WO2007136303A8 - Способ идентификации урогенитальной инфекции, олигонуклеотид, комбинация олигонуклеотидов, биочип и набор на его основе - Google Patents

Способ идентификации урогенитальной инфекции, олигонуклеотид, комбинация олигонуклеотидов, биочип и набор на его основе Download PDF

Info

Publication number
WO2007136303A8
WO2007136303A8 PCT/RU2007/000248 RU2007000248W WO2007136303A8 WO 2007136303 A8 WO2007136303 A8 WO 2007136303A8 RU 2007000248 W RU2007000248 W RU 2007000248W WO 2007136303 A8 WO2007136303 A8 WO 2007136303A8
Authority
WO
WIPO (PCT)
Prior art keywords
carrying
oligonucleotide
biological
virology
detecting
Prior art date
Application number
PCT/RU2007/000248
Other languages
English (en)
French (fr)
Other versions
WO2007136303A1 (ru
Inventor
Igor Eduardovich Granovsky
Igor Petrovich Beletsky
Elena Andreevna Shlyapnikova
Alexander Vladimirovich Gavryushkin
Sergey Vladimirovich Biryukov
Original Assignee
Closed Company Molecular Medic
Igor Eduardovich Granovsky
Igor Petrovich Beletsky
Elena Andreevna Shlyapnikova
Gavryushkin Alexander Vladimir
Sergey Vladimirovich Biryukov
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Closed Company Molecular Medic, Igor Eduardovich Granovsky, Igor Petrovich Beletsky, Elena Andreevna Shlyapnikova, Gavryushkin Alexander Vladimir, Sergey Vladimirovich Biryukov filed Critical Closed Company Molecular Medic
Priority to EP07794002A priority Critical patent/EP2028273A4/de
Publication of WO2007136303A1 publication Critical patent/WO2007136303A1/ru
Publication of WO2007136303A8 publication Critical patent/WO2007136303A8/ru

Links

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
    • C12Q1/6888—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms
    • C12Q1/689—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms for bacteria
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/70—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving virus or bacteriophage
    • C12Q1/701—Specific hybridization probes

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Virology (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
  • Apparatus Associated With Microorganisms And Enzymes (AREA)

Abstract

Изобретение относится к области микробиологии, вирусологии, биотехнологии, молекулярной биологии и генной инженерии и предназначено для выявления типичных последовательностей ДНК различных инфекционных агентов (бактерий, вирусов, грибов и т.д.), в образцах биологических материалов (кровь, биопсийный материал, слюна, слезные выделения, моча, бронхо-авеолярный лаваж, ликвор, спинномозговая жидкость и др.) человека и животных. Способ идентификации последовательностей ДНК в биологическом материале включает выделение нуклеиновых кислот, проведение мультиплексной полимеразной цепной реакции с использованием выделенной из анализируемого материала ДНК и последующую гибридизацию флуоресцентно меченых или биотинилированных продуктов этой реакции на специализированных биочипах. Предложены набор олигонуклеотидов, биологический микрочип и набор реактивов для проведения такого способа. Предложенная группа изобретений позволяет ускорить проведение анализа и повысить его точность. Изобретение может быть использовано в медицине, ветеринарии и вирусологии. Метод пригоден для массового скрининга образцов биологических материалов.
PCT/RU2007/000248 2006-05-23 2007-05-21 Способ идентификации урогенитальной инфекции, олигонуклеотид, комбинация олигонуклеотидов, биочип и набор на его основе WO2007136303A1 (ru)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
EP07794002A EP2028273A4 (de) 2006-05-23 2007-05-21 Verfahren zum nachweis einer infektions des urogenitalbereichs, oligonukleotid, oligonukleotidkombination, biochip und darauf basierendes set

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
RU2006117378 2006-05-23
RU2006117378/13A RU2348695C2 (ru) 2006-05-23 2006-05-23 Дифференцирующий и специфический олигонуклеотиды для идентификации последовательностей днк инфекционных агентов в биологических материалах, способ видовой идентификации инфекционных агентов, биочип и набор для осуществления этого способа

Publications (2)

Publication Number Publication Date
WO2007136303A1 WO2007136303A1 (ru) 2007-11-29
WO2007136303A8 true WO2007136303A8 (ru) 2009-07-16

Family

ID=38723544

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
PCT/RU2007/000248 WO2007136303A1 (ru) 2006-05-23 2007-05-21 Способ идентификации урогенитальной инфекции, олигонуклеотид, комбинация олигонуклеотидов, биочип и набор на его основе

Country Status (3)

Country Link
EP (1) EP2028273A4 (ru)
RU (1) RU2348695C2 (ru)
WO (1) WO2007136303A1 (ru)

Families Citing this family (8)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2612789C2 (ru) * 2009-04-04 2017-03-13 Конинклейке Филипс Электроникс Н.В. Способ детектирования и характеризации токсиногенного штамма clostridium difficile
KR101251538B1 (ko) * 2009-04-17 2013-04-08 (주)아벨리노 아벨리노 각막이상증 진단용 프라이머
EP2446057B1 (en) * 2009-06-23 2014-11-19 Gen-Probe Incorporated Compositions and methods for detecting nucleic acid from mollicutes
RU2470987C1 (ru) * 2011-12-22 2012-12-27 Ахматфаиль Магсумович Фахриев Нейтрализатор сероводорода и способ его получения
US10303846B2 (en) * 2014-08-14 2019-05-28 Memed Diagnostics Ltd. Computational analysis of biological data using manifold and a hyperplane
RU2595398C1 (ru) * 2015-03-12 2016-08-27 Общество с ограниченной ответственностью "ИнтерЛабСервис" Набор реагентов для выявления днк neisseria gonorrhoeae и его применение
RU2663454C1 (ru) * 2017-12-26 2018-08-06 Общество с ограниченной ответственностью "НекстБио" Набор синтетических олигонуклеотидов для количественного определения ДНК возбудителей вульвовагинального кандидоза в слизистой оболочке влагалища
RU2663453C1 (ru) * 2017-12-26 2018-08-06 ООО "НекстБио" Набор синтетических олигонуклеотидов для количественного определения ДНК Ureaplasma parvum, Ureaplasma urealyticum и Mycoplasma hominis в слизистой оболочке влагалища

Family Cites Families (36)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
EP0452596A1 (en) 1990-04-18 1991-10-23 N.V. Innogenetics S.A. Hybridization probes derived from the spacer region between the 16S and 23S rRNA genes for the detection of non-viral microorganisms
US5700636A (en) 1990-10-19 1997-12-23 Becton Dickinson And Company Methods for selectively detecting microorganisms associated with vaginal infections in complex biological samples
JPH05317099A (ja) * 1990-12-28 1993-12-03 Iatron Lab Inc ヒトサイトメガロウイルスの検出方法
JP3167138B2 (ja) 1991-02-25 2001-05-21 株式会社ヤトロン 単純ヘルペスウイルスの型特異的検出方法
US5843667A (en) 1991-03-22 1998-12-01 Amoco Corporation Nucleic acid probes for the detection for genital mycoplasmas
FR2694768B1 (fr) 1992-07-30 1994-12-23 Pasteur Institut Séquences d'oligonucléotides pour la détection spécifique de mollicutes par amplication de gènes conservés.
US5550040A (en) 1993-06-23 1996-08-27 Hoffman-La Roche Inc. Method, reagents and kits for the detection of Neisseria gonorrhoeae
EP0769068B1 (en) 1994-06-24 2005-10-12 Innogenetics N.V. Simultaneous detection, identification and differentiation of eubacterial taxa using a hybridization assay
US5656427A (en) 1994-08-29 1997-08-12 Gen-Probe Incorporated Nucleic acid hybridization assay probes, helper probes and amplification oligonucleotides targeted to Mycoplasma pneumoniae nucleic acid
US6720149B1 (en) 1995-06-07 2004-04-13 Affymetrix, Inc. Methods for concurrently processing multiple biological chip assays
US20040234999A1 (en) 1996-04-02 2004-11-25 Farrar Gwenyth Jane Genetic suppression and replacement
US6235890B1 (en) 1996-09-16 2001-05-22 The United States Of America As Represented By The Department Of Health And Human Services Methods and compositions for the detection of Candida spp.
US20030049636A1 (en) 1999-05-03 2003-03-13 Bergeron Michel G. Species-specific, genus-specific and universal DNA probes and amplification primers to rapidly detect and identify common bacterial and fungal pathogens and associated antibiotic resistance genes from clinical specimens for diagnosis in microbiology laboratories
US6242178B1 (en) 1997-07-30 2001-06-05 Centers For Disease Control And Prevention Nucleic acid probes for detecting Candida species
US20020177144A1 (en) 1997-12-30 2002-11-28 Jose Remacle Detection and/or quantification method of a target molecule by a binding with a capture molecule fixed on the surface of a disc
US6215894B1 (en) 1999-02-26 2001-04-10 General Scanning, Incorporated Automatic imaging and analysis of microarray biochips
WO2000073499A2 (en) 1999-05-28 2000-12-07 Innogenetics N.V. Nucleic acid probes and methods for detecting clinically important fungal pathogens
JP2000032992A (ja) 1999-07-26 2000-02-02 Iatron Lab Inc ヒトサイトメガロウイルスの検出方法
AU1771901A (en) * 1999-11-16 2001-05-30 Apollo Biotechnology, Inc. Method for rapid and accurate identification of microorganisms
RU2182328C2 (ru) 2000-02-17 2002-05-10 Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта РАН Флуоресцентный микроскоп
US6913879B1 (en) 2000-07-10 2005-07-05 Telechem International Inc. Microarray method of genotyping multiple samples at multiple LOCI
WO2002034953A2 (en) 2000-10-24 2002-05-02 Vigen Laboratories, Inc. Detection and quantification of human herpes viruses
EP1364063B1 (en) 2001-01-31 2010-04-21 Mayo Foundation For Medical Education And Research Detection of herpes simplex virus
US6879915B2 (en) 2001-01-31 2005-04-12 Agilent Technologies, Inc. Chemical array fabrication and use
US6790952B2 (en) 2001-02-13 2004-09-14 Cincinnati Children's Hospital Research Foundation Quantitative epstein barr virus PCR rapid assay
WO2002070728A2 (en) 2001-03-01 2002-09-12 The Johns Hopkins University Quantitative assay for the simultaneous detection and speciation of bacterial infections
RU2247390C2 (ru) 2002-02-19 2005-02-27 Научно-исследовательский институт детских инфекций (НИИДИ) Способ диагностики инфекции, вызванной вирусом эпштейн- барр
US20050202436A1 (en) 2002-07-30 2005-09-15 Baback Gharizadeh Target-specific multiple sequencing primer pool for microbial typing and sequencing applications in DNA-sequencing technologies
JP4903560B2 (ja) 2003-04-25 2012-03-28 ベクトン・ディキンソン・アンド・カンパニー 核酸増幅法による単純ヘルペスウイルス１型および２型の検出
WO2004113524A1 (en) 2003-06-23 2004-12-29 National Research Council Of Canada Variants of aminoacylase, nucleic acids coding same, and uses thereof
US20050186580A1 (en) 2004-02-23 2005-08-25 Dellinger Douglas J. Quality control method for array manufacture
RU2265656C1 (ru) 2004-03-22 2005-12-10 Общество с ограниченной ответственностью "ИнтерЛабСервис" Питательная среда для выявления ureaplasma urealyticum и способ диагностики урогенитальных уреаплазмозов
RU2270254C2 (ru) 2004-04-30 2006-02-20 Институт Молекулярной Биологии Им. В.А. Энгельгардта Российской Академии Наук Способ идентификации трансгенных последовательностей днк в растительном материале и продуктах на его основе, набор олигонуклеотидов и биочип для осуществления этого способа
RU2272293C1 (ru) 2004-08-17 2006-03-20 Сергей Юрьевич Юрьев Способ серологической диагностики активной хламидийной инфекции у беременных женщин
RU2265668C1 (ru) 2004-09-15 2005-12-10 Общество с ограниченной ответственностью Инновационная Корпорация "БИОЗАЩИТА" Набор праймеров для детекции и/или идентификации трансгенных последовательностей днк в растительном материале и его содержащих продуктах (варианты), праймер (варианты), пара праймеров (варианты), способ детекции и/или идентификации с их использованием (варианты) и устройство для осуществления способа
RU2274449C1 (ru) 2004-10-19 2006-04-20 Кировская государственная медицинская академия (КГМА) Способ повышения чувствительности метода пцр диагностики микоплазменной урогенитальной инфекции у больных с выраженным экссудативным воспалением

Also Published As

Publication number Publication date
RU2006117378A (ru) 2007-12-10
EP2028273A1 (de) 2009-02-25
WO2007136303A1 (ru) 2007-11-29
EP2028273A4 (de) 2010-09-01
RU2348695C2 (ru) 2009-03-10

Similar Documents

Publication Publication Date Title
US20220251618A1 (en) Amplicon rescue multiplex polymerase chain reaction for amplification of multiple targets
WO2007136303A8 (ru) Способ идентификации урогенитальной инфекции, олигонуклеотид, комбинация олигонуклеотидов, биочип и набор на его основе
US9315858B2 (en) Apparatus for point-of-care detection of nucleic acid in a sample
WO2005029041A2 (en) High density sequence detection methods and apparatus
RU2720713C1 (ru) Набор синтетических олигонуклеотидов для выявления рнк коронавируса
WO2011158037A2 (en) Methods and apparatuses
KR20150036262A (ko) 증폭된 뉴클레오티드 서열의 신속한 검출 방법 및 장치
US10538805B2 (en) Quantitative multiplexed identification of nucleic acid targets
US20020110835A1 (en) Microfluidic devices and methods
RU2005131568A (ru) Способ анализа генетического полиморфизма, определяющего предрасположенность к онкологическим заболеваниям и индивидуальную чувствительность к фармацевтическим препаратам с использованием олигонуклеотидного биологического микрочипа (биочипа)
EP2198965A1 (en) Integrated device for automated simultaneous detection of multiple specific targets using nucleic acid amplification
RU2010112461A (ru) Набор дифференцирующих и специфических олигонуклеотидов для идентификации днк возбудителей острых кишечных инфекций, способ идентификации оки, микрочип и диагностическая система для осуществления способа
JP5278481B2 (ja) 定性反応用試験片
KR101162422B1 (ko) 핵산 증폭용 조성물
JP4556230B2 (ja) 核酸検出容器
JP2008154490A (ja) 複数種類の標的塩基配列を同時に増幅するために用いられる基板と、該基板を用いた塩基配列の増幅方法
RU2670207C1 (ru) Набор синтетических олигонуклеотидов для выявления ДНК Gardnerella vaginalis в слизистой оболочке влагалища
JP4821219B2 (ja) 定性反応用試験片
AU2018201680B2 (en) Device and process for assays using binding members
US20050227261A1 (en) Method for sequencing-by-synthesis
Neumann et al. Isothermal Amplification Methods for Point-of-Care Diagnostics of Infectious Diseases
EP4189115A1 (en) Method of detection
WO2023055799A2 (en) Method to conduct polymerase chain reaction amplification of biological sample without nucleic acids isolation
Zhao et al. Detection of Respiratory Viruses with Plastic High Throughput Screening Devices
FI121379B (fi) Menetelmä yksijuosteisen DNA:n tuottamiseksi kaksivaiheisella symmetrisellä PCR:llä sekä menetelmään tarkoitettu reagenssipakkaus

Legal Events

Date Code Title Description
121 Ep: the epo has been informed by wipo that ep was designated in this application

Ref document number: 07794002

Country of ref document: EP

Kind code of ref document: A1

NENP Non-entry into the national phase in:

Ref country code: DE

WWE Wipo information: entry into national phase

Ref document number: 2007794002

Country of ref document: EP