TWI780045B - 抗體、醫藥組合物及方法 - Google Patents

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Abstract

本發明係揭示包含結合至階段特異性胚胎抗原4 （SSEA-4）之抗體或其抗原結合片段之醫藥組合物，以及使用其之方法。使用方法包括但不侷限於，癌症治療及診斷。本發明抗體可結合至特定癌細胞表面。本發明所揭示抗體之示例性標靶可包括癌，如乳癌、肺癌、食道癌、直腸癌、膽道癌、肝癌、頰癌、胃癌、大腸癌、鼻咽癌、腎癌、前列腺癌、卵巢癌、子宮頸癌、子宮內膜癌、胰腺癌、睾丸癌、膀胱癌、頭頸癌、口腔癌、神經內分泌癌、腎上腺癌、甲狀腺癌、骨癌、皮膚癌、基底細胞癌、鱗狀細胞癌、黑色素瘤及/或腦腫瘤。

Description

抗體、醫藥組合物及方法
本發明之揭示係有關醣類抗原之抗體及其結合片段，以及編碼如抗體之核酸、互補核酸、多胜肽、載體、宿主細胞、及製造與使用其之方法，包括含有該抗體及/或結合片段之醫藥組合物。此外，提供用於投予一有效抑制癌細胞之量的抗體至個體之方法。本發明明確地揭示結合至階段特異性胚胎抗原4 （stage-specific embryonic antigen 4；SSEA-4）之抗體，以及相關組合物與使用方法。使用方法包括但不侷限於癌症治療及診斷。
有許多表面醣類表現於惡性腫瘤細胞。舉例而言，Globo H顯示過量表現於多個上皮癌症，且與乳癌和小細胞肺癌之腫瘤侵襲性和預後不良相關聯。先前研究顯示，於乳癌細胞與乳癌幹細胞觀察到Globo H與階段特異性胚胎抗原3 （SSEA-3，亦稱作Gb5）（WW Chang et al. "Expression of Globo H and SSEA3 in breast cancer stem cells and the involvement of fucosyl transferases 1 and 2 in Globo H synthesis.” PNAS, 105（33）: 11667-11672, 2008）。這些結果支持了發展針對腫瘤相關聯醣類抗原之抗體的理論基礎，係因在癌症的有效治療及/或預防上仍有醫療未滿足的需求。鑑定有關及/或預測癌症之聚醣標記（glycan markers），及開發抗該等標記之抗體以用於診斷及治療廣範圍之癌症。
本發明基於發現階段特異性胚胎抗原4 (SSEA-4)係大量表現於大範圍之癌症，而非正常細胞。表現SSEA-4之癌症包括但不侷限於，乳癌、肺癌、食道癌、直腸癌、膽道癌、肝癌、頰癌、胃癌、大腸癌、鼻咽癌、腎癌、前列腺癌、卵巢癌、子宮頸癌、子宮內膜癌、胰腺癌、睾丸癌、膀胱癌、頭頸癌、口腔癌、神經內分泌癌、腎上腺癌、甲狀腺癌、骨癌、皮膚癌、基底細胞癌、鱗狀細胞癌、黑色素瘤或腦腫瘤。
在一方面，本發明之特徵為特異於SSEA-4之抗體或其結合片段。抗SSEA-4抗體結合至Neu5Acα2→ 3Galβ1→ 3GalNAcβ1→ 3Galα1→ 4Galβ1→ 4Glcβ1。
在特定方面，本發明提供稱為1J1s （美國菌種保存中心（ATCC）寄存號碼PTA-122679所保存）、1G1s（ ATCC寄存號碼PTA-122678所保存）、2F20s（ ATCC寄存號碼PTA-122676所保存）的融合瘤殖株，以及自其產生之抗體或抗原結合片段。
在一方面，本發明提供一抗體或其抗原結合片段，其包含：一重鏈可變區（VH），其包含一胺基酸序列，其中至少約80%序列同源於SEQ ID NO: 3所示之胺基酸序列其與SEQ ID NO: 3所示之胺基酸序列具有至少約80%的同源性，及/或一輕鏈可變區（VL），其包含一胺基酸序列，其與SEQ ID NO: 4所示之胺基酸序列具有至少約80%的同源性（表1）。於一些方面，重鏈可變區（VH）之胺基酸序列，其包含一胺基酸序列，其與SEQ ID NO: 22所示之胺基酸序列具有至少約80%的同源性，將涵蓋或排除自然存在之序列。在一些方面，輕鏈可變區（VL）之胺基酸序列，其包含一胺基酸序列，其與SEQ ID NO: 4所示之胺基酸序列具有至少約80%的同源性。
於特定具體實施例中，抗體或抗原結合片段進一步包含：H-CDR1、H-CDR2、及H-CDR3，其係分別選自於表1所示之（i）-（iii）： （i） H-CDR1係選自於SEQ ID NO:13； （ii） H-CDR2係選自於SEQ ID NO: 15； （iii） H-CDR3係選自於SEQ ID NO:17； 以及包含L-CDR1、L-CDR2、及L-CDR3，其係分別選自於（iv）-（vi）： （iv） L-CDR1係選自於SEQ ID NO: 6； （v） L-CDR2係選自於SEQ ID NO:8；以及 （vi）L-CDR3係選自於SEQ ID NO: 10。 於特定具體實施例中，抗體或其抗原結合片段包含一重鏈區，其中重鏈區包含一互補決定區（CDR）胺基酸序列，其與選自於SEQ ID NOs: 13、15或17之胺基酸序列具有至少約80%的序列同源性。於特定具體實施例中，抗體或其抗原結合片段包含一輕鏈區，其中輕鏈區包含一互補決定區（CDR）胺基酸序列，其與選自於SEQ ID NOs: 6、8或10之胺基酸序列具有至少約80%的序列同源性。於特定具體實施例中，抗體或抗原結合片段排除自然存在之序列。於特定具體實施例中，抗體或抗原結合片段涵蓋自然存在之序列。
在特定具體實施例中，抗體或抗原結合片段進一步包含：H-FW1、H-FW2、H- FW3、及H-FW4，其係分別選自於表1所示之（i）-（iv）： （i） H-FW1係選自於SEQ ID NO: 12； （ii） H-FW2係選自於SEQ ID NO: 14； （iii） H-FW3係選自於SEQ ID NO: 16； （iv） H-FW4係選自於SEQ ID NO: 18； 以及包含L-FW1、L-FW2、L-FW3、及L-FW4，其係分別選自於（v）-（viii）： （v） L-FW1係選自於SEQ ID NO: 5； （vi） L-FW2係選自於SEQ ID NO: 7； （vii） L-FW3係選自於SEQ ID NO: 9； （viii） L-FW4係選自於SEQ ID NO: 11。
在一方面，本發明提供一抗體或其抗原結合片段，其係由寄存於ATCC寄存號碼 PTA-122679下、稱為1J1s之融合瘤產生。
在一方面，本發明提供寄存於ATCC寄存號碼 PTA-122679下、稱為1J1s之融合瘤。
在特定方面，本發明提供一抗體或其抗原結合片段，其包含：一重鏈可變區（VH），其包含一胺基酸序列，其與SEQ ID NO: 21所示之胺基酸序列具有至少約80%的序列同源性，及/或一輕鏈可變區（VL），其包含一胺基酸序列，其與SEQ ID NO: 22所示之胺基酸序列具有至少約80%的同源性（表2）。在一些方面，重鏈可變區（VH）之胺基酸序列，其包含一胺基酸序列，其與SEQ ID NO: 21所示之胺基酸序列具有至少約80%的序列同源性，將涵蓋或排除自然存在之序列。在一些方面，輕鏈可變區（VL）之胺基酸序列，其包含一胺基酸序列，其與SEQ ID NO: 22所示之胺基酸序列具有至少約80%的同源性，將涵蓋或排除自然存在之序列。
於特定具體實施例中，抗體或抗原結合片段進一步包含H-CDR1、H-CDR2、及H-CDR3，其係分別選自於表2所示之（i）-（iii）： （i）H-CDR1係選自於SEQ ID NO:31； （ii）H-CDR2係選自於SEQ ID NO: 33； （iii） H-CDR3係選自於SEQ ID NO:35； 以及包含L-CDR1、L-CDR2、及L-CDR3，其係分別選自於（iv）-（vi）： （iv）L-CDR1係選自於SEQ ID NO: 24； （v） L-CDR2係選自於SEQ ID NO:26；以及 （vi） L-CDR3係選自於SEQ ID NO: 28。 於特定具體實施例中，抗體或其抗原結合片段包含一重鏈區，其中重鏈區包含一互補決定區（CDR）胺基酸序列，其與選自於SEQ ID NOs: 31、33、或35之胺基酸序列具有至少約80%的序列同源性。於特定具體實施例中，抗體或其抗原結合片段包含一輕鏈區，其中輕鏈區包含一互補決定區（CDR）胺基酸序列，其與選自於SEQ ID NOs: 24、26、或28之胺基酸序列具有至少約80%的序列同源性。於特定具體實施例中，抗體或抗原結合片段涵蓋或排除自然存在之序列。
於特定具體實施例中，抗體或抗原結合片段進一步包含：H-FW1、H-FW2、H- FW3、及H-FW4，其係分別選自於表2所示之（i）-（iv）： （i） H-FW1係選自於SEQ ID NO: 30； （ii） H-FW2係選自於SEQ ID NO: 32； （iii） H-FW3係選自於SEQ ID NO: 34； （iv） H-FW4係選自於SEQ ID NO: 36； 以及包含L-FW1、L-FW2、L-FW3、及L-FW4，其係分別選自於（v）-（viii）： （v） L-FW1係選自於SEQ ID NO: 23； （vi） L-FW2係選自於SEQ ID NO: 25； （vii） L-FW3係選自於SEQ ID NO: 27； （viii） L-FW4係選自於SEQ ID NO: 29。
在一方面，本發明提供一抗體或其抗原結合片段，其係由寄存於ATCC寄存號碼 PTA-122678下、稱為1G1s之融合瘤產生。
在一方面，本發明提供寄存於ATCC寄存號碼 PTA-122678下、稱為1G1s之融合瘤 。
在特定方面，本發明提供一抗體或其抗原結合片段，包含一重鏈可變區 （VH），其包含一胺基酸序列，其與SEQ ID NO: 39所示之胺基酸序列具有至少約80%的同源性，及/或一輕鏈可變區 （VL），其包含一胺基酸序列，其與SEQ ID NO: 40所示之胺基酸序列具有至少約80%的同源性（表3）。在一些方面，重鏈可變區 （VH）之胺基酸序列，其包含一胺基酸序列，其與SEQ ID NO: 39所示之胺基酸序列具有至少約80%的同源性，將涵蓋或排除自然存在之序列。在一些方面，輕鏈可變區 （VL）之胺基酸序列，其包含一胺基酸序列，其與SEQ ID NO: 40所示之胺基酸序列具有至少約80%的同源性，將涵蓋或排除自然存在之序列。
於特定具體實施例中，抗體或其抗原結合片段進一步包含 H-CDR1、H-CDR2、及H-CDR3，其係分別選自於表3所示之（i）-（iii）： （i） H-CDR1係選自於SEQ ID NO:49； （ii） H-CDR2係選自於SEQ ID NO: 51； （iii） H-CDR3係選自於SEQ ID NO:53； 以及包含L-CDR1、L-CDR2、及L-CDR3，其係分別選自於（iv）-（vi）： （iv） L-CDR1係選自於SEQ ID NO: 42； （v） L-CDR2係選自於SEQ ID NO:44；以及 （vi） L-CDR3係選自於SEQ ID NO: 46。 於特定具體實施例中，抗體或其抗原結合片段包含一重鏈區，其中重鏈區包含一互補決定區（CDR）胺基酸序列，其與選自於SEQ ID NOs: 49、51或53之胺基酸序列具有至少約80%的序列同源性。於特定具體實施例中，抗體或其抗原結合片段包含一輕鏈區，其中輕鏈區包含一互補決定區（CDR）胺基酸序列，其與選自於SEQ ID NOs: 42、44、或46之胺基酸序列具有至少約80%的序列同源性。於特定具體實施例中，抗體或抗原結合片段涵蓋或排除自然存在之序列。
於特定具體實施例中，抗體或抗原結合片段進一步包含：H-FW1、H-FW2、H- FW3、及H-FW4，其係分別選自於表3所示之（i）-（iv）： （i） H-FW1係選自於SEQ ID NO: 48； （ii） H-FW2係選自於SEQ ID NO: 50； （iii） H-FW3係選自於SEQ ID NO: 52； （iv） H-FW4係選自於SEQ ID NO: 54； 以及包含L-FW1、L-FW2、L-FW3、及L-FW4，其係分別選自於（v）-（viii）： （v） L-FW1係選自於SEQ ID NO: 41； （vi） L-FW2係選自於SEQ ID NO: 43； （vii） L-FW3係選自於SEQ ID NO: 45； （viii） L-FW4係選自於SEQ ID NO: 47。
在一方面，本發明提供一抗體或其抗原結合片段，其係由寄存於ATCC寄存號碼 PTA-122676下、稱為2F20s之融合瘤產生。
在一方面，本發明提供寄存於ATCC寄存號碼 PTA-122676下、稱為2F20s之融合瘤。
於特定具體實施例中，示例性抗體或其抗原結合片段包括可變區，其能結合至一或多個醣類抗原。
於特定具體實施例中，抗體或其抗原結合片段靶向醣類抗原SSEA-4 （Neu5Acα2→ 3Galβ1→ 3GalNAcβ1→ 3Galα1→ 4Galβ1→ 4Glcβ1）（SSEA-4六醣）。
在特定方面，本發明提供一抗體或其結合片段，其中抗體或其結合片段包含VH，其係選自於SEQ ID NO: 3、SEQ ID NO:21或SEQ ID NO:39，以及VL，其係選自於SEQ ID NO: 4、SEQ ID NO:22或SEQ ID NO:40。在一些方面，本發明提供一抗體或其抗原結合片段，其包含：一重鏈可變區 （VH），其包含一胺基酸序列，其與選自於SEQ ID NOs: 3、21、或39之胺基酸序列具有至少約80%的序列同源性，及/或一輕鏈可變區 （VL），其包含一胺基酸序列，其與選自於SEQ ID NOs: 4、22、或40之胺基酸序列具有至少約80%的序列同源性。在一些方面，抗體或其抗原結合片段可涵蓋或排除自然存在之序列。
於特定具體實施例中，抗體或其抗原結合片段係選自於：（a）整個免疫球蛋白分子； （b） scFv； （c）Fab片段； （d） F（ab'） 2；或者 （e）雙硫鍵連接之Fv。
於特定具體實施例中，抗體為人源化抗體。
於特定具體實施例中，抗體為IgG或IgM。
在一方面，本發明提供一醫藥組合物，其包含如請求項1至21中任一項之抗體或其抗原結合片段；以及至少一醫藥上可接受載體。
於特定具體實施例中，醫藥組合物進一步包含至少一附加之治療劑。
在一方面，本發明提供一抑制癌細胞增生之方法，其包含投予有需求之個體一有效量之示例性醫藥組合，其中癌細胞之增生係經抑制。
於特定具體實施例中，本發明提供在一個體中診斷癌症之方法。本方法包含投予有需求之個體一有效量之本發明所述示例性抗體。
於特定具體實施例中，癌症係選自於由乳癌、肺癌、食道癌、直腸癌、膽道癌、肝癌、頰癌、胃癌、大腸癌、鼻咽癌、腎癌、前列腺癌、卵巢癌、子宮頸癌、子宮內膜癌、胰腺癌、睾丸癌、膀胱癌、頭頸癌、口腔癌、神經內分泌癌、腎上腺癌、甲狀腺癌、骨癌、皮膚癌、基底細胞癌、鱗狀細胞癌、黑色素瘤或腦腫瘤組成之群組。
在一方面，本發明提供一將個體之癌症分期的方法，其包含： （a） 施加一或多個檢測SSEA-4表現之抗體至取自個體之細胞或組織樣本； （b）試驗一或多個抗體與細胞或組織樣本之結合； （c）比較與正常控制組之結合，以確定個體癌症之存在；以及 （d） 將疾病進展階段分類，其係基於比較相應抗體結合與正常基線指數之相對程度。
本發明之一或多個具體實施例將詳述如下。本發明之其他特徵及/或優勢將顯見於圖式、數個具體實施例之詳述、及申請專利範圍。
提供針對用於診斷與治療廣範圍癌症之標記的抗體方法及組合物。本發明開發及揭示抗SSEA-4抗體。使用方法包括但不侷限於，癌症治療及診斷。本文所述抗體可結合至廣範圍SSEA-4表現之癌細胞，藉以增進癌症診斷及治療。可由抗體標靶之細胞包括癌，例如那些位於皮膚、血液、淋巴結、大腦、肺臟、乳腺、小鼠、食道、胃臟、肝臟、膽管、胰臟、結腸、腎臟、子宮頸、卵巢、及前列腺等癌。 定義
除非另有指明，本發明之實施採用分子生物學、微生物學、重組型DNA、及免疫學等常規技術，其皆落於本領域技術範圍內。此類技術係於文獻中完整解釋。參見，例如，Molecular Cloning A Laboratory Manual, 2nd Ed., ed. by Sambrook, Fritsch and Maniatis（Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1989）；DNA Cloning, Volumes I and II （D. N. Glover ed., 1985）；Culture Of Animal Cells （R. I. Freshney, Alan R. Liss, Inc., 1987）；Immobilized Cells And Enzymes （IRL Press, 1986）；B. Perbal, A Practical Guide To Molecular Cloning （1984）；the treatise, Methods In Enzymology （Academic Press, Inc., N.Y.）；Gene Transfer Vectors For Mammalian Cells （J. H. Miller and M. P. Calos eds., 1987, Cold Spring Harbor Laboratory）；Methods In Enzymology, Vols. 154 and 155 （Wu et al. eds.）, Immunochemical Methods In Cell And Molecular Biology （Mayer and Walker, eds., Academic Press, London, 1987）；Antibodies: A Laboratory Manual, by Harlow and Lane s （Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1988）；以及Handbook Of Experimental Immunology, Volumes I-IV （D. M. Weir and C. C. Blackwell, eds., 1986）。
本文中使用的「聚醣」乙詞意指多醣或寡醣。本文中使用的聚醣亦指醣共軛物（glycoconjugate），如醣蛋白、醣脂質、醣胜肽、醣蛋白體、肽聚醣、脂多醣、或蛋白聚醣，之醣類部位。聚醣通常僅由單醣類間之O-醣苷鍵聯組成。舉例而言，纖維素為由ß-1,4-鍵結之D-葡萄糖組成之聚醣（或更特別地葡聚醣），且幾丁質為由ß-1,4-鍵結之N-乙醯基-D-葡萄糖胺組成之聚醣。聚醣可為單醣殘基之均聚合物或雜聚合物，且可為直鏈或支鏈。可發現與醣蛋白和蛋白聚醣中蛋白質相連的聚醣。其通常於細胞外表面上發現。O-與N-鍵結之聚醣類很常見於真核生物，但亦可於原核生物中發現，儘管較不常見。N-鍵結之聚醣發現附著於序列子（sequon）之天門冬醯胺酸之R基團氮（N）。序列子為Asn-X-Ser或Asn-X-Thr序列，其中X為除了脯胺酸以外之任何胺基酸。
本文中使用的「抗原」乙詞係定義為任何能引發免疫反應之物質。
本文中使用的「免疫原性」乙詞意指免疫原、抗原、或疫苗引發免疫反應之能力。
本文中使用的「表位」乙詞係定義為抗原分子接觸抗體或T細胞受體之抗原結合位點的部位。
本文中使用的「疫苗」乙詞意指含有抗原之製備物，其由完整致病生物體（非活性或弱化）或此類生物體之組分（如蛋白質、胜肽、或多醣）所組成，用於賦予免疫性以對抗生物體導致之疾病。疫苗製備物可包括或排除天然、合成、或重組所衍生製備物之任一者。重組衍生之製備物可利用如重組型DNA技術取得。
本文中使用的「抗原特異性」乙詞意指細胞群之性質，使得特定抗原或抗原片段之供應造成特異性細胞增生。
本文中使用的「特異性結合」乙詞意指結合對（如抗體與抗原）間之交互作用。在各種情況下，特異性結合可通過親和性常數約10 -6莫耳/升、約10 -7莫耳/升、或約10 -8莫耳/升或以下而實施。
本文中使用的「實質上類似」、「實質上相同」、「等同」、或「實質上等同」等詞表示二數值間足夠高之相似程度（例如，一者與分子相關聯，且其他者與參考/比較分子相關聯），使得本領域技術人員之一者在由所述值（如Kd值、抗病毒功效等）測量之生物特徵脈絡中，將考慮到二值間之差異為微小或無生物上及/或統計上顯著性。舉例而言，該二值間之差異為，作為參考/比較分子之值的函數，小於約50%、小於約40%、小於約30%、小於約20%、及/或小於約10%。
本文中使用的「實質上減少」或「實質上不同」等詞組表示二數值間足夠高之差異程度（一般而言一者與分子相關聯，且其他者與參考/比較分子相關聯），使得本領域技術人員之一者在由所述值（如Kd值）測量之生物特徵脈絡中，將考慮到二值間之差異為統計上顯著性。舉例而言，該二值間之差異為，作為參考/比較分子之值的函數，大於約10%、大於約20%、大於約30%、大於約40%、及/或大於約50%。
本文中使用的「結合親和性」一般而言意指一分子之單一結合位點（如抗體）與其結合配對體（如抗原）間全部非共價交互作用總和之強度。除非另有指明，本文中使用的「結合親和性」意指固有結合親和性，其反映了結合配對（如抗體與抗原）成員間之1:1交互作用。分子X與其配對體Y之親和性一般而言可以解離常數（Kd）表示。親和性可利用本領域習知之常見方法測定，包括本文所述者。低親和性抗體一般而言結合抗原緩慢，且傾向容易解離，而高親和性抗體一般而言結合抗原較快，且傾向保持更長結合時間。各測定結合親和性之方法係本領域習知，其之任一者可用於本發明之目的。以下描述特定說明性具體施例。
於特定具體實施例中，本發明之「Kd」或「Kd值」係利用放射性標記抗原結合試驗（RIA）測定，其係以感興趣抗體及其抗原之Fab版本進行，如下列試驗所述。在滴定一系列未經標記之抗原下，以最小濃度（125I）標記之抗原平衡Fab，測定Fabs對抗原之溶液結合親和性，之後以抗Fab抗體塗佈之培養盤捕捉結合之抗原（Chen, et al., （1999） J. Mol Biol 293:865-881）。欲建立試驗條件，將溶於50 mM碳酸鈉（pH 9.6）之5 μg/mL捕捉Fab抗體（Cappel Labs）隔夜塗佈於微滴定盤（Dynex），接著於室溫下（約23°C）以溶於PBS之2% （w/v）牛血清白蛋白阻斷二至五小時。於非吸附盤中（Nunc，Cat #269620），將100 pM或26 pM [125I]抗原混合一系列稀釋之感興趣的Fab （例如，與抗VEGF抗體Fab-12之評估一致，參見Presta et al., （1997）Cancer Res. 57:4593-4599）。感興趣之Fab隨後隔夜培養；不過，可持續培養更長時間（如 65小時）以確保達到平衡。之後將混合物移至捕捉盤以室溫培養（如一小時）。接著移除溶液，並以含0.1% Tween-20之PBS清洗培養盤八次。當培養盤乾燥時，每孔加入150 μL閃爍劑（MicroScint-20；Packard），且培養盤於Topcount伽瑪計數器（Packard）上計數十分鐘。選擇各Fab濃度產生小於或等於最大結合之20%，用於競爭結合試驗。依據另一具體實施例，於25°C下，利用表面等離子體共振試驗（surface plasmon resonance assays）測定Kd或Kd值，其係使用BIAcore™-2000或BIAcore™-3000 （BIAcore, Inc.，Piscataway，N.J.），其中使用固定化抗原CM5晶片，其回應單元（RU）為˜10。簡言之，依據供應商說明，以N-乙基-N′-（3-二甲基胺基丙基）碳二亞胺鹽酸鹽（EDC）與N-羥基琥珀醯亞胺（NHS）活化羧甲基化葡聚醣生物感應器晶片（CM5，BIAcore Inc.）。抗原事先以10 mM乙酸鈉（pH 4.8）稀釋至5 μg/mL （˜0.2 μM），再以流速5 μL/分鐘注射，達到約10回應單元（RU）之耦合蛋白。於抗原注射後，注射1 M乙醇胺以阻斷未反應基團。於各實驗中，墨點（spot）係經活化及乙醇胺阻斷，而不固定蛋白，以用於參考減法（reference subtraction）。在動力學測定方面，於25°C下，將二倍系列稀釋之Fab （0.78 nM至500 nM）注入含0.05% Tween 20之PBS （PBST），其流速約25 μL/min。利用簡單一對一朗繆爾結合模型（Langmuir binding model）（BIAcore Evaluation Software version 3.2）計算結合速率（kon）與解離速率（koff），其係同時擬合（fitting）結合與解離傳感圖。計算平衡解離常數（Kd）為koff/kon比率。參見，如Chen, Y., et al., （1999） J. Mol Biol 293:865-881。若前述表面等離子體共振試驗所得之結合速率超過10 6M −1s −1，則可利用螢光淬火技術（fluorescent quenching technique）測定結合速率，其係於25°C下測定溶於PBS （pH 7.2）之20 nM抗原抗體（Fab形式）的螢光發射強度（激發=295 nm；發射=340 nm，16 nm帶通）之增加或減少，其中存在濃度漸增之抗原，並以分光光度計測定，如停止流量分光光度計（Aviv Instruments）或配備攪拌型比色管的8000系列SLM-Aminco分光光度計（ThermoSpectronic）。
本發明之「結合速率（on-rate或rate of association或association rate或kon）」皆可於25°C下以前述之相同表面等離子體共振試驗測定，並使用BIAcore™-2000或BIAcore™-3000 （BIAcore, Inc.，Piscataway，N.J.），伴隨固定化抗原CM5晶片，或者，本發明之「結合速率（association rate或kon）」亦可依據供應商說明，以相同表面等離子體N-乙基-N′-（3-二甲基胺基丙基）碳二亞胺鹽酸鹽（EDC）與N-羥基琥珀醯亞胺（NHS）測定。抗原事先以10 mM乙酸鈉（pH 4.8）稀釋至5 μg/mL （˜0.2 μM），再以流速5 μL/分鐘注射，達到約10回應單元（RU）之耦合蛋白。於抗原注射後，注射1 M乙醇胺以阻斷未反應基團。在動力學測定方面，於25°C下，將二倍系列稀釋之Fab （0.78 nM至500 nM）注入含0.05% Tween 20之PBS（PBST），其流速約25 μL/min。利用簡單一對一朗繆爾結合模型（BIAcore Evaluation Software version 3.2）計算結合速率（kon）與解離速率（koff），其係同時擬合結合與解離傳感圖。計算平衡解離常數（Kd）為koff/kon比率。參見，如Chen, Y., et al., (1999) J. Mol Biol 293:865-881。然而，若前述表面等離子體共振試驗所得之結合速率超過10 6M −1s −1，則可利用螢光淬火技術測定結合速率，其係於25°C下測定溶於PBS （pH 7.2）之20 nM抗原抗體（Fab形式）的螢光發射強度（激發=295 nm；發射=340 nm，16 nm帶通）之增加或減少，其中存在濃度漸增之抗原，並以分光光度計測定，如停止流量分光光度計（Aviv Instruments）或配備攪拌型比色管的8000系列SLM-Aminco分光光度計（ThermoSpectronic）。
本文中使用的「載體」乙詞意指一核酸分子能運送另一核酸至其已連接處。一類型載體為「質體」，其意指環狀單股DNA圈環，其中連接額外之DNA片段。另一類型載體為噬菌體載體。另一類型載體為病毒載體，其中額外之DNA片段可連接至病毒基因體。特定載體能在導入之宿主細胞內（如具有細菌複製起點之細菌載體及附加型哺乳類動物載體）自主複製。其他載體（如非附加型哺乳類動物載體）在導入宿主細胞內時可整合入宿主細胞基因體內，因而伴隨宿主基因體複製。此外，特定載體能導引基因表現於其操作連接處。此類載體於此意指「重組型表現載體」（或簡言之，「重組型載體」）。一般而言，應用於重組型DNA技術之表現載體常為質體形式。於本說明書中，「質體」及「載體」可互換使用，質體為最常使用之載體形式。
本文中可互換使用的「多核苷酸」或「核酸」意指任何長度之核苷酸聚合物，且包括DNA與RNA。核苷酸可為去氧核糖核苷酸、核糖核苷酸、經修飾之核苷酸、或鹼基，及/或其類似物，或任何可利用DNA或RNA聚合酶或利用合成反應併入而成聚合物之受質。多核苷酸可包含經修飾之核苷酸，如甲基化核苷酸及其類似物。若存在該情況，則於聚合物組裝前或後，可進行核苷酸結構修飾。核苷酸序列可利用非核苷酸組分中斷。多核苷酸可於合成後進一步修飾，如結合一標記物。其他類型之修飾包括，例如，「封端（caps）」、以類似物取代一或多個天然存在之核苷酸、核苷酸間修飾，如那些具有不帶電鍵結者（如甲基膦酸酯類、磷酸三酯類、磷酸醯胺酯類、胺甲酸酯類等）及具有帶電鍵結者（如偶磷硫醇酯類、偶磷二硫醇酯類等）、那些含有懸垂部分者，例如，蛋白質（如核酸酶、毒素、抗體、訊息胜肽、ply-L-離胺酸等）、彼等具有插入劑者（intercalators）（如吖啶、補骨脂素（psoralen）等）、那些含有螯合劑者（如金屬、放射性金屬、硼、氧化金屬等）、那些含有烷化劑者、那些具有修飾鍵結者（如α變旋異構核酸等），以及未修飾形式之多核苷酸。此外，一般存在於醣類中之任一羥基可利用如膦酸基、磷酸基來取代、利用標準保護基保護、或經活化以製備額外鍵結至額外核苷酸、或可結合至固體或半固體撐體。5’與3’端羥基可經磷酸化或以胺或1至20個碳原子之有機封端基團部分取代。其他羥基亦可衍生成標準保護基。多核苷酸亦可含有核糖或去氧核糖之類似形式醣類，其一般而言係本領域習知，包括例如，2’-O-甲基、2’-O-烯丙基、2’-氟基、或2’-疊氮基核糖，碳環糖類似物，其係以胺或1至20個碳原子之有機封端基團部分取代。其他羥基亦可衍生成標準保護基團。多核苷酸亦可含有側基。一或多個磷酸二酯鍵結可利用替代連接基團取代。那些替代連接基團包括但不侷限於，特定具體實施例，其中磷酸係利用P（O）S （「硫醇酯類」）、P（S）S（「二硫醇酯類」）、（O）NR 2（「醯胺酯」）、P（O）R、P（O）OR’、CO、或CH 2（「甲縮醛」）取代，其中各R或R’係獨立地為氫或經取代或未經取代之烷基（1-20C），其任選地含有醚類（1至20個碳原子）。其他羥基亦可衍生成標準保護核苷酸，且需一致。上述描述適用於本文提及之所有多核苷酸，包括RNA與DNA。
本文中使用的「寡核苷酸」一般而言意指短型、單股、合成之多 核苷酸，其長度通常但未必小於約200個核苷酸。「寡核苷酸」與「多核苷酸」等詞係非互斥。上述針對多核苷酸之說明係同等且完全適用於寡核苷酸。
本文中使用的「抗體（Abs）」及「免疫球蛋白（Igs）」係具有相同結構特徵之醣蛋白。儘管抗體對特定抗原呈現結合特異性，但免疫球蛋白包括抗體與其他類抗體分子，其一般而言缺乏抗原特異性。舉例而言，後一類多胜肽係由淋巴系統於低量時及骨髓瘤於增量時產生。
本文中使用的「抗體」與「免疫球蛋白」等詞係於最廣泛之意義上互換使用，且包括單株抗體（如全長或完整單株抗體）、多株抗體、單價、多價抗體、多重特異性抗體（如雙特異性抗體，只要其具有所需之生物活性），且亦可包括特定抗體片段，如本文之更詳盡說明。抗體可為嵌合、人類、人源化、及/或親和性成熟抗體。
本文中使用的抗體「可變區域（variable region）」或「可變區（variable domain）」意指抗體重鏈或輕鏈之胺基端區。這些區一般而言係抗體之最可變部位，且含有抗原結合位點。
本文中使用的「可變」乙詞意指事實上於抗體中可變區之特定部分序列差異極大，且用於各特定抗體對其特定抗原之結合及特異性。然而，於整個抗體可變區中，可變性並未均勻分佈。其集中於三片段，稱作互補決定區（CDRs）或高度可變區域，皆位於輕鏈與重鏈可變區。可變區中更高度保留之部分稱作骨架（framework；FR）。原始重鏈與輕鏈之可變區各包含四FR區，大量具備β褶板構形，利用三CDRs相連接，其形成環圈連接，且在一些情況下，形成β褶板結構之一部分。各鏈之CDRs係利用FR區與其他鏈之CDRs緊貼在一起，導致形成抗體之抗原結合位點（參見，Kabat et al., Sequences of Proteins of Immunological Interest, Fifth Edition, National Institute of Health, Bethesda, Md. （1991））。恆定區未直接涉及抗體與抗原之結合，但呈現多種效應子功能，如抗體參與抗體依賴性細胞毒性。
木瓜蛋白酶水解抗體，產生二相同抗原-結合片段，稱作「Fab」片段，每一者具有單一抗原結合位點，及其餘的「Fc」片段，其名稱反映其易結晶之能力。處理胃蛋白酶產生F（ab’） 2片段，其具有二抗原結合位點，且仍能交聯抗原。
「Fv」為最小抗體片段，其含有完整之抗原辨識與結合位點。於二鏈Fv物種，此區由一重鏈與一輕鏈可變區之二聚體以緊密、非共價結合組成。於單鏈Fv物種，一重鏈與一輕鏈可變區可利用撓性胜肽連接子共價連接，如此輕鏈與重鏈可結合成「二聚體」結構，其類似於雙鏈Fv物種。於此構型中，各可變結構域之三CDRs交互作用，以在VH-VL二聚體表面上界定出抗原結合位點。總的來說，該六CDRs賦予抗原與抗體結合特異性。然而，即使單一可變結構域（或Fv之一半，其僅含有三個抗原特異性CDRs）仍具有辨識及結合抗原的能力，儘管其親和性低於整體結合位點。
Fab片段亦含有輕鏈恆定結構域與重鏈第一恆定結構域（CH1）。Fab′片段不同於Fab片段之處在於重鏈CH1結構域羧基端增加數個殘基，包括一或多個半胱胺酸位於抗體鉸鏈區。Fab′-SH於此表示Fab′恆定結構域之半胱胺酸殘基含有游離硫醇基。產生之F（ab′） 2抗體片段起初為Fab′片段配對，其間具有鉸鏈半胱胺酸。抗體片段之其他化學耦合亦為習知。
任何脊椎動物物種之抗體（免疫球蛋白）的「輕鏈」可指定為二明顯不同類型之一，稱作卡帕（κ）與拉目達（λ），其係以其恆定區之胺基酸序列為基準。
取決於其重鏈恆定區之胺基酸序列，抗體（免疫球蛋白）可分配至不同類別。免疫球蛋白有五大類：IgA、IgD、IgE、IgG、及IgM，且彼等之數者可進一步分成子類（同型），如IgG 1、IgG 2、IgG 3、IgG 4、IgA 1、及IgA 2。不同類別之免疫球蛋白重鏈恆定結構域稱作布林（bulins），其可分配至不同類別。不同類別之免疫球蛋白的五個三維構型係為習知，且一般而言描述於，如Abbas et al. Cellular and Mol. Immunology, 4th ed. （2000）其內。抗體可為較大融合分子之一部分，其係由抗體與一或多個其他蛋白質或胜肽之共價或非共價結合而形成。
「全長抗體」、「完整抗體」、及「全部抗體」等詞於此可互換使用，意指抗體實質上為完整形式，而非以下定義之抗體片段。該詞特別指抗體重鏈含有Fc區。
本文中使用的「抗體片段」僅包含完整抗體的一部分，其中該部分保留至少一者，如同大多數或全部的一樣之功能正常上與完整抗體之該部分相關聯。於一具體實施例中，抗體片段包含完整抗體之抗原結合位點，因此保留結合抗原之能力。於另一具體實施例中，抗體片段，如一包含Fc區者，保留至少一生物功能正常上與完整抗體之Fc區相關聯，如FcRn結合、抗體半衰期調控、ADCC功能、及補體結合。於一具體實施例中，抗體片段為單價抗體，其具有實質上類似於完整抗體的體內半衰期。舉例而言，此抗體片段可具有連接至Fc序列的抗原結合臂（arm），能賦予該片段體內穩定性。
本文中使用的「單株抗體」乙詞意指一抗體係取自一群實質上均質化抗體，亦即含有該群之個別抗體皆相同，除了可能的天然存在之突變以外，其係以少量存在。因此，修飾語「單株」代表抗體之特徵並非個別抗體之混合物。此單株抗體通常包括一抗體含有多胜肽序列以結合一標靶，其中該標靶結合多胜肽序列係由一過程取得，包括由複數個多胜肽序列中挑選單一標靶結合多胜肽序列。於特定具體實施例中，單株抗體可排除天然序列。於一些方面，挑選過程可以是由複數個殖株中挑選獨特殖株，該殖株如融合瘤殖株庫、噬菌體殖株庫、或重組型DNA殖株庫。應理解到，所挑選的標靶結合序列可進一步改變，例如改進標靶親和性、人源化標靶結合序列、改進其於細胞培養中之產量、減少其體內免疫原性、創建多重特異性抗體等，且含有改變之標靶結合序列的抗體亦為本發明之單株抗體。相對於通常包括針對不同決定區（如表位）之不同抗體的多株抗體製備物，單株抗體製備物之各單株抗體係針對抗原上單一決定區。除了其特異性以外，單株抗體製備物之優勢在於，其通常不受其他免疫球蛋白污染。修飾語「單株」代表抗體之特徵係取自實質上均質化群體之抗體，且不應理解為需要以任何特定方法產生抗體。舉例而言，本發明使用之單株抗體可利用各種技術製成，包括例如，融合瘤方法（如Kohler et al., Nature, 256: 495 （1975）；Harlow et al., Antibodies: A Laboratory Manual, （Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2nd ed. 1988）；Hammerling et al.所著：Monoclonal Antibodies and T-Cell hybridomas 563-681 （Elsevier, N.Y., 1981））、重組型DNA方法（參見，如美國專利號4,816,567）、噬菌體顯示技術（參見，如Clackson et al., Nature, 352: 624-628 （1991）；Marks et al., J. Mol. Biol. 222: 581-597 （1992）；Sidhu et al., J. Mol. Biol. 338（2）: 299-310 （2004）；Lee et al., J. Mol. Biol. 340（5）: 1073-1093 （2004）；Fellouse, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 101（34）: 12467-12472 （2004）；以及Lee et al., J. Immunol. Methods 284（1-2）: 119-132（2004）、及用於以動物產生人類或類人類抗體之技術，其具有部分或全部的人類免疫球蛋白基因座或編碼人類免疫球蛋白序列之基因（參見，如WO98/24893；WO96/34096；WO96/33735；WO91/10741；Jakobovits et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90: 2551 （1993）；Jakobovits et al., Nature 362: 255-258 （1993）；Bruggemann et al., Year in Immunol. 7:33 （1993）；美國專利號5,545,807；5,545,806；5,569,825；5,625,126；5,633,425；5,661,016；Marks et al., Bio. Technology 10: 779-783 （1992）；Lonberg et al., Nature 368: 856-859 （1994）；Morrison, Nature 368: 812-813 （1994）；Fishwild et al., Nature Biotechnol. 14: 845-851 （1996）；Neuberger, Nature Biotechnol. 14: 826 （1996）與Lonberg and Huszar, Intern. Rev. Immunol. 13: 65-93 （1995）。
本文中單株抗體特別包括「嵌合」抗體，其中一部分的重鏈及/或輕鏈相同或同源於源自特定物種抗體或屬於特定抗體類別或子類的序列，而鏈的其餘部分則相同或同源於源自另一物種抗體或屬於另一抗體類別或子類的相對應序列以及此類抗體之片段，只要其呈現所需之生物活性（美國專利號4,816,567；以及Morrison et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 81:6851-6855 （1984））。
本發明之抗體亦包括由本發明抗體產生之嵌合化或人源化單株抗體。
抗體可為全長或可包含抗體之片段（或數個片段），其具有抗原結合部位，包括但不侷限於，Fab、F（ab'） 2、Fab', F（ab）'、Fv、單鏈Fv （scFv）、二價scFv （bi-scFv）、三價scFv （tri-scFv）、Fd、dAb片段（如Ward et al, Nature, 341 :544-546 （1989））、CDR、雙功能抗體、三功能抗體、四功能抗體、線型抗體、單鏈抗體分子、及由抗體片段形成之多重特異性抗體。單鏈抗體係由連接抗體片段製成，其係使用重組型方法或合成之連接子，亦涵蓋於本發明之中。Bird et al. Science, 1988, 242:423-426；Huston et al, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1988, 85:5879-5883。
本發明之抗體或其抗原結合部位可為單特異性、雙特異性、或多重特異性。
所有抗體同型皆涵蓋於本發明之中，包括IgG （如IgG l、IgG 2、IgG 3、IgG 4）、IgM、IgA （IgA l、IgA 2）、IgD、或IgE（所有類別與子類皆涵蓋於本發明之中）。抗體或其抗原結合部位可為哺乳類動物（如小鼠、人類）抗體或其抗原結合部位。抗體之輕鏈可為κ或λ類型。
因此，本發明之抗癌症抗體包括結合非鼠源，較佳為人源之重鏈或輕鏈可變區、重鏈或輕鏈恆定區、框架區、或其任何部位，其可併入本發明之抗體。
具有可變重鏈區與可變輕鏈區之抗體係至少約70%、至少約75%、至少約80%、至少約81%、至少約82%、至少約83%、至少約84%、至少約85%、至少約86%、至少約87%、至少約88%、至少約89%、至少約90%、至少約91%、至少約92%、至少約93%、至少約94%、至少約95%、至少約96%、至少約97%、至少約98%、至少約99%、或約100%同源於參考抗體所產生之抗體可變重鏈區與可變輕鏈區，且亦可結合至醣類抗原（如SSEA-4）。同源性（homology）可呈現於胺基酸序列或核苷酸序列層次。在一些方面，具有所述胺基酸序列或核苷酸序列同源性之抗體序列將排除天然存在之抗體序列。在一些方面，具有所述胺基酸序列或核苷酸序列同源性之抗體序列將涵蓋天然存在之抗體序列。
於特定具體實施例中，相應於表1-3中所示CDRs之CDRs具有序列變化。舉例而言，CDRs，其中1、2、3、4、5、6、7、或8個殘基，或小於CDR中全部之20%、30%、或約40%的殘基係經取代或刪除，可存在於結合醣類抗原之抗體（或其抗原結合部位）。
抗體或抗原結合部位可為胜肽。此類胜肽可包括胜肽之變體、類似物、異種同源物、同源物、及衍生物，其呈現生物活性，如醣類抗原之結合。胜肽可含有一或多個胺基酸（包括例如，非天然存在之胺基酸、僅在不相關之生物系統中天然出現之胺基酸、哺乳類動物系統之經修飾胺基酸等）類似物、具有經取代鍵結之胜肽，以及本領域習知之其他改良。
同時，於本發明之範疇內，於抗體或其抗原結合部位中，特定胺基酸係經取代、刪除、或添加。於一示例性具體實施例中，這些改變對胜肽生物性質，如結合親和性，不具有實質影響。於另一示例性具體實施例中，抗體之框架區可具有胺基酸取代作用，如改進抗體與抗原之結合親和性。於又另一示例性具體實施例中，經選取之少數接受體框架殘基可由相對應之供應體胺基酸替代。供應體框架可為成熟或種系人類抗體框架序列或共通序列。關於如何製作表型靜默之胺基酸取代作用之方針，描述於Bowie et al., Science, 247: 1306-1310 （1990）；Cunningham et al, Science, 244: 1081-1085 （1989）；Ausubel （ed.）, Current Protocols in Molecular Biology, John Wiley and Sons, Inc. （1994）；T. Maniatis, E. F. Fritsch and J. Sambrook, Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor laboratory, Cold Spring Harbor, N.Y. （1989）；Pearson, Methods Mol. Biol. 243:307-31 （1994）；Gonnet et al., Science 256: 1443-45 （1992）。
抗體或其抗原結合部位可衍生或連接至另一功能分子。舉例而言，抗體可以是功能上連接至（利用化學耦合、基因融合、非共價交互作用等）一或多個其他分子實體，如另一抗體、可檢測劑、細胞毒性劑、藥劑、蛋白質、或可介導結合另一分子（如鏈黴親和素核心區或多組胺酸標籤）的胜肽、胺基酸連接子、訊息序列、免疫原性載體、或適於蛋白質純化之配體，如穀胱甘肽-S-轉移酶、組胺酸標籤、及葡萄球菌蛋白A。一類型之衍生蛋白係利用交聯二或多個蛋白（相同類型或不同類型）製成。適用之交聯子包括那些異雙官能性，具有由合適間隔子（如間馬來醯亞胺基苯甲醯基-N-羥基琥珀醯亞胺酯）隔開之二不同反應性基團，或同雙官能性（如二琥珀醯亞胺基辛二酸酯）。此類連接子係購自Pierce Chemical Company，Rockford，111。有效的可檢測劑，其可衍生（或標記）蛋白質，包括螢光化合物、各種酶、輔基、發光材料、生物發光材料、及放射性材料。非侷限之示例性螢光可檢測劑包括螢光素、螢光素異硫氰酸酯、玫瑰紅、及藻紅素。蛋白質或抗體亦可與可檢測酵素一起衍生，如鹼性磷酸酶、山葵過氧化酶、β-半乳糖苷酶、乙醯膽鹼酯酶、葡萄糖氧化酶、及其類似物。蛋白質亦可與輔基（如鏈黴親和素/生物素及抗生物素蛋白/生物素）一起衍生。
編碼本發明抗體或其抗原結合部位之功能活化變體的核酸亦涵蓋於本發明。這些核酸分子可於中度嚴謹、高度嚴謹、或極高度嚴謹條件下雜交於編碼本發明抗體或其抗原結合部位任一者的核酸。進行雜交反應之方針可見於Current Protocols in Molecular Biology, John Wiley & Sons, N.Y. 6.3.1-6.3.6, 1989，其在此併入本案以作為參考資料。本文提及之特異性雜交條件如下：1）中度嚴謹雜交條件：於約45°C下加入6 X SSC，接著於60°C下以0.2 X SSC與0.1% SDS清洗一或多次；2）高度嚴謹雜交條件：於約45°C下加入6 X SSC，接著於65°C下以0.2 X SSC與0.1% SDS清洗一或多次；以及3）極高度嚴謹雜交條件：於65°C下加入0.5 M磷酸鈉與7% SDS，於65°C下以0.2XSSC與1% SDS清洗一或多次。
編碼本發明抗體或其抗原結合部位之核酸可導入表現載體，其可於合適之表現系統中表現，接著分離或純化表現之抗體或其抗原結合部位。可選擇地，編碼本發明抗體或其抗原結合部位之核酸可於無細胞轉譯系統中轉譯。參見，美國專利號4,816,567；Queen et al, Proc Natl Acad Sci USA, 86: 10029-10033 (1989)。
本發明抗體或其抗原結合部位可利用宿主細胞轉形編碼所需之抗體輕鏈與重鏈（或其部分）之DNA而產生。抗體可利用標準技術自這些培養基上清液及/或細胞分離及純化。舉例而言，宿主細胞可轉形編碼抗體輕鏈、重鏈、或兩者之DNA。重組型DNA技術亦可用於移除一些或所有編碼輕鏈與重鏈之一或二者之DNA，其並非結合作用所需（如恆定區）。
本發明核酸可表現於各種適用細胞，包括原核與真核細胞，如細菌細胞（如大腸桿菌）、酵母菌細胞、植物細胞、昆蟲細胞、及哺乳類動物細胞。一些哺乳類動物細胞株係本領域習知，且包括購自美國菌種保存中心（ATCC）之永生細胞株。細胞之非侷限實例包括所有哺乳類動物源或類哺乳類動物特徵之細胞株，包括但不侷限於，親代細胞、猴腎細胞之衍生物及/或基因工程變體細胞（COS，如COS-1、COS-7）、HEK293、小倉鼠腎細胞（BHK，如BHK21）、中國倉鼠卵巢細胞（CHO）、NSO、PerC6、BSC-1、人肝細胞癌細胞（如HepG2）、SP2/0、HeLa、馬丁-達比牛腎細胞（Madin-Darby bovine kidney；MDBK）、骨髓瘤、及淋巴瘤細胞。基因工程變體包括，例如，聚醣型修飾及/或位點專一性整合位點衍生物。
本發明亦提供含有本文所述核酸之細胞。該細胞可為融合瘤或轉染體(transfectant)。
或者，本發明抗體或其抗原結合部位可利用本領域習知之固相程序合成。Solid Phase Peptide Synthesis: A Practical Approach by E. Atherton and R. C. Sheppard，由Oxford University Press之IRL (1989)出版；Methods in Molecular Biology, Vol. 35: Peptide Synthesis Protocols （ed. M. W.Pennington and B. M. Dunn），第7章；Solid Phase Peptide Synthesis, 2nd Ed., Pierce Chemical Co., Rockford, IL （1984）；G. Barany and R. B. Merrifield, The Peptides: Analysis, Synthesis, Biology，編輯係E. Gross and J. Meienhofer, Vol. 1 and Vol. 2, Academic Press, New York, （1980）, pp. 3-254；M. Bodansky, Principles of Peptide Synthesis, Springer-Verlag, Berlin （1984）。
「人源化」形式之非人類（如鼠科）抗體為嵌合抗體，其含有衍生自非人類免疫球蛋白之最小序列。於一具體實施例中，人源化抗體為人類免疫球蛋白（受體抗體），其中受體高度可變區之殘基係以非人類物種（供應體抗體）高度可變區之殘基替代，該非人類物種如小鼠、大鼠、兔、或非人類靈長類，其具有所需之特異性、親和性、及/或能力。於一些情況下，人類免疫球蛋白之框架區（FR）殘基係以相對應之非人類殘基替代。此外，人源化抗體可包含未在受體抗體或供應體抗體中發現之殘基。這些修飾之進行係旨在進一步精化抗體表現。一般而言，人源化抗體將包含實質上所有至少為一，及通常為二的可變區，其中所有或實質上所有高度可變環圈對應於那些非人類免疫球蛋白，且所有或實質上所有FRs係那些人類免疫球蛋白序列。人源化抗體亦將可選擇地包含通常係人類免疫球蛋白之至少一部分免疫球蛋白恆定區（Fc）。詳情請參見Jones et al., Nature 321:522-525 （1986）；Riechmann et al., Nature 332:323-329 （1988）；以及Presta, Curr. Op. Struct. Biol. 2:593-596 （1992）。亦請參見下列引用之回顧文獻及參考資料：Vaswani and Hamilton, Ann. Allergy, Asthma & Immunol. 1:105-115 （1998）；Harris, Biochem. Soc. Transactions 23:1035-1038 （1995）；Hurle and Gross, Curr. Op. Biotech. 5:428-433 （1994）。
本文中使用的「高度可變區」、「HVR」、或「HV」等詞意指抗體可變區之區域，其序列係高度可變及/或形成結構上可定義環圈。一般而言，抗體包含六個高度可變區；三者位於VH （H1、H2、H3），且三者位於VL （L1、L2、L3）。許多高度可變區輪廓被使用，且涵蓋於本文中。卡貝特（Kabat）互補決定區（CDRs）係依據序列可變性，且最常被使用（Kabat et al., Sequences of Proteins of Immunological Interest, 5th Ed. Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, Md. （1991））。丘夏（Chothia）則提出結構環圈之位置（Chothia and Lesk J. Mol. Biol. 196:901-917 （1987））。
本文中使用的「框架」或「FW」殘基係本文定義之高度可變區殘基以外之那些可變結構域殘基。
「如卡貝特（Kabat）中的可變區殘基之編號方式」或「如卡貝特（Kabat）中的胺基酸位置之編號方式」等術語及其變化形，意指卡貝特（Kabat）等人在Sequences of Proteins of Immunological Interest, 5th Ed. Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, Md. (1991)中，用於彙編抗體之重鏈可變區或輕鏈可變區之編號系統。使用此編號系統，實際之線型胺基酸序列可含有較少或額外之對應於縮短或插入可變區之FR或HVR之胺基酸。舉例而言，重鏈可變區可包括位於H2之殘基52之後的單一胺基酸插入子（如卡貝特之殘基52a），以及位於重鏈FR殘基82之後的插入殘基（如卡貝特之殘基82a、82b、及82c等）。卡貝特之殘基編號方式可針對給定之抗體進行確定，其係利用「標準」卡貝特編號序列比對抗體序列之同源區域。
本文中使用的「單鏈Fv」或「scFv」抗體片段包含抗體之VH與VL區域，其中這些結構域係以單一多胜肽鏈呈現。一般而言，scFv 多胜肽進一步包含介於VH與VL結構域之間之一多胜肽連接子，其使得scFv形成所需結構以進行抗原結合。針對scFv之評述，參見Pluckthun的The Pharmacology of Monoclonal Antibodies, vol. 113, Rosenburg and Moore eds., Springer-Verlag, New York, pp. 269-315 （1994）。
本文中使用的「雙功能抗體」乙詞意指具有二抗原結合位點之小型抗體片段，該片段包含連接至相同多胜肽鏈之輕鏈可變結構區（VL）（即VH-VL）的重鏈可變區 （VH）。利用過短而無法在相同鏈之二結構域間進行配對的連接子，該等區被迫與另一鏈之互補區配對並創建二抗原結合位點。雙功能抗體係更充分描述於，舉例而言，EP 404,097；WO93/1161；以及Hollinger et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90: 6444-6448 （1993）中鐘。
本文中使用的「人類抗體」係指產生之胺基酸序列相應於人類產生之抗體及/或利用任一技術製備本發明揭示之人類抗體。此人類抗體之定義特別排除含有非人類抗原結合殘基之人源化抗體。
本文中使用的「親和性成熟抗體」為抗體之一或多個HVRs具有一或多個改變，其造成改進抗體與抗原之親和性，並與母體抗體相比較，其不產生那些改變。於一具體實施例中，親和性成熟抗體具有奈莫耳或甚至皮莫耳之親和性以靶向抗原。親和性成熟抗體係利用本領域習知之程序產生。Marks et al. Bio/Technology 10:779-783 （1992）描述親和性之成熟係利用VH與VL區混編。CDR及/或框架殘基之隨機突變係描述於：Barbas et al. Proc Nat. Acad. Sci. USA 91:3809-3813 （1994）；Schier et al. Gene 169:147-155 （1995）；Yelton et al. J. Immunol. 155:1994-2004 （1995）；Jackson et al., J. Immunol. 154（7）:3310-9 （1995）；以及Hawkins et al, J. Mol. Biol. 226:889-896 （1992）。
本文中使用的「阻斷抗體」或「拮抗抗體」係抗體能抑制或減少所結合抗原之生物活性。特定阻斷抗體或拮抗抗體係實質上或完全地抑制抗原之生物活性。
本文中使用的「促效抗體」係抗體擬態感興趣之多胜肽功能活性之至少一者。
本文中使用的「病症」係可受益於本發明抗體治療之任何病況。其包括慢性與急性病症或疾病，包括那些使哺乳類動物易患病症之病理狀況。欲治療之病症的非侷限實例包括癌症。
本文中使用的「細胞增生性病症」與「增生性病症」等詞意指與一定程度之異常細胞增生相關聯之病症。於一具體實施例中，細胞增生性病症為癌症。
本文中使用的「腫瘤」意指所有腫瘤細胞生長與增生，不論惡性或良性，以及所有癌前與癌之細胞與組織。本文中使用的「癌症」、「癌性」、「細胞增生性病症」、「增生性病症」、及「腫瘤」等詞係非互斥。
本文中使用的「癌症」與「癌性」意指或說明哺乳類動物生理條件，特徵通常為未調節之細胞生長/增生。癌症之實例包括但不侷限於，癌、淋巴瘤（如霍奇金氏與非霍奇金氏淋巴瘤）、母細胞瘤、肉瘤、及血癌。此類癌症之更特定實例包括鱗狀細胞癌、小細胞肺癌、非小細胞肺癌、肺腺癌、鱗狀肺癌、腹膜癌、肝細胞癌、腸胃癌、胰腺癌、神經膠質母細胞瘤、子宮頸癌、卵巢癌、肝癌、膀胱癌、肝腫瘤、乳癌、大腸癌、大腸直腸癌、子宮內膜或子宮癌、唾腺癌、腎癌、肝癌、前列腺癌、外陰癌、甲狀腺癌、肝癌、血癌與其他淋巴增生性病症及各種頭頸癌。
本文中使用的「治療」意指臨床上的介入，其旨在改變經治療之個體或細胞的自然過程，且可以在預防（prophylaxis）或在臨床病理過程中進行。理想的治療效果包括預防疾病發生或復發、緩解症狀、減輕疾病之任何直接或間接病理後果、預防或減少發炎及/或組織/器官損傷、降低疾病進展速度、改善或減輕疾病狀態、及緩解或改進預後。於特定具體實施例中，本發明抗體係用於延緩疾病或病症之發展。
本文中使用的「抗體-藥物複合體（ADCs）」意指抗體結合至一細胞毒性劑，如化學治療劑、藥物、生長抑制劑、毒素（如細菌、真菌、植物或動物源、或其片段之酵素活性毒素）、或放射性同位素（亦即，放射性共軛物）。
本文中使用的「T細胞表面抗原」意指一抗原可包括本領域習知之代表性T細胞表面標記，包括T細胞抗原受體（TcR），其為所有T細胞之主要定義標記，其中T細胞以其用於特異性辨識MHC相關聯之胜肽抗原。TcR之相關聯實例為CD3蛋白複合體，其參與細胞內TcR結合至其同源MHC/抗原複合體後之訊息傳導。T細胞表面抗原之其他實例可包括(（或排除）CD2、CD4、CD5、CD6、CD8、CD28、CD40L、及/或CD44。
本文中使用的「個人」或「個體」係脊椎動物。於特定具體實施例中，脊椎動物為哺乳類動物。哺乳類動物包括但不侷限於，農場動物（如牛）、運動動物、寵物（如貓、狗、及馬）、靈長類動物、小鼠、及大鼠。於特定具體實施例中，脊椎動物係人類。
本文中使用的因應治療目的之「哺乳類動物」意指任何分類為哺乳類動物之動物，包括人類、家畜、及農場動物，以及動物園、運動場、或寵物動物，如狗、馬、貓、牛等。於特定具體實施例中，哺乳類動物係人類。
本文中使用的「有效量」意指在所需劑量與時間期內，能有效達到所需之治療或預防結果的量。
本發明物質/分子之「治療上有效量」可依個體之疾病狀態、年齡、性別、及體重等因素而變，以及該物質/分子於個體內引發所需之反應的能力。治療上有效量亦為，治療上有益效果超越物質/分子之任何有毒或有害影響。「預防上有效量」意指在所需劑量與時間期內，能有效達到所需之預防結果的量。通常但非必需，因個體在疾病之前或疾病早期階段使用預防劑量，該預防上有效量將小於治療上有效量。
本文中使用的「細胞毒性劑」乙詞意指抑制或預防細胞功能及/或導致細胞破壞之物質。該詞旨在包括放射性同位素（如At211、I131、I125、Y90、Re186、Re188、Sm153、Bi212、P32、Pb212、及Lu之放射性同位素）、化學治療劑（如胺甲喋呤、阿德力黴素、長春花屬生物鹼、長春新鹼、長春鹼、依托泊苷、多柔比星、黴法蘭、絲裂黴素C、氯芥苯丁酸、道諾黴素、或其他嵌入劑）、酵素及其片段，如核苷酸分解酵素（nucleolyticenzymes）、抗生素、及毒素，如細菌、真菌、植物或動物源之小分子毒素或酵素活性毒素，包括其片段及/或變體、及以下揭示之各種抗腫瘤劑或抗癌劑。其他細胞毒性劑說明如下。腫瘤毒殺劑（tumoricidal agent）導致腫瘤細胞破壞。
本文中使用的「化學治療劑」為用於治療癌症之化學化合物。化學治療劑之實例包括烷化劑，如噻替派（thiotepa）與CYTOXAN ®環磷醯胺；烷基磺酸鹽諸如白消安（busulfan）、英丙舒凡（improsulfan）和呱泊舒凡（piposulfan）；氮丙啶類諸如苯並多巴（benzodopa）、碳酮（carboquone）、美杜多巴（meturedopa）和歐羅巴（uredopa）；乙烯亞胺和甲基蜜胺類諸如六甲蜜胺（altretamine）、三亞乙基蜜胺（triethylenemelamine）、三亞乙基磷醯胺（trietylenephosphoramide）、三亞乙基硫代磷醯胺（triethiylenethiophosphoramide）和三甲基三聚氰胺（trimethylolomelamine）；乙醯青黴素（acetogenins）（特別是牛油菌素（bullatacin）和黃曲坦酮（bullatacinone）））；delta-9-四氫大麻酚 （屈大麻酚（dronabinol），MARINOL ®）；β-拉巴醌；拉帕醇（lapachol）；秋水仙鹼（colchicines）；樺木酸（betulinic acid）；喜樹鹼（camptothecin） （包括其合成類似物拓樸替康（topotecan） （HYCAMTIN ®）、CPT-11 （伊立替康(irinotecan），CAMPTOSAR ®）、 乙醯喜樹鹼、東莨菪素（scopolectin)和9-胺基喜樹鹼）；比歐抑素（bryostatin）；卡利抑素（callystatin）；CC-1065 （包括其青蒿素、卡折來新（carzelesin）和比折來新（bizelesin）合成類似物）；鬼臼毒素（podophyllotoxin）；鬼臼酸（podophyllinic acid）；替尼泊苷（teniposide）；隱球菌素（cryptophycins） （特定地，隱球菌素1與隱球菌素8）；多拉抑素（dolastatin）；多卡米（duocarmycin） （包括合成類似物 KW-2189與CB1-TM1）；絲胺酸蛋白酶（eleutherobin）；胰抑素（pancratistatin）；沙卡地丁（sarcodictyin）；海綿抑素（spongistatin）；氮芥如氯芥苯丁酸、氯羅沙芬（chlomaphazine）、氯膦醯胺、雌莫司汀（estramustine）、異環磷醯胺（ifosfamide）、類二甲基二乙酸（mechlorethamine）、類二甲基二乙酸氧化物氯化氫、黴法蘭、諾維菌素（novembichin）、酚酯（phenesterine）、潑尼昔維汀（prednimustine）、曲伐醯胺（trofosfamide）、尿嘧啶芥（uracil mustard）；亞硝脲類，如卡莫司汀（carmustine），氯佐他星（chlorozotocin），氟託他汀（fotemustine），洛莫司汀（lomustine），尼莫司汀（nimustine）和雷尼司他汀（ranimnustine）；抗體如恩二烯（enediyne）抗生素（如卡奇黴素（calicheamicin），特別地，卡奇黴素（calicheamicin）伽馬1I 和卡奇黴素（calicheamicin）歐米加I1 （參見，如Agnew, Chem. Intl. Ed. Engl., 33: 183-186 （1994））；達內黴素（dynemicin），包括達內黴素A （dynemicin A）；埃斯波（esperamicin）；以及新抑癌素發色團（neocarzinostatin chromophore）與相關發色蛋白恩二烯抗體發色團）、阿什曲莫敏（aclacinomysins）、放線菌素（actinomycin）、奧沙拉黴素（authramycin）、西西他濱（azaserine）、博來黴素（bleomycins）、仙人掌黴素（cactinomycin）、卡那黴素（carabicin）、卡黴素（caminomycin）、卡齊黴素（carzinophilin）、染色質黴菌（chromomycinis）、更生黴素（dactinomycin）、道諾黴素、阿黴素（detorubicin）、6-重氮-5-氧代-L-正亮氨酸、阿德力黴素 ®多柔比星 （包括嗎啉-多柔比星、氰嗎啉-多柔比星、2-吡咯啉-多柔比星和去氧多柔比星）、表柔比星（epirubicin）、表柔比星（esorubicin）、伊達比星（idarubicin）、馬塞羅黴素（marcellomycin）、絲裂黴素（mitomycins）如絲裂黴素C、黴酚酸（mycophenolic acid）、諾卡黴素（nogalamycin）、奧利莫黴素（olivomycins）、培洛黴素（peplomycin）、普莫黴素（potfimromycin）、嘌呤黴素（puromycin）、三鐵阿黴素（quelamycin）、羅黴素（rodorubicin）、鏈黴菌素（streptonigrin）、鏈球菌素（streptozocin）、結核菌素（tubercidin）、烏苯達黴素（ubenimex）、淨諾抑素（zinostatin）、左柔比星（zorubicin）；抗代謝物如胺甲喋呤和5-氟基脲嘧啶 （5-FU）；葉酸類似物，如去蝶呤（denopterin）、胺甲喋呤、蝶呤素（pteropterin）、三甲氧嘧啶（trimetrexate）；嘌呤類似物如氟達拉濱（fludarabine）、6-巰基嘌呤（6-mercaptopurine）、噻蟲胺（thiamiprine）、硫鳥嘌呤（thioguanine）；嘧啶類似物如阿維菌素（ancitabine）、阿扎胞苷（azacitidine）、6-氮尿苷（6-azauridine）、卡莫氟（carmofur）、阿醣胞苷（cytarabine）、二脫氧尿苷（dideoxyuridine）、多西菌定（doxifluridine）、依諾沙星（enocitabine）、氟尿苷（floxuridine）；雄性激素例如咳嗽酮（calusterone）、屈他雄酮丙酸酯（dromostanolone propionate）、環硫雄醇（epitiostanol）、睪內酯（testolactone）、美雄酮（mepitiostane）；抗腎上腺素如胺魯米特（aminoglutethimide）、米托坦（mitotane）、三環烷（trilostane）；葉酸補充劑如克羅酸（frolinic acid）；乙醯丙酮胺（aceglatone）；二磷醯胺醣苷（aldophosphamide glycoside）；胺基乙醯丙酸（aminolevulinic acid）；恩尿嘧啶（eniluracil）；安吖啶（amsacrine）；貝司布新（bestrabucil ）；比生群（bisantrene）；依達曲沙（edatraxate）；地靈醯胺（defofamine）；地美可辛（demecolcine）；地吖醌（diaziquone）；依氟鳥氨酸（elfornithine）；依利醋銨（Elliptinium Acetate）；埃博黴素（epothilone）；依托格魯（etoglucid）；硝酸鎵；羥基尿素；香菇多醣（lentinan）；氯尼達明（lonidamine）；類美登素（maytansinoids）如美登素（maytansine）與安絲菌素（ansamitocine）；米托胍腙（mitoguazone）；米托蒽醌；美德眠（mopidanmol）；鈉硝石（nitraerine）；噴脫抑素（pentostatin）；蛋氨氮芥（phenamet）；批柔比星（pirarubicin）；洛索蒽醌（losoxantrone）；2-乙基醯肼；甲節肼（procarbazine）；PSK ®多醣錯合物（JHS Natural Products, Eugene, Oreg.）；雷佐生（razoxane）；根瘤菌素（rhizoxin）；西佐喃（sizofuran）；錯螺胺（spirogermanium）；細交鏈孢菌酮酸（tenuazonic acid）；三乙撐亞胺苯醌（triaziquone）；2,2′,2″-三氯三乙基胺；單端孢黴烯毒素（trichothecenes） （特別是T-2毒素、撫孢菌素（verracurin）A、桿孢菌素（roridin）A和蛇行菌素（anguidine））；胺基甲酸乙酯（urethane）；長春地辛（vindesine）（ELDISINE ®, FILDESIN ®）；達卡巴嗪（dacarbazine）；甘露醇氮芥（mannomustine）；二溴甘露醇（mitobronitol）；二溴衛矛醇（mitolactol）；哌血生（pipobroman）；卡胞嘧啶（gacytosine）；阿醣孢苷（arabinoside）（「Ara-C」）；噻替哌（thiotepa）；紫杉烷，如TAXOL ®紫杉醇（Bristol-Myers Squibb Oncology, Princeton, N.J.）；不含聚氧乙烯蓖麻油之ABRAXANE™；紫杉醇之白蛋白改造奈米顆粒配方 （American Pharmaceutical Partners, Schaumberg, Ill.），以及TAXOTERE ®歐洲紫杉醇（doxetaxel） （Rhône-Poulenc Rorer, Antony, France）；苯丁酸氮芥（chloranbucil）；吉西他濱（gemcitabine）（GEMZAR ®）；6-硫鳥噪呤；巰嘌呤；胺甲喋呤；鉑類似物如順鉑與卡鉑；長春鹼（VELBAN ®）；鉑；依托泊苷 （VP-16）；衣弗醯胺（ifosfamide）；米托蒽醌（mitoxantrone）；長春新鹼（ONCOVIN ®）；奧沙利鉑（oxaliplatin）；亞葉酸鈣（leucovovin）；長春瑞濱（vinorelbine）（NAVELBINE ®）；諾消靈（novantrone）；依那普利（edatrexate）；柔紅黴素（daunomycin）；胺蝶呤（aminopterin）；伊班膦酸鹽（ibandronate）；拓撲異構酶抑製劑RFS 2000；二氟基甲基鳥胺酸 （DMFO）；類維生素A如視黃酸；卡培他濱（capecitabine） （XELODA ®）；上述任一者之醫藥上可接受鹽類、酸或衍生物；以及上述二或多者之組合如CHOP，此為環磷酸醯胺、多柔比星、長春新鹼與普賴蘇農（prednisolone）之合併治療縮寫，以及FOLFOX，此為奧沙利鉑（oxaliplatin） （ELOXATIN™） 與5-FU及亞葉酸鈣（leucovovin）合併治療方案之縮寫。 抗體靶向 SSEA-4
本發明之一方面為靶向SSEA-4相關抗原之新穎抗體。
mAb 1J1s （ATCC寄存號碼 PTA-122679 ）為單株抗體，其係利用融合瘤細胞株（ATCC寄存號碼 PTA-122679 ）產生。本文所述抗體可含有與抗體1J1s相同的VH與VL鏈。結合至與1J1s相同表位之抗體亦落入本發明之範疇。
以下提供實例及其胺基酸與核酸結構/序列： 表1. 抗體1J1s之胺基酸與核苷酸序列
Figure 106110636-A0305-0001
mAb 1G1s （ATCC寄存號碼 PTA-122678 ）為小鼠單株抗體，其係利用融合瘤細胞株（ATCC寄存號碼 PTA-122678 ）產生。本文所述抗體可含有與抗體1G1s相同的VH與VL鏈。結合至與1G1s相同表位之抗體亦落入本發明之範疇。
以下提供實例及其胺基酸與核酸結構/序列： 表2.  抗體1G1s之胺基酸與核苷酸序列
Figure 106110636-A0305-0002
mAb 2F20s （ATCC寄存號碼 PTA-122676 ）為單株抗體，其係利用融合瘤細胞株（ATCC寄存號碼 PTA-122676 ）產生。本文所述抗體可含有與抗體2F20s相同的VH與VL鏈。結合至與2F20s相同表位之抗體亦落入本發明之範疇。
以下提供實例及其胺基酸與核酸結構/序列： 表3.  抗體2F20s之胺基酸與核苷酸序列
Figure 106110636-A0305-0003
「1J1s抗體」或「mAb 1J1s」或「源自殖株1J1s之抗體」意指利用殖株1J1s表現之抗體或以其他方式合成之抗體，但具有相同CDRs且可選擇地，具有與殖株1J1s所表現抗體相同的框架區。
本發明之一方面係特異於SSEA-4之新穎抗體。抗SSEA-4抗體結合至Neu5Acα2→ 3Galβ1→ 3GalNAcβ1→ 3Galα1→ 4Galβ1→ 4Glcβ1 （SSEA-4六醣）。
本文所述抗體之任一者可為全長抗體或其抗原結合片段。於一些實例中，抗原結合片段為Fab片段、F（ab'） 2片段、或單鏈Fv片段。於一些實例中，抗原結合片段為Fab片段、F（ab'） 2片段、或單鏈Fv片段。於一些實例中，抗體為人類抗體、人源化抗體、嵌合抗體、或單鏈抗體。
本文所述抗體之任一者具有一或多個特徵：（a）為重組型抗體、單株抗體、嵌合抗體、人源化抗體、人類抗體、抗體片段、雙特異性抗體、單特異性抗體、單價抗體、IgG 1抗體、IgG 2抗體或抗體之衍生物；（b）為人類、鼠科、人源化、或嵌合抗體、抗原結合片段、或抗體之衍生物；（c）為單鏈抗體片段、多體、Fab片段、及/或IgG、IgM、IgA、IgE、IgD同型之免疫球蛋白及/或其子類；（d）具有一或多個下列特徵：（i）介導癌細胞之ADCC及/或CDC；（ii）誘發及/或促進癌細胞之細胞凋亡；（iii）抑制癌細胞之標靶細胞增生；（iv）誘發及/或促進癌細胞之吞噬作用；及/或（v）誘發及/或促進細胞毒性劑釋放；（e）特異性結合腫瘤相關聯之醣類抗原，其為腫瘤特異性醣類抗原；（f）不結合表現於非癌細胞、非腫瘤細胞、良性癌細胞及/或良性腫瘤細胞上之抗原；及/或（g）特異性結合表現於癌症幹細胞及正常癌細胞上之腫瘤相關聯之醣類抗原。
較佳的是，抗體與其個別抗原之結合具特異性。「特異性」乙詞一般而言用於意指結合配對之一成員除了其特異性結合配對體以外，不會顯示與分子有任何顯著結合的情況，且除了本文指定之那些以外，其與任何其他分子具有小於約30%，較佳為20%、10%、或1 %之交叉反應性。
抗體適於結合具高親和性（低KD值）之標靶表位，且較佳地KD為奈莫耳範圍或更低。親和性可利用本領域習知之方法測定，如表面電漿共振法。 示例性抗體製備物
能結合本文所述Globo H表位與SSEA-4表位之示例性抗體可由本領域習知之任何方法製成。參見，例如，Harlow and Lane, （1988） Antibodies: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory, New York。 宿主動物之免疫作用及融合瘤技術
於一具體實施例中，本發明提供用於製造融合瘤之方法，其表現特異性結合至醣類抗原（如Globo H）之抗體。本方法含有下列步驟：以包括醣類抗原（如Globo H）之組合物進行動物免疫作用；由動物分離脾細胞；自脾細胞產生融合瘤；以及挑選可產生特異性結合至Globo H之抗體的融合瘤。Kohler and Milstein, Nature, 256: 495, 1975；Harlow, E. and Lane, D. Antibodies: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, N.Y., 1988。
於一具體實施例中，醣類抗原係用於小鼠皮下免疫注射。可或可不給予一或多次加強（boosts）。可利用如ELISA （酵素鍵結免疫吸附測定）或流式細胞術監測血漿中抗體效價。以具有足夠抗醣類抗原抗體效價之小鼠進行融合。於犧牲及移除脾臟之前，小鼠可或可不以抗原加強3天。分離小鼠脾細胞，並與PEG融合至小鼠骨髓瘤細胞株。所得融合瘤隨即經篩選其抗原特異性抗體之產生。將細胞接種，之後於選擇性培養基中培養。各孔之上清液隨即以ELISA篩選人類抗醣類抗原單株抗體。重複抗體篩選融合瘤、再次篩選，且若抗醣類抗原抗體仍呈現陽性，可利用有限稀釋次選殖。
佐劑可用於增加醣類抗原之一或多者之免疫原性。佐劑之非侷限實例包括磷酸鋁、氫氧化鋁、MF59 （4.3% w/v鯊烯、0.5% w/v聚山梨醇酯80 （Tween 80）、0.5% w/v去水山梨醇三油酸酯（Span 85））、含CpG之核酸、QS21 （皂素佐劑）、α-半乳糖基神經醯胺或其合成類似物（如C34，參見美國專利號8,268,969）、MPL （單磷醯基脂質A）、3DMPL （3-O-脫醯化MPL）、艾奎拉（Aquilla）萃取物、ISCOMS （參見，如Sjolander et al. （1998） J. Leukocyte Biol. 64:713；WO90/03184；W096/11711；WO 00/48630；W098/36772；WO00/41720；WO06/134423；以及WO07/026190）、LT/CT突變體、聚（D,L-丙交酯-共-乙交酯）（PLG）微粒、Quil A、介白素、弗氏佐劑（Freund's）、N-乙醯基胞壁醯基-L-蘇胺醯基-D-異麩醯胺酸（thr-MDP）、N-乙醯基去甲胞壁醯基-L-丙胺醯基-D-異麩醯胺酸（CGP 11637，稱作nor-MDP）、N-乙醯基胞壁醯基-L-丙胺醯基-D-異麩醯胺基-L-丙胺酸-2-（ -2'-二棕櫚醯基-sn-甘油基-3-羥基磷醯氧基）-乙胺（CGP 19835 A，稱作MTP-PE）及RIBI，其含有三成分萃取自細菌、單磷醯基脂質A、海藻糖二黴菌酸酯（trehalose dimycolate）及細胞壁骨架（MPL+TDM+CWS），係溶於2%鯊烯/Tween 80乳劑。
針對SSEA-4抗體之示例性多株抗體，可利用採集免疫接種之哺乳類動物血液而製備，檢查其血清中所需抗體之增加，並以任何常規方法由血液中分離血清。多株抗體包括含多株抗體之血清，以及可分離自血清之含多株抗體之分液。
多株抗體一般而言係於多次皮下（sc）或腹腔（ip）注射相關抗原與佐劑之宿主動物（如兔、小鼠、馬、或山羊）產生。以相關抗原結合對免疫接種物種具免疫原性之蛋白質可能有用，該蛋白質如鑰孔帽貝血氰蛋白（keyhole limpet hemocyanin）、血清白蛋白、牛甲狀腺球蛋白、或大豆胰蛋白酶抑制劑，其使用雙功能或衍生劑，如馬來醯亞胺基苯甲醯基磺基琥珀醯亞胺酯（經由半胱胺酸殘基結合作用）、N-羥基琥珀醯亞胺（經由離胺酸殘基）、戊二醛、琥珀酸酐、SOCl 2等。
任何哺乳類動物可免疫接種抗原以產生所需之抗體。一般而言，可使用囓齒類、兎形類、或靈長類動物。囓齒類動物包括例如，小鼠、大鼠、及倉鼠。兎形類動物包括例如，兔。靈長類動物包括例如，狹鼻類（Catarrhini）猴子（舊大陸猴），如食蟹獼猴（Macaca fascicularis）、恆河猴（rhesus monkey）、狒狒及黑猩猩。
以抗原免疫接種動物之方法係本領域習知。腹腔注射或皮下注射抗原為哺乳類動物免疫作用之標準方法。更特別地，抗原可稀釋並懸浮於適量磷酸緩衝鹽液（PBS）、生理食鹽水等。視需求，抗原懸液可混合適量標準佐劑，如弗氏完全佐劑（Freund's complete adjuvant），製成乳劑，接著投予哺乳類動物。以抗原、免疫原性共軛物、或衍生物免疫接種動物，其係藉由結合1 mg或1 µg之胜肽或共軛物（分別針對兔或小鼠）與3倍體積之弗氏不完全佐劑（Freund's incomplete adjuvant）。
動物可經加強直到力價高峰，其係每隔4至21天投予數次抗原混合適量之弗氏不完全佐劑。動物係皮下注射多處溶於弗氏完全佐劑之1/5至1/10原始量之胜肽或共軛物以進行加強。於7至14天後，將動物放血並分析血清之抗體效價。亦可使用適當載體進行免疫作用。於如上述之免疫作用後，以標準方法檢查血清中所需抗體之增加量。較佳地，動物係以相同抗原之共軛物加強，但結合至不同蛋白質及/或經由不同交聯試劑。共軛物亦可於重組型細胞培養基中製造，稱作蛋白質融合體。同時，凝集劑，如明礬，係適於增進免疫反應。
在過去二十至三十年中，開發出一些製備嵌合、人源化、或人類抗體之方法，其可用於人類體內治療應用。最常使用且經證實之方法學為利用融合瘤方法學製備小鼠mAbs，之後將mAbs之VH與VL區及恆定區之框架區轉換成人類VH與VL區之最同源人類框架區及所需人類γ免疫球蛋白同型與子類之恆定區。許多臨床上使用的mAbs，如喜瑞樂（Xolair），係人類γ1、κ同型與子類之人源化mAbs，並利用此方法學製備。
於特定具體實施例中，抗體可以常規融合瘤技術製造。Kohler et al., Nature, 256:495 （1975）。於融合瘤方法中，小鼠或其他適當宿主動物，如倉鼠或兔，係以上述方法進行免疫接種，以引發產生或能產生抗體之淋巴細胞，其將特異性結合至用於免疫作用之蛋白質。或者，淋巴細胞可體外進行免疫接種。
欲製備單株抗體，由免疫接種抗原之哺乳類動物收集免疫細胞，並如上述檢查血清中所需抗體之增加濃度，且進行細胞融合。用於細胞融合之免疫細胞較佳地係取自脾臟。其他欲融合上述免疫細胞之較佳親代細胞包括例如，哺乳類動物骨髓瘤細胞，更佳地係具有可利用藥物篩選出融合細胞之性質的骨髓瘤細胞。
較佳之骨髓瘤細胞係那些有效融合者、支援以篩選之抗體生產細胞穩定高濃度生產抗體者、及對培養基如HAT培養基敏感者。這些中，較佳之骨髓瘤細胞株為鼠科骨髓瘤株，如那些衍生自MOPC-21與MPC-11小鼠腫瘤者，係購自Salk Institute Cell Distribution Center，San Diego，Calif. USA，以及SP-2細胞，係購自美國菌種保存中心，Rockville，Md. USA。亦有提及人類骨髓瘤及小鼠-人類異源骨髓瘤細胞株用於產生人類單株抗體（Kozbor, J. Immunol., 133:3001 （1984）；Brodeur et al., Monoclonal Antibody Production Techniques and Applications, pp. 51-63 （Marcel Dekker, Inc.，New York，1987））。
上述免疫細胞與骨髓瘤細胞可依據習知方法融合，例如，Milstein等人的方法（Galfre et al., Methods Enzymol. 73:3-46, 1981）。以適當之融合劑，如聚乙二醇，融合淋巴細胞與骨髓瘤細胞，以形成融合瘤細胞 （Goding, Monoclonal Antibodies: Principles and Practice, pp.59-103 （Academic Press，1986））。所得之取自細胞融合之融合瘤，可利用將其培養於標準選擇培養基，如HAT培養基（含有次黃嘌呤、胺喋呤、及胸腺嘧啶核苷之培養基），以進行篩選。通常，細胞培養係於HAT培養基中持續數天至數週，該時間係足以容許除了所需之融合瘤（非融合細胞）以外之所有其他細胞死亡。之後，進行標準有限稀釋，以篩選及選殖可產生所需抗體之融合瘤細胞。
將製備之融合瘤細胞種植與生長於適用之培養基，該培養基較佳地含有一或多個抑制未經融合之親代骨髓瘤細胞之物質。舉例而言，若親代骨髓瘤細胞缺乏酵素次黃嘌呤鳥糞嘌呤磷酸核糖轉移酶（HGPRT或HPRT），融合瘤使用之培養基通常將包括次黃嘌呤、胺喋呤、及胸腺嘧啶核苷（HAT培養基），該物質防止HGPRT缺陷細胞的生長。
以生長融合瘤細胞的培養基試驗針對抗原之單株抗體生產。較佳地，利用免疫沈澱或利用體外結合試驗測定融合瘤細胞所產生單株抗體結合特異性。測定酵素鍵結免疫吸附試驗（ELISA）、酵素免疫試驗（EIA）、放射免疫試驗（RIA）、及/或免疫螢光之吸光度可用於測定本發明抗體之抗原結合活性。於ELISA中，本發明抗體係固定於培養盤上，將本發明之蛋白施加於培養盤，之後施加含有所需之抗體的樣本，如抗體生產細胞之培養基上清液或純化之抗體。隨後，施加二級抗體，其辨識一級抗體，且標記一酵素，如鹼性磷酸酶，並培養該培養盤。接著，於清洗後，將酵素受質，例如對硝苯基磷酸酯，加入培養盤，並測定吸光度以評估樣本之抗原結合活性。本方法可使用蛋白質片段，如碳端或氮端片段。可使用BIAcore （Pharmacia），以評估本發明抗體之活性。可以Munson et al., Anal. Biochem., 107:220 （1980）提出之斯卡查德分析（Scatchard analysis）測定單株抗體之結合親和性。
應用包括上述的那些常規方法之任一者，可鑑定出產生結合本文所述表位之抗體的融合瘤細胞，並選取以進一步確認。
於融合瘤細胞經鑑定產生所需特異性、親和性、及/或活性之抗體後，殖株可藉由有限稀釋程序及標準方法生長以成為次殖株（Goding, Monoclonal Antibodies: Principles and Practice, pp.59-103 （Academic Press, 1986））。適用此目的之培養基包括例如，D-MEM或RPMI-1640培養基。利用常規免疫球蛋白純化程序，如蛋白A瓊脂糖、氫氧磷灰石層析術、凝膠電泳、透析、或親和性層析術，將次殖株分泌出之單株抗體適當地從培養基、腹水液、或血清中分離。
此外，融合瘤細胞可於動物體內生長成腹水腫瘤。舉例而言，所得之融合瘤可隨即移植至小鼠腹腔並收取腹水。
所得單株抗體可藉由，例如，硫酸銨沉澱、蛋白A或蛋白G管柱、DEAE離子交換層析、或可耦合本發明蛋白質之親和性管柱來純化。本發明之抗體可用於不僅是本發明蛋白質之純化與檢測，還可作為本發明蛋白質促效劑與拮抗劑之候選。此外，此抗體可應用於本發明蛋白質相關之疾病抗體治療。 重組型技術
所得單株抗體亦可使用基因工程技術進行重組型製備（參見，例如，Borrebaeck C. A. K. and Larrick J. W. Therapeutic Monoclonal Antibodies, published in the United Kingdom by MacMillan Publishers LTD, 1990）。可從免疫細胞，如融合瘤或生產抗體之免疫接種淋巴細胞選殖出編碼抗體之DNA、插入適當載體中、及導入宿主細胞，以製備重組型抗體。本發明亦提供如上述製備之重組型抗體。
當所得抗體欲投予人體時（抗體治療），人類抗體或人源化抗體較佳係用於減少免疫原性。舉例而言，具有人類抗體基因庫之轉基因動物可以藉由選自於蛋白質、表現蛋白之細胞、或其溶解產物的抗原而免疫。隨後，自動物收集抗體生產細胞並與骨髓瘤細胞融合，以取得融合瘤，由其中製備防蛋白之人類抗體。或者，生產抗體之免疫細胞，如免疫接種之淋巴細胞，可利用致癌基因進行永生且用於製備單株抗體。
使用常規流程，編碼單株抗體之DNA可易於分離且定序（如憑藉使用能特異性結合至編碼有鼠科抗體重鏈與輕鏈之基因的寡核苷酸探針）。融合瘤細胞可作為此類DNA之較佳來源。一旦經分離，DNA可置入表現載體，其隨後轉染至不另外產生免疫球蛋白之宿主細胞，如大腸桿菌細胞、猴COS細胞、中國倉鼠卵巢（CHO）細胞、或骨髓瘤細胞，以得到重組型宿主細胞中單株抗體的合成。細菌重組表現編碼抗體DNA之回顧文獻包括Skerra et al., Curr. Opinion in Immunol., 5:256-262 （1993）及Pluckthun, Immunol. Rev., 130:151-188 （1992）。
上述利用融合瘤細胞生產編碼抗體之DNAs可經由常規技術進行基因改良，以產生基因工程抗體。基因工程抗體，如人源化抗體、嵌合抗體、單鏈抗體、及雙特異性抗體，可利用常規重組型技術生產。隨後可改良DNA，例如，取代人類重鏈與輕鏈恆定結構域之編碼序列，置換成同源鼠科序列，Morrison et al., （1984） Proc. Nat. Acad. Sci. 81:6851，或以非免疫球蛋白多胜肽編碼序列之全部或部分結合連接免疫球蛋白編碼序列。以此方式，可製備具有標靶抗原結合特異性之基因工程抗體，如「嵌合」或「雜交」抗體。
經開發用於生產「嵌合抗體」之技術係本領域習知。參見，如Morrison et al. （1984） Proc. Natl. Acad. Sci. USA 81, 6851；Neuberger et al. （1984） Nature 312, 604；以及Takeda et al. （1984） Nature 314:452。
通常，此類免疫球蛋白多胜肽係用於取代抗體恆定區，或其係用於取代抗體之一抗原結合位點之可變區，以創建嵌合型二價抗體，其包含一具有抗原特異性之抗原結合位點與另一具有不同抗原特異性之抗原結合位點。
亦可使用習知之合成蛋白化學方法體外製備嵌合或雜交抗體，包括那些涉及交聯劑者。舉例而言，使用二硫化物交換反應或藉由形成硫醚鍵，可構築免疫毒素。此目的之適用試劑實例包括亞胺基硫醇酯及甲基-4-巰基丁醯亞胺酯。
非人類抗體之人源化方法係本領域習知。一般而言，人源化抗體具有由非人來源導入的一或多個胺基酸殘基。這些非人類胺基酸殘基常稱作「輸入」殘基，其通常取自一「輸入」可變區。人源化反應基本上可以下列Winter與其同事之方法進行（Jones et al., Nature, 321:522-525 （1986）；Riechmann et al., Nature, 332:323-327 （1988）；Verhoeyen et al., Science, 239:1534-1536 （1988）），其係以囓齒動物CDRs或CDR序列取代人類抗體之相應序列。據此，此類「人源化」抗體為嵌合抗體（美國專利號4,816,567），其中實質上小於一完整人類可變區係由非人類物種之相應序列取代。於執行上，人源化抗體通常為人類抗體，其中一些CDR殘基與可能的一些FR殘基係由囓齒動物抗體之類似位置之殘基取代。
用於製造人源化抗體以減少抗原性的人類可變區之選擇，輕鏈與重鏈皆極其重要。依據所謂「最合適」方法，針對習知之人類可變區序列庫，篩選出囓齒動物之抗體可變區序列。最接近囓齒動物之人類序列隨即入選作為人源化抗體之人類框架（FR）（Sims et al., J. Immunol., 151:2296 （1993）；Chothia et al., J. Mol. Biol., 196:901 （1987））。另一方法使用衍生自特定亞群之輕鏈或重鏈之人類抗體共通序列的特定框架。相同框架可用於數種不同人源化抗體（Carter et al., Proc. Natl. Acad Sci. USA, 89:4285 （1992）；Prestaetal., J. Immnol., 151:2623 （1993））。
更重要的是，經人源化之抗體保留抗原及其他有利生物性質之高度親和性。欲達成此目的，依據較佳之方法製備人源化抗體，其係利用親代與人源化序列三維模型之親代序列與各概念性人源化產物之分析方法。三維免疫球蛋白模型常可取得，且為本領域技術人員習知。電腦程式係可得，其描繪與顯示所選取之候選免疫球蛋白序列可能的三維構型結構。檢查這些顯示結果，使得能分析殘基在候選免疫球蛋白序列功能上的可能角色，亦即分析殘基影響候選免疫球蛋白結合其抗原的能力。以此方式，可從受體與輸出序列中篩選出FR殘基並組合，因此達到標靶抗原所需之抗體特性，如增加親和性。一般而言，CDR殘基係直接且最實質上涉及影響抗原結合。
或者，現有已可能生產轉基因動物（如小鼠），其能在免疫作用時，於缺乏內源性免疫球蛋白生成之下，產生完整庫之人類抗體。舉例而言，已經描述過的嵌合與種系突變體小鼠抗體之重鏈連接區（J H）基因之同型組合刪除，造成內源性抗體產生之競爭抑制作用。於此類種系突變體小鼠中轉移人類種系免疫球蛋白基因陣列，於抗原攻擊時（antigen challenge），將造成人類抗體產生。參見，如Jakobovits et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 90:2551 （1993）；Jakobovits et al., Nature, 362:255-258 （1993）；Bruggermann et al., Year in Immuno., 7:33 （1993）。人類抗體亦可衍生自噬菌體顯示庫（Hoogenboom et al., J. Mol. Biol., 227:381 （1991）；Marks et al., J. Mol. Biol., 222:581-597 （1991））。
編碼本文所述SSEA-4抗體核酸之任一者（包括重鏈、輕鏈、或兩者）、載體，如包含核酸之一或多者之表現載體、及包含載體之一或多者之宿主細胞皆落入本發明之範疇。於一些實例中，載體包含一核酸，其包含編碼本文所述Globo H抗體之重鏈可變區或輕鏈可變區之核苷酸序列。於一些實例中，載體包含一核酸，其包含編碼本文所述SSEA-4抗體之重鏈可變區或輕鏈可變區之核苷酸序列。於其他實例中，載體包含編碼重鏈可變區與輕鏈可變區之核苷酸序列，其之表現可利用單一啟動子或二個別啟動子控制。於此亦提供用於產生本文所述之Globo H抗體與SSEA-4抗體之任一者的方法，如經由本文所述之重組型技術。 其他製備抗體之技術
於特定具體實施例中，可利用商業購得之小鼠取得完整人類抗體，該小鼠經基因工程以表現特定人類免疫球蛋白。經設計以產生更理想（如完整人類抗體）或更健全免疫反應之轉基因動物，亦可用於產生人源化或人類抗體。此技術之實例為Amgen, Inc. （Fremont，Calif.）之Xenomouse RTM及Medarex, Inc. （Princeton，N.J.）之HuMAb-Mouse RTM與TC Mouse TM。或者，抗體可利用噬菌體顯示技術進行重組型製造。參見，例如，美國專利號5,565,332；5,580,717；5,733,743；以及6,265,150；以及Winter et al., （1994） Annu. Rev. Immunol. 12:433-455。或者，噬菌體顯示技術（McCafferty et al., （1990） Nature 348:552-553）可用於從未經免疫接種供應體之免疫球蛋白可變（V）區基因庫，以體外方式生產人類抗體與抗體片段。
可經由常規方法製備完整抗體（亦即，全長抗體）之抗原結合片段。舉例而言，可利用抗體分子之胃蛋白酶分解產生F（ab'） 2片段，且可利用F（ab'） 2片段二硫化物橋接之還原反應，產生Fab片段。
或者，本文所述之Globo H抗體與SSEA-4抗體可分離自抗體噬菌體庫（如單鏈抗體噬菌體庫），其係利用McCafferty et al., Nature, 348:552-554 （1990）；Clackson et al., Nature, 352:624-628 （1991）；以及Marks et al., J. Mol Biol., 222:581-597 （1991）所述之技術產生。後續出版品描述了利用鏈洗牌（chain shuffling）方式產生高親和性（nM範圍）人類抗體（Marks et al., Bio/Technology, 10:779-783 （1992）），以及組合感染與體內重組之策略構築極大之噬菌體庫（Waterhouse et al., Nuc. Acids. Res., 21:2265-2266 （1993））。因此，這些技術為用於分離單株抗體之傳統單株抗體融合瘤技術的可行替代方法。
本文所得之抗體可純化至均質化。舉例而言，可使用一般蛋白質之分離與純化方法進行抗體之分離與純化。舉例而言，抗體之分離與純化可利用適當選取與組合用途之管柱層析術，如親和性層析術、過濾、超過濾、鹽析、透析、SDS聚丙烯醯胺凝膠電泳、等電聚焦、及其他（Antibodies: A Laboratory Manual. Ed Harlow and David Lane, Cold Spring Harbor Laboratory, 1988），但不侷限於此。上述所得抗體之濃度可利用析光度測量、酵素鍵結免疫吸附試驗（ELISA）等決定。除了親和性層析術之外，示例性層析術包括例如，離子交換層析術、疏水性層析術、凝膠過濾、逆相層析術、吸附層析術等（Strategies for Protein Purification and Characterization: A Laboratory Course Manual. Ed Daniel R. Marshak et al., Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1996）。層析程序之進行可利用液相層析術，如HPLC或FPLC。
抗體之確認可利用本領域習知之方法。舉例而言，一方法為鑑定抗原結合之表位，或「表位指紋圖（epitope mapping）」。有許多本領域之習知方法用於測繪及確認蛋白質之表位位置，包括描述於例如，Harlow and Lane, Using Antibodies, a Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, N.Y., 1999之第11章中的解析抗體-抗原複合體之晶體結構、競爭試驗、基因片段表現試驗、及合成胜肽為主之試驗。此外，表位指紋圖可用於決定抗體結合之序列。表位可為直鏈型表位（如含於單獨延伸之胺基酸中）或構形表位，其係由胺基酸之三維交互作用形成，其不一定含於單獨延伸之中（一級結構直鏈型序列）。可分離或合成（如重組型方式）不同長度之胜肽（如至少4至6個胺基酸之長度），且用於抗體結合試驗。於另一實例中，可利用系統性篩選方式決定抗體結合表位，其係利用衍生自標靶抗原序列之重疊胜肽，並以抗體確定結合作用。依據基因片段表現試驗，編碼標靶抗原之開讀框係經隨機分段或利用特異性基因構築，並測定抗原表現片段與欲測試抗體之反應性。舉例而言，可利用PCR產生基因片段，之後於放射性胺基酸存在下，體外轉錄與轉譯成蛋白質。隨後，利用免疫沈澱與凝膠電泳測定抗體與放射性標記抗原片段之結合。亦可利用顯示於噬菌體顆粒表面上之大型隨機胜肽序列庫（噬菌體庫）鑑定特定表位。或者，可於簡易結合試驗中，測試一經定義之重疊胜肽片段庫與受測抗體之結合。
於額外之實例中，可進行抗原結合區之突變、區置換實驗、及丙胺酸掃描突變，以鑑定表位結合所需、足夠、及/或必需之殘基。舉例而言，可利用標靶抗原之突變體進行區置換實驗，其中針對候選抗體之結合表位各殘基係經緊密相關但抗原獨特的蛋白質（如神經滋養蛋白家族之另一成員）之序列替代（置換）。藉由評估抗體與突變體標靶蛋白之結合，可評估特定抗原片段與抗體結合之重要性。
或者，可利用其他習知之結合至相同抗原之抗體進行競爭試驗，以決定是否抗體如同其他抗體一般結合至相同表位（如本文所述之MC45抗體）。競爭試驗亦為本領域技術人員習知。 示例性適用之一般抗體生產方法之其他態樣
於動物中（如小鼠、兔、山羊、綿羊、或馬）製造單株與多株抗體及其片段之方法係本領域習知。參見，例如，Harlow and Lane, （1988） Antibodies: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory, New York。「抗體」乙詞包括完整免疫球蛋白分子及其片段，如Fab、F（ab'） 2、Fv、scFv （單鏈抗體）、及dAb （區抗體；Ward, et. al. （1989） Nature, 341, 544）。
本文揭示之組合物可包括於醫藥組合物且伴隨額外之活性劑、載體、載劑、賦形劑、或輔助劑，本領域之技術人員在閱讀本揭露內容時可易於辨別。
醫藥組合物較佳係包含至少一醫藥上可接受載體。於此類醫藥組合物中，本文揭示之組合物形成「活性化合物」，亦稱作「活性劑」。本文中使用的術語「醫藥上可接受載體」包括載劑、分散介質、塗層、抗菌劑與抗真菌劑、等張與吸收延遲劑、及其類似物，其與醫藥投予相容。補充性活性化合物亦可併入組合物中。醫藥組合物係配製成與其預期投予途徑相容。投予途徑之實例包括非口服，如靜脈、皮內、皮下、口服（如吸入）、經皮（如局部）、經黏膜、及直腸投予。用於非口服、皮內、或皮下應用之溶液或懸液可包括下列成分：無菌稀釋劑如注射用水、鹽液、固定油、聚乙二醇、甘油、丙二醇、或其他合成溶劑；抗菌劑如苯甲醇或對羥苯甲酸甲酯；抗氧化劑如抗壞血酸或亞硫酸氫鈉；螫合劑如伸乙二胺四乙酸；緩衝液如乙酸鹽、檸檬酸鹽、或磷酸鹽；以及張力調整劑如氯化鈉或葡萄糖。pH值可以是用酸或鹼調整，如鹽酸或氫氧化鈉。非口服製備物可以封閉在安瓿、拋棄式注射器、或玻璃或塑料製之多劑型小瓶。
本發明係提供含有至少一SSEA-4抗體或至少一包含編碼SSEA-4抗體序列之多核苷酸的組合物。於特定具體實施例中，組合物可為醫藥組合物。如本文所用之組合物包含一或多個抗體，其結合至一或多個 SSEA-4，及/或一或多個多核苷酸，其包含編碼一或多個結合至一或多個SSEA-4之抗體的序列。這些組合物可進一步包含適用之載體，如醫藥上可接受賦形劑，包括緩衝液，其係本領域習知。
於一具體實施例中，SSEA-4抗體為單株。於另一具體實施例中，其係提供SSEA-4抗體之片段（如Fab、Fab’-SH、及F（ab’） 2片段）。這些抗體片段可利用傳統方式創建，如酵素分解，或可利用重組型技術產生。此類抗體片段可為嵌合、人源化、或人類。這些片段係適用於如下所示之診斷及治療目的。
各方法係本領域習知，用於產生噬菌體顯示庫，自其可取得感興趣之抗體。產生感興趣抗體之一方法為通過使用噬菌體抗體庫，其係描述於Lee et al., J. Mol. Biol. （2004）, 340（5）: 1073-93。
本發明之SSEA-4抗體可利用組合庫製造，以篩選具有所需活性之合成抗體殖株。原則上，合成抗體殖株係利用篩選噬菌體庫而選取，其含有顯示各抗體可變區（Fv）片段融合至噬菌體外鞘蛋白之噬菌體。此類噬菌體庫係利用針對所需抗原之親和性層析術進行選汰。將表現能結合所需抗原之Fv片段殖株吸附至抗原，從而於庫中分離出非結合殖株。結合殖株隨後從抗原溶析出，且可進一步利用額外之抗原吸附/溶析循環富集化。本發明SSEA-4抗體之任一者可藉由設計一適用之抗原篩選程序取得，以選取感興趣之噬菌體殖株，接著構築全長SSEA-4抗體殖株，其係利用感興趣噬菌體殖株之Fv序列與適用之恆定區（Fc）序列，其係描述於Kabat et al., Sequences of Proteins of Immunological Interest, Fifth Edition, NIH Publication 91-3242, Bethesda Md. （1991），第1-3卷。
抗體之抗原結合區係由約110個胺基酸之二可變（V）區形成，每一者來自輕鏈（VL）與重鏈（VH），兩者皆呈現三高度可變環圈或互補決定區（CDRs）。可變區可功能上顯示於噬菌體上，其可為單鏈Fv （scFv）片段，其中VH與VL係經由短型撓性胜肽共價連接，或可為Fab片段，其各融合至恆定區且非共價交互作用，其係描述於Winter et al., Ann. Rev. Immunol., 12: 433-455 （1994）。如本文所用之scFv編碼噬菌體殖株與Fab編碼噬菌體殖株係統稱為「Fv噬菌體殖株」或「Fv殖株」。
VH與VL基因庫可個別以聚合酶鏈反應（PCR）選殖，且隨機重組於噬菌體庫，其可隨即用於尋找抗原結合殖株，其係描述於Winter et al., Ann. Rev. Immunol., 12: 433-455 （1994）。源自免疫接種源之庫係提供針對免疫原之高親和性抗體而無需構築融合瘤。或者，可選殖原始基因庫，以提供單一來源之人類抗體予廣泛圍非自身及自身抗原而無任何免疫作用，其係描述於Griffiths et al., EMBO J, 12: 725-734 （1993）。最後，原始庫亦可以合成方式製造，其係藉由自幹細胞選殖未經重排之V基因片段，並使用含有隨機序列之PCR引子，以編碼高度可變的CDR3區且完成體外重排，其係描述於Hoogenboom and Winter, J. Mol. Biol., 227: 381-388 （1992）。
絲狀噬菌體係用於顯示抗體片段，其係藉由融合至次要外鞘蛋白pIII。抗體片段可顯示成單鏈Fv片段，其中VH與VL區係藉由一撓性多胜肽間隔子連接相同多胜肽鏈，其係描述於Marks et al., J. Mol. Biol., 222: 581-597 （1991），或顯示成Fab片段，其中一鏈係融合至pIII且其他者係分泌至細菌宿主細胞周質，其係組裝Fab外鞘蛋白結構之處，其藉由置換一些野生型外鞘蛋白而於噬菌體表面上顯示，其係描述於Hoogenboom et al., Nucl. Acids Res., 19: 4133-4137 （1991）。
一般而言，核酸編碼抗體基因片段係取自人類或動物所收取之免疫細胞。若一庫偏向有利於SSEA-4殖株，則個體以SSEA-4免疫接種，以產生抗體反應，並回收脾臟細胞及/或循環B細胞或其他週邊血液淋巴細胞（PBLs）以進行庫構築。於一具體實施例中，取得偏向有利於抗人類SSEA-4殖株之人類抗體基因片段庫，其係藉由在攜帶功能性人類免疫球蛋白基因陣列（且缺乏功能性內源性抗體生產系統）之轉基因小鼠產生人類SSEA-4抗體反應，使得SSEA-4免疫作用引發B細胞產生針對SSEA-4之人類抗體。人類抗體產生型轉基因小鼠之產生係描述如下。
利用適當篩選程序分離表現SSEA-4特異性抗體之B細胞，如利用SSEA-4親和性層析術分離細胞或將細胞吸附於螢光染料標記之SSEA-4且隨後利用流動活化細胞分選（flow-activated cell sorting；FACS），可取得額外之抗SSEA-4反應性細胞群富集化。
或者，使用未經免疫接種供應體之脾臟細胞及/或B細胞或其他PBLs，可較佳呈現可能的抗體庫，且亦容許利用任何動物（人類或非人類）物種構築抗體庫，其中SSEA-4係非抗原性。針對併入體外抗體基因構築之庫，從個體收取幹細胞，以提供編碼未重排抗體基因片段之核酸。感興趣之免疫細胞可取自各種動物物種，如人類、小鼠、大鼠、兔形目（lagomorpha）、狼（luprine）、犬（canine）、貓（feline）、豬（porcine）、牛（bovine）、馬（equine）、及鳥禽（avian）物種等。
編碼抗體可變基因片段（包括VH與VL片段）之核酸係回收自感興趣之細胞並放大。於重組VH與VL基因庫之情況中，所需DNA之取得可利用從淋巴細胞分離基因體DNA或mRNA，接著進行聚合酶鏈反應（PCR），其中引子符合5’端與3’端重組VH與VL基因，其係描述於Orlandi et al., Proc. Natl. Acad. Sci. （USA）, 86: 3833-3837 （1989），從而製造不同V基因庫以進行表達。V基因可從cDNA與基因體DNA放大，其中外顯子5′端之反向引子編碼成熟之V區及基於J片段之正向引子，其係描述於Orlandi et al. （1989）與Ward et al., Nature, 341: 544-546 （1989）。然而，針對從cDNA放大，反向引子亦可基於前導序列外顯子，其係描述於Jones et al., Biotechnol., 9: 88-89 （1991），且正向引子位於恆定區，其係描述於Sastry et al., Proc. Natl. Acad. Sci. （USA）, 86: 5728-5732 （1989）。欲最大化互補性，簡併性可插入引子中（degeneracy），其係描述於Orlandi et al. （1989）或Sastry et al. （1989）。於特定具體實施例中，將庫之差異性最大化，其係利用PCR引子靶向各V基因家族，以放大存在於免疫細胞核酸樣本之所有可得之VH與VL排列，例如，描述於Marks et al., J. Mol. Biol., 222: 581-597 （1991）之方法，或描述於Orum et al., Nucleic Acids Res., 21: 4491-4498 （1993）之方法。針對將放大之DNA選殖至表現載體，可將稀有限制位導入PCR引子內以作為一端之標記，其係描述於Orlandi et al. （1989），或進一步利用標記引子進行PCR放大反應，其係描述於Clackson et al., Nature, 352: 624-628 （1991）。
以合成方式重排之V基因庫可從V基因片段體外衍生。多數人類VH基因片段係經選殖與定序（報導於Tomlinson et al., J. Mol. Biol., 227: 776-798 （1992）），且測繪（報導於Matsuda et al., Nature Genet., 3: 88-94 （1993）；這些選殖片段（包括H1與H2環圈之所有主要構形）可用於產生不同VH基因庫，其中PCR引子編碼不同序列與長度之H3環圈，其係描述於Hoogenboom and Winter, J. Mol. Biol., 227: 381-388 （1992）。VH庫亦可以所有專注於單一長度長型H3環圈之序列多樣性製造，其係描述於Barbas et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 89: 4457-4461 （1992）。人類Vκ與Vλ片段係經選殖與定序（報導於Williams and Winter, Eur. J. Immunol., 23: 1456-1461 （1993）），且可用於製造合成之輕鏈庫。合成之V基因庫，基於一範圍之VH與VL摺疊，及L3與H3長度，將編碼相當之結構多樣性抗體。於放大V基因編碼DNAs之後，可於體外重排種系V基因片段，其方法係依據Hoogenboom and Winter, J. Mol. Biol., 227: 381-388 （1992）。
可藉由數個方法結合VH與VL基因庫以構築抗體片段庫。各庫可以不同載體創建，且於體外重組載體，其係描述於Hogrefe et al., Gene, 128: 119-126 （1993），或於體內組合感染，如loxP系統，其係描述於Waterhouse et al., Nucl. Acids Res., 21: 2265-2266 （1993）。體內重組方法係利用Fab片段之二鏈本質，以克服大腸桿菌轉形效率造成的庫大小限制。初級VH與VL庫係分開選殖，一者進入噬粒（phagemid）且其他者進入噬菌體載體。該二庫隨後藉由噬菌體感染含噬粒之細菌而結合，使得各細包含有不同組合，且該庫大小僅受限於存在之細胞數目（約1012個殖株）。兩載體含有體內重組訊息，使得VH與VL基因重組為單一複製子（replicon），且係共同組裝成噬菌體病毒體。這些巨型庫提供大量良好親和性之不同抗體。
或者，該庫可依序選殖至相同載體，其係描述於例如Barbas et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 88: 7978-7982 （1991），或利用PCR組裝在一起然後選殖，其係描述於例如Clackson et al., Nature, 352: 624-628 （1991）。PCR組裝亦可用於連接VH和VL DNAs與編碼撓性胜肽間隔子之DNA，以形成單鏈Fv （scFv）庫。於又另一技術，「以細胞PCR組裝」係於淋巴細胞內藉由PCR結合VH與VL基因，之後選殖連接之基因庫，其係描述於Embleton et al., Nucl. Acids Res., 20: 3831-3837 （1992）。
該庫之篩選可利用任何本領域之習知技術完成。舉例而言，SSEA-4標靶可用於塗佈吸附盤之孔，於貼在吸附盤之宿主細胞上表現或用於細胞分選，或結合至生物素以捕捉鏈黴親和素塗佈珠粒，或用於任何其他本領域習知方法以淘選噬菌體顯示庫。
將噬菌體庫樣本接觸經固定之SSEA-4，其條件為適合至少一部分噬菌體顆粒與吸附劑之結合。正常而言，所選擇的條件，包括pH、離子強度、溫度、及其類似物，係模擬生理條件。結合於固相之噬菌體係經清洗，且之後以酸溶析，其係描述於Barbas et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 88: 7978-7982 （1991），或以鹼溶析，其係描述於Marks et al., J. Mol. Biol., 222: 581-597 （1991），或利用SSEA-43/抗原競爭反應，其程序類似Clackson et al., Nature, 352: 624-628 （1991）之抗原競爭方法。噬菌體可於單一回合篩選中富集20-1,000倍。此外，富集之噬菌體可培養於細菌培養基，且進行進一步之篩選。
篩選效率取決於許多因素，包括清洗時的分離動力學，以及是否單一噬菌體上之多個抗體片段可同時與抗原接觸。藉由使用短暫清洗、多價噬菌體顯示、及固相之抗原高塗佈密度，可保留具有快速分離動力學（與弱結合親和性）之抗體。高密度不僅經由多價交互作用穩定噬菌體，還有利於分離之抗體與噬菌體的再結合。欲提升緩慢分離動力學（與良好結合親和性）之抗體篩選，可利用長時間清洗及單價噬菌體顯示，其係描述於Bass et al., Proteins, 8: 309-314 （1990）及WO 92/09690，以及低塗佈密度之抗原，其係描述於Marks et al., Biotechnol., 10: 779-783 （1992）。
針對SSEA-4，即使親和性稍微不同，亦可能在不同親和性噬菌體抗體之間篩選。然而，經篩選抗體之隨機突變（如上述一些親和性成熟技術所進行之實驗）可產生許多突變體，多數結合於抗原，且少數具有更高的親和性。藉由侷限之SSEA-4，可競爭出稀少之高親和性噬菌體。欲保留所有較高親和性突變體，噬菌體可培養於過量生物素化SSEA-4，但生物素化SSEA-4之莫耳濃度低於SSEA-4之標靶莫耳親和性常數。隨後可利用鏈黴親和素塗佈之順磁性珠粒捕捉高親和性結合噬菌體。此「恆定捕捉（equilibrium capture）」容許抗體依據其結合親和性篩選，其敏感性使得能從大量過多較低親和性之噬菌體中分離具最少二倍高親和性之突變體殖株。用於清洗結合於固相之噬菌體的條件亦可基於分離動力學操作而辨別。
本發明可篩選抗SSEA-4殖株。於一具體實施例中，本發明提供阻斷SSEA-4配體與SSEA-4間結合之抗SSEA-4抗體，但其不阻斷SSEA-4配體與第二蛋白間之結合。可篩選相應於此類抗SSEA-4抗體之Fv殖株，其係利用：（1）從噬菌體庫分離抗SSEA-4殖株，其係描述於上述B（I）（2）乙節，且任意地放大分離之噬菌體殖株群體，其係藉由在適當細菌宿主中生長該群體；（2）篩選SSEA-4與第二蛋白，其分別具備所需之阻斷與非阻斷活性；（3）吸附抗SSEA-4噬菌體殖株以固定SSEA-4；（4）使用過量之第二蛋白以溶析辨識重疊或共享第二蛋白的結合決定區之SSEA-4結合決定區的任何非所需之殖株；以及（5）溶析出在步驟（4）後仍吸附之殖株。可選擇地，具有所需阻斷/非阻斷性質之殖株可進一步藉由重複本文所述篩選程序一或多次而富集。
編碼本發明Fv殖株之DNA係易於利用常規程序分離及定序（如使用寡核苷酸引子，其經設計以從融合瘤或噬菌體DNA模板特異性放大感興趣之重鏈與輕鏈編碼區）。一旦經分離，DNA可置入表現載體，其之後轉染至不另外產生免疫球蛋白的宿主細胞，如大腸桿菌細胞、猴COS細胞、中國倉鼠卵巢（CHO）細胞、或骨髓瘤細胞，以於重組型宿主細胞中合成所需之單株抗體。於細菌中重組型表現抗體編碼DNA之回顧文獻包括Skerra et al., Curr. Opinion in Immunol., 5: 256 （1993）及Pluckthun, Immunol. Revs, 130: 151 （1992）。
編碼本發明Fv殖株之DNA可結合習知編碼重鏈及/或輕鏈恆定區之DNA序列（如可自前述Kabat等人取得適當DNA序列），以形成編碼全部或部分長度之重鏈及/或輕鏈之殖株。應理解到，就此目的可使用任何同型之恆定區，包括IgG、IgM、IgA、IgD、及IgE恆定區，且此類恆定區可取自任一人類或動物物種。將源自一動物（如人類）物種可變區DNA之Fv殖株融合至另一動物物種之恆定區DNA，以形成「雜交」用之編碼序列，本文中使用的「嵌合」與「雜交」抗體等定義涵蓋全長重鏈及/或輕鏈。於一具體實施例中，將衍生自人類可變DNA之Fv殖株融合至人類恆定區DNA，以形成所有人類全部或部分長度之重鏈及/或輕鏈之編碼序列。
由初級庫（天然或合成）產生之抗體可為中度親和性，但親和性成熟亦可體外模擬，其係藉由描述於上述之Winter等人（1994）從第二庫構築與再篩選。於一些方面，抗體可排除天然存在之抗體序列。於一些方面，突變可體外隨機導入，其係利用易誤（error-prone）聚合酶（報導於Leung et al., Technique, 1: 11-15 （1989）），如Hawkins et al., J. Mol. Biol., 226: 889-896 （1992）之方法或Gram et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 89: 3576-3580 （1992）之方法。此外，親和性成熟可利用隨機突變一或多個CDRs進行，如使用引子攜帶隨機序列之PCR，於選取之個別Fv殖株中淘選感興趣之CDR，並篩選更高親和性之殖株。WO 9607754 （發表於1996年3月14日）描述於免疫球蛋白輕鏈互補決定區誘導突變之方法，以創建輕鏈基因庫。另一有效方法為重組由噬菌體顯示篩選出的VH或VL區，該噬菌體顯示具有取自未經免疫接種供應體之天然存在之V結構域變體庫，並以數回之鏈重置換方式篩選更高的親和性，其係描述於Marks et al., Biotechnol., 10: 779-783 （1992）。此技術能產生親和性範圍10 −9M之抗體與抗體片段。 其他產生抗SSEA-4抗體之方法
其他產生及評估抗體親和性之方法為本領域習知，且描述於Kohler et al., Nature 256: 495 （1975）；美國專利號4,816,567；Goding, Monoclonal Antibodies: Principles and Practice, pp. 59-103 （Academic Press，1986；Kozbor, J. Immunol., 133:3001 （1984）；Brodeur et al., Monoclonal Antibody Production Techniques and Applications, pp. 51-63 （Marcel Dekker, Inc., New York, 1987；Munson et al., Anal. Biochem., 107:220 （1980）；Engels et al., Agnew. Chem. Int. Ed. Engl., 28: 716-734 （1989）；Abrahmsen et al., EMBO J., 4: 3901 （1985）；Methods in Enzymology, vol. 44 （1976）；Morrison et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 81: 6851-6855 （1984）。 一般方法
一般而言，本發明提供親和性成熟之SSEA-4抗體。這些抗體具有增加之SSEA-4親和性與特異性。此親和性與敏感性之增加使得本發明分子可用於若干應用與方法，其受益於（a）本發明分子敏感性增加，及/或（b）本發明藉由分子緊密結合的SSEA-4。
於一具體實施例中，SSEA-4抗體適用於治療SSEA-4介導之病症，其中需要部分或全部阻斷一或多個SSEA-4活性。於一具體實施例中，本發明抗SSEA-4抗體係用於治療癌症。
本發明抗SSEA-4抗體能敏感地與特異地直接檢測表位，且用於常規生物分子試驗，如免疫沈澱、ELISAs、或免疫顯微鏡，而無需質譜或基因操作。反而，其提供明顯優勢於觀察與闡明這些途徑之正常功能，及檢測途徑之功能失常。
本發明之SSEA-4抗體亦可用於確定疾病發展與發病機制之角色。舉例而言，如上述，本發明之SSEA-4抗體可用於確定TACAs在正常情況下是否暫時表現，其可與一或多個疾病狀態相關。
本發明之SSEA-4抗體可進一步用於治療疾病，其中一或多個SSEA-4s係異常調節或功能異常，而不干擾SSEA-4s之正常活性，其中本發明抗SSEA-4抗體對其不具特異性。
於另一方面，本發明抗SSEA-4抗體可作為試劑，以檢測各細胞類型與組織之癌症狀態。
於又另一方面，本發明抗SSEA-4抗體適於發展為SSEA-4拮抗劑，其中阻斷活性情況類似於本發明之彼等主體抗體。舉例而言，本發明之抗SSEA-4抗體可用於測定與鑑定其他具有相同SSEA-4結合特徵及/或能阻斷SSEA-4途徑之抗體。
作為進一步實例，本發明抗SSEA-4抗體可用於鑑定其他抗SSEA-4抗體，其實質上結合同於本文示例性抗體之SSEA-4抗原決定區，包括線型與構形表位。
本發明之抗SSEA-4抗體可用於基於生理途徑之試驗，其中SSEA-4涉及篩選SSEA-4之小分子拮抗劑，其呈現類似於抗體阻斷一或多個結合配對體與SSEA-4之結合的藥理效用。
抗體之產生可使用本領域之常規技術，包括那些本文所述者，如融合瘤技術及篩選結合分子之噬菌體顯示庫。這些方法於本領域係已發展成熟。
簡言之，本發明抗SSEA-4抗體之製造可使用組合庫，以篩選具有所需活性之合成抗體殖株。原則上，合成抗體殖株之選擇係藉由篩選含有噬菌體之噬菌體庫，該噬菌體顯示多個抗體可變區（Fv）片段融合至噬菌體外鞘蛋白。此類噬菌體庫係利用親和性層析術針對所需抗原進行淘選。將表現能結合至所需抗原之Fv片段的殖株吸附於抗原，因此於庫中可自非結合殖株分開。隨後自抗原溶析出結合殖株，且可進一步利用額外之抗原吸附/溶析循環富集。本發明抗SSEA-4抗體之任一者可藉由設計適用之抗原篩選程序而取得，以選擇感興趣之噬菌體殖株，接著利用感興趣噬菌體殖株之Fv序列與適用之恆定區（Fc）序列構築全長之抗SSEA-4抗體殖株，其係描述於Kabat et al., Sequences of Proteins of Immunological Interest, Fifth Edition, NIH Publication 91-3242, Bethesda Md. （1991），第1至3卷。
於一具體實施例中，本發明之抗SSEA-4抗體為單株。本發明之範疇亦涵蓋本文所提供抗SSEA-4抗體之抗體片段，如Fab、Fab’、Fab’-SH、及F（ab’） 2片段、及其變體。這些抗體片段可以傳統方法創建，如酵素分解，或可利用重組型技術產生。此類抗體片段可為嵌合、人類、或人源化。這些片段係適用於本文所示之實驗、診斷、及治療目的。
單株抗體可取自一群實質上均質化抗體，亦即，含有群體之個別抗體係一致，除了可能的天然存在之突變以外，其可以小量存在。因此，修辭「單株」代表抗體之特徵，而非分開之抗體的混合。
本發明之抗SSEA-4單株抗體可利用本領域之各習知方法製造，包括融合瘤方法，其首先描述於Kohler et al., Nature, 256:495 （1975），或者，其可利用重組型DNA方法製造（如美國專利號4,816,567）。 載體、宿主細胞、及重組型方法
針對重組型產生本發明抗體，將其編碼的核酸分離且插入可複製載體以進一步選殖（放大DNA）或表現。編碼抗體之DNA係易於以常規程序分離且定序（如利用寡核苷酸探針，其能特異性結合至編碼抗體重鏈與輕鏈之基因）。許多載體係可得。載體之選擇部分取決於欲使用之宿主細胞。宿主細胞包括但不侷限於，原核或真核（一般為哺乳類動物）源之細胞。應理解到，任何同型之恆定區可用於此目的，包括IgG、IgM、IgA、IgD、及IgE 恆定區，且此類恆定區可取自任何人類或動物物種。 利用原核宿主細胞產生抗體 載體構築
編碼本發明抗體多胜肽組分之多核苷酸序列可利用標準重組型技術取得。所需之多核苷酸序列可由抗體生產細胞如融合瘤細胞分離與定序。或者，多核苷酸可利用核苷酸合成儀或PCR技術合成。一旦取得後，將編碼多胜肽之序列插入能於原核宿主中複製與表現異源性多核苷酸之重組型載體。許多可得且本領域習知之載體可用於本發明之目的。適用載體之選擇主要取決於欲插入載體之核酸大小，及欲以載體轉形之特定宿主細胞。各載體含有多個成分，取決於其功能（異源性多核苷酸之放大或表現，或兩者）及與其所存在之特定宿主細胞的相容性。載體組分一般而言包括但不侷限於：複製起點、篩選標記基因、啟動子、核糖體結合位點（RBS）、訊息序列、異源性核酸插入子、及轉錄終止序列。
一般而言，含有複製子與調節序列之質體載體，其衍生自與宿主細胞相容之物種，係用於連結這些宿主。載體正常而言攜帶複製位點，以及標記序列，其能提供經轉形細胞之表型篩選。舉例而言，大腸桿菌通常以pBR322轉形，其係衍生自大腸桿菌物種之質體。pBR322含有編碼安比西林（Amp）與四環黴素（Tet）之抗藥基因，因此提供簡易判定經轉形細胞之方法。pBR322、其衍生物、或其他微生物質體或細菌噬菌體亦可含有或經改良而含有啟動子，其可為微生物所用以表現內源性蛋白質。用於表現特定抗體之pBR322衍生物之實例係詳述於Carter等人的美國專利號5,648,237。
此外，含有複製子與調節序列之噬菌體載體，其與宿主微生物相容，可作為轉形載體，以連結這些宿主。舉例而言，細菌噬菌體，如λGEM™-11，可用於製造重組型載體，其可用於轉形易感性宿主細胞，如大腸桿菌LE392。
本發明之表現載體可包含二或多個啟動子-順反子對，其編碼多胜肽成分之每一者。啟動子為位於順反子上游（5’）之未轉譯調節序列，其調控表現。原核啟動子通常隸屬二類，誘導型與組成型。誘導型啟動子為啟動順反子轉錄程度增加的啟動子，於其控制下回應培養條件之改變，如存在或不存在營養物或溫度改變。
可由各潛在宿主細胞辨識之眾多啟動子係習知。所選擇之啟動子係可操作地連接至編碼輕鏈或重鏈之順反子DNA，其係藉由從來源DNA經由限制酵素分解以移除啟動子，並將分離之啟動子序列插入本發明之載體。原始啟動子序列與許多異源性啟動子可用於直接放大及/或表現標靶基因。於特定具體實施例中，使用異源性啟動子，係因其一般而言相較於原始標靶多胜肽啟動子，容許更大規模之轉錄及更高產率之標靶基因表現。
適用於原核宿主之啟動子包括PhoA啟動子，相較於原始標靶多胜肽啟動子，具有更大規模之轉錄及更高產率之標靶基因表現，藉由從來源DNA經由細菌之限制酵素分解以移除啟動子（如其他習知之細菌或噬菌體啟動子）的方法亦適用。其核苷酸序列係已公開，從而使得本領域技術人員可操作地連接其與編碼標靶輕鏈與重鏈之順反子（Siebenlist et al. （1980） Cell 20: 269），其係利用連接子或轉接子以供應任何所需之限制位。
於本發明之一方面，重組型載體內之各順反子包含分泌型訊息序列組分，其導引表現之多胜肽轉位通過細胞膜。一般而言，訊息序列可為載體之一組分，或其可為插入載體之標靶多胜肽DNA之一部分。針對本發明目的所選擇之訊息序列應為宿主細胞能辨識及加工者（亦即，由訊息胜肽酶切割）。針對無法辨識與加工源之於異源性多胜肽之訊息序列之原核宿主細胞，選擇一原核訊息序列取代該訊息序列，例如，取自於由鹼性磷酸酶、青黴素酶、Ipp、或熱穩定腸毒素II （STII）前導序列、LamB、PhoE、PelB、OmpA、及MBP組成之群組。於本發明之一具體實施例中，用於表現系統之兩順反子之訊息序列為STII訊息序列或其變體。
本發明免疫球蛋白之產生可發生於宿主細胞之細胞質，因此各順反子內無需存在分泌型訊息序列。於此方面，免疫球蛋白輕鏈與重鏈係表現、摺疊、組裝以於細胞質內形成功能性免疫球蛋白。特定宿主菌株（如大腸桿菌trxB −菌株）提供的細胞質條件有利於雙硫鍵形成，從而容許適當摺疊與組裝所表現之蛋白質次單元。Proba and Pluckthun Gene, 159:203 （1995）。
本發明之抗體亦可使用表現系統生產，其中可調控所表現之多胜肽組分的定量比，以最大化本發明所分泌與適當組裝之抗體的產率。至少一部分的此調控係藉由同時調控多胜肽組分轉譯強度而達成。
一用於調控轉譯強度之技術係揭示於Simmons等人的美國專利號5,840,523。其使用順反子內之轉譯起始區（TIR）之變體。針對一給定之TIR，可以一轉譯強度範圍創建一系列胺基酸或核酸序列變體，藉以提供一便利方法，以針對特定鏈之所需表現程度調整此因子。TIR變體可利用常規突變技術產生，造成密碼子改變，其可改變胺基酸序列。於特定具體實施例中，核苷酸序列之改變係沉默。TIR之改變可包括例如，改變夏因-達爾加諾序列（Shine-Dalgarno sequences）之數目或間隔，伴隨改變訊息序列。產生突變體訊息序列之一方法為在編碼序列開始時產生「密碼子庫」，其不改變訊息序列之胺基酸序列（亦即，該改變係沉默）。此可藉由改變各密碼子之第三個核苷酸位置而達成；此外，一些胺基酸，如白胺酸、絲胺酸、及精胺酸，具有多個第一與第二位置，其增加製作該庫的複雜度。此突變方法詳述於Yansura et al. （1992） METHODS: A Companion to Methods in Enzymol. 4:151-158。
於一具體實施例中，製作一組載體，其中各順反子內具有一範圍之TIR強度。此侷限組提供各鏈表現程度之比較，以及於多個TIR強度組合下所需抗體產物之產率。TIR強度可利用量化報導基因之表現程度而確定，其係詳述於Simmons等人的美國專利號5,840,523。依據轉譯之強度比較，於表現本發明之表現載體構築體上結合所選之所需個別TIRs。
適於表現本發明抗體之原核宿主細胞包括古生菌與真細菌，如革蘭氏陰性或革蘭氏陽性菌。適用之細菌實例包括大腸桿菌屬（如大腸桿菌）、桿菌屬（如枯草芽孢桿菌）、腸內菌、假單孢菌屬物種（如銅綠假單胞菌）、鼠傷寒沙門氏菌、黏質沙雷氏菌、克雷白氏菌屬、變形桿菌屬、志賀桿菌屬、根瘤菌屬、透明顫菌屬（Vitreoscilla）、或副球菌屬（Paracoccus）。於一具體實施例中，使用革蘭氏陰性細胞。於一具體實施例中，本發明以大腸桿菌細胞作為宿主。大腸桿菌菌株之實例包括菌株W3110 （Bachmann, Cellular and Molecular Biology, vol. 2 （Washington, D.C.: American Society for Microbiology, 1987）, pp. 1190-1219；ATCC寄存號碼27,325）及其衍生物，包括菌株33D3，其具基因型W3110 hmann，Cellular and Molecular Biology, vol. 2 （Washington, D.C.: American Society for Microbiology, 1987）, pp. 1190-1219；ATCC寄存N大腸桿菌 294 （ATCC 31,446）、大腸桿菌B、大腸桿菌（ATCC 31,446）、enod大腸桿菌RV308 （ATCC 31,608）亦適用。這些實例係用於闡明而非侷限。用於構築上述具有經定義基因型之細菌之任一者之衍生物的方法係本領域習知，並描述於例如，Bass et al., Proteins, 8:309-314 （1990）中。一般而言需要選擇適當細菌，以考量細菌之細胞的複製子之可複製性。舉例而言，當以習知之質體如pBR322、pBR325、pACYC177、或pKN410用於供應複製子時，大腸桿菌、黏質沙雷氏菌、或沙門氏菌屬物種可適於作為宿主。通常而言宿主細胞應分泌最小量之蛋白水解酵素，且最好可將額外之蛋白酶抑制劑摻入細胞培養基中。 抗體產生
宿主細胞以上述表現載體轉形，並培養於常規營養培養基，其係經適當改良，以誘導啟動子、篩選轉形體、或放大編碼所需序列之基因。
轉形意指將DNA導入原核宿主，以便DNA可複製，不論是作為染色體外元件或以染色體整合元件方式進行。取決於所用之宿主細胞，轉形係以適用於此類細胞之標準技術進行。一般而言，採用氯化鈣的鈣處理方式係用於含有實質上細胞壁屏障之細菌細胞。另一轉形方法採用聚乙二醇/DMSO。又另一使用的技術為電穿孔。
用於產生本發明多胜肽之原核細胞係生長於本領域習知之培養基，其適於培養所選的宿主細胞。適用培養基之實例包括路里亞培養液（LB）加上必需營養補充物。於特定具體實施例中，培養基亦含有篩選劑，其選用係基於所構築的表現載體，以選擇性容許含表現載體之原核細胞生長。舉例而言，將安比西林加入培養基，用於生長表現安比西林抗藥基因之細胞。
除了碳源、氮源、及無機磷酸鹽源之外，亦可包括任何必需之補充劑，如複雜氮源，其係以合適濃度單獨導入或混合另一補充劑或培養基。可選地，培養基可含有一或多個還原劑，其係選自於由穀胱甘肽、半胱胺酸、胱胺、巰乙酸、二硫代赤藻糖醇、及二硫蘇糖醇組成之群組。
原核宿主細胞係培養於適當溫度。例如，針對大腸桿菌的生長，生長發生在溫度範圍包括但不侷限於，約20°C至約39°C、約25°C至約37°C、及約30°C。培養基之pH值可為約5至約9之任何pH值範圍，主要取決於宿主生物體。針對大腸桿菌，pH值可為約6.8至約7.4，或約7.0。
若本發明之表現載體使用誘導性啟動子，則在適於活化啟動子之條件下，可誘導蛋白質表現。於本發明的一方面，以PhoA啟動子調節多胜肽轉錄。據此，將轉形之宿主細胞培養於磷酸鹽限制培養基以進行誘導。於一具體實施例中，磷酸鹽限制培養基為C.R.A.P培養基（參見，如Simmons et al., J. Immunol. Methods （2002）, 263:133-147）。依據所採用之載體構築體，可使用如本領域所習知的各種其他誘導劑。
於一具體實施例中，本發明所表現之多胜肽係分泌至宿主細胞周質，且可自其中回收。蛋白質回收通常涉及破壞微生物，一般而言所使用之方式為滲透性衝擊、超音波、或降解。一旦破壞細胞，可利用離心或過濾移除細胞碎片或整個細胞。可進一步純化蛋白質，例如，利用親和性樹脂層析術。或者，可將蛋白質輸送至培養基，並自其中分離。可自培養基移除細胞，並過濾培養基上清液，且濃縮以進一步純化。所表現之多胜肽可進一步分離，並以一般習知方法鑑定，如聚丙烯醯胺凝膠電泳 （PAGE）及西方墨點試驗。
於本發明的一方面，抗體產生係以發酵過程大量進行。有多個大規模進料批次發酵程序可用，以產生重組型蛋白質。大規模發酵具有至少1000公升容量，如約1,000至100,000公升容量。這些發酵槽以葉輪攪拌器分配氧氣與營養物，尤其是葡萄糖（常見之碳/能量來源）。小規模發酵一般而言係指發酵槽之發酵反應不超過約100公升體積容量，且範圍可為約1公升至約100公升。
於發酵過程中，誘發蛋白質表現通常始於細胞在適當條件下生長至所需密度後，該階段之細胞係處於早期穩定期（如OD 550值約180-220）。依據所採用之載體構築體，可使用各種誘導劑，其係如上述及本領域之習知。細胞於誘發前可短期生長。細胞通常誘發約12-50小時，儘管可使用更長或更短的誘發時間。
欲改進本發明多胜肽之產率與產量，可改良各發酵條件。舉例而言，欲改進分泌型抗體多胜肽之適當組裝與摺疊，可使用額外之載體過度表現型伴護蛋白，如Dsb蛋白（DsbA、DsbB、DsbC、DsbD、及/或DsbG）或FkpA （具有伴護蛋白活性之胜肽基脯胺醯基順反異構酶）共同轉形宿主原核細胞。伴護蛋白經證實可促進適當摺疊及異源性蛋白於細菌宿主細胞中生產時的溶解性。Chen et al. （1999） J Bio Chem 274:19601-19605；Georgiou等人的美國專利號6,083,715；Georgiou等人的美國專利號6,027,888；Bothmann and Pluckthun （2000） J. Biol. Chem. 275:17100-17105；Ramm and Pluckthun （2000） J. Biol. Chem. 275:17106-17113；Arie et al. （2001） Mol. Microbiol. 39:199-210。
欲最小化所表現之異源性蛋白的蛋白質水解（尤其是那些蛋白質水解敏感型），本發明可使用特定蛋白水解酵素缺失型宿主菌株。舉例而言，宿主細胞菌株可經改良，以影響編碼習知細菌蛋白酶基因之基因突變，該蛋白酶如蛋白酶III、OmpT、DegP、Tsp、蛋白酶I、蛋白酶Mi、蛋白酶V、蛋白酶VI、及其共軛物。一些大腸桿菌蛋白酶缺失型菌株係可得，且描述於，例如，Joly et al. （1998）, supra；Georgiou等人的美國專利號5,264,365；Georgiou等人的美國專利號5,508,192；Hara et al., Microbial Drug Resistance, 2:63-72 （1996）。
於一具體實施例中，本發明之表現系統使用蛋白水解酵素缺失型及過度表現一或多個伴護蛋白之質體轉形的大腸桿菌菌株作為宿主細胞。 抗體純化
於一具體實施例中，於此產生之抗體蛋白係進一步純化，以取得實質上同源性之製備物以進一步試驗與使用。可採用本領域習知之標準蛋白質純化方法。下列程序為適用之純化程序示例：以免疫親和性或離子交換管柱份化、乙醇沉澱、逆相HPLC、矽膠層析術或陽離子交換樹脂如DEAE、層析聚焦、SDS-PAGE、硫酸銨沉澱、及凝膠過濾，如使用Sephadex G-75。
於一方面，以蛋白A固定於固相，用於本發明抗體產物之免疫親和性純化。蛋白A為41 kD之金黃色葡萄球菌細胞壁蛋白，其與抗體Fc區之結合具有高親和性。Lindmark et al （1983） J. Immunol. Meth. 62:1-13。固定蛋白A之固相可為包含玻璃或二氧化矽表面之管柱，或孔隙可控之玻璃管柱或矽酸管柱。於一些應用中，管柱係以試劑塗佈，如甘油，以儘可能防止污染物之非特異性黏附。
作為純化之第一步驟，源自上述細胞培養物之製備物可施加至固定蛋白A之固相，使得感興趣之抗體特異性結合至蛋白A。隨後清洗固相，以移除非特異性結合至固相之污染物。最終，藉由溶析自固相回收感興趣之抗體。 使用真核宿主細胞產生抗體
載體組分一般而言包括但不侷限於，下列一或多者：訊息序列、複製起點、一或多個標記基因、強化子元件、啟動子及轉錄終止序列。 （i） 訊息序列組分
真核宿主細胞所使用之載體亦可含有訊息序列或其他多胜肽，其中成熟蛋白N端具有特殊切割位點、或感興趣之多胜肽。所選之異源性訊息序列一般而言可由宿主細胞辨識及加工（亦即，利用訊息胜肽酶切割）。於哺乳類動物之細胞表現中，可得到哺乳類動物訊息序列及病毒分泌型前導序列，例如，單純皰疹gD訊息。
此前驅區之DNA讀框係連接至編碼抗體之DNA。 （ii） 複製起點
一般而言，哺乳類動物表現載體不需要複製起點組分。舉例而言，通常僅可使用SV40起點，係因其含有早期啟動子。 （iii） 篩選基因組分
所表現與選殖之載體可含有篩選基因，其亦稱作可篩選標記。通常，篩選基因所編碼之蛋白質係：（a）賦予抗生素或其他毒素抗性，如安比西林、新黴素、胺甲喋呤、或四環黴素；（b）於相關情況下補充營養缺失；或者（c）供應複合培養基所沒有的關鍵營養物。
篩選方案之一實例為利用藥物阻止宿主細胞生長。那些成功地以異源性基因轉形之細胞產生具抗藥性之蛋白，因此能於篩選方案中存活。此優勢篩選之實例係使用藥物如新黴素、黴酚酸、及濕黴素。
哺乳類動物細胞之另一適用可篩選標記實例為彼等能識別能承受抗體核酸之細胞，如DHFR、胸腺嘧啶核苷激酶、金屬硫蛋白I與II （如靈長類動物金屬硫蛋白基因）、腺核苷去胺酶、鳥胺酸脫羧酶等。
舉例而言，以DHFR篩選基因轉形之細胞可首先將所有轉形體培養於培養基之方式識別，該培養基含有胺甲喋呤（Mtx）與DHFR之競爭性拮抗劑。當採用野生型DHFR時，適用之宿主細胞包括例如，DHFR活性缺失之中國倉鼠卵巢（CHO）細胞株 （如ATCC CRL-9096）。
或者，以編碼抗體、野生型DHFR蛋白、及另一可篩選標記如胺基糖苷3′-磷酸轉移酶（APH）之DNA序列轉形或共轉形之宿主細胞（特別是含有內源性DHFR之野生型宿主）篩選，可利用將細胞生長於含有針對可篩選標記之篩選劑的培養基，該篩選劑如胺基糖苷抗生素，如卡那黴素、新黴素、或G418。參見，美國專利號4,965,199。 （iv）啟動子組分
表現與選殖載體通常含有啟動子，其係由宿主生物體辨識且係操作地連接至編碼感興趣多胜肽（如抗體）之核酸。真核生物之啟動子序列係習知。實質上所有真核基因具有一富含AT區，其係位於轉錄起始位點上游約25至30個鹼基處。另一於許多基因之轉錄起始位點上游70至80個鹼基處發現之序列為CNCAAT區，其中N可為任一核苷酸。多數真核基因之3’端處為AATAAA序列，其可為添加多腺核苷酸尾至編碼序列3’端之訊息。所有這些序列係適當地插入真核表現載體。
載體於哺乳類動物宿主細胞中的抗體多胜肽轉錄係可控，例如，利用取自病毒基因體之啟動子，該病毒如多瘤病毒、禽痘病毒、腺病毒（如腺病毒二型）、牛乳頭瘤病毒、禽肉瘤病毒、巨細胞病毒、反轉錄病毒、B型肝炎病毒、及猴病毒40 （SV40）；利用異源性哺乳類動物啟動子，如肌動蛋白啟動子或免疫球蛋白啟動子；或者利用熱休克啟動子，其中所提供之此類啟動子係相容於宿主細胞系統。
SV40病毒之早期與晚期啟動子係取得方便，且SV40之限制片段亦含有SV40病毒複製起點。人類巨細胞病毒之立即早期啟動子係取得方便，且具有HindIII E限制片段。於哺乳類動物宿主中以牛乳頭瘤病毒作為載體之DNA表現系統係揭示於美國專利號4,419,446。此系統之改良係描述於美國專利號4,601,978。亦參見Reyes et al., Nature 297:598-601 （1982），其係於小鼠細胞中在單純皰疹病毒胸腺嘧啶核苷激酶啟動子之控制下表現人類β干擾素cDNA。或者，可以羅斯肉瘤病毒之末端長重複序列（long terminal repeat）作為啟動子。 （v） 強化子元件組分
以高等真核生物轉錄編碼本發明抗體多胜肽之DNA，常可藉由插入強化子序列至載體而增加效能。哺乳類動物基因（球蛋白、彈性蛋白酶、白蛋白、α胎蛋白、及胰島素）之許多強化子序列係習知。然而通常將使用真核細胞病毒之強化子。實例包括，位於複製起點後方之SV40強化子（bp 100-270）、巨細胞病毒早期啟動子強化子、位於複製起點後方之多瘤病毒強化子、及腺病毒強化子。亦參見Yaniv, Nature 297:17-18 （1982），其係用於活化真核啟動子之強化元件。強化子可剪接至載體中，其係位於抗體多胜肽編碼序列之5’或3’，但一般而言位於啟動子5′位點。 （vi）轉錄終止組分
真核宿主細胞所使用之表現載體通常亦含有終止轉錄與穩定mRNA所需之序列。此類序列通常可從真核或病毒DNAs或cDNAs之5’與偶爾3’未轉譯區獲得。這些區域含有核苷酸片段，其可在編碼抗體mRNA之未轉譯部位轉錄成多聚腺苷酸化片段。一適用之轉錄終止組分為牛生長激素多聚腺苷酸化區。參見WO94/11026，及其揭示之表現載體。 （vii）宿主細胞之篩選與轉形
用於選殖或表現本文載體DNA之適用宿主細胞包括本文所述之高等真核細胞，包括脊椎動物宿主細胞。脊椎動物細胞於培養基（組織培養）之繁殖係常規程序。適用之哺乳類動物宿主細胞株之實例為：SV40轉形之猴腎CV1細胞株（COS-7，ATCC CRL 1651）；人類胚胎腎細胞株（293或293細胞，經次選殖以生長於懸浮培養基，Graham et al., J. Gen Virol. 36:59 （1977））；幼倉鼠腎細胞（BHK，ATCC CCL 10）；中國倉鼠卵巢細胞/-DHFR （CHO，Urlaub et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 77:4216 （1980））；小鼠賽特利細胞（TM4，Mather, Biol. Reprod. 23:243-251 （1980））；猴腎細胞（CV1，ATCC CCL 70）；非洲綠猴腎細胞（VERO-76，ATCC CRL-1587）；人類子宮頸癌細胞（HELA，ATCC CCL 2）；犬腎細胞（MDCK，ATCC CCL 34）；水牛大鼠肝細胞（BRL 3A，ATCC CRL 1442）；人類肺細胞（W138，ATCC CCL 75）；人類肝細胞（Hep G2，HB 8065）；小鼠乳腺腫瘤（MMT 060562，ATCC CCL51）；TRI細胞（Mather et al., Annals N.Y. Acad. Sci. 383:44-68 （1982））；MRC 5細胞；FS4細胞；以及人類肝腫瘤細胞株（Hep G2）。
宿主細胞以上述之表現或選殖載體轉形，以產生抗體，並培養於常規營養培養基，其係適當改良以誘導啟動子、篩選轉形體、或放大編碼所需序列之基因。 （viii）培養宿主細胞
用於產生本發明抗體之宿主細胞可培養於各種培養基。商業購得之培養基如漢氏F10 （Sigma）、最小基礎培養基（MEM） （Sigma）、RPMI-1640 （Sigma）、及杜爾貝寇氏改良伊格爾氏培養基（DMEM） （Sigma），係適用於培養宿主細胞。此外，Ham et al., Meth. Enz. 58:44 （1979）、Barnes et al., Anal. Biochem. 102:255 （1980）、美國專利號4,767,704；4,657,866；4,927,762；4,560,655；或者5,122,469；WO 90/03430；WO 87/00195；或者美國專利回覆號30,985所述培養基之任一者皆可用作宿主細胞之培養基。這些培養基之任一者可視需求補充激素及/或其他生長因子（如胰島素、轉鐵蛋白、或表皮生長因子）、鹽類（如氯化鈉、鈣、鎂、及磷酸鹽）、緩衝液（如HEPES）、核苷酸（如腺核苷與胸腺嘧啶核苷）、抗生素（如GENTAMYCIN™藥物）、微量元素（定義為無機化合物，通常以微莫耳濃度範圍之最終濃度呈現）、及葡萄糖或同等能量來源。亦可包括適當濃度之任何其他必需補充劑，其係本領域技術人員習知。培養條件，如溫度、pH值、及其類似物，係那些先前用於表現所選之宿主細胞者，其係顯見於本領域一般技術人員。 （ix）抗體純化
當使用重組型技術時，抗體可於細胞內產生，或直接分泌至培養基。若抗體於細胞內產生，作為第一步驟，一般而言係移除宿主細胞或降解片段之顆粒型碎片，例如，利用離心或超過濾。當抗體分泌至培養基時，此類表現系統之上清液通常首先以商業購得之蛋白質濃縮過濾器濃縮，例如，Amicon或Millipore Pellicon超過濾單元。蛋白酶抑制劑如PMSF可包括於前述步驟之任一者，以抑制蛋白質水解，且可包括抗生素，以防止不定期污染物的生長。
由細胞製備之抗體組合物的純化可利用，例如，氫氧磷灰石層析術、凝膠電泳、透析、及親和性層析術，其中親和性層析術係一般而言可接受之純化技術。以親和性試劑如蛋白A作為親和性配體之適用性，取決於存在於抗體之任一免疫球蛋白Fc區之物種與同型。蛋白A可用於純化抗體，其係基於人類γ1、γ2、或γ4重鏈（Lindmark et al., J. Immunol. Meth. 62:1-13 （1983））。針對所有小鼠同型及人類γ3，推薦使用蛋白G （Guss et al., EMBO J. 5:15671575 （1986））。親和性配體接觸之基質最常為瓊脂糖，但可使用其他基質。機械穩定性基質如可控孔隙玻璃或聚（苯乙烯二乙烯基）苯容許比使用瓊脂糖達到更快流速及更短加工時間。當抗體包含CH3區時，Bakerbond ABX™樹脂（J. T. Baker，Phillipsburg，N.J.）適用於純化。亦可使用其他蛋白質純化技術，如以離子交換管柱份化、乙醇沉澱、逆相HPLC、二氧化矽層析術、肝素瓊脂糖™層析術與陰離子或陽離子交換之樹脂層析術（如聚天冬胺酸管柱）、層析聚焦、SDS-PAGE、及硫酸銨沉澱，其取決於欲回收之抗體。
在任何初步純化步驟之後，含有感興趣之抗體與污染物之混合物可進行進一步之純化步驟，視需求而定，如利用低pH值疏水性交互作用層析術，所使用之溶析緩衝液pH值介於約2.5至4.5之間，一般而言於低鹽濃度下進行（如約0至0.25M之鹽類）。
應注意到，一般而言製備用於研究、測試、及臨床用途之抗體的技術及方法學係於本領域已發展成熟，針對感興趣之特定抗體，其與前述一致及/或本領域技術人員確認合適的。 活性試驗
本發明之抗體可利用本領域習知之各種試驗確認其物理/化學性質及生物功能。
本發明揭示之抗體或抗原結合片段、變體、或其衍生物亦可於其與抗原之結合親和性方面進行說明或指定。抗體與醣類抗原之親和性可使用任何適用方法以實驗方式測定（參見，如Berzofsky et al, "Antibody- Antigen Interactions," In Fundamental Immunology, Paul, W. E., Ed., Raven Press: New York, N.Y. （1984）；Kuby, Janis Immunology, W. H. Freeman and Company: New York, N.Y. （1992）；以及本文所述方法）。若於不同條件下測定（如鹽類濃度、pH），則所測之特定抗體-醣類抗原交互作用親和性可變。因此，親和性及其他抗原結合參數（如K D、K a、Ka）之測定，較佳地係以抗體與抗原之標準化溶液及標準化緩衝液進行。
本發明之抗體或其抗原結合部位具有體外與體內治療、預防、及/或診斷用途。舉例而言，這些抗體可投予培養之細胞，如體外或離體，或投予個體，如體內，以治療、抑制、預防復發、及/或診斷癌症。
純化之抗體可進一步利用一系列之試驗確認，其包括但不侷限於，氮端定序、胺基酸分析、非變性粒徑排阻高壓液相層析術（HPLC）、質譜、離子交換層析術、及木瓜蛋白酶分解。
視需求，分析抗體之生物活性。於特定具體實施例中，測試本發明抗體之抗原結合活性。本發明可使用之抗原結合試驗係本領域習知，其包括但不侷限於，任何直接或競爭結合試驗，所使用之技術如西方墨點、放射免疫試驗、ELISA （酵素結合免疫吸附分析法）、「夾層」免疫試驗、免疫沈澱試驗、螢光免疫試驗、化學發光免疫試驗、奈米顆粒免疫試驗、適配體免疫試驗、及蛋白A免疫試驗。 抗體片段
本發明涵蓋抗體片段。於特定情況下，使用抗體片段具有優勢，而非完整抗體。較小尺寸之片段容許快速清除，且可改善實體腫瘤。
有多個技術係經開發以生產抗體片段。傳統上，這些片段係完整之抗體經由蛋白分解而衍生（參見，如Morimoto et al., Journal of Biochemical and Biophysical Methods 24:107-117 （1992）；以及Brennan et al., Science, 229:81 （1985））。然而，這些片段目前可直接由重組型宿主細胞產生。Fab、Fv、及ScFv抗體片段可全部於大腸桿菌中表現且自其分泌，因此容許產生大量之這些片段。抗體片段可從上述抗體噬菌體庫中分離。或者，Fab’-SH片段可直接從大腸桿菌回收，且化學耦合以形成F（ab’） 2片段（Carter et al., Bio/Technology 10: 163-167 （1992））。依據另一方法，F（ab’） 2片段可直接從重組型宿主細胞培養基分離。具有增加之體內半衰期的Fab與F（ab’） 2片段，其含有再利用受體（salvage receptor）結合表位殘基，係描述於美國專利號5,869,046。其他產生抗體片段之技術將顯見於技術熟習者。於其他具體實施例中，所選之抗體為單鏈Fv片段（scFv）。參見WO 93/16185；美國專利號5,571,894；以及5,587,458。Fv與sFv為不具恆定區之完整組合位點之唯一物種；因此，其適於體內使用時減少非特異性結合。可構築sFv融合蛋白，以於sFv之胺基端或羧基端產生效應子蛋白之融合。參見上述Antibody Engineering, ed. Borrebaeck。抗體片段亦可為「線型抗體」，其係描述於美國專利號5,641,870。此類線型抗體片段可為單特異性或雙特異性。 人源化抗體
本發明涵蓋人源化抗體。人源化非人類抗體之各方法係本領域習知。舉例而言，人源化抗體可具一或多個源自非人類源之胺基酸殘基導入其中。這些非人類胺基酸殘基常意指「輸入」殘基，其通常取自「輸入」可變區。人源化基本上可依據Winter與其同事之方法進行（Jones et al. （1986） Nature 321:522-525；Riechmann et al. （1988） Nature 332:323-327；Verhoeyen et al. （1988） Science 239:1534-1536），其係利用高度可變區序列取代相應之人類抗體序列。據此，此類「人源化」抗體為嵌合抗體（美國專利號4,816,567），其中實質上小於完整之人類可變結構域係經相應之非人類物種序列取代。於執行上，人源化抗體通常為人類抗體，其中一些高度可變區殘基與可能地一些FR殘基係經囓齒動物抗體之類似位點殘基取代。
用於製備人源化抗體之人類可變區（輕鏈與重鏈）的選擇對於降低抗原性是重要的。依據所謂「最佳擬合」方法，針對習知之人類可變區序列之整個庫，篩選囓齒動物抗體之可變區序列。最接近囓齒動物之人類序列隨即認定為人源化抗體之人類框架（Sims et al. （1993） J. Immunol. 151:2296；Chothia et al. （1987） J. Mol. Biol. 196:901。另一方法使用衍生自特定亞群之輕鏈或重鏈之所有人類抗體共通序列之特定框架。相同框架可用於數個不同人源化抗體（Carter et al. （1992） Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 89:4285；Presta et al. （1993） J. Immunol., 151:2623）。
一般而言更需要抗體人源化，以保留對抗原與其他有利生物性質之高親和性。欲達此目標，依據一方法，利用親代與人源化序列三維模型之親代序列與各概念性人源化產物分析過程製備人源化抗體。三維免疫球蛋白模型通常可得，且為本領域技術人員熟習。電腦程式可用於說明與顯示所選之候選免疫球蛋白序列之可能的三維構形結構。檢查這些顯示可容許分析殘基在候選免疫球蛋白序列功能上的可能角色，亦即，影響候選免疫球蛋白結合其抗原之能力的殘基分析。以此方式，可從受體與輸入序列選擇與組合FR殘基，以便達成所需之抗體特徵，如增加對標靶抗原之親和性。一般而言，高度可變區殘基係直接且多數實質上涉及影響抗原結合。 人類抗體
本發明之人類抗SSEA-4抗體可藉由將選自人類衍生之噬菌體顯示庫之Fv殖株可變區序列與習知之人類恆定域序列（如上述）相結合而構築。或者，本發明之人類單株抗SSEA-4抗體可利用融合瘤方法製造。用於生產人類單株抗體之人類骨髓瘤與小鼠-人類異源骨髓瘤細胞株已有描述，例如，Kozbor J. Immunol., 133: 3001 （1984）；Brodeur et al., Monoclonal Antibody Production Techniques and Applications, pp. 51-63 （Marcel Dekker，Inc.，New York，1987）；以及Boerner et al., J. Immunol., 147: 86 （1991）。
目前可生產能在免疫作用後，且不存在內源性免疫球蛋白之情況下，產生完整人類抗體庫之轉基因動物（如小鼠）。舉例而言，已有提及，嵌合與種系突變體小鼠之抗體重鏈連接區（JH）基因之同型組合缺失將導致完全抑制內源性抗體之產生。於此類種系突變小鼠中轉移人類種系免疫球蛋白基因陣列，將導致抗原攻擊後的人類抗體產生。參見，如Jakobovits et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 90: 2551 （1993）；Jakobovits et al., Nature, 362: 255 （1993）；Bruggermann et al., Year in Immunol., 7: 33 （1993）。
基因置換亦可用於從非人類（如囓齒動物）抗體中衍生人類抗體，其中人類抗體對起始非人類抗體具有類似之親和性與特異性。依據此方法，其亦稱作「表位印記」，取自上述噬菌體顯示技術之非人類抗體片段重鏈或輕鏈可變區係以人類V結構域基因庫替代，產生一群體之非人類鏈/人類鏈scFv或Fab嵌合體。以抗原篩選導致非人類鏈/人類鏈嵌合體scFv或Fab之分離，其中人類鏈可使抗原結合位點恢復，其於移除主噬菌體顯示植株中之相應非人類鏈時經破壞，即表位控制（印記）人類鏈配對之選擇。當重複該方法以替代剩餘之非人類鏈時，可獲得人類抗體（參見PCT WO 93/06213，其係於1993年4月1日公開）。不同於傳統非人類抗體藉由CDR移植人源化，此技術完全提供人類抗體，其不具有非人類源之FR或CDR殘基。 雙特異性抗體
雙特異性抗體為對至少二不同抗原具有結合特異性之單株抗體。於特定具體實施例中，雙特異性抗體為人類或人源化抗體。於特定具體實施例中，結合特異性之一者為針對SSEA-4，其包括特異性離胺酸鍵結，另一者為針對任何其他抗原。於特定具體實施例中，雙特異性抗體可結合至具二不同離胺酸鍵結之二不同SSEA-4s。雙特異性抗體可製成全長抗體或抗體片段（如F（ab’） 2雙特異性抗體）。
製造雙特異性抗體之方法係本領域習知。傳統上，雙特異性抗體之重組型生產係基於二免疫球蛋白重鏈-輕鏈對之共表現，其中二重鏈具有不同特異性（Milstein and Cuello, Nature, 305: 537 （1983））。由於免疫球蛋白重鏈與輕鏈之隨機分類，這些融合瘤（四源雜交瘤（quadromas））產生10個不同抗體分子之潛在混合物，其中僅一者具有正確雙特異性結構。通常，以親和性層析步驟進行正確分子之純化相當麻煩，且產物產率低。類似之程序揭示於WO 93/08829，其係於1993年5月13日公開，以及Traunecker et al., EMBO J., 10: 3655 （1991）。
依據不同具體實施例，具有所需結合特異性之抗體可變區（抗體-抗原結合位點）係融合於免疫球蛋白恆定區序列。該融合體，例如，係與免疫球蛋白重鏈恆定區，其含有至少一部分鉸鏈區、CH2區、及CH3區。於特定具體實施例中，含有輕鏈結合所需位點之第一重鏈恆定區（CH1）係存在於至少一融合體中。視需求，將編碼免疫球蛋白重鏈融合體之DNA與免疫球蛋白輕鏈插入個別的表現載體中，且共轉染至適用之宿主生物體。當在構築中所使用三個多肽鏈之不等比率提供最佳產率時，此提供了在具體實施例中調整三個多胜肽片段相互比例的極大靈活性。然而，當相等比例之至少二多胜肽鏈的表現導致高產率或當該等比率無特定顯著性時，可將二或所有三個多胜肽鏈之編碼序列插入一表現載體。
於一具體實施例中，雙特異性抗體之組成為一臂中具有第一結合特異性之雜交免疫球蛋白重鏈與另一臂中的雜交免疫球蛋白重鏈-輕鏈對（提供第二結合特異性）。發現到，此不對稱結構有助於所需之雙特異性化合物與不需要之免疫球蛋白鏈共軛物分離，係因僅一半的雙特異性分子存在免疫球蛋白輕鏈，使其易於分離。此方法揭示於WO 94/04690。針對產生雙特異性抗體之進一步詳述，參見如，Suresh et al., Methods in Enzymology, 121:210 （1986）。
依據另一方法，可改造一對抗體分子間之界面，以最大化從重組型細胞培養物中回收之異二聚體百分比。該界面包含抗體恆定區中至少一部分的CH3區。在此方法中，源自第一抗體分子界面之一或多個小型胺基酸側鏈係以大型側鏈（如酪胺酸或色胺酸）替代。藉由以小型胺基酸（如丙胺酸或蘇胺酸）替代大型胺基酸側鏈，於第二抗體分子之界面產生與大型側鏈相同或相似尺寸之補償性「空腔」。相對於其他不需要的最終產物如同二聚體，此提供一用於增加異二聚體產率的機制。
雙特異性抗體包括交聯或「異共軛物」抗體。舉例而言，異共軛物中之一抗體可耦合抗生物素蛋白，另一者耦合生物素。舉例而言，經提出，此類抗體將免疫系統細胞靶向不需要之細胞（美國專利號4,676,980），及用於治療HIV感染（WO 91/00360、WO 92/00373、及EP 03089）。可使用任何便利之交聯方法製造異共軛物抗體。適用之交聯劑係本領域習知，且揭示於美國專利號4,676,980，並伴隨一些交聯技術。
用於從抗體片段產生雙特異性抗體之技術亦於文獻中描述。舉例而言，可使用化學鍵結製備雙特異性抗體。Brennan et al., Science, 229: 81 （1985）描述一完整抗體經蛋白分解切割以產生F（ab’） 2片段的程序。這些片段於二硫醇基錯合劑亞砷酸鈉存在下還原，以穩定相鄰之二硫醇基並防止形成分子間雙硫鍵。所產生之Fab’片段隨即轉換成硫基硝基苯甲酸酯（TNB）衍生物。然後，藉由巰基乙胺還原，將Fab’-TNB衍生物之一者再轉化為Fab’-硫醇基，並與等莫耳量之其他Fab’-TNB衍生物混合，以形成雙特異性抗體。所產生之雙特異性抗體可用作選擇性固定酵素時之試劑。
最近的進展有助於從大腸桿菌中直接回收Fab’-SH片段，其可以化學耦合形成雙特異性抗體。Shalaby et al., J. Exp. Med., 175: 217-225 （1992）描述完整人源化雙特異性抗體F（ab’） 2分子之產生。各Fab’片段分別從大腸桿菌中分泌，並進行體外定向化學耦合，以形成雙特異性抗體。由此形成之雙特異性抗體能結合過度表現HER2受體之細胞與正常人類T細胞，以及驅動人類細胞毒性淋巴細胞對人類乳腺腫瘤標靶的分解活性。
亦有描述直接從重組型細胞培養物中製造與分離雙特異性抗體片段的各種技術。舉例而言，以白胺酸拉鍊產生雙特異性抗體。Kostelny et al., J. Immunol., 148（5）:1547-1553 （1992）。Fos與Jun蛋白之白胺酸拉鍊胜肽藉由基因融合連接至二不同抗體之Fab’部位。抗體同二聚體之鉸鏈區係經還原以形成單體，之後再氧化以形成抗體異二聚體。此方法亦可用於產生抗體同二聚體。「雙功能抗體（diabody）」技術係描述於Hollinger et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 90:6444-6448 （1993），其提供另一用於製造雙特異性抗體片段之機制。該片段包含藉由連接子將重鏈可變區（VH）連接至輕鏈可變區（VL），該連接子太短而無法於同一鏈之二區間配對。據此，迫使一片段之VH和VL區與另一片段之互補型VL與VH區配對，藉以形成二抗原結合位點。亦報告另一利用單鏈Fv （sFv）二聚體製造雙特異性抗體片段之策略。參見Gruber et al., J. Immunol., 152:5368 （1994）。
考量到具有二價以上之抗體。舉例而言，可製備三特異性抗體。Tutt et al. J. Immunol. 147: 60 （1991）。 多價抗體
藉由表現抗體可結合之抗原細胞，多價抗體之內化（及/或分解代謝）比二價抗體的更快。本發明之抗體可為具有三或多個抗原結合位點（如四價抗體）之多價抗體（其不同於IgM類別），其易於藉由重組型表現編碼抗體多胜肽鏈之核酸而產生。多價抗體可包含二聚化區與三或多個抗原結合位點。二聚化區包含（或由其組成），如Fc區或鉸鏈區。於此情況下，抗體將包含Fc區與Fc區胺基端之三或多個抗原結合位點。於一具體實施例中，多價抗體包含（或由其組成）），如三至約八個，或四個抗原結合位點。多價抗體包含至少一多胜肽鏈（如二多胜肽鏈），其中多胜肽鏈包含二或多個可變區。舉例而言，多胜肽鏈可包含VD1-（X1）n-VD2-（X2）n-Fc，其中VD1為第一可變區、VD2為第二可變區、Fc為Fc區之一多胜肽鏈、X1與X2代表胺基酸或多胜肽、及n為0或1。舉例而言，多胜肽鏈可包含：VH-CH1-撓性連接子-VH-CH1-Fc區鏈；或者VH-CH1-VH-CH1-Fc區鏈。本文之多價抗體可進一步包含至少二個（如四個）輕鏈可變區多胜肽。舉例而言，本文之多價抗體可包含約二至約八個輕鏈可變區多胜肽。本文考量之輕鏈可變區多胜肽包含輕鏈可變區，且任意地更包含CL區。 抗體變體
於特定具體實施例中，考量本文所述抗體之胺基酸序列改良。舉例而言，需要改進抗體之結合親和性及/或其他生物性質。藉由導入適當核苷酸變化至抗體核酸，或藉由胜肽合成，製備抗體之胺基酸序列變體。此類改良包括例如，抗體胺基酸序列殘基之刪除及/或插入及/或取代。可進行刪除、插入、及取代之任一組合，達成最終構築體，只要最終構築體具有所需特徵即可。胺基酸之改變可在製備序列時導入主體抗體胺基酸序列。
用於鑑定抗體之特定殘基或區域為較佳突變位置的適用方法稱為「丙胺酸掃描突變」，其係描述於Cunningham and Wells （1989） Science, 244:1081-1085。於此，鑑定一殘基或一組標靶殘基（如帶電殘基，如arg、asp、his、lys、及glu），並以中性或帶負電胺基酸取代（如丙胺酸或聚丙胺酸），以影響胺基酸與抗原之交互作用。那些胺基酸位置證實對取代之功能敏感性，其可藉由在取代位點導入進一步或其他變體而進行精化。因此，雖然導入胺基酸序列變異之位點係預先確定，但突變本身之性質毋須預先確定。舉例而言，欲分析給定位點之突變表現，於標靶密碼子或區域進行ala掃描或隨機突變，並篩選所表現之免疫球蛋白，以獲得所需活性。
胺基酸序列插入包括胺基端及/或羧基端融合，其長度範圍為一殘基至含有一百或以上個殘基之多胜肽，以及單一或多個胺基酸殘基之序列內插入。末端插入之實例包括具有氮端甲硫胺醯基殘基之抗體或融合至細胞毒性多胜肽之抗體。抗體分子之其他插入型變體包括抗體N端或C端與酵素（如針對ADEPT）或多胜肽之融合物，其增加抗體之血清半衰期。
另一變體類型為胺基酸取代變體。這些變體之抗體分子中具有至少一胺基酸殘基由不同殘基替代。針對取代型突變，最感興趣之位點包括高度可變區，但亦可考量框架改變。
抗體生物性質之實質改良係藉由選擇取代而進行，該取代在其對維持下述之影響明顯不同：（a）取代區域之多胜肽骨架結構，例如，褶板或螺旋構形；（b）標靶位點處分子之電荷或疏水性；或者（c）側鏈主體。胺基酸可依據其側鏈性質之相似性分組（描述於A. L. Lehninger, in Biochemistry, second ed., pp. 73-75, Worth Publishers, New York （1975））： （1） 非極性：Ala （A）、Val （V）、Leu （L）、Ile （I）、Pro （P）、Phe （F）、Trp （W）、Met （M）； （2） 不帶電極性：Gly （G）、Ser （S）、Thr （T）、Cys （C）、Tyr （Y）、Asn （N）、Gln （O）； （3） 酸性：Asp （D）、Glu （E）； （4） 鹼性：Lys （K）、Arg （R）、His （H）。
或者，天然存在之殘基可依據常見側鏈性質分組： （1） 疏水性：正白胺酸、Met、Ala、Val、Leu、Ile； （2） 中性親水性：Cys、Ser、Thr、Asn、Gln； （3） 酸性：Asp、Glu； （4） 鹼性：His、Lys、Arg； （5） 影響側鏈方向之殘基：Gly、Pro； （6） 芳族：Trp、Tyr、Phe。
非保留取代意味著需要以這些類別之一者之成員交換另一類別。此類經取代之殘基亦可導入保留性取代位點，或導入存留之（非保留）位點。
一類型之取代變體涉及取代親源抗體（如人源化或人類抗體）之一或多個高度可變區殘基。一般而言，選擇用於進一步開發之所得變體，相對於其產生之親源抗體，將具有改良之（如改進之）生物性質。產生此類取代變體之便利方法涉及親和性成熟，其係使用噬菌體顯示。簡言之，數個高度可變區位點（如6至7個位點）係經突變以在各位點產生所有可能的胺基酸取代體。從其產生之抗體係由絲狀噬菌體顆粒顯示，其中各顆粒內包裝至少部分噬菌體外鞘蛋白（如M13之基因III產物）之融合物。隨後，如本文所揭示的，篩選噬菌體顯示變體之生物活性（如結合親和性）。欲鑑定用於改良之候選高度可變區位點，可進行掃描誘變（如丙胺酸掃描），以鑑定對抗原結合有顯著貢獻之高度可變區殘基。或者，或此外，有利的是，分析抗原-抗體複合物晶體結構，以鑑定抗體與抗原間之接觸點。此類接觸殘基與相鄰之殘基係本領域習知技術中（包括本文所述技術），用於取代之候選。一旦產生此類變體，則使用本領域習知技術（包括本文所述技術）對變體組進行篩選，且可選擇在一或多個相關試驗中具有優異性質之抗體進行進一步開發。
編碼抗體胺基酸序列變體之核酸分子係以本領域習知之多種方法製備。這些方法包括但不侷限於，從天然來源分離（於天然存在胺基酸序列變體之情況），或利用寡核苷酸介導之（或定點）突變、PCR突變、及早期製備之變體或非變體形式之抗體基因匣突變等方式製備。於一些方面，核酸分子將排除天然存在之序列。
可能需要的是，於本發明抗體Fc區導入一或多個胺基酸改良體，藉以產生Fc區變體。Fc區變體可包含人類Fc區序列（如人類IgG 1、IgG 2、IgG 3、或IgG 4Fc區），其包含一或多個胺基酸位置（包括鉸鏈半胱胺酸）的胺基酸改良（如取代）。 免疫共軛物
於另一方面，本發明提供免疫共軛物或抗體-藥物複合體 （ADC），其包含將抗體結合至細胞毒性劑，如化學治療劑、藥物、生長抑制劑、毒素（如細菌、真菌、植物、或動物源之酵素學上活性毒素，或其片段）、或放射性同位素（亦即，放射性共軛物）。
以抗體-藥物複合體進行細胞毒性劑或細胞增殖抑制劑（即藥物）之局部輸送，以殺死或抑制腫瘤細胞，並治療癌症（Syrigos and Epenetos （1999） Anticancer Research 19:605-614；Niculescu-Duvaz and Springer （1997） Adv. Drg Del. Rev. 26:151-172；美國專利號4,975,278），使得能標靶輸送藥物部分至腫瘤，並於細胞內累積，其中全身性投予這些非結合藥物試劑可導致正常細胞無法接受之毒性程度及應可消除之腫瘤細胞（Baldwin et al., （1986） Lancet pp. （Mar. 15, 1986）:603-05；Thorpe, （1985） “Antibody Carriers Of Cytotoxic Agents In Cancer Therapy: A Review,” in Monoclonal Antibodies '84: Biological And Clinical Applications, A. Pinchera et al. （ed.s）, pp. 475-506）。因此，尋求具有最小毒性之最大功效。多株抗體與單株抗體兩者經報告適用於彼等策略（Rowland et al., （1986） Cancer Immunol. Immunother., 21:183-87）。彼等方法使用之藥物包括道諾黴素、多柔比星、胺甲喋呤、及長春地辛（Rowland et al., （1986），如上述）。用於抗體-毒素複合體之毒素包括細菌毒素如白喉毒素、植物毒素如蓖麻毒蛋白、小分子毒素如格爾德黴素（geldanamycin）（Mandler et al （2000） Jour. of the Nat. Cancer Inst. 92（19）:1573-1581；Mandler et al （2000） Bioorganic & Med. Chem. Letters 10:1025-1028；Mandler et al （2002） Bioconjugate Chem. 13:786-791）、美登木素（maytansinoids）（EP 1391213；Liu et al., （1996） Proc. Natl. Acad. Sci. USA 93:8618-8623）、及卡奇黴素（calicheamicin）（Lode et al （1998） Cancer Res. 58:2928；Hinman et al （1993） Cancer Res. 53:3336-3342）。毒素可影響其細胞毒性與細胞增殖性效應，其機制包括微管蛋白結合、DNA結合、或拓撲異構酶抑制。當結合至大型抗體或蛋白質受體配體時，一些細胞毒性藥物傾向無活性的或低活性。 抗體衍生物
本發明抗體可進一步改良以含有額外之本領域習知且可得之其他非蛋白質部分。於一具體實施例中，適於抗體衍生化之部分為水溶性聚合物。水溶性聚合物之非侷限實例包括但不侷限於，聚乙二醇（PEG）、乙二醇/丙二醇之共聚物、羧甲基纖維素、葡聚醣、聚乙烯醇、聚乙烯吡咯烷酮、聚-1,3-二草酸酯、聚-1,3,6-三氧環己烷、乙烯/馬來酸酐共聚物、聚胺基酸（均聚合物或隨機共聚物）、及葡聚醣或聚（正乙烯基吡咯烷酮）聚乙二醇、聚丙二醇均聚合物、聚環氧丙烷/環氧乙烷共聚物、聚氧乙烯化多元醇（如甘油）、聚乙烯醇、及其混合物。聚乙二醇丙醛於製造時由於其水中穩定性而具有優勢。聚合物可為任何分子量，且可為支鏈或非支鏈。連接抗體之聚合物數量係可變，且若大於一聚合物經連接，則聚合物可為相同或不同分子。一般而言，用於衍生化之聚合物數量及/或類型可基於若干考量而決定，包括但不限於，欲改進之抗體的特定性質或功能、抗體衍生物是否將用於定義之條件下的治療等。
於另一具體實施例中，提供可利用暴露於輻射而選擇性加熱之抗體及非蛋白質部分之共軛物。於一具體實施例中，非蛋白質部分為奈米碳管（Kam et al., Proc. Natl. Acad. Sci. 102: 11600-11605 （2005））。輻射可為任何波長，且包括但不侷限於，不傷害普通細胞之波長，但其將非蛋白質部分加熱至抗體-非蛋白質部分附近之細胞被殺死之溫度。 醫藥配方
於一具體實施例中，本發明提供包含本文所述之抗體或其抗原結合部位之醫藥組合物，及醫藥上可接受載體。於另一具體實施例中，醫藥組合物包含編碼本發明抗體或其抗原結合部位之核酸，及醫藥上可接受載體。醫藥上可接受載體包括生理上相容之任何及所有溶劑、分散介質、等張與吸收延遲劑、及其類似物。於一具體實施例中，組合物係有效抑制個體之癌細胞。
本發明醫藥組合物之給藥途徑包括但不侷限於，靜脈、肌內、鼻內、皮下、口服、局部、皮下、皮內、經皮、表皮下、非口服、直腸、脊髓、或表皮投予。
本發明之醫藥組合物可製成注射劑，不論液體溶液或懸液，或製成固體形式，其於注射前適用於液體載體中之溶液或懸液。醫藥組合物亦可製成固體形式、乳化、或將活性成分包入微脂體載劑或其他顆粒載體中，以用於持續輸送。舉例而言，醫藥組合物可為油乳劑、油包水乳劑、水包油包水乳劑、特定位點乳劑、長駐留乳劑、黏性乳劑、微乳劑、奈米乳劑、微脂體、微粒、微球、奈米球、奈米顆粒、及各種天然或合成聚合物，如不可再吸收性不可滲透聚合物，如乙烯乙酸乙烯酯共聚物與Hytrel ®共聚物、可溶脹聚合物如水凝膠、或可再吸收性聚合物，如膠原蛋白與特定多元酸或聚酯，如那些用於製造可再吸收性縫線者，其能持續釋放醫藥組合物。
本發明之抗體或其抗原結合部位係配製成醫藥組合物，用以輸送至哺乳類動物個體。醫藥組合物係單獨投予，及/或與醫藥上可接受載劑、賦形劑、或載體混合。適用之載劑為，例如，水、鹽液、葡萄糖、甘油、乙醇、或其類似物，及其共軛物。此外，載劑可含有少量輔助物質，如潤濕劑或乳化劑、pH值緩衝劑、或佐劑。醫藥上可接受載體可包含生理上可接受化合物，其作為如穩定、或增加或減少本發明醫藥組合物之吸收率或清除率。生理上可接受化合物可包括，如醣類，如葡萄糖、蔗糖、或葡聚醣、抗氧化劑，如抗壞血酸或穀胱甘肽、螯合劑、低分子量蛋白、清潔劑、微脂體載體、或賦形劑或其他安定劑、及/或緩衝液。其他生理上可接受化合物包括潤濕劑、乳化劑、分散劑、或防腐劑。參見，例如，21 stedition of Remington's Pharmaceutical Science, Mack Publishing Company, Easton, Pa. （"Remington's"）。本發明之醫藥組合物亦可包括輔助性物質，如藥理學試劑、細胞介素、或其他生物反應調節劑。
此外，醫藥組合物可配製成中性或鹽類形式之醫藥組合物。醫藥上可接受鹽類包括酸加成鹽（其伴隨活性多胜肽之游離胺基形成），且其係伴隨無機酸，如鹽酸或磷酸，或有機酸如乙酸、草酸、酒石酸、杏仁酸、及其類似物形成。由游離羧基形成之鹽類亦可衍生自無機鹼，如氫氧化鈉、氫氧化鉀、氫氧化銨、氫氧化鈣、或氫氧化鐵，以及有機鹼諸如異丙基胺、三甲基胺、2-乙基胺基乙醇、組胺酸、普魯卡因、及其類似物。
製備此類劑型之實際方法係習知，或對本領域之技術人員而言將是顯而易見。參見，例如，Remington's Pharmaceutical Sciences, Mack Publishing Company, Easton, Pennsylvania, 21 stedition。
醫藥組合物可於單一劑量治療或多劑量治療中按照時間表及適合於個體年齡、體重及病況、使用之特定組合物、及投予途徑、醫藥組合物是否用於預防或治療目的等條件下投予一段時間。舉例而言，於一具體實施例中，本發明之醫藥組合物之投予係每月一次、每月兩次、每月三次、每隔一週（qow）、每週一次（qw）、每週兩次（biw）、每週三次（tiw）、每週四次、每週五次、每週六次，每隔一天（qod）、每天（qd）、每天兩次（qid）、或每天三次（tid）。
本發明抗體之投予時間，亦即，投予醫藥組合物之時間段可變，取決於多種因素之一者，如個體反應等。舉例而言，醫藥組合物可投予之時間範圍為約一或多秒至一或多個小時、一天至約一週、約兩週至約四週、約一個月至約兩個月、約兩個月至約四個月、約四個月至約六個月、約六個月至約八個月、約八個月至約一年、約一年至約二年、或約二年至約四年、或以上。
為便於投予及劑量均勻性，可使用劑量單位形式之口服或非口服醫藥組合物。本文中使用的劑量單位形式意指適於作為欲治療對象之單位劑量的物理離散單位；各單位含有預定量之活性化合物，其經計算以產生所需治療效果，其係與所需之醫藥載體相關聯。
細胞培養試驗與動物研究取得之數據可用於配製用於人體之一系列劑量。於一具體實施例中，此類化合物之劑量落於一循環濃度範圍內，包括具有些微或無毒性之ED 50。劑量可於此範圍內改變，取決於所用之劑型及所用之投予途徑。於另一具體實施例中，治療上有效劑量可初步從細胞培養試驗估計。於動物模式中可配製一劑量，以達到循環血漿濃度範圍，其包括細胞培養物時測定之IC 50（亦即，受測化合物之濃度達到症狀之半最大抑制）。Sonderstrup, Springer, Sem. Immunopathol. 25: 35-45, 2003。Nikula et al., Inhal. Toxicol. 4（12）: 123-53, 2000。
本發明抗體或抗原結合部位之治療上或預防上有效量之示例性、非侷限範圍為約0.001至約60 mg/kg的體重、約0.01至約30 mg/kg的體重、約0.01至約25 mg/kg的體重、約0.5至約25 mg/kg的體重、約0.1至約20 mg/kg的體重、約10至約20 mg/kg的體重、約0.75至約10 mg/kg的體重、約1至約10 mg/kg的體重、約2至約9 mg/kg的體重、約1至約2 mg/kg的體重、約3至約8 mg/kg的體重、約4至約7 mg/kg的體重、約5至約6 mg/kg的體重、約8至約13 mg/kg的體重、約8.3至約12.5 mg/kg的體重、約4至約6 mg/kg的體重、約4.2至約6.3 mg/kg的體重、約1.6至約2.5 mg/kg的體重、約2至約3 mg/kg的體重、或約10 mg/kg的體重。
醫藥組合物係經配製以含有一有效量之本發明抗體或其抗原結合部位，其中該量取決於欲處理之動物及欲治療之病況。於一具體實施例中，本發明抗體或其抗原結合部位之投予劑量範圍為約0.01 mg至約10 g、約0.1 mg至約9 g、約1 mg至約8 g、約2 mg至約7 g、約3 mg至約6 g、約10 mg至約5 g、約20 mg至約1 g、約50 mg至約800 mg、約100 mg至約500 mg、約0.01 μg至約lOg、約0.05 μg至約1.5 mg、約10 μg至約1 mg蛋白、約30 μg至約500 μg、約40 μg至約300 μg、約0.1 μg至約200 μg、約0.1 μg至約5 μg、約5 μg至約10 μg、約10 μg至約25 μg、約25 μg至約50 μg、約50 μg至約100 μg、約100 μg至約500 μg、約500 μg至約1 mg、約1 mg至約2 mg。任何特定個體之具體劑量程度取決於多個因素，包括特定胜肽之活性、年齡、體重、整體健康狀況、性別、飲食、投予時間、投予途徑、及排泄速率，藥物組合及特定疾病於治療時之嚴重程度，並且可由本領域普通技術人員確定，而無需過度實驗。
製備含有本發明抗體之治療配方並保存，其係藉由混合具所需純度之抗體與任意之生理上可接受載體、賦形劑、或安定劑（Remington's Pharmaceutical Sciences 16 thedition, Osol, A. Ed. （1980）），使成水溶液、凍乾、或其他乾燥配方形式。可接受之載體、賦形劑、或安定劑於使用之劑量與濃度下對受體無毒，且包括緩衝液如磷酸鹽、檸檬酸鹽、組胺酸、及其他有機酸；抗氧化劑包括抗壞血酸與甲硫胺酸；防腐劑（如十八烷基二甲基芐基氯化銨；六甲基氯化銨；苯扎氯銨、芐索氯銨；酚、丁基、或苯甲醇；對羥基苯甲酸烷酯，如對羥基苯甲酸甲酯或丙酯；兒茶酚；間苯二酚；環己醇；3-戊醇；以及間甲酚）；低分子量（小於約10個殘基）多胜肽；蛋白質，如血清白蛋白、明膠、或免疫球蛋白；親水性聚合物如聚乙烯吡咯烷酮；胺基酸如甘胺酸、麩醯胺酸、天門冬醯胺酸、組胺酸、精胺酸、或離胺酸；單醣類、雙醣類、及其他醣類，包括葡萄糖、甘露糖、或糊精；螫合劑如EDTA；醣類如蔗糖、甘露糖醇、海藻糖、或山梨糖醇；鹽形成相對離子如鈉；金屬錯合物（如Zn-蛋白質錯合物）；及/或非離子性界面活性劑如TWEEN™、PLURONICS™、或聚乙二醇（PEG）。
本文之製劑亦可含有大於一者之活性化合物，以針對所需治療之特定適應症，其包括但不限於，那些具有互補活性且不相互有不良影響者。此類分子合適地存在於共軛物中，其量對預期之目的有效。
活性成分亦可包入微膠囊中，其係製自，例如，凝聚技術或界面聚合作用，如分別為羥甲基纖維素或明膠微膠囊與聚（甲基丙烯酸甲酯）；包入膠體藥物輸送系統（如微脂體、白蛋白微球、微乳劑、奈米顆粒、及奈米膠囊）或包入巨乳劑。此類技術係揭示於Remington's Pharmaceutical Sciences 16th edition, Osol, A. Ed. （1980）。
用於體內投予之製劑必須無菌。此係通過無菌過濾膜過濾而易於實現。
可製備持續釋放製備物。持續釋放製備物之適用實例包括含有本發明免疫球蛋白之固體疏水性聚合物之半透性基質，該基質為成形製品形式，如薄膜或微膠囊。持續釋放基質之實例包括聚酯類、水凝膠（如聚（2-羥乙基甲基丙烯酸酯）或聚（乙烯醇））、聚交酯（美國專利號3,773,919）、L-麩胺酸與γ乙基-L-麩胺酸之共聚物、非降解性乙烯-乙酸乙烯酯、降解性乳酸-乙醇酸共聚物，如LUPRON DEPOT™ （由乳酸-乙醇酸共聚物與醋酸亮丙瑞林組成之可注射微球）、及聚-D-（−）-3-羥基丁酸。儘管聚合物，如乙烯-乙酸乙烯酯與乳酸-乙醇酸，能釋放分子超過100天，但特定水凝膠之蛋白質釋放時間則較短。當包入之免疫球蛋白長時間保留於體內時，其可因暴露於37°C水分而變性或聚集，造成喪失生物活性且可能改變免疫原性。依據涉及之機制，可規劃穩當之合理化策略。舉例而言，若發現聚集機制為通過硫基-二硫化物交換而形成分子間S-S鍵，則可利用改良巰氫基殘基、從酸性溶液凍乾、控制含水量、使用合適添加劑、及開發特定聚合物基質組合物以達到安定化。 用途
本發明抗體可用於如體外、離體、及體內之治療方法。本發明抗體可作為拮抗劑，以部分或全部阻斷體外、離體、及/或體內之特異性抗原活性。此外，本發明之至少一些抗體可中和其他物種之抗原活性。據此，本發明抗體可用於抑制特異性抗原活性，如在含有抗原之細胞培養物中、在人類個體中、或在其他哺乳動物個體中（如黑猩猩、狒狒、絨猿、食蟹猴與恒河猴、豬、或小鼠），其具有本發明抗體可交叉反應之抗原。於一具體實施例中，本發明抗體可用於抑制抗原活性，其係藉由使抗體與抗原接觸以抑制抗原活性。於一具體實施例中，抗原為人類蛋白質分子。
於一具體實施例中，本發明抗體可用於抑制患有病症之個體之抗原的方法，其中該抗原活性係有害，包含投予該個體本發明之抗體，使得個體之抗原活性受抑制。於一具體實施例中，抗原為人類蛋白質分子且個體為人類個體。或者，個體可為表現抗原之哺乳動物，且本發明抗體可與之結合。此外，個體可為抗原係經導入之哺乳類動物（如藉由投予抗原或藉由表現抗原轉基因）。針對治療目的，本發明抗體可投予人類個體。此外，本發明抗體可投予表現抗原之非人類哺乳類動物，其中抗體可與之交叉反應（如靈長類動物、豬、或小鼠），用於獸醫目的或作為人類疾病之動物模式。關於後者，此類動物模式可用於評估本發明抗體之治療功效（如劑量測試及投予時程）。本發明抗體可用於治療、抑制、延緩進展、預防/延遲復發、改善、或預防與SSEA-4和SSEA-4化蛋白之異常表現及/或活性相關聯之疾病、病症、或病況，包括但不侷限於，癌症、肌肉病症、泛素途徑相關之遺傳病症、免疫/發炎性病症、神經障礙、及其他泛素途徑相關之病症。
在一方面，本發明之阻斷抗體係特異於SSEA-4。
於特定具體實施例中，投予病患包含本發明與一細胞毒性劑結合之抗體的一免疫共軛物。於特定具體實施例中，免疫共軛物及/或其結合之抗原係由細胞內化，該細胞係於其表面上表現一或多個與SSEA-4相關聯之蛋白，導致免疫共軛物毒殺其相關聯標靶細胞之治療功效增加。於一具體實施例中，細胞毒性劑靶向或干擾標靶細胞之核酸。此類細胞毒性劑之實例包括本文所述之化學治療劑之任一者（如美登木素或卡奇黴素）、放射性同位素、或核糖核酸酶或DNA內切核酸酶。
本發明抗體於治療中可單獨使用或結合其他組合物使用。舉例而言，本發明抗體可與另一抗體及/或佐劑/治療劑（如類固醇）共同投予。舉例而言，本發明抗體於治療方案中可結合抗發炎劑及/或抗菌劑，例如，治療本文所述疾病之任一者，包括癌症、肌肉病症、泛素途徑相關之遺傳病症、免疫/發炎性病症、神經障礙、及其他泛素途徑相關之病症。上述之此類結合治療包括組合給藥（其中二或多個藥物係包括於同一或分開之配方中）與分開給藥，於此情況下，可在投予輔助治療之前及/或之後投予本發明之抗體。
本發明之抗體（與輔助治療劑）可利用任何合適之方式投予，包括非口服、皮下、腹腔、肺內、及鼻內，且視需求，用於局部治療、病灶內投予。非口服輸注包括肌肉內、靜脈、動脈、腹腔、或皮下投予。此外，抗體係適於藉由脈衝輸注投予，特別是針對抗體劑量漸降。投劑可利用任何合適途徑，如利用注射（如靜脈或皮下注射），其部分取決於投予是否為短暫或慢性。
於製備與投予抗體時，可考量本發明抗體之結合標靶之位置。當結合標靶為細胞內分子時，本發明之特定具體實施例提供將抗體或其抗原結合片段導入含有結合標靶之細胞。於一具體實施例中，本發明抗體可於細胞內表達，成為內抗體。本文中使用的「內抗體」乙詞意指抗體或其抗原結合部位係於細胞內表現，且其能選擇性結合標靶分子，其係描述於Marasco, Gene Therapy 4: 11-15 （1997）；Kontermann, Methods 34: 163-170 （2004）；美國專利號6,004,940與6,329,173；美國專利申請公開號2003/0104402；及PCT公開號WO2003/077945。內抗體於細胞內之表現係受到將編碼所需抗體或其抗原結合部位之核酸導入標靶細胞的影響（缺乏野生型前導序列與分泌信號，其通常與編碼抗體或抗原結合片段之基因相關聯）。可使用任何將核酸導入細胞之標準方法，包括但不侷限於，顯微注射、彈道注射、電穿孔、磷酸鈣沉澱、微脂體、及以攜帶感興趣核酸之逆轉錄病毒、腺病毒、腺相關病毒、及牛痘載體轉染。編碼本發明抗SSEA-4抗體之全部或一部分之一或多個核酸可輸送至標靶細胞，使得表現一或多個內抗體，其能於細胞內結合SSEA-4，並調控一或多個SSEA-4介導之細胞途徑。
於另一具體實施例中，提供內化之抗體。抗體可具有特定特徵，其增強抗體輸送至細胞，或可經改良以產生此類特徵。欲達此目的之技術係本領域習知。舉例而言，抗體之陽離子化（cationization）習知有助於其攝入細胞（參見，美國專利號6,703,019）。脂轉染或微脂體亦可用於將抗體輸送至細胞。當使用抗體片段時，針對特異性結合標靶蛋白之結合區，最小之抑制片段通常具優勢。舉例而言，依據抗體之可變區序列，可設計保留結合標靶蛋白序列能力之胜肽分子。此類胜肽可化學合成及/或利用重組型DNA技術產生。參見，如Marasco et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 90: 7889-7893 （1993）。
利用本領域之習知方法，可增強調節子多胜肽進入標靶細胞。舉例而言，特定序列，如那些衍生自HIV Tat或觸角足（Antennapedia）同源性結構域蛋白者，能直接有效地攝入異源性蛋白跨越細胞膜。參見，如Chen et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA （1999）, 96:4325-4329。
當結合標靶位於腦部時，本發明之特定具體實施例提供抗體或其抗原結合片段穿過血腦障壁。特定之神經退化性疾病與血腦障壁滲透性增加相關聯，使得抗體或抗原結合片段可易於導入腦部。當血腦障壁仍完整時，有數個現有之本領域習知之運送分子穿越方法，包括但不侷限於，物理方法、基於脂質之方法、及基於受體與通道之方法。
運輸抗體或抗原結合片段穿越血腦障壁之物理方法包括但不侷限於，完全避開血腦障壁，或藉由在血腦障壁創建開口。規避方法包括但不侷限於，直接注入腦部（參見，如Papanastassiou et al., Gene Therapy 9: 398-406 （2002））、間質輸液/對流增強輸送（參見，如Bobo et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 91: 2076-2080 （1994））、及在腦部植入輸送裝置（參見，如Gill et al., Nature Med. 9: 589-595 （2003）；以及Gliadel Wafers™, Guildford Pharmaceutical）。於障壁創建開口之方法包括但不侷限於，超音波（參見，如美國專利公開號2002/0038086）、滲透壓（如藉由投予高張性甘露醇（Neuwelt, E. A., Implication of the Blood-Brain Barrier and its Manipulation, Vols 1 & 2, Plenum Press, N.Y. （1989）））、藉由通透反應，如舒緩肽或通透劑A-7 （參見，如美國專利號5,112,596、5,268,164、5,506,206、及5,686,416）、及以含有編碼抗體或抗原結合片段基因之載體轉染跨越血腦障壁的神經元（參見，如美國專利公開號2003/0083299）。
運輸抗體或抗原結合片段穿越血腦障壁之基於脂質之方法包括但不侷限於，將抗體或抗原結合片段包入耦接抗體結合片段之微脂體，其結合血腦障壁血管內皮上之受體（參見，如美國專利申請公開號20020025313），並將抗體或抗原結合片段塗佈於低密度脂蛋白顆粒（參見，如美國專利申請公開號20040204354）或脂蛋白元E （參見，如美國專利申請公開號20040131692）。
運輸抗體或抗原結合片段穿越血腦障壁之基於受體與通道之方法包括但不侷限於，使用糖皮質素阻斷劑以增加血腦障壁通透性（參見，如美國專利申請公開號2002/0065259、2003/0162695、及2005/0124533）；活化鉀通道（參見，如美國專利申請公開號2005/0089473）、抑制ABC藥物運輸蛋白（參見，如美國專利申請公開號2003/0073713）；以轉鐵蛋白塗佈抗體並調節一或多個轉鐵蛋白受體之活性（參見，如美國專利申請公開號2003/0129186）、及將抗體陽離子化（參見，如美國專利號5,004,697）。
本發明抗體組合物將以符合良好醫學實踐之方式配製、投劑、及投予。於此情況下之考慮因素包括，欲治療之特定病症、欲治療之特定哺乳類動物、個體病患之臨床狀況、病症成因、藥劑輸送部位、投予方法、投予方案、及醫師習知之其他因素。抗體毋須，而是任意地與目前用於預防或治療有問題病症之一或多個藥劑一同配製。此類其他藥劑之有效量取決於配方中存在之本發明抗體之量、病症或治療類型、及上述之其他因素。這些一般而言以與本文所述相同劑量與投予途徑使用，或本文所述劑量之約1至99%，或以經驗上/臨床上確定為適當之任何劑量及任何途徑使用。
針對疾病之預防或治療，本發明抗體之適當劑量（當單獨使用或與其他試劑結合使用時，如化學治療劑）將取決於欲治療疾病之類型、抗體類型、疾病嚴重性與過程、抗體是否用於預防或治療目的、先前治療、病患臨床病史及對抗體的反應、及主治醫師判斷。抗體適合以一次性或一系列治療之方式投予病患。取決於疾病類型與嚴重性，投予病患之起始候選劑量可為約1 μg/kg至15 mg/kg （如0.1 mg/kg至10 mg/kg）之抗體，例如，不論是藉由一或多次分開投予，或連續輸注。一通常每日劑量範圍可從約1 μg開始，以預防或治療疾病，本發明抗體之適當劑量（數天或更長時間）取決於病況，治療一般而言將持續到疾病症狀出現抑制。抗體之一示例性劑量範圍為約0.05 mg/kg至約10 mg/kg。因此，可投予病患一或多劑之約0.5 mg/kg、2.0 mg/kg、4.0 mg/kg、或10 mg/kg （或其任何組合）。此類劑量可間歇投予，如每週或每三週（諸如使病患接受約2至約20劑，或諸如約6劑之抗體）。一開始可投予較高負荷劑量，接著為一或多個較低劑量。示例性投劑方案包含投予約4 mg/kg之初始負荷劑量，接著每週維持約2 mg/kg之抗體劑量。然而，可使用其他投劑方案。此治療之進展易於以常規技術與試驗監測。 製品
於本發明之另一態樣，所提供之製品含有治療、預防、及/或診斷上述病症之適用材料。該製品包含一容器及容器上或黏貼於容器之標籤或包裝插頁。適用之容器包括例如，瓶、小瓶、注射器等。容器可由各材料製成，如玻璃或塑料。容器所持有之組合物其本身或當與另一組合物結合時能有效治療、預防、及/或診斷病況，且可具有無菌進入口（例如，容器可為靜脈輸液袋或供皮下注射針使用之塞蓋小瓶）。組合物中至少一活性劑為本發明抗體。標籤或包裝插頁指示組合物所適用之病況治療選擇。此外，該製品可包含：（a）一其中含有組合物之第一容器，其中該組合物包含本發明抗體；以及（b）一其中含有組合物之第二容器，其中該組合物包含進一步之細胞毒性或其他治療劑。本發明之此具體實施例之製品可進一步包含包裝插頁，其指示組合物可用於治療特定病況。或者，或此外，製品可進一步包含第二（或第三）容器，其包含醫藥上可接受緩衝液，如抑菌劑注射用水（BWFI）、磷酸緩衝鹽液、林格氏液、及葡萄糖溶液。可進一步包括商業與用戶觀點上所需之其他材料，包括其他緩衝液、稀釋劑、過濾器、針頭、及注射器。
於特定具體實施例中，欲治療之個體為哺乳類動物。於特定具體實施例中，個體為人類。於特定具體實施例中，個體為馴養動物，如犬、貓、牛、豬、馬、綿羊、或山羊。於特定具體實施例中，個體為伴侶動物，如犬或貓。於特定具體實施例中，個體為家畜動物，如牛、豬、馬、綿羊、或山羊。於特定具體實施例中，個體為動物園動物。於另一具體實施例中，個體為研究用動物，囓齒動物、犬、或非人類靈長類動物。於特定具體實施例中，個體為非人類轉基因動物，如轉基因小鼠或轉基因豬隻。 醫藥組合物及配方
於製備本文所述之抗體後，可製成「預凍乾配方」。用於製成配方之抗體較佳地係基本上純質，且理想地基本上係同源性（亦即，無蛋白質污染等）。「基本上純質」蛋白質意指組合物包含至少約90重量百分比之蛋白質，其係以組合物之總重量為基準，較佳地至少約95重量百分比。「基本上均質化」蛋白質意指組合物包含至少約99重量百分比之蛋白質，其係以組合物之總重量為基準。於特定具體實施例中，蛋白質為抗體。
預凍乾配方中抗體量之決定係考量所需之劑量體積、投予方式等。當所選擇之蛋白質為完整抗體（全長抗體）時，示例性起始蛋白質濃度為約2 mg/mL至約50 mg/mL、較佳地約5 mg/mL至約40 mg/mL、最佳地約20至30 mg/mL。蛋白質一般而言存在於溶液中。舉例而言，蛋白質可存在於pH值約4-8之緩衝溶液中，較佳地pH值約5-7。示例性緩衝液包括組胺酸、磷酸鹽、Tris、檸檬酸鹽、琥珀酸鹽、及其他有機酸。緩衝液濃度可為約1 mM至約20 mM，或約3 mM至約15 mM，取決於如緩衝液與配方（如回溶之配方）所需之等張性。較佳之緩衝液為組胺酸，係因如下所示，其可具凍乾保護性質。琥珀酸鹽經證明為另一適用之緩衝液。
凍乾保護劑係加入預凍乾配方。於較佳之具體實施例中，凍乾保護劑為非還原性糖，如蔗糖或海藻糖。凍乾保護劑於預凍乾製劑中之量通常使得在回溶時，所得配方將呈現等張性。然而，高張性回溶配方亦可適用。此外，凍乾保護劑之量不能過低，使得凍乾時出現不可接受量之蛋白質降解/聚集。當凍乾保護劑為糖（如蔗糖或海藻糖）且蛋白質為抗體時，示例性凍乾保護劑於預凍乾配方中之濃度為約10 mM至約400 mM，較佳地約30 mM至約300 mM，最佳地約50 mM至約100 mM。
針對各蛋白質與凍乾保護劑組合，選擇蛋白質與凍乾保護劑之比率。在以抗體作為所選之蛋白質且以糖（如蔗糖或海藻糖）作為凍乾保護劑而產生具高蛋白質濃度之等張性回溶配方的情況下，凍乾保護劑與抗體之莫耳比率可為，約100至約1500莫耳凍乾保護劑比上1莫耳抗體，且較佳地約200至約1000莫耳凍乾保護劑比上1莫耳抗體，如約200至約600莫耳凍乾保護劑比上1莫耳抗體。
於本發明之較佳具體實施例中，發現到，需要將界面活性劑加入預凍乾配方。或者，或此外，可將界面活性劑加入凍乾配方及/或回溶配方。示例性界面活性劑包括非離子性界面活性劑，如聚山梨醇酯（如聚山梨醇酯20或80）；泊洛沙姆（如泊洛沙姆188）；Triton；十二烷基硫酸鈉（SDS）；月桂基硫酸鈉；辛基辛糖鈉；月桂基、肉荳蔻基、亞油醯基、或硬脂基磺基甜菜鹼；月桂基、肉荳蔻基、亞油醯基、或硬脂基肌胺酸；亞油醯基、肉荳蔻基、或十六烷基甜菜鹼；月桂醯胺基丙基、椰油醯胺丙基、亞油醯胺基丙基、肉荳蔻醯胺基丙基、棕櫚醯丙基、或異硬脂醯胺丙基甜菜鹼（如月桂醯胺基丙基）；肉荳蔻醯胺基丙基、棕櫚醯丙基、或異硬脂醯胺丙基二甲基胺；甲基椰油基甲酯鈉、或油基牛磺酸甲酯二鈉；以及MONAQUATTM系列（Mona Industries, Inc.，Paterson，N.J.）、聚乙二醇、聚丙二醇、及乙烯與丙二醇之共聚物（如Pluronics、PF68等）。添加之界面活性劑量使得回溶蛋白之聚集減少，並使回溶後之顆粒形成最小化。舉例而言，界面活性劑可以約0.001-0.5%之量存在於預凍乾配方中，較佳地約0.005-0.05%。
於本發明之特定具體實施例中，以凍乾保護劑（如蔗糖或海藻糖）與增積劑（如甘露糖醇或甘胺酸）之混合物用於製備預凍乾配方。增積劑可容許產生均勻之凍乾餅狀物，而無過多凝塊等於其中。
其他醫藥上可接受載體、賦形劑、或安定劑，如那些描述於Remington's Pharmaceutical Sciences 16th edition, Osol, A. Ed. （1980）者，可包括於預凍乾配方（及或凍乾配方及/或回溶配方）中，條件為其不會不良影響配方所需之特徵。可接受之載體、賦形劑、或安定劑於使用之劑量與濃度下對接受者無毒，包括：額外之緩衝劑；防腐劑；共溶劑；抗氧化劑，包括抗壞血酸與甲硫胺酸；螯合劑，如EDTA；金屬錯合物（如Zn-蛋白質錯合物）；生物可降解性聚合物，如聚酯；及/或成鹽相對離子，如鈉。
本文所述之醫藥組合物與配方較佳地係安定。“「安定」配方/組合物係其中之抗體於保存時基本上維持其物理與化學安定性及完整性。用於測定蛋白質安定性之各分析技術係本領域可得，並於Peptide and Protein Drug Delivery, 247-301, Vincent Lee Ed., Marcel Dekker, Inc., New York, N.Y., Pubs. （1991）及Jones, A. Adv. Drug Delivery Rev. 10: 29-90 （1993）等文獻中回顧。安定性可於所選溫度下之所選時間段測定。
用於體內投予之配方必須無菌。此可於凍乾與回溶之前或之後利用過濾通過無菌過濾膜而易於達成。或者，除了蛋白質以外，可於約120°C下高壓滅菌該成分約30分鐘，達到整體混合物之無菌性。
於蛋白質、凍乾保護劑、及其他任意組分混合在一起後，將配方凍乾。有許多不同冷凍乾燥機可用於此目的，如Hull50® （Hull，USA）或GT20® （Leybold-Heraeus，Germany）冷凍乾燥機。藉由冷凍該配方且隨後於適合初級乾燥之溫度下將冰從冷凍內容物中昇華而達到冷凍乾燥。於此條件下，產物溫度低於配方之共熔點（eutectic point）或崩解溫度。通常，於合適壓力下（通常範圍為約50至250 mTorr），初級乾燥之上架溫度（shelf temperature）範圍約-30至25°C （條件為產物在初級乾燥期間保持冷凍）。乾燥所需之時間主要取決於配方、裝載樣本（如玻璃小瓶）之容器尺寸與類型、及液體體積，其範圍可為幾小時至數天（如40-60小時）。次級乾燥階段可於約0-40°C下進行，其主要取決於所使用之容器類型與尺寸及蛋白質類型。然而，本文發現，可能不需要次級乾燥步驟。舉例而言，在凍乾的整個除水階段中，上架溫度可為約15-30°C （如約20°C）。次級乾燥所需之時間與壓力將是產生合適凍乾餅狀物之時間與壓力，其取決於溫度與其他參數。次級乾燥時間係由產物所需之水分殘留量決定，且通常需要至少約5小時（如10-15小時）。壓力可與初級乾燥步驟使用之壓力相同。冷凍乾燥條件可依據配方與小瓶尺寸而變。
於一些情況下，可能需要凍乾容器中之蛋白質配方，其中係進行蛋白質回溶，以避免轉移步驟。容器於此情況下可為，例如，3、5、10、20、50、或100 cc小瓶。於一般前提下，凍乾將產生凍乾配方，其中水分含量係小於約5%，且較佳地小於約3%。
於所需階段，通常以蛋白質投予病患時，可以稀釋劑回溶凍乾配方，使得回溶配方之蛋白質濃度為至少50 mg/ mL，如約50 mg/mL至約400 mg/mL，更佳地約80 mg/mL至約300 mg/mL，最佳地約90 mg/mL至約150 mg/mL。於回溶配方中此類高蛋白質濃度於皮下輸送該回溶配方時特別適用。然而，針對其他投予途徑，如靜脈投予，回溶配方中可能需要較低濃度之蛋白質（例如，回溶配方中含有約5-50 mg/mL或約10-40 mg/mL之蛋白質）。於特定具體實施例中，回溶配方之蛋白質濃度明顯比預凍乾配方的高。舉例而言，回溶配方之蛋白質濃度可為預凍乾配方的約2-40倍，較佳地3-10倍，且最佳地3-6倍（如至少3倍或至少4倍）。
回溶通常在約25°C溫度下進行，以確保完全水合，儘管可視需求使用其他溫度。回溶所需之時間將取決於，如稀釋劑類型、賦形劑與蛋白質之量。示例性稀釋劑包括無菌水、制菌劑注射用水（BWFI）、pH值緩衝液（如磷酸緩衝鹽液）、無菌鹽液、林格氏溶液、或葡萄糖溶液。稀釋劑係可選地含有防腐劑。示例性防腐劑如上述，較佳之防腐劑為芳族醇類，如芐基或酚醇是。防腐劑之用量取決於評估不同防腐劑濃度與蛋白質之相容性及防腐功效測試。舉例而言，若防腐劑為芳族醇（如苯甲醇），則其存在量可為約0.1-2.0%，較佳地約0.5-1.5%，最佳地約1.0-1.2%的。較佳地，回溶配方每瓶具有小於6000個顆粒，其粒徑大於10 µm。 治療應用
本文係描述治療方法，包括投予有需求之個體一治療上有效量之組合物治療，該組合物包括本文所述之一或多個抗體。
於特定具體實施例中，有治療需求之個體（如人類病患）係診斷出、疑似患有、或有癌症風險。癌症之實例包括但不侷限於，肉瘤、皮膚癌、血癌、淋巴瘤、腦癌、肺癌、乳癌、口腔癌、食道癌、胃癌、肝癌、膽管癌、胰臟癌、大腸癌、腎癌、子宮頸癌、卵巢癌、及前列腺癌。於特定具體實施例中，癌症為肉瘤、皮膚癌、血癌、淋巴瘤、腦癌、肺癌、乳癌、卵巢癌、前列腺癌、大腸癌、或胰臟癌。於一些較佳之具體實施例中，癌症為腦癌或神經膠質母細胞瘤多形（GBM）癌。
於較佳之具體實施例中，抗體能靶向SSEA-4表現之癌細胞。於特定具體實施例中，抗體能靶向癌細胞上之SSEA-4。於特定具體實施例中，抗體能靶向癌症之SSEA-4。
該治療導致減少腫瘤尺寸、消除惡性細胞、預防轉移、預防復發、減少或毒殺瀰漫性癌症、延長存活時間、及/或延長腫瘤之癌症進展時間。
於特定具體實施例中，該治療進一步包含在投予該抗體之前、期間、或之後，投予該個體一額外之治療。於特定具體實施例中，額外之治療係以化學治療劑治療。於特定具體實施例中，額外之治療係以輻射治療。
本發明方法在治療與預防早期腫瘤方面特別有利，藉以防止進展到更晚期的階段，使得晚期癌症相關之發病率與死亡率下降。本發明方法亦有利於預防腫瘤復發或腫瘤再生長，如於移除原發性腫瘤後仍存在之休眠腫瘤（dormant tumor），或減少或預防腫瘤發生。
於特定具體實施例中，本文揭示之方法係適用於癌症之治療或預防，例如，該癌症之特徵為Globo H、SSEA-3、及/或SSEA-4之表現增加。於特定具體實施例中，癌症包含癌症幹細胞。於特定具體實施例中，癌症為前期癌症（pre-cancer）及/或惡性癌症及/或抗藥性癌症。於特定具體實施例中，癌症為腦癌。
針對本發明之方法，癌症可為液體腫瘤，如血癌與淋巴瘤、固體腫瘤，如乳癌、大腸直腸癌、直腸癌、肺癌、腎細胞癌、神經膠質瘤（如退行性星形細胞瘤、退行性小細胞瘤、退行性少突膠質細胞瘤、神經膠質母細胞瘤多形性（GBM））、腎癌、前列腺癌、肝癌、胰腺癌、軟組織肉瘤、類癌、頭頸癌、黑色素瘤、及卵巢癌。於一具體實施例中，癌症為腦癌或GBM。欲實施本文揭示之方法，可將一有效量之上述含有至少一本文所述抗體之醫藥組合物/配方投予有治療需求之個體（如人類），其係經由合適途徑進行，例如，靜脈投予，如推注或連續輸注一段時間、肌內、腹腔、腦脊髓內、皮下、關節內、滑膜內、鞘內、口服、吸入、或局部途徑。市售之液體配方噴霧器係適於投予，包括噴射式噴霧器與超音波噴霧器。液體配方可直接霧化，且凍乾粉末可於回溶後霧化。或者，可以氟碳配方與計量吸入器將抗體霧化，或製成凍乾與粉碎之粉末吸入。
以本文所述方法治療之個體可為哺乳類動物，更佳地係人類。哺乳類動物包括但不侷限於，農場動物、競技動物、寵物、靈長類動物、馬、犬、貓、小鼠、及大鼠。需要治療之人類個體可以是、存在風險、或疑似患有癌症之人類病患，該癌症包括但不侷限於，乳癌、肺癌、食道癌、直腸癌、膽道癌、肝癌、頰癌、胃癌、大腸癌、鼻咽癌、腎癌、前列腺癌、卵巢癌、子宮頸癌、子宮內膜癌、胰腺癌、睾丸癌、膀胱癌、頭頸癌、口腔癌、神經內分泌癌、腎上腺癌、甲狀腺癌、骨癌、皮膚癌、基底細胞癌、鱗狀細胞癌、黑色素瘤、或腦腫瘤。患有癌症之個體可藉由常規醫學檢查而判定。
本文中使用的「有效量」意指不論單獨使用或結合一或多個其他活性劑使用，對個體產生治療效果所需之各活性劑之量。有效量可變，如本領域那些技術人員之理解，取決於欲治療之特定病況、病況嚴重程度、個別病患參數，包括年齡、身體狀況、尺寸、性別、及體重、治療時間、並行治療之性質，視需求，特定投予途徑、及健康從業者之知識與專長範疇內之類似因素。這些因素係本領域之彼等普通技術人員習知，且僅能採取常規實驗方式解決。一般而言較佳的是，使用個別組分或其組合之最大劑量，亦即，依據健康醫學判斷之最高安全劑量。然而，本領域之那些普通技術人員應理解到，基於醫療原因、心理原因、或實質上任何其他原因，病患可能堅持使用較低劑量或耐受劑量。
經驗上考量，如半衰期，通常有助於確定投劑量。舉例而言，可使用與人類免疫系統相容之抗體（如人源化抗體或完整人抗體）延長抗體半衰期，並防止抗體受宿主免疫系統攻擊。於治療過程中可確定與調整投予頻率，且一般而言但不一定是，基於癌症之治療及/或抑制及/或改善及/或延緩。或者，本文所述抗體之持續連續釋放配方可能適用。用於達成持續釋放之各配方與裝置係本領域習知。
於一實例中，針對一或多次給予抗體之個體，可憑經驗決定本文所述抗體之劑量。投予個體遞增劑量之抗體。欲評估抗體功效，可按照常規實踐遵循疾病指示（如癌症）。
一般而言，針對投予本文所述抗體之任一者，起始候選劑量可為約2 mg/kg。針對本發明之目的，通常每日劑量範圍可為約0.1 mg/kg至3 mg/kg至30 mg/kg至300 mg/kg至3 mg/kg至30 mg/kg至100 mg/kg或以上之任一者，其取決於上述參數。針對數天或更長時間之重複投予，根據病況，治療持續到發生所需之症狀抑制或直到達到足夠之治療程度以緩解癌症或其症狀為止。示例性投劑方案包括投予約2 mg/kg之初始劑量，隨後每週維持約1 mg/kg抗體之劑量，或隨後每隔一週投予約1 mg/kg之維持劑量。然而，可使用其他劑量方案，其取決於從業人員預期達成之藥代物動力學衰變模式。舉例而言，考量每週投劑一至四次。於特定具體實施例中，可使用之投劑範圍為約3 mg/mg至約2 mg/kg （如約3 mg/mg、約10 mg/mg、約30 mg/mg、約100 mg/mg、約300 mg/mg、約1 mg/kg、及約2 mg/kg）。於特定具體實施例中，投劑頻率為每週一次、每2週一次、每4週一次、每5週一次、每6週一次、每7週一次、每8週一次、每9週一次、或每10週一次；或每月一次、每2個月一次、或每3個月一次，或更長時間。此治療之進展係易於利用常規技術與試驗監測。所使用之投劑方案，包括抗體，可隨時間改變。
針對本發明之目的，本文所述抗體之適當劑量將取決於所使用之特異性抗體（或其組合物）、癌症之類型與嚴重程度、抗體是否用於預防或治療目的、先前之治療、病患臨床病史與對抗體之反應、及主治醫師之判斷。本文所述抗體之投予可基本上持續一段預選時間，或可為一系列間隔劑量，如於癌症發展之前、期間、或之後進行。
本文中使用的「治療」乙詞意指施加或投予包括一或多個活性劑之組合物至個體，其患有癌症、癌症症狀、或癌症傾向，目的在於治癒、療癒、減輕、緩解、改變、補救、改善、改進、或影響癌症、癌症症狀、或癌症傾向。
緩解癌症包括延緩癌症之發展或進展，或降低癌症之嚴重程度。緩解癌症不一定需要治療結果。本文中使用的「延緩」癌症發展意指推遲、阻止、緩慢、延緩、穩定、及/或推遲癌症進展。取決於癌症及/或欲治療的個體之病史，此延遲可為不同時間長度。當相較於未使用方法時，「延遲」或減輕癌症發展或延緩癌症發病之方法，為在給定之時間範圍內降低發生癌症之一或多個症狀可能性（風險）及/或在給定之時間範圍內減少症狀程度的方法。此類比較通常基於臨床研究，其使用足以給出統計學上顯著結果之一些個體。
癌症之「發展」或「進展」意指癌症之初步表現及/或後續發展。利用本領域習知之標準臨床技術，可檢測與評估癌症之發展。然而，發展亦指無法檢測之進展。針對本發明之目的，發展或進展意指症狀之生物過程。「發展」包括發生、復發、及發病。本文中使用的癌症之「發病」或「復發」包括初始發病及/或復發。
醫藥領域那些普通技術人員習知之常規方法可用於投予醫藥組合物至個體，其取決於欲治療之疾病類型或疾病之部位。此組合物亦可經由其他常規途徑投予，如利用口服、非口服、吸入噴霧、局部、直腸、鼻腔、口腔、陰道、或經由植入貯液等方式投予。本文中使用的「非口服」乙詞包括皮下、皮內、靜脈、肌肉、關節、動脈、滑膜、胸骨、鞘內、腦內、及顱內注射或輸注技術。此外，可經由可注射儲庫投予途徑投予個體，例如，使用1、3、或6個月之可注射儲庫或生物可降解性材料及方法。
可注射組合物可含有各載體，如植物油、二甲基乳醯胺、二甲基甲醯胺、乳酸乙酯、碳酸乙酯、肉荳蔻酸異丙酯、乙醇、及多元醇（甘油、丙二醇、液體聚乙二醇、及其類似物）。針對靜脈注射，可利用滴注法投予水溶性抗體，其係輸注含有抗體與生理上可接受賦形劑之醫藥配方。生理上可接受賦形劑可包括例如，5%葡萄糖、0.9%鹽液、林格氏液、或其他適用之賦形劑。肌肉注射製備物，如抗體之適用可溶性鹽形式無菌配方，可溶解於醫藥賦形劑（如注射用水、0.9%鹽液、或5%葡萄糖溶液）並投予。 診斷應用
本文係描述用於診斷個體癌症之方法，其包含：（a）施加包括一或多個檢測SSEA-4表現之單株抗體的一組合物至取自個體之細胞或組織樣本；（b）試驗單株抗體與細胞或組織樣本之結合；以及（c）比較與正常控制組之結合程度，以確定個體癌症之存在。
用於檢測與診斷之癌症實例包括但不侷限於，肉瘤、皮膚癌、血癌、淋巴瘤、腦癌、肺癌、乳癌、口腔癌食道癌、胃癌、肝癌、膽管癌、胰臟癌、大腸癌、腎癌、子宮頸癌、卵巢癌、及前列腺癌。於特定具體實施例中，癌症為肉瘤、皮膚癌、血癌、淋巴瘤、腦癌、肺癌、乳癌、卵巢癌、前列腺癌、大腸癌、或胰臟癌。
於特定具體實施例中，抗體能檢測Globo H、SSEA-3、及SSEA-4表現之癌細胞。於特定具體實施例中，抗體能檢測癌細胞上之Globo H與SSEA。於特定具體實施例中，抗體能檢測癌症之SSEA。於特定具體實施例中，癌症為腦癌或神經膠質母細胞瘤多形性（GBM）癌，且抗體為抗SSEA-4單株抗體。
SSEA-4特異性單株抗體可單獨或結合使用，用於體外與體內診斷試驗，以檢測SSEA-4表現之癌細胞。於特定具體實施例中，SSEA-4特異性單株抗體係與患有或疑似患有癌症之個體之生物樣本接觸，且當高於或低於正常抗體結合指示個體患有癌症時，測定與樣本中細胞結合之抗體。於特定具體實施例中，生物樣本為血液樣本或血液分液（如血清、血漿、血小板、紅血球細胞、白血球細胞）。於特定具體實施例中，生物樣本為組織樣本（生檢），如取自疑似之腫瘤位點、或取自習知受影響之組織，如欲確定習知腫瘤之邊界。於特定具體實施例中，生物樣本係取自發炎位點。
通常係從組織，即非流體細胞類型，取得樣本以進行生檢。所應用之生檢技術將取決於欲評估之組織類型（如乳房、皮膚、結腸、前列腺、腎臟、肺臟、膀胱、淋巴結、肝臟、骨髓、氣管、或肺臟）。於癌症之情況下，在其他因素中，該技術亦將取決於腫瘤尺寸與類型（如固體、懸浮、或血液）。生檢技術參見，例如，Harrison's Principles of Internal Medicine, Kasper, et al., eds., 16th ed., 2005，第70章與整個第V部分。
檢測抗體與樣本中細胞結合之任何方法皆可用於本診斷試驗。檢測抗體結合之方法係本領域習知，如流式細胞術、螢光顯微鏡技術、ELISAs等。於特定具體實施例中，該方法包含在確定步驟之前準備生物樣本以進行檢測。舉例而言，細胞亞群（如白血球細胞）可從個體之其餘樣本分離（如其他血液成分），或可將組織中之細胞懸浮以便於檢測。
於特定具體實施例中，確定樣品中表達SSEA-4之細胞的百分比，並與控制組比較，例如，源自個體或一組個體之樣本習知患有癌症（陽性控制組）或源自個體或一組個體之樣本習知未患有癌症（正常、非疾病、或陰性控制組）。於特定具體實施例中，控制組為一給定組織表現標準範圍之SSEA-4。高於或低於SSEA-4表現細胞之正常百分比，或高於或低於表現量，代表個體患有癌症。
於一具體實施例中，提供一套組，以檢測生物樣本之SSEA-4，如血液樣本或組織樣本。舉例而言，欲確認個體之癌症診斷，可進行生檢以取得組織樣本，用於組織學檢查。或者，可取得血液樣本以檢測SSEA-4之存在。用於檢測多胜肽之套組通常將包含一或多個特異性結合SSEA-4之抗體，如本文揭示抗體之任一者。於進一步之具體實施例中，抗體係經標記（例如，具有螢光、放射性、或酵素標記）。
於一具體實施例中，套組包括說明材料，其揭示使用一或多個特異性結合SSEA-4之抗體的方法。說明材料可編寫成電子形式（如電腦磁片或光碟）或可為視覺形式（如視訊檔案）。套組亦可包括額外之成分，以促進所設計套組之特定應用。因此，舉例而言，套組可額外含有檢測標記之方法（如用於酵素標記之酵素受質、檢測螢光標記之濾片組、適用之二級標記，如二級抗體、或其類似物）。套組可額外包括常規用於實施特定方法之緩衝液與其他試劑。此類套組與適用之內容物係本領域技術人員習知。
確定存在或不存在細胞表面標記之方法係本領域習知。舉例而言，抗體可結合至其他化合物，包括但不侷限於，酵素、磁珠、膠體磁珠、半抗原、螢光染料、金屬化合物、放射性化合物、或藥物。抗體亦可用於免疫試驗，例如但不侷限於，放射免疫試驗（RIAs）、酵素結合免疫吸附試驗（ELISA）、或免疫組織化學試驗。抗體亦可用於螢光活化細胞分選 （FACS）。FACS採用複數個顏色通道、低角度與鈍角光散射檢測通道、及阻抗通道，以及其他更複雜之檢測層級，以分離或分選細胞（參見，美國專利號5, 061,620）。本文所揭示結合SSEA-4之單株抗體之任一者可用於這些試驗。因此，抗體可用於常規免疫免疫試驗，包括但不侷限於，ELISA、RIA、FACS、組織免疫組織化學、西方墨點法、或免疫沈澱。 分級及 / 或確定腫瘤預後之方法
本發明之另一態樣係針對用於分 級及/或確定人類病患腫瘤預後之方法，該方法包含：（a）施加一組合物至取自病患之細胞或組織樣本，該組合物包括一或多個檢測標記表現之抗體，該標記由SSEA-4組成；（b）試驗單株抗體與細胞或組織樣本之結合；（c）比較受測樣本之標記表現程度與參考樣本之程度；以及（d）基於步驟（c）之鑑定結果，確定病患腫瘤之分級及/或預後。
未進一步闡述，據信本領域技術人員可基於上述，最大限度地利用本發明。因此，下列特定具體實施例可理解為僅具說明性，而非以任何方式侷限本發明之其餘部分。本文引用之所有出版品經由引用併入本文參考之目的或主題。 實施例 實施例 1 ：融合瘤融合與篩選
進行典型融合瘤融合。小鼠以SSEA-4-DT-CRM197 （白喉毒素交叉反應材料197）結合OBI-821皂素佐劑進行第一次免疫接種。每隻小鼠在左與右腹部處皮下（s.c.）注射進行指定治療（100 μL/處）。小鼠投劑四次（第0天、第7天、第14天、及第23天）。血液樣本（約0.1 mL全血/時間點/動物）係在第0天之前（投劑前）、第10天、第17天、第26天，以及犧牲日（第35天，經由面部靜脈和心臟穿刺收集全血量）由面部靜脈獲得。將凝血樣品離心（1500´g，15分鐘，4°C），分離出血清並轉移到小型離心管（eppendorf）中。測試所有血清樣品的抗SSEA-4抗體效價。發現有5隻小鼠產生高含量之抗SSEA-4 IgG和IgM，並用於製造融合瘤。依據KÖhler與Milstein （KÖhler G. and Milstein C, 1975）之流程使用小鼠骨髓瘤細胞與小鼠脾細胞融合。融合瘤細胞培養基上清液係用0.2 μg SSEA-4-脂質1/每孔，以親和性ELISA進行篩選。商業購得之SSEA-4抗體（MC-813-70）（Biolegend；Cat#330402）作為陽性控制組。偵測未經稀釋之融合瘤殖株上清液之吸光值。篩選出吸光值大於背景值兩倍者。前三名融合瘤殖株為1G1s、1J1s、及2F20s。 實施例 2: 裸鼠中示例性抗體之抗腫瘤活性測量
在人類胰臟癌的異種移植腫瘤模型中，將HPAC細胞皮下（sc）植入BALB/c雄性裸鼠中，當平均腫瘤大小達到50-120 mm 3時，開始於受測者腹腔注射（i.p.）0.4 mg/kg測試品，每週二次，共五週。監測腫瘤大小並記錄，每週兩次，共36天。每週亦記錄兩次死亡率、體重、及明顯動物毒性跡象徵兆，共36天。腫瘤生長計算為T/C （治療組/控制組） x 100%。 測試物質和劑量模式
測試物質製備為1.45、1或0.5 mg/mL液體形式。測試物質在投劑前每天新鮮製備，藉由以磷酸鹽緩衝食鹽水（PBS，pH7.4）稀釋儲備溶液，以獲得指定的投劑濃度（0.04 mg/mL）。以10 ml/kg投劑量進行測試物質的腹腔注射（i.p.）給藥，每週兩次，持續5週。
表4.  示例性配方類型
Figure 106110636-A0305-0004
 細胞株
HPAC腫瘤細胞株（ATCC CRL-2119，人類胰腺癌）在注射之前係於Eurofins Panlabs Taiwan Ltd. 培養並製備，以0.1 mL的1 x 10 6個細胞/小鼠劑量皮下植入於BALB/c雄性裸鼠右側。 動物
BALB/c雄性裸鼠，6-7週齡，體重18-22g，得自BioLasco Taiwan（授權自Charles River Laboratories Licensee）。將所有動物保持在經良好控制之溫度（20-24°C）和濕度（30-70%）環境中，12小時光/暗循環。自由取用標準實驗室飲食[MFG（Oriental Yeast Co., Ltd., Japan）]和高壓滅菌自來水。這項研究的所有方面，包括飼養、實驗和動物處置，一般按照「實驗動物照顧與使用指南：第八版」（National Academyy Press，Washington，DC，2011），並於AAALAC認可的實驗動物設施中進行。此外，動物照顧和使用協議係經Eurofins Panlabs Taiwan, Ltd之IACUC審閱與核准。 化學物質
DMEM/F12培養液（Invitrogen，USA）、表皮生長因子（R&D Systems，USA）、胎牛血清（Invitrogen，USA）、胰島素（Sigma，USA）、氫皮質酮（Sigma，USA）與青黴素/鏈黴素溶液（Invitrogen，USA）。 設備
動物籠（Tecniplast，義大利）、燒杯1000mL（Kimax，USA）、Calipers（Mitutoyo，日本）、第二級生物安全櫃（NuAire，USA）、離心機 5810R（Eppendorf，德國），m培養箱（Forma Scientific Inc.，USA）、單獨通風的籠子（IVC，36迷你隔離器系統）（Tecniplast，義大利）、小鼠規模# Z-40（Taconic，USA）、不鏽鋼鑷子（Klappenecker，德國）和垂直層流櫃（Tsao-Hsin，台灣）。 方法
使用6-7週齡、體重18-22g的BALB/c裸雄鼠。將人胰腺癌腫瘤細胞HPAC（ATCC CRL-2119，1.0 x 10 6，0.1mL）皮下注射至動物右側。隨後將動物分為6組，每組5隻動物。當平均腫瘤大小達到50-120 mm 3時（設定為第1天），開始投以測試物質和載體。在每次給藥前新鮮地製備測試物質（0.4 mg/kg）。經由腹腔注射（i.p.）給予測試物質和載體，每週兩次，共5週。在給予測試物質或載體前，記錄腫瘤大小、體重和死亡率，每週兩次，共36天。在研究結束時，拍攝帶有腫瘤生長的動物照片（圖1-6）。
根據橢圓體公式決定腫瘤體積（mm 3）：長x（寬） 2×0.5。使用以下公式計算腫瘤生長（T/C）：T/C = （Tn）/（Cn） x 100%，其中C1 （Cn）是控制組中第n天的腫瘤體積，T1 （Tn）是治療組中第n天的腫瘤體積。T/C值≤ 42%被認為具有顯著的抗腫瘤活性。 結果
表5-1.  裸鼠之腫瘤、異種移植、胰腺、HPAC
Figure 106110636-A0305-0005
表5-2.  裸鼠之腫瘤、異種移植、胰腺、HPAC（續）
Figure 106110636-A0305-0006
測試物質腹腔給藥，每週兩次，共5週。測量腫瘤大小並記錄，每週兩次，共36天。腫瘤生長計算為T/C （治療組/控制組） x 100%。 T/C值≤ 42%視為具顯著的抗腫瘤活性。另外，使用雙因子ANOVA，之後進行Bonferroni檢定，以確定與第1組（載體，PBS）相較，具統計學顯著性差異* P＜ 0.05。
圖1-6顯示36天內，投以不同受測化合物的裸鼠照片。腫瘤抑制能力計算出為1G1的19.6%、1J1s的33.8%和2F20的32.5%。顯示1J1s和2F20s具有較好的腫瘤抑制能力（圖7）。 實施例 3: 以 FACS 測定示例性抗體對 MCF7 之細胞結合能力 細胞培養
將MCF-7細胞培養於含有2 mM L-穀醯胺（Invitrogen，Cat＃25030081）和1 mM丙酮酸鈉（Invitrogen，Cat＃11360070），並補充有0.01 mg/mL胰島素（Sigma，Cat＃SI-I9278-5mL）、10%胎牛血清（Invitrogen，Cat＃16000044）的最小必需培養液 (Minimum essential medium)（Invitrogen，Cat＃10370021）中。 細胞染色
自含有單層細胞的受測樣本細胞培養瓶中，移去培養液。用5 mL PBS沖洗細胞兩次。將1 mL的0.05%胰蛋白酶加入細胞培養瓶中，搖晃覆蓋所有表面積，並置入37°C的CO 2培養箱中5-10分鐘，以懸浮試驗細胞。加入5 mL完全生長培養液終止反應。輕輕移液吸出細胞。將細胞懸浮液轉移至15mL離心管中。將試管在200g下離心5分鐘。離心後，除去上清液，攪拌細胞沉澱物。 細胞計數
將1-2 mL FACS緩衝液加至細胞沉澱中，並抽吸混合均勻。將細胞加至具有細胞過濾器上蓋的5 mL聚苯乙烯圓底管上（Falcon，Cat＃352235），以獲得完整及活的單一細胞。將10 mL細胞懸浮液轉移到微量離心管中。加入10 mL台酚藍溶液（0.4%台酚藍），並抽吸混合均勻，之後在血球細胞計數器上計數活細胞。將細胞濃度調節至4x10 6個細胞/mL，之後將50 mL細胞懸浮液移液到聚苯乙烯圓管中，以製備每管2x10 5個細胞。 一級抗體
表6.  示例性一級抗體
Figure 106110636-A0305-0007
一級抗體以FACS緩衝液稀釋至最終抗體濃度為10 mg/mL。將50 mL抗體稀釋液加入50 mL細胞懸浮液中，達到每管0.5 mg抗體。將每根試管輕輕渦旋（vortex），以混合細胞懸浮液和一級抗體，然後將試管置於冰上靜置約30分鐘。在每根試管中注滿1 mL FACS緩衝液清洗一次細胞，並以400 g離心5分鐘。上清液經由真空抽吸丟棄，注意抽吸作用，避免接觸到管底部，其可能引起細胞損失。 二級抗體
用於1G1s、1J1s、及2F20s試驗設定的二級抗體為1 mg之山羊抗小鼠IgG、人類ads-FITC （Southern Biotech，Cat＃1030-02），。二級抗體以FACS緩衝液稀釋至最終抗體濃度為4 mg/mL。將100 mL經稀釋之二級抗體加入每根試管中，之後輕輕渦旋每根試管，以充分混合細胞懸浮液與二級抗體。將試管置於冰上，避光靜置約30分鐘。然後，在每根試管中注滿1 mL FACS緩衝液清洗一次細胞，並以400 g離心5分鐘。真空抽吸丟棄上清液，注意抽吸作用，避免接觸到試管底部，其可能引起細胞損失。將300 mL的4%多聚甲醛固定溶液加入每根試管中，將試管放置在冰上，同時避光靜置約30分鐘。在每根試管中注滿1 mL FACS緩衝液清洗一次細胞，並以400 g離心5分鐘。然後，通過真空抽吸丟棄上清液，注意抽吸作用，避免接觸到管底部，其可能引起細胞損失。測試細胞管以400 µL FACS緩衝液重新懸浮，然後儲存在4 ± 2°C的冰箱中並避光。 流式細胞術分析
染色後立即進行流式細胞術。進行數據分析，以FCS Express 4 Flow Research軟體分析MCF7細胞結合百分比。在直方圖中，同型控制組定出門檻值（gate），並定義5%細胞門檻值為背景值。根據背景值設定決定細胞試管的結合區域（M1）百分比。在此情況下，同型控制組的5%或以上之檢測細胞視為MCF7細胞的陽性結合。圖8A顯示市售的SSEA-4抗體 (MC-813-70) 對於HPAC 細胞具有100%的結合親和性圖8B顯示1J1s抗體對於HPAC細胞有99.59%的結合親和性。圖8C顯示2F20s抗體對於HPAC細胞有55.56%的結合親和性。圖8D顯示1G1s抗體對於HPAC細胞有95.76%的結合親和性。這表明1J1s在HPAC細胞（胰腺細胞株）上具有最佳的細胞結合親和性。另外，圖9顯示此些示例性SSEA-4抗體對各種癌症和非癌症細胞株的FACS結合試驗結果。亦顯示1J1s對MCF-7（乳癌）、MDA-MB231（乳癌）、及HK2 （腎，皮質/近端小管）均具有最佳細胞結合親和性。 實施例 4 ：使用 SSEA-4 、 SS 系列、及 Gb 系列醣類進行 ELISA 分析示例性抗 SSEA4 IgG 抗體之表位測繪 試劑 / 緩衝液製備 塗佈抗原
SSEA4-脂質1、SSEA4-神經醯胺、SS系列醣類-脂質1，以及Gb系列醣類-脂質1粉末，於玻璃瓶中溶於100%乙醇，並儲存於4°C直至使用。十倍阻斷緩衝液（Sigma，Cat＃B6429）係於二次蒸餾水中（d.d. H 2O）稀釋至一倍備用。清洗緩衝液：將0.5 mL Tween 20加入1L PBS中，以製備0.05% Tween 20之PBS溶液。 一級抗體
商業購得之MC-813-70 SSEA4抗體（BioLegend，Cat#330402）、1G1s、1J1s、及2F20s SSEA4抗體，係於小型離心管（eppendorf）中，以阻斷緩衝液稀釋至10 µg/mL。 二級抗體
山羊抗小鼠IgG-AP溶液 （Southern Biotech，Cat＃1030-04），濃度為0.5 mg/mL。 受質溶液
受質溶液（ELISA之鹼性磷酸酶黃色（pNPP）脂質受質系統，Sigma，Cat #P7998）原儲存於4°C，在使用前於37°C水浴中回溫。 盤塗佈
將各20 μg之SSEA4-脂質1、SSEA4-神經醯胺、結合脂質之SS/Gb系列醣類（塗佈抗原）分別加入至5mL乙醇中，並輕輕混合（0.2 μg醣/孔x 100孔盤= 20 μg；50 μL/孔x 100孔= 5mL）。50 µL之塗佈抗原，於冰上吸入各盤之每孔中。將盤標記，上蓋並於室溫下靜置過夜。將100 µL阻斷緩衝液加至每孔中，並於室溫（22-26°C）下靜置約30分鐘。
將120 µL經1:50稀釋之一級抗體（10 μg/ mL）吸移至第2列之頂部孔中。然後在第2列其餘孔中加入180 µL，留下第一列（列1）作為空白組。將60 µL之10 µg/mL一級抗體，從第一孔轉移到第二孔（2.5 µg/mL抗SSEA-4抗體）。各孔重複以抽吸方式混合。重複此過程，製備下列各孔之一級抗體稀釋液（四倍稀釋）：第1孔 = 10 µg/mL（1:50 稀釋）、第2孔= 2.5 µg/mL （1:200稀釋） 、第3孔= 0.625 µg/mL （1:800稀釋）、第4孔= 0.156 µg/mL （1:3200稀釋）、第5孔= 0.039 µg/mL （1:12800稀釋）、第6孔= 0.01 µg/mL （1:51200稀釋）、第7孔= 0.025 µg/mL （1:204800稀釋）、第8孔= 0.0006 µg/mL （1:819200稀釋）。
將抗原塗佈盤與阻斷緩衝液一同靜置30分鐘後，抽吸除去阻斷緩衝液，每孔以200 µL清洗緩衝液清洗三次。將50 µL稀釋之陽性控制組（商業購得之SSEA-4抗體 (MC-813-70)）與示例性一級抗體由稀釋盤加至SSEA4塗佈抗原試驗盤之各孔中。測試盤在室溫下靜置約1小時。靜置後，吸出各孔，並以200 µL清洗緩衝液清洗三次。
將25 µL二級抗體加至4975 µL阻斷緩衝液（1:200稀釋）中，並輕輕混合（50 µL/孔 x 100孔盤= 5 mL）。將50 µL二級抗體溶液移液至每孔中。將盤覆蓋、標記，並在室溫下靜置約45分鐘。靜置後，從所有孔中吸出二級抗體溶液，各孔並以200 µL清洗緩衝液清洗4次。
將100 µL受質溶液移液至每孔中，並於37 ± 2°C下靜置20分鐘，加入50 µL終止溶液（鹼性磷酸酶終止溶液，Sigma，Cat #A5852）停止反應，充分混合，之後該盤於ELISA盤式讀取儀上以405 nm偵測。 數據分析
數據採用GraphPad Prism 6軟體進行統計學分析，使用Sigmoidal劑量-反應法（可變斜率）繪製曲線，並由重複結果計算平均值與SD。二級抗體僅作為陰性控制組。
圖10顯示截斷型SSEA-4: SS系列醣類，以及結合有脂質1之Gb系列醣類之結構式。圖11顯示一級SSEA-4抗體對於SS系列及Gb系列醣類之結合活性結果。由截斷之聚醣末端抗原可看出，完整的SSEA-4結構為1J1s與2F20s辨識所必需。另一方面，商業購得之SSEA-4抗體MC-813-70與1G1s可辨識SSEA-4與SS5，係因最後一個化合物結構（N-乙醯神經胺酸；NeuAc）；這意謂，醣類還原端之第一個化合物結構（葡萄糖；Glucose），為商業購得之SSEA-4抗體MC-813-70與1G1s表位辨識較不需要的。 實施例 5 ：示例性生物素化醣類之交叉活性，使用 SSEA-4- 脂質 1 塗佈之化學發光疊層 ELISA 分析 試劑
SuperBlock，一種阻斷緩衝液（ThermoFisher，Cat #37515），係以原樣使用。一級SSEA-4抗體（1G1s、1J1s、2F20s及MC-813-70）係以SuperBlock稀釋成2.5 mg/mL。清洗緩衝液：0.5 mL之Tween 20係加入1L之PBS，以製備含0.05% Tween 20之PBS溶液。二級抗體：山羊抗小鼠IgG-HPR （Jackson ImmunoResearch，Cat#109-035-003），在SuperBlock中以1:50000稀釋。生物素化醣類（以下列出）和D-生物素 (Biotin)（Carbosynth，Cat # FB02633）溶解於1 x PBS （Sigma，Cat＃P5493-4L）中，以製備1 mg/mL 儲存液。
表7.  腫瘤相關醣類（塗佈抗原）表
Figure 106110636-A0305-0008
 盤塗佈
商業購得Streptavidin HBC塗佈黑色96-孔盤（ThermoSci，Cat #15503）以200 μL/每孔清洗緩衝液（Sigma，Cat#P5493）清洗一次。生物素化醣類儲存液以1x PBS稀釋至1 ng/mL。將稀釋之生物素化糖類加至試驗盤中（50 μL/孔；50 ng/孔）。將試驗盤在室溫下靜置2小時。各孔以200 μL清洗緩衝液清洗一次。每孔加入200 μL SuperBlock，並在室溫下靜置1小時。 一級抗體
表8.  示例性一級抗體
Figure 106110636-A0305-0009
靜置後，各孔抽吸，以200 µL清洗緩衝液清洗一次。將50 µL的2.5 µg/mL一級抗體加至各盤中。試驗盤加蓋、標記並在室溫下靜置約1小時。靜置後，各孔吸出並以200 µL清洗緩衝液清洗四次。 二級抗體
將50 µL二級抗體移液至每孔中。試驗盤加蓋、標記並在室溫下靜置約45分鐘。靜置後，自所有孔中吸出二級抗體溶液，且所有孔以200 µL清洗緩衝液清洗五次。
將100 µL受質溶液（ThermoSci，Cat#PIE37074）移液至各孔中，並在室溫下靜置1至5分鐘。試驗盤於ELISA盤讀取儀上（Molecular Devices，SpectraMax L）以470 nm偵測。 數據分析
使用GraphPad Prism 6軟體對數據進行統計分析。平均值與SD係計算自三重複之結果。
圖12顯示SSEA-4抗體之ELISA親和性試驗結果。結果顯示示例性SSEA-4抗體，包括1G1s、1J1s、2F20s、及商業購得之MC-813-70與其他腫瘤相關醣類具很低交互作用，且特異於SSEA-4抗原（SSEA4與 SSEA4-b-N-Sp）。顯示本發明之SSEA4-抗體之結合特異性。 實施例 6 ：於裸鼠中測量 Globo H 抗體與示例性抗體結合之抗腫瘤活性
在人胰腺癌的異種移植腫瘤模型中，將HPAC細胞皮下（s.c.）植入BALB/c雄性裸鼠中，測試品以0.1 mg/kg、10 mg/kg、或兩抗體各0.1 mg/kg之組合，當平均腫瘤大小達到50-120 mm 3時，腹腔（i.p.）注射給藥，每週兩次，持續5週。之後監測腫瘤大小，每週記錄兩次，共37天。死亡率、體重和明顯的動物毒性跡象，亦每週記錄兩次，共37天。腫瘤生長計算為T/C （治療組/控制組） x 100%。 測試物質與投劑模式
測試物質係製成1或1.03 mg/mL之液體形式。每日於投劑前新鮮製備測試物質，以檸檬酸鈉緩衝液（25 mM檸檬酸鈉與100 mM 氯化鈉，pH6.5）稀釋儲存液，獲得指定之投劑濃度（0.01 mg/mL或1 mg/mL）。以10 mL/kg之劑量體積腹腔注射投予測試物質，每週兩次，共5週。
表9.  示例性配方類型
Figure 106110636-A0305-0010
 細胞株
HPAC腫瘤細胞株（ATCC CRL-2119，人類胰腺癌）在注射之前係於Eurofins Panlabs Taiwan Ltd. 培養並製備，以0.1 mL之1 x 10 6個細胞/小鼠之劑量皮下植入BALB/c雄性裸鼠右側。 動物
BALB/c雄性裸鼠，6-7週齡，體重18-22g，得自BioLasco Taiwan （授權自Charles River Laboratories Licensee）。將所有動物保持在經良好控制的溫度（20-24°C）和濕度（30-70%）環境中，12小時光/暗循環。自由取用標準實驗室飲食[MFG（Oriental Yeast Co., Ltd., Japan）]和高壓滅菌自來水。此研究之所有方面，包括飼養、實驗、及動物處置，一般按照「實驗動物照顧與使用指南：第八版」（National Academyy Press，Washington，DC，2011），於AAALAC認可之實驗動物設施進行。此外，動物照顧和使用協議係經Pharmacology Discovery Services Taiwan Ltd之IACUC審閱與核准。 化學物質
DMEM/F12培養液（Invitrogen，USA）、表皮生長因子（R&D Systems，USA）、胎牛血清（Invitrogen，USA）、胰島素（Sigma，USA）、氫皮質酮（Sigma，USA）與青黴素/鏈黴素溶液（Invitrogen，USA）。 設備
動物籠（Tecniplast，義大利）、燒杯1000 mL （Kimax，USA）、Calipers （Mitutoyo，日本）、第二級生物安全櫃（NuAire，USA）、離心機 5810R （Eppendorf，德國），m培養箱（Forma Scientific Inc.，USA）、單獨通風之籠子（IVC，36迷你隔離器系統）（Tecniplast，義大利）、小鼠規模# Z-40 （Taconic，USA）、不鏽鋼鑷子（Klappenecker，德國）及垂直層流櫃（Tsao-Hsin，台灣）。 方法
使用6-7週齡、體重18-22 g之BALB/c雄性裸鼠。將人類胰腺癌腫瘤細胞HPAC （ATCC CRL-2119，1.0 x 10 6，0.1mL）皮下注射至動物右側。隨後將動物分為6組，每組8隻。當平均腫瘤大小達到50-120 mm 3時（設定為第1天），開始投予測試物質與載體。在每次給藥前新鮮製備測試物質（依據表X之劑量）。經由腹腔注射（i.p.）給予測試物質與載體，每週兩次，共5週。在給予測試物質或載體前，記錄腫瘤大小、體重和死亡率，每週兩次，共37天。
根據橢圓體公式決定腫瘤體積（mm 3）：長x（寬） 2×0.5。使用以下公式計算腫瘤生長（T/C）：T/C =（Tn ）/（Cn） x 100%，其中C1 （Cn）為控制組中第n天之腫瘤體積，T1 （Tn）為治療組中第n天之腫瘤體積。T/C值≤ 42%視為具有顯著抗腫瘤活性。 結果
表10. 裸鼠之腫瘤、異種移植、胰腺、HPAC
Figure 106110636-A0305-0011
測試物質係腹腔給藥，每週兩次，共5週。測量腫瘤大小並記錄，每週兩次，共36天。腫瘤生長計算為T/C （治療組/控制組） x 100%。 T/C值≤ 42%視為具顯著抗腫瘤活性。另外，使用雙因子ANOVA，之後進行Bonferroni檢定，以確定與第1組（載體，PBS）相較，具統計學顯著性差異* P＜ 0.05。
圖13顯示37天內，投予不同受測化合物之裸鼠照片。於試驗終止時之腫瘤生長抑制（TGI （%） = （V 控制組-V 測試組）/（V 控制組-V 原始組）*100）經計算：0.1 mg/kg 1J1s為10.8%、10 mg/kg 1J1s為24.4%、及10 mg/kg 2C2為15.4% （0.1 mg/kg 2C2並未顯示HPAC抑制能力）。然而，0.1 mg/kg 1J1s與0.1 mg/kg 2C2之組合顯示33.7%腫瘤生長抑制，甚至高於1J1s或2C2單獨治療之100倍。
儘管已描述及說明本發明的具體態樣，但此類態樣應僅被理解為用於說明本發明，而非限制本發明，如同所附申請專利範圍。本說明書中引用的所有文獻和專利申請案的全部內容皆併入本文，用於所有目的，如同每一特定且單獨指出之文獻或專利申請案，完整併入參考文獻中，用於所有目的。雖然為了清楚理解之目的，已通過說明及示例之方式對本發明進行詳細描述，但是本領域技術人員可依據本發明揭示清楚看出，特定改變與修改可在不脫離申請專利範圍之精神或範圍下進行。
無
圖1為含有HPAC移植腫瘤之BALB/c雄性裸鼠以載劑（10 mL/kg x 10）每週兩次腹腔注射處理後第36天之顯示圖。
圖2為含有HPAC移植腫瘤之BALB/c雄性裸鼠以Globo H-2C2 （0.4 mg/kg x 10）每週兩次腹腔注射處理後第36天之顯示圖。
圖3為含有HPAC移植腫瘤之BALB/c雄性裸鼠以商業購得之SSEA-4抗體（MC-813-70）（0.4 mg/kg x 10）每週兩次腹腔注射處理後第36天之顯示圖。
圖4為含有HPAC移植腫瘤之BALB/c雄性裸鼠以1G1s （0.4 mg/kg x 10）每週兩次腹腔注射處理後第36天之顯示圖。
圖5為含有HPAC移植腫瘤之BALB/c雄性裸鼠以1J1s （0.4 mg/kg x 10）每週兩次腹腔注射處理後第36天之顯示圖。
圖6為含有HPAC移植腫瘤之BALB/c雄性裸鼠以2F20s （0.4 mg/kg x 10）每週兩次腹腔注射處理後第36天之顯示圖。
圖7顯示抗體注射36天過程期間腫瘤體積之測量圖。測定SSEA-4抗體1G1s、2F20s、及1J1s對HPAC腫瘤之功效。亦測定商業購得之SSEA-4抗體（MC-813-70）及載劑（PBS）。
圖8顯示流式細胞術分佈圖。每管2´10 5個細胞以受測抗體（綠線）或同型控制組（黑線）進行染色，接著以FITC結合之二級抗體培養。
圖9為示例性SSEA-4抗體1J1s、1G1s、2F20s、及商業購得之殖株MC-813-70對各癌症與非癌症細胞株之FACS結合試驗結果。受試癌症細胞株為MCF-7 （乳癌）、MDA-MB231 （乳癌）、HPAC （胰腺癌）、LN-18 （神經膠質母細胞瘤）、及LL-2 （路易士肺癌）。受試非致瘤性細胞株為HK2 （腎臟、皮質/近端小管）、NL-20 （支氣管上皮）、THLE-3 （肝臟、正常細胞）、及HuMEC （人類乳腺上皮細胞）。
圖10顯示SS系列醣類與Gb系列醣類結合至脂質1之結構。
圖11顯示利用滴定ELISA確認表位。（A）商業購得之SSEA-4抗體 （MC-813-70）、（B）1G1s、（C） 1J1s、及（D）2F20s。
圖12顯示以化學發光疊層ELISA分析進行生物素化醣類交叉反應性測試。
圖13顯示抗體結合注射37天過程期間腫瘤體積之測量圖。測定抗體2C2 （抗Globo H）與1J1s （抗SSEA4）對HPAC腫瘤之功效。
<110> 台灣浩鼎生技股份有限公司
<120> 抗體、醫藥組合物及方法
<130> G3004-00500
<140> 62/314,841
<141> 2016-03-29
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<170> PatentIn version 3.5
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Claims (31)

  1. 一種抗體或其抗原結合片段，其包含：一重鏈可變區(VH)，其包含一胺基酸序列，其與SEQ ID NO：3所示之胺基酸序列具有至少約90%的序列同源性，且該VH包含互補決定區(CDR)胺基酸序列，包括H-CDR1、H-CDR2及H-CDR3，其分別具有SEQ ID NOs：13、15及17之胺基酸序列，及一輕鏈可變區(VL)，其包含一胺基酸序列，其與SEQ ID NO：4所示之胺基酸序列具有至少約90%的同源性，且該VL包含CDR胺基酸序列，包括L-CDR1、H-CDR2及H-CDR3，其分別具有SEQ ID NOs：6、8及10之胺基酸序列。
  2. 一種抗體或其抗原結合片段，其包含：一重鏈與一輕鏈，其中該重鏈包含一互補決定區(CDR)胺基酸序列，包括H-CDR1、H-CDR2及H-CDR3，其分別具有SEQ ID NOs：13、15及17之胺基酸序列；以及該輕鏈包含一互補決定區(CDR)胺基酸序列，包括L-CDR1、H-CDR2及H-CDR3，其分別具有SEQ ID NOs：6、8及10之胺基酸序列。
  3. 一種抗體或其抗原結合片段，其係由寄存於BCRC寄存號碼960506下、稱為1J1s之融合瘤產生。
  4. 一種寄存於BCRC寄存號碼960506下、稱為1J1s之融合瘤。
  5. 一種抗體或其抗原結合片段，其包含：一重鏈可變區(VH)，其包含一胺基酸序列，其與SEQ ID NO：21所示之胺基酸序列具有至少約90%的序列同源性，且該VH包含互補決定區(CDR)胺 基酸序列，包括H-CDR1、H-CDR2及H-CDR3，其分別具有SEQ ID NOs：31、33及35之胺基酸序列，及一輕鏈可變區(VL)，其包含一胺基酸序列，其與SEQ ID NO：22所示之胺基酸序列具有至少約90%的同源性，且該VL包含CDR胺基酸序列，包括L-CDR1、H-CDR2及H-CDR3，其分別具有SEQ ID NOs：24、26及28之胺基酸序列。
  6. 一種抗體或其抗原結合片段，其包含：一重鏈與一輕鏈，其中該重鏈包含一互補決定區(CDR)胺基酸序列，包括H-CDR1、H-CDR2及H-CDR3，其分別具有SEQ ID NOs：31、33及35之胺基酸序列；以及該輕鏈包含一互補決定區(CDR)胺基酸序列，包括L-CDR1、H-CDR2及H-CDR3，其分別具有SEQ ID NOs：24、26及28之胺基酸序列。
  7. 一種抗體或其抗原結合片段，其係由寄存於BCRC寄存號碼960505下、稱為1G1s之融合瘤產生。
  8. 一種寄存於BCRC寄存號碼960505下、稱為1G1s之融合瘤。
  9. 一種抗體或其抗原結合片段，其包含：一重鏈可變區(VH)，其包含一胺基酸序列，其與SEQ ID NO：39所示之胺基酸序列具有至少約90%的同源性，且該VH包含互補決定區(CDR)胺基酸序列，包括H-CDR1、H-CDR2及H-CDR3，其分別具有SEQ ID NOs：49、51及53之胺基酸序列，及一輕鏈可變區(VL)，其包含一胺基酸序列，其與SEQ ID NO：40所示之胺基酸序列具有至少約90%的同源性，且該VL包含CDR胺基酸 序列，包括L-CDR1、H-CDR2及H-CDR3，其分別具有SEQ ID NOs：42、44及46之胺基酸序列。
  10. 一種抗體或其抗原結合片段，其包含：一重鏈與一輕鏈，其中該重鏈包含一互補決定區(CDR)胺基酸序列，包括H-CDR1、H-CDR2及H-CDR3，其分別具有SEQ ID NOs：49、51及53之胺基酸序列；以及該輕鏈包含一互補決定區(CDR)胺基酸序列，包括L-CDR1、H-CDR2及H-CDR3，其分別具有SEQ ID NOs：42、44及46之胺基酸序列。
  11. 一種抗體或其抗原結合片段，其中該抗體或其結合片段包含VH，其係選自於SEQ ID No：3、SEQ ID No：21、或SEQ ID No：39，及VL，其係選自於SEQ ID No：4、SEQ ID No：22或SEQ ID No：40。
  12. 一種抗體或其抗原結合片段，其係由寄存於BCRC寄存號碼960509下、稱為2F20s之融合瘤產生。
  13. 一種寄存於BCRC寄存號碼960509下、稱為2F20s之融合瘤。
  14. 如請求項1至3、5至7及9至12中任一項之抗體或其抗原結合片段，其中該可變區能結合一或多個醣類抗原。
  15. 如請求項14之抗體或其抗原結合片段，其中該醣類抗原為SSEA-4(Neu5Acα2→3Galβ1→3GalNAcβ1→3Galα1→4Galβ1→4Glcβ1(SSEA-4六醣)。
  16. 如請求項1至3、5至7及9至12之抗體或其抗原結合片段，其中該抗體或其抗原結合片段係選自於：(a)整個免疫球蛋白分子；(b)scFv；(c)Fab片段；(d)F(ab')2；或者(e)雙硫鍵連接之Fv。
  17. 如請求項1至3、5至7及9至12中任一項之抗體或其抗原結合片段，其中該抗體為人源化抗體。
  18. 如請求項17之抗體或其抗原結合片段，其中該抗體為IgG或IgM。
  19. 如請求項17之抗體或其抗原結合片段，其中該抗體更包含一特異於SSEA-4之嵌合抗原受體(CAR)區。
  20. 如請求項19之抗體或其抗原結合片段，其中該CAR區包含一跨膜區與一細胞內傳訊區，其中該跨膜區包含CD8及/或CD28之跨膜區序列；且其中該細胞內傳訊結構域包含CD27、CD28、CD137、OX40、ICOS、及CD3ζ之一或多者之細胞內傳訊結構區。
  21. 一種醫藥組合物，其包含：如請求項1至3、5至7、9至12及14至20中任一項之抗體或其抗原結合片段，及至少一醫藥上可接受載體。
  22. 如請求項21之醫藥組合物，其更包含至少一附加之治療劑。
  23. 一種抗體用於製備在個體中治療癌症或抑制癌細胞增生之藥物之用途，其中該抗體包含如請求項1至3、5至7、9至12及14至20中任一項之抗體或其抗原結合片段，及/或Globo系列抗體之組合。
  24. 如請求項23之用途，其中該Globo系列抗體為抗Globo H抗體、抗SSEA3抗體、或抗SSEA4抗體。
  25. 如請求項23之用途，其中該個體為人類。
  26. 如請求項23之用途，其中該細胞為癌症幹細胞。
  27. 一種抗體用於製備對個體進行成像之試劑的用途，其中該抗體包含如請求項1至3、5至7、9至12及14至20中任一項之抗體或其抗原結合片段，係結合至一成像劑，該進行成像之試劑可於顯示器上產生及顯示影像。
  28. 如請求項27之用途，其中該成像劑為螢光團、染料、MRI對比劑、或放射性核種。
  29. 如請求項27項之用途，其中該個體具有癌症，該方法更定義為檢測癌症轉移之方法。
  30. 如請求項27之用途，其中該個體為人類。
  31. 如請求項27至30之用途，其中該試劑為基於抗體之陣列。
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