WO2019146717A1 - 熱安定性が向上したケトース 3-エピメラーゼ - Google Patents
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- C12Y501/03—Racemaces and epimerases (5.1) acting on carbohydrates and derivatives (5.1.3)
Definitions
- the present invention relates to novel ketose 3-epimerases with improved thermal stability and methods for their preparation.
- D-psicose is known as a kind of rare sugar which exists only in trace amounts in nature, and its sweetness is about 70% of that of sugar, and is used as a sweetener. D-psicose is also known to have various physiological functions such as suppression of blood sugar level increase, having a calorie value close to zero, and is attracting attention as a functional food material. As such, there is a growing need in the food industry for an efficient and safe method of producing D-psicose.
- D-psicose is an epimer of D-fructose
- a production method for causing D-psicose 3-epimerase to act on D-fructose has been established.
- ketose 3-epimerase derived from Arthrobacter globiformis M30 (Patent Document 1) and D-psicose 3-epimerase derived from Agrobacterium tumefaciens (Patent Document 2) are disclosed.
- Agrobacterium tumefaciens-derived cycose (psicose) epimerizing enzyme mutant (patent document 3) or bulk hordelia derived from which the denaturation of the enzyme due to temperature is suppressed to maintain the production efficiency and the thermal stability is improved.
- a D-psicose 3-epimerase mutant (Patent Document 4) is used for the production of D-psicose.
- the present inventors investigated various methods for producing D-psicose by acting an enzyme, and it was found that thermostability is achieved by substituting specific amino acids in the amino acid sequence of ketose 3-epimerase derived from Arthrobacter globiformis. They found that mutant enzymes with improved sex were obtained, and found that they were able to efficiently produce D-psicose. More specifically, it has at least one amino acid mutation in the amino acid sequence of wild-type ketose 3-epimerase derived from Arthrobacter globiformis represented by SEQ ID NO: 1, (1) Enzymatic activity at 50 ° C.
- T50 Ratio of enzyme activity (T70) at 70 ° C to: T70 / T50, or (2) 50 mM phosphate buffer (pH 8.0, containing 2 mM magnesium sulfate), assuming that the activity at 50 ° C of the untreated enzyme is 100 )
- the present invention has been completed based on the above findings, and comprises the following (1) to (9).
- ⁇ 1> At least one amino acid mutation in the amino acid sequence of wild-type ketose 3-epimerase derived from Arthrobacter globiformis represented by SEQ ID NO: 1, (1) 70 ° C. for enzyme activity (T 50) at 50 ° C. Enzyme activity (T70) ratio in: T70 / T50, or (2) Suspension of 50 mM phosphate buffer (pH 8.0, containing 2 mM magnesium sulfate), assuming that the activity at 50 ° C of the untreated enzyme is 100 The remaining enzyme activity at 50 ° C. of the same enzyme treated at 60 ° C.
- -Epimerase mutant ⁇ 5> Wild-type Ketose At least one amino acid mutation in the amino acid sequence of 3-epimerase, counted from the amino terminus of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1, is as follows: 6, 14, 22, 26, 34, 67, 68, 69, 70, 75, 91, 95, 100, 101, 110, 122, 137, 144, 160, 173, 177, 181, 200, 203, 214, 222, 226, 237, 261, 270, 271, 275, 278, 281 and 289, The ketose 3-epimerase mutant according to ⁇ 1>, which is present in any one of the above.
- ⁇ 6> A ketose 3-epimerase variant selected from variants having a mutation at the following position, counting from the amino terminus of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1, a ⁇ 6> ketose 3-epimerase variant.
- ⁇ 8> The ketose 3-epimerase variant according to the above ⁇ 6>, wherein the ketose 3-epimerase variant is further selected from the following variants.
- the present invention provides a ketose 3-epimerase mutant which is an enzyme producing D-psicose derived from Arthrobacter globiformis, which has improved thermostability as compared to wild-type and has food safety. it can.
- the Ketose 3-epimerase enzyme variant from Arthrobacter globiformis of the present invention with improved thermostability can maintain the enzyme activity for a relatively long time at temperatures higher than 50 ° C. By acting on D-fructose, D-psicose can be efficiently produced as compared to the kerosete 3-epimerase (wild-type) derived from conventional Arthrobacter globiformis.
- the wild-type enzyme of the ketose 3-epimerase used in the present invention is derived from Arthrobacter globiformis.
- the food industry has confirmed the safety of this bacterium.
- the FDA's EAFUS Everything Added to the Food in the United States: A Food Additive Database is listed as "Glucose isomerase from immobilized arthrobacter globiformis". This usage immobilizes the cells as it is and proves that the cells themselves are extremely safe.
- Arthrobacter is listed on the food additive list as an enzyme-based microorganism such as " ⁇ -amylase, isomalt dextrose".
- ⁇ -amylase isomalt dextrose
- the wild-type ketose 3-epimerase used in the present invention is derived from Arthrobacter globiformis. Preferably, it is derived from Arthrobacter globiformis M30 (Accession No. NITE BP-1111) and has the following amino acid sequence (SEQ ID NO: 1).
- the wild-type ketose 3-epimerase of the present invention preferably has substrate specificity of the following (A) and (B), and ketose having physicochemical properties of the following (a) to (f): -It is an epimerase.
- SEQ ID NO: 1 MKIGCHGGLVW TGHFDAEGIR YSVQKTREAG FDLVEFPLMD PFSFDVQTAK 51 SALAEHDLAA SASLGLSDAT DVSSEDPAVV KAGEELLNRA VDVLAELGAT 101 DFCGVIYSAM KKYMEPATAA GLANSKAAGG RVADRASDLG INVSLEVVNR 151 YETNVLNTGR QALAYLEELN RPNLGIHLDT YHMNIEESDM FSPILDTAEA 201 LRYVHIGESH RGYLGTGSVD FDTFFKALGR IGYDGPVVFE SFSSSVVAPD 251 LSRMLGIWRN LWADNEELGA HANAFIRDKL TAIKTIELH
- Substrate Specificity of Wild-Type Ketose 3-Epimerase (A) Epimerize the 3-position of D- or L-ketose to produce the corresponding D- or L-ketose. (B) Among D- or L-ketoses, the substrate specificity for D-fructose and D-psicose is the highest.
- the ketose 3-epimerase mutant of the present invention has at least one amino acid mutation in the amino acid sequence of wild-type ketose 3-epimerase derived from Arthrobacter globiformis as shown in SEQ ID NO: 1, (1) at 50 ° C. Ratio of enzyme activity (T70) at 70 ° C. to enzyme activity (T50): T70 / T50, or (2) 50 mM phosphate buffer (pH 8.0, when the activity at 50 ° C.
- the mutant ketose 3-epimerase of the present invention is obtained by substituting a part of the amino acid sequence with a specific amino acid sequence based on the amino acid sequence of the wild-type ketose 3-epimerase.
- Enzyme mutants were obtained by substituting amino acids at various positions shown in Table 1, and each mutant was tested to see if the thermal stability was actually improved.
- T70 / T50 is, for example, 50 mM phosphate buffer (pH 8 containing D-psicose (2 mM Mg 2 SO 4) .0)
- the epimerase activity can be determined by reacting ketose 3-epimerase at 50.degree. C. or 70.degree. C. for 10 minutes using the solution as a substrate and measuring the reaction product D-fructose. More specifically, after termination of the reaction, the reaction solution is subjected to HPLC to calculate the enzyme activity from the peak area ratio of D-psicose as the substrate at 50 ° C. and 70 ° C.
- T70 / T50 of the above-mentioned mutant-type ketose 3-epimerase calculated in this manner is preferably 0.70 or more, more preferably 0.80 or more, and still more preferably 1.0 or more. More preferably, it is 1.5 or more.
- the reaction solution is subjected to HPLC, and from the peak area ratio of D-psicose as a substrate to D-fructose as a reaction product, untreated enzyme and enzyme treated at 60 ° C. for 1 hour
- the enzyme activity of can be calculated.
- the residual enzyme activity of the mutant ketose 3-epimerase: A is 40 or more, more preferably 50 or more, where the enzyme activity of the wild-type ketose 3-epimerase of SEQ ID NO: 1 is 100. More preferably, it is 60 or more, and still more preferably 70 or more.
- At least one amino acid mutation in the amino acid sequence of wild-type ketose 3-epimerase derived from Arthrobacter gloviformis represented by SEQ ID NO: 1 may be at least one mutation as long as the above activity is exhibited. Substitution of amino acids at ⁇ 10 positions is preferable, and substitution of amino acids at 1 to 8 positions is more preferable.
- At least one amino acid mutation in the amino acid sequence of wild type ketose 3-epimerase is present at any of the following positions, counting from the amino terminus of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1. Position: 6, 14, 22, 26, 34, 67, 68, 69, 70, 75, 91, 95, 100, 101, 110, 122, 137, 144, 160, 173, 177, 181, 200, 203, 214, 222, 226, 237, 261, 270, 271, 275, 278, 281 and 289 Furthermore, it is more preferable that at least one amino acid mutation in the amino acid sequence of wild-type ketose 3-epimerase is present at any of the following positions, counting from the amino terminus of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1.
- the type of amino acid inserted by substitution at each position may be any amino acid as long as T70 / T50 or residual enzyme activity: A described above is satisfied. Usually, it is preferable to replace one amino acid with one other amino acid, but at the carboxy terminus, one amino acid may be replaced with 1 to 10 consecutive amino acids.
- ketose 3-epimerase variant is selected from variants having amino acid substitutions at the following positions:
- ketose 3-epimerase variant is selected from variants having amino acid substitutions at the following positions:
- the variants that exhibited improved thermal stability over wild-type have the amino acid substitutions shown below.
- R160A indicates that arginine (R) at position 160 from the amino terminus of SEQ ID NO: 1 is substituted with alanine (A).
- H289 VSARHKP shows that the histidine (H) at position 289 from the amino terminus of SEQ ID NO: 1 was replaced with the sequence of VSARHKP.
- more preferable ketose 3-epimerase mutants include PM3, PM4, PM5, PM9, PM12, PM14, PM17, PM18, PM23, PM26, PM28, PM29, PM31, PM32, PM33, PM38, PM39, PM41, PM43, PM44, PM46, PM48, PM51, PM55, PM56, PM57, PM58, PM59, PM60, PM61, PM62, PM63, PM64 and PM65 can be mentioned.
- more preferable ketose 3-epimerase mutants include PM4, PM17, PM18, PM23, PM26, PM29, PM32, PM33, PM39, PM41, PM43, PM44, PM45, PM48, PM51, PM55.
- PM17, PM23, PM26, PM29, PM32, PM38, PM39, PM41, PM43, PM51, PM57, PM60, PM61 and PM65 are particularly preferable.
- the ketose 3-epimerase variant of the present invention comprises any one of at least one amino acid within the amino acid sequence of wild-type ketose 3-epimerase (more specifically, at least one amino acid within the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1).
- the position can be substituted by appropriate use of known methods. For example, by known genetic engineering techniques, it is possible to obtain a mutant in which an amino acid substitution at a target position is performed.
- a ketose 3-epimerase mutant of the present invention may be obtained by, for example, using a nucleic acid sequence encoding the amino acid sequence of each mutant, or using a plasmid vector into which a DNA fragment into which a ketose 3-epimerase has been mutated is incorporated.
- the type of recombinant vector used is not particularly limited, and may be a vector commonly used in the art. Also, as a recombinant producing ketose 3-epimerase, E. coli, Bacillus, yeast or Agrobacterium may be used.
- the ketose 3-epimerase mutant of the present invention may be used as a liquid enzyme, using known immobilization means such as carrier binding, crosslinking, gel entrapment, etc. And may be used as immobilized enzymes.
- known immobilized carriers such as ion exchange resins, synthetic adsorbents, activated carbon, porous glass, or silica gel can be used.
- an ion exchange resin is used as the immobilization carrier, for example, a phenolic gel type weak base ion exchange resin or a styrene type macroporous weak base ion exchange resin can be used.
- ion exchange resins may be used, and as commercially available products of phenolic gel type weakly basic ion exchange resins, Duolite A561, Duolite A568, Duolite PWA 7 (all manufactured by Dow DuPont) And the like.
- commercially available styrene-based macroporous weakly basic ion exchange resins include Amberlite FPA 95, Amberlite IRA 904, Amberlite XE 583 (all manufactured by Dow Dupont), Purololite A 111 S, Purololite A 103 S (all , Diaion WA20, Diaion WA30 (all manufactured by Mitsubishi Chemical Corporation), and the like.
- D-psicose using the ketose 3-epimerase mutant of the present invention or the immobilized ketose 3-epimerase mutant of the present invention. More specifically, when using, for example, an immobilized ketose 3-epimerase variant of the present invention, the D-fructose aqueous solution is continuously passed through a reaction column packed with the ketose 3-epimerase to obtain A mixed aqueous solution of D-fructose and D-psicose partially converted to D-psicose is obtained and then subjected to decolorization, desalting and chromatographic fractionation by a known method to produce a highly pure D-psicose aqueous solution can do.
- crystalline D-psicose can also be produced by known methods.
- the D-fructose aqueous solution is preferably heated to 50 to 80 ° C., and its concentration is preferably 30 to 70 wt%, and a pH adjuster such as caustic soda Is preferably adjusted to pH 6-9.
- the flow rate at the time of passing the D-fructose aqueous solution into the reaction tower is preferably adjusted so that the conversion rate of D-fructose to D-psicose is 20% or more close to the reaction equilibrium of the enzyme.
- various ions such as 10 to 100 ppm of magnesium ion and 50 to 500 ppm of sulfite ion may be contained as an enzyme activator and stabilizer.
- an enzyme species whose steric structure was elucidated was selected from the above 12 types, and a model of the estimated steric structure of the target enzyme was constructed using a Swiss model and energy minimization calculation.
- a model of the estimated steric structure of the target enzyme was constructed using a Swiss model and energy minimization calculation.
- the site that contributes to the structural stability of this enzyme is searched and extracted, and the amino acid modification that is likely to be able to thermally stabilize the three-dimensional structure of the enzyme physicochemically went.
- Each of the positions shown in Table 1 was selected as a specific amino acid sequence position expected to improve the thermal stability, and it was decided to substitute for the specific amino acid sequence.
- Conversion to a specific amino acid sequence includes, for example, improvement of hydrophobic interaction, stabilization of loop structure of peptide main chain, introduction of covalent bond between amino acids by disulfide bond, improvement of space density, extension by C-terminal extension of protein It was a substitution to an amino acid sequence which is predicted to be effective in stabilization of incorporation etc. (Table 1).
- a transformant (E. coli) expressing a ketose 3-epimerase mutant enzyme was inoculated in LB medium (culture solution) containing 100 ⁇ g / ml of ampicillin and 50 ⁇ g / ml of kanamycin, and precultured at 37 ° C. for 16 hours.
- This preculture solution was added to a 10 to 100-fold volume of a main culture solution containing 0.1 mM IPTG, and cultured at 20 ° C. for 24 hours to induce the desired enzyme expression.
- the main culture broth was centrifuged at 5,500 ⁇ g for 20 minutes at 4 ° C. in a centrifuge.
- the supernatant was removed to recover the cells.
- the recovered cells were suspended in an appropriate amount of 50 mM phosphate buffer (pH 8.0, containing 2 mM magnesium sulfate), and subjected to six cycles of ultrasonic disruption at 45 second intervals for 15 seconds. Thereafter, the supernatant was removed by centrifugation at 5,500 ⁇ g for 20 minutes at 4 ° C. to obtain a crude enzyme solution.
- the crude enzyme solution of each mutant enzyme of Table 1 was obtained by the above-mentioned method, and was used for evaluation of enzyme activity.
- the enzyme reaction was performed under the reaction conditions shown in Table 2 using each crude enzyme solution obtained by the above-mentioned method.
- the reaction solution was purified by desalting with an ion exchange resin, filtered and subjected to HPLC (HPLC system (manufactured by Tosoh Corporation), MCIGEL CK08 EC (manufactured by Mitsubishi Chemical Corporation)).
- HPLC HPLC system (manufactured by Tosoh Corporation), MCIGEL CK08 EC (manufactured by Mitsubishi Chemical Corporation)).
- HPLC HPLC system (manufactured by Tosoh Corporation), MCIGEL CK08 EC (manufactured by Mitsubishi Chemical Corporation)
- the peak area of D-fructose measured by HPLC was calculated, and each enzyme activity was calculated from the peak area ratio of 50 ° C. and 70 ° C.
- One unit of enzyme activity is defined as the amount of enzyme which epimerizes D-psicose under each condition and produces 1 ⁇
- T70 / T50 showed a mutant enzyme higher than the wild type activity value (0.7 ⁇ 0.1). These mutant enzymes were suggested to have improved thermostability.
- substitution of the amino acid sequence was carried out by selecting each position shown in Table 1 as a specific amino acid sequence position expected to improve the thermal stability. In some cases, the thermal stability may not change much or may even decrease, resulting in an unexpected result.
- the T70 / T50 was 1.0 or more or the residual enzyme activity: A was 40 or more, which was superior to the wild type. Furthermore, PM17, PM23, PM26, PM29, PM32, PM38, PM39, PM41, PM43, PM51, PM57, PM60, PM61, and PM65 are twice or more the wild type T70 / T50 or the residual enzyme activity: A. Activity was particularly excellent.
- ⁇ Preparation of immobilized enzyme> 1 A crude enzyme solution of PM38 / 41/43/51 / wild type (hereinafter referred to as WT) was obtained by the same method as described above in ⁇ Preparation of crude enzyme solution>.
- the enzyme activity of each crude enzyme solution was measured by the method and conditions described in the above ⁇ Evaluation of activity of crude enzyme solution> and ⁇ Table 2>.
- Immobilized support ion exchange resin Amberlite FPA 95 or Duolite A 568 (both from Dow Dupont)
- crude enzyme solution washed with 50 mM phosphate buffer (pH 8.0) containing 2.2 mM magnesium sulfate and equilibrated was mixed in a vial at a ratio of 630 U of the enzyme activity of the crude enzyme solution to 1 mL of the immobilized carrier, and mixed by inversion for 24 hours or more. 3.
- the immobilized enzyme prepared by the above method was washed with 50 mM phosphate buffer (pH 8.0) containing 2 mM magnesium sulfate and then stored in a refrigerator at 4 ° C. until use.
- the flow rate of the reaction material was appropriately adjusted so that the isomerization rate x represented by Formula (1) was 20% or more.
- x A Psi / (A Psi + A Fru ) (1) 4.
- the ratio of enzyme activities a 1 operation starting from the day 42 of the enzymatic activity a 42 operation start Day 1 reaction column (hereinafter, the residual activity of 42 days) showing the Figure 1.
- the residual activity on the 42nd day of WT was about 60%, but the residual activity on the 42nd day of PM38 / 41/43/51 was about 80%, and the decrease range of the enzyme activity by 42 days of operation was small The This indicates that the decrease in activity is slow.
- the reaction tower is often operated at a temperature of 50 ° C. or more for a long time (about several months to several years). In this case, the enzyme activity gradually decreases and the amount of psicose produced decreases.
- the mutant mentioned in the present example has a slow decrease in activity, so that the amount of psicose produced is unlikely to decrease, which is industrially useful. From the above results, compared with the conventional wild-type enzyme, the mutant enzyme of the present invention maintains the enzyme activity at the optimum temperature by improving the heat stability, and efficiently produces D-psicose. Is possible.
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Abstract
Description
<1>配列番号1で表されるアルスロバクター グロビホルミス由来の野生型ケトース 3-エピメラーゼのアミノ酸配列内に少なくとも1つのアミノ酸変異を有し、(1)50℃における酵素活性(T50)に対する70℃における酵素活性(T70)の比:T70/T50、あるいは(2)未処理の酵素の50℃における活性を100とした場合の、50mMリン酸バッファー(pH8.0、2mM硫酸マグネシウムを含む)懸濁液で、60℃、1時間処理した同じ酵素の50℃における残存酵素活性:Aが、野生型ケトース 3-エピメラーゼのT70/T50あるいはAより高い値を示す、ケトース 3-エピメラーゼ変異体。
<2>T70/T50が1.0以上である、上記<1>記載のケトース 3-エピメラーゼ変異体。
<3>残存酵素活性:Aが40以上である、上記<1>又は<2>記載のケトース 3-エピメラーゼ変異体。
<4>野生型ケトース 3-エピメラーゼのアミノ酸配列内の少なくとも1つのアミノ酸変異が、1~10個の位置におけるアミノ酸置換である、上記<1>~<3>のいずれか一に記載のケトース 3-エピメラーゼ変異体。
<5>野生型ケトース 3-エピメラーゼのアミノ酸配列内の、少なくとも1つのアミノ酸変異が、配列番号1のアミノ酸配列のアミノ末端から数えて下記の位置:
6、14、22、26、34、67、68、69、70、75、91、95、100、101、110、122、137、144、160、173、177、181、200、203、214、222、226、237、261、270、271、275、278、281及び289、
のいずれかに存在する、上記<1>記載のケトース 3-エピメラーゼ変異体。
<6>ケトース 3-エピメラーゼ変異体が、配列番号1のアミノ酸配列のアミノ末端から数えて下記の位置に変異を有する変異体から選択されるケトース 3-エピメラーゼ変異体。
<7>ケトース 3-エピメラーゼ変異体が、さらに下記変異体から選択される上記<6>記載のケトース 3-エピメラーゼ変異体。
<8> ケトース 3-エピメラーゼ変異体が、さらに下記変異体から選択される上記<6>記載のケトース 3-エピメラーゼ変異体。
<9>固定化担体に固定化した、上記<1>~<8>のいずれか一に記載のケトース 3-エピメラーゼ変異体。
<10>D-フルクトースに対して、上記<1>~<8>のいずれか一に記載のケトース 3-エピメラーゼ変異体または<9>記載の固定化されたケトース 3-エピメラーゼ変異体を作用させることを特徴とする、D-プシコースの製造方法。
本発明の熱安定性が向上したアルスロバクター グロビホルミス由来のケトース 3-エピメラーゼ酵素変異体は、50℃よりも高い温度で酵素活性を比較的長時間維持することができるため、これを、基質のD-フルクトースに作用させることで、従来のアルスロバクター グロビホルミス由来のケトース 3-エピメラーゼ(野生型)と比較して、D-プシコースを効率的に生産することができる。
本発明で利用するケトース 3-エピメラーゼの野生型酵素はアルスロバクター グロビホルミスに由来するものである。食品産業では本細菌の安全性は確認されている。アメリカにおいては、FDAのEAFUS(Everything Added to Food in the United States):A Food Additive Databaseに“Glucose isomerase from immobilized arthrobacter globiformis”として収載されている。この使用法は、菌体をそのまま固定化するもので、菌体自体の安全性が非常に高いことを証明するものである。
このように日米欧において長い使用実績があり、アルスロバクター属は安全性の高い菌種であるといえる。
(1)本発明で使用する野生型のケトース 3-エピメラーゼは、アルスロバクター グロビホルミス由来のものである。好ましくは、アルスロバクター グロビホルミス M30(寄託番号NITE BP-1111)由来のものであり、下記アミノ酸配列(配列番号1)を有する。
また、本発明の野生型ケトース 3-エピメラーゼは、好ましくは、下記(A)、(B)の基質特異性を有し、且つ、下記(a)~(f)の理化学的性質を有するケトース 3-エピメラーゼである。
1 MKIGCHGLVW TGHFDAEGIR YSVQKTREAG FDLVEFPLMD PFSFDVQTAK
51 SALAEHGLAA SASLGLSDAT DVSSEDPAVV KAGEELLNRA VDVLAELGAT
101 DFCGVIYSAM KKYMEPATAA GLANSKAAVG RVADRASDLG INVSLEVVNR
151 YETNVLNTGR QALAYLEELN RPNLGIHLDT YHMNIEESDM FSPILDTAEA
201 LRYVHIGESH RGYLGTGSVD FDTFFKALGR IGYDGPVVFE SFSSSVVAPD
251 LSRMLGIWRN LWADNEELGA HANAFIRDKL TAIKTIELH
(A)D-またはL-ケトースの3位をエピマー化し、対応するD-またはL-ケトースを生成する。
(B)D-またはL-ケトースの中ではD-フラクトースおよびD-プシコースに対する基質特異性が最も高い。
(a)分子量
SDS‐PAGEによるサブユニットの分子量が約32kDaであり、ゲル濾過法による分子量が120kDaである、サブユニットの分子量が32kDaのホモテトラマー構造である。
(b)至適pH
30℃、30分間反応、20mMのマグネシウム(Mg2+)存在下の条件で、6ないし11。
(c)至適温度
pH7.5、30分間反応、20mMのマグネシウム(Mg2+)存在下の条件で、60ないし80℃。
(d)pH安定性
4℃、24時間保持の条件下で、少なくともpH5ないし11の範囲で安定。
(e)熱安定性
pH7.5、1時間保持、4mMのマグネシウムイオン(Mg2+)の存在下の条件で、約50℃以下で安定。マグネシウムイオン(Mg2+)の非存在下の条件で、約40℃以下で安定。
(f)金属イオンによる活性化
二価マンガンイオン(Mn2+)、二価コバルトイオン(Co2+)、カルシウム(Ca2+)およびマグネシウムイオン(Mg2+)により活性化される。
本発明のケトース 3-エピメラーゼ変異体は、配列番号1で表されるアルスロバクター グロビホルミス由来の野生型ケトース 3-エピメラーゼのアミノ酸配列内に少なくとも1つのアミノ酸変異を有し、(1)50℃における酵素活性(T50)に対する70℃における酵素活性(T70)の比:T70/T50、あるいは(2)未処理の酵素の50℃における活性を100とした場合の、50mMリン酸バッファー(pH8.0、2mM硫酸マグネシウムを含む)懸濁液で、60℃、1時間処理した同じ酵素の50℃における残存酵素活性:Aが、野生型ケトース 3-エピメラーゼのT70/T50あるいはAより高い値を示す変異体である。
表1に示す様々な位置のアミノ酸を置換することにより酵素変異体を得て、各変異体について、熱安定性が実際に向上したか否かを試験した。
このようにして算出された上記変異型ケトース 3-エピメラーゼのT70/T50が、好ましくは0.70以上であり、より好ましくは0.80以上であり、さらに好ましくは1.0以上であり、よりさらに好ましくは1.5以上である。
好ましくは、上記変異型ケトース 3-エピメラーゼの残存酵素活性:Aは、配列番号1の野生型ケトース 3-エピメラーゼの酵素活性を100とした場合に、40以上であり、より好ましくは50以上であり、さらに好ましくは60以上であり、よりさらに好ましくは70以上である。
位置:6、14、22、26、34、67、68、69、70、75、91、95、100、101、110、122、137、144、160、173、177、181、200、203、214、222、226、237、261、270、271、275、278、281及び289
さらに、野生型ケトース 3-エピメラーゼのアミノ酸配列内の少なくとも1つのアミノ酸変異は、配列番号1のアミノ酸配列のアミノ末端から数えて下記の位置のいずれかに存在することがより好ましい。
位置:6、14、22、26、34、67、68、69、70、75、91、95、100、101、110、122、137、144、160、173、177、200、214、222、237、261、270、271、275、278、281及び289
上記変異体のうちさらにより好ましいケトース 3-エピメラーゼ変異体としては、PM4、PM17、PM18、PM23、PM26、PM29、PM32、PM33、PM38、PM39、PM41、PM43、PM44、PM45、PM48、PM51、PM55、PM57、PM58、PM60、PM61、PM63及びPM65が挙げられる。
上記変異体のうち、PM17、PM23、PM26、PM29、PM32、PM38、PM39、PM41、PM43、PM51、PM57、PM60、PM61及びPM65が特に好ましい。
また、本発明のケトース 3-エピメラーゼ変異体は、例えば各変異体のアミノ酸配列をコードする核酸配列を用いて、あるいはケトース 3-エピメラーゼの変異導入したDNA断片を組み込んだプラスミドベクターを、大腸菌(宿主)などに導入し、目的の形質転換体を得て、製造することができる。使用する組換えベクターの種類は特に制限されることなく、当該技術分野で通常使用されるベクターであってもよい。またケトース 3-エピメラーゼを生産する組換え体は、大腸菌、バチルス、酵母、又はアグロバクテリウムを用いてもよい。
担体結合法を利用する場合は、公知の固定化担体、例えばイオン交換樹脂、合成吸着剤、活性炭、多孔性ガラス、あるいはシリカゲルを用いることができる。固定化担体にイオン交換樹脂を用いる場合、例えば、フェノール系ゲル型弱塩基性イオン交換樹脂あるいはスチレン系マクロポーラス型弱塩基性イオン交換樹脂を使用することができる。本発明ではこれらのイオン交換樹脂の市販品を用いても良く、フェノール系ゲル型弱塩基性イオン交換樹脂の市販品として、デュオライトA561、デュオライトA568、デュオライトPWA7(以上、ダウ・デュポン社製)等が挙げられる。また、スチレン系マクロポーラス型弱塩基性イオン交換樹脂の市販品として、アンバーライトFPA95、アンバーライトIRA904、アンバーライトXE583(以上、ダウ・デュポン社製)、ピュロライトA111S、ピュロライトA103S(以上、ピュロライト社製)、ダイヤイオンWA20、ダイヤイオンWA30(以上、三菱化学社製)等が挙げられる。
より具体的には、例えば、固定化された本発明のケトース 3-エピメラーゼ変異体を用いる場合、それが充填された反応塔にD-フラクトース水溶液を連続的に通過させることで、D-フラクトースの一部がD-プシコースに変換されたD-フラクトースおよびD-プシコースの混合水溶液を得て、その後公知の方法により脱色・脱塩・クロマト分画を施すことにより高純度なD-プシコース水溶液を生産することができる。その後さらに公知の方法により結晶D-プシコースを生産することもできる。
反応塔にD-フラクトース水溶液を通過させる際、D-フラクトース水溶液は50~80℃に加温されているのが望ましく、その濃度は30~70wt%であるのが望ましく、苛性ソーダ等のpH調節剤でpH6~9に調整されているのが望ましい。また、反応塔にD-フラクトース水溶液を通過させる際の流速は、D-フラクトースからD-プシコースへの変換率が酵素の反応平衡に近い20%以上となるように調節されているのが望ましい。また、酵素の活性化剤および安定剤として各種のイオン、例えば10~100ppmのマグネシウムイオンや50~500ppmの亜硫酸イオンを含んでいても良い。
<ケトース 3-エピメラーゼのアミノ酸配列内の置換部位の選定>
まず、ケトース 3-エピメラーゼの活性および熱安定性に関わるアミノ酸配列を選定するため、本菌株に由来するケトース 3-エピメラーゼと相同性の高い一次構造(アミノ酸配列)をBlastにより検索した。その結果、ケトース 3-エピメラーゼと相同性が高い12種類の酵素の一次構造情報を得ることができた。本菌株に由来する酵素の立体構造は決定されていないため、その情報を利用することができない。そこで、上記12種類の中から立体構造が解明されている酵素種を選定し、スイスモデルおよびエネルギー最小化計算を用いて目的酵素の推定立体構造のモデルを構築した。本モデル構造と類似酵素の構造を比較することで、本酵素における構造安定性に寄与する部位を検索・抽出し、物理化学的に酵素の立体構造を熱安定化できると思われるアミノ酸の改変を行った。
熱安定性を向上させることが予想される特定のアミノ酸配列位置として、表1に示す各位置を選定し、特定のアミノ酸配列へ置換することとした。
特定のアミノ酸配列への変換とは、例えば、疎水性相互作用の向上、ペプチド主鎖のループ構造の安定化、ジスルフィド結合によるアミノ酸間の共有結合導入、空間密度向上、タンパク質C末端の伸長による会合体の安定化等において効果があると予測されるアミノ酸配列への置換とした(表1)。
まず、表1に記載の1又は2以上置換したアミノ酸配列を含むケトース 3-エピメラーゼのDNAに基づきPCR法、又は遺伝子合成サービス(Thermo Fisher Scientific社)により変異導入を行った。変異導入したDNA断片を大腸菌発現用のpQE60(Qiagen社)ベクターに組み込み、大腸菌(宿主)を形質転換した。変異導入部位はシーケンス解析により確認した。
まず、ケトース 3-エピメラーゼ変異酵素を発現する形質転換体(大腸菌)をアンピシリン100μg/ml及びカナマイシン50μg/mlを含むLB培地(培養液)に植菌し、37℃で16時間、前培養した。この前培養液を0.1mM IPTGを含む10~100倍量の本培養液に添加し、20℃で24時間培養し、目的の酵素発現を誘導した。次に遠心分離機にて本培養液を4℃、5,500×gで20分間遠心した。遠心後、上清を取り除き、菌体を回収した。回収した菌体を適当量の50mMリン酸バッファー(pH8.0、2mM硫酸マグネシウムを含む)に懸濁し、45秒間隔で15秒間超音波破砕を6サイクル行った。その後、4℃、5,500×gで20分間遠心して上清を取り出し、粗酵素液を得た。表1の各変異酵素の粗酵素液を、上述の方法により得て、酵素活性の評価に用いた。
(i) 50℃における酵素活性(T50)に対する70℃における酵素活性(T70)の比:T70/T50の比較
ケトース 3-エピメラーゼの酵素反応は平衡反応であり、平衡状態ではおおよそD-プシコース:D-フルクトース=30:70となるため、D-プシコースを基質とした場合のD-フルクトースの生成量は測定しやすい。よって、ケトース 3-エピメラーゼ活性の評価は、D-プシコースを基質として酵素反応させた場合に生じるD-フルクトースの生成量を測定することにより行うこととした。
具体的には、上述の方法により得られた各粗酵素液を用いて表2に示す反応条件下で酵素反応を行った。反応停止後、反応液をイオン交換樹脂による脱塩により精製し、フィルター処理し、HPLC(HPLCシステム(東ソー社製)、MCIGEL CK08EC(三菱化学社製))に供試した。HPLCによって測定されたD-フルクトースのピーク面積を算出し、50℃および70℃のピーク面積比から、各酵素活性を算出した。酵素活性1単位は、各条件下において、D-プシコースをエピマー化し、1分間に1μmolのD-フルクトースを生成する酵素量と定義する。得られた結果を表4に示す。
先に述べたとおり、熱安定性を向上させることが予想される特定のアミノ酸配列位置として、表1に示す各位置を選定してアミノ酸配列の置換を行ったが、作成した変異体の中には、熱安定性があまり変化しないか、低下さえする場合もあり、予想に反する結果となった。
次に、60℃、1時間静置した熱処理後の酵素の残存活性を測定した。上述により得られた粗酵素液を用いて以下の表3に示す条件下で、D-プシコースを基質として熱処理後の酵素を反応させた。酵素反応停止後、氷水中で10分間冷却した反応液をイオン交換樹脂による脱塩によって精製し、HPLCに供試した。HPLCによって測定されたD-プシコースのピーク面積を算出し、熱処理後及び未処理の酵素の50℃における酵素活性を算出した。熱処理後の残存酵素活性は、未処理の酵素活性を100とした場合の相対活性として算出した。得られた結果は表4に示す。
またこれらの中でも特にPM4、PM17、PM18、PM23、PM26、PM29、PM32、PM33、PM38、PM39、PM41、PM43、PM44、PM45、PM48、PM51、PM55、PM57、PM58、PM60、PM61、PM63及びPM65は、野生型に比してT70/T50が1.0以上あるいは残存酵素活性:Aが40以上であり優れていた。
さらに、PM17、PM23、PM26、PM29、PM32、PM38、PM39、PM41、PM43、PM51、PM57、PM60、PM61及びPM65は、野生型T70/T50あるいは残存酵素活性:Aの数値に対して2倍以上の活性を示しており特に優れていた。
1.前述の<粗酵素液の調製>に記載した方法と同じ方法で、PM38/41/43/51/野生型(以下WT)の粗酵素液を得た。
それぞれの粗酵素液の酵素活性を、前述の<粗酵素液の活性評価>及び<表2>に記載した方法及び条件で測定した。
2.2mM硫酸マグネシウムを含む50mMリン酸緩衝液(pH8.0)で洗浄し、平衡化させた固定化担体(イオン交換樹脂Amberlite FPA95またはDuolite A568(ともにダウ・デュポン社製))と粗酵素液を固定化担体1mLに対して粗酵素液の酵素活性630Uの割合で、バイアル瓶中で混合し、24時間以上転倒混和した。
3.以上の方法により作製した固定化酵素は、2mM硫酸マグネシウムを含む50mMリン酸緩衝液(pH8.0)で洗浄した後、使用時まで4℃の冷蔵庫中で保管した。
以下の実験操作はJIS K 7002:1988(工業用グルコースイソメラーゼ)に準じて実施した。
1.55℃に加温された反応塔(φ18mm×L400mm)に固定化酵素29mLを充填し、反応原料(50wt%果糖、240ppmのMgSO4および150ppmのNa2SO3を含む)を反応塔に供給した。
2.反応塔からの流出液は1日ごとに貯留し、HPLC分析(<粗酵素液の活性評価>と同様の方法)を実施し、HPLCクロマトグラムにおけるプシコースおよび果糖の面積APsiおよびAFruを算出した。
3.反応原料の流速は、式(1)で表す異性化率xが20%以上となるように適宜調節した。
x=APsi/(APsi+AFru) (1)
4.固定化酵素の酵素活性aは式(2)により算出した。
a=F/VCSxeln(xe/(xe-x)) (2)
式中、Fは基質の流速、CSは基質濃度、xeはみかけの平衡反応率(0.29)、Vは固定化酵素のベッド体積である。
プシコースの実生産では反応塔は50℃以上の温度で長時間(数ヶ月~数年程度)運転される場合が多い。この場合、酵素活性が徐々に低下し、プシコースの生産量が低下する。本実施例で取り上げた変異体は活性低下が遅いことから、プシコース生産量も低下しにくく、産業上有用である。
以上の結果より、本発明の変異酵素は、従来の野生型酵素と比較し、熱安定性を向上することにより至適温度での酵素活性を維持し、D-プシコースを効率的に生産することが可能となる。
Claims (10)
- 配列番号1で表されるアルスロバクター グロビホルミス由来の野生型ケトース 3-エピメラーゼのアミノ酸配列内に少なくとも1つのアミノ酸変異を有し、(1)50℃における酵素活性(T50)に対する70℃における酵素活性(T70)の比:T70/T50、あるいは(2)未処理の酵素の50℃における活性を100とした場合の、50mMリン酸バッファー(pH8.0、2mM硫酸マグネシウムを含む)懸濁液で、60℃、1時間処理した同じ酵素の50℃における残存酵素活性:Aが、野生型ケトース 3-エピメラーゼのT70/T50あるいはAより高い値を示す、ケトース 3-エピメラーゼ変異体。
- T70/T50が1.0以上である、請求項1記載のケトース 3-エピメラーゼ変異体。
- 残存酵素活性:Aが40以上である、請求項1または2記載のケトース 3-エピメラーゼ変異体。
- 野生型ケトース 3-エピメラーゼのアミノ酸配列内の少なくとも1つのアミノ酸変異が、1~10個の位置におけるアミノ酸置換である、請求項1~3のいずれか一項に記載のケトース 3-エピメラーゼ変異体。
- 野生型ケトース 3-エピメラーゼのアミノ酸配列内の、少なくとも1つのアミノ酸変異が、配列番号1のアミノ酸配列のアミノ末端から数えて下記の位置:
6、14、22、26、34、67、68、69、70、75、91、95、100、101、110、122、137、144、160、173、177、200、214、222、237、261、270、271、275、278、281及び289、
のいずれかに存在する、請求項1記載のケトース 3-エピメラーゼ変異体。 - 固定化担体に固定化した、請求項1~8のいずれか一項に記載のケトース 3-エピメラーゼ変異体。
- D-フルクトースに対して、請求項1~8のいずれか一項に記載のケトース 3-エピメラーゼ変異体または請求項9記載の固定化されたケトース 3-エピメラーゼ変異体を作用させることを特徴とする、D-ケトースの製造方法。
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