TWI850259B - 三陰性乳癌之診斷及治療方法 - Google Patents

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TWI850259B
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盧西艾納 羅瑞納 莫利內羅
仁智 崔
羅艾爾 馮克
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美商建南德克公司
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Abstract

本發明提供用於診斷及治療局部晚期或轉移性乳癌(例如，TNBC)之方法及組成物。在一些實施例中，該等方法包括確定PD-L1、CD8及/或基質腫瘤浸潤淋巴球(sTIL)中之一或多者之存在及/或表現水準。本文提供用於鑑別可能對用抗癌療法之治療有反應的患有局部晚期或轉移性TNBC之患者的方法，該抗癌療法包括PD-1軸結合拮抗劑(例如，抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗(atezolizumab))或抗PD-1抗體)及紫杉烷(taxane)(例如，nab-太平洋紫杉醇(nab-paclitaxel)或太平洋紫杉醇)。亦提供為患有局部晚期或轉移性TNBC之患者選擇療法的方法。進一步提供治療患有局部晚期或轉移性TNBC之患者的方法。在一些實施例中，該等方法包括向患者，例如，經鑑別為可能對該治療有反應之患者投與PD-1軸結合拮抗劑(例如，阿特珠單抗)及紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)。亦提供用於治療患有局部晚期或轉移性TNBC之患者的醫藥組成物。

Description

三陰性乳癌之診斷及治療方法
本發明係關於例如藉由向基於本發明之生物標記物之存在及/或表現而鑑別為可能有反應的患者投與PD-1軸結合拮抗劑(例如，阿特珠單抗(atezolizumab))及紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)來診斷及治療乳癌(例如，局部晚期或轉移性三陰性乳癌(TNBC))的方法。
癌症仍然為對人類健康最致命威脅之一。癌症、或惡性腫瘤以不受控制的方式轉移並且快速生長，使得及時偵測及治療極其困難。在美國，癌症每年侵害近130萬新患者，並且為僅次於心臟病之第二大死亡原因，4例死亡中佔大約1例。實體腫瘤引起彼等死亡中之大多數。乳癌為女性中最常見的癌症。大約10-15%之乳癌對雌激素、孕酮、及HER2受體之表現呈三陰性，亦被稱為三陰性乳癌(TNBC)。TNBC通常比雌激素受體陽性乳癌及HER2陽性乳癌更具侵襲性，並且可能難以治療。
程式性死亡配位體1 (PD-L1)為在癌症、慢性感染、妊娠、組織同種異體移植物、及自體免疫疾病期間涉及免疫系統反應之抑制的蛋白。PD-L1藉由結合至在T細胞、B細胞、及單核球表面上表現的被稱為程式性死亡1 (PD-1)的抑制受體來調控免疫反應。PD-L1亦經由與另一受體B7-1相互作用而負調控T細胞功能。PD-L1/PD-1及PD-L1/B7-1複合物之形成負調控T細胞受體信號傳導，導致T細胞活化之後續下調及抗腫瘤免疫活性之抑制。
儘管在癌症(例如，乳癌(例如，局部晚期或轉移性TNBC))之治療方面取得了顯著進展，但是仍在尋求經改良之療法及診斷方法。
本發明尤其關於用於鑑別可能對用抗癌療法之治療有反應的患有局部晚期或轉移性TNBC之患者的方法，該抗癌療法包括PD-1軸結合拮抗劑(例如，抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)或抗PD-1抗體)及紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)；為患有局部晚期或轉移性TNBC之患者選擇療法之方法；治療患有局部晚期或轉移性TNBC之患者的方法；及用於治療患有局部晚期或轉移性TNBC之患者的醫藥組成物。
在一態樣中，本發明提供一種用於鑑別可能對用抗癌療法之治療有反應的患有局部晚期或轉移性TNBC之患者的方法，該抗癌療法包含(i)選自抗PD-L1抗體及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑及(ii)紫杉烷，該方法包括確定獲自該患者之腫瘤樣品中PD-L1之表現水準，其中該患者先前未針對該TNBC進行治療，並且其中該腫瘤樣品中PD-L1之可偵測的表現水準將該患者鑑別為可能對用該抗癌療法之治療有反應。
在另一態樣中，本發明提供一種用於鑑別可能對用抗癌療法之治療有反應的患有局部晚期或轉移性TNBC之患者的方法，該抗癌療法包含(i)選自抗PD-L1抗體及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑及(ii)紫杉烷，該方法包括確定獲自該患者之腫瘤樣品之腫瘤浸潤免疫細胞中PD-L1之表現水準，其中該患者先前未針對該TNBC進行治療，並且其中佔該腫瘤樣品之約1%或更多之腫瘤浸潤免疫細胞中PD-L1之可偵測的表現水準將該患者鑑別為可能對用該抗癌療法之治療有反應。
在另一態樣中，本發明提供一種用於為患有局部晚期或轉移性TNBC之患者選擇抗癌療法之方法，該方法包括：(a)確定獲自患者之腫瘤樣品中PD-L1之表現水準，其中該患者先前未針對TNBC進行治療；及(b)基於腫瘤樣品中PD-L1之可偵測的表現水準，為該患者選擇抗癌療法，該抗癌療法包含(i)選自抗PD-L1抗體及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑及(ii)紫杉烷。
在另一態樣中，本發明提供一種用於為患有局部晚期或轉移性TNBC之患者選擇抗癌療法之方法，該方法包括：(a)確定獲自患者之腫瘤樣品之腫瘤浸潤免疫細胞中PD-L1之表現水準，其中該患者先前未針對TNBC進行治療；及(b)基於佔腫瘤樣品之約1%或更多之腫瘤浸潤免疫細胞中PD-L1之可偵測的表現水準，為該患者選擇抗癌療法，該抗癌療法包含(i)選自抗PD-L1抗體及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑及(ii)紫杉烷。
在另一態樣中，本發明提供一種治療患有局部晚期或轉移性TNBC之患者的方法，該方法包括向該患者投與有效量之抗癌療法，該抗癌療法包含(i)選自抗PD-L1抗體及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑及(ii)紫杉烷，其中該患者先前未針對該TNBC進行治療，並且其中基於獲自該患者之腫瘤樣品中PD-L1之可偵測的表現水準，該患者經鑑別為可能對該抗癌療法有反應。
在另一態樣中，本發明提供一種治療患有局部晚期或轉移性TNBC之患者的方法，該方法包括向該患者投與有效量之抗癌療法，該抗癌療法包含(i)選自抗PD-L1抗體及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑及(ii)紫杉烷，其中該患者先前未針對該TNBC進行治療，並且其中基於佔獲自該患者之腫瘤樣品之約1%或更多之腫瘤浸潤免疫細胞中PD-L1之可偵測的表現水準，該患者經鑑別為可能對該抗癌療法有反應。在一些實施例中，人類PD-1軸結合拮抗劑為阿特珠單抗。
在另一態樣中，本發明提供一種用於治療患有局部晚期或轉移性TNBC之患者的方法，該方法包括：(a)確定獲自患者之腫瘤樣品中PD-L1之表現水準，其中患者先前未針對TNBC進行治療；及(b)基於腫瘤樣品中PD-L1之可偵測的表現水準，向患者投與有效量之抗癌療法，該抗癌療法包含(i)選自抗PD-L1抗體及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑及(ii)紫杉烷。
在另一態樣中，本發明提供一種用於治療患有局部晚期或轉移性TNBC之患者的方法，該方法包括：(a)確定獲自患者之腫瘤樣品之腫瘤浸潤免疫細胞中PD-L1之表現水準，其中患者先前未針對TNBC進行治療；及(b)基於佔腫瘤樣品之約1%或更多之腫瘤浸潤免疫細胞中PD-L1之可偵測的表現水準，向患者投與有效量之抗癌療法，該抗癌療法包含(i)選自抗PD-L1抗體及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑及(ii)紫杉烷。
在另一態樣中，本發明提供一種用於治療經診斷患有局部晚期或轉移性TNBC之患者的包含選自抗PD-L1抗體及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑之醫藥組成物，其中該治療包含投與該人類PD-1軸結合拮抗劑以及紫杉烷，並且其中基於獲自該患者之腫瘤樣品中PD-L1之可偵測的表現水準，該患者經鑑別為可能對包含該人類PD-1軸結合拮抗劑及紫杉烷之抗癌療法有反應。
在另一態樣中，本發明提供一種用於治療經診斷患有局部晚期或轉移性TNBC之患者的包含選自抗PD-L1抗體及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑之醫藥組成物，其中該治療包含投與該人類PD-1軸結合拮抗劑以及紫杉烷，並且其中基於佔獲自該患者之腫瘤樣品之約1%或更多之腫瘤浸潤免疫細胞中PD-L1之可偵測的表現水準，該患者經鑑別為可能對包含該人類PD-1軸結合拮抗劑及紫杉烷之抗癌療法有反應。在一些實施例中，人類PD-1軸結合拮抗劑為阿特珠單抗。
在前述態樣中任一項之一些實施例中，獲自該患者之該腫瘤樣品在佔(i)該腫瘤樣品之約5%或更多或(ii)或該腫瘤樣品之約10%或更多的腫瘤浸潤免疫細胞中具有可偵測的表現水準之PD-L1。
在前述態樣中任一項之一些實施例中，該患者先前未接受針對不宜動手術的局部晚期或轉移性TNBC的化學療法或靶向全身療法。
在前述態樣中任一項之一些實施例中，局部晚期TNBC為不可切除的。
在前述態樣中任一項之一些實施例中，腫瘤樣品為福馬林固定且石蠟包埋(formalin-fixed and paraffin-embedded，FFPE)的腫瘤樣品、檔案腫瘤樣品、新鮮腫瘤樣品或冷凍腫瘤樣品。
在前述態樣中任一項之一些實施例中，PD-L1之表現水準為蛋白表現水準。在一些實施例中，PD-L1之該蛋白表現水準係使用免疫組織化學(IHC)、免疫螢光、流動式細胞測量術或西方墨點法確定。在一些實施例中，PD-L1之蛋白表現水準係使用IHC確定。在一些實施例中，PD-L1之蛋白表現水準係使用抗PD-L1抗體偵測。在一些實施例中，抗PD-L1抗體為SP142。
在前述態樣中任一項之一些實施例中，該方法進一步包括向患者投與有效量之抗癌療法。
在前述態樣中任一項之一些實施例中，人類PD-1軸結合拮抗劑為阿特珠單抗。
在前述態樣中任一項之一些實施例中，紫杉烷為nab-太平洋紫杉醇。
在前述態樣中任一項之其他實施例中，紫杉烷為太平洋紫杉醇。
在前述態樣中任一項之一些實施例中，患者是否可能對用該抗癌療法之治療有反應係依據無進展存活來確定。
在前述態樣中任一項之一些實施例中，患者是否可能對用該抗癌療法之治療有反應係依據總體存活來確定。
應瞭解，本文所述的各個實施例的一種、一些或所有特性可組合以形成本發明的其他實施例。對於熟習此項技術者而言，本發明之此等及其他態樣變得顯而易知。以下詳細描述進一步描述本發明之此等及其他實施例。
序列表
本申請案含有序列表，該序列表已以ASCII格式以電子方式提交且由此以引用之方式整體倂入。2019年9月16日創建之該ASCII複本命名為51177-023WO4_Sequence_Listing_9.16.19_ST25並且大小為23,454個位元組。I. 介紹
本發明提供癌症例如乳癌(例如，局部晚期或轉移性三陰性乳癌(TNBC))之診斷及治療方法及組成物，包括在先前未針對癌症進行治療之患者中。本發明至少部分地基於以下發現，確定獲自患者之樣品(例如，腫瘤樣品)中本發明之生物標記物例如PD-L1、CD8、及/或基質腫瘤浸潤淋巴球(sTIL)之存在及/或表現水準可用於診斷患有癌症之患者，可用於確定患有癌症之患者是否可能對用包括PD-1軸結合拮抗劑(例如，抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)或抗PD-1抗體)及紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)之抗癌療法之治療有反應，可用於最佳化包括PD-1軸結合拮抗劑(例如，抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)或抗PD-1抗體)及紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)之抗癌療法之治療功效，可用於為患者選擇包含PD-1軸結合拮抗劑(例如，抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)或抗PD-1抗體)及紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)之抗癌療法，及/或可用於用包含PD-1軸結合拮抗劑(例如，抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)或抗PD-1抗體)及紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)之抗癌療法治療患有癌症之患者。例如，在一些實施例中，患者呈PD-L1陽性。在一些實施例中，患者是否可能對用該抗癌療法之治療有反應係依據無進展存活來確定。在其他實施例中，患者是否可能對用該抗癌療法之治療有反應係依據總體存活來確定。II. 定義
在詳細描述本發明之前，應理解本發明不限於特定之組成物或生物系統，它們當然可以變化。應該理解，在本文中使用的術語係爲了描述特定實施例的目的，而不意欲係限制性的。
如本說明書及隨附申請專利範圍中所使用，單數形式「一」及「該」包括複數提及物，除非文中內容另外清楚地指定。因此，例如，提及「一種分子」視情況包括兩種或更多種此類分子之組合，及其類似者。
如本文所用之術語「約」係指針對此技術領域中之熟練人員容易知曉之各別值的通常誤差範圍。對「約」本文中之值或參數的提及包括(且描述)本身針對彼值或參數之實施例。
應瞭解本文所述之本發明之態樣及實施例包括「由態樣及實施例組成」及/或「基本上由態樣及實施例組成」。
術語「程式性死亡配位體1」及「PD-L1」在本文中係指原生序列PD-L1多肽、多肽變異體、及原生序列多肽及多肽變異體之片段(其在本文中經進一步定義)。本文所述之PD-L1多肽可為自多種來源諸如自人類組織類型或自另一來源分離或者藉由重組或合成方法製備之PD-L1多肽。
「原生序列PD-L1多肽」包含與源自自然界之相應PD-L1多肽具有相同胺基酸序列之多肽。
「PD-L1多肽變異體」或其變化形式意謂與如本文揭示之任何原生序列PD-L1多肽序列具有至少約80%胺基酸序列一致性的如本文所定義之PD-L1多肽，通常為活性PD-L1多肽。該等PD-L1多肽變異體包括例如其中在原生胺基酸序列之N或C端處添加或缺失一或多個胺基酸殘基之PD-L1多肽。通常，PD-L1多肽變異體將與如本文所揭示之原生序列PD-L1多肽序列具有至少約80%胺基酸序列一致性，或者至少約81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、或99%胺基酸序列一致性。通常，PD-L1變異體多肽之長度為至少約10個胺基酸，或者長度為至少約20、30、40、50、60、70、80、90、100、110、120、130、140、150、160、170、180、190、200、210、220、230、240、250、260、270、280、281、282、283、284、285、286、287、288、或289個胺基酸或更長。視情況，如與原生PD-L1多肽序列相比，PD-L1變異體多肽具有不多於一個保守胺基酸取代，或者如與原生PD-L1多肽序列相比，具有不多於2、3、4、5、6、7、8、9、或10個保守胺基酸取代。
術語「CD8」或「分化群集8 (cluster of differentiation 8)」係指充當T細胞受體(TCR)之共同受體的跨膜醣蛋白，並且除非另外指示，否則係指來自任何脊椎動物來源之任何原生CD8，脊椎動物來源包括哺乳動物諸如靈長類動物(例如，人類)及齧齒動物(例如，小鼠及大鼠)。該術語涵蓋「全長」未加工CD8以及由細胞中之加工產生的任何形式之CD8。存在CD8之兩種同功型，CD8A及CD8B，其各自由不同基因編碼。如本文所用，CD8涵蓋CD8A及CD8B。在一些實施例中，CD8為人類CD8。
除非另外指示，否則如本文所用，術語「CD8A」係指來自任何脊椎動物來源之任何原生CD8A，脊椎動物來源包括哺乳動物諸如靈長類動物(例如，人類)及齧齒動物(例如，小鼠及大鼠)。CD8A亦稱為CD8α。該術語涵蓋「全長」未加工CD8A以及由細胞中之加工產生的任何形式之CD8A。該術語亦涵蓋CD8A之天然存在之變異體，例如剪接變異體或對偶基因變異體。例示性人類CD8A之胺基酸序列可在UniProtKB登錄號P01732下發現。
除非另外指示，否則如本文所用，術語「CD8B」係指來自任何脊椎動物來源之任何原生CD8B，脊椎動物來源包括哺乳動物諸如靈長類動物(例如，人類)及齧齒動物(例如，小鼠及大鼠)。CD8B亦稱為CD8β。該術語涵蓋「全長」未加工CD8B以及由細胞中之加工產生的任何形式之CD8B。該術語亦涵蓋CD8B之天然存在之變異體，例如剪接變異體或對偶基因變異體。例示性人類CD8B之胺基酸序列可在UniProtKB登錄號P10966下發現。
如本文中可互換使用之「多核苷酸」或「核酸」係指任何長度的核苷酸之聚合物，且包括DNA及RNA。該等核苷酸可為去氧核糖核苷酸、核糖核苷酸、經修飾之核苷酸或鹼基及/或其類似物、或可藉由DNA或RNA聚合酶或藉由合成反應倂入聚合物中之任何受質。因此，例如，如本文所定義之多核苷酸包括但不限於單股及雙股DNA、包括單股及雙股區之DNA、單股及雙股RNA、及包括單股及雙股區之RNA、包含可為單股或更通常雙股或包括單股及雙股區之DNA及RNA的雜交分子。另外，如本文所用之術語「多核苷酸」係指包含RNA或DNA或RNA及DNA兩者之三股區。該等區中之股可來自同一分子或來自不同分子。該等區可包括該等分子中之一或多者的全部，但更通常僅涉及一些分子之區。具有三螺旋區之分子之一常常為寡核苷酸。術語「多核苷酸」特定地包括cDNA。
如本文所用，「寡核苷酸」一般係指短的單股多核苷酸，其長度為但不一定小於約250個核苷酸。寡核苷酸可為合成的。術語「寡核苷酸」及「多核苷酸」並非互斥的。上文針對多核苷酸之描述同等且完全適用於寡核苷酸。
術語「引子」係指一般藉由提供游離3'-OH基團而能夠雜交至核酸並且實現互補核酸之聚合的單股多核苷酸。
術語「偵測」包括任何偵測手段，包括直接及間接偵測。
如本文使用之術語「生物標記物」係指可在樣品中偵測之指標，例如，預測指標、診斷指標、及/或預後指標，例如，PD-L1、CD8、及/或sTIL。生物標記物可充當藉由某些分子、病理學、組織學、及/或臨床特徵來表徵之疾病或病症(例如，癌症)之特定亞型的指標。在一些實施例中，生物標記物為基因。生物標記物包括但不限於多核苷酸(例如，DNA及/或RNA)、多核苷酸複本數變更(例如，DNA複本數)、多肽、多肽及多核苷酸修飾(例如，轉譯後修飾)、碳水化合物、及/或基於醣脂之分子標記物。
與增加的對個體之臨床益處相關之生物標記物之「量」或「水準」為生物樣品中之可偵測的水準。這些可藉由熟習此項技術者已知且亦在本文中揭示之方法量測。所評定之生物標記物之表現水準或量可用以確定治療之反應。
術語「表現之水準」或「表現水準」一般可互換使用且一般係指生物樣品中生物標記物之量。「表現」一般係指資訊(例如，基因編碼及/或表觀遺傳資訊)藉以轉化成在細胞中存在並運作之結構的過程。因此，如本文所用，「表現」可指轉錄成多核苷酸、轉譯成多肽、或甚至多核苷酸及/或多肽修飾(例如，多肽之轉譯後修飾)。經轉錄之多核苷酸、經轉譯之多肽、或多核苷酸及/或多肽修飾(例如，多肽之轉譯後修飾)的片段亦應被視為經表現，無論其源於藉由替代剪接所生成之轉錄物或經降解之轉錄物，還是源於多肽之轉譯後加工(例如，藉由蛋白水解)。「經表現之基因」包括經轉錄成呈mRNA之多核苷酸，然後經轉譯成多肽的基因，且亦包括經轉錄成RNA但未轉譯成多肽的基因(例如，轉移RNA及核糖體RNA)。
「增加之表現」、「增加之表現水準」、「增加之水準」、「升高之表現」、「升高之表現水準」、或「升高之水準」係指個體中生物標記物相對於對照諸如未患有疾病或病症(例如，癌症)之一或多個個體或內部對照(例如，持家生物標記物)的增加之表現或增加之水準。
「減少之表現」、「減少之表現水準」、「減少之水準」、「降低之表現」、「降低之表現水準」、或「降低之水準」係指個體中生物標記物相對於對照諸如未患有疾病或病症(例如，癌症)之一或多個個體或內部對照(例如，持家生物標記物)的減少之表現或減少之水準。在一些實施例中，降低之表現為幾乎無表現。
術語「持家生物標記物」係指通常類似地存在於所有細胞型中之生物標記物或生物標記物之群(例如，多核苷酸及/或多肽)。在一些實施例中，持家生物標記物為「持家基因」。「持家基因」在本文中係指編碼活性為維持細胞功能所必需且通常類似地存在於所有細胞型中的蛋白之基因或基因之群。
如本文所用，術語「PD-L1陽性」係指樣品(例如，腫瘤樣品)表現可偵測的水準之PD-L1，或自受試者獲得PD-L1陽性樣品。PD-L1可使用任何合適方法例如免疫組織化學(IHC)來直接或間接地偵測。
如本文所用之「擴增」一般係指產生所需序列之多個複本之過程。「多個複本」意謂至少兩個複本。「複本」未必意謂與模板序列之完美序列互補性或一致性。例如，複本可包括諸如去氧肌苷之核苷酸類似物、有意的、序列改變(諸如經由引子引入之序列改變，該引子包含可與模板雜交但不互補之序列)、及/或在擴增期間出現之序列錯誤。
術語「多重PCR」係指出於在單一反應中擴增二或更多個DNA序列之目的而使用多於一種引子集對獲自單一來源(例如，個體)之核酸進行的單一PCR反應。
如本文所用之「聚合酶鏈反應」或「PCR」技術一般係指其中微量之特定塊的核酸RNA及/或DNA得以擴增之程序，如例如在美國專利第4,683,195號中所描述。一般而言，來自所關注之區域末端或更遠處之序列資訊需要為可獲得的，以致寡核苷酸引子可經設計；此等引子之序列將與欲擴增之模板的相對鏈一致或相似。兩種引子之5'端核苷酸可與經擴增材料之末端一致。PCR可用於擴增特定RNA序列、來自總基因組DNA之特定DNA序列、以及自總細胞RNA、噬菌體、或質體序列轉錄之cDNA等。一般而言參見Mullis等人, Cold Spring Harbor Symp. Quant. Biol. 51:263 (1987)及Erlich編, PCR Technology, (Stockton Press, NY, 1989)。如本文所用，PCR被視為用於擴增核酸測試樣品之核酸聚合酶反應方法之一種但非唯一實例，其包含使用已知核酸(DNA或RNA)作為引子及利用核酸聚合酶來擴增或生成一特定塊的核酸或擴增或生成一特定塊的與特定核酸互補之核酸。
「定量即時聚合酶鏈反應」或「qRT-PCR」係指其中在PCR反應中之各步驟量測PCR產物之量的PCR形式。此技術已經在各種出版物中描述，包括例如Cronin等人，Am.J. Pathol. 164(1):35-42 (2004)及Ma等人, Cancer Cell 5:607-616 (2004)。
術語「微陣列」係指可雜交的陣列元件、較佳多核苷酸探針在受質上之有序排列。
術語「診斷」在本文中用於指代分子或病理狀態、疾病或病狀(例如，癌症(例如，乳癌(例如，局部晚期或轉移性TNBC)))之鑑別或分類。例如，「診斷」可指代特定類型之癌症之鑑別。「診斷」亦可指代例如藉由組織病理學標準、或藉由分子特徵來對特定亞型之癌症進行分類(例如，藉由生物標記物(例如，特定基因或由該等基因編碼之蛋白)中之一者或其組合之表現來表徵之亞型)。
如本文所用，術語「樣品」係指獲自或來源於所關注之受試者及/或個體之組成物，其含有待例如基於物理、生物化學、化學、及/或生理特徵來表徵及/或鑑別之細胞及/或其他分子實體。例如，片語「疾病樣品」及其變化形式係指獲自所關注之受試者之任何樣品，該樣品應為預期的或已知含有欲表徵之細胞及/或分子實體。樣品包括但不限於組織樣品、原代或培養細胞或細胞株、細胞上清液、細胞溶解產物、血小板、血清、血漿、玻璃狀液、淋巴液、滑液、濾泡液、精液、羊水、乳、全血、血源性細胞、尿液、腦脊髓液、唾液、痰、淚液、汗、黏液、腫瘤溶解產物、及組織培養基、組織提取物諸如均化組織、腫瘤組織、細胞提取物、及其組合。
「組織樣品」或「細胞樣品」意謂獲自受試者或個體之組織的相似細胞之集合。組織或細胞樣品之來源可為如來自新鮮、冷凍、及/或防腐器官、組織樣品、生檢體、及/或吸出物之固體組織；血液或任何血液成分，諸如血漿；體液，諸如腦脊髓液、羊水、腹膜液、或間隙液；來自受試者妊娠或發育之任何時間之細胞。組織樣品亦可為原代或經培養細胞或細胞株。視情況，組織或細胞樣品獲自疾病組織/器官。例如，「腫瘤樣品」為獲自腫瘤或其他癌組織之組織樣品。組織樣品可含有混合細胞型群體(例如，腫瘤細胞及非腫瘤細胞、癌細胞及非癌細胞)。組織樣品可含有在自然界中未與該組織天然地混合之化合物，諸如防腐劑、抗凝血劑、緩衝液、固定劑、營養物、抗生素、或其類似物。
如本文所用，「腫瘤浸潤免疫細胞」係指存在於腫瘤或其樣品中之任何免疫細胞。腫瘤浸潤免疫細胞包括但不限於腫瘤內免疫細胞、腫瘤周圍免疫細胞、其他腫瘤基質細胞(例如，纖維母細胞)、或其任何組合。此等腫瘤浸潤免疫細胞可為例如T淋巴球(諸如CD8+ T淋巴球及/或CD4+ T淋巴球)、B淋巴球、或其他骨髓譜系細胞，包括顆粒球(例如，嗜中性球、嗜伊紅性球、及嗜鹼性球)、單核球、巨噬細胞、樹突狀細胞(例如，交錯樹突狀細胞(interdigitating dendritic cell))、組織細胞、及自然殺手細胞。
如本文所用，「腫瘤細胞」係指存在於腫瘤或其樣品中之任何腫瘤細胞。使用此項技術中已知及/或本文所述之方法，腫瘤細胞可與可存在於腫瘤樣品中之其他細胞例如基質細胞及腫瘤浸潤免疫細胞區分開。
如本文所用，「參考樣品」、「參考細胞」、「參考組織」、「對照樣品」、「對照細胞」、或「對照組織」係指出於比較目的所使用之樣品、細胞、組織、標準物、或水準。在一個實施例中，參考樣品、參考細胞、參考組織、對照樣品、對照細胞、或對照組織獲自同一受試者或個體之身體之健康及/或非患病部分(例如，組織或細胞)。例如，參考樣品、參考細胞、參考組織、對照樣品、對照細胞、或對照組織可為與患病細胞或組織相鄰之健康及/或非患病細胞或組織(例如，與腫瘤相鄰之細胞或組織)。在另一實施例中，參考樣品獲自同一受試者或個體之身體的未經治療組織及/或細胞。在另一實施例中，參考樣品、參考細胞、參考組織、對照樣品、對照細胞、或對照組織獲自不為該受試者或個體之個體的身體之健康及/或非患病部分(例如，組織或細胞)。在甚至另一實施例中，參考樣品、參考細胞、參考組織、對照樣品、對照細胞、或對照組織獲自不為該受試者或個體之個體的身體之未經治療組織及/或細胞。
出於本文目的，組織樣品之「切片」意謂組織樣品之單一部分或塊，例如，自組織樣品(例如，腫瘤樣品)切割之組織或細胞之薄片。應瞭解可取得組織樣品之多個切片並進行分析，限制條件為應瞭解組織樣品之同一切片可在形態及分子水準下分析，或相對於多肽(例如，藉由免疫組織化學)及/或多核苷酸(例如，藉由原位雜交)來分析。
「相關(correlate或correlating)」意謂以任何方式將第一分析或方案之特性及/或結果與第二分析或方案之特性及/或結果比較。例如，在執行第二方案中可使用第一分析或方案之結果，及/或可使用第一分析或方案之結果來確定是否應進行第二分析或方案。關於多肽分析或方案之實施例，可使用多肽表現分析或方案之結果來確定是否應進行具體治療方案。關於多核苷酸分析或方案之實施例，可使用多核苷酸表現分析或方案之結果來確定是否應進行具體治療方案。
片語「基於」當在本文中使用時意謂使用關於一或多種生物標記物之資訊來通知治療決定、在包裝插頁上提供之資訊、或銷售/宣傳指導等。
措詞「標記」當在本文中使用時係指直接或間接地與試劑諸如多核苷酸探針或抗體綴合或融合並且促進其所綴合或融合之試劑之偵測的化合物或組成物。標記可自身為可偵測的(例如，放射性同位素標記或螢光標記)或在酶標記之情況下可催化可偵測之受質化合物或組成物之化學改變。該術語意欲涵蓋藉由將可偵測的受質與探針或抗體偶合(亦即，物理連接)來對探針或抗體進行直接標記，以及藉由與直接經標記之另一試劑之反應性來對探針或抗體進行間接標記。間接標記之實例包括使用螢光標記之二級抗體來偵測一級抗體及用生物素來對DNA探針進行末端標記以使得其可用螢光標記之鏈黴親和素來偵測。
術語「PD-1軸結合拮抗劑」係指如下分子，其抑制PD-1軸結合搭配物與其結合搭配物中之一或多者之相互作用，以便消除由PD-1信號傳導軸上之信號轉導所產生的T細胞功能障礙，並且導致恢復或增強T細胞功能(例如，增殖、細胞介素產生、及/或靶細胞殺傷)。如本文所用，PD-1軸結合拮抗劑包括PD-L1結合拮抗劑、PD-1結合拮抗劑、及PD-L2結合拮抗劑。
術語「PD-L1結合拮抗劑」係指減少、阻斷、抑制、消除、或干擾由PD-L1與其結合搭配物諸如PD-1及/或B7-1中之一或多者之相互作用所導致的信號轉導的分子。在一些實施例中，PD-L1結合拮抗劑為抑制PD-L1結合於其結合搭配物之分子。在一特定態樣中，該PD-L1結合拮抗劑抑制PD-L1結合於PD-1及/或B7-1。在一些實施例中，PD-L1結合拮抗劑包括抗PD-L1抗體、其抗原結合片段、免疫黏附素、融合蛋白、寡肽、以及減少、阻斷、抑制、消除、或干擾由PD-L1與其結合搭配物諸如PD-1及/或B7-1中之一或多者之相互作用所導致的信號轉導的其他分子。在一個實施例中，PD-L1結合拮抗劑減少藉由或經由在經由PD-L1之T淋巴球介導信號傳導時表現之細胞表面蛋白所介導的負性共刺激信號，以使得功能障礙性T細胞之功能障礙較少(例如，增強對抗原識別之效應子反應)。在一些實施例中，PD-L1結合拮抗劑為抗PD-L1抗體。在一特定態樣中，抗PD-L1抗體為本文所述之阿特珠單抗，其作為TECENTRIQ™來銷售，WHO藥物資訊(藥用物質之國際非專屬名稱), Recommended INN: 清單74, 第29卷, 第3期, 2015 (參見第387頁)。在另一特定態樣中，抗PD-L1抗體為本文所述之MDX-1105。在另一特定態樣中，抗PD-L1抗體為本文所述之YW243.55.S70。在另一特定態樣中，抗PD-L1抗體為本文所述之MEDI4736 (度伐魯單抗(durvalumab))。在另一特定態樣中，抗PD-L1抗體為本文所述之MSB0010718C (阿維單抗(avelumab))。
術語「PD-1結合拮抗劑」係指減少、阻斷、抑制、消除、或干擾由PD-1與其結合搭配物諸如PD-L1及/或PD-L2中之一或多者之相互作用所導致的信號轉導的分子。在一些實施例中，PD-1結合拮抗劑為抑制PD-1結合至其結合搭配物中之一或多者的分子。在一特定態樣中，該PD-1結合拮抗劑抑制PD-1結合於PD-L1及/或PD-L2。例如，PD-1結合拮抗劑包括抗PD-1抗體、其抗原結合片段、免疫黏附素、融合蛋白、寡肽、以及減少、阻斷、抑制、消除、或干擾由PD-1與PD-L1及/或PD-L2之相互作用所導致的信號轉導的其他分子。在一個實施例中，PD-1結合拮抗劑減少藉由或經由在經由PD-1之T淋巴球介導信號傳導時表現之細胞表面蛋白所介導的負性共刺激信號，以使得功能障礙性T細胞之功能障礙較少(例如，增強對抗原識別之效應子反應)。在一些實施例中，該PD-1結合拮抗劑為抗PD-1抗體。在一特定態樣中，PD-1結合拮抗劑為本文所述之MDX-1106 (納武單抗)。在另一特定態樣中，PD-1結合拮抗劑為本文所述之MK-3475 (派姆單抗)。在另一特定態樣中，PD-1結合拮抗劑為本文所述之MEDI-0680 (AMP-514)。在另一特定態樣中，PD-1結合拮抗劑為本文所述之PDR001。在另一特定態樣中，PD-1結合拮抗劑為本文所述之REGN2810。在另一特定態樣中，PD-1結合拮抗劑為本文所述之BGB-108。
術語「PD-L2結合拮抗劑」係指減少、阻斷、抑制、消除、或干擾由PD-L2與其結合搭配物諸如PD-1中之一或多者之相互作用所導致的信號轉導的分子。在一些實施例中，PD-L2結合拮抗劑為抑制PD-L2結合至其結合搭配物中之一或多者的分子。在一特定態樣中，PD-L2結合拮抗劑抑制PD-L2結合至PD-1。在一些實施例中，PD-L2拮抗劑包括抗PD-L2抗體、其抗原結合片段、免疫黏附素、融合蛋白、寡肽、以及減少、阻斷、抑制、消除、或干擾由PD-L2與其結合搭配物諸如PD-1中之一或多者之相互作用所導致的信號轉導的其他分子。在一個實施例中，PD-L2結合拮抗劑減少藉由或經由在經由PD-L2之T淋巴球介導信號傳導時表現之細胞表面蛋白所介導的負性共刺激信號，以使得功能障礙性T細胞之功能障礙較少(例如，增強對抗原識別之效應子反應)。在一些實施例中，PD-L2結合拮抗劑為免疫黏附素。
如本文所用，「紫杉烷」為雙萜，其可結合至微管蛋白、促進微管組裝及穩定化、及/或防止微管解聚合。在本文中包含之紫杉烷包括類紫杉醇10-脫乙醯基巴卡亭III及/或其衍生物。例示性紫杉烷包括但不限於太平洋紫杉醇(亦即，TAXOL®，CAS編號33069-62-4)、歐洲紫杉醇(docetaxel)(亦即，TAXOTERE®，CAS編號114977-28-5)、拉洛他賽(larotaxel)、卡巴他賽(cabazitaxel)、米拉他賽(milataxel)、替司他賽(tesetaxel)、及/或奧他賽(orataxel)。在一些實施例中，紫杉烷為白蛋白包覆之奈米粒子(例如，奈米白蛋白結合(nab)太平洋紫杉醇，亦即，ABRAXANE®及/或nab-歐洲紫杉醇，ABI-008)。在一些實施例中，紫杉烷為nab-太平洋紫杉醇(ABRAXANE®)。在一些實施例中，在CREMAPHOR® (例如，TAXOL®)及/或TWEEN®諸如聚山梨醇酯80 (例如，TAXOTERE®)中調配紫杉烷。在一些實施例中，紫杉烷為脂質體囊封之紫杉烷。在一些實施例中，紫杉烷為紫杉烷之前藥形式及/或綴合形式(例如，共價綴合至太平洋紫杉醇、聚麩胺酸太平洋紫杉醇、及/或碳酸亞油醇酯-太平洋紫杉醇之DHA)。在一些實施例中，太平洋紫杉醇在實質上沒有界面活性劑(例如，不存在CREMAPHOR®及/或TWEEN®，諸如TOCOSOL®太平洋紫杉醇)的情況下調配。
在免疫功能障礙的情況下的術語「功能障礙」係指對抗原刺激之免疫反應性降低。該術語包括「耗竭」及/或「失能(anergy)」兩者之共同要素，其中可發生抗原識別，但是後續免疫反應對控制感染或腫瘤生長無效。
如本文所用，術語「功能障礙」亦包括對於抗原識別具有耐抗性(refractory)或無反應，具體而言，將抗原識別轉譯成下游T細胞效應功能諸如增殖、細胞介素產生(例如，IL-2)、及/或靶細胞殺傷之能力減弱。
術語「失能」係指由經由T細胞受體遞送之信號(例如，在不存在ras活化的情況下細胞內Ca+2 增加)不完全或不充分所導致的對抗原剌激之無反應性。T細胞失能亦可在不存在共刺激的情況下用抗原刺激時產生，導致細胞對隨後抗原之活化變得具有耐抗性，即使在共刺激的情況下亦然。無反應狀態通常可由白細胞介素-2之存在來改寫。失能T細胞未經歷殖株擴增且/或獲得效應功能。
術語「耗竭」係指作為由在許多慢性感染及癌症期間發生之持續TCR信號傳導引起的T細胞功能障礙狀態的T細胞耗竭。其與失能之區別在於，其不是透過不完整或不足的信號傳導引起，而是由持續的信號傳導引起。其定義為效應功能差、抑制性受體之持續表現、及轉錄狀態與功能性效應子或記憶T細胞不同。耗竭防止感染及腫瘤之最優控制。耗竭可由外在負調控途徑(例如免疫調控細胞介素)以及內在負調控(共刺激)途徑(PD-1、B7-H3、B7-H4等)產生。
「腫瘤免疫性」係指腫瘤逃避免疫識別及清除之過程。因此，作為治療概念，腫瘤免疫性在此類逃避減弱時得以「治療」，且腫瘤由免疫系統識別且攻擊。腫瘤識別之實例包括腫瘤結合、腫瘤縮小、及腫瘤清除。
「免疫原性」係指特定物質引起免疫反應之能力。腫瘤為免疫原性的，且增強腫瘤免疫原性有助於藉由免疫反應清除腫瘤細胞。增強腫瘤免疫原性之實例包括用PD-1軸結合拮抗劑及紫杉烷進行治療。
在本發明之上下文中，術語「對…有反應(respond to或responsive to)」指示患有、疑似患有、或傾向於患有癌症(例如，乳癌(例如，局部晚期或轉移性TNBC))之患者對療法例如包括PD-1軸結合拮抗劑(例如，抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)或抗PD-1抗體)及紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)之抗癌療法表現出反應。熟習此項技術者容易能夠確定根據本發明方法用包括PD-1軸結合拮抗劑(例如，抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)或抗PD-1抗體)及紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)之抗癌療法來治療之個人是否表現出反應。例如，反應可藉由罹患癌症減輕來反映，諸如腫瘤生長減弱及/或停止、腫瘤大小減小、及/或癌症之一或多個症狀改善。較佳的是，反應可藉由癌症之轉移性轉變指數或癌症指數減少或降低來反映，例如，形成轉移之防止或轉移之數目或大小減少。反應可為例如完全反應、部分反應、無進展存活之改良、總體存活之改良、或持續反應。在一些實施例中，反應為無進展存活之改良。在其他實施例中，反應為總體存活之改良。
「持續反應」係指停止治療後對減少腫瘤生長之持續作用。例如，如與投與階段開始時的大小相比，腫瘤大小可保持相同或更小。在一些實施例中，持續反應之持續時間至少與治療持續時間相同，為1.5X、2.0X、2.5X、或3.0X治療持續時間長度。
如本文所用，「減少或抑制癌症復發」意謂減少或抑制腫瘤或癌症復發或腫瘤或癌症進展。如本文所揭示，癌症復發及/或癌症進展包括但不限於癌症轉移。
如本文所用，「完全反應」或「CR」係指所有標靶病灶消失。
如本文所用，「部分反應」或「PR」係指採用基線最長直徑之和(SLD)作為參考，標靶病灶之SLD降低至少30%。
如本文所用，「穩定疾病」或「SD」係指採用自從治療開始以來的最小SLD作為參考，標靶病灶既未充分縮小以對於PR而言合格，亦未充分增加以對於PD而言合格。
如本文所用，「進行性疾病」或「PD」係指採用自從治療開始以來所記錄之最小SLD作為參考，標靶病灶之SLD增加至少20%，或存在一或多個新病灶。
如本文所用，「無進展存活」(PFS)係指治療期間及之後所治療之疾病(例如，癌症)未惡化的時間長度。無進展存活可包括患者經歷完全反應或部分反應之時間量以及患者經歷穩定疾病之時間量。
如本文所用，「總體反應率」或「客觀反應率」(ORR)係指完全反應(CR)率及部分反應(PR)率之和。
如本文所用，「總體存活」(OS)係指群組中的可能在特定持續時間之後存活之個體之百分比。
術語「醫藥調配物」係指以下製劑，其為使活性成分之生物活性有效之形式，且不含對調配物所將投與之受試者有不可接受毒性之其他組分。此類調配物係無菌的。「醫藥學上可接受之」賦形劑(媒劑、添加劑)為可合理地向受試哺乳動物投與以提供有效劑量之所用活性成分的物質。
如本文所用，術語「治療」係指被設計來改變在臨床病理過程期間所治療之個體或細胞之自然過程的臨床干預。所需治療作用包括降低疾病進展率、改善或減輕疾病狀態、以及緩解或改良預後。例如，若減輕或消除了與癌症相關之一或多種症狀，包括但不限於減少癌細胞之增殖(或破壞癌細胞)、減少由疾病引起之症狀、提高該疾病患者之生活質量、減少治療該疾病所需之其他藥物的劑量、及/或延長個體之生存期，則成功「治療」了個體。
如本文所用，「延遲疾病之進展」意謂推遲、阻礙、減緩、阻止、穩定、及/或延後疾病(諸如癌症)之發展。此延遲可為不同時間長度，取決於病史及/或所治療之個體。如熟習此項技術者顯而易知，足夠或顯著延遲可事實上涵蓋預防，只要個體未發展該疾病。例如，可延遲晚期階段癌症，諸如轉移之發展。
如在本文中可互換使用，「有效量」或「治療有效量」至少為實現特定病症之可量測改良或預防所需要的最小量。本文中之有效量可根據諸如以下之因素而變化：患者之疾病狀態、年齡、性別、及體重、以及劑在個體中引起所需反應之能力。有效量亦為其中治療之任何毒性或有害效應均由治療有益效應超過之量。對於預防用途，有益或所需結果包括諸如以下之結果：消除或降低風險、減輕嚴重程度、或延遲疾病發作，包括疾病之生物化學、組織學、及/或行為症狀、其併發症、以及在疾病發展期間呈現之中間病理學表型。對於治療用途，有益或所需結果包括諸如以下之臨床結果：降低由疾病產生之一或多種症狀、增加疾病患者之生活品質、降低治療疾病所需要之其他藥物之劑量、及諸如經由靶向來增強另一藥物之效應、延遲疾病之進展、及/或延長存活。在癌症或腫瘤的情況下，藥物之有效量可具有以下效應：減少癌細胞之數目；減小腫瘤大小；抑制(亦即，在某種程度上減慢或合意地阻止)癌細胞對周邊器官之浸潤；抑制(亦即，在某種程度上減慢並且合意地阻止)腫瘤轉移；在某種程度上抑制腫瘤生長；及/或在某種程度上減輕與病症相關之一或多種症狀。有效量可以一或多次投與之形式投與。出於本發明之目的，藥物、化合物、或醫藥組成物之有效量為足以直接或間接地實現預防性或治療性治療之量。如臨床背景中應瞭解，藥物、化合物、或醫藥組成物之有效量可或可不聯合另一藥物、化合物、或醫藥組成物來實現。因此，「有效量」可在投與一或多種治療劑的情況下考慮，且單一劑若聯合一或多種其他劑可實現或實現所需結果，則可被視為以有效量給予。
如本文所用，「與…組合」或「與…聯合」係指除一種治療方式外亦投與另一治療方式。因此，「與...聯合」係指在向個體投與一種治療方式之前、期間、或之後投與一種治療形式。
「病症」為將受益於治療之任何病狀包括但不限於慢性及急性病症或疾病包括使哺乳動物易患所述病症之彼等病理狀況。
術語「細胞增殖性病症」及「增殖性病症」係指與某一程度之異常細胞增殖相關的病症。在一個實施例中，細胞增殖性病症為癌症。在一個實施例中，細胞增殖性病症為腫瘤。
如本文所用，術語「腫瘤」係指所有贅生性細胞生長及增殖(無論是惡性還是良性)以及所有癌前及癌性細胞及組織。如本文所提及，術語「癌症」、「癌性」、「細胞增殖性病症」、「增殖性病症」、及「腫瘤」並非互斥的。
術語「癌症」及「癌性」係指或描述哺乳動物中之生理學病狀，其特徵典型地在於未調控之細胞生長。術語「乳癌」包括但不限於HER2+乳癌及三陰性乳癌(TNBC)，其為其中癌細胞對於雌激素受體(ER-)、孕酮受體(PR-)、及HER2 (HER2-)呈陰性之乳癌形式，並且可為局部晚期、不可切除、及/或轉移性(例如，轉移性三陰性乳癌(mTNBC))。本文所述之方法適合於治療各個階段之癌症，包括局部晚期及/或轉移性癌症。在癌症分期中，局部晚期通常定義為從局部區域蔓延至相鄰組織及/或淋巴結之癌症。在羅馬數字分期系統中，局部晚期通常被歸類為II期或III期。轉移性癌症係其中癌症遍及全身蔓延至遠處組織及器官之階段(IV期)。
如本文所用，術語「細胞毒性劑」係指對細胞有害(例如，導致細胞死亡、抑制增殖、或以其他方式阻礙細胞功能)之任何劑。細胞毒性劑包括但不限於放射性同位素(例如At211 、I131 、I125 、Y90 、Re186 、Re188 、Sm153 、Bi212 、P32 、Pb212 及Lu之放射性同位素)；化學治療劑；生長抑制劑；酶及其片段，諸如核苷酸分解酶；及毒素，諸如細菌、真菌、植物、或動物來源之小分子毒素或酶活性毒素，包括其片段及/或變異體。例示性細胞毒性劑可選自抗微管劑、鉑配位複合物、烷化劑、抗生物劑、拓撲異構酶II抑制劑、抗代謝物、拓撲異構酶I抑制劑、激素及激素類似物、信號轉導途徑抑制劑、非受體酪胺酸激酶血管新生抑制劑、免疫治療劑、促凋亡劑、LDH-A之抑制劑、脂肪酸生物合成之抑制劑、細胞週期信號轉導抑制劑、HDAC抑制劑、蛋白酶體抑制劑、及癌症代謝之抑制劑。在一個實施例中，細胞毒性劑為基於鉑之化學治療劑。在一個實施例中，細胞毒性劑為EGFR之拮抗劑。在一個實施例中，細胞毒性劑為N-(3-乙炔基苯基)-6,7-雙(2-甲氧基乙氧基)喹唑啉-4-胺(例如，厄洛替尼(erlotinib)，TARCEVA™)。在一個實施例中，細胞毒性劑為RAF抑制劑。在一個實施例中，RAF抑制劑為BRAF及/或CRAF抑制劑。在一個實施例中，RAF抑制劑為維莫非尼(vemurafenib)。在一個實施例中，細胞毒性劑為PI3K抑制劑。
如本文所用，術語「化學治療劑」包括可用於治療癌症諸如mTNBC之化合物。化學治療劑之實例包括厄洛替尼(TARCEVA®，Genentech/OSI Pharm.)、硼替佐米(bortezomib)(VELCADE®，Millennium Pharm.)、雙硫侖(disulfiram)、沒食子兒茶素沒食子酸酯(epigallocatechin gallate)、鹽孢菌素A (salinosporamide A)、卡非佐米(carfilzomib)、17-AAG (格爾德黴素(geldanamycin))、根赤殼菌素(radicicol)、乳酸去氫酶A(LDH-A)、氟維司群(fulvestrant)(FASLODEX®，AstraZeneca)、舒尼替尼(sunitib)(SUTENT®，Pfizer/Sugen)、來曲唑(letrozole)(FEMARA®，Novartis)、甲磺酸伊馬替尼(imatinib mesylate)(GLEEVEC®，Novartis)、finasunate (VATALANIB®，Novartis)、奧沙利鉑(oxaliplatin)(ELOXATIN®，Sanofi)、5-FU (5-氟尿嘧啶)、亞葉酸(leucovorin)、雷帕黴素(rapamycin)(西羅莫司(Sirolimus)，RAPAMUNE®，Wyeth)、拉帕替尼(Lapatinib)(TYKERB®，GSK572016，Glaxo Smith Kline)、洛那法尼(lonafarnib)(SCH 66336)、索拉非尼(sorafenib)(NEXAVAR®，BayerLabs)、吉非替尼(gefitinib)(IRESSA®，AstraZeneca)、AG1478、烷化劑諸如塞替派(thiotepa)及CYTOXAN®環磷醯胺；烷基磺酸酯諸如白消安(busulfan)、英丙舒凡(improsulfan)及哌泊舒凡(piposulfan)；氮丙啶(aziridine)諸如苯佐替哌(benzodopa)、卡波醌(carboquone)、美妥替哌(meturedopa)、及烏瑞替哌(uredopa)；乙烯亞胺(ethylenimine)及甲基蜜胺(methylamelamine)包括六甲蜜胺(altretamine)、曲他胺(triethylenemelamine)、三乙烯磷醯胺(triethylenephosphoramide)、三乙烯硫代磷醯胺(triethylenethiophosphoramide)、及三羥甲蜜胺(trimethylomelamine)；番荔枝內酯(acetogenin)(尤其布拉他辛(bullatacin)及布拉他辛酮(bullatacinone))；喜樹鹼(camptothecin)(包括拓撲替康(topotecan)及伊立替康(irinotecan))；苔蘚抑素(bryostatin)；callystatin；CC-1065 (包括其阿多來新(adozelesin)、卡折來新(carzelesin)及比折來新(bizelesin)合成類似物)；念珠藻素(cryptophycin)(尤其念珠藻素1及念珠藻素8)；腎上腺皮質激素(包括普賴松(prednisone)及普賴蘇穠(prednisolone))；環丙孕酮乙酸酯(cyproterone acetate)；5α-還原酶包括非那雄胺(finasteride)及度他雄胺(dutasteride))；伏立諾他(vorinostat)、羅米地辛(romidepsin)、帕比司他(panobinostat)、丙戊酸(valproic acid)、莫塞司他多拉司他汀(mocetinostat dolastatin)；阿地白介素(aldesleukin)、滑石多卡米辛(talc duocarmycin)(包括合成類似物，KW-2189及CB1-TM1)；伊斯羅賓(eleutherobin)；水鬼蕉鹼(pancratistatin)；sarcodictyin；海綿抑素(spongistatin)；氮芥諸如苯丁酸氮芥(chlorambucil)、萘氮芥(chlomaphazine)、膽磷醯胺(chlorophosphamide)、雌莫司汀(estramustine)、異環磷醯胺(ifosfamide)，雙氯乙基甲胺(mechlorethamine)、雙氯乙基甲胺氧化物鹽酸鹽、美法侖(melphalan)、新氮芥(novembichin)、苯芥膽甾醇(phenesterine)、潑尼莫司汀(prednimustine)、曲洛磷胺(trofosfamide)、尿嘧啶氮芥(uracil mustard)；亞硝基脲諸如卡莫司汀(carmustine)、氯脲菌素(chlorozotocin)、福莫司汀(fotemustine)、洛莫司汀(lomustine)、尼莫司汀(nimustine)、及雷莫司汀(ranimnustine)；抗生素諸如烯二炔抗生素(例如，卡奇黴素(calicheamicin)，尤其卡奇黴素γ1I及卡奇黴素ω1I (Angew Chem. Intl. Ed. Engl. 33:183-186(1994))；達內黴素(dynemicin)，包括達內黴素A；雙膦酸鹽類藥物(bisphosphonate)，諸如氯膦酸鹽(clodronate)；埃斯培拉黴素(esperamicin)；以及新制癌素髮色團(neocarzinostatin chromophore)及相關色蛋白烯二炔抗生素發色團)、阿克拉黴素(aclacinomysin)、放線菌素(actinomycin)、安麯黴素(authramycin)、偶氮絲胺酸(azaserine)、博來黴素(bleomycin)、放線菌素C(cactinomycin)，卡柔比星(carabicin)、洋紅黴素(caminomycin)、嗜癌黴素(carzinophilin)、色黴素(chromomycin)、放線菌素D(dactinomycin)、柔紅黴素(daunorubicin)、地托比星(detorubicin)、6-重氮基-5-側氧基-L-正白胺酸、ADRIAMYCIN® (多柔比星(doxorubicin))、嗎啉基-多柔比星(morpholino-doxorubicin)、氰基嗎啉基-多柔比星(cyanomorpholino-doxorubicin)、2-吡咯啉基-多柔比星(2-pyrrolino-doxorubicin)、及去氧多柔比星(deoxydoxorubicin))、表柔比星(epirubicin)、依索比星(esorubicin)、伊達比星(idarubicin)、麻西羅黴素(marcellomycin)、絲裂黴素(mitomycin)諸如絲裂黴素C、麥可酚酸(mycophenolic acid)、諾拉黴素(nogalamycin)、橄欖黴素(olivomycin)、培洛黴素(peplomycin)、泊非羅黴素(porfiromycin)、嘌呤黴素(puromycin)、三鐵阿黴素(quelamycin)、羅多比星(rodorubicin)、鏈黑菌素(streptonigrin)、鏈佐星(streptozocin)、殺結核菌素(tubercidin)、烏苯美司(ubenimex)、淨司他丁(zinostatin)、佐柔比星(zorubicin)；抗代謝物諸如胺甲蝶呤(methotrexate)及5-氟尿嘧啶(5-FU)；葉酸類似物諸如二甲葉酸(denopterin)、胺甲蝶呤、蝶羅呤(pteropterin)、三甲曲沙(trimetrexate)；嘌呤類似物諸如氟達拉濱(fludarabine)、6-巰基嘌呤、硫咪嘌呤(thiamiprine)、硫鳥嘌呤(thioguanine)；嘧啶類似物諸如安西他濱(ancitabine)、阿紮胞苷(azacitidine)、6-氮尿苷(6-azauridine)、卡莫氟(carmofur)、阿糖胞苷(cytarabine)、雙去氧尿苷(dideoxyuridine)、去氧氟尿苷(doxifluridine)，依諾他濱(enocitabine)、氟尿苷(floxuridine)；雄激素諸如卡魯睾酮(calusterone)、丙酸屈他雄酮(dromostanolone propionate)、環硫雄醇(epitiostanol)、美雄烷(mepitiostane)、睾內酯(testolactone)；抗腎上腺類諸如胺魯米特(aminoglutethimide)，米托坦(mitotane)，曲洛司坦(trilostane)；葉酸補充劑諸如亞葉酸(frolinic acid)；醋葡醛內酯(aceglatone)；醛磷醯胺糖苷(aldophosphamide glycoside)；胺基乙醯丙酸(aminolevulinic acid)；恩尿嘧啶(eniluracil)；安吖啶(amsacrine)；bestrabucil；蒽雙咪腙(bisantrene)；依達曲沙(edatraxate)；地磷醯胺(defofamine)；地美可辛(demecolcine)；地吖醌(diaziquone)；依洛尼塞(eflornithine)；依利醋銨(elliptinium acetate)；埃博黴素(epothilone)；依託格魯(etoglucid)；硝酸鎵(gallium nitrate)；羥基脲；香菇多糖(lentinan)；氯尼達明(lonidainine)；美登木素生物鹼類(maytansinoid)諸如美登素(maytansine)及安絲菌素(ansamitocin)；米托胍腙(mitoguazone)；米托蒽醌(mitoxantrone)；莫哌達醇(mopidamnol)；二胺硝吖啶(nitraerine)；噴司他丁(pentostatin)；苯來美特(phenamet)；吡柔比星(pirarubicin)；洛索曲索(losoxantrone)；鬼臼酸(podophyllinic acid)；2-乙基醯肼；丙卡巴肼(procarbazine)；PSK®多醣複合物(JHS Natural Products, Eugene, Oreg.)；雷佐生(razoxane)；根黴素(rhizoxin)；西佐喃(sizofuran)；鍺螺胺(spirogermanium)；細交鏈孢菌酮酸(tenuazonic acid)；三亞胺醌(triaziquone)；2,2',2''-三氯三乙胺；單端孢菌素類(trichothecene)(尤其T-2毒素，疣孢菌素A(verracurin A)，桿孢菌素A(roridin A)及蛇行菌素(anguidine))；烏拉坦(urethan)；長春地辛(vindesine)；達卡巴嗪(dacarbazine)；甘露氮芥(mannomustine)；二溴甘露醇(mitobronitol)；二溴衛矛醇(mitolactol)；哌泊溴烷(pipobroman)；gacytosine；阿糖胞苷(arabinoside)(「Ara-C」)；環磷醯胺(cyclophosphamide)；塞替派(thiotepa)；紫杉烷(taxane)；苯丁酸氮芥(chloranmbucil)；GEMZAR®(吉西他賓(gemcitabine))；6-硫鳥嘌呤(6-thioguanine)；巰基嘌呤(mercaptopurine)；胺甲蝶呤；長春花鹼(vinblastine)；依託泊苷(etoposide)(VP-16)；異環磷醯胺；米托蒽醌(mitoxantrone)；長春新鹼(vincristine)；NAVELBINE®(長春瑞賓(vinorelbine))；諾肖林(novantrone)；替尼泊苷(teniposide)；依達曲沙(edatrexate)；柔紅黴素(daunomycin)；胺基喋呤(aminopterin)；卡培他濱(capecitabine)(XELODA®)；伊班膦酸鹽(ibandronate)；CPT-11；拓撲異構酶抑制劑RFS2000；二氟甲基鳥胺酸(DMFO)；類維生素A諸如維生素A酸；及以上任一者之醫藥學上可接受之鹽、酸、及衍生物。
化學治療劑亦包括「基於鉑之」化學治療劑，其包含含有鉑作為分子之組成部分的有機化合物。通常基於鉑之化學治療劑為鉑之配位複合物。基於鉑之化學治療劑有時在此項技術中被稱為「鉑類(platin)」。基於鉑之化學治療劑之實例包括但不限於卡鉑、順鉑、及奧沙利鉑。
化學治療劑亦包括(i)用於調控或抑制對腫瘤之激素作用的抗激素劑，諸如抗雌激素及選擇性雌激素受體調節劑(SERM)，包括例如他莫西芬(tamoxifen)(包括NOLVADEX®；檸檬酸他莫西芬(tamoxifen citrate))、雷洛昔芬(raloxifene)、屈洛昔芬(droloxifene)、iodoxyfene、4-羥基他莫西芬(4-hydroxytamoxifen)、曲沃昔芬(trioxifene)、雷洛西芬(keoxifene)、LY117018、奧那司酮(onapristone)、及FARESTON®(檸檬酸托瑞米芬(toremifine citrate))；(ii)抑制芳香酶之芳香酶抑制劑，其調控腎上腺中之雌激素產生，例如像4(5)-咪唑、胺魯米特(aminoglutethimide)、MEGASE® (甲地孕酮(megestrol acetate))、AROMASIN® (依西美坦(exemestane)；Pfizer)、福美司坦(formestanie)、法倔唑(fadrozole)、RIVISOR® (伏氯唑(vorozole))、FEMARA® (來曲唑(letrozole)；Novartis)、及ARIMIDEX® (阿那曲唑(anastrozole)；AstraZeneca)；(iii)抗雄激素諸如氟他胺(flutamide)、尼魯米特(nilutamide)、比卡魯胺(bicalutamide)、亮丙瑞林(leuprolide)、及戈舍瑞林(goserelin)；布舍瑞林(buserelin)、曲普瑞林(tripterelin)、乙酸甲羥孕酮(medroxyprogesterone acetate)、己烯雌酚(diethylstilbestrol)、普力馬(premarin)、氟甲睾酮(fluoxymesterone)、全反式維A酸(all transretionic acid)、芬維A胺(fenretinide)、以及曲沙他濱(troxacitabine)(1,3-二氧戊環核苷胞嘧啶類似物)；(iv)蛋白激酶抑制劑；(v)脂質激酶抑制劑；(vi)反義寡核苷酸，尤其抑制涉及異常細胞增殖之信號傳導途徑中之基因表現的反義寡核苷酸，例如像PKC-α、Ralf、及H-Ras；(vii)核酶諸如VEGF表現抑制劑(例如，ANGIOZYME®)及HER2表現抑制劑；(viii)疫苗諸如基因療法疫苗，例如ALLOVECTIN®、LEUVECTIN®、及VAXID®；PROLEUKIN®、rIL-2；拓撲異構酶1抑制劑諸如LURTOTECAN®；ABARELIX® rmRH；及(ix)以上任一者之醫藥學上可接受之鹽、酸、及衍生物。
化學治療劑亦包括抗體諸如阿侖單抗(Campath)、貝伐單抗(AVASTIN®，Genentech)；西妥昔單抗(ERBITUX®，Imclone)；帕尼單抗(VECTIBIX®，Amgen)、利妥昔單抗(RITUXAN®，Genentech/Biogen Idec)、帕妥珠單抗(OMNITARG®，2C4，Genentech)、曲妥珠單抗(HERCEPTIN®，Genentech)、托西莫單抗(Bexxar，Corixia)、及抗體藥物結合物吉妥珠單抗-刺孢黴素(MYLOTARG®，Wyeth)。具有作為與本發明化合物組合之試劑之治療潛力的另外人類化單株抗體包括：阿泊珠單抗、阿塞珠單抗、阿力珠單抗、巴匹珠單抗、比伐珠單抗-美登素、坎妥珠單抗-美登素、西利珠單抗、賽妥珠單抗-聚乙二醇、次福珠單抗、次妥珠單抗、達利珠單抗、依庫珠單抗、依法珠單抗、艾波妥珠單抗、厄利珠單抗、非維珠單抗、芳妥珠單抗、吉妥珠單抗-刺孢黴素、奧英妥珠單抗-刺孢黴素、伊匹單抗、拉美珠單抗、林妥珠單抗、馬妥珠單抗、美泊利單抗、莫維珠單抗、莫托珠單抗、那他珠單抗、尼妥珠單抗、諾維珠單抗、努馬珠單抗、奧瑞珠單抗、奧馬珠單抗、帕利珠單抗、帕考珠單抗、帕福珠單抗、帕妥珠單抗、派利珠單抗、拉利珠單抗、雷珠單抗、瑞利珠單抗、瑞斯珠單抗、瑞維珠單抗、羅維珠單抗、盧利珠單抗、西羅珠單抗、西利珠單抗、索妥珠單抗、他珠單抗-替崔斯坦、他度珠單抗、他利珠單抗、特非珠單抗、托珠單抗、托利珠單抗、妥可妥珠單抗-西莫白介素、圖庫珠單抗、烏瑪珠單抗、烏珠單抗、優特克單抗、維西珠單抗及抗介白素-12 (ABT-874/J695，Wyeth Research and Abbott Laboratories)，其為經遺傳修飾以識別介白素-12 p40蛋白之重組獨佔性人類序列、全長IgG1 λ抗體。
化學治療劑亦包括「EGFR抑制劑」，其係指與EGFR結合或以其他方式直接相互作用並且阻止或減少其信號傳導活性的化合物，並且替代地被稱為「EGFR拮抗劑」。此類劑之實例包括與EGFR結合之抗體及小分子。與EGFR結合之抗體之實例包括MAb 579 (ATCC CRL HB 8506)、MAb 455 (ATCC CRL HB8507)、MAb 225 (ATCC CRL 8508)、MAb 528 (ATCC CRL 8509)(參見美國專利第4,943, 533號)及其變異體，諸如嵌合225 (C225或西妥昔單抗；ERBUTIX®)及重構人類225 (H225)(參見例如WO 96/40210，Imclone Systems Inc.)；IMC-11F8，完全人類EGFR靶向抗體(Imclone)；結合II型突變型EGFR之抗體(美國專利第5,212,290號)；如美國專利第5,891,996號所述之結合EGFR之人源化及嵌合抗體；及結合EGFR之人類抗體，諸如ABX-EGF或帕尼單抗(參見WO98/50433，Abgenix/Amgen)；EMD 55900 (Stragliotto等人,Eur. J. Cancer 32A:636-640 (1996))；EMD7200 (馬妥珠單抗)，與EGF及TGF-α競爭結合EGFR的針對EGFR之人源化EGFR抗體(EMD/Merck)；人類EGFR抗體HuMax-EGFR (GenMab)；被稱為E1.1、E2.4、E2.5、E6.2、E6.4、E2.11、E6.3及E7.6.3並且在US 6,235,883中描述之完全人類抗體；MDX-447 (Medarex Inc)；及mAb 806或人源化mAb 806 (Johns等人,J. Biol. Chem. 279(29):30375-30384 (2004))。抗EGFR抗體可與細胞毒性劑綴合，因此生成免疫綴合物(參見例如EP659439A2，Merck Patent GmbH)。EGFR拮抗劑包括小分子，諸如以下案中所述之化合物：美國專利第5,616,582號、第5,457,105號、第5,475,001號、第5,654,307號、第5,679,683號、第6,084,095號、第6,265,410號、第6,455,534號、第6,521,620號、第6,596,726號、第6,713,484號、第5,770,599號、第6,140,332號、第5,866,572號、第6,399,602號、第6,344,459號、第6,602,863號、第6,391,874號、第6,344,455號、第5,760,041號、第6,002,008號、及第5,747,498號以及以下PCT公開案：WO98/14451、WO98/50038、WO99/09016、及WO99/24037。特定小分子EGFR拮抗劑包括OSI-774 (CP-358774，厄洛替尼，TARCEVA® Genentech/OSI Pharmaceuticals)；PD 183805 (CI 1033，N-[4-[(3-氯-4-氟苯基)胺基]-7-[3-(4-嗎啉基)丙氧基]-6-喹唑啉基]-2-丙烯醯胺二鹽酸鹽，Pfizer Inc.)；ZD1839，吉非替尼(IRESSA®) 4-(3'-氯-4'-氟苯胺基)-7-甲氧基-6-(3-嗎啉基丙氧基)喹唑啉，AstraZeneca)；ZM 105180 ((6-胺基-4-(3-甲基苯基-胺基)-喹唑啉，Zeneca)；BIBX-1382 (N8-(3-氯-4-氟-苯基)-N2-(1-甲基-哌啶-4-基)-嘧啶[5,4-d]嘧啶-2,8-二胺，Boehringer Ingelheim)；PKI-166 ((R)-4-[4-[(1-苯基乙基)胺基]-1H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-6-基]-苯酚)；(R)-6-(4-羥苯基)-4-[(1-苯基乙基)胺基]-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶)；CL-387785 (N-[4-[(3-溴苯基)胺基]-6-喹唑啉基]-2-丁炔醯胺)；EKB-569 (N-[4-[(3-氯-4-氟苯基)胺基]-3-氰基-7-乙氧基-6-喹啉基]-4-(二甲基胺基)-2-丁醯胺) (Wyeth)；AG1478 (Pfizer)；AG1571 (SU 5271；Pfizer)；雙重EGFR/HER2酪胺酸激酶抑制劑諸如拉帕替尼(TYKERB®，GSK572016或N-[3-氯-4-[(3氟苯基)甲氧基]苯基]-6[5[[[2甲磺醯基)乙基]胺基]甲基]-2-呋喃基]-4-喹唑啉胺)。
化學治療劑亦包括「酪胺酸激酶抑制劑」，包括在前一段中提及之EGFR靶向藥物；小分子HER2酪胺酸激酶抑制劑諸如可購自Takeda之TAK165；CP-724,714，ErbB2受體酪胺酸激酶之經口選擇性抑制劑(Pfizer及OSI)；雙重HER抑制劑諸如EKB-569 (可購自Wyeth)，其優先結合EGFR但是抑制HER2及EGFR-過度表現細胞；拉帕替尼(GSK572016；可購自Glaxo-SmithKline)，經口HER2及EGFR酪胺酸激酶抑制劑；PKI-166 (可購自Novartis)；泛HER抑制劑諸如卡奈替尼(CI-1033；Pharmacia)；Raf-1抑制劑諸如可購自ISIS Pharmaceuticals的抑制Raf-1信號傳導之反義劑ISIS-5132；非HER靶向酪胺酸激酶抑制劑諸如甲磺酸伊馬替尼(GLEEVEC®，其可購自Glaxo SmithKline)；多靶向酪胺酸激酶抑制劑諸如舒尼替尼(SUTENT®，其可購自Pfizer)；VEGF受體酪胺酸激酶抑制劑諸如瓦他拉尼(PTK787/ZK222584，其可購自Novartis/Schering AG)；MAPK胞外調控激酶I抑制劑CI-1040 (其可購自Pharmacia)；喹唑啉，諸如PD 153035，4-(3-氯苯胺基)喹唑啉；吡啶并并嘧啶；嘧啶并并嘧啶；吡咯并嘧啶，諸如CGP 59326、CGP 60261、及CGP 62706；吡唑并嘧啶，4-(苯基胺基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶；薑黃素(二阿魏醯甲烷，4,5-雙(4-氟苯胺基)鄰苯二甲醯亞胺)；含有硝基噻吩部分之酪胺酸磷酸化抑制劑；PD-0183805 (Warner-Lamber)；反義分子(例如，結合至HER編碼核酸之反義分子)；喹噁啉(美國專利第5,804,396號)；酪胺酸磷酸化抑制劑(美國專利第5,804,396號)；ZD6474 (Astra Zeneca)；PTK-787 (Novartis/Schering AG)；泛HER抑制劑諸如CI-1033 (Pfizer)；Affinitac (ISIS 3521；Isis/Lilly)；甲磺酸伊馬替尼(GLEEVEC®)；PKI 166 (Novartis)；GW2016 (Glaxo SmithKline)；CI-1033 (Pfizer)；EKB-569 (Wyeth)；司馬沙尼(Semaxinib)(Pfizer)；ZD6474 (AstraZeneca)；PTK-787 (Novartis/Schering AG)；INC-1C11 (Imclone)，雷帕黴素(rapamycin)(西羅莫司(sirolimus)，RAPAMUNE®)；或如在以下專利公開案中之任一者中所描述：美國專利第5,804,396號；WO 1999/09016 (American Cyanamid)；WO 1998/43960 (American Cyanamid)；WO 1997/38983 (Warner Lambert)；WO 1999/06378 (Warner Lambert)；WO 1999/06396 (Warner Lambert)；WO 1996/30347 (Pfizer, Inc)；WO 1996/33978 (Zeneca)；WO 1996/3397 (Zeneca)及WO 1996/33980 (Zeneca)。
化學治療劑亦包括地塞米松(dexamethasone)、干擾素、秋水仙素(colchicine)、氯苯胺啶(metoprine)、環孢菌素(cyclosporine)、兩性黴素(amphotericin)、甲硝噠唑(metronidazole)、阿侖單抗、阿利維A酸(alitretinoin)、別嘌呤醇(allopurinol)、阿米福汀(amifostine)、三氧化二砷、天冬醯胺酶、活BCG、貝伐單抗(bevacuzimab)、貝沙羅汀(bexarotene)、克拉屈濱(cladribine)、氯法拉濱(clofarabine)、阿法達貝泊汀(darbepoetin alfa)、地尼介白素(denileukin)、右雷佐生(dexrazoxane)、阿法依伯汀(epoetin alfa)、埃羅替尼(elotinib)、非格司亭(filgrastim)、乙酸組胺瑞林(histrelin acetate)、替伊莫單抗(ibritumomab)、干擾素α-2a、干擾素α-2b、來那度胺(lenalidomide)、左旋咪唑(levamisole)、美司那(mesna)、甲氧沙林(methoxsalen)、諾龍(nandrolone)、奈拉濱(nelarabine)、諾莫單抗(nofetumomab)、奧普瑞介白素(oprelvekin)、帕利夫明(palifermin)、帕米膦酸鹽(pamidronate)、培加酶(pegademase)、培門冬酶(pegaspargase)、培非格司亭(pegfilgrastim)、培美曲塞二鈉(pemetrexed disodium)、普卡黴素(plicamycin)、卟吩姆鈉(porfimer sodium)、阿的平(quinacrine)、拉布立酶(rasburicase)、沙格司亭(sargramostim)、替莫唑胺(temozolomide)、VM-26、6-TG、托瑞米芬(toremifene)、維A酸(tretinoin)、ATRA、戊柔比星(valrubicin)、唑來膦酸鹽(zoledronate)及唑來膦酸(zoledronic acid)及其醫藥學上可接受之鹽。
化學治療劑亦包括氫化可的松(hydrocortisone)、乙酸氫化可的松(hydrocortisone acetate)、乙酸可的松(cortisone acetate)、新戊酸托吡酯(tixocortol pivalate)、曲安奈德(triamcinolone acetonide)、曲安西龍醇(triamcinolone alcohol)、莫米松(mometasone)、安西奈德(amcinonide)、布地奈德(budesonide)、地奈德(desonide)、氟西奈德(fluocinonide)、氟輕鬆(fluocinolone acetonide)、倍他米松(betamethasone)、倍他米松磷酸鈉、地塞米松、地塞米松磷酸鈉、氟考龍(fluocortolone)、氫化可的松-17-丁酸酯、氫化可的松-17-戊酸酯、二丙酸阿氯米松(aclometasone dipropionate)、戊酸倍他米松、二丙酸倍他米松、潑尼卡松(prednicarbate)、氯倍他松-17-丁酸酯(clobetasone-17-butyrate)、氯倍他索-17-丙酸酯、己酸氟考龍、新戊酸氟考龍及乙酸氟潑尼定(fluprednidene acetate)；免疫選擇性消炎肽(ImSAID)，諸如苯丙胺酸-麩胺醯胺-甘胺酸(FEG)及其D-異構形式(feG)(IMULAN BioTherapeutics, LLC)；抗風濕藥，諸如硫唑嘌呤(azathioprine)、環孢素(ciclosporin)(環孢菌素A)、D-青黴胺、金鹽、羥氯喹、來氟米特米諾環素(leflunomideminocycline)、柳氮磺胺吡啶；腫瘤壞死因子α (TNFα)阻斷劑，諸如依那西普(etanercept，Enbrel)、英夫利昔單抗(infliximab，Remicade)、阿達木單抗(adalimumab，Humira)、賽妥珠單抗-聚乙二醇(Cimzia)、戈利木單抗(golimumab，Simponi)；介白素1 (IL-1)阻斷劑，諸如(阿那白滯素，Kineret)；T細胞共刺激阻斷劑，諸如阿巴西普(abatacept，Orencia)；介白素6 (IL-6)阻斷劑，諸如托珠單抗(ACTEMERA®)；介白素13 (IL-13)阻斷劑，諸如利伯珠單抗(lebrikizumab)；干擾素α (IFN)阻斷劑，諸如羅利珠單抗(rontalizumab)；β7整合素阻斷劑，諸如rhuMAb β7；IgE路徑阻斷劑，諸如抗-M1分泌；分泌型均三聚體LTa3及膜結合之雜三聚體LTa1/β2阻斷劑，諸如抗淋巴毒素α (LTa)；放射性同位素(例如At211 、I131 、I125 、Y90 、Re186 、Re188 、Sm153 、Bi212 、P32 、Pb212 及Lu之放射性同位素)；其它研究藥劑，諸如硫鉑、PS-341、苯基丁酸酯、ET-18-OCH3 或法呢基轉移酶抑制劑(L-739749、L-744832)；多酚，諸如槲皮素、白藜蘆醇、白皮杉醇(piceatannol)、表沒食子兒茶素沒食子酸酯、茶黃素、黃烷醇、原花青素、樺木酸及其衍生物；自噬抑制劑，諸如氯喹；δ-9-四氫大麻酚(dronabinol，MARINOL®)；β-拉帕醌(beta-lapachone)；拉帕醇(lapachol)；秋水仙素；樺木酸；乙醯基喜樹鹼、東莨菪素(scopolectin)及9-胺基喜樹鹼；鬼臼毒素；替加氟(tegafur)(UFTORAL®)；貝沙羅汀(TARGRETIN®)；雙膦酸鹽，諸如氯膦酸鹽(例如BONEFOS®或OSTAC®)、依替膦酸鹽(etidronate，DIDROCAL®)、NE-58095、唑來膦酸/唑來酸鹽(ZOMETA®)、阿侖膦酸鹽(FOSAMAX®)、帕米膦酸鹽(AREDIA®)、替魯膦酸鹽(SKELID®)或利塞膦酸鹽(risedronate)(ACTONEL®)；及表皮生長因子受體(EGF-R)；疫苗，諸如THERATOPE®疫苗；哌立福辛(perifosine)；COX-2抑制劑(例如塞來昔布(celecoxib)或依託昔布(etoricoxib))；蛋白酶體抑制劑(例如PS341)；CCI-779；替匹法尼(tipifarnib；R11577)；歐拉非尼(orafenib)，ABT510；Bcl-2抑制劑，諸如奧利默森鈉(oblimersen sodium，GENASENSE®)；匹杉群(pixantrone)；法呢基轉移酶抑制劑，諸如洛那法尼(lonafarnib)(SCH 6636，SARASARTM )；及以上任一者之醫藥學上可接受之鹽、酸或衍生物；以及以上兩者或更多者之組合，諸如CHOP，其為環磷醯胺、阿黴素、長春新鹼及潑尼松龍之組合療法的縮寫；及FOLFOX，其為奧沙利鉑(ELOXATINTM )與5-FU及亞葉酸組合之治療方案的縮寫。
化學治療劑亦包括具有鎮痛、解熱、及消炎作用之非類固醇消炎藥。NSAID包括環加氧酶之非選擇性抑制劑。NSAID之特定實例包括阿司匹林(aspirin)；丙酸衍生物，諸如布洛芬(ibuprofen)、非諾洛芬(fenoprofen)、酮洛芬(ketoprofen)、氟比洛芬(flurbiprofen)、奧沙普秦(oxaprozin)及萘普生(naproxen)；乙酸衍生物，諸如吲哚美辛(indomethacin)、舒林酸(sulindac)、依託度酸(etodolac)、雙氯芬酸(diclofenac)；烯醇酸衍生物，諸如吡羅昔康(piroxicam)、美洛昔康(meloxicam)、替諾昔康(tenoxicam)、屈噁昔康(droxicam)、氯諾昔康(lornoxicam)及伊索昔康(isoxicam)；芬那酸衍生物，諸如甲芬那酸(mefenamic acid)、甲氯芬那酸(meclofenamic acid)、氟芬那酸(flufenamic acid)、托芬那酸(tolfenamic acid)；及COX-2抑制劑，諸如塞來昔布、依託昔布、魯米昔布(lumiracoxib)、帕瑞昔布(parecoxib)、羅非昔布(rofecoxib)、羅非昔布(rofecoxib)、及伐地昔布(valdecoxib)。NSAID可經指示而用於以下病狀之症狀緩解，諸如類風濕性關節炎、骨關節炎、炎性關節病、強直性脊柱炎、牛皮癬性關節炎、萊特爾氏症候群(Reiter's syndrome)、急性痛風、痛經、轉移性骨痛、頭痛及偏頭痛、術後疼痛、炎症及組織損傷所致之輕度至中度疼痛、發熱、腸梗阻及腎絞痛。
在本文使用時，「生長抑制劑」係指在體外或體內抑制細胞生長之化合物或組成物。在一個實施例中，生長抑制劑為防止或減少表現抗體所結合之抗原的細胞之增殖的生長抑制抗體。在另一實施例中，生長抑制劑可為顯著減少S期中之細胞之百分比的抑制劑。生長抑制劑之實例包括阻斷細胞週期進展(在除了S期以外的位置處)的劑，諸如誘導G1停止及M期停止之劑。經典M期阻斷劑包括長春花(長春新鹼及長春花鹼)、紫杉烷類、及拓撲異構酶II抑制劑諸如多柔比星、表柔比星、柔紅黴素、依託泊苷、及博來黴素。停止G1之彼等劑亦發展成S期停止，例如DNA烷化劑諸如他莫昔芬、潑尼松、達卡巴嗪、氮芥、順鉑、甲胺蝶呤、5-氟尿嘧啶、及ara-C。進一步資訊可在Mendelsohn及Israel編, The Molecular Basis of Cancer，Murakami等人之標題為「Cell cycle regulation, oncogenes, and antineoplastic drugs」之第1章(W.B. Saunders, Philadelphia, 1995)，例如第13頁中發現。
如本文所用，術語「前藥」係指醫藥學活性物質之前驅物或衍生物形式，其與親本藥物相比，對腫瘤細胞之細胞毒性較小，並且能夠酶促活化或轉化成更具活性之親本形式。參見例如Wilman, 「Prodrugs in Cancer Chemotherapy」, Biochemical Society Transactions, 14, 第375-382頁, 第615次會議, Belfast (1986)及Stella等人, 「Prodrugs: A Chemical Approach to Targeted Drug Delivery」, Directed Drug Delivery, Borchardt等人(編), 第247-267頁, Humana Press (1985)。本發明之前藥包括但不限於含有磷酸酯之前藥、含有硫代磷酸酯之前藥、含有硫酸酯之前藥、含有肽之前藥、D-胺基酸修飾之前藥、醣基化前藥、含有β-內醯胺之前藥、含有視情況取代之苯氧基乙醯胺的前藥或含有視情況取代之苯乙醯胺的前藥、5-氟胞嘧啶及可轉化成更具活性之無細胞毒性藥物的其他5-氟尿苷前藥。可衍生化成適用於本發明中之前藥形式的細胞毒性藥物之實例包括但不限於上文所述之化學治療劑。
「輻射療法」意謂使用定向γ射線或β射線來誘導對細胞之足夠損傷，以限制其正常發揮功能之能力或完全破壞細胞。應當理解，此項技術中已知有許多確定治療之劑量及持續時間的方式。典型治療係作為一次投與來給予，且典型劑量範圍為每天10至200個單位(戈雷)。
「抗血管新生劑」或「血管新生抑制劑」係指直接或間接地抑制血管新生、血管生成、或非所欲的血管滲透性的小分子量物質、多核苷酸、多肽、經單離蛋白、重組蛋白、抗體、或其綴合物或融合蛋白。應瞭解抗血管新生劑包括結合血管新生因子或其受體並阻斷其血管新生活性的彼等劑。例如，抗血管新生劑為如上文所定義之血管新生劑之抗體或其他拮抗劑，例如，VEGF-A或VEGF-A受體(例如，KDR受體或Flt-1受體)之抗體、抗PDGFR抑制劑諸如GLEEVEC™ (甲磺酸伊馬替尼)。抗血管新生劑亦包括天然血管新生抑制劑，例如，血管穩定蛋白、內皮抑素等。參見例如Klagsbrun及D'Amore, Annu. Rev. Physiol., 53:217-39 (1991)；Streit及Detmar, Oncogene, 22:3172-3179 (2003)(例如，列出惡性黑素瘤中之抗血管新生療法之表3)；Ferrara及Alitalo, Nature Medicine 5(12):1359-1364 (1999)；Tonini等人, Oncogene, 22:6549-6556 (2003)及Sato Int. J. Clin. Oncol., 8:200-206 (2003)。
出於治療目的如在本文可互換使用之術語「個體」、「受試者」、或「患者」係指被分類為哺乳動物包括人類、家畜及農畜、及動物園動物、體育動物、或寵物動物諸如犬、馬、貓、牛等之任何動物。較佳的是，哺乳動物為人類。
本文中之術語「抗體」以最廣泛含義使用並且具體地包括單株抗體(包括全長單株抗體)、多株抗體、多特異性抗體(例如，雙特異性抗體)、及抗體片段，只要其展現所需生物活性即可。
「經單離之」抗體為已鑑別且自其天然環境之組分分離及/或回收的抗體。其天然環境之污染物組分為會干擾抗體之研究、診斷性或治療性用途的物質，且可包括酶、激素及其他蛋白或非蛋白溶解物。在一些實施例中，將抗體純化至(1)如藉由例如勞瑞法(Lowry method)所確定，抗體之大於95重量%，且在一些實施例中，純化至大於99重量%，(2)足以藉由使用例如轉杯式測序儀獲得N端或內部胺基酸序列之至少15個殘基的程度，或(3)藉由SDS-PAGE在還原或非還原條件下使用考馬斯藍(Coomassie blue)或銀染色之均一性。經單離抗體包括重組細胞內之原位抗體，因為抗體天然環境之至少一種組分不存在。然而，通常經單離抗體將藉由至少一個純化步驟來製備。
「原生抗體」通常為具有約150,000道爾頓之雜四聚體醣蛋白，由兩條相同的輕(L)鏈及兩條相同的重(H)鏈構成。各輕鏈藉由一個共價雙硫鍵鍵聯至重鏈，而雙硫鍵之數目在不同免疫球蛋白同型之重鏈之間變化。各重鏈及輕鏈亦具有規則隔開的鏈內雙硫橋。各重鏈在一個末端處具有可變域(VH )，接著為多個恆定域。各輕鏈在一個末端處具有可變域(VL )且在其另一末端處具有恆定域；該輕鏈之恆定域與該重鏈之第一恆定域對準，且該輕鏈可變域與該重鏈之可變域對準。據信特定胺基酸殘基形成輕鏈可變域與重鏈可變域之間的界面。
術語「恆定域」係指免疫球蛋白分子中之如下部分，其相對於免疫球蛋白中含有抗原結合位點之另一部分(即可變域)具有更保守之胺基酸序列。恆定域含有重鏈之CH 1、CH 2、及CH 3域(統稱為CH)及輕鏈之CHL (或CL)域。
抗體之「可變區」或「可變域」係指抗體重鏈或輕鏈之胺基末端結構域。重鏈之可變域可稱為「VH 」。輕鏈之可變域可稱為「VL 」。此等域通常係抗體中變異最大之部分並含有抗原結合位點。
術語「可變」係指如下實情，即可變域之某些部分在抗體之中在序列方面廣泛不同，且用於各特定抗體對其特定抗原之結合及特異性中。然而，變異性未在抗體之可變域中均勻地分佈。其集中於輕鏈及重鏈可變域兩者中三個稱作高變區(HVR)之區段中。可變域之更高度保守部分被稱為構架區(FR)。原生重鏈與輕鏈之可變域各自包含四個FR區，大部分採用β-折疊組態，由三個HVR連接，其形成環連接，且在一些情況下形成β-折疊組態之一部分。各鏈中之HVR由FR區緊密保持在一起且與另一鏈之HVR一起促成抗體之抗原結合位點的形成(參見Kabat等人,Sequences of Proteins of Immunological Interest, 第5版, National Institute of Health, Bethesda, Md. (1991))。恆定域未直接參與抗體與抗原之結合，但展現多種效應功能，諸如使抗體參與抗體依賴性細胞毒性。
任何哺乳動物物種之抗體(免疫球蛋白)之「輕鏈」均可基於其恆定域之胺基酸序列來歸為稱為卡帕(「κ」)及拉姆達(「λ」)之兩種明顯不同類型之一。
如本文所用，術語IgG「同型」或「亞類」意謂藉由恆定區之化學及抗原特徵來定義之免疫球蛋白之任何亞類。
視抗體(免疫球蛋白)重鏈恆定域之胺基酸序列而定，可將其歸為不同類別。存在五種主要免疫球蛋白類別：IgA、IgD、IgE、IgG、及IgM，並且此等免疫球蛋白中之若干種可進一步分成亞類(同型)，例如IgG1 、IgG2 、IgG3 、IgG4 、IgA1 、及IgA2 。對應於不同類別之免疫球蛋白的重鏈恆定域分別稱為α、γ、ε、γ、及μ。不同類別之免疫球蛋白之亞單元結構及三維組態為熟知的並且通常描述於例如Abbas等人,Cellular and Mol. Immunology, 第4版(W.B. Saunders, Co., 2000)中。抗體可為較大融合分子之一部分，該分子藉由抗體與一或多種其他蛋白或肽之共價或非共價締合形成。
術語「全長抗體」、「完整抗體」、及「全抗體」在本文中可互換地用於指代呈其實質上完整形式之抗體，而不是如以下定義之抗體片段。該等術語尤其係指具有含有Fc區之重鏈的抗體。
出於本文目的之「裸抗體」為不與細胞毒性部分或放射性標記綴合之抗體。
「抗體片段」包含完整抗體之一部分，較佳包含其抗原結合區。在一些實施例中，本文所述之抗體片段為抗原結合片段。抗體片段之實例包括Fab、Fab'、F(ab')2 、及Fv片段；雙功能抗體；線性抗體；單鏈抗體分子；及由抗體片段形成之多特異性抗體。
抗體之木瓜酶消化產生兩個相同的抗原結合片段，稱為「Fab」片段，其各自具有單個抗原結合位點；及殘餘「Fc」片段，其名稱反映其容易結晶之能力。胃蛋白酶處理產生F(ab')2 片段，其具有兩個抗原結合位點並且仍能與抗原交聯。
「Fv」為含有完整抗原結合位點之最小抗體片段。在一個實施例中，雙鏈Fv物質由一個重鏈可變域及一個輕鏈可變域緊密、非共價締合之二聚體組成。在單鏈Fv (scFv)物質中，一個重鏈可變域及一個輕鏈可變域可藉由可撓性肽連接子共價連接，使得輕鏈及重鏈可以類似於雙鏈Fv物質中之「二聚體」結構締合。在此組態中，各可變域之三個HVR相互作用以在VH-VL二聚體之表面上界定抗原結合位點。總之，六個HVR向抗體賦予抗原結合特異性。然而，即使單一可變域(或僅包含三個特異於抗原之HVR的Fv之一半)具有識別並且結合抗原之能力，但是親和力低於整個結合位點。
Fab片段含有重鏈可變域及輕鏈可變域，且亦含有輕鏈恆定域及第一重鏈恆定域(CH1)。Fab'片段藉由在重鏈CH1域之羧基端處添加數個殘基包括來自抗體鉸鏈區之一或多個半胱胺酸而與Fab片段不同。Fab'-SH在本文中為其中恆定域之半胱胺酸殘基具有遊離硫醇基之Fab'之名稱。F(ab')2 抗體片段最初作為成對Fab'片段來產生，該等成對Fab'片段在其之間具有鉸鏈半胱胺酸。亦已知抗體片段之其他化學偶合。
「單鏈Fv」或「scFv」抗體片段包含抗體之VH及VL域，其中此等域存在於單一多肽鏈中。一般而言，scFv多肽進一步在VH與VL域之間包含多肽連接子，這使得scFv能夠形成抗原結合所需之結構。關於scFv之評述，參見例如Pluckthün,The Pharmacology of Monoclonal Antibodies, 第113卷, Rosenburg及Moore編, (Springer-Verlag, New York, 1994), 第269-315頁。
術語「雙功能抗體」係指具有兩個抗原結合位點之抗體片段，該等片段包含在同一多肽鏈中連接於輕鏈可變域(VL)之重鏈可變域(VH)(VH-VL)。藉由使用過短而不允許同一鏈上的兩個域之間配對之連接子，迫使該等域與另一鏈之互補域配對且產生兩個抗原結合位點。雙功能抗體可為二價或具有雙特異性。雙功能抗體更充分地描述於以下文獻中，例如EP 404,097；WO 1993/01161；Hudson等人,Nat. Med. 9:129-134 (2003)；及Hollinger等人,Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90: 6444-6448 (1993)。三功能抗體及四功能抗體亦描述於Hudson等人,Nat. Med. 9:129-134 (2003)中。
如本文所用，術語「單株抗體」係指自實質上均質抗體之群體獲得之抗體，例如除了可少量存在之可能突變例如天然存在之突變以外，構成該群體的個別抗體為相同的。因此，修飾語「單株」指示該抗體之特徵為不為分立抗體之混合物。在某些實施例中，此種單株抗體通常包括包含標靶結合多肽序列之抗體，其中標靶結合多肽序列藉由如下方法獲得，該方法包括自複數個多肽序列中選擇單一標靶結合多肽序列。例如，選擇方法可為自複數個純系中選擇獨特純系，該複數個純系諸如融合瘤純系、噬菌體純系、或重組DNA純系之庫。應瞭解，可進一步改變所選標靶結合序列，例如以改良對標靶之親和力，人源化標靶結合序列，改良其在細胞培養物中之產生，降低其在活體內之免疫原性，產生多特異性抗體等，且包含改變之標靶結合序列的抗體亦為本發明之單株抗體。與通常包括針對不同決定子(抗原決定基)之不同抗體的多株抗體製劑形成對比，單株抗體製劑之各單株抗體係針對抗原上之單一決定子。除特異性外，單株抗體製劑之優點在於其通常不會經其他免疫球蛋白污染。
修飾語「單株」指示抗體之特性為獲自實質上均質的抗體群體，且不應理解為需要藉由任何具體方法來產生抗體。例如，待根據本發明來使用之單株抗體可藉由各種技術來製造，包括例如融合瘤方法(例如，Kohler及Milstein,Nature, 256:495-97 (1975)；Hongo等人, Hybridoma, 14 (3): 253-260 (1995)；Harlow等人,Antibodies: A Laboratory Manual, (Cold Spring Harbor Laboratory Press, 第2版 1988)；Hammerling等人,Monoclonal Antibodies and T-Cell Hybridomas 563-681 (Elsevier, N.Y., 1981))，重組DNA方法(參見例如美國專利第4,816,567號)，噬菌體展示技術(參見例如Clackson等人,Nature, 352: 624-628 (1991)；Marks等人,J. Mol. Biol. 222: 581-597 (1992)；Sidhu等人,J. Mol. Biol. 338(2): 299-310 (2004)；Lee等人,J. Mol. Biol. 340(5): 1073-1093 (2004)；Fellouse,Proc. Natl. Acad. Sci. USA 101(34): 12467-12472 (2004)；及Lee等人,J. Immunol. Methods 284(1-2): 119-132 (2004)，以及在具有部分或全部人類免疫球蛋白基因座或編碼人類免疫球蛋白序列之基因之動物中產生人類或人類樣抗體的技術(參見例如WO 1998/24893；WO 1996/34096；WO 1996/33735；WO 1991/10741；Jakobovits等人,Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90: 2551 (1993)；Jakobovits等人,Nature 362: 255-258 (1993)；Bruggemann等人,Year in Immunol. 7:33 (1993)；美國專利第5,545,807號；第5,545,806號；第5,569,825號；第5,625,126號；第5,633,425號；及第5,661,016號；Marks等人,Bio/Technology 10: 779-783 (1992)；Lonberg等人,Nature 368: 856-859 (1994)；Morrison,Nature 368: 812-813 (1994)；Fishwild等人, Nature Biotechnol. 14: 845-851 (1996)；Neuberger,Nature Biotechnol. 14: 826 (1996)；及Lonberg等人,Intern. Rev. Immunol. 13: 65-93 (1995)。
本文中之單株抗體尤其包括「嵌合」抗體，其中重鏈及/或輕鏈之一部分與來源於特定物種或屬於特定抗體類別或亞類之抗體中的相應序列一致或同源，而該(等)鏈之剩餘部分與來源於另一物種或屬於另一抗體類別或亞類之抗體中的相應序列一致或同源，以及該等抗體之片段，只要其展現所需生物活性即可(參見例如美國專利第4,816,567號；及Morrison等人,Proc. Natl. Acad. Sci. USA 81:6851-6855 (1984))。嵌合抗體包括PRIMATIZED®抗體，其中抗體之抗原結合區源自藉由例如用所關注之抗原使彌猴免疫所產生的抗體。
「人源化」形式之非人類(例如，鼠科)抗體係含有源自非人類免疫球蛋白之最小序列的嵌合抗體。在一個實施例中，人源化抗體為人類免疫球蛋白(接受者抗體)，其中來自接受者之HVR的殘基經來自非人類物種(施體抗體)諸如小鼠、大鼠、兔、或具有所需特異性、親和力、及/或能力之非人類靈長類之HVR的殘基置換。在一些實施例中，人類免疫球蛋白之FR殘基經對應的非人類殘基置換。此外，人源化抗體可包含未見於接受者抗體或施體抗體中之殘基。可進行此等修飾以進一步改進抗體效能。一般而言，人源化抗體將包含至少一個且通常兩個可變域之實質上全部，其中高變環之全部或實質上全部對應於非人類免疫球蛋白之高變環，且FR之全部或實質上全部為人類免疫球蛋白序列之FR。人源化抗體視情況亦將包含免疫球蛋白恆定區(Fc)之至少一部分，通常為人免疫球蛋白之至少一部分。關於進一步細節，參見例如Jones等人,Nature 321:522-525 (1986)；Riechmann等人,Nature 332:323-329 (1988)；及Presta,Curr. Op. Struct. Biol. 2:593-596 (1992)。亦參見例如Vaswani及Hamilton, Ann. Allergy, Asthma & Immunol. 1:105-115 (1998)；Harris, Biochem. Soc. Transactions 23:1035-1038 (1995)；Hurle及Gross,Curr. Op. Biotech. 5:428-433 (1994)；及美國專利第6,982,321號及第7,087,409號。
「人類抗體」為如下抗體，其胺基酸序列對應於人類所產生抗體之胺基酸序列，及/或使用如本文所揭示之用於製備人類抗體之任何技術製備。人類抗體之此定義特定地排除了包含非人類抗原結合殘基之人源化抗體。人類抗體可使用此項技術中已知之多種技術，包括噬菌體展示文庫產生。Hoogenboom及Winter,J. Mol. Biol. , 227:381 (1991)；Marks等人,J. Mol. Biol. , 222:581 (1991)。在Cole等人,Monoclonal Antibodies and Cancer Therapy , Alan R. Liss, 第77頁 (1985)；Boerner等人, J. Immunol., 147(1):86-95 (1991)中所描述之方法亦可用於製備人類單株抗體。亦參見van Dijk及van de Winkel,Curr. Opin. Pharmacol. , 5: 368-74 (2001)。人類抗體可藉由向基因轉殖動物投與抗原來製備，該基因轉殖動物已經修飾以回應於抗原攻擊而產生此類抗體，但其內源基因座已失能，例如經免疫之xenomice (XENOMOUSE™ 技術參見例如美國專利第6,075,181號及第6,150,584號)。關於經由人類B細胞融合瘤技術生成之人類抗體，亦參見，例如Li等人,Proc. Natl. Acad. Sci. USA , 103:3557-3562 (2006)。
「物種依賴性抗體」為如下抗體，其對來自第一哺乳動物物種之抗原的結合親和力強於其對該抗原之來自第二哺乳動物物種之同源物的結合親和力。通常，物種依賴性抗體與人類抗原「特異性結合」(例如結合親和力(Kd)值不大於約1×10-7 M，較佳不大於約1×10-8 M，且較佳不大於約1×10-9 M)，但對該抗原之來自第二非人類哺乳動物物種之同源物的結合親和力比其對該人類抗原之結合親和力弱至少約50倍、或至少約500倍、或至少約1000倍。物種依賴性抗體可為如上定義之抗體之各種類型中的任一種，但較佳為人源化或人類抗體。
在本文中使用時，術語「高變區」、「HVR」或「HV」係指抗體可變域中序列高度可變及/或形成結構界定環之區。一般而言，抗體包含六個HVR：三個在VH中(H1、H2、H3)，且三個在VL中(L1、L2、L3)。在原生抗體中，H3及L3在六個HVR中展示最大多樣性，且H3尤其被認為在賦予抗體優良特異性方面起獨特作用。參見例如Xu等人,Immunity 13:37-45 (2000)；Johnson及Wu,Methods in Molecular Biology 248:1-25 (Lo編, Human Press, Totowa, N.J., 2003)。實際上，僅由重鏈組成的天然存在之駱駝抗體在不存在輕鏈之情況下係功能性及穩定的。參見例如Hamers-Casterman等人,Nature 363:446-448 (1993)；Sheriff等人,Nature Struct. Biol. 3:733-736 (1996)。
多種HVR描繪可供使用且涵蓋於本文中。Kabat互補決定區(CDR)係基於序列變異性並且為最常使用的(Kabat等人,Sequences of Proteins of Immunological Interest , 第5版 Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, Md. (1991))。替代地，Chothia提及結構環之定位(Chothia及LeskJ. Mol. Biol. 196:901-917 (1987))。AbM HVR表示Kabat HVR與Chothia結構環之間的折衷，且由Oxford Molecular的AbM抗體建模軟體使用。「contact」HVR係基於可用複雜晶體結構之分析。來自此等HVR中每一者之殘基如下所述。環 Kabat AbM             Chothia Contact L1         L24-L34      L24-L34      L26-L32      L30-L36 L2         L50-L56      L50-L56      L50-L52      L46-L55 L3         L89-L97      L89-L97      L91-L96      L89-L96 H1         H31-H35B   H26-H35B   H26-H32     H30-H35B (Kabat編號) H1         H31-H35     H26-H35     H26-H32     H30-H35 (Chothia編號) H2         H50-H65     H50-H58     H53-H55     H47-H58 H3         H95-H102   H95-H102   H96-H101   H93-H101
HVR可包含如下「延長HVR」：VL中之24-36或24-34 (L1)、46-56或50-56 (L2)、及89-97或89-96 (L3)以及VH中之26-35 (H1)、50-65或49-65 (H2)、及93-102、94-102、或95-102 (H3)。對於此等定義中之每一者，可變域殘基係根據Kabat等人(出處同上)進行編號。
「構架」或「FR」殘基為除如本文所定義之HVR殘基外的彼等可變域殘基。
術語「如Kabat中之可變域殘基編號」或「如Kabat中之胺基酸位置編號」及其變化形式係指Kabat等人(出處同上)中用於抗體編譯之重鏈可變域或輕鏈可變域的編號系統。使用此編號系統，實際線性胺基酸序列可含有較少胺基酸或其他胺基酸，這對應於可變域之FR或HVR的縮短或插入。例如，重鏈可變域可包括H2之殘基52之後之單一胺基酸插入(根據Kabat之殘基52a)及重鏈FR殘基82之後之插入殘基(例如，根據Kabat之殘基82a、82b、及82c等)。可藉由將抗體序列中具有同源性之區與「標準」Kabat編號序列比對來確定給定抗體中殘基之Kabat編號。
在涉及可變域(大致為輕鏈之殘基1-107及重鏈之殘基1-113)中之殘基時，一般使用Kabat編號系統(例如，Kabat等人，Sequences of Immunological Interest. 第5版 Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, Md. (1991))。在涉及免疫球蛋白重鏈恆定區中之殘基時，一般使用「EU編號系統」或「EU索引」(例如，在Kabat等人(出處同上)中報告之EU指數)。「如Kabat中之EU索引」係指人類IgG1 EU抗體之殘基編號。
表述「線性抗體」係指在Zapata等人(1995Protein Eng, 8(10):1057-1062)中描述之抗體。簡言之，此等抗體包含一對串聯Fd區段(VH-CH1-VH-CH1)，其與互補輕鏈多肽一起形成一對抗原結合區。線性抗體可為雙特異性或單特異性的。
如本文所用，術語「結合」、「特異性結合」、或「特異於」係指標靶與抗體之間之可量測且可重現的相互作用諸如結合，其可在存在包括生物分子之異質分子群體的情況下確定標靶之存在。例如，與標靶(其可為抗原決定基)結合或特異性結合之抗體為與其與其他標靶結合相比，與該標靶結合的親和力更大、親合力更大、更容易、及/或持續時間更長。在一個實施例中，抗體與無關標靶之結合程度小於抗體與標靶之結合之約10%，如例如藉由放射免疫檢定(RIA)所量測。在某些實施例中，特異性結合至標靶之抗體之解離常數(Kd)≤1 μM、≤100 nM、≤10 nM、≤1 nM、或≤0.1 nM。在某些實施例中，抗體特異性結合至蛋白上的在來自不同物種之蛋白之間保守的抗原決定基。在另一實施例中，特異性結合可包括但不需要排他性結合。
關於本文所鑑別之多肽序列的「胺基酸序列一致性百分比(%)」定義為在比對序列並且必要時引入間隙以達成最大序列一致性百分比，並且不考慮任何保守性取代作為序列一致性之一部分之後，候選序列中與所比較多肽中之胺基酸殘基相同的胺基酸殘基之百分比。用於達成測定百分比胺基酸序列一致性之目的的比對可以在本領域之技能內的多種方式實現，例如使用公開可得之電腦軟體，諸如BLAST、BLAST-2、ALIGN或Megalign (DNASTAR)軟體。熟習此項技術者可確定用於量測比對的適當參數，包括在所比較之序列之全長上達成最大比對所需的任何演算法。然而，出於本文目的，使用序列比較電腦程式ALIGN-2生成胺基酸序列一致性%值。該ALIGN-2序列比較電腦程式由Genentech公司創造，且源代碼已由美國版權局(U.S. Copyright Office), Washington D.C., 20559之用戶文檔歸檔，其中其登記在美國版權登記號TXU510087下。ALIGN-2程式可經由Genentech, Inc., South San Francisco, California公開獲得。ALIGN-2程式應經編譯用於UNIX操作系統(包括數位UNIX V4.0D)上。所有序列比較參數均由ALIGN-2程式設定且不變化。
在其中ALIGN-2用於胺基酸序列比較之情形中，既定胺基酸序列A相對、與或針對既定胺基酸序列B之%胺基酸序列一致性(其或者可表述為具有或包含相對、與或針對既定胺基酸序列B之某一%胺基酸序列一致性的既定胺基酸序列A)計算如下： 100×分數X/Y 其中X為在序列比對程式ALIGN-2之A與B比對中藉由該程式經評分為一致匹配之胺基酸殘基的數目，且其中Y為B中胺基酸殘基之總數。應理解，在胺基酸序列A之長度不等於胺基酸序列B之長度的情況下，A相對B之胺基酸序列一致性%將不等於B相對A之胺基酸序列一致性%。除非另外特定陳述，否則本文所用之所有胺基酸序列一致性%值均如前一段落中所述使用ALIGN-2電腦程式獲得。
除非另外規定，否則本文所述之胺基酸序列為連續胺基酸序列。
術語「包裝插頁」用於指治療產品之商業包裝中慣常包括的說明書，其含有關於適應症、用法、劑量、投與、組合療法、禁忌症、及/或有關該等治療產品的用途之警告之資訊。
術語「醫藥調配物」及「醫藥組成物」在本文中可互換使用，並且係指以下製劑，其為使活性成分之生物活性有效之形式，且不含對調配物所將投與之受試者有不可接受毒性之其他組分。此類調配物係無菌的。在一較佳實施例中，醫藥組成物或醫藥調配物係向人類受試者投與。
「無菌」醫藥調配物為滅菌的或不含或基本上不含所有活微生物及其孢子。
「醫藥學上可接受之載劑」係指醫藥調配物中除活性成分以外的對受試者無毒的成分。醫藥學上可接受之載劑包括但不限於緩衝液、賦形劑、穩定劑、或防腐劑。
如本文所用，「投與」意謂向受試者給予一定劑量之化合物(例如，PD-1軸結合拮抗劑(例如，抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)或抗PD-1抗體)及/或紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇))或組成物(例如，醫藥組成物，例如，包括PD-1軸結合拮抗劑及/或紫杉烷之醫藥組成物，其視情況亦包括額外治療劑)的方法。用於本文所述之方法中之組成物可例如玻璃體內、肌肉內、靜脈內、皮內、經皮、動脈內、腹膜內、病灶內、顱內、關節內、前列腺內、胸腔內、氣管內、鞘內、鼻內、陰道內、直腸內、局部、腫瘤內、腹腔、皮下、結膜下、囊內、黏膜、心包內、臍帶內、眼內、眶內、經口、局部、經皮、眼周、結膜、眼筋膜囊內、前房內、視網膜下、眼球後、小管內、藉由吸入、藉由注射、藉由植入、藉由輸注、藉由連續輸注、藉由直接局部灌注浸泡靶細胞、藉由導管、藉由灌洗、以乳劑形式、或以脂質組成物形式來投與。用於本文所述之方法中之組成物亦可全身性或局部地投與。投與方法可視多種因素(例如，正在投與之化合物或組成物及正在治療之病狀、疾病、或病症之嚴重程度)而變化。III. 診斷方法
本文提供用於鑑別可能對用抗癌療法之治療有反應的患有癌症(例如，乳癌)的患者的診斷方法，該抗癌療法包括PD-1軸結合拮抗劑(例如，抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)或抗PD-1抗體)及紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)。本文亦提供預測患有癌症(例如，乳癌)之患者是否可能對用抗癌療法之治療有反應的方法，該抗癌療法包括PD-1軸結合拮抗劑(例如，抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)或抗PD-1抗體)及紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)。本文進一步提供為患有癌症(例如，乳癌)之患者選擇抗癌療法的方法。在一些實施例中，該方法包括確定：本發明之至少一種生物標記物之存在或水準，該至少一種生物標記物包括PD-L1 (例如，獲自患者之腫瘤樣品中之腫瘤浸潤免疫細胞(IC)上之PD-L1表現及/或獲自患者之腫瘤樣品中之腫瘤細胞(TC)上之PD-L1表現)、CD8(例如，獲自患者之腫瘤樣品中之CD8表現)；及/或例如在獲自患者之腫瘤樣品中之基質TIL (sTIL)之存在。例如，在一些實施例中，患者呈PD-L1陽性。在一些實施例中，患者患有局部晚期或轉移性乳癌(例如，局部晚期或轉移性TNBC)。在一些實施例中，患者先前未針對局部晚期或轉移性乳癌(例如，局部晚期或轉移性TNBC)進行治療。換言之，本文提供之方法可用於從未治療之患者，例如，為患者選擇第一線療法。在一些實施例中，患者是否可能對用該抗癌療法之治療有反應係依據無進展存活來確定。在其他實施例中，患者是否可能對用該抗癌療法之治療有反應係依據總體存活來確定。
例如，本文提供一種用於鑑別可能對用抗癌療法之治療有反應的患有局部晚期或轉移性乳癌(例如，局部晚期或轉移性TNBC)之患者的方法，該抗癌療法包含(i) PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑)及(ii)紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)，該方法包括確定獲自患者之樣品(例如，腫瘤樣品)中之PD-L1之表現水準，其中患者先前未針對乳癌(例如，局部晚期或轉移性TNBC)進行治療，並且其中樣品中之PD-L1之可偵測的表現水準將患者鑑別為可能對使用抗癌療法之治療有反應。
在另一實例中，本文提供一種用於預測患有局部晚期或轉移性乳癌(例如，局部晚期或轉移性TNBC)之患者是否可能對用抗癌療法之治療有反應的方法，該抗癌療法包含(i) PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑)及(ii)紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)，該方法包括確定獲自患者之樣品(例如，腫瘤樣品)中之PD-L1之表現水準，其中患者先前未針對乳癌(例如，局部晚期或轉移性TNBC)進行治療，並且其中樣品中之PD-L1之可偵測的表現水準指示患者可能對使用抗癌療法之治療有反應。
在進一步實例中，本文提供一種用於為患有局部晚期或轉移性乳癌(例如，局部晚期或轉移性TNBC)之患者選擇抗癌療法的方法，該方法包括：(a)確定獲自患者之樣品(例如，腫瘤樣品)中之PD-L1之表現水準，其中患者先前未針對乳癌(例如，局部晚期或轉移性TNBC)進行治療；及(b)基於樣品中之PD-L1之可偵測的表現水準，為患者選擇抗癌療法，該抗癌療法包含(i) PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑)及(ii)紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)。
可使用任何合適樣品。例如，樣品可為腫瘤樣品。
在另一實例中，本文提供一種用於鑑別可能對用抗癌療法之治療有反應的患有局部晚期或轉移性乳癌(例如，局部晚期或轉移性TNBC)之患者的方法，該抗癌療法包含(i) PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑)及(ii)紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)，該方法包括確定獲自患者之腫瘤浸潤免疫細胞中之PD-L1之表現水準，其中患者先前未針對乳癌(例如，局部晚期或轉移性TNBC)進行治療，並且其中佔腫瘤樣品之約1%或更多之腫瘤浸潤免疫細胞中之PD-L1之可偵測的表現水準將患者鑑別為可能對用抗癌療法之治療有反應。
在另一實例中，本文提供一種用於預測患有局部晚期或轉移性乳癌(例如，局部晚期或轉移性TNBC)之患者是否可能對用抗癌療法之治療有反應的方法，該抗癌療法包含(i) PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑)及(ii)紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)，該方法包括確定獲自患者之腫瘤浸潤免疫細胞中之PD-L1之表現水準，其中患者先前未針對乳癌(例如，局部晚期或轉移性TNBC)進行治療，並且其中佔腫瘤樣品之約1%或更多之腫瘤浸潤免疫細胞中之PD-L1之可偵測的表現水準指示患者可能對用抗癌療法之治療有反應。
在進一步實例中，本文提供一種用於為患有局部晚期或轉移性乳癌(例如，局部晚期或轉移性TNBC)之患者選擇抗癌療法的方法，該方法包括：(a)確定獲自患者之腫瘤浸潤免疫細胞中之PD-L1之表現水準，其中患者先前未針對乳癌(例如，局部晚期或轉移性TNBC)進行治療；及(b)基於佔腫瘤樣品之約1%或更多之腫瘤浸潤免疫細胞中PD-L1之可偵測的表現水準，為患者選擇抗癌療法，該抗癌療法包含(i) PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑)及(ii)紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)。
在前述態樣中任一項之一些實施例中，局部晚期或轉移性乳癌為局部晚期或轉移性TNBC。
在一個實例中，本文提供一種用於鑑別可能對用抗癌療法之治療有反應的患有局部晚期TNBC之患者的方法，該抗癌療法包含(i) PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑)及(ii)紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)，該方法包括確定獲自患者之腫瘤浸潤免疫細胞中之PD-L1之表現水準，其中患者先前未針對局部晚期TNBC進行治療，並且其中佔腫瘤樣品之約1%或更多之腫瘤浸潤免疫細胞中之PD-L1之可偵測的表現水準將患者鑑別為可能對用抗癌療法之治療有反應。
在另一實例中，本文提供一種用於鑑別可能對用抗癌療法之治療有反應的患有轉移性TNBC之患者的方法，該抗癌療法包含(i) PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑)及(ii)紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)，該方法包括確定獲自患者之腫瘤浸潤免疫細胞中之PD-L1之表現水準，其中患者先前未針對轉移性TNBC進行治療，並且其中佔腫瘤樣品之約1%或更多之腫瘤浸潤免疫細胞中之PD-L1之可偵測的表現水準將患者鑑別為可能對用抗癌療法之治療有反應。
在另一實例中，本文提供一種用於預測患有局部晚期TNBC之患者是夠可能對用抗癌療法之治療有反應的方法，該抗癌療法包含(i) PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑)及(ii)紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)，該方法包括確定獲自患者之腫瘤浸潤免疫細胞中之PD-L1之表現水準，其中患者先前未針對局部晚期TNBC進行治療，並且其中佔腫瘤樣品之約1%或更多之腫瘤浸潤免疫細胞中之PD-L1之可偵測的表現水準指示患者可能對用抗癌療法之治療有反應。
在進一步實例中，本文提供一種用於預測患有轉移性TNBC之患者是夠可能對用抗癌療法之治療有反應的方法，該抗癌療法包含(i) PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑)及(ii)紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)，該方法包括確定獲自患者之腫瘤浸潤免疫細胞中之PD-L1之表現水準，其中患者先前未針對轉移性TNBC進行治療，並且其中佔腫瘤樣品之約1%或更多之腫瘤浸潤免疫細胞中之PD-L1之可偵測的表現水準指示患者可能對用抗癌療法之治療有反應。
在進一步實例中，本文提供一種用於為患有局部晚期TNBC之患者選擇抗癌療法的方法，該方法包括：(a)確定獲自患者之腫瘤浸潤免疫細胞中之PD-L1之表現水準，其中患者先前未針對局部晚期TNBC進行治療；及(b)基於佔腫瘤樣品之約1%或更多之腫瘤浸潤免疫細胞中PD-L1之可偵測的表現水準，為患者選擇抗癌療法，該抗癌療法包含(i) PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑)及(ii)紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)。
在進一步實例中，本文提供一種用於為患有轉移性TNBC之患者選擇抗癌療法的方法，該方法包括：(a)確定獲自患者之腫瘤浸潤免疫細胞中之PD-L1之表現水準，其中患者先前未針對轉移性TNBC進行治療；及(b)基於佔腫瘤樣品之約1%或更多之腫瘤浸潤免疫細胞中PD-L1之可偵測的表現水準，為患者選擇抗癌療法，該抗癌療法包含(i) PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑)及(ii)紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)。
在一個實例中，本文提供一種用於鑑別可能對用抗癌療法之治療有反應的患有局部晚期TNBC之患者的方法，該抗癌療法包含(i) PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑)及(ii)紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)，該方法包括確定獲自患者之腫瘤浸潤免疫細胞中之PD-L1之表現水準，其中患者先前未針對局部晚期TNBC進行治療，並且其中佔腫瘤樣品之約1%或更多之腫瘤浸潤免疫細胞中之PD-L1之可偵測的表現水準將患者鑑別為可能對用抗癌療法之治療有反應。
在另一實例中，本文提供一種用於鑑別可能對用抗癌療法之治療有反應的患有轉移性TNBC之患者的方法，該抗癌療法包含(i) PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑)及(ii)紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)，該方法包括確定獲自患者之腫瘤浸潤免疫細胞中之PD-L1之表現水準，其中患者先前未針對轉移性TNBC進行治療，並且其中佔腫瘤樣品之約1%或更多之腫瘤浸潤免疫細胞中之PD-L1之可偵測的表現水準將患者鑑別為可能對用抗癌療法之治療有反應。
在另一實例中，本文提供一種用於預測患有局部晚期TNBC之患者是夠可能對用抗癌療法之治療有反應的方法，該抗癌療法包含(i) PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑)及(ii)紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)，該方法包括確定獲自患者之腫瘤浸潤免疫細胞中之PD-L1之表現水準，其中患者先前未針對局部晚期TNBC進行治療，並且其中佔腫瘤樣品之約1%或更多之腫瘤浸潤免疫細胞中之PD-L1之可偵測的表現水準指示患者可能對用抗癌療法之治療有反應。
在進一步實例中，本文提供一種用於預測患有轉移性TNBC之患者是夠可能對用抗癌療法之治療有反應的方法，該抗癌療法包含(i) PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑)及(ii)紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)，該方法包括確定獲自患者之腫瘤浸潤免疫細胞中之PD-L1之表現水準，其中患者先前未針對轉移性TNBC進行治療，並且其中佔腫瘤樣品之約1%或更多之腫瘤浸潤免疫細胞中之PD-L1之可偵測的表現水準指示患者可能對用抗癌療法之治療有反應。
在進一步實例中，本文提供一種用於為患有局部晚期TNBC之患者選擇抗癌療法的方法，該方法包括：(a)確定獲自患者之腫瘤浸潤免疫細胞中之PD-L1之表現水準，其中患者先前未針對局部晚期TNBC進行治療；及(b)基於佔腫瘤樣品之約1%或更多之腫瘤浸潤免疫細胞中PD-L1之可偵測的表現水準，為患者選擇抗癌療法，該抗癌療法包含(i) PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑)及(ii)紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)。
在進一步實例中，本文提供一種用於為患有轉移性TNBC之患者選擇抗癌療法的方法，該方法包括：(a)確定獲自患者之腫瘤浸潤免疫細胞中之PD-L1之表現水準，其中患者先前未針對轉移性TNBC進行治療；及(b)基於佔腫瘤樣品之約1%或更多之腫瘤浸潤免疫細胞中PD-L1之可偵測的表現水準，為患者選擇抗癌療法，該抗癌療法包含(i) PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑)及(ii)紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)。
在一個實例中，本文提供一種用於鑑別可能對用抗癌療法之治療有反應的患有局部晚期TNBC之患者的方法，該抗癌療法包含阿特珠單抗及nab-太平洋紫杉醇，該方法包括確定獲自患者之腫瘤浸潤免疫細胞中之PD-L1之表現水準，其中患者先前未針對局部晚期TNBC進行治療，並且其中佔腫瘤樣品之約1%或更多之腫瘤浸潤免疫細胞中之PD-L1之可偵測的表現水準將患者鑑別為可能對用抗癌療法之治療有反應。
在另一實例中，本文提供一種用於鑑別可能對用抗癌療法之治療有反應的患有轉移性TNBC之患者的方法，該抗癌療法包含有包含阿特珠單抗及nab-太平洋紫杉醇之抗癌療法，該方法包括確定獲自患者之腫瘤浸潤免疫細胞中之PD-L1之表現水準，其中患者先前未針對轉移性TNBC進行治療，並且其中佔腫瘤樣品之約1%或更多之腫瘤浸潤免疫細胞中之PD-L1之可偵測的表現水準將患者鑑別為可能對用抗癌療法之治療有反應。
在另一實例中，本文提供一種用於預測患有局部晚期TNBC之患者是否可能對用抗癌療法之治療有反應的方法，該抗癌療法包含阿特珠單抗及nab-太平洋紫杉醇，該方法包括確定獲自患者之腫瘤浸潤免疫細胞中之PD-L1之表現水準，其中患者先前未針對局部晚期TNBC進行治療，並且其中佔腫瘤樣品之約1%或更多之腫瘤浸潤免疫細胞中之PD-L1之可偵測的表現水準指示患者可能對用抗癌療法之治療有反應。
在進一步實例中，本文提供一種用於預測患有轉移性TNBC之患者是否可能對用抗癌療法之治療有反應的方法，該抗癌療法包含阿特珠單抗及nab-太平洋紫杉醇，該方法包括確定獲自患者之腫瘤浸潤免疫細胞中之PD-L1之表現水準，其中患者先前未針對轉移性TNBC進行治療，並且其中佔腫瘤樣品之約1%或更多之腫瘤浸潤免疫細胞中之PD-L1之可偵測的表現水準指示患者可能對用抗癌療法之治療有反應。
在進一步實例中，本文提供一種用於為患有局部晚期TNBC之患者選擇抗癌療法的方法，該方法包括：(a)確定獲自患者之腫瘤浸潤免疫細胞中之PD-L1之表現水準，其中患者先前未針對局部晚期TNBC進行治療；及(b)基於佔腫瘤樣品之約1%或更多之腫瘤浸潤免疫細胞中PD-L1之可偵測的表現水準，為患者選擇抗癌療法，該抗癌療法包含阿特珠單抗及nab-太平洋紫杉醇。
在進一步實例中，本文提供一種用於為患有轉移性TNBC之患者選擇抗癌療法的方法，該方法包括：(a)確定獲自患者之腫瘤浸潤免疫細胞中之PD-L1之表現水準，其中患者先前未針對轉移性TNBC進行治療；及(b)基於佔腫瘤樣品之約1%或更多之腫瘤浸潤免疫細胞中PD-L1之可偵測的表現水準，為患者選擇抗癌療法，該抗癌療法包含阿特珠單抗及nab-太平洋紫杉醇。
在一個實例中，本文提供一種用於鑑別可能對用抗癌療法之治療有反應的患有局部晚期TNBC之患者的方法，該抗癌療法包含阿特珠單抗及太平洋紫杉醇，該方法包括確定獲自患者之腫瘤浸潤免疫細胞中之PD-L1之表現水準，其中患者先前未針對局部晚期TNBC進行治療，並且其中佔腫瘤樣品之約1%或更多之腫瘤浸潤免疫細胞中之PD-L1之可偵測的表現水準將患者鑑別為可能對用抗癌療法之治療有反應。
在另一實例中，本文提供一種用於鑑別可能對用抗癌療法之治療有反應的患有轉移性TNBC之患者的方法，該抗癌療法包含有包含阿特珠單抗及太平洋紫杉醇之抗癌療法，該方法包括確定獲自患者之腫瘤浸潤免疫細胞中之PD-L1之表現水準，其中患者先前未針對轉移性TNBC進行治療，並且其中佔腫瘤樣品之約1%或更多之腫瘤浸潤免疫細胞中之PD-L1之可偵測的表現水準將患者鑑別為可能對用抗癌療法之治療有反應。
在另一實例中，本文提供一種用於預測患有局部晚期TNBC之患者是否可能對用抗癌療法之治療有反應的方法，該抗癌療法包含阿特珠單抗及太平洋紫杉醇，該方法包括確定獲自患者之腫瘤浸潤免疫細胞中之PD-L1之表現水準，其中患者先前未針對局部晚期TNBC進行治療，並且其中佔腫瘤樣品之約1%或更多之腫瘤浸潤免疫細胞中之PD-L1之可偵測的表現水準指示患者可能對用抗癌療法之治療有反應。
在進一步實例中，本文提供一種用於預測患有轉移性TNBC之患者是否可能對用抗癌療法之治療有反應的方法，該抗癌療法包含阿特珠單抗及太平洋紫杉醇，該方法包括確定獲自患者之腫瘤浸潤免疫細胞中之PD-L1之表現水準，其中患者先前未針對轉移性TNBC進行治療，並且其中佔腫瘤樣品之約1%或更多之腫瘤浸潤免疫細胞中之PD-L1之可偵測的表現水準指示患者可能對用抗癌療法之治療有反應。
在進一步實例中，本文提供一種用於為患有局部晚期TNBC之患者選擇抗癌療法的方法，該方法包括：(a)確定獲自患者之腫瘤浸潤免疫細胞中之PD-L1之表現水準，其中患者先前未針對局部晚期TNBC進行治療；及(b)基於佔腫瘤樣品之約1%或更多之腫瘤浸潤免疫細胞中PD-L1之可偵測的表現水準，為患者選擇抗癌療法，該抗癌療法包含阿特珠單抗及太平洋紫杉醇。
在進一步實例中，本文提供一種用於為患有轉移性TNBC之患者選擇抗癌療法的方法，該方法包括：(a)確定獲自患者之腫瘤浸潤免疫細胞中之PD-L1之表現水準，其中患者先前未針對轉移性TNBC進行治療；及(b)基於佔腫瘤樣品之約1%或更多之腫瘤浸潤免疫細胞中PD-L1之可偵測的表現水準，為患者選擇抗癌療法，該抗癌療法包含阿特珠單抗及太平洋紫杉醇。
在前述方法中任一者之一些實施例中，已確定獲自患者之腫瘤樣品在佔腫瘤樣品之約1%或更多(例如，約1%或更多、2%或更多、3%或更多、5%或更多、6%或更多、7%或更多、8%或更多、9%或更多、10%或更多、11%或更多、12%或更多、13%或更多、14%或更多、15%或更多、16%或更多、17%或更多、18%或更多、19%或更多、20%或更多、21%或更多、22%或更多、23%或更多、24%或更多、25%或更多、26%或更多、27%或更多、28%或更多、29%或更多、30%或更多、31%或更多、32%或更多、33%或更多、34%或更多、35%或更多、36%或更多、37%或更多、38%或更多、39%或更多、40%或更多、41%或更多、42%或更多、43%或更多、44%或更多、45%或更多、46%或更多、47%或更多、48%或更多、49%或更多、約50%或更多、約60%或更多、約70%或更多、約80%或更多、約90%或更多、約95%或更多、約96%或更多、約97%或更多、約98%或更多、約99%或更多、或100%)之腫瘤浸潤免疫細胞中具有PD-L1之可偵測的表現水準。例如，在一些實施例中，已確定獲自患者之腫瘤樣品在佔腫瘤樣品之約1%至少於約5% (例如，1%至4.9%、1%至4.5%、1%至4%、1%至3.5%、1%至3%、1%至2.5%、或1%至2%)之腫瘤浸潤免疫細胞中具有PD-L1之可偵測的表現水準。
在前述方法中任一者之一些實施例中，已確定獲自患者之腫瘤樣品在佔腫瘤樣品中之約1%或更多(例如，約1%或更多、2%或更多、3%或更多、5%或更多、6%或更多、7%或更多、8%或更多、9%或更多、10%或更多、11%或更多、12%或更多、13%或更多、14%或更多、15%或更多、16%或更多、17%或更多、18%或更多、19%或更多、20%或更多、21%或更多、22%或更多、23%或更多、24%或更多、25%或更多、26%或更多、27%或更多、28%或更多、29%或更多、30%或更多、31%或更多、32%或更多、33%或更多、34%或更多、35%或更多、36%或更多、37%或更多、38%或更多、39%或更多、40%或更多、41%或更多、42%或更多、43%或更多、44%或更多、45%或更多、46%或更多、47%或更多、48%或更多、49%或更多、約50%或更多、約60%或更多、約70%或更多、約80%或更多、約90%或更多、約95%或更多、約96%或更多、約97%或更多、約98%或更多、約99%或更多、或100%)的腫瘤浸潤免疫細胞中具有PD-L1之可偵測的表現水準。例如，在一些實施例中，已確定獲自患者之腫瘤樣品在佔腫瘤樣品中之約1%至少於約5% (例如，1%至4.9%、1%至4.5%、1%至4%、1%至3.5%、1%至3%、1%至2.5%、或1%至2%)的腫瘤浸潤免疫細胞中具有PD-L1之可偵測的表現水準。
在其他實施例中，已確定獲自患者之腫瘤樣品在佔腫瘤樣品之約5%或更多之腫瘤浸潤免疫細胞中具有PD-L1之可偵測的表現水準。例如，在一些實施例中，已確定獲自患者之腫瘤樣品在佔腫瘤樣品之約5%至少於約10% (例如，5%至9.5%、5%至9%、5%至8.5%、5%至8%、5%至7.5%、5%至7%、5%至6.5%、5%至6%、5%至5.5%、6%至9.5%、6%至9%、6%至8.5%、6%至8%、6%至7.5%、6%至7%、6%至6.5%、7%至9.5%、7%至9%、7%至7.5%、8%至9.5%、8%至9%、或8%至8.5%)之腫瘤浸潤免疫細胞中具有PD-L1之可偵測的表現水準。
在其他實施例中，已確定獲自患者之腫瘤樣品在腫瘤樣品中之約5%或更多之腫瘤浸潤免疫細胞中具有PD-L1之可偵測的表現水準。例如，在一些實施例中，已確定獲自患者之腫瘤樣品在腫瘤樣品中之約5%至少於約10% (例如，5%至9.5%、5%至9%、5%至8.5%、5%至8%、5%至7.5%、5%至7%、5%至6.5%、5%至6%、5%至5.5%、6%至9.5%、6%至9%、6%至8.5%、6%至8%、6%至7.5%、6%至7%、6%至6.5%、7%至9.5%、7%至9%、7%至7.5%、8%至9.5%、8%至9%、或8%至8.5%)之腫瘤浸潤免疫細胞中具有PD-L1之可偵測的表現水準。
在仍進一步實施例中，已確定獲自患者之腫瘤樣品在佔腫瘤樣品中之約10%或更多(例如，10%或更多、11%或更多、12%或更多、13%或更多、14%或更多、15%或更多、16%或更多、17%或更多、18%或更多、19%或更多、20%或更多、21%或更多、22%或更多、23%或更多、24%或更多、25%或更多、26%或更多、27%或更多、28%或更多、29%或更多、30%或更多、31%或更多、32%或更多、33%或更多、34%或更多、35%或更多、36%或更多、37%或更多、38%或更多、39%或更多、40%或更多、41%或更多、42%或更多、43%或更多、44%或更多、45%或更多、46%或更多、47%或更多、48%或更多、49%或更多、50%或更多、60%或更多、70%或更多、80%或更多、90%或更多、95%或更多、96%或更多、97%或更多、98%或更多、99%或更多、或100%)之腫瘤浸潤免疫細胞中具有PD-L1之可偵測的表現水準。
在仍進一步實施例中，已確定獲自患者之腫瘤樣品在腫瘤樣品中之約10%或更多(例如，10%或更多、11%或更多、12%或更多、13%或更多、14%或更多、15%或更多、16%或更多、17%或更多、18%或更多、19%或更多、20%或更多、21%或更多、22%或更多、23%或更多、24%或更多、25%或更多、26%或更多、27%或更多、28%或更多、29%或更多、30%或更多、31%或更多、32%或更多、33%或更多、34%或更多、35%或更多、36%或更多、37%或更多、38%或更多、39%或更多、40%或更多、41%或更多、42%或更多、43%或更多、44%或更多、45%或更多、46%或更多、47%或更多、48%或更多、49%或更多、50%或更多、60%或更多、70%或更多、80%或更多、90%或更多、95%或更多、96%或更多、97%或更多、98%或更多、99%或更多、或100%)之腫瘤浸潤免疫細胞中具有PD-L1之可偵測的表現水準。
在其他實施例中，已確定獲自患者之腫瘤樣品在腫瘤樣品中之約50%或更多(例如，約50%或更多、51%或更多、52%或更多、53%或更多、54%或更多、55%或更多、56%或更多、57%或更多、58%或更多、59%或更多、60%或更多、61%或更多、62%或更多、63%或更多、64%或更多、65%或更多、66%或更多、67%或更多、68%或更多、69%或更多、70%或更多、71%或更多、72%或更多、73%或更多、74%或更多、75%或更多、76%或更多、77%或更多、78%或更多、79%或更多、80%或更多、81%或更多、82%或更多、83%或更多、84%或更多、85%或更多、86%或更多、87%或更多、88%或更多、89%或更多、90%或更多、91%或更多、92%或更多、93%或更多、94%或更多、95%或更多、96%或更多、97%或更多、98%或更多、或99%或更多)之腫瘤細胞中具有PD-L1之可偵測的表現水準及/或在佔腫瘤樣品中之約10%或更多(例如，10%或更多、11%或更多、12%或更多、13%或更多、14%或更多、15%或更多、16%或更多、17%或更多、18%或更多、19%或更多、20%或更多、21%或更多、22%或更多、23%或更多、24%或更多、25%或更多、26%或更多、27%或更多、28%或更多、29%或更多、30%或更多、31%或更多、32%或更多、33%或更多、34%或更多、35%或更多、36%或更多、37%或更多、38%或更多、39%或更多、40%或更多、41%或更多、42%或更多、43%或更多、44%或更多、45%或更多、46%或更多、47%或更多、48%或更多、49%或更多、50%或更多、60%或更多、70%或更多、80%或更多、90%或更多、95%或更多、96%或更多、97%或更多、98%或更多、99%或更多、或100%)之腫瘤浸潤免疫細胞中具有PD-L1之可偵測的表現水準。
應瞭解在前述方法中任一者中，腫瘤浸潤免疫細胞佔腫瘤樣品之百分比可按照獲自患者之腫瘤樣品之切片中腫瘤浸潤免疫細胞所覆蓋之腫瘤面積之百分比，例如，如藉由使用抗PD-L1抗體(例如，SP142抗體)之IHC所評估。參見例如實例3 (例如，表5)。
在另一實例中，本文提供一種用於鑑別可能對用抗癌療法之治療有反應的患有局部晚期或轉移性乳癌(例如，局部晚期或轉移性TNBC)之患者的方法，該抗癌療法包含(i) PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑)及(ii)紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)，該方法包括確定獲自患者之腫瘤樣品之腫瘤細胞中PD-L1之表現水準，其中患者先前未針對乳癌(例如，局部晚期或轉移性TNBC)進行治療，並且其中腫瘤樣品中約1%或更多之腫瘤細胞中之PD-L1之可偵測的表現水準將患者鑑別為可能對用抗癌療法之治療有反應。
在仍另一個實例中，本文提供一種用於預測患有局部晚期或轉移性乳癌(例如，局部晚期或轉移性TNBC)之患者是否可能對用抗癌療法之治療有反應的方法，該抗癌療法包含(i) PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑)及(ii)紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)，該方法包含測定自患者獲得之腫瘤樣品之腫瘤細胞中PD-L1的表現水準，其中患者先前未針對乳癌(例如，局部晚期或轉移性TNBC)來進行治療，並且其中腫瘤樣品中之約1%或更多之腫瘤細胞中之PD-L1之可偵測的表現水準指示患者可能對用抗癌療法之治療有反應。
在進一步實例中，本文提供一種用於為患有局部晚期或轉移性乳癌(例如，局部晚期或轉移性TNBC)之患者選擇抗癌療法的方法，該方法包括：(a)確定獲自患者之腫瘤樣品之腫瘤細胞中PD-L1之表現水準，其中患者先前未針對乳癌(例如，局部晚期或轉移性TNBC)進行治療；及(b)基於腫瘤樣品中約1%或更多之腫瘤細胞中PD-L1之可偵測的表現水準，為患者選擇抗癌療法，該抗癌療法包含(i) PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑)及(ii)紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)。
在前述態樣中任一項之一些實施例中，局部晚期或轉移性乳癌為局部晚期或轉移性TNBC。
在一個實例中，本文提供一種用於鑑別可能對用抗癌療法之治療有反應的患有局部晚期TNBC之患者的方法，該抗癌療法包含(i) PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑)及(ii)紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)，該方法包括確定獲自患者之腫瘤樣品之腫瘤細胞中PD-L1之表現水準，其中患者先前未針對局部晚期TNBC進行治療，並且其中腫瘤樣品之約1%或更多之腫瘤細胞中PD-L1之可偵測的表現水準將患者鑑別為可能對用抗癌療法之治療有反應。
在另一實例中，本文提供一種用於鑑別可能對用抗癌療法之治療有反應的患有轉移性TNBC之患者的方法，該抗癌療法包含(i) PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑)及(ii)紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)，該方法包括確定獲自患者之腫瘤樣品之腫瘤細胞中PD-L1之表現水準，其中患者先前未針對轉移性TNBC進行治療，並且其中腫瘤樣品之約1%或更多之腫瘤細胞中PD-L1之可偵測的表現水準將患者鑑別為可能對用抗癌療法之治療有反應。
在仍另一實例中，本文提供一種用於預測患有局部晚期TNBC之患者是否可能對用抗癌療法之治療有反應的方法，該抗癌療法包含(i) PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑)及(ii)紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)，該方法包括確定獲自患者之腫瘤樣品之腫瘤細胞中PD-L1之表現水準，其中患者先前未針對局部晚期TNBC進行治療，並且其中腫瘤樣品之約1%或更多之腫瘤細胞中PD-L1之可偵測的表現水準指示該患者可能對用抗癌療法之治療有反應。
在進一步實例中，本文提供一種用於預測患有轉移性TNBC之患者是否可能對用抗癌療法之治療有反應的方法，該抗癌療法包含(i) PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑)及(ii)紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)，該方法包括確定獲自患者之腫瘤樣品之腫瘤細胞中PD-L1之表現水準，其中患者先前未針對轉移性TNBC進行治療，並且其中腫瘤樣品之約1%或更多之腫瘤細胞中PD-L1之可偵測的表現水準指示該患者可能對用抗癌療法之治療有反應。
在進一步實例中，本文提供一種用於為患有局部晚期TNBC之患者選擇抗癌療法的方法，該方法包括：(a)確定獲自患者之腫瘤樣品之腫瘤細胞中PD-L1之表現水準，其中患者先前未針對局部晚期TNBC進行治療；及(b)基於腫瘤樣品之約1%或更多之腫瘤細胞中PD-L1之可偵測的表現水準，為患者選擇抗癌療法，該抗癌療法包含(i) PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑)及(ii)紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)。
在仍進一步實例中，本文提供一種用於為患有轉移性TNBC之患者選擇抗癌療法的方法，該方法包括：(a)確定獲自患者之腫瘤樣品之腫瘤細胞中PD-L1之表現水準，其中患者先前未針對轉移性TNBC進行治療；及(b)基於腫瘤樣品之約1%或更多之腫瘤細胞中PD-L1之可偵測的表現水準，為患者選擇抗癌療法，該抗癌療法包含(i) PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑)及(ii)紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)。
在一個實例中，本文提供一種用於鑑別可能對用抗癌療法之治療有反應的患有局部晚期TNBC之患者的方法，該抗癌療法包含阿特珠單抗及nab-太平洋紫杉醇，該方法包括確定獲自患者之腫瘤樣品之腫瘤細胞中PD-L1之表現水準，其中患者先前未針對局部晚期TNBC進行治療，並且其中腫瘤樣品之約1%或更多之腫瘤細胞中PD-L1之可偵測的表現水準將患者鑑別為可能對使用抗癌療法之治療有反應。
在另一實例中，本文提供一種用於鑑別可能對用抗癌療法之治療有反應的患有轉移性TNBC之患者的方法，該抗癌療法包含阿特珠單抗及nab-太平洋紫杉醇，該方法包括確定獲自患者之腫瘤樣品之腫瘤細胞中PD-L1之表現水準，其中患者先前未針對轉移性TNBC進行治療，並且其中腫瘤樣品之約1%或更多之腫瘤細胞中PD-L1之可偵測的表現水準將患者鑑別為可能對使用抗癌療法之治療有反應。
在另一實例中，本文提供一種用於預測患有局部晚期TNBC之患者是否可能對用抗癌療法之治療有反應的方法，該抗癌療法包含阿特珠單抗及nab-太平洋紫杉醇，該方法包括確定獲自患者之腫瘤樣品之腫瘤細胞中PD-L1之表現水準，其中患者先前未針對局部晚期TNBC進行治療，並且其中腫瘤樣品之約1%或更多之腫瘤細胞中PD-L1之可偵測的表現水準指示患者可能對使用抗癌療法之治療有反應。
在進一步實例中，本文提供一種用於預測患有轉移性TNBC之患者是否可能對用抗癌療法之治療有反應的方法，該抗癌療法包含阿特珠單抗及nab-太平洋紫杉醇，該方法包括確定獲自患者之腫瘤樣品之腫瘤細胞中PD-L1之表現水準，其中患者先前未針對轉移性TNBC進行治療，並且其中腫瘤樣品之約1%或更多之腫瘤細胞中PD-L1之可偵測的表現水準指示患者可能對使用抗癌療法之治療有反應。
在進一步實例中，本文提供一種用於為患有局部晚期TNBC之患者選擇抗癌療法的方法，該方法包括：(a)確定獲自患者之腫瘤樣品之腫瘤細胞中PD-L1之表現水準，其中患者先前未針對局部晚期TNBC進行治療；及(b)基於腫瘤樣品之約1%或更多之腫瘤細胞中PD-L1之可偵測的表現水準，為患者選擇抗癌療法，該抗癌療法包含阿特珠單抗及nab-太平洋紫杉醇。
在進一步實例中，本文提供一種用於為患有轉移性TNBC之患者選擇抗癌療法的方法，該方法包括：(a)確定獲自患者之腫瘤樣品之腫瘤細胞中PD-L1之表現水準，其中患者先前未針對轉移性TNBC進行治療；及(b)基於腫瘤樣品之約1%或更多之腫瘤細胞中PD-L1之可偵測的表現水準，為患者選擇抗癌療法，該抗癌療法包含阿特珠單抗及nab-太平洋紫杉醇。
在一個實例中，本文提供一種用於鑑別可能對用抗癌療法之治療有反應的患有局部晚期TNBC之患者的方法，該抗癌療法包含阿特珠單抗及太平洋紫杉醇，該方法包括確定獲自患者之腫瘤樣品之腫瘤細胞中PD-L1之表現水準，其中患者先前未針對局部晚期TNBC進行治療，並且其中腫瘤樣品之約1%或更多之腫瘤細胞中PD-L1之可偵測的表現水準將患者鑑別為可能對使用抗癌療法之治療有反應。
在另一實例中，本文提供一種用於鑑別可能對用抗癌療法之治療有反應的患有轉移性TNBC之患者的方法，該抗癌療法包含阿特珠單抗及太平洋紫杉醇，該方法包括確定獲自患者之腫瘤樣品之腫瘤細胞中PD-L1之表現水準，其中患者先前未針對轉移性TNBC進行治療，並且其中腫瘤樣品之約1%或更多之腫瘤細胞中PD-L1之可偵測的表現水準將患者鑑別為可能對使用抗癌療法之治療有反應。
在另一實例中，本文提供一種用於預測患有局部晚期TNBC之患者是否可能對用抗癌療法之治療有反應的方法，該抗癌療法包含阿特珠單抗及太平洋紫杉醇，該方法包括確定獲自患者之腫瘤樣品之腫瘤細胞中PD-L1之表現水準，其中患者先前未針對局部晚期TNBC進行治療，並且其中腫瘤樣品之約1%或更多之腫瘤細胞中PD-L1之可偵測的表現水準指示患者可能對使用抗癌療法之治療有反應。
在進一步實例中，本文提供一種用於預測患有轉移性TNBC之患者是否可能對用抗癌療法之治療有反應的方法，該抗癌療法包含阿特珠單抗及太平洋紫杉醇，該方法包括確定獲自患者之腫瘤樣品之腫瘤細胞中PD-L1之表現水準，其中患者先前未針對轉移性TNBC進行治療，並且其中腫瘤樣品之約1%或更多之腫瘤細胞中PD-L1之可偵測的表現水準指示患者可能對使用抗癌療法之治療有反應。
在進一步實例中，本文提供一種用於為患有局部晚期TNBC之患者選擇抗癌療法的方法，該方法包括：(a)確定獲自患者之腫瘤樣品之腫瘤細胞中PD-L1之表現水準，其中患者先前未針對局部晚期TNBC進行治療；及(b)基於腫瘤樣品之約1%或更多之腫瘤細胞中PD-L1之可偵測的表現水準，為患者選擇抗癌療法，該抗癌療法包含阿特珠單抗及太平洋紫杉醇。
在進一步實例中，本文提供一種用於為患有轉移性TNBC之患者選擇抗癌療法的方法，該方法包括：(a)確定獲自患者之腫瘤樣品之腫瘤細胞中PD-L1之表現水準，其中患者先前未針對轉移性TNBC進行治療；及(b)基於腫瘤樣品之約1%或更多之腫瘤細胞中PD-L1之可偵測的表現水準，為患者選擇抗癌療法，該抗癌療法包含阿特珠單抗及太平洋紫杉醇。
在前述方法中任一者之一些實施例中，已確定獲自患者之腫瘤樣品在腫瘤樣品中約1%或更多(例如，約1%或更多、2%或更多、3%或更多、5%或更多、6%或更多、7%或更多、8%或更多、9%或更多、10%或更多、11%或更多、12%或更多、13%或更多、14%或更多、15%或更多、16%或更多、17%或更多、18%或更多、19%或更多、20%或更多、21%或更多、22%或更多、23%或更多、24%或更多、25%或更多、26%或更多、27%或更多、28%或更多、29%或更多、30%或更多、31%或更多、32%或更多、33%或更多、34%或更多、35%或更多、36%或更多、37%或更多、38%或更多、39%或更多、40%或更多、41%或更多、42%或更多、43%或更多、44%或更多、45%或更多、46%或更多、47%或更多、48%或更多、49%或更多、50%或更多、51%或更多、52%或更多、53%或更多、54%或更多、55%或更多、56%或更多、57%或更多、58%或更多、59%或更多、60%或更多、61%或更多、62%或更多、63%或更多、64%或更多、65%或更多、66%或更多、67%或更多、68%或更多、69%或更多、70%或更多、71%或更多、72%或更多、73%或更多、74%或更多、75%或更多、76%或更多、77%或更多、78%或更多、79%或更多、80%或更多、81%或更多、82%或更多、83%或更多、84%或更多、85%或更多、86%或更多、87%或更多、88%或更多、89%或更多、90%或更多、91%或更多、92%或更多、93%或更多、94%或更多、95%或更多、96%或更多、97%或更多、98%或更多、或99%或更多)之腫瘤細胞中具有PD-L1之可偵測的表現水準。例如，在一些實施例中，已確定獲自患者之腫瘤樣品在佔腫瘤樣品中之約1%至少於約5% (例如，1%至4.9%、1%至4.5%、1%至4%、1%至3.5%、1%至3%、1%至2.5%、或1%至2%)的腫瘤細胞中具有PD-L1之可偵測的表現水準。在其他實施例中，已確定獲自患者之腫瘤樣品在腫瘤樣品中低於約1%的腫瘤細胞中具有PD-L1之可偵測的表現水準。
在其他實施例中，已確定獲自患者之腫瘤樣品在腫瘤樣品中之約5%或更多之腫瘤細胞中具有PD-L1之可偵測的表現水準。例如，在一些實施例中，已確定獲自患者之腫瘤樣品在腫瘤樣品中約5%至少於50% (例如，5%至49.5%、5%至45%、5%至40%、5%至35%、5%至30%、5%至25%、5%至20%、5%至15%、5%至10%、5%至9%、5%至8%、5%至7%、5%至6%、10%至49.5%、10%至40%、10%至35%、10%至30%、10%至25%、10%至20%、10%至15%、15%至49.5%、15%至45%、15%至40%、15%至35%、15%至30%、15%至30%、15%至25%、15%至20%、20%至49.5%、20%至45%、20%至40%、20%至35%、20%至30%、20%至25%、25%至49.5%、25%至45%、25%至40%、25%至35%、25%至30%、30%至49.5%、30%至45%、30%至40%、30%至35%、35%至49.5%、35%至45%、35%至40%、40%至49.5%、40%至45%、或45%至49.5%)之腫瘤細胞中具有PD-L1之可偵測的表現水準。
在其他實施例中，已確定獲自患者之腫瘤樣品在腫瘤樣品中約50%或更多(例如，約50%或更多、51%或更多、52%或更多、53%或更多、54%或更多、55%或更多、56%或更多、57%或更多、58%或更多、59%或更多、60%或更多、61%或更多、62%或更多、63%或更多、64%或更多、65%或更多、66%或更多、67%或更多、68%或更多、69%或更多、70%或更多、71%或更多、72%或更多、73%或更多、74%或更多、75%或更多、76%或更多、77%或更多、78%或更多、79%或更多、80%或更多、81%或更多、82%或更多、83%或更多、84%或更多、85%或更多、86%或更多、87%或更多、88%或更多、89%或更多、90%或更多、91%或更多、92%或更多、93%或更多、94%或更多、95%或更多、96%或更多、97%或更多、98%或更多、或99%或更多)之腫瘤細胞中具有PD-L1之可偵測的表現水準。在一些實施例中，已確定獲自患者之腫瘤樣品在腫瘤樣品中約50%至約99% (例如，50%至99%、50%至95%、50%至90%、50%至85%、50%至80%、50%至75%、50%至70%、50%至65%、50%至60%、50%至55%、55%至99%、55%至95%、55%至90%、55%至85%、55%至80%、55%至75%、55%至70%、55%至65%、55%至60%、60%至99%、60%至95%、60%至90%、60%至85%、60%至80%、60%至75%、60%至70%、60%至65%、65%至99%、65%至95%、65%至90%、65%至85%、65%至80%、65%至75%、65%至70%、70%至99%、70%至95%、70%至90%、70%至85%、70%至80%、70%至75%、75%至99%、75%至95%、75%至90%、75%至85%、75%至80%、80%至99%、80%至95%、80%至90%、80%至85%、85%至99%、85%至95%、85%至90%、90%至99%、或90%至95%)之腫瘤細胞中具有PD-L1之可偵測的表現水準。
在另一實例中，本文提供一種用於鑑別可能對用抗癌療法之治療有反應的患有局部晚期或轉移性乳癌(例如，局部晚期或轉移性TNBC)之患者的方法，該抗癌療法包含(i) PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑)及(ii)紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)，該方法包括確定獲自患者之腫瘤樣品之腫瘤浸潤免疫細胞中CD8之表現水準，其中患者先前未針對乳癌(例如，局部晚期或轉移性TNBC)進行治療，並且其中佔腫瘤樣品之約0.5%或更多(例如，約0.5%或更多、約0.75%或更多、約1%或更多、約1.25%或更多、約1.35%或更多、約1.5%或更多、約2%或更多、約2.25%或更多、約2.5%或更多、約2.75%或更多、約3%或更多、約3.25%或更多、約3.5%或更多、約3.75%或更多、約4%或更多、約4.25%或更多、約4.5%或更多、約4.75%或更多、或約5%或更多)的腫瘤浸潤免疫細胞中CD8之可偵測的表現水準將患者鑑別為可能對使用抗癌療法之治療有反應。
在另一實例中，本文提供一種用於預測患有局部晚期或轉移性乳癌(例如，局部晚期或轉移性TNBC)之患者是否可能對用抗癌療法之治療有反應的方法，該抗癌療法包含(i) PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑)及(ii)紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)，該方法包括確定獲自患者之腫瘤樣品之腫瘤浸潤免疫細胞中CD8之表現水準，其中患者先前未針對乳癌(例如，局部晚期或轉移性TNBC)進行治療，並且其中佔腫瘤樣品之約0.5%或更多(例如，約0.5%或更多、約0.75%或更多、約1%或更多、約1.25%或更多、約1.35%或更多、約1.5%或更多、約2%或更多、約2.25%或更多、約2.5%或更多、約2.75%或更多、約3%或更多、約3.25%或更多、約3.5%或更多、約3.75%或更多、約4%或更多、約4.25%或更多、約4.5%或更多、約4.75%或更多、或約5%或更多)的腫瘤浸潤免疫細胞中CD8之可偵測的表現水準指示患者可能對使用抗癌療法之治療有反應。
在進一步實例中，本文提供一種用於為患有局部晚期或轉移性乳癌(例如，局部晚期或轉移性TNBC)之患者選擇抗癌療法的方法，該方法包括：(a)確定獲自患者之腫瘤樣品之腫瘤浸潤免疫細胞中CD8之表現水準，其中患者先前未針對乳癌(例如，局部晚期或轉移性TNBC)進行治療；及(b)基於佔腫瘤樣品之約0.5%或更多(例如，約0.5%或更多、約0.75%或更多、約1%或更多、約1.25%或更多、約1.35%或更多、約1.5%或更多、約2%或更多、約2.25%或更多、約2.5%或更多、約2.75%或更多、約3%或更多、約3.25%或更多、約3.5%或更多、約3.75%或更多、約4%或更多、約4.25%或更多、約4.5%或更多、約4.75%或更多、或約5%或更多)的腫瘤浸潤免疫細胞中CD8之可偵測的表現水準，為患者選擇抗癌療法，該抗癌療法包含(i) PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑)及(ii)紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)。
本文所述之任何方法均可包括確定PD-L1、CD8、及sTIL中二或更多者之存在及/或表現水準。例如，在一些實施例中，該方法包括確定PD-L1及CD8之存在及/或表現水準。在另一實施例中，該方法包括確定PD-L1及sTIL之存在及/或表現水準。在另一實施例中，該方法包括確定CD8及sTIL之存在及/或表現水準。在另一實施例中，該方法包括確定PD-L1、CD8、及sTIL之存在及/或表現水準。
在前述態樣中任一項之一些實施例中，局部晚期或轉移性乳癌為局部晚期或轉移性TNBC。
在一個實例中，本文提供一種用於鑑別可能對用抗癌療法之治療有反應的患有局部晚期TNBC之患者的方法，該抗癌療法包含(i) PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑)及(ii)紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)，該方法包括確定獲自患者之腫瘤樣品之腫瘤浸潤免疫細胞中CD8之表現水準，其中患者先前未針對局部晚期TNBC進行治療，並且其中佔腫瘤樣品之約0.5%或更多(例如，約0.5%或更多、約0.75%或更多、約1%或更多、約1.25%或更多、約1.35%或更多、約1.5%或更多、約2%或更多、約2.25%或更多、約2.5%或更多、約2.75%或更多、約3%或更多、約3.25%或更多、約3.5%或更多、約3.75%或更多、約4%或更多、約4.25%或更多、約4.5%或更多、約4.75%或更多、或約5%或更多)的腫瘤浸潤免疫細胞中CD8之可偵測的表現水準將患者鑑別為可能對使用抗癌療法之治療有反應。
在另一實例中，本文提供一種用於鑑別可能對用抗癌療法之治療有反應的患有轉移性TNBC之患者的方法，該抗癌療法包含(i) PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑)及(ii)紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)，該方法包括確定獲自患者之腫瘤樣品之腫瘤浸潤免疫細胞中CD8之表現水準，其中患者先前未針對轉移性TNBC進行治療，並且其中佔腫瘤樣品之約0.5%或更多(例如，約0.5%或更多、約0.75%或更多、約1%或更多、約1.25%或更多、約1.35%或更多、約1.5%或更多、約2%或更多、約2.25%或更多、約2.5%或更多、約2.75%或更多、約3%或更多、約3.25%或更多、約3.5%或更多、約3.75%或更多、約4%或更多、約4.25%或更多、約4.5%或更多、約4.75%或更多、或約5%或更多)的腫瘤浸潤免疫細胞中CD8之可偵測的表現水準將患者鑑別為可能對使用抗癌療法之治療有反應。
在另一實例中，本文提供一種用於預測患有局部晚期TNBC之患者是否可能對用抗癌療法之治療有反應的方法，該抗癌療法包含(i) PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑)及(ii)紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)，該方法包括確定獲自患者之腫瘤樣品之腫瘤浸潤免疫細胞中CD8之表現水準，其中患者先前未針對局部晚期TNBC進行治療，並且其中佔腫瘤樣品之約0.5%或更多(例如，約0.5%或更多、約0.75%或更多、約1%或更多、約1.25%或更多、約1.35%或更多、約1.5%或更多、約2%或更多、約2.25%或更多、約2.5%或更多、約2.75%或更多、約3%或更多、約3.25%或更多、約3.5%或更多、約3.75%或更多、約4%或更多、約4.25%或更多、約4.5%或更多、約4.75%或更多、或約5%或更多)的腫瘤浸潤免疫細胞中CD8之可偵測的表現水準指示患者可能對使用抗癌療法之治療有反應。
在進一步實例中，本文提供一種用於預測患有轉移性TNBC之患者是否可能對用抗癌療法之治療有反應的方法，該抗癌療法包含(i) PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑)及(ii)紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)，該方法包括確定獲自患者之腫瘤樣品之腫瘤浸潤免疫細胞中CD8之表現水準，其中患者先前未針對轉移性TNBC進行治療，並且其中佔腫瘤樣品之約0.5%或更多(例如，約0.5%或更多、約0.75%或更多、約1%或更多、約1.25%或更多、約1.35%或更多、約1.5%或更多、約2%或更多、約2.25%或更多、約2.5%或更多、約2.75%或更多、約3%或更多、約3.25%或更多、約3.5%或更多、約3.75%或更多、約4%或更多、約4.25%或更多、約4.5%或更多、約4.75%或更多、或約5%或更多)的腫瘤浸潤免疫細胞中CD8之可偵測的表現水準指示患者可能對使用抗癌療法之治療有反應。
在進一步實例中，本文提供一種用於為患有局部晚期TNBC之患者選擇抗癌療法的方法，該方法包括：(a)確定獲自患者之腫瘤樣品之腫瘤浸潤免疫細胞中CD8之表現水準，其中患者先前未針對局部晚期TNBC進行治療；及(b)基於佔腫瘤樣品之約0.5%或更多(例如，約0.5%或更多、約0.75%或更多、約1%或更多、約1.25%或更多、約1.35%或更多、約1.5%或更多、約2%或更多、約2.25%或更多、約2.5%或更多、約2.75%或更多、約3%或更多、約3.25%或更多、約3.5%或更多、約3.75%或更多、約4%或更多、約4.25%或更多、約4.5%或更多、約4.75%或更多、或約5%或更多)的腫瘤浸潤免疫細胞中CD8之可偵測的表現水準，為患者選擇抗癌療法，該抗癌療法包含(i) PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑)及(ii)紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)。
在進一步實例中，本文提供一種用於為患有轉移性TNBC之患者選擇抗癌療法的方法，該方法包括：(a)確定獲自患者之腫瘤樣品之腫瘤浸潤免疫細胞中CD8之表現水準，其中患者先前未針對轉移性TNBC進行治療；及(b)基於佔腫瘤樣品之約0.5%或更多(例如，約0.5%或更多、約0.75%或更多、約1%或更多、約1.25%或更多、約1.35%或更多、約1.5%或更多、約2%或更多、約2.25%或更多、約2.5%或更多、約2.75%或更多、約3%或更多、約3.25%或更多、約3.5%或更多、約3.75%或更多、約4%或更多、約4.25%或更多、約4.5%或更多、約4.75%或更多、或約5%或更多)的腫瘤浸潤免疫細胞中CD8之可偵測的表現水準，為患者選擇抗癌療法，該抗癌療法包含(i) PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑)及(ii)紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)。
在一個實例中，本文提供一種用於鑑別可能對用抗癌療法之治療有反應的患有局部晚期TNBC之患者的方法，該抗癌療法包含阿特珠單抗及nab-太平洋紫杉醇，該方法包括確定獲自患者之腫瘤樣品之腫瘤浸潤免疫細胞中CD8之表現水準，其中患者先前未針對局部晚期TNBC進行治療，並且其中佔腫瘤樣品之約0.5%或更多(例如，約0.5%或更多、約0.75%或更多、約1%或更多、約1.25%或更多、約1.35%或更多、約1.5%或更多、約2%或更多、約2.25%或更多、約2.5%或更多、約2.75%或更多、約3%或更多、約3.25%或更多、約3.5%或更多、約3.75%或更多、約4%或更多、約4.25%或更多、約4.5%或更多、約4.75%或更多、或約5%或更多)的腫瘤浸潤免疫細胞中CD8之可偵測的表現水準將患者鑑別為可能對使用抗癌療法之治療有反應。
在另一實例中，本文提供一種用於鑑別可能對用抗癌療法之治療有反應的患有轉移性TNBC之患者的方法，該抗癌療法包含阿特珠單抗及nab-太平洋紫杉醇，該方法包括確定獲自患者之腫瘤樣品之腫瘤浸潤免疫細胞中CD8之表現水準，其中患者先前未針對轉移性TNBC進行治療，並且其中佔腫瘤樣品之約0.5%或更多(例如，約0.5%或更多、約0.75%或更多、約1%或更多、約1.25%或更多、約1.35%或更多、約1.5%或更多、約2%或更多、約2.25%或更多、約2.5%或更多、約2.75%或更多、約3%或更多、約3.25%或更多、約3.5%或更多、約3.75%或更多、約4%或更多、約4.25%或更多、約4.5%或更多、約4.75%或更多、或約5%或更多)的腫瘤浸潤免疫細胞中CD8之可偵測的表現水準將患者鑑別為可能對使用抗癌療法之治療有反應。
在另一實例中，本文提供一種用於預測患有局部晚期TNBC之患者是否可能對用抗癌療法之治療有反應的方法，該抗癌療法包含阿特珠單抗nab-太平洋紫杉醇，該方法包括確定獲自患者之腫瘤樣品之腫瘤浸潤免疫細胞中CD8之表現水準，其中患者先前未針對局部晚期TNBC進行治療，並且其中佔腫瘤樣品之約0.5%或更多(例如，約0.5%或更多、約0.75%或更多、約1%或更多、約1.25%或更多、約1.35%或更多、約1.5%或更多、約2%或更多、約2.25%或更多、約2.5%或更多、約2.75%或更多、約3%或更多、約3.25%或更多、約3.5%或更多、約3.75%或更多、約4%或更多、約4.25%或更多、約4.5%或更多、約4.75%或更多、或約5%或更多)的腫瘤浸潤免疫細胞中CD8之可偵測的表現水準指示患者可能對使用抗癌療法之治療有反應。
在進一步實例中，本文提供一種用於預測患有轉移性TNBC之患者是否可能對用抗癌療法之治療有反應的方法，該抗癌療法包含阿特珠單抗及nab-太平洋紫杉醇，該方法包括確定獲自患者之腫瘤樣品之腫瘤浸潤免疫細胞中CD8之表現水準，其中患者先前未針對轉移性TNBC進行治療，並且其中佔腫瘤樣品之約0.5%或更多(例如，約0.5%或更多、約0.75%或更多、約1%或更多、約1.25%或更多、約1.35%或更多、約1.5%或更多、約2%或更多、約2.25%或更多、約2.5%或更多、約2.75%或更多、約3%或更多、約3.25%或更多、約3.5%或更多、約3.75%或更多、約4%或更多、約4.25%或更多、約4.5%或更多、約4.75%或更多、或約5%或更多)的腫瘤浸潤免疫細胞中CD8之可偵測的表現水準指示患者可能對使用抗癌療法之治療有反應。
在進一步實例中，本文提供一種用於為患有局部晚期TNBC之患者選擇抗癌療法的方法，該方法包括：(a)確定獲自患者之腫瘤樣品之腫瘤浸潤免疫細胞中CD8之表現水準，其中患者先前未針對局部晚期TNBC進行治療；及(b)基於佔腫瘤樣品之約0.5%或更多(例如，約0.5%或更多、約0.75%或更多、約1%或更多、約1.25%或更多、約1.35%或更多、約1.5%或更多、約2%或更多、約2.25%或更多、約2.5%或更多、約2.75%或更多、約3%或更多、約3.25%或更多、約3.5%或更多、約3.75%或更多、約4%或更多、約4.25%或更多、約4.5%或更多、約4.75%或更多、或約5%或更多)的腫瘤浸潤免疫細胞中CD8之可偵測的表現水準，為患者選擇抗癌療法，該抗癌療法包含阿特珠單抗及nab-太平洋紫杉醇。
在進一步實例中，本文提供一種用於為患有轉移性TNBC之患者選擇抗癌療法的方法，該方法包括：(a)確定獲自患者之腫瘤樣品之腫瘤浸潤免疫細胞中CD8之表現水準，其中患者先前未針對轉移性TNBC進行治療；及(b)基於佔腫瘤樣品之約0.5%或更多(例如，約0.5%或更多、約0.75%或更多、約1%或更多、約1.25%或更多、約1.35%或更多、約1.5%或更多、約2%或更多、約2.25%或更多、約2.5%或更多、約2.75%或更多、約3%或更多、約3.25%或更多、約3.5%或更多、約3.75%或更多、約4%或更多、約4.25%或更多、約4.5%或更多、約4.75%或更多、或約5%或更多)的腫瘤浸潤免疫細胞中CD8之可偵測的表現水準，為患者選擇抗癌療法，該抗癌療法包含阿特珠單抗及nab-太平洋紫杉醇。
在一個實例中，本文提供一種用於鑑別可能對用抗癌療法之治療有反應的患有局部晚期TNBC之患者的方法，該抗癌療法包含阿特珠單抗及太平洋紫杉醇，該方法包括確定獲自患者之腫瘤樣品之腫瘤浸潤免疫細胞中CD8之表現水準，其中患者先前未針對局部晚期TNBC進行治療，並且其中佔腫瘤樣品之約0.5%或更多(例如，約0.5%或更多、約0.75%或更多、約1%或更多、約1.25%或更多、約1.35%或更多、約1.5%或更多、約2%或更多、約2.25%或更多、約2.5%或更多、約2.75%或更多、約3%或更多、約3.25%或更多、約3.5%或更多、約3.75%或更多、約4%或更多、約4.25%或更多、約4.5%或更多、約4.75%或更多、或約5%或更多)的腫瘤浸潤免疫細胞中CD8之可偵測的表現水準將患者鑑別為可能對使用抗癌療法之治療有反應。
在另一實例中，本文提供一種用於鑑別可能對用抗癌療法之治療有反應的患有轉移性TNBC之患者的方法，該抗癌療法包含阿特珠單抗及太平洋紫杉醇，該方法包括確定獲自患者之腫瘤樣品之腫瘤浸潤免疫細胞中CD8之表現水準，其中患者先前未針對轉移性TNBC進行治療，並且其中佔腫瘤樣品之約0.5%或更多(例如，約0.5%或更多、約0.75%或更多、約1%或更多、約1.25%或更多、約1.35%或更多、約1.5%或更多、約2%或更多、約2.25%或更多、約2.5%或更多、約2.75%或更多、約3%或更多、約3.25%或更多、約3.5%或更多、約3.75%或更多、約4%或更多、約4.25%或更多、約4.5%或更多、約4.75%或更多、或約5%或更多)的腫瘤浸潤免疫細胞中CD8之可偵測的表現水準將患者鑑別為可能對使用抗癌療法之治療有反應。
在另一實例中，本文提供一種用於預測患有局部晚期TNBC之患者是否可能對用抗癌療法之治療有反應的方法，該抗癌療法包含阿特珠單抗及太平洋紫杉醇，該方法包括確定獲自患者之腫瘤樣品之腫瘤浸潤免疫細胞中CD8之表現水準，其中患者先前未針對局部晚期TNBC進行治療，並且其中佔腫瘤樣品之約0.5%或更多(例如，約0.5%或更多、約0.75%或更多、約1%或更多、約1.25%或更多、約1.35%或更多、約1.5%或更多、約2%或更多、約2.25%或更多、約2.5%或更多、約2.75%或更多、約3%或更多、約3.25%或更多、約3.5%或更多、約3.75%或更多、約4%或更多、約4.25%或更多、約4.5%或更多、約4.75%或更多、或約5%或更多)的腫瘤浸潤免疫細胞中CD8之可偵測的表現水準指示患者可能對使用抗癌療法之治療有反應。
在進一步實例中，本文提供一種用於預測患有轉移性TNBC之患者是否可能對用抗癌療法之治療有反應的方法，該抗癌療法包含阿特珠單抗及太平洋紫杉醇，該方法包括確定獲自患者之腫瘤樣品之腫瘤浸潤免疫細胞中CD8之表現水準，其中患者先前未針對轉移性TNBC進行治療，並且其中佔腫瘤樣品之約0.5%或更多(例如，約0.5%或更多、約0.75%或更多、約1%或更多、約1.25%或更多、約1.35%或更多、約1.5%或更多、約2%或更多、約2.25%或更多、約2.5%或更多、約2.75%或更多、約3%或更多、約3.25%或更多、約3.5%或更多、約3.75%或更多、約4%或更多、約4.25%或更多、約4.5%或更多、約4.75%或更多、或約5%或更多)的腫瘤浸潤免疫細胞中CD8之可偵測的表現水準指示患者可能對使用抗癌療法之治療有反應。
在進一步實例中，本文提供一種用於為患有局部晚期TNBC之患者選擇抗癌療法的方法，該方法包括：(a)確定獲自患者之腫瘤樣品之腫瘤浸潤免疫細胞中CD8之表現水準，其中患者先前未針對局部晚期TNBC進行治療；及(b)基於佔腫瘤樣品之約0.5%或更多(例如，約0.5%或更多、約0.75%或更多、約1%或更多、約1.25%或更多、約1.35%或更多、約1.5%或更多、約2%或更多、約2.25%或更多、約2.5%或更多、約2.75%或更多、約3%或更多、約3.25%或更多、約3.5%或更多、約3.75%或更多、約4%或更多、約4.25%或更多、約4.5%或更多、約4.75%或更多、或約5%或更多)的腫瘤浸潤免疫細胞中CD8之可偵測的表現水準，為患者選擇抗癌療法，該抗癌療法包含阿特珠單抗及太平洋紫杉醇。
在進一步實例中，本文提供一種用於為患有轉移性TNBC之患者選擇抗癌療法的方法，該方法包括：(a)確定獲自患者之腫瘤樣品之腫瘤浸潤免疫細胞中CD8之表現水準，其中患者先前未針對轉移性TNBC進行治療；及(b)基於佔腫瘤樣品之約0.5%或更多(例如，約0.5%或更多、約0.75%或更多、約1%或更多、約1.25%或更多、約1.35%或更多、約1.5%或更多、約2%或更多、約2.25%或更多、約2.5%或更多、約2.75%或更多、約3%或更多、約3.25%或更多、約3.5%或更多、約3.75%或更多、約4%或更多、約4.25%或更多、約4.5%或更多、約4.75%或更多、或約5%或更多)的腫瘤浸潤免疫細胞中CD8之可偵測的表現水準，為患者選擇抗癌療法，該抗癌療法包含阿特珠單抗及太平洋紫杉醇。
例如，在一些實施例中，已確定獲自患者之腫瘤樣品在佔腫瘤樣品之約0.5%或更多、約0.55%或更多、約0.6%或更多、約0.65%或更多、約0.7%或更多、約0.75%或更多、約0.8%或更多、約0.85%或更多、約0.9%或更多、約0.95%或更多、約1%或更多、約1.05%或更多、約1.1%或更多、約1.2%或更多、約1.25%或更多、約1.3%或更多、約1.35%或更多、約1.4%或更多、約1.45%或更多、約1.5%或更多、約1.55%或更多、約1.6%或更多、約1.65%或更多、約1.7%或更多、約1.75%或更多、約1.8%或更多、約1.85%或更多、約1.9%或更多、約1.95%或更多、約2%或更多、約2.1%或更多、約2.2%或更多、約2.3%或更多、約2.4%或更多、約2.5%或更多、約2.6%或更多、約2.7%或更多、約2.8%或更多、約2.9%或更多、約3%或更多、約3.1%或更多、約3.2%或更多、約3.3%或更多、約3.4%或更多、約3.5%或更多、約3.6%或更多、約3.7%或更多、約3.8%或更多、約3.9%或更多、約4%或更多、約4.1%或更多、約4.2%或更多、約4.3%或更多、約4.4%或更多、約4.5%或更多、約4.6%或更多、約4.7%或更多、約4.8%或更多、約4.9%或更多、約5%或更多、約5.5%或更多、約6%或更多、約6.5%或更多、約7%或更多、約7.5%或更多、約8%或更多、約8.5%或更多、約9%或更多、約9.5%或更多、約10%或更多、約10.5%或更多、約11%或更多、約11.5%或更多、約12%或更多、約12.5%或更多、約13%或更多、約13.5%或更多、約14%或更多、約14.5%或更多、約15%或更多、約15.5%或更多、約16%或更多、約16.5%或更多、約17%或更多、約17.5%或更多、約18%或更多、約18.5%或更多、約19%或更多、約19.5%或更多、約20%或更多、約21%或更多、約22%或更多、約23%或更多、約24%或更多、約25%或更多、約26%或更多、約27%或更多、約28%或更多、約29%或更多、約30%或更多、約31%或更多、約32%或更多、約33%或更多、約34%或更多、約35%或更多、約36%或更多、約37%或更多、約38%或更多、約39%或更多、約40%或更多、約41%或更多、約42%或更多、約43%或更多、約44%或更多、約45%或更多、約46%或更多、約47%或更多、約48%或更多、約49%或更多、約50%或更多、約51%或更多、約52%或更多、約53%或更多、約54%或更多、約55%或更多、約56%或更多、約57%或更多、約58%或更多、約59%或更多、約60%或更多、約61%或更多、約62%或更多、約63%或更多、約64%或更多、約65%或更多、約66%或更多、約67%或更多、約68%或更多、約69%或更多、約70%或更多、約71%或更多、約72%或更多、約73%或更多、約74%或更多、約75%或更多、約76%或更多、約77%或更多、約78%或更多、約79%或更多、約80%或更多、約81%或更多、約82%或更多、約83%或更多、約84%或更多、約85%或更多、約86%或更多、約87%或更多、約88%或更多、約89%或更多、約90%或更多、約91%或更多、約92%或更多、約93%或更多、約94%或更多、約95%或更多、約96%或更多、約97%或更多、約98%或更多、或約99%或更多)之腫瘤浸潤免疫細胞中具有CD8之可偵測的表現水準。
例如，在一些實施例中，已確定獲自患者之腫瘤樣品在佔腫瘤樣品之約0.5%至50%、0.5%至45%、0.5%至40%、0.5%至35%、0.5%至30%、0.5%至25%、0.5%至20%、0.5%至15%、0.5%至10%、0.5%至9%、0.5%至8%、0.5%至7%、0.5%至6%、0.5%至5%、0.5%至4%、0.5%至3%、0.5%至2%、0.5%至1%、1%至50%、1%至40%、1%至35%、1%至30%、1%至25%、1%至20%、1%至15%、1%至10%、1%至9%、1%至8%、1%至7%、1%至6%、1%至5%、1%至4%、1%至3%、1%至2%、1.35%至50%、1.35%至45%、1.35%至40%、1.35%至35%、1.35%至30%、1.35%至30%、1.35%至25%、1.35%至20%、1.35%至15%、1.35%至10%、1.35%至9%、1.35%至8%、1.35%至7%、1.35%至6%、1.35%至5%、1.35%至4%、1.35%至3%、1.35%至2%、1.5%至50%、1.5%至45%、1.5%至40%、1.5%至35%、1.5%至30%、1.5%至30%、1.5%至25%、1.5%至20%、1.5%至15%、1.5%至10%、1.5%至9%、1.5%至8%、1.5%至7%、1.5%至6%、1.5%至5%、1.5%至4%、1.5%至3%、1.5%至2%、2%至50%、2%至45%、2%至40%、2%至35%、2%至30%、2%至25%、2%至20%、2%至15%、2%至10%、2%至9%、2%至8%、2%至7%、2%至6%、2%至5%、2%至4%、2%至3%、3%至50%、3%至45%、3%至40%、3%至35%、3%至30%、3%至25%、3%至20%、3%至15%、3%至10%、3%至9%、3%至8%、3%至7%、3%至6%、3%至5%、3%至4%、4%至50%、4%至45%、4%至40%、4%至35%、4%至30%、4%至25%、4%至20%、4%至15%、4%至10%、4%至9%、4%至8%、4%至7%、4%至6%、4%至5%、5%至50%、5%至45%、5%至40%、5%至35%、5%至30%、5%至25%、5%至20%、5%至15%、5%至10%、5%至9%、5%至8%、5%至7%、5%至6%、6%至50%、6%至45%、6%至40%、6%至35%、6%至30%、6%至25%、6%至20%、6%至15%、6%至10%、6%至9%、6%至8%、6%至7%、7%至50%、7%至45%、7%至40%、7%至35%、7%至30%、7%至25%、7%至20%、7%至15%、7%至10%、7%至9%、7%至8%、8%至50%、8%至45%、8%至40%、8%至35%、8%至30%、8%至25%、8%至20%、8%至15%、8%至10%、8%至9%、9%至50%、9%至45%、9%至40%、9%至35%、9%至30%、9%至25%、9%至20%、9%至15%、9%至10%、10%至50%、10%至45%、10%至40%、10%至35%、10%至30%、10%至25%、10%至20%、或10%至15%之腫瘤浸潤免疫細胞中具有CD8之可偵測的表現水準。
應瞭解在前述方法中任一者中，腫瘤浸潤免疫細胞佔腫瘤樣品之百分比可按照腫瘤樣品之切片中表現CD8之腫瘤浸潤免疫細胞(例如，T細胞)所覆蓋之腫瘤面積之百分比。在其他實施例中，表現CD8之腫瘤浸潤免疫細胞(例如，T細胞)相對於腫瘤浸潤免疫細胞之總數的百分比可用作生物標記物。
例如，本文提供一種用於鑑別可能對用抗癌療法之治療有反應的患有局部晚期或轉移性乳癌(例如，局部晚期或轉移性TNBC)之患者的方法，該抗癌療法包含(i) PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑)及(ii)紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)，該方法包括確定獲自患者之腫瘤樣品中sTIL之百分比，其中患者先前未針對乳癌(例如，局部晚期或轉移性TNBC)進行治療，並且其中約5%或更多(例如，約5%或更多、6%或更多、7%或更多、8%或更多、9%或更多、10%或更多、15%或更多、20%或更多、25%或更多、50%或更多、60%或更多70%或更多、80%或更多、90%或更多、95%或更多、99%或更多、或100%)之sTIL之百分比將患者鑑別為可能對用抗癌療法之治療有反應。
在另一實例中，本文提供一種用於預測患有局部晚期或轉移性乳癌(例如，局部晚期或轉移性TNBC)之患者是否可能對用抗癌療法之治療有反應的方法，該抗癌療法包含(i) PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑)及(ii)紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)，該方法包括確定獲自患者之腫瘤樣品中sTIL之百分比，其中患者先前未針對乳癌(例如，局部晚期或轉移性TNBC)進行治療，並且其中腫瘤樣品之約5%或更多(例如，約5%或更多、6%或更多、7%或更多、8%或更多、9%或更多、10%或更多、15%或更多、20%或更多、25%或更多、50%或更多、60%或更多70%或更多、80%或更多、90%或更多、95%或更多、99%或更多、或100%)之sTIL之百分比指示患者可能對用抗癌療法之治療有反應。
在進一步實例中，本文提供一種用於為患有局部晚期或轉移性乳癌(例如，局部晚期或轉移性TNBC)之患者選擇抗癌療法的方法，該方法包括：(a)確定獲自患者之腫瘤樣品中sTIL之百分比，其中患者先前未針對乳癌(例如，局部晚期或轉移性TNBC)進行治療；及(b)基於腫瘤樣品之約5%或更多(例如，約5%或更多、6%或更多、7%或更多、8%或更多、9%或更多、10%或更多、15%或更多、20%或更多、25%或更多、50%或更多、60%或更多70%或更多、80%或更多、90%或更多、95%或更多、99%或更多、或100%)之sTIL之百分比，為患者選擇抗癌療法，該抗癌療法包含(i) PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑)及(ii)紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)。
在前述態樣中任一項之一些實施例中，局部晚期或轉移性乳癌為局部晚期或轉移性TNBC。
在一個實例中，本文提供一種用於鑑別可能對用抗癌療法之治療有反應的患有局部晚期TNBC之患者的方法，該抗癌療法包含(i) PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑)及(ii)紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)，該方法包括確定獲自患者之腫瘤樣品中sTIL之百分比，其中患者先前未針對局部晚期TNBC進行治療，並且其中腫瘤樣品之約5%或更多(例如，約5%或更多、6%或更多、7%或更多、8%或更多、9%或更多、10%或更多、15%或更多、20%或更多、25%或更多、50%或更多、60%或更多70%或更多、80%或更多、90%或更多、95%或更多、99%或更多、或100%)之sTIL之百分比將患者鑑別為可能對用抗癌療法之治療有反應。
在另一實例中，本文提供一種用於鑑別可能對用抗癌療法之治療有反應的患有轉移性TNBC之患者的方法，該抗癌療法包含(i) PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑)及(ii)紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)，該方法包括確定獲自患者之腫瘤樣品中sTIL之百分比，其中患者先前未針對轉移性TNBC進行治療，並且其中腫瘤樣品之約5%或更多(例如，約5%或更多、6%或更多、7%或更多、8%或更多、9%或更多、10%或更多、15%或更多、20%或更多、25%或更多、50%或更多、60%或更多70%或更多、80%或更多、90%或更多、95%或更多、99%或更多、或100%)之sTIL之百分比將患者鑑別為可能對用抗癌療法之治療有反應。
在另一實例中，本文提供一種用於預測患有局部晚期TNBC之患者是否可能對用抗癌療法之治療有反應的方法，該抗癌療法包含(i) PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑)及(ii)紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)，該方法包括確定獲自患者之腫瘤樣品中sTIL之百分比，其中患者先前未針對局部晚期TNBC進行治療，並且其中腫瘤樣品之約5%或更多(例如，約5%或更多、6%或更多、7%或更多、8%或更多、9%或更多、10%或更多、15%或更多、20%或更多、25%或更多、50%或更多、60%或更多70%或更多、80%或更多、90%或更多、95%或更多、99%或更多、或100%)之sTIL之百分比指示患者可能對用抗癌療法之治療有反應。
在進一步實例中，本文提供一種用於預測患有轉移性TNBC之患者是否可能對用抗癌療法之治療有反應的方法，該抗癌療法包含(i) PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑)及(ii)紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)，該方法包括確定獲自患者之腫瘤樣品中sTIL之百分比，其中患者先前未針對轉移性TNBC進行治療，並且其中腫瘤樣品之約5%或更多(例如，約5%或更多、6%或更多、7%或更多、8%或更多、9%或更多、10%或更多、15%或更多、20%或更多、25%或更多、50%或更多、60%或更多70%或更多、80%或更多、90%或更多、95%或更多、99%或更多、或100%)之sTIL之百分比指示患者可能對用抗癌療法之治療有反應。
在進一步實例中，本文提供一種用於為患有局部晚期TNBC之患者選擇抗癌療法的方法，該方法包括：(a)確定獲自患者之腫瘤樣品中sTIL之百分比，其中患者先前未針對局部晚期TNBC進行治療；及(b)基於腫瘤樣品之約5%或更多(例如，約5%或更多、6%或更多、7%或更多、8%或更多、9%或更多、10%或更多、15%或更多、20%或更多、25%或更多、50%或更多、60%或更多70%或更多、80%或更多、90%或更多、95%或更多、99%或更多、或100%)之sTIL之百分比，為患者選擇抗癌療法，該抗癌療法包含(i) PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑)及(ii)紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)。
在進一步實例中，本文提供一種用於為患有轉移性TNBC之患者選擇抗癌療法的方法，該方法包括：(a)確定獲自患者之腫瘤樣品中sTIL之百分比，其中患者先前未針對轉移性TNBC進行治療；及(b)基於腫瘤樣品之約5%或更多(例如，約5%或更多、6%或更多、7%或更多、8%或更多、9%或更多、10%或更多、15%或更多、20%或更多、25%或更多、50%或更多、60%或更多70%或更多、80%或更多、90%或更多、95%或更多、99%或更多、或100%)之sTIL之百分比，為患者選擇抗癌療法，該抗癌療法包含(i) PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑)及(ii)紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)。
在一個實例中，本文提供一種用於鑑別可能對用抗癌療法之治療有反應的患有局部晚期TNBC之患者的方法，該抗癌療法包含阿特珠單抗及nab-太平洋紫杉醇，該方法包括確定獲自患者之腫瘤樣品中sTIL之百分比，其中患者先前未針對局部晚期TNBC進行治療，並且其中腫瘤樣品之約5%或更多(例如，約5%或更多、6%或更多、7%或更多、8%或更多、9%或更多、10%或更多、15%或更多、20%或更多、25%或更多、50%或更多、60%或更多70%或更多、80%或更多、90%或更多、95%或更多、99%或更多、或100%)之sTIL之百分比將患者鑑別為可能對用抗癌療法之治療有反應。
在另一實例中，本文提供一種用於鑑別可能對用抗癌療法之治療有反應的患有轉移性TNBC之患者的方法，該抗癌療法包含阿特珠單抗及nab-太平洋紫杉醇，該方法包括確定獲自患者之腫瘤樣品中sTIL之百分比，其中患者先前未針對轉移性TNBC進行治療，並且其中腫瘤樣品之約5%或更多(例如，約5%或更多、6%或更多、7%或更多、8%或更多、9%或更多、10%或更多、15%或更多、20%或更多、25%或更多、50%或更多、60%或更多70%或更多、80%或更多、90%或更多、95%或更多、99%或更多、或100%)之sTIL之百分比將患者鑑別為可能對用抗癌療法之治療有反應。
在另一實例中，本文提供一種用於預測患有局部晚期TNBC之患者是否可能對用抗癌療法之治療有反應的方法，該抗癌療法包含阿特珠單抗及nab-太平洋紫杉醇，該方法包括確定獲自患者之腫瘤樣品中sTIL之百分比，其中患者先前未針對局部晚期TNBC進行治療，並且其中腫瘤樣品之約5%或更多(例如，約5%或更多、6%或更多、7%或更多、8%或更多、9%或更多、10%或更多、15%或更多、20%或更多、25%或更多、50%或更多、60%或更多70%或更多、80%或更多、90%或更多、95%或更多、99%或更多、或100%)之sTIL之百分比指示患者可能對用抗癌療法之治療有反應。
在進一步實例中，本文提供一種用於預測患有轉移性TNBC之患者是否可能對用抗癌療法之治療有反應的方法，該抗癌療法包含阿特珠單抗及nab-太平洋紫杉醇，該方法包括確定獲自患者之腫瘤樣品中sTIL之百分比，其中患者先前未針對轉移性TNBC進行治療，並且其中腫瘤樣品之約5%或更多(例如，約5%或更多、6%或更多、7%或更多、8%或更多、9%或更多、10%或更多、15%或更多、20%或更多、25%或更多、50%或更多、60%或更多70%或更多、80%或更多、90%或更多、95%或更多、99%或更多、或100%)之sTIL之百分比指示患者可能對用抗癌療法之治療有反應。
在進一步實例中，本文提供一種用於為患有局部晚期TNBC之患者選擇抗癌療法的方法，該方法包括：(a)確定獲自患者之腫瘤樣品中sTIL之百分比，其中患者先前未針對局部晚期TNBC進行治療；及(b)基於腫瘤樣品之約5%或更多(例如，約5%或更多、6%或更多、7%或更多、8%或更多、9%或更多、10%或更多、15%或更多、20%或更多、25%或更多、50%或更多、60%或更多70%或更多、80%或更多、90%或更多、95%或更多、99%或更多、或100%)之sTIL之百分比，為患者選擇抗癌療法，該抗癌療法包含阿特珠單抗及nab-太平洋紫杉醇。
在進一步實例中，本文提供一種用於為患有轉移性TNBC之患者選擇抗癌療法的方法，該方法包括：(a)確定獲自患者之腫瘤樣品中sTIL之百分比，其中患者先前未針對轉移性TNBC進行治療；及(b)基於腫瘤樣品之約5%或更多(例如，約5%或更多、6%或更多、7%或更多、8%或更多、9%或更多、10%或更多、15%或更多、20%或更多、25%或更多、50%或更多、60%或更多70%或更多、80%或更多、90%或更多、95%或更多、99%或更多、或100%)之sTIL之百分比，為患者選擇抗癌療法，該抗癌療法包含阿特珠單抗及nab-太平洋紫杉醇。
在一個實例中，本文提供一種用於鑑別可能對用抗癌療法之治療有反應的患有局部晚期TNBC之患者的方法，該抗癌療法包含阿特珠單抗及太平洋紫杉醇，該方法包括確定獲自患者之腫瘤樣品中sTIL之百分比，其中患者先前未針對局部晚期TNBC進行治療，並且其中腫瘤樣品之約5%或更多(例如，約5%或更多、6%或更多、7%或更多、8%或更多、9%或更多、10%或更多、15%或更多、20%或更多、25%或更多、50%或更多、60%或更多70%或更多、80%或更多、90%或更多、95%或更多、99%或更多、或100%)之sTIL之百分比將患者鑑別為可能對用抗癌療法之治療有反應。
在另一實例中，本文提供一種用於鑑別可能對用抗癌療法之治療有反應的患有轉移性TNBC之患者的方法，該抗癌療法包含阿特珠單抗及太平洋紫杉醇，該方法包括確定獲自患者之腫瘤樣品中sTIL之百分比，其中患者先前未針對轉移性TNBC進行治療，並且其中腫瘤樣品之約5%或更多(例如，約5%或更多、6%或更多、7%或更多、8%或更多、9%或更多、10%或更多、15%或更多、20%或更多、25%或更多、50%或更多、60%或更多70%或更多、80%或更多、90%或更多、95%或更多、99%或更多、或100%)之sTIL之百分比將患者鑑別為可能對用抗癌療法之治療有反應。
在另一實例中，本文提供一種用於預測患有局部晚期TNBC之患者是否可能對用抗癌療法之治療有反應的方法，該抗癌療法包含阿特珠單抗及太平洋紫杉醇，該方法包括確定獲自患者之腫瘤樣品中sTIL之百分比，其中患者先前未針對局部晚期TNBC進行治療，並且其中腫瘤樣品之約5%或更多(例如，約5%或更多、6%或更多、7%或更多、8%或更多、9%或更多、10%或更多、15%或更多、20%或更多、25%或更多、50%或更多、60%或更多70%或更多、80%或更多、90%或更多、95%或更多、99%或更多、或100%)之sTIL之百分比指示患者可能對用抗癌療法之治療有反應。
在進一步實例中，本文提供一種用於預測患有轉移性TNBC之患者是否可能對用抗癌療法之治療有反應的方法，該抗癌療法包含阿特珠單抗及太平洋紫杉醇，該方法包括確定獲自患者之腫瘤樣品中sTIL之百分比，其中患者先前未針對轉移性TNBC進行治療，並且其中腫瘤樣品之約5%或更多(例如，約5%或更多、6%或更多、7%或更多、8%或更多、9%或更多、10%或更多、15%或更多、20%或更多、25%或更多、50%或更多、60%或更多70%或更多、80%或更多、90%或更多、95%或更多、99%或更多、或100%)之sTIL之百分比指示患者可能對用抗癌療法之治療有反應。
在進一步實例中，本文提供一種用於為患有局部晚期TNBC之患者選擇抗癌療法的方法，該方法包括：(a)確定獲自患者之腫瘤樣品中sTIL之百分比，其中患者先前未針對局部晚期TNBC進行治療；及(b)基於腫瘤樣品之約5%或更多(例如，約5%或更多、6%或更多、7%或更多、8%或更多、9%或更多、10%或更多、15%或更多、20%或更多、25%或更多、50%或更多、60%或更多70%或更多、80%或更多、90%或更多、95%或更多、99%或更多、或100%)之sTIL之百分比，為患者選擇抗癌療法，該抗癌療法包含阿特珠單抗及太平洋紫杉醇。
在進一步實例中，本文提供一種用於為患有轉移性TNBC之患者選擇抗癌療法的方法，該方法包括：(a)確定獲自患者之腫瘤樣品中sTIL之百分比，其中患者先前未針對轉移性TNBC進行治療；及(b)基於腫瘤樣品之約5%或更多(例如，約5%或更多、6%或更多、7%或更多、8%或更多、9%或更多、10%或更多、15%或更多、20%或更多、25%或更多、50%或更多、60%或更多70%或更多、80%或更多、90%或更多、95%或更多、99%或更多、或100%)之sTIL之百分比，為患者選擇抗癌療法，該抗癌療法包含阿特珠單抗及太平洋紫杉醇。
例如，在一些實施例中，已確定獲自患者之腫瘤樣品具有佔腫瘤樣品之約5%或更多、約5.5%或更多、約6%或更多、約6.5%或更多、約7%或更多、約7.5%或更多、約8%或更多、約8.5%或更多、約9%或更多、約9.5%或更多、約10%或更多、約10.5%或更多、約11%或更多、約11.5%或更多、約12%或更多、約12.5%或更多、約13%或更多、約13.5%或更多、約14%或更多、約14.5%或更多、約15%或更多、約15.5%或更多、約16%或更多、約16.5%或更多、約17%或更多、約17.5%或更多、約18%或更多、約18.5%或更多、約19%或更多、約19.5%或更多、約20%或更多、約21%、約22%或更多、約23%或更多、約24%或更多、約25%或更多、約26%或更多、約27%或更多、約28%或更多、約29%或更多、約30%或更多、約31%或更多、約32%或更多、約33%或更多、約34%或更多、約35%或更多、約36%或更多、約37%或更多、約38%或更多、約39%或更多、約40%或更多、約41%或更多、約42%或更多、約43%或更多、約44%或更多、約45%或更多、約46%或更多、約47%或更多、約48%或更多、約49%或更多、約50%或更多、約51%或更多、約52%或更多、約53%或更多、約54%或更多、約55%或更多、約56%或更多、約57%或更多、約58%或更多、約59%或更多、約60%或更多、約61%或更多、約62%或更多、約63%或更多、約64%或更多、約65%或更多、約66%或更多、約67%或更多、約68%或更多、約69%或更多、約70%或更多、約71%或更多、約72%或更多、約73%或更多、約74%或更多、約75%或更多、約76%或更多、約77%或更多、約78%或更多、約79%或更多、約80%或更多、約81%或更多、約82%或更多、約83%或更多、約84%或更多、約85%或更多、約86%或更多、約87%或更多、約88%或更多、約89%或更多、約90%或更多、約91%或更多、約92%或更多、約93%或更多、約94%或更多、約95%或更多、約96%或更多、約97%或更多、約98%或更多、或約99%或更多之百分比之sTIL。
例如，在一些實施例中，sTIL之百分比為腫瘤樣品之約5%至50%、5%至45%、5%至40%、5%至35%、5%至30%、5%至25%、5%至20%、5%至15%、5%至10%、5%至9%、5%至8%、5%至7%、5%至6%、6%至50%、6%至45%、6%至40%、6%至35%、6%至30%、6%至25%、6%至20%、6%至15%、6%至10%、6%至9%、6%至8%、6%至7%、7%至50%、7%至45%、7%至40%、7%至35%、7%至30%、7%至25%、7%至20%、7%至15%、7%至10%、7%至9%、7%至8%、8%至50%、8%至45%、8%至40%、8%至35%、8%至30%、8%至25%、8%至20%、8%至15%、8%至10%、8%至9%、9%至50%、9%至45%、9%至40%、9%至35%、9%至30%、9%至25%、9%至20%、9%至15%、9%至10%、10%至50%、10%至45%、10%至40%、10%至35%、10%至30%、10%至25%、10%至20%、或10%至15%。
應瞭解在前述方法中任一者中，腫瘤樣品之sTIL之百分比可為總腫瘤內基質面積內單核炎症細胞所佔據之面積。sTIL之百分比可使用在此項技術中已知之任何合適方法來評估，例如在Salgado等人Annals of Oncology 26:259-271, 2015中所描述。
在前述態樣中任一項之一些實施例中，該患者先前未接受針對局部晚期或轉移性乳癌的化學療法或靶向全身療法。例如，在一些實施例中，患者先前未接受針對不宜動手術的局部晚期或轉移性TNBC的化學療法或靶向全身療法。在一些實施例中，患者先前未接受針對不宜動手術的局部晚期TNBC的化學療法或靶向全身療法。在其他實施例中，患者先前未接受針對不宜動手術的轉移性TNBC的化學療法或靶向全身療法。
在前述態樣中任一項之一些實施例中，局部晚期TNBC為不可切除的。
在前述態樣中任一項之一些實施例中，腫瘤樣品為福馬林固定且石蠟包埋(FFPE)的腫瘤樣品、檔案腫瘤樣品、新鮮腫瘤樣品或冷凍腫瘤樣品。
在前述態樣中任一項之一些實施例中，PD-1結合拮抗劑為人類PD-1結合拮抗劑，諸如抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)或抗PD-1抗體。在一些實施例中，PD-1結合拮抗劑為阿特珠單抗。
在前述態樣中任一項之一些實施例中，紫杉烷為nab-太平洋紫杉醇。
在前述態樣中任一項之其他實施例中，紫杉烷為太平洋紫杉醇。
在前述態樣中任一項之一些實施例中，患者是否可能對用該抗癌療法之治療有反應係依據無進展存活來確定。例如，與用包含紫杉烷而沒有PD-1軸結合拮抗劑之抗癌療法之治療相比，用包含(i) PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)及抗PD-1抗體之PD-1軸結合拮抗劑)及(ii)紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)之抗癌療法之治療可增加患者之無進展存活約1個月、約2個月、約2.5個月、約3個月、約3.5個月、約4個月、約4.5個月、約5個月、約5.5個月、約6個月、約6.5個月、約7個月、或更長時間。在一個實施例中，與用包含紫杉烷而沒有PD-1軸結合拮抗劑之抗癌療法之治療相比，用包含(i) PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)及抗PD-1抗體之PD-1軸結合拮抗劑)及(ii)紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)之抗癌療法之治療可增加患者之無進展存活約2.5個月。
在前述態樣中任一項之一些實施例中，患者是否可能對用該抗癌療法之治療有反應係依據總體存活來確定。例如，與用包含紫杉烷而沒有PD-1軸結合拮抗劑之抗癌療法之治療相比，用包含(i) PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)及抗PD-1抗體之PD-1軸結合拮抗劑)及(ii)紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)之抗癌療法之治療可增加患者之總體存活約1個月、約2個月、約3個月、約4個月、約5個月、約6個月、約7個月、約8個月、約9個月、約10個月、約11個月、約12個月、約13個月、約14個月、或更長時間。在一個實施例中，與用包含紫杉烷而沒有PD-1軸結合拮抗劑之抗癌療法之治療相比，用包含(i) PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)及抗PD-1抗體之PD-1軸結合拮抗劑)及(ii)紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)之抗癌療法之治療可增加患者之總體存活約7個月。
在前述態樣中任一項之一些實施例中，患者是否可能對用該抗癌療法之治療有反應係依據總體反應率來確定。
在前述態樣中任一項之一些實施例中，患者是否可能對用該抗癌療法之治療有反應係依據完全反應率來確定。
在前述態樣中任一項之一些實施例中，患者是否可能對用該抗癌療法之治療有反應係依據部分反應率來確定。
如上所述之生物標記物中任一者之存在及/或表現水準(包括PD-L1 (例如，例如獲自患者之腫瘤樣品中腫瘤浸潤免疫細胞(IC)上之PD-L1表現及/或獲自患者之腫瘤樣品中腫瘤細胞(TC)上之PD-L1表現)、CD8 (例如，獲自患者之腫瘤樣品中之CD8表現)、及/或例如獲自患者之腫瘤樣品中基質TIL (sTIL)之存在)可基於在此項技術中已知之任何合適標準來定性及/或定量地評估，該標準包括但不限於DNA、mRNA、cDNA、蛋白、蛋白片段、及/或基因複本數目。用於量測此類生物標記物之方法為此項技術中已知的並且為熟習此項技術者所理解，包括但不限於IHC、西方墨點分析、免疫沉澱、分子結合檢定、ELISA、ELIFA、螢光活化細胞分選術(「FACS」)、MassARRAY、蛋白質組學、基於血液之定量檢定(例如，血清ELISA)、生化酶活性檢定、原位雜交(ISH)、螢光原位雜交(FISH)、南方分析(Southern analysis)、北方分析（Northern analysis）、全基因組測序、聚合酶鏈反應(PCR)包括定量即時PCR (qRT-PCR)及其他擴增類型偵測方法例如像分支DNA、SISBA、TMA及其類似方法、RNASeq、微陣列分析、基因表現剖析、全基因組測序(WGS)、及/或基因表現系列分析(「SAGE」)，以及可藉由蛋白、基因、及/或組織陣列分析來執行之多種檢定中之任一者。用於評估基因及基因產物之狀態的典型方案例如在Ausubel等人編(Current Protocols In Molecular Biology, 1995)之第2單元(北方墨點法)、第4單元(南方墨點法)、第15單元(免疫墨點法)、及第18單元(PCR分析)中發現。亦可使用多重免疫分析，諸如可自Rules Based Medicine或Meso Scale Discovery (「MSD」)獲得之免疫分析。
在前述方法中任一者之一些實施例中，生物標記物之表現水準可為蛋白表現水準。在某些實施例中，該方法包括使樣品與特異性結合至本文所述之生物標記物的抗體在容許生物標記物結合之條件下接觸，及偵測在抗體與生物標記物之間是否形成複合物。此方法可為活體外或活體內方法。在一些實施例中，抗體用於選擇適合於用抗癌療法治療的患者，該抗癌療法包括PD-1軸結合拮抗劑例如抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)或抗PD-1抗體例如用於選擇個體之生物標記物。
可使用此項技術中已知或本文所提供之量測蛋白表現水準之任何方法。例如，在一些實施例中，生物標記物之蛋白表現水準係使用選自由以下組成之群之方法來確定：免疫組織化學(IHC)、流動式細胞測量術(例如，螢光活化細胞分選(FACS™))、西方墨點法、酶聯免疫吸附檢定(ELISA)、免疫沉澱、免疫螢光、放射免疫檢定、斑點墨點法(dot blotting)、免疫偵測方法、HPLC、表面電漿子共振、光譜法、質譜法、及HPLC。
在一些實施例中，生物標記物之蛋白表現水準係在腫瘤浸潤免疫細胞中確定。在一些實施例中，生物標記物之蛋白表現水準係在腫瘤細胞中確定。在一些實施例中，生物標記物之蛋白表現水準係在腫瘤浸潤免疫細胞及/或腫瘤細胞中確定。在一些實施例中，生物標記物之蛋白表現水準係在外周血單核細胞(PBMC)中確定。
在某些實施例中，樣品中生物標記物蛋白之存在及/或表現水準/量係使用IHC及染色方案來檢查。組織切片之IHC染色已顯示為確定或偵測樣品中蛋白之存在的可靠方法。在該等方法、檢定、及/或套組中任一者之一些實施例中，生物標記物為PD-L1或CD8之蛋白表現產物之一或多者。在一個實施例中，生物標記物之表現水準係使用包含以下步驟之方法來確定：(a)用抗體來執行樣品(諸如獲自患者之腫瘤樣品)之IHC分析；及(b)確定樣品中生物標記物之表現水準。在一些實施例中，IHC染色強度係相對於參考來確定的。在一些實施例中，參考物為參考值。在一些實施例中，參考物為參考樣品(例如，對照細胞株染色樣品、來自非癌患者之組織樣品、或經確定為對所關注之生物標記物呈陰性之腫瘤樣品)。
例如，在一些實施例中，PD-L1之蛋白表現水準想使用IHC確定。在一些實施例中，PD-L1之蛋白表現水準係使用抗PD-L1抗體偵測。可使用任何合適抗PD-L1抗體。在一些實施例中，抗PD-L1抗體為SP142。
在另一實例中，在一些實施例中，CD8之蛋白表現水準係使用IHC確定。在一些實施例中，CD8之蛋白表現水準係使用抗CD8抗體偵測。可使用任何合適抗CD8抗體。
IHC可與諸如形態染色及/或原位雜交(例如，ISH)之額外技術組合來執行。兩種一般IHC方法可供使用；直接及間接檢定。根據第一次檢定，直接確定抗體與靶抗原之結合。這種直接檢定使用經標記之試劑，諸如螢光標籤或酶標記之一級抗體，其可經可視化而無需進一步抗體相互作用。在典型的間接檢定中，未綴合之一級抗體結合抗原，然後經標記之二級抗體結合一級抗體。當二級抗體綴合至酶標記時，加入顯色或螢光基質以提供抗原之可視化。由於數種二級抗體可與一級抗體上之不同抗原決定基反應而發生信號放大。
用於IHC之一級及/或二級抗體通常以可偵測部分標記。許多標籤可供使用，其一般可分組為以下類別：(a)放射性同位素，諸如35 S、14 C、125 I、3 H、及131 I；(b)膠體金粒子；(c)螢光標記，包括但不限於稀土螯合物(銪螯合物)、德克薩斯紅、玫瑰紅、螢光素、丹磺醯基、麗絲胺、繖形酮、藻紅素(phycocrytherin)、藻藍素或商業上可獲得的螢光團諸如SPECTRUM ORANGE7及SPECTRUM GREEN7，及/或上文中之任何一或多種之衍生物；(d)各種酶-基質標記可供使用，且美國專利第4,275,149號提供一些酶-基質標記之評述。酶標記之實例包括螢光素酶(例如，螢火蟲螢光素酶及細菌螢光素酶；參見例如美國專利第4,737,456號)、螢光素、2,3-二氫酞嗪二酮、蘋果酸脫氫酶、脲酶、過氧化酶諸如山葵過氧化酶(HRPO)、鹼性磷酸酶、β-半乳糖苷酶、葡糖澱粉酶、溶菌酶、醣氧化酶(例如，葡萄糖氧化酶、半乳糖氧化酶、及葡萄糖-6-磷酸脫氫酶)、雜環氧化酶(諸如尿酸酶及黃嘌呤氧化酶)、乳過氧化酶、微過氧化酶、及其類似物。
酶-受質組合之實例包括例如具有作為受質之過氧化氫酶的辣根過氧物酶(HRPO)；具有作為顯色受質之對硝基苯基磷酸的鹼性磷酸酶(AP)；及具有顯色受質(例如，對硝基苯基-β-D-半乳糖苷酶)或螢光受質(例如，4-甲基傘形基-β-D-半乳糖苷酶)之β-D-半乳糖苷酶(β-D-Gal)。關於此等組合之一般綜述，參見，例如，美國專利第4,275,149號及第4,318,980號。
試樣可例如手動或使用自動染色儀器(例如，Ventana BenchMark XT或Benchmark ULTRA儀器)來製備。如此製備之試樣可經安裝及加蓋玻片。載片評估然後例如使用顯微鏡來確定，並且可使用此項技術中常規使用之染色強度標準。在一個實施例中，應瞭解當使用IHC來檢查來自腫瘤之細胞及/或組織時，可確定或評估腫瘤細胞及/或組織(而非可存在於樣品中之基質或周圍組織)中之染色。在其他實施例中，可確定或評估可存在於樣品中之基質或周圍組織中之染色。在一些實施例中，應瞭解當使用IHC檢查來自腫瘤之細胞及/或組織時，染色包括在腫瘤浸潤性免疫細胞包括腫瘤內或腫瘤周圍免疫細胞中之測定或評估。在一些實施例中，藉由IHC偵測＞0%之樣品、至少1%之樣品、至少5%之樣品、至少10%之樣品、至少15%之樣品、至少15%之樣品、至少20%之樣品、至少25%之樣品、至少30%之樣品、至少35%之樣品、至少40%之樣品、至少45%之樣品、至少50%之樣品、至少55%之樣品、至少60%之樣品、至少65%之樣品、至少70%之樣品、至少75%之樣品、至少80%之樣品、至少85%之樣品、至少90%之樣品、至少95%或更多之樣品中生物標記物之存在。樣品可使用此項技術中已知之任何方法，例如，藉由病理學或自動影像分析來評分。
在該等方法中任一者之一些實施例中，生物標記物係藉由免疫組織化學使用診斷抗體(亦即，一級抗體)來偵測。在一些實施例中，診斷抗體特異性結合人類抗原。在一些實施例中，診斷抗體為非人類抗體。在一些實施例中，診斷抗體為大鼠、小鼠、或兔抗體。在一些實施例中，診斷抗體為兔抗體。在一些實施例中，診斷抗體為單株抗體。在一些實施例中，診斷抗體經直接標記。在其他實施例中，診斷抗體經間接標記(例如，藉由二級抗體)。
在前述方法中任一者之其他實施例中，生物標記物之表現水準可為核酸表現水準(例如，DNA表現水準或RNA表現水準(例如，mRNA表現水準))。可使用確定核酸表現水準之任何合適方法。在一些實施例中，核酸表現水準係使用RNAseq、RT-qPCR、qPCR、多重qPCR或RT-qPCR、微陣列分析、SAGE、MassARRAY技術、ISH、或其組合確定。
評估細胞中之mRNA之方法為熟知的並且包括例如基因表現系列分析(SAGE)、全基因組測序(WGS)、使用互補DNA探針之雜交檢定(諸如使用對於一或多種基因具有特異性之經標記核糖核酸探針的原位雜交、北方墨點及相關技術)及各種核酸擴增檢定(諸如使用對於基因之一或多者具有特異性之互補引子的RT-PCR (例如，qRT-PCR)，及其他擴增類型偵測方法，例如像分支DNA、SISBA、TMA、及其類似方法)。此外，此類方法可包括使人們可確定生物樣品中標靶mRNA之水準的一或多個步驟(例如藉由同時檢查「持家」基因諸如肌動蛋白家族成員之比較性對照mRNA序列之水準)。視情況，可確定經擴增之靶cDNA之序列。視情況選用之方法包括藉由微陣列技術檢查或偵測組織或細胞樣品中之mRNA諸如靶mRNA之方案。使用核酸微陣列，來自測試及對照組織樣品之測試及對照mRNA樣品經逆轉錄且經標記以生成cDNA探針。該等探針接著雜交至固定於固體支撐物上之核酸陣列。該陣列經組態以使得該陣列各成員之序列及位置係已知的。例如，可將所選擇之基因排列在固體支撐物上，該等基因之表現與包含免疫療法及抑制基質拮抗劑之治療的增加或降低之臨床益處相關。經標記探針與特定陣列成員之雜交指示產生該探針之樣品表現彼基因。
在前述實施例中任一項之一些實施例中，在投與抗癌療法之前(例如，之前幾分鐘、幾小時、幾天、幾週(例如，1、2、3、4、5、6、或7週)、幾個月、或幾年)，從個體獲得樣品。在前述方法中任一者之一些實施例中，在投與抗癌療法之後約2至約10週(例如，2、3、4、5、6、7、8、9、或10週)，從個體獲得樣品。在一些實施例中，在投與抗癌療法之後約4至約6週，從個體獲得樣品。
在前述方法中任一者之一些實施例中，偵測組織樣品、原代或培養細胞或細胞株、細胞上清液、細胞溶解產物、血小板、血清、血漿、玻璃狀液、淋巴液、滑液、濾泡液、精液、羊水、乳、全血、血源性細胞、尿液、腦脊髓液、唾液、痰、淚液、汗、黏液、腫瘤溶解產物、及組織培養基、組織提取物諸如均化組織、腫瘤組織、細胞提取物、或其任何組合中生物標記物之表現水準或數目。在一些實施例中，樣品為組織樣品(例如，腫瘤組織樣品)、細胞樣品、全血樣品、血漿樣品、血清樣品、或其組合。在一些實施例中，腫瘤組織樣品包括腫瘤細胞、腫瘤浸潤免疫細胞、基質細胞、或其組合。在一些實施例中，該腫瘤組織樣品為福馬林固定且石蠟包埋(FFPE)樣品、檔案樣品、新鮮樣品或冷凍樣品。
例如，在前述方法中任一者之一些實施例中，使用已知技術(例如，IHC、免疫螢光顯微術、或流動式細胞測量術)偵測腫瘤浸潤免疫細胞、腫瘤細胞、PBMC、或其組合中生物標記物之表現水準。腫瘤浸潤免疫細胞包括但不限於腫瘤內免疫細胞、腫瘤周圍免疫細胞、或其任何組合、及其他腫瘤基質細胞(例如，纖維母細胞)。此等腫瘤浸潤免疫細胞可為例如T淋巴球(諸如CD8+ T淋巴球(例如，CD8+ T效應(Teff)細胞)及/或CD4+ T淋巴球(例如，CD4+ Teff細胞)、B淋巴球、或其他骨髓譜系細胞包括顆粒球(嗜中性球、嗜伊紅性球、嗜鹼性球)、單核球、巨噬細胞、樹突狀細胞(例如，交錯樹突狀細胞)、組織細胞、及自然殺手(NK)細胞。在一些實施例中，以膜染色、細胞質染色、或其組合之形式偵測生物標記物之染色。在其他實施例中，以相對於參考樣品的樣品之不存在或未染色偵測生物標記物之不存在。
在前述方法中任一者之特定實施例中，生物標記物之表現水準係在含有或疑似含有癌細胞之樣品中評估。樣品可為例如從患有、疑似患有、或經診斷患有癌症(例如，乳癌(例如，局部晚期或轉移性乳癌(例如，局部晚期或轉移性TNBC)))之患者獲得之組織生檢或轉移性病灶。在一些實施例中，樣品為乳腺組織之樣品、乳腺腫瘤之生檢、已知或疑似轉移性乳癌病灶或切片、或血液樣品例如已知或疑似包含循環癌細胞例如乳癌細胞之外周血樣品。樣品可包含癌細胞亦即腫瘤細胞及非癌細胞(例如，淋巴球，諸如T細胞或NK細胞)，並且在某些實施例中包含癌及非癌細胞。獲得生物樣品(包括組織切除物、生檢、及體液，例如包含癌細胞/腫瘤細胞之血液樣品)之方法為此項技術中熟知的。
患者可患有晚期、難治性、復發性、化學療法抗性、及/或鉑抗性形式之癌症。
在某些實施例中，如與第二樣品中之存在/不存在及/或表現水準/量相比，第一樣品中生物標記物之存在及/或表現水準/量增加或升高。在某些實施例中，如與第二樣品中之存在及/或表現水準/量相比，第一樣品中生物標記物之存在/不存在及/或表現水準/量減少或降低。在某些實施例中，第二樣品為參考樣品、參考細胞、參考組織、對照樣品、對照細胞、或對照組織。
在某些實施例中，參考樣品、參考細胞、參考組織、對照樣品、對照細胞、或對照組織為與獲得測試樣品時相比，在一或多個不同時間點獲得的來自同一患者或個體之單一樣品或經組合之多個樣品。例如，與獲得測試樣品時相比，參考樣品、參考細胞、參考組織、對照樣品、對照細胞、或對照組織在更早時間點從同一患者或個體獲得。若在癌症之初始診斷期間獲得參考樣品，且在癌症變成轉移性癌症時稍後獲得測試樣品，則此類參考樣品、參考細胞、參考組織、對照樣品、對照細胞、或對照組織可為可用的。
在某些實施例中，參考樣品、參考細胞、參考組織、對照樣品、對照細胞、或對照組織為來自一或多個不為該患者之健康個體的經組合之多個樣品。在某些實施例中，參考樣品、參考細胞、參考組織、對照樣品、對照細胞、或對照組織為來自一或多個不為該患者或個體之患有疾病或病症(例如，癌症)之個體的經組合之多個樣品。在某些實施例中，參考樣品、參考細胞、參考組織、對照樣品、對照細胞、或對照組織為來自正常組織之彙集RNA樣品或來自一或多個不為該患者之個體的彙集血漿或血清樣品。在某些實施例中，參考樣品、參考細胞、參考組織、對照樣品、對照細胞、或對照組織為來自腫瘤組織之彙集RNA樣品或來自一或多個不為該患者之患有疾病或病症(例如，癌症)之個體的彙集血漿或血清樣品。
在前述態樣中任一項之一些實施例中，該方法進一步包括向患者投與有效量之抗癌療法。該方法可進一步包括以下在部分IV中描述之任何方法。IV. 治療方法
本文提供用於治療個體中之局部晚期或轉移性乳癌(例如，局部晚期或轉移性TNBC)或延遲其進展的方法，其包含向個體投與有效量的PD-1軸結合拮抗劑(例如，抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)或抗PD-1抗體)及紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)。在一些實施例中，治療導致治療之後的個體中之反應。在一些實施例中，反應為部分反應。在一些實施例中，反應為完全反應。在一些實施例中，治療導致在停止治療之後的個體中之持續反應(例如，持續部分反應或完全反應)。例如，在一些實施例中，患者呈PD-L1陽性。本文所述之方法可適用於治療需要增強免疫原性(諸如為了治療癌症而增加腫瘤免疫原性)的病狀。本文亦提供在患有局部晚期或轉移性乳癌之個體中增強免疫功能之方法，其包含向個體投與有效量的PD-1軸結合拮抗劑(例如，抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)或抗PD-1抗體)及紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)。此項技術中已知或本文所述之PD-1軸結合拮抗劑及紫杉烷中之任一者均可用於該等方法中。
例如，本文提供一種治療患有局部晚期或轉移性乳癌(例如，局部晚期或轉移性TNBC)之患者的方法，該方法包括向患者投與有效量之抗癌療法，該抗癌療法包含(i) PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑)及(ii)紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)，其中患者先前未針對乳癌(例如，局部晚期或轉移性TNBC)進行治療，並且其中基於獲自患者之樣品(例如，腫瘤樣品)中之PD-L1之可偵測的表現水準，患者經鑑別為可能對抗癌療法有反應。
在另一態樣中，本發明提供一種用於治療患有局部晚期或轉移性乳癌(例如，局部晚期或轉移性TNBC)之患者的方法，該方法包括：(a)確定獲自患者之樣品(例如，腫瘤樣品)中之PD-L1之表現水準，其中患者先前未針對乳癌(例如，局部晚期或轉移性TNBC)進行治療；及(b)基於樣品中之PD-L1之可偵測的表現水準，向患者投與治療有效量的抗癌療法，該抗癌療法包含(i) PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑)及(ii)紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)。
在另一態樣中，本發明提供一種用於治療經診斷患有局部晚期或轉移性乳癌(例如，局部晚期或轉移性TNBC)之患者的包含PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑)之醫藥組成物，其中該治療包含投與人類PD-1軸結合拮抗劑以及紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)，並且其中基於獲自患者之樣品(例如，腫瘤樣品)中之PD-L1之可偵測的表現水準，該患者經鑑別為可能對包含人類PD-1軸結合拮抗劑及紫杉烷之抗癌療法有反應。在一些實施例中，患者先前未針對乳癌(例如，局部晚期或轉移性TNBC)進行治療。
可使用任何合適樣品。例如，樣品可為腫瘤樣品。
在另一實例中，本文提供一種治療患有局部晚期或轉移性乳癌(例如，局部晚期或轉移性TNBC)之患者的方法，該方法包括向患者投與有效量的抗癌療法，該抗癌療法包含(i) PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑)及(ii)紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)，其中患者先前未針對乳癌(例如，局部晚期或轉移性TNBC)進行治療，並且其中基於佔獲自患者之腫瘤樣品之約1%或更多之腫瘤浸潤免疫細胞中PD-L1之可偵測的表現水準，患者經鑑別為可能對抗癌療法有反應。
在另一態樣中，本發明提供一種治療患有局部晚期或轉移性乳癌(例如，局部晚期或轉移性TNBC)之患者的方法，該方法包括：(a)確定獲自患者之腫瘤樣品之腫瘤浸潤免疫細胞中PD-L1之表現水準，其中患者先前未針對乳癌(例如，局部晚期或轉移性TNBC)進行治療；及(b)基於佔腫瘤樣品之約1%或更多之腫瘤浸潤免疫細胞中PD-L1之可偵測的表現水準，向患者投與治療有效量的抗癌療法，該抗癌療法包含(i) PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑)及(ii)紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)。
在另一態樣中，本發明提供一種用於治療經診斷患有局部晚期或轉移性乳癌(例如，局部晚期或轉移性TNBC)之患者的包含PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑)之醫藥組成物，其中該治療包含投與人類PD-1軸結合拮抗劑以及紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)，並且其中基於佔獲自患者之腫瘤樣品之約1%或更多之腫瘤浸潤免疫細胞中PD-L1之可偵測的表現水準，該患者經鑑別為可能對包含人類PD-1軸結合拮抗劑及紫杉烷之抗癌療法有反應。在一些實施例中，患者先前未針對乳癌(例如，局部晚期或轉移性TNBC)進行治療。
在前述態樣中任一項之一些實施例中，局部晚期或轉移性乳癌為局部晚期或轉移性TNBC。
例如，本文提供一種治療患有局部晚期TNBC之患者的方法，該方法包括向患者投與有效量的抗癌療法，該抗癌療法包含(i) PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑)及(ii)紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)，其中患者先前未針對局部晚期TNBC進行治療，並且其中基於佔獲自患者之腫瘤樣品之約1%或更多之腫瘤浸潤免疫細胞中PD-L1之可偵測的表現水準，患者經鑑別為可能對抗癌療法有反應。
在另一實例中，本文提供一種治療患有轉移性TNBC之患者的方法，該方法包括向患者投與有效量的抗癌療法，該抗癌療法包含(i) PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑)及(ii)紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)，其中患者先前未針對轉移性TNBC進行治療，並且其中基於佔獲自患者之腫瘤樣品之約1%或更多之腫瘤浸潤免疫細胞中PD-L1之可偵測的表現水準，患者經鑑別為可能對抗癌療法有反應。
在另一實例中，本文提供一種治療患有局部晚期TNBC之患者的方法，該方法包括：(a)確定獲自患者之腫瘤樣品之腫瘤浸潤免疫細胞中PD-L1之表現水準，其中患者先前未針對局部晚期TNBC進行治療；及(b)基於佔腫瘤樣品之約1%或更多之腫瘤浸潤免疫細胞中PD-L1之可偵測的表現水準，向患者投與治療有效量的抗癌療法，該抗癌療法包含(i) PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑)及(ii)紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)。
在進一步實例中，本文提供一種治療患有轉移性TNBC之患者的方法，該方法包括：(a)確定獲自患者之腫瘤樣品之腫瘤浸潤免疫細胞中PD-L1之表現水準，其中患者先前未針對轉移性TNBC進行治療；及(b)基於佔腫瘤樣品之約1%或更多之腫瘤浸潤免疫細胞中PD-L1之可偵測的表現水準，向患者投與治療有效量的抗癌療法，該抗癌療法包含(i) PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑)及(ii)紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)。
在另一實例中，本文提供一種用於治療經診斷患有局部晚期TNBC之患者的包含PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑)之醫藥組成物，其中該治療包含投與PD-1軸結合拮抗劑以及紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)，並且其中基於佔獲自患者之腫瘤樣品之約1%或更多之腫瘤浸潤免疫細胞中PD-L1之可偵測的表現水準，該患者經鑑別為可能對包含人類PD-1軸結合拮抗劑及紫杉烷之抗癌療法有反應。在一些實施例中，患者先前未針對局部晚期TNBC進行治療。
在另一實例中，本文提供一種用於治療經診斷患有轉移性TNBC之患者的包含PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)及抗PD-1抗體之PD-1軸結合拮抗劑)之醫藥組成物，其中該治療包含投與PD-1軸結合拮抗劑以及紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)，並且其中基於佔獲自患者之腫瘤樣品之約1%或更多之腫瘤浸潤免疫細胞中PD-L1之可偵測的表現水準，該患者經鑑別為可能對包含人類PD-1軸結合拮抗劑及紫杉烷之抗癌療法有反應。在一些實施例中，患者先前未針對轉移性TNBC進行治療。
在另一實例中，本文提供一種治療患有局部晚期TNBC之患者的方法，該方法包括向患者投與有效量的抗癌療法，該抗癌療法包含阿特珠單抗及nab-太平洋紫杉醇，其中患者先前未針對局部晚期TNBC進行治療，並且其中基於佔獲自患者之腫瘤樣品之約1%或更多之腫瘤浸潤免疫細胞中PD-L1之可偵測的表現水準，患者經鑑別為可能對抗癌療法有反應。
在另一實例中，本文提供一種治療患有轉移性TNBC之患者的方法，該方法包括向患者投與有效量的抗癌療法，該抗癌療法包含阿特珠單抗及nab-太平洋紫杉醇，其中患者先前未針對轉移性TNBC進行治療，並且其中基於佔獲自患者之腫瘤樣品之約1%或更多之腫瘤浸潤免疫細胞中PD-L1之可偵測的表現水準，患者經鑑別為可能對抗癌療法有反應。
在進一步實例中，本文提供一種治療患有局部晚期TNBC之患者的方法，該方法包括：(a)確定獲自患者之腫瘤樣品之腫瘤浸潤免疫細胞中PD-L1之表現水準，其中患者先前未針對局部晚期TNBC進行治療，及(b)基於佔腫瘤樣品之約1%或更多之腫瘤浸潤免疫細胞中PD-L1之可偵測的表現水準，向患者投與治療有效量的抗癌療法，該抗癌療法包含阿特珠單抗及nab-太平洋紫杉醇。
在另一實例中，本文提供一種治療患有轉移性TNBC之患者的方法，該方法包括：(a)確定獲自患者之腫瘤樣品之腫瘤浸潤免疫細胞中PD-L1之表現水準，其中患者先前未針對轉移性TNBC進行治療；及(b)基於佔腫瘤樣品之約1%或更多之腫瘤浸潤免疫細胞中PD-L1之可偵測的表現水準，向患者投與治療有效量的抗癌療法，該抗癌療法包含阿特珠單抗及nab-太平洋紫杉醇。
在另一實例中，本文提供一種用於治療經診斷患有局部晚期TNBC之患者的包含阿特珠單抗之醫藥組成物，其中該治療包含投與阿特珠單抗以及nab-太平洋紫杉醇，並且其中基於佔獲自患者之腫瘤樣品之約1%或更多之腫瘤浸潤免疫細胞中PD-L1之可偵測的表現水準，患者經鑑別為可能對包含阿特珠單抗及nab-太平洋紫杉醇之抗癌療法有反應。在一些實施例中，患者先前未針對局部晚期TNBC進行治療。
在另一實例中，本文提供一種用於治療經診斷患有轉移性TNBC之患者的包含阿特珠單抗之醫藥組成物，其中該治療包含投與阿特珠單抗以及nab-太平洋紫杉醇，並且其中基於佔獲自患者之腫瘤樣品之約1%或更多之腫瘤浸潤免疫細胞中PD-L1之可偵測的表現水準，該患者經鑑別為可能對包含阿特珠單抗及nab-太平洋紫杉醇之抗癌療法有反應。在一些實施例中，患者先前未針對轉移性TNBC進行治療。
在另一實例中，本文提供一種治療患有局部晚期TNBC之患者的方法，該方法包括向患者投與有效量的抗癌療法，該抗癌療法包含阿特珠單抗及太平洋紫杉醇，其中患者先前未針對局部晚期TNBC進行治療，並且其中基於佔獲自患者之腫瘤樣品之約1%或更多之腫瘤浸潤免疫細胞中PD-L1之可偵測的表現水準，患者經鑑別為可能對抗癌療法有反應。
在另一實例中，本文提供一種治療患有轉移性TNBC之患者的方法，該方法包括向患者投與有效量的抗癌療法，該抗癌療法包含阿特珠單抗及太平洋紫杉醇，其中患者先前未針對轉移性TNBC進行治療，並且其中基於佔獲自患者之腫瘤樣品之約1%或更多之腫瘤浸潤免疫細胞中PD-L1之可偵測的表現水準，患者經鑑別為可能對抗癌療法有反應。
在進一步實例中，本文提供一種治療患有局部晚期TNBC之患者的方法，該方法包括：(a)確定獲自患者之腫瘤樣品之腫瘤浸潤免疫細胞中PD-L1之表現水準，其中患者先前未針對局部晚期TNBC進行治療，及(b)基於佔腫瘤樣品之約1%或更多之腫瘤浸潤免疫細胞中PD-L1之可偵測的表現水準，向患者投與治療有效量的抗癌療法，該抗癌療法包含阿特珠單抗及太平洋紫杉醇。
在另一實例中，本文提供一種治療患有轉移性TNBC之患者的方法，該方法包括：(a)確定獲自患者之腫瘤樣品之腫瘤浸潤免疫細胞中PD-L1之表現水準，其中患者先前未針對轉移性TNBC進行治療；及(b)基於佔腫瘤樣品之約1%或更多之腫瘤浸潤免疫細胞中PD-L1之可偵測的表現水準，向患者投與治療有效量的抗癌療法，該抗癌療法包含阿特珠單抗及太平洋紫杉醇。
在另一實例中，本文提供一種用於治療經診斷患有局部晚期TNBC之患者的包含阿特珠單抗之醫藥組成物，其中該治療包含投與阿特珠單抗以及太平洋紫杉醇，並且其中基於佔獲自患者之腫瘤樣品之約1%或更多之腫瘤浸潤免疫細胞中PD-L1之可偵測的表現水準，患者經鑑別為可能對包含阿特珠單抗及太平洋紫杉醇之抗癌療法有反應。在一些實施例中，患者先前未針對局部晚期TNBC進行治療。
在另一實例中，本文提供一種用於治療經診斷患有轉移性TNBC之患者的包含阿特珠單抗之醫藥組成物，其中該治療包含投與阿特珠單抗以及太平洋紫杉醇，並且其中基於佔獲自患者之腫瘤樣品之約1%或更多之腫瘤浸潤免疫細胞中PD-L1之可偵測的表現水準，該患者經鑑別為可能對包含阿特珠單抗及太平洋紫杉醇之抗癌療法有反應。在一些實施例中，患者先前未針對轉移性TNBC進行治療。
在前述方法中任一者之一些實施例中，已確定獲自患者之腫瘤樣品在佔腫瘤樣品之約1%或更多(例如，約1%或更多、2%或更多、3%或更多、5%或更多、6%或更多、7%或更多、8%或更多、9%或更多、10%或更多、11%或更多、12%或更多、13%或更多、14%或更多、15%或更多、16%或更多、17%或更多、18%或更多、19%或更多、20%或更多、21%或更多、22%或更多、23%或更多、24%或更多、25%或更多、26%或更多、27%或更多、28%或更多、29%或更多、30%或更多、31%或更多、32%或更多、33%或更多、34%或更多、35%或更多、36%或更多、37%或更多、38%或更多、39%或更多、40%或更多、41%或更多、42%或更多、43%或更多、44%或更多、45%或更多、46%或更多、47%或更多、48%或更多、49%或更多、約50%或更多、約60%或更多、約70%或更多、約80%或更多、約90%或更多、約95%或更多、約96%或更多、約97%或更多、約98%或更多、約99%或更多、或100%)之腫瘤浸潤免疫細胞中具有PD-L1之可偵測的表現水準。例如，在一些實施例中，已確定獲自患者之腫瘤樣品在佔腫瘤樣品之約1%至少於約5% (例如，1%至4.9%、1%至4.5%、1%至4%、1%至3.5%、1%至3%、1%至2.5%、或1%至2%)之腫瘤浸潤免疫細胞中具有PD-L1之可偵測的表現水準。
在前述方法中任一者之一些實施例中，已確定獲自患者之腫瘤樣品在佔腫瘤樣品中之約1%或更多(例如，約1%或更多、2%或更多、3%或更多、5%或更多、6%或更多、7%或更多、8%或更多、9%或更多、10%或更多、11%或更多、12%或更多、13%或更多、14%或更多、15%或更多、16%或更多、17%或更多、18%或更多、19%或更多、20%或更多、21%或更多、22%或更多、23%或更多、24%或更多、25%或更多、26%或更多、27%或更多、28%或更多、29%或更多、30%或更多、31%或更多、32%或更多、33%或更多、34%或更多、35%或更多、36%或更多、37%或更多、38%或更多、39%或更多、40%或更多、41%或更多、42%或更多、43%或更多、44%或更多、45%或更多、46%或更多、47%或更多、48%或更多、49%或更多、約50%或更多、約60%或更多、約70%或更多、約80%或更多、約90%或更多、約95%或更多、約96%或更多、約97%或更多、約98%或更多、約99%或更多、或100%)的腫瘤浸潤免疫細胞中具有PD-L1之可偵測的表現水準。例如，在一些實施例中，已確定獲自患者之腫瘤樣品在佔腫瘤樣品中之約1%至少於約5% (例如，1%至4.9%、1%至4.5%、1%至4%、1%至3.5%、1%至3%、1%至2.5%、或1%至2%)的腫瘤浸潤免疫細胞中具有PD-L1之可偵測的表現水準。
在其他實施例中，已確定獲自患者之腫瘤樣品在佔腫瘤樣品之約5%或更多之腫瘤浸潤免疫細胞中具有PD-L1之可偵測的表現水準。例如，在一些實施例中，已確定獲自患者之腫瘤樣品在佔腫瘤樣品之約5%至少於約10% (例如，5%至9.5%、5%至9%、5%至8.5%、5%至8%、5%至7.5%、5%至7%、5%至6.5%、5%至6%、5%至5.5%、6%至9.5%、6%至9%、6%至8.5%、6%至8%、6%至7.5%、6%至7%、6%至6.5%、7%至9.5%、7%至9%、7%至7.5%、8%至9.5%、8%至9%、或8%至8.5%)之腫瘤浸潤免疫細胞中具有PD-L1之可偵測的表現水準。
在其他實施例中，已確定獲自患者之腫瘤樣品在腫瘤樣品中之約5%或更多之腫瘤浸潤免疫細胞中具有PD-L1之可偵測的表現水準。例如，在一些實施例中，已確定獲自患者之腫瘤樣品在腫瘤樣品中之約5%至少於約10% (例如，5%至9.5%、5%至9%、5%至8.5%、5%至8%、5%至7.5%、5%至7%、5%至6.5%、5%至6%、5%至5.5%、6%至9.5%、6%至9%、6%至8.5%、6%至8%、6%至7.5%、6%至7%、6%至6.5%、7%至9.5%、7%至9%、7%至7.5%、8%至9.5%、8%至9%、或8%至8.5%)之腫瘤浸潤免疫細胞中具有PD-L1之可偵測的表現水準。
在仍進一步實施例中，已確定獲自患者之腫瘤樣品在佔腫瘤樣品中之約10%或更多(例如，10%或更多、11%或更多、12%或更多、13%或更多、14%或更多、15%或更多、16%或更多、17%或更多、18%或更多、19%或更多、20%或更多、21%或更多、22%或更多、23%或更多、24%或更多、25%或更多、26%或更多、27%或更多、28%或更多、29%或更多、30%或更多、31%或更多、32%或更多、33%或更多、34%或更多、35%或更多、36%或更多、37%或更多、38%或更多、39%或更多、40%或更多、41%或更多、42%或更多、43%或更多、44%或更多、45%或更多、46%或更多、47%或更多、48%或更多、49%或更多、50%或更多、60%或更多、70%或更多、80%或更多、90%或更多、95%或更多、96%或更多、97%或更多、98%或更多、99%或更多、或100%)之腫瘤浸潤免疫細胞中具有PD-L1之可偵測的表現水準。
在仍進一步實施例中，已確定獲自患者之腫瘤樣品在腫瘤樣品中之約10%或更多(例如，10%或更多、11%或更多、12%或更多、13%或更多、14%或更多、15%或更多、16%或更多、17%或更多、18%或更多、19%或更多、20%或更多、21%或更多、22%或更多、23%或更多、24%或更多、25%或更多、26%或更多、27%或更多、28%或更多、29%或更多、30%或更多、31%或更多、32%或更多、33%或更多、34%或更多、35%或更多、36%或更多、37%或更多、38%或更多、39%或更多、40%或更多、41%或更多、42%或更多、43%或更多、44%或更多、45%或更多、46%或更多、47%或更多、48%或更多、49%或更多、50%或更多、60%或更多、70%或更多、80%或更多、90%或更多、95%或更多、96%或更多、97%或更多、98%或更多、99%或更多、或100%)之腫瘤浸潤免疫細胞中具有PD-L1之可偵測的表現水準。
在其他實施例中，已確定獲自患者之腫瘤樣品在腫瘤樣品中之約50%或更多(例如，約50%或更多、51%或更多、52%或更多、53%或更多、54%或更多、55%或更多、56%或更多、57%或更多、58%或更多、59%或更多、60%或更多、61%或更多、62%或更多、63%或更多、64%或更多、65%或更多、66%或更多、67%或更多、68%或更多、69%或更多、70%或更多、71%或更多、72%或更多、73%或更多、74%或更多、75%或更多、76%或更多、77%或更多、78%或更多、79%或更多、80%或更多、81%或更多、82%或更多、83%或更多、84%或更多、85%或更多、86%或更多、87%或更多、88%或更多、89%或更多、90%或更多、91%或更多、92%或更多、93%或更多、94%或更多、95%或更多、96%或更多、97%或更多、98%或更多、或99%或更多)之腫瘤細胞中具有PD-L1之可偵測的表現水準及/或在佔腫瘤樣品中之約10%或更多(例如，10%或更多、11%或更多、12%或更多、13%或更多、14%或更多、15%或更多、16%或更多、17%或更多、18%或更多、19%或更多、20%或更多、21%或更多、22%或更多、23%或更多、24%或更多、25%或更多、26%或更多、27%或更多、28%或更多、29%或更多、30%或更多、31%或更多、32%或更多、33%或更多、34%或更多、35%或更多、36%或更多、37%或更多、38%或更多、39%或更多、40%或更多、41%或更多、42%或更多、43%或更多、44%或更多、45%或更多、46%或更多、47%或更多、48%或更多、49%或更多、50%或更多、60%或更多、70%或更多、80%或更多、90%或更多、95%或更多、96%或更多、97%或更多、98%或更多、99%或更多、或100%)之腫瘤浸潤免疫細胞中具有PD-L1之可偵測的表現水準。
應瞭解在前述方法中任一者中，腫瘤浸潤免疫細胞佔腫瘤樣品之百分比可按照獲自患者之腫瘤樣品之切片中腫瘤浸潤免疫細胞所覆蓋之腫瘤面積之百分比，例如，如藉由使用抗PD-L1抗體(例如，SP142抗體)之IHC所評估。參見例如實例3 (例如，表5)。
在另一實例中，本文提供一種治療患有局部晚期或轉移性乳癌(例如，局部晚期或轉移性TNBC)之患者的方法，該方法包括向患者投與有效量的抗癌療法，該抗癌療法包含(i) PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑)及(ii)紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)，其中患者先前未針對乳癌(例如，局部晚期或轉移性TNBC)進行治療，並且其中基於獲自患者之腫瘤樣品中之約1%或更多之腫瘤細胞中PD-L1之可偵測的表現水準，患者經鑑別為可能對抗癌療法有反應。
在另一態樣中，本發明提供一種用於治療患有局部晚期或轉移性乳癌(例如，局部晚期或轉移性TNBC)之患者的方法，該方法包括：(a)確定獲自患者之樣品(例如，腫瘤樣品)中之PD-L1之表現水準，其中患者先前未針對乳癌(例如，局部晚期或轉移性TNBC)進行治療；及(b)基於腫瘤樣品中之約1%或更多之腫瘤細胞中之PD-L1之可偵測的表現水準，向患者投與治療有效量的抗癌療法，該抗癌療法包含(i) PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑)及(ii)紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)。
在另一態樣中，本發明提供一種用於治療經診斷患有局部晚期或轉移性乳癌(例如，局部晚期或轉移性TNBC)之患者的包含PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑)之醫藥組成物，其中該治療包含投與人類PD-1軸結合拮抗劑以及紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)，並且其中基於獲自患者之腫瘤樣品中之約1%或更多之腫瘤細胞中之PD-L1之可偵測的表現水準，該患者經鑑別為可能對包含人類PD-1軸結合拮抗劑及紫杉烷之抗癌療法有反應。在一些實施例中，患者先前未針對乳癌(例如，局部晚期或轉移性TNBC)進行治療。
在前述態樣中任一項之一些實施例中，局部晚期或轉移性乳癌為局部晚期或轉移性TNBC。
例如，本文提供一種治療患有局部晚期TNBC之患者的方法，該方法包括向患者投與有效量的抗癌療法，該抗癌療法包含(i) PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑)及(ii)紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)，其中患者先前未針局部晚期TNBC進行治療，並且其中基於獲自患者之腫瘤樣品中之約1%或更多之腫瘤細胞中PD-L1之可偵測的表現水準，患者經鑑別為可能對抗癌療法有反應。
在另一實例中，本文提供一種治療患有轉移性TNBC之患者的方法，該方法包括向患者投與有效量的抗癌療法，該抗癌療法包含(i) PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑)及(ii)紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)，其中患者先前未針對轉移性TNBC進行治療，並且其中基於獲自患者之腫瘤樣品中之約1%或更多之腫瘤細胞中PD-L1之可偵測的表現水準，患者經鑑別為可能對抗癌療法有反應。
在另一實例中，本文提供一種治療患有局部晚期TNBC之患者的方法，該方法包括：(a)確定獲自患者之腫瘤樣品之腫瘤細胞中PD-L1之表現水準，其中患者先前未針對局部晚期TNBC進行治療；及(b)基於腫瘤樣品中之約1%或更多之腫瘤細胞中之PD-L1之可偵測的表現水準，向患者投與治療有效量的抗癌療法，該抗癌療法包含(i) PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑)及(ii)紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)。
在進一步實例中，本文提供一種治療患有轉移性TNBC之患者的方法，該方法包括：(a)確定獲自患者之腫瘤樣品之腫瘤細胞中PD-L1之表現水準，其中患者先前未針對轉移性TNBC進行治療；及(b)基於腫瘤樣品中之約1%或更多之腫瘤細胞中之PD-L1之可偵測的表現水準，向患者投與治療有效量的抗癌療法，該抗癌療法包含(i) PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑)及(ii)紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)。
在另一實例中，本文提供一種用於治療經診斷患有局部晚期TNBC之患者的包含PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑)之醫藥組成物，其中該治療包含投與PD-1軸結合拮抗劑以及紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)，並且其中基於獲自患者之腫瘤樣品中之約1%或更多之腫瘤細胞中之PD-L1之可偵測的表現水準，該患者經鑑別為可能對包含人類PD-1軸結合拮抗劑及紫杉烷之抗癌療法有反應。在一些實施例中，患者先前未針對局部晚期TNBC進行治療。
在另一實例中，本文提供一種用於治療經診斷患有轉移性TNBC之患者的包含PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑)之醫藥組成物，其中該治療包含投與PD-1軸結合拮抗劑以及紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)，並且其中基於獲自患者之腫瘤樣品中之約1%或更多之腫瘤細胞中之PD-L1之可偵測的表現水準，該患者經鑑別為可能對包含人類PD-1軸結合拮抗劑及紫杉烷之抗癌療法有反應。在一些實施例中，患者先前未針對轉移性TNBC進行治療。
在另一實例中，本文提供一種治療患有局部晚期TNBC之患者的方法，該方法包括向患者投與有效量的抗癌療法，該抗癌療法包含阿特珠單抗及nab-太平洋紫杉醇，其中患者先前未針對局部晚期TNBC進行治療，並且其中基於獲自患者之腫瘤樣品中之約1%或更多之腫瘤細胞中之PD-L1之可偵測的表現水準，患者經鑑別為可能對抗癌療法有反應。
在另一實例中，本文提供一種治療患有轉移性TNBC之患者的方法，該方法包括向患者投與有效量的抗癌療法，該抗癌療法包含阿特珠單抗及nab-太平洋紫杉醇，其中患者先前未針對轉移性TNBC進行治療，並且其中基於獲自患者之腫瘤樣品中之約1%或更多之腫瘤細胞中之PD-L1之可偵測的表現水準，患者經鑑別為可能對抗癌療法有反應。
在進一步實例中，本文提供一種治療患有局部晚期TNBC之患者的方法，該方法包括：(a)確定獲自患者之腫瘤樣品中之腫瘤細胞中之PD-L1之表現水準，其中患者先前未針對局部晚期TNBC進行治療，及(b)基於腫瘤樣品中之約1%或更多之腫瘤細胞中之PD-L1之可偵測的表現水準，向患者投與治療有效量的抗癌療法，該抗癌療法包含阿特珠單抗及nab-太平洋紫杉醇。
在另一實例中，本文提供一種治療患有轉移性TNBC之患者的方法，該方法包括：(a)確定獲自患者之腫瘤樣品中之腫瘤細胞中之PD-L1之表現水準，其中患者先前未針對轉移性TNBC進行治療，及(b)基於腫瘤樣品中之約1%或更多之腫瘤細胞中之PD-L1之可偵測的表現水準，向患者投與治療有效量的抗癌療法，該抗癌療法包含阿特珠單抗及nab-太平洋紫杉醇。
在另一實例中，本文提供一種用於治療經診斷患有局部晚期TNBC之患者的包含阿特珠單抗之醫藥組成物，其中該治療包含投與阿特珠單抗以及nab-太平洋紫杉醇，並且其中基於獲自患者之腫瘤樣品中之約1%或更多之腫瘤細胞中之PD-L1之可偵測的表現水準，患者經鑑別為可能對包含阿特珠單抗及nab-太平洋紫杉醇之抗癌療法有反應。在一些實施例中，患者先前未針對局部晚期TNBC進行治療。
在另一實例中，本文提供一種用於治療經診斷患有轉移性TNBC之患者的包含阿特珠單抗之醫藥組成物，其中該治療包含投與阿特珠單抗以及nab-太平洋紫杉醇，並且其中基於獲自患者之腫瘤樣品中之約1%或更多之腫瘤細胞中之PD-L1之可偵測的表現水準，患者經鑑別為可能對包含阿特珠單抗及nab-太平洋紫杉醇之抗癌療法有反應。在一些實施例中，患者先前未針對轉移性TNBC進行治療。
在另一實例中，本文提供一種治療患有局部晚期TNBC之患者的方法，該方法包括向患者投與有效量的抗癌療法，該抗癌療法包含阿特珠單抗及太平洋紫杉醇，其中患者先前未針對局部晚期TNBC進行治療，並且其中基於獲自患者之腫瘤樣品中之約1%或更多之腫瘤細胞中之PD-L1之可偵測的表現水準，患者經鑑別為可能對抗癌療法有反應。
在另一實例中，本文提供一種治療患有轉移性TNBC之患者的方法，該方法包括向患者投與有效量的抗癌療法，該抗癌療法包含阿特珠單抗及太平洋紫杉醇，其中患者先前未針對轉移性TNBC進行治療，並且其中基於獲自患者之腫瘤樣品中之約1%或更多之腫瘤細胞中之PD-L1之可偵測的表現水準，患者經鑑別為可能對抗癌療法有反應。
在進一步實例中，本文提供一種治療患有局部晚期TNBC之患者的方法，該方法包括：(a)確定獲自患者之腫瘤樣品中之腫瘤細胞中之PD-L1之表現水準，其中患者先前未針對局部晚期TNBC進行治療，及(b)基於腫瘤樣品中之約1%或更多之腫瘤細胞中之PD-L1之可偵測的表現水準，向患者投與治療有效量的抗癌療法，該抗癌療法包含阿特珠單抗及太平洋紫杉醇。
在另一實例中，本文提供一種治療患有轉移性TNBC之患者的方法，該方法包括：(a)確定獲自患者之腫瘤樣品中之腫瘤細胞中之PD-L1之表現水準，其中患者先前未針對轉移性TNBC進行治療，及(b)基於腫瘤樣品中之約1%或更多之腫瘤細胞中之PD-L1之可偵測的表現水準，向患者投與治療有效量的抗癌療法，該抗癌療法包含阿特珠單抗及太平洋紫杉醇。
在另一實例中，本文提供一種用於治療經診斷患有局部晚期TNBC之患者的包含阿特珠單抗之醫藥組成物，其中該治療包含投與阿特珠單抗以及太平洋紫杉醇，並且其中基於獲自患者之腫瘤樣品中之約1%或更多之腫瘤細胞中之PD-L1之可偵測的表現水準，患者經鑑別為可能對包含阿特珠單抗及太平洋紫杉醇之抗癌療法有反應。在一些實施例中，患者先前未針對局部晚期TNBC進行治療。
在另一實例中，本文提供一種用於治療經診斷患有轉移性TNBC之患者的包含阿特珠單抗之醫藥組成物，其中該治療包含投與阿特珠單抗以及太平洋紫杉醇，並且其中基於獲自患者之腫瘤樣品中之約1%或更多之腫瘤細胞中之PD-L1之可偵測的表現水準，患者經鑑別為可能對包含阿特珠單抗及太平洋紫杉醇之抗癌療法有反應。在一些實施例中，患者先前未針對轉移性TNBC進行治療。
在前述方法中任一者之一些實施例中，已確定獲自患者之腫瘤樣品在腫瘤樣品中約1%或更多(例如，約1%或更多、2%或更多、3%或更多、5%或更多、6%或更多、7%或更多、8%或更多、9%或更多、10%或更多、11%或更多、12%或更多、13%或更多、14%或更多、15%或更多、16%或更多、17%或更多、18%或更多、19%或更多、20%或更多、21%或更多、22%或更多、23%或更多、24%或更多、25%或更多、26%或更多、27%或更多、28%或更多、29%或更多、30%或更多、31%或更多、32%或更多、33%或更多、34%或更多、35%或更多、36%或更多、37%或更多、38%或更多、39%或更多、40%或更多、41%或更多、42%或更多、43%或更多、44%或更多、45%或更多、46%或更多、47%或更多、48%或更多、49%或更多、50%或更多、51%或更多、52%或更多、53%或更多、54%或更多、55%或更多、56%或更多、57%或更多、58%或更多、59%或更多、60%或更多、61%或更多、62%或更多、63%或更多、64%或更多、65%或更多、66%或更多、67%或更多、68%或更多、69%或更多、70%或更多、71%或更多、72%或更多、73%或更多、74%或更多、75%或更多、76%或更多、77%或更多、78%或更多、79%或更多、80%或更多、81%或更多、82%或更多、83%或更多、84%或更多、85%或更多、86%或更多、87%或更多、88%或更多、89%或更多、90%或更多、91%或更多、92%或更多、93%或更多、94%或更多、95%或更多、96%或更多、97%或更多、98%或更多、或99%或更多)之腫瘤細胞中具有PD-L1之可偵測的表現水準。例如，在一些實施例中，已確定獲自患者之腫瘤樣品在佔腫瘤樣品中之約1%至少於約5% (例如，1%至4.9%、1%至4.5%、1%至4%、1%至3.5%、1%至3%、1%至2.5%、或1%至2%)的腫瘤細胞中具有PD-L1之可偵測的表現水準。在其他實施例中，已確定獲自患者之腫瘤樣品在腫瘤樣品中低於約1%的腫瘤細胞中具有PD-L1之可偵測的表現水準。
在其他實施例中，已確定獲自患者之腫瘤樣品在腫瘤樣品中之約5%或更多之腫瘤細胞中具有PD-L1之可偵測的表現水準。例如，在一些實施例中，已確定獲自患者之腫瘤樣品在腫瘤樣品中約5%至少於50% (例如，5%至49.5%、5%至45%、5%至40%、5%至35%、5%至30%、5%至25%、5%至20%、5%至15%、5%至10%、5%至9%、5%至8%、5%至7%、5%至6%、10%至49.5%、10%至40%、10%至35%、10%至30%、10%至25%、10%至20%、10%至15%、15%至49.5%、15%至45%、15%至40%、15%至35%、15%至30%、15%至30%、15%至25%、15%至20%、20%至49.5%、20%至45%、20%至40%、20%至35%、20%至30%、20%至25%、25%至49.5%、25%至45%、25%至40%、25%至35%、25%至30%、30%至49.5%、30%至45%、30%至40%、30%至35%、35%至49.5%、35%至45%、35%至40%、40%至49.5%、40%至45%、或45%至49.5%)之腫瘤細胞中具有PD-L1之可偵測的表現水準。
在其他實施例中，已確定獲自患者之腫瘤樣品在腫瘤樣品中約50%或更多(例如，約50%或更多、51%或更多、52%或更多、53%或更多、54%或更多、55%或更多、56%或更多、57%或更多、58%或更多、59%或更多、60%或更多、61%或更多、62%或更多、63%或更多、64%或更多、65%或更多、66%或更多、67%或更多、68%或更多、69%或更多、70%或更多、71%或更多、72%或更多、73%或更多、74%或更多、75%或更多、76%或更多、77%或更多、78%或更多、79%或更多、80%或更多、81%或更多、82%或更多、83%或更多、84%或更多、85%或更多、86%或更多、87%或更多、88%或更多、89%或更多、90%或更多、91%或更多、92%或更多、93%或更多、94%或更多、95%或更多、96%或更多、97%或更多、98%或更多、或99%或更多)之腫瘤細胞中具有PD-L1之可偵測的表現水準。在一些實施例中，已確定獲自患者之腫瘤樣品在腫瘤樣品中約50%至約99% (例如，50%至99%、50%至95%、50%至90%、50%至85%、50%至80%、50%至75%、50%至70%、50%至65%、50%至60%、50%至55%、55%至99%、55%至95%、55%至90%、55%至85%、55%至80%、55%至75%、55%至70%、55%至65%、55%至60%、60%至99%、60%至95%、60%至90%、60%至85%、60%至80%、60%至75%、60%至70%、60%至65%、65%至99%、65%至95%、65%至90%、65%至85%、65%至80%、65%至75%、65%至70%、70%至99%、70%至95%、70%至90%、70%至85%、70%至80%、70%至75%、75%至99%、75%至95%、75%至90%、75%至85%、75%至80%、80%至99%、80%至95%、80%至90%、80%至85%、85%至99%、85%至95%、85%至90%、90%至99%、或90%至95%)之腫瘤細胞中具有PD-L1之可偵測的表現水準。
在另一實例中，本文提供一種治療患有局部晚期或轉移性乳癌(例如，局部晚期或轉移性TNBC)之患者的方法，該方法包括向患者投與有效量的抗癌療法，該抗癌療法包含(i) PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑)及(ii)紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)，其中患者先前未針對乳癌(例如，局部晚期或轉移性TNBC)進行治療，並且其中基於佔獲自患者之腫瘤樣品之約0.5%或更多(例如，約0.5%或更多、約0.75%或更多、約1%或更多、約1.25%或更多、約1.35%或更多、約1.5%或更多、約2%或更多、約2.25%或更多、約2.5%或更多、約2.75%或更多、約3%或更多、約3.25%或更多、約3.5%或更多、約3.75%或更多、約4%或更多、約4.25%或更多、約4.5%或更多、約4.75%或更多、或約5%或更多)的腫瘤浸潤免疫細胞中之CD8之可偵測的表現水準，患者經鑑別為可能對抗癌療法有反應。
在另一態樣中，本發明提供一種治療患有局部晚期或轉移性乳癌(例如，局部晚期或轉移性TNBC)之患者的方法，該方法包括：(a)確定獲自患者之腫瘤樣品中之腫瘤浸潤免疫細胞中之CD8之表現水準，其中患者先前未針對乳癌(例如，局部晚期或轉移性TNBC)進行治療，及(b)基於佔腫瘤樣品之約0.5%或更多(例如，約0.5%或更多、約0.75%或更多、約1%或更多、約1.25%或更多、約1.35%或更多、約1.5%或更多、約2%或更多、約2.25%或更多、約2.5%或更多、約2.75%或更多、約3%或更多、約3.25%或更多、約3.5%或更多、約3.75%或更多、約4%或更多、約4.25%或更多、約4.5%或更多、約4.75%或更多、或約5%或更多)的腫瘤浸潤免疫細胞中之CD8之可偵測的表現水準，向患者投與治療有效量的抗癌療法，該抗癌療法包含(i) PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑)及(ii)紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)。
在另一態樣中，本發明提供一種用於治療經診斷患有局部晚期或轉移性乳癌(例如，局部晚期或轉移性TNBC)之患者的包含PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑)之醫藥組成物，其中該治療包含投與人類PD-1軸結合拮抗劑以及紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)，並且其中基於佔獲自患者之腫瘤樣品之約0.5%或更多(例如，約0.5%或更多、約0.75%或更多、約1%或更多、約1.25%或更多、約1.35%或更多、約1.5%或更多、約2%或更多、約2.25%或更多、約2.5%或更多、約2.75%或更多、約3%或更多、約3.25%或更多、約3.5%或更多、約3.75%或更多、約4%或更多、約4.25%或更多、約4.5%或更多、約4.75%或更多、或約5%或更多)的腫瘤浸潤免疫細胞中之CD8之可偵測的表現水準，患者經鑑別為可能對包含人類PD-1軸結合拮抗劑及紫杉烷之抗癌療法有反應。在一些實施例中，患者先前未針對乳癌(例如，局部晚期或轉移性TNBC)進行治療。
在前述態樣中任一項之一些實施例中，局部晚期或轉移性乳癌為局部晚期或轉移性TNBC。
例如，本文提供一種治療患有局部晚期TNBC之患者的方法，該方法包括向患者投與有效量的抗癌療法，該抗癌療法包含(i) PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑)及(ii)紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)，其中患者先前未針對局部晚期TNBC進行治療，並且其中基於佔獲自患者之腫瘤樣品之約0.5%或更多(例如，約0.5%或更多、約0.75%或更多、約1%或更多、約1.25%或更多、約1.35%或更多、約1.5%或更多、約2%或更多、約2.25%或更多、約2.5%或更多、約2.75%或更多、約3%或更多、約3.25%或更多、約3.5%或更多、約3.75%或更多、約4%或更多、約4.25%或更多、約4.5%或更多、約4.75%或更多、或約5%或更多)的腫瘤浸潤免疫細胞中之CD8之可偵測的表現水準，患者經鑑別為可能對抗癌療法有反應。
在另一實例中，本文提供一種治療患有轉移性TNBC之患者的方法，該方法包括向患者投與有效量的抗癌療法，該抗癌療法包含(i) PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑)及(ii)紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)，其中患者先前未針對轉移性TNBC進行治療，並且其中基於佔獲自患者之腫瘤樣品之約0.5%或更多(例如，約0.5%或更多、約0.75%或更多、約1%或更多、約1.25%或更多、約1.35%或更多、約1.5%或更多、約2%或更多、約2.25%或更多、約2.5%或更多、約2.75%或更多、約3%或更多、約3.25%或更多、約3.5%或更多、約3.75%或更多、約4%或更多、約4.25%或更多、約4.5%或更多、約4.75%或更多、或約5%或更多)的腫瘤浸潤免疫細胞中之CD8之可偵測的表現水準，患者經鑑別為可能對抗癌療法有反應。
在另一實例中，本文提供一種治療患有局部晚期TNBC之患者的方法，該方法包括：(a)確定獲自患者之腫瘤樣品中之腫瘤浸潤免疫細胞中之CD8之表現水準，其中患者先前未針對局部晚期TNBC進行治療，及(b)基於佔腫瘤樣品之約0.5%或更多(例如，約0.5%或更多、約0.75%或更多、約1%或更多、約1.25%或更多、約1.35%或更多、約1.5%或更多、約2%或更多、約2.25%或更多、約2.5%或更多、約2.75%或更多、約3%或更多、約3.25%或更多、約3.5%或更多、約3.75%或更多、約4%或更多、約4.25%或更多、約4.5%或更多、約4.75%或更多、或約5%或更多)的腫瘤浸潤免疫細胞中之CD8之可偵測的表現水準，向患者投與治療有效量的抗癌療法，該抗癌療法包含(i) PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑)及(ii)紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)。
在進一步實例中，本文提供一種治療患有轉移性TNBC之患者的方法，該方法包括：(a)確定獲自患者之腫瘤樣品中之腫瘤浸潤免疫細胞中之CD8之表現水準，其中患者先前未針對轉移性TNBC進行治療，及(b)基於佔腫瘤樣品之約0.5%或更多(例如，約0.5%或更多、約0.75%或更多、約1%或更多、約1.25%或更多、約1.35%或更多、約1.5%或更多、約2%或更多、約2.25%或更多、約2.5%或更多、約2.75%或更多、約3%或更多、約3.25%或更多、約3.5%或更多、約3.75%或更多、約4%或更多、約4.25%或更多、約4.5%或更多、約4.75%或更多、或約5%或更多)的腫瘤浸潤免疫細胞中之CD8之可偵測的表現水準，向患者投與治療有效量的抗癌療法，該抗癌療法包含(i) PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑)及(ii)紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)。
在另一實例中，本文提供一種用於治療經診斷患有局部晚期TNBC之患者的包含PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑)之醫藥組成物，其中該治療包含投與PD-1軸結合拮抗劑以及紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)，並且其中基於佔獲自患者之腫瘤樣品之約0.5%或更多(例如，約0.5%或更多、約0.75%或更多、約1%或更多、約1.25%或更多、約1.35%或更多、約1.5%或更多、約2%或更多、約2.25%或更多、約2.5%或更多、約2.75%或更多、約3%或更多、約3.25%或更多、約3.5%或更多、約3.75%或更多、約4%或更多、約4.25%或更多、約4.5%或更多、約4.75%或更多、或約5%或更多)的腫瘤浸潤免疫細胞中之CD8之可偵測的表現水準，患者經鑑別為可能對包含人類PD-1軸結合拮抗劑及紫杉烷之抗癌療法有反應。在一些實施例中，患者先前未針對局部晚期TNBC進行治療。
在另一實例中，本文提供一種用於治療經診斷患有轉移性TNBC之患者的包含PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑)之醫藥組成物，其中該治療包含投與PD-1軸結合拮抗劑以及紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)，並且其中基於佔獲自患者之腫瘤樣品之約0.5%或更多(例如，約0.5%或更多、約0.75%或更多、約1%或更多、約1.25%或更多、約1.35%或更多、約1.5%或更多、約2%或更多、約2.25%或更多、約2.5%或更多、約2.75%或更多、約3%或更多、約3.25%或更多、約3.5%或更多、約3.75%或更多、約4%或更多、約4.25%或更多、約4.5%或更多、約4.75%或更多、或約5%或更多)的腫瘤浸潤免疫細胞中之CD8之可偵測的表現水準，患者經鑑別為可能對包含人類PD-1軸結合拮抗劑及紫杉烷之抗癌療法有反應。在一些實施例中，患者先前未針對轉移性TNBC進行治療。
在另一實例中，本文提供一種治療患有局部晚期TNBC之患者的方法，該方法包括向患者投與有效量的抗癌療法，該抗癌療法包含阿特珠單抗及nab-太平洋紫杉醇，其中患者先前未針對局部晚期TNBC進行治療，並且其中基於佔獲自患者之腫瘤樣品之約0.5%或更多(例如，約0.5%或更多、約0.75%或更多、約1%或更多、約1.25%或更多、約1.35%或更多、約1.5%或更多、約2%或更多、約2.25%或更多、約2.5%或更多、約2.75%或更多、約3%或更多、約3.25%或更多、約3.5%或更多、約3.75%或更多、約4%或更多、約4.25%或更多、約4.5%或更多、約4.75%或更多、或約5%或更多)的腫瘤浸潤免疫細胞中之CD8之可偵測的表現水準，患者經鑑別為可能對抗癌療法有反應。
在另一實例中，本文提供一種治療患有轉移性TNBC之患者的方法，該方法包括向患者投與有效量的抗癌療法，該抗癌療法包含阿特珠單抗及nab-太平洋紫杉醇，其中患者先前未針對轉移性TNBC進行治療，並且其中基於佔獲自患者之腫瘤樣品之約0.5%或更多(例如，約0.5%或更多、約0.75%或更多、約1%或更多、約1.25%或更多、約1.35%或更多、約1.5%或更多、約2%或更多、約2.25%或更多、約2.5%或更多、約2.75%或更多、約3%或更多、約3.25%或更多、約3.5%或更多、約3.75%或更多、約4%或更多、約4.25%或更多、約4.5%或更多、約4.75%或更多、或約5%或更多)的腫瘤浸潤免疫細胞中之CD8之可偵測的表現水準，患者經鑑別為可能對抗癌療法有反應。
在進一步實例中，本文提供一種治療患有局部晚期TNBC之患者的方法，該方法包括：(a)確定獲自患者之腫瘤樣品中之腫瘤浸潤免疫細胞中之CD8之表現水準，其中患者先前未針對局部晚期TNBC進行治療，及(b)基於佔腫瘤樣品之約0.5%或更多(例如，約0.5%或更多、約0.75%或更多、約1%或更多、約1.25%或更多、約1.35%或更多、約1.5%或更多、約2%或更多、約2.25%或更多、約2.5%或更多、約2.75%或更多、約3%或更多、約3.25%或更多、約3.5%或更多、約3.75%或更多、約4%或更多、約4.25%或更多、約4.5%或更多、約4.75%或更多、或約5%或更多)的腫瘤浸潤免疫細胞中之CD8之可偵測的表現水準，向患者投與治療有效量的抗癌療法，該抗癌療法包含阿特珠單抗及nab-太平洋紫杉醇。
在另一實例中，本文提供一種治療患有轉移性TNBC之患者的方法，該方法包括：(a)確定獲自患者之腫瘤樣品中之腫瘤浸潤免疫細胞中之CD8之表現水準，其中患者先前未針對轉移性TNBC進行治療，及(b)基於佔腫瘤樣品之約0.5%或更多(例如，約0.5%或更多、約0.75%或更多、約1%或更多、約1.25%或更多、約1.35%或更多、約1.5%或更多、約2%或更多、約2.25%或更多、約2.5%或更多、約2.75%或更多、約3%或更多、約3.25%或更多、約3.5%或更多、約3.75%或更多、約4%或更多、約4.25%或更多、約4.5%或更多、約4.75%或更多、或約5%或更多)的腫瘤浸潤免疫細胞中之CD8之可偵測的表現水準，向患者投與治療有效量的抗癌療法，該抗癌療法包含阿特珠單抗及nab-太平洋紫杉醇。
在另一實例中，本文提供一種用於治療經診斷患有局部晚期TNBC之患者的包含阿特珠單抗之醫藥組成物，其中該治療包含投與阿特珠單抗以及nab-太平洋紫杉醇，並且其中基於佔獲自患者之腫瘤樣品之約0.5%或更多(例如，約0.5%或更多、約0.75%或更多、約1%或更多、約1.25%或更多、約1.35%或更多、約1.5%或更多、約2%或更多、約2.25%或更多、約2.5%或更多、約2.75%或更多、約3%或更多、約3.25%或更多、約3.5%或更多、約3.75%或更多、約4%或更多、約4.25%或更多、約4.5%或更多、約4.75%或更多、或約5%或更多)的腫瘤浸潤免疫細胞中之CD8之可偵測的表現水準，患者經鑑別為可能對包含阿特珠單抗及nab-太平洋紫杉醇之抗癌療法有反應。在一些實施例中，患者先前未針對局部晚期TNBC進行治療。
在另一實例中，本文提供一種用於治療經診斷患有轉移性TNBC之患者的包含阿特珠單抗之醫藥組成物，其中該治療包含阿特珠單抗以及nab-太平洋紫杉醇，並且其中基於佔獲自患者之腫瘤樣品之約0.5%或更多(例如，約0.5%或更多、約0.75%或更多、約1%或更多、約1.25%或更多、約1.35%或更多、約1.5%或更多、約2%或更多、約2.25%或更多、約2.5%或更多、約2.75%或更多、約3%或更多、約3.25%或更多、約3.5%或更多、約3.75%或更多、約4%或更多、約4.25%或更多、約4.5%或更多、約4.75%或更多、或約5%或更多)的腫瘤浸潤免疫細胞中之CD8之可偵測的表現水準，患者經鑑別為可能對包含阿特珠單抗及nab-太平洋紫杉醇之抗癌療法有反應。在一些實施例中，患者先前未針對轉移性TNBC進行治療。
在另一實例中，本文提供一種治療患有局部晚期TNBC之患者的方法，該方法包括向患者投與有效量的抗癌療法，該抗癌療法包含阿特珠單抗及太平洋紫杉醇，其中患者先前未針對局部晚期TNBC進行治療，並且其中基於佔獲自患者之腫瘤樣品之約0.5%或更多(例如，約0.5%或更多、約0.75%或更多、約1%或更多、約1.25%或更多、約1.35%或更多、約1.5%或更多、約2%或更多、約2.25%或更多、約2.5%或更多、約2.75%或更多、約3%或更多、約3.25%或更多、約3.5%或更多、約3.75%或更多、約4%或更多、約4.25%或更多、約4.5%或更多、約4.75%或更多、或約5%或更多)的腫瘤浸潤免疫細胞中之CD8之可偵測的表現水準，患者經鑑別為可能對抗癌療法有反應。
在另一實例中，本文提供一種治療患有轉移性TNBC之患者的方法，該方法包括向患者投與有效量的抗癌療法，該抗癌療法包含阿特珠單抗及太平洋紫杉醇，其中患者先前未針對轉移性TNBC進行治療，並且其中基於佔獲自患者之腫瘤樣品之約0.5%或更多(例如，約0.5%或更多、約0.75%或更多、約1%或更多、約1.25%或更多、約1.35%或更多、約1.5%或更多、約2%或更多、約2.25%或更多、約2.5%或更多、約2.75%或更多、約3%或更多、約3.25%或更多、約3.5%或更多、約3.75%或更多、約4%或更多、約4.25%或更多、約4.5%或更多、約4.75%或更多、或約5%或更多)的腫瘤浸潤免疫細胞中之CD8之可偵測的表現水準，患者經鑑別為可能對抗癌療法有反應。
在進一步實例中，本文提供一種治療患有局部晚期TNBC之患者的方法，該方法包括：(a)確定獲自患者之腫瘤樣品中之腫瘤浸潤免疫細胞中之CD8之表現水準，其中患者先前未針對局部晚期TNBC進行治療，及(b)基於佔腫瘤樣品之約0.5%或更多(例如，約0.5%或更多、約0.75%或更多、約1%或更多、約1.25%或更多、約1.35%或更多、約1.5%或更多、約2%或更多、約2.25%或更多、約2.5%或更多、約2.75%或更多、約3%或更多、約3.25%或更多、約3.5%或更多、約3.75%或更多、約4%或更多、約4.25%或更多、約4.5%或更多、約4.75%或更多、或約5%或更多)的腫瘤浸潤免疫細胞中之CD8之可偵測的表現水準，向患者投與治療有效量的抗癌療法，該抗癌療法包含阿特珠單抗及太平洋紫杉醇。
在另一實例中，本文提供一種治療患有轉移性TNBC之患者的方法，該方法包括：(a)確定獲自患者之腫瘤樣品中之腫瘤浸潤免疫細胞中之CD8之表現水準，其中患者先前未針對轉移性TNBC進行治療，及(b)基於佔腫瘤樣品之約0.5%或更多(例如，約0.5%或更多、約0.75%或更多、約1%或更多、約1.25%或更多、約1.35%或更多、約1.5%或更多、約2%或更多、約2.25%或更多、約2.5%或更多、約2.75%或更多、約3%或更多、約3.25%或更多、約3.5%或更多、約3.75%或更多、約4%或更多、約4.25%或更多、約4.5%或更多、約4.75%或更多、或約5%或更多)的腫瘤浸潤免疫細胞中之CD8之可偵測的表現水準，向患者投與治療有效量的抗癌療法，該抗癌療法包含阿特珠單抗及太平洋紫杉醇。
在另一實例中，本文提供一種用於治療經診斷患有局部晚期TNBC之患者的包含阿特珠單抗之醫藥組成物，其中該治療包含投與阿特珠單抗以及太平洋紫杉醇，並且其中基於佔獲自患者之腫瘤樣品之約0.5%或更多(例如，約0.5%或更多、約0.75%或更多、約1%或更多、約1.25%或更多、約1.35%或更多、約1.5%或更多、約2%或更多、約2.25%或更多、約2.5%或更多、約2.75%或更多、約3%或更多、約3.25%或更多、約3.5%或更多、約3.75%或更多、約4%或更多、約4.25%或更多、約4.5%或更多、約4.75%或更多、或約5%或更多)的腫瘤浸潤免疫細胞中之CD8之可偵測的表現水準，患者經鑑別為可能對包含阿特珠單抗及太平洋紫杉醇之抗癌療法有反應。在一些實施例中，患者先前未針對局部晚期TNBC進行治療。
在另一實例中，本文提供一種用於治療經診斷患有轉移性TNBC之患者的包含阿特珠單抗之醫藥組成物，其中該治療包含阿特珠單抗以及太平洋紫杉醇，並且其中基於佔獲自患者之腫瘤樣品之約0.5%或更多(例如，約0.5%或更多、約0.75%或更多、約1%或更多、約1.25%或更多、約1.35%或更多、約1.5%或更多、約2%或更多、約2.25%或更多、約2.5%或更多、約2.75%或更多、約3%或更多、約3.25%或更多、約3.5%或更多、約3.75%或更多、約4%或更多、約4.25%或更多、約4.5%或更多、約4.75%或更多、或約5%或更多)的腫瘤浸潤免疫細胞中之CD8之可偵測的表現水準，患者經鑑別為可能對包含阿特珠單抗及太平洋紫杉醇之抗癌療法有反應。在一些實施例中，患者先前未針對轉移性TNBC進行治療。
例如，在一些實施例中，已確定獲自患者之腫瘤樣品在佔腫瘤樣品之約0.5%或更多、約0.55%或更多、約0.6%或更多、約0.65%或更多、約0.7%或更多、約0.75%或更多、約0.8%或更多、約0.85%或更多、約0.9%或更多、約0.95%或更多、約1%或更多、約1.05%或更多、約1.1%或更多、約1.2%或更多、約1.25%或更多、約1.3%或更多、約1.35%或更多、約1.4%或更多、約1.45%或更多、約1.5%或更多、約1.55%或更多、約1.6%或更多、約1.65%或更多、約1.7%或更多、約1.75%或更多、約1.8%或更多、約1.85%或更多、約1.9%或更多、約1.95%或更多、約2%或更多、約2.1%或更多、約2.2%或更多、約2.3%或更多、約2.4%或更多、約2.5%或更多、約2.6%或更多、約2.7%或更多、約2.8%或更多、約2.9%或更多、約3%或更多、約3.1%或更多、約3.2%或更多、約3.3%或更多、約3.4%或更多、約3.5%或更多、約3.6%或更多、約3.7%或更多、約3.8%或更多、約3.9%或更多、約4%或更多、約4.1%或更多、約4.2%或更多、約4.3%或更多、約4.4%或更多、約4.5%或更多、約4.6%或更多、約4.7%或更多、約4.8%或更多、約4.9%或更多、約5%或更多、約5.5%或更多、約6%或更多、約6.5%或更多、約7%或更多、約7.5%或更多、約8%或更多、約8.5%或更多、約9%或更多、約9.5%或更多、約10%或更多、約10.5%或更多、約11%或更多、約11.5%或更多、約12%或更多、約12.5%或更多、約13%或更多、約13.5%或更多、約14%或更多、約14.5%或更多、約15%或更多、約15.5%或更多、約16%或更多、約16.5%或更多、約17%或更多、約17.5%或更多、約18%或更多、約18.5%或更多、約19%或更多、約19.5%或更多、約20%或更多、約21%或更多、約22%或更多、約23%或更多、約24%或更多、約25%或更多、約26%或更多、約27%或更多、約28%或更多、約29%或更多、約30%或更多、約31%或更多、約32%或更多、約33%或更多、約34%或更多、約35%或更多、約36%或更多、約37%或更多、約38%或更多、約39%或更多、約40%或更多、約41%或更多、約42%或更多、約43%或更多、約44%或更多、約45%或更多、約46%或更多、約47%或更多、約48%或更多、約49%或更多、約50%或更多、約51%或更多、約52%或更多、約53%或更多、約54%或更多、約55%或更多、約56%或更多、約57%或更多、約58%或更多、約59%或更多、約60%或更多、約61%或更多、約62%或更多、約63%或更多、約64%或更多、約65%或更多、約66%或更多、約67%或更多、約68%或更多、約69%或更多、約70%或更多、約71%或更多、約72%或更多、約73%或更多、約74%或更多、約75%或更多、約76%或更多、約77%或更多、約78%或更多、約79%或更多、約80%或更多、約81%或更多、約82%或更多、約83%或更多、約84%或更多、約85%或更多、約86%或更多、約87%或更多、約88%或更多、約89%或更多、約90%或更多、約91%或更多、約92%或更多、約93%或更多、約94%或更多、約95%或更多、約96%或更多、約97%或更多、約98%或更多、或約99%或更多)之腫瘤浸潤免疫細胞中具有CD8之可偵測的表現水準。
例如，在一些實施例中，已確定獲自患者之腫瘤樣品在佔腫瘤樣品之約0.5%至50%、0.5%至45%、0.5%至40%、0.5%至35%、0.5%至30%、0.5%至25%、0.5%至20%、0.5%至15%、0.5%至10%、0.5%至9%、0.5%至8%、0.5%至7%、0.5%至6%、0.5%至5%、0.5%至4%、0.5%至3%、0.5%至2%、0.5%至1%、1%至50%、1%至40%、1%至35%、1%至30%、1%至25%、1%至20%、1%至15%、1%至10%、1%至9%、1%至8%、1%至7%、1%至6%、1%至5%、1%至4%、1%至3%、1%至2%、1.35%至50%、1.35%至45%、1.35%至40%、1.35%至35%、1.35%至30%、1.35%至30%、1.35%至25%、1.35%至20%、1.35%至15%、1.35%至10%、1.35%至9%、1.35%至8%、1.35%至7%、1.35%至6%、1.35%至5%、1.35%至4%、1.35%至3%、1.35%至2%、1.5%至50%、1.5%至45%、1.5%至40%、1.5%至35%、1.5%至30%、1.5%至30%、1.5%至25%、1.5%至20%、1.5%至15%、1.5%至10%、1.5%至9%、1.5%至8%、1.5%至7%、1.5%至6%、1.5%至5%、1.5%至4%、1.5%至3%、1.5%至2%、2%至50%、2%至45%、2%至40%、2%至35%、2%至30%、2%至25%、2%至20%、2%至15%、2%至10%、2%至9%、2%至8%、2%至7%、2%至6%、2%至5%、2%至4%、2%至3%、3%至50%、3%至45%、3%至40%、3%至35%、3%至30%、3%至25%、3%至20%、3%至15%、3%至10%、3%至9%、3%至8%、3%至7%、3%至6%、3%至5%、3%至4%、4%至50%、4%至45%、4%至40%、4%至35%、4%至30%、4%至25%、4%至20%、4%至15%、4%至10%、4%至9%、4%至8%、4%至7%、4%至6%、4%至5%、5%至50%、5%至45%、5%至40%、5%至35%、5%至30%、5%至25%、5%至20%、5%至15%、5%至10%、5%至9%、5%至8%、5%至7%、5%至6%、6%至50%、6%至45%、6%至40%、6%至35%、6%至30%、6%至25%、6%至20%、6%至15%、6%至10%、6%至9%、6%至8%、6%至7%、7%至50%、7%至45%、7%至40%、7%至35%、7%至30%、7%至25%、7%至20%、7%至15%、7%至10%、7%至9%、7%至8%、8%至50%、8%至45%、8%至40%、8%至35%、8%至30%、8%至25%、8%至20%、8%至15%、8%至10%、8%至9%、9%至50%、9%至45%、9%至40%、9%至35%、9%至30%、9%至25%、9%至20%、9%至15%、9%至10%、10%至50%、10%至45%、10%至40%、10%至35%、10%至30%、10%至25%、10%至20%、或10%至15%之腫瘤浸潤免疫細胞中具有CD8之可偵測的表現水準。
應瞭解在前述方法中任一者中，腫瘤浸潤免疫細胞佔腫瘤樣品之百分比可按照腫瘤樣品之切片中表現CD8之腫瘤浸潤免疫細胞(例如，T細胞)所覆蓋之腫瘤面積之百分比。在其他實施例中，表現CD8之腫瘤浸潤免疫細胞(例如，T細胞)相對於腫瘤浸潤免疫細胞之總數的百分比可用作生物標記物。
在另一實例中，本文提供一種治療患有局部晚期或轉移性乳癌(例如，局部晚期或轉移性TNBC)之患者的方法，該方法包括向患者投與有效量的抗癌療法，該抗癌療法包含(i) PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑)及(ii)紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)，其中患者先前未針對乳癌(例如，局部晚期或轉移性TNBC)進行治療，並且其中基於獲自患者之腫瘤樣品中之約5%或更多之sTIL之百分比，患者經鑑別為可能對抗癌療法有反應。
在另一個態樣中，本發明提供一種治療患有局部晚期或轉移性乳癌(例如，局部晚期或轉移性TNBC)之患者的方法，該方法包括：(a)確定獲自患者之腫瘤樣品中之sTIL之百分比，其中患者先前未針對乳癌(例如，局部晚期或轉移性TNBC)進行治療；及(b)基於腫瘤樣品之約5%或更多之sTIL之百分比，向患者投與治療有效量的抗癌療法，該抗癌療法包含(i) PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑)及(ii)紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)。
在另一態樣中，本發明提供一種用於治療經診斷患有局部晚期或轉移性乳癌(例如，局部晚期或轉移性TNBC)之患者的包含PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑)之醫藥組成物，其中該治療包含投與人類PD-1軸結合拮抗劑以及紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)，並且其中基於獲自患者之腫瘤樣品中之約5%或更多之sTIL之百分比，該患者經鑑別為可能對包含人類PD-1軸結合拮抗劑及紫杉烷之抗癌療法有反應。在一些實施例中，患者先前未針對乳癌(例如，局部晚期或轉移性TNBC)進行治療。
在前述態樣中任一項之一些實施例中，局部晚期或轉移性乳癌為局部晚期或轉移性TNBC。
例如，本文提供一種治療患有局部晚期TNBC之患者的方法，該方法包括向患者投與有效量的抗癌療法，該抗癌療法包含(i) PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑)及(ii)紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)，其中患者先前未針對局部晚期TNBC進行治療，並且其中基於獲自患者之腫瘤樣品之約5%或更多(例如，約5%或更多、6%或更多、7%或更多、8%或更多、9%或更多、10%或更多、15%或更多、20%或更多、25%或更多、50%或更多、60%或更多70%或更多、80%或更多、90%或更多、95%或更多、99%或更多、或100%)之sTIL之百分比，患者經鑑別為可能對抗癌療法有反應。
在另一實例中，本文提供一種治療患有轉移性TNBC之患者的方法，該方法包括向患者投與有效量的抗癌療法，該抗癌療法包含(i) PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑)及(ii)紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)，其中患者先前未針對轉移性TNBC進行治療，並且其中基於獲自患者之腫瘤樣品之約5%或更多(例如，約5%或更多、6%或更多、7%或更多、8%或更多、9%或更多、10%或更多、15%或更多、20%或更多、25%或更多、50%或更多、60%或更多70%或更多、80%或更多、90%或更多、95%或更多、99%或更多、或100%)之sTIL之百分比，患者經鑑別為可能對抗癌療法有反應。
在另一實例中，本文提供一種治療患有局部晚期TNBC之患者的方法，該方法包括：(a)確定獲自患者之腫瘤樣品中之sTIL之百分比，其中患者先前未針對局部晚期TNBC進行治療，及(b)基於腫瘤樣品之約5%或更多(例如，約5%或更多、6%或更多、7%或更多、8%或更多、9%或更多、10%或更多、15%或更多、20%或更多、25%或更多、50%或更多、60%或更多70%或更多、80%或更多、90%或更多、95%或更多、99%或更多、或100%)之sTIL之百分比，向患者投與治療有效量的抗癌療法，該抗癌療法包含(i) PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑)及(ii)紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)。
在進一步實例中，本文提供一種治療患有轉移性TNBC之患者的方法，該方法包括：(a)確定獲自獲自患者之腫瘤樣品中之sTIL之百分比，其中患者先前未針對轉移性TNBC進行治療，及(b)基於腫瘤樣品之約5%或更多(例如，約5%或更多、6%或更多、7%或更多、8%或更多、9%或更多、10%或更多、15%或更多、20%或更多、25%或更多、50%或更多、60%或更多70%或更多、80%或更多、90%或更多、95%或更多、99%或更多、或100%)之sTIL之百分比，向患者投與治療有效量的抗癌療法，該抗癌療法包含(i) PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑)及(ii)紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)。
在另一實例中，本文提供一種用於治療經診斷患有局部晚期TNBC之患者的包含PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑)之醫藥組成物，其中該治療包含投與PD-1軸結合拮抗劑以及紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)，並且其中基於獲自患者之腫瘤樣品之約5%或更多(例如，約5%或更多、6%或更多、7%或更多、8%或更多、9%或更多、10%或更多、15%或更多、20%或更多、25%或更多、50%或更多、60%或更多70%或更多、80%或更多、90%或更多、95%或更多、99%或更多、或100%)之sTIL之百分比，患者經鑑別為可能對包含人類PD-1軸結合拮抗劑及紫杉烷之抗癌療法有反應。在一些實施例中，患者先前未針對局部晚期TNBC進行治療。
在另一實例中，本文提供一種用於治療經診斷患有轉移性TNBC之患者的包含PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑)之醫藥組成物，其中該治療包含投與PD-1軸結合拮抗劑以及紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)，並且其中基於獲自患者之腫瘤樣品之約5%或更多(例如，約5%或更多、6%或更多、7%或更多、8%或更多、9%或更多、10%或更多、15%或更多、20%或更多、25%或更多、50%或更多、60%或更多70%或更多、80%或更多、90%或更多、95%或更多、99%或更多、或100%)之sTIL之百分比，患者經鑑別為可能對包含人類PD-1軸結合拮抗劑及紫杉烷之抗癌療法有反應。在一些實施例中，患者先前未針對轉移性TNBC進行治療。
在另一實例中，本文提供一種治療患有局部晚期TNBC之患者的方法，該方法包括向患者投與有效量的抗癌療法，該抗癌療法包含阿特珠單抗及nab-太平洋紫杉醇，其中患者先前未針對局部晚期TNBC進行治療，並且其中基於獲自患者之腫瘤樣品之約5%或更多(例如，約5%或更多、6%或更多、7%或更多、8%或更多、9%或更多、10%或更多、15%或更多、20%或更多、25%或更多、50%或更多、60%或更多70%或更多、80%或更多、90%或更多、95%或更多、99%或更多、或100%)之sTIL之百分比，患者經鑑別為可能對抗癌療法有反應。
在另一實例中，本文提供一種治療患有轉移性TNBC之患者的方法，該方法包括向患者投與有效量的抗癌療法，該抗癌療法包含阿特珠單抗及nab-太平洋紫杉醇，其中患者先前未針對轉移性TNBC進行治療，並且其中基於獲自患者之腫瘤樣品之約5%或更多(例如，約5%或更多、6%或更多、7%或更多、8%或更多、9%或更多、10%或更多、15%或更多、20%或更多、25%或更多、50%或更多、60%或更多70%或更多、80%或更多、90%或更多、95%或更多、99%或更多、或100%)之sTIL之百分比，患者經鑑別為可能對抗癌療法有反應。
在進一步實例中，本文提供一種治療患有局部晚期TNBC之患者的方法，該方法包括：(a)確定獲自患者之腫瘤樣品中之sTIL之百分比，其中患者先前未針對局部晚期TNBC進行治療，及(b)基於腫瘤樣品之約5%或更多(例如，約5%或更多、6%或更多、7%或更多、8%或更多、9%或更多、10%或更多、15%或更多、20%或更多、25%或更多、50%或更多、60%或更多70%或更多、80%或更多、90%或更多、95%或更多、99%或更多、或100%)之sTIL之百分比，向患者投與治療有效量的抗癌療法，該抗癌療法包含阿特珠單抗及nab-太平洋紫杉醇。
在另一實例中，本文提供一種治療患有轉移性TNBC之患者的方法，該方法包括：(a)確定獲自獲自患者之腫瘤樣品中之sTIL之百分比，其中患者先前未針對轉移性TNBC進行治療，及(b)基於腫瘤樣品之約5%或更多(例如，約5%或更多、6%或更多、7%或更多、8%或更多、9%或更多、10%或更多、15%或更多、20%或更多、25%或更多、50%或更多、60%或更多70%或更多、80%或更多、90%或更多、95%或更多、99%或更多、或100%)之sTIL之百分比，向患者投與治療有效量的抗癌療法，該抗癌療法包含阿特珠單抗及nab-太平洋紫杉醇。
在另一實例中，本文提供一種用於治療經診斷患有局部晚期TNBC之患者的包含阿特珠單抗之醫藥組成物，其中該治療包含投與阿特珠單抗以及nab-太平洋紫杉醇，並且其中基於獲自患者之腫瘤樣品之約5%或更多(例如，約5%或更多、6%或更多、7%或更多、8%或更多、9%或更多、10%或更多、15%或更多、20%或更多、25%或更多、50%或更多、60%或更多70%或更多、80%或更多、90%或更多、95%或更多、99%或更多、或100%)之sTIL之百分比，患者經鑑別為可能對包含阿特珠單抗及nab-太平洋紫杉醇之抗癌療法有反應。在一些實施例中，患者先前未針對局部晚期TNBC進行治療。
在另一實例中，本文提供一種用於治療經診斷患有轉移性TNBC之患者的包含阿特珠單抗之醫藥組成物，其中該治療包含投與阿特珠單抗以及nab-太平洋紫杉醇，並且其中基於獲自患者之腫瘤樣品之約5%或更多(例如，約5%或更多、6%或更多、7%或更多、8%或更多、9%或更多、10%或更多、15%或更多、20%或更多、25%或更多、50%或更多、60%或更多70%或更多、80%或更多、90%或更多、95%或更多、99%或更多、或100%)之sTIL之百分比，患者經鑑別為可能對包含阿特珠單抗及nab-太平洋紫杉醇之抗癌療法有反應。在一些實施例中，患者先前未針對轉移性TNBC進行治療。
在另一實例中，本文提供一種治療患有局部晚期TNBC之患者的方法，該方法包括向患者投與有效量的抗癌療法，該抗癌療法包含阿特珠單抗及太平洋紫杉醇，其中患者先前未針對局部晚期TNBC進行治療，並且其中基於獲自患者之腫瘤樣品之約5%或更多(例如，約5%或更多、6%或更多、7%或更多、8%或更多、9%或更多、10%或更多、15%或更多、20%或更多、25%或更多、50%或更多、60%或更多70%或更多、80%或更多、90%或更多、95%或更多、99%或更多、或100%)之sTIL之百分比，患者經鑑別為可能對抗癌療法有反應。
在另一實例中，本文提供一種治療患有轉移性TNBC之患者的方法，該方法包括向患者投與有效量的抗癌療法，該抗癌療法包含阿特珠單抗及太平洋紫杉醇，其中患者先前未針對轉移性TNBC進行治療，並且其中基於獲自患者之腫瘤樣品之約5%或更多(例如，約5%或更多、6%或更多、7%或更多、8%或更多、9%或更多、10%或更多、15%或更多、20%或更多、25%或更多、50%或更多、60%或更多70%或更多、80%或更多、90%或更多、95%或更多、99%或更多、或100%)之sTIL之百分比，患者經鑑別為可能對抗癌療法有反應。
在進一步實例中，本文提供一種治療患有局部晚期TNBC之患者的方法，該方法包括：(a)確定獲自患者之腫瘤樣品中之sTIL之百分比，其中患者先前未針對局部晚期TNBC進行治療，及(b)基於腫瘤樣品之約5%或更多(例如，約5%或更多、6%或更多、7%或更多、8%或更多、9%或更多、10%或更多、15%或更多、20%或更多、25%或更多、50%或更多、60%或更多70%或更多、80%或更多、90%或更多、95%或更多、99%或更多、或100%)之sTIL之百分比，向患者投與治療有效量的抗癌療法，該抗癌療法包含阿特珠單抗及太平洋紫杉醇。
在另一實例中，本文提供一種治療患有轉移性TNBC之患者的方法，該方法包括：(a)確定獲自獲自患者之腫瘤樣品中之sTIL之百分比，其中患者先前未針對轉移性TNBC進行治療，及(b)基於腫瘤樣品之約5%或更多(例如，約5%或更多、6%或更多、7%或更多、8%或更多、9%或更多、10%或更多、15%或更多、20%或更多、25%或更多、50%或更多、60%或更多70%或更多、80%或更多、90%或更多、95%或更多、99%或更多、或100%)之sTIL之百分比，向患者投與治療有效量的抗癌療法，該抗癌療法包含阿特珠單抗及太平洋紫杉醇。
在另一實例中，本文提供一種用於治療經診斷患有局部晚期TNBC之患者的包含阿特珠單抗之醫藥組成物，其中該治療包含投與阿特珠單抗以及太平洋紫杉醇，並且其中基於獲自患者之腫瘤樣品之約5%或更多(例如，約5%或更多、6%或更多、7%或更多、8%或更多、9%或更多、10%或更多、15%或更多、20%或更多、25%或更多、50%或更多、60%或更多70%或更多、80%或更多、90%或更多、95%或更多、99%或更多、或100%)之sTIL之百分比，患者經鑑別為可能對包含阿特珠單抗及太平洋紫杉醇之抗癌療法有反應。在一些實施例中，患者先前未針對局部晚期TNBC進行治療。
在另一實例中，本文提供一種用於治療經診斷患有轉移性TNBC之患者的包含阿特珠單抗之醫藥組成物，其中該治療包含投與阿特珠單抗以及太平洋紫杉醇，並且其中基於獲自患者之腫瘤樣品之約5%或更多(例如，約5%或更多、6%或更多、7%或更多、8%或更多、9%或更多、10%或更多、15%或更多、20%或更多、25%或更多、50%或更多、60%或更多70%或更多、80%或更多、90%或更多、95%或更多、99%或更多、或100%)之sTIL之百分比，患者經鑑別為可能對包含阿特珠單抗及太平洋紫杉醇之抗癌療法有反應。在一些實施例中，患者先前未針對轉移性TNBC進行治療。
例如，在一些實施例中，已確定獲自患者之腫瘤樣品具有佔腫瘤樣品之約5%或更多、約5.5%或更多、約6%或更多、約6.5%或更多、約7%或更多、約7.5%或更多、約8%或更多、約8.5%或更多、約9%或更多、約9.5%或更多、約10%或更多、約10.5%或更多、約11%或更多、約11.5%或更多、約12%或更多、約12.5%或更多、約13%或更多、約13.5%或更多、約14%或更多、約14.5%或更多、約15%或更多、約15.5%或更多、約16%或更多、約16.5%或更多、約17%或更多、約17.5%或更多、約18%或更多、約18.5%或更多、約19%或更多、約19.5%或更多、約20%或更多、約21%、約22%或更多、約23%或更多、約24%或更多、約25%或更多、約26%或更多、約27%或更多、約28%或更多、約29%或更多、約30%或更多、約31%或更多、約32%或更多、約33%或更多、約34%或更多、約35%或更多、約36%或更多、約37%或更多、約38%或更多、約39%或更多、約40%或更多、約41%或更多、約42%或更多、約43%或更多、約44%或更多、約45%或更多、約46%或更多、約47%或更多、約48%或更多、約49%或更多、約50%或更多、約51%或更多、約52%或更多、約53%或更多、約54%或更多、約55%或更多、約56%或更多、約57%或更多、約58%或更多、約59%或更多、約60%或更多、約61%或更多、約62%或更多、約63%或更多、約64%或更多、約65%或更多、約66%或更多、約67%或更多、約68%或更多、約69%或更多、約70%或更多、約71%或更多、約72%或更多、約73%或更多、約74%或更多、約75%或更多、約76%或更多、約77%或更多、約78%或更多、約79%或更多、約80%或更多、約81%或更多、約82%或更多、約83%或更多、約84%或更多、約85%或更多、約86%或更多、約87%或更多、約88%或更多、約89%或更多、約90%或更多、約91%或更多、約92%或更多、約93%或更多、約94%或更多、約95%或更多、約96%或更多、約97%或更多、約98%或更多、或約99%或更多之百分比之sTIL。
例如，在一些實施例中，sTIL之百分比為腫瘤樣品之約5%至50%、5%至45%、5%至40%、5%至35%、5%至30%、5%至25%、5%至20%、5%至15%、5%至10%、5%至9%、5%至8%、5%至7%、5%至6%、6%至50%、6%至45%、6%至40%、6%至35%、6%至30%、6%至25%、6%至20%、6%至15%、6%至10%、6%至9%、6%至8%、6%至7%、7%至50%、7%至45%、7%至40%、7%至35%、7%至30%、7%至25%、7%至20%、7%至15%、7%至10%、7%至9%、7%至8%、8%至50%、8%至45%、8%至40%、8%至35%、8%至30%、8%至25%、8%至20%、8%至15%、8%至10%、8%至9%、9%至50%、9%至45%、9%至40%、9%至35%、9%至30%、9%至25%、9%至20%、9%至15%、9%至10%、10%至50%、10%至45%、10%至40%、10%至35%、10%至30%、10%至25%、10%至20%、或10%至15%。
應瞭解在前述方法中任一者中，腫瘤樣品之sTIL之百分比可為總腫瘤內基質面積內單核炎症細胞所佔據之面積。sTIL之百分比可使用在此項技術中已知之任何合適方法來評估，例如在Salgado等人Annals of Oncology 26:259-271, 2015中所描述。
本文所述之任何方法均可包括確定PD-L1、CD8、及sTIL中二或更多者之存在及/或表現水準。例如，在一些實施例中，該方法包括確定PD-L1及CD8之存在及/或表現水準。在另一實施例中，該方法包括確定PD-L1及sTIL之存在及/或表現水準。在另一實施例中，該方法包括確定CD8及sTIL之存在及/或表現水準。在另一實施例中，該方法包括確定PD-L1、CD8、及sTIL之存在及/或表現水準。
在前述態樣中任一項之一些實施例中，局部晚期TNBC為不可切除的。
在一些實施例中，患者為人類。在一些實施例中，患者患有局部晚期或轉移性乳癌(例如，TNBC)。在一些實施例中，患者患有局部晚期TNBC (例如，不可切除的局部晚期TNBC)。在一些實施例中，轉移性乳癌為mTNBC。在一些實施例中，患者先前針對局部晚期或轉移性乳癌經受兩次或更少次數的細胞毒性治療方案。在一些實施例中，患者先前從未針對局部晚期或轉移性乳癌經受靶向全身治療。因此，在某些實施例中，用於治療個體中之局部晚期或轉移性乳癌(例如，局部晚期或轉移性TNBC)或延遲其進展或在患有局部晚期或轉移性乳癌之個體中增強免疫功能的方法可充當個體之第一線療法。
在一些實施例中，在用PD-1軸結合拮抗劑(例如，抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)或抗PD-1抗體)及紫杉烷(例如，nab-或紫杉醇)之組合治療之前，個體已用癌症療法太平洋紫杉醇治療。在一些實施例中，個體患有對一或多種癌症療法有抗性之癌症。在一些實施例中，對於癌症療法之抗性包括癌症復發或難治性癌症。復發可指治療之後在原始部位或新部位處再出現癌症。在一些實施例中，對癌症療法之抗性包括用抗癌療法之治療期間的癌症進展。在一些實施例中，對癌症治療之抗性包括癌症對治療無反應。癌症可在治療開始時具有抗性，或可在治療期間變得具有抗性。在一些實施例中，癌症處於早期階段或晚期階段。
在前述態樣中任一項之一些實施例中，腫瘤樣品為福馬林固定且石蠟包埋(FFPE)的腫瘤樣品、檔案腫瘤樣品、新鮮腫瘤樣品或冷凍腫瘤樣品。
在前述態樣中任一項之一些實施例中，PD-1結合拮抗劑為人類PD-1結合拮抗劑，諸如抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)或抗PD-1抗體。在一些實施例中，PD-1結合拮抗劑為阿特珠單抗。
在前述態樣中任一項之一些實施例中，紫杉烷為nab-太平洋紫杉醇。
在前述態樣中任一項之其他實施例中，紫杉烷為太平洋紫杉醇。
在前述態樣中任一項之一些實施例中，患者是否可能對用該抗癌療法之治療有反應係依據無進展存活來確定。例如，與用包含紫杉烷而沒有PD-1軸結合拮抗劑之抗癌療法之治療相比，用包含(i) PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)及抗PD-1抗體之PD-1軸結合拮抗劑)及(ii)紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)之抗癌療法之治療可增加患者之無進展存活約1個月、約2個月、約2.5個月、約3個月、約3.5個月、約4個月、約4.5個月、約5個月、約5.5個月、約6個月、約6.5個月、約7個月、或更長時間。在一個實施例中，與用包含紫杉烷而沒有PD-1軸結合拮抗劑之抗癌療法之治療相比，用包含(i) PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)及抗PD-1抗體之PD-1軸結合拮抗劑)及(ii)紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)之抗癌療法之治療可增加患者之無進展存活約2.5個月。
在前述態樣中任一項之一些實施例中，患者是否可能對用該抗癌療法之治療有反應係依據總體存活來確定。例如，與用包含紫杉烷而沒有PD-1軸結合拮抗劑之抗癌療法之治療相比，用包含(i) PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)及抗PD-1抗體之PD-1軸結合拮抗劑)及(ii)紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)之抗癌療法之治療可增加患者之總體存活約1個月、約2個月、約3個月、約4個月、約5個月、約6個月、約7個月、約8個月、約9個月、約10個月、約11個月、約12個月、約13個月、約14個月、或更長時間。在一個實施例中，與用包含紫杉烷而沒有PD-1軸結合拮抗劑之抗癌療法之治療相比，用包含(i) PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)及抗PD-1抗體之PD-1軸結合拮抗劑)及(ii)紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)之抗癌療法之治療可增加患者之總體存活約7個月。
在前述態樣中任一項之一些實施例中，患者是否可能對用該抗癌療法之治療有反應係依據總體反應率來確定。
在前述態樣中任一項之一些實施例中，患者是否可能對用該抗癌療法之治療有反應係依據完全反應率來確定。
在前述態樣中任一項之一些實施例中，患者是否可能對用該抗癌療法之治療有反應係依據部分反應率來確定。
上文所述之生物標記物(例如，PD-L1、CD8、及/或sTIL)中任一者之存在及/或表現水準可均使用本文中(例如，以上部分III中)所述之任何方法或使用在此項技術中已知的方法來確定。
在前述方法及用途中任一者之一些實施例中，本文所提供之方法包括投與有效量的選自PD-L1結合拮抗劑(例如，抗PD-L1抗體)及PD-1結合拮抗劑(例如，抗PD-1抗體)之PD-1軸結合拮抗劑。在一些實施例中，PD-L1結合拮抗劑為抗體，諸如能夠抑制PD-L1結合至PD-1及B7.1但不干擾PD-1結合至PD-L2的抗體。在一些實施例中，PD-L1結合拮抗劑抗體為阿特珠單抗，其可以每兩週約700 mg至約900 mg (例如，每兩週約750 mg至約900 mg，例如，每兩週約800 mg至約850 mg)之劑量投與。在一些實施例中，阿特珠單抗係以每兩週約840 mg之劑量投與。
作為一般建議，可向人類投與之PD-1軸結合拮抗劑(例如，抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)或抗PD-1抗體)之治療有效量應在約0.01至約50 mg/kg患者體重之範圍內，不論是藉由一次還是多次投與。在一些實施例中，例如，拮抗劑(例如，抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)或抗PD-1抗體)例如以每天投與約0.01至約45 mg/kg、約0.01至約40 mg/kg、約0.01至約35 mg/kg、約0.01至約30 mg/kg、約0.01至約25 mg/kg、約0.01至約20 mg/kg、約0.01至約15 mg/kg、約0.01至約10 mg/kg、約0.01至約5 mg/kg、或約0.01至約1 mg/kg之劑量來投與。在一些實施例中，拮抗劑(例如，抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)或抗PD-1抗體)以15 mg/kg來投與。然而，可使用其他給藥方案。在一個實施例中，PD-1軸結合拮抗劑(例如，抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)或抗PD-1抗體)以約100 mg、約200 mg、約300 mg、約400 mg、約500 mg、約600 mg、約700 mg、約800 mg、約900 mg、約1000 mg、約1100 mg、約1200 mg、約1300 mg、約1400 mg、或約1500 mg之劑量來向人類投與。在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑(例如，抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)或抗PD-1抗體)係以每兩週約800 mg至約850 mg之劑量投與。在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑(例如，抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)或抗PD-1抗體)係以每兩週以約840 mg之劑量投與。劑量可作為單一劑量或多個劑量(例如2或3個劑量)投與，諸如輸注。如與單一治療相比，在組合治療中投與之抗體之劑量可降低。在一些實施例中，例如，治療個體中之局部晚期或轉移性乳癌或延遲其進展之方法包括包括治療週期之給藥方案，其中在各週期之第1天及第15天，以約840 mg之劑量向個體投與人類PD-1軸結合拮抗劑(例如，抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)或抗PD-1抗體)，其中各週期為28天(亦即，各週期每28天重複)。此療法之進展易於藉由習知技術監測。
在一些實施例中，本文所提供之方法包括投與有效量之紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇(ABRAXANE®)、太平洋紫杉醇、或歐洲紫杉醇)。作為一般建議，向人類投與之紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)之治療有效量應在約25至約300 mg/m2 (例如，約25 mg/m2 、約50 mg/m2 、約75 mg/m2 、約100 mg/m2 、約125 mg/m2 、約150 mg/m2 、約175 mg/m2 、約200 mg/m2 、約225 mg/m2 、約250 mg/m2 、約275 mg/m2 、或約300 mg/m2 )之範圍內，不論是藉由一次投與還是多次投與。在一些實施例中，紫杉烷為nab-太平洋紫杉醇(ABRAXANE®)。在一些實施例中，nab-太平洋紫杉醇(ABRAXANE®)係以每週約100 mg/m2 至約125 mg/m2 之劑量向個體投與。在一些實施例中，nab-太平洋紫杉醇(ABRAXANE®)係以每週約100 mg/m2 之劑量向個體投與。例如，在一些實施例中，投與約100 mg/m2 之nab-太平洋紫杉醇(ABRAXANE®)。在一些實施例中，nab-太平洋紫杉醇(ABRAXANE®)係以每週一次100 mg/m2 來投與。在一些實施例中，投與約125 mg/m2 之太平洋紫杉醇。在其他實施例中，紫杉烷為太平洋紫杉醇。在一些實施例中，太平洋紫杉醇係以每週以約75 mg/m2 至約125 mg/m2 之劑量向個體投與。在一些實施例中，太平洋紫杉醇係以每週約90 mg/m2 之劑量向個體投與。在一些實施例中，太平洋紫杉醇係以每三週200 mg/m2 來投與。在一些實施例中，紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)可每週，每2週，每3週，每4週，在各21天週期之第1天、第8天、及第15天，或在各28天週期之第1天、第8天、及第15天來投與。例如，在一些實施例中，nan-太平洋紫杉醇係在各28天週期之第1天、第8天、及第15天向個體投與。在另一實例中，在一些實施例中，太平洋紫杉醇在各28天週期之第1天、第8天、及第15天向個體投與。
在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑(例如，抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)或抗PD-1抗體)及紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)係在單一給藥方案中投與。此等劑之投與可在給藥方案之情形中為並行或分開的。例如，在一些實施例中，本文所提供之方法包括包含治療週期之給藥方案，其中個體在各週期之第1天及第15天投與以約840 mg之劑量之人類PD-1軸結合拮抗劑(例如，抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)或抗PD-1抗體)，並且在各週期之第1天、第8天、及第15天投與以約80 mg/m2 至約100 mg/m2 之劑量之紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)，各週期每28天重複。例如，在一些實施例中，本文所提供之方法包括包含治療週期之給藥方案，其中個體在各週期之第1天及第15天投與以約840 mg之劑量之阿特珠單抗，並且在各週期之第1天、第8天、及第15天投與以約100 mg/m2 之劑量之nab-太平洋紫杉醇，各週期每28天重複。在另一實例中，在一些實施例中，本文所提供之方法包括包含治療週期之給藥方案，其中個體在各週期之第1天及第15天投與以約840 mg之劑量之阿特珠單抗，並且在各週期之第1天、第8天、及第15天投與以約90 mg/m2 之劑量之太平洋紫杉醇，各週期每28天重複。
在一些實施例中，該等方法進一步包括投與有效量之化學治療劑。在一些實施例中，化學治療劑為基於鉑之化學治療劑，諸如卡鉑。
在一些實施例中，本發明之組合療法包括投與PD-1軸結合拮抗劑(例如，抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)或抗PD-1抗體)及紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)。PD-1軸結合拮抗劑(例如，抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)或抗PD-1抗體)及紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)可以此項技術中已知之任何合適方式來投與。例如，PD-1軸結合拮抗劑(例如，抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)或抗PD-1抗體)及紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)可依序(在不同時間)或並行(在同一時間)投與。在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑(例如，抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)或抗PD-1抗體)在與紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)分開之組成物中。在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑(例如，抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)或抗PD-1抗體)在與紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)相同之組成物中。
PD-1軸結合拮抗劑(例如，抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)或抗PD-1抗體)及紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)可藉由相同投與途徑或藉由不同投與途徑來投與。在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑(例如，抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)或抗PD-1抗體)及/或紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)係靜脈內、肌肉內、皮下、局部、經口、經皮、腹膜內、眶內、藉由植入、藉由吸入、鞘內、心室內、或鼻內投與。在一些實施例中，紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)係靜脈內、肌肉內、皮下、局部、經口、經皮、腹膜內、眶內、藉由植入、藉由吸入、鞘內、心室內、或鼻內投與。有效量之PD-1軸結合拮抗劑(例如，抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)或抗PD-1抗體)及紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)可為了預防或治療疾病來投與。PD-1軸結合拮抗劑(例如，抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)或抗PD-1抗體)及/或紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)之合適劑量可基於待治療之疾病之類型、PD-1軸結合拮抗劑及紫杉烷之類型、疾病之嚴重程度及過程、個體之臨床狀況、個體之臨床病史及對治療之反應、及主治醫師之裁量來確定。在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑(例如，抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)或抗PD-1抗體)及/或紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)係藉由輸注來靜脈內投與。
在一些實施例中，該等方法可進一步包括額外療法。額外療法可為輻射療法、手術(例如，乳房腫瘤切除術及乳房切除術)、化學療法、基因療法、DNA療法、病毒療法、RNA療法、免疫療法、骨髓移植術、奈米療法(nanotherapy)、單株抗體療法、或前述之組合。該額外療法可呈輔助或新輔助療法之形式。在一些實施例中，額外療法為投與小分子酶抑制劑或抗轉移劑。在一些實施例中，額外療法為投與副作用限制劑(例如，意欲減輕治療之副作用之發生及/或嚴重程度之劑，諸如抗噁心劑等)。在一些實施例中，額外療法為輻射療法。在一些實施例中，額外療法為手術。在一些實施例中，額外療法為輻射療法與手術之組合。在一些實施例中，額外療法為γ照射。在一些實施例中，額外療法為靶向PI3K/AKT/mTOR途徑之療法、HSP90抑制劑、微管蛋白抑制劑、細胞凋亡抑制劑、及/或化學預防劑。額外療法可為本文所述之化學治療劑中之一或多者。
在一些實施例中，該等方法進一步包括與PD-1軸結合拮抗劑(例如，抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)或抗PD-1抗體)及紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)一起投與基於鉑之化學治療劑。在一些實施例中，基於鉑之化學治療劑為卡鉑。卡鉑之劑量及投與為此項技術中熟知的。例示性劑量之卡鉑係以6 mg/ml之目標曲線下面積(AUC)投與。在一些實施例中，卡鉑係每3週靜脈內投與。
在一些實施例中，該等方法包括藉由在4週(28天)治療週期之情形中投與每兩週(q2w) IV投與之800 mg之抗PD-L1抗體阿特珠單抗，以及每週(q1w) IV投與之125 mg/m2 之nab-太平洋紫杉醇(ABRAXANE®)持續三週來治療患有mTNBC之個體，該治療週期可重複直到喪失臨床益處、完全反應、緩解、或由主治醫師裁量之其他情形發生為止。V. 其他組合療法
本文亦提供用於治療個體中之乳癌(例如，局部晚期或轉移性乳癌(例如，局部晚期或轉移性TNBC))或延遲其進展的方法，該方法包括聯合另一抗癌劑或癌症療向個體投與PD-1軸結合拮抗劑(例如，抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)或抗PD-1抗體)及紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)。在一些實施例中，該等方法包括向個體投與PD-1軸結合拮抗劑(例如，抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)或抗PD-1抗體)、紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)、及額外治療劑。
在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑(例如，抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)或抗PD-1抗體)及紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)可聯合化學療法或化學治療劑來投與。在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑(例如，抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)或抗PD-1抗體)及紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)可聯合輻射療法或放射治療劑來投與。在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑(例如，抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)或抗PD-1抗體)及紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)可聯合靶向療法或靶向治療劑來投與。在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑(例如，抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)或抗PD-1抗體)及紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)可聯合免疫療法或免疫治療劑例如單株抗體來投與。
在不希望受理論束縛之情況下，認為藉由促進活化共刺激分子或藉由抑制陰性共刺激分子來增強T細胞刺激，可促進腫瘤細胞死亡，由此治療癌症或延遲其進展。在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑(例如，抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)或抗PD-1抗體)及紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)可聯合針對活化共刺激分子之促效劑來投與。在一些實施例中，活化共刺激分子可包括CD40、CD226、CD28、OX40、GITR、CD137、CD27、HVEM、或CD127。在一些實施例中，針對活化共刺激分子之促效劑為結合CD40、CD226、CD28、OX40、GITR、CD137、CD27、HVEM、或CD127之促效劑抗體。在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑(例如，抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)或抗PD-1抗體)及紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)可聯合針對抑制性共刺激分子之拮抗劑來投與。在一些實施例中，抑制性共刺激分子可包括CTLA-4 (亦稱為CD152)、PD-1、TIM-3、BTLA、VISTA、LAG-3、B7-H3、B7-H4、IDO、TIGIT、MICA/B、或精胺酸酶。在一些實施例中，針對抑制性共刺激分子之拮抗劑為結合至CTLA-4、PD-1、TIM-3、BTLA、VISTA、LAG-3、B7-H3、B7-H4、IDO、TIGIT、MICA/B、或精胺酸酶之拮抗劑抗體。
在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑(例如，抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)或抗PD-1抗體)及紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)可聯合針對CTLA-4 (亦稱為CD152)之拮抗劑例如阻斷抗體來投與。在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑(例如，抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)或抗PD-1抗體)及紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)可聯合依匹單抗(ipilimumab)(亦稱為MDX-010、MDX-101、或YERVOY®)來投與。在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑(例如，抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)或抗PD-1抗體)及紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)可聯合曲利木單抗(tremelimumab)(亦稱為替奇木單抗(ticilimumab)或CP-675,206)來投與。在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑(例如，抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)或抗PD-1抗體)及紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)可聯合針對B7-H3 (亦稱為CD276)之拮抗劑例如阻斷抗體來投與。在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑(例如，抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)或抗PD-1抗體)及紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)可聯合MGA271來投與。在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑(例如，抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)或抗PD-1抗體)及紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)可聯合針對TGFβ之拮抗劑例如美替木單抗(metelimumab)(亦稱為CAT-192)、弗瑞索單抗(fresolimumab)(亦稱為GC1008)、或LY2157299來投與。
在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑(例如，抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)或抗PD-1抗體)及紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)可聯合一種療法來投與，該療法包含表現嵌合抗原受體(CAR)之T細胞(例如，細胞毒性T細胞或CTL)的過繼性轉移。在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑(例如，抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)或抗PD-1抗體)及紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)可聯合一種治療來投與，該治療包含含有顯性負性(dominant-negative ) TGFβ受體例如顯性負性TGFβ II型受體之T細胞的過繼性轉移。在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑(例如，抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)或抗PD-1抗體)及紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)可聯合包含HERCREEM方案(參見，例如，ClinicalTrials.gov Identifier NCT00889954)之療法來投與。
在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑及紫杉烷可聯合針對CD137 (亦稱為TNFRSF9、4-1BB、或ILA)之促效劑例如活化抗體來投與。在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑及紫杉烷可聯合優瑞魯單抗(urelumab)(亦稱為BMS-663513)來投與。在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑及紫杉烷可聯合針對CD40之促效劑例如活化抗體來投與。在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑及紫杉烷可聯合CP-870893來投與。在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑及紫杉烷可聯合針對OX40 (亦稱為CD134)之促效劑例如活化抗體來投與。在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑及紫杉烷可聯合抗OX40抗體(例如，AgonOX)來投與。在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑及紫杉烷可聯合針對CD27之促效劑例如活化抗體來投與。在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑及紫杉烷可聯合CDX-1127來投與。在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑及紫杉烷可聯合針對吲哚胺-2,3-雙加氧酶(IDO)之拮抗劑來投與。在一些實施例中，IDO拮抗劑為1-甲基-D-色胺酸(亦稱為1-D-MT)。
在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑及紫杉烷可聯合抗體-藥物綴合物來投與。在一些實施例中，抗體-藥物綴合物包含美登素或單甲基奧里斯他汀E (MMAE)。在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑及紫杉烷可聯合抗NaPi2b抗體-MMAE綴合物(亦稱為DNIB0600A或RG7599)來投與。在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑及紫杉烷可聯合曲妥珠單抗美坦辛(trastuzumab emtansine)(亦稱為T-DM1，阿多曲妥珠單抗美坦辛(ado-trastuzumab emtansine)，或KADCYLA®，Genentech)來投與。在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑及紫杉烷可聯合DMUC5754A來投與。在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑及紫杉烷可聯合靶向內皮素B受體(EDNBR)之抗體-藥物綴合物例如與MMAE綴合之針對EDNBR之抗體來投與。
在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑及紫杉烷可聯合血管新生抑制劑來投與。在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑及紫杉烷可聯合針對VEGF例如VEGF-A之抗體來投與。在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑(例如，抗PD-L1抗體，例如，MPDL3280A)及紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)可聯合貝伐單抗(bevacizumab)(亦稱為AVASTIN®，Genentech)來投與。在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑及紫杉烷可聯合針對血管生成素2 (亦稱為Ang2)之抗體來投與。在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑及紫杉烷可聯合MEDI3617來投與。
在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑及紫杉烷可聯合抗腫瘤藥來投與。在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑及紫杉烷可聯合靶向CSF-1R (亦稱為M-CSFR或CD115)之劑來投與。在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑及紫杉烷可聯合抗CSF-1R (亦稱為IMC-CS4)來投與。在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑及紫杉烷可聯合干擾素例如干擾素α或干擾素γ來投與。在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑及紫杉烷可聯合羅飛龍-A (Roferon-A)(亦稱為重組干擾素α-2a)來投與。在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑及紫杉烷可聯合GM-CSF (亦稱為重組人類顆粒球巨噬細胞集落刺激因子、rhu GM-CSF、沙格司亭(sargramostim)、或LEUKINE®)來投與。在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑及紫杉烷可聯合IL-2 (亦稱為阿地白介素(aldesleukin)或PROLEUKIN®)來投與。在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑及紫杉烷可聯合IL-12來投與。在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑及紫杉烷可聯合靶向CD20之抗體來投與。在一些實施例中，靶向CD20之抗體為奧濱尤妥珠單抗(obinutuzumab)(亦稱為GA101或GAZYVA®)或利妥昔單抗(rituximab)。在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑及紫杉烷可聯合靶向GITR之抗體來投與。在一些實施例中，靶向GITR之抗體為TRX518。
在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑及紫杉烷可聯合癌症疫苗來投與。在一些實施例中，癌症疫苗為肽癌症疫苗，在一些實施例中其為個人化肽疫苗。在一些實施例中，肽癌症疫苗為多價長肽、多肽、肽混合物、雜合肽或肽衝擊(peptide-pulsed)之樹突狀細胞疫苗(參見例如Yamada等人, Cancer Sci, 104:14-21, 2013)。在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑及紫杉烷可聯合佐劑來投與。在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑及紫杉烷可聯合包含TLR促效劑例如Poly-ICLC (亦稱為HILTONOL®)、LPS、MPL、或CpG ODN之療法來投與。在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑及紫杉烷可聯合腫瘤壞死因素(TNF)α來投與。在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑及紫杉烷可聯合IL-1來投與。在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑及紫杉烷可聯合HMGB1來投與。在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑及紫杉烷可聯合IL-10拮抗劑來投與。在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑及紫杉烷可聯合IL-4拮抗劑來投與。在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑及紫杉烷可聯合IL-13拮抗劑來投與。在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑及紫杉烷可聯合HVEM拮抗劑來投與。在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑及紫杉烷可聯合ICOS促效劑，例如，藉由投與ICOS-L、或針對ICOS之促效抗體來投與。在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑及紫杉烷可聯合靶向CX3CL1之治療來投與。在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑及紫杉烷可聯合靶向CXCL9之治療來投與。在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑及紫杉烷可聯合靶向CXCL10之治療來投與。在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑及紫杉烷可聯合靶向CCL5之治療來投與。在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑及紫杉烷可聯合LFA-1或ICAM1促效劑來投與。在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑及紫杉烷可聯合選擇素促效劑來投與。
在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑及紫杉烷可聯合靶向療法來投與。在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑及紫杉烷可聯合B-Raf之抑制劑來投與。在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑及紫杉烷可聯合維莫非尼(vemurafenib)(亦稱為ZELBORAF®)來投與。在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑及紫杉烷可聯合達拉菲尼(dabrafenib)(亦稱為TAFINLAR®)來投與。在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑及紫杉烷可聯合厄洛替尼(erlotinib)(亦稱為TARCEVA®)來投與。在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑及紫杉烷可聯合MEK諸如MEK1 (亦稱為MAP2K1)或MEK2 (亦稱為MAP2K2)之抑制劑來投與。在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑及紫杉烷可聯合考比替尼(cobimetinib)(亦稱為GDC-0973或XL-518)來投與。在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑及紫杉烷可聯合曲美替尼(trametinib)(亦稱為MEKINIST®)來投與。在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑及紫杉烷可聯合K-Ras之抑制劑來投與。在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑及紫杉烷可聯合c-Met之抑制劑來投與。在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑及紫杉烷可聯合阿那妥珠單抗(onartuzumab)(亦稱為MetMAb)來投與。在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑及紫杉烷可聯合Alk之抑制劑來投與。在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑及紫杉烷可聯合AF802 (亦稱為CH5424802或艾樂替尼(alectinib))來投與。在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑及紫杉烷可聯合磷脂醯肌醇3-激酶(PI3K)之抑制劑來投與。在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑及紫杉烷可聯合BKM120來投與。在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑及紫杉烷可聯合艾代拉里斯(idelalisib)(亦稱為GS-1101或CAL-101)來投與。在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑及紫杉烷可聯合哌立福辛(perifosine)(亦稱為KRX-0401)來投與。在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑及紫杉烷可聯合Akt之抑制劑來投與。在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑可聯合MK2206來投與。在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑及紫杉烷可聯合GSK690693來投與。在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑及紫杉烷可聯合GDC-0941來投與。在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑及紫杉烷可聯合mTOR之抑制劑來投與。在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑及紫杉烷可聯合西羅莫司(sirolimus)(亦稱為雷帕黴素(rapamycin))來投與。在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑及紫杉烷可聯合坦羅莫司(temsirolimus)(亦稱為CCI-779或TORISEL®)來投與。在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑及紫杉烷可聯合依維莫司(everolimus)(亦稱為RAD001)來投與。在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑及紫杉烷可聯合地磷莫司(ridaforolimus)(亦稱為AP-23573、MK-8669、或德佛莫司(deforolimus))來投與。在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑及紫杉烷可聯合OSI-027來投與。在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑及紫杉烷可聯合AZD8055來投與。在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑及紫杉烷可聯合INK128來投與。在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑及紫杉烷可聯合雙重PI3K/mTOR抑制劑來投與。在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑及紫杉烷可聯合XL765來投與。在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑及紫杉烷可聯合GDC-0980來投與。在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑及紫杉烷可聯合BEZ235 (亦稱為NVP-BEZ235)來投與。在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑及紫杉烷可聯合BGT226來投與。在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑及紫杉烷可聯合GSK2126458來投與。在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑及紫杉烷可聯合PF-04691502來投與。在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑及紫杉烷可聯合PF-05212384 (亦稱為PKI-587)來投與。
在前述實施例中之任一項中，PD-1軸結合拮抗劑可為人類PD-1軸結合拮抗劑。
在前述態樣中任一項之一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑為抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)或抗PD-1抗體。
在前述態樣中任一項之一些實施例中，紫杉烷為nab-太平洋紫杉醇。
在前述態樣中任一項之其他實施例中，紫杉烷為太平洋紫杉醇。VI. PD-1 軸結合拮抗劑
本文提供鑑別可能對用抗癌療法之治療有反應的患者的方法，該抗癌療法包括PD-1軸結合拮抗劑(例如，抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)或抗PD-1抗體)及紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)。亦提供為患有乳癌(例如，局部晚期或轉移性TNBC)之患者選擇療法的方法，例如包括PD-1軸結合拮抗劑(例如，抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)或抗PD-1抗體)及紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)之抗癌療法。本文進一步提供用於治療個體中之乳癌(例如，局部晚期或轉移性乳癌(例如，局部晚期或轉移性TNBC))或延遲其進展的方法，其包含向個體投與有效量的PD-1軸結合拮抗劑(例如，抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)或抗PD-1抗體)及紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)。例如，在一些實施例中，患者呈PD-L1陽性。本文亦提供在患有乳癌(例如，局部晚期或轉移性乳癌(例如，局部晚期或轉移性TNBC))之個體中增強免疫功能之方法，其包含向個體投與有效量的PD-1軸結合拮抗劑(例如，抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)或抗PD-1抗體)及紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)。本文所述之任何方法均可涉及以下所述之任何PD-1軸結合拮抗劑。
例如，PD-1軸結合拮抗劑包括PD-L1結合拮抗劑、PD-1結合拮抗劑、及PD-L2結合拮抗劑。PD-L1 (程式性死亡配體1)在此項技術中亦稱作「程式性細胞死亡1配體1」、「PDCD1LG1」、「CD274」、「B7-H」、及「PDL1」。例示性人類PD-L1顯示於UniProtKB/Swiss-Prot登錄號Q9NZQ7.1中。PD-1 (程式性死亡1)在此項技術中亦稱作「程式性細胞死亡1」、「PDCD1」、「CD279」、及「SLEB2」。例示性人類PD-1顯示於UniProtKB/Swiss-Prot登錄號Q15116中。PD-L2 (程式性死亡配體2)在此項技術中亦稱作「程式性細胞死亡1配體2」、「PDCD1LG2」、「CD273」、「B7-DC」、「Btdc」、及「PDL2」。例示性人類PD-L2顯示於UniProtKB/Swiss-Prot登錄號Q9BQ51中。在一些實施例中，PD-L1、PD-1、及PD-L2為人類PD-L1、PD-1、及PD-L2。
在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑為抗PD-L1抗體。在一些實施例中，抗PD-L1抗體選自由以下組成之群：阿特珠單抗、YW243.55.S70、MDX-1105、MEDI4736 (度伐魯單抗)、及MSB0010718C (阿維單抗)。抗體YW243.55.S70為WO 2010/077634中所述之抗PD-L1抗體。MDX-1105，亦稱為BMS-936559，為WO2007/005874中所述之抗PD-L1抗體。MEDI4736為WO2011/066389及US2013/034559中所述之抗PD-L1單株抗體。在一些實施例中，抗PD-L1抗體能夠抑制PD-L1與PD-1之間及/或PD-L1與B7-1之間的結合。在一些實施例中，抗PD-L1抗體為單株抗體。在一些實施例中，抗PD-L1抗體為選自由以下組成之群的抗體片段：Fab、Fab'-SH、Fv、scFv、及(Fab')2 片段。在一些實施例中，抗PD-L1抗體為人源化抗體。在一些實施例中，抗PD-L1抗體為人類抗體。
可用於本發明方法之抗PD-L1抗體之實例，及其製造方法描述於PCT專利申請案WO 2010/077634、WO 2007/005874、WO 2011/066389、及US 2013/034559中，該等申請案以引用方式併入本文。可用於本發明中之抗PD-L1抗體，包括含有此類抗體之組成物，可與紫杉烷組合使用來治療癌症。
在一些實施例中，PD-1結合拮抗劑為抑制PD-1結合於其配體結合搭配物之分子。在一特定態樣中，該等PD-1配體結合搭配物為PD-L1及/或PD-L2。在另一實施例中，PD-L1結合拮抗劑為抑制PD-L1結合至其結合搭配物之分子。在一特定態樣中，PD-L1結合搭配物為PD-1及/或B7-1。在另一實施例中，PD-L2結合拮抗劑為抑制PD-L2結合至其結合搭配物之分子。在一特定態樣中，PD-L2結合搭配物為PD-1。該拮抗劑可為抗體、其抗原結合片段、免疫黏附素、融合蛋白、或寡肽。
在一些實施例中，PD-1結合拮抗劑為抗PD-1抗體(例如，人類抗體、人源化抗體、或嵌合抗體)。在一些實施例中，抗PD-1抗體選自由以下組成之群：MDX 1106 (納武單抗)、MK-3475 (派姆單抗)、MEDI-0680 (AMP-514)、PDR001、REGN2810、及BGB-108。在一些實施例中，PD-1結合拮抗劑為免疫黏附素(例如，包含融合至恆定區(例如，免疫球蛋白序列之Fc區)之PD-L1或PD-L2之細胞外或PD-1結合部分的免疫黏附素)。在一些實施例中，該PD-1結合拮抗劑為AMP-224。在一些實施例中，PD-L1結合拮抗劑為抗PD-L1抗體。MDX-1106 (亦稱作MDX-1106-04、ONO-4538、BMS-936558、或納武單抗)為WO2006/121168中所述之抗PD-1抗體。MK-3475，亦稱為蘭布魯珠單抗(lambrolizumab)，係WO2009/114335中所述之抗PD-1抗體。AMP-224，亦稱為B7-DCIg，係WO2010/027827及WO2011/066342中所述之PD-L2-Fc融合可溶性受體。抗 PD-L1 抗體
在一些實施例中，調配物中之抗體在重鏈及/或輕鏈序列中包含至少一個色胺酸(例如，至少兩個、至少三個、或至少四個)。在一些實施例中，胺基酸色胺酸在抗體之HVR區、構架區、及/或恆定區中。在一些實施例中，抗體在HVR區中包含兩個或三個色胺酸殘基。在一些實施例中，調配物中之抗體為抗PD-L1抗體。PD-L1 (程式性死亡配位體1)，亦稱為PDL1、B7-H1、B7-4、CD274、及B7-H，係跨膜蛋白，並且其與PD-1之相互作用抑制T細胞活化及細胞介素產生。在一些實施例中，本文所述之抗PD-L1抗體結合至人類PD-L1。可用於本文所述之方法中之抗PD-L1抗體的實例描述於PCT專利申請案WO 2010/077634 A1及美國專利第8,217,149號中，其以引用方式整體併入本文中。
在一些實施例中，抗PD-L1抗體能夠抑制PD-L1與PD-1之間及/或PD-L1與B7-1之間的結合。在一些實施例中，抗PD-L1抗體為單株抗體。在一些實施例中，抗PD-L1抗體為選自由以下組成之群的抗體片段：Fab、Fab'-SH、Fv、scFv、及(Fab')2 片段。在一些實施例中，抗PD-L1抗體為人源化抗體。在一些實施例中，抗PD-L1抗體為人類抗體。
WO 2010/077634 A1及US 8,217,149中所述之抗PD-L1抗體可用於本文所述之方法中。在一些實施例中，抗PD-L1抗體包含重鏈可變區序列SEQ ID NO:3及/或輕鏈可變區序列SEQ ID NO:4。在進一步實施例中，提供一種經單離抗PD-L1抗體，其包含重鏈可變區及/或輕鏈可變區序列，其中： (a) 重鏈序列與以下重鏈序列具有至少85%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%、或100%序列一致性： EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSDSWIHWVRQAPGKGLEWVAWISPYGGSTYYADSVKGRFTISADTSKNTAYLQMNSLRAEDTAVYYCARRHWPGGFDYWGQGTLVTVSA (SEQ ID NO:3)，及 (b) 輕鏈序列與以下輕鏈序列具有至少85%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%、或100%序列一致性： DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQDVSTAVAWYQQKPGKAPKLLIYSASFLYSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQYLYHPATFGQGTKVEIKR (SEQ ID NO:4)。
在一個實施例中，抗PD-L1抗體包含重鏈可變區，其包含HVR-H1、HVR-H2、及HVR-H3序列，其中： (a) HVR-H1序列為GFTFSX1 SWIH                                   (SEQ ID NO:5)； (b) HVR-H2序列為AWIX2 PYGGSX3 YYADSVKG           (SEQ ID NO:6)； (c) HVR-H3序列為RHWPGGFDY                                     (SEQ ID NO:7)； 另外，其中：X1 為D或G；X2 為S或L；X3 為T或S。在一個具體態樣中，X1 為D；X2 為S並且X3 為T。
在另一態樣中，多肽進一步包含根據下式的在HVR之間並置的可變區重鏈構架序列：(HC-FR1)-(HVR-H1)-(HC-FR2)-(HVR-H2)-(HC-FR3)-(HVR-H3)-(HC-FR4)。在另一態樣中，構架序列來源於人類共通構架序列。在進一步態樣中，構架序列為VH亞組III共通構架。在進一步態樣中，至少一個構架序列為以下序列： HC-FR1為EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAAS                     (SEQ ID NO:8) HC-FR2為WVRQAPGKGLEWV                                                (SEQ ID NO:9) HC-FR3為RFTISADTSKNTAYLQMNSLRAEDTAVYYCAR  (SEQ ID NO:10) HC-FR4為WGQGTLVTVSA                                                      (SEQ ID NO:11)。
在進一步態樣中，重鏈多肽進一步與包含HVR-L1、HVR-L2、及HVR-L3之可變區輕鏈組合，其中： (a) HVR-L1序列為RASQX4 X5 X6 TX7 X8 A                  (SEQ ID NO:12)； (b) HVR-L2序列為SASX9 LX10 S，                             (SEQ ID NO:13)； (c) HVR-L3序列為QQX11 X12 X13 X14 PX15 T                 (SEQ ID NO:14)； 其中：X4 為D或V；X5 為V或I；X6 為S或N；X7 為A或F；X8 為V或L；X9 為F或T；X10 為Y或A；X11 為Y、G、F、或S；X12 為L、Y、F、或W；X13 為Y、N、A、T、G、F、或I；X14 為H、V、P、T、或I；X15 為A、W、R、P、或T。在進一步態樣中，X4 為D；X5 為V；X6 為S；X7 為A；X8 為V；X9 為F；X10 為Y；X11 為Y；X12 為L；X13 為Y；X14 為H；X15 為A。
在進一步態樣中，輕鏈進一步包含根據下式的在HVR之間並置的可變區輕鏈構架序列：(LC-FR1)-(HVR-L1)-(LC-FR2)-(HVR-L2)-(LC-FR3)-(HVR-L3)-(LC-FR4)。在進一步態樣中，構架序列來源於人類共通構架序列。在進一步態樣中，構架序列為VL κ I共通構架。在進一步態樣中，至少一個構架序列為以下序列： LC-FR1為DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITC                           (SEQ ID NO:15) LC-FR2為WYQQKPGKAPKLLIY                                            (SEQ ID NO:16) LC-FR3為GVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYC     (SEQ ID NO:17) LC-FR4為FGQGTKVEIKR                                                       (SEQ ID NO:18)。
在另一實施例中，提供一種包含重鏈及輕鏈可變區序列之經單離抗PD-L1抗體或抗原結合片段，其中： (a) 重鏈包含HVR-H1、HVR-H2、及HVR-H3，其中進一步： (i) HVR-H1序列為GFTFSX1 SWIH；                                      (SEQ ID NO:5) (ii) HVR-H2序列為AWIX2 PYGGSX3 YYADSVKG                 (SEQ ID NO:6) (iii) HVR-H3序列為RHWPGGFDY，及                           (SEQ ID NO:7) (b) 輕鏈包含HVR-L1、HVR-L2、及HVR-L3，其中進一步： (i) HVR-L1序列為RASQX4 X5 X6 TX7 X8 A                                 (SEQ ID NO:12) (ii) HVR-L2序列為SASX9 LX10 S；及                                       (SEQ ID NO:13) (iii) HVR-L3序列為QQX11 X12 X13 X14 PX15 T；                         (SEQ ID NO:14) 其中：X1 為D或G；X2 為S或L；X3 為T或S；X4 為D或V；X5 為V或I；X6 為S或N；X7 為A或F；X8 為V或L；X9 為F或T；X10 為Y或A；X11 為Y、G、F、或S；X12 為L、Y、F、或W；X13 為Y、N、A、T、G、F、或I；X14 為H、V、P、T、或I；X15 為A、W、R、P、或T。在一特定態樣中，X1 為D；X2 為S並且X3 為T。在另一態樣中，X4 為D；X5 為V；X6 為S；X7 為A；X8 為V；X9 為F；X10 為Y；X11 為Y；X12 為L；X13 為Y；X14 為H；X15 為A。在另一態樣中，X1 為D；X2 為S並且X3 為T，X4 為D；X5 為V；X6 為S；X7 為A；X8 為V；X9 為F；X10 為Y；X11 為Y；X12 為L；X13 為Y；X14 為H並且X15 為A。
在進一步態樣中，重鏈可變區包含如下在HVR之間並置的一或多個構架序列：(HC-FR1)-(HVR-H1)-(HC-FR2)-(HVR-H2)-(HC-FR3)-(HVR-H3)-(HC-FR4)，並且輕鏈可變區包含如下在HVR之間並置的一或多個構架序列：(LC-FR1)-(HVR-L1)-(LC-FR2)-(HVR-L2)-(LC-FR3)-(HVR-L3)-(LC-FR4)。在進一步態樣中，構架序列來源於人類共通構架序列。在進一步態樣中，重鏈構架序列來源於Kabat亞組I、II、或III序列。在進一步態樣中，重鏈構架序列為VH亞組III共通構架。在進一步態樣中，一或多個重鏈構架序列係如SEQ ID NO:8、9、10、及11所示。在進一步態樣中，輕鏈構架序列來源於Kabat κ I、II、II、或IV亞組序列。在進一步態樣中，輕鏈構架序列為VL κ I共通構架。在進一步態樣中，一或多個輕鏈構架序列係如SEQ ID NO:15、16、17、及18所述。
在進一步特定態樣中，抗體進一步包含人類或鼠類恆定區。在進一步態樣中，人類恆定區選自由以下組成之群：IgG1、IgG2、IgG2、IgG3、及IgG4。在進一步特定態樣中，人類恆定區為IgG1。在進一步態樣中，鼠類恆定區選自由以下組成之群：IgG1、IgG2A、IgG2B、及IgG3。在進一步態樣中，鼠類恆定區為IgG2A。在進一步特定態樣中，抗體具有降低或最小效應功能。在進一步特定態樣中，最小效應功能由「無效應子Fc突變」或去醣基化產生。在進一步實施例中，無效應子Fc突變為恆定區中之N297A或D265A/N297A取代。
在另一實施例中，提供一種包含重鏈及輕鏈可變區序列之抗PD-L1抗體，其中： (a) 重鏈進一步包含分別與GFTFSDSWIH (SEQ ID NO:19)、AWISPYGGSTYYADSVKG (SEQ ID NO:20)、及RHWPGGFDY (SEQ ID NO:21)具有至少85%序列一致性之HVR-H1、HVR-H2、及HVR-H3序列，或 (b) 輕鏈進一步包含分別與RASQDVSTAVA (SEQ ID NO:22)、SASFLYS (SEQ ID NO:23)、及QQYLYHPAT (SEQ ID NO:24)具有至少85%序列一致性的HVR-L1、HVR-L2、及HVR-L3序列。
在一特定態樣中，序列一致性為86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、或100%。
在另一態樣中，重鏈可變區包含如下在HVR之間並置的一或多個構架序列：(HC-FR1)-(HVR-H1)-(HC-FR2)-(HVR-H2)-(HC-FR3)-(HVR-H3)-(HC-FR4)，並且輕鏈可變區包含如下在HVR之間並置的一或多個構架序列：(LC-FR1)-(HVR-L1)-(LC-FR2)-(HVR-L2)-(LC-FR3)-(HVR-L3)-(LC-FR4)。在另一態樣中，構架序列來源於人類共通構架序列。在進一步態樣中，重鏈構架序列來源於Kabat亞組I、II、或III序列。在進一步態樣中，重鏈構架序列為VH亞組III共通構架。在進一步態樣中，一或多個重鏈構架序列係如SEQ ID NO:8、9、10、及11所示。在進一步態樣中，輕鏈構架序列來源於Kabat κ I、II、II、或IV亞組序列。在進一步態樣中，輕鏈構架序列為VL κ I共通構架。在進一步態樣中，一或多個輕鏈構架序列係如SEQ ID NO:15、16、17、及18所述。
在進一步特定態樣中，抗體進一步包含人類或鼠類恆定區。在進一步態樣中，人類恆定區選自由以下組成之群：IgG1、IgG2、IgG2、IgG3、IgG4。在進一步特定態樣中，人類恆定區為IgG1。在進一步態樣中，鼠類恆定區選自由以下組成之群：IgG1、IgG2A、IgG2B、IgG3。在進一步態樣中，鼠類恆定區為IgG2A。在進一步特定態樣中，抗體具有降低或最小效應功能。在進一步特定態樣中，最小效應功能由「無效應子Fc突變」或去醣基化產生。在進一步實施例中，無效應子Fc突變為恆定區中之N297A或D265A/N297A取代。
在另一進一步實施例中，提供一種包含重鏈及輕鏈可變區序列之經單離抗PD-L1抗體，其中： (a) 重鏈序列與以下重鏈序列具有至少85%序列一致性： EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSDSWIHWVRQAPGKGLEWVAWISPYGGSTYYADSVKGRFTISADTSKNTAYLQMNSLRAEDTAVYYCARRHWPGGFDYWGQGTLVTVSS (SEQ ID NO:25)，及/或 (b) 輕鏈序列與以下輕鏈序列具有至少85%序列一致性： DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQDVSTAVAWYQQKPGKAPKLLIYSASFLYSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQYLYHPATFGQGTKVEIKR (SEQ ID NO:4)。
在一特定態樣中，序列一致性為86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、或100%。在另一態樣中，重鏈可變區包含如下在HVR之間並置的一或多個構架序列：(HC-FR1)-(HVR-H1)-(HC-FR2)-(HVR-H2)-(HC-FR3)-(HVR-H3)-(HC-FR4)，並且輕鏈可變區包含如下在HVR之間並置的一或多個構架序列：(LC-FR1)-(HVR-L1)-(LC-FR2)-(HVR-L2)-(LC-FR3)-(HVR-L3)-(LC-FR4)。在另一態樣中，構架序列來源於人類共通構架序列。在進一步態樣中，重鏈構架序列來源於Kabat亞組I、II、或III序列。在進一步態樣中，重鏈構架序列為VH亞組III共通構架。在進一步態樣中，一或多個重鏈構架序列係如SEQ ID NO:8、9、10、及WGQGTLVTVSS (SEQ ID NO:27)所示。
在進一步態樣中，輕鏈構架序列來源於Kabat κ I、II、II、或IV亞組序列。在進一步態樣中，輕鏈構架序列為VL κ I共通構架。在進一步態樣中，一或多個輕鏈構架序列係如SEQ ID NO:15、16、17、及18所述。
在進一步特定態樣中，抗體進一步包含人類或鼠類恆定區。在進一步態樣中，人類恆定區選自由以下組成之群：IgG1、IgG2、IgG2、IgG3、IgG4。在進一步特定態樣中，人類恆定區為IgG1。在進一步態樣中，鼠類恆定區選自由以下組成之群：IgG1、IgG2A、IgG2B、IgG3。在進一步態樣中，鼠類恆定區為IgG2A。在進一步特定態樣中，抗體具有降低或最小效應功能。在進一步特定態樣中，最小效應功能由在原核細胞中產生所引起。在進一步特定態樣中，最小效應功能由「無效應子Fc突變」或去醣基化產生。在進一步實施例中，無效應子Fc突變為恆定區中之N297A或D265A/N297A取代。
在進一步態樣中，重鏈可變區包含如下在HVR之間並置的一或多個構架序列：(HC-FR1)-(HVR-H1)-(HC-FR2)-(HVR-H2)-(HC-FR3)-(HVR-H3)-(HC-FR4)，並且輕鏈可變區包含如下在HVR之間並置的一或多個構架序列：(LC-FR1)-(HVR-L1)-(LC-FR2)-(HVR-L2)-(LC-FR3)-(HVR-L3)-(LC-FR4)。在進一步態樣中，構架序列來源於人類共通構架序列。在進一步態樣中，重鏈構架序列來源於Kabat亞組I、II、或III序列。在進一步態樣中，重鏈構架序列為VH亞組III共通構架。在進一步態樣中，一或多個重鏈構架序列為以下序列：。
在進一步態樣中，輕鏈構架序列來源於Kabat κ I、II、II、或IV亞組序列。在進一步態樣中，輕鏈構架序列為VL κ I共通構架。在進一步態樣中，一或多個輕鏈構架序列為以下序列：。
在進一步特定態樣中，抗體進一步包含人類或鼠類恆定區。在進一步態樣中，人類恆定區選自由以下組成之群：IgG1、IgG2、IgG2、IgG3、IgG4。在進一步特定態樣中，人類恆定區為IgG1。在進一步態樣中，鼠類恆定區選自由以下組成之群：IgG1、IgG2A、IgG2B、IgG3。在進一步態樣中，鼠類恆定區為IgG2A。在進一步特定態樣中，抗體具有降低或最小效應功能。在進一步特定態樣中，最小效應功能由「無效應子Fc突變」或去醣基化產生。在進一步實施例中，無效應子Fc突變為恆定區中之N297A或D265A/N297A取代。
在另一實施例中，提供一種包含重鏈及輕鏈可變區序列之抗PD-L1抗體，其中： (c) 重鏈進一步包含分別與GFTFSDSWIH (SEQ ID NO:19)、AWISPYGGSTYYADSVKG (SEQ ID NO:20)、及RHWPGGFDY (SEQ ID NO:21)具有至少85%序列一致性之HVR-H1、HVR-H2、及HVR-H3序列，及/或 (d) 輕鏈進一步包含分別與RASQDVSTAVA (SEQ ID NO:22)、SASFLYS (SEQ ID NO:23)、及QQYLYHPAT (SEQ ID NO:24)具有至少85%序列一致性的HVR-L1、HVR-L2、及HVR-L3序列。
在一特定態樣中，序列一致性為86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、或100%。
在另一態樣中，重鏈可變區包含如下在HVR之間並置的一或多個構架序列：(HC-FR1)-(HVR-H1)-(HC-FR2)-(HVR-H2)-(HC-FR3)-(HVR-H3)-(HC-FR4)，並且輕鏈可變區包含如下在HVR之間並置的一或多個構架序列：(LC-FR1)-(HVR-L1)-(LC-FR2)-(HVR-L2)-(LC-FR3)-(HVR-L3)-(LC-FR4)。在另一態樣中，構架序列來源於人類共通構架序列。在進一步態樣中，重鏈構架序列來源於Kabat亞組I、II、或III序列。在進一步態樣中，重鏈構架序列為VH亞組III共通構架。在進一步態樣中，一或多個重鏈構架序列係如SEQ ID NO:8、9、10、及WGQGTLVTVSSASTK (SEQ ID NO:31)所示。
在進一步態樣中，輕鏈構架序列來源於Kabat κ I、II、II、或IV亞組序列。在進一步態樣中，輕鏈構架序列為VL κ I共通構架。在進一步態樣中，一或多個輕鏈構架序列係如SEQ ID NO:15、16、17、及18所述。在進一步特定態樣中，抗體進一步包含人類或鼠類恆定區。在進一步態樣中，人類恆定區選自由以下組成之群：IgG1、IgG2、IgG2、IgG3、IgG4。在進一步特定態樣中，人類恆定區為IgG1。在進一步態樣中，鼠類恆定區選自由以下組成之群：IgG1、IgG2A、IgG2B、IgG3。在進一步態樣中，鼠類恆定區為IgG2A。在進一步特定態樣中，抗體具有降低或最小效應功能。在進一步特定態樣中，最小效應功能由「無效應子Fc突變」或去醣基化產生。在進一步實施例中，無效應子Fc突變為恆定區中之N297A或D265A/N297A取代。
在進一步實施例中，提供一種包含重鏈及輕鏈可變區序列之經單離抗PD-L1抗體，其中： (a) 重鏈序列與以下重鏈序列具有至少85%序列一致性： EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSDSWIHWVRQAPGKGLEWVAWISPYGGSTYYADSVKGRFTISADTSKNTAYLQMNSLRAEDTAVYYCARRHWPGGFDYWGQGTLVTVSSASTK (SEQ ID NO:26)，或 (b) 輕鏈序列與以下輕鏈序列具有至少85%序列一致性： DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQDVSTAVAWYQQKPGKAPKLLIYSASFLYSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQYLYHPATFGQGTKVEIKR (SEQ ID NO:4)。
在一些實施例中，提供一種包含重鏈及輕鏈可變區序列的經單離抗PD-L1抗體，其中輕鏈可變區序列與胺基酸序列SEQ ID NO:4具有至少85%、至少86%、至少87%、至少88%、至少89%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%、或100%序列一致性。在一些實施例中，提供一種包含重鏈及輕鏈可變區序列的經單離抗PD-L1抗體，其中重鏈可變區序列與胺基酸序列SEQ ID NO:26具有至少85%、至少86%、至少87%、至少88%、至少89%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%、或100%序列一致性。在一些實施例中，提供一種包含重鏈及輕鏈可變區序列的經單離抗PD-L1抗體，其中輕鏈可變區序列與胺基酸序列SEQ ID NO:4具有至少85%、至少86%、至少87%、至少88%、至少89%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%、或100%序列一致性並且重鏈可變區序列與胺基酸序列SEQ ID NO:26具有至少85%、至少86%、至少87%、至少88%、至少89%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%、或100%序列一致性。在一些實施例中，重鏈及/或輕鏈之N端處之一個、兩個、三個、四個、或五個胺基酸殘基可缺失、取代、或修飾。
在進一步實施例中，提供一種包含重鏈及輕鏈序列之經單離抗PD-L1抗體，其中： (a) 重鏈序列與以下重鏈序列具有至少85%序列一致性： EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSDSWIHWVRQAPGKGLEWVAWISPYGGSTYYADSVKGRFTISADTSKNTAYLQMNSLRAEDTAVYYCARRHWPGGFDYWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYASTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPG (SEQ ID NO:32)，及/或 (b) 輕鏈序列與以下輕鏈序列具有至少85%序列一致性： DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQDVSTAVAWYQQKPGKAPKLLIYSASFLYSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQYLYHPATFGQGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC (SEQ ID NO:33)。
在一些實施例中，提供一種包含重鏈及輕鏈序列的經單離抗PD-L1抗體，其中輕鏈序列與胺基酸序列SEQ ID NO:33具有至少85%、至少86%、至少87%、至少88%、至少89%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%序列一致性。在一些實施例中，提供一種包含重鏈及輕鏈序列的經單離抗PD-L1抗體，其中重鏈序列與胺基酸序列SEQ ID NO:32具有至少85%、至少86%、至少87%、至少88%、至少89%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%序列一致性。在一些實施例中，提供一種包含重鏈及輕鏈序列的經單離抗PD-L1抗體，其中輕鏈序列與胺基酸序列SEQ ID NO:33具有至少85%、至少86%、至少87%、至少88%、至少89%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%序列一致性並且重鏈序列與胺基酸序列SEQ ID NO:32具有至少85%、至少86%、至少87%、至少88%、至少89%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%序列一致性。
在一些實施例中，經單離抗PD-L1抗體為去醣基化的。抗體之醣基化通常為N連接或O連接的。N連接係指該碳水化合物部分連接至天冬醯胺殘基之側鏈。三肽序列天冬醯胺-X-絲胺酸及天冬醯胺-X-蘇胺酸(其中X為除了脯胺酸外之任何胺基酸)為關於該碳水化合物部分酶促連接至天冬醯胺側鏈之識別序列。因此，多肽中此等三肽序列中任一者之存在均會產生潛在醣基化位點。O連接的醣化係指糖N-乙醯半乳糖胺、半乳糖、或木糖中之一者連接於羥基胺基酸，最通常為絲胺酸或蘇胺酸，但亦可使用5-羥基脯胺酸或5-羥基離胺酸。藉由改變胺基酸序列使得移除上述三肽序列(對於N連接之醣基化位點)之一可便利地自抗體移除醣基化位點。可藉由用另一胺基酸殘基(例如甘胺酸、丙胺酸、或保守取代)取代醣基化位點內之天冬醯胺、絲胺酸、或蘇胺酸殘基取代來進行改變。
在本文中之任何實施例中，經單離抗PD-L1抗體可結合至人類PD-L1，例如如在UniProtKB/Swiss-Prot登錄號Q9NZQ7.1中展示之人類PD-L1、或其變異體。抗 PD-1 抗體
在一些實施例中，該抗PD-1抗體為MDX-1106。「MDX-1106」之替代名稱包括MDX-1106-04、ONO-4538、BMS-936558、或納武單抗。在一些實施例中，該抗PD-1抗體為納武單抗(CAS登錄號：946414-94-4)。在進一步實施例中，提供一種經單離抗PD-1抗體，其包含有包含重鏈可變區胺基酸序列SEQ ID NO: 1之重鏈可變區及/或包含輕鏈可變區胺基酸序列SEQ ID NO: 2之輕鏈可變區。在進一步實施例中，提供一種包含重鏈及/或輕鏈序列之經單離抗PD-1抗體，其中： (a) 重鏈序列與以下重鏈序列具有至少85%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%、或100%序列一致性： QVQLVESGGGVVQPGRSLRLDCKASGITFSNSGMHWVRQAPGKGLEWVAVIWYDGSKRYYADSVKGRFTISRDNSKNTLFLQMNSLRAEDTAVYYCATNDDYWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPCSRSTSESTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTKTYTCNVDHKPSNTKVDKRVESKYGPPCPPCPAPEFLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSQEDPEVQFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQFNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKGLPSSIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSQEEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSRLTVDKSRWQEGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSLGK (SEQ ID NO:1)，及 (b) 輕鏈序列與以下輕鏈序列具有至少85%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%、或100%序列一致性： EIVLTQSPATLSLSPGERATLSCRASQSVSSYLAWYQQKPGQAPRLLIYDASNRATGIPARFSGSGSGTDFTLTISSLEPEDFAVYYCQQSSNWPRTFGQGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC (SEQ ID NO:2)。核酸、宿主細胞、及載體
在進一步實施例中，提供一種編碼本文所述之任何抗體的經單離核酸。在一些實施例中，核酸進一步包含載體，其適合於表現編碼先前所述之抗PD-L1抗體中任一者的核酸。在進一步特定態樣中，載體在適合於表現核酸之宿主細胞中。在進一步特定態樣中，宿主細胞為真核細胞或原核細胞。在進一步特定態樣中，真核細胞為哺乳動物細胞，諸如中國倉鼠卵巢(CHO)細胞。
抗體或其抗原結合片段可使用在此項技術中已知之方法例如藉由以下過程來製得，該過程包括將含有編碼呈適合於表現之形式的先前所述之抗PD-L1抗體或抗原結合片段中任一者的核酸的宿主細胞在適合於產生此抗體或片段之條件下培養，及回收抗體或片段，或根據以下部分VII中所述之任何方法。VII. 抗體製備
本文所述之抗體係使用此項技術中可用於生成抗體之技術來製備，該等技術之例示性方法在以下部分更詳細地描述。
抗體針對所關注之抗原(例如，PD-L1 (諸如人類PD-L1)、PD1 (諸如人類PD-L1)、PD-L2 (諸如人類PD-L2)等)。較佳地，抗原為生物學上重要之多肽，並且向患有病症之哺乳動物投與抗體可在該哺乳動物中產生治療益處。
在某些實施例中，本文所提供之抗體之解離常數(Kd)為≤ 1 μM、≤ 150 nM、≤ 100 nM、≤ 50 nM、≤ 10 nM、≤ 1 nM、≤ 0.1 nM、≤ 0.01 nM、或≤ 0.001 nM (例如，10-8 M或更少，例如，10-8 M至10-13 M，例如，10-9 M至10-13 M)。
在一個實施例中，Kd係藉由用所關注之抗體之Fab型式及其抗原進行放射性標記抗原結合檢定(RIA)來量測，如以下檢定所述。Fab對抗原之溶液結合親和力係藉由在滴定系列之未標記抗原存在下，使Fab與最小濃度之(125 I)標記之抗原平衡，然後用抗Fab抗體塗佈之板捕獲所結合抗原來量測(參見，例如Chen等人J. Mol. Biol. 293:865-881(1999))。為了建立檢定條件，將MICROTITER®多孔板(Thermo Scientific)用5 μg/ml的在50 mM碳酸鈉(pH 9.6)中之捕獲抗Fab抗體(Cappel Lab)塗佈隔夜，隨後用PBS中之2% (w/v)牛血清白蛋白在室溫(約23℃)下封閉2至5小時。在非吸附性板(Nunc編號269620)中，將100 pM或26 pM [125 I]-抗原與所關注之Fab之系列稀釋液混合。然後將所關注之Fab孵育隔夜；然而，孵育可持續較長時期(例如約65小時)以確保達到平衡。此後，將混合物轉移至捕獲板，以在室溫下孵育(例如1小時)。然後移除溶液，並用在PBS中之0.1%聚山梨酯20 (TWEEN-20®)洗滌板8次。當板已乾燥時，加入150 μl/孔的閃爍劑(scintillant)(MICROSCINT-20TM ；Packard)，並在TOPCOUNT™ γ計數器(Packard)上對板計數達10分鐘。選擇提供小於或等於20%最大結合之各Fab的濃度用於競爭性結合檢定。
根據另一實施例，使用BIACORE®-2000或BIACORE®-3000 (BIAcore, Inc., Piscataway, NJ)，用固定之抗原CM5晶片在約10個反應單元(RU)下在25℃下使用表面電漿子共振檢定來量測Kd。簡而言之，根據供貨商說明書用N-乙基-N'-(3-二甲基胺基丙基)-碳二亞胺鹽酸鹽(EDC)及N-羥基琥珀醯亞胺(NHS)活化羧甲基化葡聚糖生物感測器晶片(CM5, BIACORE, Inc.)。抗原用10 mM乙酸鈉pH 4.8稀釋至5 μg/ml (大約0.2 μM)，然後以5 μl/分鐘之流速注射以達成大約10反應單元(RU)之偶合蛋白。在注射抗原後，注射1 M乙醇胺以阻斷未反應之基團。對於動力學量測，在25℃下將Fab之兩倍系列稀釋液(0.78 nM至500 nM)以約25 μl/min之流速注入到含有0.05%聚山梨酯20 (TWEEN-20™)界面活性劑(PBST)的PBS中。藉由同時擬合締合及解離感測圖，使用簡單的一對一朗繆耳結合模型(BIACORE® Evaluation Software 3.2版)計算締合速率(kon )及解離速率(koff )。平衡解離常數(Kd)被計算為比率koff /kon 。參見例如Chen等人，J. Mol. Biol. 293:865-881 (1999)。如果藉由以上表面電漿子共振檢定的締合速率超過106 M-1 s-1 ，則可藉由使用螢光淬滅技術來確定締合速率，該螢光淬滅技術量測在如在分光計(諸如停流配備分光光度計(Aviv Instruments)或具有攪拌比色皿的8000系列SLM-AMINCOTM 分光光度計(ThermoSpectronic))中所量測的在遞增濃度之抗原存在下，在25℃下於PBS (pH 7.2)中的20 nM抗抗原抗體(Fab形式)之螢光發射強度(激發= 295 nm；發射= 340 nm，16 nm帶通)的增加或降低。(i) 抗原製備
視情況綴合至其他分子之可溶性抗原或其片段可用作用於生成抗體之免疫原。對於跨膜分子諸如受體，此等分子之片段(例如，受體之胞外域)可用作免疫原。或者，表現該跨膜分子之細胞可用作免疫原。此類細胞可來源於天然來源(例如，癌細胞株)或可為藉由重組技術來轉型以表現跨膜分子的細胞。適用於製備抗體之其他抗原及其形式將為熟習此項技術者顯而易知的。(ii) 某些基於抗體之方法
多株抗體較佳藉由多次皮下(s.c.)或腹膜內(i.p.)注射相關抗原及佐劑來在動物中產生。使用雙官能或衍生劑例如馬來醯亞胺苯甲醯基磺基琥珀醯亞胺酯(經由半胱胺酸殘基綴合)、N-羥基琥珀醯亞胺(經由離胺酸殘基)、戊二醛、琥珀酸酐、SOCl2 、或R1 N=C=NR (其中R及R1 為不同烷基基團)，將相關抗原綴合至在待免疫之物種中具有免疫原性的蛋白例如鑰孔帽貝血藍素(keyhole limpet hemocyanin)、血清白蛋白、牛甲狀腺球蛋白、或大豆胰蛋白酶抑制劑可為有用的。
藉由將例如100 µg或5 µg之蛋白或綴合物(分別針對兔或小鼠)與3體積之弗氏完全佐劑組合並且在多個部位處皮內注射該溶液，從而使動物對抗原、免疫原性綴合物、或衍生物免疫。一個月後，藉由在多個部位處皮下注射，用弗氏完全佐劑中之1/5至1/10初始量之肽或綴合物對動物進行加強。7至14天後，採集動物之血液且分析血清之抗體效價。對動物進行加強直至效價平穩。較佳地，用相同抗原之綴合物對動物進行加強，但該抗原與不同蛋白綴合及/或經由不同交聯劑綴合。綴合物亦可呈蛋白融合物於重組細胞培養物中製成。此外，聚集劑諸如明礬適用於提高免疫反應。
本發明之單株抗體可使用融合瘤方法製得，該融合瘤方法首先由Kohler等人,Nature , 256:495 (1975)描述，並且關於人與人融合瘤進一步描述於例如Hongo等人,Hybridoma , 14 (3): 253-260 (1995)；Harlow等人,Antibodies: A Laboratory Manual, (Cold Spring Harbor LaboratoryPress, 第2版 1988)；Hammerling等人,Monoclonal Antibodies and T-Cell Hybridomas 563-681 (Elsevier, N.Y., 1981)；及Ni,Xiandai Mianyixue , 26(4):265-268 (2006)。其他方法包括例如關於自融合瘤細胞株產生單株人類天然IgM抗體之美國專利第7,189,826號中所述之方法。人類融合瘤技術(三源融合瘤技術)描述於Vollmers及Brandlein,Histology and Histopathology , 20(3):927-937 (2005)及Vollmers及Brandlein,Methods and Findings in Experimental and Clinical Pharmacology , 27(3):185-91 (2005)中。
關於各種其他融合瘤技術，參見例如美國專利公開案第2006/258841號；第2006/183887號(完全人類抗體)；第2006/059575號；第2005/287149號；第2005/100546號；及第2005/026229號；以及美國專利第7,078,492號及第7,153,507號。使用融合瘤法產生單株抗體之例示性方案係如下所述。在一個實施例中，使小鼠或其他適當宿主動物諸如倉鼠免疫以引發產生或能夠產生與用於免疫之蛋白特異性結合之抗體的淋巴球。藉由多次皮下(SC)或腹膜內(IP)注射本發明之多肽或其片段及佐劑諸如單磷醯脂質A (MPL)/海藻糖二棒分枝菌酸酯(trehalose dicrynomycolate；TDM)(Ribi Immunochem. Research, Inc., Hamilton, MT)在動物中培育抗體。本發明之多肽(例如，抗原)或其片段可使用此項技術中熟知之方法諸如重組方法來製備，該等方法中之一些在本文中進一步描述。分析來自免疫動物之血清的抗抗原抗體，且視情況投與加強免疫。單離來自產生抗抗原抗體之動物的淋巴球。或者，可活體外免疫淋巴細胞。
隨後使用適合融合劑諸如聚乙二醇使淋巴球與骨髓瘤細胞融合以形成融合瘤細胞。參見例如Goding,Monoclonal Antibodies: Principles and Practice , 第59-103頁 (Academic Press, 1986)。可使用如下骨髓瘤細胞，其有效融合，支持所選抗體產生細胞穩定高水準地產生抗體，且對培養基諸如HAT培養基敏感。例示性骨髓瘤細胞包括但不限於鼠類骨髓瘤株，諸如可從Salk Institute Cell Distribution Center, San Diego, Calif. USA獲得的來源於MOPC-21及MPC-11小鼠腫瘤之細胞，及可從美國菌種保藏中心，Rockville, Md. USA獲得之SP-2或X63-Ag8-653細胞。亦已描述用於產生人類單株抗體之人類骨髓瘤及小鼠-人類雜骨髓瘤細胞株(Kozbor,J. Immunol ., 133:3001 (1984)；Brodeur等人,Monoclonal Antibody Production Techniques and Applications , 第51-63頁(Marcel Dekker, Inc., New York, 1987))。
將由此製備之融合瘤細胞在適合培養基例如含有抑制未融合親本骨髓瘤細胞之生長或存活的一或多種物質之培養基中接種且生長。例如，若該等親本骨髓瘤細胞缺乏酶次黃嘌呤鳥嘌呤磷酸核糖基轉移酶(HGPRT或HPRT)，則用於融合瘤之培養基典型地將包括次黃嘌呤、胺基喋呤、及胸苷(HAT培養基)，該等物質防止HGPRT缺乏細胞之生長。較佳地，使用無血清融合瘤細胞培養方法來減少使用源自動物之血清諸如胎牛血清，如例如在Even等人,Trends in Biotechnology , 24(3), 105-108 (2006)中所描述。
作為改良融合瘤細胞培養物之生產力之工具的寡肽描述於Franek，Trends in Monoclonal Antibody Research , 111-122 (2005)中。特定而言，標準培養基富含某些胺基酸(丙胺酸、絲胺酸、天冬醯胺、脯胺酸)或蛋白水解產物級分，且可藉由由三至六個胺基酸殘基構成之合成寡肽顯著抑制細胞凋亡。該等肽以毫莫耳濃度或更高濃度存在。
可針對結合至本發明抗體之單株抗體之產生來分析其中生長融合瘤細胞之培養基。由融合瘤細胞產生之單株抗體之結合特異性可藉由免疫沉澱或藉由活體外結合檢定諸如放射免疫檢定(RIA)或酶聯免疫吸附檢定(ELISA)來確定。單株抗體之結合親和力可例如藉由斯卡查德分析(Scatchard analysis)來測定。參見等人Munson等人,Anal. Biochem ., 107:220 (1980)。
在鑑別產生具有所需特異性、親和力及/或活性之抗體的融合瘤細胞之後，該等純系可藉由限制稀釋程序進行次選殖且藉由標準方法生長。參見例如Goding (出處同上)。用於此目的之合適培養基包括例如D-MEM或RPMI-1640培養基。另外，融合瘤細胞可作為動物體內之腹水性腫瘤在活體內生長。可藉由習知免疫球蛋白純化程序諸如蛋白A-瓊脂糖、羥基磷灰石層析法、凝膠電泳、透析、或親和層析法自培養基、腹水、或血清中分離由亞純系分泌之單株抗體。用於自融合瘤細胞中單離蛋白之一種方法描述於US 2005/176122及美國專利第6,919,436號中。該方法包括在結合製程中使用最少量之鹽，諸如易溶鹽，且較佳在洗脫製程中使用少量有機溶劑。(iii) 衍生自文庫之抗體
本發明之抗體可藉由針對具有所需活性之抗體篩選組合文庫來單離。例如，此項技術中已知多種方法用於生成噬菌體顯示文庫及針對具有所需結合特徵之抗體篩選此類文庫。額外方法例如在Hoogenboom等人,Methods in Molecular Biology 178:1-37 (O'Brien等人編, Human Press, Totowa, NJ, 2001)中綜述並且例如在以下中進一步描述：McCafferty等人,Nature 348:552-554；Clackson等人,Nature 352: 624-628 (1991)；Marks等人,J. Mol. Biol . 222: 581-597 (1992)；Marks及Bradbury,Methods in Molecular Biology 248:161-175 (Lo等人, Human Press, Totowa, NJ, 2003)；Sidhu等人,J. Mol. Biol . 338(2): 299-310 (2004)；Lee等人,J. Mol. Biol . 340(5): 1073-1093 (2004)；Fellouse,Proc. Natl. Acad. Sci. USA 101(34): 12467-12472 (2004)；及Lee等人,J. Immunol. Methods 284(1-2): 119-132(2004)。
在某些噬菌體顯示方法中，藉由聚合酶鏈反應(PCR)分開地選殖VH及VL基因之組庫且隨機重組於噬菌體文庫中，可接著篩檢該等文庫中之抗原結合噬菌體，如Winter等人Ann. Rev. Immunol. , 12: 433-455 (1994)中所述。噬菌體通常顯示呈單鏈Fv (scFv)片段或Fab片段的抗體片段。來自免疫來源之文庫提供抗免疫原之高親和力抗體而無需構築融合瘤。或者，可選殖(例如自人類)天然組庫以提供針對大量非自體抗原以及自體抗原之抗體的單一來源而不進行任何免疫，如Griffiths等人,EMBO J , 12: 725-734 (1993)所述。最後，天然文庫亦可藉由以下方式合成製備：自幹細胞選殖未重排V基因區段，及使用含有隨機序列之PCR引子以編碼高度可變CDR3區及在活體外達成重排，如Hoogenboom and Winter,J. Mol. Biol. , 227: 381-388 (1992)所述。描述人類抗體噬菌體文庫之專利公開案包括例如：美國專利第5,750,373號及美國專利公開案第2005/0079574號、第2005/0119455號、第2005/0266000號、第2007/0117126號、第2007/0160598號、第2007/0237764號、第2007/0292936號、及第2009/0002360號。
自人類抗體文庫單離之抗體或抗體片段在本文中視為人類抗體或人類抗體片段。(iv) 嵌合、人源化、及人類抗體
在某些實施例中，本文所提供之抗體為嵌合抗體。某些嵌合抗體描述於例如美國專利第4,816,567號；及Morrison等人，Proc. Natl. Acad. Sci. USA , 81:6851-6855 (1984)。在一個實例中，嵌合抗體包含非人類可變區(例如來源於小鼠、大鼠、倉鼠、兔、或非人類靈長類諸如猴的可變區)及人類恆定區。在進一步實例中，嵌合抗體為「類別轉換」抗體，其中類別或子類別已自親本抗體之類別或子類別改變。嵌合抗體包括其抗原結合片段。
在某些實施例中，嵌合抗體為人源化抗體。通常，對非人類抗體進行人源化以降低對人類之免疫原性，同時保持親本非人類抗體之特異性及親和力。一般而言，人源化抗體包含一或多個可變域，其中例如CDR的HVR (或其部分)來源於非人類抗體，並且FR (或其部分)來源於人類抗體序列。人源化抗體視情況亦包含人類恆定區之至少一部分。在一些實施例中，人源化抗體中之一些FR殘基經來自非人類抗體(例如HVR殘基所來源的抗體)的對應殘基取代，例如以恢復或改良抗體特異性或親和力。
人源化抗體及其製備方法例如在Almagro及Fransson，Front. Biosci. 13:1619-1633 (2008)中綜述，並且在例如以下中進一步描述：Riechmann等人，Nature 332:323-329 (1988)；Queen等人,Proc. Nat'l Acad. Sci. USA 86:10029-10033 (1989)；美國專利第5, 821,337號、第7,527,791號、第6,982,321號及第7,087,409號；Kashmiri等人,Methods 36:25-34 (2005)(描述SDR(a-CDR)移植)；Padlan,Mol. Immunol . 28:489-498 (1991)(描述「表面再塑」)；Dall'Acqua等人,Methods 36:43-60 (2005)(描述「FR改組」)；及Osbourn等人,Methods 36:61-68 (2005)及Klimka等人,Br. J. Cancer, 83:252-260 (2000)(描述FR改組之「引導選擇」方法)。
可用於人類化之人類構架區包括但不限於：使用「最佳擬合」法選擇之構架區(參見例如Sims等人,J. Immunol . 151:2296 (1993))；來源於輕鏈或重鏈可變區之特定亞組之人類抗體的共通序列的構架區(參見例如Carter等人,Proc. Natl. Acad. Sci. USA , 89:4285 (1992)；及Presta等人,J. Immunol ., 151:2623 (1993))；人類成熟(體細胞突變)構架區或人類生殖系構架區(參見例如Almagro及Fransson,Front. Biosci . 13:1619-1633 (2008))；及由篩選FR文庫獲得之構架區(參見例如Baca等人,J. Biol. Chem . 272:10678-10684 (1997)及Rosok等人,J. Biol. Chem. 271:22611-22618 (1996))。
在某些實施例中，本文所提供之抗體為人類抗體。人類抗體可以使用在此項技術中已知的各種技術來產生。人類抗體一般描述於van Dijk及van de Winkel,Curr. Opin. Pharmacol . 5: 368-74 (2001)及Lonberg,Curr. Opin . Immunol. 20:450-459 (2008)。
人類抗體可藉由向已經改造以響應於抗原攻擊而產生完整人類抗體或具有人類可變區之完整抗體的基因轉殖動物投與免疫原來製備。此類動物通常含有人類免疫球蛋白基因座之全部或一部分，其置換內源性免疫球蛋白基因座，或存在於染色體外或隨機整合至動物染色體中。在此類基因轉殖小鼠中，內源性免疫球蛋白基因座一般已失活。對於自基因轉殖動物獲得人類抗體之方法之評述，參見Lonberg,Nat. Biotech . 23:1117-1125 (2005)。亦參見例如描述XENOMOUSE™ 技術的美國專利第6,075,181號及第6,150,584號；描述HUMAB®技術的美國專利第5,770,429號；描述K-M MOUSE®技術的美國專利第7,041,870號；及描述VELOCIMOUSE®技術的美國專利申請公開案第US 2007/0061900號)。由此類動物生成之完整抗體之人類可變區可例如藉由與不同人類恆定區組合來經進一步修飾。
人類抗體亦可藉由基於融合瘤之方法製得。已描述了用於產生人類單株抗體之人類骨髓瘤及小鼠-人類雜骨髓瘤細胞株。(參見例如KozborJ. Immunol ., 133: 3001 (1984)；Brodeur等人,Monoclonal Antibody Production Techniques and Applications , 第51-63頁 (Marcel Dekker, Inc., New York, 1987)；及Boerner等人,J. Immunol ., 147: 86 (1991)。) 經由人類B細胞融合瘤技術生成之人類抗體亦描述於Li等人,Proc. Natl. Acad. Sci . USA, 103:3557-3562 (2006)中。另外的方法包括例如在美國專利第7,189,826號(描述了從融合瘤細胞株產生單株人類IgM抗體)及Ni,Xiandai Mianyixue , 26(4):265-268 (2006)(描述了人類-人類融合瘤)中描述的彼等方法。人類融合瘤技術(三源融合瘤技術)亦描述於Vollmers及Brandlein, Histology and Histopathology, 20(3):927-937 (2005)及Vollmers及Brandlein,Methods and Findings in Experimental and Clinical Pharmacology , 27(3):185-91 (2005)中。
還可以藉由單離選自人源噬菌體顯示文庫之Fv純系可變域序列來生成人類抗體。此類可變域序列可隨後與所需人類恆定域組合。下文描述用於自抗體文庫選擇人類抗體之技術。(v) 抗體片段
抗體片段可藉由傳統方式諸如酶促消化或藉由重組技術生成。在某些情況下，宜使用抗體片段而非完整抗體。片段之較小尺寸使得可快速廓清，且可改良實體腫瘤之獲取。對於某些抗體片段之綜述，參見Hudson等人(2003)Nat. Med . 9:129-134。
已開發多種技術來產生抗體片段。傳統上，此等片段經由完整抗體之蛋白水解消化來產生(參見，例如，Morimoto等人，Journal of Biochemical and Biophysical Methods 24:107-117 (1992)；及Brennan等人,Science , 229:81 (1985))。然而，此等片段現可直接地藉由重組宿主細胞產生。Fab、Fv、及ScFv抗體片段可全部在大腸桿菌中表現並且從大腸桿菌中分泌，由此允許容易產生大量此等片段。抗體片段可由以上論述之抗體噬菌體文庫中單離。或者，Fab'-SH片段可直接從大腸桿菌回收並且化學偶合以形成F(ab')2 片段(Carter等人, Bio/Technology 10:163-167 (1992))。根據另一種方法，F(ab')2 片段可直接從重組宿主細胞培養物中單離。包含拯救受體結合抗原決定基殘基的具有增加活體內半衰期之Fab及F(ab')2 片段描述於美國專利第5,869,046號中。用於產生抗體片段之其他技術對於熟練從業者將為顯而易知的。在某些實施例中，抗體為單鏈Fv片段(scFv)。參見例如WO 93/16185；美國專利第5,571,894號；及第5,587,458號。Fv及scFv為無恆定區之具有完整組合位點之唯一物質；因此，其可適合於在活體內使用期間減少之非特異性結合。可構築scFv融合蛋白以在scFv之胺基或羧基端產生效應蛋白之融合。參見Antibody Engineering , Borrebaeck編(出處同上)。例如，抗體片段亦可為「線性抗體」，例如在美國專利第5,641,870號中所描述。此類線性抗體可為單特異性或雙特異性的。(vi) 多特異性抗體
多特異性抗體對至少兩種不同抗原決定基具有結合特異性，其中該等抗原決定基通常來自不同抗原。雖然此類分子通常僅結合兩種不同抗原決定基(亦即，雙特異性抗體，BsAb)，但是當此措辭在本文中使用時，其涵蓋具有額外特異性之抗體諸如三特異性抗體。雙特異性抗體可製備為全長抗體或抗體片段(例如，F(ab')2 雙特異性抗體)。
製得雙特異性抗體之方法在此項技術中為已知的。全長雙特異性抗體之傳統產生係基於兩個免疫球蛋白重鏈-輕鏈對之共表現，其中兩個鏈具有不同特異性(參見，例如，Millstein等人，Nature，305:537-539(1983))。由於免疫球蛋白重鏈及輕鏈之隨機分類，此等融合瘤(四源雜交瘤)產生10種不同抗體分子之潛在混合物，其中僅一種具有正確雙特異性結構。對正確分子之純化(通常藉由親和力層析步驟來進行)相當繁瑣，且產率低。類似程序揭示於WO 93/08829，及Traunecker等人，EMBO J ，10:3655-3659(1991)中。
此項技術中已知的製得雙特異性抗體之一種方法係「旋鈕-孔(knobs-into-holes)」或「突起-腔(protuberance-into-cavity)」方法(參見，例如，美國專利第5,731,168號)。在此方法中，兩種免疫球蛋白多肽(例如，重鏈多肽)各自包含界面。一種免疫球蛋白多肽之界面與另一免疫球蛋白多肽上之對應界面相互作用，從而使兩種免疫球蛋白多肽締合。此等界面可經工程改造以使得位於一種免疫球蛋白多肽之界面中的「旋鈕」或「突起」(此等術語在本文中可互換使用)對應於位於另一免疫球蛋白多肽之界面中的「孔」或「腔」(此等術語在本文中可互換使用)。在一些實施例中，孔具有與旋鈕相同或類似之尺寸且經適當定位，使得當兩個界面相互作用時，一個界面之旋鈕可定位於另一界面之對應孔中。在不希望受理論束縛之情況下，認為這可穩定雜多聚體且相對於其他物質例如均多聚體有利於雜多聚體之形成。在一些實施例中，可使用此方法促進兩種不同免疫球蛋白多肽之雜多聚化，從而產生包含兩種免疫球蛋白多肽之雙特異性抗體，該等免疫球蛋白多肽對不同抗原決定基具有結合特異性。
在一些實施例中，旋鈕可藉由用大側鏈置換小胺基酸側鏈來構築。在一些實施例中，孔可藉由用較小側鏈置換大胺基酸側鏈來構築。旋鈕或孔可存在於原始界面中，或其可以合成方法引入。例如，可藉由改變編碼界面之核酸序列以用至少一個「引入」胺基酸殘基置換至少一個「原始」胺基酸殘基來以合成方法引入旋鈕或孔。用於改變核酸序列之方法可包括此項技術中熟知之標準分子生物學技術。各種胺基酸殘基之側鏈體積展示於下表中。在一些實施例中，原始殘基具有較小側鏈體積(例如，丙胺酸、天冬醯胺、天冬胺酸、甘胺酸、絲胺酸、蘇胺酸、或纈胺酸)，並且形成旋鈕之引入殘基為天然存在之胺基酸並且可包括精胺酸、苯丙胺酸、酪胺酸、及色胺酸。在一些實施例中，原始殘基具有較大側鏈體積(例如，精胺酸、苯丙胺酸、酪胺酸、及色胺酸)，並且形成孔之引入殘基為天然存在之胺基酸並且可包括丙胺酸、絲胺酸、蘇胺酸、及纈胺酸。表 1. 胺基酸殘基之性質
胺基酸 單字母縮寫 質量 a ( 道耳頓 ) 體積 b (Å3 ) 可及表面積 c (Å2 )
丙胺酸(Ala) A 71.08 88.6 115
精胺酸(Arg) R 156.20 173.4 225
天冬醯胺(Asn) N 114.11 117.7 160
天冬胺酸(Asp) D 115.09 111.1 150
半胱胺酸(Cys) C 103.14 108.5 135
麩醯胺(Gln) Q 128.14 143.9 180
麩胺酸(Glu) E 129.12 138.4 190
甘胺酸(Gly) G 57.06 60.1 75
組胺酸(His) H 137.15 153.2 195
異白胺酸(Ile) I 113.17 166.7 175
白胺酸(Leu) L 113.17 166.7 170
離胺酸(Lys) K 128.18 168.6 200
甲硫胺酸(Met) M 131.21 162.9 185
苯丙胺酸(Phe) F 147.18 189.9 210
脯胺酸(Pro) P 97.12 122.7 145
絲胺酸(Ser) S 87.08 89.0 115
蘇胺酸(Thr) T 101.11 116.1 140
色胺酸(Trp) W 186.21 227.8 255
酪胺酸(Tyr) Y 163.18 193.6 230
纈胺酸(Val) V 99.14 140.0 155
a 胺基酸之分子量減去水之分子量。數值來自Handbook of Chemistry and Physics, 第43版 Cleveland, Chemical Rubber Publishing Co., 1961。b 數值來自A.A. Zamyatnin, Prog. Biophys. Mol. Biol. 24:107-123, 1972。c 數值來自C. Chothia, J. Mol. Biol. 105:1-14, 1975。可及表面積定義於此參考文獻之圖6-20中。
在一些實施例中，基於雜多聚體之三維結構鑑別用於形成旋鈕或孔之原始殘基。此項技術中已知用於獲得三維結構之技術可包括X射線結晶學及NMR。在一些實施例中，界面為免疫球蛋白恆定域之CH3域。在此等實施例中，人類IgG1 之CH3/CH3界面涉及位於四個反平行β-股上之各個域上之十六個殘基。在不希望受理論束縛之情況下，突變殘基較佳地位於兩個中心反平行β-股上以將旋鈕可被周圍溶劑接納，而非被配偶CH3域中之互補孔接納之風險減少到最低限度。在一些實施例中，形成兩種免疫球蛋白多肽中之對應旋鈕及孔的突變對應於在下表中提供的一或多個對。表 2. 形成對應旋鈕及孔之突變的例示性集合
第一免疫球蛋白之 CH3 第二免疫球蛋白之 CH3
T366Y Y407T
T366W Y407A
F405A T394W
Y407T T366Y
T366Y:F405A T394W:Y407T
T366W:F405W T394S:Y407A
F405W:Y407A T366W:T394S
F405W T394S
突變由原始殘基，接著為使用Kabat編號系統之位置，隨後為引入殘基(所有殘基均以單字母胺基酸編碼給出)來表示。多個突變由冒號分隔。
在一些實施例中，免疫球蛋白多肽包含有包含以上表2中列出的一或多個胺基酸取代的CH3域。在一些實施例中，雙特異性抗體包含：第一免疫球蛋白多肽，其包含有包含在表2之左欄中列出之一或多個胺基酸取代的CH3域；及第二免疫球蛋白多肽，其包含有包含在表2之右欄中列出之一或多個對應胺基酸取代的CH3域。
在如上論述之DNA突變之後，編碼具有一或多個形成對應旋鈕或孔之突變之經修飾免疫球蛋白多肽的多核苷酸可使用此項技術中已知之標準重組技術及細胞系統來表現並且純化。參見例如美國專利第5,731,168號；第5,807,706號；第5,821,333號；第7,642,228號；第7,695,936號；第8,216,805號；美國公開案第2013/0089553號；及Spiess等人, Nature Biotechnology 31: 753-758, 2013。經修飾之免疫球蛋白多肽可使用原核宿主細胞諸如大腸桿菌或真核宿主細胞諸如CHO細胞來產生。帶有對應旋鈕及孔之免疫球蛋白多肽可在共培養之宿主細胞中表現並且一起純化為雜多聚體，或其可在單一培養物中表現、單獨純化、並且在活體外組裝。在一些實施例中，細菌宿主細胞之兩種菌株(一種菌株表現具有旋鈕之免疫球蛋白多肽，並且另一菌株表現具有孔之免疫球蛋白多肽)係使用此項技術中已知的標準細菌培養技術來共培養。在一些實施例中，兩種菌株可例如以特定比率來混合，以便達成培養物中之相等表現水準。在一些實施例中，兩種菌株可以50:50、60:40、或70:30比率混合。在多肽表現後，可將細胞一起溶解，且可提取蛋白。此項技術中已知之可量測均多聚體與雜多聚體物質之豐度的標準技術可包括尺寸排阻層析法。在一些實施例中，使用標準重組技術單獨表現各經修飾免疫球蛋白多肽，且可在活體外將其組裝在一起。組裝可例如藉由以下步驟來達成：純化各經修飾免疫球蛋白多肽、將其以相等質量混合並且一起孵育、將二硫化物還原(例如，藉由用二硫蘇糖醇處理)、濃縮、及將多肽再氧化。可使用包括陽離子交換層析法之標準技術純化形成之雙特異性抗體，且使用包括尺寸排阻層析法之標準技術量測。對於此等方法之更詳細描述，參見Speiss等人,Nat. Biotechnol . 31:753-8, 2013。在一些實施例中，可在CHO細胞中單獨表現經修飾免疫球蛋白多肽，且使用上述方法在活體外組裝。
根據不同方法，將具有所要結合特異性之抗體可變域(抗體-抗原結合位點)融合於免疫球蛋白恆定域序列。該融合較佳地使用免疫球蛋白重鏈恆定域，包含鉸鏈區、CH2、及CH3區之至少一部分。通常在至少一種融合物中存在第一重鏈恆定區(CH1)，其含有輕鏈結合所必需之位點。將編碼該等免疫球蛋白重鏈融合物及必要時免疫球蛋白輕鏈之DNA插入至單獨的表現載體中，且共轉染至合適之宿主生物體中。在當用於構築之三條多肽鏈的不等比率提供最佳產率時的實施例中，此舉提供了調節三條多肽片段之相互比例的極大靈活性。然而，當至少兩條呈相等比率之多肽鏈的表現導致高產率時或當該等比率不具有特定重要性時，有可能在一表現載體中插入兩條或所有三條多肽鏈之編碼序列。
在此方法之一個實施例中，雙特異性抗體由一個臂中之具有第一結合特異性的雜合免疫球蛋白重鏈及另一臂中之雜合免疫球蛋白重鏈-輕鏈對(提供第二結合特異性)構成。發現此不對稱結構促進所需雙特異性化合物與不想要之免疫球蛋白鏈組合的分離，因為該雙特異性分子之僅一半中存在免疫球蛋白輕鏈會提供容易之分離方式。此方法揭示於WO 94/04690中。對於生成雙特異性抗體之進一步細節，參見，例如，Suresh等人,Methods in Enzymology , 121:210 (1986)。
根據WO96/27011中所述之另一方法，可工程改造一對抗體分子之間的界面以使自重組細胞培養物回收之雜二聚體的百分率達最高。一個界面包含抗體恆定域之CH 3域之至少一部分。在此方法中，來自第一抗體分子之界面之一或多個較小胺基酸側鏈用更大側鏈(例如，酪胺酸或色胺酸)來置換。藉由用較小胺基酸側鏈(例如丙胺酸或蘇胺酸)置換大胺基酸側鏈來在第二抗體分子之界面上產生尺寸與大側鏈相同或類似之補償「腔」。此提供了一種用於增加雜二聚體之產率超過諸如均二聚體之其他不想要的終產物之機制。
雙特異性抗體包括交聯或「雜綴合物」抗體。例如，該雜綴合物中之一種抗體可偶合至抗生物素蛋白，另一抗體可偶合至生物素。此等抗體已例如經提出以使免疫系統細胞靶向非所要細胞(美國專利第4,676,980號)，及用於治療HIV感染(WO 91/00360、WO 92/200373、及EP 03089)。雜綴合物抗體可使用任何便利交聯方法製得。適合交聯劑為此項技術中熟知的，且連同許多交聯技術一起揭露於美國專利第4,676,980號中。
該文獻中亦已描述用於自抗體片段生成雙特異性抗體之技術。例如，雙特異性抗體可使用化學連接製備。Brennan等人，Science , 229: 81 (1985)描述了其中完整抗體經蛋白水解裂解以生成F(ab')2 片段的程序。此等片段在二硫醇複合劑亞砷酸鈉存在下經還原以穩定化鄰近二硫醇且防止分子間二硫化物形成。然後將所生成的Fab'片段轉化成硫代硝基苯甲酸鹽(TNB)衍生物。然後，Fab'-TNB衍生物中之一者藉由用巰基乙胺還原來再轉化成Fab'-硫醇並且與等莫耳量之另一Fab'-TNB衍生物混合以形成雙特異性抗體。所產生之雙特異性抗體可用作用於酶之選擇性固定之劑。
最近進展促進從大腸桿菌中直接回收Fab'-SH片段，其可化學偶合以形成雙特異性抗體。Shalaby等人，J. Exp. Med ., 175: 217-225 (1992)描述產生完全人源化雙特異性抗體F(ab')2 分子。各Fab'片段單獨地從大腸桿菌中分泌並且在活體外經受定向化學偶合以形成雙特異性抗體。
亦已描述了用於直接自重組細胞培養物製造及單離雙特異性抗體片段之多種技術。例如，雙特異性抗體已使用白胺酸拉鍊產生。Kostelny等人,J. Immunol ., 148(5):1547-1553 (1992)。藉由基因融合，將來自Fos及Jun蛋白之白胺酸拉鍊肽連接至兩個不同抗體之Fab'部分。抗體均二聚體在鉸鏈區經還原以形成單體且接著再氧化以形成抗體雜二聚體。此方法亦可用於產生抗體均二聚體。由Hollinger等人,Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90:6444-6448 (1993)描述之「雙功能抗體」技術提供了一種用於製備雙特異性抗體片段之替代機制。片段包含藉由連接子連接至輕鏈可變域(VL )上的重鏈可變域(VH )，該連接子因太短以致於不能使同一條鏈上的兩個域配對。因此，迫使一個片段之VH 及VL 域與另一片段之互補VL 及VH 域配對，由此形成兩個抗原結合位點。亦已報導用於藉由使用單鏈Fv (sFv)二聚體製備雙特異性抗體片段之另一策略。參見Gruber等人,J. Immunol , 152:5368 (1994)。
製得雙特異性抗體片段之另一技術為「雙特異性T細胞銜接子」或BiTE®方法(參見，例如，WO2004/106381、WO2005/061547、WO2007/042261、及WO2008/119567)。此方法利用在單一多肽上配置的兩個抗體可變域。例如，單一多肽鏈包括兩個單鏈Fv (scFv)片段，各片段具有由多肽連接子分隔的可變重鏈(VH )及可變輕鏈(VL )域，該連接子之長度足以允許兩個域之間的分子內締合。此單一多肽進一步包括兩個scFv片段之間的多肽間隔區序列。各scFv識別不同抗原決定基，並且此等抗原決定基可對於不同細胞型具有特異性，以使得當各scFv與其同源抗原決定基銜接時，兩種不同細胞型之細胞變得緊密鄰近或經繫留。此方法之一個特定實施例包括識別由免疫細胞表現之細胞表面抗原例如T細胞上之CD3多肽的scFv，其連接至識別由靶細胞諸如惡性或腫瘤細胞表現之細胞表面抗原的另一scFv。
因為該雙特異性T細胞銜接子為單一多肽，所以其可使用此項技術中已知之任何原核或真核細胞表現系統例如CHO細胞株來表現。然而，可能需要特定純化技術(參見，例如，EP1691833)以便將單體雙特異性T細胞銜接子與其他多聚體物質分離，該等多聚體物質可具有除單體之意圖活性之外的生物活性。在一個例示性純化方案中，含有所分泌多肽之溶液首先經受金屬親和力層析，並且用咪唑濃度梯度來溶離多肽。進一步使用陰離子交換層析來純化此溶離液，並且使用氯化鈉濃度梯度來溶離多肽。最後，此溶離液經受尺寸排阻層析以便將單體與多聚體物質分離。
涵蓋多於兩價之抗體。例如，可製備三特異性抗體。參見例如Tuft等人J. Immunol. 147: 60 (1991)。(vii) 單域抗體
在一些實施例中，本發明抗體為單域抗體。單域抗體為包含抗體重鏈可變域之全部或一部分或輕鏈可變域之全部或一部分的單一多肽鏈。在某些實施例中，單域抗體為人類單域抗體(Domantis, Inc., Waltham, Mass；參見例如美國專利第6,248,516 B1號)。在一個實施例中，單域抗體由抗體重鏈可變域之全部或一部分組成。(viii) 抗體變異體
在一些實施例中，涵蓋本文所述抗體之胺基酸序列修飾。例如，可能需要改良抗體之結合親和力及/或其他生物特性。抗體之胺基酸序列變異體可藉由將適當改變引入編碼抗體之核苷酸序列中或藉由肽合成來製備。此類修飾包括例如抗體之胺基酸序列內的殘基之缺失、及/或插入、及/或取代。可製得缺失、插入、及取代之任何組合以獲得最終構築體，其限制條件在於該最終構築體具有所需特徵。可在製備序列時在標的抗體胺基酸序列中引入胺基酸改變。(ix) 取代、插入、及缺失變異體
在某些實施例中，提供具有一或多個胺基酸取代之抗體變異體。用於取代突變誘發之所關注之位點包括HVR及FR。保守取代顯示於表3中之標題「保守取代」下。更多實質性改變在表3中之標題「例示性取代」下且如下文中參考胺基酸側鏈類別進一步描述來提供。可將胺基酸取代引入所關注之抗體中並且針對所需活性來篩選產物，例如，保持/改良之抗原結合、減少之免疫原性、或改良之ADCC或CDC。表 3. 例示性取代
原始殘基 例示性取代 保守取代
Ala (A) Val；Leu；Ile Val
Arg (R) Lys；Gln；Asn Lys
Asn (N) Gln；His；Asp、Lys；Arg Gln
Asp (D) Glu；Asn Glu
Cys (C) Ser；Ala Ser
Gln (Q) Asn；Glu Asn
Glu (E) Asp；Gln Asp
Gly (G) Ala Ala
His (H) Asn；Gln；Lys；Arg Arg
Ile (I) Leu；Val；Met；Ala；Phe；正白胺酸 Leu
Leu (L) 正白胺酸；Ile；Val；Met；Ala；Phe Ile
Lys (K) Arg；Gln；Asn Arg
Met (M) Leu；Phe；Ile Leu
Phe (F) Trp；Leu；Val；Ile；Ala；Tyr Tyr
Pro (P) Ala Ala
Ser (S) Thr Thr
Thr (T) Val；Ser Ser
Trp (W) Tyr；Phe Tyr
Tyr (Y) Trp；Phe；Thr；Ser Phe
Val (V) Ile；Leu；Met；Phe；Ala；正白胺酸 Leu
胺基酸可根據常見側鏈特性進行分組： a. 疏水性：正白胺酸、Met、Ala、Val、Leu、Ile； b. 中性親水性：Cys、Ser、Thr、Asn、Gln； c. 酸性：Asp、Glu； d. 鹼性：His、Lys、Arg； e. 影響鏈取向之殘基：Gly、Pro； f. 芳族：Trp、Tyr、Phe。
非保守性取代將需要將此等類別之一的成員換成另一類別。
一種類型之取代變異體涉及取代親本抗體(例如，人源化或人類抗體)之一或多個高變區殘基。一般而言，選定用於進一步研究之所得變異體相對於親本抗體具有某些生物性質之改進(例如，改良)(例如，增加之親和力、降低之免疫原性)且/或實質上保持親本抗體之某些生物性質。例示性取代變異體為親和力成熟抗體，其可例如使用諸如本文所述的基於噬菌體顯示之親和力成熟技術來便利地生成。簡言之，一或多個HVR殘基發生突變且該等變異體抗體在噬菌體上顯示且針對特定生物活性(例如，結合親和力)進行篩選。
改變(例如，取代)可例如在HVR中進行以便改良抗體親和力。可在HVR「熱點」(亦即由在體細胞成熟過程期間以高頻率經受突變之密碼子編碼之殘基)(參見例如Chowdhury,Methods Mol. Biol. 207:179-196 (2008))及/或SDR (a-CDR)中進行此等改變，且測試所得變異體VH或VL之結合親和力。藉由構築且自二級文庫重新選擇之親和力成熟已描述於例如Hoogenboom等人.Methods in Molecular Biology 178:1-37 (O'Brien等人編, Human Press, Totowa, NJ, (2001))中。在親和力成熟之一些實施例中，多樣性經引入至經選擇用於藉由多種方法(例如，易錯PCR、鏈改組、或寡核苷酸定點突變誘發)中任一者實現成熟之可變基因中。接著產生第二文庫。接著篩選該文庫以鑑別具有所需親和力之任何抗體變異體。引入多樣性之另一方法涉及HVR定向方法，其中若干HVR殘基(例如，每次4至6個殘基)經隨機化。參與抗原結合之HVR殘基可例如使用丙胺酸掃描突變誘發或模型化特定地鑑別。通常尤其靶向CDR-H3及CDR-L3。
在某些實施例中，取代、插入、或缺失可出現於一或多個HVR內，只要該等改變不會實質上降低該抗體結合抗原之能力。例如，可在HVR中產生不會實質上降低結合親和力之保守改變(例如，如本文所提供之保守取代)。此等改變可在HVR「熱點」或SDR以外。在上文所提供之變異體VH及VL序列的某些實施例中，各HVR未改變，或含有不多於一個、兩個、或三個胺基酸取代。
用於鑑別抗體中可經靶向用於突變誘發之殘基或區的適用方法係稱作「丙胺酸掃描突變誘發」，如由Cunningham及Wells (1989) Science, 244:1081-1085所述。在此方法中，殘基或一組靶標殘基(例如，帶電荷之殘基諸如Arg、Asp、His、Lys、及Glu)得以鑑別並且藉由中性或帶負電荷之胺基酸(例如，丙胺酸或聚丙胺酸)置換以便確定是否影響了抗體與抗原之相互作用。可在對初始取代展示功能敏感性之胺基酸位置處引入進一步取代。或者或另外，抗原-抗體複合物之晶體結構鑑別該抗體與抗原之間的接觸點。該等接觸殘基及相鄰殘基可作為取代之候選物經靶向或消除。可篩選變異體以確定其是否含有所需特性。
胺基酸序列插入包括長度在一個殘基至含有一百個或更多殘基之多肽範圍內的胺基及/或羧基端融合物，以及單一或多個胺基酸殘基之序列內插入。末端插入之實例包括具有N端甲硫胺醯基殘基之抗體。該抗體分子之其他插入變異體包括該抗體的N端或C端融合至酶(例如，針對ADEPT)或增加該抗體之血清半衰期的多肽。(x) 醣基化變異體
在某些實施例中，對本文所提供之抗體進行改變以增加或降低抗體醣基化之程度。向抗體中添加醣基化位點或使抗體缺失醣基化位點可藉由改變胺基酸序列以便產生或移除一或多個醣基化位點來便利地實現。
在抗體包含Fc區之情況下，可改變連接於其上之碳水化合物。由哺乳動物細胞產生之天然抗體典型地包含分支鏈、雙觸角寡醣，該寡醣一般藉由N-鍵聯連接至該Fc區之CH2域的Asn297。參見例如Wright等人TIBTECH 15:26-32 (1997)。寡醣可包括各種碳水化合物，例如，甘露糖、N-乙醯基葡糖胺(GlcNAc)、半乳糖、及唾液酸，以及在雙觸角寡醣結構之「主幹」中連接至GlcNAc之海藻糖。在一些實施例中，可進行本發明抗體中該寡醣之修飾以便產生具有某些經改良特性之抗體變異體。
在一個實施例中，提供了包含Fc區之抗體變異體，其中與Fc區連接之碳水化合物結構具有減少之海藻糖或缺乏海藻糖，從而可改良ADCC功能。具體而言，本文中涵蓋相對於野生型CHO細胞中所產生之相同抗體上海藻糖之量，具有減少之海藻糖的抗體。亦即，其特徵在於相較於由天然CHO細胞(例如產生天然醣基化模式之CHO細胞，諸如含有天然FUT8基因之CHO細胞)產生所具有之海藻糖量，具有較少量之海藻糖。在某些實施例中，抗體為上面之N-連接聚醣中少於約50%、40%、30%、20%、10%、或5%包含海藻糖之抗體。例如，此種抗體中海藻糖之量可為1%至80%、1%至65%、5%至65%、或20%至40%。在某些實施例中，抗體為上面之N-連接聚醣均不包含海藻糖之抗體，亦即其中抗體完全不含海藻糖，或無海藻糖或經非海藻糖化。海藻糖之量藉由如藉由MALDI-TOF質譜法所量測，計算相對於連接至Asn 297之所有糖結構(例如，複合、雜合、及高甘露糖結構)的總和，在糖鏈內之Asn297處之海藻糖的平均量來確定，如例如WO 2008/077546中所述。Asn297係指位於Fc區中之約297位(Fc區殘基之EU編號)處之天冬醯胺殘基；然而，Asn297亦可由於抗體中之輕微序列變化而導致被定位在297位上游或下游大約±3個胺基酸處，亦即，在294位與300位之間。該等海藻糖化變異體可具有經改良之ADCC功能。參見例如美國專利公開案第US 2003/0157108號(Presta, L.)；US 2004/0093621 (Kyowa Hakko Kogyo Co., Ltd)。與「去海藻糖化」或「海藻糖缺乏」抗體變異體相關之公開案之實例包括：US 2003/0157108；WO 2000/61739；WO 2001/29246；US 2003/0115614；US 2002/0164328；US 2004/0093621；US 2004/0132140；US 2004/0110704；US 2004/0110282；US 2004/0109865；WO 2003/085119；WO 2003/084570；WO 2005/035586；WO 2005/035778；WO2005/053742；WO2002/031140；Okazaki等人J. Mol. Biol. 336:1239-1249 (2004)；Yamane-Ohnuki等人Biotech. Bioeng. 87:614 (2004)。能夠產生去海藻糖化抗體之細胞株之實例包括缺乏蛋白海藻糖化之Lec13 CHO細胞(Ripka等人，Arch. Biochem. Biophys. 249:533-545 (1986)；美國專利申請案第US 2003/0157108 A1號；及第WO 2004/056312 A1號，尤其在實例11處)，及剔除細胞株，諸如α-1,6-海藻糖基轉移酶基因FUT8 剔除CHO細胞(參見，例如，Yamane-Ohnuki等人Biotech. Bioeng. 87: 614 (2004); Kanda, Y.等人, Biotechnol. Bioeng., 94(4):680-688 (2006)；及WO2003/085107)。
進一步提供具有經平分寡醣之抗體變異體，例如，其中連接至抗體之Fc區之雙觸角寡醣藉由GlcNAc平分。該等抗體變異體可具有降低之海藻糖化及/或經改良之ADCC功能。此類抗體變異體之實例描述於例如WO 2003/011878；美國專利第6,602,684號；US 2005/0123546，及Ferrara等人, Biotechnology and Bioengineering, 93(5): 851-861 (2006)。亦提供在連接至Fc區之寡醣中具有至少一個半乳糖殘基之抗體變異體。該等抗體變異體可具有經改良之CDC功能。此類抗體變異體描述於例如WO 1997/30087；WO 1998/58964；及WO 1999/22764。
在某些實施例中，包含本文所述Fc區的抗體變異體能夠結合至FcγRIII。在某些實施例中，與包含人類野生型IgG1Fc區之其他方面相同之抗體相比，包含本文所述Fc區之抗體變異體在人類效應細胞存在下具有ADCC活性或在人類效應細胞存在下具有增加之ADCC活性。(xi) Fc 區變異體
在某些實施例中，可將一或多個胺基酸修飾引入至本文所提供之抗體的Fc區中，從而生成Fc區變異體。Fc區變體可以包含在一或多個胺基酸位置包含胺基酸修飾(例如，取代)的人類Fc區序列(例如，人類IgG1、IgG2、IgG3、或IgG4 Fc區)。
在某些實施例中，本發明涵蓋具有一些而非所有效應功能之抗體變異體，此使得該抗體成為對於其中活體內抗體半衰期至關重要，而某些效應功能(諸如補體及ADCC)為不必要或有害的應用合乎需要之候選物。可進行體外及/或體內細胞毒性檢定以確認CDC及/或ADCC活性的降低/減少。例如，可以進行Fc受體(FcR)結合檢定以確保抗體缺乏FcγR結合(因此有可能缺乏ADCC活性)，但是保留FcRn結合能力。介導ADCC之原代細胞，亦即NK細胞，僅表現FcγRIII，而單核球表現FcγRI、FcγRII、及FcγRIII。造血細胞上之FcR表現概述於Ravetch及Kinet,Annu. Rev. Immunol. 9:457-492 (1991)第464頁中之表3中。評估所關注之分子的ADCC活性的活體外檢定之非限制性實例描述於美國專利第5,500,362號(參見例如Hellstrom等人 Proc.Nat'l Acad. Sci . USA 83:7059-7063 (1986))及Hellstrom, I等人, Proc.Nat'l Acad. Sci. USA 82:1499-1502 (1985); 5,821,337 (參見Bruggemann等人,J. Exp. Med. 166:1351-1361 (1987))。或者，可採用非放射性檢定方法(參見例如流動式細胞量測術之ACTI™非放射性細胞毒性檢定(CellTechnology, Inc. Mountain View, CA)；及CytoTox 96®非放射性細胞毒性檢定(Promega, Madison, WI))。適用於該等檢定之效應細胞包括外周血單核細胞(PBMC)及自然殺手(NK)細胞。或者或另外，所關注之分子之ADCC活性可在活體內例如在動物模型諸如Clynes等人,Proc. Nat'l Acad. Sci. USA 95:652-656 (1998)中揭示之動物模型中評估。亦可進行C1q結合分析以確認該抗體不能結合C1q且因此缺乏CDC活性。參見，例如WO 2006/029879及WO 2005/100402中的C1q及C3c結合ELISA。為了評估補體活化，可以實施CDC檢定(參見例如Gazzano-Santoro等人,J. Immunol. Methods 202:163 (1996)；Cragg等人, Blood 101:1045-1052 (2003)；及Cragg等人, Blood 103:2738-2743 (2004))。亦可以使用此項技術中已知的方法來實施FcRn結合及活體內清除/半衰期測定(參見例如Petkova等人,Int'l. Immunol. 18(12):1759-1769 (2006))。
效應功能減小之抗體包括具有Fc區殘基238、265、269、270、297、327、及329中之一或多者之取代的彼等抗體(美國專利第6,737,056號)。此類Fc突變體包括具有胺基酸265、269、270、297、及327位中之二或更多者之取代的Fc突變體，包括殘基265及297取代為丙胺酸的所謂「DANA」Fc突變體(美國專利第7,332,581號)。
描述了具有經改良或減弱之與FcR之結合的某些抗體變異體。(參見例如美國專利第6,737,056號；WO 2004/056312及Shields等,J. Biol. Chem. 9(2): 6591-6604 (2001)。)
在某些實施例中，抗體變異體包含具有一或多個改良ADCC之胺基酸取代(例如在Fc區之298、333、及/或334位(殘基之EU編號)處的取代)的Fc區。在例示性實施例中，抗體在其Fc區中包含以下胺基酸取代：S298A、E333A、及K334A。
在一些實施例中，對Fc區做出改變，其導致改變的(亦即，改良的或降低的) C1q結合及/或補體依賴性細胞毒性(CDC)，例如，如美國專利第6,194,551號、第WO 99/51642號、及Idusogie等人J. Immunol. 164: 4178-4184 (2000)中所述。
具有延長之半衰期及改良之與新生兒Fc受體(FcRn)之結合的抗體描述於US2005/0014934A1(Hinton等人)，新生兒Fc受體(FcRn)負責將母體IgG轉移至胎兒(Guyer等人,J. Immunol. 117:587 (1976)及Kim等人,J. Immunol. 24:249 (1994))。彼等抗體包含其中具有一或多種取代之Fc區，該等取代改良Fc區與FcRn之結合。此類Fc變異體包括在Fc區殘基中之一或多者處具有取代之彼等變異體：238、256、265、272、286、303、305、307、311、312、317、340、356、360、362、376、378、380、382、413、424、或434，例如Fc區殘基434的取代(美國專利第7,371,826號)。亦參見Duncan及Winter,Nature 322:738-40 (1988)；美國專利第5,648,260號；美國專利第5,624,821號；及WO 94/29351，其涉及Fc區變異體之其他實例。(xii) 抗體衍生物
本發明抗體可進一步修飾以含有此項技術中已知並且易於得到的額外非蛋白質部分。在某些實施例中，適於衍生抗體的部分為水溶性聚合物。水溶性聚合物之非限制性實例包括但不限於聚乙二醇(PEG)、乙二醇/丙二醇之共聚物、羧甲基纖維素、葡聚糖、聚乙烯醇、聚乙烯吡咯啶酮、聚-1,3-二氧雜環戊烷、聚-1,3,6-三噁烷、乙烯/順丁烯二酸酐共聚物、聚胺基酸(均聚物或無規共聚物)及葡聚糖或聚(n-乙烯基吡咯啶酮)聚乙二醇、聚丙二醇均聚物、聚環氧丙烷/環氧乙烷共聚物、聚氧乙基化多元醇(例如甘油)、聚乙烯醇、及其混合物。聚乙二醇丙醛可由於其在水中之穩定性而在製造方面具有優勢。該聚合物可具有任何分子量，且可為分支鏈或無分支鏈的。連接至抗體之聚合物的數目可變化，且若連接多於一種聚合物，則其可為相同或不同分子。一般而言，用於衍生化之聚合物的數目及/或類型可基於多種考慮因素確定，該等考慮因素包括但不限於欲改良之抗體之特定特性或功能、抗體衍生物是否將在規定條件下用於療法等。(xiii) 載體、宿主細胞、及重組方法
抗體亦可使用重組方法製備。為了重組產生抗抗原抗體，單離出編碼抗體之核酸且將其插入可複製之載體中以用於進一步選殖(DNA擴增)或表現。編碼抗體之DNA可容易地使用習知程序單離且測序(例如藉由使用能夠特異性結合於編碼抗體重鏈及輕鏈之基因的寡核苷酸探針)。多種載體為可得的。載體組分通常包括但不限於以下中之一或多種：信號序列、複製起點、一或多種標記基因、強化子元件、啟動子、及轉錄終止序列。(a) 信號序列組分
本發明抗體不僅可直接地，而且可以作為具有異源多肽之融合多肽來重組產生，該異源多肽較佳地為信號序列或在成熟蛋白或多肽之N端處具有特定裂解位點的其他多肽。所選擇的異源信號序列較佳地為宿主細胞所識別並加工(例如，藉由信號肽酶來裂解)的信號序列。對於不識別且加工天然抗體信號序列之原核宿主細胞，將信號序列用選自例如鹼性磷酸酶、青黴素酶、lpp或熱穩定腸毒素II前導序列之群的原核信號序列取代。對於酵母分泌，原生信號序列可藉由例如酵母轉化酶前導序列、因子前導序列(包括酵母菌屬(Saccharomyces )及克魯維酵母菌屬(Kluyveromyces ) α-因子前導序列)、或酸性磷酸酶前導序列、白色念珠菌(C. albicans )葡糖澱粉酶前導序列、或在WO 90/13646中描述之信號來取代。在哺乳動物細胞表現中，可獲得哺乳動物信號序列以及病毒性分泌前導序列，例如單純皰疹gD信號。(b) 複製起點
表現及選殖載體均含有使載體能夠在一或多種所選宿主細胞中複製之核酸序列。一般而言，在選殖載體中，此序列為使載體能夠獨立於宿主染色體DNA而複製之序列，且包括複製起點或自主複製序列。用於各種細菌、酵母、及病毒之此類序列為熟知的。來自質體pBR322之複製起點適用於大多數革蘭氏陰性細菌，2μ質體起點適用於酵母，且各種病毒起點(SV40、多瘤、腺病毒、VSV、或BPV)可用於選殖哺乳動物細胞中之載體。一般而言，哺乳動物表現載體不需要複製起點組分(通常僅使用SV40起點，因為其含有早期啟動子)。(c) 選擇基因組分
表現及選殖載體可含有選擇基因，該選擇基因亦稱作可選擇標記物。典型選擇基因編碼具有以下作用的蛋白：(a)賦予對抗生素或其他毒素例如胺苄青黴素、新黴素、胺甲蝶呤、或四環素之抗性，(b)補充營養缺陷型缺乏，或(c)供應不可從複合培養基獲得之關鍵營養物，例如，編碼芽孢桿菌之D-丙胺酸消旋酶的基因。
選擇方案之一個實例利用藥物來阻止宿主細胞之生長。用異源基因成功轉型之彼等細胞產生賦予抗藥性的蛋白並且因此經受得住選擇方案。該顯性選擇之實例使用藥物新黴素、黴酚酸、及潮黴素。
用於哺乳動物細胞之適合可選擇標記物之另一實例為使得能夠鑑別能吸收抗體編碼核酸之細胞的標記物，諸如DHFR、麩胺醯胺合成酶(GS)、胸苷激酶、金屬硫蛋白-I及-II (較佳為靈長類金屬硫蛋白基因)、腺苷去胺酶、鳥胺酸去羧酶等。
例如，用DHFR基因轉型之細胞係藉由在含有DHFR之競爭性拮抗劑甲胺喋呤(Mtx)之培養基中培養轉型體來鑑別。在此等條件下，將DHFR基因與任何其他共轉型核酸一起擴增。可使用缺乏內源性DHFR活性之中國倉鼠卵巢(CHO)細胞株(例如ATCC CRL-9096)。
或者，藉由在含有GS抑制劑L-甲硫胺酸磺醯亞胺(Msx)之培養基中培養轉型體來鑑別用GS基因轉型之細胞。在此等條件下，GS基因與任何其他共轉型核酸一起擴增。GS選擇/擴增系統可與上述DHFR選擇/擴增系統組合使用。
或者，用編碼所關注抗體之DNA序列、野生型DHFR基因、及另一可選擇標記物諸如胺基糖苷3'-磷酸轉移酶(APH)轉型或共轉型之宿主細胞(尤其是含有內源性DHFR之野生型宿主)可藉由在含有可選擇標記物之選擇劑諸如胺基糖苷抗生素例如卡那徽素、新黴素、或G418之培養基中進行細胞生長來選擇。參見美國專利第4,965,199號。
用於酵母中之合適選擇基因為存在於酵母質體YRp7中之trp 1基因(Stinchcomb等人，Nature ，282:39(1979))。trp 1基因對於缺乏在色胺酸中生長之能力的突變酵母菌株例如ATCC編號44076或PEP4-1提供選擇標記物。Jones, Genetics, 85:12 (1977)。然後，在酵母宿主細胞基因組中trp 1損傷之存在對於偵測藉由在不存在色胺酸下生長來進行之轉型提供了有效環境。類似地，Leu 2缺乏酵母菌株(ATCC 20,622或38,626)由帶有Leu 2基因之已知質體來補充。
另外，可將來源於1.6 μm環形質體pKD1之載體用於克魯維酵母轉型。或者，報告了用於乳酸克魯維酵母(K. lactis )之用於大規模生產重組小牛凝乳酶之表現系統。參見例如Van den Berg,Bio/Technology, 8:135 (1990)。亦揭示了用於由克魯維酵母之工業菌株分泌成熟重組人類血清白蛋白的穩定多複本表現載體。Fleer等人,Bio/Technology, 9:968-975 (1991)。(d) 啟動子組分
表現及選殖載體通常含有啟動子，該啟動子由宿主生物體識別並且可操作地連接至編碼抗體之核酸。適於與原核宿主一起使用之啟動子包括phoA 啟動子、β-內醯胺酶及乳糖啟動子系統、鹼性磷酸酶啟動子、色胺酸(trp)啟動子系統、及雜合啟動子諸如tac啟動子。然而，其他已知細菌啟動子為合適的。用於細菌系統中之啟動子亦將含有與編碼抗體之DNA可操作連接之Shine-Dalgarno (S.D.)序列。
已知用於真核細胞之啟動子序列。實際上所有真核基因均具有位於起始轉錄之位點上游大約25至30個鹼基處的富AT區。在多種基因之轉錄開始上游70至80個鹼基處發現的另一序列為CNCAAT區，其中N可為任何核苷酸。在大多數真核基因之3'末端處為AATAAA序列，該序列可為向編碼序列之3'末端添加多聚A尾之信號。所有此等序列均合適地插入至真核表現載體中。
適於與酵母宿主一起使用之啟動子序列之實例包括用於3-磷酸甘油酸激酶或其他糖分解酶之啟動子，諸如烯醇化酶、甘油醛-3-磷酸酯去氫酶、己醣激酶、丙酮酸去羧酶、磷酸果糖激酶、葡萄糖-6-磷酸酯異構酶、3-磷酸甘油酸變位酶、丙酮酸激酶、丙醣磷酸異構酶、磷葡萄糖異構酶、及葡糖激酶。
作為具有受生長條件控制轉錄之額外優勢的可誘導啟動子的其他酵母啟動子為用於以下之啟動子區：醇去氫酶2、異細胞色素C、酸性磷酸酶、與氮代謝相關之降解酶、金屬硫蛋白、甘油醛-3-磷酸酯去氫酶、及負責麥芽糖及半乳糖利用之酶。適用於酵母表現之載體及啟動子進一步描述於EP 73,657。酵母強化子亦有利地與酵母啟動子一起使用。
來自哺乳動物宿主細胞中之載體之抗體轉錄可例如藉由獲自病毒之基因組的啟動子來控制，該等病毒諸如多瘤病毒、雞痘病毒、腺病毒(諸如腺病毒2)、牛乳頭瘤病毒、鳥類肉瘤病毒、巨細胞病毒、逆轉錄病毒、B型肝炎病毒、猿病毒40 (SV40)、或獲自異源哺乳動物啟動子例如肌動蛋白啟動子或免疫球蛋白啟動子、獲自熱休克啟動子，只要此類啟動子與宿主細胞系統相容。
SV40病毒之早期及晚期啟動子便利地以亦含有SV40病毒複製起點之SV40限制片段形式獲得。人類巨細胞病毒之即刻早期啟動子便利地作為HindIII E限制片段來獲得。使用牛乳頭狀瘤病毒作為載體在哺乳動物宿主中表現DNA之系統揭示於美國專利第4,419,446號中。此系統之修改描述於美國專利第4,601,978號中。關於在來自單純皰疹病毒之胸苷激酶啟動子控制下小鼠細胞中人類β-干擾素cDNA之表現，亦參見Reyes等人, Nature 297:598-601 (1982)。或者，勞斯肉瘤病毒長末端重複序列可用作啟動子。(e) 強化子元件組分
編碼本發明抗體之DNA藉由高等真核生物之轉錄經常藉由將強化子序列插入載體中來增加。現在已知來自哺乳動物基因(球蛋白、彈性蛋白酶、白蛋白、α-胎蛋白、及胰島素)之許多強化子序列。然而，通常將使用來自真核細胞病毒之強化子。實例包括在複製起點(bp 100-270)之後側上的SV40強化子、細胞巨化病毒早期啟動子強化子、在複製起點之後側上的多瘤強化子、及腺病毒強化子。關於用於活化真核啟動子之強化元件，亦參見Yaniv,Nature 297:17-18 (1982)。強化子可在抗體編碼序列之5'或3'位處剪接至載體中，但是較佳地位於啟動子之5'位點處。(f) 轉錄終止組分
用於真核宿主細胞(酵母、真菌、昆蟲、植物、動物、人類、或來自其他多細胞生物體之有核細胞)之表現載體亦含有用於終止轉錄及穩定mRNA所需要的序列。此類序列常可獲自真核或病毒DNA或cDNA之5'及有時3'未轉譯區。此等區含有轉錄為編碼抗體之mRNA之未轉譯部分中之多腺苷酸化片段來的核苷酸區段。一種適用之轉錄終止組分為牛生長激素聚腺苷酸化區。參見WO94/11026及其中所揭示之表現載體。(g) 宿主細胞之選擇與轉型
適用於在本文載體中選殖或表現DNA之宿主細胞為上述原核生物、酵母、或高等真核細胞。用於此目的之合適原核生物包括真細菌，諸如革蘭氏陰性或革蘭氏陽性生物體，例如，腸桿菌科(Enterobacteriaceae)諸如埃希氏菌屬(Escherichia )例如大腸桿菌、腸桿菌(Enterobacter )、歐文氏菌(Erwinia )、克雷伯氏菌(Klebsiella )、變形菌(Proteus )、沙門氏菌(Salmonella )例如鼠傷寒沙門氏菌(Salmonella typhimurium )、沙雷氏菌(Serratia )例如黏質沙雷氏菌(Serratiamarcescans )、及志賀氏菌(Shigella )、以及芽孢桿菌(Bacilli )諸如枯草芽孢桿菌(B. subtilis )及地衣芽孢桿菌(B. licheniformis )(例如，在1989年4月12日公佈之DD 266,710中揭示之地衣芽孢桿菌41P)、假單胞菌(Pseudomonas )諸如綠膿假單胞菌(P. aeruginosa )、及鏈黴菌屬(Streptomyces )。一種較佳大腸桿菌選殖宿主為大腸桿菌294 (ATCC 31,446)，但是其他菌株諸如大腸桿菌B、大腸桿菌X1776 (ATCC 31,537)、及大腸桿菌W3110 (ATCC 27,325)為合適的。此等實例為說明性的而非限制性的。
全長抗體、抗體融合蛋白、及抗體片段可在細菌中產生，尤其當不需要醣基化及Fc效應功能時，諸如當治療性抗體綴合至在腫瘤細胞破壞方面單獨表現出有效性的細胞毒性劑(例如，毒素)時。全長抗體在循環中具有較長半衰期。在大腸桿菌中之產生較快並且成本效率更高。關於抗體片段及多肽在細菌中之表現，參見例如美國專利第5,648,237號(Carter等人)、美國專利第5,789,199號(Joly等人)、美國專利第5,840,523號(Simmons等人)，該等專利案描述用於最佳化表現及分泌之轉譯啟始區(TIR)及信號序列。亦參見Charlton, Methods in Molecular Biology, 第248卷 (B.K.C. Lo編, Humana Press, Totowa, N.J., 2003), 第245-254頁，其描述抗體片段在大腸桿菌中之表現。表現之後，可自大腸桿菌細胞糊之可溶性部分中單離出抗體，且可根據同型經由例如蛋白A或G管柱進行純化。最後純化可類似於用於純化例如在CHO細胞中表現之抗體的方法進行。
除原核生物外，真核微生物諸如絲狀真菌或酵母為編碼抗體之載體的適合選殖或表現宿主。釀酒酵母(Saccharomyces cerevisiae )或常見麵包酵母在低等真核宿主微生物之中為最常使用的。然而，許多其它屬、種及菌株通常可用於本文中，諸如粟酒裂殖酵母(Schizosaccharomyces pombe )；克魯維酵母宿主，諸如乳酸克魯維酵母(K. lactis )、脆弱克魯維酵母(K. fragilis )(ATCC 12,424)、保加利亞克魯維酵母(K. bulgaricus )(ATCC 16,045)、威克克魯維酵母(K. wickeramii )(ATCC 24,178)、瓦爾提克魯維酵母(K. waltii )(ATCC 56,500)、果蠅克魯維酵母(K. drosophilarum )(ATCC 36,906)、耐熱克魯維酵母(K. thermotoleran )及馬克思克魯維酵母(K. marxianus )；耶氏酵母(yarrowia )(EP 402,226)；巴斯德畢赤氏酵母(Pichia pastoris )(EP 183,070)；念珠菌(Candida )；里氏木黴(Trichoderma reesia )(EP 244,234)；粗糙脈孢菌(Neurospora crassa )；許旺酵母(Schwanniomyces )，諸如西方許旺酵母(Schwanniomyces occidentalis )；及絲狀真菌，諸如脈孢菌(Neurospora )、青黴(Penicillium )、木黴(Tolypocladium )及麯黴宿主，諸如構巢麯黴(A. nidulans )及黑麯黴(A. niger )。關於論述酵母及絲狀真菌用於產生治療性蛋白之用途的綜述，參見例如Gerngross, Nat. Biotech. 22:1409-1414 (2004)。
可以選擇某些真菌及酵母菌株，其中醣基化路徑已經「人源化」，從而產生具有部分或完全人類醣基化模式之抗體。參見例如Li等人，Nat. Biotech. 24:210-215 (2006)(描述巴斯德畢赤酵母中之醣基化途徑之人源化)；及Gerngross等人(出處同上)。
適合用於表現醣基化抗體之宿主細胞亦來源於多細胞生物體(無脊椎動物及脊椎動物)。無脊椎動物細胞之實例包括植物及昆蟲細胞。已鑑別許多桿狀病毒毒株及變異體及來自諸如以下宿主之對應容許昆蟲宿主細胞：草地貪夜蛾(Spodoptera frugiperda )(毛蟲)、埃及伊蚊(Aedes aegypti )(蚊子)、白紋伊蚊(Aedes albopictus )(蚊子)、黑腹果蠅(Drosophila melanogaster )(果蠅)、及中國桑蠶(Bombyx mori )。用於轉染之各種病毒株為公眾可獲得的，例如苜蓿銀紋夜蛾(Autographa californica ) NPV之L-1變異體及中國桑蠶NPV之Bm-5株，並且此類病毒可用作根據本發明之本文病毒，尤其用於轉染草地夜蛾細胞之病毒。
棉花、玉米、馬鈴薯、大豆、矮牽牛、番茄、浮萍(浮萍科(Leninaceae ))、苜蓿草(蒺藜苜蓿(M. truncatula ))、及菸草之植物細胞培養物亦可用作宿主。參見例如美國專利第5,959,177號、第6,040,498號、第6,420,548號、第7,125,978號、及第6,417,429號(描述用於在基因轉殖植物中產生抗體之PLANTIBODIESTM 技術)。
脊椎動物細胞可用作宿主，且脊椎動物細胞在培養物(組織培養物)中之增殖已成為常規程序。可用哺乳動物宿主細胞株之實例為藉由SV40轉型之猴腎CV1株(COS-7，ATCC CRL 1651)；人類胚胎腎株(293細胞或經次選殖以便在懸浮培養物中生長之293細胞，Graham等人,J. Gen Virol . 36:59 (1977))；幼倉鼠腎細胞(BHK，ATCC CCL 10)；小鼠賽特利細胞(TM4, Mather,Biol. Reprod. 23:243-251 (1980))；猴腎細胞(CV1 ATCC CCL 70)；非洲綠猴腎細胞(VERO-76, ATCC CRL-1587)；人類宮頸癌細胞(HELA, ATCC CCL 2)；犬腎細胞(MDCK, ATCC CCL 34)；布法羅大鼠肝細胞(BRL 3A, ATCC CRL 1442)；人類肺細胞(W138, ATCC CCL 75)；人類肝細胞(Hep G2, HB 8065)；小鼠乳腺腫瘤(MMT 060562, ATCC CCL51)；TRI細胞(Mather等人,Annals N.Y. Acad. Sci. 383:44-68 (1982))；MRC 5細胞；FS4細胞；及人類肝癌株(Hep G2)。其他有用的哺乳動物宿主細胞株包括中國倉鼠卵巢(CHO)細胞，包括DHFR- CHO細胞(Urlaub等人,Proc. Natl. Acad. Sci. USA 77:4216 (1980))；及骨髓瘤細胞株諸如NS0及Sp2/0。關於適合於抗體產生之某些哺乳動物宿主細胞株的綜述，參見例如Yazaki及Wu,Methods in Molecular Biology, 第248卷(B.K.C. Lo編, Humana Press, Totowa, N.J., 2003), 第255-268頁。
將宿主細胞用上述表現或選殖載體轉型以進行抗體產生，且在習知營養培養基中培養，適當時將該等營養培養基改良以用於誘導啟動子、選擇轉型體或擴增編碼所需序列之基因。(h) 培養宿主細胞
用於產生本發明抗體之宿主細胞可在各種培養基中培養。可商購之培養基諸如Ham氏F10 (Sigma)、最低必需培養基((MEM)，(Sigma)、RPMI-1640 (Sigma)、及杜氏改良伊格爾氏培養基(Dulbecco's Modified Eagle's Medium)((DMEM)，Sigma)適用於培養宿主細胞。另外，Ham等人,Meth. Enz. 58:44 (1979)；Barnes等人, Anal. Biochem. 102:255 (1980)；美國專利第4,767,704號；第4,657,866號；第4,927,762號；第4,560,655號；或第5,122,469號；WO 90/03430；WO 87/00195；或美國專利再審30,985中所述之任何培養基均可用作宿主細胞之培養基。此等培養基中之任一者均可在必要時補充激素及/或其他生長因子(諸如胰島素、轉鐵蛋白、或表皮生長因子)、鹽(諸如氯化鈉、磷酸鈣、及磷酸鎂)、緩衝液(諸如HEPES)、核苷酸(諸如腺苷及胸苷)、抗生素(諸如GENTAMYCINTM 藥物)、痕量元素(定義為通常以微莫耳濃度範圍內之最終濃度存在的無機化合物)、及葡萄糖或等效能源。亦可包含合適濃度的為熟習此項技術者已知之任何其他必要補充物。培養條件諸如溫度、pH、及其類似條件為經選定用於表現之宿主細胞先前使用之條件，並且為普通熟習此項技術者顯而易知。(xiv) 抗體之純化
當使用重組技術時，抗體可在細胞內、在周質空間中產生，或直接分泌於培養基中。若抗體在細胞內產生，則作為第一步，例如藉由離心或超濾移除宿主細胞或溶解片段之微粒碎片。Carter等人，Bio/Technology 10:163-167 (1992)描述用於單離經分泌至大腸桿菌之細胞周質空間的抗體的程序。簡言之，將細胞漿料在乙酸鈉(pH 3.5)、EDTA、及苯甲基磺醯氟(PMSF)存在下在約30 min內解凍。可藉由離心移除細胞碎片。當抗體分泌至培養基中時，通常首先使用可商購之蛋白濃縮濾器(例如Amicon或Millipore Pellicon超濾單元)來濃縮此類表現系統之上清液。蛋白酶抑制劑諸如PMSF可包含在任何前述步驟中以抑制蛋白水解並且可包含抗生素以防止外來污染物之生長。
可使用例如羥磷灰石層析法、疏水相互作用層析、凝膠電泳、透析、及親和力層析法來純化由細胞製備之抗體組成物，其中親和力層析法為通常較佳純化步驟之一。蛋白A作為親和配體之適合性取決於抗體中存在的任何免疫球蛋白Fc域之種類及同型。可使用蛋白A來純化基於人類γ1、γ2、或γ4重鏈之抗體(Lindmark等人, J. Immunol. Meth. 62:1-13 (1983))。推薦蛋白G用於所有小鼠同型及人類γ3 (Guss等人,EMBO J. 5:15671575 (1986))。親和配體所連接之基質最常為瓊脂糖，但也可使用其他基質。與可用瓊脂糖實現之結果相比，機械穩定之基質，諸如可控孔徑玻璃或聚(苯乙烯二乙烯基)苯可達成較快流速及較短加工時間。當抗體包含CH 3域時，Bakerbond ABXTM 樹脂(J. T. Baker, Phillipsburg, N.J.)適用於純化。視待回收之抗體而定，亦可利用其他蛋白純化技術諸如在離子交換管柱上之分級、乙醇沉澱、逆相HPLC、矽膠層析、肝素上之層析陰離子或陽離子交換樹脂(諸如聚天冬胺酸管柱)上之SEPHAROSETM 層析、層析聚焦、SDS-PAGE、及硫酸銨沉澱。
一般而言，用於製備用於研究、測試、及臨床之抗體的各種方法在此項技術中為公認的，與上述方法一致及/或熟習此項技術者認為適用於特定所關注之抗體。(xv) 選擇生物活性抗體
可對如上述產生之抗體進行一或多種「生物活性」分析，以根據治療前景選擇具有有益特性之抗體，或選擇保留抗體生物活性之調配物及條件。可測試抗體結合如下抗原之能力，其中該抗體針對該抗原產生。例如，可使用此項技術中已知之方法(諸如ELISA、西方墨點法等)。
例如，對於抗PD-L1抗體，抗體之抗原結合性質可在偵測結合至PD-L1之能力的檢定中進行評價。在一些實施例中，抗體之結合可藉由例如飽和結合、ELISA、及/或競爭檢定(例如，RIA)來確定。亦可對抗體進行其他生物活性檢定，例如以評價其作為治療劑之有效性。此類檢定為此項技術中所已知，且取決於靶抗原及該抗體之預期用途。例如，可如美國專利8,217,149中所述在CD8+T細胞、淋巴細胞脈絡叢腦膜炎病毒(LCMV)小鼠模型、及/或同源腫瘤模型中評估抗體對PD-L1阻斷之生物學效應。
為了篩選結合至所關注之抗原上之特定抗原決定基的抗體(例如，阻斷實例之抗PD-L1抗體與PD-L1之結合的抗體)，可執行諸如在Antibodies, A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory, Ed Harlow and David Lane (1988)中所描述之常規交叉阻斷檢定。或者，可執行例如在Champe等人,J. Biol. Chem. 270:1388-1394 (1995)中所描述之抗原決定基定位以確定抗體是否結合所關注之抗原決定基。VIII. 醫藥組成物及調配物
本文亦提供包含PD-1軸結合拮抗劑及/或本文所述之抗體(諸如抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)或抗PD-1抗體)及視情況醫藥學上可接受之載劑的醫藥組成物及調配物。本發明亦提供包含紫杉烷例如，nab-太平洋紫杉醇(ABRAXANE®)、太平洋紫杉醇、或歐洲紫杉醇之醫藥組成物及調配物。
如本文所述之醫藥組成物及調配物可藉由將具有所需純度之活性成分(例如，PD-1軸結合拮抗劑(例如，抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)或抗PD-1抗體)及/或紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)與一或多種視情況選用之醫藥學上可接受之載劑(Remington's Pharmaceutical Sciences 第16版, Osol, A.編 (1980))混合成凍乾調配物或水溶液形式來製備。醫藥學上可接受之載劑在所用劑量及濃度下對接受者無毒，且包括但不限於：緩衝液，諸如磷酸鹽、檸檬酸鹽、及其他有機酸；抗氧化劑，包括抗壞血酸及甲硫胺酸；防腐劑(諸如十八烷基二甲基苯甲基氯化銨；氯化六烴季銨；苯紮氯銨；苄索氯銨；苯酚、丁基或苯甲基醇；對羥基苯甲酸烷基酯，諸如對羥基苯甲酸甲酯或丙酯；兒茶酚；間苯二酚；環己醇；3-戊醇；及間-甲酚)；低分子量(小於約10個殘基)多肽；蛋白，諸如血清白蛋白、明膠、或免疫球蛋白；親水性聚合物，諸如聚乙烯吡咯啶酮；胺基酸，諸如甘胺酸、麩醯胺、天冬醯胺、組胺酸、精胺酸、或離胺酸；單醣、二醣、及其他碳水化合物，包括葡萄糖、甘露糖、或糊精；螯合劑，諸如EDTA；糖，諸如蔗糖、甘露糖醇、海藻糖、或山梨糖醇；成鹽相對離子，諸如鈉；金屬錯合物(例如，Zn-蛋白錯合物)；及/或非離子性界面活性劑，諸如聚乙二醇(PEG)。本文中之例示性醫藥學上可接受之載劑進一步包括間質(insterstitial)藥物分散劑諸如可溶性中性活性透明質酸酶醣蛋白(sHASEGP)，例如人類可溶性PH-20透明質酸酶醣蛋白，諸如rHuPH20 (HYLENEX®, Baxter International, Inc.)。某些例示性sHASEGP (包括rHuPH20)及使用方法描述於美國專利公開案第2005/0260186號及第2006/0104968號中。在一個態樣中，sHASEGP與一或多種額外醣胺聚醣酶(諸如軟骨素酶)組合。
例示性經凍乾抗體調配物描述於美國專利第6,267,958號中。水性抗體調配物包括美國專利第6,171,586號及WO2006/044908中所述的調配物，後述調配物包括組胺酸-乙酸鹽緩衝液。
本文中之該等組成物及調配物亦可含有所治療的特定適應症所必需之超過一種活性成分，較佳地具有不會不利地彼此影響之互補活性之彼等。該等活性成分合適地以有效用於預期目的之量組合存在。
活性成分可經包埋於例如藉由凝聚技術或藉由界面聚合製備之微膠囊中，例如分別在膠狀藥物遞送系統中(例如，脂質體、白蛋白微球、微乳液、奈米粒子、及奈米膠囊)或在巨乳液中之羥基甲基纖維素或明膠-微膠囊及聚-(甲基丙烯酸甲酯)微膠囊。該等技術揭示於Remington's Pharmaceutical Sciences 第16版, Osol, A.編 (1980)中。
可製備持續釋放製劑。持續釋放製劑之適合實例包括含有抗體之固體疏水性聚合物的半透性基質，該等基質呈成形製品例如薄膜或微膠囊之形式。欲用於活體內投與之調配物一般為無菌的。無菌性可容易地藉由例如經由無菌過濾膜過濾來實現。IX. 製品或套組
在本發明之另一實施例中，提供一種包含PD-1軸結合拮抗劑(例如，抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)或抗PD-1抗體)及/或紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)的製品或套組。在一些實施例中，製品或套組進一步包含包裝插頁，其包含聯合紫杉烷使用PD-1軸結合拮抗劑以治療個體中之局部晚期或轉移性乳癌(例如，局部晚期或轉移性TNBC)或延遲其進展或增強患有局部晚期或轉移性乳癌(例如，局部晚期或轉移性TNBC)之個體之免疫功能的說明書。本文所述之任何PD-1軸結合拮抗劑及/或紫杉烷均可包括在製品或套組中。
在一些實施例中，PD-1軸結合拮抗劑(例如，抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)或抗PD-1抗體)及紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)在同一容器或單獨容器中。合適容器包括例如瓶子、小瓶、袋子、及注射器等。容器可以由各種材料形成，諸如玻璃、塑膠(諸如聚氯乙烯或聚烯烴)、或金屬合金(諸如不銹鋼或哈氏合金(hastelloy))。在一些實施例中，容器容納調配物，並且容器上或與容器相結合之標籤可指示使用說明。製品或套組可進一步包括自商業及使用者觀點而言所想要之其他材料，包括其他緩衝劑、稀釋劑、過濾器、針、注射器、及帶有使用說明書之包裝插頁。在一些實施例中，製品進一步包括一或多種其他劑(例如化學治療劑及抗腫瘤劑)。用於一或多種劑之合適容器包括例如瓶子、小瓶、袋子、及注射器。
例如，本發明提供一種用於鑑別可能對用抗癌療法之治療有反應的患有局部晚期或轉移性乳癌(例如，局部晚期或轉移性TNBC)之患者的套組，該抗癌療法包含(i) PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑)及(ii)紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)，該套組包括用於確定獲自患者之樣品(例如，腫瘤樣品)中PD-L1之表現水準的一或多種試劑，其中患者先前未針對TNBC進行治療，並且其中樣品中PD-L1之可偵測的表現水準將患者鑑別為可能對使用抗癌療法之治療有反應。在一些實施例中，套組進一步包括PD-1軸結合拮抗劑及/或紫杉烷。
在另一實例中，本發明提供一種用於治療可能對用抗癌療法之治療有反應的患有局部晚期或轉移性乳癌(例如，局部晚期或轉移性TNBC)之患者的套組，該抗癌療法包含(i) PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑)及(ii)紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)，該套組包括以下中之一或多者：(i) PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑)及(ii)紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)；及基於獲自患者之樣品(例如，腫瘤樣品)中PD-L1之可偵測的表現水準向患者投與抗癌療法的說明書。在一些實施例中，套組包括用於確定PD-L1、CD8、或sTIL中之一或多者之存在或表現水準的試劑。
在另一實例中，本發明提供一種用於鑑別可能對用抗癌療法之治療有反應的患有局部晚期或轉移性乳癌(例如，局部晚期或轉移性TNBC)之患者的套組，該抗癌療法包含(i) PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑)及(ii)紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)，該套組包括用於確定獲自患者之腫瘤樣品之腫瘤浸潤免疫細胞中PD-L1之表現水準的一或多種試劑，其中患者先前未針對TNBC進行治療，並且其中佔腫瘤樣品之約1%或更多之腫瘤浸潤免疫細胞中PD-L1之可偵測的表現水準將患者鑑別為可能對用抗癌療法之治療有反應。在一些實施例中，套組進一步包括PD-1軸結合拮抗劑及/或紫杉烷。
在另一實例中，本發明提供一種用於治療可能對用抗癌療法之治療有反應的患有局部晚期或轉移性乳癌(例如，局部晚期或轉移性TNBC)之患者的套組，該抗癌療法包含(i) PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑)及(ii)紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)，該套組包括以下中之一或多者：(i) PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑)及(ii)紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)；及基於佔獲自患者之腫瘤樣品之約1%或更多之腫瘤浸潤免疫細胞中PD-L1之可偵測的表現水準向患者投與抗癌療法的說明書。在一些實施例中，套組包括用於確定PD-L1、CD8、或sTIL中之一或多者之存在或表現水準的試劑。
在進一步實例中，本發明提供一種用於鑑別可能對用抗癌療法之治療有反應的患有局部晚期或轉移性乳癌(例如，局部晚期或轉移性TNBC)之患者的套組，該抗癌療法包含(i) PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑)及(ii)紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)，該套組包括用於確定獲自患者之腫瘤樣品之細胞中之PD-L1之表現水準的一或多種試劑，其中患者先前未針對TNBC進行治療，並且其中腫瘤樣品中之約1%或更多之腫瘤細胞中之PD-L1之可偵測的表現水準將患者鑑別為可能對用抗癌療法之治療有反應。在一些實施例中，套組進一步包括PD-1軸結合拮抗劑及/或紫杉烷。
在另一實例中，本發明提供一種用於治療可能對用抗癌療法之治療有反應的患有局部晚期或轉移性乳癌(例如，局部晚期或轉移性TNBC)之患者的套組，該抗癌療法包含(i) PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑)及(ii)紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)，該套組包括以下中之一或多者：(i) PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑)及(ii)紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)；及基於獲自患者之腫瘤樣品中之約1%或更多之腫瘤細胞中PD-L1之可偵測的表現水準向患者投與抗癌療法的說明書。在一些實施例中，套組包括用於確定PD-L1、CD8、或sTIL中之一或多者之存在或表現水準的試劑。
在進一步實例中，本發明提供一種用於鑑別可能對用抗癌療法之治療有反應的患有局部晚期或轉移性乳癌(例如，局部晚期或轉移性TNBC)之患者的套組，該抗癌療法包含(i) PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體(例如，阿特珠單抗)及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑)及(ii)紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)，該套組包括用於確定獲自患者之腫瘤樣品之腫瘤浸潤免疫細胞中CD8之表現水準的一或多種試劑，其中患者先前未針對TNBC進行治療，並且其中佔腫瘤樣品之約0.5%或更多之腫瘤浸潤免疫細胞中CD8之可偵測的表現水準將患者鑑別為可能對用抗癌療法之治療有反應。在一些實施例中，套組進一步包括PD-1軸結合拮抗劑及/或紫杉烷。
在另一實例中，本發明提供一種用於治療可能對用抗癌療法之治療有反應的患有局部晚期或轉移性乳癌(例如，局部晚期或轉移性TNBC)之患者的套組，該抗癌療法包含(i) PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑)及(ii)紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)，該套組包括以下中之一或多者：(i) PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑)及(ii)紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)；及基於佔獲自患者之腫瘤樣品之約0.5%或更多之腫瘤浸潤免疫細胞中CD8之可偵測的表現水準向患者投與抗癌療法的說明書。在一些實施例中，套組包括用於確定PD-L1、CD8、或sTIL中之一或多者之存在或表現水準的試劑。
在進一步實例中，本發明提供一種用於鑑別可能對用抗癌療法之治療有反應的患有局部晚期或轉移性乳癌(例如，局部晚期或轉移性TNBC)之患者的套組，該抗癌療法包含(i) PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑)及(ii)紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)，該套組包括用於確定獲自患者之腫瘤樣品中sTIL之百分比的一或多種試劑，其中患者先前未針對TNBC進行治療，並且其中腫瘤樣品之約5%或更多之sTIL之百分比將患者鑑別為可能對使用抗癌療法之治療有反應。在一些實施例中，套組進一步包括PD-1軸結合拮抗劑及/或紫杉烷。
在另一實例中，本發明提供一種用於治療可能對用抗癌療法之治療有反應的患有局部晚期或轉移性乳癌(例如，局部晚期或轉移性TNBC)之患者的套組，該抗癌療法包含(i) PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑)及(ii)紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)，該套組包括以下中之一或多者：(i) PD-1軸結合拮抗劑(例如，選自抗PD-L1抗體及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑)及(ii)紫杉烷(例如，nab-太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇)；及基於獲自患者之腫瘤樣品之約5%或更多之sTIL之百分比向患者投與抗癌療法的說明書。在一些實施例中，套組包括用於確定PD-L1、CD8、或sTIL中之一或多者之存在或表現水準的試劑。
在前述套組中之任一者中，抗PD-L1抗體可為阿特珠單抗。
在前述套組中之任一者中，紫杉烷可為nab-太平洋紫杉醇。
在前述套組中之任一者中，紫杉烷可為太平洋紫杉醇。
在前述套組中任一者之一些實施例中，患者是否可能對用該抗癌療法之治療有反應係依據無進展存活來確定。
在前述套組中任一者之其他實施例中，患者是否可能對用該抗癌療法之治療有反應係依據總體存活來確定。
認爲前述書面說明係足以能夠使熟習此項技術者來實踐本發明。除本文中所顯示及所描述之實例外，熟習此項技藝者將根據前文之描述明顯瞭解本發明之各種修飾，且其屬於所附申請專利範圍之範疇內。實例
本發明將藉由參考以下實例來更充分理解。然而，其不應被理解為限制本發明之範疇。應瞭解，本文所述的實例和實施例僅用於例示性目的，並且建議本領域的技術人員根據其進行各種修改或變化，並且它們將包括在本申請的精神和權限以及所附權利要求書的範圍內。 實例 1 ：用抗 PD-L1 抗體及 nab- 太平洋紫杉醇 (ABRAXANE®) 之組合治療在針對患有轉移性三陰性乳癌 (mTNBC) 之患者之 Ib 期臨床試驗中達成反應
轉移性三陰性乳癌(mTNBC)與不良預後相關並且特徵在於突變率高、腫瘤浸潤淋巴球水準增加、及PD-L1表現水準高。MPDL3280A為人源化單株抗體，其可藉由抑制PD-L1結合至PD-1來恢復腫瘤特異性T細胞免疫性並且在mTNBC中作為單一療法展示持久的反應。此研究為在患有mTNBC之患者中的檢查點抑制劑與化學療法之首次組合試驗。方法
此組多中心、多臂Ib期研究評估在患有mTNBC之患者中與每週nab-太平洋紫杉醇組合之MPDL3280A。主要終點為安全性及耐受性，並且次要終點為PK及臨床活性。關鍵合格標準包括可量測的疾病；0或1之美國東岸癌症臨床研究合作組織(Eastern Cooperative Oncology Group；ECOG)體能狀態；及≤2個先前細胞毒性方案。在4週之週期中，患者每兩週(在第1天及第15天)接受800 mg阿特珠單抗一次，並且每週(在第1天、第8天、及第15天)接受125 mg/m2 nab-太平洋紫杉醇持續三週，直到喪失臨床益處。若nab-太平洋紫杉醇由於毒性而停止，則MPDL3280A可作為單一療法繼續。藉由實體腫瘤反應評估標準(Response Evaluation Criteria In Solid Tumors；RECIST) v1.1評估ORR。基於免疫組織化學(IHC)檢定中腫瘤細胞及腫瘤浸潤免疫細胞上之PD-L1染色，PD-L1表現以4個診斷水準進行評分。結果
十一名患者為可評估安全性的。所有患者均為女性，中位年齡為58歲(年齡範圍：32-75)。未觀察到意外或劑量限制性毒性。安全性隨訪之中位持續時間為88天(範圍：27-182天)。可評估功效之群體由具有≥1次掃描及≥3個月隨訪之5名患者組成。在五名患者中，四名患者顯示部分反應(PR)並且一名患者顯示穩定疾病(SD)。所觀察到的結果指示MPDL3280A及nab-太平洋紫杉醇之組合在患有mTNBC之患者中為安全且有效的。實例 2 ：作為針對患有 mTNBC 之患者之第一線療法的抗 PD-L1 抗體及 nab- 太平洋紫杉醇 (ABRAXANE®) 之組合治療方案
作為替代方案，MPDL3280A及nab-太平洋紫杉醇之組合治療方案可充當針對患有mTNBC之患者之第一線療法。
可將患有組織學上證明之局部晚期或轉移性TNBC；先前沒有針對晚期TNBC之全身治療；ECOG體能狀態為0或1；且具有根據RECIST v1.1之可量測疾病的患者在第1天及第15天給藥MPDL3280A (840 mg)，加上在第1天、第8天、及第15天給藥nab-太平洋紫杉醇(100 mg/m2 )。所有治療在28天週期中給予。可藉由肝轉移之存在、先前紫杉烷療法、及可藉由IHC來集中評估之腫瘤浸潤免疫細胞之PD-L1狀態(IC0相對於IC1/2/3)來對患者進行分級。為了擷取假性進展及延遲的對MPDL3280A之反應，具有放射學進展之患者可繼續接受單獨的或與nab-太平洋紫杉醇的開放標籤MPDL3280A直到出現不可接受的毒性或喪失臨床益處為止。實例 3 ：腫瘤浸潤免疫細胞 (IC) 中之 PD-L1 表現預測作為針對患有局部晚期或轉移性 TNBC 之患者之第一線療法的用抗 PD-L1 抗體阿特珠單抗及 nab- 太平洋紫杉醇 (ABRAXANE®) 之組合治療之功效
III期IMpassion130研究(NCT02425891)評估作為針對患有局部晚期或轉移性TNBC之患者之第一線治療的阿特珠單抗(抗PD-L1)+nab-太平洋紫杉醇(nabPx)相對於安慰劑+nabPx。在治療意向(ITT)患者中以及在腫瘤浸潤免疫細胞上PD-L1≥1% (IC+)之患者中，研究滿足其共同主要PFS終點。在期中OS分析中，尤其在患有PD-L1 IC+腫瘤之患者中發現臨床上有意義的OS益處(表4)。此實例描述在免疫學及臨床相關的生物標記物定義之亞組中的功效資料。方法
患者患有組織學上證明之轉移性或不可切除的局部晚期TNBC (根據美國臨床腫瘤學會/美國病理醫師學院(ASCO-CAP)來局部評估)。將患者1:1隨機分組至nabPx 100 mg/m2 IV (28天週期之第1天、第8天、及第15天)+阿特珠單抗840 mg IV (A-nabPx) q2w或安慰劑(P-nabPx)直到出現進展或毒性為止。集中分析以下生物標記物：使用VENTANA SP142 IHC檢定來分析腫瘤浸潤免疫細胞(IC)及腫瘤細胞(TC)上之PD-L1、藉由IHC來分析腫瘤內CD8、基質腫瘤浸潤淋巴球(sTIL)、及ER/PR/HER2狀態。VENTANA SP142 IHC檢定係根據製造商說明書來執行。IC及TC IHC診斷標準分別描述於表4及5中。亦參見國際專利申請公開案第WO 2016/183326號及WO 2016/196298，例如在實例1中。CD8 IHC係以覆蓋腫瘤中心面積的CD8免疫染色的百分比之形式進行評估(參見，例如，Emens等人 JAMA Oncology doi:10.1001/jamaoncol.2018.4224, 2018)。在Histogenex根據Salgado等人Annals of Oncology , 26(2):259-271, 2015評估蘇木精及伊紅(H&E)染色之腫瘤載片中之sTIL。表 4. 腫瘤浸潤免疫細胞 (IC) IHC 診斷標準
PD-L1 診斷評估 IC 評分
不存在任何可辨別的PD-L1染色 或 在覆蓋由腫瘤細胞、相關腫瘤內基質、及連續腫瘤周圍促結締組織增生性基質佔據之腫瘤面積之＜1%的腫瘤浸潤免疫細胞中存在任何強度之可辨別的PD-L1染色 IC0
在覆蓋由腫瘤細胞、相關腫瘤內基質、及連續腫瘤周圍促結締組織增生性基質佔據之腫瘤面積之≥1%至＜5%的腫瘤浸潤免疫細胞中存在任何強度之可辨別的PD-L1染色 IC1
在覆蓋由腫瘤細胞、相關腫瘤內基質、及連續腫瘤周圍促結締組織增生性基質佔據之腫瘤面積之≥5%至＜10%的腫瘤浸潤免疫細胞中存在任何強度之可辨別的PD-L1染色 IC2
在覆蓋由腫瘤細胞、相關腫瘤內基質、及連續腫瘤周圍促結締組織增生性基質佔據之腫瘤面積之≥10%的腫瘤浸潤免疫細胞中存在任何強度之可辨別的PD-L1染色 IC3
表 5. 腫瘤細胞 (TC) IHC 診斷標準
PD-L1 診斷評估 TC 評分
不存在任何可辨別的PD-L1染色 或 在腫瘤細胞之＜1%中存在任何強度之可辨別的PD-L1染色 TC0
在腫瘤細胞之≥1%至＜5%中存在任何強度之可辨別的PD-L1染色 TC1
在腫瘤細胞之≥5%至＜50%中存在任何強度之可辨別的PD-L1染色 TC2
在腫瘤細胞之≥50%中存在任何強度之可辨別的PD-L1染色 TC3
結果
PD-L1 IC高度預測A-nabPx功效(表6)。大部分PD-L1 TC+腫瘤亦為PD-L1 IC+。腫瘤內CD8而不是sTIL與PD-L1 IC良好相關。因此，CD8預測針對PFS/OS之A-nabPx功效，而sTIL僅預測PFS益處。在大多數患者中，當地相對於中央TNBC評估為一致的。當地相對於中央實驗室定義之TNBC群體由A-nabPx得到相似益處。PD-L1 IC之預測度係藉由針對PD-L1狀態之PFS及OS評估之相互作用分析中的統計意義性(p＜0.05)來展示(表7)。在表7中，如下使用Cox迴歸模型：事件發生時間(INV-PFS或OS) = 治療(阿特珠單抗相對於安慰劑) + PD-L1狀態(IC 0相對於IC 1/2/3) + 相互作用(治療 x PD-L1狀態)。結論
此等資料表明在為了選擇受益於阿特珠單抗及nab-太平洋紫杉醇之組合的先前未治療之局部晚期或轉移性TNBC患者進行評估之生物標記物中，PD-L1 IC狀態為最穩健的預測生物標記物。PD-L1 IC狀態可用於鑑別可能對用抗癌療法之治療有反應的患者，該抗癌療法包含選自抗PD-L1抗體及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑及nab-太平洋紫杉醇。IMpassion130之探索性功效分析亦表明當地及中央ER/PR/HER2測試之間之一致性。表 6. Impassion130 III 期臨床試驗之結果
群體 A-nabPx P-nabPx
原始資料，經分級
ITT，n 451 451
mPFS (95% CI)，mo 7.2 (5.6-7.5) 5.5 (5.3-5.6)
PFS HR (95% CI) 0.80 (0.69-0.92)；P =0.0025
mOS (95% CI)，mo 21.3 (17.3-23.4) 17.6 (15.9-20.0)
OS HR (95% CI) 0.84 (0.69-1.02)；P =0.0840
PD-L1 IC+，n (%) 185 (41%) 184 (41%)
mPFS (95% CI)，mo 7.5 (6.7-9.2) 5.0 (3.8-5.6)
PFS HR (95% CI) 0.62 (0.49-0.78)；P ＜0.0001
mOS (95% CI) mo 25.0 (22.6-NE) 15.5 (13.1-19.4)
OS HR (95% CI) 0.62 (0.45-0.86)a
探索性/生物標記物資料，未分級
PD-L1 TC可評估，n 449 451
PD-L1 TC+，n (%) 38 (8%) 40 (9%)
PFS HR (95% CI) 0.51 (0.31-0.84)
OS HR (95% CI) 0.63 (0.33-1.21)
CD8可評估，n 371 349
CD8 ≥0.5%，n (%) 261 (70%) 239 (68%)
PFS HR (95% CI) 0.74 (0.61-0.91)
OS HR (95% CI) 0.66 (0.50-0.88)
sTIL可評估，n 448 444
sTIL ≥5%，n (%) 282 (63%) 272 (61%)
PFS HR (95% CI) 0.76 (0.63-0.92)
OS HR (95% CI) 0.83 (0.64-1.08)
cTNBC可評估，n 420 412
cTNBC ITT，n (%) 307 (73%) 317 (77%)
PFS HR (95% CI) 0.81 (0.68-0.98)
OS HR (95% CI) 0.85 (0.67-1.08)
cTNBC PD-L1 IC+，n (%) 133 (43%) 134 (42%)
PFS HR (95% CI) 0.67 (0.51-0.88)
OS HR (95% CI) 0.69 (0.47-1.00)
資料截止：2018年4月17日(12.9個月中位隨訪)。 cTNBC，集中確認之TNBC TC/IC+，PD-L1 ≥1% (VENTANA SP142檢定)a 未按照階層式研究設計進行正式測試。
表 7. PD-L1 IC 預測度
相互作用(治療 x PD-L1狀態) p-值
研究者評估之無進展存活 0.0055
總體存活 0.0178
實例 4 ： IMpassion130 ：在先前未治療之局部晚期或轉移性三陰性乳癌 (mTNBC) 中阿特珠單抗 +nab- 太平洋紫杉醇之整體、隨機化、雙盲、安慰劑 - 對照、 III 期研究的更新總體存活 (OS)
如實例3中所述，IMpassion130評估第一線mTNBC中、抗PD-L1抗體阿特珠單抗(atezo)+nab-太平洋紫杉醇(nP)相對於安慰劑+nP。初步PFS分析發現atezo+nP相對於安慰劑+nP在治療意向(ITT)及PD-L1+患者中顯著改良PFS，其中功效係藉由PD-L1+群體來推動。此時，進行第一期中OS分析。在此實例中，報道第二期中OS分析。方法
如實例3中所述，合格患者具有組織學上證明之mTNBC、ECOG PS 0-1、及腫瘤組織以供PD-L1測試。將患者1:1隨機分組至各28天週期之第1天及第15天之IV atezo 840 mg或安慰劑 + 第1天、第8天、及第15天之nP 100 mg/m2 直到出現進展為止(分級因素：先前紫杉烷、肝轉移、腫瘤浸潤免疫細胞[IC]上之PD-L1)。RECIST 1.1 PFS (在ITT及PD-L1+患者中)及OS (在ITT中，並且若顯著，則在PD-L1+患者中進行測試)為共同主要終點。結果
OS資料展示於表8中。截至資料截止日期(2019年1月2日)，atezo + nP組中之9%患者及安慰劑 + nP組中之3%患者仍然在治療中。在用atezo + nP (25.0個月)之PD-L1+患者中觀察到相對於安慰劑+nP (18.0個月；HR，0.71 [95% CI：0.54，0.94])之中位OS之7.0個月改良。4.5個月安全性更新顯示安全性概況仍為可耐受的。表 8. IMpassion130 之第二期中 OS 分析之結果
Atezo + nP 安慰劑 + nP
ITT 群體 (事件/患者，n/n [%]) 255/451 (57%) 279/451 (62%)
HR (95% CI)；對數-等級P 0.86 (0.72, 1.02)；0.078a ―
中位OS (95% CI)，mo 21.0 (19.0, 22.6) 18.7 (16.9, 20.3)
2年OS (95% CI)，% 42 (37, 47) 39 (34, 44)
中位隨訪持續時間，mo 18.5 17.5
PD-L1+ 群體b (事件/患者，n/n [%]) 94/185 (51%) 110/184 (60%)
HR (95% CI) 0.71 (0.54, 0.94) ―
中位OS (95% CI)，mo 25.0 (19.6, 30.7) 18.0 (13.6, 20.1)
2年OS (95% CI)，% 51 (43, 59) 37 (29, 45)
HR係根據經分級Cox模型來評估。a 不顯著。b IC上之PD-L1≥ 1% (VENTANA SP142檢定)。
PD-L1+及PD-L1-群體中之總體存活之比較展示於表9中。表 9. PD-L1+ 及 PD-L1 - 群體中之 OS 之比較
群體 中值OS HR (95% CI)
A +nab -P P +nab -P
PD-L1 IC+ 25.0 mo 18.0 mo 0.71 (0.54, 0.94)
PD-L1 IC- 19.7 mo 19.6 mo 0.97 (0.78, 1.20)
結論
第二IMpassion130期中OS分析與第一分析一致，確認在先前未治療PD-L1+ mTNBC中阿特珠單抗+nP之臨床上有意義的OS益處。
PD-L1 IC狀態預測使用阿特珠單抗+nab-太平洋紫杉醇之臨床益處。實例 5 ： IMpassion131 ，作為針對不宜動手術的局部晚期 / 轉移性三陰性乳癌 (mTNBC) 之第一線療法之太平洋紫杉醇 ± 阿特珠單抗之雙盲安慰劑 - 對照隨機化 III 期試驗
在隨機化III期IMpassion130試驗中，針對mTNBC將阿特珠單抗與第一線nab-太平洋紫杉醇組合顯著改良無進展存活(PFS)。在患有PD-L1陽性腫瘤之患者中，存在更顯著PFS改良及對於總體存活(OS；共同主要終點)之臨床上有意義的效應。IMpassion131試驗(NCT03125902)評估針對mTNBC之太平洋紫杉醇組合之第一線阿特珠單抗。方法
在此整體雙盲安慰劑-對照隨機化III期試驗中，合格患者患有不宜動手術的可量測局部晚期/轉移性集中確認TNBC，適合於紫杉烷單一療法，並且先前未針對mTNBC接受化學療法或靶向全身療法。若先前(新)輔助化學療法在隨機分組之前≥12個月完成，則允許此類化學療法。將患者2:1隨機分組至q28d第1天及第15天之阿特珠單抗840 mg或安慰劑，兩者均與q28d第1天、第8天、及第15天之太平洋紫杉醇90 mg/m2 一起給予，直到出現疾病進展或不可接受的毒性為止。所有患者在太平洋紫杉醇之前接受標準皮質類固醇前驅用藥(premedication)。分級因素為腫瘤PD-L1狀態(IC0[免疫細胞表現＜1%]相對於IC1/2/3 [≥1%表現]，藉由VENTANASP142檢定來集中測試並且保持盲式)、先前紫杉烷療法、存在肝轉移、及地理區域。主要終點為研究者評估之PFS，其在PD-L1+群體(IC1/2/3)中然後在治療意向(ITT)群體中經階層式測試。分析計劃由IMpassion130之實驗結果提供資訊並且針對主要PFS分析經事件驅動。次要終點包括OS、整體健康狀態/健康相關生活品質之退化時間、12個月PFS率、客觀反應率、反應持續時間、臨床受益率、及安全性。其他實施例
本文所述之技術之一些實施例可根據以下編號實施例中之任一項來定義： 1. 一種用於鑑別可能對用抗癌療法之治療有反應的患有局部晚期或轉移性三陰性乳癌(TNBC)之患者的方法，該抗癌療法包含(i)選自抗PD-L1抗體及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑及(ii) nab-太平洋紫杉醇，該方法包括確定獲自該患者之腫瘤樣品之腫瘤浸潤免疫細胞中PD-L1之表現水準，其中該患者先前未針對該TNBC進行治療，並且其中佔該腫瘤樣品之約1%或更多之腫瘤浸潤免疫細胞中PD-L1之可偵測的表現水準將該患者鑑別為可能對用該抗癌療法之治療有反應。 2. 一種用於為患有局部晚期或轉移性TNBC之患者選擇抗癌療法之方法，該方法包括： (a) 確定獲自該患者之腫瘤樣品之腫瘤浸潤免疫細胞中PD-L1之表現水準，其中該患者先前未針對該TNBC進行治療；及 (b) 基於佔該腫瘤樣品之約1%或更多之腫瘤浸潤免疫細胞中PD-L1之可偵測的表現水準，為該患者選擇抗癌療法，該抗癌療法包含(i)選自抗PD-L1抗體及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑及(ii) nab-太平洋紫杉醇。 3. 如實施例1或2之方法，其中獲自該患者之該腫瘤樣品在佔(i)該腫瘤樣品之約5%或更多或(ii)或該腫瘤樣品之約10%或更多的腫瘤浸潤免疫細胞中具有可偵測的表現水準之PD-L1。 4. 如實施例1-3中任一項之方法，其中該患者先前未接受針對不宜動手術的局部晚期或轉移性TNBC的化學療法或靶向全身療法。 5. 如實施例1-4中任一項之方法，其中該局部晚期TNBC為不可切除的。 6. 如實施例1-5中任一項之方法，其中該腫瘤樣品為福馬林固定且石蠟包埋(FFPE)的腫瘤樣品、檔案腫瘤樣品、新鮮腫瘤樣品或冷凍腫瘤樣品。 7. 如實施例1-6中任一項之方法，其中PD-L1之表現水準為蛋白表現水準。 8. 如實施例7之方法，其中PD-L1之該蛋白表現水準係使用免疫組織化學(IHC)、免疫螢光、流動式細胞測量術或西方墨點法確定。 9. 如實施例8之方法，其中PD-L1之該蛋白表現水準係使用IHC確定。 10. 如實施例8或9之方法，其中PD-L1之該蛋白表現水準係使用抗PD-L1抗體偵測。 11. 如實施例10之方法，其中該抗PD-L1抗體為SP142。 12. 如實施例1-11中任一項之方法，其進一步包括向該患者投與有效量之該抗癌療法。 13. 如實施例1-12中任一項之方法，其中該人類PD-1軸結合拮抗劑為阿特珠單抗。 14. 如實施例1-13中任一項之方法，其中該患者是否可能對用該抗癌療法之治療有反應係依據無進展存活來確定。 15. 如實施例1-14中任一項之方法，其中該患者是否可能對用該抗癌療法之治療有反應係依據總體存活來確定。 16. 一種治療患有局部晚期或轉移性TNBC之患者的方法，該方法包括向該患者投與有效量之抗癌療法，該抗癌療法包含(i)選自抗PD-L1抗體及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑及(ii) nab-太平洋紫杉醇，其中該患者先前未針對該TNBC進行治療，並且其中基於佔獲自該患者之腫瘤樣品之約1%或更多之腫瘤浸潤免疫細胞中PD-L1之可偵測的表現水準，該患者經鑑別為可能對該抗癌療法有反應。 17. 如實施例16之方法，其中該人類PD-1軸結合拮抗劑為阿特珠單抗。 18. 一種用於治療經診斷患有局部晚期或轉移性TNBC之患者的包含選自抗PD-L1抗體及抗PD-1抗體之人類PD-1軸結合拮抗劑之醫藥組成物，其中該治療包含投與該人類PD-1軸結合拮抗劑以及nab-太平洋紫杉醇，並且其中基於佔獲自該患者之腫瘤樣品之約1%或更多之腫瘤浸潤免疫細胞中PD-L1之可偵測的表現水準，該患者經鑑別為可能對包含該人類PD-1軸結合拮抗劑及nab-太平洋紫杉醇之抗癌療法有反應。 19. 如實施例18之醫藥組成物，其中該人類PD-1軸結合拮抗劑為阿特珠單抗。
雖然前述發明出於理解清楚之目的經由說明及實例較詳細地描述，但該等描述及實例不應被視為限制本發明之範圍。本文所引用之所有專利及科學文獻的揭示內容明確地以引用之方式整體倂入。
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Claims (25)

  1. 一種用於鑑別可能對用抗癌療法之治療有反應的患有局部晚期或轉移性三陰性乳癌(TNBC)之患者的方法，該抗癌療法包含(i)阿特珠單抗(atezolizumab)及(ii)nab-太平洋紫杉醇(nab-paclitaxel)，該方法包括確定獲自該患者之腫瘤樣品之腫瘤浸潤免疫細胞中PD-L1之表現水準，其中該患者先前未針對該TNBC進行治療，並且其中佔該腫瘤樣品之約1%或更多之腫瘤浸潤免疫細胞中PD-L1之可偵測的表現水準將該患者鑑別為可能對用該抗癌療法之治療有反應。
  2. 一種用於為患有局部晚期或轉移性TNBC之患者選擇抗癌療法之方法，該方法包括：(a)確定獲自該患者之腫瘤樣品之腫瘤浸潤免疫細胞中PD-L1之表現水準，其中該患者先前未針對該TNBC進行治療；及(b)基於佔該腫瘤樣品之約1%或更多之腫瘤浸潤免疫細胞中PD-L1之可偵測的表現水準，為該患者選擇抗癌療法，該抗癌療法包含(i)阿特珠單抗及(ii)nab-太平洋紫杉醇，其中佔該腫瘤樣品之約1%或更多之腫瘤浸潤免疫細胞中，PD-L1之可偵測的表現水準鑑別該患者為可能對用該抗癌療法之治療有反應。
  3. 如請求項1或2之方法，其中獲自該患者之該腫瘤樣品在佔(i)該腫瘤樣品之約5%或更多或(ii)該腫瘤樣品之約10%或更多的腫瘤浸潤免疫細胞中具有PD-L1之可偵測的表現水準。
  4. 如請求項1或2之方法，其中該患者先前未接受針對不宜動手術的局部晚期或轉移性TNBC的化學療法或靶向全身療法。
  5. 如請求項1或2之方法，其中該局部晚期TNBC為不可切除的。
  6. 如請求項1或2之方法，其中該腫瘤樣品為福馬林固定且石蠟包埋(formalin-fixed and paraffin-embedded，FFPE)的腫瘤樣品、檔案腫瘤樣品、新鮮腫瘤樣品或冷凍腫瘤樣品。
  7. 如請求項1或2之方法，其中PD-L1之該表現水準為蛋白表現水準。
  8. 如請求項7之方法，其中PD-L1之該蛋白表現水準係使用免疫組織化學(IHC)、免疫螢光、流動式細胞測量術或西方墨點法確定。
  9. 如請求項8之方法，其中PD-L1之該蛋白表現水準係使用IHC確定。
  10. 如請求項8之方法，其中PD-L1之該蛋白表現水準係使用抗PD-L1抗體偵測。
  11. 如請求項10之方法，其中該抗PD-L1抗體為SP142。
  12. 如請求項1或2之方法，其中該患者是否可能對用該抗癌療法之治療有反應係依據無進展存活來確定。
  13. 如請求項1或2之方法，其中該患者是否可能對用該抗癌療法之治療有反應係依據總體存活來確定。
  14. 一種阿特珠單抗之用途，其係用於製備治療經診斷患有局部晚期或轉移性TNBC之患者的醫藥品，其中該醫藥品係經調配用於與nab-太平洋紫杉醇共同投與，並且其中基於具有佔獲自該患者之腫瘤樣品之約1%或更多之腫瘤浸潤免疫細胞中PD-L1之可偵測的表現水準，該患者經鑑別為可能對包含阿特珠單抗及nab-太平洋紫杉醇之抗癌療法有反應。
  15. 如請求項14之用途，其中獲自該患者之該腫瘤樣品在佔(i)該腫瘤樣品之約5%或更多或(ii)該腫瘤樣品之約10%或更多的腫瘤浸潤免疫細胞 中具有PD-L1之可偵測的表現水準。
  16. 如請求項14之用途，其中該患者先前未接受針對不宜動手術的局部晚期或轉移性TNBC的化學療法或靶向全身療法。
  17. 如請求項14之用途，其中該局部晚期TNBC為不可切除的。
  18. 如請求項14之用途，其中該腫瘤樣品為福馬林固定且石蠟包埋(formalin-fixed and paraffin-embedded，FFPE)的腫瘤樣品、保存的腫瘤樣品(archival tumor sample)、新鮮腫瘤樣品或冷凍腫瘤樣品。
  19. 如請求項14至18中任一項之用途，其中PD-L1之該表現水準為蛋白表現水準。
  20. 如請求項19之用途，其中PD-L1之該蛋白表現水準係使用免疫組織化學(IHC)、免疫螢光、流動式細胞測量術或西方墨點法確定。
  21. 如請求項20之用途，其中PD-L1之該蛋白表現水準係使用IHC確定。
  22. 如請求項20之用途，其中PD-L1之該蛋白表現水準係使用抗PD-L1抗體偵測。
  23. 如請求項22之用途，其中該抗PD-L1抗體為SP142。
  24. 如請求項14之用途，其中該患者是否可能對用該抗癌療法之治療有反應係依據無進展存活來確定。
  25. 如請求項14之用途，其中該患者是否可能對用該抗癌療法之治療有反應係依據總體存活來確定。
TW108134025A 2018-09-21 2019-09-20 三陰性乳癌之診斷及治療方法 TWI850259B (zh)

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* Cited by examiner, † Cited by third party
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CN107771076A (zh) 2015-06-17 2018-03-06 豪夫迈·罗氏有限公司 使用pd‑1轴结合拮抗剂和紫杉烷治疗局部晚期或转移性乳腺癌的方法

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CN107771076A (zh) 2015-06-17 2018-03-06 豪夫迈·罗氏有限公司 使用pd‑1轴结合拮抗剂和紫杉烷治疗局部晚期或转移性乳腺癌的方法

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