CN108028077B - 用于整合临床护理的信息学平台 - Google Patents

Abstract

信息学平台提供了用来整合来自相关患者信息系统的信息的一个架构。该信息学平台可以包括：工作流程工具，其可用于准备和检查在多学科委员会会议上的信息；患者事件的可视时间线；搜索引擎，其用于搜索具有特定属性的患者；制图工具，其可以在单个图表中显示异类的临床变量；虚拟插接板，其用于使用户识别委员会会议的相关患者信息；图像查看应用，其可以提供来自不同信息系统的图像的比较；结构化报告功能，其整合了系统聚合的患者信息和委员会建议；应用界面，其整合临床相关工具以提供患者特定参考；协作接口，其促进患者特定信息的通信并将讨论线索记录为独立参考点；以及为每个临床专业定制的相关患者信息的默认显示。

Description

用于整合临床护理的信息学平台

技术领域

本申请总体上涉及整合来自异类（disparate）信息系统的患者信息以供医疗人员在患者治疗中使用的系统和方法。

背景技术

患者信息可以存储在许多个体信息系统中，这些信息系统可以对该非常特定的数据执行分析和报告。这些系统包括例如EMR（电子病历）系统、PACS（图片归档和通信系统）、数字病理学（DP）系统、LIS（实验室信息系统）、RIS（放射信息系统）等。由于缺乏整合，这些个体信息系统没有跨越信息系统利用数据的能力，也不能提供智能聚合和信息显示。相反，医疗人员不得不在异类信息系统中寻找信息内核，这里所需的信息可能位于信息系统交互主屏幕下方的许多水平。

将患者信息存储在多个信息系统中可以导致针对诸如医生、医师和/或临床医生的医疗人员的问题，所述医疗人员试图在单个时间查看患者的完整和全面的临床数据集合。例如，医疗人员可能不能利用相关诊断和生物标记来观察放射学图像以及病理图像。传统上，医疗人员进入每个相应的信息系统以查看与患者的其他临床信息无关的特定患者相关信息。由于医疗人员在单次查看时无法看到患者的所有相关信息和数据，因此医疗人员在尝试进行各种数据点的有意义的相关和关联时通常不得不依赖于他们关于某些相关的患者信息的记忆或手写笔记。

作为示例，当准备肿瘤委员会展示时，医疗人员当前必须访问个体信息系统以获得期望的患者信息。此外，医疗人员不得不打印纸质笔记，准备手写笔记并通过复制和粘贴图像和相关信息来创建数字展示。这个非常繁琐的手动过程牵扯很多时间和精力。此外，在肿瘤委员会会议期间，医疗人员无法实时展示来自异类信息系统的信息。在肿瘤委员会会议期间，经常采用手写笔记来捕获与多学科小组共享的信息，以为针对患者的小组定义治疗计划的开发提供背景，并追踪哪些医疗人员参与了小组定义的治疗计划。

目前，健康护理信息系统仅包含科室特定的患者信息。缺乏所有相关的健康护理信息系统（例如，EMR、RIS、PACS、DP、LIS和其他相关系统）的整合可以阻止医疗人员能够针对特定患者跨系统进行搜索以更好地理解患者的信息的综合整体视角。医疗人员经常在患者身上搜索每个个体系统，并手动检查、比较和关联和/或聚合信息以确定可能存在于多个临床值中的相关或独特模式。

医疗人员也面临着记录在多学科肿瘤委员会会议期间发生的讨论和治疗计划的挑战。在许多情况下，信息由医生、护士或其他行政人员记录，这些人员有时在会议发生几天或几周后向EMR输入自由文本。然后，在没有临床背景的直接益处或讨论的即时性（其将允许准确地记录群体对患者治疗计划的一致意见）的情况下，管理团队面临解译或解释他人的手写笔记的挑战。此外，自由文本文件提出了轻松挖掘数据以供将来分析或肿瘤委员会注释和建议内未记录的相关模式的挑战。

患者的相关临床值的绘制通常涉及输入若干信息系统（因为许多期望的临床值存在于不同信息系统中），随着时间聚合相关的临床结果，将聚合的数据输入到可视化应用中，以及然后最终将信息呈递在可视图表中。结果产生的图表可能是静态的，并且几乎不提供或不提供回到源系统的连接。医生不能与图表交互以添加附加的数据点，或者从图表中探索其他相关的潜在临床值，除非医生进入引起感兴趣临床值的特定信息系统。如果医生想记录制图练习，医生必须将其添加到患者的纸质病历中，或者决定将.PDF报告添加到哪个特定信息系统。

返回参考多学科肿瘤委员会会议，此类会议目前要求医疗人员依赖过时的技术，诸如来自异类信息系统的印刷笔记、手写笔记和具有从异类信息系统复制/粘贴的信息的PowerPoint展示。参加多学科肿瘤委员会会议的每位医生经常查看来自其临床领域的独特信息系统的相关信息，而没有来自其他学科的临床背景的益处。由于相关信息是“碎片化”在一起的，因此很难查看所有相关的患者信息和属性，并记录或标记作为背景展示的特定相关数据点，以了解患者当前的临床状态和最终治疗决定。

当前的医疗信息系统可以要求医疗人员和其他临床护理提供者和管理员写出自由形式的文本笔记或从下拉菜单中选择值来描述患者的医疗状态。患者的整体医疗状态包括许多个体要素，诸如患者吸烟史、过敏史、药物过敏史、当前药物治疗以及许多其他医疗相关特征或事件。当从医疗信息系统检索到这些条信息并由医疗人员查看时，该信息通常以与原始输入信息相同或类似的基于文本的格式显示。尽管原始信息本身可用，但信息的格式（即原始文本或下拉菜单值）通常需要查看者视觉上解析和阅读文本以理解患者的医疗状态。阅读这样的列表是耗时的，并且它通常要求用户记住可能容易忘记的项目列表，而没有现成的助记符来辅助记忆患者的“整体图片”。

过去的解决方案已经集中于基于文本的设计，其倾向于将可视屏幕空间细分为专用于不同医疗信息领域的离散形式或“区域”。这些区域中的每一个都分别填充了文本、表单域或两者。图片的或可视元素很少（如果有的话）用于为患者提供关键医疗事件或健康状态指示器的总结状态。

发明内容

本申请尤其涉及用于整合临床护理的信息学平台，其提供了用于整合来自相关患者信息系统的信息的架构。该信息学平台可包括：可视化和工作流程工具，其可用于准备和审核在多学科委员会会议上的信息；患者事件的可视时间线；搜索引擎，其用于搜索具有特定属性的患者；制图工具，其可以在单个图表中显示异类临床变量；虚拟插接板（PinBoard），其用于使用户识别委员会会议的相关患者信息；图像查看应用，其可以提供来自不同信息系统的图像的“并排”比较；结构化报告功能，其整合了系统聚合的患者信息和委员会建议；应用界面，其能够实现临床相关的工具的整合，以提供患者特定参考；协作接口，其有助于患者特定信息的通信并将讨论线索作为独立参考点记录；以及为每个临床专业定制的相关患者信息的默认显示。

附图说明

图1示意性地示出了信息学平台系统的实施例。

图2示意性地示出了由图1描绘的信息学平台系统的服务器的实施例。

图3示意性地示出了来自图2的服务器的信息学平台的实施例。

图4示出了来自图3的信息学平台的工作流程工具所显示的图形用户界面（GUI）的示例性屏幕截图。

图5示出由搜索引擎从图3的信息学平台显示的GUI的示例性屏幕截图。

图6示出了来自图3的信息学平台的患者数据追踪器所显示的GUI的示例性屏幕截图。

图7示出了由工作流程工具从图3的信息学平台显示的GUI的示例性屏幕截图。

图8示出了来自图3的信息学平台的图像查看器所显示的GUI的示例性屏幕截图。

图9示出了由工作流程工具从图3的信息学平台显示的GUI的示例性屏幕截图。

图10示出了由第三方应用工具从图3的信息学平台显示的GUI的示例性屏幕截图。

图11和图12示出了由协作工具从图3的信息学平台显示的GUI的示例性屏幕截图。

图13示出了具有由工作流程工具显示的管理页面的GUI的示例性屏幕截图。

图14示出了具有由工作流程工具显示的展示页面的GUI的示例性屏幕截图。

图15示出了用于利用搜索引擎执行患者搜索的过程的实施例的流程图。

图16-18示出了由搜索引擎显示的具有自动化类似患者搜索页面的GUI的示例性屏幕截图。

图19和图20示出了由搜索引擎显示的具有手动类似患者搜索页面的GUI的示例性屏幕截图。

图21示出了显示交互式建议表单的GUI的示例性屏幕截图。

图22示出了显示患者数据追踪器的GUI的示例性屏幕截图。

图23示出了具有由工作流程工具显示的虚拟插接板页面的GUI的示例性屏幕截图。

图24示出了具有由工作流程工具显示的虚拟插接板文档页面的GUI的示例性屏幕截图。

图25示意性地示出了用于提取和关联患者数据的过程的实施例。

图26示出了显示可视概要页面的GUI的示例性屏幕截图。

图27示出了从信息学平台的主页选项卡显示主页的GUI的示例性屏幕截图。

图28示出了显示来自第三方应用的参考页面的GUI的示例性屏幕截图。

图29示出了显示来自信息学平台的患者选项卡的患者页面的GUI的示例性屏幕截图。

图30是图示了在所管理的（curated）肿瘤学数据集顶上的本公开的示例性生物统计分析工具的图。

图31是图示了示例性研究员/医师工作流程的图。

图32是图示了示例性应用小部件的图。

图33是图示了示例性生物统计分析工具工作空间的图。

图34示出了在计算机系统聚合患者的神经肿瘤学临床数据之后在交互式显示器上展示的项目的示例性屏幕截图。

图35示出了多变量神经肿瘤学交互时序型可视化工具主屏幕。

图36示出了使多个患者属性可视化的多变量神经肿瘤学交互时序型可视化工具。

图37示出了如由多变量神经肿瘤学交互时序型可视化工具绘制的患者的体重属性（1）和Karnofsky值属性（2）随时间的趋势的示例。

图38示出了多变量神经肿瘤学交互时序型可视化工具的“鼠标悬停”功能（1）和手动输入功能（2）。

图39示出了多变量神经肿瘤学交互时序型可视化工具的“肿瘤标记”按钮。

图40示出了示例性的临床测序示意图。

图41示出了用于临床测序的样品收集、制备和测序的示例性示意图。

图42示出了用于临床测序的对齐、变体调用和注释的示例性示意图。

图43示出了用于评估变体的临床影响的示例性数据库。

图44示出了示例性的报告生成。

图45示出了利用单个基因组参考数据库的当前基因组测序工作流程的示例。

图46示出了根据本发明实施例的完全整合的基因组测序工作流程，在下文中称为“RAPID”。

图47示出了根据本发明实施例的数据库整合架构。

图48示出了根据本发明实施例的交互式癌症治疗可视化工具。

图49示出了FDA批准的用于特定遗传改变的药物的另外的药物信息。

图50示出了针对来自NCCN、ASCO和Local的特定遗传改变用于超链接以显示完整指南的可用指南。

图51示出了特定遗传改变的完整指南的示例性显示。

图52示出了涉及特定遗传改变的书面文本的显示。相关文本可以突出显示。

图53示出了患者对药物的反应的示例性选项。

图54示出了对患者对药物的反应的选择。

图55示出了患者对药物的特定反应。

图56示出了多种基因改变和交互界面，以使FDA批准的药物针对每个特定患者存在的各种遗传改变中的每一种可视化。

图57示出了用于从源系统访问基因组报告的选择。

图58示出了来自源系统的示例性完整基因组报告。

图59示出了用临床医生可进一步更新以改进查询结果的过滤器选择特定于这些基因改变的开放式临床试验的多个基因改变和交互界面。

图60示出了用于改进临床试验搜索的示例性交互式过滤器。

图61示出了用于交互式过滤的示例性参数。

图62示出了用于交互式过滤的示例性参数。

图63示出了满足来自临床试验搜索中的细化的参数的示例性匹配试验。

图64示出了用于特定遗传改变的示例性标示外药物。

图65示出了标示外药物的附加信息。

尽可能地，遍及各附图使用相同的附图标记来指代相同或类似的部分。

具体实施方式

本申请总体上涉及用于整合临床护理的信息学平台，其提供利用相关患者信息系统的全面整合的架构。信息学平台整合了为医疗人员提供用于诸如以下各项的访问特性和功能的能力的系统和方法：肿瘤学肿瘤委员会可视化和工作流程工具，其为医疗人员提供准备多学科肿瘤委员会会议和在多学科肿瘤委员会会议展示的能力；可视时间线，其允许按科室和程序过滤；基于特定临床属性的自动和手动搜索查询，这些属性提供具有匹配临床属性的类似患者群体的搜索结果，以容易地使类似患者的先前治疗/结果可视化，以及用于搜索可能符合临床试验或其他研究目的的条件的类似患者的“群体”的能力；图形工具，提供用于将异类临床变量（目前位于异类信息系统中）可视化并提供访问对应于特定日期和时间的定性图像和报告的能力；肿瘤委员会插接板和工作流程，其提供软件工具集来标记相关的背景患者信息，其包括图像、报告、实验室值、超链接和其他可访问的信息，以便于在准备、展示中访问和关于肿瘤委员会的未来参考；图像查看应用，其提供基本的图像操作，直接SSO（单点登录）访问源PACS和DP信息系统和“并排”比较图像；结构化报告功能，其提供系统聚合的患者信息、特定于患者的临床试验查询结果、以及捕获多学科肿瘤委员会建议的机制；应用界面（类似于“应用”商店），其能够实现来自第三方供应商的临床相关工具的整合，以提供患者特定的参考；同步和异步协作接口，其促进患者特定信息的通信，将讨论线索记录为独立参考点，为虚拟肿瘤委员会和临床咨询提供界面，以及记录不一致的临床信息的解决方案；以及为参与治疗肿瘤患者的每个临床专业定制的相关患者信息的默认显示。

本申请还总体上涉及一种工作流程工具，其能够实现来自多学科肿瘤委员会的、与癌症患者治疗计划相关联的信息的准备、展示和存档。工作流程工具包括允许用户利用以下特征的系统和方法：从异类信息系统按时间顺序的背景患者数据的可视化；可视时间线，其允许按科室和程序过滤；图像查看应用，其提供对源信息系统的基本图像操作和直接访问；可视化界面，其提供特定于肿瘤患者属性的相关临床信息，使医生能够利用用于深入探讨完整粒度细节信息的能力来轻松使当前状态详细信息可视化；同步和异步协作，其用于使医疗人员轻松共享临床信息和通信；患者列表，其提供图形指示器，以利用了解患者肿瘤委员会的讨论要点的直接机制来了解肿瘤委员会展示的当前状态和准备情况；以及界面，其使肿瘤委员会管理人员具有快速看到患者、了解准备要求、参与和分配会议室和医生日历的能力。

本申请进一步总体涉及搜索工具，其使得医疗人员能够搜索包含来自诸如EMR、放射学RIS（放射学信息系统）/ PACS、数字病理学、和LIS系统的信息系统的信息的数据库。搜索工具包括以下应用：基于特定但可编辑的临床特征为具有特定癌症类型的患者自动执行搜索查询并显示具有类似临床特征、治疗和结果的患者的患者简档的自动化类似患者搜索，；以及用以基于非常具体的临床属性来寻找类似患者的“池”以找到匹配特定特征的患者的手动交互式类似患者搜索。

本申请另外涉及提供肿瘤委员会建议表单的系统和方法，该肿瘤委员会建议表单向医疗人员提供记录患者背景信息、相关实验室报告、和临床测试结果的能力，这些内容与结构化肿瘤委员会建议一起展示，可以被挖掘以用于分析和未来疾病模式。该系统和方法为用户提供以下特征：用于包括放射图像和报告的交互能力；用于包括病理图像和报告的交互式能力；用于包括基因组测序图像和报告的交互能力；用于包括相关患者信息（例如年龄、性别、临床问题、过敏和当前药物）、肿瘤信息（例如，癌症的类型，尺寸，位置，分期和TNM（T =肿瘤侵入性评分，N =节点参与评分，M =转移评分））和具有编辑临床值的能力的其他相关人口统计信息的自动化能力；用于轻松选择逐级下达、结构化肿瘤委员会建议的交互式能力；用于使用相关患者和临床属性作为关键词来自动填充患者特定的临床试验的能力；用于记录可以为患者执行的附加临床测试的能力；以及用于基于他们对参加的回复（RSVP）来捕获参加肿瘤委员会会议的医疗人员的能力。

本申请还进一步总体上涉及能够实现随时间对各种临床变量的可视化和操纵的系统和方法。这样的系统和方法允许在所选择的时间段内对多个实验室值进行制图。此外，可以对特定患者生物标记的水平进行制图。同样，诊断图像、化学疗法治疗和其他程序也可以在相同的背景中制图，以提供以前尚未考虑的数据点的相关。

本申请还总体上涉及虚拟“插接板”，其使得医疗人员能够根据肿瘤学、放射学、病理学和其他贡献科室来指定具体患者数据点，其包括例如放射学图像、实验室报告、临床注释、和检测结果。医疗人员能够将信息“保存到肿瘤委员会”，该信息可以通过临床领域分类并编号，以向参与者提供用于由临床专家交互式地查看准备状态的能力。此外，虚拟插接板被保存并记录为针对肿瘤委员会做出的治疗决定的支持性证据。其他用户具有参考详细的临床信息的能力，这些信息为将来患者的特定肿瘤委员会提供背景作为该患者的参考，并更好地了解其他类似患者如何接受治疗。

本申请还总体上涉及用于管理两个广泛领域中的患者信息的患者健康状态工具：（1）普通患者健康，包括例如：过敏状态、吸烟/不吸烟、当前药物、过去的手术干预、以及表现状态（如Karnofsky、Zubrod、Lansky评分）；以及（2）包括“TNM分期”和生物标记状态（用于激素、基因和其他生物学测量例如HER2状态、孕酮受体（PR）抗体水平、雌激素受体（ER）抗体水平和Ki-67蛋白质表达水平）的肿瘤学特定状态测量。

本申请的一个优点是使医疗人员能够对患者信息进行可视化、相关、协作和可行动的洞察，以改善患者护理。

本申请的另一个优点是在单个易于使用的界面中提供相关患者信息的智能可视化。

本申请的另一个优点是用于提供全部源自异类信息系统的患者临床信息的工作流程和可视化的能力。

本申请的又一个优点是医疗人员可以在肿瘤委员会会议期间用交互式建议表单来快速记录治疗决定，所述交互式建议表单可以提供针对患者的临床背景和通过结构化报告对患者的治疗计划进行文档记录的简单方式。

本申请的又一个优点是生成结构化的、高分辨率的、医生管理的、诊断和治疗决定数据的“中心”。

本申请的另一个优点是其使得多学科护理团队能够在临床上将相关的患者数据与当前最好的证据进行整合以通知临床决定并改善患者的护理质量。

结合以示例的方式示出本申请的原理的附图，根据对所标识的实施例的以下更详细的描述，本申请的其他特征和优点将显而易见。

信息学平台

本申请总体上针对用于整合临床护理的信息学平台，其提供了能够实现存储专利数据和信息的相关信息系统的整合的架构。在一个实施例中，信息学平台可以用于整合肿瘤患者的患者数据。信息学平台可使医疗人员（例如医生、临床医生、管理员、医师、研究者和专家）能够在单个位置容易地获得更多的患者信息，从而能够实现医疗人员关于患者信息的改善可视化、相关、协作和可行动洞察。

信息学平台可为医疗人员提供用于医疗委员会会议（例如肿瘤学肿瘤委员会会议）的工作流程工具。工作流程工具为医疗人员提供了在多学科委员会会议上准备和展示关于患者的信息的能力。工作流程工具可以按时间顺序显示来自异类信息系统的背景患者数据，以供医疗人员可视化。在一个实施例中，由工作流程工具访问的信息系统可以包括但不限于EMR（电子病历）、PACS（图片归档和通信系统）、RIS（放射信息系统）、数字病理学（DP）CL-LIS（临床实验室 - 实验室信息系统）、AP-LIS（解剖病理 - 实验室信息系统）和下一代测序（NGS）系统。医疗人员在准备召开委员会会议时可以使用工作流程工具来总结相关信息（例如肿瘤信息）和来自异类信息系统的患者人口统计资料。工作流程工具可以提供与患者相关的相关事件的交互式可视时间线，并允许对时间线进行智能过滤，以仅获得对医疗人员感兴趣的事件。工作流程工具允许医疗人员在委员会会议期间或之前实时（同步）或在不同时间（异步）协作和交换想法和信息。该工作流程工具还可以结合第三方在线参考工具，该第三方在线参考工具可以经由相关患者临床值来提供自动背景访问。

工作流程工具允许医疗人员标记或标志诸如图像、报告、实验室值、超链接和可通过信息学平台访问的其他信息的相关的背景信息，以便于容易访问与委员会会议有关的准备、展示和未来参考。该工作流程工具提供了虚拟的“插接板”，使来自不同科室（如肿瘤学、放射学、病理学和其他贡献科室）的医疗人员能够指定特定患者数据点，其包括例如放射图像、实验室报告、临床注释或检测结果。医疗人员能够将信息“保存到委员会会议”，工作流程工具可以通过临床领域和数字来对该信息进行分类，以向委员会会议的参与者提供交互式查看个体患者的准备状态和相关信息的能力。

信息学平台可以包括可以由科室、程序或其他类似的过滤参数过滤的患者事件的可视时间线，以仅获得感兴趣的患者事件。图像查看应用可以包括在信息学平台中，以提供对源PACS和DP信息系统的基本的图像操纵和直接SSO（单点登录）访问。图像查看应用可以提供来自不同专业和/或信息系统的图像的并排比较。图像查看应用还通过传递SSO和背景信息来提供对源信息系统的1个按钮访问。信息学平台可以具有用于针对涉及患者治疗的每个临床专业定制的相关患者信息的默认显示的一个或多个协议集合。

信息学平台可以基于特定的临床属性来提供用于自动化和手动搜索查询的搜索引擎，其提供具有匹配的临床属性的类似患者群体的搜索结果以容易地使类似患者的先前治疗/结果可视化，以及寻找可能符合临床试验或其他研究目的的类似患者的“人群”的能力。搜索引擎具有使医疗人员能够搜索信息学平台数据库的相应的搜索功能。信息学平台数据库可以包括来自EMR、放射学RIS / PACS、数字病理学和LIS系统的信息。

搜索引擎可以用于执行自动类似的患者搜索。自动化的类似患者搜索基于针对特定诊断的医疗人员的搜索查询模式，例如癌症类型。搜索引擎能够基于特定的但可编辑的临床特征来使具有该特定诊断（癌症类型）的患者的搜索查询自动化，所述临床特征可以包括但不限于年龄、性别、生物标记、BIRADS（乳房成像报告和数据系统）分类、分期信息、以前的治疗、结果、和家族史。根据自动化的查询，搜索引擎显示具有类似临床特征、治疗和结果的患者概况。具有类似临床特征的患者列表为医疗人员快速查看其他类似患者已如何对指定治疗作出反应以更好地了解具有类似临床属性的特定患者可能如何对特定治疗计划作出反应提供了资源。

搜索引擎也可以用于交互式类似患者搜索。寻找类似患者的“池”的临床研究人员或临床试验主要研究者可基于驻留在信息学平台数据库中的非常具体的临床属性来使用交互式类似患者搜索。医疗人员具有交互能力来搜索非常具体的临床属性，例如年龄、性别、临床分期、生物标记、组织学、先前的治疗、基因组改变和结果，以找到匹配指定属性和/或特征的患者。医疗人员将通过进一步指定附加属性来具有交互式修改其搜索查询以缩小结果的能力。可对所得到的搜索查询中标识的患者实行附加的分析，并且可以潜在地考虑或招募已识别的患者进行临床试验，这些临床试验在患者的初步临床咨询期间以前不可用。

信息学平台可以包括患者数据追踪器工具，其提供以图形形式使来自异类信息系统的异类临床变量可视化的能力。图表不仅包括数字数据的可视化，还提供对与特定日期和时间相对应的定性图像和报告的访问。患者数据追踪器工具可以能够实现随着时间的推移同时使各种临床变量可视化和操纵各种临床变量。患者数据追踪器应用可以允许在用户选择的时间段内绘制多个实验室值。此外，特定患者生物标记的水平可以绘制和诊断图像、化学疗法治疗和也可以绘制在相同的背景中以提供数据点的相关的其他过程。

信息学平台可以提供结构化报告功能，其提供系统聚合的患者信息、特定于患者的临床试验查询结果、以及多学科委员会会议建议的捕获。结构化报告功能可以包括建议表单，其为医疗人员提供记录患者情景信息、相关的实验室报告和临床测试结果的能力，其连同可被挖掘以用于分析和未来疾病模式的结构化委员会建议一起展示。建议表单包括用于包括放射图像和报告、病理图像和报告、基因组测序图像和报告的交互式能力，以及用于包括相关患者信息（例如年龄、性别、临床问题、过敏和当前药物）、肿瘤信息（例如，癌症的类型、尺寸、位置、分期和TNM）（如果患者是肿瘤患者）、以及具有编辑临床值的能力的其他相关人口统计信息的自动能力。

结构化报告功能提供了交互能力以基于其要参与的RSVP来容易地选择逐级下达、结构化委员会建议和参加委员会会议的医疗人员。结构化报告功能进一步使用相关患者和临床属性作为关键词并自动填充特定于患者的临床试验，因此医疗人员不必退出当前会话并提供用于记录可为患者执行的附加临床试验的结构。

信息学平台可以提供应用工具，其使得能够整合来自第三方供应商的、可以应用于特定患者的临床相关工具和信息。信息学平台提供了开放式架构，其使内部和外部（第三方）两方开发人员能够开发可在信息学平台内操作并可访问与特定患者有关的信息学平台数据库中的临床和背景数据的应用，使得当利用该应用时，不一定要由医疗人员提供附加的输入数据。

应用能够访问特定的临床数据点，诸如性别、年龄、诊断（例如癌症类型）、分期和生物标记。当用户选择应用时，应用会自动展示与患者临床数据相关的编辑结果。例如，可以开发将利用以下数据的应用：性别、年龄、癌症类型、地点、生物标记和程序的应用。根据这些信息，应用可以将这些变量映射到NCCN（国家综合癌症网络）临床指南，显示这些变量如何映射到最合适的指南，并且还显示针对特定患者的建议治疗的下一行。用户将不必输入任意信息，这可节省用户时间并为用户提供更多时间来专注于治疗患者。

医疗人员具有从第三方开发者下载软件应用的能力，从而能够自动传递相关的临床信息。通过选择一个软件应用，医疗人员可启动应用，从信息学平台数据库开始查询临床信息并执行应用以用预先指定的临床数据来执行期望的动作，因此用户不会必须做任意附加的数据输入来获得所需的输出结果。

信息学平台可以包括促进患者特定信息的同步和异步通信并且将讨论线索记录为独立参考点的协作工具。该协作工具还为虚拟委员会会议、临床咨询提供了平台，并以文档记录不一致的临床信息的解决方案。

协作工具具有启用同步和异步协作的通信接口。该协作工具提供与附加的背景患者属性同步和异步的聊天，并且该聊天的文档然后被包括在患者的病历中。协作工具还具有用于确定医疗人员的可用性以及与医疗人员沟通的最佳方法的能力。该协作工具实现异步协作流来记录远程委员会工作流程。

图1示出了实现信息学平台的系统10的实施例。系统10包括具有可由一个或多个客户端设备15访问的信息学平台的服务器12。每个客户端设备15通过网络通信地耦合到服务器12以与服务器12交换（即发送和接收）指令、数据和/或信息。客户端设备15可以是台式、膝上型或平板电脑、手持设备、诸如蜂窝电话（例如智能电话）或便携式游戏设备、静止和/或视频相机或可附接的、可穿戴的、可植入的或非侵入性的计算机或设备。客户端设备15可具有用于允许用户输入用于服务器12的指令、数据和/或信息的一个或多个输入设备，和用于允许用户显示从该服务器12接收的指令、数据和/或信息的一个或多个输出设备。在一个实施例中，连接服务器12和客户端设备15的网络可以是局域网（LAN）并且使用以太网协议在网络上进行通信。然而，在其他实施例中，网络可以是因特网、内联网、广域网（WAN）或使用诸如在使用因特网时的传输控制协议/因特网协议（TCP / IP ）的一个或多个通信协议的任意其他类型的通信网络。

系统10的服务器12还可以访问一个或多个资源以获得可以存储在服务器12的数据库中的数据和信息。服务器12可以通过网络（例如LAN）通信地耦合到EMR系统20以及一个或多个信息系统22（图1中示出了两个信息系统）以交换指令、数据和/或信息。服务器12可以访问EMR系统20和信息系统22并且从EMR系统20和信息系统22检索信息和数据。服务器12然后可以为从EMR系统20和信息系统22检索的信息编索引，并将其存储在可以被信息学平台访问的数据库中。服务器12对信息的索引为信息提供了预定的结构，以便实现能够对数据库中的任意单个索引项目或多个项目进行查询。

在另一个实施例中，数据库和对应的数据和信息可以是位于与服务器12分离的计算机上的“远程”数据库。如果远程数据库是位于与服务器12相同或服务器12附近的位置，则远程数据库可以由服务器12通过LAN访问，或者如果远程数据库位于远离服务器12的位置，则远程数据库可以由服务器12通过因特网或其他类型的WAN访问。如果远程数据库处于与服务器12不同的位置，则存储在远程数据库中的数据和信息可以被匿名化以符合相应的隐私和安全要求。

服务器12还可以通过网络28（诸如因特网）通信地耦合到一个或多个第三方应用24和一个或多个第三方数据源26以交换指令、数据和/或信息。在一个实施例中，耦合到服务器12的信息系统22可以包括但不限于PACS、RIS、数字病理学、CL-LIS、AP-LIS和NGS系统。在另一个实施例中，第三方数据源26可以包括PubMed、Up-to-Date和clinicaltrials.gov。

图2示出了服务器12的一个实施例。服务器12可以包括逻辑31，在本文中被称为“服务器逻辑”，用于一般地控制服务器12的操作，包括与客户端设备15、 EMR系统20、信息系统22、第三方应用24和第三方数据源26通信。服务器12还包括自然语言处理（NLP）引擎37，以从EMR 20和信息系统22提取数据并提供数据到数据库35和信息学平台33以整合从存储在数据库35中的第三方数据源26、EMR系统20、信息系统22、和第三方应用24提取的数据和信息，并提供相应的工具、接口和功能，以允许客户端设备15的用户检索和使用数据库35中的信息。服务器逻辑31、信息学平台33和NLP引擎37可以以软件、硬件、固件或其任意组合实现。在图2所示的服务器12中，服务器逻辑31、信息学平台33和NLP引擎37以软件实现并存储在服务器12的存储器38中。注意，服务器逻辑31、信息学平台33和NLP引擎37当以软件实现时，可以在任意非暂时性计算机可读介质上存储和传输，以供可以获取并执行指令的指令执行装置使用或与其结合使用。

服务器12可以包括至少一个常规处理元件40，其具有用于执行存储在存储器38中的指令的处理硬件。作为示例，处理元件40可以包括中央处理单元（CPU）或数字信号处理器（DSP）。处理元件40经由可包括至少一个总线的本地接口42与服务器12内的其他元件通信并驱动所述其他元件。此外，可以使用输入接口44（例如小键盘、键盘或鼠标）来从服务器12的用户输入数据，以及可以使用输出接口46（例如打印机、监视器、液晶显示器（ LCD）或其他显示装置）来向用户输出数据。此外，通信接口48可用于通过一个或多个网络与客户端设备15、EMR系统20、信息系统22、第三方应用24和第三方数据源26交换数据。

图3示出了信息学平台33的实施例。信息学平台33可以从数据库35检索数据并将数据存储在数据库35中。信息学平台33可以提供接口、实用程序和工具以允许用户（例如医疗人员）检索数据库35中的数据和信息并使其可视化。工作流程工具52可使用户能够准备、展示和记录或存档与多学科委员会会议相关联的患者信息。患者数据追踪器54可以提供以图形形式使存在于异类信息系统中的异类临床变量可视化的能力。图像查看器56可以提供基本的图像操纵和对源PACS和DP信息系统的直接SSO访问。时间线工具58可以生成可以由科室、程序或其他类似的过滤参数过滤的患者事件的可视时间线，以仅获得感兴趣的患者事件。协作工具60可促进医疗人员之间关于患者特定信息的同步和异步协作和通信并将讨论线索存档为独立参考点。搜索引擎62可以基于特定的临床属性提供自动和手动搜索查询，其提供具有匹配临床属性的类似患者群体的搜索结果，以容易地使类似患者的先前治疗/结果可视化以及搜索可能符合临床试验或其他研究目的的类似患者的“群体”的能力。交互式建议表单64可以提供系统聚合的患者信息、特定于患者的临床试验查询结果、以及多学科委员会会议建议的捕获。第三方应用工具66可以使医疗人员能够访问多个第三方应用或数据源，并且能够实现来自第三方供应商的可以被应用于特定患者的临床相关工具和信息的整合。

图4-12示出了针对肿瘤患者实现的信息学平台33的工具的不同实施例。应当理解，信息学平台33和信息学平台的相应工具和功能可以用于除肿瘤学之外的不同医疗分支或专业。

图4示出了由工作流程工具52显示并且可以用于肿瘤委员会会议的图形用户界面（GUI）的示例性屏幕截图。工作流程工具52使医疗人员能够准备和展示患者信息并将关于癌症患者治疗计划的多学科肿瘤委员会的讨论归档。工作流程工具52包括具有向用户提供不同信息和功能的一个或多个部分的患者信息页面70。患者信息页面70包括概要部分72、时间线部分74、协作部分76和参考工具部分78。

概要部分72总结了相关的肿瘤信息以及与患者相关的患者人口统计数据。概要部分72可以包括关于患者的肿瘤的类型、时期和尺寸的信息。概要部分72还可以包括显示肿瘤位置和关于生物标记和治疗计划信息的图表。由概要部分72提供的肿瘤信息可以在从EMR系统20和/或信息系统22获得之后被聚合在数据库35中。

时间线部分74可以提供交互式可视时间线，其提供智能过滤能力。时间线部分74可以包括与手术、治疗、实验室评估和遗传评估相关的事件或发生。每个特定事件都可以有标识列出的事件的类型的对应的符号。用户能够过滤要展示的时间线以仅包括特定类型的事件或发生在特定时间范围内的事件。

协作部分76能够实现医疗人员之间的同步和异步协作和通信两者。参考工具部分78显示可以将用户链接到对应的应用或参考源的图标。当链接到应用或参考源时，工作流程工具52可以通过提供相关的患者临床值来提供对所选择的应用或参考源的自动背景访问。在一个实施例中，应用和参考源中的一个或多个可以被包括在信息学平台33和数据库35中。参考工具部分78中包括的其他应用和参考源可以由第三方实体提供。第三方应用可以被下载并存储在数据库35中或在匿名化患者临床值之后通过网络28访问。可以包括在参考工具部分78中并且可以从参考工具部分78访问的应用的一些示例包括可视化应用（例如，数据追踪器）和搜索应用（例如，患者池）。可以包括在参考工具部分78中并且可以从参考工具部分78访问的参考源的一些示例包括PubMed和Google Scholar。

参考工具部分78还可以包括基础医疗图标/应用，其提供到由FoundationMedicine有限公司提供的全基因组测试的订单表单的超级链接、提供对到Molecularmatch.com界面的API（应用编程接口）的访问以启动临床试验搜索查询的分子匹配图标/应用、以及提供访问交互式临床指南应用（例如NCCN）的交互指南图标/应用。分子匹配应用可以从患者的临床属性中取得所提取的相关的关键词来制定搜索查询。交互指南应用可以从特定患者获取相关的临床信息，并将其映射到临床指南，以为医疗人员提供关于从治疗的角度来看患者将位于临床指南的哪里的信息。

图5示出由搜索引擎62显示的GUI的示例性屏幕截图。搜索引擎62使得医疗人员能够使用自动和手动查询两者来搜索数据库35，其包括来自EMR系统20和信息系统22的信息，诸如放射RIS / PACS 、数字病理学和LIS。搜索引擎62包括具有向用户提供不同信息和功能的一个或多个部分的搜索结果页面80。搜索结果页面80包括结果部分82、属性选择部分84、显示部分86和日期范围选择部分88。

结果部分82提供数据库35中匹配来自搜索查询的所选择的属性的患者的列表。在一个实施例中，用户可以选择结果部分82中的患者之一并且被提供有所选择的患者的医疗文件。在另一个实施例中，用户可以在结果部分82中选择几个患者并且提供所选择的患者的属性的比较。属性选择部分84可以提供界面以选择临床属性以用于启动对类似患者的更新搜索。在一个实施例中，可以用于搜索类似患者的临床属性可以包括肿瘤时期、生物标记、和组织学。可能被搜索的其他属性可以包括癌症类型、吸烟史、性别、年龄和物理位置。

显示部分86能够实现匹配属性的可视或图形显示。显示部分86可以使用不同的类别来组织用于显示的信息和属性。类别的一些示例可以包括年龄、性别、治疗和基因组改变。然后可以将这些类别进一步组织为子类别，以为显示的结果提供更多细化。例如，治疗类别可以包括治疗类型和疗法类型的类别。然后，显示部分86可以显示与选择的属性匹配的每种治疗类型的患者数量有关的信息。日期范围选择部分88提供交互式界面以选择年/月/日的范围来更新类似患者的查询。用户可以利用范围选择部分88选择日期范围的开始点和日期范围的持续时间或长度。搜索引擎62然后使用选择的日期范围将搜索的范围限制为仅具有所选择的日期范围内的所选择的属性的那些患者。

图6示出了由患者数据追踪器54显示的GUI的示例性屏幕截图。患者数据追踪器54在包括对定性研究的访问的定量显示（图表）中提供多个患者属性的可视化，例如实验室结果和图像以及治疗。患者数据追踪器54包括具有向用户提供不同信息和功能的一个或多个部分的用户界面90。用户界面90包括表格部分92、制图部分94和时间线部分96。

表格部分92可显示用于由用户选择的预定时间段的多个临床实验室程序和相关属性的数字结果。制图部分94可以提供来自表格部分92的一个或多个结果的自动制图。自动制图可以是与表格部分92相同的时间段，或者用户选择的不同的预定时间段。制图部分94还可以包括用于治疗和成像过程的图表，其提供数字结果，例如从成像过程确定的肿瘤尺寸。在一个实施例中，制图部分94可以在独立的X / Y轴上绘制具有不同比例的数值。此外，在图像或非数字数据的情况下，可以沿着与绘制的时间轴对应的时间轴按时间来按时间顺序绘制图像或非数字数据的缩略图或其他对应图标。制图部分94可以显示在表格部分92中包括的所有结果，或者可以显示由用户选择的特定结果。时间线部分96可以提供患者时间线，其在图像或非数字数据显示在制图部分94中时自动过滤相关成像过程，以允许用户容易地从制图部分94中的图表视图直接超链接到成像研究。

图7示出了可以用于肿瘤委员会会议的由工作流程工具52显示的GUI的示例性屏幕截图。工作流程工具52为医疗人员提供虚拟“插接板”，以为患者的多学科肿瘤委员会会议按类别记录和存储相关的临床信息。工作流程工具52包括具有向用户提供不同信息和功能的一个或多个部分的虚拟插接板用户界面100。在一个实施例中，可以从肿瘤委员会时间线元件或肿瘤委员会主菜单访问虚拟插接板用户界面100。虚拟插接板用户界面100包括计数器部分102、显示部分104和准备情况指示器106。

计数器部分102包括用于每类临床信息的计数器，其追踪特定医疗人员在肿瘤委员会会议中使用的所选择的或“钉固”在类别中的临床项目的数量。在一个实施例中，医疗人员可以通过选择“保存肿瘤委员会”选项来手动钉固或选择项目，因为他们正在查看时间线元素。此外，医疗人员还能够通过保存为“关键图像”并且在关联的评论栏中添加“TB”或“CT”来从源系统中“标记”或选择与患者有关的图像或报告。“关键图像”标识和预选关键字的使用使得信息学平台33能够将来自源系统的标记信息与用于患者的虚拟插接板相关联。

除了对按类别选择的临床项目的数量进行计数之外，计数器部分102还可以追踪特定医生或专家选择的临床项目的数量。在一个实施例中，每个时间线元素具有基于提供元素的源系统的相关联类别。使用时间线元素的相关联类别，信息在钉固时保存到虚拟插接板的相应类别中。在一个实施例中，用于虚拟插接板的信息的“钉固”通常可由来自与该信息的类别对应的科室的医疗人员执行。例如，放射科医生可以检查时间线中的放射图像，放射科医生可以决定将图像“钉固”到放射科类别的虚拟插接板上。医疗类别的一些示例可以包括放射学、病理学、分子/ NGS、治疗、实验室和检测结果以及资源。另外，选择项目的人被存储并与选择的项目相关联。在一个实施例中，医生可以为多个类别选择临床项目，并且每个类别可以包括由多于一名医生选择的临床项目。医疗人员（诸如肿瘤科医生）可以根据所选择的临床项目的数量指示的每个类别或专业的活动来估计肿瘤委员会会议的准备情况。

显示部分104可以向用户提供针对类别选择的临床项目的代表性缩略图图像和.pdf的显示。用户可以从计数器部分102中选择感兴趣的类别，并且显示部分可以提供在该类别中包括的项目的缩略图。缩略图可以包括选择项目的医生以及项目的简要描述和项目生成的日期。显示部分104中的缩略图可以由用户选择并且可以向用户提供对临床项目的访问。例如，如果选择了X射线缩略图，则会为用户显示相应的X射线并允许用户与X射线信息交互。准备状态指示器106可以是复选框或由医生在每个参与临床专科中选择以指示医生在他/她准备相关患者的肿瘤委员会讨论时准备就绪的其他类似指示器。在一个实施例中，工作流程工具52基于用户登录到信息学平台33而知晓用户。当用户手动点击或选择针对类别的“就绪”复选框、按钮或其他对应的显示选项时，工作流程工具52在该类别下指示使用用户的登录以识别该人员的已选择的就绪复选框的人员的姓名。在一个实施例中，一个或多个医生或专家可被指示为对于特定类别准备就绪。

图8示出了由图像查看器56显示的GUI的示例性屏幕截图。图像查看器56提供了成像查看应用，以使医疗人员能够查看与患者相关联的医疗图像。查看器56包括具有向用户提供不同信息和功能的一个或多个部分的用户界面110。用户界面110包括操作工具112、图像比较部分114和“去往”按钮116。

操纵工具112向用户提供在显示的图像上执行不同功能的能力，以更好地增强用户对所显示的图像的查看。可以对图像执行的一些功能包括平移、缩放、翻转、旋转、亮度/对比度和移动。

图像比较部分114能够实现不同类型和来自不同信息系统的图像的多模态图像比较。例如，图像比较部分114可以在患者的病理图像旁边显示患者的放射图像。在一个实施例中，图像比较部分114可以使医疗人员能够查看具有来自不同信息系统的图像的患者的相同区域。为了访问图像比较部分114中的多个图像，医生必须通过在图像比较部分114中显示图像来手动选择第一图像。当医生想要将当前显示的图像与另一个图像进行比较时，医生会点击或者选择可以位于图像比较部分114附近的“比较”按钮来启动比较模式。然后，医生可以通过点击或选择所需图像来选择另一图像进行比较，然后所选择的图像可以显示在原始图像旁边或与其并排显示。去往按钮116利用患者背景来提供SSO访问以打开针对图像的源系统（例如，PACS /放射学、DP /病理学或NGS /基因组学）内的患者的全保真度成像研究。

图9示出了可以用于肿瘤委员会会议的由工作流程工具52显示的GUI的示例性屏幕截图。工作流程工具52包括交互式建议表单64。在一个实施例中，可以通过点击或选择肿瘤委员会展示模式窗口的左上角的“建议表单”按钮来访问交互式建议表单64。交互式建议表单64可以为医疗人员提供记录在肿瘤委员会会议上展示的患者背景信息、相关实验室报告和临床测试结果的能力，并且准备可以被挖掘用于分析和未来疾病模式的结构化肿瘤委员会建议。

交互式建议表单64为医疗人员提供了在准备患者的特定建议或治疗计划时选择逐级下达的、结构化的肿瘤委员会建议的能力。在一个实施例中，医疗人员可以基于肿瘤委员会会议期间存在的多学科医生的对话来实时完成建议表单。工作流程工具52可以捕获参与的医生以包括在建议表单中以进一步记录对建议表单中的治疗计划有贡献的特定组成员。在另一个实施例中，完成的建议表单可以提供给每个参与的医生以获得他们对建议表单中的治疗计划的批准。交互式建议表单64包括具有向用户提供不同信息和功能的一个或多个部分的建议表单界面120。建议表单界面120包括患者信息部分122、治疗部分124和临床试验部分126。

患者信息部分122为医疗人员提供了用于包括相关患者信息（例如年龄、性别、临床问题、过敏和当前药物）、肿瘤信息（例如，癌症的类型、尺寸、位置、分期和TNM分期）、以及具有编辑临床值的能力的其他相关人口统计信息的自动化能力。在一个实施例中，工作流程工具52可以基于数据库35中存储的患者信息来自动填充患者信息、肿瘤信息和人口统计信息中的一些或全部。未由工作流程工具52完成或输入的信息可以由医疗人员手动输入。另外，当将一些信息输入到患者信息部分122中时，可以提示用户输入更多信息以阐明用户的先前输入。例如，如果用户在患者信息部分122的“组织学”选项卡下选择“非侵入性恶性病变”，则可以提示用户输入或选择病变的类型（例如，导管、小叶、未确定的、多形性的、佩吉特病或其他）。

治疗部分124提供结构化界面以记录可以为患者执行的建议治疗（例如，手术、放射疗法、化学疗法、临床试验和其它疗法）和附加临床试验（例如，放射学、病理学和分子学）。类似于患者信息部分122，当向治疗部分124输入信息时，可以提示用户输入其他信息以阐明用户的先前输入。

工作流程工具52使用相关的患者和临床属性（例如性别，年龄，癌症类型，生物标记和/或TNM值）作为关键词或参数来制定搜索查询以在诸如clinicaltrials.gov的一个或多个数据库中执行搜索，用于患者参与的潜在临床试验。一旦基于搜索结果识别出针对该患者的潜在临床试验，则工作流程工具52在临床试验部分126中自动填充所识别的临床试验，因此医生不必退出工作流程工具52以便为患者确定可能的临床试验。

建议表单界面120还向用户提供对交互式NCCN指南的访问，以向医疗人员提供患者当前属性、分期和治疗如何与适当指南匹配的可视化。在一个实施例中，建议表单界面120可以包括作为肿瘤委员会建议的一部分的包括放射图像和报告、病理图像和报告以及基因组测序图像和报告的交互能力。在另一个实施例中，建议表单界面120可以基于其要参与的RSVP来包括参加肿瘤委员会会议的医疗人员作为肿瘤委员会建议的一部分。输入到建议表单界面120中的信息可以被保存在数据库35中，并形成患者病史和/或病历的一部分。

图10示出了由第三方应用工具66显示的GUI的示例性屏幕截图。信息学平台33可以提供开放架构，其使得内部和外部（第三方）开发者能够开发与信息学平台33一起工作的应用。另外，信息学平台33的开放式架构使开发的应用能够访问和使用与特定患者有关的临床和背景数据。当用户访问或启动应用时，应用可以自动访问患者的临床和背景数据，并向用户提供患者特定的结果，而无需用户执行对应用的任意附加的数据输入。例如，对于患有乳腺癌的患者，第三方应用工具66可以聚集源自工作流程工具52中的各个栏的关键词，其可以包括年龄、性别、癌症类型、生物标记和家族史。在聚集关键字之后，第三方应用工具66将聚集的关键字传递到“APP”API中，“APP”API启动搜索查询或特定地与所提供的关键字值相关的其他功能。

第三方应用工具66可以向用户提供“我的应用”界面或小部件132和“应用”界面或小部件134以便访问应用。 我的应用界面132可以包括在信息学平台33的一个或多个工具（例如，工作流程工具52、患者数据追踪器54和协作工具60）中，并且是可以从其启动第三方应用的区域。在我的应用界面132中包括的应用可以是“患者知晓的”并且直接从信息学平台33接收与患者相关联的特定临床和背景属性，使得当用户选择应用之一时，该屏幕立即填充由所选择的应用提供的、特别针对患者的结果分析和可视化。

患者知晓应用可以从数据库35检索患者的特定临床数据点，例如性别、年龄、癌症类型、分期和生物标记。当用户选择患者知晓应用时，患者知晓应用可以自动展示与所检索的患者临床数据有关的编辑结果。例如，可以开发将检索以下患者数据一个应用：性别、年龄、癌症类型、位置、生物标记和程序。从检索到的信息中，应用可以针对 NCCN临床指南来映射数据点、显示数据点如何绘制出或对应于最适合的指南，并显示针对特定患者的建议治疗的下一行。用户不必将任意信息输入患者知晓应用中，这将节省时间并且提供更多时间来专注于治疗患者。

在一个实施例中，用户将具有从在数据库35中存储的第三方开发者下载付费或免费软件应用的能力，并且将能够促进将相关临床信息从数据库35自动传递到应用。在另一个实施例中，用户可以从我的应用界面132中选择应用中的一个，并通过网络28启动或访问应用。应用将从数据库35查询临床信息，并用查询的信息来执行应用以实行所需的动作，因此除启动应用外，最终用户将不必做工作来执行动作并获得所需结果。

可以从信息学平台33的菜单栏中的“应用”图标136访问应用界面134。应用界面134是可以访问通用应用的区域。通用应用不是“患者知晓的”，并且需要用户输入其他信息以启动与应用的交互。在一个实施例中，通用应用不使用患者特定信息，并且可以针对提供对患者独立信息（例如治疗指南）的访问，或者可以针对提供对信息学平台33的工具之一（例如，搜索引擎62）的访问。

图11和图12示出由协作工具60显示的GUI的示例性屏幕截图。协作工具60提供通信接口，该通信接口能够实现医疗人员之间的同步和异步协作两者。在一个实施例中，协作工具60可以与工作流程工具52一起使用。然而，在其他实施例中，协作工具60可以与信息学平台33的其他工具一起使用或者作为独立工具来使用。协作工具60可以包括聊天界面142（参见图11）、咨询界面144（参见图11）和虚拟会议界面146（参见图12）。

聊天界面142使得两个或更多个医生或其他医疗人员能够在彼此之间进行同步或异步通信。当医生或医疗人员同时（即实时）使用聊天界面142时，发生同步通信。当医生或医疗人员在不同时间（例如离线）使用聊天界面142时，发生异步通信。除了交换消息之外，聊天界面142使医生或其他医疗人员能够用要交换的消息来包括诸如图像和报告的背景患者属性。

聊天界面142可以包括消息收发功能以允许医疗人员彼此交换消息。另外，聊天界面142还可以基于用户的登录状态来确定用户存在，并且可以向其他用户提供检测何时特定用户正在访问信息学平台33并且可用于协作的能力。另外，聊天界面142可以用于在交换关于患者的消息时共享临床背景和信息。聊天界面142还提供保存协作会话并将保存的协作会话包括在患者的病历中的能力。

咨询接口144使医生能够以实时（同步）和离线（异步）模式从一位医生向另一位医生请求即席咨询会话。在一个实施例中，协作工具60可以记录关于患者的聊天和咨询，并且可以将记录的聊天和咨询包括为患者的病历的一部分。在另一个实施例中，协作工具60可以确定医生的主动可用性以及与医生的最佳沟通形式。

虚拟会议界面146可用于启动并记录用于远程或虚拟肿瘤委员会工作流程的异步协作流。在虚拟肿瘤委员会中，医疗人员可以“钉固”信息，为其具体学科提供背景概述，并提供“草稿”建议表单和治疗计划以供委员会查看。一旦所有医疗人员已经表明“准备就绪”并且准备好了“草稿”建议表单和治疗计划，则虚拟会议界面146提供异步协作窗口以捕获针对每位参与医生的委员会成员和/或笔记之间的任意同意/不同意。如果所有委员会成员都同意“草案”建议表单和治疗计划，则虚拟会议界面146将建议表单和治疗计划的状态改变为“最终”，并记录参与的医疗人员和确定完全共识的对话。如果委员会成员和负责医生之间没有100％的一致意见，由于患者不想继续进行关于虚拟肿瘤委员会的“草案”治疗计划，虚拟会议界面146可以将患者添加到下一个实体肿瘤委员会。虚拟会议界面146可以使得用户能够为虚拟肿瘤委员会离线或异步地查看和准备并且提供用于交互式治疗表单或建议表单的相应输入，其可以在发生实体肿瘤委员会事件之前发生。

工作流程工具

工作流程工具52能够准备、展示和存档与涉及癌症患者治疗计划的多学科肿瘤委员会相关联的信息。工作流程工具52使得医疗人员能够：根据异类信息系统22按时间顺序使背景患者数据可视化；访问时间线工具58用于允许按科室和程序过滤的可视时间线；访问提供基本图像操作的图像查看器56，并排比较来自不同专业的图像并直接访问源信息系统22；利用深入探讨完整的粒度细节的能力使肿瘤患者特定的相关临床信息可视化；访问提供同步和异步通信以及共享临床信息的协作工具60；访问提供图形指示器的患者列表，以利用理解患者肿瘤委员会的讨论要点的能力来了解肿瘤委员会展示的当前状态和准备情况；并访问界面以使肿瘤委员会管理人员能够迅速查看要讨论的患者，了解准备要求和进展，查看医生参与情况并分配或安排会议室和医生日历。在一个实施例中，工作流程工具52可以用于不同癌症类型的肿瘤委员会，诸如乳房、肺、ENT（耳、鼻和喉）、GI（胃肠）、Gyn（妇科）、Hemo（血液学）和Neuro（神经）。

图13示出了显示用于工作流程工具52的管理页面的GUI的示例性屏幕截图。管理页面150提供了能够管理肿瘤委员会会议、提供关于要在肿瘤委员会事件中讨论的患者的信息、并提供对肿瘤委员会进展现状的了解的工具。管理页面150具有向用户提供不同信息和功能的一个或多个部分。管理页面150包括对话部分152、事件部分154、患者列表部分156和患者卡部分158。

对话部分152提供关于肿瘤委员会事件细节的信息，诸如肿瘤委员会的时间、日期和位置、用户的RSVP状态、以及参与肿瘤委员会的其他医疗人员的RSVP的数量和状态。

事件部分154显示肿瘤委员会事件细节，诸如要在肿瘤委员会讨论的病例的数量以及要在肿瘤委员会讨论的患者的准备情况，即准备就绪或未准备就绪。事件部分154还提供了对信息进行过滤以获得用户更集中的结果的能力。

患者列表部分156显示可通过癌症类型来过滤的患者列表。患者列表部分156包括用于患者列表部分106中包括的、并且将在肿瘤委员会会议上进行讨论的每个患者的患者卡部分158。患者卡部分158提供患者详细信息，其可以包括以下各项：姓名、性别、年龄、MRN（病历号）、照片、负责医师、讨论点和准备情况计数器，其可以类似于在图7中示出的计数器部分102和准备情况指示器106。

图14示出了显示用于工作流程工具52的展示页面或小部件的GUI的示例性屏幕截图。展示页面160可用于展示由医疗人员“标记”的临床信息作为肿瘤委员会为患者做出最合适的治疗计划所需的最相关的临床信息。展示界面160具有向用户提供不同信息和功能的一个或多个部分。展示界面160包括患者细节部分162、菜单栏164和展示工作空间166。

患者详细信息部分162向用户提供基本患者信息，并且当用户选择时，在展示工作空间166中提供详细患者概要。在展示工作空间166中显示的患者概要可以包括来自患者概述页的细节并包含患者最近临床报告的概要。在一个实施例中，医生可以在肿瘤委员会会议上准备/展示该信息。

专业插接板菜单栏164为用于存储由医疗人员钉固或标记的信息的若干专用插接板提供“选项卡”。在一个实施例中，可以有用于放射学、病理学、分子/ NGS、治疗、实验室和测试结果以及资源的专业插接板。另外，可以存在显示来自展示工作空间166中的每个专用插接板的信息的“全部”选项卡。在另一个实施例中，专业插接板的选项卡可以对应于图7的计数器部分102的类别。最相关的临床图像、报告和相关信息可以存储在专业插接板中，并且当用户选择其中选项卡之一时，可以将其显示在展示工作空间166中。展示工作空间166显示所选择的专业插接板的关联信息，并且可以通过选择与不同专业插接板相关联的不同选项卡来更新在展示工作空间166中显示的信息。

返回参考图4，工作流程工具52的患者信息页面70可以在必要的情况下利用深入探讨详细的源系统细节的能力来提供对患者的概要浏览，使得医疗人员可以快速了解患者的当前状态。如之前关于图4所描述的，概要部分72可以显示总结癌症类型、生物标记、状态、肿瘤尺寸和其他参数的图形信息。另外，工作流程工具52可以包括虚拟插接板，以按照类别记录和存储相关的临床信息，用于如参照图7描述的患者的多学科肿瘤委员会、如参照图8描述的图像查看器56、如关于图10所描述的第三方应用工具66、以及如关于图11和图12描述的协作工具60。

搜索引擎

搜索引擎62整合搜索工具，其使得医疗人员能够利用来自EMR系统20和信息系统22的聚合信息来搜索数据库35。搜索引擎62可以用于自动化类似的患者搜索和手动交互类似的患者搜索。

对于自动化类似患者搜索，搜索引擎62使用针对特定癌症类型的医疗人员的搜索查询模式，以基于特定临床特征来自动化具有该特定癌症类型的患者的搜索查询，该特定临床特征可以包括年龄、性别、生物标记、BIRADS分类、分期信息、先前治疗、结果和家族史。用户可以编辑搜索查询的自动生成的属性中的任意一个，以获得所需的搜索结果。从自动查询中，搜索引擎62可以显示具有类似临床特征、治疗和结果的患者简档。患者列表为医疗人员提供了用于快速查看其他类似患者如何对规定治疗作出反应从而更好地了解具有类似临床特征的特定患者如何可能对特定治疗计划作出反应的机制。

临床研究人员、临床试验主要研究者、或其他类似医疗人员可以使用手动交互式类似患者搜索来基于驻留在数据库35中的非常具体的临床属性来寻找类似患者的“池”。医疗人员具有交互能力，其可以用以搜索非常具体的临床特征（如年龄、性别、临床分期、生物标记、组织学、先前治疗、基因组改变和结果）以找到匹配所选择的特征或属性的患者。医疗人员可以具有交互式修改搜索查询以缩小或进一步阐明结果的能力。可以根据结果得到的搜索查询对患者进行附加的分析，并且可以潜在地考虑或招募已识别的患者进行临床试验，这些临床试验在他们的初始临床咨询期间以前不可用。

图15示出用于利用搜索引擎来执行患者搜索的过程的实施例的流程图。该过程始于用户选择或启动搜索引擎62（步骤172）以执行患者搜索。在一个实施例中，可以从第三方应用工具66的我的应用界面132或应用界面134中选择搜索引擎62。然后确定患者搜索是否将基于特定患者（步骤174）。在一个实施例中，可基于用户从我的应用界面132还是应用界面134选择搜索引擎来自动地确定患者搜索是否将基于特定患者。由于我的应用界面132中的应用是患者知晓的，搜索引擎62将基于正在查看的患者来执行搜索。相反，应用界面134中的应用不是患者知晓的，并且因此患者搜索不是基于特定患者。

如果患者搜索要基于特定患者，则搜索引擎62执行自动搜索（步骤176）并自动选择（诸如年龄、性别、癌症类型、TNM分期、组织学、生物标记和基因组改变）属性用于搜索查询（步骤178）。如果患者搜索不是基于特定患者，则通过搜索引擎62执行手动搜索（步骤180）。对于手动搜索，用户必须手动选择期望的患者属性以形成搜索查询（步骤182）。一旦生成了搜索查询，则搜索引擎62执行搜索查询并显示用户的结果（步骤184）。如果正在执行自动搜索，则一旦生成查询，搜索引擎62就自动执行搜索。然而，对于手动搜索，用户必须指示搜索引擎62对所生成的查询执行搜索。在已经显示搜索结果之后，确定是否应当修改搜索查询（步骤186）。如果搜索查询应当被修改，则搜索返回到步骤182，以供用户为搜索查询选择期望的属性。如果搜索查询不需要被修改，则用户然后具有比较针对由搜索查询识别的患者的诸如治疗和结果的信息的选项（步骤188）。

在一个实施例中，对于自动化的类似患者搜索，搜索引擎62可以自动聚合患者属性并且针对类似患者启动查询，而无需来自用户的任意手动输入要求。在另一个实施例中，对于手动类似的患者搜索，用户必须手动输入感兴趣的特定临床属性并且利用搜索引擎62启动查询。

图16-18示出了显示搜索引擎62的自动化类似患者搜索页面的GUI的示例性屏幕截图。如图16所示，可以通过用户选择患者工具应用或来自我的应用界面132的类似患者搜索图标192启动自动类似患者搜索。然后，搜索引擎62选择正在查看的当前患者的相应临床属性以启动类似的患者搜索查询。搜索引擎62所选择的临床属性可以显示在查询部分194中。查询部分194定义由搜索引擎62用于患者搜索的属性并允许用户编辑用于搜索的属性。在一个实施例中，用于形成搜索查询的查询部分194中的属性可以包括时期、生物标记、组织学、功能状态、基因组改变和其他属性。当用户从我的应用界面132中选择了类似的患者搜索图标192时，搜索引擎62自动地生成搜索查询并使用所生成的搜索查询来执行搜索。来自搜索的结果可以显示在结果部分196中供用户查看。结果部分196可以向患者显示具有类似临床属性的患者列表，并允许用户查看满足搜索查询的所有结果。在一个实施例中，结果部分196可以基于患者列表中的患者之间的匹配属性的总数和用于启动患者搜索的查询部分194中的指定属性（其基于用于自动搜索的特定患者）来对患者列表进行分类。在其他实施例中，结果部分196可以基于匹配的特定属性对患者列表进行分类，或者结果部分196可以显示具有与搜索查询中的所有或预定义数量的属性相匹配的属性的那些患者的患者列表。

在患者列表显示在结果部分196中之后，用户然后具有用于比较和查看患者列表中的患者先前已如何治疗以及这些治疗的结果的选项。为了比较和查看来自结果部分196的所选择的患者的治疗和结果，用户可以选择比较治疗“按钮”198以启动搜索引擎62的详细比较功能。一旦选择比较治疗按钮198，用户然后可以选择两个或更多患者进行比较和详细查看。如图17所示，为了方便用户，可以突出显示所选择的患者以用于比较。然后可以通过选择下一步“按钮”来启动突出显示的患者202的详细比较。

在用户启动突出显示的患者202的详细比较之后，结果部分196然后显示如图18所示的每个突出显示的患者202的详细患者卡204。患者卡204可以提供对应于患者之间的、诸如类型、时期、生物标记和功能状态的临床属性信息，并可以提供有关患者接受的治疗和那些治疗结果的信息。包括治疗和结果信息为医疗人员提供了历史参考以用于制定患者治疗计划。

除了执行自动化的类似患者搜索之外，搜索引擎62还可以用于执行手动类似的患者搜索。医疗人员可以使用手动类似的患者搜索来搜索具有非常特定临床属性的患者。在实行研究或寻找临床试验对象时，医疗人员可能需要识别具有特定诊所属性的患者。为了启动手动类似的患者搜索，用户可以从应用界面134中选择患者池应用或类似的患者搜索图标206（参见图10）。

图19和图20示出了显示用于搜索引擎62的手动类似患者搜索页面的GUI的示例性屏幕截图。由搜索引擎62提供的手动类似患者搜索选项允许医疗人员开发个性化搜索查询以搜索数据库35 ，其包括来自EMR系统20和信息系统22的信息。如图19中所示，在从应用界面134选择患者池应用或类似的患者搜索图标206之后，可向用户提供手动类似患者搜索页面210，其具有查询部分212、日期范围部分214和概要部分216。

查询部分212提供用户可以从中选择以启动类似的患者搜索的若干临床属性的列表。可以搜索的临床特征包括年龄、性别、时期、生物标记、组织学、基因组改变和治疗。用户可以交互式地选择查询部分212中的任意属性组合，以制定搜索引擎62的搜索查询。用户还可以交互式地选择日期范围部分214中由年/月/日定义的日期范围，以进一步限制来自搜索查询的结果。日期范围可以对应于与患者相关的特定事件的日期。例如，日期范围可以与患者的咨询日期、治疗日期、临床试验日期、手术日期和任意其他事件日期相关联。概要部分216包括图形界面，其显示关于存储在数据库35中的患者群体的信息。医疗人员可以利用（如查询部分212中建立的）特定临床值或属性来 “挖掘”数据库中的患者群体，以标识具有类似临床属性的患者“池”。

返回参考图5，搜索引擎62的搜索结果页面80可以被提供给用户以显示在查询部分212中启动的用户的搜索查询的结果。如前面关于图5所描述的，属性选择部分84可以允许医疗人员查看用于启动搜索查询的临床属性并且为医疗人员提供用于修改和/或进一步优化类似患者的搜索查询的能力。显示部分86可以为在结果部分82中识别的类似患者提供总结的匹配属性的可视或图形显示。

图20示出了由搜索引擎62显示的另一搜索结果页面。搜索结果页面220可以与图5中的搜索结果页面80类似，并且可以具有向用户提供不同信息和功能的一个或多个部分。搜索结果页面220包括结果部分82、属性选择部分84、显示部分222和范围选择部分88。

显示部分222为医疗人员提供了比较患者的其他属性的能力，所述其他属性包括但不限于放射学成像、病理学成像和分子成像。用户可以通过从显示部分80或显示部分222中选择“图像按钮”来访问显示部分222。类似地，显示部分80可以由用户从显示部分80或显示部分222选择“图表按钮”来访问。

显示部分222可以使用不同的类别来组织信息和属性以进行显示。类别的一些示例可以包括放射学或病理学。然后可以将这些类别进一步组织为子类别，以便为显示的结果提供更多细化。例如，病理学类别可以包括乳房X线照片、超声波和MRI（磁共振成像）的类别。显示部分222然后可以针对每种图像类型在结果部分82中显示针对患者的图像，以使得医疗人员能够关联疾病的进展。

建议表单

工作流程工具52可以包括交互式建议表单64。交互式建议表单64可以向医疗人员提供记录患者背景信息以及在肿瘤委员会处展示的相关实验室报告和临床测试结果以及可以被挖掘用于分析和未来的疾病模式的结构化肿瘤委员会建议的能力。交互式建议表单64提供了用于包括放射图像和报告的交互能力、用于包括病理图像和报告的交互能力、用于包括基因组测序图像和报告的交互能力、用于包括相关患者信息（例如年龄、性别、临床问题、过敏和当前药物、肿瘤信息（例如癌症类型、尺寸、位置、分期和TNM）以及其他相关人口统计信息）的自动能力、与编辑临床值的能力以及用以轻松选择逐级下达、结构化肿瘤委员会建议的能力。交互式建议表单64可以使用相关患者和临床属性作为关键词并自动填充特定于患者的临床试验，因此医生不必退出交互式建议表单64。交互式建议表单64还可以提供用来记录可以为患者执行的附加临床测试并且可以基于它们要参与的RSVP来捕获参加肿瘤委员会会议的医疗人员的界面。

在一个实施例中，交互式建议表单64可由医疗人员在肿瘤委员会会议期间使用以记录针对每位患者的讨论和治疗决定。在讨论每个患者的开始或期间，用户可以选择建议表单“按钮”来打开患者的交互式建议表单64。交互式建议表单64可以接收关于当前在工作流程工具52中显示的患者的信息，并且然后从数据库35检索和聚合相关的患者信息。在另一个实施例中，用户可以为交互式建议表单64选择患者，并且然后交互式建议表单可以从数据库35中检索和聚合相关的患者信息。交互式建议表单64可以显示来自NCCN、ASCO（美国临床肿瘤学会）、ESMO（欧洲医学肿瘤学会）或基于患者当前的癌症相关属性和遗传改变的机构（站点可配置）的大多数合适的临床指南。指南（例如NCCN指南）可以是交互式的，并且可以向用户提供关于患者当前属性、分期、治疗如何与适当指南相一致的可视化。

交互式建议表单64提供了用于记录治疗（例如手术、放射疗法、化学疗法或药物治疗、临床试验或其他疗法）或不需要治疗的结构。交互式建议表单64可用于指示可为患者执行的附加临床测试，例如放射学、病理学或分子/遗传测试。交互式建议表单64提供可以针对治疗和结果信息挖掘的数据结构。交互式建议表单64还使用相关患者和临床属性作为关键字来自动填充特定于患者的临床试验部分，因此医疗人员不必退出交互式建议表单以在诸如clinicaltrials.gov的网站上搜索临床试验。交互式建议表单中可以包括自由文本和语音口述附加注释，以补充结构化报告。在信息已被输入到交互式建议表单64中之后，信息和表单可以被保存到数据库35以记录针对患者的协作治疗计划。

图21示出了显示交互式建议表单64的GUI的示例性屏幕截图。交互式建议表单64包括如先前关于图9所描述的建议表单界面120。建议表单界面120包括患者信息部分122 、治疗部分124、临床试验部分126、指南部分232和附加信息部分234。

交互式建议表单64可以使用数据库35中存储的用于患者的信息将患者信息、肿瘤信息和人口统计信息预先填充到患者信息部分122中。另外，用户可以编辑患者信息部分122中预填充的值。治疗部分124提供结构化界面以记录可以为患者执行的建议治疗和附加临床测试，并且临床试验部分126可以被预先填充有临床试验以便患者可能参与。交互式建议表单64还具有用于医疗人员过滤患者属性（例如年龄、性别、癌症类型、基因变体和分期）以改进临床试验部分126中显示的临床试验的搜索结果的交互能力。

指南部分232可以显示来自NCCN、ASCO、ESMO或基于患者当前的癌症相关属性和遗传改变的机构的最合适的临床指南。在一个实施例中，指南部分232向用户提供对交互式NCCN指南的访问，以向医疗人员提供患者当前属性、分期和治疗如何与适当指南一致的可视化。附加信息部分234提供用于更新患者的状态并添加自由文本和语音口述的附加注释的接口，以补充交互建议表单64中的信息。

在一个实施例中，建议表单界面120可以包括用以包括放射图像和报告、病理图像和报告以及基因组测序图像和报告作为肿瘤委员会建议的一部分的交互能力。在另一个实施例中，建议表单界面120可以将参加肿瘤委员会会议并涉及协作治疗决定的医疗人员包括为肿瘤委员会建议的一部分。输入到建议表单界面120中的信息可以被保存在数据库35中，并形成患者的医疗历史和/或病历的一部分。

患者数据追踪器

患者数据追踪器54协助医疗人员随着时间的推移同时操纵各种临床变量并使其可视化。患者数据追踪器54提供在所选择的时间段内的多个实验室值的绘图。此外，特定患者生物标记的水平可以被制图，并且诊断图像、化学疗法治疗和其他程序也可以在相同的背景中制图或制图以提供数据点的相关。

患者数据追踪器54提供同时使来自不同信息系统的信息可视化的能力。例如，患者数据追踪器54可以在预定时间段内显示来自EMR的遗传改变值的线状图形，在相同时间和相同图形上显示在相同的预定时间段来自LIS的白血细胞计数结果。另外，患者数据追踪器54还可以在与遗传改变值和白血细胞计数结果相同的图形上显示来自PACS系统的肿瘤尺寸细节和相应的CT检查。

患者数据追踪器54为医疗人员提供单一接口以访问已经被聚合到数据库35中的所有相关数据点。医疗人员可以在查看针对患者的信息时，通过从“我的应用”界面134选择“数据追踪器”应用来启动患者的制图过程。患者数据追踪器54可以根据基于患者癌症类型的默认癌症制图协议向用户显示默认图表。

患者数据追踪器54向用户提供交互式地显示相关数据图和/或定性治疗和检查的能力。在利用患者数据追踪器54交互式操纵患者数据的同时，医疗个体可以完全访问针对特定患者的每个相关临床属性，并且可以向患者数据添加新且有意义的相关。患者数据追踪器54然后可以将生成的图表保存在数据库35中以保存该信息作为用于决定或患者通信的参考。

当在信息学平台33中查看患者的相关临床信息时，医疗人员具有用于启动患者数据追踪器54以使患者数据可视化的能力。为了启动患者数据追踪器54，用户可以从我的应用界面132选择“数据追踪器”应用图标236（参见图10）。患者数据追踪器54能够在随着时间过去来聚合关于具体的癌症类型的特定临床值，而不是聚合具体的数据点。

图22示出由患者数据追踪器54显示的GUI的示例性屏幕截图。患者数据追踪器54包括如先前关于图6所描述的用户界面90。患者数据追踪器54提供在包括对定性研究的访问的定量显示（图表）中对诸如实验室结果、图像和治疗的多个患者属性的可视化。表格部分92可以在预定的时间段内在以数值方式显示多个临床实验室结果和相关属性。表格部分92中显示的实验室结果和相关属性可以从数据库35获得，该数据库35聚合来自诸如EMR，PACS，RIS和LIS的不同信息系统的信息，以提供给表格部分92。制图部分94可以提供响应于用户从表格部分92中选择一个或多个属性以供显示，在预定时间段内从表格部分92对一个或多个属性值自动制图。用户具有在表格部分92和制图部分94两者中打开/关闭参考特定实验室值的个体属性的显示的能力。所选择的属性值可以在制图部分94中同时显示，以使用户能够看到数据之间新的相关和关系。时间线部分96可以包括在制图部分94中显示的每个临床测试和检查笔记，并且可以在制图部分94中的属性值的可视化时由医疗人员访问。时间线部分96向用户提供对以前只能通过其他信息系统访问的临床数据的直接访问，并且可以立即参考图表数据和时间线上显示的特定报告或实验室结果。在一个实施例中，制图部分94中的图表上的特定数据点的选择自动参考时间线部分96中的相应测试/研究。

虚拟插接板

工作流程工具52提供虚拟“插接板”，其使得来自肿瘤学、放射学、病理学和其他贡献科室的医疗人员能够指定特定患者数据点，诸如放射图像、实验室报告、临床注释和测试结果，以供在肿瘤委员会会议上讨论。医疗人员可以将信息“保存到肿瘤委员会”，这些信息可以通过临床领域进行分类并且被编号以便为肿瘤委员会参会者提供交互式查看临床专家对肿瘤委员会的准备状态的能力。此外，虚拟插接板被保存并记录为肿瘤委员会做出的治疗决定的支持性证据。其他医疗人员具有用于参考详细的临床信息的能力，该信息为患者的特定肿瘤委员会提供背景，未来作为该患者的参考，并且更好地理解其他类似患者如何治疗。

图23示出了显示来自工作流程工具52的虚拟插接板页面的GUI的示例性屏幕截图。工作流程工具52提供用于按分类记录和存储针对患者的多学科肿瘤委员会的相关临床信息的虚拟插接板 。工作流程工具52包括具有向用户提供不同信息和功能的一个或多个部分的用户界面240。用户界面240包括时间线部分242、添加到肿瘤委员会“按钮”244和工作空间部分246。

时间线部分242显示来自EMR系统20和信息系统22的临床测试、检查、笔记、图像和报告。用户可以选择时间线部分242中的项目中的一个以打开工作空间部分246中所选择的详细副本。工作空间部分246可以更详细地显示所选择的时间线元素的内容。医疗人员可以查看临床信息，以更好地了解患者当前的临床状态。如果医疗人员想在患者的下一个肿瘤委员会上显示相关或值得的信息，医疗人员可以选择与信息相关的添加到肿瘤委员会（Addto Tumor Board）“按钮”244。通过选择添加到肿瘤委员会按钮246，用户“虚拟狗听到”信息并将信息放置在虚拟插接板中供以后查看。添加到肿瘤委员会按钮246可以用于存储来自EMR系统20和不同信息系统22的信息。虚拟插接板可以基于选择的项目所源自的科室来自动地将选择的项目分类以包括。

返回参考图7，虚拟插接板用户界面100可以向用户提供对为虚拟插接板选择的信息的访问。返回参考图14，虚拟插接板的展示界面160可以向用户提供由肿瘤委员会成员选择的临床信息作为制定患者治疗计划时最相关的信息。

图24示出了显示来自虚拟插接板的文档页面的GUI的示例性屏幕截图。虚拟插接板可用作肿瘤委员会开发的针对患者的治疗计划的历史文档。由于虚拟插接板用作通过参与肿瘤委员会的医疗人员而视为相关内容的可视存储空间，虚拟插接板也可用于记录展示给肿瘤委员会并有助于由参与肿瘤委员会的医疗人员作出协作决定的临床假象（artifact）。虚拟插接板可以包括具有向用户提供不同信息和功能的一个或多个部分的文档页面250。文档页面250可以包括时间线元素252和显示部分254。

时间线元素252可以被包括为由时间线工具58提供的患者的时间线的一部分，并且可以被用户选择以访问虚拟插接板并且显示虚拟插接板为肿瘤委员会讨论做准备而存储的针对患者的相关临床内容。在一个实施例中，一旦医疗人员已经选择了包括在患者的虚拟插接板中的信息，时间线元素252就可以在时间线部分中显示。

显示部分254可以显示以各种临床信息类别组织的对患者肿瘤委员会特有的相关内容。在每个临床类别下，使用添加到肿瘤委员会按钮246的“为肿瘤委员会保存”的临床信息可以显示在显示部分254中。在每个临床类别中存储的临床信息可以用作针对由肿瘤委员会提出和利用的临床背景的历史文档，以共同开发患者的治疗计划。

患者健康状况

在一个实施例中，信息学平台33可以向两个广泛领域中的医疗人员提供信息：（1）普通患者健康领域；以及（2）肿瘤学特定的患者健康领域。普通患者健康领域可以包括诸如过敏状态、吸烟/非吸烟状态、当前药物、过去的手术干预和表现状态（例如Karnofsky、Zubrod、Lansky评分）的信息。肿瘤学特定的患者健康领域可以包括诸如TNM分期和生物标记状态（用于激素、基因和其他生物学测量，诸如HER2状态、孕酮受体（PR）抗体水平、雌激素受体（ER）抗体水平、Ki-67蛋白质表达水平）的信息。

工作流程工具52可以包括用于向医疗人员提供患者健康状态的概要的可视参考。由工作流程工具52提供的患者健康状态的概要可以包括来自患者健康域中的一个或两个的信息。数据库35可以存储两个患者健康域的信息。

为了填充存储在数据库35中的患者健康域中的信息，信息学平台33可以使用自然语言处理（NLP）来提取患者相关信息并将该信息存储在数据库35中的相应患者健康域中。例如，信息学平台33可以从EMR系统20和信息系统22中提取肿瘤相关的临床信息，将信息映射到数据库35中的特定数据字段，并将信息显示在工作流程工具52中的可视概要页面中。可以从EMR系统20和信息系统22中提取并在可视概要页面中显示的一些信息可以包括：癌症类型和位置；癌症的类型；生物标记；治疗；癌症时期；肿瘤尺寸；淋巴结受影响和转移。

可以从放射学和病理学报告导出癌症类型和位置信息，并且可视概要页面可以向用户提供癌症的解剖位置和类型的图形表示。在一个实施例中，图形表示可以向医疗人员示出左乳房的左上象限中患有乳腺癌的患者。可以从核心活检报告中提取癌症信息的类型，并且可视概要页面可以向用户提供报告的文件名和报告的日期作为支持文档。可视概要页面还可以包括超链接以直接从数据库35访问报告。

还可以从核心活组织检查报告中提取或检测生物标记，并且可视概要页面可以向用户提供与每个生物标记相关联的图形正面和负面图标，以提供快速的、可视的参考，以辅助医疗人员的认知和记忆。可以从EMR系统20提取治疗信息，即先前的癌症相关治疗信息和患者偏好。可以从放射学/ MRI报告中提取癌症信息的分期，即TNM分期值，并且可视概要页面可以可视地显示用于辅助医疗人员进行认知和记忆的信息。

可以从放射学/ MRI报告中提取肿瘤的尺寸（肿瘤尺寸）信息。可视概要页面可以包括MRI图像和报告的超链接，以允许医疗人员经由SSO凭证来直接访问来自源PACS系统的MRI图像和报告。如果确定并适用，可以从放射学/ MRI报告中提取淋巴结影响信息。可视概要页面可以包括对来自源PACS系统的MRI图像和报告的超链接。如果转移癌已被诊断，可以从各种放射图像和报告中提取或检测转移信息，并且可视概要页面可以向用户提供对受影响器官和区域的解剖位置的可视参考。

图25示意性地示出了用于提取和关联患者数据的过程的实施例。来自EMR系统20和信息系统22（例如PACS、RIS和LIS）的自由文本字段和其他信息可被发送到NLP引擎37。NLP引擎37可提取并关联来自EMR系统20和信息系统22的数据。由NLP引擎37提取的数据可被映射或索引到数据库35中的相应数据字段。数据库35中的数据字段然后可由信息学平台33使用以生成可视参考并提供对源文档的超链接。

返回参考图4，概要部分或可视概要页面72使用数据库35中的从异类信息系统获得的信息来提供患者健康状态以及患者人口统计的可视概要。为了访问可视概要页面72，用户可以选择患者信息页面70的“受影响区域”部分或小部件262（参见图4）。可视概要页面72可以包括肿瘤学相关细节的可视概要，以向医疗人员提供以最少的自由文本理解来快速了解癌症患者的当前临床状态。

图26示出了显示可视概要页面72的GUI的示例性屏幕截图。可视概要页面72可以具有向用户提供不同信息和功能的一个或多个部分。可视概要页面72包括定位部分264、类型部分266、生物标记部分268、治疗部分272、时期部分274、尺寸部分276、淋巴结部分278和转移部分282。

位置部分264可以向用户提供癌症的解剖位置和普通类型的图形表示。在位置部分中显示的信息可以从放射学和病理报告中导出。如图26所示，人体的突出显示的区域265可以向医疗人员指示患者在左乳房的左上象限中患有乳腺癌。

类型部分266可以显示癌症的特定类型和与癌症类型信息相关联的相应的日期信息。类型部分266可以包括提供在类型部分266中使用的信息的核心活检报告的超链接。生物标记部分268可以包括图形图标，其为每个显示的生物标记提供肯定或否定指示以及与生物标记信息关联的对应日期信息。在一个实施例中，一个或多个图标可以具有针对相应的生物标记的相关数值，例如百分比。生物标记部分268可以包括对提供生物标记部分268中使用的信息的核心活检报告的超链接。治疗部分272提供关于先前的癌症相关治疗的信息、可以与治疗相关联的任意患者偏好或请求、以及与治疗信息相关的相应的日期信息。治疗部分272可以包括对提供治疗部分272中使用的信息的治疗报告的超链接。

时期部分274可以显示TNM分期值和与TNM分期信息相关的相应日期信息。时期部分274可以包括对提供时期部分274中使用的信息的乳房MRI报告的超链接。尺寸部分276可以显示关于肿瘤尺寸（包括当前和先前的肿瘤尺寸）和与肿瘤尺寸信息相关联的相应日期信息的信息。尺寸部分276可以包括对提供在尺寸部分276中使用的信息的MRI报告的超链接。淋巴结部分278可以提供关于任意受影响的淋巴结的信息以及与该淋巴结信息相关联的相应日期信息。淋巴结部分278可以包括对提供用于淋巴结部分278中的信息的MRI报告的超链接。转移部分282可以提供对具有转移癌症的器官和受影响区域（如果有的话）的可视参考。

其他功能

图27示出了从信息学平台的主页选项卡显示主页的GUI的示例性屏幕截图。主页300可以具有向用户提供不同信息和功能的一个或多个部分。主页300包括患者部分302和通知部分304。

患者部分302可以向医生提供医生正在治疗的患者的基于图形的列表。患者部分302可以包括可用于将患者分类成不同类别的子部分。在一个实施例中，患者部分302可以将患者分类为“即将到来的咨询”和“第二意见”。然而，不同的类别可以用于不同的实施例。除了对患者进行分类之外，患者部分302还可以包括与患者相关联的一些普通信息以供医生查看。

通知部分304可以显示医生的近期通知。当新的临床数据可用于患者时，通知部分304可以向医生提供通知。通知部分304可以标识患者和可供医生查看的特定临床数据。通知部分304还可以包括与其他医生的评论和协作。其他医生的评论和协作可以由评论和协作所属的患者标识。通知部分还可以通知医生针对医生的即将到来的肿瘤委员会以及医生是否已为即将到来的肿瘤委员会准备了材料。

图28示出了显示来自第三方应用的参考页面的GUI的示例性屏幕截图。响应于用户从我的应用界面132中选择参考应用（例如PubMeds），可以向用户提供参考页面310。一旦参考应用已经基于与患者相关联的搜索查询获得搜索结果，结果可以显示在结果部分312中。结果部分312可以向用户提供关于满足搜索查询的文章的一些基本信息，诸如标题、作者、出版日期和关键词。如果用户对特定文章感兴趣，则用户可以选择该文章并链接到该文章的全文。另外，可以向用户提供允许用户进一步改进结果的搜索工具。

图29示出了显示来自信息学平台的患者选项卡的患者页面的GUI的示例性屏幕截图。患者页面320可以具有向用户提供不同信息和功能的一个或多个部分。患者页面300包括患者部分322和过滤部分324。

患者部分322可以向医生提供医生正在治疗的患者的基于图形的列表。患者部分322可以提供与患者相关的一些普通信息以供医生查看。患者部分322中的患者列表可以基于医生在过滤部分324中选择的过滤规范。过滤部分324使医生能够将他/她的患者过滤到几个不同的类别中。在一个实施例中，可以根据患者是否进行以下各项来对患者进行过滤：被提交给肿瘤委员会；新患者；治疗中；安排访问；有特殊需求的患者；研讨会的患者；或住院医生的患者。一旦医生在过滤部分324中选择期望的过滤准则，患者页面320就可以在患者部分322中显示满足相关联的准则的患者。

与管理的的肿瘤学数据集合整合的生物统计分析和可视化工具

目前，治疗医师和诊断者（例如放射科医师、内分泌学家、病理学家等）被训练以遵循由证据驱动的医疗决策制定指南。这些指南涵盖了广泛的医疗条件，并有助于确保针对最广泛数量的患者使用最佳证据。基于证据的指南基于治疗有利或不利的证据的来源来对证据质量进行排序，其中双盲、安慰剂对照的III期临床试验排名最高，而个体“病例报告”接近可接受证据的最低水平。

尽管指南为医师提供了涵盖许多患者需求的一系列选项，但仍存在以下困难情况：可能无法将患者的病例清楚地落入基于单个基于指南的建议内，并且可能反而代表其中医师对证据的依赖（如典型的临床指南所定义的）要么是相互矛盾的要么是不存在的模棱两可的或复杂的病例。

Kaplan-Meier存活曲线和其他类型的生物统计分析工具通常仅在临床试验期间运行，并且对不参与临床试验的患者不可访问。与现有的临床试验生物统计学相反的手动绘制患者的临床属性将是一项繁琐的任务，并且不是临床护理的标准。

在这样的情况下，临床医生将受益于询问过去已经治疗（但不是临床试验或其他有组织研究的一部分）的类似患者（即，具有类似状况或疾病状态、病史、家族史或其他特征的患者）的数据集合以便尽可能确定这些患者的治疗随着时间的推移如何影响其结果（积极或消极）的能力。

本申请还总体上涉及使医师能够收集和分析大量患者数据的系统和方法。通过使医师能够快速无缝地与大量基础数据交互并以直观的方式访问这些数据中包含的见解而不需要高级统计培训的能力，该应用（1）在可能不存在更可靠证据的情况下，允许医师访问最佳可用证据以作出困难治疗决定；（2）使医师能够以符合健康数据隐私规则的方式彼此交互和与研究人员进行协作；（3）使医院、健康护理机构（诸如保险公司和政府机构）以及生命科学研究实体能够与医师进行交流，并更容易地了解哪些证据差距可以影响治疗决定以及医师自己能够使用本文公开的系统和方法来揭示哪些证据。

目前，健康相关数据的统计分析是与那些与临床护理相关的活动分开的活动。今天的工作流程依赖于以下逐步过程：1）从一个或多个来源收集数据； 2）以允许多个源一起使用的方式整理数据； 3）查询整理的数据以确定其是否包含足够数量的、与当前问题或假设相关的数据点；以及4）使用可用数据并以生成见解或对问题或假设的答案的方式来应用统计模型或分析工具。

本公开描述了一种“数据中心”，其自动执行步骤（1）和（2），从而允许这些步骤在临床护理被递送时每天“在背景中”执行。在一个实施例中，数据中心包括一个系统，该系统在任意表达的分析或查询需求之前提取数据并自动对其进行核对而无需最终用户的介入。在该实施例中，数据中心代表自动收集的数据池，其被设计为解决未来的临床问题。当这些问题出现时，研究人员甚至临床医生可以使用目前描述的交互式工具集合来查询数据中心并确定在给定的问题或假设上是否存在足够的数据。例如，医师可能已经知道特定的测试将帮助她确定患者是否可能对特定的靶向药物作出反应。但是，医师可能想知道测试是否也预测老年患者的副作用。具体而言，当测试结果值超过特定阈值时，为60岁以上的、没有先前吸烟史、但先前诊断为结肠癌的女性进行乳腺癌诊断测试会预测副作用以及药物疗效。

在一个实施例中，本文描述的分析使得新手用户能够将复杂的统计模型应用于标准的、易于理解的和良好表征的设置中，使得非专家用户可以确定特定分析工具（1）是否产生有效的洞察（2）这种洞察力是否有意义。考虑以前的假设性示例：数据中心包含大约300名满足当前问题选择准则的女性。应用优势比（OR）分析，所确定的是与那些测试低于阈值或否则为“负值”的患者相比，测试值高于特定截止阈值的患者的副作用可能性是各患者的两倍。然而，基于数据中心可用的数据的这一结果的概率仅略高于5％ - 被标记为不可接受的高水平的可能性水平。

在上面的示例中，所公开的分析允许非统计学家确定虽然数据表明特定测试可以预测副作用，但数据实际上不足够健壮以支持该假设。在这里，一位医师已经测试了一些尚未完全研究的“预感（hunch）”。如果数据中心和分析套件尚不可用，这种预感可以另外在没有数据的情况下已被付诸行动。利用手中的这些工具，医师能够容易地查询可用数据，并确定此特定预感合理 - 但此时没有由可用的数据得到充分证实。

在一个实施例中，所公开的交互式应用使得医师能够利用服务器内包含的患者群体并利用该数据来填充生物统计模型，该模型绘出潜在的结果、潜伏期和其他预测模型，其利用开源的、并作为业内公认的实践标准商业获得的肿瘤学列线图。示例性生物统计模型和列线图可包括例如Kaplan Meier生存分析、cox比例风险回归、结果模型、优势比、危险比、风险比、绝对风险降低、传感器敏感性和特定分析、潜伏期可变模型、预测模型等等。

在一个实施例中，目前公开的服务器包含来自多个机构的综合患者数据。这些数据可能源于例如已经从肿瘤学角度管理的的EMR、放射学、病理学和实验室信息系统。利用这个数据集合，临床医生和研究人员具有聚合通常来自驻留在服务器上的去识别患者的非常特定的临床特征/值以识别单个患者类型或人群或患者类型的能力。

在附加实施例中，所公开的系统将利用现有的开源和商业可用的生物统计模型和列线图，并为临床医生和研究人员提供交互式地选择一个或多个模型以用系统数据集合进行探索的界面。交互式向导将为系统提供一种用于预先填充以结构化的手段存在于数据集中的生物统计模型所需的值的手段。该向导还将为临床医生/研究人员提供一种用于修改临床值以提供一种用所生成的结果和患者人群进行“实验”的方法的有用的技术。

一旦临床医生/研究人员已完成他们的实验以探索所生成的数据集和识别的患者类型，则他们可以接受向导中的临床值，这导致系统计算并生成结果得到绘制的分析图。这些图可以被定制以提供确定患者群体反应、个体患者反应和/或混合组合的技术。

一旦绘制了图表，研究人员和临床医生就有能力通过交互界面进一步修改临床属性并更新图表以更好地理解修改治疗的效果等。用户具有用于将对系统的绘制图形的多个变体保存到个体患者的记录或个体研究人员感兴趣病例的数据库的能力。

为了咨询的目的，研究人员和临床医生还能够与他们机构内或机构外的同事共享所保存的制图探索。所公开的系统包括交互式界面，其将允许协作者确认、评论或进一步修改所绘制的探索。外部用户将具有用于保存修改并将修改返回给启动查询的研究人员和临床医生以便跟进或关闭对话的能力。

图30图示了当前公开的系统1010，其包括与所管理的肿瘤学数据集合1030整合的生物统计分析工具1020。这里，服务器1030与多个医院IT系统整合，所述医院IT系统例如EMR 1050、PACS 1060、CL- LIS 1070、下一代测序1080、AP-LIS 1090等。服务器1030还与在线的第三方参考（诸如例如PubMed、最新的、clinicaltrials.gov等（未示出））整合。该平台是基于软件的，并提供用于提供肿瘤患者临床信息的工作流和可视化的能力，全部源自上面列出的异类IT系统。生物统计分析工具1020提供了管理的的数据集合的自动和半自动查询并利用生物统计模型来生成与预测、潜在结果、潜伏期、患者或患者池的缓解相关的分析图。

图31是图示了利用系统1010内的生物统计分析工具1020的示例性研究人员/临床医生工作流程的流程图。在步骤1100，研究人员/临床医生访问软件应用，软件应用访问针对多个机构中的一个机构的匿名和管理的患者数据的软件应用。目前，数据和分析公司的重点仅关于挖掘电子病历（EMR）。本方法利用其他类型的患者数据（参见图30）。

转到步骤1120，研究人员/临床医生能够从标题栏中的通用应用小部件访问生物统计分析工具1020。这一步发生在软件应用内。专注于特定患者的临床医生（步骤1130）可以访问许多开源和商业可用的生物统计分析模型1140、1150。临床医生选择感兴趣的模型，例如生存分析：Kaplan Meier（未示出）。系统1010自动填充相关临床值，例如年龄、性别、癌症类型、生物标记等（步骤1160）。更关注患者类型池的研究人员将手动输入与他们有兴趣进一步询问数据的患者群体相关的临床值（步骤1170）。

参照步骤1180，系统1010提供向导，该向导允许临床医生用于交互地选择绘制的图表的能力。临床医生然后具有预览绘制的图表或进一步修改属性以更好地修整所得的图表的能力（步骤1190）。一旦绘制的图表已被呈递，则研究人员或临床医生就能够做到以下各项：（1）将绘制的图表的各种状态保存到患者的病历或临床医生的教学文件（未示出）；（2）通过编辑、修改、预览绘制的图表的各种状态来进一步修改绘制的图表（步骤1210和1220）；以及（3）将具有完整交互式数据的绘制的图表发送到同事，用于确认、讨论或进一步修改（步骤1200）。咨询医师具有用于进一步修改绘制的图表并将它们的结果发送给患者的病历的能力（步骤1210和1220）。

图31和图32描述了本系统1010的通用研究小部件1300。系统1010提供了开放式架构，其不仅使得内部和外部第三方开发者能够利用其应用，而且还提供了用于利用与这些应用要利用的特定患者有关的临床背景数据的能力。访问这些应用时不需要附加的输入数据的工作。

再次参照图31和图32，通用应用小部件1300包括应用被显示并且最终用户可访问的区域。这些应用不是“患者知晓的”，并且需要用户输入附加值来启动与应用的交互。研究人员点击生物统计分析工具1020，其将通过应用的标题栏上的通用应用小部件可访问。生物统计分析工具将在应用的工作空间中启动。

图33图示了生物统计分析工具工作空间1400。该工具1400完全与所管理的肿瘤学数据集整合。工作空间1400包括交互式界面1420，其允许用户选择用于启动搜索类似患者池的临床属性和值。这为生物统计分析提供了有目标性的重点。在另外的实施例中，生物统计分析工具工作空间1400还可以向研究人员/临床医生提供用于交互式地选择特定于Kaplan Meier生存分析的变量的能力。这些变量可能包括生存时间和终点因素（缓解/转移/死亡等）。工具1400还可以提供关于如何显示该绘制的数据的选项。这些选项可以包括因子水平的线性趋势、生存可能性（％）、100-生存概率（％）、包括图中95％CI、图表中标记删失（censored）数据、和图下风险表格处的数目。此外，研究人员将具有用于选择特定的患者以与合计人群进行比较以便使个体患者值如何进行比较可视化的能力。一旦已选择了变量，用户将具有用于呈递绘制的图形的能力。可以编辑绘制的图表上的数据和变量以重新绘制分析。绘制的分析可以保存到患者记录或感兴趣的病例的个人档案中。

从该界面还可以访问的是以下能力：用于共享绘制的分析与对于分析的确认/评论/进一步探索可访问的全部交互式数据、匹配由研究人员/临床医生选择的临床属性和值的患者的确定、以及通用生物统计模型或列线图的图形制图。

研究人员/临床医生如何与所公开的应用交互以确定具有机构的癌症患者池的Kaplan Meier生存分析的示例如下：研究人员/临床医生将登录到系统并点击“生物统计分析”工具，其将可以经由应用的标题栏上的通用应用小部件访问。“生物统计分析”工具将在应用的工作空间中启动。研究人员/临床医生将选择患者年龄、性别、癌症类型、特定生物标记、治疗以及在系统内捕获的、对于研究或患者治疗而言是感兴趣的任意其他临床变量。那么研究人员/临床医生将具有用于从已经与系统软件应用整合的可用的“生物统计分析”模型中的任意一个中进行选择的能力。在这个示例中，将选择Kaplan Meier生存分析工具。在此背景下，系统工具包含机构和外部患者数据库，其包含用于缓解、死亡、从初始治疗起的次数等数据。研究人员/临床医生于是将具有交互式地选择例如以下特定于Kaplan Meier生存分析的变量的能力：存活时间、终点（缓解/转移/死亡等）因子、以及提供关于如何显示此绘制的数据的选项，其包括因子水平的线性趋势、生存率（％）、100 - 生存概率（％）、图表中包括95％CI、图表中标记删失数据和图表下风险表格的数目。研究人员将具有用于选择特定的患者以与聚合人群进行比较以便使个体患者的值将如何比较可视化的能力。一旦已经选择了变量，用户将具有用于呈递绘制的图表的能力。绘制的图表将提供用于“编辑”数据和变量以重新绘制分析的能力。还有用的是将绘制的分析保存到患者记录或个人感兴趣的病例档案中的能力。

慢性疾病和复杂疾病的治疗中的同步和异步协作

在过去的十年中，利用个性化治疗和基于证据的医疗实践来提高护理质量并增加患者安全性已经成为全球趋势。因此，医疗护理交付已经从单独的、个体化过程转向高度动态的实践，这需要不同专业人员之间的协作。这种团队协作方案在诸如癌症（而且还有心脏病、糖尿病、自身免疫性疾病等）的复杂的、慢性疾病中尤其重要。这些慢性疾病的复杂性及其一般的长期治疗需要多个学科、资源和能力的参与，以便为患者提供最优治疗。

为了以癌症为例，具体而言，最近的研究已经表明，为了实现对癌症患者的最佳护理，必须实现四个因素：提供者应当彼此协作、应当以最优顺序提供护理、护理的过程应当以确保提供者之间的连接同时保持其自主性和独特作用的方式进行整合、并应保持患者与护理提供者之间的关系。

许多医院和健康护理专业人员已经通过召集也称为肿瘤委员会的多学科癌症会议（MCC）来聚焦于增加癌症治疗中的多学科协作。这些会议是定期安排的会，其中每个个体患者病例由肿瘤科医师、放射肿瘤学家、外科医生/手术肿瘤学家、病理学家、放射科医师、护士、和社会工作者组成的小组查看。主要目标是确保为每位患者考虑所有适当的检查、治疗选项和建议。人们普遍认识到，这种跨学科方案归因于加强临床决策制定和改善临床结果，然而在美国，只有少部分癌症患者通过癌症会议得到治疗。归因于仅有一小部分患者通过医疗会议接受治疗的其中一个原因是缺乏支持性工作流程和足够的技术来允许医师及时准备、主办和促进医疗会议。

促进医疗会议的当前方法和技术围绕远程展示/远程医疗进行。这就是利用视听会议技术将所有人的精髓融合在一个房间中的地方。这是不够的，并且许多人觉得这不尽人意。这些解决方案也未解决必须一次收集每个人的时间负担问题，这仍然限制了医疗会议中可以接受治疗的患者数量。

此外，迄今为止，在美国和全世界的医院系统中，已经证明识别放射学和病理学诊断中的不一致是困难和具有挑战性的。在许多情况下，通常直到医学肿瘤学家正在查看诊断数据以决定最佳治疗或在直到各科室向多学科肿瘤委员会提交他们的发现才认识到不一致时才会发生放射科和病理学诊断。通常在这些实体会议上，不一致通常会被“挑出”。一旦已经识别了患者在放射学和病理学发现中的不一致，通常会为患者命令新的测试和程序以使两个学科能够解决不一致并达成诊断协议。

因此，需要克服用于多学科会议的常规系统中发现的这些重要问题并且提供了一种用于进行异步虚拟医疗会议委员会、解决诊断不协调、并促进路边咨询（第二意见）的改进方法的系统和方法。

本文描述的是建立利用最新的IT解决方案和基础设施来支持临床团队成员之间的信息交换和通信的所有方式的软件平台的系统和方法。所描述的系统和方法提供了一个有助于异步医疗会议委员会辅助解决诊断不协调并促进正式的路边咨询（第二意见）的软件平台和基础设施。这将允许更多的患者能够通过消除护理团队所有成员在相同时间和相同地点见面的需要，从而能够受益于对他们的治疗的跨学科方案。

在一个实施例中，系统可以包括利用医院系统内的所有相关IT系统的综合整合以能够实现医院系统内的医疗护理团队之间的可视化、关联和协作的架构。该系统可以为医师提供一种启动或请求召集异步虚拟医疗委员会的方法。也就是说，通过该系统的协作者将能够查看、讨论并为患者提供建议，而不需要所有人都在相同地点或相同时间。该系统还可以提供用于医师选择虚拟肿瘤委员会的患者和目的方法。所有患者相关的医疗数据可以完全整合到平台中，并可由组织医师查看。该系统可以提供医师和其他医疗专业人员的自动建议以包括在虚拟肿瘤委员会中。该系统还可以允许组织医师搜索与医院相关联的医疗护理专业人员列表并从该列表中进行选择。

该系统可以包括与医院IT系统所利用的活动目录或基于轻量级目录访问协议（LDAP）的系统紧密耦合的中央许可管理系统。这个许可管理系统可以是一个学习系统，它积极地在算法上构建系统所有用户的神经社交图。除此之外，该算法可以考虑患者群体重叠、每个用户的特性、位置和系统使用特征来构建社交图。

一旦根据所选择的患者、目的和虚拟肿瘤委员会的协作者列表来组织医师，系统就可以将通知发送给被邀请的协作者。这些邀请可以发送给用户的优选通信选择（如存储在许可管理系统中）。通知都可以有一个链接和用于让医师进入系统以在虚拟肿瘤委员会中进行查看和协作的方法。该邀请还可以包含确保用户身份的安全登录凭证。

系统还可以支持对患者安全级别的基于角色的访问和许可。只有被邀请参加或已经成为患者医疗团队的一部分的那些医疗专业人员才能访问和查看患者的病例。

该系统可以向协作者提供关于患者病例的各种视角交换输入的方法。这种用于交换的方法的一个实施例是系统内的、显示协作者的实时讨论和评论的聊天应用。每个聊天都将链接到背景患者属性/数据项。聊天可以记录在系统内的患者病历中。

该系统可以提供用于将所有协作者的建议整合为针对患者的统一建议的方法以及用于医师检查并确保所有诊断专业之间的一致性的方法。

系统可以完全整合到所有医院IT系统并且也向系统的所有用户提供背景患者信息。

系统可以评估患者数据并搜索预定的“标记”。这些标记将触发系统的用户可能需要检查一致性。用户将能够选择系统是否应检查一致性。如果用户选择了检查一致性，那么系统可以启动一致性检查工作流程。该工作流程将提示用户查看放射科、病理学以及患者的任意其他相关诊断数据，并在结果之间存在一致时确认或反驳。如果结果中存在不一致，则系统会将相关图像和.pdf报告聚合为单个放射/病理学合并界面中。从这个界面，管理专家将具有用于记录他们的讨论、选择后续临床测试来执行、并最终记录不符合日期标记的解决方案以及与其他源系统同步的能力。系统还可以记录一致性检查的结果。此工作流程也可以通过医疗会议委员会上的系统触发和执行。

系统可以追踪所有的一致性检查和结果，并且还追踪一致性检查是由用户主动启动还是在医疗会议委员会期间由观察到的不一致所触发。系统可以记录在不一致中发现的患者数据的所有相关特征，以便了解什么类型的病例可能是不一致的。这种学习算法将允许改进的“标志”，并随着时间的推移降低发生不一致的患病率。

系统可以在其数据库架构中包含捕获一致性工作流程的结果的布尔表格。该系统的一致性特征将作为用来确定和量化不一致的流行和驱动质量改进的一种方法。一致性特征数据将能够由管理员等进行查看。该系统将支持包含一致性数据的报告的导出。通过机器学习算法的系统可以能够随着时间过去自动地标记和突出显示不一致的数据，并启动工作流程来解决不一致问题。这些机器算法可能具有以下输入，例如：从EMR、PAC、AP-LIS、CP-LIS等加载的所有患者数据，包括PDF、医疗笔记、文档、图像元数据等；主要肿瘤学和覆盖到系统中的普通医疗本体（例如，Snored、NCI Thesaurus、ICD-10、Radlex等）。

通过NLP技术，可以从患者数据中提取以下属性，例如：人口统计信息、功能状态、家族史；癌症分期和特征或组织学；生物标记；遗传变异；诊断测试和结果、映射到肿瘤学本体的附加搜索查询等。所有非结构化数据都可以被提取并转换为结构化数据。然后所有的数据元素然后可以以优化的方式进行索引。然后所有索引字段可以传递给系统进行存储。然后系统可以获取这些数据，并基于报告日期来对每个诊断专业进行比较，以确定是否存在一致性。

在另一个实施例中，系统可以包括利用医院系统内的所有相关IT系统的综合整合以实现不同医院之间的医疗护理团队之间的可视化、相关和协作的架构。该系统可以为医师提供一种启动或请求正式路边咨询（第二意见）的方法。例如，通过该系统的协作者可能能够查看、讨论并为患者提供建议，而不需要所有人在相同医院系统中。该系统可以包括经由独立于任意医院驻留的中央数据库（数据中心）链接的医院网络。

数据中心可以包含中央许可管理系统驻留。该许可系统可以追踪和监控对中心中患者记录的访问。数据中心将聚合并包含每个个体医院系统中找到的去识别版本的数据。该系统将具有一种用于从报告、图像和与患者病例相关的其他数据中移除或阻止所有PHI数据的新颖的方法。

作为可能的工作流程的示例，医院A中的医师可能需要关于患者的咨询或第二意见。该系统可以允许请求医师向医院B中具有所需专业知识或知识集合的另一位医生发送请求。该系统可以向咨询医师发送通知，提示医师登录系统以查看患者的病例。邀请可以包含确保用户身份的安全登录凭证。一旦登录到系统中，咨询医师就能够查看患者病例的去识别版本。在一些实施例中，患者的健康信息（PHI）可能对咨询医生不可见；然而医师仍然可以检查所有必要的患者医疗数据以提供意见或建议。

该系统还可以促进请求和咨询医师之间的通信。这可以在记录和存储与相关数据点的通信的类似聊天的应用中。该系统可以促进将咨询医师的建议传送回到请求医生。该系统还可以为患者提供一种用于启动或请求正式路边咨询（第二意见）的方法。也就是说，患者可以通过系统发送他们的相关医疗数据以供不同医院系统中的医师查看。

神经肿瘤可视化和工作流程工具

本申请还总体上涉及用于可视化和提供神经肿瘤癌症患者的临床历史、肿瘤细节、当前临床实验室结果和治疗决定的工作流程的改进的方法、计算机程序产品和系统，如独立权利要求中所指定的。

参考图34，示出了交互式显示器。在一些实施例中，在计算机系统聚合患者的神经肿瘤学临床数据之后填充交互式显示器。在图34中，项目1a标记交互式显示器上的区域，其中示出了神经肿瘤学肿瘤信息的简化片段。神经肿瘤学肿瘤信息片段可以包括但不限于来自活检报告和EMR领域的肿瘤类型信息、从活检报告和EMR领域捕获的生物标记、从最近的MRI报告、EMR领域和RIS领域中捕获的肿瘤尺寸、来自其他肿瘤学遭遇的分期信息、从放射学报告和RIS或PACS领域捕获的诊断信息、从EMR中的手术报告中捕获的手术程序、以及从肿瘤学家的笔记和以前的肿瘤委员会建议捕获的治疗计划。项目2a在交互式显示器上标记一个具有提供智能过滤的可视时间线的区域。项目3a在交互式显示器上标记一个允许访问患者的病史、医疗问题和人口信息的区域。项目4a在交互式显示器上标记一个具有提供快速访问项目1a中描述的区域的“受影响区域”选项卡的区域。项目5a在交互式显示器上标记一个包括“Curbside Consult”的区域，其是一种使临床医生能够讨论患者的临床信息的异步和同步协作工具。项目6a在交互式显示平台上标记第三方在线参考工具的一个区域，其经由患者的神经肿瘤临床数据来提供对患者相关的临床信息的访问。

根据一个实施例，提供了一种提供患者的神经肿瘤学特定信息的系统。该系统可以包括服务器和与服务器通信的客户端设备。在一些实施例中，服务器包括数据库和患者的多个聚合和综合电子临床数据。除了其他患者特定数据之外，电子临床数据可至少包括神经肿瘤学肿瘤数据。在其他实施例中，能够与服务器通信的客户端设备包括显示界面、可操作地耦合到显示界面的处理器；以及可操作地耦合到处理器的存储器，其存储计算机可读指令，所述计算机可读指令在由处理器执行时使处理器执行操作。由处理器执行的操作可以包括从服务器检索神经肿瘤学肿瘤数据并且在显示界面上显示提供与神经肿瘤学肿瘤数据有关的患者特定信息的交互式工作空间。

根据另一个实施例，提供了一种用于提供患者的神经肿瘤学特定信息的方法。该方法可以存储在计算机可读介质上，并且可以包括由处理器执行以实行操作的逻辑指令，该操作包括从医疗数据库中检索患者的聚合的和综合的电子临床数据以及患者的癌症的至少神经肿瘤学肿瘤数据，并且在显示界面上显示交互式工作空间，该显示界面提供关于神经肿瘤学肿瘤数据的患者特定信息。

在一些实施例中，电子临床数据包括图片归档和通信系统（PACS）数据、放射学信息系统（RIS）数据、数字病理学、实验室信息系统（LIS）数据、NextGen测序（NGS）数据、和电子病历（EMR），其包括以前的医疗和测试结果。在一些实施例中，交互式工作空间可以显示关于患者和神经肿瘤学肿瘤数据的概要信息，其可以展示为图形简化的信息点。概要信息可以从来自活检报告和EMR的肿瘤类型信息、从活检报告和EMR捕获的生物标记、从最近的MRI报告、EMR或RIS中捕获的肿瘤尺寸、来自其他肿瘤学数据的时期信息、从放射学报告、RIS或PACS中捕获的诊断信息、从EMR中的手术报告捕获的手术程序、以及从肿瘤医生的注释和建议中捕获的治疗计划来获得。

在一个实施例中，交互式工作空间显示肿瘤的至少一个图像及其位置。在另一个实施例中，交互式工作空间使得用户能够准备、展示和存档与患者的治疗计划有关的神经肿瘤学肿瘤数据。交互式工作空间可以进一步自动绘制神经肿瘤学特定的临床值并使其可视化，以提供患者神经肿瘤学特定信息的临床概览。在一些实施例中，神经肿瘤学特定临床值是肿瘤尺寸和生物标记，其中生物标记是Ki67（IHQ）、MGMT甲基化、1p / 19q、IDH-1和BRAF。

在又一个实施例中，交互式工作空间使得用户能够从电子临床数据中按时间顺序选择并显示患者数据。交互式工作空间还可以使用户能够显示与之前的手术治疗和先前的疗法方案有关的信息。在又一个实施例中，交互式工作空间能够实现按类别过滤。

在一些实施例中，交互式工作空间还包括图像查看应用，其提供对第三方数据库的基本图像操纵和直接单点登录（SSO）访问，用于并排比较来自不同专科的图像。在其他实施例中，交互式工作空间使得用户能够生成提供系统聚合的患者信息、特定于患者的临床试验查询结果、以及多学科建议的报告。在其他实施例中，交互式工作空间还包括来自第三方供应商的临床工具以提供患者特定参考。

在一个实施例中，交互式工作空间使得用户能够实时与其他用户协作以共享发现并咨询潜在的临床课程。在另一个实施例中，交互式工作空间是同步的和异步的，以促进用户协作并将神经肿瘤学讨论作为独立的参考点进行文档记录。在一些实施例中，协作工具可以包括聊天界面、咨询界面和虚拟会议界面。

在非限制性示例中，聊天界面使两个或更多个医生或其他医疗人员能够在彼此之间进行同步或异步通信。当医生或医疗人员同时（即实时）使用聊天界面时发生同步通信。当医生或医疗人员在不同时间（例如离线）使用聊天界面时发生异步通信。除了交换消息之外，聊天界面还使医生或其他医疗人员能够用要交换的消息包括诸如图像和报告的背景患者属性。

在非限制性示例中，聊天界面可以包括消息收发功能以允许医疗人员彼此交换消息。此外，聊天界面还可以基于用户的登录状态确定用户存在，并可以为其他用户提供检测特定用户何时访问信息学平台并可用于协作的能力。另外，聊天界面可以用于在交换关于患者的消息时共享临床背景和信息。聊天界面还提供了用于保存协作会话并将保存的协作会话包括在患者病历中的能力。

在非限制性示例中，咨询界面使医生能够以实时（同步）和离线（异步）模式从一位医生向另一位医生请求即席咨询会话。在一个实施例中，协作工具可以记录关于患者的聊天和咨询，并且可以将记录的聊天和咨询包括为患者的病历的一部分。在另一个实施例中，协作工具可以确定医生的主动可用性以及与医生的最佳通信形式。

在非限制性示例中，虚拟会议界面可以用于启动和记录用于远程或虚拟肿瘤委员会工作流程的异步协作流。在虚拟肿瘤委员会中，医疗人员可以“钉固”信息，为它们的具体学科提供背景概述，并提供“草稿”建议表单和治疗计划供委员会查看。一旦所有医疗人员已经表明“准备就绪”并且“草稿”建议表单和治疗计划准备就绪，则虚拟会议界面提供了异步协作窗口以捕捉每位参与医生的委员会成员和/或笔记之间的任意同意/不同意。如果所有委员会成员都同意“草案”建议表单和治疗计划，则虚拟会议界面将建议表单和治疗计划的状态更改为“最终”，并记录参与的医疗人员和确定完全一致的对话。如果委员会成员和负责医生之间没有100％的一致意见，由于患者不想继续使用虚拟肿瘤委员会来进行“草案”治疗计划，虚拟会议界面可以将患者添加到下一个肿瘤实验委员会。虚拟会议界面可以使用户能够在实际肿瘤委员会事件发生之前，为虚拟肿瘤委员会进行离线或异步的查看和准备，并以交互式治疗表单或建议表单提供相应的输入。

多变量神经 - 肿瘤学交互时间顺序可视化工具

本申请还总体上还涉及从多个医院信息系统收集神经肿瘤学数据、对数据进行关联、在时域上绘制数据、并且在交互式显示器上展示数据的系统和方法。用户可以在此交互式显示器上调整视图参数，以定制信息和在屏幕上绘图。这些系统和方法允许临床医生可以快速使患者的状况可视化和了解患者的状况，并及时制定对策。

参照图35，示出了多变量神经肿瘤学交互时序型可视化工具主屏幕。在一些实施例中，在按下项目1b标记的“Onco旅程图标”时，初始化多变量神经肿瘤学交互时序型可视化工具，并且在时域绘制患者的聚合临床数据。

参考图36，示出了多变量神经肿瘤学交互时序型可视化工具主屏幕可以包含什么的示例。在一些实施例中，多变量神经肿瘤学交互时序型可视化工具使包括对定性研究的访问的定性显示（图表）中的多个患者属性可视化，所述多个患者属性包括但不限于遗传生物标记值、实验室结果和图像、治疗、和程序。项目1b标记了一个其中相关的神经肿瘤学数据在时域自动地被绘制并同时显示以使新的数据相关和关系可视化的区域。项目2b标记可以访问包括每个临床测试和考试笔记的患者时间线的区域。

参照图37，示出了绘制的属性的示例。项目1c标记一个其中绘制出了患者的体重随着时间推移的趋势的区域。项目2c标记一个其中当按下“治疗”按钮时绘制随着时间的推移患者的Karnofsky值趋势的区域。在一些实施例中，这允许临床医生根据患者的治疗计划响应于各种治疗和发作而随时间交互式地使患者的体重和Karnofsky值可视化。

参照图38，示出了多变量神经肿瘤学交互时序型可视化工具的“鼠标悬停”功能和手动输入功能。项目1d标记出了一个其中示出了“鼠标悬停”功能的示例的区域。在一些实施例中，为了最小化屏幕凌乱并且允许临床医生容易地查看生成的图，数据点默认不被显示。在一些实施例中，当用户悬停在绘制点之上时，神经肿瘤学交互时序型可视化工具在绘制的数据上显示有意义的信息，包括但不限于数据值、数据捕获日期、和相应的“Y轴”值。项目2d标记出了一个其中示出了手动输入功能的一个示例的区域。在一些实施例中，因为患者对某些治疗的反应并非总是自动记录，所以多变量神经肿瘤学交互时序型可视化工具允许临床医生手动输入治疗反应数据。

参考图39，示出了多变量神经肿瘤学交互时序型可视化工具的生物标记过滤功能。在一些实施例中，点击“肿瘤标记”按钮显示允许用户选择随时间绘制哪些生物标记的过滤器。项目1e标记出了生物标记被过滤的区域。允许用户同时在相同背景中选择生物标记。在一些实施例中，每种生物标记都是颜色编码和标记的，以允许容易区分。在一些实施例中，如果为患者标识新近可用的生物标记，则自动添加新的生物标记。

交互式肿瘤治疗的可视化

迄今为止，遗传测序报告是过度的并且包含涉及潜在治疗、临床试验和关于基因变体的信息的广泛信息。对于该领域的专家来说，这些信息是相关的且信息丰富的。对于大多数临床医生来说，此信息对于需要解释报告并为其患者规定治疗的这些临床医生来说非常大量而且过于详细。此外，测序报告完全基于从一个角度提供分析的仅基因组数据库。按照标准，基因测序报告是包含所有相关信息的16-20页.pdf报告。最初的页面通常包含概要，但很难导航pdf报告以找到和理解文档中的内容。因此，需要一种快速且便捷的方案来简化使用和通常与潜在治疗选项相关联的大量数据。

根据一个实施例，提供了一种用于提供基因组改变信息的疗法学（therapeutic）映射系统。该系统可以包括能够与服务器通信的服务器和客户端设备。该服务器可以包括基因组数据库和患者的多个聚合和综合的电子临床数据。电子医疗数据可以包括但不限于图片归档和通信系统（PACS）数据、放射科信息系统（RIS）数据、数字病理学、实验室信息系统（LIS）数据、和电子病历（EMR），其包括以前的医疗治疗和测试结果。客户端设备可以包括显示界面、可操作地耦合到显示界面的处理器、以及可操作地耦合到处理器的存储器。

在一些实施例中，存储器存储计算机可读指令，所述计算机可读指令在由处理器执行时使处理器实行包括以下各项的操作：从服务器检索电子医疗数据，其包括患者癌症的至少一个基因和基因组改变；从基因组数据库检索患者特定和基因组改变特定信息；以及在显示界面上显示交互式工作空间，其提供关于与患者癌症相关的基因组改变的患者特定信息。该工作空间被配置为显示关于患者和基因组改变的顶层概要信息，这对临床医生而言是易于消化的。该工作空间整合到更多详细信息的超链接，例如文献报告和已建立的针对基因的医学指南、基因组改变的基因组解释、以及显示界面上基因组改变的匹配疗法，以允许临床医生快速地、容易地导航到最相关的信息。

根据一个实施例，可以在显示界面上的超链接下方显示匹配疗法。电子医疗数据可以按照时间顺序显示为垂直定位并且与超链接和匹配疗法相邻的时间线。

在一些实施例中，匹配疗法可以包括食品和药物管理局（FDA）批准的药物、临床试验和标示外药物的信息。该工作空间可配置为显示证据水平、治疗方案、耐药性、药物成本和FDA批准的药物的保险覆盖百分比。工作空间还可以被配置为显示多个标签，其中标签之一被选择并被指派给FDA批准的药物以指示患者对药物的反应。在其他实施例中，工作空间被配置为显示用于临床试验的过滤器，并应用选择的过滤器来缩小适用于患者癌症的临床试验的数量。过滤器可以包括但不限于基因突变、患者状况、试用地点、试用药物、药物类别、耐药性、执行试验的机构、药物时期、试验类型和试验状态。在进一步的实施例中，工作空间被配置成显示药物指示、证据的水平、处方标签、治疗方案、药物成本、以及用于标示外药物的保险覆盖的百分比。

根据另一个实施例，提供了用于提供基因组改变信息的疗法学映射方法。该方法可以存储在计算机可读介质上，并且可以包括由处理器执行以实行操作的逻辑指令。操作可以包括：从医疗数据库检索患者的聚合和全面的电子临床数据和用于所述患者的癌症的至少一个基因和基因组改变，从基因组数据库中检索患者特定和基因组改变的特定信息，和在显示界面上显示交互式工作空间，其提供关于与患者癌症相关的基因组改变的患者特定信息。电子医疗数据的非限制性的示例可以包括图片归档和通信系统（PACS）数据、放射信息系统（RIS）数据、数字病理学、实验室信息系统（LIS）数据、和电子病历（EMR），其包括以前的医疗治疗和测试结果。

在一些实施例中，工作空间可以显示关于患者和基因组改变的概要信息。该工作空间可以在显示界面上整合对文献报告的超链接，并建立针对基因的医学指南，对基因组改变的基因组解释、以及用于基因组改变的匹配疗法。在一些实施例中，该匹配疗法可以包含食品和药物管理局（FDA）批准的药物、临床试验和标示外药物的信息。在其他实施例中，电子医疗数据可以按时间顺序在工作空间上显示。

在一些实施例中，该方法可以进一步包括显示证据水平、治疗方案、药物耐药性、药物成本、和FDA批准药物的保险覆盖百分比。在其他实施例中，该方法可以进一步包括显示多个标签。标签之一可以被选择并被指派给FDA批准的药物以指示患者对药物的反应。在进一步的实施例中，该方法还可以包括显示药物指征、证据水平、处方标签、治疗方案、药物成本、以及标示外药物的保险覆盖百分比。在其他实施例中，该方法可以进一步包括显示用于临床试验的过滤器。可以选择和应用过滤器来缩小与患者癌症有关的临床试验的数量。过滤器可以包括但不限于基因突变、患者状况、试用地点、试用药物、药物类别、耐药性、执行试验的机构、药物时期、试验类型、和试验状态。

在一些实施例中，各卷的基因组改变和相关联的信息（例如期刊文章、临床试验信息、数据库等）被分析并被合成为在疗法学映射系统上可观察的信息项目。该系统可以配置为使从业者关注于任意基因组改变信息的离散和相关部分。在系统上提供了管理的的信息，以使从业者能够就特定基因组改变的存在的含义作出明智的决定。管理的的信息包括对患者肿瘤中发现的基因组改变的可用信息（例如，现有疗法、临床试验、期刊、和出版物）的解释。

根据一个实施例，基因组解释展示了关于患者癌症中隐含的基因的背景信息。在一些实施例中，管理的的信息还可以包括总结和/或应用与基因组改变相关联的任意可用信息的当前分析的解释性陈述。管理的的信息可以包括对从其导出管理的信息的信息源的参考。在一些实施例中，系统可以提供对管理的信息的来源的直接访问。例如，在查看关于特定基因组改变的信息的背景下，系统可以提供到相关临床试验的直接导航。管理的的信息还可以包括直接链接到外部信息站点托管的源信息。信息来源也可以由用户查看，以进一步描述或验证正在提供的管理的信息。

容易且可导航的界面允许用户以及时的方式定位相关的治疗信息。在一些实施例中，界面可以基于患者癌症中发现的特定改变来组织和导航。在这样的设置中，用户可以导航到匹配患者癌症的信息（例如，肿瘤类型、基因和改变）以直接找到相关的治疗信息。另外，用户可以导航到与患者的肿瘤类型、基因和改变中的一个或多个相匹配的相关信息，以通知用户潜在的标示外治疗选择。

公开可用的数据（例如，疗法数据、临床试验数据和期刊出版物）可以被解释以提供管理的的信息。可以基于系统与患者的肿瘤、基因和改变中的一个或多个的关系来在系统上访问被管理的的信息。公开可用的信息也可以在系统上处理以提供可导航的数据结构，从而通知用户与患者癌症相关联的可用可行信息。

在一个实施例中，提供交互式工作空间以允许容易导航到基因组改变结果和相关联的信息，以减少确定用户的适当治疗所必需的时间量。可以向用户展示一组信息以提供明智的治疗建议。例如，利用已识别的基因组改变的视图，用户可导航至与每个基因组改变有关的其他信息（诸如疗法信息）、与基因组改变有关的临床试验的信息、以及可能可用于通知或支持这种疗法的应用的任意参考。通过在易于导航的界面中具有这些信息，用户可以更快地标识适当的治疗。

在一个实施例中，收集与患者的肿瘤类型、与肿瘤牵连的基因、和基因组改变类型中的任意一个或多个有关的信息源。在一个实施例中，为基因组改变生成或收集解释。解释可包括基因在健康和疾病中的作用的信息，例如在癌症中（例如患者的癌症类型）或另一种癌症，包括管理的信息，例如主要信息源的一个或多个标识符，例如，发表的期刊文章，关于特定癌症或群体改变的患病率，受试者基因组改变或相关基因组改变的疗法，针对当前患者肿瘤类型或其他方式的癌症的特定疗法的临床研究，以及基因组改变，例如一类改变，例如碱基置换、插入、缺失、扩增、纯合子缺失、重排。

参照图40和39，在实体肿瘤的情况下，样本从患者提取并且通常被冷冻或保存在福尔马林固定的石蜡包埋（FFPE）块中。也可以采取邻近的正常组织或血液。从细胞中提取DNA或RNA，捕获基因组靶标，准备库，并扩增测序测试的目标。然后使用多种新一代测序（NGS）平台中的任意一种对库进行测序。完成后，会产生数百万个短读段（通常长度为100-250个核苷酸）并存储在.fastq文件中。

参考图42，测序读取首先与人类基因组参考序列对齐。取决于测序技术，变体的数量和多样性可能很大，因此使用特定的算法来识别数据中的变体。然后基于几个度量（包括质量、群体频率、和生殖/体细胞分类）过滤这些变体。基于其功能分类进一步过滤变体，以便只保留具有已证实或预测后果的突变。

参考图43，给出以高置信度调用的一小列表的变体，下一步是确定它们与疾病和治疗的关联。搜索公开可用的数据库，用于变体和疾病之间的已知关联。使用手动和基于NLP的方法来收集关于将变体与治疗和结果联系起来的研究的文献。管理的数据存储在公共或私人知识库中。

参照图44，在评估每个变体的临床影响之后，生成通常针对治疗医师的报告。每份报告的内容各不相同，但一般而言，它们通常包括变体的总结、疗法学敏感性和耐药性、以及开放临床试验。报告是手动或计算生成的。在任一种情况下，报告都会在发送给医生之前进行内部查看。

参照图45，基因组数据库提供关于基因变体、疗法学敏感性/抗性和开放临床试验的细节，但不包括可以提供优化患者的治疗计划所必需的附加属性的其他背景患者信息。这些服务的输出限于基于文本的、难以阅读和理解的.pdf文档。报告的内容适合于该领域的专家，并且不针对新手用户进行缩放。

如图46和47所示，由电子病历（EMR）、图片归档和通信系统（PACS）、CL-LIS、基因组数据、AP-LIS和其他临床内容组成的RAPID完全整合的数据库被利用以评估变体的临床影响。RAPID是提供静态的、聚焦于基因组的.pdf报告，而是提供了完全交互式的界面，其向用户提供用于在其基因变体的评估中利用包括所有异类信息系统而不仅仅是基因组的完整、全面的医学记录的能力。RAPID界面提供了访问临床医生想要查看的信息的简化手段，但将具有用于深入探讨在基因变体、药物治疗、临床试验等中存在的所有现有文献和信息的能力。

参考图48，如部分1f中所示，RAPID背景患者信息可以包括患者概述、肿瘤细节、协作、患者特定背景应用和动态疗法学映射。部分2f是交互式癌症治疗可视化工具的工作空间。在部分3f中，完整的按时间顺序排列的患者时间线可以预先过滤，以便当在工作空间中时仅显示相关的基因组测试，但是，用户将仍然可以完全交互式访问来自任意专业的患者背景信息。部分4f是一个动态疗法学映射显示小部件。点击这个小部件将在屏幕的中央面板中启动工作空间。之前仅在基因组报告中发现的信息可以显示在工作空间中。在图47中，显示出了遗传改变EML4-ALK。RAPID可以显示来自NCCN、ASCO和Local的此遗传改变的可用指南，并且可以轻松地超链接以显示完整指南，这是pdf格式中不可用的功能。也针对此特定的基因改变列出了可用的FDA批准的药物。如图48所示，用户可以交互式地查看药物的更详细信息，例如药物成本和保险覆盖百分比。

参考图50和51，界面显示出了来自NCCN、ASCO和Local的作为单个示例的遗传改变EML4-ALK的可用指南。选择一个特定的指南可以超链接以显示针对这个遗传改变的完整的、可用的指南。当点击时，超级链接显示来自选择的机构的完整.pdf指南。竞争性基因组.pdf报告今天没有提供对可用指南的访问。

如图52中所示，通过点击遗传改变，界面显示现有的文献文本。相关信息在文中突出显示。

如图53-55所示，可以提供可用于基因改变的特定药物疗法，并且此外，来自多个异类医院系统的患者综合病历可以被映射以显示之前已经向患者规定的药物和患者如何对药物疗法作出反应的图形显示。这从静态报告中是不可能的。

参照图56，还可以显示用于针对每个特定患者存在的各种遗传改变中的每一个的多个遗传、临床试验、可视化FDA批准药物的交互界面。基于知识的细节窗口弹出按时间顺序的时间线，以提供有关基因改变的更详细信息。RAPID不提供导航长.pdf文档并搜索特定信息并丢失患者背景，而是提供了一种用于根据需求并在患者背景中以保持方向的轻松访问详细信息的手段。

如图57-58所示，点击“Foundation One”链接提供对来自Foundation Medicine源系统的全部基因组.pdf报告（作为第三方基因组报告的示例）的访问。

参照图59-63，提供了多种遗传改变和交互界面，其用于利用临床医生可以进一步更新以改进查询结果的过滤器来选择对这些基因改变特定的开放临床试验。完整的按时间顺序排列的患者时间线可以预过滤，以便当在工作空间中时显示仅相关的基因组测试；然而，用户可以完全交互式访问来自任意专业的背景患者信息。用于改进临床试验搜索的交互式过滤器为临床医生提供了用于改进参数的能力，所述参数可以包括但不限于突变、患者状况、位置距离、其他患者问题、药物类别、耐药性、机构、时期、试验类型、状态等。交互式调整临床属性以改进搜索结果的能力对于RAPID和健康护理应用是独特的。

如图64-65中所显示的，RAPID提供对标示外药物的访问，所述标示外药物是对于该特定基因变体可用但未被批准用于FDA使用的药物。如果患者已经耗尽了每个FDA批准的药物疗法并且没有可用的临床试验，则使用标示外药物可能是潜在的疗法选项。例如，如果患者患有肺癌并且没有FDA批准的药物没有或临床试验已经成功，则可以提供用于相同基因改变的标示外药物，其中药物可能以另一种癌症为目标，诸如头和脖子的癌症 。其他实施例可以展示关于临床医生在规定标示外药物之前可以考虑作为可能治疗选项的关于该标示外药物的附加信息。例如，图65显示了药品费用和保险公司将覆盖的百分比。

本文描述的计算机或计算系统可以包括各种组件，诸如处理器、操作系统、系统存储器、存储器存储设备、输入输出控制器、输入输出设备和显示设备。相关领域的普通技术人员还将理解，存在计算机的许多可能的配置和组件，并且还可以包括高速缓存存储器、数据备份单元以及许多其他设备。输入设备的示例包括键盘、光标控制设备（例如鼠标）、麦克风、扫描仪等。输出设备的示例包括显示设备（例如，监视器或投影仪）、扬声器、打印机、网卡等等。显示设备可以包括提供可视信息的显示设备，该信息通常可以逻辑地和/或物理地组织为像素阵列。还可以包括接口控制器，其可以包括用于提供输入和输出接口的各种已知或将来的软件程序中的任意一种。例如，界面可以包括通常被称为“图形用户界面”（常称为GUI）的内容，其向用户提供一个或多个图形表示。通常接口被启用以接受使用相关领域的普通技术人员已知的选择或输入手段的用户输入。界面也可以是触摸屏设备。在相同或替代实施例中，计算机上的应用可以采用包括被称为“命令行界面”（通常称为CLI）的界面。CLI通常提供应用和用户之间的基于文本的交互。通常，命令行界面通过显示设备来将输出和接收输入展示为文本行。例如，一些实现可以包括被称为诸如相关领域的普通技术人员已知的Unix Shell的“shell”、或者采用面向对象类型编程架构（诸如Microsoft .NET框架）的Microsoft Windows Powershell。

相关领域的普通技术人员将认识到，界面可以包括一个或多个GUI、CLI或其组合。处理器可以包括诸如由Intel公司制造的Celeron、Core或Pentium处理器、由SunMicrosystems制造的SPARC处理器、由AMD公司制造的Athlon、Sempron、Phenom或Opteron处理器的市售处理器，或者它可以是其他正在或将要变得可用的处理器之一。处理器的一些实施例可以包括被称为多核处理器和/或被实现为采用单核或多核配置中的并行处理技术。例如，多核架构通常包括两个或更多处理器“执行核心”。在本示例中，每个执行核心可以作为使多个线程能够并行执行的独立处理器来实行。另外，相关领域的普通技术人员将认识到，处理器可以以通常被称为32或64位架构或现在已知的或将来可能开发的其他架构配置来配置。

处理器通常执行操作系统，该操作系统可以是例如来自微软公司的Windows型操作系统；来自苹果电脑公司的Mac OS X操作系统；由许多供应商提供的或被称为开源的Unix或Linux类型的操作系统；另一个或未来的操作系统；或者它们的某种组合。操作系统以众所周知的方式与固件和硬件接口连接，并且促进处理器协调和执行可以用各种编程语言编写的各种计算机程序的功能。通常与处理器合作的操作系统协调和执行计算机其他组件的功能。操作系统也提供调度、输入输出控制、文件和数据管理、存储器管理以及通信控制和相关服务，所有这些都根据已知技术。

系统存储器可以包括可以用于存储期望的信息并且可以由计算机访问的各种已知的或将来的存储器存储设备中的任意一个。计算机可读存储介质可以包括以用于存储诸如计算机可读指令、数据结构、程序模块或其他数据的信息的任意方法或技术实现的易失性和非易失性、可移除和不可移除介质。示例包括任意常见的可用的随机存取存储器（RAM）、只读存储器（ROM）、电可擦除可编程只读存储器（EEPROM）、数字多功能盘（DVD）、诸如常驻硬盘或磁带的磁介质、诸如读写致密盘的光学介质、或其他存储器存储设备。存储器存储设备可以包括各种已知或未来设备中的任意设备，包括致密盘驱动器、磁带驱动器、可移除硬盘驱动器、USB或闪存驱动器或软盘驱动器。这种类型的存储器存储设备通常从程序存储介质（相应地诸如致密盘、磁带、可移除硬盘、USB或闪存驱动器或软盘）中读取和/或写入。这些程序存储介质或者其他现在正在使用的或者以后可能开发出的其他程序存储介质中的任意一个可以被认为是计算机程序产品。应当理解，这些程序存储介质通常存储计算机软件程序和/或数据。也称为计算机控制逻辑的计算机软件程序通常存储在系统存储器和/或与存储器存储设备结合使用的程序存储设备中。在一些实施例中，描述了包括具有存储在其中的控制逻辑（计算机软件程序，包括程序代码）的计算机可用介质的计算机程序产品。控制逻辑在由处理器执行时使处理器执行本文所述的功能。在其他实施例中，一些功能主要在使用例如硬件状态机的硬件中实现。实现硬件状态机以便执行本文描述的功能对于相关领域的技术人员将是显而易见的。输入输出控制器可以包括用于接受和处理来自用户（无论是人或机器，无论是本地还是远程）的信息的各种已知设备中的任意一个。这些设备包括例如调制解调器卡、无线卡、网络接口卡、声卡或用于各种已知输入设备中的任意一种的其他类型的控制器。输出控制器可以包括用于向用户（无论是人还是机器、无论是本地还是远程）展示信息的各种已知显示设备中的任意显示设备的控制器。在当前描述的实施例中，计算机的功能元件经由系统总线彼此通信。计算机的一些实施例可以使用网络或其他类型的远程通信与一些功能元件进行通信。对于相关领域的技术人员来说将显而易见的是，如果以软件实现，则仪器控制和/或数据处理应用可以被加载到系统存储器和/或存储器存储设备中并且从系统存储器和/或存储器存储设备执行。仪器控制和/或数据处理应用的全部或部分也可以驻留在只读存储器或存储器存储设备的类似设备中，这种设备不要求首先通过输入输出控制器来加载仪器控制和/或数据处理应用。相关领域的技术人员将会理解，仪器控制和/或数据处理应用或其部分可以由处理器以已知的方式加载到系统存储器或高速缓冲存储器或两者中以有利地执行。此外，计算机可能包括一个或多个库文件，实验数据文件以及存储在系统存储器中的因特网客户端。例如，实验数据可以包括与一个或多个实验或测定有关的数据，例如检测到的信号值或与通过合成（SBS）实验或过程的一个或多个测序相关联的其他值。此外，因特网客户端可以包括能够使用网络访问另一计算机上的远程服务的应用，并且可以例如包括通常称为“网络浏览器”的内容。在本示例中，一些常用的网络浏览器包括微软公司的Microsoft Internet Explorer、Mozilla公司的Mozilla Firefox、苹果计算机公司的Safari、谷歌公司的Google Chrome、或者本领域目前已知的或未来要开发出的其他类型的网络浏览器。而且，在相同或其他实施例中，因特网客户端可以包括或者可以是专用软件应用的元件，该专用软件应用能够经由网络来访问远程信息，诸如用于生物应用的数据处理应用。

网络可以包括本领域普通技术人员熟知的许多各种类型的网络中的一个或多个。例如，网络可以包括局域网和可以采用通常称为TCP / IP协议栈进行通信的广域网。网络可以包括一种网络，该网络包括通常被称为因特网的全球互连计算机网络系统，或者还可以包括各种内联网架构。相关领域的普通技术人员还将理解，联网环境中的一些用户可能更喜欢使用通常称为“防火墙”的设备（有时也称为分组过滤器或边界保护设备）来控制去往和来自硬件和/或软件系统的信息业务。例如，防火墙可以包括硬件或软件元素或其某种组合，并且通常被设计为实施由诸如例如网络管理员等的用户落实的安全策略。

虽然本文的附图可以示出方法步骤的具体顺序，但是步骤的顺序可以不同于所描绘的顺序。此外，两个或更多个步骤可以同时执行或者部分同时执行。步骤执行的变体可用取决于选择的软件和硬件系统以及设计人员的选择。所有这些变体都在本申请的范围内。软件实现可以利用标准编程技术来完成，其中基于规则的逻辑和其他逻辑用来完成各种连接步骤、处理步骤、比较步骤和决定步骤。

应当理解，所标识的实施例仅作为示例提供。在不脱离本申请的范围的情况下，可以在实施例的设计、操作条件和布置中进行其他替代、修改、改变和省略。因此，本申请不限于特定实施例，而是扩展到虽然落入本申请范围内的各种修改。还应当理解的是，本文使用的措辞和术语仅用于描述的目的，并且不应被认为是限制性的。

参考列表

系统10

服务器12

客户端设备15

电子病历EMR系统20

信息系统22

第三方应用24

第三方数据源26

网络28

服务器逻辑31

信息学平台33

数据库35

自然语言处理（NLP）引擎37

存储器38

常规处理元件（处理器）40

本地接口42

输入接口44

输出接口46

通信接口48

工作流程工具52

患者数据追踪器54

图像查看器56

时间线工具58

协作工具60

搜索引擎62

交互式建议表单64

第三方应用工具66

患者信息页面70

概要部分72

时间线部分74

协作部分76

参考工具部分78

搜索结果页面80

结果部分82

属性选择部分84

显示部分86

日期范围选择部分88

用户界面90

表格部分92

制图部分94

时间线部分96

虚拟插接板用户界面100

计数器部分102

显示部分104

准备情况指示器106

（查看者56的）用户界面110

操纵工具112

图像比较部分114

“去往”按钮116

建议表单界面120

患者信息部分122

治疗部分124

临床试验部分 126

“我的应用”界面或小部件132

“应用”图标136

聊天界面142

咨询界面144

虚拟会议界面146

管理页面150

对话部分152

事件部分154

患者清单部分156

患者卡部分158

展示页面/界面160

患者细节部分162

菜单栏164

展示工作空间166

步骤176

患者搜索图标192

查询部分194

结果部分196

比较治疗按钮198

突出显示的患者的详细比较202

详细的患者卡片204

患者池应用或类似的患者搜索图标206

手动类似患者搜索页面210

查询部分212

范围部分214

概要部分216

搜索结果页面220

显示部分222

指南部分232

附加信息部分234

“数据追踪器”应用图标236

（工作流程工具52的）用户界面240

时间线部分242

添加到肿瘤委员会“按钮”244

工作空间部分246

文档页面250

时间线元素252

显示部分254

“受影响的区域”部分或小部件262

位置部分264

类型部分266

生物标记部分268

治疗部分272

时期部分274

尺寸部分276

淋巴结部分278

转移部分282

主页300

患者部分302

通知部分304

参考页面310

结果部分312

患者页面320

患者部分322

过滤部分324

系统1010

生物统计分析工具1020

管理的肿瘤学数据集1030

EMR 1050

PACS 1060

CL-LIS 1070

下一代测序1080

AP-LIS 1090

开源的生物统计分析模型1140

商业上可用的生物统计分析模型1150

通用应用/研究小部件1300

生物统计分析工具工作空间1400

交互界面1420

Claims (29)

1.一种服务器（12），所述服务器（12）通信地耦合到多个信息系统（22），所述服务器（12）包括信息学平台（33）和数据库（35），其中：

所述多个信息系统（22）包括以下各项中的两项或更多项：电子病历（EMR）系统（20）、图片存档和通信系统（PACS）、实验室信息系统（LIS）、放射学信息系统（RIS）、下一代测序（NGS）系统（1080）、和数字病理学（DP）系统；

所述数据库（35）被配置为聚合并存储由所述服务器（12）从所述多个信息系统（22）获得的临床数据；

所述信息学平台（33）包括多个工具，所述多个工具包括第一工具、第二工具和第三工具（52、58、60、66、112、1020），

所述第一工具被配置为：

将来自所述数据库（35）的所述临床数据自动整合到第一工具、第二工具和第三工具（52， 58，60，66，112，1020）的相应功能中；

访问与特定患者有关的第一临床数据，所述第一临床数据来自数据库（35）中整合的临床数据；

所述第二工具被配置为：

在由所述第二工具提供的特定于患者的图形用户界面（70）中显示第一临床数据和一区域，能够从所述区域选择所述服务器外部的第三方应用（24）；以及

所述第三工具被配置为：

通过从所述患者的第一临床数据去除受保护的健康信息（PHI）来生成所述患者的匿名化临床数据；

响应于接收到对所述第三方应用（24）的选择，使得所述第三方应用（24）能够：从所述匿名化临床数据获得与所述患者有关的一个或多个临床项目以处理所述一个或多个临床项目从而生成与所述患者有关的第二临床数据；

从所述第三方应用接收第二临床数据；以及

将所述第二临床数据提供给第二工具以在所述图形用户界面（70）中与所述第一临床数据同时显示。

2.根据权利要求1所述的服务器（12），其中所述多个工具中的至少一个工具（52、58、60、66、112、1020）还被配置为：

在通信地耦合到所述服务器（12）的显示器上按时间顺序显示来自所访问的第一临床数据的患者数据；

由第一用户获得对所显示的患者数据的第一项目的第一选择以在关于所述患者的会议上进行讨论；

由第二用户获得对所显示的患者数据的第二项目的第二选择；以及

向第三用户提供对所述第一项目和所述第二项目的访问。

3.根据权利要求2所述的服务器（12），其中所述多个工具中的至少一个工具（52、58、60、66、112、1020）还被配置为重复以下步骤：所述访问第二患者的所述第一临床数据、所述按时间顺序显示第二患者的患者数据、所述获得所述第一选择和所述第二选择、以及所述向第三用户提供针对至少一个第二患者的访问。

4.根据权利要求1所述的服务器（12），其中所述多个工具中的至少一个工具（52、58、60、66、112、1020）还被配置为：

获得多个搜索准则，其中所述搜索准则是基于与所述特定患者的所述第一临床数据相关联的临床特征来自动确定的或者由用户根据临床特征列表来手动地选择的；

根据所述搜索准则来生成搜索查询；

执行所述搜索查询以找到所述数据库（35）中与所述临床特征中的至少一个匹配的患者，由此生成搜索结果；以及

在通信地耦合到所述服务器（12）的显示器上在所述图形用户界面中显示所述搜索结果。

5.根据权利要求4所述的服务器（12），其中在不接收来自所述用户的搜索命令的情况下自动执行所述搜索查询的生成。

6.根据权利要求4所述的服务器（12），其中生成用于显示的所述搜索结果包括通过以下中至少一项来组织所述搜索结果：总体匹配的临床特征、相关性、治疗类型、以及与所述临床特征相关联的特定事件的日期。

7.根据权利要求1所述的服务器（12），其中所述多个工具中的至少一个工具（52、58、60、66、112、1020）还被配置为：

在显示器的计数器部分中生成多个医疗类别，每个医疗类别与特定的医疗科室有关；

生成由一个或多个医疗人员查看并且从患者的临床数据中选择的临床项目，所述患者的所述临床数据是从所述数据库（35）获得的；

自动地将所述临床项目存储在相应的医疗类别中；

自动地存储与所述临床项目相关联的所述医疗人员的人员信息；

生成每个医疗类别中的每个临床项目的概要，其中所述临床项目的所述概要包括以下中的至少一个：缩略图图像、简要描述、生成所述临床项目的日期、和相关联的医疗人员；以及

在对应于每个医疗类别的显示部分上在所述图形用户界面中显示每个临床项目的所述概要。

8.根据权利要求7所述的服务器（12），其中存储所述临床项目的所述相应医疗类别是通过将所述临床项目源自的医疗科室与所述相应医疗类别相匹配来确定的。

9.根据权利要求7所述的服务器（12），其中所述多个工具中的至少一个工具（52、58、60、66、112、1020）还被配置为以下至少一项：

指示每个医疗类别的准备状态；以及

在所述图形 用户界面中显示包括所述患者的治疗计划的文档页面。

10.根据权利要求1所述的服务器（12），其中第二工具主办虚拟医学会议，并且其中所述多个工具中的至少一个工具（52、58、60、66、112、1020）还被配置为：

识别能够在与患者有关的虚拟医学会议中协作的多个协作者；

使用每个协作者的人员信息来通知所述协作者；

接收来自所述协作者中的至少一个的评论，所述评论包括与所述患者有关的治疗决定；

将每个协作者的所述评论发送给其他协作者；

将所述评论与所述患者的特定临床数据链接；以及

将所述协作者的所有评论记录到在所述数据库（35）中存储的所述患者的所述临床数据中。

11.根据权利要求10所述的服务器（12），其中所述多个工具中的至少一个工具（52、58、60、66、112、1020）还被配置为：

基于所述协作者的所述评论来搜索所述患者的所述临床数据以找到预定的标志；以及

如果找到预定的标志，则向所述协作者通知需要检查所述评论的一致性，并追踪协作检查的执行以及所述协作者对不一致的解决方案。

12.根据权利要求11所述的服务器（12），其中追踪所述一致性检查的执行和所述协作者对不一致的解决方案是使用机器学习系统来执行的，所述机器学习系统是基于过去的一致性检查和过去的对不一致的解决方案中的至少一个来训练的。

13.根据权利要求10所述的服务器（12），其中所述协作者的评论包括建议，并且其中所述多个工具中的至少一个工具（52、58、60、66、112、1020）还被配置为合并所述协作者的所述建议用于向所述患者展示。

14.根据权利要求10所述的服务器（12），其中所述多个工具中的至少一个工具（52、58、60、66、112、1020）还被配置为通过从所述患者的所述临床数据中移除受保护的健康信息（PHI）来生成去标识的临床数据。

15.根据权利要求10所述的服务器（12），其中所述多个工具中的至少一个工具（52、58、60、66、112、1020）还被配置为：

使所述协作者能够进行以下至少一项：请求与专家的即席咨询会话；确定所述专家的主动可用性和最佳沟通形式；记录关于所述患者的所述咨询会话；以及将所记录的咨询包括为所述患者的第一临床数据的一部分。

16.根据权利要求10所述的服务器（12），其中通知所述协作者包括邀请所述协作者加入与所述患者有关的所述虚拟医学会议。

17.根据权利要求1所述的服务器（12），其中所述多个工具中的至少一个工具（52、58、60、66、112、1020）还被配置为：

通过从所述患者的所述临床数据中移除受保护的健康信息（PHI）来生成所述患者的匿名临床数据；

将与所述患者有关的一个或多个临床项目从所述匿名临床数据转移到所述第三方应用（24）；

接收来自所述第三方应用（24）的编辑结果；

将所述编辑结果显示在通信地耦合到所述服务器（12）的显示器的第三方应用部分中；以及

在文档中存储所述编辑结果。

18.根据权利要求17所述的服务器（12），其中传送所述临床项目包括：

检索由所述第三方应用（24）预先指定的所述一个或多个临床项目；以及

向所述第三方应用（24）发送所述一个或多个临床项目，其中所述第三方应用（24）被配置为：利用所述预先指定的临床项目来执行预定动作并输出与所述检索的预先指定的临床项目相关的编辑结果。

19.根据权利要求18所述的服务器（12），其中所述第三方应用（24）的所述预定动作包括：聚集与所述预先指定的临床项目相关联的关键字，以及基于所述关键字执行操作，所述操作包括以下中至少一项：启动搜索查询、确定临床指南以及确定针对患者的建议治疗；以及

其中所述文档包括以下中至少一项：确定的临床指南或针对患者确定的建议治疗。

20.根据权利要求18所述的服务器（12），其中所述第三方应用（24）是患者知晓的并且被配置为直接从所述数据库（35）查询并接收与所述患者相关联的所述预先指定的临床项目。

21.根据权利要求1所述的服务器（12），其中所述多个工具中的至少一个工具（52、58、60、66、112、1020）还被配置为：

基于所述临床数据来确定并生成患者医学问题的解剖位置的图形表示；以及

在用户的显示器上显示所述患者医学问题的所述解剖位置的所述图形表示。

22.根据权利要求4所述的服务器，其中所述搜索结果包括匹配疗法，所述匹配疗法包括针对以下至少一项的信息：食品和药物管理局（FDA）批准的药物、临床试验和标示外药物。

23.根据权利要求22所述的服务器，其中所述多个工具中的至少一个工具（52、58、60、66、112、1020）还被配置为：对于所述食品和药物管理局批准的药物，在所述图形用户界面中显示以下中的至少一个：证据水平、治疗方案、耐药性、药物成本以及保险覆盖的百分比。

24.根据权利要求22所述的服务器，其中所述多个工具中的至少一个工具（52、58、60、66、112、1020）还被配置为在所述图形用户界面中显示多个标签，其中所述标签中的一个被选择并分配给所述食品和药物管理局批准的药物以指示所述患者对所述药物的反应。

25.根据权利要求22所述的服务器，其中所述多个工具中的至少一个工具（52、58、60、66、112、1020）还被配置为在所述图形用户界面中显示用于所述临床试验的过滤器，其中所述过滤器选自以下各项构成的组：基因突变、患者状况、试验位置、试验药物、药物类别、耐药性、进行试验的机构、药物时期、试验类型、和试验状态。

26.根据权利要求22所述的服务器，其中所述多个工具中的至少一个工具（52、58、60、66、112、1020）还被配置为：对于标示外药物，在所述图形用户界面中显示以下中的至少一个：药物指示、证据水平、处方标签、治疗方案、药物成本、以及保险覆盖的百分比。

27.根据权利要求1所述的服务器，其中所述多个工具中的至少一个工具（52、58、60、66、112、1020）还被配置为在所述图形用户界面中显示所述临床数据关于时间的相关性和关系。

28.根据权利要求1所述的服务器（12），其中所述多个工具中的至少一个工具（52、58、60、66、112、1020）还被配置为：

在启动所述第三方应用时，经由被所述信息学平台（33）显示的API访问与所述患者有关的所述一个或多个临床项目；以及

经由所述API将与所述患者有关的所述一个或多个临床项目传递给所述第三方应用。

29.根据权利要求28所述的服务器（12），其中所述第三方应用还被配置为在所述第三方应用启动时通过以下方式自动访问与所述患者有关的所述一个或多个临床项目：

聚集特定于所述患者的关键词的集合；以及

经由所述API将所述关键词的集合传递到所述信息学平台（33），其中基于所述关键词的集合来识别与所述患者有关的所述一个或多个临床项目。

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