RU2005131568A - Способ анализа генетического полиморфизма, определяющего предрасположенность к онкологическим заболеваниям и индивидуальную чувствительность к фармацевтическим препаратам с использованием олигонуклеотидного биологического микрочипа (биочипа) - Google Patents

Claims (12)

1. Набор праймеров для экспресс-анализа генетического полиморфизма, последовательность которых определена в Перечне последовательностей (SEQ ID NO: 1-44).

2. Набор олигонуклеотидов для экспресс-анализа генетического полиморфизма, последовательность которых определена в Перечне последовательностей (SEQ ID NO: 45-72).

3. Биочип для экспресс-анализа генетического полиморфизма, представляющий собой подложку с набором иммобилизованных на ней олигонуклеотидов, охарактеризованных в п.2.

4. Способ экспресс-анализа генетического полиморфизма для определения фармакогенетического статуса человека и выявления генетической предрасположенности к онкологическим заболеваниям, включающий верификацию полиморфных вариантов последовательности в клиническом образце ДНК, предусматривающий следующие стадии:

(а) мультиплексная "гнездовая" двухэтапная полимеразная цепная реакция (ПЦР) с использованием набора праймеров, охарактеризованных в п.1, для амплификации фрагментов ДНК и мечения ПЦР-продукта на втором этапе ПЦР;

(б) обеспечение биочипа, охарактеризованного в п.3, содержащего набор иммобилизованных олигонуклеотидов, охарактеризованных в п.2, для проведения гибридизации;

(в) гибридизация амплифицированного меченого продукта на биочипе;

(г) регистрация и интерпретация результатов гибридизации.

5. Способ по п.1, в котором на стадии (а) на втором этапе ПЦР для флуоресцентного мечения фрагмента гена используют флуоресцентно меченные по 5'-концу праймеры.

6. Способ по п.2, в котором на стадии (б) для обеспечения биочипа, охарактеризованного в п.3, содержащего набор иммобилизованных олигонуклеотидов, охарактеризованный в п.2, используют метод фотоиндуцируемой сополимеризации в акриламидном геле.

7. Способ по п.3, в котором на стадии (в) используют условия гибридизации, обеспечивающие высокую степень дифференциации между совершенными и несовершенными гибридизационными дуплексами.

8. Способ по п.4, в котором регистрацию результатов гибридизации на стадии (г) проводят с помощью портативного анализатора биочипов, снабженного ПЗС-камерой.

9. Способ по п.4, в котором регистрацию результатов гибридизации на стадии (г) проводят с помощью флуоресцентного микроскопа, снабженного ПЗС-камерой.

10. Способ по п.4, в котором интерпретацию результатов на стадии (г) проводят визуально.

11. Способ по п.4, в котором интерпретацию результатов на стадии (г) проводят с использованием программы автоматического анализа изображения.

12. Способ по п.4, в котором интерпретированные результаты используют для целей медицинской диагностики, определения предрасположенности к различным заболеваниям и коррекции доз лекарственных препаратов.