TW201841661A - 包含類鐸受體(toll-like receptor)促效劑之抗體結合物及組合療法 - Google Patents

包含類鐸受體(toll-like receptor)促效劑之抗體結合物及組合療法 Download PDF

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伯納德 修伯特 吉爾斯坦格
羅迪哥 安迪斯 海斯
提摩西 Z 霍夫曼
莎拉加 卡西巴拉
宇野哲郎
興 王
湯姆 姚-興 吳
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Abstract

本發明提供包含類鐸受體促效劑之抗體結合物及該等結合物用於治療癌症之用途。在一些實施例中,該等結合物包含抗HER2抗體。在一些實施例中,該等結合物與第二治療劑組合使用。

Description

包含類鐸受體(toll-like receptor)促效劑之抗體結合物及組合療法
本發明提供視情況與第二治療劑組合的包含類鐸受體(toll-like receptor)促效劑之抗體結合物用於治療癌症的用途。
先天性免疫為對抗環境損害,包括(但不限於)病原體,諸如細菌或病毒之快速非特異性免疫反應。應變性免疫為較慢但較具特異性之免疫反應,其賦予主體持久性或保護性免疫且涉及在CD4+ T輔助細胞及/或CD8+細胞毒性T細胞中進行初始T淋巴細胞之分化及活化,以促成細胞及體液免疫。先天性免疫系統之抗原呈現細胞,諸如樹突狀細胞或巨噬細胞,充當先天性免疫系統與應變性免疫系統之間的關鍵連接,該等細胞藉由吞噬且加工外來抗原且在細胞表面上將其呈現於T細胞,由此活化T細胞反應。 類鐸受體(TLR)為主要表現於樹突狀細胞、巨噬細胞、單核細胞、自然殺手細胞及T淋巴細胞上之模式識別受體(PRR)。TLR結合至來自細菌、真菌、原生動物及病毒之病原體相關分子模式(PAMPS)且充當對抗入侵病原體之第一道防線。TLR活化引起樹突狀細胞之抗原攝取、成熟及T細胞刺激能力提高。TLR包含細胞外N端富白胺酸重複(LRR)域,之後為富半胱胺酸區、跨膜域及細胞內(細胞質)尾,其含有稱為鐸/IL-1受體(TIR)域之保守區。LRR域對於配位體結合及相關信號傳遞至關重要且為PRR之常見特徵。TIR域在蛋白質-蛋白質相互作用方面至關重要且與先天性免疫相關。TLR對於誘導與發炎反應有關之基因表現必不可少且在產生抗原特異性後天性免疫方面起關鍵作用。 仍需要用於治療疾病,尤其癌症之新型免疫療法。
本發明提供包含類鐸受體促效劑之抗體結合物、其醫藥學上可接受之鹽、其醫藥組合物及其組合,其適用於治療疾病,尤其癌症。本發明進一步提供治療、預防或改善癌症之方法,其包含向有需要之個體投與有效量的本發明之抗體結合物,該抗體結合物視情況與第二治療劑組合。在一些實施例中,第二治療劑係選自化學療法、靶向抗癌療法、溶瘤藥物、細胞毒性劑、免疫類療法、細胞介素、共抑制分子之抑制劑、共刺激分子之活化劑、減少細胞介素釋放症候群(CRS)之藥劑、疫苗或細胞療法。本發明亦提供包含TLR7促效劑及連接子之化合物,其適用於結合至抗HER2抗體且由此形成本發明之免疫刺激結合物。本文中描述本發明之各種實施例。 在一個態樣中,本文提供在有需要之個體中治療癌症(例如HER2陽性癌症)之方法,該方法包含向個體投與治療有效量之與第二治療劑組合的結合物或其醫藥學上可接受之鹽,其中: (i)結合物包含具有式(I)結構之化合物,其為TLR7促效劑,附接至抗體分子,例如抗體或其抗原結合片段:式(I) 其中: RD且RE 為H;或RE且RD 為H; R1 為-NHR2 或-NHCHR2 R3 ; R2 為-C3 -C6 烷基或-C4 -C6 烷基; R3 為L1 OH; L1 為-(CH2 )m -; L2 為-(CH2 )n -、-((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-(CH2 )n X1 (CH2 )n -、-(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -、-(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n C(=O)NH(CH2 )n -、-((CH2 )n O)t (CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n 、-C(=O)(CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n X1 (CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n C(=O)NH(CH2 )n -、-C(=O)NH((CH2 )n O)t (CH2 )n X1 (CH2 )n -、-C(=O)X2 X3 C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-C(=O)X2 X3 C(=O)(CH2 )n -、-C(=O)X2 C(=O)(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -、-C(=O)X2 C(=O)(CH2 )n NHC(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-C(=O)(CH2 )n C(R7 )2 -、-C(=O)(CH2 )n C(R7 )2 SS(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -、-(CH2 )n X2 C(=O)(CH2 )n NHC(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -或-C(=O)(CH2 )n C(=O)NH(CH2 )n ; R4、-ONH2 、-NH2、-N3、-NHC(=O)CH=CH2 、-SH、-SR7 、-OH、-SSR6 、-S(=O)2 (CH=CH2 )、-(CH2 )2 S(=O)2 (CH=CH2 )、-NHS(=O)2 (CH=CH2 )、-NHC(=O)CH2 Br、-NHC(=O)CH2 I、-C(O)NHNH2、-CO2 H、-C(O)NHNH2 ; R5; X1; X2; X3 ; R6 為2-吡啶基或4-吡啶基; 各R7 獨立地選自H及C1 -C6 烷基; 各R8 獨立地選自H、C1 -C6 烷基、F、Cl及-OH; 各R9 獨立地選自H、C1 -C6 烷基、F、Cl、-NH2 、-OCH3 、-OCH2 CH3 、-N(CH3 )2 、-CN、-NO2 及-OH; 各R10 獨立地選自H、C1 - 6 烷基、氟基、經-C(=O)OH取代之苯甲氧基、經-C(=O)OH取代之苯甲基、經-C(=O)OH取代之C1 - 4 烷氧基及經-C(=O)OH取代之C1 - 4 烷基; 各m獨立地選自1、2、3及4; 各n獨立地選自1、2、3及4; 及 各t獨立地選自1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17及18;及 (ii)第二治療劑係選自共抑制分子之抑制劑、共刺激分子之活化劑、細胞介素、減少細胞介素釋放症候群(CRS)之藥劑、化學療法、靶向抗癌療法、溶瘤藥物、細胞毒性劑、免疫類療法、疫苗或細胞療法。在一些實施例中,第二藥劑係選自共抑制分子之抑制劑、共刺激分子之活化劑、細胞介素或減少細胞介素釋放症候群(CRS)之藥劑。 在一個實施例中,抗體分子,例如抗體或其抗原結合片段特異性結合至人類HER2。 在一個態樣中,本文揭示在有需要之個體中治療癌症(例如HER2陽性癌症)之方法,該方法包含向個體投與治療有效量之與第二治療劑組合的結合物或其醫藥學上可接受之鹽,其中: (i)結合物包含具有式(I)結構之化合物,其為TLR7促效劑,附接至抗體分子,例如抗體或其抗原結合片段:式(I) 其中: RD且RE 為H;或RE且RD 為H; R1 為-NHR2 或-NHCHR2 R3 ; R2 為-C3 -C6 烷基或-C4 -C6 烷基; R3 為L1 OH; L1 為-(CH2 )m -; L2 為-(CH2 )n -、-((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-(CH2 )n X1 (CH2 )n -、-(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -、-(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n C(=O)NH(CH2 )n -、-((CH2 )n O)t (CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n 、-C(=O)(CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n X1 (CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n C(=O)NH(CH2 )n -、-C(=O)NH((CH2 )n O)t (CH2 )n X1 (CH2 )n -、-C(=O)X2 X3 C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-C(=O)X2 C(=O)(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -或-C(=O)(CH2 )n C(=O)NH(CH2 )n ; R4、-ONH2 、-NH2、-N3、-NHC(=O)CH=CH2 、SH、-SSR6 、-S(=O)2 (CH=CH2 )、-(CH2 )2 S(=O)2 (CH=CH2 )、-NHS(=O)2 (CH=CH2 )、-NHC(=O)CH2 Br、-NHC(=O)CH2 I、-C(O)NHNH2、-CO2 H、-C(O)NHNH2 ; R5; X1; X2; X3; R6 為2-吡啶基或4-吡啶基; 各R7 獨立地選自H及C1 -C6 烷基; 各R8 獨立地選自H、C1 -C6 烷基、F、Cl及-OH; 各R9 獨立地選自H、C1 -C6 烷基、F、Cl、-NH2 、-OCH3 、-OCH2 CH3 、-N(CH3 )2 、-CN、-NO2 及-OH; 各R10 獨立地選自H、C1 - 6 烷基、氟基、經-C(=O)OH取代之苯甲氧基、經-C(=O)OH取代之苯甲基、經-C(=O)OH取代之C1 - 4 烷氧基及經-C(=O)OH取代之C1 - 4 烷基; 各m獨立地選自1、2、3及4; 各n獨立地選自1、2、3及4; 及 各t獨立地選自1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17及18;及 (ii)第二治療劑係選自共抑制分子之抑制劑、共刺激分子之活化劑、細胞介素、減少細胞介素釋放症候群(CRS)之藥劑、化學療法、靶向抗癌療法、溶瘤藥物、細胞毒性劑、免疫類療法、疫苗或細胞療法。在一些實施例中,第二藥劑為共抑制分子之抑制劑、共刺激分子之活化劑、細胞介素或減少細胞介素釋放症候群(CRS)之藥劑。 在一個實施例中,抗體分子,例如抗體或其抗原結合片段特異性結合至人類HER2。 在一個態樣中,本文揭示一種在有需要之個體中治療癌症(例如HER2陽性癌症)之方法,該方法包含向個體投與治療有效量之與第二治療劑組合的結合物或其醫藥學上可接受之鹽,其中: (i)結合物包含具有式(Ia)或式(Ib)結構之式(I)化合物,其附接至抗體分子,例如抗體或其抗原結合片段:式(Ia) 式(Ib) 其中: R1 為-NHR2 或-NHCHR2 R3 ; R2 為-C3 -C6 烷基或-C4 -C6 烷基; R3 為L1 OH; L1 為-(CH2 )m -; L2 為-(CH2 )n -、-((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-(CH2 )n X1 (CH2 )n -、-(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -、-(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n C(=O)NH(CH2 )n -、-((CH2 )n O)t (CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n 、-C(=O)(CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n X1 (CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n C(=O)NH(CH2 )n -、-C(=O)NH((CH2 )n O)t (CH2 )n X1 (CH2 )n -、-C(=O)X2 X3 C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-C(=O)X2 X3 C(=O)(CH2 )n -、-C(=O)X2 C(=O)(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -、-C(=O)X2 C(=O)(CH2 )n NHC(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-C(=O)(CH2 )n C(R7 )2 -、-C(=O)(CH2 )n C(R7 )2 SS(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -、-(CH2 )n X2 C(=O)(CH2 )n NHC(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -或-C(=O)(CH2 )n C(=O)NH(CH2 )n ; R4、-ONH2 、-NH2、-NHC(=O)CH=CH2 、-N3、SH、-SR7 、-OH、-SSR6 、-S(=O)2 (CH=CH2 )、-(CH2 )2 S(=O)2 (CH=CH2 )、-NHS(=O)2 (CH=CH2 )、-NHC(=O)CH2 Br、-NHC(=O)CH2 I、-C(O)NHNH2-CO2 H; R5;X1; X2; X3 ; R6 為2-吡啶基或4-吡啶基; 各R7 獨立地選自H及C1 -C6 烷基; 各m獨立地選自1、2、3及4; 各n獨立地選自1、2、3及4; 及 各t獨立地選自1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17及18;及 (ii)第二治療劑係選自共抑制分子之抑制劑、共刺激分子之活化劑、細胞介素、減少細胞介素釋放症候群(CRS)之藥劑、化學療法、靶向抗癌療法、溶瘤藥物、細胞毒性劑、免疫類療法、疫苗或細胞療法。在一些實施例中,第二藥劑為共抑制分子之抑制劑、共刺激分子之活化劑、細胞介素或減少細胞介素釋放症候群(CRS)之藥劑。 在一個實施例中,抗體分子,例如抗體或其抗原結合片段特異性結合至人類HER2。 在一個態樣中,本文揭示一種在有需要之個體中治療癌症(例如HER2陽性癌症)之方法,該方法包含向個體投與治療有效量之與第二治療劑組合的結合物或其醫藥學上可接受之鹽,其中: (i)結合物包含具有式(Ia)或式(Ib)結構之式(I)化合物,其附接至抗體分子,例如抗體或其抗原結合片段:式(Ia) 式(Ib) 其中: R1 為-NHR2 或-NHCHR2 R3 ; R2 為-C3 -C6 烷基或-C4 -C6 烷基; R3 為L1 OH; L1 為-(CH2 )m -; L2 為-(CH2 )n -、-((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-(CH2 )n X1 (CH2 )n -、-(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -、-(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n C(=O)NH(CH2 )n -、-((CH2 )n O)t (CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n 、-C(=O)(CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n X1 (CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n C(=O)NH(CH2 )n -、-C(=O)NH((CH2 )n O)t (CH2 )n X1 (CH2 )n -、-C(=O)X2 X3 C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-C(=O)X2 C(=O)(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -或-C(=O)(CH2 )n C(=O)NH(CH2 )n ; R4、-ONH2 、-NH2、-NHC(=O)CH=CH2 、-N3、SH、-SSR6 、-S(=O)2 (CH=CH2 )、-(CH2 )2 S(=O)2 (CH=CH2 )、-NHS(=O)2 (CH=CH2 )、-NHC(=O)CH2 Br、-NHC(=O)CH2 I、-C(O)NHNH2-CO2 H; R5;X1; X2; X3; R6 為2-吡啶基或4-吡啶基; 各R7 獨立地選自H及C1 -C6 烷基; 各m獨立地選自1、2、3及4; 各n獨立地選自1、2、3及4; 及 各t獨立地選自1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17及18; (ii)第二治療劑係選自共抑制分子之抑制劑、共刺激分子之活化劑、細胞介素、減少細胞介素釋放症候群(CRS)之藥劑、化學療法、靶向抗癌療法、溶瘤藥物、細胞毒性劑、免疫類療法、疫苗或細胞療法。在一些實施例中,第二藥劑為共抑制分子之抑制劑、共刺激分子之活化劑、細胞介素或減少細胞介素釋放症候群(CRS)之藥劑。 在一個實施例中,抗體分子,例如抗體或其抗原結合片段特異性結合至人類HER2。 在一個態樣中,本文揭示一種在有需要之個體中治療HER2陽性癌症之方法,該方法包含向個體投與治療有效量之與第二治療劑組合的結合物或其醫藥學上可接受之鹽,其中: (i)結合物包含式(II)結構:式(II) 其中: R50,其中*指示與Ab之連接點; Ab為特異性結合至人類HER2之抗體分子,例如抗體或其抗原結合片段; R1 為-NHR2 或-NHCHR2 R3 ; R2 為-C3 -C6 烷基或-C4 -C6 烷基; R3 為L1 OH; L1 為-(CH2 )m -; L2 為-(CH2 )n -、-((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-(CH2 )n X1 (CH2 )n -、-(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -、-(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n C(=O)NH(CH2 )n -、-((CH2 )n O)t (CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n 、-C(=O)(CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n X1 (CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n C(=O)NH(CH2 )n -、-C(=O)NH((CH2 )n O)t (CH2 )n X1 (CH2 )n -、-C(=O)X2 X3 C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-C(=O)X2 X3 C(=O)(CH2 )n -、-C(=O)X2 C(=O)(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -、-C(=O)X2 C(=O)(CH2 )n NHC(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-C(=O)(CH2 )n C(R7 )2 -、-C(=O)(CH2 )n C(R7 )2 SS(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -、-(CH2 )n X2 C(=O)(CH2 )n NHC(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -或-C(=O)(CH2 )n C(=O)NH(CH2 )n ; R40、-S-、-NHC(=O)CH2 -、-S(=O)2 CH2 CH2 -、-(CH2 )2 S(=O)2 CH2 CH2 -、-NHS(=O)2 CH2 CH2 、-NHC(=O)CH2 CH2 -、-CH2 NHCH2 CH2 -、-NHCH2 CH2 -、 ; X1; X2; X3 ; 各R7 獨立地選自H及C1 -C6 烷基; 各R8 獨立地選自H、C1 -C6 烷基、F、Cl及-OH; 各R9 獨立地選自H、C1 -C6 烷基、F、Cl、-NH2 、-OCH3 、-OCH2 CH3 、-N(CH3 )2 、-CN、-NO2 及-OH; 各R10 獨立地選自H、C1 - 6 烷基、氟基、經-C(=O)OH取代之苯甲氧基、經-C(=O)OH取代之苯甲基、經-C(=O)OH取代之C1 - 4 烷氧基及經-C(=O)OH取代之C1 - 4 烷基; R12 為H、甲基或苯基; 各m獨立地選自1、2、3及4; 各n獨立地選自1、2、3及4; 各t獨立地選自1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17及18,及 y為1至16之整數;及 (ii)第二治療劑係選自共抑制分子之抑制劑、共刺激分子之活化劑、細胞介素、減少細胞介素釋放症候群(CRS)之藥劑、化學療法、靶向抗癌療法、溶瘤藥物、細胞毒性劑、免疫類療法、疫苗或細胞療法。在一些實施例中,第二藥劑為共抑制分子之抑制劑、共刺激分子之活化劑、細胞介素或減少細胞介素釋放症候群(CRS)之藥劑。 在一些實施例中,Ab係選自曲妥珠單抗(trastuzumab)、帕妥珠單抗(pertuzumab)、馬妥昔單抗(margetuximab)或HT-19,或其位點特異性半胱胺酸突變體,其中該位點特異性半胱胺酸突變體包含處於以下位置(所有位置係依據EU編號)中之一或多者處的半胱胺酸: (a)抗體重鏈之位置152、360及375,及 (b)抗體輕鏈之位置107、159及165。 在一些實施例中,Ab係選自以下中之任一者: (a)包含以下之抗體分子: 含有胺基酸序列SEQ ID NO: 1之重鏈互補決定區1 (HCDR1); 含有胺基酸序列SEQ ID NO: 2之重鏈互補決定區2 (HCDR2); 含有胺基酸序列SEQ ID NO: 3之重鏈互補決定區3 (HCDR3); 含有胺基酸序列SEQ ID NO: 11之輕鏈互補決定區1 (LCDR1); 含有胺基酸序列SEQ ID NO: 12之輕鏈互補決定區2 (LCDR2);及 含有胺基酸序列SEQ ID NO: 13之輕鏈互補決定區3 (LCDR3); (b)包含以下之抗體分子: 含有胺基酸序列SEQ ID NO: 4之HCDR1; 含有胺基酸序列SEQ ID NO: 5之HCDR2; 含有胺基酸序列SEQ ID NO: 3之HCDR3; 含有胺基酸序列SEQ ID NO: 14之LCDR1; 含有胺基酸序列SEQ ID NO: 15之LCDR2;及 含有胺基酸序列SEQ ID NO: 16之LCDR3; (c)包含含有胺基酸序列SEQ ID NO: 7之重鏈可變區及含有胺基酸序列SEQ ID NO: 17之輕鏈可變區的抗體分子; (d)包含含有胺基酸序列SEQ ID NO: 9之重鏈及含有胺基酸序列SEQ ID NO: 19之輕鏈的抗體分子; (e)包含含有胺基酸序列SEQ ID NO: 21之重鏈及含有胺基酸序列SEQ ID NO: 19之輕鏈的抗體分子; (f)包含含有胺基酸序列SEQ ID NO: 23之重鏈及含有胺基酸序列SEQ ID NO: 19之輕鏈的抗體分子;或 (g)包含含有胺基酸序列SEQ ID NO: 32之重鏈及含有胺基酸序列SEQ ID NO: 19之輕鏈的抗體分子。 在一些實施例中,Ab為人類或人類化抗HER2抗體分子。 在一些實施例中,Ab包含經修飾之Fc區。 在一些實施例中,Ab包含處於以下位置(所有位置係依據EU編號)中之一或多者處的半胱胺酸: (a)抗體重鏈之位置152、360及375,及 (b)抗體輕鏈之位置107、159及165。 在一些實施例中,Ab包含處於抗體重鏈之位置152及375 (所有位置係依據EU編號)處的半胱胺酸。 在一個態樣中,本文揭示一種在有需要之個體中治療HER2陽性癌症之方法,該方法包含向個體投與治療有效量之與第二治療劑組合的結合物或其醫藥學上可接受之鹽,其中: (i)結合物包含式(II)結構:式(II) 其中: R50,其中*指示與Ab之連接點; Ab為特異性結合至人類HER2之抗體分子,例如抗體或其抗原結合片段; R1 為-NHR2 或-NHCHR2 R3 ; R2 為-C3 -C6 烷基或-C4 -C6 烷基; R3 為L1 OH; L1 為-(CH2 )m -; L2 為-(CH2 )n -、-((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-(CH2 )n X1 (CH2 )n -、-(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -、-(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n C(=O)NH(CH2 )n -、-((CH2 )n O)t (CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n 、-C(=O)(CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n X1 (CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n C(=O)NH(CH2 )n -、-C(=O)NH((CH2 )n O)t (CH2 )n X1 (CH2 )n -、-C(=O)X2 X3 C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-C(=O)X2 C(=O)(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -或-C(=O)(CH2 )n C(=O)NH(CH2 )n ; R40、-S-、-NHC(=O)CH2 -、-S(=O)2 CH2 CH2 -、-(CH2 )2 S(=O)2 CH2 CH2 -、-NHS(=O)2 CH2 CH2 、-NHC(=O)CH2 CH2 -、-CH2 NHCH2 CH2 -、-NHCH2 CH2 -、 ; X1; X2; X3; 各R7 獨立地選自H及C1 -C6 烷基; 各R8 獨立地選自H、C1 -C6 烷基、F、Cl及-OH; 各R9 獨立地選自H、C1 -C6 烷基、F、Cl、-NH2 、-OCH3 、-OCH2 CH3 、-N(CH3 )2 、-CN、-NO2 及-OH; 各R10 獨立地選自H、C1 - 6 烷基、氟基、經-C(=O)OH取代之苯甲氧基、經-C(=O)OH取代之苯甲基、經-C(=O)OH取代之C1 - 4 烷氧基及經-C(=O)OH取代之C1 - 4 烷基; R12 為H、甲基或苯基; 各m獨立地選自1、2、3及4; 各n獨立地選自1、2、3及4; 各t獨立地選自1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17及18,及 y為1至16之整數;及 (ii)第二治療劑係選自共抑制分子之抑制劑、共刺激分子之活化劑、細胞介素、減少細胞介素釋放症候群(CRS)之藥劑、化學療法、靶向抗癌療法、溶瘤藥物、細胞毒性劑、免疫類療法、疫苗或細胞療法。在一些實施例中,第二藥劑為共抑制分子之抑制劑、共刺激分子之活化劑、細胞介素或減少細胞介素釋放症候群(CRS)之藥劑。 在一些實施例中,Ab係選自曲妥珠單抗、帕妥珠單抗、馬妥昔單抗或HT-19,或其位點特異性半胱胺酸突變體,其中該位點特異性半胱胺酸突變體包含處於以下位置(所有位置係依據EU編號)中之一或多者處的半胱胺酸: (a)抗體重鏈之位置152、360及375,及 (b)抗體輕鏈之位置107、159及165。 在一些實施例中,Ab係選自以下中之任一者: (a)包含以下之抗體分子: 含有胺基酸序列SEQ ID NO: 1之重鏈互補決定區1 (HCDR1); 含有胺基酸序列SEQ ID NO: 2之重鏈互補決定區2 (HCDR2); 含有胺基酸序列SEQ ID NO: 3之重鏈互補決定區3 (HCDR3); 含有胺基酸序列SEQ ID NO: 11之輕鏈互補決定區1 (LCDR1); 含有胺基酸序列SEQ ID NO: 12之輕鏈互補決定區2 (LCDR2);及 含有胺基酸序列SEQ ID NO: 13之輕鏈互補決定區3 (LCDR3); (b)包含以下之抗體分子: 含有胺基酸序列SEQ ID NO: 4之HCDR1; 含有胺基酸序列SEQ ID NO: 5之HCDR2; 含有胺基酸序列SEQ ID NO: 3之HCDR3; 含有胺基酸序列SEQ ID NO: 14之LCDR1; 含有胺基酸序列SEQ ID NO: 15之LCDR2;及 含有胺基酸序列SEQ ID NO: 16之LCDR3; (c)包含含有胺基酸序列SEQ ID NO: 7之重鏈可變區及含有胺基酸序列SEQ ID NO: 17之輕鏈可變區的抗體分子; (d)包含含有胺基酸序列SEQ ID NO: 9之重鏈及含有胺基酸序列SEQ ID NO: 19之輕鏈的抗體分子; (e)包含含有胺基酸序列SEQ ID NO: 21之重鏈及含有胺基酸序列SEQ ID NO: 19之輕鏈的抗體分子; (f)包含含有胺基酸序列SEQ ID NO: 23之重鏈及含有胺基酸序列SEQ ID NO: 19之輕鏈的抗體分子;或 (g)包含含有胺基酸序列SEQ ID NO: 32之重鏈及含有胺基酸序列SEQ ID NO: 19之輕鏈的抗體分子。 在一些實施例中,Ab為人類或人類化抗HER2抗體分子。 在一些實施例中,Ab包含經修飾之Fc區。 在一些實施例中,Ab包含處於以下位置(所有位置係依據EU編號)中之一或多者處的半胱胺酸: (a)抗體重鏈之位置152、360及375,及 (b)抗體輕鏈之位置107、159及165。 在一些實施例中,Ab包含處於抗體重鏈之位置152及375 (所有位置係依據EU編號)處的半胱胺酸。 在一個態樣中,本文揭示一種在有需要之個體中治療HER2陽性癌症之方法,該方法包含向個體投與治療有效量之與第二治療劑組合的結合物或其醫藥學上可接受之鹽,其中: (i)式(II)結合物包含式(IIa)或式(IIb)結構:式(IIa) 式(IIb) 其中: Ab為特異性結合至人類HER2之抗體分子,例如抗體或其抗原結合片段; R1 為-NHR2 或-NHCHR2 R3 ; R2 為-C3 -C6 烷基或-C4 -C6 烷基; R3 為L1 OH; L1 為-(CH2 )m -; L2 為-(CH2 )n -、-((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-(CH2 )n X1 (CH2 )n -、-(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -、-(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n C(=O)NH(CH2 )n -、-((CH2 )n O)t (CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n 、-C(=O)(CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n X1 (CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n C(=O)NH(CH2 )n -、-C(=O)NH((CH2 )n O)t (CH2 )n X1 (CH2 )n -、-C(=O)X2 X3 C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-C(=O)X2 X3 C(=O)(CH2 )n -、-C(=O)X2 C(=O)(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -、-C(=O)X2 C(=O)(CH2 )n NHC(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-C(=O)(CH2 )n C(R7 )2 -、-C(=O)(CH2 )n C(R7 )2 SS(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -、-(CH2 )n X2 C(=O)(CH2 )n NHC(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -或-C(=O)(CH2 )n C(=O)NH(CH2 )n ; R40-S-; X1; X2; X3; 各R7 獨立地選自H及C1 -C6 烷基; 各m獨立地選自1、2、3及4; 各n獨立地選自1、2、3及4; 各t獨立地選自1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17及18,及 y為1至16之整數; (ii)第二治療劑係選自共抑制分子之抑制劑、共刺激分子之活化劑、細胞介素、減少細胞介素釋放症候群(CRS)之藥劑、化學療法、靶向抗癌療法、溶瘤藥物、細胞毒性劑、免疫類療法、疫苗或細胞療法。在一些實施例中,第二藥劑為共抑制分子之抑制劑、共刺激分子之活化劑、細胞介素或減少細胞介素釋放症候群(CRS)之藥劑。 在一個態樣中,本文揭示一種在有需要之個體中治療HER2陽性癌症之方法,該方法包含向個體投與治療有效量之與第二治療劑組合的結合物或其醫藥學上可接受之鹽,其中: (i)式(II)結合物包含式(IIa)或式(IIb)結構:式(IIa) 式(IIb) 其中: Ab為特異性結合至人類HER2之抗體分子,例如抗體或其抗原結合片段; R1 為-NHR2 或-NHCHR2 R3 ; R2 為-C3 -C6 烷基或-C4 -C6 烷基; R3 為L1 OH; L1 為-(CH2 )m -; L2 為-(CH2 )n -、-((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-(CH2 )n X1 (CH2 )n -、-(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -、-(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n C(=O)NH(CH2 )n -、-((CH2 )n O)t (CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n 、-C(=O)(CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n X1 (CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n C(=O)NH(CH2 )n -、-C(=O)NH((CH2 )n O)t (CH2 )n X1 (CH2 )n -、-C(=O)X2 X3 C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-C(=O)X2 C(=O)(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -或-C(=O)(CH2 )n C(=O)NH(CH2 )n ; R40-S-; X1; X2; X3; 各R7 獨立地選自H及C1 -C6 烷基; 各m獨立地選自1、2、3及4; 各n獨立地選自1、2、3及4; 各t獨立地選自1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17及18,及 y為1至16之整數;及 (ii)第二治療劑係選自共抑制分子之抑制劑、共刺激分子之活化劑、細胞介素、減少細胞介素釋放症候群(CRS)之藥劑、化學療法、靶向抗癌療法、溶瘤藥物、細胞毒性劑、免疫類療法、疫苗或細胞療法。在一些實施例中,第二藥劑為共抑制分子之抑制劑、共刺激分子之活化劑、細胞介素或減少細胞介素釋放症候群(CRS)之藥劑。 在一個實施例中, R1 為-NHR2 ; R2 為-C4 -C6 烷基; L2 為-(CH2 )n -或-C(=O)(CH2 )n ; R40; 及 各n獨立地選自1、2、3及4,及 y為1至16之整數。 在一個態樣中,本文揭示一種在有需要之個體中治療HER2陽性癌症之方法,該方法包含向個體投與治療有效量之與第二治療劑組合的結合物或其醫藥學上可接受之鹽,其中: (i)式(II)結合物包含式(IIa)或式(IIb)結構:式(IIa) 式(IIb) 其中: R1 為-NHR2 ; R2 為-C4 -C6 烷基; L2 為-(CH2 )n -、-((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-(CH2 )n X1 (CH2 )n -、-C(=O)(CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n X1 (CH2 )n -、-C(=O)NH((CH2 )n O)t (CH2 )n X1 (CH2 )n -、-C(=O)X2 X3 C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -或-C(=O)X2 C(=O)(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -; R40; X1;X2;X3; 各n獨立地選自1、2、3及4; 各t獨立地選自1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17及18,及 y為1至16之整數;及 (ii)第二治療劑係選自共抑制分子之抑制劑、共刺激分子之活化劑、細胞介素、減少細胞介素釋放症候群(CRS)之藥劑、化學療法、靶向抗癌療法、溶瘤藥物、細胞毒性劑、免疫類療法、疫苗或細胞療法。在一些實施例中,第二藥劑為共抑制分子之抑制劑、共刺激分子之活化劑、細胞介素或減少細胞介素釋放症候群(CRS)之藥劑。 在一個實施例中,如藉由疏水相互作用層析所測定,結合物之疏水性指數為0.8或大於0.8。 在一個態樣中,本文揭示一種在有需要之個體中治療HER2陽性癌症之方法,該方法包含向個體投與治療有效量之與第二治療劑組合的結合物或其醫藥學上可接受之鹽,其中: (i)結合物包含下式中之任一者的結構: , 其中Ab為特異性結合至人類HER2之抗體分子,例如抗體或其抗原結合片段,且y為1至4之整數;及 (ii)第二治療劑係選自共抑制分子之抑制劑、共刺激分子之活化劑、細胞介素、減少細胞介素釋放症候群(CRS)之藥劑、化學療法、靶向抗癌療法、溶瘤藥物、細胞毒性劑、免疫類療法、疫苗或細胞療法。在一些實施例中,第二藥劑為共抑制分子之抑制劑、共刺激分子之活化劑、細胞介素或減少細胞介素釋放症候群(CRS)之藥劑。 在一個實施例中,Ab係選自曲妥珠單抗、帕妥珠單抗、馬妥昔單抗或HT-19,或其位點特異性半胱胺酸突變體,其中該位點特異性半胱胺酸突變體包含處於以下位置(所有位置係依據EU編號)中之一或多者處的半胱胺酸: (a)抗體重鏈之位置152、360及375,及 (b)抗體輕鏈之位置107、159及165。 在一個實施例中,Ab係選自以下中之任一者: (a)包含以下之抗體分子: 含有胺基酸序列SEQ ID NO: 1之重鏈互補決定區1 (HCDR1); 含有胺基酸序列SEQ ID NO: 2之重鏈互補決定區2 (HCDR2); 含有胺基酸序列SEQ ID NO: 3之重鏈互補決定區3 (HCDR3); 含有胺基酸序列SEQ ID NO: 11之輕鏈互補決定區1 (LCDR1); 含有胺基酸序列SEQ ID NO: 12之輕鏈互補決定區2 (LCDR2);及 含有胺基酸序列SEQ ID NO: 13之輕鏈互補決定區3 (LCDR3); (b)包含以下之抗體分子: 含有胺基酸序列SEQ ID NO: 4之HCDR1; 含有胺基酸序列SEQ ID NO: 5之HCDR2; 含有胺基酸序列SEQ ID NO: 3之HCDR3; 含有胺基酸序列SEQ ID NO: 14之LCDR1; 含有胺基酸序列SEQ ID NO: 15之LCDR2;及 含有胺基酸序列SEQ ID NO: 16之LCDR3; (c)包含含有胺基酸序列SEQ ID NO: 7之重鏈可變區及含有胺基酸序列SEQ ID NO: 17之輕鏈可變區的抗體分子; (d)包含含有胺基酸序列SEQ ID NO: 9之重鏈及含有胺基酸序列SEQ ID NO: 19之輕鏈的抗體分子; (e)包含含有胺基酸序列SEQ ID NO: 21之重鏈及含有胺基酸序列SEQ ID NO: 19之輕鏈的抗體分子; (f)包含含有胺基酸序列SEQ ID NO: 23之重鏈及含有胺基酸序列SEQ ID NO: 19之輕鏈的抗體分子;或 (g)包含含有胺基酸序列SEQ ID NO: 32之重鏈及含有胺基酸序列SEQ ID NO: 19之輕鏈的抗體分子。 在一個實施例中,Ab包含含有胺基酸序列SEQ ID NO: 9之重鏈及含有胺基酸序列SEQ ID NO: 19之輕鏈。 在一個實施例中,化合物附接至處於抗體重鏈之位置152及375 (所有位置係依據EU編號)處的半胱胺酸。 在一個實施例中,y為約3至4。 在一個實施例中,如藉由疏水相互作用層析所測定,結合物之疏水性指數為0.8或大於0.8。 在一個實施例中,當與單獨抗HER2抗體分子相比時,結合物能夠抑制HER2陽性癌症持續時間段及/或減少HER2陽性癌症復發。 在另一態樣中,本文揭示一種在有需要之個體中治療HER2陽性癌症之方法,該方法包含向個體投與治療有效量之與第二治療劑組合的醫藥組合物,其中該醫藥組合物包含式(II)、式(IIa)或式(IIb)抗體結合物或其醫藥學上可接受之鹽,及醫藥學上可接受之載劑。 在另一態樣中,本文揭示一種組合物,其包含式(II)、式(IIa)或式(IIb)抗體結合物或其醫藥學上可接受之鹽,用於與第二治療劑組合以治療個體中之HER2陽性癌症。在一個實施例中,第二治療劑係選自化學療法、靶向抗癌療法、溶瘤藥物、細胞毒性劑、免疫類療法、細胞介素、共抑制分子之抑制劑、共刺激分子之活化劑、減少細胞介素釋放症候群(CRS)之藥劑、疫苗或細胞療法。 在另一態樣中,本文揭示一種包含與第二治療劑組合的式(II)、式(IIa)或式(IIb)抗體結合物或其醫藥學上可接受之鹽的組合物在製造用於在有需要之個體中治療HER2陽性癌症之藥劑中的用途。在一個實施例中,第二治療劑係選自化學療法、靶向抗癌療法、溶瘤藥物、細胞毒性劑、免疫類療法、細胞介素、共抑制分子之抑制劑、共刺激分子之活化劑、減少細胞介素釋放症候群(CRS)之藥劑、疫苗或細胞療法。 在一個實施例中,在前述方法或用途中,第二治療劑為共抑制分子之抑制劑或共刺激分子之活化劑,其中: (i)共抑制分子係選自計劃性死亡-1 (PD-1)、計劃性死亡-配位體1 (PD-L1)、淋巴細胞活化基因-3 (LAG-3)或T細胞免疫球蛋白域及黏蛋白域3(TIM-3),及 (ii)共刺激分子為糖皮質激素誘導之TNFR相關蛋白(GITR)。 在一個實施例中,第二治療劑為特異性結合至人類PD-1之抗體分子,其中該抗體分子包含: (i)重鏈可變區(VH),其包含表6或表7中所揭示之任何抗PD-1重鏈胺基酸序列(或與其具有至少約85%、90%、95%、99%或大於99%一致性,及/或具有一個、兩個、三個或大於三個取代、插入或缺失,例如保守取代的序列)的重鏈互補決定區1 (VHCDR1)、VHCDR2及VHCDR3,及/或 輕鏈可變區(VL),其包含表6或表7中所列出之任何抗PD-1輕鏈胺基酸序列(或與其具有至少約85%、90%、95%、99%或大於99%一致性,及/或具有一個、兩個、三個或大於三個取代、插入或缺失,例如保守取代的序列)的輕鏈互補決定區1 (VLCDR1)、VLCDR2及VLCDR3; (ii) VH,其包含表6或表7中所揭示之任何抗PD-1重鏈胺基酸序列(或與其具有至少約85%、90%、95%、99%或大於99%一致性,及/或具有一個、兩個、三個或大於三個取代、插入或缺失,例如保守取代的序列)的VH,及/或 VL,其包含表6或表7中所揭示之任何抗PD-1輕鏈胺基酸序列(或與其具有至少約85%、90%、95%、99%或大於99%一致性,及/或具有一個、兩個、三個或大於三個取代、插入或缺失,例如保守取代的序列)的VL;或 (iii)表6或表7中所揭示之抗PD-1重鏈胺基酸序列(或與其具有至少約85%、90%、95%、99%或大於99%一致性,及/或具有一個、兩個、三個或大於三個取代、插入或缺失,例如保守取代的序列),及/或 表6或表7中所揭示之抗PD-1輕鏈胺基酸序列(或與其具有至少約85%、90%、95%、99%或大於99%一致性,及/或具有一個、兩個、三個或大於三個取代、插入或缺失,例如保守取代的序列)。 在一個實施例中,第二治療劑為特異性結合至人類PD-1之抗體分子,其中該抗體分子包含: (i)VH,其包含SEQ ID NO: 501之VHCDR1胺基酸序列、SEQ ID NO: 502之VHCDR2胺基酸序列及SEQ ID NO: 503之VHCDR3胺基酸序列;及VL,其包含SEQ ID NO: 510之VLCDR1胺基酸序列、SEQ ID NO: 511之VLCDR2胺基酸序列及SEQ ID NO: 512之VLCDR3胺基酸序列; (ii) VH,其包含胺基酸序列SEQ ID NO: 506,及VL,其包含胺基酸序列SEQ ID NO: 520; (iii)重鏈,其包含胺基酸序列SEQ ID NO: 508,及輕鏈,其包含胺基酸序列SEQ ID NO: 522; (iv) VH,其包含胺基酸序列SEQ ID NO: 506,及VL,其包含胺基酸序列SEQ ID NO: 516;或 (v) 重鏈,其包含胺基酸序列SEQ ID NO: 508,及輕鏈,其包含胺基酸序列SEQ ID NO: 518。 在一個實施例中,第二治療劑為特異性結合至人類PD-L1之抗體分子,其中該抗體分子包含: (i) 重鏈可變區(VH),其包含表8或表9中所揭示之任何抗PD-L1重鏈胺基酸序列(或與其具有至少約85%、90%、95%、99%或大於99%一致性,及/或具有一個、兩個、三個或大於三個取代、插入或缺失,例如保守取代的序列)的重鏈互補決定區1 (VHCDR1)、VHCDR2及VHCDR3,及/或 輕鏈可變區(VL),其包含表8或表9中所列出之任何抗PD-L1輕鏈胺基酸序列(或與其具有至少約85%、90%、95%、99%或大於99%一致性,及/或具有一個、兩個、三個或大於三個取代、插入或缺失,例如保守取代的序列)的輕鏈互補決定區1 (VLCDR1)、VLCDR2及VLCDR3; (ii) VH,其包含表8或表9中所揭示之任何抗PD-L1重鏈胺基酸序列(或與其具有至少約85%、90%、95%、99%或大於99%一致性,及/或具有一個、兩個、三個或大於三個取代、插入或缺失,例如保守取代的序列)的VH,及/或 VL,其包含表8或表9中所揭示之任何抗PD-L1輕鏈胺基酸序列(或與其具有至少約85%、90%、95%、99%或大於99%一致性,及/或具有一個、兩個、三個或大於三個取代、插入或缺失,例如保守取代的序列)的VL;或 (iii)表8或表9中所揭示之抗PD-L1重鏈胺基酸序列(或與其具有至少約85%、90%、95%、99%或大於99%一致性,及/或具有一個、兩個、三個或大於三個取代、插入或缺失,例如保守取代的序列),及/或 表8或表9中所揭示之抗PD-L1輕鏈胺基酸序列(或與其具有至少約85%、90%、95%、99%或大於99%一致性,及/或具有一個、兩個、三個或大於三個取代、插入或缺失,例如保守取代的序列)。 在一個實施例中,第二治療劑為特異性結合至人類PD-L1之抗體分子,其中該抗體分子包含: (i) VH,其包含SEQ ID NO: 601之VHCDR1胺基酸序列、SEQ ID NO: 602之VHCDR2胺基酸序列及SEQ ID NO: 603之VHCDR3胺基酸序列;及VL,其包含SEQ ID NO: 609之VLCDR1胺基酸序列、SEQ ID NO: 610之VLCDR2胺基酸序列及SEQ ID NO: 611之VLCDR3胺基酸序列; (ii) VH,其包含胺基酸序列SEQ ID NO: 606,及VL,其包含胺基酸序列SEQ ID NO: 616; (iii) 重鏈,其包含胺基酸序列SEQ ID NO: 608,及輕鏈,其包含胺基酸序列SEQ ID NO: 618; (iv) VH,其包含胺基酸序列SEQ ID NO: 620,及VL,其包含胺基酸序列SEQ ID NO: 624;或 (v)重鏈,其包含胺基酸序列SEQ ID NO: 622,及輕鏈,其包含胺基酸序列SEQ ID NO: 626。 在一個實施例中,第二治療劑為特異性結合至人類LAG-3之抗體分子,其中該抗體分子包含: (i)重鏈可變區(VH),其包含表10或表11中所揭示之任何抗LAG-3重鏈胺基酸序列(或與其具有至少約85%、90%、95%、99%或大於99%一致性,及/或具有一個、兩個、三個或大於三個取代、插入或缺失,例如保守取代的序列)的重鏈互補決定區1 (VHCDR1)、VHCDR2及VHCDR3,及/或 輕鏈可變區(VL),其包含表10或表11中所列出之任何抗LAG-3輕鏈胺基酸序列(或與其具有至少約85%、90%、95%、99%或大於99%一致性,及/或具有一個、兩個、三個或大於三個取代、插入或缺失,例如保守取代的序列)的輕鏈互補決定區1 (VLCDR1)、VLCDR2及VLCDR3; (ii) VH,其包含表10或表11中所揭示之任何抗LAG-3重鏈胺基酸序列(或與其具有至少約85%、90%、95%、99%或大於99%一致性,及/或具有一個、兩個、三個或大於三個取代、插入或缺失,例如保守取代的序列)的VH,及/或 VL,其包含表10或表11中所揭示之任何抗LAG-3輕鏈胺基酸序列(或與其具有至少約85%、90%、95%、99%或大於99%一致性,及/或具有一個、兩個、三個或大於三個取代、插入或缺失,例如保守取代的序列)的VL;或 (iii) 表10或表11中所揭示之抗LAG-3重鏈胺基酸序列(或與其具有至少約85%、90%、95%、99%或大於99%一致性,及/或具有一個、兩個、三個或大於三個取代、插入或缺失,例如保守取代的序列),及/或 表10或表11中所揭示之抗LAG-3輕鏈胺基酸序列(或與其具有至少約85%、90%、95%、99%或大於99%一致性,及/或具有一個、兩個、三個或大於三個取代、插入或缺失,例如保守取代的序列)。 在一個實施例中,第二治療劑為特異性結合至人類LAG-3之抗體分子,其中該抗體分子包含: (i) VH,其包含SEQ ID NO: 701之VHCDR1胺基酸序列、SEQ ID NO: 702之VHCDR2胺基酸序列及SEQ ID NO: 703之VHCDR3胺基酸序列;及VL,其包含SEQ ID NO: 710之VLCDR1胺基酸序列、SEQ ID NO: 711之VLCDR2胺基酸序列及SEQ ID NO: 712之VLCDR3胺基酸序列; (ii) VH,其包含胺基酸序列SEQ ID NO: 706,及VL,其包含胺基酸序列SEQ ID NO: 718; (iii)重鏈,其包含胺基酸序列SEQ ID NO: 709,及輕鏈,其包含胺基酸序列SEQ ID NO: 721; (iv) VH,其包含胺基酸序列SEQ ID NO: 724,及VL,其包含胺基酸序列SEQ ID NO: 730;或 (v) 重鏈,其包含胺基酸序列SEQ ID NO: 727,及輕鏈,其包含胺基酸序列SEQ ID NO: 733。 在一個實施例中,第二治療劑為特異性結合至人類TIM-3之抗體分子,其中該抗體分子包含: (i) 重鏈可變區(VH),其包含表12或表13中所揭示之任何抗TIM-3重鏈胺基酸序列(或與其具有至少約85%、90%、95%、99%或大於99%一致性,及/或具有一個、兩個、三個或大於三個取代、插入或缺失,例如保守取代的序列)的重鏈互補決定區1 (VHCDR1)、VHCDR2及VHCDR3,及/或 輕鏈可變區(VL),其包含表12或表13中所列出之任何抗TIM-3輕鏈胺基酸序列(或與其具有至少約85%、90%、95%、99%或大於99%一致性,及/或具有一個、兩個、三個或大於三個取代、插入或缺失,例如保守取代的序列)的輕鏈互補決定區1 (VLCDR1)、VLCDR2及VLCDR3; (ii) VH,其包含表12或表13中所揭示之任何抗TIM-3重鏈胺基酸序列(或與其具有至少約85%、90%、95%、99%或大於99%一致性,及/或具有一個、兩個、三個或大於三個取代、插入或缺失,例如保守取代的序列)的VH,及/或 VL,其包含表12或表13中所揭示之任何抗TIM-3輕鏈胺基酸序列(或與其具有至少約85%、90%、95%、99%或大於99%一致性,及/或具有一個、兩個、三個或大於三個取代、插入或缺失,例如保守取代的序列)的VL;或 (iii) 表12或表13中所揭示之抗TIM-3重鏈胺基酸序列(或與其具有至少約85%、90%、95%、99%或大於99%一致性,及/或具有一個、兩個、三個或大於三個取代、插入或缺失,例如保守取代的序列),及/或 表12或表13中所揭示之抗TIM-3輕鏈胺基酸序列(或與其具有至少約85%、90%、95%、99%或大於99%一致性,及/或具有一個、兩個、三個或大於三個取代、插入或缺失,例如保守取代的序列)。 在一個實施例中,第二治療劑為特異性結合至人類TIM-3之抗體分子,其中該抗體分子包含: (i) VH,其包含SEQ ID NO: 801之VHCDR1胺基酸序列、SEQ ID NO: 802之VHCDR2胺基酸序列及SEQ ID NO: 803之VHCDR3胺基酸序列;及VL,其包含SEQ ID NO: 810之VLCDR1胺基酸序列、SEQ ID NO: 811之VLCDR2胺基酸序列及SEQ ID NO: 812之VLCDR3胺基酸序列; (ii) VH,其包含胺基酸序列SEQ ID NO: 806,及VL,其包含胺基酸序列SEQ ID NO: 816; (iii) 重鏈,其包含胺基酸序列SEQ ID NO: 808,及輕鏈,其包含胺基酸序列SEQ ID NO: 818; (iv) VH,其包含SEQ ID NO: 801之VHCDR1胺基酸序列、SEQ ID NO: 820之VHCDR2胺基酸序列及SEQ ID NO: 803之VHCDR3胺基酸序列;及VL,其包含SEQ ID NO: 810之VLCDR1胺基酸序列、SEQ ID NO: 811之VLCDR2胺基酸序列及SEQ ID NO: 812之VLCDR3胺基酸序列; (v) VH,其包含胺基酸序列SEQ ID NO: 822,及VL,其包含胺基酸序列SEQ ID NO: 826;或 (vi) 重鏈,其包含胺基酸序列SEQ ID NO: 824,及輕鏈,其包含胺基酸序列SEQ ID NO: 828。 在一個實施例中,第二治療劑為特異性結合至人類GITR之抗體分子,其中該抗體分子包含: (i)重鏈可變區(VH),其包含表14或表15中所揭示之任何抗GITR重鏈胺基酸序列(或與其具有至少約85%、90%、95%、99%或大於99%一致性,及/或具有一個、兩個、三個或大於三個取代、插入或缺失,例如保守取代的序列)的重鏈互補決定區1 (VHCDR1)、VHCDR2及VHCDR3,及/或 輕鏈可變區(VL),其包含表14或表15中所列出之任何抗GITR輕鏈胺基酸序列(或與其具有至少約85%、90%、95%、99%或大於99%一致性,及/或具有一個、兩個、三個或大於三個取代、插入或缺失,例如保守取代的序列)的輕鏈互補決定區1 (VLCDR1)、VLCDR2及VLCDR3; (ii) VH,其包含表14或表15中所揭示之任何抗GITR重鏈胺基酸序列(或與其具有至少約85%、90%、95%、99%或大於99%一致性,及/或具有一個、兩個、三個或大於三個取代、插入或缺失,例如保守取代的序列)的VH,及/或 VL,其包含表14或表15中所揭示之任何抗GITR輕鏈胺基酸序列(或與其具有至少約85%、90%、95%、99%或大於99%一致性,及/或具有一個、兩個、三個或大於三個取代、插入或缺失,例如保守取代的序列)的VL;或 (iii)表14或表15中所揭示之抗GITR重鏈胺基酸序列(或與其具有至少約85%、90%、95%、99%或大於99%一致性,及/或具有一個、兩個、三個或大於三個取代、插入或缺失,例如保守取代的序列),及/或 表14或表15中所揭示之抗GITR輕鏈胺基酸序列(或與其具有至少約85%、90%、95%、99%或大於99%一致性,及/或具有一個、兩個、三個或大於三個取代、插入或缺失,例如保守取代的序列)。 在一個實施例中,第二治療劑為特異性結合至人類GITR之抗體分子,其中該抗體分子包含: (i) VH,其包含SEQ ID NO: 909之VHCDR1胺基酸序列、SEQ ID NO: 911之VHCDR2胺基酸序列及SEQ ID NO: 913之VHCDR3胺基酸序列;及VL,其包含SEQ ID NO: 914之VLCDR1胺基酸序列、SEQ ID NO: 916之VLCDR2胺基酸序列及SEQ ID NO: 918之VLCDR3胺基酸序列; (ii) VH,其包含胺基酸序列SEQ ID NO: 901,及VL,其包含胺基酸序列SEQ ID NO: 902;或 (iii) 重鏈,其包含胺基酸序列SEQ ID NO: 903,及輕鏈,其包含胺基酸序列SEQ ID NO: 904。 在一個實施例中,在前述方法或用途中,第二治療劑為細胞介素,其中細胞介素包含與IL-15受體α (IL-15Ra)之可溶性形式複合的IL-15,且其中IL-15及IL-15Ra包含表16中所揭示之胺基酸序列(或與其具有至少約85%、90%、95%、99%或大於99%一致性,及/或具有一個、兩個、三個或大於三個取代、插入或缺失,例如保守取代的序列)。 在一個實施例中,第二治療劑為減少細胞介素釋放症候群(CRS)之藥劑,其中第二治療劑係選自IL-6抑制劑(例如思圖昔單抗(siltuximab))、IL-6受體(IL-6R)抑制劑(例如托西利單抗(tocilizumab))、巴多昔芬(bazedoxifene)、sgp130阻斷劑、激脈藥物、類固醇(例如皮質類固醇)、免疫抑制劑、組胺H2受體拮抗劑、鎮痛劑(例如乙醯胺苯酚)、解熱劑或機械換氣。 在一個實施例中,HER2陽性癌症可為以下中之任一者:胃癌、食道癌、胃食道接合部腺癌(gastroesophageal junction adenocarcinoma)、結腸癌、直腸癌、乳癌、卵巢癌、子宮頸癌、子宮癌、子宮內膜癌、膀胱癌、泌尿道癌、胰臟癌、肺癌、前列腺癌、骨肉瘤、神經母細胞瘤、神經膠母細胞瘤及頭頸癌。HER2陽性癌症可具有高HER2表現(例如具有3+ IHC評分)或低HER2表現(例如具有2+ IHC評分)。 本文所述之抗體結合物不僅可用於治療表現高HER2之腫瘤(例如具有3+ IHC評分),並且亦可用於治療表現較低HER2之腫瘤(例如具有2+ IHC評分)。 在一個實施例中,同時或依序投與結合物及第二治療劑。 在一個實施例中,向個體靜脈內、瘤內或皮下投與結合物。在一個實施例中,以每公斤體重約0.03 mg至6 mg之劑量投與結合物。在一個實施例中,以每公斤體重約0.7 mg至1.4 mg之劑量投與結合物。在一個實施例中,以每公斤體重約0.1 mg至4 mg之劑量投與結合物。在一個實施例中,以每公斤體重約0.1 mg之劑量投與結合物。在一個實施例中,以每公斤體重約0.3 mg之劑量投與結合物。在一個實施例中,以每公斤體重約1 mg之劑量投與結合物。在一個實施例中,以每公斤體重約2 mg之劑量投與結合物。在一個實施例中,以每公斤體重約4 mg之劑量投與結合物。 在一個實施例中,向個體靜脈內、瘤內或皮下投與第二治療劑。 在一個實施例中,第二治療劑為特異性結合至人類PD-1之抗體分子。在一個實施例中,以每公斤體重約50 mg至450 mg之劑量投與抗PD-1抗體分子。在一個實施例中,以每公斤體重約100 mg、200 mg、300 mg或400 mg之劑量投與抗PD-1抗體分子。在一個實施例中,藉由注射(例如皮下或靜脈內)以約100 mg至600 mg,例如約200 mg至500 mg,例如約250 mg至450 mg、約300 mg至400 mg、約250 mg至350 mg、約350 mg至450 mg、或約100 mg、約200 mg、約300 mg或約400 mg之劑量(例如均一劑量)投與抗PD-1抗體分子。給藥時程(例如均一給藥時程)可有所不同,例如一週一次至每2、3、4、5或6週一次。在一個實施例中,以約300 mg至400 mg之劑量每三週投與抗PD-1抗體分子一次或每四週投與一次。在一個實施例中,以約300 mg之劑量每三週投與抗PD-1抗體分子一次。在一個實施例中,以約400 mg之劑量每四週投與抗PD-1抗體分子一次。在一個實施例中,以約300 mg之劑量每四週投與抗PD-1抗體分子一次。在一個實施例中,以約400 mg之劑量每三週投與抗PD-1抗體分子一次。 在一個實施例中,結合物及第二治療劑與第三治療劑組合投與,其中該第三治療劑係選自化學療法、靶向抗癌療法、溶瘤藥物、細胞毒性劑、免疫類療法、細胞介素、共抑制分子之抑制劑、共刺激分子之活化劑、減少細胞介素釋放症候群(CRS)之藥劑、疫苗或細胞療法。
相關申請之交叉引用 本申請案主張2017年4月28日申請的美國臨時申請案第62/491425號的權益,該申請案以全文引用之方式併入本文中。序列表 本申請案含有序列表,該序列表已以ASCII格式、以電子方式提交且以全文引用之方式併入本文中。2018年4月12日創建的該ASCII複本命名為PAT057717-WO-PCT_SL.txt且大小為285,849個位元組。 本文描述本發明之各種枚舉實施例。應認識到在各實施例中指定之特徵可與其他指定特徵組合,以提供本發明之其他實施例。 在本申請案之本文通篇中,本說明書之文本(例如表1)與序列表之間若存在不一致,則應以本說明書之文本為準。 定義 如本文所用,術語「C4 -C6 烷基」係指含有4至6個碳原子之完全飽和分支鏈或直鏈烴。「C4 -C6 烷基」之非限制性實例包括正丁基、異丁基、第二丁基、第三丁基、正戊基、異戊基及己基。 如本文所用,「HER2」(亦稱為ERBB2;NEU;NGL;TKR1;CD340;p185;MLN19;HER-2/neu)係指表皮生長因子(EGF)受體家族之跨膜酪胺酸激酶受體。HER2包含細胞外結合域、跨膜域及細胞內酪胺酸激酶域。HER2本身並不具有配位體結合域且因此不可結合生長因子,然而,HER2與其他配位體結合EGF受體家族成員,諸如HER1或HER3緊密地結合以形成雜二聚體,使配位體結合穩定化且增強下游信號傳遞路徑的經激酶介導之活化。人類HER2/NEU基因定位於染色體位置17q12,且HER2/NEU基因之基因體組序列可見於GenBank中NG_007503.1處。在人類中,存在五種HER2同功異型物:A、B、C、D及E;術語「HER2」在本文中用於統指所有HER2同功異型物。如本文所用,人類HER2蛋白質亦涵蓋以下蛋白質:其在其整個長度上與HER2同功異型物:A、B、C、D及E具有至少約70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列一致性,其中此類蛋白質仍具有HER2之功能中之至少一者。人類HER2同功異型物A (最長同功異型物)之mRNA及蛋白質序列為:智人 erb - b2 受體酪胺酸激酶 2 ( ERBB2 ) ,轉錄變異體 1 mRNA [NM_004448.3] 受體酪胺酸 - 蛋白激酶 erbB - 2 同功異型物 a 前驅體 [ 智人 ] [NP_004439.2] 其他人類HER2同功異型物之mRNA及蛋白質序列可見於具有以下寄存編號之GeneBank中: HER2同功異型物B: NM_001005862.2 (mRNA)→ NP_001005862.1 (蛋白質); HER2同功異型物C: NM_001289936.1 (mRNA)→ NP_001276865.1 (蛋白質); HER2同功異型物D: NM_001289937.1 (mRNA)→ NP_001276866.1 (蛋白質); HER2同功異型物E: NM_001289938.1 (mRNA)→ NP_001276867.1 (蛋白質)。 如本文所用,術語「抗體分子」係指蛋白質,例如免疫球蛋白鏈或其片段,其包含至少一個免疫球蛋白可變域序列。術語「抗體分子」包括例如如本文所述之抗體或抗體片段。在一實施例中,抗體分子包含全長抗體或全長免疫球蛋白鏈。在一實施例中,抗體分子包含全長抗體或全長免疫球蛋白鏈之抗原結合或功能片段。 如本文所用,術語「抗體」係指來源於特異性結合至抗原之免疫球蛋白分子的蛋白質或多肽序列。抗體可為多株或單株、多鏈或單鏈或完整的免疫球蛋白且可來源於天然來源或重組來源。天然存在之「抗體」為包含藉由二硫鍵相互連接之至少兩條重(H)鏈及兩條輕(L)鏈的糖蛋白。各重鏈由重鏈可變區(在本文中縮寫為VH)及重鏈恆定區構成。重鏈恆定區由三個域(CH1、CH2及CH3)構成。各輕鏈由輕鏈可變區(本文中縮寫為VL)及輕鏈恆定區構成。輕鏈恆定區由一個域CL構成。VH及VL區可進一步再分成高變區,稱為「互補決定區」(CDR),其中穿插有較保守區,稱為「構架區」(FR)。 各VH及VL由自胺基端至羧基端按以下順序排列之三個CDR及四個FR組成:FR1、CDR1、FR2、CDR2、FR3、CDR3、FR4。重鏈及輕鏈之可變區含有與抗原相互作用之結合域。抗體之恆定區可介導免疫球蛋白與宿主組織或因子,包括免疫系統之各種細胞(例如效應細胞)及經典補體系統之第一組分(C1q)的結合。抗體可為單株抗體、人類抗體、人類化抗體、駱駝化抗體或嵌合抗體。抗體可具有任何同型(例如IgG、IgE、IgM、IgD、IgA及IgY)、類別(例如IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgA1及IgA2)或子類。 術語「抗體片段」或「抗原結合片段」係指抗體之至少一部分,其保持與抗原之抗原決定基特異性相互作用(例如藉由結合、位阻、穩定化/去穩定化、空間分佈)的能力。抗體片段之實例包括(但不限於)Fab、Fab'、F(ab')2、Fv片段、scFv抗體片段、二硫鍵聯之Fvs (sdFv)、由VH及CH1域組成之Fd片段、線性抗體、諸如sdAb之單域抗體(VL或VH)、駱駝科VHH域、由諸如二價片段之抗體片段形成的多特異性抗體(包含在鉸鏈區經二硫橋鍵聯之兩個Fab片段),及經分離CDR或抗體之其他抗原決定基結合片段。抗原結合片段亦可併入單域抗體、最大抗體(maxibody)、微型抗體、奈米抗體、胞內抗體(intrabody)、雙功能抗體、三功能抗體、四功能抗體、v-NAR及雙-scFv中(參見例如,Hollinger及Hudson, Nature Biotechnology 23:1126-1136, 2005)。抗原結合片段亦可移植至基於多肽之骨架,諸如III型纖維結合蛋白(Fn3)(參見美國專利第6,703,199號,其描述纖維結合蛋白多肽微型抗體)。術語「scFv」係指包含至少一種包含輕鏈之可變區的抗體片段及至少一種包含重鏈之可變區的抗體片段的融合蛋白,其中輕鏈及重鏈可變區例如經由合成性連接子,例如短可撓性多肽連接子連續連接,且能夠表現為單鏈多肽,且其中scFv保持衍生其的完整抗體的特異性。除非指定,否則如本文所使用之scFv可具有呈例如相對於多肽之N末端及C末端之任一順序之VL及VH可變區,scFv可包含VL-連接子-VH或可包含VH-連接子-VL。 如本文所用,術語「互補決定區」或「CDR」係指在抗體可變區內之胺基酸序列,其賦予抗原特異性及結合親和力。舉例而言,通常,各重鏈可變區中存在三個CDR (例如HCDR1、HCDR2及HCDR3)且各輕鏈可變區中存在三個CDR (LCDR1、LCDR2及LCDR3)。既定CDR之精確胺基酸序列邊界可使用多種熟知流程中之任一者測定,包括由以下文獻描述之流程:Kabat等人 (1991), 「Sequences of Proteins of Immunological Interest」, 第5版 Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, MD (「Kabat」編號流程),Al-Lazikani等人, (1997) JMB 273,927-948 (「Chothia」編號流程),或其組合,及ImMunoGenTics (IMGT)編號(Lefranc, M.-P., The Immunologist, 7, 132-136 (1999);Lefranc, M.-P.等人, Dev. Comp. Immunol., 27, 55-77 (2003) (「IMGT」編號流程)。在針對既定CDR區(例如HC CDR1、HC CDR2、HC CDR3、LC CDR1、LC CDR2或LC CDR3)的經組合之Kabat及Chothia編號流程中,在一些實施例中,CDR對應於定義為Kabat CDR之一部分的胺基酸殘基,連同定義為Chothia CDR之一部分的胺基酸殘基。如本文所用,根據「Chothia」編號流程定義之CDR有時亦稱為「高變環」。 舉例而言,根據Kabat,重鏈可變域(VH)中之CDR胺基酸殘基編號為31-35 (HCDR1) (例如位置35之後的插入)、50-65 (HCDR2)及95-102 (HCDR3);且輕鏈可變域(VL)中之CDR胺基酸殘基編號為24-34 (LCDR1)(例如位置27之後的插入),50-56 (LCDR2)及89-97 (LCDR3)。作為另一實例,根據Chothia,VH中之CDR胺基酸編號為26-32 (HCDR1) (例如位置31之後的插入)、52-56 (HCDR2)及95-102 (HCDR3);且VL中之胺基酸殘基編號為26-32 (LCDR1) (例如位置30之後的插入)、50-52 (LCDR2)及91-96 (LCDR3)。藉由組合Kabat及Chothia兩者之CDR定義,CDR包含或由例如以下組成:人類VH中之胺基酸殘基26-35 (HCDR1)、50-65 (HCDR2)及95-102 (HCDR3),及人類VL中胺基酸殘基24-34 (LCDR1)、50-56 (LCDR2)及89-97 (LCDR3)。根據IMGT,VH中之CDR胺基酸殘基編號為約26-35 (CDR1)、51-57 (CDR2)及93-102 (CDR3),且VL中之CDR胺基酸殘基編號為約27-32 (CDR1)、50-52 (CDR2)及89-97 (CDR3)(根據「Kabat」編號)。根據IMGT,抗體之CDR區可使用程式IMGT/DomainGap Align測定。 通常,除非特定指示,否則抗體分子可包括一或多個Kabat CDR及/或Chothia CDR之任何組合。 術語「抗原決定基」包括能夠特異性結合至免疫球蛋白或者以其他方式與分子相互作用之任何蛋白質決定子。抗原決定基決定子一般由諸如胺基酸或碳水化合物或糖側鏈之分子之化學活性表面基團組成,且通常具有特定三維結構特徵,以及荷質比特徵。抗原決定基可為「線性」或「構形」。構形抗原決定基與線性抗原決定基之區別在於,在變性溶劑存在下,與前者之結合消失,但與後者之結合未消失。 如本文所用,片語「單株抗體」或「單株抗體組合物」係指具有實質上一致的胺基酸序列或來源於同一遺傳來源之多肽,包括抗體、雙特異性抗體等。此術語亦包括具有單一分子組成之抗體分子之製劑。單株抗體組合物顯示針對特定抗原決定基之單一結合特異性及親和力。 如本文所用,片語「人類抗體」包括可變區之構架區及CDR區均來源於人源序列之抗體。此外,若抗體含有恆定區,則恆定區亦來源於此類人類序列,例如人類生殖系序列,或人類生殖系序列或抗體之突變型,其含有來源於人類構架序列分析之共同構架序列,例如如Knappik等人(2000. J Mol Biol 296, 57-86)中所述。免疫球蛋白可變域,例如CDR之結構及位置可使用熟知編號流程,例如Kabat編號流程、Chothia編號流程或Kabat與Chothia之組合及ImMunoGenTics (IMGT)編號來定義(參見例如Sequences of Proteins of Immunological Interest, U.S. Department of Health and Human Services (1991), Kabat等人編;Al Lazikani等人, (1997) J. Mol. Bio. 273:927 948);Kabat 等人, (1991) Sequences of Proteins of Immunological Interest, 第5版, NIH出版號91-3242 U.S. Department of Health and Human Services;Chothia等人, (1987) J. Mol. Biol. 196:901-917;Chothia 等人, (1989) Nature 342:877-883;Al-Lazikani等人, (1997) J. Mal. Biol. 273:927-948及Lefranc, M.-P., The Immunologist, 7, 132-136 (1999);Lefranc, M.-P.等人, Dev. Comp. Immunol., 27, 55-77 (2003))。 本發明之人類抗體可包括並非由人類序列編碼之胺基酸殘基(例如由活體外隨機或位點特異性突變誘發或藉由活體內體細胞突變引入之突變或促成穩定性或製造之保守取代)。然而,如本文所用,術語「人類抗體」並不意欲包括來源於另一哺乳動物物種(諸如小鼠)之生殖系的CDR序列已移植於人類構架序列上的抗體。 如本文所用,片語「重組人類抗體」包括藉由重組方式製備、表現、產生或分離的所有人類抗體,諸如自人類免疫球蛋白基因之轉殖基因或轉殖染色體動物(例如小鼠)或自其製備之融合瘤中分離的抗體;自經轉型以表現人類抗體之宿主細胞(例如轉染瘤)中分離的抗體;自重組、組合人類抗體文庫中分離的抗體;及藉由任何其他方式(包括將人類免疫球蛋白基因序列之全部或一部分與其他DNA序列拼接)製備、表現、產生或分離的抗體。此類重組人類抗體具有構架區及CDR區來源於人類生殖系免疫球蛋白序列之可變區。然而,在某些實施例中,此類重組人類抗體可進行活體外突變誘發(或,當使用人類Ig序列之動物轉殖基因時,為活體內體細胞突變誘發),且由此重組抗體之VH及VL區之胺基酸序列儘管來源於且關於人類生殖系VH及VL序列,然而該等胺基酸序列為可不活體內天然存在於人類抗體生殖系抗體庫內之序列。 如本文所用,術語「Fc區」係指包含抗體恆定域之CH3、CH2及鉸鏈區之至少一部分的多肽。視情況,Fc區可包括存在於一些抗體類別中之CH4域。Fc區可包含抗體恆定域之全部鉸鏈區。在一個實施例中,本發明包含抗體之Fc區及CH1區。在一個實施例中,本發明包含抗體之Fc區CH3區。在另一實施例中,本發明包含抗體恆定域之Fc區、CH1區及Cκ/λ區。在一個實施例中,本發明之結合分子包含恆定區,例如重鏈恆定區。在一個實施例中,此類恆定區與野生型恆定區相比經修飾。亦即,本文所揭示之本發明之多肽可包含對三個重鏈恆定域(CH1、CH2或CH3)及/或輕鏈恆定區域(CL)中之一或多者的更改或修飾。修飾實例包括一或多個域中之一或多個胺基酸的添加、缺失或取代。可包括此類變化以使效應功能、半衰期等最佳化。 如本文所用,術語「結合特異性」係指個別抗體組合位點與一種抗原決定子反應且不與不同抗原決定子反應之能力。抗體之組合位點位於分子之Fab部分中,且由重鏈及輕鏈之高變區構築。抗體之結合親和力為單個抗原決定子與抗體上單個組合位點之間的反應強度。其為抗原決定子與抗體組合位點之間作用的引力及斥力總和。 如本文所用,術語「親和力」係指在單一抗原位點處抗體與抗原之間相互作用的強度。在各抗原位點內,抗體「臂」之可變區經由弱非共價力與抗原在多個位點處相互作用;相互作用愈大,親和力愈強。 術語「保守序列修飾」係指胺基酸修飾不顯著影響或改變含有該胺基酸序列之抗體或抗體片段之結合特徵。此類保守修飾包括胺基酸取代、添加及缺失。修飾可藉由此項技術中已知之標準技術(諸如定點突變誘發及PCR介導之突變誘發)引入本發明之抗體或抗體片段中。保守胺基酸取代為胺基酸殘基經具有類似側鏈之胺基酸殘基置換之取代。此項技術中已限定具有類似側鏈之胺基酸殘基家族。此等家族包括具有鹼性側鏈(例如離胺酸、精胺酸、組胺酸)、酸性側鏈(例如天冬胺酸、麩胺酸)、不帶電極性側鏈(例如甘胺酸、天冬醯胺、麩醯胺酸、絲胺酸、蘇胺酸、酪胺酸、半胱胺酸、色胺酸)、非極性側鏈(例如丙胺酸、纈胺酸、白胺酸、異白胺酸、脯胺酸、苯丙胺酸、甲硫胺酸)、β分支鏈側鏈(例如蘇胺酸、纈胺酸、異白胺酸)及芳族側鏈(例如酪胺酸、苯丙胺酸、色胺酸、組胺酸)之胺基酸。因此,抗體中之一或多個胺基酸殘基可經來自相同側鏈家族之其他胺基酸殘基置換,且經改變之抗體可使用本文所述之功能分析來測試。 術語「同源」或「一致性」係指在兩個聚合分子之間,例如在諸如兩個DNA分子或兩個RNA分子之兩個核酸分子之間,或在兩個多肽分子之間的次單元序列一致性。當兩個分子中之次單元位置由相同單體次單元佔據時;例如若兩個DNA分子中之每一者中之位置均由腺嘌呤佔據,則其在彼位置處為同源或一致的。兩個序列之間的同源性為匹配或同源位置數目之直接函數;例如若兩個序列中之位置有一半(例如長度為十個次單元之聚合物中之五個位置)同源,則該兩個序列為50%同源;若90%之位置(例如10個中之9個)匹配或同源,則該兩個序列為90%同源。「序列一致性」之百分比可藉由經由比較窗比較兩個最佳比對序列來測定,其中與參考序列(其不包含添加或缺失)相比,比較窗中胺基酸序列之片段可包含添加或缺失(例如缺口或突出物),以得到兩個序列之最佳比對。該百分比可如下計算:測定兩個序列中存在之一致胺基酸殘基的位置數,得到匹配位置數,將匹配位置數除以比較窗中之總位置數且將結果乘以100,得到序列一致性百分比。輸出為目標個體序列相對關於查詢序列之一致性百分比。兩個序列之間的百分比一致性與該等序列共有的一致位置數目有關,考慮兩個序列之最佳比對所需要引入的間隙數目及各間隙長度。 可使用數學演算法達成序列比較及測定兩個序列之間的一致性百分比。在一較佳實施例中,兩個胺基酸序列之間的一致性百分比係使用Needleman及Wunsch ((1970) J. Mol. Biol. 48:444-453)演算法(其已併入GCG套裝軟體(可在www.gcg.com獲得)中之GAP程式中),使用Blossum 62矩陣或PAM250矩陣,及16、14、12、10、8、6或4之間隙權數及1、2、3、4、5或6之長度權數來測定。在另一較佳實施例中,兩個核苷酸序列之間的一致性百分比係使用GCG套裝軟體(可在www.gcg.com獲得)中之GAP程式測定,其使用NWSgapdna.CMP矩陣及40、50、60、70或80之間隙權數及1、2、3、4、5或6之長度權數。一種尤其較佳參數集合(及應使用者,除非另外說明)為Blossum 62計分矩陣,其使用間隙罰分12、間隙擴展罰分4及讀框轉移間隙罰分5。 亦可使用E. Meyers及W. Miller ((1989) CABIOS, 4:11-17)之算法(其已併入ALIGN程式(2.0版)中),使用PAM120權數殘基表、間隙長度罰分12及間隙罰分4來測定兩個胺基酸或核苷酸序列之間的一致性百分比。 本文所述之核酸及蛋白質序列可作為「查詢序列」用於對照公共資料庫執行搜尋,例如以鑑別其他家族成員或相關序列。此等檢索可使用Altschul等人(1990) J. Mol. Biol. 215:403-10之NBLAST及XBLAST程式(2.0版)進行。BLAST核苷酸檢索可用NBLAST程式(評分=100,字長=12)執行以獲得與本發明之核酸分子同源之核苷酸序列。BLAST蛋白質檢索可用XBLAST程式(評分=50,字長=3)執行以獲得與本發明之蛋白質分子同源的胺基酸序列。為使間隙式比對達成比較目的,可如Altschul等人, (1997) Nucleic Acids Res. 25:3389-3402中所述使用間隙式BLAST。使用BLAST及間隙式BLAST程式時,可使用對應程式(例如XBLAST及NBLAST)之預設參數。參見www.ncbi.nlm.nih.gov。 術語「癌症」及「癌變」係指或描述哺乳動物中典型地以不受調節之細胞生長為特徵的生理病狀。癌症之實例包括(但不限於)癌瘤、淋巴瘤、母細胞瘤(包括神經管胚細胞瘤及視網膜母細胞瘤)、肉瘤(包括脂肪肉瘤及滑膜細胞肉瘤)、神經內分泌腫瘤(包括類癌瘤、胃泌素瘤及胰島細胞癌)、間皮瘤、神經鞘瘤(包括聽神經瘤)、腦膜瘤、腺癌、黑色素瘤,及白血病或淋巴惡性疾病。該等癌症之更特定實例包括鱗狀細胞癌(例如上皮鱗狀細胞癌);肺癌,包括小細胞肺癌、非小細胞肺癌、肺腺癌及肺鱗狀癌;腹膜癌、肝細胞癌、胃癌,包括胃腸癌;胰臟癌、神經膠母細胞瘤、子宮頸癌、卵巢癌、肝癌、膀胱癌、泌尿道癌、肝瘤、乳癌、結腸癌、直腸癌、結腸直腸癌、子宮內膜或子宮癌、唾液腺癌、腎臟或腎癌、前列腺癌、外陰癌、甲狀腺癌、肝癌、肛門癌、陰莖癌、睾丸癌、食道癌、膽道腫瘤以及頭頸癌。 「HER2陽性癌症」或「表現HER2之癌」為包含以下細胞之癌症,該等細胞在其細胞表面處存在HER2蛋白質。用於偵測或測定癌細胞上存在HER2之多種方法為此項技術中已知的。舉例而言,在一些實施例中,細胞表面上HER2之存在可藉由免疫組織化學(IHC)、流式細胞測量術、西方墨點法(Western blotting)、免疫螢光分析、放射免疫分析(RIA)、酶聯結免疫吸附劑分析法(ELISA)、均相時差式螢光(HTRF)或正電子發射斷層攝影術(PET)測定。 如本文所用,術語「組合」或「醫藥組合」意謂由混合或組合多於一種活性成分所產生之產物且包括活性成分之固定與不固定組合兩者。術語「固定組合」意謂以單一實體或劑量形式向個體同時投與活性成分,舉例而言,本發明化合物及一或多種額外治療劑。術語「非固定組合」意謂在沒有特定時間限制之情況下,以單獨實體形式向個體同時、並行或依序投與活性成分,舉例而言,本發明化合物及一或多種額外治療劑,其中該投與在個體體內提供治療有效量之活性成分。後者亦適用於混合物療法,例如投與3種或大於3種活性成分。 如本文所用,術語「組合物」或「醫藥組合物」係指本發明化合物與至少一種及視情況選用之多於一種其他醫藥學上可接受之化學組分,諸如載劑、穩定劑、稀釋劑、分散劑、懸浮劑、增稠劑及/或賦形劑之混合物。 如本文所用,術語「光學異構體」或「立體異構體」係指可為本發明之指定化合物而存在之各種立體異構組態中之任一者,且包括幾何異構體。應理解,取代基可附接在碳原子之對掌性中心處。術語「對掌性」係指對其鏡像搭配物具有不重疊性之特性的分子,而術語「非對掌性」係指可重疊其鏡像搭配物之分子。因此,本發明包括化合物之對映異構體、非對映異構體或外消旋體。 「對映異構體」為一對彼此為不可重疊鏡像之立體異構體。一對對映異構體之1:1混合物為「外消旋」混合物。術語用於在適當時指明外消旋混合物。「非對映異構體」為具有至少兩個不對稱原子但彼此不為鏡像之立體異構體。根據Cahn-Ingold-Prelog R-S系統指定絕對立體化學。當化合物為純對映異構體時,可藉由R或S指定各對掌性碳處之立體化學。視化合物旋轉鈉D線之波長下之平面偏振光之方向(右旋或左旋)而定,可將絕對組態未知的經解析化合物指定為(+)或(-)。本文所述之某些化合物含有一或多個不對稱中心或軸,且可因此產生對映異構體、非對映異構體及就絕對立體化學而言可定義為(R)-或(S)-之其他立體異構形式。 如本文所用,術語「醫藥學上可接受之載劑」包括如熟習此項技術者已知的任何及所有溶劑、分散介質、包衣、界面活性劑、抗氧化劑、防腐劑(例如抗細菌劑、抗真菌劑)、等張劑、吸收延遲劑、鹽、防腐劑、藥物穩定劑、黏合劑、賦形劑、崩解劑、潤滑劑、甜味劑、調味劑、染料及其類似物及其組合(參見例如,Remington's Pharmaceutical Sciences, 第18版, Mack Printing Company, 1990, 第1289-1329頁)。除非任何習知載劑與活性成分不相容,否則涵蓋其在治療或醫藥組合物中之用途。 如本文所用,術語「醫藥學上可接受之鹽」係指不消除本發明化合物之生物活性及特性,且不會對其所投與之個體引起顯著刺激之鹽。 如本文所用,術語「個體」涵蓋哺乳動物及非哺乳動物。哺乳動物之實例包括(但不限於)人類、黑猩猩、猿、猴、牛、馬、綿羊、山羊、豬、兔、狗、貓、大鼠、小鼠、天竺鼠及其類似者。非哺乳動物之實例包括(但不限於)鳥類、魚及其類似者。個體常常為人類。 術語「需要此類治療之個體」係指將由此類治療在生物學、醫學上或在生活品質方面受益之個體。 如本文所用,術語「治療有效量」係指將引起個體發生生物或醫學反應,例如降低或抑制酶或蛋白質活性,或改善症狀、緩解病狀、減緩或延遲疾病進展,或預防疾病等的本發明抗體結合物之量。在一個非限制性實施例中,術語「治療有效量」係指當向個體投與時,有效地至少部分緩解、抑制、預防及/或減輕病狀或病症或疾病的本發明抗體結合物之量。 如本文所用,術語「TLR7促效劑」係指能夠活化類鐸受體7 (TLR7)之化合物或抗體結合物。 如本文所用,術語「治療(treat/treating/treatment)」係指緩解、緩和或改善疾病或病狀症狀;預防額外症狀;改善或預防症狀之根本代謝病因;抑制疾病或病狀,例如遏制疾病或病狀發展;減輕疾病或病狀;引起疾病或病狀消退;減輕疾病或病狀所引起之病狀;或預防性及/或治療性遏止疾病或病狀之症狀的方法。 本文中所提供之化合物名稱係使用ChemDraw Ultra第12.0版(CambridgeSoft®)或JChem第5.3.1版(ChemAxon)獲得。 除非另外規定,否則術語「本發明化合物」、「本發明之化合物」或「本文所提供之化合物」係指式(I)及其子式之化合物(亦即式(Ia)及式(Ib)化合物)及其醫藥學上可接受之鹽、立體異構體(包括非對映異構體及對映異構體)、互變異構體及經同位素標記之化合物(包括氘取代)。 除非另外規定,否則術語「本發明之抗體結合物」係指式(II)及其子式之抗體結合物(亦即式(IIa)及式(IIb)化合物)及其醫藥學上可接受之鹽、立體異構體(包括非對映異構體及對映異構體)、互變異構體及經同位素標記之化合物(包括氘取代)。 如本文所用,除非本文中另外指示或與上下文明顯矛盾,否則本發明之上下文中(尤其在申請專利範圍之上下文中)所用的術語「一(a/an)」、「該」及類似術語應解釋為涵蓋單數及複數兩者。 本發明之免疫刺激化合物 本發明之免疫刺激化合物為具有式(I)結構之TLR7促效劑:式(I) 其中: RD且RE 為H;或RE且RD 為H; R1 為-NHR2 或-NHCHR2 R3 ; R2 為-C3 -C6 烷基或-C4 -C6 烷基; R3 為L1 OH; L1 為-(CH2 )m -; L2 為-(CH2 )n -、-((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-(CH2 )n X1 (CH2 )n -、-(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -、-(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n C(=O)NH(CH2 )n -、-((CH2 )n O)t (CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n 、-C(=O)(CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n X1 (CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n C(=O)NH(CH2 )n -、-C(=O)NH((CH2 )n O)t (CH2 )n X1 (CH2 )n -、-C(=O)X2 X3 C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-C(=O)X2 X3 C(=O)(CH2 )n -、-C(=O)X2 C(=O)(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -、-C(=O)X2 C(=O)(CH2 )n NHC(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-C(=O)(CH2 )n C(R7 )2 -、-C(=O)(CH2 )n C(R7 )2 SS(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -、-(CH2 )n X2 C(=O)(CH2 )n NHC(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -或-C(=O)(CH2 )n C(=O)NH(CH2 )n ; R4、-ONH2 、-NH2、-N3、-NHC(=O)CH=CH2 、-SH、-SR7 、-OH、-SSR6 、-S(=O)2 (CH=CH2 )、-(CH2 )2 S(=O)2 (CH=CH2 )、-NHS(=O)2 (CH=CH2 )、-NHC(=O)CH2 Br、-NHC(=O)CH2 I、-C(O)NHNH2、-CO2 H、-C(O)NHNH2 ; R5; X1; X2; X3 ; R6 為2-吡啶基或4-吡啶基; 各R7 獨立地選自H及C1 -C6 烷基; 各R8 獨立地選自H、C1 -C6 烷基、F、Cl及-OH; 各R9 獨立地選自H、C1 -C6 烷基、F、Cl、-NH2 、-OCH3 、-OCH2 CH3 、-N(CH3 )2 、-CN、-NO2 及-OH; 各R10 獨立地選自H、C1 - 6 烷基、氟基、經-C(=O)OH取代之苯甲氧基、經-C(=O)OH取代之苯甲基、經-C(=O)OH取代之C1 - 4 烷氧基及經-C(=O)OH取代之C1 - 4 烷基; 各m獨立地選自1、2、3及4; 各n獨立地選自1、2、3及4; 及 各t獨立地選自1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17及18。 本發明化合物之某些態樣及實例提供於其他枚舉實施例之以下清單中。應認識到在各實施例中指定之特徵可與其他指定特徵組合,以提供本發明之其他實施例。 實施例1. 一種式(I)化合物及其醫藥學上可接受之鹽,其中: RD且RE 為H;或RE且RD 為H; R1 為-NHR2 或-NHCHR2 R3 ; R2 為-C3 -C6 烷基或-C4 -C6 烷基; R3 為L1 OH; L1 為-(CH2 )m -; L2 為-(CH2 )n -、-((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-(CH2 )n X1 (CH2 )n -、-(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -、-(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n C(=O)NH(CH2 )n -、-((CH2 )n O)t (CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n 、-C(=O)(CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n X1 (CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n C(=O)NH(CH2 )n -、-C(=O)NH((CH2 )n O)t (CH2 )n X1 (CH2 )n -、-C(=O)X2 X3 C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-C(=O)X2 C(=O)(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -或-C(=O)(CH2 )n C(=O)NH(CH2 )n ; R4、-ONH2 、-NH2、-N3、-NHC(=O)CH=CH2 、SH、-SSR6 、-S(=O)2 (CH=CH2 )、-(CH2 )2 S(=O)2 (CH=CH2 )、-NHS(=O)2 (CH=CH2 )、-NHC(=O)CH2 Br、-NHC(=O)CH2 I、-C(O)NHNH2、-CO2 H、-C(O)NHNH2 ; R5;X1; X2; X3; R6 為2-吡啶基或4-吡啶基; 各R7 獨立地選自H及C1 -C6 烷基; 各R8 獨立地選自H、C1 -C6 烷基、F、Cl及-OH; 各R9 獨立地選自H、C1 -C6 烷基、F、Cl、-NH2 、-OCH3 、-OCH2 CH3 、-N(CH3 )2 、-CN、-NO2 及-OH; 各R10 獨立地選自H、C1 - 6 烷基、氟基、經-C(=O)OH取代之苯甲氧基、經-C(=O)OH取代之苯甲基、經-C(=O)OH取代之C1 - 4 烷氧基及經-C(=O)OH取代之C1 - 4 烷基; 各m獨立地選自1、2、3及4; 各n獨立地選自1、2、3及4; 及 各t獨立地選自1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17及18。 實施例2. 一種具有式(Ia)或式(Ib)結構之式(I)化合物及其醫藥學上可接受之鹽:式(Ia) 式(Ib) 其中: R1 為-NHR2 或-NHCHR2 R3 ; R2 為-C3 -C6 烷基或-C4 -C6 烷基; R3 為L1 OH; L1 為-(CH2 )m -; L2 為-(CH2 )n -、-((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-(CH2 )n X1 (CH2 )n -、-(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -、-(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n C(=O)NH(CH2 )n -、-((CH2 )n O)t (CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n 、-C(=O)(CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n X1 (CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n C(=O)NH(CH2 )n -、-C(=O)NH((CH2 )n O)t (CH2 )n X1 (CH2 )n -、-C(=O)X2 X3 C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-C(=O)X2 X3 C(=O)(CH2 )n -、-C(=O)X2 C(=O)(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -、-C(=O)X2 C(=O)(CH2 )n NHC(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-C(=O)(CH2 )n C(R7 )2 -、-C(=O)(CH2 )n C(R7 )2 SS(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -、-(CH2 )n X2 C(=O)(CH2 )n NHC(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -或-C(=O)(CH2 )n C(=O)NH(CH2 )n ; R4、-ONH2 、-NH2、-N3、-NHC(=O)CH=CH2 、SH、-SR7 、-OH、-SSR6 、-S(=O)2 (CH=CH2 )、-(CH2 )2 S(=O)2 (CH=CH2 )、-NHS(=O)2 (CH=CH2 )、-NHC(=O)CH2 Br、-NHC(=O)CH2 I、-C(O)NHNH2、-CO2 H、-C(O)NHNH2 、 或; R5;X1; X2; X3 ; R6 為2-吡啶基或4-吡啶基; 各R7 獨立地選自H及C1 -C6 烷基; 各R8 獨立地選自H、C1 -C6 烷基、F、Cl及-OH; 各R9 獨立地選自H、C1 -C6 烷基、F、Cl、-NH2 、-OCH3 、-OCH2 CH3 、-N(CH3 )2 、-CN、-NO2 及-OH; 各R10 獨立地選自H、C1 - 6 烷基、氟基、經-C(=O)OH取代之苯甲氧基、經-C(=O)OH取代之苯甲基、經-C(=O)OH取代之C1 - 4 烷氧基及經-C(=O)OH取代之C1 - 4 烷基; 各m獨立地選自1、2、3及4; 各n獨立地選自1、2、3及4; 及 各t獨立地選自1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17及18。 實施例3. 如式(Ia)或式(Ib)化合物及其醫藥學上可接受之鹽,其中: R1 為-NHR2 或-NHCHR2 R3 ; R2 為-C3 -C6 烷基或-C4 -C6 烷基; R3 為L1 OH; L1 為-(CH2 )m -; L2 為-(CH2 )n -、-((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-(CH2 )n X1 (CH2 )n -、-(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -、-(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n C(=O)NH(CH2 )n -、-((CH2 )n O)t (CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n 、-C(=O)(CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n X1 (CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n C(=O)NH(CH2 )n -、-C(=O)NH((CH2 )n O)t (CH2 )n X1 (CH2 )n -、-C(=O)X2 X3 C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-C(=O)X2 C(=O)(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -或-C(=O)(CH2 )n C(=O)NH(CH2 )n ; R4、-ONH2 、-NH2、-N3、-NHC(=O)CH=CH2 、SH、-SSR6 、-S(=O)2 (CH=CH2 )、-(CH2 )2 S(=O)2 (CH=CH2 )、-NHS(=O)2 (CH=CH2 )、-NHC(=O)CH2 Br、-NHC(=O)CH2 I、-C(O)NHNH2、-CO2 H、-C(O)NHNH2 ; R5;X1; X2; X3; R6 為2-吡啶基或4-吡啶基; 各R7 獨立地選自H及C1 -C6 烷基; 各R8 獨立地選自H、C1 -C6 烷基、F、Cl及-OH; 各R9 獨立地選自H、C1 -C6 烷基、F、Cl、-NH2 、-OCH3 、-OCH2 CH3 、-N(CH3 )2 、-CN、-NO2 及-OH; 各R10 獨立地選自H、C1 - 6 烷基、氟基、經-C(=O)OH取代之苯甲氧基、經-C(=O)OH取代之苯甲基、經-C(=O)OH取代之C1 - 4 烷氧基及經-C(=O)OH取代之C1 - 4 烷基; 各m獨立地選自1、2、3及4; 各n獨立地選自1、2、3及4; 及 各t獨立地選自1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17及18。 實施例4. 一種具有式(Ia)或式(Ib)結構之式(I)化合物及其醫藥學上可接受之鹽:式(Ia) 式(Ib) 其中: R1 為-NHR2 或-NHCHR2 R3 ; R2 為-C3 -C6 烷基或-C4 -C6 烷基; R3 為L1 OH; L1 為-(CH2 )m -; L2 為-(CH2 )n -、-((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-(CH2 )n X1 (CH2 )n -、-(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -、-(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n C(=O)NH(CH2 )n -、-((CH2 )n O)t (CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n 、-C(=O)(CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n X1 (CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n C(=O)NH(CH2 )n -、-C(=O)NH((CH2 )n O)t (CH2 )n X1 (CH2 )n -、-C(=O)X2 X3 C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-C(=O)X2 C(=O)(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -或-C(=O)(CH2 )n C(=O)NH(CH2 )n ; R4、-ONH2 、-NH2、-NHC(=O)CH=CH2 、-N3、SH、-SSR6 、-S(=O)2 (CH=CH2 )、-(CH2 )2 S(=O)2 (CH=CH2 )、-NHS(=O)2 (CH=CH2 )、-NHC(=O)CH2 Br、-NHC(=O)CH2 I、-C(O)NHNH2-CO2 H; R5;X1; X2; X3; R6 為2-吡啶基或4-吡啶基; 各R7 獨立地選自H及C1 -C6 烷基; 各m獨立地選自1、2、3及4; 各n獨立地選自1、2、3及4; 及 各t獨立地選自1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17及18。 實施例5. 如式(I)、式(Ia)或式(Ib)化合物,其中: R1 為-NHR2 或-NHCHR2 R3 ; R2 為-C4 -C6 烷基; R3 為L1 OH; L1 為-(CH2 )m -; L2 為-(CH2 )n -、-((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-(CH2 )n X1 (CH2 )n -、-(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -、-(CH2 )n NHC(=O(CH2 )n C(=O)NH(CH2 )n -、-((CH2 )n O)t (CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n 、-C(=O)(CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n X1 (CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n C(=O)NH(CH2 )n -、-C(=O)NH((CH2 )n O)t (CH2 )n X1 (CH2 )n -、-C(=O)X2 X3 C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-C(=O)X2 C(=O)(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -或-C(=O)(CH2 )n C(=O)NH(CH2 )n -; R4、-ONH2 、-NH2; R5;X1;X2; X3; 各m獨立地選自1、2、3及4; 各n獨立地選自1、2、3及4; 及 各t獨立地選自1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17及18。 實施例6. 如式(I)、式(Ia)或式(Ib)化合物,其中: R1 為-NHR2 ;R2 為-C4 -C6 烷基; L2 為-(CH2 )n -、-((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-(CH2 )n X1 (CH2 )n -、-(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -、-(CH2 )n NHC(=O(CH2 )n C(=O)NH(CH2 )n -、-((CH2 )n O)t (CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n 、-C(=O)(CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n X1 (CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -、-C(=O)NH((CH2 )n O)t (CH2 )n X1 (CH2 )n -、-C(=O)X2 X3 C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-C(=O)X2 C(=O)(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -或-C(=O)(CH2 )n C(=O)NH(CH2 )n -; R4、、-ONH2 、-NH2; R5;X1;X2; X3; 各n獨立地選自1、2、3及4, 及 各t獨立地選自1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17及18。 實施例7. 如式(I)、式(Ia)或式(Ib)化合物,其中: R1 為-NHR2 ; R2 為-C4 -C6 烷基; L2 為-(CH2 )n -、-((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-(CH2 )n X1 (CH2 )n -、-C(=O)(CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n X1 (CH2 )n -、-C(=O)NH((CH2 )n O)t (CH2 )n X1 (CH2 )n -、-C(=O)X2 X3 C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -或-C(=O)X2 C(=O)(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -; R4、-ONH2 、-NH2; R5;X1;X2; X3; 各n獨立地選自1、2、3及4, 及 各t獨立地選自1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17及18。 實施例8. 如式(I)、式(Ia)或式(Ib)化合物,其中: R1 為-NHR2 ; R2 為-C4 -C6 烷基; L2 為-(CH2 )n -或-C(=O)(CH2 )n ; R4、-ONH2 、-NH2; R5, 及 各n獨立地選自1、2、3及4。 實施例9. 如式(I)、式(Ia)或式(Ib)化合物,其中: R1 為-NHR2 ; R2 為-C4 -C6 烷基; L2 為-(CH2 )n -或-C(=O)(CH2 )n ; R4; R5, 及 各n獨立地選自1、2、3及4。 實施例10. 如式(I)、式(Ia)或式(Ib)化合物,其中: R1 為-NHR2 ; R2 為-C4 -C6 烷基; L2 為-(CH2 )n -或-C(=O)(CH2 )n ; R4 為-ONH2 或-NH2 ; 及 各n獨立地選自1、2、3及4。 實施例11. 如式(I)、式(Ia)或式(Ib)化合物,其中: R1 為-NHR2 ; R2 為-C4 -C6 烷基; L2 為-(CH2 )n -或-C(=O)(CH2 )n ; R4; 及 各n獨立地選自1、2、3及4。 實施例12. 如式(I)、式(Ia)或式(Ib)化合物,其中:R1 為-NHR2 。 實施例13. 如式(I)、式(Ia)或式(Ib)化合物,其中:R1 為-NHCHR2 R3 。 實施例14. 如式(I)、式(Ia)或式(Ib)化合物,其中:R2 為-C4 烷基。 實施例15. 如式(I)、式(Ia)或式(Ib)化合物,其中:R2 為-C5 烷基。 實施例16. 如式(I)、式(Ia)或式(Ib)化合物,其中:R2 為-C6 烷基。 實施例17. 如式(I)、式(Ia)或式(Ib)化合物,其中:R3 為L1 OH。 實施例18. 如式(I)、式(Ia)或式(Ib)化合物,其中:L1 為-(CH2 )-。 實施例19. 如式(I)、式(Ia)或式(Ib)化合物,其中:L1 為-(CH2 CH2 )-。 實施例20. 如式(I)、式(Ia)或式(Ib)化合物,其中: L2 為-(CH2 )n -*、-((CH2 )n O)t (CH2 )n -*、-(CH2 )n X1 (CH2 )n -*、-(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -*、-(CH2 )n NHC(=O(CH2 )n C(=O)NH(CH2 )n -*或-((CH2 )n O)t (CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n *,其中*表示與R4 之連接點。 實施例21. 如式(I)、式(Ia)或式(Ib)化合物,其中: L2 為-C(=O)(CH2 )n *-、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -*、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n X1 (CH2 )n -*、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -*、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n C(=O)NH(CH2 )n -*、-C(=O)NH((CH2 )n O)t (CH2 )n X1 (CH2 )n -* 、-C(=O)X2 X3 C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -*、-C(=O)X2 C(=O)(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -*或-C(=O)(CH2 )n C(=O)NH(CH2 )n -*,其中*表示與R4 之連接點。 實施例22. 如式(I)、式(Ia)或式(Ib)化合物,其中: L2 為-(CH2 )n -*或-C(=O)(CH2 )n -*,其中*表示與R4 之連接點。 實施例23. 如式(I)、式(Ia)或式(Ib)化合物,其中: L2 為-(CH2 CH2 )-*或-C(=O)(CH2 CH2 )-* ,其中*表示與R4 之連接點。 實施例24. 如式(I)、式(Ia)或式(Ib)化合物,其中: L2 為-C(=O)X2 X3 C(=O)(CH2 )n -*、-C(=O)X2 C(=O)(CH2 )n NHC(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -*、-C(=O)(CH2 )n C(R7 )2 -*、-C(=O)(CH2 )n C(R7 )2 SS(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -*或-(CH2 )n X2 C(=O)(CH2 )n NHC(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -*,其中*表示與R4 之連接點。 實施例25. 如式(I)、式(Ia)或式(Ib)化合物,其中: R4。 實施例26. 如式(I)、式(Ia)或式(Ib)化合物,其中: R4 為-ONH2或-NH2 。 實施例27. 如式(I)、式(Ia)或式(Ib)化合物,其中: R4。 實施例28. 如式(I)、式(Ia)或式(Ib)化合物,其中: R4 為-NHC(=O)CH=CH2 、-N3、SH、-SSR6 、-S(=O)2 (CH=CH2 )、-(CH2 )2 S(=O)2 (CH=CH2 )、-NHS(=O)2 (CH=CH2 )、-NHC(=O)CH2 Br、-NHC(=O)CH2 I、-C(O)NHNH2、-CO2 H、-NHCH(=O)或-NHCH(=S)。 實施例29. 如式(I)、式(Ia)或式(Ib)化合物,其中: R4 。 實施例30. 如式(I)、式(Ia)或式(Ib)化合物,其中: R4 為-SR7 或-OH。 實施例31. 如式(I)、式(Ia)或式(Ib)化合物,其中R5。 實施例32. 如式(I)、式(Ia)或式(Ib)化合物,其中:X1。 實施例33. 如式(I)、式(Ia)或式(Ib)化合物,其中:X1。 實施例34. 如式(I)、式(Ia)或式(Ib)化合物,其中:X1。 實施例35. 如式(I)、式(Ia)或式(Ib)化合物,其中:X2。 實施例36. 如式(I)、式(Ia)或式(Ib)化合物,其中:X2。 實施例37. 如式(I)、式(Ia)或式(Ib)化合物,其中:X2。 實施例38. 如式(I)、式(Ia)或式(Ib)化合物,其中:X2。 實施例39. 如式(I)、式(Ia)或式(Ib)化合物,其中:X2。 實施例40. 如式(I)、式(Ia)或式(Ib)化合物,其中:X3。 實施例41. 如式(I)、式(Ia)或式(Ib)化合物,其中:X3。 實施例42. 如式(I)、式(Ia)或式(Ib)化合物,其中:X3。 實施例43. 如式(I)、式(Ia)或式(Ib)化合物,其中:X3。 實施例44. 如式(I)、式(Ia)或式(Ib)化合物,其中:X3。 實施例45. 如式(I)、式(Ia)或式(Ib)化合物,其中:R6 為2-吡啶基或4-吡啶基。 實施例46. 如式(I)、式(Ia)或式(Ib)化合物,其中:各R7 獨立地選自H及C1 -C6 烷基。 實施例47. 如式(I)、式(Ia)或式(Ib)化合物,其中:各R7 為H。 實施例48. 如式(I)、式(Ia)或式(Ib)化合物,其中:各R7 為C1 -C6 烷基。 實施例49. 如式(I)、式(Ia)或式(Ib)化合物,其中:各m獨立地選自1、2、3及4。 實施例50. 如式(I)、式(Ia)或式(Ib)化合物,其中:各m為1或2。 實施例51. 如式(I)、式(Ia)或式(Ib)化合物,其中:各n獨立地選自1、2、3及4。 實施例52. 如式(I)、式(Ia)或式(Ib)化合物,其中:各n為2或3。 實施例53. 如式(I)、式(Ia)或式(Ib)化合物,其中:各t獨立地選自1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17及18。 實施例54. 如式(I)、式(Ia)或式(Ib)化合物,其中:各t獨立地選自1、2、3、4、5及6。 實施例55. 如式(I)、式(Ia)或式(Ib)化合物,其選自: 1-(3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙基)-1H-吡咯-2,5-二酮; (2R)-2-胺基-3-((1-(3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙基)-2,5-二側氧基吡咯啶-3-基)硫基)丙酸; (6R)-6-(2-((3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙基)胺基)-2-側氧基乙基)-5-側氧基硫嗎啉-3-甲酸; 3-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-((3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙基)胺基)-4-側氧基丁酸; (S)-3-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-((3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙基)胺基)-4-側氧基丁酸; (R)-3-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-((3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙基)胺基)-4-側氧基丁酸; 2-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-((3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙基)胺基)-4-側氧基丁酸; (R)-2-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-((3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙基)胺基)-4-側氧基丁酸; (S)-2-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-((3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙基)胺基)-4-側氧基丁酸; 1-(2-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)乙基)-1H-吡咯-2,5-二酮; (2S)-2-胺基-3-((1-(2-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)乙基)-2,5-二側氧基吡咯啶-3-基)硫基)丙酸; (6R)-6-(2-((2-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)乙基)胺基)-2-側氧基乙基)-5-側氧基硫嗎啉-3-甲酸; 3-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-((2-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)乙基)胺基)-4-側氧基丁酸; (S)-3-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-((2-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)乙基)胺基)-4-側氧基丁酸; (R)-3-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-((2-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)乙基)胺基)-4-側氧基丁酸; 2-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-((2-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)乙基)胺基)-4-側氧基丁酸; (R)-2-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-((2-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)乙基)胺基)-4-側氧基丁酸; (S)-2-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-((2-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)乙基)胺基)-4-側氧基丁酸; 1-(2-(3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙氧基)乙基)-1H-吡咯-2,5-二酮; 3-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-((2-(3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙氧基)乙基)胺基)-4-側氧基丁酸; (S)-3-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-((2-(3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙氧基)乙基)胺基)-4-側氧基丁酸; (R)-3-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-((2-(3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙氧基)乙基)胺基)-4-側氧基丁酸; 2-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-((2-(3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙氧基)乙基)胺基)-4-側氧基丁酸; (R)-2-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-((2-(3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙氧基)乙基)胺基)-4-側氧基丁酸; (S)-2-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-((2-(3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙氧基)乙基)胺基)-4-側氧基丁酸; 1-(2-(2-(2-(3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙氧基)乙氧基)乙氧基)乙基)-1H-吡咯-2,5-二酮; (2R)-2-胺基-19-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-5-(羧甲基)-6,19-二側氧基-10,13,16-三氧雜-4-硫雜-7-氮雜十九烷-1-酸; (2R,5S)-2-胺基-19-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-5-(羧甲基)-6,19-二側氧基-10,13,16-三氧雜-4-硫雜-7-氮雜十九烷-1-酸; (2R,5R)-2-胺基-19-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-5-(羧甲基)-6,19-二側氧基-10,13,16-三氧雜-4-硫雜-7-氮雜十九烷-1-酸; (19R)-19-胺基-1-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-16-羧基-1,14-二側氧基-4,7,10-三氧雜-17-硫雜-13-氮雜二十烷-20-酸; (16R,19R)-19-胺基-1-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-16-羧基-1,14-二側氧基-4,7,10-三氧雜-17-硫雜-13-氮雜二十烷-20-酸; (16S,19R)-19-胺基-1-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-16-羧基-1,14-二側氧基-4,7,10-三氧雜-17-硫雜-13-氮雜二十烷-20-酸; 1-(21-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-21-側氧基-3,6,9,12,15,18-六氧雜二十一烷基)-1H-吡咯-2,5-二酮; (2R)-2-胺基-28-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-5-(羧甲基)-6,28-二側氧基-10,13,16,19,22,25-六氧雜-4-硫雜-7-氮雜二十八烷-1-酸; (2R,5S)-2-胺基-28-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-5-(羧甲基)-6,28-二側氧基-10,13,16,19,22,25-六氧雜-4-硫雜-7-氮雜二十八烷-1-酸; (2R,5R)-2-胺基-28-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-5-(羧甲基)-6,28-二側氧基-10,13,16,19,22,25-六氧雜-4-硫雜-7-氮雜二十八烷-1-酸; (28R)-28-胺基-1-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-25-羧基-1,23-二側氧基-4,7,10,13,16,19-六氧雜-26-硫雜-22-氮雜二十九烷-29-酸; (25R,28R)-28-胺基-1-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-25-羧基-1,23-二側氧基-4,7,10,13,16,19-六氧雜-26-硫雜-22-氮雜二十九烷-29-酸; (25S,28R)-28-胺基-1-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-25-羧基-1,23-二側氧基-4,7,10,13,16,19-六氧雜-26-硫雜-22-氮雜二十九烷-29-酸; 1-((1-(2-(2-(3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙氧基)乙氧基)乙基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)甲基)-1H-吡咯-2,5-二酮; (2R)-2-胺基-3-((2-(((1-(2-(2-(3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙氧基)乙氧基)乙基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)甲基)胺基)-2-側氧基乙基)硫基)戊二酸; N-(2-(2-(3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙氧基)乙氧基)乙基)-3-(2,5-二側氧基-2,5-二氫-1H-吡咯-1-基)丙醯胺; (19R)-19-胺基-1-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-16-(羧甲基)-1,11,15-三側氧基-4,7-二氧雜-17-硫雜-10,14-二氮雜二十烷-20-酸; (16S,19R)-19-胺基-1-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-16-(羧甲基)-1,11,15-三側氧基-4,7-二氧雜-17-硫雜-10,14-二氮雜二十烷-20-酸; (16R,19R)-19-胺基-1-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-16-(羧甲基)-1,11,15-三側氧基-4,7-二氧雜-17-硫雜-10,14-二氮雜二十烷-20-酸; (20R)-20-胺基-1-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-17-羧基-1,11,15-三側氧基-4,7-二氧雜-18-硫雜-10,14-二氮雜二十一烷-21-酸; (17R,20R)-20-胺基-1-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-17-羧基-1,11,15-三側氧基-4,7-二氧雜-18-硫雜-10,14-二氮雜二十一烷-21-酸; (17S,20R)-20-胺基-1-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-17-羧基-1,11,15-三側氧基-4,7-二氧雜-18-硫雜-10,14-二氮雜二十一烷-21-酸; 5-(4-((4-(3-胺丙基)哌嗪-1-基)甲基)-2-甲氧基苯甲基)-N4-戊基-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-2,4-二胺; 1-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-(2-(2-胺基乙氧基)乙氧基)丙-1-酮; N-(2-(2-(3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙氧基)乙氧基)乙基)-2-(2,5-二側氧基-2,5-二氫-1H-吡咯-1-基)乙醯胺; (2R)-2-胺基-19-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-5-(羧甲基)-6,9,19-三側氧基-13,16-二氧雜-4-硫雜-7,10-二氮雜十九烷-1-酸; (2R,5S)-2-胺基-19-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-5-(羧甲基)-6,9,19-三側氧基-13,16-二氧雜-4-硫雜-7,10-二氮雜十九烷-1-酸; (2R,5R)-2-胺基-19-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-5-(羧甲基)-6,9,19-三側氧基-13,16-二氧雜-4-硫雜-7,10-二氮雜十九烷-1-酸; (19R)-19-胺基-1-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-16-羧基-1,11,14-三側氧基-4,7-二氧雜-17-硫雜-10,13-二氮雜二十烷-20-酸; (16R,19R)-19-胺基-1-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-16-羧基-1,11,14-三側氧基-4,7-二氧雜-17-硫雜-10,13-二氮雜二十烷-20-酸; (16S,19R)-19-胺基-1-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-16-羧基-1,11,14-三側氧基-4,7-二氧雜-17-硫雜-10,13-二氮雜二十烷-20-酸; 4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)-N-(2-(2-(2-(2-(4-((2,5-二側氧基-2,5-二氫-1H-吡咯-1-基)甲基)-1H-1,2,3-三唑-1-基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙基)哌嗪-1-甲醯胺; 3-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-(((1-(1-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-1-側氧基-5,8,11-三氧雜-2-氮雜十三烷-13-基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)甲基)胺基)-4-側氧基丁酸; (S)-3-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-(((1-(1-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-1-側氧基-5,8,11-三氧雜-2-氮雜十三烷-13-基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)甲基)胺基)-4-側氧基丁酸; (R)-3-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-(((1-(1-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-1-側氧基-5,8,11-三氧雜-2-氮雜十三烷-13-基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)甲基)胺基)-4-側氧基丁酸; 2-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-(((1-(1-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-1-側氧基-5,8,11-三氧雜-2-氮雜十三烷-13-基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)甲基)胺基)-4-側氧基丁酸; (R)-2-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-(((1-(1-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-1-側氧基-5,8,11-三氧雜-2-氮雜十三烷-13-基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)甲基)胺基)-4-側氧基丁酸; (S)-2-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-(((1-(1-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-1-側氧基-5,8,11-三氧雜-2-氮雜十三烷-13-基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)甲基)胺基)-4-側氧基丁酸; 1-(2-(2-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)乙氧基)乙基)-1H-吡咯-2,5-二酮; 3-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-((2-(2-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)乙氧基)乙基)胺基)-4-側氧基丁酸; (S)-3-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-((2-(2-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)乙氧基)乙基)胺基)-4-側氧基丁酸; (R)-3-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-((2-(2-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)乙氧基)乙基)胺基)-4-側氧基丁酸; 2-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-((2-(2-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)乙氧基)乙基)胺基)-4-側氧基丁酸; (R)-2-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-((2-(2-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)乙氧基)乙基)胺基)-4-側氧基丁酸; (S)-2-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-((2-(2-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)乙氧基)乙基)胺基)-4-側氧基丁酸; 1-((1-(2-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)乙基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)甲基)-1H-吡咯-2,5-二酮; 3-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-(((1-(2-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)乙基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)甲基)胺基)-4-側氧基丁酸; (S)-3-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-(((1-(2-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)乙基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)甲基)胺基)-4-側氧基丁酸; (R)-3-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-(((1-(2-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)乙基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)甲基)胺基)-4-側氧基丁酸; 2-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-(((1-(2-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)乙基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)甲基)胺基)-4-側氧基丁酸; (R)-2-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-(((1-(2-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)乙基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)甲基)胺基)-4-側氧基丁酸; (S)-2-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-(((1-(2-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)乙基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)甲基)胺基)-4-側氧基丁酸; N-(21-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-21-側氧基-3,6,9,12,15,18-六氧雜二十一烷基)-3-(2,5-二側氧基-2,5-二氫-1H-吡咯-1-基)丙醯胺; 4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-甲酸4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-二側氧基-2,5-二氫-1H-吡咯-1-基)乙氧基)丙醯胺基)-3-甲基丁醯胺基)-5-脲基戊醯胺基)苯甲酯; (2R,3R,4R,5S)-6-(4-(((4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-羰基)氧基)甲基)-2-(3-(3-(2,5-二側氧基-2,5-二氫-1H-吡咯-1-基)丙醯胺基)丙醯胺基)苯氧基)-3,4,5-三羥基四氫-2H-哌喃-2-甲酸; (S)-1-(3-(4-(3-((2-胺基-4-((1-羥基己-2-基)胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-4-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙基)-1H-吡咯-2,5-二酮; 1-(3-(4-(3-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-4-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙基)-1H-吡咯-2,5-二酮; 3-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-((3-(4-(3-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-4-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙基)胺基)-4-側氧基丁酸; (S)-3-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-((3-(4-(3-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-4-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙基)胺基)-4-側氧基丁酸; (R)-3-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-((3-(4-(3-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-4-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙基)胺基)-4-側氧基丁酸; 2-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-((3-(4-(3-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-4-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙基)胺基)-4-側氧基丁酸; (R)-2-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-((3-(4-(3-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-4-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙基)胺基)-4-側氧基丁酸; (S)-2-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-((3-(4-(3-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-4-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙基)胺基)-4-側氧基丁酸; 1-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-2-(胺氧基)乙酮; 1-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-(2-胺基乙氧基)丙-1-酮; N-(2-(3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙氧基)乙基)-2-(胺氧基)乙醯胺; (S)-1-(4-(3-((2-胺基-4-((1-羥基己-2-基)胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-4-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-2-(胺氧基)乙酮; (S)-1-(4-(3-((2-胺基-4-((1-羥基己-2-基)胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-4-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-(2-(2-胺基乙氧基)乙氧基)丙-1-酮; (S)-N-(2-(2-(3-(4-(3-((2-胺基-4-((1-羥基己-2-基)胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-4-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙氧基)乙氧基)乙基)-2-(胺氧基)乙醯胺; N-(2-(2-(3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙氧基)乙氧基)乙基)-2-(胺氧基)乙醯胺; 5-(4-((4-(2-(2-(胺氧基)乙氧基)乙基)哌嗪-1-基)甲基)-2-甲氧基苯甲基)-N4-戊基-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-2,4-二胺; N-(3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)丙基)-2-(胺氧基)乙醯胺; 5-(4-((4-(2-(2-(2-胺基乙氧基)乙氧基)乙基)哌嗪-1-基)甲基)-2-甲氧基苯甲基)-N4-戊基-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-2,4-二胺; N-(2-(2-(2-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)乙氧基)乙氧基)乙基)-2-(胺氧基)乙醯胺; 5-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-5-側氧基戊酸2,5-二側氧基吡咯啶-1-基酯; 5-(4-(3-((2-胺基-4-((1-羥基己-2-基)胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-4-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-5-側氧基戊酸(S)-2,5-二側氧基吡咯啶-1-基酯; (S)-2-胺基-6-(5-(4-(3-((2-胺基-4-(((S)-1-羥基己-2-基)胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-4-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-5-側氧基戊醯胺基)己酸; (S)-2-胺基-6-(5-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-5-側氧基戊醯胺基)己酸; 5-((3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)丙基)胺基)-5-側氧基戊酸2,5-二側氧基吡咯啶-1-基酯; (S)-2-胺基-6-(5-((3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)丙基)胺基)-5-側氧基戊醯胺基)己酸; 5-(4-(3-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-4-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-5-側氧基戊酸2,5-二側氧基吡咯啶-1-基酯; (S)-2-胺基-6-(5-(4-(3-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-4-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-5-側氧基戊醯胺基)己酸; 5-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-5-側氧基戊酸全氟苯酯; 3-(3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙氧基)丙酸全氟苯酯; 3-(2-(3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙氧基)乙氧基)丙酸全氟苯酯; (S)-2-胺基-6-(3-(3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙氧基)丙醯胺基)己酸,及 N-(15-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-15-側氧基-3,6,9,12-四氧雜十五基)-5-((3aS,4S,6aR)-2-側氧基六氫-1H-噻吩并[3,4-d]咪唑-4-基)戊醯胺。 實施例56. 如式(I)、式(Ia)或式(Ib)化合物,其選自: 1-(3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙基)-1H-吡咯-2,5-二酮; 1-(2-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)乙基)-1H-吡咯-2,5-二酮; 1-(2-(3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙氧基)乙基)-1H-吡咯-2,5-二酮,及 1-(2-(2-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)乙氧基)乙基)-1H-吡咯-2,5-二酮。 實施例57. 如式(I)、式(Ia)或式(Ib)化合物,其選自: (2R,3R,4R,5S)-6-(4-(((4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-羰基)氧基)甲基)-2-(3-(3-(2-(2,5-二側氧基-2,5-二氫-1H-吡咯-1-基)乙氧基)丙醯胺基)丙醯胺基)苯氧基)-3,4,5-三羥基四氫-2H-哌喃-2-甲酸; 4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-甲酸4-((R)-6-胺基-2-((S)-2-(3-(2,5-二側氧基-2,5-二氫-1H-吡咯-1-基)丙醯胺基)-3-苯基丙醯胺基)己醯胺基)苯甲酯; 4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-甲酸4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-二側氧基-2,5-二氫-1H-吡咯-1-基)乙氧基)丙醯胺基)-3-甲基丁醯胺基)丙醯胺基)苯甲酯; (2S,3S,4S,5R,6S)-6-(4-(((4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-羰基)氧基)甲基)-2-(3-(3-(2,5-二側氧基-2,5-二氫-1H-吡咯-1-基)丙醯胺基)丙醯胺基)苯氧基)-3,4,5-三羥基四氫-2H-哌喃-2-甲酸; (2S,3S,4S,5R,6S)-6-(4-(((4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-羰基)氧基)甲基)-2-(3-(3-(2-(2,5-二側氧基-2,5-二氫-1H-吡咯-1-基)乙氧基)丙醯胺基)丙醯胺基)苯氧基)-3,4,5-三羥基四氫-2H-哌喃-2-甲酸; N-(2-((5-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-2-甲基-5-側氧基戊-2-基)二硫基)乙基)-3-(2,5-二側氧基-2,5-二氫-1H-吡咯-1-基)丙醯胺; 1-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-4-甲基-4-(甲硫基)戊-1-酮; (2S,3S,4S,5R,6S)-6-(4-((((2-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)乙氧基)(羥基)磷醯基)氧基)甲基)-2-(3-(3-(2-(2,5-二側氧基-2,5-二氫-1H-吡咯-1-基)乙氧基)丙醯胺基)丙醯胺基)苯氧基)-3,4,5-三羥基四氫-2H-哌喃-2-甲酸; (2R,2'R)-3,3'-((2-((2-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-2-側氧基乙氧基)亞胺基)丙烷-1,3-二基)雙(硫烷二基))雙(2-胺基丙酸); (R)-2-胺基-6-((((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)甲基)-17-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-10,17-二側氧基-8,14-二氧雜-4-硫雜-7,11-二氮雜十七碳-6-烯酸,及 2-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)乙-1-醇。 另外,用較重同位素,尤其氘(亦即2 H或D)取代可得到某些由較大代謝穩定性產生之治療優勢,例如活體內半衰期增加或劑量需求減少或治療指數改良。應理解,在此情形下,氘視為式(I)化合物之取代基。此類較重同位素(具體言之,氘)之濃度可由同位素增濃因素定義。如本文所用,術語「同位素增濃因素」意謂指定同位素之同位素豐度與天然豐度之間的比率。若本發明之化合物中的取代基表示為氘,則該化合物所具有的各指定氘原子之同位素增濃因素分別為至少3500 (在各指定氘原子處52.5%氘併入)、至少4000 (60%氘併入)、至少4500 (67.5%氘併入)、至少5000 (75%氘併入)、至少5500 (82.5%氘併入)、至少6000 (90%氘併入)、至少6333.3 (95%氘併入)、至少6466.7 (97%氘併入)、至少6600 (99%氘併入)或至少6633.3 (99.5%氘併入)。 根據本發明之醫藥學上可接受之溶劑合物包括其中結晶之溶劑可經同位素取代之彼等溶劑合物,例如D2 O、d6 -丙酮、d6 -DMSO。 用於製得式(I)及其子式之化合物的製程 用於製備式(I)及其子式之化合物的通用程序描述於本文中。在所述反應中,反應性官能基,例如羥基、胺基、亞胺基、硫醇基或羧基,在最終產物中需要此等基團之情況下可受保護以避免其不必要地參與反應。在此文本之範疇內,除非上下文另外指示,否則僅不為本發明化合物之特定所需最終產物之成分的可容易移除基團指定為「保護基」。官能基藉由該等保護基之保護、保護基本身及其裂解反應例如描述於諸如以下之標準參考著作中:J. F. W. McOmie, 「Protective Groups in Organic Chemistry」, Plenum Press, London and New York 1973;T. W. Greene及P. G. M. Wuts, 「Protective Groups in Organic Synthesis」, 第三版, Wiley, New York 1999;「The Peptides」; 第3卷 (編者:E. Gross及J. Meienhofer), Academic Press, London and New York 1981;「Methoden der organischen Chemie」 (Methods of Organic Chemistry), Houben Weyl, 第4版, 第15卷/I, Georg Thieme Verlag, Stuttgart 1974;H.-D. Jakubke及H. Jeschkeit, 「Aminosäuren, Peptide, Proteine」 (Amino acids, Peptides, Proteins), Verlag Chemie, Weinheim, Deerfield Beach及Basel 1982及Jochen Lehmann, 「Chemie der Kohlenhydrate: Monosaccharide und Derivate」 (Chemistry of Carbohydrates: Monosaccharides and Derivatives), Georg Thieme Verlag, Stuttgart 1974。保護基之特徵在於其可易於例如藉由溶劑分解、還原、光解或在生理條件下(例如藉由酶裂解)移除(亦即無非所期望之副反應發生)。 在某些實施例中,本文提供之式(I)及其子式化合物係藉由以下製備為醫藥學上可接受之酸加成鹽:使式(I)及其子式化合物之游離鹼形式與化學計算量之合適的醫藥學上可接受之有機酸或無機酸或適合陰離子交換試劑反應。 該等反應通常於水中或有機溶劑中,或於兩者之混合物中進行。通常,在可實行之情況下,需要使用如乙醚、乙酸乙酯、乙醇、異丙醇或乙腈之非水性介質。 或者,使用起始物質之鹽或中間物製備式(I)及其子式化合物之鹽形式。 可以熟習此項技術者已知之方式製備具有至少一個成鹽基團之本發明化合物之鹽。舉例而言,具有酸基的本發明化合物之鹽可例如藉由以下形成:用金屬化合物,諸如適合有機羧酸之鹼金屬鹽,例如2-乙基己酸之鈉鹽;用有機鹼金屬或鹼土金屬化合物,諸如對應氫氧化物、碳酸鹽或碳酸氫鹽,諸如氫氧化鈉或氫氧化鉀、碳酸鈉或碳酸鉀或碳酸氫鈉或碳酸氫鉀;用對應鈣化合物或用氨或適合有機胺處理化合物,較佳使用化學計算量或僅少量過量之成鹽劑。本發明化合物之酸加成鹽以習用方式獲得,例如藉由用酸或適合陰離子交換試劑處理化合物。含有成酸鹽及鹼性鹽之基團,例如游離羧基及游離胺基的本發明化合物之內鹽可例如藉由以下形成:例如用弱鹼將鹽,諸如酸加成鹽中和至等電點或藉由用離子交換劑加以處理。 可根據熟習此項技術者已知之方法將鹽轉化成游離化合物。金屬鹽及銨鹽可例如藉由用適合酸處理來轉化,且酸加成鹽可例如藉由用適合鹼性試劑處理來轉化。 所有上述製程步驟可在一般熟習此項技術者已知的反應條件下進行,包括特定提及的以下條件:在不存在溶劑或稀釋劑下或慣常在溶劑或稀釋劑存在下,包括例如對所用試劑為惰性的及溶解其之溶劑或稀釋劑;在不存在或存在催化劑、縮合劑或中和劑下,例如離子交換劑,諸如陽離子交換劑,例如呈H+ 形式;視處於降低溫度、常溫或高溫下的反應性質及/或反應物性質而定,例如在約-100℃至約190℃溫度範圍中,包括例如大約-80℃至大約150℃,例如在-80℃至-60℃下、在室溫下、在-20℃至40℃下或在回流溫度下;在大氣壓下或在密閉容器中,若適當在加壓下;及/或在惰性氛圍中,例如在氬氣或氮氣氛圍下。 式(I)及其子式之化合物的醫藥學上可接受之酸加成鹽包括(但不限於)乙酸鹽、己二酸鹽、抗壞血酸鹽、天冬胺酸鹽、苯甲酸鹽、苯磺酸鹽(besylatye)、苯磺酸鹽(benzenesulfonate)、碳酸氫鹽/碳酸鹽、硫酸氫鹽/硫酸鹽、溴化物/氫溴酸鹽、樟腦磺酸鹽(camphor sulfonate)、樟腦磺酸鹽(camsylate)、癸酸鹽、氯化物/鹽酸鹽、氯茶鹼鹽、檸檬酸鹽、乙二磺酸鹽、乙烷二磺酸鹽、反丁烯二酸鹽、葡庚糖酸鹽(gluceptate)、葡庚糖酸鹽(glucoheptonate)、葡糖酸鹽、葡萄糖醛酸鹽、麩胺酸鹽、戊二酸鹽、羥乙酸鹽、馬尿酸鹽、氫碘酸鹽/碘化物、羥乙磺酸鹽、乳酸鹽、乳糖酸鹽、月桂基硫酸鹽、蘋果酸鹽、順丁烯二酸鹽、丙二酸鹽、杏仁酸鹽、甲磺酸鹽、甲烷磺酸鹽、甲基硫酸鹽、半乳糖二酸鹽、萘甲酸鹽、萘磺酸鹽(napsylate)、2-萘磺酸鹽(2-napsylate)、萘磺酸鹽(naphthalenesulfonate)、2-萘磺酸鹽(2-naphthalenesulfonate)、菸鹼酸鹽、硝酸鹽、十八酸鹽、油酸鹽、草酸鹽、棕櫚酸鹽、雙羥萘酸鹽、磷酸鹽/磷酸氫/二氫磷酸鹽、聚半乳糖醛酸鹽、丙酸鹽、癸二酸鹽、硬脂酸鹽、丁二酸鹽、磺柳酸鹽、硫酸鹽、酒石酸鹽、甲苯磺酸鹽、對甲苯磺酸鹽、三氟乙酸鹽、三氟甲磺酸鹽、三苯基乙酸鹽及羥萘甲酸鹽形式。 用於形成式(I)及其子式之化合物的某些醫藥學上可接受之酸加成鹽的有機酸或無機酸包括(但不限於)乙酸、己二酸、抗壞血酸、天冬胺酸、苯甲酸、苯磺酸、碳酸、樟腦磺酸、羊脂酸、氯茶酸(chlorotheophyllinate)、檸檬酸、乙二磺酸、反丁烯二酸、D-甘油-D-古洛糖-庚酸、半乳糖二酸、半乳糖二酸/黏液酸、葡庚酸、葡糖庚酸、葡萄糖酸、葡糖醛酸、麩胺酸、戊二酸、乙醇酸、馬尿酸、氫溴酸、鹽酸、氫碘酸、羥乙基磺酸、乳酸、乳糖酸、月桂基硫酸、蘋果酸、順丁烯二酸、丙二酸、杏仁酸、甲磺酸、甲烷磺酸、黏液酸、萘甲酸、1-羥基-2-萘甲酸、萘磺酸、2-萘磺酸、菸鹼酸、硝酸、十八酸、油酸、草酸、棕櫚酸、雙羥萘酸、磷酸、聚半乳糖醛酸、丙酸、癸二酸、硬脂酸、丁二酸、磺柳酸、硫酸、酒石酸、對甲苯磺酸、三氟乙酸及三苯基乙酸。 在一個實施例中,本發明提供呈以下鹽形式之3-(3-氟-4-(3-(哌啶-4-基)丙氧基)苯基)-1-甲基-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-6-胺:乙酸鹽、己二酸鹽、抗壞血酸鹽、天冬胺酸鹽、苯甲酸鹽、苯磺酸鹽(besylatye)、苯磺酸鹽(benzenesulfonate)、碳酸氫鹽/碳酸鹽、硫酸氫鹽/硫酸鹽、溴化物/氫溴酸鹽、樟腦磺酸鹽(camphor sulfonate)、樟腦磺酸鹽(camsylate)、癸酸鹽、氯化物/鹽酸鹽、氯茶鹼鹽、檸檬酸鹽、乙二磺酸鹽、乙烷二磺酸鹽、反丁烯二酸鹽、葡庚糖酸鹽(gluceptate)、葡庚糖酸鹽(glucoheptonate)、葡糖酸鹽、葡萄糖醛酸鹽、麩胺酸鹽、戊二酸鹽、羥乙酸鹽、馬尿酸鹽、氫碘酸鹽/碘化物、羥乙磺酸鹽、乳酸鹽、乳糖酸鹽、月桂基硫酸鹽、蘋果酸鹽、順丁烯二酸鹽、丙二酸鹽、杏仁酸鹽、甲磺酸鹽、甲烷磺酸鹽、甲基硫酸鹽、半乳糖二酸鹽、萘甲酸鹽、萘磺酸鹽(napsylate)、2-萘磺酸鹽(2-napsylate)、萘磺酸鹽(naphthalenesulfonate)、2-萘磺酸鹽(2-naphthalenesulfonate)、菸鹼酸鹽、硝酸鹽、十八酸鹽、油酸鹽、草酸鹽、棕櫚酸鹽、雙羥萘酸鹽、磷酸鹽/磷酸氫/二氫磷酸鹽、聚半乳糖醛酸鹽、丙酸鹽、癸二酸鹽、硬脂酸鹽、丁二酸鹽、磺柳酸鹽、硫酸鹽、酒石酸鹽、甲苯磺酸鹽、對甲苯磺酸鹽、三氟乙酸鹽、三氟甲磺酸鹽、三苯基乙酸鹽或羥萘甲酸鹽。 在一個實施例中,本發明提供呈以下鹽形式之3-(4-(((1r,4r)-4-胺基環己基)甲氧基)-3-氟苯基)-1-甲基-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-6-胺:乙酸鹽、己二酸鹽、抗壞血酸鹽、天冬胺酸鹽、苯甲酸鹽、苯磺酸鹽(besylatye)、苯磺酸鹽(benzenesulfonate)、碳酸氫鹽/碳酸鹽、硫酸氫鹽/硫酸鹽、溴化物/氫溴酸鹽、樟腦磺酸鹽(camphor sulfonate)、樟腦磺酸鹽(camsylate)、癸酸鹽、氯化物/鹽酸鹽、氯茶鹼鹽、檸檬酸鹽、乙二磺酸鹽、乙烷二磺酸鹽、反丁烯二酸鹽、葡庚糖酸鹽(gluceptate)、葡庚糖酸鹽(glucoheptonate)、葡糖酸鹽、葡萄糖醛酸鹽、麩胺酸鹽、戊二酸鹽、羥乙酸鹽、馬尿酸鹽、氫碘酸鹽/碘化物、羥乙磺酸鹽、乳酸鹽、乳糖酸鹽、月桂基硫酸鹽、蘋果酸鹽、順丁烯二酸鹽、丙二酸鹽、杏仁酸鹽、甲磺酸鹽、甲烷磺酸鹽、甲基硫酸鹽、半乳糖二酸鹽、萘甲酸鹽、萘磺酸鹽(napsylate)、2-萘磺酸鹽(2-napsylate)、萘磺酸鹽(naphthalenesulfonate)、2-萘磺酸鹽(2-naphthalenesulfonate)、菸鹼酸鹽、硝酸鹽、十八酸鹽、油酸鹽、草酸鹽、棕櫚酸鹽、雙羥萘酸鹽、磷酸鹽/磷酸氫/二氫磷酸鹽、聚半乳糖醛酸鹽、丙酸鹽、癸二酸鹽、硬脂酸鹽、丁二酸鹽、磺柳酸鹽、硫酸鹽、酒石酸鹽、甲苯磺酸鹽、對甲苯磺酸鹽、三氟乙酸鹽、三氟甲磺酸鹽、三苯基乙酸鹽或羥萘甲酸鹽。 在一個實施例中,本發明提供呈以下鹽形式之3-(4-((4-胺基雙環[2.2.2]辛-1-基)甲氧基)-3-氟苯基)-1-甲基-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-6-胺:乙酸鹽、己二酸鹽、抗壞血酸鹽、天冬胺酸鹽、苯甲酸鹽、苯磺酸鹽(besylatye)、苯磺酸鹽(benzenesulfonate)、碳酸氫鹽/碳酸鹽、硫酸氫鹽/硫酸鹽、溴化物/氫溴酸鹽、樟腦磺酸鹽(camphor sulfonate)、樟腦磺酸鹽(camsylate)、癸酸鹽、氯化物/鹽酸鹽、氯茶鹼鹽、檸檬酸鹽、乙二磺酸鹽、乙烷二磺酸鹽、反丁烯二酸鹽、葡庚糖酸鹽(gluceptate)、葡庚糖酸鹽(glucoheptonate)、葡糖酸鹽、葡萄糖醛酸鹽、麩胺酸鹽、戊二酸鹽、羥乙酸鹽、馬尿酸鹽、氫碘酸鹽/碘化物、羥乙磺酸鹽、乳酸鹽、乳糖酸鹽、月桂基硫酸鹽、蘋果酸鹽、順丁烯二酸鹽、丙二酸鹽、杏仁酸鹽、甲磺酸鹽、甲烷磺酸鹽、甲基硫酸鹽、半乳糖二酸鹽、萘甲酸鹽、萘磺酸鹽(napsylate)、2-萘磺酸鹽(2-napsylate)、萘磺酸鹽(naphthalenesulfonate)、2-萘磺酸鹽(2-naphthalenesulfonate)、菸鹼酸鹽、硝酸鹽、十八酸鹽、油酸鹽、草酸鹽、棕櫚酸鹽、雙羥萘酸鹽、磷酸鹽/磷酸氫/二氫磷酸鹽、聚半乳糖醛酸鹽、丙酸鹽、癸二酸鹽、硬脂酸鹽、丁二酸鹽、磺柳酸鹽、硫酸鹽、酒石酸鹽、甲苯磺酸鹽、對甲苯磺酸鹽、三氟乙酸鹽、三氟甲磺酸鹽、三苯基乙酸鹽或羥萘甲酸鹽。 在一個實施例中,本發明提供呈以下鹽形式之3-(4-((4-胺基雙環[2.2.2]辛-1-基)甲氧基)-3-氯苯基)-1-甲基-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-6-胺:乙酸鹽、己二酸鹽、抗壞血酸鹽、天冬胺酸鹽、苯甲酸鹽、苯磺酸鹽(besylatye)、苯磺酸鹽(benzenesulfonate)、碳酸氫鹽/碳酸鹽、硫酸氫鹽/硫酸鹽、溴化物/氫溴酸鹽、樟腦磺酸鹽(camphor sulfonate)、樟腦磺酸鹽(camsylate)、癸酸鹽、氯化物/鹽酸鹽、氯茶鹼鹽、檸檬酸鹽、乙二磺酸鹽、乙烷二磺酸鹽、反丁烯二酸鹽、葡庚糖酸鹽(gluceptate)、葡庚糖酸鹽(glucoheptonate)、葡糖酸鹽、葡萄糖醛酸鹽、麩胺酸鹽、戊二酸鹽、羥乙酸鹽、馬尿酸鹽、氫碘酸鹽/碘化物、羥乙磺酸鹽、乳酸鹽、乳糖酸鹽、月桂基硫酸鹽、蘋果酸鹽、順丁烯二酸鹽、丙二酸鹽、杏仁酸鹽、甲磺酸鹽、甲烷磺酸鹽、甲基硫酸鹽、半乳糖二酸鹽、萘甲酸鹽、萘磺酸鹽(napsylate)、2-萘磺酸鹽(2-napsylate)、萘磺酸鹽(naphthalenesulfonate)、2-萘磺酸鹽(2-naphthalenesulfonate)、菸鹼酸鹽、硝酸鹽、十八酸鹽、油酸鹽、草酸鹽、棕櫚酸鹽、雙羥萘酸鹽、磷酸鹽/磷酸氫/二氫磷酸鹽、聚半乳糖醛酸鹽、丙酸鹽、癸二酸鹽、硬脂酸鹽、丁二酸鹽、磺柳酸鹽、硫酸鹽、酒石酸鹽、甲苯磺酸鹽、對甲苯磺酸鹽、三氟乙酸鹽、三氟甲磺酸鹽、三苯基乙酸鹽或羥萘甲酸鹽。 在一個實施例中,本發明提供呈以下鹽形式之4-((2-氯-4-(6-甲氧基-1-甲基-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-3-基)苯氧基)甲基)雙環[2.2.2]辛-1-胺:乙酸鹽、己二酸鹽、抗壞血酸鹽、天冬胺酸鹽、苯甲酸鹽、苯磺酸鹽(besylatye)、苯磺酸鹽(benzenesulfonate)、碳酸氫鹽/碳酸鹽、硫酸氫鹽/硫酸鹽、溴化物/氫溴酸鹽、樟腦磺酸鹽(camphor sulfonate)、樟腦磺酸鹽(camsylate)、癸酸鹽、氯化物/鹽酸鹽、氯茶鹼鹽、檸檬酸鹽、乙二磺酸鹽、乙烷二磺酸鹽、反丁烯二酸鹽、葡庚糖酸鹽(gluceptate)、葡庚糖酸鹽(glucoheptonate)、葡糖酸鹽、葡萄糖醛酸鹽、麩胺酸鹽、戊二酸鹽、羥乙酸鹽、馬尿酸鹽、氫碘酸鹽/碘化物、羥乙磺酸鹽、乳酸鹽、乳糖酸鹽、月桂基硫酸鹽、蘋果酸鹽、順丁烯二酸鹽、丙二酸鹽、杏仁酸鹽、甲磺酸鹽、甲烷磺酸鹽、甲基硫酸鹽、半乳糖二酸鹽、萘甲酸鹽、萘磺酸鹽(napsylate)、2-萘磺酸鹽(2-napsylate)、萘磺酸鹽(naphthalenesulfonate)、2-萘磺酸鹽(2-naphthalenesulfonate)、菸鹼酸鹽、硝酸鹽、十八酸鹽、油酸鹽、草酸鹽、棕櫚酸鹽、雙羥萘酸鹽、磷酸鹽/磷酸氫/二氫磷酸鹽、聚半乳糖醛酸鹽、丙酸鹽、癸二酸鹽、硬脂酸鹽、丁二酸鹽、磺柳酸鹽、硫酸鹽、酒石酸鹽、甲苯磺酸鹽、對甲苯磺酸鹽、三氟乙酸鹽、三氟甲磺酸鹽、三苯基乙酸鹽或羥萘甲酸鹽。 其他適合酸加成鹽之清單可見於例如「Remington's Pharmaceutical Sciences」, 第20版, Mack Publishing Company, Easton, Pa., (1985);及Stahl及Wermuth之「Handbook of Pharmaceutical Salts: Properties, Selection, and Use」 (Wiley-VCH, Weinheim, Germany, 2002)中。 除非在製程描述中另外指示,否則可選擇的適用於任何特定反應之溶劑包括特定提及之溶劑,或例如為水;酯,諸如低碳烷基-低碳烷酸酯,例如乙酸乙酯;醚,諸如脂族醚,例如乙醚,或環醚,例如四氫呋喃或二噁烷;液態芳族烴,諸如苯或甲苯;醇,諸如甲醇、乙醇或1-丙醇或2-丙醇;腈,諸如乙腈;鹵化烴,例如二氯甲烷或氯仿;醯胺,諸如二甲基甲醯胺或二甲基乙醯胺;鹼,諸如雜環氮鹼,例如吡啶或N-甲基吡咯啶-2-酮;羧酸酐,諸如低碳烷酸酐,例如乙酸酐;環狀直鏈或分支鏈烴,諸如環己烷、己烷或異戊烷;或彼等溶劑之混合物,例如水溶液。該等溶劑混合物亦可用於例如藉由層析或分配之處理。 在某些實施例中,式(I)及其子式之化合物製備或形成為溶劑合物(例如水合物)。在某些實施例中,式(I)及其子式之化合物的水合物係藉由自水性/有機溶劑混合物再結晶,使用有機溶劑,諸如二氧雜環己烯、四氫呋喃或甲醇製備。此外,本發明化合物(包括其鹽)亦可以其水合物之形式獲得,或包括用於其結晶之其他溶劑。 本發明化合物可固有地或經設計以與醫藥學上可接受之溶劑(包括水)形成溶劑合物;因此,本發明意欲涵蓋溶劑化及非溶劑化形式兩者。術語「溶劑合物」係指本發明化合物(包括其醫藥學上可接受之鹽)與一或多種溶劑分子的分子複合物。此等溶劑分子為通常用於醫藥技術中已知對接受者無害的溶劑分子,例如水、乙醇及其類似者。術語「水合物」係指其中溶劑分子為水之複合物。 本發明化合物之任何不對稱原子(例如碳或其類似者)可存在於外消旋或對映異構性增濃,例如(R )、(S )或(R , S )組態中。在某些實施例中,各不對稱原子在(R )組態或(S )組態中具有至少50%對映異構體過量、至少60%對映異構體過量、至少70%對映異構體過量、至少80%對映異構體過量、至少90%對映異構體過量、至少95%對映異構體過量或至少99%對映異構體過量。在具有不飽和雙鍵之原子處的取代基若可能可以順-(Z )或反-(E )形式存在。 相應地,如本文所用,本發明化合物可呈可能異構體、旋轉異構體、滯轉異構體、互變異構體或其混合物中之一者的形式,例如呈實質上純幾何(順或反)異構體、非對映異構體、光學異構體(對映體)、外消旋體或其混合物之形式。 任何所得異構體之混合物可基於組分之物理化學差異分離成純的或實質上純的幾何或光學異構體、非對映異構體、外消旋體,例如藉由層析及/或分步結晶。 任何所得最終產物或中間物之外消旋體可藉由已知方法而解析成光學對映體,例如藉由分離其非對映異構體鹽(該鹽用光學活性酸或鹼獲得)及釋放光學活性酸性或鹼性化合物。特定言之,鹼性部分可因此用於將本發明化合物解析為其光學對映體,例如藉由使由光學活性酸(例如酒石酸、二苯甲醯基酒石酸、二乙醯基酒石酸、二-O,O' -對甲苯甲醯基酒石酸、杏仁酸、蘋果酸或樟腦-10-磺酸)形成之鹽分步結晶。外消旋產物亦可藉由對掌性層析解析,例如使用對掌性吸附劑之高壓液相層析法(HPLC)。 在某些實施例中,式(I)或其子式之化合物製備為其獨立立體異構體。在其他實施例中,式(I)或其子式之化合物係藉由以下製備為其獨立立體異構體:使化合物之外消旋混合物與光學活性解析劑反應以形成一對非對映異構化合物,分離該等非對映異構體且回收光學純對映異構體。在某些實施例中,使用式(I)或其子式之化合物的共價非對映異構衍生物或藉由使用可解離複合物(例如結晶非對映異構鹽)進行對映異構體之解析。非對映異構體具有不同物理特性(例如熔點、沸點、溶解度、反應性等)且易於藉由利用此等不同點分離。在某些實施例中,藉由層析或藉由分離/解析技術基於溶解度差異分離非對映異構體。隨後藉由不會產生外消旋作用之任何實用方式回收光學純對映異構體以及解析劑。適用於將化合物之立體異構體自其外消旋混合物解析之技術之較詳細描述可見於Jean Jacques, Andre Collet, Samuel H. Wilen, 「Enantiomers, Racemates and Resolutions」, John Wiley And Sons, Inc., 1981中。 可根據本發明獲得之異構體之混合物可以熟習此項技術者已知之方式分離成獨立異構體;非對映異構體可例如藉由在多相溶劑混合物之間分配,再結晶及/或層析分離(例如經由矽膠)或藉由例如經由逆相管柱之中壓液相層析分離;且外消旋體可例如藉由用光學純之成鹽試劑形成鹽且分離可例如藉助於分步結晶或藉由經由光學活性管柱材料之層析如此獲得之非對映異構體混合物來分離。 視起始物質及程序之選擇而定,本發明化合物之某些實施例以可能異構體中之一者形式存在或以其混合物,例如純光學異構體或異構體混合物,諸如外消旋體及非對映異構體混合物形式存在,其視不對稱碳原子數目而定。本發明意欲包括所有該等可能異構體,包括外消旋混合物、非對映異構混合物及光學純形式。光學活性(R)-及(S)-異構體可使用對掌性合成組元或對掌性試劑製備,或使用習知技術解析。若化合物含有雙鍵,則取代基可為E或Z組態。若化合物含有經雙取代之環烷基,則環烷基取代基可具有順式或反式組態。亦意欲包括所有互變異構形式。 中間物及最終產物可根據標準方法進行處理及/或純化,例如使用層析法、分佈法、(再)結晶及其類似方法。本發明亦關於其中使用可在製程之任何階段以中間物形式獲得之化合物作為起始材料且進行其餘製程步驟,或其中起始材料係在反應條件下形成或以衍生物形式使用(例如以經保護形式或以鹽形式使用),或在製程條件下產生可藉由根據本發明之製程獲得的化合物且原位進一步處理之彼等形式之製程。用以合成本發明化合物之所有起始物質、構建塊、試劑、酸、鹼、脫水劑、溶劑及催化劑均可在市面上購得或可藉由一般熟習此項技術者已知的有機合成方法產生。 式(I)及其子式(式(Ia)及式(Ib))之化合物係藉由本文中之通用流程中所述及如實例中所示之製程來製得。 流程1A展示用於製得特定式(A1)化合物之非限制性合成流程,其中-連接基團-R4 部分係藉由醯胺鍵附接至中間物(int-A1)。在流程1A中,連接基團為具有末端羰基部分之任何連接基團(L') (亦即-L'-C(=O))。亦在流程1A中,R1 係如本文所述且R4 為可與硫醇、二硫化物、胺、酮、二酮、疊氮或炔烴反應的反應性部分。流程1B展示用於製得特定式(A1)化合物之非限制性合成流程,其中-連接基團-R4 部分係藉由醯胺鍵附接至中間物(int-A1)。在流程1B中,連接基團為具有末端羰基部分之任何連接基團(L') (亦即-L'-C(=O))。亦在流程1B中,R1 係如本文所述且R4 部分具有胺基(諸如羥基胺或胺),且RB 為具有經保護之胺基的部分,其中Prot為保護基,諸如Boc、Fmoc及Cbz。流程 1 此類醯胺鍵形成可使用加熱、EDCI偶合、HATU偶合、HBTU偶合、TBTU偶合或T3P偶合實現。 流程2A展示用於製得特定式(A2)化合物之非限制性合成流程,其中-連接基團-R4 部分係藉由醯胺鍵附接至中間物(int-A2)。在流程2A中,連接基團為具有末端羰基部分之任何連接基團(L') (亦即-L'-C(=O))。亦在流程2A中,R1 係如本文所述且R4 為可與硫醇、二硫化物、胺、酮、二酮、疊氮或炔烴反應的反應性部分。流程2B展示用於製得特定式(A2)化合物之非限制性合成流程,其中-連接基團-R4 部分係藉由醯胺鍵附接至中間物(int-A2)。在流程2B中,連接基團為具有末端羰基部分之任何連接基團(L') (亦即-L'-C(=O))。亦在流程2B中,R1 係如本文所述且R4 部分具有胺基(諸如羥基胺或胺),且RB 為具有經保護之胺基的部分,其中Prot為保護基,諸如Boc、Fmoc及Cbz。流程 2 此類醯胺鍵形成可使用加熱、EDCI偶合、HATU偶合、HBTU偶合、TBTU偶合或T3P偶合實現。 流程3A展示用於製得特定式(Ia)化合物之非限制性合成流程,其中-L2 -R4 部分係藉由醯胺鍵附接至中間物(int-A1)。此類醯胺鍵形成可使用加熱、EDCI偶合、HATU偶合、HBTU偶合、TBTU偶合或T3P偶合實現。在流程3A中,連接基團(L2 )包含具有末端羰基部分之連接部分(LA ) (亦即-LA -C(=O))。流程3B展示用於製得特定式(I)化合物之非限制性合成流程,其中-L2 -R4 部分係藉由醯胺鍵附接至中間物(int-A1)。此類醯胺鍵形成可使用加熱、EDCI偶合、HATU偶合、HBTU偶合、TBTU偶合或T3P偶合實現。在流程3B中,連接基團(L2 )包含具有末端羰基部分之連接部分(LA ) (亦即-LA -C(=O)),且RB 為具有經保護之胺基的部分,其中Prot為保護基,諸如Boc、Fmoc及Cbz。流程 3 流程4A展示用於製得特定式(Ib)化合物之非限制性合成流程,其中-L2 -R4 部分係藉由醯胺鍵附接至中間物(int-A2)。此類醯胺鍵形成可使用加熱、EDCI偶合、HATU偶合、HBTU偶合、TBTU偶合或T3P偶合實現。在流程4A中,連接基團(L2 )包含具有末端羰基部分之連接部分(LA ) (亦即-LA -C(=O))。流程4B展示用於製得特定式(Ib)化合物之非限制性合成流程,其中-L2 -R4 部分係藉由醯胺鍵附接至中間物(int-A2)。此類醯胺鍵形成可使用加熱、EDCI偶合、HATU偶合、HBTU偶合、TBTU偶合或T3P偶合實現。在流程4B中,連接基團(L2 )包含具有末端羰基部分之連接部分(LA ) (亦即-LA -C(=O)),且RB 為具有經保護之胺基的部分,其中Prot為保護基,諸如Boc、Fmoc及Cbz。流程 4 在流程3與流程4中, R4、-ONH2 、-NH2、-N3、-NHC(=O)CH=CH2 、SH、-SSR6 、-S(=O)2 (CH=CH2 )、-(CH2 )2 S(=O)2 (CH=CH2 )、-NHS(=O)2 (CH=CH2 )、-NHC(=O)CH2 Br、-NHC(=O)CH2 I、-C(O)NHNH2、-CO2 H、-C(O)NHNH2 ; RB 為-ONH-; LA 為-(CH2 )n -、-((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-((CH2 )n O)t (CH2 )n X1 (CH2 )n -、-((CH2 )n O)t (CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -、-((CH2 )n O)t (CH2 )n C(=O)NH(CH2 )n -、-NH((CH2 )n O)t (CH2 )n X1 (CH2 )n -、-X2 X3 C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-X2 C(=O)(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -或-(CH2 )n C(=O)NH(CH2 )n ; L2 為-C(=O)(CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n X1 (CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n C(=O)NH(CH2 )n -、-C(=O)NH((CH2 )n O)t (CH2 )n X1 (CH2 )n -、-C(=O)X2 X3 C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-C(=O)X2 C(=O)(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -或-C(=O)(CH2 )n C(=O)NH(CH2 )n ; 其中X1;X2 ;且X3 , 及 R1 、R7 、R8 、R9 及R10 係如本文中所定義。 流程5展示用於製得特定式(B1)化合物之非限制性合成流程,其中-連接基團-R4 部分係藉由中間物(int-A1)之二級胺的烷基化附接至中間物(int-A1)。在流程5中,連接基團(LA )起初用末端醛(亦即-LA -C(=O)H)官能化,且隨後與中間物(int-A1)之二級胺反應。亦在流程5中,R1 係如本文所述且R4 為可與硫醇、二硫化物、胺、酮、二酮、疊氮或炔烴反應的反應性部分。流程 5 該N-烷基化可使用還原劑,諸如NaCNBH3 、NaBH4 或NaBH(OAC)3 實現。 流程6展示用於製得特定式(B2)化合物之非限制性合成流程,其中-連接基團-R4 部分係藉由中間物(int-A2)之二級胺的烷基化附接至中間物(int-A2)。在流程6中,連接基團(LA )起初用末端醛(亦即-LA -C(=O)H)官能化,且隨後與中間物(int-A2)之二級胺反應。亦在流程6A中,R1 係如本文所述且R4 為可與硫醇、二硫化物、胺、酮、二酮、疊氮或炔烴反應的反應性部分。流程 6 該N-烷基化可使用還原劑,諸如NaCNBH3 、NaBH4 或NaBH(OAC)3 實現。 流程7展示用於製得特定式(Ia)化合物之非限制性合成流程,其中-L2 -R4 部分係藉由中間物(int-A1)之二級胺的烷基化附接至中間物(int-A1)。在流程7中,起初用末端醛(亦即-L'-C(=O)H)官能化之連接基團(LA )隨後與中間物(int-A1)之二級胺反應,由此形成連接基團L2 ,其包含具有末端-CH2 -基團之連接部分LA 。該N-烷基化可使用還原劑,諸如NaCNBH3 、NaBH4 或NaBH(OAC)3 實現。流程 7 流程8展示用於製得特定式(Ib)化合物之非限制性合成流程,其中-L2 -R4 部分係藉由中間物(int-A2)之二級胺的烷基化附接至中間物(int-A2)。在流程8中,起初用末端醛(亦即-L'-C(=O)H)官能化之連接基團(LA )隨後與中間物(int-A2)之二級胺反應,由此形成連接基團L2 ,其包含具有末端-CH2 -基團之連接部分LA 。該N-烷基化可使用還原劑,諸如NaCNBH3 、NaBH4 或NaBH(OAC)3 實現。流程 8 在流程7與流程8中, R4 係如針對流程3與流程4所定義; LA 為-(CH2 )(n-1) -、-((CH2 )(n-1) O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-(CH2 )(n-1) X1 (CH2 )n -、-(CH2 )(n-1) NHC(=O)(CH2 )n -、-(CH2 )(n-1) NHC(=O(CH2 )n C(=O)NH(CH2 )n -或 -((CH2 )(n-1) O)((CH2 )n O)t (CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n ; L2 為-(CH2 )n -、-((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-(CH2 )n X1 (CH2 )n -、-(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -、-(CH2 )n NHC(=O(CH2 )n C(=O)NH(CH2 )n -或-((CH2 )n O)t (CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n ; 其中X1; 及 R1 及R7 係如本文中所定義。 流程9展示用於製得特定式(A1)化合物之非限制性合成流程,其中-連接基團-R4 部分藉由醯胺鍵附接至中間物(int-A1)。在流程9中,連接基團為具有末端羰基部分之任何連接基團(L') (亦即-L'-C(=O))。亦在流程9中,R1 係如本文所述,R4,且RC 流程 9 此類醯胺鍵形成可使用加熱、EDCI偶合、HATU偶合、HBTU偶合、TBTU偶合或T3P偶合實現。 流程10展示用於製得特定式(A2)化合物之非限制性合成流程,其中-連接基團-R4 部分係藉由醯胺鍵附接至中間物(int-A2)。在流程10中,連接基團為具有末端羰基部分之任何連接基團(L') (亦即-L'-C(=O))。亦在流程10中,R1 係如本文所述,R4,且RC 流程 10 此類醯胺鍵形成可使用加熱、EDCI偶合、HATU偶合、HBTU偶合、TBTU偶合或T3P偶合實現。 流程11展示用於製得特定式(Ia)化合物之非限制性合成流程,其中-L2 -R4 部分係藉由醯胺鍵附接至中間物(int-A1)。在流程11中,連接基團(L2 )包含具有末端羰基部分之連接部分(LA ) (亦即-LA -C(=O))。此類醯胺鍵形成可使用加熱、EDCI偶合、HATU偶合、HBTU偶合、TBTU偶合或T3P偶合實現。流程 11 。 流程12展示用於製得特定式(Ib)化合物之非限制性合成流程,其中-L2 -R4 部分係藉由醯胺鍵附接至中間物(int-A2)。在流程12中,連接基團(L2 )包含具有末端羰基部分之連接部分(LA ) (亦即-LA -C(=O))。此類醯胺鍵形成可使用加熱、EDCI偶合、HATU偶合、HBTU偶合、TBTU偶合或T3P偶合實現。流程 12 。 在流程11與流程12中, R4; RCLA 為-(CH2 )n -、-((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-((CH2 )n O)t (CH2 )n X1 (CH2 )n -、-((CH2 )n O)t (CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -、-NH((CH2 )n O)t (CH2 )n X1 (CH2 )n -、-X2 X3 C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-X2 C(=O)(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -或-(CH2 )n C(=O)NH(CH2 )n -; L2 為-C(=O)(CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n X1 (CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -、-C(=O)NH((CH2 )n O)t (CH2 )n X1 (CH2 )n -、-C(=O)X2 X3 C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-C(=O)X2 C(=O)(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -或-C(=O)(CH2 )n C(=O)NH(CH2 )n -;其中X1;X2;且X3 , 及 R1 及R7 係如本文中所定義。 中間物 在下文給出用於製得本發明之式(I)及其子式之化合物(亦即式(Ia)及式(Ib)化合物)的中間物之合成。 中間物1 5-(2-甲氧基-4-(哌嗪-1-基甲基)苯甲基)-N4-戊基-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-2,4-二胺(Int-1)之合成步驟1:4-((2-胺基-4-氯-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲酸甲酯(3)之製備向圓底燒瓶中裝入4-氯-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-2-胺(1,可在市面上購得,1.0當量)、4-(溴甲基)-3-甲氧基苯甲酸甲酯(2,可在市面上購得,1.0當量)、碳酸銫(1.0當量)及DMF (1.0 M)。在室溫下攪拌反應混合物18小時且隨後真空移除溶劑。向所得混合物中添加EtOAc且真空移除溶劑。向此混合物中添加DCM且真空移除溶劑。隨後藉由ISCO層析(0%至10% MeOH:DCM,梯度)純化粗反應混合物,得到呈固體狀之4-((2-胺基-4-氯-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲酸甲酯(3)。 步驟2:(4-((2-胺基-4-氯-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧苯基)甲醇(4) 在圓底燒瓶中製備氫化鋰鋁(LAH) (1.0當量,粉末)於THF (0.3 M)中之漿液,冷卻至0℃且劇烈攪拌15分鐘。向此混合物中逐份添加4-((2-胺基-4-氯-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲酸甲酯(3,1.0當量,來自先前步驟)。移除冰浴且在室溫下攪拌反應混合物4小時,同時添加額外LAH直至反應完成為止。將Et2 O添加至反應混合物中且隨後將混合物轉移至錐形瓶(Erlenmeyer flask)且在劇烈攪拌下冷卻至0℃。隨後藉由緩慢添加飽和硫酸鈉溶液淬滅反應。獲得白色沈澱物且經由含有矽藻土之玻璃料過濾混合物且用THF及Et2 O洗滌。隨後真空移除揮發物且物質不經進一步純化即用於下一步驟中。 步驟3:4-(4-((2-胺基-4-氯-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-甲酸第三丁酯(5) 在0℃下將亞硫醯氯(10.0當量)添加至含有(4-((2-胺基-4-氯-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧苯基)甲醇(4,1.0當量,來自步驟2)之DCM (0.1 M)溶液的圓底燒瓶中。隨後移除冰浴且在室溫下攪拌反應混合物4小時。隨後將反應混合物冷卻回至0℃且藉由添加NaOH (1.0 M,40.0當量)及飽和NaHCO3 (水溶液)緩慢淬滅。將物質轉移至分液漏斗且用DCM洗滌3次。經合併之有機層經硫酸鈉乾燥,過濾且真空移除揮發物。隨後將所得粗產物溶解於圓底燒瓶中之DMF (0.1 M)中且不經進一步純化即使用。向此物質中添加哌嗪-1-甲酸第三丁酯(1.0當量)及許尼希氏鹼(Huenig's base) (1.2當量)且在室溫下攪拌18小時。隨後用EtOAc稀釋反應混合物,轉移至分液漏斗且用飽和NaCl (水溶液)洗滌兩次且用水洗滌兩次。經合併之有機層經硫酸鈉乾燥,過濾且真空移除揮發物。藉由ISCO層析(0%至10% MeOH:DCM,梯度)純化粗反應混合物,得到呈固體狀之4-(4-((2-胺基-4-氯-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-甲酸第三丁酯(5)。 步驟4:4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-甲酸第三丁酯(7) 向圓底燒瓶中裝入4-(4-((2-胺基-4-氯-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-甲酸第三丁酯(5,1.0當量,來自步驟3)、可在市面上購得之戊胺(6,3.0當量)、許尼希氏鹼(5.0當量)及DMSO (0.5 M)。將反應混合物加熱至120℃且攪拌18小時。隨後將反應混合物冷卻至室溫且添加水。隨後冷凍此混合物且藉由凍乾移除大部分揮發物。藉由ISCO層析(0%至10% MeOH (該MeOH含有0.7 N NH3 ):DCM,梯度)純化粗反應混合物,得到呈固體狀之4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-甲酸第三丁酯(7)。 步驟5:5 -( 2 - 甲氧基 - 4 -( 哌嗪 - 1 - 基甲基 ) 苯甲基 )- N4 - 戊基 - 5H - 吡咯并 [ 3 , 2 - d ] 嘧啶 - 2 , 4 - 二胺 (Int-1)在0℃下在圓底燒瓶中將HCl之二噁烷(4.0 M,20.0當量)溶液添加至4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-甲酸第三丁酯(6,1.0當量,來自步驟4)於DCM (0.1 M)之溶液中。隨後移除冰浴且在室溫下攪拌反應混合物3小時。隨後將NH3 之MeOH (0.7 N)溶液添加至反應混合物中且真空移除揮發物。添加NH3 之MeOH (0.7 N)溶液及真空移除揮發物再重複兩次。隨後藉由ISCO層析(0%至20% MeOH (該MeOH含有0.7 N NH3 ):DCM,梯度)純化粗反應混合物,得到呈固體狀之5-(2-甲氧基-4-(哌嗪-1-基甲基)苯甲基)-N4-戊基-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-2,4-二胺(Int-1):1 H NMR (CD3 OD): δ 7.37 (d, 1H), 7.10 (s, 1H), 6.91 (d, 1H), 6.74 (d, 1H), 6.22 (d, 1H), 5.52 (s, 2H), 3.92 (s, 3H), 3.61 (s, 2H), 3.54 (t, 2H), 3.35 (s, 3H), 3.22 (m, 4H), 2.69 (m, 4H), 1.51 (m, 2H), 1.30 (m, 2H), 1.18 (m, 2H), 0.89 (s, 3H)。LRMS [M+H] = 438.3。 中間物2 (S)-2-((2-胺基-5-(2-甲氧基-5-(哌嗪-1-基甲基)苯甲基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-4-基)胺基)己-1-醇(Int-2)之合成步驟1:3-((2-胺基-4-氯-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-4-甲氧基苯甲酸乙酯(9)之製備 向圓底燒瓶中裝入4-氯-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-2-胺(1,可在市面上購得,1.0當量)、3-(溴甲基)-4-甲氧基苯甲酸乙酯(8,可在市面上購得,1.0當量)、碳酸銫(1.0當量)及DMF (1.0 M)。在室溫下攪拌反應混合物18小時。隨後真空移除溶劑。向所得混合物中添加EtOAc且真空移除溶劑。向此混合物中添加DCM且真空移除溶劑。隨後藉由ISCO層析(0%至10% MeOH:DCM,梯度)純化粗反應混合物,得到呈固體狀之3-((2-胺基-4-氯-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-4-甲氧基苯甲酸乙酯(9)。 步驟2:(3-((2-胺基-4-氯-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-4-甲氧苯基)甲醇(10) 在圓底燒瓶中製備LAH (1.0當量,粉末)於THF (0.3 M)中之漿液,冷卻至0℃且劇烈攪拌15分鐘。向此混合物中逐份添加3-((2-胺基-4-氯-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-4-甲氧基苯甲酸乙酯(9,1.0當量,來自步驟1)。隨後移除冰浴且在室溫下攪拌反應混合物4小時(若至此時,反應並未完成,則添加額外LAH且繼續攪拌直至反應完成為止)。隨後使用Et2 O,將反應混合物轉移至錐形瓶。將混合物冷卻至0℃且劇烈攪拌。隨後藉由緩慢添加飽和硫酸鈉溶液淬滅反應。獲得白色沈澱物且經由含有矽藻土之玻璃料過濾混合物且用THF及Et2 O洗滌。隨後真空移除揮發物且物質不經進一步純化即用於下一步驟中。 步驟3:4-(3-((2-胺基-4-氯-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-4-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-甲酸第三丁酯(11) 在0℃下將亞硫醯氯(10.0當量)添加至含有(3-((2-胺基-4-氯-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-4-甲氧苯基)甲醇(10,1.0當量,來自步驟2)之DCM (0.1 M)溶液的圓底燒瓶中。隨後移除冰浴且在室溫下攪拌反應混合物4小時。隨後將反應混合物冷卻至0℃且藉由添加NaOH (1.0 M,40.0當量)及飽和NaHCO3 (水溶液)緩慢淬滅。將物質轉移至分液漏斗且用DCM洗滌3次。經合併之有機層經硫酸鈉乾燥,過濾且真空移除揮發物。隨後將所得粗產物溶解於圓底燒瓶中之DMF (0.1 M)中且不經進一步純化即使用。向此物質中添加哌嗪-1-甲酸第三丁酯(1.0當量)及許尼希氏鹼(1.2當量)且在室溫下攪拌18小時。隨後用EtOAc稀釋反應混合物,轉移至分液漏斗且用飽和NaCl (水溶液)洗滌兩次且用水洗滌兩次。經合併之有機層經硫酸鈉乾燥,過濾且真空移除揮發物。藉由ISCO層析(0%至10% MeOH:DCM,梯度)純化粗反應混合物,得到呈固體狀之4-(3-((2-胺基-4-氯-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-4-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-甲酸第三丁酯(11)。 步驟4:(S)-4-(3-((2-胺基-4-((1-羥基己-2-基)胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-4-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-甲酸第三丁酯(12) 向圓底燒瓶中裝入4-(3-((2-胺基-4-氯-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-4-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-甲酸第三丁酯(11,1.0當量,來自步驟3)、可在市面上購得之(S)-2-胺基己-1-醇(3.0當量)、許尼希氏鹼(5.0當量)及DMSO (0.5 M)。將反應混合物加熱至120℃且攪拌18小時。隨後將反應混合物冷卻至室溫且添加水。隨後冷凍此混合物且藉由凍乾移除大部分揮發物。藉由ISCO層析(0%至10% MeOH (該MeOH含有0.7 N NH3 ):DCM,梯度)純化粗反應混合物,得到呈固體狀之(S)-4-(3-((2-胺基-4-((1-羥基己-2-基)胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-4-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-甲酸第三丁酯(12)。 步驟5:實例1 - (S)-2-((2-胺基-5-(2-甲氧基-5-(哌嗪-1-基甲基)苯甲基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-4-基)胺基)己-1-醇(Int-2) 在0℃下在圓底燒瓶中將HCl之二噁烷(4.0 M,20.0當量)溶液添加至(S)-4-(3-((2-胺基-4-((1-羥基己-2-基)胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-4-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-甲酸第三丁酯(12,1.0當量,來自步驟4)於DCM (0.1 M)中之溶液中。隨後移除冰浴且在室溫下攪拌反應混合物3小時。隨後將NH3 之MeOH (0.7 N)溶液添加至反應混合物中且真空移除揮發物。添加NH3 之MeOH (0.7 N)溶液及真空移除揮發物再重複兩次。隨後藉由ISCO層析(0%至20% MeOH (該MeOH含有0.7 N NH3 ):DCM,梯度)純化粗反應混合物,得到呈固體狀之(S)-2-((2-胺基-5-(2-甲氧基-5-(哌嗪-1-基甲基)苯甲基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-4-基)胺基)己-1-醇(Int-2):1 H (CD3 OD): δ 7.50 (d, 1H), 7.29 (d, 1H), 7.09 (d, 1H), 6.63 (s, 1H), 6.29 (d, 1H), 5.69 (d, 1H), 5.40 (d, 1H), 4.34 (m, 1H), 3.95 (s, 3H), 3.51 (m, 2H), 3.42 (s, 2H), 3.12 (m, 4H), 2.56 (m, 2H), 1.48 (m, 1H), 1.21 (m, 3H), 0.96 (m, 2H), 0.83 (t, 3H)。LRMS [M+H] = 468.3。 中間物35-(2-甲氧基-5-(哌嗪-1-基甲基)苯甲基)-N4-戊基-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-2,4-二胺(Int-3)之合成根據(S)-2-((2-胺基-5-(2-甲氧基-5-(哌嗪-1-基甲基)苯甲基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-4-基)胺基)己-1-醇(Int-2)之合成製備5-(2-甲氧基-5-(哌嗪-1-基甲基)苯甲基)-N4-戊基-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-2,4-二胺(Int-3),不同之處在於步驟4中使用可在市面上購得之N-戊胺代替(S)-2-胺基己-1-醇。1 H NMR (CD3 OD): δ 7.42 (d, 1H), 7.32 (d, 1H), 7.09 (d, 1H), 6.70 (s, 1H), 6.25 (d, 1H), 5.54 (d, 2H), 3.92 (s, 3H), 3.52 (t, 2H), 3.46 (s, 2H), 3.14 (m, 4H), 2.60 (m, 4H), 1.48 (m, 2H), 1.30 (m, 2H), 1.13 (m, 2H), 0.88 (t, 3H)。LRMS [M+H] = 438.3。 本發明之抗體結合物 本發明之抗體結合物包含TLR7促效劑且具有式(II)結構:式(II) 其中: R50,其中*指示與Ab之連接點; Ab為特異性結合至人類HER2的抗體或其抗原結合片段; R1 為-NHR2 或-NHCHR2 R3 ; R2 為-C3 -C6 烷基或-C4 -C6 烷基; R3 為L1 OH; L1 為-(CH2 )m -; L2 為-(CH2 )n -、-((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-(CH2 )n X1 (CH2 )n -、-(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -、-(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n C(=O)NH(CH2 )n -、-((CH2 )n O)t (CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n 、-C(=O)(CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n X1 (CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n C(=O)NH(CH2 )n -、-C(=O)NH((CH2 )n O)t (CH2 )n X1 (CH2 )n -、-C(=O)X2 X3 C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-C(=O)X2 X3 C(=O)(CH2 )n -、-C(=O)X2 C(=O)(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -、-C(=O)X2 C(=O)(CH2 )n NHC(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-C(=O)(CH2 )n C(R7 )2 -、-C(=O)(CH2 )n C(R7 )2 SS(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -、-(CH2 )n X2 C(=O)(CH2 )n NHC(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -或-C(=O)(CH2 )n C(=O)NH(CH2 )n ; R40、-S-、-NHC(=O)CH2 -、-S(=O)2 CH2 CH2 -、-(CH2 )2 S(=O)2 CH2 CH2 -、-NHS(=O)2 CH2 CH2 、-NHC(=O)CH2 CH2 -、-CH2 NHCH2 CH2 -、-NHCH2 CH2 -、 ; X1; X2; X3 ; 各R7 獨立地選自H及C1 -C6 烷基; 各R8 獨立地選自H、C1 -C6 烷基、F、Cl及-OH; 各R9 獨立地選自H、C1 -C6 烷基、F、Cl、-NH2 、-OCH3 、-OCH2 CH3 、-N(CH3 )2 、-CN、-NO2 及-OH; 各R10 獨立地選自H、C1 - 6 烷基、氟基、經-C(=O)OH取代之苯甲氧基、經-C(=O)OH取代之苯甲基、經-C(=O)OH取代之C1 - 4 烷氧基及經-C(=O)OH取代之C1 - 4 烷基; R12 為H、甲基或苯基; 各m獨立地選自1、2、3及4; 各n獨立地選自1、2、3及4; 各t獨立地選自1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17及18,及 y為1至16之整數。 本發明化合物之某些態樣及實例提供於其他枚舉實施例之以下清單中。應認識到在各實施例中指定之特徵可與其他指定特徵組合,以提供本發明之其他實施例。 實施例58. 式(II)抗體結合物,其中: R50,其中*指示與Ab之連接點; Ab為特異性結合至人類HER2的抗體或其抗原結合片段; R1 為-NHR2 或-NHCHR2 R3 ; R2 為-C3 -C6 烷基或-C4 -C6 烷基; R3 為L1 OH; L1 為-(CH2 )m -; L2 為-(CH2 )n -、-((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-(CH2 )n X1 (CH2 )n -、-(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -、-(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n C(=O)NH(CH2 )n -、-((CH2 )n O)t (CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n 、-C(=O)(CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n X1 (CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n C(=O)NH(CH2 )n -、-C(=O)NH((CH2 )n O)t (CH2 )n X1 (CH2 )n -、-C(=O)X2 X3 C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-C(=O)X2 C(=O)(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -或-C(=O)(CH2 )n C(=O)NH(CH2 )n ; R40 、-S-、-NHC(=O)CH2 -、-S(=O)2 CH2 CH2 -、-(CH2 )2 S(=O)2 CH2 CH2 -、-NHS(=O)2 CH2 CH2 、-NHC(=O)CH2 CH2 -、-CH2 NHCH2 CH2 -、-NHCH2 CH2 -、 ; X1; X2; X3; 各R7 獨立地選自H及C1 -C6 烷基; 各R8 獨立地選自H、C1 -C6 烷基、F、Cl及-OH; 各R9 獨立地選自H、C1 -C6 烷基、F、Cl、-NH2 、-OCH3 、-OCH2 CH3 、-N(CH3 )2 、-CN、-NO2 及-OH; 各R10 獨立地選自H、C1 - 6 烷基、氟基、經-C(=O)OH取代之苯甲氧基、經-C(=O)OH取代之苯甲基、經-C(=O)OH取代之C1 - 4 烷氧基及經-C(=O)OH取代之C1 - 4 烷基; R12 為H、甲基或苯基; 各m獨立地選自1、2、3及4; 各n獨立地選自1、2、3及4; 各t獨立地選自1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17及18,及 y為1至16之整數。 實施例59. 一種具有式(IIa)或式(IIb)結構之式(II)抗體結合物及其醫藥學上可接受之鹽:式(IIa) 式(IIb) 其中: Ab為特異性結合至人類HER2的抗體或其抗原結合片段; R1 為-NHR2 或-NHCHR2 R3 ; R2 為-C3 -C6 烷基或-C4 -C6 烷基; R3 為L1 OH; L1 為-(CH2 )m -; L2 為-(CH2 )n -、-((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-(CH2 )n X1 (CH2 )n -、-(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -、-(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n C(=O)NH(CH2 )n -、-((CH2 )n O)t (CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n 、-C(=O)(CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n X1 (CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n C(=O)NH(CH2 )n -、-C(=O)NH((CH2 )n O)t (CH2 )n X1 (CH2 )n -、-C(=O)X2 X3 C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-C(=O)X2 X3 C(=O)(CH2 )n -、-C(=O)X2 C(=O)(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -、-C(=O)X2 C(=O)(CH2 )n NHC(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-C(=O)(CH2 )n C(R7 )2 -、-C(=O)(CH2 )n C(R7 )2 SS(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -、-(CH2 )n X2 C(=O)(CH2 )n NHC(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -或-C(=O)(CH2 )n C(=O)NH(CH2 )n ; R40、-S-、-NHC(=O)CH2 -、-S(=O)2 CH2 CH2 -、-(CH2 )2 S(=O)2 CH2 CH2 -、-NHS(=O)2 CH2 CH2 、-NHC(=O)CH2 CH2 -、-CH2 NHCH2 CH2 -、-NHCH2 CH2 -、 ; X1; X2; X3 ; 各R7 獨立地選自H及C1 -C6 烷基; 各R8 獨立地選自H、C1 -C6 烷基、F、Cl及-OH; 各R9 獨立地選自H、C1 -C6 烷基、F、Cl、-NH2 、-OCH3 、-OCH2 CH3 、-N(CH3 )2 、-CN、-NO2 及-OH; 各R10 獨立地選自H、C1 - 6 烷基、氟基、經-C(=O)OH取代之苯甲氧基、經-C(=O)OH取代之苯甲基、經-C(=O)OH取代之C1 - 4 烷氧基及經-C(=O)OH取代之C1 - 4 烷基; R12 為H、甲基或苯基; 各m獨立地選自1、2、3及4; 各n獨立地選自1、2、3及4; 各t獨立地選自1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17及18,及 y為1至16之整數。 實施例60. 如式(IIa)或式(IIb)抗體結合物及其醫藥學上可接受之鹽,其中: Ab為特異性結合至人類HER2的抗體或其抗原結合片段; R1 為-NHR2 或-NHCHR2 R3 ; R2 為-C3 -C6 烷基或-C4 -C6 烷基; R3 為L1 OH; L1 為-(CH2 )m -; L2 為-(CH2 )n -、-((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-(CH2 )n X1 (CH2 )n -、-(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -、-(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n C(=O)NH(CH2 )n -、-((CH2 )n O)t (CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n 、-C(=O)(CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n X1 (CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n C(=O)NH(CH2 )n -、-C(=O)NH((CH2 )n O)t (CH2 )n X1 (CH2 )n -、-C(=O)X2 X3 C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-C(=O)X2 C(=O)(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -或-C(=O)(CH2 )n C(=O)NH(CH2 )n ; R40、-S-、 -NHC(=O)CH2 -、-S(=O)2 CH2 CH2 -、-(CH2 )2 S(=O)2 CH2 CH2 -、 -NHS(=O)2 CH2 CH2 、-NHC(=O)CH2 CH2 -、-CH2 NHCH2 CH2 -、 -NHCH2 CH2 -、 ; X1; X2; X3; 各R7 獨立地選自H及C1 -C6 烷基; 各R8 獨立地選自H、C1 -C6 烷基、F、Cl及-OH; 各R9 獨立地選自H、C1 -C6 烷基、F、Cl、-NH2 、-OCH3 、-OCH2 CH3 、-N(CH3 )2 、-CN、-NO2 及-OH; 各R10 獨立地選自H、C1 - 6 烷基、氟基、經-C(=O)OH取代之苯甲氧基、經-C(=O)OH取代之苯甲基、經-C(=O)OH取代之C1 - 4 烷氧基及經-C(=O)OH取代之C1 - 4 烷基; R12 為H、甲基或苯基; 各m獨立地選自1、2、3及4; 各n獨立地選自1、2、3及4; 各t獨立地選自1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17及18,及 y為1至16之整數。 實施例61. 一種具有式(IIa)或式(IIb)結構之式(II)抗體結合物及其醫藥學上可接受之鹽:式(IIa) 式(IIb) 其中: Ab為特異性結合至人類HER2的抗體或其抗原結合片段; R1 為-NHR2 或-NHCHR2 R3 ; R2 為-C3 -C6 烷基或-C4 -C6 烷基; R3 為L1 OH; L1 為-(CH2 )m -; L2 為-(CH2 )n -、-((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-(CH2 )n X1 (CH2 )n -、-(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -、-(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n C(=O)NH(CH2 )n -、-((CH2 )n O)t (CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n 、-C(=O)(CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n X1 (CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n C(=O)NH(CH2 )n -、-C(=O)NH((CH2 )n O)t (CH2 )n X1 (CH2 )n -、-C(=O)X2 X3 C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-C(=O)X2 C(=O)(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -或-C(=O)(CH2 )n C(=O)NH(CH2 )n ; R40-S-; X1; X2; X3; 各R7 獨立地選自H及C1 -C6 烷基; 各m獨立地選自1、2、3及4; 各n獨立地選自1、2、3及4; 各t獨立地選自1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17及18,及 y為1至16之整數。 實施例62. 如式(II)、式(IIa)或式(IIb)抗體結合物,其中: Ab為特異性結合至人類HER2的抗體或其抗原結合片段; R1 為-NHR2 或-NHCHR2 R3 ; R2 為-C4 -C6 烷基; R3 為L1 OH; L1 為-(CH2 )m -; L2 為-(CH2 )n -、-((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-(CH2 )n X1 (CH2 )n -、-(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -、-(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n C(=O)NH(CH2 )n -、-((CH2 )n O)t (CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n 、-C(=O)(CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n X1 (CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n C(=O)NH(CH2 )n -、-C(=O)NH((CH2 )n O)t (CH2 )n X1 (CH2 )n -、-C(=O)X2 X3 C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-C(=O)X2 C(=O)(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -或-C(=O)(CH2 )n C(=O)NH(CH2 )n ; R40; X1;X2;X3; 各m獨立地選自1、2、3及4; 各n獨立地選自1、2、3及4; 各t獨立地選自1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17及18,及 y為1至16之整數。 實施例63. 如式(II)、式(IIa)或式(IIb)抗體結合物,其中: Ab為特異性結合至人類HER2的抗體或其抗原結合片段; R1 為-NHR2 ; R2 為-C4 -C6 烷基; L2 為-(CH2 )n -、-((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-(CH2 )n X1 (CH2 )n -、-(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -、-(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n C(=O)NH(CH2 )n -、-((CH2 )n O)t (CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n 、-C(=O)(CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n X1 (CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n C(=O)NH(CH2 )n -、-C(=O)NH((CH2 )n O)t (CH2 )n X1 (CH2 )n -、-C(=O)X2 X3 C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-C(=O)X2 C(=O)(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -或-C(=O)(CH2 )n C(=O)NH(CH2 )n ; R40; X1;X2;X3; 各n獨立地選自1、2、3及4; 各t獨立地選自1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17及18,及 y為1至16之整數。 實施例64. 如式(II)、式(IIa)或式(IIb)抗體結合物,其中: Ab為特異性結合至人類HER2的抗體或其抗原結合片段; R1 為-NHR2 ; R2 為-C4 -C6 烷基; L2 為-(CH2 )n -、-((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-(CH2 )n X1 (CH2 )n -、-C(=O)(CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n X1 (CH2 )n -、-C(=O)NH((CH2 )n O)t (CH2 )n X1 (CH2 )n -、-C(=O)X2 X3 C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -或-C(=O)X2 C(=O)(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -; R40; X1;X2;X3; 各n獨立地選自1、2、3及4; 各t獨立地選自1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17及18,及 y為1至16之整數。 實施例65. 如式(II)、式(IIa)或式(IIb)抗體結合物,其中: Ab為特異性結合至人類HER2的抗體或其抗原結合片段; R1 為-NHR2 ; R2 為-C4 -C6 烷基; L2 為-(CH2 )n -或-C(=O)(CH2 )n ; R40; 及 各n獨立地選自1、2、3及4,及 y為1至16之整數。 實施例66. 如式(II)、式(IIa)或式(IIb)抗體結合物,其中: Ab為特異性結合至人類HER2的抗體或其抗原結合片段; R1 為-NHR2 ; R2 為-C4 -C6 烷基; L2 為-(CH2 )n -、-((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-(CH2 )n X1 (CH2 )n -、-C(=O)(CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n X1 (CH2 )n -、-C(=O)NH((CH2 )n O)t (CH2 )n X1 (CH2 )n -、-C(=O)X2 X3 C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -或-C(=O)X2 C(=O)(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -; R40; X1;X2;X3; 各n獨立地選自1、2、3及4; 各t獨立地選自1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17及18,及 y為1至16之整數。 實施例67. 如式(II)、式(IIa)或式(IIb)抗體結合物,其中:R1 為-NHR2 。 實施例68. 如式(II)、式(IIa)或式(IIb)抗體結合物,其中:R1 為-NHCHR2 R3 。 實施例69. 如式(II)、式(IIa)或式(IIb)抗體結合物,其中:R2 為-C4 烷基。 實施例70. 如式(II)、式(IIa)或式(IIb)抗體結合物,其中:R2 為-C5 烷基。 實施例71. 如式(II)、式(IIa)或式(IIb)抗體結合物,其中:R2 為-C6 烷基。 實施例72. 如式(II)、式(IIa)或式(IIb)抗體結合物,其中:R3 為L1 OH。 實施例73. 如式(II)、式(IIa)或式(IIb)抗體結合物,其中:L1 為-(CH2 )-。 實施例74. 如式(II)、式(IIa)或式(IIb)抗體結合物,其中:L1 為-(CH2 CH2 )-。 實施例75. 如式(I)、式(Ia)或式(Ib)化合物,其中: L2 為-(CH2 )n -、-((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-(CH2 )n X1 (CH2 )n -、-(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -、-(CH2 )n NHC(=O(CH2 )n C(=O)NH(CH2 )n -、-((CH2 )n O)t (CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n 。 實施例76. 如式(I)、式(Ia)或式(Ib)化合物,其中: L2 為-C(=O)(CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n X1 (CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n C(=O)NH(CH2 )n -、-C(=O)NH((CH2 )n O)t (CH2 )n X1 (CH2 )n -、-C(=O)X2 X3 C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-C(=O)X2 C(=O)(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -或-C(=O)(CH2 )n C(=O)NH(CH2 )n -。 實施例77. 如式(II)、式(IIa)或式(IIb)抗體結合物,其中:L2 為-(CH2 )n -或-C(=O)(CH2 )n -。 實施例78. 如式(II)、式(IIa)或式(IIb)抗體結合物,其中:L2 為-C(=O)X2 X3 C(=O)(CH2 )n -、-C(=O)X2 C(=O)(CH2 )n NHC(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-C(=O)(CH2 )n C(R7 )2 -、-C(=O)(CH2 )n C(R7 )2 SS(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -或-(CH2 )n X2 C(=O)(CH2 )n NHC(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -。 實施例79. 如式(II)、式(IIa)或式(IIb)抗體結合物,其中: R40或-S-。 實施例80 如式(II)、式(IIa)或式(IIb)抗體結合物,其中:R40。 實施例81. 如式(II)、式(IIa)或式(IIb)抗體結合物,其中:R40。 實施例82. 如式(II)、式(IIa)或式(IIb)抗體結合物,其中:R40-S-。 實施例83. 如式(II)、式(IIa)或式(IIb)抗體結合物,其中:R40。 實施例84. 如式(II)、式(IIa)或式(IIb)抗體結合物,其中:R40。 實施例85. 如式(II)、式(IIa)或式(IIb)抗體結合物,其中: R40 。 實施例86. 如式(II)、式(IIa)或式(IIb)抗體結合物,其中:X1。 實施例87. 如式(II)、式(IIa)或式(IIb)抗體結合物,其中:X1。 實施例88. 如式(II)、式(IIa)或式(IIb)抗體結合物,其中:X1。 實施例89. 如式(II)、式(IIa)或式(IIb)抗體結合物,其中:X2。 實施例90. 如式(II)、式(IIa)或式(IIb)抗體結合物,其中:X2。 實施例91. 如式(II)、式(IIa)或式(IIb)抗體結合物,其中:X2。 實施例92. 如式(II)、式(IIa)或式(IIb)抗體結合物,其中:X2。 實施例93. 如式(II)、式(IIa)或式(IIb)抗體結合物,其中:X2。 實施例94. 如式(II)、式(IIa)或式(IIb)抗體結合物,其中:X3。 實施例95. 如式(II)、式(IIa)或式(IIb)抗體結合物,其中:X3。 實施例96. 如式(II)、式(IIa)或式(IIb)抗體結合物,其中:X3。 實施例97. 如式(II)、式(IIa)或式(IIb)抗體結合物,其中:X3。 實施例98. 如式(II)、式(IIa)或式(IIb)抗體結合物,其中:X3。 實施例99. 如式(II)、式(IIa)或式(IIb)抗體結合物,其中:各m獨立地選自1、2、3及4。 實施例100. 如式(II)、式(IIa)或式(IIb)抗體結合物,其中:各m為1或2。 實施例101. 如式(II)、式(IIa)或式(IIb)抗體結合物,其中:各n獨立地選自1、2、3及4。 實施例102. 如式(II)、式(IIa)或式(IIb)抗體結合物,其中:各n為2或3。 實施例103. 如式(II)、式(IIa)或式(IIb)抗體結合物,其中:各t獨立地選自1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17及18。 實施例104. 如式(II)、式(IIa)或式(IIb)抗體結合物,其中:各t獨立地選自1、2、3、4、5及6。 實施例105. 如式(II)、式(IIa)或式(IIb)抗體結合物,其中y為1至16之整數。 實施例106. 如式(II)、式(IIa)或式(IIb)抗體結合物,其中y為1至8之整數。 實施例107. 如式(II)、式(IIa)或式(IIb)抗體結合物,其中y為1至4之整數。 實施例108. 如式(II)、式(IIa)或式(IIb)抗體結合物,其選自: , 其中y為1至4之整數且Ab為抗HER2抗體或其抗原結合片段。 實施例109. 如式(II)、式(IIa)或式(IIb)抗體結合物,其選自: 。 亦提供針對用於評估本發明之抗體結合物的分析方法之一些態樣的方案。此類分析方法及結果可表明結合物具有有利特性,例如將使其較易於製造、較易於投與患者、較有效及/或對患者潛在較安全之特性。一個實例為藉由尺寸排阻層析(SEC)測定分子尺寸,其中相對於樣品中高分子量污染物(例如二聚物、多聚體或聚集抗體)或低分子量污染物(例如抗體片段、降解產物或個別抗體鏈)之量測定樣品中所需抗體物種之量。一般而言,歸因於例如聚集體對抗體樣品之其他特性(諸如(但不限於)清除率、免疫原性及毒性)之影響,需要具有較高量單體及較低量例如聚集抗體。另一實例為藉由疏水性相互作用層析(HIC)測定疏水性,其中相對於一組具有已知特性之標準抗體評估樣品之疏水性。一般而言,歸因於疏水性對抗體樣品之其他特性(諸如(但不限於)聚集、隨時間推移之聚集、對表面之黏著性、肝毒性、清除率及藥物動力學暴露)之影響,需要具有低疏水性。參見Damle, N.K., Nat Biotechnol. 2008; 26(8):884-885;Singh, S.K., Pharm Res. 2015; 32(11):3541-71。當藉由疏水性相互作用層析量測時,較高疏水性指數評分(亦即由HIC管柱進行之溶離較快)反映結合物之較低疏水性。如實例70及表3中所示,大部分所測試之抗體結合物顯示大於0.8之疏水性指數。在一些實施例中,提供如藉由疏水性相互作用層析所測定,疏水性指數為0.8或大於0.8之抗體結合物。 抗HER2抗體 本文中所提供之抗體結合物包括特異性結合至人類HER2之抗體或其抗體片段(例如抗原結合片段) (抗HER2抗體)。在多種類型之癌症中觀測到HER2過度表現,諸如胃癌、食道癌、結腸癌、直腸癌、乳癌、卵巢癌、子宮頸癌、子宮癌、子宮內膜癌、膀胱癌、胰臟癌、肺癌、前列腺癌、骨肉瘤、神經母細胞瘤或頭頸癌。抗體結合物包含可特異性地靶向至HER2陽性癌症或腫瘤之抗HER2抗體。 在一些實施例中,本文中所提供之抗體結合物包括特異性結合至人類HER2之單株抗體或其抗體片段,例如人類或人類化抗HER2單株抗體。在一些實施例中,特異性結合至人類HER2之抗體或其抗體片段可選自曲妥珠單抗、帕妥珠單抗、馬妥昔單抗或HT-19,或其抗體片段或其位點特異性半胱胺酸突變體。 曲妥珠單抗(商標名Herceptin或Herclon)為結合至HER2受體之細胞外域之近膜部分的人類化單株抗體(Hudis CA, N Engl J Med. 2007; 357(1):39-51)。曲妥珠單抗重鏈及輕鏈可變區之胺基酸序列描述於美國專利第5,821,337號中。曲妥珠單抗與由人類HER2之殘基557-561、570-573及593-603形成之三個環區相互作用(Cho等人,Nature 421: 756-760, 2003)。曲妥珠單抗可能藉由以下干擾HER2信號傳遞:防止HER2-受體二聚、促進HER2受體之內吞破環(endocytotic destruction)、抑制細胞外域脫落(Hudis CA, N Engl J Med. 2007; 357(1):39-51)。抗HER2抗體之另一重要作用機制為介導抗體依賴性細胞毒性(ADCC)。在ADCC中,抗HER2抗體結合至腫瘤細胞,且隨後經由Fcg受體(FcgR)相互作用募集免疫細胞,諸如巨噬細胞。曲妥珠單抗具有保守人類IgG Fc區,且能夠募集對抗體依賴性細胞毒性負責的免疫效應細胞(Hudis CA, N Engl J Med. 2007; 357(1):39-51)。曲妥珠單抗於1998年9月獲得美國FDA批准來治療腫瘤過度表現HER2及接受針對其轉移性疾病之一或多種化學治療療法的患者中之轉移性乳癌。 帕妥珠單抗(亦稱作2C4、Omnitarg、Perjeta)為結合至HER2受體之細胞外域且抑制HER2與其他HER受體二聚之人類化單株抗體。帕妥珠單抗重鏈及輕鏈之胺基酸序列描述於美國專利第7,560,111號中。帕妥珠單抗主要與人類HER2之區245-333內之殘基,尤其殘基His 245、Val 286、Ser 288、Leu 295、His 296或Lys 311相互作用(Franklin等人, Cancer Cell 5: 317-328, 2004)。在干擾乳房及前列腺癌細胞株中之HER1-HER2及HER3-HER2複合物形成方面,帕妥珠單抗顯示比曲妥珠單抗更有效(Agus等人, J Clin Oncol. 2005; 23(11):2534-43. Epub Feb 7, 2005)。對於功效,帕妥珠單抗不需要抗體依賴性細胞毒性,因為對於其活性,並不需要完整Fc區(Agus等人, J Clin Oncol. 2005; 23(11):2534-43. Epub Feb 7, 2005)。在2012年6月,帕妥珠單抗得到美國FDA批准而供用於與曲妥珠單抗及多西他賽(docetaxel)組合來治療尚未接受抗HER2療法或針對轉移性疾病之化學療法的患有HER2陽性轉移性乳癌之患者。 馬妥昔單抗(亦稱作MGAH22)為另一抗HER2單株抗體(參見http://www.macrogenics.com/products-margetuximab.html)。馬妥昔單抗之Fc區經最佳化而使得其在免疫效應細胞上增加與活化FcgR之結合但降低與抑制性FcgR之結合。馬妥昔單抗對於藉由免疫組織化學對腫瘤表現處於2+水準下之HER2的患有復發性或難治性晚期乳癌之患者的治療當前仍處於臨床試驗下且缺乏利用FISH之HER2基因擴增之跡象。 HT-19為結合至不同於曲妥珠單抗或帕妥珠單抗之抗原決定基的人類HER2中之抗原決定基的另一抗HER2單株抗體,且類似於曲妥珠單抗顯示抑制HER2信號傳遞且與曲妥珠單抗及帕妥珠單抗組合促進HER2降解(Bergstrom D. A.等人, Cancer Res. 2015; 75:LB-231)。 其他適合之抗HER2單株抗體包括(但不限於)以下美國專利中所述之抗-HER2抗體:第9,096,877號;第9,017,671號;第8,975,382號;第8,974,785號;第8,968,730號;第8,937,159號;第8,840,896號;第8,802,093號;第8,753,829號;第8,741,586號;第8,722,362號;第8,697,071號;第8,652,474號;第8,652,466號;第8,609,095號;第8,512,967號;第8,349,585號;第8,241,630號;第8,217,147號;第8,192,737號;第7,879,325號;第7,850,966號;第7,560,111號;第7,435,797號;第7,306,801號;第6,399,063號;第6,387,371號;第6,165,464號;第5,772,997號;第5,770,195號;第5,725,856號;第5,720,954號;第5,677,171號。 在一些實施例中,抗HER2抗體或抗體片段(例如抗原結合片段)包含具有表1中所述之任何VH域之胺基酸序列的VH域。其他適合之抗-HER2抗體或抗體片段(例如抗原結合片段)可包括VH域中已突變,但與表1中所述序列中所描繪之VH區具有至少80、85、90、95、96、97、98或99百分比一致性之胺基酸。在某些實施例中,本發明亦提供特異性結合至HER2之抗體或抗體片段(例如抗原結合片段),其中抗體或抗體片段(例如抗原結合片段)包含具有表1中所列出之VH CDR中之任一者的胺基酸序列之VH CDR。在特定實施例中,本發明提供特異性結合至HER2之抗體或抗體片段(例如抗原結合片段),其包含(或替代地由以下組成)具有表1中所列出之VH CDR中之任一者的胺基酸序列之一個、兩個、三個、四個、五個或超過五個VH CDR。 在一些實施例中,抗HER2抗體或抗體片段(例如抗原結合片段)包含具有表1中所述之任何VL域之胺基酸序列的VL域。其他適合之抗-HER2抗體或抗體片段(例如抗原結合片段)可包括VL域中已突變,但與表1中所述序列中所描繪之VL區具有至少80、85、90、95、96、97、98或99百分比一致性之胺基酸。本發明亦提供特異性結合至HER2之抗體或抗體片段(例如抗原結合片段),該抗體或抗體片段(例如抗原結合片段)包含具有表1中所列出之VL CDR中之任一者的胺基酸序列之VL CDR。特定言之,本發明提供特異性結合至HER2之抗體或抗體片段(例如抗原結合片段),其包含(或替代地由以下組成)具有表1中所列出之VL CDR中之任一者的胺基酸序列之一個、兩個、三個或大於三個VL CDR。 表1. 例示性抗HER2單株抗體之序列 本文所揭示之其他抗-HER2抗體或抗體片段(例如抗原結合片段)包括CDR區中已突變,但與表1中所述序列中所描繪之CDR區具有至少80、85、90、95、96、97、98或99百分比一致性的胺基酸。在一些實施例中,當相較於表1所述序列中所描繪之CDR區時,其包括CDR區中不超過1個、2個、3個、4個或5個胺基酸已突變的突變型胺基酸序列。 本文亦提供編碼特異性結合至HER2之抗體及其抗原結合片段的VH、VL、全長重鏈及全長輕鏈的核酸序列,例如表1中之核酸序列。該等核酸序列可針對哺乳動物細胞中之表現進行最佳化。 本文所揭示之其他抗-HER2抗體包括其中胺基酸或編碼胺基酸之核酸已突變,但與表1中所述之序列具有至少80、85、90、95、96、97、98或99百分比一致性的抗體。在一些實施例中,當相較於表1中所述序列中所描繪之可變區時,抗體或其抗原結合片段包括可變區中不超過1個、2個、3個、4個或5個胺基酸已突變,同時保持實質上相同治療活性的突變型胺基酸序列。 由於所提供之各抗體均結合至HER2,因此VH、VL、全長輕鏈及全長重鏈序列(胺基酸序列及編碼胺基酸序列之核苷酸序列)可「經混合及匹配」以形成本文所揭示之其他HER2結合抗體。該等「經混合及匹配」之HER2結合抗體可使用此項技術中已知之結合分析(例如ELISA,範例中所述之分析)進行測試。當鏈經混合及匹配時,來自特定VH/VL配對之VH序列應經結構上類似之VH序列置換。來自特定全長重鏈/全長輕鏈配對之全長重鏈序列應經結構上類似之全長重鏈序列置換。來自特定VH/VL配對之VL序列應經結構上類似之VL序列置換。來自特定全長重鏈/全長輕鏈配對之全長輕鏈序列應經結構上類似之全長輕鏈序列置換。 因此,在一個實施例中,本發明提供一種分離單株抗體或其抗原結合區,其具有:包含胺基酸序列SEQ ID NO: 7之重鏈可變區;及包含胺基酸序列SEQ ID NO: 17之輕鏈可變區;其中抗體特異性結合至HER2。在另一實施例中,本發明提供(i)一種分離單株抗體,其具有:包含SEQ ID NO: 9、SEQ ID NO: 21、SEQ ID NO: 23、SEQ ID NO: 30或SEQ ID NO: 32中之任一者的胺基酸序列之全長重鏈;及包含胺基酸序列SEQ ID NO: 19之全長輕鏈;或(ii)一種包含其抗原結合部分之功能蛋白。 在另一實施例中,本發明提供包含如表1中所述之重鏈CDR1、CDR2及CDR3及輕鏈CDR1、CDR2及CDR3或其組合的HER2結合抗體。抗體之VH CDR1之胺基酸序列顯示於SEQ ID NO: 1、SEQ ID NO:4及SEQ ID NO: 6中。抗體之VH CDR2之胺基酸序列顯示於SEQ ID NO: 2及SEQ ID NO: 5中。抗體之VH CDR3之胺基酸序列顯示於SEQ ID NO: 3中。抗體之VL CDR1之胺基酸序列顯示於SEQ ID NO: 11及SEQ ID NO: 14中。抗體之VL CDR2之胺基酸序列顯示於SEQ ID NO 12及SEQ ID NO 15中。抗體之VL CDR3之胺基酸序列顯示於SEQ ID NO: 13及SEQ ID NO: 16中。 鑒於抗體中之每一者均結合HER2且抗原結合特異性主要由CDR1、CDR2及CDR3區提供,因此VH CDR1、CDR2及CDR3序列與VL CDR1、CDR2及CDR3序列可「經混合及匹配」(亦即來自不同抗體之CDR可經混合及匹配,但各抗體必須含有VH CDR1、CDR2及CDR3與VL CDR1、CDR2及CDR3以形成本文所揭示之其他HER2結合結合分子)。該等「經混合及匹配」之HER2結合抗體可使用此項技術中已知的結合分析及實例中所述之結合分析(例如ELISA)來測試。當VH CDR序列經混合及匹配時,來自特定VH序列之CDR1、CDR2及/或CDR3序列應經結構上類似之CDR序列置換。同樣,當VL CDR序列經混合及匹配時,來自特定VL序列之CDR1、CDR2及/或CDR3序列應經結構上類似之CDR序列置換。一般熟練技術人員顯而易知,新穎VH及VL序列可藉由用來自本文中針對本發明之單株抗體所示之CDR序列之結構上類似之序列取代一或多個VH及/或VL CDR區序列來產生。 因此,本發明提供一種分離單株抗體或其抗原結合區,其包含重鏈CDR1,其包含選自由以下組成之群的胺基酸序列:SEQ ID NO: 1、SEQ ID NO: 4及SEQ ID NO: 6;重鏈CDR2,其包含選自由以下組成之群的胺基酸序列:SEQ ID NO: 2及SEQ ID NO: 5;重鏈CDR3,其包含胺基酸序列SEQ ID NO: 3;輕鏈CDR1,其包含選自由以下組成之群的胺基酸序列:SEQ ID NO: 11及SEQ ID NO: 14;輕鏈CDR2,其包含選自由以下組成之群的胺基酸序列:SEQ ID NO: 12及SEQ ID NO: 15;及輕鏈CDR3,其包含選自由以下組成之群的胺基酸序列:SEQ ID NO: 13及SEQ ID NO: 16;其中抗體特異性結合HER2。 在某些實施例中,特異性結合至HER2之抗體為表1中所述之抗體或抗體片段(例如抗原結合片段)。 在一些實施例中,特異性結合至人類HER2之抗體包含含有胺基酸序列SEQ ID NO: 1之重鏈互補決定區1 (HCDR1);含有胺基酸序列SEQ ID NO: 2之重鏈互補決定區2 (HCDR2);含有胺基酸序列SEQ ID NO: 3之重鏈互補決定區3 (HCDR3);含有胺基酸序列SEQ ID NO: 11之輕鏈互補決定區1 (LCDR1);含有胺基酸序列SEQ ID NO: 12之輕鏈互補決定區2 (LCDR2);及 含有胺基酸序列SEQ ID NO: 13之輕鏈互補決定區3 (LCDR3)。 在一些實施例中,特異性結合至人類HER2之抗體包含含有胺基酸序列SEQ ID NO: 4之HCDR1、含有胺基酸序列SEQ ID NO: 5之HCDR2;含有胺基酸序列SEQ ID NO: 3之HCDR3;含有胺基酸序列SEQ ID NO: 14之LCDR1;含有胺基酸序列SEQ ID NO: 15之LCDR2;及含有胺基酸序列SEQ ID NO: 16之LCDR3。 在一些實施例中,特異性結合至人類HER2之抗體包含含有胺基酸序列SEQ ID NO: 7之重鏈可變區及含有胺基酸序列SEQ ID NO: 17之輕鏈可變區。 在一些實施例中,特異性結合至人類HER2之抗體包含含有胺基酸序列SEQ ID NO: 9之重鏈及含有胺基酸序列SEQ ID NO: 19之輕鏈。 在一些實施例中,特異性結合至人類HER2之抗體包含含有胺基酸序列SEQ ID NO: 21之重鏈及含有胺基酸序列SEQ ID NO: 19之輕鏈。 在一些實施例中,特異性結合至人類HER2之抗體包含含有胺基酸序列SEQ ID NO: 23之重鏈及含有胺基酸序列SEQ ID NO: 19之輕鏈。 在一些實施例中,特異性結合至人類HER2之抗體包含含有胺基酸序列SEQ ID NO: 30之重鏈及含有胺基酸序列SEQ ID NO: 19之輕鏈。 在一些實施例中,特異性結合至人類HER2之抗體包含含有胺基酸序列SEQ ID NO: 32之重鏈及含有胺基酸序列SEQ ID NO: 19之輕鏈。 在一些實施例中,本發明提供特異性結合人類HER2中之抗原決定基的抗體或抗體片段(例如抗原結合片段)。在一些實施例中,本發明提供特異性結合至人類HER2中之抗原決定基的抗體或抗體片段(例如抗原結合片段),其中抗原決定基包含SEQ ID NO: 26之殘基557-561、570-573及593-603中之一或多者。在一些實施例中,本發明提供特異性結合至人類HER2中之抗原決定基的抗體或抗體片段(例如抗原結合片段),其中抗原決定基包含SEQ ID NO: 26之殘基245-333中之一或多者。在一些實施例中,本發明提供特異性結合至人類HER2中之抗原決定基的抗體或抗體片段(例如抗原結合片段),其中抗原決定基包含以下殘基中之一或多者:SEQ ID NO:26之His 245、Val 286、Ser 288、Leu 295、His 296或Lys 311。 一旦確定抗原上之所需抗原決定基,則可例如使用本發明中所述之技術產生針對該抗原決定基之抗體。或者,在探索過程期間,抗體之生成及特徵化可闡明關於所需抗原決定基之資訊。根據此資訊,隨後可競爭性篩選結合至相同抗原決定基之抗體。一種達成此舉之方法為進行交叉競爭研究,以尋找彼此競爭性結合之抗體,例如競爭結合至抗原之抗體。基於抗體之交叉競爭將其「分組」之高通量方法描述於國際專利申請案第WO 2003/48731號中。如熟習此項技術者所瞭解,實際上抗體可特異性結合之任何事物均可為抗原決定基。抗原決定基可包含抗體結合之彼等殘基。構架或 Fc 之修飾 本文所揭示之抗體及抗體結合物可包含經修飾之抗體或其抗原結合片段,其包含對VH及/或VL中之構架殘基的修飾,例如以改良抗體/抗體結合物之特性。 在一些實施例中,進行構架修飾以降低抗體之免疫原性。舉例而言,一種方法為使一或多個構架殘基「回復突變(back-mutate)」成相應生殖系序列。此類殘基可藉由比較抗體構架序列與衍生抗體之生殖系序列來鑑別。為了使構架區序列與所需生殖系構形「匹配」,殘基可藉由例如定點突變誘發來「回復突變」成相應的生殖系序列。此類「回復突變」抗體亦意欲由本發明涵蓋。 構架修飾之另一類型涉及使構架區內,或甚至一或多個CDR區內之一或多個殘基突變,以移除T細胞抗原決定基,藉此降低抗體之潛在免疫原性。此方法亦稱為「去免疫」,且進一步詳細描述於Carr等人之美國專利公開案第20030153043號中。 除了在構架或CDR區中進行修飾以外或替代地,本文所揭示之抗體可經工程改造以包括Fc區中之修飾,通常經工程改造以改變抗體之一或多種功能特性,諸如血清半衰期、補體結合、Fc受體結合及/或抗原依賴性細胞毒性。 此外,本文所揭示之抗體可經化學修飾(例如一或多個化學部分可連接至抗體)或經修飾以改變其糖基化,以再次改變抗體之一或多種功能特性。此等實施例中之每一者進一步詳細描述於下文中。 在一個實施例中,CH1之鉸鏈區經修飾以使得鉸鏈區中之半胱胺酸殘基數目改變,例如增加或減少。此方法進一步描述於Bodmer等人之美國專利案第5,677,425號中。CH1鉸鏈區中之半胱胺酸殘基數經改變以例如促進輕鏈及重鏈之組裝或提高或降低抗體之穩定性。 在一些實施例中,適用於本文中所揭示之抗體結合物中的抗體或抗體片段(例如抗原結合片段)包括經修飾或經工程改造之抗體,諸如經修飾以引入一或多個半胱胺酸殘基作為與藥物部分結合之位點的抗體(Junutula JR等人: Nat Biotechnol 2008, 26:925-932)。在一個實施例中,本發明提供一種經修飾之抗體或其抗體片段,其包含用半胱胺酸在本文所述之位置處取代一或多種胺基酸。針對半胱胺酸取代之位點處於抗體之恆定區中且因此適用於多種抗體,且位點經選擇以提供穩定及均質結合物。經修飾之抗體或片段可具有兩個或多於兩個半胱胺酸取代,且此等取代可與如本文中所述之其他修飾及結合方法組合使用。用於在抗體之特定位置處插入半胱胺酸之方法為此項技術中已知的,參見例如Lyons等人, (1990) Protein Eng., 3:703-708、WO 2011/005481、WO 2014/124316、WO 2015/138615。在某些實施例中,經修飾之抗體或抗體片段包含在其恆定區上用半胱胺酸取代一或多種胺基酸,該取代選自抗體或抗體片段之重鏈的以下位置:117、119、121、124、139、152、153、155、157、164、169、171、174、189、205、207、246、258、269、274、286、288、290、292、293、320、322、326、333、334、335、337、344、355、360、375、382、390、392、398、400及422,且其中該等位置係根據EU系統編號。在一些實施例中,經修飾之抗體或抗體片段包含在其恆定區上用半胱胺酸取代一或多種胺基酸,該取代選自抗體或抗體片段之輕鏈的以下位置:107、108、109、114、129、142、143、145、152、154、156、159、161、165、168、169、170、182、183、197、199及203,其中該等位置係根據EU系統編號,且其中輕鏈為人類κ輕鏈。在某些實施例中,經修飾之抗體或其抗體片段包含在其恆定區上用半胱胺酸進行之兩種或多於兩種胺基酸之取代之組合,其中該等組合包含在抗體重鏈之位置375、抗體重鏈之位置152、抗體重鏈之位置360或抗體輕鏈之位置107處之取代,且其中該等位置係根據EU系統編號。在某些實施例中,經修飾之抗體或其抗體片段包含在其恆定區上用半胱胺酸取代一種胺基酸,其中該取代為抗體重鏈之位置375、抗體重鏈之位置152、抗體重鏈之位置360、抗體輕鏈之位置107、抗體輕鏈之位置165或抗體輕鏈之位置159,且其中該等位置係根據EU系統編號,且其中輕鏈為κ鏈。 在特定實施例中,經修飾之抗體或其抗體片段包含在其恆定區上用半胱胺酸進行之兩種胺基酸之取代之組合,其中經修飾之抗體或其抗體片段包含抗體重鏈之位置152及375處的半胱胺酸,其中該等位置係根據EU系統編號。 在其他特定實施例中,經修飾之抗體或其抗體片段包含在抗體重鏈之位置360處用半胱胺酸取代一種胺基酸,且其中該等位置係根據EU系統編號。 在其他特定實施例中,經修飾之抗體或其抗體片段包含在抗體輕鏈之位置107處用半胱胺酸取代一種胺基酸,且其中該等位置係根據EU系統編號,且其中輕鏈為κ鏈。 在其他實施例中,適用於本文中所揭示之抗體結合物中的抗體或抗體片段(例如抗原結合片段)包括經修飾或經工程改造之抗體,諸如經修飾以引入一或多種其他反應性胺基酸(除半胱胺酸以外) (包括Pcl、吡咯離胺酸、肽標籤(諸如S6、A1及ybbR標籤))及非天然胺基酸代替原生序列中之至少一種胺基酸之抗體,由此在抗體或抗原結合片段上提供用於與式(I)或其子式之藥物部分結合之反應性位點。舉例而言,抗體或抗體片段可經修飾以合併Pcl或吡咯離胺酸(W. Ou等人, (2011) PNAS 108 (26), 10437-10442;WO2014124258)或非天然胺基酸(J.Y. Axup等人, Proc Natl Acad Sci U S A, 109 (2012), 第16101-16106頁;關於綜述,參見C.C. Liu及P.G. Schultz (2010) Annu Rev Biochem 79, 413-444;C.H. Kim等人, (2013) Curr Opin Chem Biol. 17, 412-419)作為用於與藥物結合之位點。類似地,可將用於酶促結合方法之肽標籤引入抗體(Strop P.等人, Chem Biol. 2013, 20(2):161-7;Rabuka D., Curr Opin Chem Biol. 2010 Dec;14(6):790-6;Rabuka D等人, Nat Protoc. 2012, 7(6):1052-67)。一個其他實例為使用4'-磷醯基泛醯巰基轉移酶(PPTase)結合輔酶A類似物(WO2013184514)。用於使此類經修飾或經工程改造之抗體與有效負載物或連接子-有效負載物組合結合之方法為此項技術中已知的。 在另一實施例中,抗體之Fc鉸鏈區經突變以減少抗體之生物半衰期。更特定言之,將一或多個胺基酸突變引入Fc鉸鏈片段之CH2-CH3域界面區中,使得抗體對葡萄球菌蛋白質A (SpA)的結合相對於原生Fc鉸鏈域SpA結合減弱。此方法進一步詳細描述於Ward等人之美國專利案第6,165,745號中。 在其他實施例中,Fc區藉由用不同胺基酸殘基置換至少一個胺基酸殘基來改變,以改變抗體之效應功能。舉例而言,一或多種胺基酸可經不同胺基酸殘基置換以使得該抗體具有改變之針對效應配位體的親和力,但保留親本抗體之抗原結合能力。親和力改變之效應配位體可為例如Fc受體或補體之C1組分。此方法描述於例如Winter等人之美國專利第5,624,821號與第5,648,260號中。 在另一實施例中,選自胺基酸殘基之一或多種胺基酸可用不同胺基酸殘基替換,以使得抗體具有改變之C1q結合及/或減弱或消除之補體依賴細胞毒性(CDC)。此方法描述於例如Idusogie等人之美國專利第6,194,551號中。 在另一實施例中,一或多個胺基酸殘基經改變以藉此改變抗體固定補體之能力。此方法描述於例如Bodmer等人之PCT公開案WO 94/29351中。異型胺基酸殘基亦包括(但不限於) IgG1、IgG2及IgG3子類之重鏈之恆定區以及κ同型之輕鏈之恆定區,如Jefferis等人, MAbs. 1:332-338 (2009)所述。 在又另一實施例中,Fc區經修飾以提高抗體介導抗體依賴性細胞毒性(ADCC)及/或抗體依賴性細胞吞噬作用(ADCP)之能力,其例如藉由修飾一或多個胺基酸殘基來增加抗體對活化Fcγ受體之親和力或降低抗體對抑制性Fcγ受體之親和力。人類活化Fcγ受體包括FcγRIa、FcγRIIa、FcγRIIIa及FcγRIIIb,且人類抑制性Fcγ受體包括FcγRIIb。此方法描述於例如Presta之PCT公開案WO 00/42072中。此外,人類IgG1上之針對FcγRl、FcγRII、FcγRIII及FcRn之結合位點已經定位且具有改良之結合的變異體已有描述(參見Shields等人, J. Biol. Chem. 276:6591-6604, 2001)。單株抗體之經Fc介導之效應功能之最佳化,諸如經提高之ADCC/ADCP功能已有描述(參見Strohl, W.R., Current Opinion in Biotechnology 2009; 20:685-691)。在一些實施例中,抗體結合物包含免疫球蛋白重鏈,其包含賦予經增強之ADCC/ADCP功能的突變或突變之組合,例如選自以下之一或多種突變:G236A、S239D、F243L、P247I、D280H、K290S、R292P、S298A、S298D、S298V、Y300L、V305I、A330L、I332E、E333A、K334A、A339D、A339Q、A339T、P396L(所有位置均依據EU編號)。 在另一實施例中,Fc區經修飾以提高抗體介導ADCC及/或ADCP之能力,其例如藉由修飾一或多種胺基酸以增加抗體對通常將不會識別親本抗體之活化受體,諸如FcαRI之親和力。此方法描述於例如Borrok等人, mAbs. 7(4):743-751中。在特定實施例中,抗體結合物包含免疫球蛋白重鏈,其包含賦予經增強之ADCC及/或ADCP功能的一或多個抗體序列之突變或融合。 在另一實施例中,抗體之糖基化經修飾。舉例而言,可產生去糖基化抗體(亦即,缺乏糖基化之抗體)。糖基化可經改變以例如提高抗體對「抗原」之親和力。此類碳水化合物修飾可藉由例如改變抗體序列中之一或多個糖基化位點來完成。舉例而言,可進行一或多個胺基酸取代,其使得一或多個可變區構架糖基化位點消除,進而消除位於其位點之糖基化。此類非糖基化可提高抗體對抗原之親和力。此類方法描述於例如Co等人之美國專利第5,714,350號及第6,350,861號中。 另外或替代地,可產生糖基化類型改變之抗體,諸如海藻糖基殘基量減少之低海藻糖基化抗體或二分GlcNac結構增加之抗體。已證明此類改變之糖基化模式會提高抗體之ADCC能力。此類碳水化合物修飾可藉由例如在具有改變之糖基化機構之宿主細胞中表現抗體來實現。糖基化機制改變之細胞在此項技術中已有描述且可用作表現本發明之重組抗體以藉此產生糖基化改變之抗體的宿主細胞。舉例而言,Hang等人之EP 1,176,195描述一種細胞株,其中編碼海藻糖基轉移酶之FUT8基因在功能上中斷,使得此類細胞株中所表現之抗體展現低海藻糖基化。Presta之PCT公開案WO 03/035835描述一種變異型CHO細胞株(Lecl3細胞),其中海藻糖連接至Asn(297)連接型碳水化合物的能力降低,亦導致該宿主細胞中所表現之抗體產生低海藻糖基化(亦參見Shields等人, (2002) J. Biol. Chem. 277:26733-26740)。Umana等人之PCT公開案WO 99/54342描述經工程改造以表現糖蛋白修飾型糖基轉移酶(例如β(1,4)-N乙醯基葡糖胺轉移酶III (GnTIII))的細胞株,使得經工程改造之細胞株中所表現之抗體展現增加之二分GlcNac結構,從而提高抗體之ADCC活性(亦參見Umana等人,Nat. Biotech. 17:176-18, 19990)。 在另一實施例中,抗體經修飾以增加其生物半衰期。可進行多種方法。舉例而言,可引入以下突變中之一或多者:T252L、T254S、T256F,如Ward之美國專利案第6,277,375號中所述。或者,為了增加生物半衰期,抗體可在CH1或CL區中經改變而含有取自IgG之Fc區之CH2域的兩個環的救助受體結合抗原決定基,如Presta等人之美國專利第5,869,046號及第6,121,022號中所述。 - HER2 抗體之製造 抗-HER2抗體及其抗體片段(例如抗原結合片段)可由此項技術中已知的任何手段產生,包括(但不限於)抗體四聚體之重組表現、化學合成及酶促消化,而全長單株抗體可由例如融合瘤或重組製造獲得。重組表現可獲自此項技術中已知的任何適當宿主細胞,例如哺乳動物宿主細胞、細菌宿主細胞、酵母宿主細胞、昆蟲宿主細胞等。 本文亦提供編碼本文所述之抗體的聚核苷酸,例如編碼如本文所述之重鏈或輕鏈可變區或包含互補決定區之鏈段的聚核苷酸。在一些實施例中,編碼重鏈可變區之聚核苷酸與SEQ ID NO: 8之聚核苷酸具有至少85%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%核酸序列一致性。在一些實施例中,編碼輕鏈可變區之聚核苷酸與SEQ ID NO: 18之聚核苷酸具有至少85%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%核酸序列一致性。 在一些實施例中,編碼重鏈之聚核苷酸與SEQ ID NO: 10、SEQ ID NO: 22或SEQ ID NO: 24中之任一者之聚核苷酸具有至少85%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%核酸序列一致性。在一些實施例中,編碼輕鏈之聚核苷酸與SEQ ID NO: 20或SEQ ID NO: 34之聚核苷酸具有至少85%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%核酸序列一致性。 本文所揭示之一些聚核苷酸編碼抗HER2抗體之可變區。本文所揭示之一些聚核苷酸編碼抗HER2抗體之可變區與恆定區兩者。一些聚核苷酸序列編碼包含抗HER2抗體之重鏈及輕鏈兩者之可變區的多肽。一些聚核苷酸編碼兩個多肽鏈段,其分別與本文所揭示之任何抗-HER2抗體之重鏈及輕鏈的可變區實質上相同。 聚核苷酸序列可藉由重生固相DNA合成或藉由編碼抗HER2抗體或其結合片段之現有序列(例如如以下實例中所述之序列)之PCR突變誘發來產生。核酸之直接化學合成可藉由此項技術中已知之方法實現,諸如Narang等人, Meth. Enzymol. 68:90, 1979之磷酸三酯法;Brown等人, Meth. Enzymol. 68:109, 1979之磷酸二酯法;Beaucage等人, Tetra. Lett., 22:1859, 1981之胺基磷酸二乙酯法;及美國專利案第4,458,066號之固體載體法。藉由PCR向聚核苷酸序列引入突變可如以下文獻中所述進行:例如PCR Technology: Principles and Applications for DNA Amplification, H.A. Erlich (編), Freeman Press, NY, NY, 1992;PCR Protocols: A Guide to Methods and Applications, Innis等人(編), Academic Press, San Diego, CA, 1990;Mattila等人, Nucleic Acids Res. 19:967, 1991;及Eckert等人, PCR Methods and Applications 1:17, 1991。 亦提供用於製造上文所述之抗-HER2抗體的表現載體及宿主細胞。多種表現載體可用於表現編碼抗HER2抗體鏈或結合片段之聚核苷酸。基於病毒之表現載體與非病毒表現載體均可用於在哺乳動物宿主細胞中產生抗體。 非病毒載體及系統包括質體、游離型載體(通常具有用於表現蛋白質或RNA之表現卡匣)及人類人工染色體(參見例如Harrington等人, Nat Genet. 15:345, 1997)。舉例而言,適用於哺乳動物(例如人類)細胞中抗HER2聚核苷酸及多肽之表現的非病毒載體包括pThioHis A、B及C、pCDNATM3.1/His、pEBVHis A、B及C (Invitrogen, San Diego, CA)、MPSV載體及此項技術中已知用於表現其他蛋白質之多種其他載體。適用的病毒載體包括基於逆轉錄病毒、腺病毒、腺相關病毒、疱疹病毒之載體;基於SV40、乳頭狀瘤病毒、HBP埃-巴二氏病毒(HBP Epstein Barr virus)、牛痘病毒載體及勝利基森林病毒(Semliki Forest virus;SFV)之載體。參見,Bren等人,前述;Smith, Annu. Rev. Microbiol. 49:807, 1995;及Rosenfeld等人, Cell 68:143, 1992。 表現載體之選擇視欲表現載體之所需宿主細胞而定。典型地,表現載體含有可操作地連接於編碼抗HER2抗體鏈或片段之聚核苷酸的啟動子及其他調節序列(例如增強子)。在一些實施例中,誘導性啟動子用於防止所插入之序列表現,在誘導條件下除外。誘導性啟動子包括例如阿拉伯糖、lacZ、金屬硫蛋白啟動子或熱休克啟動子。經轉型之生物體之培養可在使群體不偏向表現產物被宿主細胞良好耐受的非誘導條件下擴增。除啟動子之外,其他調節元件亦可為抗HER2抗體鏈或片段之有效表現所必需或所需的。元件典型地包括ATG起始密碼子及相鄰的核糖體結合位點或其他序列。此外,表現效率可藉由在使用中包括對細胞系統合適之強化子來增強(參見例如Scharf等人, Results Probl. Cell Differ. 20:125, 1994;及Bittner等人, Meth. Enzymol., 153:516, 1987)。舉例而言,SV40增強子或CMV增強子可用於增強哺乳動物宿主細胞中之表現。 表現載體亦可提供分泌信號序列位置以與由所插入之抗HER2抗體序列編碼之多肽形成融合蛋白。更通常地,所插入之抗HER2抗體序列在包括於載體中之前連接至信號序列。接收編碼抗HER2抗體輕鏈及重鏈可變域之序列所用的載體有時亦編碼恆定區或其一部分。此類載體允許可變區以與恆定區形成之融合蛋白形式表現,由此引起產生完整抗體或其片段。典型地,此類恆定區為人類恆定區。 含有及表現抗HER2抗體鏈之宿主細胞可為原核或真核細胞。大腸桿菌為一種適用於選殖及表現本發明之聚核苷酸之原核宿主。適用之其他微生物宿主包括桿菌(諸如枯草桿菌),及其他腸內菌科(諸如沙門氏菌、沙雷氏菌),及多種假單胞菌種。在此等原核宿主中,亦可產生表現載體,其典型地含有與宿主細胞相容之表現控制序列(例如複製起點)。此外,將存在任何數目之多種熟知啟動子,諸如乳糖啟動子系統、色胺酸(trp)啟動子系統、β-內醯胺酶啟動子系統或自噬菌體λ之啟動子系統。啟動子通常視情況與操縱序列一起控制表現,且具有用於起始且完成轉錄及轉譯之核糖體結合位點序列及其類似序列。其他微生物,諸如酵母亦可用於表現本文所揭示之抗HER2多肽。亦可使用昆蟲細胞與桿狀病毒載體之組合。 在一些特定實施例中,哺乳動物宿主細胞用於表現及產生本發明之抗HER2多肽。舉例而言,其可為表現內源性免疫球蛋白基因的融合瘤細胞株(例如骨髓瘤融合瘤純系)或含有外源性表現載體的哺乳動物細胞株(例如SP2/0骨髓瘤細胞)。此等細胞包括任何正常致死或正常或異常永生之動物或人類細胞。舉例而言,已開發出能夠分泌完整免疫球蛋白之多種適合宿主細胞株,包括各種CHO細胞株、Cos細胞株、海拉細胞(HeLa cell)、骨髓瘤細胞株、經轉型之B細胞及融合瘤。使用哺乳動物組織細胞培養物表現多肽大體上論述於例如Winnacker, From Genes to Clones, VCH Publishers, N.Y., N.Y., 1987中。哺乳動物宿主細胞之表現載體可包括表現控制序列,諸如複製起點、啟動子及強化子(參見例如Queen等人, Immunol. Rev. 89:49-68, 1986),及必需的處理資訊位點,諸如核糖體結合位點、RNA剪接位點、聚腺苷酸化位點,及轉錄終止子序列。表現載體通常含有來源於哺乳動物基因或來源於哺乳動物病毒之啟動子。適合之啟動子可為組成性、細胞類型特異性、階段特異性及/或可調節或可調控的。適用啟動子包括(但不限於)金屬硫蛋白啟動子、組成性腺病毒主要晚期啟動子、地塞米松誘導性MMTV啟動子、SV40啟動子、MRP polIII啟動子、組成性MPSV啟動子、四環素誘導性CMV啟動子(諸如人類即刻早期CMV啟動子)、組成性CMV啟動子及此項技術中已知的啟動子-增強子組合。 用於引入含有相關聚核苷酸序列之表現載體之方法視細胞宿主之類型而變化。舉例而言,氯化鈣轉染通常用於原核細胞,而磷酸鈣處理或電致孔可用於其他細胞宿主(一般參見Sambrook等人,同上)。其他方法包括例如電致孔、磷酸鈣處理、脂質體介導之轉型、注射及顯微注射、衝擊法、病毒顆粒(virosome)、免疫脂質體、聚陽離子:核酸結合物、裸DNA、人工病毒粒子、與疱疹病毒結構蛋白VP22融合(Elliot及O'Hare, Cell 88:223, 1997)、DNA之藥劑增強性吸收,及離體轉導。就長期高產量生產重組蛋白質而言,通常需要穩定的表現。舉例而言,穩定表現抗HER2抗體鏈或結合片段之細胞株可使用本文所揭示之表現載體製備,該等表現載體含有病毒複製起點或內源性表現元件及可選標記基因。在引入載體之後,可允許細胞在豐富培養基中生長1至2天,隨後將豐富培養基與選擇性培養基交換。可選標記之目的為賦予抗選擇性,且其存在允許成功表現所引入序列的細胞在選擇性培養基中生長。穩定轉染之抗性細胞可使用適合於該細胞類型之組織培養技術增殖。 用於製得式(IIa)及式(IIb)抗體結合物之製程 用於形成式(II)免疫刺激結合物之通用反應流程顯示於以下流程13中:流程 13 其中:RG1 為與相容的式(Ia)化合物之R4 基團反應以形成對應R40 基團的反應性基團,諸如與硫醇反應以得到丁二醯亞胺環之順丁烯二醯亞胺,或與酮反應以得到肟之羥胺;R1 、R4 、L2 、Ab及R40 係如本文中所定義。 用於形成式(IIb)免疫刺激結合物之通用反應流程顯示於以下流程14中:流程 14 其中:RG1 為與相容的式(Ib)化合物之R4 基團反應以形成對應R40 基團的反應性基團,諸如與硫醇反應以得到丁二醯亞胺環之順丁烯二醯亞胺,或與酮反應以得到肟之羥胺;R1 、R4 、L2 、Ab及R40 係如本文中所定義。 治療性用途及治療方法 所提供之抗體結合物適用於多種應用中,包括(但不限於)治療癌症,諸如HER2陽性癌症。在某些實施例中,本文中所提供之抗體結合物適用於抑制腫瘤生長、減小腫瘤體積、誘導分化及/或降低腫瘤,例如HER2實體腫瘤之致瘤性。使用方法可為活體外、離體或活體內方法。 在一些實施例中,本文提供在有需要之個體,例如人類患者中藉由向個體投與本文所述之抗體結合物中之任一者來治療、預防或改善疾病,例如HER2陽性癌症之方法。亦提供本發明之抗體結合物治療或預防個體,例如人類患者中之疾病的用途。另外提供抗體結合物在治療或預防個體中之疾病方面之用途。在一些實施例中,提供供用於製造用於治療或預防個體中之疾病的藥劑之製造中的抗體結合物。在某些實施例中,用抗體結合物治療之疾病為癌症,例如HER2陽性癌症。可用抗體結合物治療之各種癌症列於以上定義章節中。HER2陽性癌症可為包含以下細胞之任何癌症,該等細胞在其細胞表面處存在HER2蛋白質。舉例而言,HER2陽性癌症可為以下中之任一者的原發腫瘤或癌轉移任一者:胃癌、食道癌、胃食道接合部腺癌、結腸癌、直腸癌、乳癌、卵巢癌、子宮頸癌、子宮癌、子宮內膜癌、膀胱癌、泌尿道癌、胰臟癌、肺癌、前列腺癌、骨肉瘤、神經母細胞瘤、神經膠母細胞瘤、神經內分泌腫瘤及頭頸癌。在某些實施例中,癌症的特徵在於抗體結合物之抗體、抗體片段(例如抗原結合片段)所結合之HER2表現細胞。在某些實施例中,癌症的特徵在於除了HER2表現之外,多個人類表皮生長因子受體同時表現。在一些實施例中,HER2陽性癌症可具有高HER2表現,例如具有如藉由美國臨床腫瘤學學會及美國病理學家學院(ASCO/CAP)IHC評分所測定,3+之免疫組織化學(IHC)評分,其界定為>30%侵襲性腫瘤細胞之均一強烈膜染色(參見English等人, Mol Diagn Ther. 2013 Apr; 17(2): 85-99)。在一些實施例中,HER2陽性癌症可具有相對較低HER2表現,例如藉由ASCO/CAP IHC評分具有2+之IHC評分,其界定為在至少10%細胞中呈非均勻或強度較弱但具有明顯圓周分佈的完整膜染色或顯示30%或少於30%腫瘤細胞之完整膜染色的極其罕見之腫瘤(參見English等人, Mol Diagn Ther. 2013 Apr; 17(2): 85-99)。 在一些實施例中,提供在有需要之個體中治療HER2陽性癌症之方法,該等方法包含向個體投與治療有效量的本文所述之抗體結合物中之任一者。HER2陽性癌症可為包含以下細胞之任何癌症,該等細胞在其細胞表面處存在HER2蛋白質。在一些實施例中,當與單獨抗HER2抗體相比時,所用抗體結合物能夠抑制HER2陽性癌症持續時間段及/或減少HER2陽性癌症復發。 亦預期本文所述之抗體結合物可用於治療各種非惡性疾病或病症,諸如發炎性腸病(IBD);胃腸道潰瘍;梅內特雷爾病(Menetrier's disease);B型肝炎;C型肝炎;分泌性腺瘤或蛋白質缺失症候群;腎功能異常;血管生成病症;眼病,諸如年齡相關黃斑變性、擬眼組織漿菌病症候群或年齡相關黃斑變性;慢性閉塞性肺病或燒傷、外傷、輻射、中風、低氧或局部缺血之後出現的水腫;糖尿病腎病變;佩吉特氏病(Paget's disease);光老化(例如由人類皮膚之UV輻射所引起);良性前列腺肥大;特定微生物感染,包括選自腺病毒、漢坦病毒(hantaviruse)、伯氏疏螺旋體(Borrelia burgdorferi)、耶爾森氏菌屬(Yersinia spp.)及百日咳博德特氏菌(Bordetella pertussis)之微生物病原體;由血小板凝集所引起之血栓;生殖性病狀,諸如子宮內膜異位、卵巢過度刺激症候群、子癇前症(preeclampsia)、功能異常子宮出血或月經過多;急性及慢性腎病變(包括增殖性絲球體腎炎);肥厚性疤痕形成;內毒素休克及真菌感染;家族性腺瘤性息肉病;骨髓發育不良症候群;再生不全性貧血;缺血性損傷;肺、腎臟或肝臟纖維化;嬰兒肥大性幽門狹窄;泌尿阻塞性症候群;牛皮癬性關節炎。 此類抗體結合物之投與方法包括(但不限於)非經腸(例如靜脈內)投與,例如歷經一段時間以快速或連續輸注形式注射、口服、肌肉內投與、瘤內投與、肌肉內投與、腹膜內投與、腦脊髓內投與、皮下投與、關節內投與、滑膜內投與、注射至淋巴結或鞘內投與。 對於疾病治療而言,本發明之抗體結合物的合適劑量視各種因素,諸如待治療之疾病之類型、疾病之嚴重程度及病程、疾病反應性、先前療法、患者臨床病史等而定。抗體結合物可一次性投與或在持續數日至數月的一系列治療期間投與,或直至實現治癒或達成疾病病況之減弱(例如腫瘤尺寸減小)。最佳給藥時程可由患者體內藥物積聚之量測結果來計算且將視特定抗體結合物之相關效能而變化。在一些實施例中,劑量為每公斤體重0.01 mg至20 mg (例如0.01 mg、0.02 mg、0.03 mg、0.04 mg、0.05 mg、0.06 mg、0.07 mg、0.08 mg 、0.09 mg、0.1 mg、0.2 mg、0.3 mg、0.4 mg、0.5 mg、0.6 mg、0.7 mg、0.8 mg、0.9 mg、1 mg,2 mg、3 mg、4 mg、5 mg、6 mg、7 mg、8 mg、9 mg、10 mg、11 mg、12 mg、13 mg、14 mg、 15 mg、16 mg、17 mg、18 mg、19 mg或20 mg),且可每日、每週、每月或每年提供一次或多次。在某些實施例中,每兩週一次或每三週一次給予本發明之抗體結合物。在某些實施例中,本發明之抗體結合物僅給予一次。治療醫師可根據藥物在體液或組織中之所測滯留時間及濃度估算重複給藥率。 組合療法 在某些情況下,本發明之抗體結合物可與其他治療劑組合,諸如其他抗癌劑、抗過敏性劑、抗噁心劑(或鎮吐藥)、疼痛舒解劑、細胞保護劑及其組合。 考慮供用於組合療法中之一般化學治療劑包括阿那曲唑(anastrozole) (Arimidex®)、比卡魯胺(bicalutamide) (Casodex®)、硫酸博萊黴素(bleomycin sulfate) (Blenoxane®)、白消安(busulfan) (Myleran®)、白消安注射液(Busulfex®)、卡培他濱(capecitabine) (Xeloda®)、N4-戊氧基羰基-5-脫氧-5-氟胞苷、卡鉑(carboplatin) (Paraplatin®)、卡莫司汀(carmustine) (BiCNU®)、氯芥苯丁酸(Leukeran®)、順鉑(cisplatin) (Platinol®)、克拉屈濱(cladribine) (Leustatin®)、環磷醯胺(Cytoxan®或Neosar®)、阿糖胞苷、胞嘧啶阿拉伯糖苷(Cytosar-U®)、阿糖胞苷脂質體注射液(DepoCyt®)、達卡巴嗪(dacarbazine) (DTIC-Dome®)、放線菌素D(放射菌素D、Cosmegan)、鹽酸道諾黴素(daunorubicin hydrochloride) (Cerubidine®)、檸檬酸道諾黴素脂質體注射液(DaunoXome®)、地塞米松、多西他賽(Taxotere®)、鹽酸阿黴素(doxorubicin hydrochloride) (Adriamycin®、Rubex®)、依託泊苷(etoposide) (Vepesid®)、磷酸氟達拉賓(fludarabine phosphate) (Fludara®)、5-氟尿嘧啶(Adrucil®、Efudex®)、氟他胺(flutamide) (Eulexin®)、替紮他濱(tezacitibine) 、吉西他濱(Gemcitabine) (二氟脫氧胞苷)、羥基脲(Hydrea®)、艾達黴素(Idarubicin) (Idamycin®)、異環磷醯胺(IFEX®)、伊立替康(irinotecan) (Camptosar®)、L-天冬醯胺酶(ELSPAR®)、甲醯四氫葉酸鈣、美法侖(melphalan) (Alkeran®)、6-巰嘌呤(Purinethol®)、甲胺喋呤(methotrexate) (Folex®)、米托蒽醌(mitoxantrone) (Novantrone®)、mylotarg、太平洋紫杉醇(Taxol®)、菲尼克斯(phoenix) (釔90/MX-DTPA)、噴司他汀(pentostatin)、聚苯丙生20與卡莫司汀植入物(polifeprosan 20 with carmustine implant) (Gliadel®)、檸檬酸他莫昔芬(tamoxifen citrate) (Nolvadex®)、替尼泊甙(teniposide) (Vumon®)、6-硫代鳥嘌呤、噻替派(thiotepa)、替拉紮明(Tirazone®)、注射用鹽酸拓朴替康(topotecan hydrochloride for injection) (Hycamptin®)、長春鹼(Velban®)、長春新鹼(Oncovin®)、長春瑞濱(vinorelbine) (Navelbine®)、表柔比星(epirubicin) (Ellence®)、奧沙利鉑(oxaliplatin) (Eloxatin®)、依西美坦(exemestane) (Aromasin®)、來曲唑(letrozole) (Femara®)及氟維司群(fulvestrant) (Faslodex®)。 如本文所用,術語「醫藥組合」係指呈一種單位劑型之固定組合,或非固定組合或分裝部分之套組以用於組合投藥,其中兩種或多於兩種治療劑可同時獨立地投與或在時間間隔內分別投與,在一些實施例中,此等時間間隔使得組合搭配物展示協作效應,例如協同效應。 術語「組合療法」或「組合」係指投與兩種或多於兩種治療劑來治療本發明中所述之治療性病狀或病症。此類投藥涵蓋此等治療劑以實質上同時之方式,諸如以具有固定比率之活性成分的單一膠囊之形式共同投藥。或者,此類投藥涵蓋各活性成分在多個或單獨容器(例如膠囊、粉末及液體)中共同投與。粉末及/或液體在投藥之前可復原或稀釋至所需劑量。另外,此類投與亦涵蓋在大致相同的時間或在不同時間依序使用各類型治療劑。在任一情況下,治療方案將提供藥物組合在治療本文所述之病狀或病症方面之有益作用。 在一些實施例中,組合療法可提供「協同作用」且證實「協同性」,亦即當活性成分一起使用時所達成之作用大於由分別使用化合物所產生之作用的總和。協同作用可在活性成分如下時獲得:(1)共同調配且以組合、單位劑量調配物形式同時投與或遞送;(2)以單獨調配物形式交替或同時遞送;或(3)藉由某一其他方案。當以交替療法遞送時,協同效應可在化合物例如藉由以分開注射器不同注射依序投與或遞送時獲得。一般而言,在交替療法期間,依序,亦即連續投與各活性成分之有效劑量,而在組合療法中,一起投與兩種或多於兩種活性成分之有效劑量。 在一個實施例中,本發明提供一種藉由以下治療癌症之方法:向有需要之個體投與與一或多種其他抗-HER2抗體,例如上文所述之曲妥珠單抗、帕妥珠單抗、馬妥昔單抗或HT-19組合,或與其他抗HER2結合物,例如曲妥珠單抗-美坦新偶聯物(ado-trastuzumab emtansine) (亦稱為Kadcyla®或T-DM1)組合的本發明之抗體結合物。 在一個實施例中,本發明提供一種藉由以下治療癌症之方法:向有需要之個體投與與一或多種酪胺酸激酶抑制劑,包括(但不限於)EGFR抑制劑、Her3抑制劑、IGFR抑制劑及Met抑制劑組合的本發明之抗體結合物。 舉例而言,酪胺酸激酶抑制劑包括(但不限於)鹽酸埃羅替尼(Erlotinib hydrochloride) (Tarceva®);立尼法尼(Linifanib) (N-[4-(3-胺基-1H-吲唑-4-基)苯基]-N'-(2-氟-5-甲基苯基)脲,亦稱為ABT869,購自Genentech);蘋果酸舒尼替尼(Sunitinib malate) (Sutent®);伯舒替尼(Bosutinib) (4-[(2,4-二氯-5-甲氧苯基)胺基]-6-甲氧基-7-[3-(4-甲基哌嗪-1-基)丙氧基]喹啉-3-甲腈,亦稱為SKI-606,且描述於美國專利第6,780,996號中);達沙替尼(Dasatinib) (Sprycel®);帕唑帕尼(Pazopanib) (Votrient®);索拉非尼(Sorafenib) (Nexavar®);紮克替馬(Zactima) (ZD6474);及伊馬替尼(Imatinib)或甲磺酸伊馬替尼(Gilvec®及Gleevec®)。 表皮成長因子受體(EGFR)抑制劑包括(但不限於)鹽酸埃羅替尼(Tarceva®)、吉非替尼(Gefitinib) (Iressa®);N-[4-[(3-氯-4-氟苯基)胺基]-7-[[(3''S'')-四氫-3-呋喃基]氧基]-6-喹唑啉基]-4(二甲胺基)-2-丁烯醯胺,Tovok®);凡德他尼(Vandetanib) (Caprelsa®);拉帕替尼(Lapatinib) (Tykerb®);(3R,4R)-4-胺基-1-((4-((3-甲氧苯基)胺基)吡咯并[2,1-f][1,2,4]三嗪-5-基)甲基)哌啶-3-醇(BMS690514);卡奈替尼二鹽酸鹽(CI-1033);6-[4-[(4-乙基-1-哌嗪基)甲基]苯基]-N-[(1R)-1-苯基乙基]-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-4-胺(AEE788,CAS 497839-62-0);木利替尼(Mubritinib) (TAK165);培利替尼(Pelitinib) (EKB569);阿法替尼(Afatinib) (Gilotrif®);來那替尼(Neratinib) (HKI-272);N-[4-[[1-[(3-氟苯基)甲基]-1H-吲唑-5-基]胺基]-5-甲基吡咯并[2,1-f][1,2,4]三嗪-6-基]-胺基甲酸, (3S)-3-嗎啉基甲基酯(BMS599626);N-(3,4-二氯-2-氟苯基)-6-甲氧基-7-[[(3aα,5β,6aα)-八氫-2-甲基環戊[c]吡咯-5-基]甲氧基]-4-喹唑啉胺(XL647,CAS 781613-23-8);及4-[4-[[(1R)-1-苯基乙基]胺基]-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-6-基]-苯酚(PKI166,CAS187724-61-4)。 EGFR抗體包括(但不限於)西妥昔單抗(Cetuximab) (Erbitux®);帕尼單抗(Panitumumab) (Vectibix®);馬妥珠單抗(Matuzumab) (EMD-72000);尼妥珠單抗(Nimotuzumab) (hR3);紮魯姆單抗(Zalutumumab);TheraCIM h-R3;MDX0447 (CAS 339151-96-1);及ch806 (mAb-806,CAS 946414-09-1)。 其他HER2抑制劑包括(但不限於)來那替尼(HKI-272,(2E)-N-[4-[[3-氯-4-[(吡啶-2-基)甲氧基]苯基]胺基]-3-氰基-7-乙氧基喹啉-6-基]-4-(二甲胺基)丁-2-烯醯胺,且描述於PCT公開案第WO 05/028443號中);拉帕替尼或二甲苯磺酸拉帕替尼(Tykerb®);(3R,4R)-4-胺基-1-((4-((3-甲氧苯基)胺基)吡咯并[2,1-f][1,2,4]三嗪-5-基)甲基)哌啶-3-醇(BMS690514);(2E)-N-[4-[(3-氯-4-氟苯基)胺基]-7-[[(3S)-四氫-3-呋喃基]氧基]-6-喹唑啉基]-4-(二甲胺基)-2-丁烯醯胺(BIBW-2992,CAS 850140-72-6);N-[4-[[1-[(3-氟苯基)甲基]-1H-吲唑-5-基]胺基]-5-甲基吡咯并[2,1-f][1,2,4]三嗪-6-基]-胺基甲酸, (3S)-3-嗎啉基甲基酯(BMS599626,CAS 714971-09-2);卡奈替尼二鹽酸鹽(PD183805或CI-1033);及N-(3,4-二氯-2-氟苯基)-6-甲氧基-7-[[(3aα,5b,6aα)-八氫-2-甲基環戊[c]吡咯-5-基]甲氧基]-4-喹唑啉胺(XL647,CAS 781613-23-8)。 HER3抑制劑包括(但不限於)LJM716、MM-121、AMG-888、RG7116、REGN-1400、AV-203、MP-RM-1、MM-111及MEHD-7945A。 MET抑制劑包括(但不限於)卡博替尼(Cabozantinib) (XL184,CAS 849217-68-1);弗雷替尼(Foretinib) (GSK1363089,前身為XL880,CAS 849217-64-7);提瓦替尼(Tivantinib) (ARQ197,CAS 1000873-98-2);1-(2-羥基-2-甲基丙基)-N -(5-(7-甲氧基喹啉-4-基氧基)吡啶-2-基)-5-甲基-3-側氧基-2-苯基-2,3-二氫-1H -吡唑-4-甲醯胺(AMG458);克卓替尼(Cryzotinib) (Xalkori®,PF-02341066);(3Z)-5-(2,3-二氫-1H-吲哚-1-基磺醯基)-3-({3,5-二甲基-4-[(4-甲基哌嗪-1-基)羰基]-1H-吡咯-2-基}亞甲基)-1,3-二氫-2H-吲哚-2-酮(SU11271);(3Z)-N-(3-氯苯基)-3-({3,5-二甲基-4-[(4-甲基哌嗪-1-基)羰基]-1H-吡咯-2-基}亞甲基)-N-甲基-2-側氧基吲哚啉-5-磺醯胺(SU11274);(3Z)-N-(3-氯苯基)-3-{[3,5-二甲基-4-(3-嗎啉-4-基丙基)-1H-吡咯-2-基]亞甲基}-N-甲基-2-側氧基吲哚啉-5-磺醯胺(SU11606);6-[二氟[6-(1-甲基-1H吡唑-4-基)-1,2,4-三唑并[4,3-b]噠嗪-3-基]甲基]-喹啉(JNJ38877605,CAS 943540-75-8);2-[4-[1-(喹啉-6-基甲基)-1H-[1,2,3]三唑并[4,5-b]吡嗪-6-基]-1H-吡唑-1-基]乙醇(PF04217903,CAS 956905-27-4);N-((2R)-1,4-二噁烷-2-基甲基)-N-甲基-N'-[3-(1-甲基-1H-吡唑-4-基)-5-側氧基-5H-苯并[4,5]環庚[1,2-b]吡啶-7-基]磺醯胺(MK2461,CAS 917879-39-1);6-[[6-(1-甲基-1H -吡唑-4-基)-1,2,4-三唑并[4,3-b ]噠嗪3-基]硫基]-喹啉(SGX523,CAS 1022150-57-7);及(3Z )-5-[[(2,6-二氯苯基)甲基]磺醯基]-3-[[3,5-二甲基-4-[[(2R )-2-(1-吡咯啶基甲基)-1-吡咯啶基]羰基]-1H -吡咯-2-基]亞甲基]-1,3-二氫-2H -吲哚-2-酮(PHA665752,CAS 477575-56-7)。 IGFR抑制劑包括(但不限於)BMS-754807、XL-228、OSI-906、GSK0904529A、A-928605、AXL1717、KW-2450、MK0646、AMG479、IMCA12、MEDI-573及BI836845。對於綜述,參見例如Yee, JNCI, 104; 975 (2012)。 在另一實施例中,本發明提供一種藉由以下治療癌症之方法:向有需要之個體投與與一或多種增殖信號傳遞路徑抑制劑,包括(但不限於)MEK抑制劑、BRAF抑制劑、PI3K/Akt抑制劑、SHP2抑制劑以及mTOR抑制劑及CDK抑制劑組合的本發明之抗體結合物。 舉例而言,有絲分裂原活化蛋白激酶(MEK)抑制劑包括(但不限於) XL-518 (亦稱為GDC-0973,CAS編號1029872-29-4,購自ACC公司);2-[(2-氯-4-碘苯基)胺基]-N-(環丙基甲氧基)-3,4-二氟-苯甲醯胺(亦稱為CI-1040或PD184352且描述於PCT公開案第WO2000035436號中);N-[(2R)-2,3-二羥基丙氧基]-3,4-二氟-2-[(2-氟-4-碘苯基)胺基]-苯甲醯胺(亦稱為PD0325901且描述於PCT公開案第WO2002006213號中);2,3-雙[胺基[(2-胺基苯基)硫基]亞甲基]-丁二腈(亦稱為U0126且描述於美國專利第2,779,780號中);N-[3,4-二氟-2-[(2-氟-4-碘苯基)胺基]-6-甲氧苯基]-1-[(2R)-2,3-二羥丙基]-環丙烷磺醯胺(亦稱為RDEA119或BAY869766且描述於PCT公開案第WO2007014011號中);(3S,4R,5Z,8S,9S,11E)-14-(乙胺基)-8,9,16-三羥基-3,4-二甲基-3,4,9,19-四氫-1H-2-苯并氧雜環十四烷-1,7(8H)-二酮] (亦稱為E6201且描述於PCT公開案第WO2003076424號中);2'-胺基-3'-甲氧基黃酮(亦稱為PD98059,購自Biaffin有限公司, KG, Germany);維羅非尼(Vemurafenib) (PLX-4032,CAS 918504-65-1);(R)-3-(2,3-二羥丙基)-6-氟-5-(2-氟-4-碘苯基胺基)-8-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-4,7(3H,8H)-二酮(TAK-733,CAS 1035555-63-5);皮馬瑟替(Pimasertib)(AS-703026,CAS 1204531-26-9);及曲美替尼二甲亞碸(Trametinib dimethyl sulfoxide) (GSK-1120212,CAS 1204531-25-80)。 BRAF抑制劑包括(但不限於)維羅非尼(或Zelboraf®)、GDC-0879、PLX-4720(購自Symansis)、達拉非尼(Dabrafenib) (或GSK2118436)、LGX 818、CEP-32496、UI-152、RAF 265、瑞戈非尼(Regorafenib) (BAY 73-4506)、CCT239065或索拉非尼(或甲苯磺酸索拉非尼或Nexavar®)或伊派利單抗(Ipilimumab) (或MDX-010、MDX-101或Yervoy)。 磷酸肌醇3-激酶(PI3K)抑制劑包括(但不限於)4-[2-(1H-吲唑-4-基)-6-[[4-(甲磺醯基)哌嗪-1-基]甲基]噻吩并[3,2-d]嘧啶-4-基]嗎啉(亦稱為GDC0941、RG7321、GNE0941、皮克特昔布(Pictrelisib)或皮克立西(Pictilisib);且描述於PCT公開案第WO 09/036082號及第WO 09/055730號中);2-甲基-2-[4-[3-甲基-2-側氧基-8-(喹啉-3-基)-2,3-二氫咪唑并[4,5-c]喹啉-1-基]苯基]丙腈(亦稱為BEZ235或NVP-BEZ235,且描述於PCT公開案第WO06/122806號中);陶紮色替(Tozasertib) (VX680或MK-0457,CAS 639089-54-6);(5Z)-5-[[4-(4-吡啶基)-6-喹啉基]亞甲基]-2,4-噻唑啶二酮(GSK1059615,CAS 958852-01-2);(1E,4S,4aR,5R,6aS,9aR)-5-(乙醯氧基)-1-[(二-2-丙烯基胺基)亞甲基]-4,4a,5,6,6a,8,9,9a-八氫-11-羥基-4-(甲氧基甲基)-4a,6a-二甲基環戊[5,6]萘并[1,2-c]哌喃-2,7,10(1H)-三酮(PX866,CAS 502632-66-8);8-苯基-2-(嗎啉-4-基)-烯-4-酮(LY294002,CAS 154447-36-6);(S)-N1-(4-甲基-5-(2-(1,1,1-三氟-2-甲基丙-2-基)吡啶-4-基)噻唑-2-基)吡咯啶-1,2-二甲醯胺(亦稱為BYL719或艾培昔布(Alpelisib));2-(4-(2-(1-異丙基-3-甲基-1H-1,2,4-三唑-5-基)-5,6-二氫苯并[f]咪唑并[1,2-d][1,4]噁氮呯-9-基)-1H-吡唑-1-基)-2-甲基丙醯胺(亦稱為GDC0032、RG7604或泰尼西布(Taselisib))。 mTOR抑制劑包括(但不限於)替西羅莫司(Temsirolimus) (Torisel®);地磷莫司(Ridaforolimus) (先前稱為迪福莫司(deferolimus),二甲基次膦酸(1R ,2R ,4S )-4-[(2R )-2[(1R ,9S ,12S ,15R ,16E ,18R ,19R ,21R , 23S ,24E ,26E ,28Z ,30S ,32S ,35R )-1,18-二羥基-19,30-二甲氧基-15,17,21,23, 29,35-六甲基-2,3,10,14,20-五側氧基-11,36-二氧雜-4-氮雜三環[30.3.1.04,9]三十六基-16,24,26,28-四烯-12-基]丙基]-2-甲氧基環己酯,亦稱為AP23573及MK8669,且描述於PCT公開案第WO03/064383號中);依維莫司(Everolimus) (Afinitor®或RAD001);雷帕黴素(Rapamycin) (AY22989,Sirolimus®);斯馬匹莫(Simapimod) (CAS 164301-51-3);(5-{2,4-雙[(3S)-3-甲基嗎啉-4-基]吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-基}-2-甲氧苯基)甲醇(AZD8055);2-胺基-8-[反-4-(2-羥基乙氧基)環己基]-6-(6-甲氧基-3-吡啶基)-4-甲基-吡啶并[2,3-d ]嘧啶-7(8H )-酮(PF04691502,CAS 1013101-36-4);及N2 -[1,4-二側氧基-4-[[4-(4-側氧基-8-苯基-4H -1-苯并吡喃-2-基)嗎啉鎓-4-基]甲氧基]丁基]-L-精胺醯甘胺醯基-L-α-天冬胺醯基L-絲胺酸-(「L-精胺醯甘胺醯基-L-α-天冬胺醯基L-絲胺酸-」揭示為SEQ ID NO: 928)、內鹽(SF1126,CAS 936487-67-1)。 CDK抑制劑包括(但不限於)帕博希布(Palbociclib) (亦稱為PD-0332991,Ibrance®,6-乙醯基-8-環戊基-5-甲基-2-{[5-(1-哌嗪基)-2-吡啶基]胺基}吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H )-酮)。 在又另一實施例中,本發明提供一種藉由以下治療癌症之方法:向有需要之個體投與與一或多種促細胞凋亡劑,包括(但不限於) IAP抑制劑、BCL2抑制劑、MCl1抑制劑、TRAIL藥劑、CHK抑制劑組合的本發明之抗體結合物。 舉例而言,IAP抑制劑包括(但不限於) LCL161、GDC-0917、AEG-35156、AT406及TL32711。IAP抑制劑之其他實例包括(但不限於) WO04/005284、WO 04/007529、WO05/097791、WO 05/069894、WO 05/069888、WO 05/094818、US2006/0014700、US2006/0025347、WO 06/069063、WO 06/010118、WO 06/017295及WO08/134679中所揭示之抑制劑,該等文獻皆以引用之方式併入本文中。 BCL-2抑制劑包括(但不限於)4-[4-[[2-(4-氯苯基)-5,5-二甲基-1-環己-1-基]甲基]-1-哌嗪基]-N-[[4-[[(1R)-3-(4-嗎啉基)-1-[(苯硫基)甲基]丙基]胺基]-3-[(三氟甲基)磺醯基]苯基]磺醯基]苯甲醯胺(亦稱為ABT-263且描述於PCT公開案第WO 09/155386號中);替曲卡星A (Tetrocarcin A);抗微素;棉子酚((-)BL-193);奧巴克拉(Obatoclax);乙基-2-胺基-6-環戊基-4-(1-氰基-2-乙氧基-2-側氧基乙基)-4H色酮-3-甲酸酯(HA14-1);奧利默森(Oblimersen) (G3139,Genasense®);Bak BH3肽;(-)-棉子酚乙酸(AT-101);4-[4-[(4'-氯[1,1'-聯苯]-2-基)甲基]-1-哌嗪基]-N-[[4-[[(1R)-3-(二甲胺基)-1-[(苯硫基)甲基]丙基]胺基]-3-硝基苯基]磺醯基]-苯甲醯胺(ABT-737,CAS 852808-04-9);及納維克拉斯(Navitoclax) (ABT-263,CAS 923564-51-6)。 促細胞凋亡受體促效劑(PARA)包括DR4 (TRAILR1)及DR5 (TRAILR2),包括(但不限於)杜拉樂明(Dulanermin) (AMG-951,RhApo2L/TRAIL);瑪帕單抗(Mapatumumab) (HRS-ETR1,CAS 658052-09-6);來沙木單抗(Lexatumumab) (HGS-ETR2,CAS 845816-02-6);阿撲單抗(Apomab) (Apomab®);康納木單抗(Conatumumab) (AMG655,CAS 896731-82-1);及替加珠單抗(Tigatuzumab) (CS1008,CAS 946415-34-5,獲自Daiichi Sankyo)。 檢查點激酶(CHK)抑制劑包括(但不限於)7-羥基星孢菌素(7-Hydroxystaurosporine) (UCN-01);6-溴-3-(1-甲基-1H -吡唑-4-基)-5-(3R )-3-哌啶基吡唑并[1,5-a ]嘧啶-7-胺(SCH900776,CAS 891494-63-6);5-(3-氟苯基)-3-脲基噻吩-2-甲酸N-[(S)-哌啶-3-基]醯胺(AZD7762,CAS 860352-01-8);4-[((3S)-1-氮雜雙環[2.2.2]辛-3-基)胺基]-3-(1H-苯并咪唑-2-基)-6-氯喹啉-2(1H)-酮(CHIR124,CAS 405168-58-3);7-胺基放線菌素d (7-AAD);異格魯醯胺(Isogranulatimide);去溴已炔二醇;N-[5-溴-4-甲基-2-[(2S)-2-嗎啉基甲氧基]-苯基]-N'-(5-甲基-2-吡嗪基)脲(LY2603618,CAS 911222-45-2);蘿蔔硫素(Sulforaphane) (CAS 4478-93-7,異硫氰酸4-甲基亞磺醯基丁酯);9,10,11,12-四氫-9,12-環氧基-1H -二吲哚并[1,2,3-fg :3',2',1'-kl ]吡咯并[3,4-i ][1,6]苯并二吖㖕-1,3(2H )-二酮(SB-218078,CAS 135897-06-2);及TAT-S216A(YGRKKRRQRRRLYRSPAMPENL (SEQ ID NO: 33))及CBP501 ((D-Bpa)sws(D-Phe-F5)(D-Cha)rrrqrr)。 在另一實施例中,本發明提供一種藉由以下治療癌症之方法:向有需要之個體投與與一或多種免疫調節劑(例如共刺激分子之活化劑或免疫檢查點分子之抑制劑中之一或多者)組合的本發明之抗體結合物。 在某些實施例中,免疫調節劑為共刺激分子之活化劑。在一個實施例中,共刺激分子之促效劑係選自OX40、CD2、CD27、CDS、ICAM-1、LFA-1 (CD11a/CD18)、ICOS (CD278)、4-1BB (CD137)、GITR、CD30、CD40、BAFFR、HVEM、CD7、LIGHT、NKG2C、SLAMF7、NKp80、CD160、B7-H3或CD83配位體之促效劑(例如促效性抗體或其抗原結合片段,或可溶性融合物)。 GITR 促效劑 在某些實施例中,共刺激分子之促效劑為GITR促效劑。在一些實施例中,GITR促效劑為GWN323 (NVS)、BMS-986156、MK-4166或MK-1248 (Merck)、TRX518 (Leap Therapeutics)、INCAGN1876 (Incyte/Agenus)、AMG 228 (Amgen)或INBRX-110 (Inhibrx)。 例示性 GITR 促效劑 在一個實施例中,GITR促效劑為抗GITR抗體分子。在一個實施例中,GITR促效劑為如2016年4月14日公佈之題為「Compositions and Methods of Use for Augmented Immune Response and Cancer Therapy」之WO 2016/057846中所述之抗GITR抗體分子,該案以全文引用之方式併入本文中。 在一個實施例中,抗GITR抗體分子包含來自包含表14中所示或由表14中所示之核苷酸序列編碼之胺基酸序列(例如來自表14中所揭示之MAB7之重鏈及輕鏈可變區序列)的重鏈及輕鏈可變區的至少一個、兩個、三個、四個、五個或六個互補決定區(CDR) (或總體而言,所有CDR)。在一些實施例中,CDR係根據Kabat定義(例如如表14中所闡述)。在一些實施例中,CDR係根據Chothia定義(例如如表14中所闡述)。在一個實施例中,CDR中之一或多者(或總體而言,所有CDR)相對於表14中所示或由表14中所示之核苷酸序列編碼之胺基酸序列具有一種、兩種、三種、四種、五種、六種或多於六種變化,例如胺基酸取代(例如保守性胺基酸取代)或缺失。 在一個實施例中,抗GITR抗體分子包含含有SEQ ID NO: 909之VHCDR1胺基酸序列、SEQ ID NO: 911之VHCDR2胺基酸序列及SEQ ID NO: 913之VHCDR3胺基酸序列的重鏈可變區(VH);及含有SEQ ID NO: 914之VLCDR1胺基酸序列、SEQ ID NO: 916之VLCDR2胺基酸序列及SEQ ID NO: 918之VLCDR3胺基酸序列的輕鏈可變區(VL),各自揭示於表14中。 在一個實施例中,抗GITR抗體分子包含含有胺基酸序列SEQ ID NO: 901或與SEQ ID NO: 901具有至少85%、90%、95%或99%或大於99%一致性之胺基酸序列的VH。在一個實施例中,抗GITR抗體分子包含含有胺基酸序列SEQ ID NO: 902或與SEQ ID NO: 902具有至少85%、90%、95%或99%或大於99%一致性之胺基酸序列的VL。在一個實施例中,抗GITR抗體分子包含含有胺基酸序列SEQ ID NO: 901之VH及含有胺基酸序列SEQ ID NO: 902之VL。 在一個實施例中,抗體分子包含由SEQ ID NO: 905之核苷酸序列或與SEQ ID NO: 905具有至少85%、90%、95%或99%或大於99%一致性之核苷酸序列編碼的VH。在一個實施例中,抗體分子包含由SEQ ID NO: 906之核苷酸序列或與SEQ ID NO: 906具有至少85%、90%、95%或99%或大於99%一致性之核苷酸序列編碼的VL。在一個實施例中,抗體分子包含由SEQ ID NO: 905之核苷酸序列編碼之VH及由SEQ ID NO: 906之核苷酸序列編碼的VL。 在一個實施例中,抗GITR抗體分子包含含有胺基酸序列SEQ ID NO: 903或與SEQ ID NO: 903具有至少85%、90%、95%或99%或大於99%一致性之胺基酸序列的重鏈。在一個實施例中,抗GITR抗體分子包含含有胺基酸序列SEQ ID NO: 904或與SEQ ID NO: 904具有至少85%、90%、95%或99%或大於99%一致性之胺基酸序列的輕鏈。在一個實施例中,抗GITR抗體分子包含含有胺基酸序列SEQ ID NO: 903之重鏈及含有胺基酸序列SEQ ID NO: 904之輕鏈。 在一個實施例中,抗體分子包含由SEQ ID NO: 907之核苷酸序列或與SEQ ID NO: 907具有至少85%、90%、95%或99%或大於99%一致性之核苷酸序列編碼的重鏈。在一個實施例中,抗體分子包含由SEQ ID NO: 908之核苷酸序列或與SEQ ID NO: 908具有至少85%、90%、95%或99%或大於99%一致性之核苷酸序列編碼的輕鏈。在一個實施例中,抗體分子包含由SEQ ID NO: 907之核苷酸序列編碼的重鏈及由SEQ ID NO: 908之核苷酸序列編碼的輕鏈。 本文所述之抗體分子可藉由WO 2016/057846中所述之載體、宿主細胞及方法製得,該案以全文引用之方式併入本文中。 表14:例示性抗GITR抗體分子之胺基酸及核苷酸序列 其他例示性 GITR 促效劑 在一個實施例中,抗GITR抗體分子為BMS-986156 (Bristol-Myers Squibb),其亦稱為BMS 986156或BMS986156。BMS-986156及其他抗GITR抗體揭示於例如US 9,228,016及WO 2016/196792中,其以全文引用之方式併入。在一個實施例中,抗GITR抗體分子包含BMS-986156之CDR序列中之一或多者(或總體而言,所有CDR序列)、重鏈或輕鏈可變區序列或重鏈或輕鏈序列,例如如表15中所揭示。 在一個實施例中,抗GITR抗體分子為MK-4166或MK-1248 (Merck)。MK-4166、MK-1248及其他抗GITR抗體揭示於例如US 8,709,424、WO 2011/028683、WO 2015/026684及Mahne等人Cancer Res. 2017; 77(5):1108-1118中,其以全文引用之方式併入。在一個實施例中,抗GITR抗體分子包含MK-4166或MK-1248之CDR序列中之一或多者(或總體而言,所有CDR序列)、重鏈或輕鏈可變區序列或重鏈或輕鏈序列。 在一個實施例中,抗GITR抗體分子為TRX518(Leap Therapeutics)。TRX518及其他抗GITR抗體揭示於例如US 7,812,135、US 8,388,967、US 9,028,823、WO 2006/105021及Ponte J等人 (2010)Clinical Immunology ; 135:S96中,其以全文引用之方式併入。在一個實施例中,抗GITR抗體分子包含TRX518之CDR序列中之一或多者(或總體而言,所有CDR序列)、重鏈或輕鏈可變區序列或重鏈或輕鏈序列。 在一個實施例中,抗GITR抗體分子為INCAGN1876 (Incyte/Agenus)。INCAGN1876及其他抗GITR抗體揭示於例如US 2015/0368349及WO 2015/184099中,其以全文引用之方式併入。在一個實施例中,抗GITR抗體分子包含INCAGN1876之CDR序列中之一或多者(或總體而言,所有CDR序列)、重鏈或輕鏈可變區序列或重鏈或輕鏈序列。 在一個實施例中,抗GITR抗體分子為AMG 228 (Amgen)。AMG 228及其他抗GITR抗體揭示於例如US 9,464,139及WO 2015/031667中,其以全文引用之方式併入。在一個實施例中,抗GITR抗體分子包含AMG 228之CDR序列中之一或多者(或總體而言,所有CDR序列)、重鏈或輕鏈可變區序列或重鏈或輕鏈序列。 在一個實施例中,抗GITR抗體分子為INBRX-110 (Inhibrx)。INBRX-110及其他抗GITR抗體揭示於例如US 2017/0022284及WO 2017/015623中,其以全文引用之方式併入。在一個實施例中,GITR促效劑包含INBRX-110之CDR序列中之一或多者(或總體而言,所有CDR序列)、重鏈或輕鏈可變區序列或重鏈或輕鏈序列。 在一個實施例中,GITR促效劑(例如融合蛋白)為MEDI 1873(MedImmune),亦稱為MEDI1873。MEDI1873及其他GITR促效劑揭示於例如US 2017/0073386、WO 2017/025610及Ross等人Cancer Res 2016; 76(14增刊): Abstract nr 561中,其以全文引用之方式併入。在一個實施例中,GITR促效劑包含MEDI 1873之糖皮質激素誘導TNF受體配位體(GITRL)之IgG Fc域、官能多聚合域及受體結合域中之一或多者。 其他已知GITR促效劑(例如抗GITR抗體)包括例如WO 2016/054638中所述之促效劑,其以全文引用之方式併入。 在一個實施例中,抗GITR抗體為以本文所述之抗GITR抗體中之一者形式競爭與GITR上之相同抗原決定基結合及/或結合至其的抗體。 在一個實施例中,GITR促效劑為活化GITR信號傳遞路徑之肽。在一個實施例中,GITR促效劑為與恆定區(例如免疫球蛋白序列之Fc區)融合之免疫黏附素結合片段(例如包含GITRL之細胞外或GITR結合部分的免疫黏附素結合片段)。 表15:其他例示性抗GITR抗體分子之胺基酸序列 在某些實施例中,免疫調節劑為免疫檢查點分子之抑制劑。在一個實施例中,免疫調節劑為PD-1、PD-L1、PD-L2、CTLA4、TIM3、LAG3、VISTA、BTLA、TIGIT、LAIR1、CD160、2B4及/或TGFRβ之抑制劑。在一個實施例中,免疫檢查點分子抑制劑抑制PD-1、PD-L1、LAG-3、TIM-3或CTLA4,或其任何組合。術語「抑制」或「抑制劑」包括特定參數,例如既定分子,例如免疫檢查點抑制劑之活性有所降低。舉例而言,此術語包括抑制至少5%、10%、20%、30%、40%、50%或大於50%之活性,例如PD-1或PD-L1活性。因此,抑制無需為100%。 抑制分子之抑制可以DNA、RNA或蛋白質水準進行。在一些實施例中,可使用抑制性核酸(例如dsRNA、siRNA或shRNA)抑制抑制分子之表現。在其他實施例中,抑制信號之抑制劑為結合至抑制分子之多肽,例如可溶性配位體(例如PD-1-Ig或CTLA-4 Ig)或抗體或其抗原結合片段;例如結合至PD-1、PD-L1、PD-L2、CTLA4、TIM3、LAG3、VISTA、BTLA、TIGIT、LAIR1、CD160、2B4及/或TGFRβ,或其組合之抗體或其片段(在本文中亦稱作「抗體分子」)。 在一個實施例中,抗體分子為完整抗體或其片段(例如Fab、F(ab')2、Fv或單鏈Fv片段(scFv))。在又其他實施例中,抗體分子具有重鏈恆定區(Fc),該重鏈恆定區選自例如IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgM、IgA1、IgA2、IgD及IgE之重鏈恆定區;特定言之,選自例如IgG1、IgG2、IgG3及IgG4之重鏈恆定區,更特定言之,IgG1或IgG4 (例如人類IgG1或IgG4)之重鏈恆定區。在一個實施例中,重鏈恆定區為人類IgG1或人類IgG4。在一個實施例中,恆定區經改變,例如經突變以調節抗體分子之特性(例如增加或減少Fc受體結合、抗體糖基化、半胱胺酸殘基數、效應細胞功能或補體功能中之一或多者)。 在某些實施例中,抗體分子呈雙特異性或多特異性抗體分子形式。在一個實施例中,雙特異性抗體分子具有對PD-1或PD-L1之第一結合特異性及第二結合特異性,例如對TIM-3、LAG-3或PD-L2之第二結合特異性。在一個實施例中,雙特異性抗體分子結合至PD-1或PD-L1及TIM-3。在另一實施例中,雙特異性抗體分子結合至PD-1或PD-L1及LAG-3。在另一實施例中,雙特異性抗體分子結合至PD-1及PD-L1。在又另一實施例中,雙特異性抗體分子結合至PD-1及PD-L2。在另一實施例中,雙特異性抗體分子結合至TIM-3及LAG-3。可在多特異性抗體分子,例如,包括對PD-1或PD-1之第一結合特異性及對TIM-3、LAG-3或PD-L2中之兩者或多於兩者之第二及第三結合特異性之三特異性抗體中製造前述分子之任何組合。 在某些實施例中,免疫調節劑為PD-1 (例如人類PD-1)之抑制劑。在另一實施例中,免疫調節劑為PD-L1,例如人類PD-L1之抑制劑。在一個實施例中,PD-1或PD-L1之抑制劑為針對PD-1或PD-L1之抗體分子。PD-1或PD-L1抑制劑可單獨或與其他免疫調節劑組合,例如與LAG-3、TIM-3或CTLA4之抑制劑組合投與。在一例示性實施例中,PD-1或PD-L1之抑制劑,例如抗PD-1或PD-L1抗體分子與LAG-3抑制劑,例如抗LAG-3抗體分子組合投與。在另一實施例中,PD-1或PD-L1之抑制劑,例如抗PD-1或PD-L1抗體分子與TIM-3抑制劑,例如抗TIM-3抗體分子組合投與。在其他實施例中,PD-1或PD-L1之抑制劑,例如抗PD-1抗體分子與LAG-3抑制劑,例如抗LAG-3抗體分子及TIM-3抑制劑,例如抗TIM-3抗體分子組合投與。 免疫調節劑與PD-1抑制劑(例如PD-L2、CTLA4、TIM3、LAG3、VISTA、BTLA、TIGIT、LAIR1、CD160、2B4及/或TGFR中之一或多者)之其他組合亦屬於本發明。此項技術中已知或本文中所揭示之任何抗體分子皆可用於檢查點分子之抑制劑之前述組合中。 PD-1 抑制劑 在一些實施例中,本發明之抗體結合物與PD-1抑制劑組合投與。在一些實施例中,PD-1抑制劑係選自PDR001 (Novartis)、納武單抗(Nivolumab) (Bristol-Myers Squibb)、派立珠單抗(Pembrolizumab) (Merck & Co)、皮立珠單抗(Pidilizumab) (CureTech)、MEDI0680 (Medimmune)、REGN2810 (Regeneron)、TSR-042 (Tesaro)、PF-06801591 (Pfizer)、BGB-A317 (Beigene)、BGB-108 (Beigene)、INCSHR1210 (Incyte)或AMP-224 (Amplimmune)。 例示性 PD-1 抑制劑 在一個實施例中,PD-1抑制劑為抗PD-1抗體分子。在一個實施例中,PD-1抑制劑為如2015年7月30日公佈之題為「Antibody Molecules to PD-1 and Uses Thereof」之US 2015/0210769中所述之抗PD-1抗體分子,該案以全文引用之方式併入本文中。 在一個實施例中,抗PD-1抗體分子包含來自包含表6中所示或由表6中所示之核苷酸序列編碼的胺基酸序列(例如來自表6中所揭示之BAP049-純系-E或BAP049-純系-B的重鏈及輕鏈可變區序列)的重鏈及輕鏈可變區的至少一個、兩個、三個、四個、五個或六個互補決定區(CDR) (或總體而言,所有CDR)。在一些實施例中,CDR係根據Kabat定義(例如如表6中所闡述)。在一些實施例中,CDR係根據Chothia定義(例如如表6中所闡述)。在一些實施例中,CDR係根據Kabat及Chothia兩者之組合CDR定義(例如如表6中所闡述)。在一個實施例中,VH CDR1之Kabat及Chothia CDR之組合包含胺基酸序列GYTFTTYWMH (SEQ ID NO: 541)。在一個實施例中,CDR中之一或多者(或總體而言,所有CDR)相對於表6中所示或由表6中所示之核苷酸序列編碼之胺基酸序列具有一種、兩種、三種、四種、五種、六種或多於六種變化,例如胺基酸取代(例如保守性胺基酸取代)或缺失。 在一個實施例中,抗PD-1抗體分子包含含有SEQ ID NO: 501之VHCDR1胺基酸序列、SEQ ID NO: 502之VHCDR2胺基酸序列及SEQ ID NO: 503之VHCDR3胺基酸序列的重鏈可變區(VH);及含有SEQ ID NO: 510之VLCDR1胺基酸序列、SEQ ID NO: 511之VLCDR2胺基酸序列及SEQ ID NO: 512之VLCDR3胺基酸序列的輕鏈可變區(VL),各自揭示於表6中。 在一個實施例中,抗體分子包含含有由SEQ ID NO: 524之核苷酸序列編碼的VHCDR1、由SEQ ID NO: 525之核苷酸序列編碼的VHCDR2及由SEQ ID NO: 526之核苷酸序列編碼的VHCDR3的VH;及含有由SEQ ID NO: 529之核苷酸序列編碼的VLCDR1、由SEQ ID NO: 530之核苷酸序列編碼的VLCDR2及由SEQ ID NO: 531之核苷酸序列編碼的VLCDR3的VL,各自揭示於表6中。 在一個實施例中,抗PD-1抗體分子包含含有胺基酸序列SEQ ID NO: 506或與SEQ ID NO: 506具有至少85%、90%、95%或99%或大於99%一致性之胺基酸序列的VH。在一個實施例中,抗PD-1抗體分子包含含有胺基酸序列SEQ ID NO: 520或與SEQ ID NO: 520具有至少85%、90%、95%或99%或大於99%一致性之胺基酸序列的VL。在一個實施例中,抗PD-1抗體分子包含含有胺基酸序列SEQ ID NO: 516或與SEQ ID NO: 516具有至少85%、90%、95%或99%或大於99%一致性之胺基酸序列的VL。在一個實施例中,抗PD-1抗體分子包含含有胺基酸序列SEQ ID NO: 506之VH及含有胺基酸序列SEQ ID NO: 520之VL。在一個實施例中,抗PD-1抗體分子包含含有胺基酸序列SEQ ID NO: 506之VH及含有胺基酸序列SEQ ID NO: 516之VL。 在一個實施例中,抗體分子包含由SEQ ID NO: 507之核苷酸序列或與SEQ ID NO: 507具有至少85%、90%、95%或99%或大於99%一致性之核苷酸序列編碼的VH。在一個實施例中,抗體分子包含由SEQ ID NO: 521或SEQ ID NO: 517之核苷酸序列或與SEQ ID NO: 521或SEQ ID NO: 517具有至少85%、90%、95%或99%或大於99%一致性之核苷酸序列編碼的VL。在一個實施例中,抗體分子包含由SEQ ID NO: 507之核苷酸序列編碼的VH及由SEQ ID NO: 521或SEQ ID NO: 517之核苷酸序列編碼的VL。 在一個實施例中,抗PD-1抗體分子包含含有胺基酸序列SEQ ID NO: 508或與SEQ ID NO: 508具有至少85%、90%、95%或99%或大於99%一致性之胺基酸序列的重鏈。在一個實施例中,抗PD-1抗體分子包含含有胺基酸序列SEQ ID NO: 522或與SEQ ID NO: 522具有至少85%、90%、95%或99%或大於99%一致性之胺基酸序列的輕鏈。在一個實施例中,抗PD-1抗體分子包含含有胺基酸序列SEQ ID NO: 518或與SEQ ID NO: 518具有至少85%、90%、95%或99%或大於99%一致性之胺基酸序列的輕鏈。在一個實施例中,抗PD-1抗體分子包含含有胺基酸序列SEQ ID NO: 508之重鏈及含有胺基酸序列SEQ ID NO: 522之輕鏈。在一個實施例中,抗PD-1抗體分子包含含有胺基酸序列SEQ ID NO: 508之重鏈及含有胺基酸序列SEQ ID NO: 518之輕鏈。 在一個實施例中,抗體分子包含由SEQ ID NO: 509之核苷酸序列或與SEQ ID NO: 509具有至少85%、90%、95%或99%一致性之核苷酸序列編碼的重鏈。在一個實施例中,抗體分子包含由SEQ ID NO: 523或SEQ ID NO: 519之核苷酸序列或與SEQ ID NO: 523或SEQ ID NO: 519具有至少85%、90%、95%或99%或大於99%一致性之核苷酸序列編碼的輕鏈。在一個實施例中,抗體分子包含由SEQ ID NO: 509之核苷酸序列編碼的重鏈及由SEQ ID NO: 523或SEQ ID NO: 519之核苷酸序列編碼的輕鏈。 本文所述之抗體分子可藉由US 2015/0210769中所述之載體、宿主細胞及方法製得,該案以全文引用之方式併入本文中。 表6.例示性抗PD-1抗體分子之胺基酸及核苷酸序列 其他例示性 PD - 1 抑制劑 選自在一些實施例中,抗PD-1抗體為納武單抗(CAS登記號:946414-94-4)。納武單抗之替代名稱包括MDX-1106、MDX-1106-04、ONO-4538、BMS-936558或OPDIVO®。納武單抗為完全人類IgG4單株抗體,其特異性阻斷PD1。納武單抗(純系5C4)及特異性結合至PD1之其他人類單株抗體揭示於美國專利第8,008,449號及PCT公開案第WO2006/121168號中,其以全文引用之方式併入。在一個實施例中,抗PD-1抗體分子包含納武單抗之CDR序列中之一或多者(或總體而言,所有CDR序列)、重鏈或輕鏈可變區序列或重鏈或輕鏈序列,例如如表7中所揭示。 在其他實施例中,抗PD-1抗體為派立珠單抗。派立珠單抗(商標名KEYTRUDA,先前為蘭利珠單抗(Lambrolizumab),亦稱為Merck 3745、MK-3475或SCH-900475)為結合至PD1之人類化IgG4單株抗體。派立珠單抗揭示於例如Hamid, O.等人 (2013)New England Journal of Medicine 369 (2): 134-44、PCT公開案第WO2009/114335號及美國專利第8,354,509號中,其以全文引用之方式併入。在一個實施例中,抗PD-1抗體分子包含派立珠單抗之CDR序列中之一或多者(或總體而言,所有CDR序列)、重鏈或輕鏈可變區序列或重鏈或輕鏈序列,例如如表7中所揭示。 在一些實施例中,抗PD-1抗體為皮立珠單抗。皮立珠單抗(CT-011;Cure Tech)為結合至PD1之人類化IgG1k單株抗體。皮立珠單抗及其他人類化抗PD-1單株抗體揭示於PCT公開案第WO2009/101611號中,其以全文引用之方式併入。在一個實施例中,抗PD-1抗體分子包含皮立珠單抗之CDR序列中之一或多者(或總體而言,所有CDR序列)、重鏈或輕鏈可變區序列或重鏈或輕鏈序列,例如如表7中所揭示。 其他抗PD1抗體揭示於美國專利第8,609,089號、美國公開案第2010028330號及/或美國公開案第20120114649號中,其以全文引用之方式併入。其他抗PD1抗體包括AMP 514 (Amplimmune)。 在一個實施例中,抗PD-1抗體分子為MEDI0680 (Medimmune),亦稱為AMP-514。MEDI0680及其他抗PD-1抗體揭示於US 9,205,148及WO 2012/145493中,其以全文引用之方式併入。在一個實施例中,抗PD-1抗體分子包含MEDI0680之CDR序列中之一或多者(或總體而言,所有CDR序列)、重鏈或輕鏈可變區序列或重鏈或輕鏈序列。 在一個實施例中,抗PD-1抗體分子為REGN2810 (Regeneron)。在一個實施例中,抗PD-1抗體分子包含REGN2810之CDR序列中之一或多者(或總體而言,所有CDR序列)、重鏈或輕鏈可變區序列或重鏈或輕鏈序列。 在一個實施例中,抗PD-1抗體分子為PF-06801591 (Pfizer)。在一個實施例中,抗PD-1抗體分子包含PF-06801591之CDR序列中之一或多者(或總體而言,所有CDR序列)、重鏈或輕鏈可變區序列或重鏈或輕鏈序列。 在一個實施例中,抗PD-1抗體分子為BGB-A317或BGB-108 (Beigene)。在一個實施例中,抗PD-1抗體分子包含BGB-A317或BGB-108之CDR序列中之一或多者(或總體而言,所有CDR序列)、重鏈或輕鏈可變區序列或重鏈或輕鏈序列。 在一個實施例中,抗PD-1抗體分子為INCSHR1210 (Incyte),亦稱為INCSHR01210或SHR-1210。在一個實施例中,抗PD-1抗體分子包含INCSHR1210之CDR序列中之一或多者(或總體而言,所有CDR序列)、重鏈或輕鏈可變區序列或重鏈或輕鏈序列。 在一個實施例中,抗PD-1抗體分子為TSR-042 (Tesaro),亦稱為ANB011。在一個實施例中,抗PD-1抗體分子包含TSR-042之CDR序列中之一或多者(或總體而言,所有CDR序列)、重鏈或輕鏈可變區序列或重鏈或輕鏈序列。 其他已知的抗PD-1抗體包括例如WO 2015/112800、WO 2016/092419、WO 2015/085847、WO 2014/179664、WO 2014/194302、WO 2014/209804、WO 2015/200119、US 8,735,553、US 7,488,802、US 8,927,697、US 8,993,731及US 9,102,727中所述之抗體,其以全文引用之方式併入。 在一個實施例中,抗PD-1抗體為以本文所述之抗PD-1抗體中之一者形式競爭與PD-1上之相同抗原決定基結合及/或結合至其的抗體。 在一個實施例中,PD-1抑制劑為抑制PD-1信號傳遞路徑之肽,例如如US 8,907,053中所述,該案以全文引用之方式併入本文中。在一些實施例中,PD-1抑制劑為與恆定區(例如免疫球蛋白序列之Fc區)融合之免疫黏附素(例如包含PD-L1或PD-L2的細胞外或PD-1結合部分的免疫黏附素。在一些實施例中,PD-1抑制劑為AMP-224 (B7-DCIg (Amplimmune),例如揭示於WO 2010/027827及WO 2011/066342中,其以全文引用之方式併入)。 表7. 其他例示性抗PD-1抗體分子之胺基酸序列 PD-L1 抑制劑 在某些實施例中,免疫檢查點分子之抑制劑為PD-L1之抑制劑。在一些實施例中,本發明之抗體結合物與PD-L1抑制劑組合投與。在一些實施例中,PD-L1抑制劑係選自FAZ053 (Novartis)、阿特珠單抗(Atezolizumab) (Genentech/Roche)、艾維路單抗(Avelumab) (Merck Serono及Pfizer)、德瓦魯單抗(Durvalumab) (MedImmune/AstraZeneca)或BMS-936559 (Bristol-Myers Squibb)。 例示性 PD-L1 抑制劑 在一個實施例中,PD-L1抑制劑為抗PD-L1抗體分子。在一個實施例中,PD-L1抑制劑為如2016年4月21日公佈之題為「Antibody Molecules to PD-L1 and Uses Thereof」之US 2016/0108123中所揭示之抗PD-L1抗體分子,該案以全文引用之方式併入本文中。 在一個實施例中,抗PD-L1抗體分子包含來自包含表8中所示或由表8中所示之核苷酸序列編碼的胺基酸序列(例如來自表8中所揭示之BAP058-純系O或BAP058-純系N的重鏈及輕鏈可變區序列)的重鏈及輕鏈可變區的至少一個、兩個、三個、四個、五個或六個互補決定區(CDR) (或總體而言,所有CDR)。在一些實施例中,CDR係根據Kabat定義(例如如表8中所闡述)。在一些實施例中,CDR係根據Chothia定義(例如如表8中所闡述)。在一些實施例中,CDR係根據Kabat及Chothia兩者之組合CDR定義(例如如表8中所闡述)。在一個實施例中,VH CDR1之Kabat及Chothia CDR之組合包含胺基酸序列GYTFTSYWMY (SEQ ID NO: 647)。在一個實施例中,CDR中之一或多者(或總體而言,所有CDR)相對於表8中所示或由表8中所示之核苷酸序列編碼之胺基酸序列具有一種、兩種、三種、四種、五種、六種或多於六種變化,例如胺基酸取代(例如保守性胺基酸取代)或缺失。 在一個實施例中,抗PD-L1抗體分子包含含有SEQ ID NO: 601之VHCDR1胺基酸序列、SEQ ID NO: 602之VHCDR2胺基酸序列及SEQ ID NO: 603之VHCDR3胺基酸序列的重鏈可變區(VH);及含有SEQ ID NO: 609之VLCDR1胺基酸序列、SEQ ID NO: 610之VLCDR2胺基酸序列及SEQ ID NO: 611之VLCDR3胺基酸序列的輕鏈可變區(VL),各自揭示於表8中。 在一個實施例中,抗PD-L1抗體分子包含含有由SEQ ID NO: 628之核苷酸序列編碼的VHCDR1、由SEQ ID NO: 629之核苷酸序列編碼的VHCDR2及由SEQ ID NO: 630之核苷酸序列編碼的VHCDR3的VH;及含有由SEQ ID NO: 633之核苷酸序列編碼的VLCDR1、由SEQ ID NO: 634之核苷酸序列編碼的VLCDR2及由SEQ ID NO: 635之核苷酸序列編碼的VLCDR3的VL,各自揭示於表8中。 在一個實施例中,抗PD-L1抗體分子包含含有胺基酸序列SEQ ID NO: 606或與SEQ ID NO: 606具有至少85%、90%、95%或99%或大於99%一致性之胺基酸序列的VH。在一個實施例中,抗PD-L1抗體分子包含含有胺基酸序列SEQ ID NO: 616或與SEQ ID NO: 616具有至少85%、90%、95%或99%或大於99%一致性之胺基酸序列的VL。在一個實施例中,抗PD-L1抗體分子包含含有胺基酸序列SEQ ID NO: 620或與SEQ ID NO: 620具有至少85%、90%、95%或99%或大於99%一致性之胺基酸序列的VH。在一個實施例中,抗PD-L1抗體分子包含含有胺基酸序列SEQ ID NO: 624或與SEQ ID NO: 624具有至少85%、90%、95%或99%或大於99%一致性之胺基酸序列的VL。在一個實施例中,抗PD-L1抗體分子包含含有胺基酸序列SEQ ID NO: 606之VH及含有胺基酸序列SEQ ID NO: 616之VL。在一個實施例中,抗PD-L1抗體分子包含含有胺基酸序列SEQ ID NO: 620之VH及含有胺基酸序列SEQ ID NO: 624之VL。 在一個實施例中,抗體分子包含由SEQ ID NO: 607之核苷酸序列或與SEQ ID NO: 607具有至少85%、90%、95%或99%或大於99%一致性之核苷酸序列編碼的VH。在一個實施例中,抗體分子包含由SEQ ID NO: 617之核苷酸序列或與SEQ ID NO: 617具有至少85%、90%、95%或99%或大於99%一致性之核苷酸序列編碼的VL。在一個實施例中,抗體分子包含由SEQ ID NO: 621之核苷酸序列或與SEQ ID NO: 621具有至少85%、90%、95%或99%或大於99%一致性之核苷酸序列編碼的VH。在一個實施例中,抗體分子包含由SEQ ID NO: 625之核苷酸序列或與SEQ ID NO: 625具有至少85%、90%、95%或99%或大於99%一致性之核苷酸序列編碼的VL。在一個實施例中,抗體分子包含由SEQ ID NO: 607之核苷酸序列編碼之VH及由SEQ ID NO: 617之核苷酸序列編碼的VL。在一個實施例中,抗體分子包含由SEQ ID NO: 621之核苷酸序列編碼之VH及由SEQ ID NO: 625之核苷酸序列編碼的VL。 在一個實施例中,抗PD-L1抗體分子包含含有胺基酸序列SEQ ID NO: 608或與SEQ ID NO: 608具有至少85%、90%、95%或99%或大於99%一致性之胺基酸序列的重鏈。在一個實施例中,抗PD-L1抗體分子包含含有胺基酸序列SEQ ID NO: 618或與SEQ ID NO: 618具有至少85%、90%、95%或99%或大於99%一致性之胺基酸序列的輕鏈。在一個實施例中,抗PD-L1抗體分子包含含有胺基酸序列SEQ ID NO: 622或與SEQ ID NO: 622具有至少85%、90%、95%或99%或大於99%一致性之胺基酸序列的重鏈。在一個實施例中,抗PD-L1抗體分子包含含有胺基酸序列SEQ ID NO: 626或與SEQ ID NO: 626具有至少85%、90%、95%或99%或大於99%一致性之胺基酸序列的輕鏈。在一個實施例中,抗PD-L1抗體分子包含含有胺基酸序列SEQ ID NO: 608之重鏈及含有胺基酸序列SEQ ID NO: 618之輕鏈。在一個實施例中,抗PD-L1抗體分子包含含有胺基酸序列SEQ ID NO: 622之重鏈及含有胺基酸序列SEQ ID NO: 626之輕鏈。 在一個實施例中,抗體分子包含由SEQ ID NO: 615之核苷酸序列或與SEQ ID NO: 615具有至少85%、90%、95%或99%一致性之核苷酸序列編碼的重鏈。在一個實施例中,抗體分子包含由SEQ ID NO: 619之核苷酸序列或與SEQ ID NO: 619具有至少85%、90%、95%或99%或大於99%一致性之核苷酸序列編碼的輕鏈。在一個實施例中,抗體分子包含由SEQ ID NO: 623之核苷酸序列或與SEQ ID NO: 623具有至少85%、90%、95%或99%一致性之核苷酸序列編碼的重鏈。在一個實施例中,抗體分子包含由SEQ ID NO: 627之核苷酸序列或與SEQ ID NO: 627具有至少85%、90%、95%或99%或大於99%一致性之核苷酸序列編碼的輕鏈。在一個實施例中,抗體分子包含由SEQ ID NO: 615之核苷酸序列編碼的重鏈及由SEQ ID NO: 619之核苷酸序列編碼的輕鏈。在一個實施例中,抗體分子包含由SEQ ID NO: 623之核苷酸序列編碼的重鏈及由SEQ ID NO: 627之核苷酸序列編碼的輕鏈。 本文所述之抗體分子可藉由US 2016/0108123中所述之載體、宿主細胞及方法製得,該案以全文引用之方式併入本文中。 表8.例示性抗PD-L1抗體分子之胺基酸及核苷酸序列 其他例示性 PD - L1 抑制劑 在一些實施例中,PD-L1抑制劑為抗PD-L1抗體。在一些實施例中,抗PD-L1抑制劑係選自YW243.55.S70、MPDL3280A、MEDI-4736或MDX-1105MSB-0010718C (亦稱作A09-246 -2),其揭示於例如WO 2013/0179174中且具有本文中所揭示之序列(或與其實質上相同或類似之序列,例如與所指定序列具有至少85%、90%、95%或高於95%一致性之序列)。 在一個實施例中,PD-L1抑制劑為MDX-1105。MDX-1105,亦稱為BMS-936559,為PCT公開案第WO 2007/005874號中所述之抗PD-L1抗體。 在一個實施例中,PD-L1抑制劑為YW243.55.S70。YW243.55.S70抗體為PCT公開案第WO 2010/077634號中所述之抗PD-L1。 在一個實施例中,PD-L1抑制劑為MDPL3280A (Genentech/Roche),亦稱為阿特珠單抗、RG7446、RO5541267、YW243.55.S70或TECENTRIQ™。MDPL3280A為人類Fc最佳化IgG1單株抗體,其結合至PD-L1。MDPL3280A及針對PD-L1之其他人類單株抗體揭示於美國專利第7,943,743號及美國公開案第20120039906號中,其以全文引用之方式併入本文中。在一個實施例中,抗PD-L1抗體分子包含阿特珠單抗之CDR序列中之一或多者(或總體而言,所有CDR序列)、重鏈或輕鏈可變區序列或重鏈或輕鏈序列,例如如表9中所揭示。 在其他實施例中,PD-L2抑制劑為AMP-224。AMP-224為阻斷PD1與B7-H1之間的相互作用之PD-L2 Fc融合可溶性受體(B7-DCIg;Amplimmune;例如揭示於PCT公開案第WO2010/027827號及第WO2011/066342號中)。 在一個實施例中,PD-L1抑制劑為抗PD-L1抗體分子。在一個實施例中,抗PD-L1抗體分子為艾維路單抗(Merck Serono及Pfizer),亦稱為MSB0010718C。艾維路單抗及其他抗PD-L1抗體揭示於WO 2013/079174中,該案以全文引用之方式併入本文中。在一個實施例中,抗PD-L1抗體分子包含艾維路單抗之CDR序列中之一或多者(或總體而言,所有CDR序列)、重鏈或輕鏈可變區序列或重鏈或輕鏈序列,例如如表9中所揭示。 在一個實施例中,抗PD-L1抗體分子為德瓦魯單抗(MedImmune/AstraZeneca),亦稱為MEDI4736。德瓦魯單抗及其他抗PD-L1抗體揭示於US 8,779,108中,該案以全文引用之方式併入本文中。在一個實施例中,抗PD-L1抗體分子包含德瓦魯單抗之CDR序列中之一或多者(或總體而言,所有CDR序列)、重鏈或輕鏈可變區序列或重鏈或輕鏈序列,例如如表9中所揭示。 在一個實施例中,抗PD-L1抗體分子為BMS-936559 (Bristol-Myers Squibb),亦稱為MDX-1105或12A4。BMS-936559及其他抗PD-L1抗體揭示於US 7,943,743及WO 2015/081158中,其以全文引用之方式併入。在一個實施例中,抗PD-L1抗體分子包含BMS-936559之CDR序列中之一或多者(或總體而言,所有CDR序列)、重鏈或輕鏈可變區序列或重鏈或輕鏈序列,例如如表9中所揭示。 其他已知的抗PD-L1抗體包括例如WO 2015/181342、WO 2014/100079、WO 2016/000619、WO 2014/022758、WO 2014/055897、WO 2015/061668、WO 2013/079174、WO 2012/145493、WO 2015/112805、WO 2015/109124、WO 2015/195163、US 8,168,179、US 8,552,154、US 8,460,927及US 9,175,082中所述之抗體,其以全文引用之方式併入本文中。 在一個實施例中,抗PD-L1抗體為以本文所述之抗PD-L1抗體中之一者形式競爭與PD-L1上之相同抗原決定基結合及/或結合至其的抗體。 表9. 其他例示性抗PD-L1抗體分子之胺基酸序列 LAG-3 抑制劑 在某些實施例中,免疫檢查點分子之抑制劑為LAG-3之抑制劑。在一些實施例中,本發明之抗體結合物與LAG-3抑制劑組合投與。在一些實施例中,LAG-3抑制劑係選自LAG525 (Novartis)、BMS-986016 (Bristol-Myers Squibb)或TSR-033 (Tesaro)。例示性 LAG-3 抑制劑 在一個實施例中,LAG-3抑制劑為抗LAG-3抗體分子。在一個實施例中,LAG-3抑制劑為如2015年9月17日公佈之題為「Antibody Molecules to LAG-3 and Uses Thereof」之US 2015/ 0259420中所揭示之抗LAG-3抗體分子,該案以全文引用之方式併入本文中。 在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子包含來自包含表10中所示或由表10中所示之核苷酸序列編碼的胺基酸序列(例如來自表10中所揭示之BAP050-純系I或BAP050-純系J的重鏈及輕鏈可變區序列)的重鏈及輕鏈可變區的至少一個、兩個、三個、四個、五個或六個互補決定區(CDR) (或總體而言,所有CDR)。在一些實施例中,CDR係根據Kabat定義(例如如表10中所闡述)。在一些實施例中,CDR係根據Chothia定義(例如如表10中所闡述)。在一些實施例中,CDR係根據Kabat及Chothia兩者之組合CDR定義(例如如表10中所闡述)。在一個實施例中,VH CDR1之Kabat及Chothia CDR之組合包含胺基酸序列GFTLTNYGMN (SEQ ID NO: 766)。在一個實施例中,CDR中之一或多者(或總體而言,所有CDR)相對於表10中所示或由表10中所示之核苷酸序列編碼之胺基酸序列具有一種、兩種、三種、四種、五種、六種或多於六種變化,例如胺基酸取代(例如保守性胺基酸取代)或缺失。 在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子包含含有SEQ ID NO: 701之VHCDR1胺基酸序列、SEQ ID NO: 702之VHCDR2胺基酸序列及SEQ ID NO: 703之VHCDR3胺基酸序列的重鏈可變區(VH);及含有SEQ ID NO: 710之VLCDR1胺基酸序列、SEQ ID NO: 711之VLCDR2胺基酸序列及SEQ ID NO: 712之VLCDR3胺基酸序列的輕鏈可變區(VL),各自揭示於表10中。 在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子包含含有由SEQ ID NO: 736或SEQ ID NO: 737之核苷酸序列編碼的VHCDR1、由SEQ ID NO: 738或SEQ ID NO: 739之核苷酸序列編碼的VHCDR2及由SEQ ID NO: 740或SEQ ID NO: 741之核苷酸序列編碼的VHCDR3的VH;及含有由SEQ ID NO: 746或SEQ ID NO: 747之核苷酸序列編碼的VLCDR1、由SEQ ID NO: 748或SEQ ID NO: 749之核苷酸序列編碼的VLCDR2及由SEQ ID NO: 750或SEQ ID NO: 751之核苷酸序列編碼的VLCDR3的VL,各自揭示於表10中。在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子包含含有由SEQ ID NO: 758或SEQ ID NO: 737之核苷酸序列編碼的VHCDR1、由SEQ ID NO: 759或SEQ ID NO: 739之核苷酸序列編碼的VHCDR2及由SEQ ID NO: 760或SEQ ID NO: 741之核苷酸序列編碼的VHCDR3的VH;及含有由SEQ ID NO: 746或SEQ ID NO: 747之核苷酸序列編碼的VLCDR1、由SEQ ID NO: 748或SEQ ID NO: 749之核苷酸序列編碼的VLCDR2及由SEQ ID NO: 750或SEQ ID NO: 751之核苷酸序列編碼的VLCDR3的VL,各自揭示於表10中。 在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子包含含有胺基酸序列SEQ ID NO: 706或與SEQ ID NO: 706具有至少85%、90%、95%或99%或大於99%一致性之胺基酸序列的VH。在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子包含含有胺基酸序列SEQ ID NO: 718或與SEQ ID NO: 718具有至少85%、90%、95%或99%或大於99%一致性之胺基酸序列的VL。在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子包含含有胺基酸序列SEQ ID NO: 724或與SEQ ID NO: 724具有至少85%、90%、95%或99%或大於99%一致性之胺基酸序列的VH。在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子包含含有胺基酸序列SEQ ID NO: 730或與SEQ ID NO: 730具有至少85%、90%、95%或99%或大於99%一致性之胺基酸序列的VL。在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子包含含有胺基酸序列SEQ ID NO: 706之VH及含有胺基酸序列SEQ ID NO: 718之VL。在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子包含含有胺基酸序列SEQ ID NO: 724之VH及含有胺基酸序列SEQ ID NO: 730之VL。 在一個實施例中,抗體分子包含由SEQ ID NO: 707或SEQ ID NO: 708之核苷酸序列或與SEQ ID NO: 707或SEQ ID NO: 708具有至少85%、90%、95%或99%或大於99%一致性之核苷酸序列編碼的VH。在一個實施例中,抗體分子包含由SEQ ID NO: 719或SEQ ID NO: 720之核苷酸序列或與SEQ ID NO: 719或SEQ ID NO: 720具有至少85%、90%、95%或99%或大於99%一致性之核苷酸序列編碼的VL。在一個實施例中,抗體分子包含由SEQ ID NO: 725或SEQ ID NO: 726之核苷酸序列或與SEQ ID NO: 725或SEQ ID NO: 726具有至少85%、90%、95%或99%或大於99%一致性之核苷酸序列編碼的VH。在一個實施例中,抗體分子包含由SEQ ID NO: 731或SEQ ID NO: 732之核苷酸序列或與SEQ ID NO: 731或SEQ ID NO: 732具有至少85%、90%、95%或99%或大於99%一致性之核苷酸序列編碼的VL。在一個實施例中,抗體分子包含由SEQ ID NO: 707或SEQ ID NO: 708之核苷酸序列編碼的VH及由SEQ ID NO: 719或SEQ ID NO: 720之核苷酸序列編碼的VL。在一個實施例中,抗體分子包含由SEQ ID NO: 725或SEQ ID NO: 726之核苷酸序列編碼的VH及由SEQ ID NO: 731或SEQ ID NO: 732之核苷酸序列編碼的VL。 在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子包含含有胺基酸序列SEQ ID NO: 709或與SEQ ID NO: 709具有至少85%、90%、95%或99%或大於99%一致性之胺基酸序列的重鏈。在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子包含含有胺基酸序列SEQ ID NO: 721或與SEQ ID NO: 721具有至少85%、90%、95%或99%或大於99%一致性之胺基酸序列的輕鏈。在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子包含含有胺基酸序列SEQ ID NO: 727或與SEQ ID NO: 727具有至少85%、90%、95%或99%或大於99%一致性之胺基酸序列的重鏈。在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子包含含有胺基酸序列SEQ ID NO: 733或與SEQ ID NO: 733具有至少85%、90%、95%或99%或大於99%一致性之胺基酸序列的輕鏈。在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子包含含有胺基酸序列SEQ ID NO: 709之重鏈及含有胺基酸序列SEQ ID NO: 721之輕鏈。在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子包含含有胺基酸序列SEQ ID NO: 727之重鏈及含有胺基酸序列SEQ ID NO: 733之輕鏈。 在一個實施例中,抗體分子包含由SEQ ID NO: 716或SEQ ID NO: 717之核苷酸序列或與SEQ ID NO: 716或SEQ ID NO: 717具有至少85%、90%、95%或99%一致性之核苷酸序列編碼的重鏈。在一個實施例中,抗體分子包含由SEQ ID NO: 722或SEQ ID NO: 723之核苷酸序列或與SEQ ID NO: 722或SEQ ID NO: 723具有至少85%、90%、95%或99%或大於99%一致性之核苷酸序列編碼的輕鏈。在一個實施例中,抗體分子包含由SEQ ID NO: 728或SEQ ID NO: 729之核苷酸序列或與SEQ ID NO: 728或SEQ ID NO: 729具有至少85%、90%、95%或99%一致性之核苷酸序列編碼的重鏈。在一個實施例中,抗體分子包含由SEQ ID NO: 734或SEQ ID NO: 735之核苷酸序列或與SEQ ID NO: 734或SEQ ID NO: 735具有至少85%、90%、95%或99%或大於99%一致性之核苷酸序列編碼的輕鏈。在一個實施例中,抗體分子包含由SEQ ID NO: 716或SEQ ID NO: 717之核苷酸序列編碼的重鏈及由SEQ ID NO: 722或SEQ ID NO: 723之核苷酸序列編碼的輕鏈。在一個實施例中,抗體分子包含由SEQ ID NO: 728或SEQ ID NO: 729之核苷酸序列編碼的重鏈及由SEQ ID NO: 734或SEQ ID NO: 735之核苷酸序列編碼的輕鏈。 本文所述之抗體分子可藉由US 2015/0259420中所述之載體、宿主細胞及方法製得,該案以全文引用之方式併入本文中。 表10. 例示性抗LAG-3抗體分子之胺基酸及核苷酸序列 其他例示性 LAG - 3 抑制劑 在一個實施例中,LAG-3抑制劑為抗LAG-3抗體分子。在一個實施例中,LAG-3抑制劑為BMS-986016 (Bristol-Myers Squibb),亦稱為BMS986016。BMS-986016及其他抗LAG-3抗體揭示於WO 2015/116539及US 9,505,839中,其以全文引用之方式併入。在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子包含BMS-986016之CDR序列中之一或多者(或總體而言,所有CDR序列)、重鏈或輕鏈可變區序列或重鏈或輕鏈序列,例如如表11中所揭示。 在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子為TSR-033 (Tesaro)。在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子包含TSR-033之CDR序列中之一或多者(或總體而言,所有CDR序列)、重鏈或輕鏈可變區序列或重鏈或輕鏈序列。 在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子為IMP731或GSK2831781 (GSK及Prima BioMed)。IMP731及其他抗LAG-3抗體揭示於WO 2008/132601及US 9,244,059中,其以全文引用之方式併入。在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子包含IMP731之CDR序列中之一或多者(或總體而言,所有CDR序列)、重鏈或輕鏈可變區序列或重鏈或輕鏈序列,例如如表11中所揭示。在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子包含GSK2831781之CDR序列中之一或多者(或總體而言,所有CDR序列)、重鏈或輕鏈可變區序列或重鏈或輕鏈序列。 在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子為IMP761 (Prima BioMed)。在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子包含IMP761之CDR序列中之一或多者(或總體而言,所有CDR序列)、重鏈或輕鏈可變區序列或重鏈或輕鏈序列。 其他已知的抗LAG-3抗體包括例如WO 2008/132601、WO 2010/019570、WO 2014/140180、WO 2015/116539、WO 2015/200119、WO 2016/028672、US 9,244,059、US 9,505,839中所述之抗體,其以全文引用之方式併入。 在一個實施例中,抗LAG-3抗體為以本文所述之抗LAG-3抗體中之一者形式競爭與LAG-3上之相同抗原決定基結合及/或結合至其的抗體。 在一個實施例中,抗LAG-3抑制劑為可溶性LAG-3蛋白質,例如IMP321 (Prima BioMed),例如如WO 2009/044273中所揭示,該案以全文引用之方式併入本文中。 表11. 其他例示性抗LAG-3抗體分子之胺基酸序列 TIM-3 抑制劑 在某些實施例中,免疫檢查點分子之抑制劑為TIM-3之抑制劑。在一些實施例中,本發明之抗體結合物與TIM-3抑制劑組合投與。在一些實施例中,TIM-3抑制劑為MGB453 (Novartis)或TSR-022 (Tesaro)。例示性 TIM-3 抑制劑 在一個實施例中,TIM-3抑制劑為抗TIM-3抗體分子。在一個實施例中,TIM-3抑制劑為如2015年8月6日公佈之題為「Antibody Molecules to TIM-3 and Uses Thereof」之US 2015/0218274中所揭示之抗TIM-3抗體分子,該案以全文引用之方式併入本文中。 在一個實施例中,抗TIM-3抗體分子包含來自包含表12中所示或由表12中所示之核苷酸序列編碼的胺基酸序列(例如來自表12中所揭示之ABTIM3-hum11或ABTIM3-hum03的重鏈及輕鏈可變區序列)的重鏈及輕鏈可變區的至少一個、兩個、三個、四個、五個或六個互補決定區(CDR) (或總體而言,所有CDR)。在一些實施例中,CDR係根據Kabat定義(例如如表12中所闡述)。在一些實施例中,CDR係根據Chothia定義(例如如表12中所闡述)。在一個實施例中,CDR中之一或多者(或總體而言,所有CDR)相對於表12中所示或由表12中所示之核苷酸序列編碼之胺基酸序列具有一種、兩種、三種、四種、五種、六種或多於六種變化,例如胺基酸取代(例如保守性胺基酸取代)或缺失。 在一個實施例中,抗TIM-3抗體分子包含含有SEQ ID NO: 801之VHCDR1胺基酸序列、SEQ ID NO: 802之VHCDR2胺基酸序列及SEQ ID NO: 803之VHCDR3胺基酸序列的重鏈可變區(VH);及含有SEQ ID NO: 810之VLCDR1胺基酸序列、SEQ ID NO: 811之VLCDR2胺基酸序列及SEQ ID NO: 812之VLCDR3胺基酸序列的輕鏈可變區(VL),各自揭示於表12中。在一個實施例中,抗TIM-3抗體分子包含含有SEQ ID NO: 801之VHCDR1胺基酸序列、SEQ ID NO: 820之VHCDR2胺基酸序列及SEQ ID NO: 803之VHCDR3胺基酸序列的重鏈可變區(VH);及含有SEQ ID NO: 810之VLCDR1胺基酸序列、SEQ ID NO: 811之VLCDR2胺基酸序列及SEQ ID NO: 812之VLCDR3胺基酸序列的輕鏈可變區(VL),各自揭示於表12中。 在一個實施例中,抗TIM-3抗體分子包含含有胺基酸序列SEQ ID NO: 806或與SEQ ID NO: 806具有至少85%、90%、95%或99%或大於99%一致性之胺基酸序列的VH。在一個實施例中,抗TIM-3抗體分子包含含有胺基酸序列SEQ ID NO: 816或與SEQ ID NO: 816具有至少85%、90%、95%或99%或大於99%一致性之胺基酸序列的VL。在一個實施例中,抗TIM-3抗體分子包含含有胺基酸序列SEQ ID NO: 822或與SEQ ID NO: 822具有至少85%、90%、95%或99%或大於99%一致性之胺基酸序列的VH。在一個實施例中,抗TIM-3抗體分子包含含有胺基酸序列SEQ ID NO: 826或與SEQ ID NO: 826具有至少85%、90%、95%或99%或大於99%一致性之胺基酸序列的VL。在一個實施例中,抗TIM-3抗體分子包含含有胺基酸序列SEQ ID NO: 806之VH及含有胺基酸序列SEQ ID NO: 816之VL。在一個實施例中,抗TIM-3抗體分子包含含有胺基酸序列SEQ ID NO: 822之VH及含有胺基酸序列SEQ ID NO: 826之VL。 在一個實施例中,抗體分子包含由SEQ ID NO: 807之核苷酸序列或與SEQ ID NO: 807具有至少85%、90%、95%或99%或大於99%一致性之核苷酸序列編碼的VH。在一個實施例中,抗體分子包含由SEQ ID NO: 817之核苷酸序列或與SEQ ID NO: 817具有至少85%、90%、95%或99%或大於99%一致性之核苷酸序列編碼的VL。在一個實施例中,抗體分子包含由SEQ ID NO: 823之核苷酸序列或與SEQ ID NO: 823具有至少85%、90%、95%或99%或大於99%一致性之核苷酸序列編碼的VH。在一個實施例中,抗體分子包含由SEQ ID NO: 827之核苷酸序列或與SEQ ID NO: 827具有至少85%、90%、95%或99%或大於99%一致性之核苷酸序列編碼的VL。在一個實施例中,抗體分子包含由SEQ ID NO: 807之核苷酸序列編碼之VH及由SEQ ID NO: 817之核苷酸序列編碼的VL。在一個實施例中,抗體分子包含由SEQ ID NO: 823之核苷酸序列編碼之VH及由SEQ ID NO: 827之核苷酸序列編碼的VL。 在一個實施例中,抗TIM-3抗體分子包含含有胺基酸序列SEQ ID NO: 808或與SEQ ID NO: 808具有至少85%、90%、95%或99%或大於99%一致性之胺基酸序列的重鏈。在一個實施例中,抗TIM-3抗體分子包含含有胺基酸序列SEQ ID NO: 818或與SEQ ID NO: 818具有至少85%、90%、95%或99%或大於99%一致性之胺基酸序列的輕鏈。在一個實施例中,抗TIM-3抗體分子包含含有胺基酸序列SEQ ID NO: 824或與SEQ ID NO: 824具有至少85%、90%、95%或99%或大於99%一致性之胺基酸序列的重鏈。在一個實施例中,抗TIM-3抗體分子包含含有胺基酸序列SEQ ID NO: 828或與SEQ ID NO: 828具有至少85%、90%、95%或99%或大於99%一致性之胺基酸序列的輕鏈。在一個實施例中,抗TIM-3抗體分子包含含有胺基酸序列SEQ ID NO: 808之重鏈及含有胺基酸序列SEQ ID NO: 818之輕鏈。在一個實施例中,抗TIM-3抗體分子包含含有胺基酸序列SEQ ID NO: 824之重鏈及含有胺基酸序列SEQ ID NO: 828之輕鏈。 在一個實施例中,抗體分子包含由SEQ ID NO: 809之核苷酸序列或與SEQ ID NO: 809具有至少85%、90%、95%或99%一致性之核苷酸序列編碼的重鏈。在一個實施例中,抗體分子包含由SEQ ID NO: 819之核苷酸序列或與SEQ ID NO: 819具有至少85%、90%、95%或99%或大於99%一致性之核苷酸序列編碼的輕鏈。在一個實施例中,抗體分子包含由SEQ ID NO: 825之核苷酸序列或與SEQ ID NO: 825具有至少85%、90%、95%或99%一致性之核苷酸序列編碼的重鏈。在一個實施例中,抗體分子包含由SEQ ID NO: 829之核苷酸序列或與SEQ ID NO: 829具有至少85%、90%、95%或99%或大於99%一致性之核苷酸序列編碼的輕鏈。在一個實施例中,抗體分子包含由SEQ ID NO: 809之核苷酸序列編碼的重鏈及由SEQ ID NO: 819之核苷酸序列編碼的輕鏈。在一個實施例中,抗體分子包含由SEQ ID NO: 825之核苷酸序列編碼的重鏈及由SEQ ID NO: 829之核苷酸序列編碼的輕鏈。 本文所述之抗體分子可藉由US 2015/0218274中所述之載體、宿主細胞及方法製得,該案以全文引用之方式併入本文中。 表12. 例示性抗TIM-3抗體分子之胺基酸及核苷酸序列 其他例示性 TIM-3 抑制劑 在一個實施例中,抗TIM-3抗體分子為TSR-022 (AnaptysBio/Tesaro)。在一個實施例中,抗TIM-3抗體分子包含TSR-022之CDR序列中之一或多者(或總體而言,所有CDR序列)、重鏈或輕鏈可變區序列或重鏈或輕鏈序列。在一個實施例中,抗TIM-3抗體分子包含APE5137或APE5121之之CDR序列中之一或多者(或總體而言,所有CDR序列)、重鏈或輕鏈可變區序列或重鏈或輕鏈序列,例如如表13中所揭示。APE5137、APE5121及其他抗TIM-3抗體揭示於WO 2016/161270中,該案以全文引用之方式併入本文中。 在一個實施例中,抗TIM-3抗體分子為抗體純系F38-2E2。在一個實施例中,抗TIM-3抗體分子包含F38-2E2之CDR序列中之一或多者(或總體而言,所有CDR序列)、重鏈或輕鏈可變區序列或重鏈或輕鏈序列。 其他已知的抗TIM-3抗體包括例如WO 2016/111947、WO 2016/071448、WO 2016/144803、US 8,552,156、US 8,841,418及US 9,163,087中所述之抗體,其以全文引用之方式併入本文中。 在一個實施例中,抗TIM-3抗體為以本文所述之抗TIM-3抗體中之一者形式競爭與TIM-3上之相同抗原決定基結合及/或結合至其的抗體。 表13. 其他例示性抗TIM-3抗體分子之胺基酸序列 細胞介素 在又另一實施例中,本發明提供一種藉由以下治療癌症之方法:向有需要之個體投與與一或多種細胞介素,包括(但不限於)干擾素、IL-2、IL-15、IL-7或IL21組合的本發明之抗體結合物。在某些實施例中,與IL-15/IL-15Ra複合物組合投與抗體結合物。在一些實施例中,IL-15/IL-15Ra複合物係選自NIZ985 (Novartis)、ATL-803 (Altor)或CYP0150 (Cytune)。例示性 IL-15/IL-15Ra 複合物 在一個實施例中,細胞介素為與IL-15受體α (IL-15Ra)之可溶性形式複合的IL-15。IL-15/IL-15Ra複合物可包含共價或非共價結合至IL-15Ra之可溶性形式的IL-15。在一特定實施例中,人類IL-15非共價結合至IL-15Ra之可溶性形式。在一特定實施例中,組合物之人類IL-15包含表16中之胺基酸序列SEQ ID NO: 922或與SEQ ID NO: 922具有至少85%、90%、95%或99%或高於99%一致性的胺基酸序列,且人類IL-15Ra之可溶性形式包含表16中之胺基酸序列SEQ ID NO: 923或與SEQ ID NO: 923具有至少85%、90%、95%或99%或高於99%一致性的胺基酸序列,如WO 2014/066527中所述,該案以全文引用之方式併入本文中。本文所述之分子可藉由WO 2007084342中所述之載體、宿主細胞及方法製得,該案以全文引用之方式併入本文中。 表16. 例示性IL-15/IL-15Ra複合物之胺基酸及核苷酸序列 其他 例示性 IL-15/IL-15Ra 複合物 在一個實施例中,IL-15/IL-15Ra複合物為ALT-803,一種IL-15/IL-15Ra Fc融合蛋白(IL-15N72D:IL-15RaSu/Fc可溶性複合物)。ALT-803描述於WO 2008/143794中,該案以全文引用之方式併入本文中。在一個實施例中,IL-15/IL-15Ra Fc融合蛋白包含如表17中所揭示之序列。 在一個實施例中,IL-15/IL-15Ra複合物包含與IL-15Ra之sushi域融合的IL-15 (CYP0150,Cytune)。IL-15Ra之sushi域係指開始於IL-15Ra之信號肽之後的第一半胱胺酸殘基且結束於該信號肽之後的第四半胱胺酸殘基的域。與IL-15Ra之sushi域融合的IL-15之複合物描述於WO 2007/04606及WO 2012/175222中,其以全文引用之方式併入。在一個實施例中,IL-15/IL-15Ra sushi域融合包含如表17中所揭示之序列。 表17. 其他例示性IL-15/IL-15Ra複合物之胺基酸序列 在又另一實施例中,本發明提供一種藉由以下治療癌症之方法:向有需要之個體投與與STING受體(干擾素基因之刺激子)之一或多種促效劑,例如WO 2014/189805中所述之化合物組合的本發明之抗體結合物。 在另一實施例中,本發明提供一種藉由以下治療癌症之方法:向有需要之個體投與與以下一或多種血管生成抑制劑組合的本發明之抗體結合物:例如貝伐單抗(Bevacizumab) (Avastin®)、阿西替尼(axitinib) (Inlyta®);丙胺酸布立尼布(Brivanib alaninate) (BMS-582664,(S )-((R )-1-(4-(4-氟-2-甲基-1H -吲哚-5-基氧基)-5-甲基吡咯并[2,1-f ][1,2,4]三嗪-6-基氧基)丙-2-基)2-胺基丙酸酯);索拉非尼(Sorafenib) (Nexavar®);帕唑帕尼(Pazopanib) (Votrient®);蘋果酸舒尼替尼(Sunitinib malate) (Sutent®);西地尼布(Cediranib) (AZD2171,CAS 288383-20-1);瓦格特氟(Vargatef) (BIBF1120,CAS 928326-83-4);弗雷替尼(Foretinib) (GSK1363089);特拉替尼(Telatinib) (BAY57-9352,CAS 332012-40-5);阿帕替尼(Apatinib) (YN968D1,CAS 811803-05-1);伊馬替尼(Imatinib) (Gleevec®);普納替尼(Ponatinib) (AP24534,CAS 943319-70-8);替沃紮尼(Tivozanib) (AV951,CAS 475108-18-0);瑞戈非尼(Regorafenib) (BAY73-4506,CAS 755037-03-7);凡塔藍尼二鹽酸鹽(PTK787,CAS 212141-51-0);布立尼布(Brivanib) (BMS-540215,CAS 649735-46-6);凡德他尼(Vandetanib) (Caprelsa®或AZD6474);二磷酸莫替沙尼(Motesanib diphosphate) (AMG706,CAS 857876-30-3,N-(2,3-二氫-3,3-二甲基-1H-吲哚-6-基)-2-[(4-吡啶基甲基)胺基]-3-吡啶甲醯胺,描述於PCT公開案第WO 02/066470號中);立尼法尼(Linfanib) (ABT869,CAS 796967-16-3);卡博替尼(Cabozantinib) (XL184,CAS 849217-68-1);來他替尼(Lestaurtinib) (CAS 111358-88-4);N-[5-[[[5-(1,1-二甲基乙基)-2-噁唑基]甲基]硫基]-2-噻唑基]-4-哌啶甲醯胺(BMS38703,CAS 345627-80-7);(3R,4R)-4-胺基-1-((4-((3-甲氧苯基)胺基)吡咯并[2,1-f][1,2,4]三嗪-5-基)甲基)哌啶-3-醇(BMS690514);N -(3,4-二氯-2-氟苯基)-6-甲氧基-7-[[(3aα,5β,6aα)-八氫-2-甲基環戊[c]吡咯-5-基]甲氧基]-4-喹唑啉胺(XL647,CAS 781613-23-8);4-甲基-3-[[1-甲基-6-(3-吡啶基)-1H -吡唑并[3,4-d ]嘧啶-4-基]胺基]-N-[3-(三氟甲基)苯基]-苯甲醯胺(BHG712,CAS 940310-85-0);或阿柏西普(Aflibercept) (Eylea®)。 在另一實施例中,本發明提供一種藉由以下治療癌症之方法:向有需要之個體投與與以下一或多種熱休克蛋白抑制劑組合的本發明之抗體結合物:例如坦螺旋黴素(Tanespimycin) (17-烯丙基胺基-17-脫甲氧基格爾德黴素(17-allylamino-17-demethoxygeldanamycin),亦稱為KOS-953及17-AAG,購自SIGMA,且描述於美國專利第4,261,989號中);瑞他黴素(Retaspimycin) (IPI504);加利特皮(Ganetespib) (STA-9090);[6-氯-9-(4-甲氧基-3,5-二甲基吡啶-2-基甲基)-9H-嘌呤-2-基]胺(BIIB021或CNF2024,CAS 848695-25-0);反-4-[[2-(胺基羰基)-5-[4,5,6,7-四氫-6,6-二甲基-4-側氧基-3-(三氟甲基)-1H -吲唑-1-基]苯基]胺基]環己基甘胺酸酯(SNX5422或PF04929113,CAS 908115-27-5);或17-二甲基胺基乙基胺基-17-脫甲氧基格爾德黴素(17-DMAG)。 在另一實施例中,本發明提供一種藉由以下治療癌症之方法:向有需要之個體投與與一或多種HDAC抑制劑或其他表觀遺傳修飾劑組合的本發明之抗體結合物。例示性HDAC抑制劑包括(但不限於)伏尼諾他(Voninostat) (Zolinza®);羅米地辛(Romidepsin) (Istodax®);曲古抑菌素A (Treichostatin A) (TSA);奧克拉汀(Oxamflatin);伏立諾他(Vorinostat) (Zolinza®,辛二醯苯胺異羥肟酸);吡咯沙敏(Pyroxamide) (辛二醯基-3-胺基吡啶醯胺異羥肟酸);特拉卜辛A(Trapoxin A) (RF-1023A);特拉卜辛B (RF-10238);環[(αS ,2S )-α-胺基-η-側氧基-2-環氧乙烷辛醯基-O-甲基-D-酪胺醯基-L-異白胺醯基-L-脯胺醯基] (Cyl-1);環[(αS ,2S )-α-胺基-η-側氧基-2-環氧乙烷辛醯基-O-甲基-D-酪胺醯基-L-異白胺醯基-(2S )-2-哌啶羰基] (Cyl-2);環[L-丙胺醯基-D-丙胺醯基-(2S)-η-側氧基-L-α-胺基環氧乙烷辛醯基-D-脯胺醯基] (HC-毒素);環[(αS ,2S )-α-胺基-η-側氧基-2-環氧乙烷辛醯基-D-苯丙胺醯基-L-白胺醯基-(2S )-2-哌啶羰基] (WF-3161);克拉米多辛(Chlamydocin) ((S)-環(2-甲基丙胺醯基-L-苯丙胺醯基-D-脯胺醯基-η-側氧基-L-α-胺基環氧乙烷辛醯基);阿比西丁(Apicidin) (環(8-側氧基-L-2-胺基癸醯基-1-甲氧基-L-色胺醯基-L-異白胺醯基-D-2-哌啶羰基);羅米地辛(Romidepsin) (Istodax®,FR-901228);4-苯丁酸鹽;斯普他汀A (Spiruchostatin A);麥普因(Mylproin) (丙戊酸);恩替諾特(Entinostat) (MS-275,N-(2-胺基苯基)-4-[N-(吡啶-3-基-甲氧基羰基)-胺基-甲基]-苯甲醯胺);狄普特辛(Depudecin) (4,5:8,9-雙脫水-1,2,6,7,11-五脫氧-D-蘇-D-艾杜-十一-1,6-二烯糖醇);4-(乙醯胺基)-N-(2-胺基苯基)-苯甲醯胺(亦稱為CI-994);N1-(2-胺基苯基)-N8-苯基-辛烷二醯胺(亦稱為BML-210);4-(二甲胺基)-N-(7-(羥胺基)-7-側氧基庚基)苯甲醯胺(亦稱為M344);(E)-3-(4-(((2-(1H-吲哚-3-基)乙基)(2-羥乙基)胺基)-甲基)苯基)-N-羥基丙烯醯胺;帕比諾他(Panobinostat) (Farydak®);莫塞諾他(Mocetinostat)及貝林諾他(亦稱為PXD101、Beleodaq®或(2E )-N -羥基-3-[3-(苯胺磺醯基)苯基]丙-2-烯醯胺)或西達本胺(亦稱為CS055或HBI-8000,(E)-N-(2-胺基-5-氟苯基)-4-((3-(吡啶-3-基)丙烯醯胺基)甲基)苯甲醯胺)。其他表觀遺傳修飾劑包括(但不限於)EZH2 (zeste強化子同系物2)、EED (胚胎外胚層發育)或LSD1 (離胺酸特異性組蛋白脫甲基酶1A或KDM1A)之抑制劑。 在又另一實施例中,本發明提供一種藉由以下治療癌症至之方法:向有需要之個體投與與一或多種以下之抑制劑組合的本發明之抗體結合物:吲哚胺-吡咯2,3-雙加氧酶(IDO),例如因多莫得(Indoximod) (亦稱為NLG-8189)、α-環己基-5H-咪唑并[5,1-a]異吲哚-5-乙醇(亦稱為NLG919)或(4E)-4-[(3-氯-4-氟苯胺基)-亞硝基亞甲基]-1,2,5-噁二唑-3-胺(亦稱為INCB024360)。 在又另一實施例中,本發明提供一種藉由以下治療癌症之方法:向有需要之個體投與與一或多種控制或治療細胞介素釋放症候群(CRS)之藥劑組合的本發明之抗體結合物。CRS療法包括(但不限於)IL-6抑制劑或IL-6受體(IL-6R)抑制劑(例如托西利單抗或思圖昔單抗)、巴多昔芬、sgp130阻斷劑、激脈藥物、皮質類固醇、免疫抑制劑、組胺H2 受體拮抗劑、解熱劑、鎮痛劑(例如乙醯胺苯酚)及機械換氣。例示性CRS療法描述於國際申請案WO2014011984中,其以引用之方式併入本文中。 托西利單抗為人類化免疫球蛋白G1κ抗人類IL-6R單株抗體。托西利單抗阻斷IL-6與可溶性及膜結合IL-6受體(IL-6R)結合且因此抑制經典IL-6信號傳遞及反式IL-6信號傳遞。在實施例中,對於成人而言,以約4至12 mg/kg,例如約4至8 mg/kg之劑量投與,且對於兒科個體而言,投與約8至12 mg/kg,例如經由1小時時程投與。 在一些實施例中,CRS治療劑為IL-6信號傳遞之抑制劑,例如IL-6或IL-6受體之抑制劑。在一個實施例中,抑制劑為抗IL-6抗體,例如抗IL-6嵌合單株抗體,諸如思圖昔單抗。在其他實施例中,抑制劑包含能夠阻斷IL-6信號傳遞之可溶性gp130 (sgp130)或其片段。在一些實施例中,sgp130或其片段與異源域,例如Fc域融合,例如為gp130-Fc融合蛋白,諸如FE301。在實施例中,IL-6信號傳遞之抑制劑包含抗體,例如針對IL-6受體之抗體,諸如沙瑞盧單抗(sarilumab)、奧諾奇單抗(olokizumab) (CDP6038)、艾思莫單抗(elsilimomab)、思魯庫單抗(sirukumab) (CNTO 136)、ALD518/BMS-945429、ARGX-109或FM101。在一些實施例中,IL-6信號傳遞之抑制劑包含諸如CPSI-2364之小分子。 例示性激脈藥物包括(但不限於)血管緊張素-11、內皮素-1、α腎上腺素促效劑、羅斯特諾德(rostanoid)、磷酸二酯酶抑制劑、內皮素拮抗劑、收縮影響劑(例如腎上腺素、多巴酚丁胺、異丙腎上腺素、麻黃素)、血管加壓劑(例如去甲腎上腺素、血管加壓素、間羥胺、血管加壓素、亞甲基藍)、強心擴張劑(例如米利酮(milrinone)、左西孟旦(levosimendan))及多巴胺。 例示性血管加壓劑包括(但不限於)正腎上腺素、多巴胺、苯腎上腺素、腎上腺素及血管加壓素。在一些實施例中,高劑量血管加壓劑包括以下中之一或多者:呈≥20 μg/min之正腎上腺素單一療法、呈≥10 μg/kg/min之多巴胺單一療法、呈≥ 200 μg/min之苯腎上腺素單一療法及/或呈≥ 10 ug/min之腎上腺素單一療法。在一些實施例中,若給予個體的為血管加壓素,則高劑量血管加壓劑包括≥ 10 μg/min之血管加壓素+正腎上腺素等效物,其中正腎上腺素等效物劑量= [正腎上腺素(μg/min)] + [多巴胺(μg/kg/min) / 2] + [腎上腺素(μg/min)] + [苯腎上腺素(μg/min) / 10]。在一些實施例中,若給予個體的為組合血管加壓劑(並非血管加壓素),則高劑量血管加壓劑包括≥ 20 μg/min之正腎上腺素等效物,其中正腎上腺素等效物劑量= [正腎上腺素(μg/min)] + [多巴胺(μg/kg/min) / 2] + [腎上腺素(μg/min)] + [苯腎上腺素(μg/min) / 10]。見例如,同上。 在一些實施例中,低劑量血管加壓劑為以低於上文針對高劑量血管加壓劑所列之劑量中之一或多者的劑量投與之血管加壓劑。 例示性皮質類固醇包括(但不限於)地塞米松、氫皮質酮及甲潑尼龍(methylprednisolone)。在實施例中,使用0.5 mg/kg之地塞米松劑量。在實施例中,使用每劑量10 mg之最大地塞米松劑量。在實施例中,使用2毫克/公斤/天之甲潑尼龍劑量。 例示性免疫抑制劑包括(但不限於)TNFα之抑制劑或IL-1之抑制劑。在實施例中,TNFα之抑制劑包含抗TNFα抗體,例如單株抗體,例如英利昔單抗(infliximab)。在實施例中,TNFα之抑制劑包含可溶性TNFα受體(例如依那西普(etanercept))。在實施例中,IL-1或IL-1R抑制劑包含阿那白滯素(anakinra)。 例示性組胺H2 受體拮抗劑包括(但不限於)西咪替丁(cimetidine) (Tagamet®)、雷尼替丁(ranitidine) (Zantac®)、法莫替丁(famotidine) (Pepcid®)及尼沙替丁(nizatidine) (Axid®)。 例示性解熱劑及鎮痛劑包括(但不限於)乙醯胺苯酚(Tylenol®)、布洛芬及阿司匹林。 在一些實施例中,本發明提供一種藉由以下治療癌症之方法:向有需要之個體投與與上述抑制劑、活化劑、免疫調節劑、促效劑或修飾劑中之任一者中之兩者或多於兩者組合的本發明之抗體結合物。舉例而言,本發明之抗體結合物可與一或多種檢查點抑制劑及/或一或多種免疫活化劑組合使用。 除了以上治療方案之外,患者可經歷癌細胞之手術移除及/或放射療法。 醫藥組合物 為了製備包括一或多種本文所述之抗體結合物之醫藥或無菌組合物,所提供之抗體結合物可與醫藥學上可接受之載劑或賦形劑混合。 治療劑及診斷劑之調配物可藉由與生理學上可接受之載劑、賦形劑或穩定劑混合,以例如凍乾粉末、漿液、水溶液、洗劑或懸浮液形式製備 (參見例如Hardman等人, Goodman and Gilman's The Pharmacological Basis of Therapeutics, McGraw-Hill, New York, N.Y., 2001;Gennaro, Remington: The Science and Practice of Pharmacy, Lippincott, Williams, and Wilkins, New York, N.Y., 2000;Avis等人(編), Pharmaceutical Dosage Forms: Parenteral Medications, Marcel Dekker, NY, 1993;Lieberman等人(編), Pharmaceutical Dosage Forms: Tablets, Marcel Dekker, NY, 1990;Lieberman等人(編) Pharmaceutical Dosage Forms: Disperse Systems, Marcel Dekker, NY, 1990;Weiner及Kotkoskie, Excipient Toxicity and Safety, Marcel Dekker公司, New York, N.Y., 2000)。 在一些實施例中,包含本發明之抗體結合物之醫藥組合物為凍乾物製劑。在某些實施例中,包含抗體結合物之醫藥組合物為小瓶中含有抗體結合物、組胺酸、蔗糖及聚山梨醇酯20之凍乾物。在某些實施例中,包含抗體結合物之醫藥組合物為小瓶中含有抗體結合物、丁二酸鈉及聚山梨醇酯20之凍乾物。在某些實施例中,包含抗體結合物之醫藥組合物為小瓶中含有抗體結合物、海藻糖、檸檬酸鹽及聚山梨醇酯8之凍乾物。凍乾物可經復原,例如用水、生理鹽水,以用於注射。在一特定實施例中,溶液包含抗體結合物、組胺酸、蔗糖及聚山梨醇酯20,其pH值為約5.0。在另一特定實施例中,溶液包含抗體結合物、丁二酸鈉及聚山梨醇酯20。在另一特定實施例中,溶液包含抗體結合物、脫水海藻糖、脫水檸檬酸鹽、檸檬酸及聚山梨醇酯8,其pH值為約6.6。對於靜脈內投藥,所得溶液通常在載劑溶液中進一步稀釋。 選擇用於治療之投與方案視若干因素而定,包括實體之血清或組織周轉率、症狀程度、實體之免疫原性及生物基質中之靶細胞之可接近性。在某些實施例中,投藥方案根據副作用之可接受含量來最大化遞送至患者之治療劑量。因此,所遞送之生物制劑量部分地視特定實體及所治療之病狀嚴重程度而定。關於選擇抗體、細胞介素及小分子之適當劑量之指導為可獲得的(參見例如Wawrzynczak, Antibody Therapy, Bios Scientific Pub. Ltd, Oxfordshire, UK, 1996;Kresina (編), Monoclonal Antibodies, Cytokines and Arthritis, Marcel Dekker, New York, N.Y., 1991;Bach (編), Monoclonal Antibodies and Peptide Therapy in Autoimmune Diseases, Marcel Dekker, New York, N.Y., 1993;Baert等人, New Engl. J. Med. 348:601-608, 2003;Milgrom等人, New Engl. J. Med. 341:1966-1973, 1999;Slamon等人, New Engl. J. Med. 344:783-792, 2001;Beniaminovitz等人, New Engl. J. Med. 342:613-619, 2000;Ghosh等人, New Engl. J. Med. 348:24-32, 2003;Lipsky等人, New Engl. J. Med. 343:1594-1602, 2000)。 適當劑量由臨床師例如使用此項技術中已知或疑似影響治療或經預測影響治療之參數或因素來確定。一般而言,初始劑量為稍微小於最佳劑量的量,且隨後以較小增量遞增,直至相對於任何負面的副作用,達成所需或最佳作用。重要診斷量測包括例如炎症或所產生的炎性細胞介素之含量的量測。 本發明之醫藥組合物中活性成分之實際劑量水準可有所變化,以獲得在對患者無毒性之情況下有效地達成特定患者、組合物及投藥模式之所需治療反應的活性成分之量。所選劑量水準將視多種藥物動力學因素而定,該等因素包括所用之本發明之特定組合物或其酯、鹽或醯胺的活性;投藥途徑;投藥時間;所用特定化合物之排泄速率;治療持續時間;與所用特定組合物組合的其他藥物、化合物及/或材料;所治療之患者之年齡、性別、體重、病狀、一般健康狀況及先前病史;及醫學技術中已知的類似因素。 包含本發明之抗體結合物之組合物可藉由連續輸注或藉由以例如一天、一週或每週1至7次、每隔一週一次、每三週一次、每四週一次、每五週一次、每六週一次、每七週一次或每八週一次之間隔給藥來提供。可經靜脈內、皮下、局部、經口、經鼻、經直腸、肌肉內、顱內或藉由吸入提供劑量。特定劑量方案為包括避免顯著不良副作用之最大劑量或給藥頻率的劑量方案。 對於本發明之抗體結合物,投與患者之劑量可為每公斤患者體重0.0001 mg至100 mg。劑量可在每公斤患者體重0.001 mg與50 mg、0.005 mg與20 mg、0.01 mg與20 mg、0.02 mg與10 mg、0.05與5 mg、0.1 mg與10 mg、0.1 mg與8 mg、0.1 mg與5 mg、0.1 mg與2 mg、0.1 mg與1 mg之間。可使用患者體重(公斤;kg)乘以待投與之劑量(mg/kg)來計算抗體結合物之劑量。 本發明之抗體結合物之給藥可重複且投藥可間隔小於1天、至少1天、2天、3天、5天、10天、15天、30天、45天、2個月、75天、3個月、4個月、5個月或至少6個月。在一些實施例中,本發明之抗體結合物係每週兩次、每週一次、每兩週一次、每三週一次、每四週一次或更不頻繁地投與。在一特定實施例中,每2週一次重複本發明之抗體結合物之給藥。 用於特定患者之有效量可視諸如所治療之病狀、患者之整體健康狀況、投藥之方法、途徑及劑量以及副作用之嚴重程度之因素而改變(參見例如Maynard等人,A Handbook of SOPs for Good Clinical Practice, Interpharm Press, Boca Raton, Fla., 1996;Dent, Good Laboratory and Good Clinical Practice, Urch Publ., London, UK, 2001)。 投藥途徑可為藉由例如藉由皮下、靜脈內、腹膜內、腦內、肌肉內、眼內、動脈內、腦脊髓內、病灶內投藥進行之局部或皮膚施用、注射或輸注,或藉由持續釋放系統或植入物(參見例如Sidman等人, Biopolymers 22:547-556, 1983;Langer等人, J. Biomed. Mater. Res. 15:167-277, 1981;Langer, Chem. Tech. 12:98-105, 1982;Epstein等人, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 82:3688-3692, 1985;Hwang等人, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 77:4030-4034, 1980;美國專利案第6,350,466號及第6,316,024號)。必要時,組合物亦可包括助溶劑或局部麻醉劑(諸如利多卡因(lidocain))以減輕注射部位之疼痛,或其兩者。此外,亦可使用經肺投藥,例如藉由使用吸入器或噴霧器,及具有氣霧劑之調配物。參見例如美國專利第6,019,968號、第5,985,320號、第5,985,309號、第5,934,272號、第5,874,064號、第5,855,913號、第5,290,540號及第4,880,078號;及PCT公開案第WO 92/19244號、第WO 97/32572號、第WO 97/44013號、第WO 98/31346號及第WO 99/66903號,其各自以全文引用之方式併入本文中。 此類其他成分之實例在此項技術中已熟知。 與第二治療劑(例如細胞介素、類固醇、化學治療劑、抗生素或輻射)共同投與或用其治療的方法在此項技術中已知(參見例如Hardman等人, (編) (2001) Goodman and Gilman's The Pharmacological Basis of Therapeutics, 第10增刊版, McGraw-Hill, New York, N.Y.;Poole及Peterson (編) (2001) Pharmacotherapeutics for Advanced Practice:A Practical Approach, Lippincott, Williams & Wilkins, Phila., Pa.;Chabner及Longo (編) (2001) Cancer Chemotherapy and Biotherapy, Lippincott, Williams & Wilkins, Phila., Pa.)。有效量之治療劑可使症狀減少至少10%、至少20%、至少約30%、至少40%或至少50%。 可與本發明之抗體結合物組合投與之其他療法(例如預防劑或治療劑)可與本發明之抗體結合物相隔小於5分鐘投與、相隔小於30分鐘、相隔1小時、相隔約1小時、相隔約1至約2小時、相隔約2小時至約3小時、相隔約3小時至約4小時、相隔約4小時至約5小時、相隔約5小時至約6小時、相隔約6小時至約7小時、相隔約7小時至約8小時、相隔約8小時至約9小時、相隔約9小時至約10小時、相隔約10小時至約11小時、相隔約11小時至約12小時、相隔約12小時至18小時、相隔18小時至24小時、相隔24小時至36小時、相隔36小時至48小時、相隔48小時至52小時、相隔52小時至60小時、相隔60小時至72小時、相隔72小時至84小時、相隔84小時至96小時、或96小時至120小時。兩種或多於兩種治療劑可在同一患者問診內投與。 在某些實施例中,本發明之抗體結合物可經調配以確保活體內適當分佈。例示性靶向部分包括葉酸或生物素(參見例如Low等人之美國專利案第5,416,016號);甘露糖苷(Umezawa等人, (1988) Biochem. Biophys. Res. Commun. 153:1038);抗體(Bloeman等人, (1995) FEBS Lett. 357:140;Owais等人, (1995) Antimicrob. Agents Chemother. 39:180);界面活性劑蛋白質A受體(Briscoe等人, (1995) Am. J. Physiol. 1233:134);p 120 (Schreier等人, (1994) J. Biol. Chem. 269:9090);亦參見K. Keinanen; M. L. Laukkanen (1994) FEBS Lett. 346:123;J. J. Killion; I. J. Fidler (1994) Immunomethods 4:273。 本發明提供用於向有需要之個體投與單獨的包含本發明之抗體結合物之醫藥組合物或其與其他療法之組合之方案。本發明之組合療法之療法(例如預防劑或治療劑)可向個體同時或連續投與。本發明之組合療法之療法(例如預防劑或治療劑)亦可循環投與。循環療法涉及投與第一療法(例如第一預防劑或治療劑)持續一定時段,之後投與第二療法(例如第二預防劑或治療劑)持續一定時段,且重複此連續投與,亦即循環,以減少各療法(例如藥劑)中之一者產生抗性,進而避免或減少各療法(例如藥劑)中之一者的副作用及/或改良療法之功效。 本發明之組合療法之療法(例如預防劑或治療劑)可同時向個體投與。 術語「同時」並不限於在恰好同一時間投與療法(例如預防劑或治療劑),而在於其意指以一定順序且在一定時間間隔內向個體投與包含抗體或其片段的本發明之醫藥組合物,以使得本發明之抗體或抗體結合物可與其他療法一起作用,提供較於在以其他方式投與其之情況下,增加之益處。舉例而言,各療法可同時或按任何次序在不同時間點依序向個體投與;然而,若未同時投與,則其應在時間充分接近時投與以提供所需治療或預防作用。各療法可以任何適當形式且藉由任何適合途徑分別投與個體。在各種實施例中,以間隔小於5分鐘、間隔小於15分鐘、間隔小於30分鐘、間隔小於1小時、間隔約1小時、間隔約1小時至約2小時、間隔約2小時至約3小時、間隔約3小時至約4小時、間隔約4小時至約5小時、間隔約5小時至約6小時、間隔約6小時至約7小時、間隔約7小時至約8小時、間隔約8小時至約9小時、間隔約9小時至約10小時、間隔約10小時至約11小時、間隔約11小時至約12小時、間隔24小時、間隔48小時、間隔72小時或間隔1週向個體投與療法(例如預防劑或治療劑)。在其他實施例中,兩種或多於兩種療法(例如預防劑或治療劑)可在同一患者問診內投與。 組合療法中之預防劑或治療劑可以相同醫藥組合物投與個體。或者,組合療法之預防劑或治療劑可在獨立醫藥組合物中向個體同時投與。預防劑或治療劑可藉由相同或不同投與途徑向個體投與。 應理解,本文所述之實例及實施例僅用於說明之目的,且根據其之各種修改或變化將由熟習此項技術者提出且包括在本申請案之精神及範圍內及隨附申請專利範圍之範疇內。 實例 本發明進一步描述於以下實例中,其並不意欲限制申請專利範圍中所述之本發明範疇。 實例1 1-(3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙基)-1H-吡咯-2,5-二酮(C-1)之合成向圓底燒瓶中裝入5-(2-甲氧基-5-(哌嗪-1-基甲基)苯甲基)-N4-戊基-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-2,4-二胺(Int-1,1.0當量)、HBTU(1.2當量)、許尼希氏鹼(3.0當量)、3-(2,5-二側氧基-2,5-二氫-1H-吡咯-1-基)丙酸(1.2當量)及DMSO (0.1 M)。在室溫下攪拌反應混合物3小時,且隨後藉由RP-HPLC (0.035% TFA於ACN中:0.05% TFA於H2 O中,C18管柱)純化粗反應混合物,得到呈固體狀之呈TFA鹽形式之1-(3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙基)-1H-吡咯-2,5-二酮(C-1):1 H NMR (CDCl3 ): d 7.35 (d, 1H), 7.12 (d, 1H), 6.86 (d, 1H), 6.72 (s, 2H), 6.69 (d, 1H), 6.40 (s, 1H), 5.46 (t, 1H), 5.33 (s, 2H), 4.16 (s, 2H), 3.95 (s, 3H), 3.82 (m, 6H), 3.40 (m, 4H), 3.21 (m, 2H), 2.67 (m, 4H), 1.39 (m, 2H), 1.26 (m, 2H), 1.14 (m, 2H), 0.86 (t, 3H)。LRMS [M+H] = 589.3。 實例2 (2R)-2-胺基-3-((1-(3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙基)-2,5-二側氧基吡咯啶-3-基)硫基)丙酸(C-2)之合成向圓底燒瓶中裝入1-(3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙基)-1H-吡咯-2,5-二酮(C-1,1.0當量)且溶解於ACN-PBS緩衝液(1:2,0.02 M)中。向此混合物中添加溶解於DPBS緩衝液(0.07 M)中之L-半胱胺酸(2.0當量)。在室溫下攪拌反應混合物1小時。藉由RP-HPLC (0.035% TFA於ACN中:0.05% TFA於H2 O中,C18管柱)純化粗反應混合物,得到呈固體狀之呈非對映異構體之混合物的TFA鹽形式之(2R)-2-胺基-3-((1-(3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙基)-2,5-二側氧基吡咯啶-3-基)硫基)丙酸(C-2):1 H NMR (CD3 OD): δ 7.36 (d, 1H), 7.28 (d, 1H), 7.05 (d, 1H), 6.81 (d, 1H), 6.24 (d, 1H), 5.57 (s, 2H), 4.26 (m, 2H), 4.02 (m, 1H), 3.95 (s, 3H), 3.78 (m, 6H), 3.55 (m, 2H), 3.44 (m, 1H), 3.23 (m, 3H), 3.12 (m, 2H), 2.76 (m, 2H), 2.53 (m, 1H), 1.53 (m, 2H), 1.30 (m, 2H), 1.19 (m, 2H), 0.88 (t, 3H)。LCMS [M+H] = 710.3。 實例3 (6R)-6-(2-((3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙基)胺基)-2-側氧基乙基)-5-側氧基硫嗎啉-3-甲酸(C-3)之合成向圓底燒瓶中裝入(2R)-2-胺基-3-((1-(3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙基)-2,5-二側氧基吡咯啶-3-基)硫基)丙酸(C-1)且溶解於PBS緩衝液(pH 7.5,100 mM磷酸鹽及5 nM EDTA)及乙腈(1:1,0.012 M)中。隨後在40℃下攪拌反應混合物6小時。此時使粗反應混合物冷卻至室溫且藉由RP-HPLC (0.5 M NH4 OAc於ACN中:10 mM NH4 OAc於H2 O中,C18管柱)純化,得到呈固體狀之呈區域立體異構體與非對映異構體之混合物形式的(6R)-6-(2-((3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙基)胺基)-2-側氧基乙基)-5-側氧基硫嗎啉-3-甲酸(C-3)。1 H NMR (CD3 OD): δ 7.38 (d, 1H), 7.13 (s, 1H), 6.94 (d, 1H), 6.74 (d, 1H), 6.22 (d, 1H), 5.52 (s, 2H), 4.24 (m, 1H), 3.93 (s, 3H), 3.82 (m, 1H), 3.67 (s, 2H), 3.60 (m, 4H), 3.54 (t, 2H), 3.43 (m, 2H), 3.18 (m, 1H), 3.01 (m, 1H), 2.87 (m, 1H), 2.58 (m 7H), 1.50 (m, 2H), 1.29 (m, 2H), 1.17 (m, 2H), 0.88 (t, 3H)。LCMS [M+H] = 710.4。 實例4 3-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-((3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙基)胺基)-4-側氧基丁酸(C-4a)及2-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-((3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙基)胺基)-4-側氧基丁酸(C-4b)之合成向圓底燒瓶中裝入1-(3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙基)-1H-吡咯-2,5-二酮(C-1,1.0當量)、L-半胱胺酸(1.0當量)及PBS:MeCN (2:1,0.008 M)。在室溫下攪拌反應混合物1小時,且隨後將1 M NaOH(20.0當量)添加至反應混合物中。隨後再攪拌反應3小時,之後藉由RP-HPLC (0.5mM NH4 OAc於MeCN中:10 mM NH4 OAc於H2 O中,C18管柱)純化粗反應混合物,得到呈固體狀之呈其相應非對映異構體(以下化合物(C-4aSR)、C-4aRR)、(C-4bRR)及(C-4bRR))形式的3-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-((3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙基)胺基)-4-側氧基丁酸(C-4a)與2-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-((3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙基)胺基)-4-側氧基丁酸(C-4b)之混合物:1 H NMR (DMSO): d 7.88 (s, 1), 7.26 (s, 1H), 6.98 (s, 1H), 6.77 (d, 1H), 6.64 (s, 1H), 6.46 (s, 1H), 6.01 (s, 1H), 5.40 (s, 2H), 3.85 (s, 3H), 3.36 (m, 17H), 2.29 (m, 8H), 1.90 (s, 2H), 1.39 (m, 2H), 1.21 (m, 2H), 1.09 (m, 2H), 0.81 (t, 3H)。LRMS [M+H] = 728.4。(S)-3-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-((3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙基)胺基)-4-側氧基丁酸(C-4aSR);(R)-3-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-((3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙基)胺基)-4-側氧基丁酸(C-4aRR)(R)-2-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-((3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙基)胺基)-4-側氧基丁酸(C-4bRR)(S)-2-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-((3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙基)胺基)-4-側氧基丁酸(C-4bSR)。 實例5 1-(2-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)乙基)-1H-吡咯-2,5-二酮(C-5)之合成向圓底燒瓶中裝入5-(2-甲氧基-5-(哌嗪-1-基甲基)苯甲基)-N4-戊基-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-2,4-二胺(Int-1,1.0當量)、2-(2,5-二側氧基-2,5-二氫-1H-吡咯-1-基)乙醛(4.0當量)、氰基硼氫化鈉(13.0當量)及MeOH (0.04 M)。在室溫下攪拌反應混合物1小時,且隨後藉由RP-HPLC (0.035% TFA於ACN中:0.05% TFA於H2 O中,C18管柱)純化粗反應混合物,得到呈固體狀之呈TFA鹽形式之1-(2-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)乙基)-1H-吡咯-2,5-二酮(C-5):1 H NMR (CDCl3 ): d 7.32 (d, 1H), 7.12 (d, 1H), 6.87 (d, 1H), 6.72 (s, 2H), 6.70 (d, 1H), 6.41 (d, 1H), 5.45 (t, 1H), 5.31 (s, 2H), 4.07 (s, 2H), 3.95 (s, 3H), 3.73 (t, 2H), 3.40 (m, 4H), 3.17 (m, 6H), 2.89 (m, 4H), 1.39 (m, 2H), 1.26 (m, 2H), 1.14 (m, 2H), 0.86 (t, 3H)。LRMS [M+H] = 561.3。 附註:2-(2,5-二側氧基-2,5-二氫-1H-吡咯-1-基)乙醛係藉由將1-(2-羥乙基)-1H-吡咯-2,5-二酮(1.0當量)、戴斯-馬丁高碘烷(Dess-Martin periodinane) (1.5當量)及DCM (0.1 M)添加至圓底燒瓶中且在室溫下攪拌2小時而製備。隨後過濾反應混合物,真空移除揮發物且產物不經進一步純化即使用。 實例6 (2S)-2-胺基-3-((1-(2-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)乙基)-2,5-二側氧基吡咯啶-3-基)硫基)丙酸(C-6)之合成遵循與實例2類似的程序製備(2S)-2-胺基-3-((1-(2-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)乙基)-2,5-二側氧基吡咯啶-3-基)硫基)丙酸(C-6),不同之處在於使用化合物(C-5)代替化合物(C-1),得到呈固體狀之呈非對映異構體之混合物的TFA鹽形式的(2S)-2-胺基-3-((1-(2-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)乙基)-2,5-二側氧基吡咯啶-3-基)硫基)丙酸(C-6):1 H NMR (CD3 OD): δ 7.36 (d, 1H), 7.21 (m, 1H), 7.02 (m, 1H), 6.78 (m, 1H), 6.23 (d, 1H), 5.56 (m, 2H), 4.21 (m, 1H), 4.09 (s, 1H), 4.03 (m, 1H), 3.95 (m, 3H), 3.75 (m, 2H), 3.54 (t, 2H), 3.43 (m, 1H), 3.34 (m, 1H), 3.22 (m, 2H), 3.03 (m, 6H), 2.84 (m, 2H), 2.63 (m, 1H), 1.52 (m, 2H), 1.30 (m, 2H), 1.18 (m, 2H), 0.88 (t, 3H)。LCMS [M+H] = 682.4。 實例7 (6R)-6-(2-((2-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)乙基)胺基)-2-側氧基乙基)-5-側氧基硫嗎啉-3-甲酸(C-7)之合成遵循與實例3類似的程序製備(6R)-6-(2-((2-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)乙基)胺基)-2-側氧基乙基)-5-側氧基硫嗎啉-3-甲酸(C-7),不同之處在於使用化合物(C-5)代替化合物(C-1),得到呈固體狀之呈區域立體異構體與非對映異構體之混合物的(6R)-6-(2-((2-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)乙基)胺基)-2-側氧基乙基)-5-側氧基硫嗎啉-3-甲酸(C-7):1 H NMR (CD3 OD): δ 7.37 (d, 1H), 7.10 (s, 1H), 6.91 (d, 1H), 6.72 (d, 1H), 6.22 (d, 1H), 5.51 (s, 2H), 4.13 (m, 1H), 3.92 (s, 3H), 3.88 (m, 1H), 3.58 (s, 2H), 3.52 (t, 2H), 3.40 (m, 2H), 3.16 (m, 1H), 2.99 (m, 1H), 2.86 (m, 1H), 2.67 (m 10H), 1.49 (m, 2H), 1.29 (m, 2H), 1.17 (m, 2H), 0.88 (t, 3H)。LCMS [M+H] = 682.3。 實例8 3-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-((2-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)乙基)胺基)-4-側氧基丁酸(C-8a)及2-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-((2-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)乙基)胺基)-4-側氧基丁酸(C-8b)之合成遵循與實例4類似的程序製備3-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-((2-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)乙基)胺基)-4-側氧基丁酸(C-8a)及2-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-((2-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)乙基)胺基)-4-側氧基丁酸(C-8b),不同之處在於使用化合物(C-5)代替化合物(C-1),得到呈固體狀之呈其相應非對映異構體(以下化合物(C-8aSR)、C-8aRR)、(C-8bRR)及(C-8bRR))形式的化合物(C-8a)與化合物(C-8b)之混合物:1 H NMR (DMSO): d 7.81 (s, 1), 7.33 (s, 1H), 6.96 (s, 1H), 6.76 (d, 1H), 6.69 (s, 1H), 6.48 (s, 1H), 6.10 (s, 1H), 5.45 (s, 2H), 3.82 (s, 3H), 3.37 (m, 17H), 2.35 (m, 8H), 1.90 (s, 2H), 1.41 (m, 2H), 1.20 (m, 2H), 1.08 (m, 2H), 0.80 (t, 3H)。LRMS [M+H] = 700.4。(S)-3-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-((2-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)乙基)胺基)-4-側氧基丁酸(C-8aSR);(R)-3-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-((2-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)乙基)胺基)-4-側氧基丁酸(C-8aRR);(R)-2-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-((2-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)乙基)胺基)-4-側氧基丁酸(C-8bRR);(S)-2-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-((2-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)乙基)胺基)-4-側氧基丁酸(C-8bSR)。 實例9 1-(2-(3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙氧基)乙基)-1H-吡咯-2,5-二酮(C-9)之合成遵循與實例1類似的程序製備1-(2-(3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙氧基)乙基)-1H-吡咯-2,5-二酮(C-9),不同之處在於使用3-(2-(2,5-二側氧基-2,5-二氫-1H-吡咯-1-基)乙氧基)丙酸代替3-(2,5-二側氧基-2,5-二氫-1H-吡咯-1-基)丙酸,得到呈固體狀之呈TFA鹽形式之1-(2-(3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙氧基)乙基)-1H-吡咯-2,5-二酮(C-9):1 H NMR (CD3 OD): δ 7.37 (d, 1H), 7.27 (d, 1H), 7.06 (d, 1H), 6.82 (s, 2H), 6.81 (d, 1H), 6.24 (d, 1H), 5.58 (s, 2H), 4.38 (s, 2H), 3.96 (s, 3H), 3.86 (m, 4H), 3.67 (m, 4H), 3.56 (m, 4H), 3.24 (m, 4H), 2.61 (t, 2H), 1.53 (m, 2H), 1.31 (m, 2H), 1.20 (m, 2H), 0.88 (t, 3H)。LCMS [M+H] = 633.3。 實例10 3-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-((2-(3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙氧基)乙基)胺基)-4-側氧基丁酸(C-10a)及2-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-((2-(3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙氧基)乙基)胺基)-4-側氧基丁酸(C-10b)之合成遵循與實例4類似的程序製備3-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-((2-(3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙氧基)乙基)胺基)-4-側氧基丁酸(C-10a)及2-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-((2-(3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙氧基)乙基)胺基)-4-側氧基丁酸(C-10b),不同之處在於使用化合物(C-9)代替化合物(C-1),得到呈固體狀之呈TFA鹽形式之化合物(C-10a)與(C-10b)之混合物,該等化合物呈其相應非對映異構體(以下化合物(C-10aSR)、 C-10aRR)、(C-10bRR)及(C-10bRR))形式。藉由RP-HPLC (0.035% TFA於ACN中:0.05% TFA於H2 O中,C18管柱)純化粗反應混合物:1 H NMR (CD3 OD): δ 7.35 (d, 1H), 7.29 (d, 1H), 7.05 (d, 1H), 6.77 (m, 1H), 6.23 (s, 1H), 5.56 (s, 2H), 4.32 (m, 2H), 3.94 (s, 3H), 3.86 (m, 3H), 3.72 (m, 3H), 3.54 (m, 10H), 3.21 (m, 4H), 2.67 (m, 4H), 1.52 (m, 2H), 1.30 (m, 2H), 1.19 (m, 2H), 0.88 (t, 3H)。LCMS [M+H] = 772.4。(S)-3-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-((2-(3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙氧基)乙基)胺基)-4-側氧基丁酸(C-10aSR);(R)-3-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-((2-(3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙氧基)乙基)胺基)-4-側氧基丁酸(C-10aRR);(R)-2-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-((2-(3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙氧基)乙基)胺基)-4-側氧基丁酸(C-10bRR);(S)-2-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-((2-(3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙氧基)乙基)胺基)-4-側氧基丁酸(C-10bSR)。 實例11 1-(2-(2-(2-(3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙氧基)乙氧基)乙氧基)乙基)-1H-吡咯-2,5-二酮(C-11)之合成遵循與實例1類似的程序製備1-(2-(2-(2-(3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙氧基)乙氧基)乙氧基)乙基)-1H-吡咯-2,5-二酮(C-11),不同之處在於使用3-(2-(2-(2-(2,5-二側氧基-2,5-二氫-1H-吡咯-1-基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)丙酸代替3-(2,5-二側氧基-2,5-二氫-1H-吡咯-1-基)丙酸,得到呈固體狀之呈TFA鹽形式之1-(2-(2-(2-(3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙氧基)乙氧基)乙氧基)乙基)-1H-吡咯-2,5-二酮(C-11):1 H NMR (CD3 OD): δ 7.37 (d, 1H), 7.26 (d, 1H), 7.05 (d, 1H), 6.82 (d, 1H), 6.80 (s, 2H), 6.24 (d, 1H), 5.58 (s, 2H), 4.32 (s, 2H), 3.96 (s, 3H), 3.74 (t, 2H), 3.64 (m, 2H), 3.58 (m, 12H), 3.64 (m, 4H), 3.20 (m, 4H), 2.68 (m, 2H), 1.53 (m, 2H), 1.32 (m, 2H), 1.20 (m, 2H), 0.88 (t, 3H)。LCMS [M+H] = 721.4。 實例12 (2R)-2-胺基-19-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-5-(羧甲基)-6,19-二側氧基-10,13,16-三氧雜-4-硫雜-7-氮雜十九烷-1-酸(C-12a)及(19R)-19-胺基-1-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-16-羧基-1,14-二側氧基-4,7,10-三氧雜-17-硫雜-13-氮雜二十烷-20-酸(C-12b)之合成遵循與實例4類似的程序製備(2R)-2-胺基-19-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-5-(羧甲基)-6,19-二側氧基-10,13,16-三氧雜-4-硫雜-7-氮雜十九烷-1-酸(C-12a)及(19R)-19-胺基-1-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-16-羧基-1,14-二側氧基-4,7,10-三氧雜-17-硫雜-13-氮雜二十烷-20-酸(C-12b),不同之處在於使用化合物(C-11)代替化合物(C-1),得到呈固體狀之呈TFA鹽之化合物(C-12a)與(C-12b)之混合物,該等化合物呈其相應非對映異構體(以下化合物(C-12aSR)、C-12aRR)、(C-12bRR)及(C-12bRR))形式。藉由RP-HPLC (0.035% TFA於ACN中:0.05% TFA於H2 O中,C18管柱)純化粗反應混合物:1 H NMR (CD3 OD): δ 7.36 (d, 1H), 7.31 (s, 1H), 7.06 (d, 1H), 6.79 (d, 1H), 6.24 (d, 1H), 5.57(s, 2H), 4.34 (s, 2H), 4.23 (m, 1H), 3.96 (s, 3H), 3.86 (m, 4H), 3.76 (m, 4H), 3.58 (m, 14H), 3.27 (m, 4H), 3.22 (m, 2H), 2.84 (m, 1H), 2.71 (m, 2H), 1.53 (m, 2H), 1.31 (m, 2H), 1.19 (m, 2H), 0.88 (t, 3H)。LCMS [M+H] = 860.4。(2R,5S)-2-胺基-19-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-5-(羧甲基)-6,19-二側氧基-10,13,16-三氧雜-4-硫雜-7-氮雜十九烷-1-酸(C-12aSR);(2R,5R)-2-胺基-19-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-5-(羧甲基)-6,19-二側氧基-10,13,16-三氧雜-4-硫雜-7-氮雜十九烷-1-酸(C-12aRR);(16R,19R)-19-胺基-1-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-16-羧基-1,14-二側氧基-4,7,10-三氧雜-17-硫雜-13-氮雜二十烷-20-酸(C-12bRR);(16S,19R)-19-胺基-1-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-16-羧基-1,14-二側氧基-4,7,10-三氧雜-17-硫雜-13-氮雜二十烷-20-酸(C-12bSR)。 實例13 1-(21-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-21-側氧基-3,6,9,12,15,18-六氧雜二十一烷基)-1H-吡咯-2,5-二酮(C-13)之合成遵循與實例1類似的程序製備1-(21-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-21-側氧基-3,6,9,12,15,18-六氧雜二十一烷基)-1H-吡咯-2,5-二酮(C-13),不同之處在於使用1-(2,5-二側氧基-2,5-二氫-1H-吡咯-1-基)-3,6,9,12,15,18-六氧雜二十一烷-21-酸代替3-(2,5-二側氧基-2,5-二氫-1H-吡咯-1-基)丙酸,得到呈固體狀之呈TFA鹽形式之1-(21-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-21-側氧基-3,6,9,12,15,18-六氧雜二十一烷基)-1H-吡咯-2,5-二酮(C-13):1 H NMR (CD3 OD): δ 7.38 (d, 1H), 7.27 (d, 1H), 7.07 (d, 1H), 6.84 (d, 1H), 6.82 (s, 2H), 6.25 (d, 1H), 5.59 (s, 2H), 4.36 (s, 2H), 3.97 (s, 3H), 3.65 (m, 32H), 3.20 (m, 4H), 2.71 (m, 2H), 1.55 (m, 2H), 1.32 (m, 2H), 1.21 (m, 2H), 0.89 (t, 3H)。LCMS [M+H] = 853.5。 實例14 (2R)-2-胺基-28-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-5-(羧甲基)-6,28-二側氧基-10,13,16,19,22,25-六氧雜-4-硫雜-7-氮雜二十八烷-1-酸(C-14a)及(28R)-28-胺基-1-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-25-羧基-1,23-二側氧基-4,7,10,13,16,19-六氧雜-26-硫雜-22-氮雜二十九烷-29-酸(C-14b)之合成遵循與實例4類似的程序製備(2R)-2-胺基-28-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-5-(羧甲基)-6,28-二側氧基-10,13,16,19,22,25-六氧雜-4-硫雜-7-氮雜二十八烷-1-酸(C-14a)及(28R)-28-胺基-1-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-25-羧基-1,23-二側氧基-4,7,10,13,16,19-六氧雜-26-硫雜-22-氮雜二十九烷-29-酸(C-14b),不同之處在於使用化合物(C-13)代替化合物(C-1),得到呈固體狀之呈HCl鹽形式之化合物(C-14a)與(C-14b)之混合物,該等化合物呈其相應非對映異構體(以下化合物(C-14aSR)、C-14aRR)、(C-14bRR)及(C-14bRR))形式(RP-HPLC純化之後,將產物溶解於乙腈中,用過量2N HCl處理且隨後凍乾):1 H NMR (CD3 OD): δ 7.47 (s, 1H), 7.39 (d, 1H), 7.13 (d, 1H), 6.82 (d, 1H), 6.25 (d, 1H), 5.58 (s, 2H), 4.38 (s, 2H), 4.32 (m, 1H), 4.00 (s, 3H), 3.77 (m, 4H), 3.76 (m, 4H), 3.64 (m, 28H), 3.55 (m, 5H), 3.31 (m, 4H), 3.12 (m, 1H), 2.86 (m, 1H), 2.72 (s, 2H), 2.62 (m, 1H), 1.54 (m, 2H), 1.31 (m, 2H), 1.20 (m, 2H), 0.89 (t, 3H)。LCMS [M+H] = 992.4。(2R,5S)-2-胺基-28-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-5-(羧甲基)-6,28-二側氧基-10,13,16,19,22,25-六氧雜-4-硫雜-7-氮雜二十八烷-1-酸(C-14aSR);(2R,5R)-2-胺基-28-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-5-(羧甲基)-6,28-二側氧基-10,13,16,19,22,25-六氧雜-4-硫雜-7-氮雜二十八烷-1-酸(C-14aRR);(25R,28R)-28-胺基-1-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-25-羧基-1,23-二側氧基-4,7,10,13,16,19-六氧雜-26-硫雜-22-氮雜二十九烷-29-酸(C-14bRR);(25S,28R)-28-胺基-1-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-25-羧基-1,23-二側氧基-4,7,10,13,16,19-六氧雜-26-硫雜-22-氮雜二十九烷-29-酸(C-14bSR)。 實例15 1-((1-(2-(2-(3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙氧基)乙氧基)乙基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)甲基)-1H-吡咯-2,5-二酮(C-15)之合成步驟1:遵循與實例1類似的程序製備1-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-(2-(2-疊氮基乙氧基)乙氧基)丙-1-酮,不同之處在於使用3-(2-(2-疊氮基乙氧基)乙氧基)丙酸代替3-(2,5-二側氧基-2,5-二氫-1H-吡咯-1-基)丙酸。 步驟2:向圓底燒瓶中裝入1-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-(2-(2-疊氮基乙氧基)乙氧基)丙-1-酮(1.0當量)、CuSO4 (0.25當量)、L-抗壞血酸鈉鹽(1.1當量)、1-(丙-2-炔-1-基)-1H-吡咯-2,5-二酮(2.2當量)及t - BuOH/水之混合物(1:1,v/v,0.012 M)。將反應混合物置放在真空下且隨後用N2 沖洗(將此再重複四次)。隨後在室溫下攪拌反應混合物2小時,且隨後藉由RP-HPLC (0.035% TFA於ACN中:0.05% TFA於H2 O中,C18管柱)純化粗反應混合物,得到呈固體狀之呈TFA鹽形式之1-((1-(2-(2-(3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙氧基)乙氧基)乙基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)甲基)-1H-吡咯-2,5-二酮(C-15):1 H NMR (CD3 OD): δ7.94 (s, 1H), 7.37 (d, 1H), 7.29 (s, 1H), 7.05 (d, 1H), 6.85 (s, 2H), 6.81 (d, 1H), 6.24 (d, 1H), 5.57 (s, 2H), 4.73 (s, 2H), 4.52 (t, 2H), 4.36 (s, 2H), 3.95 (s, 3H), 3.85 (t, 2H), 3.84 (m, 4H), 3.66 (t, 2H), 3.54 (m, 6H), 3.27 (m, 4H), 2.63 (t, 2H), 1.53 (m, 2H), 1.30 (m, 2H), 1.19 (m, 2H), 0.88 (t, 3H)。LCMS [M+H] = 758.4。 實例16 3-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-(((1-(2-(2-(3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙氧基)乙氧基)乙基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)甲基)胺基)-4-側氧基丁酸(C-16a)及2-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-(((1-(2-(2-(3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙氧基)乙氧基)乙基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)甲基)胺基)-4-側氧基丁酸(C-16b)之合成 遵循與實例4類似的程序製備3-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-(((1-(2-(2-(3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙氧基)乙氧基)乙基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)甲基)胺基)-4-側氧基丁酸(C-16a)及2-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-(((1-(2-(2-(3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙氧基)乙氧基)乙基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)甲基)胺基)-4-側氧基丁酸(C-16b),不同之處在於使用化合物(C-15)代替化合物(C-1),得到呈固體狀之呈TFA鹽形式之化合物(C-16a)與(C-16b)之混合物,該等化合物呈其相應非對映異構體(以下化合物(C-16aSR)、C-16aRR)、(C-16bRR)及(C-16bRR))形式。藉由RP-HPLC (0.035% TFA於ACN中:0.05% TFA於H2 O中,C18管柱)純化粗反應混合物:1 H NMR (CD3 OD): δ 7.91 (s, 1H), 7.36 (d, 1H), 7.30 (s, 1H), 7.06 (d, 1H), 6.80 (d, 1H), 6.24 (d, 1H), 5.57 (s, 2H), 4.54 (s, 2H), 4.44 (m, 2H), 4.34 (s, 2H), 4.25 (m, 1H), 3.95 (s, 3H), 4.83 (m, 6H), 3.68 (t, 2H), 3.55 (m, 6H), 3.25 (m, 2H), 2.86 (m, 1H), 2.64 (m, 2H), 1.53 (m, 2H), 1.30 (m, 2H), 1.19 (m, 2H), 0.88 (t, 3H)。LCMS [M+H] = 897.4(S)-3-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-(((1-(2-(2-(3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙氧基)乙氧基)乙基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)甲基)胺基)-4-側氧基丁酸(C-16aSR);(R)-3-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-(((1-(2-(2-(3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙氧基)乙氧基)乙基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)甲基)胺基)-4-側氧基丁酸(C-16aRR);(R)-2-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-(((1-(2-(2-(3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙氧基)乙氧基)乙基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)甲基)胺基)-4-側氧基丁酸(C-16bRR);(S)-2-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-(((1-(2-(2-(3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙氧基)乙氧基)乙基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)甲基)胺基)-4-側氧基丁酸(C-16bSR)。 實例17 N-(2-(2-(3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙氧基)乙氧基)乙基)-3-(2,5-二側氧基-2,5-二氫-1H-吡咯-1-基)丙醯胺(C-17)之合成遵循與實例1類似的程序製備N-(2-(2-(3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙氧基)乙氧基)乙基)-3-(2,5-二側氧基-2,5-二氫-1H-吡咯-1-基)丙醯胺(C-17),不同之處在於使用3-(2-(2-(3-(2,5-二側氧基-2,5-二氫-1H-吡咯-1-基)丙醯胺基)乙氧基)乙氧基)丙酸代替3-(2,5-二側氧基-2,5-二氫-1H-吡咯-1-基)丙酸,得到呈固體狀之呈TFA鹽形式之N-(2-(2-(3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙氧基)乙氧基)乙基)-3-(2,5-二側氧基-2,5-二氫-1H-吡咯-1-基)丙醯胺(C-17):1 H NMR (CD3 OD): δ 7.37 (d, 1H), 7.28 (d, 1H), 7.06 (d, 1H), 6.82 (d, 1H), 6.80 (s, 2H), 6.24 (d, 1H), 5.58 (s, 2H), 4.37 (s, 2H), 3.96 (s, 3H), 3.84 (m, 4H), 3.40 (m, 4H), 3.56 (m, 6H), 3.48 (t, 2H), 3.20 (m, 6H), 2.69 (t, 2H), 2.45 (t, 2H), 1.53 (m, 2H), 1.31 (m, 2H), 1.19 (m, 2H), 0.88 (t, 3H)。LCMS [M+H] = 748.4。 實例18 (19R)-19-胺基-1-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-16-(羧甲基)-1,11,15-三側氧基-4,7-二氧雜-17-硫雜-10,14-二氮雜二十烷-20-酸(C-18a)及(20R)-20-胺基-1-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-17-羧基-1,11,15-三側氧基-4,7-二氧雜-18-硫雜-10,14-二氮雜二十一烷-21-酸(C-18b)之合成遵循與實例4類似的程序製備(19R)-19-胺基-1-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-16-(羧甲基)-1,11,15-三側氧基-4,7-二氧雜-17-硫雜-10,14-二氮雜二十烷-20-酸(C-18a)及(20R)-20-胺基-1-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-17-羧基-1,11,15-三側氧基-4,7-二氧雜-18-硫雜-10,14-二氮雜二十一烷-21-酸(C-18b),不同之處在於使用化合物(C-17)代替化合物(C-1),得到呈固體狀之呈TFA鹽形式之化合物(C-18a)與(C-18b)之混合物,該等化合物呈其相應非對映異構體(以下化合物(C-18aSR)、C-18aRR)、(C-18bRR)及(C-18bRR))形式。藉由RP-HPLC (0.035% TFA於ACN中:0.05% TFA於H2 O中,C18管柱)純化粗反應混合物:1 H NMR (CD3 OD): δ 7.37 (d, 1H), 7.30 (s, 1H), 7.07 (d, 1H), 6.80 (d, 1H), 6.25 (d, 1H), 5.57(s, 2H), 4.35 (s, 2H), 4.19 (m, 1H), 3.95 (s, 3H), 3.89 (s, 3H), 3.76 (m, 3H), 3.60 (s, 4H), 3.53 (m, 4H), 3.41 (m, 1H), 3.36 (m, 2H), 3.22 (s, 2H), 2.70 (t, 2H), 2.42 (2H), 1.53 (m, 2H), 1.30 (m, 2H), 1.19 (m, 2H), 0.88 (t, 3H)。LCMS [M+H] = 887.4。(16S,19R)-19-胺基-1-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-16-(羧甲基)-1,11,15-三側氧基-4,7-二氧雜-17-硫雜-10,14-二氮雜二十烷-20-酸(C-18aSR);(16R,19R)-19-胺基-1-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-16-(羧甲基)-1,11,15-三側氧基-4,7-二氧雜-17-硫雜-10,14-二氮雜二十烷-20-酸(C-18aRR);(17R,20R)-20-胺基-1-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-17-羧基-1,11,15-三側氧基-4,7-二氧雜-18-硫雜-10,14-二氮雜二十一烷-21-酸(C-18bRR);(17S,20R)-20-胺基-1-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-17-羧基-1,11,15-三側氧基-4,7-二氧雜-18-硫雜-10,14-二氮雜二十一烷-21-酸(C-18bSR)。 實例195-(4-((4-(3-胺丙基)哌嗪-1-基)甲基)-2-甲氧基苯甲基)-N4-戊基-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-2,4-二胺(C-19)之合成藉由兩步順序製備5-(4-((4-(3-胺丙基)哌嗪-1-基)甲基)-2-甲氧基苯甲基)-N4-戊基-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-2,4-二胺(C-19)。在第一步驟中,向圓底燒瓶中裝入5-(2-甲氧基-5-(哌嗪-1-基甲基)苯甲基)-N4-戊基-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-2,4-二胺(Int-1,1.0當量)、(3-溴丙基)胺基甲酸第三丁酯(1.2當量)、許尼希氏鹼(2.4當量)及DMF (0.2 M)。將反應混合物加熱至60℃,且隨後攪拌18小時。隨後將粗反應混合物冷卻至室溫且藉由ISCO層析(0%至20% MeOH:DCM)純化,得到中間物(3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)丙基)胺基甲酸第三丁酯。在第二步驟中,使用與(Int-1)之合成中的最後一個步驟類似的程序獲得呈固體狀之5-(4-((4-(3-胺丙基)哌嗪-1-基)甲基)-2-甲氧基苯甲基)-N4-戊基-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-2,4-二胺(C-19):1H NMR (CD3OD): δ 7.24 (d, 1H), 7.10 (d, 1H), 6.85 (d, 1H), 6.57 (d, 1H), 6.11 (s, 1H), 5.42 (s, 2H), 3.95 (s, 3H), 3.52 (s, 2H), 3.35 (m, 2H), 2.80 (t, 2H), 2.51 (m, 4H), 2.45 (m, 4H), 1.72 (m, 2H), 1.40 (m, 2H), 1.28 (m, 4H), 1.15 (m, 2H), 0.88 (t, 3H)。LRMS [M+H] = 495.3。 實例201-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-(2-(2-胺基乙氧基)乙氧基)丙-1-酮(C-20)之合成遵循實例19之程序製備1-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-(2-(2-胺基乙氧基)乙氧基)丙-1-酮(C-20),不同之處在於使用2,2-二甲基-4-側氧基-3,8,11-三氧雜-5-氮雜十四烷-14-酸代替(3-溴丙基)胺基甲酸第三丁酯,得到呈固體狀之1-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-(2-(2-胺基乙氧基)乙氧基)丙-1-酮(C-20):1 H NMR (CD3 OD): δ 7.24 (d, 1H), 7.11 (s, 1H), 6.86 (d, 1H), 6.57 (d, 1H), 6.12 (d, 1H), 5.42 (s, 2H), 3.96 (s, 3H), 3.76 (t, 2H), 3.59 (m, 12H), 3.37 (t, 2H), 2.76 (t, 2H), 2.66 (t, 2H), 2.45 (m, 4H), 1.41 (m, 2H), 1.28 (m, 2H), 1.16 (m, 2H), 0.89 (t, 3H)。LRMS [M+H] = 597.4。 實例21 N-(2-(2-(3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙氧基)乙氧基)乙基)-2-(2,5-二側氧基-2,5-二氫-1H-吡咯-1-基)乙醯胺(C-21)之合成向圓底燒瓶中裝入1-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-(2-(2-胺基乙氧基)乙氧基)丙-1-酮(C-20) (1.0當量)、DIEA (10.0當量)及DMF (0.004 M),且在室溫下攪拌混合物15分鐘。隨後向獨立燒瓶中裝入2-(2,5-二側氧基-2,5-二氫-1H-吡咯-1-基)乙酸2,5-二側氧基吡咯啶-1-基酯(1.5當量)、DIEA (10.0當量)及DMF (0.006 M)。亦在室溫下攪拌此混合物15分鐘,且隨後混合兩種溶液且在室溫下攪拌反應混合物1小時。藉由RP-HPLC (0.035% TFA於ACN中:0.05% TFA於H2 O中,C18管柱)純化粗反應混合物,得到呈固體狀之呈TFA鹽形式之N-(2-(2-(3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙氧基)乙氧基)乙基)-2-(2,5-二側氧基-2,5-二氫-1H-吡咯-1-基)乙醯胺(C-21):1 H NMR (CD3 CN): d 7.30 (d, 1H), 7.05 (s, 1H), 6.98 (s, 1H), 6.86 (d, 1H), 6.82 (s, 2H), 6.74 (s, 1H), 6.68 (d, 1H), 6.21 (d, 1H), 6.08 (t, 1H), 5.38 (s, 2H), 4.08 (s, 2H), 3.89 (s, 3H), 3.70 (t, 2H), 3.41 (m, 14H), 3.29 (m, 2H), 2.55, (t, 2H), 2.38 (m, 4H), 1.41 (m, 2H), 1.26 (m, 2H), 1.13 (m, 2H), 0.85 (t, 3H)。LCMS [M+H] = 734.4。 實例22 (2R)-2-胺基-19-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-5-(羧甲基)-6,9,19-三側氧基-13,16-二氧雜-4-硫雜-7,10-二氮雜十九烷-1-酸(C-22a)及(19R)-19-胺基-1-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-16-羧基-1,11,14-三側氧基-4,7-二氧雜-17-硫雜-10,13-二氮雜二十烷-20-酸(C-22b)之合成遵循與實例4類似的程序製備(2R)-2-胺基-19-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-5-(羧甲基)-6,9,19-三側氧基-13,16-二氧雜-4-硫雜-7,10-二氮雜十九烷-1-酸(C-22a)及(19R)-19-胺基-1-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-16-羧基-1,11,14-三側氧基-4,7-二氧雜-17-硫雜-10,13-二氮雜二十烷-20-酸(C-22b),不同之處在於使用化合物(C-21)代替化合物(C-1),得到呈固體狀之呈TFA鹽形式之化合物(C-22a)與(C-22b)之混合物,該等化合物呈其相應非對映異構體(以下化合物(C-22aSR)、C-22aRR)、(C-22bRR)及(C-22bRR))形式。藉由RP-HPLC (0.035% TFA於ACN中:0.05% TFA於H2 O中,C18管柱)純化粗反應混合物:1 H NMR (CD3 OD): δ 7.37 (d, 1H), 7.32 (s, 1H), 7.08 (d, 1H), 6.81 (d, 1H), 6.24 (d, 1H), 5.57(s, 2H), 4.34 (s, 2H), 4.20 (m, 1H), 3.96 (s, 3H), 3.82 (m, 9H), 3.56 (m, 9H), 3.38 (m, 3H), 3.21 (m, 2H), 2.70 (t, 2H), 1.54 (m, 2H), 1.32 (m, 2H), 1.19 (m, 2H), 0.89 (t, 3H)。LCMS [M+H] = 873.4。(2R,5S)-2-胺基-19-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-5-(羧甲基)-6,9,19-三側氧基-13,16-二氧雜-4-硫雜-7,10-二氮雜十九烷-1-酸(C-22aSR);(2R,5R)-2-胺基-19-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-5-(羧甲基)-6,9,19-三側氧基-13,16-二氧雜-4-硫雜-7,10-二氮雜十九烷-1-酸(C-22aRR);(16R,19R)-19-胺基-1-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-16-羧基-1,11,14-三側氧基-4,7-二氧雜-17-硫雜-10,13-二氮雜二十烷-20-酸(C-22bRR);(16S,19R)-19-胺基-1-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-16-羧基-1,11,14-三側氧基-4,7-二氧雜-17-硫雜-10,13-二氮雜二十烷-20-酸(C-22bSR)。 實例23 4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)-N-(2-(2-(2-(2-(4-((2,5-二側氧基-2,5-二氫-1H-吡咯-1-基)甲基)-1H-1,2,3-三唑-1-基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙基)哌嗪-1-甲醯胺(C-23)之合成向圓底燒瓶中裝入5-(2-甲氧基-5-(哌嗪-1-基甲基)苯甲基)-N4-戊基-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-2,4-二胺(Int-1,1當量)、(2-(2-(2-(2-(4-((2,5-二側氧基-2,5-二氫-1H-吡咯-1-基)甲基)-1H-1,2,3-三唑-1-基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙基)胺基甲酸4-硝基苯酯(0.9當量)、三乙胺(3.0當量)及DMSO (0.01 M)。在室溫下攪拌反應混合物2小時,且隨後藉由RP-HPLC (0.035% TFA於ACN中:0.05% TFA於H2 O中,C18管柱)純化粗反應混合物,得到呈固體狀之呈TFA鹽形式之4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)-N-(2-(2-(2-(2-(4-((2,5-二側氧基-2,5-二氫-1H-吡咯-1-基)甲基)-1H-1,2,3-三唑-1-基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙基)哌嗪-1-甲醯胺(C-23):1 H NMR (CD3 OD): δ 7.96 (s, 1H), 7.36 (d, 1H), 7.26 (d, 1H), 7.05 (d, 1H), 6.85 (s, 2H), 6.79 (d, 1H), 6.24 (d, 1H), 5.57 (s, 2H), 4.74 (s, 2H), 4.53 (t, 2H), 4.35 (s, 2H), 3.95 (s, 3H), 3.86 (t, 2H), 3.85 (m, 4H), 3.54 (m, 12H), 3.22 (m, 6H), 1.53 (m, 2H), 1.30 (m, 2H), 1.19 (m, 2H), 0.88 (t, 3H)。LCMS [M+H] = 817.4。 附註:(2-(2-(2-(2-(4-((2,5-二側氧基-2,5-二氫-1H-吡咯-1-基)甲基)-1H-1,2,3-三唑-1-基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙基)胺基甲酸4-硝基苯酯係使用以下程序製備: 步驟1:將三乙胺(2.5當量)及二碳酸二第三丁酯(1.1當量)添加至2-(2-(2-(2-疊氮基乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙胺(1.0當量)於CH2 Cl2 (0.05 M)中之溶液中且在室溫下攪拌反應混合物30分鐘。隨後真空濃縮反應混合物且使用RP-C18 ISCO純化殘餘物,且隨後加以凍乾,得到(2-(2-(2-(2-疊氮基乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙基)胺基甲酸第三丁酯。 步驟2:用N2 氣體沖洗(2-(2-(2-(2-疊氮基乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙基)胺基甲酸第三丁酯(1當量)及1-(丙-2-炔-1-基)-1H-吡咯-2,5-二酮(2.0當量)於t - BuOH (0.08 M)中之溶液五次,且隨後添加L-抗壞血酸鈉鹽(1.0當量,0.16 M於H2 O中)及CuSO4 (0.2當量,0.03 M於H2 O中)。用N2 氣體再沖洗反應混合物五次,且隨後在室溫下攪拌4小時。隨後藉由ISCO RP-C18純化反應混合物且加以凍乾,得到(2-(2-(2-(2-(4-((2,5-二側氧基-2,5-二氫-1H-吡咯-1-基)甲基)-1H-1,2,3-三唑-1-基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙基)胺基甲酸第三丁酯。 步驟3:真空濃縮(2-(2-(2-(2-(4-((2,5-二側氧基-2,5-二氫-1H-吡咯-1-基)甲基)-1H-1,2,3-三唑-1-基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙基)胺基甲酸第三丁酯於TFA (0.02 M)中之溶液,得到1-((1-(23-胺基-3,6,9,12,15,18,21-七氧雜二十三烷基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)甲基)-1H-吡咯-2,5-二酮。LCMS [M+H] = 354.2。 步驟4:將氯甲酸4-硝基苯酯(1.10當量)及三乙胺(2.50當量)添加至1-((1-(2-(2-(2-(2-胺基乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)甲基)-1H-吡咯-2,5-二酮(1當量)於CH2 Cl2 (0.01 M)中之溶液中,且在室溫下攪拌反應混合物10分鐘。隨後真空濃縮反應混合物,藉由RP-C18 ISCO純化且隨後加以凍乾,得到基(2-(2-(2-(2-(4-((2,5-二側氧基-2,5-二氫-1H-吡咯-1-基)甲基)-1H-1,2,3-三唑-1-基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙基)胺基甲酸4-硝基苯酯。LCMS [M+H] = 519.2。 實例24 3-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-(((1-(1-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-1-側氧基-5,8,11-三氧雜-2-氮雜十三烷-13-基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)甲基)胺基)-4-側氧基丁酸(C-24a)及2-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-(((1-(1-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-1-側氧基-5,8,11-三氧雜-2-氮雜十三烷-13-基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)甲基)胺基)-4-側氧基丁酸(C-24b)之合成遵循與實例4類似的程序製備3-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-(((1-(1-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-1-側氧基-5,8,11-三氧雜-2-氮雜十三烷-13-基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)甲基)胺基)-4-側氧基丁酸(C-24a)及2-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-(((1-(1-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-1-側氧基-5,8,11-三氧雜-2-氮雜十三烷-13-基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)甲基)胺基)-4-側氧基丁酸(C-24b),不同之處在於使用化合物(C-23)代替化合物(C-1),得到呈固體狀之呈TFA鹽形式之化合物(C-24a)與(C-24b)之混合物,該等化合物呈其相應非對映異構體(以下化合物(C-24aSR)、C-24aRR)、(C-24bRR)及(C-24bRR))形式。藉由RP-HPLC (0.035% TFA於ACN中:0.05% TFA於H2 O中,C18管柱)純化粗反應混合物:LCMS [M+H] = 956.4。(S)-3-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-(((1-(1-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-1-側氧基-5,8,11-三氧雜-2-氮雜十三烷-13-基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)甲基)胺基)-4-側氧基丁酸(C-24aSR);(R)-3-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-(((1-(1-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-1-側氧基-5,8,11-三氧雜-2-氮雜十三烷-13-基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)甲基)胺基)-4-側氧基丁酸(C-24aRR);(R)-2-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-(((1-(1-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-1-側氧基-5,8,11-三氧雜-2-氮雜十三烷-13-基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)甲基)胺基)-4-側氧基丁酸(C-24bRR);(S)-2-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-(((1-(1-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-1-側氧基-5,8,11-三氧雜-2-氮雜十三烷-13-基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)甲基)胺基)-4-側氧基丁酸(C-24bSR)。 實例25 1-(2-(2-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)乙氧基)乙基)-1H-吡咯-2,5-二酮(C-25)之合成向圓底燒瓶中裝入5-(2-甲氧基-5-(哌嗪-1-基甲基)苯甲基)-N4-戊基-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-2,4-二胺(Int-1,1.0當量)、2-(2-(2,5-二側氧基-2,5-二氫-1H-吡咯-1-基)乙氧基)乙醛(4.0當量)、氰基硼氫化鈉(13.0當量)及MeOH (0.04 M)。在室溫下攪拌反應混合物1小時。隨後藉由RP-HPLC (0.035% TFA於ACN中:0.05% TFA於H2 O中,C18管柱)純化粗反應混合物,得到呈固體狀之呈TFA鹽形式之1-(2-(2-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)乙氧基)乙基)-1H-吡咯-2,5-二酮(C-25):1 H NMR (CD3 OD): δ 7.36 (d, 1H), 7.16 (d, 1H), 6.96 (d, 1H), 6.83 (s, 2H), 6.76 (d, 1H), 6.23 (d, 1H), 5.53 (s, 2H), 3.93 (s, 3H), 3.84 (s, 2H), 3.78 (m, 2H), 3.71 (m, 2H), 3.64 (m, 2H), 3.54 (m, 2H), 3.35 (m, 4H), 3.27 (t, 2H), 2.95 (m, 4H), 1.52 (m, 2H), 1.30 (m, 2H), 1.19 (m, 2H), 0.88 (t, 3H)。LCMS [M+H] = 605.4。 附註:2-(2-(2,5-二側氧基-2,5-二氫-1H-吡咯-1-基)乙氧基)乙醛係藉由將1-(2-(2-羥基乙氧基)乙基)-1H-吡咯-2,5-二酮(1.0當量)、戴斯-馬丁高碘烷(1.5當量)及DCM (0.1 M)添加至圓底燒瓶中且在室溫下攪拌反應混合物2小時而製備。隨後過濾反應混合物,真空移除揮發物且產物不經進一步純化即使用。 實例26 3-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-((2-(2-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)乙氧基)乙基)胺基)-4-側氧基丁酸(C-26a)及2-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-((2-(2-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)乙氧基)乙基)胺基)-4-側氧基丁酸(C-26b)之合成遵循與實例4類似的程序製備3-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-((2-(2-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)乙氧基)乙基)胺基)-4-側氧基丁酸(C-26)及2-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-((2-(2-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)乙氧基)乙基)胺基)-4-側氧基丁酸(C-26b),不同之處在於使用化合物(C-25)代替化合物(C-1),得到呈固體狀之呈TFA鹽形式之化合物(C-26a)與(C-26b)之混合物,該等化合物呈其相應非對映異構體(以下化合物(C-26aSR)、C-26aRR)、(C-26bRR)及(C-26bRR))形式。藉由RP-HPLC (0.035% TFA於ACN中:0.05% TFA於H2 O中,C18管柱)純化粗反應混合物:LCMS [M+H] = 744.4(S)-3-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-((2-(2-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)乙氧基)乙基)胺基)-4-側氧基丁酸(C-26aSR);(R)-3-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-((2-(2-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)乙氧基)乙基)胺基)-4-側氧基丁酸(C-26aRR);(R)-2-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-((2-(2-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)乙氧基)乙基)胺基)-4-側氧基丁酸(C-26bRR);(S)-2-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-((2-(2-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)乙氧基)乙基)胺基)-4-側氧基丁酸(C-26bSR)。 實例27 1-((1-(2-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)乙基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)甲基)-1H-吡咯-2,5-二酮(C-27)之合成步驟1:向圓底燒瓶中裝入5-(2-甲氧基-5-(哌嗪-1-基甲基)苯甲基)-N4-戊基-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-2,4-二胺(Int-1,1.0當量)、2-疊氮基乙醛(4.0當量)、氰基硼氫化鈉(32.0當量)及MeOH (0.02 M)。在室溫下攪拌反應混合物2小時。隨後藉由RP-HPLC (0.035% TFA於ACN中:0.05% TFA於H2 O中,C18管柱)純化粗反應混合物,得到呈固體狀之5-(4-((4-(2-疊氮基乙基)哌嗪-1-基)甲基)-2-甲氧基苯甲基)-N4-戊基-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-2,4-二胺:LCMS [M+H] = 507.3。 步驟2:向圓底燒瓶中裝入5-(4-((4-(2-疊氮基乙基)哌嗪-1-基)甲基)-2-甲氧基苯甲基)-N4-戊基-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-2,4-二胺(1.0當量)、1-(丙-2-炔-1-基)-1H-吡咯-2,5-二酮(2.3當量)及t -BuOH與水之混合物(2:1,v/v,0.008 M)。在真空下使反應混合物脫氣且用N2 沖洗五次以移除O2 。使用注射器將L-抗壞血酸鈉鹽(1.1當量於0.5 ml H2 O中,在下脫氣且用N2 沖洗五次以移除O2 )添加至反應混合物,且隨後使用注射器添加CuSO4 (0.2當量於0.5 ml水中,在真空下脫氣且用N2 沖洗五次以移除O2 )。隨後在室溫下攪拌反應混合物2小時。隨後藉由RP-HPLC (0.035% TFA於ACN中:0.05% TFA於H2 O中,C18管柱)純化粗反應混合物,得到呈固體狀之呈TFA鹽形式之1-((1-(2-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)乙基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)甲基)-1H-吡咯-2,5-二酮(C-27):1 H NMR (CD3 OD): δ 7.95 (s, 1H), 7.36 (d, 1H), 7.22 (d, 1H), 7.02 (d, 1H), 6.86 (s, 2H), 6.79 (d, 1H), 6.23 (d, 1H), 5.57 (s, 2H), 4.76 (s, 2H), 4.52 (t, 2H), 4.26 (s, 2H), 3.95 (s, 3H), 3.54 (t, 2H), 2.85 (m, 8H), 2.94 (t, 2H), 1.53 (m, 2H), 1.31 (m, 2H), 1.18 (m, 2H), 0.88 (t, 3H)。LCMS [M+H] = 642.4。 附註:藉由將2-疊氮基乙醇(1.0當量)、戴斯-馬丁高碘烷(1.5當量)及DCM (0.20 M)添加至圓底燒瓶中來製備2-疊氮基乙醛,且隨後在室溫下攪拌反應混合物2小時。隨後過濾反應混合物,真空移除揮發物且產物不經進一步純化即使用。 實例28 3-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-(((1-(2-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)乙基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)甲基)胺基)-4-側氧基丁酸(C-28a)及2-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-(((1-(2-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)乙基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)甲基)胺基)-4-側氧基丁酸(C-28b)之合成遵循與實例4類似的程序製備3-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-(((1-(2-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)乙基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)甲基)胺基)-4-側氧基丁酸(C-28a)及2-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-(((1-(2-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)乙基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)甲基)胺基)-4-側氧基丁酸(C-28b),不同之處在於使用化合物(C-27)代替化合物(C-1),得到呈固體狀之呈TFA鹽形式之化合物(C-28a)與(C-28b)之混合物,該等化合物呈其相應非對映異構體(以下化合物(C-28aSR)、C-28aRR)、(C-28bRR)及(C-28bRR))形式。藉由RP-HPLC (0.035% TFA於ACN中:0.05% TFA於H2 O中,C18管柱)純化粗反應混合物:LCMS [M+H] = 781.4(S)-3-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-(((1-(2-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)乙基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)甲基)胺基)-4-側氧基丁酸(C-28aSR);(R)-3-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-(((1-(2-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)乙基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)甲基)胺基)-4-側氧基丁酸(C-28aRR);(R)-2-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-(((1-(2-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)乙基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)甲基)胺基)-4-側氧基丁酸(C-28bRR);(S)-2-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-(((1-(2-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)乙基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)甲基)胺基)-4-側氧基丁酸(C-28bSR)。 實例29 N-(21-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-21-側氧基-3,6,9,12,15,18-六氧雜二十一烷基)-3-(2,5-二側氧基-2,5-二氫-1H-吡咯-1-基)丙醯胺(C-29)之合成遵循與實例1類似的程序製備N-(21-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-21-側氧基-3,6,9,12,15,18-六氧雜二十一烷基)-3-(2,5-二側氧基-2,5-二氫-1H-吡咯-1-基)丙醯胺(C-29),不同之處在於使用1-(2,5-二側氧基-2,5-二氫-1H-吡咯-1-基)-3-側氧基-7,10,13,16,19,22-六氧雜-4-氮雜二十五烷-25-酸代替3-(2,5-二側氧基-2,5-二氫-1H-吡咯-1-基)丙酸,得到呈固體狀之呈TFA鹽形式之N-(21-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-21-側氧基-3,6,9,12,15,18-六氧雜二十一烷基)-3-(2,5-二側氧基-2,5-二氫-1H-吡咯-1-基)丙醯胺(C-29):1 H NMR (DMSO): d 8.00 (t, 1H), 7.42 (d, 1H), 7.38 (s, 3H), 7.20 (s, 1H), 7.00 (s, 2H), 6.95 (s, 1H), 6.57 (s, 1H), 6.23 (d, 1H), 5.57 (s, 2H), 4.30 (s, 2H), 3.87 (s, 3H), 3.59 (m, 4H), 3.49 (m, 28H), 3.35 (t, 2H), 3.14 (m, 2H), 2.32 (m, 2H), 1.45 (m, 2H), 1.21 (m, 2H), 1.09 (m, 2H), 0.81 (t, 3H)。LRMS [M+H] = 924.4。 實例30 4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-甲酸4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-二側氧基-2,5-二氫-1H-吡咯-1-基)乙氧基)丙醯胺基)-3-甲基丁醯胺基)-5-脲基戊醯胺基)苯甲酯(C-30)之合成步驟1:向圓底燒瓶中裝入5-(2-甲氧基-5-(哌嗪-1-基甲基)苯甲基)-N4-戊基-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-2,4-二胺(Int-1,1.0當量)、HOAT (2.0當量)、許尼希氏鹼(14.0當量)、(9H-茀-9-基)甲基((S)-3-甲基-1-(((S)-1-((4-((((4-硝基苯氧基)羰基)氧基)甲基)苯基)胺基)-1-側氧基-5-脲基戊-2-基)胺基)-1-側氧基丁-2-基)胺基甲酸酯(1.2當量)及吡啶:DMF (1:4,0.02 M)。在室溫下攪拌反應混合物4小時,且隨後藉由RP-HPLC (0.035% TFA於ACN中:0.05% TFA於H2 O中,C18管柱)純化粗反應混合物,得到呈固體狀之4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-甲酸4-((S)-2-((S)-2-((((9H-茀-9-基)甲氧基)羰基)胺基)-3-甲基丁醯胺基)-5-脲基戊醯胺基)苯甲酯:LCMS [M+H] = 1065.5。 步驟2:將4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-甲酸4-((S)-2-((S)-2-((((9H-茀-9-基)甲氧基)羰基)胺基)-3-甲基丁醯胺基)-5-脲基戊醯胺基)苯甲酯溶解於DMF (0.007 M)中且添加哌啶(100.0當量)。在室溫下攪拌反應30分鐘。隨後藉由RP-HPLC (0.035% TFA於ACN中:0.05% TFA於H2 O中,C18管柱)純化粗反應混合物,得到呈固體狀之4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-甲酸4-((S)-2-((S)-2-胺基-3-甲基丁醯胺基)-5-脲基戊醯胺基)苯甲酯:LCMS [M+H] = 843.5。 步驟3:向圓底燒瓶中裝入4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-甲酸4-((S)-2-((S)-2-胺基-3-甲基丁醯胺基)-5-脲基戊醯胺基)苯甲酯(1.0當量)、3-(2-(2,5-二側氧基-2,5-二氫-1H-吡咯-1-基)乙氧基)丙酸(1.1當量)、許尼希氏鹼(5.0當量)、HATU (1.05當量)及DMF (0.004 M)。在室溫下攪拌反應混合物2小時。隨後藉由RP-HPLC (0.035% TFA於ACN中:0.05% TFA於H2 O中,C18管柱)純化粗反應混合物,得到呈固體狀之呈TFA鹽形式之4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-甲酸4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-二側氧基-2,5-二氫-1H-吡咯-1-基)乙氧基)丙醯胺基)-3-甲基丁醯胺基)-5-脲基戊醯胺基)苯甲酯(C-30):LCMS [M+H] = 1038.5。 實例31 (2R,3R,4R,5S)-6-(4-(((4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-羰基)氧基)甲基)-2-(3-(3-(2,5-二側氧基-2,5-二氫-1H-吡咯-1-基)丙醯胺基)丙醯胺基)苯氧基)-3,4,5-三羥基四氫-2H-哌喃-2-甲酸(C-31)之合成步驟1:向圓底燒瓶中裝入5-(2-甲氧基-4-(哌嗪-1-基甲基)苯甲基)-N4-戊基-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-2,4-二胺(Int-1,1.0當量)、HOAT(2.0當量)、許尼希氏鹼(14.0當量)、三乙酸(3S,4R,5R,6R)-2-(2-(3-((((9H-茀-9-基)甲氧基)羰基)胺基)丙醯胺基)-4-((((4-硝基苯氧基)羰基)氧基)甲基)苯氧基)-6-(甲氧基羰基)四氫-2H-哌喃-3,4,5-三基酯(1.2當量)及吡啶:DMF (1:4,0.015 M)。在室溫下攪拌反應混合物4小時。隨後藉由RP-HPLC (0.035% TFA於ACN中:0.05% TFA於H2 O中,C18管柱)純化粗反應混合物,得到呈固體狀之三乙酸(3S,4R,5R,6R)-2-(2-(3-((((9H-茀-9-基)甲氧基)羰基)胺基)丙醯胺基)-4-(((4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-羰基)氧基)甲基)苯氧基)-6-(甲氧基羰基)四氫-2H-哌喃-3,4,5-三基酯:LCMS [M+H] = 1212.4。 步驟2:將三乙酸(3S,4R,5R,6R)-2-(2-(3-((((9H-茀-9-基)甲氧基)羰基)胺基)丙醯胺基)-4-(((4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-羰基)氧基)甲基)苯氧基)-6-(甲氧基羰基)四氫-2H-哌喃-3,4,5-三基酯(1.0當量)溶解於MeOH、THF及水(2:1:0.4) (0.005 M)中。隨後添加LiOH (8.0當量)且在室溫下攪拌反應2小時。隨後藉由RP-HPLC (0.035% TFA於ACN中:0.05% TFA於H2 O中,C18管柱)純化粗反應混合物,得到呈固體狀之(2R,3R,4R,5S)-6-(4-(((4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-羰基)氧基)甲基)-2-(3-胺基丙醯胺基)苯氧基)-3,4,5-三羥基四氫-2H-哌喃-2-甲酸:LCMS [M+H] = 850.4。 步驟3:向圓底燒瓶中裝入(2R,3R,4R,5S)-6-(4-(((4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-羰基)氧基)甲基)-2-(3-胺基丙醯胺基)苯氧基)-3,4,5-三羥基四氫-2H-哌喃-2-甲酸(1.0當量)、3-(2,5-二側氧基-2,5-二氫-1H-吡咯-1-基)丙酸(2.0當量)、許尼希氏鹼(6.0當量)、HBTU (1.8當量)及DMF (0.003 M)。在室溫下持續攪拌反應15分鐘。在室溫下攪拌反應混合物2小時。隨後藉由RP-HPLC (0.035% TFA於ACN中:0.05% TFA於H2 O中,C18管柱)純化粗反應混合物,得到呈固體狀之呈TFA鹽形式之(2R,3R,4R,5S)-6-(4-(((4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-羰基)氧基)甲基)-2-(3-(3-(2,5-二側氧基-2,5-二氫-1H-吡咯-1-基)丙醯胺基)丙醯胺基)苯氧基)-3,4,5-三羥基四氫-2H-哌喃-2-甲酸(C-31):LCMS [M+H] = 1001.3。 實例32 (S)-1-(3-(4-(3-((2-胺基-4-((1-羥基己-2-基)胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-4-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙基)-1H-吡咯-2,5-二酮(C-32)之合成遵循與實例1類似的程序製備(S)-1-(3-(4-(3-((2-胺基-4-((1-羥基己-2-基)胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-4-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙基)-1H-吡咯-2,5-二酮(C-32),不同之處在於使用化合物(Int-2)代替化合物(Int-1),得到呈固體狀之呈TFA鹽形式之(S)-1-(3-(4-(3-((2-胺基-4-((1-羥基己-2-基)胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-4-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙基)-1H-吡咯-2,5-二酮(C-32):1 H NMR (CD3 OD): δ 7.49 (d, 2H), 7.21 (d, 1H), 6.82 (s, 2H), 6.77 (d, 1), 6.28 (d, 1H), 5.67 (d, 1H), 5.51 (d, 1H), 4.36 (m, 1H), 4.18 (s, 2H), 3.98 (s, 3H), 3.76 (t, 2H), 3.54 (dd, 1H), 3.46 (dd, 1H), 3.16 (m, 4H), 3.05 (m, 4H), 2.71 (t, 2H), 1.48 (m, 1H), 1.26 (m, 3H), 1.05 (m, 1H), 0.84 (t, 3H)。LRMS [M+H] = 619.4。 實例33 1-(3-(4-(3-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-4-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙基)-1H-吡咯-2,5-二酮(C-33)之合成遵循與實例1類似的程序製備1-(3-(4-(3-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-4-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙基)-1H-吡咯-2,5-二酮(C-33),不同之處在於使用化合物(Int-3)代替化合物(Int-1),得到呈固體狀之呈TFA鹽形式之1-(3-(4-(3-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-4-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙基)-1H-吡咯-2,5-二酮(C-33)。LRMS [M+H] = 589.3。 實例34 3-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-((3-(4-(3-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-4-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙基)胺基)-4-側氧基丁酸(C-34a)及2-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-((3-(4-(3-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-4-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙基)胺基)-4-側氧基丁酸(C-34b)之合成遵循與實例4類似的程序製備3-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-((3-(4-(3-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-4-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙基)胺基)-4-側氧基丁酸(C-34)及2-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-((3-(4-(3-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-4-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙基)胺基)-4-側氧基丁酸(C-34b),不同之處在於使用化合物(C-33)代替化合物(C-1),得到呈固體狀之呈TFA鹽形式之化合物(C-34a)與(C-34b)之混合物,該等化合物呈其相應非對映異構體(以下化合物(C-34aSR)、C-34aRR)、(C-34bRR)及(C-34bRR))形式。藉由RP-HPLC (0.035% TFA於ACN中:0.05% TFA於H2 O中,C18管柱)純化粗反應混合物:1 H NMR (DMSO): d 7.51 (s, 2H), 7.39 (m, 2H), 7.27 (d, 1H), 7.15 (d, 1H), 6.59 (s, 1H), 6.22 (t, 1H), 5.56 (s, 2H), 3.86 (s, 4H), 3.66 (m, 3H), 3.42 (m, 8H), 3.25 (m, 4H), 3.08 (m, 2H), 2.81 (m, 3H), 2.65 (m, 1H), 1.43 (m, 2H), 1.22 (m, 3H), 1.07 (m, 2H), 0.83 (t, 3H)。LCMS [M+H]= 728.3(S)-3-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-((3-(4-(3-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-4-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙基)胺基)-4-側氧基丁酸(C-34aSR);(R)-3-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-((3-(4-(3-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-4-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙基)胺基)-4-側氧基丁酸(C-34aRR);(R)-2-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-((3-(4-(3-((2-胺基-4-(戊基胺基)5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-4-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙基)胺基)-4-側氧基丁酸(C-34bRR);(S)-2-(((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)-4-((3-(4-(3-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-4-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙基)胺基)-4-側氧基丁酸(C-34bSR)。 實例35 1-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-2-(胺氧基)乙酮(C-35)之合成步驟1:向圓底燒瓶中裝入5-(2-甲氧基-5-(哌嗪-1-基甲基)苯甲基)-N4-戊基-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-2,4-二胺(Int-1,1.0當量)、2-(((第三丁氧基羰基)胺基)氧基)乙酸(1.1當量)、HATU (1.05當量)、許尼希氏鹼(5.0當量)及DMF (0.2 M)。在室溫下攪拌反應混合物18小時,且隨後藉由ISCO層析(0%至20% MeOH:DCM)純化粗反應混合物,得到2-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-2-氧代乙氧基胺基甲酸第三丁酯。 步驟2:在0℃下將HCl (20.0當量,4M於二噁烷中)添加至裝有2-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-2-氧代乙氧基胺基甲酸第三丁酯(1.0當量)及DCM (0.1 M)的圓底燒瓶中。移除冰浴且在室溫下攪拌反應混合物3小時。真空移除揮發物。將MeOH (具有8% NH4 OH)添加至所得殘餘物中且真空移除揮發物。將此再重複2次。隨後藉由ISCO層析(0%至10% MeOH (8% NH4 OH):DCM)純化粗反應混合物,得到呈固體狀之1-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-2-(胺氧基)乙酮(C-35):1 H NMR (CDCl3 ): d 7.12 (d, 1H), 7.00 (s, 1H), 6.90 (s, 1H), 6.69 (d, 1H), 6.38 (d, 1H), 5.52 (t, 1H), 5.30 (s, 2H), 4.35 (s, 2H), 3.94 (s, 3H), 3.64 (s, 2H), 3.52 (m, 2H), 3.38 (m, 4H), 2.44 (m, 4H), 1.62 (s, 2H), 1.45 (m, 2H), 1.38 (m, 2H), 1.25 (m, 2H), 1.12 (m, 2H), 0.87 (t, 3H)。LRMS [M+H] = 511.4。 實例36 1-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-(2-胺基乙氧基)丙-1-酮(C-36)之合成遵循與實例35類似的程序製備1-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-(2-胺基乙氧基)丙-1-酮(C-36),不同之處在於使用3-(2-((第三丁氧基羰基)胺基)乙氧基)丙酸代替2-(((第三丁氧基羰基)胺基)氧基)乙酸,得到呈固體狀之1-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-(2-胺基乙氧基)丙-1-酮(C-36):1 H NMR (CD3 OD): δ 7.26 (d, 1H), 7.09 (d, 1H), 6.86 (d, 1H), 6.59 (d, 1H), 6.13 (d, 1H), 5.43 (s, 2H), 4.57 (s, 2H), 3.94 (s, 3H), 3.73 (t, 2H), 3.58 (m, 4H), 3.54 (m, 2H), 3.37 (m, 2H), 2.93 (t, 2H), 2.66 (m, 2H), 2.44 (m, 4H), 1.41 (m, 2H), 1.27 (m, 2H), 1.15 (m, 2H), 0.87 (t, 3H)。LRMS [M+H] = 553.4。 實例37 N-(2-(3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙氧基)乙基)-2-(胺氧基)乙醯胺(C-37)之合成遵循與實例35類似的程序製備N-(2-(3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙氧基)乙基)-2-(胺氧基)乙醯胺(C-37),不同之處在於使用1-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-(2-胺基乙氧基)丙-1-酮(C-36)代替Int-1,得到呈固體狀之N-(2-(3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙氧基)乙基)-2-(胺氧基)乙醯胺(C-37):1 H NMR (CD3 OD): δ 7.27 (d, 1H), 7.09 (d, 1H), 6.86 (d, 1H), 6.59 (d, 1H), 6.13 (d, 1H), 5.44 (s, 2H), 4.08 (s, 2H), 3.93 (s, 3H), 3.72 (t, 2H), 3.56 (m, 8H), 3.40 (m, 4H), 2.64 (t, 2H), 2.44 (m, 4H), 1.43 (m, 2H), 1.27 (m, 2H), 1.14 (m, 2H), 0.87 (t, 3H)。LRMS [M+H] = 626.4。 實例38 (S)-1-(4-(3-((2-胺基-4-((1-羥基己-2-基)胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-4-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-2-(胺氧基)乙酮(C-38)之合成遵循與實例35類似的程序製備(S)-1-(4-(3-((2-胺基-4-((1-羥基己-2-基)胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-4-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-2-(胺氧基)乙酮(C-38),不同之處在於使用化合物(Int-2)代替化合物(Int-1),得到呈固體狀之(S)-1-(4-(3-((2-胺基-4-((1-羥基己-2-基)胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-4-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-2-(胺氧基)乙酮(C-38):1 H NMR (CD3 OD): δ 7.54 (d, 1), 7.40 (d, 1H), 7.13 (d, 1H), 6.68 (s, 1H), 6.29 (d, 1H), 5.69 (d, 1H), 5.48 (d, 1H), 4.36 (m, 3H), 3.96 (s, 3H), 3.74 (m, 2H), 3.51 (m, 4H), 2.66 (m, 4H), 1.49 (m, 1H), 1.38 (m, 3H), 1.24 (m, 2H), 0.96 (m, 2H), 0.84 (t, 3H)。LRMS [M+H] = 541.3。 實例39 (S)-1-(4-(3-((2-胺基-4-((1-羥基己-2-基)胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-4-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-(2-(2-胺基乙氧基)乙氧基)丙-1-酮(C-39)遵循與實例35類似的程序製備(S)-1-(4-(3-((2-胺基-4-((1-羥基己-2-基)胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-4-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-(2-(2-胺基乙氧基)乙氧基)丙-1-酮(C-39),不同之處在於使用化合物(Int-2)代替化合物(Int-1),且使用2,2-二甲基-4-側氧基-3,8,11-三氧雜-5-氮雜十四烷-14-酸代替2-(((第三丁氧基羰基)胺基)氧基)乙酸,得到呈固體狀之(S)-1-(4-(3-((2-胺基-4-((1-羥基己-2-基)胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-4-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-(2-(2-胺基乙氧基)乙氧基)丙-1-酮(C-39):1 H NMR (CD3 OD): δ 7.56 (d, 1H), 7.44 (d, 1H), 7.16 (d, 1H), 6.77 (s, 1H), 6.31 (d, 1H), 5.71 (d, 1H), 5.50 (d, 1H), 4.38 (m, 1H), 3.98 (s, 3H), 3.78 (m, 4H), 3.72 (m, 2H), 3.67 (m, 6H), 3.53 (m, 4H), 3.14 (m, 2H), 2.77 (m, 2H), 2.69 (m, 4H), 1.51 (m, 1H), 1.26 (m, 3H), 1.02 (m, 2H), 0.86 (t, 3H)。LRMS [M+H] = 627.5。 實例40 (S)-N-(2-(2-(3-(4-(3-((2-胺基-4-((1-羥基己-2-基)胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-4-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙氧基)乙氧基)乙基)-2-(胺氧基)乙醯胺(C-40)之合成遵循與實例35類似的程序製備(S)-N-(2-(2-(3-(4-(3-((2-胺基-4-((1-羥基己-2-基)胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-4-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙氧基)乙氧基)乙基)-2-(胺氧基)乙醯胺(C-40),不同之處在於使用化合物(C-39)代替化合物(Int-1),得到呈固體狀之(S)-N-(2-(2-(3-(4-(3-((2-胺基-4-((1-羥基己-2-基)胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-4-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙氧基)乙氧基)乙基)-2-(胺氧基)乙醯胺(C-40):1 H NMR (CD3 OD): δ 7.54 (d, 1H), 7.47 (d, 1H), 7.17 (d, 1H), 6.78 (s, 1H), 6.30 (d, 1H), 5.68 (d, 1H), 5.50 (d, 1H), 4.36 (m, 1H), 4.09 (s, 2H), 3.97 (s, 3H), 3.73 (m, 8H), 3.56 (m, 4H), 3.43 (t, 2H), 3.23 (m, 2H), 2.88 (m, 4H), 2.66 (t, 2H), 1.49 (m, 1H), 1.26 (m, 3H), 1.04 (m, 2H), 0.84 (t, 3H)。LRMS [M+H] = 700.4。 實例41 N-(2-(2-(3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙氧基)乙氧基)乙基)-2-(胺氧基)乙醯胺(C-41)之合成遵循與實例35類似的程序製備N-(2-(2-(3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙氧基)乙氧基)乙基)-2-(胺氧基)乙醯胺(C-41),不同之處在於使用化合物(C-20)代替化合物(Int-1),得到呈固體狀之N-(2-(2-(3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙氧基)乙氧基)乙基)-2-(胺氧基)乙醯胺(C-41):1 H NMR (CD3 OD): δ 7.25 (d, 1H), 7.11 (s, 1H), 6.86 (d, 1H), 6.58 (d, 1H), 6.12 (d, 1H), 5.43 (s, 2H), 4.10 (s, 2H), 3.96 (s, 3H), 3.76 (t, 2H), 3.60 (m, 12H), 3.44 (t, 2H), 3.36 (t, 2H), 2.66 (t, 2H), 2.46 (m, 4H), 1.40 (m, 2H), 1.30 (m, 2H), 1.15 (m, 2H), 0.89 (t, 3H)。LRMS [M+H] = 670.4。 實例42 5-(4-((4-(2-(2-(胺氧基)乙氧基)乙基)哌嗪-1-基)甲基)-2-甲氧基苯甲基)-N4-戊基-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-2,4-二胺(C-42)之合成步驟1. 在第一步驟中,向圓底燒瓶中裝入5-(2-甲氧基-4-(哌嗪-1-基甲基)苯甲基)-N4-戊基-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-2,4-二胺(Int-1,1.0當量)及2-(2-((1,3-二側氧基異吲哚啉-2-基)氧基)乙氧基)乙醛(1.2當量)之DCE(0.02 M)溶液,且向此混合物中添加乙酸(6.0當量),在室溫下攪拌混合物15分鐘,隨後添加三乙醯氧基硼氫化鈉(3.0當量)。在室溫下再繼續攪拌3小時。隨後真空移除揮發物。將殘餘物溶解於MeOH中且藉由逆相HPLC,使用C18管柱(用10%至50%乙腈-H2 O (含有0.05% TFA)溶離)純化,得到2-(2-(2-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)乙氧基)乙氧基)異吲哚啉-1,3-二酮。LCMS [M+H]= 671.40。 步驟2. 向圓底燒瓶中裝入2-(2-(2-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)乙氧基)乙氧基)異吲哚啉-1,3-二酮(1.0當量)、水合肼(10.0當量)、MeOH (0.02 M)及水(0.2 M)。在室溫下攪拌混合物4小時。藉由逆相HPLC,使用C18管柱(用10%至50%乙腈-H2 O (含有0.05% TFA)溶離)純化反應混合物。彙集含有所需產物之溶離份且在減壓下濃縮,隨後將殘留物溶解於MeOH中且裝載至經預處理之PL-HCO3 MP樹脂管柱且用MeOH溶離,濃縮溶離劑,得到呈固體狀之5-(4-((4-(2-(2-(胺氧基)乙氧基)乙基)哌嗪-1-基)甲基)-2-甲氧基苯甲基)-N4-戊基-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-2,4-二胺(C-42):1 H NMR (CD3 OD): δ 7.22 (d, 1H), 7.08 (d, 1H), 6.83 (d, 1H), 6.56 (d, 1H), 6.10 (d, 1H), 5.40 (s, 2H), 3.94 (s, 3H), 3.76 (m, 2H), 3.60 (m, 4H), 3.50 (s, 2H), 3.34 (d, 3H), 2.59 (m, 4H), 2.49 (s, 4H), 1.38 (m, 2H), 1.26 (m, 2H), 1.12 (m, 2H), 0.87 (t, 3H)。LCMS [M+H] = 541.40。 附註:以兩步驟製程製備2-(2-((1,3-二側氧基異吲哚啉-2-基)氧基)乙氧基)乙醛: 步驟1:在0℃下向N-羥基鄰苯二甲醯亞胺(1.0當量)、二乙二醇(1.0當量)及三苯基膦(1.3當量)於THF (0.2 M)中之溶液中添加DEAD (於甲苯中之2.2 M溶液,1.3當量)。在室溫下攪拌所得溶液隔夜。將反應混合物真空濃縮。藉由矽膠層析(用20%至70% EtOA/己烷溶離)純化殘餘物。此層析之後,產物仍含有一些Ph3 PO,隨後藉由逆相層析(C18管柱,用20%至40%至100%CH3 CN/水溶離)對其進行再純化,得到2-(2-(2-羥基乙氧基)乙氧基)異吲哚啉-1,3-二酮 LCMS [M+H] = 252.10。 步驟2:向2-(2-(2-羥基乙氧基)乙氧基)異吲哚啉-1,3-二酮(1.0當量)及碳酸氫鈉(2.0當量)於乾燥DCM (0.08 M)中之攪拌混合物中添加戴斯-馬丁高碘烷(2.0當量),在室溫下攪拌所得混合物3小時。用DCM稀釋反應混合物,隨後用1 N NaOH溶液及鹽水洗滌,分離有機層且經MgSO4 乾燥且真空蒸發。藉由矽膠層析(用30%至70% EtAOc/己烷溶離)純化粗混合物,得到2-(2-((1,3-二側氧基異吲哚啉-2-基)氧基)乙氧基)乙醛。LCMS [M+H] = 250.10。 實例43 N-(3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)丙基)-2-(胺氧基)乙醯胺(C-43)之合成遵循與實例35類似的程序製備N-(3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)丙基)-2-(胺氧基)乙醯胺(C-43),不同之處在於使用化合物(C-19)代替化合物(Int-1),得到呈固體狀之N-(3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)丙基)-2-(胺氧基)乙醯胺(C-43):1 H NMR (CD3 OD): δ 7.12 (d, 1H), 6.98 (d, 1H), 6.73 (d, 1H), 6.45 (d, 1H), 6.00 (d, 1H), 5.30 (s, 2H), 3.97 (s, 2H), 3.84 (s, 3H), 3.41 (s, 2H), 3.25 (s, 2H), 2.40 (s, 6H), 2.27 (m, 3H), 1.63 (m, 2H), 1.28 (m, 2H), 1.17 (m, 3H), 1.02 (m, 2H), 0.77 (t, 3H)。LCMS [M+H] = 568.40。 實例44 5-(4-((4-(2-(2-(2-胺基乙氧基)乙氧基)乙基)哌嗪-1-基)甲基)-2-甲氧基苯甲基)-N4-戊基-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-2,4-二胺(C-44)之合成遵循與實例19類似的程序製備5-(4-((4-(2-(2-(2-胺基乙氧基)乙氧基)乙基)哌嗪-1-基)甲基)-2-甲氧基苯甲基)-N4-戊基-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-2,4-二胺(C-44),不同之處在於使用(2-(2-(2-溴乙氧基)乙氧基)乙基)胺基甲酸第三丁酯代替(3-溴丙基)胺基甲酸第三丁酯,得到呈固體狀之5-(4-((4-(2-(2-(2-胺基乙氧基)乙氧基)乙基)哌嗪-1-基)甲基)-2-甲氧基苯甲基)-N4-戊基-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-2,4-二胺(C-44):1 H NMR (CD3 OD): δ 7.36 (d, 1H), 7.13 (d, 1H), 6.92 (d, 1H), 6.73 (d, 1H), 6.21 (s, 1H), 5.51 (s, 2H), 3.92 (s, 3H), 3.69 (m, 12H), 3.53 (t, 2H), 3.12 (m, 2H), 2.84 (m, 8H), 1.50 (m, 2H), 1.28 (m, 2H), 1.17 (m, 2H), 0.87 (t, 3H)。LRMS [M+H] = 569.3。 實例45 N-(2-(2-(2-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)乙氧基)乙氧基)乙基)-2-(胺氧基)乙醯胺(C-45)之合成遵循與實例35類似的程序製備N-(2-(2-(2-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)乙氧基)乙氧基)乙基)-2-(胺氧基)乙醯胺(C-43),不同之處在於使用化合物(C-44)代替化合物(Int-1),得到呈固體狀之N-(2-(2-(2-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)乙氧基)乙氧基)乙基)-2-(胺氧基)乙醯胺(C-45):1 H NMR (CDCl3 ): d 7.20 (s, 1H), 6.97 (d, 1H), 6.90 (s, 1H), 6.87 (s, 1H), 6.76 (d, 1H), 6.56 (d, 1H), 6.17 (d, 1H), 5.84 (s, 2H), 5.21 (s, 2H), 4.69 (m, 2H), 4.07 (s, 2H), 3.85 (s, 3H), 3.53 (m, 8H), 3.45 (m, 2H), 3.39 (s, 2H), 3.24 (m, 2H), 2.52 (t, 2H), 2.40 (m, 8H), 1.22 (m, 2H), 1.16 (m, 2H), 1.02 (m, 2H), 0.78 (t, 3H)。LRMS [M+H] = 642.4。 實例46 5-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-5-側氧基戊酸2,5-二側氧基吡咯啶-1-基酯(C-46)之合成向圓底燒瓶中裝入5-(2-甲氧基-5-(哌嗪-1-基甲基)苯甲基)-N4-戊基-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-2,4-二胺(Int-1,1.0當量)、二異丙基胺(1.3當量)、戊二酸二丁二醯亞胺酯(1.3當量)及DMSO (0.1 M)。室溫攪拌反應混合物3小時。隨後藉由RP-HPLC (0.035% TFA於ACN中:0.05% TFA於H2 O中,C18管柱)純化粗反應混合物,得到呈固體狀之呈TFA鹽形式之5-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-5-側氧基戊酸2,5-二側氧基吡咯啶-1-基酯(C-46):1 H NMR (DMSO): d 7.41 (s, 1H), 7.37 (s, 3H), 7.19 (s, 1H), 6.94 (s, 1H), 6.57 (s, 1H), 6.22 (d, 1H), 5.56 (s, 2H), 4.30 (s, 2H), 3.86 (s, 3H), 3.44 (m, 4H), 3.35 (m, 2H), 2.92 (m, 2H), 2.80 (m, 8H), 2.71 (m, 2H), 1.83 (m, 2H), 1.44 (m, 2H), 1.20 (m, 2H), 1.09 (m, 2H), 0.80 (t, 3H)。LRMS [M+H] = 649.3。 實例47 5-(4-(3-((2-胺基-4-((1-羥基己-2-基)胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-4-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-5-側氧基戊酸(S)-2,5-二側氧基吡咯啶-1-基酯(C-47)之合成遵循與實例46類似的程序製備5-(4-(3-((2-胺基-4-((1-羥基己-2-基)胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-4-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-5-側氧基戊酸(S)-2,5-二側氧基吡咯啶-1-基酯(C-47),不同之處在於使用化合物(Int-2)代替化合物(Int-1),得到呈固體狀之呈TFA鹽形式之5-(4-(3-((2-胺基-4-((1-羥基己-2-基)胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-4-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-5-側氧基戊酸(S)-2,5-二側氧基吡咯啶-1-基酯(C-47):1 H NMR (DMSO): d 7.54 (s, 1H), 7.43 (s, 3H), 7.22 (s, 1H), 6.61 (s, 1H), 6.28 (d, 1H), 6.24 (d, 1H), 5.67 (d, 1H), 5.50 (d, 1H), 4.82 (s, 1H), 4.39 (s, 1H), 4.22 (m, 2H), 3.89 (s, 3H), 3.36 (m, 4H), 3.28 (m, 2H), 2.92 (m, 2H), 2.82 (m, 8H), 2.72 (m, 2H), 1.84 (m, 2H), 1.34 (m, 2H), 1.15 (m, 2H), 0.86 (m, 2H), 0.77 (t, 3H)。LRMS [M+H] = 679.3。 實例48 (S)-2-胺基-6-(5-(4-(3-((2-胺基-4-(((S)-1-羥基己-2-基)胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-4-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-5-側氧基戊醯胺基)己酸(C-48)之合成向圓底燒瓶中裝入5-(4-(3-((2-胺基-4-((1-羥基己-2-基)胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-4-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-5-側氧基戊酸(S)-2,5-二側氧基吡咯啶-1-基酯(C-47(1.0當量)、Boc-Lys-OH (2.0當量)、DIEA (5.0當量)及DMF (30 mM)。在室溫下攪拌反應16小時且真空移除揮發物。使用RP-HPLC (0.035% TFA於ACN中:0.05% TFA於H2 O中,C18管柱)純化粗反應混合物,得到(S)-6-(5-(4-(3-((2-胺基-4-(((S)-1-羥基己-2-基)胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-4-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-5-側氧基戊醯胺基)-2-((第三丁氧基羰基)胺基)己酸。LCMS [M+1] = 810.5。用於0.1 M DCM中按體積計30% TFA處理(S)-6-(5-(4-(3-((2-胺基-4-(((S)-1-羥基己-2-基)胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-4-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-5-側氧基戊醯胺基)-2-((第三丁氧基羰基)胺基)己酸且真空移除揮發物,得到呈固體狀之呈TFA鹽形式之(S)-2-胺基-6-(5-(4-(3-((2-胺基-4-(((S)-1-羥基己-2-基)胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-4-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-5-側氧基戊醯胺基)己酸(C-48):1 H NMR (CD3 OD): δ 7.49 (m, 2H), 7.21 (d, 1H), 6.77 (s, 1H), 6.29 (d, 1H), 5.68 (d, 1H), 5.50 (d, 1H), 4.36 (m, 1H), 4.20 (m, 2H), 3.99 (S, 3H), 3.93 (m, 1H), 3.76 (m, 2H), 3.50 (m, 2H), 3.19 (m, 4H), 2.44 (t, 2H), 2.24 (t, 2H), 2.16 (m, 4H), 1.88 (m, 4H), 1.51 (m, 2H), 1.25 (m, 6H), 1.03 (m, 2H), 0.84 (t, 3H)。LRMS [M+H] = 710.3。 實例49 (S)-2-胺基-6-(5-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-5-側氧基戊醯胺基)己酸(C-49)之合成遵循與實例48類似的程序製備(S)-2-胺基-6-(5-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-5-側氧基戊醯胺基)己酸(C-49),不同之處在於使用化合物(C-46)代替化合物(C-47),得到呈固體狀之呈TFA鹽形式之(S)-2-胺基-6-(5-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-5-側氧基戊醯胺基)己酸(C-49):1 H NMR (CD3 OD): δ 7.37 (d, 1H), 7.22 (d, 1H), 7.01 (d, 1H), 6.78 (d, 1H), 6.23 (s, 1H), 5.56 (s, 2H), 4.07 (m, 2H), 3.95 (s, 3H), 3.79 (m, 1H), 3.73 (m, 2H), 3.55 (m, 2H), 2.98 (m, 4H), 2.43 (t, 2H), 2.23 (t, 2H), 2.04 (m, 4H), 1.89 (m, 4H), 1.54 (m, 6H), 1.30 (m, 2H), 1.19 (m, 2H), 0.88 (t, 3H)。LRMS [M+H] = 680.4。 實例50 5-((3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)丙基)胺基)-5-側氧基戊酸2,5-二側氧基吡咯啶-1-基酯(C-50)之合成遵循與實例46類似的程序製備5-((3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)丙基)胺基)-5-側氧基戊酸2,5-二側氧基吡咯啶-1-基酯(C-50),不同之處在於使用化合物(C-19)代替化合物(Int-1),得到呈固體狀之呈TFA鹽形式之5-((3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)丙基)胺基)-5-側氧基戊酸2,5-二側氧基吡咯啶-1-基酯(C-50):1 H NMR (DMSO): d 8.00 (s, 1H), 7.40 (m, 4H), 7.02 (s, 1H), 6.82 (s, 1H), 6.55 (d, 1H), 6.21 (d, 1H), 5.53 (s, 2H), 3.83 (, m, 5H), 3.00 (m, 8H), 2.81 (m, 4H), 2.69 (m, 2H), 2.19 (m, 2H), 1.84 (m, 2H), 1.75 (m, 4H), 1.45 (m, 2H), 1.22 (m, 4H), 1.09 (m, 4H), 0.80 (t, 3H)。LRMS [M+H] = 706.4。 實例51 (S)-2-胺基-6-(5-((3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)丙基)胺基)-5-側氧基戊醯胺基)己酸(C-51)之合成遵循與實例48類似的程序製備(S)-2-胺基-6-(5-((3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)丙基)胺基)-5-側氧基戊醯胺基)己酸(C-51),不同之處在於使用化合物(C-50)代替化合物(C-47),得到呈固體狀之呈TFA鹽形式之(S)-2-胺基-6-(5-((3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)丙基)胺基)-5-側氧基戊醯胺基)己酸(C-51):1 H NMR (CD3 OD): δ 7.35 (d, 1H), 7.12 (s, 1H), 6.94 (d, 1H), 6.75 (d, 1H), 6.22 (s, 1H), 5.52 (s, 2H), 3.92 (s, 3H), 3.86 (t, 1H), 3.71 (s, 2H), 3.54 (, m, 2H), 3.22 (m, 8H), 3.05 (m, 2H), 2.82 (m, 2H), 2.21 (m, 4H), 1.89 (m, 4H), 1.53 (m, 6H), 1.30 (m, 4H), 1.18 (m, 2H), 0.88 (t, 3H)。LRMS [M+H] = 737.4。 實例52 5-(4-(3-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-4-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-5-側氧基戊酸2,5-二側氧基吡咯啶-1-基酯(C-52)之合成遵循與實例46類似的程序製備5-(4-(3-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-4-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-5-側氧基戊酸2,5-二側氧基吡咯啶-1-基酯(C-52),不同之處在於使用化合物(Int-3)代替化合物(Int-1),得到呈固體狀之呈TFA鹽形式之5-(4-(3-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-4-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-5-側氧基戊酸2,5-二側氧基吡咯啶-1-基酯(C-52):LRMS [M+H] = 649.4。 實例53 (S)-2-胺基-6-(5-(4-(3-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-4-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-5-側氧基戊醯胺基)己酸(C-53)之合成遵循與實例48類似的程序製備(S)-2-胺基-6-(5-(4-(3-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-4-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-5-側氧基戊醯胺基)己酸(C-53),不同之處在於使用化合物(C-52)代替化合物(C-47),得到呈固體狀之呈TFA鹽形式之(S)-2-胺基-6-(5-(4-(3-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-4-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-5-側氧基戊醯胺基)己酸(C-53):1 H NMR (DMSO): d 8.22 (s, 3H), 7.79 (t, 1H), 7.51 (s, 2H), 7.42 (m, 2H), 7.27 (t, 1H), 7.17 (d, 1H), 6.61 (s, 1H), 6.23 (d, 1H), 5.57 (s, 2H), 4.05 (m, 2H), 3.87 (s, 5H), 3.42 (m, 3H), 3.02 (m, 3H), 2.89 (m, 2H), 2.31 (t, 2H), 2.09 (t, 2H), 1.72 (m, 4H), 1.41 (m, 5H), 1.22 (m, 2H), 1.07 (m, 2H), 0.83 (t, 3H)。LRMS [M+H] = 680.4。 實例54 5-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-5-側氧基戊酸全氟苯酯(C-54)之合成向圓底燒瓶中裝入5-(2-甲氧基-4-(哌嗪-1-基甲基)苯甲基)-N4-戊基-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-2,4-二胺(Int-1,1.0當量)、DIEA (3.0當量)、雙(全氟苯基)戊二酸酯(2.0當量)及DMF (0.01 M)。在室溫下攪拌反應2小時,且隨後藉由RP-HPLC (0.035% TFA於ACN中:0.05% TFA於H2 O中,C18管柱)純化粗反應混合物,得到呈固體狀之呈TFA鹽形式之5-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-5-側氧基戊酸全氟苯酯(C-54)。LCMS [M+1] = 718.4。 附註:雙(全氟苯基)戊二酸酯係藉由以下製備:戊二醯二氯(glutaroyl dichloride) (1.0當量)、THF(0.15 M)及三乙胺(2.2當量)至圓底燒瓶且將反應混合物冷卻至0℃。隨後緩慢添加2,3,4,5,6-五氟苯酚(2.1當量)於THF (1.2 M)中之溶液。在室溫下攪拌反應混合物2小時。經由矽膠過濾混合物,且隨後真空濃縮。藉由矽膠管柱用己烷-乙酸乙酯(9:1)溶離來純化殘餘物且加以濃縮,得到呈固體狀之雙(全氟苯基)戊二酸酯。LCMS [M+23] = 487.2。 實例55 3-(3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙氧基)丙酸全氟苯酯(C-55)之合成遵循與實例54類似的程序製備呈固體狀之呈TFA鹽形式之3-(3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙氧基)丙酸全氟苯酯(C-55),不同之處在於使用雙(全氟苯基)3,3'-氧基二丙酸酯代替雙(全氟苯基)戊二酸酯。1 H NMR (乙腈-d 3 ) d 7.33 (d, 1H), 7.30 (d, 1H), 6.95 (d, 1H), 6.73 (d, 1H), 6.22 (d, 1H), 6.06 (m, 1H), 5.43 (s, 2H), 4.18 (s, 2H), 3.92 (s, 3H), 3.81 (t, 2H), 3.74 (t, 2H), 3.47 (m, 2H), 2.95 (t, 2H), 2.60 (t, 2H), 2.14 (d, 2H), 1.45 (m, 2H), 1.28 (m, 2H), 1.15 (m, 2H), 0.87 (t, 3H)。LRMS [M+H] = 748.4。19 F NMR (471 MHz, 乙腈-d 3 ) d -154.71 (d, 2F), -160.40 (d, 1F), -164.57 (dd, 2F)。實例56 3-(2-(3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙氧基)乙氧基)丙酸全氟苯酯(C-56)之合成遵循與實例54類似的程序製備3-(2-(3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙氧基)乙氧基)丙酸酯(C-56),不同之處在於使用雙(全氟苯基)3,3'-(乙烷-1,2-二基雙(氧基))二丙酸酯代替雙(全氟苯基)戊二酸酯,得到3-(2-(3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙氧基)乙氧基)丙酸酯(C-54)。LRMS [M+H] = 792.4。 實例57 (S)-2-胺基-6-(3-(3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙氧基)丙醯胺基)己酸(C-57)之合成向圓底燒瓶中裝入3-(3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙氧基)丙酸全氟苯酯(C-55,1.0當量)、Boc-Lys-OH (2.0當量)、DIEA (5.0當量)及DMF (30 mM)。在室溫下攪拌反應16小時且真空移除揮發物。使用RP-HPLC (0.035% TFA於ACN中:0.05% TFA於H2 O中,C18管柱)純化粗反應混合物,得到(S)-6-(3-(3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙氧基)丙醯胺基)-2-((第三丁氧基羰基)胺基)己酸。LCMS [M+1] = 810.5。用於0.1 M DCM中按體積計30% TFA處理boc經保護之化合物,且隨後真空移除揮發物,得到呈固體狀之呈TFA鹽形式之(S)-2-胺基-6-(3-(3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙氧基)丙醯胺基)己酸(C-57):1 H NMR (DMSO): d 8.18 (m, 3H), 7.80 (s, 1H), 7.41 (m, 4H), 7.18 (s, 1H), 6.94 (d, 1H), 6.59 (d, 1H), 6.22 (d, 1H), 5.56 (s, 2H), 4.24 (m, 1H), 3.86 (m, 7H), 3.56 (m, 4H), 3.44 (m, 4H), 3.01 (m, 4H), 2.60 (m, 2H), 2.28 (m, 2H), 1.74 (m, 2H), 1.45 (m, 2H), 1.38 (m, 3H), 1.21 (m, 3H), 1.09 (m, 2H), 0.80 (t, 3H)。LCMS [M+1] = 710.5。 實例58 N-(15-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-15-側氧基-3,6,9,12-四氧雜十五基)-5-((3aS,4S,6aR)-2-側氧基六氫-1H-噻吩并[3,4-d]咪唑-4-基)戊醯胺(C-58)之合成遵循與實例46類似的程序製備N-(15-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-15-側氧基-3,6,9,12-四氧雜十五基)-5-((3aS,4S,6aR)-2-側氧基六氫-1H-噻吩并[3,4-d]咪唑-4-基)戊醯胺(C-58),不同之處在於使用2,5-二側氧基吡咯啶-1-基17-側氧基-21-((3aS,4S,6aR)-2-側氧基六氫-1H-噻吩并[3,4-d]咪唑-4-基)-4,7,10,13-四氧雜-16-氮雜二十一烷-1-酸酯代替戊二酸二丁二醯亞胺酯,得到呈固體狀之呈TFA鹽形式之N-(15-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-15-側氧基-3,6,9,12-四氧雜十五基)-5-((3aS,4S,6aR)-2-側氧基六氫-1H-噻吩并[3,4-d]咪唑-4-基)戊醯胺(C-58):1 H NMR (DMSO): d 7.84 (m, 2H), 7.42 (m, 4H), 7.22 (m, 1H), 6.94 (d, 1H), 6.56 (d, 1H), 6.42 (s, 1H), 6.37 (s, 1H), 6.22 (s, 1H), 5.57 (s, 2H), 4.29 (m, 2H), 4.11 (m, 2H), 3.86 (s, 3H), 3.60 (m, 4H), 3.48 (m, 16H), 3.37 (m, 4H), 3.16 (m, 4H), 3.08 (m, 2H), 2.80 (m, 1H), 2.56 (m, 2H), 2.05 (m, 2H), 1.58 (m, 1H), 1.45 (m, 5H), 1.23 (m, 4H), 1.07 (m, 2H), 0.80 (t, 3H)。LRMS [M+H] = 911.6。 實例59 4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-甲酸4-((R)-6-胺基-2-((S)-2-(3-(2,5-二側氧基-2,5-二氫-1H-吡咯-1-基)丙醯胺基)-3-苯基丙醯胺基)己醯胺基)苯甲酯(C-59)之合成呈固體狀之呈TFA鹽形式之4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-甲酸4-((R)-6-胺基-2-((S)-2-(3-(2,5-二側氧基-2,5-二氫-1H-吡咯-1-基)丙醯胺基)-3-苯基丙醯胺基)己醯胺基)苯甲酯(C-59)係根據實例(C-30)所示之流程製備,不同之處在於在第一步驟中使用(9H-茀-9-基)甲基((S)-1-(((R)-6-胺基-1-((4-((((4-硝基苯氧基)羰基)氧基)甲基)苯基)胺基)-1-側氧基己-2-基)胺基)-1-側氧基-3-苯基丙-2-基)胺基甲酸酯代替(9H-茀-9-基)甲基((S)-3-甲基-1-(((S)-1-((4-((((4-硝基苯氧基)羰基)氧基)甲基)苯基)胺基)-1-側氧基-5-脲基戊-2-基)胺基)-1-側氧基丁-2-基)胺基甲酸酯:1 H NMR (CD3 OD): δ 8.26 (d, 1H), 7.91 (t, 1H), 7.61 (d, 2H), 7.35 (m, 3H), 7.25 (m, 3H), 7.19 (m, 3H), 7.03 (d, 1H), 6.79 (d, 1H), 6.76 (s, 2H), 6.24 (d, 1H), 5.57 (s, 2H), 5.11 (s, 2H), 4.41 (m, 1H), 4.33 (s, 2H), 3.98 (t, 1H), 3.95 (s, 3H), 3.70 (m, 3H), 3.54 (t, 2H), 3.24 (m, 4H), 3.10 (m, 1H), 3.02 (m, 1H), 2.83 (m, 1H), 2.47 (t, 2H), 1.92 (m, 2H), 1.52 (m, 4H), 1.42 (m, 2H), 1.30 (m, 3H), 1.18 (m, 2H), 0.88 (t, 3H)。LRMS [M+H] = 1013.5。 實例60 4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-甲酸4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-二側氧基-2,5-二氫-1H-吡咯-1-基)乙氧基)丙醯胺基)-3-甲基丁醯胺基)丙醯胺基)苯甲酯(C-60)之合成呈固體狀之呈TFA鹽形式之4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-甲酸4-((S)-2-((S)-2-(3-(2-(2,5-二側氧基-2,5-二氫-1H-吡咯-1-基)乙氧基)丙醯胺基)-3-甲基丁醯胺基)丙醯胺基)苯甲酯(C-60)係根據實例(C-30)所示之流程製備,不同之處在於在第一步驟中使用(9H-茀-9-基)甲基((S)-3-甲基-1-(((S)-1-((4-((((4-硝基苯氧基)羰基)氧基)甲基)苯基)胺基)-1-側氧基丙-2-基)胺基)-1-側氧基丁-2-基)胺基甲酸酯代替(9H-茀-9-基)甲基((S)-3-甲基-1-(((S)-1-((4-((((4-硝基苯氧基)羰基)氧基)甲基)苯基)胺基)-1-側氧基-5-脲基戊-2-基)胺基)-1-側氧基丁-2-基)胺基甲酸酯:1 H NMR (CD3 OD): δ 9.65 (s, 1H), 8.20 (d, 1H), 7.97 (d, 1H), 7.60 (m, 2H), 7.34 (m, 2H), 7.31 (s, 1H), 7.22 (d, 1H), 7.03 (d, 1H), 6.80 (m, 2H), 6.77 (s, 2H), 6.23 (d, 1H), 5.57 (s, 2H), 5.11 (s, 2H), 4.48 (t, 1H), 4.31 (s, 3H), 4.15 (t, 1H), 3.95 (m, 4H), 3.68 (m, 4H), 3.62 (m, 2H), 3.53 (m, 8H), 2.49 (t, 2H), 2.11 (m, 1H), 1.52 (m, 2H), 1.44 (d, 3H), 1.28 (m, 2H), 1.18 (m, 2H), 0.98 (m, 6H), 0.87 (t, 3H)。LRMS [M+H] = 952.6。 實例61 (2S,3S,4S,5R,6S)-6-(4-(((4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-羰基)氧基)甲基)-2-(3-(3-(2,5-二側氧基-2,5-二氫-1H-吡咯-1-基)丙醯胺基)丙醯胺基)苯氧基)-3,4,5-三羥基四氫-2H-哌喃-2-甲酸(C-61)之合成步驟1:向圓底燒瓶中裝入5-(2-甲氧基-5-(哌嗪-1-基甲基)苯甲基)-N4-戊基-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-2,4-二胺(Int-1,1.0當量)、HOAT (2.0當量)、許尼希氏鹼(14.0當量)、三乙酸(3S,4R,5R,6R)-2-(2-(3-((((9H-茀-9-基)甲氧基)羰基)胺基)丙醯胺基)-4-((((4-硝基苯氧基)羰基)氧基)甲基)苯氧基)-6-(甲氧基羰基)四氫-2H-哌喃-3,4,5-三基酯(1.2當量)及吡啶:DMF (1:4,0.015 M)。在室溫下攪拌反應混合物4小時。隨後藉由RP-HPLC (0.035% TFA於ACN中:0.05% TFA於H2 O中,C18管柱)純化粗反應混合物,得到呈固體狀之三乙酸(3S,4R,5R,6R)-2-(2-(3-((((9H-茀-9-基)甲氧基)羰基)胺基)丙醯胺基)-4-(((4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-羰基)氧基)甲基)苯氧基)-6-(甲氧基羰基)四氫-2H-哌喃-3,4,5-三基酯:LCMS [M+H] = 1212.4。 步驟2:將三乙酸(3S,4R,5R,6R)-2-(2-(3-((((9H-茀-9-基)甲氧基)羰基)胺基)丙醯胺基)-4-(((4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-羰基)氧基)甲基)苯氧基)-6-(甲氧基羰基)四氫-2H-哌喃-3,4,5-三基酯(1.0當量)溶解於MeOH、THF及水(2:1:0.4) (0.005 M)中。隨後添加LiOH (8.0當量)且在室溫下攪拌反應2小時。隨後藉由RP-HPLC (0.035% TFA於ACN中:0.05% TFA於H2 O中,C18管柱)純化粗反應混合物,得到呈固體狀之(2R,3R,4R,5S)-6-(4-(((4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-羰基)氧基)甲基)-2-(3-胺基丙醯胺基)苯氧基)-3,4,5-三羥基四氫-2H-哌喃-2-甲酸:LCMS [M+H] = 850.4。 步驟3:向圓底燒瓶中裝入(2R,3R,4R,5S)-6-(4-(((4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-羰基)氧基)甲基)-2-(3-胺基丙醯胺基)苯氧基)-3,4,5-三羥基四氫-2H-哌喃-2-甲酸(1.0當量)、3-(2,5-二側氧基-2,5-二氫-1H-吡咯-1-基)丙酸(2.0當量)、許尼希氏鹼(6.0當量)、HBTU(1.8當量)及DMF (0.003 M)。在室溫下持續攪拌反應15分鐘。在室溫下攪拌反應混合物2小時。隨後藉由RP-HPLC (0.035% TFA於ACN中:0.05% TFA於H2 O中,C18管柱)純化粗反應混合物,得到呈固體狀之呈TFA鹽形式之(2S,3S,4S,5R,6S)-6-(4-(((4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-羰基)氧基)甲基)-2-(3-(3-(2,5-二側氧基-2,5-二氫-1H-吡咯-1-基)丙醯胺基)丙醯胺基)苯氧基)-3,4,5-三羥基四氫-2H-哌喃-2-甲酸(C-61):LCMS [M+H] = 1001.3。 實例62 (2S,3S,4S,5R,6S)-6-(4-(((4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-羰基)氧基)甲基)-2-(3-(3-(2-(2,5-二側氧基-2,5-二氫-1H-吡咯-1-基)乙氧基)丙醯胺基)丙醯胺基)苯氧基)-3,4,5-三羥基四氫-2H-哌喃-2-甲酸(C-62)之合成呈固體狀之呈TFA鹽形式之(2S,3S,4S,5R,6S)-6-(4-(((4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-羰基)氧基)甲基)-2-(3-(3-(2-(2,5-二側氧基-2,5-二氫-1H-吡咯-1-基)乙氧基)丙醯胺基)丙醯胺基)苯氧基)-3,4,5-三羥基四氫-2H-哌喃-2-甲酸(C-62)係根據實例(C-61)所示之流程製備,不同之處在於在最後一個步驟中使用3-(2-(2,5-二側氧基-2,5-二氫-1H-吡咯-1-基)乙氧基)丙酸代替3-(2,5-二側氧基-2,5-二氫-1H-吡咯-1-基)丙酸:1 H NMR (CD3 OD): δ 8.20 (d, 1H), 7.37 (d, 1H), 7.21 (m, 2H), 7.05 (m, 1H), 6.99 (d, 1H), 6.78 (m, 3H), 6.23 (d, 1H), 5.55 (s, 2H), 5.09 (s, 2H), 3.92 (m, 4H), 4.81 (d, 1H), 4.00 (s, 2H), 3.94 (s, 3H), 3.89 (d, 1H), 3.62 (m, 9H), 3.53 (m, 8H), 2.90 (m, 3H), 2.66 (t, 2H), 2.37 (t, 2H), 1.51 (m, 2H), 1.29 (m, 2H), 1.17 (m, 2H), 0.87 (t, 3H)。LRMS [M+H] = 1045.4。 實例63 N-(2-((5-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-2-甲基-5-側氧基戊-2-基)二硫基)乙基)-3-(2,5-二側氧基-2,5-二氫-1H-吡咯-1-基)丙醯胺(C-63)之合成步驟1:向圓底燒瓶中裝入5-(2-甲氧基-5-(哌嗪-1-基甲基)苯甲基)-N4-戊基-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-2,4-二胺(Int-1,1.0當量)、4-甲基-4-(甲基二硫烷基)戊酸2,5-二側氧基吡咯啶-1-基酯(1.3當量)、許尼希氏鹼(20.0當量)及DMF (0.03 M)。在室溫下攪拌反應混合物2小時。隨後使用RP-C18 ISCO (ACN:H2 O,用TFA作為改性劑)純化粗反應混合物,且隨後加以凍乾,得到呈固體狀之呈TFA鹽形式之1-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-4-甲基-4-(甲基二硫烷基)戊-1-酮:LCMS [M+H] = 614.3。 步驟2:向圓底燒瓶中裝入1-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-4-甲基-4-(甲基二硫烷基)戊-1-酮(1.0當量)、(2S,3S)-1,4-二巰基丁烷-2,3-二醇(1.0當量)及二甲基乙醯胺:H2 O (1:1,0.03 M)。在室溫下攪拌反應混合物2小時。隨後使用RP-C18 ISCO (ACN:H2 O,用TFA作為改性劑)純化粗反應混合物,且隨後加以凍乾,得到呈固體狀之呈TFA鹽形式之1-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-4-巰基-4-甲基戊-1-酮:LCMS [M+H] = 568.3。 步驟3:向圓底燒瓶中裝入1-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-4-巰基-4-甲基戊-1-酮(1.0當量)、2-(吡啶-2-基二硫基)乙-1-胺HCl鹽(2.0當量)、許尼希氏鹼(10.0當量)及THF:PBS (1:1,0.03 M)。在室溫下攪拌反應混合物15分鐘。隨後使用RP-C18 ISCO (ACN:H2 O,用TFA作為改性劑)純化粗反應混合物,且隨後加以凍乾,得到呈固體狀之呈TFA鹽形式之1-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-4-((2-胺基乙基)二硫基)-4-甲基戊-1-酮:LCMS [M+H] = 643.4。 步驟4:向圓底燒瓶中裝入1-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-4-((2-胺基乙基)二硫基)-4-甲基戊-1-酮(1.0當量)、3-(2,5-二側氧基-2,5-二氫-1H-吡咯-1-基)丙酸(1.0當量)、許尼希氏鹼(5.0當量)、HATU (1.0當量)及DMF (0.02 M)。在室溫下攪拌反應混合物2小時。隨後使用RP-C18 ISCO (ACN:H2 O,用TFA作為改性劑)純化粗反應混合物,且隨後加以凍乾,得到呈固體狀之呈TFA鹽形式之N-(2-((5-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-2-甲基-5-側氧基戊-2-基)二硫基)乙基)-3-(2,5-二側氧基-2,5-二氫-1H-吡咯-1-基)丙醯胺(C-63):1 H NMR (CD3 OD): δ 7.37 (d, 1H), 7.26 (d, 1H), 7.08 (m, 1H), 6.83 (d, 1H), 6.81 (s, 2H), 6.24 (d, 1H), 5.58 (s, 2H), 4.37 (s, 2H), 4.20 (br, 4H), 3.97 (s, 3H), 3.75 (t, 2H), 3.55 (t, 2H), 3.38 (m, 2H), 3.38 (br, 4H), 2.72 (t, 2H), 2.55 (m, 2H), 2.45 (t, 2H), 1.89 (m, 2H), 1.54 (m, 2H), 1.31 (m, 8H), 1.19 (m, 2H), 0.88 (t, 3H)。LRMS [M+H] = 794.4。 實例64 1-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-4-甲基-4-(甲硫基)戊-1-酮(C-64)之合成遵循針對中間物Int-1所述之程序製備1-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-4-甲基-4-(甲硫基)戊-1-酮(C-63),不同之處在於在步驟3中使用4-甲基-4-(甲硫基)-1-(哌嗪-1-基)戊-1-酮代替哌嗪-1-甲酸第三丁酯。使用RP-C18 ISCO (ACN:H2 O,用TFA作為改性劑)純化粗反應混合物,且隨後加以凍乾,得到呈固體狀之呈TFA鹽形式之1-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-4-甲基-4-(甲硫基)戊-1-酮(C-64):1 H NMR (CD3 OD): δ 7.36 (d, 1H), 7.25 (d, 1H), 7.05 (m, 1H), 6.81 (d, 1H), 6.24 (d, 1H), 5.58 (s, 2H), 4.34 (s, 2H), 3.90 (br, 4H), 3.96 (s, 3H), 3.55 (t, 2H), 3.28 (br, 4H), 2.55 (m, 2H), 1.95 (s, 3H), 1.80 (m, 2H), 1.54 (m, 2H), 1.31 (m, 2H), 1.27 (s, 6H), 1.19 (m, 2H), 0.88 (t, 3H)。LRMS [M+H] = 582.4。 實例65 (2S,3S,4S,5R,6S)-6-(4-((((2-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)乙氧基)(羥基)磷醯基)氧基)甲基)-2-(3-(3-(2-(2,5-二側氧基-2,5-二氫-1H-吡咯-1-基)乙氧基)丙醯胺基)丙醯胺基)苯氧基)-3,4,5-三羥基四氫-2H-哌喃-2-甲酸(C-65)之合成步驟1:在0℃下向圓底燒瓶中裝入2-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)乙-1-醇(C-68) (1.0當量)、三氯磷烷(3.0當量)、三乙胺(9.0當量)及THF(0.2 M)且使其攪拌1小時。隨後藉由緩慢添加冰水淬滅反應且用EtOAc洗滌3次。隨後凍乾含有所需產物之水層。分離膦酸氫2-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)乙酯且不經進一步純化即用於下一步驟中:LCMS [M+H] = 546.3。 步驟2:向圓底燒瓶中裝入三乙酸(2S,3R,4S,5S,6S)-2-(2-(3-((((9H-茀-9-基)甲氧基)羰基)胺基)丙醯胺基)-4-(羥甲基)苯氧基)-6-(甲氧基羰基)四氫-2H-哌喃-3,4,5-三基酯(1.0當量)、膦酸氫2-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)乙酯(2.0當量)、特戊醯氯(42.0當量)及吡啶(0.03 M)。在室溫下攪拌反應混合物2小時。此時,添加二碘化物(1.06當量)之吡啶:H2 O (1:0.1,0.14 M)溶液且攪拌混合物10分鐘。使用RP-HPLC (0.035% TFA於ACN中:0.05% TFA於H2 O中,C18管柱)純化粗反應混合物,得到呈固體狀之呈TFA鹽形式之三乙酸(2S,3R,4S,5S,6S)-2-(2-(3-((((9H-茀-9-基)甲氧基)羰基)胺基)丙醯胺基)-4-((((2-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)乙氧基)(羥基)磷醯基)氧基)甲基)苯氧基)-6-(甲氧基羰基)四氫-2H-哌喃-3,4,5-三基酯:LCMS [M+H] = 1292.5。 步驟3:向圓底燒瓶中裝入三乙酸(2S,3R,4S,5S,6S)-2-(2-(3-((((9H-茀-9-基)甲氧基)羰基)胺基)丙醯胺基)-4-((((2-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)乙氧基)(羥基)磷醯基)氧基)甲基)苯氧基)-6-(甲氧基羰基)四氫-2H-哌喃-3,4,5-三基酯(1.0當量)、氫氧化鋰-H2 O (10.0當量)及MeOH:H2 O (3:1.5,0.007 M)。在室溫下攪拌反應混合物2小時。隨後使用RP-C18 ISCO (ACN:H2 O,用TFA作為改性劑)純化粗反應混合物,且隨後加以凍乾,得到呈固體狀之呈TFA鹽形式之(2S,3S,4S,5R,6S)-6-(4-((((2-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)乙氧基)(羥基)磷醯基)氧基)甲基)-2-(3-胺基丙醯胺基)苯氧基)-3,4,5-三羥基四氫-2H-哌喃-2-甲酸:LCMS [M+H] = 930.4。 步驟4:向圓底燒瓶中裝入(2S,3S,4S,5R,6S)-6-(4-((((2-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)乙氧基)(羥基)磷醯基)氧基)甲基)-2-(3-胺基丙醯胺基)苯氧基)-3,4,5-三羥基四氫-2H-哌喃-2-甲酸(1.0當量)、3-(2-(2,5-二側氧基-2,5-二氫-1H-吡咯-1-基)乙氧基)丙酸(1.0當量)、許尼希氏鹼(6.0當量)、HATU (1.0當量)及DMF (0.005 M)。在室溫下持續攪拌反應15分鐘。隨後藉由RP-HPLC (0.035% TFA於ACN中:0.05% TFA於H2 O中,C18管柱)純化粗反應混合物,得到呈固體狀之呈TFA鹽形式之(2S,3S,4S,5R,6S)-6-(4-((((2-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)乙氧基)(羥基)磷醯基)氧基)甲基)-2-(3-(3-(2-(2,5-二側氧基-2,5-二氫-1H-吡咯-1-基)乙氧基)丙醯胺基)丙醯胺基)苯氧基)-3,4,5-三羥基四氫-2H-哌喃-2-甲酸(C-65):1 H NMR (CD3 OD): δ 8.19 (s, 1H), 7.37 (d, 1H), 7.14 (m, 3H), 6.79 (s, 2H), 6.77 (d, 1H), 6.22 (d, 1H), 5.53 (s, 2H), 4.86 (s, 2H), 4.84 (d, 1H), 4.08 (s, 2H), 3.95 (d, 1H), 3.92 (s, 3H), 4.00 (br, 4H), 3.76 (s, 2H), 3.62 (m, 5H), 3.53 (m, 10H), 3.27 (m, 2H), 2.85 (m, 4H), 2.63 (m, 2H), 2.37 (t, 2H), 1.52 (m, 2H), 1.31 (m, 2H), 1.17 (m, 2H), 0.88 (t, 3H)。LRMS [M+H/2Z] = 563.4。 實例66 (2R,2'R)-3,3'-((2-((2-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-2-側氧基乙氧基)亞胺基)丙烷-1,3-二基)雙(硫烷二基))雙(2-胺基丙酸)(C-66)之合成向圓底燒瓶中裝入1-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-2-(胺氧基)乙-1-酮(C-35) (2.4當量)、(2R,2'R)-3,3'-((2-側氧基丙烷-1,3-二基)雙(硫烷二基))雙(2-胺基丙酸) (1.0當量)及乙醇(0.02 M)。在室溫下攪拌反應混合物30分鐘。使用RP-C18 ISCO (ACN:H2 O,用TFA作為改性劑)純化粗反應混合物,且隨後加以凍乾,得到呈固體狀之(2R,2'R)-3,3'-((2-((2-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-2-側氧基乙氧基)亞胺基)丙烷-1,3-二基)雙(硫烷二基))雙(2-胺基丙酸) (C-66):1 H NMR (CD3 OD): δ 7.35 (d, 1H), 7.28 (d, 1H), 7.05 (m, 1H), 6.80 (d, 1H), 6.23 (d, 1H), 5.57 (s, 2H), 4.32 (s, 2H), 4.20 (m, 1H), 4.05 (m, 1H), 3.94 (s, 3H), 3.81 (m, 4H), 3.55 (m, 2H), 3.44 (m, 2H), 3.20 (m, 4H), 2.96 (m, 1H), 2.88 (m, 1H), 1.53 (m, 2H), 1.31 (m, 2H), 1.18 (m, 2H), 0.88 (t, 3H)。LRMS [M+H] = 789.3。 實例67 (R)-2-胺基-6-((((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)甲基)-17-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-10,17-二側氧基-8,14-二氧雜-4-硫雜-7,11-二氮雜十七碳-6-烯酸(C-67)之合成向圓底燒瓶中裝入N-(2-(3-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-3-側氧基丙氧基)乙基)-2-(胺氧基)乙醯胺(C-37) (2.4當量)、(2R,2'R)-3,3'-((2-側氧基丙烷-1,3-二基)雙(硫烷二基))雙(2-胺基丙酸) (1.0當量)及乙醇(0.02 M)。在室溫下攪拌反應混合物30分鐘。使用RP-C18 ISCO (ACN:H2 O,用TFA作為改性劑)純化粗反應混合物,且隨後加以凍乾,得到呈固體狀之(R)-2-胺基-6-((((R)-2-胺基-2-羧乙基)硫基)甲基)-17-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)-10,17-二側氧基-8,14-二氧雜-4-硫雜-7,11-二氮雜十七碳-6-烯酸(C-67):1 H NMR (CD3 OD): δ 7.36 (d, 1H), 7.29 (d, 1H), 7.07 (m, 1H), 6.80 (d, 1H), 6.24 (d, 1H), 5.57 (s, 2H), 4.57 (s, 2H), 4.31 (m, 2H), 4.11 (m, 1H), 4.03 (m, 1H), 3.95 (s, 3H), 3.86 (br, 4H), 3.73 (t, 2H), 3.54 (m, 6H), 3.40 (m, 2H), 3.20 (m, 8H), 2.96 (m, 2H), 2.67 ( t, 2H), 1.52 (m, 2H), 1.30 (m, 2H), 1.19 (m, 2H), 0.88 (t, 3H)。LRMS [M+H] = 904.4。 實例682-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)乙-1-醇(C-68)之合成向圓底燒瓶中裝入5-(2-甲氧基-4-(哌嗪-1-基甲基)苯甲基)-N4-戊基-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-2,4-二胺(Int-1,1.0當量)、2-溴乙-1-醇(1.3當量)、三乙胺(20.0當量)及乙腈(0.03 M)。在室溫下攪拌反應混合物2小時。隨後藉由ISCO層析(0%至10% MeOH:DCM,梯度)純化粗反應混合物,得到呈固體狀之2-(4-(4-((2-胺基-4-(戊基胺基)-5H-吡咯并[3,2-d]嘧啶-5-基)甲基)-3-甲氧基苯甲基)哌嗪-1-基)乙-1-醇(C-68):1 H NMR (CD3 OD): δ 7.22 (d, 1H), 7.08 (d, 1H), 6.83 (d, 1H), 6.55 (d, 1H), 6.10 (d, 1H), 5.39 (s, 2H), 3.93 (s, 3H), 3.66 (t, 2H), 3.50 (s, 2H), 3.32 (m, 2H), 3.20 (s, 1H), 2.51 (m, 10H), 1.37 (m, 2H), 1.27 (m, 2H), 1.25 (s, 1H), 1.12 (m, 2H), 0.86 (t, 3H)。LRMS [M+H] = 482.4。 實例69 分析式(I)化合物以量測其作為類鐸受體7促效劑之活性。 報導基因分析 用人類TLR7及NF-kB驅動之螢光素酶報導基因載體(pNifty-螢光素酶)穩定轉染人胚腎293 (HEK293)細胞。使用用pNifty-Luc轉染之正常HEK293作為對照分析。將細胞培養於補充有2 mM L-麩醯胺酸、10%熱滅活FBS、1%青黴素及鏈黴素、2 µg/ml嘌呤黴素(InvivoGen #ant-pr-5)及5 µg/ml殺稻瘟菌素(Invitrogen #46-1120)之DMEM中。Bright-GloTM 螢光素酶分析緩衝液及底物由Promega #E263B及#E264B (分別對應分析底物及緩衝液)供應。384孔底透培養盤由Greiner bio-one (#789163-G)供應且為慣用的有條碼之培養盤。 以25,000個細胞/孔將細胞塗鋪於384孔培養盤中,培養基最終體積為50 µl。在37℃及5% CO2 下培養隔夜(18小時)之後,使細胞黏著於培養盤。隨後將經連續稀釋之實驗化合物及陽性對照化合物施配至各孔且在37℃及5% CO2 下培育7小時。用單獨DMSO刺激之細胞亦充當陰性對照。培育之後,根據製造商說明書將30 µl預混分析緩衝液添加至各孔中。在CLIPR機上以每盤20秒之積分時間讀取螢光信號。 針對各化合物生成劑量反應曲線且根據產生最大信號之50%的濃度測定EC50 值。選定分析結果 呈游離形式或呈醫藥學上可接受之鹽形式的不同式(I)化合物展現例如如由本申請案中所述之活體外測試所指示的藥理學特性。彼等實驗中之EC50 值以引起在基線與最大反應之間的半程(halfway)反應的相關測試化合物之濃度形式給定。在其他實例中,式(I)化合物之EC50 值在1 nM至2 μM範圍內。在其他實例中,式(I)化合物之EC50 值在1 nM至1 μM範圍內。在其他實例中,式(I)化合物之EC50 值在1 nM至500 nM範圍內。在其他實例中,式(I)化合物之EC50 值在1 nM至250 nM範圍內。在其他實例中,式(I)化合物之EC50 值在1 nM至100 nM範圍內。在其他實例中,式(I)化合物之EC50 值在1 nM至50 nM範圍內。在其他實例中,式(I)化合物之EC50 值在1 nM至25 nM範圍內。在其他實例中,式(I)化合物之EC50 值在1 nM至10 nM範圍內。 為了說明本發明之化合物之活體外活性,針對TLR7刺激之某些式(I)化合物之EC50 值列於表2中。認為半胱胺酸加合物為由溶酶體中之降解而產生的推定分解代謝產物(Bioconjugate Chem. 2006, 17, 114-124)。表2之某些化合物為具有半胱胺酸之對應母化合物的衍生作用之結果。 表2 實例70藉由 TLR7 促效劑與 HER2 抗體突變體之特異性半胱胺酸殘基結合產生抗 HER2 - TLR7 促效劑 結合物 用特異性半胱胺酸 ( Cys ) 突變製備抗 HER2 抗體 用位點特異性半胱胺酸突變製備抗-HER2抗體,例如曲妥珠單抗先前已描述於WO 2014/124316及WO 2015/138615中,其中之每一者以引用之方式併入本文中。簡言之,化學合成編碼抗HER2抗體,例如曲妥珠單抗之重鏈及輕鏈之可變區的DNA且選殖於兩種哺乳動物表現載體,pOG-HC及pOG-LC中,其含有人類IgG1及人類κ輕鏈之恆定區。載體含有CMV啟動子及信號序列:MKTFILLLWVLLLWVIFLLPGATA (SEQ ID NO: 27)。寡核苷酸定向突變誘發用於製備抗HER2抗體之Cys突變構築體,且Cys突變構築體之序列藉由DNA定序確認。 舉例而言,半胱胺酸可引入抗HER2抗體中的以下位置(所有位置係依據EU編號)中之一或多者處:(a)抗體重鏈之位置152、360及/或375及(b)抗體輕鏈之位置107、159及/或165。舉例而言,半胱胺酸可引入重鏈之位置152處,產生抗HER2 mAb4,其具有SEQ ID NO: 19之輕鏈序列及SEQ ID NO: 30之重鏈序列。 藉由使用如先前所述之短暫性轉染方法(Meissner等人,Biotechnol Bioeng . 75:197-203 (2001))共轉染重鏈及輕鏈質體而使抗HER2抗體之Cys突變體表現於293 Freestyle™細胞中。藉由標準蛋白質A親和性層析法自細胞上清液純化表現抗體。 使用類似方法將曲妥珠單抗之重鏈及輕鏈之可變區選殖於兩個載體中以在CHO細胞中表現。重鏈載體編碼人類IgG1抗體之恆定區,包括信號肽(MPLLLLLPLLWAGALA) (SEQ ID NO: 28)、驅動重鏈表現之CMV啟動子及用於在CHO細胞中穩定轉染的合適信號及選擇序列。輕鏈載體編碼人類κ輕鏈之恆定區,包括信號肽(MSVLTQVLALLLLWLTGTRC) (SEQ ID NO: 29)、驅動輕鏈表現之CMV啟動子及用於在CHO細胞中穩定轉染的合適信號及選擇序列。為了產生抗體,將重鏈載體及輕鏈載體共轉染於CHO細胞株中。細胞經歷選擇,且隨後在針對抗體產生最佳化之條件下培養經穩定轉染之細胞。藉由標準蛋白質A親和性層析法自細胞上清液純化抗體。 使用標準突變誘發方法進行對抗體載體之恆定區的另外突變。還原、再氧化 Cys 突變抗 - HER2 抗體且使其與 TLR7 促效劑 結合 使用Junutula JR等人, Nature Biotechnology 26:925-932 (2008)中所述之方法使包含連接子的本發明之式(I)化合物與抗體中經工程改造之Cys殘基結合。 因為在哺乳動物細胞中表現之抗體中經工程改造之Cys殘基在生物合成期間由加合物(二硫化物)(諸如谷胱甘肽(GSH)及/或半胱胺酸)修飾(Chen等人 2009),因此如最初表現之經修飾之Cys對硫醇反應性試劑(諸如順丁烯二醯亞胺基或溴-乙醯胺或碘-乙醯胺基團)不起反應。為了結合經工程改造之Cys殘基,需要藉由還原二硫化物來移除谷胱甘肽或半胱胺酸加合物,其通常需要還原經表現之抗體中之所有二硫化物。此可藉由首先將抗體暴露於還原劑,諸如二硫蘇糖醇(DTT),之後再氧化抗體之所有原生二硫鍵以恢復及/或穩定功能抗體結構來實現。因此,為了還原經工程改造之Cys殘基之半胱胺酸或GSH加合物之間的原生二硫鍵及二硫鍵,將新製DTT添加至先前純化之曲妥珠單抗之Cys突變體中,最終濃度為10 mM或20 mM。在抗體與DTT一起在37℃下培育1小時之後,針對PBS透析混合物三天,其中每天更換緩衝液以移除DTT及再氧化原生二硫鍵。藉由逆相HPLC監測再氧化過程,逆相HPLC能夠自個別重鏈及輕鏈分子分離抗體四聚體。用加熱至80℃之PRLP-S 4000A管柱(50 mm × 2.1 mm,Agilent)分析反應物,且在1.5 ml/min之流動速率下藉由含有0.1% TFA之30%至60%乙腈/水之線性梯度進行管柱溶離。在280 nm下監測蛋白質自管柱之溶離。繼續透析直至再氧化完成。再氧化恢復鏈內及鏈間二硫鍵,同時透析使得可透析移除連接至新近引入之Cys殘基之半胱胺酸及麩胱甘肽。 再氧化之後,以與經工程改造之Cys典型地呈1.5:1、2:1或5:1之比率將含順丁烯二醯亞胺之化合物添加至PBS緩衝液(pH 7.2)中之經再氧化之抗體中,且進行培育1小時。典型地,藉由利用標準方法經由蛋白質A樹脂純化移除過量游離化合物,之後將緩衝液更換成PBS。 以替代方式還原且使用樹脂相關方法(on-resin method)再氧化抗HER2抗體,例如曲妥珠單抗之Cys突變體。在PBS(無鈣或鎂鹽)中平衡蛋白質A瓊脂糖珠粒(1 ml/10 mg抗體),且隨後以分批模式添加至抗體樣品中。藉由將850 mg半胱胺酸HCl溶解於藉由將3.4 g NaOH添加至250 ml 0.5 M磷酸鈉(pH 8.0)而製備之10 ml溶液中來製備0.5 M半胱胺酸儲備液,且隨後將20 mM半胱胺酸添加至抗體/珠粒漿液中,且在室溫下輕輕混合30至60分鐘。將珠粒裝載至重力管柱且在小於30分鐘內用50倍床體積之PBS洗滌,隨後用再懸浮於一倍床體積之PBS中的珠粒對管柱進行加蓋。為了調節再氧化速率,視情況添加50 nM至1 mM氯化銅。藉由移除樹脂之小型測試樣品,在IgG溶離緩衝液(Thermo)中溶離且藉由如上文所述之RP-HPLC分析來監測再氧化進程。再氧化發展至所需完成度後,則可藉由添加與經工程改造之半胱胺酸相比2至3莫耳過量之化合物來立即開始結合,且使混合物在室溫下反應5至10分鐘,隨後用至少20倍管柱體積之PBS洗滌管柱。抗體結合物用IgG溶離緩衝液溶離且用0.1倍體積之0.5 M磷酸鈉(pH 8.0)中和,且緩衝液更換成PBS。或者,代替在樹脂上用抗體引發結合,用至少20倍管柱體積之PBS洗滌管柱,且抗體用IgG溶離緩衝液溶離且用緩衝液(pH 8.0)中和。隨後抗體用於結合反應或急驟冷凍以供未來使用。 HER2 - TLR7 促效劑 結合物之特性 分析抗體-TLR7促效劑結合物以測定結合程度。由經還原及脫糖基化樣品之LC-MS資料外推化合物與抗體比。LC/MS實現結合物樣品中連接至抗體之連接子-有效負載(化合物)之分子之平均數量之定量。HPLC使抗體分離成輕鏈及重鏈,且根據每條鏈中連接子-有效負載基團之數目分離重鏈(HC)及輕鏈(LC)。質譜資料實現混合物中組分物種之鑑別,例如LC、LC+1、LC+2、HC、HC+1、HC+2等。自LC及HC鏈上之平均負載,可計算出抗體結合物之平均化合物與抗體比。既定結合物樣品之化合物與抗體比表示連接至含有兩個輕鏈及兩個重鏈之四聚抗體之化合物(連接子-有效負載)分子之平均數目。 在Superdex 200 10/300 GL (GE Healthcare)及/或Protein KW-803 5 µm 300 × 8 mm (Shodex)管柱上使用分析型尺寸排阻層析(AnSEC)來分析結合物;基於分析型尺寸排阻層析分析聚集。亦藉由在安裝於Agilent 1260 LC系統(Santa Clara, CA, USA)上之Tosoh Bioscience (King of Prussia, PA, USA) TSKgel Butyl-NPR管柱(100 mm × 4.6 mm,2.5 μm)上使用緩衝液A (20 mM His-HCl、1.5 M硫酸銨,pH6.0)及緩衝液B (20 mM His-HCl、15%異丙醇,pH 6.0)之二元梯度進行分析型疏水相互作用層析(AnHIC)剖析結合物,伴隨樣品藉由用0.5倍體積之3 M硫酸銨稀釋大約20 μg之抗體(起初處於PBS中)而製備。對照已知疏水性之四個標準樣品之線性回歸計算疏水性指數。報導以面積計之最大峰之疏水性。 達成高化合物與抗體比之大多數結合物主要為單體且顯示低疏水性(高疏水性指數對應於較早自HIC管柱溶離)。經由此方法之結合使得大多數化合物之結合效率大於95% (表3)。大多數結合物含有低於4%之二聚及寡聚物(表3)。0.80或大於0.80之疏水性指數(HI)視為有利特徵。大多數結合物顯示大於0.8之HI值(表3)。此表明可高效製得結合物且其具有有利特徵。 表3.抗HER2-TLR7促效劑結合物之特性 實例71經由部分還原非經工程改造之抗 - HER2 抗體的原生二硫鍵產生抗 HER2 - TLR7 促效劑 結合物 亦可使用涉及部分還原抗體之程序來使本發明之一些化合物與非經工程改造之抗體的原生半胱胺酸殘基結合(Doronina, S. O.等人,Nat. Biotechnol. 21 , 778-784, 2003)。首先藉由添加TCEP至10 mM之最終濃度且在37℃下培育混合物1小時而使抗HER2抗體之鏈間及鏈內二硫鍵(在5至10 mg/ml之濃度下)在含有2 mM EDTA之PBS中部分還原。脫鹽且添加1% w/v PS-20清潔劑之後,在4℃下使經部分還原之抗體(1至2 mg/ml)與每10 mg抗體0.5至1 mg TLR7促效劑化合物反應隔夜。藉由蛋白質A層析利用標準方法純化所得結合物且將緩衝液更換成PBS,且藉由如上文所述之MS、AnSEC及AnHIC加以剖析。藉由還原抗HER2 mAb3,之後與化合物C-1結合而製得的一種結合物實例的所量測之化合物與抗體比、聚集特性及疏水性資料概述於表3中。 實例72使用 1 , 3 - 二氯丙烷 - 2 - 重新連接非經工程改造之抗 - HER2 抗體之原生鏈間二硫鍵產生抗 HER2 - TLR7 促效劑 結合物 在替代性方法(美國專利申請案20150150998)中,非經工程改造之重組抗HER2抗體的鏈間二硫鍵可經修飾且使用以下兩個步驟與本發明之促效劑化合物結合。流程 15 使用1,3二氯丙烷-2-酮橋連,之後添加至所引入之酮中來進行與原生半胱胺酸殘基之兩步驟結合。 步驟 1 :還原鏈間二硫橋鍵且使用1,3-二氯丙烷-2-酮再橋連:在4℃下將TCEP∙HCl (1.63 mM)添加至抗HER2抗體mAb3 (136 μM)與1,3-二氯丙烷-2-酮(33 mM)於0.1 M HEPES緩衝液(pH 8.0)中之溶液中。在4℃下輕輕攪拌所得混合物持續16小時。隨後使用PD-10脫鹽管柱(GE Healthcare)將反應混合物緩衝液更換至PBS中。使用50K Amicon過濾器濃縮所得溶液,得到經修飾之抗HER2抗體。藉由ESI-MS (溶離劑A:水+ 0.1%甲酸;溶離劑B:乙腈+ 0.04%甲酸;梯度:2分鐘內3至80% B -流速1.0 ml/min 管柱:Proswift Monolith 4.6*50 mm 40℃);145398 Da (脫糖基化之後,藉由PNGase F確認修飾。步驟 2 :促效劑化合物(C-37)之結合:使經修飾之抗HER2抗體(30 mg/ml)與包含經連接之胺基-氧基部分的3.0 mM化合物(C-37)在0.1 M乙酸苯銨緩衝液(pH 4.6)中反應,DMSO最終濃度為15% (v/v)。在23℃下培育反應混合物大約16小時。隨後使用50K Amicon過濾器將反應混合物緩衝液更換至PBS (pH 7.4)中,產生經修飾之抗HER2-化合物結合物。 使用化合物(C-35)與經修飾之抗HER2抗體結合以獲得類似結合物。 藉由如上文所述之MS、AnSEC及AnHIC剖析結合物。所量測之化合物與抗體比、聚集特性及疏水性資料概述於表3中。達成高化合物與抗體比之兩個實例結合物主要為單體且顯示低疏水性(高疏水性指數對應於較早自HIC管柱溶離)。經由此方法之結合產生大於85%之結合效率(表3)。結合物含有低於2%之二聚及寡聚物(表3)。結合物顯示大於0.85之HI值(表3)。此表明可高效製得結合物且其具有有利特徵。 實例73藉由與抗 HER2 抗體之原生離胺酸殘基結合產生抗 HER2 - TLR7 促效劑 結合物 可用本發明之某些化合物經由已獲確認之方法功能化原生抗體。舉例而言,將呈4 mg/ml的於PBS (pH 7.2)中之抗大鼠HER2抗體(7.16.4;購自Bio X Cell;West Lebanon, NH)與760 mM化合物C-47)混合,DMSO最終濃度為20% (v/v)。在室溫下培育反應隔夜,且隨後用50 mM Tris pH 8淬滅。使用類似方法製得與抗HER2 mAb3或與促效劑化合物C-46及C-50之結合物。藉由蛋白質A層析藉由標準方法純化所得抗體結合物且將緩衝液更換為PBS。 藉由如上文所述之MS、AnSEC及AnHIC剖析抗體結合物。所量測之化合物與抗體比、聚集特性及疏水性資料概述於表3中。數種經離胺酸反應之抗體結合物顯示較晚溶離及/或使用AnSEC管柱上的峰之拖尾表明管柱相互作用,其使得難以進行聚集物之偵測。 實例74使用經 A1 標記之抗 HER2 突變體抗體與含有胺基 - 氧基反應性基團之促效劑化合物的兩步驟結合產生抗 HER2 - TLR7 促效劑 結合物 轉譯後4'-磷酸泛醯巰基乙胺化(4'-phosphopantetheinylation)為用於位點特異性標記具有結構上不同之小分子之重組蛋白的通用方法(Yin J等人, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 102:15815-15820, 2005;Zhou Z等人, ACS Chem. Biol. 2:337-346, 2007)。基於混雜4'-磷酸泛醯巰基乙胺基轉移酶(PPTase)之催化作用的此酶促方法用於製備高度均質之抗體結合物(參見WO2013184514)。藉由在抗體之恆定區之不同位點處併入11或12-mer S6、ybbR及A1肽序列來實現酶促標記。舉例而言,可在抗HER2 mAb2之重鏈中之殘基E388 (EU編號)之後併入序列GDSLDMLEWSLM (SEQ ID NO: 31)之A1標記以產生抗HER2 mAb5,其具有SEQ ID NO: 19之輕鏈序列及SEQ ID NO: 32之重鏈序列。一個策略為兩步驟方法以藉由轉譯後4'-磷酸泛醯巰基乙胺化製備位點特異性抗體-化合物結合物(參見WO2013184514)。此方法之第一步驟係基於具有含有生物正交基團,諸如疊氮基、烯烴、炔烴、酮或醛部分之CoA類似物的經肽標記之抗體的經PPTase催化之標記。在親和純化經生物正交方式標記之抗體之後,兩步驟方法之第二步驟涉及包含可與生物正交基團反應之部分的化合物之結合。作為實例,以下部分描述用於在重鏈之恆定區中之特定位點處插入含有A1標記之抗HER2突變抗體的兩步驟方法。此外,儘管兩步驟方法係針對肟連接化學例示,但此策略可延伸至其他生物正交化學,諸如點擊化學,包括不含銅之點擊化學、施陶丁格連接(Staudinger ligation)、異腈類點擊化學及四嗪連接。 若干研究小組已使用肟連接化學作為用於製備位點特異性蛋白質結合物之高效生物正交方法(Axup JY等人, Proc Natl Acad Sci U S A. 109:16101-16106, 2012;Rabuka D等人, Nat Protoc. 7:1052-1067, 2012)。為了使轉譯後4'-磷酸泛醯巰基乙胺化與肟連接組合,以化學酶法由對應泛酸鹽前驅體分子(化合物int-4)使用CoA生物合成酶CoAA、CoAD及CoAE製備經酮修飾之CoA類似物(Worthington AS, Burkart MD (2006) Org Biomol Chem. 4:44-46) (Kosa NM, Haushalter RW, Smith AR, Burkart MD (2012) Nat Methods 9:981-984)。隨後,使用PPTase將生物正交酮基以位點特異性方式酶結合至抗HER2抗體之經嵌入之A1標記上。具體而言,在37℃下在約0.5 μM來自大腸桿菌之AcpS PPTase存在下於補充有12.5 mM MgCl2 及20 mM NaCl之75 mM Tris-HCl緩衝液(pH 8.0)中將2.5 μM 抗HER2 mAb5與30 μM酮-CoA類似物(化合物C-69) (相對於抗體12莫耳當量)結合持續2天。為了促使結合反應完成,反應混合物補充有大約1 μM枯草芽孢桿菌(B . subtilius ) Sfp PPTase,同時將化合物C-69之濃度提高至約60 μM。在室溫下再培育反應4天。藉由獲得經還原及脫糖基化之樣品的解卷積ESI-MS光譜驗證具有酮-CoA類似物(化合物C-69)之抗HER2 mAb5抗體的標記。所觀測到之質量與對應的經酮功能化之重鏈的計算分子量一致。藉由蛋白質A親和性層析法(MabSelect SuRe,GE Healthcare Life Sciences)移除PPTase酶及過量酮-CoA類似物之後,用Pierce™ IgG溶離緩衝液(Thermo Fisher Scientific)溶離經酮活化之抗體,抗HER2-mAb5-(C-69),之後立即用1 M Tris-HCl緩衝液(pH 8.0)中和。將經中和之抗體溶液緩衝液更換至PBS中且使用50K Amicon過濾器濃縮。 酮基之位點特異性連接實現促效劑化合物與經酮活化之抗HER2 mAb5-(C-69)之後續肟連接作為兩步驟方法之第二步驟。在含有7% (v/v) DMSO之100 mM乙酸苯銨緩衝液(pH 4.6)中使48 μM經酮功能化之抗體與30倍莫耳過量(1.4 mM)之胺氧基-促效劑C-35及C-37反應。在室溫下培育17小時之後,藉由用50K Amicon過濾器超濾移除過量胺氧基試劑且用PBS重複洗滌。藉由如上文所述之MS、AnSEC及AnHIC剖析抗體結合物。所量測之化合物與抗體比、聚集特性及疏水性資料概述於表3中。如表3中所示,兩步驟方法得到具有胺氧基-促效劑C-35及C-37的經酮活化之抗HER2 mAb5-(C-69)之接近定量的標記。 - 輔酶 A 類似物 ( 化合物 C - 69 ) 藉由在37℃下在10 μM金黃色葡萄球菌CoAA、25 μM大腸桿菌CoAD及20 μM大腸桿菌CoAE存在下使5 mM化合物(int-4)與25 mM ATP在含有20 mM MgCl2 之50 mM HEPES緩衝液(pH 8.0)中反應持續約16小時而將化合物(int-4)轉化成經酮功能化之CoA類似物(C69)。以20,817 × g離心反應混合物2分鐘之後,藉由超濾經由Amicon 超離心過濾器以10 kDa截止值分離可溶酶。藉由形成抗HER2 mAb5-(C-69)-(C-35)及抗HER2 mAb5-(C-69)-(C-37)來驗證化合物(i-4)酶促轉化成經酮功能化之CoA類似物(C59) (參見表3)。 實例75 HER2 - TLR7 促效劑 結合物之活體外穩定性測試 含有有效負載之順丁烯二醯亞胺與抗體之Cys殘基之間所形成的鍵之穩定性係藉由此反應中所形成之丁二醯亞胺環之水解增強。在小鼠血清中進行活體外培育之後研究丁二醯亞胺環水解對用本發明之促效劑化合物製備的抗體結合物之穩定性的影響。藉由LC-MS監測由有效負載脫結合及與抗體結合的順丁烯二醯亞胺有效負載之丁二醯亞胺環之水解引起的質量變化。已報導丁二醯亞胺環之水解係藉由特定條件,諸如高pH、高溫或高鹽來刺激(J. Am. Chem. Soc. 1955, 77: 3922; Biochemistry 1976, 15: 2836;Biochem. J. 1979,179: 191-197; J Pharm Sci. 1984, 73:1767-1771;Bioorg. Med. Chem. Lett. 17: 6286-6289, 2007)。為了探測結合物之活體外穩定性,在37℃下在50%至70%小鼠血清中培育抗HER2抗體mAb2結合物。在各時間點(典型地0、8、24、48及72小時)獲得50微克結合物樣品且立即急驟冷凍。隨後解凍樣品以供處理及分析。簡言之,用PNGaseF處理抗體以移除N連接聚糖及鄰近重鏈之鉸鏈區切割的蛋白水解酶,以便在用DTT還原而使二硫鍵斷裂之前分離Fab與Fc。隨後藉由ESI-MS分析輕鏈、重鏈Fab及重鏈Fc片段。由對應結合物物種之相關MS強度計算脫結合抗體、具有經連接之有效負載及水解丁二醯亞胺環的結合物及具有經連接之有效負載及完整丁二醯亞胺環的結合物的相關群數。一小類結合物的脫結合程度及丁二醯亞胺水解程度顯示於表4及表5中。一般而言,在72小時活體外培育期間結合物損失低於13%之所負載之化合物,且一般而言,丁二醯亞胺環水解經48小時完成大於85%。由化合物(C-5)及化合物(C-21)例示的本發明之某些化合物展現改良之結合物穩定性,其歸因於經由逆向順丁烯二醯亞胺反應較不易於脫結合且經由丁二醯亞胺環水解得到進一步穩定。 表4. 小鼠血清中隨活體外培育時間變化之抗HER2-TLR7促效劑結合物之丁二醯亞胺環水解 a 抗HER2 mAb2具有SEQ ID NO: 19之LC;SEQ ID NO: 21之HC。 表5. 小鼠血清中隨活體外培育時間變化之抗HER2-TLR7促效劑結合物的化合物與抗體比 a 抗HER2 mAb2具有SEQ ID NO: 19之LC;SEQ ID NO: 21之HC。 實例76 HER2 - TLR7 促效劑 結合物在 N87 胃腫瘤異種移植模型中之活體內測試 材料及方法 對於N87胃癌異種移植小鼠模型,使用6至8週齡之雌性SCID-米色小鼠(購自Harlan Laboratories)來進行植入。使N87細胞(由ATCC獲得,目錄號CRL-5822,供應商批號7686255)在具有5% CO2 之37℃培育箱中在無菌條件下生長兩週。使細胞在具有10%胎牛血清之RPMI培養基中生長。每3至4天用0.05%胰蛋白酶/EDTA對細胞進行繼代。在植入當天,提取N87細胞(繼代4次)且再懸浮於1 × 106 個細胞及50%基質膠/100 µl之濃度下之RPMI1640無血清培養基中。Radil測試細胞以確保其不含黴漿菌及鼠病毒。 使用28g針(100 µl注射體積)以皮下注射將N87細胞植入於下側腹中。植入之後,藉由測徑規量測腫瘤且在可觸摸到腫瘤後每週稱重小鼠兩次。隨後一週二維量測腫瘤兩次。使用(L × W2 )/2計算測徑規量測結果。用正常飲食餵食小鼠且根據實驗室動物之照護及使用指南(Guide for Care and Use of Laboratory Animals)及實驗動物照護及使用委員會(Institutional Animal Care and Use Committee)之規定圈養於SPF動物設備中。 當異種移植腫瘤達至約200 mm3 時,藉由靜脈內途徑向小鼠投與0.3至10 mg/kg抗HER2抗體或抗HER2-TLR7促效劑結合物。藉由以下產生同型對照抗體:表現針對未見於嚙齒動物中之靶向物的抗體且經由針對抗-HER2抗體所述之類似方法結合。一週量測腫瘤兩次。使用Prism 5 (GraphPad)軟體標繪平均腫瘤體積。當腫瘤尺寸達至2000 mm3 之體積時,達成功效研究之終點。注射之後,亦針對臨床惡化之病徵密切監測小鼠。若出於任何原因,小鼠顯示任何發病病徵,包括呼吸窘迫、駝背姿勢、活動減少、後腿麻痹、呈肋膜積液之病徵之呼吸急促、接近20%或15%之體重減輕外加其他病徵,或若其進行正常活動(進食、活動性)之能力減弱,則將小鼠安樂死。結果 用呈1 mg/kg、2.5 mg/kg、5 mg/kg或10 mg/kg之單一劑量之抗HER2-mAb2-(C-1)結合物靜脈內處理N87胃腫瘤異種移植小鼠,其中化合物(C-1)與抗HER2-mAb2重鏈之Cys 152及Cys 375結合。在用呈所測試的全部劑量,包括所測試的1 mg/kg最小劑量的抗HER2-mAb2-(C-1)結合物處理的小鼠中觀測到N87異種移植腫瘤之完全消退(圖1)。當與未經處理之動物相比時,在用10 mg/kg的單獨的非結合之抗HER2-mAb2或同型對照抗體-(C-1)結合物處理的N87異種移植小鼠中未觀測到腫瘤消退(圖1)。 用呈0.3 mg/kg或1 mg/kg任一者之單一劑量之抗HER2-mAb1-(C-1)或抗HER2-mAb1-(C-5)處理N87胃腫瘤異種移植小鼠(每組10隻小鼠)。儘管用單一劑量之1 mg/kg抗HER2-mAb1-(C-1)處理引起人類N87異種移植腫瘤完全消退,但0.3 mg/kg抗HER2-mAb1-(C-1)導致腫瘤停滯(圖2)。類似地,儘管用單一劑量之1 mg/kg 抗HER2-mAb1-(C-5)處理引起人類N87異種移植腫瘤完全消退,但0.3 mg/kg抗HER2-mAb1-(C-5)導致腫瘤停滯(圖2)。當與未經處理之動物相比時,在用同型對照抗體-(C-5)結合物處理之N87異種移植小鼠中未觀測到N87胃腫瘤消退。此等資料顯示,腫瘤消退可藉由呈低劑量,例如1 mg/kg之抗HER2-TLR7促效劑結合物(例如抗HER2-mAb1-(C-1)或抗HER2-mAb1-(C-5)、抗HER2-mAb2-(C-1))之單一治療來達成。 在個別研究中,用呈1 mg/kg、3 mg/kg或5 mg/kg之單一劑量之抗HER2-mAb1-(C-5)處理N87胃腫瘤異種移植小鼠(每組8隻小鼠)。在此研究中,儘管用單一劑量之3 mg/kg或5 mg/kg任一者之抗HER2-mAb1-(C-5)處理引起人類N87異種移植腫瘤完全消退,但1 mg/kg抗HER2-mAb1-(C-5)導致腫瘤停滯(圖3)。 此外,用呈1 mg/kg之單一劑量之抗HER2-mAb1-(C-5)、抗HER2-mAb1-(C-35)、抗HER2-mAb1-(C-37)、抗HER2-mAb1-(C-59)、抗HER2-mAb1-(C-60)、抗HER2-mAb1-(C-61)、抗HER2-mAb1-(C-62)或抗HER2-mAb1-(C-64)任一者處理N87胃腫瘤異種移植小鼠(每組6隻小鼠)。用單一劑量之1 mg/kg與不同化合物結合之抗HER2-mAb1處理導致腫瘤停滯(圖4),其類似於1 mg/kg抗HER2-mAb1-(C-5)之單一劑量處理之後觀測到的結果。 實例77 大鼠 HER2 - TLR7 促效劑 結合物在 MMC ( 大鼠 HER2 + ) 乳癌同基因型模型中之活體內測試 材料及方法 對於MMC (大鼠HER2+ )乳癌同基因型模型,使用表現含有Val664 至Glu664 突變之活化大鼠Erbb2 (c-neu)癌基因的6至10週齡雌性FVB/N轉殖基因小鼠(FVB-Tg(MMTV-Erbb2)NK1Mul/J;最初購自Jackson Laboratories,圈養)來進行植入。使MMC細胞(源自由FVB/N轉殖基因小鼠獲得之腫瘤,該小鼠由華盛頓大學(University of Washington)之教授Nora Disis獲得)在具有5% CO2 之37℃培育箱中在無菌條件下生長兩週。使細胞在具有20%胎牛血清及青黴素/鏈黴素之DMEM培養基中生長。每3至4天用0.05%胰蛋白酶/EDTA對細胞進行繼代。在植入當天,提取細胞(繼代4次)且再懸浮於2.5 × 105 個細胞及10%基質膠/100 µl之濃度下之RPMI1640無血清培養基中。Radil測試細胞以確保其不含黴漿菌及鼠病毒。 使用28規格針(100 µl注射體積)以皮下注射將MMC細胞植入於下側腹中。植入之後,藉由測徑規量測腫瘤且在可觸摸到腫瘤後每週稱重小鼠2次。隨後一週二維量測腫瘤兩次。使用(L × W2 )/2計算測徑規量測結果。用正常飲食餵食小鼠且根據實驗室動物之照護及使用指南及實驗動物照護及使用委員會之規定圈養於SPF動物設備中。 當腫瘤達至約200 mm3 時,藉由靜脈內途徑向八隻小鼠之群投與1 mg/kg抗大鼠HER2抗體(7.16.4,購自Bio X Cell;West Lebanon, NH)或1 mg/kg抗大鼠HER2-TLR7促效劑結合物(抗大鼠HER2-(C-46))。一週量測腫瘤兩次。使用Prism 5 (GraphPad)軟體標繪平均腫瘤體積。當腫瘤尺寸達至2000 mm3 之體積時,達成功效研究之終點。注射之後,亦針對臨床惡化之病徵密切監測小鼠。若出於任何原因,小鼠顯示任何發病病徵,包括呼吸窘迫、駝背姿勢、活動減少、後腿麻痹、呈肋膜積液之病徵之呼吸急促、接近20%或15%之體重減輕外加其他病徵,或若其進行正常活動(進食、活動性)之能力減弱,則將小鼠安樂死。結果 為了測試抗大鼠HER2-(C-46結合物在MMC大鼠HER2+乳癌同基因型模型中之功效,用1 mg/kg抗大鼠HER2-(C-46)結合物或非結合抗大鼠HER2靜脈內處理攜有皮下MMC乳房腫瘤之小鼠(每組8隻小鼠)。如圖5A及圖5B中所示,在用單一劑量之抗大鼠HER2-(C-46)結合物處理的八隻小鼠中之七隻(圖5A)中,但僅在用裸抗大鼠HER2抗體處理的八隻小鼠中之三隻(圖5B)中觀測到MMC小鼠乳房腫瘤(大鼠HER2+)完全消退。 此等資料表明,抗大鼠HER2-(C-46)結合物對大鼠HER2-陽性同基因型乳癌要比單獨的非結合抗大鼠HER2抗體在治療上更有效。 實例78 HER2 - TLR7 促效劑 結合物在 HCC1954 乳房腫瘤異種移植模型中的活體內測試 材料及方法 對於HCC1954乳房異種移植小鼠模型,使用6至8週齡之雌性SCID-米色小鼠(購自Harlan Laboratories)來進行植入。使HCC1954細胞(由ATCC獲得,目錄號CRL-2338,供應商批號5107643)在具有5% CO2 之37℃培育箱中在無菌條件下生長兩週。使細胞在具有10%胎牛血清之RPMI培養基中生長。每3至4天用0.05%胰蛋白酶/EDTA對細胞進行繼代。在植入當天,(收集)提取HCC1954細胞(繼代17次)且再懸浮於1 × 106 個細胞及50%基質膠/100 µl之濃度下之RPMI1640無血清培養基中。Radil測試細胞以確保其不含黴漿菌及鼠病毒。 使用27G針(100 µl注射體積)以皮下注射將HCC1954細胞植入於右乳腺脂肪墊中。植入之後,藉由測徑規量測腫瘤且在可觸摸到腫瘤後每週稱重小鼠兩次。隨後一週二維量測腫瘤兩次。使用(L × W2 )/2計算測徑規量測結果。用正常飲食餵食小鼠且根據實驗室動物之照護及使用指南及實驗動物照護及使用委員會之規定圈養於SPF動物設備中。 當異種移植腫瘤達至約200 mm3 時,藉由靜脈內途徑向小鼠投與1至10 mg/kg抗HER2抗體或抗HER2-TLR7促效劑結合物。藉由以下產生同型對照抗體:表現針對未見於嚙齒動物中之靶向物的抗體且經由針對抗-HER2抗體所述之類似方法結合。一週量測腫瘤兩次。使用Prism 5 (GraphPad)軟體標繪平均腫瘤體積。當腫瘤尺寸達至2000 mm3 之體積時,達成功效研究之終點。注射之後,亦針對臨床惡化之病徵密切監測小鼠。若出於任何原因,小鼠顯示任何發病病徵,包括呼吸窘迫、駝背姿勢、活動減少、後腿麻痹、呈肋膜積液之病徵之呼吸急促、接近20%或15%之體重減輕外加其他病徵,或若其進行正常活動(進食、活動性)之能力減弱,則將小鼠安樂死。結果 用呈1 mg/kg、3 mg/kg或10 mg/kg之單一劑量之抗HER2-mAb1-(C-5)結合物靜脈內處理HCC1954乳房腫瘤異種移植小鼠(每組8隻小鼠),其中化合物(C-5)與抗HER2-mAb1重鏈之Cys 152及Cys 375結合。儘管用單一劑量之10 mg/kg或3 mg/kg 抗HER2-mAb1-(C-5)處理引起人類HCC1954異種移植腫瘤完全消退,但1 mg/kg 抗HER2-mAb1-(C-5)導致初始腫瘤消退,之後腫瘤停滯(圖6)。在用10 mg/kg單獨的非結合抗HER2-mAb2處理之HCC1954異種移植小鼠中未觀測到腫瘤消退(圖6)。 此等資料顯示,可在藉由呈3 mg/kg之抗HER2-TLR7促效劑結合物(抗HER2-mAb1-(C-5))之單一治療的高HER2表現HCC1954乳房腫瘤異種移植物中達成腫瘤消退。 實例79 HER2 - TLR7 促效劑 結合物在 SKOV3 卵巢腫瘤異種移植模型中之活體內測試 材料及方法 對於SKOV3卵巢異種移植小鼠模型,使用6至8週齡之雌性SCID-米色小鼠(購自Harlan Laboratories)來進行植入。使SKOV3細胞(由ATCC獲得,目錄號HTB-77,供應商批號7349765)在具有5% CO2 之37℃培育箱中在無菌條件下生長兩週。使細胞在具有10%胎牛血清之McCoy's5A培養基中生長。每3至4天用0.05%胰蛋白酶/EDTA對細胞進行繼代。在植入當天,(收集)提取SKOV3細胞(繼代11次)且再懸浮於5 × 106 個細胞及50%基質膠/100 µl之濃度下之McCoy's5A無血清培養基中。Radil測試細胞以確保其不含黴漿菌及鼠病毒。 使用28 ½ G(100 µl注射體積)以皮下注射將SKOV3細胞植入於下側腹中。植入之後,藉由測徑規量測腫瘤且每週在可觸摸到腫瘤後稱重小鼠兩次。隨後一週二維量測腫瘤兩次。使用(L × W2 )/2計算測徑規量測結果。用正常飲食餵食小鼠且根據實驗室動物之照護及使用指南及實驗動物照護及使用委員會之規定圈養於SPF動物設備中。 當異種移植腫瘤達至約200 mm3 時,藉由靜脈內途徑向小鼠投與3至10 mg/kg抗HER2抗體或抗HER2-TLR7促效劑結合物。藉由以下產生同型對照抗體:表現針對未見於嚙齒動物中之靶向物的抗體且經由針對抗-HER2抗體所述之類似方法結合。一週量測腫瘤兩次。使用Prism 5 (GraphPad)軟體標繪平均腫瘤體積。當腫瘤尺寸達至2000 mm3 之體積時,達成功效研究之終點。注射之後,亦針對臨床惡化之病徵密切監測小鼠。若出於任何原因,小鼠顯示任何發病病徵,包括呼吸窘迫、駝背姿勢、活動減少、後腿麻痹、呈肋膜積液之病徵之呼吸急促、接近20%或15%之體重減輕外加其他病徵,或若其進行正常活動(進食、活動性)之能力減弱,則將小鼠安樂死。 對於HER2免疫組織化學(IHC),使用標準化指南及用於HER2染色及異種移植HER2評分之方案(參見例如English等人, Mol Diagn Ther. 2013 Apr; 17(2): 85-99)。結果 用呈3 mg/kg或10 mg/kg之單一劑量之抗HER2-mAb1-(C-5)結合物靜脈內處理SKOV3卵巢腫瘤異種移植小鼠,其中化合物(C-5)與抗HER2-mAb1重鏈之Cys 152及Cys 375結合。儘管用單一劑量之10 mg/kg 抗HER2-mAb1-(C-5)處理在8隻小鼠中之7隻中引起人類SKOV3異種移植腫瘤完全消退,但3 mg/kg 抗HER2-mAb1-(C-5)導致初始腫瘤消退,之後腫瘤再生長(圖7)。當與未經處理之動物相比時,在用10 mg/kg單獨的非結合抗HER2-mAb1或同型對照抗體-(C-5)結合物處理的SKOV3異種移植小鼠中未觀測到腫瘤消退(圖7)。 此等資料顯示,可在與N87及HCC異種移植模型相比表現較低水準Her2之異種移植模型中藉由呈10 mg/kg之抗HER2-TLR7促效劑結合物(例如抗HER2-mAb1-(C-1)或抗HER2-mAb1-(C-5))之單一治療達成腫瘤消退(圖8C相較於圖8A及圖8B)。基於HER2表現水準,N87及HCC1954具有3+ IHC評分且SKOV3具有2+ IHC評分。因此,本文所述之抗HER2-TLR7促效劑結合物不僅可在表現高HER2之腫瘤(例如具有3+ IHC評分),並且亦在表現低HER2之腫瘤(例如具有2+ IHC評分)中抑制腫瘤生長。 實例80與抗 PD - 1 組合之 NJH395 C57Bl6 小鼠同基因型腫瘤模型 中之 活體內測試 材料及方法 對於同基因型小鼠模型,使用6至8週齡之雌性C57BL/6小鼠(購自Charles River Laboratories)來進行植入。或者,將hHER2-BAC轉殖基因小鼠回交至C57BL/6背景,且使用6至10週齡之轉殖基因陽性雌性來進行植入。B16F10黑素瘤及MC38結腸腫瘤細胞株兩者均由ATCC獲得且經修飾以表現人類HER2之細胞外域。使細胞在具有5% CO2 之37℃培育箱中在無菌條件下生長兩週。使MC38細胞在補充有10%胎牛血清之DMEM培養基中生長。每2至3天用0.05%胰蛋白酶/EDTA對細胞進行繼代。在植入當天,提取細胞(繼代12次)且再懸浮於2.5 × 105 個細胞/100 µl之濃度下之HBSS中。使B16F10細胞在補充有10%胎牛血清之DMEM培養基中生長。每2至3天用0.05%胰蛋白酶/EDTA對細胞進行繼代。在植入當天,提取細胞(繼代6次)且再懸浮於5 × 105 個細胞/100 µl之濃度下之HBSS中。Radil測試細胞以確保其不含黴漿菌及鼠病毒。 使用28g針(100 µl注射體積)以皮下注射將兩種細胞株植入於下側腹中。植入之後,藉由測徑規量測腫瘤且在可觸摸到腫瘤後每週稱重小鼠3次。隨後一週二維量測腫瘤兩次。使用(L × W2 )/2計算測徑規量測結果。用正常飲食餵食小鼠且根據實驗室動物之照護及使用指南及實驗動物照護及使用委員會之規定圈養於SPF動物設備中。 當同基因型腫瘤達至約100 mm3 時,藉由靜脈內途徑一週向小鼠投與0.1至10 mg/kg單獨NJH395一次,或與腹膜內抗小鼠PD-1 (Bioxcell)組合以10 mg/kg一週、每2週投與兩次。藉由以下產生同型對照抗體:表現針對未見於嚙齒動物中之靶向物的抗體且經由針對NJH395所述之類似方法結合。一週量測腫瘤兩次。使用Prism 5 (GraphPad)軟體標繪平均腫瘤體積。當腫瘤尺寸達至2000 mm3 之體積時,達成功效研究之終點。注射之後,亦針對臨床惡化之病徵密切監測小鼠。若出於任何原因,小鼠顯示任何發病病徵,包括呼吸窘迫、駝背姿勢、活動減少、後腿麻痹、呈肋膜積液之病徵之呼吸急促、接近20%或15%之體重減輕外加其他病徵,或若其進行正常活動(進食、活動性)之能力減弱,則將小鼠安樂死。 實例81與抗 PD - 1 組合之 NJH395 Balb / c 小鼠同基因型腫瘤模型 中之 活體內測試 材料及方法 對於同基因型小鼠模型,使用6至8週齡之雌性Balb/c小鼠(購自Envigo/Charles River Laboratories)來進行植入。4T1-Luc乳房腫瘤細胞株係由ATCC獲得且經修飾以表現人類HER2之額外細胞域。使細胞在具有5% CO2 之37℃培育箱中在無菌條件下生長兩週。使4T1-Luc細胞在補充有10%胎牛血清之RPMI培養基中生長。每3至4天用0.05%胰蛋白酶/EDTA對細胞進行繼代。在植入當天,提取細胞(繼代12次)且再懸浮於1至3 × 104 個細胞/50 µl之濃度下之HBSS中。Radil測試細胞以確保其不含黴漿菌及鼠病毒。 使用28g針(50 µl注射體積)將4T1-Luc細胞植入於第4乳腺脂肪墊中。植入之後,藉由測徑規量測腫瘤且在可觸摸到腫瘤後每週稱重小鼠3次。隨後一週二維量測腫瘤兩次。使用(L × W2 )/2計算測徑規量測結果。用正常飲食餵食小鼠且根據實驗室動物之照護及使用指南及實驗動物照護及使用委員會之規定圈養於SPF動物設備中。 當同基因型腫瘤達至約100 mm3 時,藉由靜脈內途徑一週向小鼠投與0.1至10 mg/kg單獨NJH395一次,或與腹膜內抗小鼠PD-1 (Bioxcell)組合以10 mg/kg一週、每2週投與兩次。藉由以下產生同型對照抗體:表現針對未見於嚙齒動物中之靶向物的抗體且經由針對NJH395所述之類似方法結合。一週量測腫瘤兩次。使用Prism 5 (GraphPad)軟體標繪平均腫瘤體積。當腫瘤尺寸達至2000 mm3 之體積時,達成功效研究之終點。注射之後,亦針對臨床惡化之病徵密切監測小鼠。若出於任何原因,小鼠顯示任何發病病徵,包括呼吸窘迫、駝背姿勢、活動減少、後腿麻痹、呈肋膜積液之病徵之呼吸急促、接近20%或15%之體重減輕外加其他病徵,或若其進行正常活動(進食、活動性)之能力減弱,則將小鼠安樂死。
1 描繪在N87異種移植腫瘤模型中進行抗HER2-mAb2-(C-1)結合物之單一處理之後的結果。當與未經處理之動物(空心圓)相比時,所有測試劑量,包括1 mg/kg (實心菱形)、2.5 mg/kg (實心三角形)、5 mg/kg(實心圓)及10 mg/kg(實心正方形)均觀測到腫瘤消退。當與未經處理之動物(空心圓)相比時,在用10 mg/kg單獨的非結合抗HER2-mAb2 (空心三角形)或同型對照抗體-(C-1)結合物(空心菱形)處理的N87異種移植小鼠中未觀測到N87胃腫瘤消退。資料表示隨時間推移(給藥後)之平均腫瘤體積(平均值+/- SEM)。 2 描繪用單一劑量之抗HER2-mAb1-(C-1)或抗HER2-mAb1-(C-5)處理人類N87異種移植腫瘤之後的結果。當與未經處理之動物(空心圓)相比時,在用1 mg/kg抗HER2-mAb1-(C-1) (實心正方形)或1 mg/kg抗HER2-mAb1-(C-5) (實心三角形)進行處理之後,觀測到人類N87異種移植腫瘤消退,而用0.3 mg/kg抗HER2-mAb1-(C-1) (實心圓)或0.3 mg/kg之抗HER2-mAb1-(C-5) (實心菱形)處理引起腫瘤停滯。當與未經處理之動物(空心圓)相比時,在用同型對照抗體-(C-5)結合物(空心菱形)處理的N87異種移植小鼠中未觀測到N87胃腫瘤消退。資料表示隨時間推移(給藥後)之平均腫瘤體積(平均值+/- SEM)。 3 描繪用單一劑量之抗HER2-mAb1-(C-5)處理人類N87異種移植腫瘤之後的結果。當與未經處理之動物(空心圓)相比時,用5 mg/kg抗HER2-mAb1-(C-5) (實心正方形)或3 mg/kg抗HER2-mAb1-(C-5) (實心圓)進行處理之後,觀測到人類N87異種移植腫瘤消退,而用1 mg/kg抗HER2-mAb1-(C-5) (實心三角形)處理引起腫瘤停滯。資料表示隨時間推移(給藥後)之平均腫瘤體積(平均值+/- SEM)。 4 描繪用單一劑量之與不同化合物結合的抗HER2-mAb1處理人類N87異種移植腫瘤之後的結果。當與未經處理之動物(空心圓)相比時,用1 mg/kg抗HER2-mAb1-(C-5) (實心三角形)、抗HER2-mAb1-(C-60) (空心三角形)、抗HER2-mAb1-(C-59) (實心正方形)、抗HER2-mAb1-(C-61) (空心正方形)、抗HER2-mAb1-(C-35) (實心六邊形)、抗HER2-mAb1-(C-37) (空心六邊形)、抗HER2-mAb1-(C-64) (實心菱形)或抗HER2-mAb1-(C-62) (空心菱形)進行處理之後,觀測到人類N87異種移植腫瘤初始消退,之後停滯。資料表示隨時間推移(給藥後)之平均腫瘤體積(平均值+/- SEM)。 5A 5B 描繪用單一劑量之抗大鼠HER2-(C-46)結合物處理MMC小鼠乳房腫瘤(大鼠HER2陽性)之結果。結果展現,在用抗大鼠HER2-(C-46)結合物處理的八隻小鼠中觀測到有七隻出現腫瘤完全消退( 5A ),但在用抗大鼠HER2抗體處理的八隻小鼠中僅觀測到有三隻出現腫瘤完全消退( 5B )。在MMC乳癌同基因型模型中,當腫瘤平均尺寸達至200 mm3 時,開始進行處理。資料表示隨時間推移(給藥後)之平均腫瘤體積(平均值+/- SEM)。 6 描繪用單一劑量之抗HER2-mAb1-(C-5)處理人類HCC1954乳房異種移植腫瘤之後的結果。當與未經處理之動物(空心圓)相比時,用10 mg/kg抗HER2-mAb1-(C-5) (實心正方形)或3 mg/kg抗HER2-mAb1-(C-5) (實心圓)進行處理之後,觀測到人類HCC1954異種移植腫瘤消退,而用1 mg/kg抗HER2-mAb1-(C-5) (實心三角形)處理引起腫瘤停滯。當與未經處理之動物(空心圓)相比時,在用10 mg/kg同型對照抗體-(C-5)結合物(空心菱形)或單獨的非結合抗HER2-mAb1 (空心三角形)處理的HCC1954異種移植小鼠中未觀測到腫瘤消退。資料表示隨時間推移(給藥後)之平均腫瘤體積(平均值+/- SEM)。 7 描繪用單一劑量之抗HER2-mAb1-(C-5)處理人類SKOV3卵巢異種移植腫瘤之後的結果。當與未經處理之動物(空心圓)相比時,在用10 mg/kg抗HER2-mAb1-(C-5) (實心正方形)進行處理之後,觀測到人類SKOV3異種移植腫瘤消退,而用3 mg/kg 抗HER2-mAb1-(C-5)(實心圓)處理引起初始腫瘤消退,之後腫瘤再生長。當與未經處理之動物(空心圓)相比時,在用10 mg/kg同型對照抗體-(C-5)結合物(空心菱形)或單獨的非結合抗HER2-mAb1 (空心三角形)處理的SKOV3異種移植小鼠中未觀測到腫瘤消退。資料表示隨時間推移(給藥後)之平均腫瘤體積(平均值+/- SEM)。 8A 8C 描繪代表性免疫組織化學(IHC)影像,其顯示N87 ( 8A )、HCC1954 ( 8B )及SKOV3 ( 8C )異種移植腫瘤上之HER2表現。基於腫瘤之HER2表現水準,將其評分為3+ (N87及HCC1954)及2+ (SKOV3)。

Claims (49)

  1. 一種組合物,其包含與第二治療劑組合的結合物或其醫藥學上可接受之鹽,供用於治療個體中之HER2陽性癌症,其中: (i)該結合物包含式(II)結構:式(II) 其中: R50,其中*指示與Ab之連接點; Ab為特異性結合至人類HER2之抗體分子,例如抗體或其抗原結合片段; R1 為-NHR2 或-NHCHR2 R3 ; R2 為-C3 -C6 烷基或-C4 -C6 烷基; R3 為L1 OH; L1 為-(CH2 )m -; L2 為-(CH2 )n -、-((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-(CH2 )n X1 (CH2 )n -、-(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -、-(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n C(=O)NH(CH2 )n -、-((CH2 )n O)t (CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n 、-C(=O)(CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n X1 (CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n C(=O)NH(CH2 )n -、-C(=O)NH((CH2 )n O)t (CH2 )n X1 (CH2 )n -、-C(=O)X2 X3 C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-C(=O)X2 X3 C(=O)(CH2 )n -、-C(=O)X2 C(=O)(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -、-C(=O)X2 C(=O)(CH2 )n NHC(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-C(=O)(CH2 )n C(R7 )2 -、-C(=O)(CH2 )n C(R7 )2 SS(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -、-(CH2 )n X2 C(=O)(CH2 )n NHC(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -或-C(=O)(CH2 )n C(=O)NH(CH2 )n ; R40、-S-、-NHC(=O)CH2 -、-S(=O)2 CH2 CH2 -、-(CH2 )2 S(=O)2 CH2 CH2 -、-NHS(=O)2 CH2 CH2 、-NHC(=O)CH2 CH2 -、-CH2 NHCH2 CH2 -、-NHCH2 CH2 -、 ; X1; X2; X3 ; 各R7 獨立地選自H及C1 -C6 烷基; 各R8 獨立地選自H、C1 -C6 烷基、F、Cl及-OH; 各R9 獨立地選自H、C1 -C6 烷基、F、Cl、-NH2 、-OCH3 、-OCH2 CH3 、-N(CH3 )2 、-CN、-NO2 及-OH; 各R10 獨立地選自H、C1 - 6 烷基、氟基、經-C(=O)OH取代之苯甲氧基、經-C(=O)OH取代之苯甲基、經-C(=O)OH取代之C1 - 4 烷氧基及經-C(=O)OH取代之C1 - 4 烷基; R12 為H、甲基或苯基; 各m獨立地選自1、2、3及4; 各n獨立地選自1、2、3及4; 各t獨立地選自1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17及18,及 y為1至16之整數;及 (ii)該第二治療劑係選自共抑制分子之抑制劑、共刺激分子之活化劑、細胞介素、減少細胞介素釋放症候群(CRS)之藥劑、化學療法、靶向抗癌療法、溶瘤藥物、細胞毒性劑、免疫類療法、疫苗或細胞療法。
  2. 一種組合物在製造用於治療有需要之個體中的HER2陽性癌症之藥劑中之用途,該組合物包含結合物或其醫藥學上可接受之鹽或與第二治療劑組合的結合物或其醫藥學上可接受之鹽,其中: (i)該結合物包含式(II)結構:式(II) 其中: R50,其中*指示與Ab之連接點; Ab為特異性結合至人類HER2之抗體分子,例如抗體或其抗原結合片段; R1 為-NHR2 或-NHCHR2 R3 ; R2 為-C3 -C6 烷基或-C4 -C6 烷基; R3 為L1 OH; L1 為-(CH2 )m -; L2 為-(CH2 )n -、-((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-(CH2 )n X1 (CH2 )n -、-(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -、-(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n C(=O)NH(CH2 )n -、-((CH2 )n O)t (CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n 、-C(=O)(CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n X1 (CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n C(=O)NH(CH2 )n -、-C(=O)NH((CH2 )n O)t (CH2 )n X1 (CH2 )n -、-C(=O)X2 X3 C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-C(=O)X2 X3 C(=O)(CH2 )n -、-C(=O)X2 C(=O)(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -、-C(=O)X2 C(=O)(CH2 )n NHC(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-C(=O)(CH2 )n C(R7 )2 -、-C(=O)(CH2 )n C(R7 )2 SS(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -、-(CH2 )n X2 C(=O)(CH2 )n NHC(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -或-C(=O)(CH2 )n C(=O)NH(CH2 )n ; R40、-S-、-NHC(=O)CH2 -、-S(=O)2 CH2 CH2 -、-(CH2 )2 S(=O)2 CH2 CH2 -、-NHS(=O)2 CH2 CH2 、-NHC(=O)CH2 CH2 -、-CH2 NHCH2 CH2 -、-NHCH2 CH2 -、 ; X1; X2; X3 ; 各R7 獨立地選自H及C1 -C6 烷基; 各R8 獨立地選自H、C1 -C6 烷基、F、Cl及-OH; 各R9 獨立地選自H、C1 -C6 烷基、F、Cl、-NH2 、-OCH3 、-OCH2 CH3 、-N(CH3 )2 、-CN、-NO2 及-OH; 各R10 獨立地選自H、C1 - 6 烷基、氟基、經-C(=O)OH取代之苯甲氧基、經-C(=O)OH取代之苯甲基、經-C(=O)OH取代之C1 - 4 烷氧基及經-C(=O)OH取代之C1 - 4 烷基; R12 為H、甲基或苯基; 各m獨立地選自1、2、3及4; 各n獨立地選自1、2、3及4; 各t獨立地選自1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17及18,及 y為1至16之整數;及 (ii)該第二治療劑係選自共抑制分子之抑制劑、共刺激分子之活化劑、細胞介素、減少細胞介素釋放症候群(CRS)之藥劑、化學療法、靶向抗癌療法、溶瘤藥物、細胞毒性劑、免疫類療法、疫苗或細胞療法。
  3. 一種組合物,其包含與第二治療劑組合的結合物或其醫藥學上可接受之鹽,供用於治療個體中之HER2陽性癌症,其中: (i)該結合物包含式(II)結構:式(II) 其中: R50,其中*指示與Ab之連接點; Ab為特異性結合至人類HER2之抗體分子,例如抗體或其抗原結合片段; R1 為-NHR2 或-NHCHR2 R3 ; R2 為-C3 -C6 烷基或-C4 -C6 烷基; R3 為L1 OH; L1 為-(CH2 )m -; L2 為-(CH2 )n -、-((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-(CH2 )n X1 (CH2 )n -、-(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -、-(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n C(=O)NH(CH2 )n -、-((CH2 )n O)t (CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n 、-C(=O)(CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n X1 (CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n C(=O)NH(CH2 )n -、-C(=O)NH((CH2 )n O)t (CH2 )n X1 (CH2 )n -、-C(=O)X2 X3 C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-C(=O)X2 X3 C(=O)(CH2 )n -、-C(=O)X2 C(=O)(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -、-C(=O)X2 C(=O)(CH2 )n NHC(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-C(=O)(CH2 )n C(R7 )2 -、-C(=O)(CH2 )n C(R7 )2 SS(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -、-(CH2 )n X2 C(=O)(CH2 )n NHC(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -或-C(=O)(CH2 )n C(=O)NH(CH2 )n ; R40、-S-、-NHC(=O)CH2 -、-S(=O)2 CH2 CH2 -、-(CH2 )2 S(=O)2 CH2 CH2 -、-NHS(=O)2 CH2 CH2 、-NHC(=O)CH2 CH2 -、-CH2 NHCH2 CH2 -、-NHCH2 CH2 -、 ; X1; X2; X3 ; 各R7 獨立地選自H及C1 -C6 烷基; 各R8 獨立地選自H、C1 -C6 烷基、F、Cl及-OH; 各R9 獨立地選自H、C1 -C6 烷基、F、Cl、-NH2 、-OCH3 、-OCH2 CH3 、-N(CH3 )2 、-CN、-NO2 及-OH; 各R10 獨立地選自H、C1 - 6 烷基、氟基、經-C(=O)OH取代之苯甲氧基、經-C(=O)OH取代之苯甲基、經-C(=O)OH取代之C1 - 4 烷氧基及經-C(=O)OH取代之C1 - 4 烷基; R12 為H、甲基或苯基; 各m獨立地選自1、2、3及4; 各n獨立地選自1、2、3及4; 各t獨立地選自1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17及18,及 y為1至16之整數;及 (ii)該第二治療劑係選自共抑制分子之抑制劑、共刺激分子之活化劑、細胞介素、減少細胞介素釋放症候群(CRS)之藥劑、化學療法、靶向抗癌療法、溶瘤藥物、細胞毒性劑、免疫類療法、疫苗或細胞療法。
  4. 如請求項1至3中任一項之組合物或用途,其中該Ab係選自以下中之任一者: (a)包含以下之抗體分子: 含有胺基酸序列SEQ ID NO: 1之重鏈互補決定區1 (HCDR1); 含有胺基酸序列SEQ ID NO: 2之重鏈互補決定區2 (HCDR2); 含有胺基酸序列SEQ ID NO: 3之重鏈互補決定區3 (HCDR3); 含有胺基酸序列SEQ ID NO: 11之輕鏈互補決定區1 (LCDR1); 含有胺基酸序列SEQ ID NO: 12之輕鏈互補決定區2 (LCDR2);及 含有胺基酸序列SEQ ID NO: 13之輕鏈互補決定區3 (LCDR3); (b)包含以下之抗體分子: 含有胺基酸序列SEQ ID NO: 4之HCDR1; 含有胺基酸序列SEQ ID NO: 5之HCDR2; 含有胺基酸序列SEQ ID NO: 3之HCDR3; 含有胺基酸序列SEQ ID NO: 14之LCDR1; 含有胺基酸序列SEQ ID NO: 15之LCDR2;及 含有胺基酸序列SEQ ID NO: 16之LCDR3; (c)包含含有胺基酸序列SEQ ID NO: 7之重鏈可變區及含有胺基酸序列SEQ ID NO: 17之輕鏈可變區的抗體分子; (d) 包含含有胺基酸序列SEQ ID NO: 9之重鏈及含有胺基酸序列SEQ ID NO: 19之輕鏈的抗體分子; (e)包含含有胺基酸序列SEQ ID NO: 21之重鏈及含有該胺基酸序列SEQ ID NO: 19之輕鏈的抗體分子; (f)包含含有胺基酸序列SEQ ID NO: 23之重鏈及含有該胺基酸序列SEQ ID NO: 19之輕鏈的抗體分子;或 (g)包含含有胺基酸序列SEQ ID NO: 32之重鏈及含有該胺基酸序列SEQ ID NO: 19之輕鏈的抗體分子。
  5. 如請求項1至3中任一項之組合物或用途,其中該Ab為人類或人類化抗HER2抗體分子。
  6. 如請求項1至3中任一項之組合物或用途,其中該Ab包含經修飾之Fc區。
  7. 如請求項1至3中任一項之組合物或用途,其中該Ab包含處於以下位置(所有位置係依據EU編號)中之一或多者處的半胱胺酸: (a)抗體重鏈之位置152、360及375,及 (b)抗體輕鏈之位置107、159及165。
  8. 如請求項1至3中任一項之組合物或用途,其中該Ab包含處於該等抗體重鏈之位置152及375 (所有位置係依據EU編號)處的半胱胺酸。
  9. 如前述請求項中任一項之組合物或用途,其中該式(II)結合物包含式(IIa)或式(IIb)結構:式(IIa) 式(IIb) 其中: R1 為-NHR2 ; R2 為-C4 -C6 烷基; L2 為-(CH2 )n -、-((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-(CH2 )n X1 (CH2 )n -、-C(=O)(CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n X1 (CH2 )n -、-C(=O)NH((CH2 )n O)t (CH2 )n X1 (CH2 )n -、-C(=O)X2 X3 C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -或-C(=O)X2 C(=O)(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -; R40; X1;X2;X3; 各n獨立地選自1、2、3及4; 各t獨立地選自1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17及18,及 y為1至16之整數。
  10. 如請求項1至8中任一項之組合物或用途,其中 R1 為-NHR2 ; R2 為-C4 -C6 烷基; L2 為-(CH2 )n -或-C(=O)(CH2 )n ; R40; 及 各n獨立地選自1、2、3及4,及 y為1至16之整數。
  11. 如前述請求項中任一項之組合物或用途,其中如藉由疏水相互作用層析所測定,該結合物之疏水性指數為0.8或大於0.8。
  12. 一種組合物,其包含與第二治療劑組合的結合物或其醫藥學上可接受之鹽,供用於治療個體中之HER2陽性癌症,其中: (i)該結合物包含下式中之任一者的結構: , 其中Ab為特異性結合至人類HER2之抗體分子,例如抗體或其抗原結合片段,且y為1至4之整數;及 (ii)該第二治療劑係選自共抑制分子之抑制劑、共刺激分子之活化劑、細胞介素、減少細胞介素釋放症候群(CRS)之藥劑、化學療法、靶向抗癌療法、溶瘤藥物、細胞毒性劑、免疫類療法、疫苗或細胞療法。
  13. 一種組合物在製造用於治療有需要之個體中的HER2陽性癌症之藥劑中之用途,該組合物包含與第二治療劑組合的結合物或其醫藥學上可接受之鹽,其中: (i)該結合物包含下式中之任一者的結構: , 其中Ab為特異性結合至人類HER2之抗體分子,例如抗體或其抗原結合片段,且y為1至4之整數;及 (ii)該第二治療劑係選自共抑制分子之抑制劑、共刺激分子之活化劑、細胞介素、減少細胞介素釋放症候群(CRS)之藥劑、化學療法、靶向抗癌療法、溶瘤藥物、細胞毒性劑、免疫類療法、疫苗或細胞療法。
  14. 一種組合物,其包含與第二治療劑組合的結合物或其醫藥學上可接受之鹽,供用於治療個體中之HER2陽性癌症,其中: (i)該結合物包含下式中之任一者的結構: , 其中Ab為特異性結合至人類HER2之抗體分子,例如抗體或其抗原結合片段,且y為1至4之整數;及 (ii)該第二治療劑係選自共抑制分子之抑制劑、共刺激分子之活化劑、細胞介素、減少細胞介素釋放症候群(CRS)之藥劑、化學療法、靶向抗癌療法、溶瘤藥物、細胞毒性劑、免疫類療法、疫苗或細胞療法。
  15. 如請求項12至14中任一項之組合物或用途,其中該Ab係選自以下中之任一者: (a)包含以下之抗體分子: 含有胺基酸序列SEQ ID NO: 1之重鏈互補決定區1 (HCDR1); 含有胺基酸序列SEQ ID NO: 2之重鏈互補決定區2 (HCDR2); 含有胺基酸序列SEQ ID NO: 3之重鏈互補決定區3 (HCDR3); 含有胺基酸序列SEQ ID NO: 11之輕鏈互補決定區1 (LCDR1); 含有胺基酸序列SEQ ID NO: 12之輕鏈互補決定區2 (LCDR2);及 含有胺基酸序列SEQ ID NO: 13之輕鏈互補決定區3 (LCDR3); (b)包含以下之抗體分子: 含有胺基酸序列SEQ ID NO: 4之HCDR1; 含有胺基酸序列SEQ ID NO: 5之HCDR2; 含有胺基酸序列SEQ ID NO: 3之HCDR3; 含有胺基酸序列SEQ ID NO: 14之LCDR1; 含有胺基酸序列SEQ ID NO: 15之LCDR2;及 含有胺基酸序列SEQ ID NO: 16之LCDR3; (c)包含含有胺基酸序列SEQ ID NO: 7之重鏈可變區及含有胺基酸序列SEQ ID NO: 17之輕鏈可變區的抗體分子; (d) 包含含有胺基酸序列SEQ ID NO: 9之重鏈及含有胺基酸序列SEQ ID NO: 19之輕鏈的抗體分子; (e)包含含有胺基酸序列SEQ ID NO: 21之重鏈及含有該胺基酸序列SEQ ID NO: 19之輕鏈的抗體分子; (f)包含含有胺基酸序列SEQ ID NO: 23之重鏈及含有該胺基酸序列SEQ ID NO: 19之輕鏈的抗體分子;或 (g)包含含有胺基酸序列SEQ ID NO: 32之重鏈及含有該胺基酸序列SEQ ID NO: 19之輕鏈的抗體分子。
  16. 如請求項12至14中任一項之組合物或用途,其中該Ab包含含有該胺基酸序列SEQ ID NO: 9之重鏈及含有該胺基酸序列SEQ ID NO: 19之輕鏈。
  17. 如請求項16之組合物或用途,其中該化合物附接至處於該抗體重鏈之位置152及375 (所有位置係依據EU編號)處的半胱胺酸。
  18. 如請求項12至14中任一項之組合物或用途,其中y為約3至4。
  19. 如請求項12至18中任一項之組合物或用途,其中如藉由疏水相互作用層析所測定,該結合物之疏水性指數為0.8或大於0.8。
  20. 一種組合物,其包含與第二治療劑組合的結合物或其醫藥學上可接受之鹽,供用於治療個體中之癌症,其中: (i)該結合物包含具有式(I)結構之化合物,其附接至抗體分子,例如抗體或其抗原結合片段:式(I) 其中: RD且RE 為H;或RE且RD 為H; R1 為-NHR2 或-NHCHR2 R3 ; R2 為-C3 -C6 烷基或-C4 -C6 烷基; R3 為L1 OH; L1 為-(CH2 )m -; L2 為-(CH2 )n -、-((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-(CH2 )n X1 (CH2 )n -、-(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -、-(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n C(=O)NH(CH2 )n -、-((CH2 )n O)t (CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n 、-C(=O)(CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n X1 (CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n C(=O)NH(CH2 )n -、-C(=O)NH((CH2 )n O)t (CH2 )n X1 (CH2 )n -、-C(=O)X2 X3 C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-C(=O)X2 X3 C(=O)(CH2 )n -、-C(=O)X2 C(=O)(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -、-C(=O)X2 C(=O)(CH2 )n NHC(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-C(=O)(CH2 )n C(R7 )2 -、-C(=O)(CH2 )n C(R7 )2 SS(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -、-(CH2 )n X2 C(=O)(CH2 )n NHC(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -或-C(=O)(CH2 )n C(=O)NH(CH2 )n ; R4、-ONH2 、-NH2、-N3、-NHC(=O)CH=CH2 、-SH、-SR7 、-OH、-SSR6 、-S(=O)2 (CH=CH2 )、-(CH2 )2 S(=O)2 (CH=CH2 )、-NHS(=O)2 (CH=CH2 )、-NHC(=O)CH2 Br、-NHC(=O)CH2 I、-C(O)NHNH2、-CO2 H、-C(O)NHNH2 ; R5; X1; X2; X3 ; R6 為2-吡啶基或4-吡啶基; 各R7 獨立地選自H及C1 -C6 烷基; 各R8 獨立地選自H、C1 -C6 烷基、F、Cl及-OH; 各R9 獨立地選自H、C1 -C6 烷基、F、Cl、-NH2 、-OCH3 、-OCH2 CH3 、-N(CH3 )2 、-CN、-NO2 及-OH; 各R10 獨立地選自H、C1 - 6 烷基、氟基、經-C(=O)OH取代之苯甲氧基、經-C(=O)OH取代之苯甲基、經-C(=O)OH取代之C1 - 4 烷氧基及經-C(=O)OH取代之C1 - 4 烷基; 各m獨立地選自1、2、3及4; 各n獨立地選自1、2、3及4; 及 各t獨立地選自1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17及18;及 (ii)該第二治療劑係選自共抑制分子之抑制劑、共刺激分子之活化劑、細胞介素、減少細胞介素釋放症候群(CRS)之藥劑、化學療法、靶向抗癌療法、溶瘤藥物、細胞毒性劑、免疫類療法、疫苗或細胞療法。
  21. 一種組合物在製造用於治療有需要之個體中的癌症之藥劑中之用途,該組合物包含與第二治療劑組合的結合物或其醫藥學上可接受之鹽,其中: (i)該結合物包含具有該式(I)結構之化合物,其附接至抗體分子,例如抗體或其抗原結合片段:式(I) 其中: RD且RE 為H;或RE且RD 為H; R1 為-NHR2 或-NHCHR2 R3 ; R2 為C3 -C6 烷基或-C4 -C6 烷基; R3 為L1 OH; L1 為-(CH2 )m -; L2 為-(CH2 )n -、-((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-(CH2 )n X1 (CH2 )n -、-(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -、-(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n C(=O)NH(CH2 )n -、-((CH2 )n O)t (CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n 、-C(=O)(CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n X1 (CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -、-C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n C(=O)NH(CH2 )n -、-C(=O)NH((CH2 )n O)t (CH2 )n X1 (CH2 )n -、-C(=O)X2 X3 C(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-C(=O)X2 X3 C(=O)(CH2 )n -、-C(=O)X2 C(=O)(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -、-C(=O)X2 C(=O)(CH2 )n NHC(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -、-C(=O)(CH2 )n C(R7 )2 -、-C(=O)(CH2 )n C(R7 )2 SS(CH2 )n NHC(=O)(CH2 )n -、-(CH2 )n X2 C(=O)(CH2 )n NHC(=O)((CH2 )n O)t (CH2 )n -或-C(=O)(CH2 )n C(=O)NH(CH2 )n ; R4、-ONH2 、-NH2、-N3、-NHC(=O)CH=CH2 、-SH、-SR7 、-OH、-SSR6 、-S(=O)2 (CH=CH2 )、-(CH2 )2 S(=O)2 (CH=CH2 )、-NHS(=O)2 (CH=CH2 )、-NHC(=O)CH2 Br、-NHC(=O)CH2 I、-C(O)NHNH2、-CO2 H、-C(O)NHNH2 ; R5; X1; X2; X3 ; R6 為2-吡啶基或4-吡啶基; 各R7 獨立地選自H及C1 -C6 烷基; 各R8 獨立地選自H、C1 -C6 烷基、F、Cl及-OH; 各R9 獨立地選自H、C1 -C6 烷基、F、Cl、-NH2 、-OCH3 、-OCH2 CH3 、-N(CH3 )2 、-CN、-NO2 及-OH; 各R10 獨立地選自H、C1 - 6 烷基、氟基、經-C(=O)OH取代之苯甲氧基、經-C(=O)OH取代之苯甲基、經-C(=O)OH取代之C1 - 4 烷氧基及經-C(=O)OH取代之C1 - 4 烷基; 各m獨立地選自1、2、3及4; 各n獨立地選自1、2、3及4; 及 各t獨立地選自1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17及18;及 (ii)該第二治療劑係選自共抑制分子之抑制劑、共刺激分子之活化劑、細胞介素、減少細胞介素釋放症候群(CRS)之藥劑、化學療法、靶向抗癌療法、溶瘤藥物、細胞毒性劑、免疫類療法、疫苗或細胞療法。
  22. 如請求項20或21之組合物或用途,其中該癌症為HER2+癌症,且該抗體分子,例如該抗體或其抗原結合片段特異性結合至人類HER2。
  23. 如請求項1至22之組合物或用途,其中該第二治療劑係選自共抑制分子之抑制劑、共刺激分子之活化劑、細胞介素或減少細胞介素釋放症候群(CRS)之藥劑。
  24. 如請求項1至22之組合物或用途,其中該第二治療劑為共抑制分子之抑制劑、共刺激分子之活化劑或細胞介素,其中: (i)該共抑制分子係選自計劃性死亡-1 (PD-1)、計劃性死亡-配位體1 (PD-L1)、淋巴細胞活化基因-3 (LAG-3)或T細胞免疫球蛋白域及黏蛋白域3(TIM-3), (ii)該共刺激分子為糖皮質激素誘導之TNFR相關蛋白(GITR),及 (iii) 該細胞介素為與IL-15受體α (IL-15Ra)之可溶性形式複合的IL-15。
  25. 如請求項24之組合物或用途,其中該第二治療劑為特異性結合至人類PD-1之抗體分子,其中該抗體分子包含: (i) 重鏈可變區(VH),其包含表6或表7中所揭示之任何抗PD-1重鏈胺基酸序列(或與其具有至少約85%、90%、95%、99%或大於99%一致性,及/或具有一個、兩個、三個或大於三個取代、插入或缺失,例如保守取代的序列)的重鏈互補決定區1 (VHCDR1)、VHCDR2及VHCDR3,及/或 輕鏈可變區(VL),其包含表6或表7中所列出之任何抗PD-1輕鏈胺基酸序列(或與其具有至少約85%、90%、95%、99%或大於99%一致性,及/或具有一個、兩個、三個或大於三個取代、插入或缺失,例如保守取代的序列)的輕鏈互補決定區1 (VLCDR1)、VLCDR2及VLCDR3; (ii) VH,其包含表6或表7中所揭示之任何抗PD-1重鏈胺基酸序列(或與其具有至少約85%、90%、95%、99%或大於99%一致性,及/或具有一個、兩個、三個或大於三個取代、插入或缺失,例如保守取代的序列)的VH,及/或 VL,其包含表6或表7中所揭示之任何抗PD-1輕鏈胺基酸序列(或與其具有至少約85%、90%、95%、99%或大於99%一致性,及/或具有一個、兩個、三個或大於三個取代、插入或缺失,例如保守取代的序列)的VL;或 (iii)表6或表7中所揭示之抗PD-1重鏈胺基酸序列(或與其具有至少約85%、90%、95%、99%或大於99%一致性,及/或具有一個、兩個、三個或大於三個取代、插入或缺失,例如保守取代的序列),及/或 表6或表7中所揭示之抗PD-1輕鏈胺基酸序列(或與其具有至少約85%、90%、95%、99%或大於99%一致性,及/或具有一個、兩個、三個或大於三個取代、插入或缺失,例如保守取代的序列)。
  26. 如請求項24之組合物或用途,其中該第二治療劑為特異性結合至人類PD-1之抗體分子,其中該抗體分子包含: (i) VH,其包含SEQ ID NO: 501之VHCDR1胺基酸序列、SEQ ID NO: 502之VHCDR2胺基酸序列及SEQ ID NO: 503之VHCDR3胺基酸序列;及VL,其包含SEQ ID NO: 510之VLCDR1胺基酸序列、SEQ ID NO: 511之VLCDR2胺基酸序列及SEQ ID NO: 512之VLCDR3胺基酸序列; (ii) VH,其包含胺基酸序列SEQ ID NO: 506,及VL,其包含胺基酸序列SEQ ID NO: 520; (iii) 重鏈,其包含胺基酸序列SEQ ID NO: 508,及輕鏈,其包含胺基酸序列SEQ ID NO: 522; (iv) VH,其包含該胺基酸序列SEQ ID NO: 506,及VL,其包含胺基酸序列SEQ ID NO: 516;或 (v) 重鏈,其包含該胺基酸序列SEQ ID NO: 508,及輕鏈,其包含胺基酸序列SEQ ID NO: 518。
  27. 如請求項24之組合物或用途,其中該第二治療劑為特異性結合至人類PD-L1之抗體分子,其中該抗體分子包含: (i)重鏈可變區(VH),其包含表8或表9中所揭示之任何抗PD-L1重鏈胺基酸序列(或與其具有至少約85%、90%、95%、99%或大於99%一致性,及/或具有一個、兩個、三個或大於三個取代、插入或缺失,例如保守取代的序列)的重鏈互補決定區1 (VHCDR1)、VHCDR2及VHCDR3,及/或 輕鏈可變區(VL),其包含表8或表9中所列出之任何抗PD-L1輕鏈胺基酸序列(或與其具有至少約85%、90%、95%、99%或大於99%一致性,及/或具有一個、兩個、三個或大於三個取代、插入或缺失,例如保守取代的序列)的輕鏈互補決定區1 (VLCDR1)、VLCDR2及VLCDR3; (ii) VH,其包含表8或表9中所揭示之任何抗PD-L1重鏈胺基酸序列(或與其具有至少約85%、90%、95%、99%或大於99%一致性,及/或具有一個、兩個、三個或大於三個取代、插入或缺失,例如保守取代的序列)的VH,及/或 VL,其包含表8或表9中所揭示之任何抗PD-L1輕鏈胺基酸序列(或與其具有至少約85%、90%、95%、99%或大於99%一致性,及/或具有一個、兩個、三個或大於三個取代、插入或缺失,例如保守取代的序列)的VL;或 (iii)表8或表9中所揭示之抗PD-L1重鏈胺基酸序列(或與其具有至少約85%、90%、95%、99%或大於99%一致性,及/或具有一個、兩個、三個或大於三個取代、插入或缺失,例如保守取代的序列),及/或 表8或表9中所揭示之抗PD-L1輕鏈胺基酸序列(或與其具有至少約85%、90%、95%、99%或大於99%一致性,及/或具有一個、兩個、三個或大於三個取代、插入或缺失,例如保守取代的序列)。
  28. 如請求項24之組合物或用途,其中該第二治療劑為特異性結合至人類PD-L1之抗體分子,其中該抗體分子包含: (i) VH,其包含SEQ ID NO: 601之VHCDR1胺基酸序列、SEQ ID NO: 602之VHCDR2胺基酸序列及SEQ ID NO: 603之VHCDR3胺基酸序列;及VL,其包含SEQ ID NO: 609之VLCDR1胺基酸序列、SEQ ID NO: 610之VLCDR2胺基酸序列及SEQ ID NO: 611之VLCDR3胺基酸序列; (ii) VH,其包含胺基酸序列SEQ ID NO: 606,及VL,其包含胺基酸序列SEQ ID NO: 616; (iii)重鏈,其包含胺基酸序列SEQ ID NO: 608,及輕鏈,其包含胺基酸序列SEQ ID NO: 618; (iv) VH,其包含胺基酸序列SEQ ID NO: 620,及VL,其包含胺基酸序列SEQ ID NO: 624;或 (v) 重鏈,其包含胺基酸序列SEQ ID NO: 622,及輕鏈,其包含胺基酸序列SEQ ID NO: 626。
  29. 如請求項24之組合物或用途,其中該第二治療劑為特異性結合至人類LAG-3之抗體分子,其中該抗體分子包含: (i)重鏈可變區(VH),其包含表10或表11中所揭示之任何抗LAG-3重鏈胺基酸序列(或與其具有至少約85%、90%、95%、99%或大於99%一致性,及/或具有一個、兩個、三個或大於三個取代、插入或缺失,例如保守取代的序列)的重鏈互補決定區1 (VHCDR1)、VHCDR2及VHCDR3,及/或 輕鏈可變區(VL),其包含表10或表11中所列出之任何抗LAG-3輕鏈胺基酸序列(或與其具有至少約85%、90%、95%、99%或大於99%一致性,及/或具有一個、兩個、三個或大於三個取代、插入或缺失,例如保守取代的序列)的輕鏈互補決定區1 (VLCDR1)、VLCDR2及VLCDR3; (ii) VH,其包含表10或表11中所揭示之任何抗LAG-3重鏈胺基酸序列(或與其具有至少約85%、90%、95%、99%或大於99%一致性,及/或具有一個、兩個、三個或大於三個取代、插入或缺失,例如保守取代的序列)的VH,及/或 VL,其包含表10或表11中所揭示之任何抗LAG-3輕鏈胺基酸序列(或與其具有至少約85%、90%、95%、99%或大於99%一致性,及/或具有一個、兩個、三個或大於三個取代、插入或缺失,例如保守取代的序列)的VL;或 (iii) 表10或表11中所揭示之抗LAG-3重鏈胺基酸序列(或與其具有至少約85%、90%、95%、99%或大於99%一致性,及/或具有一個、兩個、三個或大於三個取代、插入或缺失,例如保守取代的序列),及/或 表10或表11中所揭示之抗LAG-3輕鏈胺基酸序列(或與其具有至少約85%、90%、95%、99%或大於99%一致性,及/或具有一個、兩個、三個或大於三個取代、插入或缺失,例如保守取代的序列)。
  30. 如請求項24之組合物或用途,其中該第二治療劑為特異性結合至人類LAG-3之抗體分子,其中該抗體分子包含: (i) VH,其包含SEQ ID NO: 701之VHCDR1胺基酸序列、SEQ ID NO: 702之VHCDR2胺基酸序列及SEQ ID NO: 703之VHCDR3胺基酸序列;及VL,其包含SEQ ID NO: 710之VLCDR1胺基酸序列、SEQ ID NO: 711之VLCDR2胺基酸序列及SEQ ID NO: 712之VLCDR3胺基酸序列; (ii) VH,其包含胺基酸序列SEQ ID NO: 706,及VL,其包含胺基酸序列SEQ ID NO: 718; (iii)重鏈,其包含胺基酸序列SEQ ID NO: 709,及輕鏈,其包含胺基酸序列SEQ ID NO: 721; (iv) VH,其包含胺基酸序列SEQ ID NO: 724,及VL,其包含胺基酸序列SEQ ID NO: 730;或 (v) 重鏈,其包含胺基酸序列SEQ ID NO: 727,及輕鏈,其包含胺基酸序列SEQ ID NO: 733。
  31. 如請求項24之組合物或用途,其中該第二治療劑為特異性結合至人類TIM-3之抗體分子,其中該抗體分子包含: (i) 重鏈可變區(VH),其包含表12或表13中所揭示之任何抗TIM-3重鏈胺基酸序列(或與其具有至少約85%、90%、95%、99%或大於99%一致性,及/或具有一個、兩個、三個或大於三個取代、插入或缺失,例如保守取代的序列)的重鏈互補決定區1 (VHCDR1)、VHCDR2及VHCDR3,及/或 輕鏈可變區(VL),其包含表12或表13中所列出之任何抗TIM-3輕鏈胺基酸序列(或與其具有至少約85%、90%、95%、99%或大於99%一致性,及/或具有一個、兩個、三個或大於三個取代、插入或缺失,例如保守取代的序列)的輕鏈互補決定區1 (VLCDR1)、VLCDR2及VLCDR3; (ii) VH,其包含表12或表13中所揭示之任何抗TIM-3重鏈胺基酸序列(或與其具有至少約85%、90%、95%、99%或大於99%一致性,及/或具有一個、兩個、三個或大於三個取代、插入或缺失,例如保守取代的序列)的VH,及/或 VL,其包含表12或表13中所揭示之任何抗TIM-3輕鏈胺基酸序列(或與其具有至少約85%、90%、95%、99%或大於99%一致性,及/或具有一個、兩個、三個或大於三個取代、插入或缺失,例如保守取代的序列)的VL;或 (iii)表12或表13中所揭示之抗TIM-3重鏈胺基酸序列(或與其具有至少約85%、90%、95%、99%或大於99%一致性,及/或具有一個、兩個、三個或大於三個取代、插入或缺失,例如保守取代的序列),及/或 表12或表13中所揭示之抗TIM-3輕鏈胺基酸序列(或與其具有至少約85%、90%、95%、99%或大於99%一致性,及/或具有一個、兩個、三個或大於三個取代、插入或缺失,例如保守取代的序列)。
  32. 如請求項24之組合物或用途,其中該第二治療劑為特異性結合至人類TIM-3之抗體分子,其中該抗體分子包含: (i) VH,其包含SEQ ID NO: 801之VHCDR1胺基酸序列、SEQ ID NO: 802之VHCDR2胺基酸序列及SEQ ID NO: 803之VHCDR3胺基酸序列;及VL,其包含SEQ ID NO: 810之VLCDR1胺基酸序列、SEQ ID NO: 811之VLCDR2胺基酸序列及SEQ ID NO: 812之VLCDR3胺基酸序列; (ii) VH,其包含胺基酸序列SEQ ID NO: 806,及VL,其包含胺基酸序列SEQ ID NO: 816; (iii) 重鏈,其包含胺基酸序列SEQ ID NO: 808,及輕鏈,其包含胺基酸序列SEQ ID NO: 818; (iv) VH,其包含SEQ ID NO: 801之VHCDR1胺基酸序列、SEQ ID NO: 820之VHCDR2胺基酸序列及SEQ ID NO: 803之VHCDR3胺基酸序列;及VL,其包含SEQ ID NO: 810之VLCDR1胺基酸序列、SEQ ID NO: 811之VLCDR2胺基酸序列及SEQ ID NO: 812之VLCDR3胺基酸序列; (v) VH,其包含胺基酸序列SEQ ID NO: 822,及VL,其包含胺基酸序列SEQ ID NO: 826;或 (vi) 重鏈,其包含胺基酸序列SEQ ID NO: 824,及輕鏈,其包含胺基酸序列SEQ ID NO: 828。
  33. 如請求項24之組合物或用途,其中該第二治療劑為特異性結合至人類GITR之抗體分子,其中該抗體分子包含: (i) 重鏈可變區(VH),其包含表14或表15中所揭示之任何抗GITR重鏈胺基酸序列(或與其具有至少約85%、90%、95%、99%或大於99%一致性,及/或具有一個、兩個、三個或大於三個取代、插入或缺失,例如保守取代的序列)的重鏈互補決定區1 (VHCDR1)、VHCDR2及VHCDR3,及/或 輕鏈可變區(VL),其包含表14或表15中所列出之任何抗GITR輕鏈胺基酸序列(或與其具有至少約85%、90%、95%、99%或大於99%一致性,及/或具有一個、兩個、三個或大於三個取代、插入或缺失,例如保守取代的序列)的輕鏈互補決定區1 (VLCDR1)、VLCDR2及VLCDR3; (ii) VH,其包含表14或表15中所揭示之任何抗GITR重鏈胺基酸序列(或與其具有至少約85%、90%、95%、99%或大於99%一致性,及/或具有一個、兩個、三個或大於三個取代、插入或缺失,例如保守取代的序列)的VH,及/或 VL,其包含表14或表15中所揭示之任何抗GITR輕鏈胺基酸序列(或與其具有至少約85%、90%、95%、99%或大於99%一致性,及/或具有一個、兩個、三個或大於三個取代、插入或缺失,例如保守取代的序列)的VL;或 (iii) 表14或表15中所揭示之抗GITR重鏈胺基酸序列(或與其具有至少約85%、90%、95%、99%或大於99%一致性,及/或具有一個、兩個、三個或大於三個取代、插入或缺失,例如保守取代的序列),及/或 表14或表15中所揭示之抗GITR輕鏈胺基酸序列(或與其具有至少約85%、90%、95%、99%或大於99%一致性,及/或具有一個、兩個、三個或大於三個取代、插入或缺失,例如保守取代的序列)。
  34. 如請求項24之組合物或用途,其中該第二治療劑為特異性結合至人類GITR之抗體分子,其中該抗體分子包含: (i) VH,其包含SEQ ID NO: 909之VHCDR1胺基酸序列、SEQ ID NO: 911之VHCDR2胺基酸序列及SEQ ID NO: 913之VHCDR3胺基酸序列;及VL,其包含SEQ ID NO: 914之VLCDR1胺基酸序列、SEQ ID NO: 916之VLCDR2胺基酸序列及SEQ ID NO: 918之VLCDR3胺基酸序列; (ii) VH,其包含胺基酸序列SEQ ID NO: 901,及VL,其包含胺基酸序列SEQ ID NO: 902;或 (iii)重鏈,其包含胺基酸序列SEQ ID NO: 903,及輕鏈,其包含胺基酸序列SEQ ID NO: 904。
  35. 如請求項24之組合物或用途,其中該第二治療劑為細胞介素,其中該細胞介素包含與IL-15受體α (IL-15Ra)之可溶性形式複合的IL-15,且其中IL-15及IL-15Ra包含如表16中所揭示之胺基酸序列(或與其具有至少約85%、90%、95%、99%或大於99%一致性,及/或具有一個、兩個、三個或大於三個取代、插入或缺失,例如保守取代的序列)。
  36. 如請求項24之組合物或用途,其中該第二治療劑為細胞介素,其中該細胞介素包含與IL-15受體α (IL-15Ra)之可溶性形式複合的IL-15,且其中IL-15包含胺基酸序列SEQ ID NO: 922且該IL-15Ra之可溶性形式包含胺基酸序列SEQ ID NO: 923。
  37. 如請求項1至22中任一項之組合物或用途,其中該第二治療劑為減少細胞介素釋放症候群(CRS)之藥劑,其中該第二治療劑係選自IL-6抑制劑(例如思圖昔單抗(siltuximab))、IL-6受體(IL-6R)抑制劑(例如托西利單抗(tocilizumab))、巴多昔芬(bazedoxifene)、sgp130阻斷劑、激脈藥物、類固醇(例如皮質類固醇)、免疫抑制劑、組胺H2受體拮抗劑、鎮痛劑(例如乙醯胺苯酚)、解熱劑或機械換氣。
  38. 如請求項1至19中任一項之組合物或用途,其中該HER2陽性癌症係選自胃癌、食道癌、胃食道接合部腺癌(gastroesophageal junction adenocarcinoma)、結腸癌、直腸癌、乳癌、卵巢癌、子宮頸癌、子宮癌、子宮內膜癌、膀胱癌、泌尿道癌、胰臟癌、肺癌、前列腺癌、骨肉瘤、神經母細胞瘤、神經膠母細胞瘤及頭頸癌。
  39. 如前述請求項中任一項之組合物或用途,其中同時或依序投與該結合物及該第二治療劑。
  40. 如前述請求項中任一項之組合物或用途,其中向該個體靜脈內、瘤內或皮下投與該結合物。
  41. 如前述請求項中任一項之組合物或用途,其中以每公斤體重約0.03 mg至6 mg之劑量投與該結合物。
  42. 如前述請求項中任一項之組合物或用途,其中以每公斤體重約0.7 mg至1.4 mg之劑量投與該結合物。
  43. 如前述請求項中任一項之組合物或用途,其中向該個體靜脈內、瘤內或皮下投與該第二治療劑。
  44. 如請求項1至26及38至43中任一項之組合物或用途,其中該第二治療劑為特異性結合至人類PD-1之抗體分子,其中以每公斤體重約50 mg至450 mg之劑量投與該抗體分子。
  45. 如請求項1至26及38至43中任一項之組合物或用途,其中該第二治療劑為特異性結合至人類PD-1之抗體分子,其中以每公斤體重約100 mg、200 mg、300 mg或400 mg之劑量投與該抗體分子。
  46. 如請求項1至26及38至43中任一項之組合物或用途,其中該第二治療劑為特異性結合至人類PD-1之抗體分子,其中以約300 mg之劑量每三週投與該抗體分子一次或每四週投與一次。
  47. 如請求項1至26及38至43中任一項之組合物或用途,其中該第二治療劑為特異性結合至人類PD-1之抗體分子,其中以約400 mg之劑量每三週投與該抗體分子一次或每四週投與一次。
  48. 如前述請求項中任一項之組合物或用途,其中該結合物及該第二治療劑與第三治療劑組合投與,其中該第三治療劑係選自化學療法、靶向抗癌療法、溶瘤藥物、細胞毒性劑、免疫類療法、細胞介素、共抑制分子之抑制劑、共刺激分子之活化劑、減少細胞介素釋放症候群(CRS)之藥劑、疫苗或細胞療法。
  49. 如前述請求項中任一項之組合物或用途,其中以每公斤體重約0.1 mg至4 mg之劑量投與該結合物。
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