CN109136099A - 一种菰黑粉菌单倍体菌株UeTSP及其应用 - Google Patents

一种菰黑粉菌单倍体菌株UeTSP及其应用 Download PDF

Info

Publication number
CN109136099A
CN109136099A CN201810827330.6A CN201810827330A CN109136099A CN 109136099 A CN109136099 A CN 109136099A CN 201810827330 A CN201810827330 A CN 201810827330A CN 109136099 A CN109136099 A CN 109136099A
Authority
CN
China
Prior art keywords
wild rice
uetsp
haploid strains
seq
nucleotide sequence
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Granted
Application number
CN201810827330.6A
Other languages
English (en)
Other versions
CN109136099B (zh
Inventor
张雅芬
叶子弘
于金梦
夏文强
俞晓平
崔海峰
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
China Jiliang University
Original Assignee
China Jiliang University
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by China Jiliang University filed Critical China Jiliang University
Priority to CN201810827330.6A priority Critical patent/CN109136099B/zh
Publication of CN109136099A publication Critical patent/CN109136099A/zh
Application granted granted Critical
Publication of CN109136099B publication Critical patent/CN109136099B/zh
Active legal-status Critical Current
Anticipated expiration legal-status Critical

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N1/00Microorganisms, e.g. protozoa; Compositions thereof; Processes of propagating, maintaining or preserving microorganisms or compositions thereof; Processes of preparing or isolating a composition containing a microorganism; Culture media therefor
    • C12N1/14Fungi; Culture media therefor
    • C12N1/145Fungal isolates
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12RINDEXING SCHEME ASSOCIATED WITH SUBCLASSES C12C - C12Q, RELATING TO MICROORGANISMS
    • C12R2001/00Microorganisms ; Processes using microorganisms
    • C12R2001/645Fungi ; Processes using fungi
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A01AGRICULTURE; FORESTRY; ANIMAL HUSBANDRY; HUNTING; TRAPPING; FISHING
    • A01GHORTICULTURE; CULTIVATION OF VEGETABLES, FLOWERS, RICE, FRUIT, VINES, HOPS OR SEAWEED; FORESTRY; WATERING
    • A01G22/00Cultivation of specific crops or plants not otherwise provided for
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A01AGRICULTURE; FORESTRY; ANIMAL HUSBANDRY; HUNTING; TRAPPING; FISHING
    • A01GHORTICULTURE; CULTIVATION OF VEGETABLES, FLOWERS, RICE, FRUIT, VINES, HOPS OR SEAWEED; FORESTRY; WATERING
    • A01G7/00Botany in general
    • A01G7/06Treatment of growing trees or plants, e.g. for preventing decay of wood, for tingeing flowers or wood, for prolonging the life of plants

Landscapes

  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Botany (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Environmental Sciences (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Mycology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Forests & Forestry (AREA)
  • Ecology (AREA)
  • Biodiversity & Conservation Biology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Virology (AREA)
  • Tropical Medicine & Parasitology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)

Abstract

一种菰黑粉菌单倍体菌株UeTSP及其应用,属于生物技术领域。本发明一方面提供了一种新的菰黑粉菌单倍体菌株UeTSP,另一方面提供了菰黑粉菌单倍体菌株UeTSP在孕茭中的用途。本发明的有益效果:本发明的菰黑粉菌(Ustilago esculenta)单倍体菌株UeTSP能够直接侵染茭白植株,使茭白孕茭,而不产生冬孢子,即不形成灰角这种不利的表型,为茭白人工孕茭提供了一种新思路。

Description

一种菰黑粉菌单倍体菌株UeTSP及其应用
技术领域
本发明属于生物技术领域,具体涉及一种菰黑粉菌单倍体菌株UeTSP及其应用。
背景技术
菰黑粉菌(Ustilago esculenta)是一种独特的病原真菌,其侵染茭白植株(Zizania latifolia)后可抑制植株抽穗开花并刺激茎基部膨大形成可食用的茭白。在东亚及东南亚地区尤其是中国,茭白是一种营养很高的水生蔬菜,也是一种重要的药材。但是田间常出现充满冬孢子的灰茭和少量冬孢子形成的芝麻茭,误食后易形成肺炎,不利于茭白产业的发展。鉴于人工育种技术的成功开发,如何控制茭白中菰黑粉菌冬孢子的形成将是茭白人工育种的一大关键。
前期研究发现,菰黑粉菌与其他二型态真菌类似,存在酵母型和菌丝型两种型态,而由酵母型向菌丝型转换是此类真菌致病性的关键。在菰黑粉菌中,其二型态转换受到ab基因的调控,需要两个性亲和单倍体融合形成双核菌丝,在侵染过程中受环境因子影响菌丝内两个细胞核核融形成一个二倍体的核从而产生二倍体的冬孢子。
申请人在长期研究过程中发现自龙茭2号灰茭中分离得到单倍体菌株UET1(交配基因型为a1b1,该菌株在CN105838616 A的发明专利中已经公开,保藏号为CGMCCNo.11843)和UET2(交配基因型为:a2b2,该菌株在CN105838615A的发明专利中已经公开,保藏号为:CGMCC No.11844)。当UET1与UET2两个性亲和菰黑粉菌共培养时,体外培养的菌落从酵母型向菌丝型转变,菌落生长气生菌丝,菌丝可以侵染茭白,使茭白孕茭,但是容易产生灰茭。由于上述情况的出现,对人工孕茭带来不必要的麻烦。
发明内容
针对现有技术存在的问题,本发明的目的在于设计提供一种菰黑粉菌单倍体菌株UeTSP及其应用的技术方案。
本发明提供了一种菰黑粉菌(Ustilago esculenta)单倍体菌株UeTSP,该菌株于2018年06月11日在中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物中心保藏,保藏号为CGMCCNo.15929。保藏单位地址为:北京市朝阳区北辰西路1号院3号。
本发明还提供了一种菰黑粉菌(Ustilago esculenta)单倍体菌株UeTSP的应用,该菰黑粉菌(Ustilago esculenta)单倍体菌株UeTSP能够侵染茭白植株使茭白正常孕茭。
本发明还提供了一种菰黑粉菌单倍体菌株UeTSP的获得方法,其特征在于包括以下步骤:
1)获得UET1菌株基因组DNA;
2)以UET1菌株基因组DNA为模板,以mfa1.2F和mfa1.2R,bE1F和bE1R为引物进行PCR,获得mfa1.2bE1基因序列,所述的mfa1.2F的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示,mfa1.2R的核苷酸序列如SEQ ID No.2所示,bE1F的核苷酸序列如SEQ ID No.3所示,bE1R的核苷酸序列如SEQ ID No.4所示;
3)用mfa1.2F和bE1R引物,以mfa1.2bE1基因序列为模板,进行融合PCR,将mfa1.2bE1基因连接成一个长片段;
4)将融合PCR产物和pUMa932质粒经限制性内切酶ECORⅤ和HindⅢ双酶切2h后的产物,连接后转化到大肠杆菌DH5α感受态细胞中,挑取单克隆培养后提取重组质粒,测序确认后获得重组质粒mfa1.2-bE1-amp-cbx;
5)使用限制性内切酶PvuⅠ线性化重组质粒mfa1.2-bE1-amp-cbx,利用PEG介导的转化将线性化的片段转入UET2原生质体中,涂布于含50μg/mL萎锈灵的双层再生培养基上,28℃培养4-5天,随后挑取转化子至含有萎锈灵的YEPS固体培养基上,然后挑取单菌落扩大培养,观察菌落是否有菌丝生长,获得UeTSP菌株。
本发明的有益效果:本发明的菰黑粉菌(Ustilago esculenta)单倍体菌株UeTSP能够直接侵染茭白植株,使茭白孕茭,而不产生冬孢子,即不形成灰角这种不利的表型,为茭白人工孕茭提供了一种新思路。
附图说明
图1为pUMa932质粒图谱;
图2为pUMa932质粒经双酶切图;
图3为mfa1.2bE1基因电泳扩增图;
图4为mfa1.2bE1基因融合PCR结果图;
图5为转化子菌液PCR结果;
图6为质粒载体经PvuⅠ酶切图;
图7为构建的UeTSP菌株在YEPS平板上活化,观察12、24、36、48小时的菌(下)及菌落(上)形态显微观察图;
图8为茭白经UeTSP菌株侵染后共聚焦观察图(左图叶鞘,右图茎部)。
具体实施方式
以下结合实施例来进一步说明本发明。
实例1:菰黑粉菌 UET1菌株中基因组DNA的提取
1、提前半小时在65℃水浴锅内水浴加热CTAB提取液。
2、用枪头取UET14菌体(厚度约5mm)于2.0mL离心管中,加入10颗左右不锈钢钢珠(直径1mm),标记。通风橱内,加入800ul预热的CTAB提取液。震荡仪70Hz,震荡150s,破碎菌体。
3、65℃水浴1h。
4、加入等体积的酚:氯仿:异戊醇(25:24:1),混匀。
5、通风橱内,室温静置15min。室温,10000rpm离心10min。此时离心管内出现分层现象,上清中含有核酸,中间是蛋白层,底部为钢珠和杂质。小心吸取上清液至新的1.5mL离心管中(可一直重复4、5步,直至肉眼不可见中间蛋白层)。
8、向上清中加入等体积的异丙醇,温和地颠倒混匀,可直接离心或静置5-10min后离心。
9、预冷离心机至4℃,然后4℃,10000rpm离心10min。
10、倒上清,加1mL的75%乙醇,轻轻颠倒洗涤DNA。4℃,10000rpm离心5min,弃上清。
11、弃去上清后,可置于37℃烘箱中或倒扣在纸巾上5-10min进行干燥 ,亦可采用其他干燥方式。若底部有残留乙醇也无碍。
12、加入30ul无菌水溶解DNA,50℃水浴20min,去除挥发物。-20℃保存。
实例2:mfa1.2基因的克隆
以实例1中获得的UET1菌株中基因组DNA为模板,根据设计的mfa1.2F和mfa1.2R引物,克隆mfa1.2基因。mfa1.2F的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示,mfa1.2R的核苷酸序列如SEQID No.2所示。
PCR扩增体系:(50 ul)
10×PCR buffer (takara) 5ul
dNTP mix (takara) 4ul
mfa1.2F 1ul
mfa1.2R 1ul
LATaq (takara) 0.5ul
dd H2O 37.5ul
UET1 DNA 1ul
PCR反应条件如下:
1%琼脂糖凝胶电泳检测PCR产物。切胶后用Magen凝胶DNA微量回收试剂盒回收产物。置于﹣20℃冰箱备用。
实例3:bE1基因的克隆
以实例1中获得的UET1UET1菌株中基因组DNA为模板,根据设计的bE1F和bE1R引物进行PCR,克隆bE1基因。bE1F的核苷酸序列如SEQ ID No.3所示,bE1R的核苷酸序列如SEQ IDNo.4所示。
PCR扩增体系:(50 ul)
10×PCR buffer (takara) 5ul
dNTP mix (takara) 4ul
bE1F 1ul
bE1R 1ul
LATaq (takara) 0.5ul
dd H2O 37.5ul
UET1UET1 DNA 1 ul
PCR反应条件如下:
1%琼脂糖凝胶电泳检测PCR产物。切胶后用Magen凝胶DNA微量回收试剂盒回收产物。置于﹣20℃冰箱备用。
mfa1.2bE1基因电泳扩增图如图3所示。mfa1.2的核苷酸序列如SEQ ID No.5所示,bE1的核苷酸序列如SEQ ID No.6所示。
实例4:pUMa932质粒线性化
酶切体系(30 ul)
pUMa932质粒DNA 4 ul
HindⅢ HF(neb) 1 ul
ECORⅤHF(neb) 1 ul
1x Qcut Buffer 3 ul
dd H2O 21 ul
在37℃下,酶切2h。
1%琼脂糖凝胶电泳检测PCR产物。切胶后用Magen凝胶DNA微量回收试剂盒回收。置于﹣20℃冰箱备用。pUMa932质粒图谱如图1所示。pUMa932质粒经双酶切如图2所示,使用ECORⅤ和HindⅢ将pUMa932质粒进行双酶切,得到两个片段,片段长度在4000左右的为我们需要的片段,进行割胶回收,得到目的片段。
实例5:融合PCR
一轮 25 ul体系
10×PCR buffer (takara) 2.5ul
dNTP mix (takara) 2ul
LATaq (takara) 0.25ul
Mfa片段 2ul
bE1片段 2ul
dd H2O 16.25 ul
PCR反应条件如下:
二轮 50 ul体系
10×PCR buffer (takara) 5ul
dNTP mix (takara) 4ul
LATaq (takara) 0.5ul
mfa1.2F 2ul
bE1R 2ul
一轮产物 3ul
dd H2O 33.5 ul
PCR反应条件如下:
1%琼脂糖凝胶电泳检测PCR产物。切胶后用试剂盒回收。
mfa1.2bE1基因融合PCR结果如图4所示。
实例6:融合PCR产物与双酶切开的pUMa932载体连接
为完成此步骤,使用南京诺维赞生物科技有限公司生产的ClonExpress II One StepCloning Kit重组克隆试剂盒。具体步骤如下所示:
1)于冰上配制以下反应体系:
组分(20 ul)
pUMa932线性化载体 1.5ul
mfa1.2- bE1融合片段 1.5ul
5×CEⅡ buffer 4ul
ExnaseⅡ 2ul
dd H2O 11ul
(注:ClonExpress® II 重组反应体系最适克隆载体使用量为0.03 pmol, 最适插入片段使用量为0.06 pmol(载体与插入片段摩尔比为1 : 2)。这些摩尔数对应的DNA质量可由以下公式粗略计算获得:最适克隆载体使用量 = [0.02 × 克隆载体碱基对数]ng(0.03 pmol)最适插入片段使用量 = [0.04 × 插入片段碱基对数]ng (0.06 pmol))。
2)使用移液器轻轻吹打混匀,(请勿震荡混匀),短暂离心反应液收集至管底。
3)37℃反应30min;降至4℃或立即置于冰上冷却。
实例7:重组产物转化
1)于- 80℃冰箱取出大肠杆菌感受态细胞(100μL),冰上放置溶解,做好标记;
2)加入10 μL连接产物,小心吹打混匀,冰上放置20 ~30 min;(备注:该过程用于使连接产物充分吸附到感受态细胞表面)
3)42℃水浴热激90 s ,快速放置到冰上冷却,并保持3-5 min;
4)加入800 μL LB培养基,37 ℃,200 rpm培养1 h;
5)8000 rpm,2 min离心;
6)移除约700 μL培养基,剩余100 μL培养基吹打混匀,涂相应抗性的平板,37 ℃倒置培养10-14 h;
7)挑取单菌落,挑单菌落于2 mL离心管,离心管中加入1 mL加入抗生素的LB液体培养基,37 ℃,180 rpm培养4-8 h即可进行菌液PCR验证。
将菌液PCR条带相符的菌液送到上海桑尼测序公司进行测序。测序正确的菌液扩摇并提质粒,将其命名为重组质粒mfa1.2-bE1-amp-cbx。
实例8:重组质粒mfa1.2-bE1-amp-cbx的酶切
重组质粒mfa1.2-bE1-amp-cbx 4ul
PVUⅠHF(neb) 1ul
1x Qcut Buffer 3ul
dd H2O 22ul
在37℃下,酶切2h。
1%琼脂糖凝胶电泳检测PCR产物。用Magen凝胶DNA微量回收试剂盒回收产物。置于﹣20℃冰箱备用。
质粒载体经PvuⅠ酶切后结构如图6所示。
实例9:UET2原生质体的制备
1、菌株培养:
从平板上挑UET2单菌落接种到15-20mL YEPS液体培养基中,28℃,180 rpm摇床振荡预培养至OD600为0.8-1.5之间(约24 h)。
将小摇的菌液5 mL接种到新的50 mL YEPS液体培养基中继续培养至OD600为0.6~0.8,(6~8 h),最长时间不超过12 h。
2、原生质体制备
(1)取少许培养好的菰黑粉菌置于载玻片上在显微镜下观察,确认无污染;
(2)将50 mL菌液收集到50 mL的无菌管中,常温3000rpm,离心5 min,弃上清;
(3)将菌体重悬于25 mL SCS中,常温3000 rpm,离心5min,弃上清;
(4)加入配制好的2mL SCS/lywallzyme重悬菌体(轻柔吹打,避免产生过多气泡);
(5)室温(25℃左右)水平慢速摇床(50 rpm以下)上酶解(MT型约40~50 min),每隔约10分钟取样观察,最终时间以酶解效果为准,原生质体产生量约为50%,几乎所有细胞开始产生原生质体时进行下一步;
(6)在菌液中加10 mL预冷的SCS,4℃,2400 rpm,离心10 min,弃上清;
(7)再次加10 mL预冷的SCS,4℃,2400 rpm,离心10 min,弃上清;
(8)再次加10 mL预冷的SCS,4℃,2400 rpm,离心10 min,弃上清;
(9)将细胞重悬于10 mL预冷的STC中,4℃,2400 rpm,离心10 min,弃上清;
(10)将细胞重悬于500 μL预冷的STC(蔗糖)中,冰上放置,分装到提前在-80℃冰箱中预冷的1.5 mL离心管中,每管50 μL,置于-80℃冰箱中保存。
实例10:UET2原生质体转化
1、取两瓶Regenerations-Agar(蔗糖)微波加热至融化,冷却至60℃后取其中一瓶培养基加入萎锈灵(10 mg/mL)使萎锈灵终浓度为50μg/mL后倒平板,每个平皿上倒约10 mL培养基(可略厚),另一瓶暂时放置在60℃烘箱中保温;
2、取原生质体冰上放置10 min;
3、各原生质体中分别加入1 μL Heparin;
4、每管加入总量为1~5 μg的实例8准备好的DNA(体积不允许超过10 μL)
轻轻吹打两三下混匀,冰浴10 min。在此期间,自烘箱中取出未加抗生素的100ml的Regenerations-Agar培养基,在已凝固的含萎锈灵的Regenerations-Agar平板上再倒一层培养基,每个平板倒约10 mL培养基(可略薄),制成再生平板;
5、每管原生质体中加入500 μL STC-PEG(蔗糖),轻轻颠倒两下混匀后冰上放置15min;
6、将冰上放置15 min后的原生质体全部加入到相应抗性的再生平板上,颠倒涂板;
7、将涂好的平板正置放在28 ℃培养箱中培养3-4天等表面干燥后倒置,再培养2-5天筛选转化子。
转化子菌液PCR结果如图5所示。
实例11:转化子表型验证
将再生平板上长出的转化子,继代于YEPS加入萎锈灵(终浓度为50μg/mL)抗性的平板上扩大培养。将菌株保存,并继代于YEPS平板上,每12h观察一次表型。经观察可知,24hUeTSP菌落上开始有菌丝大量生长。将得到的新菌株UeTSP进行保藏。
该菌株的形态特征为:短杆状, 20-25微米左右,单核无隔膜,进行芽殖。将该菌株在YEPS固体培养基上活化,36h即可观察到菌落边缘有菌丝生长。
生理代谢特性为:该菌株偏好复合碳源和复合氮源作为其生长的碳氮源,对有机碳源的喜好大于无机碳源,对乳糖和半乳糖的耐受性较差,对氨基酸的喜好程度大于无机氮源。
培养方法为:可体外培养,适于在PDA或YEPS固体培养基上进行单菌落划线培养,在液体培养中培养容易降低该菌活性。另外该菌不适宜继代三次以上,不适宜7天以上的连续培养或低温放置,否则易造成活性降低或菌体降解,适宜在-80度20%甘油保藏。
繁殖方法为:芽殖。
实例12:所构建菌株侵染能力及孕茭表型验证
活化UeTSP菌株后挑取单菌落至5-10 mL YEPS液体培养基中,28℃、180 r/min培养至OD600为2.0,浓缩菌液,用YEPS液体培养基稀释至OD600为0.6-0.8。然后吸取1 mL稀释的菌液至100 mL YEPS液体培养基中,28℃ 180 r/min过夜培养至OD600大约1.0,离心收集菌体,用纯水稀释菌液至OD600为1.0。用一次性注射器的针头扎种植两周的茭白野茭幼苗茎基部并向与其相邻的管状根中注射菌液,共注射20株茭白植株幼苗进行侵染,25℃培养15d。茭白经UeTSP菌株侵染后15天共聚焦观察如图8所示。确认侵染成功后将接种后的幼苗转移到大塑料盆中,于温网室露天栽培,并于3个月后观察茭白表型。
实验结果与结论:我们以往使菰黑粉菌侵染茭白,要经历漫长的两种菌株的融合过程。而UeTSP菌株可直接侵染茭白,使茭白孕茭。且在茭白孕茭期间不会产生冬孢子,即不形成灰茭这种不利表型。这大大提高了在田间孕茭的成功率,也为茭白的人工生产提供一种更加简便快捷的途径。
序列表
<110> 中国计量大学
<120> 一种菰黑粉菌单倍体菌株UeTSP及其应用
<160> 6
<170> SIPOSequenceListing 1.0
<210> 1
<211> 41
<212> DNA
<213> 引物(primer)
<400> 1
gaactcgagc agctgaagct taactcgctt atttgacttg c 41
<210> 2
<211> 40
<212> DNA
<213> 引物(primer)
<400> 2
ctcgtgtaag tcaacctgcg gaagctgcaa gtgtagcatg 40
<210> 3
<211> 40
<212> DNA
<213> 引物(primer)
<400> 3
catgctacac ttgcagcttc cgcaggttga cttacacgag 40
<210> 4
<211> 41
<212> DNA
<213> 引物(primer)
<400> 4
gagaccggca gatctgatat cggcggaaca agagctgatg a 41
<210> 5
<211> 2155
<212> DNA
<213> 菰黑粉菌(Ustilago esculenta)
<400> 5
aactcgctta tttgacttgc ttatccttcg cctagtctga tctctgacga gatcatgctg 60
cggaaccaca gacccaaatt tcgaatgagc gcgctttcat tcggggtggc caatatagag 120
agtaacaaaa tcgagacaaa aaggacgagg actttgcagc accgcaacca agttcagtaa 180
cttgactagg cgagcaagag ccaatcaatg agattagaat tcgaaaagag gtaggggttc 240
caaccatcgg cagtggaaag ccggcgatcc gagcatcctt gcctgttttt cgaccagaat 300
agactcgggg tcgtggccaa cgagagagat cggcgattgc ctcaacaagc gatgcaatca 360
cgtccaatgg ggttgctgcc tgtttagcga aagaattggc cgatcaaaat caaagcccct 420
gagcaacgtc agtatcgagg tctcttcaca atcagcgaag agaggcaaga agagacctga 480
acttacttac caaagcaagc ttaggcgaca atacatgtgg agtagccgag aggggctcca 540
ccgccacggc cctcatcggc gggcgagggc tgggtctcgg agacggagga ctgggcgggc 600
tgagtgaaga tggagaacat tttcagaaag aagtgtgggg tgtttaaatc ggtgttcgaa 660
cgagtgtgtg aatgagagta gttgtgcttt ggatatcgac tagcttcgga tcccgctgct 720
tatatccttt tcgacgccgt ttacatgttg tggtcaggct aactagggac acagtatctc 780
tgtgttcata ggtgcgcact cctaccgtcc aggagctgga gagtgacagt tgctactgac 840
cagcactaca gaccagtcat tgagatgaac aaaggaacac gaggctagca aggctctcct 900
ttccatcctt cagtggcgag cctcccttat tttggctcgt tccctttcca attcgggact 960
tcgagtgcga aggtggcggt ctgacgtctc tgagtctttg ttgtttagtt cagtgactga 1020
aaacgtgggc accaaccata caaactggca gccagtgcct tgcgctaaga ttatcaatca 1080
gacaatctct ttcatccttc catgcagtac tgaccatcag ataaagggca ttgtgagatt 1140
tggacaaagg gcattcagcg ccattattcc aaagtggcag ggtccctttg acacaatacg 1200
gttagtcgca cagccgattg atgcattgtt tagatctccc catgcaatct tggccgcttt 1260
cccaggctgt ctctcgaaca attatcccct ttcaacgtcc tcaacccccg gttcaggttg 1320
gagattggca tacacttttc ctttattttt ccctttgtga gcgcaaaatt cgatgcaacg 1380
cgtaggctct ttgctttata ttaaaaggga cctggggtcc ctttgtcaag ttctgcagaa 1440
gccaatccgc aatcagtttc ataccaagca cggaaagaag tacaatgtac tgtacagtac 1500
ggaccgaatc agcataccct atgtcttata ttgattcgat gatatagcag aagataagaa 1560
acgcatgtct cagacacgca gtgttcaagg tgctatttga gctttgtgtc accgcacaca 1620
aaagtgacac gccctggaag caaaccacaa acgagtccaa agggctgtcg cagacgctgt 1680
tctcacaatt agcaagtaca gtgaagatgt ttacgctcac cactgttcat tactccaaag 1740
attctgcaaa ctgtgtttga taggaaagaa ttgaaacaag cgagaacgta gctttttcgc 1800
tcgaacgctg cgaatcaaac tcgtgatcgg ggctatatca aaatcgccgg cttgtgacaa 1860
gccaaagtaa cgagattaac tcgtcagatt ggaaagaaag ggctaaacta caggctgatc 1920
gacctaggaa acactcggag actcaaacgc tggactttga accctcttgt acagaactca 1980
agcctcgtgt aagtcaacct gcggacctag ctatgcggct cggaaaggtt aaatagaggg 2040
cggtacaggt cgtcctgatc tgctttccga catcacacat cacacctcac actttacaac 2100
accacctcaa aagacctctt cccctctagc tccttctgtc actaaattct tcaaa 2155
<210> 6
<211> 1903
<212> DNA
<213> 菰黑粉菌(Ustilago esculenta)
<400> 6
gaagctgcaa gtgtagcatg tgaaatgttt tcttctaccc acttcggtca cttaaacccc 60
tgtgtcattt tatcaaagct ttgagccgta aagtgtaagc cgcggtagta tcttggctgt 120
gccgatacgc acagattctc ttgcctgacc tcaagctact ccttcctcca ccatctcaac 180
agctgacact tttcatgcat atcgactagg acaacggata tcgagtgata caacgggaat 240
ttccaaaaca caaagggtag ccagaataca aagcgaaaac gaatcaacca aacgcggcgg 300
agagactgtt tgaagagaaa gtttctctcc tgattagcac cggcacctgt ccaagtgcat 360
cgtaaggagg caaatcgtgc tgcttgacgg caggctcgag ataggttgcc gtctgagcgt 420
tgtcaagcgt gtgcgcttca ggcactgaga tgcacgtgcc aggcgcagag cctcttgtat 480
tgtctgtgag acagtaaaaa tcacagaggg ctgtggtcag tgaggggaac aagtaacgtt 540
ctctgaaagg gaaggcactt acccgtggaa agggaatccg tcgacagctt ctgaacgcgt 600
ttcggcagcg ctttgacttt tcgcccgcct ttcaagttga gactcggact ctgcagcaca 660
tcgttcgggt gcgaaaaagg attgtagtac atcatcgaaa gattgctgct gagtgaattg 720
aagctcgtgt ctaccgtaga gcatgtgctg agatctggcg ttgactccat gcctgagctt 780
tctctgttgc tgtccatgga aggagtcttg ctcgcccgct gcgtggattt cctcggcttt 840
gcctgtgctg ttgtgatcat gcgtgctgga gttcgcttcg ctgctgtagg aacagctcgc 900
ccctgacttg gattgagatt cttcttgttg gcggcgacaa gatcgtgaac ccagctacct 960
attttctctt tgacgccgta cttaatccag ctgatcatac ttgcccagtc gtcttcgaaa 1020
gctttcttat cttcggccgt gagctgtcga ccaagatttt cgcgaagaac atcgtccaac 1080
ttgtgagtca gaactgatct gagaggctca gtgcggatag gaagatcgga agagaccaac 1140
ttggtttgga taagaagtct catgcgattg cgatcattgc acgcgaactt ccggaggata 1200
tgagaccagc cagagcggcg gcgcgcgttg atgaaccata aagtgagctg atggacgtta 1260
agctgtttgt tgtcggaacg ggcggcagac tcgttggtaa cttcgacaag tgcttcttta 1320
tcgtcttgag agggataagg gtcatccagg gttgcgagga aatgcttccg catgtggtat 1380
gatggtaagc tctctgagag tggattttca ccttcagtat ccgaccgaag tagctggaat 1440
acttcttttg cagaatcatc tgctatgttc ttggattgtg cctccagttg cacaagtgct 1500
tccgagacca cagtgatgct cctaaccgtt tcttgaatct ttcgacggac atcaggatcc 1560
cctttgttgc tgattgctcc ttgtcggaat gcttcttgag cccactgtag acgggaaaga 1620
atgtcagggc tctggttatt cgatagcaat gatgcctgga tctcctccag atcagtgagt 1680
agttcgagga gttgcatttt ggtgaaacct ttctctgggt tggtggcagt aagaaaaaaa 1740
tggccacggt ccttacactg gtcagattcc aaaataatgc gcgtccacaa agcagatgta 1800
agaggttggg attggcccct tccctttgtt ccatcctacc ttatcataat ttgcgctcta 1860
gtctttcgac ccattcttga ccatcatcag ctcttgttcc gcc 1903

Claims (3)

1.一种菰黑粉菌(Ustilago esculenta)单倍体菌株UeTSP,保藏号为:CGMCCNo.15929。
2.如权利要求1所述的一种菰黑粉菌单倍体菌株UeTSP在侵染茭白植株使茭白正常孕茭中的应用。
3.如权利要求1所述的一种菰黑粉菌单倍体菌株UeTSP的获得方法,其特征在于包括以下步骤:
1)获得UET1菌株基因组DNA;
2)以UET1菌株基因组DNA为模板,以mfa1.2F和mfa1.2R,bE1F和bE1R为引物进行PCR,获得mfa1.2bE1基因序列,所述的mfa1.2F的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示,mfa1.2R的核苷酸序列如SEQ ID No.2所示,bE1F的核苷酸序列如SEQ ID No.3所示,bE1R的核苷酸序列如SEQ ID No.4所示;
3)用mfa1.2F和bE1R引物,以mfa1.2bE1基因序列为模板,进行融合PCR,将mfa1.2bE1基因连接成一个长片段;
4)将融合PCR产物和pUMa932质粒经限制性内切酶ECORⅤ和HindⅢ双酶切2h后的产物,连接后转化到大肠杆菌DH5α感受态细胞中,挑取单克隆培养后提取重组质粒,测序确认后获得重组质粒mfa1.2-bE1-amp-cbx;
5)使用限制性内切酶PvuⅠ线性化重组质粒mfa1.2-bE1-amp-cbx,利用PEG介导的转化将线性化的片段转入UET2原生质体中,涂布于含50μg/mL萎锈灵的双层再生培养基上,28℃培养4-5天,随后挑取转化子至含有萎锈灵的YEPS固体培养基上,然后挑取单菌落扩大培养,观察菌落是否有菌丝生长,获得UeTSP菌株。
CN201810827330.6A 2018-07-25 2018-07-25 一种菰黑粉菌单倍体菌株UeTSP及其应用 Active CN109136099B (zh)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN201810827330.6A CN109136099B (zh) 2018-07-25 2018-07-25 一种菰黑粉菌单倍体菌株UeTSP及其应用

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN201810827330.6A CN109136099B (zh) 2018-07-25 2018-07-25 一种菰黑粉菌单倍体菌株UeTSP及其应用

Publications (2)

Publication Number Publication Date
CN109136099A true CN109136099A (zh) 2019-01-04
CN109136099B CN109136099B (zh) 2021-06-08

Family

ID=64799046

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CN201810827330.6A Active CN109136099B (zh) 2018-07-25 2018-07-25 一种菰黑粉菌单倍体菌株UeTSP及其应用

Country Status (1)

Country Link
CN (1) CN109136099B (zh)

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN114736897A (zh) * 2022-04-14 2022-07-12 中国计量大学 菰黑粉菌t-dna突变体库的构建和插入位点分析方法

Citations (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP2010158192A (ja) * 2009-01-07 2010-07-22 Sanwa Shurui Co Ltd 糖型バイオサーファクタント生産能を有する微生物及びそれを用いる糖型バイオサーファクタントの製造方法
CN105838619A (zh) * 2016-01-28 2016-08-10 中国计量学院 两对可以成功侵染茭白植株并使其孕茭的菰黑粉菌及其人工接种方法
CN105838782A (zh) * 2016-01-28 2016-08-10 中国计量学院 一种快速稳定分离鉴定菰黑粉菌性亲和单倍体菌株的方法
CN105830760A (zh) * 2016-01-28 2016-08-10 中国计量学院 一种成功使茭白植株孕茭的菰黑粉菌人工接种方法
CN108998464A (zh) * 2018-07-25 2018-12-14 中国计量大学 pSP107质粒及其应用、构建方法

Patent Citations (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP2010158192A (ja) * 2009-01-07 2010-07-22 Sanwa Shurui Co Ltd 糖型バイオサーファクタント生産能を有する微生物及びそれを用いる糖型バイオサーファクタントの製造方法
CN105838619A (zh) * 2016-01-28 2016-08-10 中国计量学院 两对可以成功侵染茭白植株并使其孕茭的菰黑粉菌及其人工接种方法
CN105838782A (zh) * 2016-01-28 2016-08-10 中国计量学院 一种快速稳定分离鉴定菰黑粉菌性亲和单倍体菌株的方法
CN105830760A (zh) * 2016-01-28 2016-08-10 中国计量学院 一种成功使茭白植株孕茭的菰黑粉菌人工接种方法
CN108998464A (zh) * 2018-07-25 2018-12-14 中国计量大学 pSP107质粒及其应用、构建方法

Non-Patent Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
JIAJIA YU,ET AL: "An efficient genetic manipulation protocol for Ustilago esculenta", 《FEMS MICROBIOLOGY LETTERS》 *
YAFEN ZHANG等: "Investigation on the differentiation of two Ustilago esculenta strains-implications of a relationship with the host phenotypes appearing in the fields", 《BMC MICROBIOLOGY》 *

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN114736897A (zh) * 2022-04-14 2022-07-12 中国计量大学 菰黑粉菌t-dna突变体库的构建和插入位点分析方法

Also Published As

Publication number Publication date
CN109136099B (zh) 2021-06-08

Similar Documents

Publication Publication Date Title
CN105671070B (zh) 一种用于枯草芽孢杆菌基因组编辑的CRISPRCas9系统及其构建方法
CN104560742B (zh) 农杆菌介导茭白黑粉菌转化子菌株及其制备方法和应用
CN105838615B (zh) 一种菰黑粉菌单倍体菌株uet2及其应用
CN105838616B (zh) 一种菰黑粉菌单倍体菌株uet1及其应用
CN105838619B (zh) 两对可以成功侵染茭白植株并使其孕茭的菰黑粉菌及其人工接种方法
CN108060092A (zh) 一种重组菌及其用途
CN105830760B (zh) 一种成功使茭白植株孕茭的菰黑粉菌人工接种方法
CN108949774A (zh) 一种利用MsPALM1人工定点突变体获得多叶型紫花苜蓿材料的方法
CN110028566A (zh) GhPRXR1蛋白及其编码基因在调控棉籽含油量中的应用
CN110257421A (zh) 一种甘蓝型油菜基因突变体ptg8的构建方法及其应用
CN108707624A (zh) 一种利用发根农杆菌诱导培养博落回毛状根的方法及应用
CN109022290A (zh) 一种菰黑粉菌单倍体菌株UeMTSP及其应用
CN107574173A (zh) 一种重组质粒及其用于构建红曲色素高产菌株的方法
CN108384797B (zh) 一种无痕迹木霉真菌基因编辑方法
CN109136099A (zh) 一种菰黑粉菌单倍体菌株UeTSP及其应用
CN106367436A (zh) 刚毛柽柳瞬时转化方法
CN109486688A (zh) 一种里氏木霉基因工程菌及其制备方法和应用
CN106520572A (zh) 一种香椿内生真菌56‑50及其次级代谢产物、制备方法和应用
CN105255938A (zh) 一种发根农杆菌介导的转基因灯盏花毛状根转化方法
CN105039386A (zh) 一种高产酸性蛋白酶的红曲霉菌株的构建方法
CN103232994B (zh) 一种筛选嗜酸性氧化硫硫杆菌无标记基因敲除菌株的方法
CN109593769A (zh) 菰黑粉菌冬孢子形成相关基因Itd1及其应用
Cao et al. Phytophthora sojae Transformation Based on the CRISPR/Cas9 System
Magnien Biomolecular Engineering in the European Community: Achievements of the Research Programme (1982–1986)
CN110129355A (zh) 基于线性片段同源重组进行须糖多孢菌基因簇阻断的方法

Legal Events

Date Code Title Description
PB01 Publication
PB01 Publication
SE01 Entry into force of request for substantive examination
SE01 Entry into force of request for substantive examination
GR01 Patent grant
GR01 Patent grant