TW202146650A - 寡核苷酸組成物及其方法 - Google Patents

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Abstract

除其他事項外，本揭露提供了用於預防和/或治療各種病症、障礙或疾病的寡核苷酸、組成物及方法。在一些實施方式中，提供的技術包含核鹼基修飾、糖修飾、核苷酸間鍵聯修飾和/或其模式，並且具有改善的特性、活性和/或選擇性。在一些實施方式中，所提供的技術靶向MAPT。在一些實施方式中，本揭露提供了用於預防和/或治療與MAPT相關的病症、障礙或疾病，例如阿茲海默氏症（AD）或額顳葉失智（FTD）的MAPT寡核苷酸、組成物及方法。

Description

寡核苷酸組成物及其方法
本揭露尤其提供了寡核苷酸、組成物、及其方法（例如製備方法、使用方法等）。在一些實施方式中，提供的技術可用於預防和/或治療多種病症、障礙或疾病，包括多種神經退行性障礙。
寡核苷酸可用於多種應用，例如治療、診斷和/或研究應用。例如，靶向多種基因的寡核苷酸可用於治療與此類靶基因有關的病症、障礙或疾病。
相關申請的交叉引用 本申請要求於2020年3月1日提交的美國臨時申請系列號62/983,742、以及於2020年11月8日提交的美國臨時申請系列號63/111,071的優先權，其各自的全部內容藉由引用併入本文。
在一些實施方式中，本揭露提供了具有顯著改善的特性和/或高活性的MAPT寡核苷酸及其組成物。除其他事項外，本揭露提供了用於設計、製造和利用此類寡核苷酸和組成物的技術。特別地，在一些實施方式中，本揭露提供了包含核苷酸間鍵聯的有用模式和/或糖修飾的模式的寡核苷酸，當與一種或多種其他結構元件例如鹼基序列（或其部分）、核苷修飾（及其模式）、額外的化學部分等組合時，其可以提供具有高活性和/或所需特性的MAPT寡核苷酸及其組成物，包括但不限於有效和足夠地降低MAPT轉錄物和由此編碼的產物的表現、程度和/或活性。在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸和組成物降低MAPT轉錄物的程度，並且可用於治療和/或預防與MAPT相關的病症、障礙或疾病，例如阿茲海默氏症（AD）和額顳葉失智（FTD）。
在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸能夠介導MAPT的敲低，其中MAPT或其產物的程度、表現和/或活性降低。在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸能夠介導MAPT的泛特異性敲低，其中多個或所有MAPT等位基因的程度、表現和/或活性降低。在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸具有與多個或所有MAPT等位基因中共有的序列互補的鹼基序列。
在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸的鹼基序列係如下序列，包含以下序列，或包含以下序列的序列段（例如10-20個，或10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20個連續鹼基）：ACGTTGCAGTGTTCCACUAU、ACTATCCTCCTTCAGCUCCU、AGTGTTCCACTATCCUCCUU、ATCCTCCTTCAGCTCCUGCA、CACGTTGCAGTGTTCCACUA、CACTATCCTCCTTCAGCUCC、CAGTGTTCCACTATCCUCCU、CCACGTTGCAGTGTTCCACU、CCACTATCCTCCTTCAGCUC、CGTTGCAGTGTTCCACUAUC、CTATCCTCCTTCAGCUCCUG、GCAGTGTTCCACTATCCUCC、GTGTTCCACTATCCTCCUUC、GTTCCACTATCCTCCUUCAG、GUGUUCCACTATCCTCCTTC、TATCCTCCTTCAGCTCCUGC、TCCACTATCCTCCTTCAGCU、TGCAGTGTTCCACTAUCCUC、TGTTCCACTATCCTCCUUCA、TTCCACTATCCTCCTUCAGC、或TTGCAGTGTTCCACTAUCCU，或其中每個T可以獨立地被U取代，並且反之亦然。在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸的鹼基序列係這樣的序列。
本揭露尤其證實，控制MAPT寡核苷酸的結構元件可對寡核苷酸特性和/或活性具有顯著影響，包括MAPT（或其產物）的敲低（例如，活性、表現和/或程度的降低）。在一些實施方式中，MAPT的敲低係由影響翻譯和/或干擾mRNA成熟的RNA酶 H和/或位阻所介導的。在一些實施方式中，藉由涉及RNA干擾或剪接調節的機制介導MAPT的敲低。在一些實施方式中，MAPT的敲低可以藉由多種機制進行。在一些實施方式中，寡核苷酸的受控結構元件包括但不限於：鹼基序列、化學修飾（例如糖、鹼基和/或核苷酸間鍵聯的修飾）或其模式，立體化學（例如手性核苷酸間鍵聯中鍵聯磷的立體化學）或其模式的改變，第一或第二翼或核心的結構，和/或與另外的化學部分（例如碳水化合物部分、靶向部分等）的軛合。特別地，在一些實施方式中，本揭露表明控制骨架手性中心的立體化學（鍵聯磷的立體化學），視需要控制寡核苷酸設計的其他方面，可以極大地改善MAPT寡核苷酸的特性和/或活性。
在一些實施方式中，本揭露係關於經由任何機制起作用且包含本文中所描述的任何序列、結構或形式（或其部分）的任何MAPT寡核苷酸，其中該寡核苷酸包含鹼基、糖或核苷酸間鍵聯的至少一個非天然存在修飾。
在一些實施方式中，寡核苷酸組成物包含多個寡核苷酸，其中該寡核苷酸包含至少一個手性受控的核苷酸間鍵聯，例如核苷酸間鍵聯，其鍵聯磷在Rp或Sp構型或富含Rp或Sp構型（例如組成物中相同鹼基序列的所有寡核苷酸中的約70%-100%（例如約85%-100%、90%-100%、95%-100%、或約80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或更多）在鍵聯磷處共用相同的立體化學），而不是Rp和Sp的隨機混合物。在一些實施方式中，這樣的核苷酸間鍵聯也稱為「立體定義的（或立體受控的或手性受控的）核苷酸間鍵聯」。在一些實施方式中，這樣的寡核苷酸組成物被稱為「立體定義的（或立體受控的或手性受控的）寡核苷酸組成物」。在一些實施方式中，至少1個核苷酸間鍵聯係手性受控的核苷酸間鍵聯且是Sp。在一些實施方式中，至少1個核苷酸間鍵聯係手性受控的核苷酸間鍵聯且是Rp。在一些實施方式中，至少1-20，例如5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20個核苷酸間鍵聯各自獨立地是手性受控的核苷酸間鍵聯。在一些實施方式中，每個硫代磷酸酯核苷酸間鍵聯獨立地是手性受控的核苷酸間鍵聯。在一些實施方式中，包含手性鍵聯磷的每個核苷酸間鍵聯獨立地是手性受控的核苷酸間鍵聯。
在一些實施方式中，本揭露提供了一種寡核苷酸，其中該寡核苷酸的鹼基序列包含與MAPT基因或其轉錄物的鹼基序列相同或互補的鹼基序列的至少10個連續鹼基，其中該寡核苷酸包含至少一個修飾的核苷酸間鍵聯（不是天然磷酸酯鍵聯的核苷酸間鍵聯（可能以各種鹽形式存在）），並且其中寡核苷酸能夠降低MAPT靶基因或其基因產物的程度、表現和/或活性。
在一些實施方式中，本揭露關於MAPT寡核苷酸組成物，其中該MAPT寡核苷酸包含至少一個非手性受控的手性核苷酸間鍵聯（例如核苷酸間鍵聯係立體隨機的）。在一些實施方式中，非手性受控的核苷酸間鍵聯係硫代磷酸酯核苷酸間鍵聯。在一些實施方式中，非手性受控的核苷酸間鍵聯係非負電荷核苷酸間鍵聯，例如n001。
在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸包含非負電荷的或中性的核苷酸間鍵聯。
在一些實施方式中，提供的寡核苷酸包含另外的化學部分，例如碳水化合物部分，靶向部分等。在一些實施方式中，當摻入寡核苷酸中時，這樣的部分可以改善一種或多種特性和/或活性。
在一些實施方式中，本揭露提供一種手性受控的MAPT寡核苷酸組成物，其包含多個寡核苷酸，該多個寡核苷酸共用： 1) 共同的鹼基序列； 2) 共同的骨架鍵聯模式；並且 3) 共同的骨架手性中心模式，該組成物係實質上純的單一寡核苷酸製劑，因為該組成物中非隨機或受控程度的寡核苷酸具有共同的鹼基序列、共同的骨架鍵聯模式及共同的骨架手性中心模式。在一些實施方式中，多個寡核苷酸包含糖修飾的共同模式、鹼基修飾的共同模式（如果有的話）、和共同的另外的化學部分（如果有的話）。
在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸組成物係手性受控的寡核苷酸組成物，其包含特定寡核苷酸類型的多個寡核苷酸，該組成物係手性受控的，因為相對於具有相同鹼基序列的寡核苷酸的基本上外消旋製劑而言，該組成物富集特定寡核苷酸類型的寡核苷酸。在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸（例如，具有係如下序列，包含以下序列，或包含以下序列的序列段的MAPT：本文揭露的鹼基序列的至少15個連續鹼基）係立體隨機的（或非手性受控的）。
在一些實施方式中，所提供的寡核苷酸包含一個或多個嵌段。在一些實施方式中，嵌段包含一個或多個連續核苷、和/或核苷酸、和/或糖、或鹼基、和/或核苷酸間鍵聯，其共用共同的化學（例如至少一個糖、鹼基或核苷酸間鍵聯的共同的修飾，或其組合或模式，或立體化學的模式），該等在相鄰嵌段中是不存在的，或者反之亦然。在一些實施方式中，嵌段係翼或核心。
在一些實施方式中，寡核苷酸包含兩個或更多個部分，例如，至少一個翼和至少一個核心。在一些實施方式中，翼在結構上與核心不同，寡核苷酸的翼包含不存在於核心中的結構[例如，立體化學或在糖、鹼基或核苷酸間鍵聯的化學修飾（或其模式）等]，或者反之亦然。在一些實施方式中，寡核苷酸的結構包含翼-核心-翼結構。在一些實施方式中，寡核苷酸的結構包含翼-核心-翼結構，其中一個翼在結構[例如立體化學、另外的化學部分，或糖、鹼基或核苷酸間鍵聯處的化學修飾（或其模式）]上不同於另一個翼及核心（例如，不對稱寡核苷酸）。在一些實施方式中，寡核苷酸的結構具有或包含翼-核心、核心-翼或翼-核心-翼結構，且嵌段係翼或核心。在一些實施方式中，核心稱為缺口。
在一些實施方式中，翼包含在核心中不存在的糖修飾或其模式。在一些實施方式中，翼包含在核心中不存在的糖修飾。在一些實施方式中，翼中的每個糖係相同的。在一些實施方式中，翼中的至少一個糖不同於翼中的另一個糖。在一些實施方式中，寡核苷酸的第一翼（例如5’翼）中的一個或多個糖修飾和/或糖修飾的模式不同於在寡核苷酸的第二翼（例如3’翼）中的一個或多個糖修飾和/或糖修飾的模式。在一些實施方式中，修飾係2’-OR修飾，其中R如本文所述。在一些實施方式中，R係視需要經取代的C1-4 烷基。在一些實施方式中，修飾係2’-OMe。在一些實施方式中，修飾係2’-MOE。在一些實施方式中，修飾的糖係高親和力糖，例如雙環糖（例如，LNA糖），2’-MOE等。在一些實施方式中，5’-翼包含2-MOE修飾。在一些實施方式中，每個5’-翼糖係2’-MOE修飾的。在一些實施方式中，3’-翼包含2-OMe修飾。在一些實施方式中，每個3’-翼糖係2’-OMe修飾的。
在一些實施方式中，連接翼核苷和核心核苷的核苷酸間鍵聯被認為係核心的一部分。在一些實施方式中，連接翼核苷和核心核苷的核苷酸間鍵聯被認為係翼的一部分。
在一些實施方式中，翼包含一個或多個（例如1、2、3、4、5、6、7、8、9或10個）非負電荷核苷酸間鍵聯。在一些實施方式中，非負電荷的核苷酸間鍵聯係中性核苷酸間鍵聯。在一些實施方式中，如本文所證明的，包含含有非負電荷核苷酸間鍵聯的翼的寡核苷酸可以遞送高活性和/或選擇性。
在一些實施方式中，核心糖係天然DNA糖，其在2’位不包含取代（在2’-碳處係兩個-H）。在一些實施方式中，每個核心糖係天然DNA糖，其在2’位不包含取代（在2’-碳處係兩個-H）。
在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸或MAPT寡核苷酸組成物可用於在有需要的受試者中預防或治療與MAPT相關的病症、障礙或疾病。在一些實施方式中，本揭露提供了用於預防或治療與MAPT相關的病症、障礙或疾病之方法，該方法包括向患有該疾病的受試者或該疾病的受試者施用治療有效量的所提供的寡核苷酸，或可以遞送或包含治療有效量的所提供的寡核苷酸的藥物組成物。在一些實施方式中，本揭露提供了藥物組成物，該藥物組成物包含所提供的MAPT寡核苷酸和藥學上可接受的載體。在一些實施方式中，藥物組成物中的寡核苷酸呈一種或多種藥學上可接受的鹽形式，例如鈉鹽形式、銨鹽形式等。
在一些實施方式中，寡核苷酸或寡核苷酸組成物可用於製造藥物，該藥物用於預防或治療有需要的受試者的與MAPT相關的病症、障礙或疾病，例如阿茲海默氏症（AD）和額顳葉失智（FTD）。
可以利用所提供的技術（例如，寡核苷酸、組成物、方法等）來預防和/或治療與MAPT相關的多種病症、障礙或疾病。在一些實施方式中，病症、障礙或疾病係阿茲海默氏症（AD）。在一些實施方式中，病症、障礙或疾病係額顳葉失智（FTD）。
藉由參考某些實施方式的以下詳細描述，可以更容易地理解本揭露的技術。
定義
如本文所用，除非另外指明，應應用下列定義。出於此揭露的目的，根據元素週期表（Periodic Table of the Elements）, CAS版本, 化學與物理手冊（Handbook of Chemistry and Physics）, 第75版來鑒別化學元素。另外，有機化學的一般原理描述於「Organic Chemistry [有機化學]」, Thomas Sorrell, University Science Books [大學科學書籍], 索薩利托（Sausalito）: 1999及「March's Advanced Organic Chemistry [馬奇高級有機化學]」，第5版，編輯：Smith, M.B.和March, J.,約翰威利父子公司（John Wiley & Sons）, 紐約: 2001.
如本文在本揭露中使用的，除非上下文另有明確說明，否則 (i) 術語「一個（a）」或「一種（an）」可以理解為係指「至少一個」；(ii) 術語「或」可以理解為「和/或」；(iii) 術語「含有（comprising）」，「包含（comprise）」，「包括（including）」（無論是否與「不限於」一起使用）和「包括（include）」（無論是否與「不限於」一起使用）可以理解為涵蓋逐項列出的組分或步驟，無論是單獨顯示還是與一個或多個其他組分或步驟一起顯示；(iv) 術語「另一個」可以理解為係指至少一個另外的/第二的一個或多個；(v)術語「大約」和「約」可以理解為允許標準差，如熟悉該項技術者將理解的那樣；和 (vi) 提供範圍的情況下，包括端點。
除非另有說明，否則寡核苷酸及其元件的描述（例如鹼基序列、糖修飾、核苷酸間鍵聯、鍵聯磷立體化學、其模式等）係從5'至3'。如熟悉該項技術者將理解，在一些實施方式中，寡核苷酸可以作為鹽形式，特別是藥學上可接受的鹽形式（例如鈉鹽）提供和/或使用。除非另有說明，否則寡核苷酸包括多種形式的寡核苷酸。如熟悉該項技術者也將理解的，在一些實施方式中，組成物中的單一寡核苷酸可被認為具有相同的構造和/或結構，即使在這樣的組成物（例如液體組成物）中，特別地，這樣的寡核苷酸在特定時間可能處於不同的一種或多種鹽形式（並且例如在液體組成物中時，其可以溶解並且寡核苷酸鏈可以陰離子形式存在）。例如，熟悉該項技術者將意識到，在給定的pH下，沿著寡核苷酸鏈的單個核苷酸間鍵聯可以呈酸（H）形式，或呈多種可能的鹽形式之一（例如鈉鹽或不同陽離子的鹽，取決於製劑或組成物中可能存在哪些離子），並且將會理解，只要它們的酸形式（例如，用H+ 替換所有陽離子，如果有的話）具有相同的構造和/或結構，這樣的單一寡核苷酸可以適當地認為具有相同的構造和/或結構。
類似物：術語「類似物」包括在結構上與參考化學部分或部分類別不同但能執行此類參考化學部分或部分類別的至少一種功能的任何化學部分。作為非限制性實例，核苷酸類似物在結構上與核苷酸不同，但能執行核苷酸的至少一種功能；核鹼基類似物在結構上與核鹼基不同，但能執行核鹼基的至少一種功能；等。
反義：如本文所用，術語「反義」係指寡核苷酸或其他核酸的特徵，該寡核苷酸或其他核酸具有與其能夠雜交的靶核酸互補或基本互補的鹼基序列。在一些實施方式中，靶核酸係靶基因mRNA。在一些實施方式中，雜交對於一種活性係必需的或導致一種活性，例如，靶核酸或其基因產物的程度、表現或活性的降低。如本文所用，術語「反義寡核苷酸」係指與靶核酸互補的寡核苷酸。在一些實施方式中，反義寡核苷酸能夠指導靶核酸或其產物的程度、表現或活性的降低。在一些實施方式中，反義寡核苷酸能夠藉由涉及RNA酶H、空間位阻和/或RNA干擾的機制指導靶核酸或其產物的程度、表現或活性的降低。
手性控制：如本文所用，「手性控制」係指控制寡核苷酸內的手性核苷酸間鍵聯中的手性鍵聯磷的立體化學標識。如本文所用，手性核苷酸間鍵聯係其鍵聯磷係手性的核苷酸間鍵聯。在一些實施方式中，藉由寡核苷酸的糖和鹼基部分中不存在的手性元素實現控制，例如，在一些實施方式中，藉由在寡核苷酸製備期間使用一種或多種手性助劑實現控制，如在本揭露中描述的，手性助劑通常是寡核苷酸製備期間使用的手性亞磷醯胺的一部分。與手性控制相反，熟悉該項技術者認識到，如果使用常規寡核苷酸合成來形成手性核苷酸間鍵聯，則不使用手性助劑的這樣的常規寡核苷酸合成不能控制手性核苷酸間鍵聯處的立體化學。在一些實施方式中，控制了每個寡核苷酸內手性核苷酸間鍵聯中每個手性鍵聯磷的立體化學標識。
手性受控的寡核苷酸組成物：如本文所用，術語「手性受控的寡核苷酸組成物」、「手性受控的核酸組成物」等係指包含多個寡核苷酸（或核酸）的組成物，該多個寡核苷酸（或核酸）共用：1) 共同的鹼基序列，2) 共同的骨架鍵聯模式，以及3) 共同的骨架磷修飾模式，其中該多個寡核苷酸（或核酸）在一個或多個手性核苷酸間鍵聯（手性受控的或立體定義的核苷酸間鍵聯，其手性鍵聯磷在組成物（「立體定義的」）中呈Rp或Sp，而非如同非手性受控的核苷酸間鍵聯一樣的隨機Rp和Sp混合物）處共用相同的鍵聯磷立體化學。手性受控的寡核苷酸組成物中該多個寡核苷酸（或核酸）的程度係預定的/受控的（例如，藉由手性受控的寡核苷酸製備以立體選擇性地形成一個或多個手性核苷酸間鍵聯）。在一些實施方式中，手性受控的寡核苷酸組成物中的所有寡核苷酸的約1%-100%（例如，約5%-100%、10%-100%、20%-100%、30%-100%、40%-100%、50%-100%、60%-100%、70%-100%、80%-100%、90%-100%、95%-100%、50%-90%，或約5%、10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%，或至少5%、10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%）係該多個寡核苷酸中的寡核苷酸。在一些實施方式中，手性受控的寡核苷酸組成物中共用共同的鹼基序列、共同的骨架鍵聯模式以及共同的骨架磷修飾模式的所有寡核苷酸的約1%-100%（例如，約5%-100%、10%-100%、20%-100%、30%-100%、40%-100%、50%-100%、60%-100%、70%-100%、80%-100%、90%-100%、95%-100%、50%-90%，或約5%、10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%，或至少5%、10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%）係該多個寡核苷酸中的寡核苷酸。在一些實施方式中，程度係組成物中的所有寡核苷酸的；或組成物中共用共同的鹼基序列（例如，多個寡核苷酸或一種寡核苷酸類型的鹼基序列）的所有寡核苷酸的；或組成物中共用共同的鹼基序列、共同的骨架鍵聯模式以及共同的骨架磷修飾模式的所有寡核苷酸的；或組成物中共用共同的鹼基序列、共同的鹼基修飾模式、共同的糖修飾模式、共同的核苷酸間鍵聯類型模式、和/或共同的核苷酸間鍵聯修飾模式的所有寡核苷酸的約1%-100%（例如，約5%-100%、10%-100%、20%-100%、30%-100%、40%-100%、50%-100%、60%-100%、70%-100%、80%-100%、90%-100%、95%-100%、50%-90%，或約5%、10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%，或至少5%、10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%）。在一些實施方式中，多個寡核苷酸在約1-50個手性核苷酸間鍵聯處共用相同的立體化學。在一些實施方式中，多個寡核苷酸在手性核苷酸間鍵聯的約1%-100%處共用相同的立體化學。在一些實施方式中，多個寡核苷酸中的寡核苷酸（或核酸）具有相同的構造（如熟悉該項技術者所理解的，在一些實施方式中可以以一種或多種形式存在，例如酸形式、鹽形式等）。在一些實施方式中，多個寡核苷酸中的寡核苷酸（或核酸）的程度為與多個寡核苷酸中的寡核苷酸（或核酸）共用相同構造的組成物中所有寡核苷酸（或核酸）的約1%-100%。在一些實施方式中，每個手性核苷酸間鍵聯係手性受控的核苷酸間鍵聯，並且組成物係完全手性受控的寡核苷酸組成物。在一些實施方式中，多個寡核苷酸（或核酸）在結構上相同。在一些實施方式中，手性受控的核苷酸間鍵聯關於其手性連接磷具有至少80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或99.5%，典型地至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或99.5%的非鏡像異構物純度（diastereopurity）。在一些實施方式中，手性受控的核苷酸間鍵聯鏈具有至少95%的非鏡像異構物純度。在一些實施方式中，手性受控的核苷酸間鍵聯鏈具有至少96%的非鏡像異構物純度。在一些實施方式中，手性受控的核苷酸間鍵聯鏈具有至少97%的非鏡像異構物純度。在一些實施方式中，手性受控的核苷酸間鍵聯鏈具有至少98%的非鏡像異構物純度。在一些實施方式中，手性受控的核苷酸間鍵聯鏈具有至少99%的非鏡像異構物純度。在一些實施方式中，百分比（例如，本文所述之程度）係或至少係(DS)nc ，其中DS係如本揭露中所述之非鏡像異構物純度（例如，90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或99.5%或更高），並且nc係本揭露中描述的手性受控的核苷酸間鍵聯的數目（例如1-50、1-40、1-30、1-25、1-20、5-50、5-40、5-30、5-25、5-20、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25個或更多個）。在一些實施方式中，百分比（例如，本文所述之程度）係或至少係(DS)nc ，其中DS係95%-100%。例如，當DS係99%並且nc係10時，該百分比係或至少係90%（(99%)10 ≈ 0.90 = 90%）。在一些實施方式中，組成物中多個寡核苷酸的程度表示為寡核苷酸中每個手性受控的核苷酸間鍵聯鏈的非鏡像異構物純度的乘積。在一些實施方式中，連接寡核苷酸（或核酸）中兩個核苷的核苷酸間鍵聯的非鏡像異構物純度由連接相同兩個核苷的二聚體的核苷酸間鍵聯的非鏡像異構物純度表示，其中使用可比較的條件（在某些情況下，相同的合成循環條件）製備二聚體（例如，對於寡核苷酸….NxNy….中Nx和Ny之間的鍵聯，二聚體為NxNy）。在一些實施方式中，不是所有的手性核苷酸間鍵聯皆為手性受控的核苷酸間鍵聯，並且組成物係部分地手性受控的寡核苷酸組成物。在一些實施方式中，如在立體隨機寡核苷酸組成物中通常觀察到的，非手性受控的核苷酸間鍵聯具有小於約80%、75%、70%、65%、60%、55%或約50%的非鏡像異構物純度（例如，如熟悉該項技術者所知，來自傳統的寡核苷酸合成，例如亞磷醯胺方法）。在一些實施方式中，多個寡核苷酸（或核酸）具有相同的類型。在一些實施方式中，手性受控的寡核苷酸組成物包含非隨機程度或受控程度的個別寡核苷酸類型或核酸類型。例如，在一些實施方式中，手性受控的寡核苷酸組成物包含一種且不超過一種寡核苷酸類型。在一些實施方式中，手性受控的寡核苷酸組成物包含超過一種寡核苷酸類型。在一些實施方式中，手性受控的寡核苷酸組成物包含多種寡核苷酸類型。在一些實施方式中，手性受控的寡核苷酸組成物係一種寡核苷酸類型的寡核苷酸的組成物，該組成物包含非隨機程度或受控程度的該寡核苷酸類型的多個寡核苷酸。
核苷酸間鍵聯：如本文所用，短語「核苷酸間鍵聯」通常是指連接寡核苷酸或核酸的核苷單元的鍵聯。在一些實施方式中，核苷酸間鍵聯係磷酸二酯鍵聯，如在天然存在的DNA和RNA分子中廣泛發現的（天然磷酸酯鍵聯（-OP(=O)(OH)O-），熟悉該項技術者可以理解的，其以鹽形式存在）。在一些實施方式中，核苷酸間鍵聯係修飾的核苷酸間鍵聯（不是天然磷酸酯鍵聯）。在一些實施方式中，核苷酸間鍵聯係「修飾的核苷酸間鍵聯」，其中磷酸二酯鍵聯的至少一個氧原子或-OH被不同的有機或無機部分代替。在一些實施方式中，這種有機或無機部分選自=S、=Se、=NR’、-SR’、-SeR’、-N(R’)2 、B(R’)3 、-S-、-Se-、和-N(R’)-，其中每個R’獨立地如本揭露中所定義和描述的。在一些實施方式中，核苷酸間鍵聯係磷酸三酯鍵聯、硫代磷酸酯鍵聯（或硫代磷酸酯二酯鍵聯，-OP(=O)(SH)O-，如熟悉該項技術者所理解的，其可以鹽形式存在），或硫代磷酸三酯鍵聯。在一些實施方式中，經修飾的核苷酸間鍵聯係硫代磷酸酯鍵聯。在一些實施方式中，核苷酸間鍵聯係例如PNA（肽核酸）或PMO（二胺基磷酸酯𠰌啉基寡聚物）鍵聯之一。在一些實施方式中，修飾的核苷酸間鍵聯係非負電荷核苷酸間鍵聯。在一些實施方式中，修飾的核苷酸間鍵聯係中性核苷酸間鍵聯（例如，某些提供的寡核苷酸中的n001）。熟悉該項技術者理解，由於鍵聯中存在酸或鹼部分，核苷酸間鍵聯可以在給定pH下作為陰離子或陽離子存在。在一些實施方式中，修飾的核苷酸間鍵聯係命名為s、s1、s2、s3、s4、s5、s6、s7、s8、s9、s10、s11、s12、s13、s14、s15、s16、s17和s18的修飾的核苷酸間鍵聯，如WO 2017/210647中所述。
體外：如本文所用，術語「體外」係指在人造環境中（例如在試管或反應容器中、在細胞培養物中等）而不是在生物體（例如，動物、植物和/或微生物）內發生的事件。
體內：如本文所用，術語「體內」係指在生物體（例如，動物、植物和/或微生物）內發生的事件。
鍵聯磷：如本文所定義，短語「鍵聯磷」用於指示所提及的特定磷原子係存在於核苷酸間鍵聯中的磷原子，該磷原子對應於如天然存在的DNA和RNA中所存在的磷酸二酯核苷酸間鍵聯的磷原子。在一些實施方式中，鍵聯磷原子位於經修飾的核苷酸間鍵聯中，其中磷酸二酯鍵聯的每個氧原子視需要且獨立地被有機或無機部分替換。在一些實施方式中，鍵聯磷原子係如本文所述之式I的P。在一些實施方式中，鍵聯磷原子係手性的。在一些實施方式中，鍵聯磷原子係非手性的（例如，如天然磷酸酯鍵聯）。
連接子：術語「連接子」，「連接子部分」等係指將一個化學部分連接至另一化學部分的任何化學部分。如熟悉該項技術者所理解的，取決於連接子連接的化學部分的數目，連接子可以是二價或三價或更高。在一些實施方式中，連接子係將一個寡核苷酸與多聚體中的另一個寡核苷酸連接的部分。在一些實施方式中，連接子係視需要位於末端核苷與固體支持物之間或末端核苷與另一個核苷、核苷酸或核酸之間的部分。在一些實施方式中，在寡核苷酸中，連接子將化學部分（例如，靶向部分、脂質部分、碳水化合物部分等）與寡核苷酸鏈（例如，藉由其5'端、3'端、核鹼基、糖、核苷酸間鍵聯等）連接
經修飾的核鹼基：術語「經修飾的核鹼基」、「經修飾的鹼基」等係指與核鹼基化學上不同但能執行核鹼基的至少一種功能的化學部分。在一些實施方式中，經修飾的核鹼基係包含修飾的核鹼基。在一些實施方式中，經修飾的核鹼基能夠具有核鹼基的至少一種功能，例如，在能夠與包含至少互補鹼基序列的核酸鹼基配對的聚合物中形成部分。在一些實施方式中，修飾的核鹼基係經取代的A、T、C、G或U，或A、T、C、G或U的經取代的互變異構物。在一些實施方式中，在寡核苷酸的上下文中，修飾的核鹼基係指不是A、T、C、G或U的核鹼基。
經修飾的核苷：術語「經修飾的核苷」係指衍生自天然核苷或在化學上類似於天然核苷但包含使其與天然核苷有區別的化學修飾的部分。經修飾的核苷的非限制性實例包括在鹼基和/或糖處包含修飾的那些。經修飾的核苷的非限制性實例包括在糖上具有2'修飾的那些。經修飾的核苷的非限制性實例還包括無鹼基核苷（其缺乏核鹼基）。在一些實施方式中，經修飾的核苷能夠具有核苷的至少一種功能，例如，在能夠與包含至少互補鹼基序列的核酸鹼基配對的聚合物中形成部分。
經修飾的核苷酸：術語「修飾的核苷酸」包括在結構上與天然核苷酸不同但能執行天然核苷酸的至少一種功能的任何化學部分。在一些實施方式中，修飾的核苷酸包含在糖、鹼基和/或核苷酸間鍵聯處的修飾。在一些實施方式中，修飾的核苷酸包含修飾的糖、修飾的核鹼基、和/或修飾的核苷酸間鍵聯。在一些實施方式中，經修飾的核苷酸能夠具有核苷酸的至少一種功能，例如，在能夠與包含至少互補鹼基序列的核酸鹼基配對的聚合物中形成亞基。
經修飾的糖：術語「經修飾的糖」係指可以替換糖的部分。修飾的糖模仿糖的空間排列、電子特性、或一些其他物理化學特性。在一些實施方式中，如本揭露中所述，修飾的糖係經取代的核糖或去氧核糖。在一些實施方式中，經修飾的糖包含2’-修飾。有用的2’-修飾的實例在本領域中被廣泛使用並在本文中描述。在一些實施方式中，2’-修飾係2’-OR，其中R係視需要經取代的C1-10 脂肪族基。在一些實施方式中，2'-修飾係2'-OMe。在一些實施方式中，2'-修飾係2'-MOE。在一些實施方式中，修飾的糖係雙環糖（例如，LNA，BNA等中使用的糖）。在一些實施方式中，在寡核苷酸的情況下，修飾的糖係不是通常在天然RNA或DNA中發現的核糖或去氧核糖的糖。
核酸：如本文所用，術語「核酸」包括任何核苷酸及其聚合物。如本文所用，術語「多核苷酸」係指任何長度的核苷酸（核糖核苷酸（RNA）或去氧核糖核苷酸（DNA）或其組合）的聚合形式。該等術語係指分子的一級結構，並且包括雙股和單股DNA、以及雙股和單股RNA。該等術語包括作為等效物的RNA或DNA的類似物，其包含修飾的核苷酸和/或修飾的多核苷酸（例如但不限於甲基化、被保護和/或加帽的核苷酸或多核苷酸）。該術語涵蓋多核糖核苷酸或寡核糖核苷酸（RNA）和多去氧核糖核苷酸或寡去氧核糖核苷酸（DNA）；衍生自核鹼基和/或經修飾的核鹼基的N-糖苷或C-糖苷的RNA或DNA；衍生自糖和/或經修飾的糖的核酸；以及衍生自磷酸酯橋聯和/或修飾的核苷酸間鍵聯的核酸。該術語涵蓋含有核鹼基、修飾的核鹼基、糖、修飾的糖、磷酸酯橋聯或修飾的核苷酸間鍵聯的任何組合的核酸。實例包括且不限於含有核糖部分的核酸、含有去氧核糖部分的核酸、含有核糖部分和去氧核糖部分的核酸、含有核糖部分和修飾的核糖部分的核酸。除非另有說明，否則前綴「多（poly-）」係指含有2至約10,000個核苷酸單體單元的核酸，並且其中前綴「寡（oligo-）」係指含有2至約200個核苷酸單體單元的核酸。
核鹼基：術語「核鹼基」係指參與氫鍵的核酸部分，其以序列特異性方式將一條核酸股與另一條互補股結合。最常見的天然存在的核鹼基係腺嘌呤（A）、鳥嘌呤（G）、尿嘧啶（U）、胞嘧啶（C）、和胸腺嘧啶（T）。在一些實施方式中，天然存在的核鹼基係修飾的腺嘌呤、鳥嘌呤、尿嘧啶、胞嘧啶、或胸腺嘧啶。在一些實施方式中，天然存在的核鹼基係甲基化的腺嘌呤、鳥嘌呤、尿嘧啶、胞嘧啶、或胸腺嘧啶。在一些實施方式中，核鹼基包含雜芳基環，其中環原子係氮，並且當在核苷中時，氮鍵合至糖部分。在一些實施方式中，核鹼基包含雜環，其中環原子係氮，並且當在核苷中時，氮鍵合至糖部分。在一些實施方式中，核鹼基係「修飾的核鹼基」，除腺嘌呤（A）、鳥嘌呤（G）、尿嘧啶（U）、胞嘧啶（C）、和胸腺嘧啶（T）之外的核鹼基。在一些實施方式中，修飾的核鹼基係經取代的A、T、C、G或U。在一些實施方式中，修飾的核鹼基係A、T、C、G或U的經取代的互變異構物。在一些實施方式中，修飾的核鹼基係甲基化的腺嘌呤、鳥嘌呤、尿嘧啶、胞嘧啶或胸腺嘧啶。在一些實施方式中，修飾的核鹼基模擬核鹼基的空間排列、電子特性或一些其他物理化學特性，並保留氫鍵合的特性，氫鍵合以序列特異性方式將一條核酸股與另一條核酸股結合。在一些實施方式中，經修飾的核鹼基可與所有五種天然存在的鹼基（尿嘧啶、胸腺嘧啶、腺嘌呤、胞嘧啶、或鳥嘌呤）配對，而基本上不影響熔解行為、被細胞內酶識別、或寡核苷酸雙鏈體的活性。如本文所用，術語「核鹼基」還涵蓋用於代替天然的核苷酸或天然存在的核苷酸的結構類似物，如修飾的核鹼基和核鹼基類似物。在一些實施方式中，核鹼基係視需要經取代的A、T、C、G或U，或A、T、C、G或U的視需要經取代的互變異構物。在一些實施方式中，「核鹼基」係指在寡核苷酸或核酸中的核鹼基單元（例如，在寡核苷酸或核酸中的A、T、C、G或U）。
核苷：術語「核苷」係指其中核鹼基或修飾的核鹼基與糖或修飾的糖共價結合的部分。在一些實施方式中，核苷係天然核苷，例如腺苷、去氧腺苷、鳥苷、去氧鳥苷、胸苷、尿苷、胞苷或去氧胞苷。在一些實施方式中，核苷係修飾的核苷，例如選自腺苷、去氧腺苷、鳥苷、去氧鳥苷、胸苷、尿苷、胞苷和去氧胞苷的經取代的天然核苷。在一些實施方式中，核苷係修飾的核苷，例如選自腺苷、去氧腺苷、鳥苷、去氧鳥苷、胸苷、尿苷、胞苷和去氧胞苷的天然核苷的經取代的互變異構物。在一些實施方式中，「核苷」係指寡核苷酸或核酸中的核苷單元。
核苷酸：如本文所用，術語「核苷酸」係指多核苷酸的單體單元，其由核鹼基、糖和一個或多個核苷酸間鍵聯（例如，天然DNA和RNA中的磷酸鍵聯）組成。天然存在的鹼基[鳥嘌呤（G）、腺嘌呤（A）、胞嘧啶（C）、胸腺嘧啶（T）、和尿嘧啶（U）]係嘌呤或嘧啶的衍生物，但應該理解為還包括天然存在的和非天然存在的鹼基類似物。天然存在的糖係戊糖（五碳糖），即去氧核糖（其形成DNA）或核糖（其形成RNA），但應該理解，還包括天然存在的和非天然存在的糖類似物。將核苷酸經由核苷酸間鍵聯進行連接以形成核酸、或多核苷酸。許多核苷酸間鍵聯係本領域已知的（如但不限於磷酸酯、硫代磷酸酯、硼烷磷酸酯等）。人工核酸包括PNA（肽核酸）、磷酸三酯、硫代磷酸酯、H-膦酸酯、胺基磷酸酯、硼烷磷酸酯、甲基膦酸酯、膦醯乙酸酯（phosphonoacetate）、硫代膦醯乙酸酯、以及天然核酸的磷酸酯骨架的其他變體，如本文所述之那些。在一些實施方式中，天然核苷酸包含天然存在的鹼基、糖和核苷酸間鍵聯。如本文所用，術語「核苷酸」還涵蓋用於代替天然核苷酸或天然存在的核苷酸的結構類似物，如修飾的核苷酸和核苷酸類似物。在一些實施方式中，「核苷酸」係指寡核苷酸或核酸中的核苷酸單元。
寡核苷酸：術語「寡核苷酸」係指核苷酸的聚合物或寡聚物，並且可以包含天然和非天然核鹼基、糖和核苷酸間鍵聯的任何組合。
寡核苷酸可以是單股或雙股的。單股寡核苷酸可以具有雙股區域（由單股寡核苷酸的兩個部分形成），並且包含兩個寡核苷酸鏈的雙股寡核苷酸可以具有單股區域，例如其中兩個寡核苷酸鏈彼此不互補的區域。示例寡核苷酸包括但不限於結構基因、包含控制區和終止區的基因、自我複製系統（如病毒DNA或質體DNA）、單股和雙股RNAi試劑和其他RNA干擾試劑（RNAi試劑或iRNA試劑）、shRNA、反義寡核苷酸、核酶、微小RNA、微小RNA模擬物、supermir、適體、antimir、antagomir、Ul銜接子、形成三股體的寡核苷酸、G-四股體寡核苷酸、RNA啟動子、免疫刺激性寡核苷酸和誘餌寡核苷酸。
本揭露的寡核苷酸可以具有各種長度。在特定的實施方式中，寡核苷酸的長度可以是約2至約200個核苷。在多個相關實施方式中，（單股的、雙股的、或三股的）寡核苷酸的長度範圍可以從約4至約10個核苷、從約10至約50個核苷、從約20至約50個核苷、從約15至約30個核苷、從約20至約30個核苷。在一些實施方式中，寡核苷酸的長度係約9至約39個核苷。在一些實施方式中，寡核苷酸的長度係至少4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24或25個核苷。在一些實施方式中，寡核苷酸的長度係至少19個核苷。在一些實施方式中，寡核苷酸的長度係至少20個核苷。在一些實施方式中，寡核苷酸的長度係至少25個核苷。在一些實施方式中，寡核苷酸的長度係至少30個核苷。在一些實施方式中，寡核苷酸係長度為至少18個核苷的互補股的雙股體。在一些實施方式中，寡核苷酸係長度為至少21個核苷的互補股的雙股體。在一些實施方式中，寡核苷酸長度中計數的每個核苷獨立地包含A、T、C、G或U，或視需要經取代的A、T、C、G或U，或A、T、C、G或U的視需要經取代的互變異構物。
寡核苷酸類型：如本文所用，短語「寡核苷酸類型」用於定義具有特定鹼基序列、骨架鍵聯模式（即，核苷酸間鍵聯類型（例如磷酸酯、硫代磷酸酯、硫代磷酸三酯等）的模式）、骨架手性中心模式[即，鍵聯磷立體化學模式（Rp/Sp）]、以及骨架磷修飾模式（例如，本文所述之式I中的「-XLR1 」基團的模式）的寡核苷酸。在一些實施方式中，共同指定的「類型」的寡核苷酸彼此在結構上相同。
熟悉該項技術者將理解，本揭露的合成方法在合成寡核苷酸股期間提供一定程度的控制，使得可以提前設計和/或選擇寡核苷酸股的每個核苷酸單元以在鍵聯磷處具有特定的立體化學和/或在鍵聯磷處具有特定的修飾、和/或具有特定的鹼基、和/或具有特定的糖。在一些實施方式中，提前設計和/或選擇寡核苷酸股以在鍵聯磷處具有立體中心的特定組合。在一些實施方式中，設計和/或確定寡核苷酸股以在鍵聯磷處具有修飾的特定組合。在一些實施方式中，設計和/或選擇寡核苷酸股以具有鹼基的特定組合。在一些實施方式中，設計和/或選擇寡核苷酸股以具有一個或多個以上結構特徵的特定組合。在一些實施方式中，本揭露提供了包含多個寡核苷酸分子或由其組成的組成物（例如，手性受控的寡核苷酸組成物）。在一些實施方式中，所有此類分子屬於同一類型（即，在結構上彼此相同）。然而，在一些實施方式中，所提供的組成物包含多個不同類型的寡核苷酸（通常以預定的相對量）。
視需要經取代的：如本文所述，本揭露的化合物（例如寡核苷酸）可以含有視需要經取代的部分和/或經取代的部分。通常，術語「經取代的」，無論前面是否有術語「視需要」，均意指指定部分的一個或多個氫被合適的取代基替換。除非另外指明，否則「視需要經取代的」基團可以在該基團的每個可取代位置處具有合適的取代基，且當任何給定結構中的超過一個位置可以被選自指定基團的超過一個取代基取代時，在每一位置處的取代基可以相同或不同。在一些實施方式中，視需要經取代的基團係未經取代的。本揭露所設想的取代基的組合較佳的是導致形成穩定的或化學上可行的化合物的組合。如本文所用，術語「穩定」係指如下化合物，在出於本文所揭露的一個或多個目的而經歷其製備、檢測以及在某些實施方式中經歷其回收、純化和使用的條件時，它們基本上不發生改變。某些取代基描述如下。
在可取代原子（例如，合適的碳原子）上的合適的單價取代基獨立地是鹵素；-(CH2 )0-4 R°；-(CH2 )0-4 OR°；-O(CH2 )0-4 Ro 、-O-(CH2 )0-4 C(O)OR°；-(CH2 )0-4 CH(OR°)2 ；-(CH2 )0-4 Ph，其可經R°取代；-(CH2 )0-4 O(CH2 )0-1 Ph，其可經R°取代；-CH=CHPh，其可經R°取代；-(CH2 )0-4 O(CH2 )0-1 -吡啶基，其可經R°取代；-NO2 ；-CN；-N3 ；-(CH2 )0-4 N(R°)2 ；-(CH2 )0-4 N(R°)C(O)R°；-N(R°)C(S)R°；-(CH2 )0-4 N(R°)C(O)NR°2 ；-N(R°)C(S)NR°2 ；-(CH2 )0-4 N(R°)C(O)OR°；-N(R°)N(R°)C(O)R°；-N(R°)N(R°)C(O)NR°2 ；-N(R°)N(R°)C(O)OR°；-(CH2 )0-4 C(O)R°；-C(S)R°；-(CH2 )0-4 C(O)OR°；-(CH2 )0-4 C(O)SR°；-(CH2 )0-4 C(O)OSiR°3 ；-(CH2 )0-4 OC(O)R°；-OC(O)(CH2 )0-4 SR°, -SC(S)SR°；-(CH2 )0-4 SC(O)R°；-(CH2 )0-4 C(O)NR°2 ；-C(S)NR°2 ；-C(S)SR°；-(CH2 )0-4 OC(O)NR°2 ；-C(O)N(OR°)R°；-C(O)C(O)R°；-C(O)CH2 C(O)R°；-C(NOR°)R°；-(CH2 )0-4 SSR°；-(CH2 )0-4 S(O)2 R°；-(CH2 )0-4 S(O)2 OR°；-(CH2 )0-4 OS(O)2 R°；-S(O)2 NR°2 ；-(CH2 )0-4 S(O)R°；-N(R°)S(O)2 NR°2 ；-N(R°)S(O)2 R°；-N(OR°)R°；-C(NH)NR°2 ；-Si(R°)3 ；-OSi(R°)3 ；-B(R°)2 ；-OB(R°)2 ；-OB(OR°)2 ；-P(R°)2 ；-P(OR°)2 ；-P(R°)(OR°)；-OP(R°)2 ；-OP(OR°)2 ；-OP(R°)(OR°)；-P(O)(R°)2 ；-P(O)(OR°)2 ；-OP(O)(R°)2 ；-OP(O)(OR°)2 ；-OP(O)(OR°)(SR°)；-SP(O)(R°)2 ；-SP(O)(OR°)2 ；-N(R°)P(O)(R°)2 ；-N(R°)P(O)(OR°)2 ；-P(R°)2 [B(R°)3 ]；-P(OR°)2 [B(R°)3 ]；-OP(R°)2 [B(R°)3 ]；-OP(OR°)2 [B(R°)3 ]；-(C1-4 直鏈或支鏈伸烷基)O-N(R°)2 ；或-(C1-4 直鏈或支鏈伸烷基)C(O)O-N(R°)2 ，其中每個R°可如本文所定義取代且獨立地是氫；C1-20 脂肪族；具有1至5個獨立地選自氮、氧、硫、矽及磷的雜原子的C1-20 雜脂肪族；-CH2 -(C6-14 芳基)；-O(CH2 )0-1 (C6-14 芳基)；-CH2 -(5元至14元雜芳基環)；具有0至5個獨立地選自氮、氧、硫、矽及磷的雜原子的5元至20元單環、雙環或多環的飽和環、部分不飽和環或芳基環；或者不管上述定義，兩個獨立出現的R°與居於它們之間的一個或多個原子一起形成具有0至5個獨立地選自氮、氧、硫、矽及磷的雜原子的5元至20元單環、雙環或多環的飽和環、部分不飽和環或芳基環，其可如下文所定義取代。
R°（或由兩個獨立出現的R°與居於它們之間的原子共同形成的環）上的適合的單價取代基獨立地是鹵素、-(CH2 )0-2 R• 、-(鹵代R• )、-(CH2 )0-2 OH、-(CH2 )0-2 OR• 、-(CH2 )0-2 CH(OR• )2 、-O(鹵代R• )、-CN、-N3 、-(CH2 )0-2 C(O)R• 、-(CH2 )0-2 C(O)OH、-(CH2 )0-2 C(O)OR• 、-(CH2 )0-2 SR• 、-(CH2 )0-2 SH、-(CH2 )0-2 NH2 、-(CH2 )0-2 NHR• 、-(CH2 )0-2 NR• 2 、-NO2 、-SiR• 3 、-OSiR• 3 、-C(O)SR• 、-(C1-4 直鏈或支鏈伸烷基)C(O)OR• 或-SSR• ，其中每個R• 係未經取代的或在前面有「鹵代」的情況下僅被一個或多個鹵素取代，且獨立地選自C1-4 脂肪族、-CH2 Ph、-O(CH2 )0-1 Ph以及具有0-4個獨立地選自氮、氧和硫的雜原子的5-6元飽和環、部分不飽和環或芳基環。在R°的飽和碳原子上的合適的二價取代基包括=O及=S。
例如在合適的碳原子上的合適的二價取代基獨立地是以下：=O、=S、=NNR* 2 、=NNHC(O)R* 、=NNHC(O)OR* 、=NNHS(O)2 R* 、=NR* 、=NOR* 、-O(C(R* 2 ))2-3 O-或-S(C(R* 2 ))2-3 S-，其中每個獨立出現的R* 選自氫、可以如下文所定義地被取代的C1-6 脂肪族、以及具有0-4個獨立地選自氮、氧和硫的雜原子的未經取代的5-6元飽和環、部分不飽和環或芳基環。與「視需要經取代的」基團的鄰位可取代碳結合的合適的二價取代基包括：-O(CR* 2 )2-3 O-，其中每個獨立出現的R*選自氫、可以如下文所定義地被取代的C1-6 脂肪族、以及具有0-4個獨立地選自氮、氧和硫的雜原子的未經取代的5-6元飽和環、部分不飽或環或芳基環。
R* 的脂肪族基團上的合適的取代基獨立地是鹵素、-R• 、-(鹵代R• )、-OH、-OR• 、-O(鹵代R• )、-CN、-C(O)OH、-C(O)OR• 、-NH2 、-NHR• 、-NR• 2 或-NO2 ，其中每個R• 係未取代的或在前面有「鹵代」的情況下僅被一個或多個鹵素取代，且獨立地是C1-4 脂肪族、-CH2 Ph、-O(CH2 )0-1 Ph或具有0至4個獨立地選自氮、氧及硫的雜原子的5-6元飽和環、部分不飽和環或芳基環。
在一些實施方式中，可取代氮上的合適取代基獨立地是-R† 、-NR† 2 、-C(O)R† 、-C(O)OR† 、-C(O)C(O)R† 、-C(O)CH2 C(O)R† 、-S(O)2 R† 、-S(O)2 NR† 2 、-C(S)NR† 2 、-C(NH)NR† 2 、或-N(R† )S(O)2 R† ；其中每個R† 獨立地是氫，可按以下定義經取代的C1-6 脂肪族基，未取代的-OPh或具有0-4個獨立地選自氮、氧和硫的雜原子的5-6元飽和環、部分不飽和環或芳基環，或不予上述定義向左地，但兩個獨立出現的R† 及其一個或多個插入原子一起形成未取代的具有0-4個獨立地選自氮、氧和硫的雜原子的3-12元飽和的、部分不飽和的或芳基的單環或雙環。
R† 的脂肪族基團上的合適的取代基獨立地是鹵素、-R• 、-(鹵代R• )、-OH、-OR• 、-O(鹵代R• )、-CN、-C(O)OH、-C(O)OR• 、-NH2 、-NHR• 、-NR• 2 或-NO2 ，其中每個R• 係未取代的或在前面有「鹵代」的情況下僅被一個或多個鹵素取代，且獨立地是C1-4 脂肪族、-CH2 Ph、-O(CH2 )0-1 Ph或具有0至4個獨立地選自氮、氧及硫的雜原子的5-6元飽和環、部分不飽和環或芳基環。
口服：如本文所用的短語「口服施用（oral administration和administered orally）」具有其領域所理解的含義，係指藉由口施用化合物或組成物。
腸胃外：如本文所用的短語「腸胃外施用（parenteral administration和administered parenterally）」具有其領域所理解的含義，係指除了腸內和局部施用之外的施用方式，通常是藉由注射，並且包括但不局限於靜脈內、肌內、動脈內、鞘內、囊內、眼眶內、心內、真皮內、腹膜內、經氣管、皮下、表皮下、關節內、囊下、蛛網膜下、脊髓內以及胸骨內注射和輸注。
部分不飽和的：如本文使用的，術語「部分不飽和的」係指包括至少一個雙鍵或三鍵的環部分。術語「部分不飽和的」意在涵蓋具有多個不飽和的位點的環，但是如在此定義的不意在包括芳基或雜芳基部分。
藥物組成物：如本文所用，術語「藥物組成物」係指與一種或多種藥學上可接受的載體一起配製的活性劑。在一些實施方式中，活性劑以適合於在治療方案中施用的單位劑量存在，其顯示當施用於相關群體時實現預定的治療效果的統計學顯著概率。在一些實施方式中，藥物組成物能以固體或液體形式被特別配製以進行施用，包括適用於以下的那些：口服施用，例如，浸液（drench）（水性或非水性溶液或懸浮液）、片劑（例如針對口腔、舌下和全身吸收的那些）、大丸劑、粉劑、顆粒劑、糊劑（應用於舌）；腸胃外施用，例如，作為例如無菌溶液或懸浮液或持續釋放的配製物藉由皮下、肌內、靜脈內或硬膜外注射；局部應用，例如，作為乳膏劑、軟膏劑、或控制釋放貼劑或噴霧劑應用於皮膚、肺或口腔；陰道內或直腸內，例如作為陰道栓劑、乳膏劑或泡沫劑；舌下；眼部；透皮；或經鼻、肺以及應用於其他黏膜表面。
藥學上可接受的：如本文所用，短語「藥學上可接受的」係指在合理醫學判斷的範圍內適合於與人類和動物的組織接觸使用而無過多毒性、刺激、過敏反應或其他問題或併發症，與合理的效益/風險比相稱的那些化合物、材料、組成物、和/或劑型。
藥學上可接受的載體：如本文所用，術語「藥學上可接受的載體」意指藥學上可接受的材料、組成物或媒劑，如液體或固體填充劑、稀釋劑、賦形劑或溶劑包封材料，其涉及將主題化合物從一個器官（或身體的一部分）攜帶或運輸到另一個器官或身體的一部分。在與配製物的其他成分相容並且對患者無害的意義上，每種載體必須是「可接受的」。可充當藥學上可接受的載體的材料的一些實例包括：糖，如乳糖、葡萄糖和蔗糖；澱粉，如玉米澱粉和馬鈴薯澱粉；纖維素及其衍生物，如羧甲基纖維素鈉、乙基纖維素和乙酸纖維素；粉狀黃茋膠；麥芽；明膠；滑石；賦形劑，如可可脂和栓劑蠟；油，如花生油、棉籽油、紅花油、芝麻油、橄欖油、玉米油和大豆油；二醇，如丙二醇；多元醇，如甘油、山梨醇、甘露醇和聚乙二醇；酯，如油酸乙酯和月桂酸乙酯；瓊脂；緩衝劑，如氫氧化鎂和氫氧化鋁；海藻酸；無熱原水；等滲鹽水；林格氏溶液；乙醇；pH緩衝溶液；聚酯、聚碳酸酯和/或聚酸酐；以及在藥物配製物中採用的其他無毒相容的物質。
藥學上可接受的鹽：如本文所用，術語「藥學上可接受的鹽」係指適合於在製藥環境中使用的此類化合物的鹽，即，在合理醫學判斷的範圍內，適合於與人類和低等動物的組織接觸使用而無不當毒性、刺激、過敏反應等並且與合理的效益/風險比相稱的鹽。藥學上可接受的鹽係本領域習知的。例如，S. M. Berge等人在J. Pharmaceutical Sciences [藥物科學雜誌], 66: 1-19 (1977) 中詳細地描述了藥學上可接受的鹽。在一些實施方式中，藥學上可接受的鹽包括但不限於無毒的酸加成鹽，其係使用無機酸如鹽酸、氫溴酸、磷酸、硫酸和過氯酸或使用有機酸如乙酸、馬來酸、酒石酸、檸檬酸、琥珀酸或丙二酸或藉由使用本領域中所使用的其他方法如離子交換形成的具有胺基基團的鹽。在一些實施方式中，藥學上可接受的鹽包括但不限於己二酸鹽、藻酸鹽、抗壞血酸鹽、天冬胺酸鹽、苯磺酸鹽、苯甲酸鹽、硫酸氫鹽、硼酸鹽、丁酸鹽、樟腦酸鹽、樟腦磺酸鹽、檸檬酸鹽、環戊烷丙酸鹽、二葡糖酸鹽、十二烷基硫酸鹽、乙磺酸鹽、甲酸鹽、富馬酸鹽、葡庚糖酸鹽、甘油磷酸鹽、葡糖酸鹽、半硫酸鹽（hemisulfate）、庚酸鹽、己酸鹽、氫碘化物、2-羥基-乙磺酸鹽、乳糖酸鹽（lactobionate）、乳酸鹽、月桂酸鹽、月桂基硫酸鹽、蘋果酸鹽、馬來酸鹽、丙二酸鹽、甲磺酸鹽、2-萘磺酸鹽、菸酸鹽、硝酸鹽、油酸鹽、草酸鹽、棕櫚酸鹽、雙羥萘酸鹽、果膠酸鹽、過硫酸鹽、3-苯基丙酸鹽、磷酸鹽、苦味酸鹽、新戊酸鹽、丙酸鹽、硬脂酸鹽、琥珀酸鹽、硫酸鹽、酒石酸鹽、硫氰酸鹽、對甲苯磺酸鹽、十一酸鹽、戊酸鹽等。在一些實施方式中，所提供的化合物（例如寡核苷酸）包含一個或多個酸性基團，且藥學上可接受的鹽係鹼金屬鹽、鹼土金屬鹽或銨鹽（例如，N(R)3 的銨鹽，其中每個R在本揭露中被獨立地定義和描述）。代表性鹼金屬或鹼土金屬鹽包括鈉鹽、鋰鹽、鉀鹽、鈣鹽、鎂鹽等。在一些實施方式中，藥學上可接受的鹽係鈉鹽。在一些實施方式中，藥學上可接受的鹽係鉀鹽。在一些實施方式中，藥學上可接受的鹽係鈣鹽。在一些實施方式中，藥學上可接受的鹽適當地包括使用平衡離子（如鹵離子、氫氧根、羧酸根、硫酸根、磷酸根、硝酸根、具有從1至6個碳原子的烷基、磺酸根以及芳基磺酸根）形成的無毒銨、季銨以及胺陽離子。在一些實施方式中，提供的化合物包含多於一個酸性基團，例如，寡核苷酸可以包含兩個或更多個酸性基團（例如，天然磷酸酯鍵聯和/或經修飾的核苷酸間鍵聯）。在一些實施方式中，這種化合物的藥學上可接受的鹽（或者通常，鹽）包含兩個或更多個陽離子，該兩個或更多個陽離子可以是相同的或不同的。在一些實施方式中，在藥學上可接受的鹽（或通常為鹽）中，酸性基團中的所有可電離的氫（例如，在pKa不超過約11、10、9、8、7、6、5、4、3或2的水溶液中；在一些實施方式中，不超過約7；在一些實施方式中，不超過約6；在一些實施方式中，不超過約5；在一些實施方式中，不超過約4；在一些實施方式中，不超過約3）被陽離子替換。在一些實施方式中，每個硫代磷酸酯和磷酸酯基團獨立地以其鹽形式存在（例如，如果鈉鹽，分別是-O-P(O)(SNa)-O-和-O-P(O)(ONa)-O-，）。在一些實施方式中，每個硫代磷酸酯和磷酸酯磷酸核苷酸間鍵獨立地以其鹽形式存在（例如，如果鈉鹽，分別是-O-P(O)(SNa)-O-和-O-P(O)(ONa)-O-，）。在一些實施方式中，藥學上可接受的鹽係寡核苷酸的鈉鹽。在一些實施方式中，藥學上可接受的鹽係寡核苷酸的鈉鹽，其中每個酸性磷酸酯和修飾的磷酸酯基團（例如硫代磷酸酯，磷酸酯等）（如果有的話）以鹽形式存在（所有均以鈉鹽）。
保護基團：如本文所用，術語「保護基團」係本領域熟知的並且包括在Protecting Groups in Organic Synthesis [有機合成中的保護基團] T. W. Greene和P. G. M. Wuts, 第3版, 約翰威利父子公司, 1999中詳細描述的那些，將該文獻的全部內容藉由引用併入本文。還包括那些特別適用於核苷和核苷酸化學的保護基團，該保護基團描述於由Serge L. Beaucage等人在2012年06月編輯的Current Protocols in Nucleic Acid Chemistry [核酸化學實驗室指南] 中，將章節2的全部內容藉由引用併入本文。合適的胺基保護基團包括但不限於描述於本文和/或以下：WO 2018/022473、WO 2018/098264、WO 2018/223056、WO 2018/223073、WO 2018/223081、WO 2018/237194、WO 2019/032607、WO 2019/055951、和/或WO 2019/075357，或美國臨時專利申請62/825766和62/911339，其各自的保護基的描述藉由引用獨立地併入本文。
樣品：如本文所用的，術語「樣品」通常是指從感興趣的來源獲得或衍生的材料的等分試樣。在一些實施方式中，感興趣的來源係生物或環境來源。在一些實施方式中，感興趣的來源可以是或包含細胞或生物，例如微生物、植物或動物（例如，人）。在一些實施方式中，感興趣的來源係或包含生物組織或體液。在一些實施方式中，生物組織或流體可以是或包括羊水、房水、腹水、膽汁、骨髓、血液、母乳、腦脊液、耵聹、乳糜、chime、前列腺液、內淋巴、滲出物、排泄物、胃酸、胃液、淋巴、黏液、心包液、外淋巴、腹膜液、腹膜液、胸膜液、膿、發炎性分泌物、唾液、皮脂、精液、血清、包皮垢、痰、滑液、汗液、眼淚、尿液、陰道分泌物、玻璃狀液、嘔吐物、和/或其組合或一種或多種成分。在一些實施方式中，生物流體可以是或包括細胞內流體、細胞外流體、血管內流體（血漿）、間質流體、淋巴液和/或細胞透過液。在一些實施方式中，生物流體可以是或包含植物分泌物。在一些實施方式中，可以例如藉由抽吸、活體組織切片（例如，細針或組織活體組織切片）、拭子（例如，口腔、鼻、皮膚或陰道拭子）、刮擦、手術、洗滌或灌洗（例如，支氣管肺泡、導管、鼻、眼、口腔、子宮、陰道或其他洗滌或灌洗）來獲得生物組織或樣品。在一些實施方式中，生物樣品係或包含獲得自個體的細胞。在一些實施方式中，樣品係藉由任何適當方法直接獲得自目的來源的「初級樣品」。在一些實施方式中，如上下文可以清楚地看出，術語「樣品」係指藉由處理初級樣品（例如，藉由去除初級樣品的一種或多種組分和/或藉由向初級樣品中添加一種或多種試劑）而獲得的製備物。例如，使用半透膜進行過濾。這種「經處理的樣品」可以包含例如核酸或蛋白，該核酸或蛋白提取自樣品或藉由使初級樣品經受如擴增或核酸的反轉錄、分離和/或某些組分的純化等一種或多種技術而獲得。
受試者：如本文所用，術語「受試者」或「測試受試者」係指任何生物體，根據本揭露向該生物體施用所提供的化合物（例如，所提供的寡核苷酸）或組成物，例如用於實驗、診斷、預防和/或治療目的。典型的受試者包括動物（例如，哺乳動物，如小鼠、大鼠、兔、非人靈長動物和人；昆蟲；蠕蟲；等）和植物。在一些實施方式中，受試者係人。在一些實施方式中，受試者可能患有和/或易患疾病、障礙和/或病症。
基本上：如在此所使用，術語「基本上」係指展示出一個所感興趣的特徵或特性的總體的或接近總體的範圍或程度的定性的狀態。與第二序列基本上互補的鹼基序列與第二序列不相同，但與第二序列在大部分相同或幾乎相同。此外，生物和/或化學領域的普通技術人員應當理解的是生物學和化學現象（如果有的話）很少會達到完成和/或進行到完成或實現或避免一個絕對的結果。因此，術語「基本上」被用在此處用來獲得在許多生物學和/或化學現象中潛在地缺少的內在的完全性。
糖：術語「糖」係指以封閉和/或開放形式的單糖或多糖。在一些實施方式中，糖係單糖。在一些實施方式中，糖係多糖。糖包括但不限於核糖、去氧核糖、戊呋喃糖、戊哌喃糖、和己哌喃糖部分。如本文所用，術語「糖」還涵蓋用於代替常規糖分子的結構類似物，如二醇、形成核酸類似物的骨架的聚合物、二醇核酸（「GNA」）等。如本文所用，術語「糖」還涵蓋用於代替天然核苷酸或天然存在的核苷酸的結構類似物，如修飾的糖和核苷酸糖。在一些實施方式中，糖係RNA或DNA糖（核糖或去氧核糖）。在一些實施方式中，糖係修飾的核糖或去氧核糖，例如2'-修飾的，5'-修飾的等。如本文所述，在一些實施方式中，當用於寡核苷酸和/或核酸時，修飾的糖可以提供一種或多種所需的特性、活性等。在一些實施方式中，糖係視需要經取代的核糖或去氧核糖。在一些實施方式中，「糖」係指寡核苷酸或核酸中的糖單元。
易患：「易患」疾病、障礙和/或病症的個體係比一般公眾成員具有更高的發展疾病、障礙和/或病症的風險的個體。在一些實施方式中，易患疾病、障礙和/或病症的個體預先傾向於患有該疾病、障礙和/或病症。在一些實施方式中，易患疾病、障礙和/或病症的個體可以未被診斷出患有該疾病、障礙和/或病症。在一些實施方式中，易患疾病、障礙和/或病症的個體可以表現出該疾病、障礙和/或病症的症狀。在一些實施方式中，易患疾病、障礙和/或病症的個體可以不表現出該疾病、障礙和/或病症的症狀。在一些實施方式中，易患疾病、障礙、和/或病症的個體將會發展該疾病、障礙、和/或病症。在一些實施方式中，易患疾病、障礙、和/或病症的個體將不會發展該疾病、障礙、和/或病症。
治療劑：如本文所用，術語「治療劑」通常是指當施用於受試者時引起期望的作用（例如，期望的生物學、臨床或藥理作用）的任何藥劑。在一些實施方式中，如果藥劑在整個合適群體中表現出統計學上顯著的作用，則認為該藥劑係治療劑。在一些實施方式中，合適的人群係患有和/或易患疾病、障礙或病症的受試者的群體。在一些實施方式中，合適的群體係模型生物的群體。在一些實施方式中，可以藉由一種或多種標準來定義合適的群體，該標準例如年齡組、性別、遺傳背景、在接受療法之前預先存在的臨床病症。在一些實施方式中，當以有效量向受試者施用時，治療劑係減輕以下，改善以下，緩解以下，抑制以下，預防以下，延遲以下的發作，降低以下的嚴重性和/或降低以下的發生率的物質：受試者中的疾病、障礙和/或病症的一種或多種症狀或特徵。在一些實施方式中，「治療劑」係在可以被銷售施用於人之前已經或需要被政府機構批准的藥劑。在一些實施方式中，「治療劑」係需要藥物處方才能施用於人的藥劑。在一些實施方式中，治療劑係提供的化合物，例如提供的寡核苷酸。
治療有效量：如本文所用，術語「治療有效量」意指當作為治療方案的一部分施用時引發所希望的生物反應的物質（例如，治療劑、組成物和/或配製物）的量。在一些實施方式中，物質的治療有效量係當施用於患有或易患疾病、障礙、和/或病症的受試者時，足以治療、診斷、預防、和/或延遲疾病、障礙、和/或病症的發作的量。如熟悉該項技術者將理解，物質的有效量可取決於以下這類因素變化：如所希望的生物學終點、待遞送的物質、靶細胞或組織等。例如，用於治療疾病、障礙、和/或病症的配製物中化合物的有效量係緩解、改善、減輕、抑制、預防、延遲疾病、障礙、和/或病症的一種或多種症狀或特徵的發作，降低疾病、障礙、和/或病症的一種或多種症狀或特徵的嚴重程度，和/或降低疾病、障礙、和/或病症的一種或多種症狀或特徵的發病率的量。在一些實施方式中，以單個劑量施用治療有效量；在一些實施方式中，需要多個單位劑量來遞送治療有效量。
治療：如本文所用，術語「治療（treat、treatment、或treating）」係指用於部分地或完全緩解、改善、減輕、抑制、預防、延遲疾病、障礙、和/或病症的一種或多種症狀或特徵的發作，降低疾病、障礙、和/或病症的一種或多種症狀或特徵的嚴重程度，和/或降低疾病、障礙、和/或病症的一種或多種症狀或特徵的發生率的任何方法。治療可以施用於未表現出疾病、障礙、和/或病症的跡象的受試者。在一些實施方式中，治療可以施用給僅表現出疾病、障礙、和/或病症的早期跡象的受試者，例如出於降低與疾病、障礙、和/或病症相關的病理學風險的目的。
不飽和的：如本文所用，術語「不飽和的」意指具有一個或多個不飽和單元的部分。
野生型：如本文所用，術語「野生型」具有其本領域理解的含義，其係指具有如在「正常」（與突變體、患病、改變等對比）狀態或背景中在自然界中發現的結構和/或活性的實體。熟悉該項技術者將理解，野生型基因和多肽通常以多種不同形式（例如，等位基因）存在。
如熟悉該項技術者將理解的，本文描述的涉及提供的化合物（例如寡核苷酸）之方法和組成物通常也適用於此類化合物的藥學上可接受的鹽。
某些實施方式的描述
寡核苷酸係用於多種應用的有用工具。例如，MAPT寡核苷酸可用於治療、診斷和研究應用，包括治療多種與MAPT相關的病症、障礙和疾病，包括但不限於阿茲海默氏症（AD）和額顳葉失智（FTD）。天然產生的核酸（例如，未修飾的DNA或RNA）的使用受到限制，例如由於其對核酸內切酶及核酸外切酶的易感性而受到限制。這樣，已經開發了各種合成的對應物來規避該等缺點和/或進一步改善各種特性和活性。該等合成對應物包括含有化學修飾的合成寡核苷酸，該化學修飾例如鹼基修飾、糖修飾、骨架修飾等，其尤其使得該等分子不太容易降解且改善了寡核苷酸的其他特性和/或活性。從結構的角度來看，對核苷酸間鍵聯的修飾會引入手性，並且某些特性可能會受到寡核苷酸的鍵聯磷原子構型的影響。例如，骨架鍵聯磷原子的手性尤其會影響結合親和力、與互補RNA的序列特異性結合、對核酸酶的穩定性、靶核酸的切割、遞送、藥物動力學等。
在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸包含與MAPT基因組序列或其轉錄物（例如，mRNA（例如，前-mRNA、剪接後mRNA等）的10個或更多個（例如，10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20或更多個）連續鹼基完全或基本上相同或者完全或基本上互補的序列。在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸包含與MAPT轉錄物的10個或更多個（例如，10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20或更多個）連續鹼基完全互補的序列。在一些實施方式中，連續鹼基的數目為約15-20。在一些實施方式中，連續鹼基的數目為約20。在一些實施方式中，靶向MAPT的寡核苷酸可以與MAPT轉錄物（例如，前mRNA、RNA等）雜交，並且可以降低MAPT轉錄物和/或由MAPT轉錄物編碼的蛋白的程度。
在一些實施方式中，本揭露提供了如本文（例如，在表中）揭露的MAPT寡核苷酸。在一些實施方式中，本揭露提供了具有本文（例如，在表中）揭露的鹼基序列的MAPT寡核苷酸，或其包含10個（例如，10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20或更多個）連續鹼基的部分，其中MAPT寡核苷酸係立體隨機的或非手性受控的，並且其中每個T可以獨立地被U取代，並且反之亦然。
在一些實施方式中，寡核苷酸的核苷酸間鍵聯包含1-5、1-10、1-15、1-20、1-25、1-30、1-40、1-50、或1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20或更多個手性受控的核苷酸間鍵聯或由其組成。在一些實施方式中，本揭露提供了MAPT寡核苷酸組成物，其中MAPT寡核苷酸包含至少一個手性受控的核苷酸間鍵聯。在一些實施方式中，本揭露提供了MAPT寡核苷酸組成物，其中MAPT寡核苷酸係立體隨機的或非手性受控的。在一些實施方式中，在MAPT寡核苷酸中，至少一個核苷酸間鍵聯係立體隨機的，並且至少一個核苷酸間鍵聯係手性受控的。
在一些實施方式中，寡核苷酸的核苷酸間鍵聯包含一個或多個帶負電荷的核苷酸間鍵聯（例如，硫代磷酸酯核苷酸間鍵聯，天然磷酸酯鍵聯等）或由其組成。在一些實施方式中，本揭露關於MAPT寡核苷酸，其包含如本揭露中所述之至少一個中性或非負電荷核苷酸間鍵聯。 MAPT
在一些實施方式中，MAPT係指來自任何物種的基因或其基因產物（包括但不限於核酸，包括但不限於DNA或RNA、轉錄物、由此編碼的蛋白；可以來自任何形式的MAPT，例如，野生型或突變等位），其可以被稱為：MAPT、TAU、MSTD、PPND、DDPAC、MAPTL、MTBT1、MTBT2、FTDP-17、或PPP1R103。在一些實施方式中，MAPT係指人類中的基因及其產物。在一些實施方式中，MAPT係指非人靈長類動物中的基因及其產物。來自人、小鼠、大鼠、猴等的多種MAPT序列，包括其變體，對於熟悉該項技術者而言係容易獲得的。在一些實施方式中，MAPT係人或小鼠MAPT，其係野生型或突變體。據報導，MAPT可以具有許多功能。還已經報導了多種技術，例如測定、細胞、動物模型等，並且可以用於根據本揭露對所提供的技術（例如寡核苷酸、組成物、方法等）進行表徵和/或評估。
在一些實施方式中，MAPT基因、轉錄物（例如，剪接之前或之後的mRNA）或蛋白變體或同種型包含突變。在一些實施方式中，MAPT基因、轉錄物或蛋白係或剪接的變體或同種型的轉錄或翻譯產物。
與MAPT相關的病症、障礙或疾病
據報導多種病症、障礙或疾病都與MAPT有關。通常，如果MAPT和/或其產物（例如，轉錄物、編碼的蛋白等）的存在、程度、活性和/或形式與疾病、障礙或病症的發生率和/或易感性相關（例如，在相關群體中），則疾病、障礙、或病症與MAPT相關。在一些實施方式中，可以藉由降低MAPT轉錄物和/或蛋白的表現、程度和/或活性來治療和/或預防與MAPT相關的病症、障礙或疾病。
報導了與MAPT相關的多種病症、障礙或疾病。在一些實施方式中，與MAPT相關的病症、障礙或疾病係阿茲海默氏症（AD）。在一些實施方式中，與MAPT相關的病症、障礙或疾病係額顳葉失智（FTD）。
除其他事項外，所提供的技術可用於治療或預防與MAPT相關的病症、障礙或疾病（例如，阿茲海默氏症（AD）、額顳葉失智（FTD）等）。在一些實施方式中，本揭露關於MAPT寡核苷酸或其組成物在治療與MAPT相關的障礙、疾病或病症（例如，阿茲海默氏症（AD）、額顳葉失智（FTD）等）中的用途。
阿爾茨海默症協會（Alzheimer's Association）報告稱，據估計，年齡在65歲或65歲以上的人中有十分之一患有AD，在美國有將近600萬人患有這種疾病。據報導，AD導致認知能力的進行性喪失，獨立性的喪失以及最終死亡。據報導AD的特徵在於，細胞外澱粉樣斑塊以及tau聚集體的細胞內積累。除AD外，據報導tau還參與額顳葉失智（FTD）的病理生理學。據報導，FTD係一組異質性障礙，在100,000名個體中約有20名患者的患病率。據報導，FTD的特徵在於額葉、顳葉和其他皮質區域以及基底神經節、丘腦和其他區域的變性，並且在大約一半的病例中與Tau病理學有關。據報導，與tau病理學相關的FTD亞型包括以神經精神症狀為特徵的行為變異型FTD（bvFTD）、以單詞輸出減少和喚詞困難為特徵的非流利變異型原發性進行性失語（nfvPPA），有時還包括運動綜合症（包括皮質基底節變性（CBD）和原發性進行性失語（PSP）。還據報導，與主要影響老年人的AD相反，FTD通常出現在較早的年齡，因此比AD更可能影響仍在工作的個體，並且像AD一樣最終係致命的。
儘管不希望受到任何理論的束縛，但應指出，根據某些報告，遺傳和組織學證據（在遺傳和散發性疾病中）證明tau在引起AD和FTD病理、致殘和死亡中的重要性。儘管在某些情況下，據報導MAPT對AD本身並不是全基因組範圍內重要的，但據報導，對於共用AD/PD風險而言，MAPT對全基因組範圍內係重要的（Desikan等人，2015）。據報導，MAPT已被明確證明係FTD形式的病因，其潛在的tau病理學主要基於家庭遺傳學研究（Greaves和Rohrer，2019）。在某些情況下，據報導tau病理學已經非常完善。
據報導，Tau係一種神經元支架蛋白，在疾病狀態下，它在細胞內聚集形成神經原纖維纏結（NFT），據報導這係定義AD病理的關鍵。據報導，Tau病理可經由朊病毒樣機制從一個神經元擴散到另一個神經元，NFT通常在海馬體、內嗅皮層以及新腦皮層III和V層的錐體神經元中發現，而中間神經元不受影響（Braak等人，2016）。此外，據報導，從AD腦中分離出來的tau注射到齧齒動物的腦中後會致病（Goedert等人，2017）。
在一些實施方式中，所提供的技術（例如，寡核苷酸、組成物、方法等）降低了tau轉錄物和由此編碼的蛋白的表現、程度、功能和/或活性。在一些實施方式中，這樣的降低解決了細胞內聚集。在一些實施方式中，這樣的降低解決了tau擴散。在一些實施方式中，這種降低解決了細胞內聚集和tau擴散。
在一些實施方式中，本揭露提供了用於降低tau蛋白的程度、功能和/或活性之方法，該方法包括使該蛋白與本揭露的寡核苷酸或組成物接觸。在一些實施方式中，本發明提供了用於降低tau細胞內聚集之方法，該方法包括使蛋白與本揭露的寡核苷酸或組成物接觸。在一些實施方式中，本揭露提供了用於降低tau擴散之方法，該方法包括使蛋白與本揭露的寡核苷酸或組成物接觸。在一些實施方式中，本揭露提供了用於降低tau細胞內聚集和擴散之方法，該方法包括使該蛋白與本揭露的寡核苷酸或組成物接觸。在一些實施方式中，本揭露提供了一種用於降低系統中tau蛋白的程度、功能和/或活性之方法，該方法包括向系統施用有效量的本揭露的寡核苷酸或組成物。在一些實施方式中，本揭露提供了一種用於降低系統中tau細胞內聚集之方法，該方法包括向系統施用有效量的本揭露的寡核苷酸或組成物。在一些實施方式中，本揭露提供了種用於降低系統中tau擴散之方法，該方法包括向系統施用有效量的本揭露的寡核苷酸或組成物。在一些實施方式中，本揭露提供了一種用於降低系統中tau細胞內聚集和擴散之方法，該方法包括向系統施用有效量的本揭露的寡核苷酸或組成物。在一些實施方式中，系統係體外的。在一些實施方式中，系統係體內的。在一些實施方式中，系統係或包含細胞。在一些實施方式中，系統係或包含組織。在一些實施方式中，系統係或包含器官。在一些實施方式中，系統係或包含樣品。在一些實施方式中，系統係或包含受試者。在一些實施方式中，系統係或包含小鼠。在一些實施方式中，系統係或包含非人靈長類動物。在一些實施方式中，系統係或包含人。
在一些實施方式中，用所提供的技術進行的治療或預防降低了tau生產的速率，並且減少或停止或逆轉了聚集體的積累和進一步擴散。在一些實施方式中，用所提供的技術進行的治療或預防降低了病症、障礙或疾病的臨床衰退的速度、或延遲或預防了發作。
如熟悉該項技術者所理解的，可以根據本揭露來利用這種病症、障礙或疾病的機制、基因型、症狀、生物標記等，以表徵/評估所提供的技術。
寡核苷酸
尤其是，本揭露提供了各種設計的寡核苷酸，其可包含本揭露中描述的各種核鹼基及其模式、糖及其模式、核苷酸間鍵聯及其模式和/或其他化學部分及其模式。在一些實施方式中，所提供的MAPT寡核苷酸可指導MAPT基因和/或其一種或多種產物（例如，轉錄物，mRNA，蛋白等）的表現、程度和/或活性降低。在一些實施方式中，所提供的MAPT寡核苷酸可指導受試者或患者的細胞中MAPT基因和/或其一種或多種產物的表現、程度和/或活性降低。在一些實施方式中，細胞通常表現MAPT或產生MAPT蛋白。在一些實施方式中，所提供的MAPT寡核苷酸可以指導MAPT靶基因或基因產物的表現、程度和/或活性的降低，並且具有以下鹼基序列，該鹼基序列由本文揭露的MAPT寡核苷酸的鹼基序列組成、包含本文揭露的MAPT寡核苷酸的鹼基序列、或包含本文揭露的MAPT寡核苷酸的鹼基序列的一部分（例如，序列段為10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20或更多個連續鹼基），其中每個T可以獨立地被U取代，並且反之亦然，並且該寡核苷酸包含鹼基、糖和/或核苷酸間鍵聯的至少一種非天然存在的修飾。
在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸可指導靶基因例如MAPT靶基因或其產物的表現、程度和/或活性降低。在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸可以藉由RNA酶H介導的敲低來指導MAPT靶基因或其產物的表現、程度和/或活性的降低。在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸可藉由在結合MAPT靶基因mRNA後在空間上阻斷翻譯和/或藉由改變或干擾mRNA拼接來指導MAPT靶基因或其產物的表現、程度和/或活性降低。然而，無論如何，本揭露不限於任何特定機制。在一些實施方式中，本揭露提供了能夠藉由雙股RNA干擾，單股RNA干擾，RNA酶H介導的敲低，翻譯的空間位阻或兩個或多個這樣的機制的組合操作的寡核苷酸、組成物、方法等。
在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸能夠介導MAPT的表現、程度和/或活性降低。在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸能夠介導tau蛋白的程度降低。在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸能夠介導tau蛋白的程度降低。在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸能夠介導tau聚集（例如在神經元中）的程度降低。在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸能夠介導tau擴散（例如從一個神經元到另一個）的程度降低。
在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸能夠藉由涉及MAPT mRNA的mRNA降解和/或翻譯位阻的機制來介導MAPT的表現、程度和/或活性的降低。
在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸能夠介導多於一個MAPT等位基因的表現、程度和/或活性降低。
在一些實施方式中，本揭露關於治療與MAPT相關的疾病、障礙或病症（其中MAPT過表現）之方法，該方法包括施用治療有效量的能夠介導MAPT的表現、程度和/或活性降低的MAPT寡核苷酸的步驟。在一些實施方式中，可以存在MAPT的多種形式（例如等位基因），並且所提供的技術可以降低兩種或更多種或所有形式和其產物的表現、程度和/或活性。
在一些實施方式中，本揭露關於治療與MAPT相關的疾病、障礙或病症之方法，該方法包括施用治療量的能夠介導MAPT的表現、程度和/或活性降低的MAPT寡核苷酸的步驟。
在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸能夠經由涉及剪接調節（例如外顯子跳讀）的機制介導MAPT的表現、程度和/或活性降低。
在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸包含例如在表中描述的結構元件或其一部分。在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸包含本文所述之鹼基序列（或其一部分）（其中每個T可以獨立地被U取代，並且反之亦然），化學修飾或化學修飾模式（或其一部分）和/或本文所述之形式或其一部分。在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸具有包含該鹼基序列（或其一部分）的鹼基序列（其中每個T可以獨立地被U取代），化學修飾模式（或其一部分）和/或本文中所揭露的（例如在表中，或本文中所描述的）寡核苷酸的形式。在一些實施方式中，這樣的寡核苷酸，例如MAPT寡核苷酸降低了基因例如MAPT基因或其基因產物的表現、程度和/或活性。
尤其是，MAPT寡核苷酸可以與它們的靶核酸（例如，mRNA先質，成熟mRNA等）雜交。例如，在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸可以與衍生自DNA股（MAPT基因的任一股）的MAPT核酸雜交。在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸可與MAPT轉錄物雜交。在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸可與處於任何RNA加工階段的MAPT核酸雜交，包括但不限於mRNA先質或成熟mRNA。在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸可與MAPT核酸或其互補序列的任何元件雜交，包括但不限於：啟動子區域、增強子區域、轉錄終止區域、翻譯起始信號、翻譯終止信號、編碼區域、非編碼區域、外顯子、內含子、內含子/外顯子或外顯子/內含子連接，5'UTR或3'UTR。在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸可以與跟其具有不超過2個錯配的靶雜交。在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸可以與跟其具有不超過一個錯配的靶雜交。在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸可以與其不具有錯配（例如，當所有C-G和/或A-T/U鹼基配對時）的靶雜交。
在一些實施方式中，寡核苷酸可與兩個或更多個轉錄物變體雜交。在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸可與兩個或更多個或所有MAPT轉錄物變體雜交。在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸可與衍生自有義股的兩個或更多個或所有MAPT轉錄物變體雜交。
在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸的MAPT靶係並非mRNA的MAPT RNA。
在一些實施方式中，寡核苷酸（例如MAPT寡核苷酸）含有增加程度的一種或多種同位素。在一些實施方式中，寡核苷酸（例如MAPT寡核苷酸）例如經一種或多種元素（例如氫、碳、氮等）的一種或多種同位素進行標記。在一些實施方式中，所提供的組成物中的寡核苷酸（例如MAPT寡核苷酸）（例如，多種組成物的寡核苷酸）包含鹼基修飾、糖修飾和/或核苷酸間鍵聯修飾，其中該等寡核苷酸含有富集程度的氘。在一些實施方式中，寡核苷酸（例如MAPT寡核苷酸）在一個或多個位置處經氘標記（用-2 H替換-1 H）。在一些實施方式中，寡核苷酸鏈或與該寡核苷酸鏈軛合的任何部分（例如靶向部分等）的一個或多個1 H經2 H取代。此類寡核苷酸可用於本文所述之組成物和方法中。
在一些實施方式中，本揭露提供了包含多種寡核苷酸的寡核苷酸組成物，該等寡核苷酸： 1) 具有與轉錄物中的靶序列（例如，MAPT靶序列）互補的共同的鹼基序列；以及 2) 包含一個或多個修飾的糖部分和/或修飾的核苷酸間鍵聯。
在一些實施方式中，具有共同的鹼基序列的MAPT寡核苷酸可以具有相同的核苷修飾（例如糖修飾、鹼基修飾等）模式。在一些實施方式中，核苷修飾模式可以由位置和修飾的組合表示。在一些實施方式中，骨架鍵聯模式包含每個核苷酸間鍵聯的位置和類型（例如磷酸酯、硫代磷酸酯、經取代的硫代磷酸酯等）。
在一些實施方式中，例如在提供的組成物中的多個寡核苷酸係相同的寡核苷酸類型。在一些實施方式中，一種寡核苷酸類型的寡核苷酸具有共同的糖修飾模式。在一些實施方式中，一種寡核苷酸類型的寡核苷酸具有共同的鹼基修飾模式。在一些實施方式中，一種寡核苷酸類型的寡核苷酸具有共同的核苷修飾模式。在一些實施方式中，一種寡核苷酸類型的寡核苷酸具有相同的構造。在一些實施方式中，一種寡核苷酸類型的寡核苷酸係相同的。在一些實施方式中，多個寡核苷酸係相同的。在一些實施方式中，多個寡核苷酸共用相同的構造。
在一些實施方式中，如本文所舉例說明的，MAPT寡核苷酸，係手性受控的，包含一個或多個手性受控的核苷酸間鍵聯。在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸係立體化學純的。在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸與其他立體異構物基本上分開。
在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸包含一個或多個修飾的核鹼基、一個或多個修飾的糖和/或一個或多個修飾的核苷酸間鍵聯。
在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸包含一個或多個修飾的糖。在一些實施方式中，本揭露的寡核苷酸包含一個或多個修飾的核鹼基。根據本揭露，可以將各種修飾引入糖和/或核鹼基。例如，在一些實施方式中，修飾係US 9006198中描述的修飾。在一些實施方式中，修飾係描述於US 9394333、US 9744183、US 9605019、US 9598458、US 9982257、US 10160969、US 10479995、US 2020/0056173、US 2018/0216107、US 2019/0127733、US 10450568、US 2019/0077817、US 2019/0249173、US 2019/0375774、 WO 2018/223056、WO 2018/223073、WO 2018/223081、WO 2018/237194、WO 2019/032607、WO 2019/055951、WO 2019/075357、WO 2019/200185、WO 2019/217784、WO 2019/032612和/或WO 2020/191252中的修飾，其各自的糖、鹼基和核苷酸間鍵聯修飾藉由引用獨立地併入本文。
如本揭露中使用的，在一些實施方式中，「一個或多個」係1-200、1-150、1-100、1-90、1-80、1-70、1-60、1-50、1-40、1-30、或1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、或25。在一些實施方式中，「一個或多個」係一個。在一些實施方式中，「一個或多個」係兩個。在一些實施方式中，「一個或多個」係三個。在一些實施方式中，「一個或多個」係四個。在一些實施方式中，「一個或多個」係五個。在一些實施方式中，「一個或多個」係六個。在一些實施方式中，「一個或多個」係七個。在一些實施方式中，「一個或多個」係八個。在一些實施方式中，「一個或多個」係九個。在一些實施方式中，「一個或多個」係十個。在一些實施方式中，「一個或多個」係至少一個。在一些實施方式中，「一個或多個」係至少兩個。在一些實施方式中，「一個或多個」係至少三個。在一些實施方式中，「一個或多個」係至少四個。在一些實施方式中，「一個或多個」係至少五個。在一些實施方式中，「一個或多個」係至少六個。在一些實施方式中，「一個或多個」係至少七個。在一些實施方式中，「一個或多個」係至少八個。在一些實施方式中，「一個或多個」係至少九個。在一些實施方式中，「一個或多個」係至少十個。
如本揭露中使用的，在一些實施方式中，「至少一個」係1-200、1-150、1-100、1-90、1-80、1-70、1-60、1-50、1-40、1-30、或1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、或25。在一些實施方式中，「至少一個」係一個。在一些實施方式中，「至少一個」係兩個。在一些實施方式中，「至少一個」係三個。在一些實施方式中，「至少一個」係四個。在一些實施方式中，「至少一個」係五個。在一些實施方式中，「至少一個」係六個。在一些實施方式中，「至少一個」係七個。在一些實施方式中，「至少一個」係八個。在一些實施方式中，「至少一個」係九個。在一些實施方式中，「至少一個」係十個。
在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸係或包含表中描述的MAPT寡核苷酸。
如本揭露中所證明的，在一些實施方式中，所提供的寡核苷酸（例如，MAPT寡核苷酸）的特徵在於，當它與敲低系統中的轉錄物接觸時，其靶的敲低（例如，MAPT寡核苷酸的MAPT轉錄物。
在一些實施方式中，寡核苷酸以鹽形式提供。在一些實施方式中，寡核苷酸以鹽的形式提供，該鹽包含作為鹽形式存在的帶負電荷的核苷酸間鍵聯（例如，硫代磷酸酯核苷酸間鍵聯，天然磷酸酯鍵聯等）。在一些實施方式中，寡核苷酸以藥學上可接受的鹽的形式提供。在一些實施方式中，寡核苷酸以金屬鹽的形式提供。在一些實施方式中，寡核苷酸以鈉鹽形式提供。在一些實施方式中，寡核苷酸以金屬鹽例如鈉鹽的形式提供，其中每個帶負電荷的核苷酸間鍵聯獨立地為鹽形式（例如針對鈉鹽，對於硫代磷酸酯核苷酸間鍵聯係-O-P(O)(SNa)-O-，對於天然磷酸酯鍵聯係-O-P(O)(ONa)-O-，等）。
鹼基序列
在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸包含本文所述之鹼基序列或其具有0-5（例如0、1、2、3、4或5）個錯配的部分（例如5-50、5-40、5-30、5-20、或5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、或至少10、至少15個連續鹼基的序列段），其中每個T可以獨立地被U取代，並且反之亦然。在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸包含本文所述之鹼基序列或其部分，其中一部分的序列段係至少10個連續核鹼基或具有1-5個錯配的至少15個連續核鹼基。在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸包含本文所述之鹼基序列或其一部分，其中一部分的序列段係至少10個連續核鹼基或具有1-5個錯配的至少10個連續核鹼基，其中每個T可以獨立地被U取代，並且反之亦然。在一些實施方式中，寡核苷酸的鹼基序列包含以下或由以下組成：與MAPT基因或其轉錄物（例如，mRNA）（例如，在內含子中，例如內含子11）的鹼基序列相同或互補的鹼基序列的10-50個（例如，約或至少10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、30、35、40、45個；在一些實施方式中，至少15個；在一些實施方式中，至少16個；在一些實施方式中，至少17個；在一些實施方式中，至少18個；在一些實施方式中，至少19個；在一些實施方式中，至少20個；在一些實施方式中，至少21個；在一些實施方式中，至少22個；在一些實施方式中，至少23個；在一些實施方式中，至少24個；在一些實施方式中，至少25個）連續鹼基。
如熟悉該項技術者所理解的，MAPT寡核苷酸的鹼基序列通常具有足夠的長度和與其靶例如RNA轉錄物（例如，前-mRNA，成熟的mRNA等）的互補性，以介導靶特異性的敲低。在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸的鹼基序列具有充分長度及與MAPT轉錄物靶的同一性，以介導靶特定性敲低。在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸與MAPT轉錄物（MAPT轉錄物靶序列）的一部分互補。在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸的鹼基序列與表中揭露的寡核苷酸的鹼基序列具有90%或更多的同一性，其中每個T可以獨立地被U取代，並且反之亦然。在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸的鹼基序列與表中揭露的寡核苷酸的鹼基序列具有95%或更多的同一性，其中每個T可以獨立地被U取代，並且反之亦然。在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸的鹼基序列包含表中揭露的寡核苷酸的15個或更多個鹼基的連續序列段，其中每個T可以獨立地被U取代，並且反之亦然，除了該序列段內的一個或多個鹼基係無鹼基的（例如，鹼基在核苷酸中不存在）。在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸的鹼基序列包含本文揭露的MAPT寡核苷酸的19個或更多個鹼基的連續序列段，除了該序列段內的一個或多個鹼基係無鹼基的（例如，鹼基在核苷酸中不存在）。在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸的鹼基序列包含本文揭露的寡核苷酸的19個或更多個鹼基的連續序列段，其中每個T可以獨立地被U取代，並且反之亦然，除了在鹼基序列的5'端和/或3'端的1個或2個鹼基的差異之外。
在一些實施方式中，寡核苷酸的鹼基序列係如下序列，包含以下序列，或包含以下序列10-20個，例如10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20個連續鹼基：ACGTTGCAGTGTTCCACUAU、ACTATCCTCCTTCAGCUCCU、AGTGTTCCACTATCCUCCUU、ATCCTCCTTCAGCTCCUGCA、CACGTTGCAGTGTTCCACUA、CACTATCCTCCTTCAGCUCC、CAGTGTTCCACTATCCUCCU、CCACGTTGCAGTGTTCCACU、CCACTATCCTCCTTCAGCUC、CGTTGCAGTGTTCCACUAUC、CTATCCTCCTTCAGCUCCUG、GCAGTGTTCCACTATCCUCC、GTGTTCCACTATCCTCCUUC、GTTCCACTATCCTCCUUCAG、GUGUUCCACTATCCTCCTTC、TATCCTCCTTCAGCTCCUGC、TCCACTATCCTCCTTCAGCU、TGCAGTGTTCCACTAUCCUC、TGTTCCACTATCCTCCUUCA、TTCCACTATCCTCCTUCAGC、或TTGCAGTGTTCCACTAUCCU，其中每個T可以獨立地被U替換，並且反之亦然。在一些實施方式中，寡核苷酸的鹼基序列係或包含這樣的序列，其中每個T可以獨立地被U替換，並且反之亦然。在一些實施方式中，寡核苷酸的鹼基序列係這樣的序列，其中每個T可以獨立地被U替換，並且反之亦然。在一些實施方式中，寡核苷酸的鹼基序列係如下序列，包含以下序列，或包含以下序列10-20個，例如10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20個連續鹼基：ACGTTGCAGTGTTCCACUAU、ACTATCCTCCTTCAGCUCCU、AGTGTTCCACTATCCUCCUU、ATCCTCCTTCAGCTCCUGCA、CACGTTGCAGTGTTCCACUA、CACTATCCTCCTTCAGCUCC、CAGTGTTCCACTATCCUCCU、CCACGTTGCAGTGTTCCACU、CCACTATCCTCCTTCAGCUC、CGTTGCAGTGTTCCACUAUC、CTATCCTCCTTCAGCUCCUG、GCAGTGTTCCACTATCCUCC、GTGTTCCACTATCCTCCUUC、GTTCCACTATCCTCCUUCAG、GUGUUCCACTATCCTCCTTC、TATCCTCCTTCAGCTCCUGC、TCCACTATCCTCCTTCAGCU、TGCAGTGTTCCACTAUCCUC、TGTTCCACTATCCTCCUUCA、TTCCACTATCCTCCTUCAGC、或TTGCAGTGTTCCACTAUCCU。在一些實施方式中，寡核苷酸的鹼基序列係或包含這樣的序列。在一些實施方式中，寡核苷酸的鹼基序列係這樣的序列。
在一些實施方式中，寡核苷酸的鹼基序列係如下序列，包含以下序列，或包含以下序列的10-20個，例如10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20個連續鹼基：GTGTTCCACTATCCTCCUUC，其中每個T可以獨立地被U替換，並且反之亦然。在一些實施方式中，寡核苷酸的鹼基序列係或包含GTGTTCCACTATCCTCCUUC，其中每個T可以獨立地被U替換，並且反之亦然。在一些實施方式中，寡核苷酸的鹼基序列係GTGTTCCACTATCCTCCUUC，其中每個T可以獨立地被U替換，並且反之亦然。在一些實施方式中，寡核苷酸的鹼基序列係如下序列，包含以下序列，或包含以下序列的10-20個，例如10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20個連續鹼基：GTGTTCCACTATCCTCCUUC。在一些實施方式中，寡核苷酸的鹼基序列係或包含GTGTTCCACTATCCTCCUUC。在一些實施方式中，寡核苷酸的鹼基序列係GTGTTCCACTATCCTCCUUC。
在一些實施方式中，本揭露關於具有鹼基序列的寡核苷酸，該鹼基序列包含本文揭露的任何寡核苷酸的鹼基序列，其中每個T可以獨立地被U替換，並且反之亦然。
在一些實施方式中，本揭露關於具有鹼基序列的寡核苷酸，該鹼基序列包含本文揭露的任何寡核苷酸的鹼基序列的至少15個連續鹼基，其中每個T可以獨立地被U替換，並且反之亦然。
在一些實施方式中，本揭露關於具有與本文揭露的任何寡核苷酸的鹼基序列至少90%相同的鹼基序列的寡核苷酸，其中每個T可以獨立地被U替換，並且反之亦然。
在一些實施方式中，本揭露關於具有與本文揭露的任何寡核苷酸的鹼基序列至少95%相同的鹼基序列的寡核苷酸，其中每個T可以獨立地被U替換，並且反之亦然。
在一些實施方式中，寡核苷酸的鹼基序列係如下序列，包含以下序列，或包含以下序列的10-20個，例如10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20個連續鹼基：本文所述之任何寡核苷酸的鹼基序列，其中每個T可以獨立地被U替換，並且反之亦然。
在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸選自表1。
在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸的鹼基序列與MAPT轉錄物或其部分的鹼基序列互補。
在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸的鹼基序列與MAPT核酸序列的一部分（例如MAPT基因序列、MAPT轉錄物、MAPT mRNA序列等）互補。在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸與MAPT核酸序列的一部分（例如MAPT基因序列、MAPT轉錄物、MAPT mRNA序列等）相同。在一些實施方式中，一部分係或包含10或更多個，例如10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20或更多個連續核鹼基。在一些實施方式中，一部分係約15個或更多個。在一些實施方式中，一部分係約16個或更多個。在一些實施方式中，一部分係約17個或更多個。在一些實施方式中，一部分係約18個或更多個。在一些實施方式中，一部分係約19個或更多個。在一些實施方式中，一部分係約20個或更多個。在一些實施方式中，這樣的部分的鹼基序列係MAPT的特徵，因為系統中沒有其他基因組或轉錄物序列含有與該部分相同的序列。在一些實施方式中，系統中沒有其他基因組或轉錄物序列含有以不超過1個核鹼基的區別不同於這樣的部分的序列。在一些實施方式中，系統中沒有其他基因組或轉錄物序列含有以不超過2個核鹼基的區別不同於這樣的部分的序列。在一些實施方式中，與寡核苷酸互補的基因的一部分被稱為寡核苷酸的靶序列。在一些實施方式中，系統係或包含細胞、樣品、組織、器官或物種。例如，對於靶向人MAPT的寡核苷酸，在許多實施方式中相關物種係人。在一些實施方式中，例如當表徵和/或評估跨物種的活性和/或特性時，系統可以是或包括多個物種。在一些實施方式中，這樣的部分在外顯子中。在一些實施方式中，這樣的部分在內含子中。在一些實施方式中，這樣的部分在內含子11中。在一些實施方式中，這樣的部分跨內含子和外顯子。在一些實施方式中，這樣的部分跨兩個外顯子。在一些實施方式中，這樣的部分在5’-UTR區域中。在一些實施方式中，這樣的部分在3’-UTR區域中。
在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸靶向MAPT的兩個或更多個或所有等位基因（如果在相關系統中存在多個等位基因）。在一些實施方式中，寡核苷酸降低野生型MAPT和突變型MAPT和/或其轉錄物和/或產物的表現、程度和/或活性。
在一些實施方式中，所提供的寡核苷酸的鹼基序列與人和非人靈長類（NHP）MAPT靶序列兩者都完全互補。在一些實施方式中，這樣的序列可能特別有用，因為它們可以在人和非人靈長類動物中容易地評估。
在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸包含表中所述之鹼基序列或其一部分（其中每個T可以獨立地被U替換，並且反之亦然），和/或表中所述之糖、核鹼基和/或核苷酸間鍵聯修飾和/或其模式，和/或表中所述之另外的化學部分（除了寡核苷酸鏈之外，還有例如，靶部分、脂質部分、碳水化合物部分等）。
在一些實施方式中，如熟悉該項技術者從使用的上下文中將理解，就寡核苷酸（例如，MAPT寡核苷酸）鹼基序列和靶序列（例如，MAPT靶序列）之間的鹼基匹配而言，可以使用術語「互補」、「完全互補」和「基本上互補」。作為非限制性實例，如果靶序列具有例如5’-GCAUAGCGAGCGAGGGAAAAC-3’的鹼基序列，則具有5’GUUUUCCCUCGCUCGCUAUGC-3’的鹼基序列的寡核苷酸與此靶序列互補（完全互補）。應注意，用U取代T或反過來通常都不會改變互補的量。如本文所用，與靶序列「基本上互補」的寡核苷酸在很大程度上或大部分係互補的，但不是100%互補的。在一些實施方式中，當與靶序列比對時，基本互補的序列（例如，MAPT寡核苷酸）具有1、2、3、4或5個錯配。在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸具有與MAPT靶序列基本互補的鹼基序列。在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸具有與本文揭露的MAPT寡核苷酸的序列的互補序列基本互補的鹼基序列。如熟悉該項技術者所理解的，在一些實施方式中，對於寡核苷酸執行其功能（例如，敲低靶核酸），寡核苷酸的序列不需要與其靶100%互補。通常，當確定互補性時，A和T（或U）係互補核鹼基，而C和G係互補核鹼基。
在一些實施方式中，本揭露提供了MAPT寡核苷酸，其包含在表中描述的寡核苷酸中發現的序列。在一些實施方式中，本揭露提供了MAPT寡核苷酸，其包含在表中描述的寡核苷酸中發現的序列，其中一個或多個U獨立地並且視需要被T替換，或反之亦然。在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸可包含至少一個T和/或至少一個U。在一些實施方式中，本揭露提供了MAPT寡核苷酸，其包含在表中描述的寡核苷酸中發現的序列，其中所述序列與表中描述的寡核苷酸序列具有超過50%的同一性。在一些實施方式中，本揭露提供了MAPT寡核苷酸，其包含表中揭露的寡核苷酸的序列。在一些實施方式中，本揭露提供了MAPT寡核苷酸，該MAPT寡核苷酸的鹼基序列係表中揭露的寡核苷酸的序列，其中每個T可以獨立地被U替換，並且反之亦然。在一些實施方式中，本揭露提供了包含在表中的寡核苷酸中發現的序列的MAPT寡核苷酸，其中該寡核苷酸具有本文表中的相同寡核苷酸或另一種寡核苷酸的骨架鍵聯模式、骨架手性中心模式和/或骨架磷修飾模式。
除其他事項外，本揭露在表1A和其他地方提出了多種寡核苷酸，每個寡核苷酸具有確定的鹼基序列。在一些實施方式中，本揭露，本揭露提供了寡核苷酸，該寡核苷酸的鹼基序列係本文揭露的寡核苷酸的鹼基序列（例如，在表中，例如，在本文的表1中，其中每個T可以獨立地被U替換，並且反之亦然），包含本文揭露的寡核苷酸的鹼基序列，包含本文揭露的寡核苷酸的鹼基序列的一部分。在一些實施方式中，本揭露提供了具有鹼基序列的寡核苷酸，該鹼基序列係本文揭露的寡核苷酸的鹼基序列（例如，在表中，其中每個T可以獨立地被U替換，並且反之亦然），包含本文揭露的寡核苷酸的鹼基序列，包含本文揭露的寡核苷酸的鹼基序列的一部分，其中該寡核苷酸進一步包含化學修飾、立體化學、形式，本文所述之另外的化學部分（例如，靶向部分、脂質部分、碳水化合物部分等）和/或另一結構特徵。
在一些實施方式中，「一部分」（例如鹼基序列或修飾模式的一部分）係至少5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20個單體單元長（例如，對於一個鹼基序列，至少5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20個鹼基長）。在一些實施方式中，鹼基序列的「一部分」係至少5個鹼基長。在一些實施方式中，鹼基序列的「一部分」係至少10個鹼基長。在一些實施方式中，鹼基序列的「一部分」係至少15個鹼基長。在一些實施方式中，鹼基序列的「一部分」係至少16、17、18、19或20個鹼基長。在一些實施方式中，鹼基序列的「一部分」係至少20個鹼基長。在一些實施方式中，鹼基序列的一部分係10、11、12、13、14、15、16、17、18、19個或更多個相連（連續）鹼基。在一些實施方式中，鹼基序列的一部分係15個或更多個相連（連續）鹼基。在一些實施方式中，鹼基序列的一部分係16、17、18、19或20個或更多個相連（連續）鹼基。在一些實施方式中，鹼基序列的一部分係20個或更多個相連（連續）鹼基。
在一些實施方式中，本揭露提供了寡核苷酸（例如MAPT寡核苷酸），該寡核苷酸的鹼基序列係表中揭露的寡核苷酸的序列或其一部分，其中每個T可以獨立地被U替換，並且反之亦然。在一些實施方式中，本揭露提供具有表中寡核苷酸的序列的MAPT寡核苷酸，其中該寡核苷酸能夠指導MAPT基因或其基因產物的表現、程度和/或活性的降低。如熟悉該項技術者所理解的，在提供的鹼基序列中，每個U可以視需要且獨立地被T替換，或反之亦然，並且序列可以包含U和T的混合物。在一些實施方式中，C可以視需要和獨立地替換為5mC。
在一些實施方式中，一部分係至少15、16、17、18、19、20、21、22、23、24或25個總核苷酸的序列段。在一些實施方式中，一部分係具有0至3個錯配的至少15、16、17、18、19、20、21、22、23、24或25個總核苷酸的序列段。在一些實施方式中，一部分係具有0至3個錯配的至少15、16、17、18、19、20、21、22、23、24或25個總核苷酸的序列段，其中具有0個錯配的序列段係互補的，且具有1個或更多個錯配的序列段係實質上互補的非限制性實例。在一些實施方式中，鹼基構成核酸（例如基因）的特徵部分，其中該部分與核酸的一部分或其轉錄物相同或互補，而與同一基因組中的任何其他核酸（例如基因）或其轉錄物的一部分不相同或不互補。在一些實施方式中，一部分係人MAPT的特徵。
在一些實施方式中，如本文所述，提供的寡核苷酸，例如MAPT寡核苷酸的長度不超過約49、45、40、30、35、25或23個總核苷酸。在本文所述序列以5'端處的U或T開始的一些實施方式中，U可缺失和/或經另一鹼基替換。在一些實施方式中，寡核苷酸具有以下鹼基序列，該鹼基序列係表中寡核苷酸的鹼基序列，或包含表中寡核苷酸的鹼基序列或包含表中寡核苷酸的鹼基序列的一部分，其中每個T可以獨立地被U替換，並且反之亦然，其具有本文揭露的形式或本文揭露的形式的一部分。
在一些實施方式中，寡核苷酸，例如MAPT寡核苷酸係立體隨機的。在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸係手性受控的。在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸，係手性純的（或「立體異構物」，「立體化學純的」），其中寡核苷酸以單一立體異構物形式存在（在許多情況下是單一非鏡像異構（或「非鏡像異構物」））形式，因為寡核苷酸中可以存在多個手性中心，例如在鍵聯磷，糖碳等處）。如熟悉該項技術者所理解的，手性純的寡核苷酸與它的其他立體異構形式分離（其程度係，可能存在一些雜質，因為化學和生物過程、選擇性和/或純化等，很少（如果有的話）達到絕對完全性）。在手性純的寡核苷酸中，每個手性中心就其構型而言係獨立地定義的（對於手性純的寡核苷酸，每個核苷酸間鍵聯係獨立地立體定義或手性受控的）。與包含立體定義的鍵聯磷的手性受控和手性純的寡核苷酸相反，包含手性鍵聯磷的「外消旋」（或「立體隨機」，「非手性受控」）的寡核苷酸（例如，來自傳統的亞磷醯胺寡核苷酸合成，其中在偶聯步驟中無立體化學控制並與傳統的硫化作用組合（形成立體隨機的硫代磷酸酯核苷酸間鍵聯）指各種立體異構物（通常是非鏡像異構物（或「非鏡像異構物體」）的隨機混合物，因為在寡核苷酸中有多個手性中心；例如，來自使用除了核苷和鍵聯磷中的手性元素不含手性元素的試劑進行傳統的寡核苷酸的製備）。例如，對於其中*係硫代磷酸酯核苷酸間鍵聯（其包含手性鍵聯磷）的A*A*A，外消旋寡核苷酸製劑包括四個非鏡像異構物[22 = 4，考慮到兩個手性鍵聯磷，它們各自可以兩種構型（Sp或Rp）之一存在]：A *S A *S A、A *S A *R A、A *R A *S A和A *R A *R A，其中*S代表Sp硫代磷酸酯核苷酸間鍵聯，*R代表Rp硫代磷酸酯核苷酸間鍵聯。對於手性純的寡核苷酸，例如A *S A *S A，它以單一的立體異構形式存在，並且與其他立體異構物（例如，非鏡像異構物A *S A *R A、A *R A *S A和A *R A *R A）分開。
在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸，包含1、2、3、4、5、6、7、8、9、10或更多個立體隨機核苷酸間鍵聯（在核苷酸鹼鍵聯處的Rp和Sp鍵聯磷的混合物，例如來自傳統的非手性受控的寡核苷酸合成）。在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸，包含一個或多個（例如1-50、1-40、1-30、1-25、1-20、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25個或更多個）手性受控的核苷酸間鍵聯（在核苷酸鹼鍵聯處的Rp或Sp鍵聯磷，例如來自手性受控的寡核苷酸合成）。在一些實施方式中，核苷酸間鍵聯係硫代磷酸酯核苷酸間鍵聯。在一些實施方式中，核苷酸間鍵聯係立體隨機硫代磷酸酯核苷酸間鍵聯。在一些實施方式中，核苷酸間鍵聯係手性受控的硫代磷酸酯核苷酸間鍵聯。
除其他事項外，本揭露提供了用於製備手性受控的（在一些實施方式中，為立體化學純的）寡核苷酸的技術。在一些實施方式中，寡核苷酸係立體化學純的。在一些實施方式中，本揭露的寡核苷酸係約5%-100%、10%-100%、20%-100%、30%-100%、40%-100%、50%-100%、60%-100%、70%-100%、80-100%、90-100%、95-100%、50%-90%，或約5%、10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%或100%，或至少約5%、10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%或99%純的。在一些實施方式中，寡核苷酸的核苷酸間鍵聯包含以下或由以下組成：一個或多個（例如，1-50、1-40、1-30、1-25、1-20、5-50、5-40、5-30、5-25、5-20、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25個或更多個）手性核苷酸間鍵聯，其中的每個獨立地具有至少80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或99.5%，典型地至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或99.5%的非鏡像異構物純度。在一些實施方式中，本揭露的寡核苷酸，例如MAPT寡核苷酸，具有(DS)CIL 的非鏡像異構物純度，其中DS係如本揭露中所述之非鏡像異構物純度（例如90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或99.5%或更高），並且CIL係手性受控的核苷酸間鍵聯的數目（例如1-50、1-40、1-30、1-25、1-20、5-50、5-40、5-30、5-25、5-20、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25個或更多個）。在一些實施方式中，DS係95%-100%。在一些實施方式中，每個核苷酸間鍵聯獨立地是手性受控的，並且CIL係手性受控的核苷酸間鍵聯的數量。
作為實例，以下表1A和表1B中列出了某些MAPT寡核苷酸，其包含某些實例鹼基序列，核鹼基修飾及其模式，糖修飾及其模式，核苷酸間鍵聯及其模式，鍵聯磷立體化學及其模式，連接子和/或另外的化學部分。其中，寡核苷酸，例如表1A中的那些，可用於靶向MAPT轉錄物，例如降低MAPT轉錄物和/或其產物的程度。 [表1A]. 實例MAPT寡核苷酸/組成物。
ID 經修飾的序列 鹼基序列 立體化學/鍵聯
WV-14104 m5Ceo*m5CeoGeo*Teo*Teo*T*T*C*T*T*A*C*C*Aeo*m5Ceom5Ceo*m5Ceo*Teo CCGTTTTCTTACCACCCT XOXXXXXXXXXXXXOXX
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WV-30991 m5Ceo*Sm5CeoAeom5CeoTeo*SA*ST*SC*RC*ST*SC*RC*ST*ST*SC*SmA*SmG*SmC*SmU*SmC CCACTATCCTCCTTCAGCUC SOOOSSSRSSRSSSSSSSS
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WV-31012 Geo*STeoGeoTeoTeo*SC*SC*RA*RC*ST*SA*RT*SC*SC*ST*SmC*SmC*SmU*SmU*SmC GTGTTCCACTATCCTCCUUC SOOOSSRRSSRSSSSSSSS
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WV-31022 Geo*Sm5CeoAeoGeoTeo*SG*ST*ST*SC*RC*SA*SC*ST*RA*ST*SmC*SmC*SmU*SmC*SmC GCAGTGTTCCACTATCCUCC SOOOSSSSRSSSRSSSSSS
WV-31023 Geo*Sm5CeoAeoGeoTeo*SG*ST*RT*SC*SC*RA*SC*ST*RA*ST*SmC*SmC*SmU*SmC*SmC GCAGTGTTCCACTATCCUCC SOOOSSRSSRSSRSSSSSS
WV-31024 Geo*Sm5CeoAeoGeoTeo*SG*ST*RT*SC*RC*SA*SC*ST*RA*ST*SmC*SmC*SmU*SmC*SmC GCAGTGTTCCACTATCCUCC SOOOSSRSRSSSRSSSSSS
WV-31025 Teo*SGeom5CeoAeoGeo*ST*SG*ST*ST*SC*RC*SA*SC*RT*SA*SmU*SmC*SmC*SmU*SmC TGCAGTGTTCCACTAUCCUC SOOOSSSSSRSSRSSSSSS
WV-31026 Teo*SGeom5CeoAeoGeo*ST*SG*ST*RT*SC*SC*RA*SC*ST*SA*SmU*SmC*SmC*SmU*SmC TGCAGTGTTCCACTAUCCUC SOOOSSSRSSRSSSSSSSS
WV-31027 Teo*SGeom5CeoAeoGeo*ST*SG*RT*ST*SC*RC*SA*SC*RT*SA*SmU*SmC*SmC*SmU*SmC TGCAGTGTTCCACTAUCCUC SOOOSSRSSRSSRSSSSSS
WV-31028 Teo*SGeom5CeoAeoGeo*ST*SG*RT*RT*SC*SC*RA*SC*ST*SA*SmU*SmC*SmC*SmU*SmC TGCAGTGTTCCACTAUCCUC SOOOSSRRSSRSSSSSSSS
WV-31029 Teo*STeoGeom5CeoAeo*SG*ST*SG*ST*ST*RC*SC*SA*RC*ST*SmA*SmU*SmC*SmC*SmU TTGCAGTGTTCCACTAUCCU SOOOSSSSSRSSRSSSSSS
WV-31030 Teo*STeoGeom5CeoAeo*SG*ST*SG*RT*ST*SC*SC*RA*SC*ST*SmA*SmU*SmC*SmC*SmU TTGCAGTGTTCCACTAUCCU SOOOSSSRSSSRSSSSSSS
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WV-33068 Teo*STeon001RGeom5Ceon001RAeo*SG*ST*SG*RT*ST*SC*SC*RA*SC*ST*SmA*SmU*SmC*SmC*SmU TTGCAGTGTTCCACTAUCCU SnROnRSSSRSSSRSSSSSSS
WV-33069 Teo*STeon001RGeom5Ceon001RAeo*SG*ST*RG*ST*ST*RC*SC*SA*RC*ST*SmA*SmU*SmC*SmC*SmU TTGCAGTGTTCCACTAUCCU SnROnRSSRSSRSSRSSSSSS
WV-33070 Teo*STeon001RGeom5Ceon001RAeo*SG*ST*RG*RT*ST*SC*SC*RA*SC*ST*SmA*SmU*SmC*SmC*SmU TTGCAGTGTTCCACTAUCCU SnROnRSSRRSSSRSSSSSSS
WV-33071 Geo*STeon001RTeoGeon001Rm5Ceo*SA*SG*ST*SG*RT*ST*SC*SC*RA*SC*SmU*SmA*SmU*SmC*SmC GTTGCAGTGTTCCACUAUCC SnROnRSSSSRSSSRSSSSSS
WV-33072 Geo*STeon001RTeoGeon001Rm5Ceo*SA*SG*ST*SG*RT*ST*SC*RC*SA*SC*SmU*SmA*SmU*SmC*SmC GTTGCAGTGTTCCACUAUCC SnROnRSSSSRSSRSSSSSSS
WV-33073 Geo*STeon001RTeoGeon001Rm5Ceo*SA*SG*RT*SG*RT*ST*SC*SC*RA*SC*SmU*SmA*SmU*SmC*SmC GTTGCAGTGTTCCACUAUCC SnROnRSSRSRSSSRSSSSSS
WV-33074 Geo*STeon001RTeoGeon001Rm5Ceo*SA*SG*RT*SG*RT*ST*SC*RC*SA*SC*SmU*SmA*SmU*SmC*SmC GTTGCAGTGTTCCACUAUCC SnROnRSSRSRSSRSSSSSSS
WV-33075 m5Ceo*SGeon001RTeoTeon001RGeo*SC*SA*SG*ST*SG*RT*ST*SC*RC*SA*SmC*SmU*SmA*SmU*SmC CGTTGCAGTGTTCCACUAUC SnROnRSSSSSRSSRSSSSSS
WV-33076 m5Ceo*SGeon001RTeoTeon001RGeo*SC*SA*SG*ST*RG*ST*ST*RC*SC*SA*SmC*SmU*SmA*SmU*SmC CGTTGCAGTGTTCCACUAUC SnROnRSSSSRSSRSSSSSSS
WV-33077 m5Ceo*SGeon001RTeoTeon001RGeo*SC*SA*RG*ST*SG*RT*ST*SC*RC*SA*SmC*SmU*SmA*SmU*SmC CGTTGCAGTGTTCCACUAUC SnROnRSSRSSRSSRSSSSSS
WV-33078 m5Ceo*SGeon001RTeoTeon001RGeo*SC*SA*RG*ST*RG*ST*ST*RC*SC*SA*SmC*SmU*SmA*SmU*SmC CGTTGCAGTGTTCCACUAUC SnROnRSSRSRSSRSSSSSSS
WV-33079 Aeo*Sm5Ceon001RGeoTeon001RTeo*SG*SC*SA*SG*ST*RG*ST*ST*RC*SC*SmA*SmC*SmU*SmA*SmU ACGTTGCAGTGTTCCACUAU SnROnRSSSSSRSSRSSSSSS
WV-33080 Aeo*Sm5Ceon001RGeoTeon001RTeo*SG*SC*SA*RG*ST*SG*RT*ST*SC*SC*SmA*SmC*SmU*SmA*SmU ACGTTGCAGTGTTCCACUAU SnROnRSSSRSSRSSSSSSSS
WV-33081 Aeo*Sm5Ceon001RGeoTeon001RTeo*SG*SC*RA*SG*ST*RG*ST*ST*RC*SC*SmA*SmC*SmU*SmA*SmU ACGTTGCAGTGTTCCACUAU SnROnRSSRSSRSSRSSSSSS
WV-33082 Aeo*Sm5Ceon001RGeoTeon001RTeo*SG*SC*RA*RG*ST*SG*RT*ST*SC*SC*SmA*SmC*SmU*SmA*SmU ACGTTGCAGTGTTCCACUAU SnROnRSSRRSSRSSSSSSSS
WV-33083 m5Ceo*SAeon001Rm5CeoGeon001RTeo*ST*SG*SC*SA*SG*RT*SG*ST*RT*SC*SmC*SmA*SmC*SmU*SmA CACGTTGCAGTGTTCCACUA SnROnRSSSSSRSSRSSSSSS
WV-33084 m5Ceo*SAeon001Rm5CeoGeon001RTeo*ST*SG*SC*SA*RG*ST*SG*RT*ST*SC*SmC*SmA*SmC*SmU*SmA CACGTTGCAGTGTTCCACUA SnROnRSSSSRSSRSSSSSSS
WV-33085 m5Ceo*SAeon001Rm5CeoGeon001RTeo*ST*SG*RC*SA*SG*RT*SG*ST*RT*SC*SmC*SmA*SmC*SmU*SmA CACGTTGCAGTGTTCCACUA SnROnRSSRSSRSSRSSSSSS
WV-33086 m5Ceo*SAeon001Rm5CeoGeon001RTeo*ST*SG*RC*SA*RG*ST*SG*RT*ST*SC*SmC*SmA*SmC*SmU*SmA CACGTTGCAGTGTTCCACUA SnROnRSSRSRSSRSSSSSSS
WV-33087 m5Ceo*Sm5Ceon001RAeom5Ceon001RGeo*ST*ST*SG*RC*SA*SG*ST*SG*RT*ST*SmC*SmC*SmA*SmC*SmU CCACGTTGCAGTGTTCCACU SnROnRSSSRSSSSRSSSSSS
WV-33088 m5Ceo*Sm5Ceon001RAeom5Ceon001RGeo*ST*ST*SG*SC*SA*RG*ST*SG*RT*ST*SmC*SmC*SmA*SmC*SmU CCACGTTGCAGTGTTCCACU SnROnRSSSSSRSSRSSSSSS
WV-33089 m5Ceo*Sm5Ceon001RAeom5Ceon001RGeo*ST*ST*RG*RC*SA*SG*ST*SG*RT*ST*SmC*SmC*SmA*SmC*SmU CCACGTTGCAGTGTTCCACU SnROnRSSRRSSSSRSSSSSS
WV-33090 m5Ceo*Sm5Ceon001RAeom5Ceon001RGeo*ST*ST*RG*SC*SA*RG*ST*SG*RT*ST*SmC*SmC*SmA*SmC*SmU CCACGTTGCAGTGTTCCACU SnROnRSSRSSRSSRSSSSSS
WV-36875 Geo*STeon001RGeoTeon001RTeo*SC*SC*SA*SC*RT*SA*ST*SC*RC*ST*SmCn001RmC*SmUn001RmU*SmC GTGTTCCACTATCCTCCUUC SnROnRSSSSRSSSRSSnRSnRS
WV-36876 Geo*STeon001RGeoTeon001RTeo*SC*SC*SA*SC*RT*SA*ST*SC*RC*ST*SmCn001RmC*SmU*SmUn001RmC GTGTTCCACTATCCTCCUUC SnROnRSSSSRSSSRSSnRSSnR
WV-36877 Geo*STeon001RGeoTeon001RTeo*SC*SC*SA*SC*RT*SA*ST*SC*RC*ST*SmCn001RmCmUn001RmU*SmC GTGTTCCACTATCCTCCUUC SnROnRSSSSRSSSRSSnROnRS
WV-37299 mG*SmU*SmG*SmU*SmU*SC*SC*SA*SC*RT*SA*ST*SC*RC*ST*Sm5Ceom5CeoTeoTeo*Sm5Ceo GUGUUCCACTATCCTCCTTC SSSSSSSSRSSSRSSOOOS
WV-37300 mG*SmU*SmG*SmU*SmU*SC*SC*SA*SC*RT*SA*ST*SC*RC*ST*Sm5Ceon001Rm5Ceon001RTeon001RTeo*Sm5Ceo GUGUUCCACTATCCTCCTTC SSSSSSSSRSSSRSSnRnRnRS
WV-37301 mG*SmU*SmG*SmU*SmU*SC*SC*SA*SC*RT*SA*ST*SC*RC*ST*Sm5Ceon001Rm5CeoTeon001RTeo*Sm5Ceo GUGUUCCACTATCCTCCTTC SSSSSSSSRSSSRSSnROnRS
WV-37302 mGn001RmU*SmG*SmU*SmU*SC*SC*SA*SC*RT*SA*ST*SC*RC*ST*Sm5Ceon001Rm5CeoTeon001RTeo*Sm5Ceo GUGUUCCACTATCCTCCTTC nRSSSSSSSRSSSRSSnROnRS
WV-37303 mG*SmUn001RmG*SmU*SmU*SC*SC*SA*SC*RT*SA*ST*SC*RC*ST*Sm5Ceon001Rm5CeoTeon001RTeo*Sm5Ceo GUGUUCCACTATCCTCCTTC SnRSSSSSSRSSSRSSnROnRS
WV-37304 mG*SmU*SmGn001RmU*SmU*SC*SC*SA*SC*RT*SA*ST*SC*RC*ST*Sm5Ceon001Rm5CeoTeon001RTeo*Sm5Ceo GUGUUCCACTATCCTCCTTC SSnRSSSSSRSSSRSSnROnRS
WV-37305 mG*SmU*SmG*SmUn001RmU*SC*SC*SA*SC*RT*SA*ST*SC*RC*ST*Sm5Ceon001Rm5CeoTeon001RTeo*Sm5Ceo GUGUUCCACTATCCTCCTTC SSSnRSSSSRSSSRSSnROnRS
WV-37497 Geo*STeom5Ceom5CeoAeo*SC*ST*ST*ST*RC*ST*SG*RA*SC*SA*SmG*SmC*SmU*SmC*SmC GTCCACTTTCTGACAGCUCC SOOOSSSSRSSRSSSSSSS
WV-37498 Geo*STeon001Rm5Ceon001Rm5Ceon001RAeo*SC*ST*ST*ST*RC*ST*SG*RA*SC*SA*SmG*SmC*SmU*SmC*SmC GTCCACTTTCTGACAGCUCC SnRnRnRSSSSRSSRSSSSSSS
WV-37499 Geo*STeon001Rm5Ceom5Ceon001RAeo*SC*ST*ST*ST*RC*ST*SG*RA*SC*SA*SmG*SmC*SmU*SmC*SmC GTCCACTTTCTGACAGCUCC SnROnRSSSSRSSRSSSSSSS
WV-37500 Geo*STeon001Rm5Ceom5Ceon001RAeo*SC*ST*ST*ST*RC*ST*SG*RA*SC*SA*SmGn001RmC*SmU*SmC*SmC GTCCACTTTCTGACAGCUCC SnROnRSSSSRSSRSSSnRSSS
WV-37501 Geo*STeon001Rm5Ceom5Ceon001RAeo*SC*ST*ST*ST*RC*ST*SG*RA*SC*SA*SmG*SmCn001RmU*SmC*SmC GTCCACTTTCTGACAGCUCC SnROnRSSSSRSSRSSSSnRSS
WV-37502 Geo*STeon001Rm5Ceom5Ceon001RAeo*SC*ST*ST*ST*RC*ST*SG*RA*SC*SA*SmG*SmC*SmUn001RmC*SmC GTCCACTTTCTGACAGCUCC SnROnRSSSSRSSRSSSSSnRS
WV-37503 Geo*STeon001Rm5Ceom5Ceon001RAeo*SC*ST*ST*ST*RC*ST*SG*RA*SC*SA*SmG*SmC*SmU*SmCn001RmC GTCCACTTTCTGACAGCUCC SnROnRSSSSRSSRSSSSSSnR
WV-37504 mG*SmU*SmC*SmC*SmA*SC*ST*ST*ST*RC*ST*SG*RA*SC*SA*SGeom5CeoTeom5Ceo*Sm5Ceo GUCCACTTTCTGACAGCTCC SSSSSSSSRSSRSSSOOOS
WV-37505 mG*SmU*SmC*SmC*SmA*SC*ST*ST*ST*RC*ST*SG*RA*SC*SA*SGeon001Rm5Ceon001RTeon001Rm5Ceo*Sm5Ceo GUCCACTTTCTGACAGCTCC SSSSSSSSRSSRSSSnRnRnRS
WV-37506 mG*SmU*SmC*SmC*SmA*SC*ST*ST*ST*RC*ST*SG*RA*SC*SA*SGeon001Rm5CeoTeon001Rm5Ceo*Sm5Ceo GUCCACTTTCTGACAGCTCC SSSSSSSSRSSRSSSnROnRS
WV-37507 mGn001RmU*SmC*SmC*SmA*SC*ST*ST*ST*RC*ST*SG*RA*SC*SA*SGeon001Rm5CeoTeon001Rm5Ceo*Sm5Ceo GUCCACTTTCTGACAGCTCC nRSSSSSSSRSSRSSSnROnRS
WV-37508 mG*SmUn001RmC*SmC*SmA*SC*ST*ST*ST*RC*ST*SG*RA*SC*SA*SGeon001Rm5CeoTeon001Rm5Ceo*Sm5Ceo GUCCACTTTCTGACAGCTCC SnRSSSSSSRSSRSSSnROnRS
WV-37509 mG*SmU*SmCn001RmC*SmA*SC*ST*ST*ST*RC*ST*SG*RA*SC*SA*SGeon001Rm5CeoTeon001Rm5Ceo*Sm5Ceo GUCCACTTTCTGACAGCTCC SSnRSSSSSRSSRSSSnROnRS
WV-37510 mG*SmU*SmC*SmCn001RmA*SC*ST*ST*ST*RC*ST*SG*RA*SC*SA*SGeon001Rm5CeoTeon001Rm5Ceo*Sm5Ceo GUCCACTTTCTGACAGCTCC SSSnRSSSSRSSRSSSnROnRS
WV-37511 Geo*STeom5Ceom5CeoAeo*SC*ST*ST*RT*SC*ST*SG*RA*SC*SA*SmG*SmC*SmU*SmC*SmC GTCCACTTTCTGACAGCUCC SOOOSSSRSSSRSSSSSSS
WV-37512 Geo*STeon001Rm5Ceon001Rm5Ceon001RAeo*SC*ST*ST*RT*SC*ST*SG*RA*SC*SA*SmG*SmC*SmU*SmC*SmC GTCCACTTTCTGACAGCUCC SnRnRnRSSSRSSSRSSSSSSS
WV-37513 Geo*STeon001Rm5Ceom5Ceon001RAeo*SC*ST*ST*RT*SC*ST*SG*RA*SC*SA*SmG*SmC*SmU*SmC*SmC GTCCACTTTCTGACAGCUCC SnROnRSSSRSSSRSSSSSSS
WV-37514 Geo*STeon001Rm5Ceom5Ceon001RAeo*SC*ST*ST*RT*SC*ST*SG*RA*SC*SA*SmGn001RmC*SmU*SmC*SmC GTCCACTTTCTGACAGCUCC SnROnRSSSRSSSRSSSnRSSS
WV-37515 Geo*STeon001Rm5Ceom5Ceon001RAeo*SC*ST*ST*RT*SC*ST*SG*RA*SC*SA*SmG*SmCn001RmU*SmC*SmC GTCCACTTTCTGACAGCUCC SnROnRSSSRSSSRSSSSnRSS
WV-37516 Geo*STeon001Rm5Ceom5Ceon001RAeo*SC*ST*ST*RT*SC*ST*SG*RA*SC*SA*SmG*SmC*SmUn001RmC*SmC GTCCACTTTCTGACAGCUCC SnROnRSSSRSSSRSSSSSnRS
WV-37517 Geo*STeon001Rm5Ceom5Ceon001RAeo*SC*ST*ST*RT*SC*ST*SG*RA*SC*SA*SmG*SmC*SmU*SmCn001RmC GTCCACTTTCTGACAGCUCC SnROnRSSSRSSSRSSSSSSnR
WV-37518 mG*SmU*SmC*SmC*SmA*SC*ST*ST*RT*SC*ST*SG*RA*SC*SA*SGeom5CeoTeom5Ceo*Sm5Ceo GUCCACTTTCTGACAGCTCC SSSSSSSRSSSRSSSOOOS
WV-37519 mG*SmU*SmC*SmC*SmA*SC*ST*ST*RT*SC*ST*SG*RA*SC*SA*SGeon001Rm5Ceon001RTeon001Rm5Ceo*Sm5Ceo GUCCACTTTCTGACAGCTCC SSSSSSSRSSSRSSSnRnRnRS
WV-37520 mG*SmU*SmC*SmC*SmA*SC*ST*ST*RT*SC*ST*SG*RA*SC*SA*SGeon001Rm5CeoTeon001Rm5Ceo*Sm5Ceo GUCCACTTTCTGACAGCTCC SSSSSSSRSSSRSSSnROnRS
WV-37521 mGn001RmU*SmC*SmC*SmA*SC*ST*ST*RT*SC*ST*SG*RA*SC*SA*SGeon001Rm5CeoTeon001Rm5Ceo*Sm5Ceo GUCCACTTTCTGACAGCTCC nRSSSSSSRSSSRSSSnROnRS
WV-37522 mG*SmUn001RmC*SmC*SmA*SC*ST*ST*RT*SC*ST*SG*RA*SC*SA*SGeon001Rm5CeoTeon001Rm5Ceo*Sm5Ceo GUCCACTTTCTGACAGCTCC SnRSSSSSRSSSRSSSnROnRS
WV-37523 mG*SmU*SmCn001RmC*SmA*SC*ST*ST*RT*SC*ST*SG*RA*SC*SA*SGeon001Rm5CeoTeon001Rm5Ceo*Sm5Ceo GUCCACTTTCTGACAGCTCC SSnRSSSSRSSSRSSSnROnRS
WV-37524 mG*SmU*SmC*SmCn001RmA*SC*ST*ST*RT*SC*ST*SG*RA*SC*SA*SGeon001Rm5CeoTeon001Rm5Ceo*Sm5Ceo GUCCACTTTCTGACAGCTCC SSSnRSSSRSSSRSSSnROnRS
WV-38925 Geo*STeon001Rm5Ceom5Ceon001RAeo*SC*ST*ST*ST*RC*ST*SG*RA*SC*SA*SmG*SmCn001RmU*SmCn001RmC GTCCACTTTCTGACAGCUCC SnROnRSSSSRSSRSSSSnRSnR
WV-38926 mGn001RmU*SmCn001RmC*SmA*SC*ST*ST*ST*RC*ST*SG*RA*SC*SA*SGeon001Rm5CeoTeon001Rm5Ceo*Sm5Ceo GUCCACTTTCTGACAGCTCC nRSnRSSSSSRSSRSSSnROnRS
WV-38927 mG*SmUn001RmC*SmCn001RmA*SC*ST*ST*ST*RC*ST*SG*RA*SC*SA*SGeon001Rm5CeoTeon001Rm5Ceo*Sm5Ceo GUCCACTTTCTGACAGCTCC SnRSnRSSSSRSSRSSSnROnRS
WV-38928 Geo*STeon001Rm5Ceom5Ceon001RAeo*SC*ST*ST*RT*SC*ST*SG*RA*SC*SA*SmGn001RmC*SmUn001RmC*SmC GTCCACTTTCTGACAGCUCC SnROnRSSSRSSSRSSSnRSnRS
WV-38929 Geo*STeon001Rm5Ceom5Ceon001RAeo*SC*ST*ST*RT*SC*ST*SG*RA*SC*SA*SmG*SmCn001RmU*SmCn001RmC GTCCACTTTCTGACAGCUCC SnROnRSSSRSSSRSSSSnRSnR
WV-38930 mGn001RmU*SmCn001RmC*SmA*SC*ST*ST*RT*SC*ST*SG*RA*SC*SA*SGeon001Rm5CeoTeon001Rm5Ceo*Sm5Ceo GUCCACTTTCTGACAGCTCC nRSnRSSSSRSSSRSSSnROnRS
WV-38931 mG*SmUn001RmC*SmCn001RmA*SC*ST*ST*RT*SC*ST*SG*RA*SC*SA*SGeon001Rm5CeoTeon001Rm5Ceo*Sm5Ceo GUCCACTTTCTGACAGCTCC SnRSnRSSSRSSSRSSSnROnRS
WV-40376 Geo*STeon001RGeo*STeon001RTeo*SC*SC*SA*SC*RT*SA*ST*SC*RC*ST*SmCn001RmC*SmU*SmU*SmC GTGTTCCACTATCCTCCUUC SnRSnRSSSSRSSSRSSnRSSS
WV-40377 Geo*STeon001Rm5Ceo*Sm5Ceon001RAeo*SC*ST*ST*ST*RC*ST*SG*RA*SC*SA*SmGn001RmC*SmU*SmC*SmC GTCCACTTTCTGACAGCUCC SnRSnRSSSSRSSRSSSnRSSS
WV-40378 Geo*STeon001Rm5Ceo*Sm5Ceon001RAeo*SC*ST*ST*RT*SC*ST*SG*RA*SC*SA*SmGn001RmC*SmU*SmC*SmC GTCCACTTTCTGACAGCUCC SnRSnRSSSRSSSRSSSnRSSS
WV-40379 Geo*STeon001RGeo*STeon001RTeo*SC*SC*SA*SC*RT*SA*ST*SC*RC*ST*SmCn001RmC*SmUn001RmU*SmC GTGTTCCACTATCCTCCUUC SnRSnRSSSSRSSSRSSnRSnRS
WV-40380 Geo*STeon001Rm5Ceo*Sm5Ceon001RAeo*SC*ST*ST*ST*RC*ST*SG*RA*SC*SA*SmGn001RmC*SmUn001RmC*SmC GTCCACTTTCTGACAGCUCC SnRSnRSSSSRSSRSSSnRSnRS
WV-40381 Geo*STeon001Rm5Ceo*Sm5Ceon001RAeo*SC*ST*ST*RT*SC*ST*SG*RA*SC*SA*SmGn001RmC*SmUn001RmC*SmC GTCCACTTTCTGACAGCUCC SnRSnRSSSRSSSRSSSnRSnRS
[表1B]. WV-12891。
ID 基因 經修飾的序列 鹼基序列 立體化學/鍵聯
WV-12891 LUC m5Ceo*m5CeoTeoTeom5Ceo*C*C*T*G*A*A*G*G*T*T*mC*mC*mU*mC*mC CCTTCCCTGAAGGTTCCUCC XOOOXXXXXXXXXXXXXXX
注意事項： 表1A和1B中的描述、鹼基序列和立體化學/鍵聯因其長度而可能分為多行。除非另有說明，否則表1A和1B中的所有寡核苷酸均為單股。如熟悉該項技術者所理解的，除非另有說明（例如，用r、m、m5、eo等修飾），否則核苷單元係未修飾的且含有未修飾的核鹼基和2'-去氧糖；除非另有說明，否則鍵聯係天然的磷酸鍵聯；酸性/鹼性基團獨立地可以鹽的形式存在。寡核苷酸中的部分和修飾（或其他化合物，例如用於製備提供的包含該等部分或修飾的寡核苷酸的那些化合物）： m：2’-OMe； m5：C的5位處的甲基（核鹼基係5-甲基胞嘧啶）； m5Ceo：5-甲基2'-O-甲氧基乙基C； eo：2’-MOE（2’-O-甲氧乙基，2’-OCH2 CH2 OCH3 ）； O、PO：磷酸二酯（磷酸酯）。其可以是端基（或其組分）或鍵聯，例如連接子與寡核苷酸鏈之間的鍵聯、核苷酸間鍵聯（天然磷酸酯鍵聯）等。磷酸二酯通常在立體化學/鍵聯欄中以「O」表示，通常在描述欄中沒有標記（如果它係端基，例如5'端基，則在描述欄中指出，並且通常不在立體化學/鍵聯欄中標記）；如果在描述欄中未指出鍵聯，則除非另有說明，否則其通常是磷酸二酯。注意，連接子（例如，L001）和寡核苷酸鏈之間的磷酸酯鍵聯可能沒有在描述欄中標記，並且在立體化學/鍵聯欄中可能沒有用「O」指出； *、PS：硫代磷酸酯。它可以是端基（如果係端基，例如5'端基，則在說明欄中指出，通常不在立體化學/鍵聯中指出），或鍵聯，例如，連接子（例如，L001）和寡核苷酸鏈之間的鍵聯，核苷酸間鍵聯（硫代磷酸酯核苷酸間鍵聯）等； R、Rp：以Rp構象的硫代磷酸酯。注意，* R（或*R）表示以Rp構象的單個硫代磷酸酯鍵聯； S、Sp：以Sp構象的硫代磷酸酯。注意，* S（或*S）表示以Sp構象的單個硫代磷酸酯鍵聯； X：立體隨機硫代磷酸酯； n001：
Figure 02_image001
； nX立體隨機n001； n001R，nR：以Rp構型的n001； n001S，nS：以Sp構型的n001。
長度
如熟悉該項技術者所理解的，寡核苷酸可以具有各種長度，以為各種用途提供所需的特性和/或活性。用於評估、選擇和/或優化寡核苷酸長度的許多技術在本領域中是可用的，並且可以根據本揭露使用。如本文所述，在許多實施方式中，MAPT寡核苷酸具有合適的長度以與其靶雜交並降低其靶和/或其編碼產物的程度。在一些實施方式中，寡核苷酸足夠長以識別靶核酸（例如，MAPT mRNA）。在一些實施方式中，寡核苷酸足夠長以區分靶核酸和其他核酸（例如，具有不是MAPT的鹼基序列的核酸）以減少脫靶效應。在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸足夠短以降低製造或生產的複雜性並降低產品成本。
在一些實施方式中，寡核苷酸的鹼基序列的長度係約10-500個核鹼基。在一些實施方式中，鹼基序列的長度係約10-500個核鹼基。在一些實施方式中，鹼基序列的長度係約10-50個核鹼基。在一些實施方式中，鹼基序列的長度係約15-50個核鹼基。在一些實施方式中，鹼基序列的長度係約15至約30個核鹼基。在一些實施方式中，鹼基序列的長度係約10至約25個核鹼基。在一些實施方式中，鹼基序列的長度係約15至約22個核鹼基。在一些實施方式中，鹼基序列的長度係約10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24或25個核鹼基。在一些實施方式中，鹼基序列的長度係約18個核鹼基。在一些實施方式中，鹼基序列的長度係約19個核鹼基。在一些實施方式中，鹼基序列的長度係約20個核鹼基。在一些實施方式中，鹼基序列的長度係約21個核鹼基。在一些實施方式中，鹼基序列的長度係約22個核鹼基。在一些實施方式中，鹼基序列的長度係約23個核鹼基。在一些實施方式中，鹼基序列的長度係約24個核鹼基。在一些實施方式中，鹼基序列的長度係約25個核鹼基。在一些實施方式中，每個核鹼基係視需要經取代的A、T、C、G、U，或A、T、C、G或U的視需要經取代的互變異構物。
區域、翼和核心
在一些實施方式中，寡核苷酸，例如MAPT寡核苷酸，包含若干個區域，每個區域獨立地包含一個或多個連續核苷以及視需要一個或多個核苷酸間鍵聯。在一些實施方式中，區域與其相鄰區域的不同之處在於其包含一個或多個與其一個或多個相鄰區域的相應結構特徵不同的結構特徵。示例性結構特徵包括核鹼基修飾及其模式，糖修飾及其模式，核苷酸間鍵聯及其模式（其可以是核苷酸鹼鍵聯類型（例如磷酸酯、硫代磷酸酯、硫代磷酸三酯，中性核苷酸間鍵聯等及其模式），鍵聯磷修飾（骨架磷修飾）及其模式，骨架手性中心（鍵聯磷）立體化學及其模式[例如，手性受控的核苷酸間鍵聯的Rp和/或Sp（順序為5’至3’）視需要非手性受控的核苷酸間鍵聯和/或天然磷酸酯鍵聯（如果有）的組合（例如，OSOOO RSSRS SSSRS SOOOS）]。在一些實施方式中，區域包含在其一個或多個鄰近區域中不存在的化學修飾（例如糖修飾、鹼基修飾、核苷酸間鍵聯或核苷酸間鍵聯的立體化學）。在一些實施方式中，區域缺乏在其一個或多個相鄰區域中存在的化學修飾。
在一些實施方式中，寡核苷酸包含兩個或更多個區域或由其組成。在一些實施方式中，寡核苷酸包含三個或更多個區域或由其組成。在一些實施方式中，寡核苷酸包含兩個相鄰區域或由其組成，其中一個區域被稱為翼區域，另一個區域被稱為核心區。此類寡核苷酸的結構包含翼-核心或核心-翼結構或由其組成。在一些實施方式中，寡核苷酸包含三個相鄰區域或由其組成，其中一個區域側接兩個相鄰區域。在一些實施方式中，將中間區域指定為核心區，並且將每個側接區域指定為翼區域（如果連接至核心的5'端則為5'翼，如果連接至核心的3'端則為3'翼）。此類寡核苷酸的結構包含翼-核心-翼結構或由其組成。
在一些實施方式中，第一區域（例如，翼）與第二區域（例如，核心）的不同之處在於，第一區域包含第二區域中不存在的一個或多個糖修飾或其模式。在一些實施方式中，第一（例如，翼）區域包含第二（例如，核心）區域不存在的一個或多個糖修飾或其模式。在一些實施方式中，糖修飾係2'-修飾。在一些實施方式中，2'-修飾係2'-OR，其中R係視需要經取代的C1-6 脂肪族。在一些實施方式中，2’-修飾係2’-OR，其中R係視需要經取代的C1-6 烷基。在一些實施方式中，2'-修飾係2'-MOE。在一些實施方式中，2'-修飾係2'-OMe。在一些實施方式中，修飾的糖係雙環糖，例如LNA糖。在一些實施方式中，區域中的每個糖被獨立地修飾。在一些實施方式中，區域（例如翼）的每個糖獨立地包含修飾，該修飾可以彼此相同或不同。在一些實施方式中，區域（例如翼）的每個糖包含與本揭露中描述的相同的修飾，例如2’-修飾。在一些實施方式中，區域（例如核心）的糖不被修飾。在一些實施方式中，區域（例如核心）的每個糖係未修飾的DNA糖（在2'-位置具有兩個-H）。在一些實施方式中，提供的寡核苷酸的結構包含翼-核心、核心-翼或翼-核心-翼結構或由其組成，其中每個翼獨立地包含一個或多個糖修飾，並且核心中的每個糖係天然DNA糖（在2'-位置具有兩個-H）。
另外地或可替代地，第一區域（例如，翼）可以包含與另一個區域（例如，核心或另一個翼）不同的一個或多個核苷酸間鍵聯或其模式。在一些實施方式中，區域（例如，翼）包含兩個或更多個連續的天然磷酸酯鍵聯。在一些實施方式中，區域（例如，核心）不包含連續的天然磷酸酯鍵聯。在一些實施方式中，提供的寡核苷酸的結構包含翼-核心、核心-翼或翼-核心-翼結構或由其組成，其中至少一個翼獨立地包含兩個或更多個連續的天然磷酸酯鍵聯，並且該核心不包含連續的天然磷酸酯鍵聯。在一些實施方式中，在翼-核心-翼結構中，每個翼獨立地包含兩個或更多個連續的核苷酸間鍵聯。除非另有說明，出於翼-核心-翼結構的立體化學的目的，在核心中包括連接核心與翼的核苷酸間鍵聯（例如，參見上文）。
在一些實施方式中，區域係5’翼、3’翼或核心。在一些實施方式中，5'翼在寡核苷酸的5'端，3'翼在寡核苷酸的3'端，並且核心在5'翼和3'翼之間，並且寡核苷酸包含翼-核心-翼結構或形式或由其組成。在一些實施方式中，核心包含連續天然DNA糖（2’-去氧核糖）的序列段。在一些實施方式中，核心包含至少5個連續天然DNA糖（2’-去氧核糖）的序列段。在一些實施方式中，核心包含至少10個連續天然DNA糖（2’-去氧核糖）的序列段。在一些實施方式中，核心被稱為缺口。在一些實施方式中，包含翼-核心-翼結構或由其組成的寡核苷酸被描述為缺口體。在一些實施方式中，提供的寡核苷酸的結構包含翼-核心結構或由其組成。在一些實施方式中，提供的寡核苷酸的結構包含核心-翼結構或由其組成。在一些實施方式中，寡核苷酸的結構包含寡核苷酸鏈或由寡核苷酸鏈組成，該寡核苷酸鏈包含翼-核心-翼、翼-核心或翼-核心或由其組成，其中該寡核苷酸鏈視需要藉由如本揭露中描述的連接子與另外的化學部分軛合。在一些實施方式中，本揭露提供了靶向MAPT並具有包含一個或兩個翼和核心，並且包含翼-核心-翼、核心-翼或翼-核心結構或由其組成的寡核苷酸。
據報導，核糖核酸酶H（RNA酶H，例如，RNA酶H1，RNA酶H2等）識別包含RNA和DNA的雜交體的結構（例如，異源雙鏈體），並切割RNA。在一些實施方式中，包含連續天然DNA糖（例如，在核心區中的2’-去氧核糖）的序列段的寡核苷酸能夠與RNA例如mRNA退火以形成異源雙鏈體；並且這種異源雙鏈結構能夠被RNA酶H識別並且RNA被RNA酶H切割。在一些實施方式中，提供的寡核苷酸的核心包含1、2、3、4、5、6、7、8、9、10或更多個連續天然DNA糖，並且該核心能夠特異性地退火至靶轉錄物[例如，MAPT轉錄物（例如，前-mRNA，成熟的mRNA等）]；並且形成的結構能夠被RNA酶H識別並且轉錄物被RNA酶H切割。在一些實施方式中，提供的寡核苷酸的核心包含5個或更多個連續DNA糖。
區域，例如，翼、核心等，可以具有各種合適的長度。在一些實施方式中，區域（例如，翼、核心等）包含1-30個，例如1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25個或更多核鹼基。如本揭露中所述，在一些實施方式中，每個核鹼基獨立地包含視需要經取代的單環、雙環或多環，該環具有至少一個氮環原子；在一些實施方式中，核鹼基各自獨立地是視需要經取代的A、T、C、G或U，或A、T、C、G或U的經取代的互變異構物。在一些實施方式中，翼（例如第一翼、第二翼、5’-翼、3’-翼等）長度為約1-10個，例如約1、2、3、4、5、6、7、8、9、10個核鹼基。在一些實施方式中，翼的長度係1個核鹼基。在一些實施方式中，翼的長度係約2個核鹼基。在一些實施方式中，翼的長度係約3個核鹼基。在一些實施方式中，翼的長度係約4個核鹼基。在一些實施方式中，翼的長度係約5個核鹼基。在一些實施方式中，翼的長度係約6個核鹼基。在一些實施方式中，翼的長度係約7個核鹼基。在一些實施方式中，翼-核心-翼結構的每個翼獨立地具有如本揭露中所描述的長度。在一些實施方式中，兩個翼具有相同的長度。在一些實施方式中，兩個翼的長度不同。在一些實施方式中，核心的長度為約5-25，例如約5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24或25個核鹼基。在一些實施方式中，核心的長度係約1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15或更多個核鹼基。在一些實施方式中，核心的長度係約5個核鹼基。在一些實施方式中，核心的長度係約6個核鹼基。在一些實施方式中，核心的長度係約7個核鹼基。在一些實施方式中，核心的長度係約8個核鹼基。在一些實施方式中，核心的長度係約9個核鹼基。在一些實施方式中，核心的長度係約10個核鹼基。在一些實施方式中，核心的長度係約11個核鹼基。在一些實施方式中，核心的長度係約12個核鹼基。在一些實施方式中，核心的長度係約13個核鹼基。在一些實施方式中，核心的長度係約14個核鹼基。在一些實施方式中，核心的長度係約15個核鹼基。例如，在一些實施方式中，翼-核心-翼具有2-9-6、3-9-3、3-9-4、3-9-5、4-7-4、4- 9-4、4-9-5、4-10-5、4-11-4、4-11-5、5-7-5、5-8-6、5-9-3、5-9-5、5-10-4、5-10-5、6-7-6、6-8-5、或6-9-2。在一些實施方式中，翼-核心-翼係5-10-5。
在一些實施方式中，翼包含一個或多個糖修飾。在一些實施方式中，翼-核心-翼結構的兩個翼包含糖修飾的不同模式或不同的糖修飾（並且寡核苷酸具有或包含「不對稱」形式）。在一些實施方式中，與不存在糖修飾相比，糖修飾提供改善的穩定性和/或退火特性。
在一些實施方式中，第一翼（例如5'-翼）包含一個或多個2’-OR修飾，其中R係視需要經取代的C1-4 脂肪族。在一些實施方式中，第一翼的每個糖包含2’-OR修飾。在一些實施方式中，2’-OR係2’-MOE。在一些實施方式中，第一翼的每個糖包含2’-MOE。
在一些實施方式中，第二翼（例如3'-翼）包含一個或多個2’-OR修飾，其中R係視需要經取代的C1-4 脂肪族。在一些實施方式中，第二翼的每個糖包含2’-OR修飾。在一些實施方式中，2’-OR係2’-OMe。在一些實施方式中，第二翼的每個糖包含2’-OMe。在一些實施方式中，第二翼（例如3’-翼）不共用與第一翼（例如5’-翼）的糖修飾相同的模式。在一些實施方式中，第二翼（例如3’-翼）不含有第一翼（例如5’-翼）的糖修飾。如熟悉該項技術者所理解的，在一些實施方式中，第一翼可以是3’-翼，第二翼可以是5’-翼。
在一些實施方式中，核心包含1-25個，例如1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25個糖，該糖不包含2’-OR基團或該糖不是二環或多環糖。在一些實施方式中，核心包含1-25個，例如1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25個糖，該糖不包含2’-OR基團。在一些實施方式中，核心包含1-25個，例如1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25個糖，該糖包含兩個2’-H。在許多實施方式中，核心不包含2’-OR基團。在許多實施方式中，核心區域中的糖具有兩個2'-H。
在一些實施方式中，某些糖修飾例如2’-MOE在某些條件下比其他糖修飾例如2’-OMe提供更高的穩定性。在一些實施方式中，翼包含2’-MOE修飾。在一些實施方式中，包含嘧啶鹼基（例如，C、U、T等）的翼的每個核苷單元包含2’-MOE修飾。在一些實施方式中，翼的每個糖單元包含2'-MOE修飾。在一些實施方式中，包含嘌呤鹼基（例如，A，G等）的翼的每個核苷單元不包含2'-MOE修飾（例如，每個這樣的核苷單元包含2'-OMe或不包含2'-修飾等）。在一些實施方式中，包含嘌呤鹼基的翼的每個核苷單元包含2'-OMe修飾。在一些實施方式中，在包含2'-MOE修飾的糖單元的3'-位置處的每個核苷酸間鍵聯係天然磷酸酯鍵聯。
在一些實施方式中，翼不包含2'-MOE修飾。在一些實施方式中，翼包含2’-OMe修飾。在一些實施方式中，翼的每個核苷單元獨立地包含2'-OMe修飾。
在一些實施方式中，翼包含雙環糖。在一些實施方式中，每個翼獨立地包含一個或多個雙環糖。
在一些實施方式中，雙環糖係LNA、cEt或BNA糖。
在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸具有翼-核心-翼結構。在一些實施方式中，核心包含1個或更多個天然DNA糖。在一些實施方式中，核心包含5個或更多個連續天然DNA糖。在一些實施方式中，核心包括5-10、5-15、5-20、5-25、5-30或5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15個或更多個視需要係連續的天然DNA糖。在一些實施方式中，核心包含5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15個或更多個連續天然DNA糖。在一些實施方式中，核心包含10個或更多個連續天然DNA糖。在一些實施方式中，核心能夠與靶mRNA雜交，形成RNA酶 H可識別的雙鏈體結構，使得RNA酶 H能夠切割mRNA。
在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸具有翼-核心-翼結構且具有不對稱形式。
在具有不對稱形式的寡核苷酸的一些實施方式中，一個翼在糖修飾或其模式、或骨架核苷酸間鍵聯或其模式、或骨架手性中心或其模式方面不同於另一翼。在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸具有不對稱形式，其中一個翼與另一個翼相比具有不同的糖修飾。在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸，具有不對稱形式，其中一個翼與另一個翼相比包含不同的糖修飾模式。
在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸（或翼、核心、區域、嵌段或其任何部分）可以是或包含描述於以下的修飾、修飾模式、核苷酸間鍵聯、核苷酸間鍵聯模式、手性中心模式、翼、核心、嵌段、區域、和/或形式（包括但不限於不對稱形式）：US 9394333、US 9744183、US 9605019、US 9598458、US 9982257、US 10160969、US 10479995、US 2020/0056173、US 2018/0216107、US 2019/0127733、US 10450568、US 2019/0077817、US 2019/0249173、US 2019/0375774、WO 2018/223056、WO 2018/223073、WO 2018/223081、WO 2018/237194、WO 2019/032607、WO 2019/055951、WO 2019/075357、WO 2019/200185、WO 2019/217784、WO 2019/032612、和/或WO 2020/191252，上述參考文獻的每個的修飾、修飾模式、核苷酸間鍵聯、核苷酸間鍵聯模式、手性中心模式、翼、核心、嵌段、區域、和形式藉由引用獨立地併入本文。
在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸的結構係或包含翼-核心結構。
在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸的結構係或包含翼-核心-翼結構，其中第一翼和第二翼各自獨立地包含至少一個2’-MOE。
在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸的結構係或包含翼-核心-翼結構，其中第一翼和第二翼各自獨立地包含至少一個2’-OMe。
在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸的結構包含不對稱形式或由其組成。在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸的結構包含對稱形式或由其組成。
在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸的結構係或包含不對稱形式，其中寡核苷酸的結構係翼-核心-翼結構，其中第一翼的形式不同於第二翼。在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸的結構係或包含不對稱形式，其中寡核苷酸的結構係翼-核心-翼結構，其中第一和第二翼在糖修飾（或其組合或模式）和/或核苷酸間鍵聯（或其組合或模式）方面不同。在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸的結構係或包含不對稱形式，其中寡核苷酸的結構係翼-核心-翼結構，其中第一和第二翼在糖修飾（或其組合或形式）方面不同。
在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸的結構係或包含翼-核心-翼結構，其中一個翼包含一種類型的糖，且另一個翼包含那一類型和第二類型。
在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸的結構包含核心和至少一個翼，核心包含2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、或更多個連續的2’-去氧核糖。
在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸的結構包含核心和至少一個翼，核心包含至少5個連續的2’-去氧核糖。
在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸的結構包含核心和至少一個翼，核心包含至少6個連續的2’-去氧核糖。
在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸的結構包含核心和至少一個翼，核心包含至少7個連續的2’-去氧核糖。
在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸的結構包含核心和至少一個翼，其中核心包含至少8個連續的2’-去氧核糖。
在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸的結構包含核心和至少一個翼，其中核心包含至少9個連續的2’-去氧核糖。
在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸的結構包含核心和至少一個翼，其中核心包含至少10個連續的2’-去氧核糖。
在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸包含至少三種不同類型的核苷酸間鍵聯。
在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸包含：至少一個天然磷酸酯核苷酸間鍵聯；至少一個硫代磷酸酯；和至少一個中性或非負電荷的核苷酸間鍵聯。
在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸包含：至少一個天然磷酸酯核苷酸間鍵聯；至少一個手性受控的硫代磷酸酯；和至少一個中性或非負電荷的核苷酸間鍵聯。
在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸包含：至少一個天然磷酸酯核苷酸間鍵聯；至少一個硫代磷酸酯；和至少一個中性或非負電荷的手性受控的核苷酸間鍵聯。
在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸包含：至少一個天然磷酸酯核苷酸間鍵聯；至少一個手性受控的硫代磷酸酯；和至少一個中性或非負電荷的手性受控的核苷酸間鍵聯。
在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸的結構包含核心和至少一個翼，其中核心包含至少12個連續的2’-去氧核糖。
在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸的結構包含核心和至少一個翼，其中核心包含至少14個連續的2’-去氧核糖。
在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸的結構係或包含翼-核心-翼結構，其中第一翼和第二翼各自包含至少2種不同類型的糖。
在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸的結構係或包含翼-核心-翼結構，其中第一翼和第二翼各自包含2’-DNA糖（天然2’-去氧核糖）和包含2’-修飾的糖。
在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸的結構係或包含翼-核心-翼結構，其中第一翼和第二翼各自包含2’-DNA糖（天然2’-去氧核糖）和2’-OMe糖。
在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸包含至少一個天然2’-去氧核糖（未修飾的DNA糖）、至少一個LNA糖和至少一個2’-MOE糖。
在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸的結構係或包含翼-核心-翼結構，其中第一翼和第二翼各自包含天然2’-去氧核糖（未修飾的DNA糖）、LNA糖和2’-MOE糖。
在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸包含至少一個天然2’-去氧核糖（未修飾的DNA糖）、至少一個LNA糖和至少一個2’-OMe糖。
在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸的結構係或包含翼-核心-翼結構，其中第一翼和第二翼各自包含天然2’-去氧核糖（未修飾的DNA糖）、LNA糖和2’-OMe糖。
在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸的結構係或包含翼-核心-翼結構，其中第一翼和第二翼各自包含至少3種不同類型的糖（例如，選自未修飾的糖和具有多種修飾的經修飾的糖）。
在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸的結構係或包含翼-核心-翼結構，其中至少一個翼包含一個或多個（1、2、3、4、5、6、7、8、9、或10個）LNA糖。
在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸的結構係或包含翼-核心-翼結構，其中第一翼和第二翼各自包含一個或多個2’-MOE糖和一個或多個LNA糖。
在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸的結構係或包含翼-核心-翼結構，其中第一翼和第二翼各自包含一個或多個LNA糖。
在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸的結構係或包含翼-核心-翼結構，其中一個翼包含一個或多個LNA糖和一個或多個2’-MOE糖，且另一個翼包含一個或多個LNA糖和一個或多個2’-OMe糖。
在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸的結構係或包含翼-核心-翼結構，其中一個翼包含天然2’-去氧核糖（未修飾的DNA糖）、LNA糖、和2’-MOE糖。
在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸的結構係或包含翼-核心-翼結構，其中一個翼包含至少3種不同類型的糖。
在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸的結構係或包含翼-核心-翼結構，其中第一翼和第二翼各自包含天然2’-去氧核糖（未修飾的DNA糖）和至少1個經修飾的糖（與2’-去氧核糖（未修飾的DNA糖）相比）。
在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸的結構係或包含翼-核心-翼結構，其中第一翼和第二翼各自包含天然2’-去氧核糖（未修飾的DNA糖）和至少2個糖修飾。
在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸的結構係或包含翼，其中翼包含至少3種不同類型的糖。
在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸的結構包含翼，其中翼包含至少1個鹼基。
在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸的結構包含翼，其中翼包含至少2個鹼基。。
在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸的結構包含翼，其中翼包含至少3個鹼基。
在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸的結構包含翼，其中翼包含至少4個鹼基。
在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸的結構包含翼，其中翼係5個鹼基。
在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸的結構包含翼，其中翼包含至少6個鹼基。
在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸的結構包含翼，其中翼包含至少7個鹼基。
在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸的結構包含翼，其中翼係8個鹼基。
在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸的結構係或包含翼-核心-翼結構，其中第一翼和第二翼各自包含兩種不同類型的糖。
在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸的結構係或包含翼-核心-翼結構，其中一個翼包含至少一個2’-MOE糖且另一個翼包含至少一個2’-OMe糖。
在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸的結構係或包含翼-核心-翼結構，其中一個翼包含天然2’-去氧核糖（未修飾的DNA糖）和至少一個經修飾的糖。
在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸的結構係或包含翼-核心-翼結構，其中一個翼包含天然2’-去氧核糖（未修飾的DNA糖）和至少兩個經修飾的糖。
在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸可以包含如本文所述或本領域已知的任何第一翼、核心和/或第二翼。
在一些實施方式中，具有係本文揭露的MAPT寡核苷酸序列、包含本文揭露的MAPT寡核苷酸序列或包含本文揭露的MAPT寡核苷酸序列的序列段的鹼基序列的寡核苷酸可包含如本文所述或本領域已知的第一翼、核心和/或第二翼。
核苷酸間鍵聯
在一些實施方式中，寡核苷酸包含鹼基修飾、糖修飾和/或核苷酸間鍵聯修飾。根據本揭露，可以利用各種核苷酸間鍵聯來連接包含核鹼基，例如核苷的單元。在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸包含一個或多個修飾的核苷酸間鍵和一個或多個天然磷酸酯鍵兩者。如熟悉該項技術者所習知的，天然磷酸酯鍵聯廣泛存在於天然DNA和RNA分子中；它們具有-OP(O)(OH)O-的結構，連接DNA和RNA的核苷中的糖，並且可呈各種鹽形式，例如在生理pH值（約7.4）下，天然磷酸酯鍵聯主要是以具有-OP(O)(O- )O-陰離子的鹽形式存在。修飾的核苷酸間鍵聯或非天然磷酸酯鍵聯係不為天然磷酸酯鍵聯或其鹽形式的核苷酸間鍵聯。取決於它們的結構，修飾的核苷酸間鍵聯也可以呈它們的鹽形式。例如，如熟悉該項技術者所理解的，具有-OP(O)(SH)O-結構的硫代磷酸酯核苷酸間鍵聯可以處於各種鹽形式，例如在生理pH下（約7.4），具有-OP(O)(S- )O-陰離子。
在一些實施方式中，寡核苷酸包含核苷酸間鍵聯，該核苷酸間鍵聯係修飾的核苷酸間鍵聯，例如硫代磷酸酯、二硫代磷酸酯、甲基膦酸酯、胺基磷酸酯、硫代磷酸鹽、3’-硫代磷酸鹽或5’-硫代磷酸鹽。
在一些實施方式中，修飾的核苷酸間鍵聯係包含手性鍵聯磷的手性核苷酸間鍵聯。在一些實施方式中，手性核苷酸間鍵聯係硫代磷酸酯鍵聯。在一些實施方式中，手性核苷酸間鍵聯係不帶負電荷的核苷酸間鍵聯。在一些實施方式中，手性核苷酸間鍵聯係中性核苷酸間鍵聯。在一些實施方式中，手性核苷酸間鍵聯就其手性鍵聯磷而言係手性受控的。在一些實施方式中，手性核苷酸間鍵聯就其手性鍵聯磷而言係立體化學純的。在一些實施方式中，手性核苷酸間鍵不是手性受控的。在一些實施方式中，骨架手性中心模式包含以下或由以下組成：手性受控的核苷酸間鍵聯（Rp或Sp）的位置和鍵聯磷構型以及非手性核苷酸間鍵聯（例如天然磷酸酯鍵聯）的位置。
在一些實施方式中，寡核苷酸包含如在以下中描述的經修飾的核苷酸間鍵聯（例如，具有式I、I-a、I-b、或I-c、I-n-1、I-n-2、I-n-3、I-n-4、II、II-a-1、II-a-2、II-b-1、II-b-2、II-c-1、II-c-2、II-d-1、II-d-2等的結構的經修飾的核苷酸間鍵聯，或其鹽形式）：US 9394333、US 9744183、US 9605019、US 9598458、US 9982257、US 10160969、US 10479995、US 2020/0056173、US 2018/0216107、US 2019/0127733、US 10450568、US 2019/0077817、US 2019/0249173、US 2019/0375774、WO 2018/223056、WO 2018/223073、WO 2018/223081、WO 2018/237194、WO 2019/032607、WO 2019/055951、WO 2019/075357、WO 2019/200185、WO 2019/217784、WO 2019/032612、和/或WO 2020/191252，其各自的核苷酸間鍵聯（例如，具有式I、I-a、I-b、或I-c、I-n-1、I-n-2、I-n-3、I-n-4、II、II-a-1、II-a-2、II-b-1、II-b-2、II-c-1、II-c-2、II-d-1、II-d-2等的那些）藉由引用獨立地併入本文。在一些實施方式中，修飾的核苷酸間鍵聯係非負電荷的核苷酸間鍵聯。在一些實施方式中，所提供的寡核苷酸包含一個或多個不帶負電荷的核苷酸間鍵聯。在一些實施方式中，非負電荷的核苷酸間鍵聯係帶正電荷的核苷酸間鍵聯。在一些實施方式中，非負電荷的核苷酸間鍵聯係中性核苷酸間鍵聯。在一些實施方式中，本揭露提供了包含一個或多個中性核苷酸間鍵聯的寡核苷酸。在一些實施方式中，不帶負電荷的核苷酸間鍵聯或中性核苷酸間鍵聯（例如，具有式I-n-1、I-n-2、I-n-3、I-n-4、II、II-a-1、II-a-2、II-b-1、II-b-2、II-c-1、II-c-2、II-d-1、II-d-2等中的一個）如在以下中描述：US 9394333、US 9744183、US 9605019、US 9598458、US 9982257、US 10160969、US 10479995、US 2020/0056173、US 2018/0216107、US 2019/0127733、US 10450568、US 2019/0077817、US 2019/0249173、US 2019/0375774、WO 2018/223056、WO 2018/223073、WO 2018/223081、WO 2018/237194、WO 2019/032607、WO 2019/055951、WO 2019/075357、WO 2019/200185、WO 2019/217784、WO 2019/032612、和/或WO 2020/191252。在一些實施方式中，不帶負電荷的核苷酸間鍵聯或中性核苷酸間鍵聯具有式I-n-1、I-n-2、I-n-3、I-n-4、II、II-a-1、II-a-2、II-b-1、II-b-2、II-c-1、II-c-2、II-d-1、II-d-2等中一個，如在以下中描述：WO 2018/223056、WO 2019/032607、WO 2019/075357、WO 2019/032607、WO 2019/075357、WO 2019/200185、WO 2019/217784、WO 2019/032612和/或WO 2020/191252，其各自的此類核苷酸間鍵聯藉由引用獨立地併入本文。
在一些實施方式中，非負電荷的核苷酸間鍵聯可以改善寡核苷酸的遞送和/或活性（例如，降低靶基因或其基因產物的程度、活性和/或表現的能力）。
在一些實施方式中，修飾的核苷酸間鍵聯（例如，非負電荷的核苷酸間鍵聯）包含視需要經取代的三唑基。在一些實施方式中，修飾的核苷酸間鍵聯（例如，不帶負電荷的核苷酸間鍵聯）包含視需要經取代的炔基。在一些實施方式中，修飾的核苷酸間鍵聯包含三唑或炔烴部分。在一些實施方式中，三唑部分（例如三唑基基團）係視需要經取代的。在一些實施方式中，三唑部分（例如三唑基基團）係經取代的。在一些實施方式中，三唑部分係未經取代的。在一些實施方式中，修飾的核苷酸間鍵包含視需要經取代的環狀胍部分。在一些實施方式中，修飾的核苷酸間鍵包含視需要經取代的環狀胍部分，並且具有以下結構：
Figure 02_image003
、
Figure 02_image005
、或
Figure 02_image007
，其中W係O或S。在一些實施方式中，W係O。在一些實施方式中，W係S。在一些實施方式中，不帶負電荷的核苷酸間鍵聯係立體化學控制的。
在一些實施方式中，非負電荷核苷酸間鍵聯或中性核苷酸間鍵聯係包含三唑部分的核苷酸間鍵聯。在一些實施方式中，非負電荷核苷酸間鍵聯或非負電荷核苷酸間鍵聯包含視需要經取代的三唑基。在一些實施方式中，包含三唑部分（例如，視需要經取代的三唑基）的核苷酸間鍵聯具有結構
Figure 02_image009
。在一些實施方式中，包含三唑部分的核苷酸間鍵聯具有以下結構
Figure 02_image011
。在一些實施方式中，核苷酸間鍵聯，例如非負電荷核苷酸間鍵聯、中性核苷酸間鍵聯，包含環狀胍部分。在一些實施方式中，核苷酸間鍵聯包含具有結構
Figure 02_image013
的環狀胍部分。在一些實施方式中，非負電荷核苷酸間鍵聯或中性核苷酸間鍵聯係或包含選自以下的結構：
Figure 02_image015
、
Figure 02_image017
、
Figure 02_image019
、或
Figure 02_image021
，其中W係O或S。
在一些實施方式中，核苷酸間鍵聯包含Tmg基團（
Figure 02_image023
）。在一些實施方式中，核苷酸間鍵聯包含Tmg基團並具有
Figure 02_image025
的結構（「Tmg核苷酸間鍵聯」）。在一些實施方式中，中性核苷酸間鍵聯包括PNA和PMO的核苷酸間鍵聯以及Tmg核苷酸間鍵聯。
在一些實施方式中，非負電荷的核苷酸間鍵聯包含具有1-10個雜原子的視需要經取代的3-20員雜環基或雜芳基基團。在一些實施方式中，非負電荷的核苷酸間鍵聯包含具有1-10個雜原子的視需要經取代的3-20員雜環基或雜芳基基團，其中至少一個雜原子係氮。在一些實施方式中，此類雜環基或雜芳基基團具有5元環。在一些實施方式中，此類雜環基或雜芳基基團具有6元環。
在一些實施方式中，非負電荷的核苷酸間鍵聯包含具有1-10個雜原子的視需要經取代的5-20員雜芳基基團。在一些實施方式中，非負電荷的核苷酸間鍵聯包含具有1-10個雜原子的視需要經取代的5-20員雜芳基基團，其中至少一個雜原子係氮。在一些實施方式中，非負電荷的核苷酸間鍵聯包含具有1-4個雜原子的視需要經取代的5-6元雜芳基基團，其中至少一個雜原子係氮。在一些實施方式中，非負電荷的核苷酸間鍵聯包含具有1-4個雜原子的視需要經取代的5元雜芳基基團，其中至少一個雜原子係氮。在一些實施方式中，雜芳基基團直接與鍵聯磷鍵合。在一些實施方式中，非負電荷的核苷酸間鍵聯包含視需要經取代的三唑基基團。在一些實施方式中，非負電荷的核苷酸間鍵聯包含未經取代的三唑基基團，例如，
Figure 02_image027
。在一些實施方式中，非負電荷的核苷酸間鍵聯包含經取代的三唑基基團，例如，
Figure 02_image029
。
在一些實施方式中，非負電荷的核苷酸間鍵聯包含具有1-10個雜原子的視需要經取代的5-20員雜環基基團。在一些實施方式中，非負電荷的核苷酸間鍵聯包含具有1-10個雜原子的視需要經取代的5-20員雜環基基團，其中至少一個雜原子係氮。在一些實施方式中，非負電荷的核苷酸間鍵聯包含具有1-4個雜原子的視需要經取代的5-6員雜環基基團，其中至少一個雜原子係氮。在一些實施方式中，非負電荷的核苷酸間鍵聯包含具有1-4個雜原子的視需要經取代的5員雜環基基團，其中至少一個雜原子係氮。在一些實施方式中，至少兩個雜原子係氮。在一些實施方式中，雜環基基團直接與鍵聯磷鍵合。在一些實施方式中，當雜環基基團係經由其=N-直接與鍵聯磷鍵合的胍部分的一部分時，該雜環基基團經由連接子（例如=N-）與鍵聯磷鍵合。在一些實施方式中，非負電荷的核苷酸間鍵聯包含視需要經取代的
Figure 02_image031
基團。在一些實施方式中，非負電荷的核苷酸間鍵聯包含經取代的
Figure 02_image031
基團。在一些實施方式中，非負電荷的核苷酸間鍵聯包含
Figure 02_image033
基團。在一些實施方式中，每個R1 獨立地是視需要經取代的C1-6 烷基。在一些實施方式中，每個R1 獨立地是甲基。
在一些實施方式中，經修飾的核苷酸間鍵聯（例如，非負電荷的核苷酸間鍵聯）包含三唑或炔基部分，其各自視需要被取代。在一些實施方式中，經修飾的核苷酸間鍵聯包含三唑部分。在一些實施方式中，經修飾的核苷酸間鍵聯包含未經取代的三唑部分。在一些實施方式中，經修飾的核苷酸間鍵聯包含經取代的三唑部分。在一些實施方式中，經修飾的核苷酸間鍵聯包含烷基部分。在一些實施方式中，經修飾的核苷酸間鍵聯包含視需要經取代的炔基基團。在一些實施方式中，經修飾的核苷酸間鍵聯包含未經取代的炔基基團。在一些實施方式中，經修飾的核苷酸間鍵聯包含經取代的炔基基團。在一些實施方式中，炔基基團直接與鍵聯磷鍵合。
在一些實施方式中，寡核苷酸包含不同類型的核苷酸間磷鍵聯。在一些實施方式中，手性受控的寡核苷酸包含至少一個天然磷酸酯鍵聯和至少一個經修飾的（非天然）核苷酸間鍵聯。在一些實施方式中，寡核苷酸包含至少一個天然磷酸酯鍵聯和至少一個硫代磷酸酯。在一些實施方式中，寡核苷酸包含至少一個非負電荷的核苷酸間鍵聯。在一些實施方式中，寡核苷酸包含至少一個天然磷酸酯鍵聯和至少一個非負電荷的核苷酸間鍵聯。
不希望受任何特定理論的束縛，本揭露指出，中性核苷酸間鍵聯可以比硫代磷酸酯核苷酸間鍵聯（PS）更具疏水性，該硫代磷酸酯核苷酸間鍵聯可以比天然磷酸酯鍵聯（PO）更具疏水性。通常，不同於PS或PO，中性核苷酸間鍵聯攜帶更少電荷。不希望受任何特定理論的束縛，本揭露指出，將一個或多個中性核苷酸間鍵聯摻入寡核苷酸中可以增加寡核苷酸被細胞攝取和/或寡核苷酸逸出內體的能力。不希望受任何特定理論的束縛，本揭露指出，摻入一個或多個中性核苷酸間鍵聯可用於調節在寡核苷酸與其靶核酸之間形成的雙鏈體的解鏈溫度。
不希望受任何特定理論的束縛，本揭露指出，將一個或多個不帶負電荷的核苷酸間鍵聯（例如中性核苷酸間鍵聯）摻入寡核苷酸中能夠增加寡核苷酸介導例如基因敲低的功能的能力。在一些實施方式中，能夠介導核酸或由其編碼的產物的程度的敲低的寡核苷酸（例如MAPT寡核苷酸）包含一個或多個非負電荷的核苷酸間鍵聯。在一些實施方式中，能夠介導靶基因的表現敲低的寡核苷酸（例如MAPT寡核苷酸）包含一個或多個非負電荷的核苷酸間鍵聯。
在許多實施方式中，如廣泛證明的，本揭露的寡核苷酸包含兩個或更多個不同的核苷酸間鍵聯。在一些實施方式中，寡核苷酸包含硫代磷酸酯核苷酸間鍵聯和不帶負電荷的核苷酸間鍵聯。在一些實施方式中，寡核苷酸包含硫代磷酸酯核苷酸間鍵聯、不帶負電荷的核苷酸間鍵聯、和天然磷酸酯鍵聯。在一些實施方式中，非負電荷的核苷酸間鍵聯係中性核苷酸間鍵聯。在一些實施方式中，非負電荷的核苷酸間鍵聯係n001。在一些實施方式中，每個硫代磷酸酯核苷酸間鍵聯獨立地是手性受控的。在一些實施方式中，每個手性經修飾的核苷酸間鍵聯獨立地是手性受控的。
如天然DNA和RNA中的典型連接係核苷酸間鍵聯與兩個糖（其可以是未修飾的或如本文所述之修飾的）形成鍵。在許多實施方式中，如本文所例舉的，核苷酸間鍵聯藉由其氧原子或雜原子與在其5'碳處的一個視需要修飾的核糖或去氧核糖和在其3'碳處的另一個視需要修飾的核糖或去氧核糖形成鍵。在一些實施方式中，藉由核苷酸間鍵聯連接的每個核苷單元獨立地包含核鹼基，該核鹼基獨立地是視需要經取代的A、T、C、G或U，或A、T、C、G或U的視需要經取代的互變異構物。
在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸包含核苷酸間鍵聯，其中典型的磷酸二酯鍵聯的帶負電的非橋聯氧被不帶電荷的烷基取代基（例如甲基（Met）或乙基（Et））取代，如在P-烷基膦酸核酸（phNA）中，例如P-甲基phNA或P-乙基phNA。參見，例如：Micklefield等人 2001 Curr. Med. Chem.[當代藥物化學] 8, 1157-1179；和Arangundy-Franklin等人 2019 Nat. Chem. [自然化學] 11, 533-542。
在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸係膦醯基甲基-蘇糖基核酸（tPhoNA）和/或包含膦醯基甲基-蘇糖基核苷酸間鍵聯。Liu等人 2018 J. Am. Chem. Soc.[美國化學學會雜誌]140, 6690-6699。
如熟悉該項技術者所理解的，根據本揭露，可以利用許多其他類型的核苷酸間鍵聯，例如，在以下中描述的那些：美國專利號3,687,808；4,469,863；4,476,301；5,177,195；5,023,243；5,034,506；5,166,315；5,185,444；5,188,897；5,214,134；5,216,141；5,235,033；5,264,423；5,264,564；5,276,019；5,278,302；5,286,717；5,321,131；5,399,676；5,405,938；5,405,939；5,434,257；5,453,496；5,455,233；5,466,677；5,466,677；5,470,967；5,476,925；5,489,677；5,519,126；5,536,821；5,541,307；5,541,316；5,550,111；5,561,225；5,563,253；5,571,799；5,587,361；5,596,086；5,602,240；5,608,046；5,610,289；5,618,704；5,623,070；5,625,050；5,633,360；5,64,562；5,663,312；5,677,437；5,677,439；6,160,109；6,239,265；6,028,188；6,124,445；6,169,170；6,172,209；6,277,603；6,326,199；6,346,614；6,444,423；6,531,590；6,534,639；6,608,035；6,683,167；6,858,715；6,867,294；6,878,805；7,015,315；7,041,816；7,273,933；7,321,029；或RE39464。在一些實施方式中，經修飾的核苷酸間鍵聯描述於以下中：US 9394333、US 9744183、US 9605019、US 9598458、US 9982257、US 10160969、US 10479995、US 2020/0056173、US 2018/0216107、US 2019/0127733、US 10450568、US 2019/0077817、US 2019/0249173、US 2019/0375774、WO 2018/223056、WO 2018/223073、WO 2018/223081、WO 2018/237194、WO 2019/032607、WO 2019/055951、WO 2019/075357、WO 2019/200185、WO 2019/217784、WO 2019/032612和/或WO 2020/191252，其各自的核鹼基、糖、核苷酸間鍵聯，手性助劑/試劑以及寡核苷酸合成技術（試劑、條件、循環等）藉由引用獨立地併入本文。
在一些實施方式中，寡核苷酸包含一個或多個核苷酸，該核苷酸獨立地包含在某些條件下易於「自行釋放」的磷修飾。即，在某些條件下，設計特定的磷修飾，以使其從寡核苷酸自切割以提供例如天然磷酸酯鍵聯。此類磷修飾基團的某些實例可以在US 9982257中找到。在一些實施方式中，自行釋放基團包含𠰌啉基基團。在一些實施方式中，自行釋放基團的特徵在於將試劑遞送至核苷酸間磷連接子的能力，該試劑有助於進一步修飾磷原子，例如脫硫。在一些實施方式中，該試劑係水，並且進一步的修飾係水解以形成天然的磷酸酯鍵聯。
在一些實施方式中，寡核苷酸包含一個或多個核苷酸間鍵聯，其改善了寡核苷酸的一種或多種藥物特性和/或活性。在本領域充分記載，某些寡核苷酸被核酸酶迅速地降解，且表現出較差的被細胞質細胞膜的細胞攝取（Poijarvi-Virta等人, Curr.Med. Chem.[當代藥物化學] (2006), 13(28)；3441-65；Wagner等人, Med. Res. Rev.[醫學研究評論] (2000), 20(6):417-51；Peyrottes等人, Mini Rev. Med. Chem.[藥物化學短評] (2004), 4(4):395-408；Gosselin等人, (1996), 43(1):196-208；Bologna等人, (2002), Antisense & Nucleic Acid Drug Development [反義和核酸藥物開發] 12:33-41）。Vives等人（Nucleic Acids Research [核酸研究] (1999), 27(20):4071-76）報導，在某些條件下，三級丁基SATE原寡核苷酸（pro-oligonucleotide）相比於母體寡核苷酸表現出明顯增加的細胞滲透。
各種類型的核苷酸間鍵聯可以與其他結構元件例如糖組合使用，以實現所需的寡核苷酸特性和/或活性。例如，本發明在設計寡核苷酸時通常利用修飾的核苷酸間鍵聯和修飾的糖，視需要具有天然磷酸酯鍵和天然糖。在一些實施方式中，本揭露提供了包含一個或多個修飾的糖的寡核苷酸。在一些實施方式中，本揭露提供了包含一個或多個修飾的糖和一個或多個修飾的核苷酸間鍵聯的寡核苷酸，其中一個或多個係天然磷酸酯鍵聯。
寡核苷酸組成物
尤其是，本揭露提供了各種寡核苷酸組成物。在一些實施方式中，本揭露提供了本文所述之寡核苷酸的寡核苷酸組成物。在一些實施方式中，寡核苷酸組成物（例如MAPT寡核苷酸組成物）包含多個本揭露中描述的寡核苷酸。在一些實施方式中，寡核苷酸組成物（例如MAPT寡核苷酸組成物）係手性受控的。在一些實施方式中，寡核苷酸組成物（例如MAPT寡核苷酸組成物）係非手性受控的（係立體隨機性的）。
天然磷酸酯鍵聯的鍵聯磷係非手性的。許多修飾的核苷酸間鍵聯，例如硫代磷酸酯核苷酸間鍵聯的鍵聯磷係手性的。在一些實施方式中，在寡核苷酸組成物的製備期間（例如，在傳統的亞磷醯胺寡核苷酸合成中），沒有有目的地設計或控制手性鍵聯磷的構型，從而產生非手性受控（立體隨機）的寡核苷酸組成物（基本上係外消旋製劑），其係各種立體異構物的複雜的隨機的混合物（非鏡像異構物）-對於具有n個手性核苷酸間鍵聯（鍵聯磷係手性的）的寡核苷酸，通常是2n 個立體異構物（例如，當n係10時，210 = 1,032；當n為20時，220 = 1,048,576）。該等立體異構物具有相同的構造，但是其鍵聯磷的立體化學模式不同。
在一些實施方式中，立體隨機的寡核苷酸組成物具有用於某些目的和/或應用的足夠的特性和/或活性。在一些實施方式中，與手性受控的寡核苷酸組成物相比，立體隨機的寡核苷酸組成物可以更便宜地、更容易地和/或更簡單地生產。然而，立體隨機組成物中的立體異構物可具有不同的特性、活性和/或毒性，導致特別是與某些相同構造的寡核苷酸的手性受控的寡核苷酸組成物相比，立體隨機組成物的治療效果不一致和/或非預期的副作用。 手性受控的寡核苷酸組成物
在一些實施方式中，本揭露涵蓋用於設計和製備手性受控的寡核苷酸組成物的技術。在一些實施方式中，手性受控的寡核苷酸組成物包含受控/預定（不是如非立體隨機組成物中那樣隨機）程度的多個寡核苷酸，其中該寡核苷酸在一個或多個手性核苷酸間鍵聯（手性受控的核苷酸間鍵聯）處共用相同的鍵聯磷立體化學。在一些實施方式中，多個寡核苷酸中的寡核苷酸共用相同的骨架手性中心模式（鍵聯磷的立體化學）。在一些實施方式中，骨架手性中心模式如本揭露中所述。在一些實施方式中，多個寡核苷酸中的寡核苷酸共用共同的構造。在一些實施方式中，寡核苷酸係結構相同的。
例如，在一些實施方式中，本揭露提供了包含多個寡核苷酸的寡核苷酸組成物，其中多個寡核苷酸中寡核苷酸共用： 1) 共同的鹼基序列，和 2) 獨立地在一個或多個（例如，約1-50、1-40、1-30、1-25、1-20、1-15、1-10、5-50、5-40、5-30、5-25、5-20、5-15、5-10、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、或25或更多個）手性核苷酸間鍵聯處相同的鍵聯磷立體化學（「手性受控的核苷酸間鍵聯」）； 其中組成物中多個寡核苷酸中寡核苷酸的程度係非隨機的（例如，如本文所述受控/預先確定的）。
在一些實施方式中，本揭露提供了包含多個寡核苷酸的寡核苷酸組成物，其中多個寡核苷酸中寡核苷酸共用： 1) 共同的鹼基序列，和 2) 獨立地在一個或多個（例如，約1-50、1-40、1-30、1-25、1-20、1-15、1-10、5-50、5-40、5-30、5-25、5-20、5-15、5-10、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、或25或更多個）手性核苷酸間鍵聯處相同的鍵聯磷立體化學（「手性受控的核苷酸間鍵聯」）； 其中相對於共用該共同的鹼基序列的寡核苷酸的基本上外消旋製劑，該組成物富集該多個寡核苷酸中的寡核苷酸。
在一些實施方式中，本揭露提供了包含多個寡核苷酸的寡核苷酸組成物，其中多個寡核苷酸中寡核苷酸共用： 1) 共同的鹼基序列，和 2) 獨立地在一個或多個（例如，約1-50、1-40、1-30、1-25、1-20、1-15、1-10、5-50、5-40、5-30、5-25、5-20、5-15、5-10、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、或25或更多個）手性核苷酸間鍵聯處相同的鍵聯磷立體化學（「手性受控的核苷酸間鍵聯」）； 其中在組成物中共用共同的鹼基序列的所有寡核苷酸的約1%-100%,（例如，約5%-100%、10%-100%、20%-100%、30%-100%、40%-100%、50%-100%、60%-100%、70%-100%、80-100%、90-100%、95-100%、50%-90%、或約5%、10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、或100%、或至少5%、10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%）係該多個寡核苷酸中的寡核苷酸。
在一些實施方式中，多個寡核苷酸中的寡核苷酸的百分比/程度係或係至少(DS)nc ，其中DS為90%-100%，並且nc為手性受控的核苷酸間鍵聯的數目。在一些實施方式中，nc係5、6、7、8、9、10或更大。在一些實施方式中，百分比/程度為至少10%。在一些實施方式中，百分比/程度為至少20%。在一些實施方式中，百分比/程度為至少30%。在一些實施方式中，百分比/程度為至少40%。在一些實施方式中，百分比/程度為至少50%。在一些實施方式中，百分比/程度為至少60%。在一些實施方式中，百分比/程度為至少65%。在一些實施方式中，百分比/程度為至少70%。在一些實施方式中，百分比/程度為至少75%。在一些實施方式中，百分比/程度為至少80%。在一些實施方式中，百分比/程度為至少85%。在一些實施方式中，百分比/程度為至少90%。在一些實施方式中，百分比/程度為至少95%。
在一些實施方式中，多個寡核苷酸共用共同的骨架鍵聯模式。在一些實施方式中，多個寡核苷酸中的寡核苷酸各自獨立地在核苷酸間鍵聯位點各自獨立地具有特定構造（例如，-O-P(O)(SH)-O-）或其鹽形式（例如，-O-P(O)(SNa)-O-）的核苷酸間鍵聯。在一些實施方式中，在每個核苷酸間鍵聯位點處的核苷酸間鍵聯具有相同的形式。在一些實施方式中，在每個核苷酸間鍵聯位點處的核苷酸間鍵聯具有不同的形式。
在一些實施方式中，多個寡核苷酸中的寡核苷酸共用共同的構造。在一些實施方式中，多個寡核苷酸中的寡核苷酸具有共同的構造的相同形式。在一些實施方式中，多個寡核苷酸中的寡核苷酸具有兩種或更多種形式的共同構造。在一些實施方式中，多個寡核苷酸中的寡核苷酸各自獨立地具有特定的寡核苷酸或其藥學上可接受的鹽，或獨立地具有與特定的寡核苷酸或其藥學上可接受的鹽相同的構造的寡核苷酸。在一些實施方式中，在組成物中共用共同的構造的所有寡核苷酸的約1%-100%,（例如，約5%-100%、10%-100%、20%-100%、30%-100%、40%-100%、50%-100%、60%-100%、70%-100%、80-100%、90-100%、95-100%、50%-90%、或約5%、10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、或100%、或至少5%、10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%）與該多個寡核苷酸中的寡核苷酸。在一些實施方式中，程度的百分比係或係至少(DS)nc ，其中DS為90%-100%，並且nc為手性受控的核苷酸間鍵聯的數目。在一些實施方式中，nc係5、6、7、8、9、10或更大。在一些實施方式中，程度為至少10%。在一些實施方式中，程度為至少20%。在一些實施方式中，程度為至少30%。在一些實施方式中，程度為至少40%。在一些實施方式中，程度為至少50%。在一些實施方式中，程度為至少60%。在一些實施方式中，程度為至少65%。在一些實施方式中，程度為至少70%。在一些實施方式中，程度為至少75%。在一些實施方式中，程度為至少80%。在一些實施方式中，程度為至少85%。在一些實施方式中，程度為至少90%。在一些實施方式中，程度為至少95%。
在一些實施方式中，每個硫代磷酸酯核苷酸間鍵聯獨立地是手性受控的核苷酸間鍵聯。
在一些實施方式中，本揭露提供了手性受控的寡核苷酸組成物，該手性受控的寡核苷酸組成物包含藉由以下表徵的特定寡核苷酸類型的多種寡核苷酸： a) 共同的鹼基序列； b) 共同的骨架鍵聯模式； c) 共同的骨架手性中心模式； 其中相對於具有相同共同的鹼基序列的寡核苷酸的基本上外消旋製劑，該組成物富集該特定寡核苷酸類型的寡核苷酸。
在一些實施方式中，本揭露提供了手性受控的寡核苷酸組成物，該手性受控的寡核苷酸組成物包含藉由以下表徵的特定寡核苷酸類型的多種寡核苷酸： a) 共同的鹼基序列； b) 共同的骨架鍵聯模式； c) 共同的骨架手性中心模式； 其中該多個寡核苷酸中的寡核苷酸包含至少一個核苷酸間鍵聯，該核苷酸間鍵聯包含Sp構型的共同鍵聯磷； 其中相對於具有相同共同的鹼基序列的寡核苷酸的基本上外消旋製劑，該組成物富集該特定寡核苷酸類型的寡核苷酸。
如熟悉該項技術者所理解的，常見的骨架手性中心模式包括至少一個Rp或至少一個Sp。某些骨架手性中心模式在例如表1A中示出。
在一些實施方式中，相對於共用相同的共同的鹼基序列和共同的骨架鍵聯模式的寡核苷酸的基本上外消旋製劑，手性受控的核苷酸組成物富集特定寡核苷酸類型的寡核苷酸。
在一些實施方式中，多個寡核苷酸中的寡核苷酸（例如特定寡核苷酸類型）具有共同的骨架磷修飾模式和共同的核苷修飾模式。在一些實施方式中，多個寡核苷酸中的寡核苷酸具有共同的糖修飾模式。在一些實施方式中，多個寡核苷酸中的寡核苷酸具有共同的鹼基修飾模式。在一些實施方式中，多個寡核苷酸中的寡核苷酸具有共同的核苷修飾模式。在一些實施方式中，多個寡核苷酸中的寡核苷酸具有相同的構造。在許多實施方式中，多個寡核苷酸中的寡核苷酸係相同的。在一些實施方式中，多個寡核苷酸中的寡核苷酸具有相同的寡核苷酸（如熟悉該項技術者將理解的，這樣的寡核苷酸可以各自獨立地以寡核苷酸的多種形式之一存在，並且可以是寡核苷酸的相同或不同形式）。在一些實施方式中，多種寡核苷酸中的寡核苷酸各自獨立地具有相同的寡核苷酸或其藥學上可接受的鹽。
在一些實施方式中，本揭露提供了手性受控的寡核苷酸組成物，例如表1中的在其「立體化學/鍵聯」含有S和/或R的許多寡核苷酸的手性受控的寡核苷酸組成物。在一些實施方式中，多個寡核苷酸中的寡核苷酸各自獨立地是表1中的特定寡核苷酸（其「立體化學/鍵聯」含有S和/或R），視需要以各種形式。在一些實施方式中，多個寡核苷酸中的寡核苷酸各自獨立地是表1中的特定寡核苷酸（其「立體化學/鍵聯」含有S和/或R）或其藥學上可接受的鹽。
在一些實施方式中，可以將組成物中的多個寡核苷酸的程度確定為寡核苷酸中每個手性受控的核苷酸間鍵聯的非鏡像異構物純度的乘積。在一些實施方式中，連接寡核苷酸（或核酸）中兩個核苷的核苷酸間鍵聯的非鏡像異構物純度由連接相同兩個核苷的二聚體的核苷酸間鍵聯的非鏡像異構物純度表示，其中二聚體係使用可比較的條件，在某些情況下，相同的合成循環條件製備的。
在一些實施方式中，所有手性核苷酸間鍵聯都獨立地是手性受控的，並且該組成物係完全手性受控的寡核苷酸組成物。在一些實施方式中，不是所有的手性核苷酸間鍵聯皆為手性受控的核苷酸間鍵聯，並且組成物係部分地手性受控的寡核苷酸組成物。
寡核苷酸可以包含骨架手性中心的各種模式（手性鍵聯磷的立體化學模式）或由其組成。在本揭露中描述了骨架手性中心的某些有用的模式。在一些實施方式中，多個寡核苷酸中的寡核苷酸共用共同的骨架手性中心模式，其係或包含本揭露中描述的模式（例如，如「立體化學及骨架手性中心模式」中所述，表1中的手性受控的寡核苷酸的骨架手性中心模式，等）。
在一些實施方式中，手性受控的寡核苷酸組成物係手性純的（或立體純的，立體化學純的）寡核苷酸組成物，其中該寡核苷酸組成物包含多個寡核苷酸，其中該寡核苷酸獨立地具有相同的立體異構物[包括該寡核苷酸的每個手性元素，包括每個手性鍵聯磷，係獨立定義的（立體定義的）]。寡核苷酸立體異構物的手性純（或立體純，立體化學純）的寡核苷酸組成物不包含其他立體異構物（如熟悉該項技術者所理解的，一個或多個非預期的立體異構物可以作為來自製備、儲存等的雜質存在）。
手性受控的寡核苷酸組成物相對於立體隨機的寡核苷酸組成物可以顯示許多優點。尤其是，就寡核苷酸結構而言，手性受控的寡核苷酸組成物比相應的立體隨機的寡核苷酸組成物更均勻。藉由控制立體化學，可以製備和評估各個立體異構物的組成物，從而可以開發具有所需特性和/或活性的立體異構物的手性受控的寡核苷酸組成物。在一些實施方式中，與例如相應的立體隨機的寡核苷酸組成物相比，手性受控的寡核苷酸組成物提供了更好的遞送、穩定性、清除率、活性、選擇性和/或毒性譜。在一些實施方式中，手性受控的寡核苷酸組成物提供更好的功效、更少的副作用和/或更方便和有效的劑量方案。尤其是，本文所述之骨架手性中心模式可用於提供寡核苷酸靶（例如，轉錄物，例如mRNA先質，成熟mRNA等；包括控制切割位點，切割位點處的切割速率和/或程度，和/或總切割速率和程度等）的受控切割。
在一些實施方式中，提供的組成物中的寡核苷酸，例如手性首受控的寡核苷酸組成物係本文所述之MAPT寡核苷酸。
在一些實施方式中，本揭露提供了立體隨機的寡核苷酸組成物，例如立體隨機的MAPT寡核苷酸組成物。在一些實施方式中，本揭露提供了能夠降低MAPT基因或其基因產物的程度、活性或表現的立體隨機的MAPT寡核苷酸組成物。在一些實施方式中，本揭露提供了立體隨機的MAPT寡核苷酸組成物，其能夠降低MAPT基因或其基因產物的程度、活性或表現，並且其中MAPT寡核苷酸的鹼基序列係本文揭露的鹼基序列（例如在表1中的鹼基序列，其中每個T可以獨立地被U替換，並且反之亦然），包含本文揭露的鹼基序列或包含本文揭露的鹼基序列的序列段（例如，至少10或15個連續鹼基）。
在一些實施方式中，寡核苷酸組成物包含一個或多個為立體受控的（手性受控的；在一些實施方式中，立體純的）的核苷酸間鍵聯和一個或多個立體隨機的核苷酸間鍵聯。在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸組成物包含一個或多個為立體受控的（手性受控的；在一些實施方式中，立體純的）的核苷酸間鍵聯和一個或多個立體隨機的核苷酸間鍵聯。
在一些實施方式中，寡核苷酸組成物包含一個或多個立體受控的核苷酸間鍵聯（例如，手性受控的或立體純的）和一個或多個立體隨機的核苷酸間鍵聯。這樣的寡核苷酸可以靶向各種靶並且可以具有各種鹼基序列，並且可以能夠藉由多種方式（例如，RNA酶H機制、空間阻礙、雙股或單股RNA干擾、外顯子跳讀調節、CRISPR、適體等）中的一種或多種進行操作。
在一些實施方式中，本揭露提供了手性受控的寡核苷酸組成物，例如手性受控的MAPT寡核苷酸組成物。在一些實施方式中，提供的手性受控的寡核苷酸組成物包含多個相同構造的寡核苷酸（例如MAPT寡核苷酸），並具有一個或多個核苷酸間鍵聯。在一些實施方式中，例如在手性受控的寡核苷酸組成物中的多個寡核苷酸係選自表1的多個寡核苷酸，其中該寡核苷酸在手性受控的核苷酸間鍵聯中包含至少一個Rp或Sp鍵聯磷。在一些實施方式中，例如在手性受控的寡核苷酸組成物中的多個寡核苷酸係選自表1的多個寡核苷酸，其中寡核苷酸中的每個硫代磷酸酯核苷酸間鍵聯獨立地是手性受控的（每個硫代磷酸酯核苷酸間鍵聯獨立地是Rp或Sp）。在一些實施方式中，寡核苷酸組成物，例如MAPT寡核苷酸組成物係單一寡核苷酸的基本上純的製劑，因為在一些情況下，在某些純化程序後，在該組成物中的不是該單一寡核苷酸的寡核苷酸係來自該單一寡核苷酸的製備過程中的雜質。在一些實施方式中，單個寡核苷酸係表1的寡核苷酸，其中該寡核苷酸的每個手性核苷酸間鍵聯係手性受控的（例如，在「立體化學/鍵聯」中表示為S或R，但不是X）。
在一些實施方式中，相對於相應的立體隨機的寡核苷酸組成物，手性受控的寡核苷酸組成物可以具有增加的活性和/或穩定性、增加的遞送和/或降低引起不良作用（例如補體，TLR9活化等）的能力。在一些實施方式中，立體隨機的（非手性受控的）寡核苷酸組成物與手性受控的寡核苷酸組成物的不同之處在於其相應的多個寡核苷酸不包含任何手性受控的核苷酸間鍵聯，但是立體隨機的寡核苷酸組成物在其他方面與手性受控的寡核苷酸組成物相同。
在一些實施方式中，本揭露關於能夠降低MAPT基因或其基因產物的程度、活性或表現的手性受控的MAPT寡核苷酸組成物。
在一些實施方式中，本揭露提供了手性受控的MAPT寡核苷酸組成物，其能夠降低MAPT基因或其基因產物的程度、活性或表現，並且包含多個共用共同的鹼基序列的寡核苷酸，該共同的鹼基序列係或包含本文揭露的鹼基序列（例如在表1中，其中每個T可以獨立地被U替換，並且反之亦然）。
在一些實施方式中，提供的手性受控的寡核苷酸組成物係包含多個MAPT寡核苷酸的手性受控的MAPT寡核苷酸組成物。在一些實施方式中，手性受控的寡核苷酸組成物係手性純的（或「立體化學純的」）寡核苷酸組成物。在一些實施方式中，本揭露提供表1（例如1A）中的寡核苷酸的手性純的寡核苷酸組成物，其中該寡核苷酸的每個手性核苷酸間鍵聯獨立地是手性受控的（Rp或Sp，例如，「立體化學/鍵聯」中的R或S但不是X）。如熟悉該項技術者將理解的那樣，化學選擇性很少（如果有的話）達到完整性（絕對100%）。在一些實施方式中，手性純的寡核苷酸組成物包含多個寡核苷酸，其中多個寡核苷酸中寡核苷酸在結構上相同並且都具有相同的結構（相同的立體異構形式；在寡核苷酸的情況下，通常與通常在寡核苷酸中存在的多手性中心相同的非鏡像異構形式），並且手性純的寡核苷酸組成物不含有任何其他立體異構物（在寡核苷酸的情況下，通常如通常在寡核苷酸中存在的多手性中心的非鏡像異構物；其程度例如可藉由立體選擇性製備實現）。如熟悉該項技術者所理解的，立體隨機的（或「外消旋的」，「非手性受控的」）寡核苷酸組成物係許多立體異構物的隨機混合物（例如2n 個非鏡像異構物，其中n係寡核苷酸的手性鍵聯磷的數目，其中其他手性中心（例如，糖中的碳手性中心）係手性受控的，各自獨立地以一種構型存在，並且僅手性鍵聯磷中心係非手性受控的）。
在例如本文的實例中顯示某些數據，該數據顯示手性受控的寡核苷酸組成物，例如手性受控的MAPT寡核苷酸組成物在降低MAPT靶基因或其基因產物的程度、活性和/或表現方面的特性和/或活性。
在一些實施方式中，本揭露提供了包含寡核苷酸的寡核苷酸組成物，該寡核苷酸包含至少一個手性鍵聯磷。在一些實施方式中，本揭露提供了包含MAPT寡核苷酸的MAPT寡核苷酸組成物，該MAPT寡核苷酸包含至少一個手性鍵聯磷。在一些實施方式中，本揭露提供了MAPT寡核苷酸組成物，其中MAPT寡核苷酸包含手性受控的硫代磷酸酯核苷酸間鍵聯，其中該鍵聯磷具有Rp構型。在一些實施方式中，本揭露提供了MAPT寡核苷酸組成物，其中MAPT寡核苷酸包含手性受控的硫代磷酸酯核苷酸間鍵聯，其中該鍵聯磷具有Sp構型。
在一些實施方式中，與參考寡核苷酸組成物相比，所提供的手性受控的寡核苷酸組成物（例如，手性受控的MAPT寡核苷酸組成物）出人意料地有效。在一些實施方式中，所需的生物學效應（例如，如藉由被靶向降低的mRNA、蛋白等的降低的程度所測量）可被增強超過5、10、15、20、25、30、40、50、或100倍（例如，藉由mRNA、蛋白等的剩餘程度測量）。在一些實施方式中，藉由相比於參考條件的不希望的mRNA程度的降低來測量改變。在一些實施方式中，藉由相比於參考條件的所希望的mRNA程度的增加來測量改變。在一些實施方式中，藉由相比於參考條件的不希望的mRNA程度的降低來測量改變。在一些實施方式中，參考條件係沒有被例如藉由手性受控的寡核苷酸組成物治療。在一些實施方式中，參考條件係具有相同構造的相應的寡核苷酸立體隨機組成物。
在一些實施方式中，本揭露提供了手性受控的寡核苷酸組成物，例如手性受控的MAPT寡核苷酸組成物，其中至少一個手性受控的核苷酸間鍵聯的鍵聯磷係Sp。在一些實施方式中，本揭露提供了手性受控的寡核苷酸組成物，例如手性受控的MAPT寡核苷酸組成物，其中手性受控的核苷酸間鍵聯的大部分鍵聯磷係Sp。在一些實施方式中，所有手性受控的硫代磷酸酯核苷酸間鍵聯中的約50%-100%、55%-100%、60%-100%、65%-100%、70%-100%、75%-100%、80%-100%、85%-100%、90%-100%、55%-95%、60%-95%、65%-95%、或約55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、97%、99%或更多係Sp。在一些實施方式中，所有硫代磷酸酯核苷酸間鍵聯中的約50%-100%、55%-100%、60%-100%、65%-100%、70%-100%、75%-100%、80%-100%、85%-100%、90%-100%、55%-95%、60%-95%、65%-95%、或約55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、97%、99%或更多係手性受控的並且是Sp。在一些實施方式中，所有手性受控的核苷酸間鍵聯（或所有手性核苷酸間鍵聯或所有核苷酸間鍵聯）中的約50%-100%、55%-100%、60%-100%、65%-100%、70%-100%、75%-100%、80%-100%、85%-100%、90%-100%、55%-95%、60%-95%、65%-95%、或約55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、97%、99%或更多係Sp。在一些實施方式中，本揭露提供了手性受控的寡核苷酸組成物，例如手性受控的MAPT寡核苷酸組成物，其中大部分手性核苷酸間鍵聯係手性受控的並且在其鍵聯磷處係Sp。在一些實施方式中，本揭露提供了手性受控的寡核苷酸組成物，例如手性受控的MAPT寡核苷酸組成物，其中每個手性核苷酸間鍵聯係手性受控的並且每個手性鍵聯磷係Sp。在一些實施方式中，本揭露提供了手性受控的寡核苷酸組成物，例如手性受控的MAPT寡核苷酸組成物，其中至少一個手性受控的核苷酸間鍵聯具有Rp鍵聯磷。在一些實施方式中，本揭露提供了手性受控的寡核苷酸組成物，例如手性受控的MAPT寡核苷酸組成物，其中至少一個手性受控的核苷酸間鍵聯包含Rp鍵聯磷並且至少一個手性受控的核苷酸間鍵聯包含Sp鍵聯磷。在一些實施方式中，至少一個硫代磷酸酯核苷酸間鍵聯係手性受控的且是Rp。在一些實施方式中，約1-5個，例如約1、2、3、4或5個硫代磷酸酯核苷酸間鍵聯係手性受控的且是Rp。在一些實施方式中，所有手性受控的非負電荷的核苷酸間鍵聯（例如n001）中的約50%-100%、55%-100%、60%-100%、65%-100%、70%-100%、75%-100%、80%-100%、85%-100%、90%-100%、55%-95%、60%-95%、65%-95%、或約55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、97%、99%或更多係Rp。在一些實施方式中，每個手性受控的n001係Rp。 骨架手性中心的立體化學和模式
與天然磷酸酯鍵聯相反，手性修飾的核苷酸間鍵聯的例如硫代磷酸酯核苷酸間鍵聯的鍵聯磷係手性的。尤其是，本揭露提供了包括控制手性核苷酸間鍵聯中的手性鍵聯磷的立體化學的技術（例如，寡核苷酸、組成物、方法等）。在一些實施方式中，如本文所示，對立體化學的控制可以提供改善的特性和/或活性，包括所需的穩定性、降低的毒性、改善的靶核酸還原等。在一些實施方式中，本揭露提供了對於寡核苷酸和/或其區域有用的骨架手性中心模式，該模式係手性鍵聯磷的每個手性鍵聯磷（Rp或Sp）的立體化學的組合，每個手性鍵聯磷（Op，如有）等從5’到3’指示。在一些實施方式中，當在切割系統（例如，體外測定、細胞、組織、器官、生物體、受試者等）中與所提供的寡核苷酸或其組成物接觸時，骨架手性中心模式可以控制靶核酸的切割模式。在一些實施方式中，當在切割系統中與所提供的寡核苷酸或其組成物接觸時，骨架手性中心模式改善了靶核酸的切割效率和/或選擇性。
在一些實施方式中，寡核苷酸或其區域的骨架手性中心模式包含或係任何(Np)n(Op)m，其中Np係Rp或Sp，Op表示鍵聯磷係非手性的（例如，對於天然磷酸酯鍵聯的鍵聯磷），並且n和m各自獨立地如本揭露中所定義和描述的。在一些實施方式中，寡核苷酸或其區域的骨架手性中心模式包含或係(Sp)n(Op)m，其中每個變數獨立地如本揭露中所定義和描述的。在一些實施方式中，寡核苷酸或其區域的骨架手性中心模式包含或係(Rp)n(Op)m，其中每個變數獨立地如本揭露中所定義和描述的。在一些實施方式中，n係1。在一些實施方式中，寡核苷酸或其區域的骨架手性中心模式包含或係(Sp)(Op)m，其中m係1、2、3、4、5、6、7、8、9、或10。在一些實施方式中，寡核苷酸或其區域的骨架手性中心模式包含或係(Rp)(Op)m，其中m係1、2、3、4、5、6、7、8、9、或10。在一些實施方式中，5’-翼的骨架手性中心模式係或包含(Np)n(Op)m。在一些實施方式中，5’-翼的骨架手性中心模式係或包含(Sp)n(Op)m。在一些實施方式中，5’-翼的骨架手性中心模式係或包含(Rp)n(Op)m。在一些實施方式中，5’-翼的骨架手性中心模式係或包含(Sp)(Op)m。在一些實施方式中，5’-翼的骨架手性中心模式係或包含(Rp)(Op)m。在一些實施方式中，5’-翼的骨架手性中心模式係(Sp)(Op)m。在一些實施方式中，5’-翼的骨架手性中心模式係(Rp)(Op)m。在一些實施方式中，5’-翼的骨架手性中心模式係(Sp)(Op)m，其中Sp係從5'端的寡核苷酸的第一核苷酸間鍵聯的鍵聯磷構型。在一些實施方式中，5’-翼的骨架手性中心模式係(Rp)(Op)m，其中Rp係從5'端的寡核苷酸的第一核苷酸間鍵聯的鍵聯磷構型。在一些實施方式中，如本揭露中所述，m係2；在一些實施方式中，m係3；在一些實施方式中，m係4；在一些實施方式中，m係5；在一些實施方式中，m係6。
在一些實施方式中，寡核苷酸或其區域的骨架手性中心模式包含或係(Op)m(Np)n，其中Np係Rp或Sp，Op表示鍵聯磷係非手性的（例如，對於天然磷酸酯鍵聯的鍵聯磷），並且n和m各自獨立地如本揭露中所定義和描述的。在一些實施方式中，寡核苷酸或其區域的骨架手性中心模式包含或係(Op)m(Sp)n，其中每個變數獨立地如本揭露中所定義和描述的。在一些實施方式中，寡核苷酸或其區域的骨架手性中心模式包含或係(Op)m(Rp)n，其中每個變數獨立地如本揭露中所定義和描述的。在一些實施方式中，n係1。在一些實施方式中，寡核苷酸或其區域的骨架手性中心模式包含或係(Op)m(Sp)，其中m係1、2、3、4、5、6、7、8、9、或10。在一些實施方式中，寡核苷酸或其區域的骨架手性中心模式包含或係(Op)m(Rp)，其中m係1、2、3、4、5、6、7、8、9、或10。在一些實施方式中，3’-翼的骨架手性中心模式係或包含(Op)m(Np)n。在一些實施方式中，3’-翼的骨架手性中心模式係或包含(Op)m(Sp)n。在一些實施方式中，3’-翼的骨架手性中心模式係或包含(Op)m(Rp)n。在一些實施方式中，3’-翼的骨架手性中心模式係或包含(Op)m(Sp)。在一些實施方式中，3’-翼的骨架手性中心模式係或包含(Op)m(Rp)。在一些實施方式中，3’-翼的骨架手性中心模式係(Op)m(Sp)。在一些實施方式中，3’-翼的骨架手性中心模式係(Op)m(Rp)。在一些實施方式中，3’-翼的骨架手性中心模式係(Op)m(Sp)，其中Sp係從5'端的寡核苷酸的最後核苷酸間鍵聯的鍵聯磷構型。在一些實施方式中，3’-翼的骨架手性中心模式係(Op)m(Rp)，其中Rp係從5'端的寡核苷酸的最後核苷酸間鍵聯的鍵聯磷構型。在一些實施方式中，如本揭露中所述，m係2；在一些實施方式中，m係3；在一些實施方式中，m係4；在一些實施方式中，m係5；在一些實施方式中，m係6。
在一些實施方式中，寡核苷酸或其區域（例如核心）的骨架手性中心模式包含或係(Sp)m(Rp/Op)n或(Rp/Op)n(Sp)m，其中每個變數獨立地是如本揭露中所述之。在一些實施方式中，寡核苷酸或其區域（例如核心）的骨架手性中心模式包含或係(Sp)m(Rp)n或(Rp)n(Sp)m，其中每個變數獨立地是如本揭露中所述之。在一些實施方式中，寡核苷酸或其區域（例如核心）的骨架手性中心模式包含或係(Sp)m(Op)n或(Op)n(Sp)m，其中每個變數獨立地是如本揭露中所述之。在一些實施方式中，寡核苷酸或其區域（例如核心）的骨架手性中心模式包含或係(Np)t[(Rp/Op)n(Sp)m]y或[(Rp/Op)n(Sp)m]y(Np)t，其中y係1-50，並且其他變數各自獨立地如本揭露中所描述的。在一些實施方式中，寡核苷酸或其區域（例如核心）的骨架手性中心模式包含或係(Np)t[(Rp)n(Sp)m]y或[(Rp)n(Sp)m]y(Np)t，其中每個變數獨立地是如本揭露中所述之。在一些實施方式中，寡核苷酸或其區域（例如核心）的骨架手性中心模式包含或係[(Rp/Op)n(Sp)m]y(Rp)k、[(Rp/Op)n(Sp)m]y、(Sp)t[(Rp/Op)n(Sp)m]y、(Sp)t[(Rp/Op)n(Sp)m]y(Rp)k，其中k係1-50，並且其他變數各自獨立地如本揭露中所描述的。在一些實施方式中，寡核苷酸或其區域（例如核心）的骨架手性中心模式包含或係[(Op)n(Sp)m]y(Rp)k、[(Op)n(Sp)m]y、(Sp)t[(Op)n(Sp)m]y、(Sp)t[(Op)n(Sp)m]y(Rp)k，其中每個變數獨立地是如本揭露中所述之。在一些實施方式中，寡核苷酸或其區域（例如核心）的骨架手性中心模式包含或係[(Rp)n(Sp)m]y(Rp)k、[(Rp)n(Sp)m]y、(Sp)t[(Rp)n(Sp)m]y、(Sp)t[(Rp)n(Sp)m]y(Rp)k，其中每個變數獨立地是如本揭露中所述之。在一些實施方式中，寡核苷酸包含核心區域。在一些實施方式中，寡核苷酸包含核心區域，其中核心區域中的每個糖不含有2’-OR1 ，其中R1 係如本揭露所述之。在一些實施方式中，寡核苷酸包含核心區域，其中核心區域中的每個糖獨立地是天然DNA糖。在一些實施方式中，核心的骨架手性中心模式包含或係(Rp)(Sp)m。在一些實施方式中，核心的骨架手性中心模式包含或係(Op)(Sp)m。在一些實施方式中，核心的骨架手性中心模式包含或係(Np)t[(Rp/Op)n(Sp)m]y或[(Rp/Op)n(Sp)m]y(Np)t。在一些實施方式中，核心的骨架手性中心模式包含或係(Np)t[(Rp/Op)n(Sp)m]y或[(Rp/Op)n(Sp)m]y(Np)t。在一些實施方式中，核心的骨架手性中心模式包含或係(Np)t[(Rp)n(Sp)m]y或[(Rp)n(Sp)m]y(Np)t。在一些實施方式中，核心的骨架手性中心模式包含或係[(Rp/Op)n(Sp)m]y(Rp)k、[(Rp/Op)n(Sp)m]y、(Sp)t[(Rp/Op)n(Sp)m]y、(Sp)t[(Rp/Op)n(Sp)m]y(Rp)k。在一些實施方式中，核心的骨架手性中心模式包含或係[(Op)n(Sp)m]y(Rp)k、[(Op)n(Sp)m]y、(Sp)t[(Op)n(Sp)m]y、(Sp)t[(Op)n(Sp)m]y(Rp)k。在一些實施方式中，核心的骨架手性中心模式包含或係[(Rp)n(Sp)m]y(Rp)k、[(Rp)n(Sp)m]y、(Sp)t[(Rp)n(Sp)m]y、或(Sp)t[(Rp)n(Sp)m]y(Rp)k。在一些實施方式中，核心的骨架手性中心模式包含[(Rp)n(Sp)m]y(Rp)k。在一些實施方式中，核心的骨架手性中心模式包含[(Rp)n(Sp)m]y(Rp)。在一些實施方式中，核心的骨架手性中心模式包含[(Rp)n(Sp)m]y。在一些實施方式中，核心的骨架手性中心模式包含(Sp)t[(Rp)n(Sp)m]y。在一些實施方式中，核心的骨架手性中心模式包含(Sp)t[(Rp)n(Sp)m]y(Rp)k。在一些實施方式中，核心的骨架手性中心模式包含(Sp)t[(Rp)n(Sp)m]y(Rp)。在一些實施方式中，核心的骨架手性中心模式係[(Rp)n(Sp)m]y(Rp)k。在一些實施方式中，核心的骨架手性中心模式係[(Rp)n(Sp)m]y(Rp)。在一些實施方式中，核心的骨架手性中心模式係[(Rp)n(Sp)m]y。在一些實施方式中，核心的骨架手性中心模式係(Sp)t[(Rp)n(Sp)m]y。在一些實施方式中，核心的骨架手性中心模式係(Sp)t[(Rp)n(Sp)m]y(Rp)k。在一些實施方式中，核心的骨架手性中心模式係(Sp)t[(Rp)n(Sp)m]y(Rp)。在一些實施方式中，每個n係1。在一些實施方式中，每個t係1。在一些實施方式中，t係2、3、4、5、6、7、8、9或10。在一些實施方式中，t和n各自係1。在一些實施方式中，每個m係2或更大。在一些實施方式中，k係1。在一些實施方式中，k係2-10。
在一些實施方式中，骨架手性中心模式包含或係(Sp)m(Rp)n、(Rp)n(Sp)m、(Np)t(Rp)n(Sp)m、(Sp)t(Rp)n(Sp)m、(Np)t[(Rp)n(Sp)m]2、(Sp)t[(Rp)n(Sp)m]2、(Np)t(Op)n(Sp)m、(Sp)t(Op)n(Sp)m、(Np)t[(Op)n(Sp)m]2、或(Sp)t[(Op)n(Sp)m]2。在一些實施方式中，模式係(Np)t(Op/Rp)n(Sp)m(Op/Rp)n(Sp)m。在一些實施方式中，模式係(Np)t(Op/Rp)n(Sp)1-5(Op/Rp)n(Sp)m。在一些實施方式中，模式係(Np)t(Op/Rp)n(Sp)2-5(Op/Rp)n(Sp)m。在一些實施方式中，模式係(Np)t(Op/Rp)n(Sp)2(Op/Rp)n(Sp)m。在一些實施方式中，模式係(Np)t(Op/Rp)n(Sp)3(Op/Rp)n(Sp)m。在一些實施方式中，模式係(Np)t(Op/Rp)n(Sp)4(Op/Rp)n(Sp)m。在一些實施方式中，模式係(Np)t(Op/Rp)n(Sp)5(Op/Rp)n(Sp)m。
在一些實施方式中，Np係Sp。在一些實施方式中，(Op/Rp)係Op。在一些實施方式中，(Op/Rp)係Rp。在一些實施方式中，Np係Sp且(Op/Rp)係Rp。在一些實施方式中，Np係Sp且(Op/Rp)係Op。在一些實施方式中，Np係Sp且至少一個(Op/Rp)係Rp，並且至少一個(Op/Rp)係Op。在一些實施方式中，骨架手性中心模式包含或係(Rp)n(Sp)m、(Np)t(Rp)n(Sp)m、或(Sp)t(Rp)n(Sp)m，其中m ＞ 2。在一些實施方式中，骨架手性中心模式包含或係(Rp)n(Sp)m、(Np)t(Rp)n(Sp)m、或(Sp)t(Rp)n(Sp)m，其中n係1，至少一個t ＞ 1，並且至少一個m ＞ 2。
在一些實施方式中，包含核心區域（其骨架手性中心模式以Rp開始）的寡核苷酸可以提供高活性和/或改善的特性。在一些實施方式中，包含核心區域（其骨架手性中心模式以Rp結束）的寡核苷酸可以提供高活性和/或改善的特性。在一些實施方式中，包含核心區域（其骨架手性中心模式以Rp開始）的寡核苷酸提供了高活性（例如，靶切割），而不顯著影響其特性（例如穩定性）。在一些實施方式中，包含核心區域（其骨架手性中心模式以Rp結束）的寡核苷酸提供了高活性（例如，靶切割），而不顯著影響其特性（例如穩定性）。在一些實施方式中，骨架手性中心模式以Rp開始並以Sp結束。在一些實施方式中，骨架手性中心模式以Rp開始並以Rp結束。在一些實施方式中，骨架手性中心模式以Sp開始並以Rp結束。通常，對於骨架手性中心模式，在核心區域的模式中包括連接核心核苷和聯翼核苷的核苷酸間鍵聯。在本揭露中描述的許多實施方式中（例如，表1中的多種寡核苷酸），藉由這種連接核苷酸間鍵聯而連接的翼糖具有與藉由相同連接核苷酸間鍵聯而連接的核心糖不同的結構（例如，在一些實施方式中，翼糖包含2'-修飾，而核心糖不含有相同的2'-修飾或在2'位置具有兩個-H）。在一些實施方式中，翼糖包含核心糖不包含的糖修飾。在一些實施方式中，翼糖係經修飾的糖，而核心糖係天然DNA糖。在一些實施方式中，翼糖在2'位置包括糖修飾（在2'位置少於兩個-H），核心糖在2'位置不具有修飾（在2'位置的兩個-H）。
在一些實施方式中，如本文所證明，另外的Rp核苷酸間鍵聯連接不含2’-取代基的糖（例如，核心糖）和包含2’-修飾的糖（例如，2’-OR’，其中R’係視需要取代的C1-6 脂肪族（例如，2’-OMe、2’-MOE等），其可以是翼糖）。在一些實施方式中，將不含有2’-取代基的糖連接至5’端（例如，至糖的3’-碳）並將含有2’-修飾的糖連接至3’端（例如，至糖的5’-碳）的核苷酸間鍵聯係Rp核苷酸間鍵聯。在一些實施方式中，將不含有2’-取代基的糖連接至3’端（例如，至糖的5’-碳）並將含有2’-修飾的糖連接至5’端（例如，至糖的3’-碳）的核苷酸間鍵聯係Rp核苷酸間鍵聯。在一些實施方式中，連接不含有2'-取代基的糖和包含2'-修飾的糖的每個核苷酸間鍵聯獨立地是Rp核苷酸間鍵聯。在一些實施方式中，Rp核苷酸間鍵聯係Rp硫代磷酸酯核苷酸間鍵聯。
在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸或其區域（例如核心）的骨架手性中心模式包含或係(Op)[(Rp/Op)n(Sp)m]y(Rp)k(Op)、(Op)[(Rp/Op)n(Sp)m]y(Op)、(Op)(Sp)t[(Rp/Op)n(Sp)m]y(Op)、或(Op)(Sp)t[(Rp/Op)n(Sp)m]y(Rp)k(Op)，其中k係1-50，並且其他變數各自獨立地如本揭露中所述。在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸的骨架手性中心模式包含或係(Op)[(Rp/Op)n(Sp)m]y(Rp)k(Op)、(Op)[(Rp/Op)n(Sp)m]y(Op)、(Op)(Sp)t[(Rp/Op)n(Sp)m]y(Op)、或(Op)(Sp)t[(Rp/Op)n(Sp)m]y(Rp)k(Op)，其中f、g、h和j各自獨立地是1-50，並且其他變數各自獨立地如本揭露中所述，並且該寡核苷酸包含核心區域，該核心區域的骨架手性中心模式包含或係本揭露中所述之[(Rp/Op)n(Sp)m]y(Rp)k、[(Rp/Op)n(Sp)m]y、(Sp)t[(Rp/Op)n(Sp)m]y、或(Sp)t[(Rp/Op)n(Sp)m]y(Rp)k。在一些實施方式中，骨架手性中心模式係或包含(Op)[(Rp/Op)n(Sp)m]y(Rp)k(Op)。在一些實施方式中，骨架手性中心模式係或包含(Op)[(Rp/Op)n(Sp)m]y(Rp)(Op)。在一些實施方式中，骨架手性中心模式係或包含(Op)[(Rp/Op)n(Sp)m]y(Op)。在一些實施方式中，骨架手性中心模式係或包含(Op)(Sp)t[(Rp/Op)n(Sp)m]y(Op)。在一些實施方式中，骨架手性中心模式係或包含(Op)(Sp)t[(Rp/Op)n(Sp)m]y(Rp)k(Op)。在一些實施方式中，骨架手性中心模式係或包含(Op)(Sp)t[(Rp/Op)n(Sp)m]y(Rp)(Op)。在一些實施方式中，骨架手性中心模式係或包含(Op)[(Rp)n(Sp)m]y(Rp)k(Op)。在一些實施方式中，骨架手性中心模式係或包含(Op)[(Rp)n(Sp)m]y(Rp)(Op)。在一些實施方式中，骨架手性中心模式係或包含(Op)[(Rp)n(Sp)m]y(Op)。在一些實施方式中，骨架手性中心模式係或包含(Op)(Sp)t[(Rp)n(Sp)m]y(Op)。在一些實施方式中，骨架手性中心模式係或包含(Op)(Sp)t[(Rp)n(Sp)m]y(Rp)k(Op)。在一些實施方式中，骨架手性中心模式係或包含(Op)(Sp)t[(Rp)n(Sp)m]y(Rp)(Op)。在一些實施方式中，每個n係1。在一些實施方式中，k係1。在一些實施方式中，k係2-10。
在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸或其區域（例如核心）的骨架手性中心模式包含或係(Np)f(Op)g[(Rp/Op)n(Sp)m]y(Rp)k(Op)h(Np)j、(Np)f(Op)g[(Rp/Op)n(Sp)m]y(Op)h(Np)j、(Np)f(Op)g(Sp)t[(Rp/Op)n(Sp)m]y(Op)h(Np)j、或(Np)f(Op)g(Sp)t[(Rp/Op)n(Sp)m]y(Rp)k(Op)h(Np)j，其中f、g、h和j各自獨立地是1-50，並且其他變數各自獨立地如本揭露中所述。在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸的骨架手性中心模式包含或係(Np)f(Op)g[(Rp/Op)n(Sp)m]y(Rp)k(Op)h(Np)j、(Np)f(Op)g[(Rp/Op)n(Sp)m]y(Op)h(Np)j、(Np)f(Op)g(Sp)t[(Rp/Op)n(Sp)m]y(Op)h(Np)j、或(Np)f(Op)g(Sp)t[(Rp/Op)n(Sp)m]y(Rp)k(Op)h(Np)j，並且該寡核苷酸包含核心區域，該核心區域的骨架手性中心模式包含或係本揭露中所述之[(Rp/Op)n(Sp)m]y(Rp)k、[(Rp/Op)n(Sp)m]y、(Sp)t[(Rp/Op)n(Sp)m]y、或(Sp)t[(Rp/Op)n(Sp)m]y(Rp)k。在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸的骨架手性中心模式係(Np)f(Op)g[(Rp/Op)n(Sp)m]y(Rp)k(Op)h(Np)j、(Np)f(Op)g[(Rp/Op)n(Sp)m]y(Op)h(Np)j、(Np)f(Op)g(Sp)t[(Rp/Op)n(Sp)m]y(Op)h(Np)j、或(Np)f(Op)g(Sp)t[(Rp/Op)n(Sp)m]y(Rp)k(Op)h(Np)j，並且該寡核苷酸包含核心區域，該核心區域的骨架手性中心模式包含或係本揭露中所述之[(Rp/Op)n(Sp)m]y(Rp)k、[(Rp/Op)n(Sp)m]y、(Sp)t[(Rp/Op)n(Sp)m]y、或(Sp)t[(Rp/Op)n(Sp)m]y(Rp)k。在一些實施方式中，骨架手性中心模式係或包含(Np)f(Op)g[(Rp/Op)n(Sp)m]y(Rp)k(Op)h(Np)j。在一些實施方式中，骨架手性中心模式係或包含(Np)f(Op)g[(Rp/Op)n(Sp)m]y(Rp)(Op)h(Np)j。在一些實施方式中，骨架手性中心模式係或包含(Np)f(Op)g[(Rp/Op)n(Sp)m]y(Op)h(Np)j。在一些實施方式中，骨架手性中心模式係或包含(Np)f(Op)g(Sp)t[(Rp/Op)n(Sp)m]y(Op)h(Np)j。在一些實施方式中，骨架手性中心模式係或包含(Np)f(Op)g(Sp)t[(Rp/Op)n(Sp)m]y(Rp)k(Op)h(Np)j。在一些實施方式中，骨架手性中心模式係或包含(Np)f(Op)g(Sp)t[(Rp/Op)n(Sp)m]y(Rp)(Op)h(Np)j。在一些實施方式中，骨架手性中心模式係或包含(Np)f(Op)g[(Rp)n(Sp)m]y(Rp)k(Op)h(Np)j。在一些實施方式中，骨架手性中心模式係或包含(Np)f(Op)g[(Rp)n(Sp)m]y(Rp)(Op)h(Np)j。在一些實施方式中，骨架手性中心模式係或包含(Np)f(Op)g[(Rp)n(Sp)m]y(Op)h(Np)j。在一些實施方式中，骨架手性中心模式係或包含(Np)f(Op)g(Sp)t[(Rp)n(Sp)m]y(Op)h(Np)j。在一些實施方式中，骨架手性中心模式係或包含(Np)f(Op)g(Sp)t[(Rp)n(Sp)m]y(Rp)k(Op)h(Np)j。在一些實施方式中，骨架手性中心模式係或包含(Np)f(Op)g(Sp)t[(Rp)n(Sp)m]y(Rp)(Op)h(Np)j。在一些實施方式中，至少一個Np係Sp。在一些實施方式中，至少一個Np係Rp。在一些實施方式中，5’最大Np係Sp。在一些實施方式中，3’最大Np係Sp。在一些實施方式中，每個Np係Sp。在一些實施方式中，(Np)f(Op)g[(Rp/Op)n(Sp)m]y(Rp)k(Op)h(Np)j係S(Sp)(Op)g[(Rp)n(Sp)m]y(Rp)k(Op)h(Sp)。在一些實施方式中，(Np)f(Op)g[(Rp/Op)n(Sp)m]y(Rp)k(Op)h(Np)j係S(Sp)(Op)g[(Rp)n(Sp)m]y(Rp)(Op)h(Sp)。在一些實施方式中，寡核苷酸的骨架手性中心模式係或包含(Sp)(Op)g[(Rp)n(Sp)m]y(Rp)(Op)h(Sp)。在一些實施方式中，寡核苷酸的骨架手性中心模式係(Sp)(Op)g[(Rp)n(Sp)m]y(Rp)(Op)h(Sp)。在一些實施方式中，(Np)f(Op)g[(Rp/Op)n(Sp)m]y(Op)h(Np)j係(Sp)(Op)g[(Rp)n(Sp)m]y(Op)h(Sp)。在一些實施方式中，寡核苷酸的骨架手性中心模式係或包含(Sp)(Op)g[(Rp)n(Sp)m]y(Op)h(Sp)。在一些實施方式中，寡核苷酸的骨架手性中心模式係(Sp)(Op)g[(Rp)n(Sp)m]y(Op)h(Sp)。在一些實施方式中，(Np)f(Op)g(Sp)t[(Rp/Op)n(Sp)m]y(Op)h(Np)j係(Sp)(Op)g(Sp)t[(Rp)n(Sp)m]y(Op)h(Sp)。在一些實施方式中，寡核苷酸的骨架手性中心模式係或包含(Sp)(Op)g(Sp)t[(Rp)n(Sp)m]y(Op)h(Sp)。在一些實施方式中，寡核苷酸的骨架手性中心模式係(Sp)(Op)g(Sp)t[(Rp)n(Sp)m]y(Op)h(Sp)。在一些實施方式中，(Np)f(Op)g(Sp)t[(Rp/Op)n(Sp)m]y(Rp)k(Op)h(Np)j係(Sp)(Op)g(Sp)t[(Rp)n(Sp)m]y(Rp)k(Op)h(Sp)。在一些實施方式中，(Np)f(Op)g(Sp)t[(Rp/Op)n(Sp)m]y(Rp)k(Op)h(Np)j係(Sp)(Op)g(Sp)t[(Rp)n(Sp)m]y(Rp)(Op)h(Sp)。在一些實施方式中，寡核苷酸的骨架手性中心模式係或包含(Sp)(Op)g(Sp)t[(Rp)n(Sp)m]y(Rp)(Op)h(Sp)。在一些實施方式中，寡核苷酸的骨架手性中心模式係(Sp)(Op)g(Sp)t[(Rp)n(Sp)m]y(Rp)(Op)h(Sp)。在一些實施方式中，每個n係1。在一些實施方式中，f係1。在一些實施方式中，g係1。在一些實施方式中，g大於1。在一些實施方式中，g係2。在一些實施方式中，g係3。在一些實施方式中，g係4。在一些實施方式中，g為5。在一些實施方式中，g係6。在一些實施方式中，g係7。在一些實施方式中，g係8。在一些實施方式中，g係9。在一些實施方式中，g係10。在一些實施方式中，h係1。在一些實施方式中，h大於1。在一些實施方式中，h係2。在一些實施方式中，h係3。在一些實施方式中，h係4。在一些實施方式中，h係5。在一些實施方式中，h係6。在一些實施方式中，h係7。在一些實施方式中，h係8。在一些實施方式中，h係9。在一些實施方式中，h係10。在一些實施方式中，j係1。在一些實施方式中，k係1。在一些實施方式中，k係2-10。
在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸或其區域（例如核心）的骨架手性中心模式包含或係[(Rp/Op)n(Sp)m]y、(Sp)t[(Rp/Op)n(Sp)m]y、(Sp)t[(Rp/Op)n(Sp)m]yRp、[(Rp/Op)n(Sp)m]y(Rp)k、(Sp)t[(Rp/Op)n(Sp)m]y(Rp)k、(Sp)t[(Rp/Op)n(Sp)m]y(Rp)k(Op)h、(Sp)t[(Rp/Op)n(Sp)m]y(Rp)k(Op)h(Np)j，其中每個變數獨立地是如本揭露中所述之。
在一些實施方式中，在提供的骨架手性中心模式中，至少一個(Rp/Op)係Rp。在一些實施方式中，至少一個(Rp/Op)係Op。在一些實施方式中，每個(Rp/Op)係Rp。在一些實施方式中，每個(Rp/Op)係Op。在一些實施方式中，模式的[(Rp)n(Sp)m]y或[(Rp/Op)n(Sp)m]y的至少一個係RpSp。在一些實施方式中，模式的[(Rp)n(Sp)m]y或[(Rp/Op)n(Sp)m]y的至少一個係或包含RpSpSp。在一些實施方式中，模式中[(Rp)n(Sp)m]y或[(Rp/Op)n(Sp)m]y的至少一個係RpSp，並且模式中[(Rp)n(Sp)m]y或[(Rp/Op)n(Sp)m]y的至少一個係或包含RpSpSp。例如，在一些實施方式中，模式中[(Rp)n(Sp)m]y係(RpSp)[(Rp)n(Sp)m](y-1) ；在一些實施方式中，模式中[(Rp)n(Sp)m]y係(RpSp)[RpSpSp(Sp)(m-2) ][(Rp)n(Sp)m](y-2) 。在一些實施方式中，(Sp)t[(Rp)n(Sp)m]y(Rp)係(Sp)t(RpSp)[(Rp)n(Sp)m](y-1) (Rp)。在一些實施方式中，(Sp)t[(Rp)n(Sp)m]y(Rp)係(Sp)t(RpSp)[RpSpSp(Sp)(m-2) ][(Rp)n(Sp)m](y-2) (Rp)。在一些實施方式中，每個[(Rp/Op)n(Sp)m]獨立地是[Rp(Sp)m]。在一些實施方式中，(Sp)t的第一Sp表示從5'至3'的寡核苷酸的第一核苷酸間鍵聯的鍵聯磷立體化學。在一些實施方式中，(Sp)t的第一Sp表示從5'至3'的區域（例如，核心）的第一核苷酸間鍵聯的鍵聯磷立體化學。在一些實施方式中，(Np)j的最後Np代表從5'至3'的寡核苷酸的最後核苷酸間鍵聯的鍵聯磷立體化學。在一些實施方式中，最後Np係Sp。
在一些實施方式中，寡核苷酸或區域的（例如5'-翼的）骨架手性中心模式係或包含Sp(Op)3 。在一些實施方式中，寡核苷酸或區域的（例如5'-翼的）骨架手性中心模式係或包含Rp(Op)3 。在一些實施方式中，寡核苷酸或區域的（例如3'-翼的）骨架手性中心模式係或包含(Op)3 Sp。在一些實施方式中，寡核苷酸或區域的（例如3'-翼的）骨架手性中心模式係或包含(Op)3 Rp。在一些實施方式中，寡核苷酸或區域的（例如核心的）骨架手性中心模式係或包含Rp(Sp)4 Rp(Sp)4 Rp。在一些實施方式中，寡核苷酸或區域的（例如核心的）骨架手性中心模式係或包含(Sp)5 Rp(Sp)4 Rp。在一些實施方式中，寡核苷酸或區域的（例如核心的）骨架手性中心模式係或包含(Sp)5 Rp(Sp)5 。在一些實施方式中，寡核苷酸或區域的（例如核心的）骨架手性中心模式係或包含Rp(Sp)4 Rp(Sp)5 。在一些實施方式中，寡核苷酸的骨架手性中心模式係或包含Np(Op)3 Rp(Sp)4 Rp(Sp)4 Rp(Op)3 Np。在一些實施方式中，寡核苷酸的骨架手性中心模式係或包含Np(Op)3 (Sp)5 Rp(Sp)4 Rp(Op)3 Np。在一些實施方式中，寡核苷酸的骨架手性中心模式係或包含Np(Op)3 (Sp)5 Rp(Sp)5 (Op)3 Np。在一些實施方式中，寡核苷酸的骨架手性中心模式係或包含Np(Op)3 Rp(Sp)4 Rp(Sp)5 (Op)3 Np。在一些實施方式中，寡核苷酸的骨架手性中心模式係或包含Sp(Op)3 Rp(Sp)4 Rp(Sp)4 Rp(Op)3 Sp。在一些實施方式中，寡核苷酸的骨架手性中心模式係或包含Sp(Op)3 (Sp)5 Rp(Sp)4 Rp(Op)3 Sp。在一些實施方式中，寡核苷酸的骨架手性中心模式係或包含Sp(Op)3 (Sp)5 Rp(Sp)5 (Op)3 Sp。在一些實施方式中，寡核苷酸的骨架手性中心模式係或包含Sp(Op)3 Rp(Sp)4 Rp(Sp)5 (Op)3 Sp。在一些實施方式中，寡核苷酸的骨架手性中心模式係或包含Rp(Op)3 Rp(Sp)4 Rp(Sp)4 Rp(Op)3 Rp。在一些實施方式中，寡核苷酸的骨架手性中心模式係或包含Rp(Op)3 (Sp)5 Rp(Sp)4 Rp(Op)3 Rp。在一些實施方式中，寡核苷酸的骨架手性中心模式係或包含Rp(Op)3 (Sp)5 Rp(Sp)5 (Op)3 Rp。在一些實施方式中，寡核苷酸的骨架手性中心模式係或包含Rp(Op)3 Rp(Sp)4 Rp(Sp)5 (Op)3 Rp。
在一些實施方式中，m、y、t、n、k、f、g、h、和j各自獨立地是1-25。
在一些實施方式中，m係1-25。在一些實施方式中，m係1-20。在一些實施方式中，m係1-15。在一些實施方式中，m係1-10。在一些實施方式中，m係1-5。在一些實施方式中，m係2-20。在一些實施方式中，m係2-15。在一些實施方式中，m係2-10。在一些實施方式中，m係2-5。在一些實施方式中，m係1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24或25。在一些實施方式中，在骨架手性中心模式中，每個m獨立地是2或更大。在一些實施方式中，每個m獨立地是2、3、4、5、6、7、8、9或10。在一些實施方式中，每個m獨立地是2-3、2-5、2-6或2-10。在一些實施方式中，m係2。在一些實施方式中，m係3。在一些實施方式中，m係4。在一些實施方式中，m係5。在一些實施方式中，m係6。在一些實施方式中，m係7。在一些實施方式中，m係8。在一些實施方式中，m係9。在一些實施方式中，m係10。在一些實施方式中，在存在兩個或更多個m的情況下，它們可以相同或不同，並且它們各自獨立地如本揭露中所描述。
在一些實施方式中，y係1-25。在一些實施方式中，y係1-20。在一些實施方式中，y係1-15。在一些實施方式中，y係1-10。在一些實施方式中，y係1-5。在一些實施方式中，y係2-20。在一些實施方式中，y係2-15。在一些實施方式中，y係2-10。在一些實施方式中，y係2-5。在一些實施方式中，y係1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24或25。在一些實施方式中，y係1、2、3、4、5、6、7、8、9、或10。在一些實施方式中，y係1。在一些實施方式中，y係2。在一些實施方式中，y係3。在一些實施方式中，y係4。在一些實施方式中，y係5。在一些實施方式中，y係6。在一些實施方式中，y係7。在一些實施方式中，y係8。在一些實施方式中，y係9。在一些實施方式中，y係10。
在一些實施方式中，t係1-25。在一些實施方式中，t係1-20。在一些實施方式中，t係1-15。在一些實施方式中，t係1-10。在一些實施方式中，t係1-5。在一些實施方式中，t係2-20。在一些實施方式中，t係2-15。在一些實施方式中，t係2-10。在一些實施方式中，t係2-5。在一些實施方式中，t係1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24或25。在一些實施方式中，每個t獨立地是1、2、3、4、5、6、7、8、9或10。在一些實施方式中，t係2或更大。在一些實施方式中，t係1。在一些實施方式中，t係2。在一些實施方式中，t係3。在一些實施方式中，t係4。在一些實施方式中，t係5。在一些實施方式中，t係6。在一些實施方式中，t係7。在一些實施方式中，t係8。在一些實施方式中，t係9。在一些實施方式中，t係10。在一些實施方式中，在存在兩個或更多個t的情況下，它們可以相同或不同，並且它們各自獨立地如本揭露中所描述。
在一些實施方式中，n係1-25。在一些實施方式中，n係1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24或25。在一些實施方式中，n係1。在一些實施方式中，n係2。在一些實施方式中，n係3。在一些實施方式中，n係4。在一些實施方式中，n係5。在一些實施方式中，n係6。在一些實施方式中，n係7。在一些實施方式中，n係8。在一些實施方式中，n係9。在一些實施方式中，n係10。在一些實施方式中，在存在兩個或更多個n的情況下，它們可以相同或不同，並且它們各自獨立地如本揭露中所描述。在很多實施方式中，在骨架手性中心模式中，n的至少一次出現係1；在一些情況下，每個n係1。
在一些實施方式中，k係1-25。在一些實施方式中，k係1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24或25。在一些實施方式中，k係1。在一些實施方式中，k係2。在一些實施方式中，k係3。在一些實施方式中，k係4。在一些實施方式中，k係5。在一些實施方式中，k係6。在一些實施方式中，k係7。在一些實施方式中，k係8。在一些實施方式中，k係9。在一些實施方式中，k係10。
在一些實施方式中，f係1-25。在一些實施方式中，f係1-20。在一些實施方式中，f係1-10。在一些實施方式中，f係1-5。在一些實施方式中，f係1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24或25。在一些實施方式中，f係1。在一些實施方式中，f係2。在一些實施方式中，f係3。在一些實施方式中，f係4。在一些實施方式中，f係5。在一些實施方式中，f係6。在一些實施方式中，f係7。在一些實施方式中，f係8。在一些實施方式中，f係9。在一些實施方式中，f係10。
在一些實施方式中，g係1-25。在一些實施方式中，g係1-20。在一些實施方式中，g係1-10。在一些實施方式中，g係1-5。在一些實施方式中，g係2-10。在一些實施方式中，g係2-5。在一些實施方式中，g係1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24或25。在一些實施方式中，g係1。在一些實施方式中，g係2。在一些實施方式中，g係3。在一些實施方式中，g係4。在一些實施方式中，g為5。在一些實施方式中，g係6。在一些實施方式中，g係7。在一些實施方式中，g係8。在一些實施方式中，g係9。在一些實施方式中，g係10。
在一些實施方式中，h係1-25。在一些實施方式中，h係1-10。在一些實施方式中，h係1-5。在一些實施方式中，h係2-10。在一些實施方式中，h係2-5。在一些實施方式中，h係1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24或25。在一些實施方式中，h係1。在一些實施方式中，h係2。在一些實施方式中，h係3。在一些實施方式中，h係4。在一些實施方式中，h係5。在一些實施方式中，h係6。在一些實施方式中，h係7。在一些實施方式中，h係8。在一些實施方式中，h係9。在一些實施方式中，h係10。
在一些實施方式中，j係1-25。在一些實施方式中，j係1-10。在一些實施方式中，j係1-5。在一些實施方式中，j係1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24或25。在一些實施方式中，j係1。在一些實施方式中，j係2。在一些實施方式中，j係3。在一些實施方式中，j係4。在一些實施方式中，j係5。在一些實施方式中，j係6。在一些實施方式中，j係7。在一些實施方式中，j係8。在一些實施方式中，j係9。在一些實施方式中，j係10。
在一些實施方式中，至少一個n係1，且至少一個m不小於2。在一些實施方式中，至少一個n係1，至少一個t不小於2，且至少一個m不小於3。在一些實施方式中，每個n係1。在一些實施方式中，t係1。在一些實施方式中，至少一個t ＞ 1。在一些實施方式中，至少一個t ＞ 2。在一些實施方式中，至少一個t ＞ 3。在一些實施方式中，至少一個t ＞ 4。在一些實施方式中，至少一個m ＞ 1。在一些實施方式中，至少一個m ＞ 2。在一些實施方式中，至少一個m ＞ 3。在一些實施方式中，至少一個m ＞ 4。在一些實施方式中，骨架手性中心模式包含一個或多個非手性天然磷酸酯鍵聯。在一些實施方式中，m、t和n的總和（或在一種模式中無t時，m和n的總和）不小於5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20。在一些實施方式中，該總和為5。在一些實施方式中，該總和為6。在一些實施方式中，該總和為7。在一些實施方式中，該總和為8。在一些實施方式中，該總和為9。在一些實施方式中，該總和為10。在一些實施方式中，該總和為11。在一些實施方式中，該總和為12。在一些實施方式中，該總和為13。在一些實施方式中，該總和為14。在一些實施方式中，該總和為15。
在一些實施方式中，在手性受控的核苷酸間鍵聯中的許多鍵聯磷係Sp。在一些實施方式中，至少10%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%或95%的手性受控的核苷酸間鍵聯具有Sp鍵聯磷。在一些實施方式中，所有手性核苷酸間鍵聯中的至少10%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%或95%係具有Sp鍵聯磷的手性受控的核苷酸間鍵聯。在一些實施方式中，所有核苷酸間鍵聯中的至少10%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%或95%係具有Sp鍵聯磷的手性受控的核苷酸間鍵聯。在一些實施方式中，百分比為至少20%。在一些實施方式中，百分比為至少30%。在一些實施方式中，百分比為至少40%。在一些實施方式中，百分比為至少50%。在一些實施方式中，百分比為至少60%。在一些實施方式中，百分比為至少65%。在一些實施方式中，百分比為至少70%。在一些實施方式中，百分比為至少75%。在一些實施方式中，百分比為至少80%。在一些實施方式中，百分比為至少90%。在一些實施方式中，百分比為至少95%。在一些實施方式中，至少1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24或25個核苷酸間鍵聯係具有Sp鍵聯磷的手性受控的核苷酸間鍵聯。在一些實施方式中，至少5個核苷酸間鍵聯係具有Sp鍵聯磷的手性受控的核苷酸間鍵聯。在一些實施方式中，至少6個核苷酸間鍵聯係具有Sp鍵聯磷的手性受控的核苷酸間鍵聯。在一些實施方式中，至少7個核苷酸間鍵聯係具有Sp鍵聯磷的手性受控的核苷酸間鍵聯。在一些實施方式中，至少8個核苷酸間鍵聯係具有Sp鍵聯磷的手性受控的核苷酸間鍵聯。在一些實施方式中，至少9個核苷酸間鍵聯係具有Sp鍵聯磷的手性受控的核苷酸間鍵聯。在一些實施方式中，至少10個核苷酸間鍵聯係具有Sp鍵聯磷的手性受控的核苷酸間鍵聯。在一些實施方式中，至少11個核苷酸間鍵聯係具有Sp鍵聯磷的手性受控的核苷酸間鍵聯。在一些實施方式中，至少12個核苷酸間鍵聯係具有Sp鍵聯磷的手性受控的核苷酸間鍵聯。在一些實施方式中，至少13個核苷酸間鍵聯係具有Sp鍵聯磷的手性受控的核苷酸間鍵聯。在一些實施方式中，至少14個核苷酸間鍵聯係具有Sp鍵聯磷的手性受控的核苷酸間鍵聯。在一些實施方式中，至少15個核苷酸間鍵聯係具有Sp鍵聯磷的手性受控的核苷酸間鍵聯。在一些實施方式中，至少1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24或25個核苷酸間鍵聯係具有Rp鍵聯磷的手性受控的核苷酸間鍵聯。在一些實施方式中，不超過1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24或25個核苷酸間鍵聯係具有Rp鍵聯磷的手性受控的核苷酸間鍵聯。在一些實施方式中，寡核苷酸中的一個且不超過一個核苷酸間鍵聯係具有Rp鍵聯磷的手性受控的核苷酸間鍵聯。在一些實施方式中，寡核苷酸中的2個且不超過2個核苷酸間鍵聯係具有Rp鍵聯磷的手性受控的核苷酸間鍵聯。在一些實施方式中，寡核苷酸中的3個且不超過3個核苷酸間鍵聯係具有Rp鍵聯磷的手性受控的核苷酸間鍵聯。在一些實施方式中，寡核苷酸中的4個且不超過4個核苷酸間鍵聯係具有Rp鍵聯磷的手性受控的核苷酸間鍵聯。在一些實施方式中，寡核苷酸中的5個且不超過5個核苷酸間鍵聯係具有Rp鍵聯磷的手性受控的核苷酸間鍵聯。
在一些實施方式中，寡核苷酸中所有、基本上所有或大部分核苷酸間鍵聯呈Sp構型（例如，寡核苷酸中所有手性受控的核苷酸間鍵聯中、或所有手性核苷酸間鍵聯中、或所有核苷酸間鍵聯中約50%-100%、55%-100%、60%-100%、65%-100%、70%-100%、75%-100%、80%-100%、85%-100%、90%-100%、55%-95%、60%-95%、65%-95%、或約55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、97%、99%或更多），除了一個或少數核苷酸間鍵聯（例如，寡核苷酸中所有手性受控的核苷酸間鍵聯中、或所有手性核苷酸間鍵聯中、或所有核苷酸間鍵聯中1、2、3、4或5個、和/或少於50%、45%、40%、35%、30%、25%、20%、15%、10%或5%）呈Rp構型。在一些實施方式中，核心中所有、基本上所有或大部分核苷酸間鍵聯呈Sp構型（例如，核心中所有手性受控的核苷酸間鍵聯中、或所有手性核苷酸間鍵聯中、或所有核苷酸間鍵聯中約50%-100%、55%-100%、60%-100%、65%-100%、70%-100%、75%-100%、80%-100%、85%-100%、90%-100%、55%-95%、60%-95%、65%-95%、或約55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、97%、99%或更多），除了一個或少數核苷酸間鍵聯（例如，核心中所有手性受控的核苷酸間鍵聯中、或所有手性核苷酸間鍵聯中、或所有核苷酸間鍵聯中1、2、3、4或5個、和/或少於50%、45%、40%、35%、30%、25%、20%、15%、10%或5%）呈Rp構型。在一些實施方式中，核心中所有、基本上所有或大部分核苷酸間鍵聯係呈Sp構型的硫代磷酸酯（例如，核心中所有手性受控的核苷酸間鍵聯中、或所有手性核苷酸間鍵聯中、或所有核苷酸間鍵聯中約50%-100%、55%-100%、60%-100%、65%-100%、70%-100%、75%-100%、80%-100%、85%-100%、90%-100%、55%-95%、60%-95%、65%-95%、或約55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、97%、99%或更多），除了一個或少數核苷酸間鍵聯（例如，核心中所有手性受控的核苷酸間鍵聯中、或所有手性核苷酸間鍵聯中、或所有核苷酸間鍵聯中1、2、3、4或5個、和/或少於50%、45%、40%、35%、30%、25%、20%、15%、10%或5%）係呈Rp構型的硫代磷酸酯。在一些實施方式中，核心中每個核苷酸間鍵聯係呈Sp構型的硫代磷酸酯，除了一個係呈Rp構型的硫代磷酸酯。在一些實施方式中，核心中每個核苷酸間鍵聯係呈Sp構型的硫代磷酸酯，除了一個係呈Rp構型的硫代磷酸酯。
在一些實施方式中，寡核苷酸包含一個或多個Rp核苷酸間鍵聯。在一些實施方式中，寡核苷酸包含一個且不超過一個Rp核苷酸間鍵聯。在一些實施方式中，寡核苷酸包含兩個或更多個Rp核苷酸間鍵聯。在一些實施方式中，寡核苷酸包含三個或多個Rp核苷酸間鍵聯。在一些實施方式中，寡核苷酸包含四個或多個Rp核苷酸間鍵聯。在一些實施方式中，寡核苷酸包含五個或更多個Rp核苷酸間鍵聯。在一些實施方式中，寡核苷酸中所有手性受控的核苷酸間鍵聯中約5%-50%係Rp。在一些實施方式中，寡核苷酸中所有手性受控的核苷酸間鍵聯中約5%-40%係Rp。在一些實施方式中，寡核苷酸中所有手性受控的核苷酸間鍵聯中約10%-40%係Rp。在一些實施方式中，寡核苷酸中所有手性受控的核苷酸間鍵聯中約15%-40%係Rp。在一些實施方式中，寡核苷酸中所有手性受控的核苷酸間鍵聯中約20%-40%係Rp。在一些實施方式中，寡核苷酸中所有手性受控的核苷酸間鍵聯中約25%-40%係Rp。在一些實施方式中，寡核苷酸中所有手性受控的核苷酸間鍵聯中約30%-40%係Rp。在一些實施方式中，寡核苷酸中所有手性受控的核苷酸間鍵聯中約35%-40%係Rp。
在一些實施方式中，代替Rp核苷酸間鍵聯，可以類似地利用天然磷酸酯鍵聯，視需要具有修飾，例如糖修飾（例如5'-修飾，例如本文所述之R5s ）。在一些實施方式中，修飾改善了天然磷酸酯鍵聯的穩定性。
在一些實施方式中，本揭露提供了具有如本文所述之骨架手性中心模式的寡核苷酸。在一些實施方式中，手性受控的寡核苷酸組成物中的寡核苷酸共用如本文所述之共同的骨架手性中心模式。
在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸的至少約25%核苷酸間鍵聯係手性受控的且具有Sp鍵聯磷。在一些實施方式中，寡核苷酸的至少約30%的核苷酸間鍵聯係手性受控的且具有Sp鍵聯磷。在一些實施方式中，所提供的寡核苷酸的至少約40%的核苷酸間鍵聯係手性受控的且具有Sp鍵聯磷。在一些實施方式中，所提供的寡核苷酸的至少約50%的核苷酸間鍵聯係手性受控的且具有Sp鍵聯磷。在一些實施方式中，所提供的寡核苷酸的至少約60%的核苷酸間鍵聯係手性受控的且具有Sp鍵聯磷。在一些實施方式中，所提供的寡核苷酸的至少約65%的核苷酸間鍵聯係手性受控的且具有Sp鍵聯磷。在一些實施方式中，所提供的寡核苷酸的至少約70%的核苷酸間鍵聯係手性受控的且具有Sp鍵聯磷。在一些實施方式中，所提供的寡核苷酸的至少約75%的核苷酸間鍵聯係手性受控的且具有Sp鍵聯磷。在一些實施方式中，所提供的寡核苷酸的至少約80%的核苷酸間鍵聯係手性受控的且具有Sp鍵聯磷。在一些實施方式中，所提供的寡核苷酸的至少約85%的核苷酸間鍵聯係手性受控的且具有Sp鍵聯磷。在一些實施方式中，所提供的寡核苷酸的至少約90%的核苷酸間鍵聯係手性受控的且具有Sp鍵聯磷。在一些實施方式中，所提供的寡核苷酸的至少約95%的核苷酸間鍵聯係手性受控的且具有Sp鍵聯磷。
在一些實施方式中，本揭露提供了手性受控的寡核苷酸組成物，例如手性受控的MAPT寡核苷酸組成物，其中該組成物包含非隨機或受控程度的多個寡核苷酸，其中該多個寡核苷酸中的寡核苷酸共用共同的鹼基序列，且獨立地在至少1-50、1-40、1-30、1-25、1-20、1-15、1-10、5-50、5-40、5-30、5-25、5-20、5-15、5-10、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、或25或更多個手性核苷酸間鍵聯處共用鍵聯磷的相同質性。
在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸包含2-30個手性受控的核苷酸間鍵聯。在一些實施方式中，所提供的寡核苷酸組成物包含5-30個手性受控的核苷酸間鍵聯。在一些實施方式中，所提供的寡核苷酸組成物包含10-30個手性受控的核苷酸間鍵聯。
在一些實施方式中，百分比為約5%-100%。在一些實施方式中，百分比係至少50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、965、96%、98%、或99%。在一些實施方式中，百分比為約5%、10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、965、96%、98%或99%。
在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸中的骨架手性中心模式包含模式io-is -io -is -io 、io -is -is -is -io 、io -is -is -is -io -is 、is -io -is -io 、is -io -is -io 、is -io -is -io -is 、is -io -is -io -is -io 、is -io -is -io -is -io -is -io 、is -io -is -is -is -io 、is -is -io -is -is -is -io -is -is 、is -is -is -io -is -io -is -is -is 、is -is -is -is -io -is -io -is -is -is -is 、is -is -is -is -is 、is -is -is -is -is -is 、is -is -is -is -is -is -is 、is -is -is -is -is -is -is -is 、is -is -is -is -is -is -is -is -is 或ir -ir -ir ，其中is 表示呈Sp構型的核苷酸間鍵聯；io 表示非手性核苷酸間鍵聯；且ir 表示呈Rp構型的核苷酸間鍵聯。
在一些實施方式中，Sp構型的核苷酸間鍵聯（具有Sp鍵聯磷）係硫代磷酸酯核苷酸間鍵聯。在一些實施方式中，非手性核苷酸間鍵聯係天然磷酸酯鍵聯。在一些實施方式中，Rp構型的核苷酸間鍵聯（具有Rp鍵聯磷）係硫代磷酸酯核苷酸間鍵聯。在一些實施方式中，Sp構型的每個核苷酸間鍵聯係硫代磷酸酯核苷酸間鍵聯。在一些實施方式中，每個非手性核苷酸間鍵聯係天然磷酸酯鍵聯。在一些實施方式中，Rp構型的每個核苷酸間鍵聯係硫代磷酸酯核苷酸間鍵聯。在一些實施方式中，Sp構型的每個核苷酸間鍵聯係硫代磷酸酯核苷酸間鍵聯，每個非手性核苷酸間鍵聯係天然磷酸酯鍵聯，並且Rp構型的每個核苷酸間鍵聯係硫代磷酸酯核苷酸間鍵聯。
在一些實施方式中，骨架手性中心模式（例如寡核苷酸（例如MAPT寡核苷酸或寡核苷酸（例如MAPT寡核苷酸）的核心或翼中或兩個翼中）中骨架手性中心模式）包含OpSpOpSpOp、OpSpSpSpOp、OpSpSpSpOpSp、SpOpSpOp、SpOpSpOp、SpOpSpOpSp、SpOpSpOpSpOp、SpOpSpOpSpOpSpOp、SpOpSpSpSpOp、SpSpOpSpSpSpOpSpSp、SpSpSpOpSpOpSpSpSp、SpSpSpSpOpSpOpSpSpSpSp、SpSpSpSpSp、SpSpSpSpSpSp、SpSpSpSpSpSpSp、SpSpSpSpSpSpSpSp、SpSpSpSpSpSpSpSpSp、或RpRpRp的模式，其中Rp和Sp各自獨立地是手性受控的核苷酸間鍵聯的鍵聯磷構型（在一些實施方式中，Rp和Sp各自獨立地是手性受控的硫代磷酸酯核苷酸間鍵聯的鍵聯磷構型），並且每個Op獨立地表示天然磷酸酯鍵聯中非手性的鍵聯磷。
在一些實施方式中，骨架手性中心模式（例如，寡核苷酸（例如MAPT寡核苷酸或其一部分）的骨架手性中心模式）係或包含表1A中描述的骨架手性中心模式。
在一些實施方式中，例如，當描述核心核苷酸間鍵聯的類型、修飾、數量和/或模式時，鍵合於翼核苷和核心核苷的核苷酸間鍵聯被認為係核心核苷酸間鍵聯之一。在一些實施方式中，例如，當描述核心核苷酸間鍵聯的類型、修飾、數量和/或模式時，鍵合至翼核苷和核心核苷的每個核苷酸間鍵聯被認為係核心核苷酸間鍵聯之一。在一些實施方式中，核心核苷酸間鍵聯鍵合至兩個核心核苷。在一些實施方式中，核心核苷酸間鍵聯鍵合至核心核苷和翼核苷。在一些實施方式中，每個核心核苷酸間鍵聯獨立地鍵合至兩個核心核苷、或者核心核苷和翼核苷。在一些實施方式中，每個翼核苷酸間鍵聯獨立地鍵合至兩個翼核苷。
在一些實施方式中，手性受控的寡核苷酸組成物中MAPT寡核苷酸各自包含不同類型的核苷酸間鍵聯。在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸包含至少一個天然磷酸酯鍵聯和至少一個經修飾的核苷酸間鍵聯。在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸包含至少一個天然磷酸酯鍵聯和至少兩個經修飾的核苷酸間鍵聯。在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸包含至少一個天然磷酸酯鍵聯和至少三個經修飾的核苷酸間鍵聯。在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸包含至少一個天然磷酸酯鍵聯和至少四個經修飾的核苷酸間鍵聯。在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸包含至少一個天然磷酸酯鍵聯和至少五個經修飾的核苷酸間鍵聯。在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸包含至少一個天然磷酸酯鍵聯和1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24或25個經修飾的核苷酸間鍵聯。在一些實施方式中，經修飾的核苷酸間鍵聯係硫代磷酸酯核苷酸間鍵聯。在一些實施方式中，每個經修飾的核苷酸間鍵聯係硫代磷酸酯核苷酸間鍵聯。在一些實施方式中，經修飾的核苷酸間鍵聯係硫代磷酸三酯核苷酸間鍵聯。在一些實施方式中，每個經修飾的核苷酸間鍵聯係硫代磷酸三酯核苷酸間鍵聯。在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸包含至少一個天然磷酸酯鍵聯和至少2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24或25個連續經修飾的核苷酸間鍵聯。在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸包含至少一個天然磷酸酯鍵聯和至少2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24或25個連續硫代磷酸酯核苷酸間鍵聯。在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸包含至少一個天然磷酸酯鍵聯和至少2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24或25個連續硫代磷酸三酯核苷酸間鍵聯。
在一些實施方式中，手性受控的寡核苷酸組成物中的寡核苷酸各自包含至少兩個相對於彼此具有不同的立體化學和/或不同的P-修飾的核苷酸間鍵聯。在一些實施方式中，至少兩個核苷酸間鍵聯相對於彼此具有不同的立體化學，並且寡核苷酸各自包含骨架手性中心模式，該骨架手性中心模式包含交替的鍵聯磷立體化學。
在一些實施方式中，鍵聯包含手性助劑，其例如用於控制反應（例如在寡核苷酸合成循環中的偶聯反應）的立體選擇性。在一些實施方式中，硫代磷酸三酯鍵聯不包含手性助劑。在一些實施方式中，有意地維持硫代磷酸三酯鍵聯直至施用寡核苷酸組成物給受試者，和/或在施用寡核苷酸組成物給受試者期間有意地維持硫代磷酸三酯鍵聯。
在一些實施方式中，許多寡核苷酸及其組成物（其中寡核苷酸中的所有其他手性中心除了手性鍵聯磷中心已經被立體定義（例如，糖中的碳手性中心，其在寡核苷酸合成在亞磷醯胺中定義））的純度，特別是立體化學純度，和特別是非鏡像異構純度可以藉由在偶聯步驟中當形成手性核苷酸間鍵聯時手性鍵聯磷的立體選擇性（如熟悉該項技術者所理解的，在寡核苷酸合成的許多情況（其中寡核苷酸包含一個以上的手性中心）下的非鏡像異構物選擇性）來控制。在一些實施方式中，偶聯步驟在鍵聯磷處具有60%的立體選擇性（當存在其他手性中心時為非鏡像異構物選擇性）。在這樣的偶聯步驟之後，可以認為形成的新的核苷酸間鍵聯具有60%的立體化學純度（對於寡核苷酸，鑒於其他手性中心的存在，通常是非鏡像異構物純度）。在一些實施方式中，每個偶聯步驟獨立地具有至少60%的立體選擇性。在一些實施方式中，每個偶聯步驟獨立地具有至少70%的立體選擇性。在一些實施方式中，每個偶聯步驟獨立地具有至少80%的立體選擇性。在一些實施方式中，每個偶聯步驟獨立地具有至少85%的立體選擇性。在一些實施方式中，每個偶聯步驟獨立地具有至少90%的立體選擇性。在一些實施方式中，每個偶聯步驟獨立地具有至少91%的立體選擇性。在一些實施方式中，每個偶聯步驟獨立地具有至少92%的立體選擇性。在一些實施方式中，每個偶聯步驟獨立地具有至少93%的立體選擇性。在一些實施方式中，每個偶聯步驟獨立地具有至少94%的立體選擇性。在一些實施方式中，每個偶聯步驟獨立地具有至少95%的立體選擇性。在一些實施方式中，每個偶聯步驟獨立地具有至少96%的立體選擇性。在一些實施方式中，每個偶聯步驟獨立地具有至少97%的立體選擇性。在一些實施方式中，每個偶聯步驟獨立地具有至少98%的立體選擇性。在一些實施方式中，每個偶聯步驟獨立地具有至少99%的立體選擇性。在一些實施方式中，每個偶聯步驟獨立地具有至少99.5%的立體選擇性。在一些實施方式中，每個偶聯步驟獨立地具有幾乎100%的立體選擇性。在一些實施方式中，偶聯步驟具有幾乎100%的立體選擇性，因為根據分析方法（例如，NMR、HPLC等）分析的，來自偶聯步驟的每一可檢測產物都具有預期的立體選擇性。在一些實施方式中，手性受控的核苷酸間鍵聯通常以至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99.5%或幾乎100%（在一些實施方式中，至少90%；在一些實施方式中，至少95%；在一些實施方式中，至少96%；在一些實施方式中，至少97%；在一些實施方式中，至少98%；在一些實施方式中，至少99%）的立體選擇性形成。在一些實施方式中，手性受控的核苷酸間鍵聯在其手性鍵聯磷處具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99.5%或幾乎100%（在一些實施方式中，至少90%；在一些實施方式中，至少95%；在一些實施方式中，至少96%；在一些實施方式中，至少97%；在一些實施方式中，至少98%；在一些實施方式中，至少99%）的立體化學純度（對於具有多個手性中心的寡核苷酸而言通常是非鏡像異構物純度）。在一些實施方式中，每個手性受控的核苷酸間鍵聯在其手性鍵聯磷處獨立地具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99.5%或幾乎100%（在一些實施方式中，至少90%；在一些實施方式中，至少95%；在一些實施方式中，至少96%；在一些實施方式中，至少97%；在一些實施方式中，至少98%；在一些實施方式中，至少99%）的立體化學純度（對於具有多個手性中心的寡核苷酸而言通常是非鏡像異構物純度）。在一些實施方式中，非手性受控的核苷酸間鍵聯通常以低於60%、70%、80%、85%、或90%（在一些實施方式中，低於60%；在一些實施方式中，低於70%；在一些實施方式中，低於80%；在一些實施方式中，低於85%；在一些實施方式中，低於90%）的立體選擇性形成。在一些實施方式中，非手性受控的核苷酸間鍵聯各自獨立地以低於60%、70%、80%、85%、或90%（在一些實施方式中，低於60%；在一些實施方式中，低於70%；在一些實施方式中，低於80%；在一些實施方式中，低於85%；在一些實施方式中，低於90%）的立體選擇性形成。在一些實施方式中，非手性受控的核苷酸間鍵聯在其手性鍵聯磷處具有低於60%、70%、80%、85%、或90%（在一些實施方式中，低於60%；在一些實施方式中，低於70%；在一些實施方式中，低於80%；在一些實施方式中，低於85%；在一些實施方式中，低於90%）的立體化學純度（對於具有多個手性中心的寡核苷酸而言通常是非鏡像異構物純度）。在一些實施方式中，非手性受控的核苷酸間鍵聯在其手性鍵聯磷處各自獨立地具有低於60%、70%、80%、85%、或90%（在一些實施方式中，低於60%；在一些實施方式中，低於70%；在一些實施方式中，低於80%；在一些實施方式中，低於85%；在一些實施方式中，低於90%）的立體化學純度（對於具有多個手性中心的寡核苷酸而言通常是非鏡像異構物純度）。
在一些實施方式中，單體（如熟悉該項技術者所理解的，在許多實施方式中，用於寡核苷酸合成的亞磷醯胺）的至少1、2、3、4、5、6、7、8、9或10個偶聯獨立地具有小於約60%、70%、80%、85%或90%的立體選擇性[對於寡核苷酸合成，就一個或多個形成的鍵聯磷手性中心而言，通常是非鏡像異構物選擇性]。在一些實施方式中，至少一個偶聯具有低於約60%、70%、80%、85%、或90%的立體選擇性。在一些實施方式中，至少兩個偶聯獨立地具有低於約60%、70%、80%、85%、或90%的立體選擇性。在一些實施方式中，至少三個偶聯獨立地具有低於約60%、70%、80%、85%、或90%的立體選擇性。在一些實施方式中，至少四個偶聯獨立地具有低於約60%、70%、80%、85%、或90%的立體選擇性。在一些實施方式中，至少五個偶聯獨立地具有低於約60%、70%、80%、85%、或90%的立體選擇性。在一些實施方式中，各偶聯獨立地具有低於約60%、70%、80%、85%、或90%的立體選擇性。在一些實施方式中，每個非手性受控的核苷酸間鍵聯獨立地以低於約60%、70%、80%、85%、或90%的立體選擇性形成。在一些實施方式中，立體選擇性低於約60%。在一些實施方式中，立體選擇性低於約70%。在一些實施方式中，立體選擇性低於約80%。在一些實施方式中，立體選擇性低於約90%。在一些實施方式中，至少1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24或25個偶聯獨立地具有低於約90%的立體選擇性。在一些實施方式中，至少一個偶聯具有低於約90%的立體選擇性。在一些實施方式中，至少兩個偶聯具有低於約90%的立體選擇性。在一些實施方式中，至少三個偶聯具有低於約90%的立體選擇性。在一些實施方式中，至少四個偶聯具有低於約90%的立體選擇性。在一些實施方式中，至少五個偶聯具有低於約90%的立體選擇性。在一些實施方式中，各偶聯獨立地具有低於約90%的立體選擇性。在一些實施方式中，至少1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24或25個偶聯獨立地具有低於約85%的立體選擇性。在一些實施方式中，各偶聯獨立地具有低於約85%的立體選擇性。在一些實施方式中，至少1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24或25個偶聯獨立地具有低於約80%的立體選擇性。在一些實施方式中，各偶聯獨立地具有低於約80%的立體選擇性。在一些實施方式中，至少1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24或25個偶聯獨立地具有低於約70%的立體選擇性。在一些實施方式中，各偶聯獨立地具有低於約70%的立體選擇性。
在一些實施方式中，本揭露的核苷酸和組成物具有高純度。在一些實施方式中，本揭露的核苷酸和組成物具有高立體化學純度。在一些實施方式中，立體化學純度，例如非鏡像異構純度係約60%-100%。在一些實施方式中，非鏡像異構純度為約60%-100%。在一些實施方式中，該百分比係至少60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、93%、95%、96%、97%、98%、或99%。在一些實施方式中，該百分比係至少80%、85%、90%、91%、92%、93%、93%、95%、96%、97%、98%、或99%。在一些實施方式中，該百分比係至少90%、91%、92%、93%、93%、95%、96%、97%、98%、或99%。在一些實施方式中，非鏡像異構純度為至少60%。在一些實施方式中，非鏡像異構純度為至少70%。在一些實施方式中，非鏡像異構純度為至少80%。在一些實施方式中，非鏡像異構純度為至少85%。在一些實施方式中，非鏡像異構純度為至少90%。在一些實施方式中，非鏡像異構純度為至少91%。在一些實施方式中，非鏡像異構純度為至少92%。在一些實施方式中，非鏡像異構純度為至少93%。在一些實施方式中，非鏡像異構純度為至少94%。在一些實施方式中，非鏡像異構純度為至少95%。在一些實施方式中，非鏡像異構純度為至少96%。在一些實施方式中，非鏡像異構純度為至少97%。在一些實施方式中，非鏡像異構純度為至少98%。在一些實施方式中，非鏡像異構純度為至少99%。在一些實施方式中，非鏡像異構純度為至少99.5%。
在一些實施方式中，本揭露的化合物（例如，寡核苷酸，手性助劑等）包含多個手性元素（例如，多個碳和/或磷（例如，手性核苷酸間鍵聯的鍵聯磷）手性中心）。在一些實施方式中，所提供的化合物（例如，寡核苷酸）的至少1、2、3、4、5、6、7、8、9或更多個手性元素各自獨立地具有如本文所述之非鏡像異構純度。在一些實施方式中，所提供的化合物的至少1、2、3、4、5、6、7、8、9或更多個手性碳中心各自獨立地具有如本文所述之非鏡像異構純度。在一些實施方式中，所提供的化合物的至少1、2、3、4、5、6、7、8、9或更多個手性磷中心各自獨立地具有如本文所述之非鏡像異構純度。在一些實施方式中，各手性元素獨立地具有如本文所述之非鏡像異構純度。在一些實施方式中，各手性中心獨立地具有如本文所述之非鏡像異構純度。在一些實施方式中，各手性碳中心獨立地具有如本文所述之非鏡像異構純度。在一些實施方式中，各手性磷中心獨立地具有如本文所述之非鏡像異構純度。在一些實施方式中，每個手性磷中心獨立地具有至少90%、91%、92%、93%、93%、95%、96%、97%、98%、或99%或更高的非鏡像異構純度。
如熟悉該項技術者所理解的，在一些實施方式中，可以藉由在相同或相當條件下二聚體形成的非鏡像異構物選擇性和製備的二聚體的非鏡像異構物純度來評估手性鍵聯磷中心的偶聯或非鏡像異構物純度的非鏡像異構物選擇性，其中二聚體具有相同的5'-和3'-核苷以及核苷酸間鍵聯。
各種技術可用於鑒定或確認手性元素的立體化學（例如，手性鍵聯磷的構型）和/或骨架手性中心模式，和/或用於評估立體選擇性（例如，寡核苷酸合成中的偶聯步驟的非鏡像異構物選擇性）和/或立體化學純度（例如，核苷酸間鍵聯、化合物（例如，寡核苷酸）等的非鏡像異構物純度）。示例技術包括NMR[例如1D（一維）和/或2D（二維）1 H-31 P HETCOR（異核相關光譜）]、HPLC、RP-HPLC、質譜，LC-MS和立體特異性核酸酶對核苷酸間鍵聯切割等，其可以單獨或組合使用。有用的核酸酶的實例包括苯甲酸酶、微球菌核酸酶和svPDE（蛇毒磷酸二酯酶），其對於具有Rp鍵聯磷（例如，Rp硫代磷酸酯鍵聯）的某些核苷酸間鍵聯具有特異性；和核酸酶P1、綠豆核酸酶、和核酸酶S1，其對於具有Sp磷鍵的核苷酸間鍵聯（例如Sp硫代磷酸酯鍵聯）具有特異性。不希望受任何特定理論的束縛，本揭露指出，在至少一些情況下，特定核酸酶對寡核苷酸的切割可能受到結構元件例如化學修飾（例如糖的2'修飾）、鹼基序列或立體化學環境的影響。例如，觀察到在某些情況下，對具有Rp鍵聯磷的核苷酸間鍵聯特異性的苯甲酸酶和微球菌核酸酶無法切割側接Sp硫代磷酸酯鍵聯的分離的Rp硫代磷酸酯核苷酸間鍵聯。
在一些實施方式中，共用共同的鹼基序列、共同的骨架鍵聯模式和共同的骨架手性中心模式的寡核苷酸共用共同的骨架磷修飾模式和共同的鹼基修飾模式。在一些實施方式中，共用共同的鹼基序列、共同的骨架鍵聯模式和共同的骨架手性中心模式的寡核苷酸組成物共用共同的骨架磷修飾模式和共同的核苷修飾模式。在一些實施方式中，共用共同的鹼基序列、共同的骨架鍵聯模式和共同的骨架手性中心模式的寡核苷酸具有相同的結構。
在一些實施方式中，本揭露提供了包含多個能夠指導MAPT敲低的寡核苷酸的寡核苷酸組成物，其中多個寡核苷酸中的寡核苷酸具有特定的寡核苷酸類型，該組成物係手性受控的，因為相對於具有相同鹼基序列的寡核苷酸的基本上外消旋製劑而言，該組成物富集特定寡核苷酸類型的寡核苷酸。
在一些實施方式中，具有共同的鹼基序列、共同的骨架鍵聯模式和共同的骨架手性中心模式的寡核苷酸具有共同的骨架磷修飾模式和共同的鹼基修飾模式。在一些實施方式中，具有共同的鹼基序列、共同的骨架鍵聯模式和共同的骨架手性中心模式的寡核苷酸具有共同的骨架磷修飾模式和共同的核苷修飾模式。在一些實施方式中，具有共同的鹼基序列、共同的骨架鍵聯模式和共同的骨架手性中心模式的寡核苷酸具有相同的結構。
在一些實施方式中，本揭露提供了包含多個寡核苷酸的MAPT寡核苷酸組成物。在一些實施方式中，本揭露提供了MAPT寡核苷酸的手性受控的寡核苷酸組成物。在一些實施方式中，本揭露提供了MAPT寡核苷酸，該MAPT寡核苷酸的鹼基序列係以下或與以下互補：本文揭露的MAPT序列或其一部分（表1中的各種鹼基序列，其中每個T可以獨立地被U替換，並且反之亦然）。在一些實施方式中，本揭露提供了MAPT寡核苷酸，該MAPT寡核苷酸的鹼基序列包含作為以下或與以下互補的鹼基序列：本文揭露的MAPT序列或其一部分（表1中的各種鹼基序列）。在一些實施方式中，本揭露提供了MAPT寡核苷酸，該MAPT寡核苷酸的鹼基序列包含作為以下或與以下互補的鹼基序列的15個連續鹼基：本文揭露的MAPT序列或其一部分（表1中的各種鹼基序列，其中每個T可以獨立地被U替換，並且反之亦然。在一些實施方式中，本揭露提供了MAPT寡核苷酸，該MAPT寡核苷酸的鹼基序列包含作為以下或與以下互補的鹼基序列的具有0-3個錯配的15個連續鹼基：本文揭露的MAPT序列或其一部分（表1中的各種鹼基序列，其中每個T可以獨立地被U替換，並且反之亦然）。在一些實施方式中，本揭露提供MAPT寡核苷酸組成物，其中該MAPT寡核苷酸包含至少一個非手性受控的手性核苷酸間鍵聯。在一些實施方式中，本揭露提供了包含非手性受控的手性核苷酸間鍵聯的MAPT寡核苷酸，其中該MAPT寡核苷酸的鹼基序列包含作為以下或與以下互補的鹼基序列本文揭露的MAPT序列或其一部分（例如，表1中的各種鹼基序列，其中每個T可以獨立地被U替換，並且反之亦然）。在一些實施方式中，本揭露提供了包含非手性受控的手性核苷酸間鍵聯的MAPT寡核苷酸組成物，其中該MAPT寡核苷酸的鹼基序列係作為以下或與以下互補的鹼基序列：本文揭露的MAPT序列或其一部分（例如，表1中的各種鹼基序列，其中每個T可以獨立地被U替換，並且反之亦然）。在一些實施方式中，本揭露提供了包含非手性受控的手性核苷酸間鍵聯的MAPT寡核苷酸，其中該MAPT寡核苷酸的鹼基序列包含作為以下或與以下互補的鹼基序列的15個連續鹼基：本文揭露的MAPT序列或其一部分（表1中的各種鹼基序列，其中每個T可以獨立地被U替換，並且反之亦然）。在一些實施方式中，本揭露提供了包含非手性受控的手性核苷酸間鍵聯的MAPT寡核苷酸，其中該MAPT寡核苷酸的鹼基序列包含作為以下或與以下互補的鹼基序列的具有0-3個錯配的15個連續鹼基：本文揭露的MAPT序列或其一部分（表1中的各種鹼基序列，其中每個T可以獨立地被U替換，並且反之亦然）。在一些實施方式中，本揭露提供了包含手性受控的手性核苷酸間鍵聯的MAPT寡核苷酸，其中該MAPT寡核苷酸的鹼基序列包含作為以下或與以下互補的鹼基序列：本文揭露的MAPT序列或其一部分（例如，表1中的各種鹼基序列，其中每個T可以獨立地被U替換，並且反之亦然）。在一些實施方式中，本揭露提供了包含手性受控的手性核苷酸間鍵聯的MAPT寡核苷酸組成物，其中該MAPT寡核苷酸的鹼基序列係作為以下或與以下互補的鹼基序列：本文揭露的MAPT序列或其一部分（例如，表1中的多種鹼基序列，其中每個T可以獨立地被U替換，並且反之亦然）。在一些實施方式中，本揭露提供了包含手性受控的手性核苷酸間鍵聯的MAPT寡核苷酸，其中該MAPT寡核苷酸的鹼基序列包含作為以下或與以下互補的鹼基序列的15個連續鹼基：本文揭露的MAPT序列或其一部分（表1中的各種鹼基序列，其中每個T可以獨立地被U替換，並且反之亦然）。在一些實施方式中，本揭露提供了包含手性受控的手性核苷酸間鍵聯的MAPT寡核苷酸，其中該MAPT寡核苷酸的鹼基序列包含作為以下或與以下互補的鹼基序列的具有0-3個錯配的15個連續鹼基：本文揭露的MAPT序列或其一部分（表1中的各種鹼基序列，其中每個T可以獨立地被U替換，並且反之亦然）。
在一些實施方式中，相同寡核苷酸類型的寡核苷酸具有共同的骨架磷修飾模式和共同的核苷修飾模式。在一些實施方式中，相同寡核苷酸類型的寡核苷酸具有共同的糖修飾模式。在一些實施方式中，相同寡核苷酸類型的寡核苷酸具有共同的鹼基修飾模式。在一些實施方式中，相同寡核苷酸類型的寡核苷酸具有共同的核苷修飾模式。在一些實施方式中，相同寡核苷酸類型的寡核苷酸具有相同的構造。在許多實施方式中，相同寡核苷酸類型的寡核苷酸係相同的。在一些實施方式中，相同寡核苷酸類型的寡核苷酸具有相同寡核苷酸（如熟悉該項技術者將理解的，這樣的寡核苷酸可以各自獨立地以寡核苷酸的多種形式之一存在，並且可以是寡核苷酸的相同或不同形式）。在一些實施方式中，相同寡核苷酸類型的寡核苷酸各自獨立地具有相同的寡核苷酸或其藥學上可接受的鹽。
在一些實施方式中，提供的寡核苷酸組成物中的多個寡核苷酸或特定寡核苷酸類型的寡核苷酸係MAPT寡核苷酸。在一些實施方式中，本揭露提供一種手性受控的MAPT寡核苷酸組成物，其包含多個MAPT寡核苷酸，其中該等寡核苷酸共用： 1) 共同的鹼基序列； 2) 共同的骨架鍵聯模式；並且 3) 在一個或多個手性核苷酸間鍵聯（手性受控的核苷酸間鍵聯）處的相同鍵聯磷立體化學， 其中相對於共用共同的鹼基序列和骨架鍵聯模式的寡核苷酸的基本上外消旋製劑，該組成物富集該多個寡核苷酸中的寡核苷酸。
在一些實施方式中，如本文使用的，「一個或多個」或「至少一個」係1-50、1-40、1-30、1-25、1-20、1-15、1-10、5-50、5-40、5-30、5-25、5-20、5-15、5-10、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、或更多個。
在一些實施方式中，寡核苷酸類型由以下進一步定義：4) 另外的化學部分，如果有的話。
在一些實施方式中，百分比為至少約10%。在一些實施方式中，百分比為至少約20%。在一些實施方式中，百分比為至少約30%。在一些實施方式中，百分比為至少約40%。在一些實施方式中，百分比為至少約50%。在一些實施方式中，百分比為至少約60%。在一些實施方式中，百分比為至少約70%。在一些實施方式中，百分比為至少約75%。在一些實施方式中，百分比為至少約80%。在一些實施方式中，百分比為至少約85%。在一些實施方式中，百分比為至少約90%。在一些實施方式中，百分比為至少約91%。在一些實施方式中，百分比為至少約92%。在一些實施方式中，百分比為至少約93%。在一些實施方式中，百分比為至少約94%。在一些實施方式中，百分比為至少約95%。在一些實施方式中，百分比為至少約96%。在一些實施方式中，百分比為至少約97%。在一些實施方式中，百分比為至少約98%。在一些實施方式中，百分比為至少約99%。在一些實施方式中，百分比係或大於(DS)nc ，其中DS和nc各自獨立地如本揭露中所述。
在一些實施方式中，多個寡核苷酸（例如MAPT寡核苷酸）共用相同的構造。在一些實施方式中，多個寡核苷酸（例如MAPT寡核苷酸）係相同的（相同的立體異構物）。在一些實施方式中，手性受控的寡核苷酸組成物，例如手性受控的MAPT寡核苷酸組成物係立體純的寡核苷酸組成物，其中多個寡核苷酸中的寡核苷酸係相同的（相同的立體異構物），並且該組成物不包含任何其他立體異構物。熟悉該項技術者將理解，一種或多種其他立體異構物可能作為雜質存在，因為製程、選擇性、純化等可能無法實現完整性。
在一些實施方式中，所提供的組成物的特徵在於當它與靶核酸接觸時[例如，MAPT轉錄物（例如前-mRNA，成熟mRNA，與該組成物的寡核苷酸雜交的其他類型的RNA等）]，靶核酸和/或由此編碼的產物的程度和/與在參考條件下觀察到的相比降低。在一些實施方式中，參考條件選自由以下組成之群組：不存在組成物、存在參考組成物、及其組合。在一些實施方式中，參考條件係不存在組成物。在一些實施方式中，參考條件係存在參考組成物。在一些實施方式中，參考組成物係其寡核苷酸不與靶核酸雜交的組成物。在一些實施方式中，參考組成物係其寡核苷酸不包含與靶核酸充分互補的序列的組成物。在一些實施方式中，提供的組成物係手性受控的寡核苷酸組成物，而參考組成物係非手性受控的寡核苷酸組成物（其在其他方面相同但是非手性受控的（與手性受控的寡核苷酸組成物中的寡核苷酸（多個寡核苷酸）具有相同構造的寡核苷酸的外消旋製劑）。
在一些實施方式中，本揭露提供一種手性受控的MAPT寡核苷酸組成物，其包含能夠指導MAPT敲低的多個MAPT寡核苷酸，其中該等寡核苷酸共用： 1) 共同的鹼基序列； 2) 共同的骨架鍵聯模式；以及 3) 在一個或多個（例如，1-50、1-40、1-30、1-25、1-20、1-15、1-10、5-50、5-40、5-30、5-25、5-20、5-15、5-10、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20或更多個）手性核苷酸間鍵聯（手性受控的核苷酸間鍵聯）處相同的鍵聯磷立體化學， 其中相對於共用共同的鹼基序列和骨架鍵聯模式的寡核苷酸的基本上外消旋製劑，該組成物富集該多個寡核苷酸中的寡核苷酸， 該寡核苷酸組成物的特徵在於：當其與MAPT敲低系統中的MAPT轉錄物接觸時，相對於在參考條件下所觀察到的，該轉錄物的敲低有所改善，參考條件選自由以下組成之群組：不存在該組成物、存在參考組成物、及其組合。
如上文所指出和本領域中所理解的，在一些實施方式中，寡核苷酸的鹼基序列可指寡核苷酸中的核苷殘基（例如，糖和/或鹼基組分中的核苷殘基，相對於標準天然存在的核苷酸（如腺嘌呤、胞嘧啶、鳥苷、胸腺嘧啶和尿嘧啶）而言）的同一性和/或修飾狀態，和/或可指此類殘基的雜交特徵（即，與特定互補殘基雜交的能力）。
如本文所證明的，寡核苷酸結構元件（例如，糖修飾模式、骨架鍵聯、骨架手性中心、骨架磷修飾等）及其組合可以提供出人意料地改善的特性和/或生物活性。
在一些實施方式中，寡核苷酸組成物能夠降低靶基因或其基因產物的表現、程度和/或活性。在一些實施方式中，寡核苷酸組成物能夠藉由在退火至靶基因mRNA後空間阻斷翻譯，藉由切割mRNA（前-mRNA或成熟mRNA）和/或藉由改變或干擾mRNA剪接來降低靶基因或其基因產物的表現、程度和/或活性。在一些實施方式中，提供的MAPT寡核苷酸組成物能夠降低MAPT靶基因或其基因產物的表現、程度和/或活性。在一些實施方式中，所提供的MAPT寡核苷酸組成物能夠藉由在退火至MAPT靶基因mRNA後空間阻斷翻譯，藉由切割MAPT mRNA（前-mRNA或成熟mRNA）和/或藉由改變或干擾mRNA剪接來降低MAPT靶基因或其基因產物的表現、程度和/或活性。
在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸組成物，例如MAPT寡核苷酸組成物，係單一寡核苷酸立體異構物，例如MAPT寡核苷酸立體異構物的基本上純的製劑，因為在一些情況下，在某些純化程序後，在該組成物中的不屬於該寡核苷酸立體異構物的寡核苷酸係來自所述寡核苷酸立體異構物的製備過程中的雜質。
在一些實施方式中，本揭露提供了手性受控的寡核苷酸和寡核苷酸組成物，並且在一些實施方式中，提供了立體純的寡核苷酸和寡核苷酸組成物。例如，在一些實施方式中，所提供的組成物含有非隨機程度或受控程度的本文所述之一個或多個單獨的寡核苷酸類型。在一些實施方式中，同一寡核苷酸類型的寡核苷酸係相同的。
糖
根據本揭露，可以使用各種糖，包括修飾的糖。在一些實施方式中，本揭露視需要與其他結構元件（例如，核苷酸間鍵聯修飾及其模式，其骨架手性中心模式等）組合地提供糖修飾及其模式，該其他結構元件在摻入寡核苷酸時可以提供改善的特性和/或活性。
最常見的天然存在的核苷包括連接到核鹼基腺苷（A）、胞嘧啶（C）、鳥嘌呤（G）、胸腺嘧啶（T）或尿嘧啶（U）的核糖（例如在RNA中）或去氧核糖（例如在DNA中）。在一些實施方式中，糖，例如表1中許多寡核苷酸中的各種糖（除非另外說明），係天然DNA糖（在DNA核酸或寡核苷酸中，具有結構
Figure 02_image035
，其中核鹼基連接至1'位並且3'和5'位連接至核苷酸間鍵聯（如熟悉該項技術者所理解的，如果在寡核苷酸的5'端，則5'位可以連接至5'端基（例如-OH），並且如果在寡核苷酸的3'端，則3'位可以連接至3'端基（例如-OH）。在一些實施方式中，糖係天然RNA糖（在RNA核酸或寡核苷酸中，具有結構
Figure 02_image037
，其中核鹼基連接至1'位並且3'和5'位連接至核苷酸間鍵聯（如熟悉該項技術者所理解的，如果在寡核苷酸的5'端，則5'位可以連接至5'端基（例如-OH），並且如果在寡核苷酸的3'端，則3'位可以連接至3'端基（例如-OH）。在一些實施方式中，糖係修飾的糖，因為它不是天然DNA糖或天然RNA糖。尤其是，修飾的糖可提供改善的穩定性。在一些實施方式中，修飾的糖可用於改變和/或優化一種或多種雜交特徵。在一些實施方式中，修飾的糖可用於改變和/或優化靶識別。在一些實施方式中，修飾的糖可以用於優化Tm。在一些實施方式中，修飾的糖可用於改善寡核苷酸活性。
糖可以在各個位置結合到核苷酸間鍵聯上。作為非限制性實例，核苷酸間鍵聯可以鍵合至糖的2'、3'、4'或5'位。在一些實施方式中，如天然核酸中最常見的，核苷酸間鍵聯與在5'位的一個糖和在3'位的另一個糖連接，除非另有說明。
在一些實施方式中，糖係視需要經取代的天然DNA或RNA糖。在一些實施方式中，糖係視需要經取代的
Figure 02_image039
。在一些實施方式中，2’位置係視需要經取代的。在一些實施方式中，糖係
Figure 02_image039
。在一些實施方式中，糖具有
Figure 02_image041
或
Figure 02_image043
的結構，其中R1s 、R2s 、R3s 、R4s 和R5s 各自獨立地是-H、合適的取代基或合適的糖修飾（例如，US 9394333、US 9744183、US 9605019、US 9982257、US 20170037399、US 20180216108、US 20180216107、US 9598458、WO 2017/062862、WO 2018/067973、WO 2017/160741、WO 2017/192679、WO 2017/210647、WO 2018/098264、WO 2018/022473、WO 2018/223056、WO 2018/223073、WO 2018/223081、WO 2018/237194、WO 2019/032607、WO2019/055951、WO 2019/075357、WO 2019/032612和/或WO 2020/191252中描述的那些，其各自的取代基、糖修飾、R1s 、R2s 、R3s 、R4s 和R5s 的描述和修飾的糖藉由引用獨立地併入本文）。在一些實施方式中，糖具有
Figure 02_image043
的結構。在一些實施方式中，R4s 係-H。在一些實施方式中，糖具有
Figure 02_image045
的結構，其中R2s 係-H、鹵素、或-OR，其中R係視需要經取代的C1-6 脂肪族。在一些實施方式中，R2s 係-H。在一些實施方式中，R2s 係-F。在一些實施方式中，R2s 係-OMe。在一些實施方式中，R2s 係-OCH2 CH2 OMe。
在一些實施方式中，糖具有
Figure 02_image043
的結構，其中R2s 和R4s 一起形成-Ls -，其中Ls 係共價鍵或視需要經取代的二價C1-6 脂肪族或具有1至4個雜原子的雜脂肪族。在一些實施方式中，每個雜原子獨立地選自氮、氧或硫）。在一些實施方式中，Ls 係視需要經取代的C2-O-CH2 -C4。在一些實施方式中，Ls 係C2-O-CH2 -C4。在一些實施方式中，Ls 係C2-O-(R)-CH(CH2 CH3 )-C4。在一些實施方式中，Ls 係C2-O-(S)-CH(CH2 CH3 )-C4。
在一些實施方式中，糖係雙環糖，例如如本揭露中所述之其中R2s 和R4s 一起形成連接的糖。在一些實施方式中，糖選自LNA糖、BNA糖、cEt糖等。在一些實施方式中，橋在2'和4'-碳原子之間（對應於R2s 和R4s 與居於它們之間的原子一起形成如本文所述之視需要經取代的環）。在一些實施方式中，雙環糖的實例包括α-L-亞甲基氧基（4'-CH2 -O-2’）LNA、β-D-亞甲基氧基（4'-CH2 -O-2'）LNA、伸乙基氧基（4' -(CH2 )2 -O-2’）LNA、胺基氧基（4' -CH2 -O-N(R)-2’）LNA和氧基胺基（4'-CH2 -N(R)-O-2’）LNA。在一些實施方式中，雙環糖，例如LNA或BNA糖，係在兩個糖碳之間具有至少一個橋的糖。在一些實施方式中，核苷中的雙環糖可以具有α-L-呋喃核糖或β-D-呋喃核糖的立體化學構型。在一些實施方式中，糖係WO 1999014226中描述的糖。在一些實施方式中，4’-2’雙環糖或4’至2’雙環糖係包含呋喃糖環的雙環糖，該呋喃糖環包含連接糖環的2’碳原子和4’碳原子的橋。在一些實施方式中，雙環糖，例如LNA或BNA糖，在兩個呋喃戊糖基糖碳之間包含至少一個橋。在一些實施方式中，LNA或BNA糖在4'和2'呋喃戊糖基糖碳之間包含至少一個橋。
在一些實施方式中，雙環糖係以下各項的糖：α-L-亞甲基氧基(4'-CH2 -O-2’) BNA、β-D-亞甲基氧基(4'-CH2 -O-2’) BNA、伸乙基氧基(4'-(CH2 )2 -O-2’) BNA、胺基氧基(4'-CH2 -O-N(R)-2’) BNA、氧胺基(4'-CH2 -N(R)-O-2’) BNA、甲基(亞甲基氧基) (4'-CH(CH3 )-O-2’) BNA（也稱為受限制的乙基或cEt）、亞甲基-硫基(4'-CH2 -S-2’) BNA、亞甲基-胺基(4'-CH2 -N(R)-2’) BNA、甲基碳環(4'-CH2 -CH(CH3 )-2’) BNA、亞丙基碳環(4'-(CH2 )3 -2’) BNA或乙烯基BNA。
在一些實施方式中，糖修飾係2’-OMe、2’-MOE、2’-LNA、2’-F、5’-乙烯基或S-cEt。在一些實施方式中，修飾的糖係FRNA糖、FANA糖或𠰌啉代糖。在一些實施方式中，寡核苷酸包含核酸類似物，例如GNA、LNA、PNA、TNA、F-HNA（F-THP或3'-氟四氫哌喃）、MNA（甘露醇核酸，例如Leumann 2002 Bioorg. Med. Chem.[生物有機化學與醫藥化學雜誌] 10: 841-854）、ANA（安尼妥（anitol）核酸）或𠰌啉代或其一部分。在一些實施方式中，糖修飾用另一個環狀或無環狀部分代替天然糖。此類部分的實例在本領域中是眾所周知的，例如用於𠰌啉代、二醇核酸等中的那些，並且可以根據本揭露使用。如熟悉該項技術者所理解的，當與修飾的糖一起使用時，在一些實施方式中，核苷酸間鍵聯可以被修飾，例如在𠰌啉代、PNA等中。
在一些實施方式中，糖係在6-位具有(R)或(S)手性的6’-修飾的雙環糖，例如在US 7399845中描述的那些。在一些實施方式中，糖係在5-位具有(R)或(S)手性的5’-修飾的雙環糖，例如在US 20070287831中描述的那些。
在一些實施方式中，修飾的糖在2'位含有一個或多個取代基（通常是一個取代基，並且通常在軸向位置），其獨立地選自-F；-CF3 、-CN、-N3 、-NO、-NO2 、-OR'、-SR'、或-N(R')2 ，其中每個R'獨立地是視需要經取代的C1-10 脂肪族；-O-(C1 -C10 烷基)、-S-(C1 -C10 烷基)、-NH-(C1 -C10 烷基)、或-N(C1 -C10 烷基)2 ；-O-(C2 -C10 烯基)、-S-(C2 -C10 烯基)、-NH-(C2 -C10 烯基)、或-N(C2 -C10 烯基)2 ；-O-(C2 -C10 炔基)、-S-(C2 -C10 炔基)、-NH-(C2 -C10 炔基)、或-N(C2 -C10 炔基)2 ；或-O--(C1 -C10 伸烷基)-O--(C1 -C10 烷基)、-O-(C1 -C10 伸烷基)-NH-(C1 -C10 烷基)或-O-(C1 -C10 伸烷基)-NH(C1 -C10 烷基)2 、-NH-(C1 -C10 伸烷基)-O-(C1 -C10 烷基)、或-N(C1 -C10 烷基)-(C1 -C10 伸烷基)-O-(C1 -C10 烷基)，其中烷基、伸烷基、烯基和炔基各自獨立且視需要經取代。在一些實施方式中，取代基係-O(CH2 )n OCH3 、-O(CH2 )n NH2 、MOE、DMAOE或DMAEOE，其中n係1至約10。在一些實施方式中，修飾的糖描述於以下中的修飾的糖：WO 2001/088198；和Martin等人, Helv. Chim. Acta[赫爾維蒂卡化學雜誌], 1995, 78, 486-504。在一些實施方式中，經修飾的糖包含一個或多個選自以下的基團：取代的矽基、切割RNA的基團、報告基團、螢光標記、嵌入劑、用於改善核酸的藥物動力學特性的基團、用於改善核酸的藥效學特性的基團、或其他具有類似特性的取代基。在一些實施方式中，在2'、3'、4'或5'位的一個或多個上進行修飾，包括在3'末端核苷上的糖的3'位或在5’末端核苷的5’位。
在一些實施方式中，核糖的2'-OH被選自以下的基團替換：-H、-F；-CF3 、-CN、-N3 、-NO、-NO2 、-OR'、-SR'、或-N(R')2 ，其中每個R'獨立地描述於本揭露中；-O-(C1 -C10 烷基)、-S-(C1 -C10 烷基)、-NH-(C1 -C10 烷基)、或-N(C1 -C10 烷基)2 ；-O-(C2 -C10 烯基)、-S-(C2 -C10 烯基)、-NH-(C2 -C10 烯基)、或-N(C2 -C10 烯基)2 ；-O-(C2 -C10 炔基)、-S-(C2 -C10 炔基)、-NH-(C2 -C10 炔基)、或-N(C2 -C10 炔基)2 ；或-O--(C1 -C10 伸烷基)-O--(C1 -C10 烷基)、-O-(C1 -C10 伸烷基)-NH-(C1 -C10 烷基)或-O-(C1 -C10 伸烷基)-NH(C1 -C10 烷基)2 、-NH-(C1 -C10 伸烷基)-O-(C1 -C10 烷基)、或-N(C1 -C10 烷基)-(C1 -C10 伸烷基)-O-(C1 -C10 烷基)，其中烷基、伸烷基、烯基和炔基各自獨立且視需要經取代。在一些實施方式中，2'-OH被-H（去氧核糖）替換。在一些實施方式中，2'-OH被-F替換。在一些實施方式中，2'-OH被-OR'替換。在一些實施方式中，2'-OH被-OMe替換。在一些實施方式中，2'-OH被-OCH2 CH2 OMe替換。
在一些實施方式中，糖修飾係2'-修飾。常用的2'-修飾包括但不限於2'-OR，其中R係視需要經取代的C1-6 脂肪族。在一些實施方式中，修飾係2’-OR，其中R係視需要經取代的C1-6 烷基。在一些實施方式中，修飾係2'-OMe。在一些實施方式中，修飾係2'-MOE。在一些實施方式中，2'-修飾係S-cEt。在一些實施方式中，修飾的糖係LNA糖。在一些實施方式中，2'-修飾係-F。在一些實施方式中，2'-修飾係FANA。在一些實施方式中，2'-修飾係FRNA。在一些實施方式中，糖修飾係5’-修飾，例如5’-Me。在一些實施方式中，糖修飾改變糖環的大小。在一些實施方式中，糖修飾係FHNA中的糖部分。
在一些實施方式中，糖修飾用另一個環狀或無環狀部分替換糖部分。這類部分的實例係本領域廣泛已知的，包括但不限於𠰌啉基（視需要具有其二胺基磷酸酯鍵聯）、二醇核酸等中所使用的那些部分。
在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸的一個或多個糖被修飾。在一些實施方式中，寡核苷酸的每個糖被獨立地修飾。在一些實施方式中，經修飾的糖包含2’-修飾。在一些實施方式中，每個修飾的糖獨立地包含2’-修飾。在一些實施方式中，2'-修飾係2'-OR，其中R係視需要經取代的C1-6 脂肪族。在一些實施方式中，2’-修飾係2’-OMe。在一些實施方式中，2’-修飾係2’-MOE。在一些實施方式中，2’-修飾係LNA糖修飾。在一些實施方式中，2’-修改係2’-F。在一些實施方式中，每個糖修飾獨立地是2’-修飾。在一些實施方式中，每個糖修飾獨立地是2'-OR。在一些實施方式中，每個糖修飾獨立地是2'-OR，其中R係視需要經取代的C1-6 烷基。在一些實施方式中，每個糖修飾係2’-OMe。在一些實施方式中，每個糖修飾係2’-MOE。在一些實施方式中，每個糖修飾獨立地是2'-OMe或2'-MOE。在一些實施方式中，每個糖修飾獨立地是2’-OMe、2’-MOE或LNA糖。
在一些實施方式中，修飾的糖係視需要經取代的ENA糖。在一些實施方式中，糖係在以下中描述的糖：例如Seth等人, J Am Chem Soc.[美國化學學會雜誌] 2010年10月27日; 132(42): 14942-14950。在一些實施方式中，修飾的糖係在XNA（異種核酸（xenonucleic acid））中的糖，例如阿拉伯糖、無水己糖醇、蘇糖、2'氟阿拉伯糖或環己烯。
修飾的糖包括代替呋喃戊糖基糖的環丁基或環戊基部分。這種修飾的糖的代表性實例包括在US 4,981,957、US 5,118,800、US 5,319,080或US 5,359,044中描述的那些。在一些實施方式中，核糖環內的氧原子被氮、硫、硒或碳替換。在一些實施方式中，-O-被-N(R’)-、-S-、-Se-或-C(R’)2 -替換。在一些實施方式中，修飾的糖係修飾的核糖，其中核糖環內的氧原子被氮替換，且其中氮視需要被烷基基團（例如甲基、乙基、異丙基等）取代。
在一些實施方式中，糖藉由核苷酸間鍵聯（在一些實施方式中，經修飾的核苷酸間鍵聯）連接。在一些實施方式中，核苷酸間鍵聯不包含鍵聯磷。在一些實施方式中，核苷酸間鍵聯係-L-。在一些實施方式中，核苷酸間鍵聯係-OP(O)(-C≡CH)O-、-OP(O)(R)O-（例如，R係-CH3 ）、3’ -NHP(O)(OH)O- 5’、3’ -OP(O)(CH3 )OCH2 - 5’、3’-CH2 C(O)NHCH2 -5’、3’-SCH2 OCH2 -5’、3’-OCH2 OCH2 -5’、3’-CH2 NR’CH2 -5’、3’-CH2 N(Me)OCH2 -5’、3’-NHC(O)CH2 CH2 -5’、3’-NR’C(O)CH2 CH2 -5’、3’-CH2 CH2 NR’-5’、3’-CH2 CH2 NH-5’、或3’-OCH2 CH2 N(R’)-5’。在一些實施方式中，5’碳可以視需要被=O取代。
在一些實施方式中，修飾的糖係視需要經取代的戊糖或己糖。在一些實施方式中，修飾的糖係視需要經取代的戊糖。在一些實施方式中，修飾的糖係視需要經取代的己糖。在一些實施方式中，修飾的糖係視需要經取代的核糖或己糖醇。在一些實施方式中，修飾的糖係視需要經取代的核糖。在一些實施方式中，修飾的糖係視需要經取代的己糖醇。
在一些實施方式中，糖修飾係5'-乙烯基（R或S）、5'-甲基（R或S）、2'-SH、2'-F、2'-OCH3 、2'-OCH2 CH3 、2'-OCH2 CH2 F或2’-O(CH2 )20 CH3 。在一些實施方式中，在2’位上的取代基，例如2’-修飾基團係烯丙基、胺基、疊氮基、硫基、O-烯丙基、O-C1 -C10 烷基、OCF3 、OCH2 F、O(CH2 )2 SCH3 、O(CH2 )2 -O-N(Rm )(Rn )、O-CH2 -C(=O)-N(Rm )(Rn )和O-CH2 -C(=O)-N(R1 )-(CH2 )2 -N(Rm )(Rn )，其中每個烯丙基、胺基和烷基視需要經取代，並且Rl 、Rm 和Rn 各自獨立地是如本揭露中所述之R'。在一些實施方式中，Rl 、Rm 和Rn 各自獨立地是-H或視需要經取代的C1 -C10 烷基。
在一些實施方式中，糖係四氫哌喃或THP糖。在一些實施方式中，修飾的核苷係四氫哌喃核苷或THP核苷（其係用六元四氫哌喃糖替代典型的天然核苷中的呋喃戊糖基殘基的核苷）。THP糖和/或核苷包括用於己糖醇核酸（HNA）、安尼妥（anitol）核酸（ANA）、甘露醇核酸（MNA）（例如，Leumann, Bioorg. Med. Chem.[生物有機化學與醫藥化學], 2002, 10, 841-854）或氟代HNA（F-HNA）的那些。
在一些實施方式中，糖包含具有多於5個原子和/或多於一個雜原子的環，例如𠰌啉代糖。
如熟悉該項技術者將理解的，糖、核鹼基、核苷酸間鍵聯等的修飾可以並且經常與寡核苷酸（例如參見表1中的各種寡核苷酸）組合使用。例如，糖修飾和核鹼基修飾的組合係2'-F（糖）5-甲基（核鹼基）修飾的核苷。在一些實施方式中，組合係用S替換核糖基環氧原子並在2'-位置取代。
在一些實施方式中，2'-修飾的糖係在2'位被修飾的呋喃糖基糖。在一些實施方式中，2’-修飾係鹵素、-R’（其中R’不是-H）、-OR’（其中R’不是-H）、-SR’、-N(R’)2 、視需要經取代的-CH2 -CH=CH2 、視需要經取代的烯基或視需要經取代的炔基。在一些實施方式中，2’-修飾選自-O[(CH2 )n O]m CH3 、-O(CH2 )n NH2 、-O(CH2 )n CH3 、-O(CH2 )n F、-O(CH2 )n ONH2 、-OCH2 C(=O)N(H)CH3 和-O(CH2 )n ON[(CH2 )n CH3 ]2 ，其中每個n和m獨立地是1至約10。在一些實施方式中，2'-修飾係視需要經取代的C1 -C12 烷基、視需要經取代的烯基、視需要經取代的炔基、視需要經取代的烷芳基、視需要經取代的芳烷基、視需要經取代的-O-烷芳基，視需要經取代的-O-芳烷基，-SH、-SCH3 、-OCN、-Cl、-Br、-CN、-F、-CF3 、-OCF3 、-SOCH3 、-SO2 CH3 、-ONO2 、-NO2 、-N3 、-NH2 、視需要經取代的雜環烷基，視需要經取代的雜環烷芳基、視需要經取代的胺基烷基胺基，視需要經取代的聚烷基胺基，經取代的矽基，報告基團，嵌入劑，用於改善藥物動力學特性的基團，用於改善藥效學特性的基團和其他取代基。在一些實施方式中，2’-修飾係2’-MOE修飾。
在一些實施方式中，2’-修飾的或2’-取代的糖或核苷係在糖的2’位包含除-H（通常不視為取代基）或-OH以外的取代基的糖或核苷。在一些實施方式中，2’-修飾的糖係雙環糖，其包含連接糖環的兩個碳原子（其中一個係2’碳）的橋。在一些實施方式中，2’-修飾係非橋聯的，例如烯丙基，胺基，疊氮基，硫代，視需要經取代的-O-烯丙基，視需要經取代的-O-C1 -C10 烷基，-OCF3 ，-O(CH2 )2 OCH3 、2’-O(CH2 )2 SCH3 、-O(CH2 )2 ON(Rm )(Rn )或-OCH2 C(=O)N(Rm )(Rn )，其中每個Rm 和Rn 獨立地是-H或視需要經取代的C1 -C10 烷基。
在一些實施方式中，糖係N-甲醇卡巴（N-methanocarba）、LNA、cMOE BNA、cEt BNA、α-L-LNA或相關類似物、HNA、Me-ANA、MOE-ANA、Ara-FHNA、FHNA、R-6'-Me-FHNA、S-6'-Me-FHNA、ENA或c-ANA。在一些實施方式中，修飾的核苷酸間鍵聯係C3-醯胺（例如，具有與C3’連接的醯胺修飾的糖，Mutisya  等人 2014 Nucleic Acids Res.[核酸研究] 2014年6月1日; 42(10): 6542-6551），甲縮醛，硫代甲縮醛，MMI [例如，亞甲基(甲基亞胺基)，Peoc'h 等人 2006 Nucleosides and Nucleotides[核苷與核苷酸] 16 (7-9)]，PMO（二胺基磷酸酯連接的𠰌啉代）鍵聯（其連接兩個糖）或PNA（肽核酸）鍵聯。
在一些實施方式中，糖係描述於US 9394333、US 9744183、US 9605019、US 9598458、US 9982257、US 10160969、US 10479995、US 2020/0056173、US 2018/0216107、US 2019/0127733、US 10450568、US 2019/0077817、US 2019/0249173、US 2019/0375774、WO 2018/223056、WO 2018/223073、WO 2018/223081、WO 2018/237194、WO 2019/032607、WO 2019/055951、WO 2019/075357、WO 2019/200185、WO 2019/217784、WO 2019/032612和/或WO 2020/191252中的糖，其各自的糖藉由引用併入本文。
可用於製備寡核苷酸或其類似物的各種另外的糖係本領域已知的，並且可以根據本揭露使用。
核鹼基
根據本揭露，各種核鹼基可用於所提供的寡核苷酸中。在一些實施方式中，核鹼基係天然核鹼基，最常見的是A、T、C、G和U。在一些實施方式中，核鹼基係修飾的核鹼基，因為它不是A、T、C、G或U。在一些實施方式中，核鹼基係視需要經取代的A、T、C、G或U，或A、T、C、G或U的經取代的互變異構物。在一些實施方式中，核鹼基係視需要經取代的A、T、C、G或U，例如5mC、5-羥基甲基C等。在一些實施方式中，核鹼基係烷基取代的A、T、C、G或U。在一些實施方式中，核鹼基係A。在一些實施方式中，核鹼基係T。在一些實施方式中，核鹼基係C。在一些實施方式中，核鹼基係G。在一些實施方式中，核鹼基係U。在一些實施方式中，核鹼基係5mC。在一些實施方式中，核鹼基係取代的A、T、C、G或U。在一些實施方式中，核鹼基係A、T、C、G或U的經取代的互變異構物。在一些實施方式中，取代保護核鹼基中的某些官能基以最小化寡核苷酸合成過程中不希望的反應。在寡核苷酸合成中用於核鹼基保護的合適技術係本領域眾所周知的，並且可以根據本揭露使用。在一些實施方式中，修飾的核鹼基改善了寡核苷酸的特性和/或活性。例如，在許多情況下，可以使用5mC代替C來調節某些不希望的生物學效應，例如免疫應答。在一些實施方式中，當確定序列同一性時，將具有相同氫鍵模式的經取代的核鹼基與未取代的核鹼基相同處理，例如5mC可以與C相同處理[例如，具有5mC代替C（例如AT5mCG）的寡核苷酸被認為與在一個或多個相應位置（例如ATCG）具有C的寡核苷酸具有相同的鹼基序列]。
在一些實施方式中，寡核苷酸包含一個或多個A、T、C、G或U。在一些實施方式中，寡核苷酸包含一個或多個視需要經取代的A、T、C、G或U。在一些實施方式中，寡核苷酸包含一個或多個5-甲基胞苷、5-羥甲基胞苷、5-甲醯基胞嘧啶或5-羧基胞嘧啶。在一些實施方式中，寡核苷酸包含一個或多個5-甲基胞苷。在一些實施方式中，寡核苷酸中的每個核鹼基選自由以下組成之群組：視需要經取代的A、T、C、G和U，以及A、T、C、G和U的視需要經取代的互變異構物。在一些實施方式中，寡核苷酸中的每個核鹼基係視需要受保護的A、T、C、G和U。在一些實施方式中，寡核苷酸中的每個核鹼基係視需要經取代的A、T、C、G或U。在一些實施方式中，寡核苷酸中的每個核鹼基選自由以下組成之群組：A、T、C、G、U和5mC。
在一些實施方式中，核鹼基係視需要經取代的2AP或DAP。在一些實施方式中，核鹼基係視需要經取代的2AP。在一些實施方式中，核鹼基係視需要經取代的DAP。在一些實施方式中，核鹼基係2AP。在一些實施方式中，核鹼基係DAP。
在一些實施方式中，核鹼基係天然核鹼基或衍生自天然核鹼基的修飾的核鹼基。實例包括視需要其各自的胺基基團被醯基保護基團保護的尿嘧啶、胸腺嘧啶、腺嘌呤、胞嘧啶和鳥嘌呤，2-氟尿嘧啶，2-氟胞嘧啶，5-溴尿嘧啶，5-碘尿嘧啶，2,6-二胺基嘌呤，氮雜胞嘧啶，嘧啶類似物（如假異胞嘧啶和假尿嘧啶），以及其他修飾的核鹼基（如8-取代的嘌呤、黃嘌呤、或次黃嘌呤，後兩個係天然降解產物）。修飾的核鹼基的某些實例揭露於Chiu和Rana, RNA, 2003, 9, 1034-1048；Limbach 等人 Nucleic Acids Research [核酸研究], 1994, 22, 2183-2196；以及Revankar和Rao, Comprehensive Natural Products Chemistry [天然產物綜合化學], 第7卷, 313中。在一些實施方式中，經修飾的核鹼基係取代的尿嘧啶、胸腺嘧啶、腺嘌呤、胞嘧啶或鳥嘌呤。在一些實施方式中，修飾的核鹼基係尿嘧啶、胸腺嘧啶、腺嘌呤、胞嘧啶或鳥嘌呤的例如就氫鍵合和/或鹼基配對而言的功能替換物。在一些實施方式中，核鹼基係視需要經取代的尿嘧啶、胸腺嘧啶、腺嘌呤、胞嘧啶、5-甲基胞嘧啶或鳥嘌呤。在一些實施方式中，核鹼基係尿嘧啶、胸腺嘧啶、腺嘌呤、胞嘧啶、5-甲基胞嘧啶或鳥嘌呤。
在一些實施方式中，所提供的寡核苷酸包含一個或多個5-甲基胞嘧啶。在一些實施方式中，本揭露提供了寡核苷酸，該寡核苷酸的鹼基序列在本文中例如在表1中揭露，其中每個T可以獨立地被U替換，並且反之亦然，並且每個胞嘧啶視需要並且獨立地被5-甲基胞嘧啶替換，或反之亦然。如熟悉該項技術者所理解的，在一些實施方式中，就寡核苷酸的鹼基序列而言，可以將5mC視為C-這種寡核苷酸在C位置包含核鹼基修飾（例如，參見表1中的各種寡核苷酸）。在寡核苷酸的描述中，通常除非另有說明，否則核鹼基、糖和核苷酸間鍵聯係未修飾的。
在一些實施方式中，修飾的鹼基係視需要經取代的腺嘌呤、胞嘧啶、鳥嘌呤、胸腺嘧啶或尿嘧啶或其互變異構物。在一些實施方式中，修飾的核鹼基係藉由以下各項而被一個或多個修飾進行修飾的修飾的腺嘌呤、胞嘧啶、鳥嘌呤、胸腺嘧啶或尿嘧啶： (1) 核鹼基被一個或多個獨立地選自以下的視需要經取代的基團修飾：醯基、鹵素、胺基、疊氮基、烷基、烯基、炔基、芳基、雜烷基、雜烯基、雜炔基、雜環基、雜芳基、羧基、羥基、生物素、親和素、鏈黴親和素、取代的矽基及其組合； (2) 核鹼基的一個或多個原子獨立地被選自碳、氮和硫的不同原子替換； (3) 核鹼基中的一個或多個雙鍵獨立地被氫化；或 (4) 一個或多個芳基或雜芳基環獨立地插入至核鹼基中。
在一些實施方式中，修飾的核鹼基係本領域（例如 WO 2017/210647）中所已知的修飾的核鹼基。在一些實施方式中，修飾的核鹼基係其中已添加一個或多個芳基和/或雜芳基環，例如苯環的大小擴增的核鹼基。
在一些實施方式中，修飾的核鹼基選自5-取代的嘧啶、6-氮雜嘧啶、烷基或炔基取代的嘧啶、烷基取代的嘌呤、以及N-2、N-6和O-6取代的嘌呤。在某些實施方式中，修飾的核鹼基選自2-胺基丙基腺嘌呤、5-羥甲基胞嘧啶、黃嘌呤、次黃嘌呤、2-胺基腺嘌呤、6-N-甲基鳥嘌呤、6-N-甲基腺嘌呤、2-丙基腺嘌呤、2-硫尿嘧啶、2-硫胸腺嘧啶和2-硫胞嘧啶、5-丙炔基（-C≡C-CH3 ）尿嘧啶、5-丙炔基胞嘧啶、6-氮尿嘧啶、6-氮胞嘧啶、6-氮胸腺嘧啶、5-核糖基尿嘧啶（假尿嘧啶）、4-硫尿嘧啶、8-鹵代嘌呤、8-胺基嘌呤、8-硫醇嘌呤、8-硫代烷基嘌呤、8-羥基嘌呤、8-氮雜嘌呤及其他8-取代的嘌呤、5-鹵代、特別是5-溴、5-三氟甲基、5-鹵代尿嘧啶及5-鹵代胞嘧啶、7-甲基鳥嘌呤、7-甲基腺嘌呤、2-F-腺嘌呤、2-胺基腺嘌呤、7-脫氮鳥嘌呤、7-脫氮腺嘌呤、3-脫氮鳥嘌呤、3-脫氮腺嘌呤、6-N-苯甲醯基腺嘌呤、2-N-異丁醯基鳥嘌呤、4-N-苯甲醯基胞嘧啶、4-N-苯甲醯基尿嘧啶、5-甲基4-N-苯甲醯基胞嘧啶、5-甲基4-N-苯甲醯基尿嘧啶、通用鹼基、疏水性鹼基、混雜鹼基、大小擴展的鹼基、以及氟化鹼基。在一些實施方式中，修飾的核鹼基係三環嘧啶，如l,3-二氮雜吩㗁𠯤-2-酮、l,3-二氮雜吩噻𠯤-2-酮或9-(2-胺基乙氧基)-l,3-二氮雜吩㗁𠯤-2-酮（G形夾（G-clamp））。在一些實施方式中，修飾的核鹼基係其中嘌呤或嘧啶鹼基被其他雜環替換的那些核鹼基，例如，7-脫氮-腺嘌呤、7-脫氮鳥苷、2-胺基吡啶或2-吡啶酮。
在一些實施方式中，經修飾的核鹼基係取代的。在一些實施方式中，修飾的核鹼基係經取代的，使得其含有例如連接至螢光部分、生物素或親和素部分、或其他蛋白或肽的雜原子、烷基基團或連接部分。在一些實施方式中，修飾的核鹼基係並非最經典意義上的核鹼基、但功能類似於核鹼基的「通用鹼基」。通用鹼的一個實例係3-硝基吡咯。
在一些實施方式中，可用於提供的技術中的核苷包括修飾的核鹼基和/或修飾的糖，例如4-乙醯基胞苷；5-(羧基羥甲基)尿苷；2'-O-甲基胞苷；5-羧甲基胺基甲基-2-硫代尿苷；5-羧甲基胺基甲基尿苷；二氫尿苷；2'-O-甲基假尿苷；β,D-半乳糖基Q核苷（beta,D-galactosylqueosine）；2'-O-甲基鳥苷；N6 -異戊烯基腺苷；1-甲基腺苷；1-甲基假尿苷；1-甲基鳥苷；l-甲基肌苷；2,2-二甲基鳥苷；2-甲基腺苷；2-甲基鳥苷；N7 -甲基鳥苷；3-甲基-胞苷；5-甲基胞苷；5-羥甲基胞苷；5-甲醯基胞嘧啶；5-羧基胞嘧啶；N6 -甲基腺苷；7-甲基鳥苷；5-甲基胺基乙基尿苷；5-甲氧基胺基甲基-2-硫代尿苷；β,D-甘露糖基Q核苷；5-甲氧基羰基甲基尿苷；5-甲氧基尿苷；2-甲硫基-N6 -異戊烯基腺苷；N-((9-β,D-呋喃核糖基-2-甲基硫代嘌呤-6-基)胺甲醯基)蘇胺酸；N-((9-β,D-呋喃核糖基嘌呤-6-基)-N-甲基胺甲醯基)蘇胺酸；尿苷-5-氧基乙酸甲酯；尿苷-5-氧基乙酸（v）；假尿苷；Q核苷；2-硫代胞苷；5-甲基-2-硫代尿苷；2-硫代尿苷；4-硫代尿苷；5-甲基尿苷；2'-O-甲基-5-甲基尿苷；以及2'-O-甲基尿苷。
在一些實施方式中，核鹼基例如修飾的核鹼基包含一個或多個生物分子結合部分，例如像抗體、抗體片段、生物素、親和素、鏈黴親和素、受體配位基或螯合部分。在其他實施方式中，核鹼基係5-溴尿嘧啶、5-碘尿嘧啶或2,6-二胺基嘌呤。在一些實施方式中，核鹼基包含被螢光或生物分子結合部分取代。在一些實施方式中，取代基係螢光部分。在一些實施方式中，取代基係生物素或親和素。
在一些實施方式中，核鹼基係描述於US 9394333、US 9744183、US 9605019、US 9598458、US 9982257、US 10160969、US 10479995、US 2020/0056173、US 2018/0216107、US 2019/0127733、US 10450568、US 2019/0077817、US 2019/0249173、US 2019/0375774、WO 2018/223056、WO 2018/223073、WO 2018/223081、WO 2018/237194、WO 2019/032607、WO 2019/055951、WO 2019/075357、WO 2019/200185、WO 2019/217784、WO 2019/032612和/或WO 2020/191252中的核鹼基，其各自的核鹼基藉由引用併入本文。
另外的化學部分
在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸包含一個或多個另外的化學部分。各種另外的化學部分，例如靶向部分、碳水化合物部分、脂質部分等在本領域中是已知的，並且可以根據本揭露用於調節MAPT寡核苷酸的特性和/或活性，例如穩定性、半衰期、活性、遞送、藥效學特性、藥物動力學特性等。在一些實施方式中，某些另外的化學部分促進寡核苷酸向期望的細胞、組織和/或器官的遞送，包括但不限於中樞神經系統的細胞。在一些實施方式中，某些另外的化學部分促進寡核苷酸的內化。在一些實施方式中，某些另外的化學部分提高寡核苷酸穩定性。在一些實施方式中，本揭露提供用於將各種另外的化學部分併入至寡核苷酸中的技術。
在一些實施方式中，另外的化學部分能夠改善MAPT寡核苷酸的穩定性和/或遞送，例如，遍及特定的組織、器官或身體部分或遍及整個患者的身體。
在一些實施方式中，另外的化學部分係碳水化合物部分、靶向部分等，其在摻入寡核苷酸中時可以改善一種或多種特性。在一些實施方式中，另外的化學部分選自葡萄糖、GluNAc（N-乙醯葡糖胺）及茴香醯胺部分。
在一些實施方式中，另外的化學部分係靶向部分。在一些實施方式中，另外的化學部分係或包含碳水化合物部分。在一些實施方式中，另外的化學部分係或包含脂質部分。在一些實施方式中，另外的化學部分係或包含例如細胞受體（諸如δ受體、去唾液酸糖蛋白受體等）的配位基部分。在一些實施方式中，配位基部分係或包含茴香醯胺部分，其可係δ受體的配位基部分。在一些實施方式中，另外的化學部分係或包含脫唾液酸糖蛋白受體的配位基部分。
在一些實施方式中，另外的化學部分係或包含GalNAc部分。
某些有用的另外的化學部分描述於US 10479995、US 2020/0056173、US 2018/0216107、US 2019/0127733、US 10450568、US 2019/0249173、WO 2018/223056、WO 2018/223073、WO 2018/223081、WO 2019/032607、WO 2019/075357、WO 2019/200185、WO 2019/217784、WO 2019/032612、和/或WO 2020/191252。
寡核苷酸和組成物的產生
各種方法可以用於產生寡核苷酸和組成物，並且可以根據本揭露使用。例如，傳統的亞磷醯胺化學可用於製備立體隨機的寡核苷酸和組成物，並且某些試劑和手性受控的技術可用於製備手性受控的寡核苷酸組成物，例如如以下中所描述：US 9394333、US 9744183、US 9605019、US 9598458、US 9982257、US 10160969、US 10479995、US 2020/0056173、US 2018/0216107、US 2019/0127733、US 10450568、US 2019/0077817、US 2019/0249173、US 2019/0375774、WO 2018/223056、WO 2018/223073、WO 2018/223081、WO 2018/237194、WO 2019/032607、WO 2019/055951、WO 2019/075357、WO 2019/200185、WO 2019/217784、WO 2019/032612和/或WO 2020/191252，其各自的試劑和方法藉由引用併入本文。
在一些實施方式中，寡核苷酸及其組成物的手性受控/立體選擇性製備包括利用手性助劑，例如作為單體亞磷醯胺的一部分。此類手性助劑和亞磷醯胺的實例描述於以下中：US 9394333、US 9744183、US 9605019、US 9598458、US 9982257、US 10160969、US 10479995、US 2020/0056173、US 2018/0216107、US 2019/0127733、US 10450568、US 2019/0077817、US 2019/0249173、US 2019/0375774、WO 2018/223056、WO 2018/223073、WO 2018/223081、WO 2018/237194、WO 2019/032607、WO 2019/055951、WO 2019/075357、WO 2019/200185、WO 2019/217784、WO 2019/032612和/或WO 2020/191252，其各自的手性助劑和亞磷醯胺藉由引用獨立地併入本文。在一些實施方式中，手性助劑係
Figure 02_image047
或
Figure 02_image049
（DPSE手性助劑）。在一些實施方式中，手性助劑係
Figure 02_image051
或
Figure 02_image053
。在一些實施方式中，手性助劑係
Figure 02_image055
或
Figure 02_image057
。在一些實施方式中，手性助劑包含-SO2 RAU ，其中RAU 係選自以下的視需要經取代的基團：C1-20 脂肪族、具有1-10個雜原子的C1-20 雜脂肪族、C6-20 芳基、C6-20 芳基脂肪族、具有1-10個雜原子的C6-20 芳基雜脂肪族、具有1-10個雜原子的5-20員雜芳基、以及具有1-10個雜原子的3-20員雜環基。在一些實施方式中，手性助劑係
Figure 02_image059
或
Figure 02_image061
。在一些實施方式中，RAU 係視需要經取代的芳基。在一些實施方式中，RAU 係視需要經取代的苯基。在一些實施方式中，RAU 係視需要經取代的C1-6 脂肪族。在一些實施方式中，手性助劑係
Figure 02_image063
或
Figure 02_image065
（PSM手性助劑）。在一些實施方式中，此類手性助劑（例如製劑）、包含此類手性助劑的亞磷醯胺、包含此類助劑的中間寡核苷酸（該等助劑通常藉由-OH的-O-與鍵聯磷鍵合，而-NH-視需要被封端（例如藉由-C(O)R））的使用、保護、移除等描述在US 9394333、US 9744183、US 9605019、US 9598458、US 9982257、US 10160969、US 10479995、US 2020/0056173、US 2018/0216107、US 2019/0127733、US 10450568、US 2019/0077817、US 2019/0249173、US 2019/0375774、WO 2018/223056、WO 2018/223073、WO 2018/223081、WO 2018/237194、WO 2019/032607、WO 2019/055951、WO 2019/075357、WO 2019/200185、WO 2019/217784、WO 2019/032612、和/或WO 2020/191252中，並藉由引用併入本文。
在一些實施方式中，手性受控的製備技術（包括寡核苷酸合成循環、試劑和條件）描述於以下中：US 9394333、US 9744183、US 9605019、US 9598458、US 9982257、US 10160969、US 10479995、US 2020/0056173、US 2018/0216107、US 2019/0127733、US 10450568、US 2019/0077817、US 2019/0249173、US 2019/0375774、WO 2018/223056、WO 2018/223073、WO 2018/223081、WO 2018/237194、WO 2019/032607、WO 2019/055951、WO 2019/075357、WO 2019/200185、WO 2019/217784、WO 2019/032612和/或WO 2020/191252，其各自的寡核苷酸合成方法、循環、試劑和條件藉由引用獨立地併入本文。
一旦合成，通常將進一步純化MAPT寡核苷酸和組成物。合適的純化技術係熟悉該項技術者眾所周知的和實踐的，包括但不限於在以下中描述的那些：US 9394333、US 9744183、US 9605019、US 9598458、US 9982257、US 10160969、US 10479995、US 2020/0056173、US 2018/0216107、US 2019/0127733、US 10450568、US 2019/0077817、US 2019/0249173、US 2019/0375774、WO 2018/223056、WO 2018/223073、WO 2018/223081、WO 2018/237194、WO 2019/032607、WO 2019/055951、WO 2019/075357、WO 2019/200185、WO 2019/217784、WO 2019/032612和/或WO 2020/191252，其各自的純化技術藉由引用獨立地併入本文。
在一些實施方式中，循環包括偶聯、加帽、修飾和解嵌段或由其組成。在一些實施方式中，循環包括偶聯、加帽、修飾、加帽和解嵌段或由其組成。該等步驟通常以其列出的循序執行，但是在一些實施方式中，如熟悉該項技術者所理解的，可以改變某些步驟的順序，例如加帽和修飾。如果需要，可以重複一個或多個步驟以提高轉化率、產率和/或純度，如熟悉該項技術者通常在合成中所進行的。例如，在一些實施方式中，可以重複進行偶聯；在一些實施方式中，可以重複進行修飾（例如，氧化以安裝＝ O，硫化以安裝＝ S，等等）；在一些實施方式中，在修飾後重複進行偶聯，其可以將P(III)鍵聯轉化為在某些情況下可以更穩定的P(V)鍵聯，並且偶聯後通常進行修飾以轉化新形成的P(III)鍵聯為P(V)鍵聯。在一些實施方式中，當重複步驟時，可以採用不同的條件（例如，濃度、溫度、試劑、時間等）。
在一些實施方式中，寡核苷酸連接至固體支持物。在一些實施方式中，固體支持物係寡核苷酸合成的支持物。在一些實施方式中，固體支持物包括玻璃。在一些實施方式中，固體支持物係CPG（可控孔度玻璃）。在一些實施方式中，固體支持物係聚合物。在一些實施方式中，固體支持物係聚苯乙烯。在一些實施方式中，固體支持物係高度交聯的聚苯乙烯（HCP）。在一些實施方式中，固體支持物係可控孔度玻璃（CPG）和高度交聯的聚苯乙烯（HCP）的雜合支持物。在一些實施方式中，固體支持物係金屬泡沫。在一些實施方式中，固體支持物係樹脂。在一些實施方式中，從固體支持物上切割寡核苷酸。
用於配製所提供的寡核苷酸和/或製備藥物組成物的技術，例如用於經由各種途徑施用給受試者的技術，在本領域中是容易獲得的，並且可以根據本揭露使用，例如描述於以下中的那些：US 9394333、US 9744183、US 9605019、US 9598458、US 9982257、US 10160969、US 10479995、US 2020/0056173、US 2018/0216107、US 2019/0127733、US 10450568、US 2019/0077817、US 2019/0249173、US 2019/0375774、WO 2018/223056、WO 2018/223073、WO 2018/223081、WO 2018/237194、WO 2019/032607、WO 2019/055951、WO 2019/075357、WO 2019/200185、WO 2019/217784、WO 2019/032612和/或WO 2020/191252。
寡核苷酸的代謝產物和縮短形式
在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸對應於藉由較長的寡核苷酸，例如較長的MAPT寡核苷酸的切割（例如，藉由核酸酶的酶促切割）產生的代謝產物。在一些實施方式中，本揭露關於對應於本文揭露的MAPT寡核苷酸的部分或片段的MAPT寡核苷酸。
在一些實施方式中，本揭露關於對應於本文揭露的MAPT寡核苷酸的代謝產物的寡核苷酸。在一些實施方式中，本揭露關於比本文揭露的寡核苷酸短1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13個或更多個鹼基的寡核苷酸。在一些實施方式中，本揭露關於具有以下鹼基序列的寡核苷酸，該鹼基序列比本文揭露的寡核苷酸的鹼基序列短1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13個或更多個鹼基。
在一些實施方式中，將代謝產物命名為3’-N-#或5'-N-#，其中#表示去除的鹼基數，並且3'或5'表示鹼基從分子的哪端去除。例如，3'-N-1表示片段或代謝產物，其中從3'端去除了1個鹼基。
在一些實施方式中，本揭露可能是對應於本文揭露的寡核苷酸的片段或代謝產物的寡核苷酸，其中該片段或代謝產物可以描述為對應於本文所述之寡核苷酸的3’-N-1、3’-N-2、3’-N-3、3’-N-4、3’-N-5、3’-N-6、3’-N-7、3’-N-8、3’-N-9、3’-N-10、3’-N-11、3’-N-12、5’-N-1、5’-N-2、5’-N-3、5’-N-4、5’-N-5、5’-N-6、5’-N-7、5’-N-8、5’-N-9、5’-N-10、5’-N-11、或5’-N-12，其中每個T可以獨立地被U替換，並且反之亦然。
在一些實施方式中，本揭露關於對應於寡核苷酸的代謝產物的寡核苷酸，其中該代謝產物相對於本文揭露的寡核苷酸在5'和/或3'端被截短，其中每個T可以獨立地被U替換，並且反之亦然。在一些實施方式中，本揭露關於對應於寡核苷酸的代謝產物的，其中該代謝產物相對於本文揭露的寡核苷酸在5'和3'端均被截短，其中每個T可以獨立地被U替換，並且反之亦然。在一些實施方式中，本揭露關於比本文揭露的寡核苷酸在5'端和/或3'端短1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13個或更多個總鹼基的寡核苷酸。在一些實施方式中，本揭露關於具有以下鹼基序列的寡核苷酸，該鹼基序列在5'端和/或3'端比本文揭露的寡核苷酸的鹼基序列短1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13個或更多個總鹼基，其中每個T可以獨立地被U替換，並且反之亦然。
在一些實施方式中，本揭露關於寡核苷酸，其係在天然磷酸酯鍵聯處切割的本文揭露的寡核苷酸的切割產物。在一些實施方式中，本揭露關於寡核苷酸，其係在Rp硫代磷酸酯核苷酸間鍵聯處切割的本文揭露的寡核苷酸的切割產物。
根據本揭露，可以利用多種技術來鑒定、表徵和/或評估代謝物和/或縮短的MAPT寡核苷酸，例如，在US 10479995、US 2020/0056173、US 2018/0216107、US 2019/0127733、US 10450568、US 2019/0249173、WO 2018/223056、WO 2018/223073、WO 2018/223081、WO 2019/032607、WO 2019/075357、WO 2019/200185、WO 2019/217784、WO 2019/032612、和/或WO 2020/191252中描述的那些。
表徵與評估
在一些實施方式中，可以使用熟悉該項技術者可用的各種技術（例如生化測定法（例如RNA酶 H測定法）、基於細胞的測定法、動物模型、臨床試驗等）來表徵和/或評估MAPT寡核苷酸及其組成物的特性和/或活性。
在一些實施方式中，鑒定和/或表徵寡核苷酸組成物例如MAPT寡核苷酸組成物之方法包括以下步驟： 提供至少一個包含多個寡核苷酸的組成物；以及 相對於參考組成物評估傳遞。
在一些實施方式中，本揭露提供了一種鑒定和/或表徵寡核苷酸組成物例如MAPT寡核苷酸組成物之方法，該方法包括以下步驟： 提供至少一個包含多個寡核苷酸的組成物；以及 相對於參考組成物評估細胞攝取。
在一些實施方式中，本揭露提供了一種鑒定和/或表徵寡核苷酸組成物例如MAPT寡核苷酸組成物之方法，該方法包括以下步驟： 提供至少一個包含多個寡核苷酸的組成物；以及 評估靶基因基因的轉錄物和/或由此編碼的產物相對於參考組成物的減少。
在一些實施方式中，本揭露提供了一種鑒定和/或表徵寡核苷酸組成物例如MAPT寡核苷酸組成物之方法，該方法包括以下步驟： 提供至少一個包含多個寡核苷酸的組成物；以及 評估tau程度的降低，其相對於參考組成物的聚集和/或擴散。
在一些實施方式中，將寡核苷酸例如MAPT寡核苷酸及其組成物的特性和/或活性分別與參考寡核苷酸及其組成物進行比較。
在一些實施方式中，參考寡核苷酸組成物係立體隨機寡核苷酸組成物。在一些實施方式中，參考寡核苷酸組成物係所有核苷酸間鍵聯均為硫代磷酸酯的寡核苷酸的立體隨機組成物。在一些實施方式中，參考寡核苷酸組成物係具有所有磷酸酯鍵聯的DNA寡核苷酸組成物。在一些實施方式中，參考寡核苷酸組成物在其他方面與所提供的手性受控的寡核苷酸組成物相同，除了它不是手性受控的。在一些實施方式中，參考寡核苷酸組成物在其他方面與所提供的手性受控的寡核苷酸組成物相同，除了它具有不同的立體化學模式。在一些實施方式中，參考寡核苷酸組成物與所提供的寡核苷酸組成物相似，除了它具有對一個或多個糖、鹼基和/或核苷酸間鍵聯或修飾模式的不同修飾。在一些實施方式中，寡核苷酸組成物係立體隨機的，而參考寡核苷酸組成物也是立體隨機的，但是它們在糖和/或鹼基的一個或多個修飾或其模式方面有所不同。
在一些實施方式中，參考組成物係具有相同鹼基序列和相同化學修飾的寡核苷酸的組成物。在一些實施方式中，參考組成物係具有相同鹼基序列和相同化學修飾模式的寡核苷酸的組成物。在一些實施方式中，參考組成物係具有相同鹼基序列和化學修飾的寡核苷酸的非手性受控（或立體隨機）組成物。在一些實施方式中，參考組成物係具有相同構造的、與提供的手性受控的寡核苷酸組成物在其他方面相同的寡核苷酸的非手性受控的（或立體隨機的）組成物。
在一些實施方式中，參考寡核苷酸組成物係具有不同鹼基序列的寡核苷酸。在一些實施方式中，參考寡核苷酸組成物具有不靶向MAPT的寡核苷酸（例如，作為某些測定的陰性對照）。
在一些實施方式中，參考組成物係具有相同鹼基序列但不同化學修飾（包括但不限於本文所述之化學修飾）的寡核苷酸的組成物。在一些實施方式中，參考組成物係具有相同鹼基序列但不同核苷酸間鍵聯模式和/或核苷酸間鍵聯的立體化學和/或化學修飾的寡核苷酸的組成物。
各種方法係本技術領域中已知的用於檢測基因產物，該基因產物的表現、程度和/或活性可在引入施用提供的寡核苷酸之後改變。例如，可以使用qPCR檢測和定量轉錄物及其敲低，並可以藉由蛋白印跡法確定蛋白程度。
在一些實施方式中，寡核苷酸功效的評估可以在生化測定中或在細胞中體外進行。在一些實施方式中，可以藉由熟悉該項技術者可用的各種方法將MAPT寡核苷酸引入細胞，例如，裸式（gymnotic）遞送、轉染、脂轉染等。
在一些實施方式中，可以在體外測試推定的MAPT寡核苷酸的功效。
在一些實施方式中，可以使用測試MAPT基因或其基因產物的表現、程度和/或活性的任何已知方法在體外測試推定的MAPT寡核苷酸的功效。
在一些實施方式中，腦橋腹側神經元核中的MAPT程度可以藉由免疫螢光來評估。
在一些實施方式中，可以藉由免疫印跡觀察MAPT可溶性聚集體。
在一些實施方式中，在阿茲海默氏症（AD）和/或額顳葉失智（FTD）的細胞或動物模型中測試MAPT寡核苷酸。
在一些實施方式中，可以評估施用MAPT寡核苷酸的動物模型的安全性和/或功效。
在一些實施方式中，可以評估向動物施用寡核苷酸的一個或多個作用，包括對行為、炎症和毒性的任何作用。在一些實施方式中，在給藥後，可以觀察到動物的毒性跡象，包括煩擾的理毛行為、缺乏食物消耗以及嗜睡的任何其他跡象。在一些實施方式中，在阿茲海默氏症（AD）或額顳葉失智（FTD）的小鼠模型中，在施用MAPT寡核苷酸後，可以監測動物後爪緊扣表型發作的時間。
在一些實施方式中，在向動物施用MAPT寡核苷酸之後，可以處死動物，並且可以進行組織或細胞的分析以確定MAPT的改變或其他生化或其他改變。在一些實施方式中，在屍檢之後，可以收集、固定並處理肝臟、心臟、肺、腎臟和脾臟以進行組織病理學評估（蘇木精和曙紅染色的組織玻片的標準光學顯微鏡檢查）。
在一些實施方式中，向動物施用MAPT寡核苷酸後，可以監測或評估行為變化。在一些實施方式中，可以使用科學文獻中描述的技術來進行這種評估。
在施用MAPT寡核苷酸後，還可以在人受試者或患者中監測本文所述之動物中測試的各種作用。
另外，可以藉由在施用寡核苷酸後評估本領域已知的各種參數中的任何一種來測量MAPT寡核苷酸在人類受試者中的功效，該參數包括但不限於阿茲海默氏症（AD）和/或額顳葉失智（FTD）症狀的減輕、或阿茲海默氏症（AD）和/或額顳失智（FTD）症狀惡化的速率或發作降低。
在一些實施方式中，在用寡核苷酸對人進行治療後，或在體外使細胞或組織與寡核苷酸接觸後，收集細胞和/或組織用於分析。
在一些實施方式中，在各種細胞和/或組織中，靶核酸程度可以藉由本領域可用之方法（其中許多可以用市售套組（kit）和材料完成）定量。這樣之方法包括例如RNA印跡分析，競爭性聚合酶鏈反應（PCR），定量即時PCR等。可以對總細胞RNA或聚(A)+ mRNA進行RNA分析。探針和引物被設計為與待檢測的核酸雜交。設計即時PCR探針和引物之方法係本領域眾所周知的並且廣泛實踐的。例如，為了檢測和定量MAPT RNA，一種示例方法包括從用寡核苷酸或組成物處理過的細胞或動物中分離總RNA（例如包括mRNA）並且使該RNA進行逆轉錄和/或即時定量PCR，例如本文中和Moon等人. 2012 Cell Metab.[細胞代謝] 15: 240-246中所描述。
在一些實施方式中，可以用本領域已知的各種方法評估或定量蛋白程度，例如，酶聯免疫吸附測定（ELISA）、蛋白印跡分析（免疫印跡）、免疫細胞化學、螢光激活細胞分選（FACS）、免疫組織化學、免疫沈澱法、蛋白活性測定（例如，半胱天冬酶活性測定）和定量蛋白測定。可用於檢測小鼠、大鼠、猴和人蛋白的抗體可商購獲得，也可以在需要時產生。例如，已經報導了各種MAPT抗體。
用於檢測寡核苷酸或其他核酸的程度的各種技術係本領域可獲得的和/或已知的。當施用以評估例如遞送、細胞攝取、穩定性、分佈等時，此類技術可用於檢測MAPT寡核苷酸。
在一些實施方式中，選擇標準用於評估由各種測定得到的數據，並用於選擇具有某些特性和活性的特定的理想的寡核苷酸，例如理想的MAPT寡核苷酸。在一些實施方式中，選擇標準包括小於約10 nM、小於約5 nM或小於約1 nM的IC50 。在一些實施方式中，穩定性分析的選擇標準包括第1天至少50%穩定性[寡核苷酸的至少50%仍係剩餘的和/或可檢測的]。在一些實施方式中，穩定性分析的選擇標準包括第2天至少50%穩定性。在一些實施方式中，穩定性分析的選擇標準包括第3天至少50%穩定性。在一些實施方式中，穩定性分析的選擇標準包括第4天至少50%穩定性。在一些實施方式中，穩定性分析的選擇標準包括第5天至少50%穩定性。在一些實施方式中，穩定性分析的選擇標準包括第5天至少80% [至少80%的寡核苷酸剩餘]。
在一些實施方式中，藉由監測、測量或檢測與MAPT相關的病症、障礙或疾病或生物學途徑的變化，直接或間接地評估MAPT寡核苷酸的功效。
在一些實施方式中，藉由監測、測量或檢測受MAPT敲低影響的響應的變化來直接或間接評估MAPT寡核苷酸的功效。
在一些實施方式中，提供的寡核苷酸（例如，MAPT寡核苷酸）可以藉由序列分析來分析，以確定哪些其他基因[例如，不是靶基因（例如，MAPT）的基因]具有與提供的寡核苷酸（例如，MAPT寡核苷酸）的鹼基序列互補或者與提供的寡核苷酸（例如，MAPT寡核苷酸）的鹼基序列具有0、1、2或更多個錯配的序列。可以確定藉由該等潛在脫靶的寡核苷酸進行的敲低（如果有的話），以評估寡核苷酸（例如，MAPT寡核苷酸）的潛在脫靶作用。在一些實施方式中，脫靶效應也被稱為非預期效應和/或與旁觀者（非靶）序列或基因的雜交有關。
已經評估和測試了敲低MAPT的功效的寡核苷酸具有多種用途，例如用於治療或預防MAPT相關的病症、障礙或疾病或其症狀。
在一些實施方式中，已被評估和測試其提供特定生物學作用（例如，降低MAPT靶基因或其基因產物的程度、表現和/或活性）的能力的MAPT寡核苷酸可用於治療、改善和/或預防MAPT相關病症、障礙或疾病。 與MAPT相關的病症、障礙或疾病的治療
在一些實施方式中，本揭露提供了靶向MAPT並指導MAPT的靶特異性敲低的MAPT寡核苷酸。在一些實施方式中，本揭露提供了使用提供的MAPT寡核苷酸及其組成物預防和/或治療與MAPT相關的病症、障礙或疾病之方法。在一些實施方式中，本揭露提供了寡核苷酸及其組成物，用作例如針對與MAPT相關的病症、障礙或疾病的藥物。在一些實施方式中，本揭露提供了寡核苷酸及其組成物，用於治療與MAPT相關的病症、障礙或疾病。在一些實施方式中，本揭露提供了寡核苷酸及其組成物，用於製備用於治療與MAPT相關的病症、障礙或疾病的藥物。
在一些實施方式中，本揭露提供了一種在有需要的哺乳動物中治療和/或改善與MAPT相關的病症、障礙或疾病相關的一種或多種症狀之方法，該方法包括向該哺乳動物施用治療有效量MAPT寡核苷酸或其組成物。在一些實施方式中，本揭露提供了一種在有需要的哺乳動物中降低對MAPT相關的病症、障礙或疾病的易感性之方法，該方法包括：向該哺乳動物施用治療有效量的MAPT寡核苷酸或其組成物。在一些實施方式中，本揭露提供了一種在有需要的哺乳動物中預防或延遲MAPT相關的病症、障礙或疾病的發作之方法，該方法包括：向該哺乳動物施用治療有效量的MAPT寡核苷酸或其組成物。在一些實施方式中，本揭露提供了一種在有需要的哺乳動物中治療和/或改善與MAPT相關的病症、障礙或疾病相關的一種或多種症狀之方法，該方法包括：向該哺乳動物施用治療有效量的包含MAPT寡核苷酸的核酸-脂質顆粒。在一些實施方式中，本揭露提供了一種在有需要的哺乳動物中降低對MAPT相關的病症、障礙或疾病的易感性之方法，該方法包括：向該哺乳動物施用治療有效量的包含MAPT寡核苷酸的核酸-脂質顆粒。在一些實施方式中，本揭露提供了一種在有需要的哺乳動物中預防或延遲MAPT相關的病症、障礙或疾病的發作之方法，該方法包括：向該哺乳動物施用治療有效量的包含MAPT寡核苷酸的核酸-脂質顆粒。在一些實施方式中，哺乳動物係人。在一些實施方式中，哺乳動物易感、罹患和/或患有與MAPT相關的病症、障礙或疾病。在一些實施方式中，與MAPT相關的病症、障礙或疾病係阿茲海默氏症（AD）。在一些實施方式中，與MAPT相關的病症、障礙或疾病係額顳葉失智（FTD）。在一些實施方式中，與MAPT相關的病症、障礙或疾病係行為變異型FTD（bvFTD）。在一些實施方式中，與MAPT相關的病症、障礙或疾病係非流利變異型原發性進行性失語（nfvPPA）。在一些實施方式中，與MAPT相關的病症、障礙或疾病係皮質基底節變性（CBD）。在一些實施方式中，與MAPT相關的病症、障礙或疾病係進行性核上性麻痹（PSP）。在一些實施方式中，與MAPT相關的病症、障礙或疾病係癲癇。在一些實施方式中，與MAPT相關的病症、障礙或疾病係Dravet綜合症。在一些實施方式中，與MAPT相關的病症、障礙或疾病係慢性創傷性腦病變（CTE）。
在一些實施方式中，所提供之方法減少了tau的表現、程度和/或活性。在一些實施方式中，所提供之方法減少了tau在神經元中的聚集。在一些實施方式中，所提供之方法減少了tau在神經元之間的擴散。
在一些實施方式中，所提供的寡核苷酸和組成物可用於預防和/或治療神經退化性疾病，例如阿茲海默氏症（AD）、額顳葉失智（FTD）、行為變異型FTD（bvFTD）、非流利變異型原發性進行性失語（nfvPPA）、皮質基底節變性（CBD）、進行性核上性麻痹（PSP）、癲癇、Dravet綜合症、慢性創傷性腦病變（CTE）等。在一些實施方式中，本揭露提供了用於預防和/或治療神經退化性疾病，例如阿茲海默氏症（AD）、額顳葉失智（FTD）、行為變異型FTD（bvFTD）、非流利變異型原發性進行性失語（nfvPPA）、皮質基底節變性（CBD）、進行性核上性麻痹（PSP）、癲癇、Dravet綜合症、慢性創傷性腦病變（CTE）等之方法，該方法包括向易患或患有上述疾病的受試者施用治療有效量的如本文所述之MAPT寡核苷酸或組成物。在一些實施方式中，本揭露提供了用於治療神經退化性疾病之方法，該方法包括向患有該疾病的受試者施用治療有效量的如本文所述之MAPT寡核苷酸或組成物。在一些實施方式中，本揭露提供了用於預防和/或治療tau蛋白病之方法，該方法包括向易患或患有該病症、障礙或疾病的受試者施用治療有效量的如本文所述之MAPT寡核苷酸或組成物。在一些實施方式中，本揭露提供了用於治療tau蛋白病之方法，該方法包括向患有該疾病的受試者施用治療有效量的如本文所述之MAPT寡核苷酸或組成物。在一些實施方式中，本揭露提供了用於預防和/或治療阿茲海默氏症（AD）、額顳葉失智（FTD）、行為變異型FTD（bvFTD）、非流利變異型原發性進行性失語（nfvPPA）、皮質基底節變性（CBD）、進行性核上性麻痹（PSP）、癲癇、Dravet綜合症、或慢性創傷性腦病變（CTE）之方法，該方法包括向易患或患有上述疾病的受試者施用治療有效量的如本文所述之MAPT寡核苷酸或組成物。在一些實施方式中，本揭露提供了用於治療阿茲海默氏症（AD）、額顳葉失智（FTD）、行為變異型FTD（bvFTD）、非流利變異型原發性進行性失語（nfvPPA）、皮質基底節變性（CBD）、進行性核上性麻痹（PSP）、癲癇、Dravet綜合症、慢性創傷性腦病變（CTE）之方法，該方法包括向患有該疾病的受試者施用治療有效量的如本文所述之MAPT寡核苷酸或組成物。在一些實施方式中，方法用於預防和/或治療AD。在一些實施方式中，方法用於預防和/或治療FTD。在一些實施方式中，方法用於預防和/或治療bvFTD。在一些實施方式中，方法用於預防和/或治療nfvPPA。在一些實施方式中，方法用於預防和/或治療CBD。在一些實施方式中，方法用於預防和/或治療PSP。在一些實施方式中，方法用於預防和/或治療癲癇。在一些實施方式中，方法用於預防和/或治療Dravet綜合症。在一些實施方式中，方法用於預防和/或治療CTE。在一些實施方式中，受試者係人。在一些實施方式中，與例如健康受試者（或其群體）、不易患或不患有此類神經退行性疾病的受試者（或其群體）等相比，受試者具有增加的MAPT表現和/或增加的一種或多種MAPT產物（例如，轉錄物、蛋白（例如，tau蛋白）等）的程度。
在一些實施方式中，所提供的寡核苷酸和組成物可以視需要與一個或多個其他治療劑組合使用。
寡核苷酸及組成物的施用
根據本揭露，可以使用許多遞送方法、方案等來施用所提供的寡核苷酸及其組成物（通常是用於治療目的的藥物組成物），包括本領域已知的各種技術。
在一些實施方式中，寡核苷酸組成物，例如MAPT寡核苷酸組成物，以比在其他方面可比較的參考寡核苷酸組成物的劑量和/或頻率低的劑量和/或頻率施用，並且具有可比或改善的效果。在一些實施方式中，手性受控的寡核苷酸組成物以比可比較的、在其他方面相同的立體隨機的參考寡核苷酸組成物的劑量和/或頻率更低的劑量和/或頻率施用，並且具有可比或改善的作用，例如在改善靶轉錄物的敲低方面。
在一些實施方式中，本揭露認識到可以藉由化學修飾和/或立體化學來調節和優化寡核苷酸及其組成物的特性和活性，例如敲低活性、穩定性、毒性等。在一些實施方式中，本揭露提供用於經由化學修飾和/或立體化學使寡核苷酸特性和/或活性優化之方法。在一些實施方式中，本揭露提供了具有改善的特性和/或活性的寡核苷酸及其組成物。不希望受到任何理論的束縛，例如由於其更好的活性、穩定性、遞送、分佈、毒性、藥物動力學、藥效學和/或功效譜，申請人注意到，所提供的寡核苷酸及其組成物在一些實施方式中可以較低的劑量和/或降低的頻率施用以達到可比或更好的功效，並且在一些實施方式中可以更高的劑量和/或增加的頻率施用以提供增強的作用。
在一些實施方式中，本揭露提供了在施用包含多個共用共同的鹼基序列的寡核苷酸的寡核苷酸組成物之方法中的改善，該方法包括施用包含多個寡核苷酸的寡核苷酸，該寡核苷酸特徵在於相對於具有相同的共同鹼基序列的參考寡核苷酸組成物的改善的遞送。
在一些實施方式中，所提供的寡核苷酸、組成物及方法提供改善的遞送。在一些實施方式中，所提供的寡核苷酸、組成物及方法提供改善的細胞質遞送。在一些實施方式中，改善的遞送係至細胞群中。在一些實施方式中，改善的遞送係至組織中。在一些實施方式中，改善的遞送係至器官中。在一些實施方式中，改善的遞送係至生物體（例如患者或受試者）中。提供改善的遞送的實例結構元件（例如，化學修飾、立體化學、其組合等）、寡核苷酸、組成物及方法詳述於本揭露中。
可以使用各種給藥方案來施用本發明的寡核苷酸和組成物。在一些實施方式中，間隔一定時間段施用多個單位劑量。在一些實施方式中，指定組成物具有推薦的給藥方案，其可涉及一次或多次給藥。在一些實施方式中，給藥方案包含多次給藥，其中的每一者彼此間隔開相同長度的時段；在一些實施方式中，給藥方案包括多次給藥以及間隔開個別給藥的至少兩個不同時段。在一些實施方式中，給藥方案內的所有給藥具有相同單位給藥量。在一些實施方式中，給藥方案內的不同給藥具有不同的量。在一些實施方式中，給藥方案包含呈第一給藥量的第一次給藥，接著係呈不同於第一給藥量的第二給藥量的一次或多次其他給藥。在一些實施方式中，給藥方案包含以第一給藥量第一次給藥，繼之以另一次或多次與第一次給藥（或另一先前給藥）量相同或不同的第二（或後續）給藥量給藥。在一些實施方式中，手性受控的寡核苷酸組成物根據一給藥方案施用，該給藥方案不同於用於相同序列的非手性受控（例如立體隨機）的寡核苷酸組成物的給藥方案和/或用於相同序列的不同手性受控的寡核苷酸組成物的給藥方案。在一些實施方式中，手性受控的寡核苷酸組成物根據一給藥方案施用，該給藥方案相比於相同序列的非手性受控（例如立體隨機）的寡核苷酸組成物的給藥方案減少，其在給定單位時間內達成較低程度的總暴露、涉及一個或多個較低單位劑量和/或在給定單位時間內包括較少數目次給藥。在一些實施方式中，非手性受控的寡核苷酸根據一給藥方案施用，該給藥方案與相同序列的非手性受控（例如立體隨機）的寡核苷酸組成物的給藥方案相比延長較長時間段。不希望受理論限制，申請人指出，在一些實施方式中，較短給藥方案和/或給藥之間的較長時間段可根據手性受控的寡核苷酸組成物的改善的穩定性、生物可用性和/或功效來定。在一些實施方式中，由於其改進的遞送（和其他特性），所提供的組成物能以較低劑量和/或較低頻率施用以實現生物學效應，例如臨床功效。
藥物組成物
當用作治療劑時，所提供的寡核苷酸（例如MAPT寡核苷酸）或其寡核苷酸組成物通常作為藥物組成物施用。在一些實施方式中，本揭露提供了藥物組成物，該藥物組成物包含所提供的化合物（例如寡核苷酸）或其藥學上可接受的鹽、以及藥物載體。在一些實施方式中，出於治療和臨床目的，本揭露的寡核苷酸作為藥物組成物提供。如熟悉該項技術者所理解的，可以以其酸、鹼或鹽形式提供本揭露的寡核苷酸。在一些實施方式中，寡核苷酸可以是酸形式，例如對於天然磷酸酯鍵聯，-OP(O)(OH)O-的形式；對於硫代磷酸酯核苷酸間鍵聯，-OP(O)(SH)O-的形式；等。在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸可以是鹽形式，例如對於天然磷酸酯鍵聯，以鈉鹽的-OP(O)(ONa)O-的形式；對於硫代磷酸酯核苷酸間鍵聯，以鈉鹽的-OP(O)(SNa)O-的形式；等。除非另有說明，否則本揭露的寡核苷酸可以以酸、鹼和/或鹽形式存在。
在一些實施方式中，藥物組成物係液體組成物。在一些實施方式中，藉由使用合適的溶劑（例如，水或藥學上可接受的緩衝劑）溶解固體寡核苷酸組成物或稀釋濃縮的寡核苷酸組成物來提供藥物組成物。在一些實施方式中，液體組成物包含所提供的寡核苷酸的陰離子形式和一種或多種陽離子。在一些實施方式中，液體組成物具有在弱酸性、約中性或鹼性範圍內的pH值。在一些實施方式中，液體組成物的pH為約生理pH，例如約7.4。
在一些實施方式中，配製提供的寡核苷酸以施用於表現其靶的身體細胞和/或組織和/或與其接觸。例如，在一些實施方式中，配製提供的MAPT寡核苷酸以施用於表現MAPT的身體細胞和/或組織。在一些實施方式中，這樣的身體細胞和/或組織係中樞神經系統的神經元或細胞和/或組織。在一些實施方式中，寡核苷酸和組成物的廣泛分佈可以藉由實質內施用、鞘內施用或腦室內施用來實現。
在一些實施方式中，配製藥物組成物用於靜脈內注射、口服施用、口腔施用、吸入、鼻腔施用、局部施用、眼部施用或耳部施用。在一些實施方式中，藥物組成物係片劑、丸劑、膠囊、液體、吸入劑、鼻噴霧劑溶液、栓劑、懸浮液、凝膠、膠體、分散體、懸浮液、溶液、乳液、軟膏、洗液、滴眼液、或滴耳液。
在一些實施方式中，本揭露提供了藥物組成物，其包含與藥學上可接受的非活性成分（例如藥學上可接受的賦形劑，藥學上可接受的載體等）混合的手性受控的寡核苷酸或其組成物。在一些實施方式中，本揭露提供了藥物組成物，其遞送與藥學上可接受的非活性成分（例如藥學上可接受的賦形劑，藥學上可接受的載體等）混合的手性受控的寡核苷酸或其組成物。熟悉該項技術者將認識到，藥物組成物包括所提供的寡核苷酸或組成物的藥學上可接受的鹽。在一些實施方式中，藥物組成物係手性受控的寡核苷酸組成物。在一些實施方式中，藥物組成物係立體純的寡核苷酸組成物。
在一些實施方式中，本揭露提供寡核苷酸的鹽及其藥物組成物。在一些實施方式中，鹽係藥學上可接受的鹽。在一些實施方式中，藥物組成物包含視需要以其鹽形式的寡核苷酸和鈉鹽。在一些實施方式中，藥物組成物包含視需要以其鹽形式的寡核苷酸和氯化鈉。在一些實施方式中，寡核苷酸的可以給至鹼的每個氫離子（例如，在水溶液、藥物組成物等的條件下）被非H+ 陽離子替換。例如，在一些實施方式中，寡核苷酸的藥學上可接受的鹽係全金屬離子鹽，其中每個核苷酸間鍵聯（例如天然磷酸酯鍵聯、硫代磷酸酯核苷酸間鍵聯等）的每個氫離子（例如-OH、-SH等）被金屬離子替換。用於藥物組成物的各種合適的金屬鹽在本領域中是眾所周知的，並且可以根據本揭露使用。在一些實施方式中，藥學上可接受的鹽係鈉鹽。在一些實施方式中，藥學上可接受的鹽係鎂鹽。在一些實施方式中，藥學上可接受的鹽係鈣鹽。在一些實施方式中，藥學上可接受的鹽係鉀鹽。在一些實施方式中，藥學上可接受的鹽係銨鹽（陽離子N(R)4 + ）。在一些實施方式中，藥學上可接受的鹽包含一種且不超過一種類型的陽離子。在一些實施方式中，藥學上可接受的鹽包含兩種或更多種類型的陽離子。在一些實施方式中，陽離子係Li+ 、Na+ 、K+ 、Mg2+ 或Ca2+ 。在一些實施方式中，藥學上可接受的鹽係全鈉鹽。在一些實施方式中，藥學上可接受的鹽係全鈉鹽，其中為天然磷酸酯鍵聯（酸形式-O-P(O)(OH)-O-）（如果存在的話）的每個核苷酸間鍵聯以其鈉鹽形式（-O-P(O)(ONa)-O-）存在，並且為硫代磷酸酯核苷酸間鍵聯（酸形式-O-P(O)(SH)-O-）（如果存在的話）的每個核苷酸間鍵聯以其鈉鹽形式（O-P(O)(SNa)-O-）存在。
根據本揭露，可以利用本領域已知的用於遞送核酸和/或寡核苷酸的各種技術。例如，多種超分子奈米載體可用於遞送核酸。示例奈米載體包括但不限於脂質體、陽離子聚合物複合物、和各種聚合物。核酸與各種聚陽離子的複合係用於細胞內遞送的另一種方法；這包括使用聚乙二醇化的聚陽離子、聚乙烯胺（PEI）複合物、陽離子嵌段共聚物、和樹狀聚合物。若干種陽離子奈米載體（包括PEI和聚醯胺樹狀聚合物）有助於從內體釋放內容物。其他方法包括使用聚合奈米粒子、微球、脂質體、樹狀聚合物、生物可降解聚合物、軛合物、前驅藥、如硫或鐵的無機膠體、抗體、移植物、生物可降解移植物、生物可降解微球、滲透受控移植物、脂質奈米粒子、乳液、油性溶液、水溶液、生物可降解聚合物、聚乳酸羥基乙酸共聚物（poly(lactide-coglycolic acid)）、聚(乳酸)、液體儲存物、聚合物微胞、量子點以及脂複合物。在一些實施方式中，寡核苷酸與另一分子軛合。
在治療和/或診斷應用中，本揭露的化合物例如寡核苷酸可以配製用於多種施用方式，包括全身和局部（topical或localized）施用。技術和配製物通常可以在Remington, The Science and Practice of Pharmacy [藥物科學與實踐]（第20版 2000年）中找到。
鹼性部分的藥學上可接受的鹽通常是熟悉該項技術者所熟知的，並且可以包括例如乙酸鹽、苯磺酸鹽（benzenesulfonate）、苯磺酸鹽（besylate）、苯甲酸鹽、碳酸氫鹽、酒石酸氫鹽、溴化物、乙二胺四乙酸鈣、牛磺酸鹽、碳酸鹽、檸檬酸鹽、乙二胺四乙酸鹽、乙二磺酸鹽、丙酸酯月桂硫酸鹽（estolate）、酚磺乙胺（esylate）、延胡索酸鹽、葡萄糖酸鹽（gluceptate）、葡糖酸鹽（gluconate）、麩胺酸鹽、乙醇醯胺基苯胂酸鹽（glycollylarsanilate）、己基間苯二酚鹽（hexylresorcinate）、海巴明（hydrabamine）、氫溴酸鹽、鹽酸鹽、羥萘甲酸鹽、碘化物、羥乙磺酸鹽、乳酸鹽、乳糖醛酸鹽、蘋果酸鹽、馬來酸鹽、苦杏仁酸鹽、甲磺酸鹽、黏酸鹽、萘磺酸鹽、硝酸鹽、雙羥萘酸鹽（pamoate/embonate）、泛酸鹽、磷酸鹽/磷酸氫鹽、聚半乳糖醛酸鹽、水楊酸鹽、硬脂酸鹽、鹼式乙酸鹽（subacetate）、琥珀酸鹽、硫酸鹽、丹寧酸鹽、酒石酸鹽、或茶氯酸鹽（teoclate）。其他藥學上可接受的鹽可以例如在，Remington, The Science and Practice of Pharmacy[雷明頓：藥學科學與實踐]，（第20版 2000）中找到。較佳的藥學上可接受的鹽包括，例如，乙酸鹽、苯甲酸鹽、溴化物、碳酸鹽、檸檬酸鹽、葡糖酸鹽、氫溴酸鹽、鹽酸鹽、馬來酸鹽、甲磺酸鹽、萘磺酸鹽、雙羥萘酸鹽（pamoate、embonate）、磷酸鹽、水楊酸鹽、琥珀酸鹽、硫酸鹽或酒石酸鹽。
在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸被配製在WO 2005/060697、WO 2011/076807或WO 2014/136086中描述的藥物組成物中。
取決於所治療的具體病症、障礙或疾病，可以將所提供的試劑例如寡核苷酸配製成液體或固體劑型並全身或局部給施用。如熟悉該項技術者已知的，可以例如以定時或持續低釋放形式遞送所提供的寡核苷酸。配製和施用的技術可以在Remington, The Science and Practice of Pharmacy [雷明頓：藥學科學與實踐], (第20版 2000)中找到。合適的途徑可包括口服、口腔、藉由吸入噴霧、舌下、直腸、透皮、陰道、穿黏膜、鼻或腸施用；腸胃外遞送，包括肌內、皮下、髓內注射，以及鞘內、直接心室內、靜脈內、關節內、胸骨內、滑膜內、肝內、病灶內、顱內、腹膜內、鼻內或眼內注射，或其他遞送方式。
對於注射，可以在水溶液中，例如在生理相容的緩衝液中，例如漢克氏溶液、林格氏溶液或生理鹽水緩衝液中配製和稀釋所提供的試劑，例如寡核苷酸。對於這種穿黏膜施用，在配製物中使用適於障礙物滲透的滲透劑。這樣的滲透劑係本領域習知的，並且可以根據本揭露使用。
用於實施本揭露的藥學上可接受的載體用於將化合物（例如提供的寡核苷酸）配製成適合於各種施用方式的劑量的用途係本領域眾所周知的。藉由適當選擇載體和合適的製造方法，本揭露的組成物，例如配製成溶液的組成物，可以藉由各種途徑，例如腸胃外施用，例如藉由靜脈內注射。
在一些實施方式中，包含MAPT寡核苷酸的組成物還包含以下任一種或全部：二水合氯化鈣、六水合氯化鎂、氯化鉀、氯化鈉、無水磷酸氫二鈉、磷酸鈉、單鹼二水合物和/或注射用水。在一些實施方式中，組成物還包含以下任一種或全部：二水合氯化鈣（0.21 mg）USP、六水合氯化鎂（0.16 mg）USP、氯化鉀（0.22 mg）USP、氯化鈉（8.77 mg）USP、無水磷酸氫二鈉（0.10 mg）USP、二水合磷酸二氫鈉（0.05 mg）USP和注射用水USP。
在一些實施方式中，包含寡核苷酸的組成物還包含以下任一種或全部：膽固醇、(6Z,9Z,28Z,31Z)-三十七-6,9,28,31-四烯基-19-基-4-(二甲基胺基)丁酸酯（DLin-MC3-DMA）、1,2-二硬脂醯基-sn-甘油-3-磷酸膽鹼（DSPC）、α-(3’-{[1,2-二(肉豆蔻基氧基)丙氧基]羰基胺基}丙基)-ω-甲氧基、聚氧乙烯（PEG2000-C-DMG）、無水磷酸二氫鉀NF、氯化鈉、七水合磷酸氫二鈉和注射用水。在一些實施方式中，包含MAPT寡核苷酸的組成物的pH係約7.0。在一些實施方式中，包含寡核苷酸的組成物還包含以下任一種或全部：在約1 mL的總體積中，6.2 mg 膽固醇USP、13.0 mg (6Z,9Z,28Z,31Z)-三十七-6,9,28,31-四烯基-19-基-4-(二甲基胺基)丁酸酯（DLin-MC3-DMA）、3.3 mg 1,2-二硬脂醯基-sn-甘油-3-磷酸膽鹼（DSPC）、1.6 mg α-(3’-{[1,2-二(肉豆蔻基氧基)丙氧基]羰基胺基}丙基)-ω-甲氧基、聚氧乙烯（PEG2000-C-DMG）、0.2 mg無水磷酸二氫鉀NF、8.8 mg氯化鈉USP、2.3 mg七水合磷酸氫二鈉USP和注射用水USP。
可以使用本領域熟知的藥學上可接受的載體將所提供的化合物（例如寡核苷酸）容易地配製成適於口服施用的劑量。在一些實施方式中，此類載體使得提供的寡核苷酸能夠配製成片劑、丸劑、膠囊、液體、凝膠、糖漿、漿液、懸浮液等，用於例如被待治療的受試者（例如患者）口服攝取。
對於鼻或吸入遞送，可以藉由熟悉該項技術者已知之方法配製提供的化合物，例如寡核苷酸，並且可以包括例如增溶、稀釋或分散物質（如，鹽水、防腐劑（如苯甲醇）、吸收促進劑和碳氟化合物）的實例。
在某些實施方式中，寡核苷酸和組成物遞送至CNS。在某些實施方式中，寡核苷酸和組成物遞送至腦脊液。在某些實施方式中，寡核苷酸和組成物施用至腦實質。在某些實施方式中，寡核苷酸和組成物藉由鞘內施用或腦室內施用而遞送至動物/受試者。寡核苷酸和組成物的廣泛分佈可以藉由本文所述和/或本領域已知的施用方法來實現。
在某些實施方式中，腸胃外施用藉由注射進行，例如藉由針筒、泵等進行。在某些實施方式中，注射係推注。在某些實施方式中，注射直接施用至組織或部位，如紋狀體、尾狀核、皮層、海馬體、和/或小腦。
在某些實施方式中，特異性定位提供的化合物（例如寡核苷酸）之方法（例如藉由推注）可使中值有效濃度（EC50）降低20、25、30、35、40、45或50倍。在某些實施方式中，靶向的組織係腦組織。在某些實施方式中，靶向的組織係紋狀體組織。在某些實施方式中，降低EC50係所希望的，因為這減少了在有需要的患者中實現藥理學結果所需的劑量。
在某些實施方式中，將提供的寡核苷酸藉由注射或輸注每月、每兩個月、每90天、每3個月、每6個月、每年兩次或每年一次遞送。
適用於本揭露的藥物組成物包括組成物，其中包含有效量的活性成分例如寡核苷酸以實現其預期目的。有效量的確定完全在熟悉該項技術者的能力之內，尤其是根據於本文提供的具體揭露內容。
除活性成分外，藥物組成物可以含有合適的藥學上可接受的載體（包含賦形劑和助劑），該等載體有助於將活性化合物加工成可藥用的製劑。用於口服施用而配製的製劑可以呈片劑、糖衣丸、膠囊或溶液的形式。
在一些實施方式中，用於口服使用的藥物組成物可藉由以下方法獲得：將活性化合物與固體賦形劑組合，視需要研磨所得混合物，並加工該顆粒混合物（如果希望的話，在添加合適的助劑之後），以獲得片劑或糖衣丸芯。合適的賦形劑尤其是填充劑，如糖，包括乳糖、蔗糖、甘露醇或山梨醇；纖維素製劑，例如玉米澱粉、小麥澱粉、大米澱粉、馬鈴薯澱粉、明膠、黃蓍膠、甲基纖維素、羥丙基甲基纖維素、羧甲基纖維素鈉（CMC）、和/或聚乙烯吡咯啶酮（PVP：聚維酮（povidone））。如果需要，可添加崩解劑，如交聯聚乙烯吡咯啶酮、瓊脂、或海藻酸或其鹽（如海藻酸鈉）。
在一些實施方式中，糖衣丸芯提供有合適的包衣。為此目的，可以使用濃縮的糖溶液，該糖溶液可以視需要含有阿拉伯樹膠、滑石、聚乙烯吡咯啶酮、卡波姆膠、聚乙二醇（PEG）、和/或二氧化鈦、漆溶液和合適的有機溶劑或溶劑混合物。可以將染料或顏料添加到片劑或糖衣丸包衣中，以用於標識或表徵活性化合物劑量的不同組合。
可口服使用的藥物製劑包括由明膠製成的插接式膠囊（push-fit capsule）以及由明膠與增塑劑（如甘油或山梨醇）製成的密封式軟膠囊。插接式膠囊可以包含與填充劑（如乳糖）、黏合劑（如澱粉）和/或潤滑劑（如滑石或硬脂酸鎂）以及視需要穩定劑混合的活性成分，例如寡核苷酸。在軟膠囊中，活性化合物例如寡核苷酸可以溶解或懸浮在合適的液體，如脂肪油、液體石蠟、或液體聚乙二醇（PEG）中。此外，還可以添加穩定劑。
在一些實施方式中，提供的組成物包含脂質。在一些實施方式中，脂質與活性化合物，例如寡核苷酸軛合。在一些實施方式中，脂質不與活性化合物軛合。在一些實施方式中，脂質包含C10 -C40 直鏈飽和或部分不飽和脂肪族鏈。在一些實施方式中，脂質包含視需要經一個或多個C1-4 脂肪族基團取代的C10 -C40 直鏈飽和或部分不飽和脂肪族鏈。在一些實施方式中，脂質選自由以下組成之群組：月桂酸、肉豆蔻酸、棕櫚酸、硬脂酸、油酸、亞油酸、α-亞麻酸、γ-亞麻酸、二十二碳六烯酸（順-DHA）、喇叭藻酸和二亞油醇。在一些實施方式中，活性化合物係提供的寡核苷酸。在一些實施方式中，組成物包含脂質和活性化合物，並且還包含另一種組分，其係另一種脂質或靶向性化合物或部分。在一些實施方式中，脂質係胺基脂質；兩親脂質；陰離子脂質；載脂蛋白；陽離子脂質；低分子量陽離子脂質；如CLinDMA和DLinDMA的陽離子脂質；可電離陽離子脂質；掩蔽組分；輔助脂質；脂肽；中性脂質；中性兩性離子脂質；疏水性小分子；疏水性維生素；PEG-脂質；被一個或多個親水性聚合物修飾的不帶電脂質；磷脂；如1,2-二油醯基-sn-甘油基-3-磷酸乙醇胺的磷脂；隱形脂質；固醇；膽固醇；靶向性脂質；或本文所述或本領域報導的另一種適合於藥物用途的脂質。在一些實施方式中，組成物包含脂質和能夠介導另一脂質的至少一種功能的另一脂質的一部分。在一些實施方式中，靶向性化合物或部分能夠使化合物（例如寡核苷酸）靶向特定細胞或組織或者細胞或組織的亞組。在一些實施方式中，靶向性部分被設計成用於利用特定靶、受體、蛋白或另一種亞細胞組分的細胞特異性或組織特異性表現。在一些實施方式中，靶向部分係將組成物靶向細胞或組織和/或結合至靶、受體、蛋白或另一種亞細胞組分的配位基（例如，小分子、抗體、肽、蛋白、碳水化合物、適體等）。
用於遞送活性化合物例如寡核苷酸的某些示例脂質允許（例如不防止或不干擾）活性化合物的功能。在一些實施方式中，脂質係月桂酸、肉豆蔻酸、棕櫚酸、硬脂酸、油酸、亞油酸、α-亞麻酸、γ-亞麻酸、二十二碳六烯酸（順-DHA）、喇叭藻酸或二亞油醇。
如本揭露中所述，脂質軛合（如與脂肪酸軛合）可改善寡核苷酸的一個或多個特性。
在一些實施方式中，用於遞送活性化合物例如寡核苷酸的組成物能夠將活性化合物根據需要靶向特定細胞或組織。在一些實施方式中，用於遞送活性化合物的組成物能夠將活性化合物靶向肌肉細胞或組織。在一些實施方式中，本揭露提供與活性化合物的遞送相關的組成物和方法，其中組成物包含活性化合物和脂質。在肌肉細胞或組織的各種實施方式中，脂質選自月桂酸、肉豆蔻酸、棕櫚酸、硬脂酸、油酸、亞油酸、α-亞麻酸、γ-亞麻酸、二十二碳六烯酸（順-DHA）、喇叭藻酸和二亞油醇。
在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸經由設計用於將核酸遞送至中樞神經系統或細胞或其組織或部分的遞送方法或組成物被遞送至中樞神經系統或細胞或其組織或部分。
在一些實施方式中，MAPT寡核苷酸經由包含以下任何一種或多種的組成物或涉及使用以下任何一種或多種的遞送方法來遞送：靶向轉鐵蛋白受體的奈米顆粒；基於陽離子脂質體的遞送策略；陽離子脂質體；高分子奈米粒子；病毒載體；逆轉錄病毒；腺相關病毒；穩定的核酸脂質顆粒；聚合物；細胞穿透肽；脂質；樹狀聚合物；中性脂質；膽固醇；類脂質分子；融合脂質；親水分子；聚乙二醇（PEG）或其衍生物；遮罩脂質；聚乙二醇化脂質；PEG-C-DMSO；PEG-C-DMSA；DSPC；離子化脂質；基於胍的膽固醇衍生物；離子包被的奈米顆粒；金屬離子包被的奈米顆粒；錳離子包被的奈米顆粒；angubindin-1；奈米凝膠；將MAPT摻入支鏈核酸結構中；和/或將MAPT摻入包含2、3、4或更多個寡核苷酸的支鏈核酸結構中。
在一些實施方式中，將包含寡核苷酸的組成物凍乾。在一些實施方式中，將包含寡核苷酸的組成物凍乾，並將凍乾的寡核苷酸置於小瓶中。在一些實施方式中，小瓶回充氮氣。在一些實施方式中，凍乾的寡核苷酸組成物在施用前被重構。在一些實施方式中，凍乾的寡核苷酸組成物在施用前用氯化鈉溶液重構。在一些實施方式中，凍乾的寡核苷酸組成物在施用前用0.9%氯化鈉溶液重構。在一些實施方式中，在用於施用的臨床網站進行重構。在一些實施方式中，在凍乾的組成物中，寡核苷酸組成物係手性受控的或包含至少一個手性受控的核苷酸間鍵聯和/或寡核苷酸靶向MAPT。
除其他事項外，本揭露提供了以下實施方式： 1.  一種寡核苷酸，其中該寡核苷酸的鹼基序列包含與MAPT基因或其轉錄物的鹼基序列相同或互補的鹼基序列的至少15、16、17、18、19、20、21、22、23、24或25個連續鹼基，其中該寡核苷酸包含一個或多個經修飾的糖、一個或多個經修飾的核鹼基、和/或一個或多個經修飾的核苷酸間鍵聯。 2.  如實施方式1所述之寡核苷酸，其中該寡核苷酸的該鹼基序列包含與MAPT轉錄物互補的鹼基序列的至少15、16、17、18、19、20、21、22、23、24或25個連續鹼基。 3.  如實施方式1所述之寡核苷酸，其中該寡核苷酸的該鹼基序列包含與MAPT mRNA互補的鹼基序列的至少15、16、17、18、19、20、21、22、23、24或25個連續鹼基。 4.  如實施方式1所述之寡核苷酸，其中該寡核苷酸的該鹼基序列包含與MAPT RNA的內含子11互補的鹼基序列的至少15、16、17、18、19、20、21、22、23、24或25個連續鹼基。 5.  如前述實施方式中任一項所述之寡核苷酸，其中該寡核苷酸的鹼基序列包含以下序列的至少10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、或20個連續鹼基：ACGTTGCAGTGTTCCACUAU、ACTATCCTCCTTCAGCUCCU、AGTGTTCCACTATCCUCCUU、ATCCTCCTTCAGCTCCUGCA、CACGTTGCAGTGTTCCACUA、CACTATCCTCCTTCAGCUCC、CAGTGTTCCACTATCCUCCU、CCACGTTGCAGTGTTCCACU、CCACTATCCTCCTTCAGCUC、CGTTGCAGTGTTCCACUAUC、CTATCCTCCTTCAGCUCCUG、GCAGTGTTCCACTATCCUCC、GTGTTCCACTATCCTCCUUC、GTTCCACTATCCTCCUUCAG、GUGUUCCACTATCCTCCTTC、TATCCTCCTTCAGCTCCUGC、TCCACTATCCTCCTTCAGCU、TGCAGTGTTCCACTAUCCUC、TGTTCCACTATCCTCCUUCA、TTCCACTATCCTCCTUCAGC、或TTGCAGTGTTCCACTAUCCU，其中每個T可以獨立地被U取代，並且反之亦然。 6.  如前述實施方式中任一項所述之寡核苷酸，其中該寡核苷酸包含約20個核鹼基，該核鹼基各自獨立地選自視需要取代的A、T、C、G、U及其互變異構物。 7.  如前述實施方式中任一項所述之寡核苷酸，其中該寡核苷酸包含5’-翼-核心-翼-3’部分，其中該5’-翼和該3’-翼各自獨立地包含兩個或更多個經修飾的糖。 8.  如實施方式7所述之寡核苷酸，其中該5’-翼包含各自獨立地包含2’-OR的兩個或更多個糖，其中R係視需要取代的C1-4 脂肪族。 9.  如實施方式8所述之寡核苷酸，其中該5'-翼包含一個或多個2’-MOE修飾的糖。 10.      如實施方式7-9中任一項所述之寡核苷酸，其中該5'-翼中每個糖包含2'-修飾的糖。 11.      如實施方式7-10中任一項所述之寡核苷酸，其中該5'-翼中每個糖包含相同的修飾。 12.      如實施方式7-11中任一項所述之寡核苷酸，其中該5'-翼包含4、5、或7個核苷。 13.      如實施方式7-12中任一項所述之寡核苷酸，其中該5'-翼包含一個或多個硫代磷酸酯核苷酸間鍵聯。 14.      如實施方式7-13中任一項所述之寡核苷酸，其中該5'-翼包含一個或多個非負電荷核苷酸間鍵聯。 15.      如實施方式7-14中任一項所述之寡核苷酸，其中該5'-翼包含一個或多個天然磷酸酯鍵聯。 16.      如實施方式7-15中任一項所述之寡核苷酸，其中該3’-翼包含各自獨立地包含2’-OR的兩個或更多個糖，其中R係視需要取代的C1-4 脂肪族。 17.      如實施方式7-16中任一項所述之寡核苷酸，其中該5'-翼的該糖修飾模式與該3'-翼的糖修飾模式不同。 18.      如實施方式7-17中任一項所述之寡核苷酸，其中該3’-翼包含該5’-翼中不存在的糖修飾。 19.      如實施方式7-18中任一項所述之寡核苷酸，其中該3'-翼包含一個或多個2’-OMe修飾的糖。 20.      如實施方式7-19中任一項所述之寡核苷酸，其中該3'-翼中每個糖包含2'-修飾的糖。 21.      如實施方式7-20中任一項所述之寡核苷酸，其中該3'-翼中每個糖包含相同的修飾。 22.      如實施方式7-21中任一項所述之寡核苷酸，其中該3'-翼包含4、5、或7個核苷。 23.      如實施方式7-22中任一項所述之寡核苷酸，其中該3'-翼包含一個或多個硫代磷酸酯核苷酸間鍵聯。 24.      如實施方式7-23中任一項所述之寡核苷酸，其中該3'-翼包含一個或多個非負電荷核苷酸間鍵聯。 25.      如實施方式7-24中任一項所述之寡核苷酸，其中該3'-翼包含一個或多個天然磷酸酯鍵聯。 26.      如實施方式7-25中任一項所述之寡核苷酸，其中5'-翼中每個硫代磷酸酯核苷酸間鍵聯係Sp。 27.      如實施方式7-26中任一項所述之寡核苷酸，其中3'-翼中每個硫代磷酸酯核苷酸間鍵聯係Sp。 28.      如實施方式7-27中任一項所述之寡核苷酸，其中5'-翼中每個非負電荷的核苷酸間鍵聯係n001。 29.      如實施方式7-28中任一項所述之寡核苷酸，其中3'-翼中每個非負電荷的核苷酸間鍵聯係n001。 30.      如實施方式28-29中任一項所述之寡核苷酸，其中該n001係Rp。 31.      如實施方式7-30中任一項所述之寡核苷酸，其中該核心不包含2’-OR糖修飾，其中R係視需要經取代的C1-4 脂肪族。 32.      如實施方式7-31中任一項所述之寡核苷酸，其中該核心中每個糖係天然DNA糖（包含兩個2’-H）。 33.      如實施方式7-32中任一項所述之寡核苷酸，其中該核心包含約7、8、9、10或11個核苷。 34.      如實施方式7-33中任一項所述之寡核苷酸，其中鍵合到該核心中的核苷的每個核苷酸間鍵聯獨立地是硫代磷酸酯核苷酸間鍵聯。 35.      如前述實施方式中任一項所述之寡核苷酸，其中該寡核苷酸的骨架手性中心模式係或包含[(Rp)n(Sp)m]y，其中n、m、和y各自獨立地是1-25。 36.      如前述實施方式中任一項所述之寡核苷酸，其中該寡核苷酸的骨架手性中心模式係或包含(Sp)t[(Rp)n(Sp)m]y，其中t、n、m、和y各自獨立地是1-25。 37.      如實施方式7-36中任一項所述之寡核苷酸，其中該核心的骨架手性中心模式係或包含[(Rp)n(Sp)m]y，其中n、m、和y各自獨立地是1-25。 38.      如實施方式7-37中任一項所述之寡核苷酸，其中該核心的骨架手性中心模式係或包含(Sp)t[(Rp)n(Sp)m]y，其中t、n、m、和y各自獨立地是1-25。 39.      如實施方式35-38中任一項所述之寡核苷酸，其中至少一個n係1。 40.      如實施方式35-39中任一項所述之寡核苷酸，其中每個n係1。 41.      如實施方式35-40中任一項所述之寡核苷酸，其中每個m獨立地是2-25。 42.      如實施方式35-41中任一項所述之寡核苷酸，其中y係1。 43.      如實施方式35-42中任一項所述之寡核苷酸，其中y係2-5。 44.      如前述實施方式中任一項所述之寡核苷酸，其中該寡核苷酸的鹼基序列與MAPT轉錄物中的鹼基序列約90%-100%互補。 45.      如前述實施方式中任一項所述之寡核苷酸，其中該寡核苷酸的鹼基序列係ACGTTGCAGTGTTCCACUAU、ACTATCCTCCTTCAGCUCCU、AGTGTTCCACTATCCUCCUU、ATCCTCCTTCAGCTCCUGCA、CACGTTGCAGTGTTCCACUA、CACTATCCTCCTTCAGCUCC、CAGTGTTCCACTATCCUCCU、CCACGTTGCAGTGTTCCACU、CCACTATCCTCCTTCAGCUC、CGTTGCAGTGTTCCACUAUC、CTATCCTCCTTCAGCUCCUG、GCAGTGTTCCACTATCCUCC、GTGTTCCACTATCCTCCUUC、GTTCCACTATCCTCCUUCAG、GUGUUCCACTATCCTCCTTC、TATCCTCCTTCAGCTCCUGC、TCCACTATCCTCCTTCAGCU、TGCAGTGTTCCACTAUCCUC、TGTTCCACTATCCTCCUUCA、TTCCACTATCCTCCTUCAGC、或TTGCAGTGTTCCACTAUCCU，其中每個T可以獨立地被U取代，並且反之亦然。 46.      如前述實施方式中任一項所述之寡核苷酸，其中該寡核苷酸的鹼基序列係GTGTTCCACTATCCTCCUUC，其中每個T可以獨立地被U取代，並且反之亦然。 47.      如前述實施方式中任一項所述之寡核苷酸，其中該寡核苷酸的鹼基序列係GTGTTCCACTATCCTCCUUC。 48.      一種寡核苷酸，其中該寡核苷酸係WV-26758、WV-26759、WV-29875、WV-29876、WV-29877、WV-29878、WV-29879、WV-29880、WV-29881、WV-29882、WV-29883、WV-29884、WV-29885、WV-29886、WV-29887、WV-29888、WV-30672、WV-30673、WV-30674、WV-30970、WV-30971、WV-30972、WV-30973、WV-30974、WV-30975、WV-30976、WV-30977、WV-30978、WV-30979、WV-30980、WV-30981、WV-30982、WV-30983、WV-30984、WV-30985、WV-30986、WV-30987、WV-30988、WV-30989、WV-30990、WV-30991、WV-30992、WV-30993、WV-30994、WV-30995、WV-30996、WV-30997、WV-30998、WV-30999、WV-31000、WV-31001、WV-31002、WV-31003、WV-31004、WV-31005、WV-31006、WV-31007、WV-31008、WV-31009、WV-31010、WV-31011、WV-31012、WV-31013、WV-31014、WV-31015、WV-31016、WV-31017、WV-31018、WV-31019、WV-31020、WV-31021、WV-31022、WV-31023、WV-31024、WV-31025、WV-31026、WV-31027、WV-31028、WV-31029、WV-31030、WV-31031、WV-31032、WV-31033、WV-31034、WV-31035、WV-31036、WV-31037、WV-31038、WV-31039、WV-31040、WV-31041、WV-31042、WV-31043、WV-31044、WV-31045、WV-31046、WV-31048、WV-31049、WV-31050、WV-31051、WV-31052、WV-32808、WV-32809、WV-32810、WV-32811、WV-32812、WV-32813、WV-32814、WV-32815、WV-32816、WV-32817、WV-32818、WV-32819、WV-32820、WV-32821、WV-32822、WV-32823、WV-32824、WV-32825、WV-32826、WV-32827、WV-33008、WV-33009、WV-33010、WV-33011、WV-33012、WV-33013、WV-33014、WV-33015、WV-33016、WV-33017、WV-33018、WV-33019、WV-33020、WV-33021、WV-33022、WV-33023、WV-33024、WV-33025、WV-33026、WV-33027、WV-33028、WV-33029、WV-33030、WV-33031、WV-33032、WV-33033、WV-33034、WV-33035、WV-33036、WV-33037、WV-33038、WV-33039、WV-33040、WV-33041、WV-33042、WV-33043、WV-33044、WV-33045、WV-33046、WV-33047、WV-33048、WV-33049、WV-33050、WV-33051、WV-33052、WV-33053、WV-33054、WV-33055、WV-33056、WV-33057、WV-33058、WV-33059、WV-33060、WV-33061、WV-33062、WV-33063、WV-33064、WV-33065、WV-33066、WV-33067、WV-33068、WV-33069、WV-33070、WV-33071、WV-33072、WV-33073、WV-33074、WV-33075、WV-33076、WV-33077、WV-33078、WV-33079、WV-33080、WV-33081、WV-33082、WV-33083、WV-33084、WV-33085、WV-33086、WV-33087、WV-33088、WV-33089、WV-33090、WV-36875、WV-36876、WV-36877、WV-37299、WV-37300、WV-37301、WV-37302、WV-37303、WV-37304、或WV-37305。 49.      如實施方式48所述之寡核苷酸，其中該寡核苷酸係WV-29883。 50.      如實施方式48所述之寡核苷酸，其中該寡核苷酸係WV-32823。 51.      如實施方式48所述之寡核苷酸，其中該寡核苷酸係WV-29876。 52.      如實施方式48所述之寡核苷酸，其中該寡核苷酸係WV-32824。 53.      如實施方式48所述之寡核苷酸，其中該寡核苷酸係WV-32826。 54.      如實施方式48所述之寡核苷酸，其中該寡核苷酸係WV-29884。 55.      如實施方式48所述之寡核苷酸，其中該寡核苷酸係WV-29886。 56.      如實施方式48所述之寡核苷酸，其中該寡核苷酸係WV-29877。 57.      如實施方式48所述之寡核苷酸，其中該寡核苷酸係WV-32816。 58.      如實施方式48所述之寡核苷酸，其中該寡核苷酸係WV-32817。 59.      如實施方式48所述之寡核苷酸，其中該寡核苷酸係WV-29878。 60.      如實施方式48所述之寡核苷酸，其中該寡核苷酸係WV-29887。 61.      如實施方式48所述之寡核苷酸，其中該寡核苷酸係WV-32827。 62.      如實施方式48所述之寡核苷酸，其中該寡核苷酸係WV-32825。 63.      如實施方式48所述之寡核苷酸，其中該寡核苷酸係WV-29885。 64.      如實施方式48所述之寡核苷酸，其中該寡核苷酸係WV-29882。 65.      如實施方式48-64中任一項所述之寡核苷酸，其中該寡核苷酸呈鹽形式。 66.      如實施方式48-64中任一項所述之寡核苷酸，其中該寡核苷酸呈藥學上可接受的鹽形式。 67.      如實施方式66所述之寡核苷酸，其中該寡核苷酸呈鈉鹽形式。 68.      如前述實施方式中任一項所述之寡核苷酸，其中該寡核苷酸具有約60%-100%的非鏡像異構物純度。 69.      如前述實施方式中任一項所述之寡核苷酸，其中該寡核苷酸具有至少約60%的非鏡像異構物純度。 70.      如前述實施方式中任一項所述之寡核苷酸，其中在施用至包含MAPT轉錄物的系統時，該寡核苷酸能夠降低該MAPT轉錄物的程度、表現和/或活性。 71.      一種藥物組成物，該藥物組成物遞送或包含如前述實施方式中任一項所述之寡核苷酸和藥學上可接受的載體。 72.      如實施方式71所述之組成物，該組成物遞送或包含該寡核苷酸的藥學上可接受的鹽。 73.      如實施方式71-72中任一項所述之組成物，其中該組成物包含該寡核苷酸的兩種或多種形式。 74.      如實施方式71-73中任一項所述之組成物，其中該組成物係包含該寡核苷酸的一種或多種溶解的藥學上可接受的鹽形式的水性組成物。 75.      一種包含多個寡核苷酸的寡核苷酸組成物，其中該多個寡核苷酸中的寡核苷酸共用： 1) 共同的鹼基序列，和 2) 獨立地在一個或多個（例如，約1-50、1-40、1-30、1-25、1-20、1-15、1-10、5-50、5-40、5-30、5-25、5-20、5-15、5-10、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、或25或更多個）手性核苷酸間鍵聯處相同的鍵聯磷立體化學（「手性受控的核苷酸間鍵聯」）； 其中多個寡核苷酸中的寡核苷酸各自獨立地靶向MAPT。 76.      一種包含多個寡核苷酸的寡核苷酸組成物，其中該多個寡核苷酸中的寡核苷酸共用： 1) 共同的鹼基序列，和 2) 獨立地在一個或多個（例如，約1-50、1-40、1-30、1-25、1-20、1-15、1-10、5-50、5-40、5-30、5-25、5-20、5-15、5-10、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、或25或更多個）手性核苷酸間鍵聯處相同的鍵聯磷立體化學（「手性受控的核苷酸間鍵聯」）； 其中相對於共用該共同的鹼基序列的寡核苷酸的基本上外消旋製劑，該組成物富集該多個寡核苷酸中的寡核苷酸。 77.      一種包含特定寡核苷酸類型的寡核苷酸的組成物，該寡核苷酸的特徵在於： a) 共同的鹼基序列； b) 共同的骨架鍵聯模式； c) 共同的骨架手性中心模式； 其中該多個寡核苷酸中的寡核苷酸包含至少一個核苷酸間鍵聯，該核苷酸間鍵聯包含Sp構型的共同鍵聯磷； 其中相對於具有相同共同的鹼基序列的寡核苷酸的基本上外消旋製劑，該組成物富集該特定寡核苷酸類型的寡核苷酸；並且 其中多個寡核苷酸中的寡核苷酸各自獨立地靶向MAPT。 78.      如實施方式75-76任一項所述之組成物，其中在施用至包含MAPT轉錄物的系統時，該寡核苷酸能夠降低該MAPT轉錄物的程度、表現和/或活性。 79.      如實施方式75-78中任一項所述之組成物，其中該寡核苷酸與MAPT轉錄物中的位點雜交。 80.      如實施方式75-79中任一項所述之組成物，其中該寡核苷酸包含第一翼、核心、和第二翼。 81.      如實施方式75-80中任一項所述之組成物，其中該第一翼的糖修飾模式與該第二翼的糖修飾模式不同。 82.      如實施方式75-81中任一項所述之組成物，其中該核心的核苷單元不包含糖修飾。 83.      如實施方式75-82中任一項所述之組成物，其中該寡核苷酸靶向MAPT內含子11。 84.      如實施方式75-82中任一項所述之組成物，其中該寡核苷酸靶向MAPT內含子11並且該寡核苷酸具有包含以下鹼基序列的至少10個連續鹼基的鹼基序列：ACGTTGCAGTGTTCCACUAU、ACTATCCTCCTTCAGCUCCU、AGTGTTCCACTATCCUCCUU、ATCCTCCTTCAGCTCCUGCA、CACGTTGCAGTGTTCCACUA、CACTATCCTCCTTCAGCUCC、CAGTGTTCCACTATCCUCCU、CCACGTTGCAGTGTTCCACU、CCACTATCCTCCTTCAGCUC、CGTTGCAGTGTTCCACUAUC、CTATCCTCCTTCAGCUCCUG、GCAGTGTTCCACTATCCUCC、GTGTTCCACTATCCTCCUUC、GTTCCACTATCCTCCUUCAG、GUGUUCCACTATCCTCCTTC、TATCCTCCTTCAGCTCCUGC、TCCACTATCCTCCTTCAGCU、TGCAGTGTTCCACTAUCCUC、TGTTCCACTATCCTCCUUCA、TTCCACTATCCTCCTUCAGC、或TTGCAGTGTTCCACTAUCCU，其中每個T可以獨立地被U取代，並且反之亦然。 85.      一種包含多個寡核苷酸的寡核苷酸組成物，其中該多個寡核苷酸中的寡核苷酸共用： 1) 共同的鹼基序列，和 2) 獨立地在一個或多個（例如，約1-50、1-40、1-30、1-25、1-20、1-15、1-10、5-50、5-40、5-30、5-25、5-20、5-15、5-10、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、或25或更多個）手性核苷酸間鍵聯處相同的鍵聯磷立體化學（「手性受控的核苷酸間鍵聯」）； 其中該多個寡核苷酸中的寡核苷酸各自獨立地是如實施方式1-67中任一項所述之寡核苷酸。 86.      一種包含特定寡核苷酸類型的寡核苷酸的組成物，該寡核苷酸的特徵在於： a) 共同的鹼基序列； b) 共同的骨架鍵聯模式； c) 共同的骨架手性中心模式； 其中該多個寡核苷酸中的寡核苷酸包含至少一個核苷酸間鍵聯，該核苷酸間鍵聯包含Sp構型的共同鍵聯磷； 其中相對於具有相同共同的鹼基序列的寡核苷酸的基本上外消旋製劑，該組成物富集該特定寡核苷酸類型的寡核苷酸；並且 其中該多個寡核苷酸中的寡核苷酸各自獨立地是如實施方式1-67中任一項所述之寡核苷酸。 87.      如實施方式75-86中任一項所述之組成物，其中該多個寡核苷酸中的寡核苷酸獨立地在5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24或25或更多個核苷酸間鍵聯處共用相同的鍵聯磷立體化學。 88.      如實施方式75-76中任一項所述之組成物，其中該多個寡核苷酸中的寡核苷酸係具有相同構造的寡核苷酸，視需要呈一種或多種鹽形式。 89.      如實施方式75-88中任一項所述之組成物，其中該多個寡核苷酸中的寡核苷酸各自獨立地具有相同的寡核苷酸或其藥學上可接受的鹽。 90.      如實施方式75-89中任一項所述之組成物，其中該多個寡核苷酸中的寡核苷酸各自獨立地具有相同的寡核苷酸或其藥學上可接受的鹽。 91.      如實施方式75-90中任一項所述之組成物，其中該多個寡核苷酸中的寡核苷酸係相同酸形式寡核苷酸的一種或多種藥學上可接受的鹽。 92.      如實施方式75-91中任一項所述之組成物，其中該多個寡核苷酸中的寡核苷酸具有相同的結構。 93.      如實施方式75-92中任一項所述之組成物，其中該多個寡核苷酸中寡核苷酸係鈉鹽。 94.      如實施方式75-93中任一項所述之組成物，其中該多個寡核苷酸中寡核苷酸獨立地在每個硫代磷酸酯核苷酸間鍵聯處共用相同的鍵聯磷立體化學。 95.      如實施方式75-93中任一項所述之組成物，其中該多個寡核苷酸中的寡核苷酸獨立地在每個手性鍵聯磷處共用相同的鍵聯磷立體化學。 96.      如實施方式75-86中任一項所述之組成物，其中該多個寡核苷酸中的寡核苷酸各自獨立地是如實施方式48所述之寡核苷酸，視需要呈藥學上可接受的鹽形式。 97.      如實施方式75-86中任一項所述之組成物，其中該多個寡核苷酸中的寡核苷酸各自獨立地是如實施方式49所述之寡核苷酸，視需要呈藥學上可接受的鹽形式。 98.      如實施方式75-86中任一項所述之組成物，其中該多個寡核苷酸中的寡核苷酸各自獨立地是如實施方式50所述之寡核苷酸，視需要呈藥學上可接受的鹽形式。 99.      如實施方式75-86中任一項所述之組成物，其中該多個寡核苷酸中的寡核苷酸各自獨立地是如實施方式51所述之寡核苷酸，視需要呈藥學上可接受的鹽形式。 100.    如實施方式75-86中任一項所述之組成物，其中該多個寡核苷酸中的寡核苷酸各自獨立地是如實施方式52所述之寡核苷酸，視需要呈藥學上可接受的鹽形式。 101.    如實施方式75-86中任一項所述之組成物，其中該多個寡核苷酸中的寡核苷酸各自獨立地是如實施方式53所述之寡核苷酸，視需要呈藥學上可接受的鹽形式。 102.    如實施方式75-86中任一項所述之組成物，其中該多個寡核苷酸中的寡核苷酸各自獨立地是如實施方式54所述之寡核苷酸，視需要呈藥學上可接受的鹽形式。 103.    如實施方式75-86中任一項所述之組成物，其中該多個寡核苷酸中的寡核苷酸各自獨立地是如實施方式55所述之寡核苷酸，視需要呈藥學上可接受的鹽形式。 104.    如實施方式75-86中任一項所述之組成物，其中該多個寡核苷酸中的寡核苷酸各自獨立地是如實施方式56所述之寡核苷酸，視需要呈藥學上可接受的鹽形式。 105.    如實施方式75-86中任一項所述之組成物，其中該多個寡核苷酸中的寡核苷酸各自獨立地是如實施方式57所述之寡核苷酸，視需要呈藥學上可接受的鹽形式。 106.    如實施方式75-86中任一項所述之組成物，其中該多個寡核苷酸中的寡核苷酸各自獨立地是如實施方式58所述之寡核苷酸，視需要呈藥學上可接受的鹽形式。 107.    如實施方式75-86中任一項所述之組成物，其中該多個寡核苷酸中的寡核苷酸各自獨立地是如實施方式59所述之寡核苷酸，視需要呈藥學上可接受的鹽形式。 108.    如實施方式75-86中任一項所述之組成物，其中該多個寡核苷酸中的寡核苷酸各自獨立地是如實施方式60所述之寡核苷酸，視需要呈藥學上可接受的鹽形式。 109.    如實施方式75-86中任一項所述之組成物，其中該多個寡核苷酸中的寡核苷酸各自獨立地是如實施方式61所述之寡核苷酸，視需要呈藥學上可接受的鹽形式。 110.    如實施方式75-86中任一項所述之組成物，其中該多個寡核苷酸中的寡核苷酸各自獨立地是如實施方式62所述之寡核苷酸，視需要呈藥學上可接受的鹽形式。 111.    如實施方式75-86中任一項所述之組成物，其中該多個寡核苷酸中的寡核苷酸各自獨立地是如實施方式63所述之寡核苷酸，視需要呈藥學上可接受的鹽形式。 112.    如實施方式75-86中任一項所述之組成物，其中該多個寡核苷酸中的寡核苷酸各自獨立地是如實施方式64所述之寡核苷酸，視需要呈藥學上可接受的鹽形式。 113.    如實施方式75-112中任一項所述之組成物，其中該組成物中的共用共同的鹼基序列的非隨機程度的所有寡核苷酸係該多個寡核苷酸中的寡核苷酸。 114.    如實施方式75-113中任一項所述之組成物，其中該組成物中的共用相同構造的非隨機程度的所有寡核苷酸係該多個寡核苷酸中的寡核苷酸。 115.    如實施方式113-114中任一項所述之組成物，該該非隨機程度係約40%-100%，或約40%、50%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%或95%。 116.    一種藥物組成物，該藥物組成物包含或遞送本揭露的寡核苷酸或如實施方式75-115中任一項所述之組成物、和藥學上可接受的載體。 117.    一種用於製備如前述實施方式中任一項所述之寡核苷酸或組成物之方法，該方法包括使用手性助劑。 118.    如實施方式117所述之方法，該方法包括使用包含手性助劑部分的亞磷醯胺。 119.    如實施方式117-118中任一項所述之方法，其中手性助劑係DPSE。 120.    如實施方式117-119中任一項所述之方法，其中手性助劑係PSM。 121.    如實施方式117-120中任一項所述之方法，其中鍵聯磷與氮鍵合的每個手性受控的核苷酸間鍵聯係使用PSM獨立地製備的。 122.    如實施方式117-121中任一項所述之方法，其中每個手性受控的n001係使用PSM獨立地製備的。 123.    如實施方式117-122中任一項所述之方法，其中每個手性受控的硫代磷酸酯核苷酸間鍵聯係使用DPSE獨立地製備的。 124.    如實施方式117-118中任一項所述之方法，其中每個手性受控的核苷酸間鍵聯係使用PSM獨立地製備的。 125.    一種用於降低tau蛋白的程度、功能和/或活性之方法，該方法包括使該蛋白與如前述實施方式中任一項所述之寡核苷酸或組成物接觸。 126.    一種用於降低tau細胞內聚集之方法，該方法包括使該蛋白與如前述實施方式中任一項所述之寡核苷酸或組成物接觸。 127.    一種用於降低tau擴散之方法，該方法包括使該蛋白與如前述實施方式中任一項所述之寡核苷酸或組成物接觸。 128.    一種用於降低tau細胞內聚集和擴散之方法，該方法包括使該蛋白與如前述實施方式中任一項所述之寡核苷酸或組成物接觸。 129.    一種用於降低系統中tau蛋白的程度、功能和/或活性之方法，該方法包括向該系統施用有效量的如前述實施方式中任一項所述之寡核苷酸或組成物。 130.    一種用於降低系統中tau細胞內聚集之方法，該方法包括向該系統施用有效量的如前述實施方式中任一項所述之寡核苷酸或組成物。 131.    一種用於降低系統中tau擴散之方法，該方法包括向該系統施用有效量的如前述實施方式中任一項所述之寡核苷酸或組成物。 132.    一種用於降低系統中tau細胞內聚集和擴散之方法，該方法包括向該系統施用有效量的如前述實施方式中任一項所述之寡核苷酸或組成物。 133.    如實施方式129-132中任一項所述之方法，其中系統係人類。 134.    一種用於在患有或易患MAPT相關的病症、障礙或疾病或其症狀的受試者中治療或預防MAPT相關的病症、障礙或疾病或其症狀之方法，該方法包括向該受試者施用治療有效量的如前述實施方式中任一項所述之寡核苷酸或組成物。 135.    一種用於在患有或易患神經退行性疾病的受試者中治療或預防神經退行性疾病之方法，該方法包括向該受試者施用治療有效量的如前述實施方式中任一項所述之寡核苷酸或組成物。 136.    一種用於在患有或易患tau蛋白病的受試者中治療或預防tau蛋白病之方法，該方法包括向該受試者施用治療有效量的如前述實施方式中任一項所述之寡核苷酸或組成物。 137.    如實施方式134-136中任一項所述之方法，其中該病症、障礙或疾病係阿茲海默氏症（AD）。 138.    如實施方式134-136中任一項所述之方法，其中該病症、障礙和/或疾病係額顳葉失智（FTD）。 139.    如實施方式134-136中任一項所述之方法，其中該病症、障礙或疾病係行為變異型FTD（bvFTD）。 140.    如實施方式134-136中任一項所述之方法，其中該病症、障礙或疾病係非流利變異型原發性進行性失語（nfvPPA）。 141.    如實施方式134-136中任一項所述之方法，其中該病症、障礙或疾病係皮質基底節變性（CBD）。 142.    如實施方式134-136中任一項所述之方法，其中該病症、障礙或疾病係進行性核上性麻痹（PSP）。 143.    如實施方式134-136中任一項所述之方法，其中該病症、障礙或疾病係癲癇。 144.    如實施方式134-136中任一項所述之方法，其中該病症、障礙或疾病係Dravet綜合症。 145.    如實施方式134-136中任一項所述之方法，其中該病症、障礙或疾病係慢性創傷性腦病變（CTE）。
實例
下文描述了所提供的技術（化合物（寡核苷酸、試劑等）、組成物、方法（製備方法、使用方法、評估方法等）等）的某些實例。
實例1. 寡核苷酸合成
用於製備寡核苷酸和寡核苷酸組成物（立體隨機和手性受控的）的各種技術係已知的且可根據本揭露使用，該等技術包括例如US 9394333、US 9744183、US 9605019、US 9598458、US 9982257、US 10160969、US 10479995、US 2020/0056173、US 2018/0216107、US 2019/0127733、US 10450568、US 2019/0077817、US 2019/0249173、US 2019/0375774、WO 2018/223056、WO 2018/223073、WO 2018/223081、WO 2018/237194、WO 2019/032607、WO 2019/055951、WO 2019/075357、WO 2019/200185、WO 2019/217784、WO 2019/032612、和/或WO 2020/191252中的那些，將該等文獻每一者中之方法和試劑藉由引用併入本文。
在一些實施方式中，使用合適的手性助劑例如DPSE和PSM手性助劑製備寡核苷酸。根據本揭露製備多種寡核苷酸（例如表1中的那些寡核苷酸）及其組成物。
例如，在一些實施方式中，使用用於手性受控的核苷酸間鍵聯的DPSE和PSM手性助劑製備寡核苷酸。在一些實施方式中，使用DPSE手性助劑以構建手性受控的硫代磷酸酯核苷酸間鍵聯。在一些實施方式中，使用PSM手性助劑以構建手性受控的非負電荷核苷酸間鍵聯，例如n001。在一些實施方式中，PSM手性助劑用於製備寡核苷酸中的多種或所有類型的手性受控的核苷酸間鍵聯（例如，手性受控的硫代磷酸酯和n001核苷酸間鍵聯）。下文實例描述了DPSE和PSM手性助劑的某些用途，包括某些可用於手性受控的寡核苷酸製劑的包含DPSE或PSM手性助劑的亞磷醯胺。在一些實施方式中，利用標準亞磷醯胺製備天然磷酸酯鍵聯（PO）。除其他事項外，本揭露的技術對於各種類型的手性核苷酸間鍵聯的手性受控構建係高度有效的。如WV-29878製劑所舉例說明並證實的那樣，所提供的技術可以提供高立體選擇性、高粗品純度和高產率。
如熟悉該項技術者所理解的，寡核苷酸製劑通常包含多個循環。在一些實施方式中，本揭露提供了用於製備寡核苷酸及其組成物之方法，該方法包括多個其中所述之循環。在一些實施方式中，每個循環，例如用於製備手性受控的核苷酸間鍵聯的循環，獨立地包括解嵌段（例如，其對加帽的羥基進行解嵌段，例如本文所述之去三苯甲基化）、偶聯（例如，將包含手性助劑的亞磷醯胺與羥基偶聯，如本文所述之偶聯-1）、第一加帽（例如，利用可將手性助劑中的胺基加帽的條件，如本文所述之帽-1）、修飾（例如，硫醇化，疊氮化物反應等，如本文所述）和第二加帽基團（例如，利用可加帽羥基的條件，如本文所述之帽-2）。某些有用的技術（例如循環、步驟、條件、試劑等）在下面作為實例進行描述。
在一些實施方式中，利用用於手性受控的硫代磷酸酯（PS）鍵聯的DPSE手性助劑和用於手性受控的PN鍵聯（其中氮鍵合至鍵聯磷，例如n001）的PSM手性助劑製備手性受控寡核苷酸組成物。下面描述WV-29878的實例製備。在該實例中，使用2.7 x 7.0 cm不銹鋼柱以746 µmol的規模在mC-CPG固體支持物上進行WV-29878的製備。
縮寫：
mC-CPG 2’-OMe-C經由CNA連接子CPG（600Å LBD）
dA-L-DPSE 5’-O-DMT-dA (Bz)-(L)-DPSE亞磷醯胺
dC-L-DPSE 5’-O-DMT-dC (Ac)-(L)-DPSE亞磷醯胺
dC-D-DPSE 5’-O-DMT-dC (Ac)-(D)-DPSE亞磷醯胺
dT-L-DPSE 5’-O-DMT-dT-(L)-DPSE亞磷醯胺
mC-L-DPSE 5’-O-DMT-2’-OMe-C (Ac)-(L)-DPSE亞磷醯胺
mU-L-DPSE 5’-O-DMT-2’-OMe-U-(L)-DPSE亞磷醯胺
Geo-L-DPSE 5’-O-DMT-2’-O-MOE-G (iBu)-(L)-DPSE亞磷醯胺
Teo-L-DPSE 5’-O-DMT-2’-O-MOE-5-Me-U-(L)-DPSE亞磷醯胺
mC-L-PSM 5’-O-DMT-2’-OMe-C (Ac)-(L)-PSM亞磷醯胺
Teo-L-PSM 5’-O-DMT-2’-O-MOE-5-Me-U-(L)-PSM亞磷醯胺
Geo-CE 5’-O-DMT-2’-O-MOE-G (iBu)-β-氰乙基亞磷醯胺
ADIH 2-疊氮基-1,3-二甲基咪唑啉六氟磷酸鹽
帽A N-甲基咪唑於乙腈中，20/80，v/v
帽B 乙酸酐/2,6-二甲基吡啶/乙腈，20/30/50，v/v/v
CE β-氰乙基
濃度 NH4 OH 28%-30%濃縮氫氧化銨
CT 接觸時間
CV 柱體積
CMIMT 1-(氰甲基)-1H-咪唑并l-3-鎓-1-基 三氟甲磺酸酯
DCA 二氯乙酸
DEA 二乙胺
解嵌段 3% DCA，在甲苯中
DMSO 二甲亞碸
ETT 5-乙基硫代-1H-四唑
過濾單元 過濾器裝置，0.22微米過濾器，康寧公司（CORNING）
IBN 異丁腈
MeCN 乙腈
MS3A 分子篩，3Å
NLT 不少於
NMI N-甲基咪唑
Ox 在吡啶/水中0.04-0.06M碘，90/10，v/v
TEA 三乙胺
TEA.3HF 三乙胺三氫氟化物
XH 蒼耳烷氫化物
WFI 注射用水（水）
實例合成製程參數
製程步驟 參數 設定點
合成循環 DPSE手性亞醯胺 1. 脫三苯甲基 2. 偶聯-1 3. 帽-1 4. 修飾 - 硫醇化 5. 帽-2
PSM手性亞醯胺 1. 脫三苯甲基 2. 偶聯-1 3. 帽-1 4. 修飾 - 疊氮化物反應 5. 帽-2
標準亞醯胺 1. 脫三苯甲基 2. 偶聯-2 3. 修飾 - 氧化 4. 帽-2
柱，規模，合成器 柱 不銹鋼
柱直徑 2.7 cm
柱床高 7.0 cm
柱體積 40.1 mL
規模 746 µmol
合成器 AKTA OligoPilot 100
CPG 固體載體 mC-CPG
載體負載 77 µmol/g
調整的支持物密度 0.24 g/c.c.
合成前洗滌 合成前洗滌溶劑 MeCN
合成前洗滌流速 424 cm/h
合成前洗滌體積 2.0 CV
解嵌段 （脫三苯甲基） 試劑 解嵌段
控制模式 UV表命令
脫三苯甲基波長 436 nm
脫三苯甲基UV表 開：500 mAu（1.2 CV延遲） 關：1000 mAU
UV自動調零 在第一脫三苯甲基之前以支路中解嵌段自動調零
脫三苯甲基流速 424 cm/h
脫三苯甲基後MeCN洗滌 4.0 CV 424 cm/h
偶聯-1 亞醯胺當量/支持物 2.5當量
亞醯胺的濃度和稀釋液 在100% MeCN中的0.2 M的dA-L-DPSE、dT-L-DPSE、Geo-L-DPSE、Teo-L-DPSE、Teo-L-PSM，和在IBN-MeCN（20 : 80）中的0.2M mC-L-DPSE、mC-L-PSM，和在100% IBN中的dC-L-DPSE、dC-D-DPSE、mU-L-DPSE
亞醯胺溶液的密度 未經調節的
亞醯胺溶液的乾燥 MS3A，15%-20% w.r.t.亞醯胺溶液，v/v 乾燥時間 = NLT 4 h
活化劑 CMIMT
活化劑濃度 0.5M，在MeCN中
活化劑當量/支持物 10.20
活化劑溶液的密度 未經調節的
活化劑溶液的乾燥 MS3A，10%，w.r.t.活化劑溶液，v/v 乾燥時間 = NLT 4 h
活化劑/亞醯胺莫耳比 4.079 : 1
活化劑體積% 62%
所有亞醯胺的偶聯裝料流速 58.7 cm/h
活化劑的偶聯裝料流速 95.7 cm/h
偶聯裝料體積（亞醯胺 + 活化劑） 24.5 mL
推送體積 4.5 mL
再循環流速 212 cm/h
再循環時間 8 min
MeCN洗滌流速 424 cm/h
MeCN洗滌體積 2.0 CV
偶聯-2 亞醯胺當量/支持物 2.5當量
亞醯胺的濃度和稀釋液 0.2 M的Geo-CE（以100%）
亞醯胺溶液的密度 未經調節的
亞醯胺溶液的乾燥 MS3A，15%-20% w.r.t.亞醯胺溶液，v/v 乾燥時間 = NLT 4 h
活化劑 ETT
活化劑濃度 0.5M，在MeCN中
活化劑當量/支持物 7.64
活化劑溶液的密度 未經調節的
活化劑溶液的乾燥 MS3A，10%，w.r.t.活化劑溶液，v/v 乾燥時間 = NLT 4h
活化劑/亞醯胺莫耳比 3.056 : 1
活化劑體積% 55%
所有亞醯胺的偶聯裝料流速 58.7 cm/h
活化劑的偶聯裝料流速 71.7 cm/h
偶聯裝料體積（亞醯胺 + 活化劑） 20.7 mL
推送體積 4.5 mL
再循環流速 212 cm/h
再循環時間 8 min
偶聯MeCN洗滌流速 424 cm/h
偶聯MeCN洗滌體積 2.0 CV
帽1 模式 流通式
試劑 帽B
柱體積（CV） 2.0 CV
接觸時間（CT） 4 min
試劑裝料流速 20.0 mL/min
MeCN推送體積 1.3 CV
MeCN推送流速 20.0 mL/min
修飾 （硫醇化） 模式 流通式
試劑 0.1M XH，在吡啶中
硫醇化試劑的密度 未經調節的
裝料體積 1.2 CV
裝料流速 84.0 cm/h
接觸時間 6 min
MeCN推送流速 84.0 cm/h
MeCN推送體積 1.3 CV
硫代後MeCN洗滌流速（Flow_AB） 424 cm/h
硫代後MeCN洗滌體積 1.0 CV
修飾 （疊氮化物反應） 模式 流通式
試劑 0.3M ADIH，在MeCN中
疊氮化物試劑的密度 未經調節的
裝料體積 1.0 CV
接觸時間 15 min
裝料流速 28.0 cm/h
MeCN推送流速 28.0 cm/h
MeCN推送體積 1.5 CV
修飾（氧化） 模式 流通式
試劑 Ox
碘當量/固體支持物 3.0當量
接觸時間 2.0 min
試劑裝料流速 234.6 cm/h
MeCN推送流速 234.6 cm/h
MeCN推送體積 1.3 CV
MeCN洗滌流速 424 cm/h
MeCN洗滌體積 1.0 CV
帽2 試劑 帽A
帽B
模式 流通式
裝料體積 0.4 CV
接觸時間 0.8 min
裝料流速 帽A泵A = 105.0 cm/h 帽B泵B = 105.0 cm/h
MeCN推送體積_AB 1.3 CV
MeCN推送流速_AB MeCN泵A = 105.0 cm/h MeCN泵B = 105.0 cm/h
加帽洗滌體積_AB 1.0 CV
加帽洗滌流速_AB 424 cm/h
合成後MeCN洗滌 MeCN洗滌流速 424 cm/h
MeCN洗滌流量 2.0 CV
除去PSM和CE基團 試劑 20% DEA，在MeCN中
遞送模式 流通式
裝料體積 5.0 CV
接觸時間 15 min
裝料流速 140 cm/h
裝料MeCN推送流速 140 cm/h
裝料MeCN推送體積 1.3 CV
MeCN洗滌流速 424 cm/h
MeCN洗滌體積 3.0 CV
在一些實施方式中，手性助劑例如PSM（其胺基基團可以例如被-C（O）R封端）、和/或CE基團藉由使包含這樣的部分的寡核苷酸與鹼基在有機溶劑（例如，在MeCN中20%的DEA）中接觸而被除去。在一些實施方式中，在這種核苷酸間鍵聯與水接觸之前，除去在手性助劑，例如核苷酸間鍵聯中的PSM（其胺基可以例如被-C（O）R封端），其鍵聯磷與氮鍵合（例如，n001的先質）。
在製劑中，以746 μmol的規模進行切割和去保護（C & D）。某些有用的切割和去保護過程參數如下（PSM和CE磷保護基團的切割如上所述）。
製備DS1溶液（1 L）的實例配方
溶劑/試劑 體積（mL）
DMSO 733 ± 36.7
WFI 147 ± 7.4
TEA 70 ± 3.5
TEA.3HF 50 ± 2.5
實例切割和去保護參數
製程步驟 參數 設定點
除去DPSE基團 反應容器 適用於TEA-HF/氫氧化銨溶液
規模 746 µmol
試劑 DS1
體積 100 ± 5 mL/mmol
反應溫度 28 ± 2.5°C
培養搖床rpm 180 ± 10 rpm
反應時間 3 ± 0.5小時
除去殘餘保護基團 反應容器 適用於TEA-HF/氫氧化銨溶液
試劑 濃度NH4 OH
試劑體積 200 ± 5 mL/mmol
反應時間 16 ± 1小時
反應溫度 45 ± 2°C
過濾前冷卻至室溫 ＜ 25°C
過濾 初始粗濾裝置 過濾單元
過濾模式 在真空下
支持物洗滌溶劑 WFI
載體洗滌體積 250 - 350 mL/mmol
在製劑中，粗鹽寡核苷酸組成物的UPLC分析顯示，脫鹽前粗樣品中全長產物的純度（% FLP）為69.1%。粗產率估計為74 OD單位/umol。FLP淨產率為51 OD/umol（1.90 mg/umol）。在一些實施方式中，粗品儲存條件為2°C-8°C；也可以利用其他合適的存儲條件。藉由LC-MS證實了WV-29878的分子量（理論值6988.8；實測值6987.0）。
在一些實施方式中，利用用於手性受控的PS和PN（例如，n001）核苷酸間鍵聯的PSM手性助劑製備手性受控的寡核苷酸組成物。在一些實施方式中，這樣的技術可以提供高選擇性、高粗品純度、高產率和/或簡化的/替代的製造過程（例如，不使用F來源來去除例如PSM的手性助劑）等。在一些實施方式中，本揭露藉由遞送具有高純度、高立體選擇性和/或少量鹽的粗組成物而促進純化和/或配製過程。
下面描述了利用PSM手性助劑製備WV-29878的實例。在該實例中，使用2.7 x 7.0 cm不銹鋼柱以743 µmol的規模在mC-CPG固體支持物上進行WV-29878的製備。
縮寫：
mC-CPG 2’-OMe-C經由CNA連接子CPG（600Å LBD）
dA-L-PSM 5’-O-DMT-dA (Bz)-(L)-PSM亞磷醯胺
dC-L-PSM 5’-O-DMT-dC (Ac)-(L)-PSM亞磷醯胺
dC-D-PSM 5’-O-DMT-dC (Ac)-(D)-PSM亞磷醯胺
dT-L-PSM 5’-O-DMT-dT-(L)-PSM亞磷醯胺
mC-L-PSM 5’-O-DMT-2’-OMe-C (Ac)-(L)-PSM亞磷醯胺
mU-L-PSM 5’-O-DMT-2’-OMe-U-(L)-PSM亞磷醯胺
Geo-L-PSM 5’-O-DMT-2’-O-MOE-G (iBu)-(L)-PSM亞磷醯胺
Teo-L-PSM 5’-O-DMT-2’-O-MOE-5-Me-U-(L)-PSM亞磷醯胺
Geo-CE 5’-O-DMT-2’-O-MOE-G (iBu)-β-氰乙基亞磷醯胺
ADIH 2-疊氮基-1,3-二甲基咪唑啉六氟磷酸鹽
帽A N-甲基咪唑於乙腈中，20/80，v/v
帽B 乙酸酐/2,6-二甲基吡啶/乙腈，20/30/50，v/v/v
濃度NH4 OH 28%-30%濃縮氫氧化銨
CT 接觸時間
CV 柱體積
CMIMT 1-(氰甲基)-1H-咪唑并l-3-鎓-1-基 三氟甲磺酸酯
DCA 二氯乙酸
DEA 二乙胺
解嵌段 3% DCA，在甲苯中
過濾單元 過濾器裝置，0.22微米過濾器，康寧公司（CORNING）
IBN 異丁腈
MeCN 乙腈
MS3A 分子篩，3Å
NLT 不少於
NMI N-甲基咪唑
Ox 在吡啶/水中0.04-0.06M碘，90/10，v/v
TEA 三乙胺
XH 蒼耳烷氫化物
WFI 注射用水（水）
某些循環、步驟、反應、試劑、條件等在下面作為實例進行描述。
實例合成製程參數
製程步驟 參數 設定點
合成循環 從第1至第6偶聯 1. 脫三苯甲基 2. 偶聯-1 3. 帽-1 4. 偶聯-1 5. 帽-1 6. 修飾 - 硫醇化或疊氮化物反應 7. 帽-2
從第7至第19，除第17偶聯 1. 脫三苯甲基 2. 偶聯-2 3. 帽-1 4. 修飾 - 硫醇化或疊氮化物反應 5. 帽-2
第17偶聯 1. 脫三苯甲基 2. 偶聯-2 3. 修飾 - 氧化 4. 帽-2
柱，規模，合成器 柱 不銹鋼
柱直徑 2.7 cm
柱床高 7.0 cm
柱體積 40.1 mL
規模 743 µmol
合成器 AKTA OligoPilot 100
CPG 固體載體 mC-CPG
載體負載 77 µmol/g
調整的支持物密度 0.24 g/c.c.
合成前洗滌 合成前洗滌溶劑 MeCN
合成前洗滌流速 424 cm/h
合成前洗滌體積 2.0 CV
解嵌段 （脫三苯甲基） 試劑 解嵌段
控制模式 UV表命令
脫三苯甲基波長 436 nm
脫三苯甲基UV表 開：500 mAu（1.2 CV延遲） 關：1000 mAU
UV自動調零 在第一脫三苯甲基之前以支路中解嵌段自動調零
脫三苯甲基流速 424 cm/h
脫三苯甲基後MeCN洗滌 4.0 CV 424 cm/h
偶聯-1 亞醯胺當量/支持物 2.5當量
亞醯胺的濃度和稀釋液 在100% MeCN中的0.2 M的dT-L-PSM，和在IBN-MeCN（20 : 80）中的0.2M dC-L-PSM、dC-D-PSM、mC-L-PSM、mU-L-PSM
亞醯胺溶液的密度 未經調節的
亞醯胺溶液的乾燥 MS3A，15%-20% w.r.t.亞醯胺溶液，v/v 乾燥時間 = NLT 4h
活化劑 CMIMT
活化劑濃度 0.5M，在MeCN中
活化劑當量/支持物 10.20
活化劑溶液的密度 未經調節的
活化劑溶液的乾燥 MS3A，10%，w.r.t.活化劑溶液，v/v 乾燥時間 = NLT 4h
活化劑/亞醯胺莫耳比 4.079 : 1
活化劑體積% 62%
所有亞醯胺的偶聯裝料流速 58.4 cm/h
活化劑的偶聯裝料流速 95.3 cm/h
偶聯裝料體積（亞醯胺 + 活化劑） 24.5 mL
推送體積 4.5 mL
再循環流速 212 cm/h
再循環時間 16 min
MeCN洗滌流速 424 cm/h
MeCN洗滌體積 2.0 CV
偶聯-2 亞醯胺當量/支持物 2.5當量
亞醯胺的濃度和稀釋液 在100% MeCN中的0.2 M的dA-L-PSM、dT-L-PSM、Geo-L-PSM、Teo-L-PSM、Geo-CE，和在IBN-MeCN（20 : 80）中的0.2M dC-L-PSM、dC-D-PSM
亞醯胺溶液的密度 未經調節的
亞醯胺溶液的乾燥 MS3A，15%-20% w.r.t.亞醯胺溶液，v/v 乾燥時間 = NLT 4h
活化劑 CMIMT
活化劑濃度 0.5M，在MeCN中
活化劑當量/支持物 10.20
活化劑溶液的密度 未經調節的
活化劑溶液的乾燥 MS3A，10%，w.r.t.活化劑溶液，v/v 乾燥時間 = NLT 4h
活化劑/亞醯胺莫耳比 4.079 : 1
活化劑體積% 62%
所有亞醯胺的偶聯裝料流速 58.4 cm/h
活化劑的偶聯裝料流速 95.3 cm/h
偶聯裝料體積（亞醯胺 + 活化劑） 24.5 mL
推送體積 4.5 mL
再循環流速 212 cm/h
再循環時間 8 min
MeCN洗滌流速 424 cm/h
MeCN洗滌體積 2.0 CV
帽1 模式 流通式
試劑 帽B
柱體積（CV） 0.1 CV
接觸時間（CT） 0.5 min
試劑裝料流速 4 mL/min
MeCN推送體積 1.3 CV
MeCN推送流速 4 mL/min
修飾 （硫醇化） 模式 流通式
試劑 0.1M XH，在吡啶中
硫醇化試劑的密度 未經調節的
裝料體積 0.6 CV
裝料流速 84.0 cm/h
接觸時間 3 min
MeCN推送流速 84.0 cm/h
MeCN推送體積 1.3 CV
硫代後MeCN洗滌流速（Flow_AB） 424 cm/h
硫代後MeCN洗滌體積 1.0 CV
修飾 （疊氮化物反應） 模式 流通式
試劑 0.3M ADIH，在MeCN中
疊氮化物試劑的密度 未經調節的
裝料體積 1.0 CV
接觸時間 15 min
裝料流速 28.0 cm/h
MeCN推送流速 28.0 cm/h
MeCN推送體積 1.5 CV
修飾 （氧化） 模式 流通式
試劑 Ox
碘當量/固體支持物 3.0當量
接觸時間 2.0 min
試劑裝料流速 233.6 cm/h
MeCN推送流速 233.6 cm/h
MeCN推送體積 1.3 CV
MeCN洗滌流速 424 cm/h
MeCN洗滌體積 1.0 CV
帽2 試劑 帽A
帽B
模式 流通式
裝料體積 0.4 CV
接觸時間 0.8 min
裝料流速 帽A泵A = 105.0 cm/h 帽B泵B = 105.0 cm/h
MeCN推送體積_AB 1.3 CV
MeCN推送流速_AB MeCN泵A = 105.0 cm/h MeCN泵B = 105.0 cm/h
加帽洗滌體積_AB 1.0 CV
加帽洗滌流速_AB 424 cm/h
合成後MeCN洗滌 MeCN洗滌流速 424 cm/h
MeCN洗滌流量 2.0 CV
除去磷保護基團 試劑 20% DEA，在MeCN中
遞送模式 流通式
裝料體積 5.0 CV
接觸時間 15 min
裝料流速 140 cm/h
裝料MeCN推送流速 140 cm/h
裝料MeCN推送體積 1.3 CV
MeCN洗滌流速 424 cm/h
MeCN洗滌體積 3.0 CV
以743 μmol的規模進行切割和去保護（C & D）。某些有用的切割和去保護過程參數如下所示（上文描述了磷保護基團的切割，例如手性助劑，如PSM（例如，被-C(O)R（例如乙醯基）在胺基基團加帽）、CE等）：
製程步驟 參數 設定點
切割和去保護 反應容器 額定壓力反應器
規模 743 µmol
試劑 冷的濃NH4 OH
試劑體積 200 ± 10 mL/mmol
反應時間 16.0 ± 1.0 h
培養搖床rpm 180 ± 10 rpm
反應溫度 45.0 ± 2.0°C
過濾前冷卻至室溫 ＜ 25°C
初始粗濾裝置 過濾單元
過濾模式 在真空下
支持物洗滌溶劑 WFI
載體洗滌體積 250 - 350 mL/mmol
粗寡核苷酸的UPLC分析表明，脫鹽前粗樣品中全長產物的純度（%FLP）為63.9%。粗產率估計為85 OD單位/umol。FLP淨產率為54 OD/umol（2.01 mg/umol）。粗品儲存條件為2°C-8°C；也可以利用其他合適的存儲條件。藉由LC-MS證實了WV-29878的分子量（理論值6988.8；實測值6987.1）。
實例2.所提供的寡核苷酸和組成物可以有效地敲低MAPT
設計、構建、表徵和評估了各種MAPT寡核苷酸和組成物。如熟悉該項技術者所理解的，可以利用各種技術來評估所提供的寡核苷酸及其組成物的特性和/或活性。本實例中介紹了一些此類技術。熟悉該項技術者理解，根據本揭露可以容易地利用許多其他技術。如本文所證明，MAPT寡核苷酸和組成物尤其在例如降低其靶核酸和由此編碼的蛋白程度方面具有高活性。
在一些實施方式中，在iCell Neuron模型中評估了各種MAPT寡核苷酸。在一組評估中，為了確定MAPT寡核苷酸的活性，使用安捷倫Bravo液體處理平臺將不同濃度的寡核苷酸遞送至鋪板在Matrigel® （康寧，康寧公司，紐約州，美國）包被的384孔板上的iCell神經元群（富士細胞動力公司（FUJIFILM Cellular Dynamics））。接種後24小時，用含有固定濃度寡核苷酸的新鮮培養基替換培養基，並在裸式（自由攝取）條件下將細胞與寡核苷酸一起孵育5天。處理後第5天，切割細胞，並使用QuantiGeneTM Singleplex分支DNA測定（賽默飛世爾公司）定量mRNA。在一些實驗中，使用了不靶向MAPT的對照寡核苷酸（例如，WV-12891，如表1B所示）。
定量人MAPT mRNA，並使用人微管蛋白將程度標準化。將mRNA敲低程度計算為相對於非靶向對照（例如，表1B中所示的WV-12891）的mRNA剩餘百分比（在1uM寡核苷酸處理中），並且IC50值可以藉由寡核苷酸濃度相對於mRNA剩餘百分比的四個參數曲線擬合確定。
表2A顯示了相對於非靶向對照（例如，WV-12891）處理的剩餘mRNA百分比；表2B顯示了IC50值（例如，藉由寡核苷酸濃度相對於剩餘mRNA百分比的四參數曲線擬合確定）。
[表2A].某些寡核苷酸/組成物的活性。 該表顯示了相對於非靶向對照（例如，WV-12891）的剩餘mRNA百分比（在1uM寡核苷酸處理時）。SD：標準差。n：動物數量。
ID 剩餘MAPT百分比（1uM） SD n ID 剩餘MAPT百分比（1uM） SD n ID 剩餘MAPT百分比（1uM） SD n
WV-30673 18.3 2.9 4 WV-31033 29.84 5.26 4 WV-33054 23 4 4
WV-30970 90.85 6.96 4 WV-31034 41.98 0.81 3 WV-33056 17.83 2.17 4
WV-30971 83.35 2.36 4 WV-31035 26.89 2.52 4 WV-33057 9.42 1.81 4
WV-30972 71.83 4.87 4 WV-31036 28.97 1.38 4 WV-33058 11.6 1.5 4
WV-30973 77.41 5.33 4 WV-31037 56.75 6.18 4 WV-33059 5.33 1.12 4
WV-30974 109.55 2.46 4 WV-31038 93.86 3.15 4 WV-33060 6.54 1.19 4
WV-30975 92.25 15.34 4 WV-31039 51.19 0.93 3 WV-33061 4.15 0.4 4
WV-30976 93.11 14.2 4 WV-31040 64.52 12.97 4 WV-33062 4.89 0.04 3
WV-30977 89.31 4.88 4 WV-31041 87.04 7.68 4 WV-33063 18.53 0.31 3
WV-30978 95.91 1.7 3 WV-31042 59.22 1.77 4 WV-33064 12.24 1.3 4
WV-30979 107.72 18.66 4 WV-31043 57.13 2.31 4 WV-33065 6.38 0.53 4
WV-30980 86.12 11.36 4 WV-31044 40.3 1.81 4 WV-33066 7.34 0.66 4
WV-30981 113.03 6.19 4 WV-31045 91.84 2.17 4 WV-33067 61.03 5.05 4
WV-30982 82.32 9.17 4 WV-31046 66.42 0.71 3 WV-33068 10.4 2.46 4
WV-30983 95.54 8.46 4 WV-31048 50.57 13.61 4 WV-33069 26.69 2.91 4
WV-30984 90.35 7.23 4 WV-31049 49.42 5.05 4 WV-33070 8.48 1.08 4
WV-30985 91.71 19.8 4 WV-31050 52.95 2.73 4 WV-33071 4.86 0.37 4
WV-30986 109.4 11.11 4 WV-31051 52.96 2.29 4 WV-33072 7.72 1.2 4
WV-30987 118.49 9.3 4 WV-31052 55.26 0.43 3 WV-33073 3.52 0.33 4
WV-30988 105.79 11.46 4 WV-33008 64.6 3.48 3 WV-33074 5.98 0.73 4
WV-30989 100.67 5.44 4 WV-33009 71.61 1.49 3 WV-33075 37.71 5.09 4
WV-30990 81.49 3.99 4 WV-33011 45.54 6.09 4 WV-33076 83.19 9.84 4
WV-30991 82.77 0.24 3 WV-33012 83.5 11.62 4 WV-33077 12.14 0.66 4
WV-30992 81.88 5.17 3 WV-33013 59.65 7.58 4 WV-33078 42.53 5.68 4
WV-30993 85.28 5.52 4 WV-33014 68.75 9.32 4 WV-33079 68.09 8.54 4
WV-30994 75.57 3.01 3 WV-33015 59.45 16.54 4 WV-33080 34.18 2.68 4
WV-30995 73.55 6.85 4 WV-33016 60.75 3.52 4 WV-33081 26.45 4.3 4
WV-30996 60.96 3.68 4 WV-33017 87.45 7.8 4 WV-33082 17.63 2.2 4
WV-30997 52.84 3.68 4 WV-33018 53.61 10.56 4 WV-33083 89.29 2.7 4
WV-30998 66.44 0.4 3 WV-33019 92.34 14.86 4 WV-33084 41.48 1.32 3
WV-30999 92.51 5.58 3 WV-33020 54.32 20.35 4 WV-33085 34.5 4.27 4
WV-31000 54.77 2.07 3 WV-33021 102.03 12.51 4 WV-33086 30.8 4.38 4
WV-31001 79.84 3.9 4 WV-33022 64.06 6.26 4 WV-33087 14.73 1.12 4
WV-31002 61.37 1.41 3 WV-33023 102.51 3.29 3 WV-33088 18.25 2.37 4
WV-31003 79.16 2.56 3 WV-33024 90.38 9.69 4 WV-33089 12.27 1.16 4
WV-31004 41.93 1.06 3 WV-33025 94.92 3.54 4 WV-33090 20.49 3.7 4
WV-31005 58.25 6.04 4 WV-33026 91.73 5.2 4 WV-37497 39.77 1.80 4
WV-31006 48.35 3.23 4 WV-33027 68.1 4.41 4 WV-37498 7.11 2.33 4
WV-31007 57.71 4.88 4 WV-33028 63.71 6.08 4 WV-37499 12.91 1.96 4
WV-31008 33.63 2.05 4 WV-33029 66.47 4.25 4 WV-37500 9.71 1.70 4
WV-31009 35.21 7.98 4 WV-33030 64.15 8.94 4 WV-37501 8.82 3.11 4
WV-31010 27.09 5.21 4 WV-33031 49.57 2.86 3 WV-37502 11.53 2.74 4
WV-31011 60.96 9.46 4 WV-33032 54.28 0.81 3 WV-37503 9.28 2.78 4
WV-31012 28.89 2.38 4 WV-33033 30 0.42 3 WV-37504 75.28 10.15 4
WV-31013 89.17 0.91 3 WV-33034 30.22 1.59 4 WV-37505 23.69 0.69 3
WV-31014 36.41 3.02 3 WV-33035 44.55 7.68 4 WV-37506 33.27 5.21 4
WV-31015 47.85 10.51 4 WV-33036 72.35 6.24 4 WV-37507 12.05 1.61 4
WV-31016 33.88 7.87 4 WV-33037 17.34 4.72 4 WV-37508 14.43 1.24 4
WV-31017 30.16 0.33 3 WV-33038 40.09 2.95 4 WV-37509 18.90 2.36 4
WV-31018 37.25 3.18 4 WV-33039 23.34 0.17 3 WV-37510 24.24 1.30 3
WV-31019 27.78 1.32 4 WV-33040 33.44 7.46 4 WV-37511 44.05 1.05 3
WV-31020 32.37 1.7 4 WV-33041 9.97 2.03 4 WV-37512 6.64 1.83 4
WV-31021 36.42 4.74 4 WV-33042 16.54 0.22 3 WV-37513 11.26 1.18 4
WV-31022 41.74 1.37 3 WV-33043 26.66 2.71 4 WV-37514 9.79 0.90 4
WV-31023 34.88 1.27 3 WV-33044 30.72 1.06 3 WV-37515 7.59 1.87 4
WV-31024 32.69 3.05 4 WV-33045 15.09 1.35 4 WV-37516 8.27 0.68 4
WV-31025 48.32 1.13 4 WV-33046 15.8 2.53 4 WV-37517 7.86 0.88 4
WV-31026 41.51 4.03 4 WV-33047 11.97 1.85 4 WV-37518 65.92 11.45 4
WV-31027 27.14 0.39 3 WV-33048 42.65 2.07 4 WV-37519 24.38 2.76 4
WV-31028 37.56 2.51 4 WV-33049 10.8 0.47 4 WV-37520 30.54 2.59 4
WV-31029 82.9 4.07 3 WV-33050 3.12 0.2 8 WV-37521 12.04 1.42 4
WV-31030 33.38 0.68 4 WV-33051 71.88 4.25 4 WV-37522 15.46 1.74 4
WV-31031 58.43 1.4 4 WV-33052 16.85 1.85 4 WV-37523 18.44 1.96 4
WV-31032 30.75 8.5 4 WV-33053 31.19 3.99 4 WV-37524 22.38 0.87 3
[表2B]. 某些寡核苷酸/組成物的IC50。 該表顯示了IC50值（例如，藉由寡核苷酸濃度相對於剩餘mRNA百分比的四參數曲線擬合確定）。CI：置信區間。例如，95%置信區間係可以確定95%包含真實值的值範圍。
ID 體外IC50（uM） 95% CI（uM） ID 體外IC50（uM） 95% CI（uM）
WV-26758 0.138 0.119至0.16 WV-36875 0.107 0.076至0.153
WV-26759 0.223 0.163至0.288 WV-36876 0.135 0.101至0.183
WV-29875 0.169 0.137至0.211 WV-36877 0.111 0.086至0.144
WV-29876 0.049 0.031至0.064 WV-37299 2.043 1.245至6.066
WV-29877 0.073 0.042至0.131 WV-37300 0.818 0.52至1.53
WV-29878 0.084 0.068至0.106 WV-37301 0.781 0.565至1.13
WV-29879 0.12 0.09至0.158 WV-37302 0.47 0.354至0.653
WV-29880 0.109 0.085至0.14 WV-37303 0.608 0.484至0.786
WV-29881 0.13 0.094至0.182 WV-37304 0.717 0.491至1.15
WV-29882 0.1 0.091至0.11 WV-37305 0.542 0.375至0.851
WV-29883 0.032 0.022至0.04 WV-37499 0.276 0.206至0.371
WV-29884 0.062 0.031至0.121 WV-37500 0.202 0.136至0.301
WV-29885 0.095 0.058至0.162 WV-37501 0.215 0.141至0.33
WV-29886 0.069 0.051至0.096 WV-37502 0.213 0.165至0.277
WV-29887 0.088 0.055至0.138 WV-37503 0.232 0.192至0.282
WV-29888 0.149 0.113至0.199 WV-37511 1.193 0.192至7.414
WV-30672 0.205 0.143至0.269 WV-37512 0.143 0.104至0.197
WV-30674 0.108 0.14至0.222 WV-37513 0.226 0.146至0.351
WV-32808 0.141 0.086至0.233 WV-37514 0.209 0.162至0.271
WV-32809 0.139 0.103至0.195 WV-37515 0.2 0.159至0.251
WV-32810 0.208 0.16至0.273 WV-37516 0.153 0.129至0.184
WV-32811 0.134 0.111至0.163 WV-37517 0.164 0.125至0.217
WV-32813 0.107 0.085至0.136 WV-38924 0.034 0.021至0.056
WV-32814 0.103 0.079至0.135 WV-38925 0.036 0.024至0.054
WV-32815 0.121 0.09至0.167 WV-38926 0.046 0.028至0.078
WV-32816 0.083 0.065至0.105 WV-38927 0.084 0.054至0.132
WV-32817 0.083 0.066至0.106 WV-38928 0.049 0.036至0.066
WV-32818 0.123 0.083至0.176 WV-38929 0.043 0.034至0.055
WV-32819 0.131 0.097至0.175 WV-38930 0.086 0.071至0.106
WV-32820 0.143 0.124至0.166 WV-38931 0.104 0.078至0.14
WV-32821 0.126 0.104至0.154 WV-40376 0.103 0.087至0.124
WV-32822 0.15 0.114至0.203 WV-40377 0.105 0.092至0.121
WV-32823 0.043 0.032至0.059 WV-40378 0.123 0.096至0.158
WV-32824 0.052 0.043至0.064 WV-40379 0.105 0.082至0.135
WV-32825 0.095 0.072至0.126 WV-40380 0.08 0.067至0.095
WV-32826 0.054 0.043至0.07 WV-40381 0.078 0.058至0.105
WV-32827 0.094 0.075至0.12
實例3.所提供的寡核苷酸和組成物在體內具有活性
除其他事項外，本揭露證明所提供的寡核苷酸和組成物在體內具有活性。在本實例中，動物程序係按照Biomere（伍斯特市，麻塞諸塞州，美國）的IACUC指南進行的。轉基因人類野生型MAPT（hTau）小鼠在無tau的背景上含有完整的人類內含子、外顯子、5’和3’UTR MAPT序列。在3-4個月大的混合性別hTau小鼠中，以所期望的寡核苷酸濃度（包括第1天的100 μg）經由腦室內（ICV）施用用2.5 µL給藥。藉由CO2 窒息對動物進行安樂死，然後用鹽水進行心臟灌注，收集組織樣品並在乾冰中速凍。使用Direct-zol 96 RNA套組（Zymo）提取總RNA。按照製造商的說明，使用高容量cDNA反轉錄套組（賽默飛世爾公司）從RNA樣品中生產cDNA，並在CFX System中使用iQ Multiplex Powermix（伯樂公司）進行qPCR分析（如熟悉該項技術者所理解的，可以使用商業探針，例如MAPT Hs00213484_m1 FAM和Tubb3 Mm00727586_s1 VIC PL（賽默飛世爾公司））。計算mRNA敲低程度為相對於PBS處理的剩餘mRNA百分比（ΔΔCt）。如所證實的，提供的技術可以在約或至少約4、8、12、18或24週內提供降低的MAPT產物程度和/或活性。
結果示於表3A-3B中。表3A顯示了在指定時間點海馬體中的剩餘MAPT百分比。對於每個時間點，將數據標準化為PBS治療組。N = 8隻小鼠/組。表3B顯示了在指定時間點皮層中的剩餘MAPT百分比。對於每個時間點，將數據標準化為PBS治療組。N = 8隻小鼠/組。陰性對照係PBS（磷酸鹽緩衝鹽水）。
[表3A].在指定時間點海馬體中的剩餘MAPT百分比。
PBS：4wk WV-14104：4wk WV-29875：4wk WV-29877：4wk WV-29878：4wk PBS：8wk WV-14104：8wk WV-29875：8wk WV-29877：8wk WV-29878：8wk
平均值 1.00 0.19 0.07 0.11 0.06 1.00 0.19 0.18 0.08 0.09
標準差 0.11 0.10 0.03 0.15 0.02 0.11 0.11 0.17 0.12 0.11
PBS：12wk WV-14104：12wk WV-29875：12wk WV-29877：12wk WV-29878：12wk PBS：18wk WV-14104：18wk WV-29875：18wk WV-29877：18wk WV-29878：18wk
平均值 1.00 0.32 0.17 0.08 0.11 1.00 0.67 0.65 0.40 0.69
標準差 0.14 0.19 0.13 0.04 0.06 0.20 0.21 0.23 0.29 0.29
PBS：24wk WV-14104：24wk WV-29875：24wk WV-29877：24wk WV-29878：24wk
平均值 1.03 0.61 0.66 0.73 0.56
標準差 0.20 0.13 0.15 0.39 0.18
[表3B].在指定時間點皮層中的剩餘MAPT百分比。
PBS：4wk WV-14104：4wk WV-29875：4wk WV-29877：4wk WV-29878：4wk PBS：8wk WV-14104：8wk WV-29875：8wk WV-29877：8wk WV-29878：8wk
平均值 1.00 0.35 0.21 0.27 0.14 1.00 0.29 0.31 0.12 0.26
標準差 0.15 0.19 0.10 0.23 0.04 0.14 0.13 0.20 0.04 0.22
PBS：12wk WV-14104：12wk WV-29875：12wk WV-29877：12wk WV-29878：12wk PBS：18wk WV-14104：18wk WV-29875：18wk WV-29877：18wk WV-29878：18wk
平均值 1.00 0.44 0.36 0.16 0.23 1.00 0.88 0.91 0.56 0.84
標準差 0.26 0.15 0.17 0.08 0.10 0.11 0.30 0.18 0.31 0.28
PBS：24wk WV-14104：24wk WV-29875：24wk WV-29877：24wk WV-29878：24wk
平均值 1.00 0.75 0.74 0.66 0.64
標準差 0.15 0.19 0.10 0.16 0.23
在非人類靈長類動物中也證實了所提供技術的活性。在一些實施方式中，用12mg WV-29878的單一劑量鞘內治療2至4歲的食蟹猴（Cynomolgus monkey）（n = 6）。給藥後11或29天處死動物。在本實例中，動物程序係根據IACUC、美國國家研究委員會和的加拿大動物保健委員會指南下在查理斯河實驗室（塞內維爾，QC加拿大）進行的。解剖腦和脊髓組織的多個區域，並在液氮中速凍。使用RiboPure套組（生命技術公司）提取總RNA。按照製造商的說明，使用Superscript IV VILO Master Mix套組（英傑公司（Invitrogen））從RNA樣品中生產cDNA，並在QuantStudio 7 Flex即時PCR系統中使用Taqman Gene Expression Master Mic（賽默飛世爾公司）進行qPCR分析（如熟悉該項技術者所理解的，可以使用商業探針，例如MAPT Mf00902189_m1 FAM和ARL1 Mf02795431_m1 VIC PL（賽默飛世爾公司））。計算mRNA敲低程度為相對於未處理動物的剩餘mRNA %（ΔΔCt）。
某些結果示於表4中。表4顯示了給藥後第29天在各個腦和脊髓區域中的剩餘MAPT %。對於每個時間點，將數據標準化為未治療組。如所證實的，所提供的技術可以提供例如給藥後約或至少約29天或1個月的活性。
[表4].食蟹猴中給藥後29天的剩餘MAPT %。
對照 海馬體 腦皮層 頸段脊髓 胸段脊髓 腰段脊髓
平均值 100 11.5 7.848 31.08 21.36 5.967
標準差 12.22 0.9978 3.504 16.92 11.8 2.961
雖然本文中已描述且說明各種實施方式，但熟悉該項技術者將容易想到，用於執行本揭露中所描述的功能和/或獲得本揭露中所描述的結果和/或一個或多個優勢的各種其他方法和/或結構、以及此類變化形式和/或修改中的每一者均被視為包括在內。更一般而言，熟悉該項技術者將容易理解，本文所述之所有參數、尺寸、材料和構型意指實例，並且實際參數、尺寸、材料和/或構型將取決於使用本揭露的教導的一個或多個特定應用。熟悉該項技術者將認知到、或不使用過度常規實驗就能夠確定本揭露的實施方式的許多等效實例。因此，應理解，上述實施方式僅藉由實例方式呈現，且在所附申請專利範圍及其等效物的範圍內，可以與具體描述和要求的不同的方式實踐所要求的技術。另外，如果特徵、系統、物品、材料、套組和/或方法不是相互不相容的，則在本揭露的範圍內包括兩個或更多個此類特徵、系統、物品、材料、套組和/或方法的任何組合。
無
無
無
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Claims (146)

  1. 一種寡核苷酸，其中該寡核苷酸的鹼基序列包含與MAPT基因或其轉錄物的鹼基序列相同或互補的鹼基序列的至少15、16、17、18、19、20、21、22、23、24或25個連續鹼基，其中該寡核苷酸包含一個或多個經修飾的糖、一個或多個經修飾的核鹼基、和/或一個或多個經修飾的核苷酸間鍵聯。
  2. 如請求項1所述之寡核苷酸，其中該寡核苷酸的鹼基序列包含與MAPT轉錄物互補的鹼基序列的至少15、16、17、18、19、20、21、22、23、24或25個連續鹼基。
  3. 如請求項1所述之寡核苷酸，其中該寡核苷酸的鹼基序列包含與MAPT mRNA互補的鹼基序列的至少15、16、17、18、19、20、21、22、23、24或25個連續鹼基。
  4. 如請求項1所述之寡核苷酸，其中該寡核苷酸的鹼基序列包含與MAPT RNA的內含子11互補的鹼基序列的至少15、16、17、18、19、20、21、22、23、24或25個連續鹼基。
  5. 如請求項1至4中任一項所述之寡核苷酸，其中該寡核苷酸的鹼基序列包含以下序列的至少10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20個連續鹼基：ACGTTGCAGTGTTCCACUAU、ACTATCCTCCTTCAGCUCCU、AGTGTTCCACTATCCUCCUU、ATCCTCCTTCAGCTCCUGCA、CACGTTGCAGTGTTCCACUA、CACTATCCTCCTTCAGCUCC、CAGTGTTCCACTATCCUCCU、CCACGTTGCAGTGTTCCACU、CCACTATCCTCCTTCAGCUC、CGTTGCAGTGTTCCACUAUC、CTATCCTCCTTCAGCUCCUG、GCAGTGTTCCACTATCCUCC、GTGTTCCACTATCCTCCUUC、GTTCCACTATCCTCCUUCAG、GUGUUCCACTATCCTCCTTC、TATCCTCCTTCAGCTCCUGC、TCCACTATCCTCCTTCAGCU、TGCAGTGTTCCACTAUCCUC、TGTTCCACTATCCTCCUUCA、TTCCACTATCCTCCTUCAGC、或TTGCAGTGTTCCACTAUCCU，其中每個T可以獨立地被U取代，並且反之亦然。
  6. 如前述請求項中任一項所述之寡核苷酸，其中該寡核苷酸包含約20個核鹼基，該核鹼基各自獨立地選自可選地取代的A、T、C、G、U及其互變異構物。
  7. 如前述請求項中任一項所述之寡核苷酸，其中該寡核苷酸包含5’-翼-核心-翼-3’部分，其中該5’-翼和該3’-翼各自獨立地包含兩個或更多個經修飾的糖。
  8. 如請求項7所述之寡核苷酸，其中該5’-翼包含各自獨立地包含2’-OR的兩個或更多個糖，其中R係可選地取代的C1-4 脂肪族。
  9. 如請求項8所述之寡核苷酸，其中該5'-翼包含一個或多個2’-MOE修飾的糖。
  10. 如請求項7-9中任一項所述之寡核苷酸，其中該5'-翼中的每個糖包含2'-修飾的糖。
  11. 如請求項7-10中任一項所述之寡核苷酸，其中該5'-翼中每個糖包含相同的修飾。
  12. 如請求項7-11中任一項所述之寡核苷酸，其中該5'-翼包含4、5、或7個核苷。
  13. 如請求項7-12中任一項所述之寡核苷酸，其中該5'-翼包含一個或多個硫代磷酸酯核苷酸間鍵聯。
  14. 如請求項7-13中任一項所述之寡核苷酸，其中該5'-翼包含一個或多個非負電荷核苷酸間鍵聯。
  15. 如請求項7-14中任一項所述之寡核苷酸，其中該5'-翼包含一個或多個天然磷酸酯鍵聯。
  16. 如請求項7-15中任一項所述之寡核苷酸，其中該3’-翼包含各自獨立地包含2’-OR的兩個或更多個糖，其中R係可選地取代的C1-4 脂肪族。
  17. 如請求項7-16中任一項所述之寡核苷酸，其中該5'-翼的該糖修飾模式與該3'-翼的糖修飾模式不同。
  18. 如請求項7-17中任一項所述之寡核苷酸，其中該3’-翼包含該5’-翼中不存在的糖修飾。
  19. 如請求項7-18中任一項所述之寡核苷酸，其中該3'-翼包含一個或多個2’-OMe修飾的糖。
  20. 如請求項7-19中任一項所述之寡核苷酸，其中該3'-翼中的每個糖包含2'-修飾的糖。
  21. 如請求項7-20中任一項所述之寡核苷酸，其中該3'-翼中每個糖包含相同的修飾。
  22. 如請求項7-21中任一項所述之寡核苷酸，其中該3'-翼包含4、5、或7個核苷。
  23. 如請求項7-22中任一項所述之寡核苷酸，其中該3'-翼包含一個或多個硫代磷酸酯核苷酸間鍵聯。
  24. 如請求項7-23中任一項所述之寡核苷酸，其中該3'-翼包含一個或多個非負電荷核苷酸間鍵聯。
  25. 如請求項7-24中任一項所述之寡核苷酸，其中該3'-翼包含一個或多個天然磷酸酯鍵聯。
  26. 如請求項7-25中任一項所述之寡核苷酸，其中5'-翼中每個硫代磷酸酯核苷酸間鍵聯係Sp。
  27. 如請求項7-26中任一項所述之寡核苷酸，其中3'-翼中每個硫代磷酸酯核苷酸間鍵聯係Sp。
  28. 如請求項7-27中任一項所述之寡核苷酸，其中5'-翼中每個非負電荷的核苷酸間鍵聯係n001。
  29. 如請求項7-28中任一項所述之寡核苷酸，其中3'-翼中每個非負電荷的核苷酸間鍵聯係n001。
  30. 如請求項28-29中任一項所述之寡核苷酸，其中該n001係Rp。
  31. 如請求項7-30中任一項所述之寡核苷酸，其中該核心不包含2’-OR糖修飾，其中R係可選地經取代的C1-4 脂肪族。
  32. 如請求項7-31中任一項所述之寡核苷酸，其中該核心中每個糖係天然DNA糖（包含兩個2’-H）。
  33. 如請求項7-32中任一項所述之寡核苷酸，其中該核心包含約7、8、9、10或11個核苷。
  34. 如請求項7-33中任一項所述之寡核苷酸，其中該核心中鍵合到核苷的每個核苷酸間鍵聯獨立地是硫代磷酸酯核苷酸間鍵聯。
  35. 如前述請求項中任一項所述之寡核苷酸，其中該寡核苷酸的骨架手性中心模式係或包含[(Rp)n(Sp)m]y，其中n、m、和y各自獨立地是1-25。
  36. 如前述請求項中任一項所述之寡核苷酸，其中該寡核苷酸的骨架手性中心模式係或包含(Sp)t[(Rp)n(Sp)m]y，其中t、n、m和y各自獨立地1-25。
  37. 如請求項7-36中任一項所述之寡核苷酸，其中該核心的骨架手性中心模式係或包含[(Rp)n(Sp)m]y，其中n、m、和y各自獨立地是1-25。
  38. 如請求項7-37中任一項所述之寡核苷酸，其中該核心的骨架手性中心模式係或包含(Sp)t[(Rp)n(Sp)m]y，其中t、n、m、和y各自獨立地是1-25。
  39. 如請求項35-38中任一項所述之寡核苷酸，其中至少一個n係1。
  40. 如請求項35-39中任一項所述之寡核苷酸，其中每個n係1。
  41. 如請求項35-40中任一項所述之寡核苷酸，其中每個m獨立地是2-25。
  42. 如請求項35-41中任一項所述之寡核苷酸，其中y係1。
  43. 如請求項35-42中任一項所述之寡核苷酸，其中y係2-5。
  44. 如前述請求項中任一項所述之寡核苷酸，其中該寡核苷酸的鹼基序列與MAPT轉錄物中的鹼基序列約90%-100%互補。
  45. 如前述請求項中任一項所述之寡核苷酸，其中該寡核苷酸的鹼基序列係ACGTTGCAGTGTTCCACUAU、ACTATCCTCCTTCAGCUCCU、AGTGTTCCACTATCCUCCUU、ATCCTCCTTCAGCTCCUGCA、CACGTTGCAGTGTTCCACUA、CACTATCCTCCTTCAGCUCC、CAGTGTTCCACTATCCUCCU、CCACGTTGCAGTGTTCCACU、CCACTATCCTCCTTCAGCUC、CGTTGCAGTGTTCCACUAUC、CTATCCTCCTTCAGCUCCUG、GCAGTGTTCCACTATCCUCC、GTGTTCCACTATCCTCCUUC、GTTCCACTATCCTCCUUCAG、GUGUUCCACTATCCTCCTTC、TATCCTCCTTCAGCTCCUGC、TCCACTATCCTCCTTCAGCU、TGCAGTGTTCCACTAUCCUC、TGTTCCACTATCCTCCUUCA、TTCCACTATCCTCCTUCAGC、或TTGCAGTGTTCCACTAUCCU，其中每個T可以獨立地被U取代，並且反之亦然。
  46. 如前述請求項中任一項所述之寡核苷酸，其中該寡核苷酸的鹼基序列係GTGTTCCACTATCCTCCUUC，其中每個T可以獨立地被U取代，並且反之亦然。
  47. 如前述請求項中任一項所述之寡核苷酸，其中該寡核苷酸的鹼基序列係GTGTTCCACTATCCTCCUUC。
  48. 一種寡核苷酸，其中該寡核苷酸係WV-26758、WV-26759、WV-29875、WV-29876、WV-29877、WV-29878、WV-29879、WV-29880、WV-29881、WV-29882、WV-29883、WV-29884、WV-29885、WV-29886、WV-29887、WV-29888、WV-30672、WV-30673、WV-30674、WV-30970、WV-30971、WV-30972、WV-30973、WV-30974、WV-30975、WV-30976、WV-30977、WV-30978、WV-30979、WV-30980、WV-30981、WV-30982、WV-30983、WV-30984、WV-30985、WV-30986、WV-30987、WV-30988、WV-30989、WV-30990、WV-30991、WV-30992、WV-30993、WV-30994、WV-30995、WV-30996、WV-30997、WV-30998、WV-30999、WV-31000、WV-31001、WV-31002、WV-31003、WV-31004、WV-31005、WV-31006、WV-31007、WV-31008、WV-31009、WV-31010、WV-31011、WV-31012、WV-31013、WV-31014、WV-31015、WV-31016、WV-31017、WV-31018、WV-31019、WV-31020、WV-31021、WV-31022、WV-31023、WV-31024、WV-31025、WV-31026、WV-31027、WV-31028、WV-31029、WV-31030、WV-31031、WV-31032、WV-31033、WV-31034、WV-31035、WV-31036、WV-31037、WV-31038、WV-31039、WV-31040、WV-31041、WV-31042、WV-31043、WV-31044、WV-31045、WV-31046、WV-31048、WV-31049、WV-31050、WV-31051、WV-31052、WV-32808、WV-32809、WV-32810、WV-32811、WV-32812、WV-32813、WV-32814、WV-32815、WV-32816、WV-32817、WV-32818、WV-32819、WV-32820、WV-32821、WV-32822、WV-32823、WV-32824、WV-32825、WV-32826、WV-32827、WV-33008、WV-33009、WV-33010、WV-33011、WV-33012、WV-33013、WV-33014、WV-33015、WV-33016、WV-33017、WV-33018、WV-33019、WV-33020、WV-33021、WV-33022、WV-33023、WV-33024、WV-33025、WV-33026、WV-33027、WV-33028、WV-33029、WV-33030、WV-33031、WV-33032、WV-33033、WV-33034、WV-33035、WV-33036、WV-33037、WV-33038、WV-33039、WV-33040、WV-33041、WV-33042、WV-33043、WV-33044、WV-33045、WV-33046、WV-33047、WV-33048、WV-33049、WV-33050、WV-33051、WV-33052、WV-33053、WV-33054、WV-33055、WV-33056、WV-33057、WV-33058、WV-33059、WV-33060、WV-33061、WV-33062、WV-33063、WV-33064、WV-33065、WV-33066、WV-33067、WV-33068、WV-33069、WV-33070、WV-33071、WV-33072、WV-33073、WV-33074、WV-33075、WV-33076、WV-33077、WV-33078、WV-33079、WV-33080、WV-33081、WV-33082、WV-33083、WV-33084、WV-33085、WV-33086、WV-33087、WV-33088、WV-33089、WV-33090、WV-36875、WV-36876、WV-36877、WV-37299、WV-37300、WV-37301、WV-37302、WV-37303、WV-37304、或WV-37305。
  49. 如請求項48所述之寡核苷酸，其中該寡核苷酸係WV-29883。
  50. 如請求項48所述之寡核苷酸，其中該寡核苷酸係WV-32823。
  51. 如請求項48所述之寡核苷酸，其中該寡核苷酸係WV-29876。
  52. 如請求項48所述之寡核苷酸，其中該寡核苷酸係WV-32824。
  53. 如請求項48所述之寡核苷酸，其中該寡核苷酸係WV-32826。
  54. 如請求項48所述之寡核苷酸，其中該寡核苷酸係WV-29884。
  55. 如請求項48所述之寡核苷酸，其中該寡核苷酸係WV-29886。
  56. 如請求項48所述之寡核苷酸，其中該寡核苷酸係WV-29877。
  57. 如請求項48所述之寡核苷酸，其中該寡核苷酸係WV-32816。
  58. 如請求項48所述之寡核苷酸，其中該寡核苷酸係WV-32817。
  59. 如請求項48所述之寡核苷酸，其中該寡核苷酸係WV-29878。
  60. 如請求項48所述之寡核苷酸，其中該寡核苷酸係WV-29887。
  61. 如請求項48所述之寡核苷酸，其中該寡核苷酸係WV-32827。
  62. 如請求項48所述之寡核苷酸，其中該寡核苷酸係WV-32825。
  63. 如請求項48所述之寡核苷酸，其中該寡核苷酸係WV-29885。
  64. 如請求項48所述之寡核苷酸，其中該寡核苷酸係WV-29882。
  65. 如請求項48-64中任一項所述之寡核苷酸，其中該寡核苷酸呈鹽形式。
  66. 如請求項48-64中任一項所述之寡核苷酸，其中該寡核苷酸呈藥學上可接受的鹽形式。
  67. 如請求項66所述之寡核苷酸，其中該寡核苷酸呈鈉鹽形式。
  68. 如前述請求項中任一項所述之寡核苷酸，其中該寡核苷酸具有約60%-100%的非鏡像異構物純度。
  69. 如前述請求項中任一項所述之寡核苷酸，其中該寡核苷酸具有至少約60%的非鏡像異構物純度。
  70. 如前述請求項中任一項所述之寡核苷酸，其中在施用至包含MAPT轉錄物的系統時，該寡核苷酸能夠降低該MAPT轉錄物的程度、表現和/或活性。
  71. 一種藥物組成物，該藥物組成物遞送或包含如請求項1-70中任一項所述之寡核苷酸和藥學上可接受的載體。
  72. 如請求項71所述之組成物，該組成物遞送或包含該寡核苷酸的藥學上可接受的鹽。
  73. 如請求項71或72所述之組成物，其中該組成物包含該寡核苷酸的兩種或更多種形式。
  74. 如請求項71-73中任一項所述之組成物，其中該組成物係包含該寡核苷酸的一種或多種溶解的藥學上可接受的鹽形式的水性組成物。
  75. 一種包含多個寡核苷酸的寡核苷酸組成物，其中該多個寡核苷酸中的寡核苷酸共用： 1) 共同的鹼基序列，和 2) 獨立地在一個或多個（例如，約1-50、1-40、1-30、1-25、1-20、1-15、1-10、5-50、5-40、5-30、5-25、5-20、5-15、5-10、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、或25或更多個）手性核苷酸間鍵聯處相同的鍵聯磷立體化學（「手性受控的核苷酸間鍵聯」）； 其中多個寡核苷酸中的寡核苷酸各自獨立地靶向MAPT。
  76. 一種包含多個寡核苷酸的寡核苷酸組成物，其中該多個寡核苷酸中的寡核苷酸共用： 1) 共同的鹼基序列，和 2) 獨立地在一個或多個（例如，約1-50、1-40、1-30、1-25、1-20、1-15、1-10、5-50、5-40、5-30、5-25、5-20、5-15、5-10、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、或25或更多個）手性核苷酸間鍵聯處相同的鍵聯磷立體化學（「手性受控的核苷酸間鍵聯」）； 其中該組成物相對於共用該共同的鹼基序列的寡核苷酸的實質上外消旋製劑，富集該多個寡核苷酸中的寡核苷酸。
  77. 一種包含特定寡核苷酸類型的寡核苷酸的組成物，該寡核苷酸的特徵在於： a) 共同的鹼基序列； b) 共同的骨架鍵聯模式； c) 共同的骨架手性中心模式； 其中該多個寡核苷酸中的寡核苷酸包含至少一個核苷酸間鍵聯，該核苷酸間鍵聯包含Sp構型的共同鍵聯磷； 其中該組成物相對於具有相同共同的鹼基序列的寡核苷酸的實質上外消旋製劑，富集該特定寡核苷酸類型的寡核苷酸；並且 其中多個寡核苷酸中的寡核苷酸各自獨立地靶向MAPT。
  78. 如請求項75或76所述之組成物，其中在施用至包含MAPT轉錄物的系統時，該寡核苷酸能夠降低該MAPT轉錄物的程度、表現和/或活性。
  79. 如請求項75-78中任一項所述之組成物，其中該寡核苷酸與MAPT轉錄物中的位點雜交。
  80. 如請求項75-79中任一項所述之組成物，其中該寡核苷酸包含第一翼、核心、和第二翼。
  81. 如請求項75-80中任一項所述之組成物，其中該第一翼的糖修飾模式與該第二翼的糖修飾模式不同。
  82. 如請求項75-81中任一項所述之組成物，其中該核心的核苷單元不包含糖修飾。
  83. 如請求項75-82中任一項所述之組成物，其中該寡核苷酸靶向MAPT內含子11。
  84. 如請求項75-82中任一項所述之組成物，其中該寡核苷酸靶向MAPT內含子11並且該寡核苷酸具有包含以下鹼基序列的至少10個連續鹼基的鹼基序列：ACGTTGCAGTGTTCCACUAU、ACTATCCTCCTTCAGCUCCU、AGTGTTCCACTATCCUCCUU、ATCCTCCTTCAGCTCCUGCA、CACGTTGCAGTGTTCCACUA、CACTATCCTCCTTCAGCUCC、CAGTGTTCCACTATCCUCCU、CCACGTTGCAGTGTTCCACU、CCACTATCCTCCTTCAGCUC、CGTTGCAGTGTTCCACUAUC、CTATCCTCCTTCAGCUCCUG、GCAGTGTTCCACTATCCUCC、GTGTTCCACTATCCTCCUUC、GTTCCACTATCCTCCUUCAG、GUGUUCCACTATCCTCCTTC、TATCCTCCTTCAGCTCCUGC、TCCACTATCCTCCTTCAGCU、TGCAGTGTTCCACTAUCCUC、TGTTCCACTATCCTCCUUCA、TTCCACTATCCTCCTUCAGC、或TTGCAGTGTTCCACTAUCCU，其中每個T可以獨立地被U取代，並且反之亦然。
  85. 一種包含多個寡核苷酸的寡核苷酸組成物，其中該多個寡核苷酸中的寡核苷酸共用： 1) 共同的鹼基序列，和 2) 獨立地在一個或多個（例如，約1-50、1-40、1-30、1-25、1-20、1-15、1-10、5-50、5-40、5-30、5-25、5-20、5-15、5-10、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、或25或更多個）手性核苷酸間鍵聯處相同的鍵聯磷立體化學（「手性受控的核苷酸間鍵聯」）； 其中該多個寡核苷酸中的寡核苷酸各自獨立地是如請求項1-67中任一項所述之寡核苷酸。
  86. 一種包含特定寡核苷酸類型的寡核苷酸的組成物，該寡核苷酸的特徵在於： a) 共同的鹼基序列； b) 共同的骨架鍵聯模式； c) 共同的骨架手性中心模式； 其中該多個寡核苷酸中的寡核苷酸包含至少一個核苷酸間鍵聯，該核苷酸間鍵聯包含Sp構型的共同鍵聯磷； 其中該組成物相對於具有相同共同的鹼基序列的寡核苷酸的實質上外消旋製劑，富集該特定寡核苷酸類型的寡核苷酸；並且 其中該多個寡核苷酸中的寡核苷酸各自獨立地是如請求項1-67中任一項所述之寡核苷酸。
  87. 如請求項75-86中任一項所述之組成物，其中該多個寡核苷酸中的寡核苷酸獨立地在5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24或25或更多個核苷酸間鍵聯處共用相同的鍵聯磷立體化學。
  88. 如請求項75或76所述之組成物，其中該多個寡核苷酸中的寡核苷酸係具有相同構造的寡核苷酸，可選地呈一種或多種鹽形式。
  89. 如請求項75-88中任一項所述之組成物，其中該多個寡核苷酸中的寡核苷酸各自獨立地具有相同的寡核苷酸或其藥學上可接受的鹽。
  90. 如請求項75-89中任一項所述之組成物，其中該多個寡核苷酸中的寡核苷酸各自獨立地具有相同的寡核苷酸或其藥學上可接受的鹽。
  91. 如請求項75-90中任一項所述之組成物，其中該多個寡核苷酸中的寡核苷酸係相同酸形式寡核苷酸的一種或多種藥學上可接受的鹽。
  92. 如請求項75-91中任一項所述之組成物，其中該多個寡核苷酸中的寡核苷酸具有相同的結構。
  93. 如請求項75-92中任一項所述之組成物，其中該多個寡核苷酸中的寡核苷酸係鈉鹽。
  94. 如請求項75-93中任一項所述之組成物，其中該多個寡核苷酸中的寡核苷酸獨立地在每個硫代磷酸酯核苷酸間鍵聯處共用相同的鍵聯磷立體化學。
  95. 如請求項75-93中任一項所述之組成物，其中該多個寡核苷酸中的寡核苷酸獨立地在每個手性鍵聯磷處共用相同的鍵聯磷立體化學。
  96. 如請求項75-86中任一項所述之組成物，其中該多個寡核苷酸中的寡核苷酸各自獨立地是如請求項48所述之寡核苷酸，可選地呈藥學上可接受的鹽形式。
  97. 如請求項75-86中任一項所述之組成物，其中該多個寡核苷酸中的寡核苷酸各自獨立地是如請求項49所述之寡核苷酸，可選地呈藥學上可接受的鹽形式。
  98. 如請求項75-86中任一項所述之組成物，其中該多個寡核苷酸中的寡核苷酸各自獨立地是如請求項50所述之寡核苷酸，可選地呈藥學上可接受的鹽形式。
  99. 如請求項75-86中任一項所述之組成物，其中該多個寡核苷酸中的寡核苷酸各自獨立地是如請求項51所述之寡核苷酸，可選地呈藥學上可接受的鹽形式。
  100. 如請求項75-86中任一項所述之組成物，其中該多個寡核苷酸中的寡核苷酸各自獨立地是如請求項52所述之寡核苷酸，可選地呈藥學上可接受的鹽形式。
  101. 如請求項75-86中任一項所述之組成物，其中該多個寡核苷酸中的寡核苷酸各自獨立地是如請求項53所述之寡核苷酸，可選地呈藥學上可接受的鹽形式。
  102. 如請求項75-86中任一項所述之組成物，其中該多個寡核苷酸中的寡核苷酸各自獨立地是如請求項54所述之寡核苷酸，可選地呈藥學上可接受的鹽形式。
  103. 如請求項75-86中任一項所述之組成物，其中該多個寡核苷酸中的寡核苷酸各自獨立地是如請求項55所述之寡核苷酸，可選地呈藥學上可接受的鹽形式。
  104. 如請求項75-86中任一項所述之組成物，其中該多個寡核苷酸中的寡核苷酸各自獨立地是如請求項56所述之寡核苷酸，可選地呈藥學上可接受的鹽形式。
  105. 如請求項75-86中任一項所述之組成物，其中該多個寡核苷酸中的寡核苷酸各自獨立地是如請求項57所述之寡核苷酸，可選地呈藥學上可接受的鹽形式。
  106. 如請求項75-86中任一項所述之組成物，其中該多個寡核苷酸中的寡核苷酸各自獨立地是如請求項58所述之寡核苷酸，可選地呈藥學上可接受的鹽形式。
  107. 如請求項75-86中任一項所述之組成物，其中該多個寡核苷酸中的寡核苷酸各自獨立地是如請求項59所述之寡核苷酸，可選地呈藥學上可接受的鹽形式。
  108. 如請求項75-86中任一項所述之組成物，其中該多個寡核苷酸中的寡核苷酸各自獨立地是如請求項60所述之寡核苷酸，可選地呈藥學上可接受的鹽形式。
  109. 如請求項75-86中任一項所述之組成物，其中該多個寡核苷酸中的寡核苷酸各自獨立地是如請求項61所述之寡核苷酸，可選地呈藥學上可接受的鹽形式。
  110. 如請求項75-86中任一項所述之組成物，其中該多個寡核苷酸中的寡核苷酸各自獨立地是如請求項62所述之寡核苷酸，可選地呈藥學上可接受的鹽形式。
  111. 如請求項75-86中任一項所述之組成物，其中該多個寡核苷酸中的寡核苷酸各自獨立地是如請求項63所述之寡核苷酸，可選地呈藥學上可接受的鹽形式。
  112. 如請求項75-86中任一項所述之組成物，其中該多個寡核苷酸中的寡核苷酸各自獨立地是如請求項64所述之寡核苷酸，可選地呈藥學上可接受的鹽形式。
  113. 如請求項75-112中任一項所述之組成物，其中該組成物中的共用共同的鹼基序列的非隨機程度的所有寡核苷酸係該多個寡核苷酸中的寡核苷酸。
  114. 如請求項75-113中任一項所述之組成物，其中該組成物中的共用相同構造的非隨機程度的所有寡核苷酸係該多個寡核苷酸中的寡核苷酸。
  115. 如請求項113或114所述之組成物，其中該非隨機程度係約40%-100%，或約40%、50%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%或95%。
  116. 一種藥物組成物，該藥物組成物包含或遞送本揭露的寡核苷酸或如請求項75-115中任一項所述之組成物和藥學上可接受的載體。
  117. 一種用於製備如請求項1-116中任一項所述之寡核苷酸或組成物之方法，該方法包括使用手性助劑。
  118. 如請求項117所述之方法，該方法包括使用包含手性助劑部分的亞磷醯胺。
  119. 如請求項117或118所述之方法，其中手性助劑係DPSE。
  120. 如請求項117-119中任一項所述之方法，其中手性助劑係PSM。
  121. 如請求項117-120中任一項所述之方法，其中其鍵聯磷與氮鍵合的每個手性受控的核苷酸間鍵聯係使用PSM獨立地製備的。
  122. 如請求項117-121中任一項所述之方法，其中每個手性受控的n001係使用PSM獨立地製備的。
  123. 如請求項117-122中任一項所述之方法，其中每個手性受控的硫代磷酸酯核苷酸間鍵聯係使用DPSE獨立地製備的。
  124. 如請求項117-118中任一項所述之方法，其中每個手性受控的核苷酸間鍵聯係使用PSM獨立地製備的。
  125. 一種用於降低tau蛋白的程度、功能和/或活性之方法，該方法包括使該蛋白與如請求項1-116中任一項所述之寡核苷酸或組成物接觸。
  126. 一種用於降低tau細胞內聚集之方法，該方法包括使該蛋白與如請求項1-116中任一項所述之寡核苷酸或組成物接觸。
  127. 一種用於降低tau擴散之方法，該方法包括使該蛋白與如請求項1-116中任一項所述之寡核苷酸或組成物接觸。
  128. 一種用於降低tau細胞內聚集和擴散之方法，該方法包括使該蛋白與如請求項1-116中任一項所述之寡核苷酸或組成物接觸。
  129. 一種用於降低系統中tau蛋白的程度、功能和/或活性之方法，該方法包括向該系統施用有效量的如請求項1-116中任一項所述之寡核苷酸或組成物。
  130. 一種用於降低系統中tau細胞內聚集之方法，該方法包括向該系統施用有效量的如請求項1-116中任一項所述之寡核苷酸或組成物。
  131. 一種用於降低系統中tau擴散之方法，該方法包括向該系統施用有效量的如請求項1-116中任一項所述之寡核苷酸或組成物。
  132. 一種用於降低系統中tau細胞內聚集和擴散之方法，該方法包括向該系統施用有效量的如請求項1-116中任一項所述之寡核苷酸或組成物。
  133. 如請求項129-132中任一項所述之方法，其中系統係人類。
  134. 一種用於在患有或易患MAPT相關的病症、障礙或疾病或其症狀的受試者中治療或預防MAPT相關的病症、障礙或疾病或其症狀之方法，該方法包括向該受試者施用治療有效量的如請求項1-116中任一項所述之寡核苷酸或組成物。
  135. 一種用於在患有或易患神經退行性疾病的受試者中治療或預防神經退行性疾病之方法，該方法包括向該受試者施用治療有效量的如請求項1-116中任一項所述之寡核苷酸或組成物。
  136. 一種用於在患有或易患tau蛋白病的受試者中治療或預防tau蛋白病之方法，該方法包括向該受試者施用治療有效量的如請求項1-116中任一項所述之寡核苷酸或組成物。
  137. 如請求項134-136中任一項所述之方法，其中該病症、障礙或疾病係阿茲海默氏症（AD）。
  138. 如請求項134-136中任一項所述之方法，其中該病症、障礙或疾病係額顳葉失智（FTD）。
  139. 如請求項134-136中任一項所述之方法，其中該病症、障礙或疾病係行為變異型FTD（bvFTD）。
  140. 如請求項134-136中任一項所述之方法，其中該病症、障礙或疾病係非流利變異型原發性進行性失語（nfvPPA）。
  141. 如請求項134-136中任一項所述之方法，其中該病症、障礙或疾病係皮質基底節變性（CBD）。
  142. 如請求項134-136中任一項所述之方法，其中該病症、障礙或疾病係進行性核上性麻痹（PSP）。
  143. 如請求項134-136中任一項所述之方法，其中該病症、障礙或疾病係癲癇。
  144. 如請求項134-136中任一項所述之方法，其中該病症、障礙或疾病係Dravet綜合症。
  145. 如請求項134-136中任一項所述之方法，其中該病症、障礙或疾病係慢性創傷性腦病變（CTE）。
  146. 寡核苷酸、組成物及方法，其在說明書或實施方式1-145中描述。
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