具体实施方式
I.术语
使用标准命名法描述化合物。除非另外定义,否则本文使用的所有技术和科学术语具有与本发明所属领域的技术人员通常理解的含义相同的含义。
本文所述的任何式中的化合物包括外消旋体、对映体、对映体的混合物、非对映体、非对映体的混合物、互变异构体、N-氧化物、异构体例如旋转异构体,就像每个都被具体描述一样。
术语“一”和“一个”不表示数量的限制,而是表示存在至少一个所引用的项目。术语“或”表示“和/或”。除非本文另有说明,否则对数值范围的描述仅旨在用作单独提及落入该范围内的每个单独值的简写方法,并且每个单独的值并入本说明书中,如同其在本文中单独引用一样。所有范围的端点都包括在该范围内并且可独立组合。除非本文另有说明或上下文明显矛盾,否则本文所述的所有方法均可以合适的顺序进行。除非另外声明,否则示例或示例性语言(例如,“诸如”)的使用仅旨在更好地说明本发明,而不是对本发明的范围进行限制。除非另外定义,否则本文使用的技术和科学术语具有与本发明所属领域的技术人员通常理解的含义相同的含义。
本发明包括式II化合物,其具有原子的至少一个所需同位素取代,其量高于同位素的天然丰度,即富集的。同位素是具有相同原子序数但质量数不同的原子,即相同数量的质子但具有不同数量的中子。
可以掺入本发明化合物中的同位素的实例包括氢、碳、氮、氧、磷、氟、氯和碘的同位素,例如分别为2H、3H、11C、13C、14C、15N、18F 31P、32P、35S、36CI和125I。在一个非限制性实施方案中,同位素标记的化合物可用于代谢研究(用14C)、反应动力学研究(例如用2H或3H)、检测或成像技术,例如正电子发射断层扫描(PET)或单光子发射计算机断层扫描(SPECT),包括药物或基质组织分布测定,或患者的放射性治疗。特别地,18F标记的化合物对于PET或SPECT研究可能是特别理想的。同位素标记的本发明化合物及其前药通常可以通过用容易获得的同位素标记的试剂取代非同位素标记的试剂,通过下述的实施方案或实施例和制备中公开的方法制备。
作为一般实例而非限制,氢的同位素例如氘(2H)和氚(3H)可以在所描述的结构中的任何地方使用,以实现期望的结果。或者或另外,可以使用碳的同位素,例如13C和14C。
同位素取代,例如氘取代,可以是部分或完全的。部分氘取代意指至少一个氢被氘取代。在某些实施方案中,在任何感兴趣的位置的同位素中,同位素富集90%、95%或99%或更多。在一个非限制性实施方案中,氘在所需位置富集90%、95%或99%。
在一个非限制性实施方案中,可以在A、C、L或B中的任何一个中提供将氢原子取代成氘原子。在一个非限制性实施方案中,将氢原子取代成氘原子发生在R基团内,R基团选自R1、R2、R3、R4、R5、R6、R7、R8、R8*、R9、R9*、R10、R10*、R11、R12、R13、R14和Rx中的任一个。例如,当任何R基团是,或含有例如通过取代,甲基、乙基或甲氧基时,烷基残基可以是氘代的(在非限制性实施方案中,CDH2、CD2H、CD3、CH2CD3、CD2CD3、CHDCH2D、CH2CD3、CHDCHD2、OCDH2、OCD2H或OCD3等)。在某些其他实施方案中,当两个取代基组合形成环时,未取代的碳可以是氘代的。
本发明化合物可与溶剂(包括水)形成溶剂化物。因此,在一个非限制性实施方案中,本发明包括化合物的溶剂化形式。术语“溶剂化物”是指本发明化合物(包括其盐)与一种或多种溶剂分子的分子复合物。溶剂的非限制性实例是水、乙醇、二甲基亚砜、丙酮和其他常见的有机溶剂。术语“水合物”是指包含本发明化合物和水的分子复合物。根据本发明的药学上可接受的溶剂化物包括其中溶剂可以被同位素取代的那些例如D2O、d6-丙酮、d6-DMSO。溶剂化物可以是液体或固体形式。
不在两个字母或符号之间的破折号(“-”)用于表示取代基的连接点。例如,-(C=O)NH2是通过酮(C=O)基团的碳连接的。
“烷基”是支链或直链饱和脂族烃基。在一个非限制性实施方案中,烷基含有1至约12个碳原子,更通常1至约6个碳原子或1至约4个碳原子。在一个非限制性实施方案中,烷基含有1至约8个碳原子。在某些实施方案中,烷基是C1-C2、C1-C3或C1-C6。本文所用的特定范围表示将所述范围的每个成员描述为独立的一种的烷基。例如,本文所用的术语C1-C6烷基表示具有1、2、3、4、5或6个碳原子的直链或支链烷基,并且意指这些中的每一个被描述为独立的一种。例如,本文所用的术语C1-C4烷基表示具有1、2、3或4个碳原子的直链或支链烷基,并且意指这些中的每一个被描述为独立的一种。烷基的实例包括但不限于甲基、乙基、正丙基、异丙基、正丁基、异丁基、仲丁基、叔丁基、正戊基、异戊基、叔戊基、新戊基、正己基、2-甲基戊烷、3-甲基戊烷、2,2-二甲基丁烷和2,3-二甲基丁烷。在一个替代的实施方案中,烷基任选被取代。
在一个替代的实施方案中,当使用包括“烷基”的术语时,“环烷基”或“碳环”可以被认为是该定义的一部分,除非明确地被上下文排除。例如但不限于,术语烷基、烷氧基、卤代烷基等均可认为包括烷基的环状形式,除非明确地排除在上下文之外。
烷氧基”是通过氧桥(-O-)共价键合的如上定义的烷基。烷氧基的实例包括但不限于甲氧基、乙氧基、正丙氧基、异丙氧基、正丁氧基、2-丁氧基、叔丁氧基、正戊氧基、2-戊氧基、3-戊氧基、异戊氧基、新戊氧基、正己氧基、2-己氧基、3-己氧基和3-甲基戊氧基。类似地,“烷硫基”或“硫代烷基”是如上定义的烷基,其中指定数目的碳原子通过硫桥(-S-)共价键合。在一个替代的实施方案中,烷氧基被如上所述任选取代。在一个替代的实施方案中,硫代烷基被如上所述任选取代。
“氨基”是-NH2。
“酰胺”或“甲酰胺”是-C(O)RaRb,其中Ra和Rb各自独立地选自氢,烷基例如C1-C6烷基,烯基,例如C2-C6烯基,炔基例如C2-C6炔基,-C0-C4烷基(C3-C7环烷基),-C0-C4烷基(C3-C7杂环烷基),-C0-C4烷基(芳基)和-C0-C4烷基(杂芳基);或者与它们键合的氮一起,Ra和Rb可以形成C3-C7杂环。在一个替代的实施方案中,Ra和Rb基团各自独立地被如上所述任选地取代。
如本文所用,“碳环基”、“碳环的”,“碳环”或“环烷基”是在非芳香环系统中含有所有碳环原子且3至14个环碳原子(“C3-14”碳环基“)和的0个杂原子的饱和或部分不饱和(即非芳族)基团。在一些实施方案中,碳环基基团具有3至10个环碳原子(“C3-10碳环基”)。在一些实施方案中,碳环基基团具有3至9个环碳原子(“C3-9碳环基”)。在一些实施方案中,碳环基基团具有3至8个环碳原子(“C3-8碳环基”)。在一些实施方案中,碳环基基团具有3至7个环碳原子(“C3-7碳环基”)。在一些实施方案中,碳环基基团具有3至6个环碳原子(“C3-6碳环基”)。在一些实施方案中,碳环基基团具有4至6个环碳原子(“C4-6碳环基”)。在一些实施方案中,碳环基基团具有5至6个环碳原子(“C5-6碳环基”)。在一些实施方案中,碳环基基团具有5至10个环碳原子(“C5-10碳环基”)。示例性的C3-6碳环基包括但不限于环丙基(C3)、环丙烯基(C3)、环丁基(C4)、环丁烯基(C4)、环戊基(C5)、环戊烯基(C5)、环己基(C6)、环己烯基(C6)、环己二烯基(C6)等。示例性的C3-8碳环基包括但不限于上述C3-6碳环基以及环庚基(C7)、环庚烯基(C7)、环庚二烯基(C7)、环庚三烯基(C7)、环辛基(C8)、环辛烯基(C8)等。示例性的C3-10碳环基包括但不限于上述C3-8碳环基以及环壬基(C9)、环壬烯基(C9)、环癸基(C10)、环癸烯基(C10)等。如前述实施例所示,在某些实施方案中,碳环基可以是饱和的或可以含有一个或多个碳-碳双键或三键。在一个替代的实施方案中,“碳环基”还包括环系统,其中如上定义的碳环基环与一个或多个杂环基、芳基或杂芳基稠合,其中连接点在碳环基环上,并且在这种情况下,碳的数量继续表示碳环系统中的碳数。在一个替代实施方案中,碳环的每个实例任选地被一个或多个取代基取代。在某些实施方案中,碳环基基团是未取代的C3-14碳环基。在某些实施方案中,碳环基基团是取代的C3-14碳环基。
“卤代烷基”表示被1个或多个卤素原子直至最大可允许的卤素原子数取代的支链和直链烷基。卤代烷基的实例包括但不限于三氟甲基、一氟甲基、二氟甲基、2-氟乙基和五氟乙基。
“卤代烷氧基”表示通过氧桥(醇基的氧)连接的如本文所定义的卤代烷基。
“卤代”或“卤素”独立地表示氟、氯、溴或碘中的任何一种。
如本文所用,“芳基”是指芳环系统中具有6-14个环碳原子和0个杂原子(“C6-14芳基”)的单环或多环(例如,双环或三环)4n+2芳环系统(例如,具有在环阵列中共享的6、10或14个π电子)的基团。在一些实施方案中,芳基具有6个环碳原子(“C6芳基”;例如苯基)。在一些实施方案中,芳基具有10个环碳原子(“C10芳基”;例如,萘基,例如1-萘基和2-萘基)。在一些实施方案中,芳基具有14个环碳原子(“C14芳基”;例如,蒽基)。“芳基”还包括环系统,其中如上定义的芳基环与一个或多个碳环基或杂环基稠合,其中基团或连接点在芳基环上,并且在这种情况下,碳原子数继续表示芳环系统中的碳原子数。一个或多个稠合的碳环基或杂环基可以是4至7或5至7元饱和或部分不饱和的碳环基或杂环基,其任选地含有独立地选自氮、氧、磷、硫、硅和硼的1、2或3个杂原子,以形成例如3,4-亚甲二氧基苯基。在一个非限制性实施方案中,芳基是带侧基的。带侧基的环的实例是被苯基取代的苯基。在一个替代的实施方案中,芳基被如上所述任选取代。在某些实施方案中,芳基是未取代的C6-14芳基。在某些实施方案中,芳基是取代的C6-14芳基。
“芳基烷基”是通过烷基连接的如本文所定义的芳基。芳基烷基的非限制性实例包括:
“芳氧基”是通过-O-接头连接的如本文所定义的芳基。芳氧基的非限制性实例包括:
如本文所定义的“烷基亚磺酰基”和“烷基亚砜”由
表示。
II.杂芳基胺与砜/亚砜的偶联
已经发现,通过将烷基砜或烷基亚砜取代的稠合嘧啶与杂芳基胺偶联以形成中心二取代胺,有利地制备2’-(杂芳基)-内酰胺-吡咯并[2,3-d]嘧啶。使用烷基砜或烷基亚砜取代的稠合嘧啶代替氯取代的稠合嘧啶增加了偶联二胺产物的产率并降低了所需温度,导致副产物和杂质减少。
通常,如果需要,在促进反应的碱存在的情况下,偶联可以在极性非质子溶剂中在降低的温度下进行。例如,偶联可以通过在LiHMDS存在下在室温或更低温度下将砜加入杂芳基胺在THF中的搅拌溶液中来实现。尽管各种添加顺序可以获得相当的结果,但优选最后添加胺以减少二聚化副反应的发生。
在一个非限制性实施方案中,嘧啶与吡咯/螺环内酰胺环系稠合。例如,砜可以是2’-(甲基磺酰基)-7’,8’-二氢-6’H-螺[环己烷-1,9’-吡嗪并[1’,2’:1,5]吡咯并[2,3]-d]嘧啶]-6’-酮或其衍生物。
在一个替代的实施方案中,嘧啶与吡咯/环内酰胺体系稠合。例如,砜可以是2-(甲基磺酰基)-8,9-二氢吡嗪并[1’,2’:1,5]吡咯并[2,3-d]嘧啶-6(7H)-酮或其衍生物。
步骤1:将杂芳基胺与砜/亚砜偶联的方法
在步骤1中,杂芳基胺与2’-(烷基磺酰基)-内酰胺-吡咯并[2,3-d]嘧啶或2’-(烷基亚磺酰基)-内酰胺-吡咯并[2,3-d]嘧啶在碱存在下反应得到2’-(杂芳基)-内酰胺-吡咯并[2,3-d]嘧啶。将杂芳基胺与合适的碱在合适的溶剂中混合,所述溶剂通常是两种反应物都溶于其中的中性有机溶剂。然后一次或多次加入2’-(烷基磺酰基)-内酰胺-吡咯并[2,3-d]嘧啶或2’-(烷基亚磺酰基)-内酰胺-吡咯并[2,3-d]嘧啶。可以使用任何摩尔比的两种反应物,以获得所需的结果。通常,过量的杂芳基胺是有用的,例如约3当量杂芳基胺对约1.0当量砜或亚砜。反应可在允许反应发生的任何温度下进行。已经发现反应可以在低于室温下进行。使反应进行足够的时间以提供所需的产率,之后通过任何合适的方法纯化批料,包括过滤、结晶和柱色谱,得到2’-(杂芳基)-内酰胺-吡咯并[2,3-d]嘧啶。在一个非限制性说明性实施方案中,杂芳基胺是5-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-2-胺,2’-(烷基磺酰基)-内酰胺-吡咯并[2,3-d]嘧啶是2’-(甲基磺酰基)-7’,8’-二氢-6’H-螺[环己烷-1,9’-吡嗪并[1’,2’:1,5]吡咯并[2,3-d]嘧啶]-6’-酮,碱是LiHMDS,溶剂是THF,温度为约5℃,时间为约1小时。
步骤1中使用的碱可以是任何合适的碱,包括但不限于LiHMDS、NaHMDS、NaH、KH、LDA、DIPEA(N,N-二异丙基乙胺)、DMAP(4-二甲基氨基吡啶)、DBU(1,8-二氮杂双环十一-7-烯)、TEA(三乙胺)、吡啶、氨、甲胺、乙胺、丙胺、异丙胺、二甲胺、二乙胺、二丙胺、二异丙胺、三甲胺、三丙胺、三异丙胺、苯胺、甲基苯胺、二甲基苯胺、吡啶、氮杂久洛尼定、苄胺、甲基苄胺、二甲基苄胺、DABCO(1,4-二氮杂双环[2.2.2]辛烷)、1,5-二氮杂双环[4.3.0]壬-5-烯、2,6-二甲基吡啶、吗啉、哌啶、哌嗪、质子海绵、1,5,7-三氮杂双环[4.4.0]癸-5-烯、苄吡二胺、氢氧化铵、三乙醇胺、乙醇胺或三羟甲基氨基甲烷。在一个非限制性实施方案中、碱选自LiHMDS、NaHMDS、NaH、KH和LDA。在一个替代的实施方案中,在步骤1中使用多种碱。
步骤1中使用的溶剂可以是任何合适的有机溶剂,包括但不限于DMAc(N,N-二甲基乙酰胺)、DCM(二氯甲烷)、THF(四氢呋喃)、DMF(N,N-二甲基甲酰胺)、ACN(乙腈)、DMAP(4-二甲基氨基吡啶)、水、乙酸、丙酮、二噁烷、苯、1-丁醇、2-丁醇、叔丁醇、四氯化碳、氯仿、环己烷、己烷、乙醚、二甘醇二甲醚、DME(二甲氧基乙烷)、DMSO(二甲基亚砜)、乙醇、乙酸乙酯、乙二醇、甘油、庚烷、HMPA(六甲基磷酰胺)、甲醇、MTBE(甲基叔丁基醚)、NMP(N-甲基-2-吡咯烷酮)、戊烷、吡啶、甲苯、盐酸和三乙胺。在一个非限制性实施方案中,溶剂选自THF、ACN、DMAP和DMSO。在一个替代的实施方案中,在步骤1中使用溶剂混合物。
在另一个实施方案中,步骤1中使用的溶剂是二噁烷。在另一个另外的实施方案中,溶剂选自DCM、EtOAc、乙醇、二噁烷、叔丁醇和THF。
步骤1中使用的温度可以是例如约20℃至约25℃,约15℃至约30℃,约10℃至约35℃,约5℃至约40℃,或约0℃至约50℃。在一个非限制性实施方案中,温度保持在室温或低于室温。或者,虽然不太常见,但反应可在升高的温度下进行。
可以使反应进行足够的时间以获得所需的产物产率。例如,反应可在步骤1中进行约10分钟至约10小时,约30分钟至约5小时,约45分钟至约3小时,或约1小时至约2小时。
在一个实施方案中,将粗反应混合物用水淬灭。在另一个实施方案中,将粗反应混合物用饱和氯化铵淬灭。
在一个实施方案中,以至少约5、10、15或20分钟的搅拌间隔分批加入砜。在一个实施方案中,以至少10分钟的搅拌间隔分批加入砜。
在一个实施方案中,2’-(杂芳基)-内酰胺-吡咯并[2,3-d]嘧啶用作游离碱。在另一个实施方案中,将2’-(杂芳基)-内酰胺-吡咯并[2,3-d]嘧啶被转化为盐(例如步骤2)。
在一个实施方案中,2’-(杂芳基)-内酰胺-吡咯并[2,3-d]嘧啶是式X的化合物。
WO2013/163239和WO2015/061407描述了通过选自Cl、Br、I、-S-Me、-S-芳基、-S-杂芳基、SOMe、SO2Me、SO烷基、SO2烷基、SO-环烷基、SO2环烷基、SO芳基、SO2芳基、羟基、羟烷基、羟基芳基和羟基杂芳基的离去基团将杂芳基胺与内酰胺-吡咯并[2,3-d]嘧啶偶联。
步骤2:形成2’-(杂芳基)-内酰胺-吡咯并[2,3-d]嘧啶的盐的方法
在步骤2中,使2’-(杂芳基)-内酰胺-吡咯并[2,3-d]嘧啶与酸反应,得到2’-(杂芳基)-内酰胺-吡咯并[2,3-d]嘧啶盐。将2’-(杂芳基)-内酰胺-吡咯并[2,3-d]嘧啶与合适的酸在合适的溶剂中混合,所述溶剂通常是两种反应物都溶于其中的中性有机溶剂。在一个实施方案中,溶剂是酸。除了第一溶剂和酸之外,还可以使用反溶剂。可以使用任何摩尔比的两种反应物,以获得所需的结果。通常,过量的酸是有用的。反应可在允许反应发生的任何温度下进行。已经发现反应可以在室温下进行。使反应进行足够的时间以提供所需的产率,之后通过任何合适的方法纯化批料,包括过滤、结晶和柱色谱,得到2’-(杂芳基)-内酰胺-吡咯并[2,3-d]嘧啶盐。
在一个实施方案中,酸是HCl。
步骤2中使用的溶剂可以是任何合适的有机溶剂,包括但不限于DMAc(N,N-二甲基乙酰胺)、DCM(二氯甲烷)、THF(四氢呋喃)、DMF(N,N-二甲基甲酰胺)、ACN(乙腈)、DMAP(4-二甲基氨基吡啶)、水、乙酸、丙酮、二噁烷、苯、1-丁醇、2-丁醇、叔丁醇、四氯化碳、氯仿、环己烷、己烷、乙醚、二甘醇二甲醚、DME(二甲氧基乙烷)、DMSO(二甲基亚砜)、乙醇、乙酸乙酯、乙二醇、甘油、庚烷、HMPA(六甲基磷酰胺)、甲醇、MTBE(甲基叔丁基醚)、NMP(N-甲基-2-吡咯烷酮)、戊烷、吡啶、甲苯、盐酸和三乙胺。在一个非限制性实施方案中,溶剂选自DCM、甲醇、丙酮和DMSO。在一个替代的实施方案中,在步骤2中使用溶剂混合物。
在一个实施方案中,溶剂是约6M HCl水溶液。在另一个实施方案中,溶剂是在二噁烷中的约4M HCl。在另一个实施方案中,溶剂是溶剂的混合物。在一个实施方案中,溶剂的混合物是DCM和甲醇的混合物。
在另外的实施方案中,溶剂是约2M HCl水溶液。在另一个另外的实施方案中,溶剂是2M HCl水溶液。
步骤2中使用的反溶剂可以是任何合适的有机溶剂,包括但不限于DMAc(N,N-二甲基乙酰胺)、DCM(二氯甲烷)、THF(四氢呋喃)、DMF(N,N-二甲基甲酰胺)、ACN((乙腈)、DMAP(4-二甲基氨基吡啶)、水、乙酸、丙酮、二噁烷、苯、1-丁醇、2-丁醇、叔丁醇、四氯化碳、氯仿、环己烷、己烷、乙醚、二甘醇二甲醚、DME(二甲氧基乙烷)、DMSO(二甲基亚砜)、乙醇、乙酸乙酯、乙二醇、甘油、庚烷、HMPA(六甲基磷酰胺)、甲醇、MTBE(甲基叔丁基醚)、NMP(N-甲基-2-吡咯烷酮)、戊烷、吡啶、甲苯、盐酸和三乙胺。在一个非限制性实施方案中,溶剂选自DCM、甲醇、丙酮和DMSO。在一个替代的实施方案中,在步骤2中使用溶剂的混合物。
步骤2中使用的温度可以是例如约20℃至约25℃、约15℃至约30℃、约10℃至约35℃、约5℃至约40℃、约0℃至约50℃或约0℃至约70℃。在一个非限制性实施方案中,温度保持在室温或低于室温。或者,虽然不太常见,但反应可在升高的温度下进行。
可以使反应进行足够的时间以获得所需的产物产率。例如,反应可以在步骤2中进行约10分钟至约10小时、约30分钟至约5小时、约45分钟至约3小时或约1小时至约2小时。
在一个实施方案中,盐是二盐酸盐。
IIIA.从嘧啶酯制备砜/亚砜的方法
已经发现2’-(烷基磺酰基)-内酰胺-吡咯并[2,3-d]嘧啶和亚砜和硫化物类似物也可以从4-卤代-2-(烷硫基)嘧啶-5-羧酸烷基酯以七步或更少的步骤制备。在一个非限制性实施方案中,2’-(烷基磺酰基)-内酰胺-吡咯并[2,3-d]嘧啶是螺环例如2’-(甲基磺酰基)-7’,8’-二氢-6’H-螺[环己烷-1,9’-吡嗪并[1’,2’:1,5]吡咯并[2,3-d]嘧啶]-6’-酮。
步骤1:2-(烷硫基)-4-(内酰胺)嘧啶-5-羧酸烷基酯的制备
在步骤1中,使4-卤代-2-(烷硫基)嘧啶-5-羧酸烷基酯与内酰胺胺在亲核取代反应中反应,得到2-(烷硫基)-4-(内酰胺)嘧啶-5-羧酸烷基酯。将4-卤代-2-(烷硫基)嘧啶-5-羧酸烷基酯和内酰胺胺在合适的溶剂中混合,所述溶剂通常是两种反应物与碱都溶解在其中的中性有机溶剂,所述碱将促进亲核取代反应。可以使用任何摩尔比的两种反应物,以获得所需的结果。通常,小摩尔过量的内酰胺胺是有用的,例如约1.1当量的内酰胺胺对约1.0当量的羧酸酯。反应可在允许反应发生的任何温度下进行。已经发现,可以通过加热促进反应,包括直至回流。使反应进行足够的时间以提供所需的产率,然后任选地冷却并通过任何合适的方法纯化批料,包括过滤、结晶和柱色谱,得到2-(烷硫基)-4-(内酰胺)嘧啶-5-羧酸烷基酯。在一个非限制性说明性实施方案中,4-卤代-2-(烷硫基)嘧啶-5-羧酸烷基酯是4-氯-2-(甲硫基)嘧啶-5-羧酸乙酯,内酰胺胺是螺内酰胺,碱是DIPEA,溶剂为DMAc,温度为约95℃,时间为约60小时。
步骤1中使用的碱可以是任何合适的有机碱,包括但不限于DIPEA(N,N-二异丙基乙胺)、DMAP(4-二甲基氨基吡啶)、DBU(1,8-二氮杂双环十一碳-7-烯)、TEA(三乙胺)、吡啶、氨、甲胺、乙胺、丙胺、异丙胺、二甲胺、二乙胺、二丙胺、二异丙胺、三甲胺、三丙胺、三异丙胺、苯胺、甲基苯胺、二甲基苯胺、吡啶、氮杂久洛尼定、苄胺、甲基苄胺、二甲基苄胺、DABCO(1,4-二氮杂双环[2.2.2]辛烷)、1,5-二氮杂双环[4.3.0]壬-5-烯、2,6-二甲基吡啶、吗啉、哌啶、哌嗪、质子-海绵、1,5,7-三氮杂双环[4.4.0]癸-5-烯、苄吡二胺、氢氧化铵、三乙醇胺、乙醇胺或三羟甲基氨基甲烷。在一个非限制性实施方案中,碱选自DIPEA、DMAP、DBU、TEA和吡啶。在一个替代的实施方案中,在步骤1中使用多种碱。
步骤1中使用的溶剂可以是任何合适的有机溶剂,包括但不限于DMAc(N,N-二甲基乙酰胺)、DCM(二氯甲烷)、THF(四氢呋喃)、DMF(N,N-二甲基甲酰胺)、TFA(三氟乙酸)、ACN(乙腈)、DMAP(4-二甲基氨基吡啶)、水、乙酸、丙酮、二噁烷、苯、1-丁醇、2-丁醇、叔丁醇、四氯化碳、氯仿、环己烷、己烷、乙醚、二甘醇二甲醚、DME(二甲氧基乙烷)、DMSO(二甲基亚砜)、乙醇、乙酸乙酯、乙二醇、甘油、庚烷、HMPA(六甲基磷酰胺)、甲醇、MTBE(甲基叔丁基醚)、NMP(N-甲基-2-吡咯烷酮)、戊烷、吡啶、甲苯、盐酸和三乙胺。在一个非限制性实施方案中,溶剂选自DMAc、ACN、DMAP和DMSO。在一个替代的实施方案中,在步骤1中使用溶剂的混合物。
在另一个实施方案中,步骤1中使用的溶剂是二噁烷。在另一个另外的实施方案中,溶剂选自DCM、EtOAc、乙醇、二噁烷、叔丁醇和THF。
步骤1中使用的温度可以是例如约50℃至约150℃、约60℃至约125℃、约70℃至约110℃、约80℃至约100℃或约90℃至约100℃。在一个非限制性实施方案中,温度选自约80℃至约100℃。在另一个实施方案中,通过使用可以保持高压的反应容器,反应温度高于溶剂回流。或者,虽然不太常见,但反应可在室温或低于室温下进行。
可以使反应进行足够的时间以获得所需的产物产率。例如,反应可以在步骤1中进行约5小时至约110小时、约15小时至约100小时、约25小时至约90小时、约35小时至约80小时或约50小时至约70小时。本领域技术人员应该理解,反应的时间和温度是相关的。例如,如果使用更高的温度,则更低的反应时间可以获得所需的产率。
步骤2:任选地保护2-(烷硫基)-4-(内酰胺)嘧啶-5-羧酸烷基酯
在步骤2中,使2-(烷硫基)-4-(内酰胺)嘧啶-5-羧酸烷基酯与保护基试剂反应,得到受保护的2-(烷硫基)-4-(内酰胺)嘧啶-5-羧酸烷基酯。将2-(烷硫基)-4-(内酰胺)嘧啶-5-羧酸烷基酯和保护基试剂在合适的溶剂中混合,所述溶剂通常是两种反应物与碱都溶解在其中的中性有机溶剂,所述碱将有助于安装保护基团。可以使用任何摩尔比的两种反应物,以获得所需的结果。通常,小摩尔过量的保护基试剂是有用的,例如约1.5当量的保护基试剂对约1.0当量的2-(烷硫基)-4-(内酰胺)嘧啶-5-羧酸烷基酯。反应可在允许反应发生的任何温度下进行。使反应进行足够的时间以提供所需的产率,之后通过任何合适的方法纯化批料,包括过滤、结晶和柱色谱,得到保护的2-(烷硫基)-4-(内酰胺)嘧啶-5-羧酸烷基酯。在一个非限制性实施方案中,2-(烷硫基)-4-(内酰胺)嘧啶-5-羧酸烷基酯是2-(甲硫基)-4-(3-氧代-1,4-二氮杂螺[5.5]十一烷-l-基)嘧啶-5-羧酸乙酯,保护基试剂是Boc-酸酐,碱是DMAP,溶剂是二氯甲烷,温度为约25℃,时间为约3小时。
在一个非限制性实施方案中,使用的初始内酰胺胺已经被保护。在一个替代的实施方案中,内酰胺取代的嘧啶适当地反应而不需要保护基团。
步骤2中使用的保护基试剂可以是允许安装任何合适的保护基团的任何合适的试剂,包括但不限于Boc-酸酐(叔丁氧基羰基酸酐)、Boc-Cl、CBz-Cl、(羧基苄基氯)氯甲酸甲酯、苄基氯、苯甲酰氯、烯丙基氯、三氟甲磺酸酐、Tf-Cl、甲苯磺酸酐和Ts-Cl。在一个非限制性实施方案中,保护基是Boc,合适的试剂是Boc-酸酐或Boc-Cl。在一个替代的实施方案中,保护基是CBz,合适的试剂是CBz-Cl。
步骤2中使用的碱可以是任何合适的有机碱,包括但不限于DIPEA、DMAP、DBU、TEA、吡啶、氨、甲胺、乙胺、丙胺、异丙胺、二甲胺、二乙胺、二丙胺、二异丙胺、三甲胺、三丙胺、三异丙胺、苯胺、甲基苯胺、二甲基苯胺、吡啶、氮杂久洛尼定、苄胺、甲基苄胺、二甲基苄胺、DABCO、1,5-二氮杂双环[4.3.0]壬-5-烯、2,6-二甲基吡啶、吗啉、哌啶、哌嗪、质子-海绵、1,5,7-三氮杂双环[4.4.0]癸-5-烯、苄吡二胺、氢氧化铵、三乙醇胺、乙醇胺和三羟甲基氨基甲烷。在一个非限制性实施方案中,碱选自DIPEA、DMAP、DBU、TEA和吡啶。在一个替代的实施方案中,在步骤2中使用多种碱。
步骤2中使用的溶剂可以是任何合适的有机溶剂,包括但不限于DMAc、DCM、THF、DMF、TFA、ACN、DMAP、水、乙酸、丙酮、二噁烷、苯、1-丁醇、2-丁醇、叔丁醇、四氯化碳、氯仿、环己烷、己烷、乙醚、二甘醇二甲醚、DME、DMSO、乙醇、乙酸乙酯、乙二醇、甘油、庚烷、HMPA、甲醇、MTBE、NMP、戊烷、吡啶、甲苯、盐酸和三乙胺。在一个非限制性实施方案中,溶剂选自DCM、二噁烷、水和THF。在一个替代的实施方案中,在步骤2中使用溶剂的混合物。
步骤2中使用的温度可以是例如约-20℃至约100℃、约-10℃至约80℃、约0℃至约60℃、约10℃至约40℃或约20℃至约30℃。在一个非限制性实施方案中,温度选自约20℃至约30℃。
可以使反应进行足够的时间以获得所需的产物产率。例如,反应可在步骤2中进行约0.1小时至约20小时、约0.5小时至约15小时、约1小时至约10小时、约1.5小时至约5小时或约2小时至约4小时。本领域技术人员应该理解,反应的时间和温度是相关的。例如,如果使用更高的温度,则更低的反应时间可以获得所需的产率。或者,如果使用较低的温度,则需要较高的反应时间以获得所需的产率,但可能存在较少的副产物。
步骤3:5’-羟基-2’-(烷硫基)-内酰胺-吡咯并[2,3-d]嘧啶的制备
在步骤3中,保护的2-(烷硫基)-4-(内酰胺)嘧啶-5-羧酸烷基酯在分子内环化反应中与碱反应,得到5’-羟基-2’-(烷硫基)-内酰胺-吡咯并[2,3-d]嘧啶。将保护的2-(烷硫基)-4-(内酰胺)嘧啶-5-羧酸烷基酯和碱在合适的溶剂中混合,所述溶剂通常是反应物和试剂溶解于其中的中性有机溶剂。可以使用任何摩尔比的反应物和试剂,以获得所需的结果。反应可在允许反应发生的任何温度下进行。使反应进行足够的时间以提供所需的产率,之后通过任何合适的方法纯化批料,包括过滤、结晶和柱色谱,得到5’-羟基-2’-(烷硫基)-内酰胺-吡咯并[2,3-d]嘧啶。在一个非限制性实施方案中,保护的2-(烷硫基)-4-(内酰胺)嘧啶-5-羧酸烷基酯是1-(5-(乙氧基羰基)-2-(甲硫基)嘧啶-4-基)叔丁基)-3-氧代-1,4-二氮杂螺[5.5]十一烷-4-羧酸叔丁酯,碱为DBU,溶剂为THF,温度为约5℃,时间为约2小时。
步骤3中使用的碱可以是任何合适的有机碱,包括但不限于DIPEA、DMAP、DBU、TEA、吡啶、氨、甲胺、乙胺、丙胺、异丙胺、二甲胺、二乙胺、二丙胺、二异丙胺、三甲胺、三丙胺、三异丙胺、苯胺、甲基苯胺、二甲基苯胺、吡啶、氮杂久洛尼定、苄胺、甲基苄胺、二甲基苄胺、DABCO、1,5-二氮杂双环[4.3.0]壬-5-烯、2,6-二甲基吡啶、吗啉、哌啶、哌嗪、质子-海绵、1,5,7-三氮杂双环[4.4.0]癸-5-烯、苄吡二胺、氢氧化铵、三乙醇胺、乙醇胺或三羟甲基氨基甲烷。在一个非限制性实施方案中,碱选自DIPEA、DMAP、DBU、DABCO、TEA和吡啶。在一个替代的实施方案中,在步骤3中使用多个种碱。
步骤3中使用的溶剂可以是任何合适的有机溶剂,包括但不限于DMAc、DCM、THF、DMF、TFA、ACN、DMAP、水、乙酸、丙酮、二噁烷、苯、1-丁醇、2-丁醇、叔丁醇、四氯化碳、氯仿、环己烷、己烷、乙醚、二甘醇二甲醚、DME、DMSO、乙醇、乙酸乙酯、乙二醇、甘油、庚烷、HMPA、甲醇、MTBE、NMP、戊烷、吡啶、甲苯、盐酸和三乙胺。在一个非限制性实施方案中,溶剂选自DCM、二噁烷、水和THF。在另一个实施方案中,在步骤3中使用溶剂的混合物。
步骤3中使用的温度可以是例如约-50℃至约50℃、约-35℃至约40℃、约-10℃至约30℃、约-5℃至约20℃或约0℃至约10℃。在一个非限制性实施方案中,温度选自约0℃至约10℃。
可以使反应进行足够的时间以获得所需的产物产率。例如,反应可以在步骤3中进行约0.1小时至约20小时、约0.5小时至约15小时、约1小时至约10小时、约1.5小时至约5小时或约2小时至约3小时。本领域技术人员应该理解,反应的时间和温度是相关的。例如,如果使用更高的温度,则更低的反应时间可以获得所需的产率。或者,如果使用较低的温度,则需要较高的反应时间以获得所需的产率,但可能存在较少的副产物。
步骤4:5’-离去基团-2’-(烷硫基)-内酰胺-吡咯并[2,3-d]嘧啶的制备
在步骤4中,使5’-羟基-2’-(烷硫基)-内酰胺-吡咯并[2,3-d]嘧啶与离去基试剂反应,得到5’-离去基团-2’-(烷硫基)-内酰胺-吡咯并[2,3-d]嘧啶。将5’-羟基-2’-(烷硫基)-内酰胺-吡咯并[2,3-d]嘧啶和离去基试剂在合适的溶剂中混合,所述溶剂通常是两种反应物与碱都溶解在其中的中性有机溶剂,所述碱会促进反应。可以使用任何摩尔比的反应物,以获得所需的结果。通常,小摩尔过量的保护基试剂是有用的,例如约1.6当量离去基试剂对约1.0当量5’-羟基-2’-(烷硫基)-内酰胺-吡咯并[2,3-d]嘧啶。反应可在允许反应发生的任何温度下进行。使反应进行足够的时间以提供所需的产率,之后通过任何合适的方法纯化批料,包括过滤、结晶和柱色谱,得到5’-离去基团-2’-(烷硫基)-内酰胺-吡咯并[2,3-d]嘧啶。在一个非限制性实施方案中,5’-羟基-2’-(烷硫基)-内酰胺-吡咯并[2,3-d]嘧啶是5’-羟基-2’-(甲硫基)-6’-氧代-6’H-螺[环己烷-1,9’-吡嗪并[1’,2’:1,5]吡咯并[2,3-d]嘧啶]-7’(8’H)-羧酸叔丁酯,离去基试剂为三氟甲磺酸酐,碱为TEA,溶剂为DCM,温度为约0℃,时间为约3小时。
步骤4中使用的离去基试剂可以是允许羟基转化为任何合适的离去基团的任何合适的试剂,包括但不限于三氟甲磺酸酐、Tf-Cl、甲苯磺酸酐和Ts-Cl。在一个非限制性实施方案中,保护基团是三氟甲磺酸酯,合适的试剂是三氟甲磺酸酐或Tf-Cl。
步骤4中使用的碱可以是任何合适的有机碱,包括但不限于DIPEA、DMAP、DBU、TEA、吡啶、氨、甲胺、乙胺、丙胺、异丙胺、二甲胺、二乙胺、二丙胺、二异丙胺、三甲胺、三丙胺、三异丙胺、苯胺、甲基苯胺、二甲基苯胺、吡啶、氮杂久洛尼定、苄胺、甲基苄胺、二甲基苄胺、DABCO、1,5-二氮杂双环[4.3.0]壬-5-烯、2,6-二甲基吡啶、吗啉、哌啶、哌嗪、质子-海绵、1,5,7-三氮杂双环[4.4.0]癸-5-烯、苄吡二胺、氢氧化铵、三乙醇胺、乙醇胺或三羟甲基氨基甲烷。在一个非限制性实施方案中,碱选自DIPEA、DMAP、DBU、三甲胺、TEA和吡啶。在替代实施方案中,在步骤4中使用多种碱。
步骤4中使用的溶剂可以是任何合适的有机溶剂,包括但不限于DMAc、DCM、THF、DMF、TFA、ACN、DMAP、水、乙酸、丙酮、二噁烷、苯、1-丁醇、2-丁醇、叔丁醇、四氯化碳、氯仿、环己烷、己烷、乙醚、二甘醇二甲醚、DME、DMSO、乙醇、乙酸乙酯、乙二醇、甘油、庚烷、HMPA、甲醇、MTBE、NMP、戊烷、吡啶、甲苯、盐酸和三乙胺。在一个非限制性实施方案中,溶剂选自DCM、乙醚和THF。在一个替代的实施方案中,在步骤4中使用溶剂的混合物。通常,溶剂或溶剂的混合物是非质子性的,以避免与离去基团试剂反应。
步骤4中使用的温度可以是例如约-50℃至约50℃、约-35℃至约35℃、约-25℃至约25℃、约-15℃至约15℃或约-5℃至约5℃。在一个非限制性实施方案中,温度选自约-5℃至约5℃。
可以使反应进行足够的时间以获得所需的产物产率。例如,反应可在步骤4中进行约0.1小时至约20小时、约0.5小时至约15小时、约1小时至约10小时、约1.5小时至约5小时或约2小时至约4小时。本领域技术人员应该理解,反应的时间和温度是相关的。例如,如果使用较高的温度,则较低的反应时间可以获得所需的产率。或者,如果使用较低的温度,则需要较高的反应时间以获得所需的产率,但可能存在较少的副产物。
步骤5:2’-(烷硫基)-内酰胺-吡咯并[2,3-d]嘧啶的制备
在步骤5中,使5’-离去基团-2’-(烷硫基)-内酰胺-吡咯并[2,3-d]嘧啶与离去基团裂解试剂反应以除去离去基团并得到2’-(烷硫基)-内酰胺-吡咯并[2,3-d]嘧啶。将5’-离去基团-2’-(烷硫基)-内酰胺-吡咯并[2,3-d]嘧啶和离去基团裂解试剂在合适的溶剂中混合,所述溶剂通常是两种反应物与促进反应的催化剂一起都溶解于其中的中性有机溶剂。可以使用任何摩尔比的反应物,以获得所需的结果。通常,摩尔过量的离去基团裂解试剂是有用的,例如约2.0当量离去基团裂解试剂对约1.0当量5’-离去基团-2’-(烷硫基)-内酰胺-吡咯并[2,3-d]嘧啶。反应可在允许反应发生的任何温度下进行。使反应进行足够的时间以提供所需的产率,之后通过任何合适的方法纯化批料,包括过滤、结晶和柱色谱,得到2’-(烷硫基)-内酰胺-吡咯并[2,3-d]嘧啶。在一个非限制性实施方案中,5’-离去基团-2’-(烷硫基)-内酰胺-吡咯并[2,3-d]嘧啶是2’-(甲硫基)-6’-氧代-5’-(((三氟甲基)磺酰基)氧基)-6’H-螺[环己烷-1,9’-吡嗪并[1’,2’:1,5]吡咯并[2,3-d]嘧啶]-7’(8’H)-羧酸叔丁酯,离去基团裂解试剂是三乙基硅烷,催化剂是四钯,溶剂是DMF,温度为约50℃,时间为约14小时。
步骤5中使用的离去基团裂解试剂可以是允许除去离去基团的任何合适的试剂,包括但不限于三烷基硅烷。在一个非限制性实施方案中,离去基团裂解试剂是三乙基硅烷。
步骤5中使用的催化剂可以是任何合适的有机金属催化剂,包括但不限于Pd/C、四钯、乙酸钯、[1,1’-双(二苯基膦基)二茂铁]二氯化钯(II)、三(二亚苄基丙酮)二钯(0)和烯丙基氯化钯(II)。在一个替代的实施方案中,在步骤5中使用多种催化剂或催化剂和助催化剂。
步骤5中使用的溶剂可以是任何合适的有机溶剂,包括但不限于DMAc、DCM、THF、DMF、TFA、ACN、DMAP、水、乙酸、丙酮、二噁烷、苯、1-丁醇、2-丁醇、叔丁醇、四氯化碳、氯仿、环己烷、己烷、乙醚、二甘醇二甲醚、DME、DMSO、乙醇、乙酸乙酯、乙二醇、甘油、庚烷、HMPA、甲醇、MTBE、NMP、戊烷、吡啶、甲苯、盐酸和三乙胺。在一个非限制性实施方案中,溶剂选自DMF、DMSO、ACN和NMP。在另一个实施方案中,在步骤5中使用溶剂的混合物。通常,溶剂或溶剂混合物是非质子性的,以避免与试剂反应。
步骤5中使用的温度可以是例如约0℃至约100℃、约15℃至约85℃、约25℃至约75℃、约35℃至约65℃或约45℃至约55℃。在一个非限制性实施方案中,温度选自约45℃至约55℃。
可以使反应进行足够的时间以获得所需的产物产率。例如,反应可以在步骤5中进行约1小时至约30小时、约3小时至约25小时、约6小时至约20小时、约9小时至约16小时或约12小时至约15小时。本领域技术人员应该理解,反应的时间和温度是相关的。例如,如果使用较高的温度,则较低的反应时间可以获得所需的产率。或者,如果使用较低的温度,则需要较高的反应时间以获得所需的产率,但可能存在较少的副产物。
步骤6:任选地将2’-(烷硫基)-内酰胺-吡咯并[2,3-d]嘧啶脱保护
在步骤6中,将2’-(烷硫基)-内酰胺-吡咯并[2,3-d]嘧啶脱保护,得到脱保护的2-(烷硫基)-4-(内酰胺)嘧啶-5-羧酸烷基酯。将2’-(烷硫基)-内酰胺-吡咯并[2,3-d]嘧啶和脱保护试剂在合适的溶剂中混合,所述溶剂通常是两种反应物都溶于其中的有机溶剂。可以使用任何摩尔比的反应物和脱保护试剂,以获得所需的结果。通常,大摩尔过量的脱保护试剂是有用的,例如约5当量脱保护试剂对约1.0当量2’-(烷硫基)-内酰胺-吡咯并[2,3-d]嘧啶。反应可在允许反应发生的任何温度下进行。使反应进行足够的时间以提供所需的产率,然后通过任何合适的方法纯化批料,包括过滤、结晶和柱色谱,得到脱保护的2’-(烷硫基)-内酰胺-吡咯并[2,3-d]嘧啶。在一个非限制性实施方案中,2’-(烷硫基)-内酰胺-吡咯并[2,3-d]嘧啶是2’-(甲硫基)-6’-氧代-6’H-螺[环己烷-1,9’-吡嗪并[1’,2’:1,5]吡咯并[2,3-d]嘧啶]-7’(8’H)-羧酸叔丁酯,脱保护试剂为TFA,溶剂为二氯甲烷,温度为约25℃,时间为约2小时。
在一个非限制性实施方案中,2’-(烷硫基)-内酰胺-吡咯并[2,3-d]嘧啶已经脱保护,因为它在不存在保护基团的情况下适合于先前的反应。在一个替代的实施方案中,保留该保护基团以在以后的步骤中除去。
步骤6中使用的脱保护试剂可以是任何合适的试剂,其允许任何合适的保护基团的脱保护,包括但不限于TFA、乙酸、氨基甲磺酸、抗坏血酸、苯磺酸、苯甲酸、甲酸、乳酸、苹果酸、丙二酸、甲磺酸、草酸、邻苯二甲酸、水杨酸、琥珀酸、氨基磺酸、对甲苯磺酸、三氯乙酸、三氟甲磺酸、硼酸、氢碘酸、氢溴酸、盐酸、氢氟酸、碘酸、硝酸、高氯酸、高碘酸、次膦酸、磷酸、含有或不含氢气的钯碳、含有或不含氢气的铂碳、三乙基硅烷、TBAF和HF。在一个非限制性实施方案中,保护基团是Boc,合适的试剂是TFA。在另一个实施方案中,保护基团是CBz,合适的试剂是含氢气的钯碳。
在另一个实施方案中,步骤6中使用的脱保护试剂是碱性脱保护试剂,包括但不限于DIPEA、DMAP、DBU、TEA、吡啶、氨、甲胺、乙胺、丙胺、异丙胺、二甲胺、二乙胺、二丙胺、二异丙胺、三甲胺、三丙胺、三异丙胺、苯胺、甲基苯胺、二甲基苯胺、吡啶、氮杂久洛尼定、苄胺、甲基苄胺、二甲基苄胺、DABCO、1,5-二氮杂双环[4.3.0]壬-5-烯、2,6-二甲基吡啶、吗啉、哌啶、哌嗪、质子-海绵、1,5,7-三氮杂双环[4.4.0]癸-5-烯、苄吡二胺、氢氧化铵、三乙醇胺、乙醇胺、NaOH、tBuOK、NaH、KH或三羟甲基氨基甲烷。在一个非限制性实施方案中,碱选自DIPEA、DMAP、DBU、DABCO、TEA和tBuOK。
在另一个实施方案中,步骤6中使用的脱保护试剂是NaOMe。
在另一个另外的实施方案中,脱保护使用MeOH作为溶剂,NaOMe作为碱。在一个实施方案中,将反应加热约1、2、3、4、5、6、7或8小时。在一个实施方案中,在分离之前将反应冷却至室温以下。在一个实施方案中,将反应回流约3小时,冷却至约0℃,分离,并用MeOH洗涤。
步骤6中使用的溶剂可以是任何合适的有机溶剂,包括但不限于DMAc、DCM、THF、DMF、TFA、ACN、DMAP、水、乙酸、丙酮、二噁烷、苯、1-丁醇、2-丁醇、叔丁醇、四氯化碳、氯仿、环己烷、己烷、乙醚、二甘醇二甲醚、DME、DMSO、乙醇、乙酸乙酯、乙二醇、甘油、庚烷、HMPA、甲醇、MTBE、NMP、戊烷、吡啶、甲苯、盐酸和三乙胺。在一个非限制性实施方案中,溶剂选自TFA、DCM、THF和氯仿。在一个替代的实施方案中,在步骤6中使用溶剂的混合物。在另一个替代的实施方案中,脱保护试剂被用作溶剂。
步骤6中使用的温度可以是例如约-20℃至约100℃,约-10℃至约80℃,约0℃至约60℃,约10℃至约40℃,或约20℃至约30℃。在一个非限制性实施方案中,温度选自约20℃至约30℃。
可以使反应进行足够的时间以获得所需的产物产率。例如,反应可在步骤6中进行约1小时至约40小时、约3小时至约35小时、约5小时至约30小时、约10小时至约25小时或约13小时至约20小时。本领域技术人员应该理解,反应的时间和温度是相关的。例如,如果使用较高的温度,则较低的反应时间可以获得所需的产率。或者,如果使用较低的温度,则需要较高的反应时间以获得所需的产率,但可能存在较少的副产物。
步骤7:任选地氧化2’-(烷硫基)-内酰胺-吡咯并[2,3-d]嘧啶
在步骤7中,使2’-(烷硫基)-内酰胺-吡咯并[2,3-d]嘧啶与氧化剂反应,得到2’-(烷基磺酰基)-内酰胺-吡咯并[2,3-d]嘧啶或2’-(烷基亚磺酰基)-内酰胺-吡咯并[2,3-d]嘧啶。将2’-(烷硫基)-内酰胺-吡咯并[2,3-d]嘧啶和氧化剂在合适的溶剂中混合,所述溶剂通常是两种反应物都溶解的中性有机溶剂。可以使用任何摩尔比的反应物和氧化剂,以获得所需的结果。通常,大摩尔过量的氧化剂是有用的,例如约5当量氧化剂对约1.0当量2’-(烷硫基)-内酰胺-吡咯并[2,3-d]嘧啶。反应可在允许反应发生的任何温度下进行。使反应进行足够的时间以提供所需的产率,之后通过任何合适的方法纯化批料,包括过滤、结晶和柱色谱,得到2’-(烷基磺酰基)-内酰胺-吡咯并[2,3-d]嘧啶或2’-(烷基亚磺酰基)-内酰胺-吡咯并[2,3-d]嘧啶。在一个非限制性实施方案中,2’-(烷硫基)-内酰胺-吡咯并[2,3-d]嘧啶是2’-(甲硫基)-7’,8’-二氢-6’H-螺[环己烷-l,9’-吡嗪并[1’,2’:1,5]吡咯并[2,3-d]嘧啶]-6’-酮,氧化剂为过硫酸氢钾,溶剂为水和乙腈的混合物,温度为约25℃,时间为约2小时。
步骤7中使用的氧化剂可以是允许氧化成砜或亚砜氧化态的任何合适的试剂,包括但不限于过硫酸氢钾、过氧化氢、mCPBA、次氯酸钠和亚氯酸钠。在一个非限制性实施方案中,产物是砜,氧化剂是过硫酸氢钾。
在另一个实施方案中,使用的氧化剂用添加剂催化。在一个实施方案中,添加剂是Na2WO4。在一个实施方案中,添加剂是Na2WO4,氧化剂是过氧化氢。在一个实施方案中,添加剂是Na2WO4,氧化剂是过氧化氢,反应在H2O和EtOH的混合物中加热进行。在一个实施方案中,添加剂是Na2WO4并且氧化剂是过氧化氢,并且反应在H2O和EtOH的混合物中在约60℃下进行约1、2、3、4、5、6、7、8或9小时。
在另一个实施方案中,将氧化剂缓慢加入反应混合物中。在一个实施方案中,在约10、20、30、40、50、60、70、80、90或100分钟的过程中加入氧化剂。在一个实施方案中,在约50分钟的过程中加入氧化剂。在一个实施方案中,在50分钟的过程中添加比在例如10分钟的过程中添加的更快的添加产生更高的产率。
步骤7中使用的溶剂可以是任何合适的有机溶剂,包括但不限于DMAc、DCM、THF、DMF、TFA、ACN、DMAP、水、乙酸、丙酮、二噁烷、苯、1-丁醇、2-丁醇、叔丁醇、四氯化碳、氯仿、环己烷、己烷、乙醚、二甘醇二甲醚、DME、DMSO、乙醇、乙酸乙酯、乙二醇、甘油、庚烷、HMPA、甲醇、MTBE、NMP、戊烷、吡啶、甲苯、盐酸和三乙胺。在一个非限制性实施方案中,溶剂选自ACN、水和二噁烷。在一个替代的实施方案中,在步骤7中使用溶剂的混合物,例如水和ACN。
步骤7中使用的温度可以是例如约-20℃至约100℃、约-10℃至约80℃、约0℃至约60℃、约10℃至约40℃或约20℃至约30℃。在一个非限制性实施方案中,温度选自约20℃至约30℃。
可以使反应进行足够的时间以获得所需的产物产率。例如,反应可以在步骤7中进行约1小时至约40小时、约3小时至约35小时、约5小时至约30小时、约10小时至约25小时或约13小时至约20小时。本领域技术人员应该理解,反应的时间和温度是相关的。例如,如果使用较高的温度,则较低的反应时间可以获得所需的产率。或者,如果使用较低的温度,则需要较高的反应时间以获得所需的产率,但可能存在较少的副产物。
本领域技术人员应该认识到,可以切换本文所述步骤的顺序,同时仍然到达相同的最终产品。例如,氧化可以在步骤3和步骤4之间、步骤4和步骤5之间、或者步骤5和步骤6之间进行;保护步骤可以在步骤1之前、步骤3和步骤4之间、或者步骤4和步骤5之间进行;脱保护步骤可以在步骤3和步骤4之间、步骤4和步骤5之间、或者步骤7之后进行。
在一个非限制性实施方案中,内酰胺胺已经被适当地保护并且第2步不是必需的。在另一个实施方案中,所选择的试剂和起始材料不需要保护以进行至所需产物,并且不需要步骤2和步骤6。
在另一个实施方案中,内酰胺胺是式I的化合物,2-(烷硫基)-4-(内酰胺)嘧啶-5-羧酸烷基酯是式II的化合物,5’-羟基-2’-(烷硫基)-内酰胺-吡咯并[2,3-d]嘧啶和5’-离去基团-2’-(烷硫基)-内酰胺-吡咯并[2,3-d]嘧啶是式III的化合物,2’-(烷硫基)-内酰胺-吡咯并[2,3-d]嘧啶是式IV的化合物。
IIIB.从嘧啶醛制备砜/亚砜的方法
已经发现2’-(烷硫基)-内酰胺-吡咯并[2,3-d]嘧啶及其亚砜和硫化物类似物也可以从4-卤代-2-(烷硫基)嘧啶-5-甲醛以五步或更少的步骤制备。在一个非限制性实施方案中,2’-(烷硫基)-内酰胺-吡咯并[2,3-d]嘧啶是螺环,例如2’-(甲基磺酰基)-7’,8’-二氢-6’H-螺[环己烷-1,9’-吡嗪并[1’,2’:1,5]吡咯并[2,3-d]嘧啶]-6’-酮。
步骤1:2-(烷硫基)-4-(内酰胺)嘧啶-5-甲醛的制备
在步骤1中,使4-卤代-2-(烷硫基)嘧啶-5-甲醛与内酰胺胺在亲核取代反应中反应,得到2-(烷硫基)-4-(内酰胺)嘧啶-5-甲醛。将4-卤代-2-(烷硫基)嘧啶-5-甲醛和内酰胺胺在合适的溶剂中混合,所述溶剂通常是两种反应物与碱一起都溶解在其中的中性有机溶剂,所述碱将促进亲核取代反应。可以使用任何摩尔比的两种反应物,以获得所需的结果。通常,小摩尔过量的内酰胺胺是有用的,例如约1.1当量内酰胺胺对约1.0当量甲醛。反应可在允许反应发生的任何温度下进行。已经发现,可以通过加热促进反应,包括直至回流。使反应进行足够的时间以提供所需的产率,然后任选地冷却并通过任何合适的方法纯化批料,包括过滤、结晶和柱色谱,得到2-(烷硫基)-4-(内酰胺)嘧啶-5-甲醛。在一个非限制性实施方案中,4-卤代-2-(烷硫基)嘧啶-5-甲醛是4-氯-2-(甲硫基)嘧啶-5-甲醛,内酰胺胺是螺内酰胺,碱是DIPEA,溶剂是叔丁醇,温度为约85℃,时间为约24小时。
步骤1中使用的碱可以是任何合适的有机碱,包括但不限于DIPEA、DMAP、DBU、TEA、吡啶、氨、甲胺、乙胺、丙胺、异丙胺、二甲胺、二乙胺、二丙胺、二异丙胺、三甲胺、三丙胺、三异丙胺、苯胺、甲基苯胺、二甲基苯胺、吡啶、氮杂久洛尼定、苄胺、甲基苄胺、二甲基苄胺、DABCO、1,5-二氮杂双环[4.3.0]壬-5-烯、2,6-二甲基吡啶、吗啉、哌啶、哌嗪、质子-海绵、1,5,7-三氮杂双环[4.4.0]癸-5-烯、苄吡二胺、氢氧化铵、三乙醇胺、乙醇胺或三羟甲基氨基甲烷。在一个非限制性实施方案中,碱选自DIPEA、DMAP、DBU、TEA和吡啶。在一个替代的实施方案中,在步骤1中使用多种碱。
步骤1中使用的溶剂可以是任何合适的有机溶剂,包括但不限于DMAc、DCM、THF、DMF、TFA、ACN、DMAP、水、乙酸、丙酮、二噁烷、苯、1-丁醇、2-丁醇、叔丁醇、四氯化碳、氯仿、环己烷、己烷、乙醚、二甘醇二甲醚、DME、DMSO、乙醇、乙酸乙酯、乙二醇、甘油、庚烷、HMPA、甲醇、MTBE、NMP、戊烷、吡啶、甲苯、盐酸和三乙胺。在一个非限制性实施方案中,溶剂选自DMAc、叔丁醇、DMAP和DMSO。在一个替代的实施方案中,在步骤1中使用溶剂的混合物。
在另一个实施方案中,步骤1中使用的溶剂是二噁烷。在另一个另外的实施方案中,溶剂选自DCM、EtOAc、乙醇、二噁烷、叔丁醇和THF。
在非限制性实施例中,步骤1中使用的温度可为约50℃至约150℃、约60℃至约125℃、约70℃至约110℃、约80℃至约100℃或约90℃至约100℃。在一个非限制性实施方案中,温度选自约80℃至约100℃。在一个替代的实施方案中,通过使用可以保持高压的反应容器使反应温度高于溶剂回流。或者,虽然不太常见,但反应可在室温或低于室温下进行。
可以使反应进行足够的时间以获得所需的产物产率。例如,反应可在步骤1中进行约1小时至约65小时、约7小时至约55小时、约12小时至约45小时、约17小时至约35小时或约22小时至约25小时。本领域技术人员应该理解,反应的时间和温度是相关的。例如,如果使用较高的温度,则较低的反应时间可以获得所需的产率。
步骤2:任选地保护2-(烷硫基)-4-(内酰胺)嘧啶-5-甲醛
在步骤2中,使2-(烷硫基)-4-(内酰胺)嘧啶-5-甲醛与保护基试剂反应,得到保护的2-(烷硫基)-4-(内酰胺)嘧啶-5-甲醛。将2-(烷硫基)-4-(内酰胺)嘧啶-5-甲醛和保护基试剂在合适的溶剂中混合,所述溶剂通常是两种反应物与碱一起都溶解在其中的中性有机溶剂,所述碱将有助于安装保护基团。可以使用任何摩尔比的两种反应物,以获得所需的结果。通常,大摩尔过量的保护基试剂是有用的,例如约7当量保护基试剂对约1当量2-(烷硫基)-4-(内酰胺)嘧啶-5-甲醛。反应可在允许反应发生的任何温度下进行。使反应进行足够的时间以提供所需的产率,之后通过任何合适的方法纯化批料,包括过滤、结晶和柱色谱,得到保护的2-(烷硫基)-4-(内酰胺)嘧啶-5-甲醛。在一个非限制性实施方案中,2-(烷硫基)-4-(内酰胺)嘧啶-5-甲醛是2-(甲硫基)-4-(3-氧代-1,4-二氮杂螺[5.5]十一烷-1-基)嘧啶-5-甲醛,保护基试剂为Boc-酸酐,碱为DMAP,溶剂为二氯甲烷,温度为约25℃,时间为约3小时。
在一个非限制性实施方案中,使用的初始内酰胺胺已经被保护。在一个替代的实施方案中,内酰胺取代的嘧啶适当地反应而不需要保护基团。
步骤2中使用的保护基试剂可以是任何合适的试剂,其允许安装任何合适的保护基团,包括但不限于Boc-酸酐、Boc-Cl、CBz-Cl、氯甲酸甲酯、苄基氯、苯甲酰氯、烯丙基氯、三氟甲磺酸酐、Tf-Cl、甲苯磺酸酐和Ts-Cl。在一个非限制性实施方案中,保护基团是Boc,合适的试剂是Boc-酸酐或Boc-Cl。在一个替代的实施方案中,保护基团是CBz,合适的试剂是CBz-Cl。
步骤2中使用的碱可以是任何合适的有机碱,包括但不限于DIPEA、DMAP、DBU、TEA、吡啶、氨、甲胺、乙胺、丙胺、异丙胺、二甲胺、二乙胺、二丙胺、二异丙胺、三甲胺、三丙胺、三异丙胺、苯胺、甲基苯胺、二甲基苯胺、吡啶、氮杂久洛尼定、苄胺、甲基苄胺、二甲基苄胺、DABCO、1,5-二氮杂双环[4.3.0]壬-5-烯、2,6-二甲基吡啶、吗啉、哌啶、哌嗪、质子-海绵、1,5,7-三氮杂双环[4.4.0]癸-5-烯、苄吡二胺、氢氧化铵、三乙醇胺、乙醇胺和三羟甲基氨基甲烷。在一个非限制性实施方案中,碱选自DIPEA、DMAP、DBU、TEA和吡啶。在一个替代的实施方案中,在步骤2中使用多种碱。
步骤2中使用的溶剂可以是任何合适的有机溶剂,包括但不限于DMAc、DCM、THF、DMF、TFA、ACN、DMAP、水、乙酸、丙酮、二噁烷、苯、1-丁醇、2-丁醇、叔丁醇、四氯化碳、氯仿、环己烷、己烷、乙醚、二甘醇二甲醚、DME、DMSO、乙醇、乙酸乙酯、乙二醇、甘油、庚烷、HMPA、甲醇、MTBE、NMP、戊烷、吡啶、甲苯、盐酸和三乙胺。在一个非限制性实施方案中,溶剂选自DCM、二噁烷、水和THF。在一个替代的实施方案中,在步骤2中使用溶剂的混合物。
在非限制性实施例中,步骤2中使用的温度可为约-20℃至约100℃、约-10℃至约80℃、约0℃至约60℃、约10℃至约40℃或约20℃至约30℃。在一个非限制性实施方案中,温度选自约20℃至约30℃。
可以使反应进行足够的时间以获得所需的产物产率。例如,反应可在步骤2中进行约0.1小时至约20小时、约0.5小时至约15小时、约1小时至约10小时、约1.5小时至约5小时或约2小时至约4小时。本领域技术人员应该理解,反应的时间和温度是相关的。例如,如果使用较高的温度,则较低的反应时间可以获得所需的产率。或者,如果使用较低的温度,则需要较高的反应时间以获得所需的产率,但可能存在较少的副产物。
步骤3:2’-(烷硫基)-内酰胺-吡咯并[2,3-d]嘧啶的制备
在步骤3中,任选地保护的2-(烷硫基)-4-(内酰胺)嘧啶-5-甲醛在分子内环化反应中与碱反应,得到2’-(烷硫基)-内酰胺-吡咯并[2,3-d]嘧啶。将保护的烷基2-(烷硫基)-4-(内酰胺)嘧啶-5-甲醛和碱在合适的溶剂中混合,所述溶剂通常是反应物和试剂溶解在其中的中性有机溶剂。可以使用任何摩尔比的反应物和试剂,以获得所需的结果。反应可在允许反应发生的任何温度下进行。使反应进行足够的时间以提供所需的产率,之后通过任何合适的方法纯化批料,包括过滤、结晶和柱色谱,得到2’-(烷硫基)-内酰胺-吡咯并[2,3-d]嘧啶。在一个非限制性实施方案中,保护的2-(烷硫基)-4-(内酰胺)嘧啶-5-甲醛是2’-(甲硫基)-6’-氧代-6’H-螺[环己烷-1,9’-吡嗪并[1’,2’:1,5]吡咯并[2,3-d]嘧啶]-7’(8’H)-羧酸叔丁酯,碱为tBuOK,溶剂为THF,温度为约5℃,时间为约2小时。
步骤3中使用的碱可以是任何合适的碱,包括但不限于DIPEA,DMAP、DBU、TEA、吡啶、氨、甲胺、乙胺、丙胺、异丙胺、二甲胺、二乙胺、二丙胺、二异丙胺、三甲胺、三丙胺、三异丙胺、苯胺、甲基苯胺、二甲基苯胺、吡啶、氮杂久洛尼定、苄胺、甲基苄胺、二甲基苄胺、DABCO、1,5-二氮杂双环[4.3.0]壬-5-烯、2,6-二甲基吡啶、吗啉、哌啶、哌嗪、质子-海绵、1,5,7-三氮杂双环[4.4.0]癸-5-烯、苄吡二胺、氢氧化铵、三乙醇胺、乙醇胺、NaOH、tBuOK、NaH、KH或三羟甲基氨基甲烷。在一个非限制性实施方案中,碱选自DIPEA、DMAP、DBU、DABCO、TEA和tBuOK。在一个替代的实施方案中,在步骤3中使用多种碱。
步骤3中使用的溶剂可以是任何合适的有机溶剂,包括但不限于DMAc、DCM、THF、DMF、TFA、ACN、DMAP、水、乙酸、丙酮、二恶烷、苯、1-丁醇、2-丁醇、叔丁醇、四氯化碳、氯仿、环己烷、己烷、乙醚、二甘醇二甲醚、DME、DMSO、乙醇、乙酸乙酯、乙二醇、甘油、庚烷、HMPA、甲醇、MTBE、NMP、戊烷、吡啶、甲苯、盐酸和三乙胺。在一个非限制性实施方案中,溶剂选自DCM、二噁烷、水和THF。在一个替代的实施方案中,在步骤3中使用溶剂的混合物。
在非限制性实施例中,步骤3中使用的温度可以是约-50℃至约50℃、约-35℃至约40℃、约-10℃至约30℃、约-5℃至约20℃或约0℃至约10℃。在一个非限制性实施方案中,温度选自约0℃至约10℃。
可以使反应进行足够的时间以获得所需的产物产率。例如,反应可在步骤3中进行约0.1小时至约20小时、约0.5小时至约15小时、约1小时至约10小时、约1.5小时至约5小时或约2小时至约3小时。本领域技术人员应该理解,反应的时间和温度是相关的。例如,如果使用较高的温度,则较低的反应时间可以获得所需的产率。或者,如果使用较低的温度,则需要较高的反应时间以获得所需的产率,但可能存在较少的副产物。
步骤4:任选地将2’-(烷硫基)-内酰胺-吡咯并[2,3-d]嘧啶脱保护
在步骤4中,将2’-(烷硫基)-内酰胺-吡咯并[2,3-d]嘧啶脱保护,得到脱保护的2’-(烷硫基)-内酰胺-吡咯并[2,3-d]嘧啶。将保护的2’-(烷硫基)-内酰胺-吡咯并[2,3-d]嘧啶和脱保护试剂在合适的溶剂中混合,所述溶剂通常是两种反应物都溶于其中的有机溶剂。可以使用任何摩尔比的反应物和脱保护试剂,以获得所需的结果。通常,大摩尔过量的脱保护试剂是有用的,例如约5当量脱保护试剂对约1.0当量2’-(烷硫基)-内酰胺-吡咯并[2,3-d]嘧啶。反应可在允许反应发生的任何温度下进行。使反应进行足够的时间以提供所需的产率,然后通过任何合适的方法纯化批料,包括过滤、结晶和柱色谱,得到脱保护的2’-(烷硫基)-内酰胺-吡咯并[2,3-d]嘧啶。在一个非限制性实施方案中,保护的2’-(烷硫基)-内酰胺-吡咯并[2,3-d]嘧啶是2’-(甲硫基)-6’-氧代-6’H-螺[环己烷]-1,9’-吡嗪并[1’,2’:1,5]吡咯并[2,3-d]嘧啶]-7’(8’H)-羧酸叔丁酯,脱保护试剂为盐酸,溶剂为水,温度为约25℃,时间为约2小时。
在一个非限制性实施方案中,2’-(烷硫基)-内酰胺-吡咯并[2,3-d]嘧啶未被保护,因为它在不存在保护基团的情况下适合于先前的反应。在一个替代的实施方案中,保留保护基团以在以后的步骤中除去。
步骤4中使用的脱保护试剂可以是任何合适的试剂,其允许任何合适的保护基团脱保护,包括但不限于TFA、乙酸、氨基甲磺酸、抗坏血酸、苯磺酸、苯甲酸、甲酸、乳酸、苹果酸、丙二酸、甲磺酸、草酸、邻苯二甲酸、水杨酸、琥珀酸、氨基磺酸、对甲苯磺酸、三氯乙酸、三氟甲磺酸、硼酸、氢碘酸、氢溴酸、盐酸、氢氟酸、碘酸、硝酸、高氯酸、高碘酸、次膦酸、磷酸、含有或不含氢气的钯碳、含有或不含氢气的铂碳、三乙基硅烷、TBAF和HF。在一个非限制性实施方案中,保护基团是Boc,合适的试剂是盐酸。在一个替代的实施方案中,保护基团是CBz,合适的试剂是含氢气的钯碳。
步骤4中使用的溶剂可以是任何合适的有机溶剂,包括但不限于DMAc、DCM、THF、DMF、TFA、ACN、DMAP、水、乙酸、丙酮、二噁烷、苯、1-丁醇、2-丁醇、叔丁醇、四氯化碳、氯仿、环己烷、己烷、乙醚、二甘醇二甲醚、DME、DMSO、乙醇、乙酸乙酯、乙二醇、甘油、庚烷、HMPA、甲醇、MTBE、NMP、戊烷、吡啶、甲苯、盐酸和三乙胺。在一个非限制性实施方案中,溶剂选自DCM、二噁烷和水。在一个替代的实施方案中,在步骤4中使用溶剂的混合物。在另一个备选实施方案中,脱保护试剂被用作溶剂。
在非限制性实施例中,步骤4中使用的温度可为约-20℃至约100℃、约-10℃至约80℃、约0℃至约60℃、约10℃至约40℃或约20℃至约30℃。在一个非限制性实施方案中,温度选自约20℃至约30℃。
可以使反应进行足够的时间以获得所需的产物产率。例如,反应可以在步骤4中进行约1小时至约40小时、约3小时至约35小时、约5小时至约30小时、约10小时至约25小时或约13至约20小时。本领域技术人员应该理解,反应的时间和温度是相关的。例如,如果使用较高的温度,则较低的反应时间可以获得所需的产率。或者,如果使用较低的温度,则需要较高的反应时间以获得所需的产率,但可能存在较少的副产物。
步骤5:任选地氧化2’-(烷硫基)-内酰胺-吡咯并[2,3-d]嘧啶
在步骤5中,使2’-(烷硫基)-内酰胺-吡咯并[2,3-d]嘧啶与氧化剂反应,得到2’-(烷基磺酰基)-内酰胺-吡咯并[2,3-d]嘧啶或2‘-(烷基亚磺酰基)-内酰胺-吡咯并[2,3-d]嘧啶。将2’-(烷硫基)-内酰胺-吡咯并[2,3-d]嘧啶和氧化剂在合适的溶剂中混合,所述溶剂通常是两种反应物都溶于其中的中性有机溶剂。可以使用任何摩尔比的反应物和氧化剂,以获得所需的结果。通常,大摩尔过量的氧化剂是有用的,例如约5当量氧化剂对约1.0当量2’-(烷硫基)-内酰胺-吡咯并[2,3-d]嘧啶。反应可在允许反应发生的任何温度下进行。使反应进行足够的时间以提供所需的产率,之后通过任何合适的方法纯化批料,包括过滤、结晶和柱色谱,得到2’-(烷基磺酰基)-内酰胺-吡咯并[2,3-d]嘧啶或2’-(烷基亚磺酰基)-内酰胺-吡咯并[2,3-d]嘧啶。在一个非限制性实施方案中,2’-(烷硫基)-内酰胺-吡咯并[2,3-d]嘧啶是2’-(甲硫基)-7’,8’-二氢-6’H-螺[环己烷-1,9’-吡嗪并[1’,2’:1,5]吡咯并[2,3-d]嘧啶]-6’-酮,氧化剂为过硫酸氢钾,溶剂为水和乙腈的混合物,温度为约25℃,时间为约2小时。
步骤5中使用的氧化剂可以是允许氧化成砜或亚砜氧化态的任何合适的试剂,包括但不限于过硫酸氢钾、过氧化氢、mCPBA、次氯酸钠和亚氯酸钠。在一个非限制性实施方案中,产物是砜,氧化剂是过硫酸氢钾。
步骤5中使用的溶剂可以是任何合适的有机溶剂,包括但不限于DMAc、DCM、THF、DMF、TFA、ACN、DMAP、水、乙酸、丙酮、二噁烷、苯、1-丁醇、2-丁醇、叔丁醇、四氯化碳、氯仿、环己烷、己烷、乙醚、二甘醇二甲醚、DME、DMSO、乙醇、乙酸乙酯、乙二醇、甘油、庚烷、HMPA、甲醇、MTBE、NMP、戊烷、吡啶、甲苯、盐酸和三乙胺。在一个非限制性实施方案中,溶剂选自ACN、水和二噁烷。在一个替代的实施方案中,在步骤5中使用溶剂的混合物,例如水和ACN。
在非限制性实施例中,步骤5中使用的温度可为约-20℃至约100℃、约-10℃至约80℃、约0℃至约60℃、约10℃至约40℃或约20℃至约30℃。在一个非限制性实施方案中,温度选自约20℃至约30℃。
可以使反应进行足够的时间以获得所需的产物产率。例如,反应可在步骤5中进行约1小时至约40小时、约3小时至约35小时、约5小时至约30小时、约10小时至约25小时或约13至约20小时。本领域技术人员应该理解,反应的时间和温度是相关的。例如,如果使用较高的温度,则较低的反应时间可以获得所需的产率。或者,如果使用较低的温度,则需要较高的反应时间以获得所需的产率,但可能存在较少的副产物。
本领域技术人员应该认识到,可以切换本文所述步骤的顺序,同时仍然达到相同的最终产物。
在一个非限制性实施方案中,内酰胺胺已经被适当地保护,并且步骤2不是必需的。在另一个实施方案中,所选择的试剂和起始材料不需要保护以进行至所需产物,并且步骤2和步骤4不是必需的。
在另一个实施方案中,内酰胺胺是式I的化合物,2-(烷硫基)-4-(内酰胺)嘧啶-5-甲醛是式II的化合物,和2’-(烷硫基)-内酰胺-吡咯并[2,3-d]嘧啶是式IV的化合物。
IIIC.从环己酮制备1,4-二氮杂螺[5.5]十一烷-3-酮的方法
已经发现1,4-二氮杂螺[5.5]十一烷-3-酮可以由环己酮制备。在一个非限制性实施方案中,1,4-二氮杂螺[5.5]十一烷-3-酮最初未被保护并且在随后的合成步骤中任选地被保护。
步骤1:(1-氰基环己基)甘氨酸烷基酯的制备
在步骤1中,在TMSCN存在下使适当取代的甘氨酸烷基酯或其盐与环己酮反应,得到(1-氰基环己基)甘氨酸烷基酯。环己酮和甘氨酸烷基酯在合适的溶剂中混合,所述溶剂通常是两种反应物与碱一起都溶解在其中的中性有机溶剂,所述碱将促进反应。然后将TMSCN缓慢加入混合物中。可以使用任何摩尔比的两种反应物,以获得所需的结果。反应可在允许反应发生的任何温度下进行。由于反应的放热性质,大规模时要控制温度。使反应进行足够的时间以提供所需的产率,之后通过任何合适的方法纯化批料,包括过滤、结晶和柱色谱,得到(1-氰基环己基)甘氨酸烷基酯。在一个非限制性实施方案中,甘氨酸烷基酯是甘氨酸甲酯或其盐,碱是TEA,溶剂是DCM,温度为约35℃或更低,并且时间为约4小时。
步骤1中使用的碱可以是任何合适的碱,包括但不限于DIPEA、DMAP、DBU、TEA、吡啶、氨、甲胺、乙胺、丙胺、异丙胺、二甲胺、二乙胺、二丙胺、二异丙胺、三甲胺、三丙胺、三异丙胺、苯胺、甲基苯胺、二甲基苯胺、吡啶、氮杂久洛尼定、苄胺、甲基苄胺、二甲基苄胺、DABCO、1,5-二氮杂双环[4.3.0]壬-5-烯、2,6-二甲基吡啶、吗啉、哌啶、哌嗪、质子-海绵、1,5,7-三氮杂双环[4.4.0]癸-5-烯、苄吡二胺、氢氧化铵、三乙醇胺、乙醇胺、NaOH、tBuOK、NaH、KH、碳酸钾或三羟甲基氨基甲烷。在一个非限制性实施方案中,碱选自DIPEA、TEA、DBU、DABCO、碳酸钾和tBuOK。在替代实施方案中,在步骤1中使用多种碱。
步骤1中使用的溶剂可以是任何合适的有机溶剂,包括但不限于DMAc、DCM、THF、DMF、TFA、ACN、DMAP、水、乙酸、丙酮、二噁烷、苯、1-丁醇、2-丁醇、叔丁醇、四氯化碳、氯仿、环己烷、己烷、乙醚、二甘醇二甲醚、DME、DMSO、乙醇、乙酸乙酯、乙二醇、甘油、庚烷、HMPA、甲醇、MTBE、NMP、戊烷、吡啶、甲苯、盐酸和三乙胺。在一个非限制性实施方案中,溶剂选自TEA、ACN、DCM和DMSO。在一个替代的实施方案中,在步骤1中使用溶剂的混合物。
在另一个实施方案中,步骤1中使用的溶剂是二噁烷。在另一个另外的实施方案中,溶剂选自DCM、EtOAc、乙醇、二噁烷、叔丁醇和THF。
在非限制性实施例中,步骤1中使用的温度可以是约-20℃至约50℃、约-10℃至约40℃、约0℃至约35℃或约10℃至约30℃。在一个非限制性实施方案中,温度选自约10℃至约30℃。
可以使反应进行足够的时间以获得所需的产物产率。本领域技术人员应该理解,反应的时间和温度是相关的。例如,如果使用较高的温度,则较低的反应时间可以获得所需的产率。
步骤2:4-二氮杂螺[5.5]十一烷-3-酮的制备
在步骤2中,通过氢化物源和合适的催化剂还原(1-氰基环己基)甘氨酸烷基酯或其盐,随后进行分子内环化,得到4-二氮杂螺[5.5]十一烷-3-酮。将(1-氰基环己基)甘氨酸烷基酯溶解在合适的溶剂中。然后任选地在催化剂存在下加入还原剂,以使氰基还原成胺。然后胺在随后的分子内环化中充当亲核试剂,得到4-二氮杂螺[5.5]十一烷-3-酮。反应可在允许反应发生的任何温度下进行。使反应进行足够的时间以提供所需的产率,之后通过任何合适的方法纯化批料,包括过滤、结晶和柱色谱,得到4-二氮杂螺[5.5]十一烷-3-酮。在一个非限制性实施方案中,(1-氰基环己基)甘氨酸烷基酯是(1-氰基环己基)甘氨酸甲酯或其盐,溶剂是MeOH,氢化物源是氢气,催化剂是氧化铂,温度为约40℃,时间为约3小时。
步骤2中使用的氢化物源可以是任何合适的氢化物源,包括但不限于三乙酰氧基硼氢化钠、氢气、硼氢化钠、氰基硼氢化物和甲酸铵。在一个替代实施方案中,没有催化剂的氢化物源以化学计量使用,例如没有铂碳的三乙酰氧基硼氢化钠。
步骤2中使用的溶剂可以是任何合适的有机溶剂,包括但不限于DMAc、DCM、THF、DMF、TFA、ACN、DMAP、水、乙酸、丙酮、二噁烷、苯、1-丁醇、2-丁醇、叔丁醇、四氯化碳、氯仿、环己烷、己烷、乙醚、二甘醇二甲醚、DME、DMSO、乙醇、乙酸乙酯、乙二醇、甘油、庚烷、HMPA、甲醇、MTBE、NMP、戊烷、吡啶、甲苯、盐酸和三乙胺。在一个非限制性实施方案中,溶剂选自甲醇、水和乙醇。在一个替代的实施方案中,在步骤2中使用溶剂的混合物。
在非限制性实施例中,步骤2中使用的温度可为约-10℃至约90℃、约0℃至约80℃、约10℃至约70℃、约20℃至约60℃或约30℃至约50℃。在一个非限制性实施方案中,温度选自约30℃至约50℃。
可以使反应进行足够的时间以获得所需的产物产率。例如,反应可以在步骤2中进行约0.1小时至约20小时、约0.5小时至约15小时、约1小时至约10小时、约1.5小时至约5小时或约2小时至约3小时。本领域技术人员应该理解,反应的时间和温度是相关的。例如,如果使用较高的温度,则较低的反应时间可以获得所需的产率。或者,如果使用较低的温度,则需要较高的反应时间以获得所需的产率,但可能存在较少的副产物。
IIID.由2-氧代乙酸烷基酯制备1,4-二氮杂螺[5.5]十一烷-3-酮的方法
已经发现1,4-二氮杂螺[5.5]十一烷-3-酮可以由2-氧代乙酸烷基酯和1-(氨基甲基)环己-1-胺制备,1-(氨基甲基)环己-1-胺可以任选地被保护。在一个非限制性实施方案中,1,4-二氮杂螺[5.5]十一烷-3-酮是被保护的,例如3-氧代-1,4-二氮杂螺[5.5]十一烷-4-羧酸叔丁酯。
步骤1:(1-(氨基甲基)环己基)甘氨酸烷基酯的制备
在步骤1中,使1-(氨基甲基)环己-1-胺与2-氧代乙酸烷基酯在还原胺化反应中反应,得到(1-(氨基甲基)环己基)甘氨酸烷基酯。将1-(氨基甲基)环己-1-胺和2-氧代乙酸烷基酯在合适的溶剂中混合,所述溶剂通常是两种反应物与催化剂和氢化物源一起都溶解在其中的中性有机溶剂,这将促进还原胺化反应。可以使用任何摩尔比的两种反应物,以获得所需的结果。反应可在允许反应发生的任何温度下进行。使反应进行足够的时间以提供所需的产率,之后通过任何合适的方法纯化批料,包括过滤、结晶和柱色谱,得到(1-(氨基甲基)环己基)甘氨酸烷基酯。在一个非限制性实施方案中,1-(氨基甲基)环己-1-胺是((1-氨基环己基)甲基)氨基甲酸叔丁酯,2-氧代乙酸烷基酯是2-氧代乙酸乙酯,催化剂是铂碳,氢化物源是氢气,溶剂是DCM,温度为约25℃,时间为约24小时。
步骤1中使用的氢化物源可以是任何合适的氢化物源,包括但不限于三乙酰氧基硼氢化钠、氢气、硼氢化钠、氰基硼氢化物和甲酸铵。在一个替代的实施方案中,没有催化剂的氢化物源以化学计量使用,例如没有铂碳的三乙酰氧基硼氢化钠。
步骤1中使用的溶剂可以是任何合适的有机溶剂,包括但不限于DMAc、DCM、THF、DMF、TFA、ACN、DMAP、水、乙酸、丙酮、二噁烷、苯、1-丁醇、2-丁醇、叔丁醇、四氯化碳、氯仿、环己烷、己烷、乙醚、二甘醇二甲醚、DME、DMSO、乙醇、乙酸乙酯、乙二醇、甘油、庚烷、HMPA、甲醇、MTBE、NMP、戊烷、吡啶、甲苯、盐酸和三乙胺。在一个非限制性实施方案中,溶剂选自DCM、EtOAc、乙醇、叔丁醇和THF。在一个替代的实施方案中,在步骤1中使用溶剂的混合物。
在另一个实施方案中,步骤1中使用的溶剂是二噁烷。在另一个另外的实施方案中,溶剂选自DCM、EtOAc、乙醇、二噁烷、叔丁醇和THF。
在非限制性实施例中,步骤1中使用的温度可为约-50℃至约50℃、约-35℃至约40℃、约-10℃至约30℃、约-5℃至约20℃或约0℃至约10℃。在一个非限制性实施方案中,温度选自约0℃至约10℃。
可以使反应进行足够的时间以获得所需的产物产率。例如,反应可以在步骤1中进行约0.1小时至约20小时、约0.5小时至约15小时、约1小时至约10小时、约1.5小时至约5小时或约2至约3小时。本领域技术人员应该理解,反应的时间和温度是相关的。例如,如果使用较高的温度,则较低的反应时间可以获得所需的产率。或者,如果使用较低的温度,则需要较高的反应时间以获得所需的产率,但可能存在较少的副产物。
步骤2:任选地将(1-(氨基甲基)环己基)甘氨酸烷基酯脱保护
在步骤2中,将(1-(氨基甲基)环己基)甘氨酸烷基酯脱保护,得到脱保护的(1-(氨基甲基)环己基)甘氨酸烷基酯。将(1-(氨基甲基)环己基)甘氨酸烷基酯和脱保护试剂在合适的溶剂中混合,所述溶剂通常是两种反应物溶解于其中的溶剂。可以使用任何摩尔比的反应物和脱保护试剂,以获得所需的结果。通常,大摩尔过量的脱保护试剂是有用的,例如约5当量脱保护试剂对约1.0当量保护的(1-(氨基甲基)环己基)甘氨酸烷基酯。反应可在允许反应发生的任何温度下进行。使反应进行足够的时间以提供所需的产率,然后通过任何合适的方法纯化批料,包括过滤、结晶和柱色谱,得到脱保护的(1-(氨基甲基)环己基)甘氨酸烷基酯。在一个非限制性实施方案中,保护的(1-(氨基甲基)环己基)甘氨酸烷基酯是(1-(((叔丁氧基羰基)氨基)甲基)环己基)甘氨酸乙酯,脱保护试剂是盐酸,溶剂是水,温度为约25℃,时间为约2小时。
在一个非限制性实施方案中,(1-(氨基甲基)环己基)甘氨酸烷基酯已经脱保护,因为它在不存在保护基团的情况下适合于先前的反应。在一个替代的实施方案中,保留保护基团以在以后的步骤中被除去。
步骤2中使用的脱保护试剂可以是任何合适的试剂,其允许任何合适的保护基团脱保护,包括但不限于TFA,乙酸,氨基甲磺酸,抗坏血酸,苯磺酸,苯甲酸,甲酸,乳酸,苹果酸,丙二酸,甲磺酸,草酸,邻苯二甲酸,水杨酸,琥珀酸,氨基磺酸,对甲苯磺酸,三氯乙酸,三氟甲磺酸,硼酸,氢碘酸,氢溴酸,盐酸,氢氟酸,碘酸,硝酸,高氯酸,高碘酸,次膦酸,磷酸,含有或不含氢气的钯碳,含有或不含氢气的铂碳,三乙基硅烷,TBAF和HF。在一个非限制性实施方案中,保护基团是Boc,合适的试剂是盐酸。在一个替代的实施方案中,保护基团是CBz,合适的试剂是含氢气的钯碳。
步骤2中使用的溶剂可以是任何合适的有机溶剂,包括但不限于DMAc、DCM、THF、DMF、TFA、ACN、DMAP、水、乙酸、丙酮、二噁烷、苯、1-丁醇、2-丁醇、叔丁醇、四氯化碳、氯仿、环己烷、己烷、乙醚、二甘醇二甲醚、DME、DMSO、乙醇、乙酸乙酯、乙二醇、甘油、庚烷、HMPA、甲醇、MTBE、NMP、戊烷、吡啶、甲苯、盐酸和三乙胺。在一个非限制性实施方案中,溶剂选自DCM、二噁烷和水。在另一个实施方案中,在步骤2中使用溶剂的混合物。在另一个替代的实施方案中,脱保护试剂被用作溶剂。
在非限制性实施例中,步骤2中使用的温度可为约-20℃至约100℃、约-10℃至约80℃、约0℃至约60℃、约10℃至约40℃或约20℃至约30℃。在一个非限制性实施方案中,温度选自约20℃至约30℃。
可以使反应进行足够的时间以获得所需的产物产率。例如,反应可以在步骤2中进行约1小时至约40小时、约3小时至约35小时、约5小时至约30小时、约10小时至约25小时或约13至约20小时。本领域技术人员应该理解,反应的时间和温度是相关的。例如,如果使用较高的温度,则较低的反应时间可以获得所需的产率。或者,如果使用较低的温度,则需要较高的反应时间以获得所需的产率,但可能存在较少的副产物。
步骤3:4-二氮杂螺[5.5]十一烷-3-酮的制备
在步骤3中,使(1-(氨基甲基)环己基)甘氨酸烷基酯在分子内环化反应中与碱反应,得到4-二氮杂螺[5.5]十一烷-3-酮。将(1-(氨基甲基)环己基)甘氨酸烷基酯和碱在合适的溶剂中混合,所述溶剂通常是反应物和试剂都溶解在其中的中性有机溶剂。可以使用任何摩尔比的反应物和试剂,以获得所需的结果。反应可在允许反应发生的任何温度下进行。使反应进行足够的时间以提供所需的产率,之后通过任何合适的方法纯化批料,包括过滤、结晶和柱色谱,得到4-二氮杂螺[5.5]十一烷-3-酮。在一个非限制性实施方案中,(1-(氨基甲基)环己基)甘氨酸烷基酯是(1-(氨基甲基)环己基)甘氨酸乙酯,溶剂是THF,温度为约5℃,时间为约2小时。
步骤3中使用的碱可以是任何合适的碱,包括但不限于DIPEA、DMAP、DBU、TEA、吡啶、氨、甲胺、乙胺、丙胺、异丙胺、二甲胺、二乙胺、二丙胺、二异丙胺、三甲胺、三丙胺、三异丙胺、苯胺、甲基苯胺、二甲基苯胺、吡啶、氮杂久洛尼定、苄胺、甲基苄胺、二甲基苄胺、DABCO、1,5-二氮杂双环[4.3.0]壬-5-烯、2,6-二甲基吡啶、吗啉、哌啶、哌嗪、质子-海绵、1,5,7-三氮杂双环[4.4.0]癸-5-烯、苄吡二胺、氢氧化铵、三乙醇胺、乙醇胺、NaOH、tBuOK、NaH、KH或三羟甲基氨基甲烷。在一个非限制性实施方案中,碱选自DIPEA、DMAP、DBU、DABCO、TEA和tBuOK。在另一个实施方案中,在步骤3中使用多种碱。
步骤3中使用的溶剂可以是任何合适的有机溶剂,包括但不限于DMAc、DCM、THF、DMF、TFA、ACN、DMAP、水、乙酸、丙酮、二噁烷、苯、1-丁醇、2-丁醇、叔丁醇、四氯化碳、氯仿、环己烷、己烷、乙醚、二甘醇二甲醚、DME、DMSO、乙醇、乙酸乙酯、乙二醇、甘油、庚烷、HMPA、甲醇、MTBE、NMP、戊烷、吡啶、甲苯、盐酸和三乙胺。在一个非限制性实施方案中,溶剂选自DCM、二噁烷、水和THF。在另一个实施方案中,在步骤3中使用溶剂的混合物。
在非限制性实施例中,步骤3中使用的温度可以是约-50℃至约50℃、约-35至约40℃、约-10℃至约30℃、约-5℃至约20℃或约0℃至约10℃。在一个非限制性实施方案中,温度选自约0℃至约10℃。
可以使反应进行足够的时间以获得所需的产物产率。例如,反应可在步骤3中进行约0.1小时至约20小时、约0.5小时至约15小时、约1小时至约10小时、约1.5小时至约5小时或约2小时至约3小时。本领域技术人员应该理解,反应的时间和温度是相关的。例如,如果使用较高的温度,则较低的反应时间可以获得所需的产率。或者,如果使用较低的温度,则需要较高的反应时间以获得所需的产率,但可能存在较少的副产物。
IIID.从环己酮制备1,4-二氮杂螺[5.5]十一烷-3-酮的替代方法
在另外的实施方案中,可以使用氰基中间体从环己酮制备1,4-二氮杂螺[5.5]十一烷-3-酮。
步骤1:1-氨基环烷基-1-甲腈的制备
在步骤1中,使环酮与氰化物源和氨源以及任选的另外的试剂或催化剂反应,得到1-氨基环烷基-1-甲腈。将环酮、氰化物源和氨源在合适的溶剂中混合,所述溶剂通常是两种反应物都溶解在其中的中性有机溶剂。可以使用任何摩尔比的两种反应物,以获得所需的结果。反应可在允许反应发生的任何温度下进行。使反应进行足够的时间以提供所需的产率,之后通过任何合适的方法纯化批料,包括过滤、结晶和柱色谱,得到1-氨基环烷基-1-甲腈。在一个非限制性实施方案中,环酮是环己酮,氰化物源是TMSCN,氨源是氨,1-氨基环烷基-1-甲腈是1-(氨基甲基)环己-1-胺,催化剂是异丙醇钛。在一个实施方案中,离心用于分离1-氨基环烷基-1-甲腈。在另一个实施方案中,硅藻土过滤用于分离1-氨基环烷基-1-甲腈。
步骤1中使用的溶剂可以是任何合适的有机溶剂,包括但不限于DMAc、DCM、THF、DMF、TFA、ACN、DMAP、水、乙酸、丙酮、二噁烷、苯、1-丁醇、2-丁醇、叔丁醇、四氯化碳、氯仿、环己烷、己烷、乙醚、二甘醇二甲醚、DME、DMSO、乙醇、乙酸乙酯、乙二醇、甘油、庚烷、HMPA、甲醇、MTBE、NMP、戊烷、吡啶、甲苯、盐酸和三乙胺。在一个非限制性实施方案中,溶剂选自DCM、EtOAc、乙醇、叔丁醇和THF。在一个替代的实施方案中,使用溶剂的混合物。在一个实施方案中,不使用溶剂。
在另一个实施方案中,步骤1中使用的溶剂是二噁烷。在另一个另外的实施方案中,溶剂选自DCM、EtOAc、乙醇、二噁烷、叔丁醇和THF。
可以使反应进行足够的时间以获得所需的产物产率。例如,反应可以在步骤1中进行约0.1小时至约20小时、约0.5小时至约15小时、约1小时至约10小时、约1.5小时至约5小时或约2小时至约3小时。本领域技术人员应该理解,反应的时间和温度是相关的。例如,如果使用较高的温度,则较低的反应时间可以获得所需的产率。或者,如果使用较低的温度,则需要较高的反应时间以获得所需的产率,但可能存在较少的副产物。
步骤2:1-(氨基甲基)环烷基-1-胺的制备
在步骤2中,还原1-氨基环烷基-1-甲腈,得到1-(氨基甲基)环烷基-1-胺。将1-氨基环烷基-1-甲腈和还原试剂在合适的溶剂中混合,所述溶剂通常是两种反应物都溶解在其中的溶剂。可以使用任何摩尔比的反应物和还原试剂,以获得所需的结果。通常,摩尔过量的还原试剂是有用的,例如约2当量还原试剂对约1.0当量1-氨基环烷基-1-甲腈。反应可在允许反应发生的任何温度下进行。使反应进行足够的时间以提供所需的产率,之后通过任何合适的方法纯化批料,包括过滤、结晶和柱色谱,得到1-(氨基甲基)环烷基-1-胺。在一个非限制性实施方案中,1-氨基环烷基-1-甲腈是1-(氨基甲基)环己-1-胺,还原试剂是氢化铝锂(LAH),温度为约45℃,时间为约30分钟。
步骤2中使用的还原剂可以是允许还原氰基的任何合适的试剂,包括但不限于LAH、BH3-THF、BH3SMe2、H2、H2与雷尼镍以及H2与Pd/C。
步骤2中使用的溶剂可以是任何合适的有机溶剂,包括但不限于DMAc、DCM、THF、DMF、TFA、ACN、DMAP、水、乙酸、丙酮、二噁烷、苯、1-丁醇、2-丁醇、叔丁醇、四氯化碳、氯仿、环己烷、己烷、乙醚、二甘醇二甲醚、DME、DMSO、乙醇、乙酸乙酯、乙二醇、甘油、庚烷、HMPA、甲醇、MTBE、NMP、戊烷、吡啶、甲苯、盐酸和三乙胺。在一个非限制性实施方案中,溶剂选自DCM、二噁烷和水。在另一个实施方案中,在步骤2中使用溶剂的混合物。
在非限制性实施例中,步骤2中使用的温度可以是约-20℃至约100℃、约-10℃至约90℃、约0℃至约80℃、约10℃至约70℃或约20℃至约60℃。在一个非限制性实施方案中,温度选自约30℃至约50℃。
可以使反应进行足够的时间以获得所需的产物产率。例如,反应可在步骤2中进行约10分钟至约3小时、约10分钟至约2小时、约10分钟至约1小时、约10分钟至约50分钟或约20分钟至约40分钟。本领域技术人员应该理解,反应的时间和温度是相关的。例如,如果使用较高的温度,则较低的反应时间可以获得所需的产率。或者,如果使用较低的温度,则需要较高的反应时间以获得所需的产率,但可能存在较少的副产物。
步骤3:保护的1-(氨基甲基)环烷基-1-胺的制备
在步骤3中,使1-(氨基甲基)环烷基-1-胺与保护基试剂反应,得到保护的1-(氨基甲基)环烷基-1-胺。将1-(氨基甲基)环烷基-1-胺和保护基试剂在合适的溶剂中混合,所述溶剂通常是两种反应物与碱一起都溶解在其中的中性有机溶剂,这将有助于保护基团的安装。可以使用任何摩尔比的两种反应物,以获得所需的结果。通常,保护基试剂的摩尔不足或摩尔当量是有用的,例如约0.6、0.7、0.8、0.9、1或1.1当量保护基试剂对约1当量1-(氨基甲基)环烷基-1-胺。反应可在允许反应发生的任何温度下进行。使反应进行足够的时间以提供所需的产率,之后通过任何合适的方法纯化批料,包括过滤、结晶和柱色谱,得到保护的1-(氨基甲基)环烷基-1-胺。在一个非限制性实施方案中,1-(氨基甲基)环烷基-1-胺是1-(氨基甲基)环己-1-胺,保护基试剂是Boc-酸酐,保护的1-(氨基甲基)环烷基-1-胺是((1-氨基环己基)甲基)氨基甲酸叔丁酯,不使用碱,温度为约-70℃。
步骤3中使用的保护基试剂可以是允许安装任何合适的保护基团的任何合适的试剂,包括但不限于Boc-酸酐、Boc-Cl、CBz-Cl、氯甲酸甲酯、苄基氯、苯甲酰氯、烯丙基氯、三氟甲磺酸酐、Tf-Cl、甲苯磺酸酐和Ts-Cl。在一个非限制性实施方案中,保护基团是Boc,合适的试剂是Boc-酸酐或Boc-Cl。在一个替代的实施方案中,保护基团是CBz,合适的试剂是CBz-Cl。
在一个实施方案中,在不添加碱的情况下进行步骤3。如果使用碱,碱可以是任何合适的有机碱,包括但不限于DIPEA、DMAP、DBU、TEA、吡啶、氨、甲胺、乙胺、丙胺、异丙胺、二甲胺、二乙胺、二丙胺、二异丙胺、三甲胺、三丙胺、三异丙胺、苯胺、甲基苯胺、二甲基苯胺、吡啶、氮杂久洛尼定、苄胺、甲基苄胺、二甲基苄胺、DABCO、1,5-二氮杂双环[4.3.0]壬-5-烯、2,6-二甲基吡啶、吗啉、哌啶、哌嗪、质子-海绵、1,5,7-三氮杂双环[4.4.0]癸-5-烯、苄吡二胺、氢氧化铵、三乙醇胺、乙醇胺和三羟甲基氨基甲烷。
步骤3中使用的溶剂可以是任何合适的有机溶剂,包括但不限于DMAc、DCM、THF、DMF、TFA、ACN、DMAP、水、乙酸、丙酮、二噁烷、苯、1-丁醇、2-丁醇、叔丁醇、四氯化碳、氯仿、环己烷、己烷、乙醚、二甘醇二甲醚、DME、DMSO、乙醇、乙酸乙酯、乙二醇、甘油、庚烷、HMPA、甲醇、MTBE、NMP、戊烷、吡啶、甲苯、盐酸和三乙胺。在一个非限制性实施方案中,溶剂选自DCM、二噁烷、水和THF。在另一个实施方案中,在步骤3中使用溶剂的混合物。
在非限制性实施例中,步骤3中使用的温度可以是约-100℃至约20℃、约-90℃至约0℃、约-80℃至约-10℃、约-80℃至约-40℃或约-80℃至约-60℃。在一个非限制性实施方案中,温度选自约-80℃至约-60℃。
可以使反应进行足够的时间以获得所需的产物产率。例如,反应可在步骤3中进行约0.1小时至约20小时、约0.5小时至约15小时、约1小时至约10小时、约1.5小时至约5小时、或约2至约4小时。本领域技术人员应该理解,反应的时间和温度是相关的。例如,如果使用较高的温度,则较低的反应时间可以获得所需的产率。或者,如果使用较低的温度,则需要较高的反应时间以获得所需的产率,但可能存在较少的副产物。
步骤4:(1-(((保护基团)氨基)甲基)环烷基)甘氨酸烷基酯的制备
在步骤4中,使保护的1-(氨基甲基)环烷基-1-胺与碱和2-溴乙酸烷基酯反应,得到(1-(((保护基团)氨基)甲基)环烷基)甘氨酸烷基酯。将保护的1-(氨基甲基)环烷基-1-胺和碱在合适的溶剂中混合,所述溶剂通常是反应物和试剂都溶解在其中的中性有机溶剂。可以使用任何摩尔比的反应物和试剂,以获得所需的结果。反应可在允许反应发生的任何温度下进行。使反应进行足够的时间以提供所需的产率,之后通过任何合适的方法纯化批料,包括过滤、结晶和柱色谱,得到(1-(((保护基团)氨基)甲基)环烷基)甘氨酸烷基酯。在一个非限制性实施方案中,保护的1-(氨基甲基)环烷基-1-胺是((1-氨基环己基)甲基)氨基甲酸叔丁酯,溶剂是乙腈,碱是K2CO3,(1-(((保护基团)氨基)甲基)环烷基)甘氨酸烷基酯是(1-(((叔丁氧基羰基)氨基)甲基)环己基)甘氨酸甲酯。
步骤4中使用的碱可以是任何合适的碱,包括但不限于DIPEA、DMAP、DBU、TEA、吡啶、氨、甲胺、乙胺、丙胺、异丙胺、二甲胺、二乙胺、二丙胺、二异丙胺、三甲胺、三丙胺、三异丙胺、苯胺、甲基苯胺、二甲基苯胺、吡啶、氮杂久洛尼定、苄胺、甲基苄胺、二甲基苄胺、DABCO、1,5-二氮杂双环[4.3.0]壬-5-烯、2,6-二甲基吡啶、吗啉、哌啶、哌嗪、质子-海绵、1,5,7-三氮杂双环[4.4.0]癸-5-烯、苄吡二胺、氢氧化铵、三乙醇胺、乙醇胺、NaOH、tBuOK、NaH、KH或三羟甲基氨基甲烷。在一个非限制性实施方案中,碱选自K2CO3、Na2CO3和MgCO3。在一个替代的实施方案中,在步骤4中使用多种碱。
步骤4中使用的溶剂可以是任何合适的有机溶剂,包括但不限于DMAc、DCM、THF、DMF、TFA、ACN、DMAP、水、乙酸、丙酮、二噁烷、苯、1-丁醇、2-丁醇、叔丁醇、四氯化碳、氯仿、环己烷、己烷、乙醚、二甘醇二甲醚、DME、DMSO、乙醇、乙酸乙酯、乙二醇、甘油、庚烷、HMPA、甲醇、MTBE、NMP、戊烷、吡啶、甲苯、盐酸和三乙胺。在一个非限制性实施方案中,溶剂选自乙腈、二噁烷、水和THF。在另一个实施方案中,在步骤4中使用溶剂的混合物。
在非限制性实施例中,步骤3中使用的温度可以是约0℃至约100℃、约0℃至约90℃、约0℃至约80℃、约20℃至约80℃或约30℃至约80℃。
可以使反应进行足够的时间以获得所需的产物产率。例如,反应可在步骤4中进行约0.1小时至约20小时、约0.5小时至约15小时、约1小时至约10小时、约1.5小时至约5小时或约2至约3小时。本领域技术人员应该理解,反应的时间和温度是相关的。例如,如果使用较高的温度,则较低的反应时间可以获得所需的产率。或者,如果使用较低的温度,则需要较高的反应时间以获得所需的产率,但可能存在较少的副产物。
步骤5:4-二氮杂螺[5.5]十一烷-3-酮的制备
在步骤5中,用脱保护试剂将(1-(((保护基团)氨基)甲基)环烷基)甘氨酸烷基酯脱保护,然后用酸处理以引起分子内环化,得到4-二氮杂螺[5.5]十一烷-3-酮。将(1-(((保护基团)氨基)甲基)环烷基)甘氨酸烷基酯和脱保护试剂在合适的溶剂中混合,所述溶剂通常是反应物和试剂都溶解在其中的溶剂。可以使用任何摩尔比的反应物和试剂,以获得所需的结果。反应可在允许反应发生的任何温度下进行。使反应进行足够的时间以提供所需的产率,之后通过任何合适的方法纯化批料,包括过滤、结晶和柱色谱,得到4-二氮杂螺[5.5]十一烷-3-酮。在一个非限制性实施方案中,(1-(((保护基团)氨基)甲基)环烷基)甘氨酸烷基酯是(1-(((叔丁氧基羰基)氨基)甲基)环己基)甘氨酸甲酯,溶剂是DCE,酸是TFA,脱保护剂是TFA,温度为约回流,4-二氮杂螺[5.5]十一烷-3-酮是1,4-二氮杂螺[5.5]十一烷-3-酮。
步骤5中使用的脱保护试剂可以是任何合适的试剂,其允许任何合适的保护基团脱保护,包括但不限于TFA、乙酸、氨基甲磺酸、抗坏血酸、苯磺酸、苯甲酸、甲酸、乳酸、苹果酸、丙二酸、甲磺酸、草酸、邻苯二甲酸、水杨酸、琥珀酸、氨基磺酸、对甲苯磺酸、三氯乙酸、三氟甲磺酸、硼酸、氢碘酸、氢溴酸、盐酸、氢氟酸、碘酸、硝酸、高氯酸、高碘酸、次膦酸、磷酸、含有或不含氢气的钯碳、含有或不含氢气的铂碳、三乙基硅烷、TBAF和HF。在一个非限制性实施方案中,保护基团是Boc,合适的试剂是盐酸。在另一个实施方案中,保护基团是CBz,合适的试剂是含氢气的钯碳。
步骤5中使用的酸可以是允许分子内环化的任何合适的酸,包括但不限于TFA、乙酸、氨基甲磺酸、抗坏血酸、苯磺酸、苯甲酸、甲酸、乳酸、苹果酸、丙二酸、甲磺酸、草酸、邻苯二甲酸、水杨酸、琥珀酸、氨基磺酸、对甲苯磺酸、三氯乙酸、三氟甲磺酸、硼酸、氢碘酸、氢溴酸、盐酸、氢氟酸、碘酸、硝酸酸、高氯酸、高碘酸、次膦酸和磷酸。在一个非限制性实施方案中,酸是TFA。
步骤5中使用的溶剂可以是任何合适的有机溶剂,包括但不限于DMAc、DCM、THF、DMF、TFA、ACN、DMAP、水、乙酸、丙酮、二噁烷、苯、1-丁醇、2-丁醇、叔丁醇、四氯化碳、氯仿、环己烷、己烷、乙醚、二甘醇二甲醚、DME、DMSO、乙醇、乙酸乙酯、乙二醇、甘油、庚烷、HMPA、甲醇、MTBE、NMP、戊烷、吡啶、甲苯、盐酸和三乙胺。在一个非限制性实施方案中,溶剂选自DCM、DCE、TFA和THF。在另一个实施方案中,在步骤5中使用溶剂的混合物。
在非限制性实施例中,步骤5中使用的温度可为约30℃至约100℃、约35℃至约90℃、约50℃至约85℃、约55℃至约85℃或约60℃至约85℃。
可以使反应进行足够的时间以获得所需的产物产率。例如,反应可在步骤5中进行约0.1小时至约20小时、约0.5小时至约15小时、约1小时至约10小时、约1.5小时至约5小时或约2至约3小时。本领域技术人员应该理解,反应的时间和温度是相关的。例如,如果使用较高的温度,则较低的反应时间可以获得所需的产率。或者,如果使用较低的温度,则需要较高的反应时间以获得所需的产率,但可能存在较少的副产物。
在一个实施方案中,将4-二氮杂螺[5.5]十一烷-3-酮分离为盐。在另一个实施方案中,将4-二氮杂螺[5.5]十一烷-3-酮分离为游离碱。
在一个实施方案中,将4-二氮杂螺[5.5]十一烷-3-酮盐溶解或悬浮在溶剂中,然后使其经受碱。在一个实施方案中,溶剂是乙醇。在一个实施方案中,溶剂是DCM。在一个实施方案中,碱是K2CO3。在一个实施方案中,溶剂是乙醇,碱是K2CO3。在一个实施方案中,溶剂是DCM,碱是K2CO3。
IV.新中间体
在一个非限制性实施方案中,本文所述制备方法中使用的许多化合物是新的。其中一些描述如下。
在一个实施方案中,提供了式II的化合物:
及其盐。式II是与螺环内酰胺键合的杂芳基。
落入式II内的化合物的非限制性实例如下所示。该公开内容包括这些定义的所有组合,只要产生稳定的化合物。
在一个方面,本公开包括式IIA的化合物和盐:
其中R5如本文所定义。R5的非限制性实例是氢、溴、氯、氟、碘、-CF3、-OEt、-OMe、-NCH3OMe和-OC(O)CH3。
在一个方面,本公开包括式IIB的化合物和盐:
其中R2如本文所定义。R2的非限制性实例是氢、-Boc、-CBz、-Bn、氨基甲酸甲酯和甲基。
在一个方面,本公开包括式IIC的化合物和盐:
其中R1如本文所定义。R1的非限制性实例是甲基、-CF3、-Bn、-Ph、-Et、丙基和异丙基。
在一个方面,本发明包括式IID的化合物和盐:
其中R1如本文所定义。R1的非限制性实例是甲基、-CF3、-Bn、-Ph、-Et、丙基和异丙基。
可通过本发明中提出的方法合成的化合物的非限制性实例包括:
V.说明性实施例
根据本发明,提供了制备式I,式II,式III或式IV的化合物以及它们的盐的方法:
在一个非限制性实施方案中,上式的化合物用于合成CDK抑制剂。
缩写
ACN 乙腈
AUC 曲线下的面积
Boc 叔丁氧基羰基
Boc2O 二碳酸二叔丁酯
CBZ 羧基苄基
DABCO 1,4-二氮杂双环[2.2.2]辛烷
DBU 1,8-二氮杂双环十一-7-烯
DCM,CH2Cl2 二氯甲烷
DIEA,DIPEA N,N-二异丙基乙胺
DMA,DMAc N,N-二甲基乙酰胺
DMAP 4-二甲基氨基吡啶
DMF N,N-二甲基甲酰胺
DMSO 二甲基亚砜
Et 乙基
h,hr 小时
HMPA 六甲基磷酰胺
HPLC 高压液相色谱
K2CO3 碳酸钾
mCPBA 间氯过氧苯甲酸
MTBE 甲基叔丁基醚
NMP N-甲基-2-吡咯烷酮
NMR 核磁共振
Pd(PPh3)4 四(三苯基膦)钯(0)
Pt 铂
RT 室温
TEA 三乙胺
Tf2O 三氟甲磺酸酐
TFA 三氟乙酸
THF 四氢呋喃
一般方法
原料、中间体和最终产物的结构通过标准分析技术确认,包括NMR光谱和质谱。除非另有说明,否则使用从商业供应商处收到的试剂和溶剂。质子核磁共振光谱在500MHz的Bruker AVANCE 500上在DMSO-d6中获得。使用以下HPLC方法在Waters HPLC上进行HPLC分析。
HPLC方法
柱:Atlantis T3(150×4.6,3μm)
柱温:40℃
流速:1mL/min
检测:UV@275nm
分析时间:36分钟
流动相A:水(含0.1%三氟乙酸)
流动相B:乙腈(含0.1%三氟乙酸)
样品制备:将IPC样品、湿或干固体(约1mg活性化合物)溶于乙腈/水(1/1)中以完全溶解。
HPLC方法梯度
时间(分钟) |
%A |
%B |
0 |
100 |
0 |
5 |
100 |
0 |
23 |
5 |
95 |
28 |
5 |
95 |
28.1 |
100 |
0 |
实施例1.一般合成路线
方案1-1:从适当取代的卤代嘧啶开始,可以制备本发明的化合物。在步骤1中,将适当取代的卤代嘧啶在碱存在下经受1,4-二氮杂螺[5.5]十一烷-3-酮,加热得到取代的螺内酰胺。在步骤2中,用选自R
2的基团保护适当取代的螺内酰胺。在步骤3中,将保护的螺内酰胺在碱存在下环化,得到稠合的螺内酰胺。在步骤3、步骤4、步骤5或步骤6之后,可以任选地将稠合的螺内酰胺氧化成亚砜或砜。步骤3之前的氧化导致不希望的副产物。在步骤4中,将稠合的螺内酰胺的羟基转化为离去基团。在步骤5中,将离去基团脱水,得到式IV的化合物。在步骤6中,任选地将式IV化合物脱保护。
方案1-2:从适当取代的卤代嘧啶化合物开始,可以制备本发明的化合物。在步骤1中,将适当取代的卤代嘧啶在碱存在下经受1,4-二氮杂螺[5.5]十一烷-3-酮,加热得到取代的螺内酰胺。在步骤2中,用选自R2的基团保护适当取代的螺内酰胺。在步骤3中,将保护的螺内酰胺在碱存在下环化,得到式IV的稠合螺内酰胺。在步骤3或步骤4之后,可以任选地将稠合的螺内酰胺氧化成亚砜或砜。步骤3之前的氧化导致不希望的副产物。在步骤4中,任选地将式IV化合物脱保护。
方案1-3:从适当取代的甘氨酸烷基酯开始,可以制备本发明的化合物。在步骤1中,将适当取代的甘氨酸烷基酯在碱存在下经受环己酮和TMSCN,得到氰基物质。在步骤2中,将适当取代的氰基物质还原并随后环化,得到式I化合物。
方案1-4:从适当取代的1-(氨基甲基)环己-1-胺开始,可以制备本发明的化合物。在步骤1中,适当取代的1-(氨基甲基)环己-1-胺用醛还原胺化。在步骤2中,任选地将适当取代的环己烷胺脱保护(即,如果不是H,则选自R2的基团任选地被H代替)。在步骤3中,环己烷胺环化,得到式I化合物。在步骤4中,任选地保护式I化合物。
方案1-5:从适当取代的卤代嘧啶开始,可以制备本发明的化合物。在步骤1中,将适当取代的卤代嘧啶在碱存在下经受1,4-二氮杂螺[5.5]十一烷-3-酮,加热得到取代的螺内酰胺。在步骤2中,将保护的螺内酰胺在碱存在下环化,得到稠合的螺内酰胺。在步骤2、步骤3、步骤4或步骤5之后,可以任选地将稠合的螺内酰胺氧化成亚砜或砜。步骤2之前的氧化导致不希望的副产物。在步骤3中,将稠合的螺内酰胺的羟基转化为离去基团。在步骤4中,将离去基团脱水,得到式IV的化合物。在步骤5中,任选地将式IV化合物脱保护。
方案1-6:从适当取代的卤代嘧啶化合物开始,可以制备本发明的化合物。在步骤1中,将适当取代的卤代嘧啶在碱存在下经受1,4-二氮杂螺[5.5]十一烷-3-酮,加热得到取代的螺内酰胺。在步骤2中,将保护的螺内酰胺在碱存在下环化,得到式IV的稠合螺内酰胺。在步骤2或步骤3之后,可以任选地将稠合的螺内酰胺氧化成亚砜或砜。步骤2之前的氧化导致不希望的副产物。在步骤3中,任选地将式IV的化合物脱保护。
方案1-7:从式IV化合物开始,可以制备CDK4/6抑制剂。在步骤1中,使杂芳基胺经受碱,并在冷却条件下缓慢加入式IV化合物,以提供亲核取代反应。式IV化合物可以预先如本文方案中所述制备。
实施例2.代表性的合成路线
方案2-1:酯路线是本发明的一个实施方案。理想情况下,最佳合成方案将提供结晶中间体,无需柱色谱即可提供纯度一致的物质,并且在可能的情况下在使用安全且成本有效的试剂的同时提供高产率的步骤。
酯路线的第一步是使用螺内酰胺4对市售酯3中的Cl基团的SNAr亲核取代。由于4的低反应性,需要85-95℃的反应温度。由于温度要求,分别选择DIPEA和二甲基乙酰胺作为碱和溶剂。该反应遵循二级动力学并且通常在转化约85%后停止。因此,通常在60小时后通过首先将其冷却至室温来停止反应,此时观察到固体形成。然后将混合物在MTBE和水之间分配,产物以极好的纯度过滤,得到~53%产率的所需产物5。使用Boc酸酐和作为催化剂的DMAP并使用二氯甲烷作为溶剂,用Boc基团保护所得化合物5。以定量产率获得中间体6。由于化合物6的半固体性质,该物质无需进一步纯化即用于下一步骤。最初用强碱如LiHMDS和tBuOK进行Dieckmann缩合。获得与醛路线(方案2-2)类似的结果:观察到Boc基团的部分脱保护,其需要柱色谱法。然而,当DBU用作碱并且THF用作溶剂时,获得了最好的结果。反应产物完全,6完全转化为7。此外,产物在播种后从反应混合物中结晶,并获得两步的定量产率。
通过两步法除去7的羟基。首先,使用三氟甲磺酸酐和三乙胺在二氯甲烷中将化合物7完全转化为三氟甲磺酸酯8。发现反应在0℃下进行良好。由于三氟甲磺酸酯中间体的潜在不稳定性,它未被分离。将其立即用于下一步骤并用三乙基硅烷和四钯还原,得到产物9,乙酸乙酯结晶后的产率为~70%。使用三氟乙酸在二氯甲烷中除去9的Boc基团,得到10。使用OxoneTM在乙腈/水溶剂系统中将中间体10转化为最终的砜11。
所获得的砜11在偶联步骤中进行了使用测试,并且发现其表现良好。总之,开发了砜11的路线,其消除了柱色谱的使用并在所有步骤中具有良好至极好产率。
方案2-2:方案2-2的第一步始终如一地提供被大量发现的一种主要杂质污染的产物13。通过LC-MS和2D NMR对反应杂质结构进行了全面评估,结果表明杂质在结构上是两个醛12分子和一个内酰胺4分子的缩合。因此,需要柱色谱来纯化化合物13,其一致地产生适度的30%产率。溶剂筛选显示仲丁醇、戊醇、二噁烷和叔丁醇均可用于反应,但在每种情况下观察到类似的转化率。但是,叔丁醇提供了最干净的反应属性,因此选择它作为反应的溶剂。还研究了评估改变4和12的化学计量比对反应结果的影响。用4当量的胺4进行反应,试图破坏杂质的2:1醛/胺组成。结果是产品13的形成仅略微增加。接下来评估温度对反应结果的影响。在两种不同温度50℃和40℃、醛/胺比例为1:1下研究醛12和4的偶联。在2小时和4小时检查反应,然后每12小时检查一次。反应进程在50℃下减缓,并伴随着其他杂质的生长。在40℃下的反应更清洁;但是在同一时期内转化率较低。还在80℃下研究了试剂的加入方式,向反应混合物中缓慢加入(超过6小时)醛12或胺4。当胺4在回流下缓慢加入到含有醛12和DIPEA的反应混合物中时,产物分布没有变化,在产物和杂质之间观察到约1:1的比例。当醛12缓慢加入胺4和DIPEA的混合物中时,产物分布确实发生了变化。但是,反应的主要产物是不希望的杂质。尝试了其他有机碱以及不同比例的DIPEA。当碳酸钾用作碱时没有观察到产物。实验结果列于下表1中。
表1
化合物13在三种情况下成功地形成:三乙胺、2,6-二甲基吡啶和DIPEA,DIPEA结果最佳。使用Boc保护的螺内酰胺4也对杂质形成没有影响。推测其使用有利于与下一步骤即化合物14的制备一起进行偶联步骤。
在方案2-2的步骤1中形成的主要杂质是:
第二步(游离内酰胺的Boc保护)在室温下在二氯甲烷中使用DMAP作为催化剂很好地进行。产物14是稠油,因此不能通过结晶纯化。在用强碱如LiHMDS或tBuOK处理后,Boc保护的中间体14成功环化成所需的五环结构10。令人惊讶的是,Boc基团在反应过程中被部分除去。脱保护水平与内部反应温度无关,并且与所用碱的过量正相关。因此,用酸处理所需产物10和10-Boc化合物的混合物以完全脱保护Boc基团。用OxoneTM进行甲硫醚向最终砜11的转化。最初使用甲醇和水的混合物进行反应。结果,检测到甲氧基对砜的部分置换。用乙腈代替甲醇,消除砜置换。
总之,酯路线(方案2-1)是优选的,因为:
1.在方案2-2的第一步骤期间形成杂质是不可避免的,并且产率<35%。
2.需要柱纯化以分离中间体14。
3.醛原料不可商购,并且需要来自相应酯的两个合成步骤。
方案2-3:从环己酮开始,可以制备本发明的化合物。在步骤1中,在三乙胺存在下,在DCM中使甘氨酸甲酯经受环己酮和TMSCN,得到15。在步骤2中,在催化氧化铂存在下用氢气氢化15,随后进行分子内环化,得到化合物16,其用于上述方案中。
方案2-4:从化合物17开始,可以制备本发明的化合物。在步骤1中,化合物17在铂碳和氢气存在下经受2-氧代乙酸乙酯,得到化合物18。在步骤2中,化合物18用盐酸进行Boc-脱保护。在步骤3中,将化合物18环化,得到化合物16,其用于上述方案中。
方案2-5:从化合物11开始,可以制备CDK4/6抑制剂19。在步骤1中,使5-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-2-胺经受LiHMDS,并在冷却条件下缓慢加入化合物11,得到亲核取代反应和化合物19。化合物11可以如本文方案中所述制备。
方案2-6:从化合物11开始,可以制备CDK4/6抑制剂20。在步骤1中,使5-(4-异丙基哌嗪-1-基)吡啶-2-胺经受LiHMDS,并在冷却条件下缓慢加入化合物11,得到亲核取代反应和化合物20。化合物11可以如本文方案中所述制备。
化合物5的制备:
向装有机械顶置式搅拌器、热电偶、N2入口和回流冷凝器的500mL三颈烧瓶中加入4-氯-2-(甲硫基)嘧啶-5-羧酸乙酯3(49.2g,0.21mol,1.00当量)、螺内酰胺4(39.2g,0.23mol,1.10当量)、DIPEA(54.7g,0.42mol,2.00当量)和DMAc(147.6mL,3体积)。将该批料加热至90-95℃,60小时后,IPC确认残留了约14%(AUC)的4-氯-2-(甲硫基)嘧啶-5-羧酸乙酯。将批料冷却至室温,观察到沉淀形成。将悬浮液用MTBE(100mL,2体积)和水(442mL,9体积)稀释,并在室温下搅拌2小时。通过真空过滤分离产物,并用MTBE(49mL,1体积)洗涤。将固体滤饼条件化1小时并在40℃下真空干燥16小时,得到化合物5[41.0g,53%产率],为灰白色固体,纯度>99%AUC。1H NMR(CDCl3):δ8.76(d,J=2.0Hz,1H),6.51–6.29(br,1H),4.33(q,J=7.0Hz,2H),3.78(s,2H),3.58(s,2H),2.92(s,2H),2.53(s,3H),1.63–1.37(m,12H).LCMS(ESI,m/z=365.3[M+H]).
化合物6的制备:
向装有机械顶置式搅拌器、热电偶、N2入口的500mL三颈烧瓶中加入5[41.0g,0.11mol,1.00当量]、Boc-酸酐(36.8g,0.17mol,1.50当量)、DMAP(1.37g,0.01mol,0.10当量)和二氯甲烷(287mL,7体积)。将该批料在室温下搅拌3小时。IPC确认没有原料残留(AUC)。将该批料在减压下浓缩成残余物,并进行下一步骤(假定该步骤定量产率)。通过柱色谱(庚烷/乙酸乙酯0至100%)纯化等分试样(200mg),得到化合物6。1H NMR(CDCl3):δ8.64(s,1H),4.31(q,J=7.0Hz,2H),4.07(s,2H),3.83(S,2H),3.15(m,2H),2.56(s,3H),172(m,3H),1.59(m,15H),1.42(t,J=7.0Hz,3H).LCMS(ESI,m/z=465.2[M+H]).
化合物7的制备:
向装有机械顶置式搅拌器、热电偶、N2入口的500mL三颈烧瓶中加入化合物6[来自前一步骤的残余物,假定定量产率,52.2g,0.11mol,1.00当量]和THF(261毫升,5体积)。将批料冷却至0℃并加入1,8-二氮杂双环[5.4.0]十一-7-烯(17.1g,0.11mmol,1.00当量),保持内部温度在0-10℃范围内。加完后,移去冷却浴,使反应混合物升温至室温,2小时后IPC确认没有原料残留。将批料用产物(1.0g)接种并冷却至0℃。将浆液在0℃下搅拌2小时。通过真空过滤分离产物,并用冷(0℃)THF(50mL,1体积)洗涤。将固体滤饼条件化1小时并在40℃下真空干燥16小时,得到7[47g,定量产率],为浅橙色固体,纯度>99%AUC。一旦批料暴露在空气中较长时间(约1天),产物的颜色即变为黄色。根据质子NMR,用大量DBU分离物质。但是,它没有干扰下一步。1H NMR(CDCl3):δ8.71(s,1H),4.03(s,2H),2.57(s,3H),1.85(m,10H),1.51(s,9H).LCMS(ESI,m/z=419.2[M+H]).
化合物8的制备:
向装有机械顶置式搅拌器、热电偶、N2入口的500mL三颈烧瓶中加入7[40.8g,0.10mol,1.00当量]、三乙胺(31.5g,0.31mol,3.20当量)和二氯甲烷(408毫升,10体积)。将批料用N2吹扫15分钟并冷却至0℃。加入三氟甲磺酸酐(44.0g,0.16mol,1.60当量),保持内部温度在0-10℃范围内。将批料在0℃下搅拌,3小时后,IPC确认残留7%(AUC)的7。[据推测,该产物在分析过程中会水解成原料。]一旦认为反应完成,将批料转移到1L分液漏斗中并用50%饱和碳酸氢钠(200mL,5体积)洗涤。[它通过将饱和碳酸氢钠(100mL)与水(100mL)混合而制备)。分离水层,用DCM(2×40mL,1体积)萃取。合并有机层,减压浓缩成残余物,用于下一步骤。LCMS(ESI,m/z=551.6[M+H])。
化合物9的制备:
向配备有机械顶置式搅拌器、热电偶、N2入口的500mL三颈烧瓶中加入化合物8[来自前一步骤的残余物,假定定量产率,53.7g,0.10mol,1.00当量]和THF(110毫升,2体积)。在真空蒸馏下除去溶剂,重复该过程两次。向烧瓶中加入三乙基硅烷(22.7g,0.20mol,2.00当量)和DMF(268mL,5体积)。通过五次抽空循环使批料脱气,然后用氮气回填。向烧瓶中加入四(三苯基膦)钯(0)(11.3g,0.01mol,0.1当量)。将批料加热至45-50℃,14小时后,IPC确认没有原料残留。将批料转移至500mL分液漏斗中,同时保持温热。将反应在水(5体积)和乙酸乙酯(5体积)之间分配。用乙酸乙酯(3×3体积)萃取水层。合并有机层并浓缩至2体积。过滤沉淀物并用乙酸乙酯(2×1体积)洗涤。将固体滤饼条件化1小时并在40℃下真空干燥16小时,得到9[27.5g,70%产率]为黄色固体,纯度为约98%AUC。质子NMR显示存在一些三苯基氧化膦。1H NMR(DMSO-d6):δ9.01(s,1H),7.40(s,1H),4.30(s,2H),2.58(m,2H),2.58(s,3H),1.81(m,5H),1.51(s,9H).LCMS(ESI,m/z=403.4[M+H]).
从方案2-1路线制备化合物10:
向装有机械顶置式搅拌器、热电偶、N2入口的500mL三颈烧瓶中加入9(12.8g,31.8mmol,1.00当量)和二氯甲烷(64mL,5体积)。在20分钟内加入三氟乙酸(18.2g,159mmol,5.00当量),并将溶液在室温下搅拌2小时。IPC确认反应完成。将批料转移至500mL分液漏斗中并用饱和碳酸氢钠(200mL)洗涤。用二氯甲烷(3×3体积)萃取水层。合并有机层并浓缩至1体积。将沉淀物过滤并条件化1小时,并在40℃下真空干燥16小时,得到9[6.72g,70%产率],为灰白色固体,纯度为99.1%AUC。1H NMR(DMSO-d6):δ8.95(s,1H),8.32(s,1H),7.15(s,1H),3.68(d,J=1.0Hz,2H),2.86(m,2H),2.57(s,3H),1.92(m,2H),1.73(m,3H),1.39(m,3H).LCMS,ESI,m/z=303.2[M+H]).
从方案2-2路线制备化合物10:
向装有磁力搅拌棒、热电偶、N2入口的50mL三颈烧瓶中加入14(680mg,1.62mmol,1.00当量)和THF(6.8mL,10体积)。在10分钟内加入1M叔丁醇钾(3.2mL,3.24mmol,2.00当量)的THF溶液,并将溶液在室温下搅拌2小时。IPC确认反应完成。将该批料用4N氯化氢的二噁烷溶液(2.4mL,9.72mmol,6.00当量)酸化并再搅拌1小时。将批料转移至500mL分液漏斗中并用饱和碳酸氢钠(100mL)洗涤。用乙酸乙酯(3×20体积)萃取水层。合并有机层并浓缩至3体积并沉淀产物。将沉淀物过滤并条件化1小时,并在40℃下真空干燥16小时,得到9[489mg,定量产率],为灰白色固体。
化合物11的制备:
向装有机械顶置式搅拌器、热电偶、N2入口的500mL三颈烧瓶中加入10(9.00g,29.8mmol,1.00当量)和乙腈(180mL,20体积)。在20分钟内向该批料中加入OxoneTM(45.9g,0.15mol,5.00当量)在水(180mL,20体积)中的溶液。将批料搅拌2小时,IPC确认反应完成。将批料浓缩至原始体积的1/2并用二氯甲烷DCM(4×10体积)萃取。合并有机层;精滤(polish filtered)并浓缩至约10体积的DCM。通过加入庚烷(~30体积)将产物缓慢结晶出来。将混合物冷却至0℃,过滤产物,在40℃下真空干燥16小时,得到11[9.45g,95%产率],为灰白色固体,纯度>99%AUC。1H NMR(CDCl3):δ9.24(s,1H),7.78(s,1H),7.46(s,1H),3.89(d,J=2.0Hz,2H),3.43(s,3H),2.98(m,2H),2.10(m,2H),1.86(m,3H),1.50(m,3H).LCMS(ESI,m/z=335.2[M+H]).
化合物13的制备:
向装有机械顶置式搅拌器、热电偶、N2入口和回流冷凝器的250mL单颈烧瓶中加入4-氯-2-(甲硫基)嘧啶-5-甲醛(2.00g,10.6mmol,1.00当量)、螺内酰胺4(1.96g,11.7mmol,1.10当量)、DIPEA(2.74g,21.2mmol,2.00当量)和叔丁醇(20mL,10体积)。将批料加热至80-85℃,24小时后,IPC确认没有醛12残留。将批料冷却至室温并浓缩成残余物,将其装载在硅胶柱上。用乙酸乙酯/庚烷(0%至100%)洗脱产物。取出含有产物的级分并浓缩,得到13[0.98g,29%产率],为灰白色固体。
化合物14的制备:
向装有机械顶置式搅拌器、热电偶、N2入口的500mL三颈烧瓶中加入13[0.98g,3.00mmol,1.00当量]、Boc-酸酐(4.90g,21.5mmol,7.00当量)、DMAP(36mg,0.30mmol,0.10当量)和二氯甲烷(7mL,7体积)。将该批料在室温下搅拌3小时。IPC确认没有原料残留。将批料冷却至室温并浓缩成残余物,将其装载在硅胶柱上。用乙酸乙酯/庚烷(0%至100%)洗脱产物。取出含有产物的级分并浓缩,得到14[0.98g,29%产率],为灰白色固体。
化合物15的制备:
在室温下在氮气氛下向甘氨酸甲酯(500g,3.98mol,1当量)在DCM(10L)的悬浮液中滴加TEA,然后在15分钟内滴加环己酮(781g,7.96mol,2当量)。在1小时内向所得混合物中滴加TMSCN(591g,5.97mol,1.5当量),同时保持内部反应温度低于35℃。在室温下搅拌2小时后,悬浮液变成澄清溶液。通过H-NMR监测反应进程。
当如H-NMR分析所示完全消耗掉甘氨酸甲酯时,用水(5L)淬灭反应。分层。用DCM(1L)萃取水层。将合并的有机相用水(5L×2)洗涤并经Na2SO4(1.5Kg)干燥。过滤并浓缩后,得到1.24Kg粗品15,为油状物。
将粗品15溶解在IPA(4L)中。该溶液在室温下用HCl/IPA溶液(4.4mol/L,1.1L)处理。在添加过程中沉淀出大量固体。将所得悬浮液搅拌2小时。通过真空过滤收集固体产物并用MTBE(800mL)冲洗。得到819g纯的15,为白色固体。产率为88.4%。1H-NMR(300MHz,CD3OD)4.20(s,2H),3.88(s,3H),2.30-2.40(d,J=12Hz,2H),1.95-2.02(d,J=12Hz,2H),1.55-1.85(m,5H),1.20-1.40(m,1H).
化合物16的制备:
向15(10g,43mmol)的MeOH(100mL)溶液中加入甲醇盐酸溶液(2.44mol/L,35.3mL,2当量)和PtO2(0.5g,5wt%)。将反应悬浮液与氢气泡在40℃下搅拌6小时。H-NMR分析显示15消耗掉。向反应混合物中加入K2CO3(15g,108mmol,2.5当量)并将混合物搅拌3小时。过滤悬浮液,将滤液浓缩至干。将残余油状物用DCM(100mL)稀释,并将所得悬浮液搅拌3小时。过滤后,浓缩滤液得到粗品16(6.6g),为油状物。将粗品16用EtOAc/己烷(1:1,18mL)在室温下稀释2小时。过滤后,分离出16(4g)。将获得的16溶解在DCM(16.7mL)中并逐滴加入己烷(100mL)以沉淀产物。进一步搅拌1小时后,分离出2.8g纯的16,为白色固体。产率为39%。HPLC纯度为98.3%;MS(ESI):169.2(MH+);1H-NMR(300MHz,D2O)3.23(s,3H),3.07(s,3H),1.37-1.49(m,10H).
化合物19的制备:
将5-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-2-胺(803.1g;基于砜11 3.0当量)加入至22L烧瓶中。将烧瓶用N2覆盖并加入无水THF(12.4kg)。将得到的黑紫色溶液在冰浴中冷却至<5℃。通过加料漏斗以三个相等的添加量添加1M LiHMDS(4.7L;1.2当量,基于砜11)以保持温度低于10℃。加完后,将反应混合物温热至16℃。分五次加入砜11(455.1g;1.00当量)。进行反应直至IPC样品的HPLC分析表明残留少于3%的砜11。为了淬灭反应,将22L烧瓶中的内容物转移到含有水的100L烧瓶中。在<30℃下搅拌30分钟后,过滤收集粗品,用水洗涤并干燥,得到19(387g,99.1%纯度,63.7%产率)。
化合物20的制备:
将5-(4-异丙基哌嗪-1-基)吡啶-2-胺(1976.2g;基于砜113.0当量)加入50L烧瓶中。将烧瓶用N2覆盖并加入无水THF(10.7kg)。将得到的黑紫色溶液在冰浴中冷却至<5℃。通过加料漏斗以一定速率加入1M LiHMDS(9.6kg;基于砜3.6当量)以保持温度低于10℃。加完后,通过除去冰浴将反应混合物在120分钟内温热至16℃。分五次添加加入砜(1000g;1.00mol)。反应进行直到IPC样品的HPLC分析表明残留少于1%的砜11。反应完成后,将氯化铵加入反应混合物中。将混合物在<32℃下搅拌至少30分钟,过滤收集固体,得到20(900g,99.1%纯度,64.2%产率)。
通过环己酮至螺内酰胺的替代路线:
在一个实施方案中,螺内酰胺通过上述合成方案制备。通过在加入甘氨酸酯基团之前还原腈基,反应顺序以更高的产率进行。步骤1中使用的化学反应在文献中描述(J.Org.Chem.2005,70,8027-8034),并以千克规模进行。将化合物24转化为螺内酰胺的化学反应也以千克规模证明。化合物23的Boc保护在-70℃下进行,以限制二-Boc保护的产物的形成。下面描述200g试运行的实验细节。
步骤1
使用Ti(Oi-Pr)4/TMSCN/NH3将200g的环己酮21转化为22。后处理后,获得213g的22。H-NMR很干净。产率为84%。通过真空过滤除去钛盐。在一个实施方案中,通过离心或硅藻土过滤除去钛盐。
步骤2
将190g 22与LAH(2当量)在MTBE中在45℃下混合30分钟。后处理后,获得148g粗品23。
步骤3
在-70℃下,将来自步骤2的136g粗品23用0.9当量的Boc2O转化为24。反应完成并进行后处理。浓缩后,得到188g的24。产率为86%。H-NMR和C-NMR谱证实该化合物是纯的。
步骤4
将188g 24在乙腈中经受2-溴乙酸甲酯和K2CO3,得到25。得到247g粗品25。
步骤5
将247g 25在DCE中经受TFA并加热至回流,得到26。后处理后,得到112g 6的TFA盐。H-NMR很干净。
步骤6
将化合物26在室温下在EtOH中搅拌过夜,得到27。在一个实施方案中,DCM而不是EtOH用作溶剂。
实施例3.从方案2-1的步骤5中清除残留的钯:
由于在方案2-1的步骤5中使用钯,因此测定了后续合成步骤中存在的残留Pd的水平。下表2和图3显示了分离的固体中的钯含量。
表2
步骤 |
步骤5 |
步骤6 |
步骤7 |
19FB |
19盐 |
Pd ppm |
14700 |
779 |
164 |
19 |
14 |
分离步骤5后的材料,其含有1.47%(14700ppm)的残留钯。这一数据代表了最糟糕情况下钯的最高水平。后面步骤的后处理条件几乎清除了所有钯和最终产物19双HCl盐(含有14ppm的Pd),其低于标准的20ppm指导。一旦在步骤5中优化了催化剂负载,Pd水平可能会更低。
在该路线中开发的方法比用于第一代合成的方法有显著改进。总体而言,该方案包括七个步骤,五次分离,全部通过结晶。在合成中不使用硅胶柱色谱法,这使得该方法具有高度可放大性。在方案2-1的步骤5之后,该工艺后处理条件可以成功地清除1.47%的残留钯。
已经参考本发明的实施方案描述了该说明书。然而,本领域普通技术人员认识到,在不脱离如下面的权利要求所阐述的本发明的范围的情况下,可以进行各种修改和改变。因此,说明书应被视为说明性而非限制性意义,并且所有这些修改旨在包括在本发明的范围内。