CN109355434B - 定量检测鸡马立克氏病毒Meq基因缺失疫苗株和野毒株的荧光定量PCR试剂盒及其应用 - Google Patents

定量检测鸡马立克氏病毒Meq基因缺失疫苗株和野毒株的荧光定量PCR试剂盒及其应用 Download PDF

Info

Publication number
CN109355434B
CN109355434B CN201811418448.XA CN201811418448A CN109355434B CN 109355434 B CN109355434 B CN 109355434B CN 201811418448 A CN201811418448 A CN 201811418448A CN 109355434 B CN109355434 B CN 109355434B
Authority
CN
China
Prior art keywords
virus
strain
quantitative pcr
seq
meq
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Active
Application number
CN201811418448.XA
Other languages
English (en)
Other versions
CN109355434A (zh
Inventor
刘长军
王笑梅
张艳萍
李凯
高玉龙
崔红玉
高宏雷
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Harbin Weike Biotechnology Development Co
Harbin Veterinary Research Institute of CAAS
Original Assignee
Harbin Weike Biotechnology Development Co
Harbin Veterinary Research Institute of CAAS
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Harbin Weike Biotechnology Development Co, Harbin Veterinary Research Institute of CAAS filed Critical Harbin Weike Biotechnology Development Co
Priority to CN201811418448.XA priority Critical patent/CN109355434B/zh
Publication of CN109355434A publication Critical patent/CN109355434A/zh
Application granted granted Critical
Publication of CN109355434B publication Critical patent/CN109355434B/zh
Active legal-status Critical Current
Anticipated expiration legal-status Critical

Links

Images

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/70—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving virus or bacteriophage
    • C12Q1/701—Specific hybridization probes
    • C12Q1/705—Specific hybridization probes for herpetoviridae, e.g. herpes simplex, varicella zoster
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6844—Nucleic acid amplification reactions
    • C12Q1/6851—Quantitative amplification
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/166—Oligonucleotides used as internal standards, controls or normalisation probes

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Virology (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)

Abstract

本发明公开了一种定量检测鸡马立克氏病毒Meq基因缺失疫苗株和野毒株的荧光定量PCR试剂盒及其应用。所述的试剂盒中含有两套分别用于检测鸡马立克氏病毒Meq基因缺失疫苗株和野毒株的荧光定量PCR引物和探针，其中用于检测鸡马立克氏病毒Meq基因缺失疫苗株的荧光定量PCR引物序列如SEQ ID NO.1以及SEQ ID NO.2所示，探针序列如SEQ ID NO.3所示；用于检测鸡马立克氏病毒野毒株的荧光定量PCR引物序列如SEQ ID NO.4以及SEQ ID NO.5所示，探针序列如SEQ ID NO.6所示。经过体外实验证明本发明的试剂盒敏感性高，特异型好，重复性好，能分别准确定量鸡马立克氏病毒Meq基因缺失疫苗株和MDV野毒株，对于鸡马立克氏病的诊断、疫苗的免疫监控等具有重要意义。

Description

定量检测鸡马立克氏病毒Meq基因缺失疫苗株和野毒株的荧 光定量PCR试剂盒及其应用
技术领域
本发明涉及一种荧光定量PCR试剂盒及其应用，特别涉及一种定量检测鸡马立克氏病毒Meq基因缺失疫苗株和野毒株的荧光定量PCR试剂盒及其应用。本发明属于生物医药技术领域。
背景技术
鸡的马立克氏病(Marek’s Disease，MD)是鸡的一种重要病毒性传染病，病原为鸡马立克氏病病毒(Marek’s Disease virus，MDV)。MD流行病学研究证实我国的MDV野毒株持续发生变异，向更强的毒力方向进化，现地已经出现能够突破现有MD疫苗(CVI988株、814株)保护的MDV强毒株。
针对MDV毒力不断增强、严重危害养禽业发展的状况，我国学者通过基因重组技术，缺失MDV流行毒株的主要毒力基因-Meq基因，研发了具有更高免疫效力的鸡马立克氏病病毒Meq基因缺失疫苗株(rMSΔMeq株，该毒株记载在公开号为CN102363769B，发明名称为“鸡马立克氏病毒Meq基因缺失疫苗株，其构建方法及应用”的专利申请中，其微生物保藏编号是：CGMCC No.4612)，该疫苗株对MDV变异毒株能提供良好的疫苗保护作用。MD疫苗抗肿瘤但不能阻止野毒株的感染，野毒株可以和疫苗毒株共存于体内，并且可以排放到环境中，而鸡体内疫苗毒株和野毒株的分别定量对于该病的诊断、疫苗的免疫监控等具有重要意义。目前尚没有一种有效的、准确的区分MDV基因缺失疫苗和野毒株的荧光定量方法。
发明内容
本发明的目的在于提供一种可定量检测鸡马立克氏病毒Meq基因缺失疫苗株和野毒株的荧光定量PCR试剂盒。
为了达到上述目的，本发明采用了以下技术手段：
本发明的一种定量检测鸡马立克氏病毒Meq基因缺失疫苗株和野毒株的荧光定量PCR试剂盒，含有两套分别用于检测鸡马立克氏病毒Meq基因缺失疫苗株和野毒株的荧光定量PCR引物和探针，其中用于检测鸡马立克氏病毒Meq基因缺失疫苗株的荧光定量PCR引物序列如SEQ ID NO.1以及SEQ ID NO.2所示，探针序列如SEQ ID NO.3所示；用于检测鸡马立克氏病毒野毒株的荧光定量PCR引物序列如SEQ ID NO.4以及SEQ ID NO.5所示，探针序列如SEQ ID NO.6所示，所述的探针的5’端标记有报告基团，3’端标记有荧光淬灭基团。
其中，优选的，所述的试剂盒中还包括用于扩增作为内参的鸡的管家基因卵铁转蛋白基因(ovo)的引物和探针。
其中，优选的，所述的用于扩增作为内参的鸡的管家基因卵铁转蛋白基因(ovo)的引物序列如SEQ ID NO.7以及SEQ ID NO.8所示，探针序列如SEQ ID NO.9所示，所述的探针的5’端标记有报告基团，3’端标记有荧光淬灭基团。
其中，优选的，所述的试剂盒中还包括Ex Taq DNA聚合酶，10×Ex Taq缓冲液、dNTP混合物以及阳性标准品。
其中，优选的，所述的阳性标准品包括分别含有鸡马立克氏病毒Meq基因缺失疫苗株和野毒株片段的质粒，所述的质粒是用上述的引物从鸡马立克氏病毒Meq基因缺失疫苗株和野毒株上分别扩增出各自的片段连接到pMD18T载体上得到的。
其中，优选的，鸡马立克氏病毒Meq基因缺失疫苗株为rMSΔMeq，保藏在中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物中心，其微生物保藏编号是：CGMCC No.4612。该毒株已记载在公开号为CN102363769B，发明名称为“鸡马立克氏病毒Meq基因缺失疫苗株，其构建方法及应用”的专利申请中。
其中，优选的，使用所述的试剂盒用于定量检测鸡马立克氏病毒Meq基因缺失疫苗株和野毒株时，按照以下步骤进行：
(1)提取待检样本的总DNA；
(2)荧光定量方法标准曲线建立
将阳性标准品质粒从109copies/ul到101copies/ul系列稀释作为模板，以本发明所述的引物和探针进行荧光定量PCR扩增，用于建立标准曲线；
(3)以步骤(1)提取的总DNA为模板，以本发明所述的引物和探针进行荧光定量PCR扩增；
(4)PCR反应过程中自动检测、采集荧光信号，根据标准曲线对待检样本中的病毒含量进行定量。
其中，优选的，还包括以步骤(1)提取的总DNA为模板，以权利要求2或3中所述的引物和探针进行荧光定量PCR扩增，计算病毒拷贝数和管家基因卵铁转蛋白基因拷贝数的比值，得到单位细胞里的病毒拷贝数。
其中，优选的，荧光定量PCR的反应体系为25ul，25ul体系里含有0.25ul Ex TaqDNA聚合酶，2.5ul 10×Ex Taq缓冲液，2ul dNTP混合物，1ul上游引物，1ul下游引物，1uL探针，2ul模板DNA和15.25ul无菌水。
其中，优选的，荧光定量PCR的反应条件为：95℃5min；95℃15s、60℃45s，40个循环；37℃5min。
相较于现有技术，本发明的有益效果是：
MD对养禽业有重大危害，它的防控主要依靠疫苗免疫。MD疫苗不能清除MDV野毒株的感染和阻止野毒株排放，因此疫苗毒株和野毒株往往在鸡体内共存，且由于疫苗毒株和野毒株在基因组水平上的特异性差异较小，这给它们在体内载量的精确定量带来困难。
本发明针对鸡马立克氏病毒Meq基因缺失疫苗和MDV野毒建立了两套荧光定量PCR方法，一套荧光定量PCR方法只能检测到鸡马立克氏病毒Meq基因缺失疫苗株，检测不到其它MDV野毒株；另外一套荧光定量PCR方法能检测到所有MDV野毒株，检测不到鸡马立克氏病毒Meq基因缺失疫苗株。经过体外实验证明这两套荧光定量PCR方法敏感性高，特异型好，重复性好，能分别准确定量鸡马立克氏病毒Meq基因缺失疫苗株和MDV野毒株。
此外，本发明的方法可以在鸡同时接种或感染MDV疫苗毒株和野毒株的情况下，通过计算病毒拷贝数和管家基因卵铁转蛋白基因拷贝数的比值，得到单位细胞里的病毒拷贝数，从而对它们进行精确定量。本发明的提出对MDV的感染进程的分析研究、对于鸡马立克氏病的诊断、疫苗的免疫监控等具有重要意义。
附图说明
图1为rMS-qPCR上下游引物探针设计模式图，引物和探针在meq基因的位置用黑色箭头和灰色线段标示；
图2为MDV-qPCR上下游引物探针设计模式图，引物和探针在meq基因的位置用黑色箭头和灰色线段标示；
图3为MDV-qPCR的敏感性试验结果(A)及标准曲线(B)；
图4为rMS-qPCR的敏感性试验结果(A)及标准曲线(B)；
图5为MDV-qPCR的特异性检测；
图中1代表rMSΔMeq株的扩增曲线，2-9分别代表MDV中国分离株LCC、BS、HS、LTS、LMS株，中国疫苗株814株和MDV美国株GA、Md5株的扩增曲线；
图6为rMS-qPCR的特异性检测；
图中1代表rMSΔMeq株的扩增曲线，2-9分别代表MDV中国分离株LCC、BS、HS、LTS、LMS株，中国疫苗株814株和MDV美国株GA、Md5株的扩增曲线；
图7为基因缺失疫苗株rMSΔMeq对MDV-qPCR检测的干扰分析；
将MDV DNA(感染中国分离株LMS细胞的总DNA提取物)分别10倍梯度稀释到基因缺失疫苗株DNA(感染rMSΔMeq的细胞的总DNA提取物)和对照DNA(空白细胞培养物提取的总DNA)中，应用MDV-qPCR进行检测；●代表在基因缺失疫苗rMSΔMeq株干扰情况下的检测值，■代表无干扰情况下的检测值；
图8为MDV毒株对rMS-qPCR检测的干扰分析；
将基因缺失疫苗株DNA(感染rMSΔMeq的细胞的总DNA提取物)分别10倍梯度稀释到MDV DNA(感染中国分离株LMS细胞的总DNA提取物)和对照DNA(空白细胞培养物提取的总DNA)中，应用rMS-qPCR进行检测；●代表在MDV DNA干扰情况下的检测值，■代表无干扰情况下的检测值；
图9为应用MDV-qPCR对免疫攻毒的SPF鸡体内MDV野毒病毒载量的动态检测；
图中横坐标为免疫时间(天)，纵坐标为Log10(每106细胞中MDV野毒株在羽髓的复制拷贝数)；●、■、▲、▼曲线分别为rMSΔMeq疫苗免疫和非免疫情况下，MDV分离株LTS、LCC株攻毒后鸡的羽髓中病毒载量动态检测值；
图10为应用rMS-qPCR对免疫攻毒的SPF鸡体内rMSΔMeq病毒载量的动态检测。
图中横坐标为免疫时间(天)，纵坐标为Log10(每106细胞中MDV野毒株在羽髓的复制拷贝数)；●、■、▲曲线分别为rMSΔMeq疫苗免疫攻毒(MDV LTS、LCC株)及只免疫未攻毒鸡的羽髓中rMSΔMeq疫病毒载量动态检测值；
具体实施方式
下面结合具体实例来进一步描述本发明，本发明的优点和特点将会随着描述而更为清楚。但这些实例仅是范例性的，并不对本发明的范围构成任何限制。本领域技术人员应该理解的是，在不偏离本发明的精神和范围下可以对本发明技术方案的细节和形式进行修改或替换，但这些修改和替换均落入本发明的保护范围内。
实施例1定量检测鸡马立克氏病毒Meq基因缺失疫苗株和野毒株的荧光定量PCR方法的建立
1、引物和探针设计
仅能检测鸡马立克氏病病毒Meq基因缺失疫苗株rMSΔMeq株(该毒株记载在公开号为CN102363769B，发明名称为“鸡马立克氏病毒Meq基因缺失疫苗株，其构建方法及应用”的专利申请中，其微生物保藏编号是：CGMCC No.4612)的荧光定量PCR命名为：rMS-qPCR，rMS-qPCR的上下游引物和探针设计如图1所示；检测所有MDV野毒株的荧光定量PCR命名为：MDV-qPCR，MDV-qPCR的上下游引物和探针设计如图2所示。所有引物以及探针序列见表1，所述的探针的5’端标记有报告基团FAM，3’端标记有荧光淬灭基团TAMRA。
表1荧光定量PCR所用的引物和探针序列
Figure BDA0001880032420000051
2、荧光定量体系及反应条件
荧光定量PCR的反应体系为25ul，25ul体系里含有0.25ul Ex Taq，2.5ul 10×ExTaq缓冲液，2ul dNTP混合物(TaKaRa Biotechnology Co.，Ltd.，Dalian，China)，1ul上游引物(10umol)，1ul下游引物(10umol)，1uL探针(10umol)，2ul模板DNA和15.25ul无菌水。反应条件：95℃5min；95℃15s、60℃45s，40个循环；37℃5min。在60℃下检测荧光信号。
3、荧光定量方法标准曲线建立
用上述荧光定量方法的上下游引物，以MDV毒株病毒DNA为模板分别扩增出相应片段，克隆到pMD18T载体上用作阳性标准品。根据公式N＝(C×10-9)/(M×660)×6.02×1023(C为标准品浓度，M为构建的质粒碱基数)计算质粒拷贝数。将质粒从109copies/ul到101copies/ul 10倍系列稀释作为模板，用于建立荧光定量方法的标准曲线。以此方法建立的MDV-qPCR标准曲线见图3B，rMS-qPCR的标准曲线见图4B。
4、敏感性试验
将标准品质粒从109copies/ul到101copies/ul来进行10倍稀释，将稀释后的标准品质粒作为模板进行荧光定量PCR反应，MDV-qPCR以及rMS-qPCR的敏感性试验结果见图3A和图4A，两套荧光定量PCR的灵敏度均能达到10拷贝。
5、特异性试验
分别从实验室保存的MDV分离株LCC、BS、HS、LTS、LMS株，疫苗株814，美国毒株GA和Md5株以及rMSΔMeq株细胞感染物中提取总DNA，以其为模板，进行荧光定量PCR反应，验证这两套荧光定量方法的特异性。MDV-qPCR能检测到所有MDV野毒株，检测不到rMSΔMeq株，结果见图5；rMS-qPCR能检测到rMSΔMeq株，检测不到其它MDV野毒株，结果见图6。
6、重复性试验
以10倍系列稀释的3个梯度的标准质粒为模板，分别进行组内和组间平行试验。组内平行试验方法是在一次PCR检测中，每个样品做3个重复；组间平行试验方法是每个样品做3次不同批次的检测。计算组内和组间变异系数，分析试验的可重复性。实验结果显示这两套荧光定量检测方法的组内变异均低于1％，组间变异均低于2％。MDV-qPCR的重复性试验结果见表2，rMS-qPCR的重复性试验结果见表3。
表2 MDV-qPCR的重复性试验
Figure BDA0001880032420000061
Figure BDA0001880032420000071
表3 rMS-qPCR的重复性试验
Figure BDA0001880032420000072
7、rMSΔMeq株和MDV野毒株体外混合感染的定量检测
将MDV DNA(感染中国分离株LMS细胞的总DNA提取物)以1:10000,1:1000,1:100,1:10,1:1五个稀释度，分别稀释到基因缺失疫苗株DNA(感染rMSΔMeq的细胞的总DNA提取物)和对照DNA(空白细胞培养物提取的总DNA)中，应用MDV-qPCR对上述两种系列模板进行检测。结果表明，不同梯度稀释情况下，混有疫苗毒株和空白对照的定量检测值无显著差异，检测结果一致，证实rMSΔMeq株的DNA对MDV-qPCR的检测没有影响，结果见图7。
将基因缺失疫苗株DNA(感染rMSΔMeq的细胞的总DNA提取物)以1:10000,1:1000,1:100,1:10,1:1五个稀释度，分别稀释到MDV DNA(感染中国分离株LMS细胞的总DNA提取物)和对照DNA(空白细胞培养物提取的总DNA)中，应用rMS-qPCR对上述两种系列模板进行检测。检测结果显示，在rMSΔMeq1:100、1:10和1:1稀释情况下，两个系列无显著差异；较高稀释度情况下(1:10000,1:1000)，混有MDV野毒的rMSΔMeq拷贝数检测要略小于对照。检测结果见图8。上述试验表明当MDV野毒株的DNA含量要远高于rMSΔMeq株的DNA含量时(1:10000,1:1000)，rMS-qPCR对rMSΔMeq株的DNA的检测值会比真实值略小，但随着rMSΔMeq株的DNA的比例增大时，rMS-qPCR能准确定量rMSΔMeq株的拷贝数。证实在正常的混合感染比例范围内，rMS-qPCR可以对rMSΔMeq的拷贝数进行精确定量。
8、rMS-qPCR和MDV-qPCR在免疫攻毒的SPF鸡体内定量检测应用
将24只1日龄SPF白色来亨鸡随机分成6组，每组4只鸡。分组如下：第1组，rMSΔMeq株疫苗免疫组；第2组，rMSΔMeq株免疫-LCC攻毒组；第3组，rMSΔMeq株免疫-LTS攻毒组；第4组，LCC攻毒组；第5组，LTS攻毒组；第6组，空白对照组。1日龄，1-3组颈背部皮下免疫接种rMSΔMeq株，接种剂量为2000PFU；7日龄，2、4组分别腹腔接种1000PFU的MDV野毒株LCC,3、5组分别腹腔接种1000PFU的MDV野毒株LTS；6组为空白对照组。于攻毒后7天、14天、21天、28天、35天采集羽髓，提取总DNA，用本发明的两套荧光定量检测方法进行检测，并根据标准曲线对待检样本中的病毒含量进行定量。同时，用鸡的管家基因卵铁转蛋白基因(ovo)作为内参，对相应的采集样品中的细胞拷贝数进行定量PCR检测。
ovo引物探针序列(5’-3’)如下：
ovo-F:CACTGCCACTGGGCTCTGT(SEQ ID NO.7)；
ovo-R:GCAATGGCAATAAACCTCCAA(SEQ ID NO.8)；
ovo-P:FAM-AGTCTGGAGAAGTCTGTGCAGCCTCCA-TAMRA(SEQ ID NO.9)。
荧光定量体系及反应条件：
荧光定量PCR的反应体系为25ul，25ul体系里含有0.25ul Ex Taq，2.5ul 10×ExTaq缓冲液，2ul dNTP混合物(TaKaRa Biotechnology Co.，Ltd.，Dalian，China)，1ul ovo-F(10umol)，1ul ovo-R(10umol)，1uL探针(10umol)，2ul模板DNA和15.25ul无菌水。反应条件：95℃5min；95℃15s、60℃45s，40个循环；37℃5min。在60℃下检测荧光信号。
计算病毒拷贝数和细胞拷贝数(即管家基因拷贝数)的比值，得到单位细胞里的病毒拷贝数，便于对体内病毒载量的分析。
首先，应用MDV-qPCR对采集的样品中野毒株的载量进行检测，结果显示，非免疫野毒攻毒组(4、5组)的野毒株载量在鸡体内呈现逐渐上升的趋势，由最初的102-3拷贝数/106细胞数上升到106-7拷贝数/106细胞数，符合MDV野毒株在鸡体内的复制规律。免疫攻毒组(2、3组)野毒株载量显著低于相应的攻毒组，病毒滴度下降几十到100倍以上，显示rMSΔMeq显著地抑制了野毒株在鸡体内的复制。同时对rMSΔMeq疫苗免疫组的检测没有荧光信号，也显示在体内MDV-qPCR只能检测到MDV野毒株，不能检测到rMSΔMeq疫苗，检测结果见图9。
随后，应用rMS-qPCR对采集的样品中rMSΔMeq疫苗株的载量进行检测，结果显示，rMSΔMeq疫苗在体内的病毒滴度在14天到达较高值(106拷贝/106细胞数)，随着时间的推移，至免疫28日之后，疫苗在体内的滴度下降至较低水平(102-3拷贝/106细胞数)，符合一般的MD疫苗毒株在体内的复制规律。同时也发现，在整个感染进程中，野毒株对疫苗毒株的复制也有一定的干扰作用，攻毒后疫苗在体内的复制水平有所下降。另外，结果也表明rMS-qPCR只能检测到rMSΔMeq株，对攻毒组的检测没有荧光信号，证实了它检测不到MDV野毒株。检测结果见图10。
序列表
<110> 中国农业科学院哈尔滨兽医研究所（中国动物卫生与流行病学中心哈尔滨分中心）
哈尔滨维科生物技术有限公司
<120> 定量检测鸡马立克氏病毒meq基因缺失疫苗株和野毒株的荧光定量PCR试剂盒及其应用
<130> KLPI180922
<160> 9
<170> PatentIn version 3.3
<210> 1
<211> 21
<212> DNA
<213> artificial sequence
<400> 1
tccatgaagc atgtgaagag c 21
<210> 2
<211> 20
<212> DNA
<213> artificial sequence
<400> 2
agcaatgtgg agcgttaggt 20
<210> 3
<211> 23
<212> DNA
<213> artificial sequence
<400> 3
acccctaacg gtgacccttg gac 23
<210> 4
<211> 20
<212> DNA
<213> artificial sequence
<400> 4
gggagaaggc gggcagtcga 20
<210> 5
<211> 20
<212> DNA
<213> artificial sequence
<400> 5
ggaggttggg aaccggagca 20
<210> 6
<211> 28
<212> DNA
<213> artificial sequence
<400> 6
actcctccac ctccctcacc ggatgaac 28
<210> 7
<211> 19
<212> DNA
<213> artificial sequence
<400> 7
cactgccact gggctctgt 19
<210> 8
<211> 21
<212> DNA
<213> artificial sequence
<400> 8
gcaatggcaa taaacctcca a 21
<210> 9
<211> 27
<212> DNA
<213> artificial sequence
<400> 9
agtctggaga agtctgtgca gcctcca 27

Claims (9)

1.一种定量检测鸡马立克氏病毒Meq基因缺失疫苗株和野毒株的荧光定量PCR试剂盒，其特征在于，所述的试剂盒中含有两套分别用于检测鸡马立克氏病毒Meq基因缺失疫苗株和野毒株的荧光定量PCR引物和探针，其中用于检测鸡马立克氏病毒Meq基因缺失疫苗株的荧光定量PCR引物序列如SEQ ID NO.1以及SEQ ID NO.2所示，探针序列如SEQ ID NO.3所示；用于检测鸡马立克氏病毒野毒株的荧光定量PCR引物序列如SEQ ID NO.4以及SEQ IDNO.5所示，探针序列如SEQ ID NO.6所示，所述的探针的5’端标记有报告基团，3’端标记有荧光淬灭基团；所述的鸡马立克氏病毒Meq基因缺失疫苗株为rMS△Meq，保藏在中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物中心，其微生物保藏编号是：CGMCC No. 4612。
2.如权利要求1所述的试剂盒，其特征在于，所述的试剂盒中还包括用于扩增作为内参的鸡的管家基因卵铁转蛋白基因（ovo）的引物和探针。
3.如权利要求2所述的试剂盒，其特征在于，所述的用于扩增作为内参的鸡的管家基因卵铁转蛋白基因（ovo）的引物序列如SEQ ID NO.7以及SEQ ID NO.8所示，探针序列如SEQID NO.9所示，所述的探针的5’端标记有报告基团，3’端标记有荧光淬灭基团。
4.如权利要求1所述的试剂盒，其特征在于，所述的试剂盒中还包括Ex Taq DNA聚合酶，10×Ex Taq缓冲液、dNTP混合物以及阳性标准品。
5.如权利要求4所述的试剂盒，其特征在于，所述的阳性标准品包括分别含有鸡马立克氏病毒Meq基因缺失疫苗株和野毒株片段的质粒，所述的质粒是用权利要求1中所述的引物从鸡马立克氏病毒Meq基因缺失疫苗株和野毒株上分别扩增出各自的片段连接到pMD18T载体上得到的。
6.如权利要求1-5任一项所述的试剂盒，其特征在于，用于定量检测鸡马立克氏病毒Meq基因缺失疫苗株和野毒株时，按照以下步骤进行：
（1）提取待检样本的总DNA；
（2）荧光定量方法标准曲线建立
将阳性标准品质粒从109copies/μL到101copies/μL系列稀释作为模板，以权利要求1中所述的引物和探针进行荧光定量PCR扩增，用于建立标准曲线；
（3）以步骤（1）提取的总DNA为模板，以权利要求1中所述的引物和探针进行荧光定量PCR扩增；
（4）PCR反应过程中自动检测、采集荧光信号，根据标准曲线对待检样本中的病毒含量进行定量。
7.如权利要求6所述的试剂盒，其特征在于，还包括以步骤（1）提取的总DNA为模板，以权利要求2或3中所述的引物和探针进行荧光定量PCR扩增，计算病毒拷贝数和管家基因卵铁转蛋白基因拷贝数的比值，得到单位细胞里的病毒拷贝数。
8.如权利要求6所述的试剂盒，其特征在于，荧光定量PCR的反应体系为25μL，25μL体系里含有0.25μLEx Taq DNA聚合酶，2.5μL 10×Ex Taq缓冲液，2μL dNTP混合物，1μL上游引物，1μL下游引物，1μL探针，2μL模板DNA和15.25μL无菌水。
9.如权利要求6所述的试剂盒，其特征在于，荧光定量PCR的反应条件为：95℃ 5min；95℃ 15s、60℃ 45s，40个循环；37℃ 5min。
CN201811418448.XA 2018-11-26 2018-11-26 定量检测鸡马立克氏病毒Meq基因缺失疫苗株和野毒株的荧光定量PCR试剂盒及其应用 Active CN109355434B (zh)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN201811418448.XA CN109355434B (zh) 2018-11-26 2018-11-26 定量检测鸡马立克氏病毒Meq基因缺失疫苗株和野毒株的荧光定量PCR试剂盒及其应用

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN201811418448.XA CN109355434B (zh) 2018-11-26 2018-11-26 定量检测鸡马立克氏病毒Meq基因缺失疫苗株和野毒株的荧光定量PCR试剂盒及其应用

Publications (2)

Publication Number Publication Date
CN109355434A CN109355434A (zh) 2019-02-19
CN109355434B true CN109355434B (zh) 2022-04-15

Family

ID=65343024

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CN201811418448.XA Active CN109355434B (zh) 2018-11-26 2018-11-26 定量检测鸡马立克氏病毒Meq基因缺失疫苗株和野毒株的荧光定量PCR试剂盒及其应用

Country Status (1)

Country Link
CN (1) CN109355434B (zh)

Families Citing this family (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN110699469B (zh) * 2019-11-05 2022-08-09 扬州大学 一种鉴别滑液囊支原体野毒株与疫苗株ms-h的实时荧光定量pcr试剂盒
CN111733297A (zh) * 2020-08-10 2020-10-02 中国兽医药品监察所 一种马立克氏病病毒血清3型荧光定量pcr试剂盒及其应用

Citations (6)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5961982A (en) * 1985-09-06 1999-10-05 Syntro Corporation Recombinant herpesvirus of turkeys and uses thereof
CN1705755A (zh) * 2002-10-15 2005-12-07 惠氏公司 用于检测鸟类组织样品中病毒的测定方法
CN102363769A (zh) * 2011-10-12 2012-02-29 中国农业科学院哈尔滨兽医研究所 鸡马立克氏病毒Meq基因缺失疫苗株，其构建方法及应用
CN102399756A (zh) * 2011-11-28 2012-04-04 中国农业科学院哈尔滨兽医研究所 鸡马立克氏病病毒miRNA缺失疫苗株及其应用
CN102686748A (zh) * 2009-08-25 2012-09-19 惠氏有限责任公司 Mdv-1的测定方法
CN108034767A (zh) * 2018-01-03 2018-05-15 山东农业大学 鉴别血清i型马立克病毒基因缺失疫苗、传代致弱疫苗与野毒的引物、探针及试剂盒

Patent Citations (6)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5961982A (en) * 1985-09-06 1999-10-05 Syntro Corporation Recombinant herpesvirus of turkeys and uses thereof
CN1705755A (zh) * 2002-10-15 2005-12-07 惠氏公司 用于检测鸟类组织样品中病毒的测定方法
CN102686748A (zh) * 2009-08-25 2012-09-19 惠氏有限责任公司 Mdv-1的测定方法
CN102363769A (zh) * 2011-10-12 2012-02-29 中国农业科学院哈尔滨兽医研究所 鸡马立克氏病毒Meq基因缺失疫苗株，其构建方法及应用
CN102399756A (zh) * 2011-11-28 2012-04-04 中国农业科学院哈尔滨兽医研究所 鸡马立克氏病病毒miRNA缺失疫苗株及其应用
CN108034767A (zh) * 2018-01-03 2018-05-15 山东农业大学 鉴别血清i型马立克病毒基因缺失疫苗、传代致弱疫苗与野毒的引物、探针及试剂盒

Non-Patent Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
Real-time PCR for differential quantification of CVI988 vaccine virus and virulent strains of Marek"s disease virus;virusSusan J. Baigent等;《Journal of Virological Methods》;20160310;第24-26页"2. Materials and methods"部分 *
鸡马立克氏病强弱病毒株PCR鉴别检测方法在诊断中的应用评价;吕红超等;《中国预防兽医学报》;20160908;第38卷(第7期);第567-571页 *

Also Published As

Publication number Publication date
CN109355434A (zh) 2019-02-19

Similar Documents

Publication Publication Date Title
CN111172321B (zh) 鉴别非洲猪瘟感染与免疫的荧光pcr检测试剂盒
CN112646934A (zh) 一种鉴别非洲猪瘟野毒株和基因缺失株的三重荧光定量pcr检测引物及试剂盒
CN108913813B (zh) 用于鉴别DAdV-2和DAdV-3的引物组
CN110699489B (zh) 非洲猪瘟病毒cd2v基因的实时荧光pcr检测引物探针组、试剂盒及方法
CN105907890B (zh) 一种快速区分HP-PRRS疫苗GDr180株与野毒株的引物、探针及方法
CN105039585A (zh) 用于鸡传染性支气管炎病毒rt-pcr检测的引物及含有该引物的试剂盒及其检测方法
CN109355434B (zh) 定量检测鸡马立克氏病毒Meq基因缺失疫苗株和野毒株的荧光定量PCR试剂盒及其应用
CN110699485B (zh) 一种快速检测马立克氏病病毒的rpa引物对、探针、试剂盒及检测方法
CN101812539B (zh) 猪瘟病毒TaqMan-MGB荧光定量RT-PCR鉴别检测试剂盒及其生产方法
CN113564280A (zh) 一种用于检测禽腺病毒i群12个血清型的raa引物及其检测方法
CN115976285A (zh) 一种检测非洲猪瘟的四重荧光定量pcr检测试剂盒
López-Osorio et al. Molecular detection of Marek's disease virus in feather and blood samples from young laying hens in Colombia.
Thilakarathne et al. Development and application of a combined molecular and tissue culture-based approach to detect latent infectious laryngotracheitis virus (ILTV) in chickens
Chousalkar et al. LNA probe-based real-time RT-PCR for the detection of infectious bronchitis virus from the oviduct of unvaccinated and vaccinated laying hens
CN116769965A (zh) 用于鸡传染性支气管炎病毒基因分型检测的引物及其应用
CN116004925A (zh) 用于鉴别非洲猪瘟病毒野毒株和基因缺失株的三重荧光pcr引物探针组、试剂和方法
CN101875978B (zh) 一种区分马立克氏病病毒疫苗毒株与强毒株的鉴别方法
CN114592089A (zh) 一种同时检测三种圆圈病毒的三重TaqMan荧光定量PCR试剂盒
CN103361444A (zh) 利用meq基因检测鸡马立克氏病毒的试剂盒及其检测方法
CN109136409B (zh) 基于k196r基因的非洲猪瘟病毒检测试剂盒和检测方法
CN102827951A (zh) 一种基因c型鸭甲型肝炎病毒定性和定量检测方法
CN109266786B (zh) 基于e184l基因的非洲猪瘟病毒检测试剂盒和检测方法
Wu et al. Establishment and application of a PCR assay for the identification of virulent and attenuated duck plague virus DNA in cotton swabs
Shil et al. Development and validation of TaqMan real-time polymerase chain reaction assays for the quantitative and differential detection of wild-type infectious Laryngotracheitis Viruses from a glycoprotein G–deficient candidate vaccine strain
CN106319080A (zh) 一种快速鉴别猪肺炎支原体、鸡滑液支原体、猪鼻支原体的pcr检测试剂盒及其应用

Legal Events

Date Code Title Description
PB01 Publication
PB01 Publication
SE01 Entry into force of request for substantive examination
SE01 Entry into force of request for substantive examination
GR01 Patent grant
GR01 Patent grant