CN1771338A - 高亲和力抗人类IgE抗体 - Google Patents

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Abstract

本发明涉及高亲和力人类单克隆抗体，尤其那些针对免疫球蛋白E(IgE)的同型决定子的高亲和力人类单克隆抗体，以及这些抗体的直接等效物及衍生物。这些抗体可以一比原始亲代抗体高至少100倍的亲和力与其各自的靶相结合。这些抗体可用于诊断、预防和治疗疾病。

Description

高亲和力抗人类IgE抗体
技术领域
本发明涉及高亲和力人类单克隆抗体，尤其那些针对免疫球蛋白E(IgE)的同型决定子的高亲和力人类单克隆抗体，以及这些抗体的直接等效物及衍生物。这些抗体可以一比原始亲代抗体高至少100倍的亲和力与其各自的靶相结合。这些抗体可用于诊断、预防和治疗疾病。
背景技术
过敏为一种由对一异源物质(例如过敏原)的过度免疫反应引发的超敏状态。速发型(I型)超敏反应的特征为与过敏原接触后立即出现过敏反应，其通过B细胞介导并且是基于抗原-抗体反应。迟发型超敏反应通过T细胞介导并且是基于细胞免疫机理。近些年来，术语“过敏”变得越来越与I型超敏反应具有相同含义。
速发型超敏反应这一反应是基于由B细胞产生免疫球蛋白E类的抗体(IgE抗体)这一现象，当B细胞与过敏原接触时其会分化成抗体分泌浆细胞。IgE引发反应是一发生在过敏原进入身体的位置(即粘膜表面及/或局部淋巴结)处的局部事件。局部产生的IgE将首先敏化局部肥大细胞，即IgE抗体的恒定区与肥大细胞表面上的Fcε受体结合，然后“溢出”的IgE进入循环系统并整个身体中的循环嗜碱性粒细胞及组织固定的肥大细胞二者上的受体结合。当所结合的IgE随后与过敏原接触时，Fcε受体通过过敏原的结合而被交联，造成细胞脱粒并释放许多过敏介体，例如组胺、前列腺素、白细胞三烯等。这些物质的释放导致速发型超敏反应的典型临床症状，即呼吸道或肠道平滑肌收缩，小血管扩张且其对水及血浆蛋白质的通透性增加，分泌粘液并从而导致例如过敏性鼻炎，变应性湿疹及哮喘，以及刺激皮肤神经末端从而导致瘙痒及疼痛。另外，当第二次与过敏原接触时反应加剧，这是因为某些B细胞在第一次与过敏原接触后通过在细胞表面上表达IgE而形成表面IgE阳性B细胞(sIgE+B细胞)的“记忆池”。
有两大类IgE受体，即高亲和力受体FcεRI及低亲和力受体FcεRII。FcεRI主要在肥大细胞及嗜碱性粒细胞的表面上表达，但在人类朗格汉斯细胞、树突细胞及单核细胞上亦有少量表达，其中FcεRI在IgE介导的过敏原呈现中起作用。另外，已报导在人类嗜伊红细胞及血小板存在FcεRI(Hasegawa，S.等人，Hematopoiesis，1999，93：2543-2551)。在B细胞、T细胞或嗜中性粒细胞的表面上未发现FcεRI。The expression of FcεRI在朗格汉斯细胞及皮肤树突细胞上的表达在功能及生物学上对于过敏性个体中的IgE结合抗原的呈现均较为重要(KlubalR.等人，J.Invest.Dermatol.1997，108(3)：336-42)。
低亲和力受体FcεRII(CD23)为一凝集素样分子，其包含三个完全相同的亚单位，该些亚单位具有自细胞质膜的α螺旋卷曲柄延伸的头结构(Dierks，A.E.等人，J.Immunol.1993，150：2372-2382)。当与IgE结合时，FcεeRII与B细胞上参与调节IgE合成的CD21联合(Sanon，A.等人，J.Allergy Clin.Immunol.1990，86：333-344，Bonnefoy，J.等人，Eur.Resp.J.1996，9：63s-66s)。人们早已认识到FcεRII对于过敏原呈现的作用(Sutton及Gould，1993，Nature，366：421-428)。与上皮细胞上的FcεRII结合的IgE负责特定及迅速的过敏原呈现(Yang，P.P.，J.Clin.Invest，2000，106：879-886)。FceRII存在于数种细胞类型上，包括B细胞、嗜伊红细胞、血小板、天然杀伤细胞、T细胞、滤泡树突细胞及朗格汉斯细胞。
已鉴别出IgE细胞上与FcεRI及FcεRII相互作用的结构实体。诱变研究已显示，CH3结构域同时介导IgE与FcεRI的相互作用(Presta等人，J.Biol.Chem.1994，269：26368-26373；Henry A.J.等人，Biochemistry，1997，36：15568-15578)及与FcεRII的相互作用(Sutton及Gould，Nature，1993，366421-428；Shi，J.等人，Biochemistry，1997，36：2112-2122)。这两种高及低亲和力受体的结合位点沿一穿过两个CH3结构域的中心旋转轴对称分布。FcεRI结合位点位于CH3结构域中接近CH2结构域接点的外侧上，而FcεRII结合位点位于CH3的羧基端上。
一种前景良好的治疗过敏的概念涉及施用单克隆抗体，这些单克隆抗体具IgE同种型特异性，因此能结合IgE。该方法是基于通过减量调节IgE免疫反应来抑制过敏反应，而IgE免疫反应是引发过敏的最早事件并维持过敏状态。由于不影响其他类抗体的反应，因此可以对过敏症状达成一迅速并持久的影响。关于人类嗜碱性粒细胞密度的早期研究显示，患者血浆中IgE的水平与每一嗜碱性粒细胞上FcεeRI受体的数量之间有关联(Malveaux等人，J.Clin.Invest，1978，62：176)。他们注意到，过敏性及非过敏性个体中的FcεRI密度介于每一嗜碱性粒细胞104至106个受体之间。后来证明，用抗IgE剂治疗过敏性疾病可将循环IgE的量降低至治疗前水平的1％(MacGlashan等人，J.Immunol.，1997，158：1438-1445)。MacGlashan对从用全抗IgE抗体治疗的患者中获得的血清进行分析，其中全抗IgE抗体可结合在患者血清中循环的游离IgE。他们报导，降低患者体内循环IgE的水平可导致嗜碱性粒细胞表面上的受体数量减少。因此，他们猜测，嗜碱性粒细胞及肥大细胞表面上FcεRI的密度直接或间接由循环IgE抗体的水平调节。
最近，WO 99/62550揭示使用IgE分子及片段，其结合至FcεRI及FcεRII IgE结合位点，从而阻断IgE与受体的结合。然而，对这些过敏性疾病的治疗不具有有害副作用的有效治疗方法仍极为有限。一种治疗过敏性疾病的方法涉及使用人源化抗IgE抗体来治疗过敏性鼻炎及哮喘(Corne，J.等人，J.Clin.Invest.1997，99：879-887；Racine-Poon，A.等人，Clin.Pharmcol.Ther.1997，62：675-690；Fahy，J.V.等人，Am.J.Resp.Crit.Care Med.1997，155：1824-1834；Boulet，L.P.等人，Am.J.Resp.Crit.Care Med.，1997，155：1835-1840；Milgrom，E.等人，N.Engl.J.Med.，1999，341：1966-1973)。这些临床数据表明，抑制IgE与其受体的结合是一种治疗过敏性疾病的有效方法。
适合作为抗过敏剂的抗体应与可分化成产生IgE的血浆细胞的表面IgE阳性B细胞反应，因此其可用于在功能上消除那些B细胞。然而，IgE抗体原则上亦可通过交联Fcε受体引发IgE敏化的肥大细胞释放介体，从而拮抗施加于血清IgE及slgE+B细胞水平上的有益作用。因此，适合于治疗过敏的抗体必须能与敏化肥大细胞及嗜碱性粒细胞上结合的IgE反应，但亦能保持识别slgE+B细胞的能力。
此等IgE同种型特异性抗体已由Chang等人(Biotechnology 8，122-126(1990))、欧洲专利第EP0407392号及数个美国专利例如美国专利第5,449,760号阐述。然而，由于所揭示的抗体不是来自人类，因此作为异源蛋白质的免疫原性导致其不适合用于人类。这一缺点有可能通过将(例如)一啮齿动物抗IgE单克隆抗体转化成一嵌合抗体而降低，其中该嵌合抗体将啮齿动物抗体的可变结构域与人类抗体的恒定结构域结合在一起。该方法保留了啮齿动物亲代抗IgE抗体的抗原结合位点，同时赋予人类同种型及效应功能。嵌合抗体的免疫原性可通过下述方法降低，即将啮齿动物超变区(亦称为互补决定区(CDR))嫁接到人类轻和重链可变区结构域的骨架，产生重构人类抗体。该技术涉及将那些存在于“一般的”人类重及轻链可变结构域中的序列用抗原特异性啮齿动物CDR序列取代或重组嫁接(美国专利第6,180,370号)。
天然完整的免疫球蛋白或抗体包含一通常呈Y形的四聚体分子，该四聚体分子在每一上臂的末端具有一抗原结合位点。一抗原结合位点由一轻链的可变结构域结合一重链的可变结构域而组成。更具体而言，一抗体的抗原结合位点主要由一重链可变结构域(VH)的3个CDR和轻链可变结构域(VI)的3个CDR形成。在VL及VH二者中，CDR均与4个骨架区(FR)交替出现，形成一具有以下通式的多肽链
            (i)FR1-CDR1-FR2-CDR2-FR3-CDR3-FR4(I)，
其中该多肽链阐述为在N末端开始并在C末端结束。VH与VL的CDR亦分别称为H1、H2、H3和L1、L2、L3。FR或CDR构成成份通常是通过比较在同一物种中获得的多个抗体的氨基酸序列来确定且一般鉴定规则在业内为人习知(“Sequences of proteins of immunological interest”，Kabat E.A.等人，USdepartment of health and human service，Public health service，National Institute ofHealth)。
一轻链可变结构域对结合力的影响与相关重链可变结构域对结合力的影响相比较小，并且单独的重链可变结构域自身即具有一抗原结合活性。这些分子通常称为单结构域抗体(Ward，E.S.等人，Nature 341，544-546(1989))。
这些CDR形成环，其在该些结构域内与一β片状骨架相连接。环的氨基酸序列与结构间的关系可以用一个规则结构模型描述(Chothia等人，Nature 342，887-883(1989))。根据此模型，抗体的每一超变区仅具有几个主链构造或“规则结构”。这些构造通过在CDR中和(对于某些环而言)在骨架区中特定位点处存在几个关键氨基酸残基来确定。
在不同的免疫球蛋白中具有相同构造的超变区在这些位点处具有相同或非常相似的氨基酸残基。
人们已对单克隆抗体实施CDR嫁接，产生结合亲和力显著低于啮齿动物CDR供体抗体的人源化人类抗体。各种发现已经显示，除了CDR转移外，在某些情况下可能需要在人类序列骨架内进行变化，以在CDR嫁接产品中提供满意的抗原结合活性。Queen等人(Proc.Natl.Acad.Sci.USA 86，10029-10033(1989))揭示，一鼠科动物抗-Tac单克隆抗体的CDR可嫁接到一人类骨架中。该些人类骨架经选择，以最大化与鼠科动物序列的同源性。作者使用鼠科动物亲代抗体的计算机模型来确定位于FR内的其接近程度足以与这些CDR或抗原相互作用的氨基酸残基。将这些残基突变成在鼠科动物序列中发现的残基。此人源化抗-Tac抗体仅具有一约为该鼠科动物抗-Tac抗体的1/3的亲和力，并且此抗体人类特征的维持也颇成问题。
治疗IgE水平极高的疾病可需要一具较高亲和力的抗体，以降低免疫原性的风险，并将临床适应症扩展至具有极高IgE水平的疾病，例如异位性皮炎。因此，人类期望获得一人源化程度更高且对IgE的亲和力更高的抗IgE抗体。本发明中的抗体为一抗人类IgE抗体，其具有超高亲和力且更高程度的人类序列同源性，从而降低免疫原性风险。
因此，人们需要更高亲和力人源化抗体，这些更高亲和力人源化抗体应能降低治疗疾病所需抗体的量，从而降低由药物免疫原性对患者造成的潜在副作用并降低患者的花费。此外，本发明提高识别出高亲和力抗体的可能性。
发明内容
本发明涉及由一亲代抗体产生的高亲和力抗体，尤其是极高亲和力抗IgE抗体。这些高亲和性抗体可以一比原始亲代抗体高至少20倍的结合亲和力与靶抗原决定部位结合，其中亲和力的增加为高约100倍至约5000倍。
本发明还涉及一种自一亲代抗体分子制造此类高亲和力抗体的方法，其係将人源化与亲合力成熟的一非人类抗体结合于一与其它方法相比可显著增强结合亲和力的快速高效方法中。此方法涉及，通过产生一经随机取代的CDR及/或骨架区的文库来同时或顺次修饰亲代抗体分子的CDR和骨架区，及筛选高亲和力分子。
本发明一实施例
附图说明
图1是用于抗体克隆和筛选的噬菌体载体的示意图。
图2是用于产生抗体变体的寡核苷酸的示意图。
图3A绘示鼠科动物抗-IgE抗体TES-C21的轻链与L16和JK4组合人类模板的比较情况。
图3B绘示TES-21的重链与组合人类模板DP88和JH4b的比较情况。
图4展示与亲代TES-21比较具高亲和力的骨架残基变体表。
图5A及B绘示纯系4、49、72、78、及136的ELISA滴定曲线，此是与TES-C21的亲代Fab及阴性对照(5D12)相比较。
图6绘示对纯系2C、5A、及51的抑制分析，此是与亲代TES-21和一阴性对照抗体相比较。
图7A绘示具有一可导致甚至更高IgE亲和力的有益突变组合的纯系的序列。
图8A和8B绘示纯系136、1、2、4、8、13、15、21、30、31、35、43、44、53、81、90和113的整个轻链可变区的骨架序列。
图9A和9B绘示35个纯系的整个重链可变区的骨架序列。图10A至F绘示纯系136、2C、5I、5A、2B、及1136-2C的完整重链和轻链序列。
图10A至F绘示纯系136、2C、5I、5A、2B及1136-3C的完整重及轻链序列。
具体实施方式
整个本申请案中所用术语应理解为具有所属领域的技术人员习知的通常及典型意义。然而，本申请案的申请者期望下列术语具有如下所定义的特定定义。
短语“实质上相同的”就一抗体链多肽序列而言可解释为与参考多肽序列相比显示至少70％、或80％、或90％或95％的序列一致性的抗体链。该术语就一核酸序列而言可解释为与参考核酸序列相比显示至少约85％、或90％、或97％的序列一致性的核酸序列。
术语“一致性”或“同源性”应理解为指在比对序列并引入空位(若需要)以达到整个序列的最高百分比一致性后，候选序列中与拟比较对应序列的残基相同的氨基酸残基的百分比，其中不将任何保守取代视为序列一致性的一部分。N-或C-末端延伸或插入均不应理解为降低一致性或相同性。用于比对的方法及计算机程序在业内众所周知。序列一致性可使用序列分析软件测量。
术语“抗体”以广义使用，并且具体而言涵盖单克隆抗体(包含全长单克隆抗体)、多克隆抗体和多特异性抗体(例如，双特异性抗体)。抗体(Ab)和免疫球蛋白(Ig)是具有相同结构特征的糖蛋白。尽管抗体可对于一特定靶展示结合特异性，但免疫球蛋白既包括抗体亦包括其他缺乏靶特异性的抗体样分子。天然抗体和免疫球蛋白通常为约150,000道尔顿的四异聚体糖蛋白，由两条相同的轻(L)链和两条相同的重(H)链组成。每一条重链在一端均具有一可变结构域(VH)，后接多个恒定结构域。每一条轻链均在一端具有一可变结构域(VL)并在其另一端具有一恒定结构域。
本文所用“抗人类IgE抗体”指一以可抑制或实质降低人类IgE与高亲和力受体FcεRI结合的方式结合至人类IgE的抗体。术语“可变”在抗体可变结构域之语境中指此一事实，即抗体之间的这些可变结构域的某些部分在序列上极为不一致，并用于每一特定抗体对其特定靶的结合及特异性。然而，此可变性在抗体的所有可变区域中并非均匀分布。其集中于三个在轻链和重链可变结构域中均存在的片段中，这些片段称为互补决定区(CDR)，又称为超变区。可变结构域中保守程序更高的的部分称为骨架(FR)。天然重链和轻链的可变结构域各包括4个主要采用一β-薄片构造的FR区，其由三个CDR连接，形成环连接，在某些情况下形成β-薄片结构的一部分。每一链中的CDR皆借助FR区紧密地结合在一起并与其他链的CDR一起促成抗体的靶结合位点的形成(参见Kabat等人)。除非另有说明，否则本文所用免疫球蛋白氨基酸残基编号乃依照Kabat等人的免疫球蛋白氨基酸残基编号系统进行(Sequences of Proteins ofImmunological Interest，National Institute of Health，Bethesda，Md.1987)。
术语“抗体片段”指一全长抗体的一部分，通常指靶结合或可变区。抗体片段的实例包括Fab、Fab′、F(ab′)2和Fv片段。短语一抗体的“功能片段或类似物”是具有与全长抗体一样的定性生物活性的化合物。例如，抗IgE抗体的一功能片段或类似物是一可与一IgE免疫球蛋白结合以便可防止此分子具有与该高亲和力受体FcεRI结合的能力或实质降低该能力的化合物。本文所用“功能片段”就抗体而言是指Fv、F(ab)和F(ab′)2片段。一“Fv”片段是最小的抗体片段，其包含一完整的靶识别和结合位点。此区域由一个重链可变结构域与一个轻链可变结构域呈紧密非共价联接的二聚体(VH-V1二聚体)组成。每一可变结构域的三个CDR即是以该构造相互作用，从而在该VH-V1二聚体的表面上界定一靶结合位点。这六个CDR共同赋予了此抗体靶结合特异性。然而，即使一单个可变结构(或仅包含三个对一靶具特异性的CDR的半个Fv)亦具有识别和与靶结合的能力，但其亲和力以比整个结合位点要低。“单链Fv”或“sFv”抗体片段包括一抗体的VH和VL结构域，其中这些结构域呈一单多肽链形式。一般而言，Fv多肽进一步包含一位于VH和VL结构域之间的多肽连接体，该连接体能使sFv形成期望的靶结合结构。Fab片段包含轻链的恒定结构域及重链的第一恒定结构域(CH1)。Fab′片段因在重链CH1结构域的羧基端增加了几个残基而与Fab片段不同，这些残基包括一或多个来自抗体铰链区的半胱氨酸。F(ab′)片段是由在F(ab′)2胃蛋白酶消化产物的铰链半胱氨酸处的二硫键断裂而产生。抗体片段的其他化学结合已为所属领域的技术人员习知。
本文所用术语“单克隆抗体”指一自一群实质上同源的抗体获得的抗体，即，构成该抗体群的单个抗体除了可能含有天然发生的可少量存在的突变外完全相同。单克隆抗体具高度特异性，其针对一单个靶位点。而且，与通常包括针对不同决定子(抗原决定部位)的不同抗体的传统(多克隆)抗体制品相反，每一单克隆抗体皆针对靶上的一单个决定子。除其特异性外，单克隆抗体的优势在于其可通过杂交瘤培养合成，不受其他免疫球蛋白的污染。修饰词“单克隆的”表明该抗体是自一实质上同源的抗体群获得的特性，不能理解为需要借助任一特殊方法来生产该抗体。例如，用于本发明的单克隆抗体可使用习知技术自噬菌体抗体文库分离得到。依照本发明使用的亲代单克隆抗体可通过由Kohler和Milstein(Nature 256，495，495(1975))最先阐述的杂交瘤方法制得，或可通过重组方法制得。
非人类(例如鼠科动物)抗体的“人源化”形式为嵌合免疫球蛋白、免疫球蛋白链或其片段(例如，Fv、Fab、Fab′、F(ab′)2或抗体的其他靶结合序列)，其包含最低限度的源自非人类免疫球蛋白的序列。一般而言，人源化抗体包含实质上全部的至少一个且通常两个可变结构域，其中全部的或实质上全部的CDR区对应于一非人类免疫球蛋的CDR区，且全部的或实质上全部的FR区为人类免疫球蛋白共有序列的FR区。人源化抗体也可包括一免疫球蛋白恒定区(Fc)(通常为一所选人类免疫球蛋白模板的恒定区)的至少一部分。
术语“细胞”、“细胞系”和“细胞培养物”包括子代。也应了解，所有子代的DNA含量可能因特意的或无意的突变而不精确相同。当在最初转化的细胞中筛选时具有相同功能或生物学特性的变异子代可包括在内。本发明所用的“宿主细胞”通常为原核宿主或真核宿主。
用DNA“转化”一细胞有机体意指将DNA引入一有机体中，使该DNA可作为一染色体外因子或借助染色体整合而复制。用DNA“转染”一细胞有机体是指细胞或有机体接纳DNA(例如，一表达载体)，无论事实上是否有任何编码序列被表达。术语“经转染的宿主细胞”和“经转化的细胞”是指一将DNA引入其中的细胞。该细胞称为“宿主细胞”，并且其可为原核细胞或真核细胞。典型的原核宿主细胞包括多种大肠杆菌菌株。典型的真核宿主细胞为哺乳动物细胞，例如中国仓鼠卵巢(CHO)细胞或人源细胞。所引入的DNA序列可能来自与宿主细胞相同的物种或来自一与宿主细胞不同的物种，或其可为一含有一些外来DNA和一些同源DNA的杂合DNA序列。
术语“载体”意指一种DNA构筑体，其包含一可以操作方式连接至一能够影响该DNA在一适宜宿主细胞中表达的控制序列的DNA序列。此类控制序列包括影响转录的启动子、控制此转录的可选操纵序列、编码适合的mRNA核糖体结合位点的序列和控制转录与转译的终止的序列。所述载体可为一质粒、一噬菌体微粒或仅为一潜在的基因组插入体。一旦转化到一适合的宿主中，该载体可不受宿主基因组限制而进行复制并行使作用，或在某些情况下可整合进基因组本身中。在本说明书中，由于质粒是载体的最常用形式，因此“质粒”和“载体”有时可互换使用。然而，本发明意欲涵盖可起到等效作用并已经或正在为业内人士所了解的其他载体形式。
表述“控制序列”指一以可操作方式连接的编码序列在一特定宿主有机体内表达所必需的DNA序列。举例而言，适于原核生物的控制序列包括启动子、视情况操纵序列及核糖体结合位点。人们已经知道，真核细胞可利用启动子、聚腺苷酸化信号和增强子。若前序列或分泌前导序列的DNA表达为一参与一多肽分泌的前蛋白，则该前序列或分泌前导序列DNA能以可操作方式连接至此多肽的DNA；若一启动子或增强子可影响一编码序列的转录，则此启动子或增强子能以可操作方式连接至该编码序列；或者，若一核糖体结合位点可影响一编码序列的转录，则该核糖体结合位点能以可操作方式连接至该编码序列；或者，若一核糖体结合位点之位置可促进转译，则该核糖体结合位点能以可操作方式连接至一编码序列。一般而言，“以可操作方式连接”指被连接的DNA序列是连续的，并且当为一分泌前导序列时是既连续又处于阅读状态。然而，增强子则无需是连续的。用于治疗目的的“哺乳动物”指任何归为哺乳动物的动物，包括人类、家畜及饲养动物、非人类灵长类动物，以及动物园中的动物、运动场上的动物或宠物，例如狗、马、猫、牛等等。
术语“抗原决定部位标记的”当用于多肽语境中时指一与“抗原决定部位标签”融合的多肽。该抗原决定部位标签多肽具有足够多的残基以提供一可制造针对其的抗体的抗原决定部位，但却足够短而不会干扰多肽的活性。该抗原决定部位标签最好也是相当独特，这样抗体基本不会与其他抗原决定部位发生交叉反应。适合的标签多肽一般具有至少6个氨基酸残基并通常介于约8至50个氨基酸残基之间(较佳介于约9至30个残基之间)。实例包括流感HA标签多肽及其抗体12CA5(Field等人，Mol Cell.Biol.8：2159-2165(1988)))；c-myc标签和针对其的8F9、3C7、6E10、G4、B7和9E10抗体(Evan等人，Mol Cell.Biol.5(12)：3610-3616(1985))；及单纯疱疹病毒糖蛋白D(gD)标签及其抗体(Paborsky等人，Protein Engineering 3(6)：547-553(1990))。在某些实施例中，该抗原决定部位标签可为一IgG分子(例如，IgG1、IgG2、IgG3或IgG4)Fc区的抗原决定部位，其中Fc负责增加IgG分子的体内血清半衰期。
本文所用词语“标记”指一可直接或间接地与一分子或蛋白质(例如，抗体)结合的可检测到的化合物或组合物。该标记自身可检测到(例如，放射性同位素标记或荧光标记)或当为酶标记时可催化一可检测的基质化合物或组合物的化学改变。
本文所用“固相”指一本发明抗体可粘附于其上的非水性基质。本文所涵盖固相的实例包括那些部分或完全由玻璃(例如，可控孔径玻璃)、多糖(例如，琼脂糖)、聚丙烯酰胺、聚苯乙烯、聚乙烯醇和硅酮形成的固相。在某些实例中，视上下文而定，固相可包括分析板孔；在其他实施例中其可为一提纯柱(例如，一亲和色谱柱)。
本文所用术语“IgE-介导的病症”指一种状况或疾病，其特征在于免疫球蛋白IgE超量产生及/或对IgE具有超敏性。特定言之，其应理解为包括与过敏性超敏反应和变应性过敏有关的状况，包括(例如)：哮喘、过敏性鼻炎和结膜炎(干草热)、湿疹、荨麻疹、异位性皮炎和食物过敏。由(例如)蜜蜂蜇、蛇咬、食物或药物引起的过敏性休克这一严重的生理学状况也涵盖于此术语范围内。
抗体的产生
起始或“亲代”抗体可用业内现有的用于产生此类抗体的技术制得。这些技术众所周知。产生起始抗体的例示性方法在随后部分中有更详尽的阐述。这些阐述内容是制备或选择一亲代抗体的可能替代方法，而绝非限制产生此一分子的方法。
该抗体的结合亲和力在产生一本发明高亲和力抗体前确定。并且，此抗体可经受其他生物学活性测定，例如，以便评价作为治疗剂的效力。此等测试在业内已知并取决于此抗体的靶和期望用途。
为筛选出结合至一特定抗原决定部位(例如，那些可阻断IgE结合至其高亲和力受体的抗原决定部位)的抗体，可实施一常规阻断测试，例如阐述于“Antibodies：A Laboratory Manual”(Cold Spring Harbor Laboratory，Ed Harlow和David Lane(1988))中的常规阻断测试。或者，也可实施抗原决定部位作图以确定抗体与一相关抗原决定部位相结合的位置。视情况，可使用业内熟知的技术评价抗体对用来产生此抗体的靶同源物(其中该同源物来自一不同物种)的结合亲和力。在一实施例中，该其它物种为一将在临床前研究中将该抗体投予其的非人类哺乳动物。因此，该物种可为一非人类灵长类动物，例如恒河猴、猕猴、狒狒、黑猩猩和短尾猿。在其他实施例中，该物种可为(例如)一啮齿动物、猫或狗。此亲代抗体可依照本发明经改变而产生一比亲代抗体具有更高或更强靶结合亲和力的抗体。所得高亲和力抗体的靶结合亲和力优选比亲代抗体靶结合亲合力高至少约10倍或至少约20倍或至少约500倍或可能高1000至5000倍。需要或期望的结合亲和力增强的程度将取决于亲代抗体的初始结合亲和力。
一般而言，自一亲代抗体制备高亲和力抗体的方法包括以下步骤：
1.获得或选择一可结合至相关靶的亲代抗体，其应包含重链和轻链可变结构域。此可通过传统杂交瘤技术、噬菌体展示技术、或任一其他可产生靶特异性抗体的方法完成。
2.选择一序列与亲代骨架序列接近的骨架序列，较佳为一人类模板序列。该模板的选择可基于(例如)其相对总长度、CDR大小、位于骨架与CDR之间连接点处的氨基酸残基、总体同源性等。所选模板可为多个序列的混合体或可为共有模板。
3.通过在各个和所有可能的CDR位置进行随机氨基酸取代产生一纯系文库。亦可用所有可能的氨基酸随机取代人类骨架模板中(例如)毗邻CDR或可影响结合或折叠的氨基酸，产生一骨架取代文库。可估计这些骨架取代对靶结合和抗体折叠的潜在影响。骨架中的氨基酸取代可与CDR中的氨基酸取代同时进行或顺次进行。一种用来产生变体文库的方法是寡核苷酸合成。
4.构建一包含步骤(3)中产生的重链和/或轻链变体的表达载体，其包括式：FRH1-CDRH1-FRH2-CDRH2-FRH3-CDRH3-FRH4(I)及FRL1-CDRL1-FRL2-CDRL2-FRL3-CDRL3-FRL4(II)，其中FRL1、FRL2、FRL3、FRL4、FRH1、FRH2、FRH3及FRH4代表步骤3中所选骨架模板轻链和重链序列的变体，并且CDR代表亲代抗体CDR的变体CDR。一含有此等轻链和重链序列的载体实例绘示于图1中。
5.针对该特定靶筛选纯系文库，对那些可与该靶结合的纯系进行筛选以确定其是否具提高的结合亲和力。选出那些具有比亲代分子高的结合亲和力的纯系。最佳高亲和力候选者与亲代抗体比较应具有尽可能高的结合亲和力，优选为比后者高20倍、100倍、1000倍或5000倍。若所选变体包含某些非期望的氨基酸，例如一已被引入的糖基化位点或一潜在的免疫原性位点，则可用更有益的氨基酸残基取代那些氨基酸，并重新评估结合亲和力。
通过保持人类骨架区不动，仅随机地取代CDR区，也可使用此方法自一全人类亲代抗体产生高亲和力抗体。
改良的高容量筛选技术及载体(例如图1中所载体)使得技术人员可迅速并高效地对一给定CDR和/或骨架区中所有位点处的综合取代文库进行筛选。通过同时随机地取代所有位点的所有氨基酸，能够筛选出原来不能由单个取代预见或识别的因(例如)协同作用而显著增强亲和力的可能组合。
亲代抗体制备
A.靶制备
可溶性靶或其片段可用作产生抗体的免疫原。抗体针对相关靶。较佳地，靶为一生物学上重要的多肽，并且将抗体投予一患有疾病或病症的哺乳动物后可在此动物体内产生治疗益处。然而，抗体可针对非多肽靶。当靶为一多肽时，其可为一跨膜分子(例如受体)或配体，例如一生长因子。本发明的一靶为IgE。全细胞可用作免疫原来制备抗体。靶可以重组方式制备或使用合成方法制造。靶亦可自一天然来源分离出来。
对于跨膜分子，例如受体，其片段(例如，一受体的细胞外结构域)可用作免疫原。或者，表达该跨膜分子的细胞可用作免疫原。这些细胞可源自一天然来源(例如，肥大细胞系)或可为已通过重组技术转化而表达该跨膜分子的细胞。所属领域的技术人员将明了其他靶及其用于制备抗体的形式。
B.多克隆抗体
多克隆抗体通常在非人类哺乳动物中通过多次皮下或腹膜腔内注射与一佐剂联合的相应靶而产生。将相应靶与一欲免疫物种内具免疫原性的蛋白质(例如钥孔虫戚血兰素(keyhole limpet hemocyanin))结合较为有用。众多可引起一免疫学反应的因子为业内人员所熟知。
可通过将该蛋白质或结合物(分别对于兔子或小鼠而言)与弗罗因德氏(Freud’s)完全佐剂组合并将该溶液以皮内方式注射使动物对靶、免疫原性结合物或衍生物免疫。一个月后，通过多位点皮下注射对这些动物追加1/5到1/10的最初量的溶于弗罗因德氏完全佐剂中的肽或结合物。7到14天后，抽取这些动物的血液并对血清进行抗体滴度分析。对这些动物追加上述溶液直至滴度达到稳定状态。
所选择的哺乳动物抗体通常会具有一足够强的靶结合亲和力。例如，该抗体可以约1×10-8M的结合亲和力(Kd)值与人类抗IgE靶结合。抗体亲和力可通过饱和结合法、酶联免疫吸附分析(ELISA)和竞争分析(例如，放射免疫测定)测定。
为筛选可与相关靶结合的抗体，可实施一常规交叉测试，例如Antibodies(A Laboratory Manual，Cold Spring Harbor Laboratory，Ed Harlow及David Lane，1988)中所述测试。或者，可实施抗原决定部位作图(例如，如Champe等人在J.Biol.Chem.270：1388-1394(1995)中所阐述)以测定结合情况。
C.单克隆抗体
单克隆抗体是识别一单抗原位点的抗体。其一致的特异性使单克隆抗体比多克隆抗体更有用，而多克隆抗体通常含有可识别多个不同抗原位点的抗体。单克隆抗体可使用首先由Kohler等人在Nature(256：495，1975)中阐述的杂交瘤方法制备，或可使用重组DNA方法制备。在杂交瘤方法中，如上所述免疫一小鼠或其他合适的宿主动物(例如一啮齿动物)以诱发可产生或能够产生特异性地与免疫所用蛋白质相结合的抗体的淋巴细胞。或者，也可以在体外对淋巴细胞进行免疫。随后使用一适合的融合剂(例如，聚乙二醇)使淋巴细胞与骨髓瘤细胞融合，形成一杂交瘤细胞(Goding，Monoclonal Antibodies：Principalsand Practice，pp.590-103(Academic Press，1986))。
将如此制备的杂交瘤细胞在一适宜的培养基中接种并生长，该培养基中较佳含一或多种可抑制未融合的亲代骨髓瘤细胞生长或存活的物质。例如，如果亲代骨髓瘤细胞缺乏次黄嘌呤鸟嘌呤磷酸核糖转移酶(HGPRT或HPRT)这一酶，则用于杂交瘤的培养基通常将包括次黄嘌呤、氨基蝶呤及胸苷(HAT培养基)、可防止HGPRT缺乏细胞的生长的物质。较佳骨髓瘤细胞是那些可高效融合、支持所选抗体产生细胞以稳定的高水平产生抗体且对诸如HAT培养基等培养基敏感的细胞。已有人阐述，可使用人类骨髓瘤及小鼠-人杂交骨髓瘤细胞系产生人类单克隆抗体(Kozbor，J.Immunol.133：3001(1984)；Brodeur等人，Monoclonal Antibody Production Techniques and Applications，pp.51-63(MarcelDekker公司，纽约，1987))。
在鉴别出可产生具有期望特异性、亲和力、和/或活性的抗体的杂交瘤细胞后，可通过有限稀释程序将这些纯系加以亚克隆并用标准方法加以培养(Goding，Monoclonal Antibodies：Principals and Practice，pp.59-103，AcademicPress，1986)。适用于此目的的培养基包括。适宜情况为，由这些亚纯系分泌的单克隆抗体通过传统免疫球蛋白纯化程序(例如，蛋白质A-琼脂糖凝胶、羟基磷灰石层析法、凝胶电泳、透析或亲和色谱法)自培养基中分离出来。
编码单克隆抗体的DNA可使用传统程序容易地分离出来并测序(例如，通过使用能特异性地与编码单克隆抗体的重链和轻链的基因结合的寡核苷酸探针)。杂交瘤细胞可作为此类DNA的一种来源。分离后，可将此DNA置于表达载体中，随后将表达载体转移至宿主细胞(例如大肠杆菌细胞、中国仓鼠卵巢(CHO)细胞、或骨髓瘤细胞)中以在这些重组宿主细胞中实现单克隆抗体的合成。亦可通过(例如)用人类重链及轻链恒定结构域的编码序列来代替同源鼠科动物序列(美国专利第4,816,567号；Morrison等人，Proc.Nat.Acad.Sci.USA 81：6851(1984))或通过共价地连接至免疫球蛋白多肽来修饰DNA。
D.人源化抗体
人源化是一种制造嵌合抗体的技术，其中，实质上少于一个完整的人类可变结构域的部分已由来自一非人类物种的对应序列取代。人源化抗体中引入一或多个来自一非人类来源的氨基酸残基。这些非人类氨基酸残基通常称为“引入”残基，其通常取自一“引入”可变结构域。人源化基本上可依照Winter和合作者(Jones等人，Nature 321：522-525(1986)；Riechman等人，Nature 332：323-327(1988)；Verhoeyens等人，Science 239；1534-1536(1988))的方法实施，用非人类CDR的或CDR序列取代人类抗体中的对应序列(参见，例如，美国专利第4,816,567号)。如本发明中所实施，人源化抗体中的一些CDR残基和一些FR残基可由鼠科动物抗体中类似位点的残基取代。
欲用于制备人源化抗体的人类可变结构域的选择(包括轻链和重链两者)对于降低抗原性非常重要。根据所谓“最恰当”方法，将一非人类抗体可变结构域的序列与一习知人类可变结构域序列文库相比较。然后将与非人类亲代抗体的序列最接近的人类序列视为此人源化抗体的人类骨架(Sims等人，J.Immunol.151：2296(1993)；Chothia等人，J.Mol.Biol.196：901(1987))。另一方法使用一源自一特定轻链或重链亚型的所有人类抗体的共有序列的特定骨架。该同一骨架可用于数种不同的人源化抗体(Carter等人，Proc.Natl.Acad.Sci.USA，89：4285(1992)；Presta等人，J.Immunol.151：2623(1993))。
E.抗体片段
人们已经开发了多种制备抗体片段的技术。传统上，这些片段是通过完整抗体的蛋白水解消化获得(参见，例如，Morimoto等人，Journal of Biochemicaland Biophysical Methods 24：107-117(1992)和Brennan等人，Science 229：81(1985))。然而，这些片段如今可通过重组宿主细胞直接制备。举例而言，这些抗体片段可以从一抗体噬菌体文库中分离得到。或者，F(ab′)2-SH片段可以直接从大肠杆菌重新获得并用化学方法偶联以形成F(ab′)2片段(Carter等人，Bio/Technology 10：163-167(1992))。依照另一方法，F(ab′)2片段可直接自重组宿主细胞培养物中分离得到。所属领域的技术人员应明了其他制备抗体片段的方法。在其他实施例中，所选抗体是一单链Fv片段(scFv)。(PCT专利申请案WO 93/16185)。
高亲和力抗体的制备
当亲代抗体已经识别并分离出来后，改变此亲代抗体的一或多个可变结构域中的一或多个氨基酸残基。或者，或另外，可将一或多个骨架残基的取代引入该亲代抗体，其中这些取代可导致抗体(例如对人类IgE的)结合亲和力增强。欲修饰骨架区残基的实例包括那些以非共价方式直接与靶结合的残基(Amit等人，Science 233：747-753(1986))；与CDR相互作用/影响CDR构造的残基(Chothiau等人，J.Mol.Biol.196：901-917(1987))；和/或参与形成VL-VH接合部位的残基(EP 239 400 B1)。在某些实施例中，对一或多个此骨架区残基加以修饰可导致抗体对相关靶的结合亲和力增强。
对抗体生物学特性的修饰可通过选择对于保持下列特征的作用显著不同的取代：(例如)(a)取代区域中多肽主链的结构，例如，呈一薄片或螺旋状构造形式；(b)靶位点处分子的电荷或疏水性，或(c)侧链的大小。非保守性取代将需要将这些种类之一调换成另一种类。
编码氨基酸序列变体的核酸分子可通过多种业内熟知的方法制备。这些方法包括(但不限于)该物种依赖性抗体的一早期制备变体或一非变体形式的寡核苷酸介导的(或定位)诱变、PCR诱变及盒式诱变。产生变体的较佳方法是一寡核苷酸介导的合成。在某些实施例中，该抗体变体将仅有单个超变区残基受到取代，例如自约2至约15个超变区取代。
一种产生变体文库的方法是根据图2中所述方案通过由寡核苷酸介导的合成来达成。可跨越整个轻链或重链可变区合成三种各具有约100个核苷酸的寡核苷酸。每一寡核苷酸可包含：(1)一段60个氨基酸长的序列，由三联体(NNK)20生成，其中N为任一核苷酸且K为G或T，和(2)与下一寡核苷酸或与每一末端载体序列重叠的一约15至30个核苷酸的重叠序列。当在一PCR反应中将这三个寡核苷酸退火时，聚合酶将填充入相反链中，产生一完整的双链重链或轻链可变区序列。三联体的数目可调整至任一重复长度，并且其在寡核苷酸中的位置可经选择以便仅取代一给定CDR或骨架区中的氨基酸。通过使用(NNK)，所有二十种氨基酸皆可能位于被编码变体中的每一位置。5至10个氨基酸(15至30个核苷酸)的重叠序列将不会被取代，但此可经选择落入此骨架的堆叠区内，或可通过一单独的或随后的合成操作加以取代。合成寡核苷酸的方法为业内人员所熟知，并且也可以购得。自这些寡核苷酸产生抗体变体的方法为业内人员所熟知，例如，PCR。
重链和轻链变体(在其序列的任意位置处不同)的文库可在任一表达载体中构建，例如一噬菌体，特别是图1的载体，每一皆含有一编码一特定重链和轻链变体的DNA。
抗体变体产生后，测定变体相对于亲代抗体的生物学活性。如上文所述，此涉及测定变体对靶的结合亲和力。现有多种高效方法可用来快速筛选抗体变体结合至相关靶的能力。
随后对从这次最初筛选得到的一或多种抗体变体实施相对于亲代抗体结合亲和力增强的筛选。一测定结合亲和力的常用方法是使用一BIAcoreTM表面胞质团共振系统(BIAcore公司)评估结合和解离速率常数。依照制造商的(BIAcore)说明，将一生物传感器芯片激活用于靶的共价偶联。然后将靶稀释并注射至芯片上以获得固定化材料的响应单元(RU)中的一信号。由于该RU中中的信号与固定化材料的质量成比例，所以这样就可以表现基质上固定化靶密度的范围。将解离数据拟适至一单位点模型以获得koff+/-s.d(测量值的标准偏差)。计算每一结合曲线的准一级速度常数(ks)，并标绘为一蛋白质浓度的函数以获得kon+/-s.e(拟合标准误差)。结合的平衡解离常数(Kd′s)可自SPR测量值计算得出，以koff/kon表示。由于平衡解离常数Kd与koff成反比，因此可假定结合速度(kon)是一对所有变体皆适用的常数来估算亲和力提高情况。
视情况可对所得具有高亲和力的候选者实施一或多种额外的生物学活性测试以证实该(等)具有增强的结合亲和力的抗体变体仍旧保留着期望的治疗特性。举例而言，对于抗IgE抗体，可筛选那些阻断IgE与其受体结合并抑制组胺释放的变体。最佳抗体变体可保持以一显著高于亲代抗体的结合亲和力与靶结合的能力。
视抗体的预期用途而定，经常可对如此选择的抗体变体进行进一步修饰。此等修饰可包括进一步改变氨基酸序列、融合至异源多肽和/或共价修饰，例如那些在下文详细阐述者。举例而言，通常用丝氨酸取代任何不参与维持抗体变体的正确构象的半胱氨酸残基，以提高分子的氧化稳定性并阻止异常交联。相反地，可将一或多个半胱氨酸键添加至抗体中以提高其稳定性(特别地在该抗体为一抗体片段例如Fv片段的情况下)。
载体
本发明也提供编码如本文所揭示抗体的单独核酸、包含该核酸的载体及宿主细胞、和用于制造该抗体变体的重组技术。对于该抗体变体的重组制造，需将编码该抗体变体的核酸分离出来并将其插入一可复制载体中用以进一步克隆(扩增DNA)或用以表达。编码单克隆抗体的DNA可使用传统程序容易地分离出来并测序(例如，通过使用能特异性地与编码单克隆抗体的重链和轻链的基因结合的寡核苷酸探针)。
有多种载体可以利用。载体部分一般包括(但不限于)下列中的一或多种：一信号序列、一复制起点、一或多种标记基因、一增强子元件、一启动子和一转录终止序列。
图1中描绘的噬菌体表达载体由一通用M13载体和M13自身的基因III病毒分泌信号组成，该信号可用于快速分泌并筛选具有适当结合特异性和最低亲和力标准的变体Fab。此载体不使用完整的基因III序列，因此在细菌细胞的表面上没有展示，而是将这些Fab分泌至细胞周质间隙中。或者，这些Fab可在细胞质中表达并分离出来。此重链和轻链各自具有其自己的病毒分泌信号，但却以依赖方式自单个强诱导型启动子表达。
图1中载体也可以提供一组氨酸标签和一myc标签，以便于纯化及检测。所属领域的技术人员应认识到，Fab可自不同的启动子独立表达，或该分泌信号无需是所选病毒序列，但可以是一适合于自所选宿主细胞分泌抗体片段的原核或真核信号序列。亦应了解，重链和轻链可存在于不同的载体上。
A.信号序列部分
本发明的抗体变体可以重组方式制备。该变体也可以表达为一与一异源多肽融合的融合多肽，该异源多肽较佳为一信号序列或其他在成熟蛋白质或多肽的N末端具有一特定切割位点的多肽。所选异源信号序列较佳为一被宿主细胞识别和加工(即由信号肽酶分割)的序列。对于不识别和加工天然抗体信号序列的原核宿主细胞，可用一选自(例如)碱性磷酸酶、青霉素霉、lpp、或热稳定肠毒素II前导序列的组群的原核信号序列取代该信号序列。或当为图1的载体时，所选信号序列为一得自基因III的病毒信号序列。对于酵母菌分泌，该天然信号序列可用(例如)酵母菌转化酶前导序列、α因子前导序列(包括酵母属(Saccharomyces)和克鲁维酵母属(Kluyveromyces)α因子前导序列)、或酸性磷酸酯酶前导序列、白色念珠菌(C.albicans)葡萄糖淀粉酶引导部分、或WO 90/13646中阐述的一信号取代。在哺乳动物细胞表达中，可利用哺乳动物信号序列以及病毒分泌前导序列，例如单纯孢疹gD信号。此前导区的DNA在阅读框内可连接至编码该抗体变体的DNA上。
B.复制起点部分
载体通常含有一可使该载体在一或多个所选宿主细胞内复制的核酸序列。一般而言，此序列能使该载体独立于宿主染色体DNA复制，并包括复制起点或自主复制序列。对于多种细菌、酵母菌、和病毒，这些序列众所周知。来自质粒pBR322的复制起点适合于大多数格兰氏阴性细菌，2μ质粒起点适合于酵母菌，而多种病毒起点(SV40、多瘤病毒、腺病毒、VSV或BPV)适用于哺乳动物细胞中的载体。一般而言，哺乳动物表达载体不需要复制起点部分(通常可使用SV40起点，此仅是因为其含有早期启动子)。
C.选择基因部分
载体可含有一选择基因，也称为一可选标记。典型选择基因可编码具有以下性质的蛋白质：(a)赋予对抗生素或其他毒素(例如，氨苄西林(ampicillin)、新霉素、氨甲蝶呤或四环素)的抗性，(b)补足营养缺陷型不足，或(c)供给从复合培养基中无法获得的关键营养素，例如，编码杆菌的D-丙氨酸消旋酶的基因。
一选择方案的实例使用一药物阻止一宿主细胞的生长。那些用一异源基因成功转化的细胞可产生一提供抗药性的蛋白质并因此在选择方案中存活下来。此优势选择的实例使用药物新霉素、霉酚酸和潮霉素。
适合于哺乳动物细胞的另一可选标记实例是那些能鉴别有能力吸收抗体核酸的细胞的可选标记，例如，DHFR、胸苷激酶、金属硫蛋白-I和-II(较佳为灵长类动物金属硫蛋白基因)、腺苷脱胺酶、鸟氨酸脱羧酶等。
例如，用DHFR选择基因转化的细胞可首先通过在一含有氨甲蝶呤(Mtx)(DHFR的竞争性拮抗剂)的培养基中培养所有转化体识别。当采用野生型DHFR时，一适当的宿主细胞为缺乏DHFR活性的中国仓鼠卵巢(CHO)细胞系。
或者，用编码抗体、野生型DHFR蛋白和另一可选标记物(例如氨基葡萄糖苷3′-磷酸转移酶(APH))的DNA转化或共转化的宿主细胞(特别是包含内源性DHFR的野生型宿主细胞)可通过在一含有该可选标记的选择剂(例如一氨基糖苷类抗生物素，例如，卡那霉素、新霉素、或G418)的培养基上进行细胞培养来选择。(美国专利第No.4,965,199号)。
一适用于酵母菌的选择基因是位于酵母菌质粒Yrp7中的trp1基因(Stinchcomb等人，Nature 282：39(1979))。该trp1基因可为一缺乏在色氨酸中生长的能力的酵母菌变体菌株(例如，ATCC号44076或PEP4-1)提供一选择标记。Jones，Genetics 85：Z 12(1977年)。于是酵母菌宿主细胞基因组中trp1损伤的存在可提供一有效环境以检测不存在色氨酸时的生长导致的转化。同样地，Leu2缺乏的酵母菌株(ATCC 20,622或38,626)可通过已知具有Leu2基因的质粒补足。
D.启动子部分
表达和克隆载体通常包含一可被宿主有机体识别并以可操作方式连接至抗体核酸的启动子。适用于原核宿主的启动子包括phoA启动子、β-内酰胺酶和乳糖启动子系统、碱性磷酸酶、一色氨酸(trp)启动子系统和杂合启动子(例如tac启动子)。然而，其他已知细菌启动子也是适合的。用于细菌系统中的启动子也可以含有一以可操作方式与编码该抗体的DNA相连接的Shine-Dalgarno(S.D.)序列。
已知真核细胞的启动子序列。事实上，所有真核基因皆具有一AT-富集区，其位于转录起始位点上游约25到30个碱基处。在许多基因的转录起始点上游70到80个碱基处发现的另一序列为一CNCAAT区，其中N可以是任一核苷酸。在大多数真核基因的3′末端是一AATAAA序列，该序列可为向该编码序列的3′末端添加poly A尾的信号。所有这些序列皆可适合地插入真核表达载体中。
用于酵母菌宿主的适宜启动子序列实例包括3-磷酸甘油酸酯激酶或其他糖酵解酶(例如，烯醇化酶、甘油醛-3-磷酸脱氢酶、己糖激酶、丙酮酸脱羧酶、磷酸果糖激酶、葡萄糖-6-磷酸异构酶、3-磷酸甘油酸酯变位酶、丙酮酸激酶、磷酸丙糖异构酶、磷酸葡萄糖异构酶、及葡糖激酶)的启动子。其他酵母菌启动子是具有通过培养条件控制转录的额外优势的诱导型启动子，其为醇脱氢酶2、异构细胞色素C、酸性磷酸酯酶、与氮代谢有关的降解酶、金属硫蛋白、甘油醛-3-磷酸脱氢酶、及负责麦芽糖和半乳糖利用的酶的启动子区。在酵母菌表达中使用的适宜载体和启动子在EP 73,657中有进一步阐述。酵母菌增强子与酵母启动子一起使用也较为有利。
抗体从哺乳动物细胞中的载体转录可(例如)用下列启动子控制：从病毒例如多瘤病毒、禽痘病毒、腺病毒(例如腺病毒2)、牛乳头瘤病毒、鸟类肉瘤病毒、巨细胞病毒、一逆转录病毒、肝炎-B病毒及最佳地猿猴病毒40(SV40)基因组获得的启动子；从异源性哺乳动物启动子(例如，肌动蛋白启动子或一免疫球蛋白启动子)获得的启动子；从热激启动子获得的启动子，前提条件是这些启动子皆与宿主细胞系统相容。
SV40病毒的早期和晚期启动子可方便地以亦含有SV40病毒复制起点的SV40限制性片段形式获得。人类巨细胞病毒的立即早期启动子可方便地以一Hindlll E限制性片段形式获得。一使用牛乳头瘤病毒作为载体在哺乳动物宿主内表达DNA的系统揭示于美国专利第4,419,446号中。该系统的一修改形式阐述于美国专利第4,601,978号中。或者，人类β-干扰素cDNA已在一来自单纯疱疹病毒的胸苷激酶启动子的控制下在小鼠细胞中得到表达。或者，劳斯肉瘤病毒(rous sarcoma virus)长端重复序列可用作启动子。
E.增强子元件部分
高等真核细胞对编码本发明抗体的DNA的转录通常可通过将一增强子序列插入载体中而增强。如今已知许多来自哺乳动物基因(球蛋白、弹性蛋白酶、白蛋白、α-胎蛋白和胰岛素)的增强子序列。然而，通常，人们会使用一来自真核细胞病毒的增强子。实例包括：在复制起点迟侧上的SV40增强子(bp100-270)、巨细胞病毒早期启动子增强子、在复制起点迟侧上的多瘤病毒增强子、和腺病毒增强子。关于用于激活真核启动子的增强元件，也可参见Yaniv，Nature 297：17-18(1982)。此增强子可在抗体编码序列的5′或3′位处剪接至载体中，但较佳位于距启动子位点5′处。
F.转录终止部分
在真核宿主细胞(酵母菌、真菌、昆虫、植物、动物、人类细胞或来自其他多细胞有机体的有核细胞)中所用表达载体亦可包含终止转录和稳定mRNA所需的序列。这些序列通常可自真核或病毒DNA或cDNA的5′和(偶而)3′未转译区获得。这些区域含有转录为编码抗体的mRNA未转译部分中多腺苷酸化片段的核苷酸节段。一有用的转录终止部分为牛生长激素多腺苷酸化区。参见，例如，WO94/11026。
宿主细胞的选择和转化
在本文中，用于克隆或表达载体中DNA的适合的宿主细胞是原核细胞、酵母菌细胞或高等真核细胞。适用于此目的的原核生物包括格兰氏阴性菌和格兰氏阳性菌，举例而言，肠细菌，例如大肠杆菌、肠杆菌、欧文氏菌(Erwinia)、克雷白氏杆菌(Klebsiella)、变形菌(Proteus)、沙门氏菌(Salmonella)、粘质沙雷氏菌(Serratia)、和志贺氏杆菌(Shigella)，以及杆菌、假单胞菌和链霉菌。一较佳的大肠杆菌克隆宿主为大肠杆菌294(ATCC 31,446)，但其他菌株例如大肠杆菌B、大肠杆菌X1776(ATCC 31,537)和大肠杆菌W3110(ATCC27,325)也是适合的。这些实例具有例示性而不具有限制性。
除原核生物外，例如丝状真菌或酵母菌等真核微生物也是抗体编码载体的适宜克隆或表达宿主。在低等真核宿主微生物中最常使用的是酿酒酵母。然而，多种其他属、种和菌株也是通常可得到并可用于本发明中，例如，稷酒裂殖酵母菌(Schizosaccharomyces pombe)；克鲁维酵母属；念珠菌属；木霉属；粗糙链孢霉(Neurospora crassa)；及丝状真菌，例如，脉孢菌(Neurospora)、青霉菌(Penicillium)、弯颈霉(Tolypocladium)和曲霉(aspergillus)宿主，例如，构巢曲菌(A.nidulans)和黑曲霉菌(A.niger)。
适合于表达糖基化抗体的宿主细胞可从多细胞有机体获得。原则上，任何高等真核细胞培养物均可行，无论其是得自脊椎动物还是非脊椎动物培养物。非脊椎动物细胞的实例包括植物细胞和昆虫细胞，Luckow等人，Bio/Technology6，47-55(1988)；Miller等人，Genetic Engineering，Setlow等人，eds.Vol.8，pp.277-279(Plenam publishing 1986)；Mseda等人，Nature 315，592-594(1985)。已鉴别出大量杆状病毒株和变体及得自宿主(例如草地黏虫(Spodopterafrugiperda)(毛虫)、伊蚊(Aedes)(蚊子)、黑腹果蝇(Drosophila melanogaster)(果蝇)、和家蚕(Bombyx mori))的相应许可性昆虫宿主细胞。多种用于转染的病毒株可公开获得，例如，苜蓿银纹夜蛾(Autographa californica)NPV的L-1变体和家蚕NPV的Bm-5株，并且这些病毒可依照本发明用作本文中的病毒，尤其是用于草地黏虫细胞的转染。并且，棉花、玉米、马铃薯、大豆、矮牵牛、西红柿和烟草的植物细胞培养物亦可用作宿主。
脊椎动物细胞及在培养物(组织培养物)中增殖脊椎动物细胞已经成为一常规程序。参见Tissue Culture，Academic Press，Kruse和Patterson，eds.(1973)。有用哺乳动物宿主细胞系的实例为猴肾脏细胞；人类胚胎肾脏细胞系；幼小仓鼠肾脏细胞；中国仓鼠卵巢细胞/-DHFR(CHO，Urlaub等人，Proc.Natl.Acad.Sci.USA 77：4216(1980))；小鼠塞尔托利(sertoli)细胞；人类子宫颈癌细胞(HELA)；犬肾脏细胞；人类肺细胞；人类肝脏细胞；小鼠乳腺癌；和NSO细胞。
宿主细胞可用上述用于产生抗体的载体转化，并在传统的营养培养基中培养，该营养培养基修饰为适合于诱导启动子、选择转化体、或扩增编码期望序列的基因。
用于产生本发明抗体变体的宿主细胞可在多种培养基中培养。市售培养基例如Ham′s F10(Sigma)、Minimal Essential Medium(MEM，Sigma)、RPMI-1640(Sigma)、和达尔伯克氏改良伊格尔氏培养基(Dulbecco′s Modified Eagle′sMedium)(DMEM，Sigma)均适合于培养宿主细胞。另外，Ham等人，Meth.Enzymol.58：44(1979)，Barnes等人，Anal.Biochem.102：255(1980)，美国专利第4,767,704号；第4,657,866号；第4,560,655号；第5,122,469号；第5,712,163号；或第6,048,728中所述培养基的任一种均可用作这些宿主细胞的培养基。必要时这些标记中的任一种皆可补充有激素和/或其他生长因子(例如胰岛素、铁传递蛋白、或表皮生长因子)、盐(例如X-氯化物，其中X为钠、钙、镁；和磷酸盐)、缓冲液(例如HEPES)、核苷酸(例如腺苷和胸苷)、抗生素(例如GENTAMYCIN.TM.药物)、痕量元素(定义为通常以微摩尔级的终浓度存在的无机化合物)、和葡萄糖或一等效能量源。任一其它需要的补充物亦均可以所属领域技术人员熟知的恰当浓度加入。培养条件，例如温度、pH值和诸如此类，是先前选择用于表达的宿主细胞时所用条件，并被所属领域的技术人员所了解。
抗体纯化
当使用重组技术时，抗体变体可在细胞周质间隙中以细胞内方式产生，或直接分泌至培养基中。如果此抗体变体是以细胞内方式产生，作为一第一步骤，这些微粒碎片—宿主细胞或分解的片段可通过(例如)离心或超滤方法除去。Carter等人，Bio/Technology 10：163-167(1992)阐述一用于分离分泌到大肠杆菌细胞周质间隙的抗体的方法。简言之，在存在醋酸钠(pH3.5)、EDTA和苯基甲基磺酰基氟化物(PMSF)下经约30分钟将胞浆解冻。细胞碎片可通过离心法除去。当此抗体变体分泌在培养基中时，通常首先使用一市售蛋白质浓缩过滤器(例如，一Amicon或Millipore Pellicon超滤装置)浓缩取自该表达系统的上清液。在任一前述步骤中皆可加入一蛋白酶抑制剂(例如PMSF)以抑制蛋白质水解，并且可加入抗生素以防止外来污染物的生长。
由这些细胞制备的抗体组合物可使用(例如)羟基磷灰石色谱法、凝胶电泳法、透析法及亲和色谱法进行纯化，其中亲和色谱法为首选纯化技术。蛋白质A作为一亲和配体的适宜性取决于该抗体变体中所含的任一免疫球蛋白Fc结构域的种类和同种型。蛋白质A可用于纯化基于人类IgG1、IgG2或IgG4重链的抗体(Lindmark等人，J.Immunol Meth.62：1-13(1983))。蛋白质G被推荐用于所有小鼠同种型并用于人类IgG3(Guss等人，EMBO J.5：1567-1575(1986))。亲和配体所附着的基质最经常为琼脂糖，但也可利用其他基质。物理性质稳定的基质(例如可控孔径玻璃或聚(苯乙烯二乙烯基)苯)可达成比琼脂糖更高的流速和更短的处理时间。当该抗体变体包含一CH3结构域时，可使用Bakerbond ABXTM树脂(J.T.Baker，Phillipsburg，N.J.)进行纯化。视欲复原的抗体变体而定，亦可使用其他蛋白质纯化技术，例如，在一离子交换柱上分级分离、乙醇沉淀法、反相HPLC、硅胶色谱法、肝素色谱法、在阴离子或阳离子交换树脂(例如一聚天冬氨酸柱)上的SEPHAROSETM色谱法、色谱聚焦法、SDS-PAGE和硫酸铵沉淀法。
在任一初步纯化步骤后，可使用一pH值介于约2.5至4.5之间的洗脱缓冲液对包含相关抗体变体和污染物的混合物进行低pH值疏水相互作用色谱，较佳在低盐浓度(例如，从约0至0.25M盐)下实施。
医药配方
多肽或抗体的治疗配方可通过将具有期望纯度水平的多肽与业内通常采用的可选“医药上可接受的”载剂、赋形剂或稳定剂(其皆称为“赋形剂”)混合制备，以作为冻干配方或水溶液贮存。例如缓冲剂、稳定剂、保存剂、等渗剂、非离子型去污剂、抗氧化剂和其他杂类添加剂。(参见Remington′s PharmaceuticalSciences，第16版，A.Osol，Ed.(1980))。此等添加剂在所采用剂量和浓度下必须对接受者是无毒的。
缓冲剂有助于将pH值保持于接近生理状态的范围内。其较佳以一约2mM至约50mM的浓度存在。适用于本发明的缓冲剂包括有机和无机酸两者及其盐，例如柠檬酸盐缓冲液(例如，柠檬酸单钠-柠檬酸二钠混合物、柠檬酸-柠檬酸三钠混合物、柠檬酸-柠檬酸单钠混合物，等等)，琥珀酸盐缓冲液(例如，琥珀酸-琥珀酸单钠混合物、琥珀酸-氢氧化钠混合物、琥珀酸-琥珀酸二钠混和物，等等)，酒石酸盐缓冲液(例如，酒石酸-酒石酸钠混和物、酒石酸-酒石酸钾混和物、酒石酸-氢氧化钠混和物，等等)，富马酸盐缓冲液(例如，富马酸-富马酸单钠混和物，等等)，富马酸盐缓冲液(例如，富马酸-富马酸单钠混和物、富马酸-富马酸二钠混和物、富马酸单钠-富马酸二钠混和物，等等)，葡萄糖酸盐缓冲液(例如，葡萄糖酸-葡萄糖酸钠混和物、葡萄糖酸-氢氧化钠混和物、葡萄糖酸-葡萄糖酸钾混和物，等等)，草酸盐缓冲液(例如，草酸-草酸钠混和物、草酸-氢氧化钠混和物、草酸-草酸钾混和物，等等)，乳酸盐缓冲液(例如，乳酸-乳酸钠混和物、乳酸-氢氧化钠混和物、乳酸-乳酸钾混和物，等等)和醋酸盐缓冲液(例如，醋酸-醋酸钠混和物、醋酸-氢氧化钠混和物，等等)。另外，可能提到磷酸盐缓冲液、组氨酸缓冲液和三甲胺盐缓冲液，例如Tris缓冲液。
可添加保存剂以延迟微生物生长，并且其可以0.2％至1％(w/v)的量添加。适用于本发明的保存剂包括苯酚、苄醇、间甲酚、对羟基苯甲酸甲酯、对羟基苯甲酸丙酯、十八烷基二甲基苯基氯化铵、苯扎卤铵(例如，苯扎氯铵、苯扎溴铵、苯扎碘铵)、氯化六甲双铵、对羟基苯甲酸烷基酯例如对羟基苯甲酸甲酯或对羟基苯甲酸丙酯、儿茶酚、间苯二酚、环己醇和3-戊醇。
亦可添加有时称为“稳定剂”的等渗剂，以确保本发明液体组合物的等渗性，且其包括多羟基糖醇，较佳为三羟基或更多羟基糖醇，例如甘油、赤藓醇、阿糖醇、木糖醇、山梨糖醇和甘露醇。
稳定剂指一大类赋形剂，其具有自疏松剂至可溶解治疗剂或有助于防止变性或防止粘附至容器壁的添加剂的功能。典型稳定剂可为多羟基糖醇(如上文所列举)；氨基酸例如精氨酸、赖氨酸、甘氨酸、谷氨酰胺、天冬酰胺、组氨酸、丙氨酸、鸟氨酸、L-亮氨酸、2-苯丙氨酸、谷氨酸、苏氨酸、等等，有机糖或糖醇，例如乳糖、海藻糖、水苏糖、甘露醇、山梨糖醇、木糖醇、核糖醇、肌醇、卫矛醇、甘油及其类似物，包括环醇例如环己六醇；聚乙二醇；氨基酸聚合物；含硫的还原剂，例如脲、谷胱甘肽、硫辛酸、巯基醋酸钠、硫代甘油、α-单硫代甘油和硫代硫酸钠；低分子量的多肽(即＜10残基)；蛋白质例如人血清白蛋白、牛血清白蛋白、明胶或免疫球蛋白；亲水性聚合物，例如聚乙烯吡咯烷酮单糖，例如木糖、甘露糖、果糖、葡萄糖；二糖例如乳糖、麦芽糖、蔗糖；和三糖例如棉子糖；多糖例如葡聚糖。以每份重量活性蛋白质计，稳定剂可以自0.1至10,000份重量的量存在。
可添加非离子型表面活性剂或去污剂(亦称作“湿润剂”)以帮助溶解治疗剂以及保护治疗性蛋白质防止搅动引起的聚合，其亦可允许此配方暴露于降低的剪切面作用力下而不会引起蛋白质变性。适合的非离子型表面活性剂包括聚山梨醇酯(20、80，等等)、泊洛沙姆(polyoxamers)(184，188、188等等)、Pluronic.RTM.聚醇、聚氧乙烯脱水山梨糖醇单醚(Tween.RTM.-20、Tween.RTM.-80，等等)。非离子型表面活性剂可以自0.05mg/ml至约1.0mg/ml且较佳约0.07mg/ml至约0.2mg/ml的量存在。
额外杂类赋形剂包括疏松剂(例如淀粉)、鳌合剂(例如EDTA)、抗氧化剂(例如抗坏血酸、甲硫氨酸、维生素E)和共溶剂。本文配方亦可按需要含有一种以上用于所治疗的特定适应症的活性化合物，较佳为那些相互间不会产生不利影响的具有补充活性的化合物。举例而言，人们可能期望进一步提供一免疫抑制剂。适宜情况为，这些分子以对达成预期目的有效的量联合存在。这些活性成份亦可装入分别通过(例如)凝聚技术或通过接口间聚合制备的微胶囊中，例如，羟甲基纤维素或明胶微胶囊和聚甲基丙烯酸甲酯微胶囊，这些活性成份位于胶质药物输送系统(例如，脂质体、白蛋白微球体、微滴乳液、奈米颗粒及奈米胶囊)或粗滴乳液中。这些技术在Remington′s PharmaceuticalSciences(第16版，A.Osol，Ed.(1980))中揭示。
用于体内投药的配方必须是无菌的。此可(例如)通过滤过一无菌过滤膜容易地达成。也可以制备成缓释制剂。缓释制剂的适宜实例包括含有该抗体变体的固态疏水聚合物的半渗透性基质，该等基质呈成形物件形式，例如，膜或微胶囊。缓释基质的实例包括聚酯、水凝胶(例如，聚(甲基丙烯酸-2-羟乙基酯)、或聚(乙烯醇))、聚交酯(美国专利第3,773,919号)、L-谷氨酸和L-谷氨酸乙酯的共聚物、不可降解的乙烯-醋酸乙烯酯、可降解的乳酸-乙醇酸共聚物例如LUPRON DEPOTTM(由乳酸-乙醇酸共聚物和醋酸亮丙瑞林(leuprolideacetate)组成的可注射微球体)、和聚-D-(-)-3-羟基丁酸。尽管例如乙烯-醋酸乙烯酯及乳酸-乙醇酸等聚合物可使分子持续释放超过100天，但某些水凝胶释放蛋白质时间较短。当装入胶囊的抗体长时间停留在体内时，在37℃下暴露于潮湿环境中会使其变性或聚集，导致生物活性损失并可能改变免疫原性。依据所涉及机制可设计出合理的策略以保持稳定性。举例而言，若发现聚集机制是通过硫代-二硫化物互换形成份子间S--S键，则稳定性可藉由修饰巯基残基、自酸溶液冻干、控制水分含量、使用适当的添加剂和形成特定聚合物基质组合物而达成。
在一特定病症或病情的治疗中有效的治疗性多肽、抗体或其片段的数量将视病症或病情的性质而定并可通过标准临床技术确定。可能时，人们希望在本发明医药组合物用于人体测试前能测定其剂量反应曲线，首先是在活体外测定，然后是在有用动物模型系统中测定。
在一较佳实施例中，治疗性多肽、抗体或其片段的水溶液通过皮下注射施用。每一给药剂量为从约0.5μg至约50μg/kg体重，或更佳为从约3μg至约30μg/kg体重。
皮下投予的给药方案可视多种临床因素(包括疾病类型、疾病严重程度和患者对此治疗剂的敏感性)从每月一次到每天一次变化。
抗体变体的用途
本发明的抗体变体可用作亲和力纯化剂。在此过程中，用业内熟知方法将这些抗体固定于固相例如SEPHADEXTM树脂或滤纸上。使该固定化抗体变体与一含有欲纯化靶的样品接触，并随后用一适合的溶剂洗涤该支持体，此将除去实质上所有除欲纯化靶以外的材料，靶结合至该固定化抗体变体上。最后，用另一适合的溶剂(例如甘氨酸缓冲液)洗涤支持体，将靶从该抗体变体上释放出来。
这些变体抗体也可用在诊断检验中，例如用于检测一相关靶在特定细胞、组织或血清中的表达。对于诊断应用，该抗体变体通常用一可检测部分加以标记。可利用多种标记。用于定量化荧光变化的技术在上文中有阐述。化学发光基质可通过化学反应处于电激发状态，随后发射出可测量(例如，使用化学发光计)的光或向一荧光受体提供能量。酶标记的实例包括荧光素酶(例如，萤火虫荧光素酶和细菌荧光素酶；美国专利第4,737,456号)、荧光素、2，3-二氢酞嗪二酮、苹果酸脱氢酶、脲酶、过氧化物酶(例如辣根过氧化物酶(HRPO))、碱性磷酸酶、β-半乳糖苷酶、葡萄糖淀粉酶、溶菌酶、糖氧化酶(例如，葡萄糖氧化酶、半乳糖氧化酶和葡萄糖-6-磷酸脱氢酶)、杂环氧化酶(例如尿酸酶和黄嘌呤氧化酶)、乳过氧化物酶、微过氧化物酶等等。使酶结合至抗体的技术阐述于O′Sullivan等人，Methods for the Preparation of Enzyme-AntibodyConjugates for Use in Enzyme Immunoassay，in Methods in Enzym.(Ed.J.Langone& H.Van Vunakis)，Academic press，New York，73：147-166(1981)中。
有时，标记不直接与所述抗体变体结合。所属领域的技术人员应了解有多种技术可达成此目的。举例而言，该抗体变体可与生物素结合，并且上文所述三大类标记中的任一种标记皆可与抗生物素蛋白结合，或反之亦然。生物素可选择性地与抗生物素蛋白结合，因此，该标记可以此间接方式与抗体变体结合。或者，为了使此标记与此抗体变体间接结合，可将抗体变体与少量半抗原(例如地高辛(digloxin))结合并将上述不同类型标记中的一种标记与一抗半抗原抗体变体(例如，抗地高辛抗体)结合。由此，可达成标记与抗体变体的间接结合。
在本发明的另一实施例中，所述抗体变体无需标记，该抗体变体的存在可使用一可与该抗体变体结合的经标记抗体检测。
本发明抗体可用于任一熟知试验方法中，例如，竞争性结合试验、直接和间接夹心试验和免疫沉淀试验。Zola，Monoclonal Antibodies：A Manualof Techniques，pp.147-158(CRC Press公司1987)。
竞争性结合试验依靠一经标记标准样品与测试样品竞争与一有限数量的抗体变体结合的能力。测试样品中靶的数量与同抗体结合的标准样品的数量成反比。为易于测定结合的标准样品量，通常在竞争结合之前或之后使抗体不溶解。因此，结合至抗体的标准样品和测试样品可方便地与保持未结合状态的标准样品和测试样品分离。
夹心测试涉及使用两种抗体，每一种都能够结合至一不同的免疫原部分、或抗原决定部位或欲检测的蛋白质。在夹心测试中，欲分析的测试样品被一固定在固体支持体上的第一抗体结合，并随后使一第二抗体结合至此测试样品上，由此形成一不可溶解的三部分复合物。参见(例如)美国专利第4,376,110号。该第二抗体自身可用一可检测部分标记(直接夹心测试)或可使用一用可检测部分标记的抗免疫球蛋白抗体测量(间接夹心测试)。举例而言，一类夹心测试为一ELISA测试，在此情况下该可检测部分为一酶。
对于免疫组织化学而言，此肿瘤样品可为新鲜的或冻结的，或可嵌入石蜡中并用一保存剂(例如福尔马林)固定。
该些抗体也可用于活体内诊断测试。一般而言，将抗体变体用一放射性核苷酸(例如，.sup.111In、.sup.99Tc，、sup.14C、.sup.131I、.sup.3H、.sup.32P或.sup.35S)标记，以便肿瘤可使用免疫闪烁照像法定位。举例而言，一本发明高亲和力抗IgE抗体可用于检测存在于(例如)哮喘患者肺内的IgE数量。
本发明抗体可以一试剂盒的形式提供，即，包含预定量试剂与实施此诊断测试的说明书的成套组合。当抗体变体用一酶标记时，该试剂盒可包含酶所需的底物和辅因子，例如，一能提供可检测到的发色团或荧光团的底物前体。另外，可包括其他添加剂，例如，稳定剂、缓冲剂(例如封阻缓冲剂或溶胞缓冲剂)和诸如此类。各种不同试剂的相对数量可有较大变化以提供这些试剂可充分最佳化测试敏感性的溶液浓度。具体而言，这些试剂可作为一包含赋形剂且通常冻干的干燥粉末提供，其溶解后可提供一具有适当浓度的试剂溶液。
抗体的活体内用途
本发明涵盖，本发明抗体可用于治疗一哺乳动物。在一实施例中，举例而言，为了获得抗体的临床前数据而将其施用至一非人类哺乳动物。欲治疗的例示性非人类哺乳动物包括非人类灵长类动物、狗、猫、啮齿动物和其他在体内实施临床前研究的哺乳动物。这些哺乳动物可为建立的用于一欲用该抗体治疗的疾病的动物模型，或其可用于研究所述相关抗体的毒性。在这些实施例的每一个中，均可对哺乳动物实施剂量递增研究。
该抗体或多肽可通过任一适合的方式(包括非经肠、皮下、腹膜腔内、肺内、和鼻内)施用，并且，若期望，对于局部免疫抑制治疗时，可采用病变内方式用药。非经肠输注包括肌内、静脉内、动脉内、腹膜腔内、或皮下施用。另外，适宜情况为，该抗体变体可通过脉冲输注方式(特别是以渐低的抗体变体剂量)恰施用。较佳地，此定量给药应部分地视施药期的长短而通过注射(最好是通过静脉内或皮下注射)施用。
对于预防或治疗疾病，该抗体或多肽的适当剂量应视下列因素而定：欲治疗疾病的类型、疾病的严重程度和病程、施用该抗体变体的目的是预防还是治疗、先前治疗、患者的临床史和对此抗体变体的反应以及主治医师的判断力。适宜情况为，本发明此具极高亲和力的抗人类IgE抗体一次性施用至患者或经一系列治疗施用。
根据疾病的类型和严重程度，不管是通过(例如)一次或多次分开投药还是通过连续输注投药，投予患者的抗体初始候选剂量均为约0.1mg/kg至150mg/kg(例如0.1至20mg/kg)。视上文提及的因素，典型日剂量为约1mg/kg到约100mg/kg或更高。对于历经数天或更长时间的重复投药，根据病情，治疗应保持到出现想要的疾病症状抑制状况为止。然而，也可以使用其他剂量方案。该治疗的进度可容易地通过常规技术和测试方法加以监测。一抗-LFA-1或抗ICAM-1抗体的例示性定量给药方案揭示于WO 94/04188中。
该抗体变体组合物应以与良好的医疗实践相一致的方式加以调配、确定剂量、给药。在这方面，需考虑因素包括：所治疗的特定病症、所治疗的特定哺乳动物、个体患者的临床病情、病症起因、试剂的递送位点、投药方法、投药时间安排及医务人员熟知的其他因素。欲施用的抗体变体的“治疗有效量”应由这些需考虑的因素决定，并且是预防、减缓或治疗疾病或病症所需的最小数量。该抗体变体无需但可视情况用一或多种当前用于预防或治疗所讨论病症的试剂加以调配。这些其他试剂的有效量取决于抗体在配方中的含量、病症或治疗的类型及上文所讨论的其他因素。这些试剂通常以与先前相同的剂量使用并使用先前所用投药途径或以约1至99％的之前所采用剂量使用。
可将IgE识别为其靶的本发明抗体可用于治疗“IgE介导的病症”。这些病症包括(例如)：哮喘、过敏性鼻炎和结膜炎(干草热)、湿疹、荨麻疹、异位性皮炎和食物过敏。由(例如)蜜蜂蜇、蛇咬、食物或药物引起的过敏性休克这一严重生理学状况也涵盖于本发明范围内。
实例
提供下列实例以进行举例说明而并非加以限制。
实例1抗IgE鼠科动物MAb TES-C21的人源化
将鼠科动物mAb TES-C21的重链可变区(VH)和轻链可变区(VL)的序列与可在公共文库中获得的人类抗体种系序列相比较。当选定一如上文步骤1中所述模板时需使用多个标准，包括全长、在骨架中的类似CDR位置、总同源性、CDR大小等。同时考虑所有这些标准可提供一选择最佳人类模板的结果，如图3A和3B中所示的在TES-C21 MAb重链和轻链序列与相应人类模板序列间序列之间的比对中所示。
在此情况下，使用一个以上的人类骨架模板来设计此抗体。所选用于VH链的人类模板为DP88(aa残基1至95)和JH4b(aa残基103至113)的组合(参见图3B)。所选用于VL链的人类模板为L16(VK亚型III，aa残基1至87)和JK4(aa残基98至107)的组合(参见图3A)。该鼠科动物与人类模板间的骨架同源性对于VH为约70％，对于VL为约74％。
模板选定后，通过DNA合成和重叠PCR构建一Fab文库，如上文所述和图2中所绘示。该文库由用相应所选人类模板DP88/JH4b和L16/JK4合成的合成TES-C21 CDR组成。此文库的复杂度为4096(＝212)。编码部分VH和VL序列的重叠核苷酸可合成为其中有18至21个核苷酸重叠的约63至约76个核苷酸。
VL和VH基因的PCR扩增可在标准PCR条件下使用一包含骨架区FR1特定序列和退火至该前导序列(基因III)末端的悬垂序列的生物素化正向引物和一来自保守的恒定区(Ck或CH1)的反向引物实施。通过琼脂糖凝胶电泳或用市售PCR纯化试剂盒纯化该PCR产物以除去未并入的生物素化引物和非特异性PCR产物。
用2μg PCR产物、1μL的T4多核苷酸激酶(10单位/μL)、2μL的10x PNK缓冲液、1μL的10mM ATP，以用ddH2O调整的20μL的总体积实施PCR产物的5′-磷酸化。在37℃下培养45分钟后，在65℃热变性10分钟，通过添加ddH2O将反应物体积调整至200μL用于下一步骤。
用200μL 2x B&W缓冲液将100μL用抗生蛋白链菌素包覆的磁珠洗涤两次，并重新悬浮于200μL 2x B&W缓冲液中。将该磷酸化的PCR产物与磁珠混合，并在室温(RT)下在缓缓摇动的情况下培养16分钟。
使这些磁珠沉积，并用200μL 2x B&W缓冲液洗涤两次。在缓缓摇动的情况下用300μL新制备的0.15M NaOH在RT下对该非生物素化的ssDNA(负链)洗提10分钟。一第二次NaOH洗提可略微增加产量(可选)。离心洗提液以除去所有痕量磁珠。
通过添加1μL糖原(10mg/mL)、1/10体积的3M NaOAc(pH为5.2)和2.5体积的EtOH使该ssDNA从上清液中沉淀出来。然后用70％的EtOH洗涤沉淀的ssDNA，随后实施冻干处理3分钟并溶解于20μL ddH2O中。通过使用DNA标准样品在溴化乙锭(EtBr)上点样或通过测量OD260对该ssDNA进行定量。
实例2VH和VL克隆至噬菌体表达载体中
通过杂交诱变将VH和VL克隆至一噬菌体表达载体中。通过用基于M13的噬菌体(噬菌体表达载体TN003)感染CJ236大肠杆菌珠(dut-ung-)制备尿苷化模板。
通过PCR对下列组份[200ng尿苷化噬菌体载体(8.49kb)；92ng磷酸化单链H链(489碱基)；100ng磷酸化单链L链(525碱基)；1μL 10X退火缓冲液；用ddH2O将体积调整至10μL]实施退火(以约8倍摩尔比插入至载体中)，其中先使温度在85℃保持5分钟(变性)，再经1小时逐渐降至55℃。将样品在冰上冷冻。
向退火产物中添加以下组份：1.4μL 10X合成缓冲液；0.5μL T4 DNA连接酶(1单位/μL)；1μL T4 DNA聚合酶(1单位/μL)，随后在冰上培养5分钟，并在37℃下培养1.5小时。然后使此产物在乙醇中沉淀，并溶解于10μL ddH2O或TE中。
用1μL Xbal(10单位/μL)将DNA消化2小时，并在65℃下热灭活20分钟。通过电穿孔法将消化的DNA转染至50μL电感受态DH10B细胞中。通过在37℃下在XL-1 Blue菌苔上生长过夜测定所得噬菌体的浓度。对纯系实施测序以确定成份。
实例3用于文库筛选的深孔培养
A.平板培养噬菌体文库
在LB培养基中稀释该噬菌体文库以得到期望的噬斑数/板。将高滴定度的噬菌体与200μL XL-1B细胞培养物混合。将3mL LB顶层琼脂混合，倒至一LB平板上，使其在室温下静置10分钟。将板在37℃下培养过夜。
B.噬菌体洗提
将100μL噬菌体洗提缓冲液(10mM Tris-Cl，pH7.5，10mM EDTA，100mMNaCl)添加至一无菌U形底96孔板的每一孔中。用一过滤吸管端将一得自该过夜文库平板的单个噬菌体噬斑转移至一孔内。将此噬菌体洗提板在37℃下培养1小时。培养结束后，将此板在4℃下贮存。
C.深孔板培养
以1∶100稀释度将得自50mL培养物的XL1B细胞添加至2xYT培养基中。使这些细胞在37℃下在一振荡器内生长，直至A600介于0.9至1.2之间。
D.在深孔板中用噬菌体感染
当这些细胞达到适当的OD后中，将1M IPTG(1∶2000)添加至该XL1B培养物中。IPTG的最终浓度为0.5mM。将750μL细胞培养物转移至一96孔深孔板(Fisher Scientific)的每一孔中。每一孔皆用25μL经洗提的噬菌体接种。将该深孔板置于振荡器内(250rpm)并在37℃下培养过夜。
E.制备用于ELISA筛选的上清液
培养结束后，使用Beckman JA-5.3板旋转器将深孔板以3,250rpm离心20分钟。从每一孔中取出50μL上清液用于ELISA。
F.15ml XL-1细胞液体培养物的接种
使XL-1在37℃下在含10μg/mL四环素的2xYT中在振荡器(250rpm)中生长直至A600＝0.9至1.2。对于每一欲定性的纯系而言，皆以一0.5mM的终浓度添加IPTG，并将15mL培养物转移至一50毫升锥形管内。用取自高滴定度原液(滴定度＝约1011pfu/mL)的10μL噬菌体对这些细胞进行接种，并在37℃下培养1小时。在摇动的情况下使这些细胞在室温下生长过夜。
G.自细胞周质分离可溶Fab
在一IEC离心机内以4,500rpm对细胞团粒化20分钟。除去培养基，将团粒重新悬浮于650μL悬浮缓冲液(50mM Tris，pH为8.0，含1mM EDTA和500mM蔗糖)中，加以涡旋，并置于冰上轻轻地摇动1小时。在4℃下以9,000rpm离心10分钟除去细胞碎片。将含可溶Fab的上清液收集起来并在4℃下贮存。
实例4骨架修饰
在骨架中上述可能的潜在关键部位有12个鼠科动物/人类摆动残基。VH中的位置73在人源化文库中保持为鼠科动物残基苏氨酸，这是因为已确定此位置会影响结合。然而，应注意，在VH 73处的苏氨酸为人类种系VH亚型1和2中的一常见人类残基。
对在TES-C21序列与人类模板之间不同的骨架残基按上文所述实施随机取代，并随后测定其对靶结合和抗体折叠的潜在影响。确定可能已影响该结合的潜在骨架残基。在此情况下，它们是VH中的残基12、27、43、48、67、69和VL中的残基1、3、4、49、60、85(Kabat编号系统)。(参见图4)后来证明，仅位置27和69对VH区(纯系编号1136-2C)中的结合有显著影响。
所用初步筛选为一使用培养基的单点ELISA(SPE)(参见下文所述)。该初步筛选将与该抗体的靶分子结合的纯系选择出来。将给出与亲代分子相等或比亲代分子好的信号的纯系选出用于下一轮筛选。
在第二轮筛选中，使单个噬菌体在一15mL的细菌培养物中生长，并将细胞周质制品用于SPE和ELISA滴定测试。进一步确定在此测试中保持高亲和力的纯系的性质。当全部经选择的初步纯系处理完成后，对上部10至15％的纯系进行测序，并且依照序列布置这些纯系。将各序列组的代表相互进行比较，选出最佳的纯系。将这些所选纯系的序列组合起来，并评价各种不同组合的影响。
就与重组人类IgE(SE44)的改良结合，用ELISA法对所构建的文库实施筛选。将结合亲和力大于鼠科动物TES-C21 Fab的纯系分离出来并测序。进一步确定标识号为4、49、72、76和136的纯系的性质。纯系4、49、72、78和136的ELISA滴定曲线示于图5A和5B中，表明它们的亲和力与亲代TES-C21相似。这些纯系与鼠科动物TES-C21竞争与人类IgE的结合，说明此结合抗原决定部位在该人源化过程没发生改变。该人源化Fab未结合至FcεRI结合IgE上，表明当这些人源化抗体构建入二价IgG时不太可能与此受体交联而导致组胺释放。
人源化纯系136保留了5个鼠科动物重链骨架残基(＝94.3％人类VH骨架同源性)，其中通过亲和力成熟选择一100％的人类轻链骨架。人源化Fab展示出对IgE与FcεRI结合的抑制(图6)。
实例5用于筛选抗IgE的单点ELISA方案
在4℃下用在碳酸盐涂覆缓冲液中的2μg/mL羊抗人Fd涂覆平板。除去涂覆溶液，并在37℃下用200μL/孔的3％ BSA/PBS将平板封阻1小时。用PBS/0.1％TWEEN(PBST)将板洗涤4次后，添加50μL/孔的Fab样品(即，包含高滴定度噬菌体和所分泌Fab或自DMB套组(DMB block)获得的细胞周质制品的上清液，或15mL制品)。将板在室温下培养1小时，随后用PBST洗涤4次。50μL/孔的生物素化的SE44(0.015μg/mL)用0.5％ BSA/PBS稀释，并随后添加0.05％ TWEEN。然后将板在室温下培养2小时，并用PBST洗涤4次。添加50μL/孔的StreptAvidin HRP以1∶2000稀释于0.5％ BSA/PBS和0.05％ TWEEN中的稀释液，并将板在室温下培养1小时。用PBST将板洗涤6次。添加50μL/孔的TMB底物(sigma)以显色，并随后通过添加50μL/孔的0.2M H2SO4使其停止。
实例6ELISA滴定：抗IgE
在4℃下将板用溶于碳酸盐涂覆缓冲液中的0.25μg/mL(用于经纯化的Fab0.1μg/mL)SE44涂覆过夜。除去涂覆溶液，并在37℃下用200μL/孔的3％BSA/PBS将板封阻1小时。
用PBS/.1％TWEEN(PBST)将板洗涤4次。添加50μL/孔的Fab(取自15mL细胞周质制品)，以1∶2的稀释液开始，并用0.5％ BSA/PBS和.05％TWEEN20系列稀释3倍。将板在室温下培养2小时。
用PBST将板洗涤4次，并添加50μL/孔1∶1000(0.8μg/mL)溶于0.5％BSA/PBS和0.05％ TWEEN20中的生物素-羊抗人Fd稀释液。将板在室温下再次培养2小时。
用PBST洗涤4次后，添加50μL/孔的以1∶2000(0.9μg/mL)溶于0.5％BSA/PBS和0.05％ TWEEN20中的Neutra-avidin-AP溶液，并将板在室温下培养1小时。
用PBST将板洗涤4次。通过添加50μL/孔的pNPP底物使其显色。添加50μL/孔的3M NaOH使显色停止。在405nm或410nm处读取各孔的吸光度。
实例7M13噬菌体表达的可溶Fab的亲和力纯化方案
第1天
用5mL过夜原液XL1B对两份含10mg/mL四环素的500mL培养物(2xYT)进行接种，并使其在37℃下生长至A600＝0.9至1.2。添加IPTG，至浓度为0.5mM。然后，用200μL噬菌体/培养物感染细胞培养物，并在摇动的情况下在37℃下培养1小时。感染后，将细胞在25℃下在摇动的情况下生长过夜。
第2天
在4℃下在250mL离心管内以3500xg使细胞团粒化30分钟。吸出培养基，并将团粒重新悬浮于共12至15mL的溶胞缓冲液(缓冲液A+蛋白酶抑制剂混合物)中。
缓冲液A：(1升)
50mM NaH2PO4         6.9g NaH2PO4H2O(或6g NaH2PO4)
300mM NaCl           17.54g NaCl
10mM咪唑         0.68g咪唑(MW 68.08)
用NaOH将pH值调整至8.0
溶胞缓冲液：
25mL缓冲液A与一Complete Protease Inhibitor Cocktail(Roche，Basel，Switzerland)片剂混合。
将重新悬浮的细胞转移至一50mL锥形管内，并用100μL 100mg/mL的溶菌酶通过多次倒置锥形管使其溶解，直至此混合物移动到一起成为一团状物(由于溶胞作用)。在冰上对细胞实施超声处理，随后添加10μL脱氧核糖核酸酶(DNase)(约1000单位)并在4℃下轻轻摇动30分钟。使用50mL离心管，在4℃下通过以12000xg离心将碎片团粒化30分钟。将上清液转移至一新的锥形管内并在4℃下贮存。
依照厂商规程使用Ni-NT琼脂糖(Qiagen，Valencis，CA)纯化可溶的Fab。将溶胞产物与Ni-NTA混合并装入一柱中。收集流出物用于SDS-PAGE分析。用20mL缓冲液(50mM NaH2PO4、300mM NaCl、15mM咪唑，用NaOH将pH调整至8.0)洗涤此柱，随后再用一含有50mM NaH2PO4、300mM NaCl、20mM咪唑的20mL洗液洗涤。用6×500μL洗提缓冲液(50mM NaH2PO4、300mM NaCl、450mM咪唑，用NaOH将pH调整至8.0)洗提Fab，并用SDSPAGE分析。将柱馏分贮存在4℃下。用SDS-PAGE分析柱馏分，并选择具有最高量Fab的馏分在4℃下在PBS中透析。
实例8可溶解受体测试
在4至8℃下用0.05mL 0.5μg/mL FcεRIα-链受体涂覆缓冲液(50mM碳酸盐/二碳酸盐，pH值为9.6)涂覆适于ELISA的一96孔测试板12小时。将这些孔抽空，并添加250μL封阻缓冲液(PBS，1％的BSA，pH为7.2)，并在37℃下培养1小时。在一单独的测试板中，通过按1∶4用测试缓冲液(0.5％ BSA和0.05％ Tween 20、PBS，pH为7.2)稀释的稀释液将这些样品和参照物TES-C21MAb自200μg/mL滴定至0.001μg/mL，并添加等体积的100ng/mL生物素化IgE，将板在25℃下培养2至3小时。用PBS和0.05％ TWEEN 20将这些经FcεRI涂覆的孔洗涤3次，从样品孔中转移出50μL并在25℃下搅动培养30分钟。50μL/孔的1mg/mL Streptavidin-HRP(按1∶2000稀释于测试缓冲液中)搅动培养30分钟，然后按先前方法洗涤此板。添加50μL/孔的TMB底物并显色。通过添加等体积的0.2M H2SO4使反应停止，并在450nm处测量吸光度。
实例9抗体与载有IgE的FcεRI的结合
结合至与FcεRI的α亚单位相关联的人类IgE的抗体可通过用10μg/mL人类IgE在4℃预培养30分钟来测定。将板洗涤3次，随后用变化浓度的鼠科动物抗人类IgE mAb E-10-10或该人源化Fab变体培养1小时。Fab的结合可用一生物素标记的抗人Fd抗体并随后用SA-HRP检测。鼠科动物ab E10-10通过与山羊抗鼠科动物Ig Fc HRP结合Ab检测。
实例10纯系分析
测试每一候选纯系的结合亲和力，并对阳性纯系进行测序。进一步测定在CDR区具有可增加结合亲和力的有益突变的抗体变体的性质。测试包括：Biacore分析；IgE与其受体结合的抑制；和结合有受体的IgE的交联。
构建一变体文库。各种展示出改良亲和力的CDR的氨基酸序列描绘于表1中。图7列示具有取代组合的高亲和力侯选者。
表1
  CDRL1：   CDRH1：
  P RASQ SIGTNIH   SEQ ID NO 5   P MYWLE   SEQ ID NO 15
  #1RASRSIGTNIH   SEQ ID NO 6   #1WYWLE   SEQ ID NO 16
  #2RASQRIGTNIH   SEQ ID NO 7   #2YYWLE   SEQ ID NO 17
  CDRL2：   CDRH2：
  P YASESIS   SEQ ID NO 8   P EISPGTFTTNYNEKFKA   SEQ ID NO 18
  #1YAYESIS   SEQ ID NO 9   #1EIEPGTFTTNYNEKFKA   SEQ ID NO 19
  #2YASESIY   SEQ ID NO 10   #2EIDPGTFTTNYNEKFKA   SEQ ID NO 20
  #3YASESDS   SEQ ID NO 11   #3EISPDTFTTNYNEKFKA   SEQ ID NO 21
  #4YASESES   SEQ ID NO 12   #4EISPETFTTNYNEKFKA   SEQ ID NO 22
  CDRL3：   #5EISPGTFETNYNEKFKA   SEQ ID NO 23
  P QQSDSWPTT   SEQ ID NO 13   #6EIEPGTFETNYNEKFKA   SEQ ID NO 24
  #1AASWSWPTT   SEQ ID NO 14   #7EIDPGTFETNYNEKFKA   SEQ ID NO 25
  CDRH3：
  P FSHFSGSNYDYFDY   SEQ ID NO 26
  #1FSHFSGMNYDYFDY   SEQ ID NO 27
  #2FSHFSGQNYDYFDY   SEQ ID NO 28
  #3FSHFTGSNYDYFDY   SEQ ID NO 29
P＝亲代
图9中列出19种重链变体，图8中列出35种轻链变体。进一步测定3种候选者的结合亲和力性质，并将其示于表2中。
表2结合亲和力
  MAb   Kd   亲和力增加倍数
  TES-C21   614±200pM
  MAb1(CL-5A)   0.158pM   3886
  MAb2(CL-2C)   1.47±0.5pM   417
  MAb3(CL-5I)   3.2±2.2pM   191
实例11抗IgE抗体的表达和纯化及HRP-结合
产生高亲和力候选MAb。为产生完整的抗IgE MAb，将重链和轻链可变区序列自噬菌体载体模板进行PCR扩增并在一CMV启动子作用下分别亚克隆至重链和轻链表达载体中。构建6个全抗体纯系，这些纯系描述于图10A至F中。通过业内熟知技术用电穿孔法将适合的重链和轻链质粒共转染至小鼠骨髓瘤细胞系NS0中。参见，例如，Liou等人，J Immunol.143(12)：3967-75(1989)。使用蛋白A-琼脂糖(Pharmacia)将抗体自单个稳定细胞系上清液中纯化出来。使用280nm下之分光光度计及FCA测试(IDEXX)测定该抗体的浓度。
使用过氧化物酶试剂盒(Zymed Labs，San Francisco，CA)依照厂商规程用辣根过氧化物酶(HRP)结合纯化的抗体。用涂覆有一单克隆人IgE(SE44)的板使用ELISA测定每一结合的抗IgE MAb的滴定度。
以下培养物已经存放于American Type Culture Collection中，10801University Boulevard，Manassas Va.20110-2209US(ATCC)：
  杂交瘤   ATCC编号   存放日期
  抗IgE CL-2C   PTA-5678   2003年12月3日
  抗IgE CL-5A   PTA-5679   2003年12月3日
  抗IgE CL-51   PTA-5680   2003年12月3日
该存放按照国际认可的用于专利程序目的的布达佩斯微生物存放条约及其下的条例(Budapest Treaty on the International Recognition of the Deposit ofMicroorganisms for the Purpose of Patent Procedure and the Regulations thereunder)(布达佩斯条约)的规定进行。此可确保一活培养物自存放之日起可保持30年。此有机体可在布达佩斯条约的条款下通过ATCC获得，其可确保在有关美国专利发布后公众可持久并且无限制地获得此培养物的子代。
本专利申请案的受让人已经同意，如果所存放的培养物在适合的条件下培养时死亡或丢失或遭到破坏，将在得到通知时迅速用相同培养物的活样品将其取代。不应将所贮存株系的可获得性理解为允许违反任一政府的权力机构依照其专利法赋予的权利而实践本发明。
上述书面说明书被视为足以能使所属领域的技术人员实践本发明。本发明的范围并不受限于所存放的培养物，因为这些所存放的实施例皆意欲阐释示本发明的一方面，任何功能相当的培养物皆涵盖于本发明的范围内。本文材料的存放并非等同于承认本文所含的说明不足以使本发明任一方面(包括其最佳模式)得以实施，也不可将其理解为将权利要求书的范围限制至其描述的具体阐释。实际上，所属领域的技术人员通过上文的说明将明了除那些本文所展示及所阐述实施例外的本发明各种修改形式，该等修改形式皆涵盖于随附权利要求书的范围内。
所属领域的技术人员使用常规实验即可识别或能确定本文所述的本发明具体实施例的许多等效物。这些等效物均意欲涵盖在下述权利要求书的范围内。
序列表
<110>唐纳士公司(Tanox，Inc.)
<120>高亲和力抗人类IgE抗体
<130>TNX-1010(1)PCT
<150>60/444,229
<151>2003-02-01
<160>70
<170>PatentIn version 3.2
<210>1
<211>107
<212>PRT
<213>鼠科动物
<220>
<221>misc_feature
<223>TES-C21轻链
<400>1
Asp Ile Leu Leu Thr Gln Ser Pro Ala Ile Leu Ser Val Ser Pro Gly
1               5                   10                  15
Glu Arg Val Ser Phe Ser Cys Arg Ala Ser Gln Ser Ile Gly Thr Asn
            20                  25                  30
Ile His Trp Tyr Gln Gln Arg Thr Asp Gly Ser Pro Arg Leu Leu Ile
        35                  40                  45
Lys Tyr Ala Ser Glu Ser Ile Ser Gly Ile Pro Ser Arg Phe Ser Gly
    50                  55                  60
Ser Gly Ser Gly Thr Glu Phe Thr Leu Asn Ile Asn Ser Val Glu Ser
65                  70                  75                  80
Glu Asp Ile Ala Asp Tyr Tyr Cys Gln Gln Ser Asp Ser Trp Pro Thr
                85                  90                  95
Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys
            100                 105
<210>2
<211>107
<212>PRT
<213>人类
<220>
<221>misc_feature
<223>L16/-JK4人类轻链共有序列模板
<400>2
Glu Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Val Ser Pro Gly
1               5                   10                  15
Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Ser Val Ser Ser Asn
            20                  25                  30
Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu Ile
        35                  40                  45
Tyr Gly Ala Ser Thr Arg Ala Thr Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser Gly
    50                  55                  60
Ser Gly Ser Gly Thr Glu Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Ser
65                  70                  75                  80
Glu Asp Phe Ala Val Tyr Tyr Cys Gln Gln Tyr Asn Asn Trp Pro Leu
                85                  90                  95
Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys
            100                 105
<210>3
<211>123
<212>PRT
<213>鼠科动物
<220>
<221>misc_feature
<223>TES-C21重链
<400>3
Gln Val Gln Leu Gln Gln Ser Gly Ala Glu Leu Met Lys Pro Gly Ala
1               5                   10                  15
Ser Val Lys Ile Ser Cys Lys Thr Thr Gly Tyr Thr Phe Ser Met Tyr
            20                  25                  30
Trp Leu Glu Trp Val Lys Gln Arg Pro Gly His Gly Leu Glu Trp Val
        35                  40                  45
Gly Glu Ile Ser Pro Gly Thr Phe Thr Thr Asn Tyr Asn Glu Lys Phe
    50                  55                  60
Lys Ala Lys Ala Thr Phe Thr Ala Asp Thr Ser Ser Asn Thr Ala Tyr
65                  70                  75                  80
Leu Gln Leu Ser Gly Leu Thr Ser Glu Asp Ser Ala Val Tyr Phe Cys
                85                  90                  95
Ala Arg Phe Ser His Phe Ser Gly Ser Asn Tyr Asp Tyr Phe Asp Tyr
            100                 105                 110
Trp Gly Gln Gly Thr Ser Leu Thr Val Ser Ser
        115                 120
<210>4
<211>113
<212>PRT
<213>人类
<220>
<221>misc_feature
<223>DP88/3H4b人类重链共有序列模板
<400>4
Gln Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ser
1               5                   10                  15
Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Gly Thr Phe Ser Ser Tyr
            20                  25                  30
Ala Ile Ser Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Met
        35                  40                  45
Gly Gly Ile Ile Pro Ile Phe Gly Thr Ala Asn Tyr Ala Gln Lys Phe
    50                  55                  60
Gln Gly Arg Val Thr Ile Thr Ala Asp Lys Ser Thr Ser Thr Ala Tyr
65                  70                  75                  80
Met Glu Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
                85                  90                  95
Ala Arg Tyr Phe Asp Tyr Leu Val Gln Gly Thr Ser Leu Thr Val Ser
            100                 105                 110
Ser
<210>5
<211>11
<212>PRT
<213>人工的
<220>
<223>TES-C21 CDRL1序列(表1)
<400>5
Arg Ala Ser Gln Ser Ile Gly Thr Asn Ile His
1               5                   10
<210>6
<211>11
<212>PRT
<213>人工的
<220>
<223>CDRL1变体序列#1(表1)
<400>6
Arg Ala Ser Arg Ser Ile Gly Thr Asn Ile His
1               5                   10
<210>7
<211>11
<212>PRT
<213>人工的
<220>
<223>CDRL1变体序列#2(表1)
<400>7
Arg Ala Ser Gln Arg Ile Gly Thr Asn Ile His
1               5                   10
<210>8
<211>7
<212>PRT
<213>人工的
<220>
<223>TES-C21 CDRL2序列(表1)
<400>8
Tyr Ala Ser Glu Ser Ile Ser
1               5
<210>9
<211>7
<212>PRT
<213>人工的
<220>
<223>CDRL2变体#1(表1)
<400>9
Tyr Ala Tyr Glu Ser Ile Ser
1               5
<210>10
<211>7
<212>PRT
<213>人工的
<220>
<223>CDRL2变体#2(表1)
<400>10
Tyr Ala Ser Glu Ser Ile Tyr
1               5
<210>11
<211>7
<212>PRT
<213>人工的
<220>
<223>CDRL2变体#3(表1)
<400>11
Tyr Ala Ser Glu Ser Asp Ser
1               5
<210>12
<211>7
<212>PRT
<213>人工的
<220>
<223>CDRL2变体#4(表1)
<400>12
Tyr Ala Ser Glu Ser Glu Ser
1               5
<210>13
<211>9
<212>PRT
<213>人工的
<220>
<223>TES-C21 CDRL3(表1)
<400>13
Gln Gln Ser Asp Ser Trp Pro Thr Thr
1               5
<210>14
<211>9
<212>PRT
<213>人工的
<220>
<223>CDRL3变体(表)
<400>14
Ala Ala Ser Trp Ser Trp Pro Thr Thr
1               5
<210>15
<211>5
<212>PRT
<213>人工的
<220>
<223>TES-C21 CDRH1
<400>15
Met Tyr Trp Leu Glu
1               5
<210>16
<211>5
<212>PRT
<213>人工的
<220>
<223>CDRH1变体#1(表1)
<400>16
Trp Tyr Trp Leu Glu
1               5
<210>17
<211>5
<212>PRT
<213>人工的
<220>
<223>CDRH1 #2(表1)
<400>17
Tyr Tyr Trp Leu Glu
1               5
<210>18
<211>17
<212>PRT
<212>人工的
<220>
<223>TES-C21 CDRH2(表1)
<400>18
Glu Ile Ser Pro Gly Thr Phe Thr Thr Asn Tyr Asn Glu Lys Phe Lys
1               5                   10                  15
Ala
<210>19
<211>17
<212>PRT
<213>人工的
<220>
<223>CDRH2变体#1(表1)
<400>19
Glu Ile Glu Pro Gly Thr Phe Thr Thr Asn Tyr Asn Glu Lys Phe Lys
1               5                   10                  15
Ala
<210>20
<211>17
<212>PRT
<213>人工的
<220>
<223>CDRH2变体#2(表1)
<400>20
Glu Ile Asp Pro Gly Thr Phe Thr Thr Asn Tyr Asn Glu Lys Phe Lys
1               5                   10                  15
Ala
<210>21
<211>17
<212>PRT
<213>人工的
<220>
<223>CDRH2变体#3(表1)
<400>21
Glu Ile Ser Pro Asp Thr Phe Thr Thr Asn Tyr Asn Glu Lys Phe Lys
1               5                   10                  15
Ala
<210>22
<211>17
<212>PRT
<213>人工的
<220>
<223>CDRH2变体#4(表1)
<400>22
Glu Ile Ser Pro Glu Thr Phe Thr Thr Asn Tyr Asn Glu Lys Phe Lys
1               5                   10                  15
Ala
<210>23
<211>17
<212>PRT
<213>人工的
<220>
<223>CDRH2变体#5(表1)
<400>23
Glu Ile Ser Pro Gly Thr Phe Glu Thr Asn Tyr Asn Glu Lys Phe Lys
1               5                   10                  15
Ala
<210>24
<211>17
<212>PRT
<213>人工的
<220>
<223>CDRH2变体#6(表1)
<400>24
Glu Ile Glu Pro Gly Thr Phe Glu Thr Asn Tyr Asn Glu Lys Phe Lys
1               5                   10                  15
Ala
<210>25
<211>17
<212>PRT
<213>人工的
<220>
<223>CDRH2变体#7(表1)
<400>25
Glu Ile Asp Pro Gly Thr Phe Glu Thr Asn Tyr Asn Glu Lys Phe Lys
1               5                   10                  15
Ala
<210>26
<211>14
<212>PRT
<213>人工的
<220>
<223>TES-C21 CDRH3(表1)
<400>26
Phe Ser His Phe Ser Gly Ser Asn Tyr Asp Tyr Phe Asp Tyr
1               5                   10
<210>27
<211>14
<212>PRT
<213>人工的
<220>
<223>CDRH3变体#1(表1)
<400>27
Phe Ser His Phe Ser Gly Met Asn Tyr Asp Tyr Phe Asp Tyr
1               5                   10
<210>28
<211>14
<212>PRT
<213>人工的
<220>
<223>CDRH3变体#2(表1)
<400>28
Phe Ser His Phe Ser Gly Gln Asn Tyr Asp Tyr Phe Asp Tyr
1               5                   10
<210>29
<211>14
<212>PRT
<213>人工的
<220>
<223>CDRH3变体#3(表1)
<400>29
Phe Ser His Phe Thr Gly Ser Asn Tyr Asp Tyr Phe Asp Tyr
1               5                   10
<210>30
<211>23
<212>PRT
<213>人工的
<220>
<223>FRL1变体136
<400>30
Glu Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Val Ser Pro Gly
1               5                   10                  15
Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys
            20
<210>31
<211>23
<212>PRT
<213>人工的
<220>
<223>FRL1变体1
<400>31
Asp Ile Leu Met Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Val Ser Pro Gly
1               5                   10                  15
Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys
            20
<210>32
<211>23
<212>PRT
<213>人工的
<220>
<223>FRL1变体2
<400>32
Asp Ile Val Leu Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Val Ser Pro Gly
1               5                   10                  15
Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys
            20
<210>33
<211>23
<212>PRT
<213>人工的
<220>
<223>FRL1变体4
<400>33
Asp Ile Leu Leu Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Val Ser Pro Gly
1               5                   10                  15
Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys
            20
<210>34
<211>23
<212>PRT
<213>人工的
<220>
<223>FRL1变体13
<400>34
Glu Ile Val Leu Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Val Ser Pro Gly
1               5                   10                  15
Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys
            20
<210>35
<211>23
<212>PRT
<213>人工的
<220>
<223>FRL1变体18
<400>35
Glu Ile Leu Leu Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Val Ser Pro Gly
1               5                   10                  15
Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys
            20
<210>36
<211>23
<212>PRT
<213>人工的
<220>
<223>FRL1变体25
<400>36
Asp Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Val Ser Pro Gly
1               5                   10                  15
Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys
            20
<210>37
<211>23
<212>PRT
<213>人工的
<220>
<223>FRL1变体27
<400>37
Glu Ile Leu Met Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Val Ser Pro Gly
1               5                   10                  15
Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys
            20
<210>38
<211>15
<212>PRT
<213>人工的
<220>
<223>FRL2变体136
<400>38
Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu Ile Tyr
1               5                   10                  15
<210>39
<211>15
<212>PRT
<213>人工的
<220>
<223>FRL2变体1
<400>39
Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu Ile Lys
1               5                   10                  15
<210>40
<211>32
<212>PRT
<213>人工的
<220>
<223>FRL3变体136
<400>40
Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Glu Phe Thr
1           5                       10                  15
Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Ser Glu Asp Phe Ala Val Tyr Tyr Cys
        20                      25                  30
<210>41
<211>32
<212>PRT
<213>人工的
<220>
<223>FRL3变体1
<400>41
Gly Ile Pro Ser Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Glu Phe Thr
1               5                   10                  15
Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Ser Glu Asp Phe Ala Val Tyr Tyr Cys
            20                  25                   30
<210>42
<211>32
<212>PRT
<213>人工的
<220>
<223>FRL3变体13
<400>42
Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Glu Phe Thr
1               5                   10                  15
Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Ser Glu Asp Phe Ala Asp Tyr Tyr Cys
            20                  25                  30
<210>43
<211>32
<212>PRT
<213>人工的
<220>
<223>FRL3变体18
<400>43
Gly Ile Pro Ser Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Glu Phe Thr
1               5                   10                  15
Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Ser Glu Asp Phe Ala Asp Tyr Tyr Cys
            20                  25                  30
<210>44
<211>10
<212>PRT
<213>人工的
<220>
<223>FRL4变体
<400>44
Phe Gly Gly Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys
1               5                   10
<210>45
<211>30
<212>PRT
<213>人工的
<220>
<223>FRH1变体136
<400>45
Gln Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Met Lys Pro Gly Ser
1               5                   10                  15
Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Ser
            20                  25                  30
<210>46
<211>30
<212>PRT
<213>人工的
<220>
<223>FRH1变体2
<400>46
Gln Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ser
1               5                   10                  15
Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Ser
            20                  25                  30
<210>47
<211>14
<212>PRT
<213>人工的
<220>
<223>FRH1变体136
<400>47
Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly His Gly Leu Glu Trp Met Gly
1               5                   10
<210>48
<211>14
<212>PRT
<213>人工的
<220>
<223>FRH2变体2
<400>48
Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Met Gly
1               5                   10
<210>49
<211>14
<212>PRT
<213>人工的
<220>
<223>FRH2变体8
<400>49
Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Val Gly
1               5                   10
<210>50
<211>14
<212>PRT
<213>人工的
<220>
<223>FRH2变体21
<400>50
Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly His Gly Leu Glu Trp Val Gly
1               5                   10
<210>51
<211>32
<212>PRT
<213>人工的
<220>
<223>FRH3变体136
<400>51
Arg Val Thr Phe Thr Ala Asp Thr Ser Thr Ser Thr Ala Tyr Met Glu
1               5                   10                  15
Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala Arg
            20                  25                  30
<210>52
<211>32
<212>PRT
<213>人工的
<220>
<223>FRH3变体1
<400>52
Arg Ala Thr Phe Thr Ala Asp Thr Ser Thr Ser Thr Ala Tyr Met Glu
1               5                   10                  15
Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala Arg
            20                  25                  30
<210>53
<211>32
<212>PRT
<213>人工的
<220>
<223>FRH3变体43
<400>53
Arg Val Thr Ile Thr Ala Asp Thr Ser Thr Ser Thr Ala Tyr Met Glu
1               5                   10                  15
Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala Arg
            20                  25                  30
<210>54
<211>32
<212>PRT
<213>人工的
<220>
<223>FRH3变体103
<400>54
Arg Ala Thr Ile Thr Ala Asp Thr Ser Thr Ser Thr Ala Tyr Met Glu
1               5                   10                  15
Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala Arg
            20                  25                  30
<210>55
<211>11
<212>PRT
<213>人工的
<220>
<223>FRH4变体136
<400>55
Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
1               5                   10
<210>56
<211>19
<212>PRT
<213>细菌噬菌体M13mp18
<220>
<221>misc_feature
<223>基因III信号序列
<400>56
Met Glu Trp Ser Gly Val Phe Met Phe Leu Leu Ser Val Thr Ala Gly
1               5                   10                  15
Val His Ser
<210>57
<211>107
<212>PRT
<213>人工的
<220>
<223>纯系136的轻链可变区
<400>57
Glu Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Val Ser Pro Gly
1               5                   10                  15
Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Ser Ile Gly Thr Asn
            20                  25                  30
Ile His Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu Ile
        35                  40                  45
Tyr Tyr Ala Ser Glu Ser Ile Ser Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser Gly
    50                    55                60
Ser Gly Ser Gly Thr Glu Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Ser
65                  70                  75                  80
Glu Asp Phe Ala Val Tyr Tyr Cys Gln Gln Ser Asp Ser Trp Pro Thr
                85                  90                  95
Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys
            100                 105
<210>58
<211>106
<212>PRT
<213>人工的
<220>
<223>纯系136的轻链恒定区
<400>58
Thr Val Ala Ala Pro Ser Val Phe Ile Phe Pro Pro Ser Asp Glu Gln
1               5                   10                  15
Leu Lys Ser Gly Thr Ala Ser Val Val Cys Leu Leu Asn Asn Phe Tyr
            20                  25                  30
Pro Arg Glu Ala Lys Val Gln Trp Lys Val Asp Asn Ala Leu Gln Ser
        35                  40                  45
Gly Asn Ser Gln Glu Ser Val Thr Glu Gln Asp Ser Lys Asp Ser Thr
    50                  55                  60
Tyr Ser Leu Ser Ser Thr Leu Thr Leu Ser Lys Ala Asp Tyr Glu Lys
65                  70                  75                  80
His Lys Val Tyr Ala Cys Glu Val Thr His Gln Gly Leu Ser Ser Pro
                85                  90                  95
Val Thr Lys Ser Phe Asn Arg Gly Glu Cys
            100                 105
<210>59
<211>123
<212>PRT
<213>人工的
<220>
<223>纯系136的重链可变区
<400>59
Gln Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Met Lys Pro Gly Ser
1               5                   10                  15
Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Ser Met Tyr
            20                  25                  30
Trp Leu Glu Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly His Gly Leu Glu Trp Met
        35                  40                  45
Gly Glu Ile Ser Pro Gly Thr Phe Thr Thr Asn Tyr Asn Glu Lys Phe
    50                  55                  60
Lys Ala Arg Val Thr Phe Thr Ala Asp Thr Ser Thr Ser Thr Ala Tyr
65                  70                  75                  80
Met Glu Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
                85                  90                  95
Ala Arg Phe Ser His Phe Ser Gly Ser Asn Tyr Asp Tyr Phe Asp Tyr
            100                 105                 110
Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
        115                 120
<210>60
<211>330
<212>PRT
<213>人工的
<220>
<223>人类IgG1的恒定区
<400>60
Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val Phe Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys
1               5                   10                  15
Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala Ala Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr
            20                  25                  30
Phe Pro Glu Pro Val Thr Va1 Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser
        35                  40                  45
Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser
    50                  55                  60
Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr
65                  70                  75                  80
Tyr Ile Cys Asn Val Asn His Lys Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys
                85                  90                  95
Lys Val Glu Pro Lys Ser Cys Asp Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys
            100                 105                 110
Pro Ala Pro Glu Leu Leu Gly Gly Pro Ser Va1 Phe Leu Phe Pro Pro
        115                 120                 125
Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys
    130                 135                 140
Val Va1 Va1 Asp Va1 Ser His Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp
145                 150                 155                 160
Tyr Va1 Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu
                165                 170                 175
Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu
            180                 185                 190
His Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn
        195                 200                 205
Lys Ala Leu Pro Ala Pro Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly
    210                 215                 220
Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Asp Glu
225                 230                 235                 240
Leu Thr Lys Asn Gln Va1 Ser Leu Thr Cys Leu Va1 Lys Gly Phe Tyr
                245                 250                 255
Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn
            260                 265                 270
Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe
        275                 280                 285
Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn
    290                 295                 300
Val Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr
305                 310                 315                 320
Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro Gly Lys
                325                 330
<210>61
<211>107
<212>PRT
<213>人工的
<220>
<223>纯系CL-2C的轻链可变区
<400>61
Glu Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Val Ser Pro Gly
1               5                   10                  15
Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Ser Ile Gly Thr Asn
            20                  25                  30
Ile His Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu Ile
        35                  40                  45
Tyr Tyr Ala Ser Glu Ser Ile Ser Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser Gly
    50                  55                  60
Ser Gly Ser Gly Thr Glu Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Ser
65                  70                  75                  80
Glu Asp Phe Ala Val Tyr Tyr Cys Gln Gln Ser Trp Ser Trp Pro Thr
                85                  90                  95
Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys
            100                 105
<210>62
<211>123
<212>PRT
<213>人工的
<220>
<223>纯系CL-2C的重链可变区
<400>62
Gln Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Met Lys Pro Gly Ser
1               5                   10                  15
Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Ser Trp Tyr
            20                  25                  30
Trp Leu Glu Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly His Gly Leu Glu Trp Met
        35                  40                  45
Gly Glu Ile Asp Pro Gly Thr Phe Thr Thr Asn Tyr Asn Glu Lys Phe
    50                  55                  60
Lys Ala Arg Val Thr Phe Thr Ala Asp Thr Ser Thr Ser Thr Ala Tyr
65                  70                  75                  80
Met Glu Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
                85                  90                  95
Ala Arg Phe Ser His Phe Ser Gly Ser Asn Tyr Asp Tyr Phe Asp Tyr
            100                 105                 110
Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
        115                 120
<210>63
<211>107
<212>PRT
<213>人工的
<220>
<223>纯系CL-5I的轻链可变区
<400>63
Glu Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Val Ser Pro Gly
1               5                   10                  15
Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Ser Ile Gly Thr Asn
            20                  25                  30
Ile His Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu Ile
        35                  40                  45
Tyr Tyr Ala Ser Glu Ser Ile Ser Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser Gly
    50                  55                  60
Ser Gly Ser Gly Thr Glu Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Ser
65                  70                  75                  80
Glu Asp Phe Ala Val Tyr Tyr Cys Gln Gln Ser Trp Ser Trp Pro Thr
                85                  90                  95
Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys
            100                 105
<210>64
<211>123
<212>PRT
<213>人工的
<220>
<223>纯系CL-5I的重链可变区
<400>64
Gln Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Met Lys Pro Gly Ser
1               5                   10                  15
Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Ser Met Tyr
            20                  25                  30
Trp Leu Glu Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly His Gly Leu Glu Trp Met
        35                  40                  45
Gly Glu Ile Asp Pro Gly Thr Phe Glu Thr Asn Tyr Asn Glu Lys Phe
    50                  55                  60
Lys Ala Arg Val Thr Phe Thr Ala Asp Thr Ser Thr Ser Thr Ala Tyr
65                  70                  75                  80
Met Glu Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
                85                  90                  95
Ala Arg Phe Ser His Phe Ser Gly Ser Asn Tyr Asp Tyr Phe Asp Tyr
            100                 105                 110
Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
        115                 120
<210>65
<211>107
<212>PRT
<213>人工的
<220>
<223>纯系CL-5A的轻链可变区
<400>65
Glu Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Val Ser Pro Gly
1               5                   10                  15
Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Ser Ile Gly Thr Asn
            20                  25                  30
Ile His Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu Ile
        35                  40                  45
Tyr Tyr Ala Ser Glu Ser Ile Ser Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser Gly
    50                  55                  60
Ser Gly Ser Gly Thr Glu Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Ser
65                  70                  75                  80
Glu Asp Phe Ala Val Tyr Tyr Cys Gln Gln Ser Trp Ser Trp Pro Thr
                85                  90                  95
Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys
            100                 105
<210>66
<211>123
<212>PRT
<213>人工的
<220>
<223>纯系CL-5A的重链可变区
<400>66
Gln Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Met Lys Pro Gly Ser
1               5                   10                  15
Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Ser Trp Tyr
            20                  25                  30
Trp Leu Glu Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly His Gly Leu Glu Trp Met
        35                  40                  45
Gly Glu Ile Glu Pro Gly Thr Glu Thr Thr Asn Tyr Asn Glu Lys Phe
    50                  55                  60
Lys Ala Arg Val Thr Phe Thr Ala Asp Thr Ser Thr Ser Thr Ala Tyr
65                  70                  75                  80
Met Glu Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
                85                  90                  95
Ala Arg Phe Ser His Phe Ser Gly Ser Asn Tyr Asp Tyr Phe Asp Tyr
            100                 105                 110
Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
        115                 120
<210>67
<211>107
<212>PRT
<213>人工的
<220>
<223>纯系CL-2B的轻链可变区
<400>67
Glu Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Val Ser Pro Gly
1               5                   10                  15
Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Ser Ile Gly Thr Asn
            20                  25                  30
Ile His Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu Ile
        35                  40                  45
Tyr Tyr Ala Ser Glu Ser Ile Ser Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser Gly
    50                  55                  60
Ser Gly Ser Gly Thr Glu Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Ser
65                  70                  75                  80
Glu Asp Phe Ala Val Tyr Tyr Cys Gln Gln Ser Trp Ser Trp Pro Thr
                85                  90                  95
Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys
            100                 105
<210>68
<211>123
<212>PRT
<213>人工的
<220>
<223>纯系CL-2B的重链可变区
<400>68
Gln Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Met Lys Pro Gly Ser
1               5                   10                  15
Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Ser Tyr Tyr
            20                  25                  30
Trp Leu Glu Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly His Gly Leu Glu Trp Met
        35                  40                  45
Gly Glu Ile Asp Pro Gly Thr Phe Thr Thr Asn Tyr Asn Glu Lys Phe
    50                  55                  60
Lys Ala Arg Val Thr Phe Thr Ala Asp Thr Ser Thr Ser Thr Ala Tyr
65                  70                  75                  80
Met Glu Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
                85                  90                  95
Ala Arg Phe Ser His Phe Ser Gly Ser Asn Tyr Asp Tyr Phe Asp Tyr
            100                 105                 110
Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
        115                 120
<210>69
<211>107
<212>PRT
<213>人工的
<220>
<223>纯系CL-1136-2C的轻链可变区
<400>69
Glu Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Val Ser Pro Gly
1               5                   10                  15
Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Ser Ile Gly Thr Asn
            20                  25                  30
Ile His Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu Ile
        35                  40                  45
Tyr Tyr Ala Ser Glu Ser Ile Ser Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser Gly
    50                  55                  60
Ser Gly Ser Gly Thr Glu Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Ser
65                  70                  75                  80
Glu Asp Phe Ala Val Tyr Tyr Cys Gln Gln Ser Trp Ser Trp Pro Thr
                85                  90                  95
Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys
            100                 105
<210>70
<211>123
<212>PRT
<213>人工的
<220>
<223>纯系CL-1136-2C的重链可变区
<400>70
Gln Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ser
1               5                   10                  15
Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Ser Met Tyr
            20                  25                  30
Trp Leu Glu Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Met
        35                  40                  45
Gly Glu Ile Ser Pro Gly Thr Phe Thr Thr Asn Tyr Asn Glu Lys Phe
    50                  55                  60
Lys Ala Arg Val Thr Phe Thr Ala Asp Thr Ser Thr Ser Thr Ala Tyr
65                  70                  75                  80
Met Glu Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
                85                  90                  95
Ala Arg Phe Ser His Phe Ser Gly Ser Asn Tyr Asp Tyr Phe Asp Tyr
            100                 105                 110
Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
        115                 120

Claims (55)

1、一种可变轻链区，其包含一具有式FRL1-CDRL1-FRL2-CDRL2-FRL3-CDRL3-FRL4的氨基酸序列，其中FRL1由SEQ ID NO：30至37中的任一个组成；CDRL1由SEQ ID NO：5至7中的任一个组成；FRL2由SEQ ID NO：38至39中的任一个组成；CDRL2由SEQ ID NO：8至12中的任一个组成；FRL3由SEQ ID NO：40至43中的任一个组成；CDRL3由SEQ ID NO：13至14中的任一个组成；而FRL4由SEQ ID NO：44组成。
2、如权利要求1所述的可变轻链区，其包含SEQ ID NO：57、61、63、65、67和69中的任一个。
3、如权利要求1所述的可变轻链区，其进一步包含一恒定区。
4、如权利要求3所述的可变轻链区，其中所述恒定结构域具有SEQ ID NO：58。
5、如权利要求2所述的可变轻链区，其进一步包含一恒定区。
6、如权利要求5所述的可变轻链区，其中所述恒定区具有SEQ ID NO：58。
7、如权利要求1所述的可变轻链区，其进一步包含一信号肽。
8、如权利要求7所述的可变轻链区，其中所述信号肽具有SEQ ID NO：56。
9、一种可变重链区，其包含一具有式FRH1-CDRH1-FRH2-CDRH2-FRH3-CDRH3-FRH4的氨基酸序列，其中FRH1由SEQ ID NO：45至46中的任一个组成；CDRH1由SEQ ID NO：15至17中的任一个组成；FRH2由SEQ ID NO：47至50中的任一个组成；CDRH2由SEQ IDNO：18至25中的任一个组成；FRH3由SEQ ID NO：51至54中的任一个组成；CDRH3由SEQ ID NO：26至29中的任一个组成；而FRH4由SEQ ID NO：55组成。
10、如权利要求9所述的可变重链区，其包含SEQ ID NO：59、62、64、66、68和70中的任一个。
11、如权利要求7所述的可变重链区，其进一步包含一恒定区的至少CH1结构域。
12、如权利要求11所述的可变重链区，其包含一恒定区的CH1、CH2及CH3结构域。
13、如权利要求11所述的可变重链区，其中所述恒定区来自一IgG抗体。
14、如权利要求13所述的可变重链区，其中所述IgG抗体为一IgG1抗体、一IgG2抗体、一IgG3抗体或一IgG4抗体。
15、如权利要求13所述的可变重链区，其中所述恒定结构域具有SEQ ID NO：60。
16、如权利要求10所述的可变重链区，其进一步包含一恒定区。
17、如权利要求16所述的可变重链区，其中所述恒定结构域具有SEQ ID NO：60。
18、如权利要求9所述的可变重链区，其进一步包含一信号肽。
19、如权利要求18所述的可变重链区，其中所述信号肽具有SEQ ID NO：56。
20、一种包含如权利要求1所述的可变轻链区的抗体或抗体片段，其中所述抗体特异性地与IgE结合。
21、一种包含如权利要求9所述的可变重链区的抗体或抗体片段，其中所述抗体特异性地与IgE结合。
22、如权利要求20所述的抗体，其包含一如权利要求9所述的重链区。
23、如权利要求22所述的抗体，其包含一具有SEQ ID NO：57中所示氨基酸序列的可变轻链区和一具有SEQ ID NO：59中所示氨基酸序列的可变重链区。
24、如权利要求23所述的抗体，其进一步包含一恒定轻链区和一恒定重链区。
25、如权利要求24所述的抗体，其中所述恒定轻链区具有SEQ ID NO：58中所示氨基酸序列并且所述恒定重链区具有SEQ ID NO：60中所示氨基酸序列。
26、如权利要求22所述的抗体，其包含一具有SEQ ID NO：61中所示氨基酸序列的可变轻链区和一具有SEQ ID NO：62中所示氨基酸序列的可变重链区。
27、如权利要求26所述的抗体，其进一步包含一恒定轻链区和一恒定重链区。
28、如权利要求27所述的抗体，其中所述恒定轻链区具有SEQ ID NO：58中所示氨基酸序列并且所述恒定重链区具有SEQ ID NO：60中所示氨基酸序列。
29、如权利要求26所述的抗体，其由一具有ATCC存放号PTA-5678的细胞产生。
30、如权利要求22所述的抗体，其包含一具有SEQ ID NO：63中所示氨基酸序列的可变轻链区和一具有SEQ ID NO：64中所示氨基酸序列的可变重链区。
31、如权利要求30所述的抗体，其进一步包含一恒定轻链区和一恒定重链区。
32、如权利要求31所述的抗体，其中所述恒定轻链区具有SEQ ID NO：58中所示氨基酸序列并且所述恒定重链区具有SEQ ID NO：60中所示氨基酸序列。
33、如权利要求30所述的抗体，其由一具有ATCC存放号PTA-5680的细胞产生。
34、如权利要求22所述的抗体，其包含一具有SEQ ID NO：65中所示氨基酸序列的可变轻链区和一具有SEQ ID NO：66中所示氨基酸序列的可变重链区。
35、如权利要求34所述的抗体，其进一步包含一恒定轻链区和一恒定重链区。
36、如权利要求35所述的抗体，其中所述恒定轻链区具有SEQ ID NO：58中所示氨基酸序列并且所述恒定重链区具有SEQ ID NO：60中所示氨基酸序列。
37、如权利要求34所述的抗体，其由一具有ATCC存放号PTA-5679的细胞产生。
38、如权利要求22所述的抗体，其包含一具有SEQ ID NO：67中所示氨基酸序列的可变轻链区和一具有SEQ ID NO：68中所示氨基酸序列的可变重链区。
39、如权利要求38所述的抗体，其进一步包含一恒定轻链区和一恒定重链区。
40、如权利要求39所述的抗体，其中所述恒定轻链区具有SEQ ID NO：58中所示氨基酸序列并且所述恒定重链区具有SEQ ID NO：60中所示氨基酸序列。
41、如权利要求22所述的抗体，其包含一具有SEQ ID NO：69中所示氨基酸序列的可变轻链区和一具有SEQ ID NO：70中所示氨基酸序列的可变重链区。
42、如权利要求41所述的抗体，其进一步包含一恒定轻链区和一恒定重链区。
43、如权利要求42所述的抗体，其中所述恒定轻链区具有SEQ ID NO：58中所示氨基酸序列并且所述恒定重链区具有SEQ ID NO：60中所示氨基酸序列。
44、一种组合物，其包含一治疗有效量的如权利要求20或21所述的抗体和一医药上可接受的载剂。
45、如权利要求20或21所述的抗体，其进一步连接至一标记。
46、一种诊断试剂盒，其包含一如权利要求20或21所述的抗体。
47、一种载体，其包含一编码如权利要求22所述的抗体的核酸。
48、一种包含如权利要求47所述的载体的细胞。
49、如权利要求48所述的细胞，其中所述细胞为ATCC存放号PTA-5678、PTA-5679或PTA-5680。
50、一种产生抗体的方法，其包括将如权利要求48所述的细胞在适合于产生抗体的条件下培养，和分离所产生的抗体。
51、一种测量受试者体内IgE水平的方法，其包括：使所述受试者的一样品与如权利要求22所述的抗体接触，其中所述样品包含IgE分子；和测定所述样品相对于一对照受试者的对照样品的抗体保留水平，其中若所述受试者样品具有比所述对照样品更高或更低的抗体保留水平则表示所述受试者具有比所述对照受试者中更高或更低的IgE分子水平。
52、一种诊断与受试者体内异常IgE水平相关的疾病的方法，其包括：使所述受试者的一样品与如权利要求22所述的抗体接触，其中所述样品包含IgE分子；和测定所述样品相对于一对照受试者的对照样品的抗体保留水平，其中若所述受试者样品具有比所述对照样品更高或更低的抗体保留水平则表示所述受试者具有与异常IgE水平相关的疾病。
53、如权利要求52所述的方法，其中所述与异常IgE水平相关的疾病为哮喘、过敏性鼻炎、湿疹、荨麻疹或异位性皮炎。
54、一种治疗与受试者体内异常高IgE水平相关的疾病的方法，其包括对所述受试者施用一治疗有效量的如权利要求22所述的抗体，以便在所述受试者中治疗所述疾病。
55、如权利要求54所述的方法，其中所述疾病为哮喘、过敏性鼻炎、湿疹、荨麻疹、异位性皮炎或食物过敏。
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