CZ2001643A3 - Exprese a export inhibitorů angiogeneze ve formě imunofúzinů - Google Patents

Exprese a export inhibitorů angiogeneze ve formě imunofúzinů Download PDF

Info

Publication number
CZ2001643A3
CZ2001643A3 CZ2001643A CZ2001643A CZ2001643A3 CZ 2001643 A3 CZ2001643 A3 CZ 2001643A3 CZ 2001643 A CZ2001643 A CZ 2001643A CZ 2001643 A CZ2001643 A CZ 2001643A CZ 2001643 A3 CZ2001643 A3 CZ 2001643A3
Authority
CZ
Czechia
Prior art keywords
protein
immunoglobulin
region
angiostatin
endostatin
Prior art date
Application number
CZ2001643A
Other languages
English (en)
Other versions
CZ302303B6 (cs
Inventor
Kin-Ming Lo
Yue Li
Stephen D. Gillies
Original Assignee
Lexigen Pharmaceuticals Corp.
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Lexigen Pharmaceuticals Corp. filed Critical Lexigen Pharmaceuticals Corp.
Publication of CZ2001643A3 publication Critical patent/CZ2001643A3/cs
Publication of CZ302303B6 publication Critical patent/CZ302303B6/cs

Links

Classifications

    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K38/00Medicinal preparations containing peptides
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00Antineoplastic agents
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P43/00Drugs for specific purposes, not provided for in groups A61P1/00-A61P41/00
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P7/00Drugs for disorders of the blood or the extracellular fluid
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P9/00Drugs for disorders of the cardiovascular system
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/475Growth factors; Growth regulators
    • C07K14/515Angiogenesic factors; Angiogenin
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/78Connective tissue peptides, e.g. collagen, elastin, laminin, fibronectin, vitronectin or cold insoluble globulin [CIG]
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • C12N15/62DNA sequences coding for fusion proteins
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/14Hydrolases (3)
    • C12N9/48Hydrolases (3) acting on peptide bonds (3.4)
    • C12N9/50Proteinases, e.g. Endopeptidases (3.4.21-3.4.25)
    • C12N9/64Proteinases, e.g. Endopeptidases (3.4.21-3.4.25) derived from animal tissue
    • C12N9/6421Proteinases, e.g. Endopeptidases (3.4.21-3.4.25) derived from animal tissue from mammals
    • C12N9/6424Serine endopeptidases (3.4.21)
    • C12N9/6435Plasmin (3.4.21.7), i.e. fibrinolysin
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12YENZYMES
    • C12Y304/00Hydrolases acting on peptide bonds, i.e. peptidases (3.4)
    • C12Y304/21Serine endopeptidases (3.4.21)
    • C12Y304/21007Plasmin (3.4.21.7), i.e. fibrinolysin
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2317/00Immunoglobulins specific features
    • C07K2317/20Immunoglobulins specific features characterized by taxonomic origin
    • C07K2317/24Immunoglobulins specific features characterized by taxonomic origin containing regions, domains or residues from different species, e.g. chimeric, humanized or veneered
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2319/00Fusion polypeptide
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2319/00Fusion polypeptide
    • C07K2319/01Fusion polypeptide containing a localisation/targetting motif
    • C07K2319/02Fusion polypeptide containing a localisation/targetting motif containing a signal sequence
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2319/00Fusion polypeptide
    • C07K2319/30Non-immunoglobulin-derived peptide or protein having an immunoglobulin constant or Fc region, or a fragment thereof, attached thereto
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2319/00Fusion polypeptide
    • C07K2319/70Fusion polypeptide containing domain for protein-protein interaction
    • C07K2319/74Fusion polypeptide containing domain for protein-protein interaction containing a fusion for binding to a cell surface receptor
    • C07K2319/75Fusion polypeptide containing domain for protein-protein interaction containing a fusion for binding to a cell surface receptor containing a fusion for activation of a cell surface receptor, e.g. thrombopoeitin, NPY and other peptide hormones
    • YGENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
    • Y10TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC
    • Y10STECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
    • Y10S530/00Chemistry: natural resins or derivatives; peptides or proteins; lignins or reaction products thereof
    • Y10S530/81Carrier - bound or immobilized peptides or proteins and the preparation thereof, e.g. biological cell or cell fragment as carrier

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Toxicology (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Vascular Medicine (AREA)
  • Epidemiology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Heart & Thoracic Surgery (AREA)
  • Cardiology (AREA)
  • Diabetes (AREA)
  • Hematology (AREA)
  • Peptides Or Proteins (AREA)
  • Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
  • Medicines Containing Antibodies Or Antigens For Use As Internal Diagnostic Agents (AREA)

Description

Oblast techniky
Vynález obecně popisuje přípravky a způsoby využitelné pro produkci a použití fúzních proteinů zahrnujících nějaký inhibitor angiogeneze. Ještě přesněji lze říci, že vynález popisuje přípravky a způsoby využitelné pro produkci a použití fúzních proteinů označovaných jako imunofúziny, kde tyto proteiny zahrnují imunoglobulinovou oblast Fc a nějaký inhibitor angiogeneze.
Dosavadní stav techniky
Byly objeveny dva účinné inhibitory angiogeneze, a to angiostatin (O'Reilly a další, Cell, 79:315, 1994) a endostatin (O'Reilly a další, Cell, 88:277, 1997) a bylo zjištěno, že tyto sloučeniny jsou přirozeně produkovány primárními nádory. Oba zmíněné proteiny jsou specifickými inhibitory proliferace endotheliálních buněk a růst nádorů inhibují tím, že blokují angiogenezi (vytváření nových krevních kapilár vyživujících nádory). Následné studie prokázaly, že tyto inhibitory angiogeneze. nevykazují toxické účinky ani ve vysokých dávkách, a že mohou potlačovat růst metastáz a u primárních nádorů vyvolat regresi do dormantního stavu. Bylo zjištěno, že oba tyto inhibitory jsou proteolytickými fragmenty podstatně větších intaktních molekul. Angiostatin byl identifikován jako fragment plazminogenu a endostatin jako fragment kolagenu XVIII.
• ·
Oba zmíněné proteiny vyvolaly velký zájem v oblasti výzkumu rakoviny, a to vzhledem k jejich schopnosti potlačovat na myším modelu růst mnoha rozdílných typů nádorů bez pozorovatelných nežádoucích vedlejšich.účinků nebo vzniku rezistence. Při tradičně používané chemoterapeutické intervenci dochází k selekci rezistentních klonů buněk a to především v důsledku nestability genomu rakovinných buněk. Cílem terapií využívajících inhibitory angiogeneze však nejsou buňky nádorové, ale normální buňky endotheliální, které podporují růst nádorů. Vzhledem k tomu, že endotheliální buňky jsou geneticky stabilní, je možné, že terapie využívající inhibitory angiogeneze budou vznikem rezistence zatíženy v daleko menší míře. Provedené studie naznačují, že u myší vystavených dlouhodobému terapeutickému působení endostatinu (s antiangiogenním účinkem) nedošlo ke vzniku rezistence vůči této látce. Opakované léčebné cykly s využitím endostatinu vedly u myší k prodloužení doby dormance nádorů a při ukončení terapie nebyla pozorována recidiva onemocnění (Boehm a další, Nátuře, 390:440, 1997).
I přes slibné výsledky experimentů prováděných na myším modelu nebylo možné v expresívních systémech E.coli, bakulovirech, kvasinkách a savčích buňkách připravit v komerčně výhodných množstvích rozpustný, aktivní angiostatin vhodný pro klinické testování. Výsledkem exprese v E.coli byly nerozpustné proteinové agregáty nedefinovatelného složení, které nemohly být použity k injekční aplikaci do organizmu lidí. Jiné postupy, jako například bakulovirový expresívní systém nebo expresívní systémy využívající savčí buňky, produkovaly pouze velmi malá množství rekombinantnich proteinů (O'Reilly a další, Cell, 88:277, 1997).
Nízké výtěžky získané v použitých expresívních systémech mohou být vysvětleny skutečností, že jak endostatin tak angiostatin jsou vnitřními fragmenty mnohem větších proteinů.
Tyto zkrácené proteiny mohou být, v důsledku absence zbytků, které jsou z prekurzorových molekul odštěpeny, nesprávně sbaleny. Angiostatin například obsahuje 26 cysteinových zbytků, které vytvářejí velký počet disulfidových vazeb. Při expresi samotného angiostatinu možná není vytvořeno prostředí optimální pro vznik tohoto velkého počtu disulf idových vazeb. Rekombinantní endostatin produkovaný v E.coli v průběhu dialýzy precipitoval, což je pravděpodobně důsledkem hydrofobicity tohoto proteinu (O'Reilly a další, Cell, 88:277, 1997).
Hlavní překážkou pro použití angiostatinu a endostatinu v jejich současné formě je skutečnost, že k dosaženi požadovaného terapeutického cíle musí být do organizmu po dobu týdnů až měsíců injekčně aplikována relativně velká množství těchto proteinů. U v současnosti používaného myšího modelu je k dosažení optimální účinnosti například nutno aplikovat 20 mg/kg/den endostatinu (Boehm a další, Nátuře, 390:440, 1997). Vezmeme-li v úvahu, že je nezbytné klinické testování endostatinu a angiostatinu, pak je nutné vyvinout způsob produkce velkého množství tohoto materiálu v čistotě vhodné pro klinické použití.
Jedním ze systémů, který byl použit k expresi velkých množství fúzních proteinů v savčích buňkách, je konstrukt DNA kódující signální peptid, imunoglobulinovou oblast Fc a cílový (požadovaný) protein. Fúzní protein kódovaný tímto konstruktem je obvykle označován jako imunofúzin. Mezi cílové proteiny, který byly úspěšně exprimovány ve formě imunofúzinů patří: IL2, CD26, Tat, Rev, OSF-2, βΙΘ-Η3, receptor pro IgE, PSMA a gpl20. Tyto expresívní konstrukty jsou popsány v přihláškách US 5541087 a 5726044, které jsou zde uvedeny záměnou za přenesení jejich celého obsahu do popisu tohoto vynálezu.
Hlavním cílem při expresi rekombinantních fúzních proteinů v savčích buňkách bylo pokusit se takové hybridní molekule udělit nějaké nové nebo užitečné vlastnosti jako například umožnit správné sbalení (tj. vytvoření správné terciární a/nebo kvartérní struktury), zvýšit rozpustnost, směrovat cytokin nebo toxin in vivo, umožnit vazbu na receptor pro Fc, fixaci komplementu, vazbu na protein A, prodloužit biologický poločas a zvýšit schopnost přecházet hematoencefalickou bariérou. Příkladem rekombinantních fúzních proteinů produkovaných v savčích buňkách jsou imunokonjugáty cytokinů (Gillies a další, Proč. Nati. Acad. Sci. USA, 89:1428, 1992); Gillies a další, Bioconjugate Chemistry, 4:230, 1993), imunoadhesiny (Capon a další, Nátuře, 337:525, 1989) a konjugát nervového růstového faktoru (Friden a další, Science, 339:394, 1993). Každá z následujících publikací je zde uvedena záměnou za přenesení jejího celého obsahu do popisu tohoto vynálezu.
Jedna stránka popisuje nové sekvence DNA, které usnadňují účinnou produkci a sekreci inhibitorů angiogeneze v savčích hostitelských buňkách. Druhá stránka vynálezu popisuje způsoby léčby savců s využitím nukleových kyselin kódujících, nebo aminokyselinových sekvencí definujících, inhibitory angiogeneze, včetně nepřirozených, biosyntetických nebo jiných uměle vytvořených proteinů jako například proteinů vytvořených racionálním designem.
Popis obrázků na výkresech
Cíle, charakteristické rysy a výhody předkládaného vynálezu uvedené v předcházejícím i následujícím textu, jakož i vynález sám, mohou být dokonale pochopeny z následujících výhodných provedení vynálezu a přiložených obrázků.
o ·
Obrázky 1A až 1F jsou schématickým znázorněním ukázkových fúzních proteinů inhibitorů angiogeneze zkonstruovaných s využitím údajů uvedených ve vynálezu (viz. příklady 10 až 15). Na obrázcích jsou znázorněny:
Obrázek 1Ά - fúzní protein Fc-doména kringle 1 angiostatinu
Obrázek 1B - fúzní protein Fc-vnitřní část domény kringle 1 angiostatinu
Obrázek 1C - fúzní protein Fc-endostatin-linker GlyServnitřní část domény kringle 1 angiostatinu
Obrázek ID - fúzní protein Fc-endostatin-linker GlySerdoména kringle 1 angiostatinu
Obrázek 1E - fúzní protein Fc-endostatin-linker GlySerangiostatin
Obrázek 1F - fúzní protein angiostatin-Fc-endostatin
Svislé úsečky reprezentují disulfidické vazby (nemusí být přítomny) spojující cysteinové zbytky (C) v pantové oblasti domény Fc.
Podstata vynálezu
Vynález popisuje přípravky a způsoby využitelné pro produkci a použití fúzních proteinů zahrnujících nějaký inhibitor angiogeneze. Tyto fúzní proteiny mohou usnadnit expresi velkých množství biologicky aktivních proteinových inhibitorů angiogeneze. Tyto proteinové inhibitory angiogeneze mohou být následně z fúzního proteinu odštěpeny a před aplikací do organizmu nějakého savce (například člověka) smíchány s farmaceuticky přijatelným nosičem. Jinou možností je smíchat nukleotidové sekvence kódující, nebo aminokyselinové sekvence definující, fúzní proteiny zahrnující in
4 hibitor angiogeneze s nějakým farmaceuticky přijatelným nosičem a tuto směs aplikovat do organizmu savce.
Jedna stránka vynálezu popisuje molekuly nukleových kyselin, například molekuly DNA nebo RNA, kódující nějaký fúzní protein podle vynálezu. Daná molekula nukleové kyseliny kóduje signální sekvenci, Fc oblast imunoglobulinu a alespoň jeden cílový protein, v této přihlášce označovaný jako proteinový inhibitor angiogeneze, vybraný ze skupiny zahrnující angiostatin, endostatin, nějaký fragment plazminogenu s aktivitou angiostatinu, nějaký fragment kolagenu XVIII s aktivitou endostatinu a jejich kombinace. Ve výhodném provedení vynálezu kóduje molekula nukleové kyseliny postupně, ve směru 5' k 3, signální sekvenci, Fc oblast imunoglobulinu a sekvenci cílového proteinu. V jiném výhodném provedení vynálezu kóduje molekula nukleové kyseliny postupně, ve směru 5' k 3', signální sekvenci, sekvenci cílovéhó proteinu a Fc oblast imunoglobulinu.
V jiném výhodném provedení vynálezu zahrnuje Fc oblast imunoglobulinu pantovou oblast imunoglobulinu a výhodně zahrnuje alespoň jednu konstantní oblast těžkého imunoglobulinového řetězce, například konstantní doménu 2 (CH2) těžkého řetězce, konstantní doménu 3 (CH3) těžkého řetězce a volitelně dále konstantní doménu 4 (CH4) těžkého řetězce. V závislosti na typu použitého imunoglobulinu je tímto vytvořena oblast Fc. Ve výhodnějším provedení vynálezu zahrnuje Fc oblast imunoglobulinu pantovou oblast, doménu CH2 a doménu CH3. Za určitých podmínek není v Fc oblasti imunoglobulinu zastoupena alespoň doména CHi. Ačkoliv mohou být Fc oblasti imunoglobulinu odvozeny z jakékoliv třídy imunoglobulinů, například IgA, IgD, IgE, IgG a IgM, ve výhodných provedeních jsou používány Fc oblasti imunoglobulinu odvozené z třídy IgG.
V jiném výhodném provedení vynálezu může být nukleová kyselina podle vynálezu začleněna do expresívního vektoru schopného replikace a tímto vektorem mohou být následně transfekovány savčí hostitelské buňky. V jiném výhodném provedení vynález popisuje hostitelské buňky nesoucí nukleotidové sekvence podle vynálezu.
Jiná stránka vynálezu popisuje fúzní protein zahrnující Fc oblast imunoglobulinu připojenou, buď přímo peptidovou vazbou nebo prostřednictvím polypeptidového linkeru, k cílovému proteinu vybranému ze skupiny zahrnující angiostatin, endostatin, nějaký fragment plazminogenu s aktivitou angiostatinu, nějaký fragment kolagenu XVIII s aktivitou endostatinu a jejich kombinace. Cílový protein může být svým C-koncem připojen k N-konci Fc oblasti imunoglobulinu. Ve výhodnějším provedení vynálezu je nicméně cílový protein připojen svým N-koncem k C-konci Fc oblasti imunoglobulinu.
V jiném provedení vynálezu může fúzní protein podle vynálezu zahrnovat nějaký druhý cílový protein vybraný ze skupiny zahrnující angiostatin, endostatin, nějaký fragment plazminogenu s aktivitou angiostatinu a nějaký fragment kolagenu XVIII s aktivitou endostatinu. U tohoto typu konstruktu mohou být první a druhý cílový protein totožné nebo rozdílné. Ve výhodném provedení vynálezu zmíněný fúzní protein například zahrnuje první cílový protein typu angiostaťinu, Fc oblast imunoglobulinu a druhý cílový protein typu endostatinu. První a druhý cílový protein mohou být vzájemně spojeny buď přímo nebo prostřednictvím polypeptidového linkeru. V jiném uspořádání .mohou být oba cílové proteiny připojeny, buď přímo nebo prostřednictvím polypeptidového linkeru, k Fc oblasti imunoglobulinu. V tomto případě je první cílový protein připojen k N-konci Fc oblasti imunoglobulinu a druhý cílový protein připojen k C-konci Fc oblasti imunoglobulinu.
V jiném provedení vynálezu mohou být dva fúzní proteiny spojeny buď kovalentně, například disulfidovou nebo peptidovou vazbou, nebo nekovalentně, čímž je vytvořen multimerní protein. Ve výhodném provedení jsou tyto dva fúzní proteiny spojeny kovalentně prostřednictvím jedné nebo více disulfidických vazeb mezi postranními řetězci cysteinů, které se ve výhodném provedení nalézají v pantových oblastech imunoglobulinů umístěných v obou řetězcích Fc oblastí imunoglobulinů.
Ve výhodném provedení vynálezu zmíněný cílový protein zahrnuje nějaký fragment plazminogenu o molekulové hmotnosti přibližně 40 kD a volitelně rovněž zahrnuje aminokyselinou sekvenci uvedenou jako SEK. ID. Č.: 3. V jiném provedení vynálezu zmíněný cílový protein zahrnuje nějaký fragment kolagenu XVIII s aminokyselinovou sekvencí uvedenou jako SEK. ID. Č.: 1. Cílovým proteinem může být rovněž nezkrácený angiostatin nebo endostatin nebo jejich biologicky aktivní fragmenty. Zdroj cílového proteinu použitého při vytváření daných fúzních proteinů bude záviset na plánovaném použití tohoto cílového proteinu. Bude-li například cílový protein aplikován lidem, pak by tento cílový protein měl být lidského původu.
Jiná stránka vynálezu popisuje způsoby produkce fúzního proteinu zahrnujícího Fc oblast imunoglobulinů a cílový protein vybraný ze skupiny zahrnující angiostatin, endostatin, nějaký fragment plazminogenu s aktivitou angiostatinu a nějaký fragment kolagenu XVIII s aktivitou endostatinu. Tento způsob zahrnuje následující kroky: (a) vytvoření savčí buňky nesoucí DNA kódující takový fúzní protein buď s nebo bez signální sekvence; a (b) kultivaci takové buňky za účelem produkce zmíněného fúzního proteinu. Tento fúzní protein může být následně sebrán, je-li to nezbytné renaturován, a, s využitím standardních purifikačních technik v současnosti známých, vyčištěn. Za předpokladu, že ve zmíněném fúzním proteinu se mezi Fc oblastí imunoglobulinu a cílovým proteinem nalézá proteolyticky štěpitelná sekvence, pak může být cílový protein z fúzního proteinu s využitím běžně používaných proteolytických enzymů odštěpen a, je-li to nezbytné, před použitím purifikován.
Jiná stránka vynálezu popisuje způsoby léčby savců, například lidí, u kterých je žádoucí provést léčbu využívající inhibitory angiogeneze. Do rozsahu vynálezu například spadá aplikace inhibitorů angiogeneze lidem s nádorovými onemocněními. Léčba s využitím inhibitorů angiogeneze může zpomalit nebo zastavit růst nádorů a za určitých okolností může vyvolat regresi nádorů. Tato léčba může zahrnovat aplikaci inhibitoru angiogeneze do organizmu savce v množství dostačujícím ke zpomalení nebo zastavení růstu nádorů. Inhibitor angiogeneze může být aplikován ve formě fúzního proteinu nebo jako nukleová kyselina, ve výhodném provedení funkčně spojena s nějakým expresívním vektorem, v kombinaci s farmaceuticky přijatelným nosičem.
Vynález popisuje fúzní proteiny, v této přihlášce označované jako imunofúziny, které jsou využitelné k produkci komerčně výhodných množství inhibitorů angiogeneze v čistotě vhodné pro klinické použití. Před použitím mohou být tyto inhibitory angiogeneze z imunofúzních proteinů odštěpeny. Do rozsahu vynálezu nicméně rovněž spadá možnost aplikace imunofúzinů nebo nukleových kyselin kódujících imunofúziny s nějakým inhibitorem angiogeneze do organizmu savců přímo bez odštěpení.
Vynález popisuje fúzní proteiny zahrnující Fc oblast imunoglobulinu a alespoň jeden cílový protein, označovaný v této přihlášce jako inhibitor angiogeneze. Inhibitor angiogeneze je ve výhodném provedení vybrán ze skupiny zahrnuj 1 .··· ·· ··» ’·· ·* ci angiostatin, endostatin, nějaký fragment plazminogenu s aktivitou angiostatinu, nějaký fragment kolagenu XVIII s aktivitou endostatinu. Je nicméně rovněž zřejmé, že ve formě fúzních proteinů stejného typu, jaký je popsán v této přihlášce, mohou být exprimovány i jiné polypeptidy schopné inhibovat angiogenezi, a to jak peptidy v současnosti známé tak objevené v budoucnosti.
Na obrázcích 1A až AF je znázorněno šest proteinových konstruktů použitelných při průmyslovém využití vynálezu. Jelikož ve výhodném provedení vynálezu jsou využívány dimerní konstrukty, všechny tyto konstrukty jsou znázorněny ve formě dimerů spojených dvojicí disulfidických vazeb mezi cysteiny přítomnými v jednotlivých podjednotkách. Tyto disulfidové můstky na obrázcích spojují dvě Fc oblasti imunoglobulinů v pantové oblasti, což je charakteristickým znakem nativních forem těchto molekul. I když konstrukty zahrnující pantovou oblast Fc úseku jsou upřednostňovány a jejich použití terapeutických agens je nadějné, do rozsahu vynálezu rovněž spadají i možnosti zesíťováni v jiných místech. Za určitých okolností mohou být rovněž produkovány dimery nebo multimery vhodné pro praktické využití vynálezu, kde tyto dimery nebo multimery jsou spojené nekovalentně, například hydrofobními interakcemi.
Jelikož jsou homodimerní konstrukty důležitými modelovými konstrukty vynálezu, jsou tyto konstrukty znázorněny Obrázku 1. Je zřejmé, že heterodimerní konstrukty jsou rovněž využitelné, ale odborníci vědí, že takové konstrukty je často velmi obtížné purifikovat. Mohou být nicméně vytvořeny konstrukty zahrnující směs homodimerů a heterodimerů, kde tyto konstrukty jsou využitelné k inhibici angiogeneze u nej různějšich druhů savců, včetně člověka. Jeden řetězec heterodimerní struktury může například zahrnovat endostatin a druhý například angiostatin.
Obrázek 1A znázorňuje dimerní konstrukt připravený postupem uvedeným v přikladu 10. Každá monomerni jednotka tohoto dimeru zahrnuje Fc oblast imunoglobulinu (1) včetně pantové oblasti, domény 0¾ a domény CH3. Přímo k C-konci Fc oblasti (1) je připojena první doména kringle angiostatinu (2) , a to jak její vnitřní tak vnější část. Obrázek 1B, ilustrující další provedení vynálezu (viz. příklad 11), zahrnuje Fc oblast totožnou s Fc oblastí na obrázku 1A, k jejímuž C-konci je tentokrát připojena pouze vnitřní část první doména kringle angiostatinu (3.) . Obrázky 1C až 1F ilustrují různé modelové proteinové konstrukty podle vynálezu. V těchto konstruktech je cílovým proteinem kombinace inhibitorů angiogeneze v tandemovém uspořádání a spojená linkerem. V konstruktu znázorněném na obrázku 1C zahrnuje cílový protein nezkrácený endostatin (4), polypeptidový linker (5) a vnitřní část první domény kringle angiostatinu (3) . Obrázek ID znázorňuje protein zahrnující Fc oblast totožnou s Fc oblastí na obrázku 1A a cílový protein zahrnující nezkrácený endostatin (4), polypeptidový linker (5) a celou první doménu kringle angiostatinu (jak vnitřní tak vnější část) (2). Konstrukt ilustrovaný obrázkem 1E se od konstruktu na obrázku ID liší tím, že na C-konci celého konstruktu je umístěn nezkrácený řetězec angiostatinu (7).
Ačkoliv obrázky 1A až 1F reprezentují konstrukty typu Fc-X, kde X je cílový protein, do rozsahu vynálezu rovněž spadají konstrukty typu X-Fc, které jsou použitelné při průmyslovém využití vynálezu. Do rozsahu vynálezu rovněž spadají proteiny podle vynálezu popsané vzorcem X-Fc-X, kde X mohou označovat totožné nebo odlišné cílové proteiny. Obrázek 1F ilustruje takový konstrukt, který ve směru od Dokonce k C-konci zahrnuje nezkrácený lidský angiostatin (7), Fc oblast lidského imunoglobulinu (6) včetně pantové oblasti a nezkrácenou doménu lidského endostatinu (4).
• 9 ·· • · · ·
• 99
Termín inhibitor angiogeneze označuje jakoukoliv molekulu, které potlačuje nebo inhibuje tvorbu nových krevních kapilár v organizmu savců. Při léčbě rakoviny inhibitory angiogeneze potlačují nebo inhibují tvorbu nových krevních kapilár v nebo na nádorech, výhodně pak v nebo na pevných nádorech. Výhodně využitelné inhibitory angiogeneze mohou být identifikovány pomocí nejrůznějších stanovení v současnosti známých a používaných. Mezi taková stanovení patří například sledování proliferace bovinních endotheliálních buněk tvořících kapiláry, stanovení na kuřecích chorioalantoických membránách (CAM) nebo stanovení na myší rohovce. V současnosti je nicméně s výhodou používáno stanovení CAM (viz. například O'Reilly a další, Cell, 79:315 až 328, 1994; a 0'Reilly a další, Cell, 88:277 až 285, 1997; tyto publikace jsou zde uvedeny záměnou za přenesení jejich celého obsahu do popisu tohoto vynálezu.). Stručně řečeno, z oplodněných bílých vajec (3 dny po oplození) jsou vyjmuta embrya spolu s nepoškozených žloutkem a tato jsou umístěna na Petriho misky. Po třídenní inkubaci při 37°C v atmosféře 3% CO2 je na chorioalantoickou membránu každého z embryí umístěn disk z methylcelulózy obsahující předpokládaný inhibitor angiogeneze. Po přibližně 48 hodinové inkubaci jsou chorioalantoické membrány pozorovány pod mikroskopem a jsou zde sledovány známky inhibice angiogeneze.
Příkladem inhibitorů angiogeneze výhodně používaných při praktickém využití vynálezu jsou angiostatin (O'Reilly a další, Cell, 79:315 až 328, 1994; a přihlášky US 5733876, 5837682 a 5885795) a endostatin (O'Reilly a další, Cell, 88:277 až 285, 1997; a přihláška US 5854205). Jak již bylo zmíněno v předchozím textu, angiostatin i endostatin jsou specifickými inhibitory proliferace endotheliálních buněk a jsou schopny inhibovat růst nádorů tím, že blokují angioge nezi, což je tvorba nových krevních kapilár vyživujících nádory.
Angiostatin byl identifikován jako proteolytický fragment plasminogenu (O'Reilly a další, Cell, 79:315 až 328, 1994; a přihlášky US 5733876, 5837682 a 5885795; tyto publikace jsou zde uvedeny záměnou za přenesení jejich celého obsahu do popisu tohoto vynálezu). Přesněji řečeno, angiostatin je vnitřní fragment plasminogenu o velikosti 38 kDa zahrnující alespoň tři domény kringle plazminogenu. Endostatin byl identifikován jako proteolytický fragment kolagenu XVIII (O'Reilly a další, Cell, 88:277 až 285, 1997; tato publikace je zde uvedena záměnou za přenesení jejího celého obsahu do popisu tohoto vynálezu). Přesněji řečeno, endostatin je C-koncový fragment kolagenu XVIII o velikosti 20 kDa. Termíny angiostatin a endostatin označují nejenom nezkrácené proteiny, ale rovněž jejich varianty a biologicky aktivní fragmenty a rovněž biologicky aktivní fragmenty plasminogenu, respektive kolagenu XVIII. Jako biologicky aktivní fragmenty angiostatinu jsou označovány jakékoliv proteinové fragmenty plasminogenu nebo angiostatinu, které při stanovení CAM vykazují alespoň 30%, ve výhodném provedení alespoň 70% a nejvýhodněji pak přinejmenším 90% biologické aktivity nezkráceného angiostatinu. Jako biologicky aktivní fragmenty endostatinu jsou označovány jakékoliv proteinové fragmenty kolagenu XVIII nebo endostatinu, které při stanovení CMA vykazují alespoň 30%, ve výhodném provedení alespoň 70% a nejvýhodněji pak přinejmenším 90% biologické aktivity nezkráceného endostatinu.
Termín varianty zahrnuje druhové a alelické varianty, jakož i další přirozeně se vyskytující nebo nepřirozené varianty, například varianty vytvořené genovými manipulacemi, kde tyto varianty vykazují přinejmenším 70% podobnost nebo 60% identitu, výhodněji pak 75% podobnost nebo 65% identitu a nejvýhodněji alespoň 80% podobnost nebo 70% identitu s přirozeně se vyskytujícími sekvencemi endostatinu nebo angiostatinu popsanými v této přihlášce.
Skutečnost, zda-li daný polypeptid vykazuje vzhledem k referenčnímu polypeptidu požadované procento podobnosti nebo identity, je stanovena srovnáním (alignmentem) aminokyselinové sekvence testovaného polypeptidu s aminokyselinovou sekvencí referenčního polypeptidu s využitím dynamického algoritmu popsaného v publikaci Smith a Waterman, J.
Mol. Biol., 147:195 až 197, 1981 v kombinaci se substituční maticí BLOSUM62 popsanou na obrázku 2 v publikaci Henikoff a Henikoff, Aminoacid substitution matrices from protein blocks, Proč. Nati. Acad. Sci. USA, 89:10915 až 10919, 1992. Pro potřeby této přihlášky je vložení mezery do sekvence penalizováno hodnotou -12 a prodloužení mezery pak hodnotou -4. Počítačové programy provádějící srovnávání sekvencí (alignment) s využitím algoritmu Smith-Waterman 'a matice BLOSUM62 jako například programový balík GCG (Oxford Molecular Group, Oxford, England) jsou komerčně dostupné a odborníky často využívané.
Jakmile je provedeno srovnání kandidátní sekvence se sekvencí referenční, může být spočteno procento podobnosti. U jednotlivých aminokyselin je postupně srovnávána jejich vzájemná podobnost. Je-li v matici BLOSUM62 hodnota dvou vzájemně si přiřazených aminokyselin nulová nebo záporná, pak skóre pro tuto dvojici je nula; v.jiném případě je skóre pro tuto dvojici 1,0. Prvotní neupravené skóre podobnosti je poté součtem hodnot podobnosti pro jednotlivé dvojice aminokyselin. Neupravené skóre je následně normalizováno dělením počtem aminokyselin, v kratší ze srovnávaných sekvencí. Toto normalizované skóre odpovídá procentu podobnosti. Procento identity je počítáno obdobně. Vzájemně si přiřazené aminokyseliny jsou postupně srovnávány. Jestliže dvě ♦ 9
·· 99 · 9
9 9 9 99 • 9
·· 9
• 9 9
9 9 9 9
9999 • 9 999 • 9
9··
99 •9 •99 ·9 ♦ 9 vzájemně si přiřazené aminokyseliny nejsou totožné, pak hodnota identity je nulová; v opačném případě je hodnota identity rovna 1,0. Prvotní neupravené skóre identity je součtem hodnot identit aminokyselinových párů. Neupravené skóre je následně normalizováno dělením počtem aminokyselin v kratší ze srovnávaných sekvencí. Toto normalizované skóre odpovídá procentu identity. Při výpočtu procenta identity nebo podobnosti jsou inzerce a delece ignorovány. Ve stejném duchu nejsou v těchto výpočtech rovněž zahrnuty penalizace za vložení/prodloužení mezery, ačkoliv tyto jsou použity při počátečním srovnání sekvencí (alignmentu).
Cílové proteiny popsané v přihlášce jsou exprimovány ve formě fúzních proteinů s Fc oblastí nějakého imunoglobulinu. Je známo, že každá konstantní oblast těžkého imunoglobulinového řetězce se skládá ze čtyř nebo pěti domén. Tyto domény jsou označovány následovně: CHi-pantová oblast-CH2CH3-(-CH4). Sekvence DNA jednotlivých domén těžkých řetězců vykazují zkříženou homologii mezi jednotlivými třídami imunoglobulinů. Doména CH2 imunoglobulinu IgG je například homologní s doménou CH2 imunoglobulinu IgA a IgD a s doménou CH3 imunoglobulinů IgM a IgE.
Termín Fc oblast imunoglobulinu označuje C-koncovou část konstantní oblasti imunoglobulinového řetězce, výhodněji pak konstantní oblast těžkého řetězce imunoglobulinu nebo její část. Fc oblast může například zahrnovat: 1) doménu CHi, doménu CH2 a doménu CH3, 2) doménu CHi a doménu CH2, 3) doménu CHi a doménu CH3, 4) doménu CH2 a doménu CH3 nebo 5) kombinaci dvou nebo více domén a pantové oblasti imunoglobulinu. Ve výhodném provedeni vynálezu zahrnuje Fc oblast v konstruktu DNA alespoň pantovou oblast imunoglobulinu, doménu CH2 a doménu CH3 a ve výhodném provedení postrádá alespoň doménu CHi.
• 4
Ve výhodném provedení vynálezu jsou jako zdroj konstantních částí těžkých řetězců využívány ímunoglobuliny typu IgG (Igy) (podtřídy 1, 2, 3 nebo 4). Mohou být nicméně rovněž použity jiné imunoglobulinové třídy jakými jsou IgA (Iga), IgD (Ig5), IgE (Ige) a IgM (Igu). Volba vhodné konstantní oblasti těžkého řetězce imunoglobulinu je detailně diskutována v přihláškách US 5541087 a 5726044. Předpokládá se, že odborníci budou schopni zvolit vhodné sekvence konstantních oblastí těžkých řetězců imunoglobulinů z dostupných imunoglobulinových tříd a subtypů tak, aby bylo dosaženo požadovaného výsledku. Část konstruktu DNA kódující Fc oblast imunoglobulinu ve výhodném provedení zahrnuje alespoň část pantové oblasti a rovněž alespoň část domény CH3 odvozené z Fcy nebo homologních domén v imunoglobulinech typu IgA, IgD, IgE nebo IgM.
V závislosti na způsobu využití mohou být použity rovněž geny kódující konstantní oblasti z jiných živočišných druhů, například myší nebo potkanů. Oblast Fc, použitá jako fúzní partner v konstruktu DNA kódující imunofúzin, může být obecně odvozena z jakéhokoliv druhu savce. Je-li nežádoucí vyvolat v hostitelské buňce nebo organizmu imunitní odpověď vůči použité Fc oblasti, pak tato oblast může být odvozena ze stejného druhu k jakému náleží hostitelská buňka nebo živočich. Je-li například hostitelská buňka lidského původu nebo je-li hostitelem člověk, pak je použita lidská oblast Fc; obdobně je použita myší oblast Fc v případech, kdy je hostitelským živočichem myš. Využitelné jsou rovněž substituční nebo deleční mutanty oblastí F.c, kde je v doménách konstantní oblasti odstraněn nebo nahrazen jeden nebo více aminokyselinových zbytků. Jedním z příkladů je zavedení aminokyselinových substitucí v doméně CH2, čímž je vytvořen mutant se sníženou afinitou vůči receptorům pro Fc (Cole a další, J. Immunol., 159:3613, 1997). Odborník bude ♦ ·· · · · ·
9 · · · · ♦ ♦ ·2 « α · 9 9 9 99 »**· ·· ··· ··* ····♦ s využitím metod molekulární biologie schopen takové konstrukty snadno připravit.
Použití lidských Fcyl jako oblastí Fc s sebou nese řadu výhod. Bude-li například fúzní protein inhibitor angiogeneze-Fc využit jako biologický léčivý přípravek, pak doména Fcyl může v tomto proteinu vykonávat určité efektorové funkce. Mezi tyto efektorové funkce patří biologické aktivity jako například fixace komplementu, buněčná toxicita vyvolaná protilátkou, přechod přes placentu a prodloužení biologického poločasu v krevním oběhu.' Doména Fc rovněž umožňuje detekci metodou ELISA s využitím protilátek proti Fc a purifikaci s využitím vazby na protein A z mikroorganizmu Staphylococcus aureus (protein A). Při některých aplikacích je nicméně žádoucí odstranit určité efektorové funkce oblasti Fc, jako například vazbu na receptory pro Fc nebo fixaci komplementu.
V případě imunofúzinů s inhibitorem angiogeneze je jednou z funkcí oblasti Fc usnadnit správné sbalení daného inhibitoru angiogeneze tak, aby byl vytvořen aktivní inhibitor angiogeneze, a zvýšit rozpustnost aktivních částí fúzního proteinu a to přinejmenším v extracelulárním médiu. Jelikož oblast Fc je hydrofilní, pak její imunofúziny s inhibitory angiogeneze jsou, na rozdíl například od rekombinantniho endostatinu produkovaného v E.coli, rovněž snadno rozpustné (O'Reilly, Cell, 88:277, 1997). Ve všech příkladech uvedených v této přihlášce bylo dosaženo vysoké hladiny produkce imunofúzinů. Imunofúziny s inhibitory angiogeneze byly obvykle sekretovány do média v koncentracích přibližně 30 až 100 pg/ml a mohly být snadno purifikovány chromatografií na Sepharóze s navázaným proteinem A (protein A-Sepharóza). Imunofúziny s inhibitory angiogeneze mohou být rovněž rozštěpeny a dále purifikovány s využitím standardních purifikačních postupů využívajících například
499 9 •· · ··· • · ·· • ♦ · ·♦ • · 99 • 999 99 «·♦ heparin-Sepharózu, lysin-Sepharózu nebo nějaký způsob afinitní purifikace.
Mimo vysokých hladin exprese se fúzní proteiny podle vynálezu rovněž vyznačují delšími biologickými poločasy v krevním oběhu a to pravděpodobně v důsledku jejich větších molekulových hmotností. Biologický poločas fúzního proteinu lidský Fc-lidský angiostatin v krevním oběhu myší je například 33 hodin. Biologický poločas lidského angiostatinu je pro srovnání pouze 4 až 6 hodin (O'Reilly a další, Nátuře Medicine, 2:689, 1996). Předpokládá se, že angiostatin s molekulovou hmotností 40 kDa a endostatin s molekulovou hmotností 20 kDa jsou dostatečně malé, aby mohly být odstraněny filtrací v ledvinách. Naproti tomu dimerní formy Fc-angiostatin a Fc-endostatin mají molekulové hmotnosti 145 kDa, respektive 100 kDa, a to proto, že ke dvěma molekulám' angiostatinu nebo dvěma molekulám endostatinu jsou připojeny dvě oblasti Fc imunoglobulinu. Tyto dvoj vazné .. struktury mohou vykazovat vyšší vazebné afinity k receptorům pro angiostatin nebo endostatin. Je-li inhibiční aktivita angiogeneze zprostředkovaná receptorem, pak fúzní proteiny s oblastí Fc jsou při potlačení růstu nádorů potenciálně daleko účinnější než samotný monovalentní angiostatin nebo endostatin. Mimo to, jestliže angiostatin a/nebo endostatin patři do skupiny dimerních proteinových ligandů, pak připojená oblast Fc vnutí angiostatinu nebo endostatinu takové prostorové uspořádání, že dimerizace bude probíhat intramolekulárně, dimerizační rovnováha bude posunuta směrem k tvorbě dimeru a tím dojde k zesílení vazby na příslušný receptor. Standardními rekombinantními technikami manipulace DNA můžou být rovněž na vhodná místa monomerů umístěny cysteinové zbytky a vytvořením kovalentní disulfidické vazby může být dimer stabilizován.
*
44««
4
444
44 •94444 ·· • · • 4 • 4 •
• 4 4
Termín multivalentní označuje rekombinantní molekulu, která zahrnuje dvě nebo více biologicky aktivních částí. Proteinové fragmenty vytvářející multivalentní molekulu mohou být spojeny polypeptidovým řetězcem, který spojuje jednotlivé části, aniž by při tom docházelo k posunu čtecího rámce, a umožňuje všem těmto částem fungovat nezávisle..
Termín bivalentní označuje multivalentní rekombinantní molekulu, která ve fúzním konstruktu podle vynálezu zahrnuje dva cílové proteiny, například molekulu Fc-X, kde část X je nezávisle zvolená ze skupiny zahrnující angiostatin, endostatin nebo jejich varianty. Jelikož k imunoglobulinové oblasti Fc jsou připojeny dvě části X (oblast Fc je obvykle dimer fragmentů těžkých řetězců zahrnující přinejmenším část pantové oblasti a domény CH3 a volitelně doménu CH2) , tato molekula je bivalentní (viz. například obr. 1A). Jestliže může být fúzní konstrukt podle vynálezu popsán vzorcem Fc-X-X, pak výsledná dimerní molekula Fc je tetravalentní. Zmíněné dva proteiny vytvářející molekulu Fc-X-X mohou být spojeny peptidovým linkerem. Zdánlivá vazebná afinita mezi bivalentní molekulou a recepťorem může být vyšší než u molekuly monovalentni. Jestliže se například jedna endostatinová část fúzního proteinu Fc-endostatin váže na receptor na povrchu buněk s určitou afinitou, pak druhá endostatinová část téhož fúzního proteinu Fc-endostatin se může na receptor na téže buňce vázat s výrazně vyšší afinitou (zdánlivou afinitou). Tato skutečnost je způsobena fyzickým přiblížením druhé endostatinové části k příslušnému receptoru po navázání první endostatinové části. V případech vazby protilátky na antigen je zdánlivá afinita zvýšena přinejmenším 10000-krát.
Termíny multimerní a multimer označují stabilní spojení (asociaci) dvou nebo více polypeptidových řetězců. Tyto řetězce mohou být spojeny buď kovalentně, například di19 *
• · • 9 •9·· 99 •· ♦ ♦·
9♦
999 sulfidickou vazbou, nebo nekovalentně, například hydrofobními interakcemi. Termín multimer zahrnuje jak homomultimery, kde jsou všechny polypeptidy totožné, tak heteromultimery, v nichž jsou polypeptidy rozdílné.
Termín dimerní (molekula) je specifickým typem multimerní molekuly, v níž jsou dva proteinové polypeptidové řetězce spojeny kovalentní nebo nekovalentní vazbou. Mělo by být zřejmé, že imunoglobulinová oblast Fc (fragment Fc) je obvykle dimer fragmentů těžkých řetězců zahrnující přinejmenším část pantové oblasti a domény CH3 a volitelně doménu CH2. Je známo množství proteinových ligandů, které se na příslušné receptory vážou ve formě dimerů. Jestliže proteinový ligand X dimeruje přirozeně, pak část X v molekule Fc-X bude dimerovat daleko snadněji, protože dimerizace je koncentračně závislá. Fyzické přiblížení dvou molekul X spojených asociovanými imunoglobulinovými oblastmi Fc způsobí, že dimerizace bude probíhat intramolekulárně, dimerizační rovnováha bude posunuta směrem k tvorbě dimeru a tím dojde k zesílení vazby na příslušný receptor.
Je pochopitelné, že v přihlášce jsou k vytváření fúzních proteinů s oblastí Fc, použitelných při průmyslovém využiti vynálezu, používány metody práce s rekombinantní DNA. Fúzní konstrukty s oblastí Fc jsou ve výhodném provedení konstruovány na úrovni DNA a takto připravené DNA jsou'integrovány do expresívních vektorů a exprimovány. Tímto způsobem jsou připravovány imunofúziny. Termín vektor označuje jakoukoliv nukleovou kyselinu obsahující nukleotidové sekvence, které mohou být inkorporovány do hostitelské buňky, a zde rekombinovat s nebo se integrovat do genomu takové buňky nebo se replikovat autozomně ve formě epižomu. Mezi takové vektory patří lineární nukleové kyseliny, plazmidy, fágmidy, kosmidy, vektory na bázi RNA, virové vektory a podobně. Příkladem virových vektorů jsou retroviry, adenoviry a viry
4«·· • · · · · • ·· ·· · • ·· • ·· ·9 • ·« * · · ·· ♦ ♦ · ♦ • · ♦ · « ··· ·· asociované s adenoviry. Termíny genová exprese, exprese genu nebo exprese cílového proteinu zahrnují transkripci sekvence DNA, translaci příslušného transkriptu mRNA a sekreci fúzního proteinu s oblastí Fc.
Výhodně používaný expresívním vektorem je expresívní vektor pdCs (Lo a další, Protein Engineering, 11:495 až 500, 1998; tato citace je zde uvedena záměnou za přenesení jejího celého obsahu do popisu tohoto vynálezu.). V tomto vektoru je k transkripci genu Fc-X využíván posilovač transkripce/promotor z lidského cytomegaloviru a polyadenylační signál SV40. Sekvence posilovače transkripce a promotoru lidského cytomegaloviru byly odvozeny z nukleotidů -601 až +7 v sekvenci popsané v publikaci Boshart a další, Cell, 41:521, 1985; tato citace je zde uvedena záměnou za přenesení jejího celého obsahu do popisu tohoto vynálezu. Tento vektor rovněž jako selekční markér obsahuje gen pro mutantní dihydrofolát reduktázu (Simonsen a Levinson, Proč. Nati. Acad. Sci. USA, 80:2495, 1983; tato citace je zde uvedena záměnou za přenesení jejího celého obsahu do popisu tohoto vynálezu).
Vhodné hostitelské buňky mohou být transformovány nebo transfekovány sekvencemi DNA podle vynálezu a využity k expresi a sekreci cílového proteinu. Ve výhodném provedení vynálezu jsou jako hostitelské buňky využívány imortalizované hybridomové buňky, buňky myelomu NS/0, buňky 293, buňky z ovárií čínského křečka, buňky HeLa a buňky COS.
Fúzní proteiny podle vynálezu jsou ve výhodném provedení konstruovány tradičními metodami práce s rekombinantní DNA. Tyto fúzní proteiny jsou ve výhodném provedení produkovány expresí molekuly DNA kódující signální sekvenci, oblast Fc imunoglobulinu a nějaký cílový protein (v této přihlášce rovněž označován jako inhibitor angiogeneze) v hostitelských buňkách. Ve výhodném provedení tyto konstrukty, ve směru od 5' ke 3', kóduji signální sekvenci, oblast Fc imunoglobulinu a příslušný cílový protein. Alternativně mohou tyto konstrukty, ve směru od 5' ke 3', kódovat signální sekvenci, příslušný cílový protein a oblast Fc imunoglobulinu .
Termín signální sekvence, signální peptid označuje peptidovou sekvenci, která umožňuje sekreci fúzního proteinu imunoglobulinu a inhibitoru angiogeneze, a která je následně od tohoto imunofúzinu odštěpena. Signální sekvencí je polynukleotid, který kóduje aminokyselinovou sekvenci zahajující transport proteinu přes membránu endoplazmatického retikula. Mezi signální sekvence využitelné ve vynálezu patří signální sekvence z lehkých řetězců protilátek, například protilátky 14.18 (Gillies a další, J. of Immunol. Meth., 125:191 až 202, 1989), signální sekvence z těžkých řetězců protilátek, například signální sekvence z těžkého řetězce protilátky MOPC141 (Sakano a další, Nátuře, 286:5774, 1980) a jakékoliv jiné signální sekvence v současnosti známé (viz. například Watson, Nucleic Acid Res., 12:5145, 1984). Každá z těchto citací je zde uvedena záměnou za přenesení jejího celého obsahu do popisu tohoto vynálezu.
Signální sekvence jsou v současnosti dobře charakterizovány a obvykle zahrnují 16 až 30 aminokyselin; mohou nicméně zahrnovat více nebo méně aminokyselin. Typický signální peptid zahrnuje tři oblasti: Bazickou N-koncovou oblast, střední hydrofobní oblast a polárnější C-koncovou oblast. Střední hydrofobní oblast zahrnuje 4 až 12 hydrofobních aminokyselinových zbytků, které při transportu nascentního polypeptidu ukotvují signální peptid ve dvojvrstvě lipidové membrány. Následně je signální peptid obvykle v lumen endoplazmatického retikula odštěpen enzymy označovanými jako signální peptidázy. Místa potenciálního štěpení jsou obvyk22
·· ··
• · ··
··
• €
9
···· ·· ··>
• ·· ·
·· • • · • · ·· •
• · ·
• <
··· ·· ·« ·
le definována pravidlem (-3, -1). Typický signální peptid má tedy v oblasti -1 až -3 obvykle malé neutrální aminokyselinové zbytky a nevyskytuje se zde prolin. Příslušná signální peptidáza rozštěpí signální peptid mezi aminokyselinami -1 a +1. Signální sekvence (kódovaná příslušným úsekem DNA) může být tedy od N-konce imunofúzinu v průběhu sekrece odštěpena. Výsledkem pak je sekrece imunofúzinu zahrnujícího oblast Fc a cílový protein. Detailní popis signálních sekvencí je uveden v publikaci von Heijne, Nucleic Acid Res., 14:4683, 1986, která je zde uvedena záměnou za přenesení jejího celého obsahu do popisu tohoto vynálezu.
Odborníkům je zřejmé, že volba signální sekvence vhodné pro použití ve vynálezu může vyžadovat provedeni několika rutinních experimentů, jako například určení schopnosti použité signální sekvence řídit sekreci připojeného imunofúzinu a rovněž stanovení optimální konfigurace, genomové DNA nebo cDNA, této sekvence k dosažení účinné sekrece imunofúzinů. Odborník je rovněž schopen na základě pravidel popsaných v publikaci von Heijne (citace uvedena výše) vytvořit syntetický signální peptid a standardními experimenty stanovit jeho účinnost. Signální sekvence může být rovněž označována jako signální peptid, vedoucí peptid nebo vedoucí sekvence.
Konstrukt vzniklý připojením signální sekvence k imunoglobulinové oblasti Fc je někdy v přihlášce označován jako sekretorní kazeta. Příkladem sekretorní kazety použitelné při průmyslovém využití vynálezu je polynukleotid kódující, ve směru od 5' k 3', gen pro signální sekvenci lehkého imunoglobulinového řetězce a gen pro oblast Fcyl lidského imunoglobulinu yl. Oblast Fcyl genu pro lidský imunoglobulin yl ve výhodném provedení zahrnuje alespoň část pantové oblasti a část domény CH3 nebo alternativně alespoň část pantové oblasti a část domény 0¾ a domény CH3. DNA kódující sekretorni kazetu se může nacházet v konfiguraci genomové DNA nebo cDNA.
V jiném provedení vynálezu je mezi sekvence kódující sekretorní kazetu a inhibitor angiogeneze vložena sekvence DNA kódující proteolyticky štěpitelné místo. Toto místo umožňuje proteolytické štěpení kódovaného fúzního proteinu a tudíž oddělení domény Fc od inhibitoru angiogeneze. Termín proteolyticky štěpitelné místo označuje aminokyselinové sekvence, které jsou přednostně štěpeny proteolytickými enzymy nebo jinými látkami schopnými proteolýzy. Výhodně využívaná proteolyticky štěpitelná místa zahrnují aminokyselinové sekvence, které jsou rozpoznávány proteolytickými enzymy jako například trypsinem, plasminem nebo enterokinázou K. Je známo množství dvojic štěpitelné místo/proteolytické agens. Viz. například přihláška US 5726044, která je zde uvedena záměnou za přenesení jejího celého obsahu do popisu tohoto vynálezu. Je-li cílovým proteinem prekurzorová molekula angiostatinu, endostatinu nebo nějaké z jejich aktivních variant, pak požadovaný proteinový produkt může být štěpen endogenními proteolytickými enzymy jako například elastinem nebo plasminem nebo urokinázou.
Do rozsahu vynálezu rovněž spadají fúzní proteiny obsahující různé kombinace rekombinantního angiostatinu nebo endostatinu nebo jejich fragmentů, které mohou být připraveny ve velkých množstvích. I přes prokazatelnou účinnost při potlačování růstu nádorů není mechanizmus, kterým angiostatin a endostatin blokují angiogenezi, dokonale pochopen. Angiostatin zahrnuje několik domén typu kringle a endostatin obsahuje různé strukturní motivy, z nichž každý může být odpovědný za nebo přispívající k vazbě na proteiny endotheliálních buněk a antioangiogenní aktivitu. Do rozsahu vynálezu tudíž spadají cílové proteiny, které jsou bio24
• · logicky aktivními fragmenty angiostatinu, jako například kringle 1, kringle 2, kringle 3 a jejich kombinace, a biologicky aktivní fragmenty endostatinu, které vykazují aktivity fyziologicky podobné přirozeně se vyskytujícím nezkráceným molekulám angiostatinu nebo endostatinu.
Další provedení vynálezu popisuje bifunkční hybridní konstrukty inhibitorů angiogeneze. Termín bifunkční hybridní molekula označuje protein vytvořený kombinací dvou proteinových podjednotek, kde tyto dvě podjednotky mohou pocházet z odlišných proteinů. Každá z těchto proteinových podjednotek má svou nezávislou funkci a v dané hybridní molekule mohou být funkce těchto dvou podjednotek aditivní nebo synergické. Tyto funkční hybridní proteiny by umožnily prozkoumat synergické účinky angiostatinu a endostatinu na živočišných modelech. Ve výhodném provedeni zahrnují bifunkční hybridy alespoň dva rozdílné inhibitory angiogeneze tandemově spojné přímo nebo prostřednictvím polypeptidového linkeru. Ve výhodném provedení vynálezu například cílová sekvence kóduje alespoň část angiostatinu připojenou ve stejném čtecím rámci k části endostatinu a jak angiostatinová tak endostatinová doména vykazují anti-angiogenní aktivitu nebo inhibici angiogeneze. Tyto dvě jednotky mohou být spojeny polypeptidovým linkerem.
Termín polypeptidový linker označuje nějakou peptidovou sekvenci, která může spojovat dva proteiny nebo nějaký protein a oblast Fc. Polypeptidový linker ve výhodném provedení zahrnuje větší množství aminokyselin jakými jsou například glycin a/nebo serin. Ve výhodném provedení zahrnuje polypeptidový linker sérii peptidů obsahujících glycin a serin v počtu přibližně 10 až 15 zbytků. Viz. například přihláška US 5258698, která je zde uvedena záměnou za přenesení jejího celého obsahu do popisu tohoto vynálezu. Je nicméně zřejmé, že optimální délka linkeru a optimální ami ·· nokyselinové složení mohou být určeny standardními experimenty.
Bylo zjištěno, že expresí různých částí angiostatinu ve fúzi s oblastí Fc je možné dosáhnout vysokých hladin exprese. Důvodem je pravděpodobně skutečnost, že část Fc funguje jako nosič usnadňující správné sbalení polypeptidu na Ckonci. Oblast Fc může být navíc glykosylována a při fyziologické hodnotě pH je vysoce nabitá a tudíž usnadňuje solubilizaci hydrofobních proteinů.
Vynález rovněž popisuje způsoby produkce fúznich proteinů oblasti Fc a angiostatinu a endostatinu z jiných živočišných druhů. Fúzní proteiny s inhibitory angiogeneze z jiných druhů než člověk jsou vhodné pro preklinické studie inhibitorů angiogeneze, jelikož před testováním na lidech musí být účinnost a toxicita proteinových léčiv testována na živočišných modelech. Lidské proteinové sekvence nemusí na myších modelech fungovat, jelikož tyto proteiny mohou vyvolávat imunitní reakci a/nebo vykazovat odlišné farmakokinetické parametry, čímž by docházelo ke zkreslení výsledků. Ekvivalentní myší proteiny jsou tudíž pro testovaní na myších modelech nej lepší náhražkou proteinů lidských.
Srovnáni rozpustných fúznich proteinů huFchuAngiostatin, huFc-huEndostatin, muFc-muAngiostatin a muFc-muEndostatin s totožnými nerozpustnými proteiny produkovanými v expresívním systému E.coli bylo provedeno na standardním myším modelu Lewisova karcinomu plic (O'Reilly a další, Cell, 88:277, 1997). Rozpustné fúzní proteiny byly při potlačení růstu nádorů v modelu Lewisova karcinomu plic výrazně účinnější než odpovídající proteiny produkované v E.coli. Laboratorní myši jsou navíc inbredni a nádory se nevytvářejí spontánně, ale jejich tvorba je indukována. Účinnost na myších modelech tudíž nemusí korelovat s předpokládanou účinností vůči lidským nádorům. Preklinické stu die prováděné na psech. poskytnou o účinnosti těchto inhibitorů angiogeneze na spontánně vytvořené nádory daleko přesnější informace, jelikož existuje velké množství přirozeně se vyskytujících, spontánně vytvořených nádorů v organizmu psů. Způsoby produkce fúzních proteinů myší (mu) Fc-mu angiostatin, muFc-muEndostatin a psí (ca) Fc-ca angiostatin, caFc-caEndostatin podle vynálezu usnadní preklinické studie inhibitorů angiogeneze jak na myších, tak na psích systémech .
Vynález popisuje způsoby léčby potíží zprostředkovaných/doprovázených nefyziologickou angiogenezí a to aplikací DNA, RNA nebo proteinů podle vynálezu. Mezi patologické stavy doprovázené nefyziologickou angiogenezí patří například: pevné nádory, leukémie., metastázy, benigní nádory včetně hemangiomů, neurofibromů, trachomů a pyrogenních granulomů; revmatická arthritida; lupénka; poškození zrakového aparátu (diabetická retinopatie, retinopatie způsobená předčasných narozením, degenerace makuly, odvržení štěpu rohovky, neovaskulární glaukom), retrolentální fibroplazie, rubeosis iridis, Osler-Webberův syndrom; angiogeneze na srdečním svalu; neovaskularizace atherosklerotických plátů; teleangiektazie; angiofibromy kloubů hemofiliků; a granulace poranění; a nadměrná nebo abnormální stimulace endotheliálnich buněk, srůst střev, artheroskleróza, sklerodermální a hypertrofované jizvy, tj. keloidy.
Konstrukty DNA popsané v této přihlášce mohou být využitelné při genových terapiích, při nichž je gen pro angiostatin nebo endostatin zaveden do buněk jedním z mnoha způsobů, kdy například nativní DNA je spojena s promotorem nebo DNA ve virovém vektoru. Jakmile je tato DNA zavedena do buňky, gen pro angiostatin a/nebo endostatin nebo gen pro fragmenty těchto molekul je exprimován a příslušný protein je produkován in vivo a může vykonávat svou normální
biologickou funkci. Zavedení konstruktu DNA podle vynálezu do hostitelské buňky má za následek vysokou hladinu exprese příslušného fúzního proteinu. Fúzní proteiny podle vynálezu mohou být rovněž využitelné při léčbě potíží zprostředkovaných/doprovázených nefyziologickou angiogenezí a mohou vykazovat, ve srovnání s nativními inhibitory angiogeneze nebo jinými rekombinantními inhibitory angiogeneze, vyšší účinnost a to vzhledem ke skutečnosti, že imunofúzní proteiny s inhibitory angiogeneze podle vynálezu mají delší biologický poločas než samotné nativní inhibitory angiogeneze nebo jiné rekombinantni inhibitory angiogeneze. Bivalentní a dimerní formy podle vynálezu by, vzhledem k jejich bivalentní a dimerní struktuře, měly mít vyšší vazebnou afinitu. Bifunkční hybridní molekuly podle vynálezu mohou vykazovat vyšší klinickou účinnost, a to vzhledem k možným synergickým účinkům dvou odlišných inhibitorů angiogeneze spojených oblastí Fc nebo flexibilním polypeptidovým linkerem.
Přípravky podle vynálezu mohou být do organizmu živočichů .aplikovány jakýmkoliv vhodným způsobem, přímo (například lokálně injekcí, implantátem nebo místní aplikací na postiženou tkáň) nebo systemicky (například parenterálně nebo orálně). Je-li přípravek aplikován parenterálně, například intravenózně, subkutánně, do oka, intraperitoneálně, intramuskulárně, na tkáň tváře, rektálně, vaginálně, intraorbitálně, intracerebrálně, intrakraniálně, intraspinálně, intravetrikulárně, intrathekálně, intracisternálně, intrakapsulárně, intranazálně nebo prostřednictvím aerosolu, pak ve výhodném provedení část tohoto přípravku zahrnuje vodnou suspenzi nebo roztok nebo suspenzi nebo roztok v jiné fyziologicky přijatelné kapalině. Použitý nosič nebo vehikulum jsou tudíž fyziologicky přijatelné, takže s výjimkou umožnění aplikace daného přípravku do organizmu pa28
cienta, tyto složky žádným nežádoucím způsobem neovlivňuji rovnováhu elektrolytů a/nebo objem v organizmu pacienta. Kapalné médium pro použitou sloučeninu může tudíž například zahrnovat fyziologický roztok (například 9,85% vodný roztok NaCl, 0,15 M, pH 7,0 až 7,4).
Ve výhodném provedení je na jednu aplikaci použito množství imunofúzinu v intervalu 50 ng/m2 až 1 g/m2, výhodněji pak 5 pg/m2 až 200 mg/m2 a nej výhodněji 0,1 mg/m2 až 50 mg/m2. Ve výhodném provedení je na jednu aplikaci použito množství nukleové kyseliny kódující imunofúzin v intervalu 1 pg/m2 až 10 mg/m2, výhodněji pak 20 pg/m2 až 10 mg/m2 a nejvýhodněji 400 pg/m2 až 4 mg/m2. Je zřejmé, že optimální způsoby aplikace a dávkování mohou být stanoveny na základě výsledků standardních experimentů v současnosti známých.
Příklady provedení vynálezu ' Vynález je dále ilustrován následujícími příklady, které ovšem nelimitují rozsah vynálezu.
Příklad 1
Exprese huFc-huEndostatin
Lidský endostatin byl exprimován ve formě fúzního proteinu lidský Fc-lidský endostatin postupem popsaným v publikaci Lo a další, Protein Engineering, 11:495 až 500, 1998. Symbol Fc označuje Fc fragment lidského imunoglobulinu gama (sekvence DNA je uvedena jako SEK. ID. Č.: 1; aminokyselinová sekvence pak jako SEK. ID. Č.: 2). cDNA kódující endostatin (SEK. ID. Č.: 3; aminokyselinová sekvence uvedena jako SEK. ID. Č.: 4) byla polymerázovou řetězcovou reakcí (PCR) upravena tak, aby mohla být exprimována jako fúzní protein Fc-Endo. Použitými přímými primery byl buď
9
primer 5'-CCCCGGGTAAACACAGCCACCGCGACTTCC (SEK. ID. Č.: 5; kódované aminokyseliny uvedeny jako SEK. ID. Č.: 6) nebo primer 5'-CAAGCTTCACAGCCACCGCGACTTCC (SEK. ID. Č.: 7; kódované aminokyseliny uvedeny jako SEK. ID. Č.: 8), kde sekvenci kódující N-konec endostatinu předcházely sekvence rozpoznávané restrikční endonukleázou Xmal, respektive Hindlll. Primer obsahující místo Xmal upravoval cDNA pro endostatin tak, aby mohla být zaligována do místa Xmal na konci domény CH3 v oblasti IgGFc. Primer obsahující místo HindlII upravoval cDNA pro endostatin tak, aby mohla být zaligována do místa HindlII ve vektoru pdCs-Fc(D4K) . Tento vektor obsahuje sekvenci Asp4-Lys rozpoznávanou enterokinázou (LaVallie a další, J. Biol. Chem., 268:23311 až 23317, 1993). Použitým reverzním primerem byl primer 5'CCTCGAGCTACTTGGAGGCAGTCATG (SEK. ID. Č.: 9), který byl navržen tak, aby okamžitě za C-konec endostatinu zavedl kodon pro ukončení translace (antikodon CTA) následovaný restrikčnim místem Xhol. Produkty amplifikované PCR byly klonovány a osekvenovány a fragment ohraničený restrikčními místy Xmal-Xhol byl zaligován do vektoru pdCs-Fc štěpeného stejnou dvojicí enzymů. Obdobně byl fragment ohraničený restrikčními místy HindlII/Xhol byl zaligován do vektoru pdCs-huFc(D4K) štěpeného stejnou dvojicí enzymů. Stabilní klony exprimující Fc-endo nebo Fc (D4K)-endostatin byly získány elektroporací buněk NS/0 a následnou selekcí v kultivačním médiu obsahujícím 100 nM methotrexát. Exprese proteinů byla testována metodou ELISA využívající protilátky proti lidskému Fc (Příklad 3) a potvrzena SDS-PAGE, kde byl pozorován proteinový produkt o velikosti přibližně 52 kDa. Klony produkující největší množství proteinu byly subklonovány limitním ředěním.
Příklad 2
• · 9 ·* ·
9· ·· • · · •999 ···
Kultivace buněk a transfekce
Transientní transfekce byly provedeny tak, že příslušný plazmid byl do lidských ledvinných buněk 293 zaveden koprecipitaci plazmidové DNA s fosforečnanem vápenatým (Sambrook a další, Molecular Cloning: a Laboratory Manual, 2. vydání, Cold Spring Harbor, New York, Cold Spring Harbor Laboratory, 1989) nebo lipofekcí s využitím Lipofectaminu Plus (Life Technologies, Gaithesburg, MD) postupem doporučeným výrobcem.
Stabilně transfekované klony byly připraveny elektroporací plazmidové DNA do buněk myšího myelomu NS/0. Buňky NS/0 byly kultivovány v Eaglově médiu modifikovaném podle Dulbecca doplněném 10% fetálním telecím sérem. Přibližně 5 x 105 buněk bylo jednou promyto PBS a rozsuspendováno v 0,5 ml PBS. S takto připravenými buňkami bylo následně v elektroporačni kyvetě Gene Pulser (vzdálenost elektrod 0,4 cm, BioRad, Hercules CA) po dobu 10 minut při 0°C inkubováno deset mikrogramů linearizované plazmidové DNA. Elektroporace byla provedena elektroporátorem Gene Pulser (BioRad, Hercules, CA) s nastaveními 0,25V a 500 pF. Buňky byly ponechány 10 minut na ledu a poté rozsuspendovány v kultivačním médiu a vysety na 96-ti jamkové destičky. Stabilně transfekované klony byly selektovány kultivací v médiu obsahujícím 100 nM methotrexát (MTX), který byl do média přidán dva dny po transfekcí. Selekční médium bylo měněno každé tři dny a klony rezistentní vůči methotrexátu se začaly objevovat za 2 až 3 týdny. Klony exprimující požadovaný protein byly identifikovány metodou ELISA s využitím protilátek proti Fc. Klony produkující velká množství rekombinantnich proteinů byly izolovány a namnoženy v kultivačním médiu obsahujícím 100 nM MTX.
Příklad 3
ELISA
Koncentrace proteinových produktů v supernatantech po kultivaci klonů rezistentních vůči MTX a v jiných testovaných vzorcích byly stanovovány třemi odlišnými metodami ELISA. Obsah proteinů zahrnujících lidský Fc byl stanovován metodou ELISA využívající protilátky proti lidskému Fc (huFc). Obsah proteinů zahrnujících myší Fc a psí Fc byl stanovován metodou ELISA využívající protilátky proti myšímu Fc (muFc), respektive psímu Fc (caFc). Postup ELISA využívající protilátky proti lidskému Fc je detailněji popsán v dalším textu.
A. Potahování destiček
96-ti jamkové destičky (Nunc-Immuno plate MaxiSorp™, Nalge Nunc International, Rochester, NY) byly potaženy AffiniPure Goat anti-Human IgG (H4-L) (Jackson ImmunoResearch Laboratories, West Grove, PA) v koncentraci 5 pg/ml v PBS v objemu 100 μΐ/jamka. Potažené destičky byly zakryty a inkubovány při 4°C přes noc. Následně byly destičky 4-krát promyty 0,05% Tweenem v PBS a blokovány roztokem 1% BSA/1% kozí sérum v PBS v objemu 200 μΐ/jamka. Blokování probíhalo 2 hodiny při 37°C, destičky byly následně 4-krát promyty 0,05% Tweenem v PBS a vysušeny poklepem na suché papírové ručníky.
B. Inkubace s testovaným vzorkem a sekundární protilátkou
Testované vzorky byly na vhodnou koncentraci zředěny vzorkovým pufrem obsahujícím 1% BSA/1% kozí sérum/0,05% Tween v PBS. S využitím chimérické protilátky (s lidským Fc) o známé koncentraci byla vytvořena standardní křivka. Standardní křivka byla vytvořena tak, že byla připravena
• 4 · · 9 ···· 44 444 ··· ředěni standardu ve vzorkovém pufru v intervalu 125 ng/ml až 3,9 ng/ml. Zředěné vzorky a standardy byly naneseny na destičky v objemu 100 μΐ/jamka a destičky byly následně inkubovány po dobu 2 hodináři 37 °C. Po inkubaci byly destičky 8-krát promyty 0,05% Tweenem v PBS. Následně bylo do každé jamky přidáno 100 μΐ sekundární protilátky proti lidskému IgG konjugované s křenovou peroxidázou (HRP) (Jackson ImmunoResearch Laboratories, West Grove, PA) v ředění přibližně 1:120000 ve vzorkovém pufru. Přesné ředění sekundární protilátky musí být stanoveno pro každou šarži protilátky proti lidskému IgG konjugované s HRP. Po dvouhodinové inkubaci při 37°C byly destičky 8-krát promyty 0,05% Tweenem v PBS.
C. Barvení
Roztok substrátu byl připraven rozpuštěním 30 mg (1 tableta) o-fenylendiamin dihydrochloridu (OPD) v 15 ml. pufru o složení 0,025M kyselina citrónová/0,05 M Na2HPC>4, pH 5, s čerstvě přidaným 0,03% H2O2. Do každé jamky na destičce bylo přidáno 100 μΐ tohoto substrátu. Barevná reakce probíhala v temnu 30 minut při pokojové teplotě. Trvání barevné reakce může být měněno v závislosti na variabilitě v potažení destiček, variabilitě sekundárních protilátek atp. Barevná reakce byla ukončena přídavkem 4N H2SO4 v objemu 100 μΐ/jamka. Absorbance byla detekována na čtečce destiček s nastavením odečítajícím od hodnot naměřených při vlnové délce 490 nm pozadí při vlnové délce 650 nm.
Stanoveni ELISA využívající protilátky proti muFc bylo podobné pouze s tou výjimkou, že jako primární protilátka byla použita AffiniPure Goat anti-murine IgG (H+L) (Jackson ImmunoResearch Laboratories, West Grove, PA) v koncentraci 5 μς/ml v PBS v objemu 100 μΐ/jamka; a jako sekundární protilátka, použitá v ředění 1 ku 5000, pak protilátka proti ♦ · · ♦ · · · • · · • · ♦ * • · · ·« ··· myšímu IgG (Fcy) konjugovaná s křenovou peroxidázou (Jackson ImmunoResearch Laboratories, West Grove, PA). Obdobně při stanovení ELISA využívající protilátky proti caFc byly destičky potaženy AffiniPure rabbit anti-dog IgG, specifické vůči Fc (Jackson ImmunoResearch Laboratories, West Grove, PA) v koncentraci 5 pg/ml v PBS v objemu 100 μΐ/jamka; a jako sekundární protilátka, použitá v ředění 1 ku 5000, pak protilátka proti psímu IgG (specifická vůči Fc) konjugovaná s křenovou peroxidázou (Jackson ImmunoResearch Laboratories, West Grove, PA).
Příklad 4
Exprese huFc-huAngiostatin
Lidský angiostatin (sekvence DNA uvedena jako SEK. ID. Č.: 10; aminokyselinová sekvence uvedena jako SEK. ID. Č.: 11) byl exprimován ve formě fúzního proteinu lidský Fclidský angiostatin (huFc-huAngio) způsobem v podstatě identickým postupu uvedenému v Příkladu 1. cDNA kódující angiostatin (SEK. ID. Č.: 3) byla metodou PCR upravena tak, aby mohla být exprimována ve vektorech pdCs-huFc nebo pdCshuFc(D4K) . Použitými přímými primery byl buď primer 5'CCCCGGGTAAGAAAGTGTATCTCTCAGAG (SEK. ID. Č.: 12; kódované aminokyseliny uvedeny jako SEK. ID. Č.: 13) nebo primer 5ZCCCCAAGCTTAAAGTGTATCTCTCAGAG (SEK. ID. Č.: 14; kódované aminokyseliny uvedeny jako SEK. ID. Č.: 15), kde sekvenci kódující N-konec angiostatinu předcházely sekvence rozpoznávané restrikční endonukleázou Xmal, respektive HindlII. Použitým reverzním primerem byl primer 5'CCCCTCGAGCTACGCTTCTGTTCCTGAGCA (SEK. ID. Č.: 16), který byl navržen tak, aby okamžitě za C-konec angiostatinu zavedl kodon pro ukončení translace (antikodon CTA) následovaný restrikčním místem Xhol. Produkty amplifikované PCR byly klonovány, a osekvenovány a fragment ohraničený restrikčními místy Xmal-Xhol byl zaligován do vektoru pdCs-Fc štěpeného stejnou dvojicí enzymů. Obdobně byl fragment ohraničený restrikčními místy HindlII/Xhol byl zaligován do vektoru pdCs-huFc(D4K) . Stabilní klony NS/0 exprimující huFc-huAngio nebo huFc (D4K)-huAngio byly selektovány a exprese testována postupy popsanými v příkladech 2 a 3.
Příklad 5
Exprese muFc-muEndostatin
Myší endostaťin (sekvence DNA uvedena jako SEK. ID. Č.: 17; aminokyselinová sekvence uvedena jako SEK. ID. Č.: 18) a myší Fc (sekvence DNA uvedena jako SEK. ID. Č.: 19; aminokyselinová sekvence uvedena jako SEK. ID. Č.: 20) byly exprimovány ve formě fúzního proteinu myší Fc-myší endostatin (muFc-muEndo) způsobem v podstatě identickým postupu uvedeném v Příkladu 1. cDNA kódující endostatin (SEK. ID. Č.: 4) byla metodou PCR upravena tak, aby mohla být exprimována ve vektoru pdCs-muFc(D4K) . Použitým přímým primerembyl primer 5'-CCCCAAGCTTCATACTCATCAGGACTTTC (SEK. ID. Č.: 21; kódované aminokyseliny uvedeny jako SEK. ID. Č.: 22), kde sekvenci kódující N-konec endostatinu předcházela sekvence rozpoznávaná restrikční endonukleázou HindlII. Použitým reverzním primerem byl primer 5'CCCCTCGAGCTATTTGGAGAAAGAGGTC (SEK. ID. Č.: 23), který byl navržen tak, aby okamžitě za C-konec endostatinu zavedl kodon pro ukončení translace (antikodon CTA) následovaný restrikčním místem Xhol. Produkt amplifikovaný PCR byl osekvenován a fragment kódující endostatin a ohraničený restrikčními místy HindlII/Xhol byl zaligován do vektoru pdCs-muFc(D4K) . Stabilní klony NS/0 exprimující muFc(D4K)muEndo byly selektovány a exprese testována (ELISA s využitím protilátek proti muFc) postupy popsanými v příkladech 2 a 3.
Přiklad 6
Exprese muFc-muAngiostatin
Myši angiostatin (sekvence DNA uvedena jako SEK. ID. Č.: 24; aminokyselinová sekvence uvedena jako SEK. ID. Č. : 25) byl exprimován ve- formě fúzniho proteinu myší Fc-myší angiostatin (muFc-muAngio) způsobem v podstatě identickým postupu uvedeném v Příkladu 1. cDNA kódující angiostatin (SEK. ID. Č.: 6) byla metodou PCR upravena tak, aby mohla být exprimována ve vektoru pdCs-Fc (D4K) . Použitým přímým primerem byl primer 5'CCCCAAGCTTGTGTATCTGTCAGAATGTAAGCCCTCCTGTCTCTGAGCA (SEK. ID. Č.: 26; kódované aminokyseliny uvedeny jako SEK. ID. Č.: 27), kde sekvenci kódující N-konec angiostatinu předcházela sekvence rozpoznávaná restrikční endonukleázou HindlII. Použitým reverzním primerem byl primer 5'CCCCTCGAGCTACCCTCCTGTCTCTGAGCA (SEK. ID. Č.: 28), který byl navržen tak, aby okamžitě za C-konec angiostatinu zavedl kodon pro ukončení translace (antikodon CTA) následovaný restrikčním místem Xhol (CTCGAG). Produkt amplífikovaný PCR byl osekvenován a fragment kódující angiostatin a ohraničený restrikčními místy HindlII/Xhol byl zaligován do vektoru pdCs-muFc(D4K) . Stabilní klony NS/0 exprimující muFc(D4K)muAngio byly selektovány a exprese testována (ELISA s využitím protilátek proti muFc) postupy popsanými v příkladech 2 a 3.
Příklad 7
Exprese psího Fc (caFc)
K izolaci mRNA byly využity monocyty z periferní krve psů. Po syntéze prvního řetězce cDNA s využitím reverzní transkriptázy a oligo(dT) byl psí Fc (Kazuhiko a další, JN 19920408.94-A1, 1992) amplifikován přístupem PCR. Použitým • 9 přímým primerem byl primer 5'-CCTTAAGCGAAAATGGAAGAGTTCCTCGC (SEK. ID. Č.: 29; aminokyselinová sekvence uvedena jako SEK. ID. Č.: 30), kde sekvenci kódující pantovou oblast psího Fc předcházela sekvence rozpoznávaná restrikční endonukleázou AflII. Použitým reverzním primerem byl primer 5'CCTCGAGTCATTTACCCGGGGAATGGGAGAGGGATTTCTG (SEK. ID. Č. : 31), který za kodon pro ukončení translace (antikodon TCA) v sekvenci psího Fc zavádí restrikční místo Xhol. Tento reverzní primer rovněž do sekvence zavedl tichou mutaci, kterou bylo vzniklo restrikční místo Xmal usnadňující konstrukci vektoru pdCs-caFc (D4K) tím, že bude využito linkeruadaptoru a ligace konstruktů DNA kódujících psí endostatin a angiostatin. Expresívní vektor pdCs-caFc byl zkonstruován způsobem podobných postupu při konstrukci vektoru pdCs-huFc (Lo a další, Protein Engineering, 11:495, 1998). Fragment kódující psi Fc a ohraničený restrikčními místy AflII-XhoI byl ligován s fragmentem Xbal-AflII kódujícím signální peptid pro lehký řetězec a vektorem pdCs, štěpeným restrikčními endonukleázami Xbal-Xhol. Takto připravený expresívní vektor pdCs-caFc byl následně využit k transfekci buněk 293. Přibližně tři dny po transfekci byl supernatant purifikován chromatografií na Sepharóze s navázaných proteinem A. Exprese psího Fc (sekvence DNA uvedena jako SEK. ID. Č.: 32; aminokyselinová sekvence uvedena jako SEK. ID. Č.: 33) byla potvrzena SDS-PAGE a následným Western blotem využívajícím králičí protilátku proti psímu IgG konjugovanou s křenovou peroxidázou (Jackson ImmunoResearch Laboratories, West Grove, PA).
Příklad 8
Exprese caFc-caEndostatin
K sekvenci kódující psí endostatin (sekvence DNA uvedena jako SEK. ID. Č.: 34; aminokyselinová sekvence uvedena jako
SEK. ID. Č.: 35) byla metodou PCR přidána místa HindlII/XhoI tak, aby získaný fragment mohl být exprimován ve formě fúzního proteinu s Fc (postup je v podstatě totožný s postupem popsaným v příkladu 5). Na 3' konci byl metodou PCR za kodon kódující C-koncový lysin zaveden stop kodon a restrikční místo Notl. Na 5' konci již bylo přítomno restrikční místo DralII využitelné pro další klonování. Chemickou syntézou byl připraven oligonukleotidový duplex ohraničený kohézními konci HindlII a DralII a tento duplex byl použit k ligaci s restrikčním fragmentem DralII/XhoI kódujícím zbylou část cDNA psího endostatinu. Použitý duplex má následující sekvenci:
HindlII
5'-AGCTTCACACCCACCAGGACTTCCAGCCGGTGCTGCACCTG (SEK. ID. Č. : 36)
AGTGTGGGTGGTCCTGAAGGTCGGCCACGACGTG-5' (SEK, ID. Č.: 38)
DralII
První CAC triplet kóduje N-koncový histidinový zbytek psího endostatinu. Fragment HindlII/Xhol, kódující nezkrácený psí endostatin, může být tudíž zaligován do expresívního vektoru pdCs-caFc štěpeného restrikčními enzymy HindlII/XhoI (viz. Příklad 7). Stabilní klony NS/0 exprimující caFc-caEndo byly selektovány a exprese testována (ELISA s využitím protilátek proti caFc) postupy popsanými v příkladech 2 a 3. Proteinový produkt byl analyzován SDS-PAGE a exprese byla potvrzena Western blotem.
Příklad 9
Exprese caFc-caAngiostatin cDNA kódující nezkrácený psí angiostatin (sekvence DNA uvedena jako SEK. ID. Č.: 39; aminokyselinová sekvence uvedena jako SEK. ID. Č.: 40) byla pro expresi ve formě fúzní ho proteinu s caFc upravena způsobem v podstatě identickým s postupy uvedenými v předchozích příkladech. Stručně vzato, na 3 konci byl metodou PCR za kodon kódující C-koncový lysin zaveden stop kodon a restrikční místo Notl. Místem Notl bylo nahrazeno místo Xhol, protože toto místo (Xhol) je rovněž přítomno uvnitř sekvence cDNA kódující psí angiostatin. Na 5' konci bylo, ve stejném čtecím rámci, před sekvenci kódující N-konec angiostatinu, zavedeno restrikční místo HindlII. Fragment HindiII/NotI, kódující nezkrácený psí angiostatin, byl následně zaligován do expresívního vektoru pdCs-caFc štěpeného restrikčními enzymy HindlII/Notl (zde bylo místo Notl zavedeno v místě Xhol ligací linkeru). Stabilní klony NS/0 exprimující caFc-caAngio byly selektovány a exprese testována (ELISA s využitím protilátek proti caFc) postupy popsanými v příkladech 2 a 3. Proteinový produkt byl analyzován SDS-PAGE a exprese byla potvrzena Western blotem.
Příklad 10
Exprese muFc-muKl z muAngio
Angiostatin zahrnuje první čtyři z pěti domén kringle přítomných v plazminogenu. Za účelem stanovení, zda-li je za pozorovanou anti-angiogenní aktivitu angiostatinu zodpovědná jakákoliv z domén kringle nebo několik domén kringle, je možné exprimovat každou doménu kringle samostatně nebo kombinace těchto domén. Aby bylo možné prokázat vhodnost oblasti Fc jako fúzního partnera, byla nejprve následujícím způsobem exprimována první doména kringle myšího angiostatinu (Kl). První doména kringle myšího angiostatinu je ukončena aminokyselinovým zbytkem Glu-87 (SEK. ID. Č.: 25). V sekvenci cDNA je na této pozici vhodné restrikční místo Nsil; tedy, po rozštěpeni cDNA restrikční endonukleázou Nsil byl čtyř nukleotidový 3'-přesah odstraněn polymerázou
T4, čímž byl vytvořen tupý konec. Ligací palindromového linkeru TGACTCGAGTCA (SEK. ID. Č.: 41) byl po směru transkripce za triplet GAA kódující Glu-87 vložen stop kodon (TGA) následovaný restrikčním místem Xhol. Fragment HindlII/XhoI kódující tento zkrácený angiostatin, tj. pouze první doménu kringle, byl následně zaligován do expresívního vektoru pdCs-muFc(D4K) . Analýza exprese prováděná metodou ELISA s využitím protilátek proti muFc a SDS-PAGE potvrdila vysokou hladinu exprese jak u tranzientně, tak u stabilně transfekovaných buněk.
Příklad 11
Exprese muFc-vnitřní K1 z muAngio
Každá doména kringle obsahuje několik smyček, a to včetně vnější a vnitřní smyčky. V první doméně kringle myšího angiostatinu je vnitřní smyčka definována aminokyselinovými zbytky Cys55 a Cys79, které spoluvytvářejí disulfidovou vazbu v základně smyčky. Aminokyselinový zbytek Cys67 ve vnitřní smyčce vytváří další disulfidovou vazbu s cysteinovým zbytkem z vnější smyčky, čímž vzniká struktura kringle. Za účelem zjištění, zda-li vnitřní smyčka vykazuje antiangiogenní aktivitu, byl následujícím postupem exprimován fúzní protein muFc-vnitřní K1 (kringle 1). Metodou PCR, využívající jako templát fragment DNA kódující první doménu kringle a mutagenní primer o sekvenci 5'GGGCCTTGGAGCTACACTACA (SEK. ID. Č.: 42; aminokyselinová sekvence uvedena jako SEK. ID. Č.: 43), byl triplet TGC kódující Cys65 zaměněn za triplet AGC kódující serin. Tato mutageneze zajišťuje, že Cys67 nebude vytvářet disulfidickou vazbu v případě, když bude vnitřní smyčka domény kringle 1 exprimována bez smyčky vnější. K zavedení restrikčního místa HindlII (ve stejném čtecím rámci) okamžitě na 5' konec kodonu pro Ser45 (AGT) . byl použit přímý primer o sek věnci 5'-GCGGATCCAAGCTTAGTACACATCCCAATGAGGG (SEK. ID. Č.: 44; aminokyselinová sekvence uvedena jako SEK. ID. Č.: 45) . Okamžitě proti směru transkripce před místo HindlII bylo zavedeno místo BamHI. Toto místo BamHI je užitečné pro ligaci do místa BamHI na konci flexibilního linkeru Ser-Gly (viz. Příklad 12). Fragment DNA ohraničený restrikčními . místy HindlII/Xhol a v myším angiostatínu kódující aminokyselinové zbytky Ser43 až Glu87 byl zaligován do expresívního vektoru pdCs-muFc(D4K) . Analýza exprese muFc-vnitřní K1 prováděná metodou ELISA s využitím protilátek proti muFc a SDS-PAGE potvrdila vysokou hladinu exprese jak u tranzientně, tak u stabilně transfekovaných buněk.
Příklad 12
Exprese muFc-muEndo-GlySer linker-vnitřní K1 z muAngio Hybridní molekula muFc-muEndo-vnitřní K1 zahrnuje část muFc-muEndo připojenou k vnitřní smyčce první domény kringle myšího angiostatínu prostřednictvím polypeptidového linkeru obsahujícího glycinové a serinové zbytky. Tento konstrukt DNA byl sestaven následujícím způsobem.
Na 3' konci cDNA kódující myší endostatin je restrikční místo BspHI. Flexibilní linker glycinových a serinových aminokyselinových zbytků byl na C-konec myšího endostatinu připojen tak, že fragment HindlII/BspHI o velikosti 540-bp kódující endostatin byl ligován s dvojvláknovou strukturou (duplexem) vytvořenou z oligonukleotidů popsaných sekvencemi SEK. ID. Č.: 46 a SEK. ID. Č.: 48. Aminokyselinová sekvence kódovaná nukleotidovou sekvencí SEK. ID. Č.: 46 je uvedena jako sekvence SEK. ID. Č.: 47.
Fragment HindlII/BamHI kódující myší endostatin a linker Gly-Ser byl subklonován do standardního klonovacího vektoru. Místo BamHI bylo následně využito k zaklonování fragmentu BamHI/XhoI kódujícího vnitřní K1 z Příkladu 11. Takto
připravený fragment HindlII/Xhol kódující muEndoGlySer linker-vnitřní K1 byl zaligován do expresívního vektoru pdCs-muFc(D4K) . Analýza exprese muFc-muEndoGlySer linker-vnitřní K1 prováděná metodou ELISA s využitím protilátek proti muFc a SDS-PAGE potvrdila vysokou hladinu exprese jak u tranzientně, tak u stabilně transfekovaných buněk.
Příklad 13
Exprese muFc-muEndo-GlySer linker-Kl z muAngio
Hybridní molekula muFc-muEndo-Kl zahrnuje část muFcmuEndo připojenou k první doméně kringle myšího angiostatinu prostřednictvím polypeptidového linkeru obsahujícího glycinové a serinové zbytky. Tento konstrukt DNA byl sestaven následujícím způsobem.
K ligaci BamHI konce fragmentu ohraničeného restrikčními místy HindlII/BamHI kódujícího muEndo-GlySer linker (Příklad 12) k fragmentu HindlII/Xhol kódujícímu doménu kringlel myšího angiostatinu (Příklad 10) byl využit následující adaptor:
BamHI
5' GATCCTCAGGCC (SEK. (SEK. ID. Č. : 4 9) ID. Č.: 50)
GAGTCCGGTCGA HindlII
Tento adaptor obsahuje kohezní konec HindlII ', který ale
po ligaci restrikční místo HindlII zruší. Takto připravený
fragment HindlII/Xhol kódující muEndo-GlySer linker-Kl byl zaligován do expresívního vektoru pdCs-muFc(D4K) . Analýza exprese muFc-muEndo-GlySer linker-Kl prováděná metodou ELISA s využitím protilátek proti muFc a SDS-PAGE potvrdila • ·· · vysokou hladinu exprese jak u tranzientně, tak u stabilně transfekovaných buněk.
. Příklad 14
Exprese muFc-muEndo-GlySer linker-muAngio
Hybridní molekula muFc-muEndo-GlySer linker-muAngio zahrnuje část muFc-muEndo připojenou k myšímu angiostatinu prostřednictvím polypeptidového linkeru obsahujícího glycinové a serinové zbytky. Tento konstrukt DNA byl sestaven následujícím způsobem. Prostřednictvím adaptoru popsaného v Příkladu 13 byl BamHI konec fragmentu ohraničeného restrikčnimi místy HindlII/BamHI kódujícího muEndoGlySer linker (Příklad 12) připojen k fragmentu HindlII/XhoI kódujícímu myší angiostatin. Takto připravený fragment HindlII/Xhol kódující muFc-muEndo-GlySer linkermuAngio byl zaligován do expresivního vektoru pdCsmuFc(D4K). Analýza exprese muFc-muEndo-GlySer linker-muAngio prováděná metodou ELISA s využitím protilátek proti muFc a SDS-PAGE potvrdila vysokou hladinu exprese jak u tranzientně, tak u stabilně transfekovaných buněk.
Příklad 15
Exprese huAngio-huFc-huEndo
Hybridní molekula huAngio-huFc-huEndo obsahuje lidský angiostatin připojený peptidovou vazbou k huFc-huEndo. Tento konstrukt DNA byl sestaven následujícím způsobem. Nejprve byl metodou PCR připraven fragment HindlII/Xhol kódující lidský angiostatin bez stop kodonu. Za kodonem pro poslední aminokyselinový zbytek angiostatinu okamžitě následovala sekvence CTCGAG rozpoznávaná restrikčním enzymem Xhol. S využitím adaptoru Af111/HindIII' byl 5' konec (s místem HindlII) tohoto fragmentu ligován s fragmentem Xbal/AflII kódujícímu signální peptid lehkého řetězce (Lo a další,
• ·
Protein Engineering, 11:495, 1998). Sekvence použitého adaptoru Af111/HindIII' je následující:
AflII
5' TTAAGCGGCC (SEK. ID. Č.: 51)
CGCGGGTCGA (SEK. ID. Č.: 52)
HindlII'
Tento adaptor obsahuje kohezní konec HindlII', který ale po ligaci restrikční místo HindlII zruší. Místo Xhol na 3' konci bylo prostřednictvím adaptoru Xhol'/AflII ligováno do místa AflII z fragmentu AflII/XhoI kódujícího huFc-huEndo. Sekvence použitého adaptoru XhoI'/AflII je následující:
Xhol'
5'TCGACTCCGGC (SEK. ID. Č.: 53)
GAGGCCGAATT (SEK. ID. Č. : 54)
AflII
Tento adaptor obsahuje kohezní konec Xhol', který ale po ligaci restrikční místo Xhol zruší. Takto připravený fragment Xbal/Xhol kódující signální peptid-lidský angiostatinhuFc-lidský endostatin byl zaligován do expresívního vektoru pdCs. Analýza exprese rekombinantního proteinu prováděná metodou ELISA s využitím protilátek proti muFc a SDS-PAGE potvrdila vysokou hladinu exprese jak u tranzientně, tak u stabilně transfekovaných buněk.
Příklad 16
Farmakokinětiká
V jedné sérii farmakokinetických experimentů bylo myším C57/BL6 s implantovanými nádory Lewisova karcinomu plic o objemu 100 až 200 mm3 do ocasní žíly injikováno 720 pg huFc44
huAngio na jednu myš. Objem nádorů a dávka huFc-huAngio byly zvoleny tak, aby napodobovaly protokol popsaný v publikaci O'Reilly a další, Nátuře Medicíně, 2:689, 1996. 1/2, 1, 2, 4, 8, 24 a 48 hodin po injekci byly myším retrorbitálně odebírány vzorky krve. Tyto vzorky byly analyzovány metodou ELISA s využitím protilátek proti huFc a Western blotem. Bylo zjištěno, že huFc-huAngio má v organizmu myši biologický poločas přibližně 32 hodin a analýza metodou Western blot prokázala, že více než 90% huFc-huAngio zůstává v krevním oběhu v intaktní formě.
Tyto farmakokinetické studie byly rovněž opakovány s využitím myší Swiss bez nádorů a při použití dávek 200 pg/myš. V tomto případě byl biologický poločas huFc-huAngio v organizmu myší přibližně 33 hodin.
Předkládaný vynález může být, bez odchýlení se od své podstaty nebo základních charakteristik, aplikován i jinými než popsanými způsoby. Příklady provedení vynálezu uvedené v předchozích textu by tudíž měly být považovány za toliko ilustrativní a ne jakýmkoliv způsobem limitující rozsah vynálezu. Rozsah vynálezu je tudíž definován především připojenými patentovými nároky a ne uvedeným popisem a veškeré změny, které jsou ekvivalentní údajům popsaným patentovými nároky spadají rovněž do rozsahu vynálezu.
SEZNAM SEKVENCÍ <110>
<120>
Lo, Kin-Ming
Li, Yue
Gillies, Stephen D
Exprese a export inhibitorů angiogeneze ve formě imunofúzinů
<130> LEX-006PC
<140> <141>
<150> <151> US 60/09788 1998-08-25
<160> 54
<170> Patentln Ver. 2.0
<210> 1 <211> 696 <212> DNA <213> Homo sapiens <220>
<221> CDS <222> (.1) . . (696) <223> Fragment Fc lidského imunoglobulinu typu gama <400> 1
gag Glu 1 ccc aaa tet tet Ser 5 gac Asp aaa Lys act Thr cac aca tgc Cys cca ccg tgč Cys cca Pro 15 gca Ala · 48
Pro Lys Ser His Thr 10 Pro Pro
cct gaa ctc ctg ggg gga ccg tea gtc ttc ctc ttc ccc cca aaa ccc 96
Pro Glu Leu Leu Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro
20 25 30
i aag gac acc ctc atg atc tec cgg acc cct gag gtc aca tgc gtg gtg 144
Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val Val
35 40 45
gtg gac gtg age cac gaa gac cct gag gtc aag ttc aac tgg tac gtg 192
Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp Tyr Val
50 55 60
gac ggc gtg gag gtg cat aat gcc aag aca aag ccg cgg gag gag cag 240
Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gin
65 70 75 80
tac aac age a cg tac cgt gtg gtc age gtc ctc acc gtc ctg cac cag 288
Tyr Asn Šer Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His Gin
85 90 95
gac tgg ctg aat ggc aag gag tac aag tgc aag gtc tcc aac aaa gcc 336
Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys Ala
100 105 110
ctc cca gcc ccc atc gag aaa acc atc tcc aaa gcc aaa ggg cag ccc 384
• · ·« » » * · *
Leu Pro Ala 115 Pro Ile Glu Lys Thr 120 Ile Ser Lys Ala Lys 125 Gly Gin Pro
ega gaa cca cag gtg tac acc ctg ccc cca tea cgg gag gag atg acc 432·
Arg Glu Pro Gin Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Glu Glu Met Thr
130 135. 140
aag aac Cag gtc ágc ctg acc tgc ctg gtc aaa ggc ttc tat ccc age 480
Lys Asn Gin Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser '
145 150 155 160
gac atc gcc gtg gag tgg gag age aat ggg cag ccg gag aac aac tac 528
Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gin Pro Glu Asn Asn Tyr
165 .170 175
aag acc a cg cct ccc. gtg ctg gac tcc gac ggc tcc ttc ttc ctc tat 57 6
Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu Tyr
180 185 190
age aag ctc acc gtg gac aag age agg tgg cag cag ggg aac gtc ttc 624
Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gin Gin Gly Asn Val Phe
195 200 205
tea tgc tec gtg atg cat gág get ctg cac aac cac tac acg cag aag 672
Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr Gin Lys
210 215 220
age ctc tec ctg tcc ccg ggt aaa 696
Ser Leu Ser Leu Ser Pro Gly Lys
225 230
<210> 2 <211> 232 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 2
Glu 1 Pro Lys Ser Ser 5 Asp Lys Thr His Thr 10 Cys Pro Pro Cys Pro 15 Ala
Pro Glu Leu Leu 20 Gly Gly Pro Ser Val 25 Phe Leu Phe Pro Pro 30 Lys Pro
Lys Asp Thr 35 Leu Met Ile Ser Arg 40 Thr Pro Glu Val Thr 45 Cys Val Val
Val Asp. Val 50 Ser His· Glu Asp 55 Pro Glu Val Lys Phe 60 Asn Trp Tyr Val
Asp 65 Gly Val Glu Val His 70 Asn Ala Lys Thr Lys 75 Pro Arg Glu Glu Gin 80
Tyr Asn Ser Thr Tyr 85 Arg Val Val· Ser Val 90 Leu Thr Val Leu His 95 Gin
Asp Trp Leu Asn 100 Gly Lys Glu Tyr Lys 105 Cys Lys Val Ser Asn 110 Lys Ala
• ·
Leu Pro Ala Pro Ile Glu Lys Thr Ile Ser • · • · · · J.ys jGly ÍGIr «· · řr<?
115 120 • ♦ ·· · • · • · 125, J » *« · • ·
Arg Glu Pro Gin Val Tyr Thr Leu Pro Pro Šer Arg Glu Glu Met Thr
130 135 140
Lys Asn Gin Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser
145 150 155 160
Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gin Pro Glu Asn Asn Tyr
165 170 175
Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu Tyr
180 185 190
Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gin Gin Gly Asn Val Phe
195 200 205
Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr Gin Lys
210 215 220
Ser Leu Ser Leu Ser Pro Gly Lys
225 230
<210> 3 <211> 549 <212> DNA <213> Homo sapiens <220>
<221> CDS <222> (1)..(549) <223> endostatin <400> 3
cac agc His Ser 1 cac cgc His Arg gac ttc cag ccg gtg ctc cac ctg gtt gcg ctc Leu 15 aac Asn 48
Asp 5 Phe Gin Pro Val Leu 10 His Leu Val Ala
agc ccc ctg tca ggč ggc atg cgg ggc atc cgc ggg gcc gac ttc cag 96
Ser Pro Leu Ser Gly Gly Met Arg Gly Ile Arg Gly Ala Asp Phe Gin
20 25 30
tgc ttc cag cag gcg cgg gcc gtg ggg ctg gcg ggc acc ttc cgc gcc 144
Cys Phe Gin Gin Ala Arg Ala Val Gly Leu Ala Gly Thr Phe Arg Ala
35 40 45
ttc ctg tcc tcg cgc ctg cag gac ctg tac agc atc gtg cgc cgt gcc 192
Phe Leu Ser Ser Arg Leu Gin Asp Leu Tyr Ser Ile Val Arg Arg Ala
50 55 60
gac cgc gca gcc gtg ccc atc gtc aac ctc aag gac gag ctg ctg ttt 240
Asp Arg Ala Ala Val Pro Ile Val Asn Leu Lys Asp Glu Leu. Leu. Phe
65 70 75 80
ccc agc tgg gag gct ctg ttc tca ggc tet gag ggt ccg ctg aag ccc 288
Pro Ser Trp Glu Ala Leu Phe Ser Gly Ser Glu Gly Pro Leu Lys Pro
85 90 95
·· ·« • · 4 4 4 4« • ·* ·· • · • • 4 •
• 4 · • · · · • • • · · • · • •
ggg gca cgc atc ttc tcc ttt gac ggc aag gaV*<ftc**ctg c*ác • · ccc ttt
Gly Ala Arg Ile Phe Ser Phe Asp Gly Lys Asp Val Leu Arg His Pro
100 105 110
acc tgg ccc cag aag agc gtg tgg cat ggc tcg gac ccc aac ggg cgc 384
Thr Trp Pro Gin Lys Ser Val Trp His Gly Ser Asp Pro Asn Gly Arg
115 120 125
agg ctg acc gag agc tac tgt gag acg tgg cgg acg gag gct ccc tcg 432
Arg Leu Thr Glu Ser Tyr Cys Glu Thr Trp Arg Thr Glu Ala Pro Ser
130 135 140
gcc acg ggc cag gcc tcc tcg ctg ctg .ggg ggc agg ctc ctg ggg cag 480
Ala Thr Gly Gin Ala Ser Ser Leu Leu Gly Gly Arg Leu Leu Gly Gin
145 150 155 160
agt gcc gcg agc tgc cat cac gcc tac atc gtg ctc tgc att gag aac 528
* Ser Ala Ala Ser Cys His His Ala Tyr Ile Val Leu Cys Ile Glu Asn
165 170 175
, agc ttc atg act gcc tcc aag 549
Ser Phe Met Thr Ala Ser Lys
180
<210> 4
<211> 183
<212> PRT .
<213> Homo sapiens
<400> 4
1 His 1 Ser His Arg Asp Phe Gin Pro Val Leu His Leu Val Ala Leu Asn 15
5 10
Ser Pro Leu Ser Gly Gly Met Arg Gly Ile Arg Gly Ala Asp Phe Gin
20 25 30
Cys Phe Gin Gin Ala Arg Ala Val Gly Leu Ala Gly Thr Phe Arg Ala
35 40 45
Phe Leu Ser Ser Arg Leu Gin Asp Leu Tyr Ser Ile Val Arg Arg Ala
50 55 60
Asp Arg Ala Ala Val Pro Ile Val Asn Leu Lys Asp Glu Leu Leu Phe
65 70 75 80
Pro Ser Trp Glu Ala Leu Phe Ser Gly Ser Glu Gly Pro Leu Lys Pro
I 85 90 95
Gly Ala Arg Ile Phe Ser Phe Asp Gly Lys Asp Val Leu Arg His Pro
100 105 110
Thr Trp Pro Gin Lys Ser Val Trp His Gly Ser Asp Pro Asn Gly Arg
115 120 125
Arg Leu Thr Glu Ser Tyr Cys Glu Thr Trp Arg Thr Glu Ala Pro Ser
130 135 140
Ala 145 Thr'Gly Gin Ala Ser 150 Ser Leu Leu Gly Gly Arg 155 Leu Leu Gly Gin 160
Ser Ala Ala Ser Čys 165 His His Ala Tyr Ile 170 Val Leu Cys Ile Glu 175 Asn
Ser Phe Met Thr Ala Ser Lys
180 <210> 5 <211> 30 <212> DNA <213> Uměle připravená sekvence <220>
<223> Popis uměle připravené sekvence: Přímý primer pro lidský Fc-Endo <220>
<221> CDS <222> (3)..(29) <400> 5 cc ccg ggt aaa cac agc cac cgc gac ttc c 30
Pro Gly Lys His Ser His Arg Asp Phe ' 1 5 <210> 6 <211> 9 <212> PRT <213> Uměle připravená sekvence <400> 6
Pro Gly Lys His Ser His Arg Aso Phe
5 <210> 7 <211> 26 <212> DNA <213> Uměle připravená sekvence <220>
<223> Popis uměle připravené sekvence: Přímý primer pro lidský Fc-Endo <220>
<221> CDS <222> (2) . .(25) <400> 7' c aag ctt cac agc cac cgc gac ttc c Lys Leu His Ser His Arg Asp Phe 1 5 <210> 8 <211> 8 <212> PRT <213> Uměle připravená sekvence
<400> 8
Lys Leu His 1 Ser His Arg Asp Phe 5
<210> 9 <211> 26 <212> DNA <213> Uměle připravená sekvence <220>
<223> Popis uměle připravené sekvence: Reverzní primer pro lidský FcEndo <400> 9 cctcgagcta cttggaggca gtcatg <210> 10 <211> 1089 <212> DNA <213> Homo sapiens <220>
<221> CDS <222> (1) . . (1089) <223> angiostatin <400> 10
aaa Lys 1 gtg tat ctc tea Leu Ser 5 gag tgcaag act ggg aat gga aag aac tac Tyr 15 aga Arg 48
Val Tyr Glu Cys Lys Thr Gly 10 Asn Gly Lys Asn
ggg acg atg tcc aaa aca aaa aat ggc atc acc' tgt caa. aaa tgg agt 96
Gly Thr Met Ser Lys Thr Lys Asn Gly Ile Thr Cys Gin Lys Trp Ser
20 25 30
tcc act tet ccc cac aga cct aga ttc tea cct gct aca cac ccc tea 144
Ser Thr Ser Pro His Arg Pro Arg Phe Ser Pro Ala Thr His Pro Ser
35 40 45
gag gga ctg gag gag aac tac tgc agg aat cca gac aac gat ccg cag 192
Glu Gly Leu Glu Glu Asn Tyr Cys Arg Asn Pro Asp Asn Asp Pro Gin
50 55 60
ggg ccc tgg tgc tat act act gat cca gaa aag aga tat gac tac tgc 240
Gly Pro Trp Cys Tyr Thr Thr Asp Pro Glu Lys Arg Tyr Asp Tyr Cys
65 70 75 80
gac att ctt gag tgt gaa gag gaa tgt atg cát tgc agt gga gaa aac 288
Asp Tle Leu Glu Cys Glu Glu Glu Cys Met His Cys Ser Gly Glu Asn
85 90 95
tat gac ggc aaa att tcc aag acc atg tet gga ctg gaa tgc cag gcc 336
Tyr Asp Gly Lys Ile Ser Lys Thr Met Ser Gly Leu Glu Cys Gin Ala
100
105
110
tgg gac tet cag age cca cac get cat His gga Gly tac Tyr att cct Ile Pro 125 tec Ser aaa Lys ttt Phe 384
Trp Asp Ser 115 Gin Ser Pro His Ala 120
cca aac aag aac ctg aag aag aat tac tgt cgt aac ccc gat agg gag 432
Pro Asn Lys Asn Leu Lys Lys Asn Tyr Cys Arg Asn Pro Asp Arg Glu
130 135 140
ctg cgg cct tgg tgt ttc acc acc gac ccc aac aag ege tgg gaa ctt 480
Leu Arg Pro Trp Cys Phe Thr Thr Asp Pro Asn Lys Arg Trp Glu Leu
145 150 155 160
tgc gac .atc ccc ege tgc aca aca cct cca cca tet tet ggt ccc acc 528
Cys Asp Ile Pro Arg Cys Thr Thr Pro Pro Pro Ser Ser Gly Pro Thr
165 170 175
tac cag tgt ctg aag gga aca ggt gaa aac tat ege ggg aat gtg get 576
Tyr Gin Cys Leu Lys Gly Thr Gly Glu Asn Tyr Arg Gly Asn Val. Ala
180' 185 190
gtt acc gtt tec ggg cac acc tgt cag cac tgg agt gca- fcag acc cct 624
Val Thr Val Ser Gly His Thr Cys Gin His Trp Ser Ala Gin Thr Pro
195 200 205
cac aca cat aac agg aca cca gaa aac ttc ccc tgc aaa aat ttg gat 672
His Thr His Asn Arg.Thr Pro Glu Asn Phe Pro Cys Lys Asn Leu Asp
210 215 220
gaa aac tac tgc ege aat cct gac gga aaa agg gcc cca tgg tgc cat 720
Glu Asn Tyr Cys Arg Asn Pro Asp Gly-Lys Arg Ala Pro Trp cys His '
225 230 235 240
aca acc aac age caa gtg ,cgg tgg gag tac tgt aag ata ccg tec tgt 768
Thr Thr Asn Ser Gin Val Arg Trp Glu Tyr Cys Lys Ile Pro Ser Cys
245 250 255
gac tec tec cca gta tec acg gaa caa ttg get ccc aca gca cca cct 816
Asp Ser Ser Pro Val Ser Thr Glu Gin Leu Ala Pro Thr Ala Přo Pro
260 265 270
gag cta acc cct gtg gtc cag gac tgc tac cat ggt gat gga cag age 864
Glu Leu Thr Pro Val Val Gin Asp Cys Tyr His Gly Asp Gly Gin Ser
275 280 285
tac ega ggc aca tec tec acc acc acc aca gga aag aag tgt cag tet 912
Tyr Arg Gly Thr Ser Ser Thr Thr Thr Thr Gly Lys Lys Cys Gin Ser
290 295 300
tgg tea tet atg aca cca cac cgg cac cag. aag acc cca gaa aac tac 960
Trp Ser Ser Meť Thr Pro His Arg His Gin Lys Thr Pro Glu Asn Tyr
305 310 315 320
cca aat get ggc ctg aca atg aac tac tgc agg aat cca gat gcc gat 1008
Pro Asn Ala Gly Leu Thr Met Asn Tyr Cys Arg Asn Pro Asp Ala Asp'
325 330 335
aaa ggc ccc tgg tgt ttt acc aca gac ccc age gtc agg tgg gag tac 1056
1089
Lys Gly Pro Trp 340 Cys Phe Thr Thr Asp Pro Ser Val Arg Trp Glu Tyr
345 350
tgc aac ctg aaa aaa tgc tea gga aca gaa gcg
Cys Asn Leu Lys Lys Cys Ser Gly Thr Glu Ala
355 360
<210> 11
<211> 343
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 11
Lys Val Tyr Leu Ser Glu Cys Lys Thr Gly Asn Gly Lys Asn Tyr Arg
1 5 10 15
Gly Thr Met Ser Lys Thr Lys Asn Gly Ile Thr Cys Gin Lys Trp Ser
20 25 30
Ser Thr Ser Pro His Arg Pro Arg Phe Ser Pro Ala Thr His Pro Ser
35 40 45
Glu Gly Leu Glu Glu Asn Tyr Cys Arg Asn Pro Asp Asn Asp Pro Gin
50 55 60
Gly Pro Trp Cys Tyr Thr Thr Asp Pro Glu Lys Arg Tyr Asp Tyr Cys
65 70 75 80
Asp lije Leu Glu Cys Glu Glu Glu Cys Met His Cys Ser Gly Glu Asn
85 90 95
Tyr Asp Gly Lys Ile Ser Lys Thr Met Ser Gly Leu Glu Cys Gin Ala
100 105 110
Trp Asp Ser Gin Ser Pro His Ala His Gly Tyr Ile Pro Ser Lys Phe
115 120 125
Pro Asn Lys Asn Leu Lys Lys Asn Tyr Cys Arg Asn Pro Asp Arg Glu
130 135 140
Leu Arg Pro Trp Cys Phe Thr Thr Asp Pro Asn Lys Arg Trp Glu Leu
* 145 150 155 160
Cys Asp Ile Pro' Arg Cys Thr Thr Pro Pro Pro Ser Ser Gly Pro Thr
165 170 175
Tyr Gin Cys Leu Lys Gly Thr Gly Glu Asn Tyr Arg Gly Asn Val Ala
180 185 190
Val Thr Val Ser Gly His Thr Cys Gin His Trp Ser Ala Gin Thr Pro
195 200 205
His Thr His Asn Arg Thr Pro Glu Asn Phe Pro Cys Lys Asn Leu Asp
210 215 220
Glu Asn Tyr Cys Arg Asn Pro Asp Gly Lys Arg Ala Pro Trp Cys His
225 230 235 240
44 • 4 • 4 X ·· 4«· • ·
4 * O 4 4 • 4 ·. · 4 4
Thr Thr Asn Ser Gin Val Arg Trp Glu Tyr Cýs Jly4 lleÍPro^Ser ·Λ ·
245 250 ··*· ·· *·* ”555
Asp Ser Ser Pro Val Ser Thr Glu Gin Leu Ala Pro Thr Ala Pro Pro
260 265 270
Glu Leu Thr Pro Val Val Gin Asp Cys Tyr His Gly Asp Gly Gin Ser
275 280 285
Tyr Arg Gly Thr Ser Ser Thr Thr Thr Thr Gly Lys Lys Cys Gin Ser
290 295 300
Trp Ser Ser Met Thr Pro His Arg His Gin Lys Thr Pro Glu Asn Tyr
305 310 315 320
Pro Asn Ala Gly Leu Thr Met Asn Tyr Cys Arg Asn Pro Asp Ala Asp
325 330 335
Lys Gly Pro Trp Cys Phe Thr Thr Asp Pro Ser Val Arg Trp Glu Tyr
340 345 350
Cys Asn Leu Lys Lys Cys Ser Gly Thr Glu Ala
355 360
··
4»* · <210>
<211>
<212>
<213>
DNA
Uměle připravená sekvence <220>
<223>
Popis uměle připravené sekvence:
Přímý primer pro lidský Fc-Angio <220>
<221>
CDS
<222> (2) . . ( 29)
<4 00> 12
cc ccg ggt aag aaa gtg tat ctc
Pro Gly Lys Lys Val Tyr Leu
1 5
<210> 13
<211> 9
<212> PRT
<213> Uměle připravená sekvence
<400> 13
tca Ser gag Glu
Pro Gly Lys Lys Val Tyr Leu Ser Glu 1 <210> 14 <211> 28 <212> DNA <213> Uměle připravená sekvence <220> ....
<223> Popis uměle připravené sekvence: Přímý primer pro lidský Fc Angio <220>
<221> CDS <222> (2)..(28) <400> 14 c ccc
Pro aag
Lys ctt
Leu aaa
Lys gtg Val tat
Tyr ctc
Leu tea Ser gag Glu <210> 15 <211> 9 <212> PRT <213> Uměle připravená sekvence <400> 15
Pro Lys Leu Lys Val Tyr Leu Ser Glu
5 <210> 16 <211> 30 <212> DNA <213> Uměle připravená sekvence <220>
<223> Popis uměle připravené sekvence: Reverzní primer pro lidský FcAngio <400> 16 cccctcgagc tačgcttctg ttcctgagca
<210> 17
<21í> 552
<212> DNA
<213> Mus musculus
<220>
<221> CDS
<222> (1) · ..(552)
<223> endostatin
<400> 17
cat His 1 act Thr cat His cag Gin gac ttt cag Gin cca gtg Pro Val ctc cac ctg gtg gcá ctg aac Asn
Asp 5 Phe Leu 10 His Leu Val Ala .Leu 15
acc ccc ctg tet gga ggc atg cgt ggt atc cgt gga gca gat ttc cag
Thr Pro Leu Ser Gly Gly Met Arg Gly Ile Arg Gly Ala Asp Phe Gin
20 25 30
tgc ttc cag caa gcc ega gcc gtg ggg ctg tcg ggc acc ttc cgg get
Cys Phe Gin Gin Ala Arg Ala Val Gly Leu Ser Gly Thr Phe Arg Ala
35 40 45
ttc Phe ctg tcc tet agg ctg cag Gin 55 gat Asp ctc Leu • 9 taÝ Tyr • · • · • · • · • • · · agc Ser • • • • 9 9 atc Ile 60 • • · • • • • · 9 gtg Val 9 • 9 9 9 9 9 99 cgc Arg • • • · • • cgt Arg • · · • 9 9 9 9 · • 99 9 gct Ala 192
Leu 50 Ser Ser Arg Leu
gac cgg ggg tet gtg ccc atc gtc aac ctg aag gac gag gtg cta tet 240
Asp Arg Gly Ser Val Pro Ile Val Asn Leu Lys Asp Glu Val Leu Ser
65 70 75 80
ccc agc tgg gac tcc ctg ttt tet ggc tcc cag ggt caa gtg caa ccc 288
Pro Ser Trp Asp Ser Leu Phe Ser Gly Ser Gin Gly Gin Val Gin Pro
85 90 95
ggg gcc cgc atc ttt tet ttt gac ggc aga gat gtc ctg aga cac cca 336
Gly Ala Arg Ile Phe Ser Phe Asp Gly Arg Asp Val Leu Arg His Pro
100 105 110
gcc tgg ccg cag aag agc gta tgg cac ggc tcg gac ccc agt ggg cgg 384
Ala Trp Pro Gin Lys Ser Val Trp His Gly Ser Asp Pro Ser Gly Arg
115 120 125
agg ctg atg gag agt tac tgt gag aca tgg ega act gaa act act ggg 432
Arg Leu Met Glu Ser Tyr Cys Glu Thr Trp Arg Thr Glu Thr Thr Gly
130 135 140
gct aca ggt cag gcc tcc tcc. ctg ctg tea ggc agg ctc ctg gaa cag 480
Ala Thr Gly Gin Ala Ser Ser Leu Leu Ser Gly Arg Leu Leu Glu Gin
145 150 155 160
aaa gct gcg agc tgc cac aac agc tac atc gtc ctg tgc att gag aat 528
Lys Ala Ala Ser Cys His Asn Ser Tyr Ile Val Leu Cys Ile Glu Asn
165 170 175
agc ttc atg acc tet ttc tcc aaa 552
Ser Phe Met Thr Ser Phe Ser Lys
180
<210> 18 <211> 184 <212>.PRT <213> Mus musculus
<400> 18 His 1 Thr His Gin Asp 5 Phe Gin Pro Val Leu 10 His Leu Val Ala Leu 15 Asn
Thr Pro Leu Ser 20 Gly. Gly Met Arg' Gly 25 Ile Arg Gly Ala Asp 30 Phe Gin
4 Cys Phe Gin 35 Gin Ala Arg Ala Val 40 Gly Leu Ser Gly Thr 45 Phe Arg Ala
i Phe Leu 50 Ser Ser Arg Leu Gin 55 Asp Leu Tyr Ser Ile 60 Val Arg Arg Ala
Asp 65 Arg Gly Ser Val Pro 70 Ile Val Asn Leu Lys 75 Asp Glu Val Leu Ser 80
·· ·· • · · • • · • • · • · •
• · · • · · · • • • • • • · • •
Pro Ser Trp Asp Ser Leu Phe Ser Gly Ser, Glji.VaJZjGln'
85 90 95
Gly Ala Arg Ile Phe Ser Phe Asp Gly Arg Asp Val Leu Arg His Pro
100 105 110
Ala Trp Pro Gin Lys Ser Val Trp His Gly Ser Asp Pro Ser Gly Arg
115 120 125
Arg Leu Met Glu Ser Tyr Cys Glu Thr Trp Arg Thr Glu Thr Thr Gly
130 135 140
Ala Thr Gly Gin Ala Ser Ser Leu Leu Ser Gly Arg Leu Leu Glu Gin
145 150 155 160
Lys Ala Ala Ser Cys His Asn Ser Tyr Ile Val Leu Cys Ile Glu Asn
165 170 175
Ser Phe Met Thr Ser Phe Ser Lys
180
<210> 19 <211> 699 <212> DNA <213> Mus musculus <220>
<221> CDS <222> (1) . .(699) <223> Fc <400> 19
gag Glu 1 ccc aga ggg Pro Arg Gly ccc aca atc Ile aag Lys ccc tgt cct Pro cca tgc aaa Lys tgc Cys 15 cca Pro 48
Pro 5 Thr Pro Cys 10 Pro Cys
gca cct aac ctc ttg ggt gga cca tcc gtc ttc atc ttc cct cca aag 96
Ala Pro Asn Leu Leu Gly Gly Pro Ser Val Phe Ile Phe Pro Pro Lys
20 25 30
atc aag gat gta ctc atg atc tcc ctg age ccc ata gtc aca tgt gtg 144
Ile Lys Asp Val Leu Met Ile Ser Leu Ser Pro Ile Val Thr Cys Val
35 40 45
gtg gtg gat gtg age gag gat gac cca gat gtc cag atc age tgg ttt 192
Val Val Asp Val Ser Glu Asp Asp Pro Asp Val Gin Ile Ser Trp Phe
' 50 55 60
gtg aac aac gtg gaa gta cac aca gct cag aca caa acc cat aga gag 240
Val Asn Asn Val Glu Val His Thr Ala Gin Thr Gin Thr His Arg Glu
65 70 75 80
gat tac aac agt act ctc cgg gtg gtc agt gcc ctc ccc atc cag cac 288
Asp Tyr Asn Ser Thr Leu Arg Val Val Ser Ala Leu Pro Ile Gin His
85 90 95
cag gac tgg atg agt ggc aag gag ttc aaa tgc aag gtc aac aac aaa 336
Gin Asp Trp Met Ser Gly Lys Glu Phe Lys Cys Lys Val Asn Asn Lys
100 105 110
gac Asp ctc Leu cca gcg ccc atc gag aga acc atc tca Ser aaa Lys ccc Pro 125 aaa Lys ggg Gly tca Ser 384
Pro Ala 115 Pro Ile Glu Arg 120 Thr Ile
gta aga gct cca cag. gta tat gtc ttg cct cca cca gaa gaa gag atg 432
Val Arg Ala Pro Gin Val Tyr Val Leu Pro Pro Pro Glu Glu Glu Met
130 135 140.
act aag aaa cag gtc act ctg acc tgc atg gtc aca gac ttc atg cct 4 80
Thr Lys Lys Gin Val Thr Leu Thr Cys Met Val Thr Asp Phe Met Pro
145 150 155 160
gaa gac att tac gtg.. gag tgg acc aac aac ggg aaa aca gag cta aac 528
Glu Asp Ile Tyr Val Glu Trp Thr Asn Asn Gly Lys Thr Glu Leu Asn
165 170 175
tac aag aac act gaa cca gtc ctg gac tet gat ggt tet tac ttc atg 576
Tyr Lys Asn Thr Glu Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Tyr Phe Met
180 185 190
tac agc aag ctg aga gtg gaa aag aag aac tgg gtg gaa aga aat agc 624
Tyr Ser Lys Leu Arg Val Glu Lys Lys Asn Trp Val Glu Arg' Asn Ser
195 200 205
tac tcc tgt tca gtg gtc cac gag ggt ctg cac aat cac cac acg act 672
Tyr Ser Cys Ser Val Val His Glu Gly Leu His Asn His His Thr Thr
210 215 220
aag agc ttc tcc cgg acc ccg ggt aaa 699
Lys Ser Phe Ser Arg Thr Pro Gly Lys
225 230
<210> 20 <211> 233 <212> PRT <213> Mus musculus
<400> 20
Glu Pro Arg 1 Gly Pro 5 Thr Ile Lys
Ala Pro Asn Leu 20 Leu Gly Gly Pro
Ile Lys Asp.Val 35 Leu Met Ile Ser 40
Val Val 50 Asp Val Ser Glu Asp 55 Asp
Val 65 Asn Asn Val Glu Val 70 His Thr
Asp Tyr Asn Ser Thr 85 Leu Arg Val
Pro Cys 10 Pro Pro Cys Lys Cys 15 Pro
Ser 25 Val Phe Ile Phe Pro 30 Pro Lys
Leu Ser Pro Ile Val 45 Thr Cys Val
Pro Asp Val Gin 60 Ile Ser Trp Phe
Ala Gin Thr 75 Gin Thr His Arg Glu 80
Val Ser- 90 Ala Leu Pro Ile Gin 95 His
Gin Asp Trp Met Ser Gly Lys Glu Phe 105 • • Lys • • · • · • · jfye* • · · • • j>ys • • • · Va§L • · · • • · Asji 110· ♦ • Asji • • · • · · ií/s : • · ·
100
Asp Leu Pro Ala Pro Ile Glu Arg Thr Ile Ser Lys Pro Lys Gly Ser
115 120 125
Val Arg Ala Pro Gin Val Tyr Val Leu Pro Pro Pro Glu Glu Glu Met
130 135 140
Thr Lys Lys Gin Val Thr Leu Thr Cys Met Val Thr Asp Phe Met Pro
145 150 155 160
Glu Asp Ile Tyr Val Glu Trp Thr Asn Asn Gly Lys Thr Glu Leu Asn
165 .170 175
Tyr Lys Asn Thr Glu Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Tyr Phe Met
180 185 190
Tyr Ser Lys Leu Arg Val Glu Lys Lys Asn Trp Val Glu Arg Asn Ser
195 200 205
Tyr Ser Cys Ser Val Val His Glu Gly Leu His Asn His His Thr Thr
210 215 220
Lys Ser Phe Ser Arg Thr Pro Gly Lys
225 230 <210> 21 <211> 29 <212> DNA <213> Uměle připravená sekvence <220>
<223> Popis uměle připravené sekvence: Přímý primer pro myší Fc-Endo <220>
<221> CDS <222> (2)..(28) <400> 21 c ccc aag ctt cat Pro Lys Leu His 1 act cat cag gac ttt c
Thr His Gin Asp Phe <210> 22 <211> 9 <212> PRT <213> Uměle připravená sekvence <400> 22
Pro Lys Leu His.Thr His Gin Asp Phe ' 5 <210> 23 <211> 28' <212> DNA <213> Uměle připravená sekvence <220>
<223> Popis uměle připravené sekvence: Reverzní primer pro myší Fc-Endo <400> 23 cccctcgagc tatttggaga aagaggtc <210> 24 <211> 1086 <212> DNA <213> Mus musculus <220>
<221> CDS <222> (1)..(1086) <223> angiostatin <400> 24
* 1 gtg tat Val Tyr 1 ctg tea Leu Ser gaa tgt aag acc ggc atc ggc aac ggc tac aga gga Gly 48
Glu 5 Cys Lys Thr Gly Ile 10 Gly Asn Gly Tyr Arg 15
acc atg tcc agg a ca aag agt ggt gtt gcc tgt caa aag tgg ggt gcc 96
Thr Met Ser Arg Thr Lys Ser Gly Val Ala Cys Gin Lys Trp. Gly Ala
20 25 30
acg ttc ccc cac gta ccc aac tac tet ccc agt aca cat ccc aat gag 144
Thr Phe Pro His Val Pro Asn Tyr Ser Pro Ser Thr His Pro Asn Glu
35 40 45
gga cta gaa gag aac tac tgt agg aac cca gac aat gat .gaa caa ggg 192
Gly Leu Glu Glu Asn Tyr Cys Arg Asn Pro Asp Asn Asp Glu Gin Gly
50 55 60
cct tgg tgc tac act aca gat ccg gac aag aga tat gac tac tgc aac 240
Pro Trp Cys Tyr Thr Thr Asp Pro Asp Lys Arg Tyr Asp Tyr Cys Asn
65 70 75 80
att cct gaa tgt gaa gag gaa tgc atg tac tgc agt gga gaa aag tat 288
Ile Pro Glu Cys Glu Glu Glu Cys Met Tyr Cys Ser Gly Glu Lys Tyr
85 90 95
gag ggc aaa atc tcc aag acc atg tet gga ctt gac tgc cag gcc tgg 336
Glu Gly Lys Ile Ser Lys Thr Met Ser Gly Leu Asp Cys Gin Ala. Trp
100 105 110
gat tet cag agc cca cat get cat gga tac atc cct gcc aaa ttt cca 384
Asp Ser Gin Ser Pro His Ala His Gly Tyr Ile Pro Ala Lys Phe Pro
i 115 120 125
· agc aag aac ctg aag atg aat tat tgc cac aac cct gac ggg gag cca 432
Ser Lys Asn Leu Lys Met Asn Tyr Cys His Asn Pro Asp Gly Glu Pro
130 135 140
agg ccc tgg tgc ttc aca aca gac ccc acc aaa ege tgg gaa tac tgt 480
Arg 145 Pro Trp Cys Phe Thr Thr Asp Pro Thr Lys Arg Trp Glu Tyr Cys 160
150 155
gac atc ccc ege tgc aca aca ccc ccg ccc cca ccc age cca acc tac 528
Asp Ile Pro Arg Cys Thr Thr Pro Pro Pro Pro Pro Ser Pro Thr Tyr
165 170 175
caa tgt ctg aaa gga aga ggt gaa. aat tac ega ggg acc gtg tet gtc 576
Gin Cys Leu Lys Gly Arg Gly Glu Asn. Tyr Arg Gly Thr Val Ser Val
180 185 190
acc gtg tet ggg aaa acc tgt cag ege tgg agt gag caa acc cct cat 624
Thr Val Ser Gly Lys Thr Cys Gin Arg Trp Ser Glu Gin Thr Pro His
195 200 205
agg cac aac agg aca cca gaa aat ttc ccc tgc aaa aat ctg gaa gag 672
Arg His Asn Arg Thr Pro Glu Asn Phe Pro Cys Lys Asn Leu Glu Glu
210 215 220
aac tac tgc cgg aac cca gat gga gaa act gct ccc tgg tgc tat acc 720
Asn Tyr Cys Arg Asn Pro Asp Gly Glu Thr Ala Pro Trp Cys Tyr Thr
225 230 235 240
act gac age cag ctg agg tgg gag tac tgt gag att cca tcc tgc gag 768
Thr Asp Ser Gin Leu Arg Trp Glu Tyr Cys Glu Ile Pro Ser Cys Glu .
245 250 255
tcc tca gca tca cca gac cag tca gat tcc tca gtt cca cca gag gag 816
Ser Ser Ala Ser Pro Asp Gin Ser Asp Ser Ser Val Pro Pro Glu Glu
260 265 27Q
caa aca cct gtg gtc cag gaa tgc tac cag age gat ggg cag age tat 864
Gin Thr Pro Val Val Gin Glu Cys Tyr Gin Ser Asp Gly Gin Ser Tyr
275 280 285
cgg ggt aca tcg tcc act acc atc aca ggg aag aag tgc cag tcc tgg 912
Arg Gly Thr Ser Ser Thr Thr Ile Thr Gly Lys Lys Cys Gin Ser Trp
290 295 300
gca gct atg ttt cca cac agg cat tcg aag acc cca gag aac ttc cca 960
Ala Ala Met Phe Pro His Arg His Ser Lys Thr Pro Glu Asn Phe Pro
305 310 315 320
gat gct ggc ttg gag atg aac tac tgc agg aac ccg gat ggt gac aag 1008
Asp Ala Gly Leu Glu Met Asn Tyr Cys Arg Asn Pro Asp Gly Asp Lys
325 330 335
ggc cct tgg tgc tac ačc act gac ccg age gtc agg. tgg gaa tac tgc 1056
Gly Pro Trp Cys Tyr Thr Thr Asp Pro Ser Val Arg Trp ' Glu Tyr Cys
340 345 350
aac ctg aag cgg tgc tca gag aca gga ggg 1086
Asn Leu Lys Arg Cys Ser Glu Thr Gly Gly
355 360
<210> 25 <211> 362, <212> PRT' <213> Mus musculus <400> 25
Val 1 Tyr Leu Ser Glu 5 Cys Lys Thr Gly Ile 10 Gly Asn Gly Tyr Arg Gly 15
Thr Met Ser Arg Thr Lys- Ser Gly Val Ala Cys Gin Lys Trp Gly Ala·
20 25 30
Thr Phe Pro His Val Pro Asn Tyr Ser Pro Ser Thr His Pro Asn Glu
35 40 45
Gly Leu Glu Glu Asn Tyr Cys Arg Asn Pro Asp Asn Asp Glu Gin Gly
50 55 60
Pro Trp Cys Tyr Thr Thr Asp Pro Asp Lys Arg Tyr Asp Tyr Cys Asn
65 70 75 80
Ile Pro Glu Cys Glu Glu Glu Cys Met Tyr Cys Ser Gly Glu Lys. Tyr
85 90 95
Glu Gly Lys Ile Ser Lys Thr Met Ser Gly Leu Asp Cys Gin Ala Trp·
100 105 •110
Asp Ser Gin Ser Pro His Ala His Gly Tyr Ile Pro Ala Lys Phe Pro
115 120 125
Ser Lys Asn Leu Lys Met Asn Tyr Cys His Asn Pro Asp Gly Glu Pro
130 135 140
Arg Pro Třp Cys Phe Thr Thr Asp Pro Thr Lys Arg Trp Glu Tyr Cys
145 150 155 160
Asp Ile Pro Arg Cys Thr Thr Pro Pro Pro Pro Pro Ser Pro Thr Tyr
165 170 175
Gin Cys Leu Lys Gly Arg Gly Glu Asn Tyr Arg Gly Thr Val Ser Val
180 185 190
Thr Val Ser Gly Lys Thr Cys Gin Arg Trp Ser Glu Gin Thr Pro His
195 200 205
Arg His Asn Arg Thr Pro Glu Asn Phe Pro Cys Lys Asn Leu Glu Glu
210 215 220
Asn Tyr Cys Arg Asn Pro Asp Gly Glu Thr Ala Pro Trp Cys Tyr Thr
225 230 235 24.0
Thr Asp Ser Gin Leu Arg Trp Glu Tyr Cys Glu Ile Pro Ser Cys Glu
245 250 255
Ser Ser Ala Ser Pro Asp Gin Ser Asp Ser Ser Val Pro Pro Glu Glu
260 265 270
Gin Thr Pro Val Val Gin Glu Cys Tyr Gin Ser Asp Gly Gin Ser Tyr
275 280 285
Arg Gly Thr Ser Ser Thr Thr Ile Thr Gly Lys Lys Cys Gin Ser Trp
290 295 300
Ala 305 Ala Met Phe Pro His 310 Arg His Ser Lys Thr 315 Pro Glu Asn Phe Pro 320
Asp Ala Gly Leu Glu 325 Met Asn Tyr Cys Arg 330 Asn Pro Asp Gly Asp .335 Lys
Gly Pro Trp Cys 340 Tyr Thr Thr Asp Pro 345 Ser Val Arg Trp Glu 350 Tyr Cys
Asn Leu Lys 355 Arg Cys Ser Glu Thr 360 Gly Gly
<210> 26 <211> 31 <212> DNA <213> Uměle připravená sekvence <220>
<223> Popis uměle připravené sekvence: Přímý primer pro myší Fc-Angio <220>
<221> CDS <222> (2) . . (49) <400> 26 c ccc aag ctt gtg tat ctg tca gaa tgt aag Pro Lys Leu Val Tyr Leu Ser Glu Cys Lys 1 5 10 <210> 27 <211> 10 <212> PRT <213> Uměle připravená sekvence <400> 27
Pro Lys Leu Val Tyr Leu Ser Glu Cys Lys 15 10 <210> 28 <211> 30 f <212> DNA <213> Uměle připravená sekvence <220>
<223> Popis uměle připravené sekvence: Reverzní primer pro myši Fc-Angio <400> 28 cccctcgagc taccctcctg tctctgagca 30 ·« • · <210> 29 <211> 29 <212> DNA 1 <213> Uměle připravená sekvence <220>
<223> Popis uměle připravené sekvence: Přímý primer pro psí Fc <220>
<221> CDS <222> (3)..(29) <400> 29 cc tta agc gaa aat gga aga gtt cct cgc
Leu Ser Glu Asn Gly Arg Val Pro Arg
5 <210> 30 <211> 9 <212> PRT <213> Uměle připravená sekvence <400> 30
Leu Ser Glu Asn Gly Arg Val Pro Arg
5 <210> 31 <211> 40 <212> DNA <213> Uměle připravená sekvence <220>
<223> Popis uměle připravené sekvence: Reverzní primer pro psí Fc <400> 31 cctcgagtca tttacccggg gaatgggaga gggatttctg 40 <210> 32 <211> 702 <212> DNA <213> Canis familiaris <220>
<221> CDS
<222> (1) . . (702
<223> Fc
<400> 32
gaa Glu 1 aat Asn gga Gly aga Arg gtt cct cgc Arg cca Pro cct Pro gat tgt Asp Cys 10 ccc aaa tgc Cys cca Pro 15 gcc Ala 48
Val 5 Pro Pro Lys
cct gaa atg ctg gga ggg cct tcg gtc ttc atc ttt ccc ccg aaa ccc 96
Pro Glu Met Leu Gly Gly Pro Ser Val Phe Ile Phe Pro Pro Lys Pro
20 25 30
aag gac acc ctc ttg att gcc ega aca cct gag gtc aca tgt gtg gtg 144
• • • · • · • • · • · • · · ·· • ·« • · • • · • • · • • • • · « • • · • • • • · · • • • · • 1 • · • · · • · • · • · »· ···
Lys Asp Thr Leu Leu Ile Ala Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val Val
35 40 45
gtg gat ctg gga cca gaa gac cct gag gtg cag atc agc tgg ttc gtg 192
Val Asp Leu Gly Pro Glu Asp Pro Glu Val Gin Ile Ser Trp Phe Val
50 55 60
gac ggt aag cag atg caa aca gcc aag act cag cct cgt gag gag cag 240
Asp Gly Lys Gin Met Gin Thr Ala Lys Thr Gin Pro Arg Glu Glu Gin
65 70 75 80
ttc aat ggc acc tac cgt gtg gtc agt gtc ctc ccc att ggg cac cag 288
Phe Asn Gly Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Pro Ile Gly His Gin
85 90 95
gac tgg ctc aag ggg aag cag ttc acg tgc aaa gtc aac aac aaa gcc 336
Asp Trp Leu Lys Gly Lys Gin Phe Thr Cys Lys Val Asn Asn Lys Ala
100 105 110
ctc cca tcc ccg atc gag agg acc atc tcc aag gcc aga ggg cag gcc 384
Leu Pro Ser Pro Ile Glu Arg Thr Ile Ser Lys Ala Arg Gly Gin Ala
115 120 125
cat cag ccc agt gtg tat gtc ctg ccg cca tcc cgg gag gag ttg agc 432
His Gin Pro Ser Val Tyr Val Leu Pro Pro Ser Arg Glu Glu Leu Ser
130 135 140
aag aac aca gtc agc ttg aca tgc ctg atc aaa gac ttc ttc cca cct 480
Lys Asn Thr Val Ser Leu Thr Cys Leu Ile Lys Asp Phe Phe Pro Pro
145 150 155 160
gac att gat gtg gag tgg cag agc aat gga cag cag gag čet gag agc 528
Asp Ile Asp Val Glu Trp Gin Ser Asn Gly Gin Gin Glu Pro Glu Ser
165 170 175
aag tac cgc acg acc ccg ccc cag ctg gac gag gac ggg tcc tac ttc 576
Lys Tyr Arg Thr Thr Pro Pro Gin Leu Asp Glu Asp Gly Ser Tyr Phe
180 185 190
ctg tac agc aag ctc tet gtg gac aag agc, cgc tgg cag cgg gga gac 624
Leu Tyr Ser Lys Leu Ser Val Asp Lys Ser Arg Trp Gin Arg Gly Asp
195 200 205
acc ttc ata tgt gcg gtg atg cat gaa get cta cac aac cac tac aca 672
Thr Phe Ile Cys Ala Val Met His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr
210 215 220
cag aaa tcc ctc tcc cat tet ccg ggt aaa 702
Gin Lys Ser Leu Ser His Ser Pro Gly Lys
225 230
i <210> 33 <211> 234 <212> PRT <213> Canis familiaris <4.00> 33
Glu Asn Gly Arg Val Pro Arg Pro Pro Asp Cys Pro Lys Cys Pro Ala
1 . 5 10 15
Pro Glu Met Leu Gly Gly Pro Ser Val Phe Ile Phe Pro Pro Lys Pro
20 25 30
Lys Asp Thr Leu Leu Ile Ala Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val Val
35 40 .45 *
Val Asp Leu Gly Pro Glu Asp Pro Glu Val Gin Ile Ser Trp Phe Val
50 ' 55 60
Asp Gly Lys Gin Met Gin Thr Ala Lys Thr Gin Pro Arg Glu Glu Gin
65 70 75 80
Phe Asn Gly Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Pro Ile Gly His Gin
85 90 95
Asp Trp Leu Lys Gly Lys Gin Phe Thr Cys Lys Val Asn Asn Lys Ala
100 105 110
Leu Pro Ser Pro Ile Glu Arg Thr Ile Ser Lys Ala Arg Gly Gin Ala
115 120 125
His Gin Pro Ser Val Tyr Val Leu Pro Pro Ser Arg Glu Glu Leu Ser
130 135 140
Lys Asn Thr Val Ser Leu Thr Cys Leu Ile Lys Asp Phe Phe Pro Pro
145 150 155 160
Asp Ile Asp Val Glu Trp Gin Ser Asn Gly Gin Gin Glu ,,Pro Glu Ser
.165 170 175
Lys Tyr Arg Thr Thr Pro Pro Gin Leu Asp Glu Asp Gly Ser Tyr Phe
180 185 190
Leu Tyr Ser Lys Leu Ser Val Asp Lys Ser Arg Trp Gin Arg Gly Asp
195 200 205
Thr Phe Ile Cys Ala Val Met His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr
210 215 220
Gin Lys Ser Leu Ser His Ser Pro Gly Lys
225 230 <210> 34 <211> 552 <212> DNA <213> Canis familiaris <220>
<221> CDS <222> (1)..(552) <223> Endostatin <400> 34
cac acc cac cag gac ttc cag ccg gtg ctg cac ctg gtg gcc ctg aac 48
His Thr His Gin Asp Phe Gin Pro Val Leu His Leu Val Ala Leu Asn
1 5 10 15
agc ccg cag ccg ggc ggc atg ega ggc atc cgg Arg gga gcg Gly Ala gac ttc Asp Phe 30 cag Gin 96
Ser Pro Gin Pro Gly Gly Met Arg Gly Ile 25
20
tgc ttc cag cag gcg cgc gcc gcg ggg ctg gcc ggc acc ttc cgg gcc 144
Cys Phe Gin Gin Ala Arg Ala Ala Gly Leu Ala Gly Thr Phe Arg Ala
35 40 45
ttc ctg tcg tcg cgg ctg cag gac ctc tac agc atc gtg cgc cgc gcc 192
Phe Leu Ser Ser Arg Leu Gin Asp Leu Tyr Ser Ile Val Arg Arg Ala
50 55 60
gac cgc acc ggg gtg ccc gtc gtc aac ctc agg gac gag gtg ctc ttc 240
Asp Arg Thr Gly Val Pro Val Val Asn Leu Arg Asp Glu Val Leu Phe
65 70 75 80
ccc agc tgg gag gcc tta ttc tcg ggc tcc gag ggc cag ctg aag ccc 288
Pro Ser Trp Glu Ala Leu Phe Ser Gly Ser Glu Gly Gin Leu Lys Pro
85 90 95
ggg gcc cgc atc ttc tet ttc gac ggc aga gat gtc ctg cag ,cac ccc 336
Gly Ala Arg Ile Phe Ser Phe Asp Gly Arg Asp Val Leu Gin His Pro
100 105 110
gcc tgg ccc cgg aag agc gtg tgg cac ggc tcc gac ccc agc ggg cgc 384
Ala Trp Pro Arg Lys Ser Val Trp His Gly Ser Asp Pro Ser Gly Arg
115 120 125
cgc ctg acc gac agc.tac tgc gag acg tgg Thr Trp cgg acg gag gcc ccg gcg 432
Arg Leu Thr Asp Ser Tyr Cys 135 Glu Arg Thr Glu Ala 140 Pro Ala
130 .
gcc acc ggg cag gcg tcg tcg ctg ctg gcg ggc agg ctg ctg gag cag 480
Ala Thr Gly Gin Ala Ser Ser Leu Leu Ala Gly Arg Leu Leu Glu Gin
145 150 155 160
gag gcc gcg agc tgc cgc cac gcc ttc gtg gtg ctc tgc atc gag aac 528
Glu Ala Ala Ser Cys Arg His Ala Phe Val Val Leu Cys Ile Glu Asn
165 170 175 agc gtc atg acc tcc ttc tcc aag
Ser Val Met Thr Ser Phe Ser Lys
180
552 <210> 35 <211> 184 <212> PRT <213> Canis familiaris <400> 35
His 1 Thr His Gin Asp 5 Phe Gin
Ser Pro Gin Pro 20 Gly Gly Met
Cys Phe Gin Gin Ala Arg Ala
Pro Val Leu 10 His Leu Val Ala Leu 15 Asn
Arg Gly 25 Ile Arg Gly Ala Asp 30 Phe Gin
Ala Gly Leu Ala Gly Thr Phe Arg Ala
4 · « · ·« • · 4» · * • · * * • • · •
• « »· • · • • * • · · * 4 9 •
• ···· • · »· «« · · • ·· ♦ <*> ·
35 40 45
Phe Leu Ser Ser Arg Leu Gin Asp Leu Tyr Ser Ile Val Arg Arg Ala
50 55 60
Asp Arg Thr Gly Val Pro Val Val Asn Leu Arg Asp Glu Val Leu Phe
65 70 75 80
Pro Ser Trp Glu Ala Leu Phe Ser Gly Ser Glu Gly Gin Leu Lys Pro
85 90 95
Gly Ala Arg Ile Phe Ser Phe Asp Gly Arg Asp Val Leu Gin His Pro
100 105 110
Ala Trp Pro Arg Lys Ser Val Trp His Gly Ser Asp Pro Ser Gly Arg
115 120 125
Arg Leu Thr Asp Ser Tyr Cys Glu Thr Trp Arg Thr Glu Ala Pro Ala
130 135 140
Ala Thr Gly Gin Ala Ser Ser Leu Leu Ala Gly Arg Leu Leu Glu Gin
145 150 155 160
Glu Ala Ala Ser Cys Arg His Ala Phe Val Val Leu Cys Ile Glu Asn
165 170 .· 175
Ser Val Met Thr Ser Phe Ser Lys
180 <210> 36 <211> 41 <212> DNA <213> Uměle připravená sekvence <220>
<223> Popis uměle připravené sekvence: linker HindlII/Drall-I: horní řetězec <220>
<221> CDS <222> (3)..(41) <400> 36 ag ctt cac acc cac cag gac ttc cag ccg gtg ctg cac ctg
Leu His Thr His Gin Asp Phe Gin Pro Val Leu His Leu
5 10 <210> 37 <211> 13 <212> PRT <213> Uměle připravená sekvence <400> 37
Leu His Thr His Gin Asp Phe Gin Pro Val Leu His Leu
10 <210> 38 <211> 34 <212> DNA
<213> Uměle připravená sekvence <220>
<223> Popis uměle připravené sekvencelinker HindlII/DralII: spodní řetězec <400> 38 gtgcagcacc ggctggaagt cctggtgggt gtga <210> 39 <211> 1077 <212> DNA <213> Canis familiaris <220>
<221> CDS <222> (1)..(1077) <223> Angiostatin <400> 39
ata tat ctt tea Ser gag tgc aag act gga aat Asn 10 ggg aaa acc tac agg Tyr Arg 15 ggg Gly 48
Ile 1 Tyr Leu Glu Cys 5 Lys Thr Gly Gly Lys Thr
acc atg gcc aaa acg aag aat gat gtt gcc tgt caa aaa tgg agt gac 96
Thr Met Ala Lys Thr Lys Asn Asp Val Ala Cys Gin Lys Trp Ser Asp
20 25 30
aat tet ccg cac aaa cct aac tat acg cct gag aag cac ccc ttg gag 144
Asn Ser Pro His Lys Pro Asn Tyr Thr Pro Glu Lys His Pro Leu Glu
35 40 45
ggg ctg gag gag aac tat tgc agg aac. cct gac aac gac gag aac ggg 192
Gly Leu Glu Glu Asn Tyr Cys Arg Asn Pro Asp Asn Asp Glu Asn Gly
50 55 60
ccc tgg tgc tac acc aca aac cca gac gtg agg ttc gac tac tgc aac 240
Pro Trp Cys Tyr Thr Thr Asn Pro Asp Val Arg Phe Asp Tyr Cys Asn
65 70 75 80
att cca gaa tgt gaa gag gaa tgt atg cat tgc agt ggg gaa aat tat 288
Ile Pro Glu Cys Glu Glu Glu Cys Met His Cys Ser Gly Glu Asn Tyr
85 90. 95
gag ggc aaa att tcc aag aca aag tet gga ctc gag tgc caa gcc tgg 336
Glu Gly Lys Ile Ser Lys Thr Lys Ser Gly Leu Glu Cys Gin Ala Trp
100 105 110
aac tet caa acc cca cat gct cat gga tat att cct tcc aaa ttt cca 384
Asn Ser Gin Thr Pro His Ala His Gly Tyr Ile Pro Ser Lys Phe Pro
115 120 125
agc aag aac ttg aag atg aat tac tgc cgt aac cct gat ggg gag ccc 432
Ser Lys Asn Leu Lys Met Asn Tyr Cys Arg Asn Pro Asp Gly Glu Pro
130 135 140
• ·
cgc Arg 145 cca tgg tgt ttc Phe acc Thr 150
Pro Trp Cys
gac att ccc cgc tgt .aca
Asp Ile Pro Arg Cys 165 Thr
cag tgt ctg aag ggc aga
Gin Cys Leu Lys 180 Gly Arg
act gtc tet gga cat aca
Thr Val Ser 195 Gly His Thr
aag cac aac agg acc cca
Lys His 210 .Asn Arg Thr Pro
aac tac tgt cgc aac cct
Asn 225 Tyr Cys Arg Asn Pro 230
acc aac agt gag gtg agg
Thr Asn Ser Glu Val 245 Arg
tcc tet cca ata acc aca
Ser Ser Pro Ile 260 Thr Thr.
cct gaa caa act cct gtg
Pro Glu Gin 275 Thr Pro Val
agt tat ega ggc aca tea
Ser Tyr 290 Arg Gly Thr Ser
tet tgg tea tet atg aca
- Ser 305 Trp Ser Ser Met Thr 310
! ttc ccg gag get ggc ctg
Phe Pro Glu Ala Gly 325 Leu
' gac aaa agc cct tgg tgt
Asp Lys Ser Pro 340 Trp Cys
' ttc tgt aac ttg aga aaa
Phe Cys Asn 355 Leu Arg Lys
atg Met gat Asp ccc Pro aac aaa cgc Arg tgg gaa ttc tgt 480
Asn Lys 155 Trp Glu Phe Cys 160
aca cca cca ccc cct tcg ggc cca acg tac 528
Thr Pro Pro Pro Pro Ser Gly Pro Thr Tyr
170 • 175
ggg gag agc tac ega ggg aag gtg tcc gtc 576
Gly Glu Ser Tyr Arg Gly Lys Val Ser Val
185 190
tgt cag cac .tgg agt gaa cag acc cct cac 624
Cys Gin His Trp Ser Glu Gin Thr Pro His
200 205
gaa aac ttc cct tgc aaa aat ttg gat gaa 672
Glu Asn Phe Pro Cys Lys Asn Leu Asp Glu
215 220
gat gga gaa aca get cca tgg tgc tac aca 720
Asp Gly Glu Thr Ala Pro Trp Cys Tyr Thr
235 240
tgg gaa cac tgc cag att ccg tcc tgt gag 768
Trp Glu His Cys Gin Ile . -Pro Ser Cys Glu
250 255'
gaa tat ttg gat gcc cca get tea gtg cca 816
Glu Tyr Leu Asp. Ala Pro Ala Ser Val Pro
265 270
gtc cag gag tgc tac cac ggc aat ggg cag 864
Val Gin Glu Cys Tyr His Gly Asn Gly Gin
280 285
tcc act act atc aca gga aga aaa tgt cag 912
Ser Thr Thr Ile Thr Gly Arg Lys Cys Gin
295 300
cca cac ega cat gag aag acc cca gaa cac 960
Pro His Arg His Glu Lys Thr Pro Glu His
315 320
aca atg aac tac tgc agg aat ccc gac gcc 1008
Thr Met Asn Tyr Cys Arg Asn Pro Asp Ala
330 335
tac acc acc gac ccc tet gtg cgc tgg gag 1056
Tyr Thr Thr Asp Pro Ser Val Arg Trp Glu
345 350
tgc 1077
Cys
ΊΟ <210> 40 <211> 359 <212> PRT <213> Canis familiaris <400> 40
Ile 1 Tyr Leu Ser Glu Cys 5 Lys Thr Gly Asn Gly Lys 10 Thr Tyr Arg 15 Gly
Thr Met Ala Lys Thr Lys Ásn Asp Val Ala Cys Gin Lys Trp Ser Asp
20 25 λ 30
Asn Ser Pro His Lys Pro Asn Tyr Thr Pro Glu Lys His Pro Leu Glu
35 40 45
Gly Leu Glu Glu Asn Tyr Cys Arg Asn Pro Asp Asn Asp Glu Asn Gly
50 55 60
Pro Trp Cys Tyr Thr Thr Asn Pro Asp Val Arg Phe Asp Tyr Cys Asn
65 70 75 80
Ile Pro Glu Cys Glu Glu Glu Cys Met His Cys Ser Gly Glu Asn Tyr
85 90 95
Glu Gly Lys Ile Ser Lys Thr Lys Ser Gly Leu Glu Cys Gin Ala Trp
100 105 110
Asn Ser Gin Thr Pro His Ala His Gly Tyr Ile Pro Ser Lys Phe Pro
115 120 125.
Ser Lys Asn Leu Lys Met Asn Tyr Cys Arg Asn Pro Asp Gly Glu. Pro
130 135 140
Arg Pro Trp Cys Phe Thr Met Asp Pro Asn Lys Arg Trp Glu Phe Cys
145 150 155 160
Asp Ile Pro Arg Cys Thr Thr Pro Pro Pro Pro Ser Gly Pro Thr Tyr
165 170 175
Gin Cys Leu Lys Gly Arg Gly Glu Ser Tyr Arg Gly Lys Val Ser Val
180 185 190
Thr Val Ser Gly His Thr Cys Gin His Trp Ser Glu Gin Thr Pro His
195 200 205
Lys His Asn Arg Thr Pro Glu Asn Phe Pro Cys Lys Asn Leu Asp Glu
210 215 220
Asn Tyr Cys Arg Asn Pro Asp Gly Glu Thr Ala Pro Trp Cys Tyr Thr
225 230 235 240
Thr Asn Ser Glu Val Arg Trp Glu His Cys Gin Ile Pro Ser Cys Glu
245 250 255
Ser Ser Pro Ile Thr Thr Glu Tyr Leu Asp Ala Pro Ala Ser Val Pro
260 265 270
Pro Glu Gin Thr Pro Val Val Gin Glu Cys Tyr His Gly Asn .Gly Gin
275 280 285
Ser Tyr Arg Gly Thr Ser Ser Thr Thr Ile Thr Gly Arg Lys Cys Gin
290 295 300
Ser Trp Ser Ser Met Thr Pro His Arg His Glu Lys Thr Pro Glu His
305 310 315 320
Phe Pro Glu Ala Gly. Leu Thr Met Asn Tyr Cys Arg Asn Pro Asp Ala
325 · 330 335
Asp Lys Ser Pro Trp Cys Tyr Thr Thr Asp Pro Ser Val Arg Trp Glu
340 345 350
Phe Cys Asn Leu Arg Lys Cys
355 <210> 41 <211> 12 <212> DNA <213> Uměle připravená sekvence <220>
<223> Popis uměle připravené sekvence: palindromový linker, kde je stop kodon TGA následován restrikčním místem Xhol <400> 41 tgactcgagt ca 12 <210> 42 <211> 21 <212> DNA <213> Uměle připravená sekvence <220>
<223> Popis uměle připravené sekvence: mutagenní primer pro myší angiostatin <220>
<221> CDS <222> (1)..(21) <400> 42 ggg cct tgg age tac act aca,
Gly Pro Trp Ser Tyr Thr Thr'
5 <210> 43 <211> 7 <212> PRT <213> Uměle připravená sekvence <400> .43
Gly Pro Trp Ser Tyr Thr Thr
5 ♦ · <210> 44 <211> 34 <212> DNA ’ <213> Uměle připravená sekvence <220>
<223> Popis uměle připravené sekvence: primer použitý k zavedeni místa HindlII do myšího angiostatinu <220>
<221> CDS <222> (9)..(32) <400> 44 gcggatcc aag ctt agt aca cat ccc aat gag gg 34
Lys Leu Ser Thr His Pro Asn Glu
5 <210> 45 <211> 8 <212> PRT <213> Uměle připravená sekvence <400> 45
Lys Leu Ser Thr His Pro Asn Glu
5 <210> 46 <211> 59 <212> DNA <213> Uměle připravená sekvence <220>
<223> Popis uměle připravené sekvence: linker BspHI/BamHI: horní řetězec <220>
<221> CDS <222> (2)..(58) <400> 46 c atg acc tet ttc tcc aaa tcg agc ggg ggc agc ggg ggc gga ggc agc 4 9 Met Thr Ser Phe Ser Lys Ser Ser Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser 1 5 10 15 ggc ggg ggc g 59
Gly Gly Gly <210> 47 <211> 19 <212> PRT <213> Uměle připravená sekvence <400> 47
Met Thr Ser Phe Ser Lys Ser Ser Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser 1 5 10 ' 15
Gly Gly Gly
<210> 48 <211> 59 <212> DNA <213> Uměle připravená sekvence <220>
<223> Popis uměle připravené sekvence: linker BspHI/BamHI: spodní řetězec ,<400> 48 gatccgcccc cgccgctgcc tccgcccccg ctgcccccgc tcgatttgga gaaagaggt 59 <210> 49 <211> 12 <212> DNA <213> Uměle připravená sekvence <220>
<223> Popis uměle připravené sekvence: linker BamHI/HindlII: horní řetězec ....
<220>
<221> CDS <222> (3)..(11) <400> 49 ga tcc tca ggc c
Ser Ser Gly '
<210> 50 <211> 12 <212> DNA <213> Uměle připravená sekvence <220>
<223> Popis uměle připravené sekvence: linker BamHI/HindlII: spodní řetězec <400> 50 agctggčctg ag <210> 51 <211> 10 <212> DNA <213> Uměle připravená sekvence <220>
<223> Popis uměle připravené sekvence: linker AflII/HindlII: horní řetězec <220>
<221> CDS
<400> 51 tta agc ggc c
Leu Ser Gly <210> 52 <211> 10 <212> DNA <213> Uměle připravená sekvence <220>
<223> Popis uměle připravené sekvence: linker AflII/HindlII: spodní řetězec <400> 52 agctgggcgc <210> 53 <211> 11 <212> DNA <213> Uměle připravená sekvence <220>
<223> Popis uměle připravené sekvence: linker Xhol/AflII: horní řetězec <220>
<221> CDS <222> (3)..(11) <400> 53 tc gac tcc ggc Asp Ser Gly 1 <210> 54 <211> 11 <212> DNA <213> Uměle připravená sekvence <220>
<223> Popis uměle připravené sekvence: linker Xhol/AflII: spodní řetězec <400> 54' ttaagccgga g
• ·

Claims (31)

  1. PATENTOVÉ NÁROKY
    1. Molekula DNA kódující fúzní protein zahrnující:
    (a) signální sekvenci;
    (b) oblast Fc imunoglobulinu; a (c) sekvenci cílového proteinu vybranou ze skupiny zahrnující angiostatin, endostatin, nějaký fragment plazminogenu s aktivitou angiostatinu, nějaký fragment kolagenu XVIII s aktivitou endostatinu a jejich kombinace.
  2. 2. Molekula DNA podle nároku 1, kde zmíněná signální sekvence, zmíněná oblast Fc imunoglobulinu a zmíněná sekvence cílového proteinu jsou kódovány postupně ve směru 5' k
  3. 3' .
    3. Molekula DNA podle nároku 1, kde zmíněná signální sekvence, zmíněná sekvence cílového proteinu a zmíněná oblast Fc imunoglobulinu jsou kódovány postupně ve směru 5' k
  4. 4. Molekula DNA podle nároku 1, kde zmíněná oblast Fc imunoglobulinu zahrnuje pantovou oblast imunoglobulinu.
  5. 5. Molekula DNA podle nároku 1, kde zmíněná oblast Fc imunoglobulinu zahrnuje pantovou oblast imunoglobulinu a doménu konstantní části těžkého řetězce imunoglobulinu.
  6. 6. Molekula DNA podle nároku 1, kde zmíněná oblast Fc imunoglobulinu zahrnuje pantovou oblast a doménu CH3.
  7. 7. Molekula DNA podle nároku 1, kde zmíněná oblast Fc imunoglobulinu postrádá přinejmenším doménu CHi.
  8. 8. Molekula DNA podle nároku 1, kde zmíněná oblast Fc imunoglobulinu kóduje alespoň část imunoglobulinu typu gama.
  9. 9. Replikující se expresívní vektor k transfekci savčích buněk vyznačující se tím, že tento vektor obsahuje DNA podle nároku 1.
  10. 10. Savčí buňky vyznačující se tím, že tyto buňky obsahují DNA podle nároku 1.
  11. 11. Fúzní protein vyznačující se tím, že tento protein obsahuje Fc oblast imunoglobulinu a nějaký cílový protein vybraný ze skupiny zahrnující angiostatin, endostatin, nějaký fragment plazminogenu s aktivitou angiostatinu, nějaký fragment kolagenu XVIII s aktivitou endostatinu a jejich kombinace.
  12. 12. Fúzní protein podle nároku 11 vyznačuj ící se tím, že zmíněný fragment plazminogenu má molekulovou hmotnost přibližně 40 kDa a zahrnuje aminokyselinovou sekvenci uvedenou jako SEK. ID. Č.: 3.
  13. 13. Fúzní protein podle nároku 11 vyznačuj ící se tím, že zmíněný cílový protein zahrnuje aminokyselinovou sekvenci uvedenou jako SEK. ID. Č.: 3.
  14. 14. Fúzní protein podle nároku 11 vyznačuj ící se tím, že zmíněný fragment kolagenu XVIII zahrnuje aminokyselinovou sekvenci uvedenou jako SEK. ID. Č.:
  15. 15. Fúzní protein podle nároku 11 vyznačuj ici se tím, že zmíněný cílový protein zahrnuje alespoň dvě molekuly vybrané ze skupiny zahrnující angiostatin, endostatin, nějaký fragment plazminogenu a nějaký fragment kolagenu XVIII, kde zmíněné dvě molekuly jsou spojeny peptidovým linkerem.
  16. 16. Fúzní protein podle nároku 11 vyznačuj ící se tím, že zmíněný cílový protein je připojen k N-konci zmíněné oblasti Fc imunoglobulinu.
  17. 17. Fúzní protein podle nároku 11 vyznačuj ící se tím, že zmíněný cílový protein je připojen k C-konci zmíněné oblasti Fc imunoglobulinu.
  18. 18. Multimerní protein vyznačující se tím, že tento protein zahrnuje přinejmenším dva fúzní proteiny podle nároku 11 spojené disulfidickou vazbou .
  19. 19. Multimerní protein podle nároku 18 vyznačující se tím, .že cílovým proteinem v alespoň jednom ze zmíněných fúzních proteinů je angiostatin a cílovým proteinem v alespoň jednom ze zmíněných fúzních proteinů je endostatin.
  20. 20. Multimerní protein podle nároku 18 vyznačující se tím, že cílovým proteinem v obou fúzních proteinech je angiostatin.
  21. 21. Multimerní • · · • · · ··· protein podle nároku 18 vyznačující se tím, že cílovým proteinem v obou fúzních proteinech je endostatin.
  22. 22. Fúzní protein podle nároku 11 vyznačuj ící se tím, že tento protein dále obsahuje druhý cílový protein vybraný ze skupiny zahrnující angiostatin, endostatin, nějaký fragment plazminogenu s aktivitou angiostatinu, nějaký fragment kolagenu XVIII s aktivitou endostatinu.
  23. 23. Fúzní protein podle nároku 22 vyznačuj ící se tím, že zmíněný druhý cílový protein je k prvnímu cílovému proteinu připojen polypeptidovým linkerem.
  24. 24. Fúzní protein podle nároku 22 vyznačuj ící se tím, že zmíněný první cílový protein je připojen k N-konci zmíněné oblasti Fc imunoglobulinu a zmíněný druhý cílový protein je připojen k C-konci zmíněné oblasti Fc imunoglobulinu.
  25. 25. Multimerní fúzní protein vyznačující se tím, že tento protein zahrnuje alespoň dva fúzní proteiny podle nároku 11, kde tyto fúzní proteiny jsou spojeny polypeptidovou vazbou.
  26. 26. Způsob produkce fúzního proteinu vyznačuj ící se tím, že tento způsob zahrnuje:
    a) vytvoření savčí buňky podle nároku 11; a
    b) kultivaci této savčí buňky za účelem produkce zmíněného fúzního proteinu.
  27. 27. Způsob podle nároku 26 vyznačující se tím, že tento způsob zahrnuje další krok, kterým je sesbírání zmíněného fúzního proteinu.
  28. 28. Způsob podle nároku 26 vyznačující se tím, že tento způsob zahrnuje další krok, kterým je odštěpení zmíněné oblasti Fc imunoglobulinů od zmíněného cílového proteinu.
  29. 29. Způsob léčby zdravotních obtíží způsobených angiogenezí vyznačující se tím, že tento způsob zahrnuje podání DNA podle nároku.1 do organizmu savce, u kterého je žádoucí aplikovat nějaký inhibitor angiogeneze .
  30. 30. Způsob léčby zdravotních obtíží způsobených angiogenezí vyznačující se tím, že tento způsob zahrnuje podání vektoru podle nároku 9 do organizmu savce, u kterého je žádoucí aplikovat nějaký inhibitor angiogeneze .
  31. 31. Způsob léčby zdravotních obtíží, které mohou být zmírněny podáním angiostatinu nebo endostatinu, vyznačující se tím, že tento způsob zahrnuje podání účinného množství fúzního proteinu podle nároku 11 do organizmu savce trpícího zmíněnou zdravotní obtíží.
CZ20010643A 1998-08-25 1999-08-25 Homodimerní fúzní protein vykazující inhibicní aktivitu na angiogenezi, zpusob jeho produkce, molekula DNA a replikovatelný expresní vektor CZ302303B6 (cs)

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US9788398P 1998-08-25 1998-08-25

Publications (2)

Publication Number Publication Date
CZ2001643A3 true CZ2001643A3 (cs) 2002-02-13
CZ302303B6 CZ302303B6 (cs) 2011-02-16

Family

ID=22265602

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CZ20010643A CZ302303B6 (cs) 1998-08-25 1999-08-25 Homodimerní fúzní protein vykazující inhibicní aktivitu na angiogenezi, zpusob jeho produkce, molekula DNA a replikovatelný expresní vektor

Country Status (20)

Country Link
US (3) US20030139365A1 (cs)
EP (1) EP1107989B1 (cs)
JP (3) JP2002523036A (cs)
CN (2) CN101386651A (cs)
AT (1) ATE462725T1 (cs)
AU (1) AU761027B2 (cs)
BR (1) BR9913331A (cs)
CA (1) CA2339331C (cs)
CZ (1) CZ302303B6 (cs)
DE (1) DE69942207D1 (cs)
DK (1) DK1107989T3 (cs)
ES (1) ES2342239T3 (cs)
HK (1) HK1042503A1 (cs)
HU (1) HUP0103329A3 (cs)
NO (1) NO20010918L (cs)
PL (1) PL202057B1 (cs)
PT (1) PT1107989E (cs)
RU (1) RU2240328C2 (cs)
WO (1) WO2000011033A2 (cs)
ZA (1) ZA200101290B (cs)

Families Citing this family (60)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
AU9673998A (en) * 1997-10-01 1999-04-23 G.D. Searle & Co. Fusion proteins comprising an angiostatin moiety and their use in anti-tumor treatment
CA2693296C (en) 1997-12-08 2013-09-10 Merck Patent Gmbh Heterodimeric fusion proteins useful for targeted immune therapy and general immune stimulation
US20030105294A1 (en) * 1998-02-25 2003-06-05 Stephen Gillies Enhancing the circulating half life of antibody-based fusion proteins
BR9909583A (pt) * 1998-04-15 2002-01-15 Lexigen Pharm Corp Aumento da resposta imune mediado por uma proteìna de fusão anticorpo-citocina por co-administração com inibidor de angiogênese
CN101386651A (zh) * 1998-08-25 2009-03-18 默克专利股份公司 表达以及分泌制管张素和内皮抑制素的免疫融合物
SK782002A3 (en) * 1999-07-21 2003-08-05 Lexigen Pharm Corp FC fusion proteins for enhancing the immunogenicity of protein and peptide antigens
US7067110B1 (en) 1999-07-21 2006-06-27 Emd Lexigen Research Center Corp. Fc fusion proteins for enhancing the immunogenicity of protein and peptide antigens
ATE316982T1 (de) * 1999-08-09 2006-02-15 Lexigen Pharm Corp Mehrere zytokin-antikörper komplexen
IL131803A0 (en) * 1999-09-08 2001-03-19 Genena Ltd Method for improving the efficiency of cancer gene therapy
US20050202538A1 (en) * 1999-11-12 2005-09-15 Merck Patent Gmbh Fc-erythropoietin fusion protein with improved pharmacokinetics
ATE336514T1 (de) * 2000-02-11 2006-09-15 Merck Patent Gmbh Steigerung der zirkulierenden halbwertzeit von auf antikörpern basierenden fusionsproteinen
EP1294401B1 (en) * 2000-06-29 2007-08-01 EMD Lexigen Research Center Corp. Enhancement of antibody-cytokine fusion protein mediated immune responses by combined treatment with immunocytokine uptake enhancing agents
JP2003000268A (ja) * 2000-08-25 2003-01-07 Pfizer Prod Inc 血管新生にかかわる疾患を診断および治療するための方法および組成物
EP1197550A3 (en) * 2000-08-25 2002-11-20 Pfizer Products Inc. Methods and compositions for diagnosing and treating disorders involving angiogenesis
US7160858B2 (en) 2000-09-01 2007-01-09 Philadelphia, Health And Education Corporation Methods and compositions for inhibiting angiogenesis
DK1313504T3 (da) * 2000-09-01 2007-02-26 Philadelphia Health & Educatio Fremgangsmåder og sammensætninger til hæmning af angiogenese
AU2002248571B2 (en) * 2001-03-07 2007-01-18 Merck Patent Gmbh Expression technology for proteins containing a hybrid isotype antibody moiety
WO2002079415A2 (en) * 2001-03-30 2002-10-10 Lexigen Pharmaceuticals Corp. Reducing the immunogenicity of fusion proteins
JP4309662B2 (ja) * 2001-05-03 2009-08-05 メルク パテント ゲゼルシャフト ミット ベシュレンクテル ハフツング 腫瘍特異的組換え抗体およびその使用
EP2354791A1 (en) * 2001-12-04 2011-08-10 Merck Patent GmbH Immunocytokines with modulated selectivity
EP1501861A4 (en) * 2002-05-06 2007-06-20 Univ Texas TARGETED BINDING PROTEINS FOR THE ADMINISTRATION OF THERAPEUTIC OR DIAGNOSTIC REAGENTS
WO2004055056A1 (en) * 2002-12-17 2004-07-01 Merck Patent Gmbh Humanized antibody (h14.18) of the mouse 14.18 antibody binding to gd2 and its fusion with il-2
US20050069521A1 (en) * 2003-08-28 2005-03-31 Emd Lexigen Research Center Corp. Enhancing the circulating half-life of interleukin-2 proteins
US7524811B2 (en) 2003-08-29 2009-04-28 Children's Medical Center Corporation Anti-angiogenic peptides from the N-terminus of endostatin
DE602004015142D1 (de) 2003-08-29 2008-08-28 Childrens Medical Center Antiangiogene peptide zur behandlung oder vorbeugung von endometriose
BRPI0418286A (pt) 2003-12-30 2007-05-02 Merck Patent Gmbh proteìnas de fusão de il-7
EP1699821B1 (en) * 2003-12-31 2012-06-20 Merck Patent GmbH Fc-ERYTHROPOIETIN FUSION PROTEIN WITH IMPROVED PHARMACOKINETICS
EA011859B9 (ru) 2004-01-05 2013-07-30 Емд Лексиген Ресерч Сентер Корп. Соединения для адресной доставки препарата к ткани или органу-мишени
JP4987484B2 (ja) 2004-01-22 2012-07-25 メルク パテント ゲゼルシャフト ミット ベシュレンクテル ハフツング 補体結合が低下した抗癌抗体
JP2005301419A (ja) * 2004-04-07 2005-10-27 Hitachi Ltd ディスクアレイ装置およびそのデータ処理方法
US7670595B2 (en) * 2004-06-28 2010-03-02 Merck Patent Gmbh Fc-interferon-beta fusion proteins
ES2325344B1 (es) * 2004-11-02 2010-06-09 Univ Madrid Autonoma Inhibidores de angiogenesis multifuncionales y multivalentes.
CA2591297C (en) * 2004-12-09 2015-01-13 Stephen D. Gillies Il-7 variants with reduced immunogenicity
US20070104689A1 (en) * 2005-09-27 2007-05-10 Merck Patent Gmbh Compositions and methods for treating tumors presenting survivin antigens
US7807409B2 (en) * 2005-10-21 2010-10-05 Roche Palo Alto Llc Method for the recombinant expression of a polypeptide
CN101351475B (zh) * 2005-12-30 2013-05-15 默克专利有限公司 具有提高的稳定性的白细胞介素12p40变体
DK1966245T3 (da) 2005-12-30 2011-07-18 Merck Patent Gmbh Anti-CD19-Antistoffer med reduceret immunogenicitet
EP1816201A1 (en) 2006-02-06 2007-08-08 CSL Behring GmbH Modified coagulation factor VIIa with extended half-life
KR100888022B1 (ko) * 2006-12-21 2009-03-09 재단법인 목암생명공학연구소 면역글로불린 Fc와 인간 아포리포단백질(a)크링글절편의 융합단백질 LK8­Fc
US7981446B2 (en) * 2007-11-26 2011-07-19 Forhumantech. Co., Ltd. Pharmaceutical compositions and methods for delivering nucleic acids into cells
AT506216B1 (de) 2008-02-13 2009-07-15 Peter Dr Hernuss Zusammensetzung zur aufnahme über mukoses gewebe
US20120093814A1 (en) * 2009-03-30 2012-04-19 Boehringer Ingelheim International Gmbh Fusion Proteins Comprising Canine FC Portions
CN102405230A (zh) 2009-04-22 2012-04-04 默克专利有限公司 具有修饰的FcRn结合位点的抗体融合蛋白
KR101579318B1 (ko) * 2010-04-29 2015-12-21 엘지전자 주식회사 태양 전지 및 그 제조 방법
WO2012178137A1 (en) 2011-06-24 2012-12-27 Gillies Stephen D Light chain immunoglobulin fusion proteins and methods of use thereof
RU2465283C1 (ru) * 2011-06-27 2012-10-27 Государственное бюджетное образовательное учреждение высшего профессионального образования Первый Московский государственный медицинский университет имени И.М. Сеченова Министерства здравоохранения и социального развития Российской Федерации (ГБОУ ВПО Первый МГМУ им. И.М. Сеченова Минздравсоцразвити Рекомбинантный гибридный полипептид, способный ингибировать пролиферацию эндотелиальных клеток человека in vitro, и способ его получения
EP2561888A1 (en) * 2011-08-23 2013-02-27 Deutsches Krebsforschungszentrum Protein comprising NC-1 for treating angiogenesis-related diseases
JP6162891B2 (ja) * 2013-06-14 2017-07-12 エルジー・ケム・リミテッド 有機太陽電池およびその製造方法
GB201403775D0 (en) 2014-03-04 2014-04-16 Kymab Ltd Antibodies, uses & methods
US20160126391A1 (en) * 2014-10-31 2016-05-05 Byd Company Limited Solar cell module and manufacturing method thereof
EP3365363A1 (en) 2015-10-23 2018-08-29 Apogenix AG Single-chain gitr-receptor agonist proteins
CA3002588C (en) * 2015-10-23 2021-11-23 Apogenix Ag Single-chain cd137-receptor agonist proteins
WO2017068192A1 (en) * 2015-10-23 2017-04-27 Apogenix Ag Single-chain cd27-receptor agonist proteins
WO2017093569A1 (en) 2015-12-03 2017-06-08 Deutsches Krebsforschungszentrum Means and methods for treating and diagnosing fibrosis or fibrosis-associated diseases
US9567399B1 (en) 2016-06-20 2017-02-14 Kymab Limited Antibodies and immunocytokines
EP3534947A1 (en) 2016-11-03 2019-09-11 Kymab Limited Antibodies, combinations comprising antibodies, biomarkers, uses & methods
CN109824779B (zh) * 2017-11-23 2023-05-26 中山大学 一种包含IgG的Fc结构域和EB病毒包膜糖蛋白胞外域的融合蛋白
EP3781589B1 (en) 2018-04-17 2023-10-04 Heidelberg Biotech GmbH Means and methods for the treatment of angiogenesis-, fibrosis- and cancer-related diseases with protein oligomers comprising nc-1-fc
US20220047710A1 (en) * 2018-09-12 2022-02-17 Washington University Single chain constructs
EP4281471A1 (en) * 2021-01-20 2023-11-29 Monash University Fusion proteins

Family Cites Families (12)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JPH05271294A (ja) * 1992-01-24 1993-10-19 Japan Found Cancer Res ヒトプロヒビチンおよびそれをコードするdna
US5643783A (en) * 1993-12-01 1997-07-01 President And Fellows Of Harvard College Collagen and uses therefor
US5541087A (en) * 1994-09-14 1996-07-30 Fuji Immunopharmaceuticals Corporation Expression and export technology of proteins as immunofusins
US5922852A (en) * 1995-06-07 1999-07-13 Oklahoma Medical Research Foundation 3' untranslated region of the human prohibitin gene
US6346510B1 (en) * 1995-10-23 2002-02-12 The Children's Medical Center Corporation Therapeutic antiangiogenic endostatin compositions
US5854205A (en) * 1995-10-23 1998-12-29 The Children's Medical Center Corporation Therapeutic antiangiogenic compositions and methods
KR19990066981A (ko) * 1995-10-23 1999-08-16 윌리엄 뉴우 치료용 맥관형성억제 조성물 및 방법
BR9909583A (pt) * 1998-04-15 2002-01-15 Lexigen Pharm Corp Aumento da resposta imune mediado por uma proteìna de fusão anticorpo-citocina por co-administração com inibidor de angiogênese
WO1999053958A2 (en) * 1998-04-17 1999-10-28 Lexigen Pharmaceuticals Corporation Enhancement of antibody-cytokine fusion protein mediated immune responses by co-administration with prostaglandin inhibitor
JP2002517186A (ja) * 1998-06-03 2002-06-18 ザ チルドレンズ メディカル センター コーポレイション エンドスタチンタンパク質を含むタンパク質オリゴマー組成物およびその使用方法
CN101386651A (zh) * 1998-08-25 2009-03-18 默克专利股份公司 表达以及分泌制管张素和内皮抑制素的免疫融合物
US7524811B2 (en) * 2003-08-29 2009-04-28 Children's Medical Center Corporation Anti-angiogenic peptides from the N-terminus of endostatin

Also Published As

Publication number Publication date
CA2339331A1 (en) 2000-03-02
JP2002523036A (ja) 2002-07-30
CZ302303B6 (cs) 2011-02-16
HK1042503A1 (zh) 2002-08-16
ES2342239T3 (es) 2010-07-02
CN101386651A (zh) 2009-03-18
ATE462725T1 (de) 2010-04-15
DE69942207D1 (de) 2010-05-12
EP1107989B1 (en) 2010-03-31
PL346703A1 (en) 2002-02-25
JP2013128490A (ja) 2013-07-04
NO20010918D0 (no) 2001-02-23
EP1107989A2 (en) 2001-06-20
DK1107989T3 (da) 2010-05-25
RU2240328C2 (ru) 2004-11-20
AU5583699A (en) 2000-03-14
CN100422332C (zh) 2008-10-01
PL202057B1 (pl) 2009-05-29
WO2000011033A3 (en) 2000-06-22
NO20010918L (no) 2001-04-19
CA2339331C (en) 2011-03-01
US20070009538A1 (en) 2007-01-11
HUP0103329A2 (hu) 2001-12-28
ZA200101290B (en) 2002-02-15
HUP0103329A3 (en) 2003-09-29
US20130165634A1 (en) 2013-06-27
JP2009273478A (ja) 2009-11-26
WO2000011033A2 (en) 2000-03-02
US8703908B2 (en) 2014-04-22
US20030139365A1 (en) 2003-07-24
PT1107989E (pt) 2010-07-02
AU761027B2 (en) 2003-05-29
BR9913331A (pt) 2001-05-15
US8206718B2 (en) 2012-06-26
CN1326467A (zh) 2001-12-12

Similar Documents

Publication Publication Date Title
CZ2001643A3 (cs) Exprese a export inhibitorů angiogeneze ve formě imunofúzinů
JP6450365B2 (ja) 制御性t細胞の増殖のためのインターロイキン−2ムテイン
KR101993714B1 (ko) 대사 장애를 치료하는데 이용하기 위한 조성물과 방법
US9078860B2 (en) VEGF analogs
JP2019123711A (ja) Pdgfおよびvegf結合部分を含む融合タンパク質ならびにその使用方法
US11472864B2 (en) Polynucleotides encoding APOA1-PON1 fusion polypeptides
CA2356401A1 (en) Expression and export of anti-obesity proteins as fc fusion proteins
JP2003514552A (ja) 改善された性質を有するエリトロポエチンの形態
JP6676551B2 (ja) 改変フォンウィルブランド因子
KR102461210B1 (ko) Uti 융합 단백질
US20090286721A1 (en) Targeted plasminogen activator fusion proteins as thromobolytic agents
JP2013253079A (ja) 生物学的に活性なヒト尿中トリプシンインヒビターのFc融合タンパク質並びにその調製および使用
CN101914161A (zh) 抑制肿瘤生长的融合蛋白HGFα-Fc及其用途
MXPA01001970A (en) Expression and export of angiostatin and endostatin as immunofusis
BR112015023145B1 (pt) Polipeptídeos contendo fc aglicosilados e anticorpo ou proteína de fusão fc

Legal Events

Date Code Title Description
MM4A Patent lapsed due to non-payment of fee

Effective date: 20160825