CN109280664A - 一种适用于eb病毒dna提取的方法及提取试剂盒 - Google Patents
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Abstract
本发明涉及一种适用于EB病毒DNA提取的方法及提取试剂盒,所述方法将血液离心分离成上清血浆、中间白细胞层和下层红细胞层,然后分别处理后再进行裂解,采用吸附柱提取并收集得到DNA溶液。本发明的有益效果:本发明通过核酸释放剂裂解细胞,释放核酸,利用硅胶膜在高盐低pH会选择性的吸附核酸,在低盐高pH时,释放核酸的特性,达到纯化核酸的目的;提取的DNA纯度更高,含量更高,且DNA的完整性较好,基本上没有降解;通过本发明的提取方法进行提取纯化得到的EB病毒DNA的定量更加全面与准确。
Description
技术领域
本发明属于生物技术领域,具体涉及一种适用于EB病毒DNA提取的方法及提取试剂盒。
背景技术
EB病毒(Epstein-Barr virus,EBV)是疱疹病毒科嗜淋巴细胞病毒属的成员,基因组为DNA。EB病毒具有在体内外专一性地感染人类及某些灵长类B细胞的生物学特性。EB病毒在口咽部上皮细胞内增殖,然后感染B淋巴细胞,这些细胞大量进入血液循环而造成全身性感染,在增殖和血液循环过程中会将EB病毒的基因组释放到续血液中,现有的针对EB病毒核酸提取的方法大多都是只提取白细胞中的核酸或血清或血浆中的核酸,或者,只单一的针对外周血中的白细胞、血清或血浆中的EB病毒的提取,导致整个EB病毒DNA拷贝数的定量存在一定的误差,导致后续的诊断存在偏差,可能会错过预防与治疗的最佳时机。
发明内容
为了解决现有技术存在的问题,本发明提供了一种适用于EB病毒DNA提取的方法及提取试剂盒,本方法通过对血液中白细胞、血清或血浆中游离的DNA进行提取纯化,使EB病毒核酸定量更全面、更准确。
本发明的目的是提供一种适用于EB病毒DNA提取的方法。
本发明的再一目的是提供上述适用于EB病毒DNA提取的方法所用的试剂盒。
根据本发明的具体实施方式的适用于EB病毒DNA提取的方法,所述方法包括以下步骤:
(1)样品前处理:抽取2ml血液样品,注入到抗凝管中,立即颠倒混匀;离心后分离上清液得到上清血浆和下层物质,向所述上清血浆中加入裂解液Ⅰ和Proteinase K,混合均匀后温育消化,形成上清待提取液;向所述下层物质中加入红细胞裂解液,静置裂解后离心分离,弃去上清,然后用PBS洗去红色沉淀,剩余的白色沉淀用裂解液Ⅰ悬浮,温育消化,形成沉淀待提取液;
(2)裂解:将步骤(1)得到的所述上清待提取液和所述沉淀待提取液混合后加入裂解液Ⅱ,震荡混匀后离心,取上清液加入异丙醇,混合均匀,转移到已装入收集管的吸附柱中,吸附并离心后,取出所述吸附柱,倒掉所述收集管中的废液,并将所述吸附柱放回所述收集管中;
(3)DNA溶液收集:用洗涤液对步骤(2)所述收集管中的吸附柱进行洗涤,离心后弃去废液;再用无水乙醇进行洗涤,离心后弃去废液;将所述吸附柱进行继续离心后弃去废液,然后晾干;最后在吸附柱中间部位加入洗脱液或灭菌水室温孵育,离心后收集DNA溶液即可。
根据本发明的具体实施方式的适用于EB病毒DNA提取的方法,其中,+步骤(1)中,所述血液样品经4500rpm离心5分钟后,分离上清液得到上清血浆和下层物质;所述裂解液Ⅰ的添加量为160ul/200ul所述上清血浆;所述Proteinase K的添加量为20ul/200ul所述上清血浆;所述Proteinase K的浓度为20mg/ml。
根据本发明的具体实施方式的适用于EB病毒DNA提取的方法,其中,步骤(1)中,向所述上清血浆中加入裂解液Ⅰ和Proteinase K,混合均匀后60℃温育消化30分钟,消化完成后形成上清待提取液;向所述下层物质中加入等体积的红细胞裂解液,静置裂解30分钟后,1600rpm离心1分钟后分离,弃去上清;剩余的白色沉淀用裂解液Ⅰ悬浮,60℃温育消化30分钟,形成沉淀待提取液。可以用PBS洗涤数次,直至红色沉淀去除干净。温育消化时可以颠倒2-3次,使混匀并充分消化。
根据本发明的具体实施方式的适用于EB病毒DNA提取的方法,其中,步骤(1)中,所述红细胞裂解液含0.155M氯化铵,0.1mM EDTA和10mM碳酸氢钾。
根据本发明的具体实施方式的适用于EB病毒DNA提取的方法,其中,步骤(1)中,裂解液Ⅰ中含50mM Tris-HCl,50mM EDTA,20mM NaCl,1%vol SDS和200μg/mL Proteinase K。裂解液Ⅰ中的SDS能裂解细胞膜,并使蛋白质变性。
根据本发明的具体实施方式的适用于EB病毒DNA提取的方法,其中,步骤(2)中,将所述上清待提取液和所述沉淀待提取液混合后加入等体积的裂解液Ⅱ,震荡混匀后12000rpm离心5min,取上清液加入等体积的异丙醇。
根据本发明的具体实施方式的适用于EB病毒DNA提取的方法,其中,步骤(2)中,所述裂解液Ⅱ中含酚50%vol和50%vol氯仿和异戊醇,所述氯仿和异戊醇的体积比为24:1。
根据本发明的具体实施方式的适用于EB病毒DNA提取的方法,其中,步骤(3)中,向吸附柱中加入500ul的洗涤液,12000rpm离心1分钟后弃去废液,可重复上述操作进行多次洗涤;再向吸附柱中加入750ul的无水乙醇,12000rpm离心1分钟,弃去废液,12000rpm离心2分钟;在吸附柱中间部位加入20-50ul的洗脱液或灭菌水,室温孵育2-5分钟,12000rpm离心1分钟,收集DNA溶液,-20℃保存即可。
根据本发明的具体实施方式的适用于EB病毒DNA提取的方法,其中,步骤(3)中,所述洗涤液为80%的乙醇溶液;所述洗脱液为洗脱液为TE缓冲液,TE缓冲液中含10mM Tris-HCl及1mM EDTA,溶液pH为8.0。
根据本发明的具体实施方式的基因组DNA提取试剂盒,所述试剂盒包括:成分为裂解液Ⅰ的A液,成分为裂解液Ⅱ的B液,成分为洗脱液的C液,成分为洗脱液的D液,成分为红细胞裂解液的E液,以及成分为Proteinase K的F液,以及DNA吸附柱为成分F。DNA吸附柱为硅胶柱,本发明利用硅胶膜(即硅胶柱中的膜)在高盐低pH会选择性的吸附核酸,在低盐高pH时,释放核酸的特性,达到纯化核酸的目的。
与现有的DNA提取方法相比,本发明具有如下有益效果:
(1)本发明是在现有经典的DNA提取方法的基础上,通过核酸释放剂裂解细胞,释放核酸,利用硅胶膜在高盐低pH会选择性的吸附核酸,在低盐高pH时,释放核酸的特性,达到纯化核酸的目的。
(2)本发明将血液离心分离成上清血浆、中间白细胞层和下层红细胞层,然后分别处理后再进行裂解,采用吸附柱提取并收集得到DNA溶液。采用本发明的提取方法及本发明的试剂盒提取的DNA纯度更高,含量更高,且DNA的完整性较好,基本上没有降解;
(3)现有的针对EB病毒核酸提取的试剂盒大多都是只提取白细胞中的DNA,导致整个EB病毒DNA拷贝数的定量存在一定的误差,通过本发明的提取方法进行提取纯化得到的EB病毒DNA的定量更加全面与准确。
具体实施方式
为使本发明的目的、技术方案和优点更加清楚,下面将对本发明的技术方案进行详细的描述。显然,所描述的实施例仅仅是本发明一部分实施例,而不是全部的实施例。基于本发明中的实施例,本领域普通技术人员在没有做出创造性劳动的前提下所得到的所有其它实施方式,都属于本发明所保护的范围。
本实施例中的DNA提取试剂盒采用的试剂如无特殊说明,均为实验室内自配,具体如下:
本发明的试剂盒中的试剂如表1:
表1试剂盒中的试剂
其中,各试剂的具体配置方法及所有试剂如下:
1、红细胞裂解液:将所有试剂混合均匀后高压或滤膜除菌,红细胞裂解液所用试剂如表2:
表2红细胞裂解液所用试剂
2、裂解液Ⅰ:将所有试剂混合均匀后高压或滤膜除菌,裂解液Ⅰ所用试剂如表3:
表3裂解液Ⅰ所用试剂
3、裂解液Ⅱ:将所有试剂混合均匀后高压或滤膜除菌,裂解液Ⅱ所用试剂如表4:
表4裂解液Ⅱ所用试剂
4、洗脱液:将所有试剂混合均匀后高压或滤膜除菌,洗脱液所用试剂如表5:
表5洗脱液所用试剂
5、洗涤液:将所有试剂混合均匀后高压或滤膜除菌,洗涤液所用试剂如表6:
表6洗涤液所用试剂
实施例1
本实施例提供了一种适用于EB病毒DNA提取的方法,所述方法包括以下步骤:
(1)样品前处理:抽取2ml血液样品,注入到抗凝管中,立即颠倒混匀;离心后分离上清液得到上清血浆和下层物质,向所述上清血浆中加入裂解液Ⅰ和Proteinase K,混合均匀后温育消化,形成上清待提取液;向所述下层物质中加入红细胞裂解液,静置裂解后离心分离,弃去上清,然后用PBS洗去红色沉淀,剩余的白色沉淀用裂解液Ⅰ悬浮,温育消化,形成沉淀待提取液;
(2)裂解:将步骤(1)得到的所述上清待提取液和所述沉淀待提取液混合后加入裂解液Ⅱ,震荡混匀后离心,取上清液加入异丙醇,混合均匀,转移到已装入收集管的硅胶吸附柱中,吸附并离心后,取出所述吸附柱,倒掉所述收集管中的废液,并将所述吸附柱放回所述收集管中;
(3)DNA溶液收集:用洗涤液对步骤(2)所述收集管中的吸附柱进行洗涤,离心后弃去废液;再用无水乙醇进行洗涤,离心后弃去废液;将所述吸附柱进行继续离心后弃去废液,然后晾干;最后在吸附柱中间部位加入灭菌水室温孵育5分钟,离心后收集DNA溶液即可。DNA吸附柱为硅胶柱,本发明利用硅胶膜(即硅胶柱中的膜)在高盐低pH会选择性的吸附核酸,在低盐高pH时,释放核酸的特性,达到纯化核酸的目的。
实施例2
本实施例提供了一种适用于EB病毒DNA提取的方法,所述方法包括以下步骤:
(1)样品前处理:抽取2ml血液样品,注入到抗凝管中,立即颠倒混匀;经4500rpm离心5分钟后,分离上清液得到上清血浆和下层物质,向所述上清血浆中加入160ul/200ul的裂解液Ⅰ和20mg/ml的Proteinase K,混合均匀后60℃温育消化30分钟,形成上清待提取液;向所述下层物质中加入红细胞裂解液,静置裂解30分钟后1600rpm离心1分钟后分离,弃去上清,然后用PBS洗去红色沉淀,剩余的白色沉淀用裂解液Ⅰ悬浮,60℃温育消化30分钟,形成沉淀待提取液;
(2)裂解:将步骤(1)得到的所述上清待提取液和所述沉淀待提取液混合后加入等体积裂解液Ⅱ,震荡混匀后离心,取上清液加入等体积异丙醇,混合均匀,转移到已装入收集管的吸附柱中,吸附并离心后,取出所述吸附柱,倒掉所述收集管中的废液,并将所述吸附柱放回所述收集管中;
(3)DNA溶液收集:用500ul洗涤液对步骤(2)所述收集管中的吸附柱进行洗涤,12000rpm离心1分钟后弃去废液;再用750ul无水乙醇进行洗涤,12000rpm离心1分钟后弃去废液;将所述吸附柱进行继续12000rpm离心2分钟后弃去废液,然后晾干;最后在吸附柱中间部位加入洗脱液室温孵育2分钟,12000rpm离心1分钟后收集DNA溶液即可。
实施例3
本实施例提供了一种适用于EB病毒DNA提取的方法,所述方法包括两步(样本前处理和DNA提取):
样本前处理
①用无菌注射器抽取受检者的血液2ml,注入到抗凝管中,立即轻轻颠倒混匀;
②室温下4500g,离心5分钟,取上清血浆到新的1.5ml离心管中,记为A管;
③向A管中加入160ul/200ul血浆的裂解液Ⅰ,另加入20ul Proteinase K(20mg/ml)/200ul血浆;
④60℃温育消化30分钟,期间颠倒混匀2~3次以充分消化;
⑤剩余部分的血细胞和白细胞转入到另一1.5ml离心管中,记为B管;
⑥向B管中加入等体积的红细胞裂解液,室温静置裂解30分钟;
⑦1600g离心1分钟,弃上清,用1×PBS洗涤三次,直至红色沉淀去除干净;
⑧将离心管底部的白色沉淀用裂解液Ⅰ悬浮,60℃温育消化30分钟,期间颠倒混匀3次以充分消化;
DNA提取
①向上述的消化后的溶液中加入等体积的裂解液Ⅱ,震荡至彻底混匀。
②12000rpm离心5min,转移上清溶液至新的1.5ml离心管中,加入等体积的异丙醇;
③将上一步得到的溶液,转移到已装入收集管的硅胶吸附柱中,可分多次转移。12000rpm,离心1分钟,倒掉滤液,将吸附柱重新放回收集管中。
④向吸附柱中加入500ul的洗涤液,12000rpm离心1分钟;
⑤重复上述操作一次;
⑥向吸附柱中加入750ul的无水乙醇,12000rpm离心1分钟;
⑦倒弃废液,将吸附柱装回收集管中,12000rpm离心2分钟,
⑧将吸附柱转移到新的1.5ml离心管中,室温打开盖子数分钟,以彻底晾干;
⑨在吸附柱中间部位加入20~50ul的洗脱液,室温孵育5分钟,12000rpm离心1分钟,收集DNA溶液,-20℃保存。
发明人采用市售的试剂盒(其中包括裂解液、DNA提取液、分离柱、洗涤液、洗脱液)提取的DNA溶液与实施例3得到的DNA溶液进行比较,采用与实施例3等体积的2ml样品,相同的洗脱液,制得DNA溶液进行1%的琼脂糖凝胶电泳检测,结果如图1所示。图1中,泳道1为采用市售的试剂盒得到的DNA溶液样品,泳道2为本发明实施例3得到的DNA溶液样品。从图1中可以看出,泳道2更加清晰且明亮。
采用紫外分光光度计检测,(具体采用采用微量分光光度仪Nano-300进行DNA浓度检测)市售的试剂盒提取的DNA溶液:A260/A280=1.86,A260/A230=1.5,浓度为315ng/ul;采用本发明的提取方法及使用本发明试剂盒提取的DNA溶液:A260/A280=1.75,A260/A230=1.53,浓度为525ng/ul,可知,采用本发明的提取方法及使用本发明试剂盒提取的DNA浓度较高。
以上所述,仅为本发明的具体实施方式,但本发明的保护范围并不局限于此,任何熟悉本技术领域的技术人员在本发明揭露的技术范围内,可轻易想到变化或替换,都应涵盖在本发明的保护范围之内。因此,本发明的保护范围应以所述权利要求的保护范围为准。
Claims (10)
1.一种适用于EB病毒DNA提取的方法,其特征在于,所述方法包括以下步骤:
(1)样品前处理:抽取2ml血液样品,注入到抗凝管中,立即颠倒混匀;离心后分离上清液得到上清血浆和下层物质,向所述上清血浆中加入裂解液Ⅰ和Proteinase K,混合均匀后温育消化,形成上清待提取液;向所述下层物质中加入红细胞裂解液,静置裂解后离心分离,弃去上清,然后用PBS洗去红色沉淀,剩余的白色沉淀用裂解液Ⅰ悬浮,温育消化,形成沉淀待提取液;
(2)裂解:将步骤(1)得到的所述上清待提取液和所述沉淀待提取液混合后加入裂解液Ⅱ,震荡混匀后离心,取上清液加入异丙醇,混合均匀,转移到已装入收集管的吸附柱中,吸附并离心后,取出所述吸附柱,倒掉所述收集管中的废液,并将所述吸附柱放回所述收集管中;
(3)DNA溶液收集:用洗涤液对步骤(2)所述收集管中的吸附柱进行洗涤,离心后弃去废液;再用无水乙醇进行洗涤,离心后弃去废液;将所述吸附柱进行继续离心后弃去废液,然后晾干;最后在吸附柱中间部位加入洗脱液或灭菌水室温孵育,离心后收集DNA溶液即可。
2.根据权利要求1所述的适用于EB病毒DNA提取的方法,其特征在于,步骤(1)中,所述血液样品经4500rpm离心5分钟后,分离上清液得到上清血浆和下层物质,;所述裂解液Ⅰ的添加量为160ul/200ul所述上清血浆;所述Proteinase K的添加量为20ul/200ul所述上清血浆;所述Proteinase K的浓度为20mg/ml。
3.根据权利要求1所述的适用于EB病毒DNA提取的方法,其特征在于,步骤(1)中,向所述上清血浆中加入裂解液Ⅰ和Proteinase K,混合均匀后60℃温育消化30分钟,消化完成后形成上清待提取液;向所述下层物质中加入等体积的红细胞裂解液,静置裂解30分钟后,1600rpm离心1分钟后分离,弃去上清;剩余的白色沉淀用裂解液Ⅰ悬浮,60℃温育消化30分钟,形成沉淀待提取液。
4.根据权利要求1所述的适用于EB病毒DNA提取的方法,其特征在于,步骤(1)中,所述红细胞裂解液含0.155M氯化铵,0.1mM EDTA和10mM碳酸氢钾。
5.根据权利要求1所述的适用于EB病毒DNA提取的方法,其特征在于,步骤(1)中,裂解液Ⅰ中含50mM Tris-HCl,50mM EDTA,20mM NaCl,1%vol SDS和200μg/mL Proteinase K。
6.根据权利要求1所述的适用于EB病毒DNA提取的方法,其特征在于,步骤(2)中,将所述上清待提取液和所述沉淀待提取液混合后加入等体积的裂解液Ⅱ,震荡混匀后12000rpm离心5min,取上清液加入等体积的异丙醇。
7.根据权利要求1所述的适用于EB病毒DNA提取的方法,其特征在于,步骤(2)中,所述裂解液Ⅱ中含酚50%vol和50%vol氯仿和异戊醇,所述氯仿和异戊醇的体积比为24:1。
8.根据权利要求1所述的适用于EB病毒DNA提取的方法,其特征在于,步骤(3)中,向吸附柱中加入500ul的洗涤液,12000rpm离心1分钟后弃去废液;再向吸附柱中加入750ul的无水乙醇,12000rpm离心1分钟,弃去废液,12000rpm离心2分钟;在吸附柱中间部位加入20-50ul的洗脱液或灭菌水,室温孵育2-5分钟,12000rpm离心1分钟,收集DNA溶液,-20℃保存即可。
9.根据权利要求1所述的适用于EB病毒DNA提取的方法,其特征在于,步骤(3)中,所述洗涤液为80%的乙醇溶液;所述洗脱液为洗脱液为TE缓冲液,TE缓冲液中含10mM Tris-HCl及1mM EDTA,溶液pH为8.0。
10.一种基因组DNA提取试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括:成分为裂解液Ⅰ的A液,成分为裂解液Ⅱ的B液,成分为洗脱液的C液,成分为洗脱液的D液,成分为红细胞裂解液的E液,以及成分为Proteinase K的F液。
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---|---|---|---|
PB01 | Publication | ||
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SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
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RJ01 | Rejection of invention patent application after publication |
Application publication date: 20190129 |
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