WO2014042076A1 - 改質油脂組成物を用いたポリヒドロキシアルカノエートの製造方法 - Google Patents

改質油脂組成物を用いたポリヒドロキシアルカノエートの製造方法 Download PDF

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WO2014042076A1
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真紗子 田子
丈治 柘植
俊輔 佐藤
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国立大学法人東京工業大学
株式会社カネカ
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    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12PFERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
    • C12P7/00Preparation of oxygen-containing organic compounds
    • C12P7/62Carboxylic acid esters
    • C12P7/625Polyesters of hydroxy carboxylic acids
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N1/00Microorganisms, e.g. protozoa; Compositions thereof; Processes of propagating, maintaining or preserving microorganisms or compositions thereof; Processes of preparing or isolating a composition containing a microorganism; Culture media therefor
    • C12N1/20Bacteria; Culture media therefor

Definitions

  • the present invention relates to a technique for producing a polyhydroxyalkanoate (hereinafter referred to as PHA).
  • carbon sources carbon sources for culture, fermentation, etc.
  • Typical examples of the carbon source include saccharides, fats and oils (for example, vegetable fats and oils), fatty acids (for example, plant-derived fatty acids), and the like.
  • carbon sources that can be renewed especially non-petroleum-derived carbon sources
  • carbon sources that do not compete with food have been desired as these carbon sources against the background of environmental problems. ing.
  • fatty acids for example, plant-derived fatty acids
  • These fatty acids are obtained from, for example, palm and palm (including palm kernel).
  • Typical fatty acids derived from these plants include long-chain saturated fatty acids such as C12 lauric acid, C14 myristic acid and C16 palmitic acid, and C18 oleic acid.
  • Long chain fatty acids such as unsaturated fatty acids.
  • PHA is mentioned as a polyester type organic molecular polymer produced by a wide range of microorganisms using a carbon source such as a fatty acid.
  • PHA is biodegradable, is a thermoplastic polymer, and is produced from renewable resources. Therefore, PHA is industrially produced as an environmentally friendly material or biocompatible material and used in various industries. Attempts have been made. For example, research has been conducted to produce PHA using PFAD (Palm fatty acid distilate), which is a fatty acid mixture derived from a palm oil refining process, and PKAO (Palm kernel acid oil), derived from palm kernel oil (non-patented). Reference 1).
  • PFAD Palm fatty acid distilate
  • PKAO Palm kernel acid oil
  • the properties of PHA vary depending on its molecular weight, and it is desirable that the PHA has as high a molecular weight as possible when processed into a fiber or the like. There is a need for techniques for controlling the molecular weight of PHA in the fermentation production process, particularly for increasing the molecular weight.
  • PKFAD palm kernel oil that is industrially important
  • PKAO Palm kernel fatty acid distilate
  • An object of the present invention is to provide a method for producing a high molecular weight PHA using a microorganism. It is another object of the present invention to provide a modified plant-derived carbon source and to provide a method for producing PHA using the same. Specifically, the present invention provides a carbon source obtained by removing substances that are present in plant-derived carbon sources and reduce the molecular weight of PHA synthesized by microorganisms, and a method for producing PHA using the carbon source The task is to do.
  • the inventors of the present invention conducted a PHA production study using PKFAD (Palm kernel fatty acid distilate), which is derived from palm kernel oil and has a high free fatty acid content.
  • PKFAD Palm kernel fatty acid distilate
  • PKO palm kernel oil
  • the molecular weight of PHA produced by microorganisms was improved, and the substances selectively removed by the clay treatment were butanoic acid, pentanoic acid, hexane.
  • the present invention was completed by finding the acids and finding that they were actually causing the molecular weight reduction.
  • the present invention cultivates a microorganism using a plant-derived carbon source having a total content of butanoic acid, pentanoic acid and hexanoic acid of 50 mM or less and a free fatty acid content of 20% by weight or more.
  • the present invention relates to a method for producing a polyhydroxyalkanoate.
  • the content of butanoic acid in the plant-derived carbon source is preferably 6 mM or less.
  • the content of hexanoic acid in the plant-derived carbon source is preferably 35 mM or less.
  • the plant-derived carbon source is treated with activated clay.
  • the plant-derived carbon source is preferably palm kernel oil.
  • the microorganism is a genus Cupriavidus.
  • the bacterium belonging to the genus Cupriavidus is Cupriavidus necator or a gene recombinant thereof.
  • polyhydroxyalkanoate is polyhydroxybutyrate hexanoate.
  • this invention relates to the manufacturing method of the carbon source for microorganisms culture
  • the present invention makes it possible to produce a high molecular weight PHA using an industrially significant carbon source produced in a vegetable oil production process.
  • the type of PHA in the present invention is not particularly limited as long as it is a PHA produced by a microorganism.
  • PHA obtained by polymerizing a constituent selected from 3-hydroxyalkanoic acids having 4 to 16 carbon atoms
  • polyhydroxybutyrate P (3HB) obtained by polymerizing 3-hydroxyalkanoic acid having 4 carbon atoms
  • polyhydroxybutyrate hexano obtained by copolymerizing 3-hydroxyalkanoic acid having 4 and 6 carbon atoms
  • Ate P (3HB-co-3HH) polyhydroxybutyrate valerate P (3HB-co-3HV) obtained by copolymerizing 4-hydroxyalkanoic acid having 4 and 5 carbon atoms, 3 having 4 to 14 carbon atoms -Polyhydroxyalkanoate (PHA) obtained by polymerizing or copolymerizing hydroxyalkanoic acid.
  • the PHA to be produced is, for example, C.I. used as a host microorganism. When a gene related to known PHA synthesis is introduced into a necator, it can be appropriately selected.
  • a plant-derived carbon source is used in culturing microorganisms.
  • the plant-derived carbon source may contain a fatty acid mixture.
  • the fatty acid mixture refers to a mixture of fat-soluble organic substances such as triacylglycerol, diacylglycerol, monoacylglycerol, and free fatty acid.
  • any plant-derived carbon source can be used as long as the PHA-producing microorganism can be assimilated.
  • the plant is not limited, but, for example, it is derived from a plant that contains a large amount of free fatty acids distilled off in the production process of oils such as palm oil, palm kernel oil, corn oil, palm oil, olive oil, soybean oil, rapeseed oil, and jatropha oil.
  • oils such as palm oil, palm kernel oil, corn oil, palm oil, olive oil, soybean oil, rapeseed oil, and jatropha oil.
  • the carbon source is preferred. Palm kernel oil and palm oil, which are vegetable oils and fats, are more preferred because they contain shorter chain fatty acids as constituent fatty acids.
  • the total content of butanoic acid, pentanoic acid and hexanoic acid in the plant-derived carbon source is 50 mM or less, preferably 42 mM or less, more preferably 40 mM or less, and even more preferably 20 mM or less.
  • butanoic acid and pentanoic acid it is preferably 6 mM or less, more preferably 4 mM or less, and still more preferably 2 mM or less.
  • hexanoic acid it is preferably 35 mM or less, more preferably 30 mM or less, and even more preferably 25 mM or less.
  • PFAD and PKFAD expected as non-edible useful carbon sources may have a total content of butanoic acid, pentanoic acid and hexanoic acid, which are organic acids, exceeding 50 mM.
  • the total content of butanoic acid, pentanoic acid and hexanoic acid in the plant-derived carbon source is large, the total content of butanoic acid, pentanoic acid and hexanoic acid from the carbon source is 50 mM or less.
  • a plant-derived carbon source can be prepared and used. Examples of the preparation method include a method of removing the organic acid from the carbon source.
  • the removal method is not limited as long as the removal is possible, and examples thereof include an activated clay treatment method, an activated carbon treatment method, an extraction method using a water-soluble component such as water, and a combination thereof.
  • a carbon source having a total organic acid content exceeding 50 mM with other carbon sources such as PKO (Palm Kernel Oil) and POO (Palm Oil Oil)
  • PKO Palm Kernel Oil
  • POO Palm Oil Oil
  • the long-chain free fatty acid content in the plant-derived carbon source is 20% by weight or more, preferably 50% by weight or more, more preferably from the viewpoint of industrial use of non-edible components containing a large amount of free fatty acids. 80% by weight or more.
  • the free fatty acid refers to a fatty acid that is not bound to another compound.
  • Examples of long-chain free fatty acids include caprylic acid, capric acid, lauric acid, myristic acid, palmitic acid, stearic acid, oleic acid, linoleic acid, linolenic acid, arachidic acid, and palmitoleic acid.
  • the microorganism used for the production of PHA is not particularly limited as long as it is a microorganism capable of synthesizing PHA or a gene recombinant thereof.
  • Cupriavidus genus bacteria are preferable.
  • the bacteria belonging to the genus Cupriavidus Cupriavidus necator is more preferable.
  • mutant strains obtained by artificially mutating the above-mentioned microorganisms, and gene recombinants that have been mutated by genetic engineering techniques can also be used.
  • the genes involved in PHA synthesis for introduction into the host microorganism include thiolase, reductase, PHB synthase, PHB synthase, PHA synthase, PHA synthase, ⁇ -oxidation enzyme, acyl- Examples include CoA transferase, enoyl-CoA hydratase, and acyl-CoA dehydrogenase.
  • Examples of the thiolase include ⁇ -ketothiolase and the like
  • examples of the reductase include acetoacetyl CoA reductase and the like
  • examples of the PHA synthase include an N149S / D171G mutant that is a PHA synthase mutant gene derived from Aeromonas caviae
  • examples of the acyl-CoA transferase include 3-hydroxyacyl ACP-CoA transferase. These genes are preferably derived from PHA producing bacteria such as Aeromonas caviae, Aeromonas hydrophila, and Chromobacterium genus. It is also possible to introduce mutations into these genes.
  • the plasmid When using a plasmid to introduce a gene into a host microorganism, the plasmid is preferably replicated and maintained stably in the host microorganism even in the absence of selective pressure.
  • a plasmid examples include pCUP2 described in International Publication No. WO2007 / 049716.
  • pCUP2 includes C.I. It contains a region necessary for the replication and stable maintenance of the plasmid derived from the megaplasmid pMOL28 possessed by the Capriavidus metallidurans CH34 strain, which is closely related to necator.
  • the vector may contain a drug resistance gene for stable replication and maintenance in the host microorganism.
  • a method for producing a transformant by introducing a gene into a host microorganism is not particularly limited, and can be performed by a known method.
  • an electroporation method, a calcium method, a bonding transmission method, or the like can be used.
  • PHA can be accumulated in microorganisms by growing the microorganisms in a preculture medium and then culturing them in a PHA production medium.
  • the preculture medium is not particularly limited as long as it is a medium capable of growing microorganisms.
  • the PHA production medium contains a plant-derived carbon source, and may further contain a nitrogen source, inorganic salts, and the like.
  • the nitrogen source include ammonia, ammonium salts such as ammonium chloride, ammonium sulfate, and ammonium phosphate.
  • examples of inorganic salts include potassium dihydrogen phosphate, disodium hydrogen phosphate, magnesium phosphate, magnesium sulfate, sodium chloride and the like.
  • Antibiotics (such as kanamycin) corresponding to the drug resistance gene contained in the gene expression plasmid may be added to the medium.
  • the culture temperature may be any temperature at which microorganisms can grow, but is preferably 20 ° C to 40 ° C.
  • the culture time is not particularly limited, but may be about 1 to 10 days.
  • Recovery of PHA from microorganisms can be performed, for example, by the following method. After completion of the culture, the cells are separated from the culture solution with a centrifuge, and the cells are washed with distilled water, methanol, or the like and dried. PHA is extracted from the dried cells using an organic solvent such as chloroform. The bacterial cell component is removed from the solution containing PHA by filtration or the like, and a poor solvent such as methanol or hexane is added to the filtrate to precipitate PHA. Furthermore, there is a method in which the supernatant is removed by filtration or centrifugation and dried to recover PHA.
  • the production amount of microbial cells can be measured by a known method such as an absorbance method or a dry cell weight measurement method, and the production amount of a substance produced by the microorganism can be measured by a known method such as a GC method or an HPLC method.
  • the content of PHA accumulated in the cells was determined according to the method of Kato et al. (Appl. MicroBiol. Biotechnol., 45, 363, (1996); Bull. Chem. Soc., 69, 515 (1996)). It can be measured by extracting from a cultured cell using an organic solvent such as chloroform and drying.
  • Example 1 The modified carbon source PKFAD obtained by treating the PKFAD with white clay was obtained from MALAYSIAN BIOTECHNOLOGY CORPORATION SDN BDH. 1 kg of PKFAD was weighed and subjected to high-temperature decompression treatment with an evaporator (manufactured by EYELA, model N-1200) for 10 minutes at 90 ° C. Thereafter, 10 wt% activated clay (made by Mizusawa Chemical Industry Co., Ltd.) is added to PKFAD, and again subjected to high-temperature decompression treatment at 90 ° C. for 30 minutes using the same evaporator, so that butanoic acid and pentanoic acid in PKFAD are obtained. Fatty acid components such as hexanoic acid were adsorbed on clay. Thereafter, a vegetable oil (hereinafter, modified PKFAD) modified by separating and removing the white clay by filtration was produced.
  • modified PKFAD modified separating and removing the white clay
  • GC measurement was performed under the following conditions.
  • -Device GC device Gas chromatograph GC-14B (manufactured by Shimadzu Corporation)
  • Capillary column 100% methylpolysiloxane nonpolar column 1010-11143 (Bridge type, inner diameter 0.25 mm ⁇ 30 mm, film thickness 0.4 ⁇ m) (manufactured by GL Sciences Inc.)
  • Detector Hydrogen flame ionization detector (FID)
  • Auto injector AOC-20i auto injector 221-44527-30 (manufactured by Shimadzu Corporation)
  • Autosampler AOC-20s autosampler 221-44880-30 (manufactured by Shimadzu Corporation)
  • Analyzer Chromatopack C-R7A plus (manufactured by Shimadzu Corporation)
  • the gas pressure is shown in Table 1.
  • E. coli used for conjugative transfer of Luria-Bertani (LB) medium gene E. coli strain S17-1 was cultured in LB medium. The composition of the LB medium is shown in Table 5. Antibiotics were added after autoclaving.
  • MS medium The d1 strain in PHA biosynthesis was cultured in MS medium.
  • the composition of MS medium is shown in Tables 8-9.
  • When culturing using triolein as a carbon source 20 g / L of triolein was added before autoclaving.
  • the trace metal component, magnesium sulfate, and chain transfer agent were added after autoclaving.
  • the fatty acid was added so that the final concentration in the whole medium was 1 mM and the concentration in triolein was 50 mM.
  • junction transfer method The junction transfer was performed for the purpose of introducing a gene into d1.
  • E. coli strain S17-1 was inoculated into 1.7 mL of LB medium containing kanamycin and cultured at 37 ° C. for 16 hours.
  • the host to be introduced (d1 strain) was also inoculated into 1.7 mL of NR medium and cultured at 30 ° C. for 16 hours.
  • Iii After culturing, the total amount of each culture solution was transferred to an autoclaved Eppendorf tube and centrifuged at 10,000 rpm for 1 min.
  • E. coli containing kanamycin E. coli containing kanamycin.
  • antibiotics were completely removed from the E. coli S17-1 strain by adding 500 ⁇ L of LB medium and centrifuging.
  • V Discard the supernatant so that about 50 ⁇ L remains.
  • the eutropha d1 strain was mixed, dropped onto the LB agar medium, dried, and then cultured at 30 ° C. for 5 hours.
  • Vi After culturing, the cells were streaked on Simmons citrate agar medium containing kanamycin and cultured at 30 ° C. for 2 days.
  • Vii The obtained single colony was again streaked in Simmons citrate medium containing kanamycin and cultured at 30 ° C. for 2 days.
  • a 500 mL shake flask was charged with 50 mL of MS liquid medium containing triolein (20 g / L) as a single carbon source, inoculated with 500 ⁇ L of the preculture, and cultured with shaking at 30 ° C. and 130 min ⁇ 1 for 72 hours. (Main culture).
  • kanamycin 50 mg / L was added as an antibiotic.
  • the pellet was suspended in an appropriate amount of pure water (less than 5 mL), the suspension was transferred to a 5 mL collection tube that had been tared, and the tube was closed with parafilm and frozen at ⁇ 20 ° C. Several air holes were made in the parafilm that closed the mouth of the tube, and water was completely removed with a vacuum dryer (approximately 3 days). The parafilm was removed and the tube was weighed to obtain the dry cell weight.
  • -Device GC device Gas chromatograph GC-14B (manufactured by Shimadzu Corporation) Capillary column: 100% methylpolysiloxane nonpolar column 1010-11143 (Bridge type, inner diameter 0.25 mm ⁇ 30 m, film thickness 0.4 ⁇ m) (manufactured by GL Sciences Inc.) Detector: Hydrogen flame ionization detector (FID) Auto injector: AOC-20i auto injector 221-44527-30 (manufactured by Shimadzu Corporation) Autosampler: AOC-20s autosampler 221-44880-30 (manufactured by Shimadzu Corporation) Analyzer: Chromatopack C-R7A plus (manufactured by Shimadzu Corporation)
  • the gas pressure is shown in Table 11.
  • Table 12 shows the set temperatures.
  • Table 13 shows each correction coefficient normalized by the value of 3HB.
  • the PHA cell content P (wt%) can be calculated from the following equation. .
  • K is a constant determined from a calibration curve created using P (3HB), and the K value is set to 6.2 from the following equation.
  • GPC measurement (7-1) Polymer-extracted dried cells were transferred to a 50 mL screw mouth sample tube, added with 50 mL of chloroform, and stirred at room temperature for 3 days. Thereafter, the solution was filtered (No. 1 filter paper manufactured by ADVANTEC) to remove the cells. Next, the solvent was removed using a rotary evaporator to obtain a rough PHA.
  • GPC measurement conditions / apparatus system controller SCL-10A VP (manufactured by Shimadzu Corporation) Autoinjector: SIL-10A VP (manufactured by Shimadzu Corporation) Liquid feeding unit: LC-10AD VP (manufactured by Shimadzu Corporation) Column oven: CTO-10A (manufactured by Shimadzu Corporation) Separation columns: K-806M, K-802 (manufactured by Shodex) Detector: RID-10A (manufactured by Shimadzu Corporation)
  • Example 2 Production of PHA using modified PKFAD Using the modified PKFAD produced in Example 1, PHA was produced by high-density culture. Pac-bktB / AS + pCUP2-631 strain (see International Publication No. WO2009 / 145164) was used for production.
  • Tanehaha medium 1w / v% Meat-extract, 1w / v% Bacto-tryptone, 0.2w / v% Yeast extract, 0.9 w / v% Na 2 HPO 4 ⁇ 12H 2 O, 0.15w / V% KH 2 PO 4 (pH 6.8).
  • the composition of the preculture medium is 1.1 w / v% Na 2 HPO 4 ⁇ 12H 2 O, 0.19 w / v% KH 2 PO 4 , 1.29 w / v% (NH 4 ) 2 SO 4 , 0.1 w / v% MgSO 4 ⁇ 7H 2 O , 2.5w / v% palm olein oil, 0.5 v / v% trace metal salt solution (1.6 w in 0.1N HCl / v% FeCl 3 ⁇ 6H 2 O, 1w / v% CaCl 2 ⁇ 2H 2 O, 0.02 w / v% CoCl 2 ⁇ 6H 2 O, 0.016 w / v% CuSO 4 ⁇ 5H 2 O, 0.012 w / v% NiCl 2 ⁇ 6H 2 O were dissolved. Stuff).
  • palm olein oil was added at a concentration of 10 g / L.
  • the composition of the PHA production medium is 0.385 w / v% Na 2 HPO 4 ⁇ 12H 2 O, 0.067 w / v% KH 2 PO 4 , 0.291 w / v% (NH 4 ) 2 SO 4 , 0.1 w / v% MgSO 4 ⁇ 7H 2 O , 0.5v / v% trace metal salt solution (1.6 w in 0.1N HCl / v% FeCl 3 ⁇ 6H 2 O, 1w / v% CaCl 2 ⁇ 2H 2 O, 0 0.02 w / v% CoCl 2 .6H 2 O, 0.016 w / v% CuSO 4 .5H 2 O, 0.012 w / v% NiCl 2 .6H 2 O).
  • a glycerol stock (50 ⁇ l) of the Pac-bktB / AS + pCUP2-631 strain was inoculated into a seed medium (10 ml) and cultured for 24 hours to perform seed culture.
  • 1.0 v / v% of the seed mother culture solution was inoculated into a 3 L jar fermenter (MDL-300 type, manufactured by Maruhishi Bioengine) containing 1.8 L of preculture medium.
  • the operating conditions were a culture temperature of 28 ° C., an agitation speed of 500 rpm, an aeration rate of 1.8 L / min, a pH of 6.7 to 6.8 while controlling for 24 hours, and pre-culture.
  • a 14% aqueous ammonium hydroxide solution was used for pH control.
  • the preculture solution was inoculated at 5.0 v / v% into a 5 L jar fermenter (MDS-U50 type, manufactured by Maruhishi Bioengine) containing 2.5 L of PHA production medium.
  • the operating conditions were a culture temperature of 28 ° C., a stirring speed of 400 rpm, an aeration rate of 2.1 L / min, and a pH controlled between 6.7 and 6.8.
  • a 14% aqueous ammonium hydroxide solution was used for pH control.
  • Modified PKFAD was added intermittently as a carbon source. Cultivation was performed for 60 hours, and after culturing, the cells were collected by centrifugation, washed with methanol, lyophilized, and the dry cell weight was measured.
  • Mw molecular weight of PHA produced by microorganisms
  • modified PKFAD having a low content of butanoic acid, pentanoic acid, and hexanoic acid.
  • PFAD and PKFAD produced in the oil refining process have a high free fatty acid content.

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Abstract

本発明は、加工特性に優れた高分子量のポリヒドロキシアルカノエートを製造するために改質された植物由来の炭素源を提供すること、さらにそれを利用したポリエステルの製造方法を提供することを課題とする。 植物油脂由来の炭素源の高遊離脂肪酸画分を活性白土により処理することで、ブタン酸、ペンタン酸、ヘキサン酸が効率よく除去可能であること、及び、当該処理後の炭素源を用いて微生物を培養することで、より高分子量のポリヒドロキシアルカノエートを製造できることを見出した。ブタン酸、ペンタン酸、及びヘキサン酸の含有量の合計が50mM以下であり、遊離脂肪酸含有量が20重量%以上である植物由来の炭素源を用いて、微生物を培養することを特徴とする、ポリヒドロキシアルカノエートの製造方法を提供する。

Description

改質油脂組成物を用いたポリヒドロキシアルカノエートの製造方法
本発明は、ポリヒドロキシアルカノエート(以下PHA)の製造方法の技術に関する。
環境問題、食糧問題、健康・安全に対する意識の高まり、天然/自然志向の高まりなどを背景に、微生物の生産や微生物による物質製造(発酵生産、バイオ変換など)の意義・重要性が益々高まっている。
微生物の生産や微生物による物質の製造においては、微生物によって好適に資化される炭素源(培養、発酵などのための炭素源)が必要である。その炭素源の代表的なものとして、糖質、油脂(例えば、植物油脂)、脂肪酸(例えば、植物由来の脂肪酸)などが挙げられる。近年、これらの炭素源として、環境問題などを背景に、再生可能な炭素源(特に非石油由来炭素源)、さらに、食糧と競合しない炭素源(所謂、非可食の炭素源)が望まれている。
この観点から、脂肪酸(例えば、植物由来の脂肪酸)は、好適な炭素源の候補の一つとして考えられている。これらの脂肪酸は、例えば、やし、パーム(パーム核を含む)などから得られる。これらの植物に由来する代表的な脂肪酸としては、炭素数12のラウリン酸、炭素数14のミリスチン酸、炭素数16のパルミチン酸などの長鎖飽和脂肪酸や炭素数18のオレイン酸などの長鎖不飽和脂肪酸といった長鎖脂肪酸が挙げられる。
脂肪酸等の炭素源により広範な微生物によって生成されるポリエステル型有機分子ポリマーとして、PHAが挙げられる。PHAは生分解性を有し、熱可塑性高分子であること、また、再生可能資源から産生されることから、環境調和型素材または生体適合型素材として工業的に生産し、多様な産業へ利用する試みが行われている。例えば、パーム油精製工程由来の脂肪酸混合物であるPFAD(Palm fatty acid distillate)やパーム核油由来の脂肪酸混合物PKAO(Palm kernel acid oil)を用いてPHAを生産する研究が行われている(非特許文献1)。
PHAはその分子量によって特性が変化し、繊維などに加工する際にはできるだけ高分子量であることが望ましい。発酵生産工程におけるPHAの分子量制御、特に、分子量を高めるための技術が必要とされている。
これまでに、微生物が産生するPHAの分子量に強く影響する物質が報告されている。例えば、Ralstonia eutropha(現在の分類はCupriavidus necator)に炭素源としてグルコースと種々の有機化合物を添加したところ、1-プロパノールや1-ブタノール、1,4ブタンジオール、グリセロール、エチレングリコールなどのヒドロキシル基を有する化合物に分子量を低下させる効果があることが報告されている(非特許文献2)。しかしながら、油脂精製副産物である脂肪酸混合物中にそのようなヒドロキシル基を保有した物質が含まれているとは考えにくく、産業上有用な植物由来の脂肪酸混合物を利用して、分子量の低下を抑制しながらPHAを生産する技術には課題が残されていた。
植物油由来の脂肪酸混合物の1つとして、産業上重要なパーム核油由来である組成物(以後、PKFAD(Palm kernel fatty acid distillate、PKAOと同義)と記載)(非特許文献3)が存在するが、微生物によるPHAの製造における有用性は知られていない。
Appl Microbiol Biotechnol, 89: 1373-1386 (2011) Biological Macromolecules, 25: 43-53 (1999) Journal of Oleo Science 56(1):13-17 (2007)
本発明は、微生物を使用した、高分子量のPHAの生産方法を提供することを課題とする。さらに、改質された植物由来の炭素源を提供すること、およびそれを利用したPHAの製造方法を提供することを課題とする。具体的には、植物由来の炭素源中に存在し、微生物によって合成されるPHAの分子量を低下させている物質を除去して得られる炭素源、及び、当該炭素源によるPHAの製造方法を提供することを課題とする。
本発明者らは、パーム核油由来であり、遊離脂肪酸含量の高いPKFAD(Palm kernel fatty acid distillate)を用いてPHAの生産研究を行った結果、遊離脂肪酸含量の低いパーム核油(PKO)と比較して、分子量の低いPHAが生産されることを見出した。さらに、白土処理した植物由来の炭素源を用いると、微生物によって生産されるPHAの分子量が向上することを見出し、さらに、白土処理で選択的に除去されている物質がブタン酸、ペンタン酸、ヘキサン酸であることを見出し、それらが実際に分子量低下を引き起こしていることを見出して本発明を完成させた。
本発明は、ブタン酸、ペンタン酸、及びヘキサン酸の含有量の合計が50mM以下であり、遊離脂肪酸含有量が20重量%以上である植物由来の炭素源を用いて、微生物を培養することを特徴とする、ポリヒドロキシアルカノエートの製造方法に関する。
さらに、ブタン酸、ペンタン酸、及びヘキサン酸の含有量の合計が50mMを超え、遊離脂肪酸含有量が20重量%以上である植物由来の炭素源から、ブタン酸、ペンタン酸、及びヘキサン酸の含有量の合計が50mM以下である植物由来の炭素源を調製する工程を含むことが好ましい。
植物由来の炭素源中のブタン酸の含有量が6mM以下であることが好ましい。
植物由来の炭素源中のヘキサン酸の含有量が35mM以下であることが好ましい。
植物由来の炭素源が、活性白土により処理されたものであることが好ましい。
植物由来の炭素源がパーム核油であることが好ましい。
微生物がCupriavidus属細菌であることが好ましい。
Cupriavidus属細菌がCupriavidus necator、又はその遺伝子組み換え体であることが好ましい。
ポリヒドロキシアルカノエートがポリヒドロキシブチレートヘキサノエートであることが好ましい。
また、本発明は、植物由来の炭素源を活性白土と接触させることを特徴とする、微生物培養のための炭素源の製造方法に関する。
本発明は、産業上有意義な、植物油脂製造工程で生産される炭素源を利用し、高分子量のPHAを生産することを可能とする。
以下、本発明を詳細に説明する。
本発明におけるPHAの種類としては、微生物が生産するPHAであれば特に限定されないが、好ましくは、炭素数4~16の3-ヒドロキシアルカン酸から選択される構成成分を重合して得られるPHAや、炭素数4~16の3-ヒドロキシアルカン酸から選択される構成成分を共重合して得られる共重合PHAである。
例えば、炭素数4の3-ヒドロキアルカン酸を重合して得られるポリヒドロキシブチレートP(3HB)、炭素数4と6の3-ヒドロキシアルカン酸を共重合して得られるポリヒドロキシブチレートヘキサノエートP(3HB-co-3HH)、炭素数4と5の3-ヒドロキシアルカン酸を共重合して得られるポリヒドロキシブチレートバレレートP(3HB-co-3HV)、炭素数4~14の3-ヒドロキシアルカン酸を重合或いは共重合して得られるポリヒドロキシアルカノエート(PHA)などが挙げられる。製造するPHAは、例えば、宿主微生物として用いるC.necatorに、公知のPHA合成に関する遺伝子を導入する際に、適宜選択することができる。
本発明では、微生物の培養において、植物由来の炭素源を使用する。植物由来の炭素源は脂肪酸混合物を含むものであってもよい。脂肪酸混合物とは、トリアシルグリセロール、ジアシルグリセロール、モノアシルグリセロール、及び遊離脂肪酸などの脂溶性有機物の混合物を指す。
植物由来の炭素源は、PHA生産微生物が資化可能であればいずれの植物に由来する炭素源でも使用可能である。植物は限定されないが、例えば、パーム油、パーム核油、コーン油、やし油、オリーブ油、大豆油、菜種油、ヤトロファ油などの油脂の製造工程にて蒸留除去された遊離脂肪酸を多く含む植物由来の炭素源が好ましい。より短鎖の脂肪酸を構成脂肪酸として含むという理由から、植物油脂であるパーム核油、ヤシ油などがより好ましい。
植物由来の炭素源中のブタン酸、ペンタン酸、及びヘキサン酸の含有量の合計は、50mM以下であり、好ましくは42mM以下、より好ましくは40mM以下、さらに好ましくは20mM以下である。ブタン酸、ペンタン酸に関しては好ましくは6mM以下、より好ましくは4mM以下、さらに好ましくは2mM以下である。ヘキサン酸に関しては、好ましくは35mM以下、より好ましくは30mM以下、さらに好ましくは25mM以下である。
非可食の有用炭素源として期待されるPFADやPKFADは、有機酸であるブタン酸、ペンタン酸、及びヘキサン酸の含有量の合計が50mMを超える場合がある。植物由来の炭素源中のブタン酸、ペンタン酸、及びヘキサン酸の含有量の合計が多い場合には、当該炭素源から、ブタン酸、ペンタン酸、及びヘキサン酸の含有量の合計が50mM以下である植物由来の炭素源を調製して使用することができる。調製法としては、例えば、該炭素源から前記有機酸を除去する方法が挙げられる。除去方法は、除去が可能であればその方法を選ばないが、例えば、活性白土処理法、活性炭処理法、水等の水溶性成分を用いた抽出法や、それらの併用が挙げられる。また、前記有機酸の含有量の合計が50mMを超える炭素源を、PKO(Palm Kernel Oil)やPOO(Palm Olein Oil)等の他の炭素源と混合(希釈)することで、炭素源全体における遊離脂肪酸含有量を20重量%以上に維持しつつ、上記有機酸の含有量の合計が50mM以下である植物由来の炭素源を調製してもよい。これらの調製法の中でも、上記有機酸を除去する方法が好ましく、特に、植物由来の炭素源を活性白土と接触させることによる、活性白土処理法が好ましい。
植物由来の炭素源中の、長鎖の遊離脂肪酸含有量は、遊離脂肪酸を多く含む非可食成分の産業利用という観点から、20重量%以上であり、好ましくは50重量%以上、より好ましくは80重量%以上である。ここで、遊離脂肪酸とは、他の化合物と結合していない脂肪酸を指す。長鎖の遊離脂肪酸として、例えば、カプリル酸、カプリン酸、ラウリン酸、ミリスチン酸、パルミチン酸、ステアリン酸、オレイン酸、リノール酸、リノレン酸、アラキジン酸、パルミトレイン酸などが挙げられる。
PHAの製造に使用する微生物は、PHAを合成可能な微生物やその遺伝子組み換え体であれば、特に限定されないが、例えば、ラルストニア(Ralstonia)属、カプリアビダス(Cupriavidus)属、ワウテルシア(Wautersia)属、アエロモナス(Aeromonas)属、エシェリキア(Escherichia)属、アルカリゲネス(Alcaligenes)属、シュードモナス(Pseudomonas)属等が挙げられ、この中でもCupriavidus属細菌が好ましい。Cupriavidus属細菌の中では、Cupriavidus necatorがより好ましい。勿論、前記微生物を人工的に突然変異処理して得られる変異株、遺伝子工学的手法により変異処理された遺伝子組み換え体も使用できる。
宿主微生物に導入するための、PHA合成に関わる遺伝子としては、3HBの供給系であるチオラーゼ、レダクターゼ、PHB合成酵素であるPHBシンターゼ、PHA合成酵素であるPHAシンターゼ、β酸化の酵素であるアシル-CoAトランスフェラーゼ、エノイル-CoAヒドラターゼ、アシル-CoAデヒドロゲナーゼ等が挙げられる。チオラーゼとしては、β-ケトチオラーゼ等が挙げられ、レダクターゼとしては、アセトアセチルCoAレダクターゼ等が挙げられ、PHAシンターゼとしては、Aeromonas caviae由来のPHAシンターゼ変異体遺伝子であるN149S/D171G変異体等が挙げられ、アシル-CoAトランスフェラーゼとしては、3-ヒドロキシアシルACP-CoAトランスフェラーゼ等が挙げられる。これらの遺伝子は、例えばAeromonas caviae、Aeromonas hydrophila、Chromobacterium属などのPHA生産細菌由来であることが好ましい。これらの遺伝子に変異を導入して使用することも可能である。
遺伝子を宿主微生物に導入するためにプラスミドを使用する場合、プラスミドは、選択圧が存在しない条件でも宿主微生物内において安定に複製及び維持されることが好ましい。このようなプラスミドとしては、国際公開公報WO2007/049716号公報に記載のpCUP2等が挙げられる。pCUP2にはC.necatorと近縁であるカプリアビダス・メタリデュランス(Cupriavidus metallidurans)CH34株が保有するメガプラスミドpMOL28由来のプラスミドの複製や安定維持に必要な領域が含まれている。一方、ベクターは、宿主微生物内における安定的な複製及び維持のために、薬剤耐性遺伝子を含んでいてもよい。
宿主微生物に遺伝子を導入して形質転換体を作製する方法は特に限定されず、公知の方法により行うことができる。例えば、エレクトロポレーション法や、カルシウム法、接合伝達法などを用いることができる。
PHAは、微生物を前培養培地で増殖させた後、PHA生産培地で培養することにより、微生物内に蓄積させることができる。前培養培地は、微生物を増殖可能な培地であれば特に限定されない。
PHA生産培地は、植物由来の炭素源を含み、その他に、窒素源、無機塩類等を含んでいてもよい。窒素源としては、例えばアンモニア、塩化アンモニウム、硫酸アンモニウム、リン酸アンモニウム等のアンモニウム塩等が挙げられる。無機塩類としては、例えばリン酸2水素カリウム、リン酸水素2ナトリウム、リン酸マグネシウム、硫酸マグネシウム、塩化ナトリウム等が挙げられる。培地には、遺伝子発現プラスミドが含む薬剤耐性遺伝子に対応する抗生物質(カナマイシン等)を添加してもよい。
培養温度は、微生物が生育可能な温度であればよいが、20℃から40℃が好ましい。培養時間は、特に制限はないが、1日から10日間程度でよい。
微生物からのPHAの回収は、例えば、次の方法により行うことができる。培養終了後、培養液から遠心分離機等で菌体を分離し、その菌体を蒸留水およびメタノール等により洗浄し、乾燥させる。この乾燥菌体から、クロロホルム等の有機溶剤を用いてPHAを抽出する。このPHAを含んだ溶液から、濾過等によって菌体成分を除去し、そのろ液にメタノールやヘキサン等の貧溶媒を加えてPHAを沈殿させる。さらに、濾過や遠心分離によって上澄み液を除去し、乾燥させてPHAを回収する方法が挙げられる。
微生物菌体の生産量は吸光度法や乾燥菌体重量測定法などの公知の方法で測定でき、また、微生物が産生する物質の生産量はGC法、HPLC法などの公知の方法で測定できる。細胞中に蓄積されたPHAの含量は、加藤らの方法(Appl.MicroBiol.Biotechnol.,45巻、363頁、(1996);Bull.Chem.Soc.,69巻、515頁(1996))に従い、培養細胞からクロロホルムなどの有機溶媒を用いて抽出し、乾燥することで測定できる。
以下に実施例で本発明を詳細に説明するが、本発明はこれら実施例によって何ら制限されるものではない。なお全体的な遺伝子操作は、Molecular Cloning(Cold Spring Harbor Laboratory Press、(1989))に記載されているように行うことができる。また、遺伝子操作に使用する酵素、クローニング宿主等は、市場の供給者から購入し、その説明に従い使用することができる。なお、酵素としては、遺伝子操作に使用できるものであれば特に限定されない。
(実施例1)
(1)PKFADの白土処理による改質
炭素源PKFADはMALAYSIAN BIOTECHNOLOGY CORPORATION SDN BDHより入手した。PKFADを1kg計量し、90℃にて10分間、エバポレーター(EYELA製、N-1200型)にて高温減圧処理を行った。その後、PKFADに対して10wt%の活性白土(水澤化学工業社製)を添加し、再度90℃、30分間、同様のエバポレーターにて高温減圧処理を行うことで、PKFAD中のブタン酸、ペンタン酸、ヘキサン酸等の脂肪酸成分を白土に吸着させた。その後、ろ過によって白土を分離除去することで改質した植物油脂(以下、改質PKFAD)を作製した。
(2)PKFAD、及び改質PKFAD中の脂肪酸分析
PKFAD、改質PKFAD、トリオレイン(和光純薬工業社製:参考例1にて標準炭素源として利用)中の脂肪酸を定量分析した。脂肪酸量は、水素炎イオン化検出器(FID)を用いた有効炭素数法によって解析した。
(2-1)サンプル調製
PKFADおよび改質PKFADをφ0.45μm ポリフッ化ビニリデン(PVDF)フィルター(ADVANTEC社製)でろ過した。それぞれ500μLを1.5mLバイアル管中でヘキサン500μL(内標準)と混合し、8mm ポリテトラフルオロエチレン(PTFE)/シリコンセプタムを挟んで蓋をした。
(2-2)測定条件
GC測定は、以下の条件下で行った。
・装置
GC装置:ガスクロマトグラフGC-14B(島津製作所社製)
キャピラリーカラム:
100% メチルポリシロキサン無極性カラム1010-11143
(架橋タイプ、内径0.25mm×30mm、膜厚0.4μm)(ジーエルサイエンス社製)
検出器:水素炎イオン化検出器(FID)
オートインジェクタ:AOC-20iオートインジェクタ221-44527-30(島津製作所社製)
オートサンプラ:AOC-20sオートサンプラ221-44880-30(島津製作所社製)
解析装置:クロマトパックC-R7A plus(島津製作所社製)
ガス圧力を、表1に示す。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000001
温度設定を、表2に示す。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000002
(2-3)GC測定データの解析
FIDを用いた有効炭素数法とは、炭化水素では相対モル感度が炭素原子数に比例し、また炭化水素の水素原子が他の原子や官能基と置換した誘導体では、これらが結合する炭素原子に一定の補正値を増減して算出されるいわゆる有効炭素原子数の総和に比例すると考え、その物質のモル濃度を算出する方法である。Sternbergら(Sternberg,J.C.,Gallaway,W.E.,and Jones,D.T.L.:Gas Chromatography. Academic Press,New York:207(1962))によれば、各型の炭素1原子あたりの有効炭素原子数および結合各原子による補正値は表3に示す。
有効炭素原子数および補正値
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000003
例えばヘキサン酸のモル濃度を算出しようとした場合、ヘキサン酸の有効炭素原子数は、(飽和脂肪族)+(カルボニル)-(第一アルコール)であり、1.0×5 +0.0-0.6=4.4となる。
解析結果を表4に示す。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000004
(参考例1)ブタン酸、ペンタン酸、ヘキサン酸添加培養
実施例1の結果、改質PKFADでは、ブタン酸、ペンタン酸、ヘキサン酸の濃度が低下していることが明らかとなった。そこで、上記脂肪酸の添加によるPHAの分子量低下効果について検討を行った。
(1)菌株
使用した菌株を以下に示す。
・Escherichia coli S17-1(Simon, R.,Priefer,U.,and Puhler,A.:Abroad host range mobilization system for in vivo genetic engineering transposon mutagenesis in gram negative bacteria.Biotechnology,1:784-791(1983):参照)
・d1(特開2007-259708号公報参照)
(2)プラスミド
使用したプラスミドを以下に示す。
・pBBREE 32d13dPB NSDG
(Watanabe,Y.,Ichinomiya,Y.,Shimada,D.,Saika.A.,Abe,H.,Taguchi,S.,and Tsuge,T.:Dvelopment and validation of an HPLC-based screening method to acquire polyhydroxyalkanoate synthase mutants with altered substrate specificity.J Biosci Bioeng.113:286-292(2011):参照)
(3)培地
すべての培地は121℃、2気圧、20分のオートクレーブ処理により滅菌した。また、培地組成中のオートクレーブ後に加える試薬については、0.20μmフィルターによりフィルター滅菌を行った。寒天プレート培地を作成する場合には、1.5%(w/v)の割合で寒天を添加した。抗生物質を添加する場合においては、オートクレーブ後の培地に、カナマイシンを終濃度50μg/mLになるよう添加した。
(3-1)Luria-Bertani(LB)培地
遺伝子の接合伝達に使用したE.coli S17-1株はLB培地で培養した。LB培地の組成を表5に示す。オートクレーブ後に抗生物質を添加した。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000005
(3-2)Nutrient-Rich(NR)培地
接合伝達および前培養に使用したd1株はNR培地で培養した。NR培地の組成を表6に示す。オートクレーブ後に抗生物質を添加した。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000006
(3-3)シモンズクエン酸培地
接合伝達におけるd1株のスクリーニングにはシモンズクエン酸培地を使用した。シモンズクエン酸培地の組成を表7に示す。オートクレーブ後に抗生物質を添加した。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000007
(3-4)Mineral salt(MS)培地
PHA生合成におけるd1株はMS培地で培養した。MS培地の組成を表8~9に示す。トリオレインを炭素源として培養する場合には、トリオレインを20g/L添加してからオートクレーブした。また、微量金属成分、硫酸マグネシウム、連鎖移動剤は、それぞれオートクレーブ後に添加した。なお、脂肪酸は培地全体中の終濃度が1mM、トリオレイン中の濃度が50mMとなるよう添加した。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000008
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000009
(3-5)SOC培地
塩化カルシウム法での形質転換にSOC培地を使用した。SOC培地の組成を表10に示す。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000010
(4)形質転換
(4-1)塩化カルシウム法
目的遺伝子のサブクローニングに塩化カルシウム法を用いた。
(i)E.coli S17-1株のコンピテントセルを氷上で溶かし、プラスミドDNA(pBBREE32d13dPB NSDG)溶液2μLを静かに添加した。
(ii)氷上で30~60分冷却した後、42℃の恒温槽中で30~90秒ヒートショックした。
(iii)ヒートショック後、速やかに氷上に移して2~3分間冷却した。
(iv)SOC培地900μLを加え、37℃で30~60分間振とう培養した。
(v)カナマイシンを含むLB寒天培地に塗り広げ、37℃で一晩培養した。
(4-2)接合伝達法
d1に遺伝子を導入する目的で接合伝達を行った。
(i)形質転換によって目的のプラスミドを導入したE.coli S17-1株をカナマイシンを含むLB培地1.7mLに植菌し、37℃で16時間培養した。
(ii)導入する宿主(d1株)もNR培地1.7mLに植菌し、30℃で16時間培養した。
(iii)培養後、それぞれの培養液全量をオートクレーブ済みエッペンチューブに移し、10,000rpmで1min遠心した。
(iv)カナマイシンを含むE.coli S17-1株には、更にLB培地500μLを加えて遠心することにより、抗生物質を完全に除去した。
(v)上清を50μLほど残るように捨てて、E.coli S17-1株とR. eutropha d1株を混合し、LB寒天培地に滴下し、乾燥後、30℃で5時間培養した。
(vi)培養後、カナマイシンを含むシモンズクエン酸寒天培地にストリークし、30℃で2日間培養した。
(vii)得られた単一コロニーを再度カナマイシンを含むシモンズクエン酸培地にストリークし、30℃で2日間培養した。
(viii)形成された単一コロニーをカナマイシンを含むNR寒天培地にストリークし、30℃で2日間培養した。
(ix)形成された単一コロニーをカナマイシンを含むNR培地1.7mLに植菌し、30℃で16時間培養後、培養液100μLとオートクレーブ済みの30%グリセロール溶液100μLを混合し、-80℃で保存した。
(5)振とう培養および集菌
(5-1)培養方法
d1/pBBREE32d13dPB NSDGの培養はNR培地およびMS培地を用いた。上記で作成したグリセロールストック溶液をカナマイシンを含むNR寒天培地にストリークし、30℃で2日間培養した。形成された単一コロニーをカナマイシンを含むNR液体培地1.7mLに植菌し、30℃、150min-1で16時間振とう培養した(前培養)。500mL振とうフラスコに、単一炭素源としてトリオレイン(20g/L)を含む50mLのMS液体培地を入れ、前培養液500μLを植菌し、30℃、130min-1で72時間振とう培養した(本培養)。なお、抗生物質としてカナマイシン(50mg/L)を加えた。
(5-2)集菌方法
本培養液を250mL遠沈管に移し、振とうフラスコ内を適量のヘキサンで1回、純水で3回すすぎ、この洗液も遠沈管に加えて激しく撹拌した後、4℃、6000rpmで10min遠心分離し、上清を除いた。菌体ペレットを適量の純水で懸濁、激しく撹拌した後、6000rpmで10min遠心分離し、上清を除いた。ペレットを適量の純水(5mL未満)で懸濁し、懸濁液を風袋を秤量済みの5mL集菌チューブに移し、パラフィルムでチューブの口を塞いで-20℃で凍結した。チューブの口を塞いだパラフィルムに数か所の風穴を開け、真空乾燥機で水分を完全に除去した(おおよそ3日間)。パラフィルムを除き、チューブを秤量することで乾燥菌体重量を得た。
(6)ポリマー分析
(6-1)PHAの含有率とモノマー組成比の分析
培養した菌体が合成したPHAの含有率とモノマー組成比は、ガスクロマトグラフィー(GC)を用いて内部標準法(Sternberg,J.C.,Gallaway,W.E.,and Jones,D.T.L.:Gas Chromatography.Academic Press,New York:207(1962)参照)により求めた。この方法では、メタノリシス反応により生じた乾燥菌体内PHA分解物であるメチルエステルを測定する。
メタノリシス反応によるPHAの分解
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000011
(6-2)GC測定サンプル調製
乾燥菌体をネジ蓋付き試験管に約10mg採り、15%硫酸-メタノール溶液2mLとクロロホルム2mLを加え、途中で数回激しく撹拌しながら100℃で140min加熱した。室温まで放冷した後、超純水1mLを加えて激しく混合し、一晩放置した。二層分離したサンプル溶液の下層(クロロホルム層)をパスツールピペットで採り、φ0.45μm ポリフッ化ビニリデン(PVDF)フィルター(ADVANTEC製)でろ過した。1.5mLバイアル管にこのろ液と0.1vol% オクタン酸メチル-クロロホルム溶液を500μLずつ加え、8mmポリテトラフルオロエチレン(PTFE)/シリコンセプタムを挟んで蓋をした。
(6-3)GC測定
GC測定は、以下の条件で行った。
・装置
GC装置:ガスクロマトグラフGC-14B(島津製作所社製)
キャピラリーカラム:
100%メチルポリシロキサン無極性カラム1010-11143
(架橋タイプ、内径0.25mm×30m、膜厚0.4μm)(ジーエルサイエンス社製)
検出器:水素炎イオン化検出器(FID)
オートインジェクタ:AOC-20iオートインジェクタ221-44527-30(島津製作所社製)
オートサンプラ:AOC-20sオートサンプラ221-44880-30(島津製作所社製)
解析装置:クロマトパックC-R7A plus(島津製作所社製)
ガス圧力を、表11に示す。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000012
設定温度を、表12に示す。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000013
(6-4)GC測定データの解析
FIDにより検出した各保持時間のピークの積分値から、PHA菌体内含有率およびモノマー組成比を決定した。GC測定結果の解析は以下の手順で行った。
GC測定の結果、各モノマーに対応するメチルエステルa、b、cが検出されたとき、その積分値をA、B、Cとし、対応する補正係数(相対感度の逆数)をX、Y、Zとすると、aのモル分率は次式から求められる。
Figure JPOXMLDOC01-appb-M000014
なお、3HBの値で規格化された各補正係数を表13に示す。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000015
内部標準物質であるオクタン酸メチルのピークの積分値をS、サンプルに用いた乾燥菌体の重量をm(mg)とすると、PHA菌体内含有率P(wt%)は以下の式より算出できる。
Figure JPOXMLDOC01-appb-M000016
ここでKはP(3HB)を用いて作成した検量線から決定した定数であり、次式よりK値を6.2とした。
Figure JPOXMLDOC01-appb-M000017
(7)GPC測定
(7-1)ポリマー抽出
乾燥菌体を50mLネジ口サンプル管に移し、クロロホルム50mLを加えて、室温で3日間撹拌した。その後、溶液をろ過(ADVANTEC社製 No.1 ろ紙)し、菌体を除去した。次に、ロータリーエバポレーターを用いて溶媒を除去し、粗雑なPHAを得た。
(7-2)ポリマー精製
粗雑なPHAを適量のクロロホルムに完全に溶解し、約10倍量のメタノールに滴下した。静置後、析出物をろ別(ADVANTEC社製 No.5B ろ紙)した。その後、真空乾燥機で溶媒を完全に除去し、精製PHAを得た。
(7-3)GPCサンプル調製法
PHA 約1mgを5mLバイアル管に入れ、クロロホルム1mLを加えて一晩放置し、PHAを溶解させた。このPHA溶液をφ0.45μmのPVDFフィルター(ADVANTEC社製)でろ過し、ろ液の全量を1.5mLバイアル管に入れ、8mm PTFE/シリコンセプタムを挟んで蓋をした。
(7-4)GPC測定条件
・装置
システムコントローラー:SCL-10A VP(島津製作所社製)
オートインジェクター:SIL-10A VP(島津製作所社製)
送液ユニット:LC-10AD VP(島津製作所社製)
カラムオーブン:CTO-10A(島津製作所社製)
分離カラム:K-806M、K-802(Shodex社製)
検出器:RID-10A(島津製作所社製)
・測定条件
測定条件を表14に示す。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000018
(7-5)GPC測定データの解析
測定サンプルの分子量および分子量分布の解析には、解析ソフトGPC for CLASS VP(島津製作所社製)を用い、標準物質であるスタンダードポリスチレンとの相対値として重量平均分子量(Mw)を算出した。
結果を表15に示す。ブタン酸、ペンタン酸、ヘキサン酸を添加することで微生物により生産されるPHAの分子量(Mw)が低下することが明らかとなった。
ブタン酸、ペンタン酸、ヘキサン酸添加によるPHA分子量への影響評価結果
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000019
(実施例2)改質PKFADを用いたPHAの生産
実施例1にて作製した改質PKFADを用い、高密度培養によるPHAの生産を行った。生産にはPac-bktB/AS+pCUP2-631株(国際公開公報WO2009/145164号公報参照)を用いた。
種母培地の組成は1w/v% Meat-extract、1w/v% Bacto-tryptone、0.2w/v% Yeast extract、0.9 w/v% NaHPO・12HO、0.15w/v% KHPO、(pH6.8)とした。
前培養培地の組成は1.1w/v% NaHPO・12HO、0.19w/v% KHPO、1.29w/v% (NHSO、0.1w/v% MgSO・7HO、2.5w/v% パームオレインオイル、0.5v/v% 微量金属塩溶液(0.1N塩酸に1.6w/v% FeCl・6HO、1w/v% CaCl・2HO、0.02w/v% CoCl・6HO、0.016w/v% CuSO・5HO、0.012w/v% NiCl・6HOを溶かしたもの)、とした。炭素源はパームオレインオイルを10g/Lの濃度で一括添加した。
PHA生産培地の組成は0.385w/v% NaHPO・12HO、0.067w/v% KHPO、0.291w/v% (NHSO、0.1w/v% MgSO・7HO、0.5v/v% 微量金属塩溶液(0.1N塩酸に1.6w/v% FeCl・6HO、1w/v% CaCl・2HO、0.02w/v% CoCl・6HO、0.016w/v%CuSO・5HO、0.012w/v% NiCl・6HOを溶かしたもの)とした。
まず、Pac-bktB/AS+pCUP2-631株のグリセロールストック(50μl)を種母培地(10ml)に接種して24時間培養し種母培養を行なった。次に種母培養液を1.8Lの前培養培地を入れた3Lジャーファーメンター(丸菱バイオエンジ社製MDL-300型)に1.0v/v%接種した。運転条件は、培養温度28℃、攪拌速度500rpm、通気量1.8L/minとし、pHは6.7~6.8の間でコントロールしながら24時間培養し、前培養を行なった。pHコントロールには14%水酸化アンモニウム水溶液を使用した。
次に、前培養液を2.5LのPHA生産培地を入れた5Lジャーファーメンター(丸菱バイオエンジ社製MDS-U50型)に5.0v/v%接種した。運転条件は、培養温度28℃、攪拌速度400rpm、通気量2.1L/minとし、pHは6.7から6.8の間でコントロールした。pHコントロールには14%水酸化アンモニウム水溶液を使用した。炭素源として改質PKFADを断続的に添加した。培養は60時間行い、培養終了後、遠心分離によって菌体を回収、メタノールで洗浄、凍結乾燥し、乾燥菌体重量を測定した。
得られた乾燥菌体1gに100mlのクロロホルムを加え、室温で一昼夜攪拌して、菌体内のPHAを抽出した。菌体残渣をろ別後、エバポレーターで総容量が30mlになるまで濃縮後、90mlのヘキサンを徐々に加え、ゆっくり攪拌しながら、1時間放置した。析出したPHAをろ別後、50℃で3時間真空乾燥した。乾燥PHAの重量を測定し、菌体内のポリマー含量を算出した。
また、参考例1と同様の方法にて、得られたPHAの分子量、及びモノマー組成比を測定した。結果を表16に示す。
(比較例1)未改質PKFADを用いたPHAの生産
未改質のPKFADを使用した以外は実施例2と同じ方法で、PHAを製造し、分析した。結果を表16に示す。
改質PKFAD、及び未改質PKFADを用いた高密度培養結果
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000020
ブタン酸、ペンタン酸、及びヘキサン酸の含有量が少ない改質PKFADを使用することで、微生物により生産されるPHAの分子量(Mw)を向上できることが明らかとなった。
(測定例1)PFAD、又はPKFAD中の遊離脂肪酸含有量測定
PFAD、及びPKFAD、並びに、食用パーム油であるPKO(Palm kernel oil)、及びPOO(Palm Olein Oil)の遊離脂肪酸含有量を、基準油脂分析試験法「2.4.6.1-1996 トリアシルグリセリン組成(ガスクロマトグラフ法)」に準じて測定した。結果を表17に示す。
PKFAD、PFAD及び食用油脂(PKO、POO)の遊離脂肪酸含有量
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000021
油脂精製工程にて産生されるPFADやPKFADは、遊離脂肪酸含量が高い。本発明の方法によれば、非可食成分である、遊離脂肪酸含量が高い植物由来の炭素源を用いて、高分子量のPHAを効率的に製造することが可能である。
 

Claims (10)

  1. ブタン酸、ペンタン酸、及びヘキサン酸の含有量の合計が50mM以下であり、遊離脂肪酸含有量が20重量%以上である植物由来の炭素源を用いて、微生物を培養することを特徴とする、ポリヒドロキシアルカノエートの製造方法。
  2. さらに、ブタン酸、ペンタン酸、及びヘキサン酸の含有量の合計が50mMを超え、遊離脂肪酸含有量が20重量%以上である植物由来の炭素源から、ブタン酸、ペンタン酸、及びヘキサン酸の含有量の合計が50mM以下である植物由来の炭素源を調製する工程を含む、請求項1に記載の製造方法。
  3. 植物由来の炭素源中のブタン酸の含有量が6mM以下である、請求項1又は2に記載の製造方法。
  4. 植物由来の炭素源中のヘキサン酸の含有量が35mM以下である、請求項1~3のいずれかに記載の製造方法。
  5. 植物由来の炭素源が、活性白土により処理されたものである、請求項1~4のいずれかに記載の製造方法。
  6. 植物由来の炭素源がパーム核油である、請求項1~5のいずれかに記載の製造方法。
  7. 微生物がCupriavidus属細菌である、請求項1~6のいずれかに記載の製造方法。
  8. Cupriavidus属細菌がCupriavidus necator、又はその遺伝子組み換え体である、請求項7に記載の製造方法。
  9. ポリヒドロキシアルカノエートがポリヒドロキシブチレートヘキサノエートである、請求項1~8のいずれかに記載の製造方法。
  10. 植物由来の炭素源を活性白土と接触させることを特徴とする、微生物培養のための炭素源の製造方法。
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