TW201718658A - 新穎醣類抗體、醫藥組成物及其用途 - Google Patents

新穎醣類抗體、醫藥組成物及其用途 Download PDF

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Abstract

本發明係提供針對腫瘤相關醣類抗原之抗體或其抗原結合部位。本文亦揭露抑制有需要的個體體內的癌細胞之醫藥組成物及其使用方法。醫藥組成物包含抗體或其抗原結合部位以及至少一藥學上可接受之載體。

Description

新穎醣類抗體、醫藥組成物及其用途
相關申請案之交互參照
本申請案主張 2015 年 10 月 7 日所提出之美國臨時案 62/238,680 號之優先權,其全部內容於此併入本文中作為參考。
本發明係有關於針對與腫瘤相關的醣類抗原的經修飾抗體、相對未經修飾抗體具部份特定胺基酸取代的經修飾抗體、以及未修飾抗體。本發明亦有關於此些抗體於治療、預防或管理像是癌症之疾病或病症或抑制癌細胞的用途。
諸多表面醣類於惡性腫瘤細胞中表現。舉例而言,已指出Globo H (Fuc α1 --> 2Galß1 --> 3GalNAcß1 --> 3Gal α1 --> 4Galß1 --> 4Glc)於各種上皮癌(epithelial cancer)上過度表現且其與乳癌(breast cancer)及小細胞型肺癌(small cell lung carcinoma)之腫瘤攻擊性及不良的預後相關。
上述發現支持針對抑制腫瘤相關醣類之活性設計的治療理論基礎。特別是以與腫瘤相關醣類結合之抗體作為一種治療或抑制癌細胞的手段,因其在血漿中具有較長的半生期及較少的不良反應而受到較多的關注。部分最早期的抗體係為小鼠單株抗體(mAbs),其由免疫上述腫瘤相關醣類之小鼠淋巴細胞的融合瘤(hybridomas)所分泌。然而,將小鼠抗體用於人體仍存在相關的問題,例如無法觸發某些人體效應功能(effector function)及包含細胞因子釋放症候群的不良反應。源自非人類之動物物種之抗體通常被人源化(humanized)以提升效應功能的效用及/或降低不良反應。然而,人源化抗體不具有與未人源化之抗體相當之結合活性。
最佳化人源化抗體之結合親和力之需求仍未被滿足。本發明提供具有最佳化結合親和力之抗體以滿足上述及其他的需求。
本發明提供抗體或其抗原結合部位,其包含結合至醣類抗原或其片段之變異區(variable region)。
在一實施例中,本發明提供抗體或其抗原結合部位,其結合至醣類抗原或其片段且包含重鏈(heavy chain)變異區,其中該重鏈變異區包含三個互補性決定區(complementarity determining regions,CDR),CDR1、CDR2以及CDR3,其分別具有大約90%、大約91%、大約92%、大約93%、大約94%、大約95%、大約96%、大約97%、大約98%、大約99%或大約100%與SEQ ID NO:1、2以及3所載之胺基酸序列同源的胺基酸序列,其中CDR包含至少一選自以下之胺基酸取代:(a) CDR1中之胺基酸殘基28被鹼性胺基酸、非絲氨酸(Serine)之中性胺基酸或疏水性胺基酸取代; (b) CDR1中之胺基酸殘基31被鹼性胺基酸取代; (c) CDR2中之胺基酸殘基57被中性胺基酸、鹼性胺基酸或疏水性胺基酸取代; (d) CDR2中之胺基酸殘基63被中性胺基酸、鹼性胺基酸或非脯氨酸(Proline)之疏水性胺基酸取代或; (e) CDR3中之胺基酸殘基105被鹼性胺基酸、疏水性胺基酸或中性胺基酸取代。
在另一實施例中,本發明提供抗體或其抗原結合部位,其與醣類抗原或其片段結合且包含:輕鏈變異區(light chain variable region),其中該輕鏈變異區包含三個CDR,CDR1、CDR2以及CDR3,其分別具有大約90%、大約91%、大約92%、大約93%、大約94%、大約95%、大約96%、大約97%、大約98%、大約99%或大約100%與SEQ ID NO:7、8以及9所載之胺基酸序列同源的胺基酸序列,其中CDR包含至少一選自以下之胺基酸取代: (a) CDR1中之胺基酸殘基24被中性胺基酸或疏水性胺基酸取代;(b) CDR1中之胺基酸殘基32被中性胺基酸或非甲硫胺酸之疏水性胺基酸取代; (c) CDR2中之胺基酸殘基49被中性胺基酸取代; (d) CDR2中之胺基酸殘基53被中性胺基酸或鹼性胺基酸取代或; (e) CDR3中之胺基酸殘基93被鹼性胺基酸、疏水性胺基酸或非天門冬醯胺酸(Asaparagine)之中性胺基酸取代。
在又一實施例中,本發明提供抗體或其抗原結合部位,其包含: i. 重鏈變異區,其中該重鏈變異區包含三個CDR,CDR1、CDR2以及CDR3,其分別具有大約90%、大約91%、大約92%、大約93%、大約94%、大約95%、大約96%、大約97%、大約98%、大約99%或大約100%與SEQ ID NO:1、2以及3所載之胺基酸序列同源的胺基酸序列,其中重鏈包含至少一選自以下之胺基酸取代:(a) CDR1中之胺基酸殘基28被鹼性胺基酸、非絲氨酸之中性胺基酸或疏水性胺基酸取代; (b) CDR1中之胺基酸殘基31被鹼性胺基酸取代; (c) CDR2中之胺基酸殘基57被中性胺基酸、鹼性胺基酸或疏水性胺基酸取代; (d) CDR2中之胺基酸殘基63被中性胺基酸、鹼性胺基酸或非脯氨酸(Proline)之疏水性胺基酸取代或; (e) CDR3中之胺基酸殘基105被鹼性胺基酸、疏水性胺基酸或中性胺基酸取代。 ii. 輕鏈變異區,其中該輕鏈變異區包含三個CDR,CDR1、CDR2以及CDR3,其分別具有大約90%、大約91%、大約92%、大約93%、大約94%、大約95%、大約96%、大約97%、大約98%、大約99%或大約100%與SEQ ID NO:7、8以及9所載之胺基酸序列同源的胺基酸序列,其中輕鏈包含至少一選自以下之胺基酸取代: (a) CDR1中之胺基酸殘基24被中性胺基酸或疏水性胺基酸取代;(b) CDR1中之胺基酸殘基32被中性胺基酸或非甲硫胺酸之疏水性胺基酸取代; (c) CDR2中之胺基酸殘基49被中性胺基酸取代; (d) CDR2中之胺基酸殘基53被中性胺基酸或鹼性胺基酸取代或; (e) CDR3中之胺基酸殘基93被鹼性胺基酸、疏水性胺基酸或非天門冬醯胺酸(Asaparagine)之中性胺基酸取代。
在第四實施例中,本發明提供抗體或其抗原結合部位,其包含:(a) 重鏈變異區,其中該重鏈變異區包含三個CDR,CDR1、CDR2以及CDR3,其分別具有大約90%、大約91%、大約92%、大約93%、大約94%、大約95%、大約96%、大約97%、大約98%、大約99%或大約100%與SEQ ID NO:1、2以及3所載之胺基酸序列同源的胺基酸序列,以及/或 (b) 輕鏈變異區,其中該輕鏈變異區包含三個CDR,CDR1、CDR2以及CDR3,其分別具有大約90%、大約91%、大約92%、大約93%、大約94%、大約95%、大約96%、大約97%、大約98%、大約99%或大約100%與SEQ ID NO:7、8以及9所載之胺基酸序列同源的胺基酸序列。
部分實施例提供醫藥組成物,其包含如本文所述之抗體或其抗原結合部位及至少一藥學上可接受之載體。
部分實施例亦提供抑制癌細胞之方法,其包含:施予有效量的如本文所述之抗體或其抗原結合部位至需求個體。在一實施例中,該癌細胞為表現Globo H之癌細胞。
本文中「一」乙詞如用於本文中係代表文中其所指之物件之單數或複數型態。例如:「一元素」代表單一元素或複數種元素。
本文中「有效量」乙詞如用於本文中係代表足以減輕癌症之症狀或跡象之抗體或醫藥組成物的劑量,其中症狀或跡象係例如:體重減輕、疼痛及可觸腫塊(palpable mass)之無論透過臨床上(當為可觸腫塊時)或放射學上透過各種成像方法可測得的現象。本文中「有效量」乙詞及「有效治療量」乙詞可交替使用。
本文中「個體」乙詞可指患有癌症之脊椎動物或推定有癌症治療需求之脊椎動物。個體包含所有溫體動物,如哺乳動物,像是靈長類,更佳情形為人類。個體亦可為非人類之靈長類。「個體」乙詞包含馴養動物,如貓、狗等、家畜(例如:牛、馬、豬、綿羊、山羊等)及實驗動物(例如:小鼠、兔子、大鼠、沙鼠、天竺鼠等)。因此,在本文中預期具有獸醫領域的用途及醫藥製劑。
「抗體」乙詞意圖涵蓋抗體、分解片段、特定部位及其變異體,其包含抗體擬物(antibody mimetics)或包含模擬抗體之結構及/或功能之抗體部位或其特定片段或部位,包含單鏈抗體及其片段,其各包含源自本發明之抗體之至少一CDR。抗體包含抗體片段、抗體變異體、單株抗體(monoclonal antibodies)、多株抗體(polyclonal antibodies)以及重組抗體(recombinant antibodies)等。抗體可於小鼠、兔子或人類體內產生。
抗體可具有完整長度或可包含具抗原結合部位的抗體之一或多個片段,其包含但不限於:Fab (例如:由木瓜酵素(papain)分解)、Fab' (例如:由胃蛋白酶分解及部分還原)、F(ab')2 (例如:由胃蛋白酶分解)、facb (例如:由血纖維蛋白溶酶分解)、pFc' (例如:由胃蛋白酶或血纖維蛋白溶酶分解)、Fd(例如:由胃蛋白酶、部分還原及再聚集)、Fv或scFv (例如:由分子生物技術)、二價scFv (bi-scFv)、三價scFv (tri-scFv)、Fd、dAb片段 (例如:Ward 等人., Nature, 341:544-546 (1989))、經分離之CDR、二聚抗體(diabodies)、三聚抗體(tribodies)、線性抗體(linear antibodies)、單鏈抗體分子、由抗體片段組成之雙特異性(bispecific)或多特異性(multispecific)抗體。
利用重組法(recombinant methods)或合成連結子(synthetic linker)藉由加入抗體片段生成之單鏈抗體亦涵蓋於於本發明中。(參照:Bird 等人., Science, 1988, 242:423-426. Huston 等人, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1988, 85:5879-5883)
多特異性或雙特異性抗體或其片段可為對單一目標醣類(例如:Globo H)之不同表位具有特異性或可包含對多於一個目標醣類具有特異性之多個抗原結合域(antigen-binding domains), (例如:對於Globo H、SSEA-3及SSEA-4具有特異性之抗原結合域)。在一實施例中,多特異性抗體或其抗原結合部位包含至少兩種不同的變異域,其中各變異域皆可特異性地結合至個別的醣類抗原或至相同醣類抗原上之不同表位。(參照:Tutt 等人, 1991, J. Immunol. 147:60-69. Kufer 等人, 2004, Trends Biotechnol. 22:238-244) 。本發明中所述之抗體可連結至其他功能性分子(例如:另一胜肽或蛋白質)或與其共表現(co-expressed)。舉例而言,抗體或其片段可功能性地連結(例如:利用化學耦合、基因融合、非共價性連結或其他)至一或多個其他分子實體(如另一抗體或另一抗體片段)以生成具有第二結合特異性(second binding specificity)之雙特異性或多特異性抗體。
抗體或抗原結合部位可為胜肽。此種胜肽可包含胜肽之變異體(variants)、類似物(analogs)、異種同源物(orthologs)、同源物(homologs)及其衍生物,其展現生物活性(例如:與腫瘤相關醣類抗原結合)。胜肽可包含胺基酸之一或多種類似物(包含例如:非天然的胺基酸、僅於無關生物系統之天然生成的胺基酸、來自哺乳動物系統之修飾胺基酸等)、具取代之連結以及其他所屬技術領域中習知之修飾之胜肽。
抗體或其抗原結合部位可為結合至或衍生為其他功能性分子。舉例而言,抗體可功能性連結(藉化學耦合、基因融合、非共價性作用等)至一或多種其他分子實體,如另一抗體、檢測試劑、細胞毒性試劑、藥物試劑、可調控與另一分子之結合的蛋白質或胜肽(如鏈酶卵白素(streptavidin)中心區域或聚組胺酸標識物(polyhistidine tag)、胺基酸連結分子、訊號序列(signal sequence)、免疫基因載體(immunogenic carriers)、或可用於蛋白質純化之配體,如谷胱甘肽-S-轉移酶(glutathione-S-transferase)、聚組胺酸標識物及葡萄球菌蛋白A(staphylococcal protein A)。衍生蛋白質的其中一型係由兩個或多個蛋白質(同型或不同型之蛋白質)交聯生成。合適的交聯劑包含異基雙功能(heterobifunctional)交聯劑或同基雙功能(homobifunctional)交聯劑(例如:雙琥珀醯亞胺辛二酸酯,disuccinimidyl suberate),其中異基雙功能交聯劑具有藉適當的分離劑(例如:3-馬來醯亞胺基苯甲酸-N-羥基琥珀醯亞胺酯,m-maleimidobenzoyl-N-hydroxysuccinimide ester)分離之兩分離反應基。此種交聯劑可自Chemical Company, Rockford, Ill購得。利用其可衍生(或被標記)蛋白的檢測試劑包含螢光化合物、各種酶類、酵素輔成基(prosthetic groups)、發光材料(luminescent materials)、生物發光材料(bioluminescent materials)以及放射性材料(radioactive materials)。例示的螢光檢測試劑包含但不限於:螢光素(fluorescein)、螢光異硫氰酸鹽(fluorescein isothiocyanate)、鹼性蕊香紅(rhodamine)以及藻紅素(phycoerythrin)。蛋白質或抗體亦可以檢測酵素(detectable enzymes),如鹼性磷酸酶(alkaline phosphatase)、辣根過氧化物酶(horseradish peroxidase)、β-半乳糖苷酶(beta-galactosidase)、乙醯膽鹼酯酶(acetylcholinesterase)、葡萄糖氧化酶(glucose oxidase)及其類似物進行衍生。蛋白質亦可以酵素輔成基(例如:鏈酶卵白素/生物素及卵白素/生物素)進行衍生。
抗體之輕鏈或重鏈變異區包含架構區(framework region,FW),其由三個高變區(hypervariable region)所阻斷,高變區亦稱作互補性決定區(complementarity determining regions)或CDRs。在本發明的一態樣中,抗體或其抗原結合部位可具有以下結構:前導序列 -FW1-CDR1-FW2-CDR2-FW3-CDR3- 其中本發明之胺基酸序列FW1、FW2、FW3、CDR1、CDR2、CDR3揭露於表1。
本文提及之抗體或其抗原結合部位之重鏈變異區及輕鏈變異區可取自非人類或人類來源。本文提及之抗體或其抗原結合部位之架構可為人類、人源化、非人類(例如:被修飾過以降低人體內免疫反應之小鼠(murine)架構)、或合成架構(例如:共有序列(consensus sequence))。
本發明所述之抗體亦包含嵌合或人源化之單株抗體,其由融合瘤轉殖之非人類(例如:小鼠)抗體生成。本發明亦涵蓋包含如本文所揭露之一或兩個變異區之抗體或其抗原結合部位,其中變異區的部分序列(如架構序列),被來自至少一不同物種之序列取代,物種包含但不限於:人類、兔子、綿羊、狗、貓、牛、馬、山羊、豬、猴、人猿、大猩猩、黑猩猩、鴨、鵝、雞、兩棲類、爬蟲類以及其他動物。
「人源化抗體」乙詞係代表包含至少一人類架構及至少一(較佳地為全部)來自非人類抗體之CDR,且其中存在之任何恆定區與人類抗體之恆定區(constant region)實質上同源,例如:大約85-90%、至少大約90%、至少大約95%同源。因此,人源化抗體的所有部分(其中CDR可能為例外)為與一或多個人類抗體序列之對應部分實質上同源。人源化抗體可藉以下方式生成:以源自人類變異區之等效序列取代未直接參與抗原結合之部位(例如:架構)之變異區序列。取得人源化抗體之技術對於該領域具通常知識者而言為常規之技術手段,該技術被描述於以下文獻,特別是美國專利第5,225,539號;美國專利第6,548,640號;以及美國專利第6,982,321號。上述技術於該領域中為習知,包含分離、操作及表現一核酸序列,該序列編碼來自至少一重鏈或輕鏈之全部或部分變異區。舉例而言,若取得非人類(例如:小鼠)抗體,則可定序其變異區,且可定義其CDR及架構殘基之位置 (參照:Kabat, E. A., 等人 (1991) Sequences of Proteins of Immunological Interest, Fifth Edition, U.S. Department of Health and Human Services, NIH Publication NO:91-3242。Chothia, C. 等人 (1987) J. Mol. Biol., 196:901-917)。選擇性地,編碼該輕鏈及重鏈變異區之DNA可黏合(ligated)至對應恆定區並接著次選殖(subclone)至適當的表現載體(expression vector)。CDR接枝抗體(CDR-grafted antibody)分子可藉CDR接枝或CDR取代生成。免疫球蛋白鏈之一、二或全部的CDR可被取代。舉例而言,特定抗體的全部CDR可來自至少一部分非人類動物(例如:如表1所呈現之CDR之小鼠)或僅部分CDR可被取代。僅需留存用以結合抗體至預定的醣類抗原(例如Globo H)所需之CDR (參照:Morrison, S. L., 1985, Science, 229:1202-1207。 Oi等人, 1986, BioTechniques, 4:214.美國專利第5,585,089號;第5,225,539號;第5,693,761號及第5,693,762號。歐洲專利第519596號。Jones 等人, 1986, Nature, 321:552-525。Verhoeyan 等人, 1988, Science, 239:1534。Beidler 等人, 1988, J. Immunol., 141:4053-4060。)。
嵌合抗體為其中不同部位自不同動物物種衍生之分子。舉例而言,嵌合抗體可包含自小鼠mAb衍生之變異區及人類免疫球蛋白恆定區。人類恆定區DNA序列可根據習知流程自各種人類細胞分離(參照:Kabat 等人, 1991;及WO 87/02671)。嵌合抗體可藉DNA重組技術生成(參照Morrison, 等人, Proc Natl Acad Sci, 81:6851-6855 (1984))。舉例而言,編碼小鼠(或其他物種)抗體分子之基因被限制酶(restriction enzymes)分解以移除編碼小鼠Fc的區域,並接著將編碼人類Fc恆定區編碼之基因的等效部分取代進重組之DNA分子。嵌合抗體亦可由DNA重組技術生成,其中編碼小鼠V區之DNA可被黏合至編碼人類恆定區之DNA(參照:Better 等人, Science, 1988, 240:1041-1043。Liu 等人 PNAS, 1987 84:3439-3443。Liu 等人, J. Immunol., 1987, 139:3521-3526。Sun 等人 PNAS, 1987, 84:214-218。Nishimura 等人, Canc. Res., 1987, 47:999-1005。Wood 等人 Nature, 1985, 314:446-449。Shaw 等人, J. Natl. Cancer Inst., 1988, 80:1553-1559。國際專利第WO1987002671號及第WO 86/01533號. 歐洲專利申請案:184, 187;171,496;125,023;及173,494。美國專利第4,816,567號 )。
本發明涵蓋所有同型抗體,包含IgG(例如:IgG1、IgG2、IgG3、IgG4)、IgM、IgA(IgA1、IgA2)、IgD或IgE(本發明涵蓋所有分類及子類)。抗體或其抗原結合部位可為哺乳動物(例如:老鼠、人類)抗體或其抗原結合部位。抗體之輕鏈可為κ(kappa)或λ(lambda)型。
本文中「野生型抗體」乙詞及「未修飾抗體」乙詞可交替使用,且係指包含無本發明揭露的一或多個胺基酸取代之胺基酸序列之抗體。
「取代」乙詞可指以另一胺基酸取代未修飾或野生型胺基酸序列中特定部位之胺基酸。舉例而言,取代S28K係代表在位置28(使用卡貝特編號系統(Kabat numbering system))的絲胺酸被離胺酸取代。
特定胺基酸被取代、刪除或加入的抗體或其抗原結合部位亦涵蓋於本發明之範圍內。在一例示性實施例,上述修改(即保留性取代(conservative substitution)、保留性刪除(conservative deletion)或保留性加入(conservative addition))對胜肽之生物特性(如效應功能或結合親和力)不具實質影響。為了將胺基酸修改分類為保留性或非保留性,胺基酸可被分為以下群組:疏水性、中性、酸性、鹼性(詳見表2)。保留性取代涉及同一群組中胺基酸間之取代。非保留性取代即以此些群組中之一群組的胺基酸置換另一群組之胺基酸。Ng 等人(參照Predicting the Effects of Amino Acid Substitutions on Protein Function, Annu. Rev. Genomics Hum. Genet. 2006. 7:61–80)提供各種胺基酸取代(AAS)預測方法之概述,以供該領域之技術人員在不改變蛋白質功能的前提下進行胺基酸的預測及選用。
在另一例示性實施例中,抗體可具CDR中的胺基酸取代藉以例如:提升抗體對抗原之結合親和力。在又一例示性實施例中,選定且少數的受體(acceptor)架構殘基可被其對應供體(donor)胺基酸取代。供體架構可為成熟或生殖細胞人類抗體架構序列或共有序列。關於如何進行表型沉默胺基酸取代之教學可參照Bowie 等人, Science, 247: 1306-1310 (1990)。Cunningham 等人, Science, 244: 1081-1085 (1989)。Ausubel (ed.), Current Protocols in Molecular Biology, John Wiley and Sons, Inc. (1994)。T. Maniatis, E. F. Fritsch and J. Sambrook, Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor laboratory, Cold Spring Harbor, N.Y. (1989)。Pearson, Methods Mol. Biol. 243:307-31 (1994)。Gonnet 等人, Science 256:1443-45 (1992)。
根據本發明中之一態樣,本文中所述之胺基酸取代發生之位置對應於卡貝特編號表(例如:Kabat等人, Sequences of Immunological Interest。第5版Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, Md. (1991)) 。
本發明揭露之抗體或其抗原結合片段、其變異體或其衍生物亦可就其對抗原之結合親和力進行描述或特定。本文中「親和性」乙詞係指分子(例如:抗體)之單一結合位置及其結合對象(例如:腫瘤相關醣類)之間之所有非共價作用之總和強度。除非另有表示,否則「結合親和力」乙詞用本文中時係指反映結合對的對象(例如:抗體及抗原)之間1:1之相互作用之固有結合親和力。分子X與其結合對象Y之親和力通常可由解離常數(Kd)表示。親和力可藉該領域習知的常用方法測量,其包含本文中所述之方法。抗體對醣類抗原的親和力可用任何適合的方法(例如:Berzofsky 等人., “Antibody-Antigen Interactions,” In Fundamental Immunology, Paul, W. E., Ed., Raven Press: New York, N.Y. (1984);Kuby, Janis Immunology, W. H. Freeman and Company: New York, N.Y. (1992)) 或酵素免疫分析法 (ELISA)實驗確定。
本發明所述之抗體及其抗原結合部位可藉由以編碼所需抗體之輕鏈及重鏈(或其部分)之DNA轉型至宿主細胞而生成。抗體可藉標準技術由此些培養物上清液及/或細胞分離並純化。舉例而言,可將編碼抗體之輕鏈、重鏈或其兩者之DNA轉型至宿主細胞。DNA重組技術亦可用於移除結合中非必要之編碼輕鏈及重鏈中之任一或其兩者之DNA(例如:恆定區)之部分或全部。DNA可表現於各種適合的細胞中,包含原核及真核細胞,例如:細菌細胞(例如:大腸桿菌)、酵母菌、植物細胞、昆蟲細胞及哺乳動物細胞。若干哺乳動物細胞株於該領域中為習知且包含可購於美國菌種中心(American Type Culture Collection,ATCC)之永生化細胞株(immortalized cell lines)。細胞的非限制實例包含所有哺乳動物來源或類哺乳動物特性之細胞株,其包含但不限於猴腎臟細胞之未修飾細胞、衍生細胞及/或經改造之變異體(COS,例如:COS-1、COS-7)、HEK293、幼倉鼠腎臟細胞(BHK,例如:BHK21)、中國倉鼠卵巢細胞(CHO)、NS0、PerC6、BSC-1、人類肝癌細胞(例如:Hep G2)、SP2/0、HeLa、馬-達氏牛腎細胞(Madin-Darby bovine kidney, MDBK)、骨髓瘤(myeloma)細胞及淋巴瘤細胞。經改造之變異體包含:例如:醣鏈分佈修飾(glycan profile modified)及/或位點-特異性整合位點衍生物(site-specific integration site derivatives)。
本文所述之所有數量皆為約略值且可以「大約」修飾。未修飾抗體
本發明提供不含本文所揭露之至少一胺基酸取代之抗體或其抗原結合部位(未修飾抗體或野生型抗體)。
在本發明之一態樣中,未修飾抗體或其抗原結合部位包含重鏈變異區,其中該重鏈變異區包含三個CDR(CDR1、CDR2以及CDR3),其分別具有大約80%、大約81%、大約82%、大約83%、大約84%、大約85%、大約86%、大約87%、大約88%、大約89%、大約90%、大約91%、大約92%、大約93%、大約94%、大約95%、大約96%、大約97%、大約98%、大約99%或大約100%與SEQ ID NO:1、2以及3所載之胺基酸序列同源的胺基酸序列。
在部分實施例中,未修飾抗體或其抗原結合部位之重鏈變異區進一步包含至少一選自以下之架構:(i)於前導序列及重鏈之CDR1之間的架構,其具有大約80%、大約81%、大約82%、大約83%、大約84%、大約85%、大約86%、大約87%、大約88%、大約89%、大約90%、大約91%、大約92%、大約93%、大約94%、大約95%、大約96%、大約97%、大約98%、大約99%或大約100%與SEQ ID NO:4同源的胺基酸序列;(ii)於重鏈之CDR1及CDR2之間的架構,其具有大約80%、大約81%、大約82%、大約83%、大約84%、大約85%、大約86%、大約87%、大約88%、大約89%、大約90%、大約91%、大約92%、大約93%、大約94%、大約95%、大約96%、大約97%、大約98%、大約99%或大約100%與SEQ ID NO:5同源的胺基酸序列;(iii)於重鏈之CDR2及CDR3之間的架構,其具有大約80%、大約81%、大約82%、大約83%、大約84%、大約85%、大約86%、大約87%、大約88%、大約89%、大約90%、大約91%、大約92%、大約93%、大約94%、大約95%、大約96%、大約97%、大約98%、大約99%或大約100%與SEQ ID NO:6同源之胺基酸序列。
在另一實施例中,重鏈變異區的架構2(SEQ ID NO:5)中之胺基酸殘基46(或由架構2之C端算起第6個胺基酸殘基)為甘胺酸且未經取代。SEQ ID NO:5的胺基酸殘基位置呈現如下: *架構2之胺基酸殘基38(W)為與CDR1相鄰之殘基或由架構2之N端起算之第1個胺基酸殘基。 **架構2之胺基酸殘基51(A)為與CDR2相鄰之殘基或由架構2之C端起算之第1個胺基酸殘基。
在本發明的另一態樣中,未修飾抗體或其抗原結合部位包含輕鏈變異區,其中輕鏈變異區包含三個CDR(CDR1、CDR2以及CDR3),其分別具有大約80%、大約81%、大約82%、大約83%、大約84%、大約85%、大約86%、大約87%、大約88%、大約89%、大約90%、大約91%、大約92%、大約93%、大約94%、大約95%、大約96%、大約97%、大約98%、大約99%或大約100%與SEQ ID NO:7、8以及9中所載之胺基酸序列同源的胺基酸序列。
在部分實施例中,未修飾抗體或其抗原結合部位之輕鏈變異區進一步包含至少一選自以下之架構:(a)於前導序列及輕鏈之CDR1之間的架構,其具有大約80%、大約81%、大約82%、大約83%、大約84%、大約85%、大約86%、大約87%、大約88%、大約89%、大約90%、大約91%、大約92%、大約93%、大約94%、大約95%、大約96%、大約97%、大約98%、大約99%或大約100%與SEQ ID NO:10同源的胺基酸序列;(b)於輕鏈之CDR1及CDR2之間的架構,其具有大約80%、大約81%、大約82%、大約83%、大約84%、大約85%、大約86%、大約87%、大約88%、大約89%、大約90%、大約91%、大約92%、大約93%、大約94%、大約95%、大約96%、大約97%、大約98%、大約99%或大約100%與SEQ ID NO:11同源的胺基酸序列;(c)於輕鏈之CDR2及CDR3之間的架構,其具有大約80%、大約81%、大約82%、大約83%、大約84%、大約85%、大約86%、大約87%、大約88%、大約89%、大約90%、大約91%、大約92%、大約93%、大約94%、大約95%、大約96%、大約97%、大約98%、大約99%或大約100%與SEQ ID NO:12同源的胺基酸序列。
在其他實施例中,在胺基酸殘基45及/或胺基酸殘基46未被取代的前提下,輕鏈之架構2(SEQ ID NO:11)中之胺基酸殘基45(或由架構2之C端算起第4個胺基酸殘基)為脯胺酸及/或輕鏈之架構2中之胺基酸殘基46(或由架構2之C端算起第3個胺基酸殘基)為色胺酸。SEQ ID NO:11的胺基酸的位置呈現如下: *在架構2之位置34的胺基酸(W)為與CDR1相鄰之殘基或由架構2之N端起算之第1個胺基酸殘基。 **在架構2之位置48之胺基酸(Y)為與CDR2相鄰之殘基或由架構2之C端起算之第1個胺基酸殘基。
本發明所述之未修飾抗體亦包含與腫瘤醣類或其片段結合之人源化抗體。在一實施例中,人源化抗體包含具有大約80%、大約81%、大約82%、大約83%、大約84%、大約85%、大約86%、大約87%、大約88%、大約89%、大約90%、大約91%、大約92%、大約93%、大約94%、大約95%、大約96%、大約97%、大約98%、大約99%或大約100%與SEQ ID NO:13同源的胺基酸序列之重鏈變異區;及/或輕鏈變異區包含具有大約80%、大約81%、大約82%、大約83%、大約84%、大約85%、大約86%、大約87%、大約88%、大約89%、大約90%、大約91%、大約92%、大約93%、大約94%、大約95%、大約96%、大約97%、大約98%、大約99%或大約100%與SEQ ID NO:14同源的胺基酸序列之輕鏈。
本發明所述之未修飾抗體亦包含與腫瘤醣類或其片段結合之嵌合抗體。在一實施例中,該嵌合抗體包含具有大約80%、大約81%、大約82%、大約83%、大約84%、大約85%、大約86%、大約87%、大約88%、大約89%、大約90%、大約91%、大約92%、大約93%、大約94%、大約95%、大約96%、大約97%、大約98%、大約99%或大約100%與SEQ ID NO:57同源的胺基酸序列之重鏈變異區;及/或輕鏈變異區包含具有大約80%、大約81%、大約82%、大約83%、大約84%、大約85%、大約86%、大約87%、大約88%、大約89%、大約90%、大約91%、大約92%、大約93%、大約94%、大約95%、大約96%、大約97%、大約98%、大約99%或大約100%與SEQ ID NO:58同源的胺基酸序列的輕鏈。
在部分實施例中,未修飾抗體或其抗原結合部位係由命名為2C2之融合瘤(寄存於ATCC Accession NO:: PTA-121138)所得之非人類抗體生成。見PCT/US15/25305,其全部內容於此併入本文中作為參考。
表1係呈現未修飾抗體及經修飾抗體之一例示性實施例之重鏈變異區、輕鏈變異區、CDR以及FW的胺基酸序列。
表1 經修飾抗體
根據其於本領域之描述及教導,可以設想在部分實施例中,相較於野生型對應抗體,本發明所述之經修飾抗體可包含一或多種修改(例如:於一或多個CDR中)。經修飾抗體相較於其未修飾野生型對應抗體將留存與用於治療之應用所需的特性實質上相同之特性。然而認為相較於自其生成經修飾抗體之未修飾野生型抗體,於本文所述的一些胺基酸殘基中之位置的修改將生成對腫瘤相關醣類具有提升或最佳化結合親和力的經修飾抗體。在一實施例中,本發明所述之經修飾抗體為「親和性成熟」抗體。
修改的一個類型包含取代野生型/未修飾抗體之CDR的一或多個胺基酸殘基以生成經修飾抗體。此種經修飾抗體可利用以噬菌體呈現為基礎的親和力增進技術(phage display-based affinity maturation techniques)而便利的生成。簡言之,將數個高變區位(例如:6-7位)突變以在每個位置產生所有可能的胺基酸取代。因此生成之抗體於融合至包覆於每個粒子中至少一部份之噬菌體外膜蛋白(例如:M13的基因III產物)時,自花絲狀噬菌體粒子(filamentous phage particles) 呈現。其後,篩選該噬菌體-呈現的變異體之生物活性(例如結合親和力)。為確認用以修飾的候選高變區位,可執行掃描式突變(scanning mutagenesis)(例如:丙胺酸掃描)以確認對抗原結合有顯著貢獻的高變區殘基。替代性地,或另外,其可有助於分析抗原-抗體複合物(antigen-antibody complex)之晶體結構以確認抗體及抗原間之接觸位點。根據包含本文中所詳述之本領域之習知技術,接觸殘基及相鄰殘基為取代之候選殘基。一旦生成經修飾抗體,則利用包含本文中所詳述之該領域所知之技術對變異體體群進行篩選,且在一或多個相關分析中可選定具優異特性之經修飾抗體以進行進一步的開發。
經修飾抗體亦可由描述於,例如: Mark 等人, 1992, (affinity maturation by variable heavy chain (VH) and variable light chain (VL) domain shuffling)或 Barbas, 等人, 1994;Shier 等人, 1995;Yelton 等人, 1995;Jackson 等人, 1995;及Hawkins等人, 1992 (random mutagenesis of CDR and/or framework residues)之方法生成。
在本發明之一態樣中,本發明所述之經修飾抗體或其抗原結合部位包含重鏈變異區,其中該重鏈變異區包含三個CDR(CDR1、CDR2以及CDR3),其分別具有大約80%、大約81%、大約82%、大約83%、大約84%、大約85%、大約86%、大約87%、大約88%、大約89%、大約90%、大約91%、大約92%、大約93%、大約94%、大約95%、大約96%、大約97%、大約98%、大約99%或大約100%與SEQ ID NO:1、2以及3所載之胺基酸序列同源的胺基酸序列;其中選自胺基酸殘基28、31、57、63或105中之至少一胺基酸殘基被與存在於該未修飾抗體中之胺基酸不同之另一胺基酸取代,進而提升未修飾抗體的結合親和力大約5%、大約10%、大約20%、大約30%、大約40%、大約50%、大約60%、大約70%、大約80%、大約90%、大約100%、大約150%、大約200%、大約300%、大約400%、大約500%、大約600%或大約700%。
在一實施例中,經修飾抗體的重鏈變異區包含至少一種以下胺基酸取代: (a) CDR1中之胺基酸殘基28(絲氨酸)被鹼性胺基酸、非絲氨酸之中性胺基酸或疏水性胺基酸取代; (b) CDR1中之胺基酸殘基31(蘇胺酸)被鹼性胺基酸取代; (c) CDR2中之胺基酸殘基57(天門冬胺酸)被中性胺基酸、鹼性胺基酸或疏水性胺基酸取代; (d) CDR2中之胺基酸殘基63(脯胺酸)被中性胺基酸、鹼性胺基酸或非脯氨酸之疏水性胺基酸取代,以及/或; (e) CDR3中之胺基酸殘基105(天門冬胺酸)被鹼性胺基酸、疏水性胺基酸或中性胺基酸取代。
二十種胺基酸根據其側鏈被分成四個類別(鹼性、中性、疏水性以及酸性)。表2列出四個類別的胺基酸。
表2
實施例包含在重鏈區具有至少一以下胺基酸取代之經修飾抗體:(a) CDR1中之胺基酸殘基28(或由CDR1之N端起算之第3個胺基酸殘基)被鹼性胺基酸;非絲氨酸、甘胺酸或麩醯胺酸之中性胺基酸;或非異白胺酸、白胺酸、甲硫胺酸或色胺酸之疏水性胺基酸取代,(b) CDR1中之胺基酸殘基31(或由CDR1之N端起算之第6個胺基酸殘基)被非組胺酸之鹼性胺基酸取代,(c) CDR2中之胺基酸殘基57(或由CDR2之N端起算之第6個胺基酸殘基)被非天門冬醯胺酸或蘇胺酸之中性胺基酸;鹼性胺基酸或非異白胺酸、脯胺酸或纈胺酸之疏水性胺基酸取代,(d) CDR2中之胺基酸殘基63(或由CDR2之C端起算之第5個胺基酸殘基)被非天門冬醯胺酸、麩醯胺酸或蘇胺酸之中性胺基酸;鹼性胺基酸或非脯氨酸或甲硫胺酸之疏水性胺基酸取代或,(e) CDR3中之胺基酸殘基105(或由CDR3之N端起算之第6個胺基酸殘基)被鹼性胺基酸、中性胺基酸或非白胺酸之疏水性胺基酸取代。
表3提供經修飾抗體之重鏈變異區之胺基酸取代之實例。對於各取代而言,其第一字母表示未修飾抗體的胺基酸,其數字代表其根據卡貝特編號表之位置,且其第二字母代表經修飾抗體的胺基酸。例如:在胺基酸殘基28的絲胺酸被離胺酸(S028K)、精胺酸(S028R)、酪胺酸(S028Y)或苯丙胺酸(S028F)取代,在胺基酸殘基31的蘇胺酸被離胺酸(T031K)或精胺酸(T031R)取代,在胺基酸殘基57的天門冬胺酸被甘胺酸(D057G)、絲胺酸(D057S)、麩醯胺酸(D057Q)、組胺酸(D057H)或色胺酸(D057W)取代,在胺基酸殘基63的脯胺酸被組胺酸(P063H)、精胺酸(P063R)、酪胺酸(P063Y)、丙胺酸(P063A)、白胺酸(P063L)或纈胺酸(P063V)取代,在胺基酸殘基105的天門冬胺酸被精胺酸(D105R)、甘胺酸(D105G)、蘇胺酸(D105T)、甲硫胺酸(D105M)、丙胺酸(D105A)、異白胺酸(D105I)、離胺酸(D105K)或纈胺酸(D105V)取代。
表3
在本發明之另一態樣中,本發明所述之經修飾抗體或其抗原結合部位包含輕鏈變異區,其中輕鏈變異區包含三個CDR(CDR1、CDR2以及CDR3),其分別具有大約80%、大約81%、大約82%、大約83%、大約84%、大約85%、大約86%、大約87%、大約88%、大約89%、大約90%、大約91%、大約92%、大約93%、大約94%、大約95%、大約96%、大約97%、大約98%、大約99%或大約100%與SEQ ID NO:7、8以及9所載之胺基酸序列同源的胺基酸序列;其中選自胺基酸殘基24、32、49、53或93中之至少一之胺基酸殘基被與存在於未修飾抗體中之胺基酸不同之另一胺基酸取代,進而提升未修飾抗體的結合親和力大約5%、大約10%、大約20%、大約30%、大約40%、大約50%、大約60%、大約70%、大約80%、大約90%、大約100%、大約150%、大約200%、大約300%、大約400%、大約500%、大約600%或大約700%。
在一實施例中,經修飾抗體的輕鏈變異區包含至少一種以下胺基酸取代: (a) CDR1中之胺基酸殘基24(精胺酸)(或由CDR1之N端起算之第1個胺基酸殘基)被中性胺基酸或疏水性胺基酸取代, (b) CDR1中之胺基酸殘基32(甲硫胺酸)(或由CDR1之C端起算之第2個胺基酸殘基)被中性胺基酸或非甲硫胺酸之疏水性胺基酸取代, (c) CDR2中之胺基酸殘基49(丙胺酸)(或由CDR2之N端起算之第1個胺基酸殘基)被中性胺基酸取代, (d) CDR2中之胺基酸殘基53(白胺酸)(或由CDR2之N端起算之第5個胺基酸殘基)被中性胺基酸或鹼性胺基酸取代,或 (e) CDR3中之胺基酸殘基93(天門冬醯胺酸)(或由CDR3之N端起算之第6個胺基酸殘基)被非天門冬醯胺酸之中性胺基酸、鹼性胺基酸或疏水性胺基酸取代。
實施例包含在輕鏈區具有至少一以下胺基酸取代之經修飾抗體之:(a) CDR1中之胺基酸殘基24被非蘇胺酸之中性胺基酸或非甲硫胺酸、脯胺酸或纈胺酸之疏水性胺基酸取代,(b) CDR1中之胺基酸殘基32被非絲胺酸或蘇胺酸之中性胺基酸或非甲硫胺酸、白胺酸或色胺酸之疏水性胺基酸取代,(c) CDR2中之胺基酸殘基49被非天門冬醯胺酸或蘇胺酸之中性胺基酸取代,(d) CDR2中之胺基酸殘基53被非天門冬醯胺酸或絲胺酸之中性胺基酸或非精胺酸之鹼性胺基酸取代,或 (e) CDR3中之胺基酸殘基93被非天門冬醯胺酸之中性胺基酸;鹼性胺基酸或非纈胺酸之疏水性胺基酸取代。
表4提供經修飾抗體之輕鏈變異區之該胺基酸取代之實例。舉例而言,使用卡貝特編號表,在位置24之胺基酸殘基被甘胺酸(R024G)、絲胺酸(R024S)或色胺酸(R024W)取代,在位置32的胺基酸殘基被甘胺酸(M032G)、麩醯胺酸(M032Q)或纈胺酸(M032V)取代,在位置49的胺基酸殘基被甘胺酸(A049G)取代,在位置53的胺基酸殘基被離胺酸(L053K)、甘胺酸(L053G)或蘇胺酸(L053T)取代,在位置93的胺基酸殘基被精胺酸(N093R)、麩醯胺酸(N093Q)、絲胺酸(N093S)、蘇胺酸(N093T)、苯丙胺酸(N0936F)、白胺酸(N093L)或甲硫胺酸(N093M)取代。
表4
在一實施例中,經修飾抗體包含: (a) 重鏈變異區,其包含三個CDR( CDR1、CDR2以及CDR3),其分別具有大約80%、大約81%、大約82%、大約83%、大約84%、大約85%、大約86%、大約87%、大約88%、大約89%、大約90%、大約91%、大約92%、大約93%、大約94%、大約95%、大約96%、大約97%、大約98%、大約99%或大約100%與SEQ ID NO:1、2以及3所載之胺基酸序列同源的胺基酸序列,且包含至少一之以下胺基酸取代: (i) CDR1中之胺基酸殘基28被離胺酸(S028K)、精胺酸(S028R)、酪胺酸(S028Y)或苯丙胺酸(S028F)取代, (ii) CDR1中之胺基酸殘基31被離胺酸(T031K)或精胺酸(T031R)取代, (iii) CDR2中之胺基酸殘基57被組胺酸(D057H)、甘胺酸(D057G)、絲胺酸(D057S)、麩醯胺酸(D057Q)或色胺酸(D057W)取代, (iv) CDR2中之胺基酸殘基63被組胺酸(P063H)、精胺酸(P063R)、酪胺酸(P063Y)、丙胺酸(P063A)、白胺酸(P063L)或纈胺酸(P063V)取代, (v) CDR3中之胺基酸殘基105被精胺酸(D105R)、甘胺酸(D105G)、蘇胺酸(D105T)、甲硫胺酸(D105M)、丙胺酸(D105A)、異白胺酸(D105I)、離胺酸(D105K)或纈胺酸(D105V)取代,以及/或 (b) 輕鏈變異區,其包含三個CDR(CDR1、CDR2以及CDR3),其分別具有大約80%、大約81%、大約82%、大約83%、大約84%、大約85%、大約86%、大約87%、大約88%、大約89%、大約90%、大約91%、大約92%、大約93%、大約94%、大約95%、大約96%、大約97%、大約98%、大約99%或大約100%與SEQ ID NO:7、8以及9所載之胺基酸序列同源的胺基酸序列且包含至少一以下胺基酸取代: (i) CDR1中之胺基酸殘基24被甘胺酸(R024G)、絲胺酸(R024S)或色胺酸(R024W)取代, (ii) CDR1中之胺基酸殘基32被甘胺酸(M032G)、麩醯胺酸(M032Q)或纈胺酸(M032V)取代, (iii) CDR2中之胺基酸殘基49被甘胺酸(A049G)取代, (iv) CDR2中之胺基酸殘基53被離胺酸(L053K)、甘胺酸(L053G)或蘇胺酸(L053T)取代, (v) CDR3中之胺基酸殘基93被精胺酸(N093R)、麩醯胺酸(N093Q)、絲胺酸(N093S)、蘇胺酸(N093T)、苯丙胺酸(N093F)、白胺酸(N093L)或甲硫胺酸(N093M)。
在另一實施例中,經修飾抗體包含: (a) 重鏈變異區,其包含三個CDR(CDR1、CDR2以及CDR3),其分別具有大約80%、大約81%、大約82%、大約83%、大約84%、大約85%、大約86%、大約87%、大約88%、大約89%、大約90%、大約91%、大約92%、大約93%、大約94%、大約95%、大約96%、大約97%、大約98%、大約99%或大約100%與SEQ ID NO:1、2以及3所載之胺基酸序列同源的胺基酸序列且包含至少一以下胺基酸取代: (i) CDR1中之胺基酸殘基28被精胺酸(S028R)取代, (ii) CDR1中之胺基酸殘基31被精胺酸(T031R)取代, (iii) CDR2中之胺基酸殘基57被甘胺酸(D057G)取代 (iv) CDR2中之胺基酸殘基63被酪胺酸(P063Y)取代, (v) CDR3中之胺基酸殘基105被精胺酸取代(D105R)取代,以及/或 (b) 輕鏈變異區,其包含三個CDR(CDR1、CDR2以及CDR3),其分別具有大約80%、大約81%、大約82%、大約83%、大約84%、大約85%、大約86%、大約87%、大約88%、大約89%、大約90%、大約91%、大約92%、大約93%、大約94%、大約95%、大約96%、大約97%、大約98%、大約99%或大約100%與SEQ ID NO:7、8以及9所載之胺基酸序列同源的胺基酸序列且包含至少一以下胺基酸取代: (i) CDR1中之胺基酸殘基24被色胺酸(R024W)取代, (ii) CDR1中之胺基酸殘基32被麩醯胺酸(M032Q)取代, (iii) CDR2中之胺基酸殘基49被甘胺酸(A049G)取代, (iv) CDR2中之胺基酸殘基53被離胺酸取代(L053K), (v) CDR3中之胺基酸殘基93被精胺酸取代(N093R)。
在又一實施例中,本發明提供經修飾抗體或其抗原結合部位,其包含: (a) 重鏈及輕鏈,其中重鏈具有大約80%、大約81%、大約82%、大約83%、大約84%、大約85%、大約86%、大約87%、大約88%、大約89%、大約90%、大約91%、大約92%、大約93%、大約94%、大約95%、大約96%、大約97%、大約98%、大約99%或大約100%與選自SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:17、SEQ ID NO:18、SEQ ID NO:19、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:21、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:23、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:25、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:27、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:29、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:33、SEQ ID NO:34、SEQ ID NO:35、SEQ ID NO:36、SEQ ID NO:37、SEQ ID NO:38、SEQ ID NO:39之胺基酸序列同源的胺基酸序列,以及/或 (b) 輕鏈,其中輕鏈具有大約80%、大約81%、大約82%、大約83%、大約84%、大約85%、大約86%、大約87%、大約88%、大約89%、大約90%、大約91%、大約92%、大約93%、大約94%、大約95%、大約96%、大約97%、大約98%、大約99%或大約100%與選自SEQ ID NO:40、SEQ ID NO:41、SEQ ID NO:42、SEQ ID NO:43、SEQ ID NO:44、SEQ ID NO:45、SEQ ID NO:46、SEQ ID NO:47、SEQ ID NO:48、SEQ ID NO:49、SEQ ID NO:50、SEQ ID NO:51、SEQ ID NO:52、SEQ ID NO:53、SEQ ID NO:54、SEQ ID NO:55或SEQ ID NO:56同源的胺基酸序列。
在另一實施例中,本文所述之經修飾抗體或其抗原結合部位之變異區不包含第5圖所列之胺基酸取代。
各種與腫瘤相關醣類抗原中之任一種,特別是Globo H,可被用於實施本發明。腫瘤相關醣類抗原之例子包含但不限於:Globo抗原(如Globo H、階段特異性胚胎抗原3(SSEA-3,亦稱為Gb5)、階段特異性胚胎抗原4(SSEA-4)、Gb4及Gb3)、路易士抗原 (如sLex 、Lex 、sLea 、Lea 及Ley )、黏蛋白多醣體(mucin glycans)(如sTn、Tn及Thomsen-Friedenreich 抗原)、神經節苷脂(如GD1a、GT1b、A2B5、GD2、GD3、岩藻醣基(Fucosyl)GM1、GM1、GM2、GM、Neu5GcGM3及聚唾液酸(polysialic acid,PSA))、硫脂抗原(sulfitide antigen)(如6Gal-HSO3-SiaLex及6GluNAc-HSO3-SiaLex)。其他醣類抗原包含但不限於:α-半乳糖(α-Galactose)、α-葡萄糖-6-磷酸脫氫酶(α-Man-6-phosphate)、α-L-鼠李醣(α-L-Rhamnose)、α-GalNAc(Tn)、 α-NeuAc-OCH2 C6 H4 -p-NHCOOCH2 、Fucα1-2Galβ1-4GalNAcβ(H類型3)、NeuAcα2-8NeuAcα、(NeuAcα2-8)2聚唾液酸、 NeuAca2-6Galb、NeuAcb2-6Gala(STn)、Gala1-3Galb1-4GlaNAcb (NeuAca2-8)3、GalNAcαa-3(Fucα1-2)Galβ (血液群組A)、Galα1-3(Fucα1-2)Galβ (血液群組B)、6Gal-HSO3 -SiaLex、6GluNAc-HSO3 -SiaLex及α2-6唾液酸二天線型N-聚糖(α2-6 sialylated diantennary N-glycans)。
本文所述之抗體或其抗原結合部位具體內(in vitro )及體外(in vivo )治療、預防以及/或診斷功用。舉例而言,抗體可被施予於培養之細胞(例如:體外或離體(ex vivo ))或個體(例如:體內),以治療、抑制、預防復發以及/或診斷如癌症之疾病。
抗體或其抗原結合部位可被用於培養之細胞(例如:體外或離體)。舉例而言,細胞可被體外培養於培養基中並與抗體或其抗原結合部位接觸。方法可作為體內(例如:治療或預防)方案的一部分於存在於個體內之細胞上執行。就體內實施例而言,在容許抗體或其抗原結合部位與在個體內之一或多個癌細胞上(例如:在乳癌細胞內)表現之腫瘤相關醣類抗原(例如:Globo H) 結合之有效條件下,接觸步驟係於個體實施且包含施予抗體或其抗原結合部位給個體。抑制癌細胞之方法
本發明所述之抗體及其抗原結合部位可用於調節、降低、拮抗、減輕、緩解、阻斷、抑制、免除、及/或干擾在體外、原位(in situ )以及/或體內之至少一腫瘤相關醣類抗原或其片段。
本發明亦提供抑制細胞於體外、離體或體內生長之方法,其中細胞(如癌細胞)與有效量之本文所述之抗體或其抗原結合部位接觸。如過度增生細胞或組織之病理細胞(pathological cells)或組織可藉由將該細胞或組織與有效量之本發明所述之抗體或其抗原結合部分接觸來進行治療。細胞(如癌細胞)可為原發性(primary)癌細胞或可為由如美國菌種中心(ATCC)之組織銀行購得之培養細胞。病理細胞可為表現Globo H之癌症、神經膠瘤(gliomas)、腦脊髓膜瘤(meningioma)、腦下垂體瘤(pituitary adenomas)或全身性癌症(sysyrmic cancer)之中樞神經系統(CNS)轉移、肺癌(lung cancer)、前列腺癌(prostate cancer)、乳癌(breast cancer)、造血癌(hematopoietic cancer)或卵巢癌(ovarian cancer)之細胞。細胞可取自脊椎動物,較佳情形為取自哺乳動物,更佳情形為人類 (參照:美國專利第2004/0087651號。Balassiano 等人(2002) Intern. J. Mol. Med. 10:785-788。Thorne, 等人(2004) Neuroscience 127:481-496。Fernandes, 等人(2005) Oncology Reports 13:943-947。Da Fonseca, 等人(2008) Surgical Neurology 70:259267。Da Fonseca, 等人(2008) Arch. Immunol. Ther. Exp. 56:267-276。Hashizume, 等人(2008) Neuroncology 10:112-120)。在一實施例中,癌症為表現Globo H之癌症。在另一實施例中,癌症為表現SSEA-3之癌症。在又一實施例,癌症為表現SSEA-4之癌症。表現Globo H之癌症、表現SSEA-3之癌症以及表現SSEA-4之癌症包含肉瘤(sarcoma)、皮膚癌(skin cancer)、白血病(leukemia)、淋巴瘤(lymphoma)、腦癌(brain cancer)、神經膠母細胞瘤(glioblastoma)、肺癌(lung cancer)、乳癌、口腔癌(oral cancer)、頭頸部癌(head-and-neck cancer)、鼻咽癌(nasopharyngeal cancer)、食道癌(esophageal cancer)、胃癌(stomach cancer)、肝癌(liver cancer)、膽道癌(bile duct cancer)、膽囊癌(gallbladder cancer)、膀胱癌(bladder cancer)、胰臟癌(pancreatic cancer)、腸癌(intestinal cancer)、大腸癌(colorectal cancer)、腎臟癌(kidney cancer)、子宮頸癌(cervix cancer)、子宮內膜癌(endometrial cancer)、卵巢癌、睪丸癌(testicular cancer)、頰癌(buccal cancer)、口咽癌(oropharyngeal cancer)、喉癌(laryngeal cancer)以及前列腺癌中之一或多種。在一態樣中,該方法包含分析選自由一或多種以下的樣本:乳房、卵巢、肺臟、胰臟、胃、大腸、前列腺、肝臟、子宮頸、食道、腦、口腔以及/或腎臟癌。
本發明所述之抗體或其抗原結合部位之體外效用可藉該領域習知之方法進行檢測。細胞存活率分析(MTT assay)係以代謝活性細胞的MTT(四唑(tetrazolium)鹽類)攝取原理為基礎,其中MTT被代謝成為可透過光譜法讀取之藍色甲䐶(formazan)產物 (參照:J. of Immunological Methods 65: 55 63, 1983.)。本發明所述之抗體或其抗原結合部位之細胞毒性可藉群落形成分析(Colony Formation Assay)進行探討。結合Globo H抗原之功能性分析可藉酵素免疫分析法(ELISA)進行。藉抗體或其抗原結合部位阻斷之細胞週期(cell cycle)可藉標準碘化丙啶(PI)染色及流式細胞儀進行探討。侵入抑制可藉博登量測器(Boyden chambers)進行探討。分析中重組基底膜Matrigel層被塗覆至趨向性過濾器(chemotaxis filters)上,並作為在博登量測器中細胞遷移之障壁。僅具侵入能力之細胞可越過Matrigel障壁。其餘分析包含但不限於:細胞存活率分析、細胞自體凋亡分析(apoptosis assay)以及型態學分析(morphological assays)。分析亦可利用小鼠模型於體內完成(參照例如:B. Teicher, Tumor Models for Efficacy Determination. Mol Cancer Ther 2006; 5: 2435-2443)。醫藥組成物
在部分實施例中,本發明提供包含本文中所述之抗體或其抗原結合部位以及藥學上可接受之載體的醫藥組成物。藥學上可接受之載體包含生理上相容之任何及所有溶劑、分散介質、等張劑及吸收延遲劑等。在一實施例中,該醫藥組成物可有效抑制個體內之癌細胞。
施予本發明之醫藥組成物之途徑包含但不限於:靜脈注射(intravenous)、肌內注射(intramuscular)、鼻內(intranasal)、皮下(subcutaneous)、口服(oral)、局部(topical)、皮下、皮內(intradermal)、透皮(transdermal)、表皮下(subdermal)、注射(parenteral)、直腸(rectal)、脊髓(spinal)或表皮(epidermal)施予。
本發明所述之醫藥組成物可被製備成注射劑,其可為液體溶液或懸浮液,或適於在注射前可溶或懸浮於液體載體內之固體型態。醫藥組成物亦可被製備為固體型態、乳液或包覆在脂質體載體或其他用以持續遞送(sustained delivery)之顆粒載體內之活性成分。舉例而言,醫藥組成物可為能使該醫藥組成物持續釋出之以下型態:油乳液(oil emulsion)、油包水乳液(water-in-oil emulsion)、水包油包水乳 (water-in-oil-in-water emulsion)、位置特異性乳液(site-specific emulsion)、長滯留乳液(long-residence emulsion)、黏性乳液(sticky emulsion)、微乳液(micro emulsion)、奈米乳液(nano emulsion)、脂質體(liposome)、微粒(microparticle)、微球(microsphere)、奈米小球(nanosphere)、奈米粒子(nanoparticle)、以及各種天然或人造的聚合物,如不可吸收的不透水聚合物(nonresorbable impermeable polymers),如乙烯/醋酸乙烯酯共聚物(ethylenevinyl acetate copolymers)以及Hytrel ® 共聚物、可膨脹的共聚物,如水膠(hydrogels)、或可吸收聚合物,如膠原蛋白以及特定的多元酸(polyacids)或聚酯(polyesters),如可被用以製造可吸收結構者。
用於體內施予之醫藥組成物自然必須為已滅菌的;滅菌可由常規技術完成(例如:經由滅菌過濾膜進行過濾)。其可用於增加抗體之濃度以達到俗稱的高濃度液體組成(high concentration liquid formulation,HCLF);各種製造HCLF之方法皆已有記述。
醫藥組成物為單獨施予,以及/或與其他治療劑混合施予,其他治療劑可為例如:二級單株抗體或多株抗體或其抗原結合部位或抗癌劑(如DNA損毀或微管蛋白結合(tubulin binding)劑)或可抑制血管新生(angiogenesis)、訊號傳導途徑(signal transduction pathway)或有絲分裂檢查點(mitotic checkpoint)之試劑。組成產物可為兩種成分之混合物或兩種成分可共價連接。在一例子中,與特異性地結合Globo H之抗體或其抗原結合部位與特異性地結合VEGF之抗體(單株抗體或多株抗體)或其抗原結合部位組合。在另一例子中,第二種試劑為化療劑(例如:環磷酸醯胺(cyclophosphamide)、5-氟尿嘧啶(5-fluorouracil)或放線菌素D(Actinomycin-D))。抗體亦可以與癌症疫苗組合施予,例如:與白喉毒素(Diphtheria Toxin)及皂素(saponin)佐劑複合之Globo H。其他治療劑亦可與本發明所述之抗體同時施予(選擇性地作為同一藥物製劑中之成分)或於本發明所述之抗體施予前或施予後進行施予。製備此種藥劑型態之實際方法對領域中具通常知識者而言為習知或其會於未來進行改良。(參照例如:Remington’s Pharmaceutical Sciences, Mack Publishing Company, Easton, Pennsylvania, 21st edition)。
醫藥組成物可依個體之年齡、體重及病症、所施用的特定組成物、施予途徑、本醫藥組成物是否是用於預防或治療的目的等因素,按日程以單一劑量治療方案或多劑量治療方案施予一定期間。例如,在一實施例中,本發明所述之醫藥組成物於以下頻率施予:一個月一次、一個月兩次、一個月三次、隔周(qow)、一周一次(qw)、一周兩次(biw)、一周三次(tiw)、一周四次、一周六次、隔日(qod)、美日(qd)、一日兩次(qid)或一日三次(tid)。
本發明所述之抗體之施予期間(例如:醫藥組成物被施予的時間週期期間)可依各種參數調整或改變(例如:個體反應等)。舉例而言,醫藥組成物可於以下範圍之時間週期期間被施予:一或數秒至一或數小時、一天至大約一周、從大約兩周至大約四周、從大約一個月至大約兩個月、從大約兩個月至大約四個月、從大約四個月至大約六個月、從大約六個月至大約八個月、從大約八個月至大約一年、從大約一年至大約兩年、從大約兩年至大約四年或更多。
為使施予上之方便及劑量的一致性,可使用單位劑型之口服或注射型醫藥組成物。本文中所使用之單位劑型指對大治療之個體而言適於作為單位劑量之物理性離散單位;每單位包含與所需之藥物載體結合之預定量之活性化合物,其中預定量為被計算出可產生所需治療效果的量。
由細胞培養分析及動物實驗所取得之數據可用於配製用於人體之劑量範圍。在一實施例中,此種化合物之劑量介於循環濃度範圍內,其包含微小之毒性或無毒性之ED50 。在該範圍內,劑量可依劑型及施予方式進行調整。在另一實施例中,治療有效劑量可藉細胞實驗進行初步估算。劑量可配製於動物模型中以達到循環血漿濃度範圍,其包含細胞培養所測定之IC50 (即該受試化合物達到最大症狀抑制效果之一半時之濃度)(參照:Sonderstrup, Springer, Sem. Immunopathol. 25: 35-45, 2003. Nikula等人, Inhal. Toxicol. 4(12): 123-53, 2000)。
例示性地,本發明所述之抗體或其抗原結合部位之治療有效量或預防有效量並未受限制,其可為:從大約0.001至大約60 mg/kg體重、從大約0.01至大約30 mg/kg體重、從大約0.01至大約25 mg/kg體重、從大約0.5至大約25 mg/kg體重、從大約0.1至大約20 mg/kg體重、從大約10至大約20 mg/kg體重、從大約0.75至大約10 mg/kg體重、從大約1至大約10 mg/kg體重、從大約2至大約9 mg/kg體重、從大約1至大約2 mg/kg體重、從大約3至大約8 mg/kg體重、從大約4至大約7 mg/kg體重、從大約5至大約6 mg/kg體重、從大約8至大約13 mg/kg體重、從大約8.3至大約12.5 mg/kg體重、從大約4至大約6 mg/kg體重、從大約4.2至大約6.3 mg/kg體重、從大約1.6至大約2.5 mg/kg體重、從大約2至大約3 mg/kg體重或大約10 mg/kg體重。
將醫藥組成物配製成含有有效量之本發明所述之抗體或其抗原結合部位,其中該量係依待治療之動物及待治療之病症而定。在一實施例中,本發明所述之抗體或其抗原結合部位被依以下劑量範圍施予:從大約0.01mg至大約10g、從大約0.1mg至大約9g、從大約1mg至大約8g、從大約2mg至大約7g、從大約3mg至大約6g、從大約10mg至大約5g、從大約20mg至大約1g、從大約50mg至大約800mg、從大約100mg至大約500mg、從大約0.01µg至大約10g、從大約0.05µg至大約1.5mg、從大約10µg至大約1mg蛋白質、從大約30µg至大約500µg、從大約40µg至大約300µg、從大約0.1µg至大約200µg、從大約0.1µg至大約5µg、從大約5µg至大約10µg、從大約10µg至大約25µg、從大約25µg至大約50µg、從大約50µg至大約100µg、從大約100µg至大約500µg、從大約500µg至大約1mg、從大約1mg至大約2mg。用於任一特定個體之具體劑量取決於各種因素,包含特異性胜肽(specific peptide)之活性、年齡、體重、總體健康情況、性別、飲食、施予時間、施予途徑及排泄速率、藥物組成及進行治療之具體疾病的嚴重性且領域中具有通常知識者可在無需過度實驗之下判定。
本發明所述之抗體或其抗原結合部位、醫藥組成物及其使用方法適於且可用於所有脊椎動物(例如:哺乳動物及非哺乳動物,包含人類、小鼠、大鼠、天竺鼠、倉鼠、狗、貓、牛、馬、山羊、綿羊、豬、猴、人猿、大猩猩、黑猩猩、兔、鴨、鵝、雞、兩棲類、爬蟲類及其他動物)。
以下用於實施本發明之特定態樣之實例僅用以說明,而不企圖以任何形式限制本發明之範疇。實例 1 :經修飾抗體之生成
帶有包含SEQ ID NO:13的重鏈變異區及包含SEQ ID NO:14的輕鏈變異區之野生型人源化抗體,以及帶有包含SEQ ID NO:57的重鏈變異區及包含SEQ ID NO:58的輕鏈變異區的野生型嵌合抗體係衍生自融合瘤 2C2之非人類抗體。第1圖顯示未修飾人源化抗體之重鏈變異區的胺基酸序列(第1圖A部分:112個胺基酸殘基)及輕鏈變異區之胺基酸序列(第1圖B部分:96個胺基酸殘基)。實驗流程之細節請參照PCT國際專利申請(申請號:PCT/US15/25305)。
本發明所述之經修飾抗體以下列兩步驟生成:(1) 综合性定位演化(Comprehensive Positional Evolution),接著(2)组合蛋白合成(Combinatorial Protein Synthesis)。 2 :嵌合抗體及人源化抗體之結合親和力比較
藉由ELISA進行得自例1之嵌合抗體及人源化抗體之結合親和力之體外評估。第2圖顯示嵌合抗體(重鏈:SEQ ID NO:57及輕鏈:SEQ ID NO:58) 及人源化抗體(重鏈:SEQ ID NO:13及輕鏈:SEQ ID NO:14)之OD450 nm 。嵌合抗體(重鏈:SEQ ID NO:57及輕鏈:SEQ ID NO:58)之OD值為0.89而人源化抗體(重鏈:SEQ ID NO:13及輕鏈:SEQ ID NO:14)之OD值僅為0.34。人源化抗體之較低的OD值表示以下未修飾人源化抗體之CDR序列修飾/突變係必要的。 3 :綜合性定位演化
參照第3圖,利用綜合性定位演化技術(BioAtala,USA),對於未修飾抗體(SEQ ID NO:1-3及7-8)之三個重鏈及三個輕鏈CDR的每個胺基酸殘基至少產生10個胺基酸突變/取代。輕鏈CDR中的26個胺基酸殘基及重鏈CDR中的41個胺基酸殘基已被確認產生總量670個綜合性定位演化突變,其中260個在輕鏈CDR且410個在重鏈CDR。
第4圖A部份至第4圖E部分顯示經修飾抗體之OD450 nm,經修飾抗體於該野生型嵌合抗體之重鏈變異區之殘基28(第4圖A部分)、殘基31(第4圖B部分)、殘基57(第4圖C部分)、殘基63(第4圖D部分)及殘基105(第4圖E部分) 具有單一綜合性定位演化胺基酸突變取代。第5圖A部份至第5圖E部分顯示經修飾抗體之OD450 nm,該經修飾抗體於野生型嵌合抗體之輕鏈變異區之殘基24(第5圖A部分)、殘基32(第5圖B部分)、殘基49(第5圖C部分)、殘基53(第5圖D部分)及殘基93(第5圖E部分)具有單一綜合性定位演化胺基酸突變取代。
以下選擇10個綜合性定位演化突變來進行組合蛋白合成,選擇係基於其與Globo-H神經醯胺(ceramide)之結合活性及表現篩選(screening):重鏈 (HC)-S028R、HC-T031R、HC-D057G、HC-P063Y、HC-D105R、輕鏈 (LC)-R024W、LC-M032Q、LC-A049G、LC-L053K及LC-N093R。 4 :組合蛋白合成
已建立例3中選出之10個綜合性定位演化突變之組合蛋白合成庫,其包含10個選出之綜合性定位演化突變之所有組合(總量為930個組合蛋白合成突變)。
930個組合蛋白合成突變被轉染(transfected)至96孔盤型式中之CHO-S細胞,其於37℃下在摻入10%血清之DMEM內培養,並表現為完整長度之IgG1分子。上清液於轉染後48小時收集。上清液中IgG之濃度藉ELISA測定以定量人類IgGs。在細胞培養上清液之IgG藉抗人類IgG Fc抗體(anti-human-IgG Fc antibody)捕捉於盤上。結合之IgG藉與HRP複合之抗人類IgG(Promega,USA)進行偵測。IgG之濃度以市面上可購得之人類IgG作為標準品來計算。上清液被調整至50 ng/mL並藉ELISA親和性分析方法(affinity ELISA protocol)測試其與Globo-H神經醯胺之結合。未修飾嵌合抗體於ELISA盤中做為控制組使用。反應在TMB加入孔盤後藉加入1N之鹽酸(HCl)停止,並立刻讀取讀值。反應之OD450 nm值藉SpectraMax Plus (Molecular Devices、USA)測量。
第6圖顯示669個組合蛋白合成突變,其相較於未修飾嵌合抗體(重鏈:SEQ ID NO:57及輕鏈:SEQ ID NO:58) 具有較高之OD450 nm值。較高之OD值代表與Globo H之結合親和力較強。
第7圖顯示自融合瘤VK9(源自紀念史隆·凱特琳癌症研究中心,MSKCC)取得之嵌合抗體、自融合瘤2C2衍生嵌合抗體(重鏈之胺基酸為SEQ ID NO:57且輕鏈之胺基酸為SEQ ID NO:58)及例示性實施例之經修飾抗體(人類R28 mAbs,其中重鏈之胺基酸為SEQ ID NO:59且輕鏈之胺基酸為SEQ ID NO:60)之解離常數(Kd)。其顯示自融合瘤2C2衍生之嵌合抗體(8.60E-07)及人源化R28 mAb(5.04E-07)相對於VK9(1.21E-05)抗體具有較佳的結合親和力。 5 :抗 Globo H 抗體之體內抗癌評估
對體重27g之人類乳癌(MCF7)異種移植之裸鼠注射5 mg/kg劑量之以下項:自融合瘤2C2衍生之嵌合抗體(SEQ ID NO:57及58)、融合瘤2C2之人源化抗體(SEQ ID NO:13及14)或人源化R28抗體(SEQ ID NO:59及60)。小鼠以18天為周期進行腫瘤體積之觀察,並將結果記錄並整理於第8圖。腫瘤體積由以下公式計算:(長度´寬度)2 /2。如第8圖所示,自第8天起,經修飾抗體(融合瘤2C2、人源化2C2及人源化R28)之腫瘤體積相較於控制組(僅載體) (P<0.05)有顯著的減少。
雖然描述並說明本發明之具體態樣,此種態樣應被認為僅用於說明本發明,而不限制本發明,本發明係根據所附之請求項解釋。如具體且個別地指出其全部內容藉由參照整合於本文中之各出版物及專利申請案般地,本說明書中引用之所有出版物及專利申請案之全部內容藉由參照整合於本文中。儘管為了清楚地理解本發明,上述發明已以說明及例示之方式揭露部分細節,然而鑑於本發明之教示,該技術領域具通常知識者對於不背離所附請求項之精神及範疇下對於本發明進行之部分改變及修飾改為顯而易見的。
無。
第1圖A部分顯示例示性實施例之未經修飾之人源化抗體(SEQ ID NO:13)之重鏈變異區的胺基酸序列。第1圖B部分顯示例示性實施例之未經修飾之人源化抗體(SEQ ID NO:14)之輕鏈變異區的胺基酸序列。
第2圖顯示一例示性實施例之嵌合抗體(重鏈:SEQ ID NO:57及輕鏈:SEQ ID NO:58)及一例示性實施例之人源化抗體(重鏈:SEQ ID NO:13及輕鏈:SEQ ID NO:14) 之光學密度(OD450 nm):。
第3圖係示意性顯示综合性定位演化(Comprehensive Positional Evolution)及组合蛋白合成(Combinatorial Protein Synthesis)之過程。
第4圖顯示於人源化抗體及野生型(wild type,WT)嵌合抗體之重鏈變異區之殘基28(第4圖A部分)、殘基31(第4圖B部分)、殘基57(第4圖C部分)、殘基63(第4圖D部分)以及殘基105(第4圖E部分)經胺基酸(AA)取代之經修飾抗體的光學密度(OD450 nm)。
第5圖顯示人源化抗體及野生型嵌合抗體之輕鏈變異區之殘基24(第5圖A部分)、殘基32(第5圖B部分)、殘基49(第5圖C部分)、殘基53(第5圖D部分)以及殘基93(第5圖E部分)經胺基酸取代之經修飾抗體的光學密度(OD450 nm)。
第6圖顯示經至少兩個胺基酸取代(組合蛋白合成突變(Combinatorial Protein Synthesis mutants))之經修飾抗體的OD450 nm,其高於野生型嵌合抗體之OD450 nm。
第7圖顯示具有不同濃度的Globo H之源自融合瘤VK9之嵌合抗體(源自紀念史隆·凱特琳癌症研究中心,Memorial Sloan Kettering Cancer Center,MSKCC)、源自融合瘤2C2之嵌合抗體(SEQ ID NOs:57及58)及例示性實施例的經修飾抗體(人源化R28 mAbs,SEQ ID NOs:59及60)之解離常數(Kd)的比較。
第8圖係描繪顯示一般食鹽水(載體)、源自融合瘤2C2之嵌合抗體(SEQ ID NO:57及58)、源自融合瘤2C2之人源化抗體(SEQ ID NO:13及14)以及例示性實施例之經修飾抗體(人源化R28 mAbs,SEQ ID NO:59及60)對於小鼠乳癌 (MCF7) 腫瘤體積之效應的線性作圖。
<110> 台灣浩鼎生技股份有限公司 (OBI PHARMA INC) <120> 新穎醣類抗體、醫藥組成物及其用途 <130> OBI-15003-USP1, OBI-15003-TWI <160> 60 <170> PatentIn version 3.5 <210> 1 <211> 12 <212> PRT <213> 家鼷鼠 (Mus musculus) <400> 1 Gly Phe Ser Leu Tyr Thr Phe Asp Met Gly Val Gly 1 5 10 <210> 2 <211> 16 <212> PRT <213> 家鼷鼠 <400> 2 His Ile Trp Trp Asp Asp Asp Lys Tyr Tyr Asn Pro Ala Leu Lys Ser 1 5 10 15 <210> 3 <211> 13 <212> PRT <213> 家鼷鼠 <400> 3 Val Arg Gly Leu His Asp Tyr Tyr Tyr Trp Phe Ala Tyr 1 5 10 <210> 4 <211> 25 <212> PRT <213> 人工序列 (Artificial Sequence) <220> <223> 人源化重鏈架構 (Humanized Heavy Chain Frame work) 1 <400> 4 Gln Ile Thr Leu Lys Glu Ser Gly Pro Thr Leu Val Lys Pro Thr Gln 1 5 10 15 Thr Leu Thr Leu Thr Cys Thr Phe Ser 20 25 <210> 5 <211> 14 <212> PRT <213> 人工序列 <220> <223> 人源化重鏈架構 2 <400> 5 Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Leu Ala 1 5 10 <210> 6 <211> 32 <212> PRT <213> 人工序列 <220> <223> 人源化重鏈架構 3 <400> 6 Arg Leu Thr Ile Ser Lys Asp Thr Ser Lys Asn Gln Val Val Leu Thr 1 5 10 15 Met Thr Asn Met Asp Pro Val Asp Thr Ala Thr Tyr Tyr Cys Ala Arg 20 25 30 <210> 7 <211> 10 <212> PRT <213> 家鼷鼠 <400> 7 Arg Ala Ser Ser Ser Val Ser Tyr Met His 1 5 10 <210> 8 <211> 7 <212> PRT <213> 家鼷鼠 <400> 8 Ala Thr Ser Asn Leu Ala Ser 1 5 <210> 9 <211> 9 <212> PRT <213> 家鼷鼠 <400> 9 Gln Gln Trp Ser Arg Asn Pro Phe Thr 1 5 <210> 10 <211> 23 <212> PRT <213> 人工序列 <220> <223> 人源化輕鏈架構 (Humanized Light Chain Frame work) 1 <400> 10 Glu Ile Val Leu Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly 1 5 10 15 Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys 20 <210> 11 <211> 15 <212> PRT <213> 人工序列 <220> <223> 人源化輕鏈架構 2 <400> 11 Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ser Pro Lys Pro Trp Ile Tyr 1 5 10 15 <210> 12 <211> 32 <212> PRT <213> 人工序列 <220> <223> 人源化輕鏈架構 3 <400> 12 Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr 1 5 10 15 Phe Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro Glu Asp Ile Ala Thr Tyr Tyr Cys 20 25 30 <210> 13 <211> 112 <212> PRT <213> 人工序列 <220> <223> 完整長度人源化重鏈 (Full-length Humanized Heavy Chain) <400> 13 Gln Ile Thr Leu Lys Glu Ser Gly Pro Thr Leu Val Lys Pro Thr Gln 1 5 10 15 Thr Leu Thr Leu Thr Cys Thr Phe Ser Gly Phe Ser Leu Tyr Thr Phe 20 25 30 Asp Met Gly Val Gly Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu 35 40 45 Trp Leu Ala His Ile Trp Trp Asp Asp Asp Lys Tyr Tyr Asn Pro Ala 50 55 60 Leu Lys Ser Arg Leu Thr Ile Ser Lys Asp Thr Ser Lys Asn Gln Val 65 70 75 80 Val Leu Thr Met Thr Asn Met Asp Pro Val Asp Thr Ala Thr Tyr Tyr 85 90 95 Cys Ala Arg Val Arg Gly Leu His Asp Tyr Tyr Tyr Trp Phe Ala Tyr 100 105 110 <210> 14 <211> 96 <212> PRT <213> 人工序列 <220> <223> 完整長度人源化輕鏈 (Full-length Humanized Light Chain) <400> 14 Glu Ile Val Leu Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly 1 5 10 15 Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Ser Ser Val Ser Tyr Met 20 25 30 His Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ser Pro Lys Pro Trp Ile Tyr 35 40 45 Ala Thr Ser Asn Leu Ala Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly Ser 50 55 60 Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Phe Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro Glu 65 70 75 80 Asp Ile Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Trp Ser Arg Asn Pro Phe Thr 85 90 95 <210> 15 <211> 112 <212> PRT <213> 人工序列 <220> <223> S028K <400> 15 Gln Ile Thr Leu Lys Glu Ser Gly Pro Thr Leu Val Lys Pro Thr Gln 1 5 10 15 Thr Leu Thr Leu Thr Cys Thr Phe Ser Gly Phe Lys Leu Tyr Thr Phe 20 25 30 Asp Met Gly Val Gly Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu 35 40 45 Trp Leu Ala His Ile Trp Trp Asp Asp Asp Lys Tyr Tyr Asn Pro Ala 50 55 60 Leu Lys Ser Arg Leu Thr Ile Ser Lys Asp Thr Ser Lys Asn Gln Val 65 70 75 80 Val Leu Thr Met Thr Asn Met Asp Pro Val Asp Thr Ala Thr Tyr Tyr 85 90 95 Cys Ala Arg Val Arg Gly Leu His Asp Tyr Tyr Tyr Trp Phe Ala Tyr 100 105 110 <210> 16 <211> 112 <212> PRT <213> 人工序列 <220> <223> S028R <400> 16 Gln Ile Thr Leu Lys Glu Ser Gly Pro Thr Leu Val Lys Pro Thr Gln 1 5 10 15 Thr Leu Thr Leu Thr Cys Thr Phe Ser Gly Phe Arg Leu Tyr Thr Phe 20 25 30 Asp Met Gly Val Gly Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu 35 40 45 Trp Leu Ala His Ile Trp Trp Asp Asp Asp Lys Tyr Tyr Asn Pro Ala 50 55 60 Leu Lys Ser Arg Leu Thr Ile Ser Lys Asp Thr Ser Lys Asn Gln Val 65 70 75 80 Val Leu Thr Met Thr Asn Met Asp Pro Val Asp Thr Ala Thr Tyr Tyr 85 90 95 Cys Ala Arg Val Arg Gly Leu His Asp Tyr Tyr Tyr Trp Phe Ala Tyr 100 105 110 <210> 17 <211> 112 <212> PRT <213> 人工序列 <220> <223> S028Y <400> 17 Gln Ile Thr Leu Lys Glu Ser Gly Pro Thr Leu Val Lys Pro Thr Gln 1 5 10 15 Thr Leu Thr Leu Thr Cys Thr Phe Ser Gly Phe Tyr Leu Tyr Thr Phe 20 25 30 Asp Met Gly Val Gly Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu 35 40 45 Trp Leu Ala His Ile Trp Trp Asp Asp Asp Lys Tyr Tyr Asn Pro Ala 50 55 60 Leu Lys Ser Arg Leu Thr Ile Ser Lys Asp Thr Ser Lys Asn Gln Val 65 70 75 80 Val Leu Thr Met Thr Asn Met Asp Pro Val Asp Thr Ala Thr Tyr Tyr 85 90 95 Cys Ala Arg Val Arg Gly Leu His Asp Tyr Tyr Tyr Trp Phe Ala Tyr 100 105 110 <210> 18 <211> 112 <212> PRT <213> 人工序列 <220> <223> S028F <400> 18 Gln Ile Thr Leu Lys Glu Ser Gly Pro Thr Leu Val Lys Pro Thr Gln 1 5 10 15 Thr Leu Thr Leu Thr Cys Thr Phe Ser Gly Phe Phe Leu Tyr Thr Phe 20 25 30 Asp Met Gly Val Gly Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu 35 40 45 Trp Leu Ala His Ile Trp Trp Asp Asp Asp Lys Tyr Tyr Asn Pro Ala 50 55 60 Leu Lys Ser Arg Leu Thr Ile Ser Lys Asp Thr Ser Lys Asn Gln Val 65 70 75 80 Val Leu Thr Met Thr Asn Met Asp Pro Val Asp Thr Ala Thr Tyr Tyr 85 90 95 Cys Ala Arg Val Arg Gly Leu His Asp Tyr Tyr Tyr Trp Phe Ala Tyr 100 105 110 <210> 19 <211> 112 <212> PRT <213> 人工序列 <220> <223> T031K <400> 19 Gln Ile Thr Leu Lys Glu Ser Gly Pro Thr Leu Val Lys Pro Thr Gln 1 5 10 15 Thr Leu Thr Leu Thr Cys Thr Phe Ser Gly Phe Ser Leu Tyr Lys Phe 20 25 30 Asp Met Gly Val Gly Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu 35 40 45 Trp Leu Ala His Ile Trp Trp Asp Asp Asp Lys Tyr Tyr Asn Pro Ala 50 55 60 Leu Lys Ser Arg Leu Thr Ile Ser Lys Asp Thr Ser Lys Asn Gln Val 65 70 75 80 Val Leu Thr Met Thr Asn Met Asp Pro Val Asp Thr Ala Thr Tyr Tyr 85 90 95 Cys Ala Arg Val Arg Gly Leu His Asp Tyr Tyr Tyr Trp Phe Ala Tyr 100 105 110 <210> 20 <211> 112 <212> PRT <213> 人工序列 <220> <223> T031R <400> 20 Gln Ile Thr Leu Lys Glu Ser Gly Pro Thr Leu Val Lys Pro Thr Gln 1 5 10 15 Thr Leu Thr Leu Thr Cys Thr Phe Ser Gly Phe Ser Leu Tyr Arg Phe 20 25 30 Asp Met Gly Val Gly Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu 35 40 45 Trp Leu Ala His Ile Trp Trp Asp Asp Asp Lys Tyr Tyr Asn Pro Ala 50 55 60 Leu Lys Ser Arg Leu Thr Ile Ser Lys Asp Thr Ser Lys Asn Gln Val 65 70 75 80 Val Leu Thr Met Thr Asn Met Asp Pro Val Asp Thr Ala Thr Tyr Tyr 85 90 95 Cys Ala Arg Val Arg Gly Leu His Asp Tyr Tyr Tyr Trp Phe Ala Tyr 100 105 110 <210> 21 <211> 112 <212> PRT <213> 人工序列 <220> <223> D057H <400> 21 Gln Ile Thr Leu Lys Glu Ser Gly Pro Thr Leu Val Lys Pro Thr Gln 1 5 10 15 Thr Leu Thr Leu Thr Cys Thr Phe Ser Gly Phe Ser Leu Tyr Thr Phe 20 25 30 Asp Met Gly Val Gly Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu 35 40 45 Trp Leu Ala His Ile Trp Trp Asp His Asp Lys Tyr Tyr Asn Pro Ala 50 55 60 Leu Lys Ser Arg Leu Thr Ile Ser Lys Asp Thr Ser Lys Asn Gln Val 65 70 75 80 Val Leu Thr Met Thr Asn Met Asp Pro Val Asp Thr Ala Thr Tyr Tyr 85 90 95 Cys Ala Arg Val Arg Gly Leu His Asp Tyr Tyr Tyr Trp Phe Ala Tyr 100 105 110 <210> 22 <211> 112 <212> PRT <213> 人工序列 <220> <223> D057G <400> 22 Gln Ile Thr Leu Lys Glu Ser Gly Pro Thr Leu Val Lys Pro Thr Gln 1 5 10 15 Thr Leu Thr Leu Thr Cys Thr Phe Ser Gly Phe Ser Leu Tyr Thr Phe 20 25 30 Asp Met Gly Val Gly Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu 35 40 45 Trp Leu Ala His Ile Trp Trp Asp Gly Asp Lys Tyr Tyr Asn Pro Ala 50 55 60 Leu Lys Ser Arg Leu Thr Ile Ser Lys Asp Thr Ser Lys Asn Gln Val 65 70 75 80 Val Leu Thr Met Thr Asn Met Asp Pro Val Asp Thr Ala Thr Tyr Tyr 85 90 95 Cys Ala Arg Val Arg Gly Leu His Asp Tyr Tyr Tyr Trp Phe Ala Tyr 100 105 110 <210> 23 <211> 112 <212> PRT <213> 人工序列 <220> <223> D057S <400> 23 Gln Ile Thr Leu Lys Glu Ser Gly Pro Thr Leu Val Lys Pro Thr Gln 1 5 10 15 Thr Leu Thr Leu Thr Cys Thr Phe Ser Gly Phe Ser Leu Tyr Thr Phe 20 25 30 Asp Met Gly Val Gly Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu 35 40 45 Trp Leu Ala His Ile Trp Trp Asp Ser Asp Lys Tyr Tyr Asn Pro Ala 50 55 60 Leu Lys Ser Arg Leu Thr Ile Ser Lys Asp Thr Ser Lys Asn Gln Val 65 70 75 80 Val Leu Thr Met Thr Asn Met Asp Pro Val Asp Thr Ala Thr Tyr Tyr 85 90 95 Cys Ala Arg Val Arg Gly Leu His Asp Tyr Tyr Tyr Trp Phe Ala Tyr 100 105 110 <210> 24 <211> 112 <212> PRT <213> 人工序列 <220> <223> D057Q <400> 24 Gln Ile Thr Leu Lys Glu Ser Gly Pro Thr Leu Val Lys Pro Thr Gln 1 5 10 15 Thr Leu Thr Leu Thr Cys Thr Phe Ser Gly Phe Ser Leu Tyr Thr Phe 20 25 30 Asp Met Gly Val Gly Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu 35 40 45 Trp Leu Ala His Ile Trp Trp Asp Gln Asp Lys Tyr Tyr Asn Pro Ala 50 55 60 Leu Lys Ser Arg Leu Thr Ile Ser Lys Asp Thr Ser Lys Asn Gln Val 65 70 75 80 Val Leu Thr Met Thr Asn Met Asp Pro Val Asp Thr Ala Thr Tyr Tyr 85 90 95 Cys Ala Arg Val Arg Gly Leu His Asp Tyr Tyr Tyr Trp Phe Ala Tyr 100 105 110 <210> 25 <211> 112 <212> PRT <213> 人工序列 <220> <223> D057W <400> 25 Gln Ile Thr Leu Lys Glu Ser Gly Pro Thr Leu Val Lys Pro Thr Gln 1 5 10 15 Thr Leu Thr Leu Thr Cys Thr Phe Ser Gly Phe Ser Leu Tyr Thr Phe 20 25 30 Asp Met Gly Val Gly Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu 35 40 45 Trp Leu Ala His Ile Trp Trp Asp Trp Asp Lys Tyr Tyr Asn Pro Ala 50 55 60 Leu Lys Ser Arg Leu Thr Ile Ser Lys Asp Thr Ser Lys Asn Gln Val 65 70 75 80 Val Leu Thr Met Thr Asn Met Asp Pro Val Asp Thr Ala Thr Tyr Tyr 85 90 95 Cys Ala Arg Val Arg Gly Leu His Asp Tyr Tyr Tyr Trp Phe Ala Tyr 100 105 110 <210> 26 <211> 112 <212> PRT <213> 人工序列 <220> <223> P063H <400> 26 Gln Ile Thr Leu Lys Glu Ser Gly Pro Thr Leu Val Lys Pro Thr Gln 1 5 10 15 Thr Leu Thr Leu Thr Cys Thr Phe Ser Gly Phe Ser Leu Tyr Thr Phe 20 25 30 Asp Met Gly Val Gly Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu 35 40 45 Trp Leu Ala His Ile Trp Trp Asp Asp Asp Lys Tyr Tyr Asn His Ala 50 55 60 Leu Lys Ser Arg Leu Thr Ile Ser Lys Asp Thr Ser Lys Asn Gln Val 65 70 75 80 Val Leu Thr Met Thr Asn Met Asp Pro Val Asp Thr Ala Thr Tyr Tyr 85 90 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Ala Ser Ser Ser Val Ser Tyr Met 20 25 30 His Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ser Pro Lys Pro Trp Ile Tyr 35 40 45 Ala Thr Ser Asn Lys Ala Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly Ser 50 55 60 Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Phe Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro Glu 65 70 75 80 Asp Ile Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Trp Ser Arg Arg Pro Phe Thr 85 90 95 Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys Arg Thr Val Ala Ala Pro 100 105 110 Ser Val Phe Ile Phe Pro Pro Ser Asp Glu Gln Leu Lys Ser Gly Thr 115 120 125 Ala Ser Val Val Cys Leu Leu Asn Asn Phe Tyr Pro Arg Glu Ala Lys 130 135 140 Val Gln Trp Lys Val Asp Asn Ala Leu Gln Ser Gly Asn Ser Gln Glu 145 150 155 160 Ser Val Thr Glu Gln Asp Ser Lys Asp Ser Thr Tyr Ser Leu Ser Ser 165 170 175 Thr Leu Thr Leu Ser Lys Ala Asp Tyr Glu Lys His Lys Val Tyr Ala 180 185 190 Cys Glu Val Thr His Gln Gly Leu Ser Ser Pro Val Thr Lys Ser Phe 195 200 205 Asn Arg Gly Glu Cys 210
無。

Claims (23)

  1. 一種抗體或其抗原結合部位,其與一醣類抗原結合且包含:一重鏈變異區,其中該重鏈變異區包含三個互補性決定區(CDR):CDR1、CDR2以及CDR3,其分別具有大約90%至100%與SEQ ID NO:1、2以及3所載之胺基酸序列同源的胺基酸序列; 其中該抗體或其抗原結合部位包含至少一以下胺基酸取代: (a) CDR1中之胺基酸殘基28被鹼性胺基酸、非絲氨酸之中性胺基酸或疏水性胺基酸取代; (b) CDR1中之胺基酸殘基31被鹼性胺基酸取代; (c) CDR2中之胺基酸殘基57被中性胺基酸、鹼性胺基酸或疏水性胺基酸取代; (d) CDR2中之胺基酸殘基63被中性胺基酸、鹼性胺基酸或非脯氨酸之疏水性胺基酸取代,以及/或; (e) CDR3中之胺基酸殘基105被鹼性胺基酸、疏水性胺基酸或中性胺基酸取代。
  2. 如申請專利範圍第1項所述之抗體及其抗原結合部位,其進一步包含至少一以下之架構: (a) 於重鏈之前導序列及CDR1之間並具有大約90%至100%與SEQ ID NO:4同源的胺基酸序列的一架構; (b) 於重鏈之CDR1及CDR2之間並具有大約90%至100%與SEQ ID NO:5同源的胺基酸序列的一架構; (c) 於重鏈之CDR1及CDR2之間並具有大約90%至100%與SEQ ID NO:5同源的胺基酸序列的一架構,其中該架構中之胺基酸殘基46為甘胺酸且未被取代;以及/或 (d) 於重鏈之CDR2及CDR3之間並具有大約90%至100%與SEQ ID NO:6同源之胺基酸序列的一架構。
  3. 如申請專利範圍第1項所述之抗體或其抗原結合部位,其中CDR1中之胺基酸殘基28被以下任一所取代: (a) 選自離胺酸或精胺酸的鹼性胺基酸; (b) 為酪胺酸的中性胺基酸;或 (c) 為苯丙胺酸的疏水性胺基酸。
  4. 如申請專利範圍第1項所述之抗體或其抗原結合部位,其中CDR1中之胺基酸殘基31被選自離胺酸或精胺酸的鹼性胺基酸取代。
  5. 如申請專利範圍第1項所述之抗體或其抗原結合部位,其中CDR2中之胺基酸殘基57被以下任一所取代: (a) 選自麩醯胺酸、甘胺酸或絲胺酸的中性胺基酸; (b) 為組胺酸的鹼性胺基酸;或 (c) 為色胺酸的疏水性胺基酸。
  6. 如申請專利範圍第1項所述之抗體或其抗原結合部位,其中CDR2之胺基酸殘基63被以下任一所取代: (a) 為酪胺酸的中性胺基酸; (b) 選自丙胺酸、白胺酸或纈胺酸的疏水性胺基酸; 或 (c) 選自組胺酸或精胺酸的鹼性胺基酸。
  7. 如申請專利範圍第1項所述之抗體或其抗原結合部位,其中CDR3中之胺基酸殘基105被以下任一所取代: (a) 選自精胺酸或離胺酸的鹼性胺基酸; (b) 選自甘胺酸或蘇胺酸的中性胺基酸;或 (c) 選自甲硫胺酸、丙胺酸、異白胺酸或纈胺酸的疏水性胺基酸。
  8. 一種抗體或其抗原結合部位,其與一醣類抗原結合且包含:一輕鏈變異區,其中該輕鏈變異區包含三個CDR,CDR1、CDR2以及CDR3,其分別具有大約90%至100%與SEQ ID NO:7、8以及9所載之胺基酸序列同源的胺基酸序列; 其中CDR包含至少一以下胺基酸取代: (a) CDR1中之胺基酸殘基24被中性胺基酸或疏水性胺基酸取代; (b) CDR1中之胺基酸殘基32被中性胺基酸或非甲硫胺酸之疏水性胺基酸取代; (c) CDR2中之胺基酸殘基49被中性胺基酸取代; (d) CDR2中之胺基酸殘基53被中性胺基酸或鹼性胺基酸取代;以及/或 (e) CDR3中之胺基酸殘基93被非天門冬醯胺酸之中性胺基酸、鹼性胺基酸或疏水性胺基酸取代。
  9. 如申請專利範圍第8項所述之抗體或其抗原結合部位,其進一步包含至少一以下之架構: (a) 於輕鏈前導序列及CDR1之間並具有大約90%至100%與SEQ ID NO:10同源的胺基酸序列的一架構; (b) 於輕鏈之CDR1及CDR2之間並具有大約90%至100%與SEQ ID NO:11同源的胺基酸序列的一架構; (c) 於輕鏈之CDR1及CDR2之間並具有大約90%至100%與SEQ ID NO:11同源的胺基酸序列的一架構,其中該架構中之胺基酸殘基45為脯胺酸且未被取代; (d) 於輕鏈之CDR1及CDR2之間並具有大約90%至100%與SEQ ID NO:11同源的胺基酸序列的一架構,其中該架構中之胺基酸殘基46為色胺酸且未被取代;以及/或 (e) 於輕鏈之CDR2及CDR3之間並具有大約90%至100%與SEQ ID NO:12同源的胺基酸序列的一架構。
  10. 如申請專利範圍第8項所述之抗體或其抗原結合部位,其中CDR1中之胺基酸殘基24被以下任一所取代: (a) 選自甘胺酸或絲胺酸的中性胺基酸; 或 (b) 為色胺酸的疏水性胺基酸。
  11. 如申請專利範圍第8項所述之抗體或其抗原結合部位,其中CDR1中之胺基酸殘基32被以下任一所取代: (a) 選自甘胺酸或麩醯胺酸的中性胺基酸;或 (b) 為纈胺酸的疏水性胺基酸。
  12. 如申請專利範圍第8項所述之抗體或其抗原結合部位,其中CDR2中之胺基酸殘基49被為甘胺酸的中性胺基酸取代。
  13. 如申請專利範圍第8項所述之抗體或其抗原結合部位,其中CDR2中之胺基酸殘基53被以下任一所取代: (a) 選自甘胺酸或蘇胺酸的中性胺基酸;或 (b) 為離胺酸的鹼性胺基酸。
  14. 如申請專利範圍第8項所述之抗體或其抗原結合部位,其中CDR3中之胺基酸殘基93被以下任一所取代: (a) 選自麩醯胺酸、絲胺酸或蘇胺酸的中性胺基酸; (b) 為精胺酸的鹼性胺基酸;或 (c) 選自苯丙胺酸、白胺酸或甲硫胺酸的疏水性胺基酸。
  15. 一種與一醣類抗原結合之抗體或其抗原結合部位,其包含:一重鏈變異區及一輕鏈變異區,其中該重鏈變異區包含三個CDR,CDR1、CDR2以及CDR3,其分別具有大約90%至100%與SEQ ID NO:1、2以及3所載之胺基酸序列同源的胺基酸序列,以及/或其中該輕鏈變異區包含三個CDR,CDR1、CDR2以及CDR3,其分別具有大約90%至100%與SEQ ID NO:7、8以及9所載之胺基酸序列同源的胺基酸序列。
  16. 如申請專利範圍第15項所述之抗體或其抗原結合部位,其進一步包含至少一以下之架構: (a) 具有大約90%至100%與SEQ ID NO:4同源的胺基酸序列的一重鏈架構; (b) 具有大約90%至100%與SEQ ID NO:5同源的胺基酸序列的一重鏈架構; (c) 具有大約90%至100%與SEQ ID NO:6同源的胺基酸序列的一重鏈架構; (d) 具有大約90%至100%與SEQ ID NO:5同源的胺基酸序列的一重鏈架構,其中該重鏈架構中之胺基酸殘基46為甘胺酸且未被取代; (e) 具有大約90%至100%與SEQ ID NO:10同源的胺基酸序列的一輕鏈架構; (f) 具有大約90%至100%與SEQ ID NO:11同源的胺基酸序列的一輕鏈架構; (g) 具有大約90%至100%與SEQ ID NO:12同源的胺基酸序列的一輕鏈架構; (h) 具有大約90%至100%與SEQ ID NO:11同源的胺基酸序列的一輕鏈架構,其中該輕鏈架構中之胺基酸殘基45為脯胺酸且未被取代;以及/或 (i) 具有大約90%至100%與SEQ ID NO:11同源的胺基酸序列的一輕鏈架構,其中該胺基酸殘基46為色胺酸且未被取代。
  17. 如申請專利範圍第1項、第8項或第15項所述之抗體或其抗原結合部位,其中該醣類抗原為Globo H、 階段特異性胚胎抗原3 (SSEA-3)、階段特異性胚胎抗原4(SSEA-4)、Gb4、Gb3、sLex 、Lex 、sLea 、Lea 、Ley 、聚唾液酸(PSA)、sTn、Tn、TF、GD1a、GT1b、A2B5、GD2、GD3、岩藻醣基(Fucosyl)GM1、GM1、GM2、GM3或Neu5GcGM3。
  18. 一種醫藥組成物,其包含: 如申請專利範圍第1項、第8項或第15項所述之抗體或其抗原結合部位;以及 一藥學上可接受之載體
  19. 如申請專利範圍第18項所述之醫藥組成物,其進一步包含至少一其他的治療劑。
  20. 一種將如專利申請範圍第1項、第8項或第15項所述之抗體或其抗原結合部位在製備抑制癌細胞增生藥物之用途,其包含施予一有效量的該抗體或其抗原結合部位至一需求個體,其中該癌細胞的增生被抑制。
  21. 如申請專利範圍第20項所述之用途,其中該需求個體為人類。
  22. 如申請專利範圍第20項所述之用途,其中該癌症係一表現Globo H之癌症。
  23. 如申請專利範圍第22項所述之用途,其中表現Globo H之癌症係選自由以下組成之群組:肉瘤、皮膚癌、白血病、淋巴瘤、腦癌、神經膠母細胞瘤、肺癌、乳癌、口腔癌、頭頸部癌、鼻咽癌、食道癌、胃癌、肝癌、膽道癌、膽囊癌、膀胱癌、胰臟癌、腸癌、大腸癌、腎臟癌、子宮頸癌、子宮內膜癌、卵巢癌、睪丸癌、頰癌、口咽癌、喉癌以及前列腺癌。
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