CN1342200A

CN1342200A - 晶体TNF－α－转换酶及其应用

Info

Publication number: CN1342200A
Application number: CN99804893.3A
Authority: CN
Inventors: R·A·布拉克; R·J·帕克斯顿; W·博德; K·马斯科斯; C·菲尔南德兹－卡塔兰; J·M·陈; J·I·莱文
Original assignee: Max Planck Institute For Biochemistry; Immunex Corp; American Home Products Corp
Current assignee: Max Planck Institute For Biochemistry; Wyeth LLC; Immunex Corp
Priority date: 1998-02-04
Filing date: 1999-02-03
Publication date: 2002-03-27
Also published as: JP2004503202A; IL163513A0; NO20003687D0; HUP0101596A1; AR015513A1; AU2574099A; ES2293718T3; DE69936445T2; AR024804A1; DE69936445D1; ATE366303T1; EP1053304A2; EP1053304B1; IL137557A0; CA2319040A1; DK1053304T3; IL163513A; NZ505959A; WO1999040182A2; NO20003687L

Abstract

生产、纯化并结晶了一种肿瘤坏死因子－α转换酶(TACE)。该晶体的三维坐标通过X－射线衍射获得。这些坐标可以记录在一个计算机可读的介质或图象存储器的部分中,在其中它们可以作为系统的一部分来研究TACE。这些坐标也用于设计、筛选、和开发与TACE相缔合的化合物上。

Description

晶体TNF-α-转换酶及其应用

相关申请信息

本申请享有以下申请的优先权：美国临时专利申请流水号60/073,709(1998年2月4日提交)、美国专利申请流水号09/050,083(1998年3月30日提交，其将依据1999年1月27日提交的申请修改为一个美国临时申请)、以及题目为“晶体TNF-α-转换酶及其应用”的美国临时专利申请(1999年1月27日提交)。

发明背景

细胞因子肿瘤坏死因子-α(TNFα)在诱导炎症反应中起作用并已知其对肿瘤细胞具有细胞毒性。然而，当TNFα的产生过量时，其也可以通过最终导致多器官衰竭和死亡而对人体造成严重的损伤。见Bemelmans等，“Tumor Necrosis Factor：Function，Release andClearance，″Crit.Rev.Immun.16：1-11(1996)。

肿瘤坏死因子-α是由活化的细胞产生的，如单核的噬菌细胞、T-细胞、B-细胞、肥大细胞和NK细胞。TNFα以两种形式存在：具有相对分子量为26kD的II型膜蛋白，以及通过蛋白裂解、从膜形式产生的一种可溶的17kD的形式。TNFα膜蛋白是作为一个223个氨基酸的膜锚定前体被合成的。可溶的TNFα是通过一种膜锚定的蛋白酶从膜结合的前体中释放出来的。该蛋白酶最近被鉴定为是一种多结构域的金属蛋白酶，称为TNFα-转换酶(TACE)。见Black等，″Ametalloproteinase disintigrin that releases tumor-necrosisfactor-α from cell，″Nature 385：729-733(1997)，Moss等，″Cloning of a disintigrin metalloproteinase that processesprecursor tumor-necrosis factor-α，″Nature 385733-736(1997)。TACE最近已经被鉴定为是一种锌肽链内切酶，包括一个含有N-末端信号肽的细胞外区域、一个前结构域、一个263个残基的催化结构域(TCD)(在一个弗林蛋白酶裂解位点(211-214位残基)之后)、一个disintegrin结构域、一个类EGF结构域、和一个类crambin结构域、一段明显跨膜的螺旋和细胞内的C-末端尾部。肿瘤坏死因子-α转换酶(TACE)，包括一段多聚核苷酸序列，被详细描述于已发表的PCT申请编号WO 96/41624中，该专利的全部内容作为参照结合于本说明书中。

如以上所提及的，TNFα的过量产生或无控制的产生造成严重的生理危险。其已经涉及各种有害的生理疾病，如风湿性关节炎、恶病质和内毒素性休克。其也可能会最终导致器官衰竭和死亡。因此，需要有一种方法可以控制或阻断TNFα释放到循环中。由于TACE在TNFα转换中的作用，TACE的抑制、修饰或调节将影响TNFα释放到循环中。金属蛋白酶的抑制剂及其基于结构的设计如Zask等所描述，″Inhibition of Matrix Metalloproteinases：Structure BasedDesign″Current Pharmaceutical Design，2：624-661(1996)。因此，与TACE相缔合的化合物，如抑制剂、受体或调节剂对于保护病人免受与肿瘤坏死因子-α的过量产生或无控制的产生相关的不良影响是有用的。

发明概述

依据本发明的一个方面，提供了一种含有一种晶体多肽的组合物，其中的多肽是TNF-α-转换酶(TNF-α-converting enzyme)多肽。在一个实施例中，TNF-α-转换酶多肽包括TNF-α-转换酶催化结构域。在另一个实施例中，TNF-α-转换酶多肽是一段编码TNF-α-转换酶的前及催化结构域的多聚核苷酸的表达产物。在又一个实施例中，TNF-α-转换酶多肽是一段编码TNF-α-转换酶1-477位氨基酸残基的多聚核苷酸的表达产物。在又一个实施例中，该多聚核苷酸被替换，使得266位上的氨基酸残基Ser被变为Ala，542位上的氨基酸残基Asn被变为Gln，其中编码序列Gly-Ser-(His)6的另一段多聚核苷酸被融合于其C-末端。

依据本发明的另一个方面，上述的该组合物进一步包括一个适合与TNF-α-转换酶多肽共晶体结合伴侣(binding partner)。在一个实施例中，该结合伴侣是一种基于羟肟酸盐(hydroxamate)的结合伴侣。在另一个实施例中，该结合伴侣是N-{D，L-2-(羟基氨基羰基)甲基-4-甲基戊酰}-L-3-氨基-2-二甲基丁酰-L-丙氨酸，2-(氨基)乙基酰胺。

依据本发明的又一个方面，上述的该组合物(composition)具有衍射能力达到2.0的晶体结构，该晶体是单斜晶系的，其单位晶胞中包含四个晶体学上独立的TNF-α-转换酶催化结构域，这些TCD分子位于一个不对称单位中，和(或)属于单斜晶系的P21空间群，其晶胞参数为a＝61.38、b＝126.27、c＝81.27、β＝107.41°。

在本发明的又一个方面，上述的多肽是依据表1中的结构坐标或其实质性部分进行定性的。

依据本发明的进一个方面，提供了一种用于结晶TNF-α-转换酶多肽的方法，包括(A)将一种含有一种TACE多肽和一种结合伴侣的溶液与一种结晶缓冲液混合；以及(B)通过悬滴气相扩散法结晶步骤(A)中的混合物，以形成一种结晶沉淀物。在一个实施例中，该方法进一步包括(C)将用悬滴气相扩散法形成的结晶沉淀物中的晶种和一种结晶启动因子转移到一种浓缩溶液的混合物中，该混合物含有一种TACE多肽和结合伴侣底物，以及一种结晶缓冲液；以及(D)通过悬滴气相扩散法结晶步骤(C)中的混合物以形成晶体。在另一个实施例中，结晶缓冲液是0.1M柠檬酸钠，pH5.4，20％w/v PEG 4000，以及20％v/v异丙醇。在又一个实施例中，该结合伴侣是N-{D，L-2-(羟基氨基羰基)甲基-4-甲基戊酰}-L-3-氨基-2-二甲基丁酰-L-丙氨酸，2-(氨基)乙基酰胺。在又一个实施例中，结晶是在温度范围为4到20摄氏度下进行。在另一个实施例中，含有TACE多肽和抑制剂的溶液在缓冲液中的浓度为约5mg/ml到约12mg/ml。在进一个实施例中，将含有TACE多肽和结合伴侣的溶液与结晶缓冲液以1∶1的比例混合。

依据本发明的又一个方面，提供了一种肿瘤坏死因子(TNF-α)-转换酶的晶体，其是由一种TNF-α-转换酶多肽和一种共结晶底物通过共结晶得到的。

依据本发明的又一个方面，提供了一种在其上已经记录了TNF-α转换酶的催化结构域或其部分区域的X-射线晶体学坐标数据的计算机可读的介质。在一个实施例中，该计算机可读的介质已经在其上记录了表1中所列出或其中一部分的X-射线晶体学坐标数据。在另一个实施例中，该介质是选自以下群体：包括软盘、硬盘、计算机磁带、RAM、ROM、CD、DVD、磁盘、和光盘。在又一个实施例中，该计算机可读的介质已经在其上记录了机器可读的数据，其中的计算机可读的介质，当与汇编有数据使用程序的机器结合使用，可以产生描述TNF-α转换酶多肽或其部分的图象三维表示的影像信号。

依据本发明的进一个方面，提供了一种研究TNF-α转换酶多肽的系统，上述系统包括(a)一个可以储存代表TNF-α转换酶多肽的至少一部分的信息的存储器，其中上述存储器含有至少一个I型存储区域(包括指定三维空间定位的一套空间坐标)，和至少一个II型存储区域(包括描绘多个氨基酸中一个的特征的信息)，上述II型存储区域在上述存储器中与上述I型存储区域在逻辑上相关，以描绘上述TNF-α转换酶肽的上述至少一部分的至少一个特性在上述三维空间中的几何排布；(b)与上述存储器配合的处理器，以对上述I型存储区域和上述II型存储区域进行存取，其中的处理器产生描述视觉影像的影像信号，该视觉影像代表了基于从上述存储器中获得的数据的上述TNF-α转换酶多肽的上述至少一部分的上述至少一个特征在上述三维空间中的三维影像；以及(c)与上述处理器配合以接收上述影像信号的显示器，其中该显示器描述了基于上述影像信号的上述TNF-α-转换酶多肽的上述至少一部分的上述至少一个特性在上述三维空间中的视觉三维影像。在本发明的一个实施例中，该影像信号包括描述上述TNF-α-转换酶多肽的上述至少一部分在上述三维空间中的飘带结构视觉三维影像的信号。在本发明的又一个实施例中，该影像信号包括描绘上述TNF-α转换酶多肽的上述至少一部分在上述三维空间中的实体模型表示的视觉影像的信号。在本发明的又另一个实施例中，该影像信号包括描述上述TNF-α转换酶多肽的上述至少一部分在上述三维空间中的静电表面电位的视觉三维影像的信号。在本发明的又另一个实施例中，该影像信号包括描述上述TNF-α转换酶多肽的上述至少一部分在上述三维空间中的视觉三维立体图象的信号。在本发明的进一个实施例中，该系统进一步包括一个存储设备，可以储存描绘除了上述TNF-α转换酶多肽以外的组合物的特性的几何排布的数据；和一个用来接收来自操作员的指令的操作界面；其中上述处理器与上述存储设备和上述操作界面配合，以便根据来自操作员界面的命令产生与上述TNF-α转换酶多肽的上述至少一部分的上述至少一个特性的在上述显示器上的上述视觉三维影像相关的、描述上述组合物的上述特性的上述几何排布的附加的影像信号。在一个实施例中，该存储设备是上述存储器的一部分。在另一个实施例中，该系统包括多个I型和II型存储区域。

依据本发明的另一个方面，提供了一种可以储存产生TNF-α转换酶多肽的至少一部分的视觉显示的信息的图象存储器，上述图象存储器包括(a)至少一个I型存储区域，每个上述I型存储区域包括指定三维空间定位的一套空间坐标；以及(b)至少一个II型存储区域，每个上述II型存储区域含有视觉性描述多个氨基酸中的其中之一的特性的信息；其中上述II型存储区域在上述图象存储器中与上述I型存储区域在逻辑上相关，以描绘上述TNF-α转换酶多肽的上述至少一部分的至少一个特性在上述三维空间中的几何排布。在一个实施例中，该II型存储区域在上述图象存储器中与上述I型存储区域在逻辑上相关，以描绘上述TNF-α转换酶多肽的一个催化结构域部分的至少一个特性在上述三维空间中的几何排布。在另一个实施例中，该I型存储区域和上述II型存储区域是半导体存储器的区域。在又一个实施例中，该I型存储区域和上述II型存储区域是光盘的区域。在又一个实施例中，该I型存储区域与上述II型存储区域是磁性存储器的区域。在进一个实施例中，该图象存储器包括多个I型和II型存储区域。

在本发明的又一个实施例中，提供了一种鉴定与TNF-α-转换酶相缔合的化合物的方法，包括(A)基于TNF-α-转换酶多肽晶体的X-射线衍射坐标为上述多肽设计一种与之缔合的化合物，与该TNF-α-转换酶的催化结构域形成一个键；(B)合成上述化合物；以及(C)确定上述化合物与上述TNF-α-转换酶的缔合能力。在一个实施例中，该与之缔合的化合物是一种抑制剂、介质或其它调节TNF-α-转换酶活性的化合物。在另一个实施例中，该与之缔合的化合物是一种竞争性抑制剂、反竞争性抑制剂、或非竞争性抑制剂。在又一个实施例中，该坐标是表1中的坐标或其重要的部分。在进一个实施例中，该TNF-α-转换酶多肽晶体包括该TNF-α-转换酶的催化结构域。在另一个实施例中，该TNF-α-转换酶多肽是一段编码TNF-α-转换酶的前和催化结构域的多聚核苷酸的表达产物。在另一个实施例中，该TNF-α-转换酶多肽是一段编码TNF-α-转换酶的1-477位氨基酸残基的多聚核苷酸的表达产物。在另一个实施例中，该多聚核苷酸被替换，使得氨基酸残基Ser266被变为Ala，氨基酸残基Asn542被变为Gln，其中编码序列Gly-Ser-(His)6的另一段多聚核苷酸被融合于其C-末端。在进一个实施例中，该TNF-α-转换酶多肽晶体与一种结合伴侣共结晶。在又一个实施例中，该结合伴侣是基于氧肟酸盐的结合伴侣或N-{D，L-2-(羟基氨基羰基)甲基-4-甲基戊醇}-L-3-氨基-2-二甲基丁醇-L-丙氨酸，2-(氨基)乙基酰胺。在又一个实施例中，该TNF-α-转换酶多肽晶体具有衍射能力达到2.0的晶体结构，该晶体是单斜晶系，其单位晶胞包含四个晶体学上独立的TNF-α-转换酶催化结构域(TCD)分子，这些TCD分子位于一个不对称单位中，和(或)属于的单斜晶系的P2₁空间群，其晶胞参数为a＝61.38、b＝126.27、c＝81.27、β＝107.41°。在又一个实施例中，设计本发明中的与之缔合的化合物与TNF-α-转换酶的S1’区域缔合。在又一个实施例中，设计该与之缔合的化合物与TNF-α-转换酶的S1’S3’口袋缔合。在本发明的又一个实施例中，设计该与之缔合的化合物以(i)结合螯合锌的一个部分，(ii)与TNF-α-转换酶上的亮氨酸348或甘氨酸349形成一个氢键，(iii)引入一个非极性基团，其占据了TNF-α-转换酶的S1’口袋，(iv)引入一个基团，其位于连接TNF-α-转换酶的S1’-S3’口袋的通道内，其与该通道形成适当的范德华力，和(或)(v)与在TNF-α-转换酶的主链酰胺基团上的亮氨酸348或甘氨酸349形成氢键。

鉴于此处所包含的指导，本发明中的这些和其它方面对于熟练的技工将是明显的。

附图的简要描述

图1：图1是TACE催化结构域(TCD)的飘带图。该链起始于较低的左端背侧，穿过结构元素sI、hAI、hA、sII、hB、hB2、sIII、IV、IVa、sIVb、sV、hC、甲硫氨酸拐角(Met-turn)和hD，结束在较高的左端背侧。三个二硫键以连接表示，硫以小球的形式表示。催化性锌(中心的球)由His405、His409和His415的三个咪唑、以及抑制剂羟肟酸基团的氢氧根和羰基上的氧原子配位。模拟与肽底物的抗原接触位点残基相互作用的抑制剂被完整地示出。图1是用SETOR制作的。见Evans，S.″SETOR：Hardware Lighted Three-Dimensional SolidModel Representations of Macromolecules″J. Mol.Graph.11：134-138(1993)。

图2a和2b：图2a和2b是TACE催化结构域(TCD)(图2a)和MMP-3(图2b)的固体表面表示图。静电表面电位从-15(深红)到15(深蓝)k₈T/e描出等位线。两个活性位点裂缝均从左延续到右，催化锌原子(球)在中心。在TACE中，显示出结合的抑制剂的完整结构，其异丁基(P1’)和其Ala(P3’)侧链结合到深的S1’和新颖的S3’口袋内。其定向类似于图1。图2a和2b是用GRASP制作的。Nicolls，A.，Bharadwaj，R.和Houig，B.，″Grasp-Graphical representation and analysis ofsurface properties.″Biophys.64.A166(1993)。

图3：图3分别根据adamalysin II(ADAM_CROAD)、TACE以及人ADAM10(hADAM10)的拓扑学等同性和序列相似性，把它们的催化结构域序列进行对齐。残基是用TACE的一般编号方法进行编号的。箭头和竖杠代表TACE中的β-链和α-螺旋。

图4：图4是在催化性锌(中间的大圆球)周围的最终的2.0电子密度图与最终的TACE模型叠合的一个立体剖面图。可以看见His405(顶部)、His409(左边)和His415(底部)的三个锌配位咪唑环、“催化性”Glu406、以及抑制剂的氧肟酸部分。该图的定向与图1类似。图4是用TURBO-FRODO制作的。见Roussel，A.& Cambilleau，C.，″Turbo-Frodo in Silicon Graphics Geometry，″Partners Directory，Silicon Graphics，Mountain View，CA(1989)。

图5：图5是TACE(亮)和adamalysin(暗)催化结构域的飘带图的叠合。同时显示的还有TACE的催化锌(球)和三个(TACE)及两个(adamalysin)二硫键。该图的定向与图1类似。图5是用GRASP制作的。

图6：图6图解了一个研究TNF-α转换酶的系统，包括一个储存用以产生TNF-α转换酶的至少一个部分的视觉显示的信息的影像存储器。

发明详述

本发明涉及一种高度纯化的肿瘤坏死因子-α转换酶(TACE)多肽、一种生产和纯化TACE多肽的方法、一种结晶TACE多肽的方法、以及TACE的晶体。本发明进一步涉及使用TACE多肽晶体进行X-射线衍射的方法，和一种获得TACE多肽的X-射线晶体学结构坐标的方法以及结构坐标本身。又进一步，本发明涉及使用TACE多肽的结构坐标来说明TACE多肽的三维结构以及设计和开发与TACE相缔合的化合物。对本发明中所提供的三维结构和结构坐标的认识使得熟练人员可以制造将与TACE相互作用的化合物。这种相互作用的化合物可以通过许多技术和设计标准来制得，包括在Protein Engineering(Oxender和Fox编辑)(Alan R.Liss，Inc.1987)中所公布的。

如此处所用到的，TACE是指一组可以将26kD的细胞膜结合形式的TNFα转化为包括TNFα蛋白的C-末端的156个残基的可溶的17kD形式的多肽。TACE包括具有PCT申请编号WO 96/41624(该文的全部内容作为参照结合在本说明书中)中所描述的氨基酸序列的蛋白，以及在氨基酸水平上与这类序列的同源性优选的不少于50％，更优选的至少为80％，更优选的为90％的任何一种蛋白质。另外，TACE进一步指PCT申请编号WO 96/41624中所公布的核苷序列的表达产物。TACE进一步包括膜结合蛋白和可溶的或截短的蛋白，其包括该蛋白的细胞外的部分并保留生物活性，而且可以被分泌。这些蛋白的例子如PCT申请编号WO 96/41624中所描述。

TACE氨基酸序列，或其部分或残基，见Black等，″AMetalloproteinase disintigrin that releases tumour-necrosisfactors from cells，″Nature 385：729-733(1997年2月)，该文的全部内容作为参照结合于本说明书中。在TACE氨基酸序列上的变体同样包括在本发明范围之内。包含在此处的所有TACE氨基酸序列参照的是Black等，上述文献中的序列。

如此处所用的，TACE催化结构域(TCD)是指介于残基215和477之间的一段TACE多肽部分，其包括前导的弗林蛋白酶裂解位点(残基211-214)，或者是其任何可以裂解肽PLAQAVRSSS的部分。

TACE多肽的表达、分离和纯化

肿瘤坏死因子-α转换酶(TACE)在已发表的PCT申请编号WO96/41624上已被描述。该申请描述了编码TACE或部分TACE的分离出来的核苷酸、含有一段编码TACE或其部分的cDNA的表达载体、以及被含有编码TACE或TACE的部分的cDNA的表达载体转化或转染的宿主细胞。该申请进一步描述了生产TACE和其部分的过程，例如，通过培养设计用来表达TACE的被转染的细胞，接着纯化重组产生的TACE或其部分。分离、表达和纯化TACE多肽的方法在已发表的PCT专利编号WO96/41624中有详细描述。PCT 96/41624的全部作为参照结合于本说明书中。

依据本发明，编码TACE的信号肽、前和催化结构域(即氨基酸残基1-477)的cDNA被插入到一个合适的表达载体上并在合适的细胞系中表达。该cDNA也可能包括其它有助于表达或者达到不偏离本发明的本质的其它目标的区域，如侧翼区域。

编码TACE多肽或其功能部分(如TCD)的cDNA可以通过添加、替换、删除、或插入来进行改变。这些改变可以用来，例如，防止糖基化作用、防止不正确或不希望的二硫键的形成、和(或)提高表达。这些改变的例子如WO 96/41624中所描述，并可以通过其中所描述的方法和其它传统的方法进行。TACE也可能被缀合。这些缀合化合物可能包括被加入以有利于纯化和(或)鉴定的肽。这些肽包括，例如，聚组氨酸肽。缀合作用的描述于美国专利编号5,011,912和Hopp等，Bio/Technology 6：1204(1988)中。

在本发明的一个实施例中，该cDNA编码一种TNF-α-转换酶多肽，其包括TACE的信号肽、前和催化结构域(TCD)，残基1-477，其中Ser266被改变为Ala，Asn452被改变为Gln。这些替换对于防止N-连接的糖基化作用是有用的。另外，序列Gly-Ser(His)6可以被加到C-末端。序列Gly-Ser(His)6的加入有助于使用金属螯合的亲和树脂(如Ni-NTA树脂)对该多肽进行纯化。

含有编码TACE或其部分的核苷序列的重组表达载体可以使用熟知的方法进行制备。适合用于表达TACE多肽的宿主细胞包括原核细胞、酵母细胞、和较高等的真核细胞。适用于本发明的载体和宿主细胞的描述在WO 96/41624中。可以被用于表达本发明中的重组体TACE的合适的表达系统的进一步例子包括哺乳动物或昆虫的宿主细胞培养表达系统，其包括昆虫细胞中的杆状病毒系统(见Luckow和Summers，Bio/Technology 6：47(1988))和哺乳动物细胞系如COS-7细胞(Gluzman等，Cell 23：175(1981))。附加的实施例在本工艺中是已知，包括WO 96/41624中所描述的。在本发明的一个实施例中，TACE多肽在CHO细胞中表达。在该实施例中，该细胞分泌以缬氨酸212和精氨酸215为起始的TACE多肽的混合物。

在一个实施例中，稳定表达的细胞可以通过在一种药物中培养细胞来选择，该药物杀死不与载体结合的细胞。合适选择方法的例子描述于，例如，Kaufman，R.J.，“Selection and coamplification ofheterologous genes in mammalian cells，”Methods in Enzymology，185：537-566(1990)。

所表达的TACE多肽的纯化可以通过任何合适的方法进行，如WO96/41624中所描述的方法。依据本发明的一个方面，优选的是获得一种适于晶体TACE多肽。在获得适于晶体TACE多肽时，重要的是纯化TACE多肽的步骤要是以获得纯度足以适当进行晶体多肽。

一种优选的纯化方法起始于来自TACE分泌细胞的培养物的适量的培养基。该培养基通常是培养物的上清液。该培养基含有将被纯化的TACE多肽。优选的，TACE多肽是用一编码TACE多肽的DNA通过重组方法产生的，其中上述的DNA序列被改变以编码有利于纯化的一个或多个缀合化合物。例如，编码Gly-Ser-(His)6的序列可以被加到C-末端以有利于使用金属螯合树脂进行纯化。

该培养基通过如透滤法进行浓缩。合适的透滤单元包括一个Millipore 10K截流，1 ft² TFF透滤单元。然后将一种合适的缓冲溶液加入到浓缩过的培养基中。可以使用任何合适的缓冲液。一种这样合适的缓冲液含有20mM Tris(pH7.5)和300mM NaCl。

将样品多次重新浓缩和稀释。例如，可以将该样品重新浓缩并用缓冲液第二次稀释，再重新浓缩，用缓冲液稀释第三次，再最后一次重新浓缩。在透滤单元中滞留下来的样品通过合适的方法回收，如通过回冲(back-flush)法。然后可以将被回收的材料通过一个合适的膜过滤。合适的膜包括，例如，0.45或0.22微米孔径大小的膜。然后加入叠氮化物。将过滤后的样品储存在低温，如约2-9℃下过夜。在隔夜储存之后，将来自水贮存液的咪唑和来自水贮存液的ZnCl₂加入到被过滤的样品中。然后将样品通过一个合适的柱子抽吸。一种合适的柱子，尤其当TACE多肽与序列Gly-Ser-(His)6缀合时，是一种金属螯合树脂，如Ni-NTA树脂。

将柱子用一种缓冲液冲洗，该缓冲液含有如20mM Tris pH7.5，300mM NaCl，5mM咪唑和5μM ZnCl₂。然后将该TACE多肽用逐渐升高梯度的咪唑进行洗脱。在含有甘油水溶液Tris pH8的小管中收集各部分。优选的，甘油溶液在过柱的当天配制。

将每个部分的试样点在被胺黑染色的薄膜上以确定哪个部分含有明显量的蛋白。可选地，也可以取用每个部分的少量的试样，如5μl，用于使用考马斯染色的凝胶分析。汇聚含有明显量蛋白的部分，然后浓缩汇聚液，如，用一个透滤单元来进行。

在一些情况下，可能会发生多肽的聚集。为了消除聚集并进一步有利于纯化，可以加入一种TACE的抑制剂，如一种基于羟肟酸盐的抑制剂，可向浓缩的样品中加入水溶贮存液，以及加入辛基糖苷(商业上可供，来自Boehringer Mannheim)的水溶贮存液。然后将样品在室温下保温15-24小时。

保温之后，将样品上样于大小排阻柱上。该柱首先用一种合适的缓冲液，如10mM Tris pH7.5、100mM NaCl、10％甘油的缓冲进行平衡。合适的大小排阻柱包括，如，LKB 2135-365(用TSK-G3000SWG填充)或其类似柱，如Superdex-20。然后将缓冲液抽吸通过该柱。高度纯化的TACE多肽可通过在280nm的吸收来检测。

对所有具明显蛋白量的部分进行凝胶分析，以确定哪一部分需要被汇聚。大小排阻层析的汇聚液使用，如透滤单元，进行浓缩。

然后可以在经过纯化的样品中加入一种结合伴侣，如一种抑制剂。该结合伴侣对于稳定TACE多肽尤其有用。该结合伴侣可以是任何合适的化合物。合适的结合伴侣包括，如基于羟肟酸盐的抑制剂。一种合适的抑制剂是N-{D，L-2(羟基氨基羰基)甲基-4-甲基戊酰}-L-3-氨基-2-二甲基丁酰-L-丙氨酸，2-(氨基)乙基酰胺。该抑制剂，以及其它抑制剂，在美国专利编号5,594,106(Black等)中有描述，该文的全部内容作为参照结合于本说明书中。

该蛋白复合物可以在低温，如在约4℃下贮存。

TACE晶体以及TACE多肽的结晶方法

本发明的一个方面涉及TACE多肽的结晶方法。一种优选的方法包括将TACE多肽与一种以上所描述的结合伴侣共结晶。获得TACE多肽的示范性的方法、以及该多肽的纯化如以上所描述。

晶体可以通过任何合适的方法，包括悬滴气相扩散法、批量法、液体连接桥法、和透析法，并在任何合适的条件下进行生长或形成。通过悬滴气相扩散法结晶常常是优选的。另外，本工艺的熟练人员将认识到结晶条件是可以改变的。结晶多肽的各种方法在本工艺上通常是已知的。见，例如，WO 95/35367、WO 97/15588、EP 646 599 A2、GB 2 306 961 A、和WO 97/08300。

在本发明的一个实施例中，一种含有TACE的残基1-477(其Ser266变为Ala、Asn452变为Gln、并将序列Gly-Ser-(His)₆加于其C末端)的DNA构建物，可以在CHO细胞中表达。这些细胞主要分泌加工过的TACE混合物，其中大约一半从缬氨酸212起始，一半从精氨酸215起始。将混合物用如以上所描述的方法进行纯化。纯化过的TACE多肽，和加入的结合伴侣一起，如以上所描述贮存在缓冲液中。

将该TACE多肽和结合伴侣共结晶。TACE/结合伴侣溶液溶解在以上所描述的TACE缓冲液中，其中多肽的浓度大约为5mg/ml至约12mg/ml与一种合适的结晶缓冲液混合并适用一种合适的结晶技术，如悬滴气相扩散法进行结晶。合适的结晶缓冲液，如，包括：0.1M醋酸钠pH5.3、0.2M CaCl₂、30％v/v乙醇；0.1M柠檬酸钠pH5.0、40％v/v乙醇；0.1M柠檬酸钠pH8.7、20％w/v PEG 4000、20％v/v异丙醇；以及0.1M柠檬酸钠pH5.4、20％w/v PEG 4000、20％v/v异丙醇。样品在温度范围为约4到20摄氏度下保温。形成了一种结晶沉淀物。

获得的结晶沉淀物中的晶种，当作完整晶体或破碎的晶体的悬浊液形式，与一种合适的结晶启动因子(如兔毛)一起，被转移到在一种结晶缓冲液中的浓缩的TACE/底物溶液中。形成了适于X-射线数据收集的晶体。

本发明的另一个方面涉及一种TACE多肽晶体。一种这样的晶体包括与一种抑制剂共晶体一种TNF-α转换酶催化结构域(TCD)多肽。该晶体衍射能力达到约2，属于单斜晶系P2₁空间群。该晶体的单位晶胞含有四个晶体学上独立的TCD分子。这些TCD分子位于一个不对称单位中且没有聚集成独立的四聚物，但是它们整合成了无限的周期结构。该晶体的晶胞参数为：a＝61.38(埃)、b＝126.27、C＝81.27，β＝107.41°。

X-射线衍射

本发明的另一个方面涉及TACE的结构，尤其是TACE催化结构域(TCD)的结构。TACE的结构可以通过利用以上所描述的含有TACE多肽的晶体进行确定。依据本发明，TACE，尤其是TCD的结构，是利用X-射线晶体学进行确定的。任何获得多肽的三维结构坐标的合适的X-射线衍射的方法均可以使用。该三维结构坐标，或其任何体现TACE多肽中感兴趣片段特征的部分(如TACE催化结构域或其可以裂解肽PLAQAVRSSS的部分)，均可如本文中所描述的进行使用。

使用TACE X-射线衍射坐标的方法

本发明也涉及结构坐标的使用，这些坐标是从以上所描述的对TACE催化结构域的X-射线研究中获得的。这些坐标的利用可以通过直接分析、借助于计算机、或者通过它们的组合，来确定TACE催化结构域的结构，包括二级和三级结构。该TACE催化结构域的结构坐标也可以被用于开发、设计、和(或)筛选与TACE缔合的化合物。如此处所用到的，“与之缔合”是指该化合物可以通过离子键或共价键或相互作用，通过氢键、范德华力相互作用、盐桥、静电相互作用、亲水相互作用和疏水相互作用与TACE结合。此外，术语“与之缔合”包括与TACE的催化结构域的任何部分的缔合。例如，与TACE缔合的化合物可以是充当竞争性抑制剂、以及反竞争性抑制剂、和非竞争性抑制剂的化合物。与TACE缔合的化合物也可以是充当介质或其它调控化合物的化合物。与TACE缔合的化合物也可以是在底物与TACE的化学反应中异构化为短期存在的反应中间物的化合物。特别地，被设计用以与TACE缔合的化合物可以在治疗上被用作抑制剂、介质和其它调控化合物。

X-射线坐标在结构确定、分子设计以及选择及合成与其它多肽缔合的化合物中的应用在本工艺中是已知的。已发表的PCT申请WO95/35367描述了使用X-射线结构坐标以设计、评估、合成和使用与酶的活性位点相缔合的化合物。英国专利申请2306961A描述了X-射线坐标在合理的药物设计上的用途。已发表的PCT申请WO 97/15588描述了利用X-射线衍射图样来进行多肽的结构确定，以及使用坐标和三维结构来发现与感兴趣的多肽相缔合的化合物。然而，本发明首次使得可以TACE多肽的X-射线坐标可用于与TACE相缔合的化合物的结构确定、分子设计、以及挑选和合成。

在本发明的一个方面，通过前述的方法获得的结构坐标可以显示为，或转换成，一种图形表示，包括三维形态的表示。这可以通过使用商业上可供的计算机程序来达到，这些程序可以从一套结构坐标中产生分子或其部分的图形表示。可以从一套结构坐标中产生分子或其部分的图形表示的计算机程序的例子描述于已发表的PCT申请WO97/08300中，该文的全部内容作为参照结合于本说明书中。

在本发明的另一个方面，该结构坐标和结构与其它类似的分子(如其它金属蛋白酶)相比较或与其叠合。例如，TACE的结构坐标和结构可以与蛇毒金属蛋白酶(如，例如adamalysin II)的结构坐标或结构相比较或与其叠合。TACE的结构坐标和结构也可以与基质金属蛋白酶(如ADAM10，包括人ADAM10)的结构坐标或结构相比或与其叠合。TACE和其它其图形结构或三维结构坐标是可供的分子之间的比较可以通过借助于可供的应用软件，如QUANTA的the MolecularSimilarity程序(Molecular Simulations，Inc.，Waltham，MA)来进行。

对与TACE相缔合的化合物也可以通过对一些化学实体或片段与TACE(尤其是TACE催化结构域)缔合的能力进行筛选和选择来进行电脑评估和设计。可以使用几种方法来完成本发明的这一方面。在一个实施例中，基于此处所描述的结构坐标，人们可以在视觉上考察计算机产生的TACE、尤其是其催化结构域的模型。然后可以将计算机产生的化学实体或特定化学部分的模型定位在催化结构域内或周围，并根据能量最低原理和分子动力学进行评估，使用，例如可供的程序，如CHARMM或AMBER。化学实体或片段的定位可以用对接软件如Quanta和Sybyl来完成。另外，可以使用已知的和商业上可供的计算机程序来选择化学实体或片段。一旦合适的化学实体或片段被选定，它们可以被组合成单个的化合物，如一个抑制剂、介质、或其它调控化合物。已知的和商业上可供的模型构件软件可以辅助组装。

在本发明的一个方面，与TACE尤其是TACE催化结构域相缔合的化合物可以作为一个整体进行设计，而不是通过用特定化学部分或化学实体组装。该实施例可以用计算机程序如LUDI(BiosymTechnologies，San Diego，CA)、LEGEND(Molecular Simulations，Burlington，MA)、和Leap Frog(Tripos Associates，St.Louis，MO)来进行。

在一个实施例中，一种候选化合物是根据其与TACE与该候选之间相互作用的理想位点，以及根据以前所鉴定出来的相互作用的位点来选择。一旦确定了特定的候选化合物-TACE的相互作用，使用商业上可供的对接软件即可进行对接的研究，以提供所挑选出来的候选化合物和TACE的初步“定出模型”的复合物。

使用如分子动力学(MD)来进行限定性构象分析以检查已定出模型的TACE-抑制剂复合物的完整性。一旦该复合物达到了其最理想的构象状态，则对其由MD研究提出的结构进行视觉分析以确保该定模的复合物根据所测定的结合亲和力、遵从已知的实验性SAR/QSAR(结构活性关系/定量的结构活性关系)。

依据本发明，也可以使用其它的模型构建技术。这些技术的例子公开了Cohen等，“Molecular Modeling Software and Methods forMedicinal Chemistry，”J.Med.Chem.，33：883-894(1990)和Navia等，“The Use of Structural Information in Drug Design，”Current Opinions in Structural Biology，2：202-210(1992)，该文的全部内容作为参照结合于本说明书中。

可以用许多本工艺中公知的方法来对被开发和设计用以与TACE相缔合的化合物进行优化，或者对其缔合效率进行测定。例如，变形能量和静电相互作用可以被测定和优化。可以使用已知的和商业上可供的软件和硬件系统。这种软件的例子公开于WO 95/07619中。对于药物设计技术熟练的人员也可以进行基于结构重复进行类似物的分析，以优化抑制剂的效力、选择性和物质的类似药物的性质。

也可以对已选择或设计的化合物进行替换。这些替换可以用来提高或修饰该化合物的缔合性质。这些修饰可以，如，在化合物的侧基或特定原子上进行。通常，应该从保守的替换开始，使其具有与原来的基团或原子大约相同的大小、形状、电荷和其它的特性。对被替换的化合物应如上所述进行进一步的分析和优化。

在本发明的进一个方面，在实际合成和测试此类化合物之前，可以使用如商业上可供的计算机软件，对该化合物的潜在的抑制性、介导性、调控性、或其它的结合作用进行分析和评估。这样可以估计合成和检验无活性的化合物的可能性。

抑制的测定步骤通常在本工艺中是已知的并已被公布于，如，PCT96141624中。这种方法包括基于与肽底物反应的测定。

TACE催化结构域的结构

下面参照附图进一步描述TCD的物理特性，这些特性是根据用上述的方法获得的X-射线衍射数据确定的，同时也描述其在构建TCD的分子模型中的作用。

图1中所描述的结构域的形状为扁平的椭圆形，在其平坦的一侧具有凹口以形成一个相对小的活性位点裂缝，将小的“较低”子域从“较高”的分子主体中分隔开来(图2a)。TCD多肽链起始于分子表面(在较低处的背侧，图1)，它在天冬氨酸217和甲硫氨酸221之间的链表现良好(见图3)。分子的中心是五股的β-折叠片层，其β-链的排列顺序为(从后到前，见图1)sII、sI、sIII、sV和sIV(见图3)，其中sIV，即“边缘的”链，与其它链反向平行伸展。该β-片层的侧翼被位于其凸面的两个α-螺旋(hB和hB2)和位于其凹面的两个螺旋(hA和hC)高度缠绕地包围。β-链sI和sII通过一个短的α-螺旋hA1和长的α-螺旋hA(位于背侧的倾斜伸展的螺旋，图1)连接。β-链sII和sIII通过大的“多回折环”、长的“中间”α-螺旋hB和邻近的短的α-螺旋hB2连接，它们均排列在β-片层的“顶部”，因此将其中央的部分完全与大体积的水分隔开来(图1)。多回折的环在两个位点突出以分别形成一个“马刺状的”和一个酸性较强的突起(在图2a中分子的顶部可见)。sIII-sIV的连接子在其进入边缘链sIV之前，以一个小的“泡状突起”结束。sIV-sV的连接片段被切成两个大的“耳状”的定位于表面的环，第一个依偎在分子主体的旁边(形成“蓝色”的表面、中心裂缝，在图2a)，以及一个伸出分子表面的长的β-发夹环(sIIa-sIIb)(图1和2中的顶端裂缝)。一个泡状突出的环将“活性位点螺旋”hC与sV连接，hC位于分子的中央并突然终止在严格保守的甘氨酸412上，链在该处下弯以形成较低的子域。

包括最后的61个TCD残基(图3)的C-末端链首先形成由两个“狭窄的”超扭转的环连接的三个短、直、几乎垂直排列的片段，由紧密的“甲硫氨酸回折”Tyr433-Val434-Met435-Tyr436回折到表面，在该处它在脯氨酸437弯曲以形成S1’裂缝的Pro437-Ile438-Ala439外“壁”，到达并穿过一个宽的环C-末端α-螺旋hD，在接近N-末端的分子“背部”表面结束，其最后被确定的残基Arg473-Ser474通过氢键与分子主体结合。经过Cys423-Cys453，两个“狭窄”环的前一个与螺旋hD的N-末端以二硫键连接，hD的C-末端的结尾则通过Cys365-Cys469与“耳状的”sIV-sV连接肽夹紧。在空间上邻近的、TCD的第三个二硫键，Cys225-Cys333，连接β-链sI和sIII的N-末端部分。在完整的TACE分子中，Ser474下游的四个残基将留住半胱氨酸478，其已经是紧密延长的disintegrin结构域的构成整体所必需的部分(Saudek等，“Three-dimensional structure of echistatin，thesmallest active RGD protein”Biochem.30.7369-7372(1991))。考虑到Ser474和这一Cys478分别是其结构域的支点，其三个残基的连接子将允许disintigrin结构域以相对没有限制的形式对接到催化结构域的“左侧”表面上。

TACE的活性位点裂缝(图2a)在左手侧(不接触抗原non-primed)相对平坦，但向右趋于形成凹口。位于其中心的催化锌由His405、His409和His415(由活性位点螺旋和随后的含有保守的锌结合共有基序HEXXHXXGXXH的“递减”链提供)的三个咪唑N∈2原子、以及由抑制剂的异羟肟酸部分的羰基和氢氧根上的氧(见图1、2a和4)五-配位(coordinated)。这一锌-咪唑的组合是基于严格保守的Met435的远端∈-甲基-硫部分，停靠在metzincin的甲硫氨酸回折的特征中(Bode等，“Astacins，serralysins，snake venom and matrixmetalloproteinases exhibit identical zinc bindingenvironments(HEXXHXXGXXH and Met-turn)and topologies andshould be grouped into a common family，the’metzincins’”FEBSLett.331，134-140(1993)；Stcker等，“The metzincins：Topological and sequential relations between the astacins，adamalysins，serralysins，and matrixins(collagenases)define a superfamily of zinc-peptidases”Protein Sci.4，823-840(1995))。挤在His405的锌配位的咪唑和边缘链之间的“催化的”Glu406(其在催化时作为一个普遍的碱基起作用(Grams等，“X-ray structures of human neutrophil collagenase complexedwith peptide hydroxamate and peptide thiol inhibitors：Implications for substrate binding and rational drug design”Eur.J.Biochem.228，830-841(1995)))上的两个羰基氧，与异肟酸的氢氧根和N-H基团均形成氢键连接(见图4)。在催化锌的右侧打开了一个深的S1’口袋，其除了S1’的壁形成片段(底部，图1和2a)之外，与His405和Glu406(左侧)的侧链、sIV主链和Leu345侧链(顶部)、以及Val440(背侧)和Ala439(右侧)的侧链邻接。在Ala439的右侧，打开另一个(S3’)口袋，该口袋在分子内部与S1’口袋合并，留下由Ala439和Leu348(图2a)的相对的侧链形成的一个小连接。

抑制剂的(假)肽段部分以一延伸的几何形状与活性位点裂缝的凹口右手侧链连接，模仿了生产性的结合的肽底物与抗原接触的残基之间的相互作用(图2a)。它反向平行伸展到达上部的短突起Gly346-Thr347-Leu348并与S1’的壁形成片段Pro437-Ile438-Ala439平行，分别形成两个和两个链间的链的氢键连接。主要的分子间相互作用是由抑制剂的P1’异丁基(假-亮胺酰)侧链与实质上疏水的S1’口袋形成的，然而，是大的且容纳三个附加的部分有序的溶剂分子。P2’的t-丁基侧链延伸出酶之外，但紧靠着其上由酶的突起形成的疏水遮蓬。P3’的Ala侧链伸入到大的带异种电荷的S3’口袋中，但它太短以至无法形成合适的接触。C-末端的二胺乙烷基基团在四个分子中具有不同的构象。

束缚的前TNFα的P1’到P3’片段Val77-Arg78-Ser79大概以类似的方式结合，可能与其下的裂缝表面匹配得更好；在前的P3到P1残基Ala74-Gln75-Ala76肯定将调整到与边缘链反平行，它们的侧链分别延伸到(部分带电的)S3口袋和(带负电的)狭窄S2凹通道中，并伸出中央裂缝之外。TACE的与抗原接触的亚位点和其周围的分子表面由负电荷支配，然而不与抗原接触的亚位点实质上其本性是疏水的(图2a)。TACE加工前TNFα的特异性可能包括更多的远距离相互作用。含有前TNFα裂解位点的12个残基的底物也可以被一些MMP裂解，虽然特异性和效率较低(Black等，“Relaxed specificity of matrixmetalloproteinases (MMPS)and TIMP intensity of tumornecrosis factor-α(TNF-α)production suggest the major TNF-αconverting enzyme is not an MMP”Biochem.Biophys.Res.Commun.225，400-405(1996))。因此，(可能为三聚的)(Tang等，“Human pro-tumor necrosis factor is a homotrimer”Biochem.35，8216-8225(1996a)；Tang等，″Length of the linking domainof human pro-tumor necrosis factor determines the cleavageprocessing″Biochem.35，8226-8233(1996b))膜结合的前TNFα在体内的优先加工可能部分是由于正确的组装，也就是，合适地将前TNFα裂解片段递呈到明显离开锚定膜的TACE活性位点。一些实验证据(Tang等，Biochem.35，8216-8225(1996a)；Tang等，Biochem.35，8226-8233(1996b))提示该裂解位点可能不是单由裂解序列决定，而是到紧密的圆锥体的基部的距离也起了作用，该圆锥体由三个TNFα分子的相缔合的C-末端的片段形成(Jones等，″Structure oftumor necrosis factor″Nature 338，225-228(1989))。在一个生产性的TACE-前TNFα组合物中，该TNF-α三聚体圆锥体(无序的N-末端进入其中并升高)的碱基可以由TACE催化结构域(图2a)的“右”侧识别，其中大约10个残基长度的间隔有助于连接在TACE的活性位点中的前TNFα的Ala76-Val77易裂解的肽的正确定位。

多肽的拓扑学尤其是催化锌的表面表现形式显示TACE的催化结构域是一种典型的metzincin。(Bode等，“Astacins，serralysins，snake venom and matmrix metalloproteinases exhibit identicalzinc binding environments(HEXXHXXGXXH and Met-mm)andtopologies and should be grouped into a common family，the″metzincins″FEBS lett.331，134-140(1993)；Stcker等，″Themetzincins：Topological and sequential relations between theastacins，adamalysins，serralysins，and matrixins(collagenases)define a superfamily of zinc-peptidases”Protein Sci.4，823-840(1995))。然而，与其它metzincin的叠合显示其拓扑学与蛇毒素金属蛋白酶如adamylysin II(图5)的催化结构域最为相似。(Gomis-Rüth等，″First structure of a snakevenom metalloproteinase：prototype for matrixmetalloproteinases/collagenases″EMBO J.12，4151-4157(1993)；Zhang等，″Structural on of natural and syntheticinhibitors with the venom metalloproteinase，atrolysin C(form d)″Proc.Natl.Acad.Sci.USA 91.8447-8451(1994)；Kumasaka等，″Crystal structure of H2-proteinase fromthe venom Of Trimeresurus flavoviridis″J.Biochem.119，49-57(1996))。这一紧密的同源性由中心片层和大螺旋的更好的同时叠合反映出来，特别地也由一些结构特征表现出来，这些结构特征是TACE与adamalysin独特地共有的，如：长的螺旋hB和排在β-片层顶部的前端多回折环；排布和外型都很典型的C末端螺旋hC，以及位于背侧表面的延伸的C-末端。TACE的263个和adamalysin的201个α-原子中约175个是拓扑学等价的(均方根偏差为1.3，其中39个具有相同的侧链，(图3))。这些数据与从不同的metzincin家族内部成员之间的比较所获得的数据相近(Stcker等，上述文献)。另外，详细的结构特征显示了TACE和adamalysin之间的紧密联系：更保守的核心结构；松散排布的N-末端；参与相同的分子内氢键相互作用中的特征的Asp416(直接跟随在锌结合共有基序之后，图3)；连接第一个狭窄的环和C-末端螺旋hD的邻近的二硫键Cys423-Cys453(这一点TACE与adamalysin II不同，但与来自T.flavoviridis的蛇毒素的H2-蛋白酶相同)(Kumasaka等，上述文献)；二硫键Cys365-Cys469将sIV-sV连接子与C-末端螺旋hD连接起来；一个外型类似的活性位点裂缝，在S1’口袋和其它与抗原接触的亚位点上尤其相似。

TACE的催化结构域(TCD)也与adamalysin II在几个方面不同：TACE具有263个残基，链长得多；TACE的大多数附加的残基聚集成簇以形成更突出的hA-sII回折、形成多回折环的两个表面突起、形成sIV-sV连接子的两个“耳朵”、以及形成更突出的sV-hC连接子(见图3和5)；在TACE中缺少一个钙结合位点但存在第三个二硫键Cys225-Cys333，然而，两个元件均执行同样的功能，即将N-末端链与链的底面夹紧；TACE含有一个相当深的S3’口袋，其与它的S1’口袋融合；在抗原接触的亚位点的内部和周围的带电模式几乎相反，在adamalysin中正电荷完全占优势。

依据其序列，以及可能地根据其三维结构，TACE催化结构域因此不是哺乳动物ADAM(一族膜锚定的细胞表面蛋白，其催化结构域与adamalysin高度同源(Wolfsberg等，″ADAMs in Fertilization andDevelopment″Developm.Biol.180，389-401(1996)))严格意义上的成员之一。TACE可能与(牛)ADAM 10(图3)分担该“门外汉”的角色，(牛)ADAM 10确定还具有一些类似TACE的活性(Lunn等，″Purification of ADAM 10 from bovine spleen as a TNFαconvertase，″FEBS Lett.400，333-335(1997))，来源于果蝇的ADAM 10(kuz)最近被显示可以加工Notch受体(Rooke等，Science 273，1227-1231(1996))。ADAM 10也可能呈现一个延长的hA-sII环和两个TACE所具有的典型的“耳朵”，但可能具有大小在TACE和adamalysin之间的多回折中间体(见图3)。ADAM 10催化结构域的90个残基与TACE相同，进一步强调了它们紧密的同源性(见图3)，然而其它哺乳动物的ADAM可能与adamalysin II更为类似(Gomis-Ruth等，″Refined 2.0 crystal structure of snake venom zincendopeptidase adamalysin II″J.Mol.Biol.239，513-544(1994))。

TACE与MMP在结构上的同源性明显较低。相同的二级结构元件的相对排布更为不同(由约120个拓扑学等价的Cα-原子的明显较大的均方根偏差1.6反映出来)，而且MMP缺少TACE/adamalysin特征的结构元件(如中间体螺旋hB和多回折环，在第三个结合锌的组氨酸之后的Asp残基)，或者呈现没有在TACE中见到的典型的决定子(如结构锌和整合的钙离子)。虽然在二级结构上存在区别，TACE的活性位点裂缝与MMP的存在一些类似，具有平坦的不与抗原接触的(左手)一面、以及位于深S1’口袋中心的狭窄的与抗原接触的一面(图2b)。该亚位点与MMP的相似性解释了所发现的TNFα-转换酶对合成的羟肟酸抑制剂(最初设计用于抑制各种MMP)的活性的部分敏感性(DiMartino等.″Anti-arthritic activity of hydroxamic acid-basedpseudopeptide inhibitors of matrix metalloproteinases andTNFαprocessing″Inflamm.Res.46，211-215(1997))。TIMP-1结构的模型构建实验(Gomis-Rüth等，″Mechanism of inhibition ofthe human matrix metalloproteinase stromelysin-1 by TIMP-1″Nature 389，77-81(1997))显示在TACE的活性位点区域没有明显的障碍，这将很容易解释其对由TIMP阻断的抗性。

因此该TCD晶体结构给出了TACE的催化结构域和adamalysin/ADAM的催化结构域之间的拓扑学相似性，以及与MMP共用其底物结合位点的证据。然而，TACE呈现出几个关于表面轮廓、带电和形状的结构特性，其有利于设计有效的选择性合成的抑制剂。

在设计和开发与TACE缔合的化合物，如抑制剂、介质和其它具有生物学上明显的活性的化合物时，理想的是以针对TACE催化结构域的特定的表面轮廓、带电、形状、和其它物理性质的观点来选择化合物。通常，这些化合物可以在物理上和在结构上与TACE缔合，而且也可以假定一个构象以允许其与TACE缔合。以上所描述的特征将在这点上指导熟练的技工。特别地，具有线性功能特性的化合物将是尤其合适的。按照TACE催化结构域的深口袋，这些化合物将是特别适合的。

与TACE缔合的化合物，例如，可以设计为与TACE的S1’区域或S1’S3’口袋相缔合。与TACE缔合的化合物也可以设计为(i)结合螯合锌的部分。进一步的示范性的化合物包括设计为与TACE的Leu348和Gly349形成氢键的化合物，(ii)引入一个占据TACE的S1’口袋的非极性基团，(iii)引入一个位于连接TACE的S1’-S3’口袋的通道内部的基团，其与该通道形成合适的范德华力接触，以及(iv)与在TNF-α-转换酶的主链酰胺基团上的Leu348或Gly349形成氢键连接，或者(v)以上任何的组合。

计算机可读的介质

本发明也涉及到在其上已经记录了晶体TACE多肽的X-射线衍射坐标的计算机可读的介质。本发明中的计算机可读的介质对于TACE结构坐标的储存、传递、和使用软件对其进行使用是有用的。该计算机可读的介质可以是任何合适的数据存储材料，包括但不局限于，软盘、硬盘、计算机型Random Access Memory、Read-Only Memory快速存储器、CD-ROM、可记录和可再写的CD、可记录和可再写的DVD、磁-光盘、ZIP驱动器、JAZ驱动器、Syquist驱动器、数字型驱动器、等等。本技术的熟练人员将了解其它合适的介质。

在一个实施例中，该计算机可读的介质含有表1中的坐标或其实质性部分。该计算机可读的介质可以和已经编汇了用以使用记录于介质上的数据的程序的机器(例如装入一个或多个本说明书中所提及的程序的计算机)结合使用，以显示TACE多肽或其任何部分的一个图象的三维表示。

基于计算机的系统

图6显示了研究TACE多肽的一个系统1000。该系统包括一个图象存储器110，其储存描绘TACE多肽的至少一个部分的信息。该存储器具有至少一个I型存储区域112(已经在其上记录了指定三维空间中的定位的一套空间坐标)，和至少一个II型存储区域114(在其上已经记录了描绘多个氨基酸中的其中之一的特征的信息)。II型存储区域在图象存储器110中与I型存储区域在逻辑上相关，以描绘该TACE多肽的至少一个部分的至少一个特征在该三维空间中的几何排布。存储器、112和114可以含有，例如，表1中的数据。系统1000也包括一个处理器，其与存储器配合以对I型存储区域112和II型存储区域114进行存取，以产生基于存储器110中的数据的、描绘该TACE多肽的至少一个部分的至少一个特征在该三维空间的视觉三维影像的影像信号。该处理器可以是任何具有CPU、暂存器、存储器及其类似物的普通用途的处理器。一个显示器130与处理器120配合，经过线路125接收到影像信号，基于屏幕132中的影像数据来描述该TACE多肽的至少一个部分的至少一个特征在该三维空间中的视觉三维影像。

在本发明的一个实施例中，该影像数据包括用以在三维空间中描述TACE多肽的至少一个部分的飘带结构的视觉三维影像(如图1中所显示)的数据。在另一个实施例中，该影像数据包括用以在三维空间中描述上述TACE多肽的至少一个部分的固体模型表示的视觉三维影像(如图2中所显示)的数据。在又一个实施例中，该影像数据包括用以在三维空间中描述TACE多肽的至少一个部分的静电表面电位的视觉三维影像(如图2中所显示)的数据。在又另一个实施例中，该影像数据包括用以在三维空间中描述TACE多肽的至少一个部分的视觉三维立体影像(如图4中所显示)的数据。

本发明中的系统1000可以进一步包括一个存储设备145(它用以储存用以描绘除了TACE多肽之外的一种化合物的特征的几何排布的数据)和一个操作界面，如鼠标135用以接收来自操作者的指令。存储设备145可以含有，例如其它化学实体的三维X-射线坐标数据。处理器120与存储设备145和上述操作界面135配合，并产生附加的影像数据来在屏幕132上描述基于来自操作界面的命令的、与TACE多肽的上述至少一个部分的上述至少一个特征的上述视觉三维影像相关的该化合物的该特征的几何排布。在图6实施例中，存储设备145是存储器110的一个部分。

I型存储区域112和上述II型存储区域114是，例如半导体存储器的区域、光盘的区域、或磁性存储器的区域。

在一个实施例中，处理器120和图象存储器110是UNIX或VAX计算机的形式，如由Silicon Graphics、Sun Microsystems、和IBM所提供的那些计算机。然而本发明并不局限于这些特定硬件和软件的使用。

本发明在以下说明性的实施例中被描述得更加具体。虽然这些例子可能仅代表本发明中所选出的实施例，但需要理解的是以下的实施例是说明性的，而不具局限性。

实施例1-TACE多肽的表达、分离和纯化

一段编码TACE的信号肽、前和催化结构域的cDNA，氨基酸残基1-477，如Black等所公开，″A Metalloproteinase disintigrin thatreleases tumour-necrosis factors from cells，″Nature 385：729-733(1997，二月)，其Ser266变为Ala，Asn452变为Gln，以及序列Gly-Ser-(His)6被加到C-末端，被插入到CHO细胞的表达载体中。该TACE多肽在CHO细胞中表达，并且以从Val212或Arg215起始的TACE多肽的混合物被分泌出来。细胞在药物氨甲蝶呤中培养，该药物杀死没有结合载体的细胞。

然后纯化被表达的TACE多肽。纯化起始于5升含有被表达的TACE多肽的培养基。该培养基用一个Millipore 10K截流、1 ft²TFF的透滤单元浓缩到约200毫升。抽吸速度为50-100ml/分。然后向样品中加入两升的20mM Tris(pH7.5)和300mM NaCl(Buffer E)缓冲溶液。

样品如上所述进行再浓缩并再次用2升的Buffer E稀释，再次再浓缩，用2升的Buffer E第三次稀释，再次浓缩到约100毫升。滞留在透滤单元中的样品通过回冲回收。然后将这些材料通过0.45μm过滤，加入叠氮化物到0.05％。过滤后的样品储存在4℃下过夜。

隔夜储存之后，将溶于水的200mM的咪唑储备液加入到过滤后的样品中达5mM，以及加入溶于水的1M的ZnCl₂储备液达5μM。然后将样品以3毫升/分钟(柱规格为7.5×50mm)泵入2.2ml的QiagenNi-NTA Superflow树脂(Cat.#30430)中。

用100毫升的20mM Tris pH7.5、300mM NaCl、5mM咪唑、和5μM ZnCl₂(Buffer A)缓冲液以5毫升/分钟洗柱。然后用逐渐升高梯度的咪唑洗脱蛋白，一分钟内达到200mM(总体积5毫升)，接着用35毫升的溶于Buffer A的200mM咪唑过柱。收集2毫升的部分，TACE通常在洗提液中为6毫升。用含有500ul的50％甘油水溶液和200ul、1M Tris pH8的试管收集各部分。甘油在过柱的当天制备。

从各部分中取出3微升作为斑点印迹，用胺黑染色以确定哪个部分含有明显量的蛋白。汇集含有明显量蛋白的部分。然后将汇集液用10K截流Amicon Centriprep浓缩器浓缩到1-2毫升。

然后在浓缩过的样品中加入抑制剂N-{D，L-2-(羟基氨基羰基)甲基-4-甲基戊酰}-L-3-氨基-2-二甲基丁酰-L-丙氨酸，2-(氨基)乙基酰胺的50mM的水溶储备液使其达1mM，并加入辛基糖苷10％的水溶储备液使其达到1％。然后将样品在室温下保温15-24小时。

保温之后，将样品施用于21.5×600mm的分子筛柱LKB 2135-365(用TSK-G3000 SWG填充)并用10mM Tris pH7.3，100mM NaCl，10％甘油平衡。用该缓冲液以2.5ml/分钟过柱100分钟。洗脱液中的TACE多肽通过在280nm的吸收进行检测。被排除的材料通常洗脱约38分钟。纯化的TACE通常洗脱约78分钟或更长。

然后进行凝胶分析(含有明显量的蛋白的各部分取15微升)以确定哪个部分应该汇集。分子筛层析汇集液用10K截流AmiconCentriprep浓缩器浓缩到1毫升。

然后在纯化后的样品中加入抑制剂N-{D，L-2-(羟基氨基羰基)甲基-4-甲基戊酰}-L-3-氨基-2-二甲基丁酰-L-丙氨酸，2-(氨基)乙基酰胺到1mM。该蛋白可以在4℃下贮存。

实施例2-蛋白结晶

将一个含有人TACE的前结构域和催化结构域(残基1-477)的DNA构建物融合到序列Gly-Ser-(His)6上以利于蛋白在Ni-NTA亲和柱上的纯化。中国仓鼠卵巢(Chinese Hamster Ovary，CHO)细胞被用于蛋白的表达。该细胞分泌以Val212或Arg215起始的成熟的TACE的混合物。从Ni-NTA柱中得到的含有TACE的部分在含有辛基糖苷和结合伴侣N-[D，L-[2-(羟基氨基羰基)甲基]-4-甲基-戊醇)-L-3-(叔丁基)-甘氨酰-L-丙氨胺的缓冲液中保温。最后的纯化步骤是在一个凝胶过滤柱中进行。纯化后的TACE贮存在含有10mM Tris/HCL pH7.5，100mM NaCl，10％甘油和1mM抑制剂的缓冲液(TACE缓冲液)中。

结晶实验中TACE的浓度大约为5毫克/毫升，以1∶1的比例混合TACE(在TACE缓冲液中)和以下的结晶缓冲液，并使用坐滴气相扩散技术。实验以双份进行并在约4℃或在20℃下保温。在20℃时，在以下的结晶缓冲液中获得结晶沉淀物：

缓冲液A)0.1M醋酸钠pH5.3，0.2M CaCl₂，30％v/v乙醇

缓冲液B)0.1M柠檬酸钠pH5.0，40％v/v乙醇

缓冲液C)0.1M柠檬酸钠pH8.7，20％w/v PEG 4000，20％v/v异丙醇

用一根兔毛将晶种从结晶沉淀物中转移到浓缩过的TACE样品(溶于TACE缓冲液中，12mg/ml)与缓冲液B或C的比例为1∶1的混合液中以获得小晶体。缓冲液C的进一步精化产生缓冲液D，其使得适合X-射线数据收集的晶体被产生。

缓冲液D)0.1M柠檬酸钠pH5.4，20％w/vPEG 4000，20％v/v异丙醇

在一台与Rigaku-Denki转靶铜阳极X-射线发生器(功率为5.4kW，产生石墨单色CuKα射线)连接的MAR300成像板扫描仪上收集了第一套分辨率达2.5的数据。衍射数据用MOSFLM v.5.23程序和CCP4程序包例行程序进行处理。所有通过使用adamalysin II(adamalysin II的一种全丙氨酸模型)和其它模型的分子置换法来水解结构的尝试均无法产生用以确定相位的有用起始点。因此，四个独立的锌原子定位的确定是通过一种反常差值Patterson合成法辅助进行的。为了测定MAD数据，将晶体在液氮中深度冷冻。所以，晶体首先在一个合适大小的丝环的帮助下被转移到一种冷冻缓冲液(80％v/v Buffer D，含有17％v/v甘油)中，将冷冻浸渍在结晶缓冲液中约10秒，然后迅速深度冷冻到90K。

所获得的晶体属于单斜晶系P2₁空间群，其晶胞参数为：a＝61.38(埃)、b＝126.27、c＝81.27，β＝107.41°，在一个不对称单位中含有四个分子。

实施例3-X-射线衍射

使用实施例2中所描述的晶体，在一台与Rigaku-Denki转靶铜阳极X-射线发生器(功率为5.4kW，产生石墨单色CuKα射线)连接的MAR300成像板扫描仪上收集了第一套分辨率达2.5的数据。衍射数据用MOSFLM v.5.23程序和CCP4程序包例行程序进行处理。

所有通过使用adamalysin II(adamalysin II的一种全丙氨酸模型)和其它模型的分子置换法来解结构的尝试均无法产生用以确定相位的有用起始点。

因此，四个独立的锌原子定位的确定是通过一种反常差值Patterson合成法辅助进行的。为了测定MAD数据，将晶体在冷冻到液氮温度的氮气流中深度冷冻。晶体首先被转移到一种冷冻缓冲液中该缓冲液含有80％v/v Buffer D中(0.1M柠檬酸钠pH5.4，20％w/v PEG4000，20％v/v异丙醇)和17％v/v甘油。转移到冷冻缓冲液是在一个合适大小的丝环的帮助下进行的。将晶体浸渍在冷冻缓冲液中约10秒，然后迅速深度冷冻到90K。

在90K下，用装配在DORIS(DESY，Hamburg，Germany)的BW6摇束器束流线路上的MAR345成像板、在最大f’(1.2769)和最小f″(1.2776)的波长、在锌的K吸收边缘以及一个远离的波长(1.060)下使用单色X-射线衍射收集了分辨率达2.0的反常散射数据。数据的扫描和评估是用DENZO/SCALEPACK进行的，从1051836个测定值中得到77653个独立的衍射点(完整度为96.9％，衍射强度的R-merge值为0.031)。

MAD的相位用MLPHARE修正并计算，包括32.0分辨率以内的所有测量数据。使用DM通过溶剂平滑/直方图匹配方法将它们的平均品质因子从初始的0.53提高到0.76。使用该电子密度可以在SGI系统上使用TURBO-FRODO构建四个独立的TACE催化结构域及与其结合的氧肟酸底物的完整的链。用XPLOR和CCP4例行程序对该模型进行晶体学修正，使用从12.0到2分辨率的79400个独立衍射点，所得的晶体学R因子为18.6％(自由R因子Rfree为27.4％)。

四个独立的TACE分子形成周期排布。

分子1和2、以及3和4分别从Asp219和Met221起始定义，到达Ser474。

实施例4-X-射线衍射

分辨率达到2.0的反常散射的衍射数据是在100K下、用装配在DORIS(DESY，Hamburg，Germany)的摇束器束流线路上的MAR345成像板、在最大f’(1.2769)和最小f″(1.2776)的波长、在锌的K吸收边缘以及一个远离的波长(1.060)下使用单色X-射线衍射收集的。这些衍射数据使用DENZO/SCALEPACK进行估计和扫描，获得77，653个独立衍射点(完整度为96.9％，R-merge为0.031)。

所获得的结构坐标复制于表1中。

表1REMARK Created by MOLEMAN V.961218/7.2.5 at Fri Sep 19 20：05：05 1997 for usercarlosREMARK MoleMan PDB fileCRYST1 61.387 126.278 81.273 90.00 107.42 90.00 P 21 4ORIGX1 1.000000 0.000000 0.000000 0.00000ORIGX2 0.000000 1.000000 0.000000 0.00000ORIGX3 0.000000 0.000000 1.000000 0.00000SCALE1 0.016290 0.000000 0.005111 0.00000SCALE2 0.000000 0.007919 0.000000 0.00000SCALE3 0.000000 0.000000 0.012896 0.00000原子

类型残基？ # X Y Z OCC B原子 1 N ASP A 219 0.865 33.077 15.204 1.00 20.00原子 2 OD2 ASP A 219 5.154 33.868 14.335 1.00 20.00原子 3 OD1 ASP A 219 4.450 35.924 14.844 1.00 20.00原子 4 CG ASP A 219 4.191 34.718 14.461 1.00 20.00原子 5 CB ASP A 219 2.738 34.303 14.156 1.00 20.00原子 6 CA ASP A 219 2.290 33.026 14.883 1.00 20.00原子 7 C ASP A 219 3.166 32.889 16.123 1.00 20.00原子 8 O ASP A 219 3.439 33.884 16.819 1.00 20.00原子 9 N PRO A 220 3.629 31.679 16.386 1.00 20.00原子 10 CG PRO A 220 4.073 29.436 16.118 1.00 20.00原子 11 CD PRO A 220 3.224 30.531 15.588 1.00 20.00原子 12 CB PRO A 220 4.893 29.974 17.303 1.00 20.00原子 13 CA PRO A 220 4.523 31.452 17.495 1.00 20.00原子 14 C PRO A 220 5.649 32.530 17.443 1.00 20.00原子 15 O PRO A 220 6.513 32.741 18.173 1.00 20.00原子 16 N MET A 221 5.766 33.341 16.625 1.00 48.83原子 17 CE MET A 221 9.090 36.336 12.584 1.00 53.01原子 18 SD MET A 221 9.248 36.147 14.337 1.00 54.21原子 19 CG MET A 221 8.515 34.606 14.801 1.00 51.15原子 20 CB MET A 221 7.101 34.778 15.298 1.00 48.69原子 21 CA MET A 221 6.875 34.306 16.701 1.00 46.22原子 22 C MET A 221 6.485 35.500 17.614 1.00 42.51原子 23 C MET A 221 7.279 36.002 18.427 1.00 43.93原子 24 N LYS A 222 5.215 35.817 17.508 1.00 36.53原子 25 NZ LYS A 222 1.844 39.934 13.657 1.00 40.05原子 26 CE LYS A 222 2.513 39.901. 14.974 1.00 39.09原子 27 CO LYS A 222 2.353 38.522 15.613 1.00 38.20原子 28 CG LYS A 222 3.646 38.146 16.312 1.00 36.27原子 29 CB LYS A 222 3.345 37.404 17.597 1.00 33.97原子 30 CA LYS A 222 4.567 36.853 18.299 1.00 32.39原子 31 C LYS A 222 4.144 36.220 19.633 1.00 29.13原子 32 O LYS A 222 2.999 35.844 19.866 1.00 26.54原子 33 N ASN A 223 5.157 36.011 20.462 1.00 23.62原子 34 CA ASN A 223 4.951 35.295 21.704 1.00 22.97原子 35 CB ASN A 223 5.756 33.987 21.611 1.00 25.44原子 36 CG ASN A 223 7.229 34.245 21.372 1.00 26.32原子 37 OD1 ASN A 223 7.973 33.261 21.243 1.00 29.74原子 38 ND2 ASN A 223 7.688 35.482 21.319 1.00 25.96原子 39 C ASN A 223 5.327 36.123 22.908 1.00 18.46原子 40 O ASN A 223 5.365 35.556 23.983 1.00 18.08原子 41 N THR A 224 5.611 37.408 22.709 1.00 17.03

原子

类型残基？ # X Y Z OCC B原子 42 CA THR A 224 6.035 38.246 23.824 1.00 16.24原子 43 C3 THR A 224 7.507 38.721 23.599 1.00 17.52原子 44 OG1 THR A 224 8.317 37.590 23.318 1.00 16.14原子 45 CG2 THR A 224 8.002 39.440 24.840 1.00 17.72原子 46 C THR A 224 5.152 39.464 24.033 1.00 16.13原子 47 O THR A 224 4.863 40.275 23.152 1.00 15.14原子 48 N CYS A 225 4.708 39.650 25.253 1.00 16.61原子 49 CA CYS A 225 3.915 40.833 25.646 1.00 17.81原子 50 CB CYS A 225 2.895 40.460 26.723 1.00 18.01原子 51 SG CYS A 225 2.120 41.843 27.562 1.00 18.77原子 52 C CYS A 225 4.899 41.914 26.101 1.00 17.46原子 53 O CYS A 225 5.614 41.703 27.093 1.00 18.52原子 54 N LYS A 226 5.070 42.945 25.285 1.00 17.94原子 55 CA LYS A 226 6.011 44.033 25.573 1.00 18.61原子 56 CB LYS A 226 6.373 44.8l6 24.311 1.00 21.04原子 57 CG LYS A 226 6.985 43.974 23.202 1.00 22.16原子 58 CD LYS A 226 8.395 43.451 23.514 1.00 24.95原子 59 CE LYS A 226 8.867 42.585 22.365 1.00 28.75原子 60 NZ LYS A 225 10.336 42.445 22.185 1.00 31.31原子 61 C LYS A 226 5.461 44.940 26.658 1.00 17.48原子 62 O LYS A 226 4.295 45.336 26.642 1.00 16.96原子 63 N LEU A 227 6.281 45.274 27.641 1.00 15.78原子 64 CA LEU A 227 5.848 46.025 28.777 1.00 15.23原子 65 CB LEU A 227 6.182 45.347 30.117 1.00 15.96原子 66 CG LEU A 227 5.848 43.884 30.334 1.00 15.88原子 67 CD1 LEU A 227 6.375 43.381 31.692 1.00 15.72原子 68 CD2 LEU A 227 4.356 43.646 30.314 1.00 13.61原子 69 C LEU A 227 6.462 47.398 28.965 1.00 16.89原子 70 O LEU A 227 7.639 47.635 28.725 1.00 17.35原子 71 N LEU A 228 5.585 48.248 29.488 1.00 16.01原子 72 CA LEU A 228 6.024 49.559 29.935 1.00 15.78原子 73 CB LEU A 228 5.105 50.721 29.644 1.00 15.98原子 74 CG LEU A 228 5.360 52.012 30.426 1.00 17.60原子 75 CD1 LEU A 228 6.596 52.712 29.853 1.00 15.81原子 76 CD2 LEU A 228 4.154 52.945 30.340 1.00 19.40原子 77 C LEU A 228 6.144 49.360 31.455 1.00 16.70原子 78 O LEU A 228 5.124 49.074 32.104 1.00 16.99原子 79 N VAL A 229 7.356 49.488 31.983 1.00 13.83原子 90 CA VAL A 229 7.484 49.343 33.450 1.00 12.75原子 81 CB VAL A 229 8.600 48.320 33.747 1.00 15.41原子 82 CG1 VAL A 229 9.015 48.421 35.199 1.00 15.21原子 83 CG2 VAL A 229 8.062 46.910 33.451 1.00 16.11原子 84 C VAL A 229 7.758 50.710 34.055 1.00 11.45原子 85 O VAL A 229 8.592 51.462 33.529 1.00 10.78原子 86 N VAL A 230 7.029 51.092 35.090 1.00 11.10原子 87 CA VAL A 230 7.169 52.397 35.688 1.00 13.35原子 88 CB VAL A 230 5.910 53.299 35.518 1.00 13.78原子 89 CG1 VAL A 230 6.096 54.643 36.192 1.00 13.70原子 90 CG2 VAL A 230 5.577 53.586 34.050 1.00 12.14原子 91 C VAL A 230 7.495 52.252 37.154 1.00 12.98原子 92 O VAL A 230 6.791 51.546 37.877 1.00 14.51原子 93 N ALA A 231 8.582 52.891 37.570 1.00 14.57原子 94 CA ALA A 231 8.915 52.901 39.001 1.00 12.63原子 95 CB ALA A 231 10.382 52.556 39.219 1.00 14.54

原子

类型残基？ # X Y Z OCC B原子 96 C ALA A 231 8.616 54.305 39.505 1.00 13.54原子 97 O ALA A 231 9.215 55.290 39.004 1.00 12.89原子 98 N ASP A 232 7.739 54.412 40.500 1.00 13.89原子 99 CA ASP A 232 7.440 55.781 40.947 1.00 15.63原子 100 CB ASP A 232 6.061 55.875 41.560 1.00 16.03原子 101 CG ASP A 232 5.856 55.198 42.876 1.00 17.24原子 102 OD1 ASP A 232 4.725 55.249 43.432 1.00 18.20原子 103 OD2 ASP A 232 6.804 54.565 41.403 1.00 15.69原子 104 C ASP A 232 8.559 56.276 41.875 1.00 15.96原子 105 O ASP A 232 9.395 55.459 42.253 1.00 13.21原子 106 N HIS A 233 8.375 57.492 42.392 1.00 16.98原子 107 CA HIS A 233 9.399 58.118 43.244 1.00 16.61原子 108 CB HIS A 233 9.075 59.600 43.522 1.00 17.60原子 109 CG HIS A 233 7.977 59.866 44.494 1.00 17.74原子 110 CD2 HIS A 233 8.012 60.040 45.836 1.00 18.92原子 111 ND1 HIS A 233 6.648 59.946 44.152 1.00 17.72原子 112 CE1 HIS A 233 5.910 60.144 45.222 1.00 18.19原子 113 NE2 HIS A 233 6.730 60.214 46.266 1.00 19.56原子 114 C HIS A 233 9.562 57.364 44.535 1.00 16.98原子 115 O HIS A 233 10.626 57.385 45.170 1.00 14.73原子 116 N ARG A 234 8.457 56.762 45.005 1.00 15.26原子 117 CA ARG A 234 8.476 55.997 46.231 1.00 16.71原子 118 CB ARG A 234 7.083 55.600 46.688 1.00 19.19原子 119 CG ARG A 234 6.078 56.729 46.814 1.00 18.94原子 120 CD ARG A 234 4.726 56.181 47.250 1.00 21.89原子 121 NE ARG A 234 3.696 57.214 47.125 1.00 23.72原子 122 CZ ARG A 234 2.872 57.469 48.130 1.00 26.70原子 123 NH1 ARG A 234 2.923 56.798 49.270 1.00 27.34原子 124 NH2 ARG A 234 1.953 58.411 47.989 1.00 28.96原子 125 C ARG A 234 9.319 54.728 46.062 1.00 17.39原子 126 O ARG A 234 10.072 54.359 46.955 1.00 17.02原子 127 N PHE A 235 9.149 54.039 44.954 1.00 15.45原子 128 CA PHE A 235 9.913 52.829 44.669 1.00 17.15原子 129 CB PHE A 235 9.458 52.167 43.370 1.00 15.92原子 130 CG PHE A 235 10.063 50.804 43.165 1.D0 14.51原子 131 CD1 PHE A 235 11.226 50.638 42.442 1.00 14.09原子 132 CD2 PHE A 235 9.429 49.693 43.697 1.00 13.27原子 133 CE1 PHE A 235 11.786 49.394 42.283 1.00 12.49原子 134 CE2 PHE A 235 9.979 48.436 43.514 1.00 14.15原子 135 CZ PHE A 235 11.159 48.280 42.812 1.00 11.73原子 136 C PHE A 235 11.391 53.211 44.502 1.00 15.85原子 137 O PHE A 235 12.309 51.611 45.041 1.00 15.02原子 138 N TYR A 236 11.573 54.282 43.750 1.00 15.65原子 139 CA TYR A 236 12.920 54.781 43.501 1.00 18.77原子 140 CB TYR A 236 12.809 56.087 42.744 1.00 20.15原子 141 CG TYR A 236 14.079 56.831 42.453 1.00 20.77原子 142 CD1 TYR A 236 15.006 56.379 41.554 1.00 23.25原子 143 CE1 TYR A 236 16.171 57.111 41.294 1.00 25.10原子 144 CD2 TYR A 236 14.303 58.043 43.094 1.00 22.97原子 145 CE2 TYR A 236 15.434 58.789 42.840 1.00 23.38原子 146 CZ TYR A 236 16.355 58.309 41.944 1.00 24.28原子 147 OH TYR A 236 17.490 59.032 41.699 1.00 27.10原子 148 C TYR A 236 17.668 55.005 44.807 1.00 18.41原子 149 O TYR A 236 14.785 54.538 44.979 1.00 17.82

原子

类型残基？ # X Y Z OCC B原子 150 N ARG A 237 13.029 55.671 45.741 1.00 18.84原子 151 NH2 ARG A 237 16.164 60.578 45.801 1.00 36.66原子 152 NH1 ARG A 237 15.513 58.642 46.822 1.00 35.42原子 153 CZ ARG A 237 15.208 59.704 46.106 1.00 35.99原子 154 NE ARG A 237 13.940 59.862 45.712 1.00 36.11原子 155 CD ARG A 237 12.867 58.910 45.981 1.00 32.12原子 156 CG ARG A 237 12.655 58.442 47.386 1.00 28.99原子 157 CB ARG A 237 12.578 56.978 47.698 1.00 22.94原子 158 CA ARG A 237 13.566 56.021 47.029 1.00 21.89原子 159 C ARG A 237 13.824 54.847 47.959 1.00 22.82原子 160 O ARG A 237 14.874 54.759 48.586 1.00 22.33原子 161 N TYR A 238 12.826 53.995 48.165 1.00 20.93原子 162 CA TYR A 238 12.807 52.950 49.142 1.00 22.79原子 163 CB TYR A 238 11.438 52.835 49.835 1.00 25.02原子 164 CG TYR A 238 11.052 54.133 50.502 1.00 28.43原子 165 CD1 TYR A 238 10.191 55.011 49.873 1.00 30.38原子 166 CE1 TYR A 238 9.827 56.214 50.439 1.00 32.45原子 167 CD2 TYR A 238 11.570 54.501 51.729 1.00 30.38原子 168 CE2 TYR A 238 11.228 55.709 52.309 1.00 32.79原子 169 CZ TYR A 238 10.384 56.572 51.647 1.00 33.85原子 170 OH TYR A 238 10.043 57.784 52.208 1.00 34.86原子 171 C TYR A 238 13.222 51.579 48.683 1.00 22.48原子 172 O TYR A 238 13.682 50.772 49.509 1.00 24.69原子 173 N MET A 239 13.171 51.306 47.405 1.00 20.92原子 174 CA MET A 239 13.680 50.048 46.893 1.00 18.57原子 175 CB MET A 239 12.667 49.374 45.965 1.00 18.57原子 176 CG MET A 239 11.394 48.971 46.729 1.00 18.44原子 177 SD MET A 239 11.677 47.664 47.929 1.00 17.64原子 178 CE MET A 239 12.084 46.309 46.855 1.00 16.38原子 179 CM MET A 239 14.975 50.292 46.121 1.00 17.52原子 180 O MET A 239 15.826 49.422 46.133 1.00 16.58原子 181 N GLY A 240 15.067 51.440 45.447 1.00 16.74原子 182 CA GLY A 240 16.198 51.733 44.602 1.00 16.82原子 183 C GLY A 240 17.334 52.497 45.232 1.00 20.60原子 184 O GLY A 240 18.280 52.875 44.516 1.00 20.21原子 185 N ARG A 241 17.242 52.871 46.503 1.00 20.89原子 186 CA ARG A 241 18.300 53.628 47.162 1.00 24.17原子 187 CB ARG A 241 19.609 52.806 47.126 1.00 26.15原子 188 CG ARG A 241 19.504 51.488 47.875 1.00 29.48原子 189 CD ARG A 241 20.771 50.648 47.896 1.00 31.73原子 190 NE ARG A 241 21.417 50.785 49.228 1.00 32.75原子 191 CZ ARG A 241 22.188 51.837 49.428 1.00 33.64原子 192 NH1 ARG A 241 22.361 52.722 48.450 1.00 35.35原子 193 NH2 ARG A 241 22.752 52.014 50.596 1.00 32.64原子 194 C ARG A 241 18.497 55.001 46.543 1.00 25.05原子 195 O ARG A 241 19.574 55.585 46.696 1.00 21.63原子 196 N GLY A 242 17.470 55.529 45.831 1.00 22.70原子 197 CA GLY A 242 17.603 56.784 45.110 1.00 20.94原子 198 C GLY A 242 18.622 56.667 44.003 1.00 20.36原子 199 O GLY A 242 19.255 57.656 43.639 1.00 20.42原子 200 N GLU A 243 18.841 55.486 43.445 1.00 19.57原子 201 CA GLU A 243 19.832 55.277 42.418 1.00 19.51原子 202 CB GLU A 243 20.951 54.324 42.832 1.00 21.04原子 203 CG GLU A 243 21.992 54.818 43.816 1.00 22.54

原子

类型残基？ # X Y Z OCC B原子 204 CD GLU A 243 22.782 53.747 44.543 1.00 24.67原子 205 OE1 GLU A 243 23.740 54.097 45.292 1.00 24.23原子 206 CE2 GLU A 243 22.512 52.535 44.451 1.00 22.83原子 207 C GLU A 243 19.104 54.717 41.197 1.00 19.62原子 208 O GLU A 243 18.414 53.698 41.291 1.00 18.85原子 209 N GLU A 244 19.324 55.341 40.075 1.00 19.48原子 210 CA GLU A 244 18.699 54.904 38.833 1.00 22.19原子 211 CB GLU A 244 18.928 55.950 37.739 1.00 25.49原子 212 CG GLU A 244 18.502 55.433 36.371 1.00 29.88原子 213 CD GLU A 244 18.409 56.498 35.310 1.00 32.59原子 214 OE1 GLU A 244 18.205 57.691 35.608 1.00 33.16原子 215 OE2 GLU A 244 18.528 56.090 34.136 1.00 35.02原子 216 C GLU A 244 19.176 53.524 38.414 1.00 21.10原子 217 O GLU A 244 18.360 52.654 38.029 1.00 17.68原子 218 N SER A 245 20.466 53.247 38.644 1.00 18.06原子 219 CA SER A 245 21.001 51.960 38.207 1.00 20.29原子 220 CB SER A 245 22.549 51.953 38.270 1.00 21.06原子 221 OG SER A 245 22.833 52.394 39.607 1.00 21.74原子 222 C SER A 245 20.409 50.844 39.056 1.00 17.46原子 223 O SER A 245 19.970 49.834 38.536 1.00 18.81原子 224 N THR A 246 20.355 51.020 40.343 1.00 15.88原子 225 CA THR A 246 19.821 50.027 41.275 1.00 18.13原子 226 CB THR A 246 20.051 50.546 42.689 1.00 19.42原子 227 OG1 THR A 246 21.459 50.877 42.861 1.00 21.14原子 228 CG2 THR A 246 19.692 49.547 43.761 1.00 19.86原子 229 C THR A 246 18.337 49.757 41.014 1.00 16.92原子 230 O THR A 246 17.915 48.619 41.068 1.00 14.90原子 231 N THR A 247 17.545 50.799 40.800 1.00 17.19原子 232 CA THR A 247 16.108 50.689 40.560 1.00 16.84原子 233 CB THR A 247 15.458 52.076 40.443 1.00 16.21原子 234 OG1 THR A 247 15.860 52.839 41.581 1.00 14.61原子 235 CG2 THR A 247 13.920 52.069 40.449 1.00 14.87原子 236 C THR A 247 15.848 49.892 39.308 1.00 15.69原子 237 O THR A 247 15.088 48.922 39.295 1.00 14.94原子 238 N THR A 248 16.502 50.305 38.232 1.00 16.92原子 239 CA THR A 248 16.382 49.685 36.926 1.00 16.92原子 240 CB THR A 248 17.322 50.415 35.963 1.00 17.93原子 241 OG1 THR A 248 16.875 51.787 35.915 1.00 18.06原子 242 CG2 THR A 248 17.381 49.792 34.586 1.00 19.15原子 243 C THR A 248 16.712 48.202 36.972 1.00 18.22原子 244 O THR A 248 16.073 47.313 36.427 1.00 14.91原子 245 N ASN A 249 17.857 47.907 37.593 1.00 17.46原子 246 CA ASN A 249 18.342 46.545 37.700 1.00 17.81原子 247 CB ASN A 249 19.723 46.472 38.349 1.00 19.11原子 248 CG ASN A 249 20.854 47.016 37.499 1.00 22.53原子 249 OD1 ASN A 249 20.753 47.173 36.283 1.00 22.82原子 250 ND2 ASN A 249 21.989 47.306 38.157 1.00 21.73原子 251 C ASN A 249 17.364 45.662 38.478 1.00 15.16原子 252 O ASN A 249 17.157 44.510 38.066 1.00 13.94原子 253 N TYR A 250 16.850 46.170 39.578 1.00 14.10原子 254 CA TYR A 250 15.888 45.426 40.360 1.00 15.67原子 255 CB TYR A 250 15.393 46.239 41.546 1.00 16.52原子 256 CG TYR A 250 14.527 45.444 42.501 1.00 19.76原子 257 CD1 TYR A 250 15.109 44.778 43.571 1.00 20.39

原子

类型残基？ # X Y Z OCC B原子 258 CE1 TYR A 250 14.344 44.031 44.447 1.00 21.56原子 259 CD2 TYR A 250 13.138 45.344 42.332 1.00 18.76原子 260 CE2 TYR A 250 12.377 44.600 43.203 1.00 19.63原子 261 CZ TYR A 250 12.985 43.943 44.248 1.00 22.22原子 262 OH TYR A 250 12.250 43.189 45.134 1.00 24.91原子 263 C TYR A 250 14.683 45.029 39.472 1.00 14.95原子 264 O TYR A 250 14.234 43.893 39.546 1.00 11.83原子 265 N LEU A 251 14.133 46.021 38.758 1.00 13.07原子 266 CA LEU A 251 12.977 45.742 37.899 1.00 12.72原子 267 CB LEU A 251 12.271 47.059 37.519 1.00 12.66原子 268 CG LEU A 251 11.696 47.800 38.734 1.00 14.96原子 269 CD1 LEU A 251 11.038 49.099 38.363 1.00 18.53原子 270 CD2 LEU A 251 10.717 46.914 39.501 1.00 19.00原子 271 C LEU A 251 13.288 44.885 36.700 1.00 11.35原子 272 O LEU A 251 12.518 43.962 36.349 1.00 10.33原子 273 N ILE A 252 14.429 45.093 36.050 1.00 10.29原子 274 CA ILE A 252 14.832 44.209 34.944 1.00 12.09原子 275 CB ILE A 252 16.209 44.654 34.372 1.00 13.58原子 276 CG2 ILE A 252 16.848 43.570 33.523 1.00 14.17原子 277 CG1 ILE A 252 16.059 45.964 33.581 1.00 16.57原子 278 CD1 ILE A 252 17.351 46.450 32.902 1.00 18.53原子 279 C ILE A 252 14.938 42.791 35.448 1.00 10.51原子 280 O ILE A 252 14.592 41.830 34.755 1.00 12.14原子 281 N GLU A 253 15.508 42.598 36.641 1.00 9.27原子 282 CA GLU A 253 15.743 41.263 37.159 1.00 10.71原子 283 CB GLU A 253 16.762 41.233 38.306 1.00 12.25原子 284 CG GLU A 253 18.217 41.412 37.830 1.00 12.76原子 285 CD GLU A 253 19.215 41.029 38.924 1.00 15.62原子 286 OE1 GLU A 253 19.091 40.009 39.615 1.00 14.92原子 287 OE2 GLU A 253 20.134 41.798 39.207 1.00 14.69原子 288 C GLU A 253 14.422 40.619 37.605 1.00 9.88原子 289 O GLU A 253 14.195 39.441 37.388 1.00 7.43原子 290 N LEU A 254 13.559 41.420 38.230 1.00 10.47原子 291 CA LEU A 254 12.266 40.858 38.649 1.00 10.04原子 292 CB LEU A 254 11.537 41.807 39.572 1.00 9.92原子 293 CG LEU A 254 10.103 41.493 40.022 1.00 10.99原子 294 CD1 LEU A 254 9.778 42.322 41.239 1.00 11.71原子 295 CD2 LEU A 254 9.106 41.854 38.918 1.00 11.46原子 296 C LEU A 254 11.481 40.463 37.408 1.00 9.41原子 297 O LEU A 254 10.959 39.343 37.426 1.00 10.16原子 298 N ILE A 255 11.399 41.269 36.369 1.00 11.15原子 299 CA ILE A 255 10.590 40.910 35.180 1.00 11.06原子 300 CB ILE A 255 10.480 42.108 34.194 1.00 10.34原子 301 CG2 ILE A 255 9.910 41.651 32.851 1.00 12.31原子 302 CG1 ILE A 255 9.646 43.216 34.796 1.00 10.06原子 303 CD1 ILE A 255 8.235 42.810 35.286 1.00 10.90原子 304 C ILE A 255 11.113 39.671 34.495 1.00 11.34原子 305 O ILE A 255 10.466 38.704 34.055 1.00 8.95原子 306 N ASP A 256 12.458 39.596 34.420 1.00 10.09原子 307 CA ASP A 256 13.108 38.362 33.953 1.00 11.00原子 308 CB ASP A 256 14.621 38.617 33.890 1.00 12.60原子 309 CG ASP A 256 15.320 37.358 33.434 1.00 16.54原子 310 OD1 ASP A 256 15.159 37.033 32.249 1.00 17.04原子 311 OD2 ASP A 256 15.977 36.731 34.290 1.00 18.15

原子

类型残基？ # X Y Z OCC B原子 312 C ASP A 256 12.763 37.124 34.779 1.00 10.53原子 313 O ASP A 256 12.485 36.036 34.2A6 1.00 11.14原子 314 N ARG A 257 12.719 37.177 36.087 1.00 11.51原子 315 CA ARG A 257 12.362 36.025 36.923 1.00 11.03原子 316 CB ARG A 257 12.646 36.291 38.375 1.00 11.04原子 317 CG ARG A 257 14.194 36.302 38.743 1.00 9.97原子 318 CD ARG A 257 14.347 36.333 40.258 1.00 9.94原子 319 NE ARG A 257 13.581 37.392 40.951 1.00 9.56原子 320 CZ ARG A 257 14.058 38.613 41.124 1.00 10.48原子 321 NH1 ARG A 257 15.283 38.961 40.677 1.00 8.64原子 322 NH2 ARG A 257 13.363 39.539 41.718 1.00 8.45原子 323 C ARG A 257 10.868 35.673 36.655 1.00 10.99原子 324 O ARG A 257 10.495 34.509 36.580 1.00 10.38原子 325 N VAL A 258 10.033 36.685 36.635 1.00 7.90原子 326 CA VAL A 258 8.600 36.497 36.295 1.00 9.48原子 327 CB VAL A 258 7.877 37.856 36.335 1.00 8.97原子 328 CG1 VAL A 258 6.398 37.717 35.905 1.00 7.38原子 329 CG2 VAL A 258 7.915 38.447 37.733 1.00 7.76原子 330 C VAL A 258 8.469 35.851 34.931 1.00 9.20原子 331 O VAL A 258 7.769 34.858 34.706 1.00 11.73原子 332 N ASP A 259 9.193 36.330 33.947 1.00 10.41原子 333 CA ASP A 259 9.196 35.B17 32.585 1.00 11.92原子 334 CB ASP A 259 10.101 36.614 31.655 1.00 12.64原子 335 CG ASP A 259 10.059 36.157 30.219 1.00 17.49原子 336 OD1 ASP A 259 8.962 36.007 29.644 1.00 16.26原子 337 OD2 ASP A 259 11.145 35.932 29.637 1.00 20.54原子 338 C ASP A 259 9.618 34.346 32.546 1.00 13.21原子 339 O ASP A 259 9.021 33.572 31.783 1.00 11.13原子 340 N ASP A 260 10.546 33.904 33.412 1.00 12.46原子 341 OD2 ASP A 260 14.081 33.042 35.067 1.00 19.42原子 342 OD1 ASP A 260 13.629 33.074 32.936 1.00 15.68原子 343 CG ASP A 260 13.335 32.789 34.098 1.00 16.09原子 344 CB ASP A 260 11.972 32.171 34.451 1.00 13.52原子 345 CA ASP A 260 10.912 32.498 33.403 1.00 11.20原子 346 C ASP A 260 9.647 31.669 33.761 1.00 13.45原子 347 O ASP A 260 9.461 30.565 33.241 1.00 11.34原子 348 N ILE A 261 8.867 32.202 34.720 1.00 10.81原子 349 CA ILE A 261 7.643 31.469 35.052 1.00 11.86原子 350 CB ILE A 261 6.910 32.167 36.198 1.00 13.06原子 351 CG2 ILE A 261 5.538 31.612 36.416 1.00 12.50原子 352 CG1 ILE A 261 7.825 31.986 37.422 1.00 16.02原子 353 CD1 ILE A 261 7.242 32.547 38.701 1.00 17.40原子 354 C ILE A 261 6.738 31.396 33.815 1.00 10.07原子 355 O ILE A 261 6.351 30.273 33.480 1.00 11.72原子 356 N TYR A 262 6.434 32.522 33.232 1.00 8.70原子 357 CA TYR A 262 5.515 32.515 32.082 1.00 11.55原子 358 CB TYR A 262 5.275 33.937 31.548 1.00 11.91原子 359 CG TYR A 262 4.257 34.650 32.411 1.00 12.15原子 360 CD1 TYR A 262 4.554 35.110 33.670 1.00 12.29原子 361 CE1 TYR A 262 3.598 35.746 34.457 1.00 12.53原子 362 CD2 TYR A 262 2.940 34.799 31.941 1.00 14.52原子 363 CE2 TYR A 262 1.989 35.420 32.716 1.00 14.04原子 364 CZ TYR A 262 2.315 35.905 33.956 1.00 14.14原子 365 OH TYR A 262 1.368 36.538 34.721 1.00 12.39

原子

类型残基？ # X Y Z OCC B原子 366 CT TYR A 262 5.982 31.682 30.932 1.00 11.66原子 367 O TYR A 262 5.202 30.842 30.446 1.00 11.39原子 368 N ARG A 263 7.231 31.887 30.478 1.00 10.78原子 369 CA ARG A 263 7.771 31.180 29.333 1.00 14.61原子 370 CB ARG A 263 9.236 31.623 29.117 1.00 18.66原子 371 CG ARG A 263 9.634 32.729 28.194 1.00 21.81原子 372 CD ARG A 263 11.103 32.655 27.718 1.00 25.82原子 373 NE ARG A 263 11.932 31.745 28.516 1.00 27.30原子 374 CZ ARG A 263 12.427 32.092 29.708 1.00 28.71原子 375 NH1 ARG A 263 12.225 33.329 30.166 1.00 29.09原子 376 NH2 ARG A 263 13.087 31.212 30.435 1.00 27.05原子 377 C ARG A 263 7.751 29.674 29.425 1.00 15.13原子 378 O ARG A 263 7.596 28.973 28.384 1.00 17.45原子 379 N ASN A 264 8.019 29.078 30.591 1.00 12.82原子 380 CA ASN A 264 8.003 27.677 30.834 1.00 14.56原子 381 CB ASN A 264 8.878 27.204 32.013 1.00 17.95原子 382 CG ASN A 264 10.323 27.555 31.654 1.00 19.62原子 383 OD1 ASN A 264 10.776 27.002 30.654 1.00 23.25原子 384 ND2 ASN A 264 10.957 28.464 32.335 1.00 19.81原子 385 C ASN A 264 6.582 27.144 31.076 1.00 16.00原子 386 O ASN A 264 6.449 25.944 31.293 1.00 14.82原子 387 N THR A 265 5.566 28.017 31.073 1.00 13.74原子 388 CA THR A 265 4.221 27.425 31.290 1.00 13.37原子 389 CB THR A 265 3.309 28.463 31.935 1.00 14.37原子 390 OG1 THR A 265 3.800 28.787 33.238 1.00 11.71原子 391 CG2 THR A 265 1.466 27.953 32.101 1.00 12.84原子 392 C THR A 265 3.675 26.917 29.965 1.00 12.82原子 393 O THR A 265 3.698 27.628 28.968 1.00 14.37原子 394 N ALA A 266 3.134 25.708 29.970 1.00 13.65原子 395 CA ALA A 266 2.432 25.151 28.820 1.00 14.19原子 396 CB ALA A 266 2.737 23.645 28.812 1.00 14.17原子 397 C ALA A 266 0.937 25.431 28.997 1.00 11.04原子 398 O ALA A 266 0.250 24.682 29.675 1.00 10.22原子 399 N TRP A 267 0.426 26.539 28.524 1.00 11.35原子 400 CA TRP A 267 -0.962 26.949 28.736 1.00 13.04原子 401 CB TRP A 267 -1.183 28.301 28.045 1.00 11.63原子 402 CG TRP A 267 -0.186 29.330 28.523 1.00 10.70原子 403 CD2 TRP A 267 -0.205 29.920 29.819 1.00 8.77原子 404 CE2 TRP A 267 0.904 30.814 29.863 1.00 12.19原子 405 CE3 TRP A 267 -1.007 29.828 30.931 1.00 9.72原子 406 CD1 TRP A 267 0.865 29.846 27.849 1.00 10.38原子 407 NE1 TRP A 267 1.531 30.754 28.652 1.00 11.35原子 408 CZ2 TRP A 267 1.287 31.580 30.989 1.00 10.57原子 409 CZ3 TRP A 267 -0.718 30.580 32.066 1.00 11.82原子 410 CH2 TRP A 267 0.395 31.439 32.071 1.00 9.78原子 411 C TRP A 267 -2.007 25.919 28.298 1.00 16.01原子 412 O TRP A 267 -3.089 25.832 28.915 1.00 14.19原子 413 N ASP A 268 -1.688 25.091 27.326 1.00 11.86原子 414 CA ASP A 268 -2.615 24.026 26.899 1.00 13.82原子 415 CB ASP A 268 -2.765 24.051 25.382 1.00 13.92原子 416 CG ASP A 268 -1.517 23.691 24.619 1.00 16.74原子 417 OD1 ASP A 268 -0.422 23.699 25.244 1.00 16.49原子 418 OD2 ASP A 268 -1.561 23.395 23.404 1.00 15.38原子 419 C ASP A 268 -2.165 22.661 27.367 1.00 15.26

原子

类型残基？ # X Y Z OCC B原子 420 O ASP A 268 -2.554 21.608 26.834 1.00 13.18原子 421 N ASN A 269 -1.225 22.609 28.329 1.00 14.90原子 422 CA ASN A 269 -0.596 21.391 28.792 1.00 15.45原子 423 CB ASN A 269 -1.547 20.454 29.549 1.00 17.28原子 424 CG ASN A 269 -2.190 21.182 30.719 1.00 18.96原子 425 OD1 ASN A 269 -1.461 21.670 31.560 1.00 20.34原子 426 ND2 ASN A 269 -3.500 21.321 30.788 1.00 18.93原子 427 C ASN A 269 0.108 20.556 27.711 1.00 14.79原子 428 O ASN A 269 0.330 19.352 27.859 1.00 14.35原子 429 N ASN A 270 0.523 21.193 26.654 1.00 14.55原子 430 CA ALA A 270 1.203 20.593 25.533 1.00 17.42原子 431 CB ALA A 270 0.189 20.155 24.481 1.00 15.76原子 432 C ALA A 270 2.239 21.573 25.004 1.00 16.67原子 433 O ALA A 270 3.183 21.866 25.757 1.00 19.13原子 434 N GLY A 271 2.143 22.004 23.765 1.00 16.01原子 435 CA GLY A 271 3.174 22.837 23.177 1.00 18.64原子 436 C GLY A 271 2.951 24.321 23.125 1.00 17.56原子 437 O GLY A 271 3.768 25.075 22.589 1.00 18.20原子 438 N PHE A 272 1.844 24.831 23.659 1.00 17.81原子 439 CA PHE A 272 1.538 26.263 23.614 1.00 16.42原子 440 CB PHE A 272 0.047 26.539 23.710 1.00 16.73原子 441 CG PHE A 272 -0.389 27.890 23.205 1.00 17.94原子 442 CD1 PHE A 272 -0.462 28.168 21.858 1.00 19.17原子 443 CD2 PHE A 272 -0.716 28.894 24.100 1.00 18.80原子 444 CE1 PHE A 272 -0.813 29.421 21.407 1.00 18.87原子 445 CE2 PHE A 272 -1.120 30.139 23.664 1.00 18.81原子 446 CZ PHE A 272 -1.142 30.404 22.310 1.00 19.11原子 447 C PHE A 272 2.305 26.889 24.796 1.00 16.83原子 448 O PHE A 272 1.786 27.138 25.860 1.00 14.19原子 449 N LYS A 273 3.584 27.067 24.561 1.00 17.93原子 450 CA LYS A 273 4.522 27.543 25.546 1.00 21.35原子 451 CB LYS A 273 5.236 26.296 26.080 1.00 24.32原子 452 CG LYS A 273 6.157 25.698 25.023 1.00 27.94原子 453 CD LYS A 273 6.625 24.300 25.389 1.00 31.29原子 454 CE LYS A 273 7.307 24.300 26.732 1.00 32.80原子 455 NZ LYS A 273 6.347 24.136 27.857 1.00 33.38原子 456 C LYS A 273 5.479 28.518 24.906 1.00 19.96原子 457 O LYS A 273 5.444 28.763 23.706 1.00 18.61原子 458 N GLY A 274 6.382 29.094 25.709 1.00 20.59原子 459 CA GLY A 274 7.323 30.058 25.166 1.00 17.10原子 460 C GLY A 274 6.701 31.449 25.153 1.00 17.80原子 461 O GLY A 274 7.272 32.334 24.547 1.00 17.48原子 462 N TYR A 275 5.527 31.675 25.763 1.00 15.67原子 463 CA TYR A 275 4.892 32.965 25.802 1.00 16.24原子 464 CB TYR A 275 3.340 32.874 25.854 1.00 15.81原子 465 CG TYR A 275 2.838 32.446 24.503 1.00 17.73原子 466 CD1 TYR A 275 2.784 31.102 24.175 1.00 17.51原子 467 CE1 TYR A 275 2.384 30.722 22.919 1.00 20.42原子 468 CD2 TYR A 275 2.524 33.418 23.543 1.00 18.48原子 469 CE2 TYR A 275 2.140 33.017 22.279 1.00 20.02原子 470 CZ TYR A 275 2.065 31.690 21.989 1.00 19.42原子 471 OH TYR A 275 1.670 31.304 20.737 1.00 23.70原子 472 C TYR A 275 5.317 33.689 27.087 1.00 15.60原子 473 O TYR A 275 5.270 33.077 28.160 1.00 15.87

原子

类型残基？ # X Y Z OCC B原子 474 N GLY A 276 5.638 34.959 26.991 1.00 17.04原子 475 CA GLY A 276 5.978 35.692 28.190 1.00 17.48原子 476 C GLY A 276 5.988 37.183 28.020 1.00 19.17原子 477 O GLY A 276 5.226 37.751 27.278 1.00 16.76原子 478 N ILE A 277 6.893 37.805 28.811 1.00 18.66原子 479 CA ILE A 277 6.938 39.245 28.907 1.00 17.89原子 480 CB ILE A 277 6.413 39.745 30.256 1.00 19.63原子 481 CG2 ILE A 277 4.925 39.409 30.421 1.00 21.02原子 482 CG1 ILE A 277 7.212 39.101 31.390 1.00 20.19原子 483 CD1 ILE A 277 6.754 39.439 32.779 1.00 20.94原子 484 C ILE A 277 8.385 39.741 28.763 1.00 18.46原子 485 O ILE A 277 9.318 39.076 29.168 1.00 16.61原子 486 N GLN A 278 8.505 40.919 28.219 1.00 17.96原子 487 CA GLN A 278 9.743 41.629 28.051 1.00 19.65原子 488 CB GLN A 278 10.224 41.684 26.624 1.00 25.01原子 489 CG GLN A 278 11.692 41.405 26.382 1.00 28.24原子 490 CD GLN A 278 11.580 40.059 25.643 1.00 32.63原子 491 OE1 GLN A 278 11.660 40.060 24.422 1.00 33.32原子 492 NE2 GLN A 278 11.331 39.078 26.502 1.00 34.14原子 493 C GLN A 278 9.499 43.122 28.316 1.00 17.44原子 494 O GLN A 278 8.589 43.689 27.693 1.00 14.22原子 495 N ILE A 279 10.537 43.709 28.900 1.00 13.53原子 496 CA ILE A 279 10.471 45.146 29.090 1.00 15.82原子 497 CB ILE A 279 11.441 45.658 30.183 1.00 15.54原子 498 CG2 ILE A 279 11.402 47.166 30.140 1.00 15.97原子 499 CG1 ILE A 279 11.007 45.083 31.520 1.00 16.27原子 500 CD1 ILE A 279 11.940 45.388 32.661 1.00 17.52原子 501 C ILE A 279 10.745 45.847 27.771 1.00 16.97原子 502 O ILE A 279 11.741 45.578 27.115 1.00 16.40原子 503 N GLU A 280 9.824 46.719 27.370 1.00 17.63原子 504 CA GLU A 280 10.019 47.523 26.185 1.00 20.86原子 505 CB GLU A 280 8.744 47.778 25.395 1.00 23.07原子 506 CG GLU A 280 8.890 48.784 24.268 1.00 29.11原子 507 CD GLU A 280 9.843 48.327 23.189 1.00 32.61原子 508 OE1 GLU A 280 10.187 47.124 23.154 1.00 36.14原子 509 OE2 GLU A 280 10.293 49.127 22.343 1.00 34.84原子 510 C GLU A 280 10.599 48.892 26.605 1.00 18.21原子 511 O GLU A 280 11.426 49.511 25.941 1.00 16.53原子 512 N GLN A 281 10.088 49.380 27.716 1.00 18.36原子 513 NE2 GLN A 281 11.497 53.112 26.056 1.00 34.24原子 514 OE1 GLN A 281 10.702 55.093 26.755 1.00 36.11原子 515 CD GLN A 281 10.798 53.869 26.901 1.00 33.14原子 516 CG GLN A 281 10.120 53.163 28.056 1.00 29.67原子 517 CB GLN A 281 9.611 51.793 27.640 1.00 24.17原子 518 CA GLN A 281 10.509 50.675 28.207 1.00 21.85原子 518 C GLN A 281 10.385 50.730 29.723 1.00 22.08原子 520 O GLN A 281 9.444 50.170 30.275 1.00 19.43原子 521 N ILE A 282 11.379 51.377 30.337 1.00 19.26原子 522 CA ILE A 282 11.340 51.564 31.756 1.00 20.21原子 523 CB ILE A 282 12.456 50.838 32.501 1.00 23.17原子 524 CG2 ILE A 282 12.567 51.331 33.942 1.00 22.63原子 525 CG1 ILE A 282 12.183 49.337 32.486 1.00 24.53原子 526 CD1 ILE A 282 13.292 48.530 33.126 1.00 27.43原子 527 C ILE A 282 11.408 53.062 32.033 1.00 20.13

原子

类型残基？ # X Y Z OCC B原子 528 O ILE A 282 12.183 53.826 31.441 1.00 21.53原子 529 N ARG A 283 10.595 53.478 32.972 1.00 18.99原子 530 CA ARG A 283 10.541 54.878 33.353 1.00 20.71原子 531 CB ARG A 283 9.159 55.499 33.116 1.00 23.74原子 532 CG ARG A 283 8.779 55.516 31.645 1.00 28.61原子 533 CD ARG A 283 9.030 56.887 31.041 1.00 33.16原子 534 NE ARG A 283 9.596 56.759 29.712 1.00 37.40原子 535 CZ ARG A 283 9.199 57.449 28.659 1.00 40.44原子 536 NH1 ARG A 283 8.191 58.311 28.783 1.00 41.71原子 537 NH2 ARG A 283 9.800 57.245 27.492 1.00 41.03原子 538 C ARG A 283 10.826 54.930 34.844 1.00 20.40原子 539 O ARG A 283 10.049 54.339 35.566 1.00 17.37原子 540 N ILE A 284 11.881 55.634 35.220 1.00 18.94原子 541 CA ILE A 284 12.127 55.779 36.655 1.00 19.58原子 542 CB ILE A 284 13.582 55.519 37.053 1.00 20.09原子 543 CG2 ILE A 284 13.684 55.477 38.573 1.00 20.97原子 544 CG1 ILE A 284 14.178 54.254 36.460 1.00 20.86原子 545 CD1 ILE A 284 13.442 52.976 36.774 1.00 20.01原子 546 C ILE A 284 11.792 57.228 37.002 1.00 19.71原子 547 O ILE A 284 12.399 58.147 36.427 1.00 19.08原子 548 N LEU A 285 10.816 57.413 37.849 1.00 19.33原子 549 CA LEU A 285 10.379 58.729 38.276 1.00 20.90原子 550 CB LEU A 285 8.881 58.729 38.557 1.00 20.57原子 551 CG LEU A 285 8.020 58.220 37.391 1.00 18.92原子 552 CD1 LEU A 285 6.569 58.488 37.719 1.00 19.77原子 553 CD2 LEU A 285 8.426 58.759 36.039 1.00 18.79原子 554 C LEU A 285 11.153 59.078 39.542 1.00 22.65原子 555 O LEU A 285 10.861 58.536 40.585 1.00 21.09原子 556 N LYS A 286 12.179 59.897 39.370 1.00 23.47原子 557 CA LYS A 286 13.101 60.223 40.443 1.00 25.88原子 558 CB LYS A 286 14.400 60.777 39.830 1.00 24.64原子 559 CG LYS A 286 15.057 59.703 38.969 1.00 26.69原子 560 CD LYS A 286 16.105 60.262 38.032 1.00 28.58原子 561 CE LYS A 286 17.308 59.334 37.986 1.00 28.89原子 562 NZ LYS A 286 18.328 59.807 37.012 1.00 29.92原子 563 C LYS A 286 12.515 61.157 41.473 1.00 26.73原子 564 O LYS A 286 12.944 61.136 42.622 1.00 28.60原子 565 N SER A 287 11.543 61.980 41.133 1.00 25.80原子 566 CA SER A 287 10.969 62.865 42.158 1.00 26.18原子 567 CB SER A 287 11.627 64.249 42.056 1.00 26.60原子 568 OG SER A 287 11.272 64.767 40.796 1.00 28.18原子 569 C SER A 287 9.471 62.857 41.977 1.00 24.89原子 570 O SER A 287 8.996 62.358 40.947 1.00 25.47原子 571 N PRO A 288 8.739 63.268 42.989 1.00 26.04原子 572 CD PRO A 288 9.222 63.876 44.247 1.00 27.14原子 573 CA PRO A 288 7.294 63.276 42.938 1.00 26.70原子 574 CB PRO A 288 6.831 63.561 44.339 1.00 26.05原子 575 CG PRO A 288 8.010 63.972 45.128 1.00 27.69原子 576 C PRO A 288 6.826 64.313 41.928 1.00 27.00原子 577 O PRO A 288 7.522 65.301 41.666 1.00 27.28原子 578 N GLN A 289 5.681 64.051 41.341 1.00 25.80原子 579 CA GLN A 289 5.123 64.976 40.376 1.00 27.15原子 580 CB GLN A 289 4.021 64.214 39.628 1.00 27.78原子 581 CG GLN A 289 3.246 65.040 38.617 1.00 27.92

原子

类型残基？ # X Y Z OCC B原子 582 CD GIN A 289 4.207 65.636 37.616 1.00 28.41原子 583 OE1 GLN A 289 4.970 64.944 36.966 1.00 28.03原子 584 NE2 GLN A 289 4.179 66.966 37.505 1.00 32.04原子 585 C GLN A 289 4.553 66.194 41.093 1.00 27.84原子 586 O GLN A 289 3.693 66.017 41.943 1.00 27.12原子 587 N GLU A 290 4.962 67.414 40.766 1.00 30.72原子 588 OE2 GLU A 290 4.477 72.113 38.486 1.00 39.70原子 589 OE1 GLU A 290 6.067 72.564 39.857 1.00 40.48原子 590 CD GLU A 290 5.336 71.724 39.305 1.00 39.53原子 591 CG GLU A 290 5.461 70.253 39.660 1.00 37.94原子 592 CB GLU A 290 5.094 69.910 41.084 1.00 35.71原子 593 CA GLU A 290 4.384 68.595 41.401 1.00 33.44原子 594 C GLU A 290 2.912 68.679 40.978 1.00 32.66原子 595 O GLU A 290 2.615 68.487 39.807 1.00 32.60原子 596 N VAL A 291 2.027 68.929 41.928 1.00 32.52原子 597 CA VAL A 291 0.589 68.960 41.608 1.00 34.53原子 598 CB VAL A 291 0.016 67.667 42.214 1.00 34.68原子 599 CG1 VAL A 291 -0.992 67.828 43.317 1.00 33.99原子 600 CG2 VAL A 291 -0.509 66.742 41.114 1.00 33.97原子 601 C VAL A 291 -0.040 70.265 42.070 1.00 36.93原子 602 O VAL A 291 0.296 70.786 43.141 1.00 35.77原子 603 N LYS A 292 -0.879 70.860 41.231 1.00 38.91原子 604 NZ LYS A 292 0.250 74.239 36.361 1.00 47.09原子 605 CE LYS A 292 -0.459 74.753 37.563 1.00 45.89原子 606 CD LYS A 292 -1.298 73.665 38.215 1.00 45.49原子 607 CG LYS A 292 -1.226 73.759 39.722 1.00 44.08原子 608 CB LYS A 292 -2.197 72.809 40.397 1.00 42.31原子 609 CA LYS A 292 -1.595 72.078 41.589 1.00 41.28原子 610 C LYS A 292 -2.701 71.697 42.557 1.00 41.79原子 611 O LYS A 292 -3.085 70.535 42.624 1.00 42.72原子 612 N PRO A 293 -3.192 72.668 43.305 1.00 42.21原子 613 CD PRO A 293 -2.802 74.096 43.247 1.00 42.59原子 614 CA PRO A 293 -4.279 72.420 44.237 1.00 41.91原子 615 CB PRO A 293 -4.605 73.784 44.806 1.00 41.79原子 616 CG PRO A 293 -3.481 74.676 44.450 1.00 41.90原子 617 C PRO A 293 -5.441 71.807 43.474 1.00 41.40原子 618 O PRO A 293 -5.696 72.212 42.339 1.00 41.02原子 619 N GLY A 294 -6.059 70.755 44.003 1.00 40.85原子 620 CA GLY A 294 -7.176 70.123 43.332 1.00 41.30原子 621 C GLY A 294 -6.832 69.033 42.332 1.00 40.98原子 622 O GLY A 294 -7.688 68.185 42.061 1.00 41.17原子 623 N GLU A 295 -5.636 69.051 41.753 1.00 39.55原子 624 OE2 GLU A 295 -2.049 69.989 38.852 1.00 44.47原子 625 OE1 GLU A 295 -3.356 71.223 37.568 1.00 44.87原子 626 CD GLU A 295 -3.176 70.330 38.422 1.00 44.01原子 627 CG GLU A 295 -4.422 69.647 38.946 1.00 42.26原子 628 CB GLU A 295 -4.099 68.521 39.886 1.00 39.91原子 629 CA GLU A 295 -5.214 68.044 40.813 1.00 38.60原子 630 C GLU A 295 -4.641 66.825 41.552 1.00 36.59原子 631 O GLU A 295 -4.281 66.871 42.720 1.00 36.85原子 632 N LYS A 296 -4.418 65.777 40.773 1.00 33.95原子 633 CA LYS A 296 -3.782 64.575 41.294 1.00 30.68原子 634 CB LYS A 296 -4.755 63.656 41.996 1.00 31.56原子 635 CG LYS A 296 -5.992 63.312 41.185 1.00 32.22

原子

类型残基？ # X Y Z OCC B原子 636 CD LYS A 296 -7.149 32.924 42.075 1.00 32.13原子 537 CE LYS A 296 -8.161 62.034 41.381 1.00 33.43原子 638 NZ LYS A 296 -8.106 62.091 39.904 1.00 34.90原子 639 C LYS A 296 -3.028 63.883 40.167 1.00 28.79原子 640 O LYS A 296 -3.275 64.112 38.986 1.00 27.50原子 641 N HIS A 297 -1.999 63.135 40.580 1.00 25.20原子 642 CA HIS A 297 -1.216 62.396 39.584 1.00 20.71原子 643 CB HIS A 297 -0.148 63.267 38.981 1.00 20.06原子 644 CG HIS A 297 0.824 62.612 38.054 1.00 18.56原子 645 CD2 HIS A 297 1.808 61.741 38.309 1.00 15.40原子 646 ND1 HIS A 297 0.863 62.878 36.701 1.00 18.13原子 647 CE1 HIS A 297 1.844 62.180 36.160 1.00 17.97原子 648 NE2 HIS A 297 2.416 61.463 37.105 1.00 19.72原子 649 C HIS A 297 -0.730 61.151 40.292 1.00 19.15原子 650 O HIS A 297 -0.477 61.256 41.493 1.00 18.54原子 651 N TYR A 298 -0.557 60.030 39.580 1.00 18.21原子 652 CA TYR A 298 -0.155 58.824 40.330 1.00 16.80原子 653 CB TYR A 298 -0.193 57.594 39.437 1.00 16.21原子 654 CG TYR A 298 0.940 57.509 38.444 1.00 17.23原子 655 CD1 TYR A 298 2.077 56.755 38.742 1.00 15.56原子 656 CE1 TYR A 298 3.094 56.667 37.821 1.00 15.21原子 657 CD2 TYR A 298 0.881 58.184 37.236 1.00 16.74原子 658 CE2 TYR A 298 1.913 58.098 36.337 1.00 16.91原子 659 CZ TYR A 298 3.022 57.325 36.636 1.00 16.49原子 560 OH TYR A 298 4.046 57.260 35.719 1.00 18.10原子 661 C TYR A 298 1.185 58.981 41.029 1.00 16.63原子 662 O TYR A 298 1.351 58.330 42.073 1.00 16.70原子 663 N ASN A 299 2.112 59.766 40.523 1.00 16.99原子 664 CA ASN A 299 3.423 60.011 41.085 1.00 18.59原子 665 CB ASN A 299 4.463 60.166 39.965 1.00 18.92原子 666 CG ASN A 299 5.890 60.214 40.494 1.00 18.76原子 667 OD1 ASN A 299 6.205 59.456 41.412 1.00 18.23原子 668 ND2 ASN A 299 6.748 61.070 39.950 1.00 19.19原子 669 C ASN A 299 3.513 61.224 42.009 1.00 20.06原子 670 O ASN A 299 4.606 61.723 42.362 1.00 18.80原子 671 N MET A 300 2.395 61.732 42.509 1.00 20.80原子 672 CA MET A 300 2.449 62.886 43.417 1.00 22.77原子 673 CB MET A 300 1.115 63.568 43.608 1.00 23.16原子 674 CG MET A 300 0.029 62.931 44.436 1.00 25.10原子 675 SD MET A 300 -1.590 63.723 44.020 1.00 28.00原子 676 CE MET A 300 -2.640 62.839 45.144 1.00 24.04原子 677 C MET A 300 3.012 62.458 44.767 1.00 21.89原子 678 O MET A 300 2.833 61.314 45.160 1.00 18.53原子 679 N ALA A 301 3.369 63.413 45.606 1.00 22.83原子 680 CA ALA A 301 3.872 63.134 46.926 1.00 23.87原子 681 CB ALA A 301 4.450 64.429 47.484 1.00 23.72原子 682 C ALA A 301 2.841 62.580 47.893 1.00 24.63原子 683 O ALA A 301 3.085 61.615 48.637 1.00 23.46原子 684 N LYS A 302 1.652 63.178 17.913 1.00 26.09原子 685 CA LYS A 302 0.645 62.719 48.859 1.00 26.00原子 686 CB LYS A 302 -0.215 63.890 49.329 1.00 28.38原子 687 CG LYS A 302 0.554 65.188 49.528 1.00 29.29原子 688 CD LYS A 302 1.697 65.125 50.505 1.00 30.98原子 689 CE LYS A 302 2.522 66.407 50.512 1.00 32.65

原子

类型残基？ # X Y Z OCC B原子 690 NZ LYS A 302 2.617 67.085 49.191 1.00 33.62原子 691 C LYS A 302 -0.198 61.580 48.291 1.00 25.55原子 692 O LYS A 302 -0.295 61.399 47.087 1.00 24.72原子 693 N SER A 303 -0.793 60.835 49.202 1.00 24.45原子 694 CA SER A 303 -1.621 59.696 48.836 1.00 25.50原子 695 CB SER A 303 -1.434 58.619 49.878 1.00 26.64原子 696 OG SER A 303 -1.869 59.030 51.149 1.00 31.03原子 697 C SER A 303 -3.052 60.182 48.666 1.00 25.87原子 698 O SER A 303 -3.396 61.256 49.185 1.00 22.73原子 699 N TYR A 304 -3.814 59.454 47.855 1.00 24.98原子 700 CA TYR A 304 -5.181 59.862 47.550 1.00 24.27原子 701 CB TYR A 304 -5.140 60.449 46.132 1.00 25.45原子 702 CG TYR A 304 -6.466 61.015 45.686 1.00 28.35原子 703 CD1 TYR A 304 -6.762 62.357 45.929 1.00 29.08原子 704 CE1 TYR A 304 -7.978 62.891 45.552 1.00 29.59原子 705 CD2 TYR A 304 -7.426 60.214 45.085 1.00 27.54原子 706 CE2 TYR A 304 -8.630 60.754 44.702 1.00 29.33原子 707 CZ TYR A 304 -8.893 62.094 44.944 1.00 29.27原子 708 OH TYR A 304 -10.103 62.610 44.578 1.00 32.08原子 709 C TYR A 304 -6.192 58.769 47.721 1.00 25.14原子 710 O TYR A 304 -5.707 57.735 47.336 1.000 20.08原子 711 N PRO A 305 -7.356 59.000 48.279 1.00 26.60原子 712 CD PRO A 305 -8.396 58.001 48.459 1.00 25.22原子 713 CA PRO A 305 -7.989 60.240 48.637 1.00 27.02原子 714 CB PRO A 305 -9.492 60.083 48.491 1.00 25.75原子 715 CG PRO A 305 -9.707 58.646 48.789 1.00 25.74原子 716 C PRO A 305 -7.625 60.782 50.007 1.00 28.63原子 717 O PRO A 305 -7.922 61.915 50.430 1.00 28.68原子 718 N ASN A 306 -6.988 59.904 50.783 1.00 29.14原子 719 CA ASN A 306 -6.713 60.273 52.173 1.00 30.26原子 720 CB ASN A 306 -7.350 59.232 53.075 1.00 32.58原子 721 CG ASN A 306 -6.766 58.861 52.676 1.00 35.48原子 722 OD1 ASN A 306 -9.661 59.712 52.612 1.00 36.24原子 723 ND2 ASN A 306 -8.992 57.588 52.368 1.00 36.01原子 724 C ASN A 306 -5.229 60.477 52.375 1.00 29.94原子 725 O ASN A 306 -4.444 59.536 52.439 1.00 28.29原子 726 N GLU A 307 -4.819 61.724 52.507 1.00 29.94原子 727 OE2 GLU A 307 -2.295 66.669 51.130 1.00 41.44原子 728 OE1 GLU A 307 -2.711 66.223 53.238 1.00 41.35原子 729 CD GLU A 307 -2.656 65.896 52.037 1.00 40.02原子 730 CG GLU A 307 -3.034 64.464 51.678 1.00 38.20原子 731 CB GLU A 307 -3.401 63.683 52.914 1.00 33.77原子 732 CA GLU A 307 -3.461 62.152 52.717 1.00 32.32原子 733 C GLU A 307 -2.770 61.594 53.949 1.00 30.24原子 734 O GLU A 307 -1.542 61.522 53.970 1.00 30.44原子 735 N GLU A 308 -3.513 61.273 54.984 1.00 29.39原子 736 OE2 GLU A 308 -6.099 61.320 55.501 1.00 38.47原子 737 OE1 GLU A 308 -7.129 59.531 56.089 1.00 37.95原子 738 CD GLU A 308 -6.176 60.330 56.250 1.00 36.70原子 739 CG GLU A 308 -5.168 60.057 57.322 1.00 35.39原子 740 CB GLU A 308 -3.931 60.913 57.384 1.00 33.10原子 741 CA GLU A 308 -2.950 60.795 56.224 1.00 29.98原子 742 C GLU A 308 -2.487 59.353 56.093 1.00 28.21原子 743 O GLU A 308 -1.607 58.963 56.857 1.00 26.31

原子

类型残基？ # X Y Z OCC B原子 744 N LYS A 309 -3.004 58.626 55.094 1.00 24.19原子 745 CA LYS A 309 -2.648 57.216 55.015 1.00 24.20原子 746 CB LYS A 309 -3.711 56.413 54.263 1.00 24.89原子 747 CG LYS A 309 -5.098 56.344 54.884 1.00 27.73原子 748 CD LYS A 309 -5.089 56.571 56.361 1.00 31.22原子 749 CE LYS A 309 -6.317 56.792 57.162 1.00 32.52原子 750 NZ LYS A 309 -6.638 55.694 58.107 1.00 34.53原子 751 C LYS A 309 -1.285 57.012 54.387 1.00 21.98原子 752 O LYS A 309 -0.832 57.851 53.636 1.00 22.27原子 753 N ASP A 310 -0.675 55.855 54.593 1.00 20.75原子 754 CA ASP A 310 0.605 55.530 53.953 1.00 20.70原子 755 CB ASP A 310 1.130 54.173 54.501 1.00 20.19原子 756 CG ASP A 310 2.615 54.085 54.167 1.00 22.21原子 757 OD1 ASP A 310 3.335 54.893 54.831 1.00 24.55原子 758 OD2 ASP A 310 3.040 53.306 53.292 1.00 18.20原子 759 C ASP A 310 0.474 55.419 52.450 1.00 19.43原子 760 O ASP A 310 1.385 55.706 51.651 1.00 20.19原子 751 N ALA A 311 -0.727 55.044 51.990 1.00 18.69原子 762 CA ALA A 311 -0.947 54.834 50.572 1.00 17.44原子 763 CB ALA A 311 -0.991 53.296 50.429 1.00 16.55原子 764 C ALA A 311 -2.302 55.316 50.028 1.00 16.60原子 765 O ALA A 311 -3.221 55.655 50.751 1.00 12.08原子 766 N TRP A 312 -2.339 55.302 48.711 1.00 17.19原子 767 CA TRP A 312 -3.555 55.615 47.963 1.00 15.85原子 768 CB TRP A 312 -3.236 55.569 46.483 1.00 14.37原子 769 CG TRP A 312 -2.713 56.757 45.760 1.00 16.10原子 770 CD2 TRP A 312 -3.413 57.526 44.772 1.00 16.24原子 771 CE2 TRP A 312 -2.554 58.554 44.342 1.00 17.46原子 772 CE3 TRP A 312 -4.685 57.427 44.204 1.00 17.59原子 773 CD1 TRP A 312 -1.492 57.360 45.884 1.00 15.52原子 774 NE1 TRP A 312 -1.381 58.440 45.050 1.00 16.75原子 775 CZ2 TRP A 312 -2.900 59.475 43.357 1.00 17.80原子 776 CZ3 TRP A 312 -5.022 58.348 43.228 1.00 15.80原子 777 CH2 TRP A 312 -4.154 59.345 42.828 1.00 17.23原子 778 C TRP A 312 -4.562 54.502 48.204 1.00 16.18原子 779 O TRP A 312 -4.185 53.393 48.559 1.00 14.62原子 780 N ASP A 313 -5.841 54.750 47.906 1.00 17.14原子 781 CA ASP A 313 -6.817 53.682 47.741 1.00 17.42原子 782 CB ASP A 313 -8.170 54.298 47.343 1.00 19.70原子 783 CG ASP A 313 -9.106 53.244 46.797 1.00 22.89原子 784 OD1 ASP A 313 -9.073 52.935 45.598 1.00 24.60原子 785 OD2 ASP A 313 -9.841 52.697 47.623 1.00 26.78原子 786 C ASP A 313 -6.273 52.903 46.539 1.00 14.58原子 787 O ASP A 313 -6.033 53.570 45.533 1.00 14.85原子 788 N VAL A 314 -6.101 51.596 46.588 1.00 15.33原子 789 CA VAL A 314 -5.434 50.915 45.475 1.00 14.25原子 790 CB VAL A 314 -5.067 49.478 45.891 1.00 13.94原子 791 CG1 VAL A 314 -6.266 48.578 46.107 1.00 12.58原子 792 CG2 VAL A 314 -4.090 48.891 44.864 1.00 12.94原子 793 C VAL A 314 -6.110 50.966 44.129 1.00 14.22原子 794 O VAL A 314 -5.480 51.152 43.099 1.00 13.01原子 795 N LYS A 315 -7.435 50.819 44.092 1.00 16.35原子 796 NZ LYS A 315 -12.342 48.884 46.668 1.00 27.78原子 797 CE LYS A 315 -11.908 48.279 45.365 1.00 26.99

原子

类型残基？ # X Y Z OCC B原子 798 CD LYS A 315 -11.499 49.287 44.334 1.00 24.72原子 799 CG LYS A 315 -10.084 49.278 43.775 1.00 21.52原子 800 CB LYS A 315 -9.700 50.621 43.204 1.00 18.30原子 801 CA LYS A 315 -6.223 50.682 42.870 1.00 17.01原子 802 C LYS A 315 -8.111 52.273 42.255 1.00 15.42原子 803 O LYS A 315 -7.967 52.432 41.065 1.00 14.82原子 804 N MET A 316 -8.189 53.317 43.095 1.00 16.67原子 805 CA MET A 316 -8.023 54.673 42.531 1.00 16.96原子 806 CB MET A 316 -9.395 55.717 43.579 1.00 19.66原子 807 CG MET A 316 -9.874 55.616 13.966 1.00 21.49原子 808 SD MET A 316 -10.303 56.858 45.216 1.00 25.95原子 809 CE MET A 316 -11.921 56.212 45.655 1.00 23.70原子 810 C MET A 316 -6.624 54.927 41.996 1.00 16.13原子 811 O MET A 316 -6.463 55.672 41.038 1.00 16.38原子 812 N LEU A 317 -5.583 54.315 42.552 1.00 15.29原子 813 CA LEU A 317 -4.219 54.490 42.078 1.00 13.26原子 814 CB LEU A 317 -3.200 53.915 43.097 1.00 11.74原子 815 CG LEU A 317 -1.733 54.036 42.672 1.00 12.04原子 816 CD1 LEU A 317 -1.323 55.505 42.512 1.00 10.99原子 817 CD2 LEU A 317 -0.861 53.326 43.698 1.00 11.54原子 818 C LEU A 317 -4.079 53.785 40.755 1.00 12.38原子 819 O LEU A 317 -3.526 54.334 39.819 1.00 14.48原子 820 N LEU A 318 -4.637 52.580 40.616 1.00 12.87原子 821 CA LEU A 318 -4.561 51.890 39.326 1.00 12.84原子 822 CB LEU A 318 -5.112 50.457 39.453 1.00 12.79原子 823 CG LEU A 318 -4.966 49.629 38.170 1.00 14.82原子 824 CD1 LEU A 318 -3.531 49.542 37.700 1.00 15.86原子 825 CD2 LEU A 318 -5.558 48.241 38.355 1.00 14.73原子 826 C LEU A 318 -5.230 52.673 38.218 1.00 12.07原子 827 O LEU A 318 -4.780 52.829 37.099 1.00 12.74原子 828 N GLU A 319 -6.420 53.193 38.511 1.00 15.24原子 829 OE2 GLU A 319 -11.483 52.210 39.220 1.00 28.26原子 830 OE1 GLU A 319 -10.797 54.093 40.042 1.00 29.42原子 831 CD GLU A 319 -10.674 53.181 39.193 1.00 27.45原子 832 CG GLU A 319 -9.561 53.233 38.177 1.00 24.55原子 833 CB GLU A 319 -8.553 54.375 38.270 1.00 18.18原子 834 CA GLU A 319 -7.199 54.025 37.614 1.00 15.25原子 835 C GLU A 319 -6.421 55.288 37.289 1.00 14.06原子 836 O GLU A 319 -6.317 55.697 36.141 1.00 13.57原子 837 N GLN A 320 -5.879 55.947 38.303 1.00 14.48原子 838 CA GLN A 320 -5.086 57.164 38.073 1.00 15.95原子 839 CB GLN A 320 -4.631 57.772 39.413 1.00 17.37原子 840 CG GLN A 320 -3.969 59.147 39.262 1.00 20.30原子 841 CD GLN A 320 -4.917 60.189 38.681 1.00 20.82原子 842 OE1 GLN A 320 -6.069 60.198 39.101 1.00 22.55原子 843 NE2 GLN A 320 -4.480 61.016 37.768 1.00 20.50原子 844 C GLN A 320 -3.896 56.849 37.206 1.00 15.14原子 845 O GLN A 320 -3.545 57.572 36.274 1.00 16.35原子 846 N PHE A 321 -3.178 55.751 37.535 1.00 14.19原子 847 CA PHE A 321 -1.997 55.416 36.728 1.00 13.62原子 848 CB PHE A 321 -1.389 54.100 37.277 1.00 14.84原子 849 CG PHE A 321 -0.286 53.531 36.462 1.00 14.25原子 850 CD1 PHE A 321 0.874 54.232 36.256 1.00 16.53原子 851 CD2 PHE A 321 -0.407 52.275 35.889 1.00 15.71

原子

类型残基？ # X Y Z OCC B原子 852 CE1 PHE A 321 1.915 53.714 35.499 1.00 16.96原子 853 CE2 PHE A 321 0.594 51.737 35.109 1.00 16.98原子 854 CZ PHE A 321 1.760 52.464 34.920 1.00 19.64原子 855 C PHE A 321 -2.367 55.265 35.284 1.00 15.37原子 856 O PHE A 321 -1.743 55.838 34.391 1.00 17.95原子 857 N SER A 322 -3.440 54.502 35.011 1.00 15.65原子 858 CA SER A 322 -3.862 54.261 33.650 1.00 16.47原子 859 CB SER A 322 -5.052 53.312 33.545 1.00 17.62原子 860 OG SER A 322 -4.956 52.111 34.281 1.00 21.90原子 861 C SER A 322 -4.219 55.608 32.980 1.00 15.02原子 862 O SER A 322 -3.836 55.773 31.839 1.00 15.73原子 863 N PHE A 323 -4.855 56.499 33.694 1.00 15.76原子 864 CA PHE A 323 -5.163 57.831 33.153 1.00 17.15原子 865 CB PHE A 323 -5.953 58.697 34.136 1.00 18.22原子 866 CG PHE A 323 -6.374 60.050 33.604 1.00 20.68原子 867 CD1 PHE A 323 -5.660 61.195 33.861 1.00 21.45原子 868 CD2 PHE A 323 -7.524 60.161 32.852 1.00 22.31原子 869 CE1 PHE A 323 -6.032 62.425 33.329 1.00 22.60原子 870 CE2 PHE A 323 -7.945 61.384 32.325 1.00 24.15原子 871 CZ PHE A 323 -7.175 62.502 32.558 1.00 23.26原子 872 C PHE A 323 -3.897 58.570 32.756 1.00 18.08原子 873 O PHE A 323 -3.807 59.053 31.648 1.00 15.95原子 874 N ASP A 324 -2.913 58.698 33.662 1.00 19.20原子 875 CA ASP A 324 -1.748 59.521 33.405 1.00 20.57原子 876 CB ASP A 324 -0.994 59.740 34.742 1.00 23.05原子 877 CG ASP A 324 -1.773 60.624 35.687 1.00 23.08原子 878 OD1 ASP A 324 -1.894 60.419 36.896 1.00 22.69原子 879 OD2 ASP A 324 -2.335 61.620 35.188 1.00 26.34原子 880 C ASP A 324 -0.746 58.999 32.402 1.00 21.82原子 881 O ASP A 324 -0.058 59.793 31.764 1.00 21.73原子 882 N ILE A 325 -0.672 57.679 32.240 1.00 21.33原子 883 CA ILE A 325 0.264 57.038 31.339 1.00 22.61原子 884 CB ILE A 325 0.922 55.889 32.161 1.00 25.69原子 885 CG2 ILE A 325 0.154 54.579 32.043 1.00 24.65原子 886 CG1 ILE A 325 2.370 55.730 31.765 1.00 26.90原子 887 CD1 ILE A 325 3.369 56.465 32.631 1.00 27.55原子 888 C ILE A 325 -0.394 56.551 30.073 1.00 22.34原子 889 O ILE A 325 0.238 55.950 29.209 1.00 19.22原子 890 N ALA A 326 -1.663 56.970 29.849 1.00 21.30原子 891 CA ALA A 326 -2.412 56.538 28.677 1.00 21.14原子 892 CB ALA A 326 -3.743 57.301 28.568 1.00 20.96原子 893 C ALA A 326 -1.701 56.616 27.350 1.00 20.02原子 894 O ALA A 326 -1.716 55.660 26.557 1.00 18.13原子 895 N GLU A 327 -1.087 57.750 27.055 1.00 21.17原子 896 OE2 GLU A 327 1.606 59.498 22.827 1.00 38.00原子 897 OE1 GLU A 327 -0.468 59.073 22.310 1.00 37.16原子 898 CD GLU A 327 0.389 59.482 23.114 1.00 35.40原子 899 CG GLU A 327 -0.062 59.993 24.456 1.00 33.57原子 900 CB GLU A 327 0.333 59.223 25.685 1.00 26.72原子 901 CA GLU A 327 -0.310 57.845 25.805 1.00 23.82原子 902 C GLU A 327 0.748 56.760 25.705 1.00 20.97原子 903 O GLU A 327 0.932 56.156 24.626 1.00 20.68原子 904 N GLU A 328 1.536 56.501 26.758 1.00 20.00原子 905 OE2 GLU A 328 6.485 57.857 28.558 1.00 20.00

原子

类型残基？ # X Y Z OCC B原子 906 OE1 GLU A 328 5.550 56.151 29.650 1.00 20.00原子 907 CD GLU A 328 5.561 56.965 28.651 1.00 20.00原子 908 CG GLU A 328 4.474 56.875 27.579 1.00 20.00原子 909 CB GLU A 328 3.625 55.608 27.694 1.00 20.00原子 910 CA GLU A 328 2.584 55.483 26.582 1.00 20.00原子 911 C GLU A 328 1.966 54.088 26.633 1.00 20.00原子 912 O GLU A 328 2.420 53.176 25.932 1.00 20.00原子 913 N ALA A 329 0.930 53.900 27.438 1.00 19.57原子 914 CA ALA A 329 0.280 52.586 27.501 1.00 21.09原子 915 CB ALA A 329 -0.828 52.628 28.545 1.00 20.52原子 916 C ALA A 329 -0.292 52.148 26.167 1.00 21.74原子 917 O ALA A 329 -0.450 50.963 25.860 1.00 22.92原子 918 N SER A 330 -0.593 53.077 25.263 1.00 22.47原子 919 CA SER A 330 -1.185 52.807 23.972 1.00 23.55原子 920 CB SER A 330 -1.669 54.151 23.397 1.00 23.31原子 921 OG SER A 330 -0.614 54.856 22.781 1.00 25.74原子 922 C SER A 330 -0.209 52.129 23.038 1.00 23.79原子 923 O SER A 330 -0.545 51.533 22.032 1.00 23.93原子 924 N LYS A 331 1.073 52.141 23.385 1.00 20.00原子 925 NZ LYS A 331 4.949 57.241 21.295 1.00 20.00原子 926 CE LYS A 331 3.827 56.290 21.276 1.00 20.00原子 927 CD LYS A 331 4.162 54.958 21.950 1.00 20.00原子 928 CG LYS A 331 2.995 53.972 21.928 1.00 20.00原子 929 CB LYS A 331 3.327 52.639 22.588 1.00 20.00原子 930 CA LYS A 331 2.147 51.613 22.574 1.00 20.00原子 931 C LYS A 331 2.659 50.261 22.982 1.00 20.00原子 932 O LYS A 331 3.484 49.683 23.278 1.00 20.00原子 933 N VAL A 332 2.207 49.748 24.112 1.00 21.24原子 934 CA VAL A 332 2.660 48.458 24.592 1.00 19.62原子 935 CB VAL A 332 3.467 48.639 25.896 1.00 20.18原子 936 CG1 VAL A 332 4.816 49.290 25.660 1.00 19.67原子 937 CG2 VAL A 332 2.651 49.433 26.897 1.00 18.82原子 938 C VAL A 332 1.495 47.533 24.905 1.00 18.19原子 939 O VAL A 332 0.344 47.965 24.964 1.00 18.61原子 940 N CYS A 333 1.816 46.274 25.098 1.00 16.72原子 941 CA CYS A 333 0.869 45.245 25.475 1.00 18.08原子 942 CB CYS A 333 1.522 43.872 25.365 1.00 20.13原子 943 SG CYS A 333 0.694 42.448 26.048 1.00 23.29原子 944 C CYS A 333 0.346 45.494 26.878 1.00 16.83原子 945 O CYS A 333 -0.855 45.347 27.075 1.00 15.63原子 946 N LEU A 334 1.226 45.820 27.841 1.00 12.87原子 947 CA LEU A 334 0.838 46.094 29.187 1.00 12.88原子 948 CB LEU A 334 0.857 44.925 30.157 1.00 13.67原子 949 CG LEU A 334 0.004 43.686 29.867 1.00 12.92原子 950 CD2 LEU A 334 0.432 42.513 30.699 1.00 9.29原子 951 CD2 LEU A 334 -1.465 44.030 30.158 1.00 10.80原子 952 C LEU A 334 1.778 47.151 29.816 1.00 14.90原子 953 O LEU A 334 2.929 47.313 29.428 1.00 13.88原子 954 N ALA A 335 1.203 47.856 30.778 1.00 14.03原子 955 CA ALA A 335 1.920 48.854 31.544 1.00 14.38原子 956 CB ALA A 335 1.292 50.235 31.381 1.00 15.95原子 957 C ALA A 335 1.859 48.404 32.991 1.00 13.27原子 958 O ALA A 335 0.794 48.020 33.435 1.00 14.32原子 959 N HIS A 336 2.936 48.458 33.750 1.00 12.02

原子

类型残基？ # X Y Z OCC B原子 960 CA HIS A 336 2.886 48.039 35.141 1.00 10.67原子 961 CB HIS A 336 3.543 46.655 35.2S2 1.00 9.55原子 962 CG HIS A 336 3.104 45.903 36.449 1.00 12.03原子 963 CD2 HIS A 336 2.026 45.099 36.601 1.00 9.22原子 964 ND1 HIS A 336 3.730 45.915 37.684 1.00 11.53原子 965 CE1 HIS A 336 3.048 45.186 38.533 1.00 8.45原子 966 NE2 HIS A 336 1.995 44.711 37.891 1.00 12.17原子 967 C HIS A 336 3.596 49.099 36.001 1.00 13.40原子 968 O HIS A 336 4.669 49.576 35.641 1.00 13.52原子 969 N LEU A 337 2.987 49.473 37.104 1.00 12.61原子 970 CA LEU A 337 3.514 50.440 38.026 1.00 12.83原子 971 CB LEU A 337 2.357 51.336 38.563 1.00 13.25原子 972 CG LEU A 337 2.688 52.163 39.816 1.00 14.22原子 973 CD1 LEU A 337 3.886 53.054 39.540 1.00 14.34原子 974 CD2 LEU A 337 1.489 53.027 40.232 1.00 12.48原子 975 C LEU A 337 4.137 49.730 39.243 1.00 11.76原子 976 O LEU A 337 3.486 48.887 39.833 1.00 10.29原子 977 N PHE A 338 5.396 50.012 39.548 1.00 11.12原子 978 CA PHE A 338 6.001 49.502 40.775 1.00 9.77原子 979 CB PHE A 338 7.378 48.877 40.584 1.00 10.95原子 980 CG PHE A 338 7.336 47.661 39.688 1.00 10.01原子 981 CD1 PHE A 338 7.341 47.745 38.336 1.00 6.77原子 982 CD2 PHE A 338 7.147 46.392 40.263 1.00 10.50原子 983 CE1 PHE A 338 7.261 46.629 37.530 1.00 8.39原子 984 CE2 PHE A 338 7.260 45.254 39.504 1.00 7.33原子 985 CZ PHE A 338 7.257 45.387 38.135 1.00 9.45原子 986 C PHE A 338 6.093 50.673 41.742 1.00 10.02原子 987 O PHE A 338 6.621 51.737 41.430 1.00 11.99原子 988 N THR A 339 5.501 50.493 42.897 1.00 9.73原子 989 CA THR A 339 5.455 51.468 43.940 1.00 12.72原子 990 CB THR A 339 4.053 52.092 44.003 1.00 15.30原子 991 0G1 EHR A 339 4.060 53.246 44.828 1.00 16.97原子 992 CG2 THR A 339 3.048 51.044 44.495 1.00 15.12原子 993 C THR A 339 5.886 50.830 45.261 1.00 12.86原子 994 O THR A 339 6.169 49.638 45.386 1.00 12.05原子 995 N TYR A 340 5.954 51.663 46.268 1.00 11.17原子 996 C THR A 340 6.323 51.315 47.616 1.00 11.82原子 997 CB TYR A 340 7.823 51.632 47.844 1.00 10.81原子 998 CG TYR A 340 8.342 51.050 49.121 1.00 11.94原子 999 CD1 TYR A 340 8.766 49.717 49.157 1.00 13.34原子 1000 CE1 TYR A 340 9.228 49.144 50.342 1.00 13.22原子 1001 CD2 TYR A 340 8.375 51.795 50.286 1.00 11.57原子 1002 CE2 TYR A 340 8.862 51.239 51.481 1.00 13.34原子 1003 CZ TYR A 340 9.294 49.929 51.474 1.00 12.53原子 1004 OH TYR A 340 9.708 49.349 52.630 1.00 13.01原子 1005 C TYR A 340 5.422 52.066 48.560 1.00 12.56原子 1006 O TYR A 340 5.784 53.138 49.086 1.00 13.24原子 1007 N GLN A 341 4.248 51.479 48.801 1.00 12.63原子 1008 CA GLN A 341 3.279 52.124 49.697 1.00 12.73原子 1009 CB GLN A 341 2.457 53.199 48.996 1.00 15.96原子 1010 CG GLN A 341 1.630 52.745 47.790 1.00 12.86原子 1011 CD GLN A 341 1.063 53.915 47.015 1.00 14.37原子 1012 OE1 GLN A 341 0.019 54.455 47.412 1.00 14.26原子 1013 NE2 GLN A 341 1.690 54.336 45.913 1.00 12.87

原子

类型残基？ # X Y Z OCC B原子 1014 C GLN A 341 2.409 51.026 50.281 1.00 13.05原子 1015 O GLN A 341 2.135 50.001 49.651 1.00 12.36原子 1016 N ASP A 342 2.036 51.214 51.518 1.00 11.62原子 1017 CA ASP A 342 1.313 50.221 52.293 1.00 12.36原子 1018 CB ASP A 342 1.766 50.350 53.748 1.00 11.58原子 1019 CG ASP A 342 1.603 49.084 54.533 1.00 14.83原子 1020 OD1 ASP A 342 1.136 48.053 53.979 1.00 12.25原子 1021 OD2 ASP A 342 1.976 49.034 55.734 1.00 16.16原子 1022 C ASP A 342 -0.202 50.344 52.159 1.00 13.76原子 1023 O ASP A 342 -0.850 50.940 53.016 1.00 10.06原子 1024 N PHE A 343 -0.705 49.804 51.047 1.00 12.77原子 1025 CA PHE A 343 -2.123 49.686 50.828 1.00 13.67原子 1026 CB PHE A 343 -2.407 48.846 49.572 1.00 11.23原子 1027 CG PHE A 343 -1.813 49.447 48.336 1.00 13.10原子 1028 CD1 PHE A 343 -2.070 50.761 47.978 1.00 11.42原子 1029 CD2 PHE A 343 -0.968 48.703 47.519 1.00 11.91原子 1030 CE1 PHE A 343 -1.494 51.298 46.845 1.00 11.83原子 1031 CE2 PHE A 343 -0.431 49.235 46.395 1.00 13.17原子 1032 CZ PHE A 343 -0.693 50.547 46.011 1.00 11.97原子 1033 C PHE A 343 -2.827 49.073 52.018 1.00 13.82原子 1034 O PHE A 343 -2.411 48.111 52.663 1.00 11.97原子 1035 N ASP A 344 -3.976 49.646 52.364 1.00 14.70原子 1036 CA ASP A 344 -4.734 49.159 53.500 1.00 16.30原子 1037 CB ASP A 344 -6.066 49.896 53.688 1.00 19.86原子 1038 CG ASP A 344 -5.919 51.270 54.287 1.00 24.51原子 1039 OD1 ASP A 344 -4.851 51.804 54.586 1.00 24.70原子 1040 OD2 ASP A 344 -6.983 51.916 54.436 1.00 27.18原子 1041 C ASP A 344 -5.093 47.675 53.396 1.00 13.85原子 1042 O ASP A 344 -5.208 47.157 52.310 1.00 9.77原子 1043 N MET A 345 -5.213 47.069 54.564 1.00 13.16原子 1044 CA MET A 345 -5.708 45.753 54.800 1.00 17.11原子 1045 CB MET A 345 -7.235 45.710 54.450 1.00 23.01原子 1046 C GET A 345 -7.944 46.687 55.406 1.00 28.99原子 1047 SD MET A 345 -9.349 45.913 56.215 1.00 39.05原子 1048 CE MET A 345 -9.993 47.308 57.172 1.00 36.28原子 1049 C MET A 345 -4.992 44.658 54.023 1.00 16.11原子 1050 O MET A 345 -5.586 43.729 53.496 1.00 11.01原子 1051 N GLY A 346 -3.649 44.811 53.976 1.00 13.02原子 1052 CA GLY A 346 -2.848 43.775 53.364 1.00 12.48原子 1053 C GLY A 346 -2.754 43.637 51.897 1.00 10.57原子 1054 O GLY A 346 -2.092 42.654 51.492 1.00 10.20原子 1055 N THR A 347 -3.392 44.516 51.092 1.00 10.34原子 1056 CA THR A 347 -3.236 44.419 49.645 1.00 10.83原子 1057 CB THR A 347 -4.204 45.426 48.958 1.00 11.57原子 1058 OG1 THR A 347 -5.515 45.104 49.474 1.00 11.02原子 1059 CG2 THR A 347 -4.265 45.214 47.479 1.00 9.59原子 1060 C THR A 347 -1.836 44.663 49.119 1.00 11.95原子 1061 O THR A 347 -1.160 45.651 49.506 1.00 10.72原子 1062 N LEU A 348 -1.100 43.853 48.171 1.00 9.29原子 1063 CA LEU A 348 -0.082 43.950 47.585 1.00 11.62原子 1064 CB LEU A 348 0.550 42.518 47.580 1.00 11.68原子 1065 CG LEU A 348 0.940 41.992 48.967 1.00 13.21原子 1066 CD1 LEU A 348 1.053 40.466 48.924 1.00 13.82原子 1067 CD2 LEU A 348 2.282 42.599 49.398 1.00 13.80

原子

类型残基？ # X Y Z OCC B原子 1068 C LEU A 348 -0.066 44.478 46.170 1.00 10.88原子 1069 O LEU A 348 0.889 45.107 45.724 1.00 10.81原子 1070 N GLY A 349 -1.177 44.229 45.417 1.00 10.78原子 1071 CA GLY A 349 -1.154 44.718 44.035 1.00 9.96原子 1072 C GLY A 349 -2.577 44.686 43.420 1.00 11.05原子 1073 O GLY A 349 -3.461 44.195 44.075 1.00 9.57原子 1074 N LEU A 350 -2.667 45.177 42.201 1.00 12.61原子 1075 CA LEU A 350 -4.033 45.102 41.592 1.00 12.78原子 1076 CB LEU A 350 -4.766 46.348 42.090 1.00 13.89原子 1077 CG LEU A 350 -6.279 46.356 41.850 1.00 16.31原子 1078 CD1 LEU A 350 -6.981 45.416 42.807 1.00 17.00原子 1079 CD2 LEU A 350 -6.786 47.797 41.945 1.00 15.79原子 1000 C LEU A 350 -3.881 45.086 40.119 1.00 10.61原子 1081 O LEU A 350 -2.867 45.625 39.674 1.00 9.12原子 1082 N ALA A 351 -4.815 44.544 39.319 1.00 8.13原子 1083 CA ALA A 351 -4.645 44.560 37.896 1.00 9.68原子 1084 CB ALA A 351 -3.807 43.358 37.429 1.00 8.30原子 1085 C ALA A 351 -6.006 44.393 37.158 1.00 8.00原子 1086 O ALA A 351 -6.781 43.671 37.749 1.00 8.17原子 1087 N TYR A 352 -6.102 44.923 35.997 1.00 10.56原子 1088 CA TYR A 352 -7.378 44.669 35.243 1.00 11.99原子 1089 CB TYR A 352 -7.517 45.727 34.152 1.00 13.49原子 1090 CG TYR A 352 -7.816 47.102 34.704 1.00 16.49原子 1091 CD1 TYR A 352 -9.085 47.388 35.198 1.00 18.25原子 1092 CE1 TYR A 352 -9.369 48.643 35.704 1.00 18.58原子 1093 CD2 TYR A 352 -6.835 48.096 34.726 1.00 15.80原子 1094 CE2 TYR A 352 -7.121 49.344 35.231 1.00 17.33原子 1095 CZ TYR A 352 -8.385 49.612 35.726 1.00 19.62原子 1096 OH TYR A 352 -8.671 50.865 36.229 1.00 20.81原子 1097 C TYR A 352 -7.306 43.297 34.623 1.00 11.61原子 1098 O TYR A 352 -6.226 42.856 34.133 1.00 9.99原子 1099 N VAL A 353 -8.414 42.569 34.618 1.00 9.19原子 1100 CA VAL A 353 -8.433 41.240 34.027 1.00 9.63原子 1101 CB VAL A 353 -9.532 40.388 34.675 1.00 12.16原子 1102 CG1 VAL A 353 -9.580 38.963 34.168 1.00 11.71原子 1103 CG2 VAL A 353 -9.337 40.459 36.180 1.00 11.77原子 1104 C VAL A 353 -8.597 41.233 32.532 1.00 12.50原子 1105 O VAL A 353 -9.522 41.869 32.012 1.00 12.29原子 1106 N GLY A 354 -7.759 40.476 31.830 1.00 10.94原子 1107 CA GLY A 354 -7.781 40.328 30.400 1.00 14.31原子 1108 C GLY A 354 -8.927 39.377 29.976 1.00 14.67原子 1109 O GLY A 354 -9.497 38.711 30.814 1.00 13.50原子 1110 N SER A 355 -9.183 39.300 28.685 1.00 15.31原子 1111 CA SER A 355 -10.226 38.340 28.254 1.00 18.47原子 1112 CB SER A 355 -11.596 39.039 28.449 1.00 19.00原子 1113 OG SER A 355 -12.631 38.360 27.760 1.00 21.32原子 1114 C SER A 355 -9.959 38.049 26.808 1.00 17.63原子 1115 O SER A 355 -9.378 38.937 26.168 1.00 18.38原子 1116 N PRO A 356 -10.461 36.952 26.271 1.00 19.06原子 1117 CD PRO A 356 -11.125 35.862 27.017 1.00 18.95原子 1118 CA PRO A 356 -10.370 36.661 24.859 1.00 21.26原子 1119 CB PRO A 356 -10.771 35.200 24.707 1.00 20.19原子 1120 CG PRO A 356 -11.451 34.834 25.974 1.00 20.51原子 1121 C PRO A 356 -11.357 37.502 24.051 1.00 24.27

原子

类型残基？ # X Y Z OCC B原子 1122 O PRO A 356 -11.249 37.622 22.833 1.00 25.16原子 1123 N ARG A 357 -12.369 38.028 24.714 1.00 27.47原子 1124 NH2 ARG A 357 -14.829 39.823 29.846 1.00 45.75原子 1125 NH1 ARG A 357 -15.278 41.187 28.059 1.00 45.46原子 1126 CZ ARG A 357 -15.278 39.980 28.609 1.00 43.96原子 1127 NE ARG A 357 -15.708 38.909 27.965 1.00 41.93原子 1128 CDA ARG A 357 -16.239 38.818 26.627 1.00 38.04原子 1129 CG ARG A 357 -15.252 38.219 25.641 1.00 14.46原子 1130 CB ARG A 357 -14.476 39.345 24.961 1.00 32.97原子 1131 CA ARG A 357 -13.386 38.812 24.032 1.00 31.58原子 1132 C ARG A 357 -12.777 39.943 23.231 1.00 33.38原子 1133 O ARG A 357 -11.979 40.784 23.635 1.00 32.52原子 1134 CB ALA A 358 -13.971 40.872 19.874 1.00 35.32原子 1135 C ALA A 358 -12.904 42.350 2L.524 1.00 36.30原子 1136 O ALA A 358 -11.940 43.090 21.425 1.00 37.79原子 1137 N ALA A 358 -13.235 39.948 21.981 1.00 35.10原子 1138 CA ALA A 358 -12.901 40.933 20.979 1.00 36.40原子 1139 N ASN A 359 -14.027 42.745 22.100 1.00 36.18原子 1140 ND2 ASN A 359 -17.589 44.247 20.981 1.00 38.54原子 1141 OD1 ASN A 359 -15.577 44.791 20.178 1.00 40.48原子 1142 CG ASN A 359 -16.290 44.493 21.132 1.00 39.04原子 1143 CB ASN A 359 -15.760 44.367 22.540 1.00 37.70原子 1144 CA ASN A 359 -14.263 44.061 22.641 1.00 36.27原子 1145 C ASN A 359 -13.834 44.198 24.094 1.00 35.65原子 1146 O ASN A 359 -14.157 45.182 24.751 1.00 35.92原子 1147 N SER A 360 -13.119 43.218 24.615 1.00 34.08原子 1146 OG SER A 360 -10.129 42.540 26.749 1.00 34.50原子 1149 CB SER A 360 -11.683 42.108 26.257 1.00 33.68原子 1150 CA5 SER A 360 -12.647 43.261 25.982 1.00 32.95原子 1151 C SER A 360 -11.907 44.577 26.260 1.00 30.62原子 1152 O SER A 360 -11.073 45.055 25.505 1.00 29.59原子 1153 N HIS A 361 -12.244 45.128 27.405 1.00 28.43原子 1154 CD2 HIS A 361 -14.316 47.713 26.576 1.00 37.21原子 1155 NE2 HIS A 361 -14.610 48.664 25.596 1.00 37.98原子 1156 CE1 HIS A 361 -13.624 49.531 25.503 1.00 37.94原子 1157 ND1 HIS A 361 -12.729 49.221 26.413 1.00 38.32原子 1158 CG HIS A 361 -13.138 48.108 27.110 1.00 36.46原子 1159 CB HIS A 361 -12.374 47.488 28.234 1.00 33.76原子 1160 CA HIS A 361 -11.550 46.275 27.920 1.00 30.24原子 1161 C HIS A 361 -10.928 45.653 29.193 1.00 29.98原子 1162 O HIS A 361 -11.660 45.080 30.024 1.00 33.02原子 1163 N GLY A 362 -9.625 45.543 29.184 1.00 25.53原子 1164 CA GLY A 362 -8.942 45.064 30.371 1.00 20.70原子 1165 C GLY A 362 -7.829 44.108 29.983 1.00 16.68原子 1166 O GIY A 362 -7.986 43.330 29.056 1.00 12.10原子 1167 N GLY A 363 -6.695 44.301 30.672 1.00 13.81原子 1168 CA GLY A 363 -5.648 43.339 30.406 1.00 14.18原子 1169 C GLY A 363 -4.908 43.513 29.110 1.00 13.66原子 1170 O GLY A 363 -4.808 44.608 28.557 1.00 12.16原子 1171 N VAL A 364 -4.310 42.413 28.673 1.00 14.17原子 1172 CG2 VAL A 364 -4.030 40.030 27.062 1.00 15.53原子 1173 CG1 VAL A 364 -1.902 40.628 28.266 1.00 15.36原子 1174 CB VAL A 364 -2.897 41.047 27.174 1.00 18.71原子 1175 CA VAL A 364 -3.455 42.442 27.502 1.00 17.47

原子

类型残基？ # X Y Z OCC B原子 1176 C VAL A 364 -4.138 43.070 25.294 1.00 22.13原子 1177 O VAL A 364 -5.313 42.870 26.039 1.00 18.74原子 1178 N CYS A 365 -3.323 43.852 25.611 1.00 26.09原子 1179 SG CYS A 365 -3.257 42.201 22.935 1.00 38.70原子 1180 CB CYS A 365 -4.184 43.720 23.283 1.00 34.15原子 1181 CA CYS A 365 -3.608 44.572 24.400 1.00 32.02原子 1182 C CYS A 365 -4.433 45.808 24.719 1.00 32.84原子 1183 O CYS A 365 -5.505 45.800 25.307 1.00 31.41原子 1184 N PRO A 366 -3.826 46.943 24.391 1.00 34.94原子 1185 CG PRO A 366 -2.315 48.596 23.731 1.00 34.57原子 1186 CD PRO A 366 -2.542 47.119 23.698 1.00 34.14原子 1187 CB PRO A 366 -3.403 49.216 24.501 1.00 35.23原子 1188 CA PRO A 367 -4.515 48.220 24.644 1.00 35.75原子 1189 C PRO A 366 -5.714 48.244 23.715 1.00 36.16原子 1190 O PRO A 366 -5.574 47.917 22.548 1.00 38.73原子 1191 N LYS A 367 -6.905 48.420 24.211 1.00 36.55原子 1192 N2 LYS A 367 -11.060 46.083 19.713 1.00 39.83原子 1193 CE LYS A 367 -10.945 46.830 20.990 1.00 39.58原子 1194 CD LYS A 367 -10.461 45.989 22.141 1.00 39.79原子 1195 CG LYS A 367 -9.071 46.373 22.617 1.00 39.82原子 1196 CB LYS A 367 -9.031 47.227 23.867 1.00 36.78原子 1197 CA LYS A 367 -8.228 48.530 23.676 1.00 37.98原子 1198 C LYS A 367 -8.995 49.679 24.375 1.00 36.54原子 1199 O LYS A 367 -9.725 49.528 25.366 1.00 33.85原子 1200 N ALA A 368 -8.855 50.888 23.839 1.00 35.07原子 1201 CA ALA A 368 -9.376 52.113 24.400 1.00 32.73原子 1202 CB ALA A 368 -9.170 53.209 23.330 1.00 34.00原子 1203 C ALA A 368 -10.770 52.317 24.933 1.00 32.95原子 1204 O ALA A 368 -11.784 51.928 24.364 1.00 32.14原子 1205 N TYR A 369 -10.878 53.117 25.991 1.00 31.03原子 1206 CA TYR A 369 -12.087 53.643 26.567 1.00 32.06原子 1207 CB TYR A 369 12.264 53.583 28.057 1.00 34.85原子 1208 CG TYR A 369 -13.026 52.465 28.689 1.00 37.47原子 1209 CD1 TYR A 369 -12.349 51.435 29.321 1.00 38.45原子 1210 CE1 TYR A 369 -13.025 50.390 29.914 1.00 39.73原子 1211 CD2 TYR A 369 -14.410 52.415 28.669 1.00 39.08原子 1212 CE2 TYR A 369 -15.096 51.380 29.271 1.00 40.46原子 1213 CZ TYR A 369 -14.397 50.369 29.891 1.00 41.04原子 1214 OH TYR A 369 -15.067 49.320 30.483 1.00 42.68原子 1215 C TYR A 369 -11.953 55.158 26.287 1.00 32.03原子 1216 O TYR A 369 -10.842 55.634 26.529 1.00 28.95原子 1217 N TYR A 370 -12.996 55.828 25.851 1.00 32.03原子 1218 OH TYR A 370 -13.216 63.382 23.761 1.00 38.96原子 1219 CD2 TYR A 370 -14.752 60.205 24.698 1.00 36.28原子 1220 CE2 TYR A 370 -14.597 61.568 24.490 1.00 36.78原子 1221 CZ TYR A 370 -13.409 62.034 23.975 1.00 37.70原子 1222 CE1 TYR A 370 -12.383 61.168 23.662 1.00 36.85原子 1223 CD1 TYR A 370 -12.563 59.820 23.871 1.00 35.73原子 1224 CG TYR A 370 -13.741 59.312 24.388 1.00 35.35原子 1225 CB TYR A 370 -13.896 57.816 24.613 1.00 34.74原子 1226 CA TYR A 370 -12.850 57.254 25.574 1.00 33.23原子 1227 C UYR A 370 -12.982 57.999 26.897 1.00 33.56原子 1228 O TYR A 370 -13.819 57.580 27.684 1.00 33.28原子 1229 N SER A 371 -12.169 59.015 27.125 1.00 35.61

原子

类型残基？ # X Y Z OCC B原子 1230 OG SER A 371 -10.952 60.534 30.263 1.00 37.79原子 1231 CB SER A 371 -10.994 59.623 29.183 1.00 39.02原子 1232 CA SER A 371 -12.297 59.725 28.389 1.00 38.04原子 1233 C SER A 371 -12.666 61.187 28.201 1.00 39.91原子 1234 O SER A 371 -11.843 62.022 27.853 1.00 38.57原子 1235 N PRO A 372 -13.931 61.484 28.420 1.00 43.18原子 1236 CG PRO A 372 -16.243 61.324 28.452 1.00 44.76原子 1237 CD PR0 A 372 -15.008 60.574 28.867 1.00 44.03原子 1238 CB PR0 A 372 -15.900 62.772 28.425 1.00 45.09原子 1239 CA PR0 A 372 -14.403 62.878 28.437 1.00 45.43原子 1240 C PR0 A 372 -13.833 63.366 29.760 1.00 46.59原子 1241 O PRO A 372 -14.102 62.743 30.789 1.00 47.64原子 1242 N VAL A 373 -12.978 64.362 29.767 1.00 48.18原子 1243 CG2 VAL A 373 -13.693 65.070 32.937 1.00 48.74原子 1244 CG1 VAL A 373 -11.354 64.454 33.270 1.00 48.15原子 1245 CB VAL A 373 -12.534 64.295 32.314 1.00 48.02原子 1246 CA VAL A 373 -12.176 64.754 30.916 1.00 47.53原子 1247 C VAL A 373 -10.843 64.081 30.527 1.00 47.84原子 1248 O VAL A 373 -10.706 62.871 30.685 1.00 48.07原子 1249 N GLY A 374 -9.966 64.870 29.936 1.00 46.71原子 1250 CA GLY A 374 -8.687 64.329 29.474 1.00 45.92原子 1251 C GLY A 374 -8.718 64.327 27.946 1.00 44.34原子 1252 O GLY A 374 -7.703 64.386 27.276 1.00 43.53原子 1253 N LYS A 375 -9.937 64.227 27.433 1.00 20.00原子 1254 NZ LYS A 375 -11.621 70.469 25.481 1.00 20.00原子 1255 CE LYS A 375 -11.822 69.109 25.996 1.00 20.00原子 1256 CD LYS A 375 -10.786 68.111 25.474 1.00 20.00原子 1257 CG LYS A 375 -10.999 66.697 26.013 1.00 20.00原子 1258 CB LYS A 375 -9.976 65.697 25.486 1.00 20.00原子 1259 CCA LYS A 375 -10.201 64.262 26.011 1.00 20.00原子 1260 C LYS A 375 -9.308 63.297 25.260 1.00 20.00原子 1261 O LYS A 375 -8.529 63.725 24.411 1.00 20.00原子 1262 N LYS A 376 -9.386 62.003 25.604 1.00 20.00原子 1263 NZ LYS A 376 -1.285 64.692 24.559 1.00 20.00原子 1264 CE LYS A 376 -4.696 64.381 24.290 1.00 20.00原子 1265 CD LYS A 376 -5.139 63.045 24.890 1.00 20.00原子 1266 CG LYS A 376 -6.606 62.726 24.608 1.00 20.00原子 1267 CB LYS A 376 -7.050 61.390 25.194 1.00 20.00原子 1268 CA LYS A 376 -8.531 61.050 24.897 1.00 20.00原子 1269 C LYS A 376 -8.810 59.601 25.286 1.00 20.00原子 1270 O LYS A 376 -9.696 59.281 26.077 1.00 20.00原子 1271 N ASN A 377 -8.050 58.726 24.640 1.00 29.74原子 1272 CA ASN A 377 -8.240 57.295 24.862 1.00 29.33原子 1273 CB ASN A 377 -7.825 56.539 23.612 1.00 29.66原子 1274 CG ASN A 377 -8.743 56.803 22.433 1.00 30.76原子 1275 OD1 ASN A 377 -9.964 56.948 22.559 1.00 29.66原子 1276 ND2 ASN A 377 -8.128 56.865 21.249 1.00 31.26原子 1277 C ASN A 377 -7.486 56.848 26.098 1.00 28.35原子 1278 O ASN A 377 -6.411 57.376 26.306 1.00 26.83原子 1279 N ILE A 378 -8.123 56.055 26.952 1.00 26.88原子 1280 CA ILE A 378 -7.431 55.408 28.039 1.00 28.08原子 1281 CB ILE A 378 -7.802 55.780 29.473 1.00 29.37原子 1282 CG2 ILE A 378 -7.624 67.282 29.706 1.00 28.66原子 1283 CG1 ILE A 378 -9.217 55.317 29.789 1.00 31.06

原子

类型残基？ # X Y Z OCC B原子 1284 CD2 ILE A 378 -9.563 55.301 31.261 1.00 32.92原子 1285 C ILE A 378 -7.567 53.877 27.882 1.00 26.65原子 1286 O ILE A 378 -8.559 53.283 27.479 1.00 25.21原子 1287 N TYR A 379 -6.456 53.246 28.250 1.00 25.14原子 1288 CA TYR A 379 -6.298 51.805 28.141 1.00 23.62原子 1289 CB TYR A 379 -5.057 51.473 27.299 1.00 25.30原子 1290 CG TYR A 379 -5.076 52.202 25.979 1.00 27.60原子 1291 CD1 TYR A 379 -4.644 53.523 25.919 1.00 28.62原子 1292 CE1 TYR A 379 -4.683 54.224 24.736 1.00 30.42原子 1293 CD2 TYR A 379 -5.571 51.619 24.836 1.00 28.58原子 1294 CE2 TYR A 379 -5.582 52.298 23.634 1.00 29.43原子 1295 CZ TYR A 379 -5.141 53.597 23.603 1.00 30.50原子 1296 OH TYR A 379 -5.162 54.325 22.441 1.00 33.44原子 1297 C TYR A 379 -6.141 51.154 29.498 1.00 22.07原子 1298 O TYR A 379 -5.164 51.460 30.204 1.00 22.84原子 1299 N LEU A 380 -6.941 50.122 29.768 1.00 16.20原子 1300 CA LEU A 380 -6.831 49.396 30.998 1.00 17.68原子 1301 CB LEU A 380 -8.233 49.019 31.490 1.00 19.14原子 1302 CG LEU A 380 -9.204 50.207 31.624 1.00 21.74原子 1303 CD1 LEU A 380 -10.479 49.690 32.285 1.00 22.06原子 1304 CD2 LEU A 380 -8.614 51.364 32.411 1.00 20.08原子 1305 C LEU A 380 -5.903 48.191 30.845 1.00 13.92原子 1306 O LEU A 380 -6.249 47.139 31.351 1.00 12.26原子 1307 N ASN A 381 -4.762 48.385 30.190 1.00 14.40原子 1308 CA ASN A 381 -3.798 47.282 30.009 1.00 15.71原子 1309 CB ASN A 381 -3.148 47.364 28.646 1.00 13.12原子 1310 CG ASN A 381 -2.442 48.681 28.373 1.00 13.93原子 1311 OD1 ASN A 381 -2.614 49.693 29.057 1.00 15.98原子 1312 ND2 ASN A 381 -1.584 48.766 27.386 1.00 13.77原子 1313 C ASN A 381 -2.732 47.428 31.111 1.00 15.34原子 1314 O ASN A 381 -1.538 47.496 30.826 1.00 19.25原子 1315 N SER A 382 -3.178 47.587 32.318 1.00 14.28原子 1316 CA SER A 382 -2.363 47.953 33.462 1.00 16.49原子 1317 CB SER A 382 -2.722 49.449 33.712 1.00 19.36原子 1318 OG SER A 382 -4.021 49.622 34.261 1.00 19.22原子 1319 C SER A 383 -2.534 47.168 34.720 1.00 13.50原子 1320 O SER A 382 -3.491 46.443 34.986 1.00 14.79原子 1321 N GLY A 383 -1.543 47.226 35.602 1.00 12.08原子 1322 CA GLY A 383 -1.460 46.552 36.865 1.00 7.68原子 1323 C GLY A 383 -0.407 47.250 37.737 1.00 9.13原子 1324 O GLY A 383 0.356 48.018 37.167 1.00 7.23原子 1325 N LEU A 384 -0.406 46.961 39.018 1.00 9.60原子 1326 CA LEU A 384 0.596 47.604 39.860 1.00 10.98原子 1327 CB LEU A 384 0.108 48.911 40.437 1.00 10.87原子 1328 CG LEU A 384 -1.098 48.840 41.372 1.00 12.55原子 1329 CD1 LEU A 384 -0.751 48.583 42.819 1.00 11.84原子 1330 CD2 LEU A 384 -1.824 50.197 41.305 1.00 14.27原子 1331 C LEU A 384 0.963 46.614 40.982 1.00 11.40原子 1332 O LEU A 384 0.191 45.705 41.269 1.00 12.17原子 1333 N THR A 385 2.174 46.774 41.470 1.00 10.30原子 1334 CA THR A 385 2.773 45.977 42.535 1.00 10.05原子 1335 CB THR A 385 3.958 45.170 41.969 1.00 11.82原子 1336 OG1 THR A 385 3.463 44.161 41.100 1.00 12.53原子 1337 CG2 THR A 385 4.842 44.430 42.991 1.00 7.93

原子

类型残基？ # X Y Z OCC B原子 1338 C THR A 385 3.429 46.936 43.546 1.00 10.37原子 1339 O THR A 385 4.154 47.869 43.150 1.00 10.04原子 1340 N SER A 386 3.153 46.751 44.806 1.00 10.16原子 1341 CA SER A 386 3.835 47.470 45.853 1.00 12.08原子 1342 CB SER A 386 2.913 47.978 46.925 1.00 12.65原子 1343 OG SER A 386 3.625 48.590 47.976 1.00 12.90原子 1344 C SER A 386 4.773 46.445 46.540 1.00 11.71原子 1345 O SER A 386 4.348 45.314 46.714 1.00 11.70原子 1346 N THR A 387 5.929 46.899 46.978 1.00 13.21原子 1347 CA THR A 387 6.861 46.004 47.677 1.00 11.54原子 1348 CB THR A 387 8.258 45.976 47.083 1.00 12.46原子 1349 OG1 THR A 387 8.794 47.305 46.902 1.00 12.52原子 1350 CG2 THR A 387 8.193 45.224 45.771 1.00 9.84原子 1351 C THR A 387 6.917 46.429 49.137 1.00 12.59原子 1352 O THR A 387 7.750 45.916 49.857 1.00 9.86原子 1353 N LYS A 388 5.888 47.176 49.559 1.00 10.11原子 1354 CA LYS A 388 5.781 47.451 50.983 1.00 11.18原子 1355 CB LYS A 388 5.844 48.928 51.315 1.00 10.27原子 1356 CG LYS A 388 5.598 49.163 52.809 1.00 11.78原子 1357 CD LYS A 388 5.570 50.665 53.086 1.00 12.59原子 1358 CE LYS A 388 5.610 50.846 54.616 1.00 12.42原子 1359 NZ LYS A 388 5.400 52.289 54.915 1.00 12.86原子 1360 C LYS A 388 4.466 46.836 51.470 1.00 12.79原子 1361 O LYS A 388 3.445 47.068 50.803 1.00 13.47原子 1362 N ASN A 389 4.490 46.117 52.561 1.00 11.20原子 1363 CA ASN A 389 3.235 45.595 53.444 1.00 13.05原子 1364 CB ASN A 389 2.797 44.247 52.498 1.00 9.98原子 1365 CG ASN A 389 1.328 43.929 52.695 1.00 13.57原子 1366 OD1 ASN A 389 0.562 44.823 53.020 1.00 11.41原子 1367 ND2 ASN A 389 0.828 42.697 52.544 1.00 11.87原子 1368 C ASN A 389 3.401 45.431 54.605 1.00 12.01原子 1369 O ASN A 389 4.389 44.832 55.045 1.00 12.68原子 1370 N TYR A 390 2.463 45.891 55.415 1.00 9.33原子 1371 CA TYR A 390 2.544 45.725 56.834 1.00 11.32原子 1372 CB TYR A 390 2.395 44.317 57.360 1.00 13.01原子 1373 CG TYR A 390 1.034 43.646 57.138 1.00 17.63原子 1374 CD1 TYR A 390 0.888 42.699 56.135 1.00 17.99原子 1375 CE1 TYR A 390 -0.324 42.059 55.906 1.00 18.34原子 1376 CD2 TYR A 390 -0.059 43.950 57.918 1.00 17.56原子 1377 CE2 TYR A 390 -1.295 43.344 57.684 1.00 19.81原子 1378 CZ TYR A 390 -1.408 42.399 56.6B5 1.00 18.72原子 1379 OH TYR A 390 -2.599 41.770 56.456 1.00 18.16原子 1380 C TYR A 390 3.875 46.390 57.342 1.00 11.32原子 1381 O TYR A 390 4.444 45.867 58.262 1.00 10.06原子 1382 N GLY A 391 4.202 47.568 56.849 1.00 12.38原子 1383 CA GLY A 391 5.264 48.396 57.395 1.00 13.46原子 1384 C GLY A 391 6.671 47.822 57.226 1.00 14.75原子 1385 O GLY A 391 7.615 48.218 57.920 1.00 13.47原子 1386 N LYS A 392 6.864 47.001 56.213 1.00 14.18原子 1387 NZ LYS A 392 6.391 42.087 59.901 1.00 31.24原子 1388 CE LYS A 392 6.515 43.004 58.726 1.00 30.06原子 1389 CD LYS A 392 7.980 43.237 58.298 1.00 27.75原子 1390 CG LYS A 392 8.231 44.701 57.942 1.00 25.41原子 1391 CB LYS A 392 8.133 44.929 56.460 1.00 20.56

原子

类型残基？ # X Y Z OCC B原子 1392 CA LYS A 392 8.133 46.376 55.909 1.00 15.94原子 1393 C LYS A 392 8.265 46.221 54.399 1.00 14.65原子 1394 O LYS A 392 7.242 46.070 53.676 1.00 12.21原子 1395 N THR A 393 9.481 45.969 53.955 1.00 9.88原子 1396 CA THR A 393 9.744 45.629 52.574 1.00 10.28原子 1397 CB THR A 393 11.178 45.988 52.155 1.00 10.31原子 1398 OG1 THR A 393 11.412 47.397 52.330 1.00 9.91原子 1399 CG2 THR A 393 11.393 45.631 50.693 1.00 7.83原子 1400 C THR A 393 9.450 44.139 52.450 1.00 11.39原子 1301 O THR A 393 9.872 43.332 53.278 1.00 11.16原子 1402 N ILE A 394 8.715 43.737 51.399 1.00 8.47原子 1403 CA ILE A 394 8.413 42.305 51.297 1.00 8.59原子 1404 CB ILE A 394 7.223 42.076 50.329 1.00 7.43原子 1405 CG2 ILE A 394 6.044 42.929 50.867 1.00 5.89原子 1406 CG1 ILE A 394 7.562 42.401 48.910 1.00 7.72原子 1407 CD1 ILE A 394 6.413 42.268 47.877 1.00 9.17原子 1408 C ILE A 394 9.657 41.573 50.761 1.00 9.33原子 1409 O ILE A 394 10.482 42.262 50.170 1.00 8.55原子 1410 N LEU A 395 9.689 40.276 50.913 1.00 7.97原子 1411 CA LEU A 395 10.808 39.499 50.347 1.00 11.81原子 1412 CB LEU A 395 10.545 37.998 50.620 1.00 12.21原子 1413 CG LEU A 395 10.370 37.651 52.090 1.00 13.09原子 1414 CD1 LEU A 395 10.246 36.140 52.313 1.00 10.90原子 1415 CD2 LEU A 395 11.569 38.245 52.832 1.00 13.70原子 1416 C LEU A 395 10.920 39.603 48.860 1.00 13.57原子 1417 O LEU A 395 9.864 39.692 48.193 1.00 11.36原子 1418 N THR A 396 12.089 39.426 48.281 1.00 9.31原子 1419 CA THR A 396 12.273 39.345 46.840 1.00 11.95原子 1420 CB THR A 396 13.746 39.021 46.476 1.00 14.52原子 1421 OG1 THR A 396 14.575 40.034 47.090 1.00 16.31原子 1422 CG2 THR A 396 13.983 39.148 44.996 1.00 16.49原子 1423 C THR A 396 11.376 38.264 46.209 1.00 12.19原子 1424 O THR A 396 10.790 38.544 45.152 1.00 11.09原子 1425 N LYS A 397 11.286 37.104 46.840 1.00 9.73原子 1426 CA LYS A 397 10.451 36.033 46.298 1.00 12.22原子 1427 CB LYS A 397 10.630 34.680 46.935 1.00 11.19原子 1428 CG LYS A 397 10.365 34.491 48.402 1.00 10.22原子 1429 CD LYS A 397 10.459 32.971 48.678 1.00 12.87原子 1430 CE LYS A 397 9.904 32.634 50.049 1.00 10.59原子 1431 NZ LYS A 397 10.430 31.409 50.690 1.00 13.72原子 1432 C LYS A 397 8.946 36.390 46.379 1.00 11.16原子 1433 O LYS A 398 8.250 35.937 45.488 1.00 10.09原子 1434 N GLU A 398 8.588 37.196 47.346 1.00 10.22原子 1435 CA GLU A 398 7.207 37.628 47.475 1.00 13.12原子 1436 CB GLU A 398 6.931 38.233 48.857 1.00 11.64原子 1437 CG GLU A 398 6.951 37.079 49.876 1.00 15.45原子 1438 CD GLU A 398 6.952 37.662 51.284 1.00 15.72原子 1439 OE1 GLU A 398 7.139 38.861 51.557 1.00 15.77原子 1440 OE2 GLU A 398 6.722 36.861 52.186 1.00 17.81原子 1441 C GLU A 398 6.875 38.628 46.374 1.00 14.23原子 1442 O GLU A 398 5.819 38.496 45.746 1.00 11.36原子 1443 N ALA A 399 7.791 39.566 46.144 1.00 11.71原子 1444 CA ALA A 399 7.603 40.571 45.121 1.00 10.93原子 1445 CB ALA A 399 8.705 41.611 45.021 1.00 10.46

原子

类型残基？ # X Y Z OCC B原子 1446 C ALA A 399 7.464 39.901 43.737 1.00 11.66原子 1447 O ALA A 399 6.535 40.310 43.047 1.00 8.52原子 1448 N ASP A 400 8.259 38.892 43.411 1.00 10.58原子 1449 CA ASP A 400 8.092 38.172 42.164 1.00 11.27原子 1450 CB ASP A 400 9.061 37.001 41.994 1.00 13.33原子 1451 CG ASP A 400 10.525 37.443 41.936 1.00 15.25原子 1452 OD1 ASP A 400 10.787 38.685 41.868 1.00 11.52原子 1453 OD2 ASP A 400 11.331 36.459 41.963 1.00 15.55原子 1454 C ASP A 400 6.682 37.543 42.061 1.00 10.74原子 1455 O ASP A 400 6.102 37.681 40.959 1.00 11.54原子 1456 N LEU A 401 6.184 37.034 43.155 1.00 9.91原子 1457 CA LEU A 401 4.860 36.399 43.132 1.00 12.48原子 1458 CB LEU A 401 4.618 35.610 44.411 1.00 13.67原子 1459 CG LEU A 401 5.551 34.464 44.805 1.00 19.11原子 1460 CD1 LEU A 401 5.596 34.451 46.337 1.00 20.83原子 1461 CD2 LEU A 401 5.072 33.125 44.302 1.00 19.44原子 1462 C LEU A 401 3.724 37.434 42.994 1.00 11.96原子 1463 O LEU A 401 2.701 37.092 42.388 1.00 9.62原子 1464 N VAL A 402 3.849 38.626 43.576 1.00 9.23原子 1465 CA VAL A 402 2.856 39.664 43.347 1.00 10.16原子 1466 CB VAL A 402 3.222 40.976 44.086 1.00 11.53原子 1467 CG1 VAL A 402 2.219 42.096 43.805 1.00 10.53原子 1468 CG2 VAL A 402 3.254 40.598 45.565 1.00 8.46原子 1469 C VAL A 402 2.701 40.016 41.882 1.00 12.23原子 1470 O VAL A 402 1.581 40.096 41.336 1.00 9.50原子 1471 N THR A 403 3.821 40.359 41.261 1.00 8.92原子 1472 CA THR A 403 3.845 40.764 39.883 1.00 8.22原子 1473 CB THR A 403 5.220 41.259 39.386 1.00 6.99原子 1474 OG1 THR A 403 5.612 42.325 40.255 1.00 6.97原子 1475 CG2 THR A 403 5.221 41.841 37.998 1.00 6.87原子 1476 C THR A 403 3.381 39.610 38.992 1.00 9.35原子 1477 O THR A 403 2.693 39.954 38.016 1.00 5.99原子 1478 N THR A 404 3.855 38.407 39.301 1.00 6.34原子 1479 CA THR A 404 3.382 37.249 39.521 1.00 7.96原子 1480 CB THR A 404 3.962 35.946 39.104 1.00 8.71原子 1481 OG1 THR A 404 5.404 35.959 38.945 1.00 8.46原子 1482 CG2 THR A 404 3.448 34.743 38.303 1.00 8.11原子 1483 C THR A 404 1.842 37.175 38.572 1.00 6.99原子 1484 O THR A 404 1.211 36.979 37.529 1.00 6.33原子 1485 N HIS A 405 1.298 37.277 39.751 1.00 6.76原子 1486 CA HIS A 405 -0.132 37.232 40.003 1.00 9.62原子 1487 CB HIS A 405 -0.383 37.343 41.495 1.00 7.56原子 1488 CG HIS A 405 -1.828 37.311 41.919 1.00 6.65原子 1489 CD2 HIS A 405 -2.801 35.292 41.862 1.00 4.31原子 1490 ND1 HIS A 405 -2.389 36.204 42.467 1.00 7.16原子 1491 CE1 HIS A 405 -3.664 36.486 42.798 1.00 9.20原子 1492 NE2 HIS A 405 -3.937 37.722 42.413 1.00 9.52原子 1493 C HIS A 405 -0.867 38.376 39.290 1.00 9.96原子 1494 O HIS A 405 -1.836 38.080 38.597 1.00 9.05原子 1495 N GLU A 406 -0.414 39.612 39.416 1.00 9.09原子 1496 CA GLU A 406 -1.106 40.730 38.755 1.00 11.72原子 1497 CB GLU A 406 -0.532 12.078 39.207 1.00 12.02原子 1498 CG GLU A 406 -0.582 42.239 40.701 1.00 11.63原子 1499 CD GLU A 406 -1.910 42.013 41.321 1.00 12.61

原子

类型残基？ # X Y Z OCC B原子 1500 CE1 GLU A 406 -2.985 42.048 40.632 1.00 12.02原子 1501 OE2 GLU A 406 -1.910 41.759 42.535 1.00 12.54原子 1502 C GLU A 406 -1.087 40.659 37.256 1.00 13.24原子 1503 O GLU A 406 -2.110 40.827 36.529 1.00 10.09原子 1504 N LEU A 407 0.115 40.341 36.745 1.00 9.35原子 1505 CA LEU A 407 0.259 60.106 35.318 1.00 11.31原子 1506 CB LEU A 407 1.702 39.802 34.937 1.00 13.34原子 1507 CG LEU A 407 2.671 40.844 34.384 1.00 17.06原子 1508 CD1 LEU A 407 2.232 42.279 34.412 1.00 15.35原子 1509 CD2 LEU A 407 4.112 40.690 34.878 1.00 15.89原子 1510 C LEU A 407 -0.675 38.971 34.886 1.00 8.96原子 1511 O LEU A 407 -1.105 38.869 33.720 1.00 9.09原子 1512 N GLY A 408 -0.837 37.972 35.732 1.00 7.26原子 1513 CA GLY A 408 -1.649 36.774 35.444 1.00 7.95原子 1514 C GLY A 408 -3.107 37.247 35.182 1.00 8.27原子 1515 O GLY A 408 -3.776 36.757 34.277 1.00 7.64原子 1516 N HIS A 409 -3.565 38.171 36.030 1.00 10.19原子 1517 CA HIS A 409 -4.873 38.777 35.752 1.00 11.21原子 1518 CB HIS A 409 -5.162 39.920 36.713 1.00 8.68原子 1519 CG HIS A 409 -5.605 39.404 38.018 1.00 10.30原子 1520 CD2 HIS A 409 -5.193 39.710 39.255 1.00 9.44原子 1521 ND1 HIS A 409 -6.606 38.454 38.114 1.00 10.06原子 1522 CE1 HIS A 409 -6.833 38.237 39.402 1.00 12.63原子 1523 NE2 HIS A 409 -5.961 38.972 40.132 1.00 12.50原子 1524 C HIS A 409 -4.918 39.414 34.381 1.00 12.04原子 1525 O HIS A 409 -5.853 39.223 33.615 1.00 12.02原子 1526 N ASN A 410 -3.910 40.235 34.085 1.00 11.36原子 1527 CA ASN A 410 -3.859 40.925 32.820 1.00 10.24原子 1528 CB ASN A 410 -2.594 41.750 32.616 1.00 10.71原子 1529 CG ASN A 410 -2.499 43.027 33.424 1.00 12.40原子 1530 OD1 ASN A 410 -1.369 43.394 33.748 1.00 9.72原子 1531 ND2 ASN A 410 -3.598 43.762 33.714 1.00 9.17原子 1532 C ASN A 410 -3.953 39.918 31.675 1.00 12.78原子 1533 O ASN A 410 -4.538 40.276 30.652 1.00 9.40原子 1534 N PHE A 411 -3.292 38.782 31.796 1.00 9.09原子 1535 CA PHE A 411 -3.280 37.693 30.872 1.00 10.91原子 1536 CB PHE A 411 -2.105 36.703 31.101 1.00 10.93原子 1537 CG PHE A 411 -0.840 37.086 30.375 1.00 13.69原子 1538 CD1 PHE A 411 -0.102 38.216 30.730 1.00 15.12原子 1539 CD2 PHE A 411 -0.309 36.297 29.389 1.00 15.69原子 1540 CE1 PHE A 411 1.076 38.546 30.052 1.00 13.51原子 1541 CE2 PHE A 411 0.862 36.617 28.723 1.00 15.64原子 1542 CZ PHE A 411 1.556 37.782 29.051 1.00 14.11原子 1543 C PHE A 411 -4.606 36.903 30.849 1.00 10.27原子 1544 O PHE A 411 -4.694 36.100 29.931 1.00 9.02原子 1545 N GLY A 412 -5.578 37.150 31.701 1.00 11.88原子 1546 CA GLY A 412 -6.912 36.517 31.563 1.00 11.02原子 1547 C GLY A 412 -7.360 35.734 32.748 1.00 12.85原子 1548 O GLY A 412 -8.496 35.256 32.898 1.00 11.80原子 1549 N ALA A 413 -6.418 35.577 33.737 1.00 9.39原子 1550 CA ALA A 413 -6.759 34.739 34.850 1.00 8.60原子 1551 CB ALA A 413 -5.523 34.078 35.504 1.00 6.06原子 1552 C ALA A 413 -7.520 35.451 35.966 1.00 9.94原子 1553 O ALA A 413 -7.216 36.584 36.300 1.00 9.19

原子

类型残基？ # X Y Z OCC B原子 1554 N GLU A 414 -8.476 34.694 35.530 1.00 9.61原子 1555 CA GLU A 414 -9.172 35.158 37.731 1.00 12.27原子 1556 CB GLU A 414 -10.666 34.812 37.677 1.00 14.74原子 1557 CG GLU A 414 -11.293 35.591 36.517 1.00 16.17原子 1558 CD GLU A 414 -11.696 36.987 36.834 1.00 20.61原子 1559 OE1 GLU A 414 -11.520 37.544 37.933 1.00 21.11原子 1560 OE2 GLU A 414 -12.266 37.646 35.920 1.00 24.06原子 1561 C GLU A 414 -8.509 34.457 38.920 1.00 12.40原子 1562 O GLU A 414 -7.455 33.841 38.757 1.00 12.29原子 1563 N HIS A 415 -9.108 34.478 40.104 1.00 11.96原子 1564 CA HIS A 415 -8.512 33.849 41.259 1.00 13.28原子 1565 CB HIS A 415 -9.093 34.484 42.514 1.00 12.84原子 1566 CC HIS A 415 -8.513 35.841 42.716 1.00 11.55原子 1567 CD2 HIS A 415 -7.240 36.265 42.433 1.00 11.21原子 1568 ND1 HIS A 415 -9.180 36.899 43.276 1.00 10.77原子 1569 CE1 HIS A 415 -8.380 37.944 43.314 1.00 9.60原子 1570 NE2 HIS A 415 -7.174 37.576 42.791 1.00 11.71原子 1571 C HIS A 415 -8.789 32.362 41.293 1.00 14.34原子 1572 O HIS A 415 -9.851 32.007 40.751 1.00 10.53原子 1573 N ASP A 416 -7.855 31.567 41.826 1.00 10.07原子 1574 CA ASP A 416 -8.239 30.158 41.962 1.00 11.05原子 1575 CB ASP A 416 -6.978 29.338 42.310 1.00 13.78原子 1576 CG ASP A 416 -5.913 29.387 41.229 1.00 14.67原子 1577 OD1 ASP A 416 -6.267 29.373 40.039 1.00 13.81原子 1578 OD2 ASP A 416 -4.717 29.403 41.608 1.00 16.01原子 1579 C ASP A 416 -9.254 29.930 43.052 1.00 10.40原子 1580 O ASP A 416 -9.169 30.468 44.159 1.00 11.17原子 1581 N PRO A 417 -10.296 29.111 42.805 1.00 10.30原子 1582 CD PRO A 417 -10.544 28.473 41.502 1.00 12.83原子 1583 CA PRO A 417 -11.275 28.774 43.805 1.00 12.54原子 1584 CB PRO A 417 -12.495 28.328 42.975 1.00 13.91原子 1585 CG PRO A 417 -11.940 27.894 41.674 1.00 15.31原子 1586 C PRO A 417 -10.837 27.603 44.689 1.00 13.42原子 1587 O PRO A 417 -10.002 26.839 44.276 1.00 14.77原子 1588 N ASP A 418 -11.346 27.376 45.860 1.00 14.02原子 1589 CA ASP A 418 -11.086 26.217 46.694 1.00 20.43原子 1590 CB ASP A 418 -11.375 26.531 48.172 1.00 22.42原子 1591 CG ASP A 418 -10.416 27.595 48.658 1.00 25.60原子 1592 OD1 ASP A 418 -9.221 27.426 48.429 1.00 27.33原子 1593 OD2 ASP A 418 -10.724 28.666 49.204 1.00 29.81原子 1594 C ASP A 418 -11.997 25.061 46.257 1.00 23.39原子 1595 O ASP A 418 -13.034 25.354 45.640 1.00 23.78原子 1596 N GLY A 419 -11.533 23.829 46.307 1.00 24.01原子 1597 CA GLY A 419 -12.290 22.650 46.050 1.00 28.51原子 1598 C GLY A 419 -12.000 21.714 44.916 1.00 31.09原子 1599 O GLY A 419 -11.000 21.726 44.169 1.00 31.19原子 1600 N LEU A 420 -12.976 20.849 44.625 1.00 32.09原子 1601 CD2 LEU A 420 -14.406 17.142 44.111 1.00 38.06原子 1602 CD1 LEU A 420 -16.571 18.444 44.050 1.00 37.27原子 1603 CG LEU A 420 -15.061 18.507 44.238 1.00 36.91原子 1604 CB LEU A 420 -14.424 19.470 43.224 1.00 36.82原子 1605 CA LEU A 420 -12.969 19.843 43.591 1.00 35.26原子 1606 C LEU A 420 -12.193 20.130 42.331 1.00 36.08原子 1607 O LEU A 420 -11.638 19.221 41.701 1.00 37.02

原子

类型残基？ # X Y Z OCC B原子 1608 N ALA A 421 -12.053 21.380 41.907 1.00 36.27原子 1609 CB ALA A 421 -11.479 23.254 40.472 1.00 37.17原子 1610 CA A1A A 421 -11.309 21.755 40.742 1.00 36.49原子 1611 C ALA A 421 -9.841 21.381 40.794 1.00 35.18原子 1612 O ALA A 421 -3.253 21.402 39.702 1.00 36.10原子 1613 N GLU A 422 -9.183 21.102 41.907 1.00 32.65原子 1614 OE2 GLU A 422 -8.104 20.106 37.709 1.00 41.16原子 1615 OE1 GLU A 422 -6.137 19.284 37.500 1.00 39.97原子 1616 CD GLU A 422 -6.983 19.889 38.198 1.00 38.24原子 1617 CG GLU A 422 -6.638 20.311 39.582 1.00 35.89原子 1618 CB GLU A 422 -7.426 19.813 40.760 1.00 31.03原子 1619 CA GLU A 422 -7.761 20.769 41.924 1.00 29.38原子 1620 C GLU A 422 -6.901 22.028 41.779 1.00 24.25原子 1621 O GLU A 422 -9.677 21.951 41.645 1.00 21.69原子 1622 N CYS A 423 -7.530 23.185 41.837 1.00 19.59原子 1623 CA CYS A 423 -6.862 24.457 41.613 1.00 18.31原子 1624 CB CYS A 423 -7.819 25.319 40.797 1.00 21.54原子 1625 SG CYS A 423 -8.112 24.725 39.090 1.00 22.74原子 1626 C CYS A 423 -6.367 25.102 42.893 1.00 16.82原子 1627 O CYS A 423 -5.884 26.233 42.855 1.00 14.86原子 1628 N ALA A 424 -6.516 24.451 44.029 1.00 15.16原子 1629 CA ALA A 424 -5.974 24.991 45.289 1.00 16.52原子 1630 CB ALA A 424 -6.940 25.972 45.924 1.00 15.07原子 1631 C ALA A 424 -5.603 23.812 46.165 1.00 15.42原子 1632 O ALA A 424 -6.206 23.507 47.182 1.00 16.31原子 1633 N PRO A 425 -4.545 23.118 45.774 1.00 16.63原子 1634 CD PRO A 425 -3.694 23.394 44.593 1.00 14.62原子 1635 CA PRO A 425 -4.096 21.935 46.484 1.00 18.01原子 1636 CB PRO A 425 -2.965 21.392 45.635 1.00 17.36原子 1637 CG PRO A 425 -3.064 22.047 44.301 1.00 16.07原子 1638 C PRO A 425 -3.655 22.217 47.908 1.00 19.52原子 1639 O PRO A 425 -3.304 23.325 48.294 1.00 16.80原子 1640 N ASN A 426 -3.670 21.143 48.707 1.00 21.90原子 1641 ND2 ASN A 426 -6.177 19.346 50.674 1.00 32.22原子 1642 OD1 ASN A 426 -5.934 21.437 51.378 1.00 30.53原子 1643 CG ASN A 426 -6.407 20.380 51.018 1.00 30.42原子 1644 CB ASN A 426 -3.898 20.167 50.928 1.00 27.25原子 1645 CA ASN A 426 -1.224 21.249 50.088 1.00 24.17原子 1646 C ASN A 426 -1.695 21.270 50.121 1.00 22.87原子 1647 O ASN A 426 -1.014 21.025 49.127 1.00 19.72原子 1648 N GLU A 427 -1.148 21.695 51.247 1.00 24.03原子 1649 OE2 GLU A 427 3.209 21.859 55.259 1.00 39.86原子 1650 OE1 GLU A 427 2.503 23.818 54.605 1.00 37.70原子 1651 CD GLU A 427 2.640 22.595 54.427 1.00 37.41原子 1652 CG GLU A 427 2.167 21.979 53.132 1.00 36.42原子 1653 CB GLU A 427 0.679 22.110 52.857 1.00 32.16原子 1654 CA GLU A 427 0.305 21.775 51.409 1.00 29.42原子 1655 C GLU A 427 0.998 20.507 50.975 1.00 29.51原子 1656 O GLU A 437 1.971 20.497 50.213 1.00 29.26原子 1657 N ASP A 428 0.488 19.358 51.414 1.00 31.72原子 1658 OD2 ASP A 428 -1.918 16.341 52.011 1.00 41.88原子 1659 OD1 ASP A 418 -1.452 18.328 52.816 1.00 37.31原子 1660 CG ASP A 428 -1.103 17.267 52.267 1.00 38.88原子 1661 CB ASP A 428 0.320 16.958 51.853 1.00 36.50

原子

类型残基？ # X Y Z OCC B原子 1662 CA ASP A 428 1.042 18.054 51.077 1.00 32.85原子 1663 C ASP A 428 1.081 17.735 49.610 1.00 32.15原子 1664 O ASP A 428 1.827 16.851 49.173 1.00 32.63原子 1665 N GLN A 429 0.302 18.414 48.772 1.00 29.90原子 1666 NE2 GLN A 429 -0.844 15.151 46.445 1.00 35.05原子 1667 OE1 GLN A 429 -0.895 15.061 48.694 1.00 36.32原子 1668 CD GLN A 429 -1.190 15.629 47.636 1.00 35.53原子 1669 CG GLN A 429 -1.923 16.955 47.621 1.00 32.82原子 1670 CB GLN A 429 -1.138 18.032 46.865 1.00 30.20原子 1671 CA GLN A 429 0.307 18.190 47.347 1.00 26.44原子 1672 C GLN A 429 1.011 19.302 46.621 1.00 22.82原子 1673 O GLN A 429 0.832 19.463 45.426 1.00 21.67原子 1674 N GLY A 430 1.812 20.142 47.320 1.00 18.52原子 1675 CA GLY A 430 2.534 21.185 46.583 1.00 15.09原子 1676 C GLY A 430 1.982 22.581 46.889 1.00 11.53原子 1677 O GLY A 430 2.582 23.559 46.432 1.00 16.43原子 1678 N GLY A 431 0.898 22.745 47.615 1.00 11.39原子 1679 CA GLY A 431 0.314 24.011 47.958 1.00 12.94原子 1680 C GLY A 431 -0.505 21.702 46.871 1.00 10.35原子 1681 O GLY A 431 -0.764 24.181 45.795 1.00 11.85原子 1682 N LYS A 432 -0.845 25.936 47.147 1.00 11.65原子 1683 CA LYS A 432 -1.637 26.762 46.245 1.00 13.87原 1684 CB LYS A 432 -2.343 27.862 47.049 1.00 16.54原子 1685 CG LYS A A32 -3.250 27.146 48.043 1.00 20.67原子 1686 CD LYS A 432 -4.058 28.036 48.933 1.00 24.37原子 1687 CE LYS A 432 -5.090 27.228 49.718 1.00 25.86原子 1688 NZ LYS A 432 -4.539 25.962 50.296 1.00 25.58原子 1689 C LYS A 432 -0.810 27.312 45.112 1.00 12.71原子 1690 O LYS A 432 0.414 27.398 45.187 1.00 11.37原子 1691 N TYR A 433 -1.533 27.713 44.072 1.00 8.62原子 1692 CA TYR A 433 -0.997 28.243 42.844 1.00 8.63原子 1693 CB TYR A 433 -1.677 27.746 41.591 1.00 8.94原子 1694 CG TYR A 433 -1.507 26.270 41.276 1.00 12.81原子 1695 CD1 TYR A 433 -2.460 25.350 41.653 1.00 13.02原子 1696 CE1 TYR A 433 -2.310 23.999 41.361 1.00 14.63原子 1697 CD2 TYR A 433 -0.360 25.813 40.637 1.00 13.00原子 1698 CE2 TYR A 433 -0.202 24.469 40.333 1.00 14.04原子 1699 CZ TYR A 433 -1.180 23.579 40.713 1.00 15.76原子 1700 OH TYR A 433 -1.018 22.241 40.429 1.00 18.68原子 1701 C TYR A 433 -0.990 29.769 42.955 1.00 6.12原子 1702 O TYR A 433 -1.576 30.319 43.866 1.00 7.36原子 1703 N VAL A 434 -0.279 30.385 42.031 1.00 8.06原子 1704 CA VAL A 434 -0.023 31.820 42.080 1.00 9.13原子 1705 CB VAL A 434 1.026 32.189 41.035 1.00 9.24原子 1706 CG1 VAL A 434 0.473 32.255 39.614 1.00 9.78原子 1707 CG2 VAL A 434 1.656 33.531 41.432 1.00 9.67原子 1708 C VAL A 434 -1.247 32.724 41.971 1.00 9.44原子 1709 O VAL A 434 -1.224 33.807 42.521 1.00 8.77原子 1710 N MET A 435 -2.348 32.242 41.373 1.00 9.61原子 1711 CA MET A 435 -3.580 33.044 41.377 1.00 10.35原子 1712 CB MET A 435 -4.313 32.866 40.054 1.00 9.92原子 1713 CG MET A 435 -3.514 33.300 38.848 1.00 10.91原子 1714 SD MET A 435 -2.789 34.945 38.866 1.00 11.06原子 1715 CE MET A 435 -4.229 35.954 39.266 1.00 11.66

原子

类型残基？ # X Y Z OCC B原子 1716 C MET A 435 -4.479 32.835 42.569 1.00 11.89原子 1717 O MET A 435 -5.625 33.382 42.578 1.00 10.19原子 1718 N TYR A 436 -4.004 32.200 43.636 1.00 9.70原子 1719 CA TYR A 436 -4.776 32.133 44.873 1.00 10.59原子 1720 CB TYR A 436 -4.154 31.274 45.976 1.00 12.19原子 1721 CG TYR A 436 -5.187 30.700 46.929 1.00 12.41原子 1722 CD1 TYR A 436 -6.086 29.710 46.528 1.00 13.54原子 1723 CE1 TYR A 436 -7.026 29.190 47.405 1.00 10.84原子 1724 CD2 TYR A 436 -5.275 31.200 48.218 1.00 12.72原子 1725 CE2 TYR A 436 -6.216 30.710 49.104 1.00 15.95原子 1726 CZ TYR A 436 -7.105 29.725 48.659 1.00 14.43原子 1727 OH TYR A 436 -8.012 29.266 49.572 1.00 17.14原子 1728 C TYR A 436 -4.977 33.571 45.304 1.00 10.80原子 1729 O TYR A 436 -4.106 34.412 45.121 1.00 7.79原子 1730 N PRO A 437 -6.178 33.938 45.778 1.00 11.93原子 1731 CD PRO A 437 -7.340 33.037 45.939 1.00 11.26原子 1732 CA PRO A 437 -6.467 35.326 46.139 1.00 10.62原子 1733 CB PRO A 437 -7.962 35.319 46.495 1.00 12.25原子 1734 CG PRO A 437 -8.320 33.884 46.714 1.00 12.44原子 1735 C PRO A 437 -5.713 35.775 47.385 1.00 10.79原子 1736 O PRO A 437 -5.577 36.995 47.602 1.00 11.50原子 1737 N ILE A 438 -5.411 34.802 48.243 1.00 11.06原子 1738 CA ILE A 438 -4.645 35.046 49.464 1.00 14.21原子 1739 CB ILE A 438 -5.154 34.201 50.625 1.00 16.10原子 1740 CG2 ILE A 438 -4.290 34.449 51.876 1.00 19.74原子 1741 CG1 ILE A 438 -6.619 34.470 50.967 1.00 19.29原子 1742 CD1 ILE A 438 -7.175 33.545 52.055 1.00 20.13原子 1743 C ILE A 438 -3.173 34.778 49.119 1.00 14.66原子 1744 O ILE A 438 -2.796 33.666 48.710 1.00 10.76原子 1745 N ALA A 439 -2.342 35.803 49.202 1.00 12.90原子 1746 CB ALA A 439 -0.137 36.968 49.129 1.00 13.51原子 1747 CA ALA A 439 -0.946 35.702 48.748 1.00 12.56原子 1748 C ALA A 439 -0.219 34.450 49.179 1.00 11.82原子 1749 O ALA A 439 -0.053 34.221 50.350 1.00 12.72原子 1750 N VAL A 430 0.244 33.624 48.232 1.00 12.54原子 1751 CA VAL A 440 1.038 32.460 48.610 1.00 13.18原子 1752 CB VAL A 440 1.194 31.545 47.405 1.00 13.89原子 1753 CG1 VAL A 440 -0.203 30.964 47.060 1.00 14.71原子 1754 CG2 VAL A 440 1.748 32.335 46.225 1.00 14.29原子 1755 C VAL A 440 2.422 32.915 49.105 1.00 13.24原子 1756 O VAL A 440 2.951 33.937 48.665 1.00 10.97原子 1757 N SER A 441 3.009 32.117 49.958 1.00 13.77原子 1758 CA SER A 441 4.320 32.449 50.541 1.00 15.67原子 1759 CB SER A 441 4.602 31.531 51.741 1.00 14.54原子 1760 OG SER A 441 4.895 30.230 51.251 1.00 12.13原子 1761 C SER A 441 5.443 32.298 49.543 1.00 14.86原子 1762 O SER A 441 6.393 33.042 49.627 1.00 16.15原子 1763 N GLY A 442 5.365 31.340 48.626 1.00 15.69原子 1764 CA GLY A 442 6.458 31.086 47.680 1.00 15.78原子 1765 C GLY A 442 7.329 29.955 48.292 1.00 17.87原子 1766 O GLY A 442 8.313 29.533 47.700 1.00 17.88原子 1767 N ASP A 443 6.933 29.420 49.433 1.00 16.97原子 1768 CA ASP A 443 7.639 28.297 50.053 1.00 19.48原子 1769 CB ASP A 443 7.315 28.159 51.522 1.00 20.17

原子

类型残基？ # X Y Z OCC B原子 1770 CG ASP A 443 7.612 29.371 52.357 1.00 23.62原子 1771 OD1 ASP A 443 8.296 30.306 51.896 1.00 23.81原子 1772 OD2 ASP A 443 7.119 29.399 53.505 1.00 25.54原子 1773 C ASP A 443 7.308 26.945 49.435 1.00 21.78原子 1774 O ASP A 443 8.052 25.962 49.619 1.00 20.22原子 1775 N HIS A 444 6.163 26.878 48.737 1.00 18.42原子 1775 CA HIS A 444 5.734 25.593 48.195 1.00 18.25原子 1777 CB HIS A 444 4.263 25.329 48.628 1.00 19.33原子 1778 CG HIS A 444 4.010 25.631 50.066 1.00 21.40原子 1779 CD2 HIS A 444 3.475 26.703 50.697 1.00 21.56原子 1780 ND1 HIS A 444 4.407 24.765 51.066 1.00 22.82原子 1781 CE1 HIS A 444 4.098 25.274 52.242 1.00 22.65原子 1782 NE2 HIS A 444 3.540 26.457 52.047 1.00 23.53原子 1783 C HIS A 444 5.869 25.478 46.699 1.00 18.20原子 1784 O HIS A 444 5.869 26.430 45.924 1.00 16.89原子 1785 N GLU A 445 5.967 24.246 46.228 1.00 18.90原子 1786 OE2 GLU A 445 7.287 19.466 44.909 1.00 37.32原子 1887 OE1 GLU A 445 5.382 19.436 43.805 1.00 36.75原子 1788 CO GLU A 445 6.406 20.025 44.213 1.00 34.73原子 1789 CG GLU A 445 6.551 21.509 43.912 1.00 31.48原子 1790 CB GLU A 445 5.641 22.370 44.753 1.00 24.36原子 1791 CA GLU A 445 6.094 23.856 44.844 1.00 21.30原子 1892 C GLU A 445 5.192 24.573 43.856 1.00 19.12原子 1793 O GLU A 445 5.654 25.106 42.852 1.00 18.43原子 1794 N ASN A 446 3.886 24.568 44.155 1.00 14.02原子 1895 CA ASN A 446 2.931 25.161 43.217 1.00 12.89原子 1896 CB ASN A 446 1.558 24.575 43.616 1.00 13.52原子 1797 CG ASN A 446 1.492 23.081 43.416 1.00 11.57原子 1898 OD1 ASN A 446 2.288 22.530 42.688 1.00 14.69原子 1799 ND2 ASN A 446 0.580 22.359 44.016 1.00 14.47原子 1800 C ASN A 446 2.880 26.669 43.236 1.00 12.30原子 1801 O ASN A 446 2.299 27.295 42.349 1.00 11.18原子 1802 N ASN A 447 3.432 27.299 44.274 1.00 12.22原子 1803 CA ASN A 447 3.261 28.692 44.560 1.00 12.81原子 1804 CB ASN A 447 3.943 29.244 45.794 1.00 13.02原子 1805 CG ASN A 447 3.432 28.721 47.094 1.00 14.61原子 1806 OD1 ASN A 447 4.151 28.912 48.081 1.00 15.02原子 1807 ND2 ASN A 447 2.276 28.070 47.103 1.00 13.05原子 1808 C ASN A 447 3.662 29.596 43.403 1.00 14.50原子 1809 O ASN A 447 2.990 30.597 43.173 1.00 14.90原子 1810 N LYS A 448 4.698 29.182 42.679 1.00 15.41原子 1811 CA LYS A 448 5.123 30.032 41.582 1.00 19.44原子 1811 CB LYS A 448 6.678 30.007 41.496 1.00 20.29原子 1813 CG LYS A 448 7.319 30.599 42.725 1.00 22.70原子 1814 CD LYS A 448 8.503 31.527 42.408 1.00 25.96原子 1815 CE LYS A 448 8.285 32.968 42.835 1.00 24.34原子 1816 NZ LYS A 448 8.963 33.438 44.090 1.00 16.70原子 1817 C LYS A 448 4.568 29.566 40.271 1.00 19.62原子 1818 O LYS A 448 5.136 29.990 39.263 1.00 25.92原子 1819 N MET A 449 3.632 28.647 40.230 1.00 13.54原子 1820 CA MET A 449 3.122 28.149 38.956 1.00 14.78原子 1821 CB MET A 449 3.181 26.610 39.000 1.00 17.23原子 1822 CG MET A 449 4.638 26.182 39.231 1.00 23.71原子 1823 SD MET A 449 5.557 26.266 37.701 1.00 35.18

原子

类型残基？ # X Y Z OCC B原子 1824 CE MET A 449 6.512 27.753 37.876 1.00 29.45原子 1825 C MET A 449 1.660 28.558 38.779 1.00 10.74原子 1826 O MET A 449 1.051 28.898 39.776 1.00 7.03原子 1827 N PHE A 450 1.104 28.330 37.629 1.00 9.72原子 1828 CA PHE A 450 -0.319 28.583 37.393 1.00 11.38原子 1829 CB PHE A 450 -0.503 29.170 35.975 1.00 11.13原子 1830 CG PHE A 450 -0.071 30.631 35.959 1.00 12.52原子 1831 CD1 PHE A 450 -0.930 31.655 36.320 1.00 12.19原子 1832 CD2 PHE A 450 1.207 30.955 35.549 1.00 10.84原子 1833 CE1 PHE A 450 -0.508 32.973 36.265 1.00 11.08原子 1834 CE2 PHE A 450 1.624 32.264 35.490 1.00 10.58原子 1835 CZ PHE A 450 0.770 33.283 35.856 1.00 10.00原子 1836 C PHE A 450 -1.150 27.312 37.490 1.00 11.07原子 1837 O PHE A 450 -0.799 26.260 36.954 1.00 9.07原子 1838 N SER A 451 -2.323 27.410 38.138 1.00 11.36原子 1839 CA SER A 451 -3.268 26.315 38.270 1.00 10.14原子 1840 CB SER A 451 -4.487 26.735 39.155 1.00 10.95原子 1841 CG SER A 451 -5.179 27.782 38.420 1.00 9.02原子 1842 C SER A 451 -3.844 25.958 36.901 1.00 9.35原子 1843 O SER A 451 -3.770 26.735 35.963 1.00 9.40原子 1844 N GLN A 452 -4.577 24.855 36.824 1.00 12.16原子 1845 CA GLN A 452 -5.351 24.521 35.618 1.00 13.47原子 1846 CB GLN A 452 -5.964 23.125 35.803 1.00 16.94原子 1847 CG GLN A 452 -6.700 22.595 34.601 1.00 21.50原子 1848 CD GLN A 452 -5.827 22.669 33.361 1.00 23.04原子 1849 OE1 GLN A 452 -4.673 22.244 33.400 1.00 21.47原子 1850 NE2 GLN A 452 -6.377 23.285 32.307 1.00 23.25原子 1851 C GLN A 452 -6.430 25.554 35.338 1.00 13.65原子 1852 O GIN A 452 -6.638 25.907 34.165 1.00 14.17原子 1853 N CYS A 453 -7.045 26.104 36.363 1.00 14.02原子 1854 CA CYS A 453 -8.092 27.127 36.197 1.00 17.31原子 1855 CB CYS A 453 -8.719 27.417 37.560 1.00 21.49原子 1856 SG CYS A 453 -9.533 26.093 38.447 1.00 29.58原子 1857 C CYS A 453 -7.500 28.361 35.535 1.00 15.91原子 1858 O CYS A 453 -7.993 28.886 34.524 1.00 12.98原子 1859 N SER A 454 -6.301 28.786 36.002 1.00 10.78原子 1860 CA SER A 454 -5.584 29.858 35.390 1.00 9.42原子 1861 CB SER A 454 -4.341 30.410 36.146 1.00 8.01原子 1862 OG SER A 454 -4.692 30.709 37.471 1.00 8.77原子 1863 C SER A 454 -5.186 29.538 33.979 1.00 9.67原子 1864 O SER A 454 -5.237 30.413 33.113 1.00 9.80原子 1865 N LYS A 455 -4.691 28.304 33.763 1.00 11.07原子 1866 CA LYS A 455 -4.240 27.987 32.421 1.00 12.98原子 1867 CB LYS A 455 -3.599 26.587 32.376 1.00 13.14原子 1868 CG LYS A 455 -2.146 26.611 32.855 1.00 17.01原子 1869 CD LYS A 455 -1.656 25.166 32.882 1.00 19.15原子 1870 CE LYS A 455 -0.242 25.104 33.451 1.00 20.39原子 1871 NZ LYS A 455 0.195 23.673 33.295 1.00 23.90原子 1872 C LYS A 455 -5.367 28.049 31.401 1.00 12.31原子 1873 O LYS A 455 -5.180 28.539 30.315 1.00 12.74原子 1874 N GLN A 456 -5.529 27.527 31.755 1.00 14.47原子 1875 NE2 GLN A 456 -10.676 25.407 33.099 1.00 30.34原子 1876 OE1 GLN A 456 -9.503 23.500 32.899 1.00 29.79原子 1877 CD GLN A 456 -9.664 24.686 32.606 1.00 28.31

原子

类型残基？ # X Y Z OCC B原子 1878 CG GLY A 456 -8.670 25.342 31.686 1.00 25.00原子 1879 CB GLN A 456 -8.814 26.832 31.5U 1.00 19.95原子 1880 CA GLN A 456 -7.661 27.516 30.804 1.00 16.41原子 1881 C GLN A 456 -7.967 28.942 30.401 1.00 15.24原子 1882 O GLN A 456 -7.936 29.330 29.244 1.00 15.99原子 1883 N SER A 457 -8.038 29.821 31.393 1.00 14.14原子 1884 CA SER A 457 -8.377 31.231 31.194 1.00 14.81原子 1885 CB SER A 457 -8.518 31.976 32.530 1.00 15.12原子 1886 OG SER A 457 -9.565 31.464 33.315 1.00 16.45原子 1887 C SER A 457 -7.354 31.967 30.377 1.00 12.94原子 1888 O SER A 457 -7.697 32.696 29.467 1.00 12.19原子 1889 N ILE A 458 -6.051 31.825 30.722 1.00 12.21原子 1890 CA ILE A 458 -5.038 32.567 29.982 1.00 9.86原子 1891 CB ILE A 458 -3.699 32.500 30.795 1.00 11.36原子 1892 CG2 ILE A 458 -2.555 32.898 29.890 1.00 6.36原子 1893 CG1 ILE A 458 -3.853 33.384 32.036 1.00 9.88原子 1894 CD1 ILE A 458 -2.730 33.281 33.059 1.00 11.89原子 1895 C ILE A 458 -4.854 32.048 28.573 1.00 9.53原子 1896 O ILE A 458 -4.640 32.816 27.634 1.00 9.61原子 1897 N TYR A 459 -4.919 30.731 28.423 1.00 9.48原子 1898 CA TYR A 459 -4.767 30.100 27.112 1.00 11.60原子 1899 CB TYR A 459 -5.038 28.600 27.250 1.00 11.22原子 1900 CG TYR A 459 -5.045 27.843 25.943 1.00 16.31原子 1901 CD1 TYR A 459 -4.013 27.976 25.041 1.00 16.99原子 1902 CE1 TYR A 459 -4.028 27.303 23.827 1.00 19.40原子 1903 CD2 TYR A 459 -6.103 26.999 25.626 1.00 18.93原子 1904 CE2 TYR A 459 -6.108 26.299 24.422 1.00 21.51原子 1905 CZ TYR A 459 -5.075 26.458 23.532 1.00 20.71原子 1906 OH TYR A 459 -5.095 25.772 22.341 1.00 21.74原子 1907 C TYR A 459 -5.720 30.750 26.110 1.00 12.72原子 1908 O TYR A 459 -5.334 31.252 25.073 1.00 14.82原子 1909 N LYS A 460 -6.974 30.779 26.528 1.00 14.14原子 1910 NZ LYS A 460 -10.468 26.961 25.743 1.00 30.41原子 1911 CE LYS A 460 -9.733 27.718 24.702 1.00 27.82原子 1912 CD LYS A 460 -9.809 29.219 24.921 1.00 26.35原子 1911 CG LYS A 460 -9.794 29.689 26.345 1.00 23.26原子 1914 CB LYS A 460 -9.375 31.156 26.477 1.00 19.80原子 1915 CA LYS A 460 -8.043 31.371 25.721 1.00 18.07原子 1916 C LYS A 460 -7.739 32.806 25.384 1.00 16.65原子 1917 O LYS A 460 -7.735 33.206 24.228 1.00 16.84原子 1918 N THR A 461 -7.225 33.546 26.348 1.00 14.44原子 1919 CA THR A 461 -6.847 34.932 26.129 1.00 14.79原子 1920 CB THR A 461 -6.597 35.590 27.509 1.00 13.79原子 1921 OG1 THR A 461 -7.813 35.528 28.254 1.00 13.87原子 1922 CG2 THR A 461 -6.192 37.054 27.345 1.00 16.01原子 1923 C THR A 461 -5.709 35.061 25.159 1.00 14.88原子 1924 O THR A 461 -5.830 35.765 24.142 1.00 14.86原子 1925 N ILE A 462 -4.569 34.417 25.419 1.00 14.52原子 1926 CA ILE A 462 -3.422 14.528 24.542 1.00 17.34原子 1927 CB ILE A 462 -2.223 33.642 24.975 1.00 18.43原子 1928 CG2 ILE A 462 -1.130 33.6 99 23.904 1.00 20.28原子 1929 CG1 ILE A 462 -1.643 34.018 26.316 1.00 18.70原子 1930 CD1 ILE A 462 -0.726 32.967 26.946 1.00 19.10原子 1931 C ILE A 462 -3.757 34.102 23.124 1.00 18.59

原子

类型残基？ # X Y Z OCC B原子 1932 O ILE A 462 -2.420 34.813 22.189 1.00 17.11原子 1933 N GLU A 463 -4.473 32.979 22.968 1.00 22.42原子 1934 OE2 GLU A 463 -8.026 23.422 22.532 1.00 41.03原子 1935 OE1 GLU A 463 -7.006 29.787 20.674 1.00 39.73原子 1936 CD GLU A 463 -7.293 29.635 21.536 1.00 39.22原子 1937 CG GLU A 463 -6.723 31.032 21.405 1.00 36.15原子 1938 CB GLU A 463 -5.228 31.095 21.624 1.00 30.56原子 1939 CA GLU A 463 -4.692 32.520 21.587 1.00 26.30原子 1940 C GLU A 463 -5.492 33.530 20.800 1.00 27.72原子 1941 O GLU A 463 -5.233 33.704 19.607 1.00 29.03原子 1942 N SER A 464 -6.399 34.283 21.418 1.00 26.79原子 1943 CA SER A 464 -7.190 35.312 20.764 1.00 26.80原子 1944 CB SER A 464 -8.395 35.611 21.666 1.00 25.15原子 1945 OG SER A 464 -9.060 36.806 21.404 1.00 25.60原子 1946 C SER A 464 -6.434 36.623 20.582 1.00 27.79原子 1947 O SER A 464 -6.686 37.340 19.612 1.00 27.52原子 1948 N LYS A 465 -5.598 36.959 21.560 1.00 25.83原子 1949 CA LYS A 465 -4.956 38.267 21.585 1.00 28.04原子 1950 CB LYS A 465 -5.065 38.846 22.993 1.00 28.65原子 1951 CG LYS A 465 -6.217 39.766 23.316 1.00 30.43原子 1952 CD LYS A 465 -7.570 39.136 23.099 1.00 31.72原子 1953 CE LYS A 465 -8.699 40.165 23.068 1.00 32.17原子 1954 NZ LYS A 465 -8.593 41.165 24.149 1.00 32.20原子 1955 C LYS A 465 -3.505 38.293 21.145 1.00 27.28原子 1956 O LYS A 465 -3.053 39.353 20.704 1.00 27.45原子 1957 N ALA A 466 -2.767 37.193 21.184 1.00 28.49原子 1958 CA ALA A 466 -1.373 37.191 20.753 1.00 28.95原子 1959 CB ALA A 466 -0.768 35.788 20.750 1.00 27.44原子 1960 C ALA A 466 -1.152 37.821 19.385 1.00 30.12原子 1961 O ALA A 466 -0.295 38.708 19.256 1.00 28.37原子 1962 N GLN A 467 -1.922 37.440 18.373 1.00 30.63原子 1963 NE2 GLN A 467 0.360 36.582 14.061 1.00 41.77原子 1964 OE1 GLN A 467 -0.196 35.394 15.816 1.00 42.22原子 1965 CD GLN A 467 -0.524 36.191 14.967 1.00 40.84原子 1966 CG GLN A 467 -1.903 36.768 14.813 1.00 40.14原子 1967 CB GLN A 467 -2.609 37.306 16.027 1.00 36.55原子 1968 CA GLN A 467 -1.712 38.007 17.038 1.00 33.94原子 1969 C GLN A 467 -1.891 39.519 16.996 1.00 33.19原子 1970 O GLN A 467 -1.208 40.231 16.271 1.00 33.32原子 1971 N GLU A 468 -2.797 40.063 17.768 1.00 33.44原子 1972 OE2 GLU A 468 -7.657 40.802 18.969 1.00 44.61原子 1973 OE1 GLU A 468 -6.465 41.900 20.497 1.00 44.24原子 1974 CD GLU A 468 -6.664 41.480 19.332 1.00 44.10原子 1975 CG GLU A 468 -5.602 41.832 18.305 1.00 41.64原子 1976 CB GLU A 468 -4.238 41.582 18.934 1.00 38.28原子 1977 CA GLU A 468 -3.092 41.457 17.917 1.00 35.15原子 1978 C GLU A 468 -1.956 42.299 18.485 1.00 33.88原子 1979 O GLU A 468 -1.706 43.397 17.980 1.00 32.88原子 1980 N CYS A 469 -1.382 41.873 19.618 1.00 32.54原子 1981 CA CYS A 469 -0.374 42.738 20.230 1.00 32.43原子 1982 CB CYS A 469 -1.019 43.591 21.320 1.00 34.38原子 1983 SG CYS A 469 -1.294 42.874 22.918 1.00 36.46原子 1984 C CYS A 469 0.888 42.055 20.713 1.00 29.85原子 1985 O CYS A 469 1.786 42.811 21.105 1.00 30.62

原子

类型残基？ # X Y Z OCC B原子 1986 N PHE A 470 1.027 40.739 20.624 1.00 25.22原子 1987 CA PHE A 470 2.314 10.147 21.073 1.00 25.07原子 1988 CB PHE A 470 2.163 38.694 21.471 1.00 21.98原子 1989 CG PHE A 470 1.192 38.480 22.808 1.00 21.60原子 1990 CD1 PHE A 470 0.810 39.497 23.450 1.00 19.78原子 1991 CD2 PHE A 470 1.556 37.251 23.414 1.00 19.41原子 1992 CE1 PHE A 470 0.182 39.309 24.658 1.00 20.26原子 1993 CE2 PHE A 470 0.932 37.046 24.634 1.00 20.13原子 1994 CZ PHE A 470 0.257 38.065 25.257 1.00 20.62原子 1995 C PHE A 470 3.351 40.383 19.999 1.00 24.85原子 1996 O PHE A 470 2.994 40.592 18.836 1.00 23.37原子 1997 N GLN A 471 4.610 40.404 20.389 1.00 23.76原子 1998 CA GLN A 471 5.714 40.672 19.491 1.00 25.96原子 1999 CB GLN A 471 6.350 42.028 19.794 1.00 27.26原子 2000 CG GLN A 471 5.453 43.201 19.442 1.00 31.81原子 2001 CD GLN A 471 6.014 44.575 19.678 1.00 33.37原子 2002 OE1 GLN A 471 5.258 45.547 19.668 1.00 35.13原子 2003 NE2 GLN A 471 7.323 44.723 19.885 1.00 35.41原子 2004 C GLN A 471 6.772 39.578 19.615 1.00 25.85原子 2005 O GLN A 471 6.668 38.670 20.433 1.00 23.32原子 2006 N GLU A 472 7.771 39.683 18.760 1.00 27.21原子 2007 OE2 GLU A 472 8.898 4L.817 17.307 1.00 43.27原子 2008 OE1 GLU A 472 9.685 41.624 15.282 1.00 44.72原子 2009 CD GLU A 472 9.267 41.115 16.344 1.00 42.17原子 2010 CG GLU A 472 9.207 39.605 16.387 1.00 39.41原子 2011 CB GLU A 472 9.836 38.975 17.600 1.00 14.14原子 2012 CA GLU A 472 8.867 38.730 18.759 1.00 30.87原子 2013 C GLU A 472 9.656 38.993 20.037 1.00 30.26原子 2014 O GLU A 472 9.773 40.161 20.396 1.00 29.23原子 2015 N ARG A 473 10.256 37.970 20.584 1.00 31.97原子 2016 CA ARG A 473 11.073 38.106 21.778 1.00 34.21原子 2017 CB ARG A 473 11.230 36.691 22.340 1.00 34.97原子 2018 CG ARG A 473 12.230 36.454 23.443 1.00 37.52原子 2019 CD ARG A 473 11.661 35.449 24.436 1.00 39.68原子 2020 NE ARG A 473 12.564 35.155 25.532 1.00 41.06原子 2021 CZ ARG A 473 12.469 35.726 26.729 1.00 42.18原子 2022 NH1 ARG A 473 13.327 35.423 27.693 1.00 42.83原子 2023 NH2 ARG A 473 11.559 36.660 26.960 1.00 42.33原子 2024 C ARG A 473 12.451 38.665 21.456 1.00 36.39原子 2025 O ARG A 473 13.092 38.294 20.489 1.00 36.44原子 2026 N SER A 474 12.918 39.567 22.276 1.00 37.92原子 2027 OG SER A 474 15.308 38.413 23.524 1.00 36.38原子 2028 CB SER A 474 15.293 39.122 22.290 1.00 37.61原子 2029 CA SER A 474 14.200 40.202 22.359 1.00 37.96原子 2030 C SER A 474 14.436 41.341 21.403 1.00 39.67原子 2031 O SER A 474 13.589 42.259 21.336 1.00 40.16

实施例5-TACE抑制剂的设计

TACE的X-射线坐标被读入Sybyl v.6.3(Tripos Associates)软件包并通过图像来分析X-射线结构。对位于初始X-射线坐标内部的区域进行手性和原子类型的修改。对经修饰的TACE的X-射线模型进行能量最小化直至所有的TACE结构参数达到其平衡或最优值。然后将能量最小化的结构与初始结构进行比较以确证没有存在异常。

鉴定了TACE和共结晶抑制剂之间特定相互作用的位点。然后将抑制剂从X-射线复合模型中除去，仅留下TACE结构模型。

根据和TACE相互作用的位点和依据以前已经鉴定出来的共晶体抑制剂的相互作用的位点来选择候选的抑制剂。一旦特定的候选抑制剂-TACE相互作用被确定，即进行对接研究以提供所选择的候选抑制剂和TACE的初步的“定模”复合物。

使用分子动力学(MD)进行限制性构象分析，以检查定模的TACE-抑制剂复合物的完整性。一旦该复合物达到了其最适当的构象状态，即可对由MD研究提出的结构进行视觉分析以确保定模的复合物附合基于测定的结合亲和力的实验性SAR/QSAR。

分析定模的候选抑制剂-TACE复合物。选择与TACE的含有一个小的暴露于溶剂中的S1’区域缔合的复合物的区域作为修饰的靶区域。根据计算和合成化学原则选择单一的修饰，即选择埋在靶区域内部的苯甲基基团。该苯甲基被定位在一个合适的锌螯合作用的核心并伸入到S1’S3’口袋内。该修饰将一种通常是MMP选择性的抑制剂转换为TACE选择性的。苯甲基经过修饰的抑制剂的IC50数据确证了这一选择性。

反复进行基于结构的类似物研究以优化抑制剂的效力、选择性和物质的类似药物的特性。

实施例6-TACE抑制的测定

将250μM肽底物(Ac-SPLAQAVRSSSR-NH₂)与溶于缓冲液中的3.7U/μl TACE在25℃下一起保温，上述缓冲液含有10mM TRIS HCI，pH7.4，10％甘油。在两小时后用1％TFA(终浓度)终止反应。反应混合物通过HPLC在Hewlett-Packard 1150中分离。产物的组成通过在220mm的吸收进行监测。

反应的线性被确证(r²＞0.85)。使用Dunnett’s多对比较试验计算对照速度的平均值(x±sem)并将其与药物试验的速度进行统计学显著性(p＜0.05)的比较。使用多种剂量的药物产生剂量应答相关性，使用线性回归估计95％CI的IC₅₀的值。

本工艺的熟练人员从前述的描述和实施例中可以发现本发明的本质特征并且在不离开本发明的精神和范围的前提下，可以对本发明进行改变、修饰和变更以使其适应不同的用途和条件。另外，以上所引用的所有出版物和专利申请中所公布的内容，包括美国临时专利申请流水号60/073，709和美国专利申请流水号09/050.083，同各自单独作为参照结合于本说明书中的程度一样，其全部内容明确地作为参照结合于本说明书中。

Claims

1.一种含有以结晶态形式存在的多肽的组合物，其中的多肽是一种TNF-α转换酶多肽。

2.如权利要求1中所述的组合物，其中的TNF-α-转换酶多肽包括TNF-α-转化酶的催化结构域。

3.如权利要求1中所述的组合物，其中的TNF-α转换酶多肽是一段编码TNF-α-转换酶的前(pro)和催化结构域的多聚核苷酸的表达产物。

4.如权利要求1中所述的组合物，其中的TNF-α转换酶多肽是一段编码TNF-α-转换酶的1-477位氨基酸残基的多聚核苷酸的表达产物。

5.如权利要求4中所述的组合物，其中的多聚核苷酸被替换以使氨基酸残基Ser266变为Ala，氨基酸残基Asn542变为Gln，并在其C-末端融合编码序列Gly-Ser-(His)6的另一段多聚核苷酸。

6.如权利要求1中所述的组合物，进一步包括适合与TNF-α-转换酶多肽共晶体一种结合伴侣。

7.如权利要求6中所述的组合物，其中该结合伴侣是一种基于羟肟酸盐的结合伴侣。

8.如权利要求6中所述的组合物，其中该结合伴侣是N-{D，L-2-(羟基氨基羰基)甲基-4-甲基戊酰}-L-3-氨基-2-二甲基丁酰-L-丙氨酸，2-(氨基)乙基酰胺。

9.如权利要求1中所述的组合物，其中该晶体具有衍射能力达2.0的晶体结构。

10.如权利要求1中所述的组合物，其中该晶体属于单斜晶系。

11.如权利要求1中所述的组合物，其中该晶体的单位晶胞包括四个晶体学上独立的TNF-α-转换酶催化结构域(TCD)分子。

12.如权利要求11中所述的组合物，其中的TCD分子都位于一个不对称单位中。

13.如权利要求1中所述的组合物，其中的晶体属于单斜晶系的P21空间群，晶胞参数为a＝61.38、b＝126.27、c＝81.27，β＝107.41°。

14.如权利要求1中所述的组合物，其中多肽的特征是通过表1中所述的结构坐标或其主要的部分来确定的。

15.一种结晶TNF-α-转换酶多肽的方法，包括：

(A)将含有一种TACE多肽和一种结合伴侣的溶液与一种结晶缓冲液混合，以及

(B)通过悬滴气相扩散法结晶步骤(A)中的混合物以形成一种晶体沉淀物。

16.如权利要求15中所述的方法，进一步包括：

(C)将通过悬滴气相扩散法形成的晶体沉淀中的晶种和一种结晶启动因子转移到一种浓缩溶液的混合物中，该溶液包括一种TACE多肽和一种结合伴侣底物、以及一种结晶缓冲液；以及

(D)通过悬滴气相扩散法结晶步骤(C)中的混合物以形成晶体。

17.如权利要求15或16中所述的方法，其中上述结晶缓冲液是0.1M柠檬酸钠，pH5.4，20％w/v PEG 4000，以及20％v/v异丙醇。

18.如权利要求15或16中所述的方法，其中的结合伴侣是N-{D，L-2-(羟基氨基羰基)甲基-4-甲基戊酰}-L-3-氨基-2-二甲基丁酰-L-丙氨酸，2-(氨基)乙基酰胺。

19.如权利要求15或16中所述的方法，其中结晶是在温度范围为4到20摄氏度下进行的。

20.如权利要求15或16中所述的方法，其中含有TACE多肽和抑制剂的溶液在缓冲液中的浓度约为5mg/ml到约12mg/ml。

21.如权利要求20中所述的方法，其中含有TACE多肽和结合伴侣的溶液与结晶缓冲液以1∶1的比例混合。

22.一种通过将TNF-α-转换酶和一种共结晶底物共结晶制得的肿瘤坏死因子(TNF-α)-转换酶晶体。

23.一种已经在其上记录了TNF-α转换酶的催化结构域或其部分的X-射线晶体学坐标数据的计算机可读的介质。

24.一种已经在其上记录了表1中所列出的X-射线晶体学坐标数据或其部分的计算机可读的介质。

25.如权利要求23或24中所述的计算机可读的介质，其中的介质是选自以下群体的，包括：软盘、硬盘、计算机磁带、RAM、ROM、CD、DVD、磁盘和光盘。

26.一种已经在其上记录了机器可读数据的计算机可读的介质，其中的计算机可读的介质，当与安装有数据使用说明程序的机器一起使用时，能够产生用于描述TNF-α转换酶多肽或其部分的图形三维表示的影像信号。

27.一个用于研究TNF-α转换酶多肽的系统，上述的系统包括：

(a)一个可以存储描绘TNF-α转换酶多肽的至少一部分的信息的存储器，其中上述的存储器包括至少一个I型的储存区域，其含有指定三维空间定位的一套空间坐标，以及至少一个含有表述多个氨基酸中的一个的特征的信息的II型存储区域，上述II型存储区域在上述存储器中与上述I型存储区域在逻辑上相关，以表述上述TNF-α转换酶肽的上述至少一部分的至少一个特征在上述三维空间中的几何排布；

(b)与上述存储器配合以存取上述I型存储区域和上述II型存储区的处理器，其中该处理器产生影像信号以描述基于上述存储器中的数据的、上述TNF-α-转换酶的上述至少一个部分的上述至少一个特征在上述三维空间的三维影像的视觉影像表示；以及

(c)与上述处理器配合以接受上述影像信号的显示器，其中的显示器描述了基于上述影像信号的、上述TNF-α转换酶多肽的上述至少一个部分的上述至少一个特征在上述三维空间中的视觉三维影像。

28.如权利要求27中所述的系统，其中上述影像信号包括描述上述TNF-α转换酶多肽的上述至少一个部分在上述三维空间中的飘带结构的视觉三维影像的信号。

29.如权利要求27中所述的系统，其中上述信号包括描述代表上述TNF-α转换酶多肽的上述至少一个部分在上述三维空间中的固体模型表示的视觉影像的信号。

30.如权利要求27中所述的系统，其中上述信号包括描述代表上述TNF-α转换酶多肽的上述至少一个部分在上述三维空间中的静电表面电位的视觉三维影像的信号。

31.如权利要求27中所述的系统，其中上述信号包括描述代表上述TNF-α转换酶多肽的上述至少一个部分在上述三维空间中的视觉三维立体影像的信号。

32.如权利要求27中所述的系统，进一步包括：

一种可以储存代表除了上述TNF-α转换酶多肽以外的化合物的一个特征的几何排布的数据的储存装置；以及

一种接收来自操作者的命令的操作界面；其中上述处理器与上述储存装置和上述操作界面配合，产生附加的影像信号来描述上述化合物的上述特征的上述几何排布，其与基于来自操作界面的命令与上述TNF-α转换酶多肽的上述至少一个部分的上述至少一个特征在上述显示器中的上述视觉三维影像相关。

33.如权利要求32中所述的系统，其中上述储存装置是上述储存器的一部分。

34.如权利要求27中的系统，包括多个I型和II型储存区域。

35.一种可以储存信息以产生上述TNF-α转换酶多肽的至少一个部分的视觉显示的图象存储器，上述图象存储器包括：

(a)至少一个I型存储区域，每个上述I型存储区域包括指定三维空间定位的一套空间坐标；以及

(b)至少一个II型存储区域，每个上述II型存储区域含有视觉描述多个氨基酸中一个的特征的信息；其中上述II型存储区域在上述图象存储器中与上述I型存储区域在逻辑上相关，以表述上述TNF-α转换酶多肽的上述至少一个部分的至少一个特征在上述三维空间中的几何排布。

36.如权利要求35中的图象存储器，其中上述II型存储区域在上述图象存储器中与上述I型存储区域在逻辑上相关，以表述上述TNF-α转换酶多肽的一个催化结构域部分的至少一个特征在上述三维空间中的几何排布。

37.如权利要求35中的图象存储器，其中上述I型存储区域和上述II型存储区域是半导体存储器的区域。

38.如权利要求35中的图象存储器，其中上述I型存储区域和上述II型存储区域是光盘的区域。

39.如权利要求35中的图象存储器，其中上述I型存储区域和上述II型存储区域是磁性存储器的区域。

40.如权利要求35中的图象存储器，包括多个I型和II型存储区域。

41.一种鉴定一种与TNF-α-转换酶相缔合的化合物的方法，包括：

(A)设计一种与上述多肽相缔合的化合物，其基于TNF-α转换酶多肽晶体的X-射线衍射坐标与该TNF-α-转换酶催化结构域形成一个键；

(B)合成上述化合物；以及

(C)确定上述化合物与上述TNF-α-转换酶的缔合能力。

42.如权利要求41中所述的方法，其中上述与之缔合的化合物是一种抑制剂、介体、或其它调节TNF-α转换酶活性的化合物。

43.如权利要求42中所述的方法，其中上述与之缔合的化合物是一种竞争性抑制剂、反竞争性抑制剂、或非竞争性抑制剂。

44.如权利要求41中所述的方法，其中的坐标是表1中的坐标，或其主要的部分。

45.如权利要求41中所述的方法，其中上述TNF-α-转换酶多肽晶体包括TNF-α-转换酶催化结构域。

46.如权利要求41中所述的方法，其中上述TNF-α-转换酶多肽是一段编码TNF-α-转换酶的前和催化结构域的多聚核苷酸的表达产物。

47.如权利要求41中所述的方法，其中上述TNF-α-转换酶多肽是一段编码TNF-α-转换酶的氨基酸残基1-477的多聚核苷酸的表达产物。

48.如权利要求47中所述的方法，其中的多聚核苷酸被替换以使氨基酸残基Ser266被变为Ala，氨基酸残基Asn542被变为Gln，并且在其C-末端融合编码序列Gly-Ser-(His)6的另一段多聚核苷酸。

49.如权利要求41中所述的方法，其中上述TNF-α-转换酶多肽晶体与一种结合伴侣共结晶。

50.如权利要求49中所述的方法，其中的结合伴侣是一种基于羟肟酸盐的结合伴侣。

51.如权利要求49中所述的方法，其中的结合伴侣是N-{D，L-2-(羟基氨基羰基)甲基-4-甲基戊酰}-L-3-氨基-2-二甲基丁酰-L-丙氨酸，2-(氨基)乙基酰胺。

52.如权利要求40中所述的方法，其中上述TNF-α-转换酶多肽晶体具有衍射能力达2.0的晶体结构。

53.如权利要求41中所述的方法，其中上述TNF-α-转换酶多肽晶体属于单斜晶系。

54.如权利要求41中所述的方法，其中上述TNF-α-转换酶多肽晶体的单位晶胞含有四个晶体学上独立的TNF-α-转换酶催化结构域(TCD)分子。

55.如权利要求54中所述的方法，其中的TCD分子都位于一个不对称单位中。

56.如权利要求41中所述的方法，其中上述TNF-α-转换酶多肽晶体属于单斜晶系P2₁空间群，其晶胞参数为a＝61.38、b＝126.27、c＝81.27，β＝107.41°。

57.如权利要求41中所述的方法，其中与之缔合的化合物被设计以与TNF-α-转换酶的S1’区域缔合。

58.如权利要求41中所述的方法，其中与之缔合的化合物被设计以与TNF-α-转换酶的S1’S3’区域缔合。

59.如权利要求41中所述的方法，其中与之缔合的化合物被设计参入了螯合锌的部分。

60.如权利要求41中所述的方法，其中与之缔合的化合物被设计以与TNF-α-转换酶的Leu348或Gly349形成氢键。

61.如权利要求41中所述的方法，其中与之缔合的化合物被设计以引入一个占据TNF-α-转换酶的S1’口袋的非极性基团。

62.如权利要求41中所述的方法，其中与之缔合的化合物被设计以引入一个基团，其位于连接TNF-α-转换酶的S1’-S3’口袋的通道内并与该通道形成合适的范德华力。

63.如权利要求41中所述的方法，其中与之缔合的化合物被设计以与Leu348或Gly349在TNF-α-转换酶的主链酰胺基团形成氢键。