WO2009133696A1 - 糖鎖標識方法 - Google Patents

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島岡秀行
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Definitions

  • the present invention relates to a method for efficiently purifying and labeling a sugar chain contained in a biological sample.
  • Biopolymers such as sugar chains, glycoproteins, glycopeptides, peptides, oligopeptides, proteins, nucleic acids, and lipids play an important role in biotechnology fields such as medicine, cell engineering, and organ engineering. Clarifying the control mechanism of biological reactions will lead to the development of the biotechnology field.
  • sugar chains are very diverse and are substances involved in various functions of naturally occurring organisms.
  • Sugar chains often exist as complex carbohydrates bound to proteins, lipids, and the like in vivo, and are one of the important components in vivo. It is becoming clear that sugar chains in living organisms are deeply involved in cell-to-cell information transmission, protein functions, and coordination of interactions.
  • a sugar chain is a general term for molecules in which monosaccharides such as glucose, galactose, mannose, fucose, xylose, N-acetylglucosamine, N-acetylgalactosamine, and sialic acid, and derivatives thereof are linked in a chain by glycosidic bonds. is there.
  • biopolymers having sugar chains include plant cell wall proteoglycans that contribute to cell stabilization, glycolipids that affect cell differentiation, proliferation, adhesion, migration, etc., and cell-cell interactions and cells.
  • examples include glycoproteins involved in recognition.
  • the mechanisms by which sugar chains contained in these biopolymers control advanced and precise biological reactions while acting, assisting, amplifying, regulating, or inhibiting the functions of these biopolymers are gradually being clarified.
  • this sugar chain engineering and medicine, cell engineering, or organ engineering are closely related. We can expect new developments related to
  • sugar chain In glycoprotein drugs, the sugar chain often plays an important role in the expression of biological activity. Therefore, the evaluation of sugar chains is extremely important as a quality control parameter for glycoprotein drugs, and it has been reported that the sugar chain structure affects antibody-dependent cytotoxic activity (ADCC activity), especially for antibody drugs. Therefore, the importance of sugar chain structure analysis is increasing.
  • ADCC activity antibody-dependent cytotoxic activity
  • An object of the present invention is to provide a method for simply performing a step of purifying and labeling a sugar chain from a biological sample.
  • the present invention is as follows. (1) A method for labeling a sugar chain contained in a biological sample, (A) a step of capturing a sugar chain in a sugar chain-trapping substance that is a substance that specifically captures a sugar chain from a biological sample; (C) releasing sugar chains from the sugar chain-trapping substance; (D) a step of labeling the released sugar chain, A method for labeling a sugar chain, wherein the steps (a), (c), and (d) are continuously performed in the same reaction vessel.
  • a method for labeling a sugar chain contained in a biological sample (A) a step of capturing a sugar chain in a sugar chain-trapping substance that is a substance that specifically captures a sugar chain from a biological sample; (B) a step of washing the sugar chain-trapping substance that has captured the sugar chain (c) a step of releasing the sugar chain from the sugar chain-trapping substance; (D) a step of labeling the released sugar chain, A method for labeling a sugar chain, wherein the steps (a), (b), (c), and (d) are continuously carried out in the same reaction vessel.
  • the sugar chain-trapping substance is a carrier having a functional group that specifically reacts with an aldehyde group of the sugar chain.
  • the functional group is a hydrazide group or an aminooxy group.
  • R 1 and R 2 are hydrocarbon chains having 1 to 20 carbon atoms which may be interrupted by —O—, —S—, —NH—, —CO—, —CONH—, R 3 , R 4 , R 5 Represents H, CH 3 , or a hydrocarbon chain having 2 to 5 carbon atoms, and m and n represent the number of monomer units.
  • (6) The sugar chain labeling method according to (5), wherein the sugar chain-trapping substance has a crosslinked polymer structure represented by the following (formula 2).
  • (M and n indicate the number of monomer units.)
  • the compound having an amino group is 8-Aminopyrene-1,3,6-trisulfonate, 8-Aminophathalene-1,3,6-trisulphonate, 7-amino-1,3-naphthalenedisulfonic acid, 2-Amino9 (10H) -acridoneceine, 5-Aminofluorescent 2-Aminopyridine, 7-Amino-4-methylcoumarin, 2-Aminobenzomide, 2-Aminobenzoic acid, 3-Aminobenzoic acid, 7-Amino-1-naphthol, 3- (Acetylamino) -6-amino6-amino-amino6-amino-amino-amino-6-amino-amino-6-amino-amino-amino-amino-amino-amin
  • purification and labeling of a target compound such as a sugar chain contained in a biological sample can be performed in the same reaction vessel, and the target compound can be labeled easily.
  • labeling with an amino compound generally used for analysis such as HPLC or CE can be easily performed.
  • FIG. 6 is a chart showing the results of measuring the 2-AB-labeled bovine fetuin sugar chain obtained in Experimental Example 1 by high performance liquid chromatography.
  • FIG. 6 is a chart showing the results of measuring the 2-AB-labeled bovine serum-derived IgG sugar chain obtained in Experimental Example 2 by high performance liquid chromatography.
  • FIG. 6 is a chart showing the results of measuring the 2-AB-labeled bovine fetuin sugar chain obtained in Experimental Example 3 by high performance liquid chromatography.
  • the present invention is a method for labeling a sugar chain contained in a biological sample, (A) a step of capturing a sugar chain in a sugar chain-trapping substance that is a substance that specifically captures a sugar chain from a biological sample; (B) a step of washing the sugar chain-trapping substance that has captured the sugar chain (c) a step of releasing the sugar chain from the sugar chain-trapping substance; (D) a step of labeling the released sugar chain, In this method, the steps (a), (b), (c), and (d) are continuously performed in the same reaction vessel.
  • the substance that specifically captures the sugar chain preferably has a functional group that reacts with the aldehyde group of the sugar chain.
  • the functional group is more preferably a hydrazide group or an oxylamino group.
  • a cross-linked polymer having a structure represented by the following (Formula 1) or (Formula 2) is preferably used as a carrier.
  • R 1 and R 2 are hydrocarbon chains having 1 to 20 carbon atoms which may be interrupted by —O—, —S—, —NH—, —CO—, —CONH—, R 3 , R 4 , R 5 Represents H, CH 3 , or a hydrocarbon chain having 2 to 5 carbon atoms, and m and n represent the number of monomer units.
  • R 1 represents a hydrocarbon chain having 1 to 20 carbon atoms that may be interrupted by —O—, —S—, —NH—, —CO—, —CONH—, and examples thereof include the following. .
  • a, b, and d represent an integer of 1 to 5
  • c represents an integer of 1 to 10.
  • R 2 represents a hydrocarbon chain having 1 to 20 carbon atoms that may be interrupted by —O—, —S—, —NH—, —CO—, —CONH—, and examples thereof include the following. .
  • e and f represent an integer of 1 to 5
  • g represents an integer of 1 to 10.
  • R 3 , R 4 and R 5 may be the same or different and each represents H, CH 3 , or a hydrocarbon chain having 2 to 5 carbon atoms, and examples thereof include the following.
  • h represents an integer of 1 to 4.
  • hydrazide group-containing crosslinked particles such as Affigel Hz (BIO-RAD, 153-6047), CarboLink (TM) Coupling Gel (PIERCE, 20391), UltraLink (R) Hydrazide Gel (PIERCE, 53149), etc. Also good.
  • a crosslinked polymer having a structure represented by the following (Formula 5) or (Formula 6) can be used as a carrier.
  • R 1 and R 2 are hydrocarbon chains having 1 to 20 carbon atoms which may be interrupted by —O—, —S—, —NH—, —CO—, —CONH—, R 3 , R 4 , R 5 Represents H, CH 3 , or a hydrocarbon chain having 2 to 5 carbon atoms, and m and n represent the number of monomer units.
  • Specific examples of R 1 to R 5 are the same as those described in the description of (Formula 1).
  • polymer particles represented by (Formula 5) polymer particles having a structure represented by the following (Formula 6) can also be suitably used.
  • substances containing hydrazide groups can be preferably used.
  • the pH of the reaction system in which the sugar chain and the sugar chain-trapping substance are reacted is preferably acidic, preferably 2 to 9, more preferably 2 to 7, and further preferably 2 to 6.
  • the reaction temperature is preferably 4 to 90 ° C, preferably 25 to 90 ° C, more preferably 40 to 90 ° C.
  • the reaction time is 10 minutes to 24 hours, preferably 10 minutes to 8 hours, more preferably 10 minutes to 2 hours.
  • the reaction is preferably carried out in an open system to evaporate the solvent completely from the viewpoint of efficiently performing the sugar chain capture reaction.
  • the sugar chain-trapping substance in which the sugar chain has been captured in the step (a) is washed to remove sugar chains not captured by the sugar chain-trapping substance and other biological samples.
  • a protein denaturant solution such as an aqueous solution of guanidine or a surfactant, alcohols such as methanol and ethanol, water, an aqueous buffer, and the like are used.
  • the pH of the aqueous solution is preferably near neutral, and the pH is 4 to 10, more preferably 6 to 8.
  • the washing step (b) may not be performed depending on the state of the initial biological sample, for example, the degree of mixing of substances other than sugar chains.
  • a sugar chain is released from the sugar chain-trapping substance in which the sugar chain has been trapped, that is, a reaction for cutting out the sugar chain from the sugar chain-trapping substance is performed.
  • a mixed solvent of an acid, water and an organic solvent the content of water is preferably 0.1% to 90%, more preferably 0.1% to 80%, and further preferably 0.1% to 50%.
  • An aqueous buffer may be contained instead of water.
  • the concentration of the buffer is preferably 0.1 mM to 1M, more preferably 0.1 mM to 500 mM, and even more preferably 1 mM to 100 mM.
  • the pH of the reaction solution is preferably 2 to 9, more preferably 2 to 7, and further preferably 2 to 6.
  • the acid used is preferably, for example, acetic acid, formic acid, trifluoroacetic acid, hydrochloric acid, citric acid, phosphoric acid, sulfuric acid, more preferably acetic acid, formic acid, trifluoroacetic acid, phosphoric acid, and more preferably acetic acid, trifluoroacetic acid. .
  • the reaction temperature is preferably 4 to 90 ° C, preferably 25 to 90 ° C, more preferably 40 to 90 ° C.
  • the reaction time is 10 minutes to 24 hours, preferably 10 minutes to 8 hours, more preferably 10 minutes to 3 hours.
  • the reaction is preferably performed in an open system to evaporate the solvent completely from the viewpoint of efficiently carrying out the reaction for releasing the sugar chain.
  • sugar chain cleaving reaction can be carried out from weakly acidic to neutral, compared to the conventional cleaving reaction in the presence of a strong acid such as cleaving by 10% trifluoroacetic acid treatment, It is possible to suppress the occurrence of sugar chain hydrolysis such as elimination of acid residues.
  • step (d) the free sugar chain obtained in step (c) is labeled.
  • the labeling method is preferably a reaction in which an amino group-containing compound is labeled with any amino compound using, for example, a reductive amination reaction.
  • the pH is preferably from acidic to neutral, preferably from 2 to 9, more preferably from 2 to 8, and even more preferably from 2 to 7.
  • the reaction temperature is preferably 4 to 90 ° C, preferably 25 to 90 ° C, more preferably 40 to 90 ° C.
  • the concentration of the amino compound is preferably 1 mM to 10M, and the concentration of the reducing agent is preferably 1 mM to 10M.
  • the reaction time is 10 minutes to 24 hours, preferably 10 minutes to 8 hours, more preferably 10 minutes to 3 hours.
  • the compound having an amino group preferably has ultraviolet-visible absorption characteristics or fluorescence characteristics, and is preferably at least one selected from the following group, for example.
  • the pH is preferably 2 to 9, more preferably 2 to 8, and further preferably 2 to 7 under acidic to neutral conditions.
  • the reaction temperature is 4 to 90 ° C, preferably 30 to 90 ° C, more preferably 40 to 80 ° C.
  • the concentration of the amino compound is 1 mM to 10M, preferably 10 mM to 10M, more preferably 100 mM to 1M.
  • the concentration of the reducing agent is 1 mM to 10M, preferably 10 mM to 10M, more preferably 100 mM to 2M.
  • the reaction time is 10 minutes to 24 hours, preferably 10 minutes to 8 hours, more preferably 1 hour to 3 hours.
  • sodium cyanoborohydride for example, sodium cyanoborohydride, methylamine borane, dimethylamine borane, trimethylamine borane, picoline borane, pyridine borane and the like can be used, but it is reactive to use sodium cyanoborohydride. It is preferable from the viewpoint.
  • step (d) since the resulting solution contains a labeled sugar chain, an unreacted amino compound and a reducing agent added in excess, it is preferable to perform a step of removing these excess reagents. Any method of removal by silica column, removal by gel filtration, removal by ion exchange resin may be used, but the solvent used to prevent sialic acid from leaving is preferably neutral.
  • the present invention provides, from another aspect, a sugar chain detection method including a step of detecting a sugar chain labeled by the sugar chain labeling method. Furthermore, from another aspect, there is provided a sugar chain sorting method including a step of sorting sugar chains labeled by the sugar chain labeling method.
  • Example 1 Preparation of biological samples 1 mg of bovine serum-derived fetuin was dissolved in 50 ⁇ L of 100 mM ammonium bicarbonate, 5 ⁇ L of 120 mM DTT (dithiothreitol) was added, and the mixture was reacted at 60 ° C. for 30 minutes. After completion of the reaction, 10 ⁇ L of 123 mM IAA (iodoacetamide) was added and allowed to react at room temperature for 1 hour in the dark. Subsequently, protease treatment was performed with 400 U of trypsin, and the protein portion was fragmented into peptides. The reaction solution was treated at 90 ° C. for 5 minutes, and then treated with 5 U glycosidase F to release sugar chains from the peptide, thereby obtaining a pretreated biological sample.
  • IAA iodoacetamide
  • the beads were washed with a guanidine solution, water, methanol, and a triethylamine solution, 10% acetic anhydride / methanol was added, and the mixture was reacted at room temperature for 30 minutes to cap unreacted hydrazide groups. After capping, the beads were washed with methanol, aqueous hydrochloric acid and water.
  • Example reagent removal step 50 ⁇ L of the reaction solution was recovered, diluted 10-fold with acetonitrile, and then added to a column packed with silica gel (IAtrobeads, 6RS-8060, manufactured by Mitsubishi Chemical Yatron) to adsorb the labeled sugar chain to the silica gel. After washing the column with acetonitrile / acetonitrile / water mixed solution (95: 5), the labeled sugar chain was recovered with 50 ⁇ L of ultrapure water.
  • silica gel IAtrobeads, 6RS-8060, manufactured by Mitsubishi Chemical Yatron
  • the obtained labeled sugar chain was measured by HPLC. Measurement was performed using an amino column (Shodex Asahipak NH2P-50) at an excitation wavelength of 330 nm and a fluorescence wavelength of 420 nm. FIG. 1 shows the measurement results. A sugar chain labeled with 2AB was detected.
  • 1 indicates a peak derived from a 1 sialic acid-containing sugar chain
  • 2 indicates a peak derived from a 2 sialic acid-containing sugar chain
  • 3 indicates a peak derived from a 3 sialic acid-containing sugar chain
  • 4 indicates 4 sialic acid.
  • a peak derived from a contained sugar chain is shown.
  • Example 2 The same procedure as in Experimental Example 1 was performed except that bovine serum-derived IgG was used instead of bovine serum-derived fetuin.
  • FIG. 2 shows the HPLC measurement results. A sugar chain labeled with 2AB was detected.
  • 5 indicates a neutral sugar-derived peak
  • 6 indicates an acidic sugar chain-derived peak
  • Example 3 The experiment was performed in the same manner as in Experimental Example 1 except that Affigel Hz (BIO-RAD, 153-6047) was used as a bead having a hydrazide group as a carrier for capturing sugar chains. 50 ⁇ L of Affigel Hz was used.
  • FIG. 3 shows the HPLC measurement results. In the figure, the solid line indicates the case where Affigel Hz is used, and the broken line indicates the case where BlotGlyco (R) of Experimental Example 1 is used. Even when Affigel Hz was used, the strength was weaker than when BlotGlyco (R) was used, but a sugar chain labeled with 2AB was detected.

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Abstract

 本発明は、生体試料から糖鎖を精製し標識する工程を、簡便に行なう方法を提供することを目的として、生体試料中に含有する糖鎖を標識化する方法であって、(a)生体試料から糖鎖を特異的に捕捉する物質である糖鎖捕捉物質に糖鎖を捕捉する工程、(b)糖鎖を捕捉した糖鎖捕捉物質を洗浄する工程、(c)糖鎖捕捉物質から糖鎖を遊離させる工程、(d)遊離された糖鎖を標識化する工程、を含み、(a)、(b)、(c)、(d)の工程を同一の反応容器内で連続して行うことを特徴とする糖鎖標識方法である。

Description

糖鎖標識方法
 本発明は、生体試料中に含まれる糖鎖を効率よく精製、標識するための方法に関するものである。
 糖鎖、糖タンパク、糖ペプチド、ペプチド、オリゴペプチド、タンパク、核酸、脂質などといった生体高分子は、医学、細胞工学、臓器工学などのバイオテクノロジー分野において重要な役割を担っており、これら物質による生体反応の制御機構を明らかにすることはバイオテクノロジー分野の発展に繋がることになる。
 この中でも、糖鎖は、非常に多様性に富んでおり、天然に存在する生物が有する様々な機能に関与する物質である。糖鎖は生体内でタンパク質や脂質などに結合した複合糖質として存在することが多く、生体内の重要な構成成分の一つである。生体内の糖鎖は細胞間情報伝達,タンパク質の機能や相互作用の調整などに深く関わっていることが明らかになりつつある。
 なお、糖鎖とは、グルコース,ガラクトース,マンノース,フコース,キシロース,N-アセチルグルコサミン,N-アセチルガラクトサミン,シアル酸などの単糖およびこれらの誘導体がグリコシド結合によって鎖状に結合した分子の総称である。
 例えば、糖鎖を有する生体高分子としては、細胞の安定化に寄与する植物細胞の細胞壁のプロテオグリカン、細胞の分化、増殖、接着、移動等に影響を与える糖脂質、及び細胞間相互作用や細胞認識に関与している糖タンパク質等が挙げられる。これらの生体高分子に含まれる糖鎖が、この生体高分子と互いに機能を代行、補助、増幅、調節、あるいは阻害しあいながら高度で精密な生体反応を制御する機構が次第に明らかにされつつある。さらに、このような糖鎖と細胞の分化増殖、細胞接着、免疫、及び細胞の癌化との関係が明確にされれば、この糖鎖工学と、医学、細胞工学、あるいは臓器工学とを密接に関連させて新たな展開を図ることが期待できる。
 また、糖タンパク質性医薬品ではその糖鎖が生物活性発現等に重要な役割を担っている場合が多い。したがって、糖タンパク質性医薬品の品質管理のパラメーターとして、糖鎖の評価はきわめて重要であり、特に抗体医薬品についてはその糖鎖構造が抗体依存性細胞傷害活性(ADCC活性)を左右するとの報告がされており、糖鎖構造解析の重要性が高まっている。
 そのため近年糖鎖構造を迅速、簡便に、かつ精度高く解析する方法が求められるようになり、高速液体クロマトグラフィ(HPLC)、核磁気共鳴法、キャピラリー電気泳動法(CE法)、質量分析法、レクチンアレイ法などの多種多様の方法により糖鎖解析が行われている。
 これら種々の手法を用いて糖鎖を解析するためには、あらかじめ生体試料中に含まれるタンパク質、ペプチド、脂質、核酸などと糖鎖を分離・精製することが必要である。また、HPLCやCEは分離の良さ、再現性の良さ、定量性、感度の高さなどと言った点から広く用いられる手法であるが、高い感度を得るために糖鎖の還元末端を還元アミノ化法等により標識化する必要がある。しかしながら、これら糖鎖の精製や標識化は時間と工数がかかり、一度に多量の試料を調整するのは困難を要する。
 上述した課題を解決する技術として、例えば特許文献1に記載された特定の糖鎖捕捉物質を用いて実現される試料調整方法が挙げられる。
国際公開第2008/018170号パンフレット
 上記でも述べたように、糖鎖の分離・精製および標識化には時間と工数を要する。糖鎖の分離・精製には例えば、イオン交換樹脂、逆相クロマトグラフィ、活性炭、ゲル濾過クロマトグラフィなどの手法が用いられるが、これらの分離手段は糖を特異的に認識する方法ではないので、莢雑物(ペプチド、タンパク質など)の混入が避けられず、また糖鎖の構造によって回収率に差異が生じることが多い。また、糖鎖を標識するには、精製工程後得られた糖鎖試料を完全に乾燥させる必要があるなど、精製から標識化まで一連の操作に数日要してしまう。
 本発明の目的は、生体試料から糖鎖を精製し標識する工程を、簡便に行なう方法を提供することである。
 本発明は以下の通りである。
(1)生体試料中に含有する糖鎖を標識化する方法であって、
(a)生体試料から糖鎖を特異的に捕捉する物質である糖鎖捕捉物質に糖鎖を捕捉する工程、
(c)糖鎖捕捉物質から糖鎖を遊離させる工程、
(d)遊離された糖鎖を標識化する工程、
を含み、(a)、(c)、(d)の工程を同一の反応容器内で連続して行うことを特徴とする糖鎖標識方法。
(2)生体試料中に含有する糖鎖を標識化する方法であって、
(a)生体試料から糖鎖を特異的に捕捉する物質である糖鎖捕捉物質に糖鎖を捕捉する工程、
(b)糖鎖を捕捉した糖鎖捕捉物質を洗浄する工程
(c)糖鎖捕捉物質から糖鎖を遊離させる工程、
(d)遊離された糖鎖を標識化する工程、
を含み、(a)、(b)、(c)、(d)の工程を同一の反応容器内で連続して行うことを特徴とする糖鎖標識方法。
(3)(a)の工程において、糖鎖捕捉物質が糖鎖のアルデヒド基と特異的に反応する官能基を有する担体である(1)又は(2)記載の糖鎖標識方法。
(4)前記官能基が、ヒドラジド基又はアミノオキシ基である(3)記載の糖鎖標識方法。
(5)前記糖鎖捕捉物質が下記の(式1)で表される架橋型ポリマー構造を有するものである(4)記載の糖鎖標識方法。
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000001
 (R1,R2は-O-,-S-,-NH-,-CO-,-CONH-で中断されてもよい炭素数1~20の炭化水素鎖,R3,R4,R5はH,CH3,または炭素数2~5の炭化水素鎖を示す。m,nはモノマーユニット数を示す。)
(6)前記糖鎖捕捉物質が下記の(式2)で表される架橋型ポリマー構造を有するものである(5)記載の糖鎖標識方法。
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000002
(m,nはモノマーユニット数を示す。)
(7)(c)の工程において、糖鎖捕捉物質に酸処理を行なう工程を有する(1)~(6)いずれか記載の糖鎖標識方法。
(8) (a)および(c)の工程において、反応溶媒を蒸発させる工程を有する(1)~(7)いずれか記載の糖鎖標識方法。
(9)(d)の工程において、糖鎖の標識化をアミノ基を有する化合物により行う(1)~(8)いずれか記載の糖鎖標識方法。
(10)前記アミノ基を有する化合物による糖鎖の標識化が還元的アミノ化反応によりなされるものである(9)記載の糖鎖標識方法。
(11)前記アミノ基を有する化合物が紫外可視吸収特性又は蛍光特性を有するものである(9)又は(10)記載の糖鎖標識方法。
(12)前記アミノ基を有する化合物が、
8-Aminopyrene-1,3,6-trisulfonate,8-Aminonaphthalene-1,3,6-trisulphonate,7-amino-1,3-naphtalenedisulfonic acid,2-Amino9(10H)-acridone,5-Aminofluorescein,Dansylethylenediamine,2-Aminopyridine,7-Amino-4-methylcoumarine,2-Aminobenzamide,2-Aminobenzoic acid,3-Aminobenzoic acid,7-Amino-1-naphthol,3-(Acetylamino)-6-aminoacridine,2-Amino-6-cyanoethylpyridine,Ethyl p-aminobenzoate,p-Aminobenzonitrile,及び7-aminonaphthalene-1,3-disulfonic acid、
から選ばれる少なくとも1つである(9)~(11)いずれか記載の糖鎖標識方法。
(13)(1)~(12)いずれか記載の糖鎖標識方法によって標識化した糖鎖を検出する工程を含む、糖鎖の検出方法。
(14)(1)~(12)いずれか記載の糖鎖標識方法によって標識化した糖鎖を分取する工程を含む、糖鎖の分取方法。
 本発明の糖鎖標識方法によれば、生体試料中に含有する糖鎖等の標的化合物の精製及び標識化を同一の反応容器内にて行え、標的化合物を簡便に標識することが可能となる。また、HPLCやCEなどの分析に一般的に用いられるアミノ化合物による標識も簡便に行うことが可能となる。
 上述した目的、およびその他の目的、特徴および利点は、以下に述べる好適な実施の形態、およびそれに付随する以下の図面によってさらに明らかになる。
実験例1にて得られた2-AB標識ウシ由来フェツイン糖鎖を高速液体クロマトグラフィにより測定した結果を示すチャート図である。 実験例2にて得られた2-AB標識ウシ血清由来IgG糖鎖を高速液体クロマトグラフィにより測定した結果を示すチャート図である。 実験例3にて得られた2-AB標識ウシ由来フェツイン糖鎖を高速液体クロマトグラフィにより測定した結果を示すチャート図である。
本発明は、生体試料中に含有する糖鎖を標識化する方法であって、
(a)生体試料から糖鎖を特異的に捕捉する物質である糖鎖捕捉物質に糖鎖を捕捉する工程、
(b)糖鎖を捕捉した糖鎖捕捉物質を洗浄する工程
(c)糖鎖捕捉物質から糖鎖を遊離させる工程、
(d)遊離された糖鎖を標識化する工程、
を含み、(a)、(b)、(c)、(d)の工程を同一の反応容器内で連続して行う糖鎖標識方法である。
 (a)の工程において、糖鎖を特異的に捕捉する物質は糖鎖のアルデヒド基と反応する官能基を有していることが好ましい。官能基としてはヒドラジド基又はオキシルアミノ基であることがより好ましい。
 このような糖鎖捕捉物質としては、下記(式1)又は(式2)で表される構造を有する架橋型ポリマーを担体として用いることが好ましい。
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000003
 (R1,R2は-O-,-S-,-NH-,-CO-,-CONH-で中断されてもよい炭素数1~20の炭化水素鎖,R3,R4,R5はH,CH3,または炭素数2~5の炭化水素鎖を示す。m,nはモノマーユニット数を示す。)
 R1は、-O-,-S-,-NH-,-CO-,-CONH-で中断されてもよい炭素数1~20の炭化水素鎖を示し、例えば下記のものを挙げることができる。なお式中、a、b、dは1から5の整数を表し、cは1から10の整数を表す。
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000004
 R2は、-O-,-S-,-NH-,-CO-,-CONH-で中断されてもよい炭素数1~20の炭化水素鎖を示し、例えば下記のものを挙げることができる。下記式中、e、fは1から5の整数を表し、gは1から10の整数を表す。
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000005
 R3、R4、R5は、それぞれ同一であっても異なっていてもよく、H,CH3,または炭素数2~5の炭化水素鎖を示し、例えば下記のものを挙げることができる。下記式中、hは1から4の整数を表す。
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000006
 また、このような(式1)のうち、特に好適な物質Aとしては、下記の(式2)で表される架橋型ポリマー構造を有するものが挙げられる。
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000007
(m,nはモノマーユニット数を示す。)
 その他市販のヒドラジド基含有架橋粒子、例えば、アフィゲルHz(BIO-RAD、153-6047)、CarboLink(TM) Coupling Gel(PIERCE、20391)、UltraLink(R) Hydrazide Gel(PIERCE、53149)などを用いても良い。
 また、糖鎖捕捉物質として、下記(式5)又は(式6)で表される構造を有する架橋型ポリマーを担体として用いることもできる。
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000008
 (R1,R2は-O-,-S-,-NH-,-CO-,-CONH-で中断されてもよい炭素数1~20の炭化水素鎖,R3,R4,R5はH,CH3,または炭素数2~5の炭化水素鎖を示す。m,nはモノマーユニット数を示す。)。また、R1からR5の具体例としては、(式1)での説明にて挙げられたものと同様のものを挙げることができる。
 さらに、このような(式5)で示したポリマー粒子において、下記の(式6)で表される構造を有するポリマー粒子を好適に使用することもできる。
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000009
(m,nはモノマーユニット数を示す。)
 これらの糖鎖捕捉物質のうち、ヒドラジド基を含有する物質を好適に使用することができる。
 また、糖鎖と糖鎖捕捉物質とを反応させる反応系においてpHが酸性の条件であるのが好ましく、好ましくは2~9、より好ましくは2~7であり、さらに好ましくは2~6である。反応温度に関しては4~90℃が好ましく、好ましくは25~90℃で、さらに好ましくは40~90℃である。反応時間は、10分間~24時間、好ましくは10分間~8時間、より好ましくは10分間~2時間である。反応は、糖鎖の捕捉反応を効率よく行う観点から、開放系で行って溶媒を完全に蒸発させることが好ましい。
 続いて、(b)の工程では、(a)の工程で糖鎖が捕捉された糖鎖捕捉物質を洗浄して、糖鎖捕捉物質に捕捉されなかった糖鎖、他の生体試料などを除去する。糖鎖捕捉物質の洗浄に用いられる溶液としては、グアニジンや界面活性剤の水溶液のようなタンパク変性剤溶液、メタノール、エタノールなどのアルコール類、水および水性緩衝液などが使用される。ここで、洗浄に水溶液が用いられる場合、この水溶液のpHは中性付近であることが好ましく、そのpHは4~10、より好ましくは6~8である。
 なお、(b)の洗浄工程は、当初の生体試料の状態、例えば糖鎖以外の物質の混在の程度によっては行わなくても構わない。
 (c)の工程では、糖鎖が捕捉された糖鎖捕捉物質から糖鎖を遊離させる、すなわち糖鎖を糖鎖捕捉物質から切り出す反応を行う。この工程では、酸と有機溶媒の混合溶媒あるいは酸と水と有機溶媒の混合溶媒にて、糖鎖捕捉物質に酸処理を行うのが好ましい。酸と水と有機溶媒の混合溶媒の場合、水の含有率は好ましくは0.1%~90%、より好ましくは0.1%~80%、さらに好ましくは0.1%~50%である。水の代わりに水性緩衝液を含有しても良い。緩衝液の濃度は好ましくは0.1mM~1M、より好ましくは0.1mM~500mM、さらに好ましくは1mM~100mMである。反応溶液のpHは好ましくは2~9、より好ましくは2~7であり、さらに好ましくは2~6である。使用する酸は例えば、酢酸、ギ酸、トリフルオロ酢酸、塩酸、クエン酸、リン酸、硫酸が好ましく、より好ましくは酢酸、ギ酸、トリフルオロ酢酸、リン酸、さらに好ましくは酢酸、トリフルオロ酢酸である。反応温度に関しては4~90℃が好ましく、好ましくは25~90℃で、さらに好ましくは40~90℃である。反応時間は、10分間~24時間、好ましくは10分間~8時間、より好ましくは10分間~3時間である。反応は、糖鎖を遊離させる反応を効率よく行う観点から、開放系で行って溶媒を完全に蒸発させることが好ましい。
 弱酸性から中性付近で、糖鎖切り出し反応を行うことができるため、従来の強酸性処理、たとえば10%トリフルオロ酢酸処理による切出しのような強酸の存在下での切出し反応に比べて、シアル酸残基の脱離など糖鎖の加水分解などを引き起こすことを抑制することができるようになる。
 (d)の工程では(c)の工程で得られた遊離の糖鎖を標識化する。標識化の方法は、アミノ基を有する化合物により、例えば還元的アミノ化反応を用いて任意のアミノ化合物で標識化する反応であることが好ましい。反応系においてpHが酸性から中性の条件であるのが好ましく、好ましくは2~9、より好ましくは2~8であり、さらに好ましくは2~7である。反応温度に関しては4~90℃が好ましく、好ましくは25~90℃で、さらに好ましくは40~90℃である。アミノ化合物の濃度は、1mM~10Mであるのが好ましく、還元剤の濃度は、1mM~10Mであるのが好ましい。反応時間は、10分間~24時間、好ましくは10分間~8時間、より好ましくは10分間~3時間である。
 ここで、アミノ基を有する化合物は、紫外可視吸収特性又は蛍光特性を有することが好ましく、例えば下記の群から選ばれる少なくとも1つであることが好ましい。
 8-Aminopyrene-1,3,6-trisulfonate,8-Aminonaphthalene-1,3,6-trisulphonate,7-amino-1,3-naphtalenedisulfonic acid,2-Amino9(10H)-acridone,5-Aminofluorescein,Dansylethylenediamine,2-Aminopyridine,7-Amino-4-methylcoumarine,2-Aminobenzamide,2-Aminobenzoic acid,3-Aminobenzoic acid,7-Amino-1-naphthol,3-(Acetylamino)-6-aminoacridine,2-Amino-6-cyanoethylpyridine,Ethyl p-aminobenzoate,p-Aminobenzonitrile,及び7-aminonaphthalene-1,3-disulfonic acid。
 特に、アミノ化合物が2-aminobenzamideの場合、pHが酸性から中性の条件で、好ましくは2~9、より好ましくは2~8であり、さらに好ましくは2~7である。反応温度に関しては4~90℃、好ましくは30~90℃で、さらに好ましくは40~80℃である。アミノ化合物の濃度は1mM~10M、好ましくは10mM~10Mで、さらに好ましくは100mM~1Mである。還元剤の濃度は、1mM~10M、好ましくは10mM~10M、さらに好ましくは100mM~2Mである。反応時間は、10分間~24時間、好ましくは10分間~8時間、さらに好ましくは1時間~3時間である。
 また、還元剤は例えば、シアノ水素化ホウ素ナトリウム、メチルアミンボラン、ジメチルアミンボラン、トリメチルアミンボラン、ピコリンボラン、ピリジンボランなどが使用可能であるが、シアノ水素化ホウ素ナトリウムを使用するのが反応性の面から考えて好ましい。
(d)の工程後、得られる溶液は標識された糖鎖と過剰量加えた未反応アミノ化合物、還元剤が存在するため、これら余剰試薬を除去する工程を行うのが好ましい。シリカカラムによる除去、ゲル濾過による除去、イオン交換樹脂による除去、いずれの方法を用いても良いが、シアル酸の離脱を防ぐために使用する溶媒は中性であるのが好ましい。
 以上、糖鎖標識方法について説明したが、本発明は別の側面から、当該糖鎖標識方法によって標識化した糖鎖を検出する工程を含む、糖鎖の検出方法を提供する。また、さらに別の側面から、当該糖鎖標識方法によって標識化した糖鎖を分取する工程を含む、糖鎖の分取方法を提供する。
 特許文献1に記載の糖鎖捕捉技術では、捕捉した糖鎖の標識化において、過剰試薬を加えて行う交換反応による標識技術を用いているのに対して、本発明では還元アミノ化法による標識技術を用いている。還元アミノ化法は、一般的に行われる反応であるが、通常は糖鎖の精製、脱塩および乾固に時間がかかる。本発明では、担体への捕捉、精製を組み合わせることにより、還元アミノ化法を簡便に行うことを可能にしている。還元アミノ化法による標識は、特許文献1に記載されたような標識化技術と比較して、(1)2-Aminobenzamideや2-Aminopyridineと言った一般的に使用されてきた標識化合物に適応可能であることから、それら標識を用いて得られた過去の知見を参考にすることが可能である、(2)糖鎖と標識化合物との結合がより安定であるため長期保存が可能であるという点で、望ましい。
以下、本発明を以下の実験例からなる実施例により説明する。しかし、本発明はこれら実施例に限定されるものではない。
 本実施例では、モデルケースとして糖タンパク質であるウシ血清由来フェチュインおよびウシ血清由来IgGの糖鎖を分析試料として調製する方法およびその測定方法を示す。
(実験例1)
(生体試料の予備処理)
 ウシ血清由来フェチュイン1 mgを100mM重炭酸アンモニウム50μLに溶解させた後、120mM DTT(ジチオスレイトール)を5μL加え、60℃で30分間反応させた。反応終了後、123mM IAA(ヨードアセトアミド)10μLを加えて遮光下、室温で1時間反応させた。続いて400Uのトリプシンによってプロテアーゼ処理をし、タンパク質部分をペプチド断片化した。反応溶液を90℃で5分処理した後、5UのグリコシダーゼFによる処理を行って糖鎖をペプチドから遊離させ、予備処理済の生体試料を得た。
(糖鎖捕捉工程(a)、洗浄工程(b))
 糖鎖捕捉用の担体であるヒドラジド基を有するビーズ5mg(BlotGlyco(R))、住友ベークライト株式会社製、BS-45601S、式2の構造を有し、モノマー仕込み比がm:n=20:1のポリマー)が入ったディスポカラムに予備処理済の生体試料の懸濁物20μLおよび180μLの2%酢酸/アセトニトリル溶液を加え、80℃で1時間反応させた。反応は開放系で行い、溶媒が完全に蒸発しビーズが乾固した状態であることを目視で確認した。続いて、グアニジン溶液、水、メタノール、トリエチルアミン溶液にてビーズを洗浄後、10%無水酢酸/メタノールを添加し、室温で30分間反応させ、未反応のヒドラジド基をキャッピングした。キャッピング後、メタノール、塩酸水溶液、水にてビーズを洗浄した。
(糖鎖遊離工程(c))
ビーズの入ったディスポカラムに超純水20μLおよび2%酢酸/アセトニトリル溶液180μLを加え、60℃で2時間反応させた。反応は開放系で行い、溶媒が完全に蒸発しビーズが乾固した状態であることを目視で確認した。
(標識化工程(d))
ビーズの入ったディスポカラムに、2-aminobenzamide(2-AB)およびシアノ水素化ホウ素ナトリウムの終濃度がそれぞれ0.35M、1Mになるように30%酢酸/DMSO混合溶媒に溶解させて調整した溶液50μLを添加し、60℃で2時間反応させた。
上記、糖鎖捕捉工程(a)、洗浄工程(b)、糖鎖遊離工程(c)、及び標識化工程(d)は同一の容器であるディスポカラム内で行なった。
(余剰試薬除去工程)
 反応溶液50μLを回収し、アセトニトリルで10倍に希釈した後、シリカゲル (Iatrobeads、6RS-8060、三菱化学ヤトロン製)を詰めたカラムに添加してシリカゲルに標識糖鎖を吸着させた。アセトニトリル、アセトニトリル/水混合溶液(95:5)にてカラムを洗浄後、超純水50μLにて標識糖鎖を回収した。
 (標識化糖鎖の検出)
 得られた標識糖鎖をHPLCにて測定した。アミノカラム(Shodex Asahipak NH2P-50)を用いて励起波長330nm、蛍光波長420nmにて測定した。図1に測定結果を示す。2ABにより標識化された糖鎖が検出された。
 なお、図1において、1は1シアル酸含有糖鎖由来ピークを示し、2は2シアル酸含有糖鎖由来ピークを示し、3は3シアル酸含有糖鎖由来ピークを示し、4は4シアル酸含有糖鎖由来ピークを示す。
(実験例2)
 ウシ血清由来フェチュインの代わりにウシ血清由来IgGを用いた以外は、実験例1と同様に行なった。図2にHPLCの測定結果を示す。2ABにより標識化された糖鎖が検出された。
 なお、図2において、5は中性糖由来ピークを示し、6は酸性糖鎖由来ピークを示す。
(実験例3)
 糖鎖捕捉用の担体であるヒドラジド基を有するビーズとしてアフィゲルHz(BIO-RAD、153-6047)を用いた以外は、実験例1と同様に行った。アフィゲルHzは50μL使用した。図3にHPLCの測定結果を示す。図で実線は、アフィゲルHz使用の場合、破線は、実験例1のBlotGlyco(R)使用の場合を示す。アフィゲルHz使用の場合も、BlotGlyco(R)を用いた場合と比較すると強度が弱くなるが、2ABにより標識化された糖鎖が検出された。

Claims (14)

  1. 生体試料中に含有する糖鎖を標識化する方法であって、
    (a)生体試料から糖鎖を特異的に捕捉する物質である糖鎖捕捉物質に糖鎖を捕捉する工程、
    (c)糖鎖捕捉物質から糖鎖を遊離させる工程、
    (d)遊離された糖鎖を標識化する工程、
    を含み、(a)、(c)、(d)の工程を同一の反応容器内で連続して行うことを特徴とする糖鎖標識方法。
  2. 生体試料中に含有する糖鎖を標識化する方法であって、
    (a)生体試料から糖鎖を特異的に捕捉する物質である糖鎖捕捉物質に糖鎖を捕捉する工程、
    (b)糖鎖を捕捉した糖鎖捕捉物質を洗浄する工程
    (c)糖鎖捕捉物質から糖鎖を遊離させる工程、
    (d)遊離された糖鎖を標識化する工程、
    を含み、(a)、(b)、(c)、(d)の工程を同一の反応容器内で連続して行うことを特徴とする糖鎖標識方法。
  3.  (a)の工程において、糖鎖捕捉物質が糖鎖のアルデヒド基と特異的に反応する官能基を有する担体である請求項1又は2記載の糖鎖標識方法。
  4. 前記官能基が、ヒドラジド基又はアミノオキシ基である請求項3記載の糖鎖標識方法。
  5.  前記糖鎖捕捉物質が下記の(式1)で表される架橋型ポリマー構造を有するものである請求項4記載の糖鎖標識方法。
    Figure JPOXMLDOC01-appb-C000010
     (R1,R2は-O-,-S-,-NH-,-CO-,-CONH-で中断されてもよい炭素数1~20の炭化水素鎖,R3,R4,R5はH,CH3,または炭素数2~5の炭化水素鎖を示す。m,nはモノマーユニット数を示す。)
  6.  前記糖鎖捕捉物質が下記の(式2)で表される架橋型ポリマー構造を有するものである請求項5記載の糖鎖標識方法。
    Figure JPOXMLDOC01-appb-C000011
    (m,nはモノマーユニット数を示す。)
  7.  (c)の工程において、糖鎖捕捉物質に酸処理を行なう工程を有する請求項1~6いずれか記載の糖鎖標識方法。
  8.  (a)および(c)の工程において、反応溶媒を蒸発させる工程を有する請求項1~7いずれか記載の糖鎖標識方法。
  9. (d)の工程において、糖鎖の標識化をアミノ基を有する化合物により行う請求項1~8いずれか記載の糖鎖標識方法。
  10.  前記アミノ基を有する化合物による糖鎖の標識化が還元的アミノ化反応によりなされるものである請求項9記載の糖鎖標識方法。
  11. 前記アミノ基を有する化合物が紫外可視吸収特性又は蛍光特性を有するものである請求項9又は10記載の糖鎖標識方法。
  12. 前記アミノ基を有する化合物が、8-Aminopyrene-1,3,6-trisulfonate,8-Aminonaphthalene-1,3,6-trisulphonate,7-amino-1,3-naphtalenedisulfonic acid,2-Amino9(10H)-acridone,5-Aminofluorescein,Dansylethylenediamine,2-Aminopyridine,7-Amino-4-methylcoumarine,2-Aminobenzamide,2-Aminobenzoic acid,3-Aminobenzoic acid,7-Amino-1-naphthol,3-(Acetylamino)-6-aminoacridine,2-Amino-6-cyanoethylpyridine,Ethyl p-aminobenzoate,p-Aminobenzonitrile,及び7-aminonaphthalene-1,3-disulfonic acidから選ばれる少なくとも1つである請求項9~11いずれか記載の糖鎖標識方法。
  13. 請求項1~12いずれか記載の糖鎖標識方法によって標識化した糖鎖を検出する工程を含む、糖鎖の検出方法。
  14. 請求項1~12いずれか記載の糖鎖標識方法によって標識化した糖鎖を分取する工程を含む、糖鎖の分取方法。
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