagttt cctgttacaa ggaatcacat tacgttacta gcagcagatg gggaaaacac tcaggaaaat aaggaaaacg cccactccaa ggaaatacag ttatcttctg caaaaagctg aacaatacag attgataatc gatgccctca agtggtgggg attaccgata atctattcca aactctgtta gcaaccacgt gctgccacta gcagtaacta gaagcaacta aactctgtta ggaggagcga gcagacaacg tatggagaga catgatggaa atctttgaaa ttaggagctg gágaatggaa attgctggaa tatgatgcag aaagcgacaa attccacaga agcgtagttt ctttccaacc agtgaaatcg tcgagaacta gatcctaatg ttcaatatag aatttaggag tcaaaaatfa gacaaccact caagggatct ttctgggctt ttcacctatc attttaggag aactataagc ttctattttc tatatgcaac tgggatagca cctcactcta gagaaattca ttactgtcga tacaaatcca gtgggggtat ccaacaacac acaacggtgc tttttgctgt agaccggaaa ctagctctac acgcagcaaa cgatattgtc aaaccttcca aaggcggggg tatttcaaga ctctgactat gaggcggtgc atgaacctgc ccacaaaaag taacttttga cagataaaac ctacaggaaa ttacagtcca tcctggaaaa gtatctacgc ataaagtcga gtggagctgt tcaatacagc ctctctcaat aaaaaacatc tcgagaataa cagcagcaac ctttaacaaa ttggctgtat gttctgtcct ctatcgatat gtgcaatttg acaataaggt caatttatgg gtattttctt acgtaaaatt ttaacgtttc gtacaggaac aagtcacttt cctttaccca atagcaaaga ttcctactaa atgcagatag gcaacttata acaattctgc cťaaaaaagg .ttctaaaatg tctacatcaa tagggaacat cggctatagg atggcagagg ctgccttcag ataaaggctc ctgcgatacg atgacaccac .ttgcttggtt cagcaaggct cagagctaga ttctagcact acagtgcacg ttacgctgta ctgtaaaggt cattctcact aggtggcatc ttattccgct aactgctgca aggaggggct gtttgaaaac gtgttccgat cctgtattgt gaatagcagt gacatcgtta gaatgtccct gcctgtgcag tggtgggggc tcaaaatacc ggactgttct tggtgggggc aagcaaccaa ggttattaca taaggatatt aactagtctt cacgctaacc gacatcccag aaatcaatgt aacaacaaag ctctcagccc tgcaggaaat taaccctgaa tgatcttact ttttcaagac ctccaggaca ctgttcaaca tacggaaacc aaataatgag taaaaacaat tacagcaata caccaaagaa gattctattt cgcacatggg atctccaggc agcaggagga agataatgca taaagataag tcaaaattct aagtggggca atatttagga ,gacctttgac ctctatttgg gttgaacaat atctttcctt ctataccgct tcaggttttt aggtcactct gtctcggcct aacctactat atttgatctg taccttctat ctatgatcct attgqagaat ggaaccacct ggacaagtca gaaggtggag acattttctg actctctctg cctattacca tctcctgcgg ttatatagta aacgaatgcc tctcatcgcc ggtgacgatg gagaaacatg gagagcttct gaaaatattg cagcccgtgt atttacacga tcttcagaaa ttcacctata attgctgggg gcaaagaaag ggttctgtct caactacaag actactagca aatatatctg gatgcagata aatacaccca caaattgctg attattttct aaagatagct ataaccttta aatggctcac aactctgcgt ggtgcgactt gccctaactc acagccacta actagtgacg ctatgcacag gaagcttcag acaaatgctc tctggggaac a a t ct c a11 c accacaatca atcgctataa acagtagctc attgatatta tatcttggtg gttacagcca acctggaatt aaatacctgc ggagcacaaa gcaaggtttg aggaaagaag gctgtggatg ggtcacgccg acacaagcat attctattcc ccttctattg cgtttcagtg acagaagctg agatctttct ctggaggtgc tattcagtgg ccctagaaga ccatctacac gaaatacatc atcttgtaga aagcggctag tccctgctgc cagaaggact agaatcaagg tccagtttac tcacgctaac gaggtgggct gcttaaatgc tactcacctt atggagaagc aaaatgcggc atggtggtgc ttacaaatgt gaaaagcaca gtggtggggt cacaaaatac ctctacctgg.
ctaatttata gaacctttgg tacaaggtgg ttctatťtag gtggggctat taaataattc gtggaggagc aaggaaatta ctccccgtaa taaatcgcgg tcatcggtaa ttgcgccaaa caaaagcttc tcactatctc caacaaacaa cagggaaagc aagagctaaa ttcacgaaaa taggtaaaaa ctatgggccc acaatgtcat cacccactct caggaactgt aagaccgcga cgaatgtcac tggatccaaa gctggcccta actctttagt aagatcctgc tatctcgaaa ccaaacctcg agtctgaata ctctttatgc aaggtgtggc aagaaaaaaa tggatcttaa agtataccag ctgcatgctc tatctttgca caatactgcc tatagcgaat taaaaaggct gacagataat agtccgcttt caacacagct cgctgcagca gactgtatct aggtggggct tagtaataaa gaacctgaca ctctctcgcc aaatacagca cacctatact tcttgttact cttctcaaat cttacttacc caatatcacc tttcgatcgc ttatcttgaa agctacagaa aagcttcaca tggtgggggc cattacagga gggcatttat caacaactct cttctccgct cgcaaagtcg cattgcagct tgcagaaact agtctctatt aggcgctatc ctcttcaaaa ctcccaactt cataaataat tttatcagct atactgcagt tatatctttc attaaatgaa taaatcctat +- „ ___^.4. 4uyvayaautv aggatcggtt cattgatttt taaattagta gactcttcta tatcactctt ccttcaaggg ttcctcgggt catccctaga gactgtgaaa tttcaacaac ttctgactca ccaagaattt tcaccttgac tggcaaťatc gacctatggt tatggcaaac agaacctcaa aattcgccag ttatggaáac
1260 1320 1380 1440 1500 1560 1620 1680 1740 1800 1860 1920 1980 2040 2100 2160 2220 2280 2340 2400 2460 2520 2580 2640 2700 2760 2820 2880 2940 3000 3060 3120 3180 3240 3300 3360 3420 3480 3540 3600 3660 3720 3780 3840 3900 3960 4020 4080 4140 4200 4260 4320 4380 44 40 4500 4560 4620 4680 4740 4800 4860 ····
9 9 • ··· • · • · 9999 99 9
99 99 9999
9 9 9 9 .9
9 99 9 9 · *
9 9 9 9 9 9 9 ·
9 · 9 9 9 9 9
99 99 99
334 ttagcaattc ctactggatt ctctgtagac ggagcattag cttggcgtga gattattcta 4920 tataataaag tatcagctgc gtacctccct gtgattctca ggaataatcc aaaagcgacc 4980 tatgaagttc tctctacaaa agaaaagggc aacgtagtca acgttctccc tacaagaaac 5040 gcagctcgtg cagaggtgag ctctcaaatt tatcttggaa gttactggac actctacggc 5100 acgtatacta ttgatgcttc aatgaatact ttagtgcaaa tggccaacgg agggatccgg 5160 tttgtattct ag 5172 <210> 375 <211> 5172 <212> DNA <213> Chlamydia pneumoniae <400> 375 atgaagtggc taccagctac agctgttttt gctgccgtac tccccgcact aacagccttc 60 ggagatcccg cgtctgttga aataagtacc agccatacag gatccgggga tcctacaagc 120 gacgctgcct taacaggatt tacacaaagt tccacagaaa ctgacggtac tacctatacc 180 attgtcggtg atatcacctt ctctactttt acgaatattc ctgttcccgt agtaactcca 240 gacgccaacg atagttccag caatagctct aaaggaggaa gtagcagtag tggagctaca 300 tctctaatcc gatcctcaaa cctacactcc gattttgatt ttacaaaaga tagcgtgtta 360 gacctctatc accttttctt tccttcagct tcaaatactc tcaatcctgc actcctttct 420 tccagtagca gcggtggatc ctcgagcagc agtagctcct catcatctgg aagtgcatct 480 gctgttgttg ctgcggaccc aaaaggaggc gctgcctttt atagtaacga ggctaacgga 540 actttaacct tcactacaga ctctggaaat cccggctccc tgactcttca gaatcttaaa 600 atgaccggag atggagccgc catctactcg aagggtcctc tagtatttac tggtttaaaa 660 aatctaacct ttacaggaaa tgaatctcag aaatctggag gtgctgccta tactgaaggc 720 gcactcacaa cacaagcaat cgttgaagcc gtaactttta ctggcaacac ctcggcaggg 780 caaggaggcg ctatctatgt taaagaagct accctattca atgctctaga cagcctcaaa 840 tttgaaaaaa acacttctgg gcaagctggt ggtggaatct atacagagtc tacgctcaca 900 atctcgaaca tcacaaaatc tattgaattt atctctaata aagcttctgt ccčtgccccc 960 gctcctgagc čcacctctcc ggctccaagt agcttaataa attctacaac gatcgatacc 1020 tcgactctcc aaacccgagc agcatccgca actccagcag tggctcctgt tgctgccgta 1080 actccaacac caatctctac tcaagagacc gcaggaaatg gaggcgctat ctatgctaaa 1140 caaggtattt cgatatccac gtttaaagat ctgaccttca agtctaactc tgcatcggta 1200 gatgccaccc ttactgtcga ttctagcact attggagaat ctggaggtgc tatctttgca 1260 gcagactcta tacaaatcca acagtgcacg ggaaccacct tattcagtgg caatactgcc 1320 aataagtctg gtgggggtat ttacgctgta ggacaagtca ccctagaaga tatagcgaat 1380 ctgaagatga ccaacaacac ctgtaaaggt gaaggtggag ccatctacac taaaaaggct 1440 ttaactatca acaacggtgc cattctcact acattttctg gaaatacatc gacagataat 1500 ggtggggcta tttttgctgt aggtggcatc actcťctctg atcttgtaga agtccgcttt 1560 agťaaaaata agaccggaaa ttattccgct cctattacca aagcggctag caacacagct 1620 cctgtagttt ctagctctac aactgctgcá tctcctgcgg tccctgctgc cgctgcagca 1680 ectgttacaa acgcagcaaa aggaggggct ttatatagta cagaaggaot gactg-tatct 1740 ggaatcacat cgatattgtc gtttgaaaac aacgaatgcc agaatcaagg aggtggggct 1800 tacgttacta aaaccttcca gtgttccgat tctcatcgcc tccagtttac tagtaataaa 1860 gcagcagatg aaggcggggg cctgtattgt ggtgacgatg tcacgctaac gaacctgaca 1920 gggaaaacac tatttcaaga gaatagcagt gagaaacatg gaggtgggct ctctctcgcc 1980 tcaggaaaat ctctgactat gacatcgtta gagagcttct gcttaaatgc aaatacagca 2040 aaggaaaacg gaggcggtgc gaatgtccct gaaaatattg tactcacctt cacctatact 2100 cccactccaa atgaacctgc gcctgtgcag cagcccgtgt atggagaagc tcttgttact 2160 ggaaatacag ccacaaaaag tggtgggggc atttacacga aaaatgcggc cttctcaaat 2220 ttatcttctg taacttttga tcaaaatacc tcttcagaaa atggtggtgc cttacttacc 2280 caaaaagctg cagataaaac ggactgttct ttcacctata ttacaaatgt caatatcacc 2340 aacaatacag ctacaggaaa tggtgggggc attgctgggg gaaaagcaca ttttgatcgc 2400 attgataatc ttacagtcca aagcaaccaa gcaaagaaag gtggtggggt ttatcttgaa 2460 gatgccctca tcctggaaaa ggttattaca ggttctgtct cacaaaatac agctacagaa 2520 agtggtgggg gtatctacgc taaggatatt caactacaag ctctacctgg aagcttcaca 2580 attaccgata ataaagtcga aactagtctt actactagca ctaatttata tggtgggggc 2640 atctattcca gtggagctgt cacgctaacc aatatatctg gaacctttgg cattacagga 2700 aactctgtta tcaatacagc gacatcccag gatgcagata tacaaggtgg gggcatttat 2760 gcaaccacgt ctctctcaat aaatcaatgt aatacaccca ttctatttag caacaactct 2820 gctgccacta aaaaaacatc aacaacaaag caaattgctg gtggggctat cttctccgct 2880 • ·
335 • · ' ·· · ·· · ···· · ···· ·· · ··· ·· ··· · · gcagtaacta tcgagaataa ctctcagccc attattttct taaataattc cgcaaagtcg 2940 gaagcaacta cagcagcaac tgcaggaaat aaagatagct gtggaggagc cattgcagct 3000 aactctgtta ctttaacaaa taaccctgaa ataaccttta aaggaaatta tgcagaaact 3060 ggaggagcga ttggctgtat tgatcttact aatggctcac ctccccgtaa agtctctatt 3120 gcagacaacg gttctgtcct ttttcaagac aactctgcgt taaatcgcgg aggcgctatc 3180 tatggagaga ctatcgatat ctccaggaca ggtgcgactt tcaťcggtaa ctcttcaaaa 3240 catgatggaa gtgcaatttg ctgttcaaca gccctaactc ttgcgccaaa ctcccaactt 3300 atctttgaaa acaataaggt tacggaaacc acagccacta caaaagcttc cataaataat 3360 ttaggagctg caatttatgg aaataatgag actagtgaca tcactatctc tttatcagct 3420 gagaatggaa gtattttctt taaaaacaat ctatgcacag caacaaacaa atactgcagt 3480 attgctggaa acgtaaaatt tacagcaata gaagcttcag cagggaaagc tatatctttc 3540 tatgatgcag ttaacgtttc caceaaagaa acaaatgctc aagagctaaa attaaatgaa 3600 aaagcgacaa gtacaggaac gattctattt tctggggaac ttcacgaaaa taaatcctat 3660 attccacaga aagtcacttt cgcacatggg aatctcattc taggtaaaaa tgcagaactt 3720 agcgtagttt cctttaccca atctccaggc accacaatca ctatgggccc aggatcggtt 3780 ctttccaacc atagcaaaga agcaggagga atcgctataa acaatgtcat cattgatttt 3840 agtgaaatcg ttcctactaa agataatgca acagtagctc cacccactct taaattagta 3900 tcgagaacta atgcagatag taaagataag attgatatta caggaactgt gactcttcta 3960 gatcctaatg gcaacttata tcaaaattct tatcttggtg aagaccgcga tatcactctt 4020 ttcaatatag acaattctgc aagtggggca gttacagcca cgaatgtcac ccttcaaggg 4080 aatttaggag ctaaaaaagg atatttagga acctggaatt tggatccaaa ttcctcgggt 4140 tcaaaaatta ttctaaaatg gacctttgac aaatacctgc gctggcccta catccctaga 4200 gacaaccact tctacatcaa ctctatttgg ggagcacaaa actctttagt gactgtgaaa 4260 caagggatct tagggaacat gttgaacaat gcaaggtttg aagatcctgc tttcaacaac 4320 ttctgggctt cggctatagg atctttcctt aggaaagaag tatctcgaaa ttctgactca 4380 ttcacctatc atggcagagg ctataccgct gctgtggatg ccaaacctcg ccaagaattt 4440 attttaggag ctgccttcag tcaggttttt ggtcacgccg agtctgaata tcaccttgac 4500 aactataagc ataaaggctc aggtcactct acacaagcat ctctttatgc tggcaatatc 4560 ttctattttc ctgcgatacg gtctcggcct attctattcc aaggtgtggc gacctatggt 4620 tatatgcaac atgacaccac aacctactat ccttctattg aagaaaaaaa tatggcaaac 4680 tgggatagca ttgcttggtt atttgatctg cgtttcagtg tggatcttaa agaacctcaa 4740 cctcactcta cagcaaggct taccttctat acagaagctg agtataccag aattcgccag 4800 gagaaattca cagagctaga ctatgatcct agatctttct ctgcatgctc ttatggaaac 4860 ttagcaattc ctactggatt ctctgtagac ggagcattag cttggcgtga gattattcta 4920 tataataaag tatcagctgc gtacctccct gtgattctca ggaataatcc aaaagcgacc 4980 tatgaagťtc tctctacaaa agaaaagggc aacgtagtca acgttctccc tacaagaaac 5040 gcagctcgtg cagaggtgag ctctcaaatt tatcttggaa gttactggac actctacggc 5100 acgtatacta ttgatgcttc aatgaatact ttagtgcaaa tggccaacgg agggatccgg 5160 tttgtattct ag 5172 <210> 376 <211> 3759 <212> DNA <213> Chlamydia pneumoniae <400> 376 atgttgaagt gccctgaacg ggtcagtgtt aaaaaaaagg aagatatccc agaccttcca 60 aatcttatcg aaatccaaat taagtcttat aagcagtttc ttcaaattgg aaaattagca 120 gaagaaagag aaaatatcgg tttagaagag gttttcaggg aaatttttcc cattaaatcc 180 tataacgaag ctaccgttct tgagtacctt tcatataatt tgggtgtgcc aaaatattct 240 ccagaagaat gtatccgtag aggaattacc tatagcgtca ctttgaaagt ccgttttcgt 300 ttaaccgatg aaacgggaat caaagaagaa gaagtctata tgggaacgat ccctctaatg 360 actgataaag ggacatttat cattaatgga gctgaaagag tcgttgtttc ccaagttcat 420 cgttctccag gaattaactt tgaacaagaa aaacattcca aaggtaatat tttattctcc 480 ttcagaatca ttccttatcg tggaagttgg ctcgaagcta ttttcgatat taatgactta 540 atttatatcc atattgatag aaaaaaacgt agaagaaaaa ttctagcaat cacctttatc 600 cgagctcttg gatactcttc agatgcagat atcatcgaag aattcttcac aataggagaa 660 agttctctta gaagtgagaa agactttgct cttcttgttg gaaggatttt agcagacaat 720 attattgatg aagcctcctc tctagtttat ggaaaagccg- gagaaaagtt aagtacagca 780 • · .__VWÍ.U l
336 atgttaaaac ggatgctcga tgctggaatc gcttctgtta agattgctgt agatgctgat 840 gaaaatcatc ctattatcaa aatgctcgct aaggatccta cagattcata cgaagccgct 900 ttaaaagatt tttatcgtag actacgtcca ggagaacctg caactctagc taatgcacgt 960 tctactatca tgaggctctt ctttgacccc aaacgttata atctaggacg tgtagggcgt 1020 tataagctca atcgcaaact aggcttctct atagatgatg aagctctgtc tcaagttact 1080 ttgagaaaag aagatgtgat cggagcctta aagtatctga ttcgtttgaa aatgggagat 1140 gaaaaagctt gtgtagacga tattgatcat cttgctaatc gacgtgtccg ctctgtcgga 1200 gaactcattc aaaatcaatg tcgttcagga cttgctagaa tggagaaaat tgttagagag 1260 agaatgaatt tattcgattt ctcctcagat acgttgactc caggaaaagt tgtctctgct 1320 aaaggtctcg ctagcgtgtt aaaagatttc tttggccgct cccagctttc gcagtttatg 1380 gaccaaacca accctgtagc tgagttaact cacaaacgac gtctttctgc attaggtcca 1440 ggaggactaa atagagaacg cgcaggattt gaagttcgtg acgtgcacgc aagtcattat 1500 ggacgtattt gtcctattga aactcctgaa ggtccaaata ttggtctgat cacctctctt 1560 tcctcttttg ctaaaattaa cgaatttgga ttcattgaaa ctccttatag aattgtaaga 1620 gatggaatcg taacagatga aatcgaatac atgacagccg atgttgaaga agaatgtgtg 1680 attgcacagg cttcagcaag cctagatgag tacaatatgt ttacggaacc cgtctgttgg 1740 gtacgttatg ctggagaagc tttcgaagca gatacaagca ccgtaaccca tatggatgtt 1800 tctccgaaac agctcgtttc tattgttaca ggattgattc ctttcttaga gcacgacgať 1860 gcgaaccgcg ccttgatggg ctccaatatg caacgtcaag cggttccctt acttaaaacc 1920 gaagctcctg ttgttggcac tggattagaa tgtcgtgctg ctaaagattc tggagctatt 1980 gttgttgcag aagaagatgg tgttgttgat tttgttgatg gttacaaagt agttgttgct 2040 gcaaaacata atcctacaat taaacgtacc tatcatctga aaaagttcct tagatctaat 2100 tcaggaactt gcattaacca acagcccttg tgtgcagtcg gtgatgtcat aactaagggt 2160 gatgtgattg ctgatggacc cgcaactgat cgtggagaac ttgctttagg taaaaatgta 2220 ctcgttgcct ttatgccttg gtatggatac aactttgagg atgcgatcat tatctctgaa 2280 aaattgatca gagaagatgc ctatacctct atttatattg aggaattcga actaacagcc 2340 cgagatacaa aattaggaaa agaagagatc actcgtgaca ttcctaacgt atctgatgaa 2400 gtattggcca atctcggtga ggatgggatc attcgtatcg gtgctgaggt taaacctggg 2460 gatattcttg ttggtaagat cacaccaaaa tcagaaacag aattagctcc agaagagcgt 2520 ctgctccgtg ctatttttgg tgaaaaagct gctgacgtta aagatgcatc tttaacagtg 2580 cctccaggaa ctgaaggcgt cgttatggat gttaaagtct tcagtagaaa ggatagattg 2640 tcaaagagtg atgacgaact tgtagaagaa gctgttcatc ttaaagattt gcaaaaagga 2700 tataaaaacc aagttgcaac tttaaáaaca gaatatcgtg agaaattagg agctctctta 2760 ttaaatgaga aagcacctgc agccattatt caccgtcgta cagcagaaat cgttgttcat 2820 gaaggcctac tctttgatca agagacaata gaacggatag aacaagaaga tttagtggat 2880 cttttaatgc ctaactgtga aatgtatgaa gtgttgaaag gacttctatc agattacgaa 2940 acggcattac aacggctaga aatcaattat aagactgaag ttgagcatat tcgtgaggga 3000 gatgcagatt tagatcatgg tgtcattcgc caagttaaag tctacgttgc ctctaagaga 3060 aaacttcaag ttggagataa aatggctgga cgacacggaa ataaaggtgt tgtttccaaa 3120 atcgttcccg aagcggatat gccatatctc tctaacggag aaactgtaca aatgatcctg 3180 aaccccctcg gggtgccttc aaggatgaac cttggacagg tattagaaac acacctaggt 3240 tatgcagcaa aaactgcagg catttacgtg aaaacccctg tttttgaagg attccctgaa 3300 caacgtatct gggatatgat gatagaacag ggattaccag aagatgggaa gtccttctta 3360 tatgatggga agacaggtga acgctttgat aacaaggtag tgataggcta tatctatatg 3420 ctaaagctca gtcacttgat cgctgataag attcacgcaa gatctatagg gccatattct 3480 ttagtcacgc aacaacctct čggtggtaaa gctcagatgg gaggacaaag attcggggaa 3540 atggaagttt gggctctaga agcatatggg gttgctcata tgctccaaga aattctaacc 3600 gtgaaatctg atgatgtctc aggaagaaca aggatttacg aatctatcgt taagggggaa 3660 aacctcttgc gatcaggaac gcctgagtcg ttcaatgtgc taattaaaga gatgcagggt 3720 ctaggacttg atgttcgtcc tatggtcgta gacgcttaa 3759 <210> 377 <211> 675 <212> DNA <213> Chlamydia pneumoniae <400> 377 atgacatcct ggatagaatt acttgataag caaattgaag atcaacatat gttaaagcac 60 gaattttatc agcgttggtc tgaaggaaag ttagaaaaac aacaacttca agcttátgcc 120 aaagattact atttacatat taaagcattt ccttgttacc tttcagcgct gcatgctcgc 180 tgtgatgact tgcagattcg tagacaaatt cttgagaatc tcatggatga agaagctgga 240
• · v _ l
337 aatcctaatc acatagattt atggagacag tttgctttat ctcttggagt ttctgaagag 300 gagcttgcca atcatgaatt cagtcaggct gctcaagata tggtagcgac atttcgccgc 360 ttatgcgaca tgccacaact tgccgtgggt ttaggcgctc tctatactta tgagattcag 420 attcctcaag tctgtgtaga gaaaatccgt ggtttgaaag aatattttgg agtttctgct 480 cgaggctatg catactttac tgtacatcaa gaagctgata ttaaacatgc cagcgaagag 540 aaagaaatgc tacaaacttt ggtaggcaga gagaatcctg atgctgtttt gcaaggatca 600 caagaagttt taqatactct atggaacttt ttgagctctt ttattaattc aacggagcct 660 tgttcttgta agtag 675 <210> 378 <211> 1671 <212> DNA <213> Chlamydia pneumoniae <400> 378 atgtccaaac tcatcagacg agtagttacg gtccttgcgc taacgagtat ggcgagttgc 60 tttgccagcg ggggtataga ggccgctgta gcagagtctc tgatta.ctaa gatcgtcgct 120 agtgcggaaa caaagccagc acctgttcct atgacagcga agaaggttag acttgtccgt 180 agaaataaac aaccagttga acaaaaaagc cgtggtgctt tttgtgataa agaattttat 240 ccctgtgaag agggacgatg tcaacctgta gaggctcagc aagagtcttg ctacggaaga 300 ttgtattctg taaaagtaaa cgatgattgc aacgtagaaa tttgccagtc cgttccagaa 360 tacgctactg taggatctcc ttaccctatt gaaatccttg ctataggcaa aaaagattgt 420 gttgatgttg tgattacaca acagctacct tgcgaagctg aattcgtaag cagtgatcca 480 gaaacaactc ctacaagtga .tgggaaatta gtctggaaaa tcgatcgcct gggtgcagga 540 gataaatgca aaattactgt atgggtaaaa cctcttaaag aaggttgctg cttcacagct 600 gctactgtat gtgcttgccc agagctccgt tcttatacta aatgcggtca accagccatt 660 tgtattaagc aagaaggacc tgactgtgct tgcctaagat gccctgtatg ctacaaaatc 720 gaagtagtga acacaggatc tgctattgcc cgtaacgtaa ctgtagataa tcctgttccc 780 gatggctatt ctcatgcatc tggtcaaaga gttctctctt ttaacttagg agacatgaga 840 cctggcgata aaaaggtatt ťacagttgag ttctgccctc aaagaagagg tcaaatcact 900 aacgttgcta ctgtaačtta ctgcggtgga cacaaatgtt ctgcaaatgt aactacagtt 960 gttaatgagc cttgtgtaca agtaaatatc tctggtgctg attggtctta cgtatgtaaa 1020 cctgtggagt actctatctc agtatcgaat cctggagact tggttcttca tgatgtegtg 1080 atccaagata cactcccttc tggtgttaca gtactcgaag ctcctggtgg agagatctgc 1140 tgtaataaag ttgtttggcg tattaaagaa atgtgcccag gagaaaccct ccagtttaaa 1200 cttgtagtga aagctcaagt tcctggaaga ttcacaaatc aagttgcagt aactagtgag 1260 tctaactgcg gaacatgtac atcttgcgca gaaacaacaa cacattggaa aggtcttgca 1320 gctacccata tgtgcgtatt agacacaaat gatcctatct gtgtaggaga aaatactgtc 1380 tatcgtatct gtgtaactaa ccgtggttct gctgaagata ctaacgtatc tttaatcttg 1440 aagttctcaa aagaacttca gccaatagct tcttcaggtc caactaaagg aacgatttca 1500 ggtaataccg ttgttttcga cgctttacct aaactcggtt ctaaggaatc tgtagagttt 1560 toaaanntař toPtrrrrma naťnciππο.σ ncnaaorfat tctttctfcť 1fi?O gatacactga cttcaccagt atcagacaca gaaaataccc acgtgtatta a 1671 <210> 379 <211> 1386 <212> DNA <213> Chlamydia pneumoniae <400> 379 atgacccaag aatttgattg tgttgttatt ggtgcgggac ctagtggcta tgttgccgca 60 atcactgctg cgcaatcaaa attacggacc gctcttattg aagaagacca ggctgggggg 120 acctgcttaa accgcggatg catcccttca aaagccctca ttgctggagc caatgttgta 180 tctcacatta agcatgcgga gcagttcggc atccatgttg atggttatac aatcgattac 240 cctgcgatgg caaaaagaaa aaatacagtc gtccagggga tccgtcaagg attagaagga 300 ttgatccgca gcaacaagat tactgtctta aaaggaaccg gatctctagt atcttctaca 360 gaagttaaag ttattggcca agacacgact ataatcaaag ccaatcatat tatcctagct 420 acaggatccg agcctcgtcc tttcccaggg gttcccttct cctctagaat tttgagttcc 480 acagggatct tagaacttga agtcctccct aaaaagctcg ctattattgg tggcggcgtt 540 attggctgtg aatttgcgtc tctatttcac actttaggcg ttgagattac cgttatagaa 600 gctttggatc atattcttgc ggttaacaat aaagaagttt' ctcaaaccgt aacgaataaa 660 ·· ······· · · · ·
Z7 /338 tttacgaaac aaggaattcg aattcttacc aaagcctcga tctctgcaat cgaagaatcc 720 cáaaaccaag ttcgcattac tgtgaacgat caagtggaag agtttgatta tgtcttggtg 780 gctattggtc gccaatttaa tacagcaagt atagggctag ataatgctgg agtgatccgg 840 gacgatcgtg gcgtgattcc tgttgacgaa accatgcgca ctaatgttcc aaatatctat 900 gcgattggag acatcactgg aaagtggcta cttgctcatg tggcttcgca ccaaggcgtt 960 attgccgcga aaaatatttc gggacatcac gaagttatgg attattctqc cataccttct 1020 gtgatcttta cccacccaga aattgctatg gtaggtctat ctctacaaga agcagaacaa 1080 caaaatcttc ctgcaaagct caccaaattt ccttttaaag cgattggaaa agctgttgct 1140 ttgggagcat ctgatggttt tgctgctatt gtgagtcatg aaattaccca gcaaatactc 1200 ggagcttatg tcataggacc tcacgcctca tcattaattg gagagatgac cttagcgatc 1260 cgcaatgagc tgaccctacc ttgcatatat gaaaccgtgc atgctcatcc cacactctct 1320 gaagtttggg ctgaaggtgc tttacttgct acaaatcacc ctttacactt ccctcctaag 1380 tcatga 1386 <210> 380 <211> 1635 <212> DNA <213> Chlamydia pneumoniae <400> 380 atggcagcga aaaatattaa atataatgaa gaagccagaa aaaaaataca taaaggggta 60 aaaactčttg cagaagcagt aaaagttact ctaggtccta aaggacgtca cgtagttata 120 gataagagct ttggctctcc ccaagtgact aaagatggtg ttactgtagc taaagaaatc 180 gagctcgaag acaaacatga aaacatgggc gctcagatgg taaaagaagt cgccagcaaa 240 actgctgaca aagcaggcga cggaactaca acagcaactg ttcttgcaga agcaatctat 300 agcgaaggtc taagaaatgt cactgccggt gccaatccta tggacctaaa aagaggtatc 360 gacaaagccg taaaagttgt tgttgatgaa ctcaaaaaaa ttagtaaacc tgtacaacat 420 cacaaagaaa tcgctcaagt agctactatc tcagcaaata atgattccga aatcggaaat 480 cttattgcag aagctatgga aaaagttggt aaaaacggat ccattactgt tgaagaagct 540 aaaggcttcg aaactgttct cgacgttgta gaaggaatga acttcaaccg tggatacctc 600 tccagctact tctccacaaa tccagaaact caagaatgcg ttttagaaga cgctctgatt 660 ctaatctacg ataaaaaaat ctctggaatt aaagacttcc ttccagtttt acaacaagta 720 gcagaatctg gacgccctct tttaatcatt gcagaagaaa ttgaaggaga agctttagca 780 actctagtag tcaatagact ccgtgcagga ttcagagtct gtgcagtgaa agctcctggt 840 ttcggtgaca gaagaaaagc tatgttagaa gacatcgcta tecttactgg tggccaacta 900 gttagcgaag aacttggcat gaaactagag aatacaactc tagcaatgtt aggaaaagct 960 aagaaagtta tcgtaactaa agaagatacc acaatcgtcg aaggcttagg aaacaaacct 1020 gatatccaag ctcgatgcga caatattaaa aaacaaatcg aagatagcac ttcagattac 1080 gacaaagaaa aactccaaga gcgtttagct aaactctccg gtggtgtcgc cgtaatccgc 1140 qtaggagctg ctaccgaaat agaqatgaaa gagaaaaaaq acagagtaqa tgatgcacaa 1200 cacgcaacca ttgcagctgt cgaagaagga atcctccctg gtggtggaac tgccttagtt 1260 cgctgtatcc ctacactaga agctttcctt cctatgctag caaacgaaga cgaagctatt 1320 ggtactcgta ttattctaaa agcattaaca gctccattaa agcaaattgc aagtaacgca 1380 ggtaaagaag gcgctatcat ttgtcagcaa gttctagcaa gatctgcaaa tgaaggctat 1440 gatgctttac gtgacgctta tacagatatg attgacgcag gaattttaga tccaactaaa 1500 gtgactcgct cagctctaga aagcgcagct tctatcgcag gattactcct cacaacagaa 1560 gccttaatcg ctgatatccc agaagagaaa tcttcttcag ctccagcgat gccaagcgca 1620 ggaatggact actág 1635 <210> 381 <211> 1995 <212> DNA <213> Chlamydia pneumoniae <400> 381 atggaaaaag tttcttctta tccctcagtt cctttacctc ttggggcttc taaaatttcc 60 ccaaaccgct atcgatttgc tttatatgct tcacaagcta· ccgaagtcat ccttgcttta 120
339 acagacgaaa attcagaagt catagaagtc cctctttacc ccgatacaca ccgcacgggt 180 gcgatttggc atatagagat cgagggtatt tctgatcaat cgtcttatgc atttcgtgtt 240 catgggccta aaaagcatgg aatgcaatac tcttttaaag aatatcttgc agatccctat 300 gcgaagaata ttcattcccc acagagtttt ggttcgcgaa agaaácaggg ggattatgca 360 ttttgttatt taaaggaaga accatttcct tgggatggtg atcagcctct gcatttgccg 420 aaagaagaga tgatcatcta tgagatgcat gtacgttcct tcacgcaatc ttcttcatct 480 agggttcatg ctccgggaac cttcctagga atcattgaaa agatcgacca tctgcataag 540 ctgggaatca acgctgttga actcttacct atctttgagt tcgatgagac tgcgcatcct 600 tttagaaatt cgaaattccc ttatctgtgc aattattggg gttatgctcc cctaaatttc 660 ttttctcctt gccgacgtta tgcttatgcc tctgatcctt gcgctccaag tagagagttt 720 aaaactttag taaagacctt gcatcaagaa ggtattgagg tcattcttga tgttgttttt 780 aatcatacgg gcttgcaagg gacgacctgc tctttgcctt ggatagacac tccgagctat 840 tatattttag atgcacaagg tcactttaca aattattcag gctgtggaaa cactctcaat 900 acaaaccgcg cccccacgac ccaatggatt ctcgacatct tacgttattg ggtagaagaa 960 atgcatgtcg atgggttccg atttgatctt gcttctgtct tttctcgtgg tccttcggga 1020 tctcccctac aattcgctcc tgttttagag gcgatttctt ttgatccttt acttgcgagc 1080 acaaagatta tagctgagcc ttgggatgct ggcggtttgt atcaggtggg ctatttcccc 1140 acactgtctc caagatggag tgaatggaac ggcccgtatc gtgataacgt gaaagcattt 1200 cttaatgggg atcaaaatct cataggaacc tttgcttcta gaatttcagg atctcaagac 1260 atctatcctc acggctcgcc tacaaattcg attaactatg tcagttgcca tgatggtttt 1320 acgttatgtg acactgtgac ttataaccac aaacataatg aggctaacgg agaggataat 1380 cgtgacggca cagatgcgaa ctacagctac aatttcggaa cggaagggaa aacagaagac 1440 cctggcattc ttgaagttcg tgaaagacag ttacgaaatt ttttccttac tttgatggtc 1500 tcgcaaggca ttccgatgat tcaatcagga gatgagtatg cccataccgc ggaaggcaat 1560 aacaaccgtt gggctttgga ttcgaatgcg aattacttcc tttgggatca gcttaccgca 1620 aagcctacac tgatgcactt tctctgtgat ctcattgcgt ttcgaaaaaa atataaaaca 1680 ctttttaatc gaggctttct ttccaataag gaaatcagtt gggtagatgq tatgggaaat 1740 cccatgacat ggcgccctgg aaatttctta gcatttaaaa taaaatcgcc aaaagcgcat 1800 gtatatgttg cttttcacgt gggagctcaa gaccaacttg cgaccttacc taaagcctčc 1860 agcaactttc ttccttatca aatagttgcc gagagtcagc aagggtttgt ccctcaaaat 1920 gtagcaacgc cgacagtgtc gctacagccc cataccacgc taattgcgat cagccatgcg 1980 aaagaggtta cctga 1995 <210> 382 <211> 987 <212> DNA <213> Chlamydia pneumoniae <400> 382 atggcattca aagaggtcgt tcgtgttgct gtcacaggag gcaaagggca gattgcgtat 60 aattttttat. ttgcattagc ccatggagat gtttttggag tggatcgtgg tgtagattta 120 cggatctatg atgtgccggg tacaaagaga gctctctcag gggtgcgtat ggagctcgat 180 gacggtgcat atcctctttt acatcgtctg cgtgtgacga catcgttaaa cgacgctttt 240 gatggtatcg atgcggcgtt tctgataggt gctgtgcctc gtggacccgg tatggagcga 300 ggagatcttt taaagcaaaa tggtcagatc ttttcgttac agggggccgc tttaaataca 360 gcagcaaaaa gagatgctaa gatttttgtt gtagggaacc ctgtcaatac gaattgctgg 420 attgctatga aacatgctcc cagattgcat cggaaaaatt tccatgcgat gttacgcttg 480 gatcagaatc gcatgcatag catgctcgct catcgtgctg aggttcctct agaggaggtc 540 tcccgtgttg tcatctgggg aaatcattct gcaaagcagg ttcctgactt cacacaagca 600 cgtatctcag ggaaacccgc agccgaggtt atcggagatc gagattggtt ggaaaacatt 660 ttagtacact ccgtgcagaa tcgtggaagc gctgtaattg aagcaagagg gaaatcttcg 720 gcagcatccg catctcgagc acttgccgag gccgcgcgat ctattttttg tcctaaaagt 780 gacgagtggt tttcttctgg agtgtgttcg gatcataatc cttatggtat tcctgaagac 840 ttgatttttg gttttccatg tcgtatgttg ccttctggag attatgaaat cattcctgga 900 ttgccttggg agccttttat cagaaataag attcaaattt ccctggatga aattgctcag 960 gáaaaagcta gcgtgtcttc gttataa 987 <210> 383 <211> 654 <212> DNA <213> Chlamydia pneumoniae • ·
340 <400> 383 atgaaaagag agttgttccc caagagtctg cgtcgttctc caagctaact ttcgttgtct attaaggatg gctgaaaacc aatcttttct tctgaagaag tccattgtcc tcatttataa tggatcctaa ttatactgaa gaagactctt ttaagaccta cgtctgctgc ctttgtaccg ctgccttgat taacacaatt atatcgccgc aaggggaaag aaccatattt aggatataac ggaaaaccgt cgctcgacgt cgcagaaaag agaaaagtct tatccgagaa agaagggatg aagtgaagta atttgcctcc gtggcccgag tgcgggttaa ctagagacaa gaaacacctt gatcaaactc atttcagagc tcaatttcgt gtccaccctc aaaaagatgc ttttctcaag accttaggtt cttgtggata ctttacttac aaaactcgag ctcttgttaa agaaggatac aggacgaaag tagctttgtc tagctttaat aaggccgtga cttggtctca tggactccgg tagtgataac aagtttgagt ggacttaaat gagactctct gctgcaagtg agacctttct tcagggtgaa agaagctctt ttggátttgg aggggttatc gaccgttgcg ttaa
120
180
240
300
360
420'
480
540
600
654 <210> 384 <211> 813 <212> DNA <213> Chlamydia pneumoniae <400> 384 atgatcataa ccgggtcctc tgtgttccta tctcccatta attgcagaac aaagaagctg tctcctgata gggaaccgat ttcccctctc ctccctaaag ccgaaaatca tcttcaggca aagcacatga tttccaaatt taaaaaacaa aatactcttt cattttgttg ggaacctatt atttacgtct agtcgagctt ataagggcat ctaatacgtt tgaatctccc aaaaaatgct ttgatttatc gtctgttaag aaaaaagtcc tcttattatt tgagctcatg atgttatgct gttatttctc tttagtttcc ttctgcggat gcatgctctt tacaattttc atgcaatctc tcagattttt ttttaccaag tttatctgat acttccaatt tgtaatcgag aaaagctcta ataagacgtt tcgatcctga cctgaactgt tccactctat gcacctacat gggatttttt tataccttac gaggggagct ttctctcaag attcttctta gcataccctg aagaccttag agcgaaaaac tga ttttcaaaac tcgttttgag ctttatctaa ccaaagtccc atctccatga cctctttagt aaacacctat gctttcttgg aagatttaaa aggagcttgc gagaaattat atcgtgcctt aatatgtcta gcttttccct ttcccttgtt attcaatcct tcctactgcg attctctatt tatagaaaaa tgcttatgtt tcaaccgtac aatgcaaaaa tatggagtct agtgacgctc agacctgtat tgatttgcgt
120 180 240 300 360 420 480 54 0 600 660 720 780 813 <210> 385 <211> 1956 <212> DNA <213> Chlamydia pneumoniae <400> 385 a Ί- rmf* t· a a > r· — ť? - ---— x- _ ctttctgctc gcaggtgcgg ttgcgttctg aacagctcgt acgcctcctc atctttacct gtcactaata gaaactaaga gcttcggata caggctgctc atgcaagata cagacagatg tttgcaggac aacatagatt aaáaagttcc aaagatctta gttggaggct gatgatgctg atgttcaata c t a tt cj cj t cc aaggattgga aagctaagcc cagtgaatgc cttctactag cacccacgtt caacatcact taaaggatac atgccgatgc accaagcgat ttctccaatc acccagtagt ctacagcgac agaacgctag cagctaaagc ccgactctcc aaaatatcaa ccaagcaaca aaaatgagac cggaaaatcc aggtcCtata ggcgagtgca taaagaatct tctcatgagt cagatctgca tgatgattat agctgacata agcggctact agttaaagtt tcttgactct tgtagcaaac cccagggaaa acagatagag tggagctgta agcaatcgct aattcttcaa acctgcagat aggaagtagt cgcttccatt tgattctcaa ^ac^a 23Ca9 gcaaataaga aagaccgatt ctggcagata gacgtggact aagactcaag caggctgctt gatgaggaaa •ggcgcgcaaa ttaggtaaac aataacaaag acgcctgcaa aaagatggaa gaaaatgcta actgctaaga gaagcggaac ggttctgatg attggtagta ttgatgtctg gctgcccaac' aa cgc3 cacc gtgcggaagc ctgtagagcg agctgggtat caacgacagc cgcaaacagc tggtgagcct ccgcaatcgc ttacagaatt tgacttcctt cagctgagct ttgctcaatc atgcgattag aatctaataa cacaaatagc aaatggtaat ttccaaatcc ttcgtgtttc ggtttcgtca aggagctcgc
4- /» z*» <» z-r t—t —' z·»—>4— u
tcaaagaata atggagcatc tgcttctagt gaccgcacct ttacgatact ccaggatgct tgcggagtgg agcgaaatat cgacctctta tcttaaagag tttagttgat ggatgcatat cagtataagc tgaagctcag acaggctgag aggaactaca catgctgtta gatgattcac agcacaagct
120
180
240
300
360
420
480
540
600
660
720
780
840
900
960
1020
1080
1140
1200 »» ·· to· to toto« to · '· · *
-· · · · · · ·
341 agagcagcga aagccgctgg agatgacagt gctgctgcag cgctggcaga tgctcagaaa 1260 gctttagaag cggctctagg taaagctggg caacaacagg gcatactcaa tgctttagga 1320 cagatcgctt ctgctgctgt tgtgagcgca ggagttcctc ccgctgcagc aagttctata 1380 gggtcatctg taaaacagct ttacaagacc tcaaaatcta caggttctga ttataaaaca 1440 cagatatcag caggttatga tgcttacaaa tccatcaatg atgcctátgg tagggcacga 1500 aatgatgcga ctcgtgatgt gataaacaat gtaagtaccc ccgctctcac acgatccgtt 1560 cctagagcac gaacagaagc tcgaggacca gaaaaaacag atcaagccct cgctagggtg 1620 atttctggca atagcagaac tcttggagat gtctatagtc aagtttcggc actacaatct 1680 gtaatgcaga tcatecagtc gaatcctcaa gcgaataatg aggagatcag acaaaagctt 1740 acatcggcag tgacaaagcc tccacagttt ggctatcctt atgtgcaact ttctaatgac 1800 tctacacaga agttcatagc taaattagaa agtttgtttg ctgaaggatc taggacagca 1860 gctgaaataa aagcactttc ctttgaaacg aactccttgt ttattcagca ggtgctggtc 1920 aatatcggct ctctatattc tggttatctc caataa 1956 <210> 386 <211> 805 <212> PRT <213> Chlamydia pneumoniae <400> 386
| Met | Asp | Pro | Lys | Glu 5 | Lys | Asn | Tyr | Asp | Ala 10 | Ser | Ala | Ile | Thr | Val 15 | Leu |
| Glu | Gly | Leu | Gin 20 | Ala | Val | Arg | Glu | Arg 25 | Pro | Gly | Met | Tyr | Ile 30 | Gly | Asp |
| Thr | Gly | Ile 35 | Thr | Gly | Leu | His | His 40 | Leu | Val | Tyr | Glu | Val 45 | Val | Asp | Asn |
| Ser | Ile 50 | Asp | Glu | Ala | Met | Ala 55 | Gly | Tyr | Cys | Ser | Arg 60 | Ile | Asp | Val | Arg |
| Ile 65 | Leu | Glu | Asp | Gly | Gly 70 | Ile· | Val | Ile | Val | Asp 75 | Asn | Gly | Arg | Gly | Ile 80 |
| Pro | Ile | Glu | Val | His 85 | Glu | Arg | Glu | Ser | Ala 90 | Lys | Gin | Gly | Arg | Glu 95 | Val |
| Ser | Ala | Leu | Glu 100 | Val | Val | Leu | Thr | Val 105 | Leu | His | Ala | Gly | Gly 110 | Lys | Phe |
| Asp | Lys | Asp 115 | Ser | Tyr | Lys | Val | Ser 120 | Gly | Gly | Leu | His | Gly 125 | Val | Gly | Val |
| Ser | Cys 130 | Val | Asn | Ala | Leu | Ser 135 | Glu | Lys | Leu | Val | Ala 140 | Thr | Val | Phe | Lys |
| Asp 145 | Lys | Lys | Cys | Tyr | Gin 150 | Met | Glu | Phe | Ser | Arg 155 | Gly | Ile | Pro | Val | Thr 160 |
| Pro | Leu | Gin | Tyr | Val 165 | Ser | Val | Ser | Asp | Arg 170 | Gin | Gly | Thr | Glu | Ile 175 | Val |
| Phe | Tyr | Pro | Asp 180 | Pro | Lys | Ile | Phe | Ser 185 | Thr | Cys | Thr | Phe | Asp 190 | Arg | Ser |
| Ile | Leu | Met 195 | Lys | Arg | Leu | Arg | Glu 200 | Leu | Ala | Phe | Leu | Asn 205 | Arg | Gly | Ile |
| Thr | Ile | Val | Phe | Glu | Asp | Asp | Arg | Asp | Val | Ser | Phe | Asp | Lys | Val | Thr |
·· ·*·· • · ·
342
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Phe | Phe | Tyr | Glu | Gly | Gly | Ile | Gin | Ser | Phe | Val | Ser | Tyr | Leu | Asn | Gin |
| 225 | 230 | 235 | 24 0 | ||||||||||||
| Asn | Lys | Glu | Ser | Leu | Phe | Ser | Glu | Pro | Ile | Tyr | Ile | Cys | Gly | Thr | Arg |
| 245 | 250 | 255 | |||||||||||||
| Val | Gly | Asp | Asp | Gly | Glu | Ile | Glu | Phe | Glu | Ala | Ala | Leu | Gin | Trp | Asn |
| 260 | 265 | 270 | |||||||||||||
| Ser | Gly | Tyr | Ser | Glu | Leu | Val | Tyr | Ser | Tyr | Ala | Asn | Asn | Ile | Pro | Thr |
| 275 | 280 | 285 | |||||||||||||
| Arg | Gin | Gly | Gly | Thr | His | Leu | Thr | Gly | Phe | Ser | Thr | Ala | Leu | Thr | Arg |
| 290 | 295 | 300 | |||||||||||||
| Val | Ile | Asn | Thr | Tyr | Ile | Lys | Ala | His | Asn | Leu | Ala | Lys | Asn | Asn | Lys |
| 305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
| Leu | Ala | Leu | Thr | Gly | Glu | Asp | Ile | Arg | Glu | Gly | Leu | Thr | Ala | Val | Ile |
| 325 | 330 | 335 | |||||||||||||
| Ser | Val | Lys | Val | Pro | Asn | Pro | Gin | Phe | Glu | Gly | Gin | Thr | Lys | Gin | Lys |
| 340 | 345 | 350 | |||||||||||||
| Leu | Gly | Asn | Ser | Asp | Val | Ser | Ser | Val | Ala | Gin | Gin | Val | Val | Gly | Glu |
| 355 | 360 | 365 | |||||||||||||
| Ala | Leu | Thr | Ile | Phe | Phe | Glu | Glu | Asn | Pro | Gin | Ile | Ala | Arg | Met | Ile |
| 370 | 375 | 380 | |||||||||||||
| Val | Asp | Lys | Val | Phe | Val | Ala | Tkla | Gin | Ala | Arg | Glu | Ala | Ala | Lys | Lys |
| 385 | 390 | 395 | •400 | ||||||||||||
| Ala | Arg | Glu | Leu | Thr | Leu | Arg | Lys | Ser | Ala | Leu | Asp | Ser | Ala | Arg | Leu |
| 405 | 410 | 415 | |||||||||||||
| Pro | Gly | Lys | Leu | Ile | Asp | Cys | Leu | Glu | Lys | Asp | Pro | Glu | Lys | Cys | Glu |
| 420 | 425 | 430 | |||||||||||||
| m-, ,-*- | í ic | Vd-L | ,, O-LU | /-· T - _ OJLy | Asp | Ser | Ala | Gly | Gly | Ser | Ala | Lys | Gin | Gly | |
| 435 | 440 | 445 | |||||||||||||
| Arg | Asp | Arg | Arg | Phe | Gin | Ala | Ile | Leu | Pro | Ile | Arg | Gly | Lys | Ile | Leu |
| 450 | 455 | 460 | |||||||||||||
| Asn | Val | Glu | Lys | Ala | Arg | Leu | Gin | Lys | Ile | Phe | Gin | Asn | Gin | Glu | Ile |
| 465 | 470 | 475 | 480 | ||||||||||||
| Gly | Thr | Ile | Ile | Ala | Ala | Leu | Gly | Cys | Gly | Ile | Gly | Ala | Asp | Asn | Phe |
| 485 | 490 | 495 | |||||||||||||
| Asn | Leu | Ser | Lys | Leu | Arg | Tyr | Arg | Arg | Ile | Ile | Ile | Met | Thr | Asp | Ala |
| 500 | 505 | 510 | |||||||||||||
| Asp | Val | Asp | Gly | Ser | His | Ile | Arg | Thr | Leu | Leu | Leu | Thr | Phe | Phe | Tyr |
| 515 | 520 | 525 |
Arg His Met Thr Ala Leu Ile Glu Asn Glu Cys Val Tyr Ile Ala Gin 530 535 540
343
| Pro Pro 545 | Leu Tyr Lys Val 550 | Ser | Lys | Lys | Lys Asp 555 | Phe | Arg | Tyr | Ile | Leu 560 | |||||
| Ser | Glu | Lys | Glu | Met | Asp | Ser | Tyr | Leu | Leu | Met | Leu | Gly | Thr | Asn | Glu |
| 565 | 570 | 575 | |||||||||||||
| Ser | Ser | Ile | Leu | Phe | Lys | Ser | Thr | Glu | Arg | Glu | Leu | Arg | Gly | Glu | Ala |
| 580 | 585 | 590 | |||||||||||||
| Leu | Glu | Ser | Phe | Ile | Asn | Val | Ile | Leu | Asp | Val | Glu | Ser | Phe | Ile | Asn |
| 595 | 600 | 605 | |||||||||||||
| Thr | Leu | Glu | Lys | Lys | Ala | Ile | Pro | Phe | Ser | Glu | Phe | Leu | Glu | Met | Tyr |
| 610 | 615 | 620 | |||||||||||||
| Lys | Glu | Gly | Ile | Gly | Tyr | Pro | Leu | Tyr | Tyr | Leu | Ala | Pro | Ala | Thr | Gly |
| 625 | 630 | 635 | 64 0 | ||||||||||||
| Met | Gin | Gly | Gly | Arg | Tyr | Leu | Tyr | Ser | Asp | Glu | Glu | Lys | Glu | Glu | Ala |
| 645 | 650 | 655 | |||||||||||||
| Leu | Ala | Gin | Glu | Glu | Thr | His | Lys | Phe | Lys | Ile | Ile | Glu | Leu | Tyr | Lys |
| 660 | 665 | 670 | |||||||||||||
| Val | Ala | Val | Phe | Val | Asp | Ile | Gin | Asn | Gin | Leu | Lys | Glu | Tyr | Gly | Leu |
| 675 | 680 | 685 | |||||||||||||
| Asp | Ile | Ser | Ser | Tyr | Leu | Ile | Pro | Gin | Lys | Asn | Glu | Ile | Val | Ile | Gly |
| 690 | 695 | 700 | |||||||||||||
| Asn | Glu | Asp | Ser | Pro | Ser | Cys | Asn | Tyr | Ser | Cys | Tyr | Thr | Leu | Glu | Glu |
| 705 | 710 | 715 | 720 | ||||||||||||
| Val | Ile | Asn | Tyr | Leu | Lys | Asn | Leu | Gly | Arg | Lys | Gly | Ile | Glu | Ile | Gin |
| 725 | 730 | 735 | |||||||||||||
| Arg | Tyr | Lys | Gly | Leu | Gly | Glu | Met | Asn | Ala | Asp | Gin | Leu | Trp | Asp | Thr |
| 740 | 745 | 750 | |||||||||||||
| Thr | Met | Asn | Pro | Glu | Gin | Arg | Thr | Leu | Ile | His | Val | Ser | Leu | Lys | Asp |
| 755 | 760 | 765 | |||||||||||||
| Ala | Val | Glu | Ala | Asp | His | Ile | Phe | Thr | Met | Leu | Met | Gly | Glu | Glu | Val |
| 770 | 775 | 780 | |||||||||||||
| Pro | Pro | Arg | Arg | Glu | Phe | Ile | Glu | Ser | His | Ala | Leu | Ser | Ile | Arg | Ile |
| 785 | 790 | 795 | 800 | ||||||||||||
| Asn | Asn | Leu | Asp | Ile |
805 <210> 387 <211> 295 <212> PRT <213> Chlamydia pneumoniae <400> 387
Met Glu Lys Leu Leu Val Thr Asp Ile Asp Gly Thr Ile Thr His Gin 5 10 · 15 • ·
344
| Ser | His | His | Leu 20 | Asp Lys Lys Val Tyr Glu Arg Leu Tyr Ala Leu His | |
| 25 | 30 | ||||
| Gin | Ala | Gly | Trp | Lys Leu Phe Phe Leu Thr Gly Arg | Tyr Tyr Lys Tyr |
| 35 | 40 | 45 | |||
| Ala | Ala | Arg | Leu | Phe Ser Asp Phe Asp Ala Pro Tyr | Leu Leu Gly Cys |
| 50 | 55 60 | ||||
| Gin | Asn | Gly | Ala | Ser Val Trp Ser Ser Thr Ser Ser | Asn Leu Leu Tyr |
| 65 | 70 75 | 80 | |||
| Ser | Lys | Ser | Leu | Pro Ser Asp Leu Leu Cys Ile Leu | Gin Asp Cys Met |
| 85 90 | 95 | ||||
| Glu | Gly | Ala | Thr | Ala Leu Phe Ser Val Glu Ser Gly | Ala Pro Tyr Gly |
| 100 | 105 | 110 | |||
| Asp | His | Tyr | Tyr | Arg Phe Ser Pro Thr Pro Ile Ala | Gin Asp Leu His |
| 115 | 120 | 125 | |||
| Glu | Tyr | Val | Asp | Pro Arg Tyr Phe Pro Asn Ala Lys | Glu Arg GlU Ile |
| 130 | 135 ' 140 | ||||
| Leu | Phe | Glu | Thr | Arg Ser Leu Lys Asp Asp Tyr Ala | Phe Pro Ser Phe |
| 145 | 150 155 | 160 | |||
| Ala | Ala | Ala | Lys | Val Phe Gly Leu Arg Asp Glu Val | Ile Arg Ile Gin |
| 165 170 | 175 | ||||
| Lys | Glu | Leu | Glu | Arg Gin Glu Ala Leu Thr Ser Val | Ala Thr Met Thr |
| 180 | 185 | 190 | |||
| Leu | Met | Arg | Trp | Pro Phe Asp Phe Arg Tyr Ala Ile | Leu Phe Leu Thr |
| 195 | 200 | 205 | |||
| Asp | Lys | Ser | Val | Ser Lys Gly Lys Ala Leu Asp Arg | Val Val Asn Ile |
| 210 | 215 · 220 | ||||
| Leu | Tyr | Asp | Gly | Lys Lys Pro Phe Val Met Ala Ser | Gly Asp Asp Ala |
| 225 | 230 235 | 240 | |||
| Asn | Asp | Leu | Asp | Leu Ile Glu Arg Gly Asp Phe Lys | Ile Val Met Ser |
| 245 250 | 255 | ||||
| Ser | Ala | Pro | Glu | Glu Met His Val His Ala Asp Phe | Leu Ala Pro Pro |
| 260 | 265 | 270 | |||
| Ala | Asp | Lys | Asn | Gly Ile Leu Ser Ala Trp Glu Ala | Gly Val Arg Tyr |
| 275 | 280 | 285 | |||
| Tyr Asp | Asp | Leu | Met Ser Leu | ||
| 290 | 295 | ||||
| <210> 388 | |||||
| <211> 78 | |||||
| <212> PRT . | |||||
| <213> Chlamydia | pneumoniae |
345 <400> 388
| Met | Lys | Glu Phe Leu Ala Tyr Ile 5 | Ile Lys Asn Leu Val Asp Arg Pro | ||||||||||||
| 10 | 15 | ||||||||||||||
| Glu | Glu | Val | Arg | Ile | Lys | Glu | Val | Gin | Gly | Thr | His | Thr | Ile | Ile | Tyr |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Glu | Leu | Ser | Val | Ala | Lys | Pro | Asp | Ile | Gly | Lys | Ile | Ile | Gly | Lys | Glu |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Gly | Arg | Thr | Ile | Lys | Tkla | Ile | Arg | Thr | Leu | Leu | Val | Ser | Val | Ala | Ser |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Arg | Asn | Asn | Val | Arg | Val | Ser | Leu | Glu | Ile | Met | Glu | Glu | Lys | ||
| 65 | 70 | 75 | - |
<210> 389 <211> 478 <212> PRT
| <213> Chlamydia <400> 389 | pneumoniae . | ||||||||||||||
| Met | Arg | Asp | Val | Ser '5 | Glu | Leu | Phe | Arg | Thr 10 | His | Phe | Met | His | Tyr 15 | Ala |
| Ser | Tyr | Val | Ile 20 | Leu | Glu | Arg | Ala | Ile 25 | Pro | His | Ile | Leu | Asp 30 | Gly | Leu |
| Lys | Pro | Val 35 | Gin | Arg | Arg | Leu | Leu 40 | Trp | Thr | Leu | Phe | Leu 45 | Met | Asp | Asp |
| Gly | Lys 50 | Met | His | Lys | Val | Ala 55 | Asn | Ile | Ala | Gly | Arg 60 | Thr | Met | Ala | Leu |
| His 65 | Pro | His | Gly | Asp | Ala 70 | Pro | Ile | Val | Glu | Ala 75 | Leu | Val | Val | Leu | Ala 80 |
| Asn | Lys | Gly | Tyr | Leu 85 | Ile | Asp | Thr | Gin | Gly 90 | Asn | Phe | Gly | Asn | Pro 95 | Leu |
| Thr | Gly | Asp | Pro 100 | His | Ala | Ala | Ala | Arg 105 | Tyr | Ile | Glu | Ala | Arg 110 | Leu | Ser |
| Pro | Leu | Ala 115 | Arg | Glu | Thr | Leu | Phe 120 | Asn | Thr | Asp | Leu | Ile 125 | Ala | Phe | His |
| Asp | Ser 130 | Tyr | Asp | Gly | Arg | Glu 135 | Lys | Glu | Pro | Asp | Ile 140 | Leu | Pro | Ala | Lys |
| Leu 145 | Pro | Val | Leu | Leu | Leu 150 | His | Gly | Val | Asp | Gly 155 | Ile | Ala | Val | Gly | Met 160 |
| Thr | Thr | Lys | Ile | Phe 165 | Pro | His | Asn | Phe | Ala 170 | Glu | Leu | Leu | Lys | Ala 175 | Gin |
| Ile | Ala | Ile | Leu 180 | Asn | Asp Lys | Lys | Phe 185 | Thr | Val | Phe | Pro | Asp 190 | Phe | Pro | |
| Ser | Gly | Gly 195 | Leu | Met | Asp | Pro | Ser 200 | Glu | Tyr | Gin | Asp | Gly 205 | Leu | Gly | Ser |
»·'< · »·· • ·· ·
346
| Ile | Thr Leu Arg Ala Ser Ile | Asp | Ile | Ile | Asn Asp Lys 220 | Thr Leu Val | |||||||||
| 210 | 215 | ||||||||||||||
| Val | Lys | Gin | Ile | Cys | Pro | Gin | Ser | Thr | Thr | Glu | Thr | Leu | Ile | Arg | Ser |
| 225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
| Ile | Glu | Asn | Ala | Ala | Lys | Arg | Gly | Thr | Ile | Lys | Ile | Asp | Thr | Ile | Gin |
| 245 | 250 | 255 | |||||||||||||
| Asp | Phe | Ser | Thr | Asp | Val | Pro | His | Ile | Glu | Ile | Lys | Leu | Pro | Lys | Gly |
| 260 | 265 | 270 | |||||||||||||
| Ser | Arg | Ala | Lys | Glu | Met | Leu | Pro | Leu | Leu | Phe | Glu | His | Thr | Glu | Cys |
| 275 | 280 | 285 | |||||||||||||
| Gin | Val | Ile | Leu | Tyr | Ser | Lys | Pro | Thr | Val | Ile | Tyr | Glu | Asn | Lys | Pro |
| 290 | 295 | 300 | |||||||||||||
| Val | Glu | Cys | Ser | Ile | Ser | Glu | Ile | Leu | Lys | Leu | His | Thr | Thr | Ala | Leu |
| 305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
| Gin | Gly | Tyr | Leu | Glu | Lys | Glu | Leu | Leu | Leu | Leu | Gin | Glu | Gin | Leu | Thr |
| 325 | 330 | 335 | |||||||||||||
| Leu | Asp | His | Tyr | His | Lys | Thr | Leu | Glu | Tyr | Ile | Phe | Ile | Lys | His | Lys |
| 340 | 345 | 350 | |||||||||||||
| Leu | Tyr | Asp | Ser | Val | Arg | Glu | Val | Leu | Ala | Ile | Asn | Lys | Lys | Ile | Ser |
| 355 | 360 | 365 | |||||||||||||
| Ala | Asp | Asp | Leu | His | Gin | Ala | Val | Leu | His | Ala | Leu | Glu | Pro | Trp | Leu |
| 370 | 375 | 380 | |||||||||||||
| His | Glu | Leu | Ala | Thr | Pro | Val | Thr | Lys | Gin | Asp | Thr | Ser | Gin | Leu | Ala. |
| 385 | 390 | 395 | 400 | ||||||||||||
| Ser | Leu | .Thr | Ile | Lys | Lys | Ile | Leu | Cys | Phe | Asn | Glu | Glu | Ala | Cys | Thr |
| 405 | 410 | 415 | |||||||||||||
| Lys | Glu | Leu | Leu | Ala | Ile | Glu | Lys | Lys | Gin | Ala | Ala | Ile | Gin | Lys | Asp |
| 420 | 425 | 430 | |||||||||||||
| Leu | Gly | Arg | Ile | Lys | Glu | Val | Thr | Val | Lys | Tyr | Leu | Lys | Gly | Leu | Leu |
| 435 | 440 | 445 | |||||||||||||
| Glu | Arg | His | Gly | His | Leu | Gly | Glu | Arg | Lys | Thr | Gin | Ile | Thr | Asn | Phe |
| 450 | 455 | 460 | |||||||||||||
| Lys | Thr | Ala | Lys | Thr | Ser | Ile | Leu | Lys | Gin | Gin | Thr | Leu | Ile |
465 470 475 <210> 390 <211> 257 .
<212> PRT <213> Chlamydia pneumoniae <400> 390
Met Ala Phe Tyr Ser Pro Ser Thr Ile Ser Lys Tyr Phe Ile Tyr Ser 5 10 15
9·9
347
| Gly Ala Gly Asn Arg Phe Leu Leu Gly Glu Thr Leu Pro Glu Val | Glu | ||||||||||||||
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Asp | Val | Arg | Phe | Leu | Cys | Gin | Glu | Thr | Arg | Val | Asp | Gly | Phe | Leu | Tyr |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Leu | Lys | Pro | Ser | Ser | Cys | Ala | Asp | Ala | Gin | Leu | Ile | Ile | Phe | Asn | Ser |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Asp | Gly | Ser | Arg | Pro | Thr | Met | Cys | Gly | Asn | Gly | Leu | Arg | Cys | Ala | Ile |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Ala | His | Leu | Ala | Ser | Gin | Lys | Gly | Lys | Ser | Asp | Ile | Ser | Val | Ser | Thr |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Asp | Ser | Gly | Leu | Tyr | Ser | Gly | Tyr | Phe | Tyr | Ser | Trp | Asp | Arg | Val | Leu |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Val | Asp | Met | Thr | Leu | Ala | Asp | Trp | Arg | Ala | Ser | Val | His | Arg | Leu | Glu |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Ser | Arg | Pro | Asp | Pro | Leu | Pro | Lys | Glu | Val | Val | Cys | Ile | His | Thr | Gly |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Val | Pro | His | Ala | Val | Val | Ile | Leu | Pro | Glu | Ile | Ser | Thr | Leu | Asp | Leu |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Ser | Ile | Leu | Gly | Pro | Phe | Leu | Arg | Tyr | His | Gin | Thr | Phe | Ser | Pro | Asp |
| 165 | .170 | 175 | |||||||||||||
| Gly | Val | Asn | Val | Asn | Phe | Val | Gin | Ile | Leu | Gly | His | Cys | Gin | Leu | Arg |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Val | Arg | Thr | Tyr | Glu | Arg | Gly | Val | Glu | Gly | Glu | Thr | Ala | Ala | Cys | Gly |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Thr | Gly | Ala | Leu | Ala | Ser | Ala | Leu | Val | Val | Ser | Asn | Ser | Tyr | Gly | Trp |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Lys | Glu | Ser | Ile | Gin | Ile | His | Thr | Trp | Gly | Gly | Glu | Leu | Met | Thr | Val |
| 225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
| Ser | Gin | Asn | Arg | Gly | Arg | Val | Tyr | Leu | Gin | Gly | Ser | Val | Thr | Arg | Asp |
| 245 | 250 | 255 | |||||||||||||
| Leu |
| <210> 391 <211> 191 <212> PRT <213> Chlamydia pneumoniae | |||||||||||
| <400> 391 Met Ala Asp | Gly | Glu Val His 5 | Lys | Leu | Arg 10 | Asp | Ile | Ile | Glu | Lys 15 | Glu |
| Leu Leu Glu | Ala 20 | Arg Arg Val | Phe | Phe 25 | Ser | Glu | Pro | Val | Thr 30 | Glu | Lys |
.'·· ··*· * * iré ’· ' · · · ·· /, ··
-· · » ’· · · · · • '· « ·
348
| Ser | Tkla | Ser 35 | Asp | Ala | Ile | Lys | Lys 40 | Leu | Trp | Tyr | Leu | Glu 45 | Leu | Lys | Asp |
| Pro | Gly 50 | Lys | Pro | Ile | Val | Phe 55 | Val | Ile | Asn | Ser | Pro 60 | Gly | Gly | Ser | Val |
| Asp 65 | Ala | Gly | Phe | Ala | Val 70 | Trp | Asp | Gin | Ile | Lys 75 | Met | Leu | Thr | Ser | Pro 80 |
| Val | Thr | Thr | Val | Val 85 | Thr | Gly | Leu | Ala | Ala 90 | Ser | Met | Gly | Ser | Val 95 | Leu |
| Ser | Leu | Cys | Ala 100 | Ala | Pro | Gly | Arg | Arg 105 | Phe | Ala | Thr | Pro | His 110 | Ser | Arg |
| Ile | Met | Ile 115 | His | Gin | Pro | Ser | Ile 120 | Gly | Gly | Pro | Ile | Thr 125 | Gly | Gin | Ala |
| Thr | Asp 130 | Leu | Asp | Ile | His | Ala 135 | Arg | Glu | Ile | Leu | Lys 140 | Thr | Lys | Ala | Arg |
| Ile 14 5 | Ile | Asp | Val | Tyr | Val 150 | Glu | Ala | Thr | Asn | Gin 155 | Pro | Arg | Asp | Ile | Ile 160 |
| Glu | Lys | Ala | Ile | Asp 165 | Arg | Asp | Met | Trp | Met 170 | Thr | Ala | Asn | Glu | Ala 175 | Lys |
| Asp | Phe | Gly | Leu 180 | Leu | Asp | Gly | Ile | Leu 185 | Phe | Ser | Phe | Asn | Asp 190 | Leu |
<210> 392 <211> 232 .
<212> PRT <213> Chlamydia pneumoniae <4 00> 392
| Met | Thr | Lys | His | Gly 5 | Lys | Arg | Ile | Arg | Gly 10 | Ile | Leu | Lys | Asn | Tyr 15 | Asp |
| pbo | Ser | T.\7CT | Ser | Twr- | Ser | ϋ Τ~ΓΤ *-·*- tí | Glu | Ala | Ile | <3r> | Ile | Leu | T.V<3 | Gin | |
| 20 | -J- | 25 | - | 30 | |||||||||||
| Cys | Pro | Pro 35 | Val | Arg | Phe | Asp | Gin 40 | Thr | Val | Asp | Val | Ser 45 | Ile | Lys | Leu |
| Gly | Ile 50 | Asp | Pro | Lys | Lys | Ser 55 | Asp | Gin | Gin | Ile | Arg 60 | Gly | Ala | Val | Phe |
| Leu 65 | Pro | Asn | Gly | Thr | Gly 70 | Lys | Thr | Leu | Arg | Ile 75 | Leu | Val | Phe | Ala | Ser 80 |
| Gly | Asn | Lys | Val | Lys 85 | Glu | Ala | Val | Glu | Ala 90 | Gly | Ala | Asp | Phe | Met 95 | Gly |
| Ser | Asp | Asp | Leu 100 | Val | Glu | Lys | Ile | Lys 105 | Ser | Gly | Trp | Leu | Glu 110 | Phe | Asp |
| Val | Ala | Val 115 | Ala | Thr | Pro | Asp | Met 120 | Met | Arg | Glu | Val | Gly 125 | Lys | Leu | Gly |
♦ ' Φ Φ · · * /φ φ φφ Φ · ··· * φ* φ ’φ φ 'φ * ··««··« φφ ··
349
| Lys Val 130 | Leu Gly | Pro Arg | Asn Leu Met 135 | Pro | Thr | Pro Lys 140 | Thr Gly | Thr |
| Val Thr | Thr Asp | Val Ala | Lys Ala Ile | Ser | Glu | Leu Arg | Lys Gly | Lys |
| 145 | 150 | 155 | 160 | |||||
| Ile Glu | Phe Lys | Ala Asp | Arg Ala Gly | Val | Cys | Asn Val | Gly Val | Gly |
| 165 . | 170 | 175 | ||||||
| Lys Leu | Ser Phe | Glu Ser | Ser Gin Ile | Lys | Glu | Asn Ile | Glu Ala | Leu |
| 180 | 185 | 190 | ||||||
| Ser Ser | Ala Leu | Ile Lys | Ala Lys Pro | Pro | Ala | Ala Lys | Gly Gin | Tyr |
| 195 | 200 | 205 | ||||||
| Leu Val | Ser Phe | Thr Ile | Ser Ser Thr | Met | Gly | Pro Gly | Ile Ser | Ile |
| 210 | 215 | 220 | ||||||
| Asp Thr | Arg Glu | Leu Met | Ala Ser | |||||
| 225 | 230 | |||||||
| <210> 393 | ||||||||
| <211> 122 | ||||||||
| <212> PRT | ||||||||
| <213> Chlamydia | pneumoniae | |||||||
| <400> 393 | ||||||||
| Met Pro | Arg Ile | Ile Gly | Ile Asp Ile | Pro | Ala | Lys Lys | Lys Leu | Lys |
| 5 | 10 | 15 | ||||||
| Ile Ser | Leu Thr | Tyr Ile | Tyr Gly Ile | Gly | Ser | Ala Arg | Ser Asp | Glu |
| 20 | 25 | 30 | ||||||
| Ile Ile | Lys Lys | Leu Lys | Leu Asp Pro | Glu | Ala | Arg Ala | Ser Glu | Leu |
| 35 | 40 | 45 | ||||||
| Thr Glu | Glu Glu | Val Gly | Arg Leu Asn | Ser | Leu | Leu Gin | Ser Glu | Tyr |
| 50 | 55 | 60 | ||||||
| Thr Val | Glu Gly | Asp Leu | Arg Arg Arg | Val | Gin | Ser Asp | Ile Lys | Arg |
| 65 | 70 | 75 | 80 | |||||
| Leu Ile | Ala Ile | His Ser | Tyr Arg Gly | Gin | Arg | His Arg | Leu Ser | Leu |
| 85 | 90 | 95 | ||||||
| Pro Val | Arg Gly | Gin Arg | Thr Lys Thr | Asn | Ser | Arg Thr | Arg Lys | Gly |
| 100 | 105 | 110 | ||||||
| Lys Arg | Lys Thr | Val Ala | Gly Lys Lys | Lys | ||||
| 115 | 120 | |||||||
| <210> 394 | ||||||||
| <211> 1723 . | ||||||||
| <212> PRT | ||||||||
| <213> Chlamydia | pneumoniae | |||||||
| <400> 394 | ||||||||
| Met Lys | Trp Leu | Pro Ala | Thr Ala Val | Phe | Ala | -Ala Val | Leu Pro | Ala |
350 ·· ··>· ·· ···.. *··· ♦ ♦ i» ,» · · » ; * '«'* · · · '· · ·· · .· . *
| Leu | Thr | Ala | Phe 20 | Gly | Asp | Pro | Ala |
| Thr | Gly | Ser 35 | Gly | Asp | Pro | Thr | Ser 40 |
| Gin | Ser 50 | Ser | Thr | Glu | Thr | Asp 55 | Gly |
| Ile 65 | Thr | Phe | Ser | Thr | Phe 70 | Thr | Asn |
| Asp | Ala | Asn | Asp | Ser 85 | Ser | Ser | Asn |
| Ser | Gly | Ala | Thr 100 | Ser | Leu | Ile | Arg |
| Asp | Phe | Thr 115 | Lys | Asp | Ser | Val | Leu 120 |
| Ser | Ala 130 | Ser | Asn | Thr | Leu | Asn 135 | Pro |
| Gly 145 | Gly | Ser | Ser | Ser | Ser 150 | Ser | Ser |
| Ala | Val | Val | Ala | Ala 165 | Asp | Pro | Lys |
| Glu | Ala | Asn | Gly 180 | Thr | Leu | Thr | Phe |
| Ser | Leu | Thr 195 | Leu | Gin | Asn | Leu | Lys 200 |
| Tyr | Ser 210 | Lys | Gly | Pro | Leu | Val 215 | Phe |
| Thr 225 | Gly | Asn | Glu | Ser | Gin 230 | Lys | Ser |
| Ala | Leu | Thr | Thr | Gin 245 | Ala | Ile | Val |
| Thr | Ser | Ala | Gly 260 | Gin | Gly | Gly | Ala |
| Phe | Asn | Ala 275 | Leu | Asp | Sér | Leu | Lys 280 |
| Ala | Gly 290 | Gly | Gly | Ile | Tyr | Thr 295 | Glu |
| Thr 305 | Lys | Ser | Ile | Glu | Phe 310 | Ile | Ser |
| Ala | Pro | Glu | Pro | Thr | Ser | Pro | Ala |
325
15
| Ser 25 | Val | Glu | Ile | Ser | Thr 30 | Ser | His |
| Asp | Ala | Ala | Leu | Thr 45 | Gly | Phe | Thr |
| Thr | Thr | Tyr | Thr 60 | Ile | Val | Gly | Asp |
| Ile | Pro | Val 75 | Pro | Val | Val | Thr | Pro 80 |
| Ser | Ser 90 | Lys | Gly | Gly | Ser | Ser 95 | Ser |
| Ser 105 | Ser | Asn | Leu | His | Ser 110 | Asp | Phe |
| Asp | Leu | Tyr | His | Leu 125 | Phe | Phe | Pro |
| Ala | Leu | Leu | Ser 140 | Ser | Ser | Ser | Ser |
| Ser | Ser | Ser 155 | Ser | Gly | Ser | Ala | Ser 160 |
| Gly | Gly 170 | Ala | Ala | Phe | Tyr | Ser 175 | Asn |
| Thr 185 | Thr | Asp | Ser | Gly | Asn 190 | Pro | Gly |
| Met | Thr | Gly | Asp | Gly Ala 205 | Ala | Ile | |
| Thr | Gly | Leu | Lys 220 | Asn | Leu | Thr | Phe1 |
| Gly | Glv | Ala 235 | Ala | Tvr | Thr | Glu | Gly 240 |
| Glu | Ala 250 | Val | Thr | Phe | Thr | Gly 255 | Asn |
| Ile 265 | Tyr | Val | Lys | Glu | Ala 270 | Thr | Leu |
| Phe | Glu | Lys | Asn | Thr 285 | Ser | Gly | Gin |
| Ser | Thr | Leu | Thr 300 | Ile | Ser | Asn | Ile |
| Asn | Lys | Ala 315 | Ser | Val | Pro | Ala | Pro 320 |
| Pro | Ser 330 | Ser | Leu | Ile | Asn | Ser 335 | Thr |
351 ·Μ·
I 9 9 '· 9·9 « '9 » '9 ' 9 ·· ,··9 9
| Thr | Ile | Asp | Thr | Ser | Thr | Leu | Gin | Thr | Arg | Ala | Ala | Ser | Ala | Thr· | Pro |
| 340 | 345 | 350 | |||||||||||||
| Ala | Val | Ala | Pro | Val | Ala | Ala | Val | Thr | Pro | Thr | Pro | Ile | Ser. | Thr | Gin |
| 355 | 360 | 365 | |||||||||||||
| Glu | Thr | Ala | Gly | Asn | Gly | Gly | Ala | Ile | Tyr | Ala | Lys | Gin | Gly | Ile | Ser |
| 370 | 375 | 380 | |||||||||||||
| Ile | Ser | Thr | Phe | Lys | Asp | Leu | Thr | Phe | Lys | Ser | Asn | Ser. | Ala | Ser | Val |
| 385 | 390 | 395 | 4 00 | ||||||||||||
| Asp | Ala | Thr | Leu | Thr | Val | Asp | Ser | Ser | Thr | Ile | Gly | Glu | Ser | Gly | Gly |
| 405 | 410 | 415 | |||||||||||||
| Ala | Ile | Phe | Ala | Ala | Asp | Ser | Ile | Gin | Ile | Gin | Gin | Cys | Thr | Gly | Thr |
| 420 | 425 | 430 | |||||||||||||
| Thr | Leu | Phe | Ser | Gly | Asn | Thr | Ala | Asn | Lys | Ser | Gly | Gly | Gly | Ile | Tyr |
| 435 | 440 | 445 | |||||||||||||
| Ala | Val | Gly | Gin | Val | Thr | Leu | Glu | Asp | Ile | Ala | Asn | Leu | Lys | Met | Thr |
| 450 | 455 | 460 | |||||||||||||
| Asn | Asn | Thr | Cys | Lys | Gly | Glu | Gly | Gly | Ala | Ile | Tyr | Thr | Lys | Lys | Ala |
| 4 65 | 470 | 475 | 480 | ||||||||||||
| Leu | Thr | Ile | Asn | Asn | Gly | Ala | Ile | Leu | Thr | Thr | Phe | Ser | Gly | Asn | Thr |
| 485 | 4 90 | 495 | |||||||||||||
| Ser | Thr | Asp | Asn | Gly | Cly | Ala | Ile | Phe | Ala | Val | Gly | Gly | Ile | Thr | Leu |
| 500 | 505 | 510 | |||||||||||||
| Ser | Asp | Leu | Val | Glu | Val | Arg | Phe | Ser | Lys | Asn | Lys | Thr | Gly | Asn | Tyr |
| 515 | 520 | 525 | |||||||||||||
| Ser | Ala | Pro | Ile | Thr | Lys | Ala | Ala | Ser | Asn | Thr | Ala | Pro | Val | Val | Ser |
| 530 | 535 | 540 | |||||||||||||
| Ser | Ser | Thr | Thr | Ala | Ala | Ser | Pro | Ala. | Val | Pro | Ala | Ala | Ala | Ala | Ala |
| 545 | 550 | 555 | 560 | ||||||||||||
| Pro | Val | Thr | Asn | Ala | Ala | Lys | Gly | Gly | Ala | Leu | Tyr | Ser | Thr | Glu | Gly |
| 565 | 570 | 575 | |||||||||||||
| Leu | Thr | Val | Ser | Gly | Ile | Thr | Ser | Ile | Leu | Ser | Phe | Glu | Asn | Asn | Glu |
| 580 | 585 | 590 | |||||||||||||
| Cys | Gin | Asn | Gin | Gly | Gly | Gly | Ala | Tyr | Val | Thr | Lys | Thr | Phe | Gin | Cys |
| 595 | 600 | 605 | |||||||||||||
| Ser | Asp | Ser | His | Arg | Leu | Gin | Phe | Thr | Ser | Asn | Lys | Ala | Ala | Asp | Glu |
| 610 | 615 | 620 | |||||||||||||
| Gly | Gly | Gly | Leu | Tyr | Cys | Gly | Asp | Asp | Val | Thr | Leu | Thr | Asn | Leu | Thr |
| 625 | 630 | - | 635 | 640 | |||||||||||
| Gly | Lys | Thr | Leu | Phe | Gin | Glu | Asn | Ser | Ser | Glu | Lys | His | cly | Gly Gly | |
| 645 | 650 | 655 |
• toto· toto ·· . toto toto·· to to: to · to · · to to ···· · ,· ··· · · · • ·*···«·«· · .352
| Leu | Ser | Leu | Ala 660 | Ser | Gly Lys | Ser | Leu 665 | Thr | Met | Thr | Ser | Leu 670 | Glu | Ser | |
| Phe | Cys | Leu | Asn | Ala | Asn | Thr | Ala | Lys | Glu | Asn | Gly | Gly | Gly | Ala | Asn |
| 675 | 680 | 685 | |||||||||||||
| Val | Pro | Glu | Asn | Ile | Val | Leu | Thr | Phe | Thr | Tyr | Thr | Pro | Thr | Pro | Asn |
| 690 | 695 | 700 | |||||||||||||
| Glu | Pro | Ala | Pro | Val | Gin | Gin | Pro | Val | Tyr | Gly | Glu | Ala | Leu | Val | Thr |
| 705 | 710 | 715 | 720 | ||||||||||||
| Gly | Asn | Thr | Ala | Thr | Lys | Ser | Gly | Gly | Gly | Ile | Tyr | Thr | Lys | Asn | Ala |
| 725 | 730 | 735 | |||||||||||||
| Ala | Phe | Ser | Asn | Leu | Ser | Ser | Val | Thr | Phe | Asp | Gin | Asn | Thr | Ser | Ser |
| 740 | 745 | 750 | |||||||||||||
| Glu | Asn | Gly | Gly | Ala | Leu | Leu | Thr | Gin | Lys | Ala | Ala | Asp | Lys | Thr | Asp |
| 755 | 760 | 765 | |||||||||||||
| Cys | Ser | Phe | Thr | Tyr | Ile | Thr | Asn | Val | Asn | Ile | Thr | Asn | Asn | Thr | Ala |
| 770 | 775 | 780 | |||||||||||||
| Thr | Gly | Asn | Gly | Gly | Gly | Ile | Ala | Gly | Gly | Lys | Ala | His | Phe | Asp | Arg |
| 785 | 790 | 795 | 800 | ||||||||||||
| Ile | Asp | Asn | Leu | Thr | Val | Gin | Ser | Asn | Gin | Ala | Lys | Lys | Gly | Gly Gly | |
| 805 | 810 | 815 | |||||||||||||
| Val | Tyr | Leu | Glu | Asp | Ala | Leu | Ile | Leu | Glu | Lys | Val | Ile | Thr | Gly | Ser |
| 820 | 825 | 830 | |||||||||||||
| Val | Ser | Gin | Asn | Thr | Ala | Thr | Glu | Ser | Gly | Gly | Gly | Ile | Tyr | Ala | Lys |
| 835 | 840 | 845 | |||||||||||||
| Asp | Ile | Gin | Leu | Gin | Ala | Leu | Pro | Gly | Ser | Phe | Thr | Ile | Thr | Asp | Asn |
| 850 | 855 | 860 | |||||||||||||
| Lys | Val | Glu | Thr | Ser | Leu | Thr | Thr | Ser | Thr | Asn | Leu | Tyr | Gly | Gly | Gly |
| 865 | 870 | 875 | 880 | ||||||||||||
| Ile | Tyr | Ser | Ser | Gly | Ala | Val | Thr | Leu | Thr | Asn | Ile | Ser | Gly | Thr | Phe |
| 885 | 890 | 895 | |||||||||||||
| Gly | Ile | Thr | Gly | Asn | Ser | Val | Ile | Asn | Thr | Ala | Thr | Ser | Gin | Asp | Ala |
| 900 | 905 | 910 | |||||||||||||
| Asp | Ile | Gin | Gly | Gly | Gly | Ile | Tyr | Ala | Thr | Thr. | Ser | Leu | Ser | Ile | Asn |
| 915 | 920 | 925 | |||||||||||||
| Gin | Cys | Asn | Thr | Pro | Ile | Leu | Phe | Ser | Asn | Asn | Ser | Ala | Ala | Thr | Lys |
| 930 | 935 | 940 | |||||||||||||
| Lys | Thr | Ser | Thr | Thr | Lys | Gin | Ile | Ala | Gly | Gly | Ala | He | Phe | Ser | Ala |
| 945 | 950 | 955 | 960 | ||||||||||||
| Ala | Val | Thr | Ile | Glu | Asn | Asn | Ser | Gin | Pro | Ile | Ile | Phe | Leu | Asn | Asn |
| 965 | 970 | 975 | |||||||||||||
| Ser | Ala | Lys | Ser | Glu | Ala | Thr | Thr | Ala | Ala | Thr | Ala | Gly | Asn | Lys | Asp |
•4 ···· «4 .
353
4(4 4 4 * · · 4 ·«·· 4 4 '4·· · 4 · • 4 * · 4 4 4 4 '4 « • · 4 4 · · · « « • ··« 11 '4 4 4 4 4 4
| 980 | 985 | 990 |
| Ser Cvs Gly Gly Ala Ile Ala | Ala Asn Ser Val Thr Leu | Thr Asn Asn |
| 995 | 1000 1005 | |
| Pro Glu Ile Thr Phe Lys Gly Asn Tyr Ala Glu Thr Gly | Gly Ala Ile | |
| 1010 1015 1020 | ||
| Gly Cys Ile Asp Leu Thr Asn | Gly Ser Pro Pro Arg Lys | Val Ser Ile |
| 1025 1030 | 1035 | 1040 |
| Ala Asp Asn Gly Ser Val Leu | Phe Gin Asp Asn Ser Ala | Leu Asn Arg |
| 1045 | 1050 | 1055 |
| Gly Gly Ala Ile Tyr Gly Glu | Thr Ile Asp Ile Ser Arg | Thr Gly Ala |
| 1060 | 1065 | 1070 |
| Thr Phe Ile Gly Asn Ser Ser | Lys His Asp Gly Ser Ala | Ile Cys Cys |
| 1075 | 1080 1085 | |
| Ser Thr Ala Leu Thr Leu Ala | Pro Asn Ser Gin Leu Ile | Phe Glu Asn |
| 1090 1095 1100 | ||
| Asn Lys Val Thr Glu Thr Thr | Ala Thr Thr Lys Ala Ser | Ile Asn Asn |
| 1105 1110 | 1115 | 1120 |
| Leu Gly Ala Ala Ile Tyr Gly | Asn Asn Glu Thr Ser Asp | Val Thr Ile |
| 1125 | 1130 | 1135 |
| Ser Leu Ser Ala Glu Asn Gly | Ser Ile Phe Phe Lys Asn | Asn Leu Cys |
| 1140 | 1145 | 1150 |
| Thr Ala Thr Asn Lys Tyr Cys | Seř Ile Ala Gly Asn Val | Lys Phe Thr |
| 1155 | 1160 1165 | |
| Ala Ile Glu Ala Ser Ala Gly | Lys Ala Ile Ser Phe Tyr | Asp Ala Val |
| 1170 1175 1180 | ||
| Asn Val Ser Thr Lys Glu Thr | Asn Ala Gin Glu Leu Lys | Leu Asn Glu |
| 1185 1190 | 1195 | 1200 |
| Lys Ala Thr Ser Thr Gly Thr | Ile Leu Phe Ser Gly Glu | Leu His Glu |
| 1205 | 1210 | 1215 |
| Asn Lys Ser Tyr Ile Pro Gin | Lys Val Thr Phe Ala His | Gly Asn Leu |
| 1220 | 1225 | 1230 |
| Ile Leu Gly Lys Asn Ala Glu | Leu Ser Val Val Ser Phe | Thr Gin Ser |
| 1235 | 1240 1245 | |
| Pro Gly Thr Thr Ile Thr Met | Gly Pro Gly Ser Val Leu | Ser Asn His |
| 1250 1255 1260 | ||
| Ser Lys Glu Ala Gly Gly Ile | Ala.Ile Asn Asn Val Ile | Ile Asp Phe |
| 1265 1270 | 1275 | 1280 |
| Ser Glu Ile Val Pro Thr Lys | Asp Asn Ala Thr Val Ala | Pro Pro Thr |
| 1285 | 1290 | 1295 |
| Leu Lys Leu Val Ser Arg Thr | Asn Ala Asp Ser Lys Asp | Lys Ile Asp |
| 1300 | 1305 | 1310 |
·« • · '· « · · ·· ···· *· « ··. ' < '· · · * ···«. .-9 4 \4 9 4 · · * • »··.·· 4 9 4 4 .· • · · · · · ··«,«
354
| Ile | Thr | Gly Thr Val 1315 | Thr | Leu Leu Asp Pro Asn Gly Asn Leu Tyr CSln | |
| 1320 | 1325 | ||||
| Asn | Ser 133C | Tyrr-Leu Gly 1 | Glu | Asp Arg Asp Ile Thr 1335 | Leu Phe Asn Ile A\Sp 1340 |
| Asn Ser 1345 | Ala Ser Gly | Ala Val Thr Ala Thr Asn 1350 1355 | Val Thr Leu Gin Gly > 1360 | ||
| Asn | Leu | Gly Ala Lys Lys 1365 | Gly Tyr Leu Gly Thr 1370 | Trp Asn Leu Asp <E>ro 1375 | |
| Asn | Ser | Ser Gly Ser 1380 | Lys | Ile Ile Leu Lys Trp 1385 | Thr Phe Asp Lys Tyr 1390 . |
| Leu | Arg | Trp Pro Tyr 1395 | Ile | Pro Arg Asp Asn His 1400 | Phe Tyr Ile Asn Ser 1405 |
| Ile | Trp Gly Ala Gin 1410 | Asn | Ser Leu Val Thr Val 1415 | Lys Gin Gly Ile Leu 1420 | |
| Gly Asn 1425 | Met Leu Asn | Asn Ala Arg Phe Glu Asp Pro Ala Phe Asn Asn 1430 1435 1440 | |||
| Phe | Trp | Ala Ser Ala Ile 1445 | Gly Ser Phe Leu Arg 1450 | Lys Glu Val Ser Arg 1455 | |
| Asn | Ser | Asp Ser Phe 1460 | Thr | Tyr His Gly Arg Gly 14 65 | Tyr Thr Ala Ala Val 1470 |
| Asp | Ala | Lys Pro Arg 1475 | Gin | Glu Phe Ile Leu Gly 1480 | Ala Ala Phe Ser Gin 1485 |
| Val | Phe Gly His Tkla 1490 | Glu | Ser Glu Tyr His Leu 1495 | Asp Asn Tyr Lys His 1500 | |
| Lys Gly 1505 | Ser Gly His | Ser Thr Gin Ala Ser Leu Tyr Ala Gly Asn ιχθ 1510 1515 1520 | |||
| Phe | Tyr | Phe Pro Ala Ile 1525 | Arg Ser Arg Pro Ile 1530 | Leu Phe Gin Gly Val 1535 | |
| Ala | Thr | Tyr Gly Tyr 1540 | Met | Gin His Asp Thr Thr 1545 | Thr Tyr Tyr Pro ser 1550 |
| Ile | Glu | Glu Lys Asn 1555 | Met | Ala Asn Trp Asp Ser 1560 | Ile Ala Trp Leu Phe 1565 |
| Asp | Leu | Arg Phe Ser | Val | Asp Leu Lys Glu Pro | Gin Pro His Ser Thr |
1570 1575 1580
| Ala Arg | Leu | Thr | Phe | Tyr Thr | Glu | Ala | Glu Tyr Thr | Arg | Ile | Arg Gin |
| 1585 | 1590 | 1595 | 1600 | |||||||
| Glu Lys | Phe | Thr | Glu | Leu Asp | Tyr | Asp | Pro Arg Ser | Phe | Ser | Ala Cys |
| 1605 | 1610 | 1615 |
Ser Tyr Gly Asn Leu Ala Ile Pro Thr Gly Phe Ser Val Asp Gly £j.a 1620 1625 1630
á-;4žbí
0Φ φφφφ .·« ··«· ·* · • 0 00 ·· 0 0 • Φ · φ · 0 • Φ ΦΦΦ Φ · ·
Φ φ φ 0 ·.· Φ φ·Φ · · • Φ · φ · φφ«φ • Φ ··· ·· ·· '0· '··
355
| Leu | Ala Trp Arg 1635 | Glu Ile | Ile | Leu Tyr Asn Lys Val Ser Ala Ala | Tyr | |
| 1640 | 1645 | |||||
| Leu | Pro Val Ile | Leu Arg | Asn | Asn Pro | Lys Ala Thr Tyr Glu Val | Leu |
| 1650 | 1655 | 1660 | ||||
| Ser | Thr Lys Glu | Lys Gly | Asn | Val Val | Asn Val Leu Pro Thr Arg | Asn |
| 1665 | 1670 | 1675 | 1680 | |||
| Ala | Ala Arg Ala | Glu Val | Ser | Ser Gin | Ile Tyr Leu Gly Ser Tyr | Trp |
| 1685 | 1690 1695 | |||||
| Thr | Leu Tyr Gly | Thr Tyr | Thr | Ile Asp | Ala Ser Met Asn Thr Leu | Val |
| 1700 | 1705 1710 | |||||
| Gin | Met Ala Asn | Gly Gly | Ile | Arg Phe | Val Phe | |
| 1715 | 1720 |
<210> 395 <211> 1723 <212> PRT <213> Chlamydia pneumoniae <400> 395
| Met 1 | Lys | Trp Leu | Pro Ala 5 | Thr Ala | Val | Phe Ala 10 | Ala | Val | Leu | Pro 15 | Ala | ||||
| Leu | Thr | Ala | Phe | Gly | Asp | Pro | Ala | Ser | Val | Glu | Ile | Ser | Thr | Ser | His |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Thr | Gly | Ser | Gly | Asp | Pro | Thr | Ser | Asp | Ala | Ala | Leu | Thr | Gly | Phe | Thr |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Gin | Ser | Ser | Thr | Glu | Thr | Asp | Gly | Thr | Thr | Tyr | Thr | Ile | Val | Gly Asp | |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Ile | Thr | Phe | Ser | Thr | Phe | Thr | Asn | Ile | Pro | Val | Pro | Val | Val | Thr | Pro |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Asp | Ala | Asn | Asp | Ser | Ser | Ser | Asn | Ser | Ser | Lys | Gly | Gly | Ser | Ser | Ser |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Ser | Gly | Ala | Thr | Ser | Leu | Ile | Arg | Ser | Ser | Asn | Leu | His | Ser | Asp | Phe |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Asp | Phe | Thr | Lys | Asp | Ser | Val | Leu | Asp | Leu | Tyr | His | Leu | Phe | Phe | Pro |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Ser | Ala | Ser | Asn | Thr | Leu | Asn | Pro | Ala | Leu | Leu | Ser | Ser | Ser | Ser | Ser |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Gly | Gly | Ser | Ser | Ser | Ser | Ser | Ser | Ser | Ser | Ser | Ser | Gly | Ser | Ala | Ser |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Ala | Val | Val | Ala | Ala | Asp | Pro | Lys | Gly | Gly | Ala | Ala | Phe | Tyr | Ser | Asn |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Glu | Ala | Asn | Gly | Thr | Leu | Thr | Phe | Thr | Thr | Asp | Ser | Gly | Asn | Pro | Gly |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Ser | Leu | Thr | Leu | Gin | Asn | Leu | Lys | Met | Thr | Gly | Asp | Gly | Ala | Ala | Ile |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Tyr | Ser | Lys. | Gly | Pro | Leu | Val | Phe | Thr | Gly | Leu | Lys | Asn | Leu | Thr | Phe |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Thr | Gly | Asn | Glu | Ser | Gin | Lys | Ser | Gly | Gly | Ala | Ala | Tyr | Thr | Glu | Gly |
| 225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
| Ala | Leu | Thr | Thr | Gin | Ala | Ile | Val | Glu | Ala | Val | Thr | Phe | Thr | Gly | Asn |
| 245 | 250 | 255 | |||||||||||||
| Thr | Ser | Ala | Gly | Gin | Gly | Gly | Ala | Ile | Tyr | Val | Lys | Glu | Ala | Thr | Leu |
| 260 | 265 | 270 | |||||||||||||
| Phe | Asn | Ala | Leu | Asp | Ser | Leu | Lys | Phe | Glu | Lys | Asn | Thr | Ser | Gly | Gin |
| 275 | 280 | 285 |
• · • toto· ·· ···· • to to ··· • · • · «•toto ·«· • · · to · • to ··· · · • · , · · · · to « • · · · toto ·· ·· toto to·
356
| Ala Glv Gly Gly | Ile | Tyr Thr Glu 295 | Ser | Thr Leu | Thr 300 | Ile | Ser | Asn | Ile | ||||||
| 290 | |||||||||||||||
| Thr | Lys | Ser | Ile | Glu | Phe | Ile | Ser | Asn | Lys | Ala | Ser | Val | Pro | Ala | Pro |
| 305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
| Ala | Pro | Glu | Pro | Thr | Ser | Pro | Ala | Pro | Ser | Ser | Leu | Ile | Asn | Ser | Thr |
| 325 | 330 | 335 | |||||||||||||
| Thr | Ile | Asp | Thr | Ser | Thr | Leu | Gin | Thr | Arg | Ala | Ala | Ser | Ala | Thr | Pro |
| 340 | 345 | 350 | |||||||||||||
| Ala | Val | Ala | Pro | Val | Ala | Ala | Val | Thr | Pro | Thr | Pro | Ile | Ser | Thr | Gin |
| 355 | 360 | 365 | |||||||||||||
| Glu | Thr | Ala | Gly | Asn | Gly | Gly | Ala | Ile | Tyr | Ala | Lys | Gin | Gly | Ile | Ser |
| 370 | 375 | 380 | |||||||||||||
| Ile | Ser | Thr | Phe | Lys | Asp | Leu | Thr | Phe | Lys | Ser | Asn | Ser | Ala | Ser | Val |
| 385 | 390 | 395 | 400 | ||||||||||||
| Asp | Ala | Thr | Leu | Thr | Val | Asp | Ser | Ser | Thr | Ile | Gly | Glu | Ser | Gly | Gly |
| 405 | 410 | 415 | |||||||||||||
| Ala | Ile | Phe | Ala | Ala | Asp | Ser | Ile | Gin | Ile | Gin | Gin | Cys | Thr | Gly | Thr |
| 420 | 425 | 430 | |||||||||||||
| Thr | Leu | Phe | Ser | Gly | Asn | Thr | Ala | Asn | Lys | Ser | Gly | Gly | Gly | Ile | Tyr |
| 435 | 440 | 445 | |||||||||||||
| Ala | Val | Gly | Gin | Val | Thr | Leu | Glu | Asp | Ile | Ala | Asn | Leu | Lys | Met | Thr |
| 450 | 455 | 4 60 | |||||||||||||
| Asn | Asn | Thr | Cys | Lys | Gly | Glu | Gly | Gly | Ala | Ile | Tyr | Thr | Lys | Lys | Ala |
| 465 | 470 | 475 | 480 | ||||||||||||
| Leu | Thr | Ile | Asn | Asn | Gly | Ala | Ile | Leu | Thr | Thr | Phe | Ser | Gly | Asn | Thr |
| 485 | 490 | 4 95 | |||||||||||||
| Ser | Thr | Asp | Asn | Gly | Gly | Ala | Ile | Phe | Ala | Val | Gly | Gly | Ile | Thr | Leu |
| 500 | 505 | 510 | |||||||||||||
| Ser | Asp | Leu | Val | Glu | Val | Arg | Phe | Ser | Lys | Asn | Lys | Thr | Gly | Asn | Tyr |
| 515 | 520 | 525 | |||||||||||||
| Ser | Ala | Pro | Ile | Thr | Lys | Ala | Ala | Ser | Asn | Thr | Ala | Pro | Val | Val | Ser |
| 530 | 535 | 540 | |||||||||||||
| Ser | Ser | Thr | Thr | Ala | Ala | Ser | Pro | Ala | Val | Pro | Ala | Ala | Ala | Ala | Ala |
| 545 | 550 | 555 | 560 | ||||||||||||
| Pro | Val | Thr | Asn | Ala | Ala | Lys | Gly | Gly | Ala | Leu | Tyr | Ser | Thr | Glu | Gly |
| 565 | 570 | 575 | |||||||||||||
| Leu | Thr | Val | Ser | Gly | Ile | Thr | Ser | Ile | Leu | Ser | Phe | Glu | Asn | Asn | Glu |
| 580 | 585 | 590 | |||||||||||||
| Cys | Gin | Asn | Gin | Gly | Gly | Gly | Ala | Tyr | Val | Thr | Lys | Thr | Phe | Gin | Cys |
| 595 | 600 | 605 | |||||||||||||
| Ser | Asp | Ser | His | Arg | Leu | Gin | Phe | Thr | Ser | Asn | Lys | Ala | Ala | Asp | Glu |
| 610 | 615 | 620 | |||||||||||||
| Gly | Gly | Gly | Leu | Tyr | Cys | Gly | Asp | Asp | Val | Thr | Leu | Thr | Asn | Leu | Thr |
| 625 | 630 | 635 | 640 | ||||||||||||
| Gly | Lys | Thr | Leu | Phe | Gin | Glu | Asn | Ser | Ser | Glu | Lys | His | Gly | Gly | Gly |
| 645 | 650 | 655 | |||||||||||||
| Leu | Ser | Leu | Ala | Ser | Gly | Lys | Ser | Leu | Thr | Met | Thr | Ser | Leu | Glu | Ser |
| 660 | 665 | 670 | |||||||||||||
| Phe | Cys | Leu | Asn | Ala | Asn | Thr | Ala | Lys | Glu | Asn | . Gly | Gly | Gly | Ala | Asn |
| 675 | 680 | 685 | |||||||||||||
| Val | Pro | Glu | Asn | Ile | Val | Leu | Thr | Phe | Thr | Tyr | Thr | Pro | Thr | Pro | Asn |
| 690 | 695 | 700 | |||||||||||||
| Glu | Pro | Ala | Pro | Val | Gin | Gin | Pro | Val | Tyr | Gly | Glu | Ala | Leu | Val | Thr |
| 705 | 710 | 715 | 720 | ||||||||||||
| Gly | Asn | Thr | Ala | Thr | Lys | Ser | Gly | Gly | Gly | Ile | Tyr | Thr | Lys | Asn | Ala |
| 725 | 730 | 735 | |||||||||||||
| Ala | Phe | Ser | Asn | Leu | Ser | Ser | Val | Thr | Phe | Asp | Gin | Asn | Thr | Ser | Ser |
| 740 | 745 | 750 | |||||||||||||
| Glu | Asn | Gly | Gly | Ala | Leu | Leu | Thr | Gin | Lys | Ala | Ala | Asp | Lys | Thr | Asp |
| 755 | 760 | 765 | |||||||||||||
| Cys | Ser | Phe | Thr | Tyr | Ile | Thr | Asn | Val | Asn | Ile | Thr | Asn | Asn | Thr | Ala |
·· ·· • 9 • ··· · • · · · » · · · ·· ·« ·· *··· • · · · • ··· · • · ♦ · • · ··<· ·Γ· •9 ···· • · · • · • · • · · ·· ··
357
| 770 | 775 | 780 |
| Thr Gly Asn Gly Gly Gly | Ile Ala Gly | Gly Lys Ala His Phe Asp Arg |
| 785 790 | 795 800 | |
| Ile Asp Asn Leu Thr Val | Gin Ser Asn | Gin Ala Lys Lys Gly Gly Gly |
| 805 | 810 815 | |
| Val Tyr Leu Glu Asp Ala | Leu Ile Leu | Glu Lys' Val Ile Thr Gly Ser |
| 820 | 825 | 830 |
| Val Ser Gin Asn Thr Ala | Thr Glu Ser | Gly Gly Gly Ile Tyr Ala Lys |
| 835 | 840 | 845 |
| Asp Ile Gin Leu Gin Ala | Leu Pro Gly | Ser Phe Thr Ile Thr Asp Asn |
| 850 | 855 | 860 |
| Lys Val Glu Thr Ser Leu | Thr Thr Ser | Thr Asn Leu Tyr Gly Gly Gly |
| 865 870 | 875 880 | |
| Ile Tyr Ser Ser Gly Ala | Val Thr Leu | Thr Asn Ile Ser Gly Thr Phe |
| 885 | 890 895 | |
| Gly Ile Thr Gly Asn Ser | Val Ile Asn | Thr Ala Thr Ser Gin Asp Ala |
| 900 | 905 | 910 |
| Asp Ile Gin Gly Gly Gly | Ile Tyr Ala | Thr Thr Ser Leu Ser Ile Asn |
| 915 | 920 | 925 |
| Gin Cys Asn Thr Pro Ile | Leu Phe Ser | Asn Asn Ser Ala Ala Thr Lys |
| 930 | 935 | 940 |
| Lys Thr Ser Thr Thr Lys | Gin Ile Ala | Gly Gly Ala Ile Phe Ser Ala |
| 945 950 | 955 960 | |
| Ala Val Thr Ile Glu Asn | Asn Ser Gin | Pro Ile Ile Phe Leu Asn Asn - |
| 965 | 970 975 | |
| Ser Ala Lys Ser Glu Ala | Thr Thr Ala | Ala Thr Ala Gly Asn Lys Asp |
| 980 | 985 | 990 |
| Ser Cys Gly Gly Ala Ile | Ala Ala Asn | Ser Val Thr Leu Thr Asn Asn |
| 995 | 1000 | 1005 |
| Pro Glu Ile Thr Phe Lys | Gly Asn Tyr | Ala Glu Thr Gly Gly Ala Ile |
| 1010 | 1015 | 1020 |
| Gly Cys Ile Asp Leu Thr | Asn Gly Ser | Pro Pro Arg Lys Val Ser Ile |
| 1025 1030 | 1035 1040 | |
| Ala Asp Asn Gly Ser Val | Leu Phe Gin | Asp Asn Ser Ala Leu Asn Arg |
| 1045 | 1050 1055 | |
| Gly Gly Ala Ile Tyr Gly | Glu Thr Ile | Asp Ile Ser Arg Thr Gly Ala |
| 1060 | 1065 1070 | |
| Thr Phe Ile Gly Asn Ser | Ser Lys His | Asp Gly Ser Ala Ue Cys Cys |
| 1075 | 1080 | 1085 |
| Ser Thr Ala Leu Thr Leu | Ala Pro Asn | Ser Gin Leu Ile Phe Glu Asn |
| 1090 | 1095 | 1100 |
| Asn Lys Val Thr Glu Thr | Thr Ala Thr | Thr Lys Ala Ser Ile Asn Asn |
| 1105 1110 | 1115 1120 | |
| Leu Gly Ala Ala Ile Tyr | Gly Asn Asn | Glu Thr Ser Asp Ue Thr Ue |
| 1125 | 1130 1135 . | |
| Ser Leu Ser Ala Glu Asn | Gly Ser Ile | Phe Phe Lys Asn Asn Leu Cys |
| 1140 | 1145 1150 | |
| Thr Ala Thr Asn Lys Tyr | Cys Ser Ile | Ala Gly Asn Val Lys Phe Thr |
| 1155 | 1160 | 1165 |
| Ala Ile. Glu Ala Ser Ala | Gly Lys Ala | Ue Ser Phe Tyr Asp Ala Val |
| 1170 | 1175 | 1180 |
| Asn Val Ser Thr Lys Glu | Thr Asn Ala | Gin Glu Leu Lys Leu Asn Glu |
| 1185 1190 | 1195 1200 | |
| Lys Ala Thr Ser Thr Gly | Thr Ile Leu | Phe Ser Gly Glu Leu His Glu |
| 1205 | 1210 1215 | |
| Asn Lys Ser Tyr Ile Pro | Gin Lys Val | Thr Phe Ala His Gly Asn Leu |
| 1220 | 1225 1230 | |
| Ile Leu Gly Lys Asn Ala | Glu Leu Ser | Val Val Ser Phe Thr Gin Ser |
| 1235 | 1240 | 1245 |
| Pro Gly Thr Thr Ile Thr | Met Gly Pro | Gly Ser Val Leu Ser Asn His |
| 1250 | 1255 | 1260 |
• · · · • ·
358
| Ser Lys | Glu | Ala | Gly Gly Ile Ala | Ile | Asn | Asn | Val | Ile | Ile | Asp | Phe |
| 1265 | 1270 | 1275 | 1280 | ||||||||
| Ser Glu | Ile | Val | Pro Thr Lys Asp | Asn | Ala | Thr | Val | Ala | Pro | Pro | Thr |
| 1285 | 1290 | 1295- | |||||||||
| Leu Lys | Leu | Val | Ser Arg Thr Asn | Ala | Asp | Ser | Lys | Asp | Lys | Ile | Asp |
| 1300 | 1305 | 1310 | |||||||||
| Ile Thr | Gly | Thr | Val Thr Leu Leu | Asp | Pro | Asn | Gly | Asn | Leu | Tyr | Gin |
| 1315 | 1320 | 1325 | |||||||||
| Asn Ser | Tyr | Leu | Gly Glu Asp Arg | Asp | Ile | Thr | Leu | Phe | Asn | Ile | Asp |
| 1330 | 1335 | 1340 | |||||||||
| Asn Ser | Ala | Ser | Gly Ala Val Thr | Ala | Thr | Asn | Val | Thr | Leu | Gin | Gly |
| 1345 | 1350 | 1355 | 1360 | ||||||||
| Asn Leu | Gly | Ala | Lys Lys Gly Tyr | Leu | Gly | Thr | Trp | Asn | Leu | Asp | Pro |
| 1365 | 1370 | 1375 | |||||||||
| Asn Ser | Ser | Gly | Ser Lys Ile Ile | Leu | Lys | Trp | Thr | Phe | Asp | Lys | Tyr |
| 1380 | 1385 | 1390 | |||||||||
| Leu Arg | Trp | Pro | Tyr Ile Pro Arg | Asp | Asn | His | Phe | Tyr | Ile | Asn | Ser |
| 1395 | 1400 | 1405 | |||||||||
| Ile Trp | Gly | Ala | Gin Asn Ser Leu | Val | Thr | Val | Lys | Gin | Gly | He | Leu |
| 1410 | 1415 | 1420 | |||||||||
| Gly Asn | Met | Leu | Asn Asn Ala Arg | Phe | Glu | Asp | Pro | Ala | Phe | Asn | Asn |
| 1425 | 14 30 | 1435 | 1440 | ||||||||
| Phe Trp | Ala | Ser | Ala Ile Gly Ser | Phe | Leu | Arg | Lys | Glu | Val | Ser | Arg |
| 1445 | 1450 | 1455 | |||||||||
| Asn Ser | Asp | Ser | Phe Thr Tyr His | Gly | Arg | Gly | Tyr | Thr | Ala | Ala | Val |
| 1460 | 1465 | 1470 | |||||||||
| Asp Ala | Lys | Pro | Arg Gin Glu Phe | Ile | Leu | Gly | Ala | Ala | Phe | Ser | Gin |
| 1475 | 1480 | 1485 | |||||||||
| Val Phe | Gly | His | Ala Glu Ser Glu | Tyr | His | Leu | Asp | Asn | Tyr | Lys | His |
| 1490 | 1495 | 1500 | |||||||||
| Lys Gly | Ser | Gly | His Ser Thr Gin | Ala | Ser | Leu | Tyr | Ala | Gly | Asn | Ile |
| 1505 | 1510 | 1515 | 1520 | ||||||||
| Phe Tyr | Phe | Pro | Ala Ile Arg Ser | Arg | Pro | Ile | Leu | Phe | Gin | Gly | Val |
| 1525 | 1530 | 1535 | |||||||||
| Ala Thr | Tyr | Gly | Tyr Met Gin His | Asp | Thr | Thr | Thr | Tyr | Tyr | Pro | Ser |
| 1540 | 1545 | 1550 | |||||||||
| Ile Glu | Glu | Lys | Asn Met Ala Asn | Trp | Asp | Ser | Ile | Ala | Trp | Leu | Phe |
| 1555 | 1560 | 1565 | |||||||||
| Asp Leu | Arg | Phe | Ser Val Asp Leu | Lys | Glu | Pro | Gin | Pro | His | Ser | Thr |
| 1570 | 1575 | 1580 | |||||||||
| Ala Arg | Leu | Thr | Phe Tyr Thr Glu | Ala | Glu | Tyr | Thr | Arg | Ile | Arg | Gin |
| 1585 | 1590 | 1595 | 1600 | ||||||||
| Glu Lys | Phe | Thr | Glu Leu Asp Tyr | Asp | Pro | Arg | Ser | Phe | Ser | Ala | Cys |
| 1605 | 1610 | 1615 | |||||||||
| Ser Tyr | Gly | Asn | Leu Ala Ile Pro | Thr | Gly | Phe | Ser | Val | Asp | Gly | Ala |
| 1620 | 1625 | 1630 | |||||||||
| Leu Ala | Trp | Arg | Glu Ile Ile Leu | Tyr | Asn | Lys | Val | Ser | Ala | Ala | Tyr |
| 1635 | 1640 | 1645 | |||||||||
| Leu Pro | Val | Ile | Leu Arg Asn Asn | Pro | Lys | Ala | Thr | Tyr | Glu | Val | Leu |
| 1650 | 1655 | 1660 | |||||||||
| Ser Thr | Lys | Glu | Lys Gly Asn Val | Val | Asn | Val | Leu | Pro | Thr | Arg | Asn |
| 1665 | 1670 | 1675 | 1680 | ||||||||
| Ala Ala | Arg | Ala | Glu Val Ser Ser | Gin | Ile | Tyr | Leu | Gly | Ser | Tyr | Trp |
| 1685 | 1690 | 1695 | |||||||||
| Thr Leu | Tyr | Gly | Thr Tyr Thr Ile | Asp | Ala | Ser | Met | Asn | Thr | Leu | Val |
| 1700 | 1705 | 1710 | |||||||||
| Gin Met | Ala | Asn | Gly Gly Ile Arg | Phe | Val | Phe | |||||
| 1715 | 1720 |
<210> 396 • · · · ··· ··· ·· ·
359 <211> 1252 <212> PRT
| <213> Chlamydia <400> 396 | pneumoniae | ||||||||||||||
| Met | Leu | Lys | Cys | Pro 5 | Glu | Arg | Val | Ser | Val 10 | Lys | Lys | Lys | Glu | Asp 15 | Ile |
| Pro | Asp | Leu | Pro 20 | Asn | Leu | Ile | Glu | Ile 25 | Gin | Ile | Lys | Ser | Tyr 30 | Lys | Gin |
| Phe | Leu | Gin 35 | Ile | Gly | Lys | Leu | Ala 40 | Glu | Glu | Arg | Glu | Ásn 45 | Ile | Gly | Leu |
| Glu | Glu 50 | Val | Phe | Arg | Glu | Ile 55 | Phe | Pro | Ile | Lys | Ser 60 | Tyr | Asn | Glu | Ala |
| Thr 65 | Val | Leu | Glu | Tyr | Leu 70 | Ser | Tyr | Asn | Leu | Gly '75 | Val | Pro | Lys | Tyr | Ser θ° |
| '.Pro | Glu | Glu | Cys | Ile 85 | Arg | Arg | Gly | Ile | Thr 90 | Tyr | Ser | Val | Thr | Leu 95 | Lys |
| Val | Arg | Phe | Arg 100 | Leu | Thr | Asp | Glu | Thr 105 | Gly | Ile | Lys | Glu | Glu 110 | Glu | Val |
| Tyr | Met | Gly 115 | Thr | Ile | Pro | Leu | Met 120 | Thr | Asp | Lys | Gly | Thr 125 | Phe | Ile | Ile |
| Asn | Gly 130 | Ala | Glu | Arg | Val | Val 135 | Val | Ser | Gin | Val | His 140 | Arg | Ser | Pro | Gly |
| Ile 145 | Asn | Phe | Glu | Gin | Glu 150 | Lys | His | Ser | Lys | Gly 155 | Asn | Ile | Leu | Phe | Ser 160 |
| Phe | Arg | Ile | Ile | Pro 165 | Tyr | Arg | Gly | Ser | Trp 170 | Leu | Glu | Ala | Ile | Phe 175 | Asp |
| Ile | Asn | Asp | Leu 180 | Ile | Tyr | Ile | His | Ile 185 | Asp | Arg | Lys | Lys | Arg 190 | Arg | Arg |
| Lys | Ile | Leu. 195 | Ala | Ile | Thr | Phe | Ile 200 | Arg | Ala | Leu | Gly | Tyr 205 | Ser | Ser | Asp |
| Ala | Asp 210 | Ile | Ile | Glu | Glu | Phe 215 | Phe | Thr | Ile | Gly | Glu 220 | Ser | Ser | Leu | Arg |
| Ser 225 | Glu | Lys | Asp | Phe | Ala 230 | Leu | Leu | Val | Gly Arg 235 | Ile | Leu | Ala | Asp | Asn 240 | |
| Ile | Ile | Asp | Glu | Ala 245 | Ser | Ser | Leu | Val | Tyr 250 | Gly | Lys | Ala | Gly | Glu 255 | Lys |
| Leu | Ser | Thr | Ala 260 | Met | Leu | Lys | Arg | Met 265 | Leu | Asp | Ala | Gly | Ile 270 | Ala | Ser |
| Val | Lys | Ile 275 | Ala | Val | Asp | Ala | Asp 280 | Glu | Asn | His | Pro | Ile 285 | Ile | Lys | Met |
| Leu | Ala 290 | Lys | Asp | Pro | Thr | Asp 295 | Ser | Tyr | Glu | Ala | Ala 300 | Leu | Lys | Asp | Phe |
360
| Tyr 305 | Arg Arg | Leu | Arg | Pro 310 | Gly Glu | Pro | Ala Thr 315 | Leu | Ala | Asn | Ala | Arg 320 | |||
| Ser | Thr | Ile | Met | Arg | Leu | Phe | Phe | Asp | Pro | Lys | Arg | Tyr | Asn | Leu | Gly |
| 325 | 330 | 335 | |||||||||||||
| Arg | Val | Gly | Arg | Tyr | Lys | Leu | Asn | Arg | Lys | Leu | Gly | Phe | Ser | Ile | Asp |
| 340 | 345 | 350 | |||||||||||||
| Asp | Glu | Ala | Leu | Ser | Gin | Val | Thr | Leu | Arg | Lys | Glu | Asp | Val | Ile | Gly |
| 355 | 360 | 365 | |||||||||||||
| Ala | Leu | Lys | Tyr | Leu | Ile | Arg | Leu | Lys | Met | Gly | Asp | Glu | Lys | Ala | Cys |
| 370 | 375 | 380 | |||||||||||||
| Val | Asp | Asp | Ile | Asp | His | Leu | Ala | Asn | Arg | Arg | Val | Arg | Ser | Val | Gly |
| 385 | 390 | 395 | 4 00 | ||||||||||||
| Glu | Leu | Ile | Gin | Asn | Gin | Cys | Arg | Ser | Gly | Leu | Ala | Arg | Met | Glu | Lys |
| 405 | 410 | 415 | |||||||||||||
| Ile | Val | Arg | Glu | Arg | Met | Asn | Leu | Phe | Asp | Phe | Ser | Ser | Asp | Thr | Leu |
| 420 | 425 | 430 | |||||||||||||
| Thr | Pro | Gly | Lys | Val | Val | Ser | Ala | Lys | Gly | Leu | Ala | Ser | Val | Leu | Lys |
| 435 | 440 | 445 | |||||||||||||
| Asp | Phe | Phe | Gly Arg | Ser | Gin | Leu | Ser | Gin | Phe | Met | Asp | Gin | Thr | Asn | |
| 450 | 455 | 4 60 | |||||||||||||
| Pro | Val | Ala | Glu | Leu | Thr | His | Lys | Arg | Arg | Leu | Ser | Ala | Leu | Gly | Pro |
| 465 | 470 | 475 | 480 | ||||||||||||
| Gly | Gly | Leu | Asn | Arg | Glu | Arg | Ala | Gly | Phe | Glu | Val | Arg | Asp | Val | His |
| 485 | 490 | 495 | |||||||||||||
| Ala | Ser | His | Tyr | Gly | Arg | Ile | Cys | Pro | Ile | Glu | Thr | Pro | Glu | Gly | Pro |
| 500 | 505 | 510 | |||||||||||||
| Asn | Ile | Gly | Leu | Ile | Thr | Ser | Leu | Ser | Ser | Phe | Ala | Lys | Ile | Asn | Glu |
| 515 | 520 | 525 | |||||||||||||
| Phe | Gly | Phe | Ile | Glu | Thr | Pro | Tyr | Arg | Ile | Val | Arg | Asp | Gly | Ile | Val |
| 530 | 535 | 540 | |||||||||||||
| Thr | Asp | Glu | Ile | Glu | Tyr | Met | Thr | Ala | Asp | Val | Glu | Glu | Glu | Cys | Val |
| 545 | 550 | 555 | 560 | ||||||||||||
| Ile | Ala | Gin | Ala | Ser | Ala | Ser | Leu | Asp | Glu | Tyr | Asn | Met | Phe | Thr | Glu |
| 565 | 570 | 575 | |||||||||||||
| Pro | Val | Cys | Trp | Val | Arg | Tyr | Ala | Gly | Glu | Ala | Phe | Glu | Ala | Asp | Thr |
| 580 | 585 | 590 | |||||||||||||
| Ser | Thr | Val | Thr | His | Met | Asp | Val | Ser | Pro | Lys | Gin | Leu | Val | Ser | Ile |
| 595 | 600 | 605 | |||||||||||||
| Val | Thr | Gly | Leu | Ile | Pro | Phe | Leu | Glu | His | Asp | Asp | Ala | Asn | Arg | Ala |
610 615 620 • · · · • ···
361
| Leu 625 | Met | Gly | Ser | Asn | Met 630 | Gin | Arg | Gin | Ala | Val 635 | Pro | Leu | Leu | Lys | Thr 640 |
| Glu | Ala | Pro | Val | Val 645 | Gly | Thr | Gly | Leu | Glu 650 | Cys | Arg | Ala | Ala | Lys 655 | Asp |
| Ser | Gly | Ala | Ile 660 | Val | Val | Ala | Glu | Glu 665 | Asp | Gly | Val | Val | Asp 670 | Phe | Val |
| Asp | Gly | Tyr 675 | Lys | Val | Val | Val | Ala 680 | Ala | Lys | His | Asn | Pro 685 | Thr | Ile | Lys |
| Arg | Thr 690 | Tyr | His | Leu | Lys | Lys 695 | Phe | Leu | Arg | Ser | Asn 700 | Ser | Gly | Thr | Cys |
| Ile 705 | Asn | Gin | Gin | Pro | Leu 710 | Cys | Ala | Val | Gly | Asp 715 | Val | Ile | Thr | Lys | Gly 720 |
| Asp | Val | Ile | -Ala | Asp 725 | Gly | Pro | Ala | Thr | Asp 730 | Arg | Gly | Glu | Leu | Ala 735 | Leu |
| Gly | Lys | Asn | Val 740 | Leu | Val | Ala | Phe | Met 745 | Pro | Trp | Tyr | Gly | Tyr 750 | Asn | Phe |
| Glu | Asp | Ala 755 | Ile | Ile | Ile | Ser | Glu 760 | Lys | Leu | Ile | Arg | Glu 765 | Asp | Ala | Tyr |
| Thr | Ser 770 | Ile | Tyr | Ile | Glu | Glu 775 | Phe | Glu | Leu | Thr | Ala 7 80 | Arg | Asp | Thr | Lys |
| Leu 785 | Gly | Lys | Glu | Glu | Ile 790 | Thr | Arg | Asp | Ile | Pro 7 95 | Asn | Val | Ser | Asp | Glu 800 |
| Val | Leu | Ala | Asn | Leu 805 | Gly | Glu | Asp | Gly | Ile 810 | Ile | Arg | Ile | Gly | Ala 815 | Glu |
| Val | Lys | Pro | Gly Asp 820 | Ile | Leu | Val | Gly 825 | Lys | Ile | Thr | Pro | Lys 830 | Ser | Glu | |
| Thr | Glu | Leu 835 | Ala | Pro | Glu | Glu | Arg 840 | Leu | Leu | Arg | Ala | Ile 845 | Phe | Gly | Glu |
| Lys | Tkla 850 | Ala | Asp | Val | Lys | Asp 855 | Ala | Ser | Leu | Thr | Val 8 60 | Pro | Pro | Gly | Thr |
| Glu 865 | Gly | Val | Val | Met | Asp 870 | Val | Lys | Val | Phe | Ser 875 | Arg | Lys | Asp | Arg | Leu 880 |
| Ser | Lys | Ser | Asp | Asp 885 | Glu | Leu | Val | Glu | Glu 890 | Ala | Val | His | Leu | Lys 895 | Asp |
| Leu | Gin | Lys | Gly 900 | Tyr | Lys | Asn | Gin | Val 905 | Ala | Thr | Leu- | Lys | Thr 910 | Glu | Tyr |
| Arg | Glu | Lys 915 | Leu | Gly | Ala | Leu | Leu 920 | Leu | Asn | Glu | Lys | Ala 925 | Pro | Ala | Ala |
| Ile | Ile 930 | His | Arg | Arg | Thr | Ala 935 | Glu | Ile | Val | Val | His 940 | Glu | Gly | Leu | Leu |
| Phe | Asp | Gin | Glu | Thr | Ile | Glu | Arg | Ile | Glu | Gin | Glu | Asp | Leu | Val | Asp |
362
| 945 | 950 | 955 | 960 |
| Leu Leu Met | Pro Asn Cys Glu Met Tyr 965 | Glu Val 970 | Leu Lys Gly Leu Leu 975 |
| Ser Asp Tyr | Glu Thr Ala Leu Gin Arg 980 985 | Leu Glu | Ile Asn Tyr Lys Thr 990 |
| Glu Val Glu 995 | His Ile Arg Glu Gly Asp 1000 | Ala Asp | Leu Asp His Gly Val 1005 |
| Ile Arg Gin 1010 | Val Lys Val Tyr Val Ala 1015 | Ser Lys | Arg Lys Leu Gin Val 1020 |
| Gly Asp Lys 1025 | Met Ala Gly Arg His Gly 1030 | Asn Lys Gly Val Val Ser Lys 1035 1040 | |
| Ile Val Pro | Glu Ala Asp Met Pro Tyr 1045 | Leu Ser 1050 | Asn Gly Glu Thr Val 1055 |
| Gin Met Ile | Leu Asn Pro Leu Gly Val Pro Ser 1060 1065 | Arg Met Asn Leu Gly 1070 | |
| Gin Val Leu Glu Thr His Leu Gly Tyr 1075 1080 | Ala Ala | Lys Thr Ala Gly Ile 1085 | |
| Tyr Val Lys 1090 | Thr Pro Val Phe Glu Gly 1095 | Phe Pro | Glu Gin Arg Ile Trp 1100 |
| Asp Met Met 1105 | Ile Glu Gin Gly Leu Pro 1110 | Glu Asp Gly Lys Ser Phe Leu 1115 1120 | |
| Tyr Asp Gly | Lys Thr Gly Glu Arg Phe 1125 | Asp Asn 1130 | Lys Val Val Ile Gly 1135 |
| Tyr Ile Tyr | Met Leu Lys Leu Ser His Leu Ile 1140 1145 | Ala Asp Lys Ile His 1150 | |
| Ala Arg Ser Ile Gly Pro Tyr Ser Leu 1155 1160 | Val Thr | Gin Gin Pro Leu Gly 1165 | |
| Gly Lys Ala 1170 | Gin Met Gly Gly Gin Arg 1175 | Phe Gly | Glu Met Glu Val Trp 1180 |
| Ala Leu Glu 1185 | Ala Tyr Gly Val Ala His 1190 | Met Leu Gin Glu Ile Leu Thr 1195 1200 | |
| Val Lys Ser | Asp Asp Val Ser Gly Arg 1205 | Thr Arg 1210 | Ile Tyr Glu Ser Ile 1215 |
| Val Lys Gly | Glu Asn Leu Leu Arg Ser Gly Thr 1220 1225 | Pro Glu Ser Phe Asn 1230 | |
| Val Leu Ile Lys Glu Met Gin Gly Leu 1235 1240 Val Val Asp Ala 1250 | Gly Leu | Asp Val Arg Pro Met 1245 |
<210> 397 • ··· • ···
363 <211> 224 <212> PRT <213> Chlamydia pneumoniae <400> 397
| Met | Thr | Ser | Trp | Ile 5 | Glu | Leu Leu Asp Lys 10 | Gin Ile Glu Asp Gin 15 | His |
| Met | Leu | Lys | His ' 20 | Glu | Phe | Tyr Gin Arg Trp 25 | Ser Glu Gly Lys Leu 30 | Glu |
| Lys | Gin | Gin 35 | Leu | Gin | Ala | Tyr Ala Lys Asp 40 | Tyr Tyr Leu His Ile 45 | Lys |
| Ala | Phe 50 | Pro | Cys | Tyr | Leu | Ser Ala Leu His 55 | Ala Arg Cys Asp Asp 60 | Leu |
| Gin 65 | Ile | Arg | Arg | Gin | Ile 70 | Leu Glu Asn Leu | Met Asp Glu Glu Ala | Gly 80 |
| Asn | Pro | Asn | His | Ile 85 | Asp | Leu Trp Arg Gin ' 90 | Phe Ala Leu Ser Leu 95 | Gly |
| Val | Ser | Glu | Glu 100 | Glu | Leu | Ala Asn His Glu 105 | Phe Ser Gin Ala Ala 110 | Gin |
| Asp | Met | Val 115 | Ala | Thr | Phe | Arg Arg Leu Cys 120 | Asp Met Pro Gin Leu 125 | Ala |
| Val | Gly 130 | Leu | Gly | Ala | Leu | Tyr Thr Tyr Glu 135 | Ile Gin Ile Pro Gin 140 | Val |
| Cys 145 | Val | Glu | Lys | Ile | Arg 150 | Gly Leu Lys Glu | Tyr Phe Gly Val Ser 155 | Ala 160 |
| Arg | Gly | Tyr | Ala | Tyr 165 | Phe | Thr Val His Gin ,170 | Glu Ala Asp Ile Lys 175 | His |
| Ala | Ser | Glu | Glu 180 | Lys | Glu | Met Leu Gin Thr 185 | Leu Val Gly Arg Glu 190 | Asn |
| Pro | Asp | Ala 195 | Val | Leu | Gin | ΓΊττ / Ί . Γ'ΐ \j_Ly Ocr \jj.ji oj.u 200 | Val Leu Asp Thr Leu 205 | Trp |
| Asn | Phe | Leu | Ser | Ser | Phe | Ile Asn Ser Thr | Glu Pro Cys Ser Cys | Lys |
210 215 220 <210> 398 <211> 556 <212> PRT
| <213> Chlamydia | pneumoniae | |||||||||||
| <400> 398 Met Ser Lys | Leu | Ile 5 | Arg Arg | Val | Val | Thr 10 | Val Leu | Ala | Leu | Thr 15 | Ser | |
| Met | Ala Ser | Cys 20 | Phe | Ala Ser | Gly | Gly 25 | Ile | Glu Ala | Ala | Val 30 | Ala | Glu |
| Ser | Leu Ile | Thr | Lys | Ile Val | Ala | Ser | Ala | Glu· Thr | Lys | Pro | Ala | Pro |
364
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Val | Pro 50 | Met | Thr | Ala | Lys | Lys 55 | Val | Arg | Leu | Val | Arg 60 | Arg | Asn | Lys | Gin |
| Pro 65 | Val | Glu | Gin | Lys | Ser 70 | Arg | Gly | Ala | Phe | Cys 75 | Asp | Lys | Glu | Phe | Tyr 80 |
| Pro | Cys | Glu | Glu | Gly 85 | Arg | Cys | Gin | Pro | Val 90 | Glu | Ala | Gin | Gin | Glu 95 | Ser |
| Cys | Tyr | Gly | Arg 100 | Leu | Tyr | Ser | Val | Lys 105 | Val | Asn | Asp | Asp | Cys 110 | Asn | Val |
| Glu | Ile | Cys 115 | Gin | Ser | Val | Pro | Glu 120 | Tyr | Ala | Thr | Val | Gly 125 | Ser | Pro | Tyr |
| Pro | Ile 130 | Glu | Ile | Leu | Ala | Ile 135 | Gly | Lys | Lys | Asp | Cys 140 | Val | Asp | Val | Val |
| Ile 145 | Thr | Gin | Gin | Leu | Pro 150 | Cys | Glu | Ala | Glu | Phe 155 | Val, | Ser | Ser | Asp | Pro 160 |
| Glu | Thr | Thr | Pro | Thr 165 | Ser | Asp | Gly | Lys | Leu 170 | Val | Trp | Lys | Ile | Asp 175 | Arg |
| Leu | Gly | Ala | Gly 180 | Asp | Lys | Cys | Lys | Ile 185 | Thr | Val | Trp | Val | Lys 190 | Pro | Leu |
| Lys | Glu | Gly 195 | Cys | Cys | Phe | Thr | Ala 200 | Ala | Thr | Val | Cys | Ala 205 | Cys | Pro | Glu |
| Leu | Arg 210 | Ser | Tyr | Thr | Lys | Cys 215 | Gly | Gin | Pro | Ala | Ile 220 | Cys | Ile | Lys | Gin |
| Glu 225 | Gly | Pro | Asp | Cys | Ala 230 | Cys | Leu | Arg | Cys | Pro 235 | Val | Cys | Tyr | Lys | Ile 240 |
| Glu | Val | Val | Asn | Thr 245 | Gly | Ser | Ala | Ile | Tkla Arg 250 | Asn | Val | Thr | Val 255 | Asp | |
| Asn | Pro | Val | Pro 260 | Asp | Gly | Φ<ΓΤ □. | Ser | His 265 | 7\ 1 - | Ssr | Gly | OJ-li | Arg 270 | v a_L | Leu |
| Ser | Phe | Asn 275 | Leu | Gly | Asp | Met | Arg 280 | Pro | Gly Asp | Lys | Lys 285 | Val | Phe | Thr | |
| Val | Glu 290 | Phe | Cys | Pro | Gin | Arg 295 | Arg | Gly | Gin | Ile | Thr 300 | Asn | Val | Ala | Thr |
| Val 305 | Thr | Tyr | Cys | Gly | Gly 310 | His | Lys | Cys | Ser | Ala 315 | Asn | Val | Thr | Thr | Val 320 |
| Val | Asn | Glu | Pro | Cys 325 | Val | Gin | Val | Asn | Ile 330 | Ser | Gly | Ala | Asp | Trp • 335 | Ser |
| Tyr | Val | Cys | Lys 340 | Pro | Val | Glu | Tyr | Ser 345 | Ile | Ser | Val | Ser | Asn 350 | Pro | Gly |
| Asp | Leu | Val 355 | Leu | His | Asp | Val | Val 360 | Ile | Gin | Asp | Thr | Leu 365 | Pro | Ser | Gly |
·· φφφ· • ·· • φφφ • φφφ
365
| Val | Thr | Val | Leu | Glu | Ala | Pro | Gly | Gly | Glu | Ile | Cys | Cys | Asn | Lys | Val |
| 370 | 375 | 380 | |||||||||||||
| Val | Trp | Arg | Ile | Lys | Glu | Met | Cys | Pro | Gly | Glu | Thr | Leu | Gin | Phe | Lys |
| 385 | 390 | 395 | 400 | ||||||||||||
| Leu | Val | Val | Lys | Ala | Gin | Val | Pro | Gly | Arg | Phe | Thr | Asn | Gin | Val | Ala |
| 4 05 | 410 | 415. | |||||||||||||
| Val | Thr | Ser | Glu | Ser | Asn | Cys | Gly | Thr | Cys | Thr | Ser | Cys | Ala | Glu | Thr |
| 420 | 425 | 430 | |||||||||||||
| Thr | Thr | His | Trp | Lys | Gly | Leu | Ala | Ala | Thr | His | Met | Cys | Val | Leu | Asp |
| 435 | 4 40 | 445 | |||||||||||||
| Thr | Asn | Asp | Pro | Ile | Cys | Val | Gly | Glu | Asn | Thr | Val | Tyr | Arg | Ile | Cys |
| 450 | 455 | 4 60 | |||||||||||||
| ..Val | Thr | Asn | Arg | Gly | Ser | Ala | Glu | Asp | Thr | Asn | Val | Ser | Leu | Ile | Leu |
| 4 65 | 470 | 475 | 480 | ||||||||||||
| Lys | Phe | Ser | Lys | Glu | Leu | Gin | Pro | Ile | Ala | Ser | Ser | Gly | Pro | Thr | Lys |
| 485 | 490 | 495 | |||||||||||||
| Gly | Thr | Ile | Ser | Gly | Asn | Thr | Val | Val | Phe | Asp | Ala | Leu | Pro | Lys | Leu |
| 500 | 505 | 510 | |||||||||||||
| /-Gly | Ser | Lys | Glu | Ser | Val | Glu | Phe | Ser | Val | Thr | Leu | Lys | Gly | Ile | Ala |
| 515 | 520 | 525 | |||||||||||||
| Pro | Gly | Asp | Ala | Arg | Gly | Glu | Ala | Ile | Leu | Ser | Ser | Asp | Thr | Leu | Thr |
| 530 | 535 | 540 | |||||||||||||
| Ser | Pro | Val | Ser | Asp | Thr | Glu | Asn | Thr | His | Val | Tyr | ||||
| 545 | 550 | 555 |
<210> 399 <211> 461 <212> PRT <213> Chlamydia pneumoniae <400> 399
| Met | Thr | Gin | Glu | Phe | Asp | Cys | Val | Val | Ile | Gly | Ala | Gly | Pro | Ser | Gly |
| 5 | 10 | 15 | |||||||||||||
| Tyr | Val | Ala | Ala | Ile | Thr | Ala | Ala | Gin | Ser | Lys | Leu | Arg | Thr | Ala | Leu |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Ile | Glu | Glu | Asp | Gin | Ala | Gly | Gly | Thr | Cys | Leu | Asn | Arg | Gly | Cys | Ile |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Pro | Ser | Lys | Ala | Leu | Ile | Ala | Gly | Ala | Asn | Val | Val | Ser | His | Ile | Lys |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| His | Ala | Glu | Gin | Phe | Gly | Ile | His | Val | Asp | Gly | Tyr | Thr | Ile | Asp. | Tyr |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Pro | Ala | Me.t | Ala | Lys | Arg | Lys | Asn | Thr | Val | Val | Gin | Gly | Ile | Arg | Gin |
·· ···· ·· ··· · . * · • ··· · · ··· ·· · · ···' ·· · · · * · · · ·· · · · · ·
366
| Gly Leu Glu Gly | Leu | Ile Arg | Ser Asn 105 | Lys | Ile | Thr | Val | Leu 110 | Lys | Gly | |||||
| 100 | |||||||||||||||
| Thr | Gly | Ser | Leu | Val | Ser | Ser | Thr | Glu | Val | Lys | Val | Ile | Gly | Gin | Asp |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Thr | Thr | Ile | Ile | Lys | Ala | Asn | His | Ile | Ile | Leu | Ala | Thr | Gly | Ser | Glu |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Pro | Arg | Pro | Phe | Pro | Gly | Val | Pro | Phe | Ser | Ser | Arg | Ile | Leu | Ser | Ser |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Thr | Gly | Ile | Leu | Glu | Leu | Glu | Val | Leu | Pro | Lys | Lys | Leu | Ala | Ile | Ile |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Gly | Gly | Gly | Val | He | Gly | Cys | Glu | Phe | Ala | Ser | Leu | Phe | His | Thr | Leu |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Gly | Val | Glu | Ile | Thr | Val | Ile | Glu | Ala | Leu | Asp | His | Ile | Leu | Ala | Val |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Asn | Asn | Lys | Glu | Val | Ser | Gin | Thr | Val | Thr | Asn | Lys | Phe | Thr | . Lys | Gin |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Gly | Ile | Arg | Ile | Leu | Thr | Lys | Ala | Ser | Ile | Ser | Ala | Ile | Glu | Glu | Ser |
| 225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
| ‘Gin | Asn | Gin | Val | Arg | He | Thr | Val | Asn | Asp | Gin | Val | Glu | Glu | Phe | Asp |
| 245 | 250 | 255 | |||||||||||||
| Tyr | Val | Leu | Val | Ala | Ile | Gly | Arg | Gin | Phe | Asn | Thr | Ala | Ser | Ile | Gly |
| 260 | 265 | 270 | |||||||||||||
| Leu | Asp | Asn | Ala | Gly | Val | Ile | Arg | Asp | Asp | Arg | Gly | Val | Ile | Pro | Val |
| 275 | 280 | 285 | |||||||||||||
| Asp | Glu | Thr | Met | Arg | Thr | Asn | Val | Pro | Asn | Ile | Tyr | Ala | Ile | Gly | Asp |
| 290 | 295 | 300 | |||||||||||||
| Ile | Thr | Gly | Lys | Trp | Leu | Leu | Ala | His | Val | Ala | Ser | His | Gin | Gly | Val |
| 305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
| Ile | Ala | Ala | Lys | Asn | Ile | Ser | Gly | His | His | Glu | Val | Met | Asp | Tyr | Ser |
| 325 | 330 | 335 | |||||||||||||
| Ala | Ile | Pro | Ser | Val | Ile | Phe | Thr | His | Pro | Glu | Ile | Ala | Met | Val | Gly |
| 340 | 345 | 350 | |||||||||||||
| Leu | Ser | Leu | Gin | Glu | Ala | Glu | Gin | Gin | Asn | Leu | Pro | Ala | Lys | Leu | Thr |
| 355 | 360 | 365 | |||||||||||||
| Lys | Phe | Pro | Phe | Lys | Ala | Ile | Gly | Lys | Ala | Val | Ala | Leu | Gly | Ala | Ser |
| 370 | 375 | 380 | |||||||||||||
| Asp | Gly | Phe | Ala | Ala | Ile | Val | Ser | His | Glu | Ile | Thr | Gin | Gin | Ile | Leu |
| 385 | 390 | 395 | 400 | ||||||||||||
| Gly | Ala | Tyr | Val | Ile | Gly | Pro | His | Ala | Ser | Ser | Leu | Ile | Gly | Glu | Met |
405 410 415
·· ··»· '·« 9 9 ·· ···· • · »99 9 · · • 999 9 · ··· 9 · 9 • · · · · ··· · · • 9 9 · 9 · 9 9 9
367
| Thr | Leu | Ala | Ile 420 | Arg | Asn | Glu | Leu | Thr 425 | Leu | Pro | Cys | Ile | Tyr .430 | Glu | Thr |
| Val | His | Ala | His | Pro | Thr | Leu | Ser | Glu | Val | Trp | Ala | Glu | Gly | Ala | Leu |
| 435 | 440 | 445 | |||||||||||||
| Leu | Ala | Thr | Asn | His | Pro | Leu | His | Phe | Pro | Pro | Lys | Ser |
450 455 460 <210> 400 <211> 544 <212> PRT
| <213> Chlamydia pneumoniae | |||||||||||||||
| <400> 400 | |||||||||||||||
| Met | Ala | Ala | Lys | Asn | Ile | Lys | Tyr | Asn | Glu | Glu | Ala | Arg | Lys | Lys | Ile |
| 5 | 10 | 15 | |||||||||||||
| His | Lys | Gly | Val | Lys | Thr | Leu | Ala | Glu | Ala | Val | Lys | Val | Thr | Leu | Gly |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Pro | Lys | Gly | Arg | His | Val | Val | Ile | Asp | Lys | Ser | Phe | Gly | Ser | Pro | Gin |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Val | Thr | Lys | Asp | Gly | Val | Thr | Val | Ala | Lys | Glu | Ile | Glu | Leu | Glu | Asp |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Lys | His | Glu | Asn | Met | Gly | Ala | Gin | Met | Val | Lys | Glu | Val | Ala | Ser | Lys |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Thr | Ala | Asp | Lys | Ala | Gly | Asp | Gly | Thr | Thr | Thr | Ala | Thr | Val | Leu | Ala |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Glu | Ala | Ile | Tyr | Ser | Glu | Gly | Leu | Arg | Asn | Val | Thr | Ala | Gly | Ala | Ásn |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Pro | Met | Asp | Leu | Lys | Arg | Gly | Ile | Asp | Lys | Ala | Val | Lys | Val | Val | Val |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Asp | Glu | Leu | Lys | Lys | Ile | Ser | Lys | Pro | Val | Gin | His | His | Lys | Glu | Ile |
| Ί ΊΠ | 1 O c | 140 | |||||||||||||
| Ala | Gin | Val | Ala | Thr | Ile | Ser | Ala | Asn | Asn | Asp | Ser | Glu | Ile | Gly | Asn |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Leu | Ile | Ala | Glu | Ala | Met | Glu | Lys | Val | Gly | Lys | Asn | Gly | Ser | Ile | Thr |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Val | Glu | Glu | Ala | Lys | Gly | Phe· | Glu | Thr | Val | Leu | Asp | Val | Val | Glu | Gly |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Met | Asn | Phe | Asn | Arg | Gly | Tyr | Leu | Ser | Ser | Tyr | Phe | Ser | Thr | Asn | Pro |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Glu | Thr | Gin | Glu | Cys | Val | Leu | Glu | Asp | Ala | Leu | Ile | Leu | . Ile | Tyr | Asp |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Lys | Lys | Ile | Ser | Gly | Ile | Lys | Asp | Phe | Leu | Pro | Val | Leu | Gin | Gin | Val |
| 225 | 230 | 235 | 240 |
♦ · 4 «44 • 4 4444 ·» ·9 «44 44« · * ·
44 · 4 444 · · * ‘ « · 4 4’ 44 4 4 4. 4 4 • 4 4444 4444
4444 4«4 44 44 44 44
368
| Ala | Glu | Ser | Gly | Arg 245 | Pro | Leu | Leu | Ue | Ue 250 | Ala | Glu | Glu | Ue | Glu 255 | Gly |
| Glu | Ala | Leu | Ala 260 | Thr | Leu | Val | Val | Asn 265 | Arg | Leu | Arg | Ala | Gly 270 | Phe | Arg |
| Val | Cys | Ala 275 | Val | Lys | Ala | Pro | Gly 280 | Phe | Gly | Asp | Arg | Arg 285 | Lys | Ala | Met |
| Leu | Glu 290 | Asp | Ile | Ala | Ue | Leu 295 | Thr | Gly | Gly | Gin | Leu 300 | Val | Ser | Glu | Glu |
| Leu 305 | Gly | Met | Lys | Leu | Glu 310 | Asn | Thr | Thr | Leu | Ala 315 | Met | Leu | Gly | Lys | Ala 320 |
| Lys | Lys | Val | Ile | Val 325 | Thr | Lys | Glu | Asp | Thr 330 | Thr | Ile. | Val | Glu | Gly 335 | Leu |
| Gly | Asn | Lys | Pro 340 | Asp | Ue | Gin | Ala | Arg 345 | Cys | Asp | Asn | Ile | Lys 350 | Lys | Gin |
| .Ue | Glu | Asp 355 | Ser | Thr | Ser | Asp | Tyr 360 | Asp | Lys | Glu | Lys | Leu 365 | Gin | Glu | Arg |
| Leu | Ala 370 | Lys | Leu | Ser | Gly | Gly 375 | Val | Ala | Val | Ue | Arg 380 | Val | Gly | Ala | Ala |
| Thr 385 | Glu | Ile | Glu | Met | Lys 390 | Glu | Lys | Lys | Asp | Arg 395 | Val | Asp | Asp | Ala | Gin 400 |
| His | Ala | Thr | Ue | Ala 405 | Ala | Val | Glu | Glu | Gly 410 | Ile | Leu | Pro | Gly | Gly 415 | Gly |
| Thr | Ala | Leu | Val 420 | Arg | Cys | Ile | Pro | Thr 425 | Leu | Glu | Ala | Phe | Leu 430 | Pro | Met |
| Leu | Ala | Asn 435 | Glu | Asp | Glu | Ala | Ue 440 | Gly | Thr | Arg | Ue | Ile 445 | Leu | Lys | Ala |
| Leu | Thr 450 | Ala | Pro | Leu | Lys | Gin 455 | Ue | Ala | Ser | Asn | Ala 460 | Gly | Lys | Glu | Gly |
| Ala 465 | Ile | Ile | Cys | Gin | Gin 470 | Val | Leu | Ala | Arg | Ser 475 | Ala | Asn | Glu | Gly | Tyr 480 |
| Asp | Ala | Leu | Arg | Asp 485 | Ala | Tyr | Thr | Asp | Met 4 90 | Ue | Asp | Ala | Gly | Ue 495 | Leu |
| Asp | Pro | Thr | Lys 500 | Val | Thr | Arg | Ser | Ala 505 | Leu | Glu | Ser | Ala | Ala 510 | Ser | Ue |
| Ala | Gly | Leu 515 | Leu | Leu | Thr | Thr | Glu 520 | Ala | Leu | Ue | Ala | Asp 525 | Ue | Pro | Glu |
| Glu | Lys 530 | Ser | Ser | Ser | Ala | Pro 535 | Ala | Met | Pro | Ser | Ala 540 | Gly | Met | Asp | Tyr |
<210> 401 <211> 664 <212> PRT ·« ···· ♦ · ···· tOOO ··♦
OO 09 • O O • · ··* «· to « ··
369
| <213> Chlamydia <400> 401 | pneumoniae | ||||||||||||||
| Met | Glu | Lys | Val | Ser 5 | Ser | Tyr | Pro | Ser | Val 10 | Pro | Leu | Pro | Leu | Gly 15 | Ala |
| Ser | Lys | Ile | Ser 20 | Pro | Asn | Arg | Tyr | Arg 25 | Phe | Ala | Leu | Tyr | Ala 30 | Ser | Gin |
| Ala | Thr | Glu 35 | Val | Ile | Leu | Ala | Leu 40 | Thr | Asp | Glu | Asn | Ser 45 | Glu | Val | Ile |
| Glu | Val 50 | Pro | Leu | Tyr | Pro | Asp 55 | Thr | His | Arg | Thr | Gly 60 | Ala | Ile | Trp | His |
| Ile 65 | Glu | lle | Glu | Gly | Ile 70 | Ser | Asp | Gin | Ser | Ser 75 | Tyr | Ala | Phe | Arg | Val 80 |
| His | Gly | Pro | Lys | Lys 85 | His | Gly | Met | Gin | Tyr 90 | Ser | Phe | Lys | Glu | Tyr 95 | Leu |
| Ala | Asp | Pro | Tyr 100 | Ala | Lys | Asn | Ile | His 105 | Ser | Pro | Gin | Ser | Phe 110 | Gly | Ser |
| Arg | Lys | Lys 115 | Gin | Gly | Ašp | Tyr | Ala 120 | Phe | Cys | Tyr | Leu | Lys 125 | Glu | Glu | Pro |
| Phe | Pro 130 | Trp | <-Asp | Gly | Asp | Gin 135 | Pro | Leu | His | Leu | Pro 140 | Lys | Glu | Glu | Met |
| Tle 14 5 | Ile | Tyr | Glu | Met | His 150 | Val | Arg | Ser | Phe | Thr 155 | Gin | Ser | Ser | Ser | Ser 160 |
| Arg | Val | His | Ala | .Pro 165 | Gly | Thr | Phe | Leu | Gly 170 | Ile | Ile | Glu | Lys | Ile 175 | Asp |
| His | Leu | His | Lys 180 | Leu | Gly | Ile | Asn | Ala 185 | Val | Glu | Leu | Leu | Pro 190 | Ile | Phe |
| Glu | Phe | Asp 195 | Glu | Thr | Ala | His | Pro 200 | Phe | Arg | Asn | Ser | Lys 205 | Phe | Pro | Tyr |
| Leu | Cys 210 | Asn | Tyr | Trp | Gly | Tyr 215 | Ala | Pro | Leu | Asn | Phe 220 | Phe | Ser | Pro | Cys |
| Arg 225 | Arg | Tyr | Ala | Tyr | Ala 230 | Ser | Asp | Pro | Cys | Ala' 235 | Pro | Ser | Arg | Glu | Phe 240 |
| Lys | Thr | Leu | Val | Lys 245 | Thr | Leu | His | Gin | Glu 250 | Gly | Ile | Glu | Val | Ile 255 | Leu |
| Asp | Val | Val | Phe 260 | Asn | His | Thr | Gly | Leu 265 | Gin | Gly | Thr | Thr | Cys 270 | Ser | Leu |
| Pro | Trp | Ile 275 | Asp | Thr | Pro | Ser | Tyr 280 | Tyr | Ile | Leu | Asp | Ala 285 | Gin | Gly | His |
| Phe | Thr 290 | Asn | Tyr | Ser | Gly | Cys 295 | Gly Asn | Thr | Leu | Asn 300 | Thr | Asn | Arg | Ala |
Pro Thr Thr Gin Trp Ile Leu Asp Ile Leu Arg. Tyr Trp Val Glu Glu
370
| 305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
| Met | His | Val | Asp | Gly 325 | Phe | Arg | Phe | Asp | Leu 330 | Ala | Ser | Val | Phe | Ser 335 | Arg |
| Gly | Pro | Ser | Gly 340 | Ser | Pro | Leu | Gin | Phe 345 | Ala | Pro | Val | Leu | Glu 350 | Ala | Ile |
| Ser | Phe | Asp 355 | Pro | Leu | Leu | Ala | Ser 360 | Thr | Lys | Ile | Ile | Ala 365 | Glu | Pro | Trp |
| Asp | Ala 370 | Gly | Gly | Leu | Tyr | Gin 375 | Val | Gly | Tyr | Phe | Pro 380 | Thr | Leu | Ser | Pro |
| Arg 385 | Trp | Ser | Glu | Trp | Asn 390 | Gly | Pro | Tyr | Arg | Asp 395 | Asn | Val | Lys | Ala | Phe 400 |
| Leu | Asn | Gly | Asp | Gin 405 | Asn | Leu | Ile | Gly | Thr 410 | Phe | Ala | Ser | Arg | Ile 415 | Ser |
| Gly | Ser | Gin | Asp 420 | Ile | Tyr | Pro | His | Gly 425 | Ser | Pro | Thr | Asn | Ser 430 | Ile | Asn |
| Tyr | Val | Ser 435 | Cys | His | Asp | Gly | Phe 440 | Thr | Leu | Cys | Asp | Thr 445 | Val | Thr | Tyr |
| Asn | His 450 | Lys | His | Asn | Glu | Ala 455 | Asn | Gly | Glu | Asp | Asn 460 | Arg | Asp | Gly | Thr |
| Asp .4 65 | Ala | Asn | Tyr | Ser | Tyr 470 | Asn | Phe | Gly | Thr | Glu 475 | Gly | Lys | Thr | Glu | Asp 480 |
| Pro | Gly | Ile | Leu | Glu 485 | Val | Arg | Glu | Arg | Gin 4 90 | Leu | Arg | Asn | Phe | Phe 4 95 | Leu |
| Thr | Leu | Met | Val 500 | Ser | Gin | Gly | Ile | Pro 505 | Met | Ile | Gin | Ser | Gly 510 | Asp | Glu |
| Tyr | Ala | His 515 | Thr | Ala | Glu | Gly | Asn 520 | Asn | Asn | Arg | Trp | Tkla 525 | Leu | Asp | Ser |
| Asn | Ala 530 | Asn | Tyr | Phe | Leu | Trp 535 | Asp | Gin | Leu | Thr | Ala 540 | •T.vft — j *- | Pro | Thr | Ugn |
| Met 545 | His | Phe | Leu | Cys | Ašp 550 | Leu | Ile | Ala | Phe | Arg 555 | Lys | Lys | Tyr | Lys | Thr 560 |
| Leu | Phe | Asn | Arg | Gly 565 | Phe | Leu | Ser | Asn | Lys 570 | Glu | Ile | Ser | Trp | Val 575 | Asp |
| Ala | Met | Gly | Asn 580 | Pro | Meť | Thr | Trp | Arg 585 | Pro | Gly | Asn | Phe | Leu 590 | Ala | Phe |
| Lys | Ile | Lys 595 | Ser | Pro | Lys | Ala | His 600 | Val | Tyr | Val | Ala | Phe 605 | His | Val | Gly |
| Ala | Gin 610 | Asp | Gin | Leu | Ala | Thr 615 | Leu | Přo | Lys | Ala | Ser 620 | Ser | Asn | Phe | Leu |
| Pro 625 | Tyr | Gin | Ile | Val | Ala 630 | Glu | Ser | Gin | Gin | Gly 635. | Phe | Val | Pro | Gin | Asn 640 |
• ·· · • · · ·
I________
371
Val Ala Thr Pro Thr Val Ser Leu Gin Pro His Thr Thr Leu Ile Ala 645 650 655
Ile Ser His Ala Lys Glu Val Thr 660 <210> 402 <211> 328 <212> PRT <213> Chlamydia pneumoniae <400> 402
| Met | Ala | Phe | Lys | Glu 5 | Val | Val | Arg | Val | Ala 10 | Val | Thr | Gly | Gly | Lys 15 | Gly |
| Gin | Ile | Ala | Tyr 20 | Asn | Phe | Leu | Phe | Ala 25 | Leu | Ala | His | Gly | Asp 30 | Val | Phe |
| Gly | Val | Asp 35 | Arg | Gly | Val | Asp | Leu 40 | Arg | Ile | Tyr | Asp | Val 45 | Pro | Gly | Thr |
| Glu | Arg 50 | Ala | Leu | Ser | Gly | Val 55 | Arg | Met | Glu | Leu | Asp 60 | Asp | Gly | Ala | Tyr |
| Pro 65 | Leu | Leu | His | Arg | Leu 70 | Arg | Val | Thr | Thr | Ser 75 | Leu | Asn | Asp | Ala | Phe 80 |
| Asp | Gly | Ile | Asp | Ala 85 | Ala | Phe | Leu | Ile | Gly 90 | Ala | Val | Pro | Arg | Gly 95 | Pro |
| Gly | Met | Glu | Arg 100 | Gly | Asp | Leu | Leu | Lys 105 | Gin | Asn | Gly | Gin | Ile 110 | Phe | Ser |
| Leu | Gin | Gly 115 | Ala | Ala | Leu | Asn | Thr 120 | Ala | Ala | Lys | Arg | Asp 125 | Ala | Lys | Ile |
| Phe | Val 130 | Val | Gly | Asn | Pro | Val 135 | Asn | Thr | Asn | Cys | Trp 140 | Ile | Ala | Met | Lys |
| His 145 | Ala | Pro | Arg | Leu | His 150 | Arg | Lys | Asn | Phe | His 155 | m a | Mst | Leu | m ---- | Lsu 160 |
| Asp | Gin | Asn | Arg | Met 165 | His | Ser | Met | Leu | Ala 170 | His | Arg | Ala | Glu | Val 175 | Pro |
| Leu | Glu | Glu | Val 180 | Ser | Arg | Val | Val | Ile 185 | Trp | Gly | Asn | His | Ser 190 | Ala | Lys |
| Gin | Val | Pro 195 | Asp | Phe | Thr | Gin | Ala 200 | Arg | Ile | Ser | Gly | Lys 205 | Pro | .Ala | Ala |
| Glu | Val 210 | Ile | Gly | Asp | Arg | Asp 215 | Trp | Leu | Glu | Asn | Ile 220 | Leu | Val | His | Ser |
| Val 225 | Gin | Asn | Arg | Gly | Ser 230 | Ala | Val | Ile | Glu | Ala 235 | Arg | Gly | Lys | Ser | Ser 240 |
| Ala | Ala | Ser | Ala | Ser 245 | Arg | Ala | Leu | Ala | Glu 250 | Ala | Ala | Arg | Ser | Ile 255 | Phe |
372
| Cys | i Pro | Lys | Ser 260 | Asp | Glu | Trp | Phe | Ser 265 | Ser | Gly | Val | Cys | Ser 270 | Asp | His |
| Asn | Pro | Tyr 275 | Gly | Ile | Pro | Glu | Asp 280 | Leu | Ile | Phe | Gly | Phe 285 | Pro | Cys | Arg |
| Met | Leu 290 | Pro | Ser | Gly | Asp | Tyr 295 | Glu | Ile | Ile | Pro | Gly 300 | Leu | Pro | Trp | Glu |
| Pro 305 | Phe | Ile | Arg | Asn | Lys 310 | Ile | Gin | Ile | Ser | Leu 315 | Asp | Glu | Ile | Ala | Gin 320 |
| Glu | Lys | Ala | Ser | Val | Ser | Ser | Leu |
325 <210> 403 <211> 217 <212> PRT
| <213> Chlamydia | pneumoniae, |
| <400> 403 | |
| Met Lys Arg Val | Ile Tyr Lys Thr Ile Phe Cys Gly Leu Thr Leu Leu |
| 5 10 15 | |
| Thr Ser Leu Ser | Ser Cys Ser Leu Asp Pro Lys Gly Tyr Asn Leu Glu |
| 20 | 25' 30 |
| Thr Lys Asn Ser | Arg Asp Leu Asn Gin Glu Ser Val Ile Leu Lys Glu |
| 35 | 40 45 |
| Asn Arg Glu Thr | Pro Ser Leu Val Lys Arg Leu Ser Arg Arg Ser Arg |
| 50 | 55 60 |
| Arg Leu Phe Ala | Arg Arg Asp Gin Thr Gin Lys Asp Thr Leu Gin Val |
| 65 | 70 75 80 |
| Gin Ala Asn Phe | Lys Thr Tyr Ala Glu Lys Ile Ser Glu Gin Asp Glu |
| 85 90 95 | |
| Arg Asm Leu Ser | Phe Val Val Ser Ser Ala Ala Glu Lys Ser Ser Ile |
| 100 | 105 110 |
| Ser Leu Ala Leu | Ser Gin Gly Glu Ile Lys Asp Ala Leu Tyr Arg Ile |
| 115 | 120 125 |
| Arg Glu Val His | Pro Leu Ala Leu Ile Glu Ala Leu Ala Glu Asn Pro |
| 130 | 135 140 |
| Ala Leu Ile Glu | Gly Met Lys Lys Met Gin Gly Arg Asp Trp Ile Trp |
| 145 | 150 155 160 |
| Asn Leu Phe Leu | Thr Gin Leu Ser Glu Val Phe Ser Gin Ala Trp Ser |
| 165 170 175 | |
| Gin Gly Val Ile | Ser Glu Glu Asp Ile Ala Ala Phe Tkla Ser Thr Leu |
| 180 | 185 190 |
| Gly Leu Asp Ser | Gly Thr Val Ala Ser Ile Val Gin Gly Glu Arg Trp |
195 200 205 • · • · · ♦·· ·· ····.. * · · · · · ·
373
| Pro Glu | Leu | Val | Asp Ile | Val 215 | Ile | Thr | |||||||||
| 210 | |||||||||||||||
| <210> 404 <211> 270 <212> PRT | |||||||||||||||
| <213> Chlamydia | pneumoniae | ||||||||||||||
| <400> 404 | |||||||||||||||
| Met | Ile | Ile | Ile | Lys | Asn | Asn | Glu | Leu | Met | Ile | Arg | Arg | Phe | Phe | Lys |
| 5 | 10 | 15 | |||||||||||||
| Thr | Leu | Phe | Pro | Pro | Gly | Pro | Gin | Tyr | Ser | Leu | Cys | Tyr | Ala | Ser | Ile |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Leu | Ile | Val | Leu | Ser | Ser | Leu | Val | Cys | Val | Pro | Thr | Phe | Cys | Trp | Leu |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Phe | Leu | Pro | Glu | Leu | Ser | Leu | Ser | Lys | Phe | Asn | Pro | Ser | Pro | Ile | Arg |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Asn | Leu | Phe | Leu | Val | Ser | Ser | Thr | Leu | Ser | Lys | Val | Pro | Pro | Thr | Ala |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Ile | Ala | Glu | His | Leu | Arg | Leu | Ser | Ala | Asp | Ala | Pro | Thr | Tyr | Leu | His |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Glu | Phe | Ser | Ile | Lys | Glu | Ala | Glu | Ser | Ser | Leu | His | Ala | Leu | Gly | Ile |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Phe | Ser | Ser | Leu | Val | Ile | Glu | Lys | Ser | Pro | Asp | Asn | Lys | Gly | Ile | Thr |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Ile | Phe | Tyr | Thr | Leu | Gin | Thr | Pro | Ile | Ala | Tyr | Val | Gly | Asn | Arg | Ser |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Asn | Thr | Leu | Cys | Asn | Leu | Glu | Gly | Ser | Cys | Phe | Leu | Gly | Gin | Pro | Tyr |
| 14 5 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Phe | Pro | Ser | Lěu | Asn | Leu | Pro | Gin | Ile | Phe | Phe | Ser | Gin | Glu | L on | Leu |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Lys | Met | Gin | Lys | Leu | Pro | Lys | Glu | Lys | Met | Leu | Phe | Thr | Lys | Ile | Leu |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Leu | Lys | Glu | Leu | Ala | Met | Glu | Ser | Pro | Lys | Ile | Ile | Asp | Leu | Ser | Leu |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Ser | Asp | Ala | Tyr | Pro | Gly | Glu | Ile | Ile | Val | Thr | Leu | Ser | Ser | Gly | Ser |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Leu | Leu | Arg | Leu | Pro | Ile | Lys | Thr | Leu | Asp | Arg | Ala | Leu | Asp | Leu | Tyr |
| 225 | 23Ó | 235 | 240 | ||||||||||||
| Lys | His | Met | Lys | Lys | Ser | Pro | Val | Ile | Glu | Ser | Glu | Lys | Gin | Tyr | Val |
| 245 | 250 | 255 | |||||||||||||
| Tyr | Asp | Leu | Arg | Phe | Pro | Asn | Phe | Leu | Leu | Leu | Lys | Ala | Leu | ||
| 260 | 265 | 270 |
···· • ·'·. · 9 · ·· 9 · «··· · ···· · · ·
·. ··· ·· · · 9 · · • · «··· · · 9 · ·>····· · · · · ** * *
374 <210> 405 <211> 651 <212> PRT <213> Chlamydia pneumoniae <400> 405
| Met | Val | Asn | Pro | Ile 5 | Gly | Pro | Gly | Pro | Ile 10 | Asp | Glu | Thr | Glu | Arg 15 | Thr |
| Pro | Pro | Ala | Asp 20 | Leu | Ser | Ala | Gin | Gly 25 | Leu | Glu | Ala | Ser | Ala 30 | Ala | Asn |
| Lys | Ser | Ala 35 | Glu | Ala | Gin | Arg | Ile 40 | Ala | Gly | Ala | Glu | Ala 45 | Lys | Pro | Lys |
| Glu | Ser 50 | Lys | Thr | Asp | Ser | Val 55 | Glu | Arg | Trp | Ser | Ile 60 | Leu | Arg | Ser | Ala |
| Val 65 | Asn | Ala | Leu | Met | Ser 70 | Leu | Ala | Asp | Lys | Leu 75 | Gly | Ile | Ala | Ser | Ser 80 |
| Asn | Ser | Ser | Ser | Ser 85 | Thr | Ser | Arg | Ser | Ala 90 | Asp | Val | Asp | Ser | Thr 95 | Thr |
| Ala | Thr | Ala | Pro 100 | Thr | Pro | Pro | Pro | Pro 105 | Thr | Phe | Asp | Asp | Tyr 110 | Lys | Thr |
| Gin | Ala | Gin 115 | Thr | Ala | Tyr | ASp | Thr 120 | Ile | Phe | Thr | Ser | Thr 125 | Ser | Leu | Ala |
| Asp | Ile 130 | Gin | Ala | Ala | Leu | Val 135 | Ser | Leu | Gin | Asp | Ala 140 | Val | Thr | Asn | Ile |
| Lys 145 | Asp | Thr | Ala | Ala | Thr 150 | Asp | Glu | Glu | Thr | Ala 155 | Ile | Ala | Ala | Glu | Trp 160 |
| Glu | Thr | Lys | Asn | Ala 165 | Asp | Ala | Val | Lys | Val 170 | Gly | Ala | Gin | Ile | Thr 175 | Glu |
| Leu | Ala | Lys | Tyr 180 | Ala | Ser | Asp | Asn | Gin 185 | Aia | Ile | Leu | Ti cn | Ser 190 | Leu | Gly |
| Lys | Leu | Thr 195 | Ser | Phe | Asp | Leu | Leu 200 | Gin | Ala | Ala | Leu | Leu 205 | Gin | Ser | Val |
| Ala | Asn 210 | Asn | Asn | Lys | Ala | Ala 215 | Glu | Leu | Leu | Lys | Glu 220 | Met | Gin | Asp | Asn |
| Pro 225 | Val | Val | Pro | Gly | Lys 230 | Thr | Pro | Ala | Ile | Ala 235 | Gin | Ser | Leu | Val | Asp 240 |
| Gin | Thr | Asp | Ala | Thr 245 | Ala | Thr | Gin | Ile | Glu 250 | Lys | Asp | Gly | Asn | Ala 255 | Ile |
| Arg | Asp | Ala | Tyr 260 | Phe | Ala | Gly | Gin | Asn 265 | Ala | Ser | Gly | Ala | Val 270 | Glu | Asn |
| Ala | Lys | Ser | Asn | Asn | Ser | Ile | Ser | Asn | Ile | Asp | Ser | Ala | Lys | Ala | Ala |
275 280 285
375 • · · 0 · 0 0 ·» 0 0 0 0 ··
| Ile | Ala 290 | Thr | Ala | Lys | Thr | Gin 295 | Ile | Ala | Glu | Ala | Gin 300 | Lys | Lys | Phe | Pro |
| Asp 305 | Ser | Pro | Ile | Leu | Gin 310 | Glu | Ala | Glu | Gin | Met 315 | Val | Ile | Gin | Ala | Glu 320 |
| Lys | Asp | Leu | Lys | Asn 325 | Ile | Lys | Pro | Ala | Asp 330 | Gly | Ser | Asp | Val | Pro 335 | Asn |
| Pro | Gly | Thr | Thr 340 | Val | Gly | Gly | Ser | Lys 345 | Gin | Gin | Gly | Ser | Ser 350 | Ile | Gly |
| Ser | Ile | Arg 355 | Val | Ser | Met | Leu | Leu 360 | Asp | Asp | Ala | Glu | Asn 365 | Glu | Thr | Ala |
| Ser | Ile 370 | Leu | Met | Ser | Gly | Phe 375 | Arg | Gin | Met | Ile | His 380 | Met | Phe | Asn | Thr |
| Glu 385 | Asn | Pro | Asp | Ser | Gin 390 | Ala | Ala | Gin | Gin | Glu 395 | Leu | Ala | Ala | Gin | Ala 400 |
| Arg | Ala | Ala | Lys | Ala 405 | Ala | Gly | Asp | Asp | Ser 410 | Ala | Ala | Ala | Ala | Leu 415 | Ala |
| Asp | Ala | Gin | Lys 420 | Ala | Leu | Glu | Ala | Ala 425 | Leu | Gly | Lys | Ala | Gly 430 | Gin | Gin |
| Gin | Gly | Ile 435 | Leu | Asn | Ala | Leu | Gly 440 | Gin | Ile | Ala | Ser | Ala 445 | Ala | Val | Val |
| Ser | Ala 450 | Gly | Val | Pro | Pro | Ala 455 | Ala | Ala | Ser | Ser | Ile 4 60 | Gly | Ser | Ser | Val |
| Lys 465 | Gin | Leu | Tyr | Lys | Thr 470 | Ser | Lys | Ser | Thr | Gly 475 | Ser | Asp | Tyr | Lys | Thr 480 |
| Gin | Ile | Ser | Ala | Gly 485 | Tyr | Asp | Ala | Tyr | Lys 490 | Ser | Ile | Asn | Asp | Ala 4 95 | Tyr |
| Gly | Arg | Ala | Arg 500 | Asn | Asp | Ala | Thr | Arg Asp 505 | Val | Ile | Asn | Asn 510 | Val | Ser | |
| Thr | Pro | Ala 515 | Leu | Thr | Arg | Ser | Val 520 | Pro | Arg | Ala | Arg | Thr 525 | Glu | Ala | Arg |
| Gly | Pro 530 | Glu | Lys | Thr | Asp | Gin 535 | Ala | Leu | Ala | Arg | Val 540 | Ile | Ser | Gly | Asn |
| Ser 545 | Arg | Thr | Leu | Gly | Asp 550 | Val | Tyr | Ser | Gin | Val 555 | Ser | Ala | Leu | Gin | Ser 560 |
| Val | Met | Gin | Ile | Ile 565 | Gin | Ser | Asn | Pro | Gin .570 | Ala | Asn | Asn | Glu | Glu 575 | He |
| Arg | Gin | Lys | Leu 580 | Thr | Ser | Ala | Val | Thr 585 | Lys | Pro | Pro | Gin | Phe 590 | Gly | Tyr |
| Pro | Tyr | Val 595 | Gin | Leu | Ser | Asn | Asp 600 | Ser | Thr | Gin | Lys | Phe 605 | Ile | Ala | Lyš |
376
| Leu | Glu 610 | Ser Leu | Phe Ala | Glu 615 | Gly | Ser | Arg | Thr | Ala 620 | Ala | Glu | Ile | Lys |
| Ala | Leu | Ser Phe | Glu Thr | Asn | Ser | Leu | Phe | Ile | Gin | Gin | Val | Leu | Val |
| 625 | 630 | 635 | 640 | ||||||||||
| Asn | Ile | Gly Ser | Leu Tyr | Ser | Gly | Tyr | Leu | Gin | |||||
| 645 | 650 |
<210> 406 <211> 1074 <212> DNA <213? Chlamydia trachomatis serovar D <400> 406 gtgcgtaaaa ctgtcattgt tgctatgtct ggaggagtgg attcctcggt tgttgcttat 60 ctcttaaaga agcaagggga gtataatgtt gttgggctct tcatgaaaaa ttggggagag 120 caggacgaga atggtgagtg tactgcaacc aaagattttc gcgatgtaga gcggatcgca 180 gaacaattgt ccattccata ttacacagtt tccttttcta aggaatataa agagcgagtg 240 ttttctagat ttctaagaga atatgcgaac ggctacactc ccaatcctga tgtgttatgc 300 aatcgagaaa tcaaatttga tttattacag aagaaggtac gtgagctaaa aggtgattťt 360 ťtagccacgg gacattattg tcgaggaggg gctgatggaa ctggtttgtc cagaggaata 420 gaccccaata aagaccaaag ttatttctta tgtggcactc ctaaggatgc tttatccaat 480 gtacttttcc ccctgggagg tatgtataaa acggaggtac gtcgaattgc tcaagaagct 540 ggtttagcta ccgccacaaa aaaagatagc acagggattt gcttcattgg taaacggcct 600 tttaagagtt tccttgagca gtttgtagca gactctcctg gagacattat tgattttgat 660 acacaacagg tagtcggccg acatgaagga gcccattatt atacgattgg acagcgtcga 720 gggttaaaca taggaggaat ggaaaagcct tgttatgttc ttagcaagaa tatggaaaag 780 aatattgttt acattgtaag gggtgaagat catcctttac tttatcgaca agagctttta 840 gctaaggaac ttaattggtt tgttcccttg caggagccta tgatctgtag tgctaaagtt 900 cggtacagat cccctgacga gaaatgttct gtatatcctt tggaagatgg aacggtaaaa 960 gtgattttcg atgtccctgt gaaagctgtc acccctggac agactgtagc tttctaccag 1020 ggggacattt gtttaggagg aggagtgatt gaagtgccta tgattcatca gctg 1074 <210> 407 <211> 1827 <212> DNA <213> Chlamydia trachomatis serovar D <400> 407 atgggttttt ggagaacatc gattatgaaa atgaatagga tttggctatt actgcttacc 60 ttttcttctg ccatacattc tcctgtacaa ggagaaagct tggtttgcaa gaatgctctt 120 caagatttga gttttttaga gcatttatta caggttaaat atgctcctaa aacatggaaa 180 gagcaatact taggatggga tcttgttcaa agctccgttt ctgcacagca gaagcttcgt 240 acacaagaaa atccatcaac aagtttttgc cagcaggtcc ttgctgattt tatcggagga 300 ttaaatgact ttcacgctgg agtaactttc tttgcgatag aaagtgctta ccttccttat 360 accgtacaaa aaagtagtga cggccgtttc tactttgtag atatcatgac tttttcttca 420 gagatccgtg ttggagatga gttgctagag gtggatgggg cgcctgtcca agatgtactc 480 gctactctat atggaagcaa tcacaaaggg actgcagctg aagagtcggc tgctttaaga 540 acactatttt ctcgcatggc ctctttaggg cacaaagtac cttctgggcg cactacttta 600 aagattcgtc gtccttttgg tactacgaga gaagttcgtg tgaaatggcg ttatgttcct 660 gaaggtgtag gagatttggc taccatagct ccttctatca gggctccaca gttacagaaa 720 tcgatgagaa gctttttccc taagaaagat gatgcgtttc atcggtctag ttcgctattc 780 tactctccaa tggttccgca tttttgggca gagcttcgca atcattatgc aacgagtggt 840 ttgaaaagcg ggtacaatat tgggagtacc gatgggtttc tccctgtcat tgggcctgtt 900 atatgggagt cggagggtct tttccgcgct tatatttctt cggtgacťga tggggatggt 960 aagagccata aagtaggatt tctaagaatt cctacatata gttggcagga catggaagat 1020 tttgatcctt. caggaccgcc tccttgggaa gaatttgcta agattattca agtattttct 1080 tctaatacag aagctttgat tatcgaccaa acgaacaacc caggtggtag tgtcctttat 1140
···· • ♦·· • · · · · ···· ··· ·· ··
377 ctttatgcac tgctttccat gttgacagac cgtcctttag aacttcctaa acatagaatg 1200 attctgactc aggatgaagt ggttgatgct ttagattggt taaccctgtt ggaaaacgta 1260 gacacaaacg tggagtctcg ccttgctctg ggagacaaca tggaaggata tactgtggat 1320 ctacaggttg ccgagtattt aaaaagcttt ggacgtcaag tattgaattg ttggagtaaa 1380 ggggatatcg agttatcaac gcctattcct ctttttggtt ttgagaagat tcatccacat 1440 cctcgagttc aatactctaa accgatttgt gttttgatca atgagcaaga cttttcttgt 1500 gctgacttct tccctgtagt tttgaaagac aatgatcgag ctcttattgt tggtactcga 1560 acagctggag ctggaggatt tgtctttaat gtgcagttcc caaatagaac tggaataaaa 1620 acttgttctt taacaggatc attagctgtt agagagcatg gtgccttcat tgagaacatc 1680 ggagtcgaac cgcatatcga tctgcctttt acagcgaatg atattcgcta taaaggctat 1740 tccgagtatc ttgataaggt caaaaaattg gtttgtcagc tgatcaataa cgacggtacc 1800 attattcttg cggaagatgg tagtttt 1827 <210> 408 <211> 804 <212> DNA <213> Chlamydia trachomatis serovar D <400> 408 ttgccccccc gctccccctc ttttttagta catatatggc gtcttttttt tgctaaaggg 60: ccgaattatt ctcttcccta cgctttcctg tgtatcttcg ttagcgttct cgtcttttta 120 cccatcggct tatggctgac tctgcctagt tttttaaatt tcaagcactc cctaacgcct 18Ό attaagacat tgtttcttac ctgtacggag cctccttgcc ttcctgagcc ttttttctcg 240 gatatcttgc atctttctgc tgattcccct ccagctttac agacattttc cacgaagtct 300 gccgagcact tťttaaatga attaggagtt ttttctttta tttctattga gaaggttcct 360 gatcataaag gcttagctat ttcctatgct ttgcatactc cgttagcttt tttaggaaat 420 caaactcata cattcatagg ttatgaagga caaaccttcc cagctttgcc cttttttcaa 480 tccttagaac ta.cctacagt cttcttttcg caacaagctc tttcccaaac acgcattcca 54 0 caťcaaacac tgtctattgt cacgagccta atagatcaac tacagatgga tcctcctagc 600 atcattgact tatctcaaat cgatcattat ccgggagaat ttgtggtatc cttatcttct 660 ggaacactct tacgttttcg taaagactct ttccttcctg gaatccaaca ctatcaacaa 720 gcactctctc taggagcctt ctctcctcaa caagctgtca tttgcgacct tcgttgcgaa 780 gactatcttt tacttaaacg taaa 804' <210> 409 <211> 663 <212> DNA <213> Chlamydia trachomatis serovar D <400> 409 ' ' atgaaaaagt ttatctataa gtatagcttt ggagcťctct tgttgctétc cgggctctcc 60 ggattgagca gctgttgcqc caactcttat ggatcgactc ttgcaaaaaa tacagccgag 120 ataaaagaag aatctgttac acttcgcgag aagccggatg ccggctgtaa aaagaaatct 180 tóttgttact tgagaaaatt tttctcgcgc aagaaaccta aagagaagac agagcctgtg 240 ttgccgaact ttaagtctta cgcagatcca atgacagatt ccgaaagaaa agacctttct 300 ttcgtagtat ctgctgctgc tgataagtct tctattgctt tggctatggc tcagggggaa 360 attaaaggcg cattatcgcg tattagagag atccatcctc ttgcattgtt acaagctctt 420 gcagaagatc ctgctttaat tgctggaatg aaaaagatgc aaggacggga ttgggtctgg 480 aatatcttta tcacagaatt aagcaaagtt ttttctcaag cagcatcttt aggggctttc 540 agcgttgcag acgttgccgc gttcgcgtcg accttaggat tagactcggg gaccgttacc 600 tcaattgttg atggggaaag gtgggctgag ctgatcgatg tcgtgattca gaaccctgct 660 ata 663 <210> 410 <211> 1470 <212> DNA <213> Chlamydia trachomatis serovar D <400> 410 atgagcgacc tctcggacct atttaaaact catttcacac agtatgcgtc ttacgtcatt 60 ttggaacgtg caaťccctca tgttttagat ggcctcaagc·ctgttcaaag aaggcttctt 120 r
<· . ····
378 ·· »
• ··· ·· i ·· ··* · v · · · · · · «····· tggaccttat tccgtatgga tgatggtaaa atgcataagg tggctaatat cgcaggacgt 180 acgatggcgc tgcacccgca tggtgatgcg cctatcgtgg aagctcttgt cgttttggca 240 aataaagggt tcctgataga gacacaaggg aactttggta accctctcac aggagatcct 300 catgcagcgg ctcgttatat agaagcgcgg ctaagccctt tagctaaaga ggtacttttt 360 aatacggatc tcatgacctt ccatgattct tacgatggaa gagagcaaga acccgatatc 420 ttagctgcaa agattcctct actactcctt catggcgtgg atggcatcgc agtagggatg 480 actacáaaaa ttttccctca caacttttgt gatctactag aagcacaaat agctatactg 540 aatgaccaac cgttttctct ccttcccgac ttccctccag gaggcacgat ggatgcttcc 600 gactaccaag atggcttagg atccattgtt ctgcgcgcaa caattgatat tattaatgac 660 aaaaccttgc taatcaaaga aatctgtcct tccacaacta cagagactct aattcgttct 720 atcgaaaacg cagcaaaacg aggaatcatt aaaatcgatt cgattcaaga tttctctacg 780 gacctccctc atatcgagat caaactccct aaaggtatct acgctaaaga tctgttacgc 840 cctctatata cacatacaga atgtcaggtt atcttaacct ctcggccaac agctatttac 900 cagggaaaac cttgggaaac aacgatcagc gaaatcctac gcttacaaac caagactctc 960 caaaattacc taaaaaaaga attactcata ctagaagatt ccttaagccg cgagctgtac 1020 cacaaaactt tagaatatct attcattaaa cataagcttt acgataccgt gcgctccatg 1080 ctttctaaaa gaaagacgtc tccttcatca agtaccattc acaacgctgt tttggaagct 1140 ctgactccat ttcttgacac gctcccggct cctgataagc aagcaaccgc tcaactagca 1200 gctctaacta ttaaaaaaat cctctgtttt gatgaaaatt cctacgagaa ggagctggca 1260 tgcttagaaa agaaacgcag tagcgtacag aaagatctga gccaactgaa aaaatacaca 1320 gttctctaca ttaagaagct gctcgaaacc tacagacaac tcgggcatcg aaagacaaaa 1380 attgcaaaat ttgatgacct acctaccgag agagtctccg ctcataagaa agcaaaagaa 1440 ctcgctgcgc tcgatcaaga agagaacttc 14'70 <210> 411 <211> 234 <212> DNA <213>.Chlamydia trachomatis serovar D <400> 411 atgaaagagt ttttagcgta cattgtaaaa aatcttgttg ataagccaga ggaagtgcat 60 ctgaaagagg tgcagggaac caatacgatt atctacgaat tgactgttgc taagggagat 120 atcggtaaáa ttatcggtaa agaaggacgc actattaagg ctatccgtac ttťattggtt 180 tccgtagcaa gtcgagataa tgtgaaagtc agcctagaaa ttatggaaga gcgg 234 <210> 412 <211> 1941 <212> DNA <213> Chlamydia trachomatis serovar D <400> 412 atggaatcag gaccagaatc agtttcttct aatcagagct cgatgaatcc aattattaat 60 gggcaaatcg cttctaattc ggagaccaaa gagtccacga aggagtcaga agcgagtcct 120 tcagcatcgt cctctgtaag cagctggagt tttttatcct cagcaaagca tgcattaatc 180 tctcttcgtg atgccatctt gaataaaaat tctagtccaa cagactctct ctctcaatta 240 gaggcctcta cttctacctc tacggttaca cgtgtagctg cgcgagatta taatgaggct 300 aaatcgaatt ttgatacggc gaaaagtgga ttagagaacg ctacgacact tgctgaatac 360 gagacgaaaa tggctgattt aatggcagct ctccaagata tggagcgttt ggctaaacag 420 aaggctgaag tťacaagaat taaagaagct cttcaagaga aacaagaggt tattgataag 480 ctcaatcagt tagttaaact tgaaaaacag aatcagactt taaaggaaac tttaacaacc 540 acagactctg cagatcagat tccagcgatt aatagtcagt tagagatcaa caaaaattct 600 gcagatcaaa ttatcaaaga tctggaagga caaaacataa gttatgaagc tgttctcact 660 aacgcaggag aggttatcaa agcttcttct gaagcgggaa ttaagttagg acaagctttg 720 cagtctattg tggatgctgg ggatcaaagc caggctgcag ttcttcaagc acagcaaaat 780 aatagcccag ataatatcgc agccacgaag aaattaattg atgctgctga aacgaaggta 840 aacgagttaa aacaagagca tacagggcta acggactcgc ctttagtgaa aaaagctgag 900 gagcagatta gtcaagcaca aaaagatatt caagagatca aacctagtgg ttcggatatt 960 cctatcgttg gtccgagtgg gtcagctgct tccgcaggaa gtgcggtagg agcgttgaaa 1020 tcctctaaca attcaggaag aatttccttg ttgcttgatg atgtagacaa tgaaatggca 1080 gcgattgcaa tgcaaggttt tcgatctaťg atcgaacaat ttaatgtaaa caatcctgca 1140 acagctaaag agctacaagc tatggaggct cagctgactg. cgatgtcaga tcaactggtt 1200 ··· · «, · · · · · · · • ··· · ···· » · ' e*é«i'ěé··· <··· »·· ·· ·· ♦·
V’
379 ggtgcggatg gcgagctccc agccgaaata caagcaatca aagatgctct tgcgcaagct 1260 ttgaaacaac catcaacaga tggtttagct acagctatgg gacaagtggc ttttgcagct 1320 gccaaggttg gaggaggctc cgcaggaaca gctggcactg tccagatgaa tgtaaaacag 1380 ctttacaaga cagcgttttc ttcgacttct tccagctctt atgcagcagc actttccgat 1440 ggatattctg cttacaaaac actgaactct ttatattccg aaagcagaag cggcgtgcag 1500 tcagctatta gtcaaactgc aaatcccgcg ctttccagaa gcgtttctcg ttctggcata 1560 gaaagtcaag gacgcagtgc agatgctagc caaagagcag cagaaactat tgtcagagat 1620 agccaaacgt taggtgatgt atatagccgc ttacaggttc tggattcttt gatgtctacg 1680 attgtgagca atecgcaagt aaatcaagaa gagattatgc agaagctcac ggcatctatt 1740 agcaaagctc cacaatttgg gtatcctgct gttcagaatt ctgcggatag cttgcagaag 1800 tttgctgcgc aattggaaag agagtttgtt gatggggaac gtagtctcgc agaatctcga 1860 gagaatgcgt ttagaaaaca gcccgctttc attcaacagg tgttggtaaa cattgcttct 1920 ctattctctg gttatctttc t 1941 <210> 413 <211> 693 <212> DNA <213> Chlamydia trachomatis serovar D <400> 413 atgatggagg tgtttatgaa ttttttagat cagttagatt taattatťca aaataagcat 60 atgctagaac acacatttta tgtgaaatgg tcgaaggggg agcttactaa agagcaatta 120 caggcgtatg ccaaagacta ttatttacat atcaaagcct ttcctaaata tttatctgcg 180 attcatagtc gttgcgatga tttagaggcg cgtaagttat tgttagataa-cttgatggat 240 gaagagaacg gttaccctaa tcatattgat ttgtggaagc agtttgtgtt tgctctagga 300 gttactccag aagagttaga ggctcatgag cctagtgaag cagcaaaagc gaaagtagct 360 ačtttcatgc ggtggtgtac aggagattct ttagctgcag gagtggctgc tttgtattct 420 tatgagagtc aaattccacg tatcgctaga gagaaaattc gtggattgac tgagtacttt 480 ggattttcca atcctgaaga ctatgcatat ttcacagaac atgaagaagc ggatgtgcgg 540 catgctagag aagaaaaagc gctoattgag atgcttctca aagatgacgc tgataaagtg 600 ttagaggcat cgcaagaagt aacgcaatct ttgtatggct ttttagattc ttttttggat 660 ecaggaactt gttgtagttg tcatcaatct tat 693 <210> 414 <211> 1599 <212> DNA <213> Chlamydia trachomatis, serovar D <400> 414 ttgtctaata gttttcgaga ccaagaacaa ggtttacagg cagtctttcg cgccgcgcgt 60 gtaatatctc atatgttttc tcagacaatc ggtccttatg ggtttagcac gattgttcat 120 aatgtccagg atacgcggac aacgcaagat agtcagagta tgctgaagga tattctgttt 180 ccagatgtct ttgaaaatat aggtatgaaa ctcatccgag atactgcctt gcgaactcgt 240 atgcgattcg gagatggggc aaaaaccaca gctttactaa tagaagcgtt attagcggag 300 ggcatgacag gtatccagaa aggtttggat cctcatgaaa tccatcgagg aatgcttcťt 360 gcggaaaaga aaatccaaga ggttttttat agagaaacat ttcctctaag cgatctggaa 420 catacagtgt atgtatccag tatcgcgcga cgttgtaata gcgaaatcgc gtctgtttta 480 tctagcgcag tgggttatgg agggaagaac ggttactata tcgtagaaga acatgaagag 540 catgaaacat actggcatgc cgaagagcat gctgtgtggg attttggata tgcttctcct 600 tactttatta cgcatgcgga aacaggaacg gtagaatata gccaggttta tattttagtt 660 agtgaacagc cgctgcatta ttcgaaccca tcttttttaa catttcttca atcagttgtt 720 caggcaggga aaacaccgct tgtgatttta gcagaagctt ttgataaaga attattagct 780 atgctggaaa tgaatcaaat agagagggtt ttccctgtct gtgctgtgaa agtatctggg 840 aagcacgccc gggaatcttt agaggacatt gcggtattaa ccggagctac attgctctca 900 gaaatggatt tcgaagacag cgaggaagag agaatcacaa atcgattagg ctttgtagca 960 ggaatttgtg tttcttctac cagtctttgt gtccctagag aaacagacaa taagcagaga 1020 atggcagaac actgtgcttt tttacaggat aaattgagtt tctcacagga agaagaggct 1080 agcgctaggt tgagaaggag attggcaagg ctttčttcag gcgaagtatg tattcatatt 1140 gctgcagact gtattcctca ggaggagata ggttatatca cctcttctat acgagccatg 1200 acagaatctt tacgatcagg atgcttgcct ggaggtgggt gcgcattcat tcgagcggca 1260 agagaaattt ctgttccgct tgctctttct cctagtgagc gttttggttt tcttgctgtg 1320
9 9 9 ·
999 9 9 ·<
• 9 » »· ·· \\ _>'2o i
380 cttagtgccg cagagaagcc ttttcgtgcc attgttactc gcagcagaag agtggaggag 1380 gaggtgttct ctgaagtctt ctctcaagcg gactggcgag taggatttaa cggagtttct 1440 ggatttgtgg aagatattgt ttcgcaaggg atttgtgatg gagcctcttg tattcagtat 1500 gctttaagtc atgcagtggg gacgactggt ctgttgttaa catctgcgct ctttatagct 1560 tcgcaggagc cgatgttgag agaggaaaat tctgaagaa 1599 <210> 415 <211> 1395 <212> DNA <213> Chlamydia trachomatis serovar D <400> 415 atgaatgaag ctttcgactg tgtagttatc ggagcggggc cagggggcta tgttgcagca 60 atcactgccg ctcaagcagg actcaaaact gcgctaatcg aaaagcgaga ggctggcgga 120 acctgtttaa accgagggtg tattccttct aaagccctct tagcaggagc tgaagtcgtt 180 acccaaatac gccatgctga ccagtttggg attcatgtag aaggattcag catcaactat 240 cccgctatgg tacaaaggaa ggattccgta gtccgtagca tccgcgatgg acttaatggt 300
Ctcattcgca gcaataagat cactgtcttc tctggaagag gctctttgat ctcttcaaca 360 gaagtáaaaa tcttaggaga aaacccttct gtaatcaaag cgcactccat tatcctagcc 420 accggctctg aaccacgagc tttccccggg attccttttt ccgcagaatc tcctcggatt 480 ttatgctcaa caggcgtgct aaacctcaaa gaaatccctc aaaaaatggc cattattggc 540 ggtggtgtga tcggttgcga attcgcttcc ttattccata cgttaggctc cgaagtttct 600 gtgatcgaag caagctctca aatccttgct ttgaataatc cagatatttc aaaaaccatg 660 ttcgataaat tcacccgaca aggactccgt ttcgtactag aagcctctgt atcaaatatt 720 gaggatatag gagatcgcgt tcggttaact atcaatggga atgtcgaaga atacgattac 780 gttctcgtat ctataggacg ccgtttgaat acagaaaata ttggcttgga taaagctggt 840 gttatttgtg atgaacgcgg agtcatccct accgatgcca caatgcgcac aaacgtacct 900 aacatttatg ctattggaga tatcacagga aaatggcaac ttgcccatgt agcttctcat 960 caaggaatca ttgcagcacg gaatatagct ggccataaag aggaaatcga ttactctgcc 1020 gtcccttctg tgatctttac’cttccctgaa gtcgcttcag taggcctatc cccaacagca 1080 gctcaacaac aaaaaatccc cgtcaaagta acaaaattCc catttcgagc tattggaaaa 1140 gcggtcgcaa tgggcgaggc cgatggattt gcagccatta tcagccatga gactactcag 1200 cagatcctag gagcttatgt gattggccct catgcctcat cactgatttc cgaaattacc 1260 ctagcagttc gtaatgaact gactcttcct tgtatttacg aaactatcca cgcacatcca 132.0 accttagcag aagtttgggc tgaaagtgcg ttgttagctg ttgatacccc attacatatg 1380 ccccctgcta aaaaa 1395 <210> 416 <211> 366 <212> DNA · <213> Chlamydia trachomatis serovar D <400> 416 atgccacgca tcattggaat agatattcct gcgaaaaaga aattaaaaat aagtcttaca 60 tatatttatg gaatagggcc agctctttct aaagagatca ttgctagatt gcagttgaat 120 cccgaagcta gagctgcaga gttgactgag gaagaggttg gtcgactaaa cgctctttta 180 cagtcggatt acgttgttga aggggatttg cgccgtcgtg tgcaatctga tatcaaacgt 240 ctgattacta tccatgctta tcgtggacaa agacatagac tttctttgcc tgttcgtggt 300 cagagaacaa aaacaaattc tcgcacgcgt aagggtaaac gtaaaactgt tgcaggtaag 360 aagaaa 366 <210> 417 <211> 1659 <212> DNA <213> Chlamydia trachomatis serovar D <400> 417 atgcgaatag gagatcctat gaacaaactc atcagacgag cagtgacgat cttcgcggtg 60 actagtgtgg cgagtttatt tgctagcggg gtgttagaga cctctatggc agagtctctc 120 tctacaaacg ttattagctt agctgacacc aaagcgaaag acaacacttc tcataaaagc 180 aaaaaagcaa gaaaaaacca cagcaaagag actcccgtag accgtaaaga ggttgctccg 240
381 gttcatgagt ctaaagctac aggacctaaa caggattctt gctttggcag aatgtataca 300 gtcaaagtta atgatgatcg caatgttgaa atcacacaag ctgttcctga atatgctacg 360 gtaggatctc cctatcctat tgaaattact gctacaggta aaagggattg tgttgatgtt 420 atcattactc agcaattacc atgtgaagca gagťtcgtac gcagtgatcc agcgacaact 480 cctactgctg atggtaagct agtttggaaa attgaccgct taggacaagg cgaaaagagt 540 aaaattactg tatgggtaaa acctcttaaa gaaggttgct gctttacagc tgcaacagta 600 tgcgcttgtc cagagatccg ttcggttaca aaatgtggac aacctgctat čtgtgttaaa 660 caagaaggcc cagagaatgc ttgtttgcgt tgcccagtag tttacaaaat taatatagtg 720 aaccaaggaa cagcaacagc tcgtaacgtt gttgttgaaa atcctgttcc agatggttac 780 gctcattctt ctggacagcg tgtactgacg tttactcttg gagatatgca acctggagag 840 cacagaacaa ttactgtaga gttttgtccg cttaaacgtg gtcgtgctac caatatagca 900 acggtttctt actgtggagg acataaaaat acagcaagcg taacaactgt gatcaacgag 960 ccttgcgtac aagtaagtat tgcaggagca gattggtctt atgtttgtaa gcctgtagaa 1020 tatgtgatct ccgtttccaa tcctggagat cttgtgttgc gagatgtcgt cgttgaagac 1080 actctttctc ccggagtcac agttcttgaa gctgcaggag ctcaaatttc ttgtaataaa 1140 gtagtttgga ctgtgaaaga actgaatcct ggagagtctc tacagtataa agttctagta 1200 agagcacaaa ctcctggaca attcacaaat aatgttgttg tgaagagctg ctctgactgt 1260 ggtacttgta cttcttgcgc agaagcgaca acttactgga aaggagttgc tgctactcat 1320 atgtgcgtag tagatacttg tgaccctgtt tgtgtaggag aaaatactgt ttaccgtatt 1380 tgtgtcacca acagaggttc tgcagaagat acaaatgttt ctttaatgct taaattctct 1440 aaagaactgc aacctgtatc cttctctgga ccaactaaag gaacgattac aggcaataca 1500 gtagtattcg attcgttacc tagattaggt tctaaagaaa ctgtagagtt ttctgtaaca 1560 ttgaaagcag tatcagctgg agatgctcgt ggggaagcga ttctttcttc cgatacattg 1620 actgttccag tttctgatac agagaataca cacatctat 1659 <210> 418 <211> 576 <212> DNA <213> Chlamydia trachomatis serovar D <400> 418 atgcctgaag gggaaatgat gcataagttg caagatgtca tagatagaaa gttgttggat 60 tctcgtcgta ttttcttctc cgaacctgta acggagaaaa gtgctacaga agccatcaaa 120 aagctttggt atttggaact caccaatcct gggcagccaa ttgtatttgt cattaatagc 180 cctggagggt ctgttgatgc tgggtttgct gtttgggacc aaattaaaat gatctcttct 240 cctttgacta cagttgttac aggtttagca gcatctatgg gatctgtatt gagttťgtgt 300 gctgttccag gaagacgttt tgctacgcct catgcgcgca ttatgattca ccagccttct 360 attggaggaa ccattactgg tcaagccacg gacttggata ttcatgctcg tgaaatttta 420 aaaacaaaag cacgcattat tgatgtgtat gtcgaggcaa ctggacaatc tcgagaggtg 480 atagagaaag ctatcgatcg agatatgtgg atgagtgcaa atgaagcaat ggagtttgga 540 ctgttagatg ggattctctt ctcttttaac gacttg 576 <210> 419 <211> 825 <212> DNA <213> Chlamydia trachomatis serovar D <400> 419 atgggattct cttctctttt aacgacttgt agatatcttt tatattctgg agcaggaaac 60 agtttcattt tgggagaatc gatgccttct cttgaggatg ttctgttttt atgccaggaa 120 gagatggttg atgggttttt atgtgtagag tcttctgaaa tagcagatgc taaactcact 180 gtttttaata gtgatggatc tatcgcgtct atgtgcggga atgggttgcg gtgcgcaatg 240 gcgcacgtag cccagtgctt tggacttgaa gatgtttcta ttgaaacaga acgtggtgtt 300 taccaaggta agttcttttc tatgaatcgg gtattggttg atatgacatt acctgattgg 360 aaaaaagctg agcggaaatt aacgcatgtg ttgcctggta tgccggaaca agtatttttt 420 attgatacag. gggttccgca tgtcgtggtt ttcgtttctg atttaagtaa ggtťcccgta 480 caagaatggg ggtctttctt gcgttatcat gaagattttg ctcctgaagg tgtaaatgta 540 gattttgttc agcggaagaa ggatgatcta ctgcttgtct atacttatga gcgaggttgt 600 gagcgagaaa ccttatcttg tgggacaggg atgttggcaa gtgctttggt tgcagcggat 660 atcttttctc taggacaaga tttctctata gcggtgtgtt ctcgtagtag aaatctgatt 720 aagatttttt ctgagaaagg caaggtattt ttagagggtc ctgtgagcct attgaaťcgt 780 »9 .9 9 *· ► 99 · » · 999 9 » 9 9 9 9 · k 9 9 '9 9 ·· 9· ··
382 agtgagaact ttgggtggtt agagcctaaa tcaagacgtt <210> 420 <211> 5310 <212> DNA <213> Chlamydia trachomatis serovar D ttgga
825 <400> 420 atgaaattta agctcgatcc acttctcaag agtgtttcat agtagtgaag gagaaaacag atctcagaat ttcttcggag atttatggag atcgcggtcg accgaagcaa caggatatgt acagcagtaa agcttatccg aatcaagacg cctagccccg atcactggaa ggtgtattca aactcggcag acaactagtg acagctaaag acggtgactc gcgtctatac agcactcctg ccggcagccc gatactaata aacacttctg aacaatcttg gaaagcgtag gaaggtgggg tttgcagata cctccagtag agttcggcta gatgttaaca ctacaagatt tctaacgaaa gtctcatcgt ggggctccct gcgagtactg tcttcagatt agcgctggag actttaatag caaggaatat tctgacgtcc tctagacgaa gttgctggag aaaaactctg ggaggagcta aacgttgctg gtgaaattag atttacgcac ctagaagaag gttctcttca tgtcagctac aagatcaaat catttactga tctatgactt cttctccaac aagaagaact ctcaggactc aaggtgaagt agaaagaggt agaaaggggg ccttctccte taatcagtga aacaatgtct aagatacact gttcgtctga acgatgtttt ttacagggac ctaaagaaaa gtcaacatgg aaagtataac ggcacggtgg tcactaaaaa caataacaga aagtagttgc cttctctaac gcgatataga cgaaaaaagg aactttcagg aatttgatgc ctattcattc acactgttaa aaggagaaga acactaacct atgagtctca etacacaatc acacagacga cctctgaaag caggagatca atagctcccc cagacgttac actctgaaga gaggaggtgc tttctggaaa tcggaggtgc ctgtcacctt gagctatcta caacaaacaa tcggagctac acctcggatc agtctggctc ctgtcgtttc gaagcgcgat caggaaactt tgctgtattt aaagaatacc tatgatgcta ttcgacatct gacagaagga agacaatggc tctctctaat tatctttgat agtctttgaa tagcgtctat caatggtggg ttgcaacaat ggatgaagaa ggatagcact aacagaagat aggtaaaggt tatagatttt cttgtcttgc aggaggagcc tactccccct tggtatctgc ctctgcaaag taccccagaa ttctgctaaa agaggctgag cgtgtcgatt aggggctatt gaattcatcc aattggatcg taaaacggtt agcaatagta gtctacagca tgaaggatct agacacatca taatgaagaa atcatctgat tggatcatct atctatctct cgtatctaat tgcatcttct accgactgag tatctatgga caaagctatc ggtctatgct ctccgggaat ctctcctact tgctaataac ttctgctgtt tgctattggg ctactacttt cattaaagcc ttactttaca agtaacccta gctgcagcac gactgcaatg gcagacaaca tccagattac gtgtcttcat ggaatcattt caaagcatag cacagagttg aacataaaat gcaaaagaac gaacaaggtg gtacatttcc atgatcgtat ccagaaacgg acacáagtat ggtggtatct gtcagtaaca accaacacga tacgttactc ctcataggag actaacaaac gagtctggag tcttctaccc ataaatcgat tctgatcaaa gagaacattt tacgggaaaa caggatgtag ctcttatccc actctatcta gaaagcactc acagaagatc caaggggata gatactggaa aatacccttc agccacactg actcctcaag gcaaacgctt tcttcaggtt gataatccag ccagaagctg gaaactgtta gataacacca aaaacattgt actgtctctt gtaaccattg actacagata tctctatcag ttggtgccag gaaaaaaata tatactgcga aaagaagcat acgctaagca.
tctcctccgt ttagcaaatt cagagtatcg ctagaaaaca cttcatctgg atgctagaga aactccatga ccctcaaaaa ctctactagt gagtatcttt gtggtggaat aagggaatgc tgctcgcaga aacagactga cagaatcacc atacagaaaa tagctaccga atagcctaca aaaccatgtc aagtgatttt tttctttatc gagctatttt cctcttcctc tctttgcctc cggatcaaac tgaatgtcgc aagctaaact gaggaggtct actataactc acctcaagtc ctgaagctcc caaattctaa ctgctgatac ácgctgaatc ccaatagtaa aggaaataac atggaggagc gtttagctaa cagaagagcc actcttcctc gttctacaac agattgagaa cagaaggctc ttaatctcga ctcaatctac ctactcctgt ctcagagaaa gaggggctca gcacacaaaa aagctttaaa catttaacca ctattgagtc caactacaga tactgaggcg aggatattca agctgctgat tcttagtagt agaaactgat gaaactaact caatagtatt cggaggagct agaagtaaat agaaaatgtt ctattcagaa ťgcaggagca atgcgttgat gtcaaatgga agaatcaact atctttgacc ttctggagca gtttttgaaa tgttactaat ctctgaaaat taatttaaaa tacagatctg ctcgcctgca tacggcaaaa agaaacttct tatcaatcaa ttcccgtatt ctgtttaact tgctgctaaa taccttcact agaagagatt tacagaagga agggactggt tgaagaacaa tattgatcaa tgacgagagt agcttcttca aagctatgct tgtcacttct atctggagat agaaactctt cttctctggc ctcttccaaa tagcgggagc aacaggtcag agtattttct agacaccttt tttcttagaa tacagaaaca acgágctact aaacagatct tttaggctct aggcacacca
120 180 240 300 360 420 480 540 600 660 720 780 840 900 960 1020 1080 1140 1200 1260 1320 1380 1440 1500 1560 1620 1680 1740 1800 1860 1920 1980 2040 2100 2160 2220 2280 2340 2400 24 60 2520 2580 2640 2700 2760 2820 2880 2940 3000 3060 3120 3180 «I
• · 4 • · ·· • · ·· • · · *
383 gccacaacct caggagatgt aacaaaatat ggtgctgcta’ tctttggaca aatagcaagc 3240 tcaaacggat ctcagacgga taaccttccc ctgaaactca ttgcttcagg aggaaatatt 3300 tgtttccgaa acaatgaata ccgtcctact tcttctgata ccggaacctc tactttctgt 3360 agtattgcgg gagatgttaa attaaccatg caagctgcaa aagggaaaac gatcagtttc 3420 tttgatgcaa tccggacctc tactaagaaa acaggtacac aggcaactgc ctacgatact 3480 ctcgatatta ataaatctga ggattcagaa actgtaaact ctgcgtttac aggaacgatt 3540 ctgttctcct ctgaattaca tgaaaataaa tcctatattc cacaaaacgt agttctacac 3600 agtggatctc ttgtattgaa gccaaatacc gagcttcatg ttatttcttt tgagcagaaa 3660 gaaggctctt ctctcgttat gacacctgga tctgttcttt cgaaccagac tgttgctgat 3720 ggagctttgg tcataaataa catgaccatt gatttatcca gcgtagagaa aaatggtatt 3780 gctgaaggaa atatctttac tcctccagaa ttgagaatca tagacactac tacaggtgga 3840 agcggtggaa ccccatctac agatagtgaa agtaaccaga atagtgatga taccgaggag 3900 caaaataata atgacgcctc gaatcaagga gaaagcgcga atggatcgtc ttctcctgca 3960 gtagctgctg cacacacatc tcgtacaaga aactttgccg ctgcagctac agccacacct 4020 acgacaacac caacggctac aactacaaca agcaaccaag taatcctagg aggagaaatt 4080 aaactcatcg atcctaatgg gaccttcttc cagaaccctg cattaagatc cgaccaacaa 4140 atctccttgt tagtgctccc tacagactca tcaaaaatgc aagctcagaa aatagtactg 4200 acgggtgata ttgctcctca gaaaggatat acaggaacac tcactctgga tcctgatcaa 4260 ctacaaaatg gaacgatctc agtgctctgg aaaťttgact cttatagaca atgggcttat 4320 gtacctagag acaatcattt ctatgcgaac tcgattctgg gatctcaaat gttaatggtc 4380 acagtcaaac aaggcttgct caacgataaa atgaatctag ctcgctttga ggaagttagc 4440 tataacaacc tgtggatatc aggactagga acgatgctat cgcaagtagg aacacctact 4500 tctgaagaat tcacttatta cagcagagga gCttctgttg ccttagatgc taaaccagcc 4560 catgatgtga ttgttggagc tgcatttagt aagatgatcg ggaaaacaaa atccttgaaa 4620 agágagaata ačtacactca caaaggatcc gaatattctt accaagcatc ggtatacgga 4680 ggcaaaccat tccactttgt aatcaataaa aaaacggaaa aatcgctacc gctattgtta 4740 caaggagtca tctcttacgg atatatcaaa catgatacag tgactcacta tccaacgatc 4800 cgtgaacgaa acaaaggaga atgggaagac ttaggatggc tgacagctct ccgtgtctcc 4860 tctgtcttaa gaactccťgc acaaggggat actaaacgta tcactgttťa cggagaattg 4920 gaatactcca gtatccgtca gaaacaattc acagaaacag aatacgatcc tcgttacttc 4980 gacaactgca cctatagaaa cttagcaatt cctatggggt tagcattcga aggagagctc 5040 tctggtaacg aťattttgat gtacaacaga ttctctgtag catacatgct atcaatctat 5100 cgaaattctc caacatgcaa ataccaagtg ctctcttcag gagaaggcgg agaaattatt 5160 tgtggagtac cgacaagaaa ctcagctcgc ggagaataca gcacgcagct gtacctggga 5220 cctttgtgga ctctgtatgg atcctacacg atagaagcag acgcacatac actagctcat 5280 atgatgaact gcggtgctcg tatgacattc 5310 <210> 421 <211> 5253 <212> DNA <213> Chlamydia trachomatis serovar D <400> 421 atgaaatggc tgtcagctac tgcggtgttt gctgctgttc tcccctcagt ttcagggttt 60 tgcttcccag aacctaaaga attaaatttc tctcgcgtag gaacttcttc ctctaccact 120 tttactgaaa.cagttggaga agctggggca gaatatatcg tctctggtaa cgcatctttc 180 acaaaattta ccaacattcc tactaccgat acaacaactc ccacgaactc aaactcctct 240 agctctaacg gagagactgc ttccgtttct gaggatagtg actctacaac aacgactcct 300 gatcctaaag gtggcggcgc cttttataac gcgcactccg gagttttatc ctttatgaca 360 cgatcaggaa.cagaaggttc cttaactctg tctgagataa aaataactgg tgaaggcggt 420 gctatcttct ctcaaggaga gctgctattt acagatctga caggtctaac catccaaaat 480 aacttatccc agctatccgg aggagcgatt tttggagaat ctacaatctc cctatcaggg 540 attactaaag cgactttctc ctccaactct gcagaagttc ctgctcctgt taagaaacct 600 acagaaccta aagctcaaac agcaagcgaa acgtcgggtt ctagtagttc tagcggaaat 660 gattcggtgt cttcccccag ttccagtaga gctgaacccg cagcagctaa tcttcaaagt 720 cactttattt gtgctacagc tactcctgct gctcaaaccg atacagaaac atcaactccc 780 tctcataagc' caggatctgg gggagctatc tatgctaaag gcgaccttac tatcgcagac 840 tctcaagagg tactattctc aataaataaa gctactaaag atggaggagc gatctttgct 900 gagaaagatg tttctttcga gaatattaca tcattaaaag tacaaactaa cggtgctgaa 960 gaaaagggag gagctatcta tgctaaaggt gacctctcaa ttcaatcttc taaacagagt 1020 ctttttaatt ctaactacag taaacaaggt ggtggggctc tatatgttga aggagatata 1080 » 9999
9 • 9 99
99
9 » · 99 9
9 9 9 9 9 ι ·.
9 9'
384 aacttccaag atcttgaaga aattcgcatt aagtacaata aagctggaac gttcgaaaca 1140 aaaaaaatca ctttaccaaa agctcaagca tctgcaggaa atgcagatgc ttgggcctct 1200 tcctctcctc aatctggttc tggagcaact acagtctcca actcaggaga ctctagctct 1260 ggctcagact cggatacctc agaaacagtt ccagccacag ctaaaggcgg tgggctttat 1320 actgataaga atctttcgat tactaacatc acaggaatta tcgaaattgc aaataacaaa 1380 gcgacagatg ttggaggtgg tgcttacgta aaaggaaccc ttacttgtga aaactctcac 1440 cgtctacaat ttttgaaaaa ctcttccgat aaacaaggtg gaggaatcta cggagaagac 1500 aacatcaccc tatctaattt gacagggaag actctattcc aagagaatac tgccaaagaa 1560 gagggcggtg gactcttcat aaaaggtaca gataaagctc ttacaatgac aggactggat 1620 agtttctgtt taattaataa cacatcagaa aaacatggtg gtggagcctt tgttaccaaa 1680 gaaatctctc agacttacac ctctgatgtg gaaacaattc caggaatcac gcctgtacat 1740 ggtgaaacag tcattactgg caataaatct acaggaggta atggtggagg cgtgtgtaca 1800 aaacgtcttg ccttatctaa ccttcaaagc atttctatat ccgggaattc tgcagctgaa 1860 aatggtggtg gagcccacac atgcccagat agcttcccaa cggcggatac tgcagaacag 1920 cccgcagcag cttctgccgc gacgtctact cccgagtctg ccccagťggt ctcaactgct 1980 ctaagcacac cttcatcttc taccgtctct tcattaacct tactagcagc ctcttcacaa 2040 gcctctcctg caacctctaa taaggaaact caagatccta atgctgatac agacttattg 2100 atcgattatg tagttgatac gactatcagc aaaaacactg ctaagaaagg cggtggaatc 2160 tatgctaaaa aagccaagat gtcccgcata gaccaactga atatctctga gaactccgct 2220 acagagatag gtggaggtat ctgctgtaaa gaatctttag aactagatgc cctagtctcc 2280 ttatctgtaa cagagaacct tgttgggaaa gaaggtggag gcttacatgc taaaactgta 2340 aatatttcta atctgaaatc aggcttctct ttctcgaaca acaaagcaaa ctcctcatcc 2400 acaggagtcg caacaacagc ttcagcacct gctgcagctg ctgcttccct acaagcagcc 2460 gcagcagccg taccatcatc tccagcaaca ccaacttatt caggtgtagt aggaggagct 2520 atctatggag aaaaggttac attctctcaa tgtagcggga cttgtcagtt ctctgggaac 2580 caagctatcg ataacaatcc ctcccaatca tcgttgaacg tacaaggagg agccatctat 2640 gccaaaacct ctttgtctat tggatcttcc gatgctggaa cctcctatat tttctcgggg 2700 aacagtgtct ccactgggaa atctcaaaca acagggcaaa tagcgggagg agcgatctac 2760 tcccctactg ttacattgaa ttgtcctgcg acattctcta acaatacagc ctctatggct 2820 acaccaaaga· cttcttctga agatggatcc tcaggaaatt ctattaaaga taccattgga 2880 ggagccattg cagggacagc cattacccta tctggagtct ctcgattttc agggaatacg 2940 gctgatttag gagctgcaat aggaactcta gctaatgcaa atacacccag tgcaactagc 3000 ggatctcaaa atagcattac agaaaaaatt actttagaaa acggttcttt tatttttgaa 3060 agaaaccaag ctaataaacg tggagcgatt tactctccta gcgtttccat taaagggaat 3120 aatattacct tcaatcaaaa tacatccact catgatggaa gtgctatcta ctttacaaaa 3180 gatgctacga ttgagtcttt aggatctgtt ctttttacag gaaataacgt tacagctaca 3240 caagctagtt ctgcaacatc tggacaaaat acaaatactg ccaactatgg ggcagccatc 3300 tttggagatc caggaaccac tcaatcgtct caaacagatg ccattttaac ccttcttgct 3360 tcttctggaa acattacttt tagcaacaac agtttacaga ataaccaagg tgatactccc 3420 gctagcaagt tttgtagtat tgcaggatac gtcaaactct ctctacaagc cgctaaaggg 3480 aagactatta gctttttcga ttgtgtgcac acctctacca aaaaaatagg ttcaacacaa 3540 aacgtttatg aaactttaga tattaataaa gaagagaaca gtaatccata tacaggaact 3600 attgtgttct cttctgaatt acatgaaaac aaatcttaca tcccacagaa tgcaatcctt 3660 cacaacggaa ctttagttct taaagagaaa acagaactcc acgtagtctc ttttgagcag 3720 aaagaagggt ctaaattaat tatgaaaccc ggagctgtgt tatctaacca aaacatagct 3780 aacggagctc tagttatcaa tgggttaacg attgatcttt ccagtatggg gactcctcaa 3840 gcaggggaaa tcttctctcc tccagaatta cgtatcgttg ccacgacctc tagtgcatcc 3900 ggaggaagcg gggtcagcag tagtatacca acaaatccta aaaggatttc tgcagcagcg 3960 ccttcaggtt ctgccgcaac tactccaact atgagcgaga acaaagtttt cctaacagga 4020 gaccttactt taatagatcc taatggaaac ttttaccaaa accctatgtt aggaagcgat 4080 ctagatgtac cactaattaa gcttccgact aacacaagtg acgtccaagt ctatgattta 4140 actttatctg gggatctttt ccctcagaaa gggtacatgg gaacctggac attagattct 4200 aatccacaaa cagggaaact tcaagccaga tggacattcg atacctatcg tcgctgggta 4260 tacataccta gggataatca tttttatgcg aactctatct taggctccca aaactcaatg 4320 attgttgtga agcaagggct tatcaacaac atgttgaata atgcccgctt cgatgatatc 4380 gcttacaata acttctgggt ttcaggagta ggaactttct tagctcaaca aggaactcct 4440 ctttccgaag aattcagtta ctacagccgc ggaacttcag ttgccatcga tgccaaacct 4500 agacaagatt ttatcctagg agctgcattt agtaagatgg tggggaaaac caaagccatc 4560 aaaaaaatgc ataattactt ccataagggc tctgagtact cttaccaagc ttctgtctat 4620 ggaggtaaat tcctgtattt cttgctcaat aagcaacatg gttgggcact tcctttccta 4680 atacaaggag tcgtgtccta tggacatatt aaacatgata. caacaacact ttacccttct 4740 tt « e ® e « « · · · ··· · · · • ' · · · - · ···» ? 9 · . · . · · · · ·» · · . · · · · · · · · · ···· ··· ·· ·· ·· ·'·
385 atccatgaaa gaaataaagg agattgggaa gatttaggat ggttagcgga tcttcgtatc 4800 tctatggatc ttaaagaacc ttctaaagat tcttctaaac ggatcactgt ctatggggaa 4860 cttgagtatt ccagcattcg ccagaaacag ttcacagaaa tcgattacga tccaagacac 4920 ttcgatgatt gtgcttacag aaatctgtcg cttcctgtgg gatgcgctgt cgaaggagct 4980 atcatgaact gtaatattct tatgtataat aagcttgcat tagcctacat gccttctatc 5040 tacagaaata atcctgtctg taaatatcgg gtattgtctt cgaatgaagc tggtcaagtt 5100 atctgcggag tgccaactag aacctctgct agagcagaat acagtactca actatatctt 5160 ggtcccttct ggactctcta cggaaactat actatcgatg taggcatgta tacgctatcg 5220 caaatgacta gctgcggtgc tcgcatgatc ttc 5253 <210> 422 <211> 1980 <212> DNA <213> Chlamydia trachomatis serovar D <400> 422 atgagcgaaa aaagaaagtc taacaaaatt attggtatcg acctagggac gaccaactct 60 tgcgtctctg ttatggaagg tggccaacct aaagttattg cctcttctga aggaactcgt 120 actactcctt ctatcgttgc ttttaaaggt ggcgaaactc ttgttggaat tcctgcaaaa 180 cgtcaggcag taaccaatcc tgaaaaaaca ttggcttcta ctaagcgatt catcggtaga 240 aaattctctg aagtcgaatc tgaaattaaa acagtcccct acaaagttgc tcctaactcg 300aaaggagatg cggtctttga tgtggaacaa aaactgtaca ctccagaaga aatcggcgct 360' cagatcctca tgaagatgaa ggaaactgct gaggcttatc tcggagaaac agtaacggaa 420.
gcagtcatta ccgtaccagc ttactttaac gattctcaaa gagcttctac aaaagatgct 480 ggacgtatcg caggattaga tgttaaacgc attattcctg aaccaacagc ggccgctctt 540 gcttatggta ttgataagga aggagataaa aaaatcgccg tcttcgactt aggaggagga 600 actttcgata tttctatctt ggaaatcggt gacggagttt ttgaagttct ctcaaccaac 660 ggggatactc acttgggagg agacgacttc gatggagtca tcatcaactg gatgcttgat 720 gaattcaaaa aacaagaagg cattgatcta agcaaagata acatggcttt gcaaagattg 780 aaagatgctg ctgaaaaagc aaaaatagaa ttgtctggtg tatcgtctac tgaaatcaat 840 cagccattca tcactatcga cgctaatgga cctaaacatt tggctttaac tctaactcgc 900 gctcaattcg aacacctagc ttcctctctc attgagcgaa ccaaacaacc ttgtgctcag 960 gctttaaaag atgctaaatt gtccgcttct gacattgatg atgttcttct agttggcgga 1020 atgtccagaa tgcctgcggt acaagcagtt gtaaaagaga tctttggtaa agagcctaat 1080 aaaggcgtca atccagatga agttgtagcg attggagctg ctattcaggg tggtgtcctc 1140 ggcggagaag tgaaagacgt tctgttgttg gatgtgattc ccctctcttt aggaattgag 1200 actctaggtg gggtcatgac tcctttggta gagagaaaca ctacaatccc tactcagaag 1260 aagcaaatct tctctacagc cgctgacaat cagccagcag tgactatcgt cgttcttcaa 1320 ggtgaacggc ctatggcgaa agacaataag gaaattggaa gatttgatct aacagacatt 1380 cctcctgctc ctcgcggcca tccacaaatt gaggtaacct tcgatattga tgccaacgga 1440 attttacacg tttctgctaa agatgctgct agtggacgcg aacaaaaaat ccgtattgaa 1500 gcaagctctg gattaaaaga agatgaaatt caacaaatga tccgcgatgc agagcttcat 1560 aaagaggaag acaaacaacg aaaagaagct tctgatgtga aaaatgaagc cgatggaatg 1620 atctttagag ccgaaaaagc tgtgaaagat taccacgaca aaattcctgc agaacttgtt 1680 aaagaaattg aagagcatat tgagaaagta cgccaagcaa tcaaagaaga tgcttccaca 1740 acagctatca aagcagcttc tgatgagttg agtactcata tgcaaaaaat cggagaagct 1800 atgcaggctc aatccgcatc cgcagcagca tcttctgcag cgaatgctca aggagggcca 1860 aacattaact ccgaagatct gaaaaaacat agtttcagca cacgacctcc agcaggagga 1920 agcgcctctt ctacagacaa cattgaagat gctgatgttg aaattgttga taaacctgag 1980 <210> 423 <211> 978 <212> DNA <213> Chlamydia trachomatis serovar D <400> 423 atggtttctc aaacagtgag tgtagcagta acaggaggaa cagggcaaat agcctatagc 60 tttctatttt ctctggctca tggagatgtt tttggccttg attgtggcat cgatctgcgt 120 atctacgata ttcctggaac agaaagggct ttatctggtg tgcgcatgga gctagatgat 180 ggtgctttcc ctttattaca gcgtgtgcag gtaacgacat cattgcatga tgcttttgat 240 ggcattgatg cggcattcct tatagggtca gttcctagag- gcccaggaat ggagagaaga 300 ·· ·» ··«· ·· ··<· • · 9 • ··· ·· • · • ··· • · · • t * ··« ··
386 gatcttctaa agaaaaatgg ggagattttt gctacgcaag gccaagcggg atgcaaagat ttttgttgtt gggaaccctg gcaatgaatc atgctcccag attattgaga aagaactttc cagaatcgta tgcatagcat gttatcgcat agagcagaag caagttgtgg tttggggaaa tcactccgcc aaacaagtgc attaatgacc gtcctatcgc agagacgata gcggatcgtg gtgccttctg tacagagtcg tggtagtgca gtaatcgaag gcttctgcag cacgagcttt agcagaggct gctcgatcaa gaatggtttt cttccggagt gtgttcggac cacaatccct atctttggtt tcccttgtcg aatgctagca acgggagaat ccttgggatg cctttatccg tgggaaaatg caaatatctc aaagctagcg tatctttg <210> 424 <211> 696 <212> DNA <213> Chlamydia trachomatis serovar D <400> 424 atgacaaagc atggaaaacg cattcgtggt atccaagaga tattctttgg gťgaagcgat agatatttta aaacagtgtc acggttgatg tgtctgttaa attagggatc gatccaagaa ggttcggttt ctttacctca cggtacaggt aaagttttgc ggagataagg ctgCagaggc tattgaagca ggagcggact gtagagaaaa tcaaaggtgg atgggttgac ttcgatgttg atgagagagg tcggaaagct aggaaaagtt ttgggtccaa aaagccggaa ctgtaacaac agatgtggtt aaaactgttg attgaattta aagctgatcg agctggtgta tgcaacgtcg gatagtgcgc aaatcaaaga aaatgtcgaa gcgttgtgtg cccgcaactg ctaaaggaca atatttagtt aatttcacta ggggttaccg tggatactag ggagttgatt gcgtta <210> 425 <211> 3756 <212> DNA <213> Chlamydia trachomatis serovar D gaaaagcttt tgaataccaa atgcgatgct tacctttatc ctgattttac attggttaga cacgagggaa tatatcagcc atggattacc atgaagtgat ttgatgagat cttacgattt ctactgtgcg agagtgatea gaattttagt ttgttggtag cggttgccac gaaaccttat cggaactgcg gagttgcgaa cagccttagt tttcctcgac gaacacaaca ttgctggata acgattggac ggctgtatca gcaagctctg gaatattatg gtcttcggca aaaagaagga ggaagattta tccaaggctt tcttcaggaa agctaagtcg tttcgatcaa gcaaattcgt ttttgctgct egaegaetta tcccgatatg gcctacgcct aaaaggtaaa gctttctttc taaagctaaa catggggcca
360
420
480
540
600
660
720
780
840
900
960
978
120
180
240
300
360
420
480
540
600
660
696 <400> 425 atgttcaagt aatcttgtcg gaagagcgag tataatgaag ccagaagagt ttaactgatg actgataagg cgttctccag tttagaatta atctatatcc cgagctttag cgttccttac gtagttgatg atgctaaaac gaaaatcacc cttaaagatt tccacaatta tataaattaa ttgagaaaag gagaagacat gaactaattc agaatgaatc aaagggttag gcccggagcg aagttcaaat aaaacattgg /“·+“ +- +V— a o c u c gtattcgtcg aaacggggat gaacctttat gaatcaattt ttccttatcg atattgatag gatattcaac gtttagagaa cggattcttc gcatcttaga caattattaa tttatcgcag tgcgcttatt ataaaaaatt aagatgttat ctatcgatga agaatcactg tctttgattt tcagtgtcet ggtcagcatc caagtcgtat tttagaagaa
-q t-i o γγΉ -p <->4- z-» dya gggaatcacc taaagaagaa tattaatggg tgaacaagaa aggaagttgg gaaaaaacgt agatgcagat ggattttgtc attagtttac tgcgggagtc gatgctcgca attacgacca cttcgatgct aggattccca cggcgcgttg tattgaccat tcgttctgga ctcttctgat gaaagatttc aaaaagaaag aagcagtttc gtcttcagag tet 12133 Ct tatagtgtta gaagtctata gcagagagag aaacattcta ttagaagctg cgcagaaaga attattgaag gcgttagttg gggaaagctg caatctttga aaagatccta ggagagcctg aaacgctata ttagacgacg aaatatttga ttggcaaacc ttggctagaa accctaactc ttcagccgttaagatatttt ttcaaatcgg aaattttccc + a γτπώπ+· ctttaaaggt tgggaaccat tcgttgtttc aaggaaatgt tcttcgacat ttttagctat agttcttttc gtaaagtttt gagagaaget agattgctgt cggattctta caactttagt atttaggccg aaacattatc ttcgtttgcg gacgagttcg tggaaaagat caggaaagat ctcaattatc agatcttcct gaagettget tatcaagtct O 3. ct 313 C t C C tcgtttccgt ccccatcatg tcaagtccac tttattttct taatgacctt gacgtttatc tgtagaggag agctgataac aagtactgct tggcgcagat cgaagctgct taatgctcga cgttggacgt tcaagtgact aatgggcgat ctctgttgga cgttcgagaa tatttctgct tcagtttatg
120
180
240
300
360
420
480
540
600
660
720
780
840
900
960
1020
1080
1140
1200
1260
1320
1380
387 «
gatcagacaa accctgtcgc agaattgacg cacaagcgtc gtctgtcagc attaggacct 1440 gggggattga atagagaaag agctgggttt gaagttcgag acgttcacgc aagecactat 1500 ggtagaattt gtccaattga gactcctgaa ggaccaaaca ttgggttgat tacttcactg 1560 tcttcctttg ctaagatcaa tgaatttgga ttcatagaga ctccttatcg tgtcgtgcgc 1620 gatggcatcg tgacagatga aattgagtat atgacagcag atgttgaaga agagtgtgtc 1680 attgctcagg cttctgcgga gctcgatgag tatgatatgt ttaaaactcc cgtatgctgg 1740 gctagataca aaggagaggc ttttgaagcc gacacaagta cggttacgca tatggacgtt 1800 tctccaaaac agctggtatc tgtggttacg gggctgattc ctttcttgga acacgacgat 1860 gctaaccgag ctcttatggg atcgaacatg caacggcagg ctgtaccatt attgaaaacg 1920 gaagctgcta ttgttggaac tggattagaa gggcgtgctg ccaaagattc tggagctatt 1980 attgtggctc aggaagatgg ggtagtcgaa tacgtagata gctatgagat tgtcgtagcg 2040 aagaagaata atccaacgct taaggatcgt tatcagctta aaaaattctt aagatccaac 2100 tccggaacat gcatcaacca aactcctttg tgttctgtgq gagatgtggt tacgcatgga 2160 gatgttttag cggatggccc agcaaccgat aaaggggaat tggctctťgg taaaaacgta 2220 ttagtagcct tcatgccttg gtacgggtat aacttcgaag atgcgattat catctccgag 2280 aggttgatta aacaagatgc gtacacttct atttacatag aagaatttga gttaacagct 2340 cgagatacaa aactcggtaa agaágaaatt actagagata ttcctaacgt ttctgaagag 2400 gttttggcaa atctcggaga ggatggtgtc gtccgtattg gggctgaagt caagccggga 2460 gatattcttg tcggtaaaat cactccgaaa tctgagacgg aactagctcc tgaagagcgt 2520 ttgttgcgag ctatttttgg agagaaggcg gcggacgtaa aagatgcctc tctaacggtt 2580 cctcctggta cagaaggagt cgtaatggat gtcaaagtat tcagcagaaa ggatcgcttg 2640 tccaagagcg atgatgaact ggttgaagaa gctgtgcatc ttaaggatct acagaaagaa 2700 tataagagtc agttagctca attgaaagta gaacatagag agaaactggg ggctctattg 2760 ctcaatgaaa aagctcctgc agcgattata caccgtcgtt cggcagatat tttggttcaa 2820 gaaggtgcta tttttgatca agagactatc gaactcttag aaagagagtc gctagttgat 2880 ttgctgatgg ctccttgtga catgtatgat gttttgaaag atattctttc tagctatgaa 2940 acagctgttc agcgtttgga agtcaattat aaaaccgaag ctgagcacat aaaagaaggt 3000 gatgctgact tagatcatgg agttatccga caagttaaag tttacgtggc ttccaagcga 3060 aaacttcaag ttggggataa aatggctgga cgtcacggaa acaagggagt ggtttccaag 3120 attgttccag aagcagacat gcctttctta gctaacggtg aaacagtaca gatgattttg 3180 aacccgttag gggtgccttc tcgaatgaac cttggacagg ttttagagac acatttagga 3240 tatgctgcaa aaactgcagg tatctatgtg aaaactccgg tctttgaagg gttcccagag 3300 tctcgtattt gggatatgat gatagagcag ggattgcccg aagatggtaa gtcttaccta 3360 tttgatggta aaáccggaga gcgtttcgat agcaaagtgg tcgttggata catctacatg 3420 ttgaaattga gtcacttaat tgctgataag atccacgctc gttctatagg accttactct 3480 ctcgttacgc agcaacctct tggaggtaaa gcgcagatgg gaggacagag attcggggaa 3540 atggaggtat gggctttaga ggcgtatggg gtagctcata tgttacaaga gattctgact 3600 gttaagtccg acgatgtttc gggaagaact cgtatctacg aatcaatcgt gaaaggagaa 3660 aacttacttc gttctggaac gcctgagtcg ttcaácgttt tgattaaaga aatgcaaggt 3720 ctagggcttg atgttcgccc tatggtagta gatgct 3756 <210> 426 <211> 894 <212> DNA <213> Chlamydia trachomatis serovar D <400> 426 atgttgaaaa ttgatttaac aggaaaaatt gctttcatag ccggcatagg cgatgataac 60 gggtatggct ggggcattgc caaaatgtta gcagaagcag gcgcaaccat acttgtgggg 120 acctgggttc ctatctataa aattttctct caatctttgg agttaggaaa attcaatgca 180 tctcgtgaac tctccaatgg agaattgcta actttcgcta aaatctatcc catggatgcc 240 agtttcgaca ccccagaaga tattcctcag gaaattttgg aaaataaacg. ttacaaagat 300 ctttctgggt acactgtatc cgaagttgta gaacaggtga aaaaacattt tggacacatt 360 gatattcttg ttcactcttt agcaaacagt ccggaaattg ctaaaccatt acttgatacc 420 tctcgtaaag gctatcttgc cgccttaagt acatccagct actcctttat cagccttctc 480 tctcattttg gcccaattat gaatgcagga gctagcacca tctctctaac ttatcttgct 540 tccatgcgtg ctgttccagg gtatggcgga ggaatgaacg cagcaaaagc tgctttagaa 600 agtgatacaa aagtactggc ttgggaagcc ggccgacgtt ggggagtccg agtgaatact 660 atctcggcag ggccattagc tagccgtgca ggaaaagcta ttggatttat tgagagaatg 720 gtggattact accaagactg ggctccacta ccttctccaa tggaagctga gcaagtaggc 780 gcagcagcag ccttcttagt ctctccccta gctagcgcaa ttacgggaga aactctctat 840 • · ·· ····
··
388 qtggatcacg gagccaatgt gatgggcata ggtccagaaa tgtttcctaa ggat
894 <210> 427 <211> 894 <212> DNA <213> Chlamydia trachomatis serovar D <400> 427 ' atgagtttac agaagttatt agttacagac attgacggga caattacaca tcaatcccac 60 ctacttcatg atcgtgttgt aaaggctttg catcaatact atgattctgg ttggcagtta 120 ttttttctaa ctggcagata tttttcttat gcatatcctc tttttcaaaa cttttcggtt 180 ccttttctat taggtagcca gaatggttct tccgtgtggt cctccacgga taaagagttt 240 atttattttc gtagcttgtc tcgagatttt ctatatgttt tagagaaata ttttgaagat 300 ttagatctca ttgcctgtat agaatctgga gcctctaatc gtgatgtata ctttcgaaag 360 ggattaggga aaacatctca ggaactcaaa gcgattcttg atgctgtgta ttttcctaca 420 ccagaagctg cgcgactgct ggtggatgtt cagggacatt tatcagaaga attttcttat 480 gaagattttg ccattgccaa atttttcggt gagagagagg aagtgaagaa aattatggat 540 agatttattc aatctccaga agtttcttca caggtaacca tgaattacat gcgttggcct 600 tttgatttca aatacgcagt gcttttactt actttaaaag atgtttcaaa aggttttgct 660 gtagatcaag ttgttcagac cttctataaa gagaataagc cttttattat ggcttctggg 720 gatgatgcta acgatatcga cctgctatct cgaggagatt ttaaaattgt tatacagacg 780 gctccagagg agatgcatgg attagcggac tttttggctc ccccggcgaa ggattttggt 840 attctctccg cctgggaagc tggtgagctg cgttacaaac agctagttaa tcct 894 <210> 428 · <211> 459 <212> DNA <213> Chlamydia trachomatis serovar D <400> 428 atgttgcgct tgtttcaaca tatattgtgt tttttagaag aagacccttc gtttgtagac 60 gtccctcaag agctttcttt tgtcaatgaa gctttctctg gttctatgcg ttgggaagta 120 ggtaggatgc taggctcttt acttctcctg ttagggatat ttggaggggg gtgtttgcta 180 tttcgacgtt ttttgcgttc ccgcggacat cttcctagcg gcaattcgtc cattaagatt 240 ttggatcaac gggttttggc ttcaaaaacc tccatctatg tgattaaagt agcgaacaag 300 actttagttg ttgctgagag aggagagcga gtgaccttat tatctgaatt tcctccgaat 360 acagatctta atgagctaat acagaaggat caaaaaaaac cttcgactcc tcgaggggag 420 atgctttcag gtttcttaaa gcaatttaaa gaaaagaaa 459 <210> 429 <211> 1707 <212> DNA <213> Chlamydia trachomatis serovar D <400> 429 atgccaaaac aagctgatta tacttgggga gcaaaaaaga atctcgatac gatagcttgc 60 ttaccagaag acgttaaaca atttaaagac cttctctacg cgatgtatgg cttcaccgcg 120 acagaagaag aacccactag cgaagtacat cctggtgcga tcctaaaagg tacagttgtt 180 gacataagca aagactttgt tgttgtagat gtcggcttaa aatctgaggg agttattcct 240 atgtctgagt ttatcgactc ttcagaaggt ttaactgtcg gagccgaagt cgaagtttac 300 ctagaccaaa ctgaggatga cgaaggaaaa gttgttttat ccagagaaaa agcaacaaga 360 caacgacaat gggaatacat tcttgctcac tgcgaggaag gttctattgt taagggacaa 420 attacccgaa aagttaaggg tggtttgatc gtagatattg gtatggaagc cttccttcca 480 ggatcccaaa tagacaataa gaagatcaag aacttagatg attacgtagg caaggtttgt 540 gagttcaaaa ttctcaaaat caacgtagat cgtcggaacg ttgttgtatc tagaagagaa 600 cttctcgaag ctgaacgcat ttctaagaaa. gcagagttga tcgagcaaat cactatcggt 660 gagcgtcgca aaggtatcgt taagaatatc acagatttcg gágtattctt ggatcttgat 720 ggcattgacg gcctactcca cattacágac atgacatgga aacgcattcg tcacccatcc 780 gaaatggttg aactcaacca agaattggaa gtcatcatcc ttagcgttga taaagáaaaa 840 ggtcgcgtag ctcttggcct caaacaaaaa gagcataatc cttgggaaga tattgagaag 900 aaatatcctc caggaaaacg tgttcgcgga aaaattgtta·aactccttcc ttatggagca 960 ·· ····
• to **♦· • · • ···
• · ·· • · . ···'·
389 tttattgaaa tcgaagaagg aattgaaggc cttattcacg tttcagagat gtcttgggtt 1020 aagaacattg tagatcctaa tgaagtggtc aacaaaggtg atgaagtcga agtagttgtt 1080 ctttctatcc aaaaagatga aggaaaaatc tctctcggtc tcaaacaaac aaaacacaat 1140 ccttgggata acattgaaga aaaatatcct atcggcctcc gcgtaacagc agaaattaaa 1200 aatctgacaa actacggagc tttcgttgag ttggagccag gaatcgaagg tttgatccat 1260 atctctgaca tgagttggat taaaaaagtt tcccatcctt cagagctctt caaaaaaggt 1320 aataccgtcg aagcagttat tctgtctgta gacaaagaaa gcaaaaaaat cactttgggc 1380 gtgaaacaat taactcctaa tccatgggat gagattgaag ttatgttccc tgtcggaagt 1440 gatatctctg gcgtagtaac taaaattacg gctttcggag ctttcgttga gttgcaaaat 1500 ggtatcgaag gactgatcca tgtatccgag ctttcagaga aaccttttgc taaaattgaa 1560 gatgttctct ctattggaga caaagtttct gctaaagtta tcaagctaga cccagatcac 1620 aagaaagttt ctctttctat taaagag.ttc cttgttcatg ggggagatgc tggtcacgat 1680 gcggaagaag aatcttctga cagagac 1707 <210> 430 <211> 1998 <212> DNA <213> Chlamydia trachomatis serovar D <400> 430 atggaatctt tgtctgttcg ttccactatc cctttacctc taggagccaa aaagctctcc 60 gctgatcgct accgtttttc tctattttct tcacaagccc agcaggttac tcttgtacta 120 ttagaccctc tttctgaaat tcatgaaatt cctctatctt ctaccgacca caggactgga 180 gccatctggc atatcgaaat tgcaggcatt tctagtgaat ggtcgtatgc ttataaacta 240 cgtggtacag acttgagctc tcaaaagttt gctacagatt cttacatcgc agacccttat 300 tctaagaata tctactcccc tcaactattt ggatccccta aacaagaaaa ggattacgca 360 tttagttacc tgaaacatga ggattttgac tgggaaggcg acactccttt gcaccttcca 420 aaagaaaatt acttcattta tgaaatgcat gttcggtcat tcacccgaga tccgtcttcc 480 caggtttccc atcctggaac tttccttggt attatcgaaa aaatagacca cctcaaacaa 540 ctaggcgttc atgcagttga actccttcct attttcgaat tcgatgaaac cgtccatcca 600 tttaaaaatc aggacttccc ccacctgtgt aactattggg ggtattcttc ggtgaatttt 660 ttctgcccct ctcgccgtta tacttatggg gcagaccctt gcgctccggc ccgagagttc 720 aagactcttg tcaaagcatt acaccgtgcg ggaatcgaag tcattctcga tgtcgttttc 780 aatcatacag gctttgaagg cacaagctgc cctcttccct ggatagatct agaatcctat 840 tatatggtca atgatcatgg ggatctcatg aatttctccg ggtgtggtaa tacagtcaat 900 accaacaccc. ccactactct gaaatggatt cttgatgctt tgcggtactg ggtacaggaa 960 atgcacgtag atggatttcg ttttgattta gcctcagtct tctctagaga tccacaagga 1020 gtccctctcc ctttaacccc cattttgcaa gctatatcct ctgattccat tttatcagaa 1080 actaaactga tcgctgaacc ttgggacgct ggaggtttgt atcagcttgg acacttcccc 1140 tctatatcaa cccgatggag cgagtggaat ggatgctacc gtgaccatgt aaaagccttc 1200 ctgaatggag atgctcatca agtaagttcc tttgcttcac gaatatctgg atctcatgac 1260 atctatccca atgggaaacc tacgaactcg attaactata tctqctctca tqatggcttc 1320 acactctacg atactgttgc ctataacgat aagcacaatg aagagaatgg tgaatacaat 1380 cgtgatggga cttcagcaaa ctatagctat aactttggct gcgaaggaga aacgacagat 1440 cccaccattt gcgctctacg tgaacgccaa atgaaaaact tctttcttgc tctcttttta 1500 tctcaaggaa ttcccatgat acaatccgga gatgaatatg ggcacacagc ttatggaaat 1560 aataatcact ggtgcttaga cacaaagatc aattactttc tttgggatcg attagctgaa 1620 aggaaagaac tgttttcttt cttatgccaa gtcattgctc tgcgcaaagc ttataccgaa 1680 ttattcaata cctctttctt atcagaagat acgattacct ggctaaatac aaaaggttct·1740 cccagagagt ggggagccga tcattatcta gcttttgagt tgaaacacct gaactacagt 1800 ttattcgtag cgttttatag tgggaatgaa cgtattgaga tctctttacc taaacctaga 1860 aaagaacatt tggcctatga aaaaattgta gatagcacaa caggattctt ttctcagata 1920 ttatctccca aactctctct tgaaccttat agctctttgg tagccatcag cagaagaaaa 1980 acctccttgg aatctaga 1998 <210> 431 <211> 609 <212> PRT <213> Chlamydia trachomatis serovar D <400> 431
Β · Φ · Φ Φ Φ Φ>' · · ,» · Φ ' Φ Φ '
Φ ΦΦΦ Φ Φ ΦΦ'Φ . .
• · -· Φ ΦΦ Φ1·Φ • ti' «φ φφφφ
ΦΦΦ
».Φ φφφ
Φ Φ Φ Φ
Φ'.Φ
390
| Met | Gly | Phe | Trp | Arg 5 | Thr | Ser | Ile | Met | Lys 10 | Met | Asn . | Arg | Ile | Trp 15 | Leu |
| Leu | Leu | Leu | Thr 20 | Phe | Ser | Ser | Ala | Ile 25 | His | Ser | Pro | Val | Gin 30 | Gly | Glu |
| Ser | Leu | Val 35 | Cys | Lys | Asn | Ala | Leu 40 | Gin | Asp | Leu | Ser | Phe 45 | Leu | Glu | His |
| Leu | Leu 50 | Gin | Val | Lys | Tyr | Ala 55 | Pro | Lys | Thr | Trp | Lys 60 | Glu | Gin | Tyr | Leu |
| Gly 65 | Trp | Asp | Leu | Val | Gin 70 | Ser | Ser | Val | Ser | Ala 75 | Gin | Gin | Lys | Leu | Arg 80 |
| Thr | Gin | Glu | Asn | Pro 85 | Ser | Thr | Ser | Phe | Cys 90 | Gin | Gin | Val | Leu | Ala 95 | Asp |
| Phe | Ile | Gly | Gly 100 | Leu | Asn | Asp | Phe | His 105 | Ala | Gly | Val | Thr | Phe 110 | Phe | Ala |
| Ile | Glu | Ser 115 | Ala | Tyr | Leu | Pro | Tyr 120 | Thr | Val | Gin | Lys | Ser 125 | Ser | Asp | Gly |
| Arg | Phe 130 | Tyr | Phe | Val | Asp | Ile 135 | Met | Thr | Phe | Ser | Ser 140 | Glu | Ilě | Arg | Val |
| Gly 145 | Asp | Glu | Leu | Leu | Glu 150 | Val | Asp | Gly | Ala | Pro 155 | Val | Gin | Asp | Val | Leu 160 |
| Ala | Thr | Leu | Tyr | Gly 165 | Ser | Asn | His | Lys | Gly 170 | Thr | Ala | Ala | Glu | Glu 175 | Ser |
| Ala | Ala | Leu | Arg 180 | Thr | Leu | Phe | Ser | Arg 185 | Met | Ala | Ser | Leu | Gly 190 | His | Lys |
| Val | Pro | Ser 195 | Gly | Arg | Thr | Thr | Leu 200 | Lys | Ile | Arg | Arg | Pro 205 | Phe | Gly | Thr |
| Thr | Arg 210 | Glu | Val | Arg | Val | Lys 215 | Trp | Arg | Tyr | Val | Pro 220 | Glu | Gly | Val | Gly |
| Asp 225 | Leu | Ala | Thr | Ile | Ala 230 | Pro | Ser | Ile | Arg | Ala 235 | Pro | Gin | Leu | Gin | Lys 240 |
| Ser | Met | Arg | Ser | Phe 245 | Phe | Pro | Lys | Lys | Asp 250 | Asp | Ala | Phe | His | Arg 255 | Ser |
| Ser | Ser | Leu | Phe 260 | Tyr | Ser | Pro | Met | Val 265 | Pro | His | Phe | Trp | Ala 270 | Glu | Leu |
| Arg | Asn | His 275 | Tyr | Ala | Thr | Ser | Gly 280 | Leu | Lys | Ser | Gly | Tyr 285 | Asn | Ile | Gly |
| Ser | Thr 290 | Asp | Gly | Phe | Leu | Pro 295 | Val | Ile | Gly | Pro | Val 300 | Ile | Trp | Glu | Ser |
| Glu 305 | Gly | Leu | Phe | Arg | Ala 310 | Tyr | Ile | Ser | Ser | Val 315 | Thr | Asp | Gly | Asp | Gly 320 |
| Lys | Ser | His | Lys | Val | Gly | Phe | Leu | Arg | Ile | Pro | • Thr | Tyr | Ser | Trp | Gin |
391
325 330 335
| Asp | Met | Glu | Asp 340 | Phe | Asp | Pro | Ser | Gly 345 | Pro | Pro | Pro | Trp | Glu 350 | Glu | Phe |
| Ala | Lys | Ile 355 | Ile | Gin | Val | Phe | Ser 360 | Ser | Asn | Thr | Glu | Ala 365 | Leu | Ile | Ile |
| Asp | Gin 370 | Thr | Asn | Asn | Pro | Gly 375 | Gly | Ser | Val | Leu | Tyr 380 | Leu | Tyr | Ala | Leu |
| Leu 385 | Ser | Met | Leu | Thr | Asp 390 | Arg | Pro | Leu | Glu | Leu 395 | Pro | Lys | His | Arg | Met 400 |
| Ile | Leu | Thr | Gin | Asp 405 | Glu | Val | Val | Asp | Ala 410 | Leu Asp | Trp Leu | Thr 415 | Leu | ||
| Leu | Glu | Asn | Val 420 | Asp | Thr | Asn | Val | Glu 425 | Ser | Arg | Leu | Ala | Leu 430 | Gly | Asp |
| Asn | Met | Glu 435 | Gly | Tyr | Thr | Val | Asp 440 | Leu | Gin | Val | Ala | Glu 445 | Tyr | Leu | Lys |
| Ser | Phe 450 | Gly | Arg | Gin | Val | Leu 455 | Asn | Cys | Trp | Ser | Lys 460 | Gly | Asp | Ile | Glu |
| Leu 465 | Ser | Thr | Pro | Ile | Pro 470 | Leu | Phe | Gly | Phe | Glu 475 | Lys | Ile | His | Pro | His 480 |
| Pro | Arg | Val | Gin | Tyr 485 | Ser | Lys | Pro | Ile | Cys 490 | Val | Leu | Ile | Asn | Glu 495 | Gin |
| Asp | Phe | Ser | Cys 500 | Ala | Asp | Phe | Phe | Pro 505 | Val | Val | Leu | Lys | Asp 510 | Asn | ASp |
| Arg | Ala | Leu 515 | Ile | Val | Gly | Thr | Arg 520 | Thr | Ala | Gly | Ala | Gly 525 | Gly | Phe | Val |
| Phe | Asn 530 | Val | Gin | Phe | Pro | Asn 535 | Arg | Thr | Gly | Ile | Lys 540 | Thr | Cys | Ser | Leu |
| Thr 545 | Gly | Ser | Leu | Ala | Val 550 | Arg | Glu | His | Gly | Ala 555 | Phe | Ile | Glu | Asn | Ile 560 |
| Gly | Val | Glu | Pro | His 565 | Ile | Asp | Leu | Pro | Phe 570 | Thr | Ala | Asn | Asp | Ile 575 | Arg |
| Tyr | Lys | Gly | Tyr 580 | Ser | . Glu | Tyr | Leu | Asp 585 | Lys | Val | Lys | Lys | Leu 590 | Val | Cys |
| Glri | Leu | Ile 595 | Asn | Asn | Asp | Gly | Thr 600 | Ile | Ile | Leu | Ala | Glu 605 | Asp | Gly | Ser |
Phe <210> 432 <211> 268 <212> PRT <213> Chlamydia trachomatis serovar D ·· • * *
«·· ··*· ···· ·· • .· · • :* · *·· » »i»
φφ • · ··«· •Φ φφφφ • . ·
392
| <400> 432 | Ser 5 | Pro Ser Phe | Leu Val 10 | His | Ile Trp Arg | Leu 15 | Phe | |||
| Met | Pro | Pro | Arg | |||||||
| Phe | Ala | Lys | Gly | Pro | Asn Tyr Ser | Leu Pro | Tyr | Ala Phe Leu | Cys | Ile |
| 20 | 25 | 30 | ||||||||
| Phe | Val | Ser | Val | Leu | Val Phe Leu | Pro Ile | Gly | Leu Trp Leu | Thr | Leu |
| 35 | 40 | 45 | ||||||||
| Pro | Ser | Phe | Leu | Asn | Phe Lys His | Ser Leu | Thr | Pro Ile Lys | Thr | Leu |
| 50 | 55 | 60 | ||||||||
| Phe | Leu | Thr | Cys | Thr | Glu Pro Pro | Cys Leu | Pro | Glu Pro Phe | Phe | Ser |
| 65 | 70 | 75 | 80 | |||||||
| Asp | Ile | Leu | His | Leu | Ser Ala Asp | Ser Pro | Pro | Ala Leu Gin | Thr | Phe |
| 85 | i. | 90 | 95 | |||||||
| Ser | Thr | Lys | Ser | Ala | Glu His Phe | Leu Asn | Glu | Leu Gly Val | Phe | Ser |
| 100 | 105 | 110 | ||||||||
| Phe | Ile | Ser | Ile | Glu | Lys Val Pro | Asp His | Lys | Gly Leu Ala | Ile | Ser |
| 115 | 120 | 125 | ||||||||
| Tyr | Ala | Leu | His | Thr | Pro Leu Ala | Phe Leu | Gly | Asn Gin Thr | His | Thr |
| 130 | 135 | 140 | ||||||||
| Phe | Ile | Gly | Tyr | Glu | Gly Gin Thr | Phe Pro | Ala | Leu Pro Phe | Phe | Gin |
| 145 | 150 | 155 | 160 | |||||||
| Ser | Leu | Glu | Leu | Pro | Thr Val Phe | Phe Ser | Gin | Gin Ala Leu | Ser | Gin |
| 165 | 170 | 175 | ||||||||
| Thr | Arg | •Ile | Pro | His | Gin Thr Leu | Ser Ile | Val | Thr Ser Leu | Ile | Asp |
| 180 | 185 | 190 | ||||||||
| Gin | Leu | Gin | Met | Asp | Pro Pro Ser | Ile Ile | Asp | Leu Ser Gin | Ile | Asp |
| 195 | 200 | 205 | ||||||||
| His | Tyr | Pro | Gly | Glu | Phe Val Val | Ser Leu | Ser | Ser Gly Thr | Leu | Leu |
| 210 | 215 | 220 | ||||||||
| Arg | Phe | Arg | Lys | Asp | Ser Phe Leu | Pro Gly | Ile | Gin His Tyr | Gin | Gin |
| 225 | 230 | 235 | 240 | |||||||
| Ala | Leu | Ser | Leu | Gly | Ala Phe Ser | Pro Gin | Gin | Ala Val Ile | Cys | Asp |
| 245 | 250 | 255 | ||||||||
| Len | Arg | Cys | Glu | Asp | Tyr Leu Leu | Leu Lys | Arg | Lys | ||
| 260 | 265 | |||||||||
| <210> 433 | ||||||||||
| <211> 221 | ||||||||||
| <212> PRT | ||||||||||
| <213> Chlamydia | trachomatis serovar D | |||||||||
| <400> 433 | ||||||||||
| Met | Lys | Lys | Phe | Ile | Tyr Lys Tyr | Ser Phe | Gly Ala Leu Leu | i Leu | i Leu |
7.J ·· ··«« 99 99 • · · · · · • ··· · · ··· • ··· ·· · · • · · · · · ···· ··* ·· ·· ····
9 9
9 9
9 9
9 9 ·
99
393
| 5 | 10 | 15 | |||||||||||||
| Ser | Gly | Leu | Ser | Gly | Leu | Ser | Ser | Cys | Cys | Ala | Asn | Ser | Tyr | Gly | Ser |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Thr | Leu | Ala | Lys | Asn | Thr | Ala | Glu | Ile | Lys | Glu | Glu | Ser | Val | Thr | Leu |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Arg | Glu | Lys | Pro | Asp | Ala | Gly | Cys | Lys | Lys | Lys | Ser | Ser | Cys | Tyr | Leu |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Arg | Lys | Phe | Phe | Ser | Arg | Lys | Lys | Pro | Lys | Glu | Lys | Thr | Glu | Pro | Val |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Leu | Pro | Asn | Phe | Lys | Ser | Tyr | Tkla | Asp | Pro | Met | Thr | Asp | Ser | Glu | Arg |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Lys | Asp | Leu | Ser | Phe | Val | Val | Ser | Ala | Ala | Ala | Asp | Lys | Šer | Ser | Ile |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Ala | Leu | Ala | Met | Ala | Gin | Gly | Glu | Ile | Lys | Gly | Ala | Leu | Ser | Arg | Ile |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Arg | Glu | Ile | His | Pro | Leu | Tkla | Leu | Leu | Gin | Ala | Leu | Ala | Glu | Asp | Pro |
| 130 | 135 | • | 140 | ||||||||||||
| Ala | Leu | Ile | Ala | Gly | Met | Lys | Lys | Met | Gin | Gly | Arg | Asp | Trp | Val | Trp |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Asn | Ile | Phe | Ile | Thr | Glu | Leu | Ser | Lys | Val | Phe | Ser | Gin | Ala | Ala | Ser |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Leu | Gly | Ala | Phe | Ser | Val | Ala | Asp | Val | Ala | Ala | Phe | Ala | Ser | Thr | Leu |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Gly | Leu | Asp | Ser | Gly | Thr | Val | Thr | Ser | Ile | Val | Asp | Gly | Glu | Arg | Trp |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Ala | Glu | Leu | Ile | Ásp | Val | Val | Ile | Gin | Asn | Pro | Ala | Ile |
210 215 220 <210> 434 <211> 490 <212> PRT
| <213> Chlamydia trachomatis serovar D |
| <400> 434 |
| Met Ser Asp Leu Ser Asp Leu Phe Lys Thr His Phe Thr Gin Tyr Ala |
| 5 10 15 |
| Ser Tyr Val Ile Leu Glu Arg Ala Ile Pro His Val Leu Asp Gly Leu |
| 20 25 30 |
| Lys Pro Val Gin Arg Arg Leu Leu Trp Thr Leu Phe Arg Met Asp Asp |
| 35 40 45 |
| Gly Lys Met His Lys Val Ala Asn Ile Tkla Gly Arg Thr Met Ala Leu |
| 50 55 60 |
| His Pro His Gly Asp Ala Pro Ile Val Glu Ala Leu Val Val Leu Ala |
St • · · ·
394
| Asn | Lys | Gly | Phe | Leu 85 | Ile | Glu | Thr | Gin | Gly 90 | Asn | Phe | Gly | Asn | Pro 95 | Leu |
| Thr | Gly | Asp | Pro 100 | His | Ala | Ala | Tkla | Arg 105 | Tyr | Ile | Glu | Ala | Arg 110 | Leu | Ser |
| Pro | Leu | Ala 115 | Lys | Glu | Val | Leu | Phe 120 | Asn | Thr | Asp | Leu | Met 125 | Thr | Phe | His |
| Asp | Ser 130 | Tyr | Asp | Gly | Arg | Glu 135 | Gin | Glu | Pro | Asp | Ile 140 | Leu | Ala | Ala | Lys |
| Ile 145 | Pro | Leu | Leu | Leu | Leu 150 | His | Gly | Val | Asp | Gly 155 | Ile | Ala | Val | Gly | Met 160 |
| Thr | Thr | Lys | Ile | Phe 165 | Pro | His | Asn | Phe | Cys 170 | Asp | Leu | Leu | Glu | Ala 175 | Gin |
| Ile | Ala | Ile | Leu- 180 | Asn | Asp | Gin | Pro | Phe 185 | Ser | Leu | Leu | Pro | Asp 190 | Phe | Pro |
| Pro | Gly | Gly 195 | Thr | Met | Asp | Ala | Ser 200 | Asp | Tyr | Gin | Asp | Gly 205 | Leu | Gly | Ser |
| Ile | Val 210 | Leu | Arg | Ala | Thr | Ile 215 | Asp | Ile | Ile | Asn | Asp 220 | Lys | Thr | Leu | Leu |
| Ile 225 | Lys | Glu | Ile | Cys | Pro 230 | Ser | Thr | Thr | Thr | Glu 235 | Thr | Leu | Ile | Arg | Ser 240 |
| Ile | Glu | Asn | Ala | Ala 245 | Lys | Arg | Gly | Ile | Ile 250 | Lys | Ile | Asp | Ser | Ile 255 | Gin |
| Asp | Phe | Ser | Thr 260 | Asp | Leu | Pro | His | Ile 265 | Glu | Ile | Lys | Leu | Pro 270 | Lys | Gly |
| Ile | Tyr | Ala 275 | Lys | Asp | Leu | Leu | Arg 280 | Pro | Leu | Tyr | Thr | His 285 | Thr | Glu | Cys |
| Gin | Val 290 | Ile | Leu | Thr | Ser | Arg 295 | Pro | Thr | Ala | Ile | Tyr 300 | Gin | Gly | Lys | Pro |
| Trp 305 | Glu | Thr | Thr | Ile | Ser 310 | Glu | Ile | Leu | Arg | Leu 315 | Gin | Thr | Lys | Thr | Leu 320 |
| Gin | Asn | Tyr | Leu | Lys 325 | Lys | Glu | Leu | Leu | Ile 330 | Leu | Glu | Asp | Ser | Leu 335 | Ser |
| Arg | Glu | Leu | Tyr 340 | His | Lys | Thr | Leu | Glu 345 | Tyr | Leu | Phe | Ile | Lys 350 | His | Lys |
| Leu | Tyr | Asp 355 | Thr | Val | Arg | Ser | Met 360 | Leu | Ser | Lys | Arg | Lys 365 | Thr | Ser | Pro |
| Ser | Ser 370 | Ser | Thr | Ile | His | Asn 375 | Ala | Val | Leu | Glu | Ala 380 | Leu | Thr | Pro | Phe |
| Leu | Asp | Thr | Leu | Pro | Ala | Pro | Asp | Lys | Gin | Ala | Thr | Ala | Gin | Leu | Ala |
385
390
395
400 • · · ·
395
| Ala | Leu | Thr | Ile | Lys | Lys | Ile | Leu | Cys | Phe | Asp | Glu | Asn | Ser | Tyr | Glu |
| 405 | 410 | 415 | |||||||||||||
| Lys | Glu | Leu | Ala | Cys | Leu | Glu | Lys | Lys | Arg | Ser | Ser | Val | Gin | Lys | Asp |
| 420 | 425 | 430 | |||||||||||||
| Leu | Ser | Gin | Leu | Lys | Lys | Tyr | Thr | Val | Leu | Tyr | Ile | Lys | Lys | Leu | Leu |
| 435 | 440 | 445 | |||||||||||||
| Glu | Thr | Tyr | Arg | Gin | Leu | Gly | His | Arg | Lys | Thr | Lys | Ile | Ala | Lys | Phe |
| 450 | 455 | 4 60 | |||||||||||||
| Asp | Asp | Leu | Pro | Thr | Glu | Arg | Val | Ser | Ala | His | Lys | Lys | Ala | Lys | Glu |
| 4 65 | 470 | 475 | 4 80 | ||||||||||||
| Leu | Ala | Ala | Leu | Asp | Gin | Glu | Glu | Asn | Phe |
485 490 «<210> 435 <211> 78 <212> PRT
| <213> Chlamydia | trachomatis | serovar | D |
| <400> 435 | |||
| Met Lys Glu Phe | Leu Ala Tyr | Ile Val | Lys Asn Leu Val Asp Lys Pro |
| 5 | 10 15 | ||
| Glu Glu Val His | Leu Lys Glu | Val Gin | Gly Thr Asn Thr Ile Ile Tyr |
| 20 | 25 | 30 | |
| Glu Leu Thr Val | Ala Lys Gly | Asp Ile | Gly Lys Ile Ile Gly Lys Glu |
| 35 | 40 | 45 | |
| Gly Arg Thr Ile | Lys Ala Ile | Arg Thr | Leu Leu Val Ser Val Ala Ser |
| 50 | 55 | 60 | |
| Arg Asp Asn Val | Lys Val Ser | Leu Glu | Ile Met Glu Glu Arg |
| 65 | 70 | 75 | |
| <210> 436 | |||
| <211> 647 | |||
| <212> PRT | |||
| <213> Chlamydia | trachomatis | serovar | D |
| <4O0> 436 | |||
| Met Glu Ser Glý | Pro Glu Ser | Val Ser | Ser Asn Gin Ser Ser Met Asn |
| 5 | 10 15 | ||
| Pro Ile Ile Ásn | Gly Gin Ile | Ala Ser | Asn Ser Glu Thr Lys Glu Ser |
| 20 | 25 | 30 | |
| Thr Lys Glu Ser | Glu Ala Ser | Pro Ser | Ala Ser Ser Ser Val Ser Ser |
| 35 | 40 | 45 | |
| Trp Ser Phe Leu | Ser Ser Ala | Lys His | Ala Leu Ile Ser Leu Arg Asp |
| 50 | 55 | 60 | |
| Ala Ile Leu Asn | Lys Asn Ser | Ser Pro | Thr Asp Ser Leu Ser Gin Leu |
• · · >· · • · · · · · · · ·
396
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Glu | Ala | Ser | Thr | Ser 85 | Thr | Ser | Thr | Val | Thr 90 | Arg | Val | Ala. | Ala | Arg 95 | Asp |
| Tyr | Asn | Glu | Ala 100 | Lys | Ser | Asn | Phe | Asp 105 | Thr | Ala | Lys | Ser | Gly 110 | Leu | Glu |
| Asn | Ala | Thr 115 | Thr | Leu | Ala | Glu | Tyr 120 | Glu | Thr | Lys | Met | Ala 125 | Asp | Leu | Met |
| Ala | Ala 130 | Leu | Gin | Asp | Met | Glu 135 | Arg | Leu | Ala | Lys | Gin 140 | Lys | Ala | Glu | Val |
| Thr 145 | Arg | Ile | Lys | Glu | Ala 150 | Leu | Gin | Glu | Lys | Gin 155 | Glu | Val | Ile | Asp | Lys 160 |
| Leu | Asn | Gin | Leu | Val 165 | Lys | Leu | Glu | Lys | Gin 170 | Asn | Gin | Thr | Leu | Lys 175 | Glu |
| Thr | Leu | Thr | Thr 180 | Thr | Asp | Ser | Ala | Asp 185 | Gin | Ile | Pro | Ala | Ile 190 | Asn | Ser |
| Gin | Leu | Glu 195 | Ile | Asn | Lys | Asn | Ser 200 | Ala | Asp | Gin | Ile | Ile 205 | Lys | Asp | Leu |
| Glu | Gly 210 | Gin | Asn | Ile | Ser | Tyr 215 | Glu | Ala | Val | Leu | Thr 220 | Asn | Ala | Gly | Glu |
| Val 225 | Ile | Lys | Ala | Ser | Ser 230 | Glu | Ala | Gly | Ile | Lys 235 | Leu | Gly | Gin | Ala | Leu 24 0 |
| Gin | Ser | Ile | Val | Asp’ Ala 245 | Gly | Asp | Gin | Ser 250 | Gin | Ala | Ala | Val | Leu 255 | Gin | |
| Ala | Gin | Gin | Asn 260 | Asn | Ser | Pro | Asp | Asn 265 | Ile | Ala | Ala | Thr | Lys 270 | Lys | Leu |
| Ile | Asp | Ala 275 | Ala | Glu | Thr | Lys | Val 280 | Asn | Glu | Leu | Lys | Gin 285 | Glu | His | Thr |
| Gly | Leu 290 | Thr | Asp | Ser | Pro | Leu 295 | Val | Lys | Lys | Ala | Glu 300 | Glu | Gin | Ile | Ser |
| Gin 305 | Ala | Gin | Lys | Asp | Ile 310 | Gin | Glu | Ile | Lys | Pro 315 | Ser | Gly | Ser | Asp | Ile 320 |
| Pro | Ile | Val | Gly | Pro 325 | Ser | Gly | Ser | Ala | Ala 330 | Ser | Ala | Gly | Ser | Ala 335 | Val |
| Gly | Ala | Leu | Lys 340 | Ser | Ser | Asn | Asn | Ser 345 | Gly | Arg | Ile | Ser | Leu 350 | Leu | Leu |
| Asp | Asp | Val 355 | Asp | Asn | Glu | Met | Ala 360 | Ala | Ile | Ala | Met | Gin 365 | Gly | Phe | Arg |
| Ser | Met 370 | Ile | Glu | Gin | Phe | Asn 375 | Val | Asn | Asn | Pro | Ala 380 | Thr | Ala | Lys | Glu |
| Leu 385 | Gin | Ala | Met | Glu | Ala 390 | Gin | Leu | Thr | Ala | Met 395 | Ser | Asp | Gin | Leu | Val 400 |
π
Ρ
97
| Gly Ala Asp | Gly Glu Leu 405 | Pro Ala | Glu | Ile 410 | Gin Ala | Ile Lys Asp 415 | Ala |
| Leu Ala Gin | Ala Leu Lys | Gin Pro | Ser | Thr | Asp Gly | Leu Ala Thr | Ala |
| 420 | 425 | 430 | |||||
| Met Gly Gin | Val Ala Phe | Ala Ala | Ala | Lys | Val Gly | Gly Gly Ser | Ala |
| 435 | 440 | 445 | |||||
| Gly Thr Ala | Gly Thr Val | Gin Met | Asn | Val | Lys Gin | Leu Tyr Lys | Thr |
| 450 | 455 | 460 | |||||
| Ala Phe Ser | Ser Thr Ser | Ser Ser | Ser | Tyr | Ala Ala | Ala Leu Ser | Asp |
| 465 | 470 | 475 | 480 | ||||
| Gly Tyr Ser | Ala Tyr Lys | Thr Leu | Asn | Ser | Leu Tyr | Ser Glu Ser | Arg |
| 4 85 | 490 | 495 | |||||
| Ser Gly Val | Gin Ser Ala | Ile Ser | Gin | Thr | Ala Asn | Pro Ala Leu | Ser |
| 500 | 505 | 510 | |||||
| Arg Ser Val | Ser Arg Ser | Gly Ile | Glu | Ser | Gin Gly | Arg Ser Ala | Asp |
| 515 | 520 | 525 | |||||
| Ala Ser Gin | Arg Ala Ala | Glu Thr | Ile | Val | Arg Asp | Ser Gin Thr | Leu |
| 530 | 535 | 540 | |||||
| Gly Asp Val | Tyr Ser Arg | Leu Gin | Val | Leu | Asp Ser | Leu Met Ser | Thr |
| 54 5 | 550 | 555 | 560 | ||||
| Ile Val Ser | Asn Pro Gin | Val Asn | Gin | Glu | Glu Ile | Met Gin Lys | Leu |
| 565 | 570 | 575 | |||||
| Thr Ala Ser | Ile Ser Lys | Ala Pro | Gin | Phe | Gly Tyr | Pro Ala Val | Gin |
| 580 | 585 | 590 | |||||
| Asn Ser Ala | Ásp Ser Leu | Gin Lys | Phe | Ala | Ala Gin | Leu Glu Arg | Glu |
| 595 | 600 | 605 | |||||
| Phe Val Asp | Gly Glu Arg | Ser Leu | Ala | Glu | Ser Arg | Glu Asn Ala | Phe |
| 610 | 615 | 620 | |||||
| Arg Lys Gin | Pro Ala Phe | Ile Gin | l3J.ll | Val | Leu Val | Asn.Ile Ala | Ser |
| 625 | 630 | 635 | 640 | ||||
| Leu Phe Ser | Gly Tyr Leu | Ser | |||||
| 645 | |||||||
| <210> 437 | |||||||
| <211> 231 | |||||||
| <212> PRT | |||||||
| <213> Chlamydia trachomatis serovar | D | ||||||
| <400> 437 | |||||||
| Met Met Glu | Val Phe Met | Asn Phe | Leu | Asp | > Gin Leu | Asp Leu Ile | Ile |
| 5 | 10 | 15 | |||||
| Gin Asn Lys | His Met Leu | i Glu His | : Thr | Phe | • Tyr Val | Lys Trp Ser | Lys |
| 20 | 25 | 30 |
• · · ·
398
| Gly | Glu | Leu 35 | Thr | Lys Glu | Gin | Leu 40 | Gin | Ala | Tyr | Ala | Lys 45 | Asp | Tyr | Tyr |
| Leu | His 50 | Ile | Lys | Ala Phe | Pro 55 | Lys | Tyr | Leu | Ser | Ala 60 | Ile | His | Ser | Arg |
| Cys 65 | Asp | Asp | Leu | Glu Ala 70 | Arg | Lys | Leu | Leu | Leu 75 | Asp | Asn | Leu | Met | Asp 80 |
| Glu | Glu | Asn | Gly | Tyr Pro 85 | Asn | His | Ile | Asp 90 | Leu | Trp | Lys | Gin | Phe 95 | Val |
| Phe | Ala | Leu | Gly 100 | Val Thr | Pro | Glu | Glu 105 | Leu | Glu | Ala | His | Glu 110 | Pro | Ser |
| Glu | Ala | Ala 115 | Lys | Ala Lys | Val | Ala 120 | Thr | Phe | Met | Árg | Trp 125 | Cys | Thr | Gly |
| Asp | Ser 130 | Leu | Ala | Ala Gly | Val 135 | Ala | Ala | Leu | Tyr | Ser 140 | Tyr | Glu | Ser | Gin |
| Ile 145 | Pro | Arg | Ile | Ala Arg 150 | Glu | Lys | Ile | Arg | Gly 155 | Leu | Thr | Glu | Tyr | Phe 160 |
| Gly | Phe | Ser | Asn | Pro Glu 165 | Asp | Tyr | Ala | Tyr 170 | Phe | Thr | Glu | His | Glu 175 | Glu |
| Ala | Asp | Val | Arg 180 | His Ala | Arg | Glu | Glu 185 | Lys | Ala | Leu | Ile | Glu 190 | Met | Leu |
| Leu | Lys | Asp 195 | Asp | Ala Asp | Lys | Val 200 | Leu | Glu | Ala | Ser | Gin 205 | Glu | Val | Thr |
| Gin | Ser 210 | Leu | Tyr | Gly Phe | Leu 215 | Asp | Ser | Phe | Leu | Asp 220 | Pro | Gly | Thr | Čys |
| Cys | Ser | Cys | His | Gin Ser | Tyr |
225 230 <210> 438 <211> 533 <212> PRT
| <213> Chlamydia | trachomatis | serovar | D |
| <400> 438 | |||
| Met Ser Asn Ser | Phe Arg Asp | Gin Glu | Gin Gly Leu Gin Ala Val Phe |
| 5 | 10 15 | ||
| Arg Ala Ala Arg | Val Ile Ser | His Met | Phe Ser Gin Thr Ile Gly Pro |
| 20 | 25 | 30 | |
| Tyr Gly Phe Ser | Thr Ile Val | His Asn | Val Gin Asp Thr Arg.Thr Thr |
| 35 | 40 | 45 | |
| Gin Asp Ser Gin | Ser Met Leu | Lys Asp | Ile Leu Phe Pro Asp Val Phe |
| 50 | 55 | 60 | |
| Glu Asn Ile Gly | Met Lys Leu | Ile Arg | Asp Thr Ala Leu Arg Thr Arg |
70 75· 80 • ·
399
| Met | Arg | Phe | Gly | Asp 85 | Gly | Ala | Lys |
| Leu | Leu | Ala | Glu 100 | Gly | Met | Thr | Gly |
| Glu | Ile | His 115 | Arg | Gly | Met | Leu | Leu 120 |
| Phe | Tyr 130 | Arg | Glu | Thr | Phe | Pro 135 | Leu |
| Val 145 | Ser | Ser | Ile | Ala | Arg 150 | Arg | Cys |
| Ser | Ser | Ala | Val | Gly 165 | Tyr | Gly | Gly |
| Glu | His | Glu | Glu 180 | His | Glu | Thr | Tyr |
| Trp | Asp | Phe 195 | Gly | Tyr | Ala | Ser | Pro 200 |
| Gly | Thr 210 | Val | Glu | Tyr | Ser | Gin 215 | Val |
| Leu 225 | His | Tyr | Ser | Asn | Pro 230 | Ser | Phe |
| Gin | Ala | Gly | Lys | Thr 245 | Pro | Leu | Val |
| Glu | Leu | Leu | Ala· 260 | Met | Leu | Glu | Mét |
| Val | Cys | Ala 275 | Val | Lys | Val | Ser | Gly 280 |
| Asp | Ile 290 | Ala | Val | Leu | Thr | Gly 295 | Ala |
| Glu 305 | Asp | Ser | Glu | Glu | Glu 310 | Arg | Ile |
| Gly | Ile | Cys | Val | Ser 325 | Ser | Thr | Ser |
| Asn | Lys | Gin | Arg 340 | Met | Ala | Glu | His |
| Ser | Phe | Ser 355 | Gin | Glu | Glu | Glu | Ala 360 |
| Ala | Arg 370 | Leu | Ser | Ser | Gly | Glu 375 | Val |
| Ile 385 | Pro | Gin | Glu | Glu | Ile 390 | Gly | Tyr |
| Thr | Thr 90 | Ala | Leu | Leu | Ile | Glu 95 | Ala |
| Ile 105 | Gin | Lys | Gly | Leu | Asp 110 | Pro | His |
| Ala | Glu | Lys | Lys | Ile 125 | Gin | Glu | Val |
| Ser | Asp | Leu | Glu 14 0 | His | Thr | Val | Tyr |
| Asn | Ser | Glu 155 | Ile | Ala | Ser | Val | Leu 160 |
| Lys | Asn 170 | Gly | Tyr | Tyr | Ile | Val 175 | Glu |
| Trp 185 | His | Ala | Glu | Glu | His 190 | Ala | Val |
| Tyr | Phe | Ile | Thr | His 205 | Ala | Glu | Thr |
| Tyr | Ile | Leu | Val 220 | Ser | Glu | Gin | Pro |
| Leu | Thr | Phe 235 | Leu | Gin | Ser | Val | Val 240 |
| Ile | Leu 250 | Ala | Glu | Ala | Phe | Asp 255 | Lys |
| Asn 265 | Gin | Ile | Glu | Arg | Val 270 | Phe | Pro |
| Lys | His | Ala | Arg | Glu 285 | Ser | Leu | Glu |
| Thr | Leu | Leu | Ser 300 | Glu | Met | Asp | Phe |
| Thr | Asn | Arg 315 | Leu | Gly | Phe | Val | Ala 320 |
| Leu | Cys 330 | Val | Pro | Arg | Glu | Thr 335 | Asp |
| Cys 345 | Ala | Phe | Leu | Gin | Asp 350 | Lys | Leu |
| Ser | Ala | Arg | Leu | Arg 365 | Arg | Arg | Leu |
| Cys | Ile | His | Ile 380 | Ala | Ala | Asp | Cys |
| Ile | Thr | Ser 395 | Ser | Ile | Arg | Ala | Met 400 |
• · © ·
400
| Thr | Glu | Ser | Leu | Arg 405 | Ser | Gly | Cys | Leu | Pro 410 | Gly | Gly | Gly | Cys | Ala 415 | Phe |
| Ile | Arg | Ala | Ala 420 | Arg | Glu | Ile | Ser | Val 425 | Pro | Leu | Ala | Leu | Ser 430 | Pro | Ser |
| Glu | Arg | Phe 435 | Gly | Phe | Leu | Ala | Val 440 | Leu | Ser | Ala | Ala | Glu 445 | Lys | Pro | Phe |
| Arg | Ala 450 | Ile | Val | Thr | Arg | Ser 455 | Arg | Arg | Val | Glu | Glu 460 | Glu | Val | Phe | Ser |
| Glu 465 | Val | Phe | Ser | Gin | Ala 470 | Asp | Trp | Arg | Val | Gly 475 | Phe | Asn | Gly | Val | Ser 480 |
| Gly | Phe | Val | Glu | Asp 485 | Ile | Val | Ser | Gin | Gly 490 | Ile | Cys | Asp | Gly | Ala 4 95 | Ser |
| Cys | Ile | Gin | Tyr 500 | Ala | Leu | Ser | His | Ala 505 | Val | Gly | Thr | Thr | Gly 510 | Leu | Leu |
| Leu | Thr | Ser 515 | Ala | Leu | Phe | Ile | Ala 520 | Ser | Gin | Glu | Pro | Met 525 | Leu | Arg | Glu |
| Glu | Asn | Ser | Glu | Glu |
530 <210> 439 <211> 465 <212> PRT
| <213> Chlamydia | trachomatis | serovar | D |
| <400> 439 | |||
| Met Asn Glu Ala | Phe Asp Cys | Val Val | Ile Gly Ala Gly Pro Gly Gly |
| 5 | 10 15 | ||
| Tyr Val Ala Ala | Ile Thr Ala | Ala Gin | Tkla Gly Leu Lys Thr Ala Leu |
| 20 | 25 | 30 | |
| Ile Glu Lys Arg | Glu Ala Gly | Gly Thr | Cys Leu Asn Arg Gly Cys Ile |
| 35 | 40 | 45 | |
| Pro Ser Lys Ala | Leu Leu Ala | Gly Ala | Glu Val Val Thr Gin Ile Arg |
| 50 | 55 | 60 | |
| His Ala Asp Gin | Phe Gly Ile | His Val | Glu Gly Phe Ser Ile Asn Tyr |
| 65 | 70 | 75 , . 80 | |
| Pro Ala Met Val | Gin Arg Lys | Asp Ser | Val Val Arg Ser Ile Arg Asp |
| 85 | 90 95 | ||
| Gly Leu Asn Gly | Leu Ile Arg | Ser Asn | Lys Ile Thr Val Phe Ser Gly |
| 100 | 105 | 110 | |
| Arg Gly Ser Leu | Ile Ser Ser | Thr Glu | Val Lys Ile Leu Gly Glu Asn |
| 115 | 120 | 125 | |
| Pro Ser Val Ile | Lys Ala His | Ser Ile | Ile Leu Ala Thr Gly Ser Glu |
| 130 | 135 | 140 |
oin.' • · · · ·· · · · • · · · · · ···· · · · • · · ·· · · ·· · ···· ··· ·· ·· ·· ·· v
401
| Pro Arg Ala 145 | Phe | Pro | Gly 150 | Ile | Pro | Phe | Ser Ala 155 | Glu | Ser | Pro | Arg | Ile 160 | |||
| Leu | Cys | Ser | Thr | Gly | Val | Leu | Asn | Leu | Lys | Glu | Ile | Pro | Gin | Lys | Met |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Ala | Ile | Ile | Gly | Gly | Gly | Val | Ile | Gly | Cys | Glu | Phe | Ala | Ser | Leu | Phe |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| His | Thr | Leu | Gly | Ser | Glu | Val | Ser | Val | Ile | Glu | Ala | Ser | Ser | Gin | Ile |
| 195' | 200 | 205 | |||||||||||||
| Leu | Ala | Leu | Asn | Asn | Pro | Asp | Ile | Ser | Lys | Thr | Met | Phe | Asp | Lys | Phe |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Thr | Arg | Gin | Gly | Leu | Arg | Phe | Val | Leu | Glu | Ala | Ser | Val | Ser | Asn | Ile |
| 225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
| Glu | Asp | Ile | Gly | Asp | Arg | Val | Arg | Leu | Thr | Ile | Asn | Gly | Asn | Val | Glu |
| 245 | 250 | 255 | |||||||||||||
| Glu | Tyr | Asp | Tyr | Val | Leu | Val | Ser | Ile | Gly | Arg | Arg | Leu | Asn | Thr | Glu |
| 260 | 265 | 270 | |||||||||||||
| Asn | Ile | Gly | Leu | Asp | Lys | Ala | Gly | Val | Ile | Cys | Asp | Glu | Arg | Gly | Val |
| 275 | 280 | 285 | |||||||||||||
| Ile | Pro | Thr | Asp | Ala | Thr | Met | Arg | Thr | Asn | Val | Pro | Asn | Ile | Tyr | Ala |
| 290 | 295 | 300 | |||||||||||||
| Ile | Gly | Asp | Ile | Thr | Gly | Lys | Trp | Gin | Leu | Ala | His | Val | Ala | Ser | His |
| 305 | 310 | 315 | 32Ó | ||||||||||||
| Gin | Gly | Ile | Ile | Ala | Ala | Arg | Asn | Ile | Ala | Gly | His | Lys | Glu | Glu | Ile |
| 325 | 330 | 335 | |||||||||||||
| Asp | Tyr | Ser | Ala | Val | Pro | Ser | Val | Ile | Phe | Thr | Phe | Pro | Glu | Val | Ala |
| 340 | 345 | 350 | |||||||||||||
| Ser | Val | Gly | Leu | Ser | Pro | Thr | Ala | Ala | Gin | Gin | Gin | Lys | Ile | Pro | Val |
| 355 | 360 | 365 | |||||||||||||
| Lys | Val | Thr | Lys | Phe | Pro | Phe | Arg | Ala | Ile | Gly | Lys | Ala | Val | Tkla | Met |
| 370 | 375 | 380 | |||||||||||||
| Gly | Glu | Ala | Asp | Gly | Phe | Ala | Ala | Ile | Ile | Ser | His | Glu | Thr | Thr | Gin |
| 385 | 390 | 395 | 400 | ||||||||||||
| Gin | Ile | Leu | Gly Ala | Tyr | Val | Ile | Gly | Pro | His | Ala | Ser | Ser | Leu | Ile | |
| 405 | 410 | 415 | |||||||||||||
| Ser | Glu | Ile | Thr | Leu | Ala | Val | Arg | Asn | Glu | Leu | Thr | Leu | Pro | Cys | Ile |
| 420 | 425 | 430 | |||||||||||||
| Tyr | Glu | Thr | Ile | His | Ala | His | Pro | Thr | Leu | Ala | Glu | Val | Trp | Ala | Glu |
| 435 | 440 | 445 | |||||||||||||
| Ser | Ala | Leu | Leu | Ala | Val | Asp | Thr | Pro | Leu | His | Met | Pro | Pro | Ala | Lys |
450 455 460
Lys • · · ·
w
402
465 <210> 440 <211> 122 <212> PRT <213> Chlamydia trachomatis serovar D <400> 440
| Met | Pro | Arg | Ile | Ile | Gly | Ile | Asp | Ile | Pro | Ala | Lys | Lys | Lys | Leu | Lys |
| 5 | 10 | 15 | |||||||||||||
| Ile | Ser | Leu | Thr | Tyr | Ile | Tyr | Gly | Ile | Gly | Pro | Ala | Leu | Ser | Lys | Glu |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Ile | Ile | Ala | Arg | Leu | Gin | Leu | Asn | Pro | Glu | Ala | Arg | Ala | Ala | Glu | Leu |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Thr | Glu | Glu | Glu | Val | Gly | Arg | Leu | Asn | Ala | Leu | Leu | Gin | Ser | Asp | Tyr |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Val | Val | Glu | Gly | Ašp | Leu | Arg | Arg | Arg | Val | Gin | Ser | Asp | Ile | Lys | Arg |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Leu | Ile | Thr | Ile | His | Ala | Tyr | Arg | Gly | Gin | Arg | His | Arg | Leu | Ser | Leu |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Pro | Val | Arg | Gly | Gin | Arg | Thr | Lys | Thr | Asn | Ser | Arg | Thr | Arg | Lys | Gly |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Lys | Arg | Lys | Thr | Val | Ala | Gly | Lys | Lys | Lys |
115 120 <210> 441 <211> 553 <212> PRT
| <213> Chlamydia trachomatis serovar D | |||||||||||||||
| <400> 441 | |||||||||||||||
| Met | Arg | Ile | Gly | Asp 5 | Pro | Met | Asn | Lys | Leu 10 | Ile | Arg | Arg | Ala | Val 15 | Thr |
| Ile | Phe | Ala | Val 20 | Thr | Ser | Val | Ala | Ser 25 | Leu | Phe | Ala | Ser | Gly 30 | Val | Leu |
| Glu | Thr | Sér 35 | Met | Ala | Glu | Ser | Leu 40 | Ser | Thr | Asn | Val | Ile 45 | Ser | Leu | Ala |
| Asp | Thr 50 | Lys | Ala | Lys | Asp | Asn 55 | Thr | Ser | His | Lys | Ser 60 | Lys | Lys | Ala | Arg |
| Lys 65 | Asn | His | Ser | Lys | Glu 70 | Thr | Pro | Val | Asp | Arg 75 | Lys | Glu | Val | Ala | Pro 80 |
| Val | His | Glu | Ser | Lys 85 | Ala | Thr | Gly | Pro | Lys 90 | Gin | Asp | Ser | Cys | Phe 95 | Gly |
| Arg | Met | Tyr | Thr 100 | Val | Lys | Val | Asn | Asp 105 | Asp | Arg | Asn | Val | Glu 110 | Ile | Thr |
• ···
403
| Gin | Ala | Val 115 | Pro | Glu | Tyr | Ala | Thr 120 | Val | Gly | Ser | Pro | Tyr 125 | Pro | Ile | Glu |
| Ile | Thr 130 | Ala | Thr | Gly | Lys | Arg 135 | Asp | Cys | Val | Asp | Val 140 | Ile | Ile | Thr | Gin |
| Gin 145 | Leu | Pro | Cys | Glu | Ala 150 , | Glu | Phe | Val | Arg | Ser 155 | Asp | Pro | Ala | Thr | Thr 160 |
| Pro | Thr | Alá | Asp | Gly 165 | Lys | Leu | Val | Trp | Lys 170 | Ile | Asp | Arg | Leu | Gly 175 | Gin |
| Gly | Glu | Lys | Ser 180 | Lys | Ile | Thr | Val | Trp 185 | Val | Lys | Pro | Leu | Lys 190 | Glu | Gly |
| Cys | Cys | Phe 195 | Thr | Ala | Ala | Thr | Val 200 | Cys | Ala | Cys | Pro | Glu 205 | Ile | Arg | Ser |
| Val | Thr 210 | Lys | Cys | Gly | Gin | Pro 215 | Ala | Ile | Cys | Val | Lys 220 | Gin | Glu | Gly | Pro |
| Glu 225 | Asn | Ala | Cys | Leu | Arg 230 | Cys | Pro | Val | Val | Tyr 235 | Lys | Ile | Asn | Ile | Val 240 |
| Asn | Gin | Gly | Thr | Ala 245 | Thr | Ala | Arg | Asn | Val 250 | Val | Val | Glu | Asn | Pro 255 | Val |
| Pro | Asp | Gly | Tyr 260 | Ala | His | Ser | Ser | Gly 265 | Gin | Arg | Val | Leu | Thr 270 | Phe | Thr |
| Leu | Gly | Asp 275 | Met | Gin | Pro | Gly | Glu 280 | His | Arg | Thr | Ile | Thr 285 | Val | Glu | Phe |
| Cys | Pro 290 | Leu | Lys | Arg | Gly | Arg 295 | Ala | Thr | Asn· | Ile | Ala 300 | Thr | Val | Ser- | Tyr |
| Cys 305 | Gly | Gly | His | Lys | Asn 310 | Thr | Ala | Ser | Val | Thr 315 | Thr | Val | Ile | Asn | Glu 320 |
| Pro | Cys | Val | Gin | Val 325 | Ser | Ile | Ala | Gly | Ala 330 | Asp | Trp | Ser | Tyr | Val 335 | Cys |
| Lys | Pro | Val | Glu 340 | Tyr | Val | Ile | Ser | Val 345 | Ser | Asn | Pro | Gly | Asp 350 | Leu | Val |
| Leu | Arg | Asp 355 | Val | Val | Val | Glu | Asp 360 | Thr | Leu | Ser | Pro | Gly 365 | Val | Thr | Val |
| Leu | Glu 370 | Ala | Ala | Gly | Ala | Gin 375 | Ile | Ser | Cys | Asn | Lys 380 | Val | Val | Trp | Thr |
| Val 385 | Lys | Glu | Leu | Asn | Pro 390 | Gly | Glu | Ser | Leu | Gin 395 | Tyr | Lys | Val | Leu | Val 400 |
| Arg | Ala | Gin | Thr | Pro 405 | Gly | Gin | Phe | Thr | Asn 410 | Asn | Val | Val | Val | Lys 415 | Ser |
| Cys | Ser | Asp | Cys 420 | Gly | Thr | Cys | Thr | Ser 425 | Cys | Ala | Glu | Ala | Thr 430 | Thr | Tyr |
| Trp | Lys | Gly | Val | Ala | Ala | Thr | His | Met | Cys | Val | Val | Asp | Thr | Cys | Asp |
·· 9 9 ··
404
| 435 | 440 | 445 | |||||||||||||
| Pro | Val | Cys | Val | Gly | Glu | Asn | Thr | Val | Tyr | Arg | Ile | Cys. | Val | Thr | Asn |
| 450 | 455 | 460 | |||||||||||||
| Arg | Gly | Ser | Ala | Glu | Asp | Thr | Asn | Val | Ser | Leu | Met | Leu | Lys | Phe | Ser |
| 465 | 470 | 475 | 480 | ||||||||||||
| Lys | Glu | Leu | Gin | Pro | Val | Ser | Phe | Ser | Gly | Pro | Thr | Lys | Gly | Thr | Ile |
| 485 | 490 | 4 95 | |||||||||||||
| Thr | Gly | Asn | Thr | Val | Val | Phe | Asp | Ser | Leu | Pro | Arg | Leu | Gly | Ser | Lys |
| 500 | 505 | 510 | |||||||||||||
| Glu | Thr | Val | Glu | Phe | Ser | Val | Thr | Leu | Lys | Ala | Val | Ser | Ala | Gly | Asp |
| 515 | 520 | 525 | |||||||||||||
| Ala | Arg | Gly | Glu | Tkla | Ile | Leu | Ser | Ser | Asp | Thr | Leu | Thr | Val | Pro | Val |
| 530 | 535 | 540 | |||||||||||||
| Ser | Asp | Thr | Glu | Asn | Thr | His | Ile | Tyr |
545 550 <2l0> 442 <211> 192 <212> PRT
| <213> Chlamydia | trachomatis | serovar | D |
| <400> 442 | |||
| Met Pro Glu Gly | Glu Met Met | His Lys | Leu Gin Asp Val Ue Asp Arg |
| 5 | 10 15 | ||
| Lys Leu-Leu Asp | Ser Arg Arg | Ue Phe | Phe Ser Glu Pro Val Thr Glu |
| 20 | 25 | 30 | |
| Lys Ser Ala Thr | Glu Ala Ile | Lys Lys | Leu Trp Tyr Leu Glu Leu Thr |
| 35 | 40 | 45 | |
| Asn Pro Gly Gin | Pro Ile Val | Phe Val | Ile Asn Ser Pro Gly Gly Ser |
| 50 | 55 | 60 | |
| Val Asp Ala Gly | Phe Ala Val | Trp Asp | Gin Ue Lys Met Ile Ser Ser |
| 65 | 70 | 75 80 | |
| Pro Leu Thr Thr | Val Val Thr | Gly Leu | .Ala Ala Ser Met Gly Ser Val |
| 85 | 90 95 | ||
| Leu Ser Leu Cys | Ala Val Pro | Gly Arg | Arg Phe Ala Thr Pro His Ala |
| 100 | 105 | 110 | |
| Arg Ile Met Ile | His Gin Pro | Ser Ile | Gly Gly Thr Ue Thr Gly Gin |
| 115 | 120 ' | 125 | |
| Ala Thr Asp Leu | Asp Ile His | Ala Arg | Glu Ue Leu Lys Thr Lys Ala |
| 130 | 135 | 140 | |
| Arg Ue Ile Asp | Val Tyr Val | Glu Ala | Thr Gly Gin Ser Arg Glu Val |
| 145 | 150 | 155 160 | |
| Ile Glu Lys Ala | Ue Asp Arg | Asp Met | Trp Met- Ser Ala Asn Glu Ala |
165 170 175 ·· φφφφ • '· φ φ ··· • · φφφ φ · • · · · φ φ · • · · φ φ '·
405
| Met Glu Phe Gly Leu Leu Asp Gly Ile Leu Phe Ser Phe Asn Asp Leu | |||
| 180 | 185 | 190 | |
| <210> | 443 | ||
| <211> | 275 | ||
| <212> | PRT | ||
| <213> | Chlamydia | trachomatis serovar | D |
<400> 443
| Met | Gly | Phe | Ser | Ser 5 | Leu | Leu | Thr | Thr | Cys 10 | Arg | Tyr | Leu | Leu | Tyr 15 | Ser |
| Gly | Ala | Gly | Asn 20 | Ser | Phe | Ile | Leu | Gly 25 | Glu | Ser | Met | Pro | Ser 30 | Leu | Glu' |
| Asp | Val | Leu 35 | Phe | Leu | Cys | Gin | Glu 40 | Glu | Met | Val | Asp | Gly 45 | Phe | Leu | Cys |
| Val | Glu 50 | Ser | Ser | Glu | Ile | Ala 55 | Asp | Ala | Lys | Leu | Thr 60 | Val | Phe | Asn | Ser |
| Asp 65 | Gly | Ser | Ile | Ala | Ser 70 | Met | Cys | Gly | Asn | Gly 75 | Leu | Arg | Cys | Ala | Met 80 |
| Ala | His | Val | Ala | Gin 85 | Cys | Phe | Gly | Leu | Glu 90 | Asp | Val | Ser | Ile | Glu 95 | Thr |
| Glu | Arg | Gly | Val 100 | Tyr | Gin | Gly | Lys | Phe 105 | Phe | Ser | Met | Asn | Arg 110 | Val | Leu |
| Val | Asp | Met 115 | Thr | Leu | Pro | Asp | Trp 120 | Lys | Lys | Ala | Glu | Arg 125 | Lys | Leu | Thr |
| His | Val 130 | Leu | Pro | Gly | Met | Pro 135 | Glu | Gin | Val | Phe | Phe 140 | Ile | Asp | Thr | Gly |
| Val 145 | Pro | His | Val | Val | Val 150 | Phe | Val | Ser | Asp | Leu 155 | Ser | Lys | Val | Pro | Val 160 |
| Gin | Glu | Trp | Gly | Ser 165 | Phe | Leu | Arg | Tyr | His 170 | Glu | Asp | Phe | Ala | Pro 175 | Glu |
| Gly | Val | Asn | Val 180 | Asp | Phe | Val | Gin | Arg 185 | Lys | Lys | Asp | Asp | Leu 190 | Leu | Leu |
| Val | Tyr | Thr 195 | Tyr | Glu | Arg | Gly | Cys 200 | Glu | Arg | Glu | Thr | Leu 205 | Ser | Cys | Gly |
| Thr | Gly 210 | Met | Leu | Ala | Ser | Ala 215 | Leu | Val | Ala | Ala | Asp 220 | Ile | Phe | Ser | Leu |
| Gly 225 | Gin | Asp | Phe | Ser | Ile 230 | Ala | Val | Cys | Ser | Arg 235 | Ser | Arg | Asn | Leu | Ile 240 |
| Lys | Ile | Phe | Ser | Glu | Lys | Gly | Lys | Val | Phe | Leu | Glu | Gly | Pro | Val | Ser |
245 250 255
Leu Leu Asn Arg Ser Glu Asn Phe Gly Trp Leu Glu Pro Lys Ser Arg ···«···· . *<ř *· · * ···· • · · ··· « · * *· ·*· · ·’ 444 4 4 ·
406
260 265 270
Arg Phe Gly 275 <210> 444 <211> 1770 <212> PRT <213> Chlamydia trachomatis serovar D <400> 444
| Met | Lys | Phe | Met | Ser 5 | Ala | Thr | Ala |
| Val | Thr | Glu | Ala 20 | Ser | Ser | Ile | Gin |
| Asn | Val | Ser 35 | Lys | Leu | Gly | Tyr | Ser 40 |
| Met | Leu 50 | Ala | Asp | Asn | Thr | Glu 55 | Tyr |
| Tyr 65 | Asp | Phe | Ser | Thr | Ser 70 | Ser | Arg |
| Ser | Ser | Glu | Ala | Ser 85 | Pro | Thr | Thr |
| Gly | Glu | Thr | Asp 100 | Glu | Lys | Thr | Glu |
| Ile | Tyr | Ala 115 | Arg | Glu | Lys | Leu | Thr 120 |
| Ser | Asn 130 | Gin | Ser | Ile | Glu | Leu 135 | His |
| Gly 145 | Glu | Val | Ile | Phe | Asp 150 | His | Arg |
| Ile | Tyr | Gly | Glu | Lys 165 | Glu | Val | Val |
| Val | Glu | Val | Asn 180 | Ile | Ala | Val | Glu |
| Glu | Arg | Val 195 | Ser | Leu | Glu | Asn | Val 200 |
| Gly | Gly 210 | Glu | Gin | Gly | Gly | Gly 215 | Gly |
| Ile 225 | Ser | Asp | Cys | Asn | Asn 230 | Val | His |
| Thr | Ala | Val | Lys | Gin 245 | Cys | Leu | Asp |
| Glu | Cys | Val | Asp | Ser | Leu | Ser | Glu |
| Val | Phe 10 | Ala | Ala | Ala | Leu | Ser 15 | Ser |
| Asp 25 | Gin | Ile | Lys | Asn | Thr 30 | Asp | Cys |
| Thr | Ser | Gin | Ala | Phe 45 | Thr | Asp | Met |
| Arg | Ala | Ala | Asp 60 | Ser | Val | Ser | Phe |
| Leu | Pro | Arg .75 | Lys | His | Leu | Ser | Ser 80 |
| Glu | Gly 90 | Val | Ser | Ser | Ser | Ser 95 | Ser |
| Glu 105 | Glu | Leu | Asp | Asn | Gly Gly 110 | Ile | |
| Ile | Ser | Glu | Ser | Gin 125 | Asp | Ser | Leu |
| Asp | Asn | Ser | Ile 140 | Phe | Phe | Gly | Glu |
| Val | Ala | Leu 155 | Lys | Asn | Gly | Gly | Ala 160 |
| Phe | Glu 170 | Asn | Ile | Lys | Ser | Leu 175 | Leu |
| Lys 185 | Gly | Gly | Ser | Val | Tyr 190 | Ala | Lys |
| Thr | Glu | Ala | Thr | Phe 205 | Ser | Ser | Asn |
| Ile | Tyr | Ser | Glu 220 | Gin | Asp | Met | Leu |
| Phe | Gin | Gly 235 | Asn | Ala | Ala | Gly | Ala 240 |
| Glu | Glu 250 | Met | Ile | Val | Leu | Leu 255 | Ala |
| Asp | Thr | Leu | . Asp | Ser | Thr | Pro | Glu |
» ···· ·· ·-· · · · • ·♦· · · ··« ·· ···« · '· « • · ·
407
| 260 | 2 65 | 270 | |||||||||||||
| Thr | Glu | Gin | Thr | Glu | Ser | Asn | Gly | Asn | Gin | Asp | Gly | Ser | Ser | Glu | Thr |
| 275 | 280 | 285 | |||||||||||||
| Glu | Asp | Thr | Gin | Val | Ser | Glu | Ser | Pro | Glu | Ser | Thr | Pro | Ser | Pro | Asp |
| 290 | 295 | 300 | |||||||||||||
| Asp | Val | Leu | Gly | Lys | Gly | Gly | Gly | Ile | Tyr | Thr | Glu | Lys | Ser | Leu | Thr |
| 305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
| Ile | Thr | Gly | Ile | Thr | Gly | Thr | Ile | Asp | Phe | Val | Ser | Asn | Ile | Ala | Thr |
| 325 | 330 | 335 | |||||||||||||
| Asp | Ser | Gly | Ala | Gly | Val | Phe | Thr | Lys | Glu | Asn | Leu | Ser | Cys | Thr | Asn |
| 340 | 345 | 350 | |||||||||||||
| Thr | Asn | Ser | Leu | Gin | Phe | Leu | Lys | Asn | Ser | Tkla | Gly | Gin | His | Gly | Gly |
| 355 | 360 | 365 | |||||||||||||
| Gly | Ala | Tyr | Val | Thr | Gin | Thr | Met | Ser | Val | Thr | Asn | Thr | Thr | Ser | Glu |
| 370 | 375 | 380 | |||||||||||||
| Ser | Ile | Thr | Thr | Pro | Pro | Leu | Ile | Gly | Glu | Val | Ile | Phe | Ser | Glu | Asn |
| 385 | 390 | 395 | 400 | ||||||||||||
| Thr | Ala | Lys | Gly | His | Gly | Gly | Gly | Ile | Cys | Thr | Asn | Lys | Leu | Ser | Leu |
| 4 05 | 410 | 415 | |||||||||||||
| Ser | Asn | Leu | Lys | Thr | Val | Thr | Leu | Thr | Lys | Asn | Ser | Ala | Lys | Glu | Ser |
420 425 430
| Gly Gly | Ala 435 | Ile | Phe | Thr Asp Leu 440 | Ala | Ser | Ile | Pro | Ile 445 | Thr | Asp Thr | |||||
| Pro | Glu | Ser | Ser | Thr | Pro | Ser | Ser | Ser | Ser | Pro | Ala | Ser | Thr | Pro | Glu | |
| 450 | 455 | 4 60 | ||||||||||||||
| Val | Val | Tkla | Ser | Ala | Lys | Ile | Asn | Arg | Phe | Phe | Ala | Ser | Thr | Ala | Lys | |
| 465 | 470 | 475 | 480 | |||||||||||||
| Pro | Ala | Tkla | Pro | Ser | Leu | Thr | Glu | Ala | Glu | Ser | Asp | Gin | Thr | Asp | Gin | |
| 485 | 490 | 4 95 | ||||||||||||||
| Thr | Glu | Thr | Ser | Asp | Thr | Asn | Ser | Asp | Ile | Asp | Val | Ser | Ile | Glu | Asn | |
| 500 | 505 | 510 | ||||||||||||||
| Ile | Leu | Asn | Val | Tkla | Ile | Asn | Gin | Asn | Thr | Ser | Ala | Lys | Lys | Gly | Gly | |
| 515 | 520 | 525 | ||||||||||||||
| Tkla | Ile | Tyr | Gly | Lys | Lys | Ala | Lys | Leu | Ser | Arg | Ile | Asn | Asn | Leu | Glu | |
| 530 | 535 | 540 | ||||||||||||||
| Leu | Ser | Gly | Asn | Ser | Ser | Gin | Asp | Val | Gly | Gly | Gly | Leu | Cys | Leu | Thr | |
| 545 | 550 | 555 | 560 | |||||||||||||
| Glu | Ser | Val | Glu | Phe | Asp | Ala | Ile | Gly | Ser | Leu | Leu | Ser | His | Tyr | Asn | |
| 565 | 570 | 575 | ||||||||||||||
| Ser | Tkla | Ala | Lys | Glu | Gly | Gly | Ala | Ile | His | Ser | Lys | Thr | Val | Thr | Leu | |
| 580 | 585 | 590 |
'·· ···« • '· I’’· '· · • · <· · ·'· · · · • ··· • · .· · ·· ···· • '· · • · · '· · · · • · · · '·· -··
408
| Ser | Asn | Leu 595 | Lys | Ser | Thr | Phe | Thr 600 | Phe | Tkla | Asp | Asn | Thr 605 | Val | Lys | Ala |
| Ile | Val 610 | Glu | Ser | Thr | Pro | Glu 615 | Ala | Pro | Glu | Glu | Ile 620 | Pro | Pro | Val | Glu |
| Gly 625 | Glu | Glu | Ser | Thr | Ala 630 | Thr | Glu | Asp | Pro | Asn 635 | Ser | Asn | Thr | Glu | Gly 640 |
| Ser | Ser | Ala | Asn | Thr 645 | Asn | Leu | Glu | Gly | Ser 650 | Gin | Gly | Asp | Thr | Ala 655 | Asp |
| Thr | Gly | Thr | Gly 660 | Asp | Val | Asn | Asn | Glu 665 | Ser | Gin | Asp | Thr | Ser 670 | Asp | Thr |
| Gly | Asn | Ala 675 | Glu | Ser | Glu | Glu | Gin 680 | Leu | Gin | Asp | Ser | Thr 685 | Gin | Ser | Asn |
| Glu | Glu 690 | Asn | Thr | Leu | Pro | Asn 695 | Ser | Asn | Ile | Asp | Gin 700 | Ser | Asn | Glu | Asn |
| Thr 705 | Asp | Glu | Ser | Ser | Asp 710 | Ser | His | Thr | Glu | Glu 715 | Ile | Thr | Asp | Glu | Ser 720 |
| Val | Ser | Ser | Ser | Ser 725 | Glu | Ser | Gly | Ser | Ser 730 | Thr | Pro | Gin | Asp | Gly 735 | Gly |
| Ala | Ala | Ser | Ser 74 0 | Gly | Ala | Pro | Ser | Gly Ásp 745 | Gin | Ser | Ile | Ser 750 | Ala | Asn | |
| Ala | Cys | Leu 755 | Ala | Lys | Ser | Tyr | Ala 760 | Ala | Ser | Thr | Asp | Ser 765 | Ser | Pro | Val |
| Ser | Asn 770 | Ser | Ser | Gly | Ser | Glu 775 | Glu | Pro | Val | Thr | Ser 780 | Ser | Ser | Asp | Ser |
| Asp 785 | Val | Thr | Ala | Ser | Ser 790 | Asp | Asn | Pro | Asp | Ser 795 | Ser | Ser | Ser | Gly | Asp 800 |
| Ser | Ala | Gly | Asp | Ser 805 | Glu | Glu | Pro | Thr | Glu 810 | Pro | Glu | Ala | Gly | Ser 815 | Thr |
| Thr | Glu | Thr | Leu 820 | Thr | Leu | Ile | Gly | Gly 825 | Gly | Ala | Ile | Tyr | Gly 830 | Glu | Thr |
| Val | Lys | Ile 835 | Glu | Asn | Phe | Ser | Gly 840 | Gin | Gly | Ile | Phe | Ser 845 | Gly | Asn | Lys |
| Ala | Ile 850 | Asp | Asn | Thr | Thr | Glu 855 | Gly | Ser | Ser | Ser | Lys 860 | Ser | Asp | Val | Leu |
| Gly 865 | Gly | Ala | Val | Tyr | Ala 870 | Lys | Thr | Leu | Phe | Asn 875 | Leu | Asp | Ser | Gly | Ser 880 |
| Ser | Arg | Arg | Thr | Val 885 | Thr | Phe | Ser | Gly | Asn 890 | Thr | Val | Ser | Ser | Gin 895 | Ser |
| Thr | Thr | Gly | Gin 900 | Val | Ala | Gly | Gly | Ala 905 | Ile | Tyr | Ser | Pro | Thr 910 | Val | Thr |
• · · 9 · « 9 ''·
999
99 9
409
| Ile Ala | Thr 915 | Pro Val Val | Phe | Ser Lys Asn Ser Ala Thr Asn | Asn | Ala | |
| 920 | 925 | ||||||
| Asn Asn 930 | Thr | Thr Asp Thr | Gin 935 | Arg | Lys Asp Thr Phe Gly Gly 940 | Ala | Ile |
| Gly Ala 945 | Thr | Ser Ala Val 950 | Ser | Leu | Ser Gly Gly Ala His Phe 955 | Leu | Glu 960 |
| Asn Val | Ala | Asp Leu Gly 965 | Ser | Ala | Ile Gly Leu Val Pro Gly 970 | Thr 975 | Gin |
| Asn Thr | Glu | Thr Val Lys 980 | Leu | Glu | Sér Gly Ser Tyr Tyr Phe 985 990 | Glu | Lys |
| Asn Lys | Ala 995 | Leu Lys Arg | Ala | Thr Ile Tyr Ala Pro Val Val 1000 1005 | Ser | Ile | |
| Lys Ala Tyr 1010 | Thr Ala Thr | Phe Asn 1015 | Gin Asn Arg Ser Leu Glu 1020 | Glu | Gly | ||
| Ser Ala 1025 | Ile | Tyr Phe Thr Lys 1030 | Glu | Ala Ser Ile Glu Ser Leu 1035 | Gly | Ser 1040 | |
| Val Leu | Phe | Thr Gly Asn 1045 | Leu | Val | Thr Leu Thr Leu Ser Thr 1050 | Thr Thr 1055 | |
| Glu Gly | Thr | Pro Ala Thr 1060 | Thr | Ser | Gly Asp Val Thr Lys Tyr Gly 1065 1070 | Ala | |
| Ala Ile | Phe Gly Gin Ile 1075 | Ala | Ser Ser Asn Gly Ser Gin Thr 1080 1085 | Asp | Asn | ||
| Leu Pro Leu 1090 | Lys Leu Ile | Ala Ser 1095 | Gly Gly Asn Ile Cys Phe 1100 | Arg | Asn | ||
| Asn Glu 1105 | Tyr | Arg Pro Thr Ser 1110 | Ser | Asp Thr Gly Thr Ser Thr 1115 | Phe | Cys 1120 | |
| Ser Ile | Ala | Gly Asp Val 1125 | Lys | Leu | Thr Met Gin Ala Ala Lys 1130 | Gly Lys 1135 | |
| Thr Ile | Ser | Phe Phe Asp 1140 | Ala | Ile | Arg Thr Ser Thr Lys Lys Thr 1145 1150 | Gly | |
| Thr Gin | Ala Thr Ala Tyr 1155 | Asp | Thr Leu Asp Ile Asn Lys Ser 1160 1165 | Glu | Asp | ||
| Ser Glu Thr 1170 | Val Asn Ser | Ala Phe 1175 | Thr Gly Thr Ile Leu Phe 1180 | Ser | Ser | ||
| Glu Leu 1185 | His | Glu Asn Lys Ser 1190 | Tyr | Ile Pro Gin Asn Val Val 1195 | Leu | His 1200 | |
| Ser Gly | Ser | Leu Val Leu 1205 | Lys | Pro | Asn Thr Glu Leu His Val 1210 | Ile Ser 1215 | |
| Phe Glu | Gin | Lys Glu Gly 1220 | Ser | Ser | Leu Val Met Thr Pro Gly Ser 1225 1230 | Val | |
| Leu Ser | Asn | Gin Thr Val | Ala | Asp | Gly TKla Leu Val Ile Asn | Asn | Met |
'·· ··«· • · • ··♦
410
1235 1240 1245
| Thr | Ilě Asp 1250 | Leu | Ser | Ser | Val Glu 1255 | Lys Asn Gly | Ile Ala 1260 | Glu | Gly | Asn |
| Ile | Phe Thr | Pro | Pro | Glu | Leu Arg | Ile Ile Asp | Thr Thr | Thr | Gly | Gly |
| 1265 | 1270 | 1275 | 1280 | |||||||
| Ser | Gly Gly | Thr | Pro | Ser | Thr Asp | Ser Glu Ser | Asn Gin | Asn | Ser | Asp |
| 1285 | 1290 | 1295 | ||||||||
| Asp | Thr Glu | Glu | Gin | Asn | Asn Asn | Asp Ala Ser | Asn Gin | Gly | Glu | Ser |
| 1300 | 1305 | 1310 | ||||||||
| Ala | Asn Gly | Ser | Ser | Ser | .Pro Ala | Val Ala Ala | Ala His | Thr | Ser | Arg |
| 1315 | 1320 | 1325 | ||||||||
| Thr | Arg Asn | Phe | Ala | Ala | Ala Ala | Thr Ala Thr | Pro Thr | Thr | Thr | Pro |
| 1330 | 1335 | 1340 | ||||||||
| Thr | Ala Thr | Thr | Thr | Thr | Ser Asn | Gin Val Ile | Leu Gly | Gly | Glu | Ile |
| 1345 | 1350 | 1355 | 1360 | |||||||
| Lys | Leu Ile | Asp | Pro | Asn | Gly Thr | Phe Phe Gin | Asn Pro | Ala | Leu | Arg |
| 1365 | 1370 | 1375 | ||||||||
| Ser | Asp Gin | Gin | Tle | Ser | Leu Leu | Val Leu Pro | Thr Asp | Ser | Ser | Lys |
| 1380 | 1385 | 1390 | ||||||||
| Met | Gin Ala | Gin | Lys | Ile | Val Leu | Thr Gly Asp | Ile Ala | Pro | Gin | Lys |
| 1395 | 1400 | 1405 | ||||||||
| Gly | Tyr Thr | Gly | Thr | Leu | Thr Leu | Asp Pro Asp | Gin Leu | Gin | Asn | Gly |
| 1410 | 1415 | 1420 | ||||||||
| Thr | Ile Ser | Val | Leu | Trp | Lys Phe | Asp Ser Tyr | Arg Gin | Trp | Ala | Tyr |
| 1425 | 1430 | 1435 | 1440 | |||||||
| Val | Pro Arg | Asp | Asn | His | Phe Tyr | Ala Asn Ser | Ile Leu | Gly | Ser | Gin |
| 1445 | 1450 . | 1455 | ||||||||
| Met | Leu Met | Val | Thr | Val | Lys Gin | Gly Leu Leu | Asn Asp | Lys | Met | Asn |
| 1460 | 1465 | 1470 | ||||||||
| Leu | Ala Arg | Phe | Glu | Glu | Val Ser | Tyr Asn Asn | Leu Trp | Ile | Ser | Gly |
| 1475 | 1480 | 1485 | ||||||||
| Leu | Gly Thr | Met | Leu | Ser | Gin Val | Gly Thr Pro | Thr Ser | Glu | Glu | Phe |
| 1490 | 1495 | 1500 | ||||||||
| Thr | Tyr Tyr | Ser | Arg | Gly | Ala Ser | Val Ala Leu | Asp Ala | Lys | Pro | Ala |
| 1505 | 1510 | 1515 | 1520 | |||||||
| His | Asp Val | Ile | Val | Gly | Ala Ala | Phe Ser Lys | Met Ile | Gly | Lys | Thr |
| 1525 | 1530 | 1535 | ||||||||
| Lys | Ser Leu | Lys | Arg | Glu | Asn Asn | Tyr Thr His | Lys Gly | Ser | Glu | Tyr |
| 1540 | 1545 | 1550 | ||||||||
| Ser | Tyr Gin | Ala | Ser | Val | Tyr Gly | Gly Lys Pro | Phe His | Phe | Val | Ile |
| 1555 | 1560 | 1565 |
• · · · · « '·· ··<· • • · ·« *· ·« • * · • · ♦ ♦·
411
| Asn Lys Lys | Thr Glu Lys | Ser Leu 1575 | Pro | Leu | Leu | Leu Gin 1580 | Gly | Val | Ile | |
| 1570 | ||||||||||
| Ser | Tyr Gly | Tyr Ile Lys | His Asp | Thr | Val | Thr | His Tyr | Pro | Thr | Ile |
| 1585 | 1590 | 1595 | 1600 | |||||||
| Arg | Glu Arg | Asn Lys Gly | Glu Trp | Glu | Asp | Leu | Gly Trp | Leu | Thr | Ala |
| 1605 | 1610 | 1615 | ||||||||
| Leu | Arg Val | Ser Ser Val | Leu Arg | Thr | Pro | Ala | Gin Gly | Asp | Thr | Lys |
| 1620 | 1625 | 1630 | ||||||||
| Arg | Ile Thr | Val Tyr Gly | Glu Leu | Glu | Tyr | Ser | Ser Ile | Arg | Gin | Lys |
| 1635 | 1640 | 1645 | ||||||||
| Gin | Phe Thr | Glu Thr Glu | Tyr Asp | Pro | Arg | Tyr | Phe Asp | Asn | Cys | Thr |
| 1650 | 1655 | 1660 | ||||||||
| Tyr | Arg Asn | Leu Ala Ile | Pro Met | Gly | Leu | Ala | Phe Glu | Gly | Glu | Leu |
| 1665 | 1670 | 1675 | 1680 | |||||||
| Ser | Gly Asn | Asp Ile Leu | Met Tyr | Asn | Arg | Phe | Ser Val | Ala | Tyr | Met |
| 1685 | 1690 | 1695 | ||||||||
| Leu | Ser Ile | Tyr Arg Asn | Ser Pro | Thr | Cys | Lys | Tyr Gin | Val | Leu | Ser |
| 1700 | 1705 | 1710 | ||||||||
| Ser | Gly Glu | Gly Gly Glu | Ile Ile | Cys | Gly | Val | Pro Thr | Arg | Asn | Ser |
| 1715 | 1720 | 1725 | ||||||||
| Ala | Arg Gly | Glu Tyr Ser | Thr Gin | Leu | Tyr | Leu | Gly Pro | Leu | Trp | Thr |
| 1730 | 1735 | 1740 | ||||||||
| Leu | Tyr Gly | Ser Tyr Thr | Ile Glu | Ala | Asp | Ala | His Thr | Leu | Ala | His |
| 1745 | 1750 | 1755 | 1760 | |||||||
| Met | Met Asn | Cys Gly Ala | Arg Met | Thr | Phe |
1765 1770 <210> 445 <211> 1751 <212> PRT <213> Chlamydia trachomatis serovar D <400> 445
| Met | Lys | Trp | Leu | Ser 5 | Ala | Thr | Ala | Val | Phe 10 | Ala | Ala | Val | Leu | Pro 15 | Ser |
| Val | Ser | Gly | Phe 20 | Cys | Phe | Pro | Glu | Pro 25 | Lys | Glu | Leu | Asn | Phe 30 | Ser | Arg |
| Val | Gly | Thr 35 | Ser | Ser | Ser | Thr | Thr 40 | Phe | Thr | Glu | Thr | Val 45 | Gly | Glu | 711a |
| Gly | Ala 50 | Glu | Tyr | Ile | Val | Ser 55 | Gly | Asn | Ala | Ser | Phe 60 | Thr | Lys | Phe | Thr |
| Asn 65 | Ile | Pro | Thr | Thr | Asp 70 | Thr | Thr | Thr | Pro | Thr 75' | Asn | Ser | Asn | Ser | Ser 80 |
φφ φφφφ
Φ Μ Φ • ΦΦφ
Φ
Φ
Φ··ΦΦΦΦ ·· ·« φ * * ·φφ
Φ φ ΦΦ φφφφ
ΦΦ
412
| Ser | Ser | Asn | Gly | Glu 85 | Thr | Ala | Ser | Val | Ser 90 | Glu | Asp | Ser | Asp | Ser 95 | Thr |
| Thr | Thr | Thr | Pro 100 | Asp | Pro | Lys | Gly | Gly 105 | Gly | Ala | Phe | Tyr | Asn 110 | Ala | His |
| Ser | Gly | Val 115 | Leu | Ser | Phe | Met | Thr 120 | Arg | Ser | Gly | Thr | Glu 125 | Gly | Ser | Leu |
| Thr | Leu 130 | Ser | Glu | Ile. | Lys | Ile 135 | Thr | Gly | Glu | Gly | Gly 140 | Ala | Ile | Phe | Ser |
| Gin 145 | Gly | Glu | Leu | Leu | Phe 150 | Thr | Asp | Leu | Thr | Gly 155 | Leu | Thr | Ile | Gin | Asn 160 |
| Asn | Leu | Ser | Gin | Leu 165 | Ser | Gly | Gly | Ala | Ile 170 | Phe | Gly | Glu | Ser | Thr 175 | Ile |
| Ser | Leu | Ser | Gly 180 | Ile | Thr | Lys | Ala | Thr 185 | Phe | Ser | Ser | Asn | Ser 190 | Ala | Glu |
| Val | Pro | Ala 195 | Pro | Val | Lys | Lys | Pro 200 | Thr | Glu | Pro | Lys | Ala 205 | Gin | Thr | Ala |
| Ser | Glu 210 | Thr | Ser | Gly | Ser | Ser 215 | Ser | Ser | Ser | Gly | Asn 220 | Asp | Ser | Val | Ser |
| Ser 225 | Pro | Ser | Ser | . Ser | Arg 230 | Ala | Glu | Pro | Ala | Ala 235 | Ala | Asn | Leu | Gin | Ser 240 |
| His | Phe | Ile | Cys | Ala 245 | Thr | Ala | Thr | Pro | Ala 250 | Ala | Gin | Thr | Asp | Thr 255 | Glu |
| Thr | Ser | Thr | Pro 260 | Ser | His | Lys | Pro | Gly 265 | Ser | Gly | Gly | Ala | Ile 270 | Tyr | Ala |
| Lys | Gly Asp 275 | Leu | Thr | Ile | Ala | Asp 280 | Ser | Gin | Glu | Val | Leu 285 | Phe | Ser | Ile | |
| Asn | Lys 290 | Ala | Thr | Lys | Asp | Gly 295 | Gly | Ala | Ile | Phe | Ala 300 | Glu | Lys | Asp | Val |
| Ser 305 | Phe | Glu | Asn | Ile | Thr 310 | Ser | Leu | Lys | Val | Gin 315 | Thr | Asn | Gly | Ala | Glu 320 |
| Glu | Lys | Gly | Gly | Ala 325 | Ile | Tyr | Ala | Lys | Gly 330 | Asp | Leu | Ser | Ile | Gin 335 | Ser |
| Ser | Lys | Gin | Ser 340 | Leu | Phe | Asn | Ser | Asn 345 | Tyr | Ser | Lys | Gin | Gly 350 | Gly | Gly |
| Ala | Leu | Tyr 355 | Val | Glu | Gly | Asp | Ile 360 | Asn | Phe | Gin | Asp | Leu 365 | Glu | Glu | Ile |
| Arg | Ile 370 | Lys | Tyr | Asn | Lys | Ala 375 | Gly | Thr | Phe | Glu | Thr 380 | Lys | Lys | Ile | Thr |
| Leu 385 | Pro | Lys | Ala | Gin | Ala 390 | Ser | Ala | Gly | Asn | Ala 395 | Asp | Ala | Trp | Ala | Ser 400 |
. »· »··· • « « • ··· ·· ·· φ φ • φφφ φφ φφφφ
413
| Ser | Ser Pro Gin | Ser 405 | Gly | Ser | Gly | Ala | Thr Thr 410 | Val | Ser | Asn | Ser 415 | Gly |
| Asp | Ser Ser Ser 420 | Gly | Ser | Asp | Ser | Asp 425 | Thr Ser | Glu | Thr | Val 430 | Pro | Ala |
| Thr | Ala Lys Gly 435 | Gly | Gly | Leu | Tyr 440 | Thr | Asp Lys | Asn | Leu 445 | Ser | Ile | Thr |
| Asn | Ile Thr Gly 450 | Ile | Ile | Glu 455 | Ile | Ala | Asn Asn | Lys 460 | Ala | Thr | Asp | Val |
| Gly 465 | Gly Gly Ala | Tyr | Val 470 | Lys | Gly | Thr | Leu Thr 475 | Cys | Glu | Asn | Ser | His 480 |
| Arg | Leu Gin Phe | Leu 485 | Lys | Asn | Ser | Ser | Asp Lys 490 | Gin | Gly | Gly | Gly 495 | Ile |
| Tyr | Gly Glu Asp 500 | Asn | Ile | Thr | Leu | Ser 505 | Asn Leu | Thr | Gly | Lys 510 | Thr | Leu |
| Phe | Gin Glu Asn 515 | Thr | Ala | Lys | Glu 520 | Glu | Gly Gly | Gly | Leu 525 | Phe | Ile | Lys |
| Gly | Thr Asp Lys 530 | Ala | Leu | Thr 535 | Met | Thr | Gly Leu | Asp 540 | Ser | Phe | Cys | Leu |
| Ile 545 | Asn Asn Thr | Ser | Glu 550 | Lys | His | Gly | Gly Gly 555 | Ala | Phe | Val | Thr | Lys 560 |
| Glu | Ile Ser Gin | Thr 565 | Tyr | Thr | Ser | Asp | Val Glu 570 | Thr | Ile | Pro | Gly 575 | Ile |
| Thr | Pro Val His 580 | Gly | Glu | Thr | Val | Ile 585 | Thr Gly | Asn | Lys | Ser 590 | Thr | Gly |
| Gly | Asn Gly Gly 595 | Gly | Val | Cys | Thr 600 | Lys | Arg Leu | Ala | Leu 605 | Ser | Asn | Leu |
| Gin | Ser Ile Ser 610 | Ile | Ser | Gly 615 | Asn | Ser | Ala Ala | Glu 620 | Asn | Gly | Gly | Gly |
| Ala 625 | His Thr Cys | Pro | Asp 630 | Ser | Phe | Pro | Thr Ala 635 | Asp | Thr | Ala | Glu | Gin 640 |
| Pro | Ala Ala Ala | Ser 645 | Ala | Ala | Thr | Ser | Thr Pro 650 | Glu | Ser | Tkla | Pro 655 | Val |
| Val | Ser Thr Ala 660 | Leu | Ser | Thr | Pro | Ser 665 | Ser Ser | Thr | Val | Ser 670 | Ser | Leu |
| Thr | Leu Leu Ala 675 | Ala | Ser | Ser | Gin 680 | Ala | Ser Pro | Ala | Thr 685 | Ser | Asn | Lys |
| Glu | Thr Gin Asp 690 | Pro | Asn | Ala 695 | Asp | Thr | Asp Leu | Leu 700 | Ile | Asp | ' Tyr | Val |
| Val 705 | Asp Thr Thr | Ile | Ser 710 | Lys | Asn | Thr | Ala Lys 715 | Lys | Gly | Gly | Gly | Ile 720 |
| Tyr | Ala Lys Lys | Ala | Lys | Met | Ser | Arg | Ile Asp | Gin | Leu | Asn | Ile | Ser |
·· ···· ·· tt · ····
414
| 725 | 730 | 735 | |
| Glu Asn Ser Ala 740 | Thr | Glu Ile Gly Gly Gly 745 | Ile Cys Cys Lys Glu Ser 750 |
| Leu Glu Leu Asp 755 | Ala | Leu Val Ser Leu Ser 760 | Val Thr Glu Asn Leu Val 765 |
| Gly Lys Glu Gly 770' | Gly | Gly Leu His.Ala Lys 775 | Thr Val Asn Ile Ser Asn 780 |
| Leu Lys Ser Gly 785 | Phe | Ser Phe Ser Asn Asn 7 90 | Lys Ala Asn Ser Ser Ser 795 800 |
| Thr Gly Val Ala | Thr 805 | Thr Ala Ser Ala Pro 810 | Ala Ala Ala Ala Ala Ser 815 |
| Leu Gin Ala Ala 820 | Ala | Ala Ala Val Pro Ser 825 | Ser Pro Ala Thr Pro Thr 830 |
| Tyr Ser Gly Val 835 | Val | Gly Gly Ala Ile Tyr 840 | Gly Glu Lys Val Thr Phe 845 |
| Ser Gin Cys Ser 850 | Gly | Thr Cys Gin Phe Ser 855 | Gly Asn Gin Ala Ile Asp 860 |
| Asn Asn Pro Ser 865 | Gin | Ser Ser Leu Asn Val 870 | Gin Gly Gly Ala Ile Tyr 875 880 |
| Ala Lys Thr Ser | Leu 885 | Ser Ile Gly Ser Ser 890 | Asp Ala Gly Thr Ser Tyr 895 |
| Ile Phe Ser Gly 900 | Asn | Ser Val Ser Thr Gly 905 | Lys Ser Gin Thr Thr Gly 910 |
| Gin Ile Ala Gly 915 | Gly | Ala Ile Tyr Ser Pro 920 | Thr Val Thr Leu Asn Cys 925 |
| Pro Ala Thr Phe 930 | Ser | Asn Asn Thr Ala Ser 935 | Met Ala Thr Pro Lys Thr 940 |
| Ser Ser Glu Asp 945 | Gly | Ser Ser Gly Asn Ser 950 | Ile Lys Asp Thr Ile Gly 955 . 960 |
| Gly Ala Ile Ala | Gly 965 | Thr Ala Ile Thr Leu 970 | Ser Gly Val Ser Arg Phe 975 |
| Ser Gly Asn Thr 980 | Ala | Asp Leu Gly Ala Ala 985 | Ile Gly Thr Leu Ala Asn 990 |
| Ala Asn Thr Pro 995 | Ser | Ala Thr Ser Gly Ser 1000 | Gin Asn Ser Ile Thr Glu 1005 |
| Lys Ile Thr Leu 1010 | Glu | Asn Gly Ser Phe Ile 1015 | Phe Glu Arg Asn Gin Ala 1020 |
| Asn Lys Arg Gly 1025 | Ala | Ile Tyr Ser Pro Ser 1030 | Val Ser Ile Lys Gly Asn 1035 1040 |
| Asn Ile Thr Phe | Asn Gin Asn Thr Ser Thr-His Asp Gly Ser Ala Ile 1045 1050 1055 |
415
| Tyr | Phe Thr | Lys Asp 1060 | Ala | Thr Ile Glu 1065 | Ser | Leu | Gly | Ser Val Leu 1070 | Phe |
| Thr | Gly Asn | Asn Val | Thr | Ala Thr Gin | Ala | Ser | Ser | Ala Thr Ser | Gly |
| 1075 | 1080 | 1085 | |||||||
| Gin | Asn Thr | Asn Thr | Ala | Asn Tyr Gly | Ala | Ala | Ile | Phe Gly Asp | Pro |
| 1090 | 1095 | 1100 | |||||||
| Gly | Thr Thr | Gin Ser | Ser | Gin Thr Asp | Ala | Ile | Leu | Thr Leu Leu | Ala |
| 1105 | 1110 | 1115 | 1120 | ||||||
| Ser | Ser Gly | Asn Ile | Thr | Phe Ser Asn | Asn | Ser | Leu | Gin Asn Asn | Gin |
| 1125 | 1130 | 1135 | |||||||
| Gly | Asp Thr | Pro Ala | Ser | Lys Phe Cys | Ser | Ile | Ala | Gly Tyr Val | Lys |
| 1140 | 1145 | 1150 | |||||||
| Leu | Ser Leu | Gin Ala | Ala | Lys Gly Lys | Thr | Ile | Ser | Phe Phe Asp | Cys |
| 1155 | 1160 | 1165 | |||||||
| Val | His Thr | Ser Thr | Lys | Lys Ile Gly | Ser | Thr | Gin | Asn Val Tyr | Glu |
| 1170 | 1175 | 1180 | |||||||
| Thr | Leu Asp | Ile Asn | Lys | Glu Glu Asn | Ser | Asn | Pro | Tyr Thr Gly | Thr |
| 1185 | 1190 | 1195 | 1200 | ||||||
| Ile | Val Phe | Ser Ser | Glu | Leu His Glu | Asn | Lys | Ser | Tyr Ile Pro | Gin |
| 1205 | 1210 | 1215 | |||||||
| Asn | Ala Ile | Leu His | Asn | Gly Thr Leu | Val | Leu | Lys | Glu Lys Thr | Glu |
| 1220 | 1225 | 1230 | |||||||
| Leu | His Val | Val Ser | Phe | Glu Gin Lys | Glu | Gly | Ser | Lys Leu Ile | Met |
| 1235 | 1240 | 1245 | |||||||
| Lys | Pro Gly | Ala Val | Leu | Ser Asn Gin | Asn | Ile | Ala | Asn Gly Ala | Leu |
| 1250 | 1255 | 1260 | |||||||
| Val | Ile Asn | Gly Lěu | Thr | Ile Asp Leu | Ser | Ser | Met | Gly Thr Pro | Gin |
| 1265 | 1270 | 1275 | 1280 | ||||||
| Ala | Gly Glu | Ile Phe | Ser | Pro Pro Glu | Leu | Arg | Ile | Val Ala Thr | Thr |
| 1285 | 1290 | 1295 | |||||||
| Ser | Ser Ala | Sér Gly | Gly | Ser Gly Val | Ser | Ser | Ser | Ile Pro Thr | Asn |
| 1300 | 1305 | 1310 | |||||||
| Pro | Lys Arg | Ile Ser | Ala | Ala Ala Pro | Ser | Gly | Ser | Ala Ala Thr | Thr |
| 1315 | 1320 | 1325 | |||||||
| Pro | Thr Met | Ser Glu | Asn | Lys Val Phe | Leu | Thr | Gly | Asp Leu Thr | Leu |
| 1330 | 1335 | 1340 | |||||||
| Ile | Asp Pro | Asn Gly | Asn | Phe Tyr Gin | Asn | Pro | Met | Leu Gly S.er | Asp |
| 1345 | 1350 | 1355 | 1360 | ||||||
| Leu | Asp Val | Pro Leu | Ile | Lys Leu Pro | Thr | Asn | Thr | Ser Asp Val | Gin |
| 1365 | 1370 | 1375 |
• · · · • · · ·
416
| Val Tyr Asp Leu 1380 | Thr Leu Ser Gly Asp 1385 | Leu Phe Pro Gin Lys 1390 | Gly Tyr 1 |
| Met Gly Thr Trp 1395 | Thr Leu Asp Ser Asn 1400 | Pro Gin Thr Gly Lys 1405 | Leu Gin |
| Ala Arg Trp Thr 1410 | Phe Asp Thr Tyr Arg 1415 | Arg Trp Val Tyr Ile 1420 | Pro Arg |
| Asp Asn His Phe | Tyr Ala Asn Ser Ile | Leu Gly Ser Gin Asn | Ser Met |
| 1425 | 1430 | 1435 | 1440 |
| Ile Val Val Lys | Gin Gly Leu Ile Asn 1445 | Asn Met Leu Asn Asn 1450 | Ala Arg 1455 |
| Phe Asp Asp Ile | Ala Tyr Asn Asn Phe | Trp Val Ser Gly Val | Gly Thr |
| 146C | 1 1465 | i 1470 | |
| Phe Leu Ala Gin 1475 | Gin Gly Thr Pro Leu 1480 | Ser Glu Glu Phe Ser 1485 | Tyr Tyr |
| Ser Arg Gly Thr 1490 | Ser Val Ala Ile Asp 1495 | Ala Lys Pro Arg Gin 1500 | Asp Phe |
| Ile Leu Gly Ala | Ala Phe Ser Lys Met | Val Gly Lys Thr Lys | Ala Ile |
| 1505 | 1510 | 1515 | 1520 |
| Lys Lys Met His | Asn Tyr Phe His Lys 1525 | Gly Ser Glu Tyr Ser 1530 | Tyr Gin 1535 |
| Ala Ser Val Tyr | Gly Gly Lys Phe Leu | Tyr Phe Leu Leu Asn | Lys Gin |
| 1540 · 1545 1550 | |||
| His Gly Trp Ala 1555 | Leu Pro Phe Leu Ile 1560 | Gin Gly Val Val Ser 1565 | Tyr Gly |
| His Ile Lys His 1570 | Asp Thr Thr Thr Leu 1575 | Tyr Pro Ser Ile His 1580 | Glu Arg |
| Asn Lys Gly Asp | Trp Glu Asp Leu Gly | Trp Leu Ala Asp Leu | Arg Ile |
| 1585 | 1590 | 1595 | 1600 |
| Ser Met Asp Leu | Lys Glu Pro Ser Lys 1605 | Asp Ser Ser Lys Arg 1610 | Ile Thr 1615 |
| Val Tyr Gly Glu | Leu Glu Tyr Ser Ser | Ile Arg Gin Lys Gin | Phe Thr |
| 1620 1625 1630 | |||
| Glu Ile Asp Tyr 1635 | Asp Pro Arg His Phe 1640 | Asp Asp Cys Ala Tyr 1645 | Arg Asn |
| Leu Ser Leu Pro 1650 | Val Gly Cys Ala Val 1655 | Glu Gly Ala Ile Met 1660 | Asn Cys |
| Asn Ile Leu Met | Tyr Asn Lys Leu Ala | Leu Ala Tyr Met Pro | Ser Ile |
| 1665 | 1670 | 1675 | 1680 |
| Tyr Arg Asn Asn | Pro Val Cys Lys Tyr | Arg Val Leu Ser Ser | Asn Glu |
| 1685 | 1690 | 1695 | |
| Ala Gly Gin Val | Ile Cys Gly Val Pro | Thr Arg. Thr Ser Ala | Arg 'Ala |
► · · · · · . · · • ··· » · · • · • ·9· ► · · « ·· ·· •417
1700 1705 1710
Glu Tyr Ser Thr Gin Leu Tyr Leu Gly Pro Phe Trp Thr Leu Tyr Gly 1715 1720 1725
Asn Tyr Thr Ile Asp Val Gly Met Tyr Thr Leu Ser Gin Met Thr Ser 1730 1735 1740
Cys Gly Ala Arg Met Ile Phe
1745 1750 <210> 446 <211> 660 <212> PRT <213> Chlamydia trachomatis serovar D <400> 446
| Met | Ser | Glu | Lys | Arg 5 | Lys | Ser | Asn | Lys | Ile 10 | Ile | Gly | Ile | Asp | Leu 15 | Gly |
| Thr | Thr | Asn | Ser 20 | Cys | Val | Ser | Val | Met 25 | Glu | Gly | Gly | Gin | Pro 30 | Lys | Val |
| Ile | Ala | Ser 35 | Ser | Glu | Gly | Thr | Arg 40 | Thr | Thr | Pro | Ser | Ile 45 | Val | Ala | Phe |
| Lys | Gly Gly 50 | Glu | Thr | Leu | Val 55 | Gly | Ile | Pro | Ala | Lys 60 | Arg | Gin | Ala | Val | |
| Thr 65 | Asn | Pro | Glu | Lys | Thr 70 | Leu | Ala | Ser | Thr | Lys 75 | Arg | Phe | Ile | Gly | Arg 80 |
| Lys | Phe | Ser | Glu | Val 85 | Glu | Ser | Glu | Ile | Lys 90 | Thr | Val | Pro | Tyr | Lys 95 | Val |
| Ala | Pro | Asn | Ser 100 | Lys | Gly | Asp | Ala | Val 105 | Phe | Asp | Val | Glu | Gin 110 | Lys | Leu |
| Tyr | Thr | Pro 115 | Glu | Glu | Ile | Gly | Ala 120 | Gin | Ile | Leu | Met | Lys 125 | Met | Lys | Glu |
| Thr | Ala 130 | Glu | Ala | Tyr | Leu | Gly 135 | Glu | Thr | Val | Thr | Glu 140 | Ala | Val | Ile | Thr |
| Val 145 | Pro | Ala | Tyr | Phe | Asn 150 | Asp | Ser | Gin | Arg | Ala 155 | Ser | Thr | Lys | Asp | Ala 160 |
| Gly | Arg | Ile | Ala | Gly 165 | Leu | Asp | Val | Lys | Arg 170 | Ile | Ile | Pro | Glu | Pro 175 | Thr |
| Ala | Ala | Ala | Leu 180 | Ala | Tyr | Gly | Ile | Asp 185 | Lys | Glu | Gly | Asp | Lys 190 | Lys | Ile |
| Ala | Val | Phe 195 | Asp | Leu | Gly | Gly | Gly 200 | Thr | Phe | Asp | Ile | Ser 205 | Ile | Leu | Glu |
| Ile | Gly 210 | Asp | Gly | Val | Phe | Glu 215 | Val | Leu | Ser | Thr | Asn 220 | Gly | Asp | Thr | His |
| Leu | Gly | Gly | Asp | Asp | Phe | Asp | Gly | Val | Ile | Ile | Asn | Trp | Met | Leu | Asp |
'·· ·«··
418
| 225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
| Glu | Phe | Lys | Lys | Gin 245 | Glu | Gly | Ile | Asp | Leu 250 | Ser | Lys | Asp | Asn | Met 255 | Ala |
| Leu | Gin | Arg | Leu 260 | Lys | Asp | Ala | Ais | Glu 265 | Lys | Ala | Lys | Ile | Glu 270 | Leu | Ser |
| Gly | Val | Ser 275 | Ser | Thr | Glu | Ile | Asn 280 | Gin | Pro | Phe | Ile | Thr 285 | Ile | Asp | Ala |
| Asn | Gly 290 | Pro | Lys | His | Leu | Ala 295 | Leu | Thr | Leu | Thr | Arg 300 | Ala | Gin | Phe | Glu |
| His 305 | Leu | Ala | Ser | Ser | Leu 310 | Ile | Glu | Arg | Thr | Lys 315 | Gin | Pro | Cys | Ala | Gin 320 |
| Ala | Leu | Lys | Asp | Ala 325 | Lys | Leu | Ser | Ala | Ser 330 | Asp | Ile | Asp | Asp | Val 335 | Leu |
| Leu | Val | Gly | Gly 340 | Met | Ser | Arg | Met | Pro 345 | Ala | Val | Gin | Ala | Val 350 | Val | Lys |
| Glu | Ile | Phe 355 | Gly | Lys | Glu | Pro | Asn 360 | Lys | Gly | Val | Asn | Pro 365. | Asp | Glu | Val |
| Val | Ala 370 | Ile | Gly | Ala | Ala | Ile 375 | Gin | Gly | Gly | Val | Leu 380 | Gly | Gly | Glu | Val |
| Lys 385 | Asp | Val | Leu | Leu | Leu 390 | Asp | Val | Ile | Pro | Leu 395 | Ser | Leu | Gly | Ile | Glu 4 00 |
| Thr | Leu | Gly | Gly | Val 405 | Met | Thr | Pro | Leu | Val 410 | Glu | Arg | Asn | Thr | Thr 415 | Ile |
| Pro | Thr | Gin | Lys 420 | Lys | Gin | Ile | Phe | Ser 425 | Thr | Ala | Ala | Asp | Asn 430 | Gin | Pro |
| Ala | Val | Thr 435 | Ile | Val | Val | Leu | Gin 440 | Gly | Glu | Arg. | Pro | Met 445 | Ala | Lys | Asp |
| Asn | Lys 450 | Glu | Ile | Gly | Arg | Phe 455 | Asp | Leu | Thr | Asp | Ile 460 | Pro | Pro | •n 3 _ Mld | Pro |
| Arg 4 65 | Gly | His | Pro | Gin | Ile 470 | Glu | Val | Thr | Phe | Asp 475 | Ile | Asp | Ala | Asn | Gly 480 |
| Ile | Leu | His | Val | Ser 485 | Ala | Lys | Asp | Ala | Ala 490 | Ser | Gly | Arg | Glu | Gin 495 | Lys |
| Ile | Arg | Ile | Glu 500 | Ala | Ser | Ser | Gly | Leu 505 | Lys | Glu | Asp | Glu | Ile 510 | Gin | Gin |
| Met | Ile | Arg 515 | Asp | Ala | Glu | Leu | His 520 | Lys | Glu | Glu | Asp | Lys 525 | Gin | Arg | Lys |
| Glu | Ala 530 | Ser | Asp | Val | Lys | Asn 535 | Glu | Ala | Asp | Gly | Met 540 | Ile | Phe | Arg | Ala |
| Glu 545 | Lys | Ala | Val | Lys | Asp 550 | Tyr | His | Asp | Lys | Ile 555 | Pro | Ala | Glu | Leu | Val 560 |
• ···
419
| Lys | Glu | Ile | Glu | Glu 565 | His | Ile | Glu | Lys | Val 570 | Arg | Gin | Ala | Ile | Lys 575 | Glu |
| Asp | Ala | Ser | Thr 580 | Thr | Ala | Ile | Lys | Ala 585 | Ala | Ser | Asp | Glu | Leu 590 | Šer | Thr |
| His | Met | Gin 595 | Lys | Ile | Gly | Glu | Ala 600 | Met | Gin | Ala | Gin | Ser 605 | Ala | Ser | Ala |
| Ala | Ala 610 | Ser | Ser | Ala | Ala | Asn 615 | Ala | Gin | Glý | Gly | Pro 620 | Asn | Ile | Asn | Ser |
| Glu 625 | Asp | Leu | Lys | Lys | His 630 | Ser | Phe | Ser | Thr | Arg 635 | Pro | Pro | Ala | Gly | Gly 64.0 |
| Ser | Ala | Ser | Ser | Thr 645 | Asp | Asn | Ile | Glu | Asp 650 | Ala | Asp | Val | Glu | ile 655 | Val |
| Asp | Lys | Pro | Glu |
660 <210> 447 <211> 326 <212> PRT
| <213> Chlamydia trachomatis serovar D | |||||||||||||||
| <400> 447 Met Val Ser | Gin | Thr 5 | Val | Ser | Val | Ala | Val 10 | Thr | Gly | Gly | Thr | Gly 15 | Gin | ||
| Ile | Ala | Tyr | Ser 20 | Phe | Leu | Phe | Ser | Leu 25 | Ala | His | Gly | Asp | Val 30 | Phe | Gly |
| Leu | Asp | Cys 35 | Gly | Ile | Asp | Leu | Arg 40 | Ile | Tyr | Asp | Ile | Pro 45 | Gly | Thr | Glu |
| Arg | Ala 50 | Leu | Ser | Gly | Val | Arg 55 | Met | Glu | Leu | Asp | Asp 60 | Gly | Ala | Phe | Pro |
| Leu 65 | Leu | Gin | Arg | Val | Gin 70 | Val | Thr | Thr | Ser | Leu 75 | His | Asp | Ala | Phe | Asp 80 |
| Gly | Ile | Asp | Tkla | Ala 85 | Phe | Leu | Ile | Gly | Ser 90 | Val | Pro | Arg | Gly | Pro 95 | Gly |
| Mét | Glu | Arg | Arg 100 | Asp | Leu | Leu | Lys | Lys 105 | Asn | Gly | Glu | Ile | Phe 110 | Ala | Thr |
| Gin | Gly | Lys 115 | Ala | Leu | Asn | Thr | Thr 120 | Ala | Lys | Arg | Asp | Ala 125 | Lys | Ile | Phe |
| Val | Val 130 | Gly | Asn- | Pro | Val | Asn 135 | Thr | Asn | Cys | Trp | Ile 140 | Ala | Met | Asn | His |
| Ala 145 | Pro | Arg | Leu | Leu | Arg 150 | Lys | Asn | Phe | His | Ala 155 | Met | Leu | Arg | Leu | Asp 160 |
| Gin | Asn | Arg | Met | His | Ser | Met | Leu | Ser | His | Arg | Ala | Glu | Val | Pro | Leu |
165 170 175 • ···
420
| Ser | Ala | Val | Ser 180 | Gin | Val | Val | Val | Trp 185 | Gly Asn | His | Ser | Ala 190 | Lys | Gin | |
| Val | Pro | Asp | Phe | Thr | Gin | Ala | Leu | Ile | Asn | Asp | Arg | Pro | Ile | Ala | Glu |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Thr | Ile | Ala | Asp | Arg | Asp | Trp | Leu | Glu | Asn | Ile | Met | Val | Pro | Ser | Val |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Gin | Ser | Arg | Gly | Ser | Ala | Val | Ile | Glu | Ala | Arg | Gly | Lys | Ser | Ser | Ala |
| 225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
| Ala | Ser | Ala | Ala | Arg | Ala | Leu | Ala | Glu | Ala | Ala | Arg | Ser | Ile | Tyr | Gin |
| 245 | 250 | 255 | |||||||||||||
| Pro | Lys | Glu | Gly | Glu | Trp | Phe | Ser | Ser | Gly | Val | Cys | Ser | Asp | His | Asn |
| 260 | 265 | 270 | |||||||||||||
| Pro | Tyr | Gly | Leu | Pro | Glu | Asp | Leu | Ile | Phe | Gly | Phe | Pro | Cys | Arg | Met |
| 275 | 280 | 285 | |||||||||||||
| Leu | Ala | Thr | Gly | Glu | Tyr | Glu | Val | Ile | Pro | Arg | Leu | Pro | Trp | Asp | Ala |
| 290 | 295 | 300 | |||||||||||||
| Phe | Ile | Arg | Gly | Lys | Met | Gin | Ile | Ser | Leu | Asp | Glu | Ile | Leu | Gin | Glu |
| 305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
| Lys | Ala | Ser | Val | Ser | Leu |
325 <210> 448 <211> 232 <212> PRT
| <213> Chlamydia 1 | trachomatis | serovar | D |
| <400> 448 | |||
| Met Thr Lys His | Gly Lys Arg | Ile Arg | Gly Ile Gin Glu Thr Tyr Asp |
| 5 | 10 15 | ||
| Leu Ala Lys Ser | Tyr Ser Leu | Gly Glu | Ala Ile Asp Ile Leu Lys Gin |
| 20 | 25 | 30 | |
| Cys Pro Thr Val | Arg Phe Asp | Gin Thr | Val Asp Val Ser Val Lys Leu |
| 35 | 40 | 45 | |
| Gly Ile Asp Pro | Arg Lys Ser | Asp Gin | Gin Ile Arg Gly Ser Val Ser |
| 50 | 55 | 60 | |
| Leu Pro His Gly | Thr Gly Lys | Val Leú | Arg Ile Leu Val Phe Ala Ala |
| 65 | 70 | 75 80 | |
| Gly Asp Lys Ala | Ala Glu Ala | Ile Glu | Ala Gly Ala Asp Phe Val Gly |
| 85 | 90 95 | ||
| Ser Asp Asp Leu | Val Glu Lys | Ile Lys | Gly Gly Trp Val Asp Phe Asp |
| 100 | 105 | Í10 | |
| Val Ala Val Ala | Thr Pro Asp | Met Met | Arg Glu Val Gly Lys Leu Gly |
| 115 | 120 | 125 |
• · · ·
421
| Lys | Val | Leu | Gly | Pro | Arg | Asn | Leu | Met | Pro | Thr | Pro | Lys | Ala | Gly | Thr |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Val | Thr | Thr | Asp | Val | Val | Lys | Thr | Val | Ala | Glu | Leu | Arg | Lys | Gly | Lys |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Ile | Glu | Phe | Lys | Ala | Asp | Arg | Ala | Gly | Val | Cys | Asn | Val | Gly | Val | Ala |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Lys | Leu | Ser | Phe | Asp | Ser | Ala | Gin | Ile | Lys | Glu | Asn | Val | Glu | Ala | Leu |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Cys | Ala | Ala | Leu | Val | Lys | Ala | Lys | Pro | Ala | Thr | Ala | Lys | Gly | Gin | Tyr |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Leu | Val | Asn | Phe | Thr | Ile | Ser | Ser | Thr | Met | Gly | Pro | Gly | Val | Thr | Val |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Asp | Thr | Arg | Glu | Leu | Ile | Ala | Leu |
225 230 <210> 449 <211> 1252 <212> PRT
| <213> Chlamydia | trachomatis | serovar | D |
| <400> 449 | |||
| Met .Phe Lys Cys | Pro Glu Arg | Val Ser | Ile Lys Lys Lys Glu Asp Ile |
| 5 | 10 15 | ||
| Leu Asp Leu Pro | Asn Leu Val | Glu Val | Gin Ile Lys Ser Tyr Lys Gin |
| 20 | 25 | 30 | |
| Phe Leu Gin Ile | Gly Lys Leu | Ala Glu | Glu Arg Glu Asn Ile Gly Leu |
| 35 | 40 | . 45 | |
| Glu Glu Val Phe | Arg Glu Ile | Phe Pro | Ile Lys Ser Tyr Asn Glu Ala |
| 50 | 55 | 60 | |
| Thr Ile Leu Glu | Tyr Leu Ser | Tyr Asn | Leu Gly Val Pro Lys Tyr Ser |
| 65 | 70 | 75 80 | |
| Pro Glu Glu Cys | Ile Arg Arg | Gly Ile | Thr Tyr Ser Val Thr Leu Lys |
| 85 | 90 95 | ||
| Val Arg Phe Arg | Leu Thr Asp | Glu Thr | Gly Ile Lys Glu Glu Glu Val |
| 100 | 105 | 110 | |
| Tyr Met Gly Thr | Ile Pro Ile | Met Thr | Asp Lys Gly Thr Phe Ile Ile |
| 115 | 120 | 125 | |
| Asn Gly Ala Glu | Arg Val Val | Val Ser | Gin Val His Arg Ser Pro Gly |
| 130 | 135 | 140 | |
| Ile Asn Phe Glu | Gin Glu Lys | His Ser | Lys Gly Asn Val Leu Phe Ser |
| 145 | 150 | 155 160 | |
| Phe Arg Ile Ile | Pro Tyr Arg | Gly Ser | Trp Leu Glu Ala Val Phe Asp |
165 170 175 ·· ·♦··
422 ·*· ·♦ ·· · ·· · • · ·. · · ·· « • ··· · · ··· · · · • · · · · · ·· · · ·
| Ile . | Asn | Asp | Leu 180 | Ile | Tyr | Ile | His | Ue 185 | Asp . | Arg | Lys | Lys | Arg 190 | Arg | Arg |
| Lys | Ue | Leu 195 | Ala | Met | Thr | Phe | Ue 200 | Arg | Ala | Leu | Gly | Tyr 205 | Ser | Thr | Asp |
| Ala | Asp 210 | Ue | Ile | Glu | Glu | Phe 215 | Phe | Ser | Val | Glu | Glu 220 | Arg | Ser | Leu | Arg |
| Leu 225 | Glu | Lys | Asp | Phe | Val 230 | Ala | Leu | Val | Gly Lys 235 | Val | Leu | Ala | Asp | Asn 240 | |
| Val | Val | Asp | Ala | Asp 245 | Ser | Ser | Leu | Val | Tyr 250 | Gly | Lys | Ala | Gly | Glu 255 | Lys |
| Leu | Ser | Thr | Ala 260 | Met | Leu | Lys | Arg | Ile 265 | Leu | Asp | Ala | Gly | Val 270 | Gin | Ser |
| Leu | Lys | Ue 275 | Ala | Val | Gly | Ala | Asp 280 | Glu | Asn | His | Pro | Ile 285 | Ue | Lys | Met. |
| Leu | Ala 290 | Lys | Asp | Pro | Thr | Asp 295 | Ser | Tyr | Glu | Ala | Tkla 300 | Leu | Lys | Asp | Phe |
| Tyr 305 | Arg | Arg. | .Leu | Arg | Pro 310 | Gly | Glu | Pro | Ala | Thr 315 | Leu | Val | Asn | Ala | Arg 320 |
| Ser | Thr | Ue | Met | Arg 325 | Leu | Phe | Phe | Asp | Ala 330 | Lys | Arg | Tyr | Asn | Leu 335 | Gly |
| Arg | Val | Gly | Arg 340 | Tyr | Lys | Leu | Asn | Lys 34 5 | Lys | Leu | Gly | Phe | Pro 350 | Leu | Asp |
| Asp | Glu | Thr 355 | Leu | Ser | Gin | Val | Thr 360 | Leu | Arg | Lys | Glu | Asp 365 | Val | Ile | Gly |
| Ala | Leu 370 | Lys | Tyr | Leu | Ile | Arg 375 | Leu | Arg | Met | Gly | Asp 380 | Glu | Lys | Thr | Ser |
| Ile ooc | Asp | Asp | Ue | Asp. | His 390 | Leu | Ala | Asn | Arg | Arg 395 | Val | Arg | Ser | Val | Gly 400 |
| Glu | Leu | Ue | Gin | Asn 4 05 | His | Cys | Arg | Ser | Gly 410 | Leu | Ala | Arg | Met | Glu 415 | Lys |
| Ile | Val | Arg | Glu 420 | Arg | Met | Asn | Leu | Phe 425 | Asp | Phe | Ser | Ser | Asp 430 | Thr | Leu |
| Thr | Pro | Gly 435 | Lys | Ile | Ile | Ser | Ala 440 | Lys | Gly | Leu | Val | Ser 445 | Val | Leu | Lys |
| Asp | Phe 450 | Phe | Ser | Arg | Ser | Gin 455 | Leu | Ser | Gin | Phe | Met 4 60 | Asp | Gin | Thr | Asn |
| Pro 465 | Val | Ala | Glu | Leu | Thr 470 | His | Lys | Arg | Arg | Leu 475 | Ser | Ala | Leu | Gly | Pro 480 |
| Gly | Gly | Leu | Asn | Arg 485 | Glu | Arg | Ala | Gly | Phe 4 90 | Glu | Val | Arg | Asp | Val 495 | His |
·· ««·« ·· ·« «· • · • · · ·
423
| Ala | Ser | His | Tyr 500 | Gly | Arg | Ile | Cys | Pro 505 | Ile | Glu | Thr | Pro | Glu 510 | Gly | Pro |
| Asn | Ile | Gly 515 | Leu | Ile | Thr | Ser | Leu 520 | Ser | Ser | Phe | Ala | Lys 525 | Ile | Asn | Glu |
| Phe | Gly 530 | Phe | Ile | Glu | Thr | Pro 535 | Tyr | Arg | Val | Val | Arg 540 | Asp | Gly | Ile | Val |
| Thr 545 | Asp | Glu | Ile | Glu | Tyr 550 | Met | Thr | Ala | Asp | Val 555 | Glu | Glu | Glu | Cys | Val 560 |
| Ile | Ala | Gin | Ala | Ser 565 | Ala | Glu | Leu | Asp | Glu 570 | Tyr | Asp | Met | Phe | Lys 575 | Thr |
| Pro | Val | Cys | Trp 580 | Ala | Arg | Tyr | Lys | Gly 585 | Glu | Ala | Phe | Glu | Ala 590 | Asp | Thr |
| Ser | Thr | Val 595 | Thr | His | Met | Asp | Val 600 | Ser | Pro | Lys | Gin | Leu 605 | Val | Ser | Val |
| Val | Thr 610 | Gly | Leu | Ile | Pro | Phe 615 | Leu | Glu | His | Asp | Asp 620 | Ala | Asn | Arg | Ala |
| Leu 625 | Met | Gly | Ser | Asn | Met 630 | Gin | Arg | Gin | Ala | Val 635 | Pro | Leu | Leu | Lys | Thr 640 |
| Glu | Ala | Ala | Ile | Val 645 | Gly | Thr | Gly | Leu | Glu 650 | Gly | Arg | Ala | Ala | Lys 655 | Asp |
| Ser | Gly | Ala | Ile 660 | Ile | Val | Ala | Gin | Glu 665 | Asp | Gly | Val | Val | Glu 670 | Tyr | Val |
| Asp | Ser | Tyr 675 | Glu | Ile | Val | Val | Ala 680 | Lys | Lys | Asn | Asn | Pro 685 | Thr | Leu | Lys |
| Asp | Arg 690 | Tyr | Gin | Leu | Lys | Lys 695 | Phe | Leu | Arg | Ser | Asn 700 | Ser | Gly | Thr | Cys |
| Ile 705 | Asn | Gin | Thr | Pro | Leu 710 | Cys | Ser | Val | Gly | Asp 715 | Val | Val | Thr | His | Gly 720 |
| Asp | Val | Leu | Ala | Asp 725 | Gly | Pro | Ala | Thr | Asp 730 | Lys | Gly | Glu | Leu | Ala 735 | Leu |
| Gly | Lys | Asn | Val 740 | Leu | Val | Ala | Phe | Met 745 | Pro | Trp | Tyr | Gly | Tyr 750 | Asn | Phe |
| Glu | Asp | Ala 755 | Ile | Ile | Ile | Ser | Glu 7 60 | Arg | Leu | Ile | Lys | Gin 765 | Asp | Ala | Tyr |
| Thr | Ser 770 | Ile | Tyr | Ile | Glu | Glu 775 | Phe | Glu | Leu | Thr | Ala 780 | Arg | Asp | Thr | Lys |
| Leu 785 | Gly | Lys | Glu | Glu | Ile 790 | Thr | Arg | Asp | Ile | Pro 795 | Asn | Val | Ser | Glu | Glu 800 |
| Val | Leu | Ala | Asn | Leu 805 | Gly | Glu | Asp | Gly | Val 810 | Val | Arg | Ile | Gly | Ala 815 | Glu |
| Val | Lys | Pro | Gly | Asp | Ile | Leu | Val | Gly | Lys | Ile. | Thr | Pro | Lys | Ser | Glu |
·· «««· ··
424
| 820 | 825 | 830 | |
| Thr | Glu Leu Ala Pro 835 | Glu Glu Arg Leu Leu Arg Ala Ile 840 . 845 | Phe Gly Glu |
| Lys | Ala Ala Asp Val 850 | Lys Asp Ala Ser Leu Thr Val Pro 855 860 | Pro Gly Thr |
| Glu 8 65 | Gly Val Val Met | Asp Val Lys Val Phe Ser Arg Lys 870 875 | Asp Arg Leu 880 |
| Ser | Lys Ser Asp Asp 885 | Glu Leu Val Glu Glu Ala Val His 890 | Leu Lys Asp . 895 |
| Leu | Gin Lys Glu Tyr 900 | Lys Ser Gin Leu Ala Gin Leu Lys 905 | Val Glu His 910 |
| Arg | Glu Lys Leu Gly 915 | Ala Leu Leu Leu Asn Glu Lys Ala 920 925 | Pro Ala Ala |
| Ile | Ile His Arg Arg 930 | Ser Ala Asp Ile Leu Val Gin Glu 935 940 | Gly Ala Ile |
| Phe 945 | Asp Gin Glu Thr | Ile Glu Leu Leu Glu Arg Glu Ser 950 955 | Leu Val Asp 960 |
| Leu | Leu Met Ala Pro 965 | Cys Asp Met Tyr Asp Val Leu Lys 970 | Asp Ile Leu 975 |
| Ser | Ser Tyr Glu Thr 980 | Ala Val Gin Arg Leu Glu Val Asn 985 | Tyr Lys Thr 990 |
| Glu | Ala Glu His Ile 995 | Lys Glu Gly Asp Ala Asp Leu Asp His Gly Val 1000 1005 | |
| Ile | Arg Gin Val Lys 1010 | Val Tyr Val Ala Ser Lys Arg Lys 1015 1020 | Leu Gin Val |
| Gly Asp Lys Met Ala 1025 | Gly Arg His Gly Asn Lys Gly Val 1030 1035 | Val Ser Lys 1040 | |
| Ile | Val Pro Glu Ala Asp Met Pro Phe Leu Ala Asn Gly 1045 ' 1050 | Glu Thr Val 1055 | |
| Gin | Met Ile Leu Asn 1060 | Pro Leu Gly Val Pro Ser Arg Met 1065 | Asn Leu Gly 1070 |
| Gin | Val Leu Glu Thr 1075 | His Leu Gly Tyr Ala Ala Lys Thr Ala Gly Ile 1080 1085 | |
| Tyr | Val Lys Thr Pro 1090 | Val Phe Glu Gly Phe Pro Glu Ser 1095 1100 | Arg Ile Trp |
| Asp Met Met Ile Glu 1105 | Gin Gly Leu Pro Glu Asp Gly Lys 1110 1115 | Ser Tyr Leu 1120 | |
| Phe | Asp Gly Lys Thr Gly Glu Arg Phe Asp Ser Lys Val 1125 1130 | Val Val Gly 1135 | |
| Tyr | Ile Tyr Met Leu 1140 | Lys Leu Ser His Leu Ile Ala Asp 1145 | Lys Ile His 1150 |
·· ·00· • · · • ··· ·«« · • ··· • · <
425
Ala Arg Ser Ile Gly Pro Tyr Ser Leu Val Thr Gin Gin Pro Leu Gly 1155 1160 1165
Gly Lys Ala Gin Met Gly Gly Gin Arg Phe Gly Glu Met Glu Val Trp 1170 1175 1180
| Ala Leu Glu 1185 | Ala Tyr Gly Val Ala His 1190 | Met Leu Gin 1195 | Glu | Ile | Leu | Thr 1200 |
| Val Lys Ser | Asp Asp Val Ser Gly Arg 1205 | Thr Arg Ile 1210 | Tyr | Glu | Ser Ile 1215 | |
| Val Lys Gly | Glu Asn Leu Leu Arg Ser 1220 1223 | Gly Thr Pro | Glu | Ser 1230 | Phe | Asn |
| Val Leu Ile Lys Glu Met Gin Gly Leu 1235 1240 Val Val Asp Ala | Gly Leu Asp | Val Arg 1245 | Pro | Met |
1250 <210> 450 <211> 298 <212> PRT
| <213> Chlamydia | trachomatis | serovar | D |
| <400> 450 | |||
| Met Leu Lys Ile | Asp Leu Thr 5 | Gly Lys | Ile Ala Phe Ile Ala Gly Ile 10 15 |
| Gly Asp Asp Asn 20 | Gly Tyr Gly | Trp Gly 25 | Ile Ala Lys Met Leu Ala Glu 30 |
| Ala Gly Ala Thr 35 | Ile Leu Val | Gly Thr 40 | Trp Val Pro Ile Tyr Lys Ile 45 |
| Phe Ser Gin Ser 50 | Leu Glu Leu 55 | Gly Lys | Phe Asn Ala Ser Arg Glu Leu 60 |
| Ser Asn Gly Glu 65 | Leu Leu Thr 70 | Phe Ala | xjy 5 íxS i y x. xrx v net n5p ηία 75 80 |
| Ser Phe Asp Thr | Pro Glu Asp 85 | Ile Pro | Gin Glu Ile Leu Glu Asn Lys 90 95 |
| Arg Tyr Lys Asp 100 | Leu Ser Gly | Tyr Thr 105 | Val Ser Glu Val Val Glu Gin 110 |
| Val Lys Lys His 115 | Phe Gly His | Ile Asp 120 | Ile Leu Val His Ser Leu Ala 125 |
| Asn Ser Pro Glu 130 | Ile Ala Lys 135 | Pro Leu | Leu Asp Thr Ser Arg Lys Gly 140 |
| Tyr Leu Ala Ala 145 | Leu Ser Thr 150 | Ser Ser | Tyr Ser Phe Ile Ser Leu Leu 155 160 |
| Ser His Phe Gly | Pro Ile Met 165 | Asn Ala | Gly Ala Ser Thr Ile Ser Leu 170 175 |
• · · · φφφφ ·· · · · φ
426
| Thr | Tyr | Leu | Ala | Ser | Met | Arg | Ala | Val | Pro | Gly | Tyr | Gly | Gly | Gly | Met |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Asn | Ala | Ala | Lys | Ala | Ala | Leu | Glu | Ser | Asp | Thr | Lys | Val | Leu | Ala | Trp |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Glu | Ala | Gly | Arg | Arg | Trp | Gly | Val | Arg | Val | Asn | Thr | Ile | Ser | Ala | Gly |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Pro | Leu | Ala | Ser | Arg | Ala | Gly | Lys | Ala | Ile | Gly | Phe | Ile | Glu | Arg | Met |
| 225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
| Val | Asp | Tyr | Tyr | Gin | Asp | Trp | Ala | Pro | Leu | Pro | Ser | Pro | Met | Glu | Ala |
| 245 | 250 | 255 | |||||||||||||
| Glu | Gin | Val | Gly | Ala | Ala | Ala | Ala | Phe | Leu | Val | Ser | Pro | Leu | Ala | Ser |
| 260 | 265 | 270 | |||||||||||||
| Ala | Ile | Thr | Gly | Glu | Thr | Leu | Tyr | Val | Asp | His | Gly | Ala | Asn | Val | Met |
| 275 | 280 | 285 | |||||||||||||
| Gly | Ile | Gly | Pro | Glu | Met | Phe | Pro | Lys | Asp | ||||||
| 290 | 295 |
<210> 451 <211> 298 <212> PRT <213> Chlamydia trachomatis serovar D <400> 451
| Met | Ser | Leu | Gin | Lys 5 | Leu | Leu | Val | Thr | Asp 10 | Ile | Asp | Gly | Thr | Ile 15 | Thr |
| His | Gin | Ser | His | Leu | Leu | His | Asp | Arg | Val | Val | Lys | Ala | Leu | His | Gin |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Tyr | Tyr | Asp | Ser | Gly | Trp | Gin | Leu | Phe | Phe | Leu | Thr | Gly | Arg | Tyr | Phe |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Ser | Tyr | Ala | Tyr | Pro | Leu | Phe | Gin | Asn | Phe | Ser | Val | Pro | Phe | Leu | Leu |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Gly | Ser | Gin | Asn | Gly | Ser | Ser | Val | Trp | Ser | Ser | Thr | Asp | Lys | Glu | Phe |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Ile | Tyr | Phe | Arg | Ser | Leu | Ser | Arg | Asp | Phe | Leu | Tyr | Val | Leu | Glu | Lys |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Tyr | Phe | Glu | Asp | Leu | Asp | Leu | Ile | Ala | Cys | Ile | Glu | Ser | Gly | Ala | Ser |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Asn | Arg | Asp | Val | Tyr | Phe | Arg | Lys | Gly | Leu | Gly | Lys | Thr | Ser | Gin | Glu |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Leu | Lys | Ala | Ile | Leu | Asp | Ála | Val | Tyr | Phe | Pro | Thr | Pro | Glu | Ala | Ala |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Arg | Leu | Leu | Val | Asp | Val | Gin | Gly | His | Leu | Ser | Glu | Glu | Phe | Ser | Tyr |
| 14 5 | 150 | 155 | 160 |
• · · ·
427
| Glu | Asp | Phe | Ala | Ile 165 | Ala | Lys | Phe | Phe | Gly Glu Arg Glu Glu Val | Lys | |||||
| 170 | 175 | ||||||||||||||
| Lys | Ile | Met | Asp | Arg | Phe | Ile | Gin | Ser | Pro | Glu | Val | Ser | Ser | Gin | Val |
| 180 | 135 | 190 | |||||||||||||
| Thr | Met | Asn | Tyr | Met | Arg | Trp | Pro | Phe | Asp | Phe | Lys | Tyr | Ala | Val | Leu |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Leu | Leu | Thr | Leu | Lys | Asp | Val | Ser | Lys | Gly | Phe | Ala | Val | Asp | Gin | Val |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Val | Gin | Thr | Phe | Tyr | Lys | Glu | Asn | Lys | Pro | Phe | Ile | Met | Ala | Ser | Gly |
| 225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
| Asp | Asp | Ala | Asn | Asp | Ile | Asp | Leu | Leu | Ser | Arg | Gly | Asp | Phe | Lys | Ile |
| 245 | 250 | 255 | |||||||||||||
| Val | Ile | Gin | Thr | Ala | Pro | Glu | Glu | Met | His | Gly | Leu | Ala | Asp | Phe | Leu |
| 260 | 265 | 270 | |||||||||||||
| Ala | Pro | Pro | Ala | Lys | Asp | Phe | Gly | Ile | Léu | Ser | Ala | Trp | Glu | Ala | Gly |
| 275 | 280 | 285 | |||||||||||||
| Glu | Leu | Arg | Tyr | Lys | Gin | Leu | Val | Asn | Pro |
290 295 <210> 452 <211> 153 <212> PRT
| <213> Chlamydia | trachomatis | serovar | D |
| <400> 452 | |||
| Met Leu Arg Leu | Phe Gin His | Ile Leu | Cys Phe Leu Glu Glu Asp Pro |
| 5 | 10 15 | ||
| Ser Phe Val Asp | Val Pro Gin | Glu Leu | Ser Phe Val Asn Glu Ala Phe |
| 20 | 25 | 30 | |
| Ser Gly Ser Met | Arg Trp Glu | Val Gly | Arg Met Leu Gly Ser Leu Leu |
| 35 | 40 | 45 | |
| Leu Leu Leu Gly | Ile Phe Gly | Gly Gly | Cys Leu Leu Phe Arg Arg Phe |
| 50 | 55 | 60 | |
| Leu Arg Ser Arg | Gly His Leu | Pro Ser | Gly Asn Ser Ser Ile Lys Ile |
| 65 | 70 | 75 80 | |
| Leu Asp Gin Arg | Val Leu Ala | Ser Lys | Thr Ser Ile Tyr Val Ile Lys |
| 85 | 90 95 | ||
| Val Ala Asn Lys | Thr Leu Val | Val Ala | Glu Arg Gly Glu Arg Val Thr |
| 100 | 105 | 110 | |
| Leu Leu Ser Glu | Phe Pro Pro | Asn Thr | Asp Leu Asn Glu Leu Ile Gin |
| 115 | 120 | 125 | |
| Lys Asp Gin Lys | Lys Pro Ser | Thr Pro | Arg Gly Glu Met Leu Ser Gly |
| 130 | 135 | . 140 |
• · ·· · · · · ·· ·· · · · ··· · · · · · ···· '· ···· · ·
428
| Phe Leu Lys Gin Phe Lys Glu Lys Lys | |
| 145 | 150 |
| <210> 453 <211> 569 <212> PRT <213> Chlamydia | trachomatis serovar D |
<400> 453
| Met | Pro | Lys | Gin | Ala 5 | Asp | Tyr | Thr | Trp | Gly 10 | Ala | Lys | Lys | Asn | Leu 15 | Asp |
| Thr | Ile | Ala | Cys 20 | Leu | Pro | Glu | Asp | Val 25 | Lys | Gin | Phe | Lys | Asp 30 | Leu | Leu |
| Tyr | Ala | Met 35 | Tyr | Gly | Phe | Thr | Ala 40 | Thr | Glu | Glu | Glu | Pro 45 | Thr | Ser | Glu |
| Val | His 50 | Pro | Gly | Ala | Ile | Leu 55 | Lys | Gly | Thr | Val | Val 60 | Asp | Ile | Ser | Lys |
| Asp 65 | Phe | Val | Val | Val | Asp 70 | Val | Gly | Leu | Lys | Ser 75 | Glu | Gly | Val | Ile | Pro 80 |
| Met | Ser | Glu | Phe | Ile 85 | Asp | Ser | Ser | Glu | Gly 90 | Leu | Thr | Val | Gly | Ala 95 | Glu |
| Val | Glu | Val | Tyr 100 | Leu | Asp | Gin | Thr | Glu 105 | Asp | Asp | Glu | Gly | Lys HO | Val | Val |
| Leu | Ser | Arg 115 | Glu | Lys | Ala | Thr | Arg 120 | Gin | Arg | Gin | Trp | Glu 125 | Tyr | Ile | Leu |
| Ala | His 130 | Cys | Glu | Glu | Gly | Ser 135 | Ile | Val | Lys | Gly | Gin 140 | Ile | Thr | Arg | Lys |
| Val 145 | Lys | Gly | Gly | Leň | Ile 150 | Val | Asp | Ile | Gly | Met 155 | Glu | Ala | Phe | Leu | Pro 160 |
| Gly | Ser | Gin | Ile | Asp 165 | Asn | Lys | Lys | Ile | Lys 170 | Asn | Leu | Asp | Asp | Tvr 17 5 | Val |
| Gly | Lys | Val | Cys 180 | Glu | Phe | Lys | Ile | Leu 185 | Lys | Ile | Asn | Val | Asp 190 | Arg | Arg |
| Asn | Val | Val 195 | Val | Ser | Arg | Arg | Glu 200 | Leu | Leu | Glu | Ala | Glu 205 | Arg | Ile | Ser |
| Lys | Lys 210 | Ala | Glu | Leu | Ile | Glu 215 | Gin | Ile | Thr | Ile | Gly 220 | Glu | Arg | Arg | Lys |
| Gly 225 | Ile | Val | Lys | Asn | Ile 230 | Thr | Asp | Phe | Gly | Val 235 | Phe | Leu | Asp | Leu | Asp 240 |
| Gly | Ile | Asp | Gly | Leu 245 | Leu | His | Ile | Thr | Asp 250 | Met | Thr | Trp | Lys | Arg 255 | Ile |
| Arg | His | Pro | Ser 260 | Glu | Met | Val | Glu | Leu 265 | Asn | Gin | Glu | Leu | Glu 270 | Val | Ile |
• · • · · · • · · · · · • ··· ·.· · ··· • · · · · · ·
429
| Ile Leu Ser Val Asp | Lys | Glu | Lys Gly Arg Val Ala Leu | Gly | Leu | Lys | |||||||||
| 275 | 280' | 285 | |||||||||||||
| Gin | Lys | Glu | His | Asn | Pro | Trp | Glu | Asp | Ile | Glu | Lys | Lys | Tyr | Pro | Pro |
| 290 | 295 | 300 | |||||||||||||
| Gly | Lys | Arg | Val | Arg | Gly | Lys | Ile | Val | Lys | Leu | Leu | Pro | Tyr | Gly | Ala |
| 305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
| Phe | Ile | Glu | Ile | Glu | Glu | Gly | Ile | Glu | Gly | Leu | Ile | His | Val | Ser | Glu |
| 325 | 330 | 335 | |||||||||||||
| Met | Ser | Trp | Val | Lys | Asn | Ile | Val | Asp | Pro | Asn | Glu | Val. | Val | Asn | Lys |
| 340 | 34 5 | 350 | |||||||||||||
| Gly | Asp | Glu | Val | Glu | Val | Val | Val | Leu | Ser | Ile | Gin | Lys | Asp | Glu | Gly |
| 355 | 360 | 365 | |||||||||||||
| Lys | Ile | Ser | Leu | Gly | Leu | Lys | Gin | Thr | Lys | His | Asn | Pro | Trp | Asp | Asn |
| 370 | 375 | 380 | |||||||||||||
| Ile | Glu | Glu | Lys | Tyr | Pro | Ile | Gly | Leu | Arg | Val | Thr | Ala | Glu | Ile | Lys |
| 385 | 390 | 395 | 400 | ||||||||||||
| Asn | Leu | Thr | Asn | Tyr | Gly | Ala | Phe | Val | Glu | Leu | Glu | Pro | Gly | Ile | Glu |
| 4 05 | 410 | 415 | |||||||||||||
| Gly | Leu | Ile | His | Ile | Ser | Asp | Met | Ser | Trp | He | Lys | Lys | Val | Ser | His |
| 420 | 425 | 430 | |||||||||||||
| Pro | Ser | Glu | Leu | Phe | Lys | Lys | Gly | Asn | Thr | Val | Glu | Ala | Val | Ile | Leu |
| 4 35 | 4 40 | 445 | |||||||||||||
| Ser | Val | Asp | Lys | Glu | Ser | Lys | Lys | Ile | Thr | Leu | Gly | Val | Lys | Gin | Leu |
| 450 | 455 | 4 60 | |||||||||||||
| Thr | Pro | Asn | Pro | Trp | Asp | Glu | Ile | Glu | Val | Met | Phe | Pro | Val | Gly | Ser |
| 465 | 470 | 475 | 480 | ||||||||||||
| Asp | Ile | Ser | Gly | Val | Val | Thr | Lys | Ile | Thr | Ala | Phe | Gly | Ala | Phe | Val |
| 485 | 4 90 | 495 | |||||||||||||
| Glu | Leu | Gin | Asn | Gly | Ile | Glu | Gly | Leu | Ile | His | Val | Ser | Glu | Leu | Ser |
| 500 | 505 | 510 | |||||||||||||
| Glu | Lys | Pro | Phe | Ala | Lys | Ile | Glu | Asp | Val | Leu | Ser | Ile | Gly | Asp | Lys |
| 515 | 520 | 525 | |||||||||||||
| Val | Ser | Ala | Lys | Val | Ile | Lys | Leu | Asp | Pro | Asp | His | Lys | Lys | Val | Ser |
| 530 | 535 | 540 | |||||||||||||
| Leu | Ser | Ile | Lys | Glu | Phe | Leu | Val | His | Gly | Gly | Asp | Ala | Gly.His | Asp | |
| 545 | 550 | 555 | 560 | ||||||||||||
| Ala | Glu | Glu | Glu | Ser | Ser | Asp | Arg | Asp |
<210> 454 <211> 666
565 ·· ···· ·· ·· ·· ···· ··· · · · ·· · ···· 9 · ··· · · · • · · · · · ··· · ·
430
| <212> PRT <213> Chlamydia <400> 454 | trachomatis | serovar | D | ||||||||||||
| Met | Glu | Ser | Leu | Ser 5 | Val | Arg | Ser | Thr | Ile 10 | Pro | Leu | Pro | Leu | Gly 15 | Ala |
| Lys | Lys | Leu | Ser 20 | Ala | Asp | Arg | Tyr | Arg 25 | Phe | Ser | Leu | Phe | Ser 30 | Ser | Gin |
| Ala | Gin | Gin 35 | Val | Thr | Leu | Val | Leu 40 | Leu | Asp | Pro | Leu | Ser 45 | Glu | Ile | His |
| Glu | Ile 50 | Pro | Leu | Ser | Ser | Thr 55 | Asp | His | Arg | Thr | Gly 60 | Ala | Ile | Trp | His |
| Ile 65 | Glu | Ile | Ala | Gly | Ile 70 | Ser | Ser | Glu | Trp | Ser 75 | Tyr | Ala | Tyr | Lys | Leu 80 |
| Arg | Gly | Thr | Asp | Leu 85 | Ser | Ser | Gin | Lys | Phe 90 | Ala | Thr | Asp | Ser | Tyr 95 | Ile |
| Ala | Asp | Pro | Tyr 100 | Ser | Lys | Asn | Ile | Tyr 105 | Ser | Pro | Gin | Leu | Phe 110 | Gly | Ser |
| Pro | Lys | Gin 115 | Glu | Lys | Asp | Tyr | Ala 120 | Phe | Ser | Tyr | Leu | Lys 125 | His | Glu | Asp |
| Phe | Asp 130 | Trp | Glu | Gly | Asp | Thr 135 | Pro | Leu | His | Leu | Pro 140 | Lys | Glu | Asn | Tyr |
| Phe 145 | Ile | Tyr | Glu | Met | His '150 | Val | Arg | Ser | Phe | Thr 155 | Arg | Asp | Pro | Ser | Ser 160 |
| Gin | Val | Ser | His | Pro 165 | Gly | Thr | Phe | Leu | Gly 170 | Ile | Ile | Glu | Lys | Ile 175 | Asp |
| His | Leu | Lys | Gin 180 | Leu | Gly | Val | His | Ala 185 | Val | Glu | Leu | Leu | Pro 190 | Ile | Phe |
| Glu | Phe | Asp 195 | Glu | Thr | Val | His | Pro 200 | Phe | Lys | Asn | Gin | Asp 205 | Phe | Pro | His |
| Leu | Cys 210 | Asn | Tyr | Trp | Gly | Tyr 215 | Ser | Ser | Val | Asn | Phe 220 | Phe | Cys | Pro | Ser |
| Arg 225 | Arg | Tyr | Thr | Tyr | Gly 230 | Ala | Asp | Pro | Cys | Ala 235 | Pro | Ala | Arg | Glu | Phe 240 |
| Lys | Thr | Leu | Val | Lys 245 | Ala | Leu | His | Arg | Ala 250 | Gly | Ile | Glu | Val | Ile 255 | Leu |
| Asp | Val | Val | Phe 260 | Asn | His | Thr | Gly | Phe 265 | Glu | Gly | Thr | Ser | Cys 270 | Pro | Leu |
| Pro | Trp | Ile 275 | Asp | Leu | Glu | Ser | Tyr 280 | Tyr | Met | Val | Asn | Asp 285 | His | Gly | Asp |
| Leu | Met 290 | Asn | Phe | Ser | Gly | Cys 295 | Gly | Asn | Thr | Val | Asn 300 | Thr | Asn | Thr | Pro |
• · ·· • ···
4~3Ϊ
| Thr 305 | Thr | Leu | Lys | Trp | Ile 310 | Leu | Asp | Ala | Leu | Arg 315 | Tyr | Trp | Val | Gin | Glu 320 |
| Met | His | Val | Asp | Gly 325 | Phe | Arg | Phe | Asp | Leu 330 | Ala | Ser | Val | Phe | Ser 335 | Arg |
| Asp | Pro | Gin | Gly 340 | Val | Pro | Leu | Pro | Leu 345 | Thr | Pro | Ile | Leu | Gin 350 | Ala | Ile |
| Ser | Ser | Asp 355 | Ser | Ile | Leu | Ser | Glu 360 | Thr | Lys | Leu | Ile | Ala 365 | Glu | Pro | Trp |
| Asp | Ala 370 | Gly | Gly | Leu | Tyr | Gin 375 | Leu | Gly | His | Phe | Pro 380 | Ser | Ile | Ser | Thr |
| Arg 385 | Trp | Ser | Glu | Trp | Asn 390 | Gly | Cys | Tyr | Arg | Asp 395 | His | Val | Lys | Ala | Phe 400 |
| Leu | Asn | Gly | Asp | Ala 405 | His | Gin | Val | Ser | Ser 410 | Phe | Ala | Ser | Arg | Ile 415 | Ser |
| Gly | Ser | His | Asp 420 | Ile | Tyr | Pro | Asn | Gly 425 | Lys | Pro | Thr | Asn | Ser 430 | Ile | Asn |
| Tyr | Ile | Cys 435 | Ser | His | Asp | Gly | Phe 440 | Thr | Leu | Tyr | Asp | Thr 445 | Val | Ala | Tyr |
| Asn | Asp 450 | Lys | His | Asn | Glu | Glu 4 55 | Asn | Gly | Glu | Tyr | Asn 460 | Arg | Asp | Gly | Thr |
| Ser 465 | Ala | Asn | Tyr. | Ser | Tyr 470 | Asn | Phe | Gly | Cys | Glu 475 | Gly | Glu | Thr | Thr | Asp 480 |
| Pro | Thr | Ile | Cys | Ala 485 | Leu | Arg | Glu | Arg | Gin 4 90 | Met | Lys | Asn | Phe | Phe 495 | Leu |
| Ala | Leu | Phe | Leu 500 | Ser | Gin | Gly | Ile | Pro 505 | Met | Ile | Gin | Ser | Gly 510 | Asp | Glu |
| Tyr | Gly | His 515 | Thr | Ala | Tyr Gly | Asn 520 | Asn | Asn | His | Trp | Cys 525 | Leu | Asp· | Thr | |
| Lys | Ile 530 | Asn | Tyr | Phe | Leu | Trp 535 | Asp | Arg | Leu | Ala | Glu 540 | Arg | Lys | Glu | Leu |
| Phe 545 | Ser | Phe | Leu | Cys | Gin 550 | Val | Ile | Ala | Leu | Arg 555 | Lys | Ala | Tyr | Thr | Glu 560 |
| Leu | Phe | Asn | Thr | Ser 565 | Phe | Leu | Ser | Glu | Asp 570 | Thr | Ile | Thr | Trp | Leu 575 | Asn |
| Thr | Lys | Gly | Ser 580 | Pro | Arg | Glu | Trp | Gly 585 | Ala | Asp | His | Tyr | Leu 590 | Ala | Phe |
| Glu | Leu | Lys 595 | His | Leu | Asn | Tyr | Ser 600 | Leu | Phe | Val | Ala | Phe 605 | Tyr | Ser | Gly |
| Asn | Glu 610 | Arg | Ile | Glu | Ile | Ser 615 | Leu | Pro | Lys | Pro | Arg 620 | Lys | Glu | His | Leu |
| Ala | Tyr | Glu | Lys | Ile | Val | Asp | Ser | Thr | Thr | Gly | Phe | Phe | Ser | Gin | Ile |
toto·· to to··· .· ·
432
625 630 635 640
| Leu Ser | Pro | Lys | Leu 645 | Ser Leu | Glu | Pro | Tyr Ser 650 | Ser Leu Val Ala Ile 655 | ||
| Ser | Arg | Arg | Lys | Thr | Ser | Leu | Glu | Ser | Arg | |
| 660 | 665 |
<210> 455 <211> 882 <212> DNA <213> Chlamydia pneumoniae <400> 455 gtgtccaaac tctagcgtaa acctttgcaa gctcctcatc actatagact gggggcttac ggagagggta gtacagaaag acCcacacga gaaaccaaag agaaacctgc atcaaaacga acaggacaag cataagaagg actatggcta atacttctga agcaattttg aacttcatgg ttaaaacttc tatgttcatt gctctcatta cttcagacgc caacaactga ccaacattcg ctcaatccgc ccattggagc agtccagtgg aagtcataga atcaacagta gcggctctga atccaggatt tccttatčtc ggtgcccgtc aattttagat tcttcctgat tcaggttgga ctatttccct agttttagaa cttttgggaa tgaaatggag gttattattg gaacttcatc gaaccttgaa tcgaggatta aacttccgac gctcaagata ttactcacga tttgagggtt tttaaactag ctcaaagcag gattactttg cctgaagttc gataagaagg tttaacaaaa tgtgcgacac atttcagatc tttaatactt aaagtcatgc cctcatatgg agtgactatt tgttagaacg acttctctta ctatgttttc ggtctccagg cgcttatgtt tccccgtagc cggctcttgc caaactacca aatttagaaa tttttgctgc ttcccttaag atacggaaga taaaacgagc aagttggaga ga ttattctggc ctatatccaa tgctgcccat agctgcatta aggaatgtgt tagcatacgt aaattttgtt tattggcatt aaaactgtac cggataccgt gaaggaggga ccacatctta agcttctgac agccgatgac
120 180 240 300 360 420 4 80 540 600 660 720 780 840 882 <210> 456 <211> 1185 <212> DNA <213> Chlamydia pneumoniae <400> 456 atgtcaaaag gttgaccatg ttggcctctt attactatca gactgccctg ggagctatcc ttgctagctc atctctcaag gaagaaaaag ggtgatgcaa cctacaccag atctctggtc gataaagttc atgttcagga ggtattggaa cctcatacga aagcctttct gtcgtaactc gttgagctca ggtcgtacta aaacttttca gtaaaactac tccgtgacta acgcttctca gtcacgctga tagtcgtttc gccaggttgg aagatgctga gctacaaagg attatatcga aaagagaaat gtggtactgt agctcgtggg aagaacttcc agaacgatgt aatttaagtc tcagcggata ttcctgaagg ttggaacagt tcggcgctgg acgtaataag gctaacagcg tagttcaatt cgttgaatac ctatgttaaa agctacagac agttccttat acttattgac atgccctatt aaaagttcga tgataagcct ggttacagga attaggagag tgaaggtcgt tgaaagaggt agctgtttac cagacctcag aactgaaatg tgctcttgaa aacgatttca ccccatatca gcaattacac gacaatactc gaaaccccaa aatatgatta ggagctatgc atcgttgttt cttgttgaga atccgtggtt gaacttatgc ttcttaatgc agaatcgagc actaaagaaa gcaggagaaa atggtggttt gttcttcaga ttcttcttcc gtaatgcctg gaaggaatga aagatcaatg
| atattgggac | gatcgggcac | 60 |
| gcgcgctatc | aggggatgga | 120 |
| cagaagaaaa | ggctcgtgga | 180 |
| atcgtcacta | cgctcacgta | 240 |
| OcVGfQ CGJCCíjC | —X —> z-* z**· —- z^ v^aaauyyaC | 300 |
| cacaaactaa | agaacatatc | 360 |
| tcttgaataa | agtagatatg | 420 |
| tggaacttag | tgagcttctt | 480 |
| ctgctttgaa | agctcttgaa | 540 |
| aagctgtgga | tgacaacatc | 600 |
| ctatcgaaga | cgtattctca | 660 |
| gtggaatcgt | taaagtttct | 720 |
| caatcgttac | tggagtcgaa | 780 |
| acgttggttt | actcctcaga | 840 |
| gtcagcctaa | cagcgtgaag | 900 |
| aagaagaagg | cggacgtcat | 960 |
| gtactacaga | cgtgacagga | 1020 |
| gagataacgt | tgagcttgat | 1080 |
| gatttgcaat | tcgtgaaggt | 1140 |
| cttaa | 1185 |
<210> 457 <211> 1656 <212> DNA • ···
433 <213> Chlamydia pneumoniae <400> 457 atgccacaaa ggacatattg ggagacgatg gcggatcgtg gatacttttg catgctgagc cgcatatctg gaagggacgt ggtgcggatt ttagtaaaaa ctttctttta atagaacatg gactttcctg actatggaat gacggtgtag ttcccagcta tcagagtttt atggacaagt gctcctgaaa gagttggtag cactatgaca gaagaagcgc aaggctacga gcaccttgga gcatgttatt gtagctattt tatgctaggg aagtccccca aagtcctgat caggagtcta tcctttatat aggggttggg agaagttagg ttgtccaaga aacaactgta gtcctcggtg atgaggctat aagagactga ttcagggatg tcaggtctcg gaaaggtgtt gggcagcttc agtatgtcca tggaattggg atcttttaga ttttgagttc cttcggatag gaaagtttgg agctttctta gtcaacttgt gtgtgattat agctattgaa gtcagaagtt gggagatgat atctatggaa ggttattatt tacttcagct tcttcctgca ttgtggttcc gtatcaagag gtttgctttg tttttattcc ttcagaacaa cggttttgat agatttaatc gcactcatat ctatttacct agccattact ttatgtatgg tcaaggaaac gtttataggt tcagaaactt aggacggcaa ctat.tcctta tgagtttact gaattttata tcattctgtg tcgagatgct gtcactggca agaagggact gttagcttta ctcaccaaaa agaagaaatt tactactgta ttaccctatg gatgtgtatg gatgaatttg tacgtggata gatttctttt caacttaaag gaacaacgtt catgctcgag ggccctaagt tttcttttgg gatcatgtcc cgagatttat tttgacgctc cctgacgaat aaagataatc gactataaaa ttcagtaaat gacaaattgc ttccttgatt aaccgagttc gttttagaag gagaagtgct gctttaggga cgtgagcgtg atttcttatc tctttagaaa cttgatgtta gagtag ctaatggtcc caagattccg gcatagcgat tgtaccataa ctaggacgac cgtctggatt ttcttgcgga gagacgagtg ctaagatttc accgtatgaa gtaaatttgt cttgggggat ctataggata ggaagcgttt ttcctttcca aagttgatgc ccgagggcaa gctatgtatt ttaagactcg ttgcttttgc atagtgacag acagagagta atgtctattt ttgaggccat ctattattcc attgcaattt taaacgaaga gctacatttt tagattgtta caccttaaat gttacataaa gaaccctttt gattgaaaat tcgttatgta tcagagctgt tggggttgag agacgctcta tgttgattac tcctgttcca tatcagtgga ctggcttgaa ttctgtagtt cctcgtagtt ttatgtggat ggcggctaca ttgtaattct agaaaagaat ggcatttctt tagtttacgt taaccaacaa tttattctgc cgaaagcgct ggatacgatg atttcatttg
120
180
240
300
360
420
480
540
600
660
720
780
840
900
960
1020
1080
1140
1200
1260
1320
1380
1440
1500
1560
1620
1656 <210> 458 <211> 294 <212> DNA <213> Chlamydia pneumoniae <400> 458 atgattaaaa agcctagtga tcctctaatg tttactgaag acaaattcta aagatcgttt actacgcgat ttgcgatcga agattgtagt gaaaaaaaga cactaatgaa taaacaagca aacactcgtc aactgctagc tccctcagca aagttaaata aagatcaaaa ttgttagata cctactgtgg tatacttgga agcttttcga ttgccaaagg gagaagggat aaagaaagag gtgatgtaaa tagtcctttt cgatgttcgc acagcctgag atcagaacat gtaa
120
180
240
294 <210> 459 <211> 618 <212> DNA <213> Chlamydia pneumoniae <400> 459 atgaataaga ctttttacaa caagagtttt ggtgaagtcc gatcgtcagg ttagagattg ggagccttgt caggaggagt gaacggctgg attaacgacg cataggaaca tcctagttga ttagtgctcc cttctgcttt caggtaaaga ctctcttaga aaagaatttg ttattcgctc tagaaagaag agcacagtct acttaaatca tattatga ctctcctttt tgctggagtt tgctgagact ttatcatttt atgggtgttc gagcctaggg tcggatgcct gttagcttca tattgagcta agcgtacagg tctccagatc ggaaagacaa atatcggtaa gtttcccacg ttattcggag aagcacgctg agtgtatcta cggggatctg gcagctgcaa gttttaaaaa accagaagtg cacttgtccg caacaaggaa aagaatttca agtgttacgg ttgctgttat tttttattgc aagagggctc atcagtttga gcatttttat ctgtcctaag tatgttagag acctcgagag aagacttttg aacaagtatg tgatatccaa tccaccttca tcaaagaaaa ttatgtcatt agctgaagaa
120
180
240
300
360
420
480
540
600
618
434
<210> 460 <211> 1809 <212> DNA <213> Chlamydia pneumoniae <400> 460 ttgaaagaat gggaagtcta atgcgtgagc gctcatcctg gatacccctg ggcgccttac tacctggccc gccgctgatc aacattattg atcgatcttg gattctcatt ttaaaaaaag ggtatagggg gtgggttttt acgaaaacaa gtttttgctg ggaagactac ggctttggtt atcattcgag gtcttaaaaa atcatcgagc ctgagcaaca ctagatcagc ttcaatgaca gattaccgta gctttttctt aagcttgtgg aaaaaagtca tatggcggag cgtatgaagg ttagattaa ataagataga caattgctga agctcttaga tcaccatgac gtcacgtgga ttattgtaga ttgaaagaga ccgtgagaat cctgttctgc ttcctcctcc atgaccctta gagaccgcat cctttctccc ttattgccaa aacatcctgc gaatttatcc agctcaatga ttcgttgtgg aatttgactt acgggaaagt atgtggaaga ttatgaacct accgtctagt agctgaagtc agggatcgat gtttagtcca acgtgattcc ttgccagaga atattactag aatttggaaa gaacattcgc tcgcctttta ttccatggat gtatctatat cttttcgtat tgccgcccag tttagagatc tgctcaacag aaaaacaggt aaaagcacct cgttggcatt tacttttatg.
taaagcaaca tctcaaaaaa aaaaactcct tatagattct ttctgcttta cttcttagga agatattatt tctagatatt gccttgggtt ctgtttagat tcttgcttac agtaactaaa catcaaatta tagagataaa acaacaactc aacgattcgt gaaacgcaag agtttccatt aatttttcaa gaaagtacga cttgaaagag gaaggagagg gaagtctctc ggggtgcagg attcctgtat attgaagatt caggggatcc gcagaaacag atggtctacg gcggctaaag tttatagaag gtgaaggatg ttggaaggct tctgattttg actatagaac cttcttcatc gcaacggctc gataacccct catgtgaata aaacgtggga gaactccctt ggttatggat gaggttctta gcagaatctc ttcaagattc gcgctttcta ctgtgggaaa cccaatacag tcatagcgca gcacagtaga agcgtggcat tgtatcaact gatctctatc cacaaagtct taaacaagat atataggcct ctgcaatcct agcttaaagc tacgcattat gctcctcgtt gttccttacg tgaagatcgg tcaaagagat atactttgaa aagaaagcag ttgagattat caagtgtcat caggatatcc ttatcacccc tctgcgtaaa taaatgagat cctttgacta tťaacgagga gtggaagaag ccatccaagc agaacgtgac agcaaaagaa ctttcattga tattgatcac agaacgggag tacaattaaa gaacctgatt tgcatgtgag tgctaatgtc tgatctacct agacactacg gaaagcaatt tttagtcttt tagcggggaa tgaagtctta ccctggtcag cgatacagtc caatccggta agatgcttta tcactcttta ctttgaaaga ctataaagtc ggatcctgcg tcaagaatat aacagaaatg tgtctcggat ccgtcttggg gcccatagat tatctgcgaa tgocattaac cgcaaagtgt aggaaaaaaa agttctaaaa
120
180
240
300
360
420
480
540
600
660
720
780
840
900
960
1020
1080
1140
1200
1260
1320
1380
1440
1500
1560
1620
1680
1740
1800
1809 <210> 461 <211> 975 <212> DNA <213> Chlamydia pneumoniae <400> 461 atggaacttc aaagaaaaaa cgtttagata atatgtcgcc tttgtcgagc gtaaaaatcc tcacgccttc ttaggaaaac gcatatcctg tttgagctct ggtggagctt tctgtaattt gaagcagctt actgttatca gttcgagagt ttggagaaac ttccacacga ataagaaaaa aattaaaaga acccttcgcg tttgtggaga agggtcagcg ataggaactt tcgctgaaaa gattgactgc caagacttgc tgggcatggc ccccagaagg ccatgttgaa aagagcccat ttatcatcca ggtacgaaaa aaaacaagta ttctctctta aaagatctat tccccgtact tcgcaccttc ttttgtcctt cggtatgtta gtttggcttg tgaagagaga cactcccgtg tgtaggtgat atgcgcctcc aatgcatgga tgggggagct agagtggtta atttcgctct gttgaatatg tcttcttcag tcggatttga gtcaactata cgagatgatc attggccaag tgtcccgagg cctgtggtct ggacaaggat attattgtcg tctgtagcta attctttgga gaaaacttaa caccacgatc cgattaaaag ataggtcttt.
aaaaggctat agattcagaa ctccttggga ttgaagggat ccgcagttgt aaaagggatg gtttcagaaa ttcttgtcga gggcaattgc ttatcggtga tgttagagca aagatcctaa aacaatttgg ctgcattggt atctagctat atgaaactac agccgaattt attggaaaag gcgtgtacaa gtgtgaggag tggtggcttt.
cgatacagcg agcccttcgc taccccagga caaaaatctt gggatgttca ttcctattat gaaaaatagč cattatcgat atatagcaat agaagagctg ttctgaaagc
120 180 240 300 360 420 480 54 0 600 660 720 780 840 900 960
975 «· ···· ·· ·· ·· ···· ··· ··· ·· · • ··· · · ··· · · ·
435 ggtcctgagg cataa <210> 462 <211> 1980 <212> DNA <213> Chlamydia pneumoniae <400> 462 atgaaactac ttctgaaagc ggtcctgagg cataaaaatc atctcgttat attaggctgt tctctactcg caattttagg acttaccttt tcatctcaga tggagatttt ttctttaggg atgattgcta aaacaggccc cgacgccttt ttactttttg gacgtaagga atctggaaaa cttgtaaagg tttcagaact aagtcagaaa gatattttag agaattggca ggcaattagt aaggattcag agacacttac agtctctgat gccacgacat acatcgccga acatgggaaa agcacagcct ctctgacgag caagctctct aagtttgtcc gtaactacat cgatgtgagc cgctttcgag gactggcaat cttcttaatc tgcgttgcta tttttaaagc agtcacctta tttttccaac gtttccttgg gcaagtcgtt gctatacggg taagccgaga cttacgtcag gactacttta aggccctaca acaactcccc atgaccttct tccatgatca tgatatcggt aatttaagta atcgtgtcat gacagattct gcaagcattg ccttagcagt aaactcttta atgattaact acattcaagc cccaattacc- ttcatattga cattgggagt ctgtctgtcg atttcatgga agttttcaat tcttatttgt gttgcctttc ctatctttat ccttcccatt gtcgtgatcg ctagaaagat caaaaattta gcaaaacgta ttcaaaagag tcaggattca ttttcctccg ttctttatga ttttcttgct ggggttatga cagtaaaagt ctttcgtaca gaaaaatttg ccttcacaaa atattgtgag cataacaata agatttctgc tttagaggag aaaagtgctg cttacggttt gcttccacga cccctcctgc ataccatagc ttctttattt tttgcttttg tcgtcgttat cggaatttat aaatttgcta ttcctcccga agaacttatc gtattttgtg gtttgctcta cctaatctac gaccctatta agaagttcgg ggatgaaaat acctccatca tgaggggatg tgctgctgcg gagagatttt atgaagtctt gaatcacccc gatcttcata gtcaaaaaga aagagaaatc gagttccttg gactttctaa tacaatcaca ttcgagaatg tttccttcgg ctatcaggaa gataagcaca tcctcaaaaa tctaagcttt accttacata aaggcgaagc tctaggcatt gtaggaccta caggatctgg aaaaacaaca cttgttaaat tacttcctag gctctacgaa gtctcccaag gaaagattct tatcgactct cttcctatta cggaatataa caaagggtcc ttaaggaatc acatcgcctg tgtattacag aatcctttct tattctatga tactgtatgg aataacctta cctgtggtaa ggatatggag gaggaggctg ttttagaagc tctaaaacgt gcctacgctg atgagtttat tttaaagctc cctaaaggag tccatagcgt gctcgaagaa tctgggaaga atctctcagg aggacagcag caacgtttgg caatagcacg tgctctgttg aaaaacgcct ccatcttaat tttagatgag gcaacgtcag ctctagatgc cattagtgaa aattacatta agaatatcat tggagagctt aaaggacagt gcacacaaat cattattgcc cacaagctga ccactcttga acatgtagat. cgcgtgctct acatagaaaa tggtcaaaaa attgccgaag gcacaaaaga agaactctta cagacgtgtc ctgaattttt aaaaatgtgg gagctctcag ggactaaaga atataacagg gtctttgttc ctgatcacaa attagtcgca aatcctacgg acatggcaat aacaacttag <210> 463 <211> 1236 <212> DNA <213> Chlamydia pneumoniae <400> 463 atgattccta ccatgttaat gttcttcatt atctgtttta ctttatgctc gggattcatt tcgttatctc aaattgcttt gttttctttg cctacgagtt tgatctcgca ctataagcgc tctaaatcta agaaacagca gcgagtagct acccttcttc tacatcccca ccacctgctc atcaccttaa ttttttgtga tatcggactg aatattgcta ttcaaaactg ttttgccatt ctatttggag atgcagcttc gtggtggttt actgtaggtc ttcctttagc aattactttg atcttaggtg agattctccc taaagcagta gctcttcctt ttaatacaca gattgctagt tccgtagccc ctcttattct ttgtgttact aaaatcttca aacccctact ccactggggt atcgtaggaa ttaattatgt ggtccaatgg attttatcga agcaacagat tgatatcatc caaccccaag. agctgaagga agtattgcaa agttgtaagg atttcggcgt agtcaatcaa gaagaaagcc gtttactcta tggttatctt tctcttagtg attgtagtgt taaagagcgt atgcagccac gccaggatat tttattttat gatatccaaa cccctttaga gaacctctat cttttatttt ctaaacagca ttgctcacga gttcctataf gtaacgataa cctccaaaac cttctgggca tttgcacagc gcgctctctt cttttacatg acaagccact gcaatcttcg
120
180
240
300
360
420
480
540
600
660
720
780
840
900
960
1020
1080
1140
1200
1260
1320
1380
1440
1500
1560
1620
1680
1740
1800
1860
1920
1980
120
180
240
300
360
420
480
540
600
660
720
780 • <···
▼ T vz v —» ~---436 gatgatctcc tccccttgct gaaaaaaccg tattatatgc cagaaaccat ctctgcaaaa 840 atggctttat gtcagatggc agctgaagac gaaaccctag ggatgatcat tgatgaatac 900 ggatctattg aaggattgat cactcaagaa gacctctttg aaattgttgc tggagaaatt 960 gtagaccaga gagataataa aatactctat aecacctcag qagctgatgt tattattgcc 1020 tcaggaactt tagaactccg tgagtttagt gagatcttcg atatcaacct accgacgaac 1080 aataatattg cgactatagg aggctggtta atagagcaaa tcggaacgat tccgacaaca 1140 ggaatgaaac tctcttggaa taacttgctt ttccaggtat tagacgctgc tccgaatcgc 1200 attcgccgtg tgtatataag gaaattgtat gactaa 1236 <210> 464 <211> 1215 <212> DNA <213> Chlamydia pneumoniae <400> 464 atgactaatt ctgctctctt ttggatagga gtcaacatta tctgtattgt cttacaagga 60 ttctattcga tgatggaaat ggcctgcgtg tcatttaacc gtgtacgatt gcaatactat 120 ctgactaaag atcataagaa agctcgctac attaatttcc tgattcgccg cccctatcgt 180 ttatttggaa cggtgatgtt aggagtgaat atcgctctac aagtcgggtc tgagtcctca 240 agaaattgct atcgagcttt aggaatcact ccagattacg ctcctttcac tcaaattttt 300 atagttgtga tttttgcaga acttctacct ctaacaatat cacggaagat tcctgaaaaa 360 ttagcacttt ggggagcacc gattctctat tattcccact atattttcta tcctctgatt 420 cagctcatag gaagtctcac tgagggtctt tactatcttc taaatattag gaaagaaaaa 480 ttgaactcta cattaagtag agacgagttc caaaaagctt tagagactca ccatgaagaa 540 caagatttca atacaattgc tacaaatatt ttctctttaa gtgcgacttg tgcagatcag ' 600 gtatgccaac ctttagaaca ggttaccatg cttccttctt ctgcaaatgt taaagatttt 660 tgccggacta taaaaaatac agatatcaac tttattcctg·tctatcacaa ggcccgaaaa 720 aacgttattg ggattgccca tcctaaagac tttgtcaata aagctcttga tgaaccccta 780 atcaataatc tacactcgcc ttggtttatc actgcaaaat caaaacttat tcgtatcctc 840 aaagagtttc gagacaaccg ttcgagtgtt gctgttgtcc tcaatgcttc tggtgaacct 900 ataggtattc ttagtttaaa tgcaattttc aaaatcttat tcaacactac aaacattgct 960 catttaaaac ccaagaccat ctctgttatt gaaagaacgt ttcctggcaa ctctcgcata 1020 aaagatctgc aaaaagaact cgatattcaa tttccgcaat atcctgtaga aaccctagcc 1080 caattggtat tgcaactgct agacagtcct gcagaagtag gaacttctgt aattatcaac 1140 aacttgcttt tagaagttaa agagatgtct ttatctggga taaaaaccgt atcgattaaa 1200 aacttactct catag 1215 <210> 465 <211> 1632 <212> DNA <213> Chlamydia pneumoniae <400> 465 ttgttcggct cggagtccct ccgttatcaa ttgttgatcc aagattttgc aaaagtttca 60 gaagagggca taggcctttt ggagtctaaa gagtattctt tacttcaggc taagctagtt 120 ttaagggctc tggctcaaaa ttcttctttt gatgattggt ttagaagttt taagaagtgt 180 cagatttcct atccagagtt agctcatgat cgcgatgtct tagaagaatt tgggattcaa 240 gttctgcgtg agggaatcga aaatccttcc gtgaccgttc gtgctgtgag tgtccttgct 300 attgggcttg ctagagattt tcgcttggtc cctctcctgc tccaaagttg taatgatgac 360 agtgctattg ttcgatcttt ggctcttcag gttgctgtga actatggctc tgaaagttta 420 aaaaaggcca ttgtagagct tgcccgtaat gatgattcta ttcatgttcg gattacagca 480 tatcaggtgg tcgctctttt acagatagag gagctattgc catttttaag agagcgtgct 540 gagaacaaac ttgtagatag tgtagaacgt cgagaggcgt ggaaggcttg cttggaactc 600 tcttctcaat ttctagagac gggtgtagct aaggacgata ttgatcaagc gttgttcact 660 tgtgaagtgt tgcgtaacgg tatgttgcca gagactactg agatttttac agaactctta 720 tctgtagagc atcctgaagt gcaggagtct ctcttacttt ctgctttagc ttggagtcat 780 cagctacaga atcacaaaga gtttcttagt aaagtgcgcc atgtgatgtg cacttctcca 840 tttgcaaaag tacgttttca agctgctgca cttctccatc tgcatggaga ccctttgggc 900 agagactctc tggttgaggg cttgcgctct cctcaacctc ttgtgtgtga ggcagcttcg . 960 gcggctctct gctctttagg aatccatgga gtccctttgg caaaggagca tttggagagc 1020 ctttcttctc gaaaggctgc tgcgaacctc tccattttgc. ttcttgtgag ccgtgaa^at 1080 • to to··· ·· ·· ·· ···· • ·· · ♦ to · · · « ··· ·.. · ··· · to · • >········ · • · ···· ···· ·.»·· «·· ·· ·· ·· ··
437 attgaaagag ctggagatgt gattgctcgc tacctctcca atcctgaaat gtgctgggct 1140 atagagtatt tcttatggga tgcacaatgg aatttacgtg gtgatacctt ccctctatat 1200 tcggatatga ttaaacgtga gattggtagg aagctcattc gccttttggc agtagctcgc 1260 tatagccaag ccaaggctgt aacagcaacg ttcctttcag gacagcaagc tcagggatgg 1320 agcttttttt ctggaatgtt ctgggaagag ggagatgtga aaacttctga ggatttggtt 1380 acagatgctt gctttgcagc aaagttggaa ggagcgttag cctcgctatg tcagaaaaaa 1440 gatcaagctt ccctacagag ggtctcteaa ctttataatg acagccgttg gcaagataaa 1500 ttagcaatct tagagagcgt tgctttttct gagaatcttg atgctgtgcc ttttcttcta 1560 gactgctgcc atcacgaagc tccttcgctg cgaagtgcag cagcgggtgc tcttttctct 1620 attttcaaat aa 1632 <210> 466 <211> 312 <212> DNA <213> Chlamydia pneumoniae <400> 466 atgtcattta aacgtttctt gcaacagatc cctgtacgta tctgtctact tattatctat 60 ctctaccaat ggcttatctc ccctctctta ggctcgtgct gtagattttt tccttcctgt 120 tcgcactatg cagaacaagc cttaaaatct cacggcttcc tgatgggctg ctggctttct 180 ataaagagaa tcggaaagtg tggcccctgg catcctggag gcattgacat ggtccctaag 240 actgctttgc aggaagtttt agaaccttac caggaaatag acggtggtga ttcaagccat 300 ttttctgaat ga 312 <210> 467 <211> 1089 <212> DNA <213> Chlamydia pneumoniae <400> 467 atggctttca aaagaaaaac tagatggctg tggcaagtct tgatcctgag tgtgggattg 60 aatatgcttt ttttgctctt attttactct gccatatttc gtaaagacat ctataagctg 120 catttatttt ccggacctťt gattgcgaaa agtagtcgta aggtctacct ttctgaagat 180 tttttaaacg agatatctca agcatctttg gacgacttga tttcgttgtt caaagatgag 240 cgctatatgt atggťcggcc gataaaactt tgggcgttga gtgtagcgat agcttcccac 300 cacatagaca tcactcctgt gctttcgaag cctttgacct atacagagtt gaaaggatct 360 tcagtgcggt ggcttttgcc gaatattgat cttaaagact ttcctgtgat tttggactat 420 ttgcgttgcc acaagtatcc ctatacttct aagggcttgt ttttgctgat agaaaagatg 480 gtacaagaag gctgggtaga tgaagattgc ctgtatcatt tctgctcgac tccagaattt 540 ctttacttgc gtacgttact tgtaggtgca gacgtgcagg cctcttcagt agcctcatta 600 gctcgtatgg tgattcgttg cggatccgaa cgtttctttc atttttgcaa tgaagagagc 660 c^cacttcca tcj-sfctfccs-g-c tacscsaccjt cagsaacjtcfc taaaatctta 720 gaagaatctc tggcagcctt gcttttgctt gtccatgata gtgatgttgt tttgcatgaa 780 ttttgtgatg aagatcttga gaaggtcatc cgcctgatgc ctcaagagtc tccctatagt 840 cagaatttct tctctcgatt acagcattct ccgcgtagag agttggcctg catgtcgact 900 cagagggtag aggctcctcg tgttcaagaa gatcaggatg aagagtatgt ggtacaggac 960 ggggattctt tatggttgat agctaagagg tttggčattc ctatggataa gatcattcag 1020 aaaaatggct tgaatcacca ccgtctattt cctggtaagg ttctaaaact tcctgcaaag 1080 cagtcttag 1089 <210> 468 <211> 1308 <212> DNA <213> Chlamydia pneumoniae <400> 468 atgttttcac gatggatcac cctcttttta ttattcatta gccttactgg atgctcctcc 60 tactcttcaa aacataaaca atctttaatt attcccatac atgacgaccc tgtagctttt 120 tctcctgaac aagcaaaacg ggccatggac ctttctattg cccaacttct ttttgatggt 180 ctgactagag aaactcatcg cgaatccaat gatttggaat tagcgattgc cagtcgctat 240 acagtctctg aagacttttg ctcttatacg ttctttatca aagacagcgc tttatggagc 300 ·· ·**· » « φ φ φφφ • · * *· «φ • · φ φ φφφφ • · « · • · · « ·· ·· * φ · φ · · φ · · « · 9
9 9
9 9 · ·« · ·
438 gacggaacac tctccccaca acgattcatc gctatcttta ttcccagggc tccatcaact aacagaggca cataaacaat ctaaatacaa attgataaac ctgtcccgag gaaaaactcg ttaaaggaac ctgtttgtta tattacccag atcccgatct tataatgctt caatcacctc tacagatctt tcgactcgcc aaccagaaaa ataacattca ccatcaaact aggtggactg cgcaatatca aatccccaca gttctatcat gagctccaca tgcttaccta aatggaaagc acaaacgaaa gagcaaatct actatctgag ctggagctgt cgaagatatc ccaaggactt caaccccgat cccgaaqctc tttaaagaaa gctcattatt ggtaggacaa ctactacacc cttaaatgat tgaagaagct accaaatcaa tccctcagat tgctggaata agtccaagac aatttctgaa ctatgactat agatctcaaa cgtaacgctt aacttctcaa tttcctaagc tttágcggtc aaccctaact cctgatatat ccctggcatc tatcctgtag cttcaaaaca cttcaaggaa tataaaaaac attctaagat gatttaatcc tacgccatag gaagacaagc ctcactcaag tatacctatt gggagtatgc ctccttcatc ttcttgcctt cgtatactct attacgacta atacagccat aagggattcc aaggtgcctt gacatagact cccaacaacc aaaagcctct gccaacgcat ttgaaggact caacacagac tcctgcaaaa attttataga tcccctag acaggagaac aaatgcaatt tcctgcattt tgtagagtat ccactgcgtc ccacctccta ttgggagctc ctggctttgt cgctacttgt agcggaaaca aactccacaa agcagaaatc cgaataccat tggagttgct ctttgagatt gggagtaatc
360
420
480
540
600
660
720
780
840
900
960
1020
1080
1140
1200
1260
1308 <210> 469 <211> 1749 <212> DNA <213> Chlamydia pneumoniae <400> 469 gtgtctggga ctaatctttt ttgtctttac tttcctccat cgatggattg tctttaggaa ttgatggttt gctcttccag aaggctgtca gagggggtct aacgtagttt tttacagttt gcagocactc tactacaaac tgcattccca tatcgaaaag gagggggcct z~í o rr ca 2/1¼ 21¼ g a CA l_A c. o gagcgtcctt gctgtgcttc aagtaccttg aaaatctctt cttaagcttt ttggagatcc tgggatcaga aacagctcat agtcttttag cgatttgaga gatgagcttc gttccttaa agaaagatgg tacctcttcc taacggtctg ttttcttata tctcttcagg gtctatgggc caaagggttc caaaacagat aaaaacaaaa ttcgttttgt ctgtaacttg taggagatgc ttattagtaa agttgcgtca gttctccaaa aagagcctgc gccctaagga +“.<» 2J 0/10¼¼¼ <_ C O UU Cj O K. c. vggctccgagt ctttccttag aggaatcaga taagctctct tcccaaagat ttgcggaaaa aacaaaccct actcaaagtc aacggtcggt tgaaaaaaat ctaaagaaat tgtaagggga tcagatoctt ttgggtcttt tctttgccta aaccgcctct agcaacgttt ggaaagaatc ggctttagat aaatgccctt taaaggggat tctttattat tttagtgagt aatcgataag gcatttcagg attccctatc atcagaagat acaagaatca a zizi 2/1-)-¼ o rr o y 'd <~a cj >_* atttggccag aaacatcgct gagagtgttt tgtagttctt tctagaggcc agtgcgaaag tgaggtaatt taatcctgta atttaaagat gctcgaccca ccctatttcc atgatctttg cttgattttg accttaaatt ttgcggttgg tctctgattg gcgtgcctcc gcagaggtcc tctgatcttg atagaagaag gcaattatta acttcgggtt caagtacctg gaagagagcc gtggtgtcgt gttttgctcg tcttgtatag cagttctatc ttgcctgtgc aatgtatact catgaggctc ggcatcgctg tctcgcctcc gttgcggtat tctctcggat accatagatt atgcaagaga tttcgagcca catttccctg ttcttaggga tccctcttag gattgtgtat caagcaattc gattgaatct tttctttagg ttcttttctt gttcgcggtt tttctggaag gggatttctt gttgtatcct atgctcttga ctttacttac ttttaaatta tattgatctt cgagtctttt aacgtgcgtt aagtatatcg ttacttctct tagatgaaat tcaatgccga ttgaagacat ttgttagaga accaaaattc attggattgg ttcatgttga atgtgatccg tagttacgag atcttttggt tcgtttcaga catcctagta tagttttgca agcgaagctt tgcatcaaca cagtttcttc tgtgaacttt tttcttagag agcttcttat ctctgccatg tttactcgtg gcagatgtgg ttcgtgtgct cctgttcgaa ttctttgtgc atggttggcg ctcttatgtt tgcagcatcc acgtattgaa gactccagag ggtagttcaa cgttcctaag aagggtatcg tggagacagc gagaagtctc agaattgata tcgagtagac ctgtgaaaca tttatctcat tgaggtttta
120
180
240
300
360
420
480
540
600
660
720
780
840
900
960
1020
1080
1140
1200
1260
1320
1380
1440
1500
1560
1620
1680
1740
1749 <210> 470 <211> 516 <212> DNA <213> Chlamydia pneumoniae <400> 470
9« 9999 • ·* • ··« • * ·
9999 999
99 ··«· • β> 9 9 9 Λ
9 ««1 · 9 9
9 9 9 9 9 9 9
9 9 9 · 9 9 9
99 99 99
439 atgaaaaaat tattattttc tacatttctt cťtgttttag gatcaacaag cgcagctcat . 60 gcaaatttag gctatgttaa tttaaagcga tgtcttgaag aatccgatct aggtaaaaag 120 gaaactgaag aattggaagc tatgaaacag cagtttgtaa aaaatgctga gaaaatagaa 180 gaagaactca cttctattta taataagttg caagatgaag attacatgqa aagcctatcg 240 gattctgcct ctgaagagtt gcgaaagaaa ttcgaagatc tttcaggaga gtacaatgcg 300 taccagtctc agtactatca atctatcaat caaagtaatg taaaacgcat tcaaaaactc 360 attcaagaag taaaaatagc tgcagaatca gtgcggtcca aagaaaaact agaagctatc 420 cttaatgaag aagctgtctt agcaatagca cctgggactg ataaaacaac cgaaattatt 480 gctattctta acgaatcttt caaaaaacaa aactag 516 <210> 471 <211> 1083 <212> DNA <213> Chlamydia pneumoniae <400> 471 atgtccgaag caccagtcta cactcttaaa cagttagctg agctactaca agtcgaagtt 60 caaggaaata tagaaactcc tatttcaggt gttgaagata ttagtcaggc gcaacctcac 120 catattgctt ttttagataa tgagaaatac tctagctttc taaaaaacac caaagctggt 180 gctattattt tatctagatc tcaggcaatg caacatgccc acctaaagaa áaactttčtt 240 attaccaatg aatccccttc tctaacattt caaaagtgca t.agagttgtt tattgaaccc 300 gtaacatcag ggtttcctgg tattcatcct actgcagtga ttcatcctac tgcacgtatt 360 gagaaaaatg taaccataga accttacgtt gtcattagtc aacatgccca tatcggctct 420 gacacataca tcggagctgg aagtgtcatt ggagctcaca gcgttctagg tgctaactgt 480 ctgattcacc ctaaggtggt gattcgagaa agagtcctca tgggaaaccg tgtagttgtt 540 caacctggag ctgttttagg atcctgtggt tttggttata ttacaaatgc ttttggtcat 600 cacaaacctt taaagcatct aggctatgtg attgtaggtg atgatgtaga aatcggagcc 660 aacactacga tagatcgtgg tcgattcaag aacaccgtga tccatgaagg aactaaaata 720 gataaccaag tacaagtagc tcatcacgta gaaattggaa agcatagtat tattgttgcc 780 caagcaggca ttgcaggttc tacaaaaatt ggtgaacatg tcatcattgg agggcaaacc 840 ggaattactg ggcatatttc tattgcagac catgtgatca tgattgctca aactggagtc 900 acaaaatcta tcacctctcc aggcatttat ggaggcgctc cag-cacgacc ttatcaagaa 960 acacatcggt tgattgctaa aattcggaac cttcctaaaa ctgaagaaag actaagtaag 1020 ttagaaaaac aagtaagaga tctatcgact cccagccttg ctgagattcc ttcagagatc 1080 taa 1083 <210> 472 <211> 1200 <212> DNA <213> Chlamydia pneumoniae <400> 472 atggcagcat caggaggcac aggtggttta ggaggcactc agggtgtcaa ccttgcagct 60 gtagaagctg cagctgcaaa agcagatgca gcagaagttg tagccagcca agaaggttct 120 gagatgaaca tgattcaaca atctcaggac ctgacaaatc ccgcagcagc aacacgcacg 180 aaaaaaaagg aagagaagtt tcaaactcta gaatctcgga aaaaaggaga agctggaaag 240 gctgagaaaa aatctgaatc tacagaagag aagcctgaca cagatcttgc tgataagtat 300 gcttctggga attctgaaat ctctggtcaa gaacttcgcg gcctgcgtga tgcaatagga 360 gacgatgctt ctccagaaga cattcttgct cttgtacaag agaaaattaa agacccagct 420 ctgcaatcca cagctttgga ctacctggtt caaacgactc caccctccca aggtaaatta 480 aaagaagcgc ttatccaagc aaggáatact catacggagc aattcggacg aactgctatt 540 ggtgcgaaaa acatcttatt tgcctctcaa gaatatgcag accaactgaa tgtttctcct 600 tcagggcttc gctctttgta cttagaagtg actggagaca cacatacctg tgatcagcta 660 ctttctatgc ttcaagaccg ctatacctac caagatatgg ctattgtcag ctcctttcta 720 atgaaaggaa tggcaacaga attaaaaagg cagggtccct ačgtacccag tgcgcaacta 780 caagttctca tgacagaaac tcgtaacctg caagcagttc ttacctcgta cgattacttt 840 gaaagtcgcg ttcctatttt actcgatagc ttaaaagctg agggaatcca aactccttct 900 gatctaaact ttgtgaaggt agctgagtcc taccataaaa tcattaacga taagttccca 960 ačagcatcta aagtagaacg agaagtccgc aatctcatag gagacgatgt tgattctgtg 1020 accggtgtct tgaacttatt cttttctgct ttacgtcaaa cgtcgtcacg ccttttctct 1080 tcagcagaca aacgtcagca attaggagct atgattgcta atgctttaga tgctgtaaat 1140 ataaacaatg aagattatcc caaagcatca gacttcccta aaccctatcc ttggtcatga 1200 <210> 473 <211> 675 <212> DNA <213> Chlamydia pneumoniae
440 <400> 473 atgacatcct ggatagaatt acttgataag caaattgaag atcaacatat gttaaagcac 60 gaattttatc agcgttggtc tgaaggaaag ttagaaaaac aacaacttca agcttatgcc 120 aaagattact atttacatat taaagcattt ccttgttacc tttcagcgct gcatgctcgc 180 tgtgatgact tgcagattcg tagacaaatt cttgagaatc tcatggatga agaagctgga 240 aatcctaatc acatagattt atggagacag tttgctttat ctcttggagt ttctgaagag 300 gagcttgcca atcatgaatt cagtcaggct gctcaagata tggtagcgac atttcgccgc 360 ttatgcgaca tgccacaact tgccgtgggt ttaggcgctc tctatactta tgagattcag 420 attcctcaag tctgtgtaga gaaaatccgt ggtttgaaag aatattttgg agtttctgct 480 cgaggctatg catactttac tgtacatcaa gaagctgata ttaaacatgc cagcgaagag 540 aaagaaatgc tacaaacttt ggtaggcaga gagaatcctg atgctgtttt gcaaggatca 600 caagaagttt tagatactct atggaacttt ttgagctctt ttattaattc aacggagcct 660 tgttcttgta agtag 675 <210> 474 <211> 741 <212> DNA <213> Chlamydia pneumoniae <400> 474 atgaaaatca ccacagtcaa aacaccaaaa atatatcctt atgatgacct atattctatt 60 ctagagtctt cattgcctaa gttaaacgaa cgctctattg ttgtgattac gtctaagata 120 gtctctttat gtgaaggtgc tgttgtagaa cttgagaagg tttctaaaga tgaattaata 180 aagcaagaag cagatgccta tgtttttgta gagaaatacg gcatatatct aactaagaag 240 tgggggatac tcattccttc agcggggatt gacgagtcca atgttgaagg ttattttgtg 300 ttgtatccta gggatttttt gctttccgtg aatactctag gggattggtt aaggaatttc 360 tatcatctcg agcattgcgg aatcattata tcggatagtc atacgactcc gttgcgtcgg 420 ggaactatgg gtttaggctt atgttggaat ggttttttcc ctttatataa ttatgtagga 480 aaaccagatt gttttggtcg tgctttgaag atgacttata gcaatttatt agatggttta 540 tcggcagctg cggttctttg tatgggagag ggagacgagc agactcccat tgctattata 600 gaggaagctc ccaagattac cttccattct tctccaacta cattacaaga tatgagcact 660 ttagcaatcg ctgaggatga agatttatat ggtcctctgc tacaatctat ggcatgggaa 720 actcccgcac caacctcctg a 741 <210> 475 <211> 1062 <212> DNA <213> Chlamydia pneumoniae <400> 475 atgaataaaa gacaaaaaga taaattaaaa atctgtgtta ttattagcac gttgatttta 60 gtaggaattt ttgcaagagc tcctcgtggt gacactttta agactttttt aaagtctgaa 120 gaagctatca tctactcaaa tcaatgcaat gaggacatgc gtaaaattct atgcgatgct 180 atagaacacg ctgatgaaga gatcttccta cgtatttata acctctcaga acccaagatc 240 caacagagtt taactcgaca agctcaagca aaaaacaaag ttacgatcta ctatcaaaaa 300 tttaaaattc cccaaatctt aaagcaagcc agcaatgtaa ctttagtcga gcaacctcca 360 gcagggcgta aactgatgca tcaaaaagct ctttccatag ataagaaaga tgcttggcta 420 ggatctgcga actacaccaa tctttctcta cgtttagata ataatctcat tctaggaatg 480 catagctcgg agctctgtga tctcattatc acaaatacct ctggagactt ttctataaag 540 gatcaaácag gaaagtattt tgttcttcct caagatcgta aaattgcaat acaagctgtá 600 ctcgaaaaaa tccagacagc tcagaaaacc atccaagttg ctatgtttgc tctgacccac 660 tcggagatta ttcaagcctt acatcaagca aaacaacgag gaatccatgt agatattatc 720 attgatagaa gtcatagcaa acttactttt aagcaattac gacaattaaa tatcaataaa 780 gactttgttt ctataaatac cgcaccctgt actcttcacc ataagtttgc agttatagat 840 aataaaactc tacttgcagg atctataáat tggtctaaag gaagattctc cttaaatgat 900 gaaagcttga tcatactgga aaacctgacc aaacaacaaa atcagaaact tcgaatgatt 960 tggaaagatc tagctaagca ttcagaacat cctacagtag acgatgaaga aaaagaaatt 1020 atagaaaaaa gtcttccagt agaagagcaa gaagcagcgt ga 1062 <210> 476 <211> 561 <212> DNA <213> Chlamydia pneumoniae
441 <400> 476 gtggcattaa attttaagat taacaggcaa ataagagctc ctaaagttcg tctcattggt 60 tcagccggag aacagttagg aatacttgct atcaaagatg ctttggattt agcccgagag 120 gcaggtcttg atttagttga agttgcttca aatagcgagc ctcctgtatg taagatcatg 180 gactacggta aataccgtta tggtctgaca aaaaaggaaa aagatagtaa aaaagctcaa 240 catcaggtgc gcataaaaga agttaagctt aagcctaaca tagacgaaaa tgatttttcg 300 actaagttaa agcaagcgcg tacgttcgtt gaaaaaggaa ataaagtcaa aattacatgc '360 atgttccgtg gtagagaatt agcttatcca gaacatggtt ttaaagttgt tcaaaaaatg 420 agtcagggtt tagaggatat tggtttcgtt gaagctgaac ccaaactagc aggtcgttcc 480 ttgatttgtg ttgtggctcc aggaacagta aaaacaaaga aaaaacagga aaagtctcat 540 gcccaagatg aaaaccaata a 561 <210> 477 <211> 3135 <212> DNA <213> Chlamydia pneumoniae <400> 477 atggtcgaag ttgaagaaaa gcattacacc atcgtcaaac gtaatggaat gtttgtccca 60 tttaatcaag atcggatttt ccaggctttg gaggcagctt ttcgagatac gcgtagctta 120 gaaactagtt ctccactacc taaagactta gaagaatcta ttgcgcaaat tactcataaa 180 gtcgtgaagg aagtcctcgc taaaatttca gaaggtcagg tagtcactgt agagagaatc 240 caggatcttg tagaaagtca gctctatatt agcgggttgc aggatgtggc tcgcgattat 300 attgtttaca gggaccaacg caaggcagag cgcggtaact cttcgtccat aattgccatc 360 atacgtagag acgggggaag cgctaaattt aatcctatga agatctctgc agctctcgaa 420 aaagcattca gagcgacgct ccaaattaat gggatgactc ctcctgcaac actatccgaa 480 attaatgacc ttacccttag gatcgttgaa gatgtcctaa gccttcatgg tgaagaagct 540. attaatctgg aagagatcca agatattgtt gaaaagcaac ttatggttgc cggctattat 600 gatgtggcca agaattatat tttatataga gaagctcgtg cacgagcccg tgctaataaa 660 gatcaagatg gacaagaaga gtttgtcccc caagaggaaa cgtacgttgt tcaaaaagaa 720 gacggcacca cctaccttct gagaaaaaca gatttagaaa agaggttttc ttgggcatgc 780 aaacgctttc ctaaaactac agattctcaa ctqcttgcag atatgacatt tataaatttg 840 tattcaggaa tcáaagaaga cgaggtcacc acagcatgca tcatggcggc acgtgccaat 900 atcgagagag áacctgatta cgcttttatc gcagcagaac tcctcacgág ttccttgtat 960 gaagagacct taggatgcag ctctcaagac cccaatttat cagaaataca taaaaaacat 1020 tttaaagaat acatcctcaa tggagaagag tatcgcttga atcctcaatt aaaggattat 1080 gatctcgatg ctcttagtga agtcctagac ctctctagag accaacagtt ttcctatatg 1140 ggagtccaaa atctctacga tcgctatttt aatctgcatg aaggacgacg tttagagact 1200 gcgcagatct tttggatgcg ggtttctatg ggcttagcct ťaaatgaagg agaacaaaag 1260 aatttttggg caatcacttt ctataatctg ttatccacat tcdgctatac cccagcaact 1320 cctacattgt ttaactccgg aatgcgtcat tcccaactca gttcatgcta tctttccaca 1380 gtaaaagatg acctaagtca catttataag gtgatttctg ataatgcttt gctttctaaa 1440 tgggcagggg gaattggaaa tgattggaca gatgtccgtg ctacaggagc tgtaattaag 1500 ggaaccaatg gaaagagtca aggcgtcatt cccttcatta aggttgccaa tgatactgca 1560 attgcagtga atcagggggg caaacgtaaa ggtgctatgt gcgtatattt agaaaactgg 1620 cacttggatt acgaagactt tttagaattg cggaagaata caggagatga gcgtcgtaga 1680 actcacgata tcaatacagc aagctggatt cctgatctct tctttaagag actagaaaaa 1740 aaaggcatgt ggacactctt tagccccgat gatgtcccag gtttacacga agcctatggg 1800 ttagagtttg aaaagcttta tgaagaatat gaacgtaagg ttgaatctgg ggaaatccgt 1860 ctttataaaa aagtagaagc cgaagtgctg tggcgtaaaa tgttaagcat gctttacgaa 1920 acagggcatc cttggattac atttaaagat ccttcgaata ttcgctcaaa ccaagatcat 1980 ·· ··♦· ··'·'·· · · · · · • · ·· · · ·· ·
442 gttggcgtcg tacgctgttc taatctatgt acagagattt tattgaactg ttcggaatca 2040 gagactgcag tttgtaattt aggttccata aacttggtag aacatatccg taatgacaag 2100 ttagatgaag aaaaattaaa agaaactatc tcaatagcca tccgtatttt ggataacgtt 2160 attgacctga acttctaccc tacaccagag gctaaacaag ccaacctaac tcacagagct 2220 gtggggttgg gggttatggg attccaggat gttctttacg agttgaacat tagctatgcc 2280 tcacaagaag ctgtcgaatt ttctgacgag tgctcggaga tcatcgcata ctacgctatt 2340 ctagcctcga gcttactcgc gaaagaacga ggtacatatg cttcttattc aggatctaag 2400 tgggatcgtg ggtatctacc cttagatact atcgagcttc tcaaagaaac tcgcggagag 2460 cataatgttc ttgtagacac atcaagtaaa aaagattgga ctccagttcg tgatactatc 2520 cagaaatacg gaatgagaaa tagccaggtc atggcaattg ctcctacagc aacgatctcg 2580 aatatcatag gggtcaccca atctatagag cccatgtata aacatctctt tgtaaagtcc 2640 aacctttccg gagagtttac gatccccaac acctacctga ttaaaaaact taaggaatta 2700 ggactttggg atgcagaaat gttagatgat ctaaaatatt ttgacggatc tctattggaa 2760 attgaaagga tccctaatca cttgaaaaag cttttcctta cggcatttga aatcgaaccc 2820 gagtggatta tagagtgtac cťctagaaga cagaaatgga ttgatatggg agtttctcta 2880 aatctgtatc ttgctgagcc agatggtaaa aaactctcca atatgtatct cacggcttgg 2940 aaaaaaggat taaagactac ctattattta agatctcaag ctgcaacatc agtagagaaa 3000 tcatttatag atatcaataa acgcggcatt cagcctcgtt ggatgaaaaa taaatcagcg 3060 tccacaagta ttgtggtcga aagaaaaaca acccccgttt gttcaatgga agaaggttgc 3120 .gaatcttgtc aataa 3135 <210> 478 <211> 1041 <212> DNA <213> Chlamydia pneumoniae <400> 478 atggaagcag atattttaga tggaaagctc aaacgggttg aggtaagtaa aaaaggattg 60 gtgaattgta atcaagtaga tgtcaatcag ctagtcccta tcaagtataa atgggcttgg 120 gaacattacc tcaatggatg tgcaaacaac tggcttccta ctgaagttcc tatggcaaga 180 gatatcgagt tgtggaaatc agatgaactg tctgaagacg aacgcagggt cattttgtta 240 aacctaggat ttttcagtac cgcggaaagc ctagtcggaa ataacatcgt tcttgctatc 300 ttcaaacata tcacaaaccc tgaagcaaga cagtatttac tgcgtcaagc ttttgaggaa 360 gccgtacata cacatacatt tctctatatt tgcgaatctt taggacttga tgaaggcgaa 420 gtattcaatg cctataatga aagagcctca attagggcta aagatgattt tcaaatgaca 480 ttaacagtcg atgtccttga tcctaatttt tctgtacagt cttcagaagg ccttgggcag 540 ttcattaaaa acttagtagg atactatatc attatggaag gaatcttctt ctatagtggt 600 tttgtaatga ttctctcttt ccatagacaa aataaaatga caggaattgg agaacagtac 660 caatacatcc tcagagatga aaccatacat ttaaattttg gaatcgatct tatcaatgga 720 attaaagaag aaaaccccga agtttggact acggaactac aagaagaaat cgtcgctctt 780 attgaaaaag ctgtagagct tgaaattgag tacgctaaag attgcttacc tcgaggaatc 840 ttgggattaa gatcttcgat gtttatagat tacgttcgtc atattgcaga tcgtcgttta 900 gagagaattg ggttgaagcc tatctatcac tccagaaatc ctttcccttg gatgagcgaa 960 accatggatc tgaataaaga aaagaatttc tttgaaaccc gggttaccga ataccaaacc 1020 gctggtaatt taagttggta a 1041 <210> 479 <211> 984 <212> DNA <213> Chlamydia pneumoniae <400> 479 atggatgcga aaatgggata tatatttaaa gtgatgcgtt ggattttctg tttcgtggca 60 tgtggtataa cttttggatg taccaattct gggtttcaga atgcaaattc acgtccttgt 120 atactatcca tgaatcgcat gattcatgat tgtgttgaaa gagtcgtggg gaataggctt 180 gctaccgctg ttttgatcaa aggatcctta gaccctcatg cgtatgagat ggttaaaggg 240 gataaggaca agattgctgg aagtgccgta attttttgta acggcctggg tcttgagcat 300 acattaagtt tgcggaagca tttagaaaat aatcccaata gtgtcaagtt aggggagcgg 360 ttgatagcgc gtggggcctt tgttcctcta gaagaagacg gtatttgcga tcctcatatc 420 tggatggatc tttctatttg gaaggaagct gtcatagaaa ttacagaagt tctcattgaa 480 aagttccctg aatggtctgc tgaatttaaa gcaaatagtg aggaacttgt ttgtgaaatg 540
4» 4444 ···· *4 44 • 4 · · * 4 9 9 · • •44 4 · 4 4 4 4 4 4
4«· 44 444 4 4 • 4 4444 4444
4*44 ··· 44 44 44 44
443 tctattttag attcttgggc gaaacaatgc ttgagcacaa ttcctgaaaa tttacggtat 600 cttgtctcag gtcataatgc gttcagttac tttacacgtc gctatttagc tactcctgaa 660 gaagtggctt ccggagcatg gaggtctcgt tgtatttctc ctgagggtct atctccagaa 720 gctcaaatca gtgttcgtga tattatggcg gttgtagatt atattaatga qcatgatgtc 780 agtgtggttt tccctgagga tactctgaae caagatgcgt tgaaaaaaat tgtttcttct 840 ctgaagaaaa gtcatttagt tcgtctagct caaaaaccat tgtatagtga taatgtggac 900 gacaattatt ttagcacctt taaacataat gtctgcctta tcacagaaga attaggaqgg 960 gtggctcttg aatgtcaaag atga 984 <210> 480 <211> 444 <212> DNA <213> Chlamydia pneumoniae <400> 480 atgcaaaacc aatacgagca attactagaa tccttagcac ccctattaaa tacgacactt 60 gctccagata aaaataactc ttgtttaatc cgtttcagcg atacccatgt ccctgtgcaa 120 atagaagaag atggaaattc cggagatctt gcagtatcga cactactagg tactcttcct 180 gaaaacgtat ttcgcgagcg tattttcaaa gctgctctct ctgtaaatgg ctcgttccaa 240 tccagcatca agggaattct aggctacggt gaggtcactc aacagctcta tctttcagat 300 atcctgagta tgaactacct aaatggagaa aagttattcg agtatctcaa gctcttttct 360 ttgcatgcta agatttggat ggaatcccta agaacaggga atcttcctga ccttcatgtt 420 ttgggaatct actacgtcgc gtga 444 <210> 481 <211> 1581 <212> DNA <213> Chlamydia pneumoniae <400> 481 gtgaatgttt taaaatacac aaaacactca ccctcagcac atgcttggaa acttatagga 60 acctctccta aacacgggat ttatctccca ctattttcaa tacacacaaa aaatagctgt 120 ggaatcggtg aatttttaga tctcattcct ctgatctctt ggtgccaaaa acagggcttc 180 agcgttattc agcttctccc tttaaatgat actggtgaag atacgagtcc ctataacagc 240 atctcttccg tagccctgaa tcccctattc ctttccctat cctctcttcc aaatatcgat 300 accatccctg aagttgccaa gaaacttcaa gatatgcatg agttatgctc gactccatca 360 gtcagctata ctcaagttaa agaaaaaaaa tgggcattct taagagagta ctaccaaaaa 420 tgttgcaagt cttccctcga aggaaactca aatttttctg agtttctaga aagčgagcgc 480 tattggcttt atccctatgg gacctttcgt gcaatcaaac atcatatgca cggagaacct 540 attaataact ggccgaagtc gctcacagat caggagaatt ttccggactt aactaaaaaa 600 ttccatgatg aagtcctctt tttttcctat ctacagtttc tctgttacca acagctctgc 660 gaagtgaaag cctatgcaga tcaacáccac gtcctgctta aaggagacct ccctattett 720 attagcaagg atagctgtga tgtttggtat ttccgagact acttttcttc atcaaggtct 780 gtaggagctc ctcctgacct ctacaattct gaaggacaaa actggcatct gcctatttat 840 aatttttcac aacttgccaa agacgactac atttggtgga aagagcgtct gcgatatgct 900 caaaacttct attccgtcta tcgcttagat catattatag gatttttccg tttgtggatt 960 tgggattctt caggaagagg aaggttcatt ccagacaatc ctaaagacta tataaagcag 1020 ggcacggaga tcctttctac tatgctcgga gcctcttcta tgttacctat cggagaagat 1080 ttagggatta taccccaaga cgtcaaaacg acattaacac acttaggaat ctgtggaacc 1140 cggattccac gatgggaacg caactgggaa agcgacagtg ccttcattcc cctaaaagat 1200 tataatccac tttctgtgac cactctctct acccacgact ctgatacgtt tgcccaatgg 1260 tggctcaatt cacctaagga agctaagcaa tttgctaaat ttctacatct tccttttcaa 1320 aaaaccctga ctacagaaac tcaaatagac atcttaaaac tttctcatga atcagcatct 1380 atctttcata tcaacctctt taacgattat ctcgccctct gccctgattt agtatcaaaa 1440 aatctacaaa gagaacgcat taatacacct gggacaattt ctaaaaagaa ttggtcgtat 1500 cgagttcggc cttccttaga agaactcgct attcataaaa aatttaatgg ttacattgag 1560 aagatcctta caggactgta a 1581 <210> 482 <211> 1908 <212> DNA ·· ««!/·
Λ 9 .
* »·♦ • · · • · • J· · ·· » «« «Ο « · · « « «·» • · · · · • · · · «· ·· ·> · ·»·· » « · • · · • · · • · · · * · · ·
V
444 <213> Chlamydia pneumoniae <400> 482 atgatccctt ttactaaaac aatagggttc cgtttgtggt tggcttgcgc cgttgctatc 60 attgcacctc tagggatcaa catcgtatgg ttaaacctag atcaataccg caccatagtc 120 tctgctattt ctactgcact gaaagaaaac gctgctttca aagccaatac tctcactcag 180 attgtccctt tgaatgtcga tgttctatct ctattttctg atgtcttaga tttagatgct 240 ggtattccag agactccgaa cgttctcctt agcaatgaaa tgcagaaagt attccaaggg 300 atctataatg aaatctcttt aatcaaggta ttcccaaatg gagataaaat tgttgttgct 360 tctagcattc ctgaacactt aggggaaaac tataatcaca aaatagacat ccctaagaac 420 actccatttt tagcagccct aaaacaatct cctaaaaatc aggaagtctt ttctgtaatg 480 caagctaatg tttttgatgc aaaaactcaa gaactccaag ggatcttata caccacgttc 540 agtgctgaga gcttactcaa agatctcctg ataaacaagc aatcctatct cactgtaaaa 600 actgcgatcc tttccaaata cggcgttatc ttaaaagctt ctgatcctgc tctccatctc 660 catactgtct accctgacat gacgaaagaa aaattctgcc aagtttttct caatgatgat 720 ccttgcccta tagactcaga attaggtcct ttaactctct cccctctgga tattggagaa 780 aatttctatt cttttaaaat caaagatact gagatttggg gctgtattga aaatgttccc 840 agtatagata ttgcagtcct ttcctatgct aaaaaagaag agagctttgc gcctttatgg 900 cgcagagctc gcatgtacac tgcctatttc ttttgcattc tcttagggag cctcatagcc 960 tttattgtag caagacgatt gtcgttacct atcagaaaac ttgccactgc gatgatagaa 1020 tctaggaaaa acaaaaactg cctctatact gacgactcct tagggtttga gatcaacaga 1080 cttggccata tttttaatgc tatggtggag aatctccaca aacagcaaca cctcgctaag 1140 acgaactttg agatgaaaga aaatgcacag aacgctctac atttaggaga gcaggctcag 1200 cagcgacttc ttcctaatac tctccccagc tatcctcata tagaactcgc aaaagcctat 1260 atccctgcca ttactgtagg tggtgatttc tttgatgttt ttgttgtagg agagggttcg 1320 aaggctcgcc tattcctgat tgttgctgac gcctcaggga aaggtgttaa tgcttgtggg 1380 tattcgctat ttctaaaaaa tatgctcaga acattccttt ctcgctcttc gtctcttcaa 1440 caggcaatcc aagaaacctc acgcttattt tataacaata caaaaaactc agggatgttt 1500 gtcactctat gtgtgtactg ttatcatcaa acttccaaca ccatggaata ttattcttgt 1560 ggacatcctc ctgcctgcta cctagatcct gatggcgaga cttcttggct attccatcct 1620 ggaatggctt taggcttcct tcccgaagtt gcgaacatca cttcaaagct atttcatcct 1680 aagccagggt ctctctttgt cttgtattct gatggtatta cagaagccca taataacaat 1740 aacgacatgt ttggagaaga gcgcctacaa gctgcaattc aaggattgac agggaaaagt 1800 gctgctgatg ccgtccacag gttgatgtta agtgtaaaaa cctttgtcgg gaactcccat 1860 caacatgacg acatcacctt attaatatta aaggtattag aatcatga - 1908 <210> 483 <211> 945 <212> DNA <213> Chlamydia pneumoniae <400> 483 gtgttctcat acataaaaaa ccgaattctt tttaatttgc tttctctatg gattgttttg 60 acactcacgt tcctagttat gaaaaccatc ccaggagatc ctttcaatga cgaaggctgc 120 aatgttcttt ccgaagaggt cttacaaacc ctaaagtctc gatacggttt agataaacct 180 ctctatcaac aatacacaca atacctccac tccatcgcaa aactagattt tgggaactcg 240 ttagt-ttata aagatcgcaa agtaacgaac atcatttcga ctgcctttcc tatatcagca 300 atcctaggat tgcaaagtct ttttctctcc ataggagggg ggatcgctct cggcaccata 360 gcagcattaa aaaaaaagaa acaaagacgc tatattctag gcgcctctat actccaaatc 420 tcgattcctg cttttatatt cgcaacactc ttacaatatg tctttgctgt aaaaattcct 480 cttcttccta tcgcctgttg gggaagcttt. actcatacta tactcccgac tctcgcactt 540 gctgtaactc ccatggcctt catcatacag cttacctact cttcagtatc cgcagcatta 600 aacaaagact atgtcctact agcctatgca aaaggactct ccccacttaa agtcgttata 660 aaacatattt taccctacgc catattccca accatttctt attccgcatt cctaactact 720 acagtgatta caggaacctt tgctatcgaa aatatcttct gtattcctgg attaggtaaa 780 tggtttattt gtagtatcaa acaacgagac tacccagtag cccttggctt atccgtattt 840 tatggaacct tatttatgct ctcttcttta ctttctgacc tgattcaatc cattatagat 900 ccgcaaatcc gttatgcgca cggaaaggaa aaaaaaagaa aataa 945 <21O> 484 <211> 3723 • · • · λ 1
445 <212> DNA <213> Chlamydia pneumoniae <4 00> 484 ttgacctgga taccccttca ctgtcattct caatactctg ttcttgatgc aatgagctcc 60 atcaaagatt tcgttgcgaa aggtcaggaa tttggaattc ccgctctggc tctaacagac 120 catgggaatc tttatggagc tgttgatttc tataaagaat gcactcaaaa agggatccaa 180 cccatcattg gttgcgagtg ttatattgct ccaggatcac gtttcgataa gaaaaaagag 240 aagcgtagtc gtgcagcaca ccatctcatt ttattatgta aaaatgaaca agggtaccgc 300 aacctttgta ttttaacctc cctagcattt actgagggtt tctattactt tcctcggata 360 gacaaggatc ttttgagaca gtactctgaa ggcttaatct gtttatctgg ttgtttatct 420 agttctgttt cagatgctgc cttaaaatct ccggaagctc tgcttcttga attgcaatgg 480 tttcaagacc tattcaaaga tgattatttc acagaagtac aactacacaa gatgtccgaa 540 gagagcattg caggctttaa agaggaatgg ttaaagcaag aatattactc tctcattgaa 600 aaacagatca aagtcaatac tgcagtgtta gaagcaagta agcgcttagg cattcctact 660 gtagctacga atgacatcca ttacatcaat gcaaacgatt ggcaagctca tgaaatcctg 720 ttgaatgtcc aatctgggga gactgtgcgg attgcgaaac agaatactca tatccccaat 780 cctaaacgaa aggtctatcg cagtcgcgag tactatttta aatcccctgc gcaaatggca 840 gagttattta aagatattcc tgaggtcatt tccaacacat tagaagttgc caaacggtgt 900 gattttactt ttgatttttc caagaaacac taccctatct atgtccctga atctttaaaa 960 accttaaaca gctacacgga ggaagaccgt tatcaagctt ctgcagtctt cttaaaacag 1020 ctagctgaag aagctttgcc taagaaatac tcttctgaag ttcttgctca tattgctaag 1080 aaatttccac atcgggaccc tatcgatatt gtcaaagaaa ggatggacat ggagatggcc 1140 atcatcattc ctaaaggaat gtgtgactat cttttgattg tttgggacat tattcattgg 1200 gccaaagcaa atggcattcc tgtaggccct ggaagaggtt caggagctgg atccgtatta 1260 ctatttttgt tagggatcac agaaatcgag cccatacgat ttgatttatt ctttgagaga 1320 tttatcaatc ctgagcgttt gtcttaccca gatattgaca tcgatatttg catggcagga 1380 cgtgaacgtg tcattaatta tgcaattgag cgtcatggca aagataatgt agctcaaatc 1440 attacttttg gaactatgaa agccaaaatg gctgtcaaag atgtgggaag aactttagac 1500 atggccttat ctaaagtgaa ccacattgcg aaacatattc cagatttaaa tactacgttg 1560 tctaaagctt tagaaacaga tcctgaccta catcagctct atattaacga tgccgaatct 1620 gcacaagtga ttgatatggc gctttgctta gaaggctcca tacggaatac aggggttcat 1680 gctgctggtg tgattatctg tggagaccag ctgaccaatc acattccgat ttgtatttct 1740 aaagactcca caatgattac aacacaatac tctatgaaac ccgtggagag tgttggaatg 1800 cttaaagtcg acttattagg gctcaagact ttaaccagta tcaatattgc aatgťctgca 1860 attgaaaaga aaacaggáca atcgctagct atggcgacac tgcctttgga tgatgccacc 1920 acattttctc ttttacatca gggaaagact atggggatat ttcaaatgga atccaagggg 1980 atgcaagaat tagcaaaaaa cctacgccct gacctctttg aggaaatcat tgctatgggt 2040 gctttatacc gcccaggccc tatggatatg attccttctt ttattaaccg caagcatggc 2100 aaagaaatta tagaatacga ccatcccctt atggaatcca ttcttaagga aacctatgga 2160 attatggtct accaagagca agtcatgcag attgctggtg cattagctag ttattctctt 2220 ggagaaggtg atgtattacg acgtgccatg gggaagaaag acttccaaca gatggagcag 2280 gagcgcgaaa agttctgtaa acgcgcctgc aataacggca tagatcctga gttagcgact 2340 gtcatctttg ataagatgga aaaatttgct gcctacggct ttaacaaatc tcatgctgct 2400 gcctatggct tgattactta tacaacggcg tatctcaaag caaattatcc taaagagtgg 2460 cttgcggcct tacttacctg tgattctgac gatattgaga agataggaaa actgattcga 2520 gaagctcaga gtatgggcat tccgattctt cctcctcata tcaatgtctc tagcaatcac 2580 tttgtagcta ctgatgaagg catacgcttt gcgatgggag ctattaaagg gattgggcgt 2640 ggtttaattg agagcattgt agaagagaga gatcatcatg gtccttatga gagcatccgc 2700 gactttatcc agaggtctga tttaaaaaaa gtttcgaaaa aaagtataga aagtttaatc 2760 gatgcgggtt gttttgattg ctttgattct aaccgagatt tgctgttagc ctctgtagag 2820 cccctctatg aagctattgc caaagacaag aaagaggctg catctggtgt gatgacgttc 2880 tttactttag gagctatgga tcgaaaaaat gaagtcccca tttgtcttcc taaagacatt 2940 ccgactcgct ctaagaaaga acttttaaaa aaagaaaaag agctcttagg gatťtacctt 3000 acagagcacc ctatggatac cgtgcgagat catctttctc gtctttctgt agttcttgct 3060 ggagaatttg aaaatctccc gcatggttct gtagtccgca ccgtgtttat tattgataaa 3120 gtaacgacta aaatttcatc aaaagcgcaa aagaagtttg ctgtccttcg tgttagtgat 3180 ggcatcgatt cttatgaact gccgatctgg ccagatatgt atgaagaaca acaagaactt 3240 ctagaagaag atcgtcttat ctátgctatt cttgttttag ataagcgcag tgattctcta 3300 cgtatttctt gtcgctggat gaaagatctt tctattgtta atgaaaacat catttatgag 3360 tgtgatcaag cttttgatag aataaaaaat caggtgcaaa aaatgtcatt tacaatgtca 3420 • ·
446 acctctggca aagaaactaa agctaaaggg aataagccta atgagaatgg gcatacacaa 3480 gctttagctc ctgtgactct atctttagat ctcaatgaac tccgtcatag tcatctatgt 3540 atcttaaaga agattgtgca aaagcaccct ggctcacgga cattagtttt agtttttact 3600 caagataacg aaagagttgc ctcgatgtct cctgacgacg cgtatttcgt ttgtgaagat 3660 attgaagaac tccgtcaaga acttgtgact gcagaccttc ctgtgcgtgt aattactgtt 3720 tga 3723 <210> 485 <211> 1731 <212> DNA <213> Chlamydia pneumoniae <400> 485 atgacagatt ttcctactca cttcaaagga cccaaactta accccattaa agtaaatcca 60 aacttttttg agaggaatcc taaagtcgca agggtactgc aaattacagc cgtagtctta 120 ggaatcattg ccctcttatc cggtatagta ctcattatag gcacccctct cggagctcct 180 ataagtatga tcctcggcgg atgtctttta gcttctggag gcgccttatt tgttggtggt 240 acgattgcta cgatattgca agctagaaat agttataaga aggccgtgaa ccaaaagaaa 300 ctctcagagc ctttgatgga acgccccgaa ttgaaagcct tagaťtattc cctagatctg 360 aaagaggtat gggacctaca tcattctgtt gtcaaacatc ttaaaaaatt agacctgaat 420 ctttccaaaa cccaaaggga agttctaaat caaatcaaaa ttgatgatga gggaccctcc 480 ctaggggaat gcgccgctat gatttcagaa aactacgacg catgcttaaa gatgctcgcg 540 tatcgtgagg agctcctgaa agaacaaacc caataccaag agacacgatt caatcagaac 600 ctcactcata gaaataaagt tttgctctcc atcctctcaa ggatcacgga caatatttct 660 aaagcgggcg gggtcttttc tttgaaattt tccacgctaa gctcgcggat gtcacgaatt 720 cataccacca ccactgtgat tctggcttta agtgccgttg tttctgtcat ggtcgtagca 780 gctctaattc caggtggcat tttagcacta cctatacttt tggctgttgc tatttctgca 840 ggagtgattg tcaccggact ttcetatcta gttcgtcaga ttttaagtaa caccaagcgt 900 aatcgtcagg atttttataa agattttgta aaaaatgtag atatagagct tcttaaccaa 960 acggtaactt tacagcgatt cctctttgaa atgctcaaag gtgttctgaa agaagaagaa 1020 gaagtctcct tagaaggtca agattggtat acacaataca taaccaatgc acccatagaa 1080 aaaagattga tcgaagagat cagagttacc tacaaagaga tcgatgctca gaccaaaaaa 1140 atgaagacag acttggagtt cttagaaaat gaggtgcgtt ccgggagact gtctgtagcg 1200 tccccgtcgg aagatccaag tgaaactcct atttttactc aaggtaagga gtttgcaaag 1260 ttacgtcgcc aaacctctca gaatatatcc acgatttatg gtccggacaa tgaaaatatt 1320 gatcccgaat tttccttacc ctggatgcct aaaaaagaag aagaaataga ccatagctta 1380 gaacctgtta caaagttgga acccggttca agagaagagt tgttgttggt agagggggtc 1440 aacccaacct taagagaact caatatgaga attgcacttc tacaacaaca actatcaagt 1500 gtccgaaaat ggagacaccc tcgaggggaa cattacggga atgttatcta ttcagataca 1560 gaactcgatc gtattcagat gctagaaggc gcattttata atcacctcag ggaagctcaa 1620 gaggaaatca cccagtctct cggagacctt gttgacattc aaaaccgtat tttagggatc 1680 atagttgaag gggactcaga ttcaagaaca gaagaagagc ctcaggaata g 1731 <210> 486 <211> 4224 <212> DNA <213> Chlamydia pneumoniae <400> 486 atgaaatatt ctttaccttg gctacttacc tcttcggctt tagttttctc cctacatcca 60 ctaatggctg ctaacacgga tctctcatca tccgataact atgaaaatgg tagtagtggt 120 agcgcagcat tcactgccaa ggaaacttcg gatgcttcag gaactaccta cactctcact 180 agcgatgttt ctattacgaa tgtatctgca aťtactcctg cagataaaag čtgttttaca 240 aacacaggag gagcattgag ttttgttgga gctgatcact cattggttct gcaaaccata 300 gcgcttacgc atgatggtgc tgcaattaac aataccaaca cagctctttc tttctcagga 360 ttctcgtcac tcttaatcga ctcagctcca gcaacaggaa cttcgggcgg caagggtgct 420 atttgtgtga caaatacaga gggaggtact gcgactttta ctgacaatgc cagtgtcacc 480 ctccaaaaaa atacttcaga aaaagatgga gctgcagttt ctgcctacag catcgatctt 540 gctaagacta cgacagcagc tctcttagat caaaatacta gcacaaaaaa tggcggggcc 600 ctctgtagta cagcaaacac tacagtccaa ggaaactcag gaacggtgac cttctcctca 660 aatactgcta cagataaagg tggggggatc tactcaaaag aaaaggatag cacgctagat 720 • ·
447 gccaatacag tctgatgaca accggctcag cttgctacag actagtaata ggaaacacaa tatacagaaa aatacagcaa accaacctgc gagggttgcg ggactatcga ggtggtgcga ggcaatactg acaggaagta tattctaaag gctacgggcc tttcttgagt gtgagtctct gctctgcatg gcgatctata agcacaaata aaaaataagg gatcaagaag aaaagcttaa agtggtggtg gatggcaata gctaacggtc gccgatagcg cgagcgactg actaagcttg gctcctgcat gttcctcctc cctgcaaacc gcctcgattc aatgtcgttt tctacagtat ggcagcatcg ataacgattg cataacaatg ttcttagatc tctagcatgg ggagctggag ccagagcttc tctatacagc attggaggta ttgatttcca gctgttgcat tctcaagtct tcattacgtc gttctccatg aacaacacac tctcttcctg caagttgtga gacgctagcc gcaaagcccc caccctcact ttatcacgac gactgcttcg tgtggaactc gagtcgttac atcttgctct cagcacaggc caacagacaa caacaactgc ctcttacctt ctgaagattt agacaggcgg tcttttcagg gtggggcaat ttgcaaacaa tctatgctac ctggaacttc caggaaccgt gcaacaactc cgagtaattc cagcatctgt ctggtaatac gaaacacgac cagaaaccga cagcaaagac ctcttgtatt gttgtggtgg ctcttactga gtatttatgc ctgctgaaac ctgtctcctt gagaactttc agggaacttc cagcagctcc ctggaggaac cccaaccaaa caaacacggg ctgcaaatac taaaagaagg tcatggatgc atctaaagaa ccgtaaacag aaggaagttt tttcttctac ctgctccgga π <3a a. <3 <3 t <3 ac gtgcgacttt aggagatcgc ttggcaacgc gaggttatat tcagccaact atgcaggatc gccacgtcct gtcaagtttc aagggaaatc tagatctaaa gtgtaaatca atctggtcaa ccagtgcttt gcctgacctc aagctttctt cttctggaag gttattcttt cttcaaatct taccggcaac aaataacccg aactggatta gaatggtgga cgatcagaat ttctcttaag cgccttatat gaacaaagct cctagccttt ccaagaagtc caaatgtact aggaggggcg gaccttcagc tctgtctggt ttcagcaaataagtactaaa tgcaacagta tcttaccttt agattttact agcaggggct ttctggaaat agcgatcctc aaatgagagt tcctaagtgt ttcgggagga taccaataat cttagaggct aactcccaac tggtcatacg aatagaggag aaatggtcct aactatagta taccaccata agccacccta aggaacgacc tctctctgta cacaagtggg ctatgacaat ttcaggaact ttatgggtat tttggtcgcg agttcctaat cactgcgatg cttccatcaa tgttggtggc ctttggcaaa tctctgtgct ctctaaggtc ctatggaaga agactgggac ctacagatac aaaaggattc cgtgtctatc gcttcttact cttaacaaat tgctgaggct ttgtgaactg ctaa aatactgcaa actcaagtac gaaggttgtg gccatttctc gcgatctacg actgcgacag ggaagtacgg tctaaaggaa acgggcccga attgattcag agcctcacta ctaactggaa atctatacag acaaatacag aataccaacc caagagggtt aaaggactct agtggcggtg gatggcaata cttacgggaa ctacatacta tcagcaacag tgtaatatct ttaagtttca gtaatctcag gcgatttatt tctggaggca attgatgggg tcgatccatt atttattttt ttagtcatca atagcttcag ttttcttctg ctgaaccaga caagtatatt ttagagacca aatctggatg ggattaaaaa cctgggttga gtaaatttag caagggagtt gaatggcaag agcctttgga tcggacgctc gacaagcaaa agcatgacca tctaaggatt cagagctctt cttccagagc aaccaccata agccatagct cttaccagct caagaggttg cctatgggac ttaggttacg ggcacctcgt tctggacatc cgcagctcct agacgggggg tttttcagga gtggggcaat agaatcaaga ctactaaatg caggatgtgg gaaccgtgac acagctcgct gtaattcttc gatccgtaag gtaatgctgc acggctccct aaactgaaga caaagacagg tgctcttttc gcggtggggc ggattgaaga cgatctatgc ctgccgaaac gtacgggaac aaggaaatac caacagcaac cagagtctga ttaacaatac gcagtgaatc cgaaaaacct agggaggcgc atattacttt taggtgcagg atgatcctat atcctgttgt tgcctgtagt gaaaactccc agatcaactt ccttcacaca cgacaactaa ctttagatgg tctcagggga aagcaaactt acgacttcaa ggactctggt cgttaggata atgcttatgt cctcacatcc aggaaaatgc cccctcaaga acgtagtctc atgtcattcc tcccaggaga atatgacgac tcgctgttga actctcccta ct,gctgatcc tcaccttcaa ctgtagatgc ggtctacgtt tgaagttact caagaagcta tgcttggagc aaataaaaca ctgttgttat aatgagcttc tactctggat cggagctatc cttcagcaca gactggaaat agcaaatcaa cgataaaaca aacagtaagt gacctttgac ttttactctt cggcgcctta agggaacaaa aatcctatcg taacgaaaac gaccaagtgt tgcaggaqga cgtgaccttc ttcctttacc aacaactaca catagctaca ggcaaaaaga cataaacttt ttcgattaca catttatata ctcagggaac ggctaagatc tacgatggaa caaagctatt ccctgtagca cagtcaagat agcaggagga gcagcctgat caatacagat caagcgtatg tctgaaattc aaatcttcct tccgattcct tcctaaagta cactcctaaa aaacatccat agggatttgg aggattccgt atataccttt ggatattaaa cctgcatagc aactcccctt aaagcttgcg agtcggtggt tgtgaaactc acgtatcttt acacgaatca ttaccgggat tgctacaaac tcatggtctt taatgcaaac
780 840 900 960 1020 1080 1140 1200 1260 1320 1380 1440 1500 1560 1620 1680 1740 1800 1860 1920 1980 2040 2100 2160 2220 2280 2340 2400 2460 2520 2580 2640 2700 27 60 2820 2880 2940 3000 3060 3120 3180 3240 3300 3360 3420 3480 3540 3600 3660 3720 3780 3840 3900 3960 4020 4080 4140 4200 4224 <210> 487 ·· ·····< i · ♦ · · ’ * · · · · · · a
448 <211> 804 <212> DNA <213> Chlamydia pneumoniae <400> 487 atgggcaatt cgtcttggtc actccaacag ataacaccat gataaaatct caaagtctaa agagcattta gaaaatatag aatgctaata gtggccttgg tccgctggat ccagttaaat atgccaaatg gtaaaaccac caggtttcta aaatgaccac taacaaaatt ctagcactac taactcaaat tagaagaagt aagatgttaa ggaatttaga gtatgttctt cgttagttaa atccgaatat tctctttgag gagaaaaaat aaacaaatgg tttacaagat agttcttaaa tagtggcgat tttttctttg tgaagatgag aattaagaaa tataactaat cggaggaaca aatttgtgcg agaaggagat aatttcacta agcaggaggg tttaggagtt ttaa actcaaaaca aaagacgagg aagggaattg gatatggaag ttagtcaaag atacacattg aaaattcagt gaaatagctt gatattatag ttatctcctt agagcaaccg atggatagtg gacgcagttt ctattttcgc ttattatagg taattactac ctgtaatcaa acattataaa atccttcttt gcaatggtct cgtcttcagt ccacacgcat gctctattag tcggaaacaa gtgttgtgtg cgaagattac agataacatt cacagataca agactcaacc agaagtaaca aaacataact ctcatattct atttacaaaa aacacctgat ggaaggaaca ttatggatac aacaactgct ggtaaatgct tatettagaa
120
180
240
300
360
420
480
540
600
660
720
780
804 <210> 488 <211> 306 <212> DNA <213> Chlamydia pneumoniae <400> 488 atgaataaca tttccagaac ccaacagagc tcatctctag aagctcaaaa gaataa gacaaaacac tagatatcaa ttťatcacaa accttttccc aagctctgat taatgacttt agtaaaaata aagtatatct agactctcca catgctaatt atcagaattg tgaaggatgt gataaagaaa aagttacttt gtcatactca atttactaaa gtagttgaag aattagaaaa ctatcaagaa aagacatgtt tgaaaaggcg tttgacttct cagcattgaa aaataatctt ctcaaaaaca
120
180
240
300
306 <210> 489 <211> 806 <212> DNA <213> Chlamydia pneumoniae <400> 489 gtgaaaacaa aatgttggtt ccacaagcaa gacattttta ttacacatag gtactggata tgtattttag gatcatttga aaagagtttt tctttttggg tacgaaggga ttaaaagaaa cgtctaacaa ttgtgagtaa tagcattttg gtaatttagc acctiz. act ac gaagttcagg taccttctag caagtcattt acactccacc ttgtttgtct gttcagtgtt acggaaggaa aagtgttatc catccatagc aggagataga gttagtcaaa ctcatttaaa ccaatatagc aggtcttggt aaacgtaagg tattctcata gcgttcatct aagtctgggg tactcctgaa acctaaaaag ttcaacaaat tagtaaagta taacgcatac agataaacta gaagca ggagggactg aacaaaaagg gtacaatctt gatatcattc gaggagtttc ttacaactta acgctcaccg ccattttcca aaagacttat tcaacctact cgaagagaca cctaattcta ttcaataaag gtaaaactac cttgtctctc ttttgcttgt ggatttagat attatqaatc taatttaaac aagatacgaa gagaatttaa ttgaatccaa aagaagcctt tattaggatt cagtgttagg tgaacattat taacattaag gagcaagtca aaatgtctgc gatagaaaac tagaaatagt ttatgatctg tattgcatca acagaaaatc aatagttttt agaatctatc cagatctctt tgacatactg ccaggaagtg
120
180
240
300
360
420
480
540
600
660
720
780
806 <210> 490 <211> 293 <212> PRT <213> Chlamydia pneumoniae <400> 490
Met Ser Lys His Thr Ser Glu Ser Arg Ile Ala Gin Asp Met Leu Glu • ··· • ···
| - | 449 | ||||||||||||||
| 1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
| Arg | Tyr | Ser | Gly | Ser | Ser | Val | Lys | Gin | Phe | Cys | Pro | Tyr | Leu | Leu | Leu |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Thr | Asn | Phe | Ser | Tyr | Tyr | Ile | Gin | Thr | Phe | Ala | Lys | Leu | His | Gly | Val |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Pro | Val | Phe | Glu | Gly | Ser | Met | Phe | Ser | Ala | Ala | His | Ala | Pro | His | Leu |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Lys | Thr | Ser | Ile | Leu | Asp | Phe | Lys | Leu | Gly | Ser | Pro | Gly | Ala | Ala | Leu |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Thr | Ile | Asp | Leu | Cys | Ser | Phe | Leu | Pro | Asp | Leu | Lys | Ala | Ala | Leu | Met |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Leu | Gly | Met | Cys | Gly | Gly | Leu | Arg | Ser | His | Tyr | Gin | Val | Gly Asp | Tyr | |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Phe | Val | Pro | Val | Ala | Ser | Ile | Arg | Gly | Glu | Gly | Thr | Ser | Asp | Ala | Tyr |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Phe | Pro | Pro | Glu | Val | Pro | Ala | Leu | Ala | Asn | Phe | Val | Val | Gin | Lys | Ala |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Thr | Thr | Glu | Val | Leu | Glu | Asp | Lys | Lys | Ala | Asn | Tyr | His | Ile | Gly | Ile |
| 14 5 | 150 | • | 155 | 160 | |||||||||||
| Thr | His | Thr | Thr | Asn | Ile | Arg | Phe | Trp | Glu | Phe | Asn | Lys | Lys | Phe | Arg |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Lys | Lys | Leu | Tyr | Glu | Thr | Lys | Ala | Gin | Ser | Ala | Glu | Met | Glu | Cys | Ala |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Thr | Leu | Phe | Ala | Ala | Gly | Tyr | Arg | Arg | Asn | Leu | Pro | Ile | Gly | Ala | Leu |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Leu | Leu | Ile | Ser | Asp | Leu | Pro | Leu | Arg | Lys | Glu | Gly | Ile | Lys | Thr | Lys |
| .210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Ser | Ser | Gly | Asn | Phe | Ile | Phe | Asn | Thr | Tyr | Thr | Glu | Asp | His | Ile | Leu |
| 225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
| Thr | Gly | Gin | Glu | Val | Ile | Glu | Asn | Leu | Glu | Lys | Val | Met | Leu | Lys | Arg |
| 245 | 250 | 255 | |||||||||||||
| Ala | Ala | Ser | Asp | His | Lys | Lys | Asp | Gin | Gin | Tyr | Arg | Gly | Leu | Pro | His |
| 260 | 265 | 270 | |||||||||||||
| Met | Glu | Val | Gly | Glu | Ala | Asp | Asp | Thr | Met | Ala | Ser | Gly | Ser | Glu | Thr |
| 275 | 280 | 285 | |||||||||||||
| Ser | Asp | Ser | Asp | Tyr |
290 <210> 491 <211> 394 <212> PRT
| <213> Chlamydia | pneumoniae | ||||||||||||||
| <400> 491 | |||||||||||||||
| Met | Ser | Lys | Glu | Thr | Phe | Gin | Arg | Asn | Lys | Pro | His | Ile | Asn | Ile | Gly |
| 1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
| Thr | Ile | Gly | His | Val | Asp | His | Gly | Lys | Thr | Thr | Leu | Thr | Ala | Ala | Ile |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Thr | Arg | Ala | Leu | Ser | Gly | Asp | Gly | Leu | Ala | Ser1 | Phe | Arg | Asp | Tyr | Ser |
| 35 | 40 | 4 5 | |||||||||||||
| Ser | Ile | Asp | Asn | Thr | Pro | Glu | Glu | Lys | Ala | Arg | Gly | Ile | Thr | Ile | Asn |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Ala | Ser | His | Val | Glu | Tyr | Glu | Thr | Pro | Asn | Arg | His | Tyr | Ala | His | Val |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Asp | Cys | Pro | Gly | His | Ala | Asp | Tyr | Val | Lys | Asn | Met | Ile | Thr | Gly | Ala |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Ala | Gin | Met | Asp | Gly | Ala | Ile | Leu | Val | Val | Ser | Ala | Thr | Asp | Gly | Ala |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Met | Pro | Gin | Thr | Lys | Glu | His | Ile | Leu | Leu | Ala | Arg | Gin | Val | Gly | Val |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Pro | Tyr | Ile | Val | Val | Phe | Leu | Asn | Lys | Val | Asp | Met | Ile | Ser | Gin | Glu |
» ··♦· • · • ··· • ···
450
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Asp | Ala | Glu | Leu | Ile | Asp | Leu | Val | Glu | Met | Glu | Leu | Ser | Glu | Leu | Leu |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Glu | Glu | Lys | Gly | Tyr | Lys | Gly | Cys | Pro | Ile | Ile | Arg | Gly | Ser | Ala | Leu |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Lys | Ala | Leu | Glu | Gly | Asp | Ala | Asn | Tyr | Ile | Glu | Lys | Val | Arg | Glu | Leu |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Met | Gin | Ala | Val | Asp Asp | Asn | Ile | Pro | Thr | Pro | Glu | Arg | Glu | Ile | Asp | |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Lys | Pro | Phe | Leu | Met | Pro | Ile | Glu | Asp | Val | Phe | Ser | Ile | Ser | Gly | Arg |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Gly | Thr | Val | Val | Thr | Gly | Arg | Ile | Glu | Arg | Gly | Ile | Val | Lys | Val | Ser |
| 225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
| Asp | Lys | Val | Gin | Leu | Val | Gly | Leu | Gly | Glu | Thr | Lys | Glu | Thr | Ile | Val |
| 245 | 250 | 255 | |||||||||||||
| Thr | Gly | Val | Glu | Met | Phe | Arg | Lys | Glu | Leu | Pro | Glu | Gly | Arg | Ala | Gly |
| 260 | 265 | 270 | |||||||||||||
| Glu | Asn | Val | Gly | Leu | Leu | Leu | Arg | Gly | Ile | Gly | Lys | Asn | Asp | Val | Glu |
| 275 | 280 | 285 | |||||||||||||
| Arg | Gly | Met | Val | Val | Cys | Gin | Pro | Asn | Ser | Val | Lys | Pro | His | Thr | Lys |
| 290 | 295 | 300 | |||||||||||||
| Phe | Lys | Ser | Ala | Val | Tyr | Val | Leu | Gin | Lys | Glu | Glu | Gly | Gly | Arg | His |
| 305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
| Lys | Pro | Phe | Phe | Ser | Gly | Tyr | Arg | Pro | Gin | Phe | Phe | Phe | Arq | Thr | Thr |
| 325 | 330 | 335 | |||||||||||||
| Asp | Val | Thr | Gly | Val | Val | Thr | Leu | Pro | Glu | Gly | Thr | Glu | Met | Val | Met |
| 340 | 345 | 350 | |||||||||||||
| Pro | Gly | Asp | Asn | Val | Glu | Leu | Asp | Val | Glu | Leu | Ile | Gly | Thr | Val | Ala |
| - | 355 | 360 | 365 | ||||||||||||
| Leu | Glu | Glu | Gly | Met | Arg | Phe | Ala | Ilě | Arg | Glu | Gly | Gly | Arg | Thr | Ile |
| 370 | 375 | 380 | |||||||||||||
| Gly | Ala | Gly | Thr | Ile | Ser | Lys | Ile | Asn | Ala |
385 390 <210> 492 <211> 560 <212> PRT
| <213> | Chlamydia | pneumoniae |
| <220> | ||
| <221> | VARIANT | |
| '•záó/ | 553,554,555,556,558,559,560 | |
| <223> | : Xaa = jakáko liv aminokyselina | |
| <400> | 492 | |
| Met Pro Gin Lys | Val Leu Ile Thr Ser Ala Leu Pro Tyr Ala Asn Gly | |
| 1 | 5 10 15 | |
| Pro Leu His Phe | Gly His Ile Ala Gly Val Tyr Leu Pro Ala Asp Val | |
| 20 | 25 30 | |
| Tyr Ala Arg Phe | Arg Arg Leu Leu Gly Asp Asp Val Leu Tyr Ile Cys | |
| 35 | 40 . 45 | |
| Gly Ser Asp Glu | Phe Gly Ile Ala Ile Thr Leu Asn Ala Asp Arg Glu | |
| 50 | 55 60 | |
| Gly Leu Gly Tyr | Gin Glu Tyr Val Asp Met Tyr His Lys Leu His Lys | |
| 65 | 70 75 80 | |
| Asp Thr Phe Glu | Lys Leu Gly Phe Ala Leu Asp Phe Phe Ser Arg Thr | |
| 85 90 95 | ||
| Thr Asn Pro Phe | His Ala Glu Leu Val Gin Asp Phe Tyr Ser Gin Leu | |
| 100 | 105 110 | |
| Lys Ala Ser Gly | Leu Ile Glu Asn Arg Ile Ser Glu'Gin Leu Tyr Ser |
115 120 125 • · . ·· · ·· · ·
....... ·..··..· • 4» ·«*· • · • ··* «· «···
451
| Glu Gin Glu 130 | Gin Arg | Phe | Leu Ala Asp Arg Tyr Val Glu Gly Thr Cys | ||||||||||||
| 135 | 140 | ||||||||||||||
| Pro | Arg | Cys | Gly | Phe | Asp | His | Ala | Arg | Gly | Asp | Glu | Cys ' | Gin | Ser | Cys |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Gly | Ala | Asp | Tyr . | Glu | Ala | Ile | Asp | Leu | Ile | Gly | Pro | Lys | Ser | Lys | Ile |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Ser | Gly | Val | Glu | Leu | Val | Lys | Lys | Glu | Thr | Glu | His | Ser | Tyr | Phe | Leu |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Leu | Asp | Arg | Met | Lys | Asp | Ala | Leu | Leu | Ser | Phe | Ile | Gin | Gly | Cys | Tyr |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| .Leu | Pro | Asp | His | V.al | Arg | Lys | Phe | Val | Val | Asp | Tyr | Ile | Glu | His | Val |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Arg | Ser | Arg | Ala | Ile | Thr | Arg | Asp | Leu | Ser | Trp | Gly | Ile | Pro | Val | Pro |
| 225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
| Asp | Phe | Pro | Gly | Lys | Val | Phe | Tyr | Val | Trp | Phe | Asp | Ala | Pro | Ile | Gly |
| 24 5 | 250 | 255 | |||||||||||||
| Tyr | Ile | Ser | Gly | Thr | Met | Glu | Trp | Ala | Ala | Ser | Gin | Gly | Asn | Pro | Asp |
| 260 | 265 | 270 | |||||||||||||
| Glu | Trp | Lys | Arg | Phe | Trp | Leu | Glu | Asp | Gly | Val | Glu | Tyr | Val | Gin | Phe |
| 275 | 280 | 285 | |||||||||||||
| Ile | Gly | Lys | Asp | Asn | Leu | Pro | Phe | His | Ser | Val | Val | Phe | Pro | Ala | Met |
| 290 | 295 | 300 | |||||||||||||
| Glu | Leu | Gly | Gin | Lys | Leu | Asp | Tyr | Lys | Lys | Val | Asp | Ala | Leu | Val | Val |
| 305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
| Ser | Glu | Phe | Tyr | Leu | Leu | Glu | Gly | Arg | Gin | Phe | Ser | Lys | Ser | Glu | Gly |
| 325 | 330 | 335 | |||||||||||||
| Asn | Tyr | Val | Asp | Met | Asp | Lys | Phe | Leu | Ser | Ser | Tyr | Ser | Leu | Asp | Lys |
| 340 | 345 | 350 | |||||||||||||
| Léu | Arg | Tyr | Val | Leu | Ala | Tkla | Thr | Ala | Pro | Glu | Thr | Ser | Asp | Ser | Glu |
| 355 | 360 | 365 | |||||||||||||
| Phe | Thr | Phe | Leu | Asp | Phe | Lys | Thr | Arg | Cys | Asn | Ser | Glu | Leu | Val | Gly |
| 370 | 375 | 380 | |||||||||||||
| Lys | Phe | Gly | Asn | Phe | Ile | Asn | Arg | Val | Leu | Ala | Phe | Ala | Glu | Lys | Asn |
| 385 | 390 | 395 | 400 | ||||||||||||
| His | Tyr | Asp | Lys | Leu | Ser | Tyr | His | Ser | Val | Val | Leu | Glu | Asp | Ser | Asp |
| 405 | 410 | 415 | |||||||||||||
| Arg | Ala | Phe | Leu | Glu | Glu | Ala | Arg | Gin | Leu | Val | Arg | Asp | Ala | Glu | Lys |
| 420 | 425 | 430 | |||||||||||||
| Cys | Tyr | Arg | Glu | Tyr | Ser. | Leu | Arg | Lys | Ala | Thr | Ser | Val | Ile | Met | Ser |
| 435 | 440 | 445 | |||||||||||||
| Leu | Ala | Ala | Leu | Gly | Asn | Val | Tyr | Phe | Asn | Gin | Gin | Ala | Pro | Trp | Lys |
| 450 | 455 | 460 | |||||||||||||
| Leu | Leu | Lys | Glu | Gly Thr | Arg | Glu | Arg | Val | Glu | Ala | Ile | Leu | Phe | Cys | |
| 4 65 | 470 | 475 | 480 | ||||||||||||
| Ala | Cys | Tyr | Cys | Gin | Lys | Leu | Leu | Ala | Leu | Ile | Ser | Tyr | Pro | Ile | Ile |
| 4 85 | 4 90 | 495 | |||||||||||||
| Pro | Glu | Ser | Ala | Val | Ala | Ile | Trp | Glu | Met | Ile | Ser | Pro | Lys | Ser | Leu |
| 500 | 505 | 510 | |||||||||||||
| Glu | Asn | Cys | Asn | Leu | Asp | Thr | Met | Tyr | Ala | Arg | Asp | Leu | Trp | Lys | Glu |
| 515 | 520 | 525 | |||||||||||||
| Glu | Ile | Leu | Asp | Val | Ile | Asn | Glu | Glu | Phe | His | Leu | Lys | Ser | Pro | Arg |
| 530 | 535 | 540 | |||||||||||||
| Leu | Leu | Phe | Thr | Thr | Val | Glu | Thr | Xaa | Xaa | Xaa | Xaa | Phe | Xaa | Xaa | Xaa |
| 545 | 550 | 555 | 560 |
<210> 493 <211> 97 <212> PRT <213> Chlamydia pneumoniae <400> 493
-sři
WO 02/08267 • ··· • · • · ···· ·«· • · · • · ··· • · · • · · · ·· ··
PCT/US01/23121
452
| Met | Ile | Lys | Lys | Asp | Arg | Phe | Thr | Asn | Glu | Lys | Leu | Asn | Lys | Leu | Phe |
| 1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
| Asp | Ser | Pro | Phe | Ser | Leu | Val | Asn | Tyr | Ala | Ile | Lys | Gin | Ala | Lys | Ile |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Lys | Ile | Ala | Lys | Gly | Asp | Val | Arg | Ser | Ser | Asn | Val | Ala | Ile | Glu | Thr |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Leu | Val | Leu | Leu | Asp | Arg | Glu | Gly | Ile | Gin | Pro | Glu | Phe | Thr | Glu | Glu |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Ile | Val | Val | Thr | Ala | Ser | Pro | Thr | Val | Glu | Arg | Lys | Arg | Ser | Glu | His |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Thr | Asn | Ser | Arg | Lys | Lys | Asp | Pro | Ser | Ala | Tyr | Thr | Trp | Ser | Asp | Val |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Lys |
<210> 494 <211> 205 <212> PRT <213> Chlamydia pneumoniae <400> 494
| Met | Asn | Lys | Ile | Leu | Val | Asp | Ser | Pro | Phe | Ser | Pro . | Asp | His | Gin | Lys |
| 1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
| Cys | Cys | Pro | Lys | Leu | Phe | Thr | Ile | Ser | Ala | Pro | Ala | Gly | Val | Gly | Lys |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Thr | Thr | Leu | Val | Arg | Met | Leu | Glu | Gin | Glu | Phe | Ser | Ser | Ala | Phe | Ala |
| 35 | 40 | 4 5 | |||||||||||||
| Glu | Thr | Ile | Ser | Val | Thr | Thr | Arg | Lys | Pro | Arg | Glu | Gly | Glu | Val | Pro |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Gly | Lys | Asp | Tyr | His | Phe | Val | Ser | His | Glu | Glu | Phe | Gin | Arg | Leu | Leu |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Asp | Arg | Gin | Ala | Leu | Leu | Glu | Trp | Val | Phe | Leu | Phe | Gly | Glu | Cys | Tyr |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Gly | Thr | Ser | Met | Leu | Glu | Ile | Glu | Arg | Ile | Trp | Ser | Leu | Gly | Lys | His |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Ala | Val | Ala | Val | Ile | Asp | Ile | Gin | Gly | Ala | Leu | Phe | Ile | Arg | Ser | Arg |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Mét | Pro | Ser | Val | Ser | Ile | Phe | Ile | Ala | Pro | Pro | Ser | Gin | Glu | Glu | Leu |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Glu | Arg | Arg | Leu | Ala | Ser | Arg | Gly | Ser | Glu | Glu | Gly | Ser | Gin | Arg | Lys |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Glu | Arg | Leu | Glu | His | Ser | Leu | Ile | Glu | Leu | Ala | Ala | •Λ Ί _ hLLd | Asn | Gin | Phe |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Asp | Tyr | Val | Ile | Ile | Asn | Asp | Asp | Leu | Asn | Gin | Ala | Tyr | Arg | Val | Leu |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Lys | Ser | Ile | Phe | Ile | Ala | Glu | Glu | His | Arg | Asn | Ile | Leu | |||
| 195 | 200 | 205 |
<210> 495 <211> 602 <212> PRT <213> Chlamydia pneumoniae <400> 495
| Met | Lys | Glu | Tyr | Lys | Ile | Glu Asn Ile Arg | Asn | Phe | Ser | Ile | Ile | Ala |
| 1 | 5 | 10 | 15 | |||||||||
| His | Ile | Asp | His | Gly | Lys | Ser Thr Ile Ala | Asp | Arg | Leu | Leu | Glu | Ser |
| 20 | 25 | 30 | ||||||||||
| Thr | Ser | Thr | Val | Glu | Glu | Arg Glu Met Arg | Glu | Gin | Leu | Leu | Asp | Ser |
| 35 | 40 | 45 | ||||||||||
| Met | Asp | Leu | Glu | Arg | Glu | Arg Gly Ile Thr | Ile | Lys | Ala | His | Pro | Val |
·· ····
453
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Thr | Met | Thr | Tyr | Leu | Tyr | Glu | Gly | Glu | Val | Tyr | Gin | Leu | Asn | Leu | Ile- |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Asp | Thr | Pro | Gly | His | Val | Asp | Phe | Ser | Tyr | Glu | Val | Ser | Arg | Ser | Leu |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Ser | Ala | Cys | Glu | Gly | Ala | Leu | Leu | Ile | Val | Asp | Ala | Ala | Gin | Gly | Val |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Gin | Ala | Gin | Ser | Leu | Ala | Asn | Val | Tyr | Leu | Ala | Leu | Glu | Arg | Asp | Leu |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Glu | Ile | Ile | Pro | Val | Leu | Asn | Lys | Ile | Asp | Leu | Pro | Ala | Ala | Asp | Pro |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Val | Arg | Ile | Ala | Gin | Gin | Ile | Glu | Asp | Tyr | Ile | Gly | Leu | Asp | Thr | Thr |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Asn | Ile | Ile | Ala | Cys | Ser | Ala | Lys | Thr | Gly | Gin | Gly | Ile | Pro | Ala | Ile |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Leu | Lys | Ala | Ile | Ile | Asp | Leu | Val | Pro | Pro | Pro | Lys | Ala | Pro | Ala | Glu |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Thr | Glu | Leu | Lys | Ala | Leu | Val | Phe | Asp | Ser | His | Tyr | Asp | Pro | Tyr | Val |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Gly | Ile | Met | Val | Tyr | Val | Arg | Ile | Ile | Ser | Gly | Glu | Leu | Lys | Lys | Gly |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Asp | Arg | Ile | Thr | Phe | Met | Ala | Ala | Lys | Gly | Ser | Ser | Phe | Glu | Val | Leu |
| 225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
| Gly | Ile | Gly | Ala | Phe | Leu | Pro | Lys | Ala | Thr | Phe | Ile | Glu | Gly | Ser | Leu |
| 245 | 250 | 255 | |||||||||||||
| Arg | Pro | Gly | Gin | Val | Gly | Phe | Phe | Ile | Ala | Asn | Leu | Lys | Lys | Val | Lys |
| 260 | 265 | 270 | |||||||||||||
| Asp | Val | Lys | Ile | Gly | Asp | Thr | Val | Thr | Lys | Thr | Lys | His | Pro | Ala | Lys |
| 275 | 280 | 285 | |||||||||||||
| Thr | Pro | Leu | Glu | Gly | Phe | Lys | Glu | Ile | Asn | Pro | Val | Val | Phe | Ala | Gly |
| 290 | 295 | 300 | |||||||||||||
| Ile | Tyr | Pro | Ile | Asp | Ser | Ser | Asp | Phe | Asp | Thr | Leu | Lys | Asp | Ala | Leu |
| 305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
| Gly | Arg | Leu | Gin | Leu | Asn | Asp | Ser | Ala | Leu | Thr | Ile | Glu | Gin | Glu | Ser |
| 325 | 330 | 335 | |||||||||||||
| Ser | His | Ser | Leu | Gly | Phe | Gly | Phe | Arg | Cys | Gly | Phe | Leu | Gly | Leu | Leu |
| 340 | 345 | 350 | |||||||||||||
| His | Leu | Glu | Ile | Ile | Phe | Glu | Arg | Ile | Tle | Arg | Glu | Phe | Asp | Leu | Asp |
| 355 | 360 | 365 | |||||||||||||
| Ile | Ile | Ala | Thr | Ala | Pro | Ser | Val | Ile | Tyr | Lys | Val | Val | Leu | Lys | Asn |
| 370 | 375 | 380 | |||||||||||||
| Gly | Lys | Val | Leu | Asp | Ile | Asp | Asn | Pro | Ser | Gly | Tyr | Pro | Asp | Pro | Ala |
| 385 | 390 | 395 | 400 | ||||||||||||
| Ile | Ile | Glu | His | Val | Glu | Glu | Pro | Trp | Val | His | Val | Asn | Ile | Ile | Thr |
| 405 | 410 | 415 | |||||||||||||
| Pro | Gin | Glu | Tyr | Leu | Ser | Asn | Ile | Met | Asn | Leu | Cys | Leu | Asp | Lys | Arg |
| 420 | 425 | 4 30 | |||||||||||||
| Gly | Ile | Cys | Val | Lys | Thr | Glu | Met | Leu | Asp | Gin | His | Arg | Leu | Val | Leu |
| 435 | 440 | 445 | |||||||||||||
| Ala | Tyr | Glu | Leu | Pro | Leu | Asn | Glu | Ile | Val | Ser | Asp | Phe | Asn | Asp | Lys |
| 450 | 455 | 4 60 | |||||||||||||
| Leu | Lys | Ser | Val | Thr | Lys | Gly | Tyr | Gly | Ser | Phe | Asp | Tyr | Arg | Leu | Gly |
| 465 | 470 | 475 | 480 | ||||||||||||
| Asp | Tyr | Arg | Lys | Gly | Ser | Ile | Ile | Lys | Leu | Glu | Val | Leu | Ile | Asn | Glu |
| 485 | 490 | 495 | |||||||||||||
| Glu | Pro | Ile | Asp | Ala | Phe | Ser | Cys | Leu | Val | His | Arg | Asp | Lys | Ala | Glu |
| 500 | 505 | 510 | |||||||||||||
| Ser | Arg | Gly | Arg | Ser | Ile | Cys | Glu | Lys | Leu | Val | Asp | Val | Ile | Pro | Gin |
| 515 | 520 | 525 | |||||||||||||
| Gin | Leu | Phe | Lys | Ile | Pro | Ile | Gin | Ala | Ala | Ile | Asn | Lys | Lys | Val | Ile |
| 530 | 535 | 540 |
* · • · · ·
454
| Ala | Arg | Glu | Thr | Ile | Arg | Ala | Leu | Ser | Lys | Asn | Val | Thr | Ala | Lys | Cys |
| 545 | 550 | 555 | 560 | ||||||||||||
| Tyr | Gly | Gly | Asp | Ile | Thr | Arg | Lys | Arg | Lys | Leu | Trp | Glu | Lys | Gin | Lys |
| 565 | 570 | 57 5 | |||||||||||||
| Lýs | Gly | Lys | Lys | Arg | Met | Lys | Glu | Phe | Gly | Lys | Val | Ser | Ile | Pro | Asn |
| 580 | 585 | 590 | |||||||||||||
| Thr | Ala | Phe | Ile | Glu | Val | Leu | Lys | Leu | Asp | ||||||
| 595 | 600 |
<210> 496 <211> 324 <212> PRT <213> Chlamydia pneumoniae <400> 496
| Met 1 | Glu | Leu Leu | Pro His 5 | Glu Lys | Gin Val Val Glu Tyr Glu Lys Ala | ||||||||||
| 10 | 15 | ||||||||||||||
| Ile | Ala | Glu | Phe | Lys | Glu | Lys | Asn | Lys | Lys | Asn | Ser | Leu | Leu | Ser | Ser |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Ser | Glu | Ile | Gin | Lys | Leu | Glu | Lys | Arg | Leu | Asp | Lys | Leu | Lys | Glu | Lys |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| .Ile | Tyr | Ser | Asp | Leu | Thr | Pro | Trp | Glu | Arg | Val | Gin | Ile | Cys | Arg | His |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Pro | Ser | Arg | Pro | Arg | Thr | Val | Asn | Tyr | Ile | Glu | Gly | Met | Cys | Glu | Glu |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Phe | Val | Glu | Leu | Cys | Gly | Asp | Arg | Thr | Phe | Arg | Asp | Asp | Pro | Ala | Val |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Val | Gly | Gly | Phe | Val | Lys | Ile | Gin | Gly | Gin | Arg | Phe | Val | Leu | Ile | Gly |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Gin | Glu | Lys | Gly | Cys | Asp | Thr | Ala | Ser | Arg | Leu | His | Arg | Asn | Phe | Gly |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Met | Leu | Cys | Pro | Glu | Gly | Phe | Arg | Lys | Ala | Leu | Arg | Leu | Gly | Lys | Leu |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Ala | Glu | Lys | Phe | Gly | Leu | Pro | Val | Val | Phe | Leu | Val | Asp | Thr | Pro | Gly |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Ala | Tyr | Pro | Gly | Leu | Thr | Ala | Glu | Glu | Arg | Gly | Gin | Gly | Trp | Ala | Ile |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Ala | Lys | Asn | Leu | Phe | Glu | Leu | Ser | Arg | Leu | Ala | Thr | Pro | Val | Ile | Ile |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Val | Val | Ile | Gly | Glu | Gly | Cys | Ser | Gly | Gly | Ala | Leu | Gly | Met | Ala | Val |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Gly | Asp | Ser | Val | Ala | Met | Leu | Glu | His | Sex1 | Tyr | Tyr | Ser | Val | Ile | Ser |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Pro | Glu | Gly | Cys | Ala | Ser | Ile | Leu | Trp | Lys | Asp | Pro | Lys | Lys | Asn | Ser |
| 225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
| Glu | Ala | Ala | Ser | Met | Leu | Lys | Met | His | Gly | Glu | Asn | Leu | Lys | Gin | Phe |
| 245 | 250 | 255 | |||||||||||||
| Gly | Ilě | Ile | Asp | Thr | Val | Ile | Lys | Glu | Pro | Ile | Gly | Gly | Ala | His | His |
| 260 | 265 | 270 | |||||||||||||
| Asp | Pro | Ala | Leu | Val | Tyr | Ser | Asn | Val | Arg | Glu | Phe | Ile | Ile | Gin | Glu |
| 275 | 280 | 285 | |||||||||||||
| Trp | Leu | Arg | Leu | Lys | Asp | Leu | Ala | Ile | Glu | Glu | Leu | Leu | Glu | Lys | Arg |
| 290 | 295 | 300 | |||||||||||||
| Tyr | Glu | Lys | Phe | Arg | Ser | Ile | Gly | Leu | Tyr | Glu | Thr | Thr | Ser | Glu | Ser |
| 305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
| Gly | Pro | Glu | Ala |
<210> 497 <211> 659 <212> PRT • · • · · · • · · · · · * ··· · · ··· • ······ • · · · · · ······· ·· ··
455 <213> Chlamydia pneumoniae <400> 497
| Met | Lys | Leu | Leu | Leu | Lys | Ala | Val | Leu | Arg | His | Lys | Asn | His | Leu | Val |
| 1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
| Ile | Leu | Gly | Cys | Ser | Leu | Leu | Ala | Ile | Leu | Gly | Leu | Thr | Phe | Ser | Ser |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Gin | Met | Glu | Ile | Phe | Ser | Leu | Gly | Met | Ile | Ala | Lys | Thr | Gly | Pro | Asp |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Ala | Phe | Leu | Leu | Phe | Gly | Arg | Lys | Glu | Ser | Gly | Lys | Leu | Val | Lys | Val |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Ser | Glu | Leu | Ser | Gin | Lys | Asp | Ile | Leu | Glu | Asn | Trp | Gin | Ala | Ile | Ser |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Lys | Asp | Ser | Glu | Thr | Leu | Thr | Val | Ser | Asp | Ala | Thr | Thr | Tyr | Ile | Ala |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Glu | His | Gly | Lys | Ser | Thr | Ala | Ser | Leu | Thr | Ser | Lys | Leu | Ser | Lys | Phe |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Val | Arg | Asn | Tyr | Ile | Asp | Val | Ser | Arg | Phe | Arg | Gly | Leu | Ala | Ile | Phe |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Leu | Ile | Cys | Val | Ala | Ile | Phe | Lys | Ala | Val | Thr | Leu | Phe | Phe | Gin | Arg |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Phe | Leu | Gly | Gin | Val | Val | Ala | Ile | Arg | Val | Ser | Arg | Asp | Leu | Arg | Gin |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Asp | Tyr | Phe | Lys | Ala | Leu | Gin | Gin | Leu | Pro | Met | Thr | Phe | Phe | His | Asp |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| His | Asp | Ile | Gly | Asn | Leu | Ser | Asn | Arg | Val | Met | Thr | Asp | Ser | Ala | Ser |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Ile | Ala | Leu | Ala | Val | Asn | Ser | Leu | Met | Ile | Asn | Tyr | Ile | Gin | Ala | Pro |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Ile | Thr | Phe | Ile | Leu | Thr | Leu | Gly | Val | Cys | Leu | Ser | Ile | Ser | Trp | Lys |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Phe | Ser | Ile | Leu | Ile | Cys | Val | Ala | Phe | Pro | Ile | Phe | Ile | Leu | Pro | Ile |
| 225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
| Val | Val | He | Ala | Arg | Lys | Ile | Lys | Asn | Leu | Ala | Lys | Arg | Ile | Gin | Lys |
| 245 | 250 | 255 | |||||||||||||
| Ser | Gin | Asp | Ser | Phe | Ser | Ser | Val | Leu | Tyr | Asp | Phe | Leu | Ala | Gly | Val |
| 260 | 265 | 270 | |||||||||||||
| Met | Thr | Val | Lys | Val | Phe | Arg | Thr | Glu | Lys | Phe | Ala | Phe | Thr | Lys | Tyr |
| 275 | 280 | 285 | |||||||||||||
| Cys | Glu | His | Asn | Asn | Lys | Ile | Ser | Ala | Leu | Glu | Glu | Lys | Ser | Ala | Ala |
| 290 | 295 | 300 | |||||||||||||
| Tyr | Gly | Leu | Leu | Pro | Arg | Pro | Leu | Leu | His | Thr | Ile | Tkla | Ser | Leu | Phe |
| 305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
| Phe | Ala | Phe | Val | Val | Val | Ile | Gly | Ile | Tyr | Lys | Phe | Ala | Ile | Pro | Pro |
| 325 | 330 | 335 | |||||||||||||
| Glu | Glu | Leu | Ile | Val | Phe | Cys | Gly | Leu | Leu | Tyr | Leu | Ile | Tyr | Asp | Pro |
| 340 | 345 | 350 | |||||||||||||
| Ile | Lys | Lys | Phe | Gly | Asp | Glu | Asn | Thr | Ser | Ile | Met | Arg | Gly | Cys | Ala |
| 355 | 360 | 365 | |||||||||||||
| Ala | Ala | Glu | Arg | Phe | Tyr | Glu | Val | Leu | Asn | His | Pro | Asp | Leu | His | Ser |
| 370 | 375 | 380 | |||||||||||||
| Gin | Lys | Glu | Arg | Glu | Ile | Glu | Phe | Leu | Gly | Leu | Ser | Asn | Thr | Ile | Thr |
| 385 | 390 | 395 | 400 | ||||||||||||
| Phe | Glu | Asn | Val | Ser | Phe | dy | Tyr | Gin | Glu | Asp | Lys | His | Ile | Leu | Lys |
| 405 | 410 | 415 | |||||||||||||
| Asn | Leu | Ser | Phe | Thr | Leu | His | Lys | Gly | Glu | Ala | Leu | Gly | Ile | Val | Gly |
| 420 | 425 | 430 | |||||||||||||
| Pro | Thr | Gly | Ser | Gly | Lys | Thr | Thr | Leu | Val | Lys | Leu | Leu | Pro | Arg | Leu |
| 435 | 440 | 445 | |||||||||||||
| Tyr | Glu | Val | Ser | Gin | Gly | Lys | Ile | Leu | He | Asp | Ser | Leu | Pro | Ile | Thr |
| 450 | 455 | 460 |
• · · · • · · · · « ► · I l ’· ·
456
| Glu | Tyr | Asn | Lys | Gly | Ser | Leu | Arg | Asn | His | Ue | Ala | Cys | Val | Leu | Gin |
| 4 65 | 470 | 475 | 480 | ||||||||||||
| Asn | Pro | Phe | Leu | Phe | Tyr | Asp | Thr | Val | Trp | Asn | Asn | Leu | Thr | Cys | Gly |
| 485 | 4 90 | 4 95 | |||||||||||||
| Lys | Asp | Met | Glu | Glu | Glu | Ala | Val | Leu | Glu | Ala | Leu | Lys | Arg | Ala | Tyr |
| 500 | 505 | 510 | |||||||||||||
| Ala | Asp | Glu | Phe | Ue | Leu | Lys | Leu | Pro | Lys | Gly | Val | His | Ser | Val | Leu |
| 515 | 520 | 525 | |||||||||||||
| Glu | Glu | Ser | Gly | Lys | Asn | Leu | Ser | Gly | Gly | Gin | Gin | Gin | Arg | Leu | Ala |
| 530 | 535 | 540 | |||||||||||||
| Ile | Ala | Arg | Ala | Leu | Leu | Lys | Asn | Ala | Ser | Ue | Leu | Ue | Leu | Asp | Glu |
| 545 | 550 | 555 | 560 | ||||||||||||
| Ala | Thr | Ser | Ala | Leu | Asp | Ala | Ue | Ser | Glu | Asn | Tyr | Ue | Lys | Asn | Ile |
| 565 | 570 | 575 | |||||||||||||
| Ue | Gly | Glu | Leu | Lys | Gly | Gin | Cys | Thr | Gin | Ue | Ue | Ue | Ala | His | Lys |
| 580 | 585 | 590 | |||||||||||||
| Leu | Thr | Thr | Leu | Glu | His | Val | Asp | Arg | Val | Leu | Tyr | Ue | Glu | Asn | Gly |
| 595 | 600 | 605 | |||||||||||||
| Gin | Lys | Ile | Ala | Glu | Gly | Thr | Lys | Glu | Glu | Leu | Leu | Gin | Thr | Cys | Pro |
| 610 | 615 | 620 | |||||||||||||
| Glu | Phe | Leu | Lys | Met | Trp | Glu | Leu | Ser | Gly | Thr | Lys | Glu | Tyr | Asn | Arg |
| 625 | 630 | 635 | 640 | ||||||||||||
| Val | Phe | Val | Pro | Asp | His | Lys | Leu | Val | Ala | Asn | Pro | Thr | Asp | Met | Ala |
| 645 | 650 | 655 | |||||||||||||
| Ue | Thr | Thr |
| <210> 498 <211> 411 <212> PRT <213> Chlamydia | pneumoniae | ||||||||||||||
| <400> 498 | |||||||||||||||
| Met | Ue | Pro | Thr | Met | Leu | Met | Phe | Phe | Ue | Ue | Cys | Phe | Thr | Leu | c,ys |
| 1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
| Ser | Gly | Phe | Ue | Ser | Leu | Ser | Gin | Ue | Ala | Leu | Phe | Ser | Leu | Pro | Thr |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Ser | Leu | Ue | Ser | His | Tyr | Lys | Arg | Ser | Lys | Ser | Lys | Lys | Gin | Gin | Arg |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Val | Ala | Thr | Leu | Leu | Leu | His | Pro | His | His | Leu | Leu | Ue | Thr | Leu | Ile |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Phe | Cys | A.sp | Ue | Gly | Leu | Asn | Ue | Ala | Ue | Gin | Asn | Cys | Phe | Ala | Ile |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Leu | Phe | Gly Asp | Ala | Ala | Ser | Trp | Trp | Phe | Thr | Val | Gly | Leu | Pro | Leu | |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Ala | Ue | Thr | Leu | Ue | Leu | Gly | Glu | Ile | Leu | Pro | Lys | Ala | Val | Ala | Leu |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Pro | Phe | Asn | Thr | Gin | Ile | Ala | Ser | Ser | Val | Ala | Pro | Leu | Ue | Leu | Cys |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Val | Thr | Lys | Ue | Phe | Lys | Pro | Leu | Leu | His | Trp | Gly | Ue | Val | Gly | Ile |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Asn | Tyr | Val | Val | Gin | Trp | Ile | Leu | Ser | Lys | Gin | Gin | Ue | Asp | Ile | Ile |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Gin | Pro | Gin | Glu | Leu | Lys | Glu | Val | Leu | Gin | Ser | Cys | Lys | Asp | Phe | Gly |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Val | Val | Asn | Gin | Glu | Glu | Ser | Arg | Leu | Leu | Tyr | Gly | Tyr | Leu | Ser | Leu |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Ser | Asp | Cys | Ser | Val | Lys | Glu | Arg | Met | Gin | Pro | Arg | Gin | Asp | Ile | Leu |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Phe | Tyr | Asp | Ue | Gin | Thr | Pro | Leu | Glu | Asn | Leu | Tyr | Leu | Leu | Phe | Ser |
210 215 220
1,.
99 9 *> · · ·
9999 999 «*
157
| Lys | Gin | His | Cys | Ser | Arg | Val | Pro | Ile | Cys | Asn | Asp | Asn | Leu | Gin | Asn |
| 225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
| Leu | Leu | Gly | Ile | Cys | Thr | Ala | Arg | Ser | Leu | Leu | Leu | His | Asp | Lys | Pro |
| 245 | 250 | 255 | |||||||||||||
| Leu | Gin | Ser | Ser | Asp | Asp | Leu | Leu | Pro | Leu | Leu | Lys | Lys | Pro | Tyr | Tyr |
| 260 | 265 | 270 | |||||||||||||
| Met | Pro | Glu | Thr | Ile | Ser | Ala | Lys | Met | Ala | Leu | Cys | Gin | Met | Ala | Ala |
| 275 | 280 | 285 | |||||||||||||
| Glu | Asp | Glu | Thr | Leu | Gly | Met | Ile | Ile | Asp | Glu | Tyr | Gly | Ser | Ile | Glu |
| 290 | 295 | 300 | |||||||||||||
| Gly | Leu | Ile | Thr | Gin | Glu | Asp | Leu | Phe | Glu | Ile | Val | Ala | Gly | Glu | Ile |
| 305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
| Val | Asp | Gin | Arg | Asp | Asn | Lys | Ile | Leu | Tyr | Thr | Thr | Ser | Gly | Ala | Asp |
| 325 | 330 | 335 | |||||||||||||
| Val | Ile | Ile | Ala | Ser | Gly | Thr | Leu | Glu | Leu | Arg | Glu | Phe | Ser | Glu | Ile |
| 340 | 345 | 350 | |||||||||||||
| Phe | Asp | Ile | Asn | Leu | Pro | Thr | Asn | Asn | Asn | Ile | Ala | Thr | Ile | Gly | Gly |
| 355 | 360 | 365 | |||||||||||||
| Trp | Leu | Ile | Glu | Gin | Ile | Gly | Thr | Ile | Pro | Thr | Thr | Gly | Met | Lys | Leu |
| 370 | 375 | 380 | |||||||||||||
| Ser | Trp | Asn | Asn | Leu | Leu | Phe | Gin | Val | Leu | Asp | Ala | Ala | Pro | Asn | Arg |
| 385 | 390 | 395 | 400 | ||||||||||||
| Ile | Arg | Arg | Val | Tyr | Ile | Arg | Lys | Leu | Tyr | Asp | |||||
| 405 | 410 |
<210> 499 <211> 404 <212> PRT <213> Chlamydia pneumoniae
| <400> 499 | |||||||||||||||
| Met | Thr | Asn | Ser | Ala | Leu | Phe | Trp | Ile | Gly | Val | Asn | Ile | Ile | Cys | Ile |
| 1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
| Val | Leu | Gin | Gly | Phe | Tyr | Ser | Met | Met | Glu | Met | Ala | Cys | Val | Ser | Phe |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Asn | Arg | Val | Arg | Leu | Gin | Tyr | Tyr | Leu | Thr | Lys | Asp | His | Lys | Lys | Ala |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Arg | Tyr | Ile | Asn | Phe | Leu | Ile | Arg | Arg | Pro | Tyr | Arg | Leu | Phe | Gly | Thr |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Val | Met | Leu | Gly | Val | Asn | Ile | Ala | Leu | Gin | Val | Gly | Ser | Glu | Ser | Ser |
| 65 | 70. | 75 | 80 | ||||||||||||
| Arg | Asn | Cys | Tyr | Arg | Ala | Leu | Gly | Ile | Thr | Pro | Asp | Tyr | Ala | Pro | Phe |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Thr | Gin | Ile | Phe | Ile | Val | Val | Ile | Phe | Ala | Glu | Leu | Leu | Pro | Leu | Thr |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| lle | Ser | Arg | Lys | Ile | Pro | Glu | Lys | Leu | Ala | Leu | Trp | Gly | Ala | Pro | Ile |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Leu | Tyr | Tyr | Ser | His | Tyr | Ile | Phe | Tyr | Pro | Leu | Ile | Gin | Leu | Ile | Gly |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Ser | Leu | Thr | Glu | Gly | Leu | Tyr | Tyr | Leu | Leu | Asn | Ile | Arg | Lys | Glu | Lys |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Leu | Asn | Ser | Thr | Leu | Ser | Arg | Asp | Glu | Phe | Gin | Lys | Ala | Leu | Glu | Thr |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| His | His | Glu | Glu | Gin | Asp | Phe | Asn | Thr | Ile | Ala | Thr | Asn | Ile | Phe | Ser |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Leu | Ser | Ala | Thr | Cys | Ala | Asp | Gin | Val | Cys | Gin | Pro | Leu | Glu | Gin | Val |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Thr | Met | Leu | Pro | Ser | Ser | Ala | Asn | Val | Lys | Asp | Phe | Cyš | Arg | Thr | Ile |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Lys | Asn | Thr | Asp | Ile | Asn | Phe | Ile | Pro | Val | Tyr | His | Lys | Ala | Arg | Lys |
| 225 | 230 | 235 | 240 |
»1 <9 · ·· » a a
»· · · · • ···
458
| Asn | Val | Ile Gly | Ile Ala 245 | His | Pro Lys | Asp 250 . | Phe | Val | Asn | Lys | Ala 255 | Leu | |||
| Asp | Glu | Pro | Leu | Ile | Asn | Asn | Leu | His | Ser | Pro | Trp | Phe | Ile | Thr | Ala |
| 260 | 265 | 270 | |||||||||||||
| Lys | Ser | Lys | Leu | Ile | Arg | Ile | Leu | Lys | Glu | Phe | Arg | Asp | Asn | Arg | Ser |
| 275 | 280 | 285 | |||||||||||||
| Ser | Val | Ala | Val | Val | Leu | Asn | Ala | Ser | Gly | Glu | Pro | Ile | Gly | Ile | Leu |
| 290 | 295 | 300 | |||||||||||||
| Ser | Leu | Asn | Ala | Ile | Phe | Lys | Ile | Leu | Phe | Asn | Thr | Thr | Asn | Ile | Ala |
| 305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
| His | Leu | Lys | Pro | Lys | Thr | Ile | Ser | Val | Ile | Glu | Arg | Thr | Phe | Pro | Gly |
| 325 | 330 | 335 | |||||||||||||
| Asn | Ser | Arg | Ile | Lys | Asp | Leu | Gin | Lys | Glu | Leu | Asp | Ile | Gin | Phe | Pro |
| 340 | 345 | 350 | |||||||||||||
| Gin | Tyr | Pro | Val | Glu | Thr | Leu | Ala | Gin | Leu | Val | Leu | Gin | Leu | Leu | Asp |
| 355 | 360 | 365 | |||||||||||||
| Ser | Pro | Ala | Glu | Val | Gly | Thr | Ser | Val | Ile | Ile | Asn | Asn | Leu | Leu | Leu |
| 370 | 375 | 380 | |||||||||||||
| Glu | Val | Lys | Glu | Met | Ser | Leu | Ser | Gly | Ile | Lys | Thr | Val | Ser | Ile | Lys |
| 385 | 390 | 395 | 400 | ||||||||||||
| íAsn | Leu | Leu | Ser |
| <210> 500 <211> 543 <212> PRT <213> Chlamydia | pneumoniae | ||||||||||||||
| <400> 500 | |||||||||||||||
| Met | Phe | Gly | Ser | Glu | Ser | Leu | Arg | Tyr | Gin | Leu | Leu | Ile | Gin | Asp | Phe |
| 1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
| Ala | Lys | Val | Ser | Glu | Glu | Gly | Ile | Gly | Leu | Leu | Glu | Ser | Lys | Glu | Tyr |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Ser | Leu | Leu | Gin | Ala | Lys | Leu | Val | Leu | Arg | Ala | Leu | Ala | Gin | Asn | Ser |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Ser | Phe | Asp | Asp | Trp | Phe | Arg | Ser | Phe | Lys | Lys | Cys | Gin | Ile | Ser | Tyr |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Pro | Glu | Leu | Ala | His | Asp | Arg | Asp | Val | Leu | Glu | Glu | Phe | Gly | Ile | Gin |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Val | Leu | Arg | Glu | Gly | Ile | Glu | Asn | Pro | Ser | Val | Thr | Val | Arg | Ala | Val |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Ser | Val | Leu | Ala | Ile | Gly | Leu | Ala | Arg | Asp | Phe | Arg | Leu | Val | Pro | Leu |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Leu | Leu | Gin | Ser | Cys | Asn | Asp | Asp | Ser | Ala | Ile | Val | Arg | Ser | Leu | Ala |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Leu | Gin | Val | Ala | Val | Asn | Tyr | Gly | Ser | Glu | Ser | Leu | Lys | Lys | Ala | Ile |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Val | Glu | Leu | Ala | Arg | Asn | Asp | Asp | Ser | Ile | His | Val | Arg | Ile | Thr | Ala |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Tyr | Gin | Val | Val | Ala | Leu | Leu | Gin | Ile | Glu | Glu | Leu | Leu | Pro | Phe | Leu |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Arg | Glu | Arg | Ala | Glu | Asn | Lys | Leu | Val | Asp | Ser | Val | Glu | Arg | Arg | Glu |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Ala | Trp | Lys | Ala | Cys | Leu | Glu | Leu | Ser | Ser | Gin | Phe | Leu | Glu | Thr | Gly |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Val | Ala | Lys | Asp | Asp | Ile | Asp | Gin | Ala | Leu | Phe | Thr | Cys | Glu | Val | Leu |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Arg | Asn | Gly | Met | Leu | Pro | Glu | Thr | Thr | Glu | Ile | Phe | Thr | Glu | Leu | Leu |
| 225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
| Ser | Val | Glu | His | Pro | Glu | Val | Gin | Glu | Ser | Leu | Leu | Leu | Ser | Ala | Leu |
245 250 255 • ··· ···
459
| Ala | Trp | Ser | His 260 | Gin | Leu | Gin | Asn | His 265 | Lys | Glu | Phe | Leu | Ser 270 | Lys | Val |
| Arg | His | Val 275 | Met | Cys | Thr | Ser | Pro 280 | Phe | Ala | Lys | Val | Arg 285 | Phe | Gin | Ala |
| Ala | Ala 290 | Leu | Leu | His | Leu | His 295 | Gly | Asp | Pro | Leu | Gly 300 | Arg | Asp | Ser | Leu |
| Val 305 | Glu | Gly | Leu | Arg | Ser 310 | Pro | Gin | Pro | Leu | Val 315 | Cys | Glu | Ala | Ala | Ser 320 |
| Ala | Ala | Leu | Cys | Ser 325 | Leu | Gly | Ile | His | Gly 330 | Val | Pro | Leu | Ala | Lys 335 | Glu |
| His | Leu | Glu | Ser 340 | Leu | Ser | Ser | Arg | Lys 345 | Ala | Ala | Ala | Asn | Leu 350 | Ser | Ile |
| Leu | Leu | Leu 355 | Val | Ser | Arg | Glu | Asp 360 | Ile | Glu | Arg | Ala | Gly 365 | Asp | Val | Ile |
| Ala | Arg 37 0 | Tyr | Leu | Ser | Asn | Pro 375 | Glu | Met | Cys | Trp | Ala 380 | Ile | Glu | Tyr | Phe |
| Leu 385 | Trp | Asp | Ala | Gin | Trp 390 | Asn | Leu | Arg | Gly | Asp 395 | Thr | Phe | Pro | Leu | Tyr 400 |
| Ser | Asp | Met | Ile | Lys 405 | Arg | Glu | Ile | Gly | Arg 410 | Lys | Leu | Ile | Arg | Leu 415 | Leu |
| Ala | Val | Ala | Arg 420 | Tyr | Ser | Gin | Ala | Lys 425 | Ala | Val | Thr | Ala | Thr 430 | Phe | Leu |
| Ser | Gly | Gin 435 | Gin | Ala | Gin | Gly | Trp 440 | Ser | Phe | Phe | Ser | Gly 445 | Met | Phe | Trp |
| Glu | Glu 450 | Gly | Asp | Val. | Lys | Thr 455 | Ser | Glu | Asp | Leu | Val 4 60 | Thr | Asp | Ala | Cys |
| Phe 4 65 | Ala | Ala | Lys | Leu | Glu 470 | Gly | Ala | Leu | Ala | Ser 475 | Leu | Cys | Gin | Lys | Lys 480 |
| Asp | Gin | Ala | Ser | Leu 485 | Gin | Arg | Val | Ser | Gin 490 | Leu | Tyr | Asn | Asp | Ser 4 95 | Arg |
| .Trp | Gin | Asp | Lys 500 | Leu | Ala | Ile | Leu | Glu 505 | Ser | Val | Ala | Phe | Ser 510 | Glu | Asn |
| Leu | Asp | Ala 515 | Val | Pro | Phe | Leu | Leu 520 | Asp | Cys | Cys | His | His 525 | Glu | Ala | Pro |
| Ser | Leu | Arg | Ser | Ala | Ala | Ala | Gly | Ala | Leu | Phe | Ser | Ile | Phe | Lys |
530 535 540 <210> 501 <211> 103 <212> PRT
| <213> Chlamydia pneumoniae | |||||||||||||||
| <400> 501 | |||||||||||||||
| Met | Ser | Phe | Lys | Arg | Phe | Leu | Gin | Gin | Ile | Pro | Val | Arg | Ile | Cys | Leu |
| 1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
| Leu | Ile | Ile | Tyr | Leu | Tyr | Gin | Trp | Leu | Ile | Ser | Pro | Leu | Leu | Gly | Ser |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Cys | Cys | Arg | Phe | Phe | Pro | Ser | Cys | Ser | His | Tyr | Ala | Glu | Gin | Tkla | Leu |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Lys | Ser | His | Gly | Phe | Leu | Met | Gly | Cys | Trp | Leu | Ser | Ile | Lys | Arg | Ile |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Gly | Lys | Cys | Gly | Pro | Trp | His | Pro | Gly | Gly | Ile | Asp | Met | Val | Pro | Lys |
| 65 | 70 | 75 | 90 | ||||||||||||
| Thr | Ala | Leu | Gin | Glu | Val | Leu | Glu | Pro | Tyr | Gin | Glu | Ile | Asp | Gly | Gly |
| 85 | 90 | 95 |
Asp Ser Ser His Phe Ser Glu 100 <210> 502 <211> 362 <212> PRT • · · • ·· ·
460 <213> Chlamydia pneumoniae <400> 502
| Met | Ala | Phe | Lys | Arg | Lys | Thr | Arg | Trp | Leu | Trp | Gin | Val | Leu | Ile | Leu |
| 1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
| Ser | Val | Gly | Leu | Asn | Met | Leu | Phe | Leu | Leu | Leu | Phe | Tyr | Ser | Ala | Ile |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Phe | Arg | Lys | Asp | Ile | Tyr | Lys | Leu | His | Leu | Phe | Ser | Gly | Pro | Leu | Ile |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Ala | Lys | Ser | Ser | Arg | Lys | Val | Tyr | Leu | Ser | Glu | Asp | Phe | Leu | Asn | Glu |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Ile | Ser | Gin | Ala | Ser | Leu | Asp | Asp | Leu | He | Ser | Leu | Phe | Lys | Asp | Glu |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Arg | Tyř | Met | Tyr | Gly | Arg | Pro | Ile | Lys | Leu | Trp | Ala | Leu | Ser | Val | Ala |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Ile | Ala | Ser | His | His | Ile | Asp | Ile | Thr | Pro | Val | Leu | Ser | Lys | Pro | Leu |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Thr | Tyr | Thr | Glu | Leu | Lys | Gly | Ser | Ser | Val | Arg | Trp | Leu | Leu | Pro | Asn |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Ile | Asp | Leu | Lys | Asp | Phe | Pro | Val | Ile | Leu | Asp | Tyr | Leu | Arg | Cys | His |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Lys | Tyr | Pro | Tyr | Thr | Ser | Lys | Gly | Leu | Phe | Leu | Leu | Ile | Glu | Lys | Met |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| 'Val | Gin | Glu | Gly | Trp | Val | Asp | Glu | Asp | Cys | Leu | Tyr | His | Phe | Cys | Ser |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Thr | Pro | Glu | Phe | Leu | Tyr | Leu | Arg | Thr | Leu | Leu | Val | Gly | Ala | Asp | Val |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Gin | Ala | Ser | Ser | Val | Ala | Ser | L.eu | Ala | Arg | Met | Val | Ile | Arg | Cys | Gly |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Ser | Glu | Arg | Phe | Phe | His | Phe | Cys | Asn | Glu | Glu | Ser | Arg | Thr | Ser | Met |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| 'Ile | Ser | Ala | Thr | Gin | Arg | Gin | Lys | Val | Leu | Lys | Ser | Tyr | Leu | Asp | Cys |
| 225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
| Glu | Glu | Ser | Leu | Ala | Ala | Leu | Leu | Leu | Leu | Val | His | Asp | Ser | Asp | Val |
| 245 | 250 | 255 | |||||||||||||
| Val | Leu | His | Glu | Phe | Cys | Asp | Glu | Asp | Leu | Glu | Lys | Val | Ile | Arg | Leu |
| 260 | 265 | 270 | |||||||||||||
| Met | Pro | Gin | Glu | Ser | Pro | Tyr | Ser | Gin | Asn | Phe | Phe | Ser | Arg | Leu | Gin |
| 275 | 280 | 285 | |||||||||||||
| His | Ser | Pro | Arg | Arg | Glu | Leu | Ala | Cys | Met | Ser | Thr | Gin | Arg | Val | Glu |
| 290 | 295 | 300 | |||||||||||||
| Ala | Pro | Arg | Val | Gin | Glu | Asp | Gin | Asp | Glu | Glu | Tyr | Val | Val | Gin | Asp |
| 305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
| Gly | Asp | Ser | Leu | Trp | Leu | Ile | Ala | Lys | Arg | Phe | Gly | Ile | Pro | Met | Asp |
| 325 | 330 | 335 | |||||||||||||
| Lys | Ile | Ile | Gin | Lys | Asn | Gly | Leu | Asn | His | His | Arg | Leu | Phe | Pro | Gly |
| 340 | 345 | 350 | |||||||||||||
| Lys | Val | Leu | Lys | Leu | Pro | Ala | Lys | Gin | Ser | ||||||
| 355 | 360 |
<210> 503 <211> 582 <212> PRT <213> Chlamydia pneumoniae <400> 503
| Met | Ser | Gly | Lys | Lys | Asp | Gly | Val | Arg | Gly | Met | Ile | Phe | Val | Pro | Leu |
| 1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
| Ser | Ile | Leu | Val | Leu | Ile | Phe | Leu | Pro | Leu | Pro | Gin | Ile | Leu | Leu | Asp |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Phe | Gly | Leu | Cys | Ile | Ser | Phe | Ala | Leu | Ser | Leu | Leu | Thr | Val | Cys | Trp |
• · • ·· · • · ·· ► a « > · · ·« • ··· • · « • · «
461
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Val | Phe | Thr | Leu | Asn | Ser | Ser | Asn | Ser | Ala | Lys | Leu | Phe | Pro | Pro | Phe |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Phe | Leu | Tyr | Leu | Cys | Leu | Leu | Arg | Leu | Gly | Leu | Asn | Leu | Ala | Ser | Thr |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Arg | Trp | Ile | Val | Ser | Ser | Gly | Thr | Ala | Ser | Ser | Leu | Ile | Val | Ser | Leu |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Gly | Ser | Phe | Phe | Ser | Leu | Gly | Ser | Leu | Trp | Ala | Ala | Thr | Phe | Ala | Cys |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Leu | Leu | Leu | Phe | Phe | Val | Asn | Phe | Leu | Met | Val | Ser | Lys | Gly | Ser | Glu |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Arg | Ile | Ala | Glu | Val | Arg | Ser | Arg | Phe | Phe | Leu | Glu | Ala | Leu | Pro | Ala |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Lys | Gin | Met | Ala | Leu | Asp | Ser | Asp | Leu | Val | Ser | Gly | Arg | Ala | Ser | Tyr |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Lys | Ala | Val | Lys | Lys | Gin | Lys | Asn | Ala | Leu | Ile | Glu | Glu | Gly | Asp | Phe |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Phe | Sér | Ala | Met | Glu | Gly | Val | Phe | Arg | Phe | Val | Lys | Gly | Asp | Ala | Ile |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Ile | Ser | Cys | Ile | Leu | Leu | Leu | Val | Asn | Val | Val | Ser | Val | Thr | Cys | Leu |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Tyr | Tyr | Thr | Ser | Gly | Tyr | Ala | Leu | Glu | Gin | Met | Trp | Phe | Thr | Val | Leu |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Gly | Asp | Ala | Leu | Val | Ser | Gin | Val | Pro | Ala | Leu | Leu | Thr | Ser | Cys | Ala |
| 225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
| Ala | Ala | Thr | Leu | Ile | Ser. | Lys | Ile | Asp | Lys | Glu | Glu | Ser | Leu | Leu | Asn |
| 245 | 250 | 255 | |||||||||||||
| Tyr | Leu | Phe | Glu | Tyr | Tyr | Lys | Gin | Leu | Arg | Gin | His | Phe | Arg | Val | Val |
| 260 | 265 | 270 | |||||||||||||
| Ser | Leu | Leu | Ile | Phe | Ser | Leu | Cys | Cys | Ile | Pro | Ser | Ser | Pro | Lys | Phe |
| 275 | 280 | 285 | |||||||||||||
| Pro | Ile | Val | Leu | Leu | Ala | Ser | Leu | Leu | Trp | Leu | Ala | Tyr | Arg | Lys | Glu |
| 290 | 295 | 300 | |||||||||||||
| Glu | Pro | Ala | Ser | Glu | Asp | Ser | Cys | Ile | Glu | Arg | Ala | Phe | Ser | Tyr | Val |
| 305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
| Glu | Gly | Ala | Cys | Pro | Lys | Glu | Gin | Glu | Ser | Gin | Phe | Tyr | Gin | Val | Tyr |
| 325 | 330 | 335 | |||||||||||||
| Arg Ala | Ala | Ser | Glu | Glu | Val | Phe | Glu | Asp | Leu | Gly | Val | Arg | Leu | Pro | |
| 340 | 345 | 350 | |||||||||||||
| Val | Leu | Thr | Ser | Leu | Arg | . He | Glu | Glu | Arg | Pro | Trp | Leu | Arg | Val | Phe |
| 355 | 360 | 365 | |||||||||||||
| Gly | Gin | Asn | Val | Tyr | Leu | Asp | Glu | Met | Thr | Pro | Glu | Ala | Val | Leu | Pro |
| 370 | 375 | 380 | |||||||||||||
| Phe | Leu | Arg | Asn | Ile | Ala | His | Glu | Ala | Leu | Asn | Ala | Glu | Val | Val | Gin |
| 385 | 390 | 395 | 400 | ||||||||||||
| Lys | Tyr | Leu | Glu | Glu | Ser | Glu | Arg | Val | Phe | Gly | Ile | Ala | Val | Glu | Asp |
| 4 05 | 410 | 415 | |||||||||||||
| Ile | Val | Pro | Lys | Lys | Ile | Ser | Leu | Ser | Ser | Leu | Val | Val | Leu | Ser | Arg |
| 420 | 425 | 430 | |||||||||||||
| Leu | Leu | Val | Arg | Glu | Arg | Val | Ser | Leu | Lys | Leu | Phe | Pro | Lys | Ile | Leu |
| 435 | 440 | 445 | |||||||||||||
| Glu | Ala | Val | Ala | Val | Tyr | Gin | Asn | Ser | Gly | Asp | Ser | Leu | Glu | Ile | Leu |
| 450 | 455 | 460 | |||||||||||||
| Ala | Glu | Lys | Val | Arg | Lys | Ser | Leu | Gly | Tyr | Trp | Ile | Gly Arg | Ser | Leu | |
| 465 | 470 | 475 | 480 | ||||||||||||
| Trp | Asp | Gin | Lys | Gin | Thr | Leu | Glu | Val | Ile | Thr | Ile | Asp | Phe | His | Val |
| 485 | 490 | 495 | |||||||||||||
| Glu | Glu | Leu | Ile | Asn | Ser | Ser | Tyr | Ser | Lys | Ser | Asn | Pro | Val | Met | Gin |
| 500 | 505 | 510 | |||||||||||||
| Glu | Asn | Val | Ile | Arg | Arg | Val | Asp | Ser | Leu | Leu | Glu | Arg | Ser | Val | Phe |
| 515 | 520 | 525 |
• · · · · • · 999 · · • · · · · » 9 • · · 9 9 · ·· ·« ··
62
| Lys Asp Phe | Arg | Ala | Ile Val 535 | Thr | Ser | Cys | Glu Thr Arg '540 | Phe Glu | Met | ||||||
| 530 | |||||||||||||||
| Lys | Lys | Met | Leu | Asp | Pro | His | Phe | Pro | Asp | Leu | Leu | Val | Leu | Ser | His |
| 545 | 550 | 555 | 560 | ||||||||||||
| Asp | Glu | Leu | Pro | Lys | Glu | Ile | Pro | Ile | Ser | Phe | Leu | Gly | Ile | Val | Ser |
| 565 | 570 | 575 | |||||||||||||
| Asp | Glu | Val | Leu | Val | Pro |
580 <210> 504 <211> 435 <212> PRT <213> Chlamydia pneumoniae <400> 504
| Met | Phe | Ser | Arg | Trp | Ile | Thr | Leu | Phe | Leu | Leu | Phe | Ile | Ser | Leu | Thr |
| 1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
| Gly | Cys | Ser | Ser | Tyr | Ser | Ser | Lys | His | Lys | Gin | Ser | Leu | Ile | Ile | Pro |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Ile | His | Asp | Asp | Pro | Val | Ala | Phe | Ser | Pro | Glu | Gin | Ala | Lys | Arg | Ala |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Met | Asp | Leu | Ser | Ile | Ala | Gin | Leu | Leu | Phe | Asp | Gly | Leu | Thr | Arg | Glu |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Thr | His | Arg | Glu | Ser | Asn | Asp | Leu | Glu | Leu | Ala | Ile | Ala | Ser | Arg | Tyr |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Thr | Val | Ser | Glu | Asp | Phe | Cys | Ser | Tyr | Thr | Phe | Phe | Ile | Lys | Asp | Ser |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Ala | Leu | Trp | Ser | Asp | Gly | Thr | Pro | Ile | Thr | Ser | Glu | Asp | Ile | Arg | Asn |
| ioo | 105 | 110 | |||||||||||||
| Ala | Trp | Glu | Tyr | Ala | Gin | Glu | Asn | Ser | Pro | His | Ile | Gin | Ile | Phe | Gin |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Gly | Leu | Asn | Phe | Ser | Thr | Pro | Ser | Ser | Asn | Ala | Ile | Thr | Ile | His | Leu |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Asp | Ser | Pro | Asn | Pro | Asp | Phe | Pro | Lys | Leu | Leu | Ala | Phe | Pro | Ala | Phe |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Ala | Ile | Phe | Lys | Pro | Glu | Asn | Pro | Lys | Leu | Phe | Ser | Gly | Pro | Tyr | Thr |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Leu | Val | Glu | Tyr | Phe | Pro | Gly | His | Asn | Ile | His | Leu | Lys | Lys | Asn | Pro |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Asn | Tyr | Tyr | Asp | Tyr | His | Cys | Val | Ser | Ile | Asn | Ser | Ile | Lys | Leu | Leu |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Ile | Ile | Pro | Asp | Ile | Tyr | Thr | Ala | Ile | His | Leu | Leu | Asn | Arg | Gly | Lys |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Val | Asp | Trp | Val | Gly | Gin | Pro | Trp | His | Gin | Gly | Ile | Pro | Trp | Glu | Leu |
| 225 | 230 | 235 | 24 0 | ||||||||||||
| His | Lys | Gin | Ser | Gin | Tyr | His | Tyr | Tyr | Thr | Tyr | Pro | Val | Glu | Gly | Ala |
| 245 | 250 | 255 | |||||||||||||
| Phe | Trp | Leu | Cys | Leu | Asn | Thr | Lys | Ser | Pro | His | Leu | Asn | Asp | Leu | Gin |
| 260 | 265 | 270 | |||||||||||||
| Asn | Arg | His | Arg | Leu | Ala | Thr | Cys | Ile | Asp | Lys | Arg | Ser | Ile | Ile | Glu |
| 275 | 280 | 285 | |||||||||||||
| Glu | Ala | Leu | Gin | Gly | Thr | Gin | Gin | Pro | Ala | Glu | Thr | Leu | Ser | Arg | Gly |
| 290 | 295 | 300 | |||||||||||||
| Ala | Pro | Gin | Pro | Asn | Gin | Tyr | Lys | Lys | Gin | Lys | Pro | Leu | Thr | Pro | Gin |
| 305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
| Glu | Lys | Leu | Val | Leu | Thr | Tyr | Pro | Ser | Asp | Ile | Leu | Arg | Cys | Gin | Arg |
| 325 | 330 | 335 | |||||||||||||
| Ile | Ala | Glu | Ile | Leu | Lys | Glu | Gin | Trp | Lys | Ala | Ala | Gly | Ile | Asp | Leu |
| 340 | 345 | 350 | |||||||||||||
| Ile | Leu | Glu | Gly | Leu | Glu | Tyr | His | Leu | Phe | Val | Asn | Lys | Arg | Lys | Val |
| 355 | 360 | 365 |
• ·· ·
463
| Gin Asp Tyr | Ala | Ile Ala | Thr Gin Thr Gly Val Ala | Tyr Tyr | Pro | Gly | |||||||||
| 370 | 375 | 380 | |||||||||||||
| Ala | Asn | Leu | Ile | Ser | Glu | Glu | Asp | Lys | Leu | Leu | Gin | Asn | Phe | Glu | Ile |
| 385 | 390 | 395 | 400 | ||||||||||||
| Ile | Pro | Ile | Tyr | Tyr | Leu | Ser | Tyr | Asp | Tyr | Leu | Thr | Gin | Asp | Phe | Ile |
| 405 | 410 | 415 | |||||||||||||
| Glu | Gly | Val | Ile | Tyr | Asn | Ala | Ser | Gly | Ala | Val | Asp | Leu | Lys | Tyr | Thr |
| 420 | 425 | 430 | |||||||||||||
| Tyr | Phe | Pro |
435 <210> 505 <211> 171 <212> PRT <213> Chlamydia pneumoniae <400> 505
| Met 1 | Lys | Lys | Leu | Leu 5 | Phe | Ser Thr | Phe | Leu 10 | Leu | Val | Leu | Gly | Ser 1.5 | Thr | |
| Ser | Ala | Ala | His | Ala | Asn | Leu | Gly | Tyr | Val | Asn | Leu | Lys | Arg | Cys | Leu |
| 20 | 25 · | 30 | |||||||||||||
| Glu | Glu | Ser | Asp | Leu | Gly | Lys | Lys | Glu | Thr | Glu | Glu | Leu | Glu | Ala | Met |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Lys | Gin | Gin | Phe | Val | Lys | Asn | Ala | Glu | Lys | Ile | Glu | Glu | Glu | Leu | Thr |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Ser | Ile | Tyr | Asn | Lys | Leu | Gin | Asp | Glu | Asp | Tyr | Met | Glu | Ser | Leu | Ser |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Asp | Ser | Ala | Ser | Glu | Glu | Leu | Arg | Lys | Lys | Phe | Glu | Asp | Leu | Ser | Gly |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Glu | Tyr | Asn | Ala | Tyr | Gin | Ser | Gin | Tyr | Tyr | Gin | Ser | Ile | Asn | Gin | Ser |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Asn | Val | Lys | Arg | Ile | Gin | Lys | Leu | Ile | Gin | Glu | Val | Lys | Ile | Ala | Ala |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Glu | Ser | Val | Arg | Ser | Lys | Glu | Lys | Leu | Glu | Ala | Ile | Leu | Asn | Glu | Glu |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Ala | Val | Leu | Ala | Ile | Ala | Pro | Gly | Thr | Asp | Lys | Thr | Thr | Glu | Ile | Ile |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Ala | Ile | Leu | Asn | Glu | Ser | Phe | Lys | Lys | Gin | Asn | |||||
| 165 | 170 |
<210> 506 <211> 360 <212> PRT <213> Chlamydia pneumoniae <400> 506
| Met | Ser | Glu | Ala | Pro | Val | Tyr | Thr | Leu | Lys | Gin | Leu | Ala | Glu | Leu | Leu |
| 1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
| Gin | Val | Glu | Val | Gin | Gly | Asn | Ile | Glu | Thr | Pro | Ile | Ser | Gly | Val | Glu |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Asp | Ile | Ser | Gin | Ala | Gin | Pro | His | His | Ile | Ala | Phe | Leu | Asp | Asn | Glu |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Lys | Tyr | Ser | Ser | Phe | Leu | Lys | Asn | Thr | Lys | Ala | Gly | Ala | Ile | Ile | Leu |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Ser | Arg | Ser | Gin | Ala | Met | Gin | His | Ala | His | Leu | Lys | Lys | Asn | Phe | Leu |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Ile | Thr | Asn | Glu | Ser | Pro | Ser | Leu | Thr | Phe | Gin | Lys | Cys | Ile | Glu | Leu |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Phe | Ile | Glu | Pro | Val | Thr | Ser | Gly | Phe | Pro | Gly | Ile | His | Pro | Thr | Ala |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Val | Ile | His | Pro | Thr | Ala | Arg | Ile | Glu | Lys | Asn | Val | Thr | Ile | Glu | Pro |
» «'toto to toto ·· *' · ♦ · to f· ···· 4 e * '.·,*· · · · • to · '· · »· ··* • «toto
464
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Tyr | Val | Val | Ile | Ser | Gin | His. | Ala | His | Ile | Gly | Ser | Asp | Thr | Tyr | Ile |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Gly | Ala | Gly | Ser | Val | Ile | Gly | Ala | His | Ser | Val | Leu | Gly | Ala | Asn | Cys |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Leu | Ile | His | Pro | Lys | Val | Val | Ile | Arg | Glu | Arg | Val | Leu | Met | Gly | Asn |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Arg | Val | Val | Val | Gin | Pro | Gly | Ala | Val | Leu | Gly | Ser | Cys | Gly | Phe | Gly |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Tyr | Ile | Thr | Asn | Ala | Phe | Gly | His | His | Lys | Pro | Leu | Lys | His | Leu | Gly |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Tyr | Val | Ile | Val | Gly | Asp | Asp | Val | Glu | Ile | Gly | Ala | Asn | Thr | Thr | Ile |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Asp | Arg | Gly | Arg | Phe | Lys | Asn | Thr | Val | Ile | His | Glu | Gly | Thr | Lys | Ile |
| 225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
| Asp | Asn | Gin | Val | Gin | Val | Ala | His | His | Val | Glu | Ile | Gly | Lys | His | Ser |
| 245 | 250 | 255 | |||||||||||||
| Ile | Ile | Val | Ala | Gin | Ala | Gly | Ile | Ala | Gly | Ser | Thr | Lys | Ile | Gly. | Glu |
| 260 | 265 | 270 | |||||||||||||
| His | Val | Ile | Ile | Gly | Gly | Gin | Thr | Gly | Ile | Thr | Gly | His | Ile | Ser | Ile |
| 275 | 280 | 285 | |||||||||||||
| Ala | Asp | His | Val | Ile | Met | Ile | Ala | Gin | Thr | Gly | Val | Thr | Lys | Ser | Ile |
| 290 | 295 | 300 | |||||||||||||
| Thr | Ser | Pro | Gly | Ile | Tyr | Gly | Gly | Ala | Pro | Ala | Arg | Pro | Tyr | Gin | Glu |
| 305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
| Thr | His | Arg | Leu | Ile | Ala | Lys | Ile | Arg | Asn | Leu | Pro | Lys | Thr | Glu | Glu |
| 325 | 330 | 335 | |||||||||||||
| Arg | Leu | Ser | Lys | Leu | Glu | Lys | Gin | Val | Arg | Asp | Leu | Ser | Thr | Pro | Ser |
| 34 0 | 345 | 350 | |||||||||||||
| Leu | Ala | Glu | Ile | Pro | Ser | Glu | Ile | ||||||||
| 355 | 360 | < |
<210> 507 <211> 399 <212> PRT <213> Chlamydia pneumoniae <400> 507
| Met 1 | Ala | Ala | Ser | Gly 5 | Gly | Thr | Gly | Gly | Leu 10 | Gly | Gly | Thr | Gin | Gly 15 | Val |
| Asn | Leu | Ala | Ala 20 | Val | Glu | Ala | Ala | Ala 25 | Ala | Lys | Ala | Asp | Ala 30 | Ala | Glu |
| Val | Val | Ala 35 | Ser | Gin | Glu | Gly | Ser 40 | Glu | Met | Asn | Met | Ile 45 | Gin | Gin | Ser |
| Gin | Asp 50 | Leu | Thr | Asn | Pro | Ala 55 | Ala | Ala | Thr | Arg | Thr 60 | Lys | Lys | Lys | Glu |
| Glu 65 | Lys | Phe | Gin | Thr | Leu 10 | Glu | Ser | Arg | Lys | Lys 75 | Gly | Glu | Ala | Gly | Lys 80 |
| Ala | Glu | Lys | Lys | Ser 85 | Glu | Ser | Thr | Glu | Glu 90 | Lys | Pro | Asp | Thr | Asp 95 | Leu |
| Ala | Asp | Lys | Tyr 100 | Ala | Ser | Gly | Asn | Ser 105 | Glu | Ile | Ser | Gly | Gin 110 | Glu | Leu |
| Arg | Gly | Leu 115 | Arg | Asp | Ala | Ile | Gly 120 | Asp | Asp | Ala | Ser | Pro 125 | Glu | Asp | Ile |
| Leu | Ala 130 | Leu | Val | Gin | Glu | Lys 135 | Ile | Lys | Asp | Pro | Ala 140 | Leu | Gin | Ser | Thr |
| Ala 145 | Leu | Asp | Tyr | Leu | Val 150 | Gin | Thr | Thr | Pro | Pro 155 | Ser | Gin | Gly | Lys | Leu 160 |
| Lys | Glu | Ala | Leu | Ile 165 | Gin | Ala | Arg | Asn | Thr 170 | His | Thr | Glu | Gin | Phe 175 | Gly |
| Arg | Thr | Ala | Ile | Gly | Ala | Lys | Asn | Ile | Leu | Phe | Ala | Ser | Gin | Glu | Tyř |
465
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Ala | Asp | Gin | Leu | Asn | Val | Ser | Pro | Ser | Gly | Leu | Arg' | Ser | Leu | Tyr | Leu |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Glu | Val | Thr | Gly | Asp | Thr | His | Thr | Cys | Asp | Gin | Leu | Leu | Ser | Met | Leu |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Gin | Asp | Arg | Tyr | Thr | Tyr | Gin | Asp | Met | Ala | Ile | Val | Ser | Ser | Phe | Leu |
| 225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
| Met | Lys | Gly | Met | Ala | Thr | Glu | Leu | Lys | Arg | Gin | Gly | Pro. | Tyr | Val | Pro |
| 245 | 250 | 255 | |||||||||||||
| Ser | Ala | Gin | Leu | Gin | Val | Leu | Met | Thr | Glu | Thr | Arg | Asn | Leu | Gin | Ala |
| 260 | 265 | 270 | |||||||||||||
| Val | Leu | Thr | Ser | Tyr | Asp | Tyr | Phe | Glu | Ser | Arg | Val | Pro | Ile | Leu | Leu |
| 275 | 280 | 285 | |||||||||||||
| Asp | Ser | Leu | Lys | Ala | Glu | Gly | Ile | Gin | Thr | Pro | Ser | Asp | Leu | Asn | Phe |
| 290 | 295 | 300 | |||||||||||||
| Val | Lys | Val | Ala | Glu | Ser | Tyr | His | Lys | Ile | Ile | Asn | Asp | Lys | Phe | Pro |
| 305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
| Thr | Ala | Ser | Lys | Val | Glu | Arg | Glu | Val | Arg | Asn | Leu | Ile | Gly | Asp | Asp |
| 325 | 330 | 335 | |||||||||||||
| Val. | Asp | Ser | Val | Thr | Gly | Val | Leu | Asn | Leu | Phe | r Phe | Ser | Ala | Leu | Arg |
| 340 | 345 | 350 | |||||||||||||
| Gin | Thr | Ser | Ser | Arg | Leu | Phe | Ser | Ser | Ala | Asp | Lys | Arg | Gin | Gin | Leu |
| 355 | 360 | 365 | |||||||||||||
| Gly | Ala | Met | Ile | Ala | Asn | Ala | Leu | Asp | Ala | Val | Asn | Ile | Asn | Asn | Glu |
| 370 | 375 | 380 | |||||||||||||
| Asp | Tyr | Pro | Lys | Ala | Ser | Asp | Phe | Pro | Lys | Pro | Tyr | Pro | Trp | Ser |
385 390 395 <210> 508 <211> 224 <212> PRT
| <213> Chlamydia | pneumoniae | ||||||||||||||
| <400> 508 | |||||||||||||||
| Met | Thr | Ser | Trp | Ile | Glu | Leu | Leu | Asp | Lys | Gin | Ile | Glu | Asp | Gin | His |
| 1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
| Met | Leu | Lys | His | Glu | Phe | Tyr | Gin | Arg | Trp | Ser | Glu | Gly | Lys | Leu | Glu |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Lys | Gin | Gin | Leu | Gin | Ala | Tyr | Ala | Lys | Asp | Tyr | Tyr | Leu | His | Ile | Lys |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Ala | Phe | Pro | Cys | Tyr | Leu | Ser | Ala | Leu | His | Ala | Arg | Cys | Asp | Asp | Leu |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Gin | Ile | Arg | Arg | Gin | Ile | Leu | Glu | Asn | Leu | Met | Asp | Glu | Glu | Ala | Gly |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Asn | Pro | Asn | His | Ile | Asp | Leu | Trp | Arg | Gin | Phe | Ala | Leu | Ser | Leu | Gly |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Val | Ser | Glu | Glu | Glu | Leu | Ala | Asn | His | Glu | Phe | Ser | Gin | Ala· | Ala | Gin |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Asp | Met | Val | Ala | Thr | Phe | Arg | Arg | Leu | Cys | Asp | Met | Pro | Gin | Leu | Ala |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Val | Gly’ | Leu | Gly | Ala | Leu | Tyr | Thr | Tyr | Glu | Ile | Gin | Ile | Pro | Gin | Val |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Cys | Val | Glu | Lys | Ile | Arg | Gly | Leu | Lys | Glu | Tyr | Phe | Gly | Val | Ser | Ala |
| 145 | 150 | 155 | 1.60 | ||||||||||||
| Arg | Gly | Tyr | Ala | Tyr | Phe | Thr | Val | His | Gin | Glu | Ala | Asp' | Ile | Lys | His |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Ala | Ser | Glu | Glu | Lys | Glu | Met | Leu | Gin | Thr | Leu | Val | Gly | Arg | Glu | Asn |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Pro | Asp | Ala | Val | Leu | Gin | Gly | Ser | Gin | Glu | Val | Leu | Asp | Thr | Leu | Trp |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Asn | Phe | Leu | Ser | Ser | Phe | Ile | Asn | Ser | Thr | Glu | Pro | Cys | Ser | Cys | Lys |
·· ·· » · · · ··· • · ·» · • ·· · *· ··· ·· ··
466
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| <210> 509 | |||||||||||||||
| <211> 246 | |||||||||||||||
| <212> PRT | |||||||||||||||
| <213> Chlamydia | pneumoniae | ||||||||||||||
| <400> 509' | |||||||||||||||
| Met | Lys | Ile | Thr | Thr | Val | Lys | Thr | Pro | Lys | Ile | Tyr | Pro | Tyr | Asp | Asp |
| 1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
| Leu | Tyr | Ser | Ile | Leu | Glu | Ser | Ser | Leu | Pro | Lys | Leu | Asn | Glu | Arg | Ser |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Ile | Val | Val | He | Thr | Ser | Lys | Ile | Val | Seř | Leu | Cys | Glu | Gly | Ala | Val |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Val | Glu | Léu | Glu | Lys | Val | Ser | Lys | Asp | Glu | Leu | Ile | Lys | Gin | Glu | Ala |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Asp | Ala | Tyr | Val | Phe | Val | Glu | Lys | Tyr | Gly | Ile | Tyr | Leu | Thr | Lys | Lys |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Trp | Gly | Ile | Leu | Ile | Pro | Ser | Ala | Gly | Ile | Asp | Glu | Ser | Asn | Val | Glu |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Gly | Tyr | Phe | Val | Leu | Tyr | Pro | Arg | Asp | Phe | Leu | Leu | Ser | Val | Asn | Thr |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Leu | Gly | Asp | Trp | Leu | Arg | Asn | Phe | Tyr | His | Leu | Glu | His | Cys | Gly | Ile |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Ile | Ile | Ser | Asp | Ser | His | Thr | Thr | Pro | Leu | Arg | Arg | Gly | Thr | Met | Gly |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Leu | Gly | Leu | Cys | Trp | Asn | Gly | Phe | Phe | Pro | Leu | Tyr | Asn | Tyr | Val, | Gly |
| 14 5 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Lys | Pro | Asp | Cys | Phe | Gly | Arg | Ala | Leu | Lys | Met | Thr | Tyr | Ser | Asn | Leu |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| 'Leu | Asp | Gly | Leu | Ser | Ala | Ala | Ala | Val | Leu | Cys | Met | Gly | Glu | Gly | Asp |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Glu | Gin | Thr | Pro | Ile | Ala | Ile | Ile | Glu | Glu | Ala | Pro | Lys | He | Thr | Phe |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| His | Ser | Ser | Pro | Thr | Thr | Leu | Gin | Asp | Met | Ser | Thr | Leu | Ala | Ile | Ala |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Glu | Asp | Glu | Asp | Leu | Tyr | Gly | Pro | Leu | Leu | Gin | Ser | Met | Ala | Trp | Glu |
| 225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
| Thr | Pro | Ala | Pro | Thr | Ser |
245 <210> 510 <211> 353 <212> PRT
| <213> Chlamydia pneumoniae | |||||||||||||||
| <400> 510 | |||||||||||||||
| Met | Asn | Lys | Arg | Gin | Lys | Asp | Lys | Leu | Lys | Ile | Cys | Val | Ile | Ile | Ser |
| 1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
| Thr | Leu | Ile | Leu | Val | Gly | Ile | Phe | Ala | Arg | Ala | Pro | Arg | Gly | Asp | Thr |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Phe | Lys | Thr | Phe | Leu | Lys | Ser | Glu | Glu | Ala | Ile | Ile | Tyr | Ser | Asn | Gin |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Cys | Asn | Glu | Asp | Met | Arg | Lys | Ile | Leu | Cys | Asp | Ala | Ile | Glu | His | Ala |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Asp | Glu | Glu | Ile | Phe | Leu | Arg | Ile | Tyr | Asn | Leu | Ser | Glu | Pro | Lys | Ile |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Gin | Gin | Ser | Leu | Thr | Arg | Gin | Ala | Gin | Tkla | Lys | Asn | Lys | Val | Thr | Ile |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Tyr | Tyr | Gin | Lys | Phe | Lys | Ile | Pro | Gin | Ile | Leu | Lys | Gin | Ala | Ser | Asn |
100 105 HO
999 9
467
| Val | Thr | Leu Val 115 | Glu | Gin | Pro | Pro 120 | Ala | Gly Arg | Lys | Leu 125 | Met | His | Gin | ||
| Lys | Ala | Leu | Ser | Ile | Asp | Lys | Lys | Asp | Ala | Trp | Leu | Gly | Ser | Ala | Asn |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Tyr | Thr | Asn | Leu | Ser | Leu | Arg | Leu | Asp | Asn | Asn | Leu | Ile | Leu | Gly | Met |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| His | Ser | Ser | Glu | Leu | Cys | Asp | Leu | Ile | Ile | Thr | Asn | Thr | . Ser | Gly | Asp |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Phe | Ser | Ile | Lys | Asp | Gin | Thr | Gly | Lys | Tyr | Phe | Val | Leu | Pro | Gin | Asp |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Arg | Lys | Ile | Ala | Ile | Gin | Ala | Val | Leu | Glu | Lyš | Ile | Gin | Thr | Ala | Gin |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Lys | Thr | Ile | Gin | Val | Ala | Met | Phe | Ala | Leu | Thr | His | Ser | Glu | Ile | Ile |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Gin | Ala | Leu | His | Gin | Ala | Lys | Gin | Arg | Gly | Ile | His | Val | Asp | Ile | Ile |
| 225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
| Ile | Asp | Arg | Ser | His | Ser | Lys | Leu | Thr | Phe | Lys | Gin | Leu | Arg | Gin | Leu |
| 245 | 250 | 255 | |||||||||||||
| Asn | Ile | Asn | Lys | Asp | Phe | Val | Ser | Ile | Asn | Thr | Ala | Pro | Cys | Thr | Leu |
| 260 | 265 | 270 | |||||||||||||
| His | His | Lys | Phe | Ala | Val | Ile | Asp | Asn | Lys | Thr | Leu | Leu | Ala | Gly | Ser |
| 275 | 280 | 285 | |||||||||||||
| Ile | Asn | Trp | Ser | Lys | Gly | Arg | Phe | Ser | Leu | Asn | Asp | Glu | Ser | Leu | Ile |
| 290 | 295 | 300 | |||||||||||||
| Ile | Leu | Glu | Asn | Leu | Thr | Lys | Gin | Gin | Asn | Gin | Lys | Leu | Arg | Met | Ile |
| 305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
| Trp | Lys | Asp | Leu | Ala | Lys | His | Ser | Glu | His | Pro' | Thr | Val | Asp | Asp | Glu |
| 325 | 330 | 335 | |||||||||||||
| Glu | Lys | Glu | Ile | Ile | Glu | Lys | Ser | Leu | Pro | Val | Glu | Glu | Gin | Glu | Ala |
| 34 0 | 345 | 350 | |||||||||||||
| Ala |
| <210> 511 <211> 186 <212> PRT <213> Chlamydia pneumoniae | |||||||||||||||
| <400> 511 | |||||||||||||||
| Met | Ala | Leu | Asn | Phe | Lys | Ile | Asn | Arg | Gin | Ile | Arg | Ala | Pro | Lys | Val |
| 1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
| Arg | Leu | Ile | Gly | Ser | Ala | Gly | Glu | Gin | Leu | Gly | Ile | Leu | Ala | Ile | Lys |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Asp | Ala | Leu | Asp | Leu | Ala | Arg | Glu | Ala | Gly | Leu | Asp | Leu | Val | Glu | Val |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Ala | Ser | Asn | Ser | Glu | Pro | Pro | Val | Cys | Lys | Ile | Met | Asp | Tyr | Gly | Lys |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Tyr | Arg | Tyr | Gly | Leu | Thr | Lys | Lys | Glu | Lys | Asp | Ser | Lys | Lys | Ala | Gin |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| His | Gin | Val | Arg | Ile | Lys | Glu | Val | Lys | Leu | Lys | Pro | Asn | Ile | Asp | Glu |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Asn | Asp | Phe | Ser | Thr | Lys | Leu | Lys | Gin | Ala | Arg | Thr | Phe. | Val | Glu | Lys |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Gly | Asn | Lys | Val | Lys | Ile | Thr | Cys | Met | Phe | Arg | Gly | Arg | Glu | Leu | Ala |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Tyr | Pro | Glu | His | Gly | Phe | Lys | Val | Val | Gin | Lys | Met | Ser | Gin | Gly | Leu |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Glu | Asp | Ile | Gly | Phe | Val | Glu | Ala | Glu | Pro | Lys | Leu | Ala | Gly | Arg | Ser |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Leu | Ile | Cys | Val | Val | Ala | Pro | Gly | Thr | Val | Lys | Thr | Lys | Lys | Lys | Gin |
165 170 175 ·· ·«·· * · · ··'··· ···
«·· ·
468
Glu Lys Ser His Ala Gin Asp Glu Asn Gin 180 185 <210> 512 <211> 276 <212> PRT <213> Chlamydia pneumoniae <220>
<221> VARIANT <222> 269,270,271,272,274,275,276 <2 2 3> Xaa = jakáko liv aminokyselina <400> 512
| Met | Gly | Asn | Ser | Gly | Phe | Tyr | Leu | Gin | Asp | Thr | Gin | Asn | Thr | Ile· | Phe |
| 1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
| Ala | Asp | Asn | Ile | Arg | Leu | Gly | Gin | Met | Thr | Thr | Val | Leu | Lys | Lys | Asp |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Glu | Val | Ile | Ile | Gly | Thr | Asp | Thr | Thr. | Pro | Thr | Val | Thr | Lys | Phe | Ser |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Gly | Asp | Lys | Gly | Ile | Val | Ile | Thr | Thr | Asp | Ser | Thr | Ile | Thr | Pro | Ser |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Ser | Thr | Thr | Phe | Ser | Leu | Asp | Met | Glu | Ala | Val | Ile | Lys | Glu | Val | Thr |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Asp | Lys | Ile | Leu | Thr | Gin | Ile | Glu | Asp | Glu | Leu | Val | Lys | Asp | Ile | Ile |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Lys | Asn | Ile | Thr | Gin | Ser | Leu | Ile | Glu | Glu | Val | Ile | Lys | Lys | Ile | His |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Ile | Asp | Pro | Ser | Phe | Ser | Tyr | Ser | Arg | Ala | Phe | Lys | Asp | Val | Asn | Ile |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Thr | Asn | Lys | Ile | Gin | Cys | Asn | Gly | Leu | Phe | Thr | Lys | Glu | Asn | Ile | Gly |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Asn | Leu | Asp | Gly | Gly | Thr | Glu | Ile | Ala | Ser | Ser | Ser- | Val | Thr | Pro | Asp |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Asn | Ala | Asn | Ser | Met | Phe | Leu | Ile | Cys | Ala | Asp | Ile | Ile | Ala | Thr | Arg |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Met | Glu | Gly | Thr | Val | Ala | Leu | Ala | Leu | Val | Lys | Glu | Gly | Asp | Leu | Ser |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Pro | Cys | Ser | Ile | Ser | Tyr | Gly | Tyr | Ser | Ala | Gly | Tyr | Pro | Asn | Ile | Ile |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Ser | Leu | Arg | Ala | Thr | Val | Gly | Asn | Lys | Thr | Thr | Ala | Pro | Val | Lys | Phe |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Ser | Leu | Arg | Ala | Gly | Gly | Met | Asp | Ser | Gly | Val | Val | Trp | Val | Asn | Ala |
| 225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
| Met | Pro | Asn | Gly | Glu | Lys | Ile | Leu | Gly | Val | Asp | Ala | Val | Ser | Lys | Ile |
| 245 | 250 | 255 | |||||||||||||
| Thr | Ile | Leu | Glu | Val | Lys | Pro | Gin | Thr | Asn | Gly | Thr | Xaa | Xaa | Xaa | Xaa |
| 260 | 265 | 270 | |||||||||||||
| Phe | Xaa | Xaa | Xaa | ||||||||||||
| 275 |
<21O> 513 <211> 1044 <212> PRT <213> Chlamydia pneumoniae <400> 513
| Met 1 | Val | Glu | Val | Glu 5 | Glu | Lys | His | Tyr | Thr 10 | Ile | Val | Lys | Arg | Asn 15 | Gly |
| Met | Phe | Val | Pro 20 | Phe | Asn | Gin | Asp | Arg 25 | Ile | Phe | Gin | Ala | Leu 30 | Glu | Ala |
:-4 69
| Ala | Phe | Arg 35 | Asp | Thr | Arg | Ser |
| Asp | Leu 50 | Glu | Glu | Ser | Ile | Ala 55 |
| Val 65 | Leu | Ala | Lys | Ile | Ser 70 | Glu |
| Gin | Asp | Leu | Val | Glu 85 | Ser | Gin |
| Ala | Arg | Asp | Tyr 100 | Ile | Val | Tyr |
| Asn | Ser | Ser 115 | Ser | Ile | Ile | Ala |
| Lys | Phe 130 | Asn | Pro | Met | Lys | Ile 135 |
| Ala 145 | Thr | Leu | Gin | Ile | Asn 150 | Gly |
| Ile | Asn | Asp | Leu | Thr 165 | Leu | Arg |
| Gly | Glu | Glu | Ala 180 | Ile | Asn | Leu |
| Gin | Leu | Met 195 | Val | Ala | Gly | Tyr |
| Tyr | Arg 210 | Glu | Ala | Arg | Ala | Arg 215 |
| Gin 225 | Glu | Glu | Phe | Val | Pro 230 | Gin |
| Asp | Gly | Thr | Thr | Tyr 245 | Leu | Leu |
| Ser | Trp | Ala | Cys 260 | Lys | Arg | Phe |
| Tkla | Asp | Met 275 | Ala | Phe | Met | Asn |
| Val | Thr 290 | Thr | Ala | Cys | Ile | Met 295 |
| Pro 305 | Asp | Tyr | Ala | Phe | Ile 310 | Ala |
| Glu | Glu | Thr | Leu | Gly 325 | Cys | Ser |
| His | Lys | Lys | His 340 | Phe | Lys | Glu |
| Leu | Asn | Pro 355 | Gin | Leu | Lys | Asp |
| Leu | Asp 370 | Leu | Ser | Arg | Asp | Gin 375 |
| Leu 385 | Tyr | Asp | Arg | Tyr | Phe 390 | Asn |
| Ala | Gin | Ile | Phe | Trp 405 | Met | Arg |
| Gly | Glu | Gin | Lys 420 | Asn | Phe | Trp |
| Thr | Phe | Arg 435 | Tyr | Thr | Pro | Ala |
| Arg | His 450 | Ser | Gin | Leu | Ser | Ser 455 |
| Leu 4 65 | Ser | His | Ile | Tyr | Lys 4.70 | Val |
| Trp | Ala | Gly | Gly | Ile 485 | Gly | Asn |
| Ala | Val | Ile | Lys 500 | Gly | Thr | Asn |
| Ile | Lys | Val | Ala | Asn & | Asp | Thr |
| Leu 40 | Glu | Thr | Ser | Ser | Pro 45 | Leu | Pro | Lys |
| Gin | Ile | Thr | His | Lys 60 | Val | Val | Lys | Glu |
| Gly | Gin | Val | Val 75 | Thr | Val | Glu | Arg | Ile 80 |
| Leu | Tyr | Ile 90 | Ser | Gly | Leu | Gin | Asp 95 | Val |
| Arg | Asp 105 | Gin | Arg | Lys | Ala | Glu 110 | Arg | Gly |
| Ile 120 | Ile | Arg | Arg | Asp | Gly 125 | Gly | Ser | Ala |
| Ser | Ala | Ala | Leu | Glu 140 | Lys | Ala | Phe | Arg |
| Met | Thr | Pro | Pro 155 | Ala | Thr | Leu | Ser | Glu 160 |
| Ile | Val | Glu 170 | Asp | Val | Leu. | Ser | Leu 175 | His |
| Glu | Glu 185 | Ile | Gin | Asp | Ile | Val 190 | Glu | Lys |
| Tyr 200 | Asp | Val | Ala | Lys | Asn 205 | Tyr | Ile | Leu |
| Ala | Arg | Ala. | Asn | Lys 220 | Asp | Gin | Asp | Gly |
| Glu | Glu | Thr | Tyr 235 | Val | val | Gin | Lys | Glu 240 |
| Arg | Lys | Thr 250 | Asp | Leu | Glu | Lys | Arg 255 | Phe |
| Pro | Lys 265 | Thr | Thr | Asp | Ser | Gin 270 | Leu | Leu |
| Leu 280 | Tyr | Ser | Gly | Ile | Lys 285 | Glu | Asp | Glu |
| Ala | Ala | Arg | Ala | Asn 300 | Ile | Glu | Arg | Glu |
| Ala | Glu | Leu | Leu 315 | Thr | Ser | Ser | Leu | Tyr 320 |
| Ser | Gin | Asp 330 | Pro | Asn | Leu | Ser | Glu 335 | Ile |
| Tyr | Ile 345 | Leu | Asn | Gly | Glu | Glu 350 | Tyr | Arg |
| Tyr 360 | Asp | Leu | Asp | Ala | Leu 365 | Ser | Glu | Val |
| Gin | Phe | Ser | Tyr | Met 380 | Gly | Val | Gin | Asn |
| Leu | His | Glu | Gly Arg 395 | Arg | Leu | Glu | Thr 400 | |
| Val | Ser | Met 410 | Gly | Leu | Ala | Leu | Asn 415 | Glu |
| Ala | Ile 425 | Thr | Phe | Tyr | Asn | Leu 430 | Leu | Ser |
| Thr 440 | Pro | Thr | Leu | Phe | Asn 445 | Ser | Gly | Met |
| Cys | Tyr | Leu | Ser | Thr 4 60 | Val | Lys | Asp | Asp |
| Ile | Ser | Asp | Asn 475 | Ala | Leu | Leu | Ser | Lys 480 |
| Asp | Trp | Thr 490 | Asp | Val | Arg | Ala | Thr 4 95 | Gly |
| Gly | Lys 505 | Ser | Gin | Gly | Val | Ile 510 | Pro | Phe |
| Ala | Ile | Ala | Val | Asn | Gin | Gly | Gly | Lys |
♦ ·· · •47 0
| 515 | 520 | 525 | |||||||||||||
| Arg | Lys | Gly | Ala | Met | Cys | Val | Tyr | Leu | Glu | Asn | Trp | His | Leu | Asp | Tyr |
| 530 | 535 | 540 | |||||||||||||
| Glu | Asp | Phe | Leu | Glu | Leu | Arg | Lys | Asn | Thr | Gly | Asp | Glu | Arg | Arg | Arg |
| 545 | 550 | 555 | 560 | ||||||||||||
| Thr | His | Asp | Ile | Asn | Thr | Ala | Ser | Trp | Ile | Pro | Asp | Leu | Phe | Phe | Lys |
| 565 | 570 | 575 | |||||||||||||
| Arg | Leu | Glu | Lys | Lys | Gly | Met | Trp | Thr | Leu | Phe | Ser | Pro | Asp | Asp | Val |
| 580 | 585 | 590 | |||||||||||||
| Pro | Gly | Leu | His | Glu | Ala | Tyr | Gly | Leu | Glu | Phe | Glu | Lys | Leu | Tyr | Glu |
| 595 | 600 | 605 | |||||||||||||
| Glu | Tyr | Glu | Arg | Lys | Val | Glu | Ser | Gly | Glu | Ile | Arg | Leu | Tyr | Lys | Lys |
| 610 | 615 | 620 | |||||||||||||
| Val | Glu | Ala | Glu | Val | Leu | Trp | Arg | Lys | Met | Leu | Ser | Met | Leu | Tyr | Glu |
| 625 | 630 | 635 | 640 | ||||||||||||
| Thr | Gly | His | Pro | Trp | Ile | Thr | Phe | Lys | Asp | Pro | Ser | Asn | Ile | Arg | Ser |
| 645 | 650 | 655 | |||||||||||||
| Asn | Gin | Asp | His | Val | Gly | Val | Val | Arg | Cys | Ser | Asn | Leu | Cys | Thr | Glu |
| 660 | 665 | 670 | |||||||||||||
| Ile | Leu | Leu | Asn | Cys | Ser | Glu | Ser | Glu | Thr | Ala | Val | Cys | Asn | Leu | Gly |
| 675 | 680 | 685 | |||||||||||||
| Ser | Ile | Asn | Leu | Val | Glu | His | Ile | Arg | Asn | Asp | Lys | Leu | Asp | Glu | Glu |
| 690 | 695 | 700 | |||||||||||||
| Lys | Leu | Lys | Glu | Thr | Ile | Ser | Ile | Ala | Ile | Arg | Ile | Leu | Asp | Asn | Val |
| 705 | 710 | 715 | 720 | ||||||||||||
| Ile | Asp | Leu | Asn | Phe | Tyr | Pro | Thr | Pro | Glu | Ala | Lys | Gin | Ala | Asn | Leu |
| Thr | 725 | 730 | 735 | ||||||||||||
| His | Arg | Ala | Val | Gly | Leu | Gly | Val | Met | Gly | Phe | Gin | Asp | Val | Leu | |
| 740 | 745 | 750 | |||||||||||||
| Tyr | Glu | Leu | Asn | Ile | Ser | Tyr | Ala | Ser | Gin | Glu | Ala | Val | Glu | Phe | Ser |
| 755 | 760 | 7 65 | |||||||||||||
| Asp | Glu | Cys | Ser | Glu | Ile | Ile | Ala | Tyr | Tyr | Ala | Ile | Leu | Ala | Ser | Ser |
| 770 | 775 | 780 | |||||||||||||
| Leu | Leu | Ala | Lys | Glu | Arg | Gly | Thr | Tyr | Ala | Ser | Tyr | Ser | Gly | Ser | Lys |
| 785 | 790 | 795 | 800 | ||||||||||||
| Trp | Asp | Arg | Gly | Tyr | Leu | Pro | Leu | Asp | Thr | Ile | Glu | Leu | Leu | Lys | Glu |
| 805 | 810 | 815 | |||||||||||||
| Thr | Arg | Gly | Glu | His | Asn | Val | Leu | Val | Asp | Thr | Ser | Ser | Lys | Lys | Asp |
| 820 | 825 | 830 | |||||||||||||
| Trp | Thr | Pro | Val | Arg | Asp | Thr | Ile | Gin | Lys | Tyr | Gly | Met | Arg | Asn | Ser |
| 835 | 840 | 845 | |||||||||||||
| Gin | Val | Met | Ala | Ile | Ala | Pro | Thr | Ala | Thr | Ile | Ser | Asn | Ile | Ile | Gly |
| 850 | 855 | 860 | |||||||||||||
| Val | Thr | Gin | Ser | Ile | Glu | Pro | Met | Tyr | Lys | His | Leu | Phe | Val | Lys | Ser |
| 865 | 870 | 875 | 880 | ||||||||||||
| Asn | Leu | Ser | Gly | Glu | Phe | Thr | Ile | Pro | Asn | Thr | Tyr | Leu | Ile | Lys | Lys |
| 885 | 890 | 895 | |||||||||||||
| Leu | Lys | Glu | Leu | Gly | Leu | Trp | Asp | Ala | Glu | Met | Leu | Asp | Asp | Leu | Lys |
| 900 | 905 | 910 | |||||||||||||
| Tyr | Phe | Asp | Gly | Ser | Leu | Leu | Glu | Ile | Glu | Arg | Ile | Pro | Asn | His | Leu |
| 915 | 920 | 925 | |||||||||||||
| Lys | Lys | Leu | Phe | Leu | Thr | Ala | Phe | Glu | Ile | Glu | Pro | Glu | Trp | Ile | Ile |
| 930 | 935 | 940 | |||||||||||||
| Glu | Cys | Thr | Ser | Arg | Arg | Gin | Lys | Trp | Ile | Asp | Met | Gly | Val | Ser | Leu |
| 945 | 950 | 955 | 960 | ||||||||||||
| Asn | Leu | Tyr | Leu | Ala | Glu | Pro | Asp | Gly | Lys | Lys | Leu | Ser | Asn | Met | Tyr |
| 965 | 970 | 975 | |||||||||||||
| Leu | Thr | Ala | Trp | Lys | Lys | Gly | Leu | Lys | Thr | Thr | Tyr | Tyr | Leu | Arg | Ser |
| 980 | 985 | 990 | |||||||||||||
| Gin | Ala | Ala | Thr | Ser | Val | Glu | Lys | Ser | Phe | Ile | Asp | Ile | Asn | Lys | Arg |
| 995 | 1000 | 1005 |
• 0 ····
·· «!)·« * « · < 0Φ« .· : · 0000··« »0 0«
0 0 · ···
0 0 ·
0 0 0 • 0 00
471
| Gly | Ile Gin | Pro | Arg | Trp | Met Lys | Asn | Lys | Ser Ala Ser | Thr | Ser | Ile |
| 1010 | 1015 | 1020 | |||||||||
| Val | Val Glu | Arg | Lys | Thr | Thr Pro | Val | Cys | Ser Met Glu | Glu | Gly | Cys |
| 1025 | 1030 | 1035 | 1040 |
Glu Ser Cys Gin
| <210> 514 <211> 346 <212> PRT <213> Chlamydia | pneumoniae | ||||||||||||||
| <400> 514 | |||||||||||||||
| Met | Glu | Ala | Asp | Ile | Leu | Asp | Gly | Lys | Leu | Lys | Arg | Val | Glu | Val | Ser |
| 1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
| Lys | Lys | Gly | Leu | Val | Asn | Cys | Asn | Gin | Vál | Asp | Val | Asn | Gin | Leu | Val |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Pro | Ile | Lys | Tyr | Lys | Trp | Ala | Trp | Glu | His | Tyr | Leu | Asn | Gly | Cys | Ala |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Asn | Asn | Trp | Leu | Pro | Thr | Glu | Val | Pro | Met | Ala | Arg | Asp | Ile | Glu | Leu |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Trp | Lys | Ser | Asp | Glu | Leu | Ser | Glu | Asp | Glu | Arg | Arg | Val | Ile | Leu | Leu |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Asn | Leu | Gly | Phe | Phe | Ser | Thr | Ala | Glu | Ser | Leu | Val | Gly | Asn | Asn | Ile |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Val | Leu | Ala | Ile | Phe | Lys | His | Ile | Thr | Asn | Pro | Glu | Ala | Arg | Gin | Tyr |
| 100 | 105 | HO | |||||||||||||
| Leu | Leu | Arg | Gin | Ala | Phe | Glu | Glu | Ala | Val | His | Thr | His | Thr | Phe | Leu |
| 115 | 120 | .125 | |||||||||||||
| Tyr | Ile | Cys | .Glu | Ser | Leu | Gly | Leu | Asp | Glu | Gly | Glu | Val | Phe | Asn | Ala |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Tyr | Asn | Glu | Arg | Ala | Ser | Ile | Arg | Ala | Lys | Asp | Asp | Phe | Gin | Met | Thr |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Leu | Thr | Val | Asp | Val | Leu | Asp | Pro | Asn | Phe | Ser | Val | Gin | Ser | Ser | Glu |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Gly | Leu | Gly | Gin | Phe | Ile | Lys | Asn | Leu | Val | Gly | Tyr | Tyr | Ile | Ile | Met |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Glu | Gly | Ile | Phe | Phe | Tyr | Ser | Gly | Phe | Val | Met | Ile | Leu | Ser | Phe | His |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Arg | Gin | Asn | Lys | Met | Thr | Gly | Ile | Gly | Glu | Gin | Tyr | Gin | Tyr | Ile | Leu |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Arg | Asp | Glu | Thr | Ile | His | Leu | Asn | Phe | Gly | Ile | Asp | Leu | Ile | Asn | Gly |
| 225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
| Ile | Lys | Glu | Glu | Asn | Pro | Glu | Val | Trp | Thr | Thr | Glu | Leu | Gin | Glu | Glu |
| 245 | 250 | 255 | |||||||||||||
| Ile | Val | Ala | Leu | Ile | Glu | Lys | Ala | Val | Glu | Leu | Glu | Ile | Glu | Tyr | Ala |
| 260 | 265 | 270 | |||||||||||||
| Lys | Asp | Cys | Leu | Pro | Arg | Gly | Ile | Leu | Gly | Leu | Arg | Ser | Ser | Met | Phe |
| 275 | 280 | 285 | |||||||||||||
| Ile | Asp | Tyr | Val | Arg | His | Ile | Ala | Asp | Arg Arg | Leu | Glu | Arg | Ile | Gly | |
| 290 | 295 | 300 | |||||||||||||
| Leu | Lys | Pro | Ile. | Tyr | His | Ser | Arg | Asn | Pro | Phe | Pro | Trp | Met | Ser | Glu |
| 305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
| Thr | Met | Asp | Leu | Asn | Lys | Glu | Lys | Asn | Phe | Phe | Glu | Thr | Arg | Val | Thr |
| 325 | 330 | 335 | |||||||||||||
| Glu | Tyr | Gin | Thr | Ala | Gly | Asn | Leu | Ser | Trp | ||||||
| 340 | 345 |
<210> 515 <211> 327 <212> PRT
472 ·« »·β· • » · • ··· .· : · ··«« ·«· ·<3 ·«· • · • >
• Φ ·· ***· • · · • · · • ♦ · • · · · ·» ΦΟ <213> Chlamydia pneumoniae <400> 515
| Met | Asp Ala | Lys | Met | Gly | Tyr | Ile | Phe | Lys Val Met Arg | Trp | Ile | Phe | ||||
| 1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
| Cys | Phe | Val | Ala | Cys | Gly | Ile | Thr | Phe | Gly | Cys | Thr | Asn | Ser | Gly | Phe |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Gin | Asn | Ala | Asn | Ser | Arg | Pro | Cys | Ile | Leu | Ser | Met | Asn | Arg | Met | Ile |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| His | Asp | Cys | Val | Glu | Arg | Val | Val | Gly | Asn | Arg | Leu | Ala | Thr | Ala | Val |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Leu | Ile | Lys | Gly | Ser | Leu | Asp | Pro | His' | Ala | Tyr | Glu | Met | Val | Lys | Gly |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Asp | Lys | Asp | Lys | Ile | Ala | Gly | Ser | Ala | Val | Ile | Phe | Cys | Asn | Gly | Leu |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Gly | Leu | Glu | His | Thr | Leu | Ser | Leu | Arg | Lys | His | Leu | Glu | Asn | Asn | Pro |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Asn | Ser | Val | Lys | Leu | Gly | Glu | Arg | Leu | Ile | Ala | Arg | Gly | Ala | Phe | Val |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Pro | Leu | Glu | Glu | Asp | Gly | Ile | Cys | Asp | Pro | His | Ile | Trp | Met | Asp | Leu |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Ser | Ile | Trp | Lys | Glu | Ala | Val | Ile | Glu | Ile | Thr | Glu | Val | Leu | Ile | Glu |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Lys | Phe | Pro | Glu | Trp | Ser | Ala | Glu | Phe | Lys | Ala | Asn | Ser | Glu | Glu | Leu |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Val | Cys | GlU | Met | Ser | Ile | Leu | Asp | Ser | Trp | Ala | Lys | Gin | Cys | Leu | Ser |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Thr | Ile | Pro | Glu | Asn | Leu | Arg | Tyr | Leu | Val | Ser | Gly | His | Asn | Ala | Phe |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Ser | Tyr | Phe | Thr | Arg | Arg | Tyr | Leu | Ala | Thr | Pro | Glu | Glu | Val | Ala | Ser |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Gly | Ala | Trp | Arg | Ser | Arg | Cys | Ile | Ser | Pro | Glu | Gly | Leu | Ser | Pro | Glu |
| 225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
| Ala | Gin | Ile | Ser | Val | Arg | Asp | Ile | Met | Ala | Val | Val | Asp | Tyr | Ile | Asn |
| 245 | 250 | 255 | |||||||||||||
| Glu | His | Asp | Val | Ser | Val | Val | Phe | Pro | Glu | Asp | Thr | Leu | Asn | Gin | Asp |
| 260 | 265 | 270 | |||||||||||||
| Ala | Leu | Lys | Lys | Ile | Val | Ser | Ser | Leu | Lys | Lys | Ser | His | Leu | Val | Arg |
| 275 | 280 | 285 | |||||||||||||
| Leu | Ala | Gin | Lys | Pro | Leu | Tyr | Ser | Asp | Asn | Val | Asp | Asp | Asn | Tyr | Phe |
| 290 | 295 | 300 | |||||||||||||
| Ser | Thr | Phe | Lys | His | Asn | Val | Cys | Leu | Ile | Thr | Glu | Glu | Leu | Gly | Gly |
| 305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
| Val | Ala | Leu | Glu | Cys | Gin | Árg | |||||||||
| 325 |
<210> 516 <211> 101 <212> PRT <213> Chlamydia pneumoniae <400> 516
| Met | Asn | Asn | Arg | Gin | Asn | Thr | Asn | Asp | Phe | Ile | Arg | Ile | Val | Lys | Asp |
| 1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
| Val | Glu | Lys | Ala | Phe | Pro | Glu | Leu | Asp | Ile | Lys | Val | Lys | Ile | Asp | Lys |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Glu | Lys | Val | Thr | Phe | Leu | Thr | Ser | Pro | Thr | Glu | Leu | Tyr | His | Lys | Ser |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Ile | Ser | Val | Ile | Leu | Asn | Leu | Leu | Asn | Ser | Ile | Glu | Ser | Ser | Leu | Asp |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Leu | Phe | Pro | Asp | Ser | Pro | Val | Val | Glu | Glu | Leú | Glu | Lys | Asn | Asn | Leu |
··· • · · • ··· • · • · ···· ··· • · • ·ι • · ·· ··
473
70 75 80
Lys Leu Lys Lys Ala Leu Ue Met Leu Ue Leu Ser Arg Lys Asp Met
90 95
Phe Ser Lys Thr Glu
100 <210> 517 <211> 261 <212> PRT <213> Chlamydia pneumoniae <400> 517
| Met | Lys | Thr | Ue | Ala | Phe | Cys | Ser | Phe | Lys | Gly | Gly | Thr | Gly | Lys | Thr |
| 1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
| Thr | Leu | Ser | Leu | Asn | Val | Gly | Cys | Asn | Leu | Ala | Gin | Tyr | Ser | Asn | Lys |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Lys | Val | Leu | Leu | Val | Asp | Leu | Asp | Pro | Gin | Ala | Asn | Leu | Thr | Thr | Gly |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Leu | Gly | Val | Gin | Ser | Cys | Tyr | Glu | Ser | Asn | Leu | Asn | Asp | Ue | Phe | Arg |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Ser | Ser | Gly | Asn | Val | Arg | Asp | Ue | Ue | Gin | Asp | Thr | Lys | Ue | Glu | Asn |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Leu | His | Ue | Val | Pro | Ser | Ser | Ue | Leu | Ue | Glu | Glu | Phe | Arg | Glu | Phe |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Asn | Arg | Asn | Ser | Val | Leu | Asp | Thr | Ser | His | Leu | Arg | Ser | Ser | Leu | Gin |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Leu | Ue | Glu | Ser | Asn | Tyr | Asp | Leu | Cys | Ue | Leu | Asp | Thr | Pro | Pro | Ser |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Leu | Gly | Thr | Leu | Thr | Glu | Glu | Ala | Phe | Ue | Ala | Ser | Asp | His | Leu | Ue |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Val | cys | Leu | Thr | Pro | Glu | Pro | Phe | Ser | Ile | Leu | Gly | Leu | Gin | Lys | Ue |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Lys | Glu | Phe | Cys | Ser | Val | Leu | Pro | Lys | Lys | Lys | Asp | Leu | Ser | Val | Leu |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Gly | Ue | Val | Phe | Ser | Phe | Trp | Asp | Gly | Arg | Asn | Ser | Thr | Asn | Ser | Thr |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Tyr | Leu | Asn | Ue | Ile | Glu | Ser | Ue | Tyr | Glu | Gly | Lys | Val | Leu | Ser | Ser |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Lys | Val | Arg | Arg | Asp | Ue | Thr | Leu | Ser | Arg | Ser | Leu | Leu | Lys | Glu | Thr |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Ser | Ue | Ala | Asn | Ala | Tyr | Pro | Asn | Ser | Arg | Ala | Ser | His | Asp | Ile | Leu |
| 225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
| Arg | Leu | Thr | Lys | Glu | Ue | Glu | Asp | Lys | Leu | Phe | Asn | Lys | Glu | Met | Ser |
| 245 | 250 | 255 | |||||||||||||
| Ala | Gin | Glu | Val | Leu | |||||||||||
| 260 |
<210> 518 <211> 526 <212> PRT <213> Chlamydia pneumoniae <400> 518
| Met | Asn | Val | Leu | Lys | Tyr | Thr | Lys | His | Ser | Pro | Ser | Ala | His | Tkla | Trp |
| 1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
| Lys | Leu | Ue | Gly | Thr | Ser | Pro | Lys | His | Gly | Ile | Tyr | Leu | Pro | Leu | Phe |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Ser | Ue | His | Thr | Lys | Asn | Ser | Cys | Gly | Ile | Gly | Glu | Phe | Leu | Asp | Leu |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Ile | Pro | Leu | Ue | Ser | Trp | CyS | Gin | Lys | Gin | Gly | Phe | Ser | Val | Ue | Gin |
| 50 | 55 | 60 |
474
| Leu | Leu | Pro | Leu | Asn | Asp | Thr | Gly | Glu | Asp | Thr | Ser | Pro | Tyr | Asn | Ser |
| 65 | 70 | 75 | 8.0 | ||||||||||||
| Ile | Ser | Ser | Val | Ala | Leu | Asn | Pro | Leu | Phe | Leu | Ser | Leu | Ser | Ser | Leu |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Pro | Asn | Ile | Asp | Thr | Ile | Pro | Glu | Val | Ala | Lys | Lys | Leu | Gin | Asp | Met |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| His | Glu | Leu | Cys | Ser | Thr | Pro | Ser | Val | Ser | Tyr | Thr | Gin | Val | Lys | Glu |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Lys | Lys | Trp | Ala | Phe | Leu | Arg | Glu | Tyr | Tyr | Gin | Lys | Cys | Cys | Lys | Ser |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Ser | Leu | Glu | Gly | Asn | Ser | Asn | Phe | Ser | Glu | Phe | Leu | Glu | Ser | Glu | Arg |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Tyr | Trp | Leu | Tyr | Pro | Tyr | Gly | Thr | Phe | Arg | Ala | Ile | Lys | His | His | Met |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| His | Gly | Glu | Pro | Ile | Asn· | Asn | Trp | Pro | Lys | Ser | Leu | Thr | Asp | Gin | Glu |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Asn | Phe | Pro | Asp | Leu | Thr | Lys | Lys | Phe | His | Asp | Glu | Val | Leu | Phe | Phe |
| 195 | 2Ó0 | 205 | |||||||||||||
| Ser | Tyr | Leu | Gin | Phe | Leu | Cys | Tyr | Gin | Gin | Leu | Cys | Glu | Val | Lys | Ala |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Tyr | Ala | Asp | Gin | His | His | Val | Leu | Leu | Lys | Gly Asp | Leu | Pro | Ile | Leu | |
| 225 | 230 | '235 | 240 | ||||||||||||
| Ile | Ser | Lys | Asp | Ser | Cys | Asp | Val | Trp | Tyr | Phe | Arg | Asp | Tyr | Phe | Ser |
| 245 | 250 | 255 | |||||||||||||
| Ser | Ser | Arg | Ser | Val | Gly | Ala | Pro | Pro | Asp | Leu | Tyr | Asn | Ser | Glu | Gly |
| 260 | 265 | 270 | |||||||||||||
| Gin | Asn | Trp | His | Leu | Pro | Ile | Tyr | Asn | Phe | Ser | Gin | Leu | Ala | Lys | Asp |
| 275 | 280 | 285 | |||||||||||||
| Asp | Tyr | Ile | Trp | Trp | Lys | Glu | Arg | Leu | Arg | Tyr | Ala | Gin | Asn | Phe | Tyr |
| 290 | 295 | 300 | |||||||||||||
| Ser | Val | Tyr | Arg | Leu | Asp | His | Ile | Ile | Gly | Phe | Phe | Arg | Leu | Trp | Ile |
| 305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
| Trp | Asp | Ser | Ser | Gly Arg | Gly | Arg | Phe | Ile | Pro | Asp | Asn | Pro | Lys | Asp | |
| 325 | 330 | 335 | |||||||||||||
| Tyr | Ile | Lys | Gin | Gly | Thr | Glu | Ile | Leu | Ser | Thr | Met | Leu | Gly | Ala | Ser |
| 340 | 345 | 350 | |||||||||||||
| Ser | Met | Leu | Pro | Ile | Gly | Glu | Asp | Leu | Gly | Ile | Ile | Pro | Gin | Asp | Val |
| 355 | 360 | 365 | |||||||||||||
| Lys | Thr | Thr | Leu | Thr | His | Leu | Gly | Ile | Cys | Gly | Thr | Arg | Ile | Pro | Arg |
| 370 | 375 | 380 | |||||||||||||
| Trp | Glu | Arg | Asn | Trp | Glu | Ser | Asp | Ser | Ala | Phe | Ile | Pro | Leu | Lys | Asp |
| 385 | 390 | 395 | 400 | ||||||||||||
| Tyr | Asn | Pro | Leu | Ser | Val | Thr | Thr | Leu | Ser | Thr | His | Asp | Ser | Asp | Thr |
| 405 | 410 | 415 | |||||||||||||
| Phe | Ala | Gin | Trp | Trp | Leu | Asn | Ser | Pro | Lys | Glu | Ala | Lys | Gin | Phe | Ala |
| 420 | 425 | 430 | |||||||||||||
| Lys | Phe | Leu | His | Leu | Pro | Phe | Gin | Lys | Thr | Leu | Thr | Thr | Glu | Thr | Gin |
| 435 | 440 | 445 | |||||||||||||
| Ile | Asp | Ile | Leu | Lys | Leu | Ser | His | Glu | Ser | Ala | Ser | Ile | Phe | His | Ile |
| 450 | 455 | 460 | |||||||||||||
| Asn | Leu | Phe | Asn | Asp | Tyr | Leu | Ala | Leu | Cys | Pro | Asp | Leu | Val | Ser | Lys |
| 4 65 | 470 | 475 | 480 | ||||||||||||
| Asn | Leu | Gin | Arg | Glu | Arg | Ile | Asn | Thr | Pro | Gly | Thr | Ile | Ser | Lys | Lys |
| 485 | 490 | 495 | |||||||||||||
| Asn | Trp | Ser | Tyr | Arg | Val | Arg | Pro | Ser | Leu | Glu | Glu | Leu | Ala | Ile | His |
| 500 | 505 | 510 | |||||||||||||
| Lys | Lys | Phe | Asn | Gly | Tyr | Ile | Glu | Lys | Ile | Leu | Thr | Gly | Leu |
515 520 525 <210> 519 <211> 147 • · · · · ·
475 <212> PRT <213> Chlamydia pneumoniae <400> 519
| Met | Gin | Asn | Gin | Tyr | Glu | Gin | Leu | Leu | Glu | Ser | Leu. | Ala | Pro | Leu | Leu |
| 1 | 5’ | 10 | 15 | ||||||||||||
| Asn | Thr | Thr | Leu | Ala | Pro | Asp | Lys | Asn | Asn | Ser | Cys | Leu | Ile | Arg | Phe |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Ser | Asp | Thr | His | Val | Pro | Val | Gin | Ile | Glu | Glu | Asp | Gly | Asn | Ser | Gly |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Asp | Leu | Ala | Val | Ser | Thr | Leu | Leu | Gly | Thr | Leu | Pro | Glu | Asn | Val | Phe |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Arg | Glu | Arg | Ile | Phe | Lys | Ala | Ala | Leu | Ser | Val | Asn | Gly | Ser | Phe | Gin |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Ser | Ser | Ile | Lys | Gly | Ile | Leu | Gly | Tyr | Gly | Glu | Val | Thr | Gin | Gin | Leu |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Tyr | Leu | Ser | Asp | Ile | Leu | Ser | Met | Asn | Tyr | Leu | Asn | Gly | Glu | Lys | Leu |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Phe | Glu | Tyr | Leu | Lys | Leu | Phe | Ser | Leu | His | Ala | Lys | Ile | Trp | Met | Glu |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Ser | Leu | Arg | Thr | Gly | Asn | Leu | Pro | Asp | Leu | His | Val | Leu | Gly | Ile | Tyr |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Tyr | 'Val | Ala |
145 <210> 520 <211> 635 <212> PRT
| <213> Chlamydia pneumoniae | |||||||||||||||
| <400> 520 | |||||||||||||||
| Met | Ile | Pro | Phe | Thr | Lys | Thr | Ile | Gly | Phe | Arg | Leu | Trp | Leu | Ala | Cys |
| 1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
| Ala | Val | Ala | Ile | Ile | Ala | Pro | Leu. | Gly | Ile | Asn | Ile | Val | Trp | Leu | Asn |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Leu | Asp | Gin | Tyr | Arg | Thr | Ile | Val | Ser | Ala | Ile | Ser | Thr | Ala | Leu | Lys |
| 35 | 40 | 4'5 | |||||||||||||
| Glu | Asn | Ala | Ala | Phe | Lys | Ala, | Asn | Thr | Leu | Thr | Gin | Ile | Val | Pro | Leu |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Asn | Val | Asp | Val | Leu | Ser | Leu | Phe | Ser | Asp | Val | Leu | Asp | Leu | Asp | Ala |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Gly | Ile | Pro | Glu | Thr | Pro | Asn | Val | Leu | Leu | Ser Asn | Glu | Met | Gin | Lys | |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Val | Phe | Gin | Gly | Ile | Tyr | Asn | Glu | Ile | Ser | Leu | Ile | Lys | Val | Phe | Pro |
| Gly | 100 | 105 | 110 | ||||||||||||
| Asn | Asp | Lys | Ile | Val | Val | Ala | Ser | Ser | Ile | Pro | Glu | His | Leu | Gly | |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Glu | Asn | Tyr | Asn | His | Lys | Ile | Asp | Ile | Pro | Lys | Asn | Thr | Pro | Phe | Leu |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Ala | Ala | Leu | Lys | Gin | Ser | Pro | Lys | Asn | Gin | Glu | Val | Phe | Ser | Val | Met |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Gin | Ala | Asn | Val | Phe | Asp | Ala | Lys | Thr | Gin | Glu | Leu | Gin | Gly | Ile | Leu |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Tyr | Thr | Thr | Phe | Ser | Ala | Glu | Ser | Leu | Leu | Lys | Asp | Leu | Leu | Ile | Asn |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Lys | Gin | Ser | Tyr | Leu | Thr | Val | Lys | Thr | Ala | Ile | Leu | Ser | Lys | Tyr | Gly |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Val | Ile | Leu | Lys | Ala | Ser | Asp | Pro | Ala | Leu | His | Leu | His | Thr | Val | Tyr |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Pro Asp | Met | Thr | Lys | Glu | Lys | Phe | Cys | Gin | Val | Phe | Leu | Asn | Asp | Asp |
225 230 235' Í240 @005
SEED IP lAU CMflíP p£.íe ; * · : ”: ’ \ · ·* ***· « · · * ··; i, i ·!····· ·· ·· *· * ” - -s* /
Ux»' 4^, .476
| Pro | Cys | Pro | Ile | Asp 245 | Ser | Glu | Leu | Gly | Pro 250 | Leu | Thr | Leu | Ser | Pro 255 | Leu |
| Asp | Ile | Gly | Glu 260 | Asn | Phe | Tyr | Ser | Phe 265 | Lys | Ile | Lys | Asp | Thr 270 | Glu | Ile |
| Trp | Gly | Cys 275 | Ile | Glu | Asn | Val | Pro 280 | Ser | Ile | Asp | Ile | Ala 285 | Val | Leu | ser |
| Tyr | Ala 2S0 | Lys | Lys | Glu | Glu | Ser 295 | Phe | Ala | Pro | Leu | Trp 300 | Arg | Arg | Ais | Arg |
| Mot 305 | TyX | Thr | Ala | Tyr | Phe 310 | Phe | Cys | Ile | Leu | Leu 315 | Gly | Ser | Leu | Ile | Ala 320 |
| Phe | Ile | Val | Ala | Arg Arg 325 | Leu | Ser | Leu | Pro 330 | Ile | Arg | Lys | Leu | Ala 335 | Thr | |
| Ala | Met | Ile | Glu 340 | Ser | Arg | Lys | Asn | Lys 345 | Asn | Cys | Len | Tyr | Thr 350 | Asp | Asp |
| Ser- | Lati | Gly 355 | Phe | Glu | Ile | Asn | Arg 360 | Leu | Gly | His | Ile | Phe 3G5 | Asn | Ala | Met |
| val | Glu 370 | Asn | Leu | His | Lys | Gin 375 | Gin | His | Leu | Ala | Lys 3S0 | Thr | Asn | Pha | Glu |
| Mat 355 | Lys | Glu | Asn | Ala | 61n 390 | Asn | Ala | Leu | His | Leu Gly 395 | Glu | Gin | Ala | 31n 4 00 | |
| Gin | Arg | Leu | Leu | Pro 405 | Asn | Thr | Leu | Pro | Ser 410 | Tyr | Pro | His | Ile | Glu 415 | Leu |
| Ala | lys | Ala | Tvr 420 | Ile | Pro | Ala | Ile | Thr 425 | Val | Gly | Gly | Asp | Phe 430 | Phe | ASP |
| Val | Phe | Val 435 | val | Gly | Glu | Gly | Ser 440 | Lys | Ala | Arg | Leu | Phe 445 | Leu | Ile | Val |
| Ala | Asp 450 | Ala | Ser | Gly | Lys | Gly 4S5 | Val | Asn | Ala | Cys | Gly 460 | Tyr | Ser | Leu | Phe |
| Leu 465 | Lys | Asn | Met | Leu | Arg 470 | Thr | Phe | Leu | Ser | Arg 475 | Ser | Ser | Ser | Leu | Gin Ί 80 |
| Gin | Ala | Ile | Gin | Glu 485 | Thr | Ser | Arg | Leu | Phe 4 90 | Tyr | Asn. | Asn | Thr | Lys 4 95 | Asn |
| Ser | Gly | f-Set | Phe 500 | Val | Thr | Leu | Cys | Val 505 | Tyr | Cys | Tyr | HiS | Gin 510 | Thr | £er |
| Asn | Thr | Met 515 | Glu | Tyr | Tyr | Ser | Cys 520 | Gly | His | Pro | Pro | Ala 525 | Cys | Tyr | Leu |
| Asp | Pro 530 | Asp | Gly | Glu | Thr | Ser 535 | Trp | Leu | Phe | His | Pro 540 | Gly | Met | Ala | Leu |
| Gly 545 | Phe | Leu | Pro | Glu | Val 550 | Ala | Asn | Ile | Thr | Ser 555 | Lys | Leu | Phe | HÍS | Pro 550 |
| Lys | Pro | Gly | Ser | Leu 565 | Phe | Val | Leu | Tyr | ser 57Q | Asp | Gly | Ile | Thr | Glu 575 | -11a |
| His | Asn | Asn | Asn 580 | Asn | Asp | Met | Phe | Gly 585 | Glu | Glu | Arg | Leu | Gin 590 | Ala | Ata |
| Ile | Gin | Gly 595 | Leu | Thr | Gly | Lys | Ser 600 | Ala | Ala | Asp | Ala | Val 605 | His | Arg | Leu |
| Met Ile 625 | Leu 610 Thr | Ser Leu | Val Leu | LyS Ile | Thr Leu 630 | Phe 615 Lys | Val Val | Gly Leu | Asn Glu | Ser Ser 635 | His S2D | Gin | His | Asp | Asp |
<210> 521 <211> 314 <212> PRT <Z13> Chlamydia pnetanoniae <400> 521
| Met 1 | Phe | Ser | Tyr | Ile 5 | Ly3 | Asn | Arg | Ile | Leu 10 | Phe | Asn | Leu | Leu | Ser 15 | Leu |
| Trp | Ile | Val | Leu 20 | Thr | Leu | Thr | Phe | Leu 25 | Val | Met | Lys | Thr | Ile 30 | Pro | Gly |
• · · ·
I
477
| Asp | Pro Phe 35 | Asn Asp | Glu | Gly | Cys 40 | Asn Val Leu Ser | Glu Glu 45 | Val | Leu | ||||||
| Gin | Thr | Leu | Lys | Ser | Arg | Tyr | Gly | Leu | Asp | Lys | Pro | Leu | Tyr | Gin | Gin |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Tyr | Thr | Gin | Tyr | Leu | His | Ser | Ile | Ala | Lys | Leu | Asp | Phe | Gly | Asn | Ser |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Leu | Val | Tyr | Lys | Asp | Arg | Lys | Val | Thr | Asn | Ile | Ile | Ser | Thr | Ala | Phe |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Pro | Ile | Ser | Ala | Ile | Leu | Gly | Leu | Gin | Ser | Leu | Phe | Leu | Ser | Ile | Gly |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Gly | Gly | Ile | Ala | Leu | Gly | Thr | Ile | Ala | Ala | Leu | Lys | Lys | Lys | Lys | Gin |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Arg | Arg | Tyr | Ile | Leu | Gly | Ala | Ser | Ile | Leu | Gin | Ile | Ser | Ile | Pro | Ala |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Phe | Ile | Phe | Ala | Thr | Leu | Leu | Gin | Tyr | Val | Phe | Ala | Val | Lys | Ile | Pro |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Leu | Leu | Pro | Ile | Ala | Cys | Trp | Gly | Ser | Phe | Thr | His | Thr | Ile | Leu | Pro |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Thr | Leu | Ala | Leu | Ala | Val | Thr | Pro | Met | Ala | Phe | Ile | Ile | Gin | Leu | Thr |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Tyr | Ser | Ser | Val | Ser | Ala | Ala | Leu | Asn | Lys | Asp | Tyr | Val | Leu | Leu | Ala |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Tyr | Ala | Lys | Gly | Leu | Ser | Pro | Leu | Lys | Val | Val | Ile | Lys | His | Ile | Leu |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Pro | Tyr | Ala | Ile | Phe | Pro | Thr | Ile | Ser | Tyr | Ser | Ala | Phe | Leu | Thr | Thr |
| 225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
| Thr | Val | Ile | Thr | Gly | Thr | Phe | Ala | Ile | Glu | Asn | Ile | Phe | Cys | Ile | Pro |
| 245 | 250 | 255 | |||||||||||||
| Gly | Leu | Gly | Lys | Trp | Phe | Ile | Cys | Ser | Ile | Lys | Gin | Arg | Asp | Tyr | Pro |
| 260 | 265 | 270 | |||||||||||||
| Val | Ala | Leu | Gly | Leu | Ser | Val | Phe | Tyr | Gly | Thr | Leu | Phe | Met | Leu | Ser |
| 275 | 280 | 285 | |||||||||||||
| Ser | Leu | Leu | Ser | Asp | Leu | Ile | Gin | Ser | Ile | Ile | Asp | Pro | Gin | Ile | Arg |
| 290 | 295 | 300 | |||||||||||||
| Tyr | Ala | His | Gly | Lys | Glu | Lys | Lys | Arg | Lys | ||||||
| 305 | 310 |
<210> 522 <211> 1240 <212> PRT
| <213> Chlamydia | pneumoniae | ||||||||||||||
| <400> 522 | |||||||||||||||
| Met | Thr | Trp | Ile | Pro | Leu | His | Cys | His | Ser | Gin | Tyr | Ser | Val | Leu | Asp |
| 1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
| Ala | Met | Ser | Ser | Ile | Lys | Asp | Phe | Val | Ala | Lys | Gly | Gin | Glu | Phe | Gly |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Ile | Pro | Ala | Leu | Ala | Leu | Thr | Asp | His | Gly | Asn | Leu | Tyr | Gly | Ala | Val |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Asp | Phe | Tyr | Lys | Glu | Cys | Thr | Gin | Lys | Gly | Ile | Gin | Pro | Ile | Ile | Gly |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Cys | Glu | Cys | Tyr | Ile | Ala | Pro | Gly | Ser | Arg | Phe | Asp | Lys | Lys | Lys | Glu |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Lys | Arg | Ser | Arg | Ala | Ala | His | His | Leu | Ile | Leu | Leu | Cys | Lys | Asn | Glu |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Gin | Gly | Tyr | Arg | Asn | Leu | Cys | Ile | Leu | Thr | Ser | Leu | Ala | Phe | Thr | Glu |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Gly | Phe | Tyr | Tyr | Phe | Pro | Arg | Ile | Asp | Lys | Asp | Leu | Leu | Arg | Gin | Tyr |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Ser | Glu | Gly | Leu | Ile | Cys | Leu | Ser | Gly | Cys Leu | Ser | Ser | Ser | Val | Ser | |
| 130 | 135 | 140 |
• ·
478
| Asp 145 | Ala | Ala | Leu | Lys | Ser 150 | Pro | Glu | Ala | Leu | Leu 155 | Leu | Glu | Leu | Gin | Trp 160 |
| Phe | Gin | Asp | Leu | Phe 165 | Lys | Asp | Asp | Tyr | Phe 170 | Thr | Glu | Val | Gin | Leu 175 | His |
| Lys | Met | Ser | Glu 180 | Glu | Ser | Ile | Ala | Gly 185 | Phe | Lys | Glu | Glu | Trp 190 | Leu | Lys |
| Gin | Glu | Tyr 195 | Tyr | Ser | Leu | Ile | Glu 200 | Lys | Gin | Ile | Lys | Val 205 | Asn | Thr | Ala |
| Val | Leu 210 | Glu | Ala | Ser | Lys | Arg 215 | Leu | Gly | Ile | Pro | Thr 220 | Val | Ala | Thr | Asn |
| Asp 225 | Ile | His | Tyr | Ile | Asn 230 | Ala | Asn | Asp | Trp | Gin 235 | Ala | His | Glu | Ile | Leu 240 |
| Leu | Asn | Val | Gin | Ser 245 | Gly | Glu | Thr | Val | Arg 250 | Ile | Ala | Lys | Gin | Asn 255 | Thr |
| His | Ile | Pro' | Asn 260 | Pro | Lys | Arg | Lys | Val 265 | Tyr | Arg | Ser | Arg | Glu 270 | Tyr | Tyr |
| Phe | Lys | Ser 275 | Pro | Ala | Gin | Met | Ala 280 | Glu | Leu | Phe | Lys | Asp 285 | Ile | Pro | Glu |
| Val | Ile 290 | Ser | Asn | Thr | Leu | Glu 295 | Val | Ala | Lys | Arg | Cys 300 | Asp | Phe | Thr | Phe |
| Asp 305 | Phe | Ser | Lys | Lys | His 310 | Tyr | Pro | Ile | Tyr | Val .315 | Pro | Glu | Ser | Leu | Lys 320 |
| Thr | Leu | Asn | Ser | Tyr 325 | Thr | Glu | Glu | Asp | Arg 330 | Tyr | Gin | Ala | Ser | Ala 335 | Val |
| Phe | Leu | Lys | Gin 340 | Leu | Ala | Glu | Glu | Ala 345 | Leu | Pro | Lys | Lys | Tyr 350 | Ser | Ser |
| Glu | Val | Leu 355 | Ala | His | Ile | Ala | Lys 360 | Lys | Phe | Pro | His | Arg 365 | Asp | Pro | Ile |
| Asp | Ile 370 | Val | Lys | Glu | Arg | Met 375 | Asp | Met | Glu | Met | Ala 380 | Ile | Ile | Ile | Pro |
| Lys 385 | Gly | Met | Cys | Asp | Tyr 390 | Leu | Leu | Ile | Val | Trp 395 | Asp | Ile | He | His | Trp 4 00 |
| Ala | Lys | Ala | Asn | Gly 405 | Ile | Pro | Val | Gly | Pro 410 | Gly | Arg | Gly | Ser | Gly 415 | Ala |
| Gly | Ser | Val | Leu 420 | Leu | Phe | Leu | Leu | Gly 425 | Ile | Thr | Glu | Ile | Glu 430 | Pro | Ile |
| Arg | Phe | Asp 435 | Leu | Phe | Phe | Glu | Arg 440 | Phe | Ile | Asn | Pro | Glu 445 | Arg | Leu | Ser |
| Tyr | Pro 450 | Asp | Ile | Asp | Ile | Asp 455 | Ile | Cys | Met | Ala | Gly 4 60 | Arg | Glu | Arg | Val |
| Ile 465 | Asn | Tyr | Ala | Ile | Glu 470 | Arg | His | Gly | Lys | Asp 475 | Asn | Val | Ala | Gin | Ile 480 |
| Ile | Thr | Phe | Gly | Thr 485 | Met | Lys | Tkla' | Lys | Met 490 | Ala | Val | Lys | Asp | Val 495 | Gly |
| Arg | Thr | Leu | Asp 500 | Met | Ala | Leu | Ser | Lys 505 | Val | Asn | His | Ile | Ala 510 | Lys | His |
| Ile | Pro | Asp 515 | Leu | Asn | Thr | Thr | Leu 520 | Ser | Lys | Ala | Leu | Glu 525 | Thr | Asp | Pro |
| Asp | Leu 530 | His | Gin | Leu | Tyr | Ile 535 | Asn | Asp | Ala | Glu | Ser 540 | Ala | Gin | Val | Ile |
| Asp 545 | Met | Ala | Leu | Cys | Leu 550 | Glu | Gly | Ser | Ile | Arg 555 | Asn | Thr | Gly | Val | His 560 |
| Ala | Ala | Gly | Val | Ile 565 | Ile | Cys | Gly | Asp | Gin 570 | Leu | Thr | Asn | His | Ile 575 | Pro |
| Ile | Cys | Ile | Ser 580 | Lys | Asp | Ser | Thr | Met 585 | Ile | Thr | Thr | Gin | Tyr 590 | Ser | Met |
| Lys | Pro | Val 595 | Glu | Ser | Val | Gly | Met 600 | Leu | Lys | Val | Asp | Leu 605 | Leu | Gly | Leu |
| Lys | Thr 610 | Leu | Thr | Ser | Ile | Asn 615 | Ile | Ala | Met | Ser | Ala 620 | Ile | Glu | Lys | Lys |
| Thr | Gly | Gin | Ser | Leu | Tkla | Met | Ala | Thr | Leu | Pro | Leu | Asp | Asp | Ala | Thr |
• · • · · · * · · · · · ··.··»· · · · * · · · · · ···· ······ · · · · φ · · φ 447 9
| 625 | 630 | 635 | 640 |
| Thr Phe Ser Leu Leu 64 5 | His Gin Gly | Lys Thr Met Gly Ile 650 | Phe Gin Met 655 |
| Glu Ser Lys Gly Met 660 | Gin Glu Leu | Ala Lys Asn Leu Arg 665 | Pro Asp Leu 670 |
| Phe Glu Glu Ile Ile 675 | Ala Met Gly 680 | Ala Leu Tyr Arg Pro 685 | Gly Pro Met |
| Asp Met Ile Pro Ser 690 | Phe Ile Asn 695 | Arg Lys His Gly Lys 700 | Glu Ile Ile |
| Glu Tyr Asp His Pro 705 | Leu Met Glu 710 | Ser Ile Leu Lys Glu 715 | Thr Tyr Gly 720 |
| Ile Met Val Tyr Gin 725 | Glu Gin Val | Met Gin Ile Ala Gly 730 | Ala Leu Ala 735 |
| Ser Tyr Ser Leu Gly 740 | Glu Gly Asp | Val Leu Arg Arg Ala 745 | Met Gly Lys 750 |
| Lys Asp Phe Gin Gin 755 | Met Glu Gin 760 | Glu Arg Glu Lys Phe 7 65 | Cys Lys Arg |
| Ala Cys Asn Asn Gly 770 | Ile Asp Pro 775 | Glu Leu Ala Thr Val 780 | Ile Phe Asp |
| Lys Met Glu Lys Phe 785 | Ala Ala Tyr 790 | Gly Phe Asn Lys Ser 795 | His Ala Ala 800 |
| Ala Tyr Gly Leu Ile 805 | Thr Tyr Thr | Thr Ala Tyr Leu Lys 810 | Ala Asn Tyr 815 |
| Pro Lys Glu Trp Leu 820 | Ala Ala Leu | Leu Thr Cys Asp Ser 825 | Asp Asp Ile 830 |
| Glu Lys Ile Gly Lys 835 | Leu Ile Arg 840 | Glu Ala Gin Ser Met 845 | Gly Ile Pro |
| Ile Leu Pro Pro His 850 | Ile Asn Val 855 | Ser Ser Asn His Phe 860 | Val Ala Thr |
| Asp Glu Gly Ile Arg 865 | Phe Ala Met 870 | Gly Ala Ile Lys Gly 875 | Ile Gly Arg 880 |
| Gly Leu Ile Glu Ser 885 | Ile Val Glu | Glu Arg Asp His His 890 | Gly Pro Tyr 895 |
| Glu Ser Ile Arg Asp 900 | Phe Ile Gin | Arg Ser Asp Leu Lys 905 | Lys Val Ser 910 |
| Lys Lys Ser Ile Glu 915 | Ser Leu Ile 920 | Asp Ala Gly Cys Phe 925 | Asp Cys Phe |
| Asp Ser Asn Arg Asp 930 | Leu Leu Leu 935 | Ala Ser Val Glu Pro 940 | Leu Tyr Glu |
| Ala Ile Ala Lys Asp 945 | Lys Lys Glu 950 | Ala Ala Ser Gly Val 955 | Met Thr Phe 960 |
| Phe Thr Leu Gly Ala 965 | Met Asp Arg | Lys Asn Glu Val Pro 970 | Ile Cys Leu 975 |
| Pro Lys Asp Ile Pro 980 | Thr Arg Ser | Lys Lys Glu Leu Leu 985 | Lys Lys Glu 990 |
| Lys Glu Leu Leu Gly 995 | Ile Tyr Leu Thr Glu His Pro Met Asp Thr Val 1000 1005 | ||
| Arg Asp His Leu Ser 1010 | Arg Leu Ser 1015 | Val Val Leu Ala Gly 1020 | Glu Phe Glu |
| Asn Leu Pro His Gly 1025 | Ser Val Val 1030 | Arg Thr Val Phe Ile 1035 | Ile Asp Lys 1040 |
| Val Thr Thr Lys Ile Ser Ser Lys 1045 | Ala Gin Lys Lys Phe 1050 | Ala Val Leu 1055 | |
| Arg Val Ser Asp Gly 1060 | Ile Asp Ser | Tyr Glu Leu Pro Ile 1065 | Trp Pro Asp 1070 |
| Met Tyr Glu Glu Gin 1075 | Gin Glu Leu Leu Glu Glu Asp Arg Leu Ile Tyr 1080 1085 | ||
| Ala Ile Leu Val Leu 1090 | Asp .Lys Arg 1095 | Ser Asp Ser Leu Arg 1100 | Ile Ser Cys |
| Arg Trp Met Lys Asp | Leu Ser Ile | Val Asn Glu Asn Ile | Ile Tyr Glu |
1105 1110 1115 1120 • · · ·
480
| Cys Asp Gin | Ala | Phe Asp 1125 | Arg | Ile | Lys Asn Gin 1130 | Val | Gin | Lys Meť Ser 1135 |
| Phe Thr Met | Ser | Thr Ser | Gly | Lys | Glu Thr Lys | Ala | Lys | Gly Asn Lys |
| 1140 | 1145 | 1150 | ||||||
| Pro Asn Glu | Asn | Gly His | Thr | Gin | Ala Leu Ala | Pro | Val | Thr Leu Ser |
| 1155 | 1160 | 1165 | ||||||
| Leu Asp Leu | Asn | Glu Leu | Arg | His | Ser His Leu | Cys | Ile | Leu Lys Lys |
| 1170 | 1175 | 1180 | ||||||
| Ile Val Gin | Lys | His Pro | Gly | Ser | Arg Thr Leu | Val | Leu | Val Phe Thr |
| 1185 | 1190 | 1195 | 1200 | |||||
| Gin Asp Asn | Glu | Arg Val | Ala | Ser | Met Ser Pro | Asp | Asp | Ala Tyr Phe |
| 1205 | 1210 | 1215 | ||||||
| Val Cys Glu | Asp | Ile Glu | Glu | Leu | Arg Gin Glu | Leu | Val | Thr Ala Asp |
| 1220 | 1225 | 1230 | ||||||
| Leu Pro Val | Arg | Val Ile | Thr | Val | ||||
| 1235 | 1240 |
<210> 523 <211> 576 <212> PRT <213> Chlamydia pneumoniae <400> 523
| Met | Thr | Asp | Phe | Pro | Thr | His | Phe | Lys | Gly | Pro | Lys | Leu | Asn | Pro | Ile |
| 1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
| Lys | Val | Asn | Pro | Asn | Phe | Phe | Glu | Arg | Asn | Pro | Lys | Val | Ala | Arg | Val |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Leu | Gin | Ile | Thr | Ala | Val | Val | Leu | Gly | Ile | Ile | Ala | Leu | Leu | Ser | Gly |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Ile | Val | Leu | Ile | Ile | Gly | Thr | Pro | Leu | Gly | Ala | Pro | Ile | Ser | Met | Ile |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Leu | Gly | Gly | Cys | Leu | Leu | Ala | Ser | Gly | Gly | Ala | Leu | Phe | Val | Gly Gly | |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Thr | Ile | Ala | Thr | Ile | Leu | Gin | Ala | Arg | Asn | Ser | Tyr | Lys | Lys | Tkla | Val |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Asn | Gin | Lys | Lys | Leu | Ser | Glu | Pro | Leu | Met | Glu | Arg | Pro | Glu | Leu | Lys |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Ala | Leu | Asp | Tyr | Ser | Leu | Asp | Leu | Lys | Glu | Val | Trp | Asp | Leu | His | His |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Ser | Val | Val | Lys | His | Leu | Lys | Lys | Leu | Asp | Leu | Asn | Leu | Ser | Lys | Thr |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Gin | Arg | Glu | Val | Leu | Asn | Gin | Ile | Lys | Ile. | Asp | Asp | Glu | Gly | Pro | Ser |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Leu | Gly | Glu | Cys | Ala | Ala | Met | Ile | Ser | Glu | Asn | Tyr | Asp | Ala | Cys | Leu |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Lys | Met | Leu | Ala | Tyr | Arg | Glu | Glu | Leu | Leu | Lys | Glu | Gin | Thr | Gin | Tyr |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Gin | Glu | Thr | Arg | Phe | Asn | Gin | Asn | Leu | Thr | His | Arg | Asn | Lys | Val | Leu |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Leu | Ser | Ile | Leu | Ser | Arg | Ile | Thr | Asp | Asn | Ile | Ser | Lys | Ala | Gly | Gly |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Val | Phe | Ser | Leu | Lys | Phe | Ser | Thr | Leu | Ser | Ser | Arg | Met | Ser | Arg | Ile |
| 225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
| His | Thr | Thr | Thr | Thr | Val | Ue | Leu | Ala | Leu | Ser | Ala | Val | Val | Ser | Val |
| 245 | 250 | 255 | |||||||||||||
| Met | Val | Val | Ala | Ala | Leu | Ile | Pro | Gly | Gly | Ile | Leu | Ala | Leu | Pro | Ile |
| 260 | 265 | 270 | |||||||||||||
| Leu | Leu | Ala | Val | Ala | Ile | Ser | Ala | Gly | Val | Ile | Val | Thr | Gly | Leu | Ser |
| 275 | 280 | 285 | |||||||||||||
| Tyr | Leu | Val | Arg | Gin | Ile | Leu | Ser | Asn | Thr | Lys | Arg | Asn | Arg | Gin | Asp |
| 290 | 295 | 300 |
• · · 9 • · · 9 • ··· 9 · • · · · · · 9 ·· - ·9 9 · · 9
481
| Phe | Tyr | Lys | Asp | Phe | Val | Lys | Asn | Val | Asp | Ile | Glu | Leu | Leu | Asn | Gin |
| 305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
| Thr | Val | Thr | Leu | Gin | Arg | Phe | Leu | Phe | Glu | Met | Leu | Lys | Gly | Val | Leu |
| 325 | 330 | 335 | |||||||||||||
| Lys | Glu | Glu | Glu | Glu | Val | Ser | Leu | Glu | Gly | Gin | Asp | Trp | Tyr | Thr | Gin |
| 340 | 345 | 350 | |||||||||||||
| Tyr | Ile | Thr | Asn | Ala | Pro | Ile | Glu | Lys | Arg | Leu | Ile | Glu | Glu | Ile | Arg |
| 355 | 360 | 365 | |||||||||||||
| Val | Thr | Tyr | Lys | Glu | Ile | Asp | Ala | Gin | Thr | Lys | Lys | Met | Lys | Thr | Asp |
| 370 | 375 | 380 | |||||||||||||
| Leu | Glu | Phe | Leu | Glu | Asn | Glu | Val | Arg | Ser | Gly | Arg | Leu | Ser | Val | Ala |
| 385 | 390 | 395 | 400 | ||||||||||||
| Ser | Pro | Ser | Glu | Asp | Pro | Ser | Glu | Thr | Pro | Ile | Phe | Thr | Gin | Gly | Lys |
| 405 | 410 | 415 | |||||||||||||
| Glu | Phe | Ala | Lys | Leu | Arg | Arg | Gin | Thr | Ser | Gin | Asn | Ile | Ser | Thr | Ile |
| 420 | 4 25 | 430 | |||||||||||||
| Tyr | Gly | Pro | Asp | Asn | Glu | Asn | Ile | Asp | Pro | Glu | Phe | Ser | Leu | Pro | Trp |
| 435 | 440 | 445 | |||||||||||||
| Met | Pro | Lys | Lys | Glu | Glu | Glu | Ile | Asp | His | Ser | Leu | Glu | Pro | Val | Thr |
| 450 | 455 | 4 60 | |||||||||||||
| Lys | Leu | Glu | Pro | Gly | Ser | Arg | Glu | Glu | Leu | Leu | Leu | Val | Glu | Gly | Val |
| 465 | 470 | 475 | 480 | ||||||||||||
| Asn | Pro | Thr | Leu | Arg | Glu | Leu | Asn | Met | Arg | Ile | Ala | Leu | Leu | Gin | Gin |
| 485 | 490 | 4 95 | |||||||||||||
| Gin | Leu | Ser | Ser | Val | Arg | Lys | Trp | Arg | His | Pro | Arg | Gly | Glu | His | Tyr |
| 500 | 505 | 510 | |||||||||||||
| Gly | Asn | Val | Ile | Tyr | Ser | Asp | Thr | Glu | Leu | Asp | Arg | Ile | Gin | Met | Leu |
| 515 | 520 | 525 | |||||||||||||
| Glu | Gly | Ala | Phe | Tyr | Asn | His | Leu | Arg | Glu | Ala | Gin | Glu | Glu | Ile | Thr |
| 530 | 535 | 540 | |||||||||||||
| Gin | Ser | Leu | Gly | Asp | Leu | Val | Asp | Ile | Gin | Asn | Arg | Ile | Leu | Gly | Ile |
| 545 | 550 | 555 | 560 | ||||||||||||
| Ile | Val | Glu | Gly | Asp | Ser | Asp | Ser | Arg | Thr | Glu | Glu | Glu | Pro | Gin | Glu |
| 565 | 570 | 57 5 |
<210> 524 <211> 439 <212> PRT <213> Chlamydia pneumoniae <220>
<221> VARIANT <222> 428,429, 430, 431, 4 32,433,434,435, 4 37,438,439 <223> Xaa = jakákoliv aminokyselina <400> 524
| Ile | Thr | Ile | Ala | Val | Asn | Ser | Thr | Ser | Gly | Gly | Leu | Lys | Ile | Ser | Gly |
| 1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
| Asp | Leu | Lys | Phe | His | Asn | Asn | Glu | Gly | Ser | Phe | Tyr | Asp | Asn | Pro | Gly |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Leu | Lys | Tkla | Asn | Leu | Asn | Leu | Pro | Phe | Leu | Asp | Leu | Ser | Ser | Thr | Ser |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Gly | Thr | Val | Asn | Leu | Asp | Asp | Phe | Asn | Pro | Ile | Pro | Ser | Ser | Met | Ala |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Ala | Pro | Asp | Tyr | Gly | Tyr | Gin | Gly | Ser | Trp | Thr | Leu | Val | Pro | Lys | Val |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Gly | Ala | Gly | Gly | Lys | Val | Thr | Leu | Val | Ala | Glu | Trp | Gin | Ala | Leu | Gly |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Tyr | Thr | Pro | Lys | Pro | Glu | Leu | Arg | Ala | Thr | Leu | Val | Pro | Asn | Ser | Leu |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Trp | Asn | Ala | Tyr | Val | Asn | Ile | His | Ser | Ile | Gin | Gin | Glu | Ile | Ala | Thr |
• ’ 4 ··· « · 4
4 ♦ <
«·
482
| Ala | Met 130 | 115 Ser | Asp | Ala | Pro | Ser 135 | 120 His | Pro | Gly | Ile | Trp 140 | 125 Ile | Gly | Gly | Ile |
| Gly | Asn | Ala | Phe | His | Gin | Asp | Lys | Gin | Lys | Glu | Asn | Ala | Gly | Phe | Arg |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Leu | Ile | Ser | Arg | Gly | Tyr | Ile | Val | Gly | Gly | Ser | Met | Thr | Thr | Pro | Gin |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Glu | Tyr | Thr | Phe | Ala | Val | Ala | Phe | Ser | Gin | Leu | Phe | Gly | Lys | Ser | Lys |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Asp | Tyr | Val | Val | Ser | Asp | Ile | Lys | Ser | Gin | Val | Tyr | Ala | Gly | Ser | Leu |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Cys | Ala | Gin | Ser | Ser | Tyr | Val | Ile | Pro | Leu | His | Ser | Ser | Leu | Arg | Arg |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| His | Val | Leu | Ser | Lys | Val | Leu | Pro | Glu | Leu | Pro | Gly | Glu | Thr | Pro | Leu |
| 225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
| Val | Leu | His | Gly | Gin | Val | Ser | Tyr Gly | Arg | Asn | His | His | Asn | Met | Thr | |
| 245 | 250 | 255 | |||||||||||||
| Thr | Lys | Leu | Ala | Asn | Asn | Thr | Gin | Gly | Lys | Ser | Asp | Trp | Asp | Ser | His |
| 260 | 265 | 270 | |||||||||||||
| Ser | Phe | Ala | Val | Glu | Val | Gly | Gly | Ser | Leu | Pro | Val | Asp | Leu | Asn | Tyr |
| 27 5 | 280 | 285 | |||||||||||||
| Arg | Tyr | Leu | Thr | Ser | Tyr | Ser | Pro | Tyr | Val | Lys | Leu | Gin | Val | Val | Ser |
| 290 | 295 | 300 | |||||||||||||
| Val | Asn | Gin | Lys | Gly | Phe | Gin | Glu | Val | Ala | Ala | Asp | Pro | Arg | Ile | Phe |
| 305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
| Asp | Ala | Ser | His | Leu | Val | Asn | Val | Ser | Ile | Pro | Met | Gly | Leu | Thr | Phe |
| 325 | 330 | 335 | |||||||||||||
| Lys | His | Glu | Ser | Ala | Lys | Pro | Pro | Ser | Ala | Leu | Leu | Leu | Thr | Leu | Gly |
| 340 | 345 | 350 | |||||||||||||
| Tyr | Ala | Val | Asp | Ala | Tyr | Arg | Asp | His | Pro | His | Cys | Leu | Thr | Ser | Leu |
| 355 | 360 | 365 | |||||||||||||
| Thr | Asn | Gly | Thr | Ser | Trp | Ser | Thr | Phe | Ala | Thr | Asn | Leu | Ser | Arg | Gin |
| 370 | 375 | 380 | |||||||||||||
| Ala | Phe | Phe | Ala | Glu | Ala | Ser | Gly | His | Leu | Lys | Leu | Leu | His | Gly | Leu |
| 385 | 390 | 395 | 400 | ||||||||||||
| Asp | Cys | Phe | Ala | Ser | Gly | Ser | Cys | Glu | Leu | Arg | Ser | Ser | Ser | Arg | Ser |
| 405 | 410 | 415 | |||||||||||||
| Tyr | Asn | Ala | Asn | Cys | Gly | Thr | Arg | Tyr | Ser | Phe | Xaa | Xaa | Xaa | Xaa | Xaa |
| 420 | 425 | 430 | |||||||||||||
| Xaa | Xaa | Xaa | Phe | Xaa | Xaa | Xaa |
35 <210> 525 <211> 867 <212> DNA <213> C. Trachomatis D serovar <400> 525 atgacccatč agcataaaaa aatcagcgaa gaaacaatcg cctgtgacat gctagagcgc tataccggct ctaccgttca agagttccag ccctatctcc ttcttactaa ttttgcgtat tacgtggatg ttttcgctga aatctatcag gtccctgttt ctcgaggatc catgttttcg gcagcgcatg cgcctcaaat tcacacctca atcatcgatt ttaaattagg ctctccagga gcagctctta ccgtagatct gtgttctttc cttcccaatg ctacagcagc gatcatgttg ggcatgtgtg gaggcttaag atcccactac caaataggag attattttgt ccctgttgct agcatccgaa aagatggaac atcagatgca tacttccccc cagaggtccc tgcattagct aattttgtcg tacaaaaaat gatcaccaat attctcgaag ccaaaaacct cccttaccat ataggcatca cccacacgac taacattcgg ttttgggagt ttaataaaga gttccgtcga aaactatatg aaaataaagc tcaaactgtc gagatggagt gtgccacctt atttgctgca ggataccgaa ggaatcttcc tttaggagca cttttgctga tatcggatct acctttgcga áaagatggaa ttaaaactaa ggaaagcagt tcggcagtcc taaactctca caccaaagag catatactaa caggcgttga ggtgtttgcc tctctacaag' agaaatcagg cccaggaatc
120
180
240
300
360
420
480
540
600
660
720
780 . 4
483 aagaaaacaa aaggcttgcc gcacatggag tttgggcaag ccgatgattc tctttctgaa 840 caaactgaag tttctggcgg ggatttc 867 <210> 526 <211> 1182 <212> DNA <213> C. Trachomatis D serovar <400> 526 atgtcaaaag aaacttttca acgtaataag cctcatatca acatagggac cattggccac 60 gttgaccatg gtaagactac gttgacagct gctattacgc gtgcgttgtc tggagatggg 120 ttggctgatt ttcgtgatta tagctctatt gacaacactc ctgaagaaaa agctcgcggt 180 attacaatta acgcttccca cgttgagtac gaaacagcta atcgtcacta cgctcacgtg 240 gactgccctg gtcacgctga ctatgttaaa aacatgatca ccggtgcagc tcaaatggac 300 ggggctattc tagtagtttc tgcaacagac ggagctatgc ctcaaactaa agagcatatt 360 cttttggcaa gacaagttgg ggttccttac atcgttgttt ttctcáataa aattgacatg 420 atttccgaag aagacgctga attggtcgac ttagttgaga tggagttggt tgagcttctt 480 gaagagaaag gatacaaagg gtgtccaatc atcagaggtt ctgctctgaa agctttggaa 540 ggggatgctg catacataga gaaagttcga gagctaatgc aagccgtcga tgataacatc 600 cctactccag aaagagaaat tgacaagcct ttcttaatgc ctattgagga cgtattctct 660 atctccggac gaggaactgt agtaactgga cgtattgagc gtggaattgt taaagtttcc 720 gataaagttc agttggtcgg tcttagagat actaaagaaa cgattgttac tggggttgaa 780 atgttcagaa aagaactccc agaaggtcgt gcaggagaga acgttggatt gctcctcaga 840 ggtattggta agaacgatgt ggaaagagga atggttgttt gcttgccaaa cagtgttaaa 900 cctcatacac agttcaagtg tgctgtttac gttttgcaaa aagaagaagg tggacgacat 960 aagcctttct tcacaggata tagacctcaa ttcttcttcc gtacaacaga cgtcacaggt 1020 gtggtaactc tgcctgaggg aattgagatg gtcatgcctg gggataacgt tgagtttgaa 1080 gtgcaattga ttagccctgt ggctttagaa gaaggtatga gatttgcgat tcgtgaaggt 1140 ggtcgtacaa tcggtgctgg aactatttct aagatcattg ca 1182 <210> 527 <211> 1650 <212> DNA <213> C. Trachomatis D serovar <400> 527 gtggaatctt cccgtattct tattacttct gcgttgcctt acgcaaatgg tcctttgcat 60 tttggacata ttaccggtgc ttatttgcct gcagatgttt atgcgcgttt tcagagácta 120 caaggcaaag aggtcttgta tatttgtggt tctgatgaat acggaatcgc aattaccctt 180 aatgcagagt tggcaggcat ggggtatcaa gaatatgtcg acatgtatca taagcttcat 240 aaagatacct tcaagaaatt gggaatttct gtagatttct tttccagaac tacgaacact 300 tatcatcctg ctattgtgca agatttctat cgaaacttgc aggaacgcgg actggtagag 360 aatcaggtga ccgaacagct gtattctgag gaagaaggga agtttctagc ggaccgttat 420 gttgtaggta cttgtcccaa gtgtgggttc gatcgagctc gaggagatga gtgtcagcag 480 tgcggtgccg attacgaagc tagagatctg aaagagcctc gttctaaatt aacgggggca 540 gctttatctt tacgtgatac ggaacatgct tacttgcatt tggagcgcat gaaagaagat 600 ttgcttgctt tcgtgcaagg tatttatcta cgtcctcata tgcgtaattt cgttacggat 660 tacatcgagc atttacgtcc tcgagcagtg actcgagatt tgtcttgggg aatacccgtt 720 cctgatttgg aaaataaggt attctatgta tggttcgatg ctccaattgg ttacataagt 780 ggaactatgg attgggcagc atcgattgga gaccctgaag cttggaagaa gttttggttg 840 gacgatactg tgacctacgc acagtttata ggtaaagata atacttcttt ccatgcggct 900 attttcčctg ctatggaaat aggacaatct cttccctata agaaagtgga tgctcttgta 960 acatcagaat ttttattgtt agaaggtttc cagttcagta aatcggatgg gaattttata 1020 gacatggatg cgtttttaga aacgtattcc ttggataaac tgcgttatgt gttggcagcg 1080 attgctccag agacttcgga tagcgaattc tctttccaag agttcaagac gcgatgcaat 1140 tctgagcttg tagggaagta tggaaatttt gtgaatcgag ttctagcttt tgctgttaag 1200. aatggatgca cagagctttc ttctcctcaa ttagagcaaa aggatttgga ttttatctca 1260 aaatctcaaa aacttgctaa ggatgcagcc gaacattacg cacaatacag tttgcgtaag 1320 gcgtgttcca cgattatgga attagctgct ttagggaatg gctatttcaa tgatgaagct 1380 ccatggaaat tggctaaaga gggtaactgg aatcgggtac gcgctattct attctgtgct 1440 tgttactgcc agaagttgct agctctcatt tcctaťccta ttatgcctga aacagcattg 1500 • · ··· aagattttgg aaatgatagc tccacattcc ttagatctag gttcccaaga tccagataga 1560 ttacaatctc tttggacaga ttcctttttt gattactcgg aagagaaatt ttctctgaaa 1620 gagcctgaat tattgttcac aatggtagag 1650 <210> 528 <211> 300 <212> DNA <213> C. Trachomatis D serovar
484 <400> 528 atggctagaa aagatcgttt aactaatgaa agactgaata agctatttga tagccccttt 60 agtttggtta attacgtaat taagcaagct aagaacaaaa ttgctagagg agatgttcgt 120 tcttctaatg tcgcgattga ggcgctgaac ttcctggatc tttatggcat tcagtccgaa 180 tacgctgaaa gagatgatcg agagagacat ttgtctgcta caggagagag acgaagagaa 240 caaggtttcg gaacatccag aagaaaagat ccttctctgt acaactggag cgacgtgaaa 300 <210> 529 <211> 615 <212> DNA <213> C. Trachomatis D serovar <400> 529 atgtcagtaa aggttatttc ccccttttct caagacgggg ttcaatgctt tcccaagctt 60 tttatcatta gcgctcctgc tggagcaggg aagacaacac tcacccatat gctacaaaga 120 gagtttcctg atgcatttga gaagacggtg tcgtcaacga cacgttcggc tcgtccaggc 180 gaagtgcatg gcgtggatta tttgtttgta tctgaagatg actttaágca atctttagat 240 agggaagatt ttttggaatg ggtcttttta tttgggactt attacggaac gagtaaggcg 300 gagatttcta gagttctgca aaagggtaag cactgtatag ccgtgattga tgtacaagga 360 gctttggctc tgaagaagca aatgccggca gtcactattt ttattcaagc tccctctcaa 420 gaagaacttg agcgccgttt gaatgctcgg gattcagaga aagatttcca gaagaaagaa 480 agattagagc atagcgctgt cgaaattgct gccgctagcg aatttgatta tgttgtggtt 540 aatgatgatt tgattacagc atatcaagtt ttaagaagta tttttatagC tgaagaacat 600 aggatgagtc atggc 615 <210> 530 <211> 1806 <212> DNA <213> G. Trachomatis D serovar <400> 530 ttgaaaecgt ataaaattga gaacattcgt aatttttcta tcattgctca tatcgaccac 60 gggaaatcta cgatcgcaga tcgtttgtta gaaagtacta gtactatcga acaaagagag 120 atgcgcgaac aacttttaga ttctatggat ctagaaagag aacgcgggat taccatcaaa 180 gcgcatccgg tcactatgac ctatgaatac gaaggggaga cttacgaact caatctaata 240 gatactcctg gacacgtaga tttctcttat gaagtatccc gatcactagc agcttgtgaa 300 ggagcgctgc ttatagtaga tgctgcccaa ggtgttcaag ctcaaagctt agctaatgta 360 tatctggctc tagaacgaga tttagaaatc attcctgttt taaataaaat agacttacct 420 gctgctcaac cagaagctat aaaaaaacaa atcgaagagt tcatcggatt agatacttca 480 aacaccattg cttgctcagc gaaaacaggt cagggtatcc ctgaaatttt agagtctatt 540 atacgactcg ttcccccacc aaaacctcca caggaaacag aacttaaagc tttgatcttt 600 gattctcact acgatcctta tgtaggaatc atggtttatg tacgcgtgat cagtggagaa 660 atcaaaaagg gagatcgcat taccttcatg gcaaccaaag gctcctcttt tgaggtctta 720 ggaataggag ctttcttacc ggaagctact ctcatggaag gatccttacg agccggacaa 780 gtgggatact tcattgccaa cctaaaaaaa gtaaaggatg taaaaattgg cgatacagtc 840 actactgtta aacatcctgc taaagagcct ttagaaggct ttaaagaaat caaacctgta 900 gtgtttgctg gtatctatcc tatagattct tctgactttg ataccctgaa agatgctcta 960 ggccggttgc agctaaacga ctcagctctt acgattgaac aagagaacag tcattctcťc 1020 ggatttgggt tccgctgtgg atttttagga ctgctgcact tagaaatcat ctttgagaga 1080 atctctagag aatttgatct cgatattatt gctacagctc ctagcgttat ctacaaagtc 1140 gtcttaaaaa atggtaaaac cctttttatt gataacccaa cagcatatcc tgacccagct 1200 cttattgaac acatggagga gccttgggtc catgttaata tcattacgcc tcaagagtat 1260
485 ctcagcaata ttatgagcct ttgtatggat aagcgtggga tctgtctaaa aacagatatg 1320 cttgaccaac acagactggt gctttcatat gagctgcctc tcaatgagat tgtttctgat 1380 ttcaatgata aactcaaatc tgtgacgaaa ggatacggct cctttgatta ccggttagga 1440 gattataaaa agggtgctat cattaagctg gaaattctaa ttaatgatga ggctgttgat 1500 gccttttcct gccttgtaca cagagacaaa gcagaatcaa aaggcagaag catctgcgag 1560 aaactcgtag atgttatccc tcctcagctc tttaaaatcc ctattcaggc ggccatcaat 1620 aaaaagatta ttgccagaga gacgattcga gctttagcga aaaatgtaac tgctaagtgc 1680 tatggtggag atatcacaag aaaacgcaag ttgtgggaca aacagaaaaa agggaagaaa 1740 cgaatgaaag aattcggaaa agtatccatt ccgaacacgg cgtttgttga agtccttaaa 1800 atggag 1806 <210> 531 <211> 972 <212> DNA <213> C. Trachomatis D serovar <400> 531 gtggáactac ttcctcatga aaaacaggtt gtcgaatacg aaaaaacgat cgccgagttt 60 aaagaaaaaa ataaagaaaa cagcctgctt tcttcttcag agattcaaaa attggataag 120 cgtttagata gattaaaaga aaaaatttat tccgatctca coccttggga aagagtacaa 180 atttgtcgac atccttcgag acctagaaca gtgaattata tcgaaggaat gtgcgaagag 240 tttgtagaac tttgtggaga tcgaacgttc cgagatgatc ctgcagttgt cggagggttc 300 gcaaagattc aagggcagcg tttcatgctt atagggcaag aaaagggttg cgacacaaaa 360 tctcgcatgc atcgtaactt cgggatgctt tgtcccgaag gctttagaaa ggctctacgc 420 ttagctaaaa tggcagagaa attcggtttg ocaattatct ttctcgttga tacccctgga 480 gctttccctg gattaacagc cgaagaaaga ggtcaaggtt gggctattgc gacaaactta 540 tttgagttag ctagattagc taccccaatc attgtaattg tgattggtga aggatgttca 600 ggaggcgctc taggaatggc tataggagat gttgtagcga tgctagaaca ctcgtattat 660 tctgtaattt ctcctgaagg gtgtgcttct attttatgga aagatcctaa aaagaacagc 720 gatgctgctg ccatgttaaa aatgcatgga gaggatctta agggatttgc tattgtggac 780 gcagtgatca aagaacccat aggtggggct catcacaatc ctgcggccac atatcgtagt 840 gttcaagaat atgtccttca agaatggctt aaattgaaag atttaccggt agaagagttg 900 ctagaaaaac gatatcagaa attccgaacg ataggtctat atgaaacttc ttctgaaagc 960 gattctgagg ca 972 <210> 532 <211> 1938 <212> DNA <213> C. Trachomatis D serovar <400> 532 , atgaaacttc ttctgaaagc gattctgagg cataagaagc atttagtttt attcggtttt 60 tctcttttat ccatattagg gctaacaata acgtctcaag cagaaatttt ttctctaggt 120 cttattgcta agacaggtcc tgatacgttt cttctttttg ggaagcagga gggagcttcc 180 ttagtcaaaa ggaaagagct gtccaaagat caacttcttg aacagtggga taatattgtt 240 ggtgagggag acacgctatc tttgcctcaa gcgaatgctt atattgcgaa acattcagga 300 ggctctcagt caataacaaa aaggctttcc gcctatctct ctggttgttt tgacttttct 360 cgtttgcaat gcctcgcgct ttttctagta gttgttgcta ttttgaaatc aacaacgcta 420 ttttttcaga ggtttttagc acaattaatt gctattcgtg tgagctgctc tttacgtaaa 480 gattacttct tagctttaca aacgctcccg atgacattct ttcatgcaca cgatatgggg 540 aatctaagta gtcgtgtgat agcagattca tctatgattg cattagctat taatgccctt 600 atggtgaatt acattcaggc tcctatcact atgactttag ccttagtagt gtgcttgtct 660 atttcttgga aattttgtgc ttgtgtttgt ttagcgttcc ctatttttat tttgccaatt 720 gttatcattg caaagaaagt taaagcattg gctaaacgaa ttcaaaagag tcaagatcat 780 tctgccgctg cgttattgga ttttctttta ggtattctta cagtaaaagt atttagaact 840 gagcagtttt cttttagtaa gtattgtcag aaaaatgatg agattgctcg attggaagag 900 cgcagtgctg cgtatagttt aattccaaga cctcttctgc acactattgc ctcgttgttc 960 tttgctttgg tcattatgat cggtttgtat cattttcata tcccacctga ggagcttgtg 1020 gtcttttgtg ggcttttgta tctcatttat gatccgatta aaaagtttgc tgatgaaaat 1080 gcgaatatca tgtggggatg cgctgctgca gaacggtttt atgaagtatt ggatctagca 1140 aagcagcagt ccaatgtttc tgaaaagtta aatgaattcc agggattaca acatagtatt 1200 φφ ·»»· φφ φφ 'φφ φ φ φ·φ φ φ φ φ φ φ φφφ · ···· φ φ φ φφφ φφ Φ·φ φ φ · φ φ φ φ φ φ φ
486 cagttttgca atgtatcctt tggatatgta gaggatagtc ccgtattatc ggatttcaac ' 1260 ttagtattaa aaaaagggga ggctatcggt attgttggtc caacaggatc tgggaaatct 1320 accatagcaa agttattgcc aaggctttat gaagtctctc atggcgaact gttaattgat 1380 tcacttccga tacgaagcta ctgcaaaaat tctttaagga aacatattgg ttgtgtgctg 1440 cagcatccat ttttattcta tgatacggtg tggaataacc tgacttgtgg cagaaccttt 1500 tcagaagaag aagtatttca tgctttaaag caagctcatg cctacgaatt tgtttctaaa 1560 atgcctcaag gcgtgcacag cttattagag gaatccagta aaaatttatc tggaggtcag 1620 cagcaacgtt tgacaatagc tagagcattg ctgcataaca cctccattct gttgctagat 1680 gaggcaacat cagcattgga tgccattagc gaaaattatg ttaaagagat agtcgggcag 1740 ttaaaaggcc gttgtacaca aattatcatt gcccacaagc tctccactct cgaatacgta 1800 gatcggattg tttacttgga acaagggaag aaaatagcag aaggaaccaa agaagagtta 1860 ttagactctt gcccagcttt tcaaagaatg tgggtcttat cgggtgctaa ggactgggaa 1920 ctcaatgctg tcgtaaaa 1938 <210> 533 <211> 1242 <212> DNA <213> C. Trachomatis D serovar <400> 533 atgttttctt cagcaattgt tattctaact gcaatttttg tcttgtgctc ggggtttgtt 60 tctttatcgc atatagcttt attctcgctc ccttcttccc ttattgctca ttacagtcac 120 tcaaaaaata ggcagctccg acaaattgcc aatcttatgg cctaccccaa tcatttgctc 180 atgaccctag tcttcttcga catagggatt aatattggag tgcaaaactg catagcaacc 240 ttagtaggcg attcggcatc tctattgctt accgtaggag ttcccctcgc tttgacacta 300 gttttgggag aaattgtccc taaggttatc gcaatccctt acaatgcacg aattgcaaag 360 attgtaaccc caatcatctt ťgcctcaact aaaagcttcc gccctatatt tgattgggct 420 atctcgggta tcaattttat cgttcagaaa atgttggccc gtcaagaaag tgattttatt 480 caaccccaag aattaaaaga agtcctccga agctgtaaag atttcggagt tgtaaatcat 540 gaggaaagtc gtcttctatt tggctatcta tccatggaag aaggtagcat taaagaacgc 600 atgacgccca aacaagaaat cattttttat gatgtcctta ctccgattga aaatttatat 660 aaactcttct ctggacctaa acaaagctat tccaaagttc tagtttgtaa aggtggtcta 720 caaaatctct taggagtttg ttctgcaaaa ttgcttcttc tctacaaaga aaaattacaa 780 tctgccgaag aactcttgcc tctccttcgt aaacctcact acattcctga aacagtatca 840 gctaagacag ctttgtatca tctagcagga gaagactgtg gtttaggtat tatcattgat 900 gaatatgggt ctatagaagg attgatcacc caaaatgatc tatttaaaat agtctctgat 960 ggggtagctc ataatcgccc atcttttaaa caattcgctc actcagacaa gaatgttgtt 1020 attgctgcag gcacctatga gctttctgat ttctatgacc tgtttggagt tgatcttcct 1080 actacagcta attgcgttac cataggcgga tggctgacag aacaattagg agaaatccct 1140 gaaacaggaa caaaattcgc ttggggacaa tttgtattcc aaatactaga cgcggctcct 1200 aattgtgtga aacgggtgta tataaggaaa acccatggaa ac 1242 <210> 534 <211> 1212 <212> DNA <213> C. Trachomatis D serovar <400> 534 atggaaacta actctccctt tttctggtta ggagtgaacc tcctttgtat ttttgtccaa 60 gggttctttt ccatgatgga aatggcttgc atatcattca atcgcgtgcg gttgcaatat 120 taccttacga aaagcaataa aaaagcctct tacattaact tccttgttag aagaccttat 180 cgcttatttg gaaccgtaat gttgggagta aatattgctt tgcaaatagg gtctgagtca 240 tcacgaactt gttacaaact cctagggatt tctcctgaat atgctcctgc aacgcaaatt 300 attttagtcg tcatttttgc tgaattaatt cctttagcta tctctcgtaa aattccagaa 360 aaaatcgcct taaaaggagc ccctatcctc tatttcgctc actatctttt ctatccgctc 420 atccaatgtg tcggtggcat taccaatatg atctacttta ttctgaatat taaggaagag 480 acgctccact caacgcttag ccgagatgaa ttgcaaaaga cattagaaac tcatcatgaa 540 gagcatgatt tcaatgtgat agctacaaat attttctctt taagcgcaac ttctgtagag 600 caagtatgtc aatatttgga ccaaatcccg atactttcag ctaccgcttc cgtacgagat 660 gtttgccagc tcgttcgtcg ccatcgttta gattttgtcc ctgtttacca taaagttaaa 720 aagaatgtag tgggaatagc ttttccaaaa aacctcatta.atcgaaatcc cagtgaccct 780 • · · · · · · · · · 9 9 9 9 9 9
999 9 ..9 999
487 gttgtccctt acctaagctc tccctggttc ataacagcta aatctaagct cattcatgcg 840 atccaagaat tccgcaagaa tagttctaac gtcgccattg ttttaaataa taatggcgag 900 cctatgggag ttttaggctt acatacggtg tttaaaacgt tattcaacac aagaaatatc 960 gcccaattaa aacccaaacc aacttcttta attgaacgaa ctttctctgg gaacacacct 1020 ttgtctgaaa tagaaaatga gctcgatatt atttttatgg ataatgattg tacaacaatt 1080 gagcaactca tgttaaaact tctggatact cctccagaag taggcgcctc tatcattatc 1140 aacgacctac tgttagaggt aaaagagatt tccttgtacg gcatcaaaac tgttgctatc 1200 aaagatactc tg 1212 <210> 535 <211> 1617 <212> DNA <213> C. Trachomatis D serovar <400> 535 atgtgttgtg tggatggatc taattccatc caacaacgaa tgcgtttttg tgagtatcgt 60 acegcagcgc aagaggctaa gacctcatta tcttccgatt gttccttact agaagctcgc ' 120 ttggctttac gagccttagc caaacatcat gaatattctg cttggagaga ggccttcctc 180 cgttctcaag aacgctttcc ttcattggaa gcagatcgtg atattcatga ggatcttgca 240 gcttctcttc tacaaaaaaa tattagacat tcttcactta ccgttcgagt aattactatt 300 vttagctgtag ggatggcgag agactatcgg ttagtgccta ttgttttgca ggctttgtct 360 gatgatagcg ataccgtacg tgagattgct gtacaagtag ctgttatgta tggttctagt 420 tgettactgc gcgccgtggg cgatttagcg aaaaatgatt cttctattca agtacgcatc 480 actgcttatc gtgctgcagc cgtgttggag atacaagatc ttgtgcctca tttaegagtt 540 gtagtccaaa atacacaatt agatggaacg gaaagaagag aagcttggag atctttatgt 600 gttcttactc ggcctcatag tggtgtatta actggcatag atcaagcttt aatgacctgt 660 gagatgttaa aggaatatcc tgaaaagtgt acggaagaac agattcgtac attattggct 720 gcagatcatc cagaagtgca ggtagctact ttacagatca ttctgagagg aggtagagta 780 'ttccggtcat cttctataat ggaatcggtt caaaagttag cttgtaattc actttctgct 840 cgtgttcaga tgcaagctgc agccattctc tatttagaag gagatccttt cggagaagat 900 aagcttacag aaggtttatc agctacttcc agcatccttt gtgaagctgc ctcagaagcg 960 •gtctgctcat tagggattca tggagttcat ttagctggac gttttttatc aaaagtacaa 1020 ggaatgcgtt ctcgagtgaa tcttgctttc gcgcttttgg taagtcgaga gaaggtagaa 1080 gaagctggag atgttgttgc ttcttttatt catagaatag agccctgtcg agctattgaa 1140 cagtttttat gtgaagatca gaagattttt gtagcttcat ctcctctgca ggtagaaatc 1200 atgaaaaggg atttggcgaa gaagatcatt cgtttattag ttgcagctca gtacagcaaa 1260 gcaaaaatgg ttgtcgctca gtatttagca gggcagcagg tgggatggag tttctgťtct 1320 gaagtctttt gggaagaagg ggatagcgag gattttgttg aaccattaca agaagagagt 1380 tttgcgtttg ccttagagaa agctctttct tttttgcaac gcgaaggagg agaagctggg 1440 ttgcatgcag tgatcagttt atatccacat agtcgctggc aagacaagtt gactatcttg 1500 gaagcaattg cttattcaga aaatagaatc gctacatgtt ttttaagaga gcgttgtctg 1560 caggaagcgg cctctttáca atcggcagct gcaggagctg tattcgcctt attcaaa 1617 <210> 536 <211> 312 <212> DNA <213> C. Trachomatis Ď serovar <400> 536 atgcaaactt cccggatcag ctcttttttc cgagggcttg ttcacctgta ccgttgggcg 60 atttctcctt ttctcggggc tccttgtcgc tttttcccta catgctctga gtacgctctt 120 gttgcactaa agaaacatcc gctcagaaaa agcctttttc tcatcgccaa gcgcttactc 180 áaatgcggcc cttggtgcat aggaggtatc gatctcgtcc ctagaacttc tgttgaagaa 240 ťatctcagtt cccctacccc tctagcagaa tccccagacg acaggactgt gccacacacc 300 caagaaactt ct 312 <210> 537 <211> 1008 <212> DNA <213> C. Trachomatis D serovar ····♦· ' '♦ ·’ ·· · 9 4 4 94 4 · .>· · · <’· · ' · '« • ··· · ,···· · · « • ··· » 4 · ι· · · · • · · · · · · · 9 9
488 <400> 537 atgcagcttt tttttggtag attttacgaa gtggcgtgta tagtagcaag tattttgagg gagagggatg taggagtttt tatggggata gaaggaagag gatcaggagc tatgcaaagt aaaaaaacga ttaaatggct gaagcaagct ctcgttctta gttctattgt gaatatccta ttactgcttt tgatttattc gaccgtattt agaaaagata tttataaatt acgggttttt ccagggaatc tcatcgctaa aagttcacga atagggaaga ttcctgaaga cattttggaa agactagaaa atgcttcgtt tgccgattta ttagccttgt tgcaggaaga gagaatggtt ttcggccatc cattaaaatc ttgggctcta ggggtgagca tccaaaaata ttttgtagat atcgctccta tgctgacgca tcctttaact tttattagac tcaaaagtcc tgaacgtact tggttacttc cggatattaa tgatcaggag tttacacgga tttgtcagta tttgcttaca gagaggttcc cattctcttc acgaggtttt tttcgtatta tggtgcgtga ttgtgaagca gggatggtgg atgaagatgt tctgtatcgg ttttgtcatc ttcctgagtt tctctatgtg cgttctctcc tttttggtgc ggaaatcgaa gctgcttcgg tcgcttctct ggcaagaatg attatccaag gaggggagga cttattcttt tccctgtgtt gtttagaaaa tcgtcaaacg gcgatttctg atcatcagag gcgctgtttt ctgaaagctt atgtggatag acaggáacct ttagcagctc ttctcttgtt agtacatgac gcggactggg tgttgcatga gttttctgat agcgatttac aatcctttat tcaacttttg cctagagagg cacactatac taagaagttt cttgggtgtg tggcacagtc ctgtcgtctg gggattctgc tagagggg <210> 538 •<213> 1278 <212> DNA <213> C. Trachomatis D serovar <400> 538 atgtatgttc gctctatctt ttttagtatt atcgccttcc taacggtcgg atgctccttt tctcctccag aatcgggctt aatcatagcc attcacgatg atcctcgctc tctttctcca gaaaaaggag aaaatgcttt ccatttttct ttgtccaagg ctttatttgc tactctcttc agagaagagc tctctggatt aacccctgct ctggtctcct cctatcaagt ttcggaagac gggcggtttt atcgtttttg tattcgtaaa gatgctaagt ggagtgacgg ctctctttta cttgcagaag atgtaatagc tgcttgggaa cacactaaac aagctgggcg atattcccta ctttttgaaa agctatcttt tcgagcctct tcttcttcag aaatccttat tgaactcaaa gaacccgagc ctcaactatt ggcgatatta gcctctccgt tttttgctgt gtatcgtcca gaaaatcctt ttctttcttc tggacctttt atgccaaaaa cctatgtgca agggcaaacg ctcgttctac aaaaaaaccc ttattactat gaccatgcgc atgtggaatt acattccata gactttcgca tcattcccaa catttacaca gctctacacc tcttaagaag aggtgacgtg gattgggtgg ggcagccttg gcaccaaggg attccttttg agcttcggac tacctctgct ctctacaccc attactctgt agatggcaca ttctggctta ttcttaatcc caaagatcct gtactttcct ctctatctaa tcgtcagcga ttgattgctg ccgtccaaaa ggaaaaactg gtgaagcaag ctttaggaac acaatatcga gtagctgaaa.gctctccatc tccagaggga atcatagctc atcaagaagc ttctactcct tttcctggga aaattacttt gatatatccc aataatatta cgcgctgtca gcgtttggcc gaggtattgc aagaacaatg ccgagacgca ggtatccagc tgactcttga aggactcgaa taccatgtat ttgttcaaaa acgagccact caagatttct ctgtctccac agcaacttct atagctttcc atccccttgc taaatctaag ttcgatcaaa cggctctaga caatttcact tgtctgccct tgtaccacat agaatatgat tatattttga gcagaccgct agatcaaatt gttcactatc cttcaggtag tgttgatttg acctatgcac actttcac <210> 539 <211> 1815 <212> DNA <213> C. Trachomatis D serovar <400> 539 atgcaaaata ttcttcgaac ttcttcttgc agatatatgt ttttgctggg tattcgttcg gtgtggaatc gggtggctgt tgtgaataac tttagaggaa gttcatggaa aattgtagca atccccagtt gtatactgtt tactttgata ttccatttac ctagatggct gattgatttt ggggtatgta caaatttagc gtgctccttg tcgatcattt tttgggtgtt ttctctacgc tcttcagctt cggctcgtat tttcccttct ctccttttgt atctttgtct attgcgactt ggcctgaatt tagcctccac ccgatggatt ttatcttctg gatgggcttc tcctttaatt tttgcgttag ggaatttctt ttcccttggg agcatcccgg ttgctcttac ggtatgttta
120
180 .240
300
360
420
480
540
600
660
720
780
840
900
960
1008
120
180
240
300
360
420
480
540
600
660
720
780
840
900
960
1020
1080
1140
1200
1260
1278
120
180
240
300
360
420 • · ··· 9 ' · · • ··· · ·.-··© · · ·
Φ Φ · Φ Φ · φ«· · « • ·. Φ··· · φ · © *·· ··· ·· ΦΦ Φ» Φ·
489 ctcctgtttt tagtgaattt tctcgtcata actaaaggag cagagcgtat tgcggaagtg 480 cgagctcgtt tttcattaga agcgctccca ggtaaacaaa tgtctttaga tgctgatatt 540 gctgctggaa ggatcgggta tagcagagcg tctgttaaaa aaagctctct tttagaagag 600 agtgattact tctccgccat ggagggcgta ttccgctttg taaaaggcga tgcgataatg 660 agttgggtgt tgttaggagt gaatatccta gctgctctgt ttttaggacg agctactcat 720 gttggcgatt tgtggttaac tgtattaggc gatgctttag tgagtcaaat tccagcattg 780 cttacatcgt gtgcagcagc aacgcttata gctaaagttg gggaaaaaga aagtctagcg 840 cagcatctgc tagattatta tgagcagagt cgccagagtt ttctttttat cgctttgatc 900 ctatgtggga tggcttgtat tccaggagct cctaaagctc tgatcctagg tttttcagtt 960 ttattattct tagggtataa gaatccttct tcaggagaga ctcttctctt ccagaaagaa 1020 cgggtagagt ttgtattgcc tgatgaggga gtgggaaatc ctgctaattt gtacaaggac 1080 gcccgcaatc agatttatca agagttaggc gtagttttcc cggaagctat tgttgtacgt 1140 catgtaacaq gatcttctcc acgtttaatc ttttctgggc aagaggtcgc tttgagagag 1200 ctgtcttgcc cagctatact agaatcgatt aggcagctag ctccagaaac gatcagtgaa 1260 cgcttcgtta ctcgcttagt tgatgagttt cgagagcatg cattcttatc gatagaagag 1320 atccttccgt taaaaatatc agagaattct ttgattttct tattgagagc tcttgttaga 1380 gaacgagtgt ctttgcattt attccctaag attctcgaag ctatagatgt atatggctct 1440 caaccaaaga attctcagga attggtagag tgtgtacgaa aatatcttgg gaagcaaatt 1500 ggtttatcct tatggaatcg ccaagatgtc ttagaggtaa ttacgataga ctctctggtt 1560 gagcagtttg tgagagattc acaagaaaag gttgtgttgg atttaaatga aaaagtagtt 1620 gctcaggtga agcatttatt gcgggtaggg gaggggaatt ttcgagctat cgtaacggga 1680 tccgaaacaa gaaaagaact gaaacgcata gtggatcctt atttcccaga tttattggtt 1740 ttagcacata gcgaacttcc agaagagatc cctaťaactt tgttaggagc ggtgtctgat 1800 gaggttttat tatca 1815 <210> 540 <211> 519 <212> DNA <213> C. Trachomatis D serovar <400> 540 atgaaaaagt tcttattact tagcttaatg tctttgtcat ctctacctac atttgcagct 60 aattctacag gcacaattgg aatcgttaat ttacgtcgct gcctagaaga gtctgctctt 120 gggaaaaaag aatctgctga attcgaaaag atgaaaaacc aattctctaa cagcatgggg 180 aagatggagg aagaactgtc ttctatctat tccaagctcc aagacgacga ttacatggaa 240 ggtctatccg agaccgcagc tgccgaatta agaaaaaaat tcgaagatct atctgcagaa 300 tacaacacag ctcaagggca gtattaccaa atattaaacc aaagtaatct caagcgcatg 360 caaaagatta tggaagaagt gaaaaaagct tctgaaactg tgcgtattca agaaggcttg 420 tcagtccttc ttaacgaaga tattgtctta tctatcgata gttcggcaga taaaaccgat 480 gctgttatta aagttcttga tgattctttt caaaataat 519 <210> 541 <211> 1062 <212> DNA <213> C. Trachomatis D serovar <400> 541 atgtctcaat ccacttattc tcttgaacaa ttagctgatt ttttgaaagt cgagtttcáa 60 ggaaatggag ctactcttct ttccggagtt gaagagatcg aggaagcaaa aacggcacac 120 atcacattct tagataatga aaagtatgct aaacatttaa aatcatcgga agctggcgct 180 •atcatcatat ctcgaacaca gtttcaaaaa tatcgagact tgaataaaaa ctttcttatc 240 acttctgagt ctccttccct agtttttcaa'aagtgtttag aattattcat tactcctgtt 300 gactcaggat tcccaggtat tcatccgaca gccgttatcc atccaactgc gattattgaa 360 gatcatgttt gtattgagcc ctatgctgta gtttgtcagc atgctcatgt tggatctgct 420 tgccatattg ggtcaggtag cgtcattgga gcttattcaa ccgttggaga acactcttat 480 atccatcctc gagtagttat tagagaacga gtctctattg ggaaacgagt aattattcaa 540 ccaggagctg ttataggctc ttgtgggttc gggtatgtta ctagtgcttt tggacagcac 600 aaacatttaa aacacctcgg gaaagtcatt attgaagacg acgtagagat cggcgcaaat 660 acaactatcg acagaggccg gtttaaacac agtgttgtgc gtgaaggttc gaaaattgat 720 aatcttgtgc aaattgccca tcaggtggag gtcggtcaac acagcatgat tgtagctcaa 780 gctggaattg caggttctac aaagattggc aatcatgtaa ttatcggtgg acaagccggc 840 '490 · '· 0 Φ 0
Φ Φ Φ <Φ0’ ♦ ···
Γ;» ataaccggac atatttgcat tgcagatcat gtcattatga tggctcagac tggcgtcact 900 aaatctatta cttctccagg gatctatggc ggagcgcctg ctcgtccata tcaagaaatt 960 catcgccaag tagccaaagt acgcaacctt ccacgactcg aagaacgtat cgcagcactt 1020 gagaaactag tccagaaatt agaagctctc tcagaacaac at 1062 <21O> 542 <211> 1263 <212> DNA <213> C. Trachomatis D serovar <400> 542 atgactgcat caggaggagc tggagggcta ggcagcaccc aaacagtaga cgttgcgcga 60 gcacaagctg ctgcagctac tcaagatgca caagaggtta tcggctctca ggaagcttct 120 gaggcaagta tgctcaaagg atgtgaggat ctcataaatc ctgcagctgc aacccgaatc 180 aaaaaaaaag gagagaagtt tgaatcatta gaagctcgtc gcaaaccaac agcggataaa 240 gcagaaaaga aatccgagag cacagaggaa aaággcgata ctcctcttga agatcgtttc 300 acagaagatc tttccgaagt ctccggagaa gattttcgag gattgaaaaa ttcgttcgat 360 gatgattctt ctcctgacga aattctcgat gcgctcacaa gtaaattttc tgatcccaca 420 ataaaggatc tagctcttga ttatctaatt caaacagctc cctctgatgg gaaacttaág 480 tccactctca ttcaggcaaa gcatcaactg atgagccaga atcctcaggc gattgttgga 540 <ggacgcaatg ttctgttagc ttcagaaacc tttgcttcca gagcaaatac atctccttca 600 tcgcttcgct ccttatattt ccaagtaacc tcatccccct ctaattgcgc taatttacat 660 caaatgcttg cttottactt gccatcagag aaaaccgctg ttatggagtt tctagtaaat. 720 ggcatggtag cagatttaaa atcqgagggc ccttccattc ctcctgcaaa attgcaagta 780 tatatgacgg aactaagcaa tctccaagcc ttacactctg taaatagctt ttttgataga 840 aatattggga acttggaaaa tagcttaaag catgaaggac atgcccctat tccatcctta 900 acgacaggaa atttaactaa aaccttctta caattagtag aagataaatt cccttcctct . 960 tccaaagctc aaaaggcatt aaatgaactg gtagggccag atactggtcc tcaaactgaa 1020 gttttaaact tattcttccg cgctcttaat ggctgttcgc ctagaatatt ctctggagct 1080 gaaaaaaaac agcagctggc atcggttatc acaaatacgc tagatgcgat aaatgcggat 1140 aatgaggatt atcctaaacc aggtgacttc ccaCgatctt ccttctctag tacgcctcct 1200 catgctccag tacctcaatc tgagattcca acgtcaccta cctcaacaca gcctccatca 1260 ccc 1263 <210> 543 <211> 693 <212> DNA <213> C. Trachomatis D serovar <400> 543 atgatggagg tgtttatgaa ttttttagat cagttagatt taattattca aaataagcat 60 atgctagaac acacatttta tgtgaaatgg tcgaaggggg agcttactaa agagcaatta 120 caggcgtatg ccaaagacta ttatttacat atcaaagcct ttcctaaata tttatctgcg 180 attcatagtc gttgcgatga tttagaggcg cgtaagttat tgttagataa cttgatggat 240 gaagagaacg gttaccctaa tcatattgat ttgtggaagc agtttgtgtt tgctctagga 300 gttactccag aagagttaga ggctcatgag cctagtgaag cagcaaaagc gaaagtagct 360 actttcatgc ggtggtgtac aggagattct ttagctgcag gagtggctgc tttgtattct 420 tatgagagtc aaattccacg tatcgctaga gagaaaattc gtggattgac tgagtacttt 480 ggattttcca atcctgaaga ctatgcatat ttcac.agaac atgaagaagc ggatgtgcgg 540 catgctagag aagaaaaagc gctcattgag atgcttctca aagatgacgc tgataaagtg 600 ttagaggcat cgcaagaagt aacgcaatct ttgtatggct ttttagattc ttttttggat 660 ccaggaactt gttgtagttg tcatcaatct tat 693 <210> 544 <211> 729 <212> DNA <213> C. Trachomatis D serovar <400> 544 atgaaaataa ctccgatcaa aacacgtaaa gtatttgcac atgattcgct tcaagagatc 60 ttgcaagagg ctttgccgcc tctgcaagaa cggagtgtgg tagttgtctc ttcaaagatt 120 *
Su*
I ·*·· • ·» • 9 99 ♦·' ·· • · • ···
-491 gtgagtttat gtgaaggcgc tgtcgctgat gcaagaatgt gcaaagcaga gctgataaaa 180 aaagaagcgg atgcttattt gttttgtgag aaaagcggga tatatctaac gaaaaaagaa 240 ggtattttga ttccttctgc agggattgat gaatcgaata cggaccagcc ttttgtttta 300 tatcctaaag atattttggg atcgtgtaat cgcatcggag aatggttaag aaattatttt 360 cgagtgaaag agctaggcgt aatcattaca gatagccata ctactccaat gcggcgtgga 420 gtactgggta tcgggctgtg ttggtatgga ttttctccat tacacaacta tataggatcg 480 ctagattgtt tcggtcgtcc cttacagatg acgcaaagta atcttgtaga tgccttagca 540 gttgcggctg ttgtttgtat gggagagggg aatgagcaaa caccgttagc ggtgatagag 600 caggcaccta atatggtcta ccattcacat cctacttctc gagaagagta ttgttctttg 660 cgcatagatg aaacagagga cttatacgga ccttttttgc aagcggttac gtggagtcaa 720 gaaaagaaa 729 <210> 545 <211> 1149 <212> DNA <213> C. Trachomatis D serovar <400> 545 atgcttccac atcagcagaa cagcagttct gaacgtgccc gtcatcacga atctcgctca 60 catcggcatt cctcatcatc aagacatcat gttacgcgat ctcaatcaag cgcactccct 120 caattgcaag agcgtcctgt gcctcatcca cttgcagaaa gagaattgat tatattccat 180 tccgtacatc agcagcagaa taataatcct ctaagaatga tttgcgatac cattcgccaa 240 gctcaaagag ggatatttat gcgcatttac accatatcat ctgatgacat tatccaatct 300 ctaattcaga cttcgcacca tgttcctgta gaagtcaaat accattgcgg agaaagctta 360 cctgtagcat gtcaaaactc gagagtcgtc ttgcgtctga ctaacggaag aaccctccaa 420 cataaaaaaa ctatgttggc tgatttccaa acagtagtta caggatcagc caactacacg 480 gacttgtctc tcaatcacga tgccaacgtg acggcatgta tagaaagttc agaattacat 540 gacgcagtct tttctgaaag accccaactg gttcatgtcg gacctcagct gctcaattac 600 attcctatcc agcgtttgat tcctaatgcá gcatcaaaaa tgattttgaa tgcaattaac 660 caagcaacgg acagtatttt tgtcttgatg tatatcttct taagcccaga attcttctta 720 gctcttgccc aagctatgcg aagaggagtt cgagtaaaag taatcatcga caaccattcc 780 aaacaagata catgcaaact actgagcaaa ttgggtatcc aacttcctat ttacgaaaga 840 aaaacggaag gcgttctcca'tactaagatt tgttgcatcg acaataaaac tctaatcttt 900 ggctctgcta actggagcgg tgctggtatg attaaaaact ttgaagacct attcatcctt 960 cgcccaatta cagagacaca gcttcaggcc tttatggacg tctggtctct tctagaaaca 1020 aatagctcct atctgtcccc agagagcgtg cttacggctc ctactccttc aagtagacct 1080 actcaacaag atacagattc tgatgacgaa caaccgagta ccagccagca agatatccgt 1140 atgagaaaa 1149 <210> 546 <211> 579 <212> DNA <213> C. Trachomatis D serovar <400> 546 ttgtggtttt ttttaggctc tccgtcagcg attactaat.t ttagcagggt agatgtggct 60 ttaaacctaá gaataaatag gcagatacga gctcctaggg tacgtgtaat aggttccgca 120 ggagagcagc taggcatatt gagtataaaa gaggccctag atttagccaa ggaagctaat 180 ttagaccttg ttgaggttgc ttcaaactca gagcctcccg tgtgcaaaat catggactat 240 gggaagtatc gttacgacgt aactaaaaaa gaaaaagata gtaagaaagc acagcaccaa 300 gtacgtatca aagaggttaa gcttaagcct aatatcgatg ataacgactt tcttacgaaa 360 gcaaagcaag ctagagcctt tattgagaaa ggaaataaag taaaggtttc ttgtatgttt 420 cgggggcgag agttggctta tcccgaacac gggtataagg ttattcaaag aatgtgtcag 480 ggcttagagg acataggttt tgttgagtca gagcctaaac tgaatggccg ttctttgatc 540 tgtgttattg ctccgggaac actaaaaact aagaaaaaa 579 <210> 547 <211> 3159 <212> DNA <213> C. Trachomatis D serovar
•492 ·· ·«*· ο» ·« * « t · · · ♦ ··· · · ··· • · < · · · · • · · » · · »··· ··· ♦· »· <400> 547 atgtttacaa ggatagttat ggtcgatcta caagaaaagc aatgcacaat tgttaagcgc aatggaatgt ttgttccttt cgatcggaac cgtatttttc aggctttaga agcagctttt cgagacactc gcagaattga tgatcatatg cctttgcctg aagatctgga aagttccata cgctcgataa cgcatcaggt agttaaagaa gttgtgcaaa agattacaga tggacaagtg gttactgtag agcgtatcca agatatggtt gaaagccaac tatatgtgaa tggtttgcaa gatgttgctc gcgattatat tgtctatcgc gatgaccgta aagcgcatcg gaaaaaatct tggcaaagcc tatccgttgt tcgtcgttgt gggactgttg tacactttaa tcctatgaaa atttccgccg ctttggaaaa agctttccga gctaccgata agactgaggg gatgactccá agttctgtgc gagaggaaat caatgctttg acgcaaaaca ttgtcgcgga aatagaagaa tgttgtcctc aacaggatag acgcattgat atcgagaaga ttcaagatat tgttgaacag caactaatgg ttgttgggca ttatgctgtt gcaaagaact atattcttta tcgagaagct cgcgctcgtg ttcgtgataa cagagaagag gacgggagta cagaaaagac tatagcagaa gaagctgttg aggtgctcag taaagacggt tctacctata caatgacgca ttcgcagttg ttggctcatt tagcgcgcgc ttgtagtcgt tttccagaaa cgacagatgc ggcgctgctt accgatatgg ctttcgcaaa tttctattcc ggtatcaaag agtctgaagt agtactggcc tgtattatgg cggctcgtgc caatattgaa aaggagcctg attatgcctt tgttgctgca gagctcttac ttgacgttgt atataaggaa gcgttaggga aatcgaaata tgctgaggat ttagaacaag cacatcgcga tcatttcaaa cgctacátcg cagaagggga tacctatcgt ctgaatgctg aactgaaaca tctttttgat ttagacgcgt tagccgatgc tatggatcta tctcgagatc tacagttttc ttacatgggt attcaaaatc tgtatgatcg ttattttaat caccacgaag gttgccgttt agaaactccc caaatttttt ggatgcgcgt tgctatgggg ttggcattga atgagcaaga caagacttct tgggctatta ctttttataa tttgctttcg acattccgat atacaccagc tacgccaacc ttgttcaatt caggtatgcg gcattctcag ttaagctctt gctatctttc cactgtacaa gataatttgg tcaatatcta taaggtcatt gctgataacg ctatgctatc taagtgggca ggagggatag gtaatgattg gacggcgatt cgtgcaacag gggctttaat taaaggaacc aatggaagaa gtcagggagt aattcctttt attaaggtga caaatgatac agcagtcgca gtgaatcaag gtggtaaacg caagggagct gtatgcgtct atttagaagt ttggcacctc gactacgaag atttccttga attgagaaag aatacagggg atgagcgtcg acgggctcat gatgtcaata tagctagctg gattccagat; cttttcttca aacgtttaca gcaaaaaggg acatggactc tattcagccc agatgatgtt ccgggattac acgatgctta tggggaagaa tttgagcgtt tgtacgaaga atatgagcgg aaggttgata ccggagagat tcggttattc aagaaggtag aagctgaaga tctgtggaga aaaatgctca gcatgctttt tgaaacggga cacccatgga tgacttttaa agatccatcc aacatccgtt cggctcaaga tcataaaggc gtggtgcgtt gttccaatct gtgtacggag attttgttaa actgctcgga gacagaaact gctgtttgta atttaggatc gattaactta gttcaacata tcgtagggga tgggttagat gaggaaaaac tctctgagac gatctctata gcagtccgta tgttggataa cgtgattgat attaactttt atccaacaaa ggaagctaaa gaggcgaact ttgctcaccg cgctattgga ttaggggtga tgggattcca agatgccttg tataagctag atataagcta tgcttcgcaa gaagctgtag aatttgctga ctacagttca gagttgattt cttactatgc gattcaagct tcttgtctgc tcgctaaaga acgaggcact tacagctctt ataaaggatc gaaatgggat agaggtttgc tccctattga tacgattcag ttgttagcga actatcgagg agaagcaaat ctccagatgg atacgtcatc aagaaaagat tgggaaccta tccgtagttt ggttaaagag catggtatgc gacattgtca gcttatggct atagctccga cagcgacgat ctccaacatt ataggagtaa ctcaatctat tgagccaacg tacaaacatt tgtttgtgaa gtctaatttg tccggagaat tcacgattcc aaatgtgtat ttaattgaga agttgaagaa attaggtatč tgggatgctg atatgttaga tgacctgaaa tattttgatg ggtctttatt ggaaatcgag cgtataccag atcacttaaa acatattttc ttgacagctt ttgagattga accagaatgg attatcgaat gcgcgtctcg aagacaaaaa tggattgata tggggcaatc cctcaacctt tatcttgccc agccagacgg gaaaaaactg tcgaatatgt atttaacggc ttggaaaaaa ggtttgaaaa ctacgtatta tctgagatct tcatcagcaa cgaccgttga aaaatctttt gtagatatta ataagagagg aattcagcct cgttggatga agaataagtc tgcttcggca ggaattattg ttgaaagagc gaagaaagca cctgtctgtt ctttggaaga agggtgtgaa gcatgtcag <210> 548 <211> 1038 <212> DNA <213> C. Trachomatis D serovar <400>· 548
120
180
240
300
360
420
480
540
600
660
720
780
840
900
960
1020
1080
1140 .1200
1260
1320
1380
1440
1500
1560
1620
1680
1740
1800
1860
1920
1980
2040
2100
2160
2220
2280
2340
2400
2460
2520
2580
2640
2700
2760
2820
2880
2940
3000
3060
3120
3159 • Φ φφφφ φφ φφφφ φ' φ φ φφφ φφ φφ • * » φ · φ φ φφφφ φ φ φ φ φφφ φφ φφφ· · φ φ φφφφ φφφφ • ΦΦ φφφ ·· ·Φ φφ φφ
493 atgcaagcag atattttaga tggaaaacag aaacgcgtta atctaaatag caagcgtcta 60 gtgaactgca accaggtcga tgtcaaccaa cttgttccta ttaagtacaa atgggcttgg 120 gaacattatt tgaatggctg cgcaaataac tggctcccta cagagatccc catggggaaa 180 gacatcgaat tatggaagtc ggatcgtctt tctgaagatg agcggcgagt cattcttttg 240 aatttaggtt ttttcagcac cgcagagagc ttggttggga ataatattgt tctagcaatt 300 tttaaacatg taactaatcc ggaagcgaga caatatcttt taagacaagc ttttgaagaa 360 gcggttcaca cgcacacatt tttgtatatt tgtgagtcac tcggattaga cgagaaagaa 420 attttcaatg cctataacga gcgtgctgcg attaaggcca aagatgattt ccagatggaa 480 atcactggca aggtattaga tcctaatttt cgcacggact ctgttgaggg tctacaggag 540 tttgttaaaa acttagtagg atactacatc attatggaag ggattttctt ctatagtggg 600 tttgtgatga tcctttcctt ccacagacaa aataagatga ttggtattgg agaacaatat 660 caatacatct taagagatga gacaatccac ttgaactttg gtattgattt gatcaacggg 720 ataaaagaag agaacccgga gatttggact ccagagttac agcaagaaat tgtcgaatta 780 attaagcgag ctgtcgattt agaaattgag tatgcgcaag actgtctccc tagagggatt 840 ttgggattga gagcttcgat gttcatcgat tatgtgcagc atattgcaga ccgtcgtttg 900 gaaagaatcg gatfcaaaacc .tatttatcat acgaaaaacc cattcccttg gatgagcgaa 960 acaatagacc ttaataaaga gaaaaacttc tttgaaacaa gggttataga atatcaacat 1020 gcagcaagct taacttgg 1038 <210> 549 <211> 978 <212> DNA <213> C. Trachomatis D serovar <400> 549 atgtcttttt ttcatactag aaaatataag cttatcctca gaggactctt gtgtttagca 60 ggctgtttct taatgaacag ctgttcctct agtcgaggaa atcaacccgc tgatgaaagc 120 atctatgtct tgtctatgaa tcgcatgatt tgtgattgcg tgtctcgcat aactggggat 180 cgagtcaaga atattgttct gattgatgga gcgattgatc ctcattcatá tgagatggtg 240 aagggggatg aagaccgaat ggctatgagc cagctgattt tttgcaatgg tttaggttta 300 gagcattcag ctagtttacg taaacattta gagggtaacc caaaagtcgt tgatttaggt 360 caacgtttgc ttaacaaaaa ctgttttgat cttctgagtg aagaaggatt ccctgaccca 420 catatttgga cggatatgag agtatggggt gctgctgtaa aagagatggc tgcqgcatta 480 attcaacaat ttcctcaata tgaagaagat tttcaaaaga atgcggatca gatcttatca 540 gagatggagg aacttgatcg ttgggcagcg cgttctctct ctacgattcc tgaaaaaaat 600 cgctatttag tcacaggcca caatgcgttc agttacttta ctcgtčggta tctatcctct 660 gatgcggaga gagtgtctgg ggagtggaga tcgcgttgca tttctccaga agggttgtct 720 cctgaggctc agattagtat ccgagatatt aťgcgtgtag tggagtatat ctctgcaaac 7θθ gatgtagaag ttgtcttttt agaggatacc ttaaatcaag atgctttgag aaagattgtt 840 tcttgctcta agagcggaca aaagattcgt ctcgctaagt ctcctttata tagcgataat 900 gtctgtgata actattttag cacgttccag cacaatgttc gcacaattac agaagaattg 960 ggagggactg ttcttgaa 978 <210> 550 <21Ϊ> 438 <212> DNA <213> C. Trachomatis D serovar <400> 550 atgcaaaatc aatttgaaca actccttact gaattaggga ctcaaatcaa cagccctctt 60 actcctgatt ccaataatgc ctgtatagtt cgctttggat acaacaatgt tgctgtacaa 120 attgaagagg atggtaattc aggattttta gttgctggag tcatgcttgg aaaacttcca 180 gagaatacct ttagacaaaa aattttcaaa gctgctttgt ctatcaatgg atctccgcaa 240 tctaatatta aaggcactct aggatacggt gaaatctcta accaactcta tctctgtgat 300 cggcttaaca tgacctatct aaatggagaa aagctcgccc gttacttagt tcttttttcg 360 cagcatgcca atatctggat gcaatctatc tcaaaaggag cacttccaga tttacatgct 420 ctaggtatgt ateacctg 438 <210> 551 <211> 1581 <212>-DNA • ·
9· ···· » · · • ··· *· ·· < • · · · • ' · ··« · • · · · · · • · · · ·· 4 ··«· ··
494 <213> C. Trachomatis D serovar <400> 551 atgccgtcat tatcccaatc ccgacgtatc atccagcaat cttccattcg aaagatttgg 60 aatcagatag atacttctcc taagcatggc gtatgcgtac cgttattttc tctctatact 120 caagaaagtt gtgggatagg tgaatttctt gacctgattc ctatgatcga ttggtgtatc 180 tcgtgtggtt ttcaaatcct tcaaattctt ccgattaacg atacagggtc ctgttcgagt 240 ccttacaata gcatttcttc gatagcactc aatcctcttc acctttctat ctctgcgctc 300 ccctataaag aagaagtgcc agctgcggaa acacgcatac gagaaatgca gcaactctct 360 caacttcctc aagtacatta tgaaaaagtt cgctctatga agagagattt ttttcaagag '420 tactaccgcg tgtgtaaaca gaaaaaactc actgatcatc ctgattttta tgccttctgt 480 gaacaggaaa aatattggtt acatccctac gctctctttc gctctatccg agaacatttg 540 gataaccttc ctattaatca ttggccaacc acctacacag atctctccca gattaccgag 600 catgaacgta cttttgcgga agatatacaa tttcactctt atctacagta tttgtgcttc 660 caacagatga cacaagtgcg ggagcatgcc aattgcaaaa gctgtctcat caaaggggat 720 atccctattc taatcagtaa agatagctgc gatgtctggt tttataggca ttacttttcc 780 tcttcagaat ctgtaggtgc tcctcctgac ctgtataatg cggaaggtca gaactggcat 840 ctccccattt gtaatatgaa aactttgcaa caagataacť acctctggtg gaaggagcgc 900 ttacgttatg cggagaattt ttactcttta taccgtcttg atcatgtcgt cggtctcttt 960 cgattttggg tatgggatga gtctggatgc ggacgctttg aacctcatga tccgaaaaac 1020 tatctagctc aagggcaaga tatcttatct cacctcttga ccagttcatc tatgctacct 1080 ataggagaag atctgggaac gatcccttcc gatgtgaaac gtatgctcga gtcttttgcc 1140 gtatgcggca ctagaattcc tcgttgggaa cgaaáctggg aggggaatgg agcctatacc 1200 cctttcgatc aatacgaccc tctatccgtc acaagcctct ctactcatga ttcctctaca 1260 ttagcctcat ggtggaaaga atctcctcag gaatccaaac tatttgctca gtttttagga 1320 ctcccctatt cttccaccct atctcttcac aatcataccg aaatcctgaa actctctcac 1380 aaaacctctt ctatttttcg catcaatctt attaatgact atctggctct gttcccggat 1440 ttgatatcaa aaactcctcg ctacgaaaga atcaatctgc caggaactat ttcaaaaaat 1500 aattgggtgt atcgagttaa gccttctatt gaagatttat cctctcattc taagctaaat 1560 tctttacttg aggctctatt t 1581 <210> 552 <211> 1950 <212> DNA <213> C. Trachomatis D serovar <400> 552 atgaccatcc ctattcatga gaataaatat tccatgatct ccttcacacg cacgataggt 60 tttcgtttat ggcttatctg tgtggccgct attatgttcc ccttagggat caatatcttg 120 caattgaacc ttcagcaata caagaaaaca ctctcctcta tcacttccga tctgcgagaa 180 aatgctttat ttaaagctca cactttacaa caaactattc ctttaaatat tgatatcetg 240 gctctctttt cagaaatttt tgatctagac agaggagtcc ctgctgaacc ggatcttgct 300 ctaagtaaag aaatggagaa gatctttcac tccacttata aagagatttc tctagtaaaa 360 aaagaggctg atgggaactt tagagtcgtt gcttctagcc gcatcgaaca acttggtaaa 420 aactataacc aagagatttt cctatcagat tctcaaccat ttctcgctac tttgcgacat 480 tccggttccg attctcaggt tctggctgtc ttacaaacga atatttttga tatcagctct 540 caagaagtcc ttggcgtact ctataccctt tcggatacca actatttatt aaatggatta 600 cttgcagcta aagatcctct ctccgtaaaa actgcaattc tctctaaaaa tggcatcatt 660 cttcaagcaa cagattcctc tttagatctt gtatcgatac acaaaacggt ttctaaagag 720 caattttgtg atgttttcct tcgcgatgat atctgccccc' ctcatctctt actacgcccc 780 cctttaaatc tcgatcctct tccttatggc gagaatttcg tttcattttg cattgggaac 840 acagaaatgt ggggatatat ccactctcta cctgagatgg atttccgtat attgacttat 900 gaagaaaaat ctataatttt tgcttcttta tggcgacgaa ccttactgta ctttgcttat 960 ttttgttgcg tacttttagg aagcattaca gcttttttag ttgcaaaacg cctatccaag 1020 cctatccgga agctggctac ggccatgatg gaaactcgtc gcaatcaaca ccatccatat 1080 gaacccgatt ctctgggctt tgaaattaat catctaggág aaatctttaa ctccatggtg 1140 caaagccttt tgcaacagca atctttagca gaaaaaaatt tcgagatcaa acagcatgca 1200 caaaatgcat tacgactagg agaagaagct caacaatgcc tgcttcctaa ccagctgcct 1260 gattccccaa ctacagaaat cgctaaagcc tatattcctg caattacggt aggaggagat 1320 ttctttgata tctttgttat aggcgaaggt ccccaagcta aactctttct aatcgttgct 1380 gatgcttccg ggaaaggagt caatgcgtgc gcctactcct tattcctgaa aaacatgtta 1440 • · · ·
MÍ
495 catacctttt tgagtgagct ctcctctatt caagaagccg ttcaacaaac agctgctctc 1500 ttctatcaac agacagctga atctgggatg tttgtaacac tatgcattta ttgttatcat 1560 tacgcaacac gagaactaga atactattct tgtggccaca acccagcgtg tctccgagct 1620 cctaatggag atatctcttt cctgtcgcat cctggtatgg ccttaggatt tttacctgaa 1680 gttcctcctc accctgctta cactctcgtt cttgaagagg agtctctttt agtgctctat 1740 accgatgggg tgactgaagc aagcaataag catggagaga tgtttggaga agaacgctta 1800 aaagcattag tggcttcgtt gacgaaacaa agtgccgaag aagccatcca atctatcatg 1860 ttctctatta agtcttttgt gaaagattgc ccacaacatg acgatatcac tttactcgtt 1920 ttgaaaatac ctaaggaacc ttccgcttat 1950 <210> 553 <211> 939 <212> DNA <213> Č. Trachomatis D serovar <400> 553 atgctcagct acataaagag gcggctgttg tttaatttgc tttctttatg ggtagtagtg 60 actctaacgt tttttattat taagacgatc cccggagatc cttttaatga tgaaaacgga 120 aacatccttt cgtcagaaac tttagcacta ttaaagaatc gttacgggtt agataagcct 180 ttattcaccc agtatcttat ctatttgaaa tgtctgctaa cactagattt cggggaatct 240 cttatctaca aagatcgtac tgtgatcagt attattgctg ccgctcttcc atcttccgct 300 attcťtggac ttgaaagctt gtgtttatcc ctcttcggag gcattactct tggaattctg 360 gcagctttct ataaaaaaag ctgcggccga actattttct tttcttctgt gattcagata 420 tcagtacccg cctttgttat aggagccttt ttacaatatg tttttgctat aaaatattct 480 tgtctaccca tagcttgctg gggaaatttc tctcacacct tattgčcctc aatagcttta 540 gcaattactc ctatggcatt cattactcag ctaacctgtg cctčtgtttc cgccaattta 600 aaaaaagatt acgtcttatt agcttacgct aaaggacttt ctccttttaa ggtgttaata 660 aaacacattt tgccctacgc tttattccct gtgatttcgt actcagcttt tcttataaca 720 actttaatga ctggaacctt ctctatagaa aaccttttct gcatccccgg tcttgggaaa 780 tggttcattt gcagtattaa acaaagagac taccctatca ccttaggact ttctgtgttt 840 tacggggcct ttttcatgct aacttcactt tgttgcgacc ttctgcaagc gtggatagat 900 ccacaaattc gttattctta tgggaaagaa cgttcťaaa 939 <210> 554 <211> 3711 <212> DNA <213> C. Trachomatis D serovar <400> 554 ttgacctgga ttccattaca ttgccactct cagtattcca tcttggatgc aacatgctca 60 atcaagaagt ttgttgccaa agcagtggaa tatcaaattc ccgcgctcgc tcttaccgat 120 cacgggaatt tgtttggcgc ggtcgaattt tataagacct gtaaacaaaa cgcgattaaa 180 cctatcatcg ggtgtgagct atacgtcgca ccctcttctc gtttcgataa aaaaaaagaa 240 cgaaaaagcc gagttgccaa ccatctcatc cttctttgta aagatgaaga agggtatcgc 300 aacctttgtt tgctctcctc tcttgcttac acagaaggtt tttactatgt gcctcgcata 360 gatagagatc ttttgagcca acactccaaa ggacttatct gcttatcagc ctgtttatcc 420 ggatcggttg ctcaagctgc attggaatct gaagaagatt tagaaaaaga tcttttatgg 480 · tatcaagatc tgtttcaaga agactttttc agtgaagtac aactccacaa atcctcagaa 540 gaaaaagttg ctctatttga agaaacttgg ttaaaacaaa actactatca attcattgag 600 aaacaactca aagtaaatga agctgtttta gctacttcta aacgccttgg tattccttca 660 gttgctacaa atgatattca ctatttgaat ccggacgatt ggctcgctca tgaaatttta 720 ctcaatgttc agtctagaga gcctattcgg acagctaaac aaaatactta cattcccaat 780 cctaaacgca aaacctatcc tagtagggaa ttttatttta aatcccctca agagatcgca 840 gagctatttg cagcacatcc agagactatt accaatacgt gtatcgttgc cgagcgctgc 900 cacctagagc ttgattttga aaccaaacac tatcctatct acgtcccaga agctttacaa 960 aaaaaaggat cctacacaga agaggagcgc tacaaagcat cctcagcctt cttagaagaa 1020 ctttgcgagc aaggattaac cagcaaatac acacccgagc ttctaggaca cattgcaaag 1080 aaattccctg gggaagaccc tcttacgctg gttaaagaac gtctcaaatt ggaatcctct 1140 attattatct ccaaagggat gtgcgattac ttgctcattg tctgggatat tattaactgg 1200 gcaaaagatc atgggattcc tgttggcccc ggtcgaggct ctggagcggg ctctgtcatg 1260 cttttccttc tggggattac tgaaatagaa ccgattcgct- tcgacctttt cttcgaacgt 1320
496 ttcatcaacc cggaacggat atcgtatccc gatatcgata tcgatatctg tatgattggc 1380 agagagcgcg ttattaacta tgctatagaa cgtcatggta aagataatgt agcccaaatt 1440 attacatttg gcaccatgaa agccaaaatg gctattaagg atgtgggtag aactttagat 1500 acccccttag ctaaagtgaa cttcatcgcg aaacatattc ccgatcttaa tgctaccatt 1560 acttcggcat tagaggctga tccagaatta aggcaactgt atgtagatga cgctgaagct 1620 gcagaagtta ttgatatggc taaaaaacta gagggatcta tccgcaatac tggagtgcat 1680 gctgcgggag tgattatctg tggagatcct ctcactaacc atatcccgat ttgtgtccct 1740 aaagactcat ccatgatttc tactcagtac tcaatgaagc cagtagaaag cgttggcatg 1800 cttaaagtgg attttttggg tctaaaaacc ttaaccggca ttcacatcgc cacacaggcg 1860 atctataaaa aaacaggcat tctactccgg gctgccacga ttcctctaga tgaccagaat 1920 actttctctc ttcttcatca aggtaaaacc atggggatct tccaaatgga atctcgtggc 1980atgcaagacc ttgctaaaaa cttacgccca gatgcgtttg aagaaattat agcgatcgga 2040 gccctctatc gccctggccc tatggatatg atcccatcat ttatcaatag gaagcatggt 2100 aaagagaata ttgaatacga ccatcctctc atggaaccta ttctaaaaga aacttttgga 2160 attatggttt accaagaaca agtcatgcag attgccggtt cattagcaaa atactctttg 2220 ggagaagggg atgttttacg ccgcgctatg gggaaaaaag accatgaaca gatggtcaag 2280 gaacgagaga aattttgttc aagagccgca gcgaatggca tcgacccttc catagcaacg 2340 actatcttcg ataagatgga aaagtttgct tcctatggat ttaataagtc ccatgccgca 2400 gcttacggtc ttataaccta cacaacagca tatcttaaag ccaactaccc caaagaatgg 2460 cttgccgccc ttctcacttg cgattatgac gatattgaga aagttgggaa gctaattcaa 2520 gaagctcaca gtatgaacat tctcgttctg cctcctgata ttaatgagtc tggacaagat 2580 tttgaagcca ctcagaaagg gattcgcttt tctctaggag ctgtcaaagg cgttggaatg 2640 agcattgtgg atagtattgt tgaagagaga gaaaaaaacg gcccctataa aagtctgcag 2700 gatttcgttc aacgcgcaga ttttaaaaaa gtcactaaga aacagcttga aaatttggtg 2760 gatgcaggaa cctttgactg cttcgaacct aataaagatc ttgcgctggc aatccttaat '2820.
gacctttacg acacgttctc tagagaaaaa aaagaagctg ctacaggagt cctaaccttt 2880 ttttcactag atagcatggc tagagatcct gttaaaatta ctgtctctcc tgaaaatgtt 2940 atccaacgct ctcctaagga gttgttgaaa agagáaaaag aattacttgg agtatatttg 3000 actgcccatc ctatggatgc tgttgaacac atgctccctt tcttatctgt agtcccagct 3060 cgagattttg aaggactccc tcatggaacc attattcgta cagtctttct aatcgataaa 3120 gtcactacta aaatttcctc tgcagagcag aaaaaatttg cacttttaca agtcagcgat 3180 gaagtcgatt catatgaact tccaatctgg gccgatatgt acgccgaata ccgtgatcta 3240 ttggaagaag atcgtcttat ttatgccatt ttggctatag atcgacgtag tgattccttg 3300 cgtctatctt gtcggtggat gcgagactta tctaccgtta atgattcagt aattgcggaa 3360 tgcgacgaag tctatgatcg actgaaaagt cagaaagtat actcttcaac gaaaaaatca 3420 accggagccc agtcctcagc aatgataaag aaagtagaga ctagagagat ctctcccgta 3480 accatctctt tagatttaaa taaattacgc catagccact tatttattct caaagggctg 35.40 atacgcaaat attctggatc tcaagcactc tctcttgtat tcacaaaaga taatcagcgg 3600 ttcgcctcta tctctccaga tgcagatttt ttcgtaacag atgatatctc ttctcttctt 3660 caagaaattg aagcaaccaa tatccctgct cgcgttctag ccactacagt a 3711 <210> 555 <211> 1689 <212> DNA <213> C. Trachomatis D serovar <400> 555 atggtttatt ttagagctca tcaacctagg catacgccta aaacatttcc tttggaagtt caccattcgt tctccgataa gcatcctcaa attgctaaag ctatgcggat tacggggata gccctcgcag ctctatctct gctcgctgta gtcgcctgcg ttattgccgt ctctgcggga ggagctgcca ttcctcttgc tgtcattagt ggaaťtgctg taatgtctgg cctcttatcc gctgccacca ttatctgttc tgcaaaaaag gctttggctc aacgaaaaca aaaacaacta gaagagtcgc ttccgttaga taatgcgacc gagcatgtga gttacctgac ctcagacacc tcttatttta atcaatggga atccttaggt gctctaaata agcagttgtc tcagattgac ttaactattc aagctcccga aaaaaaacta ttaaaagaag ttcttggttc cagatacgat tccattaatc actccatcga agagatctcc gatcgcttta cgaaaatgct ctctcttctt cgattaagag aacattttta tcgaggagaa gagcgttatg ccccctattt aagccctccť ctacttaaca agaatcgttt gctgacccaa atcacatcca atatgattag gatgctacca aaatccggtg gtgttttttc cctcaaagcc aatacactaa gtcatgccag ccgcacacta tatacagtat taaaagtcgc tttatcctta ggagttctcg ctggagtcgc tgctcttatc atctttcttc cccctagcct gccttttatc gctgttatag- gagtatcttc cttagcattg
120
180
240
300
360
420
480
540
600
660
720
780
840 ·«·· *
• · ·
497 gggatggcat ctttccttat gattcggggc attaagtatt tgctcgaaca ttctcctctg aatagaaagc aactagctaa agatattcaa aaaaccattg gcccagatgt cttggcctct atggttcatt accagcatca attactatca catctacatg aaactctatt agatgaagcc atcacagcta gatggagcga gcccttcttt attgaacacg ctaatcttaa ggcaaaaatt gaagatttga caaaacaata tgatatattg aacgcagcct ttaataaatc tttacaacaa gatgaggcgc tccgttctca attagagaaa cgagcttact tattcccaat tcctaataac gacgaaaatg ctaaaactaa agaatcgcag cttctagact cagaaaatga ttcaaattct gaatttcagg agattataaa taaaggacta gaagctgcca ataaacgacg agctgacgct aagtcaaaat tctatacgga agacgaaacc tctgacaaaa tattctctat atggaaaccc acaaagaact tggcattaga agatttgtgg agagtgcatg aagcttgcaa tgaagagcaa caagctctcc tcttagaaga ttatatgagt tataaaacct cagaatgtca agctgcactc caaaaagtga gtcaagaact gaaggcggca caaaaatcat tcgcagtcct agaaaagcat gctctagaca gatcttatga atccagtgta gccacgatgg atttagctag agcgaatcaa gaaacacacc ggcttctgaa catcctctct gaattacaac aactagcaca atacctgtta gataatcac <210> 556 <211> 5253 <212> DNA <213> C. Trachomatis D serovar <400> 556 atgaaatggc tgtcagctac tgcggtgttt gctgctgttc tcccctcagt ttcagggttt tgcttcccag aacctaaaga attaaatttc tctcgcgtag gaacttcttc ctctaccact tttactgaaa cagttggaga agctggggca gaatatatcg tctctggtaa cgcatctttc acaaaattta ccaacattcc tactaccgat acaacaactc Ccacgaactc aaactcctct agctctaacg gagagactgc ttccgtttct gaggatagtg actctacaac aacgactcct gatcctaaag gtggcggcgc ettttataac gcgcactccg gagttttatc ctttatgaca cgatcaggaa cagaaggttc cttaactctg tctgagataa aaataactgg tgaaggcggt gctatcttct ctcaaggaga gctgctattt acagatctga caggtctaac catccaaaat aacttatccc agctatccgg aggagcgatt tttggagaat ctacaatctc cctatcaggg attactaaag cgactttctc ctccaactct gcagaagttc ctgctcctgt taagaaacct acagaaccta aagctcaaac agcaagcgaa acgtcgggtt ctagtagttc tagcggaaat gattcggtgt cttcccccag ttccagtaga gctgaacccg cagcagctaa tcttcaaagt cactttattt gtgctacagc tactcctgct gctcaaaccg atacagaaac atcaactccc tctcataagc caggatctgg gggagctatc tatgctaaag gcgaccttac tatcgcagac tctcaagagg tactattctc aataaataaa gctactaaag atggaggagc gatctttgct gagaaagatg tttctttcga gaatattaca tcattaaaag tacaaactaa cggtgctgaa gaaaagggag gagctatcta tgctaaaggt gacctctcaa ttcaatcttc taaacagagt ctttttaatt ctaactacag taaacaaggt ggtggggctc tatatgttga aggagatata aacttccaag atcttgaaga aattcgcatt aagtacaata aagctggaac gttcgaaaca aaaaaaatca ctttaccaaa agctcaagca tctgcaggaa atgcagatgc ttgggcctct tcctctcctc aatctggttc tggagcaact acagtctcca actcaggaga ctctagctct ggctcagact cggatacctc agaaacagtt ccagccacag ctaaaggcgg tgggctttat actgataaga atctttcgat tactaacatc acaggaatta tcgaaattgc aaataacaaa gcgacagatg ttggaggtgg tgcttacgta aaaggaaccc ttacttgtga aaactctcac cgtctacaat ttttgaaaaa ctcttccgat aaacaaggtg gaggaatcta cggagaagac aacatcaccc tatctaattt gacagggaag actctattcc aagagaatac tgccaaagaa gagggcggtg gactcttcat aaaaggtaca gataaagctc ttacaatgac aggactggat agtttctgtt taattaataa cacatcagaa aaacatggtg gtggagcctt tgttaccaaa gaaatctctc agacttacac ctctgatgtg gaaacaattc caggaatcac gcctgtacat ggtgaaacag tcattactgg caataaatct acaggaggta atggtggagg cgtgtgtaca aaacgtcttg ccttatctaa ccttcaaagc atttctatat ccgggaattc tgcagctgaa aatggtggtg gagcccacac atgcccagat agcttcccaa cggcggatac tgcagaacag cccgcagcag cttctgccgc gacgtctact cccgagtctg ccccagtggt ctcaactgct ctaagcacac cttcatcttc taccgtctct tcattaacct tactagcagc ctcttcacaa gcctctcctg caacctctaa taaggaaact caagatccta atgctgatac agacttattg atcgattatg tagttgatac gactatcagc aaaaacactg ctaagaaagg cggtggaatc tatgctaaaa aagccaagat gtcccgcata gaccaactga atatctctga gaactčcgct acagagatag gtggaggtat ctgctgtaaa gaatctttag aactagatgc cctagtctcc ttatctgtaa cagagaacct tgttgggaaa gaaggtggag- gcttacatgc taaaactgta
900
960
1020
1080
1140
1200
1260
1320
1380
1440
1500
1560
1620
1680
1689
120
180
240
300
360
420
480
540
600
660
720
780
840
900
960
1020
1080
1140
1200
1260
1320
1380
1440
1500
1560
1620
1680
1740
1800
1860
1920
1980
2040
2100
2160
2220
2280
2340 ·· ···· ·· ·· ·· ···· ·· ··· · · · • ··· · , · ··· ' · · ·
498 aatatttcta atctgaaatc aggcttctct ttctcgaaca acaaagcaaa ctcctcatcc 2400 acaggagtcg caacaacagc ttcagcacct gctgcagctg ctgcttccct acaagcagcc 2460 gcagcagccg taccatcatc tccagcaaca ccaacttatt caggtgtagt aggaggagct 2520 atctatggag aaaaggttac attctctcaa tgtagcggga cttgtcagtt ctctgggaac 2580 caagctatcg ataacaatcc ctcccaatca tcgttgaacg tacaaggagg agccatctat 2640 gccaaaacct ctttgtctat tggatcttcc gatgctggaa cctcctatat tttctcgggg 2700 aacagtgtct ccactgggaa atctcaaaca acagggcaaa tagcgggagg agcgatctac 2760 tcccctactg ttacattgaa ttgtcctgcg acattctcta acaatacagc ctctatggct 2820 acaccaaaga cttcttctga agatggatcc tcaggaaatt ctattaaaga taccattgga 2880 ggagccattg cagggacagc cattacccta tctggagtct ctcgattttc agggaatacg 2940 gctgatttag gagctgcaat aggaactcta gctaatgcaa atacacccag tgcaactagc 3000 ggatctcaaa atagcattac agaaaaaatt actttagaaa acggttcttt tatttttgaa 3060 agaaaccaag ctaataaacg tggagcgatt tactctccta gcgtttccat taaagggaat 3120 aatattacct tcaatcaaaa tacatccact catgatggaa gtgctatcta ctttacaaaa 3180 gatgctacga ttgagtcttt aggatctgtt ctttttacag gaaataacgt tacagctaca 3240 caagctagtt ctgcaacatc tggacaaaat acaaatactg ccaactatgg ggcagccatc 3300 tttggagatc caggaaccac tcaatcgtct caaacagatg ccattttaac ccttcttgct 3360 tcttctggaa acattacttt tagcaacaac agtttacaga ataaccaagg tgatactccc 3420 gctagcaagt tttgtagtat tgcaggatac gtcaaactct ctctacaagc cgctaaaggg 3480 aagactatta gctttttcga ttgtgtgcac acctctacca aaaaaatagg ttcaacacaa 3540 aacgtttatg aaactttaga tattaataaa gaagagaaca gtaatccata tacaggaact 3600 attgtgttct cttctgaatt acatgaaaac aaatcttaca tcccacagaa tgcaatcctt 3660 cacaacggaa ctttagttct taaagagaaa acagaactcc acgtagtctc ttttgagcag 3720 aaagaagggt ctaaattaat tatgaaaccc ggagctgtgt tatctaacca aaacatagct 3780 aacggagctc tagttatcaa tgggttaacg attgatcttt ccagtatggg gactcctcaa 3840 gcaggggaaa tcttctctcc tccagaatta cgtatcgttg ccacgacctc tagtgcatcc 3900 ggaggaagcg gggtcagcag tagtatacca acaaatccta aaaggatttc tgcagcagcg 3960 ccttcaggtt ctgccgcaac tactccaact atgagcgaga acaaagtttt cctaacagga 4020 gaccttactt taatagatcc taatggaaac ttttaccaaa accctatgtt aggaagcgat 4080 ctagatgtac cactaattaa gcttccgact aacacaagtg acgtccaagt ctatgattta 4140 actttatctg gggatctttt ccctcagaaa gggtacatgg gaacctggac attagattct 4200 aatccacaaa cagggaaact tcaagccaga tggacattcg atacctatcg tcgctgggta 4260 tacataccta gggataatca tttttatgcg aactctatct taggctccca aaactcaatg 4320 attgttgtga agcaagggct tatcaacaac atgttgaata atgcccgctt cgatgatatc 4380 gcttacaata acttctgggt ttcaggagta ggaactttct tagctcaaca aggaactcct 4440 ctttccgaag aattcagtta ctacagccgc ggaacttcag ttgccatcga tgccaaacct 4500 agacaagatt ttatcctagg agctgcattt agtaagatgg tggggaaaac caaagccatc 4560 aaaaaaatgc ataattactt ccataagggc tctgagtact cttaccaagc ttctgtctat 4620 ggaggtaaat tcctgtattt cttgctcaat aagcaacatg gttgggcact tcctttccta 4680 atacaaggag tcgtgtccta tggacatatt aaacatgata caacaacact ttacccttct 4740 atccatgaaa gaaataaagg agattgggaa gatttaggat ggttagcgga tcttcgtatc 4800 tctatggatč ttaaagaacc ttctaaagat tcttctaaac ggatcactgt ctatggggaa 4860 cttgagtatt ccagcattcg ccagaaacag ttcacagaaa tcgattacga tccaagacac 4920 ttcgatgatt gtgcttacag aaatctgtcg cttcctgtgg gatgcgctgt cgaaggagct 4980 atcatgaact gtaatattct tatgtataat aagcttgcat tagcctacat gccttctatc 5040 tacagaaata atcctgtctg taaatatcgg gtattgtctt cgaatgaagc tggtcaagtt 5100 atctgcggag tgccaactag aacctctgct agagcagaat acagtactca actatatctt 5160 ggtcccttct ggactctcta cggaaactat actatcgatg taggcatgta tacgctatcg 5220 caaatgacta gctgcggtgc tcgcatgatc ttc 5253 <210> 557 <211> 792 <212> DNA <213> C. Trachomatis D serovar <400> 557 atgggaaatt ctggttttta tttgtataac actgaaaact gcgtctttgc tgataatatc aaagttgggc aaatgacaga gccgctcaag gaccagcaaa taatccttgg gacaaaatca acacctgtcg cagccaaaat gacagcttct gatggaatat ctttaacagt ctccaataat
120
180 • 9 · ·
-4 99
Μ·9
999 tcatcaacca atgcttctat tacaattggt ttggatgcgg aaaaagctta ccagcttatt ctagaaaagt tgggaaatca aattcttgat gqaattgctg atactattgt tgatagtaca gtccaagata ttttagacaa aatcacaaca gacccttctc taggtttgtt gaaagctttt aacaactttc caatcactaa taaaattcaa tgcaacgggt tattcactcc cagtaacatt gaaactttat taggaggaac tgaaatagga aaattcacag tcacacccaa aagctctggg agcatgttct tagtctcagc agatattatt gcatcaagaa tggaaggcgg cgttgttcta gctttggtac gagaaggtga ttctaagccc tgcgcgatta gttatggata ctcatcaggc gttcctaatt tatgtagtct aagaaccagc attactaata caggattgac accaacaacg tattcattac gtgtaggcgg tttagaaagc ggtgtggtat gggttaatgc cctttctaat ggcaatgata ttttaggaat aacaaatact tctaatgtat cttttttgga agtaatacct caaacaaacg ct <210> 558 <211> 306 <212> DNA <213> C. Trachomatis D serovar <400> 558 atgcaaaata aaagaaaagt gagggacgat tttattaaaa ttgttaaaga tgtgaaaaaa gatttccccg aattagacct aaaaatacga gtaaacaagg aaaaagtaac tttcttaaat tctcccttag aactctacca taaaagtgtc tcactaattc taggactgct tcaacaaata gaaaactctt taggattatt cccagactct cctgttcttg aaaaattaga ggataacagt ttaaagctaa aaaaggcttt gattatgctť atcttgtcta gaaaagacat gttttccaag gctgáa <210> 559 <211> 729 <212> DNA <213> C. Trachomatis D serovar <400> 559 gtgggatgca acttggccca atttttaggg aaaaaagtgt tacttgctga cctagacccg caatccaatt tatcttctgg attgggggct agtgtcagaa ataaccaaaa aggcttgcac gacatagtat acaaatcaaa cgatttaaaa tcaatcattt gcgaaacaaa aaaagatagt gtggacctaa ttcctgcatc aťttttatcc gaacagttta gagaattgga tattcataga ggacctagta acaacttaaa gttatttctg aatgagtact gcgctccttt ttatgacatc tgcataatag acactccacc tagcctagga gggttaacga aagaagcttt tgttgcagga gacaaattaa ttgcttgttt aactccagaa cctttttcta ttctagggtt acaaaagata cgtgaattct taagttcggt cggaaaacct gaagaagaac acattcttgg aatagctttg tctttttggg atgatcgtaa ctcgactaac caaatgtata tagacattat cgagtctatt tacaaaaaca agcttttttc aacaaaaatt cgtcgagata tttctctcag ccgttctctt cttaaagaag attctgtagc taatgtctat ccaaattcta gggccgcaga agatattctg aagttaacgc atgaaatagc aaatattttg catatcgaat atgaacgaga ttactctcag aggacaacg <210> 560 <211> 289 <212> PRT <213> C. Trachomatis D serovar
240
300
360
420
480
540
600
660
720
780
792
120
180
240
300
306
120
180
240
300
360
420
480
540
600
660
720
729 <400> 560
| Met | Thr | His | Gin | His | Lys | Lys | Ile | Ser | Glu | Glu | Thr | Ile | Ala | Cys | Asp |
| 1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
| Met | Leu | Glu | Arg | Tyr | Thr | Gly | Ser | Thr | Val | Gin | Glu | Phe | Gin | Pro | Tyr |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Leu | Leu | Leu | Thr | Asn | Phe | Ala | Tyr | Tyr | Val | Asp | Val | Phe | Ala | Glu | Ile |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Tyr | Gin | Val | Pro | Val | Ser | Arg | Gly | Ser | Met | Phe | Ser | Ala | Tkla | His | Ala |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Pro | Gin | Ile | His | Thr | Ser | Ile | Ile | Asp | Phe | Lys | Leu | Gly | Ser | Pro | Gly |
| .65 | 70 | 75 - | 80 |
• 4 ·*··
4 4
4 4
4 4
4 4 4
4 4 4
500
| Ala | Ala | Leu | Thr | Val 85 | Asp | Leu | Cys | Ser | Phe 90 | Leu | Pro | Asn | Ala | Thr 95 | Ala |
| Ala | Ile | Met | Leu 100 | Gly | Met | Cys | Gly | Gly 105 | Leu | Arg | Ser | His | Tyr 110 | Gin | Ile |
| Gly | Asp | Tyr 115 | Phe | Val | Pro | Val | Ala 120 | Ser | Ile | Arg | Lys | Asp 125 | Gly | Thr | Ser |
| Asp | Ala 130 | Tyr | Phe | Pro | Pro | Glu 135 | Val | Pro | Ala | Leu | Ala 140 | Asn | Phe | Val | Val |
| Gin 145 | Lys | Met | Ile | Thr | Asn 150 | Ile | Leu | Glu | Ala | Lys 155 | Asn | Leu | Pro | Tyr | His 160 |
| Ile | Gly | Ile | Thr | His 165 | Thr | Thr | Asn | Ile | Arg 170 | Phe | Trp | Glu | Phe | Asn 175 | Lys |
| Glu | Phe | Arg | Arg 180 | Lys | Leu | Tyr | Glu | Asn 185 | Lys | Ala | Gin | Thr | Val 190 | Glu | Met |
| Glu | Cys | Ala 195 | Thr | Leu | Phe | Ala | Ala 200 | Gly | Tyr | Arg | Arg | Asn 205 | Leu | Pro | Leu |
| Gly | Ala 210 | Leu | Leu | Leu | Ile | Ser 215 | Asp | Leu | Pro | Leu | Arg 220 | Lys | Asp | Gly | Ile |
| Lys 225 | Thr | Lys | Glu | Ser | Ser 230 | Ser | Ala | Val | Leu | Asn 235 | Ser | His | Thr | Lys | Glu 240 |
| His | Ile | .Leu | Thr | Gly 245 | Val | Glu | Val | Phe | Ala 25.0 | Ser | Leu | Gin | Glu | Lys 255 | Ser |
| Gly | Pro | Gly | Ile 260 | Lys | Lys | Thr | Lys | Gly 265 | Leu | Pro | His | Met | Glu 270 | Phe | Gly |
| Gin Phe | Ala | Asp 275 | Asp | Ser | Leu | Ser | Glu 280 | Gin | Thr | Glu | Val | Ser 285 | Gly | Gly | Asp |
| <210> 561 | |||||||||||||||
| <211> 394 <212> PRT | |||||||||||||||
| <213> C. | Trachomatis | : D serovar | |||||||||||||
| <400> 561 | |||||||||||||||
| Met | Ser | Lys | Glu | Thr | Phe | Gin | Arg | Asn | Lys | Pro | His | Ile | Asn | Ile | Gly |
| 1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
| Thr | Ile | Gly | His | Val | Asp | His | Gly | Lys | Thr | Thr | Leu | Thr | Ala | Ala | Ile |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Thr | Arg | Ala | Leu | Ser | Gly | Asp | Gly | Leu | Ala | Asp | Phe | Arg | Asp | Tyr | Ser |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Ser | Ile | Asp | Asn | Thr | Pro | Glu | Glu | Lys | Ala | Arg | Gly | Ile | Thr | Ile | Asn |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Ala | Ser | His | Val | Glu | Tyr | Glu | Thr | Ala | Asn | Arg | His | Tyr | Ala | His | Val |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Asp | Cys | Pro | Gly | His | Ala | Asp | Tyr | Val | Lys | Asn | Met | Ile | Thr | Gly | Ala |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Ala | Gin | Met | Asp | Gly | Ala | Ile | Leu | Val | Val | Ser | Ala | Thr | Asp | Gly | Ala |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Met | Pro | Gin | Thr | Lys | Glu | His | Ile | Leu | Leu | Ala | Arg | Gin | Val | Gly | Val' |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Pro | Tyr | Ile | Val | Val | Phe | Leu | Asn | Lys | Ile | Asp | Met | Ile | Ser | Glu | Glu |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Asp | Ala | Glu | Leu | Val | Asp | Leu | Val | Glu | Met | Glu | Leu | Val | Glu | Leu | Leu |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Glu | Glu | Lys | Gly | Tyr | Lys | Gly | Cys | Pro | Ile | Ile | Arg | Gly | Ser | Ala | Leu |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Lys | Ala | Leu | Glu | Gly | Asp | Ala | Ala | Tyr | Ile | Glu | Lys | Val | Arg | Glu | Leu |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Met | Gin | Ala | Val | Asp | Asp | Asn | Ile | Pro | Thr | Pro | Glu | Arg | Glu | Ile | Asp |
195 200 - 205
9999
9999
99
9 9 9 9 9 * .9 «
999 9 ' 9 999 Λ 9 9 • ········· ·
9 9 9 9 9 9 9 9 9
9999 999 99 99 99 99
501
| Lys | Pro 210 | Phe | Leu Met | Pro | Ile Glu Asp Val Phe Ser Ile Ser Gly Arg | ||||||||||
| 215 | 220 | ||||||||||||||
| Gly | Thr | Val | Val | Thr | Gly | Arg | Ile | Glu | Arg | Gly | Ile | Val | Lys | Val | Ser |
| 225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
| Asp | Lys | Val | Gin | Leu | Val | Gly | Leu | Arg | Asp | Thr | Lys | Glu | Thr | Ile | Val |
| 245 | 250 | 255 | |||||||||||||
| Thr | Gly | Val | Glu | Met | Phe | Arg | Lys | Glu | Leu | Pro | Glu | Gly | Arg | Ala | Gly |
| 260 | 265 | 270 | |||||||||||||
| Glu | Asn | Val | Gly | Leu | Leu | Leu | Arg | Gly | Ile | Gly | Lys | Asn | Asp | Val | Glu |
| 275 | 280 | 285 | |||||||||||||
| Arg | Gly | Met | Val | Val | Cys | Leu | Pro | Asn | Ser | Val | Lys | Pro | His | Thr | Gin |
| 290 | 295 | 300 | |||||||||||||
| Phe | Lys | Cys | Ala | Val | Tyr | Val | Leu | Gin | Lys | Glu | Glu | Gly | Gly Arg | His | |
| 305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
| Lys | Pro | Phe | Phe | Thr | Gly | Tyr | Arg | Pro | Gin | Phe | Phe | Phe | Arg | Thr | Thr |
| 325 | 330 | 335 | |||||||||||||
| Asp | Val | Thr | Gly | Val | Val | Thr | Leu | Pro | Glu | Gly | Ile | Glu | Met | Val | Met |
| 340 | 345 | 350 | |||||||||||||
| Pro | Gly | Asp | Asn | Val | Glu | Phe | Glu | Val | Gin | Leu | Ile | Ser | Pro | Val | Ala |
| 355 | 360 | 365 | |||||||||||||
| Leu | Glu | Glu | Gly | Met | Arg | Phe | Ala | Ile | Arg | Glu | Gly | Gly | Arg | Thr | Ile |
| 370 | 375 | 380 | |||||||||||||
| Gly | Ala | Gly | Thr | Ile | Ser | Lys | Ile | Ile | Ala |
385 390 <210> 562 <211> 550 <212> PRT <213> C. Trachomatis D serovar <400> 562
| Met | Glu | Ser | Ser | Arg | Ile | Leu | Ile | Thr | Ser | Ala | Leu | Pro | Tyr | Ala | Asn |
| 1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
| Gly | Pro | Leu | His | Phe | Gly | His | Ile | Thr | Gly | Ala | Tyr | Leu | Pro | Ala | Asp |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Val | Tyr | Ala | Arg | Phe | Gin | Arg | Leu | Gin | Gly Lys | Glu | Val | Leu | Tyr | Ile | |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Cys | Gly | Ser | Asp | Glu | Tyr | Gly | Ile | Ala | Ile | Thr | Leu | Asn | Ala | Glu | Leu |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Ala | Gly | Met | Gly | Tyr | Gin | Glu | Tyr | Val | Asp | Met | Tyr | His | Lys | Leu | His |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Lys | Asp | Thr | Phe | Lys | Lys | Leu | Gly | Ile | Ser | Val | Asp | Phe | Phe | Ser | Arg |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Thr | Thr | Asn | Thr | Tyr | His | Pro | Ala | Ile | Val | Gin | Asp | Phe | Tyr | Arg | Asn |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Leu | Gin | Glu | Arg | Gly | Leu | Val | Glu | Asn | Gin | Val | Thr | Glu | Gin | Leu | Tyr |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Ser | Glu | Glu | Glu | Gly | Lys | Phe | Leu | Ala | Asp Arg | Tyr | Val | Val | Gly | Thr | |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Cys | Pro | Lys | Cys | .Gly | Phe | Asp | Arg | Ala | Arg | Gly | Asp | Glu | Cys | Gin | Gin |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Cys | Gly | Ala | Asp | Tyr | Glu | Ala | Arg | Asp | Leu | Lys | Glu | Pro | Arg | Ser | Lys |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Leu | Thr | Gly | Ala | Ala | Leu | Ser | Leu | Arg | Asp | Thr | Glu | His | Ala | Tyr | Leu |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| His | Leu | Glu | Arg | Met | Lys | Glu | Asp | Leu | Leu | Ala | Phe | Val | Gin | Gly | Ile |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Tyr | Leu | Arg | Pro | His | Met | Arg | Asn | Phe | Val | Thr | Asp | Tyr | Ile | Glu | His |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Leu | Arg | Pro | Arg | Ala | Val | Thr | Arg | Asp | Leu | Ser | Trp | Gly | Ile | Pro | Val |
| 225 | 230 | 23S | 240 |
• ···
502
| Pro Asp | Leu Glu Asn 245 | Lys | Val | Phe | Tyr Val Trp Phe Asp Ala Pro Ile | ||||||||||
| 250 | 255 | ||||||||||||||
| Gly | Tyr | Ile | Ser | Gly | Thr | Met | Asp | Trp | Ala | Ala | Ser | Ile | Gly | Asp | Pro |
| 260 | 265 | 270 | |||||||||||||
| Glu | Ala | Trp | Lys | Lys | Phe | Trp | Leu | Asp | Asp | Thr | Val | Thr | Tyr | Ala | Gin |
| 275 | 280 | 285 | |||||||||||||
| Phe | Ile | Gly | Lys | Asp | Asn | Thr | Ser | Phe | His | Ala | Ala | Ile | Phe | Pro | Ala |
| 290 | 295 | 300 | |||||||||||||
| Met | Glu | Ile | Gly | Gin | Ser | Leu | Pro | Tyr | Lys | Lys | Val | Asp | Ala | Leu | Val |
| 305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
| Thr | Ser | Glu | Phe | Leu | Leu | Leu | Glu | Gly | Phe | Gin | Phe | Ser | Lys | Ser | Asp |
| 325 | 330 | 335 | |||||||||||||
| Gly | Asn | Phe | Ile | Asp | Met | Asp | Ala | Phe | Leu | Glu | Thr | Tyr | Ser | Leu | Asp |
| 340 | 345 | 350 | |||||||||||||
| Lys | Leu | Arg | Tyr | Val | Leu | Ala | Ala | Ile | Ala | Pro | Glu | Thr | Ser | Asp | Ser |
| 355 | 360 | 365 | |||||||||||||
| Glu | Phe | Ser | Phe | Gin | Glu | Phe | Lys | Thr | Arg | Cys | Asn | Ser | Glu | Leu | Val |
| 370 | 375 | 380 | |||||||||||||
| Gly | Lys | Tyr | Gly | Asn | Phe | Val | Asn | Arg | Val | Leu | Ala | Phe | Ala | Val | Lys |
| 385 | 390 | 395 | 400 | ||||||||||||
| Asn | Gly | Cys | Thr | Glu | Leu | Ser | Ser | Pro | Gin | Leu | Glu | Gin | Lys | Asp | Leu |
| 405 | 410 | 415 | |||||||||||||
| Asp | Phe | Ile | Ser | Lys | Ser | Gin | Lys | Leu | Ala | Lys | Asp | Ala | Ala | Glu | His |
| 420 | 425 | 430 | |||||||||||||
| Tyr | Ala | Gin | Tyr | Ser | Leu | Arg | Lys | Ala | Cys | Ser | Thr | Ile | Met | Glu | Leu |
| 435 | 440 | 445 | |||||||||||||
| Ala | Ala | Leu | Gly' | Asn | Gly | Tyr | Phe | Asn | Asp | Glu | Ala | Pro | Trp | Lys | Leu |
| 450 | 455 | 460 | |||||||||||||
| Ala | Lys | Glu | Gly | Asn | Trp | Asn | Arg | Val | Arg | Ala | Ile | Leu | Phe | Cys | Ala |
| 4 65 | 470 | 475 | 480 | ||||||||||||
| Cys | Tyr | Cys | Gin | Lys | . Leu | Leu | Ala | Leu | Ile | Ser | Tyr | Pro | Ile | Met | Pro |
| 4 85 | 490 | 495 | |||||||||||||
| Glu | Thr | Ala | Leu | Lys | Ile | Leu | Glu | Met | Ile | Ala | Pro | His | Ser | Leu | Asp |
| 500 | 505 | 510 | |||||||||||||
| Leu | Gly | Ser | Gin | Asp | Pro | Asp | Arg | Leu | Gin | Ser | Leu | Trp | Thr | Asp Ser | |
| 515 | 520 | 525 | |||||||||||||
| Phe | Phe | Asp | Tyr | Ser | Glu | Glu | Lys | Phe | Ser | Leu | Lys | Glu | Pro | Glu | Leu |
| 530 | 535 | 540 | |||||||||||||
| Leu | Phe | Thr | Met | Val | Glu | ||||||||||
| 545 | 550 |
<210> 563 <211> 100 <212> PRT <213> C. Trachomatis D serovar <400> 563
| Met | Ala | Arg | Lys | Asp | Arg | Leu | Thr | Asn | Glu | Arg | Leu | Asn | Lys | Leu | Phe |
| 1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
| Asp | Ser | Pro | Phe | Ser | Leu | Val | Asn | Tyr | Val | Ile | Lys | Gin | Ala | Lys | Asn |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Lys | Ile | Ala | Arg | Gly | Asp | Val | Arg | Ser | Ser | Asn | Val | Ala | Ile | Glu | Ala |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Leu | Asn | Phe | Leu | Asp | Leu | Tyr | Gly | Ile | Gin | Ser | Glu | Tyr | Ala | Glu | Arg |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Asp | Asp | Arg | Glu | Arg | His | Leu | Ser | Ala | Thr | Gly | Glu | Arg | Arg | Arg | Glu |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Gin | Gly | Phe | Gly | Thr | Ser | Arg | Arg | Lys | Asp | Pro | Ser | Leu | Tyr | Asn | Trp |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Ser | Asp | Val | Lys | ||||||||||||
| 100 |
503 <210> 564 <211> 205 <212> PRT <213> C. Trachomatis D serovar <400> 564
| Met | Ser | Val | Lys | Val | Ile | Ser | Pro | Phe | Ser | Gin | Asp | Gly | Val | Gin | Cys |
| 1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
| Phe | Pro | Lys | Leu | Phe | Ile | Ile | Ser | Ala | Pro | Ala | Gly | Ala | Gly | Lys | Thr |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Thr | Leu | Thr | His | Met | Leu | Gin | Arg | Glu | Phe | Pro | Asp | Ala | Phe | Glu | Lys |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Thr | Val | Ser | Ser | Thr | Thr | Arg | Ser | Ala | Arg | Pro | Gly | Glu | Val | His | Gly |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Val | Asp | Tyr | Leu | Phe | Val | Ser | Glu | Asp | Asp | Phe | Lys | Gin | Ser | Leu | Asp |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Arg | Glu | Asp | Phe | Leu | Glu | Trp | Val | Phe | Leu | Phe | Gly | Thr | Tyr | Tyr | Gly |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Thr | Ser | Lys | Ala | Glu | Ile | Ser | Arg | Val | Leu | Gin | Lys | Gly | Lys | His | Cys |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Ile | Ala | Val | Ile | Asp | Val | Gin | Gly | Ala | Leu | Ala | Leu | Lys | Lys | Gin | Met |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Pro | Ala | Val | Thr | Ile | Phe | Ile | Gin | Ala | Pro | Ser | Gin | Glu | Glu | Leu | Glu |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Arg | Arg | Leu | Asn | Ala | Arg | Asp | Ser | Glu | Lys | Asp | Phe | Gin | Lys | Lys | Glu |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Arg | Leu | Glu | His | Ser | Ala | Val | Glu | Ile | Ala | Ala | Ala | Ser | Glu | Phe | Asp |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Tyr | Val | Val | Val | Asn | Asp | Asp | Leu | Ile | Thr | Ala | Tyr | Gin | Val | Leu | Arg |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Ser | Ile | Phe | Ile | Ala | Glu | Glu | His | Arg | Met | Ser | His | Gly | |||
| 195 | 200 | 205 |
<210> 565 <211> 602 <212> PRT <213> C. Trachomatis D serovar <400> 565
| Met | Lys | Pro | Tyr | Lys | Ile | Glu | Asn | Ile | Arg | Asn | Phe | Ser | Ile | Ile | Ala |
| 1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
| His | Ile | Asp | His | Gly | Lys | Ser | Thr | Ile | Ala | Asp | Arg | Leu | Leu | Glu | Ser |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Thr | Ser | Thr | Ile | Glu | Gin | Arg | Glu | Met | Arg | Glu | Gin | Leu | Leu | Asp | Ser |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Met | Asp | Leu | Glu | Arg | Glu | Arg | Gly | Ile | Thr | Ile | Lys | Ala | His | Pro | Val |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Thr | Met | Thr | Tyr | Glu | Tyr | Glu | Gly | Glu | Thr | Tyr | Glu | Leu | Asn | Leu | Ile |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Asp | Thr | Pro | Gly | His | Val | Asp | Phe | Ser | Tyr | Glu | Val | Ser | Arg | Ser | Leu |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Ala | Ala | Cys | Glu | Gly | Ala | Leu | Leu | Ile | Val | Asp | Ala | Ala | Gin | Gly | Val |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Gin | Ala | Gin | Ser | Leu | Ala | Asn | Val | Tyr | Leu | Ala | Leu | Glu | Arg | Asp | Leu |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Glu | Ile | Ile | Pro | Val | Leu | Asn | Lys | Ile | Asp | Leu | Pro | Ala | Ala | Gin | Pro |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Glu | Ala | Ile | Lys | Lys | Gin | Ile | Glu | Glu | Phe | Ile | Gly | Leu | Asp | Thr | Ser |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Asn | Thr | Ile | Ala | Cys | Ser | Ala | Lys | Thr | Gly | Gin- | Gly | Ile | Pro | Glu | Ile |
• · · ·
504
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Leu | Glu | Ser | Ile | Ile | Arg | Leu | Val | Pro | Pro | Pro | Lys | Pro | Pro | Gin | Glu |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Thr | Glu | Leu | Lys | Ala | Leu | Ile | Phe | Asp | Ser | His | Tyr | Asp | Pro | Tyr | Val |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Gly | Ile | Met | Val | Tyr | Val | Arg | Val | Ile | Ser | Gly | Glu | Ile | Lys | Lys | Gly |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Asp Arg | Ile | Thr | Phe | Met | Ala | Thr | Lys | Gly | Ser | Ser | Phe | Glu | Val | Leu | |
| 225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
| Gly | Ile | Gly | Ala | Phe | Leu | Pro | Glu | Ala. | Thr | Leu | Met | Glu | Gly | Ser | Leu |
| 245 | 250 | 255 | |||||||||||||
| Arg | Ala | Gly | Gin | Val | Gly | Tyr | Phe | Ile | Ala | Asn | Leu | Lys | Lys | Val | Lys |
| 260 | 265 | 270 | |||||||||||||
| Asp | Val | Lys | Ile | Gly | Asp | Thr | Val | Thr | Thr | Val | Lys | His | Pro | Ala | Lys |
| 275 | 280 | 285 | |||||||||||||
| Glu | Pro | Leu | Glu | Gly | Phe | Lys | Glu | Ile | Lys | Pro | Val | Val | Phe | Ala | Gly |
| 290 | 295 | 300 | |||||||||||||
| Ile | Tyr | Pro | Ile | Asp | Ser | Ser | Asp | Phe | Asp | Thr | Leu | Lys | Asp | Ala | Leu |
| 305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
| Gly | Arg | Leu | Gin | Leu | Asn | Asp | Ser | Ala | Leu | Thr | Ile | Glu | Gin | Glu | Asn |
| 325 | 330 | 335 | |||||||||||||
| Ser | His | Ser | Leu | Gly | Phe | Gly | Phe | Arg | Cys | Gly | Phe | Leu | Gly | Leu | Leu |
| 340 | 345 | 350 | |||||||||||||
| His | Leu | Glu | Ile | Ile | Phe | Glu | Arg | Ile | Ser | Arg | Glu | Phe | Asp | Leu | Asp |
| 355 | 360 | 365 | |||||||||||||
| Ile | Ile | Ala | Thr | Ala | Pro | Ser | Val | Ile | Tyr | Lys | Val | Val | Leu | Lys | Asn |
| 370 | 375 | 380 | |||||||||||||
| Gly | Lys | Thr | Leu | Phe | Ile | Asp | Asn | Pro | Thr | Ala | Tyr | Pro | Asp | Pro | Ala |
| 385 | 390 | 395 | 400 | ||||||||||||
| Leu | Ile | Glu | His | Met | Glu | Glu | Pro | Trp | Val | His | Val | Asn | Ile | Ile | Thr |
| 405 | 410 | 415 | |||||||||||||
| Pro | Gin | Glu | Tyr | Leu | Ser | Asn | Ile | Met | Ser | Leu | Cys | Met | Asp | Lys | Arg |
| 420 | 425 | 430 | |||||||||||||
| Gly | Ile | Cys | Leu | Lys | Thr | Asp | Met | Leu | Asp | Gin | His | Arg | Leu | Val | Leu |
| 435 | 440 | 445 | |||||||||||||
| Ser | Tyr | Glu | Leu | Pro | Leu | Asn | Glu | Ile | Val | Ser | Asp | Phe | Asn | Asp | Lys |
| 450 | 455 | 4 60 | |||||||||||||
| Leu | Lys | Ser | Val | Thr | Lys | Gly Tyr | Gly | Ser | Phe | Asp | Tyr | Arg | Leu | Gly | |
| 4 65 | 470 | 475 | 480 | ||||||||||||
| Asp | Tyr | Lys | Lys | Gly | Ala | Ile | Ile | Lys | Leu | Glu | Ile | Leu | Ile | Asn | Asp |
| 485 | 490 | 495 | |||||||||||||
| Glu | Ala | Val | Asp | Ala | Phe | Ser | Cys | Leu | Val | His | Arg | Asp | Lys | Ala | Glu |
| 500 | 505 | 510 | |||||||||||||
| Ser | Lys | Gly | Arg | Ser | Ile | Cys | Glu | Lys | Leu | Val | Asp | Val | Ile | Pro | Pro |
| 515 | 520 | 525 | |||||||||||||
| Gin | Leu | Phe | Lys | Ile | Pro | Ile | Gin | Ala | Ala | Ile | Asn | Lys | Lys | Ile | Ile |
| 530 | 535 | 540 | |||||||||||||
| Ala | Arg | Glu | Thr | Ile | Arg | Ala | Leu | Ala | Lys | Asn | Val | Thr | Ala | Lys | Cys |
| 545 | 550 | 555 | 560 | ||||||||||||
| Tyr | Gly | Gly | Asp | Ile | Thr | Arg | Lys | Arg | Lys | Leu | Trp | Asp | Lys | Gin | Lys |
| 565 | 570 | 575 | |||||||||||||
| Lys | Gly | Lys | Lys | Arg | Met | Lys | Glu | Phe | Gly | Lys | Val | Ser | Ile | Pro | Asn |
| 580 | 585 | 590 | |||||||||||||
| Thr | Ala | Phe | Val | Glu | Val | Leu | Lys | Met | Glu | ||||||
| 595 | 600 |
<210> 566 <211> 324 <212> PRT <213> C. Trachomatis D serovar
505 <4Ό0> 566
| Met | Glu | Leu | Leu | Pro | His | Glu | Lys | Gin | Val | Val | Glu | Tyr | Glu | Lys | Thr |
| 1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
| Ile | Ala | Glu | Phe | Lys | Glu | Lys | Asn | Lys | Glu | Asn | Ser | Leu | Leu | Ser | Ser |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Ser | Glu | Ile | Gin | Lys | Leu | Asp | Lys | Arg | Leu | Asp | Arg | Leu | Lys | Glu | Lys |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Ile | Tyr | Ser | Asp | Leu | Thr | Pro | Trp | Glu | Arg | Val | Gin | Ile | Cys | Arg | His |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Pro | Ser | Arg | Pro | Arg | Thr | Val | Asn | Tyr | Ile | Glu | Gly | Met | Cys | Glu | Glu |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Phe | Val | Glu | Leu | Cys | Gly | Asp | Arg | Thr | Phe | Arg | Asp | Asp | Pro | Ala | Val |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Val | Gly | Gly | Phe | Ala | Lys | Ile | Gin | Gly | Gin | Arg | Phe | Met | Leu | Ile | Gly |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Gin. | Glu | Lys | Gly | Cys | Asp | Thr | Lys | Ser | Arg | Met | His | Arg | Asn | Phe | Gly |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Met | Leu | Cys | Pro | Glu | Gly | Phe | Arg | Lys | Ala | Leu | Arg | Leu | Ala | Lys | Met |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Ala | Glu | Lys | Phe | Gly | Leu | Pro | Ile | Ile | Phe | Leu | Val | Asp | Thr | Pro | Gly |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Ala | Phe | Pro | Gly | Leu | Thr | Ala | Glu | Glu | Arg | Gly | Gin | Gly | Trp | Ala | Ile |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Ala | Thr | Asn | Leu | Phe | Glu | Leu | Ala | Arg | Leu | Ala | Thr | Pro | Ile | Ile | Val |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Ile | Val | Ile | Gly | Glu | Gly | Cys | Ser | Gly | Gly | Ala | Leu | Gly | Met | Ala | Ile |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Gly | Asp | Val | Val | Ala | Met | Leu | Glu | His | Ser | Tyr | Tyr | Ser | Val | Ile | Ser |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Pro | Glu | Gly | Cys | Ala | Ser | Ile | Leu | Trp | Lys | Asp | Pro | Lys | Lys | Asn | Ser |
| 225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
| Asp | Ala | Ala | Ala | Met | Leu | Lys | Met | His | Gly | Glu | Asp | Leu | Lys | Gly | Phe |
| 245 | 250 | 255 | |||||||||||||
| Ala | Ile | Val | Asp | Ala | Val | Ile | Lys | Glu | Pro | Ile | Gly | Gly | Ala | His | His |
| 260 | 265 | 27 0 | |||||||||||||
| Asn | Pro | Ala | Ala | Thr | Tyr | Arg | Ser | Val | Gin | Glu | Tyr | Val | Leu | Gin | Glu |
| 275 | 280 | 285 | |||||||||||||
| Trp | Leu | Lys | Leu | Lys | Asp | Leu | Pro | Val | Glu | Glu | Leu | Leu | Glu | Lys | Arg |
| 290 | 295 | 300 | |||||||||||||
| Tyr | Gin | Lys | Phe | Arg | Thr | Ile | Gly | Leu | Tyr | Glu | Thr | Ser | Ser | Glu | Ser |
| 305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
| Asp | Ser | Glu | Ala |
| <210> 567 | ||||||||||||||
| <211> 646 | ||||||||||||||
| <212> PRT | ||||||||||||||
| <213> C. | Trachomatis | D serovar | ||||||||||||
| <400> 567 | ||||||||||||||
| Met Lys | Leu | Leu | Leu | Lys | Ala | Ile | Leu | Arg | His | Lys | Lys | His | Leu | Val |
| .1 | 5 | 10 | 15 | |||||||||||
| Leu Phe | Gly | Phe | Ser | Leu | Leu | Ser | Ile | Leu | Gly | Leu | Thr | Ile | Thr | Ser |
| 20 | 25 | 30 | ||||||||||||
| Gin Ala | Glu | Ile | Phe | Ser | Leu | Gly | Leu | Ile | Ala | Lys | Thr | Gly | Pro | Asp |
| 35 | 40 | 45 | ||||||||||||
| Thr Phe | Leu | Leu | Phe | Gly | Lys | Gin | Glu | Gly | Ala | Ser | Leu | Val | Lys | Arg |
| 50 | 55 | 60· | ||||||||||||
| Lys Glu | Leu | Ser | Lys | Asp | Gin | Leu | Leu | Glu | Gin | Trp Asp | Asn | Ile | Val | |
| 65 | 70 | 75 | 80 | |||||||||||
| Gly Glu | Gly | Asp | Thr | Leu | Ser | Leu | Pro | Gin | Ala | Asn | Tkla | Tyr | Ile | Ala |
; -- »1 ’ <* .506
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Lys | His | Ser | Glv | Gly | Ser | Gin | Ser | Ile | Thr | Lys | Arg | Leu | Ser | Ala | Tyr |
| 10Ó | 105 | 110 | |||||||||||||
| Leu | Ser | Gly | Cys | Phe | Asp | Phe | Ser | Arg | Leu | Gin | Cys | Leu | Ala | Leu | Phe |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Leu | Val | Val | Val | Ala | Ile | Leu | Lys | Ser | Thr | Thr | Leu | Phe | Phe | Gin | Arg |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Phe | Leu | Ala | Gin | Leu | Ile | Ala | Ile | Arg | Val | Ser | Cys | Ser | Leu | Arg | Lys |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Asp | Tyr | Phe | Leu | Ala | Leu | Gin | Thr | Leu | Pro | Met | Thr | Phe | Phe | His | Ala |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| His | Asp | Met | Gly | Asn | Leu | Ser | Šer | Arg | Val | Ile | Ala | Asp | Ser | Ser | Met |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Ile | Ala | Leu | Ala | Ile | Asn | Ála | Leu | Met | Val | Asn | Tyr | Ile | Gin | Ala | Pro |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Ile | Thr | Met | Thr | Leu | Ala | Leu | Val | Val | Cys | Leu | Ser | Ile | Ser | Trp | Lys |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Phe | Cys | Ala | Cys | Val | Cys | Leu | Ala | Phe | Pro | Ile | Phe | Ile | Leu | Pro | Ile |
| 225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
| Val | Ile | Ile | Ala | Lys | Lys | Val | Lys | Ala | Leu | Ala | Lys | Arg | Ile | Gin | Lys |
| 245 | 250 | 255 | |||||||||||||
| 'Ser | Gin | Asp | His | Ser | Ala | Ala | Ala | Leu | Leu | Asp | Phe | Leu | Leu | Gly | Ile |
| 260 | 265 | 270 | |||||||||||||
| Leu | Thr | Val | Lys | Val | Phe | Arg | Thr | Glu | Gin | Phe | Ser | Phe | Ser | Lys | Tyr . |
| 275 | 280 | 285 | |||||||||||||
| Cys | Gin | Lys | Asn | Asp | Glu | Ile | Ala | Arg | Leu | Glu | Glu | Arg | Ser | Ala | Ala |
| 290 | 295 | 300 | |||||||||||||
| Tyr | Ser | Leu | Ile | Pro | Arg | Pro | Leu | Leu | His | Thr | Ile | Ala | Ser | Leu | Phe |
| 1305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
| The | Ala | Leu | Val | Ile | Met | Ile | Gly | Leu | Tyr | His | Phe | His | Ile | Pro | Pro |
| 325 | 330 | 335 | |||||||||||||
| ,Glu | Glu | Leu | Val | Val | Phe | Cys | Gly | Leu | Leu | Tyr | Leu | Ile | Tyr | Asp | Pro |
| 340 | 345 | 350 | |||||||||||||
| Ile | Lys | Lys | Phe | Ala | Asp | Glu | Asn | Ala | Asn | Ile | Met | Trp | Gly | Cys | Ala |
| 355 | 360 | 365 | |||||||||||||
| Ala | Ala | Glu | Arg | Phe | Tyr | Glu | Val | Leu | Asp | Leu | Ala | Lys | Gin | Gin | Ser |
| 370 | 375 | 380 | |||||||||||||
| Asn | Val | Ser | Glu | Lys | Leu | Asn | Glu | Phe | Gin | Gly | Leu | Gin | His | Ser | Ile |
| 385 | 390 | 395 | 400 | ||||||||||||
| Gin | Phe | Cys | Asn | Val | Ser | Phe | Gly | Tyr | Val | Glu | Asp | Ser | Pro | Val | Leu |
| 405 | 410 | 415 | |||||||||||||
| Ser | Asp | Phe | Asn | Leu | Val | Leu | Lys | Lys | Gly | Glu | Ala | Ile | Gly | Ile | Val |
| 420 | 425 | 430 | |||||||||||||
| Gly | Pro | Thr | Gly | Ser | Gly | Lys | Ser | Thr | Ile | Ala | Lys | Leu | Leu | Pro | Arg |
| 435 | 440 | 445 | |||||||||||||
| Leu | Tyr | Glu | Val | Ser | His | Gly | Glu | Leu | Leu | Ile | Asp | Ser | Leu | Pro | Ile |
| 450 | 455 | 4 60 | |||||||||||||
| Arg | Ser | Tyr | Cys | Lys | Asn | Ser | Leu | Arg | Lys | His | Ile | Gly | Cys | Val | Leu |
| 4 65 | 470 | 475 | 480 | ||||||||||||
| Gin | His | Pro | Phe | Leu | Phe | Tyr | Asp | Thr | Val | Trp | Asn | Asn | Leu | Thr | Cys |
| 485 | 490 | 495 | |||||||||||||
| Gly | Arg | Thr | Phe | Ser | Glu | Glu | Glu | Val | Phe | His | Ala | Leu | Lys | Gin | Ala |
| 500 | 505 | 510 | |||||||||||||
| His | Ala | Tyr | Glu | Phe | Val | Ser | Lys | Met | Pro | Gin | Gly | Val | His | Ser | Leu |
| 515 | 520 | 525 | |||||||||||||
| Leu | Glu | Glu | Ser | Ser | Lys | Asn | Leu | Ser | Gly | Gly | Gin | Gin | Gin | Arg | Leu |
| 530 | 535 | 540 | |||||||||||||
| Thr | Ile | Ala | Arg | Ala | Leu | Leu | His | Asn | Thr | Ser | Ile | Leu | Leu | Leu | Asp |
| 545 | 550 | 555 | 560 | ||||||||||||
| Glu | Ala | Thr | Ser | Ala | Leu | Asp | Ala | Ile | Ser | Glu | Asn | Tyr | Val | Lys | Glu |
| 565 | 570 | 575 |
507
| Ile | Val | Gly | Gin Leu Lys 580 | Gly Arg Cys 585 | Thr Gin | Ile Ile | Ile 590 | Ala His | |||||||
| Lys | Leu | Ser | Thr | Leu | Glu | Tyr | Val | Asp | Arg | Ile | Val | Tyr | Leu | Glu | Gin |
| 595 | 600 | 605 | |||||||||||||
| Gly | Lys | Lys | Ile | Ala | Glu | Gly | Thr | Lys | Glu | Glu | Leu | Leu | Asp | Ser | Cys |
| 610 | 615 | 620 | |||||||||||||
| Pro | Ala | Phe | Gin | Arg | Met | Trp | Val | Leu | Ser | Gly | Ala | Lys | Asp | Trp | Glu |
| 625 | 630 | 635 | 640 | ||||||||||||
| Leu | Asn | Ala | Val | Val | Lys |
645 <210> 568 <211> 414 <212> PRT
| <213> C. | Trachomatis | D serovar | |||||||||||||
| <400> 568 | |||||||||||||||
| Met | Phe | Ser | Ser | Ala | Ile | Val | Ile | Leu | Thr | Ala | Ile | Phe | Val | Leu | Cys |
| 1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
| Ser | Gly | Phe | Val | Ser | Leu | Ser | His | Ile | Ala | Leu | Phe | Ser | Leu | Pro | Ser |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Ser | Leu | Ile | Ala | His | Tyr | Ser | His | Ser | Lys | Asn | Arg | Gin | Leu | Arg | Gin |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Ile | 'Ala | Asn | Leu | Met | Ala | Tyr | Pro | Asn | His | Leu | Leu | Met | Thr | Leu | Val |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Phe | Phe | Asp | Ile | Gly | Ile | Asn | Ile | Gly | Val | Gin | Asn | Cys | Ile | Ala | Thr |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Leu | Val | Gly | Asp | Ser | Ala | Ser | Leu | Leu | Leu | Thr | Val | Gly | Val | Pro | Leu |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Ala | Leu | Thr | Leu | Val | Leu | Gly | Glu | Ile | Val | Pro | Lys | Val | Ile | Ala | Ile |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| .'Pro | Tyr | Asn | Ala | Arg | Ile | Ala | Lys | Ile | Val | Thr | Pro | Ile | Ile | Phe | Ala |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Ser | Thr | Lys | Ser | Phe | Arg | Pro | Ile | Phe | Asp | Trp | Ala | Ile | Ser | Gly | Ile |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Asn | Phe | Ile | Val | Gin | Lys | Met | Leu | Ala | Arg | Gin | Glu | Ser | Asp | Phe | Ile |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Gin | Pro | Gin | Glu | Leu | Lys | Glu | Val | Leu | Arg | Ser | Cys | Lys | Asp | Phe | Gly |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Val | Val | Asn | His | Glu | Glu | Ser | Arg | Leu | Leu | Phe | Gly | Tyr | Leu | Ser | Met |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Glu | Glu | Gly | Ser | Ile | Lys | Glu | Arg | Met | Thr | Pro | Lys | Gin | Glu | Ile | Ile |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Phe | Tyr | Asp | Val | Leu | Thr | Pro | Ile | Glu | Asn | Leu | Tyr | Lys | Leu | Phe | Ser |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Gly | Pro | Lys | Gin | Ser | Tyr | Ser | Lys | Val | Leu | Val | Cys | Lys | Gly | Gly | Leu |
| 225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
| Gin | Asn | Leu | Leu | Gly | Val | Cys | Ser | Ala | Lys | Leu | Leu | Leu | Leu | Tyr | Lys |
| 245 | 250 | 255 | |||||||||||||
| Glu | Lys | Leu | Gin | Ser | Ala | Glu | Glu | Leu | Leu | Pro | Leu | Leu | Arg | Lys | Pro |
| 260 | 265 | 270 | |||||||||||||
| His | Tyr | Ile | Pro | Glu | Thr | Val | Ser | Ala | Lys | Thr | Tkla | Leu | Tyr | His | Leu |
| 275 | 280 | 285 | |||||||||||||
| Ala | Gly | Glu | Asp | Cys | Gly | Leu | Gly | Ile | Ile | Ile | Asp | Glu | Tyr | Gly | Ser |
| 290 | 295 | 300 | |||||||||||||
| Ile | Glu | Gly | Leu | Ile | Thr | Gin | Asn | Asp | Leu | Phe | Lys | Ile | Val | Ser | Asp |
| 305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
| Gly | Val | Ala | His | Asn | Arg | Pro | Ser | Phe | Lys | Gin | Phe | Ala | His | Ser | Asp |
| 325 | 330 | 335 | |||||||||||||
| Lys | Asn | Val | Val | Ile | Ala | Ala | Gly | Thr | Tyr | Glu | Leu | Ser | Asp | Phe | Tyr |
| 340 | 345 | 350 |
·· «···
508
| Asp | Leu | Phe | Gly | Val | Asp | Leu | Pro | Thr | Thr | Ala | Asn | Cys | Val. | Thr | Ile |
| 355 | 360 | 365 | |||||||||||||
| Gly | Gly | Trp | Leu | Thr | Glu | Gin | Leu | Gly | Glu | Ile | Pro | Glu | Thr | Gly | Thr |
| 370 | 375 | 380 | |||||||||||||
| Lys | Phe | Ala | Trp | Gly | Gin | Phe | Val | Phe | Gin | Ile | Leu | Asp | Ala | Ala | Pro |
| 385 | 390 | 395 | 400 | ||||||||||||
| Asn | Cys | Val | Lys | Arg | Val | Tyr | Ile | Arg | Lys | Thr | His | Gly | Asn | ||
| 405 | 410 |
<210> 569 <211> 404 <212> PRT <213> C. Trachomatis D serovar <400> 569
| Met Glu Thr Asn Ser | Pro Phe | Phe | Trp Leu Gly Val Asn Leu Leu Cys | ||||||||||||
| 1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
| Ile | Phe | Val | Gin | Gly | Phe | Phe | Ser | Met | Met | Glu | Met | Ala | Cys | Ile | Ser |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Phe | Asn | Arg | Val | Arg | Leu | Gin | Tyr | Tyr | Leu | Thr | Lys | Ser | Asn | Lys | Lys |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Ala | Ser | Tyr | Ile | Asn | Phe | Leu | Val | Arg | Árg | Pro | Tyr | Arg | Leu | Phe | Gly |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| 'Thr | Val | Met | Leu | Gly | Val | Asn | Ile | Ala | Leu | Gin | Ile | Gly | Ser | Glu | Ser |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Ser | Arg | Thr | Cys | Tyr | Lys | Leu | Leu | Gly | Ile | Ser | Pro | Glu | Tyr | Ala | Pro |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Ala | Thr | Gin | Ile | Ile | Leu | Val | Val | Ile | Phe | Ala | Glu | Leu | Ile | Pro | Leu |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Ala | Ile | Ser | Arg | Lys | Ile | Pro | Glu | Lys | Ile | Ala | Leu | Lys | Gly | Ala | Pro |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Ile | Leu | Tyr | Phe | Ala | His | Tyr | Leu | Phe | Tyr | Pro | Leu | Ile | Gin | Cys | Val |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Gly | Gly | Ile | Thr | Asn | Met | Ile | Tyr | Phe | Ile | Leu | Asn | Ile | Lys | Glu | Glu |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Thr | Leu | His | Ser | Thr | Leu | Ser | Arg | Asp | Glu | Leu | Gin | Lys | Thr | Leu | Glu |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Thr | His | His | Glu | Glu | His | Asp | Phe | Asn | Val | Ile | Ala | Thr | Asn | Ile | Phe |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Ser | Leu | Ser | Ala | Thr | Ser | Val | Glu | Gin | Val | Cys | Gin | Tyr | Leu Asp | Gin | |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Ile | Pro | Ile | Leu | Ser | Ala | Thr | Ala | Ser | Val | Arg | Asp | Val | Cys | Gin | Leu |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Val | Arg | Arg | His | Arg | Leu | Asp | Phe | Val | Pro | Val | Tyr | His | Lys | Val | Lys |
| 225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
| Lys | Asn | Val | Val· | Gly | Ile | Ala | Phe | Pro | Lys | Asn | Leu | Ile | Asn | Arg | Asn |
| 245 | 250 | 255 | |||||||||||||
| Pro | Ser | Asp | Pro | Val | Val | Pro | Tyr | Leu | Ser | Ser | Pro | Trp | Phe | Ile | Thr |
| 260 | 265 | 270 | |||||||||||||
| Ala | Lys | Ser | Lys | Leu | Ile | His | Ala | Ile | Gin | Glu | Phe | Arg | Lys | Asn | Ser |
| .275 | 280 | 285 | |||||||||||||
| Ser | Asn | Val | Ala | Ile | Val | Leu | Asn | Asn | Asn | Gly | Glu | Pro | Met | Gly | Val |
| 290 | 295 | 300 | |||||||||||||
| Leu | Gly | Leu | His | Thr | Val | Phe | Lys | Thr | Leu | Phe | Asn | Thr | Arg | Asn | Ile |
| 305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
| Ala | Gin | Leu | Lys | Pro | Lys | Pro | Thr | Ser | Leu | Ile | Glu | Arg | Thr | Phe | Ser |
| 325 | 330 | 335 | |||||||||||||
| Gly | Asn | Thr | Pro | Leu | Ser | Glu | Ile | Glu | Asn | Glu | Leu | Asp | Ile | Ile | Phe |
| 340 | 345 | 350 | |||||||||||||
| Met | Asp | Asn | Asp | Cys | Thr | Thr | Ile | Glu | Gin | Leu | Met | Leu | Lys | Leu | Leu |
| 355 | 360 | 365 |
509
| Asp | Thr Pro 370 | Pro | Glu Val | Gly Ala 375 | Ser | Ile | Ile | Ile Asn Asp Leu Leu 380 | ||||||
| Leu | Glu | Val | Lys | Glu | Ile | Ser Leu | Tyr | Gly | Ile | Lys | Thr | Val | Ala | ile |
| 385 | 390 | 395 | 400 | |||||||||||
| Lys | Asp | Thr | Leu |
<210> 570 <211> 539 <212> PRT <213> C. Trachomatis D serovar <400> 570
| Met 1 | Cys | Cys | Val | Asp 5 | Gly | Ser | Asn | Ser | Ile 10 | Gin | Gin | Arg | Met | Arg 15 | Phe |
| Cys | Glu | Tyr | Arg 20 | Thr | Ala | Ala | Gin | Glu 25 | Ala | Lys | Thr | Ser | Leu 30. | Ser | Ser |
| Asp | Cys | Ser 35 | Leu | Leu | Glu | Ala | Arg 40 | Leu | Ala | Leu | Arg | Ala 45 | Leu | Ala | Lys |
| His | His 50 | Glu | Tyr | Ser | Ala | Trp 55 | Arg | Glu | Ala | Phe | Leu 60 | Arg | Ser | Gin | Glu |
| Arg ,65 | Phe | Pro | Ser | Leu | Glu 70 | Ala | Asp | Arg | ASP | Ile 75 | His | Glu | Asp | Leu | Ala 80 |
| Ala | Ser | Leu | Leu | Gin 85 | Lys | Asn | Ile | Arg | His 90 | Ser | Ser | Leu | Thr | Val 95 | Arg |
| Val | Ile | Thr | Ile 100 | Leu | Ala | Val | Gly | Met 105 | Ala | Arg | Asp | Tyr | Arg 110 | Leu | Val |
| Pro | Ile | Val 115 | Leu | Gin | Ala | Leu | Ser 120 | Asp | Asp | Ser | Asp | Thr 125 | Val | Arg | Glu |
| Ile | Ala 130 | Val | Gin | Val | Ala | Val 135 | Met | Tyr | Gly | Ser | Ser 140 | Cys | Leu | Leu | Arg |
| Ala 145 | Val | Gly | Asp | Leu | Ala 150 | Lys | Asii | Asp | Ser | Ser 155 | Ile | Gin | Val | Arg | Ile 160 |
| Thr | Ala | Tyr | Arg | Ala 165 | Tkla | Ala | Val | Leu | Glu 170 | Ile | Gin | Asp | Leu | Val 175 | Pro |
| His | Leu | Arg | Val 180 | Val | Val | Gin | Asn | Thr 185 | Gin | Leu | Asp | Gly | Thr 190 | Glu | Arg |
| Arg | Glu | Ala 195 | Trp | Arg | Ser | Leu | Cys 200 | Val | Leu | Thr | Arg | Pro 205 | His | Ser | Gly |
| Val | Leu 210 | Thr | Gly | Ile | Asp | Gin 215 | Ala | Leu | Met | Thr | Cys 220 | Glu | Met | Leu | Lys |
| Glu 225 | Tyr | Pro | Glu | Lys | Cys 230 | Thr | Glu | Glu | Gin | Ile 235 | Arg | Thr | Leu | Leu | Ala 240 |
| Ala | Asp | His | Pro | Glu 245 | Val | Gin | Val | Ala | Thr 250 | Leu | Gin | Ile | Ile | Leu 255 | Arg |
| Gly | Gly | Arg | Val 260 | Phe | Arg | Ser | Ser | Ser 265 | Ile | Met | Glu | Ser | Val 270 | Gin | Lys |
| Leu | Ala | Cys 275 | Asn | Ser | Leu | Ser | Ala 280 | Arg | Val | Gin | Met | Gin 285 | Ala | Ala | Ala |
| Ile | Leu 290 | Tyr | Leu | Glu | Gly Asp 295 | Pro | Phe | Gly | Glu | Asp 300 | Lys | Leu | Thr | Glu | |
| Gly 305 | Leu | Ser | Ala | Thr | Ser 310 | Ser | Ile | Leu | Cys | Glu 315 | Ala | Ala | Ser | Glu | Ala 320 |
| Val | Cys | Ser | Leu | Gly 325 | Ile | His | Gly | Val | His 330 | Leu | Tkla | Gly | Arg | Phe 335 | Leu |
| Ser | Lys | Val | Gin 340 | Gly | Met | Arg | Ser | Arg 345 | Val | Asn | Leu | Tkla | Phe 350 | Ala | Leu |
| Leu | Val | Ser 355 | Arg | Glu | Lys | Val | Glu 360 | Glu | Ala | Gly | Asp | Val 365 | Val | Ala | Ser |
| Phe | Ile 370 | His | Arg | Ile | Glu | Pro 375 | Cys | Arg | Ala | Ile | Glu 380 | Gin | Phe | Leu | Cys |
• · · • ’ · ··· • · · · · • · · · ·· ··
510
| Glu | Asp | Gin | Lys | Ile | Phe | Val | Ala | Ser | Ser | Pro | Leu | Gin | Val | Glu | Ile |
| 385 | 390 | 395 | 400 | ||||||||||||
| Met | Lys | Arg | Asp | Leu | Ala | Lys | Lys | Ile | Ile | Arg | Leu | Leu | Val | Ala | Ala |
| 405 | 410 | 415 | |||||||||||||
| Gin | Tyr | Ser | Lys | Ala | Lys | Met | Val | Val | Ala | Gin | Tyr | Leu | Ala | Gly | Gin |
| 420 | 425 | 430 | |||||||||||||
| Gin | Val | Gly | Trp | Ser | Phe | Cys | Ser | Glu | Val | Phe | Trp | Glu | Glu | Gly | Asp |
| 435 | 440 | 445 | |||||||||||||
| Ser | Glu | Asp | Phe | Val | Glu | Pro | Leu | Gin | Glu | Glu | Ser | Phe | Ala | Phe | Ala |
| 450 | 455 | 4 60 | |||||||||||||
| Leu | Glu | Lys | Ala | Leu | Ser | Phe | Leu | Gin | Arg | Glu | Gly | Gly | Glu | Ala | Gly |
| 465 | 470 | 475 | 480 | ||||||||||||
| Leu | His | Ala | Val | Ile | Ser | Leu | Tyr | Pro | His | Ser | Arg | Trp | Gin | Asp | Lys |
| 485 | 490 | 495 | |||||||||||||
| Leu | Thr | Ile | Leu | Glu | Ala | Ile | Ala | Tyr | Ser | Glu | Asn | Arg | Ile | Ala | Thr |
| 500 | 505 | 510 | |||||||||||||
| Cys | Phe | Leu | Arg | Glu | Arg | Cys | Leu | Gin | Glu | Ala | Ala | Ser | Leu | Gin | Ser |
| 515. | 520 | 525 | |||||||||||||
| Ala | Ala | Ala | Gly | Ala | Val | Phe | Ala | Leu | Phe | Lys |
530 535 <210> 571 <211> 104 <212> PRT <213> C. Trachomatis D serovar
| <400> 571 | |||||||||||||||
| Met | Gin | Thr | Ser | Arg | Ile | Ser | Ser | Phe | Phe | Arg | Gly | Leu | Val | His | Leu |
| 1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
| Tyr | Arg | Trp | Ala | Ile | Ser | Pro | Phe | Leu | Gly | Ala | Pro | Cys | Arg | Phe | Phe |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Pro | Thr | Cys | Ser | Glu | Tyr | Ala | Leu | Val | Ala | Leu | Lys | Lys | His | Pro | Leu |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Arg | Lys | Ser | Leu | Phe | Leu | Ile | Ala | Lys | Arg | Leu | Leu | Lys | Cys | Gly | Pro |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Trp | Cys | Ile | Gly | Gly | Ile | Asp | Leu | Val | Pro | Arg | Thr | Ser | Val | Glu | Glu |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Tyr | Leu | Ser | Ser | Pro | Thr | Pro | Leu | Ala | Glu | Ser | Pro | Asp | Asp | Arg | Thr |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Val | Pro | His | Thr | Gin | Glu | Thr | Ser |
100 <210> 572 <211> 336 <212> PRT <213> C. Trachomatis D serovar
| <400> 572 | |||||||||||||||
| Met | Gin | Leu | Phe | Phe | Gly | Arg | Phe | Tyr | Glu | Val | Ala | Cys | Ile | Val | Ala |
| 1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
| Ser | Ile | Leu | Arg | Glu | Arg | Asp | Val | Gly | Val | Phe | Met | Gly | Ile. | Glu | Gly |
| 20. | 25 | 30 | |||||||||||||
| Arg | Gly | Ser | Gly | Ala | Met | Gin | Ser | Lys | Lys | Thr | Ile | Lys | Trp | Leu | Lys |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Gin | Ala | Leu | Val | Leu | Ser | Ser | Ile | Val | Asn | Ile | Leu | Leu | Leu | Leu | Leu |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Ile | Tyr | Ser | Thr | Val | Phe | Arg | Lys | Asp | Ile | Tyr | Lys | Leu | Arg | Val | Phe |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Pro | Gly | Asn | Leu | Ile | Ala | Lys | Ser | Ser | Arg | Ile | Gly | Lys | Ile | Pro | Glu |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Asp | Ile | Leu | Glu | Arg | Leu | Glu | Asn | Ala | Ser | Phe | Ala | Asp | Leu | Leu | Ala |
511
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Leu | Leu | Gin | Glu | Glu | Arg | Met | Val | Phe | Gly | His | Pro | Leu | Lys | Ser | Trp |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Ala | Leu | Gly | Val | Ser | Ile | Gin | Lys | Tyr | Phe | Val | Asp | Ile | Ala | Pro | Met |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Leu | Thr | His | Pro | Leu | Thr | Phe | Ile | Arg | Leu | Lys | Ser | Pro | Glu | Arg | Thr |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Trp | Leu | Leu | Pro | Asp | Ile | Asn | Asp | Gin | Glu | Phe | Thr | Arg | Ile | Cys | Gin |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Tyr | Leu | Leu | Thr | Glu | Arg | Phe | Pro | Phe | Ser | Ser | Arg | Gly | Phe | Phe | Arg |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Ile | Met | Val | Arg | Asp | Cys | Glu | Ala | Gly | Met | Val | Asp | Glu | Asp | Val | Leu |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Tyr | Arg | Phe | Cys | His | Leu | Pro | Glu | Phe | Leu | Tyr | Val | Arg | Ser | Leu | Leu |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Phe | Gly | Ala | Glu | Ile | Glu | Ala | Ala | Ser | Val | Ala | Ser | Leu | Ala | Arg | Met |
| 225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
| Ile | Ile | Gin | Gly | Gly | Glu | Asp | Leu | Phe | Phe | Ser | Leu | Cys | Cys | Leu | Glu |
| 245 | 250 | 255 | |||||||||||||
| Asn | Arg | Gin | Thr | Ala | Ile | Ser | Asp | His | Gin | Arg | Arg | Cys | Phe | Leu | Lys |
| 260 | 265 | 270 | |||||||||||||
| Ala | Tyr | Val | Asp | Arg | Gin | Glu | Pro· | Leu | Ala | Ala | Leu | Leu | Leu | Leu | Val |
| 275 | 280 | 285 | |||||||||||||
| His | Asp | Ala | Asp | Trp | Val | Leu | His | Glu | Phe | Ser | Asp | Ser | Asp | Leu | Gin |
| 290 | 295 | 300 | |||||||||||||
| Ser | Phe | Ile | Gin | Leu | Leu | Pro | Arg | Glu | Ala | His | Tyr | Thr | Lys | Lys | Phe |
| 305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
| Leu | Gly | Cys | Val | Ala | Gin | Ser | Cys | Arg | Leu | Gly | Ile. | Leu | Leu | Glu | Gly |
| 325 | 330 | 335 |
<210> 573 <211> 426 <212> PRT <213> C. Trachomatis D serovar <400> 573
| Met 1 | Tyr | Val | Arg | Sér 5 | Ile Phe | Phe | Ser | Ile 10 | Ile Ala | Phe Leu | Thr 15 | Val | |||
| Gly | Cys | Ser | Phe | Ser | Pro | Pro | Glu | Ser | Gly | Leu | Ile | Ile | Ala | Ile | His |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Asp | Asp | Pro | Arg | Ser | Leu | Ser | Pro | Glu | Lys | Gly | Glu | Asn | Ala | Phe | His |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Phe | Ser. | Leu | Ser | Lys | Ala | Leu | Phe | Ala | Thr | Leu | Phe | Arg | Glu | Glu | Leu |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Ser | Gly | Leu | Thr | Pro | Ala | Leu | Val | Ser | Ser | Tyr | Gin | Val | Ser | Glu | Asp |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Gly | Arg | Phe | Tyr | Arg | Phe | Cys | Ile | Arg | Lys | Asp | Ala | Lys | Trp | Ser | Asp |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Gly | Ser | Leu | Leu | Leu | Ala | Glu | Asp | Val | Ile | Ala | Ala | Trp | Glu | His | Thr |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Lys | Gin | Ala | Gly | Arg | Tyr | Ser | Leu | Leu | Phe | Glu | Lys | Leu | Ser | Phe | Arg |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Ala | Ser | Sér | Ser | Ser | Glu | Ile | Leu | Ile | Glu | Leu | Lys | Glu | Pro | Glu | Pro |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Gin | Leu | Leu. | Ala | Ile | Leu | Ala | Ser | Pro | Phe | Phe | Ala | Val | Tyr | Arg | Pro |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Glu | Asn | Pro | Phe | Leu | Ser | Ser | Gly | Pro | Phe | Met | Pro | Lys | Thr | Tyr | Val |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Gin | Gly | Gin | Thr | Leu | Val | Leu | Gin | Lys | Asn | Pro | Tyr | Tyr | Tyr | Asp | His |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Ala | His | Val | Glu | Leu | His | Ser | Ile | Asp | Phe | Arg- | Ile | Ile | Pro | Asn | Ile |
.512 ···· Φ··
WO 02/08267 • φφφ φφφ • · · · · φ ' • φ φ φ φ φ φ
PCT/US01/23121
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Tyr | Thr | Ala | Leu | His | Leu | Leu | Arg | Arg | Gly | Asp | Val | Asp | Trp | Val | Gly |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Gin | Pro | Trp | His | Gin | Gly | Ile | Pro | Phe | Glu | Leu | Arg | Thr | Thr | Ser | Ala |
| 225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
| Leu | Tyr | Thr | His | Tyr | Ser | Val | Asp | Gly | Thr | Phe | Trp | Leu | Ile | Leu | Asn |
| 245 | 250 | 255 | |||||||||||||
| Pro | Lys | Asp | Pro | Val | Leu | Ser | Ser | Leu | Ser | Asn | Arg | Gin | Arg | Leu | Ile |
| 260 | 265 | 270 | |||||||||||||
| Ala | Ala | Val | Gin | Lys | Glu | Lys | Leu | Val | Lys | Gin | Ala | Leu | Gly | Thr | Gin |
| 275 | 280 | 285 | |||||||||||||
| Tyr | Arg | Val | Ala | Glu | Ser | Ser | Pro | Ser | Pro | Glu | Gly | Ile | Ile | Ala | His |
| 290 | 295 | 300 | |||||||||||||
| Gin | Glu | Ala | Ser | Thr | Pro | Phe | Pro | Gly | Lys | Ile | Thr | Leu | Ile | Tyr | Pro |
| 305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
| Asn | Asn | Ile | Thr | Arg | Cys | Gin | Arg | Leu | Ala | Glu | Val | Leu | Gin | Glu | Gin |
| 325 | 330 | 335 | |||||||||||||
| Cys | Arg | Asp | Ala | Gly | Ile | Gin | Leu | Thr | Leu | Glu | Gly | Leu | Glu | Tyr | His |
| 340 | 345. | 350 | |||||||||||||
| Val | Phe | Val | Gin | Lys | Arg | Ala | Thr | Gin | Asp | Phe | Ser | Val | Ser | Thr | Ala |
| 355 | 360 | 365 | |||||||||||||
| Thr | Ser | Ile | Ala | Phe | His | Pro | Leu | Ala | Lys | Ser | Lys | Phe | Asp | Gin | Thr |
| 370 | 375 | 380 | |||||||||||||
| Ala | Leu | Asp | Asn | Phe | Thr | Cys | Leu | Pro | Leu | Tyr | His | Ile | Glu | Tyr | Asp |
| 385 | 390 | 395 | 4 00 | ||||||||||||
| Tyr | Ile | Leu | Ser | Arg | Pro | Leu | Asp | Gin | Ile | Val | His | Tyr | Pro | Ser | dy |
| 405 | 410 | 415 | |||||||||||||
| Ser | Val | Asp | Leu | Thr | Tyr | Ala | His | Phe | His | ||||||
| 420 | 425 |
<210> 574 <211> 605 <212> PRT <213> C. Trachomatis D serovar <400> 574
| Met | Gin | Asn | Ile | Leu | Arg | Thr | Ser | Ser | Cys | Arg | Tyr | Met | Phe | Leu | Leu |
| 1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
| Gly | Ile | Arg | Ser | Val | Trp | Asn | Arg | Val | Ala | Val | Val | Asn | Asn | Phe | Arg |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Gly | Ser | Ser | Trp | Lys | Ile | Val | Ala | Ile | Pro | Ser | Cys | Ile | Leu | Phe | Thr |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Leu | Ile | Phe | His | Leu | Pro | Arg | Trp | Leu | Ile | Asp | Phe | Gly | Val | Cys | Thr |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Asn | Leu | Ala | Cys | Ser | Leu | Ser | Ile | Ile | Phe | Trp | Val | Phe | Ser | Leu | Arg |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Ser | Ser | Ala | Ser | Ala | Arg | Ile | Phe | Pro | Ser | Leu | Leu | Leu | Tyr | Leu | Cys |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Leu | Leu | Arg | Leu | Gly | Leu | Asn | Leu | Ala | Ser | Thr | Arg | Trp | He | Leu | Ser |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Ser | Gly | Trp | Ala | Ser | Pro | Leu | Ile | Phe | Ala | Leu | Gly | Asn | Phe | Phe | Ser |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Leu | Gly | Ser | Ile | Pro | Val | Ala | Leu | Thr | Val | Cys | Leu | Leu | Leu | Phe | Leu |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Val | Asn | Phe. | Leu | Val | Ile | Thr | Lys | Gly | Ala | Glu | Arg | Ile | Ala | Glu | Val |
| 145 | 150 | 155 | Γ60 | ||||||||||||
| Arg | Ala | Arg | Phe | Ser | Leu | Glu | Ala | Leu | Pro | .Gly | Lys | Gin | Met | Ser | Leu |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Asp | Ala | Asp | Ile | Ala | Ala | Gly | Arg | Ile | Gly | Tyr | Ser | Arg | Ala | Ser | Val |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Lys | Lys | Ser | Ser | Leu | Leu | Glu | Glu | Ser | Asp | Tyr | Phe | Ser | Ala | Met | Glu |
• Σ ·* ·· ·· ♦··♦ ♦ · * · '· · · a • ··· · « · ··· · · · • * ·· · ·· ··· · ·
513
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Gly | Val | Phe | Arg | Phe | Val | Lys | Gly | Asp | Ala | Ile | Met | Ser | Trp | Val | Leu |
| Leu | 210 | 215 | 220 | ||||||||||||
| Gly | Val | Asn | Ile | Leu | Ala | Ala | Leu | Phe | Leu | Gly | Arg | Ala | Thr | His | |
| 225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
| Val | Gly | Asp | Leu | Trp | Leu | Thr | Val | Leu | Gly Asp | Ala | Leu | Val | Ser | Gin | |
| 245 | 250 | 255 | |||||||||||||
| Ile | Pro | Ala | Leu | Leu | Thr | Ser | Cys | Ala | Ala | Ala | Thr | Leu | Ile | Tkla | Lys |
| 260 | 265 | 270 | |||||||||||||
| Val | Gly | Glu | Lys | Glu | Ser | Leu | Ala | Gin | His | Leu | Leu | Asp | Tyr | Tyr | Glu |
| 275 | 280 | 285 | |||||||||||||
| Gin | Ser | Arg | Gin | Ser | Phe | Leu | Phe | Ile | Ala | Leu | Ile | Leu | Cys | Gly | Met |
| 290 | 295 | 300 | |||||||||||||
| Tkla | Cys | Ile | Pro | Gly | Tkla | Pro | Lys | Ala | Leu | Ile | Leu | Gly | Phe | Ser | Val |
| 305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
| Leu | Leu | Phe | Leu | Gly | Tyr | Lys | Asn | Pro | Ser | Ser | Gly | Glu | Thr | Leu | Leu |
| 325 | 330 | 335 | |||||||||||||
| Phe | Gin | Lys | Glu | Arg | Val | Glu | Phe | Val | Leu | Pro | Asp | Glu | Gly | Val | Gly |
| 340 | 345 | 350 | |||||||||||||
| Asn | Pro | Ala | Asn | Leu | Tyr | Lys | Asp | Ala | Arg | Asn | Gin | Ile | Tyr | Gin | Glu |
| 355 | 360 | 365 | |||||||||||||
| Leu | Gly | Val | Val | Phe | Pro | Glu | Ala | Ile | Val | Val | Arg | His | Val | Thr | Gly |
| 370 | Ile | 375 | 380 | ||||||||||||
| Ser | Ser | Pro | Arg | Leu | Phě | Ser | Gly | Gin | Glu | Val | Ala | Leu | Arg | Glu | |
| 385 | 390 | 395 | 400 | ||||||||||||
| Leu | Ser | Cys | Pro | Ala | Ile | Leu | Glu | Ser | Ile | Arg | Gin | Leu | Ala | Pro | Glu |
| 405 | 410 | 415 | |||||||||||||
| Thr | Ile | Ser | Glu | Arg | Phe | Val | Thr | Arg | Leu | Val | Asp | Glu | Phe | Arg | Glu |
| 420 | 425 | 430 | |||||||||||||
| His | Ala | Phe | Leu | Ser | Ile | Glu | Glu | Ile | Leu | Pro | Leu | Lys | Ile | Ser | Glu |
| 435 | 440 | 445 | |||||||||||||
| Asn | Ser | Leu | Ile | Phe | Leu | Leu | Arg | Ala | Leu | Val | Arg | Glu | Arg | Val | Ser |
| 450 | 455 | 460 | |||||||||||||
| Leu | His | Leu | Phe | Pro | Lys | Ile | Leu | Glu | Ala | Ile | Asp | Val | Tyr | Gly | Ser |
| 465 | 470 | 475 | 480 | ||||||||||||
| Gin | Pro | Lys | Asn | Ser | Gin | Glu | Leu | Val | Glu | Cys | Val | Arg | Lys | Tyr | Leu |
| Gly | 485 | 490 | 495 | ||||||||||||
| Lys | Gin | Ile | Gly | Leu | Ser | Leu | Trp | Asn | Arg | Gin | Asp | Val | Leu | Glu | |
| 500 | 505 | 510 | |||||||||||||
| Val | Ile | Thr | Ile | Asp | Ser | Leu | Val | Glu | Gin | Phe | Val | Arg Asp | Ser | Gin | |
| 515 | 520 | 525 | |||||||||||||
| Glu | Lys | Val | Val | Leu | Asp | Leu | Asn | Glu | Lys | Val | Val | Ala | Gin | Val | Lys |
| 530 | 535 | 540 | |||||||||||||
| His | Leu | Leu | Arg | Val | Gly | Glu | Gly | Asn | Phe | Arg | Ala | Ile | Val | Thr | Gly |
| 545 | 550 | 555 | 560 | ||||||||||||
| Ser | Glu | Thr | Arg | Lys | Glu | Leu | Lys | Arg | Ile | Val | Asp | Pro | Tyr | Phe | Pro |
| 565 | 570 | 575 | |||||||||||||
| Asp | Leu | Leu | Val | Leu | Tkla | His | Ser | Glu | Leu | Pro | Glu | Glu | Ile | Pro | Ile |
| 580 | 585 | 590 | |||||||||||||
| Thr | Leu | Leu | Gly | Tkla | Val | Ser | Asp | Glu | Val | Leu | Leu | Ser | |||
| 595 | 600 | 605 |
<210> 575 <211> 173 <212> PRT <213> C. Trachomatis D serovar <400> 575
Met Lys Lys Phe Leu Leu Leu Ser Leu Met Ser Leu Ser Ser Leu Pro 15 10 15
Thr Phe Ala Ala Asn Ser Thr Gly Thr Ile Gly Ile Val Asn Leu Arg ··«« • · · • ··· • * • ···
514
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Arg | Cys | Leu | Glu | Glu | Ser | Ala | Leu | Gly | Lys | Lys | Glu | Ser | Ala | Glu | Phe |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Glu | Lys | Met | Lys | Asn | Gin | Phe | Ser | Asn | Ser | Met | Gly | Lys | Met | Glu | Glu |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Glu | Leu | Ser | Ser | Ile | Tyr | Ser | Lys | Leu | Gin | Asp | Asp | Asp | Tyr | Met | Glu |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Gly | Leu | Ser | Glu | Thr | Ala | Ala | Ala | Glu | Leu | Arg | Lys | Lys | Phe | Glu | Asp |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Leu | Ser | Ala | Glu | Tyr | Asn | Thr | Ala | Gin | Gly | Gin | Tyr | Tyr | Gin | Ile | Leu |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Asn | Gin | Ser | Asn | Leu | Lys | Arg | Met | Gin | Lys | Ile | Met | Glu | Glu | Val | Lys |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Lys | Ala | Ser | Glu | Thr | Val | Arg | Ile | Gin | Glu | Gly | Leu | Ser | Val | Leu | Leu |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Asn | Glu | Asp | Ile | Val | Leu | Ser | Ile | Asp | Ser | Ser | Ala | Asp | Lys | Thr | Asp |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Ala | Val | Ile | Lys | Val | Leu | Asp | Asp | Ser | Phe | Gin | Asn | Asn |
165 170
| <210> 576 <211> 354 <212> PRT <213> C. Trachomatis D serovar | |||||||||||||||
| <400> 576 | |||||||||||||||
| Met | Ser | Gin | Ser | Thr | Tyr | Ser | Leu | Glu | Gin | Leu | Ala | Asp | Phe | Leu | Lys |
| 1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
| Val | Glu | Phe | Gin | Gly | Asn | Gly | Ala | Thr | Leu | Leu | Ser | Gly | Val | Glu | Glu |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| •Ile | Glu | Glu | Ala | Lys | Thr | Ala | His | Ile | Thr | Phe | Leu | Asp | Asn | Glu | Lys |
| 35 | * | 40 | 45 | ||||||||||||
| Tyr | Ala | Lys | His | Leu | Lys | Ser | Ser | Glu | Ala | Gly | Ala | Ile | Ile | Ile | Ser |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Arg | Thr | Gin | Phe | Gin | Lys | Tyr | Arg | Asp | Leu | Asn | Lys | Asn | Phe | Leu | Ile |
| 65 | 70 | 75 , | 80 | ||||||||||||
| Thr | Ser | Glu | Ser | Pro | Ser | Leu | Val | Phe | Gin | Lys | Cys | Leu | Glu | Leu | Phe |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Ile | Thr | Pro | Val | Asp | Ser | Gly | Phe | Pro | Gly | Ile | His | Pro | Thr | Ala | Val |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Ile | His | Pro | Thr | Ala | Ile | Ile | Glu | Asp | His | Val | Cys | Ile | Glu | Pro | Tyr |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Ala | Val | Val | Cys | Gin | His | Ala | His | Val | Gly | Ser | Ala | Cys | His | Ile | Gly |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Ser | Gly | Ser | Val | Ile | Gly | Ala | Tyr | Ser | Thr | Val | Gly | Glu | His | Ser | Tyr |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Ile | His | Pro | Arg | Val | Val | Ile | Arg | Glu | Arg | Val | Ser | Ile | Gly | Lys | Arg |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Val | Ile | Ile | Gin | Pro | Gly | Ala | Val | Ile | Gly | Ser | Cys | Gly | Phe | Gly | Tyr |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Val | Thr | Ser | Ala | Phe | Gly | Gin | His | Lys | His | Leu | Lys | His | Leu | Gly | Lys |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Val | Ile | Ile | Glu | Asp | Asp | Val | Glu | Ile | Gly | Ala | Asn | Thr | Thr | Ile | Asp |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Arg | Gly | Arg | Phe | Lys | His | Ser | Val | Val | Arg | Glu | Gly | Ser | Lys | Ile | Asp |
| 225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
| Asn | Leu | Val | Gin | Ile | Ala | His | Gin | Val | Glu | Val | Gly | Gin | His | Ser | Met |
| 245 | 250 | 255 | |||||||||||||
| Ile | Val | Ala | Gin | Ala | Gly | Ile | Ala | Gly | Ser | Thr | Lys | Ile | Gly | Asn | His |
| 260 | 265 | 270 | |||||||||||||
| Val | Ile | Ile | Gly | Gly | Gin | Ala | Gly | Ile | Thr | Gly | His | Ile | Cys | Ile | Ala |
·· «««· 99 ’· · · φ • ··· « • · 9 · ' • · ♦ ···· te *· · · ». * · · • · · • · 9 • · · · ·· ··
515
| 275 | 280 | 285 | |||||||||||||
| Asp | His | Val | Ile | Met | Met | Ala. | Gin | Thr | Gly | Val | Thr | Lys | Ser | Ile | Thr |
| 290 | 295 | 300 | |||||||||||||
| Ser | Pro | Gly | Ile | Tyr | Gly | Gly | Ala | Pro | Ala | Arg | Pro | Tyr | Gin | Glu | Ile |
| 305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
| His | Arg | Gin | Val | Ala | Lys | Val | Arg | Asn | Leu | Pro | Arg | Leu | Glu | Glu | Arg |
| 325 | 330 | 335 | |||||||||||||
| Ile | Ala | Ala | Leu | Glu | Lys | Leu | Val | Gin | Lys | Leu | Glu | Ala | Leu | Ser | Glu |
| 340 | 345 | 350 | |||||||||||||
| Gin | His |
<210> 577 <211> 421 <212> PRT <213> C. Trachomatis D serovar <400> 577
| Met 1 | Thr | Ala | Ser | Gly 5 | Gly | Ala | Gly | Gly | Leu 10 | Gly | Ser | Thr | Gin | Thr 15 | Val |
| Asp | Val | Ala | Arg 20 | Ala | Gin | Ala | Ala | Ala 25 | Ala | Thr | Gin | Asp | Ala 30 | Gin | Glu |
| Val | Ile | Gly 35 | Ser | Gin | Glu | Ala | Ser 40 | Glu | Ala | Ser | Met | Leu 45 | Lys | Gly | Cys |
| Glu | Asp 50 | Leu | Ile | Asn | Pro | Ala 55 | Ala | Ala | Thr | Arg | Ile 60 | Lys | Lys | Lys | Gly |
| Glu 65 | Lys | Phe | Glu | Ser | Leu 70 | Glu | Ala | Arg | Arg | Lys 75 | Pro | Thr | Ala | Asp | Lys 80 |
| Ala | Glu | Lys | Lys | Ser 85 | Glu | Ser | Thr | Glu | Glu 90 | Lys | Gly | Asp | Thr | Pro 95 | Leu |
| Glu | Asp. | Arg | Phe 100 | Thr | Glu | Asp | Leu | Ser 105 | Glu | Val | Ser | Gly | Glu 110 | Asp | Phe |
| Arg | Gly | Leu 115 | Lys | Asn | Ser | Phe | Asp 120 | Asp | Asp | Ser | Ser | Pro 125 | Asp | Glu | Ile |
| Leu | Asp 130 | Ala | Leu | Thr | Ser | Lys 135 | Phe | Ser | Asp | Pro | Thr 140 | Ile | Lys | Asp. | Leu |
| Ala 145 | Leu | Asp | Tyr | Leu | Ile 150 | Gin | Thr | Ala | Pro | Ser 155 | Asp | Gly | Lys | Leu | Lys 160 |
| Ser | Thr | Leu | Ile | Gin 165 | Ala | Lys | His | Gin | Leu 170 | Met | Ser | Gin | Asn | Pro 175 | Gin |
| Ala | Ile | Val | Gly 180 | Gly | Arg | Asn | Val | Leu 185 | Leu | Ala | Ser | Glu | Thr 190 | Phe | Ala |
| Ser | Arg | Ala 195 | Asn | Thr | Ser | Pro | Ser 200 | Ser | Leu | Arg | Ser | Leu 205 | Tyr | Phe | Gin |
| Val | Thr 210 | Ser | Ser | Pro | Ser | Asn 215 | Cys | Ala | Asn | Leu | His 220 | Gin | Met | Leu | Ala |
| Ser 225 | Tyr | Leu | Pro | Ser | Glu 230 | Lys | Thr | Ala | Val | Met 235 | Glu | Phe | Leu | Val | Asn 240 |
| Gly | Met | Val | Ala | Asp 245 | Leu | Lys | Ser | Glu | Gly 250 | Pro | Ser | Ile | Pro | Pro 255 | Ala |
| Lys | Leu | Gin | Val 260 | Tyr | Met | Thr | Glu | Leu 265 | Ser | Asn | Leu | Gin | Ala 270 | Leu | His |
| Ser | Val | Asn 275 | Ser | Phe | Phe | Asp | Arg 280 | Asn | Ile | Gly | Asn | Leu 285 | Glu | Asn | Ser |
| Leu | Lys 290 | His | Glu | Gly | His | Ala 295 | Pro | Ile | Pro | Ser | Leu 300 | Thr | Thr | Gly | Asn |
| Leu 305 | Thr | Lys | Thr | Phe | Leu 310 | Gin | Leu | Val | Glu | Asp 315 | Lys | Phe | Pro | Ser | Ser 320 |
| Ser | Lys | Ala | Gin | Lys 325 | Ala | Leu | Asn | Glu | Leu 330 | Val | Gly | Pro | Asp | Thr 335 | Gly |
| Pro | Gin | Thr | Glu | Val | . Leu | Asn | Leu | Phe | Phe | Arg | Ala | Leu | Asn | Gly | Cys |
• V · • 999 « · · • 9 ··»· ··· ·* ««·· • · · •99 • · # • « · 9
99
516
| 340 | |||
| Ser | Pro | Arg 355 | Ile |
| Val | Ile 370 | Thr | Asn |
| Pro 385 | Lys | Pro | Gly |
| His | Ala | Pro | Val |
| Gin | Pro | Pro | Ser 420 |
| Phe | Ser | Gly | Ala 360 |
| Thr | Leu | Asp 375 | Ala |
| Asp | Phe 390 | Pro | Arg |
| Pro 405 Pro | Gin | Ser | Glu |
| 345 | |||
| Glu | Lys | Lys | Gin |
| Ile | Asn | Ala | Asp 380 |
| Ser | Ser | Phe 395 | Ser |
| Ile | Pro 410 | Thr | Ser |
| 350 | |||
| Gin 365 | Leu | Ala | Ser |
| Asn | Glu | Asp | Tyr |
| Ser | Thr | Pro | Pro 4 00 |
| Pro | Thr | Ser 415 | Thr |
<210> 578 <211> 231 <212> PRT <213> C. Trachomatis D serovar <400> 578
| Met | Met | Glu | Val | Phe | Met | Asn | Phe | Leu | Asp | Gin | Leu | Asp | Leu | Ile |
| 1 | 5 | 10 | 15 | |||||||||||
| Gin | Asn | Lys | His | Met | Leu | Glu | His | Thr | Phe | Tyr | Val | Lys | Trp | Ser |
| 20 | 25 | 30 | ||||||||||||
| Gly | Glu | Leu | Thr | Lys | Glu | Gin | Leu | Gin | Ala | Tyr | Ala | Lys | Asp | Tyr |
| 35 | 40 | 45 | ||||||||||||
| Leu | His | Ile | Lys | Ala | Phe | Prd | Lys | Tyr | Leu | Ser | Ala | Ile | His | Ser |
| 50 | 55 | 60 | ||||||||||||
| Cys | Asp | Asp | Leu | Glu | Ala | Arg | Lys | Leu | Leu | Leu | Asp | Asn | Leu | Met |
| 65 | 70 | 75 | ||||||||||||
| Glu | Glu | Asn | Gly | Tyr | Pro | Asn | His | Ile | Asp | Leu | Trp | Lys | Gin | Phe |
| 85 | 90 | 95 | ||||||||||||
| Phe | Ala | Leu | Gly | Val | Thr | Pro | Glu | Glu | Leu | Glu | Ala | His | Glu | Pro |
| 100 | 105 | 110 | ||||||||||||
| Glu | Ala | Ala | Lys | Ala | Lys | Val | Ala | Thr | Phe | Met | Arg | Trp | Cys | Thr |
| 115 | 120 | 125 | ||||||||||||
| Asp | Ser | Leu | Ala | Ala | Gly | Val | Ala | Ala | Leu | Tyr | Ser | Tyr | Glu | Ser |
| 130 | 135 | 140 | ||||||||||||
| Ile | Pro | Arg | Ile | Ala | Arg | Glu | Lys | Ile | Arg | Gly | Leu | Thr | Glu | Tyr |
| 145 | 150 | 155 | ||||||||||||
| Gly | Phe | Ser | Asn | Pro | Glu | Asp | Tyr | Ala | Tyr | Phe | Thr | Glu | His | Glu |
| 165 | 170 | 175 | ||||||||||||
| Ala | Asp | Val | Arg | His | Ala | Arg | Glu | Glu | Lys | Ala | Leu | Ile | Glu | Met |
| 180 | 185 | 190 | ||||||||||||
| Leu | Lys | Asp | Asp | Ala | Asp | Lys | Val | Leu | Glu | Ala | Ser | Gin | Glu | Val |
| 195 | 200 | 205 | ||||||||||||
| Gin | Ser | Leu | Tyr | Gly | Phe | Leu | Asp | Ser | Phe | Leu | Asp | Pro | Gly | Thr |
| 210 | 215 | 220 | ||||||||||||
| Cys | Ser | Cys | His | Gin | Ser | Tyr | ||||||||
| 225 | 230 |
Ile
Lys
Tyr·
Arg
Asp
Val
Ser
Gly
Gin
Phe
160
Glu
Leu
Thr
Cys <210> 579 <211> 243 <212> PRT <213> C. Trachomatis D serovar <400> 579
| Met | Lys | Ile | Thr | Pro | Ile | Lys | Thr | Arg | Lys | Val | Phe | Ala | His | Asp | Ser |
| 1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
| Leu | Gin | Glu | Ile | Leu | Gin | Glu | Ala | Leu | Pro | Pro | Leu | Gin | Glu | Arg | Ser |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Val | Val | Val | Val | Ser | Ser | Lys | Ile | Val | Ser | Leu | Cys | Glu | Gly | Ala | Val |
| 35 | 40 | 45 |
·· 9944 ·· 9·* ·4·9 •·· · ¢9 9 9 · « ··· 9 <· 949 · 4 9 • * · · 9 9 9 Λ 9 4 · · · · 4 4 9 9··
4··· 994 ·· 44 9· 9»
517
| Ala Asp | Ala Arg | Met | Cys Lys Ala Glu Leu Ile Lys Lys Glu Ala Asp | ||||||||||||
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Ala | Tyr | Leu | Phe | Cys | Glu | Lys | Ser | Gly | Ile | Tyr | Leu | Thr | Lys | Lys | Glu |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Gly | Ile | Leu | Ile | Pro | Ser | Ala | Gly | Ile | Asp | Glu | Ser | Asn | Thr | Asp | Gin |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Pro | Phe | Val | Leu | Tyr | Pro | Lys | Asp | Ile | Leu | Gly | Ser | Cys | Asn | Arg | Ile |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Gly | Glu | Trp | Leu | Arg | Asn | Tyr | Phe | Arg | Val | Lys | Glu | Leu | Gly | Val | Ile |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Ile | Thr | Asp | Ser | His | Thr | Thr | Pro | Met | Arg | Arg | Gly | Val | Leu | Gly | Ile |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Gly | Leu | Cys | Trp | Tyr | Gly | Phe | Ser | Pro | Leu | His | Asn | Tyr | Ile | Gly | Ser |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Leu | Asp | Cys | Phe | Gly | Arg | Pro | Leu | Gin | Met | Thr | Gin | Ser | Asn | Leu | Val |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Asp | Ala | Leu | Ala | Val | Ala | Ala | Val | Val | Cys | Met | Gly | Glu | Gly | Asn | Glu |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Gin | Thr | Pro | Leu | Ala | Val | Ile | Glu | Gin | Ala | Pro | Asn | Met | Val | Tyr | His |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Ser | His | Pro | Thr | Ser | Arg | Glu | Glu | Tyr | Cys | Ser | Leu | Arg | Ile | Asp | Glu |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Thr | Glu | Asp | Leu | Tyr | Gly | Pro | Phe | Leu | Gin | Ala | Val | Thr | Trp | Ser | Gin |
| 225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
| Glu | Lys | Lys |
| <210> 580 | |||||||||||||||
| <211> 383 | |||||||||||||||
| <212> PRT | |||||||||||||||
| <213> C. | Trachomatis | ; D serovar | |||||||||||||
| <400> 580 | |||||||||||||||
| Met | Leu | Pro | His | Gin | Gin | Asn | Ser | Ser | Ser | Glu | Arg | Ala | Arg | His | His |
| 1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
| Glu | Ser | Arg | Ser | His | Arg | His | Ser | Ser | Ser | Ser | Arg | His | His | Val | Thr |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Arg | Ser | Gin | Ser | Ser | Ala | Leu | Pro | Gin | Leu | Gin | Glu | Arg | Pro | Val | Pro |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| His | Pro | Leu | Ala | Glu | Arg | Glu | Leu | Ile | Ile | Phe | His | Ser | Val | His | Gin |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Gin | Gin | Asn | Asn | Asn | Pro | Leu | Arg | Met | Ile | Cys | Asp | Thr | Ile | Arg | Gin |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Ala | Gin | Arg | Gly | Ile | Phe | Met | Arg | Ile | Tyr | Thr | Ile | Ser | Ser | Asp | Asp |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Ile | Ile | Gin | Ser | Leu | Ile | Gin | Thr | Ser | His | His | Val | Pro | Val | Glu | Val |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Lys | Tyr | His | Cys | Gly | Glu | Ser | Leu | Pro | Val | Ala | Cys | Gin | Asn | Ser | Arg |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Val | Val | Leu | Arg | Leu | Thr | Asn | Gly | Arg | Thr | Leu | Gin | His | Lys | Lys | Thr |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Met | Leu | Ala | Asp | Phe | Gin | Thr | Val | Val | Thr | Gly | Ser | Ala | Asn | Tyr | Thr |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Asp | Leu | Ser | Leu | Asn | His | Asp | Ala | Asn | Val | Thr | Ala | Cys | Ile | Glu | Ser |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Ser | Glu | Leu | His | Asp | Ala | Val | Phe | Ser | Glu | Arg | Pro | Gin | Leu | Val | His |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Val | Gly | Pro | Gin | Leu | Leu | Asn | Tyr | Ile | Pro | Ile | Gin | Arg | Leu | Ile | Pro |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Asn | Ala | Ala | Ser | Lys | Met | Ile | Leu | Asn | Ala | Ile | Asn | Gin | Ala | Thr | Asp |
| 210 | 215 | 220 |
• · · · · · · fr · · • · · ·
518
| Ser | Ile | Phe | Val | Leu | Met | Tyr | Ile | Phe | Leu | Ser | Pro | Glu | Phe | Phe | Leu |
| 225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
| Ala | Leu | Ala | Gin | Ala | Met | Arg | Arg | Gly | Val | Arg | Val | Lys | Val | Ile | Ile |
| 245 | 250 | 255 | |||||||||||||
| Asp | Asn | His | Ser | Lys | Gin | Asp | Thr | Cys | Lys | Leu | Leu | Ser | Lys | Leu | Gly |
| 260 | 265 | 270 | |||||||||||||
| Ile | Gin | Leu | Pro | Ile | Tyr | Glu | Arg | Lys | Thr | Glu | Gly | Val | Leu | His | Thr |
| 275 | 280 | 285 | |||||||||||||
| Lys | Ile | Cys | Cys | Ile | Asp | Asn | Lys | Thr | Leu | Ile | Phe | Gly | Ser | Ala | Asn |
| 290 | 295 | 300 | |||||||||||||
| Trp | Ser | Gly | Ala | Gly | Met | Ile | Lys | Asn | Phe | Glu | Asp | Leu | Phe | Ile | Leu |
| 305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
| Arg | Pro | Ile | Thr | Glu | Thr | Gin | Leu | Gin | Ala | Phe | Met | Asp | Val | Trp | Ser |
| 325 | 330 | 335 | |||||||||||||
| Leu | Leu | Glu | Thr | Asn | Ser | Ser | Tyr | Leu | Ser | Pro | Glu | Ser | Val | Leu | Thr |
| 340 | 345 | 350 | |||||||||||||
| Ala | Pro | Thr | Pro | Ser | Ser | Arg | Pro | Thr | Gin | Gin | Asp | Thr | Asp | Ser | Asp |
| 355 | 360 | 365 | |||||||||||||
| Asp | Glu | Gin | Pro | Ser | Thr | Ser | Gin | Gin | Asp | Ile | Arg | Met | Arg | Lys |
370 375 380 <210> 581 <211> 193 <212> PRT <213> C. Trachomatis D serovar <400> 581
| Met 1 | Trp Phe Phe | Leu 5 | Gly Ser | Pro | Ser Ala Ile Thr 10 | Asn | Phe | Ser 15 | Arg | ||||||
| Val | Asp | Val | Ala | Leu | Asn | Leu | Arg | Ile | Asn | Arg | Gin | Ile | Arg | Ala | Pro |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Arg | Val | Arg | Val | Ile | Gly | Ser | Ala | Gly | Glu | Gin | Leu | Gly | Ile | Leu | Ser |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Ile | Lys | Glu | Ala | Leu | Asp | Leu | Ala | Lys | Glu | Ala | Asn | Leu | Asp | Leu | Val |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Glu | Val | Ala | Ser | Asn | Ser | Glu | Pro | Pro | Val | Cys | Lys | Ile | Met | Asp | Tyr |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Gly | Lys | Tyr | Arg | Tyr | Asp | Val | Thr | Lys | Lys | Glu | Lys | Asp | Ser | Lys | Lys |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Ala | Gin | His | Gin | Val | Arg | Ile | Lys | Glu | Val | Lys | Leu | Lys | Pro | Asn | Ile |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Asp | Asp | Asn | Asp | Phe | Leu | Thr | Lys | Ala | Lys | Gin | Ala | Arg | Ala | Phe | Ile |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Glu | Lys | Gly | Asn | Lys | Val | Lys | Val | Ser | Cys | Met | Phe | Arg | Gly | Arg | Glu |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Leu | Ala | Tyr | Pro | Glu | His | Gly | Tyr | Lys | Val | Ile | Gin | Arg | Met | Cys | Gin |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Gly | Leu | Glu | Asp | Ile | Gly | Phe | Val | Glu | Ser | Glu | Pro | Lys | Leu | Asn | Gly |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Arg | Ser | Leu | Ile | Cys | Val | Ile | Ala | Pro | Gly | Thr | Leu | Lys | Thr | Lys | Lys |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Lys |
<210> 582 <211> 264 <212> PRT <213> C. Trachomatis D serovar <400> 582
Met Gly Asn Ser Gly Phe Tyr Leu Tyr Asn Thr· Glu Asn Cys Val Phe » ···· ·· • · · • · i· * • ···
519
| 1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
| Ala | Asp | Asn | Ile | Lys | Val | Gly | Gin | Met | Thr | Glu | Pro | Leu | Lys | Asp | Gin |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Gin | Ile | Ile | Leu | Gly | Thr | Lys | Ser | Thr | Pro | Val | Ala | Ala | Lys | Met | Thr |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Ala | Ser | Asp | Gly | Ile | Ser. | Leu | Thr | Val | Ser | Asn | Asn | Ser | Ser | Thr | Asn |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Ala | Ser | Ile | Thr | Ile | Gly | Leu | Asp | Ala | Glu | Lys | Ala | Tyr | Gin | Leu | Ile |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Leu | Glu | Lys | Leu | Gly | Asn | Gin | Ile | Leu | Asp | Gly | Ile | Ala | Asp | Thr | Ile |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Val | Asp | Ser | Thr | Val | Gin | Asp | Ile | Leu | Asp | Lys | Ile | Thr | Thr | Asp | Pro |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Ser | Leu | Gly | Leu | Leu | Lys | Ala | Phe | Asn | Asn | Phe | Pro | Ile | Thr | Asn | Lys |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Ile | Gin | Cys | Asn | Gly | Leu | Phe | Thr | Pro | Ser | Asn | Ile | Glu | Thr | Leu | Leu |
| 130 | 135 | 14 0 | |||||||||||||
| Gly | Gly | Thr | Glu | Ile | Gly | Lys | Phe | Thr | Val | Thr | Pro | Lys | Ser | Ser | Gly |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Ser | Met | Phe | Leu | Val | Ser | Ala | Asp | Ile | Ile | Ala | Ser | Arg | Met | Glu | Gly |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Gly | Val | Val | Leu | Ala | Leu | Val | Arg | Glu | Gly | Asp | Ser | Lys | Pro | Cys | Ala |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Ile | Ser | Tyr | Gly | Tyr | Ser | Ser | Gly | Val | Pro | Asn | Leu | Cys | Ser | Leu | Arg |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Thr | Ser | Ile | Thr | Asn | Thr | Gly | Leu | Thr | Pro | Thr | Thr | Tyr | Ser | Leu | Arg |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Val | Gly | Gly | Leu | Glu | Ser | Gly | Val | Val | Trp | Val | Asn | Ala | Leu | Ser | Asn |
| 225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
| Gly | Asn | Asp | Ile | Leu | Gly | Ile | Thr | Asn | Thr | Ser | Asn | Val | Ser | Phe | Leu |
| 245 | 250 | 255 | |||||||||||||
| Glu | Val | Ile | Pro | Gin | Thr | Asn | Ala |
<210> 583 <211> 1053 <212> PRT <213> C. Trachomatis D serovar
| Met | Phe | Thr | Arg | Ile | Val | Met | Val | Asp | Leu | Gin | Glu | Lys | Gin | Cys | Thr |
| 1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
| Ile | Val | Lys | Arg | Asn | Gly | Met | Phe | Val | Pro | Phe | Asp | Arg | Asn | Arg | Ile |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Phe | Gin | Ala | Leu | Glu | Ala | Ala | Phe | Arg | Asp | Thr | Arg | Arg | Ile | Asp | Asp |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| His | Met | Pro | Leu | Pro | Glu | Asp | Leu | Glu | Ser | Ser | Ile | Arg | Ser | Ile | Thr |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| His | Gin | Val | Val | Lys | Glu | Val | Val | Gin | Lys | Ile | Thr | Asp | Gly | Gin | Val |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Val | Thr | Val | Glu | Arg | Ile | Gin | Asp | Met | Val | Glu | Ser | Gin | Leu | Tyr | Val |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Asn | Gly | Leu | Gin | Asp | Val | Ala | Arg | Asp | Tyr | Ile | Val | Tyr | Arg | Asp | Asp |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Arg | Lys | Ala | His | Arg | Lys | Lys | Ser | Trp | Gin | Ser | Leu | Ser | Val | Val | Arg |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Arg | Cys | Gly | Thr | Val | Val | His | Phe | Asn | Pro | Met | Lys | Ile | Ser | Ala | Ala |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Leu | Glu | Lys | Ala | Phe | Arg | Ala | Thr | Asp | Lys | Thr | Glu | Gly | Met | Thr | Pro |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Ser | Ser | Val | Arg | Glu | Glu | Ile | Asn | Ala | Leu | Thr- | Gin | Asn | Ile | Val | Ala |
• · • · · ·
520
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Glu | Ile | Glu | Glu 180 | Cys | Cys | Pro | Gin | Gin 185 | Asp | Arg | Arg | Ile | Asp 190 | Ile | Glu |
| Lys | Ile | Gin 195 | Asp | Ile | Val | Glu | Gin 200 | Gin | Leu | Met | Val | Val 205 | Gly | His | Tyr |
| Ala | Val 210 | Ala | Lys | Asn | Tyr | Ile 215 | Leu | Tyr | Arg | Glu | Ala 220 | Arg | Ala | Arg | Val |
| Arg 225 | Asp | Asn | Arg | Glu | Glu 230 | Asp | Gly | Ser | Thr | Glu 235 | Lys | Thr | Ile | Ala | Glu 240 |
| Glu | Ala | Val | Glu | Val 245 | Leu | Ser | Lys | Asp | Gly 250 | Ser | Thr | Tyr | Thr | Met 255 | Thr |
| His | Ser | Gin | Leu 260 | Leu | Ala | His | Leu | Ala 265 | Arg | Ala | Cys | Ser | Arg 270 | Phe | Pro |
| Glu | Thr | Thr 275 | Asp | Ala | Ala | Leu | Leu 280 | Thr | Asp | Met | Ala | Phe 285 | Ala | Asn | Phe |
| Tyr | Ser 290 | Gly | Ile | Lys | Glu | Ser 295 | Glu | Val | Val | Leu | Ala 300 | Cys | Ile | Met | Ala |
| Ala 305 | Arg | Ala | Asn | Ile | Glu 310 | Lys | Glu | Pro | Asp | Tyr 315 | Ala | Phe | Val | Ala | Ala 320 |
| Glu | Leu | Leu | Leu | Asp 325 | Val | Val | Tyr | Lys | Glu 330 | Ala | Leu | Gly | Lys | Ser 335 | Lys |
| Tyr | Ala | Glu | Asp 340 | Leu | Glu | Gin | Ala | His 345 | Arg | Asp | His | Phe | Lys 350 | Arg | Tyr |
| Ile | Ala | Glu 355 | Gly Asp | Thr | Tyr | Arg 360 | Leu | Asn | Ala | Glu | Leu 365 | Lys | His | Leu | |
| Phe | Asp 370 | Leu | Asp | Ala | Leu | Ala 375 | Asp | Ala | Met | Asp | Leu 380 | Ser | Arg | Asp | Leu |
| Gin 385 | Phe | Ser | Tyr | Met | Gly 390 | Ile | Gin | Asn | Leu | Tyr 395 | Asp | Arg | Tyr | Phe | Asn 4 00 |
| His | His | Glu | Gly | Cys 405 | Arg | Leu | Glu | Thr | Pro 410 | Gin | Ile | Phe | Trp | Met 415 | Arg |
| Val | Ala | Met | Gly 420 | Leu | Ala | Leu | Asn | Glu 425 | Gin | Asp | Lys | Thr | Ser 430 | Trp | Ala |
| Ile | Thr | Phe 435 | Tyr | Asn | Leu | Leu | Ser 440 | Thr | Phe | Arg | Tyr | Thr 445 | Pro | Ala | Thr |
| Pro | Thr 450 | Leu | Phe | Asn | Ser | Gly 455 | Met | Arg | His | Ser | Gin 4 60 | Leu | Ser | Ser | Cys |
| Tyr 4 65 | Leu | Ser | Thr | Val | Gin 470 | Asp | Asn | Leu | Val | Asn 475 | Ile | Tyr | Lys | Val | Ile 480 |
| Ala | Asp | Asn | Ala | Met 485 | Leu | Ser | Lys | Trp | Ala 4 90 | Gly | Gly | Ile | Gly | Asn 495 | Asp |
| Trp | Thr | Ala | Ile 500 | Arg | Ala | Thr | Gly | Ala 505 | Leu | Ile | Lys | Gly | Thr 510 | Asn | Gly |
| Arg | Ser | Gin 515 | Gly | Val | Ile | Pro | Phe 520 | Ile | Lys | Val | Thr | Asn 525 | Asp | Thr | Ala |
| Val | Ala 530 | Val | Asn | Gin | Gly | Gly 535 | Lys | Arg | Lys | Gly | Ala 540 | Val | Cys | Val | Tyr |
| Leu 545 | Glu | Val | Trp | His | Leu 550 | Asp | Tyr | Glu | Asp | Phe 555 | Leu | Glu | Leu | Arg | Lys 560 |
| Asn | Thr | Gly | Asp | Glu 565 | Arg | Arg | Arg | Ala | His 570 | Asp | Val | Asn | Ile | Ala 575 | Ser |
| Trp | Ile | Pro | Asp 580 | Leu | Phe | Phe | Lys | Arg 585 | Leu | Gin | Gin | Lys | Gly 590 | Thr | Trp |
| Thr | Leu | Phe 595 | Ser | Pro | Asp | Asp | Val 600 | Pro | Gly | Leu | His | Asp 605 | Ala | Tyr | Gly |
| Glu | Glu 610 | Phe | Glu | Arg | Leu | Tyr 615 | Glu | Glu | Tyr | Glu | Arg 620 | Lys | Val | Asp | Thr |
| Gly 625 | Glu | Ile | Arg | Leu | Phe 630 | Lys | Lys | Val | Glu | Ala 635 | Glu | Asp | Leu | Trp | Arg 640 |
| Lys | Met | Leu | Ser | Met 645 | Leu | Phe | Glu | Thr | Gly 650 | His | Pro | Trp | Met | Thr 655 | Phe |
·· ···· ·· ·· ·· ····
521
| Lys Asp Pro Ser Asn Ile Arg Ser Ala Gin Asp His Lys Gly Val Val | |||
| 660 | 665 | 67 0 | |
| Arg Cys | Ser Asn Leu 675 | Cys Thr Glu Ile 680 | Leu Leu Asn Cys Ser Glu Thr 685 |
| Glu Thr 690 | Ala Val Cys | Asn Leu Gly Ser 695 | Ile Asn Leu Val Gin His Ile 700 |
| Val Gly 705 | Asp Gly Leu | Asp Glu Glu Lys 710 | Leu Ser Glu Thr Ile Ser Ile 715 720 |
| Ala Val | Arg Met Leu 725 | Asp Asn Val Ile | Asp Ile Asn Phe Tyr Pro Thr 730 735 |
| Lys Glu | Ala Lys Glu 740 | Ala Asn Phe Ala 745 | His Arg Ala Ile Gly Leu Gly 750 |
| Val Met | Gly Phe Gin 755 | Asp Ala Leu Tyr 760 | Lys Leu Asp Ile Ser Tyr Ala 765 |
| Ser Gin 770 | Glu Ala Val | Glu Phe Ala Asp 775 | Tyr Ser Ser Glu Leu Ile Ser 780 |
| Tyr Tyr 785 | Ala Ile Gin | Ala Ser Cys Leu 790 | Leu Ala Lys Glu Arg Gly Thr 795 800 |
| Tyr Ser | Ser Tyr Lys 805 | Gly Ser Lys Trp | Asp Arg Gly Leu Leu Pro Ile 810 815 |
| Asp Thr | Ile Gin Leu 820 | Leu Ala Asn Tyr 825 | Arg Gly Glu Ala Asn Leu Gin 830 |
| Met Asp | Thr Ser Ser 835 | Arg Lys Asp Trp’ 840 | Glu Pro Ile Arg Ser Leu Val 845 |
| Lys Glu 850 | His Gly Met | Arg His Cys Gin 855 | Leu Met Ala Ile Ala Pro Thr 860 |
| Ala Thr 865 | Ile Ser Asn | Ile Ile Gly Val 870 | Thr Gin Ser Ile Glu Pro Thr 875 880 |
| Tyr Lys | His Leu Phe 885 | Val Lys Ser Asn | Leu Ser Gly Glu Phe Thr Ile 890 895 |
| Pro Asn | Val Tyr Leu 900 | Ile Glu Lys Leu 905 | Lys Lys Leu Gly Ile Trp Asp 910 |
| Ala Asp | Met Leu Asp 915 | Asp Leu Lys Tyr 920 | Phe Asp Gly Ser Leu Leu Glu 925 |
| Ile Glu 930 | Arg Ile Pro | Asp His Leu Lys 935 | His Ile Phe Leu Thr Ala Phe 940 |
| Glu Ile 945 | Glu Pro Glu | Trp Ile Ile Glu 950 | Cys Ala Ser Arg Arg Gin Lys 955 -960 |
| Trp Ile | Asp Met Gly 965 | Gin Ser Leu Asn | Leu Tyr Leu Ala Gin Pro Asp 970 975 |
| Gly Lys | Lys Leu Ser 980 | Asn Met Tyr Leu 985 | Thr Ala Trp Lys Lys Gly Leu 990 |
| Lys Thr | Thr Tyr Tyr 995 | Leu Arg Ser Ser 1000 | Ser Ala Thr Thr Val Glu Lys 1005 |
| Ser Phe Val Asp Ile 1010 | Asn Lys Arg Gly 1015 | Ile Gin Pro Arg Trp Met Lys 1020 | |
| Asn Lys 1025 Pro Val | Ser Ala Ser Ala Gly Ile Ile 1030 Cys Ser Leu Glu Glu Gly Cys 1045 | Val Glu Arg Ala Lys Lys Ala 1035 1040 Glu Ala Cys Gin 1050 |
<210> 584 <211> 346 <212> PRT <213> C. Trachomatis D serovar <400> 584
| Met 1 | Gin Ala | Asp | Ile 5 | Leu | Asp | Gly | Lys | Gin 10 | Lys | Arg | Val | Asn | Leu 15 | Asn |
| Ser | Lys Arg | Leu 20 | Val | Asn | Cys | Asn | Gin 25 | Val | Asp | Val | Asn | Gin 30 | Leu | Val |
• · · · • · · · · · · · · · · · • · · · · · · · · «··· · ···· · · ·' • ········· · • · · · · · ···· ···· ··· *· ·· ·· ♦ ·
522
| Pro Ile Lys | Tyr Lys | Trp Ala | Trp Glu His Tyr Leu Asn Gly Cys Ala | ||||||||||||
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Asn | Asn | Trp | Leu | Pro | Thr | Glu | Ue | Pro . | Met | Gly | Lys | Asp | Ue | Glu | Leu |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Trp | Lys | Ser | Asp | Arg | Leu | Ser | Glu | Asp | Glu | Arg | Arg | Val | Ue | Leu | Leu |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Asn | Leu | Gly | Phe | Phe | Ser | Thr | Ala | Glu | Ser | Leu | Val | Gly | Asn | Asn | Ue |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Val | Leu | Ala | Ue | Phe | Lys | His | Val | Thr | Asn | Pro | Glu | Ala | Arg | Gin | Tyr |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Leu | Leu | Arg | Gin | Ala | Phe | Glu | Glu | Ala | Val | His | Thr | His | Thr | Phe | Leu |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Tyr | Ue | Cys | Glu | Ser | Leu | Gly | Leu | Asp | Glu | Lys | Glu | Ue | Phe | Asn | Ala |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Tyr | Asn | Glu | Arg | Ala | Ala | Ue | Lys | Ala | Lys | Asp | Asp | Phe | Gin | Met | Glu |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Ue | Thr | Gly | Lys | Val | Leu | Asp | Pro | Asn | Phe Arg | Thr | Asp | Ser | Val | Glu | |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Gly | Leu | Gin | Glu | Phe | Val | Lys | Asn | Leu | Val | Gly | Tyr | Tyr | Ue | Ue | Met |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Glu | Gly | Ue | Phe | Phe | Tyr | Ser | Gly | Phe | Val | Met | Ile | Leu | Ser | Phe | His |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Arg | Gin | Asn | Lys | Met | Ue | Gly | Ile | Gly | Gíu | Gin | Tyr | Gin | Tyr | Ile | Leu |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Arg Asp | Glu | Thr | Ue | His | Leu | Asn | Phe | Gly | Ue | Asp | Leu | Ue | Asn | Gly | |
| 225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
| Ile | Lys | Glu | Glu | Asn | Pro | Glu | Ue | Trp | Thr | Pro | Glu. | Leu | Gin | Gin | Glu |
| 24 5 | 250 | 255 | |||||||||||||
| Ue | Val | Glu | Leu | Ile | Lys | Arg | Ala | Val | Asp | Leu | Glu | Ile | Glu | Tyr | Ala |
| 260 | 265 | 270 | |||||||||||||
| Gin | Asp | Cys | Leu | Pro | Arg | Gly | Ile | Leu | Gly | Leu | Arg | Ala | Ser | Met | Phe |
| 275 | 280 | 285 | |||||||||||||
| Ue | Asp | Tyr | Val | Gin | His | Ue | Ala | Asp | Arg Arg | Leu | Glu | Arg | Ue | Gly | |
| 290 | 295 | 300 | |||||||||||||
| Leu | Lys | Pro | Ue | Tyr | His | Thr | Lys | Asn | Pro | Phe | Pro | Trp | Met | Ser | Glu |
| 305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
| Thr | Ue | Asp | Leu | Asn | Lys | Glu | Lys | Asn | Phe | Phe | Glu | Thr | Arg | Val | Ue |
| 325 | 330 | 335 | |||||||||||||
| Glu | Tyr | Gin | His | Ala | Ala | Ser | Leu | Thr | Trp | ||||||
| 340 | 345 |
<210> 585 <211> 326 <212> PRT <213> C. Trachomatis D serovar <400> 585
| Met | Ser | Phe | Phe | His | Thr | Arg | Lys | Tyr | Lys | Leu | Ue | Leu | Arg | Gly | Leu |
| 1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
| Leu | Cys | Leu | Ala | Gly | Cys | Phe | Leu | Met | Asn | Ser | Cys | Ser | Ser | Ser | Arg |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Gly | Asn | Gin | Pro | Ala | Asp | Glu | Ser | Ue | Tyr | Val | Leu | Ser | Met | Asn | Arg |
| 35 | 4 0 | 45 | |||||||||||||
| Met | Ue | Cys | Asp | Cys | Val | Ser | Arg | Ue | Thr | Gly | Asp | Arg | Val | Lys | Asn |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Ue | Val | Leu | Ile | Asp | Gly | Ala | Ue | Asp | Pro | His | Ser | Tyr | Glu | Met | Val |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Lys | Gly | Asp | Glu | Asp | Arg | Met | Ala | Met | Ser | Gin | Leu | Ile | Phe | Cys | Asn |
| 85 | . 90 | 95 | |||||||||||||
| Gly | Leu | Gly | Leu | Glu | His | Ser | Ala | Ser | Leu | Arg | Lys | His | Leu | Glu | Gly |
| 100 | 105 | - | 110 |
» ···« • · ’ • ··*
523
| Asn | Pro | Lys 115 | Val | Val | Asp | Leu | Gly 120 |
| Phe | Asp 130 | Leu | Leu | Ser | Glu | Glu 135 | Gly |
| Asp 145 | Met | Arg | Val | Trp | Gly 150 | Ala | Ala |
| Ile | Gin | Gin | Phe | Pro 165 | Gin | Tyr | Glu |
| Gin | Ile | Leu | Ser 180 | Glu | Met | Glu | Glu |
| Leu | Ser | Thr 195 | Ile | Pro | Glu | Lys | Asn 200 |
| Ala | Phe 210 | Ser | Tyr | Phe | Thr | Arg 215 | Arg |
| Val 225 | Ser | Gly | Glu | Trp | Arg 230 | Ser | Arg |
| Pro | Glu | Ala | Gin | Ile 245 | Ser | Ile | Arg |
| Ile | Ser | Ala | Asn 260 | Asp | Val | Glu | Val |
| Gin | Asp | Ala 27 5 | Leu | Arg | Lys | Ile | Val 280 |
| Ile | Arg 290 | Leu | Ala | Lys | Ser | Pro 295 | Leu |
| Tyr 305 Gly | Phe Gly | Ser Thr | Thr Val | Phe Leu 325 | Gin 310 Glu | His | Asn |
| Gin | Arg | Leu | Leu | Asn 125 | Lys | Asn | Cys |
| Phe | Pro | Asp | Pro 140 | His | Ile | Trp | Thr |
| Val | Lys | Glu 155 | Met | Ala | Ala | Ala | Leu 160 |
| Glu | Asp 170 | Phe | Gin | Lys | Asn | Ala 175 | Asp |
| Leu 185 | Asp | Arg | Trp | Ala | Ala 190 | Arg | Ser |
| Arg | Tyr | Leu | Val | Thr 205 | Gly | His | Asn |
| Tyr | Leu | Ser | Ser 220 | Asp | Ala | Glu | Arg |
| Cys | Ile | Ser 235 | Pro | Glu | Gly | Leu | Ser 240 |
| Asp | Ile 250 | Met | Arg | Val | Val | Glu 255 | Tyr |
| Val 265 | Phe | Leu | Glu | Asp | Thr 270 | Leu | Asn |
| Ser | Cys | Ser | Lys | Ser 285 | Gly | Gin | Lys |
| Tyr | Ser | Asp | Asn 300 | Val | Cys | Asp | Asn |
| Val | Arg | Thr 315 | Ile | Thr | Glu | Glu | Leu 320 |
<210> 586 <211> 102 <212> PRT <213> C. Trachomatis D serovar <400> 586
| Met 1 | Gin | Asn | Lys | Arg 5 | Lys | Val | Arg |
| Asp | Val | Lys | Lys 20 | Asp | Phe | Pro | Glu |
| Lys | Glu | Lys 35 | Val | Thr | Phe | Leu | Asn 40 |
| Ser | Val 50 | Ser | Leu | Ile | Leu | Gly 55 | Leu |
| Gly 65 | Leu | Phe | Pro | Asp | Ser 70 | Pro | Val |
| Leu Met | Lys Phe | Leu Ser | Lys Lys 100 | Lys 85 Ala | Ala Glu | Leu | Ile |
| Asp | Asp 10 | Phe | Ile | Lys | Ile | Val 15 | Lys |
| Leu 25 | Asp | Leu | Lys | Ile | Arg 30 | Val | Asn |
| Ser | Pro | Leu | Glu | Leu 45 | Tyr | His | Lys |
| Leu | Gin | Gin | Ile 60 | Glu | Asn | Ser | Leu |
| Leu | Glu | Lys 75 | Leu | Glu | Asp | Asn | Ser 80 |
| Met | Leu 90 | Ile | Leu | Ser | Arg | Lys 95 | Asp |
<210> 587 <211> 243 <212> PRT <213> C. Trachomatis D serovar <400> 587
| Val 1 | Gly | Cys | Asn | Leu 5 | Ala | Gin | Phe |
| Asp | Leu | Asp | Pro 20 | Gin | Ser | Asn | Leu |
| Arg | Asn | Asn | Gin | Lys | Gly | Leu | His |
| Leu | Gly 10 | Lys | Lys | Val | Leu | Leu 15 | Ala |
| Ser 25 | Ser | Gly | Leu | Gly | Ala 30 | Ser | Val |
| Asp | Ile | Val | Tyr | Lys | Ser | Asn | Asp |
··'
| - | '524 | ||||||||||||||
| 35 - | 40 | 45 | |||||||||||||
| Leu | Lys | Ser | Ile | Ile | Cys | Glu | Thr | Lys | Lys | Asp | Ser | Val | Asp | Leu | Ile |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Pro | Ala | Ser | Phe | Leu | Ser | Glu | Gin | Phe | Arg | Glu | Leu | Asp | Ile | His | Arg |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Gly | Pro | Ser | Asn | Asn | Leu | Lys | Leu | Phe | Leu | Asn | Glu | Tyr | Cys | Ala | Pro |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Phe | Tyr | Asp | Ile | Cys | Ile | Ile | Asp | Thr | Pro | Pro | Ser | Leu | Gly | Gly | Leu |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Thr | Lys | Glu | Ala | Phe | Val | Ala | Gly | Asp | Lys | Leu | Ile | Ala | Cys | Leu | Thr |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Pro | Glu | Pro | Phe | Ser | Ile | Leu | Gly | Leu | Gin | Lys | Ile | Arg | Glu | Phe | Leu |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Ser | Ser | Val | Gly | Lys | Pro | Glu | Glu | Glu | His | Ile | Leu | Gly | Ile | Ala | Leu |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Ser | Phe | Trp | Asp | Asp | Arg | Asn | Ser | Thr | Asn | Gin | Met | Tyr | Ile | Asp | Ile |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Ile | Glu | Ser | Ile | Tyr | Lys | Asn | Lys | Leu | Phe | Ser | Thr | Lys | Ile | Arg | Arg |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Asp | Ile | Ser | Leu | Ser | Arg | Ser | Leu | Leu | Lys | Glu | Asp | Ser | Val | Ala | Asn |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Val | Tyr | Pro | Asn | Ser | Arg | Ala | Ala | Glu | Asp | Ile | Leu | Lys | Leu | Thr | His |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Clu | Ile | Ala | Asn | Ile | Leu | His | Ile | Glu | Tyr | Glu | Arg | Asp | Tyr | Ser | Gin |
| 225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
| Arg | Thr | Thr |
| <2.10> 588 •<211> 527 <212> PRT <213> C. Trachomatis D serovar | |||||||||||||||
| <400> 588 | |||||||||||||||
| Met | Pro | Ser | Leu | Ser | Gin | Ser | Arg | Arg | Ile | Ile | Gin | Gin | Ser | Ser | Ile |
| 1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
| Arg | Lys | Ile | Trp | Asn | Gin | Ile | Asp | Thr | Ser | Pro | Lys | His | Gly | Val | Cys |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Val | Pro | Leu | Phe | Ser | Leu | Tyr | Thr | Gin | Glu | Ser | Cys | Gly | Ile | Gly | Glu |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Phe | Leu | Asp | Leu | Ile | Pro | Met | Ile | Asp | Trp | Cys | Ile | Ser | Cys | Gly | Phe |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Gin | Ile | Leu | Gin | Ile | Leu | Pro | Ile | Asn | Asp | Thr | Gly | Ser | Cys | Ser | Ser |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Pro | Tyr | Asn | Ser | Ile | Ser | Ser | Ile | Ala | Leu | Asn | Pro | Leu | His | Leu | Ser |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Ile | Ser | Ala | Leu | Pro | Tyr | Lys | Glu | Glu | Val | Pro | Ala | Ala | Glu | Thr | Arg |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Ile | Arg | Glu | Met | Gin | Gin | Leu | Ser | Gin | Leu | Pro | Gin | Val | His | Tyr | Glu |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Lys | Val | Arg | Ser | Met. | Lys | Arg | Asp | Phe | Phe | Gin | Glu | Tyr | Tyr | Arg | Val |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Cys | Lys | Gin | Lys | Lys | Leu | Thr | Asp | His | Pro | Asp | Phe | Tyr | Ala | Phe | Cys |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Glu | Gin | Glu | Lys | Tyr | Trp | Leu | His | Pro | Tyr | Ala | Leu | Phe | Arg | Ser | Ile |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Arg | Glu | His | Leu | Asp | Asn | Leu | Pro | Ile | Asn | His | Trp | Pro | Thr | Thr | Tyr |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Thr | Asp | Leu | Ser | Gin | Ile | Thr | Glu | His | Glu | Arg | Thr | Phe | Ala | Glu | Asp |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Ile | Gin | Phe | His | Ser | Tyr | Leu | Gin | Tyr | Leu | Cys- | Phe | Gin | Gin | Met | Thr |
210 215 220
525
| Gin 225 | Val | Arg | Glu | His | Ala 230 | Asn | Cys | Lys | Ser | Cys 235 | Leu | Ile | Lys | Gly | Asp 240 |
| Ile | Pro | Ile | Leu | Ile 245 | Ser | Lys | Asp | Ser | Cys 250 | Asp | Val | Trp | Phe | Tyr 255 | Arg |
| His | Tyr | Phe | Ser 260 | Ser | Ser | Glu | Ser | Val 265 | Gly | Ala | Pro | Pro | Asp 270 | Leu | Tyr |
| Asn | Ala | Glu 275 | Gly | Gin | Asn | Trp | His 280 | Leu | Pro | Ile | Cys | Asn 285 | Met | Lys | Thr |
| Leu | Gin 290 | Gin | Asp | Asn | Tyr | Leu 295 | Trp | Trp | Lys | Glu | Arg 300 | Leu | Arg | Tyr | Ala |
| Glu 305 | Asn | Phe | Tyr | Ser | Leu 310 | Tyr | Arg | Leu | Asp | His 315 | Val | Val | Gly | Leu | Phe 320 |
| Arg | Phe | Trp | Val | Trp 325 | Asp | Glu | Ser | Gly | Cys 330 | Gly | Arg | Phe | Glu | Pro 335 | His |
| Asp | Pro | Lys | Asn 340 | Tyr | Leu | Ala | Gin | Gly 345 | Gin | Asp | Ile | Leu | Ser 350 | His | Leu |
| Leu | Thr | Ser 355 | Ser | Ser | Met | Leu | Pro 360 | Ile | Gly | Glu | Asp | Leu 365 | Gly | Thr | Ile |
| Pro | Ser 370 | Asp | Val | Lys | Arg | Met 375 | Leu | Glu | Ser | Phe | Ala 380 | Val | Cys | Gly | Thr |
| -Arg 385 | Ile | Pro | Arg | Trp | Glu 390 | Arg | Asn | Trp | Glu | Gly 395 | Asn | Gly | AÍa | Tyr | Thr 400 |
| :Pro | Phe | Asp | Gin | Tyr 405 | Asp | Pro | Leu | Ser | Val 410 | Thr | Ser | Leu | Ser | Thr 415 | His |
| Asp | Ser | Ser | Thr 420 | Leu | Ala | Ser | Trp | Trp 425 | Lys | Glu | Ser | Pro | Gin 430 | Glu- | Ser |
| Lys | Leu | Phe 435 | Ala | Gin | Phe | Leu | Gly 440 | Leu | Pro | Tyr | Ser | Ser 445 | Thr | Leu | Ser |
| Leu | His 450 | Asn | His | Thr | Glu | Ile 455 | Leu | Lys | Leu | Ser | His 460 | Lys | Thr | Ser | Ser |
| Ile 4 65 | Phe | Arg | Ile | Asn | Leu 470 | Ile | Asn | Asp | Tyr | Leu 475 | Ala | Leu | Phe | Pro | Asp 480 |
| Leu | Ile | Ser | Lys | Thr 485 | Pro | Arg | Tyr | Glu | Arg 490 | Ile | Asn | Leu | Pro | Gly 4 95 | Thr |
| Ile | Ser | Lys | Asn 500 | Asn | Trp | Val | Tyr | Arg 505 | Val | Lys | Pro | Ser | Ile 510 | Glu | Asp |
| Leu | Ser | Ser | His | Ser | Lys | Leu | Asn | Ser | Leu | Leu | Glu | Ala | Leu | Phe |
515 520 525 <210> 589 <211> 146 <212> PRT <213> C. Trachomatis D serovar <400> 589
| Met 1 | Gin | Asn Gin Phe 5 | Glu Gin Leu | Leu Thr Glu Leu Gly Thr Gin Ile | |||||||||||
| 10 | 15 | ||||||||||||||
| Asn | Ser | Pro | Leu | Thr | Pro | Asp | Ser | Asn | Asn | Ala | Cys | Ile | Val | Arg,Phe | |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Gly | Tyr | Asn | Asn | Val | Ala | Val | Gin | Ile | Glu | Glu | Asp | Gly | Asn | Ser | Gly |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Phe | Leu | Val | Ala | Gly | Val | Met | Leu | Gly. | Lys | Leu | Pro | Glu | Asn | Thr | Phe |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Arg | Gin | Lys | Ile | Phe | Lys | Ala | Ala | Leu | Ser | Ile | Asn | Gly | Ser | Pro | Gin |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Ser | Asn | Ile | Lys | Gly | Thr | Leu | Gly | Tyr | Gly | Glu | Ile | Ser | Asn | Gin | Leu |
| 85 | 90 | 95 . | |||||||||||||
| Tyr | Leu | Cys | Asp | Arg | Leu | Asn | Met | Thr | Tyr | Leu | Asn | Gly | Glu | Lys | Leu |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Ala | Arg | Tyr | Leu | Val | Leu | Phe | Ser | Gin | His | Ala' | Asn | Ile | Trp | Met | Gin |
526 'i
115 120 125
Ser Ile Ser Lys Gly Ala Leu Pro Asp Leu His Ala Leu Gly Met Tyr
130 135 140
His Leu 145 <210> 590 <211> 650 <212> PRT <213> C. Trachomatis D serovar <400> 590
| Met 1 | Thr | Ile | Pro | Ile 5 | His | Glu | Asn | Lys Tyr Ser 10 | Met | Ile | Ser | Phe 15 | Thr | ||
| Arg | Thr | Ile | Gly | Phe | Arg | Leu | Trp | Leu | Ile | Cys | Val. | Ala | Ala | Ile | Met |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Phe | Pro | Leu | Gly | Ile | Asn. | Ile | Leu | Gin | Leu | Asn | Leu | Gin | Gin | Tyr | Lys |
| 35 | 4 0 | 45 | |||||||||||||
| Lys | Thr | Leu | Ser | Ser | Ile | Thr | Ser | Asp | Leu | Arg | Glu | Asn | Ala | Leu | Phe |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Lys | Ala | His | Thr | Leu | Gin | Gin | Thr | Ile | Pro | Leu | Asn | Ile | Asp | Ile | Leu |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Ala | Leu | Phe | Ser | Glu | Ile | Phe | Asp | Leu | Asp | Arg | Gly | Val | Pro | Ala | Glu |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Pro | Asp | Leu | Ala | Leu | Ser | Lys | Glu | Met | Glu | Lys | Ile | Phe | His | Ser | Thr |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Tyr | Lys | Glu | Ile | Ser | Leu | Val | Lys | Lys | Glu | Ala | Asp | Gly | Asn | Phe | Arg |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Val | Val | Ala | Ser | Ser | Arg | Ile | Glu | Gin | Leu | Gly | Lys | Asn | Tyr | Asn | Gin |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Glu | Ile | Phe | Leu | Ser | Asp | Ser | Gin | Pro | Phe | Leu | Ala | Thr | Leu | Arg | His |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Ser | Gly | Ser | Asp | Ser | Gin | Val | Leu | Ala | Val | Leu | Gin | Thr | Asn | Ile | Phe |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Asp | Ile | Ser | Ser | Gin | Glu | Val | Leu | Gly | Val | Leu | Tyr | Thr | Leu | Ser | Asp |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Thr | Asn | Tyr | Leu | Leu | Asn | Gly | Leu | Leu | Ala | Ala | Lys | Asp | Pro | Leu | Ser |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Val | Lys | Thr | Ala | Ile | Leu | Ser | Lys | Asn | Gly | Ile | Ile | Leu | Gin | Ala | Thr |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Asp | Ser | Ser | Leu | Asp | Leu | Val | Ser | Ile | His | Lys | Thr | Val | Ser | Lys | Glu |
| 225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
| Gin | Phe | Cys | Asp | Val | Phe | Leu | Arg | Asp | Asp | Ile | Cys | Pro | Pro | His | Leu |
| 245 | 250 | 255 | |||||||||||||
| Leu | Leu | Arg | Pro | Pro | Leu | Asn | Leu | Asp | Pro | Leu | Pro | Tyr | Gly | Glu | Asn |
| 260 | 265 | 270 | |||||||||||||
| Phe | Val | Ser | Phe | Cys | Ile | Gly | Asn | Thr | Glu | Met | Trp | Gly | Tyr | Ile | His |
| 275 | 280 | 285 | |||||||||||||
| Ser | Leu | Pro | Glu | Met | Asp | Phe | Arg | Ile | Leu | Thr | Tyr | Glu | Glu | Lys | Ser |
| 290 | 295 | 300 | |||||||||||||
| Ile | Ile | Phe | Ala | Ser | Leu | Trp Arg | Arg | Thr | Leu | Leu | Tyr | Phe | Ala | Tyr | |
| 305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
| Phe | Cys | Cys | Val | Leu | Leu | Gly | Ser | Ile | Thr | Ala | Phe | Leu | Val | Ala | Lys |
| 325 | 330 | 335 | |||||||||||||
| Arg | Leu | Ser | Lys | Pro | Ile | Arg | Lys | Leu | Ala | Thr | Ala | Met | Met | Glu | Thr |
| 340 | 345 | 350 | |||||||||||||
| Arg | Arg | Asn | Gin | His | His | Pro | Tyr | Glu | Pro | Asp | Ser | Leu | Gly | Phe | Glu |
| 355 | 360 | 365 | |||||||||||||
| Ile | Asn | His | Leu | Gly | Glu | Ile | Phe | Asn | Ser | Met | Val | Gin | Ser | Leu | Leu |
| 370 | 375 | 380 | |||||||||||||
| Gin | Gin | Gin | Ser | Leu | Ala | Glu | Lys | Asn | Phe | Glu | Ile | Lys | Gin | His | Ala |
• · · · ♦» · é · · · · ·· · · • · ·φ · '· φ · ·
Φ Φ Φ Φ · φ φ · · · · φ • · · · · Φ ·>© φ φ
Φ Φ ·······« ······ ·φ ·· ©· ··
527
| 385 | 390 | 395 | 400 | ||||||||||||
| Gin | Asn | Ala | Leu | Arg | Leu | Gly | Glu | Glu | Ala | Gin | Gin | Cys | Leu | Leu | Pro |
| 405 | 410 | 415 | |||||||||||||
| Asn | Gin | Leu | Pro | Asp | Ser | Pro | Thr | Thr | Glu | Ile | Ala | Lys | Ala | Tyr | Ile |
| 420 | 425 | 430 | |||||||||||||
| Pro | Ala | Ile | Thr | Val | Gly | Gly | Asp | Phe | Phe | Asp | Ile | Phe | Val | Ile | Gly |
| 435 | 440 | 445 | |||||||||||||
| Glu | Gly | Pro | Gin | Ala | Lys | Leu | Phe | Leu | Ile | Val | Ala | Asp | Ala | Ser | Gly |
| 450 | 455 | 4 60 | |||||||||||||
| Lys | Gly | Val | Asn | Ala | Cys | Ala | Tyr | Ser | Leu | Phe | Leu | Lys | Asn | Met | Leu |
| 4 65 | 470 | 475 | 480 | ||||||||||||
| His | Thr | Phe | Leu | Ser | Glu | Leu | Ser | Ser | Ile | Gin | Glu | Ala | Val | Gin | Gin |
| 485 | 4 90 | 4 95 | |||||||||||||
| Thr | Ala | Ala | Leu | Phe | Tyr | Gin | Gin | Thr | Ala | Glu | Ser | Gly | Met | Phe | Val |
| 500 | 505 | 510 | |||||||||||||
| Thr | Leu | Cys | Ile | Tyr | Cys | Tyr | His | Tyr | Ala | Thr | Arg | Glu | Leu | Glu | Tyr |
| 515 | 520 | 525 | |||||||||||||
| Tyr | Ser | Cys | Gly | His | Asn | Pro | Ala | Cys | Leu | Arg | Ala | Pro | Asn | Gly | Asp |
| 530 | 535 | 540 | |||||||||||||
| Ile | Ser | Phe | Leu | Ser | His | Pro | Gly | Met | Ala | Leu | Gly | Phe | Leu | Pro | Glu |
| 54 5 | 550 | 555 | 560 | ||||||||||||
| Val | Pro | Pro | His | Pro | Ala | Tyr | Thr | Leu | Val | Leu | Glu | Glu | Glu | Ser | Leu |
| 565 | 570 | 575 | |||||||||||||
| Leu | Val | Leu | Tyr | Thr | Asp | Gly | Val | Thr | Glu | Ala | Ser | Asn | Lys | His | Gly |
| 580 | 585 | 590 | |||||||||||||
| Glu | Met | Phe | Gly | Glu | Glu | Arg | Leu | Lys | Ala | Leu | Val | Ala | Ser | Leu | Thr |
| 595 | 600 | 605 | |||||||||||||
| Lys | Gin | Ser | Ala | Glu | Glu | Ala | Ile | Gin | Ser | Ile | Met | Phe | Ser | Ile | Lys |
| 610 | 615 | 620 | |||||||||||||
| Ser | Phe | Val | Lys | Asp | Cys | Pro | Gin | His | Asp | Asp | Ile | Thr | Leu | Leu | Val |
| 625 | 630 | 635 | 640 | ||||||||||||
| Leu | Lys | Ile | Pro | Lys | Glu | Pro | Ser | Ala | Tyr | ||||||
| 645 | 650 |
<210> 591 <211> 313 <212> PRT <213> C. Trachomatis D serovar <400> 591
| Met | Leu | Ser | Tyr | Ile | Lys | Arg | Arg | Leu | Leu | Phe | Asn | Leu | Leu | Ser | Leu |
| 1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
| Trp | Val | Val | Val | Thr | Leu | Thr | Phe | Phe | Ile | Ile | Lys | Thr | Ile | Pro | Gly |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Asp | Pro | Phe | Asn | Asp | Glu | Asn | Gly | Asn | Ile | Leu | Ser | Ser | Glu | Thr | Leu |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Ala | Leu | Leu | Lys | Asn | Arg | Tyr | Gly | Leu | Asp | Lys | Pro | Leu | Phe | Thr | Gin |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Tyr | Leu | Ile | Tyr | Leu | Lys | Cys | Leu | Leu | Thr | Leu | Asp | Phe | Gly | Glu | Ser |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Leu | Ile | Tyr | Lys | Asp | Arg | Thr | Val | Ile | Ser | Ile | Ile | Ala | Ala | Ala | Lěu |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Pro | Ser | Ser | Ala | Ile | Leu | Gly | Leu | Glu | Ser | Leu | Cys | Leu | Ser | Leu | Phe |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Gly | Gly | Ile | Thr | Leu | Gly | Ile | Leu | Ala | Tkla | Phe | Tyr | Lys | Lys | Ser | Cys |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Gly | Arg | Thr | Ile | Phe | Phe | Ser | Ser | Val | Ile | Gin | Ile | Ser | Val | Pro | Ala |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Phe | Val | Ile | Gly | Ala | Phe | Leu | Gin | Tyr | Val | Phe | Ala | Ile | Lys | Tyr | Ser |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Cys | Leu | Pro | Ile | Ala | Cys | Trp | Gly | Asn | Phe | Ser | His | Thr | Leu | Leu | Pro |
·· ·♦·· ·»' 99 99 9999 «»·ι · · · · · · • »·· · 9 999 9 9 9
999 9Í 999 9 9
9' · 9 * · · 9 9 9 9
9999 999 -99 99 99 '9 9
528
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Ser | Ile | Ala | Leu | Ala | Ile | Thr | Pro | Met | Ala | Phe | Ile | Thr | Gin | Leu | Thr |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Cys | Ala | Ser | Val | Ser | Ala | Asn | Leu | Lys | Lys | Asp | Tyr | Val | Leu | Leu | Ala |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Tyr | Ala | Lys | Gly | Leu | Ser | Pro | Phe | Lys | Val | Leu | Ile | Lys | His | Ile | Leu |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Pro | Tyr | Ala | Leu | Phe | Pro | Val | Ile | Ser | Tyr | Ser | Ala | Phe | Leu | Ile | Thr |
| 225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
| Thr | Leu | Met | Thr | Gly | Thr | Phe | Ser | Ile | Glu | Asn | Leu | Phe | Cys | Ile | Prp |
| 245 | 250 | 255 | |||||||||||||
| Gly | Leu | Gly | Lys | Trp | Phe | Ile | Cys | Ser | Ile | Lys | Gin | Arg | Asp | Tyr | Pro |
| 260 | 265 | 270 | |||||||||||||
| Ile | Thr | Leu | Gly | Leu | Ser | Val | Phe | Tyr | Gly | Ala | Phe | Phe | Met | Leu | Thr |
| 275 | 280 | 285 | |||||||||||||
| Ser | Leu | Cys | Cys | Asp | Leu | Leu | Gin | Ala | Trp | Ile | Asp | Pro | Gin | Ile | Arg |
| 290 | 295 | 300 | |||||||||||||
| Tyr | Ser | Tyr | Gly | Lys | Glu | Arg | Ser | Lys | |||||||
| 305 | 310 |
<210> 592 <211> 1237 <212> PRT <213> C. Trachomatis D serovar <400> 592
| Met 1 | Thr | Trp | Ile | Pro 5 | Leu His Cys | His | Ser 10 | Gin | Tyr | Ser | Ile | Leu 15 | Asp | ||
| Ala | Thr | Cys | Ser | Ile | Lys | Lys | Phe | Val | Ala | Lys | Ala | Val | Glu | Tyr | Gin |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Ile | Pro | Ala | Leu | Ala | Leu | Thr | Asp | His | Gly | Asn | Leu | Phe | Gly | Ala | Val |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Glu | Phe | Tyr | Lys | Thr | Cys | Lys | Gin | Asn | Ala | Ile | Lys | Pro | Ile | Ile | Gly |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Cys | Glu | Leu | Tyr | Val | Ala | Pro | Ser | Ser | Arg | Phe | Asp | Lys | Lys | Lys | Glu |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Arg | Lys | Ser | Arg | Val | Ala | Asn | His | Leu | Ile | Leu | Leu | Cys | Lys | Asp | Glu |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Glu | Gly | Tyr | Arg | Asn | Leu | Cys | Leu | Leu | Ser | Ser | Leu | Ala | Tyr | Thr | Glu |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Gly | Phe | Tyr | Tyr | Val | Pro | Arg | Ile | Asp | Arg | Asp | Leu | Leu | Ser | Gin | His |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Ser | Lys | Gly | Leu | Ile | Cys | Leu | Ser | Ala | Cys | Leu | Ser | Gly | Ser | Val | Ala |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Gin | Ala | Ala | Leu | Glu | Ser | Glu | Glu | Asp | Leu | Glu | Lys | Asp | Leu | Leu | Trp |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Tyr | Gin | Asp | Leu | Phe | Gin | Glu | Asp | Phe | Phe | Ser | Glu | Val | Gin | Leu | His |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Lys | Ser | Ser | Glu | Glu | Lys | Val | Ala | Leu | Phe | Glu | Glu | Thr | Trp | Leu | Lys |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Gin | Asn | Tyr | Tyr | Gin | Phe | Ile | Glu | Lys | Gin | Leu | Lys | Val | Asn | Glu | Ala |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Val | Leu | Ala | Thr | Ser | Lys | Arg | Leu | Gly | Ile | Pro | Ser | Val | Ala | Thr | Asn |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Asp | Ile | His | Tyr | Leu | Asn | Pro | Asp | Asp | Trp | Leu | Tkla | His | Glu | Ile | Leu |
| 225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
| Leu | Asn | Val | Gin | Ser | Arg | Glu | Pro | Ile | Arg | Thr | Ala | Lys | Gin | Asn | Thr |
| 245 | 250 | 255 | |||||||||||||
| Tyr | Ile | Pro | Asn | Pro | Lys | Arg | Lys | Thr | Tyr | Pro | Ser | Arg | Glu | Phe | Tyr |
| 260 | 265 | 270 | |||||||||||||
| Phe | Lys | Ser | Pro | Gin | Glu | Ile | Ala | Glu | Leu | Phe | Ala | Ala | His | Pro | Glu |
0 ·♦·· ·*' ·· ·· '0 * 0 · · 0 0 0 00* 0 0 000 0 0 · ♦ · 00 *0 0
-529
| 275 | 280 | 285 | |||||||||||||
| Thr | Ile | Thr | Asn | Thr | Cys | Ile | Val | Ala | Glu | Arg Cys | His | Leu | Glu | Leu | |
| 290 | 295 | 300 | |||||||||||||
| Asp | Phe | Glu | Thr | Lys | His | Tyr | Pro | Ile | Tyr | Val | Pro | Glu | Ala | Leu | Gin |
| 305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
| Lys | Lys | Gly | Ser | Tyr | Thr | Glu | Glu | Glu | Arg | Tyr | Lys | Ala | Ser | Ser | Ala |
| 325 | 330 | 335 | |||||||||||||
| Phe | Leu | Glu | Glu | Leu | Cys | Glu | Gin | Gly | Leu | Thr | Ser | Lys | Tyr | Thr | Pro |
| 340 | 345 | 350 | |||||||||||||
| Glu | Leu | Leu | Gly | His | Ile | Ala | Lys | Lys | Phe | Pro | Gly | Glu | Asp | Pro | Leu |
| 355 | 360 | 365 | |||||||||||||
| Thr | Leu | Val | Lys | Glu | Arg | Leu | Lys | Leu | Glu | Ser | Ser | Ile | Ile | Ile | Ser |
| 370 | 375 | 380 | |||||||||||||
| Lys | Gly | Met | Cys | Asp | Tyr | Leu | Leu | Ile | Val | Trp | Asp | Ile | Ile | Asn | Trp |
| 385 | 390 | 395 | 400 | ||||||||||||
| Ala | Lys | Asp- | His | Gly | Ile | Pro | Val | Gly | Pro | Gly | Arg | Gly | Ser | Gly | Ala |
| 405 | 410 | 415 | |||||||||||||
| Gly | Ser | Val | Met | Leu | Phe | Leu | Leu | Gly | Ile | Thr | Glu | Ile | Glu | Pro | Ile |
| 420 | 425 | 430 | |||||||||||||
| Arg | Phe | Asp | Leu | Phe | Phe | Glu | Arg | Phe | Ile | Asn | Pro | Glu | Arg | Ile | Ser |
| 435 | 440 | 445 | |||||||||||||
| Tyr | Pro | Asp | Ile. | Asp | Ile | Asp | Ile | Cys | Met | Ile | Gly | Arg | Glu | Arg | Val |
| 450 | 455 | 4 60 | |||||||||||||
| Ile | Asn | Tyr | Ala | Ile | Glu | Arg | His | Gly | Lys | Asp | Asn | Val | Ala | Gin | Ile |
| 4 65 | 470 | 475 | 480 | ||||||||||||
| He | Thr | Phe | Gly | Thr | Met | Lys | Ala | Lys | Met | Ala | Ile | Lys | Asp | Val | Gly |
| 485 | 490 | 495 | |||||||||||||
| Arg | Thr | Leu | Asp | Thr | Pro | Leu | Ala | Lys | Val | Asn | Phe | Ile | Ala | Lys | His |
| 500 | 505 | 510 | |||||||||||||
| Ile | Pro | Asp | Leu | Asn | Ala | Thr | Ile | Thr | Ser | Ala | Leu | Glu | Ala | Asp | Pro |
| 515 | 520 | 525 | |||||||||||||
| Glu | Leu | Arg | Gin | Leu | Tyr | Val | Asp | Asp | Ala | Glu | Ala | Ala | Glu | Val | Ile |
| 530 | 535 | 54 0 | |||||||||||||
| Asp | Met | Ala | Lys | Lys | Leu | Glu | Gly | Ser | Ile | Arg | Asn | Thr | Gly | Val | His |
| 545 | 550 | 555 | 560 | ||||||||||||
| Ala | Ala | Gly | Val | Ile | Ile | Cys | Gly | Asp | Pro | Leu | Thr | Asn | His | Ile | Pro |
| Ile | 565 | 570 | 575 | ||||||||||||
| Cys | Val | Pro | Lys | Asp | Ser | Ser | Met | Ile | Ser | Thr | Gin | Tyr | Ser | Met | |
| 580 | 585 | 590 | |||||||||||||
| Lys | Pro | Val | Glu | Ser | Val | Gly | Met | Leu | Lys | Val | Asp | Phe | Leu | Gly | Leu |
| 595 | 600 | 605 | |||||||||||||
| Lys | Thr | Leu | Thr | Gly | Ile | His | Ile | Ala | Thr | Gin | Ala | Ile | Tyr | Lys | Lys |
| 610 | 615 | 620 | |||||||||||||
| Thr | Gly | Ile | Leu | Leu | Arg | Ala | Ala | Thr | Ile | Pro | Leu | Asp | Asp | Gin | Asn |
| 625 | 630 | 635 | - | 640 | |||||||||||
| Thr | Phe | Ser | Leu | Leu | His | Gin | Gly | Lys | Thr | Met | Gly | Ile | Phe | Gin | Met |
| 645 | 650 | 655 | |||||||||||||
| Glu | Ser | Arg | Gly | Met | Gin | Asp | Leu | Ala | Lys | Asn | Leu | Arg | Pro | Asp | Ala |
| 660 | 665 | 670 | |||||||||||||
| Phe | Glu | Glu | Ile | Ile | Ala | Ile | Gly | Ala | Leu | Tyr | Arg | Pro | Gly | Pro | Met |
| 675 | 680 | 685 | |||||||||||||
| Asp | Met | Ile | Pro | Ser | Phe | Ile | Asn | Arg | Lys | His | Gly | Lys | Glu | Asn | Ile |
| 690 | 695 | 700 | |||||||||||||
| Glu | Tyr | Asp | His | Pro | Leu | Met | Glu | Pro | Ile | Leu | Lys | Glu | Thr | Phe | Gly |
| 705 | 710 | 715 | 720 | ||||||||||||
| Ile | Met | Val | Tyr | Gin | Glu | Gin | Val | Met | Gin | Ile | Ala | Gly | Ser | Leu | Ala |
| 725 | 730 | 735 | |||||||||||||
| Lys | Tyr | Ser | Leu | Gly | Glu | Gly | Asp | Val | Leu | Arg | Arg | Ala | Met | Gly | Lys |
| 740 | 745 | 750 | |||||||||||||
| Lys | Asp | His | Glu | Gin | Met | Val | Lys | Glu | Arg | Glu | Lys | Phe | Cys | Ser | Arg |
| 755 | 760 | 765 |
530
| Ala | Ala Ala Asn Gly Ile Asp Pro | Ser | Ile | Ala | Thr 780 | Thr | Ile | Phe | Asp | |
| 770 | 775 | |||||||||
| Lys 785 | Met | Glu Lys Phe Ala Ser Tyr 790 | Gly | Phe | Asn 795 | Lys | Ser | His | Ala | Ala 800 |
| Ala | Tyr | Gly Leu Ile Thr Tyr Thr 805 | Thr | Ala 810 | Tyr | Leu | Lys | Ala | Asn 815 | Tyr |
| Pro | Lys | Glu Trp Leu Ala Ala Leu 820 | Leu 825 | Thr | Cys | Asp | Tyr | Asp 830 | Asp | Ile |
| Glu | Lys | Val Gly Lys Leu Ile Gin 835 840 | Glu | Ala | His | Ser | Met 845 | Asn | Ile | Leu |
| Val | Leu 850 | Pro Pro Asp Ile Asn Glu 855 | Ser | Gly | Gin | Asp 8 60 | Phe | Glu | Ala | Thr |
| Gin 865 | Lys | Gly Ile Arg Phe Ser Leu 870 | Gly | Ala | Val 875 | Lys | Gly | Val | Gly | Met 880 |
| Ser | Ile | Val Asp Ser Ile Val Glu 885 | Glu | Arg 890 | Glu | Lys | Asn | Gly | Pro 895 | Tyr |
| Lys | Ser | Leu Gin Asp Phe Val Gin 900 | Arg 905 | Ala | Asp- | Phe | Lys | Lys 910 | Val | Thr |
| Lys | Lys | Gin Leu Glu Asn Leu Val 915 920 | Asp | Ala | Gly | Thr | Phe 925 | Asp | Cys | Phe |
| Glu | Pro 930 | Asn Lys Asp Leu Ala Leu 935 | Ala | Ile | Leu | Asn 940 | Asp | Leu | Tyr | Asp |
| Thr 945 | Phe | Ser Arg Glu Lys Lys Glu 950 | Ala | Ala | Thr 955 | Gly | Val | Leu | Thr | Phe 960 |
| Phe | Ser | Leu Asp Ser Met Ala Arg 965 | Asp | Pro 970 | Val | Lys | Ile | Thr | Val 975 | Ser |
| Pro | Glu | Asn Val Ile Gin Arg Ser 980 | Pro 985 | Lys | Glu | Leu | Leu | Lys 990 | Arg | Glu |
| Lys | Glu | Leu Leu Gly Val Tyr Leu Thr 995 1000 | Ala | His | Pro | Met Asp 1005 | Ala | Val | ||
| Glu | His Met Leu Pro Phe Leu Ser 1010 1015 | Val | Val | Pro | Ala Arg 1020 | Asp | Phe | Glu | ||
| Gly Leu 1025 | Pro His Gly Thr Ile Ile 1030 | Arg | Thr | Val Phe 1035 | Leu | Ile | Asp | Lys 1040 | ||
| Val | Thr | Thr Lys Ile Ser Ser Ala 104 5 | Glu | Gin Lys 1050 | Lys | Phe | Ala | Leu Leu 1055 | ||
| Gin | Val | Ser Asp Glu Val Asp Ser 1060 | Tyr Glu 1065 | Leu | Pro | Ile | Trp Ala 1070 | Asp | ||
| Met | Tyr | Ala Glu Tyr Arg Asp Leu Leu 1075 1080 | Glu | Glu | Asp | Arg Leu 1085 | Ile | Tyr | ||
| Ala | Ile Leu Ala Ile Asp Arg Arg 1090 1095 | Ser | Asp | Ser | Leu Arg 1100 | Leu | Ser | Cys | ||
| Arg Trp 1105 | Met Arg Asp Leu Ser Thr 1110 | Val | Asn | Asp Ser 1115 | Val | Ile | Ala | Glu 1120 | ||
| Cys | Asp | Glu Val Tyr Asp Arg Leu 1125 | Lys | Ser Gin 1130 | Lys | Val | Tyr | Ser Ser 1135 | ||
| Thr | Lys | Lys Ser Thr Gly Ala Gin 1140 | Ser Šer 1145 | Ala | Met | Ile | Lys Lys 1150 | Val | ||
| Glu | Thr | Arg Glu Ile Ser Pro Val Thr 1155 1160 | Ile | Ser | Leu | Asp Leu 1165 | Asn | Lys | ||
| Leu | Arg His Ser His Leu Phe Ile 1170 1175 | Leu | Lys | Gly | Leu Ile 1180 | Arg | Lys | Tyr | ||
| Ser Gly 1185 | Ser Gin Ala Leu Ser Leu 1190 | Val | Phe | Thr Lys 1195 | Asp | Asn | Gin | Arg 1200 | ||
| Phe | Ala | Ser Ile Ser Pro Asp Ala 1205 | Asp | Phe Phe 1210 | Val | Thr | Asp | Asp Ile 1215 | ||
| Ser Leu | Ser Ala | Leu Leu Gin Glu Ile Glu 1220 Thr Thr Val | Ala Thr 1225 | Asn | Ile | Pro | Ala Arg Val 1230 |
1235
9 ···· ·· ♦ 9 · - · φ ·
9 99 · ·,.· ·« • ····· • · · · ·
····
531 <210> 593 <211> 563 <212> PRT <213> C. Trachomatis D serovar <400> 593
| Met | Val | Tyr | Phe | Arg | Ala | His | Gin | Pro | Arg | His | Thr | Pro | Lys | Thr | Phe |
| 1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
| Pro | Leu | Glu | Val | His | His | Ser | Phe | Ser | Asp | Lys | His | Pro | Gin | Ile | Ala |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Lys | Ala | Met | Arg | Ile | Thr | Gly | He | Ala | Leu | Ala | Ala | Leu | Ser | Leu | Leu |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Ala | Val | Val | Ala | Cys | Val | Ile | Ala | Val | Ser | Ala | Gly | Gly | Ala | Ala | Ile |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Pro | Leu | Ala | Val | Ile | Ser | Gly | Ile | Ala | Val | Met | Ser | Gly | Leu | Leu | Ser |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Ala | Ala | Thr | Ile | Ile | Cys | Ser | Ala | Lys | Lys | Ala | Leu | Ala | Gin | Arg | Lys |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Gin | Lys | Gin | Leu | Glu | Glu | Ser | Leu | Pro | Leu | Asp | Asn | Ala | Thr | Glu | His |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Val | Ser | Tyr | Leu | Thr | Ser | Asp | Thr | Ser | Tyr | Phe | Asn | Gin | Trp | Glu | Ser |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Leu | Gly | Ala | Leu | Asn | Lys | Gin | Leu | Ser | Gin | He | Asp | Leu | Thr | Ile | Gin |
| 130 | 135 | 14 0 | |||||||||||||
| Ala | Pro | Glu | Lys | Lys | Leu | Leu | Lys | Glu | Val | Leu | Gly | Ser | Arg | Tyr | Asp |
| 145. | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Ser | Ile | Asn | His | Ser | Ile | Glu | Glu | He. | Ser | Asp | Arg | Phe | Thr | Lys | Met |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Leu | Ser | Leu | Leu | Arg | Leu | Arg | Glu | His | Phe | Tyr | Arg | Gly | Glu | Glu | Arg |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Tyr | Ala | Pro | Tyr | Leu | Ser | Pro | Pro | Leu | Leu | Asn | Lys | Asn | Arg | Leu | Leu |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Thr | Gin | Ile | Thr | Ser | Asn | Met | Ile | Arg | Met | Leu | Pro | Lys | Ser | Gly | Gly |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Val | Phe | Ser | Leu | Lys | Ala | Asn | Thr | Leu | Ser | His | Ala | Ser | Arg | Thr | Leu |
| 225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
| Tyr | Thr | Val | Leu | Lys | Val | Ala | Leu | Ser | Leu | Gly | Val | Leu | Ala | Gly | Val |
| 245 | 250 | 255 | |||||||||||||
| Ala | Ala | Leu | Ile | Ile | Phe | Leu | Pro | Pro | Ser | Leu | Pro | Phe | Ile | Ala | Val |
| 260 | 265 | 270 | |||||||||||||
| Ile | Gly | Val | Ser | Ser | Leu | Ala | Leu | Gly | Met | Ala | Ser | Phe | Leu | Met | Ile |
| 275 | 280 | 285 | |||||||||||||
| Arg | Gly | Ile | Lys | Tyr | Leu | Leu | Glu | His | Ser | Pro | Leu | Asn | Arg | Lys | Gin |
| 290 | 295 | 300 | |||||||||||||
| Leu | Ala | Lys | Asp | Ile | Gin | Lys | Thr | Ile | Gly | Pro | Asp | Val | Leu | Ala | Ser |
| 305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
| Met | Val | His | Tyr | Gin | His | Gin | Leu | Leu | Ser | His | Leu | His | Glu | Thr | Leu |
| 325 | 330 | 335 | |||||||||||||
| Leu | Asp | Glu | Ala | Ile | Thr | Ala | Arg Trp | Ser | Glu | Pro | Phe | Phe | Ile | Glu | |
| 340 | 345 | 350 | |||||||||||||
| His | Ala | Asn | Leu | Lys | Ala | • Lys | Ile | Glu | Asp | Leu | Thr | Lys | Gin | Tyr | Asp |
| 355 | 360 | 365 | |||||||||||||
| He | Leu | Asn | Ala | Ala | Phe | Asn | Lys | Ser | Leu | Gin | Gin | Asp | Glu | Ala | Leu |
| 370 | 375 | 380 | |||||||||||||
| Arg | Ser | Gin | Leu | Glu | Lys | Arg | Ala | Tyr | Leu | Phe | Pro | Ile | Pro | Asn | Asn |
| 385 | 390 | 395 | 400 | ||||||||||||
| Asp | Glu | Asn | Ala | Lys | Thr | Lys | Glu | Ser | Gin | Leu | Leu | Asp | Ser | Glu | Asn |
| 405 | 410 | 415 | |||||||||||||
| Asp | Ser | Asn | Ser | Glu | Phe | Gin | Glu | Ile | Ile | Asn | Lys | Gly | Leu | Glu | Tkla |
| 420 | 425 | 430 | |||||||||||||
| Ala | Asn | Lys | Arg | Arg | Ala | Asp | Ala | • Lys. | Ser | Lys | Phe | Tyr | Thr | Glu | Asp |
φφφφ ·· φφφφ ·· φφ
ΦΦ'Φ, φφφ φφ φ φφφ φ φ Φφφ φ φ • φφφ φ φ φφφ φ φ φ φ φφφφ φφφφ •φφφφ φφφ φφ φφ φφ φφ
| - | 532 | ||||||||||||||
| 435 | 440 | 445 | |||||||||||||
| Glu | Thr | Ser | Asp | Lys | Ile | Phe | Ser | Ile | Trp | Lys | Pro | Thr | Lys | Asn | Leu |
| 450 | 455 | 460 | |||||||||||||
| Ala | Leu | Glu | Asp | Leu | Trp | Arg | Val | His | Glu | Ala | Cys | Asn | Glu | Glu | Gin |
| 4 65 | 470 | 475 | 480 | ||||||||||||
| Gin | Ala | Leu | Leu | Leu | Glu | Asp | Tyr | Met | Ser | Tyr | Lys | Thr | Ser | Glu | Cys |
| 485 | 4 90 | 495 | |||||||||||||
| Gin | Ala | Ala | Leu | Gin | Lys | Val | Ser | Gin | Glu | Leu | Lys | Ala | Ala | Gin | Lys |
| Ser | 500 | 505 | 510 | ||||||||||||
| Phe | Ala | Val | Leu | Glu | Lys | His | Ala | Leu | Asp | Arg | Ser | Tyr | Glu | Ser | |
| 515 | 520 | 525 | |||||||||||||
| Ser | Val | Ala | Thr | Met | Asp | Leu | Ala | Arg | Ala | Asn | Gin | Glu | Thr | His | Arg |
| 530 | 535 | 540 | |||||||||||||
| Leu | Leu | Asn | Ile | Leu | Ser | Glu | Leu | Gin | Gin | Leu | Ala | Gin | Tyr | Leu | Leu |
| 545 | 550 | 555 | 560 | ||||||||||||
| Asp | Asn | His |
| <210> 594 | |||||||||||||||
| <211> 1751 | |||||||||||||||
| <212> PRT | |||||||||||||||
| <213> C. | Trachomatis | ; D serovar | |||||||||||||
| <400> 594 | |||||||||||||||
| Met | Lys | Trp | Leu | Ser | Ala | Thr | Ala | Val | Phe | Ala | Tkla | Val | Leu | Pro | Ser |
| 1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
| Val | Ser | Gly | Phe | Cys | Phe | Pro | Glu | Pro | Lys | Glu | Leu | Asn | Phe | Ser | Arg |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Val | Gly | Thr | Ser | Ser | Ser | Thr | Thr | Phe | Thr | Glu | Thr | Val | Gly | Glu | Ala |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Gly | Ala | Glu | Tyr | Ile | Val | Ser | Gly | Asn | Ala | Ser | Phe | Thr | Lys | Phe | Thr |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Asn | Ile | Pro | Thr | Thr | Asp | Thr | Thr | Thr | Pro | Thr | Asn | Ser | Asn | Ser | Ser |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Ser | Ser | Asn | Gly | Glu | Thr | Ala | Ser | Val | Ser | Glu | Asp | Ser | Asp | Ser | Thr |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Thr | Thr | Thr | Pro | Asp | Pro | Lys | Gly | Gly | Gly | Ala | Phe | Tyr | Asn | Ala | His |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Ser | Gly | Val | Leu | Ser | Phe | Met | Thr | Arg | Ser | Gly | Thr | Glu | Gly | Ser | Leu |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Thr | Leu | Ser | Glu | Ile | Lys | Ile | Thr | Gly | Glu | Gly | Gly | Ala | Ile | Phe | Ser |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Gin | Gly | Glu | Leu | Leu | Phe | Thr | Asp | Leu | Thr | Gly | Leu | Thr | Ile | Gin | Asn |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Asn | Leu | Ser | Gin | Leu | Ser | Gly | Gly | Ala | Ile | Phe | Gly | Glu | Ser | Thr | Ile |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Ser | Leu | Ser | Gly | Ile | Thr | Lys | Ala | Thr | Phe | Ser | Ser | Asn | Ser | Ala | Glu |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Val | Pro | Ala | Pro | Val | Lys | Lys | Pro | • Thr | Glu | Pro | Lys | Ala | Gin | Thr | Ala |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Ser | Glu | Thr | Ser | Gly | Ser | Ser | Ser | Ser | Ser | Gly | Asn | Asp | Ser | Val | Ser |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Ser | Pro | Ser | Ser | Ser | Arg | Ala | Glu | Pro | Ala | Ala | Ala | Asn | Leu | Gin | Ser |
| 225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
| His | Phe | Ile | Cys | Ala | Thr | Ala | Thr | Pro | Ala | Ala | Gin | Thr | Asp | Thr | Glu |
| 245 | 250 | 255 | |||||||||||||
| Thr | Ser | Thr | Pro | Ser | His | Lys | Pro | Gly | Ser | Gly | Gly | Ala | Ile | Tyr | Ala |
| 260 | 265 | 270 | |||||||||||||
| Lys | Gly | Asp | Leu | Thr | Ile | Ala | Asp | Ser | Gin | Glu | Val | Leu | Phe | Ser | Ile |
| 275 | 280 | 285 | |||||||||||||
| Asn | Lys | Ala | Thr | Lys | Asp | Gly | Gly | Ala | Ile | Phe | Ala | Glu | Lys | Asp | Val |
• 9 9 »4 • 9 99
533
| 290 | 295 | 300 | |||||||||||||
| Ser | Phe | Glu | Asn | Ile | Thr | Ser | Leu | Lys | Val | Gin | Thr | Asn | Gly | Ala | Glu |
| 305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
| Glu | Lys | Gly | Gly | Ala | Ile | Tyr | Ala | Lys | Gly | Asp | Leu | Ser | Ile | Gin | Ser |
| 325 | 330 | 335 | |||||||||||||
| Ser | Lys | Gin | Ser | Leu | Phe | Asn | Ser | Asn | Tyr | Ser | Lys | Gin | Gly | Gly | Gly |
| 340 | 345 | 350 | |||||||||||||
| Ala | Leu | Tyr | Val | Glu | Glv Asp | Ile | Asn. | Phe | Gin | Asp | Leu | Glu | Glu | Ile | |
| 355 | 360 | 365 | |||||||||||||
| Arg | Ile | Lys | Tyr | Asn | Lys | Ala | Gly | Thr | Phe | Glu | Thr | Lys | Lys | Ile | Thr |
| 370 | 375 | 380 | |||||||||||||
| Leu | Pro | Lys | Ala | Gin | Ala | Ser | Ala | Gly | Asn | Ala | Asp | Ala | Trp | Ala | Ser |
| 385 | 390 | 395 | 400 | ||||||||||||
| Ser | Ser | Pro | Gin | Ser | Gly | Ser | Gly | Ala | Thr | Thr | Val | Ser | Asn | Ser | Gly |
| 405 | 410 | 415 | |||||||||||||
| Asp | Ser | Ser | Ser | Gly | Ser | Asp | Ser | Asp | Thr | Ser | Glu | Thr | Val | Pro | Ala |
| 420 | 425 | 430 | |||||||||||||
| Thr | Ala | Lys | Gly | Gly | Gly | Leu | Tyr | Thr | Asp | Lys | Asn | Leu | Ser | Ile | Thr |
| 4 35 | 440 | 445 | |||||||||||||
| Asn | Ile | Thr | Gly | Ile | Ile | Glu | Ile | Ala | Asn | Asn | Lys | Ala | Thr | Asp | Val |
| 450 | 4 55 | 460 | |||||||||||||
| Gly | Gly | Gly | Ala | Tyr | Val | Lys | Gly | Thr | Leu | Thr | Cys | Glu | Asn | Ser | His |
| 4 65 | 470 | 475 | 480 | ||||||||||||
| Arg | Leu | Gin | Phe | Leu | Lys | Asn | Ser | Ser | Asp | Lys | Gin | Gly | Gly | Gly | Ile |
| 485 | 490 | 495 | |||||||||||||
| Tyr | Gly | Glu | Asp | Asn | Ile | Thr | Leu | Ser | Asn | Leu | Thr | Gly | Lys | Thr | Leu |
| 500 | 505 | 510 | |||||||||||||
| Phe | Gin | Glu | Asn | Thr | Ala | Lys | Glu | Glu | Gly | Gly | Gly | Leu | Phe | Ile | Lys |
| 515 | 520 | 525 | |||||||||||||
| Gly | Thr | Asp | Lys | Ala | Leu | Thr | Met | Thr | Gly | Leu | Asp | Ser | Phe | Cys | Leu |
| 530 | 535 | 540 | |||||||||||||
| Ile | Asn | Asn | Thr | Ser | Glu | Lys | His | Gly | Gly | Gly | Ala | Phe | Val | Thr | Lys |
| 545 | 550 | 555 | 560 | ||||||||||||
| Glu | Ile | Ser | Gin | Thr | Tyr | Thr | Ser | Asp | Val | Glu | Thr | Ile | Pro | Gly | Ile |
| 565 | 570 | 575 | |||||||||||||
| Thr | Pro | Val | His | Gly | Glu | Thr | Val | Ile | Thr | Gly | Asn | Lys | Ser | Thr | Gly |
| 580 | 585 | 590 | |||||||||||||
| Gly | Asn | Gly Gly Gly. | Val | .Cys. | -Thr. | .Lys | Arg. | -Lett | Ala. | -Leu. | -Ser. | ||||
| -□yo’ | 600 | 605 | |||||||||||||
| Gin | Ser | Ile | Ser | Ile | Ser | Gly | Asn | Ser | Tkla | Ala | Glu | Asn | Gly | Gly | Gly |
| 610 | 615 | 620 | |||||||||||||
| Ala | His | Thr | Cys | Pro | Asp | Ser | Phe | Pro | Thr | Ala | Ásp | Thr | Ala | Glu | Gin |
| 625 | 630 | 635- | 640 | ||||||||||||
| Pro | Ala | Ala | Ala | Ser | Ala | Ala | Thr | Ser | Thr | Pro | Glu | Ser | Ala | Pro | Val |
| 645 | 650 | 655 | |||||||||||||
| Val | Ser | Thr | Ala | Leu | Ser | Thr | Pro | Ser | Ser | Ser | Thr | Val | Ser | Ser | Leu |
| 660 | 665 | 670 | |||||||||||||
| Thr | Leu | Leu | Ala | Ala | Ser | Ser | Gin | Ala | Ser | Pro | Ala | Thr | Ser | Asn | Lys |
| 675 | 680 | 685 | |||||||||||||
| Glu | Thr | Gin | Asp | Pro | Asn | Ala | Asp | Thr | Asp | Leu | Leu | Ile | Asp | Tyr | Val |
| 690 | 695 | 700 | |||||||||||||
| Val | Asp | Thr | Thr | Ile | Ser | Lys | Asn | Thr | Ala | Lys | Lys | Gly | Gly | Gly | Ile |
| 705 | 710 | 715 | 720 | ||||||||||||
| Tyr | Ala | Lys | Lys | Ala | Lys | Met | Ser | Arg | Ile | Asp | Gin | Leu | Asn | Ile | Ser |
| 725 | 730 | 735 | |||||||||||||
| Glu | Asn | Ser | Ala | Thr | Glu | Ile | Gly | Gly | Gly | Ile | Cys | Cys | Lys | Glu | Ser |
| 740 | 745 | 750 | |||||||||||||
| Leu | Glu | Leu | Asp | Ala | Leu | Val | Ser | Leu | Ser | Val | Thr | Glu | Asn | Leu | Val |
| 7 55 | 7 60 | 765 | |||||||||||||
| Gly | Lys | Glu | Gly | Gly | Gly | Leu | His | Ala | Lys | Thr | Val | Asn | Ile | Ser | Asn |
| 770 | 775 | - | 780 |
• 9 ··«· ·9
9 9 . '9
99« · • ·«· '99
534
| Leu Lys | Ser | Gly Phe Ser Phe Ser | Asn Asn | Lys Ala Asn | Ser | Ser | Ser |
| 785 | 790 | 795 | 800 | ||||
| Thr Gly | Val | Ala Thr Thr Ala Ser | Ala Pro | Ala Ala Ala | Ala | Ala | Ser |
| 805 | 810 | 815 | |||||
| Leu Gin | Ala | Ala Ala Ala Ala Val | Pro Ser | Ser Pro Ala | Thr | Pro | Thr |
| 820 | 825 | 830 | |||||
| Tyr Ser | Gly | Val Val Gly Gly Ala | Ile Tyr | Gly Glu Lys | Val | Thr | Phe |
| 835 | 840 | 845 | |||||
| Ser Gin | Cys | Ser Gly Thr Cys Gin | Phe Ser | Gly Asn Gin | Ala | Ile | Asp |
| 850 | 855 | 860 | |||||
| Asn Asn | Pro | Ser Gin Ser Ser Leu | Asn Val | Gin Gly Gly | Ala | Ile | Tyr |
| 865 | 870 | 875 | 880 | ||||
| Ala Lys | Thr | Ser Leu Ser Ile Gly | Ser Ser | Asp Ala Gly | Thr | Ser | Tyr |
| 885 | 890 | 895 | |||||
| Ile Phe | Ser | Gly Asn Ser Val Ser | Thr Gly | Lys Ser Gin | Thr | Thr | Gly |
| 900 | 905 | 910 | |||||
| Gin Ile | Ala | Gly Gly Ala Ile Tyr | Ser Pro | Thr Val Thr | Leu | Asn | Cys |
| 915 | 920 | 925 | |||||
| Pro Ala | Thr | Phe Ser Asn Asn Thr | Ala Ser | Met Ala Thr | Pro | Lys | Thr |
| 930 | 935 | 940 | |||||
| Ser Ser | Glu | Asp Gly Ser Ser Gly | Asn Ser | Ile Lys Asp | Thr | Ile | Gly |
| 945 | 950 | 955 | 960 | ||||
| Gly Ala | Ile | Ala Gly Thr Ala Ile | Thr Leu | Ser Gly Val | Ser | Arg | Phe |
| 965 | 970 | 975 | |||||
| Ser Gly | Asn | Thr Ala Asp Leu Gly | Ala Ala | Ile Gly Thr | Leu | Ala | Asn |
| 980 | 985 | 990 | |||||
| Ala Asn | Thr | Pro Ser Ala Thr Ser | Gly Ser | Gin Asn Ser | Ile | Thr | Glu |
| 995 | 1000 | 1005 | |||||
| Lys Ile | Thr | Leu Glu Asn Gly Ser | Phe Ile | Phe Glu Arg | Asn | Gin | Ala |
| 1010 | 1015 | 1020 | |||||
| Asn Lys | Arg | Gly Ala Ile Tyr Ser | Pro Ser | Val Ser Ile | Lys | Gly | Asn |
| 1025 | 1030 | 1035 | 1040 | ||||
| Asn Ile | Thr | Phe Asn Gin Asn Thr | Ser Thr | His Asp Gly | Ser | Ala | Ile |
| 1045 | 1050 | 1055 | |||||
| Tyr Phe | Thr | Lys Asp Ala Thr Ile | Glu Ser | Leu Gly Ser | Val | Leu | Phe |
| 1060 | 1065 | 1070 | |||||
| Thr Gly | Asn | Asn Val Thr Ala Thr | Gin Ala | Ser Ser Ala | Thr | Ser | Gly |
| 1075 1080 | 1085 | ||||||
| Gin Asn | Thr | Asn Thr Ala Asn Tyr | Gly Ala | Ala Ile Phe | Gly Asp | Pro | |
| 1090 | 1095 | 1100 | |||||
| Gly Thr | Thr | Gin Ser Ser Gin Thr | Asp .Ala | Ile Leu Thr | Leu | Leu | Ala |
| 1105 | 1110 | 1115 | 1120 | ||||
| Ser Ser | Gly | Asn Ile Thr Phe Ser | Asn Asn | Ser Leu Gin | Asn | Asn | Gin |
| 1125 | 1130 | 1135( | |||||
| Gly Asp | Thr | Pro Ala Ser Lys Phe | Cys Ser | Ile Ala Gly | Tyr | Val | Lys |
| 1140 | 1145 | 1150 | |||||
| Leu Ser | Leu | Gin Ala Ala Lys Gly | Lys Thr | Ile Ser Phe | Phe | Asp | Cys |
| 1155 1160 | 1165 | ||||||
| Val His | Thr | Ser Thr Lys Lys Ile | Gly Ser | Thr Gin Asn | Val | Tyr | Glu |
| 1170 | 1175 | 1180 | |||||
| Thr Leu | Asp | Ile Asn Lys Glu Glu | Asn Ser | Asn Pro Tyr | Thr | Gly | Thr |
| 1185 | 1190 | 1195 | 1200 | ||||
| Ile Val | Phe | Ser Ser Glu Leu His | Glu Asn | Lys Ser Tyr | Ile | Pro | Gin |
| 1205 | 1210 | 1215 | |||||
| Asn Ala | Ile | Leu His Asn Gly Thr | Leu Val | Leu Lys Glu | Lys | Thr | Glu |
| 1220 | 1225 | 1230 | |||||
| Leu His | Val | Val Ser Phe Glu Gin | Lys Glu | Gly Ser Lys | Leu | Ile | Met |
| 1235 1240 | 1245 | ||||||
| Lys Pro | Gly Ala Val Leu Ser Asn | Gin Asn | Ile Ala Asn Gly | Ala | Leu | ||
| -1250 | 1255 | 1260 | |||||
| Val Ile | Asn | Gly Leu Thr Ile Asp | Leu Ser | Ser Met Gly Thr | Pro | Gin |
1265 1270
1275
O“ ·· ·*«· ·♦ • · · « «··· · • ··· • · · · ·· ·· ··
535
1280
| Ala Gly Glu Ile Phe Ser Pro Pro Glu Leu Arg | Ile.Val Ala | Thr Thr 1295 | ||
| 1285 | 1290 | |||
| Ser Ser Ala | Ser Gly Gly Ser Gly Val | Ser Ser | Ser Ile Pro | Thr Asn |
| 1300 1305 | 1310 | |||
| Pro Lys Arg | Ile Ser Ala Ala Ala Pro | Ser Gly | Ser Ala Ala | Thr Thr |
| 1315 | 1320 | 1325 | ||
| Pro Thr Met | Ser Glu Asn Lys Val Phe | Leu Thr | Gly Asp Leu | Thr Leu |
| 1330 | 1335 | 1340 | ||
| Ile Asp Pro | Asn Gly Asn Phe Tyr Gin | Asn Pro | Met Leu Gly | Ser Asp |
| 1345 | 1350 | 1355 | 1360 | |
| Leu Asp Val | Pro Leu Ile Lys Leu Pro | Thr Asn | Thr Ser Asp | Val Gin |
| 1365 | 1370 | 1375 | ||
| Val Tyr Asp | Leu Thr Leu Ser Gly Asp | Leu Phe | Pro Gin Lys | Gly Tyr |
| 1380 - 1385 | 1390 | |||
| Met Gly Thr | Trp Thr Leu Asp Ser Asn | Pro Gin | Thr Gly Lys | Leu Gin |
| 1395 | , 1400 | 1405 | ||
| Ala Arg Trp | Thr Phe Asp Thr Tyr Arg | Arg Trp | Val Tyr Ile | Pro Arg |
| 1410 | 1415 | 1420 | ||
| Asp Asn His | Phe Tyr Ala Asn Ser Ile | Leu Gly | Ser Gin Asn | Ser Met |
| 1425 | 1430 | 1435 | 1440 | |
| Ile Val Val | Lys Gin Gly Leu Ile Asn | Asn Met | Leu Asn Asn | Ala Arg |
| 1445 | 1450 | 1455 | ||
| Phe Asp Asp | Ile Ala Tyr Asn Asn Phe | Trp Val | Ser Gly Val | Gly Thr |
| 1460 1465 | 1470 | |||
| Phe Leu Ala | Gin Gin Gly Thr Pro Leu | Ser Glu | Glu Phe Ser | Tyr Tyr |
| 1475 1480 | 1485 | |||
| Ser Arg Gly | Thr Ser Val Ala Ile Asp | Ala Lys | Pro Arg Gin | Asp Phe |
| 14 90 | 1495 | 1500 | ||
| Ile Leu Gly | Ala Ala Phe Ser Lys Met | Val Gly | Lys Thr Lys | Ala Ile |
| 1505 | 1510 | 1515 | 1520 | |
| Lys Lys Met | His Asn Tyr Phe His Lys | Gly Ser | Glu Tyr Ser | Tyr Gin |
| 1525 | 1530 | 1535 | ||
| Ala Ser Val | Tyr Gly Gly Lys Phe Leu | Tyr Phe | Leu Leu Asn | Lys Gin |
| 1540 1545 | 1550 | |||
| His Gly Trp | Ala Leu Pro Phe Leu Ile | Gin Gly | Val Val Ser | Tyr Gly |
| 1555 1560 | 1565 | |||
| His Ile Lys | His Asp Thr Thr Thr Leu | Tyr Pro | Ser Ile His | Glu Arg |
| 1570 | 1575 | 1580 | ||
| Asn Lys Gly | Asp Trp Glu Asp Leu Gly | Trp Leu | Ala Asp Leu | Arg Ile |
| 1585 | 1590 | 1595 | 1600 | |
| Ser Met Asp | Leu Lys Glu Pro Ser Lys | Asp Ser | Ser Lys Arg | Ile Thr |
| 1605 | 1610 | 1615 | ||
| Val Tyr Gly | Glu Leu Glu Tyr Ser Ser | Ile Arg | Gin Lys Gin | Phe Thr |
| 1620 1625 | 1630 | |||
| Glu Ile Asp | Tyr Asp Pro Arg His Phe | Asp Asp | Cys Ala Tyr | Arg Asn |
| 1635 1640 | 1645 | |||
| Leu Ser Leu | Pro Val Gly Cys Ala Val | Glu Gly | Ala Ile Met | Asn Cys |
| 1650 | 1655 | 1660 | ||
| Asn Ile Leu | Met Tyr Asn Lys Leu Ala | Leu Tkla | Tyr Met Pro | Ser Ile |
| 1665 | 1670 | 1675 | 1680 | |
| Tyr Arg Asn | Asn Pro Val Cys Lys Tyr | Arg Val | Leu Ser Ser | Asn Glu |
| 1685 | 1690 | 1695 | ||
| Ala Gly Gin | Val Ile Cys Gly Val Pro | Thr Arg | Thr Ser Ala | Arg Ala |
| 1700 1705 | 1710 | |||
| Glu Tyr Ser | Thr Gin Leu Tyr Leu Gly | Pro Phe | Trp Thr Leu | Tyr Gly |
| 1715 1720 | 1725 | |||
| Asn Tyr Thr | Ile Asp Val Gly Met Tyr | Thr Leu | Ser Gin Met | Thr Ser |
1730
Cys Gly Ala Arg Met 1745
1735 Ile Phe 1750
1740 . 9'9 Φ··'»· ·» ·· ·· » ·· · '· 9 · · ·
9 99 9 9 9 99 · • 9 φ 9 9 9 9 9 9 9
9 9 9 9 9 9 9
536 <210> 595 <211> 900 <212> DNA <213> Chlamydia pneumoniae <400> 595 atgctaaaga ttgatctaac aggaaaggta gcatttgttg cgggcattgg tgatgaccaa 60 ggatatggct ggggtattgc taaacttctt gcagaagcag gagctacgat tattgtagga 120 acatgggtac cgatttacaa aattttctct cagtcttggg aattaggaáa attcaatgaa 180 tctagaaaat tatcgaatgg cactctctta gagattgcta agatctatcc catggacgca 240 agttttgata gccctgaaga tgttcctgaa gatattgctg aaaataaacg ttacaagggc 300 attacgggat tcacgatatc agaagtcgca gaacaggtaa aaaaagattt tggtcatatt 360 gacattcttg tccactcgct ggcaaatagt cctgaaattt ctaagtctct attagaaaca 420 tcaagaaaag gttacttagc ggctctcagt gcctctagtt attcttttgt tagccttcťc 480 tctcactttg gaagtatcat gaaccgtggt ggatcgacaa tatcgctcac ctatttggct 540 tctatgcgcg ctgttcctgg atacggaggg ggcatgagtt cggcaaaagc agctttggaa 600 agtgacacca aaactcttgc ttgggaagcg ggacgccgtt ggggcatacg tgtcaatacc 660 atctctgcag gacctttagc aagccgagct ggaaaagcaa ttggttttat tgaaagaatg 720 gtagactatt accaagagtg ggcgcctatt cccgaggcta tgaatgccga gcaggtgggt 780 gccgttgcag ctttcttagc atčacčtcta gcttcagcaa ttactggtga gaccttatac 840 gtagatcacg gagccaatgt gatgggaatt ggtcctgaga tgttccctaa agactcataa 900 <210> 596 <211> 1743 <212> DNA <213> Chlamydia pneumoniae <4OO> 596 atgccaaaac aagctgaata tacttgggga tctaaaaaaa ttctggacaa tatagaatgc 60 ctcacagaag acgttgccga atttaaagat ttgctttata cggcacacag aattacttcg 120 agcgaagaag aatctgataa cgaaatacag cctggcgcca tcctaaaagg taccgtagtt 180 gatattaata aagactttgt cgtagttgat gttggtctga agtctgaggg agtgatccct 240 atgtcagagt tcatagactc ttcagaaggt ttagtgcttg gagctgaagt agaagtctat 300 ctcgaccaag ccgaagacga agagggcaaa gttgtccttt ctagagaaaa agccacacga 360 caaCgtcaat gggaatacat cttagctcat tgtgaagaag gttctattgt taaaggtcaa 420 attacacgta aagtcaaagg cggccttatt gtagatattg gaatggaagc cttcctacct 480 ggatcacaaa ttgacaacaa gaaaatcaaa aatttagatg attatgtcgg aaaagtttgt 540 gaattcaaaa ttttaaaaat taacgttgaa cgtpgcaata ttgttgtctc aagaagagaa 600 ctcttagaag ctgagagaat ctctaagaaa gccgaactta ttgaacaaat ttctatcgga 660 gaataccgca aaggagttgt taaaaacatt actgactttg gtgtattctt agatctcgat 720 ggtattgacg gtcttctcca cattaccgat -atgacctgga agcgcatacg acatccttcc 780 gaaatggtcg aattgaatca agagttggaa gtaattattt taagcgtaga taaagaaaaa 840 ggacgagttg ctčtaggtct caaacaaaaa gagcataatc cttgggaaga tattgagaag 900 aaataccctc ctggaaaacg agttcttggt aaaattgtga agcttctccc ctacggagct 960 ttcattgaaa ttgaagaggg cattgaaggt ctaattcaca tttctgaaat gtcttgggtg 1020 aaaaatattg tagatcctag tgaagtcgta aataaaggcg atgaagttga agccattgtt 1080 ctatctattc agaaggacga aggaaaaatt tctctaggat taaagcaaac agaacgtaat 1140 ccttgggaca atatcgaaga aaaatatcct ataggtctcc atgtcaatgc tgaaatcaag 1200 aacttaacca attacggtgc tttcgttgaa ttagaaccag gaattgaggg tctgattcat 1260 atttctgaca tgagttggat taaaaaagtc tčtcaccctt cagaactatt caaaaaagga 1320 aattctgtag aggctgttat tttatcagta gacaaagaaa gtaaaaaaat tactttagga 1380 gttaagcaat taagttctaa tccttggaat gaaattgaag ctatgttccc tgctggcaca 1440 gtaatttcag gagttgtgac taaaatcact gcatttggag cctttgttga gctacaaaac 1500 gggattgaag gattgattca cgtttcagaa ctttctgaca agccctttgc aaaaattgaa 1560 gatattatct ccattggaga aaatgtttct gcaaaagtaa ttaagctaga tccagatcat 1620 aaaaaagttt ctctttctgt aaaagaatac ttagctgaca atgcttatga tcaagactct 1680 aggactgaat tagatttcaa ggattctcaa ggccctaáag agagaaagaa aaaaggaaaa 1740 tag 1743 ·'· ··«· ·· 4« *««· • · * ' · » ♦ » · « • · ·« · « · ··' « · >· • .· ·♦ · · · · · * « • · · · · · 4 · « <
·····,·· ·« ·* 4 4 4«
537 <210> 597 <211> 299 <212> PRT
| <213> Chlamydia pneumoniae | |||||||||||||||
| <400> 597 | |||||||||||||||
| Met | Leu | Lys | Ile | Asp | Leu | Thr | Gly | Lys | Val | Ala | Phe | Val | Ala | Gly | Ile |
| 5 | 10 | 15 | |||||||||||||
| Gly | Asp | Asp | Gin | Gly | Tyr | Gly | Trp | Gly | Ile | Ala | Lys | Leu | Leu | Ala | Glu |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||||
| Ala | Gly | Ala | Thr | Ile | Ile | Val | Gly | Thr | Trp | Val | Pro | Ile | Tyr | Lys | Ile |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| Phe | Ser | Gin | Ser | Trp | Glu | Leu | Gly | Lys | Phe | Asn | Glu | Ser | Arg | Lys | Leu |
| 50 | 55 | 60 | |||||||||||||
| Ser | Asn | Gly | Thr | Leu | Leu | Glu· | Ile | Ala | Lys | Ile | Tyr | Pro | Met | Asp | Ala |
| 65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
| Ser | Phe | Asp | Ser | Pro | Glu | Asp | Val | Pro | Glu | Asp | Ile | Ala | Glu | Asn | Lys |
| 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
| Arg | Tyr | Lys | Gly | Ile | Thr | Gly | Phe | Thr | Ile | Ser | Glu | Val | Ala | Glu | Gin |
| 100 | 105 | 110 | |||||||||||||
| Val | Lys | Lys | Asp | Phe | Gly | His | Ile | Asp | Ile | Leu | Val | His | Ser | Leu | Ala |
| 115 | 120 | 125 | |||||||||||||
| Asn | Ser | Pro | Glu | Ile | Ser | Lys | Ser | Leu | Leu | Glu | Thr | Ser | Arg | Lys | Gly |
| 130 | 135 | 140 | |||||||||||||
| Tyr | Leu | Ala | Ala | Leu | Ser | Ala | Ser | Ser | Tyr | Ser | Phe | Val | Ser | Leu | Leu |
| 145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
| Ser | His | Phe: | Gly | Ser | Ile | Met | Asn | Arg | Gly | Gly | Ser | Thr | Ile | Ser | Leu |
| 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
| Thr | Tyr | Leu | Ala | Ser | Met | Arg | Ala | Val | Pro | Gly | Tyr | Gly | Gly | Gly | Met |
| 180 | 185 | 190 | |||||||||||||
| Ser | Ser | Ala | Lys | Ala | Ala | Leu | Glu | Ser | Asp | Thr | Lys | Thr | Leu | Ala | Trp |
| 195 | 200 | 205 | |||||||||||||
| Glu | Ala | Gly Arg | Arg | Trp | Gly | Ile | Arg | Val | Asn | Thr | Ile | Ser | Ala | Gly | |
| 210 | 215 | 220 | |||||||||||||
| Pro | Leu | Ala | Ser | Arg | Ala | Gly | Lys | Ala | Ile | Gly | Phe | Ile | Glu | Arg | Met |
| 225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
| Val | Asp | Tyr | Tyr | Gin | Glu | Trp | Ala | Pro | Ile | Pro | Glu | Ala | Met | Asn | Ala |
| 245 | 250 | 255 | |||||||||||||
| Glu | Gin | Val | Gly | Ala | Val | Ala | Ala | Phe | Leu | Ala | Ser | Pro | Leu | Ala | Ser |
| 260 | 265 | 270 | |||||||||||||
| _,Ala | Ile | Thr | Gly | Glu | Thr | Leu | Tyr | Val | Asp | His | Gly | Tkla | Asn | Val | Met |
| 275 | 280 | 285 | |||||||||||||
| Gly | Ile | Gly | Pro | Glu | Met | Phe | Pro | Lys | Asp | Ser- |
buřt
9999 • · · , • ··· ·· · 99 99··
9 9 9 9 9
9 999 · « » • 9 9 Μ 9 9 · ·
·.·.·· · · · 4
9 ·· 9 9 9-9
538
| 290 <210> 598 <211> 580 <212> PRT <213> Chlamydia <400> 598 | 295 pneumoniae | ||||||||||||||
| Met | Pro | Lys | Gin | Ala 5 | Glu | Tyr | Thr | Trp | Gly 10 | Ser | Lys | Lys | Ile | Leu 15 | Asp |
| Asn | Ile | Glu | Cys 20 | Leu | Thr | Glu | Asp | Val 25 | Ala | Glu | Phe | Lys | Asp 30 | Leu | Leu |
| Tyr | Thr | Ala 35 | His | Arg | Ile | Thr | Ser 40 | Ser | Glu | Glu | Glu | Ser 45 | Asp | Asn | Glu |
| Ile | Gin 50 | Pro | Gly | Ala | Ile | Leu 55 | Lys | Gly | Thr | Val | Val 60 | Asp | Ile | Asn | Lys |
| Asp 65 | Phe | Val | Val | Val | Asp 70 | Val | Gly | Leu | Lys | Ser 75 | Glu | Gly | Val | Ile | Pro 80 |
| Met | Ser | Glu | Phe | Ile 85 | Asp | Ser | Ser | Glu | Gly 90 | Leu | Val | Leu | Gly | Ala 95 | Glu |
| Val | Glu | Val | Tyr 100 | Leu | Asp | Gin | Ala | Glu 105 | Asp | Glu | Glu | Gly | Lys 110 | Val | Val |
| Leu | Ser | Arg 115 | Glu | Lys | Ala | Thr | Arg 120 | Gin | Arg | Gin | Trp | Glu 125 | Tyr | Ile | Leu |
| Ala | His 130 | Cys | Glu | Glu | Gly | Ser 135 | Ile | Val | Lys | Gly | Gin 140 | Ile | Thr | Arg | Lys |
| Val 145 | Lys | Gly | Gly | Leu | Ile 150 | Val | Asp | Ile | Gly | Met 155 | Glu | Ala | Phe | Leu | Pro 160 |
| Gly | Ser | Gin | Ile | Asp 165 | Asn | Lys | Lys | Ile | Lys 170 | Asn | Leu | Asp | Asp | Tyr 175 | Val |
| Gly | Lys | Val | Cys 180 | Glu | Phe | Lys | Ile | Leu 185 | Lys | Ile | Asn | Val | Glu 190 | Arg | Arg |
| Asn | Ile | Val 195 | Val | Ser | Arg | Arg | Glu 200 | Leu | Leu | Glu | Ala | Glu 205 | Arg | Ile | Ser |
| Lys | Lys 210 | Ala | Glu | Leu | Ile | Glu 215 | Gin | Ile | Ser | Ile | Gly 220 | Glu | Tyr | Arg | Lys |
| Gly 225 | Val | Val | Lys | Asn | Ile 230 | Thr | Asp | Phe | Gly | Val 235 | Phe | Leu | Asp | Leu | Asp 240 |
| Gly | Ile | Asp | Gly | Leu 245 | Leu | His | Ile | Thr | Asp 250 | Met | Thr | .Trp | Lys | Arg 255 | Ile |
| Arg | His | Pro | Ser 260 | Glu | Met | Val | Glu | Leu 265 | Asn | Gin | Glu | Leu | Glu 270 | Val | Ile |
| Ile | Leu | Ser 275· | Val | Asp | Lys | Glu | Lys 280 | Gly | Arg | Val | Ala | Leu 285 | Gly | Leu | Lys |
?x>
‘539 «99« « 9 • é·· ·* .♦· <*9 9999 • * « · · 9 t 9 999 9 · · • ·««··· 9 9 « e « 999« 9 9*·
9999 999 99 «9 «9 99
| Gin | Lys 290 | Glu | His | Asn | Pro | Trp 295 | Glu | Asp | Ile | Glu | Lys 300 | Lys | Tyr | Pro | Pro |
| Gly 305 | Lys | Arg | Val | Leu | Gly 310 | Lys | Ile | Val | Lys | Leu 315 | Leu | Pro | Tyr | Gly | Ala 320 |
| Phe | Ile | Glu | Ile | Glu 325 | Glu | Gly | Ile | Glu | Gly 330 | Leu | Ile | His | Ile | Ser 335 | Glu |
| Met | Ser | Trp | Val 340 | Lys | Asn | Ile | Val | Asp 345 | Pro | Ser | Glu | Val | Val 350 | Asn | Lys |
| Gly Asp | Glu 355 | Val | Glu | Ala | Ile | Val 360 | Leu | Ser | Ile | Gin | Lys 365 | Asp | Glu | Gly | |
| Lys | Ile 370 | Ser | Leu | Gly | Leu | Lys 375 | Gin | Thr | Glu | Arg | Asn 380 | Pro | Trp | Asp | Asn |
| Ile 385 | Glu | Glu | Lys | Tyr | Pro 390 | Ile | Gly | Leu | His | Val 395 | Asn | Ala | Glu | Ile | Lys 400 |
| Asn | Leu | Thr | Asn | Tyr 405 | Gly | Ala | Phe | Val | Glu 410 | Leu | Glu | Pro | Gly | Ile 415 | Glu |
| Gly | Leu | Ile | His 420 | Ile | Ser | Asp | Met | Ser 425 | Trp | Ile | Lys | Lys | Val 430 | Ser | His |
| Pro | Ser | Glu 4 35 | Leu | Phe | Lys | Lys | Gly Asn 440 | Ser | Val | Glu | Ala 445 | Val | Ile | Leu | |
| Ser | Val 450 | Asp | Lys | Glu | Ser | Lys 455 | Lys | Ile | Thr | Leu | Gly 4 60 | Val | Lys | Gin | Leu |
| Ser 4 65 | Ser | Asn | Pro | Trp | Asn 470 | Glu | Ile | Glu | Ala | Met 475 | Phe | Pro | Ala | Gly | Thr 480 |
| Val | Ile | Ser | Gly | Val 485 | Val | Thr | Lys | Ile | Thr 4 90 | Ala | Phe | Gly | Ala | Phe 4 95 | Val |
| Glu | Leu | Gin | Asn 500 | Gly | Ile | Glu | Gly | Leu 505 | Ile | His | Val | Ser | Glu 510 | Leu | Ser |
| Asp | Lys | Pro 515 | Phe | Ala | Lys | Ile | Glu 520 | Asp | Ile | Ile | Ser | Ile 525 | Gly | Glu | Asn |
| Val | Ser 530 | Ala | Lys | Val | Ile | Lys 535 | Leu | Asp | Pro | Asp | His 540 | Lys | Lys | Val | Ser |
| Leu 545 | Ser | Val | Lys | Glu | Tyr 550 | Leu | Ala | Asp | Asn | Ala 555 | Tyr | Asp | Gin | Asp | Ser 560 |
| Arg | Thr | Glu | Leu | Asp 565 | Phe | Lys | Asp | Ser | Gin 570 | Gly | Pro | Lys | Glu | Arg 575 | Lys |
Lys Lys Gly Lys
580 * <210> 599 <211> 358 /OS-* ·· ·«·· • · • ··* ·· 6» < · · • · ··· • · · · *· ··
540 <212> PRT <213> Chlamydia trachomatis serovar D <400> 599
| Met | Arg | Lys | Thr | Val 5 | Ile | Val | Ala | Met | Ser 10 | Gly | Gly | Val | Asp | Ser 15 | Ser |
| Val | Val | Ala | Tyr 20 | Leu | Leu | Lys | Lys | Gin 25 | Gly | Glu | Tyr | Asn | Val 30 | Val | Gly |
| Leu | Phe | Met 35 | Lys | Asn | Trp | Gly | Glu 40 | Gin | Asp | Glu | Asn | Gly 45 | Glu | Cys | Thr |
| Tkla | Thr 50 | Lys | Asp | Phe | Arg | Asp 55 | Val | Glu | Arg | Ile | Ala 60 | Glu | Gin | Leu | Ser |
| Ile 65 | Pro | Tyr | Tyr | Thr | Val 70 | Ser | Phe | Ser | Lys | Glu 75 | Tyr | Lys | Glu | Arg | Val 80 |
| Phe | Ser | Arg | Phe | Leu ’ 85 | Arg | Glu | Tyr | Ala | Asn 90 | Gly | Tyr | Thr | Pro | Asn 95 | Pro |
| Asp | Val | Leu | Cys 100 | Asn | Arg | Glu | Ile | Lys 105 | Phe | Asp | Leu | Leu | Gin 110 | Lys | Lys |
| Val | Arg | Glu 115 | Leu | Lys | Gly | Asp | Phe 120 | Leu | Ala | Thr | Gly | His 125 | Tyr | Cys | Arg |
| Gly | Gly 130 | Ala | Asp | Gly | Thr | Gly 135 | Leu | Ser | Arg | Gly | Ile 140 | Asp | Pro | Asn | Lys |
| Asp 145 | Gin | Ser | Tyr | Phe | Leu 150 | Cys | Gly | Thr | Pro | Lys 155 | Asp | Ala | Leu | Ser | Asn 160 |
| Val | Leu. | Phe | Pro | Leu 165 | Gly | Gly | Met | Tyr | Lys 170 | Thr | Glu | Val | Arg | Arg 175 | Ile |
| Ala | Gin | Glu | Ala 180 | Gly | Leu | Ala | Thr | Ala 185 | Thr | Lys | Lys | Asp | Ser 190 | Thr | Gly |
| Ile | Cys | Phe 195 | Ile | Gly | Lys | Arg | Pro 200 | Phe | Lys | Ser | Phe | Leu 205 | Glu | Gin | Phe |
| Val | Ala 210 | Asp | Ser | Pro | Gly | Asp 215 | Ile | Ile | Asp | Phe | Asp 220 | Thr | Gin | Gin | Val |
| Val 225 | Gly | Arg | His | Glu | Gly 230 | Ala | His | Tyr | Tyr | Thr 235 | Ile | Gly | Gin | Arg | Arg 240 |
| Gly | Leu | Asn | Ile | Gly 245 | Gly | Met | Glu | Lys | Pro 250 | Cys | Tyr | Val | Leu | Ser 255 | Lys |
| Asn | Met | Glu | Lys 260 | Asn | Ile | Val | Tyr | Ile 265 | Val | Arg | Gly | Glu | Asp 270 | His | Pro |
| Leu | Leu | Tyr 275 | Arg | Gin | Glu | Leu | Leu 280 | Ala | Lys | Glu | Leu | Asn 285 | Trp | Phe | Val |
| Pro | Leu 290 | Gin | Glu | Pro | Met | Ile 295 | Cys | Ser | Ala | Lys | Val 300 | Arg | Tyr | Arg | Ser |
• · • · • ···
541
| Pro 305 | Asp | Glu | Lys | Cys | Ser 310 | Val | Tyr | Pro | Leu | Glu 315 | Asp | Gly | Thr | Val | Lys 320 |
| Val | Ile | Phe | Asp | Val 325 | Pro | Val | Lys | Ala | Val 330 | Thr | Pro | Gly | Gin | Thr 335 | Val |
| Ala | Phe | Tyr | Gin 34 0 | Gly | Asp | Ile | Cys | Leu 345 | Gly | Gly | Gly | Val | Ile 350 | Glu | Val |
| Pro | Met | Ile | His | Gin | Leu |
355
JUDr. Petr Kalenský advokát
EČNÁ ADVOKÁTNÍ KANCELÁŘ ZELENÝ ŠVORČÍK KALENSKÝ A PARTNEŘI
120 00 Praha 2, Hálkova 2
Claims (39)
1. Prostředek pro vyvolání imunitní reakce vyznačuj ící setím, že obsahuje Chlamydiový Čapl protein nebo jeho imunogenní fragment a imunostimulační činidlo.
2. Prostředek podle nároku lvyznačující se tím, že imunogenní fragment obsahuje alespoň CTL epitop skládající se v podstatě z aminokyselin 139-147 Čapl proteinu.
3. Prostředek podle nároku lvyznačující se tím, že Čapl protein obsahuje aminokyselinovou sekvenci uvedenou v SEQ ID NO: 121 nebo sekvenci mající alespoň přibližně 90% identitu se sekvencí uvedenou v SEQ ID NO: 121.
4. Prostředek podle nároku lvyznačující se tím, že Čapl protein nebo jeho imunogenní fragment obsahuje sekvenci uvedenou v kterékoliv ze SEQ ID NO: 121, 123, 125, 127, 129, 131,
133, 135, 137 a 139. \
5. Prostředek podle nároku lvyznačující se tím, že imunogenní fragment obsahuje aminokyseliny 107-176 Čapl proteinu.
6. Prostředek podle nároku Svyznačující setím, že imunogenní fragment obsahuje aminokyseliny 107-176 Čapl proteinu a má aminokyselinovou sekvenci uvedenou v jakékoliv ze SEQ ID NO:
121, 123, 125, 127, 129, 131, 133, 135, 137 a 139.
7. Prostředek podle nároku lvyznačující se tím, že imunogenní fragment je imunologicky reaktivní s CD8+ T-lymfocyty zvířete infikovaného Chlamydiemi.
8. Způsob pro stimulování T-lymfocytární reakce specifické pro
543 • · · · • ·· • · ·· ·· ···· • · · · · · • ···· · · · • ·· · · · · · ·· · · · 9
Chlamydie vyznačující se tím, že zahrnuje podání účinného množství prostředku podle nároku 1 živočichovi.
9. Způsob pro inhibici Chlamydiové infekce u živočicha vyznačující se tím, že zahrnuje podání účinného množství prostředku podle nároku 1 živočichovi.
10. Prostředek pro vyvolání imunitní reakce vyznačuj ící setím, že obsahuje izolovaný polynukleotid kódující Chlamydiový Čapl protein nebo jeho imunogenní fragment a imunostimulační činidlo.
11. Prostředek podle nároku 10 vyznačující se tím, že imunogenní fragment obsahuje alespoň sekvenci CTL epitopů skládající se v podstatě z aminokyselin 139-147 Čapl proteinu.
12. Prostředek podle nároku 10 vyznačující se tím, že Čapl protein obsahuje aminokyselinovou sekvenci uvedenou v SEQ ID NO: 121 nebo sekvenci mající alespoň přibližně 90% identitu se sekvencí uvedenou v SEQ ID NO: 121.
13. Prostředek podle nároku 10 vyznačující se tím, že Čapl protein nebo jeho imunogenní fragment obsahuje sekvenci uvedenou v kterékoliv ze SEQ ID NO: 121, 123, 125, 127, 129, 131, 133, 135, 137 a 139.
14. Prostředek podle nároku 10 vyznačující se tím, že imunogenní fragment obsahuje aminokyseliny 107-176 Čapl proteinu.
15. Prostředek podle nároku 14 vyznačuj ící se tím, že imunogenní fragment obsahuje aminokyseliny 107-176 Čapl proteinu a má aminokyselinovou sekvenci uvedenou v jakékoliv ze «· ···· ·· ·· ·· ···· •·· · · · · · · β · · ·· · ···· · V · . τ · ···· ···· ······· ·· ·· ·· ··
544
SEQ ID NO: 121, 123, 125, 127, 129, 131, 133, 135, 137 a 139.
16. Prostředek podle nároku 10 vyznačující se tím, že imunogenní fragment je imunologicky reaktivní s CD8+ T-lymfocyty zvířete infikovaného Chlamydiemi.
17. Prostředek podle nároku 10 vyznačující se tím, že izolovaný polynukleotid je operativně navázán do virového transportního vektoru.
18. Prostředek podle nároku 17 vyznačuj ící se tím, že virový transportní vektor je vektor z viru vakcinie.
19.. Způsob pro stimulování T-lymfocytární reakce specifické pro Chlamydie vyznačující se tím, že zahrnuje podání účinného množství prostředku podle nároku 10 živočichovi.
20. Způsob pro inhibici Chlamydiové infekce u živočicha vyznačující se tím, že zahrnuje podání účinného množství prostředku podle nároku 10 živočichovi.
21. Způsob pro inhibici Chlamydiové infekce u živočicha vyznačující se t i m, že zahrnuje podání účinného množství prostředku podle nároku 18 živočichovi.
22. Izolovaný polynukleotid vyznačující se tím, že obsahuje sekvenci vybranou ze skupiny zahrnující:
(a) sekvence uvedené v SEQ ID NO: 358-361;
(b) sekvence komplementární k sekvencím uvedeným v SEQ ID NO: 358-361;
(c) sekvence skládající se z alespoň 20 kontinuálních zbytků sekvence uvedené v SEQ ID NO: 358-361;
(d) sekvence, které hybridizují na sekvence uvedené v SEQ ID NO • · · · • · • · ··
545
358-361 za středně přísných podmínek;
(e) sekvence mající alespoň 95% identitu se sekvencemi SEQ ID NO: 358-361;
(f) sekvence mající alespoň 99% identitu se sekvencemi SEQ ID NO: 358-361; a (g) degenerované varianty sekvencí uvedených v SEQ ID NO: 358-361.
23. Izolovaný polypeptid vyznačující se tím, že obsahuje aminokyselinovou sekvenci vybranou ze skupiny zahrnuj ící:
(a) sekvence kódované polynukleotidem podle nároku 22;
(b) sekvence mající alespoň 95% identitu se sekvencemi kódovanými polynukelotidem podle nároku 22; a (c) sekvence mající alespoň 99% identitu se sekvencemi kódovanými polynukelotidem podle nároku 22.
24. Izolovaný polypeptid vyznačující se tím, že obsahuje alespoň imunogenní fragment polypeptidové sekvence vybrané ze skupiny zahrnuj ící:
(a) polypeptidové sekvence uvedené v SEQ ID NO: 362-365;
(b) polypeptidové sekvence mající alespoň 95% identitu se sekvencemi uvedenými v SEQ ID NO: 362-365; a (c) polypeptidové sekvence mající alespoň 99% identitu se sekvencemi uvedenými v SEQ ID NO: 362-365.
25. Expresní vektor vyznačující se tím, že obsahuje polynukleotid podle nároku 22 operativně navázaný na sekvence řídící expresi.
26. Hostitelská buňka vyznačující se tím, že je transformovaná nebo transfektovaná expresním vektorem podle nároku 25.
• ·
546
27. Izolovaná protilátka nebo její vazebný fragment pro antigen vyznačující se tím, že se specificky váže na polypeptid podle jakéhokoliv z nároků 23 a 24.
28. Způsob pro detekci přítomností Chlamydie u pacienta vyznačující se tím, že zahrnuje kroky:
(a) získání biologického vzorku od pacienta;
(b) kontaktování biologického vzorku s vazebným činidlem, které se váže na polypeptid podle jakéhokoliv z nároků 23 a 24;
(c) detekování množství polypeptidu ve vzorku, které se váže na vazebné činidlo;
(d) srovnání množství polypeptidu s předem určenou hraniční hodnotou a z toho určení přítomnosti Chlamydie u pacienta.
29. Fúzní protein vyznačující se tím, že obsahuje alespoň jeden polypeptid podle nároků 23 nebo 24.
30. Oligonukleotid vyznačující se tím, že hybridizuje na sekvence uvedené v SEQ ID NO: 358-361 za přísných hybridizačních podmínek.
31. Způsob pro stimulaci a/nebo expanzi T-lymfocytů specifických pro Chlaymdiový protein vyznačující se tím, že zahrnuje kontaktování T-lymfocytů s alespoň jednou sloučeninou vybranou ze skupiny zahrnuj ící:
(a) polypeptid podle nároků 23 nebo 24;
(b) polynukleotid podle nároku 22; a (c) buňku prezentující antigen exprimující polynukleotid podle nároku 22;
za podmínek a po dobu dostatečnou pro umožnění stimulace a/nebo expanze T-lymfocytů.
·· ···· ·* ·· ·· ···· • · · ··· * .· · • · · · · · · · · · · · • ······«·· ·
CA ή · · ···· ···.
/ ······· ·» «> ·· ··
32. Izolovaná populace T-lymfocytů vyznačující se tím, že obsahuje T-lymfocyty připravené způsobem podle nároku 31.
33. Prostředek vyznačující se tím, že obsahuje první složku vybranou ze skupiny zahrnující fyziologicky přijatelné nosiče a imunostimulační činidla a druhou složku vybranou ze skupiny zahrnující:
(a) polypeptid podle nároků 23 nebo 24;
(b) polynukleotid podle nároku 22;
(c) protilátku podle nároku 27;
(d) fúzní protein podle nároku 29;
(e) populaci T-lymfocytů podle nároku 32; a (f) buňku prezentující antigen, která exprimuje polypeptid podle nároků 23 nebo 24.
34. Způsob pro stimulaci imunitní reakce u pacienta vyznačující se tím, že pacientovi je podán prostředek vynraný ze skupiny zahrnující:
(a) prostředek podle nároku 33;
(b) polynukleotidovou sekvenci podle jakékoliv ze SEQ ID NO: 407-430, 525-559 a 582-598; a (c) polypeptidové sekvence podle jakékoliv ze SEQ ID NO: 431-454 a 560=-581.
35. Způsob pro léčbu Chlamydiové infekce u pacienta vyznačující se tím, že pacientovi je podán prostředek vybraný ze skupiny zahrnuj ící:
(a) prostředek podle nároku 33;
(b) polynukleotidovou sekvenci podle jakékoliv ze SEQ ID NO: 407-430, 525-559 a 582-598; a (c) polypeptidové sekvence podle jakékoliv ze SEQ ID NO: 431-454 a 560-581.
• · ··
548
36. Způsob pro určení přítomnosti Chlamydie u pacienta vyznačující se tím, že zahrnuje kroky:
(a) získání biologického vzorku od pacienta;
(b) kontaktování biologického vzorku s oligonukleotidem podle nároku 30;
(c) detekování množství polynukleotidu ve vzorku, které hybridizuje na oligonukleotid; a (d) srovnání množství polynukleotidu, který hybridizuje na oligonukleotid, s předem určenou hraniční hodnotou a z toho určení přítomnosti Chlamydie u pacienta.
37. Diagnostický kit vyznačující se tím, že obsahuje alespoň jeden oligonukleotid podle nároku 30.
38. Diagnostický kit vyznačující setím, že obsahuje alespoň jednu protilátku podle nároku 27 a detekční činidlo, kde detekční činidlo obsahuje reportérovou skupinu.
39. Způsob pro léčbu Chlamydiové infekce u pacienta vyznačující se tím, že zahrnuje kroky:
(a) inkubování CD4+ a/nebo CD8+ T-lymfocytů izolovaných od pacienta s alespoň jednou složkou vybranou ze skupiny zahrnující:
(i) polypeptid podle jakéhokoliv z nároků 23 a 24;
(ii) polypeptidovou sekvenci podle jakékoliv ze SEQ ID NO: 431-454 a 560-581;
(iii) polynukleotid podle nároku 22;
(iv) polynukleotidovou sekvenci podle jakékoliv ze SEQ ID NO: 407-430, 525-559 a 582-598;
(v) buňku prezentující antigen, která exprimuje. polypeptidovou sekvenci uvedenou v jakémkoliv z nároků 23 a 24;
(vi) buňku prezentující antigen, která exprimuje • ··· ··♦ · · ·
549 polypeptidovou sekvenci podle jakékoliv ze SEQ ID NO: 431-454 a 560-581;
(b) podání účinného množství proliferovaných T-lymfocytů pacientovi.
Applications Claiming Priority (2)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| US09/620,412 US6448234B1 (en) | 1998-12-08 | 2000-07-20 | Compounds and methods for treatment and diagnosis of chlamydial infection |
| US09/841,132 US20020061848A1 (en) | 2000-07-20 | 2001-04-23 | Compounds and methods for treatment and diagnosis of chlamydial infection |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| CZ2003480A3 true CZ2003480A3 (cs) | 2003-09-17 |
Family
ID=27088713
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| CZ2003480A CZ2003480A3 (cs) | 2000-07-20 | 2001-07-20 | Sloučeniny a způsoby léčení a diagnózy chlamydiální infekce |
Country Status (25)
| Country | Link |
|---|---|
| US (9) | US20020061848A1 (cs) |
| EP (1) | EP1307564B1 (cs) |
| JP (1) | JP2004513622A (cs) |
| KR (1) | KR20030016423A (cs) |
| CN (1) | CN100467600C (cs) |
| AT (1) | ATE373092T1 (cs) |
| AU (2) | AU2001280702B8 (cs) |
| BR (1) | BR0112602A (cs) |
| CA (1) | CA2418282A1 (cs) |
| CY (1) | CY1107796T1 (cs) |
| CZ (1) | CZ2003480A3 (cs) |
| DE (1) | DE60130468T2 (cs) |
| DK (1) | DK1307564T3 (cs) |
| ES (1) | ES2294018T3 (cs) |
| HK (1) | HK1067381A1 (cs) |
| HU (1) | HUP0400477A3 (cs) |
| IL (2) | IL153904A0 (cs) |
| MX (1) | MXPA03000564A (cs) |
| NO (1) | NO20030252L (cs) |
| NZ (3) | NZ523628A (cs) |
| PL (1) | PL209107B1 (cs) |
| PT (1) | PT1307564E (cs) |
| RU (2) | RU2003104976A (cs) |
| WO (1) | WO2002008267A2 (cs) |
| ZA (1) | ZA200300719B (cs) |
Families Citing this family (49)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US5629167A (en) * | 1994-04-19 | 1997-05-13 | Biocine S.P.A. | Detection of antibodies against Chlamydia trachomatis pgp3 antigen in patient sera by enzyme-linked immunosorbent assay |
| US7459524B1 (en) | 1997-10-02 | 2008-12-02 | Emergent Product Development Gaithersburg Inc. | Chlamydia protein, sequence and uses thereof |
| WO2000011181A1 (en) | 1998-08-20 | 2000-03-02 | Connaught Laboratories Limited | NUCLEIC ACID MOLECULES ENCODING INCLUSION MEMBRANE PROTEIN C OF $i(CHLAMYDIA) |
| EP1105489A1 (en) | 1998-08-20 | 2001-06-13 | Aventis Pasteur Limited | Nucleic acid molecules encoding pomp91a protein of chlamydia |
| US6686339B1 (en) | 1998-08-20 | 2004-02-03 | Aventis Pasteur Limited | Nucleic acid molecules encoding inclusion membrane protein C of Chlamydia |
| US6649370B1 (en) | 1998-10-28 | 2003-11-18 | Aventis Pasteur Limited | Chlamydia antigens and corresponding DNA fragments and uses thereof |
| US6607730B1 (en) | 1998-11-02 | 2003-08-19 | Aventis Pasteur Limited/Aventis Pasteur Limitee | Chlamydia antigens and corresponding DNA fragments and uses thereof |
| EP1135501A1 (en) | 1998-12-01 | 2001-09-26 | Aventis Pasteur Limited | Chlamydia antigens and corresponding dna fragments and uses thereof |
| US6555115B1 (en) * | 1998-12-08 | 2003-04-29 | Corixa Corporation | Compounds and methods for treatment and diagnosis of chlamydial infection |
| CN100365120C (zh) | 1998-12-08 | 2008-01-30 | 科里克萨有限公司 | 用于治疗及诊断衣原体感染的化合物和方法 |
| US20020061848A1 (en) | 2000-07-20 | 2002-05-23 | Ajay Bhatia | Compounds and methods for treatment and diagnosis of chlamydial infection |
| US20080213264A1 (en) * | 1998-12-08 | 2008-09-04 | Corixa Corporation | Compounds and methods for treatment and diagnosis of chlamydial infection |
| GB9828000D0 (en) | 1998-12-18 | 1999-02-10 | Chiron Spa | Antigens |
| US7297341B1 (en) | 1998-12-23 | 2007-11-20 | Sanofi Pasteur Limited | Chlamydia antigens and corresponding DNA fragments and uses thereof |
| US6808713B1 (en) | 1998-12-28 | 2004-10-26 | Aventis Pasteur Limited | Chlamydia antigens and corresponding DNA fragments and uses thereof |
| DE69938059T2 (de) | 1998-12-28 | 2009-01-08 | Sanofi Pasteur Ltd., Toronto | Chlamydia antigene, entsprechende dna-fragmente und ihre verwendungen |
| GB9902555D0 (en) | 1999-02-05 | 1999-03-24 | Neutec Pharma Plc | Medicament |
| MXPA01009256A (es) | 1999-03-12 | 2003-07-14 | Aventis Pasteur | Antigenos de chlamydia y fragmentos de acido desoxirribonucleico correspondientes y usos de los mismos. |
| ATE375391T1 (de) | 1999-05-03 | 2007-10-15 | Sanofi Pasteur Ltd | Chlamydia-antigene und entsprechende dna- fragmente und deren verwendungen |
| WO2001021804A1 (en) | 1999-09-20 | 2001-03-29 | Aventis Pasteur Limited | Chlamydia antigens and corresponding dna fragments and uses thereof |
| US6632663B1 (en) | 1999-09-22 | 2003-10-14 | Aventis Pasteur Limited | DNA immunization against chlamydia infection |
| WO2001046224A2 (en) | 1999-12-22 | 2001-06-28 | Aventis Pasteur Limited | Chlamydia antigens and corresponding dna fragments and uses thereof |
| EP1278855B1 (en) | 2000-04-21 | 2008-03-12 | Corixa Corporation | Compounds and methods for treatment and diagnosis of chlamydial infection |
| US6919187B2 (en) * | 2000-04-21 | 2005-07-19 | Corixa Corporation | Compounds and methods for treatment and diagnosis of chlamydial infection |
| AU2001258105A1 (en) | 2000-05-08 | 2001-11-20 | Aventis Pasteur Limited | Chlamydia antigens and corresponding dna fragments and uses thereof |
| EP1297005B1 (en) | 2000-07-03 | 2009-08-26 | Novartis Vaccines and Diagnostics S.r.l. | Immunisation against chlamydia pneumoniae |
| US7731980B2 (en) * | 2000-10-02 | 2010-06-08 | Emergent Product Development Gaithersburg Inc. | Chlamydia PMP proteins, gene sequences and uses thereof |
| US7537772B1 (en) | 2000-10-02 | 2009-05-26 | Emergent Product Development Gaithersburg Inc. | Chlamydia protein, gene sequence and the uses thereof |
| US20030059896A1 (en) * | 2000-12-21 | 2003-03-27 | Shire Biochem Inc. | Novel chlamydia antigens and corresponding DNA fragments |
| GB2370838A (en) * | 2001-01-06 | 2002-07-10 | Benedikt Timmerman | Immunogenic complex |
| KR100982204B1 (ko) | 2001-12-12 | 2010-09-14 | 노바티스 백신즈 앤드 다이아그노스틱스 에스.알.엘. | 클라미디아 트라코마티스에 대한 면역화 |
| GB0203403D0 (en) | 2002-02-13 | 2002-04-03 | Chiron Spa | Chlamydia cytotoxic-T cell epitopes |
| MXPA05013260A (es) * | 2003-06-26 | 2006-03-09 | Chiron Corp | Composiciones inmunogenicas para chlamydia trachomatis. |
| US20080019994A1 (en) * | 2003-11-20 | 2008-01-24 | Robert Brunham | Immunization Against Chlamydia Infection |
| US8541007B2 (en) | 2005-03-31 | 2013-09-24 | Glaxosmithkline Biologicals S.A. | Vaccines against chlamydial infection |
| MX2007012108A (es) | 2005-03-31 | 2007-12-05 | Glaxosmithkline Biolog Sa | Vacunas contra infeccion por chlamydia. |
| AU2006259858A1 (en) * | 2005-05-12 | 2006-12-28 | Novartis Vaccines And Diagnostics S.R.L. | Immunogenic compositions for Chlamydia trachomatis |
| WO2007030879A1 (en) * | 2005-09-13 | 2007-03-22 | Diatech Pty Ltd | Diagnostic markers and uses therefor |
| WO2007082105A2 (en) * | 2006-01-16 | 2007-07-19 | Government Of The United States Of America, As Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Services | Chlamydia vaccine |
| EP1970708A1 (de) * | 2007-03-07 | 2008-09-17 | Mikrogen Molekularbiologische Entwicklungs-GmbH | Biochip und Verfahren zum selektiven Nachweis von Chlamydia trachomatis-Infektionen |
| US20100310593A1 (en) * | 2007-06-14 | 2010-12-09 | Emergent Product Development Gaithersburg Inc. | Vaccines Against Chlamydia Infection |
| CA2695421A1 (en) | 2007-08-03 | 2009-02-12 | President And Fellows Of Harvard College | Chlamydia antigens |
| CA2744739A1 (en) * | 2007-12-03 | 2009-06-11 | President And Fellows Of Harvard College | Chlamydia antigens |
| ES2733084T3 (es) | 2009-03-06 | 2019-11-27 | Glaxosmithkline Biologicals Sa | Antígenos de Chlamydia |
| US9458513B2 (en) | 2010-03-23 | 2016-10-04 | Wako Pure Chemical Industries, Ltd. | Primer and probe for detecting chlamydia trachomatis, and method for detecting chlamydia trachomatis using same |
| US20120135025A1 (en) * | 2010-10-20 | 2012-05-31 | Genocea Biosciences, Inc. | Chlamydia antigens and uses thereof |
| US20130095487A1 (en) * | 2011-10-18 | 2013-04-18 | University Of South Florida | Interferon-Gamma Response as a Diagnostic Test for Persistent Chlamydial Infections |
| CN109535259A (zh) * | 2012-12-05 | 2019-03-29 | 生控基因疫苗股份有限公司 | 用作诱发抗原特异性t细胞反应的免疫原性增强剂的融合蛋白 |
| CN113801191B (zh) * | 2021-08-18 | 2022-05-17 | 南京大学 | 一种检测衣原体的多肽探针及其应用 |
Family Cites Families (85)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US4118469A (en) * | 1976-04-27 | 1978-10-03 | Research Corporation | Antigen for trachoma lymphogranuloma venereum (LGV) and non-gonococcal urethritis (NGU) |
| US4497899A (en) * | 1982-04-12 | 1985-02-05 | Abbott Laboratories | Immunoassay for Chlamydia trachomatis antigens |
| US4497900A (en) | 1982-04-12 | 1985-02-05 | Abbott Laboratories | Immunoassay for Neisseria gonorrhoeae antigens |
| US4497863A (en) * | 1984-03-07 | 1985-02-05 | Milliken Research Corporation | Laminated weft insertion fabric |
| ATE143414T1 (de) | 1985-01-14 | 1996-10-15 | Chiron Corp | Hauptprotein der aussenmembran von chlamydia |
| US5785973A (en) * | 1988-02-01 | 1998-07-28 | Praxis Biologics, Inc. | Synthetic peptides representing a T-cell epitope as a carrier molecule for conjugate vaccines |
| EP0348725A3 (en) | 1988-06-29 | 1990-10-24 | Miles Inc. | Species-specific epitode of chlamydia trachomatis and antibodies that recognize the same |
| ATE123780T1 (de) * | 1989-02-17 | 1995-06-15 | Chiron Mimotopes Pty Ltd | Verfahren zur verwendung und herstellung von peptiden. |
| US5869608A (en) | 1989-03-17 | 1999-02-09 | The United States Of America As Represented By The Department Of Health And Human Services | Nucleotide and amino acid sequences of the four variable domains of the major outer membrane proteins of Chlamydia trachomatis |
| US5166053A (en) * | 1990-02-23 | 1992-11-24 | Miles Inc. | Specimen adequacy control for chlamydia assays |
| JP3018553B2 (ja) * | 1990-05-08 | 2000-03-13 | 日立化成工業株式会社 | クラミジア・トラコマティス抗体測定方法及びクラミジア・トラコマティス感染症診断用製剤 |
| US5725863A (en) | 1991-09-06 | 1998-03-10 | The United States Of America As Represented By The Secretary Of Agriculture | Polypeptides useful in prevention of chlamydia infection |
| PT761231E (pt) * | 1992-06-25 | 2000-06-30 | Smithkline Beecham Biolog | Composicao de vacina contendo adjuvantes |
| AU669000B2 (en) | 1992-09-18 | 1996-05-23 | Government Of The United States Of America, As Represented By The Secretary Of The Department Of Health And Human Services, The | Synthetic peptide vaccine for chlamydia trachomatis |
| US5549978A (en) * | 1992-10-30 | 1996-08-27 | Kabushiki Kaisha Toshiba | Magnetoresistance effect element |
| US5629167A (en) * | 1994-04-19 | 1997-05-13 | Biocine S.P.A. | Detection of antibodies against Chlamydia trachomatis pgp3 antigen in patient sera by enzyme-linked immunosorbent assay |
| EP2045261A1 (en) | 1994-09-20 | 2009-04-08 | Hitachi Chemical Co., Ltd. | Chlamydia pneumoniae antigenic polypeptides |
| GB9626864D0 (en) | 1996-12-24 | 1997-02-12 | Smithkline Beecham Biolog | Vaccine |
| GB9506863D0 (en) | 1995-04-03 | 1995-05-24 | Smithkline Beecham Biolog | Vaccines |
| GB9516293D0 (en) | 1995-08-09 | 1995-10-11 | Immunova Ltee | Novel peptides and their use as vaccines |
| CN1223589A (zh) * | 1996-05-06 | 1999-07-21 | 美国拜尔公司 | 包含鹦鹉热衣原体的猫疫苗及其制备方法 |
| DE69734882T2 (de) | 1996-07-12 | 2006-08-17 | University Of Manitoba, Winnipeg | Dna immunisierung gegen chlamydia infektion |
| US6464979B1 (en) | 1996-09-12 | 2002-10-15 | Aventis Pasteur Limited | Chlamydial vaccines and methods of preparation thereof |
| US7459524B1 (en) * | 1997-10-02 | 2008-12-02 | Emergent Product Development Gaithersburg Inc. | Chlamydia protein, sequence and uses thereof |
| JP4249279B2 (ja) | 1997-10-22 | 2009-04-02 | デンカ生研株式会社 | クラミジア・トラコマティス主要外膜蛋白質及びその製造方法、並びにクラミジア・トラコマティスの抗体測定方法及び抗体測定試薬 |
| DE69841894D1 (de) * | 1997-11-21 | 2010-10-21 | Merck Serono Biodevelopment Sa | Äusseres Membranpolypeptid von Chlamydia pneumoniae sowie Fragmente davon und deren Verwendung, insbesondere zur Diagnose, Prävention und Behandlung einer Infektion |
| KR20010032336A (ko) | 1997-11-21 | 2001-04-16 | 브랑디 빠스깔 | 클라미디아 뉴모니아 게놈 서열과 폴리펩티드, 이의 단편및 이의 용도, 특히, 감염의 진단, 예방 및 치료 용도 |
| US7041490B1 (en) * | 1997-11-28 | 2006-05-09 | Serono Genetics Institute, S.A. | Chlamydia trachomatis polynucleotides and vectors, recombinant host cells, DNA chips or kits containing the same |
| JP2002517179A (ja) * | 1997-11-28 | 2002-06-18 | ジェンセット | Ｃｈｌａｍｙｄｉａｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓゲノム配列およびポリペプチド、それらのフラグメント、ならびに特に感染症の診断、予防および治療のためのそれらの使用 |
| AU753995B2 (en) | 1998-04-07 | 2002-10-31 | Corixa Corporation | Fusion proteins of mycobacterium tuberculosis antigens and their uses |
| DE69935606T9 (de) * | 1998-10-16 | 2021-03-11 | Glaxosmithkline Biologicals S.A. | Adjuvanzsysteme und impfstoffe |
| US6607730B1 (en) | 1998-11-02 | 2003-08-19 | Aventis Pasteur Limited/Aventis Pasteur Limitee | Chlamydia antigens and corresponding DNA fragments and uses thereof |
| WO2000027994A2 (en) | 1998-11-12 | 2000-05-18 | The Regents Of The University Of California | Chlamydia pneumoniae genome sequence |
| US6166177A (en) * | 1998-12-08 | 2000-12-26 | Corixa Corporation | Compounds and methods for the treatment and diagnosis of chlamydial infection |
| US6565856B1 (en) * | 1998-12-08 | 2003-05-20 | Corixa Corporation | Compounds and methods for treatment and diagnosis of chlamydial infection |
| CN100365120C (zh) * | 1998-12-08 | 2008-01-30 | 科里克萨有限公司 | 用于治疗及诊断衣原体感染的化合物和方法 |
| US20020061848A1 (en) | 2000-07-20 | 2002-05-23 | Ajay Bhatia | Compounds and methods for treatment and diagnosis of chlamydial infection |
| US6448234B1 (en) * | 1998-12-08 | 2002-09-10 | Corixa Corporation | Compounds and methods for treatment and diagnosis of chlamydial infection |
| US6447779B1 (en) * | 1998-12-08 | 2002-09-10 | Corixa Corporation | Compounds for the diagnosis of Chlamydial infection |
| US6555115B1 (en) * | 1998-12-08 | 2003-04-29 | Corixa Corporation | Compounds and methods for treatment and diagnosis of chlamydial infection |
| US6432916B1 (en) * | 1998-12-08 | 2002-08-13 | Corixa Corporation | Compounds and methods for treatment and diagnosis of chlamydial infection |
| US20080213264A1 (en) * | 1998-12-08 | 2008-09-04 | Corixa Corporation | Compounds and methods for treatment and diagnosis of chlamydial infection |
| GB9828000D0 (en) | 1998-12-18 | 1999-02-10 | Chiron Spa | Antigens |
| GB9902555D0 (en) | 1999-02-05 | 1999-03-24 | Neutec Pharma Plc | Medicament |
| MXPA01009256A (es) | 1999-03-12 | 2003-07-14 | Aventis Pasteur | Antigenos de chlamydia y fragmentos de acido desoxirribonucleico correspondientes y usos de los mismos. |
| ATE375391T1 (de) | 1999-05-03 | 2007-10-15 | Sanofi Pasteur Ltd | Chlamydia-antigene und entsprechende dna- fragmente und deren verwendungen |
| US6811783B1 (en) * | 1999-09-07 | 2004-11-02 | Aventis Pasteur Limited | Immunogenic compositions for protection against chlamydial infection |
| WO2001021804A1 (en) | 1999-09-20 | 2001-03-29 | Aventis Pasteur Limited | Chlamydia antigens and corresponding dna fragments and uses thereof |
| US6632663B1 (en) | 1999-09-22 | 2003-10-14 | Aventis Pasteur Limited | DNA immunization against chlamydia infection |
| CA2906516C (en) | 1999-09-28 | 2017-03-07 | Geneohm Sciences Canada Inc. | Nucleic acids and methods for the detection of streptococcus |
| AU4503201A (en) * | 1999-10-14 | 2001-06-12 | University Of Utah Research Foundation | Resonant optical cavities for high-sensitivity, high-throughput biological sensors and methods |
| AU1481001A (en) | 1999-11-19 | 2001-05-30 | Michigan State University | Recombinant chlamydia vaccine |
| WO2001046224A2 (en) | 1999-12-22 | 2001-06-28 | Aventis Pasteur Limited | Chlamydia antigens and corresponding dna fragments and uses thereof |
| US20010048927A1 (en) * | 2000-02-01 | 2001-12-06 | Richard Stephens | Porin B (PorB) as a therapeutic target for prevention and treatment of infection by chlamydia |
| US6919187B2 (en) | 2000-04-21 | 2005-07-19 | Corixa Corporation | Compounds and methods for treatment and diagnosis of chlamydial infection |
| EP1278855B1 (en) * | 2000-04-21 | 2008-03-12 | Corixa Corporation | Compounds and methods for treatment and diagnosis of chlamydial infection |
| US20020146776A1 (en) * | 2000-04-21 | 2002-10-10 | Corixa Corporation | Compounds and methods for treatment and diagnosis of chlamydial infection |
| AU2001258105A1 (en) | 2000-05-08 | 2001-11-20 | Aventis Pasteur Limited | Chlamydia antigens and corresponding dna fragments and uses thereof |
| US6589361B2 (en) * | 2000-06-16 | 2003-07-08 | Applied Materials Inc. | Configurable single substrate wet-dry integrated cluster cleaner |
| EP1297005B1 (en) | 2000-07-03 | 2009-08-26 | Novartis Vaccines and Diagnostics S.r.l. | Immunisation against chlamydia pneumoniae |
| EP1301726A1 (de) * | 2000-07-20 | 2003-04-16 | ZF FRIEDRICHSHAFEN Aktiengesellschaft | Elektromagnetisch betätigbare, schleifringlose einflächen-reibungskupplung |
| US7731980B2 (en) * | 2000-10-02 | 2010-06-08 | Emergent Product Development Gaithersburg Inc. | Chlamydia PMP proteins, gene sequences and uses thereof |
| US7537772B1 (en) * | 2000-10-02 | 2009-05-26 | Emergent Product Development Gaithersburg Inc. | Chlamydia protein, gene sequence and the uses thereof |
| GB0103169D0 (en) * | 2001-02-08 | 2001-03-28 | Smithkline Beecham Biolog | Vaccine composition |
| WO2002077183A2 (en) * | 2001-03-21 | 2002-10-03 | Elitra Pharmaceuticals, Inc. | Identification of essential genes in microorganisms |
| WO2002079244A2 (en) | 2001-03-30 | 2002-10-10 | University Of Manitoba | Chlamydial protease-like activity factor responsible for degradation of host transcription factor |
| US20030199438A1 (en) * | 2001-04-09 | 2003-10-23 | Shaw Allan Christian | Method for identification of proteins from intracellular bacteria |
| US20040029129A1 (en) * | 2001-10-25 | 2004-02-12 | Liangsu Wang | Identification of essential genes in microorganisms |
| KR100982204B1 (ko) * | 2001-12-12 | 2010-09-14 | 노바티스 백신즈 앤드 다이아그노스틱스 에스.알.엘. | 클라미디아 트라코마티스에 대한 면역화 |
| US7105171B2 (en) * | 2002-03-07 | 2006-09-12 | The Regents Of The University Of California | Porin B (PorB) as a therapeutic target for prevention and treatment of infection by Chlamydia |
| MXPA05013260A (es) * | 2003-06-26 | 2006-03-09 | Chiron Corp | Composiciones inmunogenicas para chlamydia trachomatis. |
| FR2869057B1 (fr) * | 2004-04-16 | 2006-06-02 | Piscines Desjoyaux Sa Sa | Dispositif pour la realisation d'un haut de chainage d'un escalier |
| WO2006045308A2 (en) | 2004-10-25 | 2006-05-04 | Statens Serum Institut | Chlamydia trachomatis antigens for vaccine and diagnostic use |
| MX2007012108A (es) * | 2005-03-31 | 2007-12-05 | Glaxosmithkline Biolog Sa | Vacunas contra infeccion por chlamydia. |
| US8541007B2 (en) * | 2005-03-31 | 2013-09-24 | Glaxosmithkline Biologicals S.A. | Vaccines against chlamydial infection |
| AU2006259858A1 (en) * | 2005-05-12 | 2006-12-28 | Novartis Vaccines And Diagnostics S.R.L. | Immunogenic compositions for Chlamydia trachomatis |
| WO2007110700A2 (en) * | 2005-12-22 | 2007-10-04 | Novartis Vaccines And Diagnostics, Srl. | Chlamydial antigens |
| WO2007082105A2 (en) * | 2006-01-16 | 2007-07-19 | Government Of The United States Of America, As Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Services | Chlamydia vaccine |
| US20080124338A1 (en) * | 2006-09-22 | 2008-05-29 | The Scripps Research Institute | Methods for treatment of inflammatory disease and chlamydia infectious disease |
| AU2007304199A1 (en) * | 2006-10-04 | 2008-04-10 | Corixa Corporation | Vaccines against Chlamydial infection |
| US7892567B2 (en) * | 2007-10-01 | 2011-02-22 | Board Of Regents, The University Of Texas System | Methods and compositions for immunization against chlamydial infection and disease |
| EP2342215A4 (en) * | 2008-10-09 | 2012-06-27 | Univ Texas | METHODS AND COMPOSITIONS FOR CHLAMYDIA ANTIGENS FOR THE DIAGNOSIS AND TREATMENT OF CHLAMYDIA DISEASES AND INFECTIONS |
| CA2781805A1 (en) * | 2008-12-17 | 2010-07-08 | Genocea Biosciences, Inc. | Chlamydia antigens and uses thereof |
| ES2733084T3 (es) * | 2009-03-06 | 2019-11-27 | Glaxosmithkline Biologicals Sa | Antígenos de Chlamydia |
| WO2011112670A2 (en) * | 2010-03-09 | 2011-09-15 | Board Of Regents, University Of Texas System | Methods and compositions for chlamydial antigens for diagnosis and treatment of chlamydial infection and disease |
-
2001
- 2001-04-23 US US09/841,132 patent/US20020061848A1/en not_active Abandoned
- 2001-07-20 ES ES01959114T patent/ES2294018T3/es not_active Expired - Lifetime
- 2001-07-20 CA CA002418282A patent/CA2418282A1/en not_active Abandoned
- 2001-07-20 EP EP01959114A patent/EP1307564B1/en not_active Expired - Lifetime
- 2001-07-20 IL IL15390401A patent/IL153904A0/xx unknown
- 2001-07-20 HU HU0400477A patent/HUP0400477A3/hu unknown
- 2001-07-20 DK DK01959114T patent/DK1307564T3/da active
- 2001-07-20 NZ NZ523628A patent/NZ523628A/en not_active IP Right Cessation
- 2001-07-20 RU RU2003104976/13A patent/RU2003104976A/ru not_active Application Discontinuation
- 2001-07-20 PL PL365951A patent/PL209107B1/pl not_active IP Right Cessation
- 2001-07-20 PT PT01959114T patent/PT1307564E/pt unknown
- 2001-07-20 BR BR0112602-4A patent/BR0112602A/pt not_active Application Discontinuation
- 2001-07-20 KR KR10-2003-7000885A patent/KR20030016423A/ko not_active Application Discontinuation
- 2001-07-20 AU AU2001280702A patent/AU2001280702B8/en not_active Ceased
- 2001-07-20 RU RU2006120003/10A patent/RU2410394C2/ru not_active IP Right Cessation
- 2001-07-20 DE DE60130468T patent/DE60130468T2/de not_active Expired - Lifetime
- 2001-07-20 WO PCT/US2001/023121 patent/WO2002008267A2/en active IP Right Grant
- 2001-07-20 AU AU8070201A patent/AU8070201A/xx active Pending
- 2001-07-20 JP JP2002514171A patent/JP2004513622A/ja active Pending
- 2001-07-20 MX MXPA03000564A patent/MXPA03000564A/es active IP Right Grant
- 2001-07-20 NZ NZ549873A patent/NZ549873A/xx not_active IP Right Cessation
- 2001-07-20 CN CNB018148484A patent/CN100467600C/zh not_active Expired - Fee Related
- 2001-07-20 AT AT01959114T patent/ATE373092T1/de active
- 2001-07-20 NZ NZ541013A patent/NZ541013A/xx not_active IP Right Cessation
- 2001-07-20 CZ CZ2003480A patent/CZ2003480A3/cs unknown
-
2003
- 2003-01-13 IL IL153904A patent/IL153904A/en not_active IP Right Cessation
- 2003-01-17 NO NO20030252A patent/NO20030252L/no not_active Application Discontinuation
- 2003-01-27 ZA ZA200300719A patent/ZA200300719B/en unknown
-
2004
- 2004-06-18 US US10/872,155 patent/US7462357B2/en not_active Expired - Fee Related
- 2004-10-14 HK HK04107907.3A patent/HK1067381A1/xx not_active IP Right Cessation
-
2007
- 2007-10-30 US US11/929,665 patent/US8052975B2/en not_active Expired - Fee Related
- 2007-10-30 US US11/928,432 patent/US20090028887A1/en not_active Abandoned
- 2007-10-30 US US11/929,672 patent/US20090035296A1/en not_active Abandoned
- 2007-10-30 US US11/929,620 patent/US20080181918A1/en not_active Abandoned
- 2007-10-30 US US11/928,873 patent/US8263089B2/en not_active Expired - Fee Related
- 2007-10-30 US US11/928,855 patent/US20080317772A1/en not_active Abandoned
- 2007-11-12 CY CY20071101457T patent/CY1107796T1/el unknown
-
2011
- 2011-09-30 US US13/250,137 patent/US20120114684A1/en not_active Abandoned
Also Published As
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| US6565856B1 (en) | Compounds and methods for treatment and diagnosis of chlamydial infection | |
| CZ2003480A3 (cs) | Sloučeniny a způsoby léčení a diagnózy chlamydiální infekce | |
| KR100829407B1 (ko) | 클라미디아 감염을 치료 및 진단하기 위한 조성물 및 이를 포함하는 약제학적 조성물 및 진단 키트 | |
| CZ2001200A3 (en) | Herbicidal agents containing substituted phenylsulfonyl ureas compounds for controlling weed in rice, process of their preparation and use | |
| US6448234B1 (en) | Compounds and methods for treatment and diagnosis of chlamydial infection | |
| US6432916B1 (en) | Compounds and methods for treatment and diagnosis of chlamydial infection | |
| CN101219215A (zh) | 用于治疗及诊断衣原体感染的化合物和方法 | |
| US6555115B1 (en) | Compounds and methods for treatment and diagnosis of chlamydial infection | |
| US20080213264A1 (en) | Compounds and methods for treatment and diagnosis of chlamydial infection |