CN108251522B - 人类mthfr和mtrr基因检测试剂盒及其用途 - Google Patents
人类mthfr和mtrr基因检测试剂盒及其用途 Download PDFInfo
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Abstract
本发明公开了一种人类MTHFR和MTRR基因检测试剂盒及其用途,所述试剂盒包括以下各组分:MTHFR 677/MTHFR 1298/MTRR 66三重检测液以及可选的以下组分:核酸扩增反应液、酶混合液、阳性对照和空白对照。本发明公开的人类MTHFR和MTRR基因检测试剂盒能够在同一反应管中同时检测出MTHFR基因677位点和1298位点以及MTRR基因66位点基因型。此外,该试剂盒还具有特异性强、灵敏度高,操作简便、可重复性强、检测结果快速客观等优点,本发明的提出为人类MTHFR和MTRR基因的体外检测提供了一种有效的技术手段。
Description
技术领域
本发明涉及一种人类基因组DNA基因型检测的体外诊断试剂盒,尤其涉及MTHFR和MTRR基因检测试剂盒及其用途,属于生物技术领域。
背景技术
叶酸是饮食中重要的甲基供体,参与DNA甲基化和DNA合成通路。叶酸缺少会引起人DNA中的尿嘧啶错误插入,及染色体断裂,从而导致基因组的不稳定性和突变概率的增加。叶酸代谢通路异常,会导致高同型半胱氨酸败血症。高同型半胱氨酸败血症是多种疾病的危险因子,会导致各种增加的风险,如血管和神经疾病,妊娠并发症,男性不育,新生儿缺陷,糖尿病,肾脏疾病,骨质疏松症,神经精神疾病和癌症。
MTHFR(5,10-methylenetetrahydrofolate reductase)基因,编码5,10亚甲基四氢叶酸还原酶,位于第一号染色体1p36.3位置。MTHFR全长19.3kb,共有外显子12个,mRNA全长7,105bp,编码657个氨基酸残基组成的蛋白;能够催化5,10-MTHFR还原为5-甲基四氢叶酸,作为一个甲基供体,参与同型半胱氨酸到甲硫氨酸的甲基化。MTHFR基因突变主要发生在677和1298位点,677位点(C>T)突变会使基因编码的5,10-亚甲基四氢叶酸还原酶的活性发生不同程度的变化,677TT使酶活性降低几乎为70%左右,677CT则是降低了35%的活性。MTHFR基因的1298位点,其多态性导致异亮氨酸被甲硫氨酸替换,从而导致同型半胱氨酸再甲基化的速率。而据相关文献研究,1298位点的突变可以和677位点的突变发生协同效应,导致5,10-亚甲基四氢叶酸还原酶的活性进一步的降低。
MTRR(5-methyltetrahydrofolate-homocysteinemethyltransferasereductase)基因,编码甲硫氨酸合成酶还原酶,位于染色体5p15.3-p15.2位置,MTRR基因全长32021kb,mRNA全长3274bp,共有15个外显子,编码具有726个氨基酸的蛋白质。MTRR编码的甲硫氨酸合成酶还原酶能够通过还原型甲基化作用重新生成具有功能活性的甲硫氨酸合酶。MTRR基因的66位点(A>G)突变会对叶酸DNA甲基化代谢途径产生影响。
现有的针对MTHFR和MTRR基因检测的体外诊断试剂盒大多采用单重荧光PCR反应,或者直接采用直接测序法,焦磷酸测序法等。若要完成MTHFR和MTRR基因3个位点基因型的检测需要分别进行一个荧光PCR反应,在面对大规模样本检测时,无疑会耗费大量的人力物力,也会延长诊断时间;测序法则操作繁琐耗时且灵敏度低。因此,目前急需建立一种特异性好,灵敏性高的能够实现单一反应管中同时检测3个位点基因型的方法,以期能够更好、更快的用于MTHFR和MTRR基因3个位点基因型的检测。
发明内容
本发明所要解决的技术问题是提供一种能够在单一反应管中同时检测MTHFR和MTRR基因3个位点基因型检测的试剂盒,该试剂盒具有特异性强、灵敏度高等优点。
为了达到上述目的,本发明采用了以下的技术手段:
本发明是一种人类MTHFR和MTRR基因检测试剂盒,其特征在于,包括以下各组分:MTHFR 677/MTHFR 1298/MTRR 66三重检测液以及可选的以下组分:核酸扩增反应液、酶混合液、阳性对照和空白对照;
其中,所述的MTHFR 677/MTHFR 1298/MTRR 66三重检测液包括以下3组组分:
组分(1):由检测MTHFR基因677位点一对引物对和一条探针组成,其中,所述的引物对的碱基序列分别为SEQ ID No.1和SEQ ID No.2所示;所述探针的碱基序列如SEQ IDNo.3所示,其中,SEQ ID No.3的5′端标记有荧光报告基团,3′端标记有荧光淬灭基团;
组分(2):由检测MTHFR基因1298位点一对引物对和一条探针组成,其中,所述的引物对的碱基序列分别为SEQ ID No.4和SEQ ID No.5所示;所述探针的碱基序列如SEQ IDNo.6所示,其中,SEQ ID No.6的5′端标记有荧光报告基团,3′端标记有荧光淬灭基团;
组分(3):由检测MTRR基因66位点一对引物对和一条探针组成,其中,所述的引物对的碱基序列分别为SEQ ID No.7和SEQ ID No.8所示;所述探针的碱基序列如SEQ IDNo.9所示,其中,SEQ ID No.9的5′端标记有荧光报告基团,3′端标记有荧光淬灭基团。
其中,优选的,所述荧光报告基团选自FAM、VIC、ROX、Cy3或Cy5荧光报告基团,且组分(1)、组分(2)以及组分(3)选自不同的荧光报告基团;荧光淬灭基团选自BHQ1、BHQ2、BHQ3、Dabcyl和Tamra中的任意一种或几种,但要求其能够淬灭标记在同一条探针上的荧光报告基团。
本发明对上述引物和探针的配比比例进行了摸索和优化,试验结果发现,它们之间不同的配比比例对于检测结果的特异性和灵敏性具有显著的差异,本发明通过高通量的筛选试验发现,上述引物和探针在下述配比下,具有最优的检测效果:
优选的,在本发明的一些实施方案中,组分(1)中引物及探针之间的配比为:SEQID No.1所示的引物:SEQ ID No.2所示的引物:SEQ ID No.3所示的探针=0.125μM:1μM:0.5μM。
优选的,在本发明的一些实施方案中,组分(2)中引物及探针之间的配比为:SEQID No.4所示的引物:SEQ ID No.5所示的引物:SEQ ID No.6所示的探针=0.125μM:1μM:0.5μM。
优选的,在本发明的一些实施方案中,组分(3)中引物及探针之间的配比为:SEQID No.7所示的引物:SEQ ID No.8所示的引物:SEQ ID No.9所示的探针=0.125μM:1μM:0.5μM。
优选的,在本发明的一些实施方案中,所述的核酸扩增反应液包括以下组分中的任意一种或多种的组合:PCR缓冲液、MgCl2、dATP、dTTP、dCTP、dGTP、dUTP、以及去DNA酶水。
优选的,在本发明的一些实施方案中,所述的酶混合液包括以下组分中的任意一种或多种的组合:DNA聚合酶和UDG酶。
DNA聚合酶在PCR扩增中起着非常重要的作用,为了达到更好的效果,更优选的,所述DNA聚合酶是化学修饰酶,所述UDG酶是E.coli尿嘧啶-DNA糖基化酶。
优选的,在本发明的一些实施方案中,所述的阳性对照为所述的阳性对照为6种质粒DNA,所述6种质粒DNA分别为4种不同的MTHFR等位基因和2种不同的MTRR等位基因,所述的空白对照为去DNA酶水。
优选的,在本发明的一些实施方案中,所述的检测试剂盒进行人类MTHFR和MTRR基因检测时,按照以下步骤进行:
(1)采用核酸提取试剂盒提取样本的基因组DNA;
(2)准备以下组分:核酸扩增反应液9μL,酶混合液1μL,MTHFR677/MTHFR 1298/MTRR 66三重检测液8μL,样本DAN2μL;
(3)荧光PCR扩增及熔解曲线分析,按照以下程序进行:扩增(37℃5min;95℃15min;95℃10s,55℃40s,共进行45个循环),然后进行熔解曲线分析(95℃10s,50-72℃0.03℃/s);
(4)结果判定:扩增结束后,根据熔解曲线判断样本的MTHFR和MTRR基因型;
其中,优选的,当SEQ ID No.3的5′端标记有荧光报告基团FAM,3′端标记有荧光淬灭基团BHQ1,SEQ ID No.6的5′端标记有荧光报告基团VIC,3′端标记有荧光淬灭基团BHQ1,SEQ ID No.9的5′端标记有荧光报告基团ROX,3′端标记有荧光淬灭基团BHQ1;
在FAM通道内熔解曲线为单峰且Tm值为65.00±1.00℃,判断为MTHFR 677位点为野生型,熔解曲线为单峰且Tm值为55.50±1.00℃,判断为MTHFR 677位点突变型,熔解曲线为双峰且Tm值分别为65.00±1.00℃和55.50±1.00℃,则为MTHFR 677位点杂合型(如图1所示);
在VIC通道内熔解曲线为单峰且Tm值为58.00±1.00℃,判断为MTHFR 1298位点为野生型,熔解曲线为单峰且Tm值为66.50±1.00℃,判断为MTHFR 1298位点突变型,熔解曲线为双峰且Tm值分别为58.00±1.00℃和66.50±1.00℃,则为MTHFR 1298位点杂合型(如图1所示);
在ROX通道内熔解曲线为单峰且Tm值为56.50±1.00℃,判断为MTRR 66位点为野生型,熔解曲线为单峰且Tm值为63.00±1.00℃,判断为MTRR 66位点突变型,熔解曲线为双峰且Tm值分别为56.50±1.00℃和63.00±1.00℃,则为MTRR 66位点杂合型(如图1所示)。
更进一步的,本发明还提出了所述的试剂盒在制备人类MTHFR和MTRR基因检测试剂中的应用。
相较于现有技术,本发明的有益效果是:
使用本发明提供的MTHFR和MTRR基因检测试剂盒能够在单个反应管中同时检测出MTHFR基因677和1298位点以及MTRR基因66位点的基因型,解决了现有产品无法在单个反应管中同时检测MTHFR和MTRR基因3个位点基因型的问题。
此外,本发明提供的MTHFR和MTRR基因检测试剂盒还具有操作简便、可重复性强、检测结果快速客观等优点,利于大规模推广使用。
附图说明
为了更清楚地说明本发明实施例的技术方案,下面将对实施例中所需要使用的附图作简单地介绍,应当理解,以下附图仅示出了本发明的某些实施例,因此不应被看作是对范围的限定,对于本领域普通技术人员来讲,在不付出创造性劳动的前提下,还可以根据这些附图获得其他相关的附图。
图1为本发明试剂盒检测样本的熔解曲线图;
图2为本发明试剂盒的重复性检测的实验结果(MTHFR 677杂合型,MTHFR 1298杂合型,MTRR 66杂合型);
图3为本发明试剂盒的灵敏度检测的实验结果;
图4为本发明试剂盒的特异性检测的实验结果。
具体实施方式
为使本发明实施例的目的、技术方案和优点更加清楚,下面将对本发明实施例中的技术方案进行清楚、完整地描述。实施例中未注明具体条件者,按照常规条件或制造商建议的条件进行。所用试剂或仪器未注明生产厂商者,均为可以通过市售购买获得的常规产品。
以下结合实施例对本发明的特征和性能作进一步的详细描述。
实施例1
人类MTHFR和MTRR基因检测试剂盒的组装
所述的试剂盒包括以下组分:
(1)核酸扩增反应液:
所述核酸扩增反应液由去DNA酶水、10×PCR缓冲液、25mM Mg2+、10mM dNTPs组成(表1)。
表1核酸扩增反应液的组成
试剂名称 | 加入体积(μL)/50人份 |
PCR buffer | 100 |
MgCl<sub>2</sub> | 3 |
100mM dATP | 2.5 |
100mM dGTP | 2.5 |
100mM dCTP | 2.5 |
100mM dUTP | 1.25 |
100mM dTTP | 1.25 |
去DNA酶水 | 337 |
总体积 | 450 |
(2)酶混合液
所述的酶混合液包括DNA聚合酶、酶稀释液、UDG酶。DNA聚合酶在PCR扩增中起着非常重要的作用,包括逆扩增的效率和特异性,为了达到更好的效果,本发明优选采用Taq热启动酶(表2和表3)。
表2酶稀释液的配制
Taq酶稀释液组分 | 加量(mL) | 终浓度 |
1M Tris-HCl pH9.0 | 2 | 20mM |
1M氯化钾 | 10 | 100mM |
0.5M乙二胺四乙酸二钠盐 | 0.02 | 0.1mM |
1M DL-二硫代苏糖醇 | 0.1 | 1mM |
吐温20 | 0.2 | 0.2%(V/V) |
甘油 | 50 | 50% |
去DNA酶水 | 37.68 | / |
总体积 | 100 | / |
按上表配好的酶稀释液,用pH计测其pH值,若pH值不是9.0,需用浓盐酸或氢氧化钠调至9.0(±0.1),并用0.22μM滤器过滤除菌,于-20℃保存。
表3酶混合液的组成
试剂名称 | 加入体积(μL)/50反应 |
DNA聚合酶 | 30 |
UDG酶 | 1 |
酶稀释液 | 19 |
总计 | 50 |
(3)MTHFR 677/MTHFR 1298/MTRR 66三重反应液
所述的MTHFR 677/MTHFR 1298/MTRR 66三重反应液包括以下3组组分:
其中,所述的MTHFR 677/MTHFR 1298/MTRR 66三重检测液包括以下3组组分:
组分(1):由检测MTHFR基因677位点一对引物对和一条探针组成,其中,所述的引物对的碱基序列分别为SEQ ID No.1和SEQ ID No.2所示;所述探针的碱基序列如SEQ IDNo.3所示,其中,SEQ ID No.3的5′端标记有荧光报告基团FAM,3′端标记有荧光淬灭基团BHQ1;
SEQ ID No.1所示的引物:SEQ ID No.2所示的引物:SEQ ID No.3所示的探针=0.125μM:1μM:0.5μM。
组分(2):由检测MTHFR基因677位点一对引物对和一条探针组成,其中,所述的引物对的碱基序列分别为SEQ ID No.4和SEQ ID No.5所示;所述探针的碱基序列如SEQ IDNo.6所示,其中,SEQ ID No.6的5′端标记有荧光报告基团VIC,3′端标记有荧光淬灭基团BHQ1;
SEQ ID No.4所示的引物:SEQ ID No.5所示的引物:SEQ ID No.6所示的探针=0.125μM:1μM:0.5μM;
组分(3):由检测MTRR基因66位点一对引物对和一条探针组成,其中,所述的引物对的碱基序列分别为SEQ ID No.7和SEQ ID No.8所示;所述探针的碱基序列如SEQ IDNo.9所示,其中,SEQ ID No.9的5′端标记有荧光报告基团ROX,3′端标记有荧光淬灭基团BHQ1。
SEQ ID No.7所示的引物:SEQ ID No.8所示的引物:SEQ ID No.9所示的探针=0.125μM:1μM:0.5μM。
用于检测MTHFR 677/MTHFR 1298/MTRR 66的引物及探针序列以及MTHFR 677/MTHFR 1298/MTRR 66检测液组成如下表4及表5所示:
表4用于检测的引物及探针
表5 MTHFR 677/MTHFR 1298/MTRR 66三重检测液的组分
试剂名称 | 引物/探针浓度 | 加入体积(μL)/50人份 |
MTHFR 677上游引物 | 100μM | 0.5 |
MTHFR 677下游引物 | 100μM | 4 |
MTHFR 677探针 | 100μM | 2 |
MTHFR 1298上游引物 | 100μM | 0.5 |
MTHFR 1298下游引物 | 100μM | 4 |
MTHFR 1298探针 | 100μM | 2 |
MTRR 66上游引物 | 100μM | 0.5 |
MTRR 66下游引物 | 100μM | 4 |
MTRR 66探针 | 100μM | 2 |
去DNA酶水 | / | 380.5 |
总体积 | / | 400 |
(4)阳性对照
阳性对照有6种质粒DNA(2种不同的MTHFR 677位点等位基因、2种不同的MTHFR1298位点等位基因和2种不同的MTRR 66位点等位基因)混合配制液。
阳性对照的配制如表6所示:
表6 50ng/μL阳性对照的配制
组分 | 使用浓度 | 体积(μL) |
MTHFR-677CC质粒 | 500ng/μL | 5 |
MTHFR-677TT质粒 | 500ng/μL | 5 |
MTHFR-1298AA质粒 | 500ng/μL | 5 |
MTHFR-1298CC质粒 | 500ng/μL | 5 |
MTRR-66AA质粒 | 500ng/μL | 5 |
MTRR-66GG质粒 | 500ng/μL | 5 |
TE缓冲液 | / | 70 |
终体积 | / | 100 |
注:质粒载体均为pUC57,插入的酶切位点均为EcoRV。
(5)空白对照
去DNA酶水。
实施例2
采用本发明实施例1的试剂盒对临床样本的检测试验
1、样本处理(全血样本提取)
取200μL全血样本,应用Qiagen全血基因组DNA提取试剂盒(QIAamp DNA BloodMini Kit,Cat No.:51104),按照试剂盒说明书进行提取,获得样本DNA。
2、试剂准备
采用实施例1制备得到的试剂盒进行反应体系的准备(表7):
表7反应体系配置表
反应体系 | 加量(μL)/1人份 |
核酸扩增反应液 | 9 |
酶混合液 | 1 |
检测液 | 8 |
样本DNA | 2 |
总体积 | 20 |
3、PCR扩增程序
按照以下程序进行RT-PCR扩增:扩增(37℃5min;95℃15min;95℃10s,55℃40s,共进行40个循环),然后进行熔解曲线分析(95℃10s,50-72℃0.03℃/s);
4、结果判定
扩增结束后,根据熔解曲线判断样本的MTHFR和MTRR基因型;
其中,在FAM通道内熔解曲线为单峰且Tm值为65.00±1.00℃,判断为MTHFR 677位点为野生型,熔解曲线为单峰且Tm值为55.50±1.00℃,判断为MTHFR 677位点突变型,熔解曲线为双峰且Tm值分别为65.00±1.00℃和55.50±1.00℃,则为MTHFR 677位点杂合型(如图1所示);
在VIC通道内熔解曲线为单峰且Tm值为58.00±1.00℃,判断为MTHFR 1298位点为野生型,熔解曲线为单峰且Tm值为66.50±1.00℃,判断为MTHFR 1298位点突变型,熔解曲线为双峰且Tm值分别为58.00±1.00℃和66.50±1.00℃,则为MTHFR 1298位点杂合型(如图1所示);
在ROX通道内熔解曲线为单峰且Tm值为56.50±1.00℃,判断为MTRR 66位点为野生型,熔解曲线为单峰且Tm值为63.00±1.00℃,判断为MTRR 66位点突变型,熔解曲线为双峰且Tm值分别为56.50±1.00℃和63.00±1.00℃,则为MTRR 66位点杂合型(如图1所示)。
10个临床样本具体结果如下表8所示:
表8 10个临床样本的检测结果
试验例1
本发明实施例1提供的试剂盒重复性实验结果
为了检测本发明实施例1提供的MTHFR 677/MTHFR1298/MTRR 66检测试剂盒的重复性,用实施例1制备得到的核酸检测试剂盒检测阳性对照,重复检测10次。结果表明FAM通道对MTHFR 677位点进行熔解曲线分析;VIC通道对MTHFR 1298位点进行熔解曲线分析;ROX通道对MTRR 66点进行熔解曲线分析,都具有很好的重复性(如图2所示)。
试验结果表明,本发明实施例1的试剂盒对于MTHFR677/MTHFR 1298/MTRR 66的诊断具有很好的重复性。
试验例2
本发明实施例1提供的试剂盒灵敏度实验结果
对阳性对照进行10倍倍比稀释,获得浓度分别为5ng/μL,2ng/μL,1ng/μL,0.5ng/μL。实验结果表明本发明实施例1的试剂盒可检测至0.5ng/μL,并且随浓度减少熔解曲线也呈梯度改变(如图3所示)。
试验结果表明,本发明实施例1的试剂盒对于MTHFR677/MTHFR 1298/MTRR 66的诊断具有高灵敏度。
试验例3
本发明实施例1提供的试剂盒特异性实验结果
对特异性参考品T1~T5(具体信息见表9)为模板进行检测。实验结果表明本发明实施例1的试剂盒在检测上述特异性参考品时,检测结果均为野生型(如图4所示)。结果表明,本发明实施例1的试剂盒对于MTHFR 677/MTHFR 1298/MTRR 66的检测或诊断具有高特异性。
表9特异性参考品组成
注:质粒载体均为pUC57,插入的酶切位点均为EcoRV。
以上所述仅为本发明的优选实施例而已,并不用于限制本发明,对于本领域的技术人员来说,本发明可以有各种更改和变化。凡在本发明的精神和原则之内,所作的任何修改、等同替换、改进等,均应包含在本发明的保护范围之内。
序列表
<110> 江苏硕世生物科技股份有限公司
<120> 人类MTHFR和MTRR基因检测试剂盒及其用途
<160> 9
<170> PatentIn version 3.5
<210> 1
<211> 21
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 1
cctgaagcac ttgaaggaga a 21
<210> 2
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 2
caaagcggaa gaatgtgtca 20
<210> 3
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 3
tgtctgcggg agccgatttc atcat 25
<210> 4
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 4
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<213> 人工序列
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<212> DNA
<213> 人工序列
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<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 9
tcgcagaaga aatgtgtgag ca 22
Claims (7)
1.一种人类MTHFR和MTRR基因检测试剂盒,其特征在于,包括MTHFR 677/MTHFR 1298/MTRR 66三重检测液以及以下组分:核酸扩增反应液、酶混合液、阳性对照和空白对照;
其中,所述的MTHFR 677/MTHFR 1298/MTRR 66三重检测液包括以下3组组分:
组分(1):由检测MTHFR基因677位点一对引物对和一条探针组成,其中,所述的引物对的碱基序列分别为SEQ ID No.1和SEQ ID No.2所示;所述探针的碱基序列如SEQ ID No.3所示,其中,SEQ ID No.3的5′端标记有荧光报告基团,3′端标记有荧光淬灭基团;
组分(2):由检测MTHFR基因1298位点一对引物对和一条探针组成,其中,所述的引物对的碱基序列分别为SEQ ID No.4和SEQ ID No.5所示;所述探针的碱基序列如SEQ ID No.6所示,其中,SEQ ID No.6的5′端标记有荧光报告基团,3′端标记有荧光淬灭基团;
组分(3):由检测MTRR基因66位点一对引物对和一条探针组成,其中,所述的引物对的碱基序列分别为SEQ ID No.7和SEQ ID No.8所示;所述探针的碱基序列如SEQ ID No.9所示,其中,SEQ ID No.9的5′端标记有荧光报告基团,3′端标记有荧光淬灭基团;
其中,所述荧光报告基团选自FAM、VIC、ROX、Cy3或Cy5荧光报告基团,且组分(1)、组分(2)以及组分(3)选自不同的荧光报告基团;荧光淬灭基团选自BHQ1、BHQ2、BHQ3、Dabcyl和Tamra中的任意一种或几种。
2.按照权利要求1所述的检测试剂盒,其特征在于:组分(1)中引物及探针之间的配比为:SEQ ID No.1所示的引物:SEQ ID No.2所示的引物:SEQ ID No.3所示的探针=0.125μM:1μM:0.5μM。
3.按照权利要求1所述的检测试剂盒,其特征在于:组分(2)中引物及探针之间的配比为:SEQ ID No.4所示的引物:SEQ ID No.5所示的引物:SEQ ID No.6所示的探针=0.125μM:1μM:0.5μM。
4.按照权利要求1所述的检测试剂盒,其特征在于:组分(3)中引物及探针之间的配比为:SEQ ID No.7所示的引物:SEQ ID No.8所示的引物:SEQ ID No.9所示的探针=0.125μM:1μM:0.5μM。
5.按照权利要求1所述的检测试剂盒,其特征在于,所述的核酸扩增反应液包括以下组分中的任意一种或多种的组合:PCR缓冲液、MgCl2、dATP、dTTP、dCTP、dGTP、dUTP、以及去DNA酶水。
6.按照权利要求1所述的检测试剂盒,其特征在于,所述的酶混合液包括以下组分中的任意一种或多种的组合:DNA聚合酶和UDG酶;
所述DNA聚合酶是化学修饰酶;所述UDG酶是E.coli尿嘧啶-DNA糖基化酶。
7.按照权利要求1所述的检测试剂盒,其特征在于:所述的阳性对照为6种质粒DNA,所述6种质粒DNA分别为4种不同的MTHFR等位基因和2种不同的MTRR 66位点等位基因,所述的空白对照为去DNA酶水,其中,4种不同的MTHFR等位基因包括2种不同的MTHFR 677位点等位基因和2种不同的MTHFR 1298位点等位基因。
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CN109593846A (zh) * | 2019-02-14 | 2019-04-09 | 阿吉安(福州)基因医学检验实验室有限公司 | 检测叶酸代谢能力相关基因的引物、探针及试剂盒 |
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CN111334571A (zh) * | 2020-04-13 | 2020-06-26 | 青岛智博生物科技有限公司 | 一种可自由组合检测mthfr和mtrr基因序列的试剂盒及其使用方法 |
Citations (10)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN101240324A (zh) * | 2007-02-06 | 2008-08-13 | 上海主健生物工程有限公司 | 一种评估孕前营养代谢遗传能力的试剂盒 |
CN101560555A (zh) * | 2009-03-18 | 2009-10-21 | 上海中优医药高科技有限公司 | 一种用于儿童个性化教育和健康指导的基因检测方法 |
CN104053785A (zh) * | 2011-11-14 | 2014-09-17 | 综合医院公司 | 为患有抑郁症的受试者选择治疗方案的测定法和方法 |
CN104131087A (zh) * | 2014-07-11 | 2014-11-05 | 武汉千麦医学检验所有限公司 | 一种针对叶酸代谢基因进行基因分型的试剂盒 |
CN104789685A (zh) * | 2015-05-06 | 2015-07-22 | 陈瑛 | 一种叶酸需求遗传检测试剂盒及其应用 |
CN106591473A (zh) * | 2017-01-20 | 2017-04-26 | 广州市达晖生物技术有限公司 | 一种人mthfr和mtrr基因多态性检测引物、探针、试剂盒及方法 |
CN106957903A (zh) * | 2016-11-01 | 2017-07-18 | 上海泽因生物科技有限公司 | 一种检测叶酸代谢关键酶基因多态性位点基因分型试剂盒和其检测方法 |
CN107385063A (zh) * | 2017-08-15 | 2017-11-24 | 北京鑫诺美迪基因检测技术有限公司 | 一种用于检测mthfr和mtrr基因多态性的组合物及其应用 |
CN107828870A (zh) * | 2017-11-16 | 2018-03-23 | 沈阳迪安医学检验所有限公司 | 一种利用分子信标探针熔解曲线法同时检测mthfr和mtrr基因多态性试剂盒及方法 |
CN107841537A (zh) * | 2017-09-28 | 2018-03-27 | 苏州旷远生物分子技术有限公司 | 一种全预混mthfr和mtrr多重pcr基因多态性检测试剂盒和方法 |
-
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Patent Citations (10)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN101240324A (zh) * | 2007-02-06 | 2008-08-13 | 上海主健生物工程有限公司 | 一种评估孕前营养代谢遗传能力的试剂盒 |
CN101560555A (zh) * | 2009-03-18 | 2009-10-21 | 上海中优医药高科技有限公司 | 一种用于儿童个性化教育和健康指导的基因检测方法 |
CN104053785A (zh) * | 2011-11-14 | 2014-09-17 | 综合医院公司 | 为患有抑郁症的受试者选择治疗方案的测定法和方法 |
CN104131087A (zh) * | 2014-07-11 | 2014-11-05 | 武汉千麦医学检验所有限公司 | 一种针对叶酸代谢基因进行基因分型的试剂盒 |
CN104789685A (zh) * | 2015-05-06 | 2015-07-22 | 陈瑛 | 一种叶酸需求遗传检测试剂盒及其应用 |
CN106957903A (zh) * | 2016-11-01 | 2017-07-18 | 上海泽因生物科技有限公司 | 一种检测叶酸代谢关键酶基因多态性位点基因分型试剂盒和其检测方法 |
CN106591473A (zh) * | 2017-01-20 | 2017-04-26 | 广州市达晖生物技术有限公司 | 一种人mthfr和mtrr基因多态性检测引物、探针、试剂盒及方法 |
CN107385063A (zh) * | 2017-08-15 | 2017-11-24 | 北京鑫诺美迪基因检测技术有限公司 | 一种用于检测mthfr和mtrr基因多态性的组合物及其应用 |
CN107841537A (zh) * | 2017-09-28 | 2018-03-27 | 苏州旷远生物分子技术有限公司 | 一种全预混mthfr和mtrr多重pcr基因多态性检测试剂盒和方法 |
CN107828870A (zh) * | 2017-11-16 | 2018-03-23 | 沈阳迪安医学检验所有限公司 | 一种利用分子信标探针熔解曲线法同时检测mthfr和mtrr基因多态性试剂盒及方法 |
Non-Patent Citations (2)
Title |
---|
Geographical Distribution of MTHFRC677T, A1298C and MTRR A66G Gene Polymorphisms in China: Findings from 15357 Adults of Han Nationality;Boyi Yang等;《PLOS ONE》;20130331;第8卷(第3期);e57917 * |
Improved Real-Time Multiplex Polymerase Chain Reaction Detection of Methylenetetrahydrofolate Reductase ( MTHFR) 677C>T and 1298A>C Polymorphisms Using Nearest Neighbor Model-Based Probe Design;Raghunath P. Agarwal等;《Journal of Molecular Diagnostics》;20070331;第9卷(第3期);345-350 * |
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