CN111194215B - 用于调节剪接的方法和组合物 - Google Patents

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Abstract

本文描述了调节基因编码的mRNA(例如前mRNA)的剪接的小分子剪接调节剂化合物,以及使用小分子剪接调节剂化合物调节剪接和治疗疾病和病症的方法。

Description

用于调节剪接的方法和组合物
交叉引用
本申请要求于2017年8月4日提交的美国临时申请号62/541,202;于2017年9月25日提交的美国临时申请号62/562,927;以及于2017年9月25日提交的美国临时申请号62/562,948的优先权,其各自的全部内容通过引用并入本文。
背景技术
人类基因组中的大多数蛋白质编码基因由被内含子(非编码区)分开的多个外显子(编码区)组成。基因表达产生单一前体信使RNA(前mRNA)。内含子序列随后通过称为剪接的过程自所述前mRNA去除,这导致成熟的信使RNA(mRNA)。通过包含不同的外显子组合,选择性剪接产生了编码不同蛋白质同工型的多个mRNA。剪接体(多种蛋白质和核糖核蛋白的细胞内复合物)催化剪接。
目前用于指导和控制mRNA表达的治疗方法需要诸如基因治疗、基因组编辑或多种寡核苷酸技术(反义,RNAi等)的方法。基因治疗和基因组编辑通过影响DNA编码并由此改变mRNA表达而在mRNA转录的上游起作用。寡核苷酸通过规范的碱基/碱基杂交调节RNA的作用。这种方法的吸引力在于寡核苷酸的基本药效团的设计,其可以通过与靶序列对象的已知碱基配对而以直接的方式定义。这些治疗方式中的每一种都面临着巨大的技术、临床和监管挑战。寡核苷酸作为治疗剂(例如反义,RNAi)的一些局限性包括不利的药代动力学、口服生物利用度不足和血脑屏障穿透不足,后者阻止在胃肠外药物施用后递送至脑或脊髓用于治疗疾病(例如神经疾病,脑癌)。此外,如果没有复杂的递送系统(如脂质纳米颗粒),则寡核苷酸不能有效地吸收到实体瘤中。此外,吸收到细胞和组织中的大多数寡核苷酸保留在非功能性区室(例如内体)中,无法进入靶标所位于的细胞质和/或细胞核。
此外,为了退火至靶标,寡核苷酸疗法需要接近靶标的互补碱基对。该方法假定前mRNA序列作为RNA的线性链存在于细胞中。然而,前mRNA很少是线性的;它具有复杂的二级和三级结构。此外,顺式作用元件(例如蛋白质结合元件)和反式作用因子(例如剪接复合物组分)可以产生另外的二维和三维复杂性(例如,通过与前mRNA结合)。这些特征可能是寡核苷酸疗法的效力和功效限制。
发明内容
本文所述的新型小分子剪接调节剂(SMSM)没有上述限制,也没有极大地限制寡核苷酸治疗的结构和空间障碍(例如,通过阻断与前mRNA靶标的杂交)。小分子对于揭示许多细胞过程(包括DNA复制/转录和翻译)的机制/调控和功能至关重要。尽管最近的几篇报道描述了对小分子剪接效应子的筛选,但仅鉴定了少量的组成型或替代性剪接调节剂,许多小分子抑制剂缺乏特异性、缺乏选择性、缺乏效力、展示毒性或口服不可用。用小分子调节剂靶向RNA转录组代表了一种未开发的治疗方法以治疗多种RNA介导的疾病。因此,仍然需要开发用作治疗剂的小分子RNA调节剂。在本领域中需要剪接或剪接依赖性过程的新型调节剂。本文提供了满足该需求的小分子剪接调节剂及其用途。
本文提供的是具有式(IV)结构的化合物或其药学上可接受的盐或溶剂化物:
其中,
每个A独立地为N或CRA
每个RA独立地选自H,D,卤素,-CN,-OH,-OR1,=O,=N-OR1,-SR1,-S(=O)R1,-S(=O)2R1,-N(R1)2,-NR1S(=O)(=NR1)R2,-NR1S(=O)2R2,-S(=O)2N(R1)2,-C(=O)R1,-OC(=O)R1,-C(=O)OR1,-OC(=O)OR1,-C(=O)N(R1)2,-OC(=O)N(R1)2,-NR1C(=O)R1,-P(=O)(R2)2,取代或未取代的C1-C6烷基,取代或未取代的C1-C6卤代烷基,取代或未取代的C1-C6杂烷基,取代或未取代的C3-C8环烷基,取代或未取代的C2-C7杂环烷基,取代或未取代的芳基,以及取代或未取代的单环杂芳基;
环Q为单环芳基,双环芳基,单环杂芳基或稠合双环杂芳基;
X为-O-,-NR3-,-CR4R5-,-C(=O)-,-C(=CR2 2)-,-S-,-S(=O)-,-S(=O)2-,或-S(=O)(=NR1)-;
每个R1独立地为H,D,取代或未取代的C1-C6烷基,-CD3,取代或未取代的C1-C6卤代烷基,取代或未取代的C1-C6杂烷基,取代或未取代的C3-C8环烷基,取代或未取代的C2-C7杂环烷基,取代或未取代的芳基,或者取代或未取代的杂芳基;
每个R2独立地为H,D,取代或未取代的C1-C6烷基,取代或未取代的C1-C6卤代烷基,取代或未取代的芳基,取代或未取代的单环杂芳基,-OR1,-N(R1)2,-CH2OR1,-C(=O)OR1,-OC(=O)R1,-C(=O)N(R1)2,或-NR1C(=O)R1
R3为-OR1,-N(R1)2,取代或未取代的C1-C6烷基,取代或未取代的C1-C6卤代烷基,取代或未取代的C1-C6杂烷基,取代或未取代的C3-C8环烷基,或者取代或未取代的C2-C7杂环烷基;
R4为H,D,F,-CN,-OR1,-SR1,-N(R1)2,取代或未取代的C1-C6烷基,取代或未取代的C1-C6卤代烷基,取代或未取代的C1-C6杂烷基,取代或未取代的C1-C6亚烷基-OR1,取代或未取代的C3-C8环烷基,取代或未取代的C2-C7杂环烷基,取代或未取代的芳基,或者取代或未取代的杂芳基;
R5为H,D,F,-CN,-OR1,-SR1,-N(R1)2,取代或未取代的C1-C6烷基,取代或未取代的C1-C6卤代烷基,取代或未取代的C1-C6杂烷基,取代或未取代的C1-C6亚烷基-OR1,取代或未取代的C3-C8环烷基,取代或未取代的C2-C7杂环烷基,取代或未取代的芳基,或者取代或未取代的杂芳基;或者
R4和R5与它们所连接的碳原子组合形成取代或未取代的C3-8环烷基或者取代或未取代的C2-7杂环烷基;
Z为CR2;且R2独立地为H,D,取代或未取代的C1-C6烷基,取代或未取代的C1-C6卤代烷基或-CH2OR1
W为取代或未取代的C1-C4亚烷基,取代或未取代的C2-C4亚烯基,或者取代或未取代的C1-C4杂亚烷基;
R选自H,取代或未取代的C1-6烷基,取代或未取代的C1-6氟代烷基,取代或未取代的C1-C6杂烷基,取代或未取代的C3-C8环烷基,取代或未取代的C2-C7杂环烷基,取代或未取代的芳基,以及取代或未取代的杂芳基,其中烷基任选地取代有羟基,氨基,取代或未取代的单-C1-6烷基氨基,或者取代或未取代的二-C1-6烷基氨基;
R11,R12,R13,R14,R15,R16,R17和R18各自独立地选自:H,F,OR1,取代或未取代的C1-6烷基,取代或未取代的C1-6氟代烷基,取代或未取代的C1-C6杂烷基,其中烷基任选地取代有羟基,氨基,甲氧基,取代或未取代的单-C1-6烷基氨基或者取代或未取代的二-C1-6烷基氨基;
R11和R13,组合形成取代或未取代的C1-3亚烷基或者取代或未取代的C1-3杂亚烷基;或者
R11和R15,组合形成取代或未取代的C1-3亚烷基;或者
R16和R17,组合形成取代或未取代的C1-3亚烷基;或者
R13和R14,与它们所连接的碳原子组合形成螺环C3-8环烷基;或者
R17和R2,组合形成取代或未取代的C1-3亚烷基;或者
当X为-NR3-时,则R3和R2任选地与它们所连接的中间原子一起形成4,5或6-元环;或者
当X为-NR3-,则R3和R16任选地与它们所连接的中间原子一起形成4,5或6-元环;
a和b各自独立地选自0,1,2或3;
c和d各自独立地选自1,2,3或4;并且
其中式(IV)化合物具有至少80%的立体化学纯度。
在一些实施方式中,W为取代或未取代的C1-C4亚烷基。
在一些实施方式中,为/>
在一些实施方式中,为/>
在一些实施方式中,X为-O-,-NR3-,-S-,-CR4R5-,-C(=O)-或-C(=CR2 2)-。
在一些实施方式中,X为-O-,-NR3-或-C(=O)-。
在一些实施方式中,环Q为取代或未取代的芳基。
在一些实施方式中,环Q为经以下取代的2-羟基-苯基:0、1、2或3个独立选自以下的取代基:C1-6烷基,氧代,肟,羟基,卤代-C1-6烷基,二卤代-C1-6烷基,三卤代-C1-6烷基,C1-6烷氧基,C1-6烷氧基-C3-7环烷基,卤代-C1-6烷氧基,二卤代-C1-6烷氧基,三卤代-C1-6烷氧基,羟基,氰基,卤素,氨基,单-C1-6烷基氨基,二-C1-6烷基氨基,芳基,杂芳基,羟基取代的C1-6烷基,芳基取代的C1-6烷氧基,氨基,-C(=O)NH-C1-6烷基-杂芳基,-NHC(=O)-C1-6烷基杂芳基,C1-6烷基-C(=O)NH-杂芳基,C1-6烷基-NHC(=O)-杂芳基,C3-7环烷基,5-7元环烯基或含有1或2个独立选自S、O和N的杂原子的5、6或9元杂环,其中两个C1-6烷基可以与它们所键合的原子组合以形成5-6元环;其中杂芳基具有5、6、9或10个环原子,1、2或3个选自N、O和S的环杂原子,并经0、1或2个独立选自以下的取代基取代:氧代,羟基,硝基,卤素,C1-6烷基,C1-6烯基,C1-6烷氧基,C3-7环烷基,C1-6烷基-OH,三卤代-C1-6烷基,单-C1-6烷基氨基,二-C1-6烷基氨基,-C(=O)NH2,-NH2,-NO2,羟基-C1-6烷基氨基,羟基-C1-6烷基,4-7元杂环-C1-6烷基,氨基-C1-6烷基,单-C1-6烷基氨基-C1-6烷基和二-C1-6烷基氨基-C1-6烷基。
在一些实施方式中,环Q为其中环P为芳基或杂芳基。
在一些实施方式中,环Q为其中环P为芳基或杂芳基。
在一些实施方式中,环P为选自以下的杂芳基: 其中每个RB独立地选自氰基,卤素,羟基,取代或未取代的C1-6烷基,-OCH3,-OCD3,取代或未取代的C2-6烯基,取代或未取代的C2-6炔基,取代或未取代的C1-6烷氧基,取代或未取代的C3-7环烷基,取代或未取代的C2-8杂环烷基,杂芳基,取代或未取代的杂环烷基-C1-6烷基,取代或未取代的C1-6烷基-芳基,取代或未取代的C1-6烷基-杂环烷基,取代或未取代的C1-6烷基-杂芳基,取代或未取代的C1-6烷氧基-芳基,取代或未取代的C1-6烷氧基-杂环烷基,取代或未取代的C1-6烷氧基-杂芳基,和羟基取代的C1-6烷氧基,C1-6烷氧基,氨基,单-C1-6烷基氨基和二-C1-6烷基氨基;并且m为0,1,2或3。
在一些实施方式中,环P为选自以下的杂芳基:
在一些实施方式中,环P为选自以下的杂芳基:
在一些实施方式中,环P为选自以下的杂芳基:
在一些实施方式中,环P为选自以下的杂芳基:
在一些实施方式中,环Q为2-萘基,其任选在3位取代有羟基,并另外取代有0,1或2个选自以下的取代基:羟基,氰基,卤素,C1-6烷基,C2-6烯基,C1-6烷氧基,其中所述烷氧基是未取代的或取代有羟基,C1-6烷氧基,氨基,-NHC(=O)-C1-6烷基,-NHC(=O)-C1-6烷基,C1-6亚烷基-4-7元杂环,4-7元杂环,单-C1-6烷基氨基和二-C1-6烷基氨基。
在一些实施方式中,环Q为
在一些实施方式中,环Q为并且每个R6独立地为H,-OR1,-N(R1)2,取代或未取代的C1-C6烷基,取代或未取代的C1-C6卤代烷基,取代或未取代的C1-C6杂烷基,取代或未取代的C3-C8环烷基,取代或未取代的C2-C7杂环烷基,取代或未取代的芳基,或者取代或未取代的杂芳基;或者两个R6与它们所连接的N原子一起以形成取代或未取代的C2-C6杂环烷基。在一些实施方式中,每个R6独立地为H,取代或未取代的C1-C6烷基,取代或未取代的C1-C6杂烷基,或者取代或未取代的C3-C8环烷基。在一些实施方式中,每个R6独立地为H,取代或未取代的C1-C4烷基,或者取代或未取代的C3-C6环烷基。
在一些实施方式中,环Q为单环杂芳基或稠合双环杂芳基。
在一些实施方式中,环Q为具有1-4个环氮原子的5或6元单环杂芳基,并且其被苯基或具有5或6个环原子,1或2个独立选自N、O和S的杂原子的杂芳基取代,并且其经0、1或2个独立选自以下的取代基取代:氰基,C1-6烷基,单-C1-6烷基氨基,二-C1-6烷基氨基,羟基-C1-6烷基氨基,羟基-C1-6烷基,氨基-C1-6烷基和单-C1-6烷基氨基-C1-6烷基,和二-C1-6烷基氨基-C1-6烷基。
在一些实施方式中,环Q为具有8至10个环原子,1、2或3个独立选自N、O和S的环杂原子的稠合双环杂芳基,并且其经0、1或2个独立选自以下的取代基取代:氰基,肟,卤素,羟基,C1-6烷基,C24烯基,C24炔基,C1-6烷氧基,羟基取代的C1-6烷氧基,氨基,单-C1-6烷基氨基和二-C1-6烷基氨基。
在一些实施方式中,环Q为选自以下的单环杂环:
在一些实施方式中,环Q为6-5稠合杂芳基,6-6稠合杂芳基,5-6稠合杂芳基,5-5稠合杂芳基,7-5稠合杂芳基或5-7稠合杂芳基。
在一些实施方式中,环Q为6-5稠合杂芳基,6-6稠合杂芳基或5-6稠合杂芳基,选自以下:
在一些实施方式中,环Q为 并且每个R6独立地为H,-OR1,-N(R1)2,取代或未取代的C1-C6烷基,取代或未取代的C1-C6卤代烷基,取代或未取代的C1-C6杂烷基,取代或未取代的C3-C8环烷基,取代或未取代的C2-C7杂环烷基,取代或未取代的芳基,或者取代或未取代的杂芳基;或者两个R6与它们所连接的N原子一起以形成取代或未取代的C2-C6杂环烷基。在一些实施方式中,每个R6独立地为H,取代或未取代的C1-C6烷基,取代或未取代的C1-C6杂烷基,或者取代或未取代的C3-C8环烷基。在一些实施方式中,每个R6独立地为H,取代或未取代的C1-C4烷基,或者取代或未取代的C3-C6环烷基。
在一些实施方式中,X为-NR3-。
在一些实施方式中,R3为-OR1,取代或未取代的C1-C6烷基,取代或未取代的C1-C6卤代烷基,取代或未取代的C1-C6杂烷基,或者取代或未取代的C3-C8环烷基。
在一些实施方式中,R3为选自以下的C3-C8环烷基:环丙基,环丁基,环戊基或环己基。
在一些实施方式中,R3为环丙基。
在一些实施方式中,R3为选自环戊烯基或环己烯基的C3-C8环烷基。
在一些实施方式中,R3为-CH3或-CF3
在一些实施方式中,R3为-CD3
在一些实施方式中,R3为-OCH3,-OCH2CH3,-OCH2CH2OH或-OCH2CH2OCH3
在一些实施方式中,R3为-OCD3
在一些实施方式中,为/>其中p为1,2或3。
在一些实施方式中,R为H;R15和R18为H;且p为2或3。
在一些实施方式中,R为H;R15和R18为H;且p为2。
在一些实施方式中,R为H;R15和R18为H;且p为3。
在一些实施方式中,R为H;R15和R18为CH3;且p为2或3。
在一些实施方式中,R为H;R15和R18为CH3;且p为2。
在一些实施方式中,R为H;R15和R18为CH3;且p为3。
在一些实施方式中,为/>其中R19为H,D,-CN,-OH,-OR1,-SR1,-S(=O)R1,-S(=O)2R1,-CH2-N(R1)2,-S(=O)2N(R1)2,-C(=O)R1,-CO2R1,-C(=O)N(R1)2,取代或未取代的C1-C6烷基,取代或未取代的C1-C6卤代烷基,取代或未取代的C1-C6杂烷基,取代或未取代的C3-C8环烷基,或者取代或未取代的C2-C8杂环烷基。
本文提供了包含小分子剪接调节剂化合物(SMSM)的组合物;其中所述SMSM与RNA双链体(duplex)的不成对的凸起核碱基(bulged nucleobase)相互作用,并且其中所述RNA双链体包含剪接位点。
本文提供了包含复合物的组合物,所述复合物包含与RNA双链体结合的小分子剪接调节剂化合物(SMSM),其中所述SMSM与RNA双链体的不成对的凸起核碱基相互作用,并且其中所述RNA双链体包含剪接位点。
在一些实施方式中,所述双链体RNA包含α螺旋。
在一些实施方式中,所述不成对的凸起核碱基位于双链体RNA的螺旋的外部部分上。
在一些实施方式中,所述不成对的凸起核碱基位于双链体RNA的螺旋的内部部分内。
在一些实施方式中,所述SMSM与所述双链体RNA形成一种或多种分子间相互作用。
在一些实施方式中,所述SMSM与所述不成对的凸起核碱基形成一种或多种分子间相互作用。
在一些实施方式中,所述分子间相互作用选自包含以下的组:离子相互作用、氢键、偶极-偶极相互作用或范德华相互作用。
在一些实施方式中,所述SMSM的第一部分与所述RNA双链体的第一RNA链上的不成对的凸起核碱基相互作用。
在一些实施方式中,所述SMSM的第二部分与所述RNA双链体的第二RNA链上的一个或多个核碱基相互作用,其中所述第一RNA链不是所述第二RNA链。
在一些实施方式中,从所述双链体RNA的螺旋的内部至所述螺旋的外部部分的不成对的凸起核碱基的交换率降低。
在一些实施方式中,所述SMSM降低所述不成对的凸起核碱基的旋转率。
在一些实施方式中,所述SMSM降低所述RNA双链体的RNA链的磷酸骨架周围的不成对的凸起核碱基的旋转率。
在一些实施方式中,所述SMSM调节所述不成对的凸起核碱基与所述双链体RNA的第二核碱基的距离。
在一些实施方式中,所述SMSM减小所述不成对的凸起核碱基与所述双链体RNA的第二核碱基的距离。
在一些实施方式中,所述不成对的凸起核碱基位于所述复合物的双链体RNA的螺旋内部。
在一些实施方式中,所述SMSM减小所述RNA双链体的凸起的大小。
在一些实施方式中,所述SMSM去除所述RNA双链体的凸起。
在一些实施方式中,所述SMSM稳定所述RNA双链体的凸起。
在一些实施方式中,所述SMSM调节所述RNA双链体的剪接位点处的剪接。
在一些实施方式中,所述SMSM增加所述RNA双链体的剪接位点处的剪接。
在一些实施方式中,所述SMSM减少所述RNA双链体的剪接位点处的剪接。
在一些实施方式中,所述不成对的凸起核碱基在所述RNA双链体的RNA链内具有受调的碱基堆积。
在一些实施方式中,所述不成对的凸起核碱基在所述RNA双链体的RNA链内具有增加的碱基堆积。
在一些实施方式中,所述不成对的凸起核碱基在所述RNA双链体的RNA链内具有减少的碱基堆积。
在一些实施方式中,所述SMSM不是适体。
在一些实施方式中,所述RNA双链体包括前mRNA。
在一些实施方式中,在不存在所述SMSM的情况下,所述不成对的凸起核碱基可围绕所述RNA双链体的RNA链的磷酸骨架自由旋转。
本文提供了一种调节剪接的方法,其包括使小分子剪接调节剂化合物(SMSM)与细胞接触,其中所述SMSM以小于50nM的IC50杀灭所述细胞。
本文提供了一种调节剪接的方法,其包括使小分子剪接调节剂化合物(SMSM)与细胞接触,其中所述SMSM调节编码mRNA的前mRNA的剪接位点序列处调节剪接,其中所述mRNA编码靶蛋白或功能性RNA,并且其中与对照细胞中产生的编码靶蛋白或功能性RNA的mRNA的总量相比,所述mRNA的总量增加至少约10%。
本文提供了一种调节剪接的方法,其包括使小分子剪接调节剂化合物(SMSM)与细胞接触,其中所述SMSM调节编码mRNA的前mRNA的剪接位点序列处的剪接,其中所述mRNA编码靶蛋白或功能性RNA,并且其中所述mRNA、所述靶蛋白和/或所述功能性RNA的总量比对照细胞中的所述mRNA、所述靶蛋白和/或所述功能性RNA的总量少至少10%。
本文提供了一种调节剪接的方法,其包括使小分子剪接调节剂化合物(SMSM)与细胞接触,其中所述SMSM调节编码与疾病或病症相关的第一mRNA同工型以及第二mRNA同工型的前mRNA的剪接位点序列处的剪接,其中所述第一mRNA同工型的总量与对照细胞中所述第一mRNA同工型的总量相比减少至少约10%,和/或所述第二mRNA同工型的总量与对照细胞中所述第一mRNA同工型的总量相比增加至少约10%。
本文提供了一种调节剪接的方法,其包括使小分子剪接调节剂化合物(SMSM)与细胞接触,所述细胞包含存在于所述细胞中的一定量的第一mRNA同工型和一定量的第二mRNA同工型;其中所述第一mRNA同工型与所述第二mRNA同工型的比率降低至少1.2倍;其中所述第一和第二mRNA由包含剪接位点序列的前mRNA编码,并且其中所述第一mRNA同工型与疾病或病症相关,以及第二mRNA同工型。
本文提供了一种调节剪接的方法,其包括使小分子剪接调节剂化合物(SMSM)与包含具有剪接位点序列的多核苷酸的细胞接触,其中所述SMSM调节外显子包含、外显子排除、假外显子包含、内含子保留、或所述多核苷酸的隐蔽剪接位点处的剪接,并且其中所述SMSM调节所述剪接位点序列的剪接。
本文提供了一种调节剪接的方法,其包括使小分子剪接调节剂化合物(SMSM)与包含具有剪接位点序列的多核苷酸的细胞接触,从而调节所述多核苷酸的剪接,其中所述剪接位点序列包括选自表2A、表2B、表2C或表2D的剪接位点序列的剪接位点序列。
本文提供了一种调节剪接的方法,其包括使小分子剪接调节剂化合物(SMSM)与包含具有剪接位点序列的多核苷酸的细胞接触,其中所述剪接位点序列包括选自GGAguaag和AGAguaag的序列。
本文提供了一种调节剪接的方法,其包括使小分子剪接调节剂化合物(SMSM)与包含具有剪接位点序列的多核苷酸的细胞接触,其中剪接位点序列在所述剪接位点序列的-3,-2,-1,+1,+2,+3,+4,+5或+6位置处包含至少一个凸起核苷酸。
本文提供了一种调节剪接的方法,其包括使小分子剪接调节剂化合物(SMSM)与包含具有剪接位点序列的多核苷酸的细胞接触,其中剪接位点序列在所述剪接位点序列的-3,-2,-1,+1,+2,+3,+4,+5或+6位置处包含突变核苷酸。
本文提供一种调节剪接的方法,其包括使小分子剪接调节剂化合物(SMSM)与包含具有剪接位点序列的多核苷酸的细胞接触,从而调节所述多核苷酸的剪接,其中所述剪接位点序列包括选自NGAgunvrn,NHAdddddn,NNBnnnnnn和NHAddmhvk的序列;其中N或n为A,U,G或C;B为C,G或U;H或h为A,C或U;d为a,g或u;m为a或c;r为a或g;v为a,c或g;k为g或u。
本文提供一种调节剪接的方法,其包括使小分子剪接调节剂化合物(SMSM)与包含具有剪接位点序列的多核苷酸的细胞接触,从而调节所述多核苷酸的剪接,其中所述剪接位点序列包括选自NNBgunnnn,NNBhunnnn或NNBgvnnnn的序列;其中N或n为A,U,G或C;B为C,G或U;H或h为A,C或U;d为a,g或u;m为a或c;r为a或g;v为a,c或g;k为g或u。
在一些实施方式中,所述剪接位点序列包括选自以下的序列:NNBgurrrn,NNBguwwdn,NNBguvmvn,NNBguvbbn,NNBgukddn,NNBgubnbd,NNBhunngn,NNBhurmhd或NNBgvdnvn;其中N或n为A,U,G或C;B为C,G或U;H或h为A,C或U;d为a,g或u;m为a或c;r为a或g;v为a,c或g;k为g或u。
在一些实施方式中,所述剪接位点序列的-3,-2,-1,+1,+2,+3,+4,+5或+6位置处的核苷酸是凸起核苷酸。
在一些实施方式中,所述剪接位点序列的-3,-2,-1,+1,+2,+3,+4,+5或+6位置处的核苷酸是突变核苷酸。
在一些实施方式中,所述剪接位点序列包括选自表2A,表2B,表2C或表2D的剪接位点序列的序列。
本文提供了一种调节剪接的方法,其包括使小分子剪接调节剂化合物(SMSM)与包含具有剪接位点序列的多核苷酸的细胞接触,从而调节所述多核苷酸的剪接,其中所述多核苷酸由选自以下的基因编码:表2A,表2B,表2C或表2D的基因。
在一些实施方式中,所述基因是SMN2。
在一些实施方式中,调节所述多核苷酸的剪接包括抑制外显子7的跳跃。
在一些实施方式中,所述基因是DMD。
在一些实施方式中,调节所述多核苷酸的剪接包括促进外显子51的跳跃。
本文提供了一种调节剪接的方法,其包括使小分子剪接调节剂化合物(SMSM)与细胞接触;其中所述SMSM与所述细胞中RNA双链体的不成对的凸起核碱基相互作用。其中所述双链体RNA包含剪接位点序列;并且其中所述SMSM调节所述RNA双链体的剪接。
本文提供了一种调节第一核碱基相对于第二核碱基的相对位置的方法,其中所述第一核碱基和第二核碱基在双链体RNA内,所述方法包括将小分子剪接调节剂化合物(SMSM)与所述双链体RNA或其药学上可接受的盐接触,其中所述第一核碱基是所述RNA双链体的不成对的凸起核碱基;其中所述双链体RNA包含剪接位点序列。
在一些实施方式中,所述双链体RNA包含螺旋。
在一些实施方式中,在接触所述SMSM之前,所述不成对的凸起核碱基位于所述双链体RNA的螺旋的外部部分上。
在一些实施方式中,所述SMSM与所述双链体RNA形成一种或多种分子间相互作用。
在一些实施方式中,所述SMSM与所述不成对的凸起核碱基形成一种或多种分子间相互作用。
在一些实施方式中,所述分子间相互作用选自包含以下的组:离子相互作用、氢键、偶极-偶极相互作用或范德华相互作用。
在一些实施方式中,从所述双链体RNA的螺旋的内部到所述螺旋的外部部分的所述不成对的凸起核碱基的交换率降低。
在一些实施方式中,所述不成对的凸起核碱基的旋转率降低。
在一些实施方式中,所述RNA双链体的RNA链的磷酸骨架周围的不成对的凸起核碱基的旋转率降低。
在一些实施方式中,在接触所述SMSM之后,所述不成对的凸起核碱基与所述双链体RNA的第二核碱基的距离受到调节。
在一些实施方式中,所述不成对的凸起核碱基与所述双链体RNA的第二核碱基的距离减小。
在一些实施方式中,所述不成对的凸起核碱基位于所述双链体RNA的螺旋的内部。
在一些实施方式中,所述RNA双链体的凸起的大小减小。
在一些实施方式中,去除或维持所述RNA双链体的凸起。
在一些实施方式中,促进所述RNA双链体的剪接位点处的剪接。
在一些实施方式中,在接触所述SMSM之后,所述RNA双链体的RNA链内所述不成对的凸起核碱基的碱基堆积增加。
在一些实施方式中,所述不成对的凸起核碱基与所述双链体RNA的第二核碱基的距离增加或维持。
在一些实施方式中,在接触所述SMSM之后,所述RNA双链体的凸起稳定化。
在一些实施方式中,所述不成对的凸起核碱基位于所述双链体RNA的螺旋的外部部分。
在一些实施方式中,所述RNA双链体的凸起的大小增加。
在一些实施方式中,所述RNA双链体的剪接位点处的剪接被抑制。
在一些实施方式中,剪接位点处的剪接被抑制。
在一些实施方式中,在接触所述SMSM之后,所述RNA双链体的RNA链内所述不成对的凸起核碱基的碱基堆积减少。
在一些实施方式中,所述RNA双链体包括前mRNA。
本文提供了一种治疗患有肿瘤的受试者的方法,其包括向所述受试者施用小分子剪接调节剂化合物(SMSM),其中所述肿瘤的尺寸减小。
本文提供了一种治疗患有肿瘤的受试者的方法,其包括向所述受试者施用小分子剪接调节剂化合物(SMSM),其中肿瘤的生长被抑制至少20。
本文提供了一种治疗、预防病症或疾病和/或延迟其进展的方法,其包括向受试者施用小分子剪接调节剂化合物(SMSM),其中所述SMSM调节所述受试者细胞中多核苷酸的剪接位点的剪接,其中所述病症或疾病与所述剪接位点的剪接有关。
在一些实施方式中,所述受试者患有疾病或病症。
本文提供了一种治疗患有疾病或病症的受试者的方法,其包括向患有选自以下的疾病或病症的受试者施用小分子剪接调节剂化合物(SMSM):表2A,表2B,表2C和表2D的疾病。
本文提供了一种治疗患有疾病或病症的受试者的方法,其包括向患有疾病或病症的受试者施用小分子剪接调节剂化合物(SMSM),其中所述SMSM选自表1A,表1B或表1C的SMSM。
本文提供了一种治疗患有疾病或病症的受试者的方法,其包括向患有疾病或病症的受试者施用小分子剪接调节剂化合物(SMSM),其中所述SMSM与包含选自以下的剪接位点序列的前mRNA结合:表2A,表2B,表2C或表2D的剪接位点序列。
在一些实施方式中,所述疾病或病症是脊髓性肌萎缩。
在一些实施方式中,所述疾病或病症是杜兴氏肌营养不良症。
在一些实施方式中,所述SMSM选自表1A,表1B和表1C的SMSM。
在一些实施方式中,所述SMSM是本文所述的化合物。
在一些实施方式中,所述方法还包括向所述受试者施用另外的治疗性分子。
在一些实施方式中,所述受试者是哺乳动物。
在一些实施方式中,所述哺乳动物是人。
在一些实施方式中,所述多核苷酸是前mRNA。
在一些实施方式中,调节剪接包括防止、抑制或减少所述多核苷酸的剪接位点序列处的剪接。
在一些实施方式中,调节剪接包括增强、促进或增加所述多核苷酸的剪接位点序列处的剪接。
在一些实施方式中,所述剪接位点序列是5'剪接位点序列,3'剪接位点序列,分支点剪接位点序列或隐蔽剪接位点序列。
在一些实施方式中,所述剪接位点包括突变,所述剪接位点包括凸起,所述剪接位点包括突变和凸起,所述剪接位点不包括突变,所述剪接位点不包括凸起或者所述剪接位点不包括突变且不包括凸起。
在一些实施方式中,所述凸起是由突变引起的凸起。
在一些实施方式中,凸起核苷酸是突变核苷酸。
在一些实施方式中,凸起核苷酸不是突变核苷酸。
在一些实施方式中,所述SMSM减小剪接复合物组分与多核苷酸的KD。
在一些实施方式中,所述SMSM增加剪接复合物组分与多核苷酸的KD。
在一些实施方式中,所述SMSM在剪接位点序列、剪接位点序列的上游或剪接位点序列的下游处抑制剪接复合物组分与多核苷酸的结合。
在一些实施方式中,所述SMSM在剪接位点序列、剪接位点序列的上游或剪接位点序列的下游处促进剪接复合物组分与多核苷酸的结合。
在一些实施方式中,所述多核苷酸是RNA。
在一些实施方式中,所述RNA是前mRNA。
在一些实施方式中,所述RNA是异质核RNA。
在一些实施方式中,所述剪接位点序列是5'剪接位点序列,3'剪接位点序列,分支点(BP)剪接位点序列,外显子剪接增强子(ESE)序列,外显子剪接沉默子(ESS)序列,内含子剪接增强子(ISE)序列,内含子剪接沉默子(ISS)序列,聚嘧啶束序列或其任意组合。
The在一些实施方式中,所述多核苷酸的长度为至少5,6,7,8,9,10,15,20,25,50,100,250,500,750,1,000,2,000,5,000,10,000,50,000,100,000,500,000或1,000,000个核苷酸。
在一些实施方式中,所述SMSM与所述多核苷酸的剪接位点序列结合。
在一些实施方式中,所述SMSM与所述多核苷酸的剪接位点序列的凸起相互作用。
在一些实施方式中,所述多核苷酸包含顺式作用元件序列。
在一些实施方式中,所述顺式作用元件序列不包含凸起。
在一些实施方式中,所述顺式作用元件序列不包含突变。
在一些实施方式中,所述顺式作用元件序列在顺式作用元件序列、顺式作用元件序列的1-1000个核碱基上游或顺式作用元件序列的1-1000个核碱基下游处包含突变、凸起或其组合。
在一些实施方式中,所述顺式作用元件序列包含调节元件序列,所述调节元件序列调节剪接复合物组分向所述多核苷酸的募集。
在一些实施方式中,所述顺式作用元件序列包含调节元件序列,所述调节元件序列调节剪接体向所述多核苷酸的募集。
在一些实施方式中,所述调节元件序列包括外显子剪接增强子(ESE)序列,外显子剪接沉默子(ESS)序列,内含子剪接增强子(ISE)序列,内含子剪接沉默子(ISS)序列,及其组合。
在一些实施方式中,所述SMSM结合所述剪接复合物组分。
在一些实施方式中,所述剪接复合物组分为9G8,A1 hnRNP,A2 hnRNP,ASD-1,ASD-2b,ASF,B1 hnRNP,C1 hnRNP,C2 hnRNP,CBP20,CBP80,CELF,F hnRNP,FBP11,Fox-1,Fox-2,G hnRNP,H hnRNP,hnRNP 1,hnRNP 3,hnRNP C,hnRNP G,hnRNP K,hnRNP M,hnRNP U,Hu,HUR,I hnRNP,K hnRNP,KH型剪接调节蛋白(KSRP),L hnRNP,M hnRNP,mBBP,肌盲样蛋白(muscle-blind like)(MBNL),NF45,NFAR,Nova-1,Nova-2,nPTB,P54/SFRS11,聚嘧啶束结合蛋白(PTB),PRP19复合物蛋白,R hnRNP,RNPC1,SAM68,SC35,SF,SF1/BBP,SF2,SF3 a,SF3B,SFRS10,Sm蛋白,SR蛋白,SRm300,SRp20,SRp30c,SRP35C,SRP36,SRP38,SRp40,SRp55,SRp75,SRSF,STAR,GSG,SUP-12,TASR-1,TASR-2,TIA,TIAR,TRA2,TRA2a/b,U hnRNP,U1snRNP,U11 snRNP,U12 snRNP,U1-C,U2 snRNP,U2AF1-RS2,U2AF35,U2AF65,U4 snRNP,U5snRNP,U6 snRNP,Urp,YB1或其任意组合。
在一些实施方式中,所述剪接复合物组分包括RNA。
在一些实施方式中,所述剪接复合物组分是小核RNA(snRNA)。
在一些实施方式中,所述snRNA包括U1 snRNA,U2 snRNA,U4 snRNA,U5 snRNA,U6snRNA,U11 snRNA,U12 snRNA,U4atac snRNA,U5 snRNA,U6 atac snRNA或其任意组合。
在一些实施方式中,所述剪接复合物组分包括蛋白质。
在一些实施方式中,所述剪接复合物组分包括小核核糖核蛋白(snRNP)。
在一些实施方式中,所述snRNP包括U1 snRNP,U2 snRNP,U4 snRNP,U5 snRNP,U6snRNP,U11 snRNP,U12 snRNP,U4atac snRNP,U5 snRNP,U6 atac snRNP或其任意组合。
164所述的方法,其中所述蛋白质是富丝氨酸/精氨酸(SR)蛋白。
在一些实施方式中,所述剪接位点序列包含与snRNA序列的碱基不匹配的碱基。
在一些实施方式中,凸起是由于所述剪接位点序列和snRNA序列之间的碱基配对不匹配。
通过引用并入
本说明书中提及的所有出版物、专利和专利申请均以相同的程度通过引用并入本文,如同每个单独的出版物、专利或专利申请均被明确地并单独地指出通过引用并入一样。
附图说明
图1描绘了示例性前mRNA的选择性剪接的图。描绘的一种mRNA同工型编码增强或促进细胞增殖和/或癌症的蛋白质。描绘的另一种mRNA同工型编码增强或抑制细胞增殖和/或癌症的蛋白质。两种同工型的区别在于单个外显子。
图2描绘了RNA(左)、具有突变的RNA(中)和与具有突变的RNA结合的小分子(右)的图。所描绘的突变破坏包含增加5’ss可及性的突变碱基的茎环。所描绘的稳定茎环的小分子剪接调节剂可减少进入5'剪接位点的机会。在这种情况下,所得的mRNA同工型被小分子剪接调节剂跳过了一个外显子。
图3描绘了示例性一级RNA结构(上)、示例性二级RNA结构(中)和示例性三级RNA结构(下)的图。
图4描绘了与包含多核苷酸并剪接复合蛋白的复合物结合的示例性小分子剪接调节剂的图。
图5描绘了从所示基因转录的示例性前mRNA的选择性剪接的图。左侧描绘的mRNA同工型是正常的;右侧描绘的mRNA同工型促进癌症。
图6A描绘了具有凸起的示例性SMN2前mRNA序列。
图6B描绘了具有凸起的示例性前mRNA序列。
图6C描绘了具有凸起的示例性前mRNA序列。
图6D描绘了具有凸起的示例性前mRNA序列。
图6E描绘了不具有凸起的示例性前mRNA序列。
图7描绘了在与指定浓度的SMSM一起孵育的A-673细胞中FOXM1同工型A(抑制癌症)和FOXM1同工型B(促进癌症)的相对转录水平的图。
图8描绘了针对所示细胞的SMSM的细胞活力的经测量IC50的图。
图9A描绘了当与所示浓度的SMSM一起孵育时存活的A-673细胞的图。
图9B描绘了当与所示浓度的SMSM一起孵育时存活的A-673细胞的图。
图9C描绘了当与所示浓度的SMSM一起孵育时存活的A-673细胞的图。
图9D描绘了当与所示浓度的SMSM一起孵育时存活的A-673细胞的图。
图9E描绘了当与所示浓度的SMSM一起孵育时存活的A-673细胞的图。
图9F描绘了当与所示浓度的SMSM一起孵育时存活的A-673细胞的图。
图9G描绘了当与所示浓度的SMSM一起孵育时存活的A-673细胞的图。
图9H描绘了当与所示浓度的SMSM一起孵育时存活的A-673细胞的图。
图10描绘了当与所示浓度的SMSM一起孵育时存活的A-375细胞的图。
图11A描绘了当与所示浓度的SMSM一起孵育时,与HDAC抑制剂相比具有100倍高治疗指数的存活的正常人真皮成纤维细胞(NHDF)的图。
图11B描绘了当与所示浓度的DMSO一起孵育时存活的正常人真皮成纤维细胞(NHDF)的图。
图12描绘了本文公开的SMSM的IC50剪接相对IC50增殖的图。结果表明活力与细胞剪接相关。
图13说明了所描绘的化合物1和化合物2的立体化学对细胞活性的代表性影响。
图14A描绘了显示在用指示剂量的SMSM治疗小鼠指定时间后,A-673异种移植肿瘤体积的标准化倍数变化的图。
图14B描绘了用指示剂量的SMSM治疗后小鼠的体重变化百分数的图。
图14C描述了显示用指示剂量的SMSM治疗小鼠后A-673异种移植肿瘤体积的标准化百分数变化的图。
图15A描绘了显示用指示剂量的SMSM治疗小鼠后A-673异种移植肿瘤体积的变化的图。
图15B描绘了用指示剂量的SMSM治疗后小鼠的体重变化百分数的图。
图16A描绘了显示用指示剂量的SMSM治疗小鼠后A-673异种移植肿瘤体积的标准化百分数变化的图。
图16B描绘了用指示剂量的SMSM治疗后的小鼠的体重变化百分数的图。
图16C描绘了显示用指示剂量的SMSM治疗后小鼠中FOXM1同工型B的标准化相对转录水平的图。
图17A描绘了显示用指定剂量的SMSM或维罗非尼治疗小鼠后A-375异种移植肿瘤体积的标准化倍数变化的图。
图17B描绘了用指示剂量的SMSM或维罗非尼治疗后的小鼠的体重变化百分数的图。
图17C描绘了显示用指示剂量的SMSM或维罗非尼治疗后的小鼠中FOXM1同工型B的标准化相对转录水平的图。
图18A描绘了显示用指定剂量的SMSM治疗严重联合免疫缺陷(SCID)小鼠三天后U87(胶质母细胞瘤)异种移植瘤体积的倍数变化的图。
图18B描绘了显示用指定剂量的SMSM处理SCID小鼠三天后U87(胶质母细胞瘤)异种移植肿瘤体积的倍数变化的图。
图19A描绘了用SMSM治疗后Raji(淋巴瘤)异种移植SCID小鼠的背侧和腹侧生物发光。
图19B描绘了用SMSM治疗后Raji(淋巴瘤)异种移植SCID小鼠的腹侧生物发光图。
图19C描述了用SMSM治疗五天后Raji(淋巴瘤)异种移植SCID小鼠的腹侧生物发光。
图20A描绘了显示用指定剂量的SMSM治疗小鼠后A-673异种移植肿瘤体积的倍数变化的图。
图20B描绘了用指示剂量的SMSM治疗后小鼠的体重变化百分数的图。
图21A描绘了显示用指定剂量的SMMS治疗小鼠后A-375异种移植肿瘤体积的标准化百分数变化的图。
图21B描绘了显示用指定剂量的SMMS治疗后的A-375异种移植小鼠中的肿瘤体积的图。
图21C描绘了用指示剂量的SMSM或维罗非尼治疗后的小鼠的体重变化百分数的图。
图22描绘了每天两次(b.i.d.)用施用指定剂量的SMSM治疗后,A-673尤因肉瘤小鼠的生存率随时间变化的Kaplan-Meier图。
图23描绘了用指定剂量的SMSM治疗小鼠后的A-673异种移植肿瘤重量的图。
图24A描绘了显示用指定剂量的媒介物、SMSM、媒介物+放射疗法(RT)和SMSM+放射疗法治疗后的A-375异种移植小鼠中肿瘤体积的图。
图24B描绘了用指示剂量的媒介物、SMSM、媒介物+放射疗法(RT)和SMSM+放射疗法治疗后的小鼠的体重变化百分比的图。
具体实施方式
阐述了本说明书的某些特定细节,以提供对各种实施方式的透彻理解。然而,本领域技术人员将理解,可以在没有这些细节的情况下实践本公开。在其他情况下,未示出或详细描述公知的结构,以避免不必要地混淆实施方式的描述。除非上下文另有要求,否则在随后的说明书和权利要求中,术语“包括”及其变体(例如“包含”)应以开放的、包含性的含义解释,即“包括但不限于”。此外,本文提供的标题仅是为了方便,并不解释所要求保护的公开的范围或含义。
如在本说明书和所附权利要求书中所使用的,单数形式“一(a)”、“一个/种(an)”和“该(the)”包括复数对象,除非内容另有明确指出。还应注意,除非内容清楚地另外指出,否则术语“或”通常以包括“和/或”的意义使用。
除非另有定义,否则本文中使用的所有技术和科学术语具有与本公开所属领域的普通技术人员通常理解的相同含义。尽管与本文描述的那些类似或等同的方法和材料可以用于本公开的实践或测试中,但是下面描述了合适的方法和材料。
定义
术语“公开的化合物”、“本公开的化合物”、“小分子空间调节剂”、“小分子剪接调节剂”、“空间调节剂”、“剪接调节剂”、“修饰剪接的化合物”和“修饰剪接化合物”、“SMSM”或“结合靶RNA的小分子”在本文可互换使用,并且是指如本文所公开的化合物及其立体异构体、互变异构体、溶剂化物及盐(例如,药学上可接受的盐)。术语“公开的化合物”、“本公开的化合物”、“小分子空间调节剂”、“小分子剪接调节剂”、“空间调节剂”、“剪接调节剂”、“修饰剪接的化合物”和“修饰剪接化合物”,“SMSM”或“结合靶RNA的小分子”表示结合细胞组分(例如,DNA、RNA、前mRNA、蛋白质、RNP、snRNA、碳水化合物、脂质、辅因子、营养物和/或代谢物)并调节目标多核苷酸(例如前-mRNA)的剪接的小分子化合物。例如,SMSM可以直接或间接经突变的、非突变的、凸起的和/或异常的剪接位点结合于靶多核苷酸,例如RNA(例如前mRNA),从而导致靶多核苷酸的剪接的调节。例如,SMSM可以直接或间接结合于蛋白质,例如剪接体蛋白质或核糖核蛋白,导致蛋白质的空间调节以及靶RNA剪接的调节。例如,SMSM可以直接或间接结合于剪接体组分,例如剪接体蛋白或snRNA,从而导致剪接体蛋白或snRNA的空间调节以及靶多核苷酸剪接的调节。这些术语明确地排除了由寡核苷酸组成的化合物。这些术语包括可与靶RNA的一个或多个二级或三级结构元件结合的小分子化合物。这些位点包括RNA三链体、3WJ、4WJ、平行Y结、发夹、凸起环、假结、内部环和其他高阶RNA结构基序。
如本文所用的术语“RNA”(核糖核酸)是指独立于来源(例如,RNA可以由人、动物、植物、病毒或细菌产生或可为合成来源)、生物学背景(例如,RNA可能在细胞核中、在血液中循环、在体外、细胞裂解物或者分离或纯净形式)或物理形式(例如,RNA可以是单链、双链或三重链形式(包括RNA-DNA杂合物)的天然存在的或合成的寡核糖核苷酸,其可能包括表观遗传修饰、天然转录后修饰、人工修饰(例如,通过化学或体外修饰获得)或其他修饰,可能结合于例如金属离子、小分子、蛋白质例如伴侣蛋白或辅因子,或可能处于变性、部分变性或折叠状态,包括任何天然或非天然的二级或三级结构,例如四链体、发夹、三链体、三向连接(3WJ)、四向连接(4WJ)、平行Y结、发夹、凸起环、伪结和内部环等,以及RNA所采用的任何瞬时形式或结构)。在一些实施方式中,RNA的长度为20,22,50,75或100或更多个核苷酸。在一些实施方式中,RNA的长度为250或更多个核苷酸。在一些实施方式中,RNA的长度为350,450,500,600,750或1,000,2,000,3,000,4,000,5,000,7,500,10,000,15,000,25,000,50,000或更多个的核苷酸。在一些实施方式中,RNA的长度在250和1,000个核苷酸之间。在一些实施方式中,RNA是前-RNA,前-miRNA或前转录本。在一些实施方式中,RNA是非编码RNA(ncRNA)、信使RNA(mRNA),微-RNA(miRNA)、核酶、核糖开关、lncRNA、lincRNA、snoRNA、snRNA、scaRNA、piRNA、ceRNA、假基因、病毒RNA、真菌RNA、寄生RNA或细菌RNA。
如本文所用,术语“靶多核苷酸”或“靶RNA”分别是指具有能够被本文所述的小分子化合物调节的剪接位点的任何类型的多核苷酸或RNA。例如,“靶多核苷酸”或“靶RNA”可以具有能够结合本文所述的小分子化合物的二级或三级结构。
本文中的“空间改变”、“空间修饰”或“空间调节”是指化学部分相对于彼此的空间取向的变化。本领域普通技术人员将认识到,空间机制包括但不限于空间位阻、空间屏蔽、空间吸引、链交叉、空间排斥、共振的空间抑制和质子化的空间抑制。
本文结构中的碳、氧、硫或氮原子上出现的任何开放价均表示存在氢,除非另有说明。
不论所讨论的术语是单独出现还是结合出现,本文所述的定义均适用。可以预期的是,本文描述的定义可以附加以形成化学相关的组合,例如“杂环烷基芳基”、“卤代烷基杂芳基”、“芳基烷基杂环烷基”或“烷氧基烷基”。组合的最后一个成员是与分子其余部分结合的基团。就文字序列而言,组合的其他成员以相反的顺序连接到结合基团上,例如芳基烷基杂环烷基的组合是指被芳基取代的烷基取代的杂环烷基基团。
当表示取代基的数目时,术语“一个或多个”是指从一个取代基到最高可能的取代数目的范围,即,被取代基取代一个氢直至取代所有氢。
术语“任选的”或“任选地”表示随后描述的事件或情况可以发生但不必须发生,并且该描述包括事件或情况发生的情况以及事件或情况不发生的情况。
术语“取代基”表示取代母体分子上的氢原子的原子或原子团。
术语“取代的”表示指定基团带有一个或多个取代基。在任何基团可以带有多个取代基并提供各种可能的取代基的情况下,取代基是独立选择的且不必相同。术语“未取代的”是指指定的基团不带有取代基。术语“任选取代的”是指指定的基团未被取代或被一个或多个独立选自可能的取代基的取代基取代。当表示取代基的数目时,术语“一个或多个”是指从一个取代基到最大可能的取代数,即,被取代基取代一个氢直至取代所有氢。
在整个说明书中使用以下缩写:乙酸(AcOH);乙酸乙酯(EtOAc);丁醇(n-BuOH);1,2-二氯乙烷(DCE);二氯甲烷(CH2Cl2,DCM);二异丙基乙胺(Diipea);二甲基甲酰胺(DMF);氯化氢(HCl);甲醇(MeOH);甲氧基甲基溴化物(MOMBr);N-甲基-2-吡咯烷酮(NMP);碘甲烷(MeI);正丙醇(n-PrOH);对甲氧基苄基(PMB);三乙胺(Et3N);[1,1’-双(二苯基膦)二茂铁]二氯化钯(II)(Pd(dppf)Cl2);乙硫醇钠(EtSNa);乙酸钠(NaOAc);氢化钠(NaH);氢氧化钠(NaOH);四氢吡喃(THP);四氢呋喃(THF)。
如本文所用,C1-Cx包括C1-C2,C1-C3...C1-Cx。仅作为示例,命名为“C1-C4”的基团表示在该部分中具有1-4个碳原子,即含1个碳原子,2个碳原子,3个碳原子或4个碳原子的基团。因此,仅作为示例,“C1-C4烷基”表示烷基中具有1-4个碳原子,即,烷基选自甲基、乙基、丙基、异丙基、正丁基、异丁基、仲丁基和叔丁基。
术语“氧代”是指=O取代基。
术语“硫代”是指=S取代基。
术语“卤代”、“卤素”和“卤化物”在本文中可互换使用,并表示氟代、氯代、溴代或碘代。
术语“烷基”是指直链或支链的烃链基团,具有一个至二十个碳原子,并且通过单键连接至分子的其余部分。同样地,包含至多10个碳原子的烷基被称为C1-C10烷基,例如,包含至多6个碳原子的烷基是C1-C6烷基。包含其他数量的碳原子的烷基(和本文定义的其他部分)类似地表示。烷基包括但不限于C1-C10烷基,C1-C9烷基,C1-C8烷基,C1-C7烷基,C1-C6烷基,C1-C5烷基,C1-C4烷基,C1-C3烷基,C1-C2烷基,C2-C8烷基,C3-C8烷基和C4-C8烷基。代表性的烷基包括但不限于甲基,乙基,正丙基,1-甲基乙基(i-丙基),正丁基,异丁基,仲丁基,正戊基,1,1-二甲基乙基(叔丁基),3-甲基己基,2-甲基己基,1-乙基-丙基等。在一些实施方式中,烷基为甲基或乙基。在一些实施方式中,烷基为-CH(CH3)2或-C(CH3)3。除非在说明书中另有特别说明,否则烷基可以如下所述任选地被取代。“亚烷基”或“亚烷基链”是指将分子的其余部分连接至基团的直链或支链二价烃链。在一些实施方式中,亚烷基为-CH2-,-CH2CH2-,或-CH2CH2CH2-。在一些实施方式中,亚烷基为-CH2-。在一些实施方式中,亚烷基为-CH2CH2-。在一些实施方式中,亚烷基为-CH2CH2CH2-。
术语“烷氧基”是指式-OR的基团,其中R是如所定义的烷基。除非在说明书中另有特别说明,否则烷氧基可以如下所述任选地被取代。代表性的烷氧基基团包括但不限于甲氧基,乙氧基,丙氧基,丁氧基,戊氧基。在一些实施方式中,烷氧基为甲氧基。在一些实施方式中,烷氧基为乙氧基。
术语“烷基氨基”是指式-NHR或-NRR的基团,其中每个R独立地是如上定义的烷基基团。除非在说明书中另有特别说明,否则烷基氨基可以如下所述任选地被取代。
术语“烯基”是指其中存在至少一个碳-碳双键的烷基类型。在一个实施方式中,烯基具有式-C(R)=CR2,其中R是指烯基的其余部分,其可以相同或不同。在一些实施方式中,R为H或烷基。在一些实施方式中,烯基选自乙烯基(即,乙烯基),丙烯基(即,烯丙基),丁烯基,戊烯基,戊二烯基等。烯基的非限制性实例包括-CH=CH2,-C(CH3)=CH2,-CH=CHCH3,-C(CH3)=CHCH3和-CH2CH=CH2
术语“炔基”是指其中存在至少一个碳-碳三键的烷基类型。在一个实施方式中,炔基具有式-C≡CR,其中R是指炔基的其余部分。在一些实施方式中,R为H或烷基。在一些实施方式中,炔基选自乙炔基,丙炔基,丁炔基,戊炔基,己炔基等。炔基的非限制性实例包括-C≡CH,-C≡CCH3-C≡CCH2CH3,-CH2C≡CH。
术语“芳族”是指具有离域的π电子系统的平面环,所述π电子系统包含4n+2π个电子,其中n是整数。芳族可以任选地被取代。术语“芳族”既包括芳基基团(例如,苯基、萘基)又包括杂芳基基团(例如,吡啶基、喹啉基)。
术语“芳基”是指芳族环,其中形成该环的每个原子是碳原子。芳基可以任选地被取代。芳基的实例包括但不限于苯基和萘基。在一些实施方式中,芳基是苯基。取决于结构,芳基可以是单价或双价的(即亚芳基)。除非在说明书中另有具体说明,否则术语“芳基”或前缀“芳”(例如在“芳烷基”中)旨在包括任选地被取代的芳基基团。在一些实施方式中,芳基被部分还原以形成本文定义的环烷基。在一些实施方式中,芳基被完全还原以形成本文定义的环烷基。
术语“卤代烷基”表示烷基,其中该烷基的至少一个氢原子已被相同或不同的卤原子,特别是氟原子取代。卤代烷基的实例包括一氟、二氟或三氟甲基、乙基或丙基,例如3,3,3-三氟丙基、2-氟甲苯、2,2,2-三氟乙基、氟甲基或三氟甲基。术语“全卤代烷基”表示烷基,其中该烷基的所有氢原子均被相同或不同的卤原子取代。
术语“卤代烷氧基”表示烷氧基,其中该烷氧基的至少一个氢原子已被相同或不同的卤原子,特别是氟原子取代。卤代烷氧基的实例包括一氟、二氟或三氟甲氧基、乙氧基或丙氧基,例如3,3,3-三氟丙氧基、2-氟乙氧基、2,2,2-三氟乙氧基、氟甲氧基或三氟甲氧基。术语“全卤代烷氧基”表示烷氧基,其中该烷氧基的所有氢原子均被相同或不同的卤原子取代。
术语“双环环系”是指通过共同的单键或双键(退火双环环系),通过三个或更多个共同原子的序列(桥联双环环系)或通过共同的单个原子(螺双环环系)彼此稠合的两个环。双环环系可以是饱和的、部分不饱和的、不饱和的或芳族的。双环环系可包含选自N、O和S的杂原子。
术语“碳环”或“碳环”是指环或环系,其中形成环骨架的原子都是碳原子。因此,该术语将碳环与其中环骨架含有至少一个不同于碳的原子的“杂环”环或“杂环”相区分。在一些实施方式中,双环碳环的两个环中至少一个是芳族的。在一些实施方式中,双环碳环的两个环都是芳族的。碳环包括环烷基和芳基。
术语“环烷基”是指单环或多环非芳族基团,其中形成环的每个原子(即骨架原子)是碳原子。在一些实施方式中,环烷基是饱和的或部分不饱和的。在一些实施方式中,环烷基是螺环或桥连化合物。在一些实施方式中,环烷基与芳环稠合(在这种情况下,环烷基通过非芳族环碳原子键合)。环烷基基团包括具有3至10个环原子的基团。代表性的环烷基包括但不限于具有3至10个碳原子,3至8个碳原子,3至6个碳原子或3至5个碳原子的环烷基。单环环烷基基团包括,例如,环丙基,环丁基,环戊基,环己基,环庚基和环辛基。在一些实施方式中,单环环烷基是环丙基,环丁基,环戊基或环己基。在一些实施方式中,单环环烷基是环戊烯基或环己烯基。在一些实施方式中,单环环烷基是环戊烯基。多环基团包括例如金刚烷基,1,2-二氢萘基,1,4-二氢萘基,四氢萘基(tetrainyl),萘烷基(decalinyl),3,4-二氢萘基-1(2H)-酮,螺[2.2]戊基,降冰片基和双环[1.1.1]戊基。除非说明书中另有特别说明,否则环烷基可以任选地被取代。
术语“桥连”是指具有两个或更多个环的任何环结构,其包含连接两个桥头原子的桥。桥头原子定义为该分子的骨架结构的一部分,并与三个或更多个其他骨架原子键合的原子。在一些实施方式中,桥头原子为C、N或P。中,桥是连接两个桥头原子的单个原子或原子链。在一些实施方式中,桥是连接两个桥头原子的价键。在一些实施方式中,桥环系统是环烷基。在一些实施方式中,桥环系统是杂环烷基。
术语“稠合”是指与现有环结构稠合的本文描述的任何环结构。当稠合环为杂环基环或杂芳基环时,现有环结构上成为稠合杂环基环或稠合杂芳基环一部分的任何碳原子可以被一个或多个N、S和O原子替代。稠合杂环基或杂芳基环结构的非限制性例子包括6-5稠合杂环,6-6稠合杂环,5-6稠合杂环,5-5稠合杂环,7-5稠合杂环合5-7稠合杂环。
术语“卤代烷基”是指被一个或多个如上定义的卤素基团取代的如上定义的烷基基团,例如,三氟甲基,二氟甲基,氟甲基,三氯甲基,2,2,2-三氟乙基,1,2-二氟乙基,3-溴-2-氟丙基,1,2-二溴乙基等。除非在说明书中另有特别说明,否则卤代烷基可以任选地被取代。
术语“卤代烷氧基”是指被一个或多个如上定义的卤代基团取代的如上定义的烷氧基基团,例如,三氟甲氧基,二氟甲氧基,氟甲氧基,三氯甲氧基,2,2,2-三氟乙氧基,1,2-二氟乙氧基,3-溴-2-氟丙氧基,1,2-二溴乙氧基等。除非在说明书中另有特别说明,否则卤代烷氧基可以任选地被取代。
术语“氟代烷基”是指其中一个或多个氢原子被氟原子替代的烷基。一方面,氟代烷基是C1-C6氟代烷基。在一些实施方式中,氟代烷基选自三氟甲基,二氟甲基,氟甲基,2,2,2-三氟乙基,1-氟甲基-2-氟乙基等。
术语“杂烷基”是指烷基,其中该烷基的一个或多个骨架原子选自除碳以外的原子,例如氧、氮(例如-NH-,-N(烷基)-,或-N(芳基)-)、硫(例如-S-,-S(=O)-,或-S(=O)2-)或其组合。在一些实施方式中,杂烷基在杂烷基的碳原子处与分子的其余部分相连。在一些实施方式中,杂烷基在杂烷基的杂原子处与分子的其余部分相连。在一些实施方式中杂烷基是C1-C6杂烷基。代表性的杂烷基包括但不限于-OCH2OMe,-OCH2CH2OH,-OCH2CH2OMe,或-OCH2CH2OCH2CH2NH2
术语“杂亚烷基”是指如上所述的烷基,其中该烷基的一个或多个碳原子被O、N或S原子替代。“杂亚烷基”或“杂亚烷基链”是指将分子的其余部分连接至基团的直链或支链二价杂烷基链。除非在说明书中另有特别说明,否则杂烷基或杂亚烷基基团可以如下所述被任选地被取代。代表性的杂亚烷基基团包括但不限于-OCH2CH2O-,-OCH2CH2OCH2CH2O-,或-OCH2CH2OCH2CH2OCH2CH2O-。
术语“杂环烷基”是指包括选自氮、氧和硫中的至少一个杂原子的环烷基。除非在说明书中另有特别说明,否则所述杂环烷基可以是单环或双环环系,其可以包括稠合(当与芳基或杂芳基环稠合时,杂环烷基通过非芳族环原子键合)或桥环系统。杂环基中的氮、碳或硫原子可任选地被氧化。氮原子可以任选地被季铵化。杂环烷基是部分或完全饱和的。杂环烷基的实例包括但不限于二氧戊环基,噻吩基[1,3]二噻烷基,四氢喹啉基,四氢异喹啉基,十氢喹啉基,十氢异喹啉基,咪唑啉基,咪唑啉啶基,异噻唑烷基,异噁唑啉基,吗啉基,八氢吲哚基,八氢异吲哚基,2-氧代哌嗪基,2-氧代哌啶基,2-氧代吡咯烷基,噁唑烷基,哌啶基,哌嗪基,4-哌啶酮基,吡咯烷基,吡唑烷基,奎宁基,噻唑烷基,四氢呋喃基,三噻烷基,四氢吡喃基,硫代吗啉基,硫吗啉基,1-氧代硫代吗啉基,1,1-二氧代硫代吗啉基。术语杂环烷基还包括糖类的所有环形式,包括但不限于单糖、二糖和寡糖。除非另有说明,否则杂环烷基具有环中的2至12个碳。在一些实施方式中,杂环烷基具有环中的2至10个碳。在一些实施方式中,杂环烷基具有环中的2至10个碳和1或2个N原子。在一些实施方式中,杂环烷基具有环中的2至10个碳和3或4个N原子。在一些实施方式中,杂环烷基在环中具有2至12个碳,0-2个N原子,0-2个O原子,0-2个P原子和0-1个S原子。在一些实施方式中,杂环烷基在环中具有2至12个碳,1-3个N原子,0-1个O原子和0-1个S原子。可以理解的是,当提及杂环烷基中的碳原子数时,杂环烷基中的碳原子数与构成杂环烷基(即,杂环烷基环的骨架原子)的原子总数(包括杂原子)不同。除非在说明书中另有特别说明,否则杂环烷基可以任选地被取代。
术语“杂环”或杂环”是指杂芳族环(也称为杂芳基)和杂环烷基环(也称为杂脂族环基团),其包括至少一个选自氮、氧和硫的杂原子,其中每个杂环基在其环系中具有3至12个原子,并且条件是任何环均不含有两个相邻的O或S原子。在一些实施方式中,杂环是单环,双环,多环,螺环或桥接化合物。非芳族杂环基团(也称为杂环烷基)包括在其环系中具有3至12个原子的环,并且芳族杂环基团包括在其环系中具有5至12个原子的环。杂环基包括苯并稠合环系。非芳族杂环基的实例是吡咯烷基,四氢呋喃基,二氢呋喃基,四氢噻吩基,噁唑烷二酮基,四氢吡喃基,二氢吡喃基,四氢硫代吡喃基,哌啶基,吗啉基,硫代吗啉基,硫代噁烷基,哌嗪基,氮杂环丙烷基,氮杂环丁烷基,氧杂环丁烷基,硫杂环丁烷基,高哌啶基,氧杂环庚基(oxepanyl),硫杂环庚基(thiepanyl),氧氮杂环庚基(oxazepinyl),二氮杂卓基,硫氮杂卓基,1,2,3,6-四氢吡啶基,吡咯啉-2-基,吡咯啉-3-基,吲哚基,2H-吡喃基,4H-吡喃基,二噁烷基,1,3-二氧戊环基,吡唑啉基,二噻烷基,二硫戊环基,二氢吡喃基,二氢噻吩基,二氢呋喃基,吡唑烷基,咪唑啉基,咪唑啉啶基,3-氮杂双环[3.1.0]己基,3-氮杂双环[4.1.0]庚基,3h-吲哚基,吲哚啉-2-酮基,异吲哚啉-2-酮基,异吲哚啉-1,3-二酮基,3,4-二氢异喹啉-1(2H)-酮基,3,4-二氢喹啉-2(1H)-酮基,异吲哚啉-1,3-二硫酮基,苯并[d]噁唑-2(3H)-酮基,1H-苯并[d]咪唑-2(3H)-酮基,苯并[d]噻唑-2(3H)-酮基和喹嗪基。芳族杂环基的实例是吡啶基,咪唑基,嘧啶基,吡唑基,三唑基,吡嗪基,四唑基,呋喃基,噻吩基,异噁唑基,噻唑基,噁唑基,异噻唑基,吡咯基,喹啉基,异喹啉基,吲哚基,苯并咪唑基,苯并呋喃基,噌啉基,吲唑基,吲哚嗪基,酞嗪基,哒嗪基,三嗪基,异吲哚基,蝶啶基,嘌呤基,噁二唑基,噻二唑基,呋咱基,苯并呋咱基,苯并噻吩基,苯并噻唑基,苯并噁唑基,喹唑啉基,喹喔啉基,萘啶基和氟吡啶基。在可能的情况下,前述基团是C-连接的(或C-连接的)或N-连接的。例如,衍生自吡咯的基团包括吡咯-1-基(N-连接的)或吡咯-3-基(C-连接的)。另外,衍生自咪唑的基团包括咪唑-1-基或咪唑-3-基(均为N-连接的)或咪唑-2-基、咪唑-4-基或咪唑-5-基(均为C-连接的)。杂环基包括苯并稠合环系。非芳族杂环任选地被一个或两个氧代(=O)部分取代,例如吡咯烷-2-酮。在一些实施方式中,双环杂环的两个环中至少一个是芳族的。在一些实施方式中,双环杂环的两个环都是芳族的。
术语“杂芳基”是指包括一个或多个选自氮、氧和硫的环杂原子的芳基。杂芳基是单环或双环的。单环杂芳基的说明性实例包括吡啶基,咪唑基,嘧啶基,吡唑基,三唑基,吡嗪基,四唑基,呋喃基,噻吩基,异噁唑基,噻唑基,噁唑基,异噻唑基,吡咯基,哒嗪基,三嗪基,噁二唑基,噻二唑基,呋咱基,吲哚嗪,吲哚,苯并呋喃,苯并噻吩,吲唑,苯并咪唑,嘌呤,喹啉嗪,喹啉,异喹啉,噌啉,酞嗪,喹唑啉,喹喔啉,1,8-萘啶和蝶啶。单环杂芳基的说明性实例包括吡啶基,咪唑基,嘧啶基,吡唑基,三唑基,吡嗪基,四唑基,呋喃基,噻吩基,异噁唑基,噻唑基,噁唑基,异噻唑基,吡咯基,哒嗪基,三嗪基,噁二唑基,噻二唑基和呋咱基。双环杂芳基的说明性实例包括吲哚嗪,吲哚,苯并呋喃,苯并噻吩,吲唑,苯并咪唑,嘌呤,喹啉嗪,喹啉,异喹啉,噌啉,酞嗪,喹唑啉,喹喔啉,1,8-萘啶和哌啶。在一些实施方式中,杂芳基为吡啶基,吡嗪基,嘧啶基,噻唑基,噻吩基,噻二唑基或呋喃基。在一些实施方式中,杂芳基在环中含有0-6个N原子。在一些实施方式中,杂芳基在环中含有0-4个N原子。在一些实施方式中,杂芳基在环中含有4-6个N原子。在一些实施方式中,杂芳基在环中含有0-4个N原子,0-1个O原子,0-1个P原子和0-1个S原子。在一些实施方式中,杂芳基在环中含有1-4个N原子,0-1个O原子和0-1个S原子。在一些实施方式中,杂芳基为C1-C9杂芳基。在一些实施方式中,单环杂芳基为C1-C5杂芳基。在一些实施方式中,单环杂芳基为5元或6元杂芳基。在一些实施方式中,双环杂芳基为C6-C9杂芳基。在一些实施方式中,杂芳基被部分还原以形成本文定义的杂环烷基。在一些实施方式中,杂芳基被完全还原以形成本文定义的杂环烷基。
术语“部分”是指分子的特定片段或官能团。化学部分通常是嵌入或附至分子的已知化学实体。
术语“任选取代的”或“取代的”是指所提及的基团任选地被单独和独立选自以下的一个或多个另外的基团取代:D,卤素,-CN,-NH2,-NH(烷基),-N(烷基)2,-OH,-CO2H,-CO2烷基,-C(=O)NH2,-C(=O)NH(烷基),-C(=O)N(烷基)2,-S(=O)2NH2,-S(=O)2NH(烷基),-S(=O)2N(烷基)2,烷基,环烷基,氟代烷基,杂烷基,烷氧基,氟代烷氧基,杂环烷基,芳基,杂芳基,芳基氧基,烷基硫基,芳基硫基,烷基亚砜,芳基亚砜,烷基砜和芳基砜。在一些其他实施方式中,任选的取代基独立选自以下:D,卤素,-CN,-NH2,-NH(CH3),-N(CH3)2,-OH,-CO2H,-CO2(C1-C4烷基),-C(=O)NH2,-C(=O)NH(C1-C4烷基),-C(=O)N(C1-C4烷基)2,-S(=O)2NH2,-S(=O)2NH(C1-C4烷基),-S(=O)2N(C1-C4烷基)2,C1-C4烷基,C3-C6环烷基,C1-C4氟代烷基,C1-C4杂烷基,C1-C4烷氧基,C1-C4氟代烷氧基,-SC1-C4烷基,-S(=O)C1-C4烷基和-S(=O)2(C1-C4烷基)。在一些实施方式中,任选的取代基独立选自以下:D,卤素,-CN,-NH2,-OH,-NH(CH3),-N(CH3)2,-NH(环丙基),-CH3,-CH2CH3,-CF3,-OCH3和-OCF3。在一些实施方式中,取代的基团被前述基团中的一个或两个取代。在一些实施方式中,脂族碳原子(无环或环状)上的任选的取代基包括氧代(=O)。
术语“互变异构体”是指质子从分子的一个原子到相同分子的另一个原子的转移。本文提出的化合物可以互变异构体形式存在。互变异构体是通过氢原子迁移可相互转化的化合物,同时伴随着单键和相邻双键的转换。在可能发生互变异构的键合结构中,将存在互变异构体的化学平衡。考虑了本文公开的化合物的所有互变异构形式。互变异构体的确切比例取决于若干因素,包括温度、溶剂和pH。互变异构互换的一些实例包括:
如本文所用,术语“施用”等是指可用于使化合物或组合物递送至所需的生物作用部位的方法。这些方法包括但不限于口服途径(p.o.),十二指肠内途径(i.d.),胃肠外注射(包括静脉内(i.v.),皮下(s.c.),腹膜内(i.p.),肌肉内(i.m.),血管内或输注(inf.)),局部(top.)和直肠(p.r.)施用。本领域技术人员熟悉可与本文所述的化合物和方法一起使用的施用技术。在一些实施方式中,本文所述的化合物和组合物经口服施用。
如本文所用,术语“共同施用”等意在包括将选择的治疗剂施用于单个患者,并且意图包括其中通过相同或不同施用途径或在相同或不同时间施用药剂的治疗方案。
如本文所用,术语“有效量”或“治疗有效量”是指所施用的足以在某种程度上减轻正在治疗的疾病或病症的一种或多种症状的药剂或化合物的量;例如减轻和/或缓解疾病的一种或多种体征、症状或原因或任何其他任何希望的生物系统改变。例如,用于治疗用途的“有效量”可以是在临床上显著减轻一种或多种疾病症状的药剂的量。在个体情况下,可以使用诸如剂量递增研究的技术来确定适当的“有效”量。
如本文所用,术语“增强”是指增加或延长所需效果的量、效力或持续时间。例如,关于增强靶标的剪接,术语“增强”可以指增加或延长靶标的剪接(无论是在数量、效力还是持续时间上)的能力。
术语“受试者”或“患者”涵盖哺乳动物。哺乳动物的实例包括但不限于哺乳动物类别的任何成员:人、非人灵长类如黑猩猩以及其他猿类和猴类物种;牲畜,例如牛、马、绵羊、山羊、猪;家畜,例如兔、狗和猫;实验动物,包括啮齿类动物,例如大鼠、小鼠和豚鼠等。一方面,哺乳动物是人。如本文所用,术语“动物”包括人和非人动物。在一个实施方式中,“非人动物”是哺乳动物,例如啮齿动物如大鼠或小鼠。在一个实施方式中,非人动物是小鼠。
如本文所用,术语“治疗”包括减轻、减退或改善疾病或病症的至少一种症状,预防其他症状,抑制疾病或病症,例如阻止疾病或病症的发展,缓解疾病或病症,引起疾病或病症的消退,缓解由疾病或病症引起的状况或者预防和/或治疗性地停止疾病或病症的症状。
术语“预防”或“预防”疾病状态是指引起该疾病状态的临床症状不在可暴露于或易患该疾病状态但尚未经历或展示疾病状态的症状的受试者中发展。
术语“药物组合物”和“药物制剂”(或“制剂”)可互换使用,并表示待施用于受试者(例如,有此需要的人)的包含治疗有效量的活性药物成分以及一种或多种药学上可接受的赋形剂的混合物或溶液。
如本文所用,术语“药物组合”是指通过混合或组合超过一种活性成分而得到的产品,并且包括活性成分的固定和非固定组合。术语“固定组合”是指活性成分,例如本文所述的化合物和助剂,均以单一实体或剂量的形式同时施用于患者。术语“非固定组合”是指活性成分,例如本文所述的化合物和助剂,作为单独的实体同时、并存或依次施用于患者而没有特定的间隔时间限制,其中这种施用提供了患者体内两种化合物的有效水平。后者也适用于鸡尾酒疗法,例如,三种或超过三种活性成分的施用。
术语“药学上可接受的”表示可用于制备药物组合物的材料的属性,该材料通常是安全、无毒的,在生物学上或其他方面都不是不期望的,并且对于兽药以及人用药是可接受的。“药学上可接受的”可以指不消除化合物的生物学活性或特性并且相对无毒的材料(例如载体或稀释剂),即可以在不引起不良生物学效应或与含有其的组合物的任何组分以有害方式相互作用的情况下施用于个体的材料。
术语“药学上可接受的赋形剂”、“药学上可接受的载体”和“治疗惰性赋形剂”可以互换使用,并且表示药物组合物中的任何药学上可接受的成分均不具有治疗活性并且对所施用的受试者无毒,如用于配制药物产品的崩解剂,粘合剂,填充剂,溶剂,缓冲剂,张力剂,稳定剂,抗氧化剂,表面活性剂,载体,稀释剂,赋形剂,防腐剂或润滑剂。
术语“药学上可接受的盐”表示在生物学上或其他方面不是不期望的盐。药学上可接受的盐包括酸和碱加成盐。“药学上可接受的盐”可以指不会对所施用的生物体造成明显刺激和/或不会消除化合物的生物学活性和特性的化合物制剂。通过使式(I)-(V)中任一项的SMSM化合物与酸反应来获得药学上可接受的盐。还可以通过使式(I)-(V)中任一项的化合物与碱反应形成盐来获得药学上可接受的盐。
如本文所用,术语“核酸”通常是指一种或多种核碱基、核苷或核苷酸,并且它们包括多核碱基、多核苷和多核苷酸。
如本文所用,术语“多核苷酸”通常是指包含两个或更多个连接的核酸亚基(例如核苷酸)的分子,并且可以与“寡核苷酸”互换使用。例如,多核苷酸可以包括选自腺苷(A)、胞嘧啶(C)、鸟嘌呤(G)、胸腺嘧啶(T)和尿嘧啶(U)或其变体的一个或多个核苷酸。核苷酸通常包含一个核苷和至少1,2,3,4,5,6,7,8,9,10或更多个磷酸(PO3)基团。核苷酸可以包括核碱基、五碳糖(核糖或脱氧核糖)以及一个或多个磷酸基。核糖核苷酸包括其中糖为核糖的核苷酸。脱氧核糖核苷酸包括其中糖为脱氧核糖的核苷酸。核苷酸可以是核苷单磷酸,核苷二磷酸,核苷三磷酸或核苷多磷酸。例如,核苷酸可以是脱氧核糖核苷多磷酸,例如脱氧核糖核苷三磷酸(dNTP),示例性的dNTP包括脱氧腺苷三磷酸(dATP),脱氧胞苷三磷酸(dCTP),脱氧鸟苷三磷酸(dGTP),尿苷三磷酸(dUTP)和脱氧胸苷三磷酸(dTTP)。dNTP还可以包括可检测的标签,例如发光标签或标记(例如,荧光团)。例如,核苷酸可以是嘌呤(即,A或G或其变体)或嘧啶(即,C、T或U或其变体)。在一些实例中,多核苷酸是脱氧核糖核酸(DNA)、核糖核酸(RNA)或其衍生物或变体。示例性的多核苷酸包括但不限于短干扰RNA(siRNA)、微小RNA(miRNA)、质粒DNA(pDNA)、短发夹RNA(shRNA)、小核RNA(snRNA)、信使RNA(mRNA)、前体mRNA(前mRNA)、反义RNA(asRNA)和异核RNA(hnRNA),并涵盖核苷酸序列及其任何结构实施方式,例如单链、双链、三链、螺旋、发夹、茎环、凸起等。在一些情况下,多核苷酸是圆形的。多核苷酸可以具有各种长度。例如,多核苷酸的长度可以至少约为7个碱基,8个碱基,9个碱基,10个碱基,20个碱基,30个碱基,40个碱基,50个碱基,100个碱基,200个碱基,300个碱基,400个碱基,500个碱基,1千个碱基(kb),2kb,3kb,4kb,5kb,10kb,50kb或更多。可以从细胞或组织分离多核苷酸。例如,多核苷酸序列可以包括分离和纯化的DNA/RNA分子,合成的DNA/RNA分子和/或合成的DNA/RNA类似物。
多核苷酸可包括一个或多个核苷酸变体,包括非标准核苷酸、非天然核苷酸、核苷酸类似物和/或修饰的核苷酸。修饰的核苷酸的实例包括但不限于二氨基嘌呤,5-氟尿嘧啶,5-溴尿嘧啶,5-氯尿嘧啶,5-碘尿嘧啶,次黄嘌呤,黄嘌呤,4-乙酰胞嘧啶,5-(羧基羟甲基)尿嘧啶,5-羧基甲基氨基甲基-2-硫尿苷,5-羧基甲基氨基甲基尿嘧啶,二氢尿嘧啶,β-D-半乳糖基肌苷,肌苷,N6-异戊烯腺嘌呤,1-甲基鸟嘌呤,1-甲基肌苷,2,2-二甲基鸟嘌呤,2-甲基腺嘌呤,2-甲基鸟嘌呤,3-甲基胞嘧啶,5-甲基胞嘧啶,N6-腺嘌呤,7-甲基鸟嘌呤,5-甲基氨基甲基尿嘧啶,5-甲氧基氨基甲基-2-硫脲嘧啶,β-D-甘露糖基辫苷,5'-甲氧基羧甲基尿嘧啶,5-甲氧基尿嘧啶,2-甲基硫代-N6-异戊烯腺嘌呤,尿嘧啶-5-氧乙酸(v),wybutoxosine,伪尿嘧啶,辫苷,2-硫胞嘧啶,5-甲基-2-硫尿嘧啶,2-硫尿嘧啶,4-硫尿嘧啶,5-甲基尿嘧啶,尿嘧啶-5-氧乙酸甲酯,5-甲基-2-硫尿嘧啶,3-(3-氨基-3-N-2-羧基丙基)尿嘧啶,(acp3)w,2,6-二氨基嘌呤等。在某些情况下,核苷酸的磷酸部分可能包括修饰,包括对三磷酸部分的修饰。此类修饰的非限制性实例包括更长长度的磷酸酯链(例如,具有4、5、6、7、8、9、10或更多磷酸酯部分的磷酸酯链)和硫醇部分的修饰(例如,α-硫代三磷酸酯和β-硫代三磷酸酯)。核酸分子也可在碱基部分(例如,在一个或多个通常可用来与互补核苷酸形成氢键的原子处和/或在一个或多个通常无法与互补核苷酸形成氢键的原子处)、糖部分或磷酸骨架处被修饰。核酸分子还可包含胺修饰的基团,例如氨基烯丙基1-dUTP(aa-dUTP)和氨基己基丙烯酰胺-dCTP(aha-dCTP),以使胺反应性部分例如N-羟基琥珀酰亚胺酯(NHS)共价连接。本公开的寡核苷酸中标准DNA碱基对或RNA碱基对的替代物可以提供更高的以每立方mm比特数为单位的密度,更高的安全性(抵抗天然毒素的偶然或有目的合成),在光编程聚合酶中更容易识别或更低的二级结构。在Betz K,Malyshev DA,Lavergne T,Welte W,Diederichs K,Dwyer TJ,Ordoukhanian P,Romesberg FE,MarxA.Nat.Chem.Biol.2012Jul;8(7):612-4中描述了与天然和突变聚合酶兼容的用于从头和/或扩增合成的替代碱基对,其出于所有目的而通过引用并入本文。
如本文所用,术语“多肽”、“蛋白质”和“肽”可互换使用,并且是指经由肽键连接的氨基酸残基的聚合物,并且其可以由两个或更多个多肽链组成。术语“多肽”、“蛋白质”和“肽”是指通过酰胺键连接在一起的至少两个氨基酸单体的聚合物。氨基酸可以是L-光学异构体或D-光学异构体。更具体地,术语“多肽”、“蛋白质”和“肽”是指由两个或两个以上特定顺序的氨基酸组成的分子;例如,该顺序由编码蛋白质的基因或RNA中核苷酸的碱基序列决定。蛋白质对于人体细胞、组织和器官的结构、功能和调节至关重要,并且每种蛋白质具有独特的功能。实例为激素、酶、抗体及其任何片段。在某些情况下,蛋白质可以是蛋白质的一部分,例如蛋白质的域、子域或基序。在某些情况下,蛋白质可以是蛋白质的变体(或突变),其中一个或多个氨基酸残基被插入、删除和/或替换为蛋白质的天然存在的(或至少已知的)氨基酸序列。蛋白质或其变体可以是天然存在的或重组的。
用于检测和/或测量生物材料中的多肽的方法是本领域众所周知的,并且包括但不限于蛋白质印迹法,流式细胞术,ELISA,RIA和各种蛋白质组学技术。测量或检测多肽的示例性方法是免疫测定法,例如ELISA。这种类型蛋白质定量可以基于能够捕获特定抗原的抗体以及能够检测经捕获抗原的第二抗体。用于检测和/或测量多肽的示例性测定描述于Harlow,E.和Lane,D.Antibodies:A Laboratory Manual(1988),Cold Spring HarborLaboratory Press。
用于检测和/或测量生物材料中的RNA的方法是本领域众所周知的,并且包括但不限于RNA印迹法,RNA保护测定,RT PCR。适合的方法描述于Molecular Cloning:ALaboratory Manual(第4版),Michael R.Green,Joseph Sambrook,Peter MacCallum2012,2,028pp,ISBN 978-1-936113-42-2。
如本文所用,“小分子量化合物”可以与“小分子”或“小有机分子”互换使用。小分子是指除肽或寡核苷酸以外的化合物;并且分子量通常小于约2000道尔顿,例如小于约900道尔顿。
核糖核蛋白(RNP)是指含有RNA的核蛋白。RNP可以是核糖核酸和RNA结合蛋白的复合物。这种组合也可以称为蛋白质-RNA复合物。这些复合物可以发挥多种生物学功能,包括但不限于DNA复制、基因表达、RNA代谢和前mRNA剪接。RNP的实例包括核糖体、端粒酶、穹顶核糖核蛋白、RNase P、异质核RNP(hnRNP)和小核RNP(snRNP)。
来自蛋白质编码基因和mRNA加工中间体的新生RNA转录物统称为前mRNA,通常与真核细胞核中的蛋白质结合。从新生转录物自RNA聚合酶(例如,RNA聚合酶II)首次出现直至成熟的mRNA被转运入细胞质的时间,RNA分子与大量的剪接复合物组分(例如,核蛋白和snRNA)相关联。这些蛋白质可以是hnRNP的组分,其可以包含各种大小的异质核RNA(hnRNA)(例如前mRNA和核RNA复合物)。
剪接复合物组分在剪接和/或剪接调节中起作用。剪接复合物组分可以包括但不限于核糖核蛋白(RNP)、剪接蛋白、小核RNA(snRNA)、小核核糖核蛋白(snRNP)和异质核核糖核蛋白(hnRNP)。剪接复合物组分包括但不限于剪接可能所需的那些,例如本构剪接、选择性剪接、规范剪接和特定信息或信息组的剪接。一组相关蛋白,富丝氨酸精氨酸蛋白(SR蛋白),可以在组成型前mRNA剪接中起作用,并且还可以以浓度依赖性方式调节选择性剪接位点选择。SR蛋白通常具有模块化结构,该结构由一个或两个RNA识别基序(RRM)和一个富含精氨酸和丝氨酸残基的C末端(RS域)组成。hnRNP A/B蛋白家族成员可能拮抗其在选择性剪接中的活性。剪接复合物组分也可以包括与一种或多种snRNA相关的蛋白质。人类中的SR蛋白包括但不限于SC35,SRp55,SRp40,SRm300,SFRS10,TASR-1,TASR-2,SF2/ASF,9G8,SRp75,SRp30c,SRp20和P54/SFRS11。人类中可参与剪接位点选择的其他剪接复合物组分包括但不限于U2 snRNA辅助因子(例如U2AF65,U2AF35),Urp/U2AF1-RS2,SF1/BBP,CBP80,CBP 20,SF1和PTB/hnRNP1。人类中的hnRNP蛋白包括但不限于A1,A2/B1,L,M,K,U,F,H,G,R,I和C1/C2。编码hnRNP的人类基因包括HNRNPA0,HNRNPA1,HNRNPA1L1,HNRNPA1L2,HNRNPA3,HNRNPA2B1,HNRNPAB,HNRNPB1,HNRNPC,HNRNPCL1,HNRNPD,HNRPDL,HNRNPF,HNRNPH1,HNRNPH2,HNRNPH3,HNRNPK,HNRNPL,HNRPLL,HNRNPM,HNRNPR,HNRNPU,HNRNPUL1,HNRNPUL2,HNRNPUL3和FMR1。剪接复合物组分可以与snRNP或转录物稳定或短暂关联。
术语“内含子”是指基因内的DNA序列和未加工的RNA转录物中的相应序列。作为RNA加工途径的一部分,内含子可以在转录后不久或与转录同时通过RNA剪接除去。内含子存在于大多数有机体和许多病毒的基因中。它们可以存在于广泛的基因中,包括产生蛋白质、核糖体RNA(rRNA)和转移RNA(tRNA)的那些。
“外显子”可以是基因的任何部分,其编码内含子通过RNA剪接除去后该基因产生的最终成熟RNA的一部分。术语“外显子”是指基因内的DNA序列和RNA转录物中的相应序列。
“剪接体”可以由snRNA和蛋白质复合物组装而成。剪接体可以从转录的前mRNA中去除内含子。
“中等有效剂量”(ED50)是50%的全体表达特定反应的剂量。“中等致死剂量”(LD50)是50%群体死亡的剂量。“中等毒性剂量”(TD50)是50%群体表现出特定毒性作用的剂量。一种特别有用的药理指标是“治疗指数”,其传统上定义为LD50与ED50的比率或TD50与ED50的比率。治疗指数提供了药物益处相对不良作用的简单而有用的指标。具有高治疗指数的那些药物具有大的治疗窗口,即,该药物可以更宽范围的有效剂量施用而不会引起显著的不良事件。相反,具有小治疗指数的药物具有小的治疗窗口(不会引起显著不良事件的有效剂量范围小)。
如本文所用,术语“AUC”是指已向其施用治疗剂的受试者的某些部位或组织(例如血液或血浆)中治疗剂浓度随时间变化的曲线图中的“曲线下面积”的缩写。
小分子剪接调节剂(SMSM)
现已发现,本发明的化合物及其药学上可接受的组合物有效地用作用于治疗、预防或改善与靶RNA有关的疾病或病症的药剂。本发明提供了意想不到的发现,即某些小化学分子可以修饰前mRNA分子中的剪接事件,在本文中称为小分子剪接调节剂(SMSM)。这些SMSM可以调节特定前mRNA分子中的特定剪接事件。这些SMSM可以通过多种机制进行操作以修饰剪接事件。例如,本发明的SMMS可以:1)干扰剪接复合物、剪接体和/或其组分如hnRNP、snRNP、SR-蛋白和其他剪接因子或元件的形成和/或功能和/或其他性质,导致前mRNA分子中剪接事件的预防或诱导。作为另一实例;2)防止和/或修饰诸如hnRNP、snRNP、SR-蛋白和其他剪接因子的基因产物的转录后调控(例如剪接),其随后可能参与剪接体或剪接复合物组分的形成和/或功能;3)防止和/或修饰基因产物的磷酸化、糖基化和/或其他修饰,所述基因产物包括但不限于hnRNP、snRNP、SR-蛋白和其他剪接因子,其随后可能参与剪接体或剪接复合物组分的形成和/或功能;4)结合和/或另外影响特定前mRNA,从而例如通过不涉及以序列特异性方式与RNA碱基配对的机制来预防或诱导特定剪接事件。本发明的小分子不同于反义或反基因寡核苷酸且与之无关。
本文描述了修饰基因产物剪接的化合物,其用于治疗、预防疾病或病症(例如,癌症)和/或延迟其进展。本文描述了修饰基因产物剪接的化合物,其中所述化合物诱导基因产物的转录失活变体或转录本。本文描述了修饰基因产物剪接的化合物,其中所述化合物抑制基因产物的转录活性变体或转录本。
一方面,本文描述了具有式(I)结构的化合物或其药学上可接受的盐或其溶剂化物:
其中,
每个A独立地为N或CRA
每个RA独立地选自H,D,卤素,-CN,-OH,-OR1,=O,=N-OR1,-SR1,-S(=O)R1,-S(=O)2R1,-N(R1)2,-NR1S(=O)(=NR1)R2,-NR1S(=O)2R2,-S(=O)2N(R1)2,-C(=O)R1,-OC(=O)R1,-C(=O)OR1,-OC(=O)OR1,-C(=O)N(R1)2,-OC(=O)N(R1)2,-NR1C(=O)R1,-P(=O)(R2)2,取代或未取代的C1-C6烷基,取代或未取代的C1-C6卤代烷基,取代或未取代的C1-C6杂烷基,取代或未取代的C3-C8环烷基,取代或未取代的C2-C7杂环烷基,取代或未取代的芳基,以及取代或未取代的单环杂芳基;
环Q为芳基,单环杂芳基或稠合双环杂芳基;
X为-NR3-,-CR4R5-,-C(=O)-,-S-,-S(=O)-,-S(=O)2-,或-S(=O)(=NR1);
每个R1独立地为H,D,取代或未取代的C1-C6烷基,取代或未取代的C1-C6卤代烷基,取代或未取代的C1-C6杂烷基,取代或未取代的C3-C8环烷基,取代或未取代的C2-C7杂环烷基,取代或未取代的芳基,或者取代或未取代的杂芳基;
每个R2独立地为H,D,取代或未取代的C1-C6烷基,取代或未取代的C1-C6卤代烷基,取代或未取代的芳基,取代或未取代的单环杂芳基,-OR1,-N(R1)2,-CH2OR1,-C(=O)OR1,-OC(=O)R1,-C(=O)N(R1)2,或-NR1C(=O)R1
R3为-OR1,-N(R1)2,取代的C1-C6烷基,取代或未取代的C1-C6卤代烷基,取代或未取代的C1-C6杂烷基,取代或未取代的C3-C8环烷基,取代或未取代的C2-C7杂环烷基,取代或未取代的芳基,或者取代或未取代的杂芳基,
其中取代C1-C6烷基包含一个或多个除-OH,-NH2和-CO2H以外的取代基,
其中取代或未取代的C1-C6杂烷基包含至少2个O原子,2个N原子,或S原子,并且
其中取代的C3-C8环烷基包含至少1个选自以下的取代基:D,卤素和-OR1
R4为D,F,-CN,-OR1,-SR1,-N(R1)2,取代的C1-C6烷基,取代或未取代的C1-C6卤代烷基,取代或未取代的C1-C6杂烷基,取代或未取代的C1-C6亚烷基-OR1,取代或未取代的C3-C8环烷基,取代或未取代的C2-C7杂环烷基,取代或未取代的芳基,或者取代或未取代的杂芳基;
R5为H,D,F,-CN,-OR1,-SR1,-N(R1)2,取代或未取代的C1-C6烷基,取代或未取代的C1-C6卤代烷基,取代或未取代的C1-C6杂烷基,取代或未取代的C1-C6亚烷基-OR1,取代或未取代的C3-C8环烷基,取代或未取代的C2-C7杂环烷基,取代或未取代的芳基,或者取代或未取代的杂芳基;
环G为式的基团,其中
Z为N或CR7;且R7为H,D,取代或未取代的C1-C6烷基,取代或未取代的C1-C6卤代烷基或-CH2OR1
a,b和c各自独立地选自0,1或2;
R11,R12,R13,R14,R15,R16和R17各自独立地选自以下:H,F,OR1,取代或未取代的C1-6烷基,取代或未取代的C1-6氟代烷基,取代或未取代的C1-C6杂烷基,其中烷基任选地被以下取代:羟基,氨基,甲氧基,取代或未取代的单-C1-6烷基氨基或者取代或未取代的二-C1-6烷基氨基;或者
R和R13,组合形成稠合5或6元杂环,其具有0或1个选自N、O或S的另外的环杂原子;或者
R11和R13,组合形成取代或未取代的C1-3亚烷基;或者
R11和R15,组合形成取代或未取代的C1-3亚烷基;或者
R11和R17,组合形成取代或未取代的C1-3亚烷基;或者
R16和R17,组合形成取代或未取代的C1-3亚烷基;或者
R16和R17,组合形成键;或者
R13和R14,与它们所连接的碳原子组合形成螺环C3-8环烷基;或者
R16和R2,组合形成双键;或者
R17和R2,组合形成取代或未取代的C1-3亚烷基;或者
当Z为CR7时,则R3和R7任选地与它们所连接的中间原子一起形成4,5或6-元环;或者
当X为-NR3-时,则R3和R16任选地与它们所连接的中间原子一起形成4,5或6-元环;或者
当Z为CR7且X为-CR4R5-,则R7和R5任选地组合形成双键。
对于任何和所有实施方式,从所列替代方案的子集中选择取代基。例如,在一些实施方式中,a为0,1或2。在其他实施方式中,a为0.在一些其他实施方式中,a为1。在一些其他实施方式中,a为2。
在一些实施方式中,is/>在一些实施方式中,/>为/>
在一些实施方式中,Z为N且X为-NR3-,-CH(CH2OR1)-,-CH(OR1)-,-C(=O)-,-S(=O)-,-S(=O)2-,或-S(=O)(=NR1)-。在一些实施方式中,Z为N。在一些实施方式中,X为-NR3-。在一些实施方式中,X为-CH(CH2OR1)-。在一些实施方式中,X为-CH(CH2OH)-。在一些实施方式中,X为-CH(CH2OCH3)-。在一些实施方式中,X为-CH(OR1)-。在一些实施方式中,X为-CH(OH)-。在一些实施方式中,X为-CH(OCH3)-。在一些实施方式中,X为-C(=O)-。在一些实施方式中,X为-S(=O)-。在一些实施方式中,X为-S(=O)2-。在一些实施方式中,X为-S(=O)(=NR1)-。
在一些实施方式中,R3为H,-OR1,-N(R1)2,取代或未取代的C1-C6烷基,取代或未取代的C1-C6卤代烷基,取代或未取代的C1-C6杂烷基,取代或未取代的C3-C8环烷基,或者取代或未取代的C2-C7杂环烷基。
在一些实施方式中,R3为-OR1,-N(R1)2,取代或未取代的C1-C6烷基,取代或未取代的C1-C6卤代烷基,取代或未取代的C1-C6杂烷基,取代或未取代的C3-C8环烷基,或者取代或未取代的C2-C7杂环烷基。
在一些实施方式中,Z为CR7且X为-C(=O)-,-CH(CH2OR1)-,或-CH(OR1)-。在一些实施方式中,Z is CR7。在一些实施方式中,X为-C(=O)-。在一些实施方式中,X为-CH(CH2OR1)-。在一些实施方式中,X为-CH(OR1)-。
在一些实施方式中,环Q为取代或未取代的芳基。在一些实施方式中,环Q为取代的芳基。在一些实施方式中,环Q为未取代的芳基.
在一些实施方式中,环Q为取代的苯基。在一些实施方式中,环Q为经以下取代的2-羟基-苯基:0,1,2或3个独立选自以下的取代基:C1-6烷基,氧代,肟,羟基,卤代-C1-6烷基,二卤代-C1-6烷基,三卤代-C1-6烷基,C1-6烷氧基,C1-6烷氧基-C3-7环烷基,卤代-C1-6烷氧基,二卤代-C1-6烷氧基,三卤代-C1-6烷氧基,羟基,氰基,卤素,氨基,单-C1-6烷基氨基,二-C1-6烷基氨基,杂芳基,羟基取代的C1-6烷基,芳基取代的C1-6烷氧基,氨基,-C(=O)NH-C1-6烷基-杂芳基,-NHC(=O)-C1-6烷基杂芳基,C1-6烷基-C(=O)NH-杂芳基,C1-6烷基-NHC(=O)-杂芳基,C3-7环烷基,5-7元环烯基或含有1或2个独立选自S、O和N的杂原子的5,6或9元杂环。
在一些实施方式中,环Q为被2个C1-6烷基取代的2-羟基-苯基。在一些实施方式中,两个C1-6烷基可以与它们所键合的原子组合以形成5-6元环。
在一些实施方式中,环Q为被杂芳基取代的2-羟基-苯基。在一些实施方式中,杂芳基具有5、6、9或10个环原子,1、2或3个选自N、O和S的环杂原子,并被0、1或2个独立选自以下的取代基取代:氧代,羟基,硝基,卤素,C1-6烷基,C1-6烯基,C1-6烷氧基,C3-7环烷基,C1-6烷基-OH,三卤代-C1-6烷基,单-C1-6烷基氨基,二-C1-6烷基氨基,-C(=O)NH2,-NH2,-NO2,羟基-C1-6烷基氨基,羟基-C1-6烷基,4-7元杂环-C1-6烷基,氨基-C1-6烷基,单-C1-6烷基氨基-C1-6烷基,和二-C1-6烷基氨基-C1-6烷基。
在一些实施方式中,环Q为被选自以下的杂芳基取代的2-羟基-苯基:
其中每个RB独立地选自氰基,卤素,羟基,取代或未取代的C1-6烷基,-OCH3,-OCD3,取代或未取代的C2-6烯基,取代或未取代的C2-6炔基,取代或未取代的C1-6烷氧基,取代或未取代的C3-7环烷基,取代或未取代的C2-8杂环烷基,杂芳基,取代或未取代的杂环烷基-C1-6烷基,取代或未取代的C1-6烷基-芳基,取代或未取代的C1-6烷基-杂环烷基,取代或未取代的C1-6烷基-杂芳基,取代或未取代的C1-6烷氧基-芳基,取代或未取代的C1-6烷氧基-杂环烷基,取代或未取代的C1-6烷氧基-杂芳基,和被羟基取代的C1-6烷氧基,C1-6烷氧基,氨基,单-C1-6烷基氨基和二-C1-6烷基氨基;并且m为0,1,2或3。/>
在一些实施方式中,环Q为在一些实施方式中,环Q为在一些实施方式中,环Q为/>在一些实施方式中,环Q为在一些实施方式中,环Q为/>在一些实施方式中,环Q为/>在一些实施方式中,环Q为/>
在一些实施方式中,环Q为在一些实施方式中,环Q为在一些实施方式中,环Q为/>在一些实施方式中,环Q为/>在一些实施方式中,环Q为/>在一些实施方式中,环Q为/>在一些实施方式中,环Q为/>在一些实施方式中,环Q为/>
在一些实施方式中,环Q为任选地在3位被羟基取代且另外被0、1或2个选自以下的取代基取代的2-萘基:羟基,氰基,卤素,C1-6烷基,C2-6烯基,C1-6烷氧基,其中所述烷氧基是未取代的或被羟基取代,C1-6烷氧基,氨基,-NHC(=O)-C1-6烷基,-NHC(=O)-C1-6烷基,C1-6亚烷基-4-7元杂环,4-7元杂环,单-C1-6烷基氨基,和二-C1-6烷基氨基。
在一些实施方式中,环Q为单环杂芳基或稠合双环杂芳基.
在一些实施方式中,环Q为具有1-4个环氮原子的5或6元单环杂芳基,并且其被苯基或杂芳基取代,所述杂芳基具有5或6个环原子,1或2个独立选自N、O和S的环杂原子,并且其被0、1或2个独立选自以下的取代基取代:氰基,C1-6烷基,单-C1-6烷基氨基,二-C1-6烷基氨基,羟基-C1-6烷基氨基,羟基-C1-6烷基,氨基-C1-6烷基和单-C1-6烷基氨基-C1-6烷基,和二-C1-6烷基氨基-C1-6烷基。
在一些实施方式中,环Q为选自以下的5元单环杂芳基:
其中
每个RB独立地选自氰基,卤素,羟基,取代或未取代的C1-6烷基,-OCH3,-OCD3,取代或未取代的C2-6烯基,取代或未取代的C2-6炔基,取代或未取代的C1-6烷氧基,取代或未取代的C3-7环烷基,取代或未取代的C2-8杂环烷基,杂芳基,取代或未取代的杂环烷基-C1-6烷基,取代或未取代的C1-6烷基-芳基,取代或未取代的C1-6烷基-杂环烷基,取代或未取代的C1-6烷基-杂芳基,取代或未取代的C1-6烷氧基-芳基,取代或未取代的C1-6烷氧基-杂环烷基,取代或未取代的C1-6烷氧基-杂芳基,和羟基取代的C1-6烷氧基,C1-6烷氧基,氨基,单-C1-6烷基氨基和二-C1-6烷基氨基;并且m为0,1,2或3。
在一些实施方式中,环Q为选自以下的6元单环杂芳基:
其中
每个RB独立地选自氰基,卤素,羟基,取代或未取代的C1-6烷基,-OCH3,-OCD3,取代或未取代的C2-6烯基,取代或未取代的C2-6炔基,取代或未取代的C1-6烷氧基,取代或未取代的C3-7环烷基,取代或未取代的C2-8杂环烷基,杂芳基,取代或未取代的杂环烷基-C1-6烷基,取代或未取代的C1-6烷基-芳基,取代或未取代的C1-6烷基-杂环烷基,取代或未取代的C1-6烷基-杂芳基,取代或未取代的C1-6烷氧基-芳基,取代或未取代的C1-6烷氧基-杂环烷基,取代或未取代的C1-6烷氧基-杂芳基,和羟基取代的C1-6烷氧基,C1-6烷氧基,氨基,单-C1-6烷基氨基和二-C1-6烷基氨基;并且m为0,1,2或3.
在一些实施方式中,环Q为具有8至10个环原子,1、2或3个独立选自N、O或S的环杂原子的稠合双环杂芳基,并且其被0、1或2个独立选自以下的取代基取代:氰基,肟,卤素,羟基,C1-6烷基,C24烯基,C24炔基,C1-6烷氧基,羟基取代的C1-6烷氧基,氨基,单-C1-6烷基氨基,和二-C1-6烷基氨基。
在一些实施方式中,环Q为6-5稠合杂芳基,6-6稠合杂芳基,5-6稠合杂芳基,5-5稠合杂芳基,7-5稠合杂芳基或5-7稠合杂芳基。
在一些实施方式中,环Q为6-5稠合杂芳基,6-6稠合杂芳基或5-6稠合杂芳基,其选自以下:
/>
其中每个RB独立地选自氰基,卤素,羟基,取代或未取代的C1-6烷基,-OCH3,-OCD3,取代或未取代的C2-6烯基,取代或未取代的C2-6炔基,取代或未取代的C1-6烷氧基,取代或未取代的C3-7环烷基,取代或未取代的C2-8杂环烷基,杂芳基,取代或未取代的杂环烷基-C1-6烷基,取代或未取代的C1-6烷基-芳基,取代或未取代的C1-6烷基-杂环烷基,取代或未取代的C1-6烷基-杂芳基,取代或未取代的C1-6烷氧基-芳基,取代或未取代的C1-6烷氧基-杂环烷基,取代或未取代的C1-6烷氧基-杂芳基,和羟基取代的C1-6烷氧基,C1-6烷氧基,氨基,单-C1-6烷基氨基和二-C1-6烷基氨基;并且m为1,2或3。
在一些实施方式中,X为S。
在一些实施方式中,X为-NR3-。
在一些实施方式中,R3为-OR1。在一些实施方式中,R3为-OCH3。在一些实施方式中,R3为-OCH2CH3。在一些实施方式中,R3为-OCH2CH2CH3。在一些实施方式中,R3为-OCH(CH3)2
在一些实施方式中,R3为取代的C1-C6烷基,其包含一个或多个除-OH,-NH2和-CO2H以外的取代基。在一些实施方式中,R3为-CD3
在一些实施方式中,R3为取代或未取代的C1-C6卤代烷基。在一些实施方式中,R3为CF3。在一些实施方式中,R3为-CH2CH2F。在一些实施方式中,R3为-CH2CH2CH2F。在一些实施方式中,R3为-CH2CF3。在一些实施方式中,R3为-CH2CH2CF3
在一些实施方式中,R3为取代或未取代的C1-C6杂烷基。在一些实施方式中,取代或未取代的C1-C6杂烷基包含至少2个O原子或S原子。在一些实施方式中,R3为-OCH2CH2OCH3或-OCH2CH2OCF3。在一些实施方式中,R3为-CH2CH2OCH3。在一些实施方式中,R3为-OCH2CH2OCF3。在一些实施方式中,R3为-CH2CH2SCH3或-CH2SCH3。在一些实施方式中,R3为-CH2CH2SCH3。在一些实施方式中,R3为-CH2SCH3
在一些实施方式中,R3为取代或未取代的C3-C5环烷基。在一些实施方式中,R3为取代或未取代的C3-C8环烷基。在一些实施方式中,R3为环丙基,环丁基,环戊基,环己基,环庚基或环辛基。在一些实施方式中,R3为环戊烯基,环己烯基,环庚烯基或环辛烯基。
在一些实施方式中,X为-NR3-且环G为在一些实施方式中,X为-NR3-且环G为/>在一些实施方式中,X为-NR3-且环G为在一些实施方式中,X为-NR3-且环G为/>
在一些实施方式中,环G为 其中p为1或2。在一些实施方式中,环G为/>在一些实施方式中,环G为在一些实施方式中,环G为/>
在一些实施方式中,环G为 其中p为1或2。在一些实施方式中,环G为/>在一些实施方式中,环G为在一些实施方式中,环G为/>
在一些实施方式中,环G为
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其中
每个RC独立地选自H,D,F,-CN,-OH,-OR1,-SR1,-S(=O)R1,-S(=O)2R1,-N(R1)2,-CH2-N(R1)2,-NHS(=O)2R1,-S(=O)2N(R1)2,-C(=O)R1,-OC(=O)R1,-CO2R1,-OCO2R1,-C(=O)N(R1)2,-OC(=O)N(R1)2,-NR1C(=O)N(R1)2,-NR1C(=O)R1,-NR1C(=O)OR1,取代或未取代的C1-C6烷基,取代或未取代的C1-C6卤代烷基,取代或未取代的C1-C6杂烷基,取代或未取代的C3-C8环烷基,和取代或未取代的C2-C8杂环烷基;且q为0,1,2,3,4,5或6。
在一些实施方式中,环G为
在一些实施方式中,为/>在一些实施方式中,为/>在一些实施方式中,/>为/>
在一些实施方式中,为/>在一些实施方式中,/>为/>
在一些实施方式中,式(I)的化合物选自表1A、表1B或表1C中的化合物。
在一个方面,本文描述了具有式(II)结构的化合物或其药学上可接受的盐或其溶剂化物:
其中,
每个A独立地为N或CRA
每个RA独立地选自H,D,卤素,-CN,-OH,-OR1,=O,=N-OR1,-SR1,-S(=O)R1,-S(=O)2R1,-N(R1)2,-NR1S(=O)(=NR1)R2,-NR1S(=O)2R2,-S(=O)2N(R1)2,-C(=O)R1,-OC(=O)R1,-C(=O)OR1,-OC(=O)OR1,-C(=O)N(R1)2,-OC(=O)N(R1)2,-NR1C(=O)R1,-P(=O)(R2)2,取代或未取代的C1-C6烷基,取代或未取代的C1-C6卤代烷基,取代或未取代的C1-C6杂烷基,取代或未取代的C3-C8环烷基,取代或未取代的C2-C7杂环烷基,取代或未取代的芳基,和取代或未取代的单环杂芳基;
环Q为单环芳基,双环芳基,单环杂芳基或稠合双环杂芳基;
X为-O-,-NR3-,-CR4R5-,-C(=O)-,-C(=C(R2)2)-,-S-,-S(=O)-,-S(=O)2-,或-S(=O)(=NR1)-;
环S为稠合双环杂环;
R选自H,取代或未取代的C1-6烷基,取代或未取代的C1-6氟代烷基,取代或未取代的C1-C6杂烷基,取代或未取代的C3-C8环烷基,取代或未取代的C2-C7杂环烷基,取代或未取代的芳基,和取代或未取代的杂芳基,其中烷基任选地被以下取代:羟基,氨基,取代或未取代的单-C1-6烷基氨基,或者取代或未取代的二-C1-6烷基氨基;
每个R1独立地为H,D,取代或未取代的C1-C6烷基,取代或未取代的C1-C6卤代烷基,取代或未取代的C1-C6杂烷基,取代或未取代的C3-C8环烷基,取代或未取代的C2-C7杂环烷基,取代或未取代的芳基,或者取代或未取代的杂芳基;
每个R2独立地为H,D,取代或未取代的C1-C6烷基,取代或未取代的C1-C6卤代烷基,取代或未取代的芳基,取代或未取代的单环杂芳基,-OR1,-N(R1)2,-CH2OR1,-C(=O)OR1,-OC(=O)R1,-C(=O)N(R1)2,或-NR1C(=O)R1
R3为H,-OR1,-N(R1)2,取代或未取代的C1-C6烷基,-CD3,取代或未取代的C1-C6卤代烷基,取代或未取代的C1-C6杂烷基,取代或未取代的C3-C8环烷基,取代或未取代的C2-C7杂环烷基,取代或未取代的芳基,或者取代或未取代的杂芳基;
R4为H,D,F,-CN,-OR1,-SR1,-N(R1)2,取代或未取代的C1-C6烷基,取代或未取代的C1-C6卤代烷基,取代或未取代的C1-C6杂烷基,取代或未取代的C1-C6亚烷基-OR1,取代或未取代的C3-C8环烷基,取代或未取代的C2-C7杂环烷基,取代或未取代的芳基,或者取代或未取代的杂芳基;
R5为H,D,F,-CN,-OR1,-SR1,-N(R1)2,取代或未取代的C1-C6烷基,取代或未取代的C1-C6卤代烷基,取代或未取代的C1-C6杂烷基,取代或未取代的C1-C6亚烷基-OR1,取代或未取代的C3-C8环烷基,取代或未取代的C2-C7杂环烷基,取代或未取代的芳基,或者取代或未取代的杂芳基;或者
R4和R5与它们所连接的碳原子组合形成取代或未取代的C3-8环烷基或者取代或未取代的C2-7杂环烷基;并且
其中所述式(II)化合物具有至少80%的立体化学纯度。
对于任何和所有实施方式,从所列替代方案的子集中选择取代基。例如,在一些实施方式中,a为0,1或2。在其他实施方式中,a为0。在一些其他实施方式中,a为1。在一些其他实施方式中,a为2。
在一些实施方式中,为/>在一些实施方式中,/>为/>在一些实施方式中,/>为/>
在一些实施方式中,X为-O-,-NR3-,-S-,-CR4R5-,-C(=O)-,或-C(=CR2 2)-。在一些实施方式中,X为-O-。在一些实施方式中,X为-NR3-。在一些实施方式中,X为-S-。在一些实施方式中,X为-CR4R5-。在一些实施方式中,X为-C(=O)-。在一些实施方式中,X为-C(=CR2 2)-。
在一些实施方式中,X为-CH(CH2OR1)-或-CH(OR1)-。在一些实施方式中,X为-CH(CH2OR1)-。在一些实施方式中,X为-CH(OR1)-。
在一些实施方式中,R3为H,-OR1,-N(R1)2,取代或未取代的C1-C6烷基,取代或未取代的C1-C6卤代烷基,取代或未取代的C1-C6杂烷基,取代或未取代的C3-C8环烷基,或者取代或未取代的C2-C7杂环烷基。
在一些实施方式中,R3为-OR1,-N(R1)2,取代或未取代的C1-C6烷基,取代或未取代的C1-C6卤代烷基,取代或未取代的C1-C6杂烷基,取代或未取代的C3-C8环烷基,或者取代或未取代的C2-C7杂环烷基。
在一些实施方式中,环Q为取代或未取代的单环芳基。在一些实施方式中,环Q为取代的单环芳基。在一些实施方式中,环Q为未取代的单环芳基。
在一些实施方式中,环Q为取代的苯基。在一些实施方式中,环Q为被以下取代的2-羟基-苯基:0,1,2或3个独立选自以下的取代基:C1-6烷基,氧代,肟,羟基,卤代-C1-6烷基,二卤代-C1-6烷基,三卤代-C1-6烷基,C1-6烷氧基,C1-6烷氧基-C3-7环烷基,卤代-C1-6烷氧基,二卤代-C1-6烷氧基,三卤代-C1-6烷氧基,羟基,氰基,卤素,氨基,单-C1-6烷基氨基,二-C1-6烷基氨基,杂芳基,羟基取代的C1-6烷基,芳基取代的C1-6烷氧基,氨基,-C(=O)NH-C1-6烷基-杂芳基,-NHC(=O)-C1-6烷基杂芳基,C1-6烷基-C(=O)NH-杂芳基,C1-6烷基-NHC(=O)-杂芳基,C3-7环烷基,5-7元环烯基或者含有1或2个独立选自S、O和N的杂原子的5、6元9元杂环。
在一些实施方式中,环Q为被两个C1-6烷基取代的2-羟基-苯基。在一些实施方式中,两个C1-6烷基可以与它们所键合的原子组合以形成5-6元环。
在一些实施方式中,环Q为被杂芳基取代的2-羟基-苯基。在一些实施方式中,杂芳基具有5、6、9或10个环原子,1、2或3个选自N、O和S的环杂原子,并被0、1或2个独立选自以下的取代基取代:氧代,羟基,硝基,卤素,C1-6烷基,C1-6烯基,C1-6烷氧基,C3-7环烷基,C1-6烷基-OH,三卤代-C1-6烷基,单-C1-6烷基氨基,二-C1-6烷基氨基,-C(=O)NH2,-NH2,-NO2,羟基-C1-6烷基氨基,羟基-C1-6烷基,4-7元杂环-C1-6烷基,氨基-C1-6烷基,单-C1-6烷基氨基-C1-6烷基,和二-C1-6烷基氨基-C1-6烷基。
在一些实施方式中,环Q为其中环P为芳基或杂芳基。在一些实施方式中,环Q为/>其中环P为芳基。在一些实施方式中,环Q为其中环P为杂芳基。在一些实施方式中,杂芳基选自以下:
其中
每个RB独立地选自氰基,卤素,羟基,取代或未取代的C1-6烷基,-OCH3,-OCD3,取代或未取代的C2-6烯基,取代或未取代的C1-6烷氧基,取代或未取代的C3-7环烷基,取代或未取代的C2-8杂环烷基,杂芳基,取代或未取代的杂环烷基-C1-6烷基,取代或未取代的C1-6烷基-芳基,取代或未取代的C1-6烷基-杂环烷基,取代或未取代的C1-6烷基-杂芳基,取代或未取代的C1-6烷氧基-芳基,取代或未取代的C1-6烷氧基-杂环烷基,取代或未取代的C1-6烷氧基-杂芳基,和羟基取代的C1-6烷氧基,C1-6烷氧基,氨基,单-C1-6烷基氨基和二-C1-6烷基氨基;并且m为0,1,2或3。
在一些实施方式中,环Q为在一些实施方式中,环Q为在一些实施方式中,环Q为/>在一些实施方式中,环Q为在一些实施方式中,环Q为/>在一些实施方式中,环Q为/>在一些实施方式中,环Q为/>在一些实施方式中,环Q为/>在一些实施方式中,环Q为/>在一些实施方式中,环Q为/>在一些实施方式中,环Q为/>在一些实施方式中,环Q为/>在一些实施方式中,环Q为/>在一些实施方式中,环Q为/>在一些实施方式中,环Q为/>在一些实施方式中,环Q为/>在一些实施方式中,环Q为/>在一些实施方式中,环Q为/>在一些实施方式中,环Q为/>在一些实施方式中,环Q为/>在一些实施方式中,环Q为/>
在一些实施方式中,环Q为任选在3位被羟基取代并另外被0、1或2个选自以下的取代基取代的2-萘基:羟基,氰基,卤素,C1-6烷基,C2-6烯基,C1-6烷氧基,其中所述烷氧基是未取代的或取代有羟基,C1-6烷氧基,氨基,-NHC(=O)-C1-6烷基,-NHC(=O)-C1-6烷基,C1-6亚烷基-4-7元杂环,4-7元杂环,单-C1-6烷基氨基,和二-C1-6烷基氨基。
在一些实施方式中,环Q为在一些实施方式中,环Q为
在一些实施方式中,环Q为 并且每个R6独立地为H,-OR1,-N(R1)2,取代或未取代的C1-C6烷基,取代或未取代的C1-C6卤代烷基,取代或未取代的C1-C6杂烷基,取代或未取代的C3-C8环烷基,取代或未取代的C2-C7杂环烷基,取代或未取代的芳基,或者取代或未取代的杂芳基;或者两个R6与它们所连接的N原子一起以形成取代或未取代的C2-C6杂环烷基。在一些实施方式中,每个R6独立地为H,取代或未取代的C1-C6烷基,取代或未取代的C1-C6杂烷基,或者取代或未取代的C3-C8环烷基。在一些实施方式中,每个R6独立地为H,取代或未取代的C1-C4烷基,或者取代或未取代的C3-C6环烷基。
在一些实施方式中,环Q为单环杂芳基或稠合双环杂芳基。
在一些实施方式中,环Q为具有1-4个环氮原子的5或6元单环杂芳基,并且其被苯基或杂芳基取代,所述杂芳基具有5或6个环原子,1或2个独立选自N、O和S的环杂原子,并且其被0、1或2个独立选自以下的取代基取代:氰基,C1-6烷基,单-C1-6烷基氨基,二-C1-6烷基氨基,羟基-C1-6烷基氨基,羟基-C1-6烷基,氨基-C1-6烷基和单-C1-6烷基氨基-C1-6烷基,和二-C1-6烷基氨基-C1-6烷基。
在一些实施方式中,环Q为选自以下的5元单环杂芳基:
其中
每个RB独立地选自氰基,卤素,羟基,取代或未取代的C1-6烷基,-OCH3,-OCD3,取代或未取代的C2-6烯基,取代或未取代的C2-6炔基,取代或未取代的C1-6烷氧基,取代或未取代的C3-7环烷基,取代或未取代的C2-8杂环烷基,杂芳基,取代或未取代的杂环烷基-C1-6烷基,取代或未取代的C1-6烷基-芳基,取代或未取代的C1-6烷基-杂环烷基,取代或未取代的C1-6烷基-杂芳基,取代或未取代的C1-6烷氧基-芳基,取代或未取代的C1-6烷氧基-杂环烷基,取代或未取代的C1-6烷氧基-杂芳基,和羟基取代的C1-6烷氧基,C1-6烷氧基,氨基,单-C1-6烷基氨基和二-C1-6烷基氨基;并且m为0,1,2或3。
在一些实施方式中,环Q为选自以下的6元单环杂芳基:
其中
每个RB独立地选自氰基,卤素,羟基,取代或未取代的C1-6烷基,-OCH3,-OCD3,取代或未取代的C2-6烯基,取代或未取代的C2-6炔基,取代或未取代的C1-6烷氧基,取代或未取代的C3-7环烷基,取代或未取代的C2-8杂环烷基,杂芳基,取代或未取代的杂环烷基-C1-6烷基,取代或未取代的C1-6烷基-芳基,取代或未取代的C1-6烷基-杂环烷基,取代或未取代的C1-6烷基-杂芳基,取代或未取代的C1-6烷氧基-芳基,取代或未取代的C1-6烷氧基-杂环烷基,取代或未取代的C1-6烷氧基-杂芳基,和羟基取代的C1-6烷氧基,C1-6烷氧基,氨基,单-C1-6烷基氨基和二-C1-6烷基氨基;并且m为0,1,2或3.
在一些实施方式中,环Q为具有8至10个环原子,1、2或3个独立选自N、O或S的环杂原子的稠合双环杂芳基,并且其被0、1或2个独立选自以下的取代基取代:氰基,肟,卤素,羟基,C1-6烷基,C24烯基,C24炔基,C1-6烷氧基,羟基取代的C1-6烷氧基,氨基,单-C1-6烷基氨基,和二-C1-6烷基氨基。
在一些实施方式中,环Q为6-5稠合杂芳基,6-6稠合杂芳基,5-6稠合杂芳基,5-5稠合杂芳基,7-5稠合杂芳基或5-7稠合杂芳基。
在一些实施方式中,环Q为6-5稠合杂芳基,6-6稠合杂芳基或5-6稠合杂芳基,其选自以下:
其中
每个RB独立地选自氰基,卤素,羟基,取代或未取代的C1-6烷基,-OCH3,-OCD3,取代或未取代的C2-6烯基,取代或未取代的C2-6炔基,取代或未取代的C1-6烷氧基,取代或未取代的C3-7环烷基,取代或未取代的C2-8杂环烷基,杂芳基,取代或未取代的杂环烷基-C1-6烷基,取代或未取代的C1-6烷基-芳基,取代或未取代的C1-6烷基-杂环烷基,取代或未取代的C1-6烷基-杂芳基,取代或未取代的C1-6烷氧基-芳基,取代或未取代的C1-6烷氧基-杂环烷基,取代或未取代的C1-6烷氧基-杂芳基,和羟基取代的C1-6烷氧基,C1-6烷氧基,氨基,单-C1-6烷基氨基和二-C1-6烷基氨基;并且m为1,2或3。
在一些实施方式中,环Q为 并且每个R6独立地为H,-OR1,-N(R1)2,取代或未取代的C1-C6烷基,取代或未取代的C1-C6卤代烷基,取代或未取代的C1-C6杂烷基,取代或未取代的C3-C8环烷基,取代或未取代的C2-C7杂环烷基,取代或未取代的芳基,或者取代或未取代的杂芳基;或者两个R6与它们所连接的N原子一起以形成取代或未取代的C2-C6杂环烷基。在一些实施方式中,每个R6独立地为H,取代或未取代的C1-C6烷基,取代或未取代的C1-C6杂烷基,或者取代或未取代的C3-C8环烷基。在一些实施方式中,每个R6独立地为H,取代或未取代的C1-C4烷基,或者取代或未取代的C3-C6环烷基。
在一些实施方式中,环Q为 并且每个R6独立地为H,-OR1,-N(R1)2,取代或未取代的C1-C6烷基,取代或未取代的C1-C6卤代烷基,取代或未取代的C1-C6杂烷基,取代或未取代的C3-C8环烷基,取代或未取代的C2-C7杂环烷基,取代或未取代的芳基,或者取代或未取代的杂芳基;或者两个R6与它们所连接的N原子一起以形成取代或未取代的C2-C6杂环烷基。在一些实施方式中,每个R6独立地为H,取代或未取代的C1-C6烷基,取代或未取代的C1-C6杂烷基,或者取代或未取代的C3-C8环烷基。在一些实施方式中,每个R6独立地为H,取代或未取代的C1-C4烷基,或者取代或未取代的C3-C6环烷基。
在一些实施方式中,X为-NR3-。
在一些实施方式中,R3为-OR1。在一些实施方式中,R3为-OCH3。在一些实施方式中,R3为-OCH2CH3。在一些实施方式中,R3为-OCH2CH2CH3。在一些实施方式中,R3为-OCH(CH3)2
在一些实施方式中,R3为-CD3
在一些实施方式中,R3为取代或未取代的C1-C6卤代烷基。在一些实施方式中,R3为CF3。在一些实施方式中,R3为-CH2CH2F。在一些实施方式中,R3为-CH2CH2CH2F。在一些实施方式中,R3为-CH2CF3。在一些实施方式中,R3为-CH2CH2CF3
在一些实施方式中,R3为取代或未取代的C1-C6杂烷基。在一些实施方式中,R3为-OCH2CH2OCH3或-OCH2CH2OCF3。在一些实施方式中,R3为-CH2CH2OCH3
在一些实施方式中,R3为取代或未取代的C3-C8环烷基。在一些实施方式中,R3为环丙基,环丁基,环戊基,环己基,环庚基或环辛基。
在一些实施方式中,R3为环戊烯基,环己烯基,环庚烯基或环辛烯基。
在一些实施方式中,为/>其中Z为CR7,且R7为H,D,取代或未取代的C1-C6烷基,取代或未取代的C1-C6卤代烷基,或-CH2OR1
在一些实施方式中,为/> 在一些实施方式中,/>为/>在一些实施方式中,/>为/>在一些实施方式中,/>为/>
在一些实施方式中,为/>
在一些实施方式中,为/>其中Z为CR7,且R7为H,D,取代或未取代的C1-C6烷基,取代或未取代的C1-C6卤代烷基,或-CH2OR1
在一些实施方式中,为/>在一些实施方式中,/>为/>在一些实施方式中,/>
/>
在一些实施方式中,为/>其中环R为取代或未取代的C3-C8环烷基,取代或未取代的C2-C7杂环烷基,取代或未取代的芳基,或者取代或未取代的杂芳基。
在一些实施方式中,为/>
在一些实施方式中,为/>在一些实施方式中,为/>
在一些实施方式中,为/>在一些实施方式中,为/>
在一些实施方式中,为/>在一些实施方式中,为/>
在一些实施方式中,式(II)的化合物不是外消旋的。在一些优选实施方式中,式(II)的化合物基本上不含其他异构体。在一些优选实施方式中,式(V)的化合物是基本上不含其他异构体的单一异构体。在一些优选实施方式中,式(II)的化合物包含25%或更少的其他异构体。在一些优选实施方式中,式(II)的化合物包含20%或更少的其他异构体。在一些优选实施方式中,式(II)的化合物包含15%或更少的其他异构体。在一些优选实施方式中,式(II)的化合物包含10%或更少的其他异构体。在一些优选实施方式中,式(II)的化合物包含5%或更少的其他异构体。在一些优选实施方式中,式(II)的化合物包含1%或更少的其他异构体。
在一些优选实施方式中,式(II)的化合物具有至少75%的立体化学纯度。在一些优选实施方式中,式(II)的化合物具有至少80%的立体化学纯度。在一些优选实施方式中,式(II)的化合物具有至少85%的立体化学纯度。在一些优选实施方式中,式(II)的化合物具有至少90%的立体化学纯度。在一些优选实施方式中,式(II)的化合物具有至少95%的立体化学纯度。在一些优选实施方式中,式(II)的化合物具有至少96%的立体化学纯度。在一些优选实施方式中,式(II)的化合物具有至少97%的立体化学纯度。在一些优选实施方式中,式(II)的化合物具有至少98%的立体化学纯度。在一些优选实施方式中,式(II)的化合物具有至少99%的立体化学纯度。
在一些优选实施方式中,式(I)化合物的不对称碳原子(CR7)以对映体富集形式存在。在某些实施方式中,式(II)化合物的不对称碳原子(CR7)具有(S)-或(R)-构型的至少50%的对映体过量,至少60%的对映体过量,至少70%的对映体过量,至少80%的对映体过量,至少90%的对映体过量,至少95%的对映体过量或至少99%的对映体过量。
在一些实施方式中,式(II)的化合物选自表1A,表1B或表1C中的化合物。
本文考虑了上述用于各种变量的基团的任何组合。在整个说明书中,本领域技术人员选择基团及其取代基以提供稳定的部分和化合物。
一方面,本文描述了具有式(III)结构的化合物或其药学上可接受的盐或其溶剂化物:
其中,
每个A独立地为N或CRA
每个RA独立地选自H,D,卤素,-CN,-OH,-OR1,=O,=N-OR1,-SR1,-S(=O)R1,-S(=O)2R1,-N(R1)2,-NR1S(=O)(=NR1)R2,-NR1S(=O)2R2,-S(=O)2N(R1)2,-C(=O)R1,-OC(=O)R1,-C(=O)OR1,-OC(=O)OR1,-C(=O)N(R1)2,-OC(=O)N(R1)2,-NR1C(=O)R1,-P(=O)(R2)2,取代或未取代的C1-C6烷基,取代或未取代的C1-C6卤代烷基,取代或未取代的C1-C6杂烷基,取代或未取代的C3-C8环烷基,取代或未取代的C2-C7杂环烷基,取代或未取代的芳基,以及取代或未取代的单环杂芳基;
环Q为取代或未取代的单环芳基,取代或未取代的双环芳基,取代或未取代的单环杂芳基,或者取代或未取代的稠合双环杂芳基;
X为-NR3-,-CR4R5-,-C(=O)-,-O-,-S-,-S(=O)-,-S(=O)2-,或-S(=O)(=NR1)-;
每个R1独立地为H,D,取代或未取代的C1-C6烷基,取代或未取代的C1-C6卤代烷基,取代或未取代的C1-C6杂烷基,取代或未取代的C3-C8环烷基,取代或未取代的C2-C7杂环烷基,取代或未取代的芳基,或者取代或未取代的杂芳基;
每个R2独立地为H,D,取代或未取代的C1-C6烷基,取代或未取代的C1-C6卤代烷基,取代或未取代的芳基,取代或未取代的单环杂芳基,-OR1,-N(R1)2,-CH2OR1,-C(=O)OR1,-OC(=O)R1,-C(=O)N(R1)2,或-NR1C(=O)R1
R3为-OR1,-N(R1)2,取代或未取代的C1-C6烷基,-CD3,取代或未取代的C1-C6卤代烷基,取代或未取代的C1-C6杂烷基,取代或未取代的C3-C8环烷基,取代或未取代的C2-C7杂环烷基,取代或未取代的芳基,或者取代或未取代的杂芳基;
R4为H,D,F,-CN,-OR1,-SR1,-N(R1)2,取代或未取代的C1-C6烷基,取代或未取代的C1-C6卤代烷基,取代或未取代的C1-C6杂烷基,取代或未取代的C1-C6亚烷基-OR1,取代或未取代的C3-C8环烷基,取代或未取代的C2-C7杂环烷基,取代或未取代的芳基,或者取代或未取代的杂芳基;
R5为H,D,F,-CN,-OR1,-SR1,-N(R1)2,取代或未取代的C1-C6烷基,取代或未取代的C1-C6卤代烷基,取代或未取代的C1-C6杂烷基,取代或未取代的C1-C6亚烷基-OR1,取代或未取代的C3-C8环烷基,取代或未取代的C2-C7杂环烷基,取代或未取代的芳基,或者取代或未取代的杂芳基;
Z为N或CR7;且R7为H,D,取代或未取代的C1-C6烷基,取代或未取代的C1-C6卤代烷基或-CH2OR1
a,b和c各自独立地选自0,1或2;
R11,R12,R13和R14各自独立地选自以下:H,F,OR1,取代或未取代的C1-6烷基,取代或未取代的C1-6氟代烷基,取代或未取代的C1-C6杂烷基,其中烷基任选地取代有羟基,氨基,甲氧基,取代或未取代的单-C1-6烷基氨基或者取代或未取代的二-C1-6烷基氨基;
R15,R16和R17各自独立地选自H,F,OR1,以及取代或未取代的C1-6烷基;或者
R11和R13,组合形成键或者取代或未取代的C1-3亚烷基;或者
R11和R15,组合形成取代或未取代的C1-3亚烷基;或者
R11和R17,组合形成取代或未取代的C1-3亚烷基;或者
R16和R17,组合形成键或者取代或未取代的C1-3亚烷基;或者
R13和R14,与它们所连接的碳原子组合形成螺环C3-8环烷基;或者
当Z为CR7时,则R16和R7,任选地与它们所连接的中间原子一起形成双键或者取代或未取代的C1-3亚烷基;或者
当Z为CR7且X为NR3时,则R3和R7任选地与它们所连接的中间原子一起以形成取代或未取代的C1-3亚烷基;或者
当Z为CR7且X为NR3时,则R3和R16任选地与它们所连接的中间原子一起以形成取代或未取代的C1-3亚烷基;或者
当Z为CR7且X为-CR4R5-时,则R7和R5任选地组合在一起以形成双键;并且
Y未W-L-V,其中
W为-C(=O)-,-S(=O)-,-S(=O)2-,-S(=O)(=NR1)-,-C(=O)O-,-C(=O)NR1-,-S(=O)NR1-,或-S(=O)2NR1-;
L不存在,为取代或未取代的C1-C4亚烷基,取代或未取代的C2-C4亚烯基,取代或未取代的C2-C4亚炔基,取代或未取代的C1-C4杂亚烷基,取代或未取代的C1-C4环亚烷基,取代或未取代的C1-C4杂环亚烷基,取代或未取代的亚芳基,或者取代或未取代的单环杂亚芳基,或其组合;并且
V为-CN,-OR1,-SR1,-S(=O)R1,-S(=O)2R1,-N(R1)2,-NR1S(=O)(=NR1)R2,-NR1S(=O)2R2,-S(=O)2N(R1)2,-C(=O)R1,-OC(=O)R1,-C(=O)OR1,-OC(=O)OR1,-C(=O)N(R1)2,-OC(=O)N(R1)2,-NR1C(=O)R1,取代或未取代的C1-C4烷基,取代或未取代的C1-C4氟代烷基,取代或未取代的C1-C4杂烷基,取代或未取代的C3-C8环烷基,取代或未取代的C2-C7杂环烷基,取代或未取代的芳基,或者取代或未取代的单环杂芳基。
对于任何和所有实施方式,从所列替代方案的子集中选择取代基。例如,在一些实施方式中,a为0,1或2。在其他实施方式中,a为0。在一些其他实施方式中,a为1。在一些其他实施方式中,a为2。
在一些其他实施方式中,为/> 在一些其他实施方式中,/>为/>在一些其他实施方式中,/>在一些其他实施方式中,/>为/>
在一些其他实施方式中,为/>
在一些实施方式中,Z为N。在一些实施方式中,Z为CR7
在一些实施方式中,X为-O-,-NR3-,-S-,-CR4R5-,-C(=O)-,-C(=C(R2)2)-,-S(=O)-,-S(=O)2-,或-S(=O)(=NR1)-。在一些实施方式中,X为-O-。在一些实施方式中,X为-NR3-。在一些实施方式中,X为-S-。在一些实施方式中,X为-CR4R5-。在一些实施方式中,X为-C(=O)-。在一些实施方式中,X为-C(=C(R2)2)-。在一些实施方式中,X为-S(=O)-。在一些实施方式中,X为-S(=O)2-。在一些实施方式中,X为-S(=O)(=NR1)-。
在一些实施方式中,X为-CH(CH2OR1)-或-CH(OR1)-。在一些实施方式中,X为-CH(CH2OR1)-。在一些实施方式中,X为-CH(OR1)-。
在一些实施方式中,R3为H,-OR1,-N(R1)2,取代或未取代的C1-C6烷基,取代或未取代的C1-C6卤代烷基,取代或未取代的C1-C6杂烷基,取代或未取代的C3-C8环烷基,或者取代或未取代的C2-C7杂环烷基。
在一些实施方式中,R3为-OR1,-N(R1)2,取代或未取代的C1-C6烷基,取代或未取代的C1-C6卤代烷基,取代或未取代的C1-C6杂烷基,取代或未取代的C3-C8环烷基,或者取代或未取代的C2-C7杂环烷基。
在一些实施方式中,环Q为取代或未取代的单环芳基。在一些实施方式中,环Q为取代的单环芳基。在一些实施方式中,环Q为未取代的单环芳基。
在一些实施方式中,环Q为取代的苯基。在一些实施方式中,环Q为被以下取代的2-羟基-苯基:0、1、2或3个独立选自以下的取代基:C1-6烷基,氧代,肟,羟基,卤代-C1-6烷基,二卤代-C1-6烷基,三卤代-C1-6烷基,C1-6烷氧基,C1-6烷氧基-C3-7环烷基,卤代-C1-6烷氧基,二卤代-C1-6烷氧基,三卤代-C1-6烷氧基,羟基,氰基,卤素,氨基,单-C1-6烷基氨基,二-C1-6烷基氨基,杂芳基,羟基取代的C1-6烷基,芳基取代的C1-6烷氧基,氨基,-C(=O)NH-C1-6烷基-杂芳基,-NHC(=O)-C1-6烷基杂芳基,C1-6烷基-C(=O)NH-杂芳基,C1-6烷基-NHC(=O)-杂芳基,C3-7环烷基,5-7元环烯基或者含有1或2个独立选自S、O和N的杂原子的5、6或9元杂环。
在一些实施方式中,环Q为被两个C1-6烷基取代的2-羟基-苯基。在一些实施方式中,两个C1-6烷基可以与它们所键合的原子组合以形成5-6元环。
在一些实施方式中,环Q为被杂芳基取代的2-羟基-苯基。在一些实施方式中,杂芳基具有5、6、9或10个环原子,1、2或3个选自N、O和S的环杂原子,并被0、1或2个独立选自以下的取代基取代:氧代,羟基,硝基,卤素,C1-6烷基,C1-6烯基,C1-6烷氧基,C3-7环烷基,C1-6烷基-OH,三卤代-C1-6烷基,单-C1-6烷基氨基,二-C1-6烷基氨基,-C(=O)NH2,-NH2,-NO2,羟基-C1-6烷基氨基,羟基-C1-6烷基,4-7元杂环-C1-6烷基,氨基-C1-6烷基,单-C1-6烷基氨基-C1-6烷基,和二-C1-6烷基氨基-C1-6烷基。
在一些实施方式中,环Q为其中环P为芳基或杂芳基。在一些实施方式中,环Q为/>其中环P为芳基。在一些实施方式中,环Q为其中环P为杂芳基。
在一些实施方式中,环Q为其中环P为杂芳基,其中所述杂芳基选自以下:/>
其中
每个RB独立地选自氰基,卤素,羟基,取代或未取代的C1-6烷基,-OCH3,OCD3,取代或未取代的C2-6烯基,取代或未取代的C2-6炔基,取代或未取代的C1-6烷氧基,取代或未取代的C3-7环烷基,取代或未取代的C2-8杂环烷基,杂芳基,取代或未取代的杂环烷基-C1-6烷基,取代或未取代的C1-6烷基-芳基,取代或未取代的C1-6烷基-杂环烷基,取代或未取代的C1-6烷基-杂芳基,取代或未取代的C1-6烷氧基-芳基,取代或未取代的C1-6烷氧基-杂环烷基,取代或未取代的C1-6烷氧基-杂芳基,和羟基取代的C1-6烷氧基,C1-6烷氧基,氨基,单-C1-6烷基氨基和二-C1-6烷基氨基;并且m为0,1,2或3。
在一些实施方式中,环Q为在一些实施方式中,环Q为在一些实施方式中,环Q为/>在一些实施方式中,环Q为在一些实施方式中,环Q为/>在一些实施方式中,环Q为在一些实施方式中,环Q为/>在一些实施方式中,环Q为/>在一些实施方式中,环Q为/>在一些实施方式中,环Q为/>在一些实施方式中,环Q为/>在一些实施方式中,环Q为/>
在一些实施方式中,环Q为在一些实施方式中,环Q为在一些实施方式中,环Q为/>在一些实施方式中,环Q为在一些实施方式中,环Q为/>在一些实施方式中,环Q为/>在一些实施方式中,环Q为/>在一些实施方式中,环Q为/>在一些实施方式中,环Q为/>
在一些实施方式中,环Q为2-萘基,其任选地在3位取代有羟基,并另外经0、1或2个选自以下的取代基取代:羟基,氰基,卤素,C1-6烷基,C2-6烯基,C1-6烷氧基,其中所述烷氧基被未取代的或取代有羟基,C1-6烷氧基,氨基,-NHC(=O)-C1-6烷基,-NHC(=O)-C1-6烷基,C1-6亚烷基-4-7元杂环,4-7元杂环,单-C1-6烷基氨基,和二-C1-6烷基氨基。
在一些实施方式中,环Q为在一些实施方式中,环Q为/>
在一些实施方式中,环Q为或/>并且每个R6独立地为H,-OR1,-N(R1)2,取代或未取代的C1-C6烷基,取代或未取代的C1-C6卤代烷基,取代或未取代的C1-C6杂烷基,取代或未取代的C3-C8环烷基,取代或未取代的C2-C7杂环烷基,取代或未取代的芳基,或者取代或未取代的杂芳基;或者两个R6与它们所连接的N原子一起以形成取代或未取代的C2-C6杂环烷基。在一些实施方式中,每个R6独立地为H,取代或未取代的C1-C6烷基,取代或未取代的C1-C6杂烷基,或者取代或未取代的C3-C8环烷基。在一些实施方式中,每个R6独立地为H,取代或未取代的C1-C4烷基,或者取代或未取代的C3-C6环烷基。
在一些实施方式中,环Q为单环杂芳基或稠合双环杂芳基。
在一些实施方式中,环Q为具有1-4个环氮原子的5或6元单环杂芳基,并且其被苯基或杂芳基取代,所述杂芳基具有5或6个环原子,1或2个独立选自N、O和S的环杂原子,并且其被0、1或2个独立选自以下的取代基取代:氰基,C1-6烷基,单-C1-6烷基氨基,二-C1-6烷基氨基,羟基-C1-6烷基氨基,羟基-C1-6烷基,氨基-C1-6烷基和单-C1-6烷基氨基-C1-6烷基,和二-C1-6烷基氨基-C1-6烷基。
在一些实施方式中,环Q为选自以下的5元单环杂芳基:
其中
每个RB独立地选自氰基,卤素,羟基,取代或未取代的C1-6烷基,-OCH3,-OCD3,取代或未取代的C2-6烯基,取代或未取代的C2-6炔基,取代或未取代的C1-6烷氧基,取代或未取代的C3-7环烷基,取代或未取代的C2-8杂环烷基,杂芳基,取代或未取代的杂环烷基-C1-6烷基,取代或未取代的C1-6烷基-芳基,取代或未取代的C1-6烷基-杂环烷基,取代或未取代的C1-6烷基-杂芳基,取代或未取代的C1-6烷氧基-芳基,取代或未取代的C1-6烷氧基-杂环烷基,取代或未取代的C1-6烷氧基-杂芳基,和羟基取代的C1-6烷氧基,C1-6烷氧基,氨基,单-C1-6烷基氨基和二-C1-6烷基氨基;并且m为0,1,2或3。
在一些实施方式中,环Q为选自以下的6元单环杂芳基:
其中
每个RB独立地选自氰基,卤素,羟基,取代或未取代的C1-6烷基,-OCH3,-OCD3,取代或未取代的C2-6烯基,取代或未取代的C2-6炔基,取代或未取代的C1-6烷氧基,取代或未取代的C3-7环烷基,取代或未取代的C2-8杂环烷基,杂芳基,取代或未取代的杂环烷基-C1-6烷基,取代或未取代的C1-6烷基-芳基,取代或未取代的C1-6烷基-杂环烷基,取代或未取代的C1-6烷基-杂芳基,取代或未取代的C1-6烷氧基-芳基,取代或未取代的C1-6烷氧基-杂环烷基,取代或未取代的C1-6烷氧基-杂芳基,和羟基取代的C1-6烷氧基,C1-6烷氧基,氨基,单-C1-6烷基氨基和二-C1-6烷基氨基;并且m为0,1,2或3。
在一些实施方式中,环Q为具有8至10个环原子,1、2或3个独立选自N、O或S的环杂原子的稠合双环杂芳基,并且其被0、1或2个独立选自以下的取代基取代:氰基,肟,卤素,羟基,C1-6烷基,C24烯基,C24炔基,C1-6烷氧基,羟基取代的C1-6烷氧基,氨基,单-C1-6烷基氨基,和二-C1-6烷基氨基。
在一些实施方式中,环Q为6-5稠合杂芳基,6-6稠合杂芳基,5-6稠合杂芳基,5-5稠合杂芳基,7-5稠合杂芳基或5-7稠合杂芳基.
在一些实施方式中,环Q为6-5稠合杂芳基,6-6稠合杂芳基或5-6稠合杂芳基,其选自以下:
其中
每个RB独立地选自氰基,卤素,羟基,取代或未取代的C1-6烷基,-OCH3,-OCD3,取代或未取代的C2-6烯基,取代或未取代的C2-6炔基,取代或未取代的C1-6烷氧基,取代或未取代的C3-7环烷基,取代或未取代的C2-8杂环烷基,杂芳基,取代或未取代的杂环烷基-C1-6烷基,取代或未取代的C1-6烷基-芳基,取代或未取代的C1-6烷基-杂环烷基,取代或未取代的C1-6烷基-杂芳基,取代或未取代的C1-6烷氧基-芳基,取代或未取代的C1-6烷氧基-杂环烷基,取代或未取代的C1-6烷氧基-杂芳基,和羟基取代的C1-6烷氧基,C1-6烷氧基,氨基,单-C1-6烷基氨基和二-C1-6烷基氨基;并且m为1,2或3。
在一些实施方式中,环Q为 并且每个R6独立地为H,-OR1,-N(R1)2,取代或未取代的C1-C6烷基,取代或未取代的C1-C6卤代烷基,取代或未取代的C1-C6杂烷基,取代或未取代的C3-C8环烷基,取代或未取代的C2-C7杂环烷基,取代或未取代的芳基,或者取代或未取代的杂芳基;或者两个R6与它们所连接的N原子一起以形成取代或未取代的C2-C6杂环烷基。在一些实施方式中,每个R6独立地为H,取代或未取代的C1-C6烷基,取代或未取代的C1-C6杂烷基,或者取代或未取代的C3-C8环烷基。在一些实施方式中,每个R6独立地为H,取代或未取代的C1-C4烷基,或者取代或未取代的C3-C6环烷基。
在一些实施方式中,Z为CR7且X为-NR3-,-CR4R5-,-C(=O)-,-S-,或-O-。在一些实施方式中,Z为CR7且X为-NR3-。在一些实施方式中,Z为CR7且X为-CR4R5-。在一些实施方式中,Z为CR7且X为-C(=O)-。在一些实施方式中,Z为CR7且X为-S-。在一些实施方式中,Z为CR7且X为-O-。
在一些实施方式中,Z为CR7且X为-NR3-。
在一些实施方式中,每个R7独立地为H,D,取代或未取代的C1-C6烷基,取代或未取代的C1-C6卤代烷基,或-CH2OR1
在一些实施方式中,R3为-OR1,取代或未取代的C1-C6卤代烷基,取代或未取代的C1-C6杂烷基,或者取代或未取代的C3-C8环烷基。在一些实施方式中,R3为-OR1。在一些实施方式中,R3为取代或未取代的C1-C6卤代烷基。在一些实施方式中,R3为取代或未取代的C1-C6杂烷基。在一些实施方式中,R3为取代或未取代的C3-C8环烷基。在一些实施方式中,R3为-CD3
在一些实施方式中,R3为环丙基。在一些实施方式中,R3为环丁基。在一些实施方式中,R3为环戊基。在一些实施方式中,R3为环己基。在一些实施方式中,R3为环庚基。在一些实施方式中,R3为环辛基。
在一些实施方式中,R3为环戊烯基。在一些实施方式中,R3为环己烯基。在一些实施方式中,R3为环庚烯基。在一些实施方式中,R3为环辛烯基。
在一些实施方式中,R3为-CF3,-CH2CH2F,-CH2CF3,或-CH2CH2CH2F。在一些实施方式中,R3为-CF3。在一些实施方式中,R3为-CH2CH2F。在一些实施方式中,R3为-CH2CF3。在一些实施方式中,R3为-CH2CH2CH2F。
在一些实施方式中,R3为-OCH3。在一些实施方式中,R3为-OCH2CH3。在一些实施方式中,R3为-OCH2CH2OH。在一些实施方式中,R3为-CH2CH2OCH3。在一些实施方式中,R3为-OCH2CH2OCH3
在一些实施方式中,为/>在一些实施方式中,/>为/>在一些实施方式中,/>
在一些实施方式中,为/> 在一些实施方式中,/>为/>在一些实施方式中,为/>在一些实施方式中,/>为/>在一些实施方式中,p为1或2。在一些实施方式中,p为1。在一些实施方式中,p为2。
在一些实施方式中,为/> 其中
每个RC独立地选自D,F,-CN,-OH,-OR1,-SR1,-S(=O)R1,-S(=O)2R1,-N(R1)2,-CH2-N(R1)2,-NHS(=O)2R1,-S(=O)2N(R1)2,-C(=O)R1,-OC(=O)R1,-CO2R1,-OCO2R1,-C(=O)N(R1)2,-OC(=O)N(R1)2,-NR1C(=O)N(R1)2,-NR1C(=O)R1,-NR1C(=O)OR1,取代或未取代的C1-C6烷基,取代或未取代的C1-C6卤代烷基,取代或未取代的C1-C6杂烷基,取代或未取代的C3-C8环烷基,以及取代或未取代的C2-C8杂环烷基;并且q为0,1,2,3,4,5或6。
在一些实施方式中,为/>在一些实施方式中,/>为/>在一些实施方式中,/>为/>
在一些实施方式中,为/>
在一些实施方式中,为/>
在一些实施方式中,Y为-C(=O)(CH2)yNH2,-S(=O)(CH2)yNH2,或-S(=O)2(CH2)yNH2,其中y为0,1或2。在一些实施方式中,Y为-C(=O)NH2。在一些实施方式中,Y为-C(=O)CH2NH2。在一些实施方式中,Y为-C(=O)CH2CH2NH2。在一些实施方式中,Y为-S(=O)NH2。在一些实施方式中,Y为-S(=O)CH2NH2。在一些实施方式中,Y为-S(=O)CH2CH2NH2。在一些实施方式中,Y为-S(=O)2NH2。在一些实施方式中,Y为-S(=O)2CH2NH2。在一些实施方式中,Y为-S(=O)2CH2CH2NH2
在一些实施方式中,Y为-C(=O)(CH2)yCH=CH2或-C(=O)(CH2)yC≡CH,其中y为0,1或2。在一些实施方式中,Y为-C(=O)CH=CH2。在一些实施方式中,Y为-C(=O)CH2CH=CH2。在一些实施方式中,Y为-C(=O)CH2CH2CH=CH2。在一些实施方式中,Y为-C(=O)CH≡CH2。在一些实施方式中,Y为-C(=O)CH2CH≡CH2。在一些实施方式中,Y为-C(=O)CH2CH2CH≡CH2
在一些实施方式中,Y为在一些实施方式中,Y为/>在一些实施方式中,Y为/>
在一些实施方式中,Y为其中y为0,1或2。
在一些实施方式中,Y为
在一些实施方式中,Y为
在一些实施方式中,Y为
在一些实施方式中,Y为其中y为0,1或2。
在一些实施方式中,在一些实施方式中,Y为或/>
在一些实施方式中,在一些实施方式中,Y为或/>
在一些实施方式中,Y为
在一些实施方式中,式(III)的化合物选自表1A,表1B或表1C中的化合物。
一方面,本文描述了具有式(IV)结构的化合物或其药学上可接受的盐或溶剂化物:
其中,
每个A独立地为N或CRA
每个RA独立地选自H,D,卤素,-CN,-OH,-OR1,=O,=N-OR1,-SR1,-S(=O)R1,-S(=O)2R1,-N(R1)2,-NR1S(=O)(=NR1)R2,-NR1S(=O)2R2,-S(=O)2N(R1)2,-C(=O)R1,-OC(=O)R1,-C(=O)OR1,-OC(=O)OR1,-C(=O)N(R1)2,-OC(=O)N(R1)2,-NR1C(=O)R1,-P(=O)(R2)2,取代或未取代的C1-C6烷基,取代或未取代的C1-C6卤代烷基,取代或未取代的C1-C6杂烷基,取代或未取代的C3-C8环烷基,取代或未取代的C2-C7杂环烷基,取代或未取代的芳基,以及取代或未取代的单环杂芳基;
环Q为单环芳基,双环芳基,单环杂芳基或稠合双环杂芳基;
X为-O-,-NR3-,-CR4R5-,-C(=O)-,-C(=CR2 2)-,-S-,-S(=O)-,-S(=O)2-,或-S(=O)(=NR1)-;
每个R1独立地为H,D,取代或未取代的C1-C6烷基,取代或未取代的C1-C6卤代烷基,取代或未取代的C1-C6杂烷基,取代或未取代的C3-C8环烷基,取代或未取代的C2-C7杂环烷基,取代或未取代的芳基,或者取代或未取代的杂芳基;
每个R2独立地为H,D,取代或未取代的C1-C6烷基,取代或未取代的C1-C6卤代烷基,取代或未取代的芳基,取代或未取代的单环杂芳基,-OR1,-N(R1)2,-CH2OR1,-C(=O)OR1,-OC(=O)R1,-C(=O)N(R1)2,或-NR1C(=O)R1
R3为H,-OR1,-N(R1)2,取代或未取代的C1-C6烷基,-CD3,取代或未取代的C1-C6卤代烷基,取代或未取代的C1-C6杂烷基,取代或未取代的C3-C8环烷基,取代或未取代的C2-C7杂环烷基,取代或未取代的芳基,或者取代或未取代的杂芳基;
R4为H,D,F,-CN,-OR1,-SR1,-N(R1)2,取代或未取代的C1-C6烷基,取代或未取代的C1-C6卤代烷基,取代或未取代的C1-C6杂烷基,取代或未取代的C1-C6亚烷基-OR1,取代或未取代的C3-C8环烷基,取代或未取代的C2-C7杂环烷基,取代或未取代的芳基,或者取代或未取代的杂芳基;
R5为H,D,F,-CN,-OR1,-SR1,-N(R1)2,取代或未取代的C1-C6烷基,取代或未取代的C1-C6卤代烷基,取代或未取代的C1-C6杂烷基,取代或未取代的C1-C6亚烷基-OR1,取代或未取代的C3-C8环烷基,取代或未取代的C2-C7杂环烷基,取代或未取代的芳基,或者取代或未取代的杂芳基;或者
R4和R5与它们所连接的碳原子组合形成取代或未取代的C3-8环烷基或者取代或未取代的C2-7杂环烷基;
Z为CR7;且R7为H,D,取代或未取代的C1-C6烷基,取代或未取代的C1-C6卤代烷基或-CH2OR1
W为取代或未取代的C1-C4亚烷基,取代或未取代的C2-C4亚烯基,或者取代或未取代的C1-C4杂亚烷基;
R选自H,取代或未取代的C1-6烷基,取代或未取代的C1-6氟代烷基,取代或未取代的C1-C6杂烷基,取代或未取代的C3-C8环烷基,取代或未取代的C2-C7杂环烷基,取代或未取代的芳基,和取代或未取代的杂芳基,其中烷基任选取代有羟基,氨基,取代或未取代的单-C1-6烷基氨基,或者取代或未取代的二-C1-6烷基氨基;
R11,R12,R13,R14,R15,R16,R17和R18各自独立地选自H,F,OR1,取代或未取代的C1-6烷基,取代或未取代的C1-6氟代烷基,取代或未取代的C1-C6杂烷基,其中烷基任选取代有羟基,氨基,甲氧基,取代或未取代的单-C1-6烷基氨基或者取代或未取代的二-C1-6烷基氨基;
R11和R13,组合形成取代或未取代的C1-3亚烷基或者取代或未取代的C1-3杂亚烷基;或者
R11和R15,组合形成取代或未取代的C1-3亚烷基;或者
R16和R17,组合形成取代或未取代的C1-3亚烷基;或者
R13和R14,与它们所连接的碳原子组合形成螺环C3-8环烷基;或者
R17和R2,组合形成取代或未取代的C1-3亚烷基;或者
当X为-NR3-时,则R3和R2任选地与它们所连接的中间原子一起形成4,5或6-元环;或者
当X为-NR3-时,则R3和R16任选地与它们所连接的中间原子一起形成4,5或6-元环;
a和b各自独立地选自0,1,2或3;
c和d各自独立地选自1,2,3或4;并且
其中式(IV)化合物具有至少80%的立体化学纯度。
对于任何和所有实施方式,从所列替代方案的子集中选择取代基。例如,在一些实施方式中,a为0,1或2。在其他实施方式中,a为0。在一些其他实施方式中,a为1。在一些其他实施方式中,a为2。
在一些实施方式中,W为取代或未取代的C1-C4亚烷基。
在一些实施方式中,为/>
在一些实施方式中,为/>在一些实施方式中,/>为/>在一些实施方式中,/>为/>
在一些实施方式中,X为-O-,-NR3-,-S-,-CR4R5-,-C(=O)-,或-C(=CR2 2)-。在一些实施方式中,X为-O-,-NR3-,或-C(=O)-。在一些实施方式中,X为-O-。在一些实施方式中,X为-NR3-。在一些实施方式中,X为-S-。在一些实施方式中,X为-CR4R5-。在一些实施方式中,X为-C(=O)-。在一些实施方式中,X为-C(=CR2 2)-。
在一些实施方式中,X为-CH(CH2OR1)-或-CH(OR1)-。在一些实施方式中,X为-CH(CH2OR1)-。在一些实施方式中,X为-CH(OR1)-。
在一些实施方式中,R3为H,-OR1,-N(R1)2,取代或未取代的C1-C6烷基,取代或未取代的C1-C6卤代烷基,取代或未取代的C1-C6杂烷基,取代或未取代的C3-C8环烷基,或者取代或未取代的C2-C7杂环烷基。
在一些实施方式中,R3为-OR1,-N(R1)2,取代或未取代的C1-C6烷基,取代或未取代的C1-C6卤代烷基,取代或未取代的C1-C6杂烷基,取代或未取代的C3-C8环烷基,或者取代或未取代的C2-C7杂环烷基。
在一些实施方式中,环Q为取代或未取代的单环芳基。在一些实施方式中,环Q为取代的单环芳基。在一些实施方式中,环Q为未取代的单环芳基。
在一些实施方式中,环Q为取代的苯基。在一些实施方式中,环Q为被以下取代的2-羟基-苯基:0,1,2或3个独立选自以下的取代基:C1-6烷基,氧代,肟,羟基,卤代-C1-6烷基,二卤代-C1-6烷基,三卤代-C1-6烷基,C1-6烷氧基,C1-6烷氧基-C3-7环烷基,卤代-C1-6烷氧基,二卤代-C1-6烷氧基,三卤代-C1-6烷氧基,羟基,氰基,卤素,氨基,单-C1-6烷基氨基,二-C1-6烷基氨基,杂芳基,羟基取代的C1-6烷基,芳基取代的C1-6烷氧基,氨基,-C(=O)NH-C1-6烷基-杂芳基,-NHC(=O)-C1-6烷基杂芳基,C1-6烷基-C(=O)NH-杂芳基,C1-6烷基-NHC(=O)-杂芳基,C3-7环烷基,5-7元环烯基或者含有1或2个独立选自S、O和N的杂原子的5、6或9元杂环。
在一些实施方式中,环Q为被两个C1-6烷基取代的2-羟基-苯基。在一些实施方式中,两个C1-6烷基可以与它们所键合的原子组合以形成5-6元环。
在一些实施方式中,环Q为被杂芳基取代的2-羟基-苯基。在一些实施方式中,杂芳基具有5、6、9或10个环原子,1、2或3个选自N、O和S的环杂原子,并被0、1或2个独立选自以下的取代基取代:氧代,羟基,硝基,卤素,C1-6烷基,C1-6烯基,C1-6烷氧基,C3-7环烷基,C1-6烷基-OH,三卤代-C1-6烷基,单-C1-6烷基氨基,二-C1-6烷基氨基,-C(=O)NH2,-NH2,-NO2,羟基-C1-6烷基氨基,羟基-C1-6烷基,4-7元杂环-C1-6烷基,氨基-C1-6烷基,单-C1-6烷基氨基-C1-6烷基,和二-C1-6烷基氨基-C1-6烷基。
在一些实施方式中,环Q为其中环P为芳基或杂芳基。在一些实施方式中,环Q为/>其中环P为芳基。在一些实施方式中,环Q为/>其中环P为杂芳基。在一些实施方式中,环Q为/>其中环P为芳基或杂芳基。在一些实施方式中,环Q为/>其中环P为芳基。在一些实施方式中,环Q为/>其中环P为杂芳基。在一些实施方式中,环P为杂芳基,且所述杂芳基选自以下:
其中
每个RB独立地选自氰基,卤素,羟基,取代或未取代的C1-6烷基,-OCH3,-OCD3,取代或未取代的C2-6烯基,取代或未取代的C2-6炔基,取代或未取代的C1-6烷氧基,取代或未取代的C3-7环烷基,取代或未取代的C2-8杂环烷基,杂芳基,取代或未取代的杂环烷基-C1-6烷基,取代或未取代的C1-6烷基-芳基,取代或未取代的C1-6烷基-杂环烷基,取代或未取代的C1-6烷基-杂芳基,取代或未取代的C1-6烷氧基-芳基,取代或未取代的C1-6烷氧基-杂环烷基,取代或未取代的C1-6烷氧基-杂芳基,和羟基取代的C1-6烷氧基,C1-6烷氧基,氨基,单-C1-6烷基氨基和二-C1-6烷基氨基;并且m为0,1,2或3。
在一些实施方式中,环P为选自以下的杂芳基:
在一些实施方式中,环P为选自以下的杂芳基:
在一些实施方式中,环P为选自以下的杂芳基:
在一些实施方式中,环P为选自以下的杂芳基:
在一些实施方式中,环Q为在一些实施方式中,环Q为在一些实施方式中,环Q为/>在一些实施方式中,环Q为/>在一些实施方式中,环Q为/>在一些实施方式中,环Q为/>在一些实施方式中,环Q为/>在一些实施方式中,环Q为/>在一些实施方式中,环Q为/>在一些实施方式中,环Q为/>在一些实施方式中,环Q为/>在一些实施方式中,环Q为/>
在一些实施方式中,环Q为在一些实施方式中,环Q为在一些实施方式中,环Q为/>在一些实施方式中,环Q为/>在一些实施方式中,环Q为/>在一些实施方式中,环Q为/>在一些实施方式中,环Q为/>在一些实施方式中,环Q为/>在一些实施方式中,环Q为/>在一些实施方式中,环Q为/>在一些实施方式中,环Q为/>
在一些实施方式中,环Q为2-萘基,其任选地在3位被羟基取代,并另外被选自以下的0、1或2个取代基取代:羟基,氰基,卤素,C1-6烷基,C2-6烯基,C1-6烷氧基,其中所述烷氧基是未取代的或取代有羟基,C1-6烷氧基,氨基,-NHC(=O)-C1-6烷基,-NHC(=O)-C1-6烷基,C1-6亚烷基-4-7元杂环,4-7元杂环,单-C1-6烷基氨基,和二-C1-6烷基氨基。
在一些实施方式中,环Q为在一些实施方式中,环Q为
在一些实施方式中,环Q为 并且每个R6独立地为H,-OR1,-N(R1)2,取代或未取代的C1-C6烷基,取代或未取代的C1-C6卤代烷基,取代或未取代的C1-C6杂烷基,取代或未取代的C3-C8环烷基,取代或未取代的C2-C7杂环烷基,取代或未取代的芳基,或者取代或未取代的杂芳基;或者两个R6与它们所连接的N原子一起以形成取代或未取代的C2-C6杂环烷基。在一些实施方式中,每个R6独立地为H,取代或未取代的C1-C6烷基,取代或未取代的C1-C6杂烷基,或者取代或未取代的C3-C8环烷基。在一些实施方式中,每个R6独立地为H,取代或未取代的C1-C4烷基,或者取代或未取代的C3-C6环烷基。
在一些实施方式中,环Q为单环杂芳基或稠合双环杂芳基。
在一些实施方式中,环Q为具有1-4个环氮原子的5或6元单环杂芳基,并且其被苯基或杂芳基取代,所述杂芳基具有5或6个环原子,1或2个独立选自N、O和S的环杂原子,并且其被0、1或2个独立选自以下的取代基取代:氰基,C1-6烷基,单-C1-6烷基氨基,二-C1-6烷基氨基,羟基-C1-6烷基氨基,羟基-C1-6烷基,氨基-C1-6烷基和单-C1-6烷基氨基-C1-6烷基,和二-C1-6烷基氨基-C1-6烷基。
在一些实施方式中,环Q为选自以下的5元单环杂芳基:
其中/>
每个RB独立地选自氰基,卤素,羟基,取代或未取代的C1-6烷基,-OCH3,-OCD3,取代或未取代的C2-6烯基,取代或未取代的C2-6炔基,取代或未取代的C1-6烷氧基,取代或未取代的C3-7环烷基,取代或未取代的C2-8杂环烷基,杂芳基,取代或未取代的杂环烷基-C1-6烷基,取代或未取代的C1-6烷基-芳基,取代或未取代的C1-6烷基-杂环烷基,取代或未取代的C1-6烷基-杂芳基,取代或未取代的C1-6烷氧基-芳基,取代或未取代的C1-6烷氧基-杂环烷基,取代或未取代的C1-6烷氧基-杂芳基,和羟基取代的C1-6烷氧基,C1-6烷氧基,氨基,单-C1-6烷基氨基和二-C1-6烷基氨基;并且m为0,1,2或3。
在一些实施方式中,环Q为选自以下的6元单环杂芳基:
其中
每个RB独立地选自氰基,卤素,羟基,取代或未取代的C1-6烷基,-OCH3,-OCD3,取代或未取代的C2-6烯基,取代或未取代的C2-6炔基,取代或未取代的C1-6烷氧基,取代或未取代的C3-7环烷基,取代或未取代的C2-8杂环烷基,杂芳基,取代或未取代的杂环烷基-C1-6烷基,取代或未取代的C1-6烷基-芳基,取代或未取代的C1-6烷基-杂环烷基,取代或未取代的C1-6烷基-杂芳基,取代或未取代的C1-6烷氧基-芳基,取代或未取代的C1-6烷氧基-杂环烷基,取代或未取代的C1-6烷氧基-杂芳基,和羟基取代的C1-6烷氧基,C1-6烷氧基,氨基,单-C1-6烷基氨基和二-C1-6烷基氨基;并且m为0,1,2或3。
在一些实施方式中,环Q为具有8至10个环原子,1、2或3个独立选自N、O或S的环杂原子的稠合双环杂芳基,并且其被0、1或2个独立选自以下的取代基取代:氰基,肟,卤素,羟基,C1-6烷基,C24烯基,C24炔基,C1-6烷氧基,羟基取代的C1-6烷氧基,氨基,单-C1-6烷基氨基,和二-C1-6烷基氨基。
在一些实施方式中,环Q为为6-5稠合杂芳基,6-6稠合杂芳基,5-6稠合杂芳基,5-5稠合杂芳基,7-5稠合杂芳基或5-7稠合杂芳基。
在一些实施方式中,环Q为6-5稠合杂芳基,6-6稠合杂芳基或5-6稠合杂芳基,其选自以下:
/>
其中
每个RB独立地选自氰基,卤素,羟基,取代或未取代的C1-6烷基,-OCH3,-OCD3,取代或未取代的C2-6烯基,取代或未取代的C2-6炔基,取代或未取代的C1-6烷氧基,取代或未取代的C3-7环烷基,取代或未取代的C2-8杂环烷基,杂芳基,取代或未取代的杂环烷基-C1-6烷基,取代或未取代的C1-6烷基-芳基,取代或未取代的C1-6烷基-杂环烷基,取代或未取代的C1-6烷基-杂芳基,取代或未取代的C1-6烷氧基-芳基,取代或未取代的C1-6烷氧基-杂环烷基,取代或未取代的C1-6烷氧基-杂芳基,和羟基取代的C1-6烷氧基,C1-6烷氧基,氨基,单-C1-6烷基氨基和二-C1-6烷基氨基;并且m为1,2或3。
在一些实施方式中,环Q为/>并且每个R6独立地为H,-OR1,-N(R1)2,取代或未取代的C1-C6烷基,取代或未取代的C1-C6卤代烷基,取代或未取代的C1-C6杂烷基,取代或未取代的C3-C8环烷基,取代或未取代的C2-C7杂环烷基,取代或未取代的芳基,或者取代或未取代的杂芳基;或者两个R6与它们所连接的N原子一起以形成取代或未取代的C2-C6杂环烷基。在一些实施方式中,每个R6独立地为H,取代或未取代的C1-C6烷基,取代或未取代的C1-C6杂烷基,或者取代或未取代的C3-C8环烷基。在一些实施方式中,每个R6独立地为H,取代或未取代的C1-C4烷基,或者取代或未取代的C3-C6环烷基。
在一些实施方式中,X为-NR3-。
在一些实施方式中,R3为-OR1,取代或未取代的C1-C6烷基,取代或未取代的C1-C6卤代烷基,取代或未取代的C1-C6杂烷基,或者取代或未取代的C3-C8环烷基。
在一些实施方式中,R3为-OR1。在一些实施方式中,R3为-OCH3,-OCH2CH3,-OCH2CH2OH或-OCH2CH2OCH3。在一些实施方式中,R3为-OCH3。在一些实施方式中,R3为-OCH2CH3。在一些实施方式中,R3为-OCH2CH2CH3。在一些实施方式中,R3为-OCH(CH3)2。在一些实施方式中,R3为-OCD3
在一些实施方式中,R3为-CD3
在一些实施方式中,R3为取代或未取代的C1-C6卤代烷基。在一些实施方式中,R3为CF3。在一些实施方式中,R3为-CH2CH2F。在一些实施方式中,R3为-CH2CH2CH2F。在一些实施方式中,R3为-CH2CF3。在一些实施方式中,R3为-CH2CH2CF3
在一些实施方式中,R3为-CH3或-CF3
在一些实施方式中,R3为取代或未取代的C1-C6杂烷基。在一些实施方式中,R3为-OCH2CH2OCH3或-OCH2CH2OCF3。在一些实施方式中,R3为-CH2CH2OCH3
在一些实施方式中,R3为取代或未取代的C3-C8环烷基。在一些实施方式中,R3为环丙基,环丁基,环戊基,环己基,环庚基或环辛基。在一些实施方式中,R3为环丙基,环丁基,环戊基或环己基。在一些实施方式中,R3为环丙基。在一些实施方式中,R3为环丁基。在一些实施方式中,R3为环戊基。在一些实施方式中,R3为环己基。
在一些实施方式中,R3为环戊烯基,环己烯基,环庚烯基或环辛烯基。在一些实施方式中,R3为环戊烯基或环己烯基。在一些实施方式中,R3为环戊烯基。在一些实施方式中,R3为环己烯基。
在一些实施方式中,为/>其中p为1,2或3。/>
在一些实施方式中,为/>其中p为1,2或3。在一些实施方式中,R为H;R15和R18为H;且p为2或3。在一些实施方式中,R为H;R15和R18为H;且p为2。在一些实施方式中,R为H;R15和R18为H;且p为3。在一些实施方式中,R为H;R15和R18为CH3;且p为2或3。在一些实施方式中,R为H;R15和R18为CH3;且p为2。在一些实施方式中,R为H;R15和R18为CH3;且p为3。
在一些优选实施方式中,X位于的平伏位(equatorial position)。
在一些实施方式中,为/>在一些实施方式中,/>在一些实施方式中,/>为/>在一些实施方式中,为/>
在一些优选实施方式中,X位于的平伏位。在一些其他优选实施方式中,/>具有结构/>
在一些优选实施方式中,X位于的平伏位。在一些其他优选实施方式中,/>具有结构/>/>
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在一些实施方式中,为/>
在一些优选实施方式中,X位于的平伏位。
在一些实施方式中,为/>其中
R19为H,D,-CN,-OH,-OR1,-SR1,-S(=O)R1,-S(=O)2R1,-CH2-N(R1)2,-S(=O)2N(R1)2,-C(=O)R1,-CO2R1,-C(=O)N(R1)2,取代或未取代的C1-C6烷基,取代或未取代的C1-C6卤代烷基,取代或未取代的C1-C6杂烷基,取代或未取代的C3-C8环烷基,或者取代或未取代的C2-C8杂环烷基。
在一些优选实施方式中,X位于的平伏位。
在一些实施方式中,式(IV)化合物不是外消旋的。在一些优选实施方式中,式(IV)化合物基本上不含其他异构体。在一些优选实施方式中,式(IV)化合物基本上不含其他异构体。在一些优选实施方式中,式(IV)化合物包含25%或更少的其他异构体。在一些优选实施方式中,式(IV)化合物包含20%或更少的其他异构体。在一些优选实施方式中,式(IV)化合物包含15%或更少的其他异构体。在一些优选实施方式中,式(IV)化合物包含10%或更少的其他异构体。在一些优选实施方式中,式(IV)化合物包含5%或更少的其他异构体。在一些优选实施方式中,式(IV)化合物包含1%或更少的其他异构体。
在一些优选实施方式中,式(IV)化合物具有至少75%的立体化学纯度。在一些优选实施方式中,式(IV)化合物具有至少80%的立体化学纯度。在一些优选实施方式中,式(IV)化合物具有至少85%的立体化学纯度。在一些优选实施方式中,式(IV)化合物具有至少90%的立体化学纯度。在一些优选实施方式中,式(IV)化合物具有至少95%的立体化学纯度。在一些优选实施方式中,式(IV)化合物具有至少96%的立体化学纯度。在一些优选实施方式中,式(IV)化合物具有至少97%的立体化学纯度。在一些优选实施方式中,式(IV)化合物具有至少98%的立体化学纯度。在一些优选实施方式中,式(IV)化合物具有至少99%的立体化学纯度。
在一些优选实施方式中,式(IV)化合物的不对称碳原子(CR7)以对映体富集形式存在。在某些实施方式中,式(IV)化合物的不对称碳原子(CR7)具有(S)-或(R)-构型的至少50%对映体过量,至少60%对映体过量,至少70%对映体过量,至少80%对映体过量,至少90%对映体过量,至少95%对映体过量或至少99%对映体过量。
在一些实施方式中,式(IV)的化合物选自表1A,表1B或表1C中的化合物。
另一方面,本文描述了具有式(V)结构的化合物或其药学上可接受的盐或溶剂化物:
其中,
每个A独立地为N或CRA
每个RA独立地选自H,D,卤素,-CN,-OH,-OR1,=O,=N-OR1,-SR1,-S(=O)R1,-S(=O)2R1,-N(R1)2,-NR1S(=O)(=NR1)R2,-NR1S(=O)2R2,-S(=O)2N(R1)2,-C(=O)R1,-OC(=O)R1,-C(=O)OR1,-OC(=O)OR1,-C(=O)N(R1)2,-OC(=O)N(R1)2,-NR1C(=O)R1,-P(=O)(R2)2,取代或未取代的C1-C6烷基,取代或未取代的C1-C6卤代烷基,取代或未取代的C1-C6杂烷基,取代或未取代的C3-C8环烷基,取代或未取代的C2-C7杂环烷基,取代或未取代的芳基,以及取代或未取代的单环杂芳基;
环Q为单环芳基,双环芳基,单环杂芳基或稠合双环杂芳基;
X为-O-,-NR3-,-CR4R5-,-C(=O)-,-C(=CR2 2)-,-S-,-S(=O)-,-S(=O)2-,或-S(=O)(=NR1)-;
每个R1独立地为H,D,取代或未取代的C1-C6烷基,取代或未取代的C1-C6卤代烷基,取代或未取代的C1-C6杂烷基,取代或未取代的C3-C8环烷基,取代或未取代的C2-C7杂环烷基,取代或未取代的芳基,或者取代或未取代的杂芳基;
每个R2独立地为H,D,取代或未取代的C1-C6烷基,取代或未取代的C1-C6卤代烷基,取代或未取代的芳基,取代或未取代的单环杂芳基,-OR1,-N(R1)2,-CH2OR1,-C(=O)OR1,-OC(=O)R1,-C(=O)N(R1)2,或-NR1C(=O)R1
R3为H,-OR1,-N(R1)2,取代或未取代的C1-C6烷基,-CD3,取代或未取代的C1-C6卤代烷基,取代或未取代的C1-C6杂烷基,取代或未取代的C3-C8环烷基,取代或未取代的C2-C7杂环烷基,取代或未取代的芳基,或者取代或未取代的杂芳基;
R4为H,D,F,-CN,-OR1,-SR1,-N(R1)2,取代或未取代的C1-C6烷基,取代或未取代的C1-C6卤代烷基,取代或未取代的C1-C6杂烷基,取代或未取代的C1-C6亚烷基-OR1,取代或未取代的C3-C8环烷基,取代或未取代的C2-C7杂环烷基,取代或未取代的芳基,或者取代或未取代的杂芳基;
R5为H,D,F,-CN,-OR1,-SR1,-N(R1)2,取代或未取代的C1-C6烷基,取代或未取代的C1-C6卤代烷基,取代或未取代的C1-C6杂烷基,取代或未取代的C1-C6亚烷基-OR1,取代或未取代的C3-C8环烷基,取代或未取代的C2-C7杂环烷基,取代或未取代的芳基,或者取代或未取代的杂芳基;或者
R4和R5与它们所连接的碳原子组合形成取代或未取代的C3-8环烷基或者取代或未取代的C2-7杂环烷基;
Z为CR7;且R7为H,D,取代或未取代的C1-C6烷基,取代或未取代的C1-C6卤代烷基或-CH2OR1
W为取代或未取代的C1-C4亚烷基,取代或未取代的C2-C4亚烯基,或者取代或未取代的C1-C4杂亚烷基;
R选自H,取代或未取代的C1-6烷基,取代或未取代的C1-6氟代烷基,取代或未取代的C1-C6杂烷基,取代或未取代的C3-C8环烷基,取代或未取代的C2-C7杂环烷基,取代或未取代的芳基,和取代或未取代的杂芳基,其中烷基任选地取代有羟基,氨基,取代或未取代的单-C1-6烷基氨基,或者取代或未取代的二-C1-6烷基氨基;
R11,R12,R13,R14,R15,R16,R17和R18各自独立地选自H,F,OR1,取代或未取代的C1-6烷基,a取代或未取代的C1-6氟代烷基,取代或未取代的C1-C6杂烷基,其中烷基任选地取代有羟基,氨基,甲氧基,取代或未取代的单-C1-6烷基氨基或者取代或未取代的二-C1-6烷基氨基;
R11和R13,组合形成取代或未取代的C1-3亚烷基或者取代或未取代的C1-3杂亚烷基;或者
R11和R15,组合形成取代或未取代的C1-3亚烷基;或者
R16和R17,组合形成取代或未取代的C1-3亚烷基;或者
R13和R14,与它们所连接的碳原子组合形成螺环C3-8环烷基;或者
R17和R2,组合形成取代或未取代的C1-3亚烷基;或者
当X为-NR3-时,则R3和R2任选地与它们所连接的中间原子一起形成4,5或6-元环;或者
当X为-NR3-时,则R3和R16任选地与它们所连接的中间原子一起形成4,5或6-元环;
a,b和e各自独立地选自0,1或2;并且
其中式(V)的化合物具有至少80%的立体化学纯度。
对于任何和所有实施方式,从所列替代方案的子集中选择取代基。例如,在一些实施方式中,a为0,1或2。在其他实施方式中,a为0。在一些其他实施方式中,a为1。在一些其他实施方式中,a为2。
在一些实施方式中,为/>在一些实施方式中,/>为/>在一些实施方式中,/>为/>
在一些实施方式中,X为-O-,-NR3-,-S-,-CR4R5-,-C(=O)-,或-C(=CR2 2)-。在一些实施方式中,X为-O-。在一些实施方式中,X为-NR3-。在一些实施方式中,X为-S-。在一些实施方式中,X为-CR4R5-。在一些实施方式中,X为-C(=O)-。在一些实施方式中,X为-C(=CR2 2)-。
在一些实施方式中,X为-CH(CH2OR1)-或-CH(OR1)-。在一些实施方式中,X为-CH(CH2OR1)-。在一些实施方式中,X为-CH(OR1)-。
在一些实施方式中,R3为H,-OR1,-N(R1)2,取代或未取代的C1-C6烷基,取代或未取代的C1-C6卤代烷基,取代或未取代的C1-C6杂烷基,取代或未取代的C3-C8环烷基,或者取代或未取代的C2-C7杂环烷基。
在一些实施方式中,R3为-OR1,-N(R1)2,取代或未取代的C1-C6烷基,取代或未取代的C1-C6卤代烷基,取代或未取代的C1-C6杂烷基,取代或未取代的C3-C8环烷基,或者取代或未取代的C2-C7杂环烷基。
在一些实施方式中,环Q为取代或未取代的单环芳基。在一些实施方式中,环Q为取代的单环芳基。在一些实施方式中,环Q为未取代的单环芳基。
在一些实施方式中,环Q为取代的苯基。在一些实施方式中,环Q为被以下取代的2-羟基-苯基:0,1,2或3个独立选自以下的取代基:C1-6烷基,氧代,肟,羟基,卤代-C1-6烷基,二卤代-C1-6烷基,三卤代-C1-6烷基,C1-6烷氧基,C1-6烷氧基-C3-7环烷基,卤代-C1-6烷氧基,二卤代-C1-6烷氧基,三卤代-C1-6烷氧基,羟基,氰基,卤素,氨基,单-C1-6烷基氨基,二-C1-6烷基氨基,杂芳基,羟基取代的C1-6烷基,芳基取代的C1-6烷氧基,氨基,-C(=O)NH-C1-6烷基-杂芳基,-NHC(=O)-C1-6烷基杂芳基,C1-6烷基-C(=O)NH-杂芳基,C1-6烷基-NHC(=O)-杂芳基,C3-7环烷基,5-7元环烯基或者含有1或2个独立选自S、O和N的杂原子的5、6或9元杂环。
在一些实施方式中,环Q为被两个C1-6烷基取代的2-羟基-苯基。在一些实施方式中,两个C1-6烷基可以与它们所键合的原子组合以形成5-6元环。
在一些实施方式中,环Q为被杂芳基取代的2-羟基-苯基。在一些实施方式中,杂芳基具有5、6、9或10个环原子,1、2或3个选自N、O和S的环杂原子,并被0、1或2个独立选自以下的取代基取代:氧代,羟基,硝基,卤素,C1-6烷基,C1-6烯基,C1-6烷氧基,C3-7环烷基,C1-6烷基-OH,三卤代-C1-6烷基,单-C1-6烷基氨基,二-C1-6烷基氨基,-C(=O)NH2,-NH2,-NO2,羟基-C1-6烷基氨基,羟基-C1-6烷基,4-7元杂环-C1-6烷基,氨基-C1-6烷基,单-C1-6烷基氨基-C1-6烷基,和二-C1-6烷基氨基-C1-6烷基。
在一些实施方式中,环Q为其中环P为芳基或杂芳基。在一些实施方式中,环Q为/>其中环P为芳基。在一些实施方式中,环Q为其中环P为杂芳基。在一些实施方式中,杂芳基选自以下:
其中每个RB独立地选自氰基,卤素,羟基,取代或未取代的C1-6烷基,-OCH3,-OCD3,取代或未取代的C2-6烯基,取代或未取代的C2-6炔基,取代或未取代的C1-6烷氧基,取代或未取代的C3-7环烷基,取代或未取代的C2-8杂环烷基,杂芳基,取代或未取代的杂环烷基-C1-6烷基,取代或未取代的C1-6烷基-芳基,取代或未取代的C1-6烷基-杂环烷基,取代或未取代的C1-6烷基-杂芳基,取代或未取代的C1-6烷氧基-芳基,取代或未取代的C1-6烷氧基-杂环烷基,取代或未取代的C1-6烷氧基-杂芳基,和羟基取代的C1-6烷氧基,C1-6烷氧基,氨基,单-C1-6烷基氨基和二-C1-6烷基氨基;并且m为0,1,2或3。
在一些实施方式中,环Q为在一些实施方式中,环Q为在一些实施方式中,环Q为/>在一些实施方式中,环Q为/>在一些实施方式中,环Q为/>在一些实施方式中,环Q为/>在一些实施方式中,环Q为/>在一些实施方式中,环Q为/>在一些实施方式中,环Q为/>在一些实施方式中,环Q为/>在一些实施方式中,环Q为在一些实施方式中,环Q为/>在一些实施方式中,环Q为/>在一些实施方式中,环Q为/>在一些实施方式中,环Q为/>在一些实施方式中,环Q为/>在一些实施方式中,环Q为/>在一些实施方式中,环Q为/>在一些实施方式中,环Q为/>在一些实施方式中,环Q为/>在一些实施方式中,环Q为/>在一些实施方式中,环Q为/>在一些实施方式中,环Q为/>
在一些实施方式中,环Q为2-萘基,其任选地在3位被羟基取代,并另外被0、1或2个选自以下的取代基取代:羟基,氰基,卤素,C1-6烷基,C2-6烯基,C1-6烷氧基,其中所述烷氧基是未取代的或取代有羟基,C1-6烷氧基,氨基,-NHC(=O)-C1-6烷基,-NHC(=O)-C1-6烷基,C1-6亚烷基-4-7元杂环,4-7元杂环,单-C1-6烷基氨基,和二-C1-6烷基氨基。
在一些实施方式中,环Q为在一些实施方式中,环Q为
在一些实施方式中,环Q为 并且每个R6独立地为H,-OR1,-N(R1)2,取代或未取代的C1-C6烷基,取代或未取代的C1-C6卤代烷基,取代或未取代的C1-C6杂烷基,取代或未取代的C3-C8环烷基,取代或未取代的C2-C7杂环烷基,取代或未取代的芳基,或者取代或未取代的杂芳基;或者两个R6与它们所连接的N原子一起以形成取代或未取代的C2-C6杂环烷基。在一些实施方式中,每个R6独立地为H,取代或未取代的C1-C6烷基,取代或未取代的C1-C6杂烷基,或者取代或未取代的C3-C8环烷基。在一些实施方式中,每个R6独立地为H,取代或未取代的C1-C4烷基,或者取代或未取代的C3-C6环烷基。
在一些实施方式中,环Q为单环杂芳基或稠合双环杂芳基。
在一些实施方式中,环Q为具有1-4个环氮原子的5或6元单环杂芳基,并且其被苯基或杂芳基取代,所述杂芳基具有5或6个环原子,1或2个独立选自N、O和S的环杂原子,并且其被0、1或2个独立选自以下的取代基取代:氰基,C1-6烷基,单-C1-6烷基氨基,二-C1-6烷基氨基,羟基-C1-6烷基氨基,羟基-C1-6烷基,氨基-C1-6烷基和单-C1-6烷基氨基-C1-6烷基,和二-C1-6烷基氨基-C1-6烷基。
在一些实施方式中,环Q为选自以下的5元单环杂芳基:
其中
每个RB独立地选自氰基,卤素,羟基,取代或未取代的C1-6烷基,-OCH3,-OCD3,取代或未取代的C2-6烯基,取代或未取代的C2-6炔基,取代或未取代的C1-6烷氧基,取代或未取代的C3-7环烷基,取代或未取代的C2-8杂环烷基,杂芳基,取代或未取代的杂环烷基-C1-6烷基,取代或未取代的C1-6烷基-芳基,取代或未取代的C1-6烷基-杂环烷基,取代或未取代的C1-6烷基-杂芳基,取代或未取代的C1-6烷氧基-芳基,取代或未取代的C1-6烷氧基-杂环烷基,取代或未取代的C1-6烷氧基-杂芳基,和羟基取代的C1-6烷氧基,C1-6烷氧基,氨基,单-C1-6烷基氨基和二-C1-6烷基氨基;并且m为0,1,2或3。
在一些实施方式中,环Q为选自以下的6元单环杂芳基:
其中
每个RB独立地选自氰基,卤素,羟基,取代或未取代的C1-6烷基,-OCH3,-OCD3,取代或未取代的C2-6烯基,取代或未取代的C2-6炔基,取代或未取代的C1-6烷氧基,取代或未取代的C3-7环烷基,取代或未取代的C2-8杂环烷基,杂芳基,取代或未取代的杂环烷基-C1-6烷基,取代或未取代的C1-6烷基-芳基,取代或未取代的C1-6烷基-杂环烷基,取代或未取代的C1-6烷基-杂芳基,取代或未取代的C1-6烷氧基-芳基,取代或未取代的C1-6烷氧基-杂环烷基,取代或未取代的C1-6烷氧基-杂芳基,和羟基取代的C1-6烷氧基,C1-6烷氧基,氨基,单-C1-6烷基氨基和二-C1-6烷基氨基;并且m为0,1,2或3。
在一些实施方式中,环Q为具有8至10个环原子,1、2或3个独立选自N、O或S的环杂原子的稠合双环杂芳基,并且其被0、1或2个独立选自以下的取代基取代:氰基,肟,卤素,羟基,C1-6烷基,C24烯基,C24炔基,C1-6烷氧基,羟基取代的C1-6烷氧基,氨基,单-C1-6烷基氨基,和二-C1-6烷基氨基。
在一些实施方式中,环Q为6-5稠合杂芳基,6-6稠合杂芳基,5-6稠合杂芳基,5-5稠合杂芳基,7-5稠合杂芳基或5-7稠合杂芳基。
在一些实施方式中,环Q为6-5稠合杂芳基,6-6稠合杂芳基或5-6稠合杂芳基,其选自以下:
其中
每个RB独立地选自氰基,卤素,羟基,取代或未取代的C1-6烷基,-OCH3,-OCD3,取代或未取代的C2-6烯基,取代或未取代的C2-6炔基,取代或未取代的C1-6烷氧基,取代或未取代的C3-7环烷基,取代或未取代的C2-8杂环烷基,杂芳基,取代或未取代的杂环烷基-C1-6烷基,取代或未取代的C1-6烷基-芳基,取代或未取代的C1-6烷基-杂环烷基,取代或未取代的C1-6烷基-杂芳基,取代或未取代的C1-6烷氧基-芳基,取代或未取代的C1-6烷氧基-杂环烷基,取代或未取代的C1-6烷氧基-杂芳基,和羟基取代的C1-6烷氧基,C1-6烷氧基,氨基,单-C1-6烷基氨基和二-C1-6烷基氨基;并且m为1,2或3。
在一些实施方式中,环Q为 并且每个R6独立地为H,-OR1,-N(R1)2,取代或未取代的C1-C6烷基,取代或未取代的C1-C6卤代烷基,取代或未取代的C1-C6杂烷基,取代或未取代的C3-C8环烷基,取代或未取代的C2-C7杂环烷基,取代或未取代的芳基,或者取代或未取代的杂芳基;或者两个R6与它们所连接的N原子一起以形成取代或未取代的C2-C6杂环烷基。在一些实施方式中,每个R6独立地为H,取代或未取代的C1-C6烷基,取代或未取代的C1-C6杂烷基,或者取代或未取代的C3-C8环烷基。在一些实施方式中,每个R6独立地为H,取代或未取代的C1-C4烷基,或者取代或未取代的C3-C6环烷基。
在一些实施方式中,X为-NR3-。
在一些实施方式中,R3为-OR1,取代或未取代的C1-C6烷基,取代或未取代的C1-C6卤代烷基,取代或未取代的C1-C6杂烷基,或者取代或未取代的C3-C8环烷基。
在一些实施方式中,R3为-OR1。在一些实施方式中,R3为-OCH3,-OCH2CH3,-OCH2CH2OH或-OCH2CH2OCH3。在一些实施方式中,R3为-OCH3。在一些实施方式中,R3为-OCH2CH3。在一些实施方式中,R3为-OCH2CH2CH3。在一些实施方式中,R3为-OCH(CH3)2。在一些实施方式中,R3为-OCD3
在一些实施方式中,R3为-CD3
在一些实施方式中,R3为取代或未取代的C1-C6卤代烷基。在一些实施方式中,R3为CF3。在一些实施方式中,R3为-CH2CH2F。在一些实施方式中,R3为-CH2CH2CH2F。在一些实施方式中,R3为-CH2CF3。在一些实施方式中,R3为-CH2CH2CF3
在一些实施方式中,R3为-CH3或-CF3
在一些实施方式中,R3为取代或未取代的C1-C6杂烷基。在一些实施方式中,R3为-OCH2CH2OCH3或-OCH2CH2OCF3。在一些实施方式中,R3为-CH2CH2OCH3
在一些实施方式中,R3为取代或未取代的C3-C8环烷基。在一些实施方式中,R3为环丙基,环丁基,环戊基,环己基,环庚基或环辛基。在一些实施方式中,R3为环丙基,环丁基,环戊基或环己基。在一些实施方式中,R3为环丙基。在一些实施方式中,R3为环丁基。在一些实施方式中,R3为环戊基。在一些实施方式中,R3为环己基。
在一些实施方式中,R3为环戊烯基,环己烯基,环庚烯基或环辛烯基。在一些实施方式中,R3为环戊烯基或环己烯基。在一些实施方式中,R3为环戊烯基。在一些实施方式中,R3为环己烯基。
在一些实施方式中,为/>其中p为1,2或3。
在一些优选实施方式中,X位于的平伏位。
在一些实施方式中,为/>在一些实施方式中,/>
在一些优选实施方式中,X位于的平伏位。在一些其他优选实施方式中,/>具有结构/>
在一些实施方式中,为/>其中p为1,2或3。
在一些优选实施方式中,X位于的平伏位。
在一些实施方式中,为/>在一些实施方式中,/>为/>
在一些实施方式中,为/>其中W为-CH2OCH2-。
在一些优选实施方式中,X位于的平伏位,其中W为-CH2OCH2-。/>
在一些实施方式中,为/>其中W为-CH2N(R19)CH2-,其中R19为H,D,-CN,-OH,-OR1,-SR1,-S(=O)R1,-S(=O)2R1,-CH2-N(R1)2,-S(=O)2N(R1)2,-C(=O)R1,-CO2R1,-C(=O)N(R1)2,取代或未取代的C1-C6烷基,取代或未取代的C1-C6卤代烷基,取代或未取代的C1-C6杂烷基,取代或未取代的C3-C8环烷基,或者取代或未取代的C2-C8杂环烷基。
在一些优选实施方式中,X位于的平伏位,其中W为-CH2N(R19)CH2-。
在一些实施方式中,式(V)的化合物不是外消旋的。在一些优选实施方式中,式(V)的化合物基本上不含其他异构体。在一些优选实施方式中,式(V)的化合物是基本上不含其他异构体的单一异构体。在一些优选实施方式中,式(V)的化合物包含25%或更少的其他异构体。在一些优选实施方式中,式(V)的化合物包含20%或更少的其他异构体。在一些优选实施方式中,式(V)的化合物包含15%或更少的其他异构体。在一些优选实施方式中,式(V)的化合物包含10%或更少的其他异构体。在一些优选实施方式中,式(V)的化合物包含5%或更少的其他异构体。在一些优选实施方式中,式(V)的化合物包含1%或更少的其他异构体。
在一些优选实施方式中,式(V)的化合物具有至少75%的立体化学纯度。在一些优选实施方式中,式(V)的化合物具有至少80%的立体化学纯度。在一些优选实施方式中,式(V)的化合物具有至少85%的立体化学纯度。在一些优选实施方式中,式(V)的化合物具有至少90%的立体化学纯度。在一些优选实施方式中,式(V)的化合物具有至少95%的立体化学纯度。在一些优选实施方式中,式(V)的化合物具有至少96%的立体化学纯度。在一些优选实施方式中,式(V)的化合物具有至少97%的立体化学纯度。在一些优选实施方式中,式(V)的化合物具有至少98%的立体化学纯度。在一些优选实施方式中,式(V)的化合物具有至少99%的立体化学纯度。
在一些实施方式中,式(V)化合物的不对称碳原子(CR7)以对映体富集形式存在。在某些实施方式中,式(V)化合物的不对称碳原子(CR7)具有(S)-或(R)-构型的至少50%对映体过量,至少60%对映体过量,至少70%对映体过量,至少80%对映体过量,至少90%对映体过量,至少95%对映体过量或至少99%对映体过量。
在一些实施方式中,式(V)化合物选自表1A,表1B或表1C中的化合物。
本文考虑了上述针对各种变量的基团的任何组合。在整个说明书中,本领域技术人员选择基团及其取代基来提供稳定的部分和化合物。
在一些实施方式中,式(I),(II),(III),(IV)或(V)的化合物选自:
(6-(2-羟基-4-(1H-吡唑-4-基)苯基)哒嗪-3-基)(哌嗪-1-基)甲酮;
2-(6-(哌啶-4-基巯基)哒嗪-3-基)-5-(1H-吡唑-4-基)苯酚;
(3,6-二氮杂双环[3.1.1]庚-3-基)(6-(2-羟基-4-(1H-吡唑-4-基)苯基)哒嗪-3-基)甲酮;
2-(6-((6-氮杂双环[3.1.1]庚-3-基)(2-氟乙基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(1H-吡唑-4-基)苯酚;
(3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(6-(2-羟基-4-(1H-吡唑-4-基)苯基)哒嗪-3-基)甲酮;
2-(6-((8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(2-氟乙基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(1H-吡唑-4-基)苯酚;
2-(6-(八氢-1,6-萘啶-1(2H)-基)哒嗪-3-基)-5-(1H-吡唑-4-基)苯酚;
2-(6-(甲氧基(2,2,6,6-四甲基哌啶-4-基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(1H-吡唑-4-基)苯酚;
2-(6-(羟基(2,2,6,6-四甲基哌啶-4-基)甲基)哒嗪-3-基)-5-(1H-吡唑-4-基)苯酚;
(6-(2-羟基-4-(1H-吡唑-4-基)苯基)哒嗪-3-基)(3,3,5,5-四甲基哌嗪-1-基)甲酮;
(6-(2-羟基-4-(1H-吡唑-4-基)苯基)哒嗪-3-基)(2,2,6,6-四甲基哌啶-4-基)甲酮;
5-(1H-吡唑-4-基)-2-(6-((2,2,6,6-四甲基哌啶-4-基)硫基)哒嗪-3-基)苯酚;
2-(6-((2-甲氧基乙氧基)(2,2,6,6-四甲基哌啶-4-基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(1H-吡唑-4-基)苯酚;
5-(1H-吡唑-4-基)-2-(6-((2,2,6,6-四甲基哌啶-4-亚基)甲基)哒嗪-3-基)苯酚;
5-(1H-吡唑-4-基)-2-(6-((2,2,6,6-四甲基哌啶-4-基)(三氟甲基)氨基)哒嗪-3-基)苯酚;
2-(6-((2-氟乙基)(2,2,6,6-四甲基哌啶-4-基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(1H-吡唑-4-基)苯酚;
5-(1H-吡唑-4-基)-2-(6-((2,2,6,6-四甲基哌啶-4-基)(2,2,2-三氟乙基)氨基)哒嗪-3-基)苯酚;
2-(6-((3-氟丙基)(2,2,6,6-四甲基哌啶-4-基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(1H-吡唑-4-基)苯酚;
5-(1H-吡唑-4-基)-2-(6-((2,2,6,6-四甲基哌啶-4-基)(3,3,3-三氟丙基)氨基)哒嗪-3-基)苯酚;
3-(6-((2-氟乙基)(2,2,6,6-四甲基哌啶-4-基)氨基)哒嗪-3-基)-7-甲氧基萘-2-醇;
2-(6-((2-氟乙基)(2,2,6,6-四甲基哌啶-4-基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(1-甲基-1H-吡唑-4-基)苯酚;
2-(6-((2-氟乙基)(2,2,6,6-四甲基哌啶-4-基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(5-甲基-1H-吡唑-4-基)苯酚;
2-(6-((2-氟乙基)(2,2,6,6-四甲基哌啶-4-基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(5-甲基噁唑-2-基)苯酚;
2-(6-((2-氟乙基)(2,2,6,6-四甲基哌啶-4-基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(1H-吡唑-1-基)苯酚;
5-(4-(6-((2-氟乙基)(2,2,6,6-四甲基哌啶-4-基)氨基)哒嗪-3-基)-3-羟基苯基)吡啶-2(1H)-酮;
5-(4-(6-((2-氟乙基)(2,2,6,6-四甲基哌啶-4-基)氨基)哒嗪-3-基)-3-羟基苯基)嘧啶-2(1H)-酮;
2-(6-((2-甲氧基乙氧基)(2,2,6,6-四甲基哌啶-4-基)甲基)哒嗪-3-基)-5-(1H-吡唑-4-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)氧基)哒嗪-3-基)-5-(1H-吡唑-4-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)氧基)哒嗪-3-基)-5-(5-甲基噁唑-2-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)氧基)哒嗪-3-基)-5-(4-甲基-1H-咪唑-1-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)氧基)哒嗪-3-基)-5-(1H-咪唑-1-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)氧基)哒嗪-3-基)-5-(3-甲基-1H-吡唑-4-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)氧基)哒嗪-3-基)-5-(1-甲基-1H-吡唑-4-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)氧基)哒嗪-3-基)-5-(1H-吡唑-1-基)苯酚;
4-(4-(6-(((1R,3s,5S)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)氧基)哒嗪-3-基)-3-羟基苯基)吡啶-2(1H)-酮;
4-(4-(6-(((1R,3s,5S)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)氧基)哒嗪-3-基)-3-羟基苯基)-1-甲基吡啶-2(1H)-酮;
2-(6-(((1R,3s,5S)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)氧基)哒嗪-3-基)-5-(4-氨基-1H-吡唑-1-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)氧基)哒嗪-3-基)-5-(4-氨基-5-甲基-1H-吡唑-1-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)氧基)哒嗪-3-基)-5-(4-氨基-3-甲基-1H-吡唑-1-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)氧基)哒嗪-3-基)-5-(5-甲基-1,3,4-噁二唑-2-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)氧基)哒嗪-3-基)-5-(5-甲基-1,3,4-噻二唑-2-基)苯酚;
3-(6-(((1R,3s,5S)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)氧基)哒嗪-3-基)-7-甲氧基萘-2-醇;
3-(6-(((1R,3s,5S)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)氧基)哒嗪-3-基)萘-2,7-二醇;
6-(6-(((1R,3s,5S)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)氧基)哒嗪-3-基)异喹啉-7-醇;
6-(6-(((1R,3s,5S)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)氧基)哒嗪-3-基)-1-甲基异喹啉-7-醇;
2-(6-(((1R,3s,5S)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(1H-吡唑-4-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)硫基)哒嗪-3-基)-5-(1H-吡唑-4-基)苯酚;
((1R,3s,5S)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(6-(2-羟基-4-(1H-吡唑-4-基)苯基)哒嗪-3-基)甲酮;
2-(6-(1-((1R,3s,5S)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)乙烯基)哒嗪-3-基)-5-(1H-吡唑-4-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(5-甲基噁唑-2-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(4-甲基-1H-咪唑-1-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(1H-咪唑-1-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(3-甲基-1H-吡唑-4-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(1-甲基-1H-吡唑-4-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(1H-吡唑-1-基)苯酚;
4-(4-(6-(((1R,3s,5S)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-3-羟基苯基)吡啶-2(1H)-酮;
4-(4-(6-(((1R,3s,5S)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-3-羟基苯基)-1-甲基吡啶-2(1H)-酮;
2-(6-(((1R,3s,5S)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(4-氨基-1H-吡唑-1-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(4-氨基-5-甲基-1H-吡唑-1-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(4-氨基-3-甲基-1H-吡唑-1-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(5-甲基-1,3,4-噁二唑-2-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(5-甲基-1,3,4-噻二唑-2-基)苯酚;
3-(6-(((1R,3s,5S)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-7-甲氧基萘-2-醇;
3-(6-(((1R,3s,5S)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)萘-2,7-二醇;
6-(6-(((1R,3s,5S)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)异喹啉-7-醇;
6-(6-(((1R,3s,5S)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-1-甲基异喹啉-7-醇;
2-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-3-氟-5-(1H-吡唑-4-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-3,4-二氟-5-(1H-吡唑-4-基)苯酚;
4-(4-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-3-氟-5-羟基苯基)-1-甲基吡啶-2(1H)-酮;
4-(4-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-2,3-二氟-5-羟基苯基)-1-甲基吡啶-2(1H)-酮;
2-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-3-氟-5-(2-甲氧基吡啶-4-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-3,4-二氟-5-(2-甲氧基吡啶-4-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-3-氟-5-(6-甲氧基哒嗪-4-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-3,4-二氟-5-(6-甲氧基哒嗪-4-基)苯酚;
5-(4-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-3-氟-5-羟基苯基)-2-甲基哒嗪-3(2H)-酮;
5-(4-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-2,3-二氟-5-羟基苯基)-2-甲基哒嗪-3(2H)-酮;
2-(6-(环丙基((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)氨基)哒嗪-3-基)-3-氟-5-(6-甲氧基哒嗪-4-基)苯酚;
2-(6-(环丙基((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)氨基)哒嗪-3-基)-3,4-二氟-5-(6-甲氧基哒嗪-4-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-3-氟-5-(6-甲氧基嘧啶-4-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-3,4-二氟-5-(6-甲氧基嘧啶-4-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(2-氟乙基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(1H-吡唑-4-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(2-氟乙基)氨基)哒嗪-3-基)-4-氟-5-(1H-吡唑-4-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(2-氟乙基)氨基)哒嗪-3-基)-3-氟-5-(1H-吡唑-4-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(2-氟乙基)氨基)哒嗪-3-基)-3,4-二氟-5-(1H-吡唑-4-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-3-氟-5-(2-(甲氧基-d3)吡啶-4-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-3,4-二氟-5-(2-(甲氧基-d3)吡啶-4-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-3-氟-5-(6-(甲氧基-d3)哒嗪-4-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-3,4-二氟-5-(6-(甲氧基-d3)哒嗪-4-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基-d3)氨基)哒嗪-3-基)-3-氟-5-(2-(甲氧基-d3)吡啶-4-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基-d3)氨基)哒嗪-3-基)-3,4-二氟-5-(2-(甲氧基-d3)吡啶-4-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基-d3)氨基)哒嗪-3-基)-3-氟-5-(6-(甲氧基-d3)哒嗪-4-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基-d3)氨基)哒嗪-3-基)-3,4-二氟-5-(6-(甲氧基-d3)哒嗪-4-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-3-氟-5-(1-甲基-1H-吡唑-4-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-3,4-二氟-5-(1-甲基-1H-吡唑-4-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-4-氟-5-(1,2,3-三嗪-5-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-3,4-二氟-5-(1,2,3-三嗪-5-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-3-氟-5-(1,2,3-三嗪-5-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-4-氟-5-(6-甲氧基哒嗪-4-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-3,4-二氟-5-(6-甲氧基哒嗪-4-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-3-氟-5-(6-甲氧基哒嗪-4-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-3,4-二氟-5-(6-甲氧基嘧啶-4-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-3-氟-5-(6-甲氧基嘧啶-4-基)苯酚;
2-(6-(环丙基((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-基)氨基)哒嗪-3-基)-4-氟-5-(6-甲氧基哒嗪-4-基)苯酚;
2-(6-(环丙基((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-基)氨基)哒嗪-3-基)-3,4-二氟-5-(6-甲氧基哒嗪-4-基)苯酚;
2-(6-(环丙基((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-基)氨基)哒嗪-3-基)-3-氟-5-(6-甲氧基哒嗪-4-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-基)(2-氟乙基)氨基)哒嗪-3-基)-4-氟-5-(6-甲氧基哒嗪-4-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-基)(2-氟乙基)氨基)哒嗪-3-基)-3,4-二氟-5-(6-甲氧基哒嗪-4-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-基)(2-氟乙基)氨基)哒嗪-3-基)-3-氟-5-(6-甲氧基哒嗪-4-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-基)氧基)哒嗪-3-基)-4-氟-5-(6-甲氧基哒嗪-4-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-基)氧基)哒嗪-3-基)-3,4-二氟-5-(6-甲氧基哒嗪-4-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-基)氧基)哒嗪-3-基)-3-氟-5-(6-甲氧基哒嗪-4-基)苯酚;
4-(4-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-基)氧基)哒嗪-3-基)-2-氟-5-羟基苯基)-1-甲基吡啶-2(1H)-酮;
4-(4-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-基)氧基)哒嗪-3-基)-2,3-二氟-5-羟基苯基)-1-甲基吡啶-2(1H)-酮;
4-(4-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-基)氧基)哒嗪-3-基)-3-氟-5-羟基苯基)-1-甲基吡啶-2(1H)-酮;
4-(4-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-2-氟-5-羟基苯基)-1-甲基吡啶-2(1H)-酮;
4-(4-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-2,3-二氟-5-羟基苯基)-1-甲基吡啶-2(1H)-酮;
4-(4-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-3-氟-5-羟基苯基)-1-甲基吡啶-2(1H)-酮;
2-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)-4-氟哒嗪-3-基)-4-氟-5-(1H-吡唑-4-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)-5-氟哒嗪-3-基)-4-氟-5-(1H-吡唑-4-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-基)(甲基)氨基)-4-氟哒嗪-3-基)-4-氟-5-(1H-吡唑-4-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-基)(甲基)氨基)-5-氟哒嗪-3-基)-4-氟-5-(1H-吡唑-4-基)苯酚;
7-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-6-羟基-N-甲基异喹啉-3-羧酰胺;
7-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-6-羟基-N-甲基异喹啉-3-羧酰胺;
6-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-7-羟基-N-甲基喹啉-2-羧酰胺;
6-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-1-氟-7-羟基-N-甲基-2-萘甲酰胺;
6-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-3-氟-7-羟基-N-甲基-2-萘甲酰胺;
6-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-3-氟-7-羟基-N-甲基-2-萘甲酰胺;
6-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-1-氟-7-羟基-N-甲基-2-萘甲酰胺;
2-(6-(环丙基(2,2,6,6-四甲基哌啶-4-基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(1H-吡唑-4-基)苯酚;
2-(6-(环丁基(2,2,6,6-四甲基哌啶-4-基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(1H-吡唑-4-基)苯酚;
2-(6-(八氢-1H-吡咯并[3,2-c]吡啶-1-基)哒嗪-3-基)-5-(1H-吡唑-4-基)苯酚;
2-(6-(1,7-二氮杂螺[3.5]壬-1-基)哒嗪-3-基)-5-(1H-吡唑-4-基)苯酚;
2-(6-((2-甲氧基乙基)(2,2,6,6-四甲基哌啶-4-基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(1H-吡唑-4-基)苯酚;
2-(5-(甲基(2,2,6,6-四甲基哌啶-4-基)氨基)嘧啶-2-基)-5-(1H-吡唑-4-基)苯酚;
2-(5-(甲基(2,2,6,6-四甲基哌啶-4-基)氨基)吡啶-2-基)-5-(1H-吡唑-4-基)苯酚;
2-(5-(甲基(2,2,6,6-四甲基哌啶-4-基)氨基)吡嗪-2-基)-5-(1H-吡唑-4-基)苯酚;
2-(6-(((1R,5S,6s)-3-氮杂双环[3.1.0]己-6-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(1H-吡唑-4-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(1H-吡唑-4-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3r,5S)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(1H-吡唑-4-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)氧基)哒嗪-3-基)-5-(1H-吡唑-4-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3r,5S)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)氧基)哒嗪-3-基)-5-(1H-吡唑-4-基)苯酚;
2-(6-(甲基((3R,5r,6S)-八氢环戊二烯并[c]吡咯-5-基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(1H-吡唑-4-基)苯酚;
2-(6-(甲基((3R,5s,6S)-八氢环戊二烯并[c]吡咯-5-基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(1H-吡唑-4-基)苯酚;
2-(6-(((1R,5S,8s)-3-氮杂双环[3.2.1]辛-8-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(1H-吡唑-4-基)苯酚;
2-(6-(((1R,5S,8r)-3-氮杂双环[3.2.1]辛-8-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(1H-吡唑-4-基)苯酚;
2-(6-(((1R,4R,5S)-2-氮杂双环[2.2.1]庚-5-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(1H-吡唑-4-基)苯酚;
2-(6-(((1S,4S,5R)-2-氮杂双环[2.2.1]庚-5-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(1H-吡唑-4-基)苯酚;
2-(6-(((1R,4R,5R)-2-氮杂双环[2.2.1]庚-5-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(1H-吡唑-4-基)苯酚;
2-(6-(((1S,4S,5S)-2-氮杂双环[2.2.1]庚-5-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(1H-吡唑-4-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3r,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(1H-吡唑-4-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(1H-吡唑-4-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)氧基)哒嗪-3-基)-5-(1H-吡唑-4-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3r,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)氧基)哒嗪-3-基)-5-(1H-吡唑-4-基)苯酚;
2-(6-(((1R,5S,7r)-3-氧杂-9-氮杂双环[3.3.1]壬-7-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(1H-吡唑-4-基)苯酚;
2-(6-(((1R,5S,7s)-3-氧杂-9-氮杂双环[3.3.1]壬-7-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(1H-吡唑-4-基)苯酚;
2-(6-(((1R,5S,7r)-1,5-二甲基-3-氧杂-9-氮杂双环[3.3.1]壬-7-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(1H-吡唑-4-基)苯酚;
2-(6-(((1R,5S,7s)-1,5-二甲基-3-氧杂-9-氮杂双环[3.3.1]壬-7-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(1H-吡唑-4-基)苯酚;
2-(6-(((1R,5S,7s)-3-氧杂-9-氮杂双环[3.3.1]壬-7-基)氧基)哒嗪-3-基)-5-(1H-吡唑-4-基)苯酚;
2-(6-(((1R,5S,7r)-3-氧杂-9-氮杂双环[3.3.1]壬-7-基)氧基)哒嗪-3-基)-5-(1H-吡唑-4-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(1H-吡唑-4-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-4-氟-5-(1H-吡唑-4-基)苯酚;
6-(6-(((1R,3s,5S)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)喹啉-7-醇;
3-(6-(((1R,3s,5S)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-7-甲氧基萘-2-醇;
6-(6-(((1R,3s,5S)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-5-羟基-3-甲基苯并[d]噁唑-2(3H)-酮;
3-(6-(((1R,3s,5S)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-7-(氟甲氧基)萘-2-醇;
3-(6-(((1R,3s,5S)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-7-(二氟甲氧基)萘-2-醇;
2-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-4-氟-5-(1H-吡唑-4-基)苯酚;
4-(4-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-3-羟基苯基)-1-甲基吡啶-2(1H)-酮;
4-(4-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-2-氟-5-羟基苯基)-1-甲基吡啶-2(1H)-酮;
5-(4-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-3-羟基苯基)-2-甲基哒嗪-3(2H)-酮;
2-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(1-(甲基-d3)-1H-吡唑-4-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(2-(甲氧基-d3)吡啶-4-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(2-甲氧基吡啶-4-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(1-(氟甲基)-1H-吡唑-4-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(4-氟-1H-吡唑-1-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(4-氟-1H-咪唑-1-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(4-甲基-1H-咪唑-1-基)苯酚;
4-(4-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-5-羟基-2-甲基苯基)-1-甲基吡啶-2(1H)-酮;
5-(1-(二氟甲基)-1H-吡唑-4-基)-2-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)苯酚;
4-(4-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-3-羟基苯基)-1-甲基嘧啶-2(1H)-酮;
4-(4-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-3-羟基苯基)-1-甲基-1,3,5-三嗪-2(1H)-酮;
2-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-4-甲基-5-(1H-吡唑-4-基)苯酚;
4-(4-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-3-羟基苯基)吡啶-2(1H)-酮;
4-(4-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-2-氟-5-羟基苯基)吡啶-2(1H)-酮;
5-(2-(二氟甲氧基)吡啶-4-基)-2-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(1-(三氟甲基)-1H-吡唑-4-基)苯酚;
4-(4-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-3-羟基苯基)-1-(氟甲基)吡啶-2(1H)-酮;
6-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-5-羟基-N-甲基苯并呋喃-2-羧酰胺;
2-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(2-氟-6-甲氧基吡啶-4-基)苯酚;
4-(4-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-3-羟基苯基)-6-氟吡啶-2-醇;
2-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(6-甲氧基哒嗪-4-基)苯酚;
5-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-6-羟基-N-甲基苯并呋喃-2-羧酰胺;
4-(4-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-2-氟-5-羟基苯基)-1-(氟甲基)吡啶-2(1H)-酮;
6-(4-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-3-羟基苯基)-3-甲基嘧啶-4(3H)-酮;
4-(4-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-3-羟基苯基)-1-甲基-1H-吡咯-2-腈;
1-(4-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-3-羟基苯基)-1H-咪唑-4-腈;
1-(4-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-2-氟-5-羟基苯基)-1H-咪唑-4-腈;
6-(4-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-2-氟-5-羟基苯基)-3-甲基嘧啶-4(3H)-酮;
4-(4-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-3-羟基苯基)氰基吡啶;
1-(4-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-3-羟基苯基)-1H-吡唑-4-腈;
2-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(乙基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(1H-吡唑-4-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(乙基)氨基)哒嗪-3-基)-4-氟-5-(1H-吡唑-4-基)苯酚;
1-(4-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-3-羟基苯基)-1H-吡咯-3-腈;
5-(2,6-二氟吡啶-4-基)-2-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(6-(甲氧基-d3)哒嗪-4-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-4-氟-5-(6-(甲氧基-d3)哒嗪-4-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(2-氟-6-(甲氧基-d3)吡啶-4-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-4-氟-5-(2-氟-6-(甲氧基-d3)吡啶-4-基)苯酚;
4-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-3'-甲氧基-[1,1'-联苯基]-3-醇;
4-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-4'-氟-3'-甲氧基-[1,1'-联苯基]-3-醇;
2-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(5-甲氧基吡啶-3-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(6-氟-5-甲氧基吡啶-3-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-4-氟-5-(6-甲氧基哒嗪-4-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基-d3)氨基)哒嗪-3-基)-4-氟-5-(1H-吡唑-4-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(6-甲氧基嘧啶-4-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-4-氟-5-(6-甲氧基嘧啶-4-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(1H-咪唑-1-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(4-甲基-1H-咪唑-1-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(5-甲基-1,3,4-噁二唑-2-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(1H-吡唑-1-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(4-甲基-1H-吡唑-1-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(3-甲基-1H-吡唑-1-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(2H-1,2,3-三唑-2-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(1H-1,2,3-三唑-1-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(4-甲基-1H-1,2,3-三唑-1-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(1H-1,2,3-三唑-4-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(1H-四唑-5-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(2-甲基噁唑-5-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(3-甲基异噁唑-5-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(2-甲基-1H-咪唑-1-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(2,4-二甲基-1H-咪唑-1-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(5-(三氟甲基)-1,3,4-噁二唑-2-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(5-甲基-1H-四唑-1-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(5-甲基-2H-四唑-2-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(4H-1,2,4-三唑-4-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(6-甲基吡啶-3-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(2-甲基嘧啶-5-基)苯酚;
5-(4-(6-(((1R,3s,5S)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-3-羟基苯基)-2-甲基哒嗪-3(2H)-酮;
2-(6-(((1R,3s,5S)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(6-甲基哒嗪-3-基)苯酚;
4-(4-(6-(((1R,3s,5S)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-3-羟基苯基)-1-甲基吡啶-2(1H)-酮;
5-(4-(6-(((1R,3s,5S)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-3-羟基苯基)-1-甲基吡啶-2(1H)-酮;
2-(6-(((1R,3s,5S)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(4-(三氟甲基)-1H-咪唑-1-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(1H-1,2,4-三唑-1-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(3-甲基-1H-1,2,4-三唑-1-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)氧基)哒嗪-3-基)-5-(1H-咪唑-1-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)氧基)哒嗪-3-基)-5-(4-甲基-1H-咪唑-1-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)氧基)哒嗪-3-基)-5-(5-甲基-1,3,4-噁二唑-2-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)氧基)哒嗪-3-基)-5-(1H-吡唑-1-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)氧基)哒嗪-3-基)-5-(4-甲基-1H-吡唑-1-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)氧基)哒嗪-3-基)-5-(3-甲基-1H-吡唑-1-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)氧基)哒嗪-3-基)-5-(2H-1,2,3-三唑-2-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)氧基)哒嗪-3-基)-5-(1H-1,2,3-三唑-1-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)氧基)哒嗪-3-基)-5-(1H-1,2,3-三唑-4-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)氧基)哒嗪-3-基)-5-(1H-四唑-5-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)氧基)哒嗪-3-基)-5-(2-甲基噁唑-5-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)氧基)哒嗪-3-基)-5-(3-甲基异噁唑-5-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)氧基)哒嗪-3-基)-5-(5-甲基-1H-四唑-1-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)氧基)哒嗪-3-基)-5-(5-甲基-2H-四唑-2-基)苯酚;
4-(4-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-3-羟基苯基)-1-甲基吡啶-2(1H)-酮;
5-(4-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-3-羟基苯基)-2-甲基哒嗪-3(2H)-酮;
5-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-6-羟基-N-甲基苯并呋喃-2-羧酰胺;
2-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-基)氧基)哒嗪-3-基)-5-(1H-吡唑-4-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-基)氧基)哒嗪-3-基)-4-氟-5-(1H-吡唑-4-基)苯酚;
4-(4-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-2-氟-5-羟基苯基)-1-(氟甲基)吡啶-2(1H)-酮;
4-(4-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-2-氟-5-羟基苯基)-1-甲基吡啶-2(1H)-酮;
6-(4-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-3-羟基苯基)-3-甲基嘧啶-4(3H)-酮;
2-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(6-甲氧基哒嗪-4-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(6-(甲氧基-d3)哒嗪-4-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-4-氟-5-(6-(甲氧基-d3)哒嗪-4-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(6-甲氧基嘧啶-4-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-4-氟-5-(1H-吡唑-4-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(1H-咪唑-1-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(2-甲基噁唑-5-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-4-氟-5-(2-甲基噁唑-5-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(2H-1,2,3-三唑-2-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-基)氧基)哒嗪-3-基)-5-(1H-吡唑-4-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3r,5S)-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-基)氧基)哒嗪-3-基)-5-(1H-吡唑-4-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-基)氧基)哒嗪-3-基)-4-氟-5-(1H-吡唑-4-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(1H-1,2,3-三唑-1-基)苯酚;
5-(4-(6-(((1R,3s,5S)-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-3-羟基苯基)-2-甲基哒嗪-3(2H)-酮;
5-(4-(6-(((1R,3s,5S)-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-3-羟基苯基)-2-(甲基-d3)哒嗪-3(2H)-酮;
5-(4-(6-(((1R,3s,5S)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-3-羟基苯基)-2-(甲基-d3)哒嗪-3(2H)-酮;
4-(4-(6-(((1R,3s,5S)-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-3-羟基苯基)-1-甲基吡啶-2(1H)-酮;
4-(4-(6-(((1R,3s,5S)-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-3-羟基苯基)-1-(甲基-d3)吡啶-2(1H)-酮;
4-(4-(6-(((1R,3s,5S)-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-2-氟-5-羟基苯基)-1-甲基吡啶-2(1H)-酮;
5-(4-(6-(((1R,3s,5S)-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-2-氟-5-羟基苯基)-2-甲基哒嗪-3(2H)-酮;
2-(6-(((1R,3s,5S)-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(1-甲基-1H-吡唑-4-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(1-(甲基-d3)-1H-吡唑-4-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(2-甲氧基吡啶-4-基)苯酚;
4-(4-(6-(((1R,3s,5S)-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-3-羟基苯基)-1,6-二甲基吡啶-2(1H)-酮;
4-(4-(6-(((1R,3s,5S)-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-3-羟基苯基)-1-(氟甲基)吡啶-2(1H)-酮;
4-(6-(((1R,3s,5S)-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-3’-甲氧基-4’-甲基-[1,1’-联苯基]-3-醇;
4-(4-(6-(((1R,3s,5S)-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-3-羟基苯基)吡啶-2(1H)-酮;
6-(6-(((1R,3s,5S)-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-5-羟基-N-甲基苯并呋喃-2-羧酰胺;
6-(6-(((1R,3s,5S)-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-5-羟基-N,N-二甲基苯并呋喃-2-羧酰胺;
6-(6-(((1R,3s,5S)-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-N-环丙基-5-羟基苯并呋喃-2-羧酰胺;
5-(6-(((1R,3s,5S)-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-6-羟基-N-甲基苯并呋喃-2-羧酰胺;
5-(6-(((1R,3s,5S)-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-6-羟基-N,N-二甲基苯并呋喃-2-羧酰胺;
5-(6-(((1R,3s,5S)-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-N-环丙基-6-羟基苯并呋喃-2-羧酰胺;
6-(4-(6-(((1R,3s,5S)-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-3-羟基苯基)-3-甲基嘧啶-4(3H)-酮;
2-(6-(((1R,3s,5S)-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(1-(二氟甲基)-1H-吡唑-4-基)苯酚;
2-(6-(环丙基((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(1H-吡唑-4-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(2-(甲基-d3)噁唑-5-基)苯酚;
2-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-4-氟-5-(2-(甲基-d3)噁唑-5-基)苯酚;
4-(4-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-3-羟基苯基)-1-甲基嘧啶-2(1H)-酮;
4-(4-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-3-羟基苯基)吡啶-2(1H)-酮;
4-(4-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-2-氟-5-羟基苯基)吡啶-2(1H)-酮;
5-(2-(二氟甲氧基)吡啶-4-基)-2-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)苯酚;
3-氨基-1-(4-(环丙基(6-(2-羟基-4-(1H-吡唑-4-基)苯基)哒嗪-3-基)氨基)-2,2,6,6-四甲基哌啶-1-基)丙-1-酮;
3-氨基-1-(4-(6-(2-羟基-4-(1H-吡唑-4-基)苯基)哒嗪-3-羰基)-2,2,6,6-四甲基哌啶-1-基)丙-1-酮;
3-氨基-1-(4-((6-(2-羟基-4-(1H-吡唑-4-基)苯基)哒嗪-3-基)硫基)-2,2,6,6-四甲基哌啶-1-基)丙-1-酮;
3-氨基-1-((1R,3s,5S)-3-((6-(2-羟基-4-(1H-吡唑-4-基)苯基)哒嗪-3-基)氧基)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-8-基)丙-1-酮;
3-氨基-1-(4-((6-(2-羟基-4-(1H-吡唑-4-基)苯基)哒嗪-3-基)(甲基)氨基)-2,2,6,6-四甲基哌啶-1-基)丙-1-酮;
3-氨基-1-(4-((6-(2-羟基-4-(1H-吡唑-4-基)苯基)哒嗪-3-基)氧基)-2,2,6,6-四甲基哌啶-1-基)丙-1-酮;
3-氨基-1-((1R,5S)-6-((6-(2-羟基-4-(1H-吡唑-4-基)苯基)哒嗪-3-基)(甲基)氨基)-3-氮杂双环[3.1.0]己-3-基)丙-1-酮;
3-氨基-1-(4-(环丁基(6-(2-羟基-4-(1H-吡唑-4-基)苯基)哒嗪-3-基)氨基)-2,2,6,6-四甲基哌啶-1-基)丙-1-酮;
3-氨基-1-(4-((6-(2-羟基-4-(1H-吡唑-4-基)苯基)哒嗪-3-基)(甲氧基)氨基)-2,2,6,6-四甲基哌啶-1-基)丙-1-酮;
3-氨基-1-(1-(6-(2-羟基-4-(1H-吡唑-4-基)苯基)哒嗪-3-基)八氢-5H-吡咯并[3,2-c]吡啶-5-基)丙-1-酮;
3-氨基-1-(1-(6-(2-羟基-4-(1H-吡唑-4-基)苯基)哒嗪-3-基)八氢-1,6-萘啶-6(2H)-基)丙-1-酮;
3-氨基-1-(1-(6-(2-羟基-4-(1H-吡唑-4-基)苯基)哒嗪-3-基)-1,7-二氮杂螺[3.5]壬-7-基)丙-1-酮;
3-氨基-1-(4-((6-(2-羟基-4-(1H-吡唑-4-基)苯基)哒嗪-3-基)硫基)哌啶-1-基)丙-1-酮;
3-氨基-1-(4-((6-(2-羟基-4-(1H-吡唑-4-基)苯基)哒嗪-3-基)氧基)-2,2,6,6-四甲基哌啶-1-基)丙-1-酮;
3-氨基-1-(4-((6-(2-羟基-4-(1H-吡唑-4-基)苯基)哒嗪-3-基)(甲基)氨基)-2,2,6,6-四甲基哌啶-1-基)丙-1-酮;
3-氨基-1-(4-((6-(2-羟基-4-(1H-吡唑-4-基)苯基)哒嗪-3-基)(2-甲氧基乙氧基)氨基)-2,2,6,6-四甲基哌啶-1-基)丙-1-酮;
3-氨基-1-(4-((6-(2-羟基-4-(1H-吡唑-4-基)苯基)哒嗪-3-基)亚甲基)-2,2,6,6-四甲基哌啶-1-基)丙-1-酮;
3-氨基-1-(4-(6-(2-羟基-4-(1H-吡唑-4-基)苯基)哒嗪-3-羰基)哌啶-1-基)丙-1-酮;
3-氨基-1-(4-(羟基(6-(2-羟基-4-(1H-吡唑-4-基)苯基)哒嗪-3-基)甲基)-2,2,6,6-四甲基哌啶-1-基)丙-1-酮;
3-氨基-1-(4-((6-(2-羟基-4-(1H-吡唑-4-基)苯基)哒嗪-3-基)(甲氧基)甲基)-2,2,6,6-四甲基哌啶-1-基)丙-1-酮;
3-氨基-1-(4-(6-(2-羟基-4-(1H-吡唑-4-基)苯基)哒嗪-3-羰基)-2,2,6,6-四甲基哌嗪-1-基)丙-1-酮;
3-氨基-1-(4-((6-(2-羟基-4-(1H-吡唑-4-基)苯基)哒嗪-3-基)(三氟甲基)氨基)-2,2,6,6-四甲基哌啶-1-基)丙-1-酮;
3-氨基-1-(4-((2-氟乙基)(6-(2-羟基-4-(1H-吡唑-4-基)苯基)哒嗪-3-基)氨基)-2,2,6,6-四甲基哌啶-1-基)丙-1-酮;
3-氨基-1-(4-((6-(2-羟基-4-(1H-吡唑-4-基)苯基)哒嗪-3-基)(2,2,2-三氟乙基)氨基)-2,2,6,6-四甲基哌啶-1-基)丙-1-酮;
3-氨基-1-(4-((3-氟丙基)(6-(2-羟基-4-(1H-吡唑-4-基)苯基)哒嗪-3-基)氨基)-2,2,6,6-四甲基哌啶-1-基)丙-1-酮;
3-氨基-1-(4-((6-(2-羟基-4-(1H-吡唑-4-基)苯基)哒嗪-3-基)(2-甲氧基乙基)氨基)-2,2,6,6-四甲基哌啶-1-基)丙-1-酮;
3-氨基-1-((1R,3s,5S)-3-((6-(2-羟基-4-(1H-吡唑-4-基)苯基)哒嗪-3-基)氧基)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-8-基)丙-1-酮;
3-氨基-1-((1R,3r,5S)-3-((6-(2-羟基-4-(1H-吡唑-4-基)苯基)哒嗪-3-基)氧基)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-8-基)丙-1-酮;
3-氨基-1-((1R,3s,5S)-3-((6-(2-羟基-4-(1H-吡唑-4-基)苯基)哒嗪-3-基)(甲基)氨基)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-8-基)丙-1-酮;
3-氨基-1-((1R,3r,5S)-3-((6-(2-羟基-4-(1H-吡唑-4-基)苯基)哒嗪-3-基)(甲基)氨基)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-8-基)丙-1-酮;
3-氨基-1-(3-((6-(2-羟基-4-(1H-吡唑-4-基)苯基)哒嗪-3-基)氧基)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-8-基)丙-1-酮;
3-氨基-1-(4-((5-(2-羟基-4-(1H-吡唑-4-基)苯基)吡嗪-2-基)(甲基)氨基)哌啶-1-基)丙-1-酮;
3-氨基-1-(4-((5-(2-羟基-4-(1H-吡唑-4-基)苯基)吡嗪-2-基)(甲基)氨基)-2,2,6,6-四甲基哌啶-1-基)丙-1-酮;
3-氨基-1-(4-((5-(2-羟基-4-(1H-吡唑-4-基)苯基)吡嗪-2-基)氧基)-2,2,6,6-四甲基哌啶-1-基)丙-1-酮;
3-氨基-1-(4-((6-(2-羟基-4-(1H-吡唑-4-基)苯基)吡啶-3-基)(甲基)氨基)-2,2,6,6-四甲基哌啶-1-基)丙-1-酮;
3-氨基-1-(4-((2-(2-羟基-4-(1H-吡唑-4-基)苯基)嘧啶-5-基)(甲基)氨基)-2,2,6,6-四甲基哌啶-1-基)丙-1-酮;
5-(4-(5-((1-(3-氨基丙酰基)-2,2,6,6-四甲基哌啶-4-基)(甲基)氨基)吡嗪-2-基)-3-羟基苯基)嘧啶-2(1H)-酮;
1-(4-((4-(5-(1H-吡唑-4-基)嘧啶-2-基)-3-羟基苯基)(甲基)氨基)-2,2,6,6-四甲基哌啶-1-基)-3-氨基丙-1-酮;
2’-(4-((1-(3-氨基丙酰基)哌啶-4-基)(甲基)氨基)-2-羟基苯基)-[5,5’-双嘧啶]-2(1H)-酮;
(E)-3-(4-氨基苯基)-1-(4-((6-(2-羟基-4-(1H-吡唑-4-基)苯基)哒嗪-3-基)(甲基)氨基)-2,2,6,6-四甲基哌啶-1-基)丙-2-烯-1-酮;
3-(4-氨基苯基)-1-(4-((6-(2-羟基-4-(1H-吡唑-4-基)苯基)哒嗪-3-基)(甲基)氨基)-2,2,6,6-四甲基哌啶-1-基)丙-1-酮;
1-(4-((6-(2-羟基-4-(1H-吡唑-4-基)苯基)哒嗪-3-基)(甲基)氨基)-2,2,6,6-四甲基哌啶-1-基)-2-(哌啶-4-基)乙-1-酮;
4-(4-((6-(2-羟基-4-(1H-吡唑-4-基)苯基)哒嗪-3-基)(甲基)氨基)-2,2,6,6-四甲基哌啶-1-羰基)环己烷-1-羧酸;
1-(4-((6-(2-羟基-4-(1H-吡唑-4-基)苯基)哒嗪-3-基)(甲基)氨基)-2,2,6,6-四甲基哌啶-1-基)-2-(2-(甲基氨基)乙氧基)乙-1-酮;
4-((6-(2-羟基-4-(1H-吡唑-4-基)苯基)哒嗪-3-基)(甲基)氨基)-2,2,6,6-四甲基-N-(3-(甲基氨基)丙基)哌啶-1-羧酰胺;
(4-((6-(2-羟基-4-(1H-吡唑-4-基)苯基)哒嗪-3-基)(甲基)氨基)-2,2,6,6-四甲基哌啶-1-基)(哌啶-4-基)甲酮;
1-(4-((6-(2-羟基-4-(1H-吡唑-4-基)苯基)哒嗪-3-基)(甲基)氨基)-2,2,6,6-四甲基哌啶-1-基)-2-(甲基(2-(甲基氨基)乙基)氨基)乙-1-酮;
2-(氮杂环丁-3-基)-1-(4-((6-(2-羟基-4-(1H-吡唑-4-基)苯基)哒嗪-3-基)(甲基)氨基)-2,2,6,6-四甲基哌啶-1-基)乙-1-酮;
1-(4-((6-(2-羟基-4-(1H-吡唑-4-基)苯基)哒嗪-3-基)(甲基)氨基)-2,2,6,6-四甲基哌啶-1-基)戊-4-炔-1-酮。
示例性的SMSM化合物汇总在表1A,表1B和表1C中。
表1A:示例性的SMSM化合物
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表1B–示例性的SMSM化合物
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A细胞活力
BFoxM1 A mRNA增加(不包括外显子)
CFoxM1 BC mRNA减少(包括外显子)
表1C–示例性的SMSM化合物
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在一些实施方式中,化合物选自以下:
6-氯-N-(2,2,6,6-四甲基哌啶-4-基)哒嗪-3-胺;
6-氯-N-环丙基-N-(2,2,6,6-四甲基哌啶-4-基)哒嗪-3-胺;
6-(4-氯-2-甲氧基苯基)-N-环丙基-N-(2,2,6,6-四甲基哌啶-4-基)哒嗪-3-胺;
N-环丙基-6-(2-甲氧基-4-(1H-吡唑-4-基)苯基)-N-(2,2,6,6-四甲基哌啶-4-基)哒嗪-3-胺;
(1R,3S,5S)-3-((6-氯哒嗪-3-基)氨基)-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯;
(1R,3s,5S)-3-((6-氯哒嗪-3-基)(甲基)氨基)-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯;
(1R,3s,5S)-3-((6-(4-氯-2-甲氧基苯基)哒嗪-3-基)(甲基)氨基)-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯;
(1R,3s,5S)-3-((6-(2-甲氧基-4-(1H-吡唑-4-基)苯基)哒嗪-3-基)(甲基)氨基)-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯;
(1R,3s,5S)-3-((6-(2-羟基-4-(1H-吡唑-4-基)苯基)哒嗪-3-基)(甲基)氨基)-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯;
(1R,3s,5S)-3-((6-氯哒嗪-3-基)(甲基)氨基)-9-氮杂双环[3.3.1]壬烷-9-羧酸叔丁酯;
(1R,3s,5S)-3-((6-(2-(甲氧基甲氧基)-4-(1-(四氢-2H-吡喃-2-基)-1H-吡唑-4-基)苯基)哒嗪-3-基)(甲基)氨基)-9-氮杂双环[3.3.1]壬烷-9-羧酸叔丁酯;
(1R,3s,5S)-N-(6-氯哒嗪-3-基)-9-(4-甲氧基苄基)-1,5-二甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-胺;
(1R,3s,5S)-N-(6-氯哒嗪-3-基)-9-(4-甲氧基苄基)-N,1,5-三甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-胺;
(1R,3s,5S)-9-(4-甲氧基苄基)-N-(6-(2-(甲氧基甲氧基)-4-(1-(四氢-2H-吡喃-2-基)-1H-吡唑-4-基)苯基)哒嗪-3-基)-N,1,5-三甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-胺;
(1R,3s,5S)-3-((6-(4-氯-5-氟-2-(甲氧基甲氧基)苯基)哒嗪-3-基)(甲基)氨基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯;
(1R,3s,5S)-3-((6-(5-氟-2-(甲氧基甲氧基)-4-(1H-吡唑-4-基)苯基)哒嗪-3-基)(甲基)氨基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯;
(1R,3s,5S)-N-(6-氯哒嗪-3-基)-9-(4-甲氧基苄基)-N,1,5-三甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-胺;
(1R,3s,5S)-N-(6-(4-氯-5-氟-2-(甲氧基甲氧基)苯基)哒嗪-3-基)-9-(4-甲氧基苄基)-N,1,5-三甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-胺;
(1R,3s,5S)-N-(6-(5-氟-2-(甲氧基甲氧基)-4-(1H-吡唑-4-基)苯基)哒嗪-3-基)-9-(4-甲氧基苄基)-N,1,5-三甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-胺;
(1R,3s,5S)-3-((6-(2-(甲氧基甲氧基)-4-(1-甲基-2-氧代-1,2-二氢吡啶-4-基)苯基)哒嗪-3-基)(甲基)氨基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯;
(1R,3s,5S)-3-((6-(4-氯-5-氟-2-(甲氧基甲氧基)苯基)哒嗪-3-基)(甲基)氨基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯;
(1R,3s,5S)-3-((6-(5-氟-2-(甲氧基甲氧基)-4-(1-甲基-2-氧代-1,2-二氢吡啶-4-基)苯基)哒嗪-3-基)(甲基)氨基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯;
(1R,3s,5S)-3-(6-氯哒嗪-3-基氧基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷;和
(1R,3s,5S)-3-((6-(2-(甲氧基甲氧基)-4-(1-(四氢-2H-吡喃-2-基)-1H-吡唑-4-基)苯基)哒嗪-3-基)氧基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷。
在一些实施方式中,本文描述的SMSM具有一个或多个立体中心,并且每个立体中心独立地以R或S构型存在。本文提出的化合物包括所有非对映体、对映体和差向异构体形式及其适当的混合物。本文提供的化合物和方法包括所有顺式(cis)、反式(trans)、顺式(syn)、反式(anti)、entgegen(E)和zusammen(Z)异构体,及其适当的混合物。在某些实施方式中,通过使化合物的外消旋混合物与旋光拆分剂反应形成一对非对映异构体化合物/盐,分离非对映异构体并回收光学纯的对映异构体,将本文描述的化合物制备成其单独的立体异构体。在一些实施方式中,对映异构体的拆分使用本文所述化合物的共价非对映异构体衍生物进行。在另一个实施方式中,基于溶解度的差异,通过分离/拆分技术分离非对映异构体。在其他实施方式中,立体异构体的分离的进行是通过色谱法或通过形成非对映盐并通过重结晶或色谱或其任意组合而分离。Jean Jacques,Andre Collet,Samuel H.Wilen,“Enantiomers,Racemates and Resolutions”,John Wiley And Sons,Inc.,1981。在一个方面,通过立体选择性合成获得立体异构体。
在一些实施方式中,本文所述的化合物被制备为前药。“前药”是指在体内转化为母体药物的试剂。前药通常是有用的,因为在某些情况下,它们可能比母药更易于施用。例如,它们通过口服施用可为生物可用的,而母体药物则不能。前药在药物组合物中的溶解度也可能高于母体药物。在一些实施方式中,前药的设计增加了有效水溶性。前药的一个实例是,但不限于,本文所述的化合物,其以酯(“前药”)的形式施用,以促进其中水溶性不利于迁移的细胞膜上的传递,但一旦在水溶性有益的细胞内侧,其随后代谢水解为羧酸活性实体。前药的另一个实例可以是与酸性基团结合的短肽(聚氨基酸),其中该肽经代谢以显示出活性部分。在某些实施方式中,在体内施用时,前药被化学转化为该化合物的生物学、药学或治疗学活性形式。在某些实施方式中,前药通过一个或多个步骤或过程被酶促代谢为该化合物的生物学、药学或治疗学活性形式。
一方面,设计前药以改变药物的代谢稳定性或转运特性,以掩盖副作用或毒性,以改善药物的风味或改变药物的其他特性或性质。凭借体内药代动力学、药效学过程和药物代谢的知识,一旦知晓药物活性化合物,就可以设计该化合物的前药(参见,例如,Nogrady(1985)Medicinal Chemistry A Biochemical Approach,Oxford University Press,NewYork,388-392页;Silverman(1992),The Organic Chemistry of Drug Design and DrugAction,Academic Press,Inc.,San Diego,352-401页,Rooseboom等,PharmacologicalReviews,56:53-102,2004;Aesop Cho,“Recent Advances in Oral Prodrug Discovery”,Annual Reports in Medicinal Chemistry,Vol.41,395-407,2006;T.Higuchi andV.Stella,Pro-drugs as Novel Delivery Systems,Vol.14of the A.C.S.SymposiumSeries)。
在某些情况下,本文所述的某些化合物可能是另一衍生物或活性化合物的前药。
在一些实施方式中,本文描述的化合物的芳环部分上的位点易于发生各种代谢反应,因此在芳环结构上引入适当的取代基将减少、最小化或消除该代谢途径。在特定的实施方式中,减少或消除芳环对代谢反应的敏感性的合适的取代基是卤素或烷基(仅举例而言)。
在另一实施方式中,本文所述的化合物经同位素标记(例如,采用放射性同位素)或通过其他方式标记,其包括但不限于使用发色团或荧光部分、生物发光标记或化学发光标记。
本文所述的化合物包括同位素标记的化合物,其与本文呈现的各种式和结构中所述的那些相同,但事实上一个或多个原子被原子质量或质量数与通常在自然界中发现的原子质量或质量数不同的原子替代。可掺入本发明化合物的同位素的实例包括氢、碳、氮、氧、硫、氟和氯的同位素,例如,2H,3H,13C,14C,15N,18O,17O,35S,18F,36Cl。一方面,本文所述的同位素标记的化合物,例如其中掺入有放射性同位素如3H和14C的那些,可用于药物和/或底物组织分布测定。一方面,用同位素如氘取代获得了由更大的代谢稳定性所导致的某些治疗优势,例如,增加的体内半衰期或降低的剂量要求。
在另外的或进一步的实施方式中,本文所述的化合物在施用于有需要的生物时代谢以产生代谢产物,其然后用于产生期望的作用,包括期望的治疗作用。
本文所述的化合物可以形成为和/或用作为药学上可接受的盐。药学上可接受的盐的类型包括但不限于:(1)酸加成盐,通过化合物的游离碱形式与药学上可接受的以下反应而形成:无机酸,例如,盐酸,氢溴酸,硫酸,磷酸,间磷酸等;或者有机酸,例如乙酸,丙酸,己酸,环戊烷丙酸,乙醇酸,丙酮酸,乳酸,丙二酸,琥珀酸,苹果酸,马来酸,富马酸,三氟乙酸,酒石酸,柠檬酸,苯甲酸,3-(4-羟基苯甲酰基)苯甲酸,肉桂酸,扁桃酸,甲磺酸,乙磺酸,1,2-乙烷二磺酸,2-羟基乙烷磺酸,苯磺酸,甲苯磺酸,2-萘磺酸,4-甲基双环-[2.2.2]辛-2-烯-1-羧酸,葡庚酸,4,4’-亚甲基双-(3-羟基-2-烯-1-羧酸),3-苯基丙酸,三甲基乙酸,叔丁基乙酸,月桂基硫酸,葡萄糖酸,谷氨酸,羟基萘甲酸,水杨酸,硬脂酸,粘康酸,丁酸,苯乙酸,苯基丁酸酸,丙戊酸等;(2)母体化合物中存在的酸性质子被金属离子(例如碱金属离子(例如锂、钠、钾)、碱土金属离子(例如镁或钙)或铝离子)替代时形成的盐。在某些情况下,本文所述的化合物可能与有机碱配位,所述有机碱例如但不限于乙醇胺,二乙醇胺,三乙醇胺,三甲胺,N-甲基葡糖胺,二环己基胺,三(羟甲基)甲胺。在其他情况下,本文所述的化合物可与氨基酸形成盐,所述氨基酸例如但不限于精氨酸、赖氨酸等。用于与包括酸性质子的化合物形成盐的可接受的无机碱包括但不限于氢氧化铝,氢氧化钙,氢氧化钾,碳酸钠,氢氧化钠等。
应当理解的是,对药物上可接受的盐的提及包括溶剂加成形式,特别是溶剂化物。溶剂化物包含化学计量的或非化学计量的溶剂,并且可以在采用药学上可接受的溶剂(例如水、乙醇等)的结晶过程中形成。当溶剂是水时形成水合物,或者当溶剂是醇时形成醇化物。在一些实施方式中,本文所述化合物的溶剂化物可在本文所述方法期间方便地制备或形成。另外,本文提供的化合物可以以非溶剂化物以及溶剂化物形式存在。通常,出于本文提供的化合物和方法的目的,溶剂化形式被认为等同于非溶剂化形式。
在一些实施方式中,SMSM的分子量至多为约2000道尔顿,1500道尔顿,1000道尔顿或900道尔顿。在一些实施方式中,SMSM的分子量至少为100道尔顿,200道尔顿,300道尔顿,400道尔顿或500道尔顿。在一些实施方式中,SMSM不包含磷酸二酯键。
制备化合物的方法
可以使用标准合成技术或使用本领域已知的方法与本文描述的方法的组合来合成本文描述的化合物。除非另有说明,否则可以使用常规的质谱、NMR、HPLC、蛋白质化学、生物化学、重组DNA技术和药理学方法。可以使用标准有机化学技术制备化合物,例如,March’s Advanced Organic Chemistry,第6版,John Wiley and Sons,Inc中所述的那些。可以采用本文所述的合成转化的替代反应条件,例如变化溶剂、反应温度、反应时间以及不同的化学试剂和其他反应条件。起始原料可以从商业来源获得或可以容易地制备。仅作为示例,提供了用于制备本文所述的SMSM的方案。
在一些实施方式中,用于制备本文所述的SMSM的方案为方案1:
在一些实施方式中,用于制备本文所述的SMSM的方案为方案2:
在一些实施方式中,用于制备本文所述的SMSM的方案为方案3:
在一些实施方式中,用于制备本文所述的SMSM的方案为方案4:
在一些实施方式中,用于制备本文所述的SMSM的方案为方案5:
在一些实施方式中,用于制备本文所述的SMSM的方案为方案6:
在一些实施方式中,用于制备本文所述的SMSM的方案为方案7:
在一些实施方式中,用于制备本文所述的SMSM的方案为方案8:
在一些实施方式中,用于制备本文所述的SMSM的方案为方案9:
在一些实施方式中,用于制备本文所述的SMSM的方案为方案10:
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在一些实施方式中,用于制备本文所述的SMSM的方案为方案12:
在一些实施方式中,用于制备本文所述的SMSM的方案为方案13:
在一些实施方式中,用于制备本文所述的SMSM的方案为方案14
在一些实施方式中,用于制备本文所述的SMSM的方案为方案15:
在一些实施方式中,用于制备本文所述的SMSM的方案为方案16
在一些实施方式中,用于制备本文所述的SMSM的方案为方案17:
在一些实施方式中,用于制备本文所述的SMSM的方案为方案18:
在一些实施方式中,用于制备本文所述的SMSM的方案为方案19:
详述可用于制备本文所述化合物的反应物的合成或提供描述该制备的文章的参考的合适的参考书和论文包括例如,“Synthetic Organic Chemistry”,John Wiley&Sons,Inc.,New York;S.R.Sandler等,“Organic Functional Group Preparations”,第2版,Academic Press,New York,1983;H.O.House,“Modern Synthetic Reactions”,第2版,W.A.Benjamin,Inc.Menlo Park,Calif.1972;T.L.Gilchrist,“HeterocyclicChemistry”,第2版,John Wiley&Sons,New York,1992;J.March,“Advanced OrganicChemistry:Reactions,Mechanisms and Structure”,第4版,Wiley Interscience,NewYork,1992。详述可用于制备本文所述化合物的反应物的合成或提供描述该制备的文章的参考的另外的合适的参考书和论文包括例如,Fuhrhop,J.和Penzlin G.“OrganicSynthesis:Concepts,Methods,Starting Materials”,第二修订和增补版(1994)JohnWiley&Sons ISBN:3527-29074-5;Hoffman,R.V.“Organic Chemistry,An IntermediateText”(1996)Oxford University Press,ISBN 0-19-509618-5;Larock,R.C.“Comprehensive Organic Transformations:A Guide to Functional GroupPreparations”第2版(1999)Wiley-VCH,ISBN:0-471-19031-4;March,J.“AdvancedOrganic Chemistry:Reactions,Mechanisms,and Structure”第4版(1992)John Wiley&Sons,ISBN:0-471-60180-2;Otera,J.(编辑)“Modern Carbonyl Chemistry”(2000)Wiley-VCH,ISBN:3-527-29871-1;Patai,S.“Patai’s 1992Guide to the Chemistry ofFunctional Groups”(1992)Interscience ISBN:0-471-93022-9;Solomons,T.W.G.“Organic Chemistry”第7版(2000)John Wiley&Sons,ISBN:0-471-19095-0;Stowell,J.C.,“Intermediate Organic Chemistry”第2版(1993)Wiley-Interscience,ISBN:0-471-57456-2;“Industrial Organic Chemicals:Starting Materials andIntermediates:An Ullmann’s Encyclopedia”(1999)John Wiley&Sons,ISBN:3-527-29645-X,共8卷;“Organic Reactions”(1942-2000)John Wiley&Sons,超过55卷;和“Chemistry of Functional Groups”John Wiley&Sons,共73卷。
在所述反应中,可能需要保护反应性官能团,例如羟基、氨基、亚氨基、硫代或羧基,在最终产物中所需要它们的情况下,以避免它们不希望地参与反应。适用于创建保护基以及它们的去除的技术的详细说明描述于Greene和Wuts,Protective Groups in OrganicSynthesis,第3版,John Wiley&Sons,New York,NY,1999和Kocienski,ProtectiveGroups,Thieme Verlag,New York,NY,1994,它们的这些公开内容通过引用并入本文。
SMSM可以使用已知技术制备,并进一步经化学修饰,在一些实施方式中,以促进核内转移至例如剪接复合物组分、剪接体或前mRNA分子。本领域普通技术人员将理解用于核内转移的化学修饰的标准药物化学方法(例如,减少电荷、优化大小和/或改变亲脂性)。
药物组合物
在一些实施方式中,将本文描述的化合物配制成药物组合物。药物组合物以常规方式使用一种或多种促进活性化合物加工成可药用制剂的药学上可接受的非活性成分配制。适当的制剂取决于所选的施用途径。例如,本文描述的药物组合物的汇总可以在例如以下中找到:Remington:The Science and Practice of Pharmacy,Nineteenth编(Easton,Pa.:Mack Publishing Company,1995);Hoover,John E.,Remington’s PharmaceuticalSciences,Mack Publishing Co.,Easton,Pennsylvania 1975;Liberman,H.A.和Lachman,L.编,Pharmaceutical Dosage Forms,Marcel Decker,New York,N.Y.,1980;和Pharmaceutical Dosage Forms and Drug Delivery Systems,第7版(LippincottWilliams&Wilkins1999),此类公开内容通过引用并入本文。
药物组合物可以是本文描述的SMSM与一种或多种其他化学成分(即药学上可接受的成分)的混合物,所述其他化学成分例如载体,赋形剂,粘合剂,填充剂,悬浮剂,调味剂,甜味剂,崩解剂,分散剂,表面活性剂,润滑剂,着色剂,稀释剂,增溶剂,增湿剂,增塑剂,稳定剂,渗透增强剂,润湿剂,消泡剂,抗氧化剂,防腐剂或它们的一种或多种组合。该药物组合物促进施用化合物至生物体。
本文所述的组合物可以多种方式施用于受试者,包括肠胃外,静脉内,皮内,肌内,结肠,直肠或腹膜内。在一些实施方式中,通过受试者的腹膜内注射,肌内注射,皮下注射或静脉内注射施用小分子剪接调节剂或其药学上可接受的盐。在一些实施方式中,药物组合物可以肠胃外,静脉内,肌内或口服施用。包含小分子剪接调节剂的口服剂可以是用于口服施用的任何合适形式,例如液体、片剂、胶囊等。可以将口服制剂进一步包衣或处理以防止或减少其在胃中的溶解。可以使用本领域已知的任何适当方法将本发明的组合物施用于受试者。用于本发明的合适制剂和递送方法通常是本领域众所周知的。例如,本文描述的小分子剪接调节剂可以配制成具有药学上可接受的稀释剂、载体或赋形剂的药物组合物。所述组合物可以包含近似生理条件所需的药学上可接受的助剂,包括pH调节剂和缓冲剂,张力调节剂,湿润剂等,例如乙酸钠,乳酸钠,氯化钠,氯化钾,氯化钙,脱水山梨糖醇单月桂酸酯,三乙醇胺油酸酯等。
本文所述的药物制剂可以通过多种施用途径以多种方式向受试者施用,包括但不限于口服,肠胃外(例如,静脉内,皮下,肌内,髓内注射,鞘内,直接心室内,腹膜内,淋巴内,鼻内注射),鼻内,颊,局部或经皮施用途径。本文所述的药物制剂包括但不限于水性液体分散体,自乳化分散体,固溶体,脂质体分散体,气雾剂,固体剂型,粉剂,速释制剂,控释制剂,速溶制剂,片剂,胶囊,丸剂,延迟释放制剂,延长释放制剂,脉冲释放制剂,多颗粒制剂以及速释和控释混合制剂。
在一些实施方式中,药物制剂为片剂形式。在其他实施方式中,包含本文所述的SMSM的药物制剂为胶囊形式。一方面,用于口服施用的液体制剂剂型是水性悬浮液或溶液形式,其选自但不限于水性口服分散液、乳剂、溶液剂、酏剂、凝胶剂和糖浆剂。
对于通过吸入施用,可以将本文所述的SMSM配制用作气雾剂、雾剂或粉剂。对于经颊或舌下施用,组合物可以采取以常规方式配制的片剂、锭剂或凝胶剂的形式。在一些实施方式中,本文所述的SMSM可以制备为透皮剂型。在一些实施方式中,可以将本文所述的SMSM配制成适用于肌内、皮下或静脉内注射的药物组合物。在一些实施方式中,本文所述的SMSM可以局部施用,并且可以配制成多种局部可施用的组合物,例如溶液,悬浮液,洗液,凝胶,糊剂,药用棒,香脂,乳膏或软膏。在一些实施方式中,本文所述的SMSM可以配制成直肠组合物,例如灌肠剂,直肠凝胶,直肠泡沫,直肠气雾剂,栓剂,果冻栓或保留灌肠剂。
剪接
广泛的转录后加工发生在真核前mRNA成熟和从细胞核出口至细胞质之前,包括在5'末端添加7-甲基鸟苷帽,在3'末端切割和添加聚-A尾,以及通过剪接体去除中间序列或内含子。绝大多数高级真核基因含有多个内含子,这些内含子以高精度和高保真度被剪接,以维持外显子的阅读框架。前mRNA的剪接可利用通过一系列小核核糖核蛋白(snRNP)复合物(例如,snRNP U1,U2,U4,U5,U6,U11,U12m U4atc和U6 atc)和大量蛋白,包括剪接体蛋白以及正性和负性作用剪接调节剂的内含子和外显子边界和内部短共有序列的识别。
含富丝氨酸-精氨酸(SR)-结构域的蛋白质通常用于促进组成型剪接。它们还可以通过分别结合内含子或外显子剪接增强子(ISE)或ESE序列来调节选择性剪接。其他前mRNA结合蛋白(例如hnRNP)通过与内含子或外显子剪接抑制子(分别为ISS或ESS)序列结合来调节剪接,并且还可以充当一般的剪接调节剂。SR蛋白家族是一类至少10种蛋白,其除了RNA结合外还具有特征性的富丝氨酸/精氨酸结构域。通常认为SR蛋白通过在5'剪接位点同时结合U1 snRNP的核心组分U170K和在3'剪接位点结合U2AF35来增强剪接,从而桥接内含子的两端。尽管SR蛋白的这种特殊功能似乎是多余的,但由于任何单个SR蛋白都可以保证一个前mRNA进行组成性剪接,因此各种SR蛋白在特定前mRNA的选择性剪接中的作用是不同的,部分是由于它们识别并结合独特的共有序列的能力。SR蛋白的RS结构域的磷酸化可以导致其蛋白相互作用、RNA结合、定位、运输以及在选择性剪接中作用的调节。已经鉴定出若干磷酸化SR蛋白的细胞激酶,包括SR蛋白激酶(SRPK),Cdc2样激酶(Clks),前mRNA加工突变体4(PRP4)和拓扑异构酶I。SR蛋白的适当功能化可能需要最佳磷酸化,因为RS结构域的低磷酸化和超磷酸化均可能不利于其在组成型剪接和选择性剪接中的作用。
在高等真核生物中,绝大多数基因包含一个或多个内含子,这导致外显子剪接在一起以生成成熟的mRNA和微RNA(miRNA)。在宿主细胞核中,前mRNA剪接是从前mRNA中去除内含子并将外显子连接在一起以生成成熟的mRNA和前-miRNA,然后将其输出至细胞质以翻译成多肽基因产物的机制。前mRNA的剪接可以顺式发生,其中两个外显子来自两个相邻的共转录序列,或反式发生,当两个外显子来自不同的前mRNA转录本时。不同蛋白质产物(同工型)之比可能是由于前mRNA内选择性剪接事件的频率,其导致不同数量的不同剪接变体。在一些实施方式中,前mRNA的选择性剪接可能导致到2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16,17,18,19或20种蛋白同工型被表达。
剪接的异常被认为是所有遗传疾病的大约半数的原因。由于涉及外显子-内含子边界识别的共有序列中的突变而引起的异常剪接可导致多达15%的遗传疾病。另外,由于剪接因子和调节剂的功能丧失或获得而导致的剪接系统本身的缺陷是导致从癌症到神经退行性疾病的广泛人类疾病的原因。组成型和选择性剪接均受上游信号通路的调节。这种调节在发育期间,在某些同工型的组织特异性表达中,在细胞周期期间以及对外部信号分子的响应中可能是必不可少的。
选择性剪接允许单个基因表达不同的mRNA同工型,从而在不需要扩展基因组的情况下在促进高等真核生物的细胞复杂性中起主要作用。剪接也可以通过上游信号通路进行调节。例如,上游信号传导途径可调节选择性剪接并增加或减少mRNA不同同工型的表达水平。
选择性剪接事件由多种剪接因子以组织类型、发育阶段和信号依赖性方式高度调节。此外,剪接缺陷的非突变基原因和剪接系统本身的缺陷,例如由于剪接因子功能的丧失/获得或它们的相对化学计量,导致了从癌症到神经变性疾病的多种人类疾病。在许多疾病中,疾病状态是由基因表达的两种或多种蛋白质的不同同工型的比率改变引起的。在一些实施方式中,蛋白质产物比率的改变是由于前mRNA内的选择性剪接事件频率的改变,导致产生的剪接变体的比率发生变化。在一些实施方式中,前mRNA的选择性剪接可导致2,3,4,5,6,7,8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20种蛋白同工型被表达。在一些实施方式中,剪接变体比率的变化是由基因突变引起的。
在真核生物中,绝大多数剪接过程是由剪接体催化的,剪接体是一种独特步骤中出现的RNA-蛋白复合物,并且除了五个剪接体snRNA以外,可能包含数百种不同蛋白的子集。这些因素决定了剪接体在5'和3'剪接位点序列上的准确定位。需要这么多因素的原因反映出这样的观察,即外显子识别可能受许多前mRNA特征的影响,这些特征例如外显子长度、序列识别、增强子和沉默子元件的存在、上游剪接信号的强度、启动子结构、以及RNA的合成率、二级和三级RNA结构。
所有哺乳动物疾病最终都由转录组介导。只要信使mRNA(mRNA)是转录组的一部分,并且所有蛋白表达均来自mRNA,则有可能通过调节相关蛋白的表达并进而通过调控相应上游mRNA的翻译来干预蛋白介导的疾病。但是,mRNA只是转录组的一小部分:其他转录的RNA也直接通过RNA结构(例如核糖核蛋白)的结构和功能以及通过蛋白质表达和作用(包括(但不限于)microRNA(miRNA),长非编码RNA(lncRNA),长基因间非编码RNA(lincRNA),小核仁RNA(snoRNA),小核RNA(snRNA),小卡哈尔体特异性RNA(scaRNA),piwi相互作用RNA(piRNA),竞争内源性(ceRNA)和伪基因)来调节细胞生物学。以此水平干预的药物具有调节任何和所有细胞过程的潜力。在大多数情况下,现有的治疗方法(如反义RNA或siRNA)尚未克服诸如药物递送、吸收、靶器官分布、药代动力学和细胞渗透等重大挑战。相比之下,小分子具有成功克服这些障碍的悠久历史,并且这些特性使它们适合用作药物,可以通过一系列类似物的轻易优化来克服这些挑战。与之形成鲜明对比的是,小分子作为产生治疗益处的RNA配体的应用几乎没有受到药物发现界的关注。
染色体中的DNA序列被转录成前mRNA,其包含编码区(外显子),通常还包含中间非编码区(内含子)。通过剪接从前mRNA中除去内含子。前mRNA剪接通过两步骤机制进行。第一步,切割5'剪接位点,得到“自由”5'外显子和套索中间体。第二步,将5'外显子连接至3'外显子,并释放内含子作为套索产物。这些步骤在小核核糖核蛋白和称为剪接体的蛋白的复合物中被催化。
在大多数情况下,剪接反应发生在相同的前mRNA分子内,其称为顺式剪接。两个独立转录的前mRNA之间的剪接称为反式剪接。
内含子是真核DNA的一部分,其插入该DNA的编码部分或“外显子”之间。内含子和外显子被转录入RNA,其称为“初级转录本,mRNA前体”(或“前mRNA”)。可以从前mRNA中去除内含子,从而可以产生外显子编码的天然蛋白质(如本文所用的术语“天然蛋白质”是指天然存在的,野生型或功能性蛋白质)。在剪接过程中进行自前mRNA去除内含子以及外显子的后续连接。
剪接过程是一系列反应,它们在转录后但在翻译前在RNA上进行,并由剪接因子介导。因此,“前mRNA”可以是既包含外显子又包含内含子的RNA,且成熟的mRNA(“mRNA”)可以是去除内含子并将外显子依序连接在一起,以至于蛋白质可以自其通过核糖体翻译的RNA。
内含子可以由一组“剪接元件”定义,所述“剪接元件”是剪接系统的一部分,可能是剪接所必需的,并且是相对短的,保守的RNA片段,其结合进行剪接反应的各种剪接因子。因此,每个内含子由一个5'剪接位点,一个3'剪接位点和位于它们之间的分支点定义。剪接元件还包括位于外显子中的外显子剪接增强子和沉默子,以及位于内含子中与剪接位点和分支点相距一定距离的内含子剪接增强子和沉默子。除了剪接位点和分支点外,这些元件还控制可选异常和组成型剪接。
大多数真核基因的初始RNA转录物(前mRNA)保留在细胞核中,直到非编码内含子序列被剪接体去除以产生成熟的信使RNA(mRNA)。发生的剪接会有所不同,因此来自同一初级转录本的替代蛋白质产物的合成可能会受到组织特异性或发育信号的影响。据信,包括许多癌症在内的人类遗传疾病中有很大一部分是由前mRNA剪接的正常模式的偏差引起的。剪接体是一种复合物,其包含由小核RNA和蛋白质组成的核糖核蛋白(snRNP)颗粒。剪接体的snRNA组分可以促进剪接的两个酯交换反应。
在大多数真核生物中共存两种独特的剪接体:U2依赖性剪接体,其催化U2型内含子的去除;以及数量较少的U12依赖性剪接体,其仅存在于真核生物的一部分中,并剪接罕见的U12型内含子。U2依赖性剪接体由U1,U2,U5和U4/U6 snRNP以及许多非snRNP蛋白组装而成。U2snRNP在剪接体装配中的第一ATP依赖性步骤期间由两个弱结合蛋白亚基SF3a和SF3b募集。SF3b由七个保守蛋白组成,包括PHF5α,SF3b155,SF3b145,SF3b130,SF3b49,SF3b14a和SF3b10。
剪接或RNA剪接通常是指将新生的前体信使RNA(前mRNA)转录物编辑成成熟的信使RNA(mRNA)。剪接是一个生物化学过程,其包括去除内含子,然后进行外显子连接。顺序酯交换反应是由下游内含子中的分支腺苷(分支点;BP)对5'剪接位点(5’ss)的亲核攻击引发的,其导致形成具有2’,5’--磷酸二酯键的内含子套索中间体。接着是对3'剪接位点(3’ss)的5’ss介导的攻击,导致去除内含子套索并形成剪接的RNA产物。
剪接可以通过各种顺式作用元件和反式作用因子来调节。顺式作用元件是mRNA的序列,并且可以包括核心共有序列和其他调控元件。核心共有序列通常可以指保守的RNA序列基序,包括5’ss,3’ss,聚嘧啶束和BP区,它们可以起到剪接体募集的作用。BP是指前mRNA的部分保守序列,通常为3’ss上游少于50个核苷酸。在剪接反应的第一步骤期间,BP与5’ss发生反应。其他调控型顺式作用元件可包括外显子剪接增强子(ESE),外显子剪接沉默子(ESS),内含子剪接增强子(ISE)和内含子剪接沉默子(ISS)。反式作用因子可以是与顺式作用元件结合的蛋白质或核糖核蛋白。
剪接位点识别和调节的剪接可以主要通过两个动力学大分子机构完成,即主要(U2依赖性)和次要(U12依赖性)剪接体。每个剪接体均含有五个snRNP:主要剪接体为U1,U2,U4,U5和U6 snRNP(其处理约95.5%的全部内含子);次要剪接体为U11,U12,U4atac,U5和U6 atac snRNP。5’ss,3’ss and BP位点处共有序列元件的剪接体识别是剪接途径的步骤之一,并且可以通过ESE,ISE,ESS和ISS进行调节,其可以通过辅助剪接因子(包括SR蛋白和hnRNP)来识别。聚嘧啶束结合蛋白(PTBP)可以与内含子的聚嘧啶束结合,并可能促进RNA环化。
选择性剪接是单个基因最终可产生若干种不同蛋白质的机制。选择性剪接可以通过与前mRNA关联的多种不同蛋白(称为“选择性剪接调节蛋白”)的协调作用来实现,并导致成熟mRNA中包含独特的替代外显子。这些基因转录物的替代形式可以产生特定蛋白质的不同同工型。可与选择性剪接调节蛋白结合的前mRNA分子序列可在内含子或外显子中找到,其包括但不限于ISS,ISE,ESS,ESE和聚嘧啶束。许多突变可以改变剪接模式。例如,突变可以是顺式作用元件,并且可以位于核心共有序列(例如5’ss,3’ss和BP)或调节剪接体募集的调节元件,包括ESE,ESS,ISE和ISS。
隐蔽剪接位点,例如,隐蔽5’ss和隐蔽3’ss,可以指通常不被剪接体识别的剪接位点,因此处于休眠状态。隐蔽剪接位点可以例如通过顺式作用元件或反式作用因子的突变,或结构构型(例如凸起)来识别或激活。
剪接调节
本发明预期使用具有有利的药物性质的小分子,其调节靶RNA的剪接活性。本文提供了调节靶多核苷酸剪接的小分子剪接调节剂(SMSM)。在一些实施方式中,SMSM结合并调节靶RNA。在一些实施方式中,本文提供了一种SMSM库,所述SMSM结合并调节一个或多个靶RNA。在一些实施方式中,靶RNA为mRNA。在一些实施方式中,靶RNA为非编码RNA的mRNA。在一些实施方式中,靶RNA为前mRNA。在一些实施方式中,靶RNA为hnRNA。在一些实施方式中,小分子调节靶RNA的剪接。在一些实施方式中,本文提供的小分子在靶RNA的序列处调节剪接。在一些实施方式中,本文提供的一个小分子在靶RNA的隐蔽剪接位点序列处调节剪接。在一些实施方式中,本文提供的一个小分子与靶RNA结合。在一些实施方式中,本文提供的小分子与剪接复合物组分结合。在一些实施方式中,本文提供的小分子与靶RNA和剪接复合物组分结合。
因此,本文提供了预防或诱导前mRNA分子中的剪接事件的方法,其包括使前mRNA分子和/或剪接系统的其他元件(例如,在细胞内)与本文提供的化合物接触以预防或诱导前mRNA分子中的剪接事件。预防或诱导的剪接事件可以是例如异常剪接事件,组成型剪接事件或选择性剪接事件。
本文进一步提供了一种鉴定能够预防或诱导前mRNA分子中的剪接事件的化合物的方法,其包括使该化合物与如本文所述的涉及可变、异常和/或组成型剪接的剪接元件和/或因子在由此产生并检测阳性(预防或诱导剪接)或阴性(未预防或诱导剪接)作用的条件下接触(例如,在细胞内),并将产生阳性作用的化合物鉴定为能够预防或诱导剪接事件的化合物。
在一些实施方式中,在药学上可接受的载体中的本文所述的小分子化合物预防或诱导前mRNA分子中的可变或异常剪接事件。如上所述,本文提供的小分子化合物不是反义或反基因寡核苷酸。表1A、表1B和表1C显示了示例性化合物的化学结构和名称,且并不旨在包括所有内容。
在一些实施方式中,本文提供了一种上调天然蛋白质在含有编码该天然蛋白质的DNA的细胞中的表达的方法,其中该DNA包含突变或无突变,所述突变通过其异常和/或选择性剪接导致天然蛋白质的下调。例如,该DNA可以编码具有突变或异常二级或三级结构的前mRNA,从而导致一种或多种蛋白质同工型的下调。该方法可以包括将本文提供的预防异常剪接事件的小分子引入细胞中,从而通过正确剪接除去天然内含子,并由细胞产生天然蛋白质。在一些实施方式中,提供了一种方法,其包括将本文提供的调节选择性剪接事件的小分子引入细胞,以产生与不调节选择性剪接而将产生的蛋白质具有不同功能的蛋白质。
在一些实施方式中,本文提供了一种在包含编码天然蛋白质的DNA的细胞中下调该天然蛋白质表达的方法,其中该DNA包含突变或无突变,所述突变通过其异常和/或选择性剪接导致天然蛋白质的上调。例如,该DNA可以编码具有突变或异常的二级或三级结构的前mRNA,其导致一种或多种蛋白质同工型的上调。该方法可以包括将本文提供的预防异常剪接事件的小分子引入细胞中,从而通过正确剪接除去天然内含子,并由细胞产生天然蛋白质。在一些实施方式中,提供了一种方法,其包括将本文提供的调节选择性剪接事件的小分子引入细胞,以产生与不调节选择性剪接而将产生的蛋白质具有不同功能的蛋白质。例如,方法可以包括在含有突变或异常的二级或三级结构的前mRNA分子中预防异常剪接和/或预防选择性剪接事件。当存在于前mRNA中时,突变或异常的二级或三级结构可导致前mRNA剪接错误,并产生不同于通常由无突变或异常的二级或三级结构的前mRNA产生的mRNA的异常mRNA或mRNA片段。例如,前mRNA分子可包含:(i)定义天然内含子的第一组剪接元件,当不存在突变或异常的二级或三级结构时,可通过剪接将其除去,以产生编码天然蛋白质的第一mRNA分子,和(ii)由突变或异常的二级或三级结构诱导的第二组剪接元件,其定义了不同于天然内含子的异常内含子,当存在突变或异常的二级或三级结构时,通过剪接将异常内含子去除产生不同于第一mRNA分子的异常第二mRNA分子。该方法可以包括使如本文所述的剪接系统的前mRNA分子和/或其他因子和/或元件(例如,在细胞内)与本文所述的化合物接触,以预防或促进前mRNA分子中的异常剪接事件,从而通过正确剪接除去天然内含子,并增加细胞中天然蛋白质的产生。
本文还提供了一种上调RNA表达的方法,该RNA表达否则将通过调节RNA中的选择性剪接事件而下调。该方法可以包括使剪接系统的前mRNA分子和/或其他元件和/或因子与本文所述的化合物接触以调节选择性剪接事件,从而抑制天然剪接事件并促进选择性剪接事件,其上调在天然剪接事件的控制下被下调的RNA表达。
本文还提供了一种下调RNA表达的方法,该RNA表达否则将通过调节RNA中的选择性剪接事件而上调。该方法可以包括使剪接系统的前mRNA分子和/或其他元件和/或因子与本文所述的化合物接触以调节选择性剪接事件,从而抑制天然剪接事件并促进选择性剪接事件,其下调在天然剪接事件的控制下被上调的RNA表达。
本文所述的方法、化合物和组合物具有多种用途。例如,它们在需要具有手段下调要表达的RNA表达直到一定时间,此后需要上调RNA表达的任何过程中都是有用的。对于此用途,要表达的RNA可以是编码要生产的蛋白质的任何RNA,只要基因包含天然内含子即可。RNA可以通过任何合适的方式突变,例如位点特异性诱变(参见,T.Kunkel,美国专利号4,873,192)以故意产生异常的第二组剪接元件,其定义了异常内含子,该内含子实质上下调基因的表达。可以通过标准重组技术将编码RNA的序列插入合适的表达载体中,并将表达载体插入宿主细胞(例如,真核细胞如酵母、昆虫或哺乳动物细胞(例如,人、大鼠))中。然后可以通过标准技术在培养物中培养宿主细胞。当需要上调突变基因的表达时,可以将合适制剂中的本发明的合适化合物加入培养基中,从而上调基因的表达。
本文还提供了一种改变从基因产生的剪接变体的比率的方法。该方法可以包括使剪接系统的前mRNA分子和/或其他元件和/或因子与本文所述的一种或多种化合物接触以调节选择性剪接事件。本发明的一种或多种化合物可用于作用于前mRNA内可能发生的1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16,17,18,19或20个选择性剪接事件。在一些实施方式中,第一剪接变体可能被下调或抑制和/或第二剪接变体可能被上调,导致两种或更多种RNA的剪接变体的比率发生改变。在一些实施方式中,第一剪接变体可能被上调而第二剪接变体可能不受影响,从而改变RNA的比率。在一些实施方式中,第一剪接变体可能被下调而第二剪接事件可能不受影响,从而改变RNA的比率。
本文所述的方法、化合物和制剂还可用作体外或体内工具,以检查和调节由基因编码的人或动物RNA中的剪接事件,例如那些发育和/或组织调节的剪接事件(例如,选择性剪接事件)。
本文所述的化合物和制剂也可用作治疗涉及异常和/或选择性剪接的疾病的治疗剂。因此,在一些实施方式中,一种治疗患有与前mRNA分子中的选择性或异常剪接事件有关的病症或障碍的受试者的方法,其包括向该受试者施用治疗有效量的本文所述的化合物以调节选择性剪接事件或预防异常剪接事件,从而治疗该受试者。该方法可以例如在前mRNA分子中恢复正确的剪接事件。该方法可以例如在药学上可接受的载体中利用本文所述的小分子化合物。
包含本文所述的小分子的制剂可以包含生理或药学上可接受的载体,例如水性载体。因此,本文所述方法中使用的制剂包括但不限于适于口服施用,胃肠外施用,包括皮下,皮内,肌内,静脉内和动脉内施用以及局部施用(例如,将可吸入颗粒物的雾化制剂施用于患有囊性纤维化或肺癌的患者的肺部,或用于牛皮癣患者的经皮施用的乳膏或洗剂制剂)的那些制剂。该制剂可以方便地以单位剂型存在,并且可以通过本领域公知的任何方法制备。在任何给定情况下,最合适的施用途径可能取决于受试者、所治疗疾病的性质和严重程度以及所使用的特定活性化合物,这将很容易被本领域技术人员确定。
本文还提供了具有上述特征的本文所述的化合物用于制备用于上调或下调患有如上所述的与前mRNA分子的异常或选择性剪接相关的疾病的患者中的RNA表达的药物中的方法。在一些实施方式中,药物上调基因表达。在其他实施方式中,药物下调基因表达。在根据本发明的药物的制造中,该化合物可以与尤其是药学上可接受的载体混合。载体可以是固体或液体。一种或多种化合物可以以任何组合掺入本文所述的制剂中,所述制剂可以通过任何众所周知的药学技术来制备,例如将组分混合和/或包括一种或多种辅助治疗成分。
本发明人在本文中鉴定了低分子量化合物(有时在本文中称为小分子),其阻断mRNA剪接和/或增强(促进、强化)mRNA剪接。可以通过本文所述的方法调节的剪接包括选择性剪接,例如外显子跳跃、内含子保留、假外显子跳跃、外显子排斥、部分内含子排斥等,根据所涉及的剪接序列和RNA(或编码RNA的基因)或外显子等因素,可以在存在或不存在对目标剪接序列具有特异性的反义寡核苷酸(AO)的情况下完成剪接的调节。在一些实施方式中,小分子和AO协同作用。
在一些方面,方法包括使剪接调节化合物(例如,SMSM)与调节前mRNA的剪接的前mRNA接触以利于促进细胞增殖的转录物的表达。例如,本文描述的SMSM可以增加促进细胞增殖的转录物的一种或多种同工型。例如,本文描述的SMSM可以减少预防或抑制细胞增殖的转录物的一种或多种同工型的表达。
在一些方面,方法包括使剪接调节化合物(例如,SMSM)与调节前mRNA的剪接的前mRNA接触以利于预防或抑制细胞增殖的转录物的表达。例如,本文描述的SMSM可以增加预防或抑制细胞增殖的转录物的一种或多种同工型。例如,本文描述的SMSM可以减少促进细胞增殖的转录物的一种或多种同工型的表达。
在一些实施方式中,调节前mRNA的剪接的方法包括使用SMSM来降低受试者中转录物的一种或多种同工型的表达或功能。该方法可以包括向受试者施用SMSM或包含SMSM的组合物,其中该SMSM结合前mRNA或剪接复合物组分并调节前mRNA的剪接以利于转录物的一种或多种同工型的表达。该方法可以包括向受试者施用SMSM或包含SMSM的组合物,其中该SMSM结合前mRNA或剪接复合物组分并调节前mRNA的剪接以不利于转录物的的一种或多种同工型的表达。
在一些实施方式中,本发明提供了一种治疗患有与前mRNA的异常剪接相关的疾病或病症的受试者的方法。该方法可以包括向受试者施用SMSM或包含SMSM的组合物,其中该SMSM结合前mRNA或剪接复合物组分并调节前mRNA的剪接以抑制转录物的一种或多种同工型的表达。该方法可以包括向受试者施用SMSM或包含SMSM的组合物,其中该SMSM结合前mRNA或剪接复合物组分并调节前mRNA的剪接以增加转录物的一种或多种同工型的表达。
许多疾病与基因的异常基因产物(例如,RNA转录物或蛋白质)的表达有关。例如,由于蛋白质表达的相应变化,异常数量的RNA转录物可能导致疾病。特定RNA转录物数量的变化可能是多种因素导致的。首先,RNA转录物数量的变化可能是由于特定基因的转录水平异常所致,例如转录因子或转录过程的一部分的扰动,从而导致了特定RNA转录物表达水平的变化。其次,特定RNA转录物的剪接变化,例如由于特定剪接过程的扰动或导致修饰剪接的基因突变,可能会改变特定RNA转录物的水平。特定RNA转录物稳定性的改变或维持RNA转录物稳定性的组分的改变,例如聚-A尾并入过程或对某些结合和稳定RNA转录物的因子或蛋白质的影响,可能会导致特定RNA转录物的水平改变。特定RNA转录物的翻译水平也会影响这些转录物的数量,影响或上调RNA转录物的衰变过程。最后,异常的RNA运输或RNA螯合也可能导致RNA转录物功能水平的改变,并可能影响RNA转录物的稳定性、进一步加工或翻译。
在一些实施方式中,本文提供了调节前mRNA编码的一种,两种,三种或更多种RNA转录物的量的方法,其包括使细胞与SMSM化合物或药学上可接受的盐接触。在一些实施方式中,在细胞培养物中使细胞与SMSM化合物或其药学上可接受的盐接触。在其他实施方式中,在受试者(例如,非人类动物受试者或人受试者)中,使细胞与SMSM化合物或其药学上可接受的盐接触。
在一些实施方式中,本文提供了用于治疗、预防疾病或病症和/或延缓其进展的方法,其包括向受试者,特别是哺乳动物,施用有效量的如本文所述的小分子剪接调节剂。
在一些实施方式中,本文提供了用于治疗疾病或病症的组合物和方法,其包括促进前mRNA的外显子跳跃的预防或纠正的空间调节剂化合物或其药学上可接受的盐。本发明还提供了用于在需要其的受试者(例如,可以从蛋白质的产量增加中受益的受试者)的细胞中增加成熟mRNA生产,以及继而增加蛋白质生产的组合物和方法。本发明还提供了用于在需要其的受试者(例如,可以从蛋白质的产量减少中受益的受试者)的细胞中减少成熟mRNA生产,以及继而减少蛋白质生产的组合物和方法。在一个实施方式中,所描述的方法可以用于治疗患有由基因突变引起的疾病或病症的受试者,所述基因突变包括错义、剪接、移码和无义突变,以及全基因缺失,其导致蛋白质产生不足。在另一个实施方式中,所描述的方法可以用于治疗患有不是由基因突变引起的疾病或病症的受试者。在一些实施方式中,本发明的组合物和方法用于治疗患有疾病或病症的受试者,所述受试者可以从蛋白质的增加生产中受益。在一些实施方式中,本发明的组合物和方法用于治疗患有疾病或病症的受试者,所述受试者可以从蛋白质的增加生产中受益。在一些实施方式中,本发明的组合物和方法用于治疗患有疾病或病症的受试者,所述受试者可以从蛋白质的减少生产中受益。
在一些实施方式中,本文提供了通过增加受试者细胞的靶蛋白或功能性RNA的表达来治疗有此需要的受试者中的疾病或病症的方法,其中该细胞具有引起例如前mRNA的外显子跳跃或内含子包含或其部分的突变,其中该前mRNA编码靶蛋白或功能性RNA。该方法可以包括使受试者的细胞与靶向编码靶蛋白或功能性RNA的前mRNA或剪接复合物组分的SMSM化合物或其药学上可接受的盐接触,从而预防或抑制来自编码靶蛋白或功能性RNA的前mRNA的外显子剪接,从而增加编码靶蛋白或功能性RNA的mRNA的水平,并增加受试者细胞中靶蛋白或功能性RNA的表达。在一些实施方式中,本文还公开了增加通过具有引起前mRNA的外显子跳跃的突变或异常的二级或三级RNA结构的细胞的靶蛋白表达的方法,该前mRNA包含引起外显子跳跃的突变或异常的二级或三级RNA结构。该方法可包括使细胞与靶向编码靶蛋白或功能性RNA的前mRNA的SMSM化合物或其药学上可接受的盐接触,从而预防或抑制来自编码靶蛋白或功能性RNA的前mRNA的外显子剪接,由此增加编码功能性蛋白的RNA的水平,并增加细胞中蛋白质的表达。在一些实施方式中,靶蛋白是一种肿瘤抑制物。在一些实施方式中,靶蛋白是一种肿瘤促进物。在一些实施方式中,靶蛋白或功能性RNA为在功能上增强或替代受试者中数量或活性不足的靶蛋白或功能性RNA的补偿性蛋白或补偿性功能性RNA。在一些实施方式中,该细胞是在具有由蛋白质的数量或活性不足引起病症的受试者中,或来自该受试者。在一些实施方式中,靶蛋白的量不足是由靶蛋白的单倍剂量不足引起的,其中受试者具有编码功能性靶蛋白的第一等位基因,以及由其不产生靶蛋白的第二等位基因或编码非功能性靶蛋白的第二等位基因,并且其中SMSM化合物或其药学上可接受的盐结合自第一等位基因转录的前mRNA的靶向部分。在一些实施方式中,靶蛋白以与其中外显子经跳跃或缺失的mRNA产生的同等蛋白相比具有完全功能的形式产生。在一些实施方式中,前mRNA由与前mRNA具有至少约80%,85%,90%,95%,96%,97%,98%,99%或100%序列同一性的基因序列编码。在一些实施方式中,SMSM化合物或其药学上可接受的盐通过调节自编码功能性RNA或靶蛋白的基因转录前mRNA的选择性剪接来增加靶蛋白或功能性RNA的量。在一些实施方式中,SMSM化合物或其药学上可接受的盐通过调节由编码靶蛋白或功能性RNA的基因的突变产生的异常剪接来增加靶蛋白或功能性RNA的量。
在一些实施方式中,与在对照细胞中产生的编码靶蛋白或功能性RNA的mRNA的总量相比,与SMSM化合物或其药学上可接受的盐接触的细胞中产生的编码靶蛋白或功能性RNA的mRNA的总量增加至少约10%,至少约20%,至少约50%,至少约60%,至少约70%,至少约80%,至少约90%,至少约100%,至少约150%,至少约200%,至少约250%,至少约300%,至少约400%或至少约500%。
在一些实施方式中,与在对照细胞中产生的编码靶蛋白或功能性RNA的mRNA的总量相比,与SMSM化合物或其药学上可接受的盐接触的细胞中产生的编码靶蛋白或功能性RNA的mRNA的总量增加约20%至约300%,约50%至约300%,约100%至约300%,约150%至约300%,约20%至约50%,约20%至约100%,约20%至约150%,约20%至约200%,约20%至约250%,约50%至约100%,约50%至约150%,约50%至约200%,约50%至约250%,约100%至约150%,约100%至约200%,约100%至约250%,约150%至约200%,约150%至约250%,或约200%至约250%。
在一些实施方式中,与通过对照细胞产生的靶蛋白的总量相比,通过与SMSM化合物或其药学上可接受的盐接触的细胞产生的靶蛋白的总量增加至少约20%,至少约50%,至少约100%,至少约150%,至少约200%,至少约250%或至少约300%。在一些实施方式中,与通过对照细胞产生的靶蛋白的总量相比,通过与SMSM化合物或其药学上可接受的盐接触的细胞产生的靶蛋白的总量增加约20%至约300%,约50%至约300%,约100%至约300%,约150%至约300%,约20%至约50%,约20%至约100%,约20%至约150%,约20%至约200%,约20%至约250%,约50%至约100%,约50%至约150%,约50%至约200%,约50%至约250%,约100%至约150%,约100%至约200%,约100%至约250%,约150%至约200%,约150%至约250%,或约200%至约250%。
在一些实施方式中,与在对照细胞中产生的编码靶蛋白或功能性RNA的mRNA的总量相比,与SMSM化合物或其药学上可接受的盐接触的细胞中产生的编码靶蛋白或功能性RNA的mRNA的总量增加至少约1.1倍,至少约1.5倍,至少约2倍,至少约2.5倍,至少约3倍,至少约3.5倍,至少约4倍,至少约5倍或至少约10倍。在一些实施方式中,与在对照细胞中产生的编码靶蛋白或功能性RNA的mRNA的总量相比,与SMSM化合物或其药学上可接受的盐接触的细胞中产生的编码靶蛋白或功能性RNA的mRNA的总量增加约1.1至约10倍,约1.5至约10倍,约2至约10倍,约3至约10倍,约4至约10倍,约1.1至约5倍,约1.1至约6倍,约1.1至约7倍,约1.1至约8倍,约1.1至约9倍,约2至约5倍,约2至约6倍,约2至约7倍,约2至约8倍,约2至约9倍,约3至约6倍,约3至约7倍,约3至约8倍,约3至约9倍,约4至约7倍,约4至约8倍,或约4至约9倍。
在一些实施方式中,与通过对照细胞产生的靶蛋白的总量相比,通过与SMSM化合物或其药学上可接受的盐接触的细胞产生的靶蛋白的总量增加至少约1.1倍,至少约1.5倍,至少约2倍,至少约2.5倍,至少约3倍,至少约3.5倍,至少约4倍,至少约5倍或至少约10倍。在一些实施方式中,与通过对照细胞产生的靶蛋白的总量相比,通过与SMSM化合物或其药学上可接受的盐接触的细胞产生的靶蛋白的总量增加约1.1至约10倍,约1.5至约10倍,约2至约10倍,约3至约10倍,约4至约10倍,约1.1至约5倍,约1.1至约6倍,约1.1至约7倍,约1.1至约8倍,约1.1至约9倍,约2至约5倍,约2至约6倍,约2至约7倍,约2至约8倍,约2至约9倍,约3至约6倍,约3至约7倍,约3至约8倍,约3至约9倍,约4至约7倍,约4至约8倍,或约4至约9倍。
在一些实施方式中,与在对照细胞中产生的编码靶蛋白或功能性RNA的mRNA的总量相比,与SMSM化合物或其药学上可接受的盐接触的细胞中产生的编码靶蛋白或功能性RNA的mRNA的总量减少至少约10%,至少约20%,至少约30%,至少约40%,至少约50%,至少约60%,至少约70%,至少约80%,至少约90%或至少约100%。
在一些实施方式中,与在对照细胞中产生的编码靶蛋白或功能性RNA的mRNA的总量相比,与SMSM化合物或其药学上可接受的盐接触的细胞中产生的编码靶蛋白或功能性RNA的mRNA的总量减少约10%至约100%,约20%至约100%,约30%至约100%,约40%至约100%,约50%至约100%,约60%至约100%,约70%至约100%,约80%至约100%about90%至约100%,约20%至约30%,约20%至约40%,约20%至约50%,约20%至约60%,约20%至约70%,约20%至约80%,约20%至约90%,约30%至约40%,约30%至约50%,约30%至约60%,约30%至约70%,约30%至约80%,约30%至约90%,约40%至约50%,约40%至约60%,约40%至约70%,约40%至约80%,约40%至约90%,约50%至约60%,约50%至约70%,约50%至约80%,约50%至约90%,约60%至约70%,约60%至约80%,约60%至约90%,70%至约80%,约70%至约90%,或约80%至约90%。
在一些实施方式中,与通过对照细胞产生的靶蛋白的总量相比,通过与SMSM化合物或其药学上可接受的盐接触的细胞产生的靶蛋白的总量减少至少约10%,至少约20%,至少约30%,至少约40%,至少约50%,至少约60%,至少约70%,至少约80%,至少约90%或至少约100%。在一些实施方式中,与通过对照细胞产生的靶蛋白的总量相比,通过与SMSM化合物或其药学上可接受的盐接触的细胞产生的靶蛋白的总量减少约10%至约100%,约20%至约100%,约30%至约100%,约40%至约100%,约50%至约100%,约60%至约100%,约70%至约100%,约80%至约100%about 90%至约100%,约20%至约30%,约20%至约40%,约20%至约50%,约20%至约60%,约20%至约70%,约20%至约80%,约20%至约90%,约30%至约40%,约30%至约50%,约30%至约60%,约30%至约70%,约30%至约80%,约30%至约90%,约40%至约50%,约40%至约60%,约40%至约70%,约40%至约80%,约40%至约90%,约50%至约60%,约50%至约70%,约50%至约80%,约50%至约90%,约60%至约70%,约60%至约80%,约60%至约90%,70%至约80%,约70%至约90%,或约80%至约90%。
在一些实施方式中,与通过对照细胞产生的两种剪接变体之间的量的差异相比,与SMSM化合物或其药学上可接受的盐接触的细胞中产生的编码靶蛋白或功能性RNA同工型的第一剪接变体和第二剪接变体之间的量的差异增加约20%至约300%,约50%至约300%,约100%至约300%,约150%至约300%,约20%至约50%,约20%至约100%,约20%至约150%,约20%至约200%,约20%至约250%,约50%至约100%,约50%至约150%,约50%至约200%,约50%至约250%,约100%至约150%,约100%至约200%,约100%至约250%,约150%至约200%,约150%至约250%,约200%至约250%,至少约20%,至少约50%,至少约100%,至少约150%,至少约200%,至少约250%或至少约300%。在一些实施方式中,与通过对照细胞产生的产生自剪接变体的两种蛋白质同工型之间的量的差异相比,通过与SMSM化合物或其药学上可接受的盐接触的细胞产生的表达自第一剪接变体的第一蛋白质同工型和表达自第二剪接变体的第二蛋白质同工型之间的量的差异增加约20%至约300%,约50%至约300%,约100%至约300%,约150%至约300%,约20%至约50%,约20%至约100%,约20%至约150%,约20%至约200%,约20%至约250%,约50%至约100%,约50%至约150%,约50%至约200%,约50%至约250%,约100%至约150%,约100%至约200%,约100%至约250%,约150%至约200%,约150%至约250%,约200%至约250%,至少约20%,至少约50%,至少约100%,至少约150%,至少约200%。
在一些实施方式中,与通过对照细胞产生的两种剪接变体之间的量的差异相比,与SMSM化合物或其药学上可接受的盐接触的细胞中产生的编码靶蛋白或功能性RNA同工型的第一剪接变体和第二剪接变体之间的量的差异增加约1.1至约10倍,约1.5至约10倍,约2至约10倍,约3至约10倍,约4至约10倍,约1.1至约5倍,约1.1至约6倍,约1.1至约7倍,约1.1至约8倍,约1.1至约9倍,约2至约5倍,约2至约6倍,约2至约7倍,约2至约8倍,约2至约9倍,约3至约6倍,约3至约7倍,约3至约8倍,约3至约9倍,约4至约7倍,约4至约8倍,约4至约9倍,至少约1.1倍,至少约1.5倍,至少约2倍,至少约2.5倍,至少约3倍,至少约3.5倍,至少约4倍,至少约5倍或至少约10倍。在一些实施方式中,与通过对照细胞产生的表达自剪接变体的两种蛋白质同工型之间的量的差异相比,通过与SMSM化合物或其药学上可接受的盐接触的细胞产生的表达自第一剪接变体的第一蛋白质同工型和表达自第二剪接变体的第二蛋白质同工型之间的量的差异增加约1.1至约10倍,约1.5至约10倍,约2至约10倍,约3至约10倍,约4至约10倍,约1.1至约5倍,约1.1至约6倍,约1.1至约7倍,约1.1至约8倍,约1.1至约9倍,约2至约5倍,约2至约6倍,约2至约7倍,约2至约8倍,约2至约9倍,约3至约6倍,约3至约7倍,约3至约8倍,约3至约9倍,约4至约7倍,约4至约8倍,约4至约9倍,至少约1.1倍,至少约1.5倍,至少约2倍,至少约2.5倍,至少约3倍,至少约3.5倍,至少约4倍,至少约5倍或至少约10倍。
在一些实施方式中,与通过对照细胞产生的两种剪接变体之间的量的差异相比,与SMSM化合物或其药学上可接受的盐接触的细胞中产生的编码靶蛋白或功能性RNA同工型的第一剪接变体和第二剪接变体之间的量的差异减少约20%至约300%,约50%至约300%,约100%至约300%,约150%至约300%,约20%至约50%,约20%至约100%,约20%至约150%,约20%至约200%,约20%至约250%,约50%至约100%,约50%至约150%,约50%至约200%,约50%至约250%,约100%至约150%,约100%至约200%,约100%至约250%,约150%至约200%,约150%至约250%,约200%至约250%,至少约20%,至少约50%,至少约100%,至少约150%,至少约200%,至少约250%或至少约300%。在一些实施方式中,与通过对照细胞产生的产生自剪接变体的两种蛋白质同工型之间的量的差异相比,通过与SMSM化合物或其药学上可接受的盐接触的细胞产生的表达自第一剪接变体的第一蛋白质同工型和表达自第二剪接变体的第二蛋白质同工型之间的量的差异减少约20%至约300%,约50%至约300%,约100%至约300%,约150%至约300%,约20%至约50%,约20%至约100%,约20%至约150%,约20%至约200%,约20%至约250%,约50%至约100%,约50%至约150%,约50%至约200%,约50%至约250%,约100%至约150%,约100%至约200%,约100%至约250%,约150%至约200%,约150%至约250%,约200%至约250%,至少约20%,至少约50%,至少约100%,至少约150%,至少约200%,至少约250%或至少约300%。
在一些实施方式中,与通过对照细胞产生的两种剪接变体之间的量的差异相比,与SMSM化合物或其药学上可接受的盐接触的细胞中产生的编码靶蛋白或功能性RNA同工型的第一剪接变体和第二剪接变体之间的量的差异减少约1.1至约10倍,约1.5至约10倍,约2至约10倍,约3至约10倍,约4至约10倍,约1.1至约5倍,约1.1至约6倍,约1.1至约7倍,约1.1至约8倍,约1.1至约9倍,约2至约5倍,约2至约6倍,约2至约7倍,约2至约8倍,约2至约9倍,约3至约6倍,约3至约7倍,约3至约8倍,约3至约9倍,约4至约7倍,约4至约8倍,约4至约9倍,至少约1.1倍,至少约1.5倍,至少约2倍,至少约2.5倍,至少约3倍,至少约3.5倍,至少约4倍,至少约5倍或至少约10倍。在一些实施方式中,与通过对照细胞产生的表达自剪接变体的两种蛋白质同工型之间的量的差异相比,通过与SMSM化合物或其药学上可接受的盐接触的细胞产生的表达自第一剪接变体的第一蛋白质同工型和表达自第二剪接变体的第二蛋白质同工型之间的量的差异减少约1.1至约10倍,约1.5至约10倍,约2至约10倍,约3至约10倍,约4至约10倍,约1.1至约5倍,约1.1至约6倍,约1.1至约7倍,约1.1至约8倍,约1.1至约9倍,约2至约5倍,约2至约6倍,约2至约7倍,约2至约8倍,约2至约9倍,约3至约6倍,约3至约7倍,约3至约8倍,约3至约9倍,约4至约7倍,约4至约8倍,约4至约9倍,至少约1.1倍,至少约1.5倍,至少约2倍,至少约2.5倍,至少约3倍,至少约3.5倍,至少约4倍,至少约5倍或至少约10倍。
第一同工型和第二同工型的比率可导致许多病症和疾病。在一些实施方式中,不具有病症或疾病的受试者具有1:1的第一同工型与第二同工型比率。在一些实施方式中,具有本文所述病症或疾病的受试者具有约1:1.2,1:1.4,1:1.6,1:1.8,1:2,1:2.5,1:3,1:3.5,1:4,1:4.5或1:5的第一同工型与第二同工型比率。在一些实施方式中,具有本文所述病症或疾病的受试者具有约1:1至约1:1.1,约1:1至约1:1.2,约1:1至约1:1.3,约1:1至约1:1.4,约1:1至约1:1.5,约1:1至约1:1.6,约1:1至约1:1.8,约1:1至约1:2,约1:1至约1:3,约1:1至约1:3.5,约1:1至约1:4,约1:1至约1:4.5,约1:1至约1:5,1:2至约1:3,约1:2至约1:4,约1:2至约1:5,约1:3至约1:4,约1:3至约1:5,或约1:4至约1:5的第一同工型与第二同工型比率。
在一些实施方式中,SMSM化合物与前m-RNA的结合预防自前mRNA群体剪接出一个或多个外显子和/或内含子和/或其蛋白以产生编码靶蛋白或功能性RNA的mRNA。在一些实施方式中,细胞包含自编码靶蛋白或功能性RNA的基因转录的前mRNA群体,其中前mRNA群体包含导致剪接出一个或多个外显子的突变,并且其中SMSM化合物或其药学上可接受的盐结合于导致前mRNA群体中剪接出一个或多个外显子的突变。在一些实施方式中,SMSM化合物或其药学上可接受的盐结合于导致剪接出一个或多个外显子的突变预防自前mRNA群体剪接出一个或多个外显子以产生编码靶蛋白或功能性RNA的mRNA。在一些实施方式中,状况是疾病或障碍。在一些实施方式中,该方法还包括评估蛋白质表达。在一些实施方式中,SMSM化合物或其药学上可接受的盐与前mRNA的靶向部分结合。
在一些实施方式中,SMSM化合物或其药学上可接受的盐的结合催化包含缺失的外显子或去除不需要的保留内含子或其部分,从而产生健康的mRNA和蛋白质。在一些实施方式中,SMSM化合物或其药学上可接受的盐的结合对未患病细胞的作用很小至没有作用。
在一些实施方式中,SMSM以小于50nM的IC50杀灭细胞。在一些实施方式中,细胞是原代细胞。在一些实施方式中,SMSM以小于48nM,45nM,40nM,35nM,30nM,25nM,20nM,15nM,10nM,5nM,3nM或1nM的IC50杀灭细胞。
在一些实施方式中,SMSM调节原代细胞的多核苷酸剪接位点序列处的剪接。在一些实施方式中,SMSM调节原代细胞的增殖或存活。在一些实施方式中,原代细胞是原发性病变细胞。在一些实施方式中,原发性病变细胞是原发性癌细胞。在一些实施方式中,SMSM的存在浓度为至少约1nM,10nM,100nM,1μM,10μM,100μM,1mM,10mM,100mM或1M。在一些实施方式中,至少约5%,10%,25%,30%,40%,50%,60%,70%,75%,80%,85%,90%,95%,97%,98%,99%或100%的原发性病变细胞被杀灭。在一些实施方式中,至少约5%,10%,25%,30%,40%,50%,60%,70%,75%,80%,85%,90%,95%,97%,98%,99%或100%的原发性病变细胞经历凋亡。在一些实施方式中,至少约5%,10%,25%,30%,40%,50%,60%,70%,75%,80%,85%,90%,95%,97%,98%,99%或100%的原发性病变细胞经历坏死。在一些实施方式中,至少约5%,10%,25%,30%,40%,50%,60%,70%,75%,80%,85%,90%,95%,97%,98%,99%或100%的原发性病变细胞中的增殖被减少或抑制。在一些实施方式中,原发性病变细胞是未转化的细胞。
在一些实施方式中,SMSM减少受试者中的肿瘤大小。在一些实施方式中,施用SMSM或其药学上可接受的盐的受试者中的肿瘤大小在受试者中减少至少约1%,5%,10%,15%,20%,25%,30%,35%,40%,45%,50%,55%,60%,70%,75%,80%,85%,90%,95%,96%,97%,98%或99%。在一些实施方式中,施用SMSM或其药学上可接受的盐的受试者中的肿瘤直径减少至少约1%,5%,10%,15%,20%,25%,30%,35%,40%,45%,50%,55%,60%,70%,75%,80%,85%,90%,95%,96%,97%,98%或99%。在一些实施方式中,受试者中的肿瘤体积减少至少约1%,5%,10%,15%,20%,25%,30%,35%,40%,45%,50%,55%,60%,70%,75%,80%,85%,90%,95%,96%,97%,98%或99%。在一些实施方式中,肿瘤是恶性的。
在一些实施方式中,方法包括使SMSM与原发性非病变细胞接触。在一些实施方式中,至多约1%,5%,10%,15%,20%,25%或50%的原发性非病变细胞被杀灭。在一些实施方式中,至多约1%,5%,10%,15%,20%,25%或50%的原发性非病变细胞经历凋亡。在一些实施方式中,至多约1%,5%,10%,15%,20%,25%或50%的原发性非病变细胞经历坏死。在一些实施方式中,至多约1%,5%,10%,15%,20%,25%或50%的原发性非病变细胞中的增殖被减少或抑制。在一些实施方式中,原发性非病变细胞与原发性病变细胞为相同的组织。在一些实施方式中,原发性非病变细胞是分化细胞。
SMSM可以调节多核苷酸的剪接位点处的剪接,并且不表现出显著的毒性。在一些实施方式中,当施用于受试者时,SMSM穿透血脑屏障(BBB)。
在一些实施方式中,SMSM具有至少约0.1,0.2,0.3,0.4,0.5,0.6,0.7,0.8,0.9,1.0,1.1,1.2,1.3,1.4,1.5,1.6,1.7,1.8,1.9,2.0,2.5,3.0,3.5,40或更高的脑/血AUC。
在一些实施方式中,SMSM在人中具有至少约1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16,17,18,19,20,21,22,23,24,25,30,35,40,45,50,51,52,53,54,55,56,57,58,59,60,61,62,63,64,65,66,67,68,69,70,71,72,73,74,75,76,77,78,79,80,81,82,83,84,85,90,95,100,110,120,130,140,150,160,170,180,190,200,210,220,230,240,250,275,300,325,350,375,400,425,450,475,500,550,600,650,700,750,800,850,900,950或1000小时的半衰期。
在一些实施方式中,SMSM在室温下稳定至少1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16,17,18,19,20,21,22,23或24小时;或者至少1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11或12个月;或者至少1,2,3,4或5年。在一些实施方式中,SMSM在4℃下稳定至少1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16,17,18,19,20,21,22,23或24小时;或者至少1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11或12个月;或者至少1,2,3,4或5年。在一些实施方式中,SMSM在室温下在水或有机溶剂中稳定至少1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16,17,18,19,20,21,22,23或24小时;或者至少1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11或12个月;或者至少1,2,3,4或5年。在一些实施方式中,SMSM在4℃下在水或有机溶剂中稳定至少1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16,17,18,19,20,21,22,23或24小时;或者至少1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11或12个月;或者至少1,2,3,4或5年。
在一些实施方式中,SMSM具有0.01-10nM,0.01-5nM,0.01-2.5nM,0.01-1nM,0.01-0.75nM,0.01-0.5nM,0.01-0.25nM,0.01-0.1nM,0.1-100nM,0.1-50nM,0.1-25nM,0.1-10nM,0.1-7.5nM,0.1-5nM,0.1-2.5nM,2-1000nM,2-500nM,2-250nM,2-100nM,2-75nM,2-50nM,2-25nM,2-10nM,10-1000nM,10-500nM,10-250nM,10-100nM,10-75nM,10-50nM,10-25nM,25-1000nM,25-500nM,25-250nM,25-100nM,25-75nM,25-50nM,50-1000nM,50-500nM,50-250nM,50-100nM,50-75nM,60-70nM,100-1000nM,100-500nM,100-250nM,250-1000nM,250-500nM或500-1000nM的细胞活力IC50
在一些实施方式中,SMSM具有至多2nM,3nM,4nM,5nM,6nM,7nM,8nM,9nM,10nM,11nM,12nM,13nM,14nM,15nM,16nM,17nM,18nM,19nM,20nM,21nM,22nM,23nM,24nM,25nM,30nM,35nM,40nM,45nM,50nM,51nM,52nM,53nM,54nM,55nM,56nM,57nM,58nM,59nM,60nM,61nM,62nM,63nM,64nM,65nM,66nM,67nM,68nM,69nM,70nM,71nM,72nM,73nM,74nM,75nM,76nM,77nM,78nM,79nM,80nM,81nM,82nM,83nM,84nM,85nM,90nM,95nM,100nM,110nM,120nM,130nM,140nM,150nM,160nM,170nM,180nM,190nM,200nM,210nM,220nM,230nM,240nM,250nM,275nM,300nM,325nM,350nM,375nM,400nM,425nM,450nM,475nM,500nM,550nM,600nM,650nM,700nM,750nM,800nM,850nM,900nM,950nM,1μM或10μM的细胞活力IC50
在一些实施方式中,当用浓度为2-1000nM,2-500nM,2-250nM,2-100nM,2-75nM,2-50nM,2-25nM,2-10nM,10-1000nM,10-500nM,10-250nM,10-100nM,10-75nM,10-50nM,10-25nM,25-1000nM,25-500nM,25-250nM,25-100nM,25-75nM,25-50nM,50-1000nM,50-500nM,50-250nM,50-100nM,50-75nM,60-70nM,100-1000nM,100-500nM,100-250nM,250-1000nM,250-500nM或500-1000nM的SMSM处理细胞至少1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16,17,18,19,20,21,22,23,24,25,26,27,28,29,30,21,32,33,34,35,36,37,38,39,40,41,42,43,44,45,46,47或48小时时,SMSM减少病变细胞的细胞增殖超过1%,2%,3%,4%,5%,6%,7%,8%,9%,10%,11%,12%,13%,14%,15%,16%,17%,18%,19%,20%,21%,22%,23%,24%,25%,30%,35%,40%,45%,50%,51%,52%,53%,54%,55%,56%,57%,58%,59%,60%,61%,62%,63%,64%,65%,66%,67%,68%,69%,70%,71%,72%,73%,74%,75%,76%,77%,78%,79%,80%,81%,82%,83%,84%,85%,86%,87%,88%,89%,90%,91%,92%,93%,94%,95%,96%,97%,98%,99%或100%。
在一些实施方式中,当用浓度为至少2nM,3nM,4nM,5nM,6nM,7nM,8nM,9nM,10nM,11nM,12nM,13nM,14nM,15nM,16nM,17nM,18nM,19nM,20nM,21nM,22nM,23nM,24nM,25nM,30nM,35nM,40nM,45nM,50nM,51nM,52nM,53nM,54nM,55nM,56nM,57nM,58nM,59nM,60nM,61nM,62nM,63nM,64nM,65nM,66nM,67nM,68nM,69nM,70nM,71nM,72nM,73nM,74nM,75nM,76nM,77nM,78nM,79nM,80nM,81nM,82nM,83nM,84nM,85nM,90nM,95nM,100nM,110nM,120nM,130nM,140nM,150nM,160nM,170nM,180nM,190nM,200nM,210nM,220nM,230nM,240nM,250nM,275nM,300nM,325nM,350nM,375nM,400nM,425nM,450nM,475nM,500nM,550nM,600nM,650nM,700nM,750nM,800nM,850nM,900nM,950nM,1μM或10μM的SMSM处理细胞至少1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16,17,18,19,20,21,22,23,24,25,26,27,28,29,30,21,32,33,34,35,36,37,38,39,40,41,42,43,44,45,46,47或48小时时,SMSM减少病变细胞的细胞增殖超过1%,2%,3%,4%,5%,6%,7%,8%,9%,10%,11%,12%,13%,14%,15%,16%,17%,18%,19%,20%,21%,22%,23%,24%,25%,30%,35%,40%,45%,50%,51%,52%,53%,54%,55%,56%,57%,58%,59%,60%,61%,62%,63%,64%,65%,66%,67%,68%,69%,70%,71%,72%,73%,74%,75%,76%,77%,78%,79%,80%,81%,82%,83%,84%,85%,86%,87%,88%,89%,90%,91%,92%,93%,94%,95%,96%,97%,98%,99%或100%。
在一些实施方式中,当用浓度为2-1000nM,2-500nM,2-250nM,2-100nM,2-75nM,2-50nM,2-25nM,2-10nM,10-1000nM,10-500nM,10-250nM,10-100nM,10-75nM,10-50nM,10-25nM,25-1000nM,25-500nM,25-250nM,25-100nM,25-75nM,25-50nM,50-1000nM,50-500nM,50-250nM,50-100nM,50-75nM,60-70nM,100-1000nM,100-500nM,100-250nM,250-1000nM,250-500nM或500-1000nM的SMSM处理细胞至少1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16,17,18,19,20,21,22,23,24,25,26,27,28,29,30,21,32,33,34,35,36,37,38,39,40,41,42,43,44,45,46,47或48小时时,SMSM减少病变细胞的活力超过10%,11%,12%,13%,14%,15%,16%,17%,18%,19%,20%,21%,22%,23%,24%,25%,30%,35%,40%,45%,50%,51%,52%,53%,54%,55%,56%,57%,58%,59%,60%,61%,62%,63%,64%,65%,66%,67%,68%,69%,70%,71%,72%,73%,74%,75%,76%,77%,78%,79%,80%,81%,82%,83%,84%,85%,86%,87%,88%,89%,90%,91%,92%,93%,94%,95%,96%,97%,98%,99%或100%。
在一些实施方式中,当用浓度为至少2nM,3nM,4nM,5nM,6nM,7nM,8nM,9nM,10nM,11nM,12nM,13nM,14nM,15nM,16nM,17nM,18nM,19nM,20nM,21nM,22nM,23nM,24nM,25nM,30nM,35nM,40nM,45nM,50nM,51nM,52nM,53nM,54nM,55nM,56nM,57nM,58nM,59nM,60nM,61nM,62nM,63nM,64nM,65nM,66nM,67nM,68nM,69nM,70nM,71nM,72nM,73nM,74nM,75nM,76nM,77nM,78nM,79nM,80nM,81nM,82nM,83nM,84nM,85nM,90nM,95nM,100nM,110nM,120nM,130nM,140nM,150nM,160nM,170nM,180nM,190nM,200nM,210nM,220nM,230nM,240nM,250nM,275nM,300nM,325nM,350nM,375nM,400nM,425nM,450nM,475nM,500nM,550nM,600nM,650nM,700nM,750nM,800nM,850nM,900nM,950nM,1μM或10μM的SMSM处理细胞至少1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16,17,18,19,20,21,22,23,24,25,26,27,28,29,30,21,32,33,34,35,36,37,38,39,40,41,42,43,44,45,46,47或48小时时,SMSM减少病变细胞的活力超过10%,11%,12%,13%,14%,15%,16%,17%,18%,19%,20%,21%,22%,23%,24%,25%,30%,35%,40%,45%,50%,51%,52%,53%,54%,55%,56%,57%,58%,59%,60%,61%,62%,63%,64%,65%,66%,67%,68%,69%,70%,71%,72%,73%,74%,75%,76%,77%,78%,79%,80%,81%,82%,83%,84%,85%,86%,87%,88%,89%,90%,91%,92%,93%,94%,95%,96%,97%,98%,99%或100%。
在一些实施方式中,当用浓度为2-1000nM,2-500nM,2-250nM,2-100nM,2-75nM,2-50nM,2-25nM,2-10nM,10-1000nM,10-500nM,10-250nM,10-100nM,10-75nM,10-50nM,10-25nM,25-1000nM,25-500nM,25-250nM,25-100nM,25-75nM,25-50nM,50-1000nM,50-500nM,50-250nM,50-100nM,50-75nM,60-70nM,100-1000nM,100-500nM,100-250nM,250-1000nM,250-500nM或500-1000nM的SMSM处理细胞至少1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16,17,18,19,20,21,22,23,24,25,26,27,28,29,30,21,32,33,34,35,36,37,38,39,40,41,42,43,44,45,46,47或48小时时,SMSM减少非病变细胞的活力不超过1%,2%,3%,4%,5%,6%,7%,8%,9%,10%,11%,12%,13%,14%,15%,16%,17%,18%,19%,20%,21%,22%,23%,24%,25%,30%,35%,40%,45%或50%。
在一些实施方式中,当用浓度为至少2nM,3nM,4nM,5nM,6nM,7nM,8nM,9nM,10nM,11nM,12nM,13nM,14nM,15nM,16nM,17nM,18nM,19nM,20nM,21nM,22nM,23nM,24nM,25nM,30nM,35nM,40nM,45nM,50nM,51nM,52nM,53nM,54nM,55nM,56nM,57nM,58nM,59nM,60nM,61nM,62nM,63nM,64nM,65nM,66nM,67nM,68nM,69nM,70nM,71nM,72nM,73nM,74nM,75nM,76nM,77nM,78nM,79nM,80nM,81nM,82nM,83nM,84nM,85nM,90nM,95nM,100nM,110nM,120nM,130nM,140nM,150nM,160nM,170nM,180nM,190nM,200nM,210nM,220nM,230nM,240nM,250nM,275nM,300nM,325nM,350nM,375nM,400nM,425nM,450nM,475nM,500nM,550nM,600nM,650nM,700nM,750nM,800nM,850nM,900nM,950nM,1μM或10μM的SMSM处理细胞至少1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16,17,18,19,20,21,22,23,24,25,26,27,28,29,30,21,32,33,34,35,36,37,38,39,40,41,42,43,44,45,46,47或48小时时,SMSM减少非病变细胞的活力不超过1%,2%,3%,4%,5%,6%,7%,8%,9%,10%,11%,12%,13%,14%,15%,16%,17%,18%,19%,20%,21%,22%,23%,24%,25%,30%,35%,40%,45%或50%。
在一些实施方式中,SMSM减少受试者中肿瘤大小至少5%,6%,7%,8%,9%,10%,11%,12%,13%,14%,15%,16%,17%,18%,19%,20%,21%,22%,23%,24%,25%,30%,35%,40%,45%,50%,51%,52%,53%,54%,55%,56%,57%,58%,59%,60%,61%,62%,63%,64%,65%,66%,67%,68%,69%,70%,71%,72%,73%,74%,75%,76%,77%,78%,79%,80%,81%,82%,83%,84%,85%,86%,87%,88%,89%,90%,91%,92%,93%,94%,95%,96%,97%,98%,99%或100%。
在一些实施方式中,SMSM抑制受试者中肿瘤的肿瘤生长至少5%,6%,7%,8%,9%,10%,11%,12%,13%,14%,15%,16%,17%,18%,19%,20%,21%,22%,23%,24%,25%,30%,35%,40%,45%,50%,51%,52%,53%,54%,55%,56%,57%,58%,59%,60%,61%,62%,63%,64%,65%,66%,67%,68%,69%,70%,71%,72%,73%,74%,75%,76%,77%,78%,79%,80%,81%,82%,83%,84%,85%,86%,87%,88%,89%,90%,91%,92%,93%,94%,95%,96%,97%,98%,99%或100%。
SMSM靶标
mRNA(例如前mRNA)的异常剪接可导致蛋白质缺陷,并可能导致受试者中的疾病或障碍。本文描述的组合物和方法可以减少这种mRNA(例如前mRNA)的异常剪接,并且治疗由这种异常剪接引起的疾病或障碍。
与RNA转录物量变化有关的疾病通常以异常的蛋白质表达为重点来治疗。然而,如果可以通过用小分子处理来靶向导致RNA水平异常变化的过程(例如剪接过程的组分或相关的转录因子或相关的稳定性因子),则有可能恢复蛋白质表达水平,例如RNA转录物或相关蛋白异常表达的不良影响。因此,需要一种调节某些基因编码的RNA转录物的量的方法,以预防或治疗与RNA转录物或相关蛋白异常表达有关的疾病。
结构靶标
顺式作用元件中的突变和/或异常的二级或三级RNA结构可以诱导前mRNA的三维结构变化。当前mRNA例如与至少一个snRNA或至少一个snRNP或至少一个其他辅助剪接因子结合时,顺式作用元件中的突变和/或异常的二级RNA结构可诱导前mRNA的三维结构变化。例如,非规范的剪接位点序列与snRNA的非规范碱基配对可形成凸起。例如,当5’ss与U1-U12 snRNA或其一部分结合时,可能形成凸起。例如,当含有至少一个突变的5’ss与U1-U12snRNA或其一部分结合时,可能诱导形成凸起。例如,当隐蔽5’ss与U1-U12 snRNA或其一部分结合时,可能形成凸起。例如,当含至少一个突变的隐蔽5’ss与U1-U12 snRNA或其一部分结合时,可能诱导形成凸起。例如,当3’ss与U2 snRNA或其一部分结合时,可能形成凸起。例如,当3’ss与U2 snRNA或其一部分结合时,可能诱导诱导凸起。例如,当隐蔽3’ss与U2snRNA或其一部分结合时,可能形成凸起。例如,当隐蔽3’ss与U2 snRNA或其一部分结合时,可能诱导形成凸起。U1和U2的蛋白质组分可能会或可能不会形成凸起。表2A、表2B、表2C和表2D中显示了可以诱导凸起结构的示例性的5'剪接位点突变和/或异常的二级和/或三级结构。本文公开的方法中的多核苷酸可以含有表2A、表2B、表2C和表2D中汇总的任一示例性5’剪接位点序列。
在一些实施方式中,小分子可以结合至凸起。在一些实施方式中,凸起是自然发生的。在一些实施方式中,凸起是通过剪接位点和小核RNA之间的非规范碱基配对形成的。例如,可以通过5’ss和U1-U12 snRNA之间的非规范碱基配对来形成凸起。凸起可以包含1个核苷酸,2个核苷酸,3个核苷酸,4个核苷酸,5个核苷酸,6个核苷酸,7个核苷酸,8个核苷酸,9个核苷酸,10个核苷酸,11个核苷酸,12个核苷酸,13个核苷酸,14个核苷酸或15个核苷酸。在一些实施方式中,可以通过突变而无凸起形成来诱导三维结构改变。在一些实施方式中,可以在剪接位点中形成凸起而无任何突变。在一些实施方式中,识别部分可以由任何顺式作用元件中的突变形成。在一些实施方式中,小分子可以与由突变诱导的识别部分结合。在一些实施方式中,真实5'剪接位点处的突变和/或异常的二级或三级RNA结构可导致在隐蔽5'剪接位点处进行剪接。在一些实施方式中,突变和/或异常的二级或三级RNA结构可位于一种调控元件中,其包括ESE,ESS,ISE和ISS。
在一些实施方式中,SMSM的靶标是包含剪接位点序列且在外显子中具有凸起核苷酸的前mRNA。在一些实施方式中,SMSM的靶标是包含剪接位点序列且具有剪接位点序列的剪接位点的凸起核苷酸上游(5’)的前mRNA。在一些实施方式中,SMSM的靶标是包含剪接位点序列且在相对于剪接位点序列的剪接位点的-1位置处具有凸起核苷酸的前mRNA。例如,SMSM的靶标可以是包含NNN*nnnnnn的剪接位点序列的前mRNA,其中N*代表凸起核苷酸。在一些实施方式中,SMSM的靶标是包含剪接位点序列且在相对于剪接位点序列的剪接位点的-2位置处具有凸起核苷酸的前mRNA。例如,SMSM的靶标可以是包含NN*Nnnnnnn的剪接位点序列的前mRNA,其中N*代表凸起核苷酸。在一些实施方式中,SMSM的靶标是包含剪接位点序列且在相对于剪接位点序列的剪接位点的-3位置处具有凸起核苷酸的前mRNA。例如,SMSM的靶标可以是包含N*NNnnnnnn的剪接位点序列的前mRNA,其中N*代表凸起核苷酸。
在一些实施方式中,SMSM的靶标是包含剪接位点序列且在内含子中具有凸起核苷酸的前mRNA。在一些实施方式中,SMSM的靶标是包含剪接位点序列且具有剪接位点序列的剪接位点的凸起核苷酸下游(3’)的前mRNA。
在一些实施方式中,SMSM的靶标是包含剪接位点序列且在相对于剪接位点序列的剪接位点的+1位置处具有凸起核苷酸的前mRNA。例如,SMSM的靶标可以是包含NNNn*nnnnn的剪接位点序列的前mRNA,其中n*代表凸起核苷酸。在一些实施方式中,SMSM的靶标是包含剪接位点序列且在相对于剪接位点序列的剪接位点的+2位置处具有凸起核苷酸的前mRNA。例如,SMSM的靶标可以是包含NNNnn*nnnn的剪接位点序列的前mRNA,其中n*代表凸起核苷酸。在一些实施方式中,SMSM的靶标是包含剪接位点序列且在相对于剪接位点序列的剪接位点的+3位置处具有凸起核苷酸的前mRNA。例如,SMSM的靶标可以是包含NNNnnn*nnn的剪接位点序列的前mRNA,其中n*代表凸起核苷酸。在一些实施方式中,SMSM的靶标是包含剪接位点序列且在相对于剪接位点序列的剪接位点的+4位置处具有凸起核苷酸的前mRNA。例如,SMSM的靶标可以是包含NNNnnnn*nn的剪接位点序列的前mRNA,其中n*代表凸起核苷酸。在一些实施方式中,SMSM的靶标是包含剪接位点序列且在相对于剪接位点序列的剪接位点的+5位置处具有凸起核苷酸的前mRNA。例如,SMSM的靶标可以是包含NNNnnnnn*n的剪接位点序列的前mRNA,其中n*代表凸起核苷酸。在一些实施方式中,SMSM的靶标是包含剪接位点序列且在相对于剪接位点序列的剪接位点的+6位置处具有凸起核苷酸的前mRNA。例如,SMSM的靶标可以是包含NNNnnnnnn*的剪接位点序列的前mRNA,其中n*代表凸起核苷酸。在一些实施方式中,SMSM的靶标是包含剪接位点序列且在相对于剪接位点序列的剪接位点的+7位置处具有凸起核苷酸的前mRNA。例如,SMSM的靶标可以是包含NNNnnnnnnn*的剪接位点序列的前mRNA,其中n*代表凸起核苷酸。
在一些实施方式中,SMSM的靶标是包含剪接位点序列且在相对于剪接位点序列的剪接位点的-1,-2,-3,+1,+2,+3,+4,+5,+6和/或+7位置处具有一个或多个凸起核苷酸的前mRNA。例如,SMSM的靶标可以是包含NNN*nnnnnn,NN*Nnnnnnn,N*NNnnnnnn,NNNn*nnnnn,NNNnn*nnnn,NNNnnn*nnn,NNNnnnn*nn,NNNnnnnn*n,NNNnnnnnn*或NNNnnnnnnn*的剪接位点序列的前mRNA,其中N*或n*代表凸起核苷酸。
在一些实施方式中,SMSM的靶标是包含剪接位点序列且在相对于剪接位点序列的剪接位点的-1,-2和/或-3位置处具有一个或多个凸起核苷酸的前mRNA。例如,SMSM的靶标可以是包含NNN*nnnnnn,NN*Nnnnnnn或N*NNnnnnnn的剪接位点序列的前mRNA,其中N*代表凸起核苷酸。
在一些实施方式中,SMSM的靶标是包含剪接位点序列且在相对于剪接位点序列的剪接位点的+1,+2,+3,+4,+5,+6和/或+7位置处具有一个或多个凸起核苷酸的前mRNA。例如,SMSM的靶标可以是包含NNNn*nnnnn,NNNnn*nnnn,NNNnnn*nnn,NNNnnnn*nn,NNNnnnnn*n,NNNnnnnnn*或NNNnnnnnnn*的剪接位点序列的前mRNA,其中n*代表凸起核苷酸。
在一些实施方式中,SMSM的靶标是包含剪接位点序列且在相对于剪接位点序列的剪接位点的-1位置处具有凸起核苷酸并在相对于剪接位点序列的剪接位点的-2位置处具有凸起核苷酸的前mRNA。例如,SMSM的靶标可以是包含NN*N*nnnnnn的剪接位点序列的前mRNA,其中N*代表凸起核苷酸。在一些实施方式中,SMSM的靶标是包含剪接位点序列且在相对于剪接位点序列的剪接位点的-2位置处具有凸起核苷酸并在相对于剪接位点序列的剪接位点的-3位置处具有凸起核苷酸的前mRNA。例如,SMSM的靶标可以是包含N*N*Nnnnnnn的剪接位点序列的前mRNA,其中N*代表凸起核苷酸。
在一些实施方式中,SMSM与包含剪接位点的RNA双链体的凸起核苷酸相互作用。在一些实施方式中,RNA双链体包括前mRNA。在一些实施方式中,SMSM结合于RNA双链体并于包含剪接位点的RNA双链体的不成对的凸起核碱基相互作用。在一些实施方式中,SMSM的第一部分与RNA双链体的第一RNA链的凸起核苷酸相互作用。在一些实施方式中,SMSM的第二部分与RNA双链体的第二RNA链的一个或多个核苷酸相互作用,其中该第一RNA链不是该第二RNA链。在一些实施方式中,SMSM与双链体RNA形成一种或多种分子间相互作用,例如,离子相互作用、氢键、偶极-偶极相互作用或范德华相互作用。在一些实施方式中,SMSM与凸起核苷酸形成一种或多种分子间相互作用,例如,离子相互作用、氢键、偶极-偶极相互作用或范德华相互作用。
在一些实施方式中,双链体RNA包含α螺旋。在一些实施方式中,凸起核苷酸位于双链体RNA的螺旋的外部部分上。在一些实施方式中,凸起核苷酸位于双链体RNA的螺旋的内部部分内。
在一些实施方式中,凸起核苷酸从双链体RNA的螺旋的内部至螺旋的外部部分的交换率降低。
在一些实施方式中,SMSM调节凸起核苷酸与双链体RNA的第二核苷酸的距离。在一些实施方式中,SMSM减少凸起核苷酸与双链体RNA的第二核苷酸的距离。在一些实施方式中,SMSM增加凸起核苷酸与双链体RNA的第二核苷酸的距离。
在一些实施方式中,凸起核苷酸位于复合物的双链体RNA的螺旋的内部内。在一些实施方式中,凸起核苷酸在RNA双链体的RNA链内具有受调的碱基堆积。在一些实施方式中,凸起核苷酸在RNA双链体的RNA链内具有增加的碱基堆积。在一些实施方式中,凸起核苷酸在RNA双链体的RNA链内具有减少的碱基堆积。
在一些实施方式中,SMSM调节RNA双链体的剪接位点处的剪接。在一些实施方式中,SMSM增加RNA双链体的剪接位点处的剪接。在一些实施方式中,SMSM减少RNA双链体的剪接位点处的剪接。在一些实施方式中,SMSM减少RNA双链体的凸起的大小。在一些实施方式中,SMSM去除RNA双链体的凸起。在一些实施方式中,SMSM稳定化RNA双链体的凸起。
在一些实施方式中,在不存在SMSM的情况下,不成对的凸起核苷酸在RNA双链体的RNA链的磷酸骨架周围自由旋转。在一些实施方式中,SMSM减少不成对的凸起核苷酸的旋转率。在一些实施方式中,SMSM减少不成对的凸起核苷酸在RNA双链体的RNA链的磷酸骨架周围的旋转率。
在一些实施方式中,SMSM不是适体。
另外,本文提供了一种调节剪接的方法,其包括使小分子剪接调节剂化合物(SMSM)与细胞接触;其中SMSM与细胞中RNA双链体的不成对的凸起核苷酸相互作用;其中双链体RNA包含剪接位点;并且其中SMSM调节该RNA双链体的剪接。
本文提供了一种调节第一核苷酸相对于第二核苷酸的相对位置的方法,其中该第一核苷酸和第二核苷酸在双链体RNA内,该方法包括将小分子剪接调节剂化合物(SMSM)与双链体RNA或其药学上可接受的盐接触,其中第一核苷酸是RNA双链体的凸起核苷酸;其中该双链体RNA包含剪接位点。
在一些实施方式中,双链体RNA包含螺旋。
在一些实施方式中,在与SMSM接触之前,凸起核苷酸位于双链体RNA的螺旋的外部部分上。
在一些实施方式中,SMSM与双链体RNA形成一种或多种分子间相互作用。
在一些实施方式中,SMSM与不成对的凸起核苷酸形成一种或多种分子间相互作用。在一些实施方式中,分子间相互作用选自包含以下的组:离子相互作用、氢键、偶极-偶极相互作用或范德华相互作用。在一些实施方式中,不成对的凸起核苷酸自双链体RNA的螺旋的内部至螺旋的外部部分的交换率降低。在一些实施方式中,不成对的凸起核苷酸的旋转率降低。在一些实施方式中,不成对的凸起核苷酸在RNA双链体的RNA链的磷酸骨架周围的旋转率降低。在一些实施方式中,接触SMSM后,不成对的凸起核苷酸与双链体RNA的第二核苷酸的距离受调。在一些实施方式中,不成对的凸起核苷酸与双链体RNA的第二核苷酸的距离减小。在一些实施方式中,不成对的凸起核苷酸位于双链体RNA的螺旋的内部内。在一些实施方式中,RNA双链体的凸起的大小减小。在一些实施方式中,RNA双链体的凸起被去除或维持。
在一些实施方式中,促进RNA双链体的剪接位点处的剪接。在一些实施方式中,接触SMSM后,RNA双链体的RNA链内的不成对的凸起核苷酸的碱基堆积增加。在一些实施方式中,不成对的凸起核苷酸与双链体RNA的第二核苷酸的距离增加或维持。在一些实施方式中,接触SMSM后,RNA双链体的凸起被稳定化。在一些实施方式中,不成对的凸起核苷酸位于双链体RNA的螺旋的外部部分上。在一些实施方式中,RNA双链体的凸起的大小增加。在一些实施方式中,RNA双链体的剪接位点处的剪接被抑制。在一些实施方式中,在剪接位点处抑制剪接。在一些实施方式中,接触SMSM后,RNA双链体的RNA链内的不成对的凸起核苷酸的碱基堆积减少。
本文描述的SMSM靶向的示例性位点包括5'剪接位点,3'剪接位点,聚嘧啶束,分支位点,剪接增强子和沉默子元件。突变或异常的二级或三级RNA结构是可产生可被靶向的mRNA位点或支架序列的热点。例如,许多外显子在5'和3'剪接位点处分别侧接内含子二核苷酸GT和AG。例如,在这些位点处的突变或异常的二级或三级RNA结构可以引起例如排除相邻的外显子或包含相邻的内含子。许多因子影响复杂的前mRNA剪接过程,包括数百种不同的蛋白,至少五种剪接体snRNA,mRNA上的序列,序列长度,增强子和沉默子元件以及剪接信号的强度。本文所述的SMSM靶向的示例性位点包括RNA的二级和有时三级结构。例如,本文所述的SMSM靶向的示例性位点包括茎环,发夹,分支点序列(BPS),聚嘧啶束(PPT),5'剪接位点(5’ss)和3'剪接位点(3’ss),双链体snRNA和剪接位点以及与RNA的结合的反式作用蛋白。靶标前mRNA可能包含缺陷序列,例如产生缺陷蛋白的序列,所述蛋白例如酶活性或表达(例如缺乏表达)等功能改变的蛋白。在一些实施方式中,缺陷序列影响RNA的结构。在一些实施方式中,缺陷序列影响snRNP的识别。
除了共有的剪接位点序列以外,结构限制,包括由突变引起的那些,还可以影响顺式作用序列如外显子/内含子剪接增强子(ESE/ISE)或沉默子元件(ESS/ISS)。
在一些实施方式中,天然DNA和/或前mRNA中的突变或RNA的异常二级或三级结构,产生了新的剪接位点序列。例如,突变或异常的RNA结构可能导致通常处于休眠状态或不充当剪接元件的RNA天然区域被激活并用作剪接位点或剪接元件。此类剪接位点和元件可以称为“隐蔽的”。例如,一个天然内含子可能会被分为两个异常内含子,而在它们之间会出现一个新的外显子。例如,突变可能会在天然5'剪接位点和天然分支点之间创建新的剪接位点。例如,突变可以激活天然剪接位点和天然分支点之间的隐蔽分支点序列。例如,突变可以在天然分支点和天然剪接位点之间创建新的剪接位点,并且可以进一步在异常突变的剪接位点的上游依次激活隐蔽剪接位点和隐蔽分支点。
在一些实施方式中,调节剪接活性的反式作用蛋白的突变或错误表达可能导致通常处于休眠状态或不充当剪接元件的RNA天然区域被激活并用作剪接位点或剪接元件。例如,SR蛋白的突变或错误表达可能导致通常处于休眠状态或不充当剪接元件的RNA天然区域被激活并用作剪接位点或剪接元件。
在一些实施方式中,天然DNA和/或前mRNA的突变抑制剪接位点处的剪接。例如,突变可导致在天然剪接位点序列的上游(即5’-)以及天然分支点序列的下游(即3’-)产生新的剪接位点。天然剪接位点序列和天然分支点序列可以充当天然剪接位点序列集和异常的剪接位点序列集的成员。
在一些实施方式中,天然剪接元件(例如,分支点)也是异常剪接元件集的成员。例如,本文提供的SMSM可以阻断天然元件并激活隐蔽元件(例如,隐蔽5’ss、隐蔽3’ss或隐蔽分支点),其可能招募天然剪接要素集的其余成员来促进错误剪接之上的正确剪接。在一些实施方式中,激活的隐蔽剪接元件在内含子中。在一些实施方式中,激活的隐蔽剪接元件在外显子中。取决于异常剪接元件的类型(例如,突变的剪接元件或非突变的剪接元件)和/或取决于剪接元件的调控(例如,上游信号通路的调控),本文提供的化合物和方法可用于阻断或激活各种不同的剪接元件。例如,本文提供的化合物和方法可以阻断突变的元件,非突变的元件,隐蔽元件或天然元件;其可能阻断5'剪接位点,3'剪接位点或分支点。
在一些实施方式中,可以通过采用本文提供的化合物来调节选择性剪接事件。例如,可以将本文提供的化合物引入其中存在编码包含选择性剪接位点的前mRNA的基因的细胞中。在一些实施方式中,在不存在该化合物的情况下,第一剪接事件发生以产生具有特定功能的基因产物。例如,在本文提供的化合物的存在下,可以抑制第一剪接事件。在一些实施方式中,在本文提供的化合物的存在下,可以抑制第一剪接事件并发生第二或选择性剪接事件,导致同一基因的表达以产生具有不同功能的基因产物。
在一些实施方式中,在本文提供的化合物的存在下,促进或增强了第一被抑制的剪接事件(例如,被突变、突变诱导的凸起或非突变诱导的凸起抑制的剪接事件)。在一些实施方式中,在本文提供的化合物的存在下,促进或增强了第一被抑制的剪接事件(例如,被突变、突变诱导的凸起或非突变诱导的凸起抑制的剪接事件)。例如,在本文提供的化合物的存在下,对第一剪接事件的抑制(例如,被突变、突变诱导的凸起或非突变诱导的凸起抑制的剪接事件)可以恢复为相应的未被抑制的第一剪接事件;或者在本文提供的化合物的存在下,第一剪接事件的抑制可以减少。在一些实施方式中,发生第二或选择性剪接时间,导致同一基因的表达以产生具有不同功能的基因产物。
靶标多核苷酸
本文描述的化合物可以调节基因产物的剪接,例如表2A,表2B,表2C和表2D中所示的那些。在一些实施方式中,本文描述的化合物用于治疗、预防疾病或病症(例如癌症和神经退行性疾病)和/或延迟其进展。某一些实施方式中,本文所述的化合物可以调节剪接并诱导基因产物的转录失活变体或转录物,如表2A,表2B,表2C和表2D中所示的那些。在一些实施方式中,本文所述的化合物调节剪接并抑制基因产物的转录活性变体或转录物,如表2A,表2B,表2C和表2D中所示的那些。
本文所述化合物对剪接的调节包括但不限于调节天然剪接,患病细胞中表达的RNA的剪接,RNA的隐蔽剪接位点序列的剪接或选择性剪接。本文所述化合物对剪接的调节可恢复或促进正确的剪接或所需的剪接事件。本文所述化合物对剪接的调节可以恢复或促进正确剪接或期望的剪接事件。本文所述化合物对剪接的调节包括但不限于预防异常剪接事件,例如,由与病症和疾病相关的RNA的突变或异常二级或三级结构引起的剪接事件。在一些实施方式中,本文所述的化合物在剪接位点序列处预防或抑制剪接。在一些实施方式中,本文所述的化合物在剪接位点序列处促进或增加剪接。在一些实施方式中,本文所述的化合物在特定剪接位点序列处调节剪接。
本文所述的组合物和方法可用于调节由基因编码的靶RNA例如前mRNA的剪接。编码靶RNA例如前mRNA的基因的实例包括但不限于表2A中的基因。编码本文所述的组合物和方法的靶RNA例如前mRNA的基因的实例包括但不限于ABCA4,ABCD1,ACADM,ACADSB,ADA,ADAMTS13,AGL,AGT,ALB,ALDH3A2,ALG6,ANGPTL3,APC,APOA1,APOB,APOC3,AR,ATM,ATP7A,ATP7B,ATR,ATXN2,ATXN3,B2M,BCL2–like 11(BIM),BMP2K,BRCA1,BRCA2,BTK,C3,CACNA1B,CACNA1C,CALCA,CAT,CD33,CD46,CDH1,CDH23,CFB,CFTR,CHM,CLCN1,COL11A1,COL11A2,COL1A1,COL1A2,COL2A1,COL3A1,COL4A5,COL6A1,COL7A1,COL9A2,COLQ,CREBBP,CSTB,CUL4B,CYBB,CYP17,CYP19,CYP27A1,DES,DGAT2,DMD,DUX4,DYSF,EGFR,EMD,ETV4,F11,F13A1,F5,F7,F8,FAH,FANCA,FANCC,FANCG,FBN1,FECH,FGA,FGFR2,FGG,FIX,FLNA,FOXM1,FRAS1,GALC,GBA,GCGR,GH1,GHR,GHV,GLA,HADHA,HBA2,HBB,HEXA,HEXB,HLCS,HMBS,HMGCL,HNF1A,HPRT1,HPRT2,HSF4,HSPG2,HTT,IDH1,IDS,IKBKAP,IL7RA,INSR,ITGB2,ITGB3,ITGB4,JAG1,KLKB1,KRAS,KRT5,L1CAM,LAMA2,LAMA3,LDLR,LGALS3,LMNA,LPA,LPL,LRRK2,MADD,MAPT,MET,MLH1,MSH2,MST1R,MTHFR,MUT,MVK,NF1,NF2,NR1H4,OAT,OPA1,OTC,OXT,PAH,PBGD,PCCA,PDH1,PGK1,PHEX,PKD2,PKLR,PKM1,PKM2,PLEKHM1,PLKR,POMT2,PRDM1,PRKAR1A,PROC,PSEN1,PTCH1,PTEN,PYGM,RP6KA3,RPGR,RSK2,SBCAD,SCN5A,SCNA,SERPINA1,SH2D1A,SLC12A3,SLC6A8,SMN2,SOD1,SPINK5,SPTA1,TMPRSS6,TP53,TRAPPC2,TSC1,TSC2,TSHB,TTN,TTR,UBE3A,UGT1A1和USH2A。
编码靶RNA例如前mRNA的基因的实例包括但不限于表2B中的基因。编码本文所述的组合物和方法的靶RNA例如前mRNA的基因的实例包括但不限于ABCD1,APOB,AR,ATM,BRCA1,C3,CFTR,COL1A1,COL3A1,COL6A1,COL7A1,CYP19,CYP27A1,DMD,F5,F7,FAH,FBN1,FGA,GCK,GHV,HBA2,HBB,HMGCL,HPRT1,HXA,IDS,ITGB2,ITGB3,KRT5,LDLR,LMNA,LPL,MTHFR,NF1,NF2,PBGD,PGK1,PKD1,PTEN,RPGR,TP53,TSC2,UGT1A1和YGM。
编码靶RNA例如前mRNA的基因的实例包括但不限于表2C中的基因。编码本文所述的组合物和方法的靶RNA例如前mRNA的基因的实例包括但不限于编码靶RNA例如前mRNA(其具有包含AGAguaag的剪接位点序列的剪接位点)的基因。编码本文所述的组合物和方法的靶RNA例如前mRNA的基因的实例包括但不限于ABCA9,ABCB1,ABCB5,ACADL,ACSS2,ADAL,ADAM10,ADAM15,ADAMTS20,ADAMTS6,ADAMTS9,ADCY10,ADCY8,AFP,AGL,AHCTF1,AKAP10,AKAP3,ALAS1,ALS2CL,AMBRA1,ANK3,ANTXR2,ANXA10,ANXA11,AP2A2,AP4E1,APOB,ARFGEF1,ARFGEF2,ARHGAP1,ARHGAP18,ARHGEF18,ARHGEF2,ARPC3,ARS2,ASH1L,ASNSD1,ASPM,ATAD5,ATG4A,ATP11C,ATP6V1G3,BBOX1,BCS1L,BMPR2,BRCC3,BRSK2,C10orf137,C11orf70,C12orf51,C13orf1,C13orf15,C14orf118,C15orf29,C15orf42,C16orf33,C16orf38,C16orf48,C18orf8,C19orf42,C1orf107,C1orf114,C1orf130,C1orf149,C1orf27,C1orf71,C1orf94,C1R,C20orf74,C21orf70,C3orf23,C4orf18,C5orf34,C8B,C8orf33,C9orf114,C9orf86,C9orf98,CA11,CAB39,CACNA2D1,CALCOCO2,CAMK1D,CAMKK1,CAPN9,CAPSL,CBX1,CBX3,CCDC102B,CCDC11,CCDC15,CCDC18,CCDC5,CCDC81,CD4,CDC14A,CDC16,CDC2L5,CDC42BPB,CDCA8,CDH10,CDH11,CDH24,CDH8,CDH9,CDK5RAP2,CDK8,CELSR3,CENPI,CENTB2,CENTG2,CEP110,CEP170,CEP192,CETP,CFH,CHAF1A,CHD9,CHIC2,CHN1,CLIC2,CLINT1,CLPB,CMIP,CNOT1,CNOT7,COG3,COL11A1,COL12A1,COL14A1,COL19A1,COL1A1,COL1A2,COL22A1,COL24A1,COL25A1,COL29A1,COL2A1,COL3A1,COL4A1,COL4A2,COL4A5,COL4A6,COL5A2,COL9A1,COMTD1,COPA,COPB2,COPS7B,COPZ2,CPSF2,CPXM2,CR1,CREBBP,CRKRS,CSE1L,CT45-6,CUBN,CUL5,CXorf41,CYP3A4,CYP3A43,CYP3A5,DCC,DCTN3,DDA1,DDX1,DDX24,DDX4,DENND2D,DEPDC2,DHFR,DHRS7,DIP2A,DMD,DNAH3,DNAH8,DNAI1,DNAJA4,DNAJC13,DNAJC7,DNTTIP2,DOCK11,DOCK4,DPP4,DSCC1,DYNC1H1,ECM2,EDEM3,EFCAB3,EFCAB4B,EIF3A,ELA1,ELA2A,EMCN,EML5,ENPP3,EPB41L5,EPHA3,EPHB1,EPHB3,EPS15,ERCC8,ERGIC3,ERMN,ERMP1,ERN1,ERN2,ETS2,EVC2,EXO1,EXOC4,F3,FAM13A1,FAM13B1,FAM13C1,FAM184A,FAM19A1,FAM20A,FAM23B,FAM65C,FANCA,FANCM,FANK1,FAR2,FBXO15,FBXO18,FBXO38,FEZ2,FGFR1OP,FGFR1OP2,FGFR2,FGR,FLJ35848,FLJ36070,FLNA,FN1,FNBP1L,FOLH1,FRAS1,FUT9,FZD3,FZD6,GAB1,GALNT3,GART,GAS2L3,GCG,GJA1,GLT8D1,GNAS,GNB5,GOLGB1,GOLT1A,GOLT1B,GPATCH1,GPR160,GRAMD3,GRHPR,GRIA1,GRIA3,GRIA4,GRIN2B,GRM3,GRM4,GRN,GSDMB,GSTCD,GTPBP4,HDAC3,HDAC5,HDX,HEPACAM2,HERC1,HIPK3,HNRNPH1,HSPA9,HSPG2,HTT,ICA1,IFI44L,IL1R2,IL5RA,IMMT,INPP5D,INTU,IPO4,IPO8,ISL2,IWS1,JAK1,JAK2,KATNAL2,KCNN2,KCNT2,KIAA0256,KIAA0586,KIAA1033,KIAA1219,KIAA1622,KIF15,KIF16B,KIF5A,KIF5B,KIF9,KIN,KIR2DL5B,KIR3DL2,KIR3DL3,KLF12,KLF3,KPNA5,KREMEN1,KRIT1,KRTCAP2,L1CAM,L3MBTL,L3MBTL2,LACE1,LAMA2,LAMB1,LGMN,LHCGR,LHX6,LIMCH1,LIMK2,LMBRD1,LMBRD2,LMLN,LMO2,LOC390110,LPCAT2,LRP4,LRPPRC,LRRC19,LRRC42,LUM,LVRN,LYST,MADD,MAGI1,MAGT1,MALT1,MAP4K4,MAPK8IP3,MAPK9,MATN2,MCF2L2,MDGA2,MEGF10,MEGF11,MEMO1,MGAM,MGAT4A,MGC34774,MIB1,MIER2,MKL2,MLANA,MLL5,MLX,MME,MPI,MRAP2,MRPL39,MRPS28,MRPS35,MTDH,MTF2,MUC2,MYB,MYCBP2,MYH2,MYO19,MYO3A,MYO9B,MYOM2,MYOM3,NAG,NARG1,NARG2,NCOA1,NDFIP2,NEDD4,NEK1,NEK5,NFIA,NFIX,NFRKB,NKAP,NLRC3,NLRC5,NME7,NOL10,NOS1,NOS2A,NOTCH1,NPM1,NR4A3,NRXN1,NSMAF,NSMCE2,NT5C3,NUBP1,NUBPL,NUMA1,NUP160,NUP98,NUPL1,OBFC2B,OLIG2,OSBPL11,OSBPL8,OSGEPL1,PADI4,PAH,PAN2,PAPOLG,PARVB,PA WR,PCNX,PCOTH,PDCD4,PDE8B,PDIA3,PDK4,PDS5A,PDS5B,PHACTR4,PHKB,PHLDB2,PHTF1,PIAS1,PIGF,PIGN,PIGT,PIK3C2G,PIK3CG,PIK3R1,PIWIL3,PKHD1L1,PLCB1,PLCB4,PLCG1,PLD1,PLEKHA5,PLEKHA7,PLXNC1,POLN,POLR3D,POMT2,POSTN,PPFIA2,PPP1R12A,PPP3CB,PPP4C,PPP4R1L,PPP4R2,PRAME,PRC1,PRIM1,PRIM2,PRKG1,PRMT7,PROCR,PROSC,PROX1,PRPF40B,PRPF4B,PRRG2,PSD3,PSMAL,PTK2,PTK2B,PTPN11,PTPN22,PTPN3,PTPN4,PTPRD,PTPRK,PTPRM,PUS10,PVRL2,QRSL1,RAB11FIP2,RAB23,RB1CC1,RBM39,RBM45,REC8,RFC4,RHPN2,RLN3,RNF32,RNFT1,ROCK1,ROCK2,RP1,RP11-265F1,RP13-36C9.,RPAP3,RPN1,RTEL1,RYR3,SAAL1,SAE1,SCN11A,SCN1A,SCN3A,SCO1,SCYL3,SDK2,SEC24A,SEC24D,SEC31A,SEL1L,SENP3,SENP6,SENP7,SETD3,SETD4,SGCE,SGOL2,SGPL1,SH3PXD2A,SH3PXD2B,SH3RF2,SH3TC2,SIPA1L2,SIPA1L3,SKAP1,SKIV2L2,SLC13A1,SLC28A3,SLC38A1,SLC38A4,SLC39A10,SLC4A2,SMARCA1,SMARCA5,SMC5,SNRK,SNRP70,SNX6,SPAG9,SPATA13,SPATA4,SPATS1,SPECC1L,SPP2,SRP72,SSX3,SSX5,SSX9,STAG1,STAMBPL1,STARD6,STK17B,STX3,STXBP1,SUCLG2,SULF2,SUPT16H,SYCP1,SYTL5,TAF2,TBC1D3G,TBC1D8B,TBCEL,TBK1,TCEB3,TCF12,TCP11L2,TDRD3,TEAD1,TET2,TFRC,TG,THOC2,TIAL1,TIAM2,TIMM50,TLK2,TMEM156,TMEM27,TMF1,TNFRSF10A,TNFRSF10B,TNFRSF8,TNK2,TNKS,TNKS2,TOM1L1,TOP2B,TP53INP1,TP63,TRAF3IP3,TRIM44,TRIM65,TRIML1,TRIML2,TRPM7,TTC17,TTLL5,TTN,TTPAL,UHRF1BP1,UNC45B,UNC5C,USP38,USP39,USP6,UTP15,UTP18,UTRN,UTX,UTY,UVRAG,UXT,VAPA,VPS29,VPS35,VTI1A,VTI1B,VWA3B,WDFY2,WDR17,WDR26,WDR44,WDR67,WDTC1,WRNIP1,WWC3,XRN1,XRN2,XX-FW88277,YARS,ZBTB20,ZC3HAV1,ZC3HC1,ZNF114,ZNF365,ZNF37A,ZNF618和ZWINT。
编码靶RNA例如前mRNA的基因的实例包括但不限于表2D中的基因。编码本文所述的组合物和方法的靶RNA例如前mRNA的基因的实例包括但不限于编码靶RNA例如前mRNA(其具有包含GGAgtaag的剪接位点序列的剪接位点)的基因。编码本文所述的组合物和方法的靶RNA例如前mRNA的基因的实例包括但不限于ABCC9,ACTG2,ADAM22,ADAM32,ADAMTS12,ADCY3,ADRBK2,AFP,AKNA,APOH,ARHGAP26,ARHGAP8,ATG16L2,ATP13A5,B4GALNT3,BBS4,BRSK1,BTAF1,C11orf30,C11orf65,C14orf101,C15orf60,C1orf87,C2orf55,C4orf29,C6orf118,C9orf43,CACHD1,CACNA1G,CACNA1H,CAPN3,CARKD,CCDC131,CCDC146,CD1B,CDK6,CEL,CGN,CGNL1,CHL1,CLEC16A,CLK1,CLPTM1,CMYA5,CNGA3,CNTN6,COL11A1,COL15A1,COL17A1,COL1A1,COL2A1,CRYZ,CSTF3,CYFIP2,CYP24A1,CYP4F2,CYP4F3,DAZ2,DCBLD1,DCUN1D4,DDEF1,DDX1,DHRS9,DMTF1,DOCK10,DPP3,DPY19L2P2,DVL3,EFNA4,EFTUD2,EPHA4,EPHB2,ERBB4,ERCC1,FAM134A,FAM161A,FAM176B,FCGBP,FGD6,FKBP3,GAPDH,GBGT1,GFM1,GPR158,GRIA1,GSTCD,GSTO2,HCK,HLA-DPB1,HLA-G,HLTF,HP1BP3,HPGD,HSF2BP,INTS3,IQGAP2,ITFG1,ITGAL,ITGB1,ITIH1,ITPR2,JMJD1C,KALRN,KCNN2,KIAA0528,KIAA0564,KIAA1166,KIAA1409,KIAA1787,KIF3B,KLHL20,KLK12,LAMA1,LARP7,LENG1,LOC389634,LRWD1,LYN,MAP2K1,MCM6,MEGF10,MGAM,MGAT5,MGC16169,MKKS,MPDZ,MRPL11,MS4A13,MSMB,MTIF2,NDC80,NEB,NEK11,NFE2L2,NFKBIL2,NKAIN2,NLRC3,NLRC5,NLRP13,NLRP7,NLRP8,NT5C,NUDT5,NUP88,OBFC2A,OPN4,OPTN,PARD3,PBRM1,PCBP4,PDE10A,PDLIM5,PDXK,PDZRN3,PELI2,PGM2,PIP5K1A,PITRM1,PKIB,PMFBP1,POMT2,PRKCA,PRODH,PRUNE2,PTPRN2,PTPRT,RALBP1,RALGDS,RBL2,RFT1,RFTN1,RIF1,RMND5B,RNF11,RNGTT,RPS6KA6,RRM1,RRP1B,RTF1,RUFY1,SCN2A,SCN4A,SCN8A,SDK1,SEZ6,SFRS12,SH3BGRL2,SIVA1,SLC22A17,SLC25A14,SLC6A11,SLC6A13,SLC6A6,SMTN,SNCAIP,SNX6,STAT6,SUPT6H,SV2C,SYCP2,SYT6,TAF2,TBC1D26,TBC1D29,TBPL1,TECTB,TEK,TGM7,TGS1,TM4SF20,TM6SF1,TMEM194A,TMEM77,TOM1L2,TP53BP2,TP53I3,TRPM3,TRPM5,TSPAN7,TTLL9,TUSC3,TXNDC10,UCK1,USH2A,USP1,UTP20,VPS39,WDR16,ZC3H7A,ZFYVE1,ZNF169和ZNF326。
本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节剪接,例如基因编码的多核苷酸的异常剪接,所述基因例如ABCA4,ABCA9,ABCB1,ABCB5,ABCC9,ABCD1,ACADL,ACADM,ACADSB,ACSS2,ACTG2,ADA,ADAL,ADAM10,ADAM15,ADAM22,ADAM32,ADAMTS12,ADAMTS13,ADAMTS20,ADAMTS6,ADAMTS9,ADCY10,ADCY3,ADCY8,ADRBK2,AFP,AGL,AGT,AHCTF1,AKAP10,AKAP3,AKNA,ALAS1,ALB,ALDH3A2,ALG6,ALS2CL,AMBRA1,ANGPTL3,ANK3,ANTXR2,ANXA10,ANXA11,AP2A2,AP4E1,APC,APOA1,APOB,APOC3,APOH,AR,ARFGEF1,ARFGEF2,ARHGAP1,ARHGAP18,ARHGAP26,ARHGAP8,ARHGEF18,ARHGEF2,ARPC3,ARS2,ASH1L,ASNSD1,ASPM,ATAD5,ATG16L2,ATG4A,ATM,ATP11C,ATP13A5,ATP6V1G3,ATP7A,ATP7B,ATR,ATXN2,ATXN3,B2M,B4GALNT3,BBOX1,BBS4,BCL2样11(BIM),BCS1L,BMP2K,BMPR2,BRCA1,BRCA2,BRCC3,BRSK1,BRSK2,BTAF1,BTK,C10orf137,C11orf30,C11orf65,C11orf70,C12orf51,C13orf1,C13orf15,C14orf101,C14orf118,C15orf29,C15orf42,C15orf60,C16orf33,C16orf38,C16orf48,C18orf8,C19orf42,C1orf107,C1orf114,C1orf130,C1orf149,C1orf27,C1orf71,C1orf87,C1orf94,C1R,C20orf74,C21orf70,C2orf55,C3,C3orf23,C4orf18,C4orf29,C5orf34,C6orf118,C8B,C8orf33,C9orf114,C9orf43,C9orf86,C9orf98,CA11,CAB39,CACHD1,CACNA1B,CACNA1C,CACNA1G,CACNA1H,CACNA2D1,CALCA,CALCOCO2,CAMK1D,CAMKK1,CAPN3,CAPN9,CAPSL,CARKD,CAT,CBX1,CBX3,CCDC102B,CCDC11,CCDC131,CCDC146,CCDC15,CCDC18,CCDC5,CCDC81,CD1B,CD33,CD4,CD46,CDC14A,CDC16,CDC2L5,CDC42BPB,CDCA8,CDH1,CDH10,CDH11,CDH23,CDH24,CDH8,CDH9,CDK5RAP2,CDK6,CDK8,CEL,CELSR3,CENPI,CENTB2,CENTG2,CEP110,CEP170,CEP192,CETP,CFB,CFH,CFTR,CGN,CGNL1,CHAF1A,CHD9,CHIC2,CHL1,CHM,CHN1,CLCN1,CLEC16A,CLIC2,CLINT1,CLK1,CLPB,CLPTM1,CMIP,CMYA5,CNGA3,CNOT1,CNOT7,CNTN6,COG3,COL11A1,COL11A2,COL12A1,COL14A1,COL15A1,COL17A1,COL19A1,COL1A1,COL1A2,COL22A1,COL24A1,COL25A1,COL29A1,COL2A1,COL3A1,COL4A1,COL4A2,COL4A5,COL4A6,COL5A2,COL6A1,COL7A1,COL9A1,COL9A2,COLQ,COMTD1,COPA,COPB2,COPS7B,COPZ2,CPSF2,CPXM2,CR1,CREBBP,CRKRS,CRYZ,CSE1L,CSTB,CSTF3,CT45-6,CUBN,CUL4B,CUL5,CXorf41,CYBB,CYFIP2,CYP17,CYP19,CYP24A1,CYP27A1,CYP3A4,CYP3A43,CYP3A5,CYP4F2,CYP4F3,DAZ2,DCBLD1,DCC,DCTN3,DCUN1D4,DDA1,DDEF1,DDX1,DDX24,DDX4,DENND2D,DEPDC2,DES,DGAT2,DHFR,DHRS7,DHRS9,DIP2A,DMD,DMTF1,DNAH3,DNAH8,DNAI1,DNAJA4,DNAJC13,DNAJC7,DNTTIP2,DOCK10,DOCK11,DOCK4,DPP3,DPP4,DPY19L2P2,DSCC1,DUX4,DVL3,DYNC1H1,DYSF,ECM2,EDEM3,EFCAB3,EFCAB4B,EFNA4,EFTUD2,EGFR,EIF3A,ELA1,ELA2A,EMCN,EMD,EML5,ENPP3,EPB41L5,EPHA3,EPHA4,EPHB1,EPHB2,EPHB3,EPS15,ERBB4,ERCC1,ERCC8,ERGIC3,ERMN,ERMP1,ERN1,ERN2,ETS2,ETV4,EVC2,EXO1,EXOC4,F11,F13A1,F3,F5,F7,F8,FAH,FAM134A,FAM13A1,FAM13B1,FAM13C1,FAM161A,FAM176B,FAM184A,FAM19A1,FAM20A,FAM23B,FAM65C,FANCA,FANCC,FANCG,FANCM,FANK1,FAR2,FBN1,FBXO15,FBXO18,FBXO38,FCGBP,FECH,FEZ2,FGA,FGD6,FGFR1OP,FGFR1OP2,FGFR2,FGG,FGR,FIX,FKBP3,FLJ35848,FLJ36070,FLNA,FN1,FNBP1L,FOLH1,FOXM1,FRAS1,FUT9,FZD3,FZD6,GAB1,GALC,GALNT3,GAPDH,GART,GAS2L3,GBA,GBGT1,GCG,GCGR,GCK,GFM1,GH1,GHR,GHV,GJA1,GLA,GLT8D1,GNAS,GNB5,GOLGB1,GOLT1A,GOLT1B,GPATCH1,GPR158,GPR160,GRAMD3,GRHPR,GRIA1,GRIA3,GRIA4,GRIN2B,GRM3,GRM4,GRN,GSDMB,GSTCD,GSTO2,GTPBP4,HADHA,HBA2,HBB,HCK,HDAC3,HDAC5,HDX,HEPACAM2,HERC1,HEXA,HEXB,HIPK3,HLA-DPB1,HLA-G,HLCS,HLTF,HMBS,HMGCL,HNF1A,HNRNPH1,HP1BP3,HPGD,HPRT1,HPRT2,HSF2BP,HSF4,HSPA9,HSPG2,HTT,HXA,ICA1,IDH1,IDS,IFI44L,IKBKAP,IL1R2,IL5RA,IL7RA,IMMT,INPP5D,INSR,INTS3,INTU,IPO4,IPO8,IQGAP2,ISL2,ITFG1,ITGAL,ITGB1,ITGB2,ITGB3,ITGB4,ITIH1,ITPR2,IWS1,JAG1,JAK1,JAK2,JMJD1C,KALRN,KATNAL2,KCNN2,KCNT2,KIAA0256,KIAA0528,KIAA0564,KIAA0586,KIAA1033,KIAA1166,KIAA1219,KIAA1409,KIAA1622,KIAA1787,KIF15,KIF16B,KIF3B,KIF5A,KIF5B,KIF9,KIN,KIR2DL5B,KIR3DL2,KIR3DL3,KLF12,KLF3,KLHL20,KLK12,KLKB1,KPNA5,KRAS,KREMEN1,KRIT1,KRT5,KRTCAP2,L1CAM,L3MBTL,L3MBTL2,LACE1,LAMA1,LAMA2,LAMA3,LAMB1,LARP7,LDLR,LENG1,LGALS3,LGMN,LHCGR,LHX6,LIMCH1,LIMK2,LMBRD1,LMBRD2,LMLN,LMNA,LMO2,LOC389634,LOC390110,LPA,LPCAT2,LPL,LRP4,LRPPRC,LRRC19,LRRC42,LRRK2,LRWD1,LUM,LVRN,LYN,LYST,MADD,MAGI1,MAGT1,MALT1,MAP2K1,MAP4K4,MAPK8IP3,MAPK9,MAPT,MATN2,MCF2L2,MCM6,MDGA2,MEGF10,MEGF11,MEMO1,MET,MGAM,MGAT4A,MGAT5,MGC16169,MGC34774,MIB1,MIER2,MKKS,MKL2,MLANA,MLH1,MLL5,MLX,MME,MPDZ,MPI,MRAP2,MRPL11,MRPL39,MRPS28,MRPS35,MS4A13,MSH2,MSMB,MST1R,MTDH,MTF2,MTHFR,MTIF2,MUC2,MUT,MVK,MYB,MYCBP2,MYH2,MYO19,MYO3A,MYO9B,MYOM2,MYOM3,NAG,NARG1,NARG2,NCOA1,NDC80,NDFIP2,NEB,NEDD4,NEK1,NEK11,NEK5,NF1,NF2,NFE2L2,NFIA,NFIX,NFKBIL2,NFRKB,NKAIN2,NKAP,NLRC3,NLRC5,NLRP13,NLRP7,NLRP8,NME7,NOL10,NOS1,NOS2A,NOTCH1,NPM1,NR1H4,NR4A3,NRXN1,NSMAF,NSMCE2,NT5C,NT5C3,NUBP1,NUBPL,NUDT5,NUMA1,NUP160,NUP88,NUP98,NUPL1,OAT,OBFC2A,OBFC2B,OLIG2,OPA1,OPN4,OPTN,OSBPL11,OSBPL8,OSGEPL1,OTC,OXT,PADI4,PAH,PAN2,PAPOLG,PARD3,PARVB,PAWR,PBGD,PBRM1,PCBP4,PCCA,PCNX,PCOTH,PDCD4,PDE10A,PDE8B,PDH1,PDIA3,PDK4,PDLIM5,PDS5A,PDS5B,PDXK,PDZRN3,PELI2,PGK1,PGM2,PHACTR4,PHEX,PHKB,PHLDB2,PHTF1,PIAS1,PIGF,PIGN,PIGT,PIK3C2G,PIK3CG,PIK3R1,PIP5K1A,PITRM1,PIWIL3,PKD1,PKD2,PKHD1L1,PKIB,PKLR,PKM1,PKM2,PLCB1,PLCB4,PLCG1,PLD1,PLEKHA5,PLEKHA7,PLEKHM1,PLKR,PLXNC1,PMFBP1,POLN,POLR3D,POMT2,POSTN,PPFIA2,PPP1R12A,PPP3CB,PPP4C,PPP4R1L,PPP4R2,PRAME,PRC1,PRDM1,PRIM1,PRIM2,PRKAR1A,PRKCA,PRKG1,PRMT7,PROC,PROCR,PRODH,PROSC,PROX1,PRPF40B,PRPF4B,PRRG2,PRUNE2,PSD3,PSEN1,PSMAL,PTCH1,PTEN,PTK2,PTK2B,PTPN11,PTPN22,PTPN3,PTPN4,PTPRD,PTPRK,PTPRM,PTPRN2,PTPRT,PUS10,PVRL2,PYGM,QRSL1,RAB11FIP2,RAB23,RALBP1,RALGDS,RB1CC1,RBL2,RBM39,RBM45,REC8,RFC4,RFT1,RFTN1,RHPN2,RIF1,RLN3,RMND5B,RNF11,RNF32,RNFT1,RNGTT,ROCK1,ROCK2,RP1,RP11-265F1,RP13-36C9,RP6KA3,RPAP3,RPGR,RPN1,RPS6KA6,RRM1,RRP1B,RSK2,RTEL1,RTF1,RUFY1,RYR3,SAAL1,SAE1,SBCAD,SCN11A,SCN1A,SCN2A,SCN3A,SCN4A,SCN5A,SCN8A,SCNA,SCO1,SCYL3,SDK1,SDK2,SEC24A,SEC24D,SEC31A,SEL1L,SENP3,SENP6,SENP7,SERPINA1,SETD3,SETD4,SEZ6,SFRS12,SGCE,SGOL2,SGPL1,SH2D1A,SH3BGRL2,SH3PXD2A,SH3PXD2B,SH3RF2,SH3TC2,SIPA1L2,SIPA1L3,SIVA1,SKAP1,SKIV2L2,SLC12A3,SLC13A1,SLC22A17,SLC25A14,SLC28A3,SLC38A1,SLC38A4,SLC39A10,SLC4A2,SLC6A11,SLC6A13,SLC6A6,SLC6A8,SMARCA1,SMARCA5,SMC5,SMN2,SMTN,SNCAIP,SNRK,SNRP70,SNX6,SOD1,SPAG9,SPATA13,SPATA4,SPATS1,SPECC1L,SPINK5,SPP2,SPTA1,SRP72,SSX3,SSX5,SSX9,STAG1,STAMBPL1,STARD6,STAT6,STK17B,STX3,STXBP1,SUCLG2,SULF2,SUPT16H,SUPT6H,SV2C,SYCP1,SYCP2,SYT6,SYTL5,TAF2,TBC1D26,TBC1D29,TBC1D3G,TBC1D8B,TBCEL,TBK1,TBPL1,TCEB3,TCF12,TCP11L2,TDRD3,TEAD1,TECTB,TEK,TET2,TFRC,TG,TGM7,TGS1,THOC2,TIAL1,TIAM2,TIMM50,TLK2,TM4SF20,TM6SF1,TMEM156,TMEM194A,TMEM27,TMEM77,TMF1,TMPRSS6,TNFRSF10A,TNFRSF10B,TNFRSF8,TNK2,TNKS,TNKS2,TOM1L1,TOM1L2,TOP2B,TP53,TP53BP2,TP53I3,TP53INP1,TP63,TRAF3IP3,TRAPPC2,TRIM44,TRIM65,TRIML1,TRIML2,TRPM3,TRPM5,TRPM7,TSC1,TSC2,TSHB,TSPAN7,TTC17,TTLL5,TTLL9,TTN,TTPAL,TTR,TUSC3,TXNDC10,UBE3A,UCK1,UGT1A1,UHRF1BP1,UNC45B,UNC5C,USH2A,USP1,USP38,USP39,USP6,UTP15,UTP18,UTP20,UTRN,UTX,UTY,UVRAG,UXT,VAPA,VPS29,VPS35,VPS39,VTI1A,VTI1B,VWA3B,WDFY2,WDR16,WDR17,WDR26,WDR44,WDR67,WDTC1,WRNIP1,WWC3,XRN1,XRN2,XX-FW88277,YARS,YGM,ZBTB20,ZC3H7A,ZC3HAV1,ZC3HC1,ZFYVE1,ZNF114,ZNF169,ZNF326,ZNF365,ZNF37A,ZNF618或ZWINT基因。
例如,本文提供了剪接调节化合物,其调节剪接,例如以下的异常剪接:ABCA4,ABCA9,ABCB1,ABCB5,ABCC9,ABCD1,ACADL,ACADM,ACADSB,ACSS2,ACTG2,ADA,ADAL,ADAM10,ADAM15,ADAM22,ADAM32,ADAMTS12,ADAMTS13,ADAMTS20,ADAMTS6,ADAMTS9,ADCY10,ADCY3,ADCY8,ADRBK2,AFP,AGL,AGT,AHCTF1,AKAP10,AKAP3,AKNA,ALAS1,ALB,ALDH3A2,ALG6,ALS2CL,AMBRA1,ANGPTL3,ANK3,ANTXR2,ANXA10,ANXA11,AP2A2,AP4E1,APC,APOA1,APOB,APOC3,APOH,AR,ARFGEF1,ARFGEF2,ARHGAP1,ARHGAP18,ARHGAP26,ARHGAP8,ARHGEF18,ARHGEF2,ARPC3,ARS2,ASH1L,ASNSD1,ASPM,ATAD5,ATG16L2,ATG4A,ATM,ATP11C,ATP13A5,ATP6V1G3,ATP7A,ATP7B,ATR,ATXN2,ATXN3,B2M,B4GALNT3,BBOX1,BBS4,BCL2样11(BIM),BCS1L,BMP2K,BMPR2,BRCA1,BRCA2,BRCC3,BRSK1,BRSK2,BTAF1,BTK,C10orf137,C11orf30,C11orf65,C11orf70,C12orf51,C13orf1,C13orf15,C14orf101,C14orf118,C15orf29,C15orf42,C15orf60,C16orf33,C16orf38,C16orf48,C18orf8,C19orf42,C1orf107,C1orf114,C1orf130,C1orf149,C1orf27,C1orf71,C1orf87,C1orf94,C1R,C20orf74,C21orf70,C2orf55,C3,C3orf23,C4orf18,C4orf29,C5orf34,C6orf118,C8B,C8orf33,C9orf114,C9orf43,C9orf86,C9orf98,CA11,CAB39,CACHD1,CACNA1B,CACNA1C,CACNA1G,CACNA1H,CACNA2D1,CALCA,CALCOCO2,CAMK1D,CAMKK1,CAPN3,CAPN9,CAPSL,CARKD,CAT,CBX1,CBX3,CCDC102B,CCDC11,CCDC131,CCDC146,CCDC15,CCDC18,CCDC5,CCDC81,CD1B,CD33,CD4,CD46,CDC14A,CDC16,CDC2L5,CDC42BPB,CDCA8,CDH1,CDH10,CDH11,CDH23,CDH24,CDH8,CDH9,CDK5RAP2,CDK6,CDK8,CEL,CELSR3,CENPI,CENTB2,CENTG2,CEP110,CEP170,CEP192,CETP,CFB,CFH,CFTR,CGN,CGNL1,CHAF1A,CHD9,CHIC2,CHL1,CHM,CHN1,CLCN1,CLEC16A,CLIC2,CLINT1,CLK1,CLPB,CLPTM1,CMIP,CMYA5,CNGA3,CNOT1,CNOT7,CNTN6,COG3,COL11A1,COL11A2,COL12A1,COL14A1,COL15A1,COL17A1,COL19A1,COL1A1,COL1A2,COL22A1,COL24A1,COL25A1,COL29A1,COL2A1,COL3A1,COL4A1,COL4A2,COL4A5,COL4A6,COL5A2,COL6A1,COL7A1,COL9A1,COL9A2,COLQ,COMTD1,COPA,COPB2,COPS7B,COPZ2,CPSF2,CPXM2,CR1,CREBBP,CRKRS,CRYZ,CSE1L,CSTB,CSTF3,CT45-6,CUBN,CUL4B,CUL5,CXorf41,CYBB,CYFIP2,CYP17,CYP19,CYP24A1,CYP27A1,CYP3A4,CYP3A43,CYP3A5,CYP4F2,CYP4F3,DAZ2,DCBLD1,DCC,DCTN3,DCUN1D4,DDA1,DDEF1,DDX1,DDX24,DDX4,DENND2D,DEPDC2,DES,DGAT2,DHFR,DHRS7,DHRS9,DIP2A,DMD,DMTF1,DNAH3,DNAH8,DNAI1,DNAJA4,DNAJC13,DNAJC7,DNTTIP2,DOCK10,DOCK11,DOCK4,DPP3,DPP4,DPY19L2P2,DSCC1,DUX4,DVL3,DYNC1H1,DYSF,ECM2,EDEM3,EFCAB3,EFCAB4B,EFNA4,EFTUD2,EGFR,EIF3A,ELA1,ELA2A,EMCN,EMD,EML5,ENPP3,EPB41L5,EPHA3,EPHA4,EPHB1,EPHB2,EPHB3,EPS15,ERBB4,ERCC1,ERCC8,ERGIC3,ERMN,ERMP1,ERN1,ERN2,ETS2,ETV4,EVC2,EXO1,EXOC4,F11,F13A1,F3,F5,F7,F8,FAH,FAM134A,FAM13A1,FAM13B1,FAM13C1,FAM161A,FAM176B,FAM184A,FAM19A1,FAM20A,FAM23B,FAM65C,FANCA,FANCC,FANCG,FANCM,FANK1,FAR2,FBN1,FBXO15,FBXO18,FBXO38,FCGBP,FECH,FEZ2,FGA,FGD6,FGFR1OP,FGFR1OP2,FGFR2,FGG,FGR,FIX,FKBP3,FLJ35848,FLJ36070,FLNA,FN1,FNBP1L,FOLH1,FOXM1,FRAS1,FUT9,FZD3,FZD6,GAB1,GALC,GALNT3,GAPDH,GART,GAS2L3,GBA,GBGT1,GCG,GCGR,GCK,GFM1,GH1,GHR,GHV,GJA1,GLA,GLT8D1,GNAS,GNB5,GOLGB1,GOLT1A,GOLT1B,GPATCH1,GPR158,GPR160,GRAMD3,GRHPR,GRIA1,GRIA3,GRIA4,GRIN2B,GRM3,GRM4,GRN,GSDMB,GSTCD,GSTO2,GTPBP4,HADHA,HBA2,HBB,HCK,HDAC3,HDAC5,HDX,HEPACAM2,HERC1,HEXA,HEXB,HIPK3,HLA-DPB1,HLA-G,HLCS,HLTF,HMBS,HMGCL,HNF1A,HNRNPH1,HP1BP3,HPGD,HPRT1,HPRT2,HSF2BP,HSF4,HSPA9,HSPG2,HTT,HXA,ICA1,IDH1,IDS,IFI44L,IKBKAP,IL1R2,IL5RA,IL7RA,IMMT,INPP5D,INSR,INTS3,INTU,IPO4,IPO8,IQGAP2,ISL2,ITFG1,ITGAL,ITGB1,ITGB2,ITGB3,ITGB4,ITIH1,ITPR2,IWS1,JAG1,JAK1,JAK2,JMJD1C,KALRN,KATNAL2,KCNN2,KCNT2,KIAA0256,KIAA0528,KIAA0564,KIAA0586,KIAA1033,KIAA1166,KIAA1219,KIAA1409,KIAA1622,KIAA1787,KIF15,KIF16B,KIF3B,KIF5A,KIF5B,KIF9,KIN,KIR2DL5B,KIR3DL2,KIR3DL3,KLF12,KLF3,KLHL20,KLK12,KLKB1,KPNA5,KRAS,KREMEN1,KRIT1,KRT5,KRTCAP2,L1CAM,L3MBTL,L3MBTL2,LACE1,LAMA1,LAMA2,LAMA3,LAMB1,LARP7,LDLR,LENG1,LGALS3,LGMN,LHCGR,LHX6,LIMCH1,LIMK2,LMBRD1,LMBRD2,LMLN,LMNA,LMO2,LOC389634,LOC390110,LPA,LPCAT2,LPL,LRP4,LRPPRC,LRRC19,LRRC42,LRRK2,LRWD1,LUM,LVRN,LYN,LYST,MADD,MAGI1,MAGT1,MALT1,MAP2K1,MAP4K4,MAPK8IP3,MAPK9,MAPT,MATN2,MCF2L2,MCM6,MDGA2,MEGF10,MEGF11,MEMO1,MET,MGAM,MGAT4A,MGAT5,MGC16169,MGC34774,MIB1,MIER2,MKKS,MKL2,MLANA,MLH1,MLL5,MLX,MME,MPDZ,MPI,MRAP2,MRPL11,MRPL39,MRPS28,MRPS35,MS4A13,MSH2,MSMB,MST1R,MTDH,MTF2,MTHFR,MTIF2,MUC2,MUT,MVK,MYB,MYCBP2,MYH2,MYO19,MYO3A,MYO9B,MYOM2,MYOM3,NAG,NARG1,NARG2,NCOA1,NDC80,NDFIP2,NEB,NEDD4,NEK1,NEK11,NEK5,NF1,NF2,NFE2L2,NFIA,NFIX,NFKBIL2,NFRKB,NKAIN2,NKAP,NLRC3,NLRC5,NLRP13,NLRP7,NLRP8,NME7,NOL10,NOS1,NOS2A,NOTCH1,NPM1,NR1H4,NR4A3,NRXN1,NSMAF,NSMCE2,NT5C,NT5C3,NUBP1,NUBPL,NUDT5,NUMA1,NUP160,NUP88,NUP98,NUPL1,OAT,OBFC2A,OBFC2B,OLIG2,OPA1,OPN4,OPTN,OSBPL11,OSBPL8,OSGEPL1,OTC,OXT,PADI4,PAH,PAN2,PAPOLG,PARD3,PARVB,PAWR,PBGD,PBRM1,PCBP4,PCCA,PCNX,PCOTH,PDCD4,PDE10A,PDE8B,PDH1,PDIA3,PDK4,PDLIM5,PDS5A,PDS5B,PDXK,PDZRN3,PELI2,PGK1,PGM2,PHACTR4,PHEX,PHKB,PHLDB2,PHTF1,PIAS1,PIGF,PIGN,PIGT,PIK3C2G,PIK3CG,PIK3R1,PIP5K1A,PITRM1,PIWIL3,PKD1,PKD2,PKHD1L1,PKIB,PKLR,PKM1,PKM2,PLCB1,PLCB4,PLCG1,PLD1,PLEKHA5,PLEKHA7,PLEKHM1,PLKR,PLXNC1,PMFBP1,POLN,POLR3D,POMT2,POSTN,PPFIA2,PPP1R12A,PPP3CB,PPP4C,PPP4R1L,PPP4R2,PRAME,PRC1,PRDM1,PRIM1,PRIM2,PRKAR1A,PRKCA,PRKG1,PRMT7,PROC,PROCR,PRODH,PROSC,PROX1,PRPF40B,PRPF4B,PRRG2,PRUNE2,PSD3,PSEN1,PSMAL,PTCH1,PTEN,PTK2,PTK2B,PTPN11,PTPN22,PTPN3,PTPN4,PTPRD,PTPRK,PTPRM,PTPRN2,PTPRT,PUS10,PVRL2,PYGM,QRSL1,RAB11FIP2,RAB23,RALBP1,RALGDS,RB1CC1,RBL2,RBM39,RBM45,REC8,RFC4,RFT1,RFTN1,RHPN2,RIF1,RLN3,RMND5B,RNF11,RNF32,RNFT1,RNGTT,ROCK1,ROCK2,RP1,RP11-265F1,RP13-36C9,RP6KA3,RPAP3,RPGR,RPN1,RPS6KA6,RRM1,RRP1B,RSK2,RTEL1,RTF1,RUFY1,RYR3,SAAL1,SAE1,SBCAD,SCN11A,SCN1A,SCN2A,SCN3A,SCN4A,SCN5A,SCN8A,SCNA,SCO1,SCYL3,SDK1,SDK2,SEC24A,SEC24D,SEC31A,SEL1L,SENP3,SENP6,SENP7,SERPINA1,SETD3,SETD4,SEZ6,SFRS12,SGCE,SGOL2,SGPL1,SH2D1A,SH3BGRL2,SH3PXD2A,SH3PXD2B,SH3RF2,SH3TC2,SIPA1L2,SIPA1L3,SIVA1,SKAP1,SKIV2L2,SLC12A3,SLC13A1,SLC22A17,SLC25A14,SLC28A3,SLC38A1,SLC38A4,SLC39A10,SLC4A2,SLC6A11,SLC6A13,SLC6A6,SLC6A8,SMARCA1,SMARCA5,SMC5,SMN2,SMTN,SNCAIP,SNRK,SNRP70,SNX6,SOD1,SPAG9,SPATA13,SPATA4,SPATS1,SPECC1L,SPINK5,SPP2,SPTA1,SRP72,SSX3,SSX5,SSX9,STAG1,STAMBPL1,STARD6,STAT6,STK17B,STX3,STXBP1,SUCLG2,SULF2,SUPT16H,SUPT6H,SV2C,SYCP1,SYCP2,SYT6,SYTL5,TAF2,TBC1D26,TBC1D29,TBC1D3G,TBC1D8B,TBCEL,TBK1,TBPL1,TCEB3,TCF12,TCP11L2,TDRD3,TEAD1,TECTB,TEK,TET2,TFRC,TG,TGM7,TGS1,THOC2,TIAL1,TIAM2,TIMM50,TLK2,TM4SF20,TM6SF1,TMEM156,TMEM194A,TMEM27,TMEM77,TMF1,TMPRSS6,TNFRSF10A,TNFRSF10B,TNFRSF8,TNK2,TNKS,TNKS2,TOM1L1,TOM1L2,TOP2B,TP53,TP53BP2,TP53I3,TP53INP1,TP63,TRAF3IP3,TRAPPC2,TRIM44,TRIM65,TRIML1,TRIML2,TRPM3,TRPM5,TRPM7,TSC1,TSC2,TSHB,TSPAN7,TTC17,TTLL5,TTLL9,TTN,TTPAL,TTR,TUSC3,TXNDC10,UBE3A,UCK1,UGT1A1,UHRF1BP1,UNC45B,UNC5C,USH2A,USP1,USP38,USP39,USP6,UTP15,UTP18,UTP20,UTRN,UTX,UTY,UVRAG,UXT,VAPA,VPS29,VPS35,VPS39,VTI1A,VTI1B,VWA3B,WDFY2,WDR16,WDR17,WDR26,WDR44,WDR67,WDTC1,WRNIP1,WWC3,XRN1,XRN2,XX-FW88277,YARS,YGM,ZBTB20,ZC3H7A,ZC3HAV1,ZC3HC1,ZFYVE1,ZNF114,ZNF169,ZNF326,ZNF365,ZNF37A,ZNF618或ZWINT mRNA,例如前mRNA。
在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节ABCA4的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节ABCA9的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节ABCB1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节ABCB5的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节ABCC9的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节ABCD1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节ACADL的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节ACADM的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节ACADSB的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节ACSS2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节ACTG2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节ADA的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节ADAL的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节ADAM10的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节ADAM15的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节ADAM22的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节ADAM32的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节ADAMTS12的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节ADAMTS13的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节ADAMTS20的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节ADAMTS6的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节ADAMTS9的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节ADCY10的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节ADCY3的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节ADCY8的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节ADRBK2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节AFP的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节AGL的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节AGT的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节AHCTF1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节AKAP10的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节AKAP3的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节AKNA的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节ALAS1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节ALB的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节ALDH3A2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节ALG6的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节ALS2CL的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节AMBRA1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节ANGPTL3的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节ANK3的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节ANTXR2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节ANXA10的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节ANXA11的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节AP2A2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节AP4E1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节APC的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节APOA1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节APOB的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节APOC3的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节APOH的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节AR的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节ARFGEF1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节ARFGEF2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节ARHGAP1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节ARHGAP18的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节ARHGAP26的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节ARHGAP8的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节ARHGEF18的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节ARHGEF2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节ARPC3的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节ARS2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节ASH1L的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节ASNSD1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节ASPM的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节ATAD5的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节ATG16L2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节ATG4A的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节ATM的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节ATP11C的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节ATP13A5的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节ATP6V1G3的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节ATP7A的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节ATP7B的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节ATR的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节ATXN2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节ATXN3的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节B2M的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节B4GALNT3的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节BBOX1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节BBS4的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节BCL2样11(BIM)的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节BCS1L的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节BMP2K的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节BMPR2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节BRCA1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节BRCA2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节BRCC3的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节BRSK1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节BRSK2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节BTAF1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节BTK的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节C10orf137的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节C11orf30的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节C11orf65的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节C11orf70的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节C12orf51的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节C13orf1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节C13orf15的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节C14orf101的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节C14orf118的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节C15orf29的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节C15orf42的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节C15orf60的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节C16orf33的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节C16orf38的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节C16orf48的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节C18orf8的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节C19orf42的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节C1orf107的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节C1orf114的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节C1orf130的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节C1orf149的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节C1orf27的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节C1orf71的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节C1orf87的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节C1orf94的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节C1R的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节C20orf74的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节C21orf70的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节C2orf55的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节C3的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节C3orf23的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节C4orf18的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节C4orf29的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节C5orf34的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节C6orf118的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节C8B的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节C8orf33的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节C9orf114的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节C9orf43的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节C9orf86的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节C9orf98的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CA11的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CAB39的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CACHD1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CACNA1B的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节的CACNA1C前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CACNA1G的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CACNA1H的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CACNA2D1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CALCA的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CALCOCO2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CAMK1D的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CAMKK1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CAPN3的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CAPN9的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CAPSL的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CARKD的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CAT的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CBX1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CBX3的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CCDC102B的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CCDC11的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CCDC131的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CCDC146的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CCDC15的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CCDC18的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CCDC5的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CCDC81的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CD1B的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CD33的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CD4的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CD46的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CDC14A的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CDC16的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CDC2L5的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CDC42BPB的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CDCA8的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CDH1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CDH10的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CDH11的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CDH23的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CDH24的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CDH8的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CDH9的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CDK5RAP2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CDK6的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CDK8的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CEL的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CELSR3的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CENPI的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CENTB2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CENTG2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CEP110的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CEP170的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CEP192的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CETP的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CFB的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CFH的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CFTR的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CGN的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CGNL1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CHAF1A的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CHD9的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CHIC2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CHL1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CHM的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CHN1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CLCN1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CLEC16A的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CLIC2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CLINT1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CLK1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CLPB的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CLPTM1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CMIP的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CMYA5的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CNGA3的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CNOT1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CNOT7的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CNTN6的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节COG3的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节COL11A1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节COL11A2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节COL12A1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节COL14A1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节COL15A1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节COL17A1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节COL19A1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节COL1A1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节COL1A2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节COL22A1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节COL24A1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节COL25A1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节COL29A1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节COL2A1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节COL3A1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节COL4A1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节COL4A2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节COL4A5的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节COL4A6的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节COL5A2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节COL6A1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节COL7A1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节COL9A1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节COL9A2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节COLQ的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节COMTD1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节COPA的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节COPB2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节COPS7B的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节COPZ2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CPSF2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CPXM2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CR1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CREBBP的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CRKRS的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CRYZ的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CSE1L的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CSTB的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CSTF3的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CT45-6的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CUBN的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CUL4B的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CUL5的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CXorf41的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CYBB的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CYFIP2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CYP17的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CYP19的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CYP24A1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CYP27A1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CYP3A4的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CYP3A43的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CYP3A5的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CYP4F2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节CYP4F3的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节DAZ2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节DCBLD1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节DCC的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节DCTN3的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节DCUN1D4的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节DDA1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节DDEF1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节DDX1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节DDX24的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节DDX4的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节DENND2D的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节DEPDC2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节DES的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节DGAT2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节DHFR的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节DHRS7的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节DHRS9的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节DIP2A的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节DMD的前mRNA的剪接。例如,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节DMD的外显子51a前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节DMTF1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节DNAH3的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节DNAH8的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节DNAI1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节DNAJA4的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节DNAJC13的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节DNAJC7的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节DNTTIP2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节DOCK10的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节DOCK11的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节DOCK4的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节DPP3的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节DPP4的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节DPY19L2P2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节DSCC1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节DUX4的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节DVL3的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节DYNC1H1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节DYSF的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节ECM2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节EDEM3的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节EFCAB3的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节EFCAB4B的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节EFNA4的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节EFTUD2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节EGFR的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节EIF3A的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节ELA1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节ELA2A的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节EMCN的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节EMD的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节EML5的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节ENPP3的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节EPB41L5的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节EPHA3的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节EPHA4的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节EPHB1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节EPHB2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节EPHB3的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节EPS15的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节ERBB4的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节ERCC1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节ERCC8的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节ERGIC3的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节ERMN的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节ERMP1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节ERN1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节ERN2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节ETS2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节ETV4的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节EVC2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节EXO1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节EXOC4的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节F11的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节F13A1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节F3的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节F5的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节F7的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节F8的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节FAH的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节FAM134A的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节FAM13A1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节FAM13B1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节FAM13C1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节FAM161A的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节FAM176B的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节FAM184A的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节FAM19A1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节FAM20A的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节FAM23B的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节FAM65C的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节FANCA的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节FANCC的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节FANCG的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节FANCM的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节FANK1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节FAR2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节FBN1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节FBXO15的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节FBXO18的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节FBXO38的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节FCGBP的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节FECH的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节FEZ2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节FGA的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节FGD6的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节FGFR1OP的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节FGFR1OP2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节FGFR2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节FGG的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节FGR的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节FIX的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节FKBP3的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节FLJ35848的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节FLJ36070的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节FLNA的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节FN1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节FNBP1L的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节FOLH1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节FOXM1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节FRAS1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节FUT9的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节FZD3的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节FZD6的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节GAB1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节GALC的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节GALNT3的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节GAPDH的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节GART的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节GAS2L3的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节GBA的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节GBGT1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节GCG的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节GCGR的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节GCK的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节GFM1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节GH1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节GHR的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节GHV的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节GJA1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节GLA的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节GLT8D1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节GNAS的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节GNB5的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节GOLGB1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节GOLT1A的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节GOLT1B的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节GPATCH1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节GPR158的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节GPR160的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节GRAMD3的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节GRHPR的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节GRIA1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节GRIA3的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节GRIA4的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节GRIN2B的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节GRM3的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节GRM4的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节GRN的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节GSDMB的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节GSTCD的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节GSTO2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节GTPBP4的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节HADHA的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节HBA2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节HBB的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节HCK的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节HDAC3的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节HDAC5的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节HDX的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节HEPACAM2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节HERC1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节HEXA的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节HEXB的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节HIPK3的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节HLA-DPB1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节HLA-G的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节HLCS的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节HLTF的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节HMBS的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节HMGCL的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节HNF1A的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节HNRNPH1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节HP1BP3的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节HPGD的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节HPRT1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节HPRT2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节HSF2BP的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节HSF4的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节HSPA9的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节HSPG2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节HTT的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节HXA的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节ICA1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节IDH1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节IDS的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节IFI44L的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节IKBKAP的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节IL1R2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节IL5RA的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节IL7RA的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节IMMT的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节INPP5D的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节INSR的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节INTS3的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节INTU的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节IPO4的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节IPO8的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节IQGAP2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节ISL2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节ITFG1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节ITGAL的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节ITGB1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节ITGB2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节ITGB3的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节ITGB4的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节ITIH1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节ITPR2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节IWS1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节JAG1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节JAK1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节JAK2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节JMJD1C的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节KALRN的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节KATNAL2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节KCNN2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节KCNT2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节KIAA0256的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节KIAA0528的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节KIAA0564的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节KIAA0586的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节KIAA1033的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节KIAA1166的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节KIAA1219的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节KIAA1409的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节KIAA1622的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节KIAA1787的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节KIF15的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节KIF16B的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节KIF3B的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节KIF5A的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节KIF5B的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节KIF9的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节KIN的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节KIR2DL5B的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节KIR3DL2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节KIR3DL3的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节KLF12的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节KLF3的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节KLHL20的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节KLK12的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节KLKB1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节KPNA5的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节KRAS的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节KREMEN1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节KRIT1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节KRT5的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节KRTCAP2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节L1CAM的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节L3MBTL的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节L3MBTL2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节LACE1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节LAMA1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节LAMA2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节LAMA3的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节LAMB1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节LARP7的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节LDLR的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节LENG1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节LGALS3的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节LGMN的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节LHCGR的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节LHX6的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节LIMCH1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节LIMK2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节LMBRD1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节LMBRD2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节LMLN的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节LMNA的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节LMO2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节LOC389634的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节LOC390110的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节LPA的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节LPCAT2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节LPL的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节LRP4的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节LRPPRC的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节LRRC19的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节LRRC42的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节LRRK2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节LRWD1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节LUM的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节LVRN的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节LYN的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节LYST的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节MADD的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节MAGI1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节MAGT1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节MALT1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节MAP2K1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节MAP4K4的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节MAPK8IP3的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节MAPK9的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节MAPT的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节MATN2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节MCF2L2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节MCM6的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节MDGA2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节MEGF10的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节MEGF11的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节MEMO1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节MET的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节MGAM的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节MGAT4A的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节MGAT5的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节MGC16169的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节MGC34774的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节MIB1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节MIER2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节MKKS的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节MKL2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节MLANA的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节MLH1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节MLL5的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节MLX的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节MME的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节MPDZ的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节MPI的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节MRAP2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节MRPL11的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节MRPL39的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节MRPS28的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节MRPS35的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节MS4A13的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节MSH2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节MSMB的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节MST1R的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节MTDH的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节MTF2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节MTHFR的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节MTIF2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节MUC2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节MUT的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节MVK的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节MYB的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节MYCBP2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节MYH2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节MYO19的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节MYO3A的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节MYO9B的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节MYOM2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节MYOM3的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节NAG的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节NARG1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节NARG2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节NCOA1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节NDC80的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节NDFIP2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节NEB的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节NEDD4的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节NEK1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节NEK11的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节NEK5的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节NF1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节NF2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节NFE2L2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节NFIA的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节NFIX的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节NFKBIL2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节NFRKB的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节NKAIN2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节NKAP的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节NLRC3的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节NLRC5的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节NLRP13的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节NLRP7的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节NLRP8的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节NME7的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节NOL10的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节NOS1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节NOS2A的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节NOTCH1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节NPM1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节NR1H4的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节NR4A3的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节NRXN1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节NSMAF的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节NSMCE2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节NT5C的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节NT5C3的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节NUBP1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节NUBPL的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节NUDT5的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节NUMA1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节NUP160的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节NUP88的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节NUP98的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节NUPL1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节OAT的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节OBFC2A的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节OBFC2B的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节OLIG2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节OPA1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节OPN4的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节OPTN的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节OSBPL11的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节OSBPL8的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节OSGEPL1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节OTC的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节OXT的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PADI4的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PAH的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PAN2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PAPOLG的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PARD3的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PARVB的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PAWR的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PBGD的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PBRM1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PCBP4的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PCCA的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PCNX的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PCOTH的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PDCD4的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PDE10A的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PDE8B的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PDH1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PDIA3的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PDK4的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PDLIM5的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PDS5A的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PDS5B的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PDXK的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PDZRN3的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PELI2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PGK1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PGM2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PHACTR4的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PHEX的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PHKB的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PHLDB2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PHTF1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PIAS1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PIGF的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PIGN的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PIGT的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PIK3C2G的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PIK3CG的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PIK3R1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PIP5K1A的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PITRM1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PIWIL3的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PKD1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PKD2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PKHD1L1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PKIB的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PKLR的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PKM1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PKM2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PLCB1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PLCB4的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PLCG1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PLD1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PLEKHA5的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PLEKHA7的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PLEKHM1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PLKR的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PLXNC1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PMFBP1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节POLN的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节POLR3D的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节POMT2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节POSTN的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PPFIA2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PPP1R12A的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PPP3CB的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PPP4C的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PPP4R1L的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PPP4R2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PRAME的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PRC1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PRDM1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PRIM1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PRIM2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PRKAR1A的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PRKCA的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PRKG1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PRMT7的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PROC的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PROCR的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PRODH的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PROSC的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PROX1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PRPF40B的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PRPF4B的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PRRG2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PRUNE2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PSD3的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PSEN1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PSMAL的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PTCH1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PTEN的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PTK2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PTK2B的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PTPN11的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PTPN22的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PTPN3的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PTPN4的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PTPRD的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PTPRK的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PTPRM的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PTPRN2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PTPRT的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PUS10的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PVRL2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节PYGM的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节QRSL1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节RAB11FIP2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节RAB23的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节RALBP1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节RALGDS的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节RB1CC1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节RBL2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节RBM39的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节RBM45的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节REC8的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节RFC4的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节RFT1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节RFTN1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节RHPN2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节RIF1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节RLN3的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节RMND5B的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节RNF11的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节RNF32的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节RNFT1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节RNGTT的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节ROCK1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节ROCK2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节RP1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节RP11-265F1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节RP13-36C9的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节RP6KA3的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节RPAP3的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节RPGR的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节RPN1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节RPS6KA6的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节RRM1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节RRP1B的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节RSK2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节RTEL1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节RTF1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节RUFY1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节RYR3的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节SAAL1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节SAE1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节SBCAD的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节SCN11A的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节SCN1A的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节SCN2A的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节SCN3A的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节SCN4A的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节SCN5A的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节SCN8A的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节SCNA的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节SCO1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节SCYL3的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节SDK1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节SDK2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节SEC24A的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节SEC24D的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节SEC31A的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节SEL1L的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节SENP3的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节SENP6的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节SENP7的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节SERPINA1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节SETD3的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节SETD4的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节SEZ6的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节SFRS12的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节SGCE的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节SGOL2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节SGPL1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节SH2D1A的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节SH3BGRL2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节SH3PXD2A的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节SH3PXD2B的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节SH3RF2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节SH3TC2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节SIPA1L2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节SIPA1L3的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节SIVA1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节SKAP1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节SKIV2L2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节SLC12A3的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节SLC13A1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节SLC22A17的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节SLC25A14的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节SLC28A3的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节SLC38A1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节SLC38A4的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节SLC39A10的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节SLC4A2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节SLC6A11的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节SLC6A13的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节SLC6A6的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节SLC6A8的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节SMARCA1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节SMARCA5的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节SMC5的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节SMN2的前mRNA的剪接。例如,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节SMN2的前mRNA的外显子7的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节SMTN的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节SNCAIP的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节SNRK的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节SNRP70的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节SNX6的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节SOD1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节SPAG9的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节SPATA13的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节SPATA4的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节SPATS1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节SPECC1L的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节SPINK5的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节SPP2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节SPTA1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节SRP72的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节SSX3的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节SSX5的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节SSX9的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节STAG1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节STAMBPL1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节STARD6的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节STAT6的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节STK17B的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节STX3的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节STXBP1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节SUCLG2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节SULF2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节SUPT16H的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节SUPT6H的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节SV2C的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节SYCP1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节SYCP2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节SYT6的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节SYTL5的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节TAF2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节TBC1D26的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节TBC1D29的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节TBC1D3G的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节TBC1D8B的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节TBCEL的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节TBK1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节TBPL1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节TCEB3的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节TCF12的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节TCP11L2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节TDRD3的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节TEAD1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节TECTB的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节TEK的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节TET2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节TFRC的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节TG的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节TGM7的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节TGS1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节THOC2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节TIAL1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节TIAM2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节TIMM50的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节TLK2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节TM4SF20的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节TM6SF1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节TMEM156的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节TMEM194A的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节TMEM27的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节TMEM77的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节TMF1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节TMPRSS6的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节TNFRSF10A的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节TNFRSF10B的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节TNFRSF8的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节TNK2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节TNKS的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节TNKS2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节TOM1L1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节TOM1L2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节TOP2B的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节TP53的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节TP53BP2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节TP53I3的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节TP53INP1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节TP63的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节TRAF3IP3的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节TRAPPC2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节TRIM44的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节TRIM65的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节TRIML1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节TRIML2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节TRPM3的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节TRPM5的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节TRPM7的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节TSC1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节TSC2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节TSHB的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节TSPAN7的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节TTC17的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节TTLL5的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节TTLL9的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节TTN的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节TTPAL的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节TTR的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节TUSC3的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节TXNDC10的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节UBE3A的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节UCK1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节UGT1A1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节UHRF1BP1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节UNC45B的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节UNC5C的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节USH2A的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节USP1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节USP38的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节USP39的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节USP6的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节UTP15的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节UTP18的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节UTP20的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节UTRN的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节UTX的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节UTY的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节UVRAG的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节UXT的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节VAPA的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节VPS29的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节VPS35的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节VPS39的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节VTI1A的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节VTI1B的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节VWA3B的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节WDFY2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节WDR16的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节WDR17的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节WDR26的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节WDR44的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节WDR67的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节WDTC1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节WRNIP1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节WWC3的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节XRN1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节XRN2的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节XX-FW88277的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节YARS的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节YGM的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节ZBTB20的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节ZC3H7A的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节ZC3HAV1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节ZC3HC1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节ZFYVE1的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节ZNF114的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节ZNF169的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节ZNF326的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节ZNF365的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节ZNF37A的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节ZNF618的前mRNA的剪接。在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节ZWINT的前mRNA的剪接。
在一些实施方式中,本文所述的SMSM化合物及其使用方法可调节剪接,如MAPT基因编码的多核苷酸的选择性剪接。在一些实施方式中,MAPT前mRNA的选择性剪接可能导致tau蛋白的1,2,3,4,5,6,7,8,9或10种同工型的表达。在一些实施方式中,MAPT前mRNA的选择性剪接可能导致tau蛋白的6种同工型的表达。在一些实施方式中,tau的6种同工型包括tau蛋白的3种四重复(4R)同工型和3种三重复(3R)同工型。在3R tau同工型中,外显子10自剪接变体中排除。例如,其中排除外显子10的3R tau同工型可包括外显子2和/或外显子3。在4R tau同工型中,剪接变体中包含外显子10。例如,其中包含外显子10的4R tau同工型可以包含外显子2和/或外显子3。外显子10的包含或排除可能取决于外显子10内含子10接合处茎环中的选择性剪接事件。在一些实施方式中,5’ss处发生的突变导致在编码tau蛋白的mRNA中包含外显子10。在一些实施方式中,茎环ISS区中的突变导致外显子10从编码tau蛋白的mRNA中排除。在一些实施方式中,5’ss处的突变使茎环不稳定,从而减少tau的mRNA中的外显子10包含。在一些实施方式中,5’ss处的突变抑制剪接体组分与前mRNA结合,从而减少tau的mRNA中的外显子10包含。在一些实施方式中,茎环ISS区处的突变抑制剪接体组分与前mRNA的结合,从而增加tau的mRNA中的外显子10包含。
3R与4R tau同工型的比率可能导致许多病症或疾病。在一些实施方式中,无病症或疾病的受试者的3R与4R比率为1:1。在一些实施方式中,患有本文所述病症或疾病的受试者的3R与4R比率为约1:1.2,1:1.4,1:1.6,1:1.8,1:2,1:2.5,1:3,1:3.5,1:4,1:4.5或1:5。在一些实施方式中,患有本文所述病症或疾病的受试者的3R与4R比率为约1:1至约1:1.1,约1:1至约1:1.2,约1:1至约1:1.3,约1:1至约1:1.4,约1:1至约1:1.5,约1:1至约1:1.6,约1:1至约1:1.8,约1:1至约1:2,约1:1至约1:3,约1:1至约1:3.5,约1:1至约1:4,约1:1至约1:4.5,约1:1至约1:5,1:2至约1:3,约1:2至约1:4,约1:2至约1:5,约1:3至约1:4,约1:3至约1:5,或约1:4至约1:5。在一些实施方式中,患有本文所述病症或疾病的受试者的4R与3R比率为约1:1.2,1:1.4,1:1.6,1:1.8,1:2,1:2.5,1:3,1:3.5,1:4,1:4.5or 1:5。在一些实施方式中,患有本文所述病症或疾病的受试者的4R与3R比率为约1:1至约1:1.1,约1:1至约1:1.2,约1:1至约1:1.3,约1:1至约1:1.4,约1:1至约1:1.5,约1:1至约1:1.6,约1:1至约1:1.8,约1:1至约1:2,约1:1至约1:3,约1:1至约1:3.5,约1:1至约1:4,约1:1至约1:4.5,约1:1至约1:5,1:2至约1:3,约1:2至约1:4,约1:2至约1:5,约1:3至约1:4,约1:3至约1:5,或约1:4至约1:5。
在一些方面,SMSM化合物用于调节tau前mRNA的选择性剪接。在一些实施方式中,SMSM化合物与tau前mRNA的外显子10的茎环结合,降低剪接体组分与5’ss的结合亲和力,从而增加tau mRNA中外显子10的排除,并增加3R:4R tau同工型的比率。在一些实施方式中,SMSM化合物与tau前mRNA的外显子10的茎环结合,增加剪接体组分与5’ss的结合亲和力,从而增加tau mRNA中外显子10的包含,并降低3R:4R tau同工型的比率。在一些实施方式中,SMSM化合物与tau前mRNA的外显子10的茎环结合,降低剪接体组分与ISS区的结合亲和力,从而增加tau mRNA中外显子10的包含,并降低3R:4R tau同工型的比率。在一些实施方式中,SMSM化合物与tau前mRNA的外显子10的茎环结合,增加剪接体组分与ISS区的结合亲和力,从而减少tau mRNA中外显子10的包含,并增加3R:4R tau同工型的比率。在一些实施方式中,SMSM化合物恢复3R:4R比率至1:1。在一些实施方式中,SMSM化合物改变比率从3R>4R至4R>3R。在一些实施方式中,SMSM化合物改变比率从3R<4R至4R<3R。在一些实施方式中,SMSM化合物与tau前mRNA的外显子10的茎环结合,增加茎环的热力学稳定性,从而减少taumRNA中外显子10的包含,并增加3R:4R tau同工型的比率。在一些实施方式中,SMSM化合物与tau前mRNA的外显子10的茎环结合,降低茎环的热力学稳定性,从而增加tau mRNA中外显子10的包含,并减少3R:4R tau同工型的比率。
剪接的顺式作用元件中的突变和/或异常的二级或三级RNA结构可以改变剪接模式。突变和/或异常的二级或三级RNA结构可见于核心共有序列中,其包括5’ss,3’ss和BP区或其他调控元件,包括ESE,ESS,ISE和ISS。顺式作用元件中的突变可导致多种疾病。示例性疾病描述如下。本公开提供了靶向顺式作用元件中含有一个或多个突变和/或异常的二级或三级RNA结构的前mRNA的剪接调节化合物和方法。在一些实施方式中,本公开提供了靶向剪接位点或BP区中含有一个或多个突变和/或异常的二级或三级RNA结构的前mRNA的方法和小分子结合剂。在一些实施方式中,本公开提供了靶向其它调控元件(例如,ESE、ESS、ISE和ISS)中含有一个或多个突变和/或异常的二级或三级RNA结构的前mRNA的方法和小分子结合剂。
在一些实施方式中,调节原代细胞的多核苷酸的剪接位点序列处的剪接。在一些实施方式中,调节肿瘤细胞的多核苷酸的剪接位点序列处的剪接。在一些实施方式中,SMSM调节隐蔽剪接位点序列处的剪接。在一些实施方式中,SMSM调节多核苷酸的剪接位点的剪接。在一些实施方式中,其中该多核苷酸转录自基因。在一些实施方式中,SMSM调节多核苷酸中的外显子包含以及剪接位点序列的剪接。在一些实施方式中,SMSM调节多核苷酸中的假外显子包含以及剪接位点序列的剪接。在一些实施方式中,SMSM调节多核苷酸的隐蔽剪接位点序列处的剪接。
在一些实施方式中,SMSM通过预防、抑制或减少多核苷酸的剪接而调节剪接。在一些实施方式中,SMSM通过预防、抑制或减少剪接位点序列处的剪接而调节剪接。在一些实施方式中,SMSM降低剪接复合物组分与多核苷酸的亲和力。在一些实施方式中,SMSM降低剪接复合物组分与多核苷酸在剪接位点序列,剪接位点序列的上游或剪接位点序列的下游处的亲和力。在一些实施方式中,SMSM抑制或减少多核苷酸的剪接的催化率。在一些实施方式中,SMSM抑制或减少剪接位点序列处的多核苷酸的剪接的催化率。在一些实施方式中,SMSM增加剪接复合物组分和多核苷酸之间的空间位阻。在一些实施方式中,SMSM增加剪接复合物组分和多核苷酸之间在剪接位点序列,剪接位点序列的上游或剪接位点序列的下游处的空间位阻。在一些实施方式中,SMSM增加第一剪接复合物组分和第二剪接复合物组分之间的空间位阻。在一些实施方式中,SMSM预防、抑制、扰乱或减少第一剪接复合物组分和第二剪接复合物组分的结合。
在一些实施方式中,SMSM降低第一剪接复合物组分与第二剪接复合物组分的亲和力。在一些实施方式中,SMSM预防、抑制、扰乱或减少剪接复合物组分与多核苷酸的结合。在一些实施方式中,SMSM预防、抑制、扰乱或减少剪接复合物组分与多核苷酸在剪接位点序列,剪接位点序列的上游或剪接位点序列的下游处的结合。
在一些实施方式中,SMSM通过促进或增加多核苷酸的剪接而调节剪接。在一些实施方式中,SMSM通过促进或增加剪接位点序列的剪接而调节剪接。在一些实施方式中,SMSM增加剪接复合物组分与多核苷酸的亲和力。在一些实施方式中,SMSM增加剪接复合物组分与多核苷酸在剪接位点序列,剪接位点序列的上游或剪接位点序列的下游处的亲和力。在一些实施方式中,SMSM增加多核苷酸的剪接的催化率。在一些实施方式中,SMSM增加剪接位点序列处的多核苷酸的剪接的催化率。在一些实施方式中,SMSM减少或降低剪接复合物组分和多核苷酸之间的空间位阻。在一些实施方式中,SMSM减少剪接复合物组分和多核苷酸之间在剪接位点序列,剪接位点序列的1-1000个核碱基上游或剪接位点序列的1-1000个核碱基下游处的空间位阻。在一些实施方式中,SMSM减少或降低第一剪接复合物组分和第二剪接复合物组分之间的空间位阻。在一些实施方式中,SMSM促进或增加第一剪接复合物组分和第二剪接复合物组分的结合。在一些实施方式中,SMSM增加第一剪接复合物组分与第二剪接复合物组分的亲和力。在一些实施方式中,SMSM促进或增加剪接复合物组分与多核苷酸的结合。在一些实施方式中,SMSM促进或增加剪接复合物组分与多核苷酸在剪接位点序列,剪接位点序列的1-1000个核碱基上游或剪接位点序列的1-1000个核碱基下游处的结合。在一些实施方式中,SMSM结合剪接复合物组分,多核苷酸或其组合。在一些实施方式中,SMSM在在剪接位点序列,剪接位点序列的1-1000个核碱基上游或剪接位点序列的1-1000个核碱基下游处结合多核苷酸。在一些实施方式中,SMSM结构性调节剪接复合物组分,多核苷酸或二者。在一些实施方式中,SMSM促进或增加多核苷酸、剪接复合物组分或其组合的空间位阻、空间屏蔽、空间吸引、链交叉、空间排斥、共振的空间抑制、质子化的空间抑制或其组合。在一些实施方式中,SMSM与多核苷酸或剪接复合物组分的结合降低剪接位点序列的构象稳定性。在一些实施方式中,SMSM与多核苷酸的结合增加剪接位点序列的构象稳定性。
在一些实施方式中,SMSM调节靶标多核苷酸(例如前mRNA)的外显子跳跃。例如,SMSM可以抑制靶标多核苷酸(例如前mRNA)的外显子跳跃。例如,SMSM可以促进靶标多核苷酸(例如前mRNA)的外显子跳跃。在一些实施方式中,SMSM调节患有与多核苷酸(例如前mRNA)的外显子跳跃相关的疾病或病症的受试者的细胞中多核苷酸在剪接位点序列处的剪接。在一些实施方式中,SMSM调节患有与多核苷酸(例如前mRNA)的异常外显子跳跃相关的疾病或病症的受试者的细胞中多核苷酸在剪接位点序列处的剪接。
在一些实施方式中,SMSM调节靶标多核苷酸(例如前mRNA)的外显子包含。例如,SMSM可以抑制靶标多核苷酸(例如前mRNA)的外显子包含。例如,SMSM可以促进靶标多核苷酸(例如前mRNA)的外显子包含。在一些实施方式中,SMSM调节患有与多核苷酸(例如前mRNA)的外显子包含相关的疾病或病症的受试者的细胞中多核苷酸在剪接位点序列处的剪接。在一些实施方式中,SMSM调节患有与多核苷酸(例如前mRNA)的异常外显子包含相关的疾病或病症的受试者的细胞中多核苷酸在剪接位点序列处的剪接。
在一些实施方式中,SMSM调节靶标多核苷酸(例如前mRNA)的无义介导的降解(NMD)。例如,SMSM可以抑制靶标多核苷酸如前mRNA或mRNA的无义介导的降解(NMD)。在一些实施方式中,SMSM调节患有与多核苷酸如前mRNA或mRNA的NMD相关的疾病或病症的受试者的细胞中多核苷酸在剪接位点序列处的剪接。
在一些实施方式中,SMSM调节靶标多核苷酸的内含子包含。例如,SMSM可以抑制靶标多核苷酸(例如前mRNA)的内含子包含。例如,SMSM可以促进靶标多核苷酸(例如前mRNA)的内含子包含。在一些实施方式中,SMSM调节患有与多核苷酸的内含子包含相关的疾病或病症的受试者的细胞中多核苷酸在剪接位点序列处的剪接。在一些实施方式中,SMSM调节患有与多核苷酸的内含子包含相关的疾病或病症的受试者的细胞中多核苷酸在剪接位点序列处的剪接。
在一些实施方式中,SMSM调节多核苷酸(例如前mRNA)的剪接位点序列处的剪接,其中剪接位点序列包含选自以下的序列:NGAgunvrn,NHAdddddn,NNBnnnnnn和NHAddmhvk;其中N或n为A,U,G或C;B为C,G或U;H或h为A,C或U;d为a,g或u;m为a或c;r为a或g;v为a,c或g;k为g或u。
在一些实施方式中,SMSM调节包含序列NNBgunnnn,NNBhunnnn或NNBgvnnnn的剪接位点序列的剪接。在一些实施方式中,SMSM调节包含序列NNBgurrrn,NNBguwwdn,NNBguvmvn,NNBguvbbn,NNBgukddn,NNBgubnbd,NNBhunngn,NNBhurmhd或NNBgvdnvn的剪接位点序列的剪接;其中N或n为A,U,G或C;B为C,G或U;H或h为A,C或U;d为a,g或u;m为a或c;r为a或g;v为a,c或g;k为g或u。
在一些实施方式中,SMSM调节包含表2A,表2B,表2C或表2D的序列的剪接位点序列的剪接。在一些实施方式中,SMSM调节包含以下序列的剪接位点序列的剪接:AAAauaagu,AAAguaagua,AAAguacau,AAAguaga,AAAguaug,AAAguaugu,AAAgugagug,AAAgugaguu,AACaugagga,AACguaagu,AACgugacu,AACgugauu,AAGaugagc,AAGauuugu,AAGgaugag,AAGgcaaaa,AAGgcaaggg,AAGgcaggga,AAGggaaaa,AAGguaugag,AAGguaaag,AAGguaaau,AAGguaaca,AAGguaacaug,AAGguaacu,AAGguaagcc,AAGguaagcg,AAGguaauaa,AAGguaaugu,AAGguaaugua,AAGguacag,AAGguacgg,AAGguacug,AAGguagacc,AAGguagag,AAGguagcg,AAGguagua,AAGguagug,AAGguauac,AAGguauau,AAGguauauu,AAGguauca,AAGguaucg,AAGguaucu,AAGguauga,AAGguaugg,AAGguaugu,AAGguauuu,AAGgucaag,AAGgucaau,AAGgucucu,AAGgucuggg,AAGgucugu,AAGgugaccuu,AAGgugagau,AAGgugaguc,AAGgugccu,AAGgugggcc,AAGgugggu,AAGguggua,AAGguguau,AAGgugucu,AAGgugugc,AAGgugugu,AAGguguua,AAGguuaag,AAGguuagc,AAGguuagug,AAGguuca,AAGguuuaa,AAGguuuau,AAGguuugg,AAGuuaagg,AAGuuaaua,AAGuuagga,AAUguaaau,AAUguaagc,AAUguaagg,AAUguaauu,AAUguaugu,AAUgugagu,AAUgugugu,ACAguaaau,ACAgugagg,ACAguuagu,ACAguuuga,ACCaugagu,ACCgugaguu,ACGauaagg,ACGcuaagc,ACGguagcu,ACGgugaac,ACGgugagug,ACUguaaau,ACUguaacu,ACUguauu,ACUgugagug,AGAguaag,AGAguaaga,AGAguaagg,AGAguaagu,AGAguagau,AGAguaggu,AGAgugaau,AGAgugagc,AGAgugagu,AGAgugcgu,AGCguaagg,AGCguaagu,AGCguacgu,AGCguaggu,AGCgugagu,AGGguaauga,AGGguagac,AGGguauau,AGGgugaau,AGGgugagg,AGGgugauc,AGGgugcaa,AGGgugucu,AGUguaagc,AGUguaagu,AGUgugagu,AGUgugaguac,AUAgucagu,AUAgugaau,AUCgguaaaa,AUCguuaga,AUGguaaaa,AUGguaacc,AUGguacau,AUGguaugu,AUGguauuu,AUGgucauu,AUGgugacc,AUUuuaagc,CAAGguaccu,CAAguaaac,CAAguaacu,CAAguaagc,CAAguaagg,CAAguaagua,CAAguaau,CAAguaugu,CAAguauuu,CAAgugaaa,CAAgugagu,CACgugagc,CACguuggu,CAGauaacu,CAGaugagg,CAGaugagu,CAGauuggu,CAGcugugu,CAGgcgagu,CAGgcuggu,CAGguaaggc,CAGguaaaa,CAGguaaag,CAGguaaccuc,CAGguaagac,CAGguaagc,CAGguaagu,CAGguaau,CAGguaaugc,CAGguaaugu,CAGguacaa,CAGguacag,CAGguacagu,CAGguaccg,CAGguacug,CAGguagag,CAGguagcaa,CAGguaggagg,CAGguaggc,CAGguagguga,CAGguagua,CAGguagug,CAGguauag,CAGguauau,CAGguaucc,CAGguauga,CAGguaugg,CAGguaugu,CAGguauug,CAGgucaau,CAGgucagug,CAGgucuga,CAGgucugga,CAGgucuggu,CAGgucuuu,CAGgugacu,CAGgugagc,CAGgugaggg,CAGgugagugg,CAGgugaua,CAGgugcac,CAGgugcag,CAGgugcgc,CAGgugcug,CAGguggau,CAGgugggug,CAGgugua,CAGguguag,CAGguguau,CAGguguga,CAGgugugu,CAGguuaag,CAGguugau,CAGguugcu,CAGguuggc,CAGguuguc,CAGguuguu,CAGguuuagu,CAGguuugc,CAGguuugg,CAGuuuggu,CAUggaagac,CAUguaau,CAUguaauu,CAUguaggg,CAUguauuu,CCAguaaac,CCAgugaga,CCGguaacu,CCGgugaau,CCGgugacu,CCGgugagg,CCUauaagu,CCUaugagu,CCUguaaau,CCUguaagc,CCUguaauu,CCUgugaau,CCUgugauu,CGAguccgu,CGCauaagu,CGGguaau,CGGguauau,CGGguaugg,CGGgucauaauc,CGGgugggu,CGGguguau,CGGgugugu,CGUgugaau,CGUgugggu,CUGguauga,CUGgugaau,CUGgugaguc,CUGgugaguuc,CUGgugcau,CUGgugcuu,CUGguguga,CUGguuugu,CUGuuaag,CUGuugaga,GAAggaagu,GAAguaaac,GAAguaaau,GAAgucugg,GAAguggg,GAAgugugu,GAAuaaguu,GACaugagg,GAGaucugg,GAGaugagg,GAGCAGguaagcu,GAGcugcag,GAGgcaggu,GAGgcgugg,GAGgcuccc,GAGguggguuu,GAGguaaag,GAGguaaga,GAGguaagag,GAGguaagcg,GAGguaauac,GAGguaauau,GAGguaaugu,GAGguacaa,GAGguagga,GAGguauau,GAGguauga,GAGguaugg,GAGgucuggu,GAGgugaag,GAGgugagg,GAGgugca,GAGgugccu,GAGgugcggg,GAGgugcug,GAGguguac,GAGguguau,GAGgugugc,GAGgugugu,GAGuuaagu,GAUaugagu,GAUguaaau,GAUguaagu,GAUguaauu,GAUguaua,GAUgugacu,GAUgugagg,GAUgugauu,GCAguaaau,GCAguagga,GCAguuagu,GCGaugagu,GCGgagagu,GCGguaaaa,GCGguaauca,GCGgugacu,GCGgugagca,GCGgugagcu,GCGguggga,GCGguuagu,GCUguaaau,GCUguaacu,GCUguaauu,GGAguaag,GGAguaagg,GGAguaagu,GGAguaggu,GGAgugagu,GGAguuagu,GGCguaagu,GGCgucagu,GGGauaagu,GGGaugagu,GGGguaagug,GGGguaaau,GGGguaacu,GGGguacau,GGGgugacg,GGGgugagug,GGGgugcau,GGGguuggga,GGUguaagu,GUAgugagu,GUGguaagu,GUGguaagug,GUGgugagc,GUGgugagu,GUGgugauc,GUGguugua,GUUauaagu,GUUCUCAgugug,GUUguaaau,GUUuugguga,uAGCAGguaagca,uGGguaccug,UAGaugcgu,UAGguaaag,UAGguaccc,UAGguaggu,UAGguauau,UAGguauc,UAGguauga,UAGguauug,UAGgucaga,UAGgugcau,UAGguguau,UCAguaaac,UCAguaaau,UCAguaagu,UCAgugauu,UCAgugug,UCCgugaau,UCCgugacu,UCCgugagc,UCUguaaau,UGAgugaau,UGGauaagg,UGGguaaag,UGGguacca,UGGguaugc,UGGguggau,UGGguggggg,UGGgugggug,UGGgugugg,UGGguuagu,UGUgcaagu,UGUguaaau,UGUguacau,UUAguaaau,UUCauaagu,UUGguaaag,UUGguaaca,UUGguacau,UUGguagau,UUGgugaau,UUGgugagc,UUUauaagc或UUUgugagc。
ABCA4,ABCA9,ABCB1,ABCB5,ABCC9,ABCD1,ACADL,ACADM,ACADSB,ACSS2,ACTG2,ADA,ADAL,ADAM10,ADAM15,ADAM22,ADAM32,ADAMTS12,ADAMTS13,ADAMTS20,ADAMTS6,ADAMTS9,ADCY10,ADCY3,ADCY8,ADRBK2,AFP,AGL,AGT,AHCTF1,AKAP10,AKAP3,AKNA,ALAS1,ALB,ALDH3A2,ALG6,ALS2CL,AMBRA1,ANGPTL3,ANK3,ANTXR2,ANXA10,ANXA11,AP2A2,AP4E1,APC,APOA1,APOB,APOC3,APOH,AR,ARFGEF1,ARFGEF2,ARHGAP1,ARHGAP18,ARHGAP26,ARHGAP8,ARHGEF18,ARHGEF2,ARPC3,ARS2,ASH1L,ASNSD1,ASPM,ATAD5,ATG16L2,ATG4A,ATM,ATP11C,ATP13A5,ATP6V1G3,ATP7A,ATP7B,ATR,ATXN2,ATXN3,B2M,B4GALNT3,BBOX1,BBS4,BCL2样11(BIM),BCS1L,BMP2K,BMPR2,BRCA1,BRCA2,BRCC3,BRSK1,BRSK2,BTAF1,BTK,C10orf137,C11orf30,C11orf65,C11orf70,C12orf51,C13orf1,C13orf15,C14orf101,C14orf118,C15orf29,C15orf42,C15orf60,C16orf33,C16orf38,C16orf48,C18orf8,C19orf42,C1orf107,C1orf114,C1orf130,C1orf149,C1orf27,C1orf71,C1orf87,C1orf94,C1R,C20orf74,C21orf70,C2orf55,C3,C3orf23,C4orf18,C4orf29,C5orf34,C6orf118,C8B,C8orf33,C9orf114,C9orf43,C9orf86,C9orf98,CA11,CAB39,CACHD1,CACNA1B,CACNA1C,CACNA1G,CACNA1H,CACNA2D1,CALCA,CALCOCO2,CAMK1D,CAMKK1,CAPN3,CAPN9,CAPSL,CARKD,CAT,CBX1,CBX3,CCDC102B,CCDC11,CCDC131,CCDC146,CCDC15,CCDC18,CCDC5,CCDC81,CD1B,CD33,CD4,CD46,CDC14A,CDC16,CDC2L5,CDC42BPB,CDCA8,CDH1,CDH10,CDH11,CDH23,CDH24,CDH8,CDH9,CDK5RAP2,CDK6,CDK8,CEL,CELSR3,CENPI,CENTB2,CENTG2,CEP110,CEP170,CEP192,CETP,CFB,CFH,CFTR,CGN,CGNL1,CHAF1A,CHD9,CHIC2,CHL1,CHM,CHN1,CLCN1,CLEC16A,CLIC2,CLINT1,CLK1,CLPB,CLPTM1,CMIP,CMYA5,CNGA3,CNOT1,CNOT7,CNTN6,COG3,COL11A1,COL11A2,COL12A1,COL14A1,COL15A1,COL17A1,COL19A1,COL1A1,COL1A2,COL22A1,COL24A1,COL25A1,COL29A1,COL2A1,COL3A1,COL4A1,COL4A2,COL4A5,COL4A6,COL5A2,COL6A1,COL7A1,COL9A1,COL9A2,COLQ,COMTD1,COPA,COPB2,COPS7B,COPZ2,CPSF2,CPXM2,CR1,CREBBP,CRKRS,CRYZ,CSE1L,CSTB,CSTF3,CT45-6,CUBN,CUL4B,CUL5,CXorf41,CYBB,CYFIP2,CYP17,CYP19,CYP24A1,CYP27A1,CYP3A4,CYP3A43,CYP3A5,CYP4F2,CYP4F3,DAZ2,DCBLD1,DCC,DCTN3,DCUN1D4,DDA1,DDEF1,DDX1,DDX24,DDX4,DENND2D,DEPDC2,DES,DGAT2,DHFR,DHRS7,DHRS9,DIP2A,DMD,DMTF1,DNAH3,DNAH8,DNAI1,DNAJA4,DNAJC13,DNAJC7,DNTTIP2,DOCK10,DOCK11,DOCK4,DPP3,DPP4,DPY19L2P2,DSCC1,DUX4,DVL3,DYNC1H1,DYSF,ECM2,EDEM3,EFCAB3,EFCAB4B,EFNA4,EFTUD2,EGFR,EIF3A,ELA1,ELA2A,EMCN,EMD,EML5,ENPP3,EPB41L5,EPHA3,EPHA4,EPHB1,EPHB2,EPHB3,EPS15,ERBB4,ERCC1,ERCC8,ERGIC3,ERMN,ERMP1,ERN1,ERN2,ETS2,ETV4,EVC2,EXO1,EXOC4,F11,F13A1,F3,F5,F7,F8,FAH,FAM134A,FAM13A1,FAM13B1,FAM13C1,FAM161A,FAM176B,FAM184A,FAM19A1,FAM20A,FAM23B,FAM65C,FANCA,FANCC,FANCG,FANCM,FANK1,FAR2,FBN1,FBXO15,FBXO18,FBXO38,FCGBP,FECH,FEZ2,FGA,FGD6,FGFR1OP,FGFR1OP2,FGFR2,FGG,FGR,FIX,FKBP3,FLJ35848,FLJ36070,FLNA,FN1,FNBP1L,FOLH1,FOXM1,FRAS1,FUT9,FZD3,FZD6,GAB1,GALC,GALNT3,GAPDH,GART,GAS2L3,GBA,GBGT1,GCG,GCGR,GCK,GFM1,GH1,GHR,GHV,GJA1,GLA,GLT8D1,GNAS,GNB5,GOLGB1,GOLT1A,GOLT1B,GPATCH1,GPR158,GPR160,GRAMD3,GRHPR,GRIA1,GRIA3,GRIA4,GRIN2B,GRM3,GRM4,GRN,GSDMB,GSTCD,GSTO2,GTPBP4,HADHA,HBA2,HBB,HCK,HDAC3,HDAC5,HDX,HEPACAM2,HERC1,HEXA,HEXB,HIPK3,HLA-DPB1,HLA-G,HLCS,HLTF,HMBS,HMGCL,HNF1A,HNRNPH1,HP1BP3,HPGD,HPRT1,HPRT2,HSF2BP,HSF4,HSPA9,HSPG2,HTT,HXA,ICA1,IDH1,IDS,IFI44L,IKBKAP,IL1R2,IL5RA,IL7RA,IMMT,INPP5D,INSR,INTS3,INTU,IPO4,IPO8,IQGAP2,ISL2,ITFG1,ITGAL,ITGB1,ITGB2,ITGB3,ITGB4,ITIH1,ITPR2,IWS1,JAG1,JAK1,JAK2,JMJD1C,KALRN,KATNAL2,KCNN2,KCNT2,KIAA0256,KIAA0528,KIAA0564,KIAA0586,KIAA1033,KIAA1166,KIAA1219,KIAA1409,KIAA1622,KIAA1787,KIF15,KIF16B,KIF3B,KIF5A,KIF5B,KIF9,KIN,KIR2DL5B,KIR3DL2,KIR3DL3,KLF12,KLF3,KLHL20,KLK12,KLKB1,KPNA5,KRAS,KREMEN1,KRIT1,KRT5,KRTCAP2,L1CAM,L3MBTL,L3MBTL2,LACE1,LAMA1,LAMA2,LAMA3,LAMB1,LARP7,LDLR,LENG1,LGALS3,LGMN,LHCGR,LHX6,LIMCH1,LIMK2,LMBRD1,LMBRD2,LMLN,LMNA,LMO2,LOC389634,LOC390110,LPA,LPCAT2,LPL,LRP4,LRPPRC,LRRC19,LRRC42,LRRK2,LRWD1,LUM,LVRN,LYN,LYST,MADD,MAGI1,MAGT1,MALT1,MAP2K1,MAP4K4,MAPK8IP3,MAPK9,MAPT,MATN2,MCF2L2,MCM6,MDGA2,MEGF10,MEGF11,MEMO1,MET,MGAM,MGAT4A,MGAT5,MGC16169,MGC34774,MIB1,MIER2,MKKS,MKL2,MLANA,MLH1,MLL5,MLX,MME,MPDZ,MPI,MRAP2,MRPL11,MRPL39,MRPS28,MRPS35,MS4A13,MSH2,MSMB,MST1R,MTDH,MTF2,MTHFR,MTIF2,MUC2,MUT,MVK,MYB,MYCBP2,MYH2,MYO19,MYO3A,MYO9B,MYOM2,MYOM3,NAG,NARG1,NARG2,NCOA1,NDC80,NDFIP2,NEB,NEDD4,NEK1,NEK11,NEK5,NF1,NF2,NFE2L2,NFIA,NFIX,NFKBIL2,NFRKB,NKAIN2,NKAP,NLRC3,NLRC5,NLRP13,NLRP7,NLRP8,NME7,NOL10,NOS1,NOS2A,NOTCH1,NPM1,NR1H4,NR4A3,NRXN1,NSMAF,NSMCE2,NT5C,NT5C3,NUBP1,NUBPL,NUDT5,NUMA1,NUP160,NUP88,NUP98,NUPL1,OAT,OBFC2A,OBFC2B,OLIG2,OPA1,OPN4,OPTN,OSBPL11,OSBPL8,OSGEPL1,OTC,OXT,PADI4,PAH,PAN2,PAPOLG,PARD3,PARVB,PAWR,PBGD,PBRM1,PCBP4,PCCA,PCNX,PCOTH,PDCD4,PDE10A,PDE8B,PDH1,PDIA3,PDK4,PDLIM5,PDS5A,PDS5B,PDXK,PDZRN3,PELI2,PGK1,PGM2,PHACTR4,PHEX,PHKB,PHLDB2,PHTF1,PIAS1,PIGF,PIGN,PIGT,PIK3C2G,PIK3CG,PIK3R1,PIP5K1A,PITRM1,PIWIL3,PKD1,PKD2,PKHD1L1,PKIB,PKLR,PKM1,PKM2,PLCB1,PLCB4,PLCG1,PLD1,PLEKHA5,PLEKHA7,PLEKHM1,PLKR,PLXNC1,PMFBP1,POLN,POLR3D,POMT2,POSTN,PPFIA2,PPP1R12A,PPP3CB,PPP4C,PPP4R1L,PPP4R2,PRAME,PRC1,PRDM1,PRIM1,PRIM2,PRKAR1A,PRKCA,PRKG1,PRMT7,PROC,PROCR,PRODH,PROSC,PROX1,PRPF40B,PRPF4B,PRRG2,PRUNE2,PSD3,PSEN1,PSMAL,PTCH1,PTEN,PTK2,PTK2B,PTPN11,PTPN22,PTPN3,PTPN4,PTPRD,PTPRK,PTPRM,PTPRN2,PTPRT,PUS10,PVRL2,PYGM,QRSL1,RAB11FIP2,RAB23,RALBP1,RALGDS,RB1CC1,RBL2,RBM39,RBM45,REC8,RFC4,RFT1,RFTN1,RHPN2,RIF1,RLN3,RMND5B,RNF11,RNF32,RNFT1,RNGTT,ROCK1,ROCK2,RP1,RP11-265F1,RP13-36C9,RP6KA3,RPAP3,RPGR,RPN1,RPS6KA6,RRM1,RRP1B,RSK2,RTEL1,RTF1,RUFY1,RYR3,SAAL1,SAE1,SBCAD,SCN11A,SCN1A,SCN2A,SCN3A,SCN4A,SCN5A,SCN8A,SCNA,SCO1,SCYL3,SDK1,SDK2,SEC24A,SEC24D,SEC31A,SEL1L,SENP3,SENP6,SENP7,SERPINA1,SETD3,SETD4,SEZ6,SFRS12,SGCE,SGOL2,SGPL1,SH2D1A,SH3BGRL2,SH3PXD2A,SH3PXD2B,SH3RF2,SH3TC2,SIPA1L2,SIPA1L3,SIVA1,SKAP1,SKIV2L2,SLC12A3,SLC13A1,SLC22A17,SLC25A14,SLC28A3,SLC38A1,SLC38A4,SLC39A10,SLC4A2,SLC6A11,SLC6A13,SLC6A6,SLC6A8,SMARCA1,SMARCA5,SMC5,SMN2,SMTN,SNCAIP,SNRK,SNRP70,SNX6,SOD1,SPAG9,SPATA13,SPATA4,SPATS1,SPECC1L,SPINK5,SPP2,SPTA1,SRP72,SSX3,SSX5,SSX9,STAG1,STAMBPL1,STARD6,STAT6,STK17B,STX3,STXBP1,SUCLG2,SULF2,SUPT16H,SUPT6H,SV2C,SYCP1,SYCP2,SYT6,SYTL5,TAF2,TBC1D26,TBC1D29,TBC1D3G,TBC1D8B,TBCEL,TBK1,TBPL1,TCEB3,TCF12,TCP11L2,TDRD3,TEAD1,TECTB,TEK,TET2,TFRC,TG,TGM7,TGS1,THOC2,TIAL1,TIAM2,TIMM50,TLK2,TM4SF20,TM6SF1,TMEM156,TMEM194A,TMEM27,TMEM77,TMF1,TMPRSS6,TNFRSF10A,TNFRSF10B,TNFRSF8,TNK2,TNKS,TNKS2,TOM1L1,TOM1L2,TOP2B,TP53,TP53BP2,TP53I3,TP53INP1,TP63,TRAF3IP3,TRAPPC2,TRIM44,TRIM65,TRIML1,TRIML2,TRPM3,TRPM5,TRPM7,TSC1,TSC2,TSHB,TSPAN7,TTC17,TTLL5,TTLL9,TTN,TTPAL,TTR,TUSC3,TXNDC10,UBE3A,UCK1,UGT1A1,UHRF1BP1,UNC45B,UNC5C,USH2A,USP1,USP38,USP39,USP6,UTP15,UTP18,UTP20,UTRN,UTX,UTY,UVRAG,UXT,VAPA,VPS29,VPS35,VPS39,VTI1A,VTI1B,VWA3B,WDFY2,WDR16,WDR17,WDR26,WDR44,WDR67,WDTC1,WRNIP1,WWC3,XRN1,XRN2,XX-FW88277,YARS,YGM,ZBTB20,ZC3H7A,ZC3HAV1,ZC3HC1,ZFYVE1,ZNF114,ZNF169,ZNF326,ZNF365,ZNF37A,ZNF618或ZWINT。
在一些实施方式中,SMSM调节包含表2A的序列的剪接位点序列的剪接。在一些实施方式中,SMSM调节包含以下序列的剪接位点序列的剪接:AAAauaagu,AAAguaagua,AAAguacau,AAAguaga,AAAguaug,AAAguaugu,AAAgugagug,AAAgugaguu,AACaugagga,AACguaagu,AACgugacu,AACgugauu,AAGaugagc,AAGauuugu,AAGgaugag,AAGgcaaaa,AAGgcaaggg,AAGgcaggga,AAGggaaaa,AAGgtatgag,AAGguaaag,AAGguaaau,AAGguaaca,AAGguaacaug,AAGguaacu,AAGguaagcc,AAGguaagcg,AAGguaauaa,AAGguaaugu,AAGguaaugua,AAGguacag,AAGguacgg,AAGguacug,AAGguagacc,AAGguagag,AAGguagcg,AAGguagua,AAGguagug,AAGguauac,AAGguauau,AAGguauauu,AAGguauca,AAGguaucg,AAGguaucu,AAGguauga,AAGguaugg,AAGguaugu,AAGguauuu,AAGgucaag,AAGgucaau,AAGgucucu,AAGgucuggg,AAGgucugu,AAGgugaccuu,AAGgugagau,AAGgugaguc,AAGgugccu,AAGgugggcc,AAGgugggu,AAGguggua,AAGguguau,AAGgugucu,AAGgugugc,AAGgugugu,AAGguguua,AAGguuaag,AAGguuagc,AAGguuagug,AAGguuca,AAGguuuaa,AAGguuuau,AAGguuugg,AAGuuaagg,AAGuuaaua,AAGuuagga,AAUguaaau,AAUguaagc,AAUguaagg,AAUguaauu,AAUguaugu,AAUgugagu,AAUgugugu,ACAguaaau,ACAgugagg,ACAguuagu,ACAguuuga,ACCaugagu,ACCgugaguu,ACGauaagg,ACGcuaagc,ACGguagcu,ACGgugaac,ACGgugagug,ACUguaaau,ACUguaacu,ACUguauu,ACUgugagug,AGAguaaga,AGAguaagg,AGAguaagu,AGAguagau,AGAguaggu,AGAgugaau,AGAgugagc,AGAgugagu,AGAgugcgu,AGCguaagg,AGCguaagu,AGCguacgu,AGCguaggu,AGCgugagu,AGGguaauga,AGGguagac,AGGguauau,AGGgugaau,AGGgugagg,AGGgugauc,AGGgugcaa,AGGgugucu,AGUguaagc,AGUguaagu,AGUgugagu,AGUgugaguac,AUAgucagu,AUAgugaau,AUCgguaaaa,AUCguuaga,AUGguaaaa,AUGguaacc,AUGguacau,AUGguaugu,AUGguauuu,AUGgucauu,AUGgugacc,AUUuuaagc,CAAGguaccu,CAAguaaac,CAAguaacu,CAAguaagc,CAAguaagg,CAAguaagua,CAAguaau,CAAguaugu,CAAguauuu,CAAgugaaa,CAAgugagu,CACgugagc,CACguuggu,CAGauaacu,CAGaugagg,CAGauuggu,CAGcugugu,CAGgcuggu,CAGgtaaggc,CAGguaaaa,CAGguaaag,CAGguaaccuc,CAGguaagac,CAGguaagc,CAGguaagu,CAGguaau,CAGguaaugc,CAGguaaugu,CAGguacaa,CAGguacag,CAGguacagu,CAGguaccg,CAGguacug,CAGguagag,CAGguagcaa,CAGguaggagg,CAGguaggc,CAGguagguga,CAGguagua,CAGguagug,CAGguauag,CAGguauau,CAGguaucc,CAGguauga,CAGguaugg,CAGguaugu,CAGguauug,CAGgucaau,CAGgucagug,CAGgucuga,CAGgucugga,CAGgucuggu,CAGgucuuu,CAGgugagc,CAGgugaggg,CAGgugagugg,CAGgugaua,CAGgugcac,CAGgugcag,CAGgugcgc,CAGgugcug,CAGguggau,CAGgugggug,CAGgugua,CAGguguag,CAGguguau,CAGguguga,CAGgugugu,CAGguuaag,CAGguugau,CAGguugcu,CAGguuggc,CAGguuguc,CAGguuguu,CAGguuuagu,CAGguuugc,CAGguuugg,CAGuuuggu,CAUggaagac,CAUguaau,CAUguaauu,CAUguaggg,CAUguauuu,CCAguaaac,CCAgugaga,CCGguaacu,CCGgugaau,CCGgugacu,CCGgugagg,CCUauaagu,CCUaugagu,CCUguaaau,CCUguaagc,CCUguaauu,CCUgugaau,CCUgugauu,CGAguccgu,CGCauaagu,CGGguaau,CGGguauau,CGGguaugg,CGGgucauaauc,CGGgugggu,CGGguguau,CGGgugugu,CGUgugaau,CGUgugggu,CUGguauga,CUGgugaau,CUGgugaguc,CUGgugaguuc,CUGgugcau,CUGgugcuu,CUGguguga,CUGguuugu,CUGuuaag,CUGuugaga,GAAggaagu,GAAguaaac,GAAguaaau,GAAgucugg,GAAguggg,GAAgugugu,GAAuaaguu,GACaugagg,GAGaucugg,GAGaugagg,GAGCAGguaagcu,GAGcugcag,GAGgcaggu,GAGgcgugg,GAGgcuccc,GAGgtgggttt,GAGguaaag,GAGguaaga,GAGguaagag,GAGguaagcg,GAGguaauac,GAGguaauau,GAGguaaugu,GAGguacaa,GAGguagga,GAGguauau,GAGguauga,GAGguaugg,GAGgucuggu,GAGgugaag,GAGgugagg,GAGgugca,GAGgugccu,GAGgugcggg,GAGgugcug,GAGguguac,GAGguguau,GAGgugugc,GAGgugugu,GAGuuaagu,GAUaugagu,GAUguaaau,GAUguaagu,GAUguaauu,GAUguaua,GAUgugacu,GAUgugagg,GAUgugauu,GCAguaaau,GCAguagga,GCAguuagu,GCGaugagu,GCGgagagu,GCGguaaaa,GCGguaauca,GCGgugacu,GCGgugagca,GCGgugagcu,GCGguggga,GCGguuagu,GCUguaaau,GCUguaacu,GCUguaauu,GGAguaagg,GGAguaagu,GGAguaggu,GGAgugagu,GGAguuagu,GGCguaagu,GGCgucagu,GGGauaagu,GGGaugagu,GGGgtaagtg,GGGguaaau,GGGguaacu,GGGguacau,GGGgugacg,GGGgugagug,GGGgugcau,GGGguuggga,GGUguaagu,GUUCUCAgugug,UCAgugug,GUAgugagu,GUGguaagu,GUGguaagug,GUGgugagc,GUGgugagu,GUGgugauc,GUGguugua,GUUauaagu,GUUguaaau,GUUuugguga,UAGCAGguaagca,TGGgtacctg,UAGaugcgu,UAGguaaag,UAGguaccc,UAGguaggu,UAGguauau,UAGguauc,UAGguauga,UAGguauug,UAGgucaga,UAGgugcau,UAGguguau,UCAguaaac,UCAguaaau,UCAguaagu,UCAgugauu,UCCgugaau,UCCgugacu,UCCgugagc,UCUguaaau,UGAgugaau,UGGauaagg,UGGguaaag,UGGguacca,UGGguaugc,UGGguggau,UGGguggggg,UGGgugggug,UGGgugugg,UGGguuagu,UGUgcaagu,UGUguaaau,UGUguacau,UUAguaaau,UUCauaagu,UUGguaaag,UUGguaaca,UUGguacau,UUGguagau,UUGgugaau,UUGgugagc,UUUauaagc或UUUgugagc。
在一些实施方式中,SMSM调节包含表2B的序列的剪接位点序列的剪接。在一些实施方式中,SMSM调节包含以下序列的剪接位点序列的剪接:AAAauaagu,AAGaugagc,AAGauuugu,AAGgaugag,AAGgcaaaa,AAGuuaagg,AAGuuaaua,AAGuuagga,ACCaugagu,ACGauaagg,ACGcuaagc,AGGguauau,AGGgugagg,AGGgugauc,AGGgugucu,AUGgugacc,AUUuuaagc,CAAgugagu,CACgugagc,CACguuggu,CAGauaacu,CAGaugagg,CAGaugagu,CAGauuggu,CAGcugugu,CAGgcgagu,CAGgcuggu,CAGgugacu,CAGguugau,CAGguugcu,CAGguuggc,CAGguuguu,CAGuuuggu,CAUguaggg,CAUguauuu,CCGgugaau,CCUauaagu,CCUaugagu,CCUgugaau,CGCauaagu,CGGguguau,CUGuuaag,CUGuugaga,GAAggaagu,GAAguaaau,GAAgucugg,GAAguggg,GAAgugugu,GAAuaaguu,GACaugagg,GAGaucugg,GAGaugagg,GAGgcaggu,GAGgcgugg,GAGgcuccc,GAGguaaga,GAGguagga,GAGgugagg,GAGuuaagu,GAUaugagu,GAUaugagu,GCAguagga,GCGaugagu,GCGgagagu,GCGgugacu,GCGguuagu,GCUguaacu,GGGaugagu,GUAgugagu,GUGgugagc,GUGgugauc,UAGaugcgu,UGGauaagg,UGGguacca,UGGguggau,UGGgugggug,UGUgcaagu,UUCauaagu,UUGguaaca,UUUauaagc或UUUgugagc。
在一些实施方式中,SMSM调节包含表2C或表2D的序列的剪接位点序列的剪接。在一些实施方式中,SMSM调节包含序列NGAguaag的剪接位点序列的剪接。
在一些实施方式中,SMSM调节包含表2C的序列的剪接位点序列的剪接。在一些实施方式中,SMSM调节包含序列AGAguaag的剪接位点序列的剪接。
在一些实施方式中,SMSM调节包含表2D的序列的剪接位点序列的剪接。在一些实施方式中,SMSM调节包含序列GGAguaag的剪接位点序列的剪接。
表2A–示例性靶标
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表2B–示例性靶标
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A表2C-具有AGAguaag剪接位点序列的示例性靶标
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A来自基因组参考序列联盟的智人(人)基因组装配GRCh37(hg19)
A表2D-具有GGAguaag剪接位点序列的示例性的SMSM剪接位点靶标
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A来自基因组参考序列联盟的智人(人)基因组装配GRCh37(hg19)
治疗方法
本文所述的组合物和方法可用于治疗与异常剪接(例如异常的前mRNA剪接)相关的人类疾病或病症。本文所述的组合物和方法可通过调节mRNA(例如前mRNA)而用于治疗人类疾病或病症。在一些实施方式中,本文所述的组合物和方法可通过调节核酸的剪接而用于治疗人类疾病或病症,即使当该核酸在在所治疗的疾病或病症的发病机理中未被异常剪接时。
本文提供了在有需要的哺乳动物中治疗癌症或非癌症疾病或病症的方法。该方法可以包括向患有癌症或非癌症疾病或病症的哺乳动物施用治疗有效量的本文所述的化合物或其药学上可接受的盐。在一些实施方式中,本公开涉及如本文所述的SMSM在制备用于治疗、预防癌症或非癌症疾病或病症和/或延缓其进展的药物中的用途。在一些实施方式中,本公开涉及如本文所述的空间调节剂用于治疗、预防癌症或非癌症疾病或病症和/或延缓其进展的用途。
在一些实施方式中,在施用SMSM化合物或其药学上可接受的盐或其组合物或药物的背景中,有效量是指对患者具有治疗作用和/或有益作用的SMSM化合物或其药学上可接受的盐的量。在某些具体实施方式中,在向患者施用SMSM化合物或其药学上可接受的盐或其组合物或药物的背景中的有效量导致以下作用中的一种、两种或多种:(i)降低或改善疾病的严重程度;(ii)延迟疾病发作;(iii)抑制疾病的发展;(iv)减少受试者的住院;(v)缩短受试者的住院时间;(vi)增加受试者的存活;(vii)改善受试者的生活质量;(viii)减少与疾病有关的症状数量;(ix)减轻或改善与疾病有关的症状的严重程度;(x)减少与疾病有关的症状的持续时间;(xi)预防与疾病有关的症状的复发;(xii)抑制疾病症状的发展或发作;和/或(xiii)抑制与疾病相关的症状的进展。在一些实施方式中,SMSM化合物或其药学上可接受的盐的有效量是有效地恢复基因的RNA转录物的量至健康患者或健康患者细胞中可检测的RNA转录物量的量。在其他实施方式中,SMSM化合物或其药学上可接受的盐的有效量是有效地恢复基因的RNA同工型和/或蛋白质同工型的量至健康患者或健康患者细胞中可检测的RNA同工型和/或蛋白质同工型量的量。
在一些实施方式中,SMSM化合物或其药学上可接受的盐的有效量是有效减少与疾病相关的基因的RNA转录物的异常量的量。在一些实施方式中,SMSM化合物或其药学上可接受的盐的有效量是有效减少基因的同工型的异常表达的量。在一些实施方式中,SMSM化合物或其药学上可接受的盐的有效量是有效导致RNA转录物(例如,mRNA转录物),选择性剪接变体或同工型的量的实质性改变的量。
在一些实施方式中,SMSM化合物或其药学上可接受的盐的有效量是有效增加或减少有益于预防和/或治疗疾病的基因的RNA转录物(例如,mRNA转录物)量的量。在一些实施方式中,SMSM化合物或其药学上可接受的盐的有效量是有效增加或减少有益于预防和/或治疗疾病的基因的RNA转录物的选择性剪接变体量的量。在一些实施方式中,SMSM化合物或其药学上可接受的盐的有效量是有效增加或减少有益于预防和/或治疗疾病的基因的同工型量的量。
在有此需要的受试者中治疗癌症的方法可以包括向该受试者施用治疗有效量的本文所述的化合物或其药学上可接受的盐。在有此需要的受试者中治疗非癌症疾病或病症的方法可以包括向受试者施用治疗有效量的本文所述的化合物或其药学上可接受的盐。
在一些实施方式中,本公开涉及用于治疗、预防癌症或非癌性疾病或病症和/或延缓其进展的方法,其包括向受试者特别是哺乳动物施用有效量的如本文所述的SMSM。
在一些实施方式中,在施用SMSM化合物或其药学上可接受的盐或其组合物或药物的背景中,有效量是指对患者具有治疗作用和/或有益作用的SMSM化合物或其药学上可接受的盐的量。在某些具体实施方式中,在向患者施用SMSM化合物或其药学上可接受的盐或其组合物或药物的背景中的有效量导致以下作用中的一种、两种或多种:(i)降低或改善疾病的严重程度;(ii)延迟疾病发作;(iii)抑制疾病的发展;(iv)减少受试者的住院;(v)缩短受试者的住院时间;(vi)增加受试者的存活;(vii)改善受试者的生活质量;(viii)减少与疾病有关的症状数量;(ix)减轻或改善与疾病有关的症状的严重程度;(x)减少与疾病有关的症状的持续时间;(xi)预防与疾病有关的症状的复发;(xii)抑制疾病症状的发展或发作;和/或(xiii)抑制与疾病相关的症状的进展。在一些实施方式中,SMSM化合物或其药学上可接受的盐的有效量是有效地恢复基因的RNA转录物的量至健康患者或健康患者细胞中可检测的RNA转录物量的量。在其他实施方式中,SMSM化合物或其药学上可接受的盐的有效量是有效地恢复基因的RNA同工型和/或蛋白质同工型的量至健康患者或健康患者细胞中可检测的RNA同工型和/或蛋白质同工型量的量。
在一些实施方式中,SMSM化合物或其药学上可接受的盐的有效量是有效减少与疾病相关的基因的RNA转录物的异常量的量。在一些实施方式中,SMSM化合物或其药学上可接受的盐的有效量是有效减少基因的同工型的异常表达的量。在一些实施方式中,SMSM化合物或其药学上可接受的盐的有效量是有效导致RNA转录物(例如,mRNA转录物),选择性剪接变体或同工型的量的实质性改变的量。
在一些实施方式中,SMSM化合物或其药学上可接受的盐的有效量是有效增加或减少有益于预防和/或治疗疾病的基因的RNA转录物(例如,mRNA转录物)量的量。在一些实施方式中,SMSM化合物或其药学上可接受的盐的有效量是有效增加或减少有益于预防和/或治疗疾病的基因的RNA转录物的选择性剪接变体量的量。在一些实施方式中,SMSM化合物或其药学上可接受的盐的有效量是有效增加或减少有益于预防和/或治疗疾病的基因的同工型量的量。SMSM化合物或其药学上可接受的盐的有效量的非限制性实例在本文中描述。例如,有效量可以是预防和/或治疗与人类受试者中基因的mRNA转录物的异常量有关的疾病所需的量。通常,对于体重范围在约1kg至约200kg之间的患者,有效量将在约0.001mg/kg/天至约500mg/kg/天的范围内。预期典型的成人受试者的中值体重范围在约70和约100kg之间。
在一个实施方式中,本文所述的SMSM可以用于制备用于治疗本文所述的疾病或病症的药物。另外,在需要此种治疗的受试者中治疗本文所述的任何疾病或病症的方法可以涉及以治疗有效量向受试者施用包含本文所述的至少一种SMSM或其药学上可接受的盐的药物组合物。
在某些实施方式中,可以施用本文所述的SMSM用于预防和/或治疗性治疗。在某些治疗应用中,将组合物以足以治愈或至少部分阻止至少一种疾病或病症症状的量施用于已经患有疾病或病症的患者。有效用于该用途的量取决于疾病或症状的严重程度和病程、既往治疗、患者的健康状况、体重、对药物的反应以及治疗医师的判断。治疗有效量任选地通过包括但不限于剂量递增临床试验的方法来确定。在预防性应用中,可以将含有本文所述的SMSM的组合物施用于易患特定疾病、障碍或病症或处于其风险中的患者。在某些实施方式中,可以暂时减少或暂时中止所施用的药物剂量某一时间长度(即“药物假期”)。用于成人治疗的剂量通常为每天0.01mg-5000mg或每天约1mg至约1000mg的范围。在一些实施方式中,所需剂量可以方便地以单剂量或分剂量呈现。
对于本文所述的联合疗法,共同施用的化合物的剂量可以根据所使用的共同药物的类型、所使用的特定药物、所治疗的疾病或病症等而变化。在另外的实施方式中,当与一种或多种其他治疗剂共同施用时,本文提供的化合物与一种或多种其他治疗剂同时施用或顺序施用。如果同时施用,则可以以单一、统一形式或以多重形式提供多种治疗剂,以上仅作为示例。
病症和疾病
本公开涉及包含本文所述的SMSM的药物组合物,其用于治疗、预防疾病、病症或病状和/或延迟其进展。在一些实施方式中,本公开涉及包含本文所述的SMSM的药物组合物,其用于治疗、预防表2A,表2B,表2C和表2D中的疾病、病症或病状和/或延迟其进展。
治疗、预防或延迟非癌症疾病或病症的方法可以包括向患有2A,表2B,表2C和表2D中的疾病、病症或病状的受试者施用治疗有效量的本文所述的化合物或其药学上可接受的盐。
在一些实施方式中,本公开涉及包含本文所述的SMSM的药物组合物,其用于治疗、预防癌症和/或延迟其进展。
治疗、预防或延迟癌症的方法可包括向患有液体癌的受试者施用治疗有效量的本文所述的化合物或其药学上可接受的盐。治疗、预防或延迟癌症的方法可以包括向患有白血病或淋巴瘤的受试者施用治疗有效量的本文所述的化合物或其药学上可接受的盐。治疗、预防或延迟癌症的方法可以包括向患有以下的受试者施用治疗有效量的本文所述的化合物或其药学上可接受的盐:白血病,急性髓细胞性白血病,结肠癌,胃癌,黄斑变性,急性单核细胞白血病,乳腺癌,肝细胞癌,圆锥体营养不良,肺泡软部分肉瘤,骨髓瘤,皮肤黑素瘤,前列腺炎,胰腺炎,胰腺癌,视网膜炎,腺癌,腺样体炎,腺样囊性癌,白内障,视网膜变性,胃肠道间质瘤,韦格纳肉芽肿病,肉瘤,肌病,前列腺腺癌,霍奇金淋巴瘤,卵巢癌,非霍奇金淋巴瘤,多发性骨髓瘤,慢性粒细胞白血病,急性淋巴细胞白血病,肾细胞癌,移行细胞癌,结肠直肠癌,慢性淋巴细胞白血病,间变性大细胞淋巴瘤,肾癌,乳腺癌,宫颈癌。
治疗、预防或延迟癌症的方法可包括向患有实体癌或实体瘤的受试者施用治疗有效量的本文所述的化合物或其药学上可接受的盐。
在一些实施方式中,肿瘤选自腺癌,黑色素瘤(例如转移性黑色素瘤),肝癌(例如肝细胞癌,肝母细胞瘤,肝癌),前列腺癌(例如前列腺腺癌,非雄激素依赖性前列腺癌,雄激素依赖性前列腺癌,前列腺肿瘤),肉瘤(例如,平滑肌肉瘤,横纹肌肉瘤),脑癌(例如,神经胶质瘤,恶性神经胶质瘤,星形细胞瘤,脑干神经胶质瘤,室管膜瘤,少突胶质细胞瘤,非神经胶质瘤,声学神经母细胞瘤,颅咽管瘤,髓母细胞瘤,脑膜瘤,成松果体细胞瘤,松果体母细胞瘤,原发性脑淋巴瘤,间变性星形细胞瘤,幼年毛细胞星形细胞瘤,少突胶质细胞瘤和星形细胞瘤元素的混合物),乳腺癌(例如三阴性乳腺癌,转移性乳腺癌,乳腺癌,乳房肉瘤,腺癌,小叶(小细胞)癌,导管内癌,髓样乳腺癌,粘液乳腺癌,乳腺小管癌,乳头状乳腺癌,炎性乳腺癌),佩吉特氏病,青少年佩吉特氏病,肺癌(例如,KRAS突变的非小细胞肺癌,非小细胞肺癌,鳞状细胞癌(表皮样癌),腺癌,大细胞癌,小细胞肺癌,肺癌),胰腺癌(例如,胰岛素瘤,胃泌素瘤,胰高血糖素瘤,胰腺瘤,分泌生长抑素的肿瘤,类癌瘤,胰岛细胞瘤,胰腺癌),皮肤癌(例如皮肤黑色素瘤,基底细胞癌,鳞状细胞癌,黑色素瘤,浅表扩散性黑色素瘤,结节性黑色素瘤,小痣恶性黑色素瘤,肢端雀斑样痣性黑素瘤,皮肤癌),宫颈癌(例如鳞状细胞癌,腺癌,宫颈癌),卵巢癌(例如,卵巢上皮癌,边界线肿瘤,生殖细胞瘤,间质肿瘤,卵巢癌),口腔癌,神经系统癌(例如中枢神经系统癌,CNS胚细胞肿瘤),杯状细胞化生,肾癌(例如,肾细胞癌,腺癌,肾上腺癌,Wilms肿瘤,纤维肉瘤,移行细胞癌(肾盂和/或输尿管),肾细胞癌,肾癌),膀胱癌(例如移行细胞癌,鳞状细胞癌,癌肉瘤),胃癌(例如,真菌样(息肉样),溃疡,浅表扩散,弥漫性扩散,脂肪肉瘤,纤维肉瘤,癌肉瘤),子宫癌(例如子宫内膜癌,子宫内膜样腺癌,子宫肉瘤),食道癌(例如鳞状癌,腺癌,腺样细胞性癌,粘液表皮样癌,腺鳞状癌,肉瘤,黑素瘤,浆细胞瘤,疣状癌和燕麦细胞(小细胞)瘤,食道癌),结肠癌(例如,结肠癌),直肠癌(例如,直肠癌),结肠直肠癌(例如,结直肠癌,转移性结肠直肠癌,遗传性非息肉性结肠直肠癌,KRAS突变的结肠直肠癌),胆囊癌(例如腺癌,胆管癌,乳头状胆管癌,结节性胆管癌,弥散性胆管癌),睾丸癌(例如胚组织瘤,精原细胞瘤,间变性睾丸癌,经典(典型)睾丸癌,精细胞性睾丸癌,非精原细胞瘤睾丸癌),胚胎癌(例如畸胎瘤,绒毛膜癌(卵黄囊瘤)),胃癌(例如胃肠间质瘤,其他胃肠道器官的癌症,胃癌),骨癌(例如结缔组织肉瘤,骨肉瘤,胆脂瘤诱导的骨肉瘤,佩吉特氏骨病,骨肉瘤,软骨肉瘤,尤因肉瘤,恶性巨细胞瘤,骨纤维肉瘤,脊索瘤,骨膜肉瘤,软组织肉瘤,血管肉瘤(血管肉瘤),纤维肉瘤,卡波西肉瘤,平滑肌肉瘤,腺泡状软组织肉瘤),脂肪肉瘤,淋巴管肉瘤,神经母细胞瘤,横纹肌肉瘤,滑膜肉瘤,淋巴结癌(如淋巴结内膜肉瘤),腺样囊性癌,阴道癌(如鳞状细胞癌,腺癌,黑素瘤),外阴癌(如鳞状细胞癌,黑色素瘤,腺癌,肉瘤,佩吉特氏病),其他生殖器官癌,甲状腺癌(如乳头状甲状腺癌,滤泡性甲状腺癌,甲状腺髓样癌,间变性甲状腺癌,甲状腺癌),唾液腺癌(如腺癌,粘液表皮样癌),眼癌(如眼黑素瘤,虹膜黑素瘤,脉络膜黑色素瘤,睫状体黑素瘤,视网膜母细胞瘤),阴茎癌,口腔癌(如鳞状细胞癌,基底细胞癌),咽癌(例如鳞状细胞癌,疣状咽癌),头癌,颈癌,喉癌,胸癌,脾癌,骨骼肌癌,皮下组织癌,肾上腺癌,嗜铬细胞瘤,肾上腺皮质癌,垂体癌,库欣病,催乳素分泌性肿瘤,肢端肥大症,糖尿病尿崩症,粘液肉瘤,成骨肉瘤,内皮肉瘤,间皮瘤,滑膜瘤,成血管细胞瘤,上皮癌,囊腺癌,支气管癌,汗腺癌,皮脂腺癌,乳头状癌,乳头状腺癌,室管膜瘤,视神经胶质瘤,原始神经外胚层肿瘤,类人瘤,肾癌,多形胶质母细胞瘤,神经纤维瘤,神经纤维瘤病,小儿癌,神经母细胞瘤,恶性黑色素瘤,表皮癌,红细胞增多症,Waldenstrom巨球蛋白血症,意义不明的单克隆丙种球蛋白病,良性单克隆丙种球蛋白病,重链病,小儿实体瘤,尤文氏肉瘤,Wilms瘤,表皮癌,HIV相关的卡波西肉瘤,横纹肌肉瘤,卵泡膜细胞瘤,男性细胞瘤,子宫内膜癌,子宫内膜增生,子宫内膜异位,纤维肉瘤,绒毛膜癌,鼻咽癌,喉癌,肝母细胞瘤,卡波西肉瘤,血管瘤,海绵状血管瘤,血管母细胞瘤,视网膜母细胞瘤,胶质母细胞瘤,神经鞘瘤,神经母细胞瘤,横纹肌肉瘤,成骨肉瘤,平滑肌肉瘤,尿路癌,与斑痣相关的血管增生异常,水肿(如与脑肿瘤有关的水肿),Meigs综合征,垂体腺瘤,原发性神经外胚层肿瘤,髓母细胞瘤和听神经瘤。
治疗、预防或延迟癌症的方法可包括向患有基底细胞癌、杯状细胞化生或恶性神经胶质瘤的受试者施用治疗有效量的本文所述化合物或其药学上可接受的盐。治疗、预防或延迟癌症的方法可以包括向患有肝癌,乳腺癌,肺癌,前列腺癌,子宫颈癌,子宫癌,结肠癌,胰腺癌,肾癌,胃癌,膀胱癌,卵巢癌或脑癌的患者服用治疗有效量的本文所述的化合物或其药学上可接受的盐。
治疗、预防或延迟癌症的方法可包括向患有以下癌症的受试者施用治疗有效量的本文所述的化合物或其药学上可接受的盐:头,颈,眼,口,喉,食道,食道,胸,骨,肺,肾,结肠,直肠或其他胃肠道器官,胃,脾,骨骼肌,皮下组织,前列腺,乳腺,卵巢,睾丸或其他生殖器官,皮肤,甲状腺,血液,淋巴结,肾脏,肝脏,胰腺以及脑或中枢神经系统的癌症。
根据本公开可以预防和/或治疗的癌症的具体实例包括但不限于以下:肾癌,肾癌,多形恶性神经胶质瘤,转移性乳腺癌;乳腺癌;乳腺肉瘤;神经纤维瘤;神经纤维瘤病;小儿肿瘤;神经母细胞瘤;恶性黑色素瘤;表皮癌;白血病,例如但不限于急性白血病,急性淋巴细胞性白血病,急性粒细胞性白血病,例如成髓细胞性,早幼粒细胞性,髓单核细胞性,单核细胞性,红血球性白血病和Myclodysplastic综合征,慢性白血病例例如但不限于慢性粒细胞性(粒性白细胞)白血病,慢性淋巴细胞白血病,毛细胞白血病;真性红细胞增多症;淋巴瘤,例如但不限于霍奇金氏病,非霍奇金氏病;多发性骨髓瘤,例如但不限于冒烟型多发性骨髓瘤,非分泌性骨髓瘤,骨硬化性骨髓瘤,浆细胞白血病,孤立浆细胞瘤和髓外浆细胞瘤;Waldenstrom巨球蛋白血症;意义不明的单克隆丙种球蛋白病;良性单克隆丙种球蛋白病;重链疾病;骨癌和结缔组织肉瘤,例如但不限于骨肉瘤,骨髓瘤骨病,多发性骨髓瘤,胆脂瘤诱发的骨骨肉瘤,佩吉特氏骨病,骨肉瘤,软骨肉瘤,尤因肉瘤,恶性巨细胞瘤,骨纤维肉瘤,脊索瘤,骨膜肉瘤,软组织肉瘤,血管肉瘤(血管肉瘤),纤维肉瘤,卡波西肉瘤,平滑肌肉瘤,脂肪肉瘤,淋巴管肉瘤,神经瘤,横纹肌肉瘤和滑膜肉瘤;脑肿瘤,例如但不限于,脑胶质瘤,星形细胞瘤,脑干神经胶质瘤,室管膜瘤,少突神经胶质瘤,非神经胶质瘤,声学神经瘤,颅咽管瘤,髓母细胞瘤,脑膜瘤,松细胞瘤,松原细胞瘤和原发性脑淋巴瘤;乳腺癌,包括但不限于腺癌,小叶(小细胞)癌,导管内癌,髓样乳腺癌,粘液乳腺癌,乳腺小管癌,乳头状乳腺癌,佩吉特氏病(包括青少年佩吉特氏病)和炎性乳腺癌;肾上腺癌,例如但不限于嗜铬细胞瘤和肾上腺皮质癌;甲状腺癌,例如但不限于乳头状或滤泡性甲状腺癌,甲状腺髓样癌和间变性甲状腺癌;胰腺癌,例如但不限于,胰岛素瘤,胃泌素瘤,胰高血糖素瘤,胰腺瘤,分泌生长抑素的肿瘤,类癌或胰岛细胞瘤;垂体癌,例如但不限于库欣氏病,催乳素分泌性肿瘤,肢端肥大症和糖尿病性尿崩症;眼癌例如但不限于眼黑色素瘤,例如虹膜黑色素瘤,脉络膜黑色素瘤,睫状体黑色素瘤和视网膜母细胞瘤;阴道癌,如鳞状细胞癌,腺癌和黑色素瘤;外阴癌,例如鳞状细胞癌,黑色素瘤,腺癌,基底细胞癌,肉瘤和佩吉特氏病;子宫颈癌,例如但不限于鳞状细胞癌和腺癌;子宫癌,例如但不限于子宫内膜癌和子宫肉瘤;卵巢癌,例如但不限于卵巢上皮癌,交界性肿瘤,胚细胞瘤和间质瘤;宫颈癌;食管癌,例如但不限于鳞状癌,腺癌,腺样囊性癌,粘液表皮样癌,腺鳞癌,肉瘤,黑素瘤,浆细胞瘤,疣状癌和燕麦细胞(小细胞)癌;胃癌,例如但不限于腺癌,真菌样(息肉样),溃疡性,浅表性扩散,弥散性扩散,恶性淋巴瘤,脂肪肉瘤,纤维肉瘤和癌肉瘤;结肠癌;KRAS突变的结肠直肠癌;结肠癌;直肠癌;肝癌,例如但不限于肝细胞癌和肝母细胞瘤;胆囊癌,例如腺癌;胆管癌,例如但不限于乳头状,结节状和弥漫性胆管癌;肺癌,例如KRAS突变的非小细胞肺癌,非小细胞肺癌,鳞状细胞癌(表皮样癌),腺癌,大细胞癌和小细胞肺癌;肺癌;睾丸癌,例如但不限于胚组织瘤,精原细胞瘤,间变性,经典(典型),精细胞,非精原细胞瘤,胚胎性癌,畸胎瘤癌,绒毛膜癌(卵黄囊肿瘤),前列腺癌,例如但不限于,非雄激素依赖性前列腺癌,雄激素依赖性前列腺癌,腺癌,平滑肌肉瘤和横纹肌肉瘤;阴茎癌;口腔癌,例如但不限于鳞状细胞癌;基底癌;唾液腺癌,例如但不限于腺癌,粘液表皮样癌和腺样囊性癌;咽癌,例如但不限于鳞状细胞癌和疣状;皮肤癌例如但不限于:基底细胞癌,鳞状细胞癌和黑色素瘤,浅表扩散性黑色素瘤,结节性黑色素瘤,小痣恶性黑色素瘤,肢端雀斑样痣性黑素瘤;肾癌,例如但不限于肾细胞癌,腺癌,肾上腺瘤,纤维肉瘤,移行细胞癌(肾盂和/或输尿管);肾癌;威尔姆斯瘤;膀胱癌,例如但不限于移行细胞癌,鳞状细胞癌,腺癌,癌肉瘤。此外,癌症还包括粘液肉瘤,成骨肉瘤,内皮细胞肉瘤,淋巴管内皮细胞肉瘤,间皮瘤,滑膜瘤,血管母细胞瘤,上皮癌,囊腺癌,支气管癌,汗腺癌,皮脂腺癌,乳头状癌和乳头状腺癌。
治疗、预防或延迟癌症的方法可包括向患有以下的受试者施用治疗有效量的本文所述的化合物或其药学上可接受的盐:小儿实体瘤,尤因肉瘤,威尔姆斯瘤,神经母细胞瘤,神经纤维瘤,表皮癌,恶性黑色素瘤,宫颈癌,结肠癌,肺癌,肾癌,乳腺癌,乳腺癌,乳房肉瘤,转移性乳腺癌,与艾滋病相关的卡波西氏肉瘤,前列腺癌,非雄激素依赖性前列腺癌,雄激素依赖性前列腺癌,神经纤维瘤病,肺癌,非小细胞肺癌,KRAS突变的非小细胞肺癌,恶性黑色素瘤,黑色素瘤,结肠癌,KRAS突变的结肠直肠癌,多形胶质母细胞瘤,肾癌,肾癌,膀胱癌,卵巢癌,肝细胞癌,甲状腺癌,横纹肌肉瘤,急性髓细胞性白血病或多发性骨髓瘤。
在一些实施方式中,根据本公开预防和/或治疗的癌症以及与之相关的病症为:乳腺癌,肺癌,胃癌,食道癌,结直肠癌,肝癌,卵巢癌,卵泡膜细胞瘤(thecomas),男性细胞瘤,宫颈癌,子宫内膜癌,子宫内膜增生,子宫内膜异位,纤维肉瘤,绒毛膜癌,头颈癌,鼻咽癌,喉癌,肝母细胞瘤,卡波西肉瘤,黑色素瘤,皮肤癌,血管瘤,海绵状血管瘤,血管母细胞瘤,胰腺癌,视网膜母细胞瘤,星形细胞瘤,胶质母细胞瘤,神经鞘瘤,少突胶质细胞瘤,髓母细胞瘤,神经母细胞瘤,横纹肌肉瘤,成骨肉瘤,平滑肌肉瘤,泌尿道癌,甲状腺癌,Wilm瘤,肾细胞癌,前列腺癌,与斑痣相关的血管异常增生,水肿(例如与脑瘤相关的水肿)或Meigs综合征。在特定的实施方式中,癌症是星形细胞瘤,少突神经胶质瘤,少突神经胶质瘤和星形细胞瘤成分的混合物,室管膜瘤,脑膜瘤,垂体腺瘤,原始神经外胚层肿瘤,髓母细胞瘤,原发性中枢神经系统(CNS)淋巴瘤或CNS胚细胞肿瘤。
在一些实施方式中,根据本公开治疗的癌症是听神经瘤,间变性星形细胞瘤,多形性胶质母细胞瘤或脑膜瘤。在一些实施方式中,根据本公开治疗的癌症是脑干神经胶质瘤,颅咽管瘤,室管膜瘤,幼年型毛细胞性星形细胞瘤,髓母细胞瘤,视神经胶质瘤,原始神经外胚层肿瘤或横纹肌样瘤。
治疗、预防或延迟病症或疾病的方法可以包括向患有以下的受试者施用治疗有效量的本文所述的化合物或其药学上可接受的盐:急性髓细胞性白血病,als,阿尔茨海默病,嗜银颗粒病,癌症代谢,慢性淋巴细胞性白血病,结肠直肠癌,皮质基底变性,囊性纤维化,扩张型心肌病,Duchenne肌营养不良,Ehlers-Danlos综合征,子宫内膜癌,Fabry病,家族性自主神经失调,家族性高胆固醇血症,家族性持续性高胰岛素血症性低血糖,额颞叶痴呆,FTDP-17,gucher病,神经胶质瘤,球状胶质tau蛋白病,HIV-1,亨廷顿氏病,Hutchinson-Gilford早衰综合征,高胆固醇血症,Leber先天性黑朦,偏头痛,多发性硬化症,骨髓增生异常综合征,NASH,Niemann-Pick病,非小细胞肺癌,疼痛,帕金森氏病,苯丙酮尿症,Pick病,进行性核上性麻痹,脊髓性肌萎缩,脊髓型小脑性共济失调2型或威尔逊氏病。
治疗、预防或延迟非癌症疾病或病症的方法可以包括向患有以下的受试者施用治疗有效量的本文所述的化合物或其药学上可接受的盐:非典型溶血性尿毒症综合征(aHUS),囊性纤维化,肌营养不良,多囊性常染色体显性肾病,癌症引起的恶病质,良性前列腺增生,类风湿性关节炎,牛皮癣,动脉粥样硬化,肥胖症,视网膜病变(包括糖尿病性视网膜病和早产儿视网膜病变),晶体后纤维增生症,血管性青光眼,年龄相关性黄斑变形,渗出性黄斑变性,甲状腺增生(包括Grave病),角膜等组织移植,流行性角膜结膜炎,维生素A缺乏症,隐形眼镜罩,特应性角膜炎,上缘性角膜炎和干燥性翼状胬肉角膜炎,病毒感染,与病毒感染有关的炎症,慢性炎症,肺部炎症,肾病综合征,先兆子痫,腹水,心包积液(例如与心包炎相关),胸腔积液,Sjogren综合征,酒渣鼻痤疮,phylectenulosis,梅毒,脂质变性,化学烧伤,细菌性溃疡,真菌性溃疡,单纯疱疹感染,带状疱疹病毒感染,原生动物感染,Mooren溃疡,Terrien边缘性变性,边缘性角质层分离,系统性狼疮,多动脉炎,创伤,韦格纳结节病,佩吉特氏病,巩膜炎,史蒂文斯-约翰逊氏病,天疱疮,放射状角膜切开术,埃尔斯氏病,贝塞特氏病,镰状细胞性贫血,弹性假性黄瘤,斯达加特氏病,睫状体平坦部炎,慢性视网膜脱离,静脉闭塞,动脉闭塞,颈动脉阻塞性疾病,慢性葡萄膜炎/玻璃体炎,眼组织胞浆菌病,分枝杆菌感染,莱姆病,贝斯特氏病,近视,视盘小凹,高黏度综合征,弓形体病,结节病,创伤,激光后并发症,与虹膜红变有关的疾病(虹膜和角膜的新生血管)以及由纤维血管或纤维组织异常增生引起的疾病,包括各种形式的多发性玻璃体视网膜病变。可以根据本文所述的方法预防和/或治疗的非肿瘤性病症的某些实例包括病毒感染,包括但不限于与属于以下的病毒相关的病毒感染:黄病毒科,黄病毒,瘟病毒,肝炎病毒,西尼罗河病毒,丙型肝炎病毒(HCV)或人乳头瘤病毒(HPV),视锥细胞营养不良,前列腺炎,胰腺炎,视网膜炎,白内障,视网膜变性,韦格纳肉芽肿,肌病,腺样体炎,胚细胞瘤,组合的甲基丙二酸尿症和高半胱氨酸尿症,cb1C型,阿尔茨海默病,血脯氨酸过多,痤疮,结核病,琥珀酸半醛脱氢酶缺乏症,食管炎,智力低下,甘氨酸脑病,克罗恩病,脊柱裂,常染色体隐性疾病,精神分裂症,神经管缺损,骨髓增生异常综合征,肌萎缩性侧索硬化症,神经炎,帕金森氏病,马蹄内翻足,肌营养不良症,脑炎,膀胱相关疾病,唇裂,腭裂,宫颈炎,痉挛,脂肪瘤,硬皮病,盖特曼综合征,脊髓灰质炎,瘫痪,Aagenaes综合征,动眼神经麻痹和脊髓性肌萎缩。
治疗、预防或延迟非癌症疾病或病症的方法可以包括向患有以下的受试者施用治疗有效量的本文所述的化合物或其药学上可接受的盐:非典型溶血性尿毒症综合征(aHUS),Hutchinson-Gilford早衰综合征(HGPS),肢带肌营养不良1B型,家族性部分脂肪营养不良2型,额颞叶痴呆伴帕金森氏症第17号染色体,理查森氏症,PSP-帕金森氏症,嗜银颗粒病,皮质基底节变性,皮克氏病,球状神经胶质tau蛋白病,瓜德罗普斯帕金森病,肌强直性营养不良,唐氏综合症,新生儿缺氧缺血,家族性植物神经障碍,脊髓性肌萎缩,次黄嘌呤磷酸核糖基转移酶缺乏症,埃勒斯-丹洛斯综合征,Occipital Horn综合征,范可尼贫血,Marfan综合征,血栓性血小板减少性紫癜,III型糖原贮积病,囊性纤维化,神经纤维瘤病,酪氨酸血症(I型),门克斯病,无白蛋白血症,先天性乙酰胆碱酯酶缺乏症,血友病B缺乏症(凝血因子IX缺乏症),隐性营养不良性大疱性表皮松解,显性营养不良性大疱性表皮松解,肾小管上皮细胞体细胞突变,II型神经纤维瘤病,X连锁肾上腺皮质营养不良(X-ALD),FVII缺乏症,纯合子低脂蛋白血症,共济失调-毛细血管扩张症,雄激素敏感性,常见先天性纤维蛋白原血症,肺气肿风险,II型粘多糖贮积病(Hunter综合征),III型严重成骨不全症,Ehlers-Danlos综合征IV,Glanzmann血小板无力症,轻度Bethlem肌病,Dowling-Meara单纯大疱性表皮松解,MTHFR严重不足,急性间歇性卟啉症,Tay-Sachs综合征,肌磷酸化酶缺乏症(McArdle病),1型慢性酪氨酸血症,胎盘突变,白细胞黏附缺乏症,遗传性C3缺乏症,I型神经纤维瘤病,胎盘芳香化酶缺乏症,脑腱黄瘤病,杜切氏肌营养不良,严重V因子缺乏症,α-地中海贫血,β-地中海贫血,遗传性HL缺乏症,Lesch-Nyhan综合征,家族性高胆固醇血症,磷酸甘油酸激酶缺乏症,Cowden综合征,X连锁性视网膜色素变性(RP3),Crigler-Najjar综合征1型,慢性酪氨酸血症I型,Sandhoff病,青年成熟期发病型糖尿病(MODY),家族性结节性硬化症,多囊肾病1或原发性甲亢。
在一些实施方式中,可以根据WO2016/196386 Al,WO2016/128343 A1,WO2015/024876 A2和EP3053577A1的公开预防和/或治疗的非癌症疾病。在一些实施方式中,可以预防和/或治疗的非癌症疾病包括但不限于,非典型溶血性尿毒症综合征(aHUS),Hutchinson-Gilford早衰综合征(HGPS),肢带肌营养不良1B型,家族性部分脂肪营养不良2型,额颞叶痴呆伴帕金森氏症第17号染色体,理查森氏症,PSP-帕金森氏症,嗜银颗粒病,皮质基底节变性,皮克氏病,球状神经胶质tau蛋白病,瓜德罗普斯帕金森病,肌强直性营养不良,唐氏综合症,新生儿缺氧缺血,家族性植物神经障碍,脊髓性肌萎缩,次黄嘌呤磷酸核糖基转移酶缺乏症,埃勒斯-丹洛斯综合征,Occipital Horn综合征,范可尼贫血,Marfan综合征,血栓性血小板减少性紫癜,III型糖原贮积病,囊性纤维化,神经纤维瘤病,酪氨酸血症(I型),门克斯病,无白蛋白血症,先天性乙酰胆碱酯酶缺乏症,血友病B缺乏症(凝血因子IX缺乏症),隐性营养不良性大疱性表皮松解,显性营养不良性大疱性表皮松解,肾小管上皮细胞体细胞突变,II型神经纤维瘤病,X连锁肾上腺皮质营养不良(X-ALD),FVII缺乏症,纯合子低脂蛋白血症,共济失调-毛细血管扩张症,雄激素敏感性,常见先天性纤维蛋白原血症,肺气肿风险,II型粘多糖贮积病(Hunter综合征),III型严重成骨不全症,Ehlers-Danlos综合征IV,Glanzmann血小板无力症,轻度Bethlem肌病,Dowling-Meara单纯大疱性表皮松解,MTHFR严重不足,急性间歇性卟啉症,Tay-Sachs综合征,肌磷酸化酶缺乏症(McArdle病),1型慢性酪氨酸血症,胎盘突变,白细胞黏附缺乏症,遗传性C3缺乏症,I型神经纤维瘤病,胎盘芳香化酶缺乏症,脑腱黄瘤病,杜切氏肌营养不良,严重V因子缺乏症,α-地中海贫血,β-地中海贫血,遗传性HL缺乏症,Lesch-Nyhan综合征,家族性高胆固醇血症,磷酸甘油酸激酶缺乏症,Cowden综合征,X连锁性视网膜色素变性(RP3),Crigler-Najjar综合征1型,慢性酪氨酸血症I型,Sandhoff病,青年成熟期发病型糖尿病(MODY),家族性结节性硬化症或多囊肾病1。
施用方法
本文所述的组合物可以多种方式施用于受试者,包括肠胃外,静脉内,皮内,肌肉内,结肠,直肠或腹膜内。在一些实施方式中,小分子剪接调节剂或其药学上可接受的盐通过受试者的腹膜内注射,肌内注射,皮下注射或静脉内注射施用。在一些实施方式中,药物组合物可以肠胃外,静脉内,肌内或口服施用。包含小分子剪接调节剂的口服剂可以是任何适合口服施用的形式,例如液体,片剂,胶囊等。可以将口服制剂进一步包衣或处理以防止或减少在胃中的溶出。可以使用本领域已知的任何合适方法将本发明的组合物施用于受试者。用于本发明的合适制剂和递送方法通常是本领域众所周知的。例如,本文描述的小分子剪接调节剂可以配制成具有药学上可接受的稀释剂、载体或赋形剂的药物组合物。所述组合物可包含近似生理条件所需的药学上可接受的辅助物质,包括pH调节剂和缓冲剂,张力调节剂,润湿剂等,例如乙酸钠,乳酸钠,氯化钠,氯化钾,氯化钙,脱水山梨糖醇单月桂酸酯,三乙醇胺油酸酯等。
本文所述的药物制剂可以通过多种施用途径以多种方式向受试者施用,包括但不限于口服,肠胃外(例如,静脉内,皮下,肌内,髓内注射,鞘内,直接心室内,腹膜内,淋巴内,鼻内注射),鼻内,口腔,局部或经皮施用途径。本文所述的药物制剂包括但不限于水性液体分散体,自乳化分散体,固溶体,脂质体分散体,气雾剂,固体剂型,粉剂,速释制剂,控释制剂,速熔制剂,片剂,胶囊,药丸,延迟释放制剂,延长释放制剂,脉冲释放制剂,多颗粒制剂以及速释和控释混合制剂。
在一些实施方式中,口服施用本文描述的药物组合物。在一些实施方式中,局部施用本文描述的药物组合物。在这样的实施方式中,本文描述的药物组合物被配制成各种局部可施用的组合物,例如溶液,悬浮液,洗液,凝胶,糊剂,洗发剂,擦剂,搓剂,涂片,涂药片,药用绷带,绷带,香脂,乳膏或软膏。在一些实施方式中,本文描述的药物组合物局部施用于皮肤。在一些实施方式中,本文描述的药物组合物通过吸入施用。在一些实施方式中,配制本文所述的药物组合物用于鼻内施用。此类制剂包括鼻喷雾剂,鼻雾剂等。在一些实施方式中,本文所述的药物组合物配制成滴眼剂。在一些实施方式中,本文所述的药物组合物为:(a)全身性施用于哺乳动物;和/或(b)口服施用于哺乳动物;和/或(c)静脉内施用于哺乳动物;和/或(d)通过吸入施用于哺乳动物;和/或(e)经鼻施用于哺乳动物;和/或(f)通过注射施用于哺乳动物;和/或(g)局部施用于哺乳动物;和/或(h)通过眼科施用而施用;和/或(i)直肠施用于哺乳动物;和/或(j)非全身性或局部施用于哺乳动物。在一些实施方式中,本文所述的药物组合物口服施用于哺乳动物。在某些实施方式中,本文描述的SMSM以局部施用而非全身性施用的方式施用。在一些实施方式中,本文描述的SMSM为局部施用。在一些实施方式中,本文描述的SMSM为全身施用。
口服组合物通常包含惰性稀释剂或可食用载体。它们可以装入明胶胶囊中或压成片剂。为了口服治疗性施用的目的,活性化合物可以与赋形剂结合,并以片剂、锭剂或胶囊的形式使用。药学上相容的粘合剂和/或佐剂材料可以作为组合物的一部分包括在内。片剂、丸剂、胶囊剂、锭剂等可含有以下任何成分或性质相似的化合物:粘合剂如微晶纤维素,黄芪胶或明胶;赋形剂如淀粉或乳糖;崩解剂如藻酸,Primogel或玉米淀粉;润滑剂如硬脂酸镁或Sterotes;助流剂如胶体二氧化硅;甜味剂如蔗糖或糖精;或者调味剂如薄荷、水杨酸甲酯或橙味调味剂。
对于通过吸入施用,将化合物以气溶胶喷雾的形式自加压容器或分配器递送,该容器或分配器包含合适的推进剂,例如诸如二氧化碳的气体或喷雾器。
全身施用也可以通过透粘膜或透皮方式进行。对于透粘膜或透皮施用,在制剂中使用适于渗透屏障的渗透剂。此类渗透剂是本领域公知的,并且包括例如用于经粘膜施用的洗涤剂、胆汁盐和夫西地酸衍生物。透粘膜施用可以通过使用鼻喷雾剂或栓剂来完成。对于经皮施用,将活性化合物配制成本领域通常已知的软膏、药膏、凝胶或乳膏。
适于注射使用的SMSM包括无菌水溶液(在水溶性时)或分散液,以及用于临时制备无菌可注射液或分散液的无菌粉末。对于静脉内施用,合适的载体包括生理盐水、抑菌水、Cremophor ELTM(BASF,Parsippany,NJ)或磷酸盐缓冲盐水(PBS)。在所有情况下,组合物必须是无菌的,并且应以易于注射的程度流动。它必须在生产和储存条件下稳定,并且必须进行防腐处理,以免受到细菌和真菌等微生物的污染。载体可以是溶剂或分散介质,其包含例如水、乙醇、多元醇(例如甘油、丙二醇和液体聚乙二醇等)及其合适的混合物。可以例如通过使用诸如卵磷脂的涂层,在分散液的情况下通过保持所需的粒径,以及通过使用表面活性剂,来保持适当的流动性。可以通过各种抗菌剂和抗真菌剂来预防微生物的作用,例如对羟基苯甲酸酯,氯丁醇,苯酚,抗坏血酸,硫柳汞等。在许多情况下,将优选在组合物中包括等渗剂,例如糖、多元醇如甘露醇、山梨醇、氯化钠。
给药和日程
在本发明的方法中使用的SMSM可以例如以可以根据受试者的需要、所治疗和/或成像的疾病的严重性和/或所采用的SMSM而改变的剂量施用。例如,可以根据经验来确定剂量,其考虑到在特定受试者中诊断出的疾病的类型和阶段和/或结合SMSM使用的成像方式的类型。在本发明的上下文中,施用于受试者的剂量应足以影响受试者中的有益诊断或治疗反应。剂量的大小还可以根据在特定受试者中施用SMSM所伴随的任何不良副作用的存在、性质和程度来确定。
以剂量单位形式配制组合物是有利的,其易于施用且剂量均匀。如本文所用,剂量单位形式是指适合作为用于待治疗受试者的单位剂量的物理上离散的单位;每个单位包含经计算预定量的活性化合物,以与所需的药物载体结合产生期望的治疗效果。本发明的剂量单位形式的规范决定于并直接取决于活性化合物的独特特性和所要达到的特定治疗效果,以及配混此类活性化合物以治疗个体的领域中固有的限制。此类化合物的毒性和治疗功效可通过细胞培养或实验动物中的程序来确定,例如,确定LD50(对50%群体致命的剂量)和ED50(在50%群体中治疗有效的剂量)的程序。毒性和治疗效果之间的剂量比是治疗指数,其可以表示为比率LD50/ED50。表现出大治疗指数的化合物是优选的。尽管可以使用具有毒副作用的化合物,但应谨慎设计将这类化合物靶向受影响组织部位的递送系统,以最小化对未感染细胞的潜在损害,从而减少副作用。
从细胞培养测定和/或动物研究中获得的治疗指数数据可用于预测体内治疗指数并制定用于受试者(例如人类受试者)的剂量范围。从细胞培养测定和动物研究中获得的数据可用于制定用于人类的剂量范围。此类化合物的剂量优选在循环浓度的范围内,该循环浓度包括几乎没有或没有毒性的ED50。剂量可以在该范围内变化,这取决于所采用的剂型和所采用的施用途径。对于本发明的方法中使用的任何化合物,治疗有效剂量可以首先从细胞培养测定中估计。可以在动物模型中配制剂量以达到循环血浆浓度范围,该范围包括如在细胞培养中确定的达到症状的最大半数抑制的测试化合物的浓度。此类信息可用于更准确地确定人中有用的剂量。例如,可以通过高效液相色谱测量血浆中的水平。用于评估特定SMMS在预防或减轻疾病或病症中的有效性的各种动物模型和临床测定是本领域已知的,并且可以在本发明中使用。剂量可以在该范围内变化,这取决于所采用的剂型和所采用的施用途径。确切的制剂、施用途径和剂量可由个体医师根据患者的病情选择(参见例如Fingl等,1975,The Pharmacological Basis of Therapeutics.Ch.1pi)。
在一些方面,所提供的SMSM具有至少约1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16,17,18,19,20,40,50,60,70,80,90,100,200,300,400,500,600,700,800,900,1000,10000或100000或更高的治疗指数(LD50/ED50)。在一些方面,所提供的SMSM具有至少约1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16,17,18,19,20,40,50,60,70,80,90,100,200,300,400,500,600,700,800,900,1000,10000或100000或更高的治疗指数(LD50/ED50),如在细胞培养中所确定。
在一些方面,所提供的SMSM具有至少约1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16,17,18,19,20,40,50,60,70,80,90,100,200,300,400,500,600,700,800,900,1000,10000或100000或更高的IC50活力/EC50剪接值。在一些方面,所提供的SMSM具有至少约1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16,17,18,19,20,40,50,60,70,80,90,100,200,300,400,500,600,700,800,900,1000,10000或100000或更高的IC50活力/EC50剪接值,如在细胞培养中所确定。
施用时使用SMSM的剂量可以是至少1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20克/m2(人中),或与人中剂量相当的在另一受试者中的剂量。如果以剂量X施用SMSM后除人以外的受试者中清除剂的血清浓度等于以剂量Y施用化合物后人中SMSM的血清浓度,则在该受试者中SMSM的剂量(“剂量X”)与人中SMSM的剂量(“剂量Y”)相当。
在本说明书的范围内,用于制造药物、制备药物试剂盒或用于预防和/或治疗有此需要的人类受试者中的疾病的方法的SMSM化合物或其药学上可接受的盐的有效量旨在包括约1μg至约50克的量。
本发明的组合物可以根据需要频繁地施用,包括每小时、每天、每周或每月施用。
在任何前述方面中的是进一步的实施方式,其包括单次施用有效量的本文所述的SMSM,包括其中(i)化合物施用一次;(ii)化合物在一天的时间内多次施用于哺乳动物;(iii)持续施用;或者(iv)连续施用的进一步的实施方式。
在任何前述方面中的是进一步的实施方式,其包括多次施用本文所述的有效量的SMSM,包括其中(i)以单剂量连续或间歇地施用化合物;(ii)多次施用之间的间隔时间为每6小时;(iii)每8小时向哺乳动物服用化合物;(iv)每12小时向哺乳动物施用化合物;(v)每24小时向哺乳动物施用化合物的进一步的实施方式。在其他或替代实施方式中,该方法包括药物假期,其中本文所述的SMMS的施用被暂时中止或所施用的化合物的剂量被暂时降低;在药物假期的最后,将继续给药该化合物。在一个实施方式中,药物假期的长度从2天至1年不等。
组合治疗
在某些情况下,将本文所述的至少一种SMSM与另一种治疗剂组合施用是合适的。例如,本文所述的化合物SMSM可以与第二治疗剂共同施用,其中SMSM和第二治疗剂调节所治疗的疾病、病症或病状的不同方面,因此与施用任何一种单独的治疗剂相比,提供了更大的总体益处。
在一些实施方式中,本文所述的SMSM可以与抗癌疗法组合使用。在一些实施方式中,空间调节剂与常规化学疗法、放射疗法、激素疗法和/或免疫疗法组合使用。在一些实施方式中,本文所述的SMSM可与包括以下的常规化学治疗剂组合使用:烷基化剂(如替莫唑胺,环磷酰胺,异环磷酰胺,苯丁酸氮芥,白消安,美法仑,二氯甲基二乙胺,乌拉莫司汀,塞替派,亚硝基脲等),抗代谢物(例如5-氟尿嘧啶,硫唑嘌呤,甲氨蝶呤,亚叶酸钙,卡培他滨,阿糖胞苷,氟尿苷,氟达拉滨,吉西他滨,培美曲塞,雷替曲塞等),植物生物碱(例如长春新碱,长春碱,长春瑞滨,长春地辛,鬼臼毒素,紫杉醇,多西他赛等),拓扑异构酶抑制剂(如伊立替康,拓扑替康,安吖啶,依托泊苷(VP16),依托泊苷磷酸酯,替尼泊苷等),抗肿瘤抗生素(例如,多柔比星,阿霉素,柔红霉素,表阿霉素,放线菌素,博来霉素,丝裂霉素,米托蒽醌,普卡霉素等),铂基化合物(例如顺铂,奥沙利铂,卡铂等),EGFR抑制剂(例如吉非替尼,厄洛替尼等)等。
在一些实施方式中,SMSM可以与一种或多种其他SMSM组合施用。
可以在化学治疗剂的施用之前、同时或之后将SMSM施用于有此需要的受试者。例如,可以在施用化学治疗剂的开始时间之前至少8小时,7小时,6小时,5小时,4小时,3小时,2小时,1.5小时,1小时或30分钟将SMSM施用于受试者。在某些实施方式中,它们可以与化学治疗剂的施用同时施用。换言之,在这些实施方式中,在开始施用化疗剂的同时施用SMSM。在其他实施方式中,可以在施用化学治疗剂的开始时间后施用SMSM(例如,施用化学治疗剂的开始时间后至少30分钟,1小时,2小时,3小时,4小时,5小时,6小时,7小时或8小时)。在某些实施方式中,或者,可以在化学治疗剂的施用完成后至少30分钟,1小时,2小时,3小时,4小时,5小时,6小时,7小时或8小时施用SMSM。通常,将这些SMSM施用足够的时间,以预防或减轻疾病或病症。这样的足够的时间可以与化学治疗剂的施用时间相同或不同。在某些实施方式中,每次施用化学治疗剂或多种化学治疗剂的组合均施用多次剂量的SMSM。
在某些实施方式中,将适当剂量的SMSM与特定时机和/或特定途径结合以达到预防或减少疾病或病症的最佳效果。例如,在开始或完成施用化学治疗剂或化学治疗剂的组合之前或之后,至少1小时,2小时,3小时,4小时,5小时,6小时,7小时8小时,9小时,10小时,11小时或12小时;或者至少1天,2天,3天,4天,5天,6天,7天,8天,9天,10天,11天,12天;或者至少1周,2周,3周或4周;或者至少1个月,2个月,3个月,4个月,5个月,6个月,7个月,8个月,9个月,10个月,11个月或12个月向人口服施用SMSM。
受试者
可以用本文描述的SMSM和方法治疗的受试者可以是产生经受选择性剪切的mRNA的任何受试者,例如,该受试者可以是真核生物受试者,例如植物或动物。在一些实施方式中,受试者是哺乳动物,例如人。在一些实施方式中,受试者是人。在一些实施方式中,受试者是非人类动物。在一些实施方式中,受试者是胎儿、胚胎或儿童。在一些实施方式中,受试者是非人灵长类动物,例如黑猩猩以及其他猿类和猴类;农场动物,例如牛、马、绵羊、山羊、猪;家畜,例如兔、狗和猫;实验动物,包括啮齿类动物,例如大鼠、小鼠和豚鼠等。
在一些实施方式中,受试者为产前(例如胎儿)、儿童(例如新生儿、婴儿、学步儿童、青春期前)、青少年、青春期或成人(例如,早期成年人,中年成年人,老年人)。人类受试者的年龄可以在约0个月和约120岁之间,或更大。人类受试者的年龄可在约0和约12个月之间;例如,约1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11或12个月大。人类受试者的年龄可在0和12岁之间;例如,约0和30天之间;约1个月和12个月之间;约1岁和3岁之间;约4岁和5岁之间;约4岁和12岁之间;约1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11或12岁。人类受试者的年龄可在约13岁和19岁之间;例如,约13,14,15,16,17,18或19岁。人类受试者的年龄可在约20岁和约39岁之间;例如,约20,21,22,23,24,25,26,27,28,29,30,31,32,33,34,35,36,37,38或39岁。人类受试者的年龄可在约40岁和约59岁之间;例如,约40,41,42,43,44,45,46,47,48,49,50,51,52,53,54,55,56,57,58或59岁。人类受试者的年龄可大于59岁;例如,约60,61,62,63,64,65,66,67,68,69,70,71,72,73,74,75,76,77,78,79,80,81,82,83,84,85,86,87,88,89,90,91,92,93,94,95,96,97,98,99,100,101,102,103,104,105,106,107,108,109,110,111,112,113,114,115,116,117,118,119或120岁。人类受试者可包括活着的受试者或已故的受试者。人类受试者可包括男性受试者和/或女性受试者。
测定
基因表达实验通常涉及测量在两个或更多个实验条件下表达的基因表达产物例如mRNA的相对量。这是因为基因表达产物特定序列的水平改变可能暗示对基因表达产物编码的蛋白质的需求发生了改变,这可能表明体内稳态反应或病理状况。
在一些实施方式中,方法可以包括测量、测定或获得一个或多个基因的表达水平。在某些情况下,该方法提供了一定数量或数量范围的基因,这些基因的表达水平可用于诊断、表征或分类生物样品。在一些实施方式中,基因表达数据对应于与疾病或病症相关的一种或多种生物标志物的表达水平的数据。使用的基因数量可以在约1和约500之间;例如约1-500,1-400,1-300,1-200,1-100,1-50,1-25,1-10,10-500,10-400,10-300,10-200,10-100,10-50,10-25,25-500,25-400,25-300,25-200,25-100,25-50,50-500,50-400,50-300,50-200,50-100,100-500,100-400,100-300,100-200,200-500,200-400,200-300,300-500,300-400,400-500,1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16,17,18,19,20,21,22,23,24,25,26,27,28,29,30,31,32,33,34,35,36,37,38,39,40,41,42,43,44,45,46,47,48,49,50,55,60,65,70,75,80,85,90,95,100,110,120,130,140,150,160,170,180,190,200,210,220,230,240,250,260,270,280,290,300,310,320,330,340,350,360,370,380,390,400,410,420,430,440,450,460,470,480,490,500或任何包含的范围或整数。例如,可使用至少约1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,15,20,25,30,33,35,38,40,43,45,48,50,53,58,63,65,68,100,120,140,142,145,147,150,152,157,160,162,167,175,180,185,190,195,200,300,400,500或更多的总基因。使用的基因的数量可少于或等于约1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,15,20,25,30,33,35,38,40,43,45,48,50,53,58,63,65,68,100,120,140,142,145,147,150,152,157,160,162,167,175,180,185,190,195,200,300,400,500或更多。
在一些实施方式中,相比于同一个器官的正常细胞和/或组织的相对基因表达的确定可以通过测量RNA的相对转录率,例如通过产生相应的cDNA,然后使用从对应于遗传标记的基因序列开发的探针来分析所得的DNA。因此,利用逆转录酶和怀疑是癌细胞的全RNA补体产生的cDNA水平会产生相应量的cDNA,然后可以使用聚合酶链反应或一些其他手段如线性扩增、等温扩增、NASB或滚环扩增将其扩增,以确定所得cDNA的相对水平,从而确定基因表达的相对水平。确定基因表达产物水平的一般方法是本领域已知的,并且可以包括但不限于以下一种或多种:附加的细胞学测定,针对特定蛋白质或酶活性的测定,针对特定表达产物(包括蛋白质或RNA或特定的RNA剪接变体)的测定,原位杂交,全基因组或部分基因组表达分析,微阵列杂交测定,SAGE,酶联免疫吸附测定,质谱,免疫组化,印迹,微阵列,RT-PCR,定量PCR,测序,RNA测序,DNA测序(例如,从RNA获得的cDNA的测序);下一代测序,纳米孔测序,焦磷酸测序或纳米串测序。基因表达产物水平可以标准化为内标,例如总mRNA或特定基因的表达水平,包括但不限于3-磷酸甘油醛脱氢酶或微管蛋白。
基因表达数据通常包括对多个基因的活性(或表达)的测量,以产生细胞功能图像。例如,可以使用基因表达数据来区分活跃分裂的细胞或显示细胞对特定治疗的反应。微阵列技术可用于测量先前鉴定的靶基因和其他表达序列的相对活性。基于序列的技术,如基因表达的序列分析(SAGE,SuperSAGE)也用于分析、测量或获得基因表达数据。SuperSAGE尤其准确,并且可以测量任何活性基因,而不仅仅是预定组。在RNA、mRNA或基因表达谱微阵列中,可以同时监测数千种基因的表达水平,以研究某些治疗方法、疾病和发育阶段对基因表达的影响。
根据前述,可以使用RNA印迹法并使用如本文鉴定的序列确定基因、标志物、基因表达产物、mRNA、前mRNA或其组合的表达水平以为此目的开发探针。这样的探针可以由DNA或RNA或合成核苷酸或它们的组合组成,并且可以有利地由与图4中鉴定的遗传标记相对应的序列匹配或互补的核苷酸残基的连续片段组成。此类探针将最有用地包含至少15-200个或更多残基的连续片段,包括15,16,17,18,19,20,21,22,23,24,25,26,27,28,29,30,31,32,33,34,35,36,37,38,39,40,41,42,43,44,45,46,47,48,49,50,51,52,53,54,55,56,57,58,59,60,61,62,63,64,65,66,67,68,69,70,71,72,73,74,75,80,85,90,95,100,110,120,130,140,150,160,175或200个核苷酸或更多。因此,单个探针与实验细胞的转录组多次结合,而同一探针与相同器官或组织的对照细胞的基因组衍生的相似数量的转录组的结合导致可观察到或多或少的结合,这表明基因、标记、基因表达产物、mRNA或前mRNA的差异表达,其包含或对应于衍生探针序列的遗传标记的序列。
在本发明的一些实施方式中,基因表达的确定可以通过使用例如以下的微阵列分析来确定:来自Bioffide、Agilent或Eppendorf的Affymetrix阵列、cDNA微阵列、寡核苷酸微阵列、斑点微阵列或其他微阵列产品。微阵列具有特别的优势,因为它们可能包含可在单一实验中测定的大量基因或其他剪接变体。在一些情况下,微阵列装置可能包含整个人类基因组或转录组或其中的很大一部分,从而可以全面评估基因表达模式,基因组序列或选择性剪接。可以使用标准分子生物学和微阵列分析技术发现标记,如Sambrook MolecularCloning a Laboratory Manual 2001以及Baldi,P.和Hatfield,W.G.,DNA Microarraysand Gene Expression 2002中所述。
微阵列分析通常开始于使用本领域已知的方法从生物样品(例如活检或细针抽吸物)提取和纯化核酸。对于表达和选择性剪接分析,从DNA提取和/或纯化RNA可能是有利的。从其他形式的RNA(例如tRNA和RRNA)提取和/或纯化mRNA可能更有利。在一些实施方式中,RIN≤5.0的RNA样品通常不用于多基因微阵列分析,而可能仅用于单基因RT-PCR和/或TaqMan分析。微阵列、RT-PCR和TaqMan分析是相关领域众所周知的标准分子技术。基于TaqMan探针的测定广泛用于实时PCR,包括基因表达测定、DNA定量和SNP基因分型。
各种试剂盒可用于主题方法的核酸扩增和探针产生。在一些实施方式中,可以使用Ambion WT表达试剂盒。Ambion WT表达试剂盒允许直接扩增总RNA,而无需单独的核糖体RNA(rRNA)消耗步骤。使用表达试剂盒,可以在/>人、小鼠和大鼠外显子以及Gene 1.0ST阵列上分析小至50ng总RNA的样品。除了较低的输入RNA需求以及/>方法与/>实时PCR数据之间的高度一致性外,表达试剂盒还显著提高了灵敏度。例如,由于信噪比提高,可以使用表达试剂盒在外显子水平上获得在背景以上检测到的更多探针组。AmbionWT表达试剂盒可以与另外的Affymetrix标记试剂盒组合使用。
在一些实施方式中,AmpTec TRinucleotide mRNA扩增试剂盒(6299-A15)可用于主题方法。TRinucleotide mRNA扩增纳米试剂盒适用于从1ng至700ng的输入总RNA的广泛范围。根据输入的总RNA量和所需的RNA产量,其可以使用1轮(输入>300ng总RNA)或2轮(最小输入量1ng总RNA),RNA产量在>10μg的范围内。AmpTec专有的TRinucleotide引物技术导致优先扩增mRNA(与通用的真核3'-聚(A)序列无关),并结合针对rRNA的选择。该试剂盒可与cDNA转化试剂盒以及Affymetrix标记试剂盒组合使用。
在一些实施方式中,无需先获取样品即可在个体中获得或测量基因表达水平。例如,基因表达水平可以在体内,即在个体中确定。用于确定体内基因表达水平的方法是本领域已知的,并且包括成像技术如CAT,MRI;NMR;PET;以及使用抗体或分子信标对蛋白质或RNA水平的光学、荧光或生物光子成像。此类方法描述于US 2008/0044824、US 2008/0131892,其通过引用并入本文。用于体内分子谱分析的其他方法被认为在本发明的范围内。
本文提供了确定SMSM化合物或其药学上可接受的盐是否调节一个、两个、三个或更多个基因的一种、两种、三种或更多种RNA转录物(例如,前mRNA或mRNA转录物或其同工型)的量的方法。
在一个实施方式中,本文提供了确定SMSM化合物或其药学上可接受的盐是否调节RNA转录物的量的方法,其包括:(a)使细胞与SMSM化合物或其药学上可接受的盐接触,和(b)测定由该细胞产生的RNA转录物的量,其中在存在SMSM化合物或其药学上可接受的盐的情况下RNA转录物的量相对于在不存在SMSM化合物或其药学上可接受的盐或存在阴性对照(例如媒介物对照如PBS或DMSO)的情况下RNA转录物的量的改变指示SMSM化合物或其药学上可接受的盐调节RNA转录物的量。在一些实施方式中,本文提供了确定SMSM化合物或其药学上可接受的盐是否调节RNA转录物(例如mRNA转录物)的量的方法,其包括:(a)使第一细胞与SMSM化合物或其药学上可接受的盐接触,(b)使第二细胞与阴性对照(例如媒介物对照如PBS或DMSO);接触;和(c)测定由第一细胞以及第二细胞产生的RNA转录物的量;和(d)比较由第一细胞产生的RNA转录物的量与由第二细胞表达的RNA转录物的量,其中由第一细胞产生的RNA转录物的量相对于由第二细胞产生的RNA转录物的量的改变指示SMSM化合物或其药学上可接受的盐调节RNA转录物的量。在一些实施方式中,细胞与化合物的接触发生在细胞培养物中。在其他实施方式中,细胞与化合物的接触发生在受试者(例如非人动物受试者)中。在一些实施方式中,本文提供了确定SMSM化合物或其药学上可接受的盐是否调节RNA转录物(例如mRNA转录物)的剪接的方法,其包括:(a)在存在SMSM化合物或其药学上可接受的盐的情况下培养细胞;和(b)测定由该细胞产生的两种或更多种RNA转录物剪接变体的量,其中在存在化合物的情况下两种或更多种RNA转录物的量相对于在不存在化合物或存在阴性对照(例如媒介物对照如PBS或DMSO)的情况下两种或更多种RNA转录物剪接变体的量的改变指示SMSM化合物或其药学上可接受的盐调节RNA转录物的剪接。
在一些实施方式中,本文提供了确定SMSM化合物或其药学上可接受的盐是否调节RNA转录物(例如mRNA转录物)的剪接的方法,其包括:(a)在存在SMSM化合物或其药学上可接受的盐的情况下培养细胞;(b)特定时间段后自细胞分离两种或更多种RNA转录物剪接变体;和(c)测定由该细胞产生的两种或更多种RNA转录物剪接变体的量,其中在存在化合物的情况下两种或更多种RNA转录物的量相对于在不存在化合物或存在阴性对照(例如媒介物对照如PBS或DMSO)的情况下两种或更多种RNA转录物剪接变体的量的改变指示SMSM化合物或其药学上可接受的盐调节RNA转录物的剪接。在一些实施方式中,本文提供了确定SMSM化合物或其药学上可接受的盐是否调节RNA转录物(例如mRNA转录物)的剪接的方法,其包括:(a)在存在SMSM化合物或其药学上可接受的盐的情况下培养第一细胞;(b)在存在阴性对照(例如媒介物对照如PBS或DMSO)的情况下培养第二细胞;(c)分离由第一细胞产生的两种或更多种RNA转录物剪接变体并分离由第二细胞产生的两种或更多种RNA转录物剪接变体;(d)测定由第一细胞和第二细胞产生的两种或更多种RNA转录物剪接变体的量;和(e)将由第一细胞产生的两种或更多种RNA转录物剪接变体的量与由第二细胞产生的两种或更多种RNA转录物剪接变体的量进行比较,其中由第一细胞产生的两种或更多种RNA转录物剪接变体的量相对于由第二细胞产生的两种或更多种RNA转录物剪接变体的量的改变指示SMSM化合物或其药学上可接受的盐调节RNA转录物的剪接。
在一些实施方式中,本文提供了确定SMSM化合物或其药学上可接受的盐是否调节RNA转录物(例如mRNA转录物)的量的方法,其包括:(a)使不含细胞的系统与SMSM化合物或其药学上可接受的盐接触,和(b)测定由不含细胞的系统产生的RNA转录物的量,其中在存在化合物的情况下RNA转录物的量相对于在不存在化合物或存在阴性对照(例如媒介物对照如PBS或DMSO)的情况下RNA转录物的量的改变指示SMSM化合物或其药学上可接受的盐调节RNA转录物的量。在一些实施方式中,本文提供了确定SMSM化合物或其药学上可接受的盐是否调节RNA转录物(例如mRNA转录物)的量的方法,其包括:(a)使第一不含细胞的系统与SMSM化合物或其药学上可接受的盐接触,(b)使第二不含细胞的系统与阴性对照(例如媒介物对照如PBS或DMSO)接触;和(c)测定由第一不含细胞的系统以及第二不含细胞的系统产生的RNA转录物的量;和(d)将由第一不含细胞的系统产生的RNA转录物的量与由第二不含细胞的系统表达的RNA转录物的量进行比较,其中由第一不含细胞的系统产生的RNA转录物的量相对于由第二不含细胞的系统产生的RNA转录物的量的改变指示SMSM化合物或其药学上可接受的盐调节RNA转录物的量。在一些实施方式中,不含细胞的系统包括纯合成RNA,合成或重组(纯化)酶,和蛋白质因子。在其他实施方式中,不含细胞的系统包括转录自合成DNA模板的RNA,合成或重组(纯化)酶,和蛋白质因子。在其他实施方式中,不含细胞的系统包括纯合成RNA和核提取物。在其他实施方式中,不含细胞的系统包括转录自合成DNA模板的RNA和核提取物。在其他实施方式中,不含细胞的系统包括纯合成RNA和全细胞提取物。在其他实施方式中,不含细胞的系统包括转录自合成DNA模板的RNA和全细胞提取物。在一些实施方式中,不含细胞的系统另外包括调节性RNA(例如微RNA)。
在一些实施方式中,本文提供了确定SMSM化合物或其药学上可接受的盐是否调节RNA转录物(例如mRNA转录物)的剪接的方法,其包括:(a)使不含细胞的系统与SMSM化合物或其药学上可接受的盐接触;和(b)测定由不含细胞的系统产生的两种或更多种RNA转录物剪接变体的量,其中在存在化合物的情况下两种或更多种RNA转录物剪接变体的量相对于在不存在化合物或存在阴性对照(例如媒介物对照如PBS或DMSO)的情况下两种或更多种RNA转录物剪接变体的量的改变指示SMSM化合物或其药学上可接受的盐调节RNA转录物的剪接。在一些实施方式中,本文提供了确定SMSM化合物或其药学上可接受的盐是否调节RNA转录物(例如mRNA转录物)的剪接的方法,其包括:(a)使第一不含细胞的系统与SMSM化合物或其药学上可接受的盐接触;(b)使第二不含细胞的系统与阴性对照(例如媒介物对照如PBS或DMSO)接触;和(c)测定由第一不含细胞的系统以及第二不含细胞的系统产生的两种或更多种RNA转录物剪接变体的量;和(d)将由第一不含细胞的系统产生的两种或更多种RNA转录物剪接变体的量与由第二不含细胞的系统表达的RNA转录物的量进行比较,其中由第一不含细胞的系统产生的两种或更多种RNA转录物剪接变体的量相对于由第二不含细胞的系统产生的两种或更多种RNA转录物剪接变体的量的改变指示SMSM化合物或其药学上可接受的盐调节RNA转录物的剪接。在一些实施方式中,不含细胞的系统包括纯合成RNA,合成或重组(纯化)酶,和蛋白质因子。在其他实施方式中,不含细胞的系统包括转录自合成DNA模板的RNA,合成或重组(纯化)酶,和蛋白质因子。在其他实施方式中,不含细胞的系统包括纯合成RNA和核提取物。在其他实施方式中,不含细胞的系统包括转录自合成DNA模板的RNA和核提取物。在其他实施方式中,不含细胞的系统包括纯合成RNA和全细胞提取物。在其他实施方式中,不含细胞的系统包括转录自合成DNA模板的RNA和全细胞提取物。在一些实施方式中,不含细胞的系统另外包括调节性RNA(例如微RNA)。
在一些实施方式中,本文提供了确定SMSM化合物或其药学上可接受的盐是否调节RNA转录物(例如mRNA转录物)的量的方法,其包括:(a)在存在SMSM化合物或其药学上可接受的盐的情况下培养细胞,(b)在特定时段后自细胞分离RNA转录物;和(c)测定由细胞产生的RNA转录物的量,其中在存在化合物的情况下RNA转录物的量相对于在不存在化合物或存在阴性对照(例如媒介物对照如PBS或DMSO)的情况下RNA转录物的量的改变指示SMSM化合物或其药学上可接受的盐调节RNA转录物的量。在一些实施方式中,本文提供了确定SMSM化合物或其药学上可接受的盐是否调节RNA转录物(例如mRNA转录物)的量的方法,其包括(a)在存在SMSM化合物或其药学上可接受的盐的情况下培养第一细胞,(b)在存在阴性对照(例如媒介物对照如PBS或DMSO)的情况下培养第二细胞;(c)分离由第一细胞产生的RNA转录物并分离由第二细胞产生的RNA转录物;(d)测定由第一细胞以及第二细胞产生的RNA转录物的量;和(e)将由第一细胞产生的RNA转录物的量与由第二细胞产生的RNA转录物的量进行比较,其中由第一细胞产生的RNA转录物的量相对于由第二细胞产生的RNA转录物的量的改变指示SMSM化合物或其药学上可接受的盐调节RNA转录物的量。
在一些实施方式中,采用SMSM化合物或其药学上可接受的盐接触或培养的细胞是来自受试者的原代细胞。在一些实施方式中,采用SMSM化合物或其药学上可接受的盐接触或培养的细胞是来自患有疾病的受试者的原代细胞。在特定实施方式中,采用SMSM化合物或其药学上可接受的盐接触或培养的细胞是来自患有与特定基因的RNA转录物的异常量相关的疾病的受试者的原代细胞。在一些特定实施方式中,采用SMSM化合物或其药学上可接受的盐接触或培养的细胞是来自患有与特定基因的同工型的异常量相关的疾病的受试者的原代细胞。在一些实施方式中,采用SMSM化合物或其药学上可接受的盐接触或培养的细胞是成纤维细胞、免疫细胞或肌肉细胞。在一些实施方式中,采用SMSM化合物或其药学上可接受的盐接触或培养的细胞是患病细胞。
在一些实施方式中,采用SMSM化合物或其药学上可接受的盐接触或培养的细胞来自细胞系。在一些实施方式中,采用SMSM化合物或其药学上可接受的盐接触或培养的细胞是源自患有疾病的受试者的细胞系。在一些实施方式中,采用SMSM化合物或其药学上可接受的盐接触或培养的细胞是来自已知具有特定基因的异常RNA转录物水平的细胞系。在特定实施方式中,采用SMSM化合物或其药学上可接受的盐接触或培养的细胞来自源自患有已知具有特定基因的异常RNA转录物水平的疾病的受试者的细胞系。在一些实施方式中,采用SMSM化合物或其药学上可接受的盐接触或培养的细胞是患病细胞系。在一些特定实施方式中,采用SMSM化合物或其药学上可接受的盐接触或培养的细胞来自源自患有已知具有特定基因的RNA同工型和/或蛋白质同工型的异常量的疾病的受试者的细胞系。细胞系的非限制性实例包括293,3T3,4T1,721,9L,A2780,A172,A20,A253,A431,A-549,A-673,ALC,B 16,B35,BCP-1,BEAS-2B,bEnd.3,BHK,BR 293,BT20,BT483,BxPC3,C2C12,C3 h-10T1/2,C6/36,C6,Cal-27,CHO,COR-L23,COS,COV-434,CML Tl,CMT,CRL7030,CT26,D17,DH82,DU145,DuCaP,EL4,EM2,EM3,EMT6,FM3,H1299,H69,HB54,HB55,HCA2,HEK-293,HeLa,Hepalclc7,HL-60,HMEC,Hs578T,HsS78Bst,HT-29,HTB2,HUVEC,Jurkat,J558L,JY,K562,Ku812,KCL22,KG1,KYOl,LNCap,Ma-Mel,MC-38,MCF-7,MCF-IOA,MDA-MB-231,MDA-MB-468,MDA-MB-435,MDCK,MG63,MOR/0.2R,单-MAC 6,MRC5,MTD-1A,NCI-H69,NIH-3T3,NALM-1,NSO,NW-145,OPCN,OPCT,PNT-1A,PNT-2,Raji,RBL,RenCa,RIN-5F,RMA,Saos-2,Sf21,Sf9,SiHa,SKBR3,SKOV-3,T2,T-47D,T84,THP1,U373,U87,U937,VCaP,Vero,VERY,W138,WM39,WT-49,X63,YAC-1和YAR细胞。在一个实施方式中,细胞来自患者。
在一些实施方式中,进行剂量反应测定。在一个实施方式中,剂量反应测定包括:(a)使细胞与一定浓度的SMSM化合物或其药学上可接受的盐接触;(b)测定由细胞产生的RNA转录物的量,其中在存在化合物的情况下RNA转录物的量相对于在不存在化合物或存在阴性对照(例如媒介物对照如PBS或DMSO)的情况下RNA转录物的量的改变指示SMSM化合物或其药学上可接受的盐调节RNA转录物的量;(c)重复步骤(a)和(b),其中唯一改变的实验变量是化合物或其形式的浓度;和(d)比较由不同浓度的化合物或其形式产生的RNA转录物的量。在一些实施方式中,剂量反应测定包括:(a)在存在SMSM化合物或其药学上可接受的盐的情况下培养细胞;(b)在特定时段后自细胞分离RNA转录物;(c)测定由细胞产生的RNA转录物的量,其中在存在化合物的情况下RNA转录物的量相对于在不存在化合物或存在阴性对照(例如媒介物对照如PBS或DMSO)的情况下RNA转录物的量的改变指示SMSM化合物或其药学上可接受的盐调节RNA转录物的量;(d)重复步骤(a),(b)和(c),其中唯一改变的实验变量是化合物或其形式的浓度;和(e)比较由不同浓度的化合物或其形式产生的RNA转录物的量。在一些实施方式中,剂量反应测定包括:(a)使含有细胞的微量滴定板的每个孔与不同浓度的SMSM化合物或其药学上可接受的盐接触;(b)测定由每个孔中的细胞产生的RNA转录物的量;和(c)评估不同浓度的化合物或其形式下RNA转录物的量的改变。
在本文所述的一些实施方式中,采用SMSM化合物或其药学上可接受的盐接触或培养细胞,或采用SMSM化合物或其药学上可接受的盐或阴性对照接触组织样品15分钟,30分钟,45分钟,1小时,2小时,3小时,4小时,5小时,6小时,8小时,12小时,18小时,24小时,48小时,72小时或更长的时间。在本文所述的其他实施方式中,采用SMSM化合物或其药学上可接受的盐接触或培养细胞,或采用SMSM化合物或其药学上可接受的盐或阴性对照接触组织样品15分钟至1小时,1至2小时,2至4小时,6至12小时,12至18小时,12至24小时,28至24小时,24至48小时,48至72小时的时间。
在本文所述的一些实施方式中,采用一定浓度的SMSM化合物或其药学上可接受的盐接触或培养细胞,或采用一定浓度的SMSM化合物或其药学上可接受的盐接触组织样品,其中该浓度为0.01μΜ,0.05μΜ,1μΜ,2μΜ,5μΜ,10μΜ,15μΜ,20μΜ,25μΜ,50μΜ,75μΜ,100μΜ或150μΜ。在本文所述的其他实施方式中,采用一定浓度的SMSM化合物或其药学上可接受的盐接触或培养细胞,或采用一定浓度的SMSM化合物或其药学上可接受的盐接触组织样品,其中该浓度为175μΜ,200μΜ,250μΜ,275μΜ,300μΜ,350μΜ,400μΜ,450μΜ,500μΜ,550μΜ600μΜ,650μΜ,700μΜ,750μΜ,800μΜ,850μΜ,900μΜ,950μΜ或1mM。在本文所述的一些实施方式中,采用一定浓度的SMSM化合物或其药学上可接受的盐接触或培养细胞,或采用一定浓度的SMSM化合物或其药学上可接受的盐接触组织样品,其中该浓度为5nM,10nM,20nM,30nM,40nM,50nM,60nM,70nM,80nM,90nM,100nM,150nM,200nM,250nM,300nM,350nM,400nM,450nM,500nM,550nM,600nM,650nM,700nM,750nM,800nM,850nM,900nM或950nM。在本文所述的一些实施方式中,采用一定浓度的SMSM化合物或其药学上可接受的盐接触或培养细胞,或采用一定浓度的SMSM化合物或其药学上可接受的盐接触组织样品,其中该浓度在0.01μΜ至0.1μΜ,0.1μΜ至1μΜ,1μΜ至50μΜ,50μΜ至100μΜ,100μΜ至500μΜ,500μΜ至1nM,1nM至10nM,10nM至50nM,50nM至100nM,100nM至500nM,500nM至1000nM之间。
本领域技术人员已知的技术可以用于确定RNA转录物的量。在一些实施方式中,使用深度测序测量一种、两种、三种或更多种RNA转录物的量,所述深度测序例如RNASeq,/>下一代测序(NGS),ION TORRENTTM RNA下一代测序,454TM焦磷酸测序或寡核苷酸连接检测测序(SOLIDTM)。在其他实施方式中,使用一种外显子阵列(例如/>人类外显子阵列)测量多种RNA转录物的量。在一些实施方式中,通过RT-PCR测定一种、两种、三种或更多种RNA转录物的量。在其他实施方式中,通过RT-qPCR测量一种、两种、三种或更多种RNA转录物的量。进行这些测定的技术是本领域技术人员已知的。
在一些实施方式中,针对用于测量RNA转录物的测定数据进行统计分析或其他分析。在一些实施方式中,针对用于测量RNA转录物的测定数据进行学生t检验统计分析以确定在存在化合物的情况下相对于在不存在化合物或存在阴性对照的情况下其量发生改变的那些RNA转录物。在特定实施方式中,那些具有改变的RNA转录物的学生t检验值为10%,5%,4%,3%,2%,1%,0.5%或0.1%。在一些特定实施方式中,那些具有改变的RNA转录物的p值为10%,5%,4%,3%,2%,1%,0.5%或0.1%。在某些特定实施方式中,那些具有改变的RNA转录物的的学生t检验和p值分别为10%,5%,4%,3%,2%,1%,0.5%或0.1%和10%,5%,4%,3%,2%,1%,0.5%或0.1%。
在一些实施方式中,进行进一步的分析以确定SMSM化合物或其药学上可接受的盐如何改变RNA转录物的量。在特定实施方式中,进行进一步的分析以确定在存在SMSM化合物或其药学上可接受的盐的情况下RNA转录物的量相对于在不存在该化合物或其形式或存在阴性对照的情况下RNA转录物的量的改变是否是由于RNA转录物的转录、剪接和/或稳定性的变化。可以使用本领域技术人员已知的技术来确定SMSM化合物或其药学上可接受的盐是否改变了例如RNA转录物的转录、剪接和/或稳定性。
在一些实施方式中,一种或多种RNA转录物的稳定性的测定是通过基因表达的序列分析(SAGE),差异显示分析(DD),RNA任意引物(RAP)-PCR,差异表达序列的限制性内切酶水解分析(READS),扩增限制性片段长度多态性(ALFP),总基因表达分析(TOGA),RT-PCR,RT-qPCR,高密度cDNA滤膜杂交分析(HDFCA),抑制消减杂交(SSH),差异筛选(DS),cDNA阵列,寡核苷酸芯片或组织微阵列。在其他实施方式中,一种或多种RNA转录物的稳定性的测定是通过Northern印迹,RNase保护或狭缝印迹。
在一些实施方式中,在采用转录抑制剂如鹅膏菌素(a-amanitin),DRB,黄酮吡醇,雷公藤甲素或放线菌素D接触或培养细胞或组织样品前(例如,5分钟,10分钟,30分钟,1消失,2小时,4小时,6小时,8小时,12小时,18小时,24小时,36小时,48小时或72小时前)或后(例如,5分钟,10分钟,30分钟,1小时,2小时,4小时,6小时,8小时,12小时,18小时,24小时,36小时,48小时或72小时后)抑制该细胞或组织样品中的转录。在其他实施方式中,采用转录抑制剂如鹅膏菌素,DRB,黄酮吡醇,雷公藤甲素或放线菌素D抑制细胞或组织样品中的转录,同时采用SMSM化合物或其药学上可接受的盐接触或培养该细胞或组织样品。
在一些实施方式中,通过核运行分析或体外转录起始和延伸分析来确定一种或多种RNA转录物的转录水平。在一些实施方式中,转录的检测是基于放射性或荧光的测量。在一些实施方式中,使用基于PCR的扩增步骤。
在一些实施方式中,测量特定基因的RNA转录物的选择性剪接形式的量,以观察该基因的RNA转录物的一种、两种或多种选择性剪接形式的量是否存在改变。在一些实施方式中,测量由特定基因编码的同工型的量,以观察该同工型的量是否存在改变。在一些实施方式中,通过RT-PCR,RT-qPCR或northern印迹定量RNA的剪接形式的水平。在其他实施方式中,可以使用序列特异性技术检测个体剪接形式的水平。在一些实施方式中,使用核提取物在体外测量剪接。在一些实施方式中,检测是基于测量放射性或荧光。可以使用本领域技术人员已知的技术来测量基因的RNA转录物的选择性剪接形式的量的改变和基因编码的同工型的量的改变。
生物样品
可以从受试者获取样品,例如生物样品,并进行检查以确定受试者是否产生经受选择性剪接的mRNA。生物样品可以包括多个生物样品。多个生物样品可以包括两个或更多个生物样品;例如,约2-1000,2-500,2-250,2-100,2-75,2-50,2-25,2-10,10-1000,10-500,10-250,10-100,10-75,10-50,10-25,25-1000,25-500,25-250,25-100,25-75,25-50,50-1000,50-500,50-250,50-100,50-75,60-70,100-1000,100-500,100-250,250-1000,250-500,500-1000,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16,17,18,19,20,21,22,23,24,25,30,35,40,45,50,51,52,53,54,55,56,57,58,59,60,61,62,63,64,65,66,67,68,69,70,71,72,73,74,75,76,77,78,79,80,81,82,83,84,85,90,95,100,110,120,130,140,150,160,170,180,190,200,210,220,230,240,250,275,300,325,350,375,400,425,450,475,500,550,600,650,700,750,800,850,900,950,1000或更多生物样品。生物样品可以获得自多个受试者,给出多个样品组。生物样品可以获得自约2至约1000个受试者或更多;例如,约2-1000,2-500,2-250,2-100,2-50,2-25,2-20,2-10,10-1000,10-500,10-250,10-100,10-50,10-25,10-20,15-20,25-1000,25-500,25-250,25-100,25-50,50-1000,50-500,50-250,50-100,100-1000,100-500,100-250,250-1000,250-500,500-1000或至少2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16,17,18,19,20,21,22,23,24,25,30,35,40,45,50,55,60,65,68,70,75,80,85,90,95,100,110,120,130,140,150,160,170,180,190,200,210,220,230,240,250,275,300,325,350,375,400,425,450,475,500,550,600,650,700,750,800,850,900,950至1000或更多个受试者。
生物样品可以获得自人类受试者。生物样品可以获得自不同年龄的人类受试者。人类受试者可以是产前(例如胎儿)、儿童(例如新生儿、婴儿、学步儿童、青春期前)、青少年、青春期或成人(例如,早期成年人,中年成年人,老年人)。人类受试者的年龄可以在约0个月和约120岁之间,或更大。人类受试者的年龄可在约0和约12个月之间;例如,约1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11或12个月大。人类受试者的年龄可在0和12岁之间;例如,约0和30天之间;约1个月和12个月之间;约1岁和3岁之间;约4岁和5岁之间;约4岁和12岁之间;约1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11或12岁。人类受试者的年龄可在约13岁和19岁之间;例如,约13,14,15,16,17,18或19岁。人类受试者的年龄可在约20岁和约39岁之间;例如,约20,21,22,23,24,25,26,27,28,29,30,31,32,33,34,35,36,37,38或39岁。人类受试者的年龄可在约40岁和约59岁之间;例如,约40,41,42,43,44,45,46,47,48,49,50,51,52,53,54,55,56,57,58或59岁。人类受试者的年龄可大于59岁;例如,约60,61,62,63,64,65,66,67,68,69,70,71,72,73,74,75,76,77,78,79,80,81,82,83,84,85,86,87,88,89,90,91,92,93,94,95,96,97,98,99,100,101,102,103,104,105,106,107,108,109,110,111,112,113,114,115,116,117,118,119或120岁。人类受试者可包括活着的受试者或已故的受试者。人类受试者可包括男性受试者和/或女性受试者。
可从允许确定基因表达水平的任何合适来源获得生物样品,例如,获得自细胞、组织、体液或分泌物或自其衍生的基因表达产物(例如核酸,例如DNA或RNA;多肽,例如蛋白质或蛋白质片段)。生物样品的性质可以取决于受试者的性质。如果生物样品来自具有未分化组织的单细胞生物或多细胞生物的受试者,则该生物样品可以包含细胞,例如细胞培养物样品,生物切除物或整个生物。如果生物样品来自多细胞生物,则该生物样品可以是组织样品、液体样品或分泌物。
生物样品可获自不同的组织。术语组织意在包括具有共同发育起源并且具有相似或相同功能的细胞集合。术语组织还意在涵盖器官,其可以是起源可能不同的细胞的功能分组和组织。可以从任何组织获得生物样品。来自植物的合适组织可以包括但不限于表皮组织,例如叶子的外表面;维管组织例如木质部和韧皮部,以及基本组织。合适的植物组织还可以包括叶,根,根尖,茎,花,种子,锥,新枝,球果,花粉或其一部分或组合。
生物样品可获得自来自一种或多种人类或非人类动物的不同组织样品。合适的组织可以包括结缔组织,肌肉组织,神经组织,上皮组织或它们的一部分或组合。合适的组织还可以包括全部或部分肺,心脏,血管(例如,动脉、静脉、毛细血管),唾液腺,食道,胃,肝脏,胆囊,胰腺,结肠,直肠,肛门,下丘脑,垂体腺,松果体,甲状腺,甲状旁腺,肾上腺,肾脏,输尿管,膀胱,尿道,淋巴结,扁桃体,腺样体,胸腺,脾脏,皮肤,肌肉,脑,脊髓,神经,卵巢,输卵管,子宫,阴道组织,乳腺,睾丸,输精管,精囊,前列腺,阴茎组织,咽,喉,气管,支气管,横膈膜,骨髓,毛囊或其组合。来自人类或非人类动物的生物样品还可包括体液,分泌物或排泄物;例如,生物样品可以是以下的样品:房水,玻璃体,胆汁,血液,血清,母乳,脑脊液,内淋巴,外淋巴,女性射精,羊水,胃液,月经,粘液,腹膜液,胸水,唾液,皮脂,精液,汗液,眼泪,阴道分泌物,呕吐物,尿液,粪便或其组合。生物样品可以来自健康组织,患病组织,疑似患病疾病组织或其组合。
在一些实施方式中,生物样品是液体样品,例如血液,血清,痰,尿,精液或其他生物液体的样品。在某些实施方式中,样品是血液样品。在一些实施方式中,生物样品是组织样品,例如用于确定组织中疾病存在或不存在的组织样品。在某些实施方式中,样品是甲状腺组织的样品。
可以从处于疾病进展的不同阶段或不同状况的受试者获得生物样品。疾病进展的不同阶段或不同状况可以包括健康、原发症状发作、继发症状发作、三级症状发作、原发症状过程期间、继发症状过程期间、三级症状过程期间,原发症状的末尾,继发症状的末尾,三级症状的末尾,原发症状的末尾后,继发症状的末尾后,三级症状的末尾后或其组合。疾病进展的不同阶段可能是在被诊断或怀疑患有某种疾病之后的一段时间;例如,被诊断或怀疑患有某种疾病之后至少约或至少1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16,17,18,19,20,21,22,23或24小时;1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16,17,18,19,20,21,22,23,24,25,26,27或28天;1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16,17,18,19或20周;1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11或12个月;1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16,17,18,19,20,21,22,23,24,25,26,27,28,29,30,31,32,33,34,35,36,37,38,39,40,41,42,43,44,45,46,47,48,49或50年。疾病进展的不同阶段或不同状况可以包括在一个动作或状态之前、之中或之后;例如,药物治疗,手术治疗,程序治疗,执行标准护理程序,休息,睡觉,饮食,禁食,行走,奔跑,执行认知任务,性活动,思考,跳跃,排尿,放松,不动,精神受挫,震惊等。
本公开的方法提供了对来自受试者或一组受试者的生物样品的分析。受试者可以是例如任何动物(例如哺乳动物),包括但不限于人类、非人灵长类、啮齿动物、狗、猫、猪、鱼等。如本文所述,本发明的方法和组合物可以应用于来自人类的生物样品。
生物样品可以通过本领域已知的方法获得,例如本文提供的活检方法,擦拭,刮擦,放血或任何其他合适的方法。可以使用本公开的试剂盒的组分获得、存储或运输生物样品。在某些情况下,可以根据本公开的方法获得多个生物样品,例如多个甲状腺样品,以进行分析、表征或诊断。在某些情况下,可以通过本公开的方法获得多种生物样品,例如来自一种组织类型(例如甲状腺)的一个或多个样品和来自另一种组织类型(例如颊部)的一个或多个样品,以进行诊断或表征。在某些情况下,可以在相同或不同的时间获得多个样本,例如来自一种组织类型(例如甲状腺)的一个或多个样本以及来自另一组织(例如颊部)的一个或多个样本。在某些情况下,在不同时间获得的样本将通过不同的方法进行存储和/或分析。例如,可以获得样品并通过细胞学分析(例如,使用常规染色)进行分析。在某些情况下,可以根据细胞学分析结果从受试者中获得其他样品。癌症或其他疾病的诊断可以包括由医师、护士或其他医学专家对受试者的检查。该检查可以是常规检查的一部分,也可以是由于特定的不适引起的,包括但不限于以下一项:疼痛,疾病,疾病预期,有可疑的肿块或团块,疾病或病症。受试者可能知道或可能不知道该疾病或病症。医学专业人员可以获取生物样品进行测试。在某些情况下,医学专业人员可以将受试者转诊至测试中心或实验室以提交生物样品。本文提供的获取方法包括活检方法,包括细针穿刺,芯针活检,真空辅助活检,切口活检,切除活检,穿孔活检,刮取活检或皮肤活检。在某些情况下,本文提供的方法和组合物仅适用于通过FNA获得的生物样品的数据。在某些情况下,本文提供的方法和组合物仅适用于通过通过FNA或手术活检获得的生物样品的数据。在某些情况下,本文提供的方法和组合物仅适用于通过手术活检获得的生物样品的数据。可以通过非侵入性方法获得生物样品,这些方法包括但不限于:刮擦皮肤或子宫颈,擦拭脸颊,唾液采集,尿液采集,粪便采集,月经、泪液或精液采集。生物样品可以通过侵入性方法获得,这些方法包括但不限于:活检,肺泡或肺灌洗,针吸或放血。活检方法可以进一步包括切开活检,切除活检,穿孔活检,刮取活检或皮肤活检。针吸的方法还可以包括细针穿刺,芯针活检,真空辅助活检或大芯针活检。可以通过本文的方法获得多种生物样品,以确保足够量的生物材料。获得合适的甲状腺样品的方法在本领域中是已知的,并且在ATA甲状腺结节管理指南(Cooper等ThyroidVol.16No.2 2006)中作了进一步描述,其在此通过引用整体并入。获得生物样品的通用方法在本领域中也是已知的,并且在例如Ramzy,Ibrahim Clinical Cytopathology andAspiration Biopsy 2001中进一步描述,其在此通过引用整体并入。生物样品可以是甲状腺结节或疑似甲状腺肿瘤的细针抽吸物。细针抽吸取样过程可以通过使用超声波、X射线或其他成像设备进行指导。
在某些情况下,可以将该受试者转介给专家,例如肿瘤学家、外科医生或内分泌学家以进行进一步诊断。专家同样可以获取生物样品进行测试,或将个体转介至测试中心或实验室以提交生物样品。在任何情况下,都可以由医师、护士或其他医学专业人员(例如,医疗技术人员、内分泌学家、细胞学家、抽血员、放射医师或肺科医生)获取生物样品。医疗专业人员可以指示对样品执行的适当测试或测定,或者本公开的分子谱分析业务可以咨询最合适指示哪些测定或测试。分子谱分析业务可以向个人或其医疗或保险提供商收取咨询工作、样品采集和/或存储、材料或所提供的所有产品和服务的费用。
医学专业人员无需参与初始诊断或样本采集。个体也可以通过使用非处方试剂盒获得样品。试剂盒可包含用于获得如本文所述样品的装置,用于存储样品以进行检查的装置以及正确使用试剂盒的说明。在某些情况下,购买试剂盒的价格中包含了分子谱分析服务。在其他情况下,分子谱分析服务则单独收费。
适用于分子谱分析业务的生物样品可以是包含待测试个体的组织,细胞,核酸,基因,基因片段,表达产物,基因表达产物和/或基因表达产物片段的任何物质。提供了确定样品适用性和/或充分性的方法。生物样品可以包括但不限于组织、细胞和/或来自细胞或源自个体细胞的生物材料。样品可以是细胞或组织的异质或同质群体。可以使用本领域已知的可以提供适合于本文所述的分析方法的样品的任何方法获得生物样品。
可以通过使用试剂盒来辅助获得生物样品。可以提供试剂盒,其包含用于获取、存储和/或运输生物样品的材料。该试剂盒可以包含例如用于收集生物样品的材料和/或仪器(例如无菌拭子、无菌棉、消毒剂、针、注射器、解剖刀、麻醉棉签、刀、刮匙刀片,液氮等)。该试剂盒可包含例如用于存储和/或保存生物样品的材料和/或仪器(例如,容器;用于温度控制的材料,例如冰、冰袋、冷袋、干冰、液氮;化学防腐剂或缓冲剂如甲醛、福尔马林、低聚甲醛、戊二醛、醇类如乙醇或甲醇、丙酮、乙酸、HOPE固定剂(Hepes-谷氨酸缓冲液介导的有机溶剂保护作用)、肝素、盐水、磷酸盐缓冲盐水、TAPS、Bicine、Tris、Tricine、TAPSO、HEPES、TES、MOPS、PIPES、二甲胂酸盐、SSC、MES、磷酸盐缓冲液;蛋白酶抑制剂如抑肽酶、抑氨肽酶、钙蛋白酶抑制剂I和II、抑糜朊酶素、E-64、亮肽素、α-2-巨球蛋白、Pefabloc SC、胃酶抑素、苯基甲烷磺酰氟、胰蛋白酶抑制剂;DNAse抑制剂如2-巯基乙醇、2-硝基-5-氰基苯甲酸(2-nitro-5-thicyanobenzoic acid)、钙、EGTA、EDTA、十二烷基硫酸钠、碘乙酸盐等;RNAse抑制剂如核糖核酸酶抑制剂蛋白;双蒸水;用水处理的DEPC(焦碳酸二乙酯)等。该试剂盒可包含使用说明。该试剂盒可以作为用于运输的合适容器提供或含有用于运输的合适容器。运输容器可以是隔热容器。运输容器可以自行寻址至采集代理(例如实验室、医疗中心、基因检测公司等)。试剂盒可以提供给受试者在家中使用或由医疗专业人员使用。另外,试剂盒可直接提供给医疗专业人员。
可以从给定的受试者获得一个或多个生物样品。在某些情况下,从给定的受试者中获得约1和约50个之间的生物学样品;例如,可以从给定的受试者获得约1-50,1-40,1-30,1-25,1-20,1-15,1-10,1-7,1-5,5-50,5-40,5-30,5-25,5-15,5-10,10-50,10-40,10-25,10-20,25-50,25-40或至少1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16,17,18,19,20,21,22,23,24,25,26,27,28,29,30,31,32,33,34,35,36,37,38,39,40,41,42,43,44,45,46,47,48,49或50个生物样品。来自给定受试者的多个生物样品可以获得自同一来源(例如,同一组织),例如,多个血液样品或多个组织样品,或获得自多个来源(例如,多个组织)。可以在相同时间或在不同时间获得来自给定受试者的多个生物样品。可以在相同条件或在不同条件下获得来自给定受试者的多个生物样品。可以在受试者的相同疾病进展或不同疾病进展下获得来自给定受试者的多个生物样品。如果从特定受试者的同一来源(例如同一组织)采集多个生物样品,则可以将这些样品合并为单一样品。以这种方式组合样品可以确保获得足够的材料用于测试和/或分析。
实施例
提供这些示例仅出于说明目的,并且不限制本文提供的权利要求的范围。用于合成本文所述化合物的起始原料和试剂可以合成或从商业来源获得,所述商业来源例如但不限于,Sigma-Aldrich、Acros Organics、Fluka和Fischer Scientific。
实施例1:2-(6-(环丙基(2,2,6,6-四甲基哌啶-4-基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(1H-吡 唑-4-基)苯酚
步骤1:合成6-氯-N-(2,2,6,6-四甲基哌啶-4-基)哒嗪-3-胺
将2,2,6,6-四甲基哌啶-4-胺(2.1g,14.1mmol),3,6-二氯哒嗪(2g,12.8mmol)和二异丙基乙胺(3.6g,28.2mmol)在50mL正丁醇中的混合物在120℃下搅拌4h。将混合物浓缩并加入乙酸乙酯(60mL)。将所得混合物用10mL H2O洗涤,浓缩并在乙酸乙酯/石油醚中磨碎,其得到2.3g白色固体状的6-氯-N-(2,2,6,6-四甲基哌啶-4-基)哒嗪-3-胺(67%收率)。LCMS:m/z 269.2[M+H]+;tR=1.46分钟。
步骤2:合成6-氯-N-环丙基-N-(2,2,6,6-四甲基哌啶-4-基)哒嗪-3-胺
将6-氯-N-(2,2,6,6-四甲基哌啶-4-基)哒嗪-3-胺(400mg,1.5mmol),环丙基硼酸(387mg,4.5mmol),Cu(OAc)2(273mg,1.5mmol),Na2CO3(318mg,3mmol)和三乙胺(303mg,3mmol)在10mL 1,2-二氯乙烷中的混合物在室温下搅拌16h。将混合物过滤,浓缩并通过硅胶柱(甲醇/二氯甲烷=0-20%)纯化,其得到210mg黑色固体状的6-氯-N-环丙基-N-(2,2,6,6-四甲基哌啶-4-基)哒嗪-3-胺(34%收率)。LCMS:m/z 309.2[M+H]+;tR=1.77分钟。
步骤3:合成6-(4-氯-2-甲氧基苯基)-N-环丙基-N-(2,2,6,6-四甲基哌啶-4-基)哒嗪-3-胺
将6-氯-N-环丙基-N-(2,2,6,6-四甲基哌啶-4-基)哒嗪-3-胺(160mg,0.52mmol),4-氯-2-甲氧基苯基硼酸(106mg,0.57mmol),[1,1′-双(二苯基膦)二茂铁]二氯化钯(II)(42mg,0.05mmol)和K2CO3(144mg,1.04mmol)在3mL 1,4-二噁烷和0.3mL水中的混合物脱气并在氮气氛和105℃下搅拌8h。然后将混合物浓缩并通过硅胶色谱(0-20%甲醇/二氯甲烷)纯化,其得到150mg黑色固体状的6-(4-氯-2-甲氧基苯基)-N-环丙基-N-(2,2,6,6-四甲基哌啶-4-基)哒嗪-3-胺(53%收率)。LCMS:m/z 415.1[M+H]+;tR=1.51分钟。
步骤4:合成N-环丙基-6-(2-甲氧基-4-(1H-吡唑-4-基)苯基)-N-(2,2,6,6-四甲基哌啶-4-基)哒嗪-3-胺
将6-(4-氯-2-甲氧基苯基)-N-环丙基-N-(2,2,6,6-四甲基哌啶-4-基)哒嗪-3-胺(110mg,0.27mmol),4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼-2-基)-1H-吡唑(78mg,0.4mmol),1,1′-双(二苯基膦)二茂铁]二氯化钯(II)(22mg,0.03mmol)和K2CO3(73mg,0.53mmol)在4mL 1,4-二噁烷和0.4mL水中的混合物用氮气吹扫并密封。将混合物在130℃和微波辐射下搅拌2h,浓缩并通过硅胶色谱(0-20%MeOH/CH2Cl2)纯化,其得到100mg白色固体状的N-环丙基-6-(2-甲氧基-4-(1H-吡唑-4-基)苯基)-N-(2,2,6,6-四甲基哌啶-4-基)哒嗪-3-胺(25%收率)。LCMS:m/z 447.3[M+H]+;tR=1.78分钟。
步骤5:合成标题化合物,2-(6-(环丙基(2,2,6,6-四甲基哌啶-4-基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(1H-吡唑-4-基)苯酚
将N-环丙基-6-(2-甲氧基-4-(1H-吡唑-4-基)苯基)-N-(2,2,6,6-四甲基哌啶-4-基)哒嗪-3-胺(80mg,0.18mmol)和乙硫醇钠(30mg,0.36mmol)的混合物溶于N-甲基-2-吡咯烷酮(2mL)中。将混合物在185℃下搅拌8h。冷却至室温后,将混合物通过反相HPLC纯化,其得到33mg黄色固体状的2-(6-(环丙基(2,2,6,6-四甲基哌啶-4-基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(1H-吡唑-4-基)苯酚(34%收率)。
实施例2:合成2-(6-(((1R,3s,5S)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒 嗪-3-基)-5-(1H-吡唑-4-基)苯酚
步骤1:合成(1R,3S,5S)-3-((6-氯哒嗪-3-基)氨基)-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯
将(1R,3S,5S)-3-氨基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯(400mg,1.77mmol),3,6-二氯哒嗪(489mg,3.28mmol)和DIPEA(652mg,5.1mmol)在4mL DMSO中的混合物在120℃下搅拌18h。冷却至室温后,将混合物用10mL水淬灭,用EtOAc(20mL X 3)萃取。将合并的有机溶剂用水(10mL)洗涤,浓缩并通过硅胶柱(5-80%EtOAc/石油醚)纯化,其得到320mg白色固体状的(1R,3S,5S)-3-((6-氯哒嗪-3-基)氨基)-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯(53%收率)。LCMS:m/z 339.2[M+H]+;tR=1.41分钟。
步骤2:合成(1R,3s,5S)-3-((6-氯哒嗪-3-基)(甲基)氨基)-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯
0℃下将氢化钠(89mg,2.23mmol,60%于矿物油中)加至(1R,3S,5S)-3-((6-氯哒嗪-3-基)氨基)-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯(300mg,0.89mmol)在4mL DMF中的搅拌溶液中。在0℃下搅拌40分钟后,加入碘甲烷(253mg,1.78mmol)。然后使混合物升温至室温并搅拌2h。将混合物用水(10mL)淬灭,用EtOAc(30mL X 3)萃取,浓缩并通过硅胶柱(5-60%EtOAc/石油醚)纯化,其得到300mg白色固体状的(1R,3s,5S)-3-((6-氯哒嗪-3-基)(甲基)氨基)-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯(96%收率)。LCMS:m/z 353.0[M+H]+;tR=1.43分钟。
步骤3:合成(1R,3s,5S)-3-((6-(4-氯-2-甲氧基苯基)哒嗪-3-基)(甲基)氨基)-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯
将(1R,3s,5S)-3-((6-氯哒嗪-3-基)(甲基)氨基)-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯(300mg,0.85mmol),4-氯-2-甲氧基苯基硼酸(158mg,0.85mmol),Pd(dppf)Cl2(78mg,0.1mmol)和K2CO3(265mg,1.92mmol)在4mL 1,4-二噁烷和0.4mL水中的混合物脱气并在氮气氛和105℃下搅拌6h。然后将混合物浓缩并通过硅胶色谱(5-60%EtOAc/石油醚)纯化,其得到130mg白色固体状的(1R,3s,5S)-3-((6-(4-氯-2-甲氧基苯基)哒嗪-3-基)(甲基)氨基)-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯(34%收率)。LCMS:m/z 459.1[M+H]+;tR=1.64分钟。
步骤4:合成(1R,3s,5S)-3-((6-(2-甲氧基-4-(1H-吡唑-4-基)苯基)哒嗪-3-基)(甲基)氨基)-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯
将(1R,3s,5S)-3-((6-(4-氯-2-甲氧基苯基)哒嗪-3-基)(甲基)氨基)-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯(130mg,0.28mmol),4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼-2-基)-1H-吡唑(66mg,0.34mmol),Pd(dppf)Cl2(20mg,0.028mmol)和K2CO3(77mg,0.56mmol)在2mL 1,4-二噁烷和0.4mL水中的混合物用氮气吹扫并密封。将混合物在130℃以及MW下搅拌2h,浓缩并通过硅胶色谱(0-50%MeOH/CH2Cl2)纯化,其得到120mg白色固体状的(1R,3s,5S)-3-((6-(2-甲氧基-4-(1H-吡唑-4-基)苯基)哒嗪-3-基)(甲基)氨基)-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯(87%收率)。LCMS:m/z 491.3[M+H]+;tR=1.98分钟。
步骤5:合成(1R,3s,5S)-3-((6-(2-羟基-4-(1H-吡唑-4-基)苯基)哒嗪-3-基)(甲基)氨基)-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯
将(1R,3s,5S)-3-((6-(2-甲氧基-4-(1H-吡唑-4-基)苯基)哒嗪-3-基)(甲基)氨基)-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯(120mg,0.24mmol)和EtSNa(41mg,0.48mmol)的混合物溶于NMP(2mL)中。将混合物在180℃下搅拌6h。冷却至室温后,将混合物通过反相HPLC(NH4)2CO3纯化,其得到70mg黄色固体状的(1R,3s,5S)-3-((6-(2-羟基-4-(1H-吡唑-4-基)苯基)哒嗪-3-基)(甲基)氨基)-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯(61%收率)。LCMS:m/z 477.2[M+H]+;tR=1.58分钟。
步骤6:合成标题化合物:2-(6-(((1R,3s,5S)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(1H-吡唑-4-基)苯酚
室温下将2ml 4N氯化氢在二噁烷中的溶液加至(1R,3s,5S)-3-((6-(2-羟基-4-(1H-吡唑-4-基)苯基)哒嗪-3-基)(甲基)氨基)-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯(70mg,0.15mmol)在1mL CH2Cl2中的溶液。在室温下搅拌1h后,将混合物浓缩,用氢氧化铵中和并通过制备型HPLC(NH4HCO3)纯化,其得到36mg黄色固体状的2-(6-(((1R,3s,5S)-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(1H-吡唑-4-基)苯酚(45%收率)。
实施例3:合成2-(6-(((1R,3s,5S)-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-基)(甲基)氨基)哒 嗪-3-基)-5-(1H-吡唑-4-基)苯酚
步骤1:合成(1R,3s,5S)-3-((6-氯哒嗪-3-基)氨基)-9-氮杂双环[3.3.1]壬烷-9-羧酸叔丁酯
将(1R,3s,5S)-3-氨基-9-氮杂双环[3.3.1]壬烷-9-羧酸叔丁酯(2.5g,10.42mmol),3,6-二氯哒嗪(2.02g,13.55mmol)和DIPEA(2.96g,22.92mmol)在50mL DMSO中的混合物在120℃下搅拌6h。将混合物冷却至室温,用H2O淬灭并用乙酸乙酯(160mL X 3)萃取。将合并的有机层用盐水洗涤,经无水Na2SO4干燥并在减压下浓缩.除去溶剂后,将粗产物通过硅胶柱(50%EtOAc/石油醚)纯化,其得到2.3g黄色固体状的(1R,3s,5S)-3-((6-氯哒嗪-3-基)氨基)-9-氮杂双环[3.3.1]壬烷-9-羧酸叔丁酯(收率:63%)。LCMS:m/z 353.2[M+H]+;tR=1.93分钟。
步骤2:合成(1R,3s,5S)-3-((6-氯哒嗪-3-基)(甲基)氨基)-9-氮杂双环[3.3.1]壬烷-9-羧酸叔丁酯
0℃下将氢化钠(784mg,19.60mmol,60%于矿物油中)加至(1R,3s,5S)-3-((6-氯哒嗪-3-基)氨基)-9-氮杂双环[3.3.1]壬烷-9-羧酸叔丁酯(2.3g,6.54mmol)在40mL DMF中的搅拌溶液中。在0℃下搅拌20分钟后,加入CH3I(1.9g,13.08mmol)。然后将混合物在室温下搅拌1h,用H2O淬灭并用EtOAc(80mL X 3)萃取。将合并的有机相用盐水洗涤,经无水Na2SO4干燥,在减压下浓缩并通过硅胶柱(50%EtOAc/石油醚)纯化,其得到2.0g黄色固体状的(1R,3s,5S)-3-((6-氯哒嗪-3-基)(甲基)氨基)-9-氮杂双环[3.3.1]壬烷-9-羧酸叔丁酯(84%收率)。LCMS:m/z 367.2[M+H]+;tR=2.11分钟。
步骤3:合成1-溴-4-碘-2-(甲氧基甲氧基)苯
0℃下将溴甲基甲醚(1.25g,10mmol)加至2-溴-5-碘苯酚(1.5g,5mmol)和K2CO3(1.38g,10mmol)在20mL DMF中的搅拌溶液中。然后将混合物在室温下搅拌16h,用20mL H2O淬灭并用EtOAc(20mL X 3)萃取。将合并的有机溶剂经无水Na2SO4干燥,浓缩并通过硅胶柱(0-5%EtOAc/石油醚)纯化,其得到1.45g无色液体状的1-溴-4-碘-2-(甲氧基甲氧基)苯(79%收率)。LCMS:tR=1.50分钟。
步骤4:合成4-(4-溴-3-(甲氧基甲氧基)苯基)-1-(四氢-2H-吡喃-2-基)-1H-吡唑.
将1-溴-4-碘-2-(甲氧基甲氧基)苯(3.3g,9.6mmol),1-(四氢-2H-吡喃-2-基)-4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼-2-基)-1H-吡唑(2.67g,9.6mmol),Pd(dppf)Cl2(866mg,1mmol)和K2CO3(2.66g,19.3mmol)在40mL二噁烷和4mL H2O中的混合物脱气并在105℃下搅拌8h。冷却至室温后,将混合物用EtOAc(30mL X 3)萃取。将合并的有机溶剂浓缩并通过硅胶柱(10-50%EtOAc/石油醚)纯化,其得到2.5g无色油状的4-(4-溴-3-(甲氧基甲氧基)苯基)-1-(四氢-2H-吡喃-2-基)-1H-吡唑(69%收率)。LCMS:m/z 367.1[M+H]+;tR=2.03分钟。
步骤5:合成4-(3-(甲氧基甲氧基)-4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼-2-基)苯基)-1-(四氢-2H-吡喃-2-基)-1H-吡唑.
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将4-(4-溴-3-(甲氧基甲氧基)苯基)-1-(四氢-2H-吡喃-2-基)-1H-吡唑(1.5g,4.1mmol),4,4,4',4',5,5,5',5'-八甲基-2,2'-双(1,3,2-二氧杂环戊硼烷)(2.1g,8.2mmol),Pd(dppf)Cl2(369mg,0.41mmol)和KOAc(804mg,8.2mmol)在20mL二噁烷中的混合物脱气并在105℃下搅拌8h。将混合物过滤,浓缩并通过硅胶柱纯化,其得到0.81g无色油状的4-(3-(甲氧基甲氧基)-4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼-2-基)苯基)-1-(四氢-2H-吡喃-2-基)-1H-吡唑(48%收率)。LCMS:m/z 415.3[M+H]+;tR=2.10分钟。
步骤6:合成(1R,3s,5S)-3-((6-(2-(甲氧基甲氧基)-4-(1-(四氢-2H-吡喃-2-基)-1H-吡唑-4-基)苯基)哒嗪-3-基)(甲基)氨基)-9-氮杂双环[3.3.1]壬烷-9-羧酸叔丁酯
将(1R,3s,5S)-3-((6-氯哒嗪-3-基)(甲基)氨基)-9-氮杂双环[3.3.1]壬烷-9-羧酸叔丁酯(1.7g,4.64mmol),4-(3-(甲氧基甲氧基)-4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼-2-基)苯基)-1-(四氢-2H-吡喃-2-基)-1H-吡唑(2.5g,6.04mmol),Pd(dppf)Cl2(339mg,0.46mmol)和K2CO3(1.28g,9.28mmol)在40mL 1,4-二噁烷和8mL水中的混合物脱气并在105℃和氮气氛下搅拌2h。然后将混合物浓缩并通过硅胶色谱(5-60%EtOAc/石油醚)纯化,其得到2.2g淡黄色固体状的(1R,3s,5S)-3-((6-(2-(甲氧基甲氧基)-4-(1-(四氢-2H-吡喃-2-基)-1H-吡唑-4-基)苯基)哒嗪-3-基)(甲基)氨基)-9-氮杂双环[3.3.1]壬烷-9-羧酸叔丁酯(77%收率)。LCMS(A039):m/z 619.3[M+H]+;tR=2.17分钟。
步骤7:合成标题化合物:2-(6-(((1R,3s,5S)-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(1H-吡唑-4-基)苯酚
将10mL 4N HCl在二噁烷中的溶液加至(1R,3s,5S)-3-((6-(2-(甲氧基甲氧基)-4-(1-(四氢-2H-吡喃-2-基)-1H-吡唑-4-基)苯基)哒嗪-3-基)(甲基)氨基)-9-氮杂双环[3.3.1]壬烷-9-羧酸叔丁酯(2.2g,3.56mmol)在4mL CH2Cl2中的搅拌溶液。将混合物在室温下搅拌2h,在减压下浓缩,用NH3/MeOH中和并通过制备型HPLC纯化,其得到900mg黄色固体状的2-(6-(((1R,3s,5S)-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(1H-吡唑-4-基)苯酚(65%收率)。
实施例4:合成2-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲 基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(1H-吡唑-4-基)苯酚
步骤1:合成1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-酮
0℃下将氢氧化钾(108g,1.93mol)在70mL H2O中的溶液加至3-氧代戊二酸(120g,822mmol)和己烷-2,5-二酮(49.2g,432mmol)在350mL H2O中的搅拌溶液。然后伴随搅拌加入667mL H2O中的氯化铵(70.1g,1.32mol)和NaOAc三水合物(70.1g,515mmol)。使用1NNaOH水溶液将所得溶液的pH调节至~9。将混合物在室温下搅拌约72h,在此期间通过使用另外的1N NaOH将pH维持在约9。将混合物用CH2Cl2(1L X 5)萃取。将合并的有机溶剂经无水Na2SO4干燥,浓缩并通过硅胶色谱(0-25%MeOH/CH2Cl2)纯化,其得到16.7g黑色油状的1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-酮(25%收率)。LCMS(039):m/z 154.2[M+H]+;tR=1.20分钟;纯度:85%。
步骤2:合成1,5-二甲基-3-氧代-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯
将1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-酮(24g,163mmol),二碳酸二叔丁酯(35.6g,326mmol)和DIPEA(31.5g,244mmol)在500mL 1,4-二噁烷中的混合物在70℃下搅拌6h。将混合物浓缩并通过硅胶色谱(0-30%EtOAc/石油醚)纯化,其得到16.7白色固体状的1,5-二甲基-3-氧代-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯(收率:42%).LCMS(042):m/z198.1[M-55]+;tR=1.40分钟;纯度:100%。
步骤3:合成3-(肟基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯
将1,5-二甲基-3-氧代-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯(16.7g,66mmol),盐酸羟胺(18.2g,26.4mmol)和乙酸钠(10.8g,132mmol)在250mL乙醇中的混合物在70℃下搅拌4h。将混合物浓缩。加入200mL EtOAc和60mL H2O。将有机相分离,用盐水(50mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥,浓缩以得到16.7g黄色固体状的3-(肟基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯,其直接用于下一步骤(93%收率)。LCMS(039):m/z 269.2[M+H]+;tR=1.92分钟;纯度:100%。
步骤4:合成(1R,3s,5S)-3-氨基-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯
将金属钠(40.2g,1.75mol)分批加至3-(肟基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯(26.8g,0.1mol)在1000mL n-PrOH中的混合物中,经1h加热至110℃。加入后,将混合物在回流下另外搅拌1h。将混合物冷却至室温并用H2O(500mL)小心淬灭。将有机层分离并浓缩。将DCM(500mL)加至残余物。滤除固体并将滤液在减压下浓缩以得到20g黄色油状的(1R,3s,5S)-3-氨基-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯,其直接用于下一步骤(收率:79%)。LCMS(A038):m/z 255.3[M+H]+;tR=1.37分钟;纯度:99%。
步骤5:合成(1R,3s,5S)-3-((6-氯哒嗪-3-基)氨基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯
将(1R,3s,5S)-3-氨基-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯(20g,78.7mmol),3,6-二氯哒嗪(23.3g,157.5mmol)和DIPEA(20.48g,157.5mmol)在500mLDMSO中的混合物在120℃下搅拌24h。将混合物冷却至室温,用H2O淬灭并用乙酸乙酯(500mLX 3)萃取。将合并的有机层用盐水洗涤,经无水Na2SO4干燥并在减压下浓缩.除去溶剂后,将粗产物通过硅胶柱(50%EtOAc/石油醚)纯化以得到17.5g黄色固体状的(1R,3s,5S)-3-((6-氯哒嗪-3-基)氨基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯(收率:61%)。LCMS(038):m/z 367.2[M+H]+;tR=1.88分钟;纯度:99%。
步骤6:合成(1R,3s,5S)-3-((6-氯哒嗪-3-基)(甲基)氨基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯
0℃下将氢化钠(2.87g,71.7mmol)加至(1R,3s,5S)-3-((6-氯哒嗪-3-基)氨基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯(17.5g,47.8mmol)在400mL DMF中的搅拌溶液。在0℃下搅拌20分钟后,加入CH3I(13.58g,95.6mmol)。然后将混合物在室温下搅拌1h,用H2O淬灭并用EtOAc(300mL X 3)萃取。将合并的有机相用盐水洗涤,经无水Na2SO4干燥,在减压下浓缩并通过硅胶柱(30%EtOAc/石油醚)纯化以得到14.5g黄色固体状的(1R,3s,5S)-3-((6-氯哒嗪-3-基)(甲基)氨基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯(80%收率)。LCMS(039):m/z 381.2[M+H]+;tR=2.17分钟;纯度:99%。
步骤7:合成1-溴-4-氯-2-(甲氧基甲氧基)苯
0℃下将氢化钠(1.85g,46.3mmol,60%于矿物油中)加至2-溴-5-氯苯酚(8g,38.6mmol)在150mL DMF中的搅拌溶液。在0℃下搅拌30分钟后,加入甲氧基甲基溴化物(7.25g,58mmol)。然后将混合物在室温下搅拌2h,用NH4Cl水溶液(15mL)淬灭,用EtOAc(30mL X 3)萃取。将合并的有机层经无水Na2SO4干燥,浓缩并通过硅胶色谱(0-10%EtOAc/石油醚)纯化,其得到8.1g无色油状的1-溴-4-氯-2-(甲氧基甲氧基)苯(84%收率)。1H NMR(500MHz,氯仿-d)δ7.45(d,J=8.5Hz,1H),7.17(d,J=2.3Hz,1H),6.89(dd,J=8.4,2.3Hz,1H),5.24(s,2H).LCMS:tR=1.51分钟。
步骤8:合成4-氯-2-(甲氧基甲氧基)苯基硼酸
在氮气和-78℃下将n-BuLi的THF溶液(5.76mL,14.4mmol)加至1-溴-4-氯-2-(甲氧基甲氧基)苯(3g,12mmol)在40mL THF中的搅拌溶液。在-78℃下搅拌40分钟后,加入B(OMe)3(2g,19.2mmol)。使混合物升温至室温并搅拌16h。将NH4Cl水溶液(10mL)加至混合物。将混合物用EtOAc(20mL X 3)萃取。将合并的有机溶剂用盐水(10mL)洗涤,经Na2SO4干燥,浓缩并自3%EtOAc/石油醚重结晶以得到1.6g灰白色固体状的4-氯-2-(甲氧基甲氧基)苯基硼酸(62%收率)。LCMS:m/z 199.1[M-OH]+;tR=1.65分钟。
步骤9:合成(1R,3s,5S)-3-((6-(4-氯-2-(甲氧基甲氧基)苯基)哒嗪-3-基)(甲基)氨基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯
将(1R,3s,5S)-3-((6-氯哒嗪-3-基)(甲基)氨基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯(6g,16.4mmol),4-氯-2-(甲氧基甲氧基)苯基硼酸(5.3g,24.6mmol),Pd(dppf)Cl2(1.6mg,2mmol)和K2CO3(4.53mg,32.8mmol)在80mL二噁烷和8mLH2O中的混合物脱气并在100℃下搅拌7h。冷却至室温后,将混合物浓缩并通过硅胶柱(10-60%EtOAc/石油醚)纯化,其得到4.52g白色固体状的(1R,3s,5S)-3-((6-(4-氯-2-(甲氧基甲氧基)苯基)哒嗪-3-基)(甲基)氨基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯(57%收率)。LCMS:m/z 517.3[M+H]+;tR=1.86分钟。
步骤10:合成(1R,3s,5S)-3-((6-(2-(甲氧基甲氧基)-4-(1H-吡唑-4-基)苯基)哒嗪-3-基)(甲基)氨基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯
将(1R,3s,5S)-3-((6-(4-氯-2-(甲氧基甲氧基)苯基)哒嗪-3-基)(甲基)氨基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯(14.5g,28.1mmol),4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼-2-基)-1H-吡唑(10.9g,56.2mmol),催化剂(2.21g,2.82mmol)和K3PO4(11.9g,56.2mmol)在100mL二噁烷和50mL H2O中的混合物脱气并在100℃下搅拌5h。将混合物浓缩并通过硅胶柱(10-80%EtOAc/石油醚)纯化,其得到11.1g白色固体状的(1R,3s,5S)-3-((6-(2-(甲氧基甲氧基)-4-(1H-吡唑-4-基)苯基)哒嗪-3-基)(甲基)氨基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯(72%收率)。LCMS:m/z 549.2[M+H]+;tR=2.09分钟。
步骤10:合成标题化合物:2-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(1H-吡唑-4-基)苯酚
室温下将4N HCl在二噁烷中的溶液(80ml)加至(1R,3s,5S)-3-((6-(2-(甲氧基甲氧基)-4-(1H-吡唑-4-基)苯基)哒嗪-3-基)(甲基)氨基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯(16g,29.2mmol)在80mL CH2Cl2中的搅拌溶液。将混合物在室温下搅拌3h并浓缩。将残余物溶于水中。调节pH值至9。将混合物用CH2Cl2/MeOH(4/1,v/v)萃取。将合并的有机溶剂浓缩并通过硅胶色谱(0-60%MeOH/CH2Cl2)纯化以得到11.2g黄色固体状的2-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(1H-吡唑-4-基)苯酚(84%收率)。
实施例5:合成2-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-基)(甲 基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(1H-吡唑-4-基)苯酚.
步骤1:合成1-溴-4-碘-2-(甲氧基甲氧基)苯.
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0℃下将甲氧基甲基溴化物(1.25g,10mmol)加至2-溴-5-碘苯酚(1.5g,5mmol)和K2CO3(1.38g,10mmol)在20mL DMF中的搅拌溶液。然后将混合物在室温下搅拌16h,用20mLH2O淬灭并用EtOAc(20mL X 3)萃取。将合并的有机溶剂经无水Na2SO4干燥,浓缩并通过硅胶柱(0-5%EtOAc/石油醚)纯化以得到1.45g无色液体状的1-溴-4-碘-2-(甲氧基甲氧基)苯(79%收率)。LCMS:tR=1.50分钟。
步骤2:合成4-(4-溴-3-(甲氧基甲氧基)苯基)-1-(四氢-2H-吡喃-2-基)-1H-吡唑
将1-溴-4-碘-2-(甲氧基甲氧基)苯(3.3g,9.6mmol),1-(四氢-2H-吡喃-2-基)-4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼-2-基)-1H-吡唑(2.67g,9.6mmol),Pd(dppf)Cl2(866mg,1mmol)和K2CO3(2.66g,19.3mmol)在40mL二噁烷和4mL H2O中的混合物脱气并在105℃下搅拌8h。冷却至室温后,将混合物用EtOAc(30mL X 3)萃取。将合并的有机溶剂浓缩并通过硅胶柱(10-50%EtOAc/石油醚)纯化以得到2.5g无色油状的4-(4-溴-3-(甲氧基甲氧基)苯基)-1-(四氢-2H-吡喃-2-基)-1H-吡唑(69%收率)。LCMS:m/z 367.1[M+H]+;tR=2.03分钟。
步骤3:合成4-(3-(甲氧基甲氧基)-4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼-2-基)苯基)-1-(四氢-2H-吡喃-2-基)-1H-吡唑
将4-(4-溴-3-(甲氧基甲氧基)苯基)-1-(四氢-2H-吡喃-2-基)-1H-吡唑(1.5g,4.1mmol),4,4,4',4',5,5,5',5'-八甲基-2,2'-双(1,3,2-二氧杂环戊硼烷)(2.1g,8.2mmol),Pd(dppf)Cl2(369mg,0.41mmol)和KOAc(804mg,8.2mmol)在20mL二噁烷中的混合物脱气并在105℃下搅拌8h。将混合物过滤,浓缩并通过硅胶柱纯化,其得到0.81g无色油状的4-(3-(甲氧基甲氧基)-4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼-2-基)苯基)-1-(四氢-2H-吡喃-2-基)-1H-吡唑(48%收率)。LCMS:m/z 415.3[M+H]+;tR=2.10分钟。
步骤4:合成N1,N5-二甲氧基-N1,N5-二甲基戊二酰胺.
0℃下经30分钟将戊二酰基二氯(50g,0.299mol)加至N,O-二甲基盐酸羟胺(64g,0.658mmol)和Et3N(121.2g,1.2mmol)在1000mL CH2Cl2中的搅拌溶液。使反应混合物至室温并搅拌3h。将500mL水加至混合物,将其用CH2Cl2(1000mL X 3)萃取。将合并的有机层用1%HCl溶液,盐水洗涤,经无水Na2SO4干燥并在减压下浓缩以得到55g棕色油状的N1,N5-二甲氧基-N1,N5-二甲基戊二酰胺(85%yield),其未经进一步纯化即用于下一步骤。LCMS:m/z219.2[M+H]+;tR=1.26分钟。
步骤5:合成庚烷-2,6-二酮
0℃下经30分钟将甲基溴化镁(250mL,0.756mol)加至N1,N5-二甲氧基-N1,N5-二甲基戊二酰胺(55g,0.252mol)在800mL干燥THF中的搅拌溶液。所有格氏试剂均加入后,使反应混合物加温至室温并搅拌2h。将50mL水加至混合物,然后是1%HCl水溶液300mL。将混合物用乙酸乙酯(1000mL X 3)萃取。将合并的有机层用1%HCl水溶液,盐水洗涤,经无水Na2SO4干燥,在减压下浓缩并通过硅胶柱(10-50%乙酸乙酯/石油醚)纯化以得到13g近棕色固体状的庚烷-2,6-二酮(40%收率)。LCMS:m/z 129.1[M+H]+;tR=1.24分钟。
步骤6:合成1,5-二甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-酮
室温下将乙酸铵(18.3g,0.238mol)和丙酮二羧酸(34.7g,0.238mol)加至庚烷-2,6-二酮(5.07g,39.6mmol)在AcOH(49mL)中的搅拌溶液。然后将反应混合物在80℃下搅拌3h。将混合物冷却至0℃并用CH2Cl2和水稀释。分离水相并用10%HCl水溶液(pH=1)酸化,然后用EtOAc稀释。将所得混合物用水萃取。将合并的水层用20%NaOH(pH=11)碱化并用CH2Cl2(三次)萃取。将合并的有机层经K2CO3干燥并在减压下浓缩。将残余物通过快速硅胶柱色谱(50%乙酸乙酯/石油醚至10%MeOH/CH2Cl2)纯化以得到深红色油状的1,5-二甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-酮(2.0g,30%收率)。LCMS:m/z 168.2[M+H]+;tR=1.24分钟。
步骤7:合成9-(4-甲氧基苄基)-1,5-二甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-酮
在氮气保护下将1,5-二甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-酮(2.0g,11.98mmol),K2CO3(3.3g,24mmol)和1-(氯甲基)-4-甲氧基苯(2.2g,14.4mmol.)在50mL丙酮中的溶液加热至回流16h。将反应混合物冷却至室温,将50mL水加至该混合物,将其用乙酸乙酯(50mL X3)萃取。将合并的有机层用盐水洗涤,经无水Na2SO4干燥,浓缩并通过硅胶色谱(10-30%乙酸乙酯/石油醚)纯化,其得到淡黄色固体状的9-(4-甲氧基苄基)-1,5-二甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-酮(2.4g,70%收率)。LCMS:m/z 288.2[M+H]+;tR=1.22分钟。
步骤8:合成9-(4-甲氧基苄基)-1,5-二甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-酮肟
将9-(4-甲氧基苄基)-1,5-二甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-酮(8.5g,29.62mmol)和NH2OH HCl(4.1g,60mmol)在150mL乙醇中的溶液加热至85℃ 3h。然后将混合物浓缩至残余物,将其溶于水中并用Na2CO3水溶液调节pH至8。将混合物用乙酸乙酯(200mLX 3)萃取。将合并的有机层用盐水洗涤,经无水Na2SO4干燥并浓缩,其得到白色固体状的9-(4-甲氧基苄基)-1,5-二甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-酮肟(8.1g,90%收率)。LCMS:m/z303.1[M+H]+;tR=1.19分钟。
步骤9:合成(1R,3s,5S)-9-(4-甲氧基苄基)-1,5-二甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-胺
105℃下将钠(6.72g,280mmol)按份加至9-(4-甲氧基苄基)-1,5-二甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-酮肟(8.1g,26.82mmol)在100mL丙醇中的搅拌溶液。加入后,将反应在105℃下搅拌1h。将反应混合物浓缩并加入100mL水。将混合物用乙酸乙酯(150mL X 3)萃取。将合并的有机层用盐水洗涤,经无水Na2SO4干燥并浓缩以得到无色油状的(1R,3s,5S)-9-(4-甲氧基苄基)-1,5-二甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-胺(6.3g,82%收率)。LCMS:m/z289.1[M+H]+;tR=1.18分钟。
步骤10:合成(1R,3s,5S)-N-(6-氯哒嗪-3-基)-9-(4-甲氧基苄基)-1,5-二甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-胺
将(1R,3s,5S)-9-(4-甲氧基苄基)-1,5-二甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-胺(6.3g,21.88mmol),3,6-二氯哒嗪(3.9g,26.26mmol)和DIPEA(5.4g,42mmol)在100mL DMSO中的溶液在氮气保护下加热至140℃ 6h。将反应混合物冷却至室温。将100mL水加至该混合物并用乙酸乙酯(105mL X 3)萃取。将合并的有机层用饱和NH4Cl水溶液,盐水洗涤,经无水Na2SO4干燥,浓缩并通过硅胶色谱(10-50%乙酸乙酯/石油醚)纯化,其得到棕色固体状的(1R,3s,5S)-N-(6-氯哒嗪-3-基)-9-(4-甲氧基苄基)-1,5-二甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-胺(4.2g,50%收率)。LCMS:m/z 401.2[M+H]+;tR=1.39分钟。
步骤11:合成(1R,3s,5S)-N-(6-氯哒嗪-3-基)-9-(4-甲氧基苄基)-N,1,5-三甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-胺
室温下将氢化钠(768mg,16mmol,60%于矿物油中)加至(1R,3s,5S)-N-(6-氯哒嗪-3-基)-9-(4-甲氧基苄基)-1,5-二甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-胺(4.2g,10.5mmol)在100mL THF中的搅拌溶液。将反应搅拌30分钟后,将碘甲烷(1.78g,12.6mmol)加至该混合物。将反应加热至50℃ 6h。将反应混合物冷却至室温,用50mL水淬灭并用乙酸乙酯(100mLX 3)萃取。将合并的有机层用盐水洗涤,经无水Na2SO4干燥,浓缩并通过硅胶色谱(10-60%乙酸乙酯/石油醚)纯化,其得到棕色固体状的(1R,3s,5S)-N-(6-氯哒嗪-3-基)-9-(4-甲氧基苄基)-N,1,5-三甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-胺(2.7g,60%收率)。LCMS:m/z 415.2[M+H]+;tR=1.42分钟。
步骤12:合成(1R,3s,5S)-9-(4-甲氧基苄基)-N-(6-(2-(甲氧基甲氧基)-4-(1-(四氢-2H-吡喃-2-基)-1H-吡唑-4-基)苯基)哒嗪-3-基)-N,1,5-三甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-胺
将(1R,3s,5S)-N-(6-氯哒嗪-3-基)-9-(4-甲氧基苄基)-N,1,5-三甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-胺(120mg,0.3mmol),4-(3-(甲氧基甲氧基)-4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼-2-基)苯基)-1-(四氢-2H-吡喃-2-基)-1H-吡唑(120mg,0.3mmol),Pd(dppf)Cl2(22mg,0.03mmol)和K2CO3(81mg,0.6mmol)在5mL二噁烷和1mL H2O中的混合物脱气并在85℃下搅拌6h。冷却至室温后,将混合物用EtOAc(30mL X 3)萃取。将合并的有机溶剂浓缩并通过硅胶柱(10-50%EtOAc/石油醚)纯化,其得到100mg g微黄色固体状的(1R,3s,5S)-9-(4-甲氧基苄基)-N-(6-(2-(甲氧基甲氧基)-4-(1-(四氢-2H-吡喃-2-基)-1H-吡唑-4-基)苯基)哒嗪-3-基)-N,1,5-三甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-胺(50%收率)。LCMS:m/z667.5[M+H]+;tR=1.51分钟。
步骤13:合成(1R,3s,5S)-N-(6-(2-(甲氧基甲氧基)-4-(1-(四氢-2H-吡喃-2-基)-1H-吡唑-4-基)苯基)哒嗪-3-基)-N,1,5-三甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-胺
将(1R,3s,5S)-9-(4-甲氧基苄基)-N-(6-(2-(甲氧基甲氧基)-4-(1-(四氢-2H-吡喃-2-基)-1H-吡唑-4-基)苯基)哒嗪-3-基)-N,1,5-三甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-胺(100mg,0.15mmol)和Pd(OH)2(100mg)在MeOH(5mL)中的溶液在室温和氢气球下搅拌6h。将混合物过滤通过Celite垫并浓缩,其得到微黄色固体状的(1R,3s,5S)-N-(6-(2-(甲氧基甲氧基)-4-(1-(四氢-2H-吡喃-2-基)-1H-吡唑-4-基)苯基)哒嗪-3-基)-N,1,5-三甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-胺(52mg,78%收率)。LCMS:m/z 547.3[M+H]+;tR=1.54分钟。
步骤13:合成2-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(1H-吡唑-4-基)苯酚
将(1R,3s,5S)-N-(6-(2-(甲氧基甲氧基)-4-(1-(四氢-2H-吡喃-2-基)-1H-吡唑-4-基)苯基)哒嗪-3-基)-N,1,5-三甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-胺(52mg,0.095mmol)在10mL HCl/二噁烷(4N)中的溶液在室温下搅拌3h。将反应混合物浓缩。加入氨/甲醇溶液(7N)以调节pH至9。将混合物浓缩并通过硅胶柱(80%MeOH/EtOAc)纯化,其得到25mg黄色固体状的2-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(1H-吡唑-4-基)苯酚(60%收率)。1H NMR(500MHz,甲醇-d4)δ8.15(d,J=9.9Hz,1H),8.09(s,1H),7.95(s,1H),7.78(d,J=8.0Hz,1H),7.33(d,J=9.8Hz,1H),7.21-7.20(m,2H),6.08-6.03(m,1H),2.99(s,3H),2.45-2.42(m,1H),2.15-1.76(m,9H),1.48(s,6H).LCMS:m/z 419.2.0[M+H]+;tR=1.34分钟。
实施例6:合成2-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲 基)氨基)哒嗪-3-基)-4-氟-5-(1H-吡唑-4-基)苯酚
步骤1:合成1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-酮
0℃下将70mL H2O中的氢氧化钾(108g,1.93mol)加至3-氧代戊二酸(120g,822mmol)和己烷-2,5-二酮(49.2g,432mmol)在350mL H2O中的搅拌溶液。加入后,加入667mL H2O中的NH4Cl(70.1g,1.32mol)和NaOAc三水合物(70.1g,515mmol)。通过使用1NNaOH水溶液调节pH值至~9。将混合物在室温下搅拌72h,其间通过使用另外的1N NaOH水溶液调节pH值至~9。将混合物用CH2Cl2(1L X 5)萃取。将合并的有机溶剂经无水Na2SO4干燥,浓缩并通过硅胶色谱(0-25%MeOH/CH2Cl2)纯化,其得到16.7g黑色油状的1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-酮(25%收率)。LCMS:m/z 154.2[M+H]+;tR=1.20分钟。
步骤2:合成1,5-二甲基-3-氧代-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯
将1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-酮(24g,163mmol),二碳酸二叔丁酯(35.6g,326mmol)和DIPEA(31.5g,244mmol)在500mL 1,4-二噁烷中的混合物在70℃下搅拌6h。将混合物浓缩并通过硅胶色谱(0-30%EtOAc/石油醚)纯化,其得到16.7白色固体状的1,5-二甲基-3-氧代-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯(收率:42%)。LCMS:m/z198.1[M-55]+;tR=1.40分钟。
步骤3:合成3-(肟基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯
将1,5-二甲基-3-氧代-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯(16.7g,66mmol),盐酸羟胺(18.2g,26.4mmol)和NaOAc(10.8g,132mmol)在250mL EtOH中的混合物在70℃下搅拌4h。将混合物浓缩。加入200mL EtOAc和60mL H2O。将有机相分离,用盐水(50mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥,浓缩以得到16.7g黄色固体状的3-(肟基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯,其直接用于下一步骤(93%收率)。LCMS:m/z269.2[M+H]+;tR=1.92分钟。
步骤4:合成(1R,3s,5S)-3-氨基-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯
将钠(40.2g,1.75mol)按份加至was added in portions to a mixture of 3-(肟基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯(26.8g,0.1mol)在1000mL n-PrOH中的混合物,其经1h加热至110℃。加入后,将混合物在回流下另外搅拌1h。将混合物冷却至室温,用H2O(500mL)淬灭。将有机层分离并浓缩。将DCM(500mL)加至残余物。滤除固体并将滤液在减压下浓缩以得到20g黄色油状的(1R,3s,5S)-3-氨基-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯,其直接用于下一步骤(收率:79%)。LCMS:m/z 255.3[M+H]+;tR=1.37分钟。
步骤5:合成(1R,3s,5S)-3-((6-氯哒嗪-3-基)氨基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯
将(1R,3s,5S)-3-氨基-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯(20g,78.7mmol),3,6-二氯哒嗪(23.3g,157.5mmol)和DIPEA(20.48g,157.5mmol)在500mLDMSO中的混合物在120℃下搅拌24h。将混合物冷却至室温,用H2O淬灭并用乙酸乙酯(500mLX 3)萃取。将合并的有机层用盐水洗涤,经无水Na2SO4干燥并在减压下浓缩.除去溶剂后,将粗产物通过硅胶柱(50%EtOAc/石油醚)纯化以得到17.5g黄色固体状的(1R,3s,5S)-3-((6-氯哒嗪-3-基)氨基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯(收率:61%)。LCMS:m/z 367.2[M+H]+;tR=1.88分钟。
步骤6:合成(1R,3s,5S)-3-((6-氯哒嗪-3-基)(甲基)氨基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯
0℃下将氢化钠(2.87g,71.7mmol,60%于矿物油中)加至(1R,3s,5S)-3-((6-氯哒嗪-3-基)氨基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯(17.5g,47.8mmol)在400mL DMF中的搅拌溶液。在0℃下搅拌20分钟后,加入CH3I(13.58g,95.6mmol)。然后将混合物在室温下搅拌1h,用H2O淬灭并用EtOAc(300mL X 3)萃取。将合并的有机相用盐水洗涤,经无水Na2SO4干燥,在减压下浓缩并通过硅胶柱(30%EtOAc/石油醚)纯化以得到14.5g黄色固体状的(1R,3s,5S)-3-((6-氯哒嗪-3-基)(甲基)氨基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯(80%收率)。LCMS:m/z 381.2[M+H]+;tR=2.17分钟。
步骤7:合成2-溴-5-氯-4-氟苯酚
室温下将溴(3.52g,22mmol)加至3-氯-4-氟苯酚(4.02g,20mmol)在80mL CH2Cl2中的搅拌溶液。将混合物在室温下搅拌18h并用10mL Na2S2O3水溶液淬灭。将有机相收集,浓缩并通过硅胶色谱(0-10%EtOAc/石油醚)纯化以得到2.5g白色固体状的2-溴-5-氯-4-氟苯酚(44%收率)。1H NMR(500MHz,氯仿-d)δ7.29(d,J=8.0Hz,1H),7.08(d,J=6.6Hz,1H),5.45(s,1H)。LCMS:tR=1.44分钟。
步骤8:合成1-溴-4-氯-5-氟-2-(甲氧基甲氧基)苯
0℃下将氢化钠(215mg,5.4mmol)加至2-溴-5-氯-4-氟苯酚(1g,4.48mmol)在14mLDMF中的搅拌溶液。搅拌30分钟后,加入溴(甲氧基)甲烷(428mg,8mmol)。然后将混合物在室温下搅拌2h,用10mL饱和NH4Cl水溶液淬灭并用EtOAc(30mL X 3)萃取。将合并的有机溶剂浓缩并通过硅胶柱(0-8%EtOAc/石油醚)纯化以得到1.01g白色固体状的1-溴-4-氯-5-氟-2-(甲氧基甲氧基)苯(70%收率)。1H NMR(500MHz,氯仿-d)δ7.37(d,J=8.1Hz,1H),7.23(d,J=6.6Hz,1H),5.20(s,2H),3.52(s,3H)。
步骤9:合成(1R,3s,5S)-3-((6-(4-氯-5-氟-2-(甲氧基甲氧基)苯基)哒嗪-3-基)(甲基)氨基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯
将1-溴-4-氯-5-氟-2-(甲氧基甲氧基)苯(8.5g,31.7mmol),4,4,4',4',5,5,5',5'-八甲基-2,2'-双(1,3,2-二氧杂环戊硼烷)(12.1g,47.5mmol),Pd(dppf)Cl2(1.86g,2.54mmol)和乙酸钾(6.2g,63.4mmol)在200mL二噁烷中的混合物脱气并在100℃下搅拌8h。冷却至室温后,加入(1R,3s,5S)-3-((6-氯哒嗪-3-基)(甲基)氨基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯(8g,21.2mmol),K2CO3(5.8g,42.3mmol)和H2O(30mL)。将混合物在100℃下搅拌3h,浓缩并通过硅胶柱(10-25%EtOAc/石油醚)纯化,其得到6g淡黄色固体状的(1R,3s,5S)-3-((6-(4-氯-5-氟-2-(甲氧基甲氧基)苯基)哒嗪-3-基)(甲基)氨基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯(53%收率)。LCMS:m/z 535.2[M+H]+;tR=2.40分钟。
步骤10:合成(1R,3s,5S)-3-((6-(5-氟-2-(甲氧基甲氧基)-4-(1H-吡唑-4-基)苯基)哒嗪-3-基)(甲基)氨基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯
将(1R,3s,5S)-3-((6-(4-氯-5-氟-2-(甲氧基甲氧基)苯基)哒嗪-3-基)(甲基)氨基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯(120mg,0.22mmol),4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼-2-基)-1H-吡唑(66mg,0.34mmol),Pd(dppf)Cl2(20mg,0.028mmol)和K2CO3(77mg,0.56mmol)在2mL 1,4-二噁烷和0.4mL水中的混合物用氮气吹扫并密封。将混合物在130℃和MW下搅拌2h,浓缩并通过硅胶色谱(0-20%MeOH/CH2Cl2)纯化,其得到90mg白色固体状的(1R,3s,5S)-3-((6-(5-氟-2-(甲氧基甲氧基)-4-(1H-吡唑-4-基)苯基)哒嗪-3-基)(甲基)氨基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯(72%收率)。LCMS:m/z 567.2[M+H]+;tR=1.59分钟。
步骤11:合成2-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-4-氟-5-(1H-吡唑-4-基)苯酚
将HCl/二噁烷溶液(4N,4ml)加至(1R,3s,5S)-3-((6-(5-氟-2-(甲氧基甲氧基)-4-(1H-吡唑-4-基)苯基)哒嗪-3-基)(甲基)氨基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯(90mg,0.16mmol)在2mL CH2Cl2中的搅拌溶液。将混合物在室温下搅拌2h,在减压下浓缩,用NH3/MeOH中和并通过制备型HPLC纯化以得到32mg黄色固体状的2-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-4-氟-5-(1H-吡唑-4-基)苯酚(54%收率)。1H NMR(500MHz,DMSO-d6)δ13.56(s,1H),13.14(s,1H),8.21(d,J=9.9Hz,1H),8.11(s,2H),7.81(d,J=12.6Hz,1H),7.35(d,J=9.9Hz,1H),7.30(d,J=7.0Hz,1H),5.00-4.87(m,1H),2.93(s,3H),1.83-1.77(m,2H),1.56-1.39(m,6H),1.17(s,6H)。LCMS(A038):m/z 423.3[M+H]+;tR=1.36分钟。
实施例7:合成2-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-基)(甲 基)氨基)哒嗪-3-基)-4-氟-5-(1H-吡唑-4-基)苯酚
步骤1:合成N1,N5-二甲氧基-N1,N5-二甲基戊二酰胺
0℃经30分钟将戊二酰基二氯(50g,0.299mol)加至N,O-二甲基盐酸羟胺(64g,0.658mmol)和Et3N(121.2g,1.2mmol)在1000mL CH2Cl2中的搅拌溶液。使反应混合物至室温并搅拌3h。将500mL水加至混合物,将其用CH2Cl2(1000mL X 3)萃取。将合并的有机层用1%HCl溶液,盐水洗涤,经无水Na2SO4干燥并在减压下浓缩,其得到55g棕色油状的N1,N5-二甲氧基-N1,N5-二甲基戊二酰胺(85%收率),其未经进一步纯化即用于下一步骤。LCMS:m/z219.2[M+H]+;tR=1.26分钟。
步骤2:合成庚烷-2,6-二酮
0℃下经30分钟将甲基溴化镁(250mL,0.756mol)加至N1,N5-二甲氧基-N1,N5-二甲基戊二酰胺(55g,0.252mol)在800mL THF中的搅拌溶液。使反应混合物加温至室温并搅拌2h。将50mL水加至混合物,然后是1%HCl水溶液300mL。将混合物用乙酸乙酯(1000mL X3)萃取。将合并的有机层用1%HCl水溶液,盐水洗涤,经无水Na2SO4干燥,在减压下浓缩并通过硅胶柱(10-50%乙酸乙酯/石油醚)纯化,其得到13g近棕色固体状的庚烷-2,6-二酮(40%收率)。LCMS:m/z 129.1[M+H]+;tR=1.24分钟。
步骤3:合成1,5-二甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-酮
室温下将乙酸铵(18.3g,0.238mol)和丙酮二羧酸(34.7g,0.238mol)加至庚烷-2,6-二酮(5.07g,39.6mmol)在AcOH(49mL)中的搅拌溶液。然后将反应混合物在80℃下搅拌3h。将混合物冷却至0℃,并用CH2Cl2和水稀释。分离水相并用10%HCl水溶液酸化(pH=1),然后用AcOEt稀释。将所得混合物用水萃取。将合并的水层用20%NaOH碱化(pH=11)并用CH2Cl2(三次)萃取。将合并的有机层经K2CO3干燥并在减压下浓缩。将残余物通过快速硅胶柱色谱(50%乙酸乙酯/石油醚至10%MeOH/CH2Cl2)纯化,其得到深红色油状的1,5-二甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-酮(2.0g,30%收率)。LCMS:m/z 168.2[M+H]+;tR=1.24分钟。
步骤4:合成9-(4-甲氧基苄基)-1,5-二甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-酮
将1,5-二甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-酮(2.0g,11.98mmol),K2CO3(3.3g,24mmol)和1-(氯甲基)-4-甲氧基苯(2.2g,14.4mmol.)在50mL丙酮中的溶液在氮气保护下加热至回流16h。将反应混合物冷却至室温,将50mL水加至该混合物,将其用乙酸乙酯(50mLX 3)萃取。将合并的有机层用盐水洗涤,经无水Na2SO4干燥,浓缩并通过硅胶色谱(10-30%乙酸乙酯/石油醚)纯化,其得到微黄色固体状的9-(4-甲氧基苄基)-1,5-二甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-酮(2.4g,70%收率)。LCMS:m/z 288.2[M+H]+;tR=1.22分钟。
步骤5:合成9-(4-甲氧基苄基)-1,5-二甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-酮肟
将9-(4-甲氧基苄基)-1,5-二甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-酮(8.5g,29.62mmol)和NH2OH HCl(4.1g,60mmol)在150mL乙醇中的溶液加热至85℃ 3h。然后将混合物浓缩至残余物,将其溶于水中并用Na2CO3水溶液调节pH至8。将混合物用乙酸乙酯(200mLX 3)萃取。将合并的有机层用盐水洗涤,经无水Na2SO4干燥并浓缩,其得到白色固体状的9-(4-甲氧基苄基)-1,5-二甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-酮肟(8.1g,90%收率)。LCMS:m/z303.1[M+H]+;tR=1.19分钟。
步骤6:合成(1R,3s,5S)-9-(4-甲氧基苄基)-1,5-二甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-胺
105℃下将钠(6.72g,280mmol)按份加至9-(4-甲氧基苄基)-1,5-二甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-酮肟(8.1g,26.82mmol)在100mL丙醇中的搅拌溶液。加入后,将反应在105℃下搅拌1h。将反应混合物浓缩并加入100mL水。将混合物用乙酸乙酯(150mL X 3)萃取。将合并的有机层用盐水洗涤,经无水Na2SO4干燥并浓缩,其得到无色油状的(1R,3s,5S)-9-(4-甲氧基苄基)-1,5-二甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-胺(6.3g,82%收率)。LCMS:m/z289.1[M+H]+;tR=1.18分钟。
步骤7:合成(1R,3s,5S)-N-(6-氯哒嗪-3-基)-9-(4-甲氧基苄基)-1,5-二甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-胺
将(1R,3s,5S)-9-(4-甲氧基苄基)-1,5-二甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-胺(6.3g,21.88mmol),3,6-二氯哒嗪(3.9g,26.26mmol)和DIPEA(5.4g,42mmol)在100mL DMSO中的溶液在氮气保护下加热至140℃ 6h。将反应混合物冷却至室温。将100mL水加至该混合物并用乙酸乙酯(105mL X 3)萃取。将合并的有机层用饱和NH4Cl水溶液,盐水洗涤,经无水Na2SO4干燥,浓缩并通过硅胶色谱(10-50%乙酸乙酯/石油醚)纯化,其得到棕色固体状的(1R,3s,5S)-N-(6-氯哒嗪-3-基)-9-(4-甲氧基苄基)-1,5-二甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-胺(4.2g,50%收率)。LCMS:m/z 401.2[M+H]+;tR=1.39分钟。
步骤8:合成(1R,3s,5S)-N-(6-氯哒嗪-3-基)-9-(4-甲氧基苄基)-N,1,5-三甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-胺
室温下将氢化钠(768mg,16mmol,60%于矿物油中)加至(1S,3R)-N-(6-氯哒嗪-3-基)-9-(4-甲氧基苄基)-1,5-二甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-胺(4.2g,10.5mmol)在100mL THF中的搅拌溶液。将反应搅拌30分钟后,将碘甲烷(1.78g,12.6mmol)加至混合物。将反应加热至50℃ 6h。将反应混合物冷却至室温,用50mL水淬灭并用乙酸乙酯(100mL X3)萃取。将合并的有机层用盐水洗涤,经无水Na2SO4干燥,浓缩并通过硅胶色谱(10-60%乙酸乙酯/石油醚)纯化,其得到棕色固体状的(1S,3R)-N-(6-氯哒嗪-3-基)-9-(4-甲氧基苄基)-N,1,5-三甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-胺(2.7g,60%收率)。LCMS:m/z 415.2[M+H]+;tR=1.42分钟。
步骤9:合成2-溴-5-氯-4-氟苯酚
室温下将溴(3.52g,22mmol)加至3-氯-4-氟苯酚(4.02g,20mmol)在80mL CH2Cl2中的搅拌溶液。将混合物在室温下搅拌18h并用10mLa2S2O3水溶液淬灭。收集有机相,浓缩并通过硅胶色谱(0-10%EtOAc/石油醚)纯化,其得到2.5g白色固体状的2-溴-5-氯-4-氟苯酚(44%收率)。1H NMR(500MHz,氯仿-d)δ7.29(d,J=8.0Hz,1H),7.08(d,J=6.6Hz,1H),5.45(s,1H)。LCMS:tR=1.44分钟。
步骤10:合成1-溴-4-氯-5-氟-2-(甲氧基甲氧基)苯
0℃下将氢化钠(215mg,5.4mmol,60%于矿物油中)加至2-溴-5-氯-4-氟苯酚(1g,4.48mmol)在14mL DMF中的搅拌溶液。搅拌30分钟后,加入溴(甲氧基)甲烷(428mg,8mmol)。然后将混合物在室温下搅拌2h,用10mL饱和NH4Cl水溶液淬灭并用EtOAc(30mL X 3)萃取。将合并的有机溶剂浓缩并通过硅胶柱(0-8%EtOAc/石油醚)纯化,其得到1.01g白色固体状的1-溴-4-氯-5-氟-2-(甲氧基甲氧基)苯(70%收率)。1H NMR(500MHz,氯仿-d)δ7.37(d,J=8.1Hz,1H),7.23(d,J=6.6Hz,1H),5.20(s,2H),3.52(s,3H)。
步骤11:合成(1R,3s,5S)-N-(6-(4-氯-5-氟-2-(甲氧基甲氧基)苯基)哒嗪-3-基)-9-(4-甲氧基苄基)-N,1,5-三甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-胺
将1-溴-4-氯-5-氟-2-(甲氧基甲氧基)苯(600mg,2.22mmol),4,4,4',4',5,5,5',5'-八甲基-2,2'-双(1,3,2-二氧杂环戊硼烷)(677mg,2.66mmol),Pd(dppf)Cl2(325mg,0.44mmol)和KOAc(435mg,4.44mmol)在8mL二噁烷中的混合物脱气并在100℃下搅拌6h。将混合物冷却至室温,加入(1R,3s,5S)-N-(6-氯哒嗪-3-基)-9-(4-甲氧基苄基)-N,1,5-三甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-胺(735mg,1.78mmol),Pd(dppf)Cl2(325mg,0.44mmol),K2CO3(613mg,4.44mmol)和1mL H2O。将混合物脱气并在100℃下搅拌2h,浓缩并通过硅胶柱(40%EtOAc/石油醚)纯化,其得到615mg棕色固体状的(1R,3s,5S)-N-(6-(4-氯-5-氟-2-(甲氧基甲氧基)苯基)哒嗪-3-基)-9-(4-甲氧基苄基)-N,1,5-三甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-胺(49%收率)。LCMS:m/z 569.0[M+H]+;tR=2.54分钟。
步骤12:合成(1R,3s,5S)-N-(6-(5-氟-2-(甲氧基甲氧基)-4-(1H-吡唑-4-基)苯基)哒嗪-3-基)-9-(4-甲氧基苄基)-N,1,5-三甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-胺
将(1R,3s,5S)-N-(6-(4-氯-5-氟-2-(甲氧基甲氧基)苯基)哒嗪-3-基)-9-(4-甲氧基苄基)-N,1,5-三甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-胺(188mg,0.33mmol),4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼-2-基)-1H-吡唑(65mg,0.33mmol),催化剂(52mg,0.07mmol)和K3PO4(141mg,0.66mmol)在2mL二噁烷和0.3mL H2O中的混合物脱气并在100℃下搅拌16h。将混合物过滤,浓缩并通过硅胶柱(40-100%EtOAc/石油醚)纯化,其得到113mg白色固体状的(1R,3s,5S)-N-(6-(5-氟-2-(甲氧基甲氧基)-4-(1H-吡唑-4-基)苯基)哒嗪-3-基)-9-(4-甲氧基苄基)-N,1,5-三甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-胺(57%收率)。LCMS:m/z 601.2[M+H]+;tR=2.27分钟。
步骤13:合成2-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-4-氟-5-(1H-吡唑-4-基)苯酚
将(1R,3s,5S)-N-(6-(5-氟-2-(甲氧基甲氧基)-4-(1H-吡唑-4-基)苯基)哒嗪-3-基)-9-(4-甲氧基苄基)-N,1,5-三甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-胺(113mg,0.19mmol)在10mL TFA中的混合物在70℃下搅拌72h。将反应混合物浓缩,加入NH3/MeOH(7N)以使pH=9,浓缩并通过硅胶柱(80%MeOH/EtOAc)纯化,其得到2-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-9-氮杂双环[3.3.1]壬-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-4-氟-5-(1H-吡唑-4-基)苯酚(13mg,16%收率)。H NMR(500MHz,DMSO-d6)δ13.52(s,1H),13.13(s,1H),8.22(d,J=10.1Hz,1H),8.18-7.91(m,2H),7.80(d,J=12.7Hz,1H),7.29(dd,J=11.7,8.3Hz,2H),5.74(m,1H),2.88(s,2H),2.15-1.99(m,1H),1.63(m,5H),1.56-1.24(m,4H),1.05(s,6H)。LCMS:m/z437.0[M+H]+;tR=1.77分钟。
实施例8:合成4-(4-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基) (甲基)氨基)哒嗪-3-基)-3-羟基苯基)-1-甲基吡啶-2(1H)-酮
步骤1:合成1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-酮
将70mL H2O中的氢化钾(108g,1.93mol)加至3-氧代戊二酸(120g,822mmol)和己烷-2,5-二酮(49.2g,432mmol)在350mL H2O中和0℃下的搅拌溶液.加入后,加入667mL H2O中的NH4Cl(70.1g,1.32mol)和NaOAc三水合物(70.1g,515mmol)。通过使用1N NaOH水溶液调节pH值至~9。将混合物在室温下搅拌72h,其间通过使用另外的1N NaOH水溶液调节pH值至~9。将混合物用CH2Cl2(1L X 5)萃取。将合并的有机溶剂经无水Na2SO4干燥,浓缩并通过硅胶色谱(0-25%MeOH/CH2Cl2)纯化,其得到16.7g黑色油状的1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-酮(25%收率)。LCMS:m/z 154.2[M+H]+;tR=1.20分钟;纯度:85%。
步骤2:合成1,5-二甲基-3-氧代-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯
将1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-酮(24g,163mmol),二碳酸二叔丁酯(35.6g,326mmol)和DIPEA(31.5g,244mmol)在500mL 1,4-二噁烷中的混合物在70℃下搅拌6h。将混合物浓缩并通过硅胶色谱(0-30%EtOAc/石油醚)纯化,其得到16.7白色固体状的1,5-二甲基-3-氧代-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯(收率:42%)。LCMS:m/z198.1[M-55]+;tR=1.40分钟;纯度:100%.
步骤3:合成3-(肟基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯
将1,5-二甲基-3-氧代-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯(16.7g,66mmol),盐酸羟胺(18.2g,26.4mmol)和NaOAc(10.8g,132mmol)在250mL EtOH中的混合物在70℃下搅拌4h。将混合物浓缩。加入200mL EtOAc和60mL H2O。将有机相分离,用盐水(50mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥,浓缩以得到16.7g黄色固体状的3-(肟基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯,其直接用于下一步骤(93%收率)。LCMS:m/z269.2[M+H]+;tR=1.92分钟;纯度:100%。
步骤4:合成(1R,3s,5S)-3-氨基-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯
将钠(40.2g,1.75mol)按份加至3-(肟基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯(26.8g,0.1mol)在1000mL n-PrOH中的混合物,其经1h加热至110℃。加入后,将混合物在回流下另外搅拌1h。将混合物冷却至室温,用H2O(500mL)淬灭。将有机层分离并浓缩。将DCM(500mL)加至残余物。滤除固体并将滤液在减压下浓缩,其得到20g黄色油状的(1R,3s,5S)-3-氨基-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯,其直接用于下一步骤(收率:79%)。LCMS:m/z 255.3[M+H]+;tR=1.37分钟;纯度:99%。
步骤5:合成(1R,3s,5S)-3-((6-氯哒嗪-3-基)氨基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯
将(1R,3s,5S)-3-氨基-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯(20g,78.7mmol),3,6-二氯哒嗪(23.3g,157.5mmol)和DIPEA(20.48g,157.5mmol)在500mLDMSO中的混合物在120℃下搅拌24h。将混合物冷却至室温,用H2O淬灭并用乙酸乙酯(500mLX 3)萃取。将合并的有机层用盐水洗涤,经无水Na2SO4干燥并在减压下浓缩.除去溶剂后,将粗产物通过硅胶柱(50%EtOAc/石油醚)纯化,其得到17.5g黄色固体状的(1R,3s,5S)-3-((6-氯哒嗪-3-基)氨基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯(收率:61%)。LCMS:m/z 367.2[M+H]+;tR=1.88分钟;纯度:99%。
步骤6:合成(1R,3s,5S)-3-((6-氯哒嗪-3-基)(甲基)氨基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯
0℃下将氢化钠(2.87g,71.7mmol)加至(1R,3s,5S)-3-((6-氯哒嗪-3-基)氨基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯(17.5g,47.8mmol)在400mL DMF中的搅拌溶液。0℃下搅拌20分钟后,加入碘甲烷(13.58g,95.6mmol)。然后将混合物在室温下搅拌1h,用H2O淬灭并用EtOAc(300mL X 3)萃取。将合并的有机相用盐水洗涤,经无水Na2SO4干燥,在减压下浓缩并通过硅胶柱(30%EtOAc/石油醚)纯化,其得到14.5g黄色固体状的(1R,3s,5S)-3-((6-氯哒嗪-3-基)(甲基)氨基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯(80%收率)。LCMS:m/z 381.2[M+H]+;tR=2.17分钟;纯度:99%。
步骤7:合成1-溴-4-氯-2-(甲氧基甲氧基)苯
0℃下将氢化钠(185g,46.3mmol,60%于矿物油中)加至2-溴-5-氯苯酚(8g,38.6mmol)在150mL DMF中的搅拌溶液。0℃下搅拌30分钟后,加入MOMBr(7.25g,58mmol)。然后将混合物在室温下搅拌2h,用NH4Cl水溶液(15mL)淬灭,用EtOAc(30mL X 3)萃取。将合并的有机溶剂经无水Na2SO4干燥,浓缩并通过硅胶色谱(0-10%EtOAc/石油醚)纯化,其得到8.1g无色油状的1-溴-4-氯-2-(甲氧基甲氧基)苯(84%收率)。1H NMR(500MHz,氯仿-d)δ7.45(d,J=8.5Hz,1H),7.17(d,J=2.3Hz,1H),6.89(dd,J=8.4,2.3Hz,1H),5.24(s,2H)。LCMS:tR=1.51分钟。
步骤8:合成4-氯-2-(甲氧基甲氧基)苯基硼酸
-78℃和氮气下将n-BuLi的己烷溶液(5.76mL,14.4mmol)加至1-溴-4-氯-2-(甲氧基甲氧基)苯(3g,12mmol)在40mL THF中的搅拌溶液。-78℃下搅拌40分钟后,加入B(OMe)3(2g,19.2mmol)。使混合物升温至室温,并搅拌16h。将NH4Cl水溶液(10mL)加至混合物。将混合物用EtOAc(20mL X 3)萃取。将合并的有机溶剂用盐水(10mL)洗涤,经Na2SO4干燥,浓缩并自3%EtOAc/石油醚重结晶,其得到1.6g灰白色固体状的4-氯-2-(甲氧基甲氧基)苯基硼酸(62%收率)。LCMS:m/z 199.1[M-OH]+;tR=1.65分钟。
步骤9:合成(1R,3s,5S)-3-((6-(4-氯-2-(甲氧基甲氧基)苯基)哒嗪-3-基)(甲基)氨基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯
将(1R,3s,5S)-3-((6-氯哒嗪-3-基)(甲基)氨基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯(6g,16.4mmol),4-氯-2-(甲氧基甲氧基)苯基硼酸(5.3g,24.6mmol),Pd(dppf)Cl2(1.6mg,2mmol)和K2CO3(4.53mg,32.8mmol)在80mL二噁烷和8mLH2O中的混合物脱气并在100℃下搅拌7h。冷却至室温后,将混合物浓缩并通过硅胶柱(10-60%EtOAc/石油醚)纯化,其得到4.52g白色固体状的(1R,3s,5S)-3-((6-(4-氯-2-(甲氧基甲氧基)苯基)哒嗪-3-基)(甲基)氨基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯(57%收率)。LCMS:m/z 517.3[M+H]+;tR=1.86分钟。
步骤10:合成(1R,3s,5S)-3-((6-(2-(甲氧基甲氧基)-4-(1-甲基-2-氧代-1,2-二氢吡啶-4-基)苯基)哒嗪-3-基)(甲基)氨基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯
将(1R,3s,5S)-3-((6-(4-氯-2-(甲氧基甲氧基)苯基)哒嗪-3-基)(甲基)氨基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯(4g,7.75mmol),1-甲基-2-氧代-1,2-二氢吡啶-4-基硼酸(1.77g,11.6mmol),催化剂(610mg mg,0.78mmol)和K3PO4(3.29g,15.5mmol)在30mL二噁烷和10mL H2O中的混合物脱气并在100℃下搅拌6h。将混合物过滤,浓缩并通过硅胶柱(0-15%MeOH/EtOAc)纯化,其得到4.2g白色固体状的(1R,3s,5S)-3-((6-(2-(甲氧基甲氧基)-4-(1-甲基-2-氧代-1,2-二氢吡啶-4-基)苯基)哒嗪-3-基)(甲基)氨基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯(77%收率)。LCMS:m/z590.2[M+H]+;tR=2.09分钟。
步骤11:合成4-(4-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-3-羟基苯基)-1-甲基吡啶-2(1H)-酮
将30mL 4N HCl/二噁烷溶液加至(1R,3s,5S)-3-((6-(2-(甲氧基甲氧基)-4-(1-甲基-2-氧代-1,2-二氢吡啶-4-基)苯基)哒嗪-3-基)(甲基)氨基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯(3g,5.1mmol)在20mL CH2Cl2和20mL MeOH中的搅拌溶液。将混合物在室温下搅拌3h,在减压下浓缩。将残余物溶于水中。加入K2CO3水溶液以调节pH=9。收集固体并真空干燥,其得到2.15g黄色固体状的4-(4-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-3-羟基苯基)-1-甲基吡啶-2(1H)-酮(80%收率)。
1H NMR(500MHz,DMSO-d6)δ13.75(s,1H),8.25(d,J=10.0Hz,1H),7.97(d,J=8.2Hz,1H),7.78(d,J=7.1Hz,1H),7.38(d,J=9.9Hz,1H),7.29-7.22(m,2H),6.70(s,1H),6.61(d,J=7.2Hz,1H),4.94(s,1H),3.46(s,3H),2.94(s,3H),1.88-1.83(m,2H),1.61-1.42(m,6H),1.23(s,6H)。LCMS:m/z 446.1[M+H]+;tR=1.72分钟。
实施例9:合成4-(4-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基) (甲基)氨基)哒嗪-3-基)-2-氟-5-羟基苯基)-1-甲基吡啶-2(1H)-酮
步骤1:合成1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-酮
将70mL H2O中的氢氧化钾(108g,1.93mol)加至3-氧代戊二酸(120g,822mmol)和己烷-2,5-二酮(49.2g,432mmol)在350mL H2O中和0℃下的搅拌溶液。加入后,加入667mLH2O中的NH4Cl(70.1g,1.32mol)和NaOAc三水合物(70.1g,515mmol)。通过使用1N NaOH水溶液调节pH值至~9。将混合物在室温下搅拌72h,其间通过使用另外的1N NaOH水溶液调节pH值至~9。将混合物用CH2Cl2(1L X 5)萃取。将合并的有机溶剂经无水Na2SO4干燥,浓缩并通过硅胶色谱(0-25%MeOH/CH2Cl2)纯化以得到16.7g黑色油状的1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-酮(25%收率)。LCMS:m/z 154.2[M+H]+;tR=1.20分钟。
步骤2:合成1,5-二甲基-3-氧代-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯
将1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-酮(24g,163mmol),二碳酸二叔丁酯(35.6g,326mmol)和DIPEA(31.5g,244mmol)在500mL 1,4-二噁烷中的混合物在70℃下搅拌6h。将混合物浓缩并通过硅胶色谱(0-30%EtOAc/石油醚)纯化以得到16.7白色固体状的1,5-二甲基-3-氧代-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯(收率:42%)。LCMS:m/z 198.1[M-55]+;tR=1.40分钟。
步骤3:合成3-(肟基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯
将1,5-二甲基-3-氧代-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯(16.7g,66mmol),盐酸羟胺(18.2g,26.4mmol)和NaOAc(10.8g,132mmol)在250mL EtOH中的混合物在70℃下搅拌4h。将混合物浓缩。加入200mL EtOAc和60mL H2O。将有机相分离,用盐水(50mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥,浓缩以得到16.7g黄色固体状的3-(肟基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯,其直接用于下一步骤(93%收率)。LCMS:m/z269.2[M+H]+;tR=1.92分钟。
步骤4:合成(1R,3s,5S)-3-氨基-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯
将钠(40.2g,1.75mol)按份加至3-(肟基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯(26.8g,0.1mol)在1000mL n-PrOH中的混合物,其经1h加热至110℃ 1h。加入后,将混合物在回流下另外搅拌1h。将混合物冷却至室温,用H2O(500mL)淬灭。分离有机层并浓缩。将DCM(500mL)加至残余物。滤除固体并将滤液在减压下浓缩以得到20g黄色油状的(1R,3s,5S)-3-氨基-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯,其直接用于下一步骤(收率:79%).LCMS:m/z 255.3[M+H]+;tR=1.37分钟。
步骤5:合成(1R,3s,5S)-3-((6-氯哒嗪-3-基)氨基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯
将(1R,3s,5S)-3-氨基-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯(20g,78.7mmol),3,6-二氯哒嗪(23.3g,157.5mmol)和DIPEA(20.48g,157.5mmol)在500mLDMSO中的混合物在120℃下搅拌24h。将混合物冷却至室温,用H2O淬灭并用乙酸乙酯(500mLX 3)萃取。将合并的有机层用盐水洗涤,经无水Na2SO4干燥并在减压下浓缩.除去溶剂后,将粗产物通过硅胶柱(50%EtOAc/石油醚)纯化以得到17.5g黄色固体状的(1R,3s,5S)-3-((6-氯哒嗪-3-基)氨基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯(收率:61%)。LCMS:m/z 367.2[M+H]+;tR=1.88分钟。
步骤6:合成(1R,3s,5S)-3-((6-氯哒嗪-3-基)(甲基)氨基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯
0℃下将氢化钠(2.87g,71.7mmol,60%于矿物油中)加至(1R,3s,5S)-3-((6-氯哒嗪-3-基)氨基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯(17.5g,47.8mmol)在400mL DMF中的搅拌溶液。0℃下搅拌20分钟后,加入CH3I(13.58g,95.6mmol)。然后将混合物在室温下搅拌1h,用H2O淬灭并用EtOAc(300mL X 3)萃取。将合并的有机相用盐水洗涤,经无水Na2SO4干燥,在减压下浓缩并通过硅胶柱(30%EtOAc/石油醚)纯化以得到14.5g黄色固体状的(1R,3s,5S)-3-((6-氯哒嗪-3-基)(甲基)氨基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯(80%收率)。LCMS:m/z 381.2[M+H]+;tR=2.17分钟。
步骤7:合成2-溴-5-氯-4-氟苯酚
室温下将溴(3.52g,22mmol)加至3-氯-4-氟苯酚(4.02g,20mmol)在80mL CH2Cl2中的搅拌溶液。将混合物在室温下搅拌18h,并用10mL Na2S2O3水溶液淬灭。收集有机相,浓缩并通过硅胶色谱(0-10%EtOAc/石油醚)纯化以得到2.5g白色固体状的2-溴-5-氯-4-氟苯酚(44%收率)。1H NMR(500MHz,氯仿-d)δ7.29(d,J=8.0Hz,1H),7.08(d,J=6.6Hz,1H),5.45(s,1H)。LCMS:tR=1.44分钟。
步骤8:合成1-溴-4-氯-5-氟-2-(甲氧基甲氧基)苯
0℃下将氢化钠(215mg,5.4mmol)加至2-溴-5-氯-4-氟苯酚(1g,4.48mmol)在14mLDMF中的搅拌溶液。搅拌30分钟后,加入溴(甲氧基)甲烷(428mg,8mmol)。然后将混合物在室温下搅拌2h,用10mL饱和NH4Cl水溶液淬灭并用EtOAc(30mL X 3)萃取。将合并的有机溶剂浓缩并通过硅胶柱(0-8%EtOAc/石油醚)纯化以得到1.01g白色固体状的1-溴-4-氯-5-氟-2-(甲氧基甲氧基)苯(70%收率)。1H NMR(500MHz,氯仿-d)δ7.37(d,J=8.1Hz,1H),7.23(d,J=6.6Hz,1H),5.20(s,2H),3.52(s,3H)。
步骤9:合成(1R,3s,5S)-3-((6-(4-氯-5-氟-2-(甲氧基甲氧基)苯基)哒嗪-3-基)(甲基)氨基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯
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将1-溴-4-氯-5-氟-2-(甲氧基甲氧基)苯(8.5g,31.7mmol),4,4,4',4',5,5,5',5'-八甲基-2,2'-双(1,3,2-二氧杂环戊硼烷)(12.1g,47.5mmol),Pd(dppf)Cl2(1.86g,2.54mmol)和KOAc(6.2g,63.4mmol)相似200mL二噁烷中的混合物脱气并在100℃下搅拌8h。冷却至室温后,加入(1R,3s,5S)-3-((6-氯哒嗪-3-基)(甲基)氨基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯(8g,21.2mmol),K2CO3(5.8g,42.3mmol)和H2O(30mL)。将混合物在100℃下搅拌3h,浓缩并通过硅胶柱(10-25%EtOAc/石油醚)纯化,其得到6g淡黄色固体状的(1R,3s,5S)-3-((6-(4-氯-5-氟-2-(甲氧基甲氧基)苯基)哒嗪-3-基)(甲基)氨基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯(53%收率)。LCMS:m/z 535.2[M+H]+;tR=2.40分钟。
步骤10:合成(1R,3s,5S)-3-((6-(5-氟-2-(甲氧基甲氧基)-4-(1-甲基-2-氧代-1,2-二氢吡啶-4-基)苯基)哒嗪-3-基)(甲基)氨基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯
将(1R,3s,5S)-3-((6-(4-氯-5-氟-2-(甲氧基甲氧基)苯基)哒嗪-3-基)(甲基)氨基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯(120mg,0.22mmol),1-甲基-2-氧代-1,2-二氢吡啶-4-基硼酸(63mg,0.27mmol),Pd(dppf)Cl2(20mg,0.028mmol)和K2CO3(77mg,0.56mmol)在2mL 1,4-二噁烷和0.4mL水中的混合物用氮气吹扫并密封。将混合物在130℃和MW下搅拌2h,浓缩并通过硅胶色谱(0-10%MeOH/CH2Cl2)纯化,其得到110mg白色固体状的(1R,3s,5S)-3-((6-(5-氟-2-(甲氧基甲氧基)-4-(1-甲基-2-氧代-1,2-二氢吡啶-4-基)苯基)哒嗪-3-基)(甲基)氨基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯(82%收率)。LCMS:m/z 608.2[M+H]+;tR=1.59分钟。
步骤11:合成4-(4-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-2-氟-5-羟基苯基)-1-甲基吡啶-2(1H)-酮
向(1R,3s,5S)-3-((6-(5-氟-2-(甲氧基甲氧基)-4-(1-甲基-2-氧代-1,2-二氢吡啶-4-基)苯基)哒嗪-3-基)(甲基)氨基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯(100mg,0.16mmol)在2mL CH2Cl2中的搅拌溶液中加入4mL 4N HCl/二噁烷溶液。将混合物在室温下搅拌2h,在减压下浓缩,用NH3/MeOH中和并通过制备型HPLC纯化以得到37mg黄色固体状的4-(4-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-2-氟-5-羟基苯基)-1-甲基吡啶-2(1H)-酮(50%收率)。
实施例10:合成2-(6-((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基氧 基)哒嗪-3-基)-5-(1H-吡唑-4-基)苯酚
步骤1:合成1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-酮
将70mL H2O中的氢氧化钾(108g,1.93mol)加至3-氧代戊二酸(120g,822mmol)和己烷-2,5-二酮(49.2g,432mmol)在350mL H2O中的和0℃下的搅拌溶液。加入后,加入667mLH2O中的NH4Cl(70.1g,1.32mol)和NaOAc三水合物(70.1g,515mmol)。通过使用1N NaOH水溶液调节pH值至~9。将混合物在室温下搅拌72h,其间通过使用另外的1N NaOH水溶液调节pH值至~9。将混合物用CH2Cl2(1L X 5)萃取。将合并的有机溶剂经无水Na2SO4干燥,浓缩并通过硅胶色谱(0-25%MeOH/CH2Cl2)纯化,其得到16.7g黑色油状的1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-酮(25%收率)。LCMS:m/z 154.2[M+H]+;tR=1.20分钟。
步骤2:合成1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-醇
0℃下将硼氢化钠(224mg,5.88mmol)加至1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-酮(600mg,3.92mmol)在10mL甲醇中的搅拌溶液。将混合物在室温下搅拌3h并浓缩。加入100mL EtOAc和60mL H2O。分离有机相,用盐水(50mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥并浓缩,其得到600mg白色固体状的1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-醇的异构体混合物(收率:99%)。LCMS:m/z 156.3[M+H]+;tR=0.28分钟。
步骤3:合成(1R,3s,5S)-3-(6-氯哒嗪-3-基氧基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷
室温下将氢化钠(129mg,3.23mmol,60%于矿物油中)加至1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-醇(200mg,1.29mmol)在THF(10mL)中的混合物。将混合物在室温下搅拌30分钟。然后加入3,6-二氯哒嗪(210mg,1.42mmol)。将混合物在50℃下搅拌18小时。冷却至室温后,将混合物用20mL水淬灭,用EtOAc(20mL X 3)萃取。将合并的有机溶剂用水(10mL)洗涤,浓缩并通过硅胶柱(0-10%MeOH/DCM)纯化异构体,其得到45mg白色固体状的(1R,3s,5S)-3-(6-氯哒嗪-3-基氧基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷(13%收率)。LCMS:m/z268.1[M+H]+;tR=1.56分钟。
步骤4:合成1-溴-4-碘-2-(甲氧基甲氧基)苯
0℃下将甲氧基甲基溴化物(1.25g,10mmol)加至2-溴-5-碘苯酚(1.5g,5mmol)和K2CO3(1.38g,10mmol)在20mL DMF中的搅拌溶液。然后将混合物在室温下搅拌16h,用20mLH2O淬灭并用EtOAc(20mL X 3)萃取。将合并的有机溶剂经无水Na2SO4干燥,浓缩并通过硅胶柱(0-5%EtOAc/石油醚)纯化以得到1.45g无色液体状的1-溴-4-碘-2-(甲氧基甲氧基)苯(79%收率)。LCMS:tR=1.50分钟。
步骤5:合成4-(4-溴-3-(甲氧基甲氧基)苯基)-1-(四氢-2H-吡喃-2-基)-1H-吡唑
将1-溴-4-碘-2-(甲氧基甲氧基)苯(3.3g,9.6mmol),1-(四氢-2H-吡喃-2-基)-4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼-2-基)-1H-吡唑(2.67g,9.6mmol),Pd(dppf)Cl2(866mg,1mmol)和K2CO3(2.66g,19.3mmol)在40mL二噁烷和4mL H2O中的混合物脱气并在105℃下搅拌8h。冷却至室温后,将混合物用EtOAc(30mL X 3)萃取。将合并的有机溶剂浓缩并通过硅胶柱(10-50%EtOAc/石油醚)纯化,其得到2.5g无色油状的4-(4-溴-3-(甲氧基甲氧基)苯基)-1-(四氢-2H-吡喃-2-基)-1H-吡唑(69%收率)。LCMS:m/z 367.1[M+H]+;tR=2.03分钟。
步骤6:合成4-(3-(甲氧基甲氧基)-4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼-2-基)苯基)-1-(四氢-2H-吡喃-2-基)-1H-吡唑
将4-(4-溴-3-(甲氧基甲氧基)苯基)-1-(四氢-2H-吡喃-2-基)-1H-吡唑(1.5g,4.1mmol),4,4,4',4',5,5,5',5'-八甲基-2,2'-双(1,3,2-二氧杂环戊硼烷)(2.1g,8.2mmol),Pd(dppf)Cl2(369mg,0.41mmol)和KOAc(804mg,8.2mmol)在20mL二噁烷中的混合物脱气并在105℃下搅拌8h。将混合物过滤,浓缩并通过硅胶柱纯化以得到0.81g无色油状的4-(3-(甲氧基甲氧基)-4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼-2-基)苯基)-1-(四氢-2H-吡喃-2-基)-1H-吡唑(48%收率)。LCMS:m/z 415.3[M+H]+;tR=2.10分钟。
步骤7:合成(1R,3s,5S)-3-((6-(2-(甲氧基甲氧基)-4-(1-(四氢-2H-吡喃-2-基)-1H-吡唑-4-基)苯基)哒嗪-3-基)氧基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷
将(1R,3s,5S)-3-(6-氯哒嗪-3-基氧基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷(40mg,0.15mmol),4-(3-(甲氧基甲氧基)-4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼-2-基)苯基)-1-(四氢-2H-吡喃-2-基)-1H-吡唑(81mg,0.20mmol),Pd(dppf)Cl2(15mg,0.021mmol)和K2CO3(42mg,0.30mmol)在1.5mL1,4-二噁烷和0.5mL水中的混合物脱气并在氮气氛和105℃下搅拌2h。然后将混合物浓缩并通过硅胶色谱(1-15%MeOH/DCM)纯化,其得到60mg白色固体状的(1R,3s,5S)-3-((6-(2-(甲氧基甲氧基)-4-(1-(四氢-2H-吡喃-2-基)-1H-吡唑-4-基)苯基)哒嗪-3-基)氧基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷(78%收率)。LCMS:m/z 520.3[M+H]+;tR=1.89分钟。
步骤8:合成2-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)氧基)哒嗪-3-基)-5-(1H-吡唑-4-基)苯酚
室温下将1mL 4N HCl/二噁烷溶液加至(1R,3s,5S)-3-((6-(2-(甲氧基甲氧基)-4-(1-(四氢-2H-吡喃-2-基)-1H-吡唑-4-基)苯基)哒嗪-3-基)氧基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷(60mg,0.12mmol)在1mL CH2Cl2中的溶液。在室温下搅拌1h后,将混合物浓缩,用氢氧化铵中和并通过制备型HPLC(NH4HCO3)纯化,其得到30mg黄色固体状的2-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)氧基)哒嗪-3-基)-5-(1H-吡唑-4-基)苯酚(67%收率)。
实施例11:合成2-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基) (甲基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(6-甲氧基哒嗪-4-基)苯酚
步骤1:合成1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-酮
将70mL H2O中的氢氧化钾(108g,1.93mol)加至3-氧代戊二酸(120g,822mmol)和己烷-2,5-二酮(49.2g,432mmol)在350mL H2O中的0℃下的搅拌溶液。加入后,加入667mLH2O中的NH4Cl(70.1g,1.32mol)和NaOAc三水合物(70.1g,515mmol)。通过使用1N NaOH水溶液调节pH值至~9。将混合物在室温下搅拌72h,其间通过使用另外的1N NaOH水溶液调节pH值至~9。将混合物用CH2Cl2(1L X 5)萃取。将合并的有机溶剂经无水Na2SO4干燥,浓缩并通过硅胶色谱(0-25%MeOH/CH2Cl2)纯化,其得到16.7g黑色油状的1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-酮(25%收率)。LCMS:m/z 154.2[M+H]+;tR=1.20分钟;纯度:85%。
步骤2:合成1,5-二甲基-3-氧代-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯
将1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-酮(24g,163mmol),二碳酸二叔丁酯(35.6g,326mmol)和DIPEA(31.5g,244mmol)在500mL 1,4-二噁烷中的混合物在70℃下搅拌6h。将混合物浓缩并通过硅胶色谱(0-30%EtOAc/石油醚)纯化,其得到16.7白色固体状的1,5-二甲基-3-氧代-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯(收率:42%)。LCMS:m/z198.1[M-55]+;tR=1.40分钟;纯度:100%。
步骤3:合成3-(肟基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯
将1,5-二甲基-3-氧代-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯(16.7g,66mmol),盐酸羟胺(18.2g,26.4mmol)和NaOAc(10.8g,132mmol)在250mL EtOH中的混合物在70℃下搅拌4h。将混合物浓缩。加入200mL EtOAc和60mL H2O。分离有机相,用盐水(50mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥,浓缩,其得到16.7g黄色固体状的3-(肟基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯,其直接用于下一步骤(93%收率)。LCMS:m/z269.2[M+H]+;tR=1.92分钟;纯度:100%。
步骤4:合成(1R,3s,5S)-3-氨基-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯
将钠(40.2g,1.75mol)按份加至3-(肟基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯(26.8g,0.1mol)在1000mL n-PrOH中的混合物,其经1h加热至110℃。加入后,将混合物在回流下另外搅拌1h。将混合物冷却至室温,用H2O(500mL)淬灭。将有机层分离并浓缩。将DCM(500mL)加至残余物。磨碎滤除固体并将滤液在减压下浓缩以得到20g黄色油状的(1R,3s,5S)-3-氨基-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯,其直接用于下一步骤(收率:79%)。LCMS:m/z 255.3[M+H]+;tR=1.37分钟;纯度:99%。
步骤5:合成(1R,3s,5S)-3-((6-氯哒嗪-3-基)氨基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯
将(1R,3s,5S)-3-氨基-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯(20g,78.7mmol),3,6-二氯哒嗪(23.3g,157.5mmol)和DIPEA(20.48g,157.5mmol)在500mLDMSO中的混合物在120℃下搅拌24h。将混合物冷却至室温,用H2O淬灭并用乙酸乙酯(500mLX 3)萃取。将合并的有机层用盐水洗涤,经无水Na2SO4干燥并在减压下浓缩。除去溶剂后,将粗产物通过硅胶柱(50%EtOAc/石油醚)纯化,其得到17.5g黄色固体状的(1R,3s,5S)-3-((6-氯哒嗪-3-基)氨基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯(收率:61%)。LCMS:m/z 367.2[M+H]+;tR=1.88分钟;纯度:99%。
步骤6:合成(1R,3s,5S)-3-((6-氯哒嗪-3-基)(甲基)氨基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯
0℃下将氢化钠(2.87g,71.7mmol)加至(1R,3s,5S)-3-((6-氯哒嗪-3-基)氨基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯(17.5g,47.8mmol)在400mL DMF中的搅拌溶液。0℃下搅拌20分钟后,加入CH3I(13.58g,95.6mmol)。然后将混合物在室温下搅拌1h,用H2O淬灭并用EtOAc(300mL X 3)萃取。将合并的有机相用盐水洗涤,经无水Na2SO4干燥,在减压下浓缩并通过硅胶柱(30%EtOAc/石油醚)纯化,其得到14.5g黄色固体状的(1R,3s,5S)-3-((6-氯哒嗪-3-基)(甲基)氨基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯(80%收率)。LCMS:m/z 381.2[M+H]+;tR=2.17分钟;纯度:99%。
步骤7:合成1-溴-4-氯-2-(甲氧基甲氧基)苯
0℃下将氢化钠(185g,46.3mmol,60%于矿物油中)加至2-溴-5-氯苯酚(8g,38.6mmol)在150mL DMF中的搅拌溶液。0℃下搅拌30分钟后,加入MOMBr(7.25g,58mmol)。然后将混合物在室温下搅拌2h,用NH4Cl水溶液(15mL)淬灭,用EtOAc(30mL X 3)萃取。将合并的有机溶剂经无水Na2SO4干燥,浓缩并通过硅胶色谱(0-10%EtOAc/石油醚)纯化,其得到8.1g无色油状的1-溴-4-氯-2-(甲氧基甲氧基)苯(84%收率)。1H NMR(500MHz,氯仿-d)δ7.45(d,J=8.5Hz,1H),7.17(d,J=2.3Hz,1H),6.89(dd,J=8.4,2.3Hz,1H),5.24(s,2H)。LCMS:tR=1.51分钟。
步骤8:合成4-氯-2-(甲氧基甲氧基)苯基硼酸
在氮气和-78℃下向1-溴-4-氯-2-(甲氧基甲氧基)苯(3g,12mmol)在40mL THF中的搅拌溶液中加入n-BuLi(5.76mL,14.4mmol)。-78℃下搅拌40分钟后,加入B(OMe)3(2g,19.2mmol)。使混合物升温至室温并搅拌16h。将NH4Cl水溶液(10mL)加至混合物。将混合物用EtOAc(20mL X 3)萃取。将合并的有机溶剂用盐水(10mL)洗涤,经Na2SO4干燥,浓缩并自3%EtOAc/石油醚重结晶,其得到1.6g灰白色固体状的4-氯-2-(甲氧基甲氧基)苯基硼酸(62%收率)。LCMS:m/z 199.1[M-OH]+;tR=1.65分钟。
步骤9:合成(1R,3s,5S)-3-((6-(4-氯-2-(甲氧基甲氧基)苯基)哒嗪-3-基)(甲基)氨基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯
将(1R,3s,5S)-3-((6-氯哒嗪-3-基)(甲基)氨基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯(6g,16.4mmol),4-氯-2-(甲氧基甲氧基)苯基硼酸(5.3g,24.6mmol),Pd(dppf)Cl2(1.6mg,2mmol)和K2CO3(4.53mg,32.8mmol)在80mL二噁烷和8mLH2O中的混合物脱气并在100℃下搅拌7h。冷却至室温后,将混合物浓缩并通过硅胶柱(10-60%EtOAc/石油醚)纯化,其得到4.52g白色固体状的(1R,3s,5S)-3-((6-(4-氯-2-(甲氧基甲氧基)苯基)哒嗪-3-基)(甲基)氨基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯(57%收率)。LCMS:m/z 517.3[M+H]+;tR=1.86分钟。
步骤10:合成5-氯-3-甲氧基哒嗪
0℃下将甲醇钠(5.84g,0.108mol)加至3,5-二氯哒嗪(8g,0.054mol)在350mL THF中的搅拌溶液。加入后,将混合物在室温下搅拌16h。将混合物用水(100mL)淬灭,用EA(300mL X 2)萃取。将合并的有机溶剂经无水Na2SO4干燥,浓缩并通过硅胶色谱(0-40%EtOAc/石油醚)纯化,其得到1.5g黄色固体状的5-氯-3-甲氧基哒嗪(17%收率)。LCMS:m/z145.1[M+H]+;tR=1.42分钟。
步骤11:合成(1R,3s,5S)-3-((6-(2-(甲氧基甲氧基)-4-(6-甲氧基哒嗪-4-基)苯基)哒嗪-3-基)(甲基)氨基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯
将(1R,3s,5S)-3-((6-(4-氯-2-(甲氧基甲氧基)苯基)哒嗪-3-基)(甲基)氨基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯(200mg,0.39mmol),4,4,4',4',5,5,5',5'-八甲基-2,2'-双(1,3,2-二氧杂环戊硼烷)(197mg,0.77mmol),Pd2(dba)3(32mg,0.04mmol),X-Phos(20mg,0.04mmol)和KOAc(115mg,1.2mmol)在4mL 1,4-二噁烷中的混合物脱气并在90℃下搅拌2h。冷却至室温后,加入Pd(dppf)Cl2(61mg,0.08),5-氯-3-甲氧基哒嗪(113mg,0.78mmol),K2CO3(163mg,1.2mmol)和H2O(0.3mL)。将混合物在110℃下搅拌2h,浓缩并通过硅胶柱(10-80%EtOAc/石油醚)纯化以得到230mg淡黄色固体状的(1R,3s,5S)-3-((6-(2-(甲氧基甲氧基)-4-(6-甲氧基哒嗪-4-基)苯基)哒嗪-3-基)(甲基)氨基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯(78%收率)。LCMS:m/z 591.2[M+H]+;tR=2.20分钟。
步骤12:合成2-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(6-甲氧基哒嗪-4-基)苯酚
将4N HCl/二噁烷溶液4mL加至(1R,3s,5S)-3-((6-(2-(甲氧基甲氧基)-4-(6-甲氧基哒嗪-4-基)苯基)哒嗪-3-基)(甲基)氨基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯(180mg,0.3mmol)在4mL CH2Cl2中的搅拌溶液。将混合物在室温下搅拌3h,在减压下浓缩,用NH3/MeOH中和并通过制备型HPLC纯化,其得到58mg黄色固体状的2-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-5-(6-甲氧基哒嗪-4-基)苯酚(43%收率)。
实施例12:合成4-(4-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3- 基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-2-氟-5-羟基苯基)-1-(氟甲基)吡啶-2(1H)-酮.
步骤1:合成1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-酮
将70mL H2O中的氢氧化钾(108g,1.93mol)加至3-氧代戊二酸(120g,822mmol)和己烷-2,5-二酮(49.2g,432mmol)在350mL H2O中和0℃下的搅拌溶液。加入后,加入667mLH2O中的NH4Cl(70.1g,1.32mol)和NaOAc三水合物(70.1g,515mmol)。通过使用1N NaOH水溶液将pH值调节至~9。将混合物在室温下搅拌72h,其间过使用另外的1N NaOH水溶液将pH值调节至~9。将混合物用CH2Cl2(1L X 5)萃取。将合并的有机溶剂经无水Na2SO4干燥,浓缩并通过硅胶色谱(0-25%MeOH/CH2Cl2)纯化,其得到16.7g黑色油状的1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-酮(25%收率)。LCMS:m/z 154.2[M+H]+;tR=1.20分钟。
步骤2:合成1,5-二甲基-3-氧代-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯
将1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-酮(24g,163mmol),二碳酸二叔丁酯(35.6g,326mmol)和DIPEA(31.5g,244mmol)在500mL 1,4-二噁烷中的混合物在70℃下搅拌6h。将混合物浓缩并通过硅胶色谱(0-30%EtOAc/石油醚)纯化,其得到16.7白色固体状的1,5-二甲基-3-氧代-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯(收率:42%)。LCMS:m/z198.1[M-55]+;tR=1.40分钟。
步骤3:合成3-(肟基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯
将1,5-二甲基-3-氧代-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯(16.7g,66mmol),盐酸羟胺(18.2g,26.4mmol)和NaOAc(10.8g,132mmol)在250mL EtOH中的混合物在70℃下搅拌4h。将混合物浓缩。加入200mL EtOAc和60mL H2O。分离有机相,用盐水(50mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥,浓缩以得到16.7g黄色固体状的3-(肟基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯,其直接用于下一步骤(93%收率)。LCMS:m/z269.2[M+H]+;tR=1.92分钟。
步骤4:合成(1R,3s,5S)-3-氨基-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯
将钠(40.2g,1.75mol)按份加至3-(肟基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯(26.8g,0.1mol)在1000mL n-PrOH中的混合物,其经1h加热至110℃。加入后,将混合物在回流下另外搅拌1h。将混合物冷却至室温,用H2O(500mL)淬灭。将有机层分离并浓缩。将DCM(500mL)加至残余物。滤除固体并将滤液在减压下浓缩,其得到20g黄色油状的(1R,3s,5S)-3-氨基-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯,其直接用于下一步骤(收率:79%)。LCMS:m/z 255.3[M+H]+;tR=1.37分钟。
步骤5:合成(1R,3s,5S)-3-((6-氯哒嗪-3-基)氨基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯
将(1R,3s,5S)-3-氨基-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯(20g,78.7mmol),3,6-二氯哒嗪(23.3g,157.5mmol)和DIPEA(20.48g,157.5mmol)在500mLDMSO中的混合物在120℃下搅拌24h。将混合物冷却至室温,用H2O淬灭并用乙酸乙酯(500mLX 3)萃取。将合并的有机层用盐水洗涤,经无水Na2SO4干燥并在减压下浓缩。除去溶剂后,将粗产物通过硅胶柱(50%EtOAc/石油醚)纯化,其得到17.5g黄色固体状的(1R,3s,5S)-3-((6-氯哒嗪-3-基)氨基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯(收率:61%)。LCMS:m/z 367.2[M+H]+;tR=1.88分钟。
步骤6:合成(1R,3s,5S)-3-((6-氯哒嗪-3-基)(甲基)氨基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯
0℃下将氢化钠(2.87g,71.7mmol,60%于矿物油中)加至(1R,3s,5S)-3-((6-氯哒嗪-3-基)氨基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯(17.5g,47.8mmol)在400mL DMF中的搅拌溶液。0℃下搅拌20分钟后,加入CH3I(13.58g,95.6mmol)。然后将混合物在室温下搅拌1h,用H2O淬灭并用EtOAc(300mL X 3)萃取。将合并的有机相用盐水洗涤,经无水Na2SO4干燥,在减压下浓缩并通过硅胶柱(30%EtOAc/石油醚)纯化,其得到14.5g黄色固体状的(1R,3s,5S)-3-((6-氯哒嗪-3-基)(甲基)氨基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯(80%收率)。LCMS:m/z 381.2[M+H]+;tR=2.17分钟。
步骤7:合成2-溴-5-氯-4-氟苯酚
室温下将溴(3.52g,22mmol)加至3-氯-4-氟苯酚(4.02g,20mmol)在80mL CH2Cl2中的搅拌溶液。将混合物在室温下搅拌18h,并用10mL Na2S2O3水溶液淬灭。收集有机相,浓缩并通过硅胶色谱(0-10%EtOAc/石油醚)纯化,其得到2.5g白色固体状的2-溴-5-氯-4-氟苯酚(44%收率)。1H NMR(500MHz,氯仿-d)δ7.29(d,J=8.0Hz,1H),7.08(d,J=6.6Hz,1H),5.45(s,1H)。LCMS:tR=1.44分钟。
步骤8:合成1-溴-4-氯-5-氟-2-(甲氧基甲氧基)苯
0℃下将氢化钠(215mg,5.4mmol,60%于矿物油中)加至2-溴-5-氯-4-氟苯酚(1g,4.48mmol)在14mL DMF中的搅拌溶液。搅拌30分钟后,加入溴(甲氧基)甲烷(428mg,8mmol)。然后将混合物在室温下搅拌2h,用10mL饱和NH4Cl水溶液淬灭并用EtOAc(30mL X 3)萃取。将合并的有机溶剂浓缩并通过硅胶柱(0-8%EtOAc/石油醚)纯化,其得到1.01g白色固体状的1-溴-4-氯-5-氟-2-(甲氧基甲氧基)苯(70%收率)。1H NMR(500MHz,氯仿-d)δ7.37(d,J=8.1Hz,1H),7.23(d,J=6.6Hz,1H),5.20(s,2H),3.52(s,3H)。
步骤9:合成(1R,3s,5S)-3-((6-(4-氯-5-氟-2-(甲氧基甲氧基)苯基)哒嗪-3-基)(甲基)氨基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯
将1-溴-4-氯-5-氟-2-(甲氧基甲氧基)苯(8.5g,31.7mmol),4,4,4',4',5,5,5',5'-八甲基-2,2'-双(1,3,2-二氧杂环戊硼烷)(12.1g,47.5mmol),Pd(dppf)Cl2(1.86g,2.54mmol)和KOAc(6.2g,63.4mmol)在200mL二噁烷中的混合物脱气并在100℃下搅拌8h。冷却至室温后,加入(1R,3s,5S)-3-((6-氯哒嗪-3-基)(甲基)氨基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯(8g,21.2mmol),K2CO3(5.8g,42.3mmol)和H2O(30mL)。将混合物在100℃下搅拌3h,浓缩并通过硅胶柱(10-25%EtOAc/石油醚)纯化,其得到6g淡黄色固体状的(1R,3s,5S)-3-((6-(4-氯-5-氟-2-(甲氧基甲氧基)苯基)哒嗪-3-基)(甲基)氨基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯(53%收率)。LCMS:m/z 535.2[M+H]+;tR=2.40分钟。
步骤10:合成4-溴-1-(氟甲基)吡啶-2(1H)-酮
0℃下将氢化钠(111mg,4.62mmol,60%于矿物油中)加至4-溴吡啶-2(1H)-酮(400mg,2.31mmol)在15mL THF中的搅拌溶液。0℃下搅拌20分钟后,加入溴氟甲烷(517mg,4.62mmol)。然后将混合物在50℃下搅拌1h,用H2O淬灭并用EtOAc(30mL X 3)萃取。将合并的有机相用盐水洗涤,经无水Na2SO4干燥,在减压下浓缩并通过硅胶柱(50%EtOAc/石油醚)纯化,其得到400mg白色固体状的4-溴-1-(氟甲基)吡啶-2(1H)-酮(84%收率)。LCMS:m/z207.9[M+H]+;tR=1.46分钟。
步骤11:合成(1R,3s,5S)-3-((6-(5-氟-4-(1-(氟甲基)-2-氧代-1,2-二氢吡啶-4-基)-2-(甲氧基甲氧基)苯基)哒嗪-3-基)(甲基)氨基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯
将4-溴-1-(氟甲基)吡啶-2(1H)-酮(65mg,0.32mmol),4,4,4',4',5,5,5',5'-八甲基-2,2'-双(1,3,2-二氧杂环戊硼烷)(97mg,0.38mmol),Pd2(dba)3(27mg,0.03mmol),X-Phos(29mg,0.06mmol)和KOAc(63mg,0.64mmol)在4mL 1,4-二噁烷中的混合物脱气并在90℃下搅拌8h。冷却至室温后,加入(1R,3s,5S)-3-((6-(4-氯-5-氟-2-(甲氧基甲氧基)苯基)哒嗪-3-基)(甲基)氨基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯(100mg,0.19mmol),K2CO3(52mg,0.38mmol)和H2O(0.8mL)。将混合物在110℃下搅拌3h,浓缩并通过硅胶柱(10-80%EtOAc/石油醚)纯化,其得到90mg淡黄色油状的(1R,3s,5S)-3-((6-(5-氟-4-(1-(氟甲基)-2-氧代-1,2-二氢吡啶-4-基)-2-(甲氧基甲氧基)苯基)哒嗪-3-基)(甲基)氨基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯(77%收率)。LCMS:m/z 626.1[M+H]+;tR=2.19分钟。
步骤12:合成4-(4-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-2-氟-5-羟基苯基)-1-(氟甲基)吡啶-2(1H)-酮
将4N HCl/二噁烷溶液(4mL)加至(1R,3s,5S)-3-((6-(4-氯-5-氟-2-(甲氧基甲氧基)苯基)哒嗪-3-基)(甲基)氨基)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯(90mg,0.14mmol)在4mL CH2Cl2中的搅拌溶液。将混合物在室温下搅拌2h,在减压下浓缩,用NH3/MeOH中和并通过制备型HPLC纯化,其得到32mg黄色固体状的4-(4-(6-(((1R,3s,5S)-1,5-二甲基-8-氮杂双环[3.2.1]辛-3-基)(甲基)氨基)哒嗪-3-基)-2-氟-5-羟基苯基)-1-(氟甲基)吡啶-2(1H)-酮(46%收率)。
实施例13:剪接测定(MAPTau,MADD,FOXM1)
用本文所述的SMSM处理各种细胞系。然后分离RNA,合成cDNA,进行qPCR,并测定SMSM的各种mRNA靶标的水平。在某些情况下,分离RNA,合成cDNA,进行qPCR,并测定种细胞样品中mRNA同工型的水平。
材料
Cells to Ct试剂盒:ThermoFisher,AM1728。TaqMan基因表达预混液:ThermoFisher,4369542。PPIA探针/引物:ThermoFisher,Hs03045993_gH,VIC-MGB_PL。
探针/引物序列:
FoxM1
FOXM1 A2探针/引物:IDT DNA
引物1:ACA GGT GGT GTT TGG TTA CA
引物2:AAA TTA AAC AAG CTG GTG ATG GG
探针:/56-FAM/AG TTC TTT A/Zen/G TGG CGA TCT GCG AGA/3IABkFQ/
FOXM1 BC探针/引物:IDT DNA
引物1:GAG CTT GCC CGC CAT AG
引物2:CTG GTC CTG CAG AAG AAA GAG
探针:/5HEX/CC AAG GTG C/ZEN/T GCT AGC TGA GGA/3IABkFQ/
MADD
同工型4(WT)
引物1:GGC TAA ATA CTC TAA TGG AGA TTG TTA C
引物2:GGC TGT GTT TAA TGA CAG ATG AC
探针:/5HEX/AG TGG TGA A/ZEN/G GAA ACA GGA GGG CGT TAG/3IABkFQ/
同工型3(Ex16)
引物1:CAC TGT TGG GCT GTG TTT AAT G
引物2:ACA GTA CCA GCT TCA GTC TTT C
探针:/56-FAM/TC TGA AAG G/ZEN/A AAC AGG AGG GCG TT/3IABkFQ/
MAPTau
MAPT全长(4R)探针/引物:IDT DNA
引物1:CCA TGC CAG ACC TGA AGA AT
引物2:TTG GAC TGG ACG TTG CTA AG
探针:/5HEX/AA TTA TCT G/ZEN/C ACC TTC CCG CCT CC/3IABkFQ/
MAPT截断(3R)探针/引物:IDT DNA
引物1:AGA TCG GCT CCA CTG AGA A
引物2:GGT TTA TGA TGG ATG TTG CCT AAT G
探针:/56-FAM/CA ACT GGT T/ZEN/T GTA GAC TAT TTG CAC CTT CCC/3IABkFQ/
细胞:
使用的细胞包括93–T449,A–375,A–673,ASPC–1,BxPC–3,CCL–136,Daoy,DU-145,G-401,Hep-3B,IMR–32,K-562,LP–LoVo,MDA–MB–157,MDA–MB–231–luc,MDA-MB-468,MG–63,Ms751,NCI-H358,PACA–2,PANC–1,PC-3,RGX–MPC–11,RGX–PACA–2,SH-SY5Y,SJSA,SKOV3,SNU–16,SW872(HTB–92),TOLEDO,T.T,U–118,U–251MG,U–87MG和Z–138细胞。
实验当天,在96孔板中接种目标细胞系。用完全生长培养基将细胞稀释至2.0x105个细胞/mL的浓度,并向每个孔中添加100μL细胞(每孔20,000个细胞)。点板后立即用化合物处理细胞。
然后使用HP化合物分配器将化合物添加至细胞板。在最初的实验中,使用10μM的最高浓度和8点4倍稀释方案。使得原料化合物的浓度为5mM,DMSO的浓度设为0.2%。DMSO用于标准化所有含化合物的孔和未处理的细胞。
将处理的细胞在37℃下于5%CO2培养箱中培养所需的时间量。将板置于带有湿纸巾的塑料袋中以防止蒸发。
使用Cells to CT试剂盒(ThermoFisher,AM1728)分离RNA。将细胞用100μL冷PBS洗涤一次。将50μL裂解缓冲液加至各孔/管(每孔/管49.5μL裂解缓冲液+0.5μL DNase I)。混合裂解反应,并在室温下孵育5分钟。将5μL终止溶液直接添加到每个细胞裂解反应中,并通过上下移液5次进行混合。如果要立即进行cDNA合成,则将板/管在室温下孵育2分钟,然后置于冰上。否则,将板/管保存在-80℃下。然后进行cDNA合成反应。逆转录(RT)预混液是根据下表制备的。
组分 每个反应
2x RT缓冲液 25μL
20x RT酶混合物 2.5μL
不含核酸酶的水 12.5μL
将40μL RT预混液加至PCR管或板孔。将10μL RNA加至各管/孔。然后运行RT热循环仪程序,将管或板孔在37℃下孵育1小时,然后在95℃下孵育5分钟以使酶失活。
使用QuantStudio 6仪器(ThermoFisher)并在以下循环条件下根据下表进行qPCR。一式三份分析所有样品和标准品。周期1:在50℃下2分钟。周期2:在95℃下10分钟。循环3(重复40次):在95℃下15秒,在60℃下1分钟。
同工型1或同工型2标准样品
未知样品(FOXM1同工型A2/FOXM1同工型BC定量)
PPIA标准样品
组分 每qPCR孔
2x TaqMan基因表达预混液 10μL
60x PPIA探针/引物 0.33μL
不含核酸酶的水 4.67μL
标准DNA 5μL
未知样品(PPIA定量)
组分 每qPCR孔
2x TaqMan基因表达预混液 10μL
60x PPIA探针/引物 0.33μL
不含核酸酶的水 5.67μL
样品DNA 4μL
然后将所确定的同工型2和同工型1量用于确定各种化合物浓度下的同工型2:同工型2比率。PPIA量用于标准化以考虑化合物对细胞增殖的影响。
标准构建
PPIA标准(5834bps)
G嵌段序列(G Block sequence)(IDT DNA)
FoxM1 A2(5558bps)
G嵌段序列(IDT DNA)
FoxM2 BC(6439bps)
G嵌段序列(IDT DNA)
MADD同工型4(WT)(5668bps)
G嵌段序列(IDT DNA)
MADD同工型3(Ex16)(5689bps)
G嵌段序列(IDT DNA)
MAPTau全长(4R)(5654bps)
G嵌段序列(IDT DNA)
MAPTau截断(3R)(5644bps)
G嵌段序列(IDT DNA)
使用输注克隆技术(Clontech)将G嵌段在EcoRI和NotI限制性酶切位点(粗体)处插入pCI-neo哺乳动物表达载体(Promega)。然后使用标准的miniprep或maxiprep试剂盒(Macherey Nagel)纯化质粒。
标准曲线制备
计算达到最高标准所必需的稀释度。在TE缓冲液中制备最高浓度为200,000,000拷贝/μL的储备质粒。然后在TE中也进行一系列10倍稀释。在qPCR孔中使用每种标准液总共5μL,以生成包含109拷贝,108拷贝,107拷贝,106拷贝,105拷贝,104拷贝,103拷贝,102拷贝,101拷贝和0拷贝的样品。
进行在细胞孔中同时测量FOXM1A2 mRNA和FOXM1BC mRNA或MADDWT(同工型4)mRNA和MADDEx16(同工型3)mRNA或MAPTau4R mRNA和MAPTau3R mRNA的测定。测量相对于DMSO对照的RNA值,并且还包括一个管家基因PPIA,以确保数据一致。与SMSM化合物一起孵育24小时后,测量mRNA值。SMSM剂量依赖性地增加FOXM1A2的水平,同时伴随着以纳摩尔范围的EC50和IC50值降低FOXM1BC的水平。该测定在表3A中所示的细胞系中进行。示例性的FOXM1结果显示在表3A中。
表3A
FOXM1
实施例14:SMN2剪接测定-使用实时定量PCR监测SMN2剪接变体的表达水平
用本文所述的SMSM处理各种细胞系。然后分离RNA,合成cDNA,进行qPCR,并测定SMSM的各种mRNA靶标的水平。在某些情况下,分离RNA,合成cDNA,进行qPCR,并测定种细胞样品中mRNA同工型的水平。
材料
Cells to Ct试剂盒:ThermoFisher,AM1728。TaqMan基因表达预混液:ThermoFisher,4369542。PPIA探针/引物:ThermoFisher,Hs03045993_gH,VIC-MGB_PL。
探针/引物序列:
下表汇总了所使用的引物。
/>
细胞:
SMA I型患者细胞(GM03813(Coriell))
方案
实验当天,在96孔板中接种目标细胞系。用完全生长培养基将细胞稀释至2.0x105个细胞/mL的浓度,并向每个孔中添加100μL细胞(每孔20,000个细胞)。点板后立即用化合物处理细胞。
然后使用HP化合物分配器将化合物添加至细胞板。在最初的实验中,使用10μM的最高浓度和8点4倍稀释方案。使得原料化合物的浓度为5mM,DMSO的浓度设为0.2%。DMSO用于标准化所有含化合物的孔和未处理的细胞。
将处理的细胞在37℃下于5%CO2培养箱中培养所需的时间量。将板置于带有湿纸巾的塑料袋中以防止蒸发。
使用Cells to CT试剂盒(ThermoFisher,AM1728)分离RNA。将细胞用100μL冷PBS洗涤一次。将50μL裂解缓冲液加至各孔/管(每孔/管49.5μL裂解缓冲液+0.5μL DNase I)。混合裂解反应,并在室温下孵育5分钟。将5μL终止溶液直接添加到每个细胞裂解反应中,并通过上下移液5次进行混合。如果要立即进行cDNA合成,则将板/管在室温下孵育2分钟,然后置于冰上。否则,将板/管保存在-80℃下。
然后进行cDNA合成反应。将40μL RT预混液加至PCR管或板孔。将10μL RNA加至各管/孔。然后运行RT热循环仪程序,将管或板孔在37℃下孵育1小时,然后在95℃下孵育5分钟以使酶失活。
使用QuantStudio 6仪器(ThermoFisher)并在以下循环条件下根据下表进行qPCR。一式三份分析所有样品和标准品。周期1:在50℃下2分钟。周期2:在95℃下10分钟。循环3(重复40次):在95℃下15秒,在60℃下1分钟。
SMN2FL或SMN2Δ7标准样品
未知样品(FOXM1同工型A2/FOXM1同工型BC定量)
PPIA标准样品
未知样品(PPIA定量)
然后将所确定的SMN2Δ7和SMN2FL量用于确定各种化合物浓度下的SMN2Δ7:SMN2FL比率。PPIA量用于标准化以考虑化合物对细胞增殖的影响。
标准构建
PPIA标准(5834bps)
G嵌段序列(IDT DNA)
使用SMN2FL标准G嵌段序列(IDT DNA)
使用SMN2Δ7标准G嵌段序列(IDT DNA)
使用输注克隆技术(Clontech)将G嵌段在EcoRI和NotI限制性酶切位点(粗体)处插入pCI-neo哺乳动物表达载体(Promega)。然后使用标准的miniprep或maxiprep试剂盒(Macherey Nagel)纯化质粒。
标准曲线制备
计算获得最高标准的稀释度。在TE缓冲液中制备最高浓度为200,000,000拷贝/μL的储备质粒。然后在TE中也进行一系列10倍稀释。在qPCR孔中使用每种标准液总共5μL,以生成包含109拷贝,108拷贝,107拷贝,106拷贝,105拷贝,104拷贝,103拷贝,102拷贝,101拷贝和0拷贝的样品。
进行在细胞孔中同时测量SMN2FL mRNA和SMN2Δ7mRNA的测定。测量相对于DMSO对照的RNA值,并且还包括一个管家基因PPIA,以确保数据一致。与SMSM化合物一起孵育24小时后,测量mRNA值。SMSM剂量依赖性地增加SMN2FL值,同时伴随着以纳摩尔范围的EC50和IC50值降低SMN2Δ7值。
另外,为了使用实时定量PCR监测SMN2剪接变体的表达水平,在96孔板中将SMA I型患者细胞(GM03813(Coriell))以5,000个细胞/孔接种在200μl含GlutaMAX和10%的胎牛血清(FBS)的达尔伯克改良伊格尔培养基(DMEM)(Life Technologies,Inc.)中,并在细胞培养箱中孵育6小时。然后一式两份用不同浓度的SMSM(0.5%DMSO)处理细胞24小时。去除上清液后,根据制造商的建议,将细胞在Cells-To-Ct裂解缓冲液(Life Technologies,Inc.)中裂解。使用基于Taqman的RT-qPCR和SMN2特异性引物和探针对SMN2 FL,SMN2Δ7的mRNA水平进行定量。SMN2正向和反向引物各自以0.4μM的最终浓度使用。SMN2探针以0.15μM的最终浓度使用。RT-qPCR在以下温度下进行指定的时间:步骤1:48℃(15分钟);步骤2:95℃(10分钟);步骤3:95℃(15秒);步骤4:60℃(1分钟);重复步骤3和4共40个循环。使用实际的PCR效率将每个mRNA的Ct值转换为mRNA丰度。
在以上实施例中描述的测定的示例性结果在表3B中示出。
表3B
实施例15:IKBKAP剪接测定
用本文所述的SMSM处理各种细胞系。然后分离RNA,合成cDNA,进行qPCR,并测定SMSM的IKBKAP靶标的水平。
材料
Cells to Ct试剂盒:ThermoFisher,AM1728。TaqMan基因表达预混液:ThermoFisher,4369542。PPIA探针/引物:ThermoFisher,Hs03045993_gH,VIC-MGB_PL。
探针/引物序列:
IKBKAP
IKBKAP WT探针/引物:IDT DNA
引物1:ACC AGG GCT CGA TGA TGA A
引物2:GCA GCA ATC ATG TGT CCC A
探针:/56-FAM/GT TCA CGG A/ZEN/T TGT CAC TGT TGT GCC/3IABkFQ/
IKBKAP MU探针/引物:IDT DNA
引物1:GAA GGT TTC CAC ATT TCC AAG
引物2:CAC AAA GCT TGT ATT ACA GAC T
探针:/5HEX/CT CAA TCT G/ZEN/A TTT ATG ATC ATA ACC CTA AGG TG/3IABkFQ/
方案
实验当天,在96孔板中接种目标细胞系。用完全生长培养基将细胞稀释至2.0x105个细胞/mL的浓度,并向每个孔中添加100μL细胞(每孔20,000个细胞)。点板后立即用化合物处理细胞。
然后使用HP化合物分配器将化合物添加至细胞板。在最初的实验中,使用10μM的最高浓度和8点4倍稀释方案。使得原料化合物的浓度为5mM,DMSO的浓度设为0.2%。DMSO用于标准化所有含化合物的孔和未处理的细胞。
将处理的细胞在37℃下于5%CO2培养箱中培养所需的时间量。将板置于带有湿纸巾的塑料袋中以防止蒸发。
使用Cells to CT试剂盒(ThermoFisher,AM1728)分离RNA。将细胞用100μL冷PBS洗涤一次。将50μL裂解缓冲液加至各孔/管(每孔/管49.5μL裂解缓冲液+0.5μL DNase I)。混合裂解反应,并在室温下孵育5分钟。将5μL终止溶液直接添加到每个细胞裂解反应中,并通过上下移液5次进行混合。如果要立即进行cDNA合成,则将板/管在室温下孵育2分钟,然后置于冰上。否则,将板/管保存在-80℃下。
然后进行cDNA合成反应。将40μL RT预混液加至PCR管或板孔。将10μL RNA加至各管/孔。然后运行RT热循环仪程序,将管或板孔在37℃下孵育1小时,然后在95℃下孵育5分钟以使酶失活。
使用QuantStudio 6仪器(ThermoFisher)并在以下循环条件下根据下表进行qPCR。一式三份分析所有样品和标准品。周期1:在50℃下2分钟。周期2:在95℃下10分钟。循环3(重复40次):在95℃下15秒,在60℃下1分钟。
IKBKAPFL或IKBKAPΔ20标准样品
未知样品(IKBKAPFL/IKBKAPΔ20定量)
/>
PPIA标准样品
未知样品(PPIA定量)
然后将所确定的IKBKAPFL和IKBKAPΔ20同工型量用于确定增加的SMSM化合物浓度下的IKBKAPFL:IKBKAPΔ20比率。PPIA量用于标准化以考虑化合物对细胞增殖的影响。
标准构建
PPIA标准(5834bps)
G嵌段序列(IDT DNA
/>
IKBKAP WT(5639bps)
IKBKAP MU(5645bps)
使用输注克隆技术(Clontech)将G嵌段在EcoRI和NotI限制性酶切位点(粗体)处插入pCI-neo哺乳动物表达载体(Promega)。然后使用标准的miniprep或maxiprep试剂盒(Macherey Nagel)纯化质粒。
标准曲线制备
计算实现最高标准的稀释度。在TE缓冲液中制备最高浓度为200,000,000拷贝/μL的储备质粒。然后在TE中也进行一系列10倍稀释。在qPCR孔中使用每种标准液总共5μL,以生成包含109拷贝,108拷贝,107拷贝,106拷贝,105拷贝,104拷贝,103拷贝,102拷贝,101拷贝和0拷贝的样品。
进行在细胞孔中同时测量IKBKAPFL mRNA和IKBKAPΔ20mRNA的测定。测量相对于DMSO对照的RNA值,并且还包括一个管家基因PPIA,以确保数据一致。与SMSM化合物一起孵育24小时后,测量mRNA值。SMSM剂量依赖性地增加IKBKAPFL值,同时伴随着以纳摩尔范围的EC50和IC50值降低IKBKAPΔ20值。示例性的FOXM1结果显示在表3A中。
示例性的测定结果显示在表3C中:
表3C
SMSM# IKBKAPFL EC50(nM) IKBKAPΔ20IC50(nM)
266 <100 <200
162 - 201-1000
138 101-350 201-1000
152 351-1000 >1000
217 351-1000 201-1000
315 >1000 >1000
160 <100 <200
161 <100 <200
223 101-350 >1000
238 101-350 201-1000
154 351-1000 -
278 101-350 <200
282 101-350 201-1000
218 351-1000 >1000
228 351-1000 >1000
240 101-350 201-1000
实施例16:细胞活力与增殖
使用不同的癌细胞系,在剂量反应测定法中测试小分子剪接调节剂。首先将细胞接种在96孔塑料组织培养板中(每孔10,000个细胞)。将细胞用500nM SMSM或单独的媒介物(DMSO)处理48小时。处理后,将细胞用PBS洗涤,用结晶紫染色溶液染色,并干燥48-72小时。干燥后,将柠檬酸钠缓冲液加至各孔,并在室温下孵育5分钟。使用酶标仪(Biorad;Hercules,CA)在450nM处测量吸光度。确定每种癌细胞系的相对细胞增殖。
为了测量细胞活力,将细胞以5xl03个细胞/孔的密度接种在96孔塑料组织培养板中。接种后二十四小时,将细胞用各种SMSM处理。72小时后,移除细胞培养基,并用100mL/孔的含0.5%结晶紫和25%甲醇的溶液对板染色,用去离子水冲洗,干燥过夜,并重悬于100mL柠檬酸盐缓冲液(50%乙醇中0.1M柠檬酸钠)以评估接种效率。在570nm处评估并使用Vmax动力学微孔板读数器和Softmax软件(Molecular Devices Corp.,Menlo Park,CA)进行定量的结晶紫染色的强度与细胞数成正比。将数据相对于媒介物处理的细胞标准化,并表示为来自代表性实验的平均值±SE。针对各种细胞系确定有效的SMSM。
使用A673细胞和NHDF细胞在剂量反应测定中测试小分子剪接调节剂。
首先将A673细胞或NHDF细胞接种在96孔塑料组织培养板中(每孔10,000个细胞)。用单独的媒介物(DMSO)或增加浓度的SMSM化合物处理细胞72小时。处理后,使用结晶紫测定法测定细胞增殖。确定每种浓度下的相对细胞增殖。
示例性的结果在下表和图9A-9H中示出。
实施例17:使用实时定量PCR监测FOXM1剪接变体的表达水平
在细胞培养箱(37℃,5%CO2,100%相对湿度)中的96孔板中,将人成纤维细胞以10,000个细胞/孔的浓度接种在200μL含GlutaMAX和10%FBS的DMEM中。然后采用表1B中的SMSM以不同浓度(0.1-1000nM,各自在0.5%DMSO中)一式三份处理细胞24小时。按照Cells-to-CTTM试剂盒(Applied Biosystems)中的说明进行RNA提取。RNA样品在-20℃下冷冻直至进一步分析。使用单步骤多重逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)测量全长FOXM1(FOXM1FL)或缺少外显子VIIa的FOXM1(FOXM1ΔVIIa)的相对表达水平,采用GAPDH作为内部对照。/>FAM探针用于FOXM1FL或FOXM1ΔVIIa表达水平的相对定量,/>VIC探针用于人GAPDH水平的相对定量。使用定量PCR的ΔΔCt相对定量方法测定扩增方法的保真度。数据表明,化合物诱导了FOXM1向全长FOXM1的选择性剪接。SMSM增加了FOXM1FL mRNA的表达。相应地,减少了FOXM1ΔVIIa的mRNA。数据表明,通过用本公开的SMSM处理,FOXM1FL的上调与FOXM1ΔVIIa的下调是直接相关的,表明SMSM对FOXM1的选择性剪接的作用。将得到的FOXM1ΔVIIa剪接变体的浓度依赖性曲线拟合至Hill结合方程,以产生IC50值。总而言之,数据强调了FOXM1基因中的剪接修饰活性。这可能导致细胞周期停滞和凋亡诱导,因为通过SMSM处理产生的FOXM1FL变体功能失活,并拮抗功能性FOXM1的促增殖作用。示例性结果显示在图7和图12中。
实施例18:最大耐受剂量研究
评估施用SMMS后10或11天后小鼠的存活。
通过在给药期间测量小鼠的体重来确定药物治疗的耐受性。在接种肿瘤之前和施用处理之前测量体重,然后每天测量体重。确定进行SMSM处理的小鼠最终体重的变化。结果汇总在下表中:
实施例19:剂量范围和时程研究
进行了剂量范围和时程研究,其比较了SMSM-167和SMSM-151相对媒介物的抗肿瘤作用。
用于本研究的实验组显示在下表和图14A-C中。
/>
使用了雌性NCrNu小鼠。准入周龄范围为7-10周。总共75只动物用于研究。
A673肿瘤细胞系在体外作为单层培养物被维持。每周两次用TryplE将肿瘤细胞常规传代培养,且不超过4-5代。收获在指数生长期生长的细胞,并计数肿瘤接种量。
将无血清RPMI 1640培养基中的95%活肿瘤细胞的单细胞悬液接种到每只小鼠的右侧(5x 106个细胞/小鼠)用于肿瘤发展。当平均肿瘤大小达到约75mm3时施用治疗。
为了使动物适应实验室环境,在动物接受和肿瘤接种之间允许至少72小时的适应期。将免疫缺陷的NCrNu小鼠保持在无病原体的环境中。给动物饲喂Irradiated小鼠pelletfeed Purina啮齿动物饲料#5053(Fisher Feeds,Bound Brook,NJ)和来自反渗透(RO)系统的氯化水(4-6ppm)。
在开始治疗之前,将所有动物称重并使用随机程序分配至治疗组。根据小鼠的肿瘤大小将其随机分组,以确保每组的平均肿瘤大小和肿瘤大小范围大致相同。
接种后,每天检查动物的发病率和死亡率。在常规监测时,检查动物是否有肿瘤生长对正常行为的任何影响,例如活动性、食物和水的消耗,体重增加/减少,眼睛/毛发缠结以及任何其他异常影响。记录死亡和观察到的临床体征。对观察到处于持续恶化状态或肿瘤大小超过2,000mm3的动物实施安乐死。
在肿瘤接种之前和治疗施用之前测量体重,然后每天测量体重。每周使用卡尺在二维上测量肿瘤大小2-3次,并使用以下公式以mm3为单位表示体积:V=0.5x a x b2,其中a和b分别是肿瘤的长径和短径。
当媒介物治疗组中的肿瘤大小达到2,000mm3时,终止研究。在最后一次给药后2小时将每只小鼠放血,并从每只小鼠收集至少50μl血浆。每个剂量水平收集的所有血浆样品和保留剂给药溶液均用于生物分析测量。还收集所有肿瘤并称重。从每个肿瘤中取出一个约50mg的无坏死的肿瘤片段,并快速冷冻用于RNA分离。将剩余的肿瘤快速冷冻用于PK分析。
实施例20:Ncr裸鼠中皮下U87-Luc脑肿瘤模型
评估SMSM-167、SMSM-160和SMSM-151在C.B-17SCID小鼠中皮下U87-Luc脑肿瘤模型中的功效。
用于本研究的实验组在下表和图15A-B中示出。
/>
在第0天开始肿瘤接种。当平均肿瘤大小达到约100mm3时施用治疗。100只小鼠用于本项研究。
为了使动物适应实验室环境,在动物接受和肿瘤接种之间允许至少72小时的适应期。给动物饲喂Irradiated小鼠pellet feed Purina啮齿动物饲料#5053(Fisher Feeds,Bound Brook,NJ)和来自反渗透(RO)系统的氯化水(4-6ppm)。
在开始治疗之前,将所有动物称重并使用随机程序分配至治疗组。根据如通过卡尺测量的小鼠的肿瘤大小将其随机分组,以确保每组的平均肿瘤大小和肿瘤大小范围大致相同。
接种后,每天检查动物的发病率和死亡率。在常规监测时,检查动物是否有肿瘤生长对正常行为的任何影响,例如活动性、食物和水的消耗,体重增加/减少,眼睛/毛发缠结以及任何其他异常影响。记录死亡和观察到的临床体征。对观察到处于持续恶化状态或肿瘤大小超过2,000mm3的动物实施安乐死。
在肿瘤接种之前和治疗施用之前测量体重,然后每天测量体重。每周使用卡尺在二维上测量肿瘤大小2次。当媒介物治疗组中的肿瘤大小达到2,000mm3时,终止研究。在最后一次给药后2小时将每只小鼠放血,并从每只小鼠收集至少50μl血浆。每个剂量水平收集的所有血浆样品和保留剂给药溶液均用于生物分析测量。还收集所有肿瘤并称重。从每个肿瘤中取出一个约50mg的无坏死的肿瘤片段,并快速冷冻用于RNA分离。将剩余的肿瘤快速冷冻用于PK分析。
实施例21:体内SMSM治疗抑制肿瘤生长
进行研究以评估体内SMSM治疗对胶质母细胞瘤、乳腺癌、胰腺癌、前列腺癌、黑色素瘤、淋巴瘤和尤因肉瘤的影响。还进行研究以评估体内SMSM治疗对mRNA水平的影响。用媒介物或SMSM治疗具有已存在的胶质母细胞瘤、乳腺癌、胰腺癌、前列腺癌、黑色素瘤、淋巴瘤和尤因肉瘤异种移植物的免疫受损的裸鼠。使用BioPulverizer(Biospec Products,Inc.)将来自皮下异种移植物的肿瘤组织破碎成粉末。SMSM处理后,自异种移植物分离mRNA并通过qRT-PCR分析。
每周使用卡尺在二维上测量肿瘤大小2次。当媒介物治疗组中的肿瘤大小达到2,000mm3时,终止研究。在最后一次给药后2小时将每只小鼠放血,并从每只小鼠收集至少50μl血浆。每个剂量水平收集的所有血浆样品和保留剂给药溶液均用于生物分析测量。还收集所有肿瘤并称重。从每个肿瘤中取出一个约50mg的无坏死的肿瘤片段,并快速冷冻用于RNA分离。将剩余的肿瘤快速冷冻用于PK分析。
评估体内SMSM治疗对已存在的皮下胶质母细胞瘤、乳腺癌、胰腺癌、前列腺癌、黑色素瘤、淋巴瘤和尤因肉瘤异种移植的影响。对于这些体内实验,将1x 106Raji,A375,A673,MDA-MB-231,BxPC-3,PC-3或U87细胞重悬于100μl PBS中并细胞皮下注射到裸鼠的腹侧。当肿瘤达到约100mm3(体积=(3/4)(π)(长度/2)(宽度/2)2)时,开始下表中所示的治疗。
如在下表以及图14A、14B和14C中所示,SMSM-160治疗具有预先存在的A673异种移植物的免疫受损裸鼠导致了肿瘤生长抑制(TGI)。
(TGI(%)=(1-(TV治疗/Dx–TV治疗/D1)/(TV对照/Dx-TV对照/D1))×100)。
如在下表以及图16A、16B和16C中所示,SMSM-160治疗具有预先存在的A673异种移植物的免疫受损裸鼠导致了肿瘤生长抑制(TGI)。
(TGI(%)=(1-(TV治疗/Dx–TV治疗/D1)/(TV对照/Dx-TV对照/D1))×100)。
如在下表以及图17A和17B中所示,SMSM-160治疗具有预先存在的A375异种移植物的免疫受损裸鼠导致了肿瘤生长抑制(TGI)。
如在下表以及图20A和20B中所示,SMSM-151治疗具有预先存在的A673异种移植物的免疫受损裸鼠导致了肿瘤生长抑制(TGI)。
如在下表以及图21A和21B中所示,SMSM-160或SMSM-151治疗具有预先存在的A-375异种移植物的免疫受损裸鼠导致了肿瘤生长抑制(TGI)。
/>
实施例22:药效学
测定了SMSM的A-673细胞活力(IC50)、剪接(IC50)和脑AUC/血浆AUC。如下表中所示,SMSM具有高CNS暴露。
/>
实施例23:SMSM联合放疗在皮下U87-Luc脑肿瘤模型中的功效
研究目的
评估SMSM联合放疗在皮下U87-Luc脑肿瘤模型中的功效
实验设计
NcrNude小鼠中的皮下U87-Luc脑肿瘤模型:在第0天接种肿瘤;在100mm3(第0天)时开始化合物治疗,每天两次通过管饲;在第3天进行放疗。放疗(10Gy)的进行使用ImageGuided Small Animal Radiation Research Platform(SARRP)辐照器(Xstrahl Limited,GU15 3YL)。
实验组
用于本研究的实验组如下表所示。结果显示在图24A和24B中。
本文描述的实例和实施方式仅出于示例性目的,并且向本领域技术人员建议的各种修改或改变将包括在本申请的精神和范围以及所附权利要求的范围之内。

Claims (13)

1.式(IV)的化合物或其药学上可接受的盐:
其中,
为/>环Q为喹啉、异喹啉、苯并噁唑或苯并呋喃基;
其中环Q任选地被选自以下的一个或多个取代基取代:
卤素,-CN,-NH2,-NH(CH3),-N(CH3)2,-OH,-CO2H,-CO2(C1-C4烷基),-C(=O)NH2,-C(=O)NH(C1-C4烷基),-C(=O)N(C1-C4烷基)2,-C(=O)NH(C3-C6环烷基),C1-C4烷基,C1-C4氟代烷基,C1-C4烷氧基,C1-C4氟代烷氧基,-NH(环丙基)、-OCD3和氧代;
X为-NR3-;
每个R1独立地为H,D,C1-C6烷基或-CD3
R3为C1-C6烷基、-CD3或C1-C6卤代烷基;
Z为CR7;且R7为H;
W为C2-C3亚烷基;
R为H;
R15,R16,R17和R18各自独立地选自:H,F,OR1,C1-6烷基或C1-6氟代烷基,其中烷基任选地取代有羟基,氨基,甲氧基,单-C1-6烷基氨基或者二-C1-6烷基氨基;
a和b各自为0;并且
c和d各自为1。
2.权利要求1所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中环Q选自以下:
其中每个RB独立地选自氰基,卤素,羟基,C1-C4烷基,-OCH3和-OCD3
并且m为0,1,2或3。
3.权利要求1所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中环Q为
并且
每个R6独立地为H、C1-C4烷基或C3-C6环烷基。
4.权利要求1所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中环Q为其中每个RB独立地选自氰基,卤素,羟基,C1-C4烷基,-OCH3和-OCD3;并且m为0,1,2或3。
5.权利要求1所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R3为-CH3
6.权利要求1所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R3为-CH3,-CD3或-CF3
7.权利要求1-6中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中
为/>其中p为1,2或3。
8.权利要求7所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中
R为H;R15和R18为H;且p为2。
9.权利要求7所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中
R为H;R15和R18为H;且p为3。
10.权利要求7所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中
R为H;R15和R18为CH3;且p为3。
11.权利要求7所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中
R为H;R15和R18为CH3;且p为2。
12.药物组合物,其包含根据权利要求1-11中任一项的化合物或其药学上可接受的盐,以及药学上可接受的载体或赋形剂。
13.根据权利要求1-11中任一项的化合物或其药学上可接受的盐在制造用于治疗疾病或病症的药物中的用途,其中所述病症或疾病与RNA剪接位点的剪接有关,并且其中所述化合物调节所述剪接位点的RNA剪接。
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