TW201022492A - Blood transcriptional signature of mycobacterium tuberculosis infection - Google Patents

Blood transcriptional signature of mycobacterium tuberculosis infection Download PDF

Info

Publication number
TW201022492A
TW201022492A TW098121444A TW98121444A TW201022492A TW 201022492 A TW201022492 A TW 201022492A TW 098121444 A TW098121444 A TW 098121444A TW 98121444 A TW98121444 A TW 98121444A TW 201022492 A TW201022492 A TW 201022492A
Authority
TW
Taiwan
Prior art keywords
active
latent
gene
protein
patients
Prior art date
Application number
TW098121444A
Other languages
English (en)
Inventor
Jacques F Banchereau
Damien Chaussabel
Anne O'garra
Matthew Berry
Onn Min Kon
Original Assignee
Baylor Res Inst
Medical Res Council On Behalf Of The Nat Inst For Medical Res
Imp College Healthcare Nhs Trust
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Baylor Res Inst, Medical Res Council On Behalf Of The Nat Inst For Medical Res, Imp College Healthcare Nhs Trust filed Critical Baylor Res Inst
Publication of TW201022492A publication Critical patent/TW201022492A/zh

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6876Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
    • C12Q1/6883Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/53Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
    • G01N33/569Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for microorganisms, e.g. protozoa, bacteria, viruses
    • G01N33/56911Bacteria
    • G01N33/5695Mycobacteria
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/112Disease subtyping, staging or classification
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/158Expression markers
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N2800/00Detection or diagnosis of diseases
    • G01N2800/60Complex ways of combining multiple protein biomarkers for diagnosis

Landscapes

  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Pathology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Hematology (AREA)
  • Urology & Nephrology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • General Physics & Mathematics (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Virology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Tropical Medicine & Parasitology (AREA)
  • Food Science & Technology (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)

Description

201022492 六、發明說明: 【發明所屬之技術領域】 本發明一般而言係關於結核分枝桿菌(M少 iMijercM/osz··?)感染之領域,且更特定言之係關於一種用於 在治療之前、期間及之後對潛伏性及活動性結核分枝桿菌 感染及疾病進程進行診斷、預後及監控之系統、方法及裝 置。 超長表格 本專利申請案含有超長表格部分。該表格之複本可以電 子形式自 USPTO 網站(http://seqdata.uspto.gov/)獲得。在申 請且支付37 CFR 1.19 (b) (3)中所闡明之費用後,該表格 之電子複本亦可自USPTO獲得。 【先前技術】 在不限制本發明之範疇的情況下,與結核分枝桿菌感染 之鑑別及治療相結合來描述本發明之背景。 肺結核(PTB)為全世界由結核分枝桿菌(M. 引起之發病率及死亡率的主要且漸增之病因。然而,受結 核分枝桿菌感染之大多數個體保持為無症狀的,從而使感 染保持處於潛伏形式,且據信此潛伏狀態係由活動性免疫 反應來維持(WHO ; Kaufmann, SH 及 McMichael, AJ.,Nat Med, 2005)。此係由以下報導支持,該等報導顯示以抗 TNF抗體治療患有克隆氏病(Crohn’s Disease)或類風濕性關 節炎之患者使自體免疫性症狀得以改良,但另一方面引起 先前與結核分枝桿菌接觸之患者的TB再活化(Keane)。對 141281.doc 201022492 結核分枝桿菌之免疫反應為多因子的且包括Thl軸之經遺 傳確定之宿主因子,諸如TNF及IFN-γ及IL-12(評述於 Casanova, Ann Rev 中;Newport)。然而,來自成人肺部 TB 患者之免疫細胞可產生IFN-γ、IL-12及TNF,且IFN-γ療法 對改善疾病無幫助(評述於Reljic,2007,J Interferon & Cyt . Res.,27, 353-63中),此表明較大數目之宿主免疫因子與保 護免受結核分枝桿菌感染及維持潛伏狀態有關。因此,潛 伏性對活動性TB中所誘導之宿主因子之知識可提供關於可 • 控制結核分枝桿菌感染之免疫反應的資訊。 PTB之診斷由於許多原因可能困難且有問題。首先,由 顯微鏡檢查證實唾液中典型結核分枝桿菌之存在(抹片陽 性)僅具有50-70%之敏感度,且陽性診斷需要由培養分離 結核分枝桿菌,可能耗時長達8週。另外,一些患者之唾 液呈抹片陰性或不能產生唾液,因此需要由支氣管鏡檢 (一種侵襲性程序)另外取樣。由於PTB診斷中之此等限 制,有時測試抹片陰性患者之結核菌素(PPD)皮膚反應性 胃 (Mantoux)。然而,結核菌素(PPD)皮膚反應性不可區分 BCG接種、潛伏性或活動性TB。對此問題回應,已開發出 _ 證實對BCG中不存在之特異性結核分枝桿菌抗原具有免疫 '反應性的檢定。然而,如在干擾素γ釋放檢定(IGRA)中jk 細胞產生IFN-γ所測量,對此等結核分枝桿菌抗原之反應 性無法區別潛伏性疾病與活動性疾病。潛伏性TB在臨床上 定義為在不存在臨床症狀或病徵或活動性疾病之放射學表 明下,以PPD經皮内激發患者時有遲發型過敏反應,連同 141281.doc 201022492 IGRA陽性結果。潛伏性/休眠性結核(TB)之再活化呈現有 傳播給其他個體之風險的主要健康危害,因此反映潛伏性 與活動性TB患者差異的生物標記可用於疾病管理尤其因 為抗分枝桿菌藥物治療難難且可能引起嚴重副作用。 【發明内容】 本發明包括與健康對照相比,用於鑑別潛伏性對活動性 結核(TB)患者之方法及套組。在一個實施例中,使用相異 且相反免疫特徵之血液微陣列分析以測定、診斷、追蹤及 治療潛伏性對活動性結核(TB)患者。 在一個實施例中’本發明包括用於區分疑受結核分枝桿 菌感染之患者的活動性與潛伏性結核分枝桿菌感染之方 法、系統及套組’該方法包括以下步驟:自患者之全血樣 m獲得基因表現資料集(dataset);測定一或多個區分受感 染患者與非感染個體之轉錄基因表現模組的差異表現,其 中該資料集展示與匹配之非感染個體相比,該一或多個轉 錄基因表現模組中聚核苦酸量之聚合變化(aggregate change);及基於該—或多個區別活動性與潛伏性感染之轉 錄基因表現模組來區分活動性與潛伏性結核分枝桿菌⑽ 感染。在-態樣中,本發明亦可包括使用敎之比較基因 產物資訊來制定診斷之步驟。 在另-態樣中,該方法亦可包括使用經確定之比較性基 因產物資訊來制定預後之步驟或使用經確定之比較性基因 產物資訊來敎治療計劃之步驟。在—替代態樣中,該方 法可包括區分潛伏性TB患者與活動性TB患者之步驟。在 141281.doc 201022492 一態樣中,模組可包括模組M1 2、Ml 3、Mi 4、Ml 5、 Μ1·8、M2.1、M2.4 ' M2.8、Μ3·1、Μ3·2、M3 3、M3.4、 M3.6、M3.7、M3.8或M3.9中基因之資料集以偵測活動性 肺部感染。m樣巾,模組可包括额Mi 5、M2 i、 M2.6 M2.10、M3.2或M3.3中基因之資料集以福測潛伏性 ❹mi樣以下基因在活動性肺部感染中下 調:CD3、CTLA_4、CD28、ΖΑρ·7〇、il_7r、⑽、 SLAM、CCR7及GATA-3。在-特定態樣中,圖9中之模組 表現圖譜指示活動性肺部感染且圖1〇中之模組表現圖譜指 示潛伏性感染。已發現模組Μ3.4、Μ36、Μ3·7、Μ3·^ Μ3.9中基因之不足表現指示活動性感染。亦已發現模組 Μ3.1中基因之過度表現指示活動性感染。 曰在本發明之另—態樣中,該方法亦可包括藉由在除分枝 杯菌以外之感染中確定周邊血液單核細胞或全血過度表現 模、.且M2.2、M2.3及M3 _5中之基因表現來區分ΤΒ感染與 其他細菌感染之步驟。或者,該方法可包括使用以下模組 中之兩者或兩者以上區分潛伏性及活動性ΤΒ患者之血液中 之差異且相反之轉錄特徵的步驟:對於活動性肺部感染而 言為 Ml·3、Μ1·4、Μ1.5、亂8、M2」、Μ2·4、Μ2.8、 M3.l、Μ3.2、Μ3·3、Μ3 4、Μ3 6、Μ3 7、Μ3 8或奶 9, 且對於潛伏性感染而言為模組Μ15、Μ2 ι、Μ2 6、 M2·10、Μ3.2或Μ3.3。對比健康患者在活動性肺部ΤΒ感染 中上調之基因的實例係選自表7八、表7〇、表Η、表π及表 7K。對比健康患者在活動性肺部TB感染中下調之基因的 141281.doc 201022492 其他實例係選自表7B、表7C、表7E、表mG、表 W、表7L、表™、表7N、表7〇及表7p。在一特定態樣 中,對比健康患者在潛伏性TB感染中上調之基因可選自表 8B。在另—特定態樣中’對比健康患者在潛伏性TB感染 中下調之基因可選自表从、表8C、表8D、表8E及表8ρ/、 本發明之另一實施例為一種用⑥區分疑受結核分枝桿菌 感染之患者的活動性與潛伏性結核分枝桿菌感染之方法, u方法包括以下步驟:獲得自患有活動性結核分枝桿菌感 染之第-臨床組獲得之第一基因表現資料集、自潛伏性結 核分技桿菌感染患者之第二臨床組獲得之第二基因表現資 料集及自非感染個體之臨床組獲得之第三基因表現資料 集’產生包含第-資料集、第二資料集及第三資料集中之 任意兩者之間的基因差異表現之基因叢資料集;且確定指 不潛伏性感染、活動性感染或健康之獨特表現/表示模 式。在一態樣中,將各臨床組分成表6之119種基因中之每 一者的獨特表現/表示模式。在另-態樣中,W第一資料 集與第三資料集之值作比較^自其扣除來自第三資料集之 資料集的值。在另—特定態樣中,將第二資料集與第三資 料集之值作比較且自其扣除來自第三資料集之資料集的 :。在-特定實施例中,該方法可進一步包括將兩個不同 資料集之值作比較且扣除剩餘資料集之值以區分患有潛伏 性感染之患者、患有活動性感染之患者及非感染個體之步 驟在九、樣中,該方法可進一步包含使用經確定之比 性基因產物資訊來制定診斷或預後之步驟。在另一態樣 141281.doc 201022492 中,該方法包括使用經確定之比較性基因產物資訊來制定 治療計劃之步驟。該方法亦可包括藉由分析基因及患者叢 中基因之表現/表示來區分潛伏性TB患者與活動性TB患者 之步驟。
在一特定態樣中,該方法可進一步包括確定以下基因之 表現量的步驟:ST3GAL6、PAD14、TNFRSF12A、 VAMP3、BR13、RGS19、PILRA、NCF1、LOC652616、 PLAUR(CD87)、SIGLEC5、B3GALT7、IBRDC3(NKLAM)、 ALOX5AP(FLAP)、MMP9、ANPEP(APN)、NALP12、 CSF2RA、IL6R(CD126)、RASGRP4、TNFSF14(CD258) ' NCF4、HK2、ARID3A、PGLYRPl(PGRP),該等基因在潛 伏性TB患者之血液中不足表現/不足表示,但在健康個體 或活動性TB患者之血液中並非如此。在另一特定態樣中, 該方法可進另一步包括確定以下基因之表現量的步驟: ABCG1、SREBF1、RBP7(CRBP4)、C22orf5、FAM101B、 S100P、LOC649377、UBTD1、PSTPIP-1、RENBP、 PGM2、SULF2、FAM7A1、HOM-TES-103、NDUFAF1、 CES1、CYP27A1、FLJ33641、GPR177、MID1IP1(MIG-12)、PSD4、SF3A1 、NOV(CCN3)、SGK(SGKl)、 CDK5R1、LOC642035,該等基因在健康對照個體之血液 中過度表現/過度表示,但在潛伏性TB患者之血液中不足 表現/不足表示,且在活動性TB患者之血液中不足表現/不 足表示。在另一特定態樣中,該方法可進另一步包括確定 以下基因之表現量的步驟:ARSG、LOC284757、MDM4、 141281.doc -9- 201022492 CRNKLl ' IL8、LOC389541、CD300LB、NIN、PHKG2、 HIP1,該等基因在健康個體之血液中過度表現/過度表 示,在潛伏性與活動性TB患者之血液中不足表現/不足表 示。在一特定態樣中,該方法可進一步包括確定以下基因 之表現量的步驟:PSMB8(LMP7)、APOL6、GBP2、 - GBP5、GBP4、ATF3、GCH1、VAMP5、WARS、LIMK1、 . NPC2、IL-15、LMTK2、STX11(FHL4),該等基因在活動 性TB之血液中過度表現/過度表示,且在潛伏性TB患者及 健康對照個體之血液中不足表現/不足表示。在一特定態 ® 樣中,該方法可進一步包括確定以下基因之表現量的步 驟:FLJ11259(DRAM)、JAK2、GSDMDC1(DF5L)(FKSG10)、 SIPAIL1、[2680400](KIAA1632)、ACTA2(ACTSA)、KCNMB1 (SLO-β),該等基因在活動性TB患者之血液中過度表現/過 度表示,且在潛伏性TB患者及健康對照個體之血液中不足 表現/不足表示。在一特定態樣中,該方法可進一步包括 確定以下基因之表現量的步驟:SPTANI、KIAAD179 (Nnpl)(RRPl)、FAM84B(NSE2)、SELM、IL27RA、 MRPS34、[6940246](IL23A)、PRKCA(PKCA)、CCDC41、 CD52(CDW52)、[3890241](ZN404)、MCCC1(MCCA/B)、 SOX8、SYNJ2、FLJ21127、FHIT,該等基因在活動性TB ^ 患者之血液中不足表現/不足表示,但在潛伏性TB患者或 健康對照個體之血液中並非如此。在一特定態樣中,該方 法可進一步包括確定以下基因之表現量的步驟: CDKLl(p42)、MICALCL、MBNL3、RHD、ST7(RAY1)、 141281.doc -10· 201022492 PPR3R1 、[360739](PIP5K2A)、AMFR、FLJ22471 、 CRAT(CATl)、PLA2G4C、AC0T7(ACT)(ACH1)、RNF182、 KLRC3(NKG2E)、HLA-DPB1,該等基因在健康對照個體 之血液中不足表現/不足表示,在潛伏性TB患者之血液中 •過度表現/過度表示,且在活動性TB患者之血液中過度表 .現/過度表示。 本發明之另一實施例為一種用於區分疑受結核分枝桿菌 感染之患者的活動性與潛伏性結核分枝桿菌感染之方法, ❹ 該方法包括以下步驟:自全血樣品獲得基因表現資料集; 將該基因表現資料集分類為一或多個轉錄基因表現模組; 且對該或該等區分活動性與潛伏性結核分枝桿菌感染之轉 錄基因表現模組之差異表現進行繪圖,藉此區分活動性與 潛伏性結核分枝桿菌感染。在一態樣中,資料集包括 TRIM基因。在一態樣中,資料集包括TRIM基因,尤其 TRIM 5、6、19(PML)、21、22、25、68,其在活動性肺 部TB中過度表示/表現。在一態樣中,TRIM基因之資料集 • 包括TRIM 28、32、5 1、52、68 ’其在活動性肺部TB中不 足表示/表現。 本發明之另一實施例為一種在疑受結核分枝桿菌感染之 ' 患者中診斷患有活動性及潛伏性結核分枝桿菌感染之患者 的方法,該方法包含偵測一或多個區分受感染患者與非感 染患者之獲自全金的轉錄基因表現模組之差異表現,其中 全血展示與匹配之非感染患者相比,該或該等轉錄基因表 現模組中聚核苷酸量之聚合變化,藉此區分活動性與潛伏 141281.doc -11 - 201022492 性結核分枝桿菌感染。在另一態樣中,該方法包括一或多 個以下步驟:使用經確定之比較性基因產物資訊來制定診 斷,使用經確定之比較性基因產物資訊來制定預後之步驟 及使用經確定之比較性基因產物資訊來制定治療計劃之步 驟。在一替代態樣中,該方法可包括區分潛伏性TB患者與 活動性TB患者之步驟。在一態樣中,模組可包括模組 Μ1·2、Μ1·3、M1.4、Μ1·5、M1.8、M2.1、Μ2·4、M2.8、 Μ3.1、Μ3.2、Μ3.3、Μ3.4、Μ3.6、Μ3.7、Μ3.8 或 Μ3.9 中 基因之資料集以偵測活動性肺部感染。在另一態樣中,模 組可包括模組 Μ1.5、Μ2.1、Μ2.6、Μ2·1〇、Μ3.2 或 Μ3.3 中 基因之資料集以偵測潛伏性感染。在另一態樣_,以下基 因在活動性肺部感染中下調:CD3、ctla_4、CD28、 ZAP-70、IL-7R、CD2、SLAM、CCR7 及 GATA-3。在一特 定態樣中,圖9中之模組表現圖譜指示活動性肺部感染且 圖10中之模組表現圖譜指示潛伏性感染。已發現模組 M3.4、M3.6、M3.7、M3.8及M3.9中基因之不足表現指示 活動性感染。亦已發現模組^^」中基因之過度表現指示活 動性感染。 在本發明之另一態樣中,該方法亦可包括藉由在除分枝 桿菌以外之感染中確定周邊血液單核細胞或全血過度表現 之模組M2.2、M2.3及M3.5中之基因表現來區分TB感染與 其他細菌感染之步驟。或者,該方法可包括使用以下模組 中之兩者或兩者以上區分潛伏性及活動性TB患者之血液中 之差異且相反之轉錄特徵的步驟:對於活動性肺部感染而 141281.doc -12· 201022492 。為 Μ1·3、M1.4、M1.5、M1.8、M2」、M2 4、M2 8、 M3.1>M3.2>M3.3.M3.4.M3.6^M3.7.M3.8^M3.9^ 且對於潛伏性感染而言為模組Ml.5、M2.1、M2 6、 敗1〇、处2或亂31比健康患者在活動性肺部η感染 中上調之基因的實例係選自纽、表7D、表7ι、表7j及表 7K。對比健康患者在活動性肺部TB感染中下調之基因的 其他實例係選自表7B、表%、表7E、表7F、表%、表
7H、表7L、表™、表7N、表7〇及表7p。在一特定態樣 中’對比健康患者在潛伏性TB感染中上調之基因可選自表 8B。在另—特定態樣中,對比健康患者在潛伏性Μ感染 中下調之基因可選自表8八、表8C、表8D、表8Ε及表8卜 本發明之另-實施例為—種用於在疑受結核分枝桿菌感 染之患者中診斷患有活動性及潛伏性結核分枝桿®感染之 患者的套組,該套組包括用於自患者獲得基因表現資料集 之基因表現偵測器;及能夠將基因表現與區分受感染患者 與非感染患者之獲自全血的預定基因模組資料集作比較之 處理器,#中全血展示與匹配之非感染患者相比,該或該 等轉錄基因表現模組中聚核苷酸量之聚合變化,藉此區分 活動性與潛伏性結核分枝桿菌感染。 另一實施例包括一種診斷患有活動性及潛伏性結核分枝 才干菌感染之患者的系統,其包含:來自患者之基因表現資 料集,及能夠將基因表現與區分受感染患者與非感染患者 之獲自全血的預疋基因模組資料集作比較之處理器,其中 全血展示與匹配之非感染患者相比,該或該等轉錄基因表 141281.doc •13· 201022492 現模組中聚核苷酸量之聚合變化,藉此區分活動性與潛伏 性結核分枝桿菌感染,其中該等模組對於活動性肺部感染 而言係選自 Μ1·3、M1.4、M1.5、M1.8、Μ2·1、M2.4、 Μ2.8、Μ3.1、Μ3·2、Μ3.3、Μ3.4、Μ3.6、Μ3.7、Μ3.8 或 Μ3.9 ’且對於潛伏性感染而言係選自模組M1 $、Μ2.ι、 M2.6、M2.10、M3.2或 M3.3。 【實施方式】 為更全面地瞭解本發明之特徵及優勢,現參考[實施方 式]以及隨附圖式。 _ 儘管下文詳細論述達成及使用本發明之各種實施例,但 應瞭解,本發明提供可在多種特定情形中具體化之許多可 應用之發明概念。本文所論述之特定實施例僅說明達成及 使用本發明之特定方式且並不限定本發明之範疇。 為有利於理解本發明,下文定義許多術語。本文所定義 之術語具有如一般熟習本發明相關領域者通常所理解之含 義諸如 」及該」之術語並不意欲僅指代單數實 體而包括可用於說明之特定實例的一般種類。本文之術⑩ 用於描述本發明之特定實施例,但除如申請專利範圍中 所概述外,其使用並不限定本發明。除非另作定義,否則 本文所用之所有技術及科學術語具有熟習本發明所屬技術 者通常所理解之含義。以下參考文獻向熟習此項技術者提 供本發明所用之許多術語的一般定義· Singlet〇n等人, D1Ct1〇nary of Micr〇bi〇1〇gy and M〇lecuiar (第之版 1994) , The Cambridge Dictionary of Science and Technology 141281.doc -14- 201022492 (Walker編,1988) ; The Glossary of Genetics,第 5版,R. Rieger 等人(編),Springer Verlag (1991);及 Hale及 Marham, The Harper Collins Dictionary of Biology (1991)。 各種生物化學及分子生物學方法在此項技術中已為熟 知。舉例而言,分離及純化核酸之方法詳細描述於以下文 獻中:WO 97/10365 ; WO 97/27317 ; Laboratory Techniques
in Biochemistry and Molecular Biology: Hybridization with Nucleic Acid Probes,第 I 部分 Theory and Nucleic Acid Preparation, (P. Tijssen編)Elsevier, N.Y. (1993)之第 3章; Sambrook等人,Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Press, N.Y., (1989);及 Current
Protocols in Molecular Biology, (Ausubel,F.M.等人編) John Wiley & Sons,Inc.,New York (1987-1999),包括增 刊。 生物資訊定義 如本文所用之「物件」係指所關注之任何項目或資訊 (一般為文字,包括名詞、動詞、形容詞、副詞、片語、 句子、符號、數字特徵等)。因此,物件為可形成關係之 任何事物及可自來源獲得、鑑別及/或搜尋之任何事物。 「物件」包括(但不限於)諸如基因、蛋白質、疾病、表 型、機制、藥物等之所關注實體。在一些態樣中,如下文 進一步描述,物件可為資料。 如本文所用之「關係」係指同一單元(例如片語、句 子、兩行或兩行以上文字、段落、部分網頁、頁面、雜 141281.doc -15· 201022492 誌、論文、書等)内之物件共同出現。其可為文字、符 號、數字及其組合。 如本文所用之「元資料内容」係指關於在資料源中之文 字組織的資訊。元資料可包含諸如都柏林核心元資料 (Dublin Core metadata)之標準元資料或可具集合特定性。 · 元資料格式之實例包括(但不限於)用於圖書館目錄之機器 可讀目錄(Machine Readable Catalog,MARC)記錄、資源 描述形式(Resource Description Format,rdF)及可延伸性 標示語言(Extensible Markup Language,XML)。可手動或 ❹ 經由自動資訊擷取演算法產生元物件。 如本文所用之「引擎」係指執行其他程式之核心功能或 基本功能之程式。舉例而言,引擎可為協調其他程式之整 體操作的操作系統或應用程式中之中心程式。術語「引 擎」亦可指代含有可改變之演算法的程式。舉例而言,可 設計知識發掘引擎使得其鑑別關係之方法可改變以反映將 關係加以鑑別及排序之新規則。 如本文所用之「語義分析」係指(例如)經由移除字尾或 〇 取词幹或藉由採用詞庫來鑑別表示類似概念之詞之間的關 係。r統計分析」係指基於對各項目(詞、詞根、詞幹、η · 元語法(η-gram)、片語等)出現之次數進行計數的技術。在 . 關於主題無限制之集合中,不同情形中所用之相同片語可 表不不同概念。片語共同出現之統計分析可幫助解析詞義 歧義。「語法分析」可用於藉由詞性分析來進一步減少歧 義。如本文所用之該等分析中之一或多者更一般而言稱作 141281.doc • 16 · 201022492 置:」。「人工智慧(AI)」係指諸如電腦之非人類裳 :人類將認為值得關注或「智慧」之任務的方法。實 鑑別照片、理解口語詞或書寫文字及解決 如同「杳却 「 胃訊」及「知識」’諸如「資料」、「資料集」及 二:」之術語常常可互換使用。如本文所用之「 為作為經驗量度或量户 :欠 X,且之最基本早位。編譯資料以構成 一貝料根本上獨立於資訊且可組合成資料集,亦 …組資料。相比之下’資訊來源於關注,例如出於發 現與心血管疾病風險相關聯之變數的目的,資料(可 集t於種族、性別、|古、神杳 身153體重及飲食。然而,可使用相 3貝料以開發公式或產生關於飲食偏好之「資訊」’亦 即超級市場中某些產品具有較高銷售可能性之可能性。 本文所用之術5吾「資料庫」係指原始資料或編課資料 之赌存庫,即使在資料棚内可發現各種資訊面。資料庫可 包括-或多個資料集。m常組織資料庫以使可存取、管理 及更新其内容(例如,資料庫為動態的)。由於資料及資訊 之主源為資料庫,因此術語「資料庫」及「源」在本發明 中亦可互換使用。然而,「源資料庫」或「源資料」一般 係指資料,例如輸入系統中以供鑑別物件且確定關係之非 結構化文字及/或結構化資料。源資料庫可能為或可能不 為關係資料庫。然而,系統資料庫通常包括儲存涉及物件 之間的關係之值的關係資料庫或一些等效類型之資料庫。 如本文所用之「系統資料庫」及「關係資料庫」可互換 使用且係指一或多冑組織為一組含有符合預冑類別之資料 141281.doc -17· 201022492 的表格之資料集合。舉例而令 個由行定義之類別(例如屬性。)’而=表格可包含一或多 定義之類別的獨特物件。因 /庫之列可含有由行 具有關於該基因之存在 _如基因-致性之物件可 資料庫之列亦可稱作「隼不存在及’或表現量之行。關係 係資料庫之情形中般由其行之值定義。在關 效值。 ㉟」為攔(諸如行)可包括之-系列有 如本文所用之「知铐从 ^ 域,例如所有生物醫學資料。:系統操作所處之研究領 於此…: 程資料)組合為有利的,此係由 域)之常人而言不可匯^:通—個領域或研究(-個 料庫. ° 起之事物相關聯。「分散式資 =偏曰在網路之不同點中可分散或複製之資料庫。 如本文所用之「資訊」係指可包括數字 組、字母組或得自或源自— 聚子 料@1, ^ ^ !貝枓之結論的資料集。「資 :二為貝訊之量度或統計及基本單位。「資訊」亦可包 由' 類型之#枓’諸如詞、符號、文字(諸如非結構化 = 代瑪等。「知識」寬鬆地定義為一組提供對系 用關π刀理解以模擬因果之資訊。為延伸先前實例,可使 ^關於人口統計學、性別及優先購買之資訊來開發食品銷 ::區域性市場策略,巾買主可使用關於國籍之資訊作為 之早則i要的疋,注意到資料'資訊與知識之 間不存在嚴格界限;該三個項目有時視為等效的。一般而 a ’資料來自檢查,資訊來自關聯,且知識來自模擬。 141281.doc •18· 201022492 如本文所用之「程式 式「 定程式設計語言之規則且3勹人電腦程式」-般係指遵照特 能、任務或問題所需之%成解決或執行某一功 語法單位。程式設計語言—Ί之宣告及敘述或指令的 言。 σ般為用於表達程式之人工語 即不又所用之 . 電腦系統」一船在共 斗、充 個進行資料處理之電腦、 叙係札一或多 「么 间邊設備及軟體。「佶用去弋 系統操作者」一般包括中扒… 」〆
使用經「使用者裝置」(例 、-交換之目的 腦網路的個人。「電腦^ &、無線裝置等)存取之電 #細」一般為在無人為干預之情況下可 元。 #運算之實質性計算的功能單 如本文所用之「應用軟髅. 」或應用程式」一般传指特 由定:對解決應用問題之軟體或程式。「應用問題= 由最終使用者提交且需要資 戈貝訊處理以使之得以解決之問 題。 如本文所用之「自然語言」 未特別規定之語言,例如英文 係指其規則基於當前用法而 、西班牙文或中文。如本文
人工語言」係指在使用前明確確立 言,例如電腦程式設計語言,諸如C、C++、U BASIC、FORTRAN或 COBOL。 如本文所用之「統計相關性」係指使用排序機制中之一 或多者(O/E比率、強度等),其中若關係比隨機機會所預 期顯著更頻繁地出現,則將其確定為統計學上相關的。 141281.doc -19· 201022492 如本文所用之術語「協同調節基因」或「轉錄模組」可 互換使用以指代特定基因之分組基因表現圖譜(例如,與 特定基因序列相關之信號值)。各轉錄模組使兩個關鍵資 料塊(文獻搜尋部分與獲自基因微陣列之實際經驗基因表 現值資料)相關聯。選入轉錄模組中之基因組係基於基因 表現資料之分析(如上文所述之模組擷取演算法)。其他步 驟係由 Chaussabel,D.及 Sher,A. Mining microarray expression data by literature profiling. Genome Biol 3, RESEARCH005 5 (2002)(http://genomebiology.eom/2002/3/ 10/research/0055)教示,相關部分以引用的方式併入本文 中,且表現資料獲自所關注之疾病或病狀,例如全身性紅 斑性狼瘡症、關節炎、淋巴瘤、癌瘤、黑色素瘤、急性感 染、自體免疫性病症、自體發炎性病症等。 下表列出用於開發轉錄模組之文獻搜尋部分或貢稿的關 鍵詞之實例。熟習此項技術者將認識到可易於選擇其他術 語用於其他病狀,例如特定癌症、特定傳染病、移植等。 舉例而言,下文將與T細胞活化相關之基因及彼等基因之 信號描述為模組ID「Μ 2.8」,其中某些關鍵詞(例如淋巴 瘤、Τ細胞、CD4、CD8、TCR、胸腺、淋巴、IL2)用於鑑 別關鍵Τ細胞相關基因,例如Τ細胞表面標記(CD5、CD6、 CD7、CD26、CD28、CD96);由淋巴系細胞表現之分子 (淋巴毒素β、IL2誘導性Τ細胞激酶、TCF7 ;及Τ細胞分化 蛋白ma卜GATA3、STAT5B)。接著,藉由使針對此等基因 之來自患者群體的資料相關聯(與平台、存在/不存在及/或 141281.doc -20- 201022492 上調或下調無關)來開發完整模組以產生轉錄模組。在一 些狀況下’基因圖譜(此時)與此等疾病病狀之基因的任何 特疋叢及^料不匹配,然而,在「欠定(Underdetermined)」 模組中發現某些生理學路徑(例如cAMp信號轉導、鋅指蛋 白、細胞表面標記等)。實際上,基因表現資料集可在與 關鍵詞搜尋匹配之前用於擷取具有協調表現之基因,亦 即’任一資料集可在交叉參考之前與第二資料集相關聯。 表1 :轉錄模組
實例模組I.D. 實例關鍵詞選摆 ""基因圖譜分析 Μ 1.1 Ig、免疫球蛋 白、骨骼、骨 髋、PreB ' IgM ' Mu. 漿細胞:包括編碼免疫球蛋白鏈(例如IGHM、 IGJ、IGLL卜IGKC、IGHD)及漿細胞標記CD38之 基因。 Μ 1.2 血小板、黏附、 聚集、内皮、jk 管 血小板:包括編碼血小板醣蛋白(ITGA2B、 ITGB3、GP0、GP1A/B)及諸如PPPB(前血小板鹼性 蛋白)及PF4(血小板因子4)之jk小板源性免疫介體 的基因。 Μ 1.3 免疫受體、 BCR、B細胞、 IgG B細胞:包括編碼B細胞表面標記(CD72、 CD79A/B、CD19、CD22)及其他B細胞相關分子: 早期B細胞因子(EBF)、B細胞連接子(BLNK)及B淋 巴酪胺酸激酶(BLK)之基因。 Μ 1.4 複製、抑制、修 復、CREB、淋 巴、TNF-a 未確定。此組包括cAMP信號轉導路徑之調節子及 標靶(JUND、ATF4、CREM、PDE4、NR4A2、 VIL2)以及TNF-a介導之NF-KB活化的抑制體 (CYLD、ASK、TNFAIP3)。 Μ 1.5 單核細胞、樹突 狀、MHC、協同 刺激、TLR4、 MYD88 骨髄系:包括由骨髄系細胞表現之分子(CD86、 CD163、FCGR2A),其中一些涉及於病原體識別中 (CD14、TLR2、MYD88)。此組亦包括TNF家族成 員(TNFR2、BAFF)。 Μ 1.6 鋅、指、P53、 RAS 未確定。此組包括編碼信號轉導分子之基因,例如 含有活化STAT之抑制子(PIAS1及PIAS2)的辞指或 活化T細胞之核因子NFATC3。 Μ 1.7 核糖體、轉譯、 40S、60S、HLA MHC/核糖體蛋白:幾乎僅由編碼MHC I類分子 (HLA-A、B、C、G、Ε)+ β2-微球蛋白(B2M)或核 糖體蛋白(RPL、RPS)之基因形成。 141281.doc -21 - 201022492 實例模組I.D. Μ 1.8 實例-關鍵詞選擇 代謝、生物合 成、複製、解螺 旋酶 基因圖譜分析 未確定。包括編碼代謝酶(GLS、NSF1、NAT1)之 基因及DNA複製中所涉及之因子(PURA、 TERF2 ' EIF2S1) 〇 Μ 2.1 ΝΚ、殺傷細胞、 細胞溶解、 CD8、細胞介 導、Τ細胞、 CTL、IFN-e 細胞毒性細胞:包括細胞毒性T細胞及NK細胞表面 標記(CD8A、CD2、CD160、NKG7、KLR) ' 細胞 溶解分子(顆粒梅(granzyme)、穿孔素(perforin)、顆 粒溶解素(granulysin))、趨化激素(CCL5、XCL1)及 CTL/NK細胞相關分子(CTSW)。 Μ 2.2 顆粒球、嗜中性 白血·球、防絮、 脊越、骨髓 嗜中性白血球:此組包括嗜中性白血球顆粒中所見 之先天性分子(乳運鐵蛋白(Lactotransferrin): LTF,防禦素(defensin) : DEAF1,殺菌通透性增加 蛋白:BPI,抗菌肽(Cathelicidin)抗菌蛋白: CAMP)。 Μ 2.3 紅血球、紅色、 貧血'血球蛋 白、血色素 紅血球:包括血色素基因(HGB)及其他紅血球相關 基因(紅血球錨蛋白:ANK1,血型醣蛋白 C(Glycophorin C) : GYPC,羥甲基膽汁烷合成酶: HMBS,紅血球相關因子:ERAF)。 Μ 2.4 核糖核蛋白、 60S、核仁、裝 配、延長 核糖體蛋白:包括編碼核糖體蛋白(RPL、RPS)、 真核轉譯延長因子家族成員(EEF)及核仁蛋白 (NPM1、NOAL2、NAP1L1)之基因。 Μ 2.5 腺瘤、間質、間 葉、樹突、運動 未確定。此模組包括編碼免疫相關分子(CD40、 CD80、CXCL12、IFNA5、IL4R)以及細胞骨架相 關分子(肌凝蛋白、細胞質分裂之作用因子 (Dedicator)、多配體蛋白聚糖2(Syndecan 2)、叢蛋 白Cl(PlexinCl)、異連蛋白(Distrobrevin))之基因。 Μ 2.6 顆粒球、單核細 胞、脊髓、 ERK、壞死 脊髓系:與Μ 1.5有關。包括在諸如單核細胞及嗜 中性白血球之脊髓系細胞(IGTB2/CD18、淋巴毒素 β受體、脊髓相關蛋白8八4曱醯基肽受體1)中表現 之基因。 Μ 2.7 未擷取關鍵詞。 未確定。此模組主要包含功能未知之轉錄物。僅20 種基因與文獻相關,包括趨化激素樣因子超家族之 成員(CKLFSF8)。 Μ 2.8 淋巴瘤、T細胞、 CD4、CD8、 TCR、胸腺、淋 巴、IL2 Τ細胞:包括Τ細胞表面標記(CD5、CD6、CD7、 CD26、CD28、CD96)及由淋巴系細胞表現之分子 (淋巴毒素β、IL2誘導性Τ細胞激酶、TCF7、Τ細胞 分化蛋白 mal、GATA3、STAT5B)。 Μ 2.9 ERK、轉錄活 化、細胞骨架、 MAPK' JNK 未確定。包括編碼與細胞骨架相關之分子(肌動蛋 白相關蛋白 2/3、MAPK1、MAP3K1、RAB5A)的 基因。亦存在T細胞所表現之基因(FAS、 ITGA4/CD49D、ΖΝΠΑ1)。 Μ2.10 脊趙、巨嗔細 胞、樹突狀、發 炎性、介白素 未球定。包括編碼免疫相關細胞表面分子(CD36、 CD86、LILRB)、細胞激素(IL15)及信號轉導路徑 中所涉及之分子(FYB、TICAM2-Toll樣受體路徑) 的基因。 141281.doc ·22· 201022492 實例模組I.D. 實例關鍵詞ΐϊ擇 基因圖譜分析 M2.ll 複製、抑制、 RAS、自體碟酸 化、致癌 未確定。包括激酶(UHMK1、CSNK1G卜CDK6、 WNK1、ΤΑΟΚ1、CALM2、PRKCI、ΙΤΡΚΒ、 SRPK2、STK17B、DYRK2、PIK3R1、STK4、 CLK4、ΡΚΝ2)及RAS 家族成員(G3BP、RAB14、 RASA2、RAP2A、KRAS)。 M3.1 ISRE、流感、抗 病毒、IFN-γ、 IFN-α '干擾素 干擾素誘導性:此組包括干擾素誘導性基因:抗病 毒分子(OAS1/2/3/L 、GBP1 、G1P2 、 EIF2AK2/PKR、MX1 、PML)、趨化激素 (CXCL10/IP-10)、信號轉導分子(STAT1、STAt2、 IRF7、ISGF3G)。 Μ 3.2 TGF-β、TNF、發 炎性、細胞凋 亡、脂多醣 炎症I:包括編碼發炎過程中所涉及之分子(例如 IL8、ICAM1、C5R1、CD44、PLAUR、ILIA、 CXCL16)及細胞凋亡之調節子(MCL卜F0X03A、 RARA、BCL3/6/2A1、GADD45B)的基因。 Μ 3.3 顆粒球、發炎 性、防禦、氧 化、溶酶體 發炎II:包括誘導或可由顆粒球巨噬細胞CSF誘導 之分子(SPI1、IL18、ALOX5、ANPEP)以及溶酶體 酶(PPT1、CTSB/S、CES1、NEU1、ASAH1、 LAMP2、CAST)。 Μ 3.4 未擷取關鍵詞 未確定。包括蛋白質磷酸鹽(PPP1R12A、PTPRC、 PPP1CB、PPM1B)及磷酸肌醇3-激酶(PI3K)家族成 員(PIK3CA、PIK32A、PIP5K3)。 Μ 3.5 未擷取關鍵詞 未確定。僅包含少量轉錄物。包括血色素基因 (HBA1、HBA2、HBB)。 Μ 3.6 補體、宿主、氧 化、細胞骨架、T 細胞 未確定。包括T細胞表面標記(CD101、CD102、 CD103)以及在血液白金球中普遍表現之分子 (CXRCR1 :神經趨化蛋白受艘(fjactajjtine receptor)、CD47、P 選擇素配位體(P-seiectin ligand))之大組。 Μ 3.7 剪接體、甲基 化、泛素、β-索 烴素 未確定。包括編碼蛋白酶體次單元(PSMA2/5、 PSMB5/8)之基因;泛素蛋白連接酶Ηχρ2、STUB1 以及泛素連接酶複合物之組份(SUGT1)。 Μ 3.8 CDC、TCR、 CREB、糖基化酶 未確定。包括編碼以下若干酶之基因:胺基甲基轉 移酶、精胺醯基轉移酶、天冬醯胺合成酶、二醯基 甘油激酶、肌醇填酸酶、曱基轉移酶、解螺旋酶。 Μ 3.9 染色質、檢查 點、複製、轉錄 活化 未確定。包括編碼蛋白激酶(PRKPIR、PRKDC、 PRKCI)及磷酸酶(例如PTPLB、PPP1R8/2CB)之基 因。亦包括RAS致癌基因家族成員及nk細胞受體 2B4(CD244)»
生物學定義 如本文所用之術語「陣列」係指一或多個肽或核酸探針 附著於支撐物之固體支撐物或基質。陣列通常具有一或多 141281.doc -23- 201022492 個在不同已知位置偶合至機制表面的不同核酸或肽探針。 亦描述為「微陣列」或「基因晶片」之此等陣列基於已知 基因組(例如人類基因組)可具有10 000、2〇 〇〇〇、3〇 〇〇〇或 40,000個*同可鑑別基因。此等_陣列用於摘測在樣品 中表現或發現之基因的整個「轉錄組(transcript〇me)」或 轉錄庫,例如表現為可經受尺丁及/或RT_pcR以製備dna複 製子之互補組的RNA、mRNA及其類似物之核酸。可使用 機械合成方法、光引導合成方法及其併入非微影及/或光 微影方法與固相合成方法之組合的類似方法來產生陣列。 已描述用於合成此等核酸陣列之各種技術,例如在實際 上任何形狀之表面或甚至多個表面上製造。陣列可為珠 粒、凝膠、聚合物表面、諸如光學纖維之纖維、玻璃或任 何其他適當基質上之肽或核酸。陣列可以允許所有内含裝 置之診斷或其他操縱的方式封裝,參見(例如)美國專利第 6,955,788號,其相關部分以引用的方式併入本文中。 如本文所用之術語「疾病」係指具有細胞之任何異常生 物狀態的生物體生理狀態。疾病包括(但不限於)細胞、組 織、身體功能、系統或器官中斷、停止或失調,其可為固 有的’遺傳的’感染所引起的,#常細胞功能、異常細胞 分裂及其類似行為所引起的。導致「疾病病況」之疾病一 般對生物系統(亦即,疾病之宿主)有害。就本發明而言, 與疾病或病症相關之諸如感染(例如病毒、細菌、真菌、 腸蟲等炎症 '自體炎症 '自體免疫、過敏反應、過敏 症、前惡性疾病、惡性疾病、手術疾病、移植疾病、生理 141281.doc •24- 201022492 疾病及其類似疾病的任何生物狀態皆視為疾病病況。病理 狀態一般等效於疾病病況。 疾病病況亦可分類為不同程度之疾病病況。本文所用之 疾病或疾病病況之程度為反映疾病或疾病病況之進行以及 治療之時、期間及之後的生理反應之任意量度。一般而 言,疾病或疾病病況將進行經過幾個程度或階段,其中疾 病之影響變得愈加嚴重。疾病病況之程度可受樣品中細胞 之生理狀態影響。 本文所用之術語「療法」或「治療方案」係指用以緩解 或改變疾病病況之醫學步驟,例如,意欲使用藥理學、手 術、膳食及/或其他技術減輕或消除疾病之影響或症狀的 療程。治療方案可包括處方劑量之—或多種藥物或手術。 療法大部份通常有利且減輕疾病病況,但在許多情況下療 法之作用具有不合需要之作用或副作用。療法之作用亦將 爻宿主之生理狀態例如年齡、性別、遺傳、體重、其他疾 病病狀等影響。 本文所用之術語「藥理狀態」或「藥理狀況」係指將 用、正用及/或已用一或多種藥物、手術及顧似處理之樣 品’可能影響樣品中一或多種核酸之藥理狀態,例如因藥 理學干預而新轉錄、穩定及/或去穩定。如本文所教示, 樣品之藥理狀態係關於藥物治療之前、期間及/或之後的 生物狀況之變化,可提供診斷或預後功能。藥物治療或手 術後之些變化可能與疾病病況相關及/或可能為與療法 無關之副作用。藥理狀態之變化為療法持續時間、處方藥 141281.doc •25- 201022492 物之類型及劑量'所給治療過程之順應程度及/或所攝取 之非處方藥物的可能結果。 本文所用之術語「生物狀態」係指經分離及純化以供分 析表見變化的細胞樣品之轉錄組(transcript〇me)(亦即RNA 轉錄物之整個集合)之狀態。生物狀態係藉由測量細胞組 份之豐度及/或活性,根據形態學表型表徵或偵測轉錄物 之方法的組合來反映樣品中細胞之生理狀態。 本文所用之術語「表現圖譜(pr〇file)」係指rNA、dna 之相對豐度或蛋白質豐度或活性程度。表現圖譜可為例如 轉錄狀態或轉譯狀態藉由任何方法及使用許多基因晶片、 基因陣列、珠粒、.多重PCR、定量pcR、連綴檢定(_·〇η assay)、北方墨點分析、西方墨點分析、S白質表現、發 光活化細胞分類(FACS)、酶聯結免疫吸附劑檢定 (ELISA)、化學發光研究、酶檢定、增殖研究中之任一 者’或任何其他易於購得之用於測定及/或分析基因表現 之方法、裝置及系統之量度。 如本文所用之術語樣品之「轉錄狀態」包括職物質、 尤其樣品中存在之mRNA6〇_致性及相對豐度。作為魏 之-致性與豐度之組合的樣品之整個轉錄狀態在本文中亦 稱作轉錄組…般而言,量測樣品中整組RNA物質之所有 相對組份的實質性部分。 邶不又所 -—」丨小 <日久狀 1 差異 現基因之_」的㈣表現資i舉例而言對各模組 言’該比例為至少兩組(例如健康個體對患者)之間差異 14128I.doc •26- 201022492 現之轉錄物的比例。此向量來源於兩組樣品之比較。第一 分析步驟用於選擇各模組中轉錄物之疾病特異性組。接著 為表現量」。所給疾病之組比較提供各模組之差異表現 轉錄物的列表。發現不同疾病產生模組轉錄物之不同子 . ’且。以此表現量’則可能藉由對鑑別為差異表現之基因的 《病特異性子組之表現值求平均來計算單-樣品之各模組 的向量。Itbt法允許產纟單—樣品之模組表現向量的胃, 例如描述於本文所揭示之模組圖中彼等向量。此等向量模 籲 Μ圖表示可對各樣品獲得之各模組的平均表現量(替代差 異表現基因之比例)。 使用本發明,可能不僅在模組層面上而且在基因層面上 鑑別及區分疾病;亦即,兩種疾病可具有相同向量(差異 表現轉錄物之相同比例,相同Γ極性」),但向量之基因 組成可仍為疾病特異性的。基因層面上之表現提供大大增 加分析之解析度的獨特優勢,此外,本發明利用複合轉錄 φ 標記。如本文所用之術語「複合轉錄標記」係指與使用個 別基因作為標記相比,多個基因(模組之子組)之平均表現 值(且此等標記之組成可為疾病特異性的)。由於使用者可 開發多變數微陣列計分來分析患有(例如)SLE之患者的疾 病嚴重度或獲得本文所揭示之表現向量,因此複合轉錄標 記法為獨特的。最重要的是,已發現使用本發明之複合模 組轉錄標記,本文中所見之結果跨越微陣列平台為可再現 的,藉此提供管制認可之較大可靠性。 用於本發明之基因表現監控系統可包括具有有限及/或 141281.doc -27- 201022492 基本數目之對-或多種標乾疾病具特異性及/或專用於該 或該專疾病之基因的專用基因陣列。不同於習用之一 瓜P基因組陣列,本發明不僅在無需使用特定平台之情 況下提供使用此等一般pan陣列以供回溯性基因及基因組 分析,而且更重要的1,其提供開發提供用於在無需數千 個其他非相關基因之情況下分析之最佳基因組的專用陣 列本發明之最優化陣列及模組優於現有技術之一獨特優 勢在於財務成本(例如每次檢定、材料、設備、時間、人 員、培訓等成本)降低’且更重要的是,製造大多數資料 不相關之pan陣列的環境成本降低。本發明之模組允許首 次設計以最少數目之探針提供最佳資料同時使信雜比最大 的簡單專用陣列。藉由消除用於分析之基因的總數,有可 能(例如)消除在製造提供大量不相關資料之p a n基因晶片期 間製造數千個用於光微影之昂貴鉑遮罩的需要。若本發明 之有限探針組用於(例如)數位光化學陣列、球珠粒陣列、 珠粒(例如Luminex)、多重PCR、定量pcR、連綴檢定北 方墨點分析,或甚至用於蛋白質分析,例如西方墨點分 析、2-D及3-D凝謬蛋白質表現、MALDI、MALDI-TOF、 螢光活化細胞分類(FACS)(細胞表面或細胞内)、酶聯結免 疫吸附劑檢定(ELISA)、化學螢光研究、酶促檢定、增殖 研究或任何其他易於購得之用於測定及/或分析基因表現 之方法、裝置及系統,則使用本發明有可能完全避免對微 陣列的需要。 本發明之「分子指紋系統」可用於促進及進行針對其他 141281.doc •28· 201022492 疾病及/或正常細胞對照之不同細胞或組織、相同細胞或 組織之不同亞群、相同細胞或組織之不同生理狀態、相同 細胞或組織之不同發育階段或相同組織之不同細胞群體中 之表現的比較分析。在一些狀況下,正常或野生型表現資 料可來自同時或幾乎同時分析之樣品,或其可為獲自或精 選自現有基因陣列表現資料庫(例如公 動I基因表現綜合資料庫,NCBI Gene E::n Omnibus database)之表現資料。 如本文所用之術語「差異表現」係指在兩個或兩個以上 樣品中(例如在疾病樣品與正常樣品之間)變化的細胞組份 (例如核酸、蛋白質、酶活性及其類似物)之量度。細胞組 份可有或無(存在或不存在),相對於參考上調或相對於參 考下調。對用於基因-晶片或基因陣列而言,例如mRNA* 其他 RNA(miRNA、siRNA、hnRNA、rRNA、tRNA 等)之核 酸的差異基因表現可用於區分細胞類型或核酸。最為通常 地,細胞之轉錄狀態之量測係藉由定量逆轉錄酶(RT)及/或 定量逆轉錄酶-聚合酶鏈反應(RT_PCR) '基因組表現分 析、轉譯後分析、對基因組DNA之修飾、移位、原位雜交 及其類似技術來實現。 對一些疾病病況而言,有可能鑑別細胞或形態差異,尤 其在疾病病況之初級。本發明藉由檢查細胞本身之基因的 模組或更重要地來自在常規生理情形中(亦即,在免疫活 化、免疫耐受或甚至免疫缺失期間)起作用之免疫效應細 胞之基因之細胞RNA表現的模組來避免鑑別彼等特定突變 141281.doc -29- 201022492 或一或多種基因之需要。儘管遺傳突變可引起一組基因之 表現量顯著變化,但生物系統常常藉由改變其他基因之表 現來對變化作出補償。由於此等内部補償反應,許多擾動 可對系統之可觀測表型具有最小影響,但對細胞組份之組 成具有顯著影響。同樣地,基因轉錄物之實際複本可能不 會增加或減少,然而,轉錄物之壽命或半衰期可受影響, 從而使得蛋白質產生大大增加。本發明藉由在一實施例中 檢查效應細胞(例如白血球、淋巴細胞及/或其亞群)而非單 一訊息及/或突變來消除偵測實際訊息之需要。 熟習此項技術者應易於瞭解’樣品可獲自多種來源包 括(例如)單一細胞、細胞集合、組織、細胞培養物及其類 似物。在某些狀況下,甚至可能自(例如)尿液、血液、唾 液、組織或活組織檢查樣品及其類似物中所見之細胞分離 足夠RNA。在某些情況下,足夠細胞及/或rna可獲自: 黏膜分泌物、糞便、淚液、血漿、腹膜液、間質液、硬膜 内液、腦脊髓液、汗液或其他體液。來自(例如)組織或細 胞來源之核酸來源可包括組織活組織檢查樣品、一或多個 至为類之細胞群體、細胞培養物、細胞純系、轉型細胞、 活組織檢查切片或單一細胞。組織來源可包括(例如)腦、 肝、心臟、腎、肺、脾、視網膜、骨骼、神經系統、淋巴 結、内分泌腺、生殖器官、血液、神經、血管組織及嗅覺 上皮。 本發明包括可單獨或組合使用之以下基本組份:亦即, 一或多種資料探勘演算法;一或多種模組層面分析過程; 141281,doc •30- 201022492 血液白血球轉錄模組之表徵;用於人類疾病之分子診斷/ 預後的多變數分析中聚合模組資料之使用;及/或模組層 面資料及結果之觀測。使用本發明,亦可能開發及分析複 合轉錄標記,其可進一步聚合成單一多變數計分。 • 冑料獲取速率之激增已刺激用㈣發微陣列資料及生物 ‘ f學知識之探勘工具及演算法的發展。針對揭示轉錄系統 之模、,且化組織及功此的方法構成用於鐘別疾病之穩固分子 肖徵的具前景方法。實際上,該等分析可藉由將越過個別 基因或基因列表之層面的微陣列資料概念化來轉換大規模 轉錄研究之感知。 本發明者已認m到當前基於微陣列之研究正面臨對眾所 周知具「雜訊」之資料(亦即,難以解釋且跨越實驗室及 平台不可良好比較之資料)進行分析的顯著挑戰。用於分 析微陣列資料之廣泛公認的方法以鑑別研究組之間差異表 現之基因的子組起始。接著,使用者隨後嘗試使用模式發 Φ 掘演算法及現有科學知識「弄僅」所得基因列表。
本發明者已開發出強調在分析之早期階段選擇生物學上 相關之基因的策略,而非處理跨越平台之大變化性。簡言 之,該方法包括鐘別表徵給定生物系統之轉錄组份,為^ 生物系統開發出改良之資料探勘演算法以自大型資料集合 分析及擷取協調表現基因之組或轉錄模組。 、D 肺結核(PTB)為全世界由結核分枝桿菌引起之發病率及 死亡率的主要且漸增之病因。然而,受結核分枝桿菌感染 之大多數個體保持為無症狀的,從而使感染保持處於潛伏 141281.doc 201022492 形式’且據信此潛伏狀態係由活動性免疫反應來維持。血 液為免疫系統之管線且因而為可確立個體之健康及免疫狀 況的理想生物材料。此處,使用微陣列技術評估血細胞中 整個基因組之活性,吾人鑑別患有活動性肺結核及潛伏性 結核之患者的相異且相反之血液轉錄生物標記特徵。此等 . 特徵亦不同於對照個體之特徵。顯示免疫細胞毒性基因表 現在全血中過度表示之潛伏性結核的特徵可幫助確定對抗 結核分枝桿菌感染之保護性免疫因子,此係由於此等患者 雖受感染,但大多數並未顯現明顯疾病。來自活動性78及 春 潛伏性TB患者之此相異轉錄生物標記特徵亦可用於診斷感 染且監控對抗分枝桿菌藥物治療之反應。另外,活動性結 核患者之特徵將幫助確定免疫發病機理中所涉及之因子且 可倉b產生免疫治療干預之策略。本發明係關於主張使用血 液轉錄生物標記診斷感染之先前申請案。然而,此先前申 請案並未揭示活動性及潛伏性結核之生物標記的存在,而 疋集中於患有其他急性感染之兒童(Ramiu〇, 2007)。 ,❹ 本發明對潛伏性對活動性TB患者之血液中之轉錄特徵 的鑑別可用於測試患有疑似結核分枝桿菌感染之患者且用 於疾病之健康普查/早期偵測。本發明亦允許評估對抗分 枝桿菌藥物治療之反應。在此情形中,測試亦將在藥物試 驗之情形中尤其有價值,且尤其評估多重抗藥性患者之藥 =治療。此外’本發明可用於自潛伏性結核之免疫特徵獲 得直接、中間及長期資料以更好地定義接種試驗期間之保 141281.doc •32· 201022492 護性免疫反應。又,活動性結核患者之特徵將幫助確定免 疫發病機理中所涉及之因子且可能產生免疫治療干預之策 略0 血液表示先天性及適應性免疫系統之細胞(分別包括嗜 中性白血球、樹突狀細胞及單核細胞或B及T淋巴細胞’其 在感染期間將暴露於組織中之感染物)的儲集層及遷移 區。為此,受感染個體之全血提供臨床上相關之材料的可 得來源,其中無偏分子表型可如先前針對組織中之癌症研 究(Alizadeh AA·,2000 ; Golub,TR·,1999 ; Bittner, 2000) 及血液或組織(Bleharski,JR等人,2003)中之自體免疫 (Bennet, 2003 ; Baechler, EC, 2003 ; Burczynski, ME, 2005 ; Chaussabel, D., 2005 ; Cobb, JP., 2005 ; Kaizer, EC·,2007 ; Allantaz,2005 ; Allantaz,2007)及炎症(Thach, DC.,2005)及傳染病(Ramillo, Blood,2007)所述使用基因表 現微陣列而獲得。血液白血球中基因表現之微陣列分析已 鑑別出診斷性及預後性基因表現特徵,其已使得更好地理 解疾病發作之機制及對治療之反應(Bennet,L 2003 ; Rubins, KH.,2004 ; Baechler,EC,2003 ; Pascual,V., 2005 ; Allantaz, F., 2007 ; Allantaz, F., 2007)。此等微陣 列方法已嘗試用於活動性TB及潛伏性TB之研究,但迄今 僅產生少量差異表現基因(Jacobsen, M.,Kaufmann,SH., 2006 ; Mistry, R,Lukey, PT, 2007)且在相對少數患者中產 生(Mistry,R.,2007),其可能並不足以穩固地區分其他發 炎性疾病與傳染病。 141281.doc -33- 201022492 為定義TB中之免疫特徵,分析活動性丁6及潛伏性TB患 者及對照之血液;使用極嚴格之臨床準則來選擇患者。自 英國倫敦募集患者,其中活動性TB病例之數目漸增,且最 重要地,其中混同共同感染之風險最小,從而產生可區分 潛伏性TB與活動性TB之穩固特徵。使用微陣列分析整個 基因組且後續資料探勘揭示據發現跨越所有患者組(包括 活動性TB及潛伏性TB患者及健康對照)在統計學顯著層面 上差異表現之眾多基因。接著,使用基於模組資料探勘策 略之新穎方法,此方法提供選擇用於分析SLE及其他疾病 0 之血液微陣列轉錄圖譜的臨床上相關之轉錄生物標記的基 礎,且提供吾人對疾病發病機理之理解的改良 (Chaussabel,2008, Immunity)。此研究中所定義之模組圖 提供組織且降低複雜資料之維度,同時仍保留在人類血液 中表現之眾多基因的方式,由此允許觀測特定疾病指紋 (Chaussabel,2008,immunity)。使用此明確定義之模組方 法,獲得在活動性TB及潛伏性TB患者之全血中相異且相 反且亦不同於健康對照之模組轉錄特徵。本文所述之生物 Ο 私§己改良PTB之診斷,且此外將幫助定義在潛伏性TB患者 中保濩免受結核分枝桿菌感染方面重要的宿主因子及活動 性TB之免疫發病機理中所涉及之彼等因子且由此用於減 輕且控制TB疾病。 患者、材料及方法 參與者募集及患者表徵:自倫敦帝國學院健保信託機構 聖瑪麗醫 Ρτο TB 臨床部(St. Mary's Hospital TB Clinic, 141281.doc -34- 201022492
Imperial College Healthcare NHS Trust, London)募集參與 者,其中自倫敦米爾希爾國家醫學研究所(National Institute for Medical Research (NIMR), Mill Hill, London) 之自願者募集健康對照。該研究經英國倫敦聖瑪麗醫院之 地方性NHS研究倫理委員會(local NHS Research Ethics Committee at St Marys Hospital (LREC),London,UK)批 准。所有參與者(年齡18歲及18歲以上)皆提供書面知情同 意書。在確認所募集之參與者的臨時研究分組且接著僅將 其分配給最終組以供分析之前滿足嚴格臨床準則。患者及 對照群組如下··(i)基於臨床診斷之活動性PTB,其隨後藉 由實驗室分離分枝桿菌培養物上之結核分枝桿菌而確認; (ii)潛伏性TB-由陽性結核菌素皮膚測試(TST,使用2TU結 核菌素(Serum Statens Institute, Copenhagen, Denmark), 若未經BCG接種,則26 mm,若經BCG接種,則215 mm) 連同使用干擾素γ釋放檢定(IGRA,特定言之為 Quantiferon-TB Gold In-tube檢定,Cellestis,Australia)之 陽性結果一起定義。此IGRA檢定藉由IFN-γ自全血之釋放 量測對抗原(ESAT-6/CFP-10/TB 7·7-存在於結核分枝桿菌 中,但在大多數環境分枝桿菌或牛結核分枝桿菌(Μ. bovis)BCG疫苗中並不存在)之反應性。
潛伏性TB患者亦必須具有經由封閉家庭或工作場所接 觸或作為來自疫區之「新進入者」而暴露於傳染性TB病例 之證據;偶然發現有TST陽性而無暴露於受感染者之證據 的患者不適於包括在研究中。(iii)健康自願者對照(經BCG 141281.doc -35- 201022492 接種及未經BCG接種,藉由TST,分別£14 mm或$5 mm ; 且藉由IGRA,呈陰性)。懷孕、據知經免疫抑制、進行免 疫抑制療法或患有糖尿病或自體免疫疾病之參與者亦不合 格且自此初步研究排除。HIV陽性個體(僅1 %之倫敦TB患 者帶有先前未經診斷之HIV)自研究排除。在投與任何抗分 枝桿菌藥物之前收集活動性及潛伏性PTB患者之血液以供 研究,且隨後以設定之時間間隔收集血液用於縱向研究部 分以供後續研究。 預期收集每位參與者之詳細臨床資訊且已將其輸入本發 明者所開發之網路可訪資料庫中。使用此記錄之臨床資料 及如上文所述之基於免疫之檢定,自研究排除58位參與者 中之1 5位,此係由於其不滿足該研究之標準準則。此產生 以下群組:6位未經BCG接種之健康自願者,6位經BCG接 種之健康自願者,17位潛伏性TB患者及14位活動性PTB患 者,接著將所有此等樣品用於RNA分離。一個來自活動性 TB患者之樣品在處理後未產生足夠經血球蛋白還原之RNA 以繼續進行且因此自最終分析排除。 RNA取樣、萃取、處理以供微陣列用:將來自上述患者 群組之全血收集至 Tempus 管(Applied Biosystems, Foster City, CA, USA)中且在RNA萃取前儲存在-20〇C與-80°C之 間。使用 PerfectPure RNA Blood 套組(5 PRIME Inc, Gaithersburg, MD, US A)分離總 RNA。將樣品以 100%冷乙 醇均質化,進行渦旋,接著在〇°C下以4000 g離心60分鐘且 拋棄上清液。接著將300 μΐ溶解溶液添加至小球中且進行 141281.doc -36- 201022492 渦旋。接著根據製造商之說明書進行RNA結合、去氧核糖 核酸酶處理、洗滌及RNA溶離步驟。接著根據製造商之說 明書使用 GLOBINclear™ 96 孔格局套組(Ambion,Austin, TX, USA)以血球蛋白還原經分離之總RNA。使用安捷倫 2100生物分析儀(Agilent 2100 Bioanalyzer)(Agilent,Palo Alto, CA)分析總RNA及經血球蛋白還原之RNA的完整性。 一個來自活動性TB患者之樣品在處理後未產生足夠經血球 蛋白還原之RNA以繼續進行且因此自最終分析排除。接著 • 使用 Illumina CustomPrep RNA擴增套組(Ambion, Austin, TX,USA)自經血球蛋白還原之RNA製備經生物素標記、經 擴增之RNA標靶(cRNA)。遵循製造商之方案,使經標記之 cRNA 與 Sentrix Human-6 V2 BeadChip 陣列(>48,000個探 針,Illumina Inc,San Diego,CA,USA)雜交隔夜,洗條’ 阻斷,染色且在Illumina BeadStation 500上掃描。使用 Illumina之第2版BeadStudio軟體自掃描產生信號強度值, 扣除背景且將各微陣列定標為所有樣品之中值平均強度 ^ (每個晶片正規化)。此正規化資料用於所有後續資料分 析。 ' 微陣列資料分析:使用基因表現分析軟體程式第7.1·3版 • Genespring(Agilent)進行樣品之統計分析及階層式叢集。 如結果及圖式說明所述,選擇差異表現基因且使其叢集。 結果與論述 血液特徵將活動性TB患者與潛伏性TB患者彼此區分, 且將其與健康對照個體區分:為判定與健康對照相比,自 141281.doc -37- 201022492 〜有活動性TB及潛伏性TB之患者所取之血液是否帶有允 許區分活動性TB與潛伏性TB的基因表現特徵,進行逐步 刀析。濾除自中值之偏差小於2倍(亦即,具有平坦曲線)之 未偵測到的轉錄物及基因之後,藉由獲自活動性ΤΒ及潛伏 性ΤΒ及健康對照之全樣品的表現圖譜之皮爾森相關 (Pearson correiati〇n),使用6269種基因進行非監督式叢集 分析(圖1)。此非監督式分析鑑別據發現對應於在患有活動 性肺部TB(活動性PTB)之患者中與患有潛伏性結核(潛伏性 TB)之個體中之相異臨床表型的相異特徵。樣品之分組並 不理想(13位患有活動性TB之患者中的1〇位及17位患有潛 伏性TB之患者中的⑽)。然而’來自患者訓練組之此組 中大多數活動性PTB及潛伏性丁8患者似乎具有清晰且相異 之轉錄特徵。重要的是,此等特徵似乎跨越眾多收集以供 研究之種族而表示,該等種族包括白種人、非洲黑種人、 亞洲印度人、亞洲孟加拉國人、亞洲其他人種、愛爾蘭白 種人、混血白種人、加勒比海黑種人(此資料之細節並未 展示)。 接著使用非參數統計組比較(克拉斯卡-瓦立斯測試 (Kmskal-Wallis test))進一步分析此6269種基因列表以鑑別 在組之間顯著差異表現之基因。使用中等嚴格之多重比較 校正用於控制I型誤差(本傑明_豪克伯格校正(Benjamini-Hochberg correction))’ 1473種基因跨越活動性TB及潛伏 性TB及健康對照而差異表現/表示(p<0.01)(圖2 ;及共同申 請之LENGHTY表中1473種基因之列表)。接著使此等基因 141281.doc -38- 201022492 叢與文獻中之有關發現相關聯。針對本體術語Γ免疫反 應」過濾此等基因產生158種該等基因之列表(圖3 A-D ;表 2)。158種基因之此表現/表示模式(圖3A_3D)允許區分活動 性TB患者及潛伏性TB患者及健康對照個體之組。 表2:注有基因本體術語生物過程(免疫反應)且據發現在活 動性TB組與其他臨床組之間顯著差異表現(p<〇 〇丨)的i 5 8 種基因之列表。 基因符號 描述--- LILRB3 白血琛免疫球蛋白樣受體,子族B(具有TNlgjnM域),成員3 PGLYRP1 狀聚糖識別蛋白1 FAS Fas(TNF受體超家族,成員6) - IFITM3 干擾素誘導性跨膜蛋白3il-8U、 FCGR2A lg(i之Fc片段’低親和力na,受體(cd32) FCGR2A IgG之Fc片段,低親和力na,受體(CD32) ST6GAL1 S16 μ-半乳糖醯胺α·2,6·唾液酸基棘蒋醢1 ETS1 v-ets霄趙成紅血細胞增多症病毒Ε26致癌基因同源物丨(禽類) CYBB 細胞色素b-245,β多肽(慢性肉芽腫病) IFNAR1 卞设常(α ' ρ及ω)受鱧1 LY96 淋巴細胞抗原96 —-....... TRIM22 含二聯基元22 --- GBP2 鳥甘S曼結合蛋白2 ,干擾素誘導性 DDX58 UiiAD(Asp_Glu· Ala-Asp)盒冬壯;sr LAX1 淋巴細胞跨犋接附 IFI16 干擾素γ誘導性蛋白16 LCK 淋巴細胞特異性蛋白路胺酸激酶 IL32 介白素32 ' —--- CXCL16 趨化激素(C-X-C基το)配位體16 CD40LG ULHO配位艘(TNF超家族,成員5,高IrM症候群) TNFSF13B 腫瘤壞死因子(配位體)超家焱,虚昌m —— IRF2 十擾素調節因子2 C5 補體組份5 CD46 UU46分子,補體調節蛋白 — - TNFAIP6 腫瘤壞死因子α誘導性蛋白6 DPP4 一狀基肌卿HUUZb,脲苷去胺酶複合|白2) EBI2 埃潑斯坦-巴爾病毒(Epstein_Barr virus)誘導性基因2(淋巴細胞特 異性G蛋白偶合受艎) NFX1 核轉錄因子,X盒結合1 … 141281.doc •39· 201022492 基因符號 描述 —--—η MICB MHCI類多肽相關序列B ---- GBP3 烏苷酸結合蛋白3 --- SLAMF7 SLAM家族成員7 ----- CARD 12 NLR 家族,含CARD域4 ----- GBP6 鳥苷酸結合蛋白家族,成員6 ---- IFIT3 具有三角形四肽重複之干擾素誘導~-- TAP2 轉運體2 , ATP結合卡匣’子族--- HLA-DPB1 主要組織相容性複合物,11類,B1 ---- CD3G CD3g分子,Y(CD3-TCR複合物) ---- PRKCQ 蛋白激酶C,Θ --一 IL7R 介白素7受體 ---- SLAMF1 CD274 信號轉導淋巴細胞活化分子家族成員] _-— CD274分子 ----- GBPl '島苷酸結合蛋白1,干擾素誘導性,67kDa ~ IFITM2 干擾素誘導性跨膜蛋白2(1-8D) ' 一~-- ITK APOL2 1L2-魂辱性1細跑激酶 --- 白元L,2 ' ~ ---- PSMEl 蛋白酶艘(刖體,巨蛋白因子)活化次單元KPAMd --— LAT2 T細胞家族之活化連接子,成員2--— IL18RAP 介白素18受體輔助蛋白 —---- OSM 制瘤素Μ -~~~--- CD6 [0D6 分子 --J WWP1 含WW域之Ε3泛素蛋白連接晦1 --- CD3E CD3e分子,<CD3-TCR複合物) ---- VIPR1 血管活性腸肽受體1 ----- TNFSF10 _腫瘤壞死因子(S己位雜)超家族,成員10 ~ -— PRKRA 蛋·白激酶,干擾素誘導性雙股RNA依賴性活;--- TNFRSF1A 腫瘤壞死因子受體超家族,成員1A --- BCL6 IL8 B細胞CLL/淋巴瘤6(辞指蛋白51) ------- 介台辛fi ------ OAS3 2-5募腺苷酸合成梅3,i〇〇k£)a ---- IFIH1 干擾素誘導性解螺旋酶C域1 ------- SIGIRR 單免疫球蛋白及toll介白素1受體(TIR)娀 --- SIGIRR 單免疫球蛋白及toll介白素1受體(tir)垴 -一 SIT1 乜號轉導閾值調節跨膜接附子1 ----- ITGAM 整合素,α Μ(補體組份3受體3次單元、 --- C1QB 補體組份1,q亞組份,Β鏈 --- IL27RA ["介白素27受¥,α ------- ALOX5AP 铯生四烯酸5-脂肪加氧酶活化蛋白---- SERPING1 =严肽酶抑制子’分枝G(C1抑· IL1RN 受體拮抗子 ---—--— IL1RN 介白素1受體拮抗子 141281.doc •40- 201022492
基因符號 描述 CLEC4D C型凝集素域家族4,成員D ICOS 誘導性T細胞協同刺激子 - OAS1 2,5-养腺普酸合成輕1,40/46kDa ZAP70 ζ鍵(TCR)相關蛋白激酶70 kDa IL1B 介白素1,β C4BPA 補體組份4結合蛋白,α -- TNFSF13 腫瘤壞死因子(配位體)超家族,成員13 IFI30 干擾素γ誘導性蛋白30 — HPSE 乙醯肝素酶(heparanase) CD59 CD59分子,補體調節蛋白 --- CTLA4 細胞毒性T淋巴細胞相關蛋白4 ~ BCL2 B細胞/CLL淋巴瘤2 — TNFRSF7 CD27分子 ----- FPR1 甲醯基肽受體1 ---- IL2RA 介白素2受體,α - GATA3 GATA結合蛋白3 ---- S100A9 S100鈣結合蛋白A9 ----- TLR8 toll樣受體8 ---- NCF1 嗜中性白血球胞質因子1(慢性肉芽腫病,體染色體η BCL6 Β細胞CLL/淋巴瘤6(鋅指蛋白51) '-- BST1 骨髓基質細胞抗原1 -- G1P2 1^!G15泛素樣修飾子 ~ - C1QA 補體組份1,q亞組份,A鍵 TCF7 轉錄因子7(T細胞特異性,HMG盒) 一 IFITM1 干擾素誘導性跨膜蛋白1(9-27) TAPBPL TAP結合蛋白樣 --- AIM2 不存在於黑色素瘤中2 CCR7 趨化激素(U-C基元)受艘7 ---- LTBR 淋巴毒素β受體(TNFR超家族,成員3) ' FYB FYN 結合蛋白(FYB-120/130) ---'~—— NFIL3 核因子,介白素3調節 LAT Τ細胞之活化連接子 _ --- CBLB Cas-Br-M(鼠類)親嗜性逆轉錄病毒轉型序列^ CD74 CD74分子,主要组織相容性複合物,π類恆定鏈 TAP2 轉運體2,ΑΤΡ結合卡匣,子族B(MDR/TAP) FLJ14466 跨膜蛋白142A -- PSMB9 蛋白酶體(前體’巨蛋白因子)次單元,β型,9(大多功能肽酶2) PSMB8 蛋白酶體(前體’巨蛋白因子)次單元,β型,8(大多功能肽酶7) FAIM3 Fas細胞凋亡抑制分子3 LTA4H 白三烯A4水解酶 IRF1 干擾素調節因子1 OAS2 2'-5'-募·腺苷酸合成酶2,69/71 kDa 141281.doc •41- 201022492 基因符號 描述--- RELB 双刪同源物B ’ B細胞中K輕多肽基因 TRA@ T細胞受艘α基因座 .-.- LTB4R 白二烯B4受體 -- PIK3R1 碟酸肌醇-3·灰酶’調節次單亓〗- OASL 2-5-募腺苷酸合成酶檨 OASL 2-5-寡腺苷酸合成酶檨 -- PSME2 —,巨蛋白因子)活化次單元2ίΡΑ28β) CLEC6A L型凝集素域‘豕族6,志畐a NBN 斷蛋白(nibrin) ........... FCGR1A IgG之#又’尚親和力ia,受器(CD64) SH2D1A 域蛋白1A ’部月氏病(Duncan's diseased狀巴增丰戒値群) IL15 介白素15 --^- LY9 淋巴細胞抗原9 LILRB1 白血球免疫球蛋白樣受體,子族B(具有丁^1及1111^域 APOL3 脂蛋白元L·,3 ---—— PSMB8 f白酶,(前體’巨f白因子)次單元,βΐ!,8ί大多功能肤醢7、 CCR6 趨化激素(C-C基元)受體6 -—~~ PDCD1LG2 漸進式細胞死亡lse*位艚2 -- CD96 CD96分子 ------— EPHX2 環氧化物水化酶2,細胞皙 BST2 骨髓基質細胞抗原2 一-- RIPK2 乂艘相立作用絲胺酸-棘胺酸激酶2 SCAP1 src激酶相關磷蛋白1 --- GBP5 烏苷酸結合蛋白5--- TRAT1 1細胞受想相關跨膜接附子1 ALOX5 花生四烯酸5-脂肪加氧酶 -- LY9 淋巴細胞抗原9 ~-- TAPI 轉運體1,ATP結合卡匣,子族b(MDR/TAP) RHOH ras同源物基因家族,成 IFI35 干擾素誘導性蛋白35 - CD28 CD28 分子 ~~~- FYB FYN 結合蛋白(FYB-120/130) IFIT2 具有二角形四肽重複之干擾素誘導性蛋白2 TLR7 toll樣受體7 ~ — ---- CD2 CD2 分子 ~ ' --- FCER1G IgE之Fc片段,高親和力I,γ多肽之受體 SMAD3 SMAD家族成員3 ------- FCER1A IgE之Fc片段,高親和力I,α多肽之受體 ~ SERPINA1 絲胺酸肽梅抑制子,分枝Α(α-1抗蛋白酶,抗狹蛋白酶),点昌、 SERPINA1 絲胺酸肽鱗抑制子,分枝Α(α-1抗蛋白酶,抗胰蛋白酶),忐昌1 SECTM1 分泌及跨膜1 --- NMI N-myc(及STAT)相互作用子 — - 141281.doc .42· 201022492 基因符號 描述 TLR5 toll樣受體5 IFIT3 具有三角形四肽重複之干優素誘導性蛋白3 IFIT3 具有三角形四肽重複之干擾素誘導性蛋白3 CD5 CD5分子 活動性TB中過度表現/表示之基因:關注表現眾多IFN相 . 關/誘導性基因:例如干擾素(IFN)誘導性基因,例如 SOCS1、STAT1、PML(TRIM19)、TRIM22、許多鳥苷酸結 合蛋白及如表2所示且如活動性TB中所預期之許多其他 IFN誘導性基因,但令人關注的是,儘管潛伏性TB患者之 φ IFN-γ轉錄物在全血中之表示/表現實際上高於活動性TB患 者,但此等干擾素誘導性基因在此等患者中並不顯著。為 集中於此點,進一步研究某些基因家族(包括TRIM家族), 已知其中一些係藉由IFN上調,且其他家族並非如此。 TRIM之子組在活動性TB中過度表現/表示:蛋白質之三 聯基元(TRIM)家族係由周密結構表徵(Reymond,A., EMBO J., 2001)且已顯示具有多重功能,包括E3泛素連接酶活 性,誘導細胞增殖、分化及凋亡,免疫細胞信號轉導 • (Meroni, G·,Bioessays,2005)。其涉入已牽涉於蛋白質-蛋 白質相互作用、自體免疫及發育中(Meroni, G.,Bioessays, • 2005)。此外,已發現許多TRIM蛋白具有抗病毒活性且可 能涉及於先天免疫中(Nisole,F,2005,Nat. Rev. Microbiol. ; Gack,MU.,2007,Nature)。令人關注的是,顯 示30種TRIM轉錄物(一些重疊探針)在活動性TB中表現, 其中一些亦在潛伏性TB及健康對照血液中表現(圖4 ;表 3)。先前已顯示大多數此等TRIM在人類巨噬細胞與小鼠 141281.doc -43- 201022492 巨噬細胞及樹突狀細胞中表現(Rajsbaum,2008,EJI; Martinez, FO·,J. Imm·, 2006)且由 IFN調節,而據顯示在 DC中或T細胞中組成性表現之TRIM(Rajsbaum, 2008,EJI) 未偵測到或對比健康對照血液在活動性或潛伏性TB中未發 現差異表現。令人關注的是,發現TRIM 5、6、19 (PML)、21、22、25、68過度表示/表現;而其他者不足表 示/表現:TRIM 28、32、51、52、68。所關注之一組 TRIM在活動性TB中高度表現,但在潛伏性TB及健康對照 中低至不可偵測,且已顯示此等TRIM中之四者(TRIM 5、 6、21、22)在人類染色體11上叢集且據報導具有抗病毒活 性(Song,B.,2005,J. Virol· ; Li,X,Virology,2007)。然 而,發現對比在潛伏性TB及健康對照之血液中,一組 TRIM在活動性TB患者之血液中不足表現,包括TRIM 28、32、51、52、68,且已報導此等TRIM在人類血液源 性巨噬細胞中不表現(TRIM 51)或僅在未分化單核細胞中 表現(TRIM 28、52)或在未活化巨噬細胞或者活化巨噬細 胞中表現(TRIM 32),或在自人類血液分化之活化巨噬細 胞中僅上調至低水準(TRIM 68)(Martinez,FO.,J. Imm., 2006) 〇 表3 :在活動性肺結核、潛伏性結核及健康對照中差異表 現之TRIM基因。 常用名 基因符靓 描逡 RNF94 ; STAF50 ; GPSTAF50 TRIM22 含三聯基元22 RNF91 ; SPRING ; KIAA0282 TRIM9 含三聯基元9 141281.doc -44 - 201022492
常用名 基因符珑 描述 MYL ; RNF71 ; PP8675 ; TRIM19 PML 前趙細胞性白血病 RNF89 TRIM6 含三聯基元6 TRIM51 ; MGC10977 TRIM51 含SPRY域5 RNF9 ; HERF1 ; RFB30 ; MGC141979 TRIM10 含三聯基元10 PML PML 前髄細胞性白血病;同義詞:MYL、 RNF71、PP8675、TRIM19 ;同功異型物7係 由轉錄物變異體7編碼;前髓細胞性白血病 之誘導物;三聯基元蛋白TRIM19 ;前链細 胞性白血病蛋白;智人前髓細胞性白血病 (PML),轉錄物#異體7 ’ mRNA RNF88 ; TRIM5a TRIM5 含三聯基元5 RNF88 ; TRIM5a TRIM5 含三聯基元5 BIA2 ; DKFZp434C091 TRIM58 含三聯基元58 Trif ; HSD34 ; RNF36 TRIM69 含三聯基元69 RNF88 ; TRIM5a TRIM5 含三聯基元5 SSA ; R052 ; SSA1 ; RNF81 TRIM21 含三聯基元21 KIAA0129 TRIM14 含三聯基元14 RNF9 ; HERF1 ; RFB30 ; MGC141979 TRIM10 含三聯基元10 EFP ; Z147 ; RNF147 ; ZNF147 TRIM25 含三聯基元25 HLS5 ; MAIR ; KIAA1098 ; MGC17233 TRIM35 含三聯基元35 RNF86 ; KIAA0517 TRIM2 含三聯基元2 RNF9 ; HERF1 ; RFB30 ; MGC141979 TRIM10 含三聯基元10 GNIP ; RNF90 TRIM7 含三聯基元7 KIAA0129 TRIM14 含三聯基元14 TRIM50B ; MGC45477 TRIM50B 含三聯基元73 4732463G12Rik TRIM65 含三聯基元65 MRF1 ; TSBF1 ; RNF104 ; TRIM57 ; MGC26631 ; TRIM59 含三聯基元59 141281.doc •45- 201022492 常用名 基因符狭 描述 MGC129860 ; MGC129861 FMF ; MEF ; TRIM20 ; MGC126560 ; MGC126586 MEFV 地中海熱(Mediterranean fever) TRIM52 含三聯基元52 CAR ; LEU5 ; RFP2 ; DLEU5 ; RNF77 RFP2 含三聯基元13 KAP1 ; TF1B ; RNF96 ; TIF1B ; FLJ29029 TRIM28 含三聯基元28 SS-56 ; RNF137 ; FLJ10369 ; MGC126176 TRIM68 含三聯基元68 HT2A ; BBS11 ; TATIP ; LGMD2H TRIM32 含三聯基元32 特異性免疫調節配位體在活動性TB患者中之選擇性過 度表現/表示:相異轉錄圖譜之分析揭示基因CD274(PDL1) 及PCDLG2(PDL2、CD273)之轉錄物僅在活動性tb患者中 表現(圖5 A及圖5B)。先前已顯示此等分子涉及於對急性病 毒感染與慢性病毒感染之免疫反應的調節中(A Sharpe, Ann· Rev. Imm.)。此等分子在T細胞與APC之間的相互作 用中充當分子PD 1之抑制性協同刺激受體,且已顯示此路 徑之阻斷使HIV、B型肝炎感染及C型肝炎感染中之抗原特 異性T細胞的增殖功能及效應功能得以恢復。 在活動性TB中不足表現/表示之基因:令人驚對的是, 發現已知在T細胞中(一些亦在NK及B細胞上)表現之許多 基因在活動性TB患者之血液中顯著下調/不足表示(圖 3D)(但在潛伏性TB或健康對照中並非如此,包括CD3、 CTLA-4、CD28、ZAP-70(T、NK 及 B 細胞)、IL-7R、 I41281.doc •46- 201022492 CD2(亦在B細胞上)、SLAM(亦在NK細胞上)、CCR7、 GATA-3(亦在ΝΚ細胞中)。此可表明由於受結核分枝桿菌 感染,基因表現在活動性PTB期間在T、NK及B細胞中下 調,或細胞已在其他地方(例如肺)募集。此目前正處於使 用來自不同患者組之血液的流式細胞分析以及藉由來自不 同患者組之經純化T細胞群體的轉錄分析進行研究中。 對比健康對照,潛伏性及活動性TB患者中轉錄圖譜之 較高嚴格度統計分析。如前所述藉由使用非參數克拉斯 卡-瓦立斯測試鑑別組之間的差異表現基因,但現使用最 嚴格之多重比較校正用於控制I型誤差(邦弗朗尼校正 (Bonferroni correction)),來進一步進行統計組比較。以此 增加之嚴格度’ 46種基因(卩<〇.1)及18種基因(p<〇〇5)經鑑 別為在組之間差異表現(圖6及圖7 ;表4及表5)。46種基因 中’仍觀測到諸如STAT-1、GBP及IRF-1之眾多IFN誘導性 基因在活動性TB患者之血液中過度表現/表示且在潛伏性 患者或健康對照中下調或不變。亦發現即使使用仍擷取基 因之最高嚴格度分析(邦弗朗尼校正,P<0_05),許多此等 基因亦在活動性TB患者之金液中過度表現/表示。仍觀測 到活動性TB中僅3種轉錄物在46種基因組中下調/不足表 不,包括IL-7R(在T細胞中表現)、趨化激素受體excR3(在 較尚統計嚴格度下損失)及α II-血影蛋白。關注於CXCR3 之不足表現/表示,此係由於已顯示此趨化激素受體在保 護免受分枝桿菌感染所需之Thl細胞申高度表現,此可反 映其抑制或遷移出血液至受感染組織。表5包括18種基 141281.doc •47- 201022492 因,其中IL7R及SPTAN1在活動性PTB中不足表示/表現且 所有其他者過度表示/表現且用於診斷活動性疾病。 表4 :在活動性TB組與其他臨床組之間顯著差異表現的基 因。 基因符號 ____________ 描述 __ FAM84B 具有序列相似性之家族84,~__- CXCR3 趨化激素(C-X-C基元)受體3 ___ ETV7 ets變異基因7(TEL2致癌基因)" __一_ DUSP3 雙特異性碟酸醋酶3(痘療病毒碟酸醋酸VH1相關) __ WARS 色胺醯基-tRNA合成酶 CNIH4 comichon同源物4(果绳) STAT1 信號轉導子及轉錄活化子1,91 kDa IRF1 干擾素調節因子1 LILRB1 白血球免疫球蛋白樣受體,子族B(具有TM及ΠΊΜ域),成員1 SIPA1L1 信號誘導性增殖相關基因1樣1 GSDMDC1 含 gasdermin 域 1 DYNLT1 動力蛋白,輕璉,Tctex型1 DKFZp761E198 DKFZp761E198 蛋白 LOC400759 GBP1 鳥苷酸結合蛋白1,干擾素誘導性,67kDa GBP5 烏苷酸結合蛋白5 FLJ11259 損傷調節自體吞噬調節子 LYPLA1 溶血磷脂酶I RHBDF2 扁菱形蛋白5同源物2(果绳) PLEK 血小板-白jk球C激梅受質(pleckstrin) ANKRD22 錨蛋白重複域22 CASP1 卡斯蛋白酶1,細胞凋亡相關半胱胺酸肽酶(介白素1,β,轉化 酶) FLJ39370 染色體4開放閱讀框架32 FBX06 盒蛋白6 GCH1 GTP環水解酶多巴反應性肌張力障礙) GBP4 鳥苷酸結合蛋白4 IFI30 干擾素γ誘導性蛋白30 VAMP5 曩泡相關膜蛋白5(肌短蛋白) GBP2 烏苷酸結合蛋白2,干擾素誘導性 STX11 突觸融合蛋白11 SPTAN1 血影蛋白,α,非紅血球1(α-胞襯蛋白) POLB 聚合酶(DNA引導),β IL7R 介白素7受體 APOL6 脂蛋白元L,6 141281.doc -48- 201022492
基因符嬈 描述 -----~| ATG3 ΑΊ G3自體吞觉相關3同源物(釀酒酵母(<Sr⑶卿恤 SQRDL 硫醚醌還原酶樣(¾¾ --- PSME2 蛋白酶體(刖體,巨蛋白因子)活化次單元2fPA280) FLJ10379 SI RNA結合域 1 ---~~--- WDFY1 含WD重複及FYVE域1 ----- TAP2 轉運想2,ATP結合卡匣,子族B(MDR/TAp) NPC2 尼皮一氏病(Niemann-Pick disease),C2型 ATF3 /舌化轉錄因子3 ___ VAMP3 囊泡相關膜蛋白3(縮缴|白、 PSMB8 白酶體(前體,包资白因子)次單元,β型,8(大多功能肽酶7) JAK2 詹納斯氏激酶2(Janus kinase 2)(蛋白路胺酸激酶) 表5 :在活動性TB組與其他臨床組之間顯著差異表現的18 種基因。
基因符靓 描述 -----—— VAMP5 囊泡相關膜蛋白5(肌短蛋白) GBP2 」島普酸結合蛋白2,干擾素諉導性 STX11 突觸融合蛋白11 ' --- SPTAN1 血影蛋白,α,非紅血球ι(α-胞襯蛋白) POLB 聚合酶(DNA引導、,β " —— IL7R 介白素7受體 — APOL6 脂蛋白元L,6 ATG3 ATCi·3自體呑噬相關3同源物(釀酒酵母) SQRDL 硫醚醌還原酶樣(酵母) - PSME2 蛋白酶體(前體’巨蛋白因子)活化次單元2(pA28 β) FLJ10379 Si ΚΝΑ結合域1 WDFY1 含WD重複及FYVE坺1 TAP2 轉運體2,ATP結合卡匣,子族b(MDR/TAP) — NPC2 尼-皮二氏病,C2^ _ ATF3 活化轉錄因子^ ~ VAMP3 裳泡相關膜蛋白3(縮纖蛋白) PSMB8 蛋白酶體(前體’巨蛋白因子)次單元,β型,8(大多功能肽酶7) JAK2 廣納斯氏激酶2(蛋白酪胺酸激酶) 患有活動性TB及潛伏性TB之患者與健康對照之間的改 良區分:儘管上文所述之方法能夠區分活動性TB與潛伏性 TB及健康對照’但不太能夠區分所有三個臨床組。為選擇 區分性基因,使用以下方法。首先’使用魏氏-曼-惠特尼 141281.doc -49- 201022492 測試(Wilcoxon-Mann-Whitney test)在 p<〇.〇〇5 下對比潛伏 性TB患者來比較健康個體之血液中所表現的基因此產生 89種區分性基因。接著再次使用魏氏_曼_惠特尼測試但以 P<0.5及最嚴格之邦弗朗尼校正因子對比活動性tb患者來 比較健康個體之血液中所表現的基因,此產生3〇種區分性 基因之列表。將此列表組合以得到119種區分性基因之總 列表(表6)。接著使用此基因列表以藉由皮爾森相關使用非 監督式叢集分析詢問所有臨床組之資料集。此分析產生臨 床組之三個相異叢(圖8A至圖8F): 一個叢包含13位活動性 ❿ TB患者中之11位(圖8,叢c);第二叢包含17位潛伏性丁8 患者中之16位及1位活動性TB患者(圖8,叢B);第三叢含 有研究中所包括之所有12位健康對照加上1位活動性丁]8及1 位潛伏性丁8異常者(圖8,叢A)。對圖8A至圖SF中之每一 者而言,患者/臨床組叢水平地呈現且基因叢垂直地呈 現。119種基因之整個列表的此表現/表示模式(圖8A)現允 呼將所有二個臨床組彼此區分:亦即,允許將活動性TB、
潛伏性TB及健康個體彼此區分,各臨床組展現此等】丨9種 G 基因或其亞組之獨特表現/表示模式。熟習此項技術者將 認識到 1、2、3、4、5、6、7、8、1〇、12、15、20、25、 · ° 35或35種以上基因可置於表示可跨越臨床組A(健 - 康)、B(潛伏性)、C(活動性)叢相比較之基因叢的資料集 中’且單獨或與其他該等叢組合之各臨床組可展現自此等 119種基因獲得之獨特表現/表示模式。 特定言之’圖8B展示基因ST3GAL6、PAD14、 H1281.doc •50- 201022492 TNFRSF12A、VAMP3、BR13、RGS19、PILRA、NCFl、 LOC652616、PLAUR(CD87)、SIGLEC5、B3GALT7、 IBRDC3(NKLAM)、ALOX5AP(FLAP)、MMP9、ANPEP (APN)、NALP12、CSF2RA、IL6R(CD126)、RASGRP4、 • TNFSF14(CD258)、NCF4、HK2、ARID3A、PGLYRP1 (PGRP)在潛伏性TB患者之血液中不足表現/不足表示,但 在健康個體或活動性TB患者之血液中並非如此。 顯示圖8C中所呈現之基因ABCG1、SREBF1、RBP7 # (CRBP4)、C22orf5、FAM101B、S100P、LOC649377、 UBTD1、PSTPIP-1、RENBP、PGM2、SULF2、FAM7A1、 HOM-TES-103、NDUFAF1、CES1、CYP27A1、FLJ33641、 GPR177、MID1IP1(MIG_12)、PSD4、SF3A1 、NOV (CCN3)、SGK(SGKl)、CDK5R1、LOC642035在健康對照 個體之血液中過度表現/過度表示,但在潛伏性TB患者之 血液中不足表現/不足表示,且在活動性TB患者之血液中 在很大程度上不足表現/不足表示。 顯示圖 8D 中之基因 ARSG、LOC284757、MDM4、 CRNKL1、IL8、LOC389541、CD300LB、NIN、PHKG2、 HIP1之模式在健康個體之血液中過度表現/過度表示,但 在潛伏性TB患者與活動性TB患者之血液中不足表現/不足 表示。相反地,顯示圖8D中之基因PSMB8(LMP7)、 APOL6 ' GBP2 、 GBP5 、 GBP4 、 ATF3 、 GCH1 、 VAMP5、WARS、LIMK1 ' NPC2 ' IL-15 ' LMTK2 ' STX11(FHL4)在活動性TB之血液中過度表現/過度表示, U1281.doc -51 - 201022492 但在潛伏性TB患者及健康對照個體之血液中不足表現/不 足表示。 圖 8E 中之基因 、JAK2、GSDMDCi (DF5L)(FKSG10) 、SIPAIL1 、[2680400](KIAA1632)、 ACTA2(ACTSA)、KCNMBl(SLO-P)之模式在活動性TB 患 者之血液中皆過度表現/過度表示,但在潛伏性TB患者及 健康對照個體之血液中不表示或甚至不足表現/不足表 示。相反地,基因 SPTANI、KIAAD179(Nnpl)(RRPl)、 FAM84B(NSE2)、SELM、IL27RA、MRPS34、[6940246] (IL23A)、PRKCA(PKCA)、CCDC41、CD52(CDW52)、 [3890241](ZN404)、MCCC1(MCCA/B)、SOX8、SYNJ2、 FLJ21127、FHIT在活動性TB患者之血液中不足表現/不足 表示,但在潛伏性TB患者或健康對照個體之血液中並非如 此,該等基因在其中過度表現/過度表示。 圖8D及圖8E中所列之據發現在活動性TB患者之血液中 過度表現/過度表示的許多基因(在由上文所述之此方法選 擇之此等119種基因中)為藉由使用先前所述在活動性TB患 者、潛伏性TB患者及健康對照中之轉錄圖譜之較高嚴格度 分析的替代方法所鑑別之彼等者所共有(上文自圖8D及圖 8E展示為加下劃線之基因含於圖7中之基因列表(表5,18 種基因)中,p<0.05 ;上文自圖8D及圖8E展示為斜體之基 因含於圖6中之基因列表(表4, 46種基因)中,P<0.1)。 圖 8F 中所示之基因 CD52(CDW52)、[3890241] (ZNF404)、 MCCC1(MCCA/B)、SOX8、SYNJ2、FLJ21127、FHIT之模 141281.doc -52. 201022492 式在活動性TB患者之血液中不足表現/不足表示,但在潛 伏性TB患者或健康對照個體之血液中並非如此,該等基因 (若有)在其中過度表現/過度表示。此亦呈現(重疊)於圖8E 中。基因 CDKLl(p42)、MICALCL、MBNL3、RHD、 ST7(RAY1)、PPR3R1、[360739](PIP5K2A)、AMFR、 FLJ22471 、CRAT(CATl) 、PLA2G4C 、ACOT7(ACT) (ACH1)、RNF182、KLRC3(NKG2E)、HLA-DPB1在健康對 照個體之血液中不足表現/不足表示,但在潛伏性TB患者 之血液中過度表現/過度表示,且在大多數活動性TB患者 之血液中過度表現/過度表示(圖8F)。總之,圖8A中總共 119種基因之表現的聚合模式(在圖8B-8F中出於基因清晰 性及臨床病況之間的特異性而加以分解)區分受感染(活動 性TB及潛伏性TB)患者與非感染患者(健康對照)且另外, 區分兩組受感染患者(亦即,活動性TB患者與潛伏性TB患 者)。經由此方法在活動性TB患者之血液中過度表現之許 多基因為與使用最嚴格之統計過濾所鑑別之彼等者相同的 基因(展示於圖7,表6中),且許多基因為IFN誘導性的及/ 或涉及於内吞細胞運輸及/或脂質代謝中。 表6 :據發現在潛伏性與健康之間或活動性與健康之間顯 著差異表現之基因,該等基因當組合使用時使用非監督式 皮爾森相關叢集演算法(119種基因)將活動性、健康及潛伏 性加以區別。 141281.doc •53- 201022492 基因符珑 搞述 - HMFN0839 ^癌轉移相關蛋白 ---— LOC653820 MIDI IP 1 MIDI相互作用蛋白1(原腸化特異性ϋΐ2同源物(斑馬争y; SPTAN1 血影蛋白’ α ’非紅血球1(α-胞襯蛋白) NALP12 NLR家族,含pyrin域12 PSMB8 蛋白酶體(前體,巨蛋白因子)次單元,β型,8(大多功能肽酶7) RNF182 環指蛋白182 KCNMB1 鉀大電導鈣活化通道,子族Μ,β成員1 介白素23,α次單元ρ19 CDKL1 細胞週期素依賴性激酶樣1(CDC2相關激酶) IL8 介白素8 NOV 腎胚細胞瘤過度表現基因 APOL6 脂蛋白元L,6 KLRC3 殺傷細胞凝集素樣受體子族C,成員3 SOX8 SRY(性別決定區)-盒8 B3GALT7 UDP-GlcNAc:pGal β-1,3-Ν-乙醯胺基葡萄糖轉移酶8 GCH1 GTP環水解酶1(多巴反應性肌張力障礙) IL6R 介白素6受體 RASGRP4 RAS烏苷酸釋放蛋白4 SGK ▲清/糖皮質激素調節激酶 LOC389541 類似於 CG14977-PA MICALCL MICAL C末端樣 VAMP3 囊泡相關膜蛋白3(縮纖蛋白) NPC2 尼-皮二氏病,C2型 SYNJ2 突觸伸蛋白2 NIN 中心體蛋白(ninein)(GSK3B相互作用蛋白) MBNL3 肌盲樣3(果绳) FLJ11259 損傷調節自體吞嗤調節子 NALP12 NLR家族’含pyrin域12 LIMK1 ARSG 芳基硫酸酯梅G FLJ33641 染色體5開放閱讀框架29 PADI4 肽基精胺酸去亞胺酶,ιν^ RENBP 腎素結合蛋白 SULF2 硫酸酯酶2 GSDMDC1 含 gasdermin 域 1 ST7 抑瘤7 RBP7 細胞視黃酵結合蛋白7 HK2 己糖激酶2 VAMP5 囊泡相關膜蛋白5(肌短|⑷ GPR177 G蛋白偶合受體177 CES1 羧酸酯酶1(单核細胞/巨噬細胞絲胺酸酯酶1) CD52 CD52分子 141281.doc -54- 201022492
基因符號 描述 ABCG1 ATP結合卡匣,子族G(WHITE),成員1 ----- GBP5 鳥苷酸結合蛋白5 ---- MDM4 Mdm4 ’轉型3T3細胞雙微4,p53結合蛋白(]、窟、 -- SIGLEC5 嗤液酸結合Ig樣凝集素5 ---- ARID3A AT富集相互作用域3A(BRIGHT樣) --- KIAA0179 核糖體Wna加工1同源物釀酒酵母) - PSD4 含血小板-白血球C激酶受質及Sec7域4 — ALOX5AP 花生四烯酸5-脂肪加氧酶活化蛋^ -- CSF2RA 群落刺激因子2¾體’ α,低親和力(顆粒玻巨禮細胞、 MMP9 基質金屬肽酶9(明膠酶Β,92kDa明膠酶, 92 kDa IV型膠原酿) PGLYRP1 肽聚糖識別蛋白1 _ —--- CYP27A1 細胞色素P450 ’家族27,子族A,多肽1 ---- LMTK2 lemur路胺酸激酶2 —一- BRI3 腦蛋白13 " -- PILRA 配對免疫球蛋白樣2型受體α ----- 辞指蛋白404 ----- FLJ21127 tectonic 1 —-- GBP2 鳥苷酸結合蛋白2,干擾素誘導性 ST3GAL6 ST3 β半乳糖苷α-2,3-唾液酸轉移酶6 --—-—— PLAUR 纖維溶酶原活化子,尿激酶受體 -_ --— NCF4 嗜中性白血球胞質因子4,40kDa ---- JAK2 詹納斯氏激酶2(蛋白酪胺酸激酶) - SREBF1 固醇調節元件結合轉錄因子1 ----- SELM 场蛋白Μ --- PPP3R1 蛋白磷酸酯酶3(先前為2Β),調節 ,α同功異型物 PRKCA 蛋白激酶C,α PLA2G4C 磷脂晦Α2,組IYC(胞質,鈣非依賴性) GBP4 烏苷酸結合蛋白4 --- HIP1 亨廷頓素(huntingtin)相互作用蛋白1 - PGM2 葡萄糖磷酸變位酶2 —--- "ΚΪΑΑΪ632 *--- S100P S100鈣結合蛋白ρ —-- IL27RA 介白素27受體,α —*--- IL15 i 白素 15 -- FHIT 脆性組胺酸二合體基因 -- FAM84B 具有序列相似性之家族84,成員B ' --- MCCC1 甲基巴立酿基-輔叛化酶1(a) ~ ACOT7 酿基-CoA硫醋酶7 TNFRSF12A 腫瘤壞死因子受體超家族,成員12乂-- SF3A1 剪接因子3a,次單元1,120kDa --- TNFSF14 腫瘤壞死因子(配位體)超家族,成—--- CD300LB CD300分子樣家族成員b ~-- 141281.doc •55- 201022492 基因符號 描述 ΑΝΡΕΡ 丙胺醢基(膜)胺基肽酶(胺基肽酶N,胺基肽酶M,微粒體胺基肽 酶,CD13,pl50) FAM7A1 RHD RH血型,D抗原 HOM-TES- 103 假定蛋白LOC25900 CCDC41 含捲曲螺旋域41 CRNKL1 曲頸前mRNA剪接因子樣1(果蠅) NCF1 嗜中性白血球胞質因子1(慢性肉芽腫病,艏染色體1) UBTD1 含泛素域1 FLJ22471 含捲曲螺旋域92 FAM101B 「具有序列相似性之家族1(U,成員B LOC284757 LOC649377 CDK5R1 細胞週期素依賴性激梅5,調節次單元丨化%、 智人(人類)正規化神經母細胞瘤c〇t 25之全長cDNA純系 CS0DC025YP03 MBNL3 肌盲樣3(果蠅) PSTPIP1 脯胺酸-絲胺酸-蘇胺酸碗酸醋酶相互作用1白1 WARS 色胺醢基-tRNA合成酶 HLA-DPB1 主要組織相容性複合物,II類,DP β 1 LOC652616 ACTA2 肌動蛋白,α2,平滑肌,主動脈 IBRDC3 含IBR域3 PHKG2 磷睃化酶激酶,γ2(睾丸) 磷脂醯肌醇-4-磷酸5激酶,II型,α LOC642035 AMFR RGS19 G蛋白信號轉導調節子19 C22orf5 染色艘22開放閱讀框架5 一 - ATF3 活化轉錄因子3 SIPA1L1 信號誘導性增殖相關基因1樣1 MRPS34 粒線體核糖體蛋白S34 ADAL 腺苷去胺酶樣 NDUFAF1 NADH去氫酶(泛規)ΐα子複合物,裝配因早1 CRAT 肉鹼乙醯基轉移酶 STX11 突觸融合蛋白11 使用模組法揭示活動性TB與潛伏性TB中之不同且相反 之免疫特徵。為產生關於發病機理之其他資訊,接著使用 新近描述之穩定模組分析框架,基於據顯示跨越眾多疾病 協調表現且常常表示在功能層面上相關之分子或細胞叢的 141281.doc -56· 201022492 預定基因轉錄物叢來進-步分析正規化之每個晶片資料 (Chaussabel等人,2008, Immunity)。 由於此分析之目的在於產生各組之轉錄特徵中所含之關 於基因的功能資訊’因此分析集中於據發現在吾人之先前 分析中緊密叢集於-起之患者子組(排除異常者),從而推 論該等組將更有可能揭示疾病過程中所涉及之共同途徑及 過程。 選擇9位患有活動性TB之患者、6位健康對照及9位患有 潛伏性TB之患者且將其用於模組分析。獨立地進行各比 較,因此在一個分析甲比較9位活動性丁3患者與6位健康對 照,且接著在獨立分析中比較9位潛伏性丁8患者與相同的6 位健康對照。過濾轉錄物以自任一正處於比較中之組排除 在至少兩個個體中未偵測到之任何轉錄物。接著進行患者 組與健康對照組之間的統計比較(非參數魏氏_曼_惠特尼測 試,Ρ<0·05),以鐘別在患者組與健康對照之間差異表現 的基因。接著將此等差異表現基因分離為與對照相比在疾 病組中上調/過度表示之基因及與對照相比在疾病組中下 調/不足表示之基因。接著以模組為基礎針對模組分析此 等列表。差異表現基因在各模組中主要過度表現或主要不 足表現。為確保有效性,各模組在所表示之方向上必須具 有>25%之總基因變化且在特定方向上變化之基因數必須 。為在活動性ΤΒ對比健康對照或潛伏性ΤΒ對比健康對 照中圖不呈現總體轉錄變化,在柵格上對準斑點,其中各 位置基於初始定義對應於不同模組。斑點強度指示在針對 141281.doc •57· 201022492 彼权』所偵測之轉錄物之總數中在所示方向上變化之差異 表現轉錄物的比例,而斑點顏色指示變化之極性(紅色: 過度表現/表不’藍色:不足表現/表示)。另外,模組之座 “可與功斯《 6主釋相關以有利於資料解釋 Immunity,2008 ;及圖9及圖 1〇)。 顯示與健康對照相比之活動性⑶的模組圖(圖9,表7八 P ;及表8)不同於與健康對照相比之潛伏性TB的圖(圖1〇 ’ 表7 A F,及表9)。實際上,此等自活動性tb及潛伏性TB 獨立得到之模組圖在當與健康對照相比時顯示疾病病況變 化之模組中展示相反之基因表現/表示模式。與細胞毒性 細胞相關之模組M2」中之基因在活動性TB中不足表現/表 示(36%-在該模組中所偵測之5〇種基因中之18種基因不足 表現/表示,表6F中所列之基因),且在潛伏性τβ*過度表 現/表示(43%-在該模組—所偵測之”種基因中之22種基因 過度表現/表示,表7B中所列之基因)。另一方面,M3 2及 M3_3(炎症」)中之許多基因在活動性TB患者中過度表 現/表示(表6J及表6〖中所列之基因),但在潛伏性tb患者 中不足表現/表示(表7Ε及表7F令所列之基因)。同樣地, Ml.5(「骨髓系」)中之基因在活動性TB中過度表現/表示 (表6D中所列之基因),而在潛伏性TB中不足表現/表示(表 7A中所狀基因)。未形成_致功能性模組但由明顯不同 之基因組組成的模組Μ2·10中之基因在潛伏性了8中不足表 現/表示(表7D中所列之基因),但與對照相比在活動性τβ 中不會過度或不足表現/表示 此等基因之一為toll樣受體 141281.doc -58· 201022492 接附子TRAM,其在TLR-4(LPS)及TLR-3(dsRNA)信號轉導 之下游(Akira, Nat· Rev. Imm.)。 對於表7A至表70而言,活動性TB之相對jE規化表現係 以相對於對照在活動性患者中之表現而提供。在表8 A至表 8F中,潛伏性TB之相對正規化表現係以相對於潛伏性患 者在健康對照中之表現而提供。 表7A : Ml ·2 PTB對比對照,在活動性TB中過度表示之基 因0
相對正規 化表現 常用名 基因符號 描述 P22J 5_PTBvCSelect_09 May08 PAL2Ttest UP Μ 1.2 ~ 2.447 KX ; Xlk ; XKR1 χκ X連接之Kx血型(麥克爾德症候 群(McLeod syndrome)) 2.239 CD62 ; GRMP ; PSEL ; CD62P ; GMP140 ; PADGEM ; FLJ45155 SELP 選擇蛋白P(顆粒膜蛋白140 kDa,抗原 CD62) 2.161 URG EGF 表皮生長因子(β-尿抑胃素) 2.133 JAMC ; JAM-C ; FU14529 JAM3 接合黏附分子3 2.13 H2B ; GL105 ; H2B.1 ; H2B/q ; H2BFQ ; MGC129733 ; MGC129734 HIST2H2BE 組蛋白叢2,H2be 1.889 4.10 ; P410 ; EPB41L40 ; MGC20553 ; RP11-439K3.2 FRMD3 含FERM域3 1.875 CKLFSF5 ; FLJ37521 CMTM5 含CKLF樣MARVEL跨膜域5 1.829 ECM ; MMRN ; GPIa* ; EMILIN4 MMRN1 多聚素1 1.757 PSA ; PROS ; PS21 ; PS22 ; PS23 ; PS24 ; PS25 ; PS26 ;蛋白質S ; 蛋白質Sa PR0S1 蛋白質S(a) 1.752 F13A F13A1 釦血因子XIII,A1多肽 141281.doc -59- 201022492 相對正规 化表現 常用名 基因符% 描述 1.698 H2B/S ; H2BFT ; H2BFAiii ; MGC131989 HIST1H2BK 組蛋白叢1,H2bk 1.638 RTN2 1.59 TMSA ; ΗΤΜ-α ; ΤΡΜ1-α ; TPMl-κ TPM1 原肌球蛋白l(c〇 1.419 C6orf79 1.408 BSS ; GP1B ; CD42B ; MGC34595 ; CD42b-a GP1BA 醣蛋白lb(血小板),α多肽 1.338 CD61 ; GP3A ; GPIIIa ITGB3 整合素β3(血小板醣蛋白ma, 抗原CD61) 1.183 CMIP ; KIAA1694 CMIP c-Maf誘導蛋白 表7B : M1.3 PTB對比對照,在活動性TB中不足表示之基 因。 相對正规 化表現 常用名 基因符甕 描迷 P22 15 PTBvCSelect 09 May08 PAL2Ttest DOW N Ml.3 0.82 FLJ31738 ; KIAA1209 PLEKHG1 含血小板-白血球c激酶受質同源 域,家族G(具有RhoGef域)成員1 0.778 SPI-B SPIB Spi-B轉錄因子(Spi-1/PU.l相關) 0.767 EVI9 ; CTIP1 ; BCL11A-L ; BCL11A-S ; FLJ10173 ; FLJ34997 ; KIAA1809 ; BCL11A-XL BCL11A B細胞CLL/淋巴瘤11A(鋅指蛋白) 0.715 MGC20446 CYBASC3 細胞色素b,抗壞血酸鹽依賴性3 0.677 NIDD ; MGC42530 ZDHHC23 鋅指,含DHHC型23 0.629 ESG ; ESG1 ; GRG1 TLE1 轉導素樣分裂強化子l(E(spl)同 源物,果绳) 0.612 B29 ; IGB CD79B CD79b分子,免疫球蛋白相關β 0.581 LYB2 ; CD72b CD72 CD72分子 0.559 KIAA0977 COBLL1 COBL 樣 1 0.556 BASH ; Ly57 ; SLP65 ; BLNK-s ; SLP-65 ; MGC111051 BLNK Β細胞連接子 0.543 TCL1 TCL1A Τ細胞白血病/淋巴瘤1A 0.518 c-Myc MYC v-myc趙細胞組織增殖病毒致癌 基因同源物(禽類) 0.512 BANK ; FLJ20706 ; FLJ34204 BANK1 具錨蛋白重複之B細胞支架蛋白1 0.51 B4 ; MGC12802 CD19 CD 19分子 141281.doc -60· 201022492
相對正规 化表現 常用名 基因符鏡 ---- 描述 0.496 FCRH1 ; IFGP1 ; IRTA5 ; RP11-367J7.7 ; DKFZp66701421 FCRL1 Fc受體樣l 0.487 FLJ00058 GNG7 烏嘌呤核苷酸結合蛋 0.482 FLJ21562 ; FLJ43762 C13orfl8 杂色體13開放閱讀框秦 0.477 BRDG1 ;STAP1 BRDG1 BCR下游信號轉導1 ~----- 0.471 MGC10442 BLK B淋巴酪胺酸激酶 -- 0.467 Rl ; JP02 ; RAM2 ; DKFZp762L0311 CDCA7L ----- 細胞分裂週期相關7樣 0.445 ORPIO ; OSBP9 ; FLJ20363 OSBPLIO 氧固醇結合蛋白樣10 0.397 8HS20 ; N27C7-2 VPREB3 刖B淋巴細胞基因3~~'-- 0.361 LAF4 ; MLLT2 樣 AFF3 AF4/FMR2 家族,成^-'一~~ 0.334 FCRL ; FREB ; FCRLX ; FCRLb ; FCRLd ; FCRLe ; FCRLM1 ; FCRLcl ; FCRLc2 ; MGC4595 ; RP11-474116.5 FCRLM1 Fc受體樣A 表7C : M1.4 PTB對比對照,在活動性TB中不足表示之基 因0 相對正规 化表現 常用名 基因符號 描述 P22_15_PTBvCSelect_0 9May08 PAL2Ttest DO WN Ml:4 _ 0.907 FLjF2298 ; ZKSCAN14 ZNF394 名辛指蛋白394^ . 0.835 JMY ; FLJ37870 ; MGC 163496 JMY 接合介導及調節1白 0.825 Cl ; C2 ; HNRNP ; SNRPC ; hnRNPC ; MGC 104306 ; MGC105117 ; MGC117353 ; MGC131677 HNRPC r--------w 異質核核糖核酸蛋白c(c丨/C2) 0.78 SON3 ; BASS1 ; DBP-5 ; NREBP ; C21orf50 ; FLJ21099 ; FLJ33914 ; KIAA1019 SON SONDNA結合i白 1---- 141281.doc -61- 201022492 相對正規 化表現 常用名 基因符靓 描述 0.77 HMGE ; FLJ25609 GRPEL1 GiTE樣1,粒線體(大腸桿菌(Ε· coli)) 0.747 HEPP ; FLJ20764 ; MGC19517 CDCA4 細胞分裂週期相關4 0.723 RITA ; ZNF361 ; ZNF463 ; DKFZp686L0787 ZNF331 鋅指蛋白331 0.698 FLJ12670 ; FLJ20436 C12orf41 染色體12開放閱讀框架41 0.698 DRBF ; MMP4 ; MPP4 ; NF90 ; NFAR ; TCP80 ; DRBP76 ; NFAR-1 ; MPHOSPH4 ; NF-AT-90 ILF3 介白素強化子結合因子3,90 kDa 0.689 TIMAP ; ANKRD4 ; KIAA0823 PPP1R16B 蛋白磷酸酯酶1,調節(抑制子)次 單元16B 0.678 PRP21 ; PRPF21 ; SAP114 ; SF3A120 SF3A1 剪接因子3a,次單元1,120kDa 0.667 SDS ; SWDS ; CGI-97 ;FLJ10917 SBDS 許氏症候群(Shwachman-Bodian-Diamond syndrome) 0.665 BL11 ; HB15 CD83 (JD83分子 0.645 NOT ; RNR1 ; HZF-3 ; NURR1 ; TINUR NR4A2 核受體子族4,組A,成員2 0.62 H1RNA RNASEH1 核糖核酸酶H1 表7D ·· Μ1 ·5 PTB對比對照,在活動性TB中過度表示之基
因0 相對正規 化表現. 常用名 基因符犹 描述 P22 15 PTBvCSelect 09 May08 PAL2Ttest UP Ml .5 ·1~~ .- 2.384 VHR DUSP3 雙特異性磷酸酯酶 酯酶VH1相關) 2.139 4. IB ; DALI ; DAL-1 ; FLJ37633 ; KIAA0987 EPB41L3 紅血球膜蛋白帶4.1樣3 2.014 HXK3 ; HKIII HK3 己糖激酶3(白血球) - 1.972 HL14 ; MGC75071 LGALS2 _凝集素,半乳糖苷結合 1.844 KYNU KYNU 犬尿胺酸酶(L-犬尿胺酸王在- 1.618 BLYR ; BVRA BLVRA 膽綠素還原酶A ^-- —---- 141281.doc -62- 201022492
相對正規 化表現 常用名 基因符珑 描述 1.594 RP35 ; SEMB ; SEMAB ; CORD 10 ; FLJ12287 ; RP11-54H19.2 SEMA4A sema域、免疫球蛋白域你)、跨膜 域(TM)及短細胞質域(轴突導向因 子)4A 1.535 GRN 1.531 G6S ; MGC21274 GNS 葡糖胺(Ν·乙醯基)-6-硫酸醋酶(山 菲立普病(Sanfilippo diseaseMIID、 1.524 FOAP-10 ; EMILIN-2 ; FLJ33200 EMILIN2 彈性蛋白微原纖維界面2 1.507 cent-b ; HSA272195 CENTA2 矢車菊普蛋白,α2 1.449 APPS ; CPSB CTSB 組織蛋白酶Β — 1.438 ASGPR ; CLEC4H1 ; Hs.12056 ASGR1 去唾液酸醣蛋白受體1 1.433 CD32 ; FCG2 ; FcGR ; CD32A ; CDw32 ; FCGR2 ; IGFR2 ; FCGR2A1 ; MGC23887 ; MGC30032 FCGR2A IgG之Fc片段、低親和力iia、受體 (CD32) 1.425 TIL4 ; CD282 TLR2 toll樣受體2 1.424 PI ; ΑΙΑ ; AAT ; PI1 ; A1AT ; MGC9222 ; PR02275 ; MGC23330 SERPINA1 絲胺酸肽酶抑制子,分枝Α(α-1抗 蛋白酶,抗腺蛋白酶),成員1 1.413 TEM7R ; FLJ14623 PLXDC2 含叢狀蛋白域2 1.41 CD14 CD14 CD14分子 1.398 Rab22B RAB31 RAB31,RAS致癌基因家族成員〜 1.386 FEX1 ; FEEL-1 ; FELE-1 ; STAB-1 ; CLEVER-1 ; KIAA0246 STAB1 穩定素1 1.352 MYD88 MYD88 骨髓分化一級反應基因(88) 1.349 MLN70 ; S100C S100A11 S100舞結合蛋白All 〜 1.347 FLJ22662 FLJ22662 假定蛋白FLJ22662 > 1.346 CLN2 ; GIG1 ; LPIC ; TPPI ; MGC21297 TPP1 三肽基肽酶I 1.251 p75 ; TBPII ; TNFBR ; TNFR2 ; CD 120b ; TNFR80 ; TNF-R75 ; p75TNFR ; TNF-R-II TNFRSF1B 腫瘤壞死因子受體超家族,成員 1B 1.239 JTK9 HCK 造血細胞激酶 1.172 IBA1 ; AIF-1 ; IRT-1 AIF1 同種異體移植發炎因子1 〜 表7E : Μ1·8 PTB對比對照,在活動性TB中不足表示之基 因0 141281.doc •63- 201022492 相對正規 化表現 常用名 基因符號 描述 P22 15 PTBvCSelect 09May 08 PAL2Ttest_DOWN Ml.8 0.878 DBP2 ; PRP8 ; DDX16 ; PRO2014 DHX16 DEAI^Aspdu-Ala-His)盒多 肽16 0.858 AN11 ; HAN11 WDR68 WD重複域68 0.843 NDR ; NDR1 STK38 絲胺酸/蘇胺酸激酶38 0.821 FLJ20097 ; FLJ23581 ; KIAA1861 FLJ20097 含捲曲螺旋域132 0.814 FLJ42526 ; FLJ45813 ; MGC71764 RSBN1L 圓精細胞鹼性蛋白1樣 0.809 C9orf55 ; C9orf55B ; FLJ20686 ; bA513M16.3 ; DKFZp686I09113 DENND4C 含 DENN/MADD 域 4C 0.808 SON3 ; BASS1 ; DBP-5 ; NREBP ; C21orf50 ; FLJ21099 ; FLJ33914 ; KIAA1019 SON SONDNA結合蛋白 0.807 pl50 ; VPS15 ; MGC102700 PIK3R4 磷酸肌醇-3-激酶,調節次單 元4,pi50 0.8 4E-T ; Clast4 ; FLJ21601 ; FLJ26551 EIF4ENIF1 真核轉譯起始因子4E核輸入 因子1 0.798 TAF2D ; TAFII100 TAF5 TAF5 RNA聚合酶Π,TATA盒 結合蛋白(TBP)相關因子,100 kDa 0.793 DBR1 DBR1 去支酶同源物1(釀酒酵母) 0.785 SMAP ; pl20 ; SMAP2 BRD8 含溴域8 0.785 CASP2 0.772 TRF2 ; TRBF2 TERF2 調聚重複結合因子2 0.772 hNUP133 ; FLJ10814 ; MGC21133 NUP133 核孔蛋白133 kDa 0.762 MGC4268 ; FLJ38552 MGC4268 ΑΜΜΕ染色體區基因1樣 0.761 PUMH2 ; PUML2 ; FLJ36528 ; KIAA0235 ; MGC138251 ; MGC138253 PUM2 pumilio同源物2(果蠅) 0.751 BYE1 ; DIOl ; DATF1 ; DID02 ; DID03 ; DIO-1 ; FLJ11265 ; KIAA0333 ; MGC16140 ; C20orfl58 ; dJ885L7.8 ; DKFZp434P1115 DIDOl 死亡誘導子-清理子1 0.738 KOX5 ; ZNF13 ZNF45 鋅指蛋白45 0.727 FLJ20558 FLJ20558 染色體2開放閱讀框架42 0.713 FLJ32343 CWF19L2 CWF19樣2,細胞週期控制(粟 酒裂殖酵母(&/7〇w6e)) 141281.doc -64- 201022492
相對正規 化表現 常用名 基因符號 -- 描述 0.709 MGC16770 RAB22A RAB22A,RAS致癌基因篆^ 成員 0.708 FLJ14431 CBR4 羰基還原酶4 0.704 AASDH ; NRPS998 ; NRPS1098 AASDH ~~— -----—_ 2-胺基己二酸6-半醛去氫酶 0.698 ZSCAN11 ZNF232 鋅指蛋白232 0.692 NudCL ; KIAA1068 NUDCD3 含NudC域33 0.691 CCA1 ; MtCCA ; CGI-47 TRNT1 «ΝΑ核苷酸轉移酶,CCA^~ 加,1 0.689 RBM30 ; RBM4L ; ZCRB3B ; ZCCHC15 ; MGC 10871 RBM4B RNA結合基元蛋白4B 0.683 CLF ; CRN ; HCRN ; SYF3 ; MSTP021 CRNKL1 曲頸前mRNA剪接因子樣1(果 蠅) 0.676 ZBU1 ; HLTF1 ; RNF80 ; HIP116 ; SNF2L3 ; HIP116A ; SMARCA3 SMARCA3 解螺旋酶樣轉錄因子 0.666 SWAN ; KIAA0765 ; HRIHFB2091 RBM12 RNA結合基元蛋白12 0.658 FLJ10287 ; FLJ11219 CCDC76 含捲曲螺旋域76 0.654 INT5 ; KIAA1698 KIAA1698 整合子複合次單元5 0.652 IAN7 ; hIAN7 ; MGC27027 GIMAP7 GTPase,IMAP家族成員7 0.651 TTC20 ; DKFZP586B0923 KIAA1279 KIAA1279 0.65 RAL ; MGC48949 RALA v-ral猴白血病病毒致癌基因同 源物A(ras相關) 0.639 MPRB ; LMPB1 ; C6orf33 ; FLJ32521 ; FLJ46206 PAQR8 助孕素及adipoQ受體家族成員 VIII 0.634 FLJ11171 FLJ11171 假定蛋白FLJ11171 0.613 LCF ; IL-16 ; prIL-16 ; FLJ16806 ; FLJ42735 ; FLJ44234 ; HsT19289 IL16 介白素16(淋巴細胞化學引誘 物因子) 0.611 FLJ33226 ; 1190004M21Rik PYG02 pygopus同源物2(果绳) 0.577 GLC1G ; UTP21 ; TAWDRP ; TA-WDRP ; DKFZp686I1650 WDR36 WD重複域36 0.574 FLJ20287 ; bA208F1.2 ; RP11-208F1.2 TEX10 睾丸表現10 0.568 KIAA1982 ZNF721 辞指蛋白721 0.55 FLJ22457 ; RP5-1180E21.2 DENND2D 含 DENN/MADD 域 2D 0.545 ozrfl ; ZFP260 ZFP260 鋅指蛋白260 0.491 GLS1 ; FLJ10358 ; KIAA0838 ; DKFZp686015119 GLS 麩醯胺酸酶 141281.doc -65- 201022492 表7F : M2.1 PTB對比對照,在活動性TB中不足表示之基 因。 相對正规 化表現 常用名 基因符珑 描迷 P22_l 5_PTBvCSelect_09 May08 PAL2Ttest DOW N M2.01 " 0.712 PTPMEG ; PTPMEG1 PTPN4 蛋白酪胺酸磷酸酯酶,非受體型 4(巨核細胞) 0.665 FLJ34563 ; MGC35163 SAMD3 含不育α基元域3 0.643 STAT4 STAT4 信號轉導子及轉錄活化子4 0.638 DILI ; DIL-1 ; Mindin ; M-脊椎蛋白 SPON2 脊椎蛋白2,胞外基質蛋白 0.631 SLP2 ; SGA72M ; CHR11SYT ; KIAA1597 ; MGC102768 SYTL2 突觸結合蛋白樣2 0.628 DORZ1 ; DKFZP5640243 ABHD14A 含自水解酶域14Α 0.615 LPAP ; CD45-AP ; MGC138602 ; MGC138603 PTPRCAP 蛋白酪胺酸填酸酯酶,受體型,C 相關蛋白 0.595 PKCL ; PKC-L ; PRKCL ; MGC5363 ; MGC26269 ; nPKC-η PRKCH 蛋白激酶C,η 0.581 MGC33870 ; MGC74858 NCALD 神經鈣蛋白δ 0.566 Til ; SRBC CD2 CD2分子 0.554 KLR ; CD314 ; NKG2D ; NKG2-D ; D12S2489E KLRK1 殺傷細胞凝集素樣受體子族Κ,成 員1 0.546 LAX ; FLJ20340 LAX1 淋巴細胞跨膜接附子1 0.529 CD122 ; P70-75 IL2RB 介白素2受體,β 0.515 FEZ1 FEZ1 束化及延伸蛋白ξΐ(椎骨蛋白I) 0.509 CHK ; CTK ; HYL ; Lsk ; HYLTK ; HHYLTK ; MGC 1708 ; MGC2101 ; DKFZp434N1212 MATK 巨核細胞相關酪胺酸激酶 0.468 CLIC3 CLIC3 氣離子細胞内通道3 0.439 1C7 ; CD337 ; LY117 ; NKp30 NCR3 天然細胞毒性觸發受趙3 0.39 TRYP2 GZMK 顆粒酶Κ(顆粒酶3 ;類胰蛋白酶π) 141281.doc -66 - 201022492 表7G : M2.4 PTB對比對照,在活動性TB中不足表示之基 因0
相對正規 化表現 常用名 基因符獍 描述 Ρ22 15 PTBvCSelect 09 May08 PAL2Ttest DOW N M2.04 0.858 ATPO ; OSCP ATP50 ATP合成酶,轉運,粒線體FI 複合物’ 〇次單元(募黴素敏感性 賦予蛋白) 0.831 M9 ; eIF3k ; ARG134 ; PTD001 ; HSPC029 ; MSTP001 ; PLAC-24 ; PR01474 EIF3S12 真核轉譯起始因子3,次箪元12 0.822 RPL8 RPL8 核糖體蛋白L8 0.811 EF2 ; EEF-2 EEF2 真核轉譯延長因子2 0.804 RPB9 ; hRPB14.5 POLR2I 聚合酶(RNA)II(DNA引導)多肽I, 14.5 kDa 0.801 RP8 ; ZMYND7 ; MGC12347 PDCD2 漸進式細胞死亡2 0.788 ARI2 ; TRIAD 1 ; FLJ10938 ; FLJ33921 ARIH2 ariadne同源物2(果球λ 0.776 Erv46 ; CGI-54 ; PRO0989 ; C20orf47 ; NY-BR-84 ; SDBCAG84 ; dJ47704.2 ERGIC3 ERGIC及高爾基體3 0.771 ART-27 UXT 普遍表現轉錄物 --- 0.769 H12.3 ; HLC-7 ; PIG21 ; RACK1 ; Gnb2-rsl GNB2L1 — 烏嘌呤核苷酸結合蛋白(G|白 質),β多肽2樣1 0.766 eIF3h ; eIF3-p40 , MGC102958 ; eIF3-y EIF3S3 真核轉譯起始因子3,次 40 kDa γ 0.759 HCA56 LGTN 連接素 0.758 2PP2A ; IGAAD ; I2PP2A ; PHAPII ; TAF-IP SET ----— SET移位(骨雜白血病相關、 0.752 ANG2 CllorG 染色體11開放閱讀框架^-- 0.74 C6.1B MTCP1 成熟T細胞增殖1 -~~~ 0.736 LCP ; HCLP-1 KLHDC2 含kelch 域 2 —~~ 0.722 DKFZP566B023 RPL36 核糖體蛋白L36 ~--- 0.712 KOX30 ZNF32 鋅指蛋白32 ---- 141281.doc •67- 201022492 相對正規 化表現 常用名 基因符號 描述 0.71 AMP ; MGC125856 ; MGC125857 ; MGC129961 ; DKFZp686D13177 APRT ~~---~~-_ 腺嘌呤磷酸核糖基轉移酶 0.694 GDH ; MGC 149525 ; MGC 149526 ; λ-CRY CRYL1 —---_ 晶體蛋白,λΐ 0.689 FLJ27451 ; MGC102930 RPS20 核糖體蛋白S20 - 0.686 INT6 ; eIF3e ; EIF3-P48 ; eIF3-p46 EIF3S6 真核轉譯起始因子3 kDa ^*6 48 0.68 LK4 ; hCERK ; FLJ21430 ; FLJ23239 ; KIAA1646 ; MGC131878 ; dA59H18.2 ; dA59H18.3 ; DKFZp434E0211 CERK ^---- 神經醯胺激酶 0.675 HINT ; PKCI-1 ; PRKCNH1 HINT1 組胺酸三合體核苷酸結合孓_ 1 0.675 NHP2 ; NHP2P NOLA2 核仁蛋白家族a ’成 核仁RNP) 0.668 AMP ; MGC 125856 ; MGC125857 ; MGC 129961 ; DKFZp686D13177 APRT 腺嘌呤磷酸核糖基轉移醢 0.667 TOM7 TOMM7 粒線艘外膜7同源 母) 0.655 SIVA ; CD27BP ; Siva-1 ; Siva-2 SIVA SIVA1,細胞凋亡議導闵子 0.646 PBP ; HCNP ; PEBP ; RKIP PEBP1 磷脂醯乙酵胺結合孓 0.628 PRP9 ; PRPF9 ; SAP61 ; SF3a60 SF3A3 剪接因子3a ’次單元3,60 kDa 0.62 FLJ12525 ; dJ475B7.2 ; RP3-475B7.2 LAS1L LAS1樣(釀酒酵母) 0.593 EC45 ; RPL10 ; RPLY10 ; RPYL10 ; FLJ26304 ; MGC88603 RPL15 核糖體蛋白L15 0.567 HNRNP ; JKTBP ; JKTBP2 ; laAUFl HNRPDL 異源核核糖核酸蛋白D祥 0.562 SMD2 ; SNRPD1 SNRPD2 小核核糖核酸蛋白質D2多肽16.5 kDa 0.549 PPIA 0.527 LOCI30074 ; MGC87527 LOCI 30074 p20 141281.doc -68 - 201022492 相對正規 化表現 常用名 基因符號 描述 0.524 RDGBB ; RDGBB1 ; RDGB-β PITPNC1 填月旨酿肌醇轉移蛋白,細胎皙1 0.5 ΗΕΙ10 ; C14orfl8 CCNB1IP1 細胞週期素Β1相互作用|白〗 - 0.492 ΕΑΡ ; ΗΒΡ15 ; HBP15/L22 RPL22 核糖體蛋白L22 表7H : M2.8 PTB對比對照,在活動性TB中不足表示之基
因0 相對正規 化表現 常用名 基因符靓 描述 Ρ22 15 PTBvCSelect 09 May08 PAL2Ttest DOW N M2.08 0.871 KPL1 ;PHR1 ;PHRET1 PLEKHB1 含血小板-白血球c激酶受質同源 域,家族B(evectins)成員1 0.816 MGC132014 INPP4B 肌醇聚填酸-4-碟酸酷辑,Π型, 105 kDa 0.732 SEP2 ; SEPT2 ; KIAA0128 ; MGC16619 ; MGC20339 ; RP5-876A24.2 6-Sep 胞裂蛋白6 0.711 GIL AQP3 水通道蛋白3(Gill血型)'-- 0.691 FLJ36386 LZTFL1 白胺酸拉鏈轉錄因子樣1 0.67 p52 ; p75 ; PAIP ; DFS70 ; LEDGF ; PSIP2 ; MGC74712 PSIP1 ---- PC4及SFRS1相互作用蛋白j 0.669 GRG ; ESP1 ; GRG5 ; TLE5 ; AES-1 ; AES-2 AES 胺基末端分裂強化子 0.668 p33 ; TNFC ; TNFSF3 LTB 淋巴毒素P(TNF超家族,成~~~ 0.646 KIAA0521 ; MGC15913 ARHGEF18 rho/rac烏嘌呤核苷酸 (GEF)18 0.634 TEM3 ; TEM7 ; FLJ36270 ; FLJ45632 ; DKFZp686F0937 PLXDC1 — 含叢狀蛋白域1 0.626 HPIP PBXIP1 前B細胞白血病同源盒相互; 0.621 KIAA0495 ; MGC138189 KIAA0495 ΚΙΑΑ0495 0.615 KUP ; ZNF46 ZBTB25 含辞指及ΒΤΒ域25 — 0.61 FLJ20729 ; FLJ20760 ; NY-BR-75 ; MGC131963 Clorfl81 ------- 染色體1開放閱讀框架181 --—. 141281.doc -69- 201022492 相對正規 化表現 常用名 基因符獍 描述 0.609 AAG6 ; PKCA ; PRKACA ; MGC129900 ; MGC129901 ; PKC-a PRKCA 蛋白激酶C,a 0.604 CGI-25 NOSIP 氧化氮合成酶相互作用卷白 0.602 FLJ20152 ; FLJ22155 ; FLJ22179 FLJ20152 其有序列相似性之家族134,成員 0.599 FRA3B ; AP3Aase FHIT 脆性組胺酸二合體某囡 0.596 WDR74 WDR74 wd 重複 FLF10439、FLJ21730 ;智人WD重 複域74(WDR74),χηΐ^Λ 0.595 E25A ; BRICD2A ITM2A 整合膜蛋6j2A " 0.587 HPF2 ZNF84 鋅指蛋白84 0.58 SEK ; HEK8 ; TYROl EPHA4 EPH受體A4 0.578 SID1 ; SID-1 ; FLJ20174 ; B830021E24Rik SIDT1 SID1跨膜家族,成員1 0.557 LTBP2 ; LTBP-3 ; pp6425 ; FLJ33431 ; FLJ39893 ; FLJ42533 ; FLJ44138; DKFZP586M2123 LTBP3 潛在轉型生長因子βΜ合蛋白3 0.556 V ; RASGRP ; hRasGRPl '» MGC 129998 ; MGC 129999 ; CALDAG-GEFI ; CALDAG-GEFII RASGRP 1 鳥苦酸釋放蛋白1(齊及DAG 0.546 TTF ; ARHH RHOH 0.545 LAT3 ; LAT-2 ; y+LAT-2 ; KIAA0245 ; DKFZp686K15246 SLC7A6 ----—^ /?又只 η :質,,家族7(陽離子胺基酸轉運 體,y+系統),杰^ ^ 0.541 TP120 CD6 CD6分子 一--- 0.537 MGC29816 CHMP7 CHMP 豕族, 0.53 DAGK ; DAGK1 ; MGC 12821 ; MGC42356 ; DGK-a DGKA ---------- 酿基甘油瀣输,a 8n 0.523 0.52 hly9 ; mLY9 ; CD229 ; SLAMF3 EMT ; LYK ; PSCTK2 ; MGC126257 ; MGC126258 LY9_ ITK ——_z_ u ου JcDa _'淋巴細胞抗雇Q ' -------- IL2-誘導性T細胎.也《& 141281.doc -70- 201022492
相對正規 化表現 常用名 基因符% 描述 0.519 TACTILE ; MGC22596 ; DKFZp667E2122 CD96 CD96分子 0.518 SEP2 ; SEPT2 ; KIAA0128 ; MGC16619 ; MGC20339 ; RP5-876A24.2 6-Sep 胞裂蛋白6 0.501 SCAP1 ; SKAP55 SCAP1 src激酶相關填蛋白1 --- 0.49 FLJ12884 ; MGC130014 ; MGC130015 C10orf38 -------- 染色艘10開放閱讀框架38 0.488 ΤΙ ; LEU1 CD5 CD5分子 ------- 0.487 MAL MAL mal,T細胞分化蛋白 0.484 SATB1 SATB1 SATB同源盒1 -- 0.48 LDH-H ; TRG-5 LDHB 乳酸去氫酶B --- 0.473 Ray ; FLJ39121 ; DKFZP586F1318 SH3YL1 --- 含SH3域’ Ysc84樣1(釀酒醏畨、 0.466 P19 ; SGRF ; IL-23 ; IL-23A ; IL23P19 ; MGC79388 IL23A —- 介白素23,α次單元ρΐ9 0.465 KE6 ; FABG ; HKE6 ; FABGL ; RING2 ; H2-KE6 ; D6S2245E ; dJ1033B10.9 HSD17B8 ------ 羥類固醇(17·β)去氫酶8 0.456 ARH ; ARH1 ; ARH2 ; FHCB1 ; FHCB2 ; MGC34705 ; DKFZp586D0624 LDLRAP1 —---- 低密度脂蛋白受體接附蛋白i 0.453 MGC45416 ; DKFZp686C03164 OCIAD2 含OCIA域2 0.451 CD172g ; SIRPB2 ; SIRP-B2 ; bA77C3.1 ; SIRPy SIRPB2 信號調節蛋白γ 0.435 GP40 ; TP41 ; Tp40 ; LEU-9 CD7 CD7分子 0.427 MGC15763 MGC 15763 含氧化還原酶NAD結合域1 0.41 AS160 ; DKFZp779C0666 TBC1D4 TBC1域家族,成員4 0.404 HMIC ; MANIC ; MAN1A3 ; pp6318 MAN1C1 甘露糖苷酶,a,1C類,成員1 0.401 Tp44 ; MGC 13 8290 CD28 CD28分子 0.394 FLJ12586 ZNF329 辞指蛋白329 141281.doc -71- 201022492 相對正规 化表現 常用名 基因符就 ------^ 描述 0.39 TCF-1 ; MGC47735 TCF7 轉錄因子7(T細胞特異性, 盒) 0.385 ABLIM ; LIMAB1 ; LIMATIN ; MGC1224 ; FLJ14564 ; ΚΙΑΑ0059 ; DKFZp781D0148 ABLIM1 ----- 肌動蛋白結合LIM蛋白1 0.383 NSE2 ; BCMP101 FAM84B 具有序列相似性之家族84, 0.377 TOSO FAIM3 Fas細胞凋亡抑制分子3 0.371 EEIG1 ; C9orfl32 ; MGC50853 ; bA203J24.7 C9orfl32 具有序列相似性之家族102厂 A 0.36 RIT1 ; CTIP2 ; CTIP-2 ; hRITl-α BCL11B -------- B細胞CLL/淋巴瘤11B(鋅指蛋白、 0.33 CLP24 ; FLJ20898 ; MGC111564 C16orf30 染色體16開放閱讀框架30 0.315 TCFla ; DKFZp586H0919 LEF1 ------ 淋巴強化子結合因子1 0.29 BLR2 ; EBI1 ; CD197 ; CDwl97 ; CMKBR7 CCR7 趨化激素(C-C基元)受體7 0.244 STK37 ; PASKIN ; KIAA0135 ; DKFZP434O051 ; DKFZp686P2031 PASK 含PAS域之絲胺酸/蘇胺酸激酶 0.205 NRP2 NELL2 NEL樣2(雞) 表71 : M3 · 1 PTB對比對照,在活動性TB中過度表示之基 因0 相對正规 化表現 常用名 基因符猇 描述 P22_l 5_PTBvCSelect_09 May08 PAL2Ttest UP M3.1 _ _ 17.93 MGC22805 ANKRD22 錨蛋白重複域22 ' 14.86 C1IN ; C1NH ; HAE1 ; HAE2 ; C1INH SERPING1 絲胺酸狀酶抑制子,分枝G(C1抑 制子),成員1(血管性水腫,遺傳 性) 9.425 cig5 ; vigl ; 2510004L01Rik RSAD2 含根本S-腺苷曱硫胺酸域2 8.938 BRESI1 ; MGC29634 EPSTI1 上皮基質相互作用1(乳房) 8.226 GS3686 ; Clorf29 IFI44L 干擾素誘導性蛋白44樣 7.566 GBP1 GBP1 鳥苷酸結合蛋白1,干擾素誘 性,67 kDa 5.677 p44 ; MTAP44 IFI44 干擾素誘導性蛋白44 141281.doc -72· 201022492
相對正規 化表現 常用名 基因符猇 描述 4.701 LAP ; PEPS ; LAPEP LAP3 白胺酸胺基肽酶3 4.401 IRG2 ; IFI60 ; IFIT4 ; ISG60 ; RIG-G ; CIG-49 ; GARG-49 IFIT3 具有三角形四肽重複之干擾素誘 導性蛋白3 4.091 OIAS ; IFI-4 ; OIASI OAS1 2',5'-寡腺苷酸合成酶卜40/46 kDa 3.947 plOO ; MGC133260 OAS3 券脲苷酸合成酶3,100kDa 3.944 G1P2 ; UCRP ; IFI15 G1P2 iSCil5泛素樣修飾子 3.915 UEF1 ; DRIF2 ; C7orf6 ; FLJ39885 ; KIAA2005 SAMD9L 含不育α基元域9樣 3.909 MMTRA1B PLSCR1 磷脂混雜酶1 3.792 XAF1 ; BIRC4BP ; HSXIAPAF1 BIRC4BP ΧΙΑΡ相關因子-1 3.731 RIGE ; SCA2 ; RIG-E ; SCA-2 ; TSA-1 LY6E 淋巴細胞抗原6複合物,某因座Ε 3.726 C7 ; IFI10 ; INP10 ; IP-10 ;crg-2 ; mob-1 ; SCYB10 ; gIP-10 CXCL10 趨化激素(C-X-C基元)位艚1〇 3.668 FBG2 ; FBS2 ; FBX6 ; Fbx6b FBX06 F盒蛋白6 3.652 RNF94 ; STAF50 ; GPSTAF50 TRIM22 含三聯基元22 3.619 LOC129607 LOCI 29607 假定蛋白LOC129607 3.419 ISGF-3 ; STAT91 ; DKFZp686B04100 STAT1 信號轉導子及轉錄活化子1,91 kDa 3.398 TRIP14 ; p590ASL OASL 2’-5'-寡腺苷酸合成峰檨 3.284 IFP35 ; FLJ21753 IFI35 干擾素誘導性蛋白35 3.154 LOC26010 ; DNAPTP6 ; DKFZp564A2416 DNAPTP6 病毒DNA聚合酶反式活化各 3.076 BAL ; BALI ; FLJ26637 ; FU41418 ; MGC:7868 ; DKFZp666B0810 ; DKFZp686M15238 PARP9 聚(ADP-核糖)聚合酶家施,ώ gQ 3.032 BAL2 ; KIAA1268 PARP14 聚(ADP-核糖)聚合酶家族,成員 14 2.977 RIG-B ; UBCH8 ; MGC40331 UBE2L6 泛素結合酶E2L6 2.839 ΑΡΤΙ ; PSF1 ; ABC17 ; ABCB2 ; RING4 ; TAP1N ; D6S114E ; FLJ26666 ; FLJ41500 ; TAP1*0102N TAPI 轉運體1,ATP結合卡匣,子族 B(MDRAAP) 141281.doc •73- 201022492 相對正規 化表現 常用名 基因符珑 描述 2.814 MX ; MxA ; IFI78 ; IFI-78K MX1 黏病毒(流感病毒)抗性1,干擾素 誘導性蛋白p78(小鼠) 2.632 IRF7 2.511 GCH ; DYT5 ; GTPCH1 ; GTP-CH-1 GCH1 GTP環水解酶1(多巴反應性肌張力 障礙) 2.434 9-27 ; CD225 ; IFI17 ; LEU13 IFITM1 干擾素誘導性跨膜蛋白1(9-27) 2.415 G10P2 ; IFI54 ; ISG54 ; cig42 ; IFI-54 ; GARG-39 ; ISG-54K IFIT2 具有三角形四肽重複之干擾素誘 導性蛋白2 2.414 Hied ; MDA5 ; MDA-5 ; IDDM19 ; MGC133047 IFIH1 干擾素誘導性解螺旋酶C域1 2.378 P113 ; ISGF-3 ; STAT113 ; MGC59816 STAT2 信號轉導子及轉錄活化子2,113 kDa 2.321 TL2 ; AP02L ; CD253 ; TRAIL ; Apo-2L TNFSF10 腫瘤壞死因子(配位體)超家族,成 員10 2.32 TEL2 ; TELB ; TEL-2 ETV7 ets變異基因7(TEL2致癌基因) 2.214 OIAS ; IFI-4 ; OIASI OAS1 2’,5*_暮腺苷酸合成梅1,40/46 kDa 2.206 APT2 ; PSF2 ; ABC 18 ; ABCB3 ; RING11 ; D6S217E TAP2 轉運體2,ATP結合卡匣,子族 B(MDR/TAP) 2.134 MGC78578 OAS2 2'-5'-寡腺苷酸合成酶2,69/71 kDa 2 VRK2 VRK2 牛痘相關激酶2 1.975 PN-I ; PSN1 ; UMPH ; UMPH1 ; Ρ5Ή-1 ; cN-III ; MGC27337 ; MGC87109 ; MGC87828 NT5C3 5’-核苷酸酶,胞質III 1.895 RNF88 ; TRIM5a TRIM5 含三聯基元5 1.89 CGI-34 ; PNAS-2 ; C9orf83 ; HSPC177 ; SNF7DC2 CHMP5 染色質修飾蛋白5 1.863 ZC3H1 ; PARP-12 ; ZC3HDC1 ; FLJ22693 PARP12 聚(ADP-核糖)聚合酶家族,成員 12 1.845 PKR ; PRKR ; EIF2AK1 ; MGC126524 EIF2AK2 真核轉譯起始因子2-α激酸2 1.842 90K ; MAC-2-BP LGALS3BP 凝集素’半乳糖苷結合,可溶,3 結合蛋白 1.807 RNF88 ; TRIM5a TRIM5 含三聯基元5 " ' 1.743 C15 ; onzin PLAC8 胎盤特異性8 1.732 p48 ; IRF9 ; IRF-9 ; ISGF3 ISGF3G 干擾素刺激之轉錄因子3,γ 48 kDa 1.713 CD317 BST2 骨髓基質細胞抗原2 141281.doc -74- 201022492
相對正規 化表現 常用名 基因符號 描述 1.665 ESNA1 ; ERAP140 ; FLJ45605 ; MGC88425 ; Nbla00052 ; Nblal0993 ; dJ187J11.3 NCOA7 核受體輔活化子7 1.649 FLJ39275 ; MGC131926 ZNFX1 鋅指,含NFX1型1 1.628 VODI ; IFI41 ; IFI75 ; FLJ22835 SP110 SP110核體蛋白 1.627 EFP ; Z147 ; RNF147 ; ZNF147 TRIM25 '*---- 含三聯基元25 1.523 NMI NMI 「N-myc(及STAT)相互作用子^ 1.505 TRAP ; KIAA1529 ; PCTAIRE2BP ; RP11-508D10.1 TDRD7 含tudor域7 1.499 DSH ; G1P1 ; IFI4 ; pi36 ; ADAR1 ; DRADA ; DSRAD ; IFI-4 ; K88dsRBP ADAR 腺苷去胺酶,RNA特異性 1.494 Cl GALT ; T-合成酶 C1GALT1 核心1合成梅,糖蛋白-N-乙酿半乳^ 糖胺3-β-半乳糖基轉移酶,1 1.478 PHF11 1.461 SCOTIN SCOTIN scotin 1.433 FLJ00340 ; FLJ34579 ; DKFZp686E07254 SPIOO SP100核抗原 1.415 FLJ45064 AGRN 集聚蛋白 1.351 NFTC ; OEF1 ; OEF2 ; C7orf5 ; FLJ20073 ; KIAA2004 SAMD9 含不育α基元域9 1.26 MEL ; RAB8 RAB8A RAB8A,RAS致癌基因家族成員_ 1.215 6-16 ; G1P3 ; FAM14C ; IFI616 ; IFI-6-16 G1P3 干擾素α誘導性蛋白6 表7J : M3.2 PTB對比對照,在活動性TB中過度表示之基 因0 相#正规 化表現 常用名 基因符就 ------ ----- 描述 Ρ22 15 PTBvCSelect 09 May08 PAL2Ttest UP M3.2 2.767 MGC20461 OSM 制瘤素Μ 2.202 FHL4 ; HLH4 ; HPLH4 STX11 融合 141281.doc -75- 201022492 相對正规 化表現 常用名 基因符我 描述 2.136 LPCAT2 ; FLJ20481 ; LysoPAFAT ; DKFZp686H22112 AYTL1 醯基轉移酶樣1 1.987 UP ; UPP ; UPASE ; UDRPASE UPP1 尿苷磷酸化酶1 1.969 IL-1 ; IL1F2 ; ILl-β IL1B 介白素1,β 1.886 SAT ; DC21 ; KFSD ; SSAT ; SSAT-1 SAT 牙精胺/精胺Ν1-乙醢基轉移酶1 1.862 PFK2 ; IPFK2 PFKFB3 6-磷酸果糖-2-激酶/果糖-2,6-雙磷 酸酶3 1.755 BB2 ; CD54 ; P3.58 ICAM1 細胞間黏附分子1(CD54),人類 鼻病毒受體 1.742 BCL4 ; D19S37 BCL3 B細胞CLL/淋巴瘤3 1.695 KRML ; MGC43127 MAFB v-maf^L腱膜纖維肉瘤致癌基因同 源物B(禽類) 1.686 SRPSOX ; CXCLG16 ; SR-PSOX CXCL16 趨化激素(C-X-C基元)S&位體16 1.658 B3GN-T5 ; p3Gn-T5 B3GNT5 UDP-GlcNAc:pGal β-1,3-Ν-乙醯 胺基葡萄糖轉移酶5 1.62 MLA1 ; ME491 ; LAMP-3 ; OMA81H ; TSPAN30 CD63 CD63分子 1.562 P21 ; CIP1 ; SDI1 ; WAF1 ; CAP20 ; CDKN1 ; MDA-6 ; P21CIP1 CDKN1A 細胞週期素依賴性激酶抑制子 1Α(ρ21 > Cipl) 1.548 URAX1 ; TAIP-3 ; FAM130B ; DKFZp566F164 AXUD1 AXIN1上調1 1.542 NHE8 ; FLJ42500 ; KIAA0939 ; MGC138418 ; DKFZp686C03237 SLC9A8 溶質載體家族9(納/氫交換子),成 員8 1.542 GS ; GLNS ; PIG43 GLUL 麩胺酸-氨連接酶(麩醯胺酸合成 酶) 1.504 CD87 ; UPAR ; URKR PLAUR 纖維溶酶原活化子,尿激酶受艚 1.474 PBEF ; NAMPT ; MGC117256 ; DKFZP666B131 ; 1110035014Rik PBEF1 前B細胞群落增強因子1 1.472 P47 ; FLJ27168 PLEK 血小板-白血球C激酶受質 1.45 GNA16 GNA15 鳥嘌呤核苷酸結合蛋白(G蛋白fT a 15(Gq 類) 141281.doc -76- 201022492 ❹ 相對正規 化表現 常用名 基因符猇 描述 1.435 FTH ; PLIF ; FTHL6 ; PIG15 ; MGC104426 FTH1 鐵蛋白,重多肽1 1.42 MGC14376 ; MGC149751 ; DKFZp686O06159 MGC14376 假定蛋白MGC14376 1.395 NER ; UNR ; LXRB ; LXR-b ; NER-I ; RIP 15 NR1H2 核受體子族1,組Η,成員2 1.39 TTP ; G0S24 ; GOS24 ; TIS11 ; NUP475 ; RNF162A ZFP36 鋅指蛋白36,C3H型,同源物(小 鼠) 1.389 E4BP4 ; IL3BP1 ; NFIL3A ; NF-IL3A NFIL3 核因子,介白素3調節 1.328 C8FW ; GIG2 ; SKIP1 TRIB1 tribbles同源物1 (果绳) 1.296 ARI ; HARI ; HHARI ; UBCH7BP ARIH1 ariadne同源物,泛素結合酶E2結 合蛋白,1(果蝇) 1.272 FRA2 ; FLJ23306 FOSL2 FOS樣抗原2 1.269 RIT ; RIBB ; ROC1 ; MGC 125864 ; MGC 125865 RIT1 ~ 1 丨_ Ras 樣無 CAAX 1 1.25 RBT1 SERTAD3 含 SERIAL ~~~---- 1.227 MAPKAPK2 MAPKAPK2 1.217 PPG ; PRG ; PRG1 ; MGC9289 ; FLJ12930 PRG1 絲甘蛋白聚糖 1.181 SEI1 ; TRIP-Brl SERTAD1 含 SERTA 域 1 '~~~~~---_ 1.172 CMT2 ; KIAA0110 ; MGC11282 ; RP1-261G23.6 MAD2L1BP " --- MAD2L1結合蛋白 1.169 UBP ; SIH003 ; MGC 129878 ; MGC 129879 USP3 ------ 泛素特異性狀酶3 表7K 因。 :M3.3 PTB對比對照,在活動性TB中過度表示 t 、之基 相對正规 化表現 常用名 基因符珑 ---^^ 描述 P22_l 5_PTBvCSelect_09 May08 PAL2Ttest UP M3.3 ~ ------ 3.651 MAYP ; MGC34175 PSTPIP2 =蛋絲白胺 141281.doc -77- 201022492 相對JL規 化表現 常用名 基因符统 描述 3.2 Tiff66 ; MGC116930 ; MGC116931 ; MGC116932 ; MGC116933 VNN1 vanin 1 2.604 Rsc6p ; BAF60C ; CRACD3 ; MGC111010 SMARCD3 SWI/SNF相關,基質相關,染色 質之肌動蛋白依賴性調節子,子 族d,成員3 2.157 FER1L1 ; LGMD2B ; FLJ00175 ; FLJ90168 DYSF dysferlin,肢帶肌肉萎縮症2B(艘 染色體隱性) 2.091 ASRT5 ; IRAKM ; IRAK-M IRAK3 介白素1受體相關激酶3 2.082 p6 ; CAGC ; CGRP ; MRP6 ; CAAF1 ; ENRAGE S100A12 S100妈結合蛋白A12 1.888 CGI-44 SQRDL 硫醚绲還原酶樣(酵母) 1.819 FAM31A ; FLJ38464 ; KIAA1608 ; RP11-230L22.3 DENND1A 含 DENN/MADD域 1A 1.736 APG3 ; APG3L ; PC3-96 ; FU22125 ; MGC15201 ; DKFZp564M1178 ATG3 ATG3自體吞嗟相關3同源物(磙酒 酵母) 1.715 CAT1 CRAT 肉鹼乙醯基轉移酶 1.703 MGC2654 ; FLJ12433 MGC2654 染色體16開放閱讀框架68 1.7 MD-2 LY96 淋巴細胞抗原96 1.695 AD3 ; VRP ; HBLP1 TBC1D8 TBC1域家族’成員8(具有gram 域) 1.663 FLJ20424 C14orf94 染色體14開放閱讀框架94 1.638 P28 ; GSTTLp28 ; DKFZp686H13163 GSTOl 麩胱甘肽S轉移酶ω 1 1.635 ATRAP ; MGC29646 AGTRAP 血管緊張素II受體相關蛋白 1.572 FAT ; GP4 ; GP3B ; GPIV ; CHDS7 ; PASIV ; SCARB3 CD36 CD36分子(血小板反應蛋白夸骽、 1.547 El ; LEI ; PI2 ; MNEI ; M/NEI ; ELANH2 SERPINB1 絲胺酸肽酶抑制子,分枝 蛋白),成員1 1.546 RAB32 RAB32 RAB32 ’ rajs致癌基因突施忐 1.541 CR3A ; MOIA ; CD11B ; MAC-1 ; MAC1A ; MGC117044 ITGAM — 整合素αΜ(補體組份3受體3次 元) 1.481 ALFY ; ZFYVE25 ; KIAA0993 ; MGC 16461 WDFY3 ---— 含WD重複及fyvf^^ ----1 141281.doc ·78· 201022492
相對正規 化表現 常用名 基因符珑 —---- 描述 1.467 ARHU ; WRCH1 ; hG28K ; CDC42L1 ; FLJ10616 ; DJ646B12.2 ; fJ646B12.2 RHOU ras同源物基因窄故,&STT 1.459 SELR ; SELX ; MSRB1 ; HSPC270 ; MGC3344 SEPX1 硒蛋白X , 1 1.432 LTA4H LTA4H 白二烯A4水觝崎 1.409 VMP1 ; DKFZP566I133 TMEM49 跨膜蛋^ 49 1.405 MGC33054 SNX10 分類連接蛋白1〇 1.376 STX3A STX3A Γ"突觸融合蛋白3 1.369 TTG2 ; RBTN2 ; RHOM2 ; RBTNL1 LM02 JILIM域2(Τ細胞原癌基因樣1) 1.368 DBI ; IBP ; MBR ; PBR ; BZRP ; PKBS ; PTBR ; mDRC ; pkl8 BZRP 轉運蛋白(18 kDU 1.361 CRE-BPA CREB5 cAMP反應性元件結合蛋白5 1.344 MAY1 ; MGC49908 ; nPKC-δ PRKCD 蛋白激酶C,δ 1.341 AAA ; ADI ; PN2 ; ABPP ; APPI ; CVAP ; Αβ ; CTFy APP 類澱粉β(Α4)前驅體蛋白(肽酶連接 蛋白II,阿茲海默氏病(Alzheimer disease)) 1.333 CRFB4 ; CRF2-4 ; D21S58 ; D21S66 ; CDW210B ; IL-10R2 IL10RB 介白素10受體,β 1.31 DCIR ; LLIR ; DDB27 ; CLECSF6 ; HDCGC13P CLEC4A C型凝集素域家族4,成員a 1.304 HUFI-2 ; FLJ20248 ; FLJ22683 ; DKFZp434H2035 LRRFIP2 白胺酸富集重複(於FLII中)相互作 用蛋白2 1.301 C32 ; CKLF1 ; CKLF2 ; CKLF3 ; CKLF4 ; UCK-1 ; HSPC224 CKLF 趨化激素樣因子 1.289 ACSS2 1.265 ESP-2 ; HED-2 ZYX 斑聯蛋白 1.263 SH3BGR ; MGC117402 SH3BGRL SH3域結合麩胺酸富集蛋白樣 1.239 MTX ; MTXN MTX1 metaxin 1 1.237 ASC ; TMS1 ; CARD5 ; MGC10332 PYCARD 含PYD及CARD域 141281.doc -79- 201022492 相對正規 化表現 常用名 基因符被 描述 1.233 a3 ; Stvl Vphl ; Atp6i ; OC116 ; OPTB1 ; TIRC7 ; ATP6N1C ; ATP6V0A3 ; OC-116 kDa TCIRG1 '^™·1----- τ細胞,免疫調節子】,ATPase, H+轉運,溶酶體v〇次簞开μ 1.223 JTK8 ; FLJ26625 LYN ν-yes-l 楊氏肉瘤(Yamaguehi _ sarcoma)病毒相關致癌篡闵同洱物 1.209 GAIP ; RGSGAIP RGS19 υ蛋白信號轉導之調節早1() 1.186 NEU ; SIAL1 NEU1 唾液酸酶- 表7L : Μ3·4 PTB對比對照,在活動性TB中不足表示之基 因0 相對正规 化表現 常用名 基因符琥 描述 P22 15 PTBvCSelect 09 May08 PAL2Ttest DOW N M3.4 0.921 ZZZ4 ; FLJ10821 ; FLJ45574 ; KIAA0399 ZZEF1 辞指,具有EF手域之ΖΖΐΠ 0.905 TILZ4a ; TILZ4b ; TILZ4c ; KIAA0669 TSC22D2 TSC22域家族,成員2 0.891 XTP2 ; BAT2-iso BAT2D1 一谷 ΒΑΤ2 域 1 -- 0.885 U2AF65 U2AF2 U2小核RNA輔助因子f 0.878 DKFZp781I24156 PCNP 含PEST蛋白水解信號之核蛋白 0.876 NY-CO-1 ; FLJ10051 SDCCAG1 血清學定義之結腸癌抗原1 0.868 GCP16 ; HSPC041 ; MGC4876 ; MGC21096 ; GOLGA3AP1 GOLGA7 高爾基體自號抗原,高爾基體蛋 白子族a,7 0.866 CPR3 ; DJA2 ; DNAJ ; DNJ3 ; RDJ2 ; HIRIP4 ; PRO3015 DNAJA2 DnaJ(Hsp40)同源物,子族a,成 員2 0.863 B2-1 ; SEC7 ; D17S811E ; FLJ34050 ; FLJ41900 ; CYTOHESIN-1 PSCD1 血小板-白血球C激酶受質同源 性’ Sec7及捲曲螺旋域1(細胞附著 蛋白1) 0.855 SRrp86 SRrp508 ; MGC133045 ; DKFZp564B176 SFRS12 剪接因子,富集精胺酸/絲胺酸12 0.84 G3BP2 G3BP2 GTPase活化蛋白(SH3域)結合蛋白 2 141281.doc •80- 201022492
相對正規 化表現 常用名 基因符覿 描述 0.831 p532 ; p619 HERC1 hect(與E6-AP(UBE3A)羧基末端同 源)域及 RCC1 (CHC1)樣域(RLD)l 0.826 DKFZP564O0523 ; HSPC304 ; DKFZp686D1651 DKFZP564 00523 假定蛋白 DKFZp564O0523 0.823 TSPYL TSPYL1 TSPY 樣 1 0.82 KIP1 ; MEN4 ; CDKN4 ; MEN1B ; P27KIP1 CDKN1B 細胞週期素依賴性激酶抑制子 1Β(ρ27 « Kipl) 0.82 SA2 ; SA-2 ; FLJ25871 ; bA51701.1 ; DKFZp686P168 ; DKFZp781H1753 STAG2 基質抗原2 0.815 HR21 ; MCD1 ; NXP1 ; SCC1 ; hHR21 ; HRAD21 ; FLJ25655 ; FLJ40596 ; KIAA0078 RAD21 RAD21同源物(粟酒裂殖酵母) 0.808 GCC185 ; KIAA0336 GCC2 含GRIP及捲曲螺旋域2 0.806 PIR1 DUSP11 雙特異性磷酸酯酶11 (RNA/RNP複 合物1-相互作用) 0.804 AS3 ; CG008 ; PDS5B ; FLJ23236 ; KIAA0979 ; RP1-267P19.1 APRIN 雄激素誘導性增生抑制子 0.803 LOC58486 0.798 SLTM 0.795 AS ; ANCR ; E6-AP ; HPVE6A ; EPVE6AP ; FLJ26981 UBE3A 泛素蛋白連接酶E3A(人類乳頭狀 瘤病毒E6相關蛋白,安氏症候群 (Angelman syndrome)) 0.793 DKFZp686C1054 THUMPD1 含THUMP域1 0.791 SIR2L1 SIRT1 去乙酿化酶(sirtuin)(沉默配合型資 訊調節2同源物)1(酸酒酵母) 0.79 FLJ40359 TPP2 三肽基肽酶II 0.789 DKFZP564D172 C5orf21 染色體5開放閲讀框架21 0.788 PALBH ; CALPAIN7 ; FU36423 CAPN7 妈蛋白酶7 0.775 KIAA1116 RBM16 RNA結合基元蛋白16 0.771 FLJ42355 ; KIAA0276 DCUN1D4 DCN1 ’清選蛋白類泛素化修飾缺 陷1,含域4(釀酒酵母) 0.768 Rhe ; FLJ33619 ; DKFZp586K0717 FIP1L1 FIP1樣1(釀酒酵母) 0.766 RCP9 ; RCP ; CRCP ; CGRP-RCP ; MGC111194 RCP9 降血鈣素基因相關肽受體組份蛋 白 141281.doc • 81 · 201022492 相對正規 化表現 常用名 基因符猇 描述 0.764 DIF3 ; LZK1 ; DIF-3 ; LCRG1 ; ZFP403 ; FLJ21230 ; FLJ22561 ; FLJ42090 ZNF403 鋅指蛋白403 0.76 AD013 ; CReMM ; KISH2 ; PRIC320 CHD9 染色質域解螺旋酶DNA結合蛋白9 0.757 VACM1 ; VACM-1 CUL5 清選蛋白5 0.755 MGC13407 NUP54 核孔蛋白54kDa 0.751 ΕΝΤΉ ; EPN4 ; EPNR ; CLINT ; EPSINR ; KIAA0171 ΕΝΤΗ 内涵蛋白相互作用子1 0.743 SEC24B SEC24B SEC24相關基因家族,成員B(釀酒 酵母);同義詞:SEC24、 MGC48822;同功異型物a係由轉 錄物變異體1編碼;分泌蛋白24 ; Sec24相關蛋白B ;蛋白轉運蛋白 Sec24B ;智人SEC24相關基因家 族,成員B(釀酒酵母)(SEC24B), 轉錄物變異體1,mRNA 0.742 HAKAI ; RNF188 ; FLJ23109 ; MGC163401 ; MGC163403 CBLL1 Cas-Br-M(鼠類)親嗜性逆轉錄病毒 轉型序列樣1 0.738 XE7 ; 721P ; XE7Y ; CCDC133 ; CXYorfi ; DXYS155E ; MGC39904 ; MGC125365 ; MGC125366 DXYS155E 剪接因子’富集精胺酸八綵胺酸 17A 0.737 NGB ; CRFG ; FLJ10686 ; FLJ10690 ; FLJ39774 GTPBP4 GTP結合蛋白4 0.734 VELD ; LIN-7C ; MALS-3 ; LIN-7-C ; FLJ11215 LIN7C lin·7 同源物C(線蟲(C. 0.732 JTK5 ; RYK1 ; JTK5A ; D3S3195 RYK RYK受體樣酪胺酸激酶 0.731 K10 ; KPP ; CK10 KRT10 角蛋白10(表皮松解性角化過度 症;掌疏角化症) 0.728 CYP-M ; MGC22229 CYP20A1 細胞色素P450,家族20,子族A, 多肽1 0.725 CHP1 CHORDC1 含半胱胺酸及組胺酸富集域 (CHORD)l 0.724 NET1A ; ARHGEF8 NET1 神經上皮細胞轉型基因1 I4I281.doc -82 - 201022492
相瓣正規 化表現 常用名 基因符% 描述 0.723 ZF5 ; ZBTB14 ; ZNF478 ; MGC126126 ZFP161 鋅指蛋白161同源物(小鼠) 0.718 JAK1A ; JAK1B JAK1 詹納斯氏激酶1(蛋白酪胺酸激酶) 0.717 p5 ; p6 ; RRP45 ; PMSCL1 ; Rrp45p ; PM/Scl-75 EXOSC9 外來體組份9 0.716 GR ; GCR ; GRL ; GCCR NR3C1 核受體子族3,組C,成員1(糖皮 質激素受體) 0.713 L9mt MRPL9 粒線體核糖體蛋白L9 0.705 GRB1 ; p85-a PIK3R1 磷酸肌醇-3-激酶,調節次單元 l(p85 a) 0.7 MST4 ; MASK MASK 絲胺酸/蘇胺酸蛋白激酶MST4 0.7 UPF3 ; HUPF3A ; RENT3A UPF3A 無義轉錄物同源物之UPF3調節子 A(酵母) 0.698 pi7 ; YBL1 ; CHRAC17 ; CHARAC17 POLE3 聚合酶(DNA引導),ε3(ρ17次單一 元) 0.694 PCGF4 ; RNF51 ; MGC12685 PCGF4 ΒΜΙ1多梳環指致癌基因 0.692 MIF2 ; CENPC ; hcp-4 ; CENP-C CENPC1 著絲點蛋白C1 0.686 YAF9 ; GAS41 ; NUBI-1 ; 4930573H17Rik ; B230215M10Rik YEATS4 含YEATS域4 0.679 R3HDM ; FLJ23334 ; KIAA0029 R3HDM1 含R3H域1 0.676 FBX21 ; FU90233 ; KIAA0875 ; MGC26682 ; DKFZp434G058 FBX021 F盒蛋白21 0.665 GRIPE ; TULIP1 ; KIAA0884 ; DKFZp566D133 ; DKFZp667F074 GARNL1 GTPase 活化 Rap/RanGAP 域樣 1 0.663 BRL ; BRPF1 ; BRPF2 ; DKFZp686F0325 BRD1 含溴域1 0.651 TIFIA ; MGC104238 ; DKFZp566E104 RRN3 RRN3 RNA聚合酶I轉錄百罕 物(釀酒酵母) ' 0.65 DKFZP586L0724 NOL11 蛋白 11 ' -— 0.645 FLJ20628 , DKFZp564I2178 FLJ20628 假定蛋白FLJ20628 0.642 FLJ21657 ; MGC90226 ; MGC 149524 FLJ21657 -------- 染色體5開放閱讀框架28 141281.doc -83 - 201022492 相對正規 化表現 常用名 基因符我 ----- 描述 _____--- 0.638 NS3TP1 ; FLJ20752 ; NBLA00058 ASNSD1 含天冬醯胺合成酶冷— 0.636 MEX3C ; ΒΜ-013 ; MEX-3C ; RNF194 ; FLJ38871 RKHD2 含環指及KH域2__一 0.628 Ε6ΒΡ ; ERC55 ; ERC-55 RCN2 内質網鈣結合蛋白2,手的結合 域 0.613 PHLL1 CRY1 隱花色素基因K光解酶樣) 0.612 cdcl4 ; hCDC14 ; Cdcl4Al ; Cdcl4A2 CDC14A CDC14細胞分裂週期I4同源物 A(釀酒酵母) 0.576 LCA ; LY5 ; B220 ; CD45 ; T200 ; GP180 PTPRC 蛋白酪胺酸填酸酯酶,受體型’ C 0.521 PBF ; PRF1 ; HDBP2 ; PRF-1 ; Si-1-8-14 ; DKFZp434K1210 ZNF395 鋅指蛋白395 表7M : M3.6 PTB對比對照,在活動性TB中不足表示之基 因0 相對正規 化表現 常用名 基因符ft 描述 P22 15 PTBvCSelect 09 May08 PAL2Ttest DOW N M3.6 0.898 ABHS ; ORF20 ; TTDN1 C7orfll 染色體7開放閱讀框架11 0.852 BTF2 ; TFIIH GTF2H1 一般轉錄因子IIH,多肽1, 0.845 MGC51029 FUNDC1 含 FUN14 域 1 -- 0.844 SCOCO ; HRIHFB2072 SCOC 短捲曲螺旋蛋白 0.839 IF_3mt,IF3(mt) MTIF3 粒線體轉譯起始因子3 ~一一 0.816 DABl ; MPRP-1 ; YKR087C ; ZMPOMA1 ; FLJ33782 ; 2010001009Rik OMA1 同源物’鋅金屬狀酶(酿酒 0.815 LOC644560 ------- 0.795 JNKK ; MEK4 ; MKK4 ; SEK1 ; JNKK1 ; SERK1 ; MAPKK4 ; PRKMK4 MAP2K4 -----S 有絲分裂原活化蛋白淑崎i 0.775 REPA2 ; RPA32 RPA2 複製蛋白A2,- 141281.doc -84· 201022492
相對正規 化表現 常用名 基因符我 描述 0.765 AMMERC1 AMMECRl 阿爾伯特症候群(Alp〇ri syndrome),智力遲鈍,中間面發 育不全及概圓形紅血球性貧i染 色艎區,基因1 ' 0.741 CBX ; M31 ; MODI ; ΗΡ1-β ; ΗΡΙΗ-β CBX1 染色盒同源物1(ΗΡ1β同源物,果 蠅) 0.739 DLTA ; PDCE2 ; PDC-E2 DLAT 二風硫辛酿胺S-乙醯基轉移酶(丙 酮酸去氫酶複合物之Ε2組份) 0.732 p38 ; AHA1 ; C14orf3 AHSA1 ΑΗΑ1 ’ 熱休克90 kDa蛋白 ATPase 同源物之活化子1(酵母) 0.731 VEZATIN ; DKFZp761C241 VEZT — . vezatin ’黏著接合跨膜蛋白 0.728 HDPY-30 LOC84661 dpy-30樣蛋白 0.727 DERP6 ; MST071 ; HSPC002 ; MSTP071 C17orf81 染色體17開放閱讀框架81 0.723 EFG ; GFM ; EFG1 ; EFGM ; EGF1 ; hEFGl ; COXPD1 ; FLJ12662 ; FLJ13632 ; FLJ20773 GFM1 G延長因子,粒線體1 0.721 MGC3232 ; hAtNOSl ; mAtNOSl C4orfl4 染色體4開放閱讀框架14 0.72 P15RS ; FLJ10656 ; MGC19513 P15RS ---- 假定蛋白FLJ10656 0.719 MGC9912 C14orfl26 染色體14開放閱讀框架126 ~'一· 0.704 CCR4 ; KIAA1194 CNOT6 CCR4-NOT轉錄複合物, 0.7 PRED31 ; HSPC230 ; FLJ34245 ; RP 11-5919.1 C6orf203 ------ 染色體6開放閱讀框架203 0.696 76P ; GCP4 76P γ微管蛋白環狀複合物至^^~ 0.694 FLJ10422 ELP3 延長蛋白3同源物(釀酒 0.677 MGC13379 MGC13379 HSPC244 --- 0.677 CCTE ; KIAA0098 ; CCT-ε ; TCP-1-ε CCT5 --~~~~-—- 含伴侣蛋白之TCP1,次單亓.Vp、 0.675 MTMR12 .. 0.671 ABRA1 ; FLJ11520 ; FLJ12642 ; FLJ13614 FLJ13614 含捲曲螺旋域98 0.671 CDG1 ; CDGS ; CDGla PMM2 磷酸甘露糖酶2 一- 0.646 TPA1 ; FLJ10826 ; KIAA1612 OGFOD1 -氧化戊二酸鹽及鐵 酶域1 0.641 HV1 ; MGC15619 MGC15619 氫電壓閘控通道1 - 0.639 JJJ3 ; ZCSL3 ZCSL3 DPH4,JJJ3同源物(釀鎘系纪-- 141281.doc -85- 201022492 相對正規 化表現 常用名 基因符垅 描述 0.631 GI008 ; RPMS13 ; MRP-S13 ; MRP-S26 ; ΝΥ-BR-87 ; C20orfl93 ; dJ534B8.3 MRPS26 粒線體核糖體蛋白S26 0.63 RPMS6 ; MRP-S6 ; C21orfl01 MRPS6 粒線體核糖體蛋白% 0.622 CGI-55 ; CHD3IP ; HABP4L ; PAIRBP1 ; FLJ90489 ; PAI-RBP1 ; DKFZp564M2423 SERBP1 SERPINE1 mRNA 結合蛋白 1 0.621 MRP-S14 ; HSMRPS14 ; DJ262D12.2 MRPS14 粒線體核糖體蛋白S14 0.542 LOCI53364 ; MGC46734 ; DKFZp686P15118 LOC153364 類似於金屬-β-内醯胺酶超家族蛋 白
表7N : Μ3·7 PTB對比對照,在活動性TB中不足表示之基 因0 相對正规 化表現 常用名 基因符猇 描述 Ρ22 15 PTBvCSelect 09 May08 PAL2Ttest DOW N M3.7 0.914 R^D ; CSA2 ; MGC59741 ; IK蛋白 IK - ---------- IK細胞激素,HLAII之下調子 0.875 IBP DEF6 於FDCP 6同源物中差異表現(小~~~ 0.861 NAT3 ; dJ1002M8.1 NAT5 N-乙醯基轉移酶5 0.857 OFOXD ; OFOXD1 ; FLJ20308 ALKBH5 alkB,烷基化修復同源物5(大^ 菌) 0.848 H-IDHB ; MGC903 ; FLJ11043 IDH3B 異檸檬酸去氫酶3(ΝΑϋ+)β 0.846 PGR1 ; PAM14 MRFAP1 Mof4家族相關蛋白1 0.845 B17.2 ; DAP13 NDUFA12 NADH去氫酶(泛醗)1 α子複合物, 12 0.836 MGC11134 TRPT1 tRNA麟酸轉移酶1 0.832 H-l(3)mbt-l L3MBTL2 l(3)mbt 樣 2(果绳) 0.831 HSCARG ; FLJ25918 HSCARG 含NmrA樣家族域1 0.817 ABC27 ; ABC50 ABCF1 ATP結合卡匣,子族f(GCN20),成 員1 0.816 LOC124512 LOC124512 假定蛋白LOC124512 0.815 HSPC203 C14orfll2 染色體14開放閱讀框架112 141281.doc -86 · 201022492
相對正規 化表現 常用名 基因符猇 描述 0.814 EXOSC1 EXOSC1 外來體組份1 ;同義詞:pl3、 CSL4、SKI4、Csl4p、Ski4p、 hCsl4p 、 CGI-108 ' RP11-452K12.9 ;酵母外來體核心蛋白 CSL4之同源物;3W核糖核酸外切 酶CSL4同源物;CSL4外來體核心 蛋白同源物;智人外來體組份 l(EXOSCl) > mRNA 0.81 pl4 ; DOC-1R ; FLJ10636 CDK2AP2 CDK2相關蛋白2 0.81 MGC14833 ; bA6B20.2 C6orfl25 染色體6開放閱讀框架125 0.809 SRP68 SRP68 信號識別顆粒68 kDa 0.805 MGC3320 ; FLJ14936 ; RP5-965L7.1 PRPF38A 含PRP38前mRNA加工因子38(酵母) 域A 0.805 DBP-RB ; UKVH5d DDX1 DEAD(Asp-Glu-Ala-Asp)盒多肽 1 0.804 ACRP ; FSA-1 ; MGC20134 SPAG7 精子相關抗原7 0.802 MDHA ; MOR2 ; MDH-s ; MGC:1375 MDH1 蘋果酸去氫酶1,NAD(可溶) 0.801 MDS016 ; RPMS21 ; MRP-S21 MRPS21 粒線體核糖體蛋白S21 0.8 AIBP ; MGC119143 ; MGC119144 ; MGC119145 APOA1BP 脂蛋白元A-Ι結合蛋白 0.8 ERV29 ; FLJ22993 ; MGC102753 SURF4 飲食過度抗體4 0.797 MGC874 CXorf26 染色體X開放閱讀框架26 0.795 FLJ22789 C12orf26 染色體12開放閱讀框架26 0.795 RC68 ; INT11 ; RC-68 ; INTS11 ; CPSF73L ; FLJ13294 ; FLJ20542 CPSF3L 裂解及聚腺嘌呤特異性因子3樣 0.793 HSPC196 HSPC196 跨膜蛋白138 0.79 DS-1 ICT1 未成熟結腸癌轉錄物1 0.789 SIAHBP1 ; FIR ; PUF60 ; RoBPI ; FLJ31379 SIAHBP1 融合結合蛋白相互作用抑制體 0.788 bMRP36a ; MGC17989 ; MGC48892 MRPL43 粒線體核糖體蛋白L43 0.788 HIT-17 HINT2 組胺酸三合艘核苷酸結合蛋白2 0.785 MGC2714 ; FLJ32431 DCUN1D5 DCN1 ’清選蛋白類泛素化修飾缺陷 1,含域5(釀酒酵母) 0.784 WDC146 ; FLJ11294 WDR33 WD重複域33 0.775 N27C7-4 ; MGC70831 C22orfl6 染色體22開放閲讀框架16 141281.doc -87 - 201022492 相對正规 化表現 常用名 基因符親 描述 0.774 LOC653709 0.772 CGI-138 ; HSPC329 ; MRP-S23 MRPS23 粒線體核糖體蛋白S23 0.769 P54 ; NMT55 ; NRB54 ; P54NRB ΝΟΝΟ 含非POU域,八聚體結合 0.764 NSE2 ; MMS21 ; C8orf36 ; FLJ32440 C8orf36 非SMC元件2,MMS21同源物(醸酒 酵母) 0.764 C8orf40 C8orf40 染色體8開放閱讀框架40 0.763 FLJ31795 CCDC43 含捲曲螺旋域43 0.755 NSE1 NSMCE1 非SMC元件1同源物(釀酒酵母) 0.753 MY105 ; THY28 ; MDS012 ; HSPC144 ; THY28KD ; MGC12187 THYN1 胸腺細胞核蛋白1 0.752 YSA1H ; hYSAHl NUDT5 nudix(二磷酸核苷連接之部分X)型_ 基元5 _ 0.751 TOK-1 BCCIP BRCA2及CDKN1A相互作用蛋白 0.747 VARSL ; VARS2L ; MGC138259 ; MGC142165 VARSL 異纈草胺醯基-tRNA合成酶2,粒線 體(推定) 0.732 FLJ13657 ; RP11-337A23.1 C9orf82 染色體9開放閱讀框架82 0.728 GLOD2 MCEE 曱基丙二醯基CoA差向異構酶 0.728 C40 C2orf29 染色體2開放閱讀框架29 0.726 MGC12966 MGC12966 假定蛋白LOC84792 ;智人假定蛋白 LOC84792(MGC12966) > mRNA 0.722 FLJ14803 FLJ14803 假定蛋白FLJ14803 0.717 HSPC335 ; MRP-S24 MRPS24 粒線體核糖體蛋白S24 _ 0.716 RALBP1 REPS1 含RALBP1相關Eps域1 0.712 CAF1 ; hCAF-1 CNOT7 CCR4-NOT轉錄複合物,次單元7 1 0.711 A1U ; UBIN ; Clorf6 UBQLN4 泛素4 0.71 CGI-118 ; MGC13323 MRPL48 粒線體核糖體蛋白L48 0.701 Gm83 ; HSPC064 ; MGC 126859 ; MGC 13 8247 ; DKFZP564O0463 WDSOF1 含WD重複及SOF1域 0.701 FMT1 MTFMT 粒線體曱硫胺醯基-tRNA甲醯基轉 移酶 0.697 DKFZp686E10109 NUDCD2 jNudC 域 32 0.697 MGC11321 MRPL45 粒線體核糖體蛋白L45 0.691 SDOS ; MGC 11275 NUDT16L1 nudix(二磷酸核苷連接之部^ 基元16樣1 0.683 FLJ20989 C8orf33 桊色體8開放閱讀框架33 — H1281.doc -88 - 201022492 相對正規 化表現 常用名 基因符珑 描述 0.681 ΑΚ6 ; FIX ; AK3L1 ; AKL3L ; AKL3L1 AK3 腺苷酸激酶3 0.671 RIP ; HRIP ; MGC4189 RIP RPA相互作用蛋白 — 0.666 PRP8 ; RP13 ; HPRP8 ; PRPC8 PRPF8 PRP8前mRNA加工因子8同源物(酿 酒酵母) 0.664 PCMT ; PPMT ; PCCMT ; HSTE14 ; MST098 ; MSTP098 ; MGC39955 ICMT 異戊烯半胱胺酸羧基甲基轉移酶 0.66 YTM1 ; FLJ10881 ; FLJ12719 ; FLJ12720 WDR12 WD重複域12 0.646 GAB1 ; CDC91L1 ; MGC40420 CDC91L1 磷脂酿肌醇多醣錨生物合成,U類 0.613 MGC4248 C10orf58 染色體10開放閱讀框架58 0.613 senl5 Clorfl9 染色體1開放閱讀框架19 0.599 MGC2404 ACBD6 含醯基-輔酶A結合域6
表70 : M3·8 PTB對比對照,在活動性TB中不足表示之基 因0 相訝正规 化表現 常用名 基因符號 描述 P22 15 PTBvCSelect 09 May08 PAL2Ttest DOW N M3.8 0.841 MAP ; RUSC3 ; SGSM3 ; DKFZp761D051 RUTBC3 含RUN及TBC1域3 0.84 FLJ13848 FLJ13848 N-乙醯基轉移酶11 0.827 HEL308 ; MGC20604 HEL308 DNA解螺旋酶HEL308 0.826 dgkd-2 ; DGK6 ; KIAA0145 DGKD 二醯基甘油激酶,δ 130kDa 0.814 DKFZp779L2418 SFRS14 剪接因子,富集精胺酸/絲胺酸14 0.814 HMMH ; MUTM ; OGH1 ; HOGG1 OGGI 8-側氧基鳥嘌呤DNA糖基化酶 0.808 PR09856 ; LAVS3040 ; DKFZp434D0711 ; DKFZp686L0539 BRD9 含溴域9 0.807 HCDI C14orfl24 染色體14開放閱讀框架124 141281.doc •89· 201022492 相對正规 化表現 常用名 基因符號 描述 0.798 GTF2D ; SCA17 ; TFIID ; GTF2D1 ; MGC117320 ; MGC126054 ; MGC126055 TBP TATA盒結合|白 0.772 ZIS ; ZIS1 ; ZIS2 ; ZNF265 ; FLJ41119 ; DKFZp686J1831 ; DKFZp686N09117 ZNF265 鋅指,含RAN結合域2 0.764 OGT 0.762 MTMR8 ; C8orf9 ; LIP-STYX ; MGC126672 ; DKFZp434K171 MTMR9 肌管素相關蛋白9 0.76 TDP-43 TARDBP TARDNA結合蛋白 0.754 FPM315 ; ZKSCAN12 ZNF263 鋅指蛋白263 0.754 C42 ; CGI-05 ; HSPC167 ; C20orf34 ; CDK5RAP1.3 ; CDK5RAP1.4 CDK5RAP1 CDK5調節次單元相關蛋白1 0.747 P50 ; P85 ; PAK3 ; PIXB ; COOL1 ; P50BP ; P85SPR ; β-PIX ; KIAA0142 ; KIAA0412 ; P85COOL1 ; Nblal0314 ; DKFZp761K1021 ARHGEF7 Rh〇鳥嘌呤核苷酸交換因子〔GEF)7 0.745 NAC ; CARD7 ; NALP1 ; SLEV1 ; DEFCAP ; PP1044 ; VAMAS1 ; CLR17.1 ; KIAA0926 ; DEFCAP-L/S ; DKFZp58601822 NALP1 NLR家族,含pyrin域1 0.744 KIAA0388 EZH1 zeste同源物之強化子1(果绳) 0.741 MGC19570 ; dJ34B21.3 C6orfl30 染色體6開放閱讀框架130 0.737 RP11-336K24.1 KIAA0907 KIAA0907 0.732 LAM ; TSC ; KIAA0243 ; MGC86987 TSC1 結節性硬化症1 0.725 LRS ; LEUS ; LARS1 ; LEURS ; PIG44 ; RNTLS ; HSPC192 ; hr025Cl ; FLJ10595 ; FLJ21788 ; KIAA1352 LARS 白胺酿基-tRNA合成酶 0.724 HZF1 ZNF266 鋅指蛋白266 ~ 141281.doc •90- 201022492
相對正規 化表現 常用名 基因符珑 描述 0.72 FAC1 ;FALZ; NURF301 FALZ 溴域PHD指轉錄因子 0.72 FLJ12892 ; FLJ41065 ; DKFZp434L1050 CCDC14 含捲曲螺旋域14 0.708 TIR8 ; MGC110992 SIGIRR 單一免疫球蛋白及toll介白素1受體 (TIR)域 0.7 FLJ21007 ; RP11-459E2.1 TDRD3 含tudor域3 0.691 CGI75 ; mtTFB ; CGI-75 TFB1M 轉錄因子B1,粒線體 0.689 FP977 ; FLJ12270 ; MGC11230 WDR59 WD重複域59 0.684 TS11 ASNS 天冬醯胺合成酶 0.677 MGC111199 NIT2 腈水解酶家族,成員2 0.675 ASB1 0.663 MCAF2 ; FLJ12668 ATF7IP2 活化轉錄因子7相互作用蛋白2 0.648 SIN ; RPC5 POLR3E 聚合酶(RNA)III(DNA引導)多肽 E(80 kD) 0.646 BMS1L ; KIAA0187 BMS1L BMS1同源物,核糖體組裝蛋白(酵 母) 0.636 CBX7 CBX7 染色盒同源物7 0.63 PAN2 ; hPAN2 ; FLJ39360 ; KIAA0710 USP52 泛素特異性肽酶52 0.623 MSK1 ; RLPK ; MSPK1 ; MGC1911 RPS6KA5 核糖體蛋白S6激酶,90 kDa,多 肽5 0.612 SYB1 ; VAMP-1 ; DKFZp686H12131 VAMP1 囊泡相關膜蛋白1(突觸泡蛋白1) 0.601 ALC1 ; CHDL; FLJ22530 CHD1L 染色質域解螺旋酶DNA結合蛋白1 樣 0.587 KIAA0355 KIAA0355 KIAA0355 0.557 KIAA1615 ZNF529 鋅指蛋白529 0.554 MGC2146 IL11RA 介白素11受體,α 0.552 RNF84 ; MGC:39780 TRAF5 TNF受體相關因子5 0.551 FLJ11795 ; MGC126013 ; MGC126014 FLJ11795 錨蛋白重複域55 0.548 DKFZp68601788 MTX3 metaxin 3 0.544 DABP DBP 白蛋白啟動子(白蛋白D盒)結合蛋 白之D位點 0.541 FISH ; SH3MD1 SH3PXD2A SH3JLPX^2A 0.524 CLAX ; LLT1 ; OCIL CLEC2D C型凝集素域家族2,成員D 0.518 HPF1 ; FLJ11015 ; FLJ14876 ; FLJ90585 ; MGC33853 ZNF83 鋅指蛋白83 141281.doc -91 - 201022492 相對正規 化表現 常用名 基因符猇 描述 0.514 ZCW4 ; ZCWCC2 ; FLJ11565 ; dJ75H8.2 MORC4 MORC家族C W型鋅招4 0.512 RTS ; TYMSAS ; RTS β ; HSRTSP ; RTS α ENOSF1 烯醇化酶超家族成員1 0.483 C7orf32 ; ATP6V0E2L ATP6V0E2L ATPase ’ H+轉運V0次單元e2 0.458 PLC1 ; PLC-II ; PLC148 ; PLCyl PLCG1 磷脂酶C,γΐ 0.428 RLK ; TKL ; BTKL ; PTK4 ; PSCTK5 ; MGC22473 TXK τχκ酪胺酸激酶 0.367 T14 ; S152 ; Tp55 ; TNFRSF7 ; MGC20393 TNFRSF7 CD27分子 表7P : M3.9 PTB對比對照,在活動性TB中不足表示之基 因。 相對正規 化表現 常用名 基因符犹 描述 P22_l 5_PTBvCSelect_0 9May08 PAL2Ttest DO WN M3:9 — 0.869 ABC43 ; PMP70 ; PXMP1 ABCD3 ATP結合卡匣,子族D(ALD),成 員3 0.86 SPG8 ; MGC111053 KIAA0196 KIAA0196 0.859 PUMH ; HSPUM ; PUMH1 ; PUML1 ; KIAA0099 PUM1 pumilio同源物1 (果绳) 0.856 ASF ; SF2 ; SF2p33 ; SRp30a ; MGC5228 SFRS1 剪接因子,富集精胺酸/絲胺藏厂 1(剪接因子2,替代剪接因子) 0.848 DKFZp779N2044 KIAA0528 KIAA0528 0.843 ALG6 ALG6 天冬醯胺睃連接之糖基化6同源物 (釀酒酵母,α-1,3-葡糖基轉移酶) 0.829 MGC111579 ; DKFZp781B11202 DARS 天冬胺醯基-tRNA合成酶 0.829 ADDL ADD3 内收蛋白3(γ) ~ 0.829 KOX18 ; ZNF36 ; PHZ-37 ; ZNF139 ; MGC138429 ; 9130423L19Rik ZKSCAN1 具有KRAB及SCAN域之鋅指1 0.826 RPD3 ; YAF1 HDAC2 組蛋白去乙醯基酶2 141281.doc -92· 201022492
相對正规 化表現 常用名 基因符靓 描述 0.825 FLJ21634 ; MGC71630 GALNT11 UDP-N-乙醯基-α-D-半乳胺糖:多 肽N-乙醯基胺基半乳糖苷轉移酶 ll(GalNAc-Tll) 0.816 POLZ ; REV3 REV3L REV3樣,DNA聚合酶ξ之催化次 單元(酵母) 0.812 Ki ; PA28G ; REG-γ ; ΡΑ28-γ PSME3 蛋白酶體(前體,巨蛋白因子)活仆* 次單元3 (ΡΑ28 γ ; Ki) 0.811 BRM ; SNF2 ; SWI2 ; hBRM ; Sthlp ; BAF190 ; SNF2L2 ; SNF2LA ; hSNF2a ; FLJ36757 ; MGC74511 SMARCA2 SWI/SNF相關,基質相關,染色 質之肌動蛋白依賴性調節子,子 族a,成員2 0.807 ZNT5 ; ZTL1 ; ZNTL1 ; ZnT-5 ; MGC5499 ; FLJ12496 ; FLJ12756 SLC30A5 溶質載體家族30(辞轉運體),成員 5 0.802 RAB7L ; DKFZp686P1051 RAB7L1 RAB7,RAS致癌基因家族成員樣 1 0.796 ASCIZ ; KIAA0431 ; DKFZp779K1455 ASCIZ ATM/ATR受質Chk2相互作用 Zn2+-指蛋白 0.796 TAF2B ; CIF150 ; TAFII150 TAF2 TAF2 RNA聚合酶II,TATA盒結合 蛋白(TBP)相關因子,i5〇kDa 0.786 N4WBP5 ; MGC10924 NDFIP1 Nedd4家族相互作用蛋白1 0.782 PAP41 ; MGC117304 ; MGC126719 ; MGC 126721 PRPSAP2 磷酸核糖焦磷酸合成酶相關蛋白2 0.779 FLJ22584 TTC13 三角形四肽重複域13 0.775 CLCI ; ICln ; CLNS1B CLNS1A 氣離子通道,核苷酸敏感性,1A 0.772 LRRC5 ; FLJ10470 ; FLJ20403 LRRC8D 含白胺酸富集重複8家族,成員D 0.77 CCT6 ; Cctz ; HTR3 ; TCPZ ; TCP20 ; MoDP-2 ; TTCP20 ; CCT-ζ ; MGC 126214 ; MGC 126215 ; CCT-ζ-1 ; TCP-1-ζ CCT6A 含伴侣蛋白TCP1,次單元6A(£1) 0.765 TOK-1 BCCIP BRCA2及CDKN1A相互作用蛋白 0.764 G3BP ; HDH-VIII ; MGC111040 G3BP GTPase活化蛋白(SH3域)結合蛋白 1 0.763 FACT ; CDC68 ; FACTP140 ; FLJ10857 ; FLJ14010 ; FLJ34357 ; SPT16/CDC68 SUPT16H Ty 16同源物之抑制子(酿酒酵母) 141281.doc 93- 201022492 相對正規 化表現 常用名 基因符犹 描述 0.757 FBP2 ; FLJ12799 ; FLJ38170 C14orfl35 染色體14開放閱讀框架135 0.753 GCP3 ; SPBC98 ; Spc98p TUBGCP3 微管蛋白,γ複合物相關蛋白3 0.752 FLJ13576 ; DKFZp564C012 FLJ13576 跨膜蛋白168 0.751 SRP72 SRP72 信號識別顆焱72kDa 〜 0.75 CIA1 ; WDR39 WDR39 胞質鐵硫蛋白裝配1同源物(釀酒酵·' 母) 0.738 HPT ; MRS2 ; MGC78523 MRS2L MRS2樣,鎂穩定因子(讓酒酵母) 0.729 CED-4 ; FLASH ; RIP25 ; FLJ11208 ; KIAA1315 CASP8AP2 CASP8相關蛋白2 0.728 PTPLB PTPLB 蛋白路胺酸填酸酯酶樣(脯胺酸代 替催化精胺酸),成員b 0.724 CHAC ; FU42030 ; KIAA0986 VPS13A 液泡蛋白分類13同源物A(釀酒酵 母) 0.724 REC14 WDR61 WD重複域61 0.719 EB9 ; PDAF ; RCAS1 EBAG9 雌激素受體結合位Sfc相關,抗 原,9 0.712 SNX4 SNX4 分類連接蛋白4 0.704 TOPIIB ; ΐορ2β TOP2B 拓撲異構酶(DNA)II0 180 kDii 0.704 CGI-12 ; FLJ10939 MTERFD1 含MTERF域1 0.703 CBC2 ; NIP1 ; CBP20 ; PIG55 NCBP2 核蓋結合蛋白次單元2,2〇1cDa 0.702 HAD ; HHF4 ; HADH1 ;SCHAD ; HADHSC ; M/SCHAD ; MGC8392 HADHSC 羥基醯基輔酶A去氫酶 0.701 p56 ; HSD8 ; FLJ11088 ; DKFZP779L1558 ; DKFZp779L1558 DKFZP779 L1558 含捲曲螺旋域91 0.701 CREB ; MGC9284 CREB1 cAMP反應性件結合蛋白1 0.7 AIP5 ; Tiull ; hSDRPl ; DKFZp434D2111 WWP1 含WW域之E3泛素蛋白遠桩醢1 0.681 TAT-SF1 ; dJ196E23.2 HTATSF1 HIV-1 Tat特異性因子1 0.674 LDLC COG2 寡聚尚爾基姓複合物之细粉9 0.671 HC71 ; CGI-150 ; C17orf25 C17or£25 含乙二醛酶域4 0.67 GABAT ; NPD009 ; GABA-AT ABAT 4-胺基丁酸胺基轉蒋酶 14I281.doc • 94· 201022492
相對正規 化表現 常用名 基因符號 --- 描述 0.668 ΑΚΑΡ18 AKAP7 A激酶(PRKA)錨蛋白7 ^ 0.661 LSFC ; GP130 ; LRP130 ; CLONE-23970 LRPPRC 含白胺酸富集PPR基元 0.644 SCC-112 ; PIG54 ; FLJ41012 ; KIAA0648 ; MGC131948 ; MGC161503 ; DKFZp686B 19246 SCC-112 " -----〜 SCC-112 蛋白 0.643 GDE AGL 澱粉-1,6-葡糖苷酶, 移酶(糖原去支酶,ΠΙ型糖原倚存 病) 0.643 NIP3 BNIP3 BCL2/腺病毒E1B 19 kDa^目幻 蛋白3 0.64 HSSB ; RF-A ; RP-A ; REPA1 ; RPA70 RPA1 ~~ — 複製蛋白Al,70kDa 0.63 TAF2C ; TAF4A ; TAF2C1 ; FLJ41943 ; TAFII130 ; TAFII135 TAF4 ------ TAF4 RNA聚合酶II,TATA盒結合 蛋白(TBP)相關因子,135 kDa ° 0.626 TMP21 ; S311125 ; Tmp-21-I ; S31III125 ; Ρ24(δ) TMED10 "---- 跨膜emp24樣轉運蛋白10(酵母) 0.617 FLJ20397 ; FLJ25564 ; FLJ31671 ; FU39381 FU20397 含HEAT重複2 0.612 CHA ; Figlb ; E2BP-1 ; MGC46135 TCFL5 轉錄因子樣5(鹼性螺旋-環-螺旋) 0.588 SRB ; Cctd ; MGC126164 ; MGC126165 CCT4 含伴侣蛋白TCP1,次單元4(δ) 0.582 Sehl ; SEH1A ; SEH1B ; SEC13L SEH1L SEH1樣(釀酒酵母) 0.527 HSU79274 C12orf24 染色體12開放閱讀框架24 表8A : M1.5 LTB對比對照,在潛伏性TB中不足表示之基 因。 相對正規 化表現 常用名 基因符就 描述 Ρ22 15 LTBvCSelect 09 May08 PAL2Ttest DOW N Ml.5 _ 2.007 STF1 ; STFA CSTA 半脱胺酸蛋白酶抑制素A(stefin A) 141281.doc -95- 201022492 相對正规 化表現 常用名 基因符我 描述 1.915 LSH ; NRAMP ; NRAMP1 SLC11A1 溶質載體家族11(質子偶合之二價_ 金屬離子轉運體),成員1 1.903 EZI ; Zfp467 ZNF467 辞指蛋白467 1.813 TIL4 ; CD282 TLR2 t〇U樣受體2 —— 1.811 HSULF-2 ; FLJ90554 ; KIAA1247 ; MGC126411 ; DKFZp313E091 SULF2 硫酸酯酶2 1.716 FU22662 FLJ22662 假定蛋白FLJ22662 " 1.691 FDF03 PILRA 配對免疫球蛋白樣2型受體α ' 1.686 HET ; ΓΓΜ ; BWR1A ; IMPT1 ; TSSC5; ORCTL2 ; BWSCR1A ; SLC22A1L ; p45-BWR1A ; DKFZp667A184 SLC22A18 溶質载體家族22(有機陽離子轉運 艘),成員18 1.682 ILT1 ; LIR7 ; CD85H ; LIR-7 LILRA2 白血球免疫球蛋白樣受體,子族 Α(具有ΤΜ域),成員2 1.657 C1QR1 ; ClqRP ; CDw93 ; MXRA4 ; ClqR(P) ; dJ737E23.1 C1QR1 CD93分子 1.636 NCF ; MGC3810 ; P40PHOX ; SH3PXD4 NCF4 嗜中性白血球胞質因子4,40kDa 1.623 NOXA2 ; p67phox ; P67-PHOX NCF2 嗜中性白血球胞質因子2(65 kDa, 慢性肉芽腫病,體染色體2) 1.542 FLJ10357 ; SOLO FLJ10357 假定蛋白FLJ10357 1.525 JTK9 HCK 造血細胞激酶 1.521 FEM-2 ; POPX2 ; hFEM-2 ; CaMKPase ; KIAA0015 PPM1F 蛋白磷酸酯酶1F(含PP2C域) 1.498 CD32 ; FCG2 ; FcGR ; CD32A ; CDw32 ; FCGR2 ; IGFR2 ; FCGR2A1 ; MGC23887 ; MGC30032 FCGR2A IgG之Fc片段、低親和力iia、受體 (CD32) 1.493 DHRS8 ; PAN1B ; RETSDR2 ; 17-β-HSD11 ; 17-p-HSDXI DHRS8 羥類固醇(17⑴去氫酶11 1.482 FLJ11151 ; CSTP1 FLJ11151 假定蛋白FLJ11151 1.478 CD31 ; PECAM-1 PECAM1 血小板/内皮細胞黏附分子(CD31 抗原) 1.469 DORA IGSF6 免疫球蛋白超家族,成員6 141281.doc ·96· 201022492
相對正規 化表現 常用名 基因符號 描述 1.452 GP ; G1RZFP ; GOLIATH ; MGC99542 ; MGC117241 ; MGC138647 RNF130 環指蛋白130 1.45 MLN70 ; S100C S100A11 S100約結合蛋白All 1.449 MGC3886 CTSS 組織蛋白酶s 1.425 APPH ; APPL2 ; CDEBP APLP2 類澱粉β(Α4)前驅體樣蛋白2 1.41 IMPD ; RP10 ; IMPD1 ; LCA11 ; sWSS2608 ; DKFZp781N0678 IMPDH1 IMP(單磷酸肌苷)去氫酶1 1.406 FCNM FCN1 纖維膠凝蛋白(含膠原/jk纖蛋白原 域)1 1.376 MYD88 MYD88 骨髓分化一級反應基因(88) 1.371 B144 ; LST-1 ; D6S49E ; MGC119006 ; MGC119007 LST1 白血球特異性轉錄物1 1.348 OS9 OS9 在骨肉瘤中擴增 1.334 TEM7R ; FLJ14623 PLXDC2 含叢狀蛋白域2 1.334 Rab22B RAB31 RAB31,RAS致癌基因家族成員 1.301 TS ; TXS ; CYP5 ; THAS ; TXAS ; CYP5A1 TBXAS1 凝血烧A合成酶1(血小板,細胞色 素P450,家族5,子族A) 1.292 HXK3 ; HKIII HK3 己糖激酶3(白血球) 1.292 RISC ; HSCP1 SCPEP1 絲胺酸羧肽酶1 1.283 EBA1 ; AIF-1 ; IRT-1 AIF1 同種異體移植發炎因子1 1.283 CD14 CD14 CD14分子 1.27 PI ; ΑΙΑ ; AAT ; PI1 ; A1AT ; MGC9222 ; PR02275 ; MGC23330 SERPINA1 絲胺酸肽酶抑制子,分枝Α(α-1抗 蛋白酶,抗肤蛋白酶),成員1 1.261 LIR6 ; CD85I ; LIR-6 ; MGC126563 LILRA1 白血球免疫球蛋白樣受趙,子族 Α(具有ΤΜ域),成員1 1.221 CAP 102 ; FLJ36832 CTNNA1 索烴素(鈣黏著蛋白相關蛋白), αΐ > 102 kDa 1.192 BCKDK BCKDK 支鍵酮酸去氫酶激酶 一 1.137 p75 ; TBPII ; TNFBR ; TNFR2 ; CD120b ; TNFR80 ; TNF-R75 ; p75TNFR ; TNF-R-II TNFRSF1B 腫瘤壞死因子受體超家族,成員 1B 141281.doc -97- 201022492 表8B : M2.1 LTB對比對照,在潛伏性TB*過度表示之基 因0
相對正规 化表現 常用名 基因符犹 描述 P22 15 LTBvCSelect 09 May08l>AL2Ttest UP M2.01 0.801 LIME ; LP8067 ; FLJ20406 ; dJ583P15.4 ; RP4-583P15.5 LIME1 Lck相互作用跨贿#抑4 ^ 0.769 FLJ34563 ; MGC35163 SAMD3 含不育α基元垃飞 0.763 SISd ; SCYA5 ; RANTES ; TCP228 ; D17S136E ; MGC17164 CCL5 趨化激素(C-C基元)配位體5 0.758 ORP7 ; MGC71150 OSBPL7 氧固醇結合蛋白樣7 0.757 LOC387882 0.736 SLP2 ; SGA72M ; CHR11SYT ; KIAA1597 ; MGC102768 SYTL2 突觸結合蛋白樣2 0.735 DORZ1 ; DKFZP5640243 ABHD14A 含自水解酶域14Α 0.727 MGC33870 ; MGC74858 NCALD 神經鈣蛋白δ 0.691 LPAP ; CD45-AP ; MGC 138602 ; MGC 13 8603 PTPRCAP 蛋白酪胺酸碟酸酯酶,受體型,c 相關蛋白 0.686 Til ; SRBC CD2 CD2分子 0.671 CD8 ; MAL ; p32 ; Leu2 CD8A CD8a分子 0.656 HOP;OBI ;LAGY ; Toto ; Cameo ; NECC1 ; SMAP31 ; MGC20820 HOP 僅同源域蛋白 0.651 2F1 ; MAFA ; MAFA-L ; CLEC15A ; MAFA-2F1 ; MGC13600 KLRG1 殺傷細胞凝集素樣受體子族G,成 員1 0.65 LOC197135 0.643 GIG1 NKG7 天然殺傷細胞組7序列 0.638 TSAd ; F2771 SH2D2A SH2域蛋白2A 0.634 FEOM ; CFEOM ; FEOM1 ; CFEOM1 ; FLJ20052 ; KIAA1708 ; DKFZp779C159 KIF21A 驅動蛋白家族成員21A 141281.doc • 98 - 201022492
0.627 ΚΙΑΑ0442 ; MGC13140 AUTS2 孤獨症易感性~~......... 0.583 BFPP ; TM7LN4 ; ΤΜ7ΧΝ1 ; DKFZp781L1398 GPR56 G蛋白偶合受體56 0.572 TARP ; CD3G ; TCRG ; TCRGC1 ; TCRGC2 TARP TCRy替代閲讀抱架落占 0.502 519 ; LAG2 ; NKG5 ; LAG-2 ; D2S69E ; TLA519 GNLY 顆粒溶素 0.303 CCP-X ; CGL-2 ; CSP-C ; CTLA1 ;CTSGL2 GZMH 顆粒酶Η(組織蛋白畴〇樣2,蛋白 h-CCPX) 表8C : M2.6 LTB對比對照,在潛伏性TB中不足表示之基 因。 相對正規 化表現 常用名 基因符犹 描述 P22 15 LTBvC Select 09M ay08 PAL2Ttest DOWN M2.06 模組2.06,骨髓,倍數變 化相對於LTB為健康的, 亦即,在LTB中下降 2.409 HsT287 ZNF516 鋅指蛋白516 2.286 CRISP 11 ; LCRISP2 ; MGC74865 ; DKFZP434B044 CRISPLD2 含半脱胺酸富集分泌1白LCCL域2 2.177 MAGI ; GPAT3 ; AGPAT8 ; MGC11324 HMFN0839 肺癌轉移相關1白 2.095 CDD CDA 胞苷去胺酶 2.094 CRBP4 ; CRBPIV ; MGC70641 RBP7 視黃醇結合蛋白7,細胞 1.917 SSC1 ; HsT17287 AQP9 水通道蛋白9 1.916 GMR ; CD116 ; CSF2R ; CDwll6 ; CSF2RX ; CSF2RY ; GMCSFR ; CSF2RAX ; CSF2RAY ; MGC3848 ; MGC4838 ; GM-CSF-R-a CSF2RA 群落刺激因子2受體,a,低親和力 (顆粒球巨噬細胞) 1.853 G0S8 RGS2 G蛋白彳&號轉導之調節子2, 1.734 HKII ; HXK2 ; DKFZp686M1669 HK2 己糖激酶2 1.734 BB1 LENG4 白血球受體叢(LRC)成員4 141281.doc -99- 201022492 1.701 UB1 ; CEP3 ; BORG2 ; FLJ46903 CDC42EP3 CDC42效應蛋白(Rh〇 GTPase結 合)3 1.671 SPAL2 ; FLJ23126 ; FLJ23632 ; KIAA1389 SIPA1L2 信號誘導性增殖相關基因1樣2 1.669 ST1 ; SYCL ; MDA-9 ; TACIP18 SDCBP 多配體蛋白聚糖結合蛋白(同線蛋 白) 1.669 CAN ; CAIN ; N214 ; D9S46E ; MGC104525 NUP214 核孔蛋白214kDa 1.651 SLC19A1 1.65 LPB3 ; S1P3 ; EDG-3 ; S1PR3 ; FLJ37523 ; MGC71696 EDG3 内皮細胞分化,鞘脂G蛋白偶合受 體,3 1.642 FPR ; FMLP FPR1 曱醯基肽受體1 1.61 GPCR1 ; GPR86 ; GPR94 ; P2Y13 ; SP174 ; FKSG77 P2RY13 嘌呤能受體P2Y,G蛋白偶合,13 1.606 WDR80 ; FLJ00012 ATG16L2 ATG16自體吞噬相關16樣2(釀酒酵 母) 1.601 LENG5 ; SEN34 ; SEN34L TSEN34 tRNA剪接核酸内切酶34同源物(讓 酒酵母) 1.575 FPF ; p55 ; p60 ; TBP1 ; TNF-R ; TNFAR ; TNFR1 ; p55-R ; CD120a ; TNFR55 ; TNFR60 ; TNF-R-I ; TNF-R55 ; MGC19588 TNFRSF1A 腫瘤壞死因子受體超家族,成員 1A 1.572 PELI2 PELI2 皮層同源物2(果绳) 1.562 FLJ13052 ; FU37724 ; dJ283E3.1 ; RP1-283E3.6 NADK ----- NAD激酶 1.558 5-LO ; 5LPG ; LOG5 ; MGC 163204 ALOX5 花生四烯酸5-脂肪加氧酶 1.534 TMPIT TMPIT 腫瘤壞死因子α誘導性跨膜蛋白 1.517 FLJ31978 GLT1D1 含糖基轉移酶1域1 1.517 PFKFB4 PFKFB4 6-磷酸果糖-2-激酶/果糖-2,6-雙碟 酸酶4 1.516 FLJ22470 ; KIAA1993 ; MGC24652 ; RP11-106H5.1 ZBTB34 含辞指及ΒΤΒ域34 1.482 P39 ; VATX ; VMA6 ; ATP6D ; ATP6DV ; VPATPD ATP6V0D1 ATPase,Η+轉運,溶酶體38 kDa,V0次單元dl 1.473 PRAM-1 ; MGC39864 PRAM1 PML-RARA調節之接附分子Γ~ — 141281.doc •100· 201022492
1.471 BIT ; MFR ; P84 ; SIRP ; MYD-1 ; SHPS1 ; CD172A ; PTPNS1 ; SHPS-1 ; SIRPa ; SIRPa2 ; SIRP-a-1 PTPNS1 信號調節蛋白a 1.463 Ml30 ; MM130 CD163 CD163 分子 一- 1.434 AF-1 ; IFGR2 ; IFNGT1 IFNGR2 干擾素γ受體2(干擾素γ轉導子n 一 1.405 RALB RALB v-ral猴白血病病毒致癌基因同源物 B(ras相關;GTP結合蛋白) 1.405 SLC03A1 SLC03A1 溶質載體有機陰離子轉運體家; 成員3A1 ;同義詞:〇atP-D、 OATP3A1 、 FLJ40478 、 SLC21A11 ;溶質載體家族21(有機 陰離子轉運體),成員11 ;智人溶 質載體有機陰離子轉運體家族,成 員 3A1(SLC03A1),mRNA 1.397 PTPE ; HPTPE ; DKFZp313F1310 ; R-PTP- ε PTPRE 蛋白酪胺酸碗酸酯酶,受艚剞,T? 1.397 RCC4 ; FLJ14784 DERC2 在腎癌瘤中破壞2 1.396 DAP12 ; KARAP ; PLOSL TYROBP TYRO蛋白路胺酸激酶結合蛋白 1.371 B144 ; LST-1 ; D6S49E ; MGC119006 ; MGC119007 LST1 白血球特異性轉錄物1 1.359 BFD ; PFC ; PFD ; PROPERDIN PFC 補體因子備解素 1.31 CAG4A ; ERDA5 ; PRAT4A TNRC5 ~~一 — 含三核苷酸重複5 1.307 CD18 ; TNFCR ; D12S370 ; TNFR-RP ; TNFRSF3 ; TNFR2-RP ; LT-p-R ; TNF-R-III LTBR 淋巴毒素β受體(TNFR超家族,成 員3) 1.305 CEB VAMP3 囊泡相關膜蛋白3(縮纖蛋白) 1.304 CSC-21K TIMP2 ΤΙΜΡ金屬肽酶抑制劑2 1.301 BPOZ ; EF1ABP ; PP2259 ; MGC20585 ABTB1 含錨蛋白重複及ΒΤΒ(Ρ〇Ζ)域1 1.294 C6orf209 ; FLJ11240 ; bA810I22.1 ; RP11-810122.1 LMBRD1 含LMBR1域1 1.266 PBF ; C21orfl ; C21orD PTTG1IP 垂體瘤轉型1相互作用蛋白 - 1.235 ZFYVE10 ; FLJ32333 ; KIAA0371 ; FYVE-DSP1 MTMR3 —----- 肌管素相關蛋白3 1.216 CFP1 ; CBCP1 ; C10orf9 C10orf9 細胞週期素Υ ~~ 1.2 SPT4H ; SUPT4H SUPT4H1 iy 4同源物之抑制子ι(釀、~~~ 141281.doc -101- 201022492 表8D : M2.10 LTB對比對照,在潛伏性TB中不足表示之基 因。 相對正規 化表現 常用名 基因符狭 描述 P22_l 5_LTBvCSelect_09 May08 PAL2Ttest DOW N Μ2.Ϊ0 ~ 未定義模組M2.10,倍數 變化相對於LTB為健康 的,亦即,在LTB中下 降 1.608 JAML ; AMICA ; Gm638 ; CREA7-1 ; CREA7-4 ; FLJ37080 ; MGC118814 ; MGC118815 AMICA1 黏著分子,與CXADR抗原1相互 作用 1.537 MPEG1 ; MGC132657 ; MGC138435 MPEG1 巨噬細胞表現之基因1 1.514 L13 ; MGC13061 RNF135 環指蛋白135 1.507 ΡΑΚα ; MGC130000 ; MGC130001 ΡΑΚΙ p21/Cdc42/Racl活化之激酶 1(STE20同源物,酵母) 1.471 Τ49 ; ρΤ49 FGL2 纖維蛋白原樣2 1.405 ΚΙΑΑ0513 KIAA0513 KIAA0513 _ 1.396 NCKX4 ; SLC24A2 ; FLJ38852 SLC24A4 溶質載體家族24(鈉/鉀/鈣交換 子),成員4 1.358 FLJ34389 MLKL 混合系激酶域樣 1.348 ΕΤ02 ; MTG16 ; MTGR2 ; ZMYND4 CBFA2T3 核心結合因子,runt域,α次單元 2 ;移位至,3 1.331 IRC1 ; IRC2 ; IRp60 ; IGSF12 ; CMRF35H ; CMRF-35H ; CMRF35H9 ; CMRF-35-H9 CD300A CD300a分子 1.3 GLIPR ; RTVP1 ; CRISP7 GLIPR1 GLI發病機理相關1(神經膠質瘤) 1.229 ENC-1AS HEXB 胺基己糖苷酶Β(β多肽) ' 1.222 TIRP ; TRAM ; TIRAP3 ; TICAM-2 ; MGC 129876 ; MGC 129877 TICAM2 t〇U樣受體接附分子2 1.175 FLJ31265 NUDT16 nudix(二磷酸核苷連接之部分X)型 基元16 1.17 FKBP133 ; KIAA0674 KIAA0674 FK506結合蛋白 15,133kDa 141281.doc -102- 201022492 表8E : M3.2 LTB對比對照,在潛伏性TB中不足表示之基 因。
相對正規 化表現 常用名 基因符猇 描述 P22_15_LTBvCSelect 09 May08 PAL2Ttest DOW N M3.2 ~ ------------ 炎症,3.2倍變化相對於 LTB為健康的,亦即, 在LTB中下降 4.289 K60 ; NAF ; GCP1 ; LECT ; LUCT ; NAP1 ; 3-10C ; CXCL8 ; GCP-1 ; LYNAP ; MDNCF ; MONAP ; NAP-1 ; SCYB8 ; TSG-1 ; AMCF-I ; b-ENAP IL8 ----- ----- 介白素8 2.068 CD87 ; UPAR ; URKR PLAUR ,維溶 2.009 PBEF ; NAMPT ; MGC117256 ; DKFZP666B131 ; 1110035014Rik PBEF1 前B細胞群落增強BE)子1 1.9 IER3 1.87 TREM-1 TREM1 在骨趙細胞上表現.之觸發受體1 1.79 E4BP4 ; IL3BP1 ; NFIL3A ; NF-IL3A NFIL3 核因子’介白素3調筋 1.739 KIAA1145 TMCC3 跨膜及捲曲螺旋域家族3 1.728 ΡΙΝΗ ; FLJ21759 ; FLJ23500 ; C20orfll0 ; dJ1181N3.1 ; DKFZp434B2411 ; DKFZp434O0827 TP53INP2 腫瘤蛋白P53誘導性核蛋白2 1.705 MAD ; MAD1 ; MGC104659 MXD1 MAX二聚化蛋白1 1.657 SGK1 SGK 血清/糖皮質激素調節激酶 1.654 SLC03A1 SLC03A1 溶質載艎有機陰離子轉運體家族, 成員3A1 ;同義詞:oatP-D、 OATP3A1 、 FLJ40478 、 SLC21A11 ;溶質載體家族21(有機 陰離子轉運體),成員11 ;智人溶 質載體有機陰離子轉運體家族,成 員 3A1(SLC03A1),mRNA 141281.doc -103- 201022492 相對正规 化表現 常用名 基因符猇 描述 1.637 C5orf6 FAM53C 具有序列相似性之家族53,成員C 1.632 PDLIM7 PDLIM7 PDZ 及 LIM 域 7(enigma) 1.591 ΝΙΝΙ ; NINJURIN NINJ1 神經損傷誘導性蛋白基因l(ninjurin 1) 1.572 RIT ; RIBB ; ROC1 ; MGC125864 ; MGC125865 RIT1 Ras 樣無 CAAX 1 1.567 SB135 MYADM 骨趙相關分化標記 1.54 RCP ; NOEL1A ; FLJ22524 ; FLJ22622 ; MGC78448 ; rabll-FIP1 ; DKFZp686E2214 RAB11FIP 1 RAB11家族相互作用蛋白叩類) 1.526 DANGER ; bA127L20 ; bA127L20.2 ; RP11-127L20.4 KIAA1754 KIAA1754 1.515 SPAG9 1.499 HSS ; JLP ; HLC4 ; PHET ; PIG6 ; FU13450 ; FLJ14006 ; FLJ26141 ; FLJ34602 ; KIAA0516 ; MGC14967 ; MGC74461 ; MGC117291 SPAG9 精子相關抗原9 1.496 MGC20461 OSM 制瘤素Μ 1.444 KIAA1673 CPEB4 細胞質聚腺嘌呤元件結合蛋白4 1.433 IL-1 ; IL1F2 ; ILl-β IL1B 介白素1,β 1.413 TRIP8 ; FLJ14374 ; KIAA1380 ; RP11-10C13.2 ; DKFZp761F0118 JMJD1C 含jumonji域 1C 1.41 FLJ11080 ; FLJ33961 ; DKFZP566A1524 FAM49A 具有序列相似性之家族49,成員A 1.4 EOPA ; NUDEL ; MITAP1 ; DKFZp451M0318 NDEL1 nudE核分布基因E同源物(構巢麯黴 (A· nidulans))樣 1 1.384 NHE8 ; FLJ42500 ; KIAA0939 ; MGC138418 ; DKFZp686C03237 SLC9A8 溶質載體家族9(鈉/氫交換子),成 員8 1.379 FLJ14744 PPP1R15B 蛋白填酸a旨酶1,調節(抑制子)次單 元15B 1.356 PPG ; PRG ; PRG1 ; MGC9289 ; FLJ12930 PRG1 絲甘蛋白聚糖 141281.doc -104- 201022492
相对正規 化表現 常用名 基因符珑 描述 1.348 ATG8 ; GEC1 ; APG8L GABARAP LI GABA(A)受體相關蛋白檨】 1.332 TTP ; G0S24 ; GOS24 ; TIS11 ; NUP475 ; RNF162A ZFP36 ^—--- 鋅指蛋白36,C3H型’同源物(小 鼠) 1.329 PFK2 ; IPFK2 PFKFB3 6-磷酸果糖-2-激酶/果^^^· 酶3 1.31 DKFZp547M072 MIDN 中腦核仁蛋白 '~~~-- 1.301 FLJ13448 CO〇 1 OB 輔酶Q10同源物B(釀酒- 1.285 C8FW ; GIG2 ; SKIP1 TRIB1 tribbles同源物1 (果繩) 1.284 FLJ13725 ; KIAA1930 FAM65A 具有序列相似性之家族65 , ώ i_A 1.272 FLJ46337 ; MGC117209 ; DKFZP434H132 C15orf39 染色體15開放閱讀框架39 1.258 All ; AVP ; FCU ; MWS ; FCAS ; CIAS1 ; NALP3 ; Clorf7 ; CLR1.1 ; PYPAF1 ; AII/AVP ; AGTAVPRL CIAS1 NLR家族,含pyrin域3 1.252 BRF1 ; ERF1 ; cMGl ; ERF-1 ; Berg36 ; TIS11B ; RNF162B ZFP36L1 鋅指蛋白36,C3H型樣1 1.249 FRA2 ; FLJ23306 FOSL2 FOS樣抗原2 - 1.235 GADD34 PPP1R15A 蛋白磷酸酯酶1,調節(抑制子 元15Α 1.235 p33 ; p47 ; p33INGl ; p24INGlc ; p33INGlb ; p47INGla ING1 生長家族之抑制子,成員1 1.231 P47 ; FLJ27168 PLEK 血小板-白血球C激酶受質 1.218 UBP ; SIH003 ; MGC129878 ; MGC129879 USP3 泛素特異性肽酶3 1.208 Sei-2 ; TRIP-Br2 ; MGC126688 ; MGC126690 SERTAD2 含SERTA域2 1.204 DCTN4 DCTN4 動力蛋白4(ρ62) 1.192 ROX ; MAD6 ; MXD6 MNT MAX結合蛋白 1.165 RBT1 SERTAD3 含SERTA域3 1.157 WIPI3 ; WIPI-3 WDR45L WDR45 樣 1.156 ERF ; RF1 ; ERF1 ; TB3-1 ; D5S1995 ; SUP45L1 ; MGC111066 ETF1 真核轉譯終止因子1 1.156 KIAA0118 RAB21 RAB21,RAS致癌某因家族成員__ 141281.doc -105- 201022492 相對正規 化表現 常用名 基因符號 -^ 描述 1.098 ΜΑΡΚΑΡΚ2 ΜΑΡΚΑΡ Κ2 _有絲分裂原 白激酶2 ^<蛋 表8F : M3.3 LTB對比對照,在潛伏性TB中不足表示 因。 相對正规 化表現 常用名 基因符致 -—^ 描述 P22 15 LTBvCSelect 09 May08 PAL2Ttest DOW N M3.3 —^s ,3.2倍變化相對於 LTB為健康的,亦即, 在LTB中下降 -—^ 2.716 QC ; GCT QPCT 麵ip睡.基狀環轉移酶(麵 2.579 CRE-BPA CREB5 cAMP反應性元件結合本白厂 2.468 APN ; CD13 ; LAP1 ; PEPN ; gpl50 ANPEP 丙胺酸基(膜)胺基肽 訧肽:/微粒體胺基A 2.426 PAD ; PDI4 ; PDI5 ; PADI5 PADI4 肽基精胺酸去亞胺酶,iv^;) 2.245 MRP ; WLS ; Clorfl39 ; FLJ23091 ; MGC14878 ; MGC131760 GPR177 G蛋白偶合受體177 2 HIS ; HSTD ;組胺酸酶 HAL 組胺酸氨解酶 ^---- 1.963 PYGL PYGL 磷酸化酶’糖原;肝臟 (Hersdisease) ’ VI型糖原儲存如 1.948 EGFL5 --~^ 1.935 ,ASljP'-R, CLEC4H2 ; Hs.1259 ASGR2 去唾液酸醣蛋白受體2 1.892 CD114 ; GCSFR CSF3R 群落刺激因子3受體(粒細胞) -- 1.882 LAMPB ; CD 107b ; LAMP-2C LAMP2 溶酶體相關膜蛋白2 1.813 ALFY ; ZFYVE25 ; KIAA0993 ; MGC16461 WDFY3 含WD重複及FYVE域3 1.8 STX3A STX3A 突觸融合蛋白3 1.771 CR1 CR1 補體組份(3b/4b)受體l(Knops血型); 同義詞:KN、C3BR、CD35 ;同功異 型物F前驅體係由轉錄物變異體F編 碼;C3結合蛋白;CD35抗原;補體 組份受體1 ; C3b/C4b受體;Knops血 141281.doc -106- 201022492
相對正规 化表現 常用名 基因符號 描述 型抗原;智人補體組份(3b/4b)受體 l(Knops血型)(CR1),轉錄物變異體 F,mRNA 1.764 DCL-l ; BIMLEC ; CLEC13A ; KIAA0022 CD302 CD302分子 1.758 FER1L1 ; LGMD2B ; FLJ00175 ; FLJ90168 DYSF dysferlin,肢帶肌肉萎縮症2B(體染色 體隱性) 1.733 TM6SF1 TM6SF1 跨膜6超家族成員1 1.721 MY01F MY01F 肌凝蛋白IF 1.691 CPR8 ; KIAA1254 CCPG1 細胞週期進程1 1.688 LAB ; NTAL ; WSCR5 ; WBSCR5 ; HSPC046 ; WBSCR15 LAT2 T細胞家族之活化連接子,成員2 1.687 CNAIP ; FLJ40652 ; bK126B4.4 NFAM1 具有ITAM基元之NFAT活化蛋白】 1.659 FVL ; PCCF ;因子V F5 凝血因子V(前加速素,不穩定—面^'- 1.655 FLJ20273 ; DKFZp686F02235 FLJ20273 --L__ RNA結合蛋白 1.647 NR4 ; CD213A1 ; IL-13Ra IL13RA1 —— 介白素13受體,αΐ 1.636 NCF ; MGC3810 ; P40PHOX ; SH3PXD4 NCF4 ---- 嗜中性白血球胞質因子4,40kDa 1.635 p63 ; CLIMP-63 ; ERGIC-63 ; MGC99554 CKAP4 細胞骨架相關蛋白4 1.611 SELR ; SELX ; MSRB1 ; HSPC270 ; MGC3344 SEPX1 ------ 确蛋白X,1 1.6 MD-2 LY96 淋巴細胞抗原96 ---— 1.599 NPL1 ; cll2 ; Clorfl3 ; MGC61869 ; MGC149582 NPL N-乙醯基神經胺酸丙酮酸解離 氫吡啶二羧酸合成(― 1.59 HAP ; ASYIP ; NSPL2 ; NSPLII ; RTN3-A1 RTN3 — 網黴素3 1.581 VMP1 ; DKFZP566I133 TMEM49 跨膜蛋白49 ----— 1.567 HBP ; HEBP HEBP1 血紅素結合蛋白"】 一----— 1.562 LAMPB ; CD 107b ; LAMP-2C LAMP2 ---- 溶酶體相關膜杳白? 1.559 1 ^10 C32 ; CKLF1 ; CKLF2 ; CKLF3 ; CKLF4 ; UCK-1 ; HSPC224 CKLF T> Λ CCI70 ----, 趨化激素樣因子 丄· J «3 ϋ 1.532 SemE ; SEMAE SEMA3C --- sema 域,免 以八„、—ττ-^— 141281.doc -107- 201022492 相對正规 化表現 常用名 基因符猇 描述 域,分泌,(轴突導向因子)3C 1.53 ARAP3 ; DRAG1 ; FLJ21065 CENTD3 矢車菊苷蛋白,δ3 1.516 HIG-1 ; C14orf75 ; FLJ36164 ; MGC135025 ; DKFZp434N0820 TDRD9 含tudor域9 1.51 CAMKK ; CAMKKB ; KIAA0787 ; MGC15254 CAMKK2 妈/約調蛋白依賴性蛋白激酶2,β 1.503 MEKK3 ; MAPKKK3 MAP3K3 有絲分裂原活化之蛋白激酶3 1.488 AC ; PHP ; ASAH ; PHP32 ; FLJ21558 ; FLJ22079 ASAH1 Ν-醯基鞘胺醇胺基水解酶(酸性神經 醯胺酶)1 1.484 FCRN ; a-鏈 FCGRT IgG之Fc片段,受體,轉運體,α 1.479 MGC33054 SNX10 分類連接蛋白10 1.474 H068 ; VA68 ; VPP2 ; Vmal ; ATP6A1 ; ATP6V1A1 ATP6V1A ATPase,Η+轉運,溶酶體70 kDa, VI次單元A 1.466 MGST ; GST12 ; MGST-I ; MGC14525 MGST1 微粒體麩胱甘肽S轉移酶1 1.466 GAIP ; RGSGAIP RGS19 G蛋白信號轉導之調節子19 1.461 TKT1 ; FLJ34765 TKT 轉酮酶(韋尼克-科爾薩科症候群 (Wernicke Korsakoff syndrome)) 1.449 S171 NUMB numb同源物(果绳) 1.448 FCH02 FCH02 僅FCH域2 1.444 LOC339745 LOC3397 45 假定蛋白LOC339745 1.443 CR3A ; M01A ; CD11B ; MAC-1 ; MAC1A ; MGC117044 ITGAM 整合素,α Μ(補體組份3受體3次單元) 1.442 D54 ; hD54 ; DKFZp686A1765 TPD52L2 腫瘤蛋白D52樣2 1.432 MY014 ; KIAA0488 ; MGC20471 ; MGC 126871 ; MGC 126873 SNX27 分類連接蛋白家族成員27 1.429 QK ; Hqk ; QK3 ; DKFZp586I0923 OKI 震動同源物,ΚΗ域RNA結合(小鼠) 1.424 EVDB ; D17S376 EVI2B 親嗜性病毒整合位點2Β 1.424 PPT ; CLN1 ; INCL PPT1 棕櫚醯基蛋白硫酯酶1(蠟樣質脂褐素 沈積病,神經元1,幼兒) 1.405 AOAH AOAH 醯氧基酿基水解酶(嗜中性白血球) 1.404 MAY1 ; MGC49908 ; nPKC-8 PRKCD 蛋白激酶C,δ 141281.doc •108· 201022492
相對正規 化表現 常用名 基因符狭 描述 1.39 IMPA2 IMPA2 肌醇(肌)-1(或4)-單填酸酶2 1.382 ZYG11 ; FLJ13456 ZYG11B zyg-ΙΙ同源物B(線蟲) 1.366 a3 ; Stvl ; Vphl ; Atp6i ; OC116 ; OPTB1 ; TIRC7 ; ATP6N1C; ATP6V0A3 ; OC-116 kDa TCIRG1 T細胞,免疫調節子1,ATPase,H+ 轉運,溶酶體V0次單元A3 1.364 PGCP PGCP 「血漿麩胺酸羧肽酶 1.362 NNA1 ; KIAA1035 ; DKFZp686M20191 AGTPBP1 ATP/GTP結合蛋白1 1.355 TTG2 ; RBTN2 ; RHOM2 ; RBTNL1 LM02 僅LIM域2(T細胞原癌基因樣1) 1.344 CIP1 ; FLJ46905 SLC12A9 溶質載體家族12(钟/氣離子轉運體), 成員9 1.34 ASRT5 ; IRAKM ; IRAK-M IRAK3 介白素1受體相關激酶3 1.34 NEU ; SIAL1 NEU1 唾液酸酶1(溶酶艘唾液酸酶) 1.332 CRFB4 ; CRF2-4 ; D21S58 ; D21S66 ; CDW210B ; IL-10R2 IL10RB 介白素10受體,|3 1.321 ASC ; TMS1 ; CARD5 ; MGC10332 PYCARD 含PYD及CARD域 1.31 KLHDC7C ; KIAA0711 KBTBD11 含kelch重複及BTB(POZ)域11 1.308 LTA4H LTA4H 白三烯Α4水解酶 1.307 NR2B1 ; FLJ16020 ; FLJ16733 ; MGC102720 RXRA 類視色素X受體,α 1.303 JAM ; KAT ; JAM1 ; JAMA ; JCAM ; CD321 ; JAM-1 ; ΙΑΜΑ ;PAM-1 F11R F11受體 1.298 LH ; LLH ; PLOD PLOD1 前膠原-離胺酸1,2-氧化戊二酸5雙加 氧酶1 1.285 JTK8 ; FLJ26625 LYN ν-yes-l楊氏肉瘤病毒相關致癌基gj 同源物 1.281 MTX ; MTXN MTX1 metaxin 1 1.28 CGI-44 SQRDL 硫鰱酿還原酶樣(酵母) 1.267 FU20424 C14orf94 染色體14開放閱讀框架94 1.248 DCIR ; LLIR ; DDB27 ; CLECSF6 ; HDCGC13P CLEC4A C型凝集素域家族4,成員A 1.238 El ; LEI ; PI2 ; MNEI ; M/NEI ; ELANH2 SERPINB1 絲胺酸肽酶抑制子,分枝B(卵白蛋 白),成員1 141281.doc -109- 201022492 1.234 3PK ; MAPKAP3 MAPKAP K3 有絲分裂原活化蛋白激酶活化之蛋 白激酶3 1.227 ACSS2 —._· 1.217 H2A.y ; H2A/y ; H2AFJ ; mH2Al ; H2AF12M ; MACROH2A1.1 ; macroH2A1.2 H2AFY — H2A組蛋白家族,忐昌γ 1.213 PP3856 NAPRT1 基轉移醢— 1.212 ESP-2 ; HED-2 ZYX 1.179 SPC18 ; SPCS4A ; SEC11L1 ; sid2895 ; 1810012E07Rik SEC11L1 SEgl 1 (酿酒酵母、 1.173 hEDTP ; C3orf29 ; FLJ22405 ; FLJ90311 C3orf29 ------------ _____ 肌f素相關尽白14 1.129 TGN38 ; TGN46 ; TGN48 ; TGN51 ; TTGN2 ; MGC14722 TGOLN2 '------ 反-高爾基體緬政疋m 魯 現,興潛伏性組(兵興對照相比僅顯不31375¾ JL m 裡悬因差異表 現)相比’可能反映更多抑制,儘管細胞毒祕抬Λ丄 母r玍模組中基因
之過度表現/表示顯示明確活動性免疫反應。I 作為對本發 明之說明而非限制,此等結果可能說明以下掏 規州結果:與 對照相比在活動性TB患者中,而非與對昭知 J ",、相比在潛伏性 TB中觀察到其他模組變化。此等模組包括Ml 2 + % 現/表示之基因(血小板,表7A中所列之基田、 迅四)及Ml .3中不 足表現/表示之基因(B細胞,表7B中所列之A m、 』爻基因)及M2.8中 不足表現/表示之基因(T細胞,表7H中所列夕f m 1 N <基因),後者 或許可預期,此係由於在T細胞中對結核分 文不干固起反 應,τ細胞有可能募集至感染部位及/或在慢性感^期p 一 抑制 因 模組M2.4中不足表現/表示之基因f * 7 、衣7G中所列之基 )包括編碼在急性感染及膿毒病中表現改激a t 足叹變之核糖體蛋 141281.doc -110- 201022492 因)包括編碼在急性感染及膿毒病中表現改變之核糖體蛋 白家族成員之轉錄物(Calvano,2005 ; Thach,2005),且亦 已顯示此模組中之基因在SLE、肝臟移植患者及受肺炎鏈 球菌感染者中不足表現 (Chaussabel, Immunity, 2005)。在模組M3.1(IFN誘導性)中 觀測到活動性TB中之最大過度表現基因組(90種所偵測基 因中之66種基因,表71)且其與IFN-γ在保護方面之作用一 致,然而,與對照相比,此模組中之基因在控制感染之潛 Φ 伏性TB患者中並不差異表現。活動性TB中之基因在許多 含有基因之模組中不足表現(M3.4、M3.6、M3.7、M3.8及 M3.9,表7L-7P中所列之基因),該等模組未呈現一致功能 性模組但由明顯不同之基因組組成,且亦已觀測到活動性 TB中之基因在肝臟移植受體中不足表現(Chaussabel., 2008,Immunity) ° 基於全血之轉錄分析且使用此模組圖法,可將活動性 TB患者與潛伏性TB患者加以區分。此外,在此研究中針 對活動性TB所獲得之模組圖與針對不同疾病所產生之其他 模組圖的比較,顯而易見的是,與患有SLE之患者、移 植、黑色素瘤或肺炎鏈球菌患者中所觀測相比,活動性TB '患者具有相異之總體轉錄圖譜(圖9)(Chaussabel, 2008, Immunity)。某些模組可為許多疾病所共有,諸如M2.4, 其包括編碼核糖體蛋白家族成員之轉錄物,該等轉錄物在 活動性TB、SLE、肝臟移植患者及受肺炎鏈球菌感染者中 不足表現。然而,其他模組中之基因未廣泛受影響,諸如 141281.doc -111 - 201022492 M3.1(IFN誘導性),其儘管在活動性TB(圖9)及SLE中過度 表現(Chaussabel,2008,Immunity),但在其他疾病(尤其肺 炎鏈球菌)中並非如此’其顯示與對照相比在M3.1中無差 異之基因表現。SLE之轉錄圖譜就許多其他模組中基因之 過度或不足表現而言不同於活動性TB。同樣地,儘管在活 動性TB及肺炎鏈球菌中觀測到在模組m3 ·2及M3.3 (「發炎 性」)、M1.2(血小板)及]V[1.5(「骨髓」)中基因之過度表現 及在M3.4、5、6、7、8及9(非功能性一致模組)中基因之 不足表現,但此等疾病仍可由此方法區分,此係由於與對 電 照相比模組Μ2.2(嗜中性白血球)、Μ2·3(紅血球)、Μ3.5(非 功成性一致模組)中之基因在肺炎鏈球菌中過度表現,但 在活動性ΤΒ中不受差異影響。因此,藉由保留資料之複雜 性及量值,而組織且降低複雜資料之維度,有可能藉由血 液之轉錄圖譜區分不同傳染病及發炎性疾病(Chaussabel, 2008, Immunity) 〇 本發明鑑別潛伏性及活動性TB患者血液中之轉錄特徵 之周密的差異且相反之資料集。特定言之,活動性TB患者 · 顯示基因在功能性IFN誘導性、發炎性及骨髓模組中過度 表現/表示,其另一方面在潛伏性73中下調/不足表示。活 動性TB患者顯示且增加免疫調節基因pDL1及pDL 2之表 現/過度表示,其可有助於TBi免疫發病機理。潛伏性丁8 患者之血液顯示細胞毒性模組中基因之過度表現/表示, 其在此等患者中可有助於含有結核分枝桿菌感染之保護性. 反應且在臨床試驗令可提供用於測試接種功效之生物標 141281.doc -112- 201022492 記。吾人咸信,藉由所採用之嚴格臨床準則,伴隨支持潛 伏狀態之歸因的免疫反應性研究、改良之RNA收集及分離 品質、先進的高通量全基因組微陣列平台及保留基因表現 之量值但具有可存取格式的成熟資料探勘工具取得初步研 •究之成功(Chaussabel等人,已提交)。該等發現將具有潛 . 伏性及活動性TB診斷價值,可產生對此等轉錄差異下潛在 免疫保護機制(潛伏性TB)對比免疫發病機理(活動性tb)的 理解及用於保護之新穎療法設計或活動性ΤΒ之免疫療法設 ® 計,以使用抗分枝桿菌藥物達成較快治癒。 預期本說明書中所論述之任何實施例可關於本發明之任 何方法、套組、試劑或組合物來實施,且反之亦然。此 外,本發明之組合物可用於實現本發明之方法。 應瞭解,本文所述之特定實施例以說明的方式展示且並 不作為本發明之限制。本發明之主要特徵可在不脫離本發 明之範疇的情況下在各種實施例中使用。熟習此項技術者 φ 應瞭解,或能夠僅使用常規實驗確定本文所述之特定程序 的眾多等效物。該等等效物被視為在本發明之範疇内且由 申請專利範圍涵蓋。 本說明書中所提及之所有公開案及專利申請案皆指示熟 習本發明所屬技術者之技能水準。所有公開案及專利申請 案係以引用的方式併入本文中,該引用的程度就如同特定 地及個別地將各公開案或專利申請案以引用的方式併入一 般。 當在申請專利範圍及/或說明書中與術語「包含」一起 14I281.doc -113· 201022492 使用時’詞「-」的使用可意謂「一個(種)」,但其亦與 「一或多個(種)」、「至少一個(種)」及「—個(種)或一個 (種)以上」之含義一致。除非明確指示為僅指代替代物或 替代物為互斥的,否則申請專利範圍中術語「或」的使用 用於意謂「及/或」,而本揭示案支持僅指代替代物及「及/ 或」之定義。在整個申請案令,術語「約」用於表明值包 括用於測定該值之裝置、方法的固有誤差變化或研究個體 中存在之變化。 如本說明書及申請專利範圍中所用之詞「包含」、「具 有」、包括」或「含有」為包含性的或開放式的且並不排 除其他未陳述之元件或方法步驟。 如本文所用之術語「或其組合」係指該術語之前所列之 項目的所有排列及組合。舉例而言,「A、B、c或其組 合」意欲包括八、8、(:、八6、八(:、8(:或八8(:中之至少一 者,且若在特定情形中次序為重要的,則亦包括ba、 CA、CB、CBA、BCA、ACB、BAC 或 CAB。繼續此實 例,明確包括含有重複出現之一或多個項目或術語的組 合,諸如BB、AAA、MB、BBC、AAABCCCC、CBBAAA、 CABABB等。熟習此項技術者應瞭解,除非自上下文另外 顯而易見,否則通常在任何組合中不存在對項目或術語之 數目的限制。 本文所揭示及主張之所有組合物及/或方法可根據本揭 示案在無不當實驗之情況下製得及執行。儘管已就較佳實 施例描述本發明之組合物及方法,但熟習此項技術者將顯 UUSLdoc •114· 201022492 而易見,在不脫離本發明之概念、精神及範疇的情況下變 化可適用於本文所述之組合物及/或方法及方法之步驟或 步驟之順序。熟習此項技術者顯而易見之所有該等相似替 代物及修改被視為在如隨附申請專利範圍所定義之本發明 之精神、範疇及概念中。 參考文獻
Alizadeh, A. A., Eisen, Μ. B., Davis, R. E., Ma, C., Lossos, I. S., Rosenwald, A., Boldrick, J. C., Sabet, H., Tran, T.,Yu, X.等人(2000). Distinct types of diffuse large
Bcell lymphoma identified by gene expression profiling. Nature 403,503-51 1。
Allantaz, F., Chaussabel, D., Stichweh, D., Bennett, L., Allman, W., Mejias, A., Ardura, M., Chung, W., Wise, C., Palucka,K.等人(2007). Blood leukocyte microarrays to diagnose systemic onset juvenile idiopathic arthritis and follow the response to IL-1 blockade. J Exp Med 204, 2131-2144。
Allantaz F, Chaussabel D, Banchereau J, Pascual V (2007) Microarray-based identification of novel biomarkers in IL-1 -mediated diseases. Curr Opin Immunol 19: 623-632。
Baechler, E. C., Batliwalla, F. M., Karypis, G., Gaffney, P. M., Ortmann, W. A., Espe, K. J., Shark, K. B., Grande, W. J.,Hughes, K. M·, Kapur, V.等人(2003). Interferon 141281.doc -115- 201022492 inducible gene expression signature in peripheral blood cells of patients with severe lupus. Proc Natl Acad Sci U S A 100, 2610-2615 。
Bennett, L.,Palucka, A. K·,Arce, E.,Cantrell, V·, Borvak, J·, Banchereau,J.及 Pascual, V. (2003). Interferon and granulopoiesis signatures in systemic lupus erythematosus blood. J Exp Med 197,711-723 °
Bittner, M., Meltzer, P., Chen, Y., Jiang, Y., Seftor, E., Hendrix, M·,Radmacher, M., Simon, R., Yakhini, Z., Ben-Dor,A.等人(2000). Molecular classification of cutaneous malignant melanoma by gene expression profiling. Nature 406, 536-540 °
Bleharski, J.R., H. Li, C. Meinken, T.G. Graeber, M.T. Ochoa, M. Yamamura, A. Burdick, E.N. Sarno, M. Wagner, M. Rollinghoff, T.H. Rea, M. Colonna, S. Stenger, B.R. Bloom, D. Eisenberg 及 R.L. Modlin. Use of genetic profiling in leprosy to discriminate clinical forms of the disease. Science (New York), N.Y 2003.301:1527-1530。
Burczynski, Μ. E., Twine, N. C., Dukart, G., Marshall, B., Hidalgo, M., Stadler, W. M., Logan, T., Dutcher, J., Hudes, G., Trepicchio,W. L.等人(2005). Transcriptional profiles in peripheral blood mononuclear cells prognostic of clinical outcomes in patients with advanced renal cell carcinoma. Clin Cancer Res 11, 1181-1189。 141281.doc -116- 201022492
Casanova,J.L.及L. Abel. Genetic dissection of immunity to mycobacteria: the human model. Annual review of immunology 2002.20:581-620 °
Chaussabel, D.,Allman, W.,Mejias,A.,Chung, W., Bennett, L.,Ramilo,O.,Pascual,V.,Palucka, A. K.及 Banchereau, J. (2005). Analysis of significance patterns identifies ubiquitous and disease-specific gene-express ion signatures in patient peripheral blood leukocytes. Ann N Y Acad Sci 1062, 146-154。
Chaussabel, C., Quinn, C., Shen, J., Patel, P, Glaser, C., Baldwin, N·, Stichweh, D., Blankenship, D., Li, L., Munagala,I_,Bennett, L.,Allantaz,F., Mejias, A.,Ardura, M.,Kaizer, E·,Monnet,L.,Allman, W.,Randall,H., Johnson, D.,Lanier, A., Punar, M., Wittkowski, K. M., White, P., Fay, J., Klintmalm, G., Ramilo, O., Palucka, A. K_, Banchereau, J·及 Pascual, V· (2008). A Modular Framework for Biomarker and Knowledge Discovery from Blood Transcriptional Profiling Studies: Application to Systemic Lupus Erythematosus. Immunity.出版中。
Cobb, J. P., Mindrinos, Μ. N., Miller-Graziano, C., Calvano, S. E., Baker, Η. V., Xiao,W., Laudanski, K., Brownstein,B. H” Elson, C. M.,Hayden, D. L.等人(2005). Application of genome-wide expression analysis to human health and disease. Proc Natl Acad Sci USA 102, 4801- 141281.doc -117- 201022492 4806。
Gack, M.U., Y.C. Shin, C.H. Joo, T. Urano, C. Liang, L. Sun, O. Takeuchi, S. Akira, Z. Chen, S. Inoue^LJ.U. Jung. TRIM25 RING-finger E3 ubiquitin ligase is essential for RIG-I-mediated antiviral activity. Nature 2007.446:916- 920 °
Greenwald, R.J.,Y.E. Latchman及 A.H. Sharpe. Negative co-receptors on lymphocytes. Current opinion in immunology 2002.14:391-396 °
Golub, T. R., Slonim, D. K., Tamayo, P., Huard, C., Gaasenbeek, M., Mesirov, J. P., Coller, H., Loh, M. L., Downing, J. R·,Caligiuri, M. A.等人(1999). Molecular classification of cancer: class discovery and class prediction by gene expression monitoring. Science 286, 531-537 。
Jacobsen,M·,J. Mattow,D. Repsilber及 S.H. Kaufmann. Novel strategies to identify biomarkers in tuberculosis. Biological chemistry 2008。
Jacobsen, M., D. Repsilber, A. Gutschmidt, A. Neher, K. Feldmann,H.J. Mollenkopf, A. Ziegler及 S.H. Kaufmann.
Candidate biomarkers for discrimination between infection and disease caused by Mycobacterium tuberculosis. Journal of molecular medicine (Berlin, Germany) 2007.85:613- 621 ° 141281.doc -118- 201022492
Kaizer, E. C., Glaser, C. L., Chaussabel, D., Banchereau, J·,Pascual,V.及White, P. C. (2007)· Gene expression in peripheral blood mononuclear cells from children with diabetes. J Clin Endocrinol Metab 92, 3705-3711。
Kaufmann, S.H.及 A.J. McMichael. Annulling a dangerous liaison: vaccination strategies against AIDS and tuberculosis. Nature medicine 2005.ll:S33-44。
Keane, J. TNF-blocking agents and tuberculosis: new drugs illuminate an old topic. Rheumatology (Oxford, England) 2005.44:714-720。
Li, X., B. Gold, C. O'Huigin, F. Diaz-Griffero, B. Song, Z. Si, Y. Li, W. Yuan, M. Stremlau, C. Mische, H. Javanbakht, M. Scally, C. Winkler,M. Dean及 J. Sodroski. Unique features of TRIM5alpha among closely related human TRIM family members. Virology 2007.360:419-433。
Martinez, F.O.,S. Gordon, M. Locati 及 A. Mantovani. Transcriptional profiling of the human monocyte-to-macrophage differentiation and polarization: new molecules and patterns of gene expression. J Immunol 2006.177:7303-7311 °
Meroni,G.及 G. Diez-Roux. TRIM/RBCC,a novel class of 'single protein RING finger' E3 ubiquitin ligases. Bioessays 2005.27:1147-1157 ° 141281.doc -119- 201022492
Mistry, R., J.M. Cliff, C.L. Clayton, N. Beyers, Y.S. Mohamed, P.A. Wilson, H.M. Dockrell, D.M. Wallace, P.D. van Helden, K. Duncan 及 P.T. Lukey. Gene-express ion patterns in whole blood identify subjects at risk for recurrent tuberculosis. The Journal of infectious diseases 2007.195:357-365。
Nisole, S.,J.P· Stoye及 A. Saib. TRIM family proteins: retroviral restriction and antiviral defence. Nat Rev Microbiol 2005.3:799-808 °
Pascual V,Allantaz F, Arce E, Punaro M, Banchereau J (2005) Role of interleukin-1 (IL-1) in the pathogenesis of systemic onset juvenile idiopathic arthritis and clinical response to IL-1 blockade. J Exp Med 201: 1479-1486。
Rajsbaum, R., J.P. StoyeJIA. O'Garra. Type I interferon-dependent and -independent expression of tripartite motif proteins in immune cells. European journal of immunology 2008.38:619-630 °
Ramilo, O., Allman, W., Chung, W., Mejias, A., Ardura, M., Glaser, C., Wittkowski, K. M., Piqueras, B., Banchereau, J·,Palucka,A. K.及 Chaussabel,D. (2007). Gene expression patterns in blood leukocytes discriminate patients with acute infections. Blood 109,2066-2077 o
Reljic, R. IFN-gamma therapy of tuberculosis and related infections. J Interferon Cytokine Res 2007.27:353-364 ° 141281.doc -120- 201022492
Reymond, A., G. Meroni, A. Fantozzi, G. Merla, S. Cairo, L. Luzi, D. Riganelli, E. Zanaria, S. Messali, S. Cainarca, A. Guffanti,S. Minucci,P.G. Pelicci及 A. Ballabio. The tripartite motif family identifies cell compartments. Embo J 2001.20:2140-2151 °
Rubins, K.H., L.E. Hensley, P.B. Jahrling, A.R. Whitney, T.W. Geisbert, J.W. Huggins, A. Owen, J.W. Leduc, P.O. Brown 及 D.A. Reiman. The host response to smallpox:
analysis of the gene expression program in peripheral blood cells in a nonhuman primate model. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 2004.101:15190-15195。
Song, B., B. Gold, C. O'Huigin, H. Javanbakht, X. Li, M. Stremlau, C. Winkler, M. Dean 及 J. Sodroski. The B30.2(SPRY) domain of the retroviral restriction factor TRIM5alpha exhibits lineage-specific length and sequence variation in primates. J Virol 2005.79:6111-6121 °
Thach, D. C.,Agan, B. K.,Olsen, C., Diao, J‘,Lin, B·, Gomez, J., Jesse, M.,Jenkins, M.,Rowley, R., Hanson, E. 等人(2005). Surveillance of transcriptomes in basic military trainees with normal, febrile respiratory illness, and convalescent phenotypes. Genes Immun. 6(7): 588-95 ° 【圖式簡單說明】 圖1展示42位參與者之存在於至少2個樣品中之基因 141281.doc -121 - 201022492 (PAL2)的基因陣列表現結果,基因與中值相比過度表示或 不足表示2倍,藉由比較活動性PTB、潛伏性TB、未經 BCG接種之健康對照及經BCG接種之健康對照的皮爾森相 關而叢集; 圖2展示PAL2之基因陣列表現結果,其上調表現或下調 表現2倍,使用非參數測試(克拉斯卡-瓦立斯)以本傑明-豪 克伯格校正(1473種基因)針對臨床組之間的表現之統計學 上顯著差異(Ρ<〇.〇1)而過濾且使用比較活動性PTB、潛伏 性TB及健康對照之皮爾森相關而獨立地叢集; 圖3A-3D展示PAL2之基因陣列表現結果,其上調表現或 下調表現2倍,使用非參數測試(克拉斯卡-瓦立斯)以本傑 明-豪克伯格校正對臨床組之間的表現之統計學上顯著差 異(P<0.01)進行過濾且接著在基因註釋中針對生物過程之 基因本體術語「免疫反應」的存在進行過濾且使用皮爾森 相關(158種基因)而獨立地叢集。為清晰起見,此等158種 基因分成4個圖(3A-3D)展示; 圖3A展示比較活動性PTB、潛伏性TB、未經BCG接種之 健康對照及經BCG接種之健康對照的基因陣列表現結果; 圖3B展示比較活動性PTB、潛伏性TB、未經BCG接種之 健康對照及經BCG接種之健康對照的基因陣列表現結果; 圖3C展示比較活動性PTB、潛伏性TB、未經BCG接種之 健康對照及經BCG接種之健康對照的基因陣列表現結果; 圖3D展示比較活動性PTB、潛伏性TB、未經BCG接種之 健康對照及經BCG接種之健康對照的基因陣列表現結果; 141281.doc -122- 201022492 圖4展不42位參與者之存在於至少2個樣品中之基因 (PAL2)的基因陣列表現結果,基因與中值相比過度表示或 不足表示2倍’選擇為TRIM之基因係藉由比較活動性 PTB、潛伏性TB、未經BCg接種之健康對照及經BC(3接種 . 之健康對照的皮爾森相關而叢集; 圖5A展示42位參與者之存在於至少2個樣品中之基因 (PAL2)的詳細基因陣列表現結果,基因與中值相比過度表 示或不足表示2倍’藉由比較活動性ρτΒ、潛伏性tb、未 ❿經BCG接種之健康對照及經BCG接種之健康對照的皮爾森 相關而叢集’其顯示抑制性免疫調節配位體(pDL Η CD274、PDL2/CD273)在活動性ΤΒ患者中過度表現; 圖5Β展示證實PDL1僅在活動性ΤΒ患者中表現之未經過 濾基因陣列表現結果; 圖6展示針對存在於至少2個樣品中之基因而過濾之基因 陣列表現結果,與中值相比上調「表示」或下調「表示」 φ 2仡跨越組在統計學上顯著差異地表現(Ρ<〇. 1,克拉斯 卡-瓦立斯非參數測試,以邦弗朗尼校正)(46種基因),使 用比較活動性ΡΤΒ、潛伏性ΤΒ、未經BCG接種之健康對照 及經BCG接種之健康對照的皮爾森相關而獨立地叢集; 圖7展示針對存在於至少2個樣品中之基因而過濾之基因 陣列表現結果,與中值相比上調「表示」或下調「表示」 2倍,跨越組在統計學上顯著差異地表現(p<〇〇5,克拉斯 卡-瓦立斯非參數測試,以邦弗朗尼校正)〇8種基因)中, 使用比較活動性PTB、潛伏性TB、未經BCG接種之健康對 141281.doc -123- 201022492 照及經BCG接種之健康對照的皮爾森相關而獨立地叢集; 圖8 A展示合併應用於存在於至少2個樣品中之經過濾基 因列表之不同統計過濾的結果(與中值相比上調「表示」 或下調「表示」2倍)區分所有三個臨床組。所示轉錄物在 潛伏性與健康之間在統計學上顯著差異地表現(p<〇 〇〇5, 魏氏-曼-惠特尼非參數測試,無校正),且轉錄物在活動性 與健康之間在統計學上顯著差異地表現(p<〇 5,魏氏_曼_ 惠特尼非參數測試,以邦弗朗尼校正),總共119種基因係 使用皮爾森相關而獨立地叢集(患者/臨床組叢水平地呈現 參 且基因叢垂直地呈現);為清晰起見且為顯示此等基因之 子組亦可用以區分不同臨床組(亦即,活動性、潛伏性及 健康),此等119種基因分成5個其他圖(8B_8F)而展示; 圖8B展不針對存在於至少2個樣品中之基因而過濾的基 因陣列表現結果,與中值相比上調「表示」或下調「表 不」2倍’轉錄物在潛伏性與健康之間在統計學上顯著差 異地表現(P<〇.〇〇5,魏氏_曼_惠特尼非參數測試,無校正) 且轉錄物在活動性與健康之間在統計學上顯著差異地表現© (P<〇.5,魏氏-曼-惠特尼非參數測試,以邦弗朗尼校正患 者/臨床組叢水平地呈現且基因叢垂直地呈現); · 圖8C展示針對存在於至少2個樣品中之基因而過濾的基 · 因陣列表現結果’與中值相比上_「表示」或下調「表 不」2倍,轉錄物在潛伏性與健康之間在統計學上顯著差 異地表現(P<G.GG5 ’魏氏·曼·惠特尼非參數測試,無校正) 且在活動性與健康之間在統計學上顯著差異地表現 141281.doc -124· 201022492 (P<〇.5,魏氏-曼-惠特尼非參數測試以邦弗朗尼校正); 圖8D展示針對存在於至少2個樣品中之基因而過滤的基 因陣列表現結果,與中值相比上調「表示」或下調「表 不」2倍,轉錄物在潛伏性與健康之間在統計學上顯著差 異地表現(P<G_GG5,魏氏·曼·惠特尼非參數測試,無校正) 且轉錄物在活動性與健康之間在統計學上顯著差異地表現 (P<〇.5,魏氏-曼-惠特尼非參數測試,以邦弗朗尼校正穴患 者/臨床組叢水平地呈現且基因叢垂直地呈現广 圖8E展示針對存在於至少2個樣品中之基因而過濾的基 因陣列表現結果,與十值相比上調「表示」或下調「表 示」2倍,轉錄物在潛伏性與健康之間在統計學上顯著差 異地表現(Ρ<〇·〇〇5,魏氏-曼-惠特尼非參數測試無校正) 且轉錄物在活動性與健康之間在統計學上顯著差異地表現 (Ρ<〇.5,魏氏-曼-惠特尼非參數測試,以邦弗朗尼校正X患 者/臨床組叢水平地呈現且基因叢垂直地呈現); 圖8F展示針對存在於至少2個樣品中之基因而過濾的基 因陣列表現結果,與中值相比上調「表示」或下調「表 示」2倍,轉錄物在潛伏性與健康之間在統計學上顯著差 異地表現(Ρ<0.005,魏氏-曼-惠特尼非參數測試,無校正) 且轉錄物在活動性與健康之間在統計學上顯著差異地表現 (Ρ<〇·5,魏氏·曼-惠特尼非參數測試,以邦弗朗尼校正)(患 者/臨床組叢水平地呈現且基因叢垂直地呈現); 圖9展示ΡΤΒ(9)對比對照(6)之基因模組分析的基因陣列 表現結果.來自5281種基因,針對pal 2進行過渡,藉由魏 141281.doc -125- 201022492 氏-曼-惠特尼測試在無多次測試校正下在活動性PTB與健 康對照之間在統計學上顯著差異地表現(ρ<〇·〇5);及 圖10展示LTB(9)對比對照(6)之基因模組分析的基因陣列 表現結果:來自3137種基因,針對PAL2進行過濾,藉由魏 氏-曼-惠特尼測試在無多次測試校正下在活動性PTB與健 康對照之間在統計學上顯著差異地表現(ρ<〇·〇5)。 141281.doc 126- 201022492 探針Π) Entrez 基因 Π) 5260463 0.00998 常用名 基因庫ID 基因符號 描述 獨特基因ID CR603183 智人(人類)胎肝之全長cDNA^t系CS0DM012YE14HS.586401 4610546 0.00998 EIF1A; EIF4C; eIF-ΙΑ; eIF-4C 1964 KIAA1423 跨膜蛋白181 S100P S100 鈣結合蛋白 P Hs.2962 6286 160398 0.00992 GPR178; KIAA1423 57583 2640609 0.00992 MIG9 NM_005980 2350026 0.00992 CECR6 M«_031890 CBCR6 Hs 209577 27439 - 5090386 0.00991 LOC653904 XM 943043 653904 1820196 0.00989 RAYL NM_006860 BAK.4 11020 5690201 0.00986 PAR2; GPR11 NM 005242 Hs.154299 2150 ^ 1780392 0.00984 DKC; NAP57; N0LA4; XAP101;角化素 Hs.4747 1736 1030142 0.00984 P5-1; D6S2650B NM 006674 HCP5 6200017 0.00979 GIG18 M«_002079 GOTI HsT500756 2805 從1412 EIF1AX「真核轉譯起始因子lA,X.連接Hs52259〇 XM 941693 貓眼症候群染色體區域,候選者6」 L0C653904 類似於假定蛋白FLJ14346 RAS致癌基因家族樣成員4」 Hs.415172 凝血因子Π (凝血酶)受體樣1 NM_〇〇m3 DKC1 「先天性角化不良i,角化素」 HLA 複合物 P5 Hs.654480 10866 麩胺酸草醮乙酸轉胺酶1,可溶(天冬胺酸轉胺酶丄) 「CM3-MT0357-260101*6904)10MT0357智人CDNA、mRNA^ 列」 6380424 0,00978 PMSL1; hPMSJ; HNPCE3; DKFZp781M0253 ^,000534 PMS1 pMSl 增加之減數分裂後分^ 一一 Hs.488171 5890653 0.00979 BI024234 厂 F2RL1
Is.111749 1 (ft®酵母 iS.cerevtsiae) ) Η! 3\4mr〇:〇m5 Nuda; KIAA1068 NM 015332 23386 — 3940719 0.00975 BX111927 得錄丞四厓 Hs.659410 2760475 0.00975 ANKRD46 NM 198401 ANKRD46錨蛋白重複域46 Hs 530199 730519 0.00972 MDIG; N052; MINA53; FU14393; DKFZp76201912 NM 153182 MINA MYC Hs .655935 84S64 ' 830674 0.00972 IGA; MB-1 NM 001783 CD79A CD79a分子,免疫球蛋白相關a」 Hs.631567 973 7200086 0.00966 BOG; RBBP10; MGC9236 NM.006606 FBBP9 視網膜母細胞瘤結合蛋白9 Hs.69330 10741 5890327 0.00966 AR; ADR;^1;^1804 ^001628 船皿「醛酮還原酶家族卜成員B1 (醛糖還原酶) 6550161 0.00964 K60; NAF; GCP1; LECT; LUCT; NAP1: 3-l»C: a〇8; GCP-l; LYNAP; MDNCF; MONAP* NAP-1- STYRR-TSG-1; AMCF-1; b-ENAP NM.000584 IL8 务白射 Hs.624 3576 # ^ 漏482 0.00963 eIF3f; eIF3-p47雜溫 ㈣ 「真核轉譯起始因子3,次單元5。47心」 7160577 0.00963 FLJ38973 NMJ53689 FLJ38973 ' 205327 ~ 6620348 0.0096 FU13639 NM_024705 FLJ 13639 Hs.266728 79758 5490142 0.00957 p2; p3; p4; RSP6; PMSCL; Rrp6p; PM-Scl; PMSCL2; PM/Scl-100 NM 002685 外來體組份 10 Hs. 632368 5394 " 5420035 0.00957 SUN1; FU12407; KIAA0810 NM 025154 Hs.438072 23353 ' 290484 0.00957 p〇071; FU31261; FU42243 NM 003628 8502 7610594 0.00957 RIPS; DustyHC; HDCMD38P; KIAA0472 NM」)15375 RIPK5 Hs.6874 25778 4850678 0.00957 LRR-1; 4-18^^20689^ NM.152329 PPIL5 肽基脯胺醯異構酶(親環素)樣5 6040445 0.00954 MGC150678;*MGC150679 NM 015231 23279 1690521 0.00954 RSAS NM 006270 6237 " 1470711 0.00954 CD3H; CD3Q; CD3Z; ΤΠΙΖ; CD3-ZETA 919 2710612 0.00951 Brox; FLJ32421; W3C142195; MGC142197; RP11-452F19.1 NM 144695 Clorf他 条色體1開放閱讀框架58 Hs. 552608 148362 Uorf58 1690537 0.00946 C18B11; C15orfl9; FU31409 NM^l52260 RPUSD2 含RNA假尿芬縫合ώ 維祕2 Hs. 173311 27079 m 外贫硬〇取魄域^ 4050592 0.00946 BX115904 轉錄基因座 Hs. 171251 4260241 0.00942 LSG; HMFT1766 NM.052972 LRG1 白胺酸富集a-2-醣蛋白 1 Hs.655559 116S44 5130475 0.00942 ACPL; CDw218b^MGCl20589;^MQC120590 NM_003853 ILl8RAP 介白素 18受體附加蛋白 4590243 0.0094 0SGEPL1 NM:022353 OSGEPL1 O-嗓液酸醣蛋白内肽酶樣 1 Hs.60772 64172 NUDCD3 含NudC域3 157567 誘導之核抗原 假定蛋白 FU 38973 Hs. 471040 去氩酶/還原酶(SDR家族)成員12 EX0SC10 UNC84Aunc-84同源物A (缘蟲(C.deg3ns)) ΪΚΡ4 斑菲素蛋白4 Hs. 407580 受體相互作用蛋白激酶5 NUP160 核孔蛋白 10〇kDa Hs.643526 相關RAS病毒(r-ras)致癌基因同源物 Hs.515536 NM_i98053 CD3Z CD247 分子 HS. 156445 6200397 0.00939 ΜΟ:15763 NM—l 38381 MC5C15763 Hs.655449 92Ϊ06 含氧化還原梅NAD結合域1 141281.doc 127- 201022492 3990376 0.00939 KIAA1862 NM.032534 84626 4610113 0.00939 PYGL ^002863 Hs.282417 4250398 0.00939 H4/g; H4FG; dJ221C16.1 NM_003542 Hs.46423 8364 KIAA1665; ^2965¾ 3890079 0.00936 IRF-2; Dl(FZp686F0244 NM*002199 3660 " 5860553 0.00936 KIAA0442; MGC13140 NM_015570 Hs.654801 26053 — 3840364 0.00935 GLYI; GL0D1 ^006708 GL01 4560^9 0.00933 EHT; MTGR1; 2MYND3; DKFZp333F2116 含 KRAB>A域 1 Hs. 299560 pGL 「5f3f化酶,糖原:肝臟(赫斯氏病,糖原儲存疾病贝型)」κΛ,「組蛋白叢集l,H4cj KIAA1862
HIST1H4C Πΐϋ338 聚合酶(RNA) ΠΙ (DNA引導) IRF2干擾素調節因子2 Hs.654566 AUTS2孤獨症易感性候選者2 乙二醛酶I 1^.001032999 Hs.153934
Hs.268849 2739 恶^2 「核心ίΐ合因子,runt域,α次單元 1S50068 0.00933 L0C652672^^^ XM_942252 LDC652672 類似於損傷特異性>DNA結合蛋白 1 1440487 0.0093 SSF; SSF1; SSF2; BXDC3; MGC14226; MGC45852 NM.020230 PPAN 彼得潘同源物(果繩) 1990180 0.0093 00^ 彰21151 CR0T 肉鹼0-辛醯基轉移酶 Hs.125039 54677 5900296 0.0093 C10orf6 NM„018121 C10orf6 染色體 1〇開放閱讀框架6 Hs.447458 2190008 0.0093 FN14; CD266; TOFRSF12A 「腫瘤壞死因子受體超家族,成員 12A」 7330497 0.00928 5220408 0.00927 4250168 0.00926 2470274 0.00925 1440037 0.00924 Ray; FU39121; CKFZP5&6F1318 Hs.515951 1980608 0.00921 380438 0.00916 5261 6580075 0.00914 NRF2 4780 RZF: MGC13689 NMJ ?mm NM.000294 W.006164 130010 0.00913 Xtt_945975 5550470 0.00912 C20orf99; M0C104290 Hs.28608 85364 2630451 0.00912 H2B; Gl :總應?微 3M.942836 L0C647346 CR613022 智人(人類)胸腺之全長cDNA純系CS0CAP006YGO5 AK091337 「CDi^^3忠Jgfis,純系FCBBF2002801」Hs.659401 AW079487 墓因產 Hs. 542299 267515677 酿1*1「含挪域,Ys〇84樣1 (酿酒醉母;)」 007282 PHKG2 RNF13 環指蛋白13 「4酸化酶激酶,γ2 (睾丸)」 NFE2L2核因子(紅血球衍生之2)樣2 11342
Hs.196177 Hs.155396 C17orf60 HM_033089 Hs.28608 85364 S30451 0.00912 H2B; GL105; H2B.1; H2B/q; H21 〜一 —』 Hs,2178 8349 IL3ffi>l; NFIL3A; NF-IL3A NM.005384 Hs.79334 4783 94034S 0.0091 GCL NM 012198 GCA 25801 6550437 0.0091 CLB; bA134015,l NM.206808 5260332 0.0091 0R11-7 ΝΜβ001005172 OR52K2 Hs.553568 119774 6760630 0.00909 FU10563 NM.018139 55172 580367 0.00909 IPP1; IPPI1 NM.00450S Hs.283652 3422 5090739 0.00909 FU40871; KIAA1129; MGC44594 Hs.655084 26249 270102 0.0090S TCFla; DKFZp586H0919 Hs.555947 51176 5260546 0.00906 FLJ13848 NM„024771 79829 460685 0.00906 AT?6 NM.007348 ATF6 22926 1780521 0.00906 PML XM„942288 亂「早幼粒細胞性白叙病;同物異名:MYL、RNF71、PP8675、 微&:白%異蛋气气7春Ϊ筆11¾¾¾¾¾田)胞十聯基元^ 3850082 0.00905 Bcl-2 NM_000633 _____BCL2 B細胞CLL/淋巴遍2 2COO「辞指,含CCHC域3 MGC129733; IIGC129734 M*_003528 NFIL3 「核因子 「粒鈣蛋白,EF手鈣結合蛋白」 CLYBL 檸檬睃解離峰β樣 Hs. 655642 HTST2H2BE 受介白素3調節」 「嗅覺受體 Ci4orfl04 IDI1 Ν〇17415 NM.016269 FLJ13848 活化轉錄因子6 家族52,子族K,成員2」 染色體14開放閱讀框架1〇4 異戊烯基-二磷酸δ異構酶1 KLHL3 kelch 樣3 (果蠅) 淋巴強化子結合因子1 N·乙醯基轉移酶11 Hs. 523753 Hs.492740
Hs.377894 171425 _ i _____ Hs. 150749 596 3990538 0.00903 EVDA; EVI2 NM.001003927 EVI2A 親啫性病|整合位點2A 2123 Γ XM.93626? WDR74 「WD重複域74 :同物異名:FLJ10439、FLJ21730 ;智人
Hs.591198 33906Q3 0.00903 WDR74 XM WD重複域74 (WDR74y 70097 0.00903 L0C400987 一400987 XM 376101 L0C4O0987 Hs.534785 4070139 0.00901 XM 941763 L0C652334 1770092 0.00901 LSD; DHP2; DNAS1L3 Nli_004944 DNASE1L3 Hs.476453 1776 ^ tu 6040343 0.009 ΚΙΜ1982 NMJ33474 ZNF721 鋅指蛋白 721 類似於錨蛋白重複域36 去氡核糖核酸酶I樣3 Hs.428360 17W60 141281.doc •128- 201022492 m 001013840 C10orf61 W(FZp564D116 26123 PheRS; HSPC320; dJ520BI8.2 Hs.484547 10667 ΑΙΌ49390 MRNA; 染色體10開放閱讀框架61 FARS2 「苯基丙胺醯基-tRNA合成酶 cIM DKFZp58601318 (來自純系DKFQ)58601318) ❹ 6270546 0.009 TECT3; Hs.438991 130403 0.00899 FARSI; 2,釭線身」 4220301 (Γ00898 Hs.22689 2480762 0.00898 7610131 0.00896 _ 2070497 0.00896 ZF5; ΖΒΊΒ14; ZNF478 Hs. 592340 7541 160523 0.00896 YER146W; FU12710 NMJH2322 LSM5 Hs.424908 23658 4260433 0.00896 FAT; GP4; GP3B; GPIV; CHDS7; PASIV; SCARB3 i^62^)〇〇m HZF10 NM_00341§S’12〇94|nF345 蛋白 345 1090041 0.00892 MGC21518 NMJ45274 ΏΙΕΜ99 跨膜蛋白 99 147184 2690356 0.00889 NM 031943 IFP38 3170598 0.00889 TOSP; KIAA1397; RP3-442A17.1 NMJJ20245 ΐυΐΡ4 56995 2650170 0.00889 SKI6; pl2A; RRP41; Ski6p; RRP41A; Rrp41p; bRrp41p; FU20591 外來艟組份4 Hs.632041 54512 L m 2490471 0.00889 pim-3 XM_938171 PIM3 pira-3 致癌基因 730561 0.00888 DKFZP434AOT31; MGC40269; MGC131759 NM_018991 蛋白 Hs 63的10 54441 7050020 0.00885 FRRS2 NM„001017916 CYB561 鈿胞色素lv561 2710491 0.00884 XM:929879 w υ〇Μ44850 3370470 0.00884 PP791; KIAA1837; PKDiiJt; RP4-765A10.3 NM.024874 KIAA0319 樣 Hs.456507 79932 4880687 0.00883 DEP.7; PGR22; DEPDC3; FU31819; FU39346 lfl!_001033045 Hs.516604 151556 ^ ^ , 1780131 0.00879 Cos5; MGC59928 NM 021915 ZNF69 鋅指蛋白69 - "MGC1910; PRmBP; FU41108; RF11-490K7.3 Hs.33962 9410 _________________ _______ ____________NR1F1; MGCU9326; MGC119329 娜—134262 RAR-相關孤兒受體 A Hs,654353 6095 一 3930010 0.00878 NBPF1 XM_934972 舰们「神經母細胞瘸斷裂點家族,成員1 ;同物異名:AD2 、HAA1693 ;智人#經母細胞瘤斷裂點家族’ ΧΜ„945523 ΧΜ 935475 ΝΜ·006567 L0C649564 L0C65382O ί; MGC126126 ΝΚ.003409 ι/ouiji υ.υυΰ/y losd; nm u^iyj 6770053 0,00879 40K; SPF38; PRP8BP" MGC] WD貪複域57 ( U5 snRNP特矣幻 6200068 0.00878 R0R1; R0R2; ROT3; TOM;
AB13、ABU、AB23、NBPF EU20719 NM 138779 L0C93081 鋅指蛋白161同源物(小鼠) 「LSM5同源物,U6小核RNA相關(釀酒酵母)」 CD36分子(血小板反應 Hs.362324 ZFP161 NHL001001548 0)36 tubby樣蛋白4 25850 Hs.353163 NM 019037
Hs.486993 K0SC4 415116 DKFZP434A0131
Hs.355264 DKFZp434A0131 1534 KIAA0319L GPRl!i5 G蛋白偶和受體155
Hs.661955 NM 004814 7620 WDR57
SORA _ NBG> ,-咸員l(NBPFl),mRNAj 染色體13開放閲讀框架27 4250121 0.00876 C13orf27 Hs.398111 93081 4260392 0.00876 ATI; ATA; ATC; ATD; ATB; ATDC; TEL1; TCLOl; M( ATM 「共濟失調毛細血管擴張突變(包括互補組A、CAD 472 1260746 0.00874 IRK1; LQT7; SQT3; HHIRK1; KIR2.1; HHBIRK1 NM_000891 「内向整流奸44,子暴J,2』 Hs · 1547 3759 3060274 0.00874T1-7A; SGBS2; OorT5; MGC117039; MGCI17040 口-面-指症候群1 Hs .6483 8481 540634 0.00874 DPB1: HLA-DP1B; MHC DI^l NM„002121 Hs,485130 3U5 5340164 O.OOS74 p9; CIP3; EAP2; OIP2; RRP43; Rrp43p; bA421P11.3; RPU-421P11.3 外來體組份8 Hs. 294041 11340 6620747 0.00872 HSZFP36 XM 936858 HSZFP36 辞指蛋白之ZFP-36 55<c-> 5720273 0.0087 GPR19 NM.006143 GPR19 G^:白偶和r受體 19 Hs.657862 2^2 5720743 0.00866 FLJ14464 NM.032789 PAS>ia 令聚(奶?·核糖)聚合酶家族,成員 10 :74674; DKFZp781A0353 NM.003611 HLA-IPB1 ML000051 Hs.367437 KCNJ2 0FD1 「主要组織相容性複合物,Π類,ΟΡβΙ」 NM^181503 EX(BC8 OJI Hs.348609 84875 2100471 0.00866 FRBZ1; FU36199; RP11-469L3.1; DKFZp686C06120 含鋅指及 BTB域 41 Hs. 529439 360023 5690619 0.00866 dJ492J12.1 XM 940057 C20orfl74 128611 ~ NM 194314 ΖΒ1Έ41 染色艘20開放閱讀框架Π4 670121 0.00866 FBX14; Fbx31; NM_024735 FBX031 F· 3400767 0.00866 GPR54; AX0R12; ΗΟΓ7Τ175 MJ_032551 6550064 0.00861 U2AF1L4; FU22573 NM_024660 79713 2710278 0.00859 GLYA; SHKT NM.005412 SI Hs.75069 6472 _ 1940544 0.00856 TAT-SF1; dJ196E23.2 NM 014500 27336 " 5310408 0.00853 RJ13297; K1AA0643 NM 015041 23059 ' BFIP-4; IjC-PTP ' Hs.402773 FBW)14; pp2386; MGC9527; FU22477; MC5C15419; IKFZP434B027; DKFZp434J1815 蛋白31
Hs.567582 KISS1R 79791 “ KISS1受嫌 U2AF1L4跨膜蛋白149
Hs.208229 84634 Hs.352548 絲胺酸羥甲基轉移酶2 (粒線艘) HTATSF1 HIV-1 Tat特異性因子ι CLUAP1凝聚素相關蛋白1
Hs.204475 Hs.155995 3180402 0.00853 LPTP; HEPTP; PTPNI: BI ^•白酪胺酸填酸酯酶,非受體也7j 2940358 0.00853 BCS; BJS; PTD; BCS1; · Hs.471401 617 fW_080588 5778 PTPN7 h-BCS; GRACILE; Hs.6719 NM_004328 BCS1L BCS1 樣(酵母) 141281.doc -129- 201022492 4040634 0.00851 FU45386沿视18^1_00025^你 WTO 5-甲基四氫葉酸-高半胱胺酸甲基轉移酶 1820288 0.00851 Hkpl; FU22661; FLI23182 NM.022366 TFB2M 「轉錄因子B2,粒線體, Hs.693731 64216 _ 6280333 0.00851 AF1Q; RP11-316M1.10 NM_006818 MLLT11 「骨髓/淋巴或混合系白血病 (三空腔結也要白间森痂,桌场);移位至llj Hs.75823 10962 4880142 0.0085 U31; RNU31 NR_002560 RNU31 「小核仁RNA,C/D盒31」 5700296 0.0085 TM4-A; TO4SF8; TSPAN-3 !«L198902 TSPAN3 四分子交聯體3 Hs.5062 10099 5220717 0.00844 GCP6 NM_020461 HIBGCP6 ------- 853夕8 2710253 0.00844 Mib 9780 「微管杏白,γ複合▲相M蛋白6」 Hs.336431 NM.014745 FAM38A 「具有序列相似性之家族38,成員A」 Hs.513807 6560255 0.00844^20729^ FU20760^gNY-BR-75; MGC131963 NM_017953 Clorfl81 染色體 1 開放閲讀框架 ’ NM.031953 SNX25 分類連接蛋白 25 Hs. 369091 刚_005035 POLRifT聚合酶(RNA)粒線體(DNA引導) NCAID 神經鈣蛋白δ Hs. 492427 KIAA1279 KIAA1279 Hs.279580 6040142 0.00844 SBBI31; MSTP043; FU23161 83891 7330368 0.00844 APOIifT; inBPOL; h-mtRPOL Hs.254113 5442 3130564 0.{K)844 MGC33870; MGC74858 NM 032041 83988 一 110114 0.00843 TTC20; imP586B0923 NM 015634 26128 _ 4070601 0.00843 HP10481 NM_014254 TKEM5 跨膜蛋白5 Hs.216386 10329 »366 2370400 0.00841 PIF79三 P79PIF; OAA1269 NM_012384 GMEB2 糖灰質素調節元件結合蛋白2 Hs.473286 26205 1070377 0.00839 NM_207106 UIPl ,,°J0837 A0Pl '· k0p·1'· SP·22". ΗΪ01748; MGC24293; MGC104387 NM 014098 PRDX3 過氧化物酶3 Hs. 523302 10935 ~ 2750435 0.00833 ML939844 L0C650761 5720184 0.00833 XM.935596 L0C641750 3450221 0.00831 FU12884; MGC130014; MC5C130015 NM_〇〇1〇1〇924 C10orf38 染色«〗〇開故閱讀框架38 Hs.66762 221061 940504 0.00831 TAB1; MGC57664 ΝΗ.006Π6 MAKK7IP1 有絲分裂原活化蛋白激酶7相互作用蛋白i Hs.507681 10454 Γ 5090368 0.00828 AXIL; MGC126582; DKFZp781B0869 NM_004655 AXIN2 「抽蛋白2 (傳導蛋白,轴蛋白同源物) Hs.156527 8313 」 2570450 0.00825 Τ8Αβ 01592039 Τ 細胞受體α基因座 Hs.74647 650131 0.00824 MGC132014 NIL003866 INPP4B「肌酵聚磷酸-4·磷酸酯酶,II塑,105kDa| Hs.658245 8821 , 60441 0,00824 BHLHB6 NM.138983 0LIG1 少突膠質轉錄因子 1 Hs.56663 116448 4120707 0.00823 rpL17; MGC72008; MC5C111167; MGC117346 NM.000978 RR23 核糖體蛋白 L23 Hs.406300 9349 ~ 3520386 0.0082 FP2653; 1100123 Nll„177441 Hs.181391 79089 RP0RIP1 4730100 0.0082 UOC440093 Hs.448697 440093 3130273 0.00819 KIAA0571 9846 NM.001013699 NO80491 5310431 0-00819 E4-DBP; HQ0256; MS1P162; FU30012; (Asp-Glu-Ala-Asp)盒多肽47 Hs.504828 2190672 0.00819 NlfWMPl NM 003634 NI 8508 ~ MGC3123 含跨膜及泛素樣域2 L0C440093 「類似於H3組蛋白,家族3Β」 GAB2 GRB2·相關結合蛋白2 Hs.429434 DDX47 DEAD Hs.173878 義 PABPC4 多聚(A)結合蛋白,細胞質4 DKFZp5640176 NM 016355 51202 PSNAP1 nipsnap 同源物 1 (線蟲) 6550142 0.00819 APP1; APP^l; PABP4; iPABP (可誘導形式L Hs. 169900 150056 0.00819 M0C78578 NM 016817 Hs.414332 4939 ~ 2810767 0.00819 LDLC r«L〇07357 OCX32 22796 6110204 0.00819 U0C642443 XM 926158 〈麩晄甘肽·依賴性甲醛去氩酶)(ίΰΗ) 5690008 0.00818 A0S1; S0A1; RLJ3091; HSPC140 Hs.515500 10055 380523 0.00808 DKFZp68601788 NM.001010891 1690474 0.00808 DA653196 5820594 0.00808 ZNF392; ZNF435; FU22191; dJ265Q4.3 Hs.656641 80345Γ Α 「UI-E^CLl-afe-e-O^OULrl UI-E-CL1 智人 cDNAA 序列.」 ML003819 8761 Γ 0AS2「2Ά-寡腺苷酸合成酶2,69/71 kDaj 募聚高爾基體複合物之組份2 Hs.211800 L0CS42443 mjQS5QQ ΙΠΧ3 SAE1 metaxin 3 轉錄基因座 ML025231 類似於酵去氩酶III類chi鍵 Hs.573295 642443 SUII01 活化酶次單元1 Hs.531418 345778 Hs.633361 ZNF435 含辞指及SCAN域16 5260338 0.00808 BM703456 「纯系 UI-ECLl-rfe»e-04*O-UI 5',mRNA序列 _ 3780603 0.00808 SPI; K1AA1379 NM.020804 Hs.52(K«7 29993 2490279 0.00804 RliP; URI; WC3; FU10575 PACSIN1 神經元1中之蛋白激酶C及酪蛋白激晦受質 NIL134447 Cl9orf2 染色體19開放閱讀框架 141281.doc 130- 201022492 GOLGA8A「高爾基體自«抗原,高爾基嫌蛋白子族a,8Aj Hs. 182982 i hs.400391 8725 620328 0.008 0188 NM.181077 23015 r ^ 4890039 0.00799 BX101194 「3乂101194 3〇财3總胎抓>21^8_細智人(^^^ 純系 IMAGp998B082580; IMAGE: 1032871 5', mRNA序列.」 ~ 2510296 0.0079S TOAP1; TRAP-1 NM_004257 TGFBRAP1 「轉型生長因子,β受艘相關蛋白 1」
Hs 446350 9392 4060044 0.00798 RDL 1340139 0.00798
Hs.567662 123169 N0C1; HSP.CBF NM 005760 Hs.135406 10153 3140491 0.00798 FU13297; KIAA0643 _一015041 23059 6100364 0.00798 FU26025; HSD-PLA2 NJL000437 Hs.477083 5051 580291 0.00798 PRED31; HSPQ30; FU34245; RP11-59I9.1 Hs. 486084 51250 1470647 0.00798 HTP1; Dtrpl; SBC62; HJ32803 NM 003262 7095 3800537 0.00798 L0C152485 NM 178835 U0C1524&5 152485 4390615 0.00798 NM.138557 TIR4 4180187 0.00795 MQC23980; RP11-27J8.2 NM.018325 C9orf72 Hs.493639 203228 730435 0,00795 NAG6; MGC129657; DKFZP434G156 Nil 022742 NAG6 Hs.521178 64753 NM.138792 ' LEOl 「Leol,Pafl/RNA聚合酶II複合物組份,同源物(釀酒酵母)」 CEBPZ CCAAT/強化子結合蛋白ζ ΟϋΑΡΙ凝聚素相關蛋白1 Hs.155995 PAFAH2 「血小板活化因子乙醢基水解酶2,40 kDa」 NIL016487 C6orf203染色體6開放閱讀框架203 TL0C1 移位蛋白 1 Hs.59256! 假定蛋白 U0C152485 Hs. 133916 染色髏9開放閱讀框架72 含捲曲螺旋域136 參 鋅指蛋白404 Hs.76561 AFF3 「AF4/FMR2家族,成員3」 ______ Hs.444414 NM_001706 BCL6 B-細胞 CLL/淋巴瘤 δ LPIN1 脂質素 1 Hs. 467740 23175 3890241 0.00795 ZNF404 BC041923 5960731 0,00795 LAF4; MLLT2-樣 NIL002285 3899 50563 0.00795 BCL5; LAZ3; BCL6A; ZNF51; ΖΒΤΒ27 (辞指蛋白 51) Hs.478588 604 1050324 0·00794 KIAA0188; 0ΚΡΖρ781Π796 MU45693「 ..... ............. 130497 0.00794 BCL7C XM.944463 BCL7C 「B細胞CLL/淋巴瘤7C ;智人B知胞CLL/淋巴邊7(: (BCL7C) mRNAj 1980128 0.00791 RJ20512 NM.017854 FLJ20512 跨膜蛋白 160 Hs. 105606 54958
Hs.434053 腫瘤蛋白p53誘導性蛋白13 Hs.514050 130717 0.00791 GS3786 NM_014888 PAM3C 「具有序列相似性之家族3,成員C」 10447 3830184 0.00786 DSC?1 MI.138349 TP53I13 90313 7160753 0.00786 ITL; D3S1319E ΝΜ_053024 ΙΨΝ2 前纖維蛋白 2 Hs.91747 5217 3450653 0.00786 CBR; hCBRl NM:0O1757 CBR1 羰基還原酶 1 Hs.88778 873 2650347 0.00784 MGC138308; MGC138310; DKFZp781D2217; PFK-2/FBPasc-2 NM 001018053 PFKFB2 「6-磷狻果糖-2-激酶/果糖-2,6-雙磷酸酯酶2」 Hs. 282702 3800082 0.00782 XM 930277 L0C653518 6650475 0.00781 L0C646163 XM.929125 L0C646163 類似於60S核糖鱧蛋白 L3 (L4) 鋅指蛋白染 1¾¾¾1 讀框架r 具有四個mbt域之Scm樣1 參 646163 6250047 0.00781 FU20557 NM 017879 ZNF416 840242 0.0078 MGC23980; RP11-27J8.2 NM 145005 Hs.493639 203228 3840358 0.00778 RUl; SFMBT; I*FZp434L243 NM 001005158 Hs.343679 51460 " 4390408 0.00774 歷 AY475219 T 細胞受體α基因座 Hs 74647 6520075 0.00771 ZNF544 NM.014480 ZNF544 鋅指蛋白 544 Hs 4389W · 27300 5890041 0.00771 C3G; GRF2; DKFZp781P1719 NIL005312 ----- w 1 Hs.127897 2889 6330450 0.00763 TR2; TB2-11 NMJJ01032287 NR2C1「核受體子族2,組C,成員 1 _ Hs.108301 7181 7560615 0.00763 XM_929502 BGFL5 1300524 0.00763 U0C647436 XM 937113 L0C647436 647436 6520167 0.00763 AIP1; API2; MIHC; CIAP2; HAIP1; HIAP1; MALT2; RNF49 MH 001165 含桿狀病毒IAP重複3 Hs. 127799 330 ~ 5290100 0.00762 CBa; NIP1; CBP20; PIG55 NJL007362 NCBP2 Hs. 591671 22916 C9orf72 SFMBT1 RAPQEF1 Rap烏嘌呤核苷酸交換因子(GEF) ,成員1」 類似於核糖饉蛋白L5 BIRC3 核蓋結合蛋白次單元2,20kDa」 1001031806 ALW13A2 3j L0C643591 電位依頼性,α2/δ3次單元」 FU11806 含辞指CCCH型 3190328 0.00759 SLS; FALffl; AIDH10; FU20851; M(FZp686E23276 「搭去氫酶3家族,成員A2」 Hs.499886 224 5490634 0.00752 TFIIS; TFIIS.H NM_003196 TCEA3 「轉錄延長因子A (SII)
Hs.446354 6920 ^ J ΚΙΑΛΙ641 3190446 0.00752 FU21281; FU90089; MC5C149864; MGC149865 XM 931666 57730 - 7550598 0.00752 HSA272268 NM.018398 CACNA2D3 「銘逋播
Hs.656687 55799 現 4280692 0.00752 UKp68; FU11806; MGC26892; NY-REN-37 NH 024824 14 Hs.325846 79882 141281.doc -131 - 201022492 6480593 0.00752 PEN; PUF6; ΧΓΡ5; HU-HA8; W3Cm9\ RP11-526D20.2 KIAA0020 Hs,493309 9933 3420632 0.00752 C21orf5 NMe005128 D0PEY2 3420164 0.00752 BGGI; GGTI NM^005023 Hs.254006 5229 4480324 0.00752 SMVT NM.021095 SLC5A6 Hs.435735 8884 4850255 0.00752 HCFZp686I1536 NM.00S920 4209 6370035 0.00752 TRIP14; p590ASL NM.003733 OASL 8638 1470296 0.00752 dJ83L6.1 NIL0071S7 ZXDB 158586 7560554 0.00752 XM 929797 U0C653784 5220022 0.0075 LCHN; PR02561 AF116707 KIAA1147 KIAA1247 870437 0.0075 Gal9; ΝΑΤΉ; TON100 NM.057175 NARG1 NHDA 80155 1030327 0.0075 CD25; IL2R; TCGFR; IDDM10 NM.000417 IL2RA Hs. 231367 3559 riU 110706 0.00747 CTB Ml 004388 CTBS 「幾丁質酶,ώ-Ν·乙釀基-j NM.014878 KIAA0020 dopey家族成員 2 Hs·204575 9980 PGQT1B「蛋白\W^\基基轉移酶I型,β次單元j 「可溶載體家族5(鈉依賴性維生素轉運逋),成具6」 MEF2D 心肌鉍胞強化子因子2D Hs.314327 2L51·寡腺苷酸合成酶樣 「鋅指,X-連接,複製Bj
Hs.118633 Hs. 156257
Hs.521240 受《調節1 「介白素2受艘,α」 Hs.513557 57189 Hs. 555985 1486 4540367 0.00747 PARIS1; PARISH; TBC1D2A; FU10702; FU16244; FU42782; DKFZp761D1823 TBC1D2「TBC1 域家族,成負2」 Hs.371016 55357 5560487 0.00747 FU10738; C14orfll4; IXFZp781A0133; I*FZp781L15100 核酸外切酶3'-5·域樣 2 Hs.649365 55218 5810072 0.00747 IGA; MB-1 NII.001783 CD79A Hs.631567 973 4610152 0.00747 MGC75048; MGC117376; IIQC156196 NM_004506 iWl Hs.158195 3298 7570403 0.00747 mG12;TOSPL;FU10386;G12·樣;SmiTU499 ML021242 (原腸胚形成特異G12同源物(斑馬魚)) Hs.522605 4220278 0.00747 NM 176S78 INADL Γ 7570189 0.00747 ARP1B; CI8N2 NM^£»5735 ACTOIB 「ARP1 肌動蛋白相關蛋白 1 同源物B (酵母)j Hs.98791 10120 4590577 0.00747 WLOW177 CI8orf55 29090 6110008 0.00747 BCAM; BCT2 N»_001190 BCAT2 Hs.512670 587 7380181 0.00747 NLRR3; NLRR-3; FU11129 NM.018334 UWC 54674 2810255 0.00747 ILWBQ; MGC126506 NII.005338 HIP1 Hs.329266 3092 630768 0.00746 ALP; hALP; FU10774; FU12179; FLJ23850; KIAA1709; DKFZp434C116 NM 024662 N- 6¾基麵移酶 10 Hs.577281 55226 ~ 360753 0.00743 LTBP2; LTBP-3; pp^^^?^;a^|f^^42533; FU44138; DKFZP586M2123 20647 0.007« PRCl KIAA0595; RPU-302K17Pr ^MJ)15062 fe§9Q19「過氧化|%想增瘦因 + 活化受體γ,輔活化夺相蘭1」 Hs.533551 23082 6400072 0.00742 afl'i; SM-D; RT,LI; HCERN3; SNRNP-N·,SNURF-SNRPN NMJ)22805 SNRPN 小核核糖核蛋白多肽 N Hs.564847 6638 2060170 0.00742 CLCS; MDR1; P-sp; PGY1; ABQO; CD243; GP170; MGC163296 NM 000927 ABCB1 『ATP-結合卡匣,子族 B (MDR/TAP),成 Hs. 489033 " 5243 705Q661.0,00742 ^es; c-yes; HsT441; NMJX)5433 YES1 v-yes-1 楊氏肉瘤(YamaguChisarC〇ma) NM„01S42i NM_018199 EXDL2 「CD79a分子,免疫球蛋白相關〇u HSF2 熱休克轉錄因子2 MIDI 1P1 MIDI相互作用蛋白1 58526 中心體肌動蛋白β 染色體18開放閱讀框架55 Hs.532835 支鏠轉胺酶2,粒線體」 白胺酸富集重複神經元3 Hs.3781 亨廷頓素相互作用蛋白1 NAT10 1021070 ❹ ___________............. MUW5433 病毒致癌基因同源物1 Hs.194148 7525 2900524 0.00741 IFH2L2 NML〇〇1384 DPH2 DPH2 4830608 0.00741 G6a; M)AH; NG30; DDAHII ^013974 Hs.247362 23564 6400064 0.00741 PPP1R6; DiiFZp781L2441 NM„006242 Hs.42215 5509 0.00741 XM.929619 U0C653503 FLI38663 NM.152269 91574 4590608 6450286 0.0074 Hs.319128 3460341 0.0074 B0034720 •004597 TW7SF3 同源物(琢酒酵母) Hs.632398 1802 ^ DDAH2 二曱基精胺酸二甲基胺基水解蜂2 © PPP1R3D「蛋白磷酸酯酶1 ’調節(抑制子)次單元3Dj 3190053 0.0074 SMD2; SNRH)1 16,5kDa Hs.515472 6633 5130138 0.00733 W7SF3 NM^016551 51768 70092 0.00731 C6_IB NM.001018025 4570735 O.W)729 ΚΥΝϋ NM.003937 8942 4890754 0.00728 BX093329 6130563 0.00724 TP; MNGIE; PDBCBF; hPD-EOOF Hs 592212 1890 4850561 0.00723 ART-4; N0B1P; MST158; MSTP158; PSMD8BP1 NM_014062 結合蛋白1同源物(醸酒酵母) Hs.271695 28987 MTCP1 ΚΥΝϋ FLJ38663 染色«12開放閱讀框架65 「智人,純系IMAGE:3867102,mRNAj Hs.385535 SNRPD2 小核核糖核蛋白D2多肽 跨膜7超家族成貝3 Hs.438641 成熟T細胞增殖1 Hs.6917 4515 犬尿胺酸酶(L-犬尿胺酸水解酶)Hs.470126 轉錄基因座 NM_〇〇1953 B0GF1
Hs. 133181 内皮細胞生長因子1 (jfe小板街生) N0B1P NIN1/RPN12 141281.doc -132- 201022492
AU0X5AP 4180411 0.00719 FLAP NHL001629 241 1030148 0.00719 MGC42193; lXFa)68®2081 fW 175066 Hs.445168 317781 4780672 0.00719 QC; GCT N»L〇12413 qpCT Hs.79033 25797 460102 0.00718 P0; L10E; RPPO; PR 大型,P〇J Hs.546285 3440240 0.00717 册080562 7330719 0.00717 BX098605 2340563 0.00717 FIB; FU»l; RNU3IP1 花生四烯酸5-脂肪加氧酶-活化蛋白 M)X51 DEAD (Asp-Glu*Ala-Asp) qpcr 麩皤胺鏟基-肽環轉移酶(麩醯胺醯基環化酶) »10^8175; MC5C111226 NM.053275 RPLP0 「核糖體蛋白 轉錄棊因座 Hs. 563552 Hs.687277
Hs.507658 盒多肽51 ❹
轉錄基因座 __________ ,040296 0.00717 Si〇13233 (STE20/SPS1同源物,酵母)」Hs.276271 27347 称《cK脒妝暇激酶39 3420315 0.00714 MATA2; MATII; SAHS2 NU 005911 MAT2A r甲硫胺跋脉苷轉移蜂π,α」 Hs.516157 4144 3E40221 0.00709 ΊΗΤΓΙ; FU21127 ΝΜ_024549 FU21127 構造 1 Hs 211511 2·°9Ζ09 ^63^3 ΝΜ.001010853 ACT1L2 醯化胺基酸水解酶 1 樣2 Hs:652106 1660546 0.00709 EPH; EPHT; EPHT1; HGC163163 NM.005232 EPHA1 EPH 受.89839135293 2041 4880563 0.00709 BS-17; M(3C9402 NM.001750 CAST 鈣蛋白酶抑制蛋白 Hs.440961 831 4200482 0.00709 LAMPB; CD107b; LAMP-2C NM 002294 LAMP2 溶兹肢疋人 Hs. 496684 3920 ~ 备坤甩相Ml联蛋白2 4|807i7 0.00708 ACS1; UCS; FAai; FACL2; 1ACS1;2LACS2 NM.001995 ACSL1 醯基-CoA合成酶長鏈家族 1990471 0.00707 MGC45416; DKF2^686C03164 N«_l52398 0CIAD2 含OCIA域2 Hs.95835 132299 1340731 0.00707 NY-00-3 NM.006643 SD0CAG3 血清學確定結腾癌抗原 3 Hs.94300 620593 0.00706 ES18; HES18; MGC22015 WL005707 PDCD7 . 10081 6770132 0.00706 0GF0D1 NM.001031707 OGF0D1 「含2-氧化戊二酸鹽及鐵依*性加氧時域l ;同物異名· FL^0^6、、KIAA1612 ; TPA1,終止及多聚腺苷酸卜同源物;含智人2-策化戊及 ^ mRNA」 ^ XM^28068 L0C645001 ΓΓ3; FU90380 NHL006931 SLC2A3 Hs.419240 6515 1820424 0.00705 JM31; SB73; KIAA0974 NH 015190 Hs.654694 23234 ~ 4280632 0.00705 1MAI; IWF188; FU23109; MGC163401; MGC163403 m 024814 親嗜性逆轉錄病毒轉塑序列樣1 Hs.592271 — 79872 5860110 0.00704 U)C648984 % XM.938063 L0C648984 顛似於含桿狀病毒IAP重複之蛋白 ι ζ神經το細胞凋亡抑制蛋白) 7320411 0.00704 ΝΜ 144637 ZDHHC19 3400544 0.00704 ΗΡ55; Ρ01Β; ΡΕ0Α4; P0LGB 血清學確定結踢癌抗原3 漸進式細胞死亡7 Hs.458596 啤域 1 (OGF0D1) 4810609 0.00705 4920092 0.00705 「可溶載體家族2 (易化葡葡糖轉運體),成員3」 »IAJC9 「DnaJ (Hsp40)同源物,子族c,成貝9」 CBLL1 Cas-Br-M (良類) ❹ 輔助次單元」 6250121 0.00704 MGC921; FLJ10903 55766 360577 0.00704 IPO-B; MNSOD; Mn-SOD Hs.487046 6648 5290070 0.00704 XM 935588 620040 0.00704 NH.148973 6900603 0.00704 BQ437417 3460349 0.00704 RIF; ARHF; FU20247 Hs.524804 54509 2940541 0.00704 BB2; CD54; P3.58 P0LG2 「聚合嗨(DNA引導),γ2 「H2A組蛋白家族,成員j」 Hs.524280 NM_001024465 S0D2 「超氧化物歧化酶2 ,粒線體」 MS?
NMJ307215 11232 H2AFJ L0C641848 TOFRSF25 NM.019034 假定益
Hs.633116 「ras同源物基因家‘ 成員F (在絲狀偽足中) 「細胞間人類鼻病毒受逋」黏附分子1 (CD54) 7650386 0.00703 MSF; MSF1; NAPB; SINT1; PNUIL4; SeptDl; AF17q25; KIAA0991 NM 006640 9-Sen 胞裂蛋白9 Hs.440932 10801 一 V 7000768 0.00703 LAX; FU20340 NM.017773 LAX1 淋巴細胞跨膜接附子 1 Hs.272794 460450 0.00701 FLJ90430 NM_178558 ZNF680 辞指蛋白680 Hs.520886 340252 3420086 0.007 AK091091 「CDNAFLJ33772fis,純系BRSSN2000175J Hs 653331 6620279 0.007. Ό6οτί20Ί·, FU40584; MGC163388; bA325024.3; bA325024.4 NM.001010923 C6orfl90 染色體6開放閱讀框架 Hs.661756 387357 7560619 0.00697 KIAA1615 NM_020951 ZNF529 辞指蛋白 529 Hs.654960 57711 1260427 0.00697 4.10; P410; EPB41L40; MGC20553; RP11-439K3.2 NM_174938 FRMD3 含FER^& 3 Hs.127535 257019 2630500 0.00697 FRA3B; AP3Aase NM_002012 FIHT 脆性組胺酸三合體基因 Hs 655995 2272 2510110 0.00697 MST017; HSPC028; MSIP017 Mi 014038 BZW2 鹼性白胺酸拉鏈及W2域2 Hs.487635 28969 _ !?:= 4070280 0.00697 650521 0.00697 BACH2 6650021 0.00697
AK095855 NM 021813 Hs.269764 KC09040S COW 纯系 IMAGE: 4513453 「BTB及CNC同琢物1,ί 轉錄基因座 Hs.406106
Hs.213061 鹼性白胺酸拉鏈轉錄因子2」 141281.doc -133 201022492 5270364 0.00694 XM.933893 L0C389672 3800243 0.00694 ΡΒΕΡ; NAMPT; MGC117256; DKFZP666B131; 1110035014Rik NM_005746 PBEF1 前Bi«胞群落增強因子l Hs, 489615 10135 3420112 0.00691 TRA@ DQ286431 τ細胞受艘α基因座 Hs.74647 5670605 0.00686 WBifT; PP3381; HUSSY-3; MGa〇22; MGC5140; HASJ4442; MGC19709 NM.017528 威灰氏症候_ (Wil丨iamsBeurensyndiime)染色ft 區域22 Hs .647063 114049 940224 0.00686 UQ0R1 NM_007103 NDUFVi rNADH去氩酶(泛醌)黃素蛋白卜 51 kDa」 Hs.7744 4723 2350059 0.00683 DPDE4; RffilYB; MGC126529; DKFZp686F2182 ΜΛ_002600 cAMP·特異性(磷酸二酶酶E4dunce同猓物,果蠅)」 6250754 0.00683 B3GALT7; BGALT15; p3Gn-T8 r«l_198540 β»ΐ,3·Ν·乙釀基葡糖胺轉移酶8j Hs.441681 1980050 0.00682 0)642056 「T細胞受« Hs.494932 4920064 0.00682 C6orf74; CGI-130; NS5ATP2; I4QC87330; dJ16705.2 NM.016063 Hs.32826 51020 2650626 0.00682 MAD4; MST149; MS1P149 NMJJ06454 10608 6590681 0.00682 MGC4175; MM-TOAG NM_024315 Hs.196129 79161 2570497 0.00679 EV1; EVER1; EVIN1; LAK-4P NM.007267 Hs.632227 11322 2230475 0.00678 ZAC; U0T1; ZAC1; MGC126275; MGC126276; DKFZp781P1017 NM 006718 WBSCR22 「磷酸二 SI 酶 4B, Hs.198072 5142 B3GALT7 v\m?-G\cUAc:pGfd 374907 8.1 » JaABU,Cal)mRNAj MXD4 MAX二聚化蛋白4 C7orf23染色》7開故明讀框架23 跨膜通道樣6 含HD域2
Hs.655020 PUGL1 淚脒多形性練瘸基因樣1 7150747 0.00678 ARID1B XM.930472 同物異名:6A3-5, DAN15, p250R,册IfflT, BRG1-結合蛋白ELD/0SA1 : Eld (暾瞼)/Osa蛋白 智人AT富集相互作用域IB ( SWI1樣)(ARID1B )
Hs·444975 5325 L0C64507O 「at富集相互作用域iB (swn樣); BAF250b, ELD/0SA1, KIAA1235, RP11-419U0.1;同功異型物3由轉錄變異艘3編碼 晶f為品%」酶HI Hs.568006 5490280 0,00676 HI咖A ML002936 刷ASEH1 核糖 6290274 0.00672 C032; SCAR; SCR10; DXS306; FU40595 雄接1」 Hs.446628 6191 3840523 0.0067 iGAT; iGOT; B3GNT6; B3GN-T1; P3GNTI NM.006876 N,3-N-乙醢基葡糖胺轉移酶i j Hs. 8526 11041 2120341 0.0067 TLR7 Mi_016S62 TUR7 toll樣受β 3310368 0.0067 HEIR-1 NM 002167 ID3 「dna結合之抑制子3, 頰性陰性螺旋-環-螺旋蛋白』 Hs. 76884 3399 6580753 0.0067 LIN7; VBLI1; LIN-7A; MALS-1; TIP-33; MGC148143 NM.004664 Hs.144333 8825 ML001007
RPS4X 246243 「核糖艘蛋白S4< B3GNT6 rUDP-GlcNAc:pGal 7 Hs.659215 51284 LIN7A 1ΐη·7同源物a (線蟲) 6220564 0.0067 TAPP1 NM 001001974 (磷睃肌醉結合特異性)成貝1」 1030672 0.0067 MGC4730 NM.033428 C9orfl23 90871 3840463 0.0067 StIP; SHINC-2; STATIP1; FLJ10879 Hs.8739 55250 3420154 0.0067 DHLAG; HLADG; la-γ;蛋白 41 相容性複合物* II類不變鏈J 3420209 0.00669 LCMR1 NM_153450 MED19 Hs.43619 219541 2630553 0.00669 N4wbp5a; aJ25842; KIAA1165 NM_019080 Hs.525093 54602 3360541 0.00669 HEEW1; DKFZp667P2311 NM.020964 57724 PLEKHA1 「含血小板·白細跑C激酶受f同源域,家族a Hs.693627 59338 染色開放鬩讀框架123 NM.018255 NM.001025159 Hs.436568 「聚合酶H轉錄之介艘
Hs.7517 STATIP1延伸蛋白2同源物(酿酒酵母) CD74 rCD74分子,主要组織 972 次單元19同源物(釀酒酵母)」 NDFIP2 Nedd4家族相互作用蛋白2 KIAA1632 KIAA1632
Hs.514843 3870333 0.00669 Z02; X104; ZD-2; MGC26306 (閉合小環蛋白2) Hs. 50382 9414 3360246 0.00669 Clorf72; FLJ10199 55092 2630541 0.00669 CIN85; GIG10; MIG18 Hs.444770 30011 380386 0.00666 RNF89 NM 001003818 7330022 0.00666 GAS6 XM.942084 FLJ34709, H(FZp666G247; axl. NM.201629 NM 018022 TJP2 緊密接合蛋白2 TMEM51跨膜蛋白51
Hs.465305 NM_001024666 SH3KBP1 SH3-城激酶結合蛋白 ι TRIM6 含三播基元6 Hs. 125300 GAS6 「生長抑制特異性6 :同物異名:AXSF、AXLLG、 ,刺激因子;智人生長抑制·特異性6(GAS6),mRNA*j 117854 4760609 0.00666 EDARAK) NM 145861 EDARADD EDAR相關死亡域 1230634 0,00665 U0C652699 XM_942311 U0C652699 (NCF-1) (嗜中性白血球NADPH氡化酶因子1) (47kDa嗜中性白血球氡化酶因子) kDa姓染色體慢性肉芽腫病蛋白) (WX02) 652699 4150431 0.00664 XM.927125 U0C653371 110025 0.00664 XM 371273 U0C388654 63肋709 0,00661 PPR3; m3; PVRR3; CDwll3; FLJ90624;連接蛋白-3; DKFZP566B0846 脊髄灰白質炎病毒受II相關3 Hs. 293917 25945 6510603 0.00661 Parf; pp8875; FLJ10101; FU13045; bA216L13.9; RP11-216L13.9 染色體9開放閱讀框架86 Hs. 567803 55684 7160546 0.00661 F10; FU11305; MGC16774; RP11-98F14.6 NM.018386 FLJ11305 Hs.508769 55795 2600008 0.00661 ARPP-19; ARPP16; ARPP19; ARPP-16; FU41622 r«i_006628 ,
Hs.352224 128178 類似於嗜+性白血球胞質因子1 (p47-phox) (NCF-47K) (47 NM 015480 NM.024718 PVRL3 C9orf86 含ρα域2
「環狀AMP 141281.doc 134- 201022492 咐重曰,iyioj」 Hs_ 512908 10776 4480367 0.00661 KRT6; K6irs; K6IRS2; KRT6IRS2; MGC142246 Hs.662013 140807 1070403 0.00661 AXSF; AXLLG; FLJ34709; W0FZp666G247 Hs.646346 2621 NM.080747 NM_000820 GAS6 K6IRS2 角蛋白72 生長抑制-特異性6 ❿ 1050121 0.00661 NM.201625 CLEC12A 4220097 0.00659 TFIIS NM 003195 TCEA2 6919 5260161 0.00659 VASP NM 003370 VASP 7408 6960717 0.00658 TSH3; 57616 5360349 0.00658 Hs.480116 3850497 0.00656 IEF-SSP-9502 11137 6200021 0.00654 RASGRP4 NM 170604 RA«SRP4 10082 0.00651 DNAPTP2; iCJ90504 ΝΜ_Π3647 284996 630671 0.00651 FU21308; MGC42864 NM.024615 PARP8 Hs.369581 79668 ' 6650326 0.0065 PS04; SNEV; TOP19; V±4 ; hPS04; NMP200 NM 014502 處理因子19同源物(酿酒酵母) Hs.502705 27339 3290681 0.0065 AF070595 纯象 24583 mRNA 序列 Hs 655754 3310243 0.0065 DQ1; MGC4386 NM_014506 T0R1B 「对扭蛋白家族卜成貝B (耐扭蛋白B)」 27348 7150601 0.0065 My013; HRPAP20; HSPC125; bA22L21.1 NM.014165 C6orf66 染色艎6開玫閲讀框架砧 Hs.591333 29078 780148 0.0065 MLKL XM.936963 MLXL r混合蟠系激酶域樣•,同物異名:^4339 ; 智人混合譜系激酶域樣(MLKL),mRNA_j 5900021 0.0065 FU10218; MGC126756; MGC142027 NM.01S031 職6 wd重複域6 4150224 0.0065 GELB; CLG4B; MMP-9 NM_004994 MMP5 92kDa明膠酶,92kDaIV^謬原酶)J ~ Hs.297413 5290411 0.0065 NVL NM.002533 NVL 铉 vcp 樣 5550309 0.00649 PARP; PPOLT ADPRT; ADPRT1; PARP-1; pADPRT-1 「多聚(ADP-核糖)聚合酶家族,成Hij Hs. 177766 1710259 0.00648 CEB1; CHBP1 NM.016323 HERC5 hect域及RLD5 5260484 0.00648 MGC75174; MGC117277; E»CFZp686L13217 NM—032239 L Hs.657067 55132 " 1240762 0.00648 L0C642019 XM 936090 L0C642019 642019 — 6060181 0.00648 SLP2; SGA72M; CHR11SYT; KIAA1597; MGC102768 NM 032943 突觸結合蛋白樣2 Hs. 369520 54843 " 3420193 0,00644 KIAA0599; MGC156299; MGC156300 NM_015549 PLEKHG3「含血小板-白細胞C激酶受質同泺域 家族G (具有RhoGef域)成員3J Hs.509637 26030 Ϊ; ZNF537; r; ZFYVE25; KIAA1474 NM.020856 KIAA0993: MGC16461 23001 NM_007062 PWP1 「轉錄延長因子A(sn),2j 血管鏺張刺激磷蛋白 2NF537 teashirt 家族鋅指 3 NM.178583 WDFY3 PWP1同源•物(釀酒酵母) RAS烏苷酸釋放蛋白4 RNF149環指蛋白149
Hs.505004 Hs.515469 Hs.278436 含WD重複及FYVE域3 Hs.506652
Hs.130434 115727 Hs.142074
「多聚(adp-核糖)聚合酶家族,成員8」 PRPF19 PRP19/PS04 前raRNA 「基質金屬肽酶9 (明謬蛛B 4318 Hs.497867 既001618 142 PARP1 Hs.26663 4931
Hs.654672
Hs.654815 51191 「La核糖核蛋白域家族,成貝2」 類似於核仁蛋白5A SYTL2 6900465 0.00642 5-L0; 5LPG; U0G5; MGC163204 Hs.89499 240 6840189 0.00642 XM_939934 L0C65O845 5340064 0.0064 FU14129 NM 030895 ZNF696 2650390 0.0064 PLC1; PLC-II; PLC148; PLCyl NM.002660 Hs.268177 5335 *" 1570687 0.00636 0X2R; M0X2R; CD200R; HCRTO NM 138940 131450 ' 6420719 0.00635 PR02405; FU31228; MGC163452; bA100C15.1; I*FZP434F195; DKFZp434G2311; RP11-100C15.2 NM 015447 CAMSAP1鈣調蛋白調節之血影蛋白•相W蛋白1 Hs,522493 157922 7150112 0.00635 ΗΨ; ρ55; ρ60; ΊΕΡΙ; TOF-R; WAR; TOFR1; p55-R; CD120a; WR55; WR60; TWF-R-I; TNF-R55; MGC19588 NM_001065 TWFRSF1A r腫疱壞死因子受體超家族, 成 JUAj Hs. 279594 7132 3780689 0.00635 PN-I; PSN1; UMPH; UMPH1; P5'N-1; cN-III; MGC27337; MGC87109; MGC87828 NM.016489 NT5C3 核苷酸酶,胞質 111」 Hs.487933 51251 ~ 7200255 0.00633 GS3686; Clorf29 NM.006820 IFI44L 干擾素誘導性蛋白私樣 Hs.389724 10964 990494 0.00633 FU11090; MGC104252 NM 018319 TDP1 55775 " 10274 0.00633 L0C652626 XM.942172 L0C652626 (白血球免疫球蛋白樣受體2 ) (LIR-2) (免疫球蛋白樣轉錄物4) (ILT-4)(單核細胞/巨噬_胞免疫球蛋白樣受醴1〇) (CD8Sd ant... 652626 2510095 0.00633 AML2; OTA3; PEBP2aC; FU34510; MGC16070 Hs.170019 864 2640114 0.00633 MS; IARS1; Πί00785; RJ20736 NM_002161 Hs.445403 3376 ~ 2970598 0.00633 NM.024048 MGC3020 5270372 0.00633 XPV; XP-V; RAD30A; FLJ16395; FLJ21978 NM 006502 AL0XS 花生西烯酸5-脂肪加氧酶 鋅指蛋白696 PL0G1
Hs.657615 「磷脂酶C,Ylj 79943 CD200R1 CD200 受體 1
Hs.309158 酪胺醮基-DNA4酸二酯酶l Hs. 209945 類似於白血球免疫球蛋白樣受體子族B成貝2前驅體 (MIR-10) NM 004350 RUNX3 ^«財8闞轉錄因子3
IARS 異白胺酿基-tRNA合成酶
P0LH 「聚合酶(DNA引導) 141281.doc 135- 201022492
Hs.655467 5429 7J50196 0.00633 TRIP14; p590ASL NM_003733 OASL 8638 1770068 0.00633 XM.929369 L0C653743 3400669 0.00633 XHJ36265 L0C642120 2650082 0.00633 HM74a; HM74b; PlftiAG; Puma-g NM 177551 Hs.524812 338442 4220435 0.00633 plOO; MGC133260 NM„006187 0AS3 Hs.528634 4940 5360519 0.00628 FPM315; ZKSCAN12 NM.005741 ZNF263 10127 1070717 0.00628 RANGNRF; M0G1; KSPC165; ESPC236; MGC110973; DiCFZp686F02139 RAN烏嘌呤核苷酸释放因子 Hs. 408233 29098 4850725 0.(K)628 SDS-RS1 ΝΜ.138432 SDSL 絲胺酸脫水酶樣 5810709 0.00628 L0C26O1O; DNAPIP6; DKFZp564A2416 Μ 015535 聚合酶·反式活化之蛋白6 Hs. 120323 26010 2690068 0.00628 NM.182790 PBEF1 7560138 0.00628 MCT3; MCT4; MGCI38472; MGfC138474 NM 004207 16,成»3 (單羧酸轉運體4)」 Hs.693616 3930292 0,00626 L0C651738 XM.944898 L0C651738 651738 1770639 0.00625 NS3TP1; FU20752; NBLA00058 NJL019048 Hs.101364 54529 6040747 0.00625 MGC45400 NMJ53333 TCEAL8 Hs.389734 90843 5360215 0.00625 FLJ13052; FLJ37724; dJ283E3.I; RP1-283E3.6 NM„023018 NADK Hs.654792 65220 ~ 22304S2 0.00624 KIAA0286; DKFZp686N1768 NM_015257 KIAA0286 KIM0286 蛋白 23306 2Ί募腺苷酸合成酶樣
Hs. 118633
GPR109A G蛋白偶和受體109A 暮腺苷酸合成酶3,lOOkDa」 辞指蛋白263 Hs.611475 W4_016492 RANGNRF Hs.337594 113675 DNAFTP6 病毒 DNA iS6A3 可溶載體家族 假定蛋白LOC651738 ASNSD1 含天冬醯胺合成酶域1 轉錄延長因子A (SII)樣8 C NAD激酶
Hs.591040 6620307 0.00624 p7; RRP4; Rrp4p; hRrp4p NM.014285 23404 3610255 0.00624 CA396207 「cs75c04yl人類視網膜色素上皮/脈絡膜CDNA (未正規化,未擴增J : cs智人cDNA純泉cs75c04 5',mRNA序列.j 4670070 0.00624 FAM44B NM.138369 FAM44B ^具有序列相似性之家族44,成員B」Hs.425091 91272 1 6290358 0.00624 SASP; BX0SC2 外來體組份2
Hs.654643 );Taps; SASP酶 Hs.556025 151516 2340435 0.00624 P15; MTC2 NM_013248 29107 5260673 0.00624 NM.134264 WSB1 4120301 0.00624 MGC20576 NM_144691 2260463 0.00623 XM.937579 6480201 0.00623 Scml3 NM.001031694 22955 2350639 0.00623 MAP-1; PNMA4 NM_022151 64112 4810673 0.00623 XM.925939 U0C653O80 3610435 0.00622 TIP39; FLJ22086; bK445C9.6 Hs.20225 24144 6040050 0.00622 HT2A; BBS11; TAT1P; UMm Hs.591910 22954 160128 0.00617 TTF; ARHH NM.004310 399 6420762 0.00616 «etRS; ratMetRS NM.138395 Hs.116602 92935 3450286 0.00612 ELC2; HPC2; FLJ10530; FLJ36693; FLJ42848 (大腸样菌) 60528 4760242 0.00611 TATI; FU32714 NM_138718 SLC26A8「可溶載體家族26,成員8j 116369 4890114 0,00611 FU13639 NM.001031719 FLJ13639 Hs 266728 79758 450114 0.00611 IAN7; hIAN7; MGC27027 N1U53236 GIMAP7 168537 4200132 0.00605 0LC1G; UTP21; TAWEKP; TA-WDRP; DKFZp686I1650 Hs.533237 134430 4810131 0.00601 CRBP4; CRBPIV; MGC70641 NM.052960 RBP7 Hs.422688 116362 2750056 0.00601 L0C645691 XM 936790 L0C647727 — 核_核蛋白Al(螺旋失穩蛋白)(單鏈結合蛋白)(hnRNP核心蛋白 Al) (HDP-1)(抑制之拓撲異構酶-抑制子) 645691 3120670 0,00601 AD-018; 0GI-30; NPD015; HSPC143; MGC61450 NM.015958 DPH5 酵母) Hs. 440776 51611 6370026 0.00601 B28; FASP1; C21orf46 NM_018944 Hs.190518 54069 198054】 0,00601 KIAA0094; M(FZp781C0«9 刚_015143 NM_152792 NXTl FU25084 NTF2#_輸出因子1 皮廣天冬胺酸蛋白轉 Hs.516933 CAPN12 鈣蛋白酶 12 Hs.653110 L0C648526 SCMH1 中足性梳同琢物1 (果4¾) 147968
Hs.571874 MQAP1 細胞凋亡之調節子1
Hs.24719 NM_001008697 TFIPU 轴叢蛋白相互作用蛋白11 ffli_012210 TRIM32 含三聯基元 32 _ 「ras同源物基因家族,成員Hj Hs.654594 MARS2 「甲硫胺疃基-tRNA合成酶2,粒線體j NM.018127 EUC2 elaC 同源物2 Hs.435836 去氩酶/還原酶(SDR家族)成貝12 「GTPase,IMAP家族成員 7j Hs.647074 NM_139281 WDR36 WD 重複域36 「視黃醇結合蛋白7,細胞j 類似於異源核 DPH5同泺物(璩酒 C21orf45 染色«21開放閱讀框架45 ΜΕΓΑΡ1甲硫胺醯基胺基肽酶1 Hs .480364 141281.doc 136- 201022492 2060347 0.00601 RNB6 NM 016337 EVL Enah/Vasp 樣 3170398 0.00601 ACHRB; CH®B; CMS1D; CMS2A; SOCMS NM.OOO 菸撿,pi (肌肉)j Hs.330386 Ϊ140 ~ 3520341 0.00601 RNF56; FLI36865; FLJ41152; Nbla00127; MFZp779A0729; IKFZd779F1443; I*FZp686J 10223 MJ70662 CBLB Cas-Br-M (鼠類)親嗜性逆轉錄病毒轉型序列b Hs.430589 868 580709 0.006 M.945154 L0C649095 4560341 0,00597 RAX; PACT; HSD14 1003690 PRKRA 雙股RN A依頼性活化子j Hs. 632540 5670427 0.00597 DUS4; PP35; MGC133233 施L181581 DUS4L (釀酒酵母) Hs.97627 11062 380220 0.00597 L0C286440 AK123807 假定蛋白 L0C286440 Hs.348844 286440 1190273 0,00597 cdcl4; hO)C14; CdcHAl; Cdcl4A2 NM 003672 同源物A (釀酒酵母) Hs.l274】l 8556
Hs.125867 47 CHRNB1 「蛋白激酶 8575 二氩尿苷合成酶4樣 51466 「膽鹼能受饉 干擾素誘導性 CDC14A CDC14 細胞分裂週期14 O.OOS96 MgtE NMJ73854 SLC41A1 「可溶載艎家族41,成貝lj ❹ 620746 254428 840039 0.00596 MCH3i QSi-1 肽酶j Hs,9216 840 1340600 0.00594 MGC10992; MGC13119 102A Hs.644611 92922 5700326 0.00594 UHX1 NM^004651 6550307 0.00591 MGC119599; MGCU9600 51311 6590561 0.00585 BLR2; EBI1; CD197; CDffl97; CMKBR7 受《7 Hs.370036 1236 1050465 0.00585 PSG11 NM 002784 «78 3890735 0.00585 DYRK2 NM.003583 激酶 2 Hs. 173135 8445 5960685 0.00582 EPI64; TBC1DI0; dJI30H16.1; dJ!30H16.2 家族,成員l〇Aj Hs.655273 83874 655CM63 0.00582 CCS XM.938909 CCS 「超氡化物歧化酶之銅伴侣蛋白;同物異名 MGC138260;智人超氣化物歧化典之銅伴侶蛋白(CCS),mRNA_j 2370255 0.00579 FAM31A; FLJ38464; KIAA1608; RP11-230L22.3 1A Hs. 655834 57706 1240082 0.00578 TCFSC; Tim NM一012252 1990707 0.00576 FU13868 NM_022744 Hs.9003 64755 ' 4890274 0.00573 TEM7R; FU14623 NM 032812 84898 M 145029 ICE-LAP3 NM.033339 NM 033212 USP11 NM 016610 PSG9
Hs.20274 CASP7 「卡斯蛋白雖7,細跑凋亡相關半耽胺酸 MGC10992 含捲曲螺旋域 泛素特異性肽酶11 T1R8 toll樣受想8
Hs.171501
Hs,660543 8237 .001838 CCR7 趨化激素(c_c基元) 妊娠特異性β*ι·醣蛋白9
Hs.502092 DYRK2 雙·特異性酪胺酸~(Y)·磷酸化調節 NM 031937
TBC1D10A HH.020946
Cl6orf58 「tbci域 含 DENN/MADD 域 轉錄因子ECHs. 125962 染色體16開放閱讀框架58 含叢狀蛋白域2 22797
Hs.658134
3290059 0.00572 MGC15854 Hs.591787 221545 60470 0.00572 AX2R; AXIIR C6orfl36 參
Hs.529385 2260445 0,0057 Hs.523309 1500619 0.00565 Hs,672089 5910465 0.00562 子族J,成貝15j 4280047 0.00562 3800333 0.00561 Hs,279061 4780484 0.0056 5090201 0.0056 (果蠅) 4120632 0.0056 389289 BIS; BAG-3; 9531 NM.001014279 L0C389289 CAIR-I; MGC104307 NMJJ04281 染色鳢6開放閱讀框架136 染色體5開放閱讀框架39 BAG3 BCL2-相關永生基因3 AL832727 MRNA; cDNA MCFZp3130229 (來自純系 dkfz:p3 130229) IRKK; K1R1.3; KIR4.2; MGC13584 Hs.411299 NIL183382 RNF13 GGI-150; C17orf25 NM 016080 NM„170736 3772 KCNJ15 「内向整流鉀通道 C17orf25 HC71; 51031 2NF279; ZNF632; 5ΌΥ11.1; D87009.C22.3 Hs.43S34 140883 KHLHX; KLEIP; KLHLX: RP3-383J4.3 Hs.495035 27252 MEX3C: M*013; MEX-3C; RNF194; FLJ38871 NM 016626 Hs.465144 51320 ~ XIL942150 L0C652615 MGC111199 NM,020202 NIT2 「腈水解酶家族 ΝΜ_080764 ΝΜ·014458 含乙二接酶域4 SUHW2 毛翅同源物抑制子2 (果蠅) KLHL20 kelch樣20 RKHD2 含環指及KH域2 7160039 0.0056 620349 0.0056 MGC111199 ΝΜβ020202 ΝΙΤ2 「腈水解酶家族 * 成員2」 Hs,439152 56954 126Q228 0.0056 MMTRA1B Ntt^.021105 PLSCR1 2760398 0.00559 ΝΚΓΓ2 ΝΜ_004808 Μΐ2 3890128 0.00559 IAT1; pp36 ML001014988 27040 · 6760670 0.00559 TKA; TCRA; TORD; TRDD3; FU22602; MGC22624; «GC23964; MGC71411; MGC117436 ΙΈΑβ T 細胞受 基因座 Hs, 74647 6955 2570338 0.00559 FU11175; FU33303; MGC111402 NIL〇18349 HCIP2 「多姻C2域, 跨膜 2」 Hs. 592017 55784 1070564 0.00559 KRML; MGC43127 NM 005461 磷脂混雜酶1 N-肉豆蔻醮基轉移酶2 LAT 用於活化T細胞之連接子 5359 9397 Hs.632179 BC070337 同涞物B (禽類) Hs.651210 ~ 9935 1010424 0.00559 CPAKM; MGC14229S NM_001735 C5 v-maf)此腱貘織雉肉瘤致癌基因 補逋组份5
Hs.494997 141281.doc -137- 201022492 727 670068 0.00558 BX089889 7000133 0.00557 RIT1; CTIP2; CTIP-2; hRITl-a (鋅指蛋白) Hs. 5丨0396 64919 3440615 0.00556 ATPIO; ATPIQ NM.173694 286410 1710307 0.00556 T0X1; KIAA0808 NM_014729 組盒 Hs. 491805 9760 5910615 0.00556 FLJ10362; IXFZP564I052; DKF2p313N0119 Hs.480506 26009 770397 0.00555 FLJ10539; DKFZp686H07226 NM.018130 Hs.658816 55164 2120576 0.00555 RbAp46; MGC138867; MGC138868 NM_002893 Hs.495755 5931 2060685 0.00555 KOX16; ZMF359; ZNF612; Zfp612 NM_145911 Hs.656643 7571 „ 6980070 0.00555 £t-V; B«5al-T5; MGC138470; p4Gal-T5; β4 B4GALT5 ΙΦΡ-σΑβΟΙοΝΑίίβ 1,4*半乳糖基轉移酶,多肽5」 5720458 0.00555 R1G1; TIG3; HRASLS4; M0C8906 NM_004585
純系HLSJMAGEJ468630 mRNA序列 Hs.652637 NM_022898 BCL11B B 細胞 CLL/淋巴瘤 11B
ATP11C TOX
Hs.88252 (他紮羅汀(tazarotene)誘'導之)3 Hs.17466 ------------ XM_936105 L0C642035 5670440 0.00551 PIGS; 「ATPase,VI類,11C 塑 j 胸腺細胞選擇相關高遷移率 NM_015534 ZZZ3 「含鋅指,ZZ塑3」 SHQ1 SHQ1同源物(釀酒酵母) RBBP7 視網膜母細胞瘤結合蛋白7 ZNF23 辞指蛋白 23_(KOX 16) P4GaIT-V; B4-GALT-IV NM„004776 Hs.370487 9334 RARRES3 視黃酸受體反應因子 5920 360128 0.00555 XM. NM.001012302 1T«EM16J 1450717 0.00551 0RC5; 0RC5P; (»C5T NM_002553 0RC5L 母 h Hs.432948 5001 6960209 0.00551 pim-3 NM.001001852 3940768 0.00551 ARFL1 ML001177 270242 0.00551 XM.934555 4250349 0.00551 FU34563; MGC35163 Hs.440508 154075 5890184 0.00551 U0C284230 XM.2081S5 L0C28423O 蛋白 L36a 284230 580592 0.00551 MQC22960; RP4-603I14.2 NM.199044 NSUN4 Hs.163424 387338 3830048 0.0055 FU10853 NM_018246 0CDC25 55246 1510736 0.00549 AGR1; ERP18; ERP19; TLP19; hAG-1 娜JH5913 (内質網 5 Hs. 476033 51060 2450414 0.00547 PI; ΑΙΑ; AAT; Pit; A1AT; MGC9222; ΡΚΪ2275; MGa3330 「絲胺酸肽酶抑制子,分技A (a-1抗蛋白酶,抗胰蛋白酶),成員Ij 5265 4540424 0.00546 CEH; SEH NH.001979 EPHX2 「環氧化物水解酶2,細胞質」 2053 63S0687 0.00546 KIAA0478; MGC133098 NM_014870 ZBTB40 含辞指及BTB域40 Hs.418966 9923 3400075 0.00546 FLJ20211 NMJ)01031703 54859 10563 0.00546 GEF; HffiPl; Si-l-2; Si-1-2-19 Hs.435126 56731 2850576 0.00542 BFP; Z147; RNF147; ZNF147 Hs.528952 7706 7550082 0.00542 MOiP; MDC9; Mltng; K1AA0021 (meltrinY) Hs.591852 8754 4670035 0.00539 ME1TL2; FLJ12760 NIL181725 339175 940470 0.00539 KFZP586L0724 NM.015462 N0L1I 核仁蛋白 11 Hs.463936 3370605 0.00539 SPAL2; FU23126; FU23632; KIAA1389 NMJK0808 SIPA1L2 信號誘導之 增殖相關 1 樣2 Hs. 268774 57568 4390113 0.00539 HK4; TAIF; TAIFa; TAIFb; TAIFc; TAIFd; IL-32 β ; IL-32a; IL-32 δ ; IL-32Y N«_001012632 IL32 介白素 32 Hs·943 9235 ^ 160138 0.00539 BF511281 轉錄基因座 Hs.564310 2900672 0.00536 MAS20; M0M19; TC»I20; KIAA0016; MGC117367 ^014765 K删20 粒線雜外膜20闾通 物之穆位酶(酵母) Hs,533192 9804 1 6020500 0,00535 miO; P0M210; RJ22389; KIAA0906 N〇24923 N0P210 核孔蛋白 21〇kDa Hs 475525 23225 870685 0.00535 FU34917 NMJ53263 ZNF549 鋅指蛋白 549 Hs·564295 256051 3830538 0.00535 GPX6; CL683; NPGPx; FU14777 NMJ15696 GPX7 麩胱甘肽過氧化物酶7 Hs.43728 2882 1190474 0.00535 CD697230 轉錄基因座 Hs.568805 1240347 0.00535 Sei-2; TRIP-Br2; MGC126688; MGC126690 NM_014755 SERTAD2 含SERTA域2 Hs.693696 9792 1300450 0.00534 FU22531 NM„024650 Hs.292088 79703 6420129 0.00531 RPF2; FU21087; bA397G5.4 跨膜蛋白16J 「起點識別複合物 338440 次單元5樣(酵 PIM3 pim-3 致癌基因 Hs.530381 ARL1 ADP-核糖基化因子樣 L0C653518 N1U52552 SAID3 含不育α基元域3 1 415116 Hs.372616 400 類似於大次單元核糖體 「NOLl/NOP2/Sun域家族,成負4」 含捲曲螺旋域25 Hs.445512 TXNDC12含硫氧還蛋白域12 NM 001002236 a
Hs.212088 TUEM103 NIL〇2(X)62 NM_005082 Mil„003816 跨膜蛋白103 Hs.3111〇0 SLC2MRG SLC2A4 調節子 TRIM25含三聯基元25 ADAM9 ADAM金屬肽酶域9
METTL2A f基轉移酶樣2A
Hs.381204 25926
Hs.372265 84154 6220692 0.0053 9-27; CD225; IFI17; IflJ13 FLJ22531 NM_032194 NM_00364l 染色逋11開放閱讀框架80 BXDC1 含 brix 域 1 IFimi干擾素誘導性跨臈蛋白1 (9-27) 141281.doc -138 201022492
Hs.458414 8519 830026 0.0053 HNRPAIP4 XM.372050 L0C389674 異源核核糖核蛋白A1 假基因4 Hs.521130 389674 650370 0.0053 U0C153364; MGC46734; DKFZp686Pl511S NM 203406 LOCI53364 類似於金屬今醢胺酶超家族蛋白 Hs.64004 153364 6480102 0.00529 XM 928^ L0C388275 C7〇Tf36染色《7開放閱讀框架36 .928429 3420162 0.00529 GK003 NM'〇20192 57002 _ 430458 0.00529 MRPU5 XM_936540 智人粒線體核糖饉蛋白L45 (_MRPL45) 5570685 0.00529 RAGD; bAllD8.2.1; DKFZP761H171 Hs.485938 58528 5550402 0,00529 GLUT14 NM 153449 SLC2A14「可溶載艘家族2 (易化葡葡糖轉運«),成員14」 Hs.655169 144195 ILTOQ; FLF14000; KIAA0655; MGC47513 NM 003959 HIPIR ....... Hs.654842 9026 4830672 0.00529 TGS; BARA; TCS1; Lin-9; BARPsv NM 173083 LIN9 1ίη·9 同源物(線蟲) Hs.120817 286826 ' 4280048 0.00529 0)511953 「AGENGOURT 14360380 NIH MGC 186 智人cDNA純系 IMAGB:30406177 5*,rnTOIA 厚列.」 —
Hs.83313
MRPL45「粒線髏核糖逋蛋白L45 ;同物異名:MGC11321 ; 核基因編碼粒線艘蛋白,mRNA.」 NM.021244 RRA® Ras·相關 GTP 結合D 2450253 0.00529 HIP3; HIP12; 亨廷頓素相互作用蛋白1相關
5960563 0.00529 KLP; CMT2; ΟίΓ2Α; ΟΪΓ2Α1; FLJ23699; KIAA0591; KIAA1448; MGC134844 K1F1B 驅動蛋白家族成員IB Hs. 97858 23095 4830192 0.00529 MCMBP; MCM-BP; FU13081; FU36756 Mi 024834 C10orfll9 開放閱讀框架119 Hs. 124246 ----- ' 4290735 0.00529 MGC11321 M ❹ FU13081; FU36756 79892 NM 032351 MRPL45 84311 ' 7160520 0.00529 HSPC265; MGC131656 NM.13S493 Hs.284207 154467 " 6280292 0.00527 HINT4; FU33126; MGC22976 NM 13857】 Hs. 72325 135114 2370332 0.00527 XM.940054 LOC650954 6100743 0.00527 NK10; ZNF756 NM 133458 ZFP90 146198 " 3290066 0.00526 EIF-4B; PR01843 NM.001417 EIF4B Hs.648394 1975 ' 870370 0.00526 FU13046; KIAA1721 NM 022459 XP04 2710475 0,00526 TRM11; MDS024; C6orf75; dJ187JU; dJ187J11.2 甲基轉移酶11同源物(釀酒酵母) Hs.404186 1070528 0.00526 G1P2; UCRP; IFI15 NM 005101 G1P2 9636 " 7570634 0.00525 Sno; Stno; FLJ00173; KIAA0963 NM_014963 (果蝿) Hs. 408708 22904 " 2490477 0.00525 XM.377933 U0C402251 1660593 0.00525 MGC3207 NM~032285 MGC3207 2760520 0.00525 FW; C4BP HM_0(K)715 C4BPA Hs.1012 722 ~ 4010259 0.00523 ZNF400; RJ14524; MGC13153; MGC54050 NM 032799 Hs·133122 84885 AICARFT; IMPCHASE NM.004044 ATIC Hs.90280 離胺醯基氧化酶樣3 轉錄基因座 C6orfl29 NRIJ83416 染色體10 Hs.462913 粒線體核糠體蛋白L45 染色體6開放閱讀框架129 組胺酸三合體核苷酸結合蛋白3 HINTS 辞指蛋白90同源物(小鼠) Hs.461074 真核轉譯起始因子4B 輸出蛋白4 Hs. 507452 ^.001031712 C6orf75 tRNA 64328 60487 ISG1S 泛素樣修飾手 Hs.458485 KIAA0963 草莓洛奇蛋白(notch)同源物2 84245 假定蛋白 MGC3207 Hs. 439370 「補艚組份4結合去白,α」 ZDHHC12 「含鋅指,DHHC型12」 甲醯胺核糖核酸甲醯 84695 6110768 0.00522 PURH; AICAR; AICARFT; IMPCHASE 基轉移峰/IMP環水解兹 5700349 0.00522 L0XL NM.032603 L0XL3 5130349 0.00521 BQ068637 2710711 0.00514 Ml 149379 NSUN5C 10273 0.00514 RCN3; MCIP5; hRCN3 NM_013441 Hs.656799 11123 " 麵;勤8228;膽酬|5441 6900348 0.00513 Sbk NM_001024401 SBK1 … 6650575 0.00513 Mill34264 WSB1 5-胺基咪唑-4 471 Hs.591563 Hs.284464 DSCR1L2 唐氏症候群關鍵區基因1樣2
Nil 001017928 7330349 0.00511 FU33273 131076 5220487 0.00511 FU16577; KIAA1595; HKO3209 Hs.286173 57696 4760424 0.00511 C23; FU45706 ΝϋΙ_005381 2760148 0.00511 FU12519; DKFZp781N1244 ΝΜ.032168 84128 ~ 1430753 0.00511 ADAP; PR00823; SLAP^130 NM.001465 iis 370503 2533 4780025 0.0051 FCE1A; FcERI NM.002001 RM1A Hs.897 2205 730592 0.00509 RFC36; MGC1155 NM_007370 RFC5 Hs.506989 5985 Ϊ240088 0.00507 ORP10; 0SBP9; FLJ20363 NM.017784 Hs.150122 114884 SH3-結合域激酶1 CCDC58含捲曲螺旋域58 NM.020936 DDX55 Να
Hs.97837 388228 Hs.220594 DEAD (Asp-Glu-AU-Asp)盒多肽55 核仁素 職75 4691 Hs.399984 FYB FYN 結合蛋白(FYB-120/130J 「映之Fc片段,高親和力i,受體;#肽」 「複製因子C (活化子1) 5,36.5kDa」 OSHPL10氧固醇結合蛋白樣1〇 141281.doc -139- 201022492 NHL006018 GPR109B G蛋白偶和受艟l〇®
Hs·458425 5960360 0,00507 HM74; PUMAG; Puma-g &843 4250280 0.00507 TIC; EFA6B; FU36237; FLJ37279 NM_012455 PSD4 含血小板-白細胞C激酶受質及Sec7域4 Hs. 693679 23550 3460674 0.00507 SFRSKl NM.003137 SRPK1 SFRS蛋白激酶 1 Hs.443861 4390092 0.00505 KIM1340; MGC131714 侧_〇20782 KLHDC5 含kekh^5 57542 4010541 0.00505 FOF03 NM_178272 PILKA 配對免疫球蛋白樣2^受餿〇1 29992 7160088 0.00505 CBNP-T; C16orf56; FLJ13111; FLJ43376 NM_025082 C16orf56 Hs.288382 80152 6732
Hs. 505104 Hs.444407 著絲點蛋白T NM 26207 ' NM_001721
.181671 BMX PIIPNC1 「磷脂醢肌醉轉移蛋白, BMX非-受《酪胺酸激酶 ZNF30 鋅指蛋白30 形態發生之蓬亂蛋白相關活化子1 細胞質1j 5960189 0.00505 RDGBB; RDGBB1; RDGB Hs.591185 5560451 0.00505 BIX; PSCIX2; PSCTK3 Hs.495731 660 6770292 0.00505 KOX28; FU20562; OKFZp686N19164 NM_194325 90075 3460019 0.00504 FLJ41657; KIAA0666 NM_014992 DAAM1 1580279 0.00503 HS’65493^K02161623002 「CDNAFLJ11554fis ,純系HEMBA1003037J Hs. 135282 4210647 0.00503 OJP24; FU20898; MGC111564 NM.024600 C16orf30 染色體 16開放閱讀框架30 Hs. 459652 79652 3290397 0.00503 HSAN; HSN1; LBCl; LCB1; SPT1; SPTI; HSAN1; MGC14645 NM_178324 SPTLC1 「絲胺酸稼櫊釀基轉移醻,長鏈鹼次單元1j Hs.90458 10558 1170706 0.00503 FU25219; MGCI4839; MGC131888 N«_080659 Cllorf52 染色«11開放閱讀框架52 Hs.97013 91894 2630224 0.00503 CLP46; MDSRP; C3orf9; MDSOIO; hCLP46; KDELai; MGC32995 NM 152305 C3orf9 ^KTEL (Lys-Tyr-Glu-Leu) 1 Hs.231750 56983 r 2900S6 0.00503 AD3; VRP; HBLP1 NM 007063 TBC1D8「TBC1 域家族,成員8 (具有GRAM域)」 11138 η 430537 0.00503 BL0S1; GCN5L1; MGC87455 NM 001487 BL0C1S1「容酶饉相關細胞器生物發生複合物-1, 次單元1」 Hs. 94672 2647 7380594 0.00503 KIAA0564; FU21779 NM_015058 KIAA0564 KIM0564蛋白 Hs.368282 23078 , s 4480440 0.00502 CSIB1; SCRB1; SCRIB1; Vartul NM.015356 SCRIB 拼接同源物(果蠅) Hs.436329 23513 4760747 0 00502 C0Q8; A1XX3; MGC4849 NM-〇2〇247 CABC1 「伴侣蛋白,bcl複合物同源物之ABC1活性(菜酒裂殖酵母 (S.pcxnbe))」 Hs.118241 56997 510634 0.00498 HSPC111; HSPC185 1980059 0.00498 L0C648189 XM 937239 L0C64S189 顗似於TBC1 域家族成員2 (由SEREX識別及鑑別之前列線抗原J (PARIS-1) 6481明 4570196 0.00498 Fmip; MCI.3; C22orfl9 NfcL0010Q2878 C22orfl9 TH)複合物5 8563 7650193 0.00498 NM.177436 CSE1L 4610097 0.00498 FLJ10498; DKFZp686E22207 NM.018115 SDAD1 含SDA1 域 1 Hs.632604 55153 4230273 0,00498 FU16004; Nblal0512; DKFZp313K2238; DKFZp547B0714 NMj52606 辞指蛋白 540 Hs. 121283 163255 " 3710692 0.00498 SIAT10; ST3C5ALVI NM_006100 ST3GAL6「ST3|3-半乳糖普 〇^3唾液酸基轉移啤6」 Hs,14S716 " 10402 7550719 0.00498 PA28A; IFI5111; MGCS628; REGa; PA28a NM 176783 「蛋白酶* C前艘,巨蛋白因子)活化子次單元1 (PA28a)」Hs.75348 — 5720 2060242 0.00498 AK125150 卜源發性4經母細胞癌cDNA Hs.522924 7150647 0.00498 NO(X4; SLC24A2; FU38852 NM 153646 (鈉/鉀/鈣交換子),成貝4」 Hs.510281 5550343 0.00497 LMN2; LAMB2; MGC2721 NM_032737 LMNB2 3120402 0.00497 LYSPI00-A; LYSP100-B; MGC126440 NM 001005176 Hs.632549 11262 2190139 0.00497 P2Y14; GPR105; K1AA0001 NM 014879 P2RY14 〇·蛋白偶合,14」Hs.2465 9934 3420131 0.00497 XM.936044 L0C641997 4570343 0.00494 P2Y10 NM.014499 P2RY10「嘌呤能受艘P2Y,G-蛋白偶合,l〇j Hs.296433 27334 1230040 0.00493 NRIP; ARCAP; PC326; MSTP055; RP4-745I14.1; 1200006M05Rik WJU8442 IQ 基元及 WD 重複 1 Hs.435741 55827 5550364 0.00493 XR_000904 RPLI4L 1190082 0.00493 L0C652726 XM.9423S1 LDC652726 652726 ~ 6620711 0.00493 cig5; vigl; 25l0004L01Rik NMJ80657
Hs.657402 ❹ NM_016391 HSPC111 假定蛋白 HSPC111
Hs.652195
Hs.75361 ZNF540 PSME1 純系Nblall051,全長插入序列j SLC24A4「可溶載艏家族24 123041 核纖層蛋白B2 Hs. 538286 SP140 SP140核饉蛋白 「嘌呤能受«Ρ2Υ 84823 1QWD1
Hs.17518 91543 4050241 0.00492 FLJ 16627; KIM0436 Nli_006036 9581 " 5550360 0.00492 TRIM; TCRIM; HSPC062 Ml_016388 TRAT1 類似於錨蛋白重複域36 RSAD2含基困S-腺苷甲硫胺酸域2 脯胺釀基内肽峰樣 Hs. 444349 T細胞受«相關跨膜接附子1 141281.doc 140 201022492
Hs.138701 50852 7200482 0.00492 NM_053000 TIGA1 _ 7380670 0.00492 Sep-ll NM_0l8243 II-Sep 胞裂蛋白ll Hs.l28l99 55752 2710458 0.0049 FU31158; RP11-5906.1 NM 152569 C9orf66 染色想9開放閱讀框架66 Hs.190877 157983 290646 0.0049 BBC1; D16S444E; FU27453; FLI27454; MGC71373; MGC117342 NM_〇33251 RPL13 核糖 «蛋白 L13 Hs.410817 6137 2140433 0.00489 ABH2; hAK12; MGC90512 NM 001001655 ALKBH2 「alkB,烷基化修復同滹物2 (大腸桿菌)_ Hs. 374458 121642 ' 3120470 0.00487 DN7; DN-7; TAF9L: TAFII31L: TFIID-31 NM_015975 TAF9L 「TAF9BRNA聚合酶II,TATA盒結合蛋白(TBP)-相關因子,3lkDaj Hs.5922« 51616 6180768 0.00485 TCR M64350 「TCR可變區Va30子族基因(VA30,JA,CA片段5,51端j Hs.495112 1580129 0.00485 XM 375152 LOC400304 ,. 1070626 0.00485 GL; PPP1R4; FU14005 NM 024607 PPP1R3B 「蛋白磷酸酯嗨1,調節(抑制子)攻嚴矛犯· Hs.458513 79660 ^ 160736 0.00485 HSP75; HSP90L NM 016292 TOtf>l INF 受逋-相關蛋白 1 10131 ' 1400739 0.00485 RAB24 ΝΜ_ωΐ031677 RAB24 「RAB24,RAS致癌基因家族成貝j Hs. 16258
Hs.30345 NM_006329 WD重複域5 NM_006624 MCEMP1
5570608 0.00479 EVEC; UP50; ASMD3; DANCE; FU90059 10516 3370195 0.00479 SWD3; BIG-3 側 052821 Wl®5 70630 0.00479 XM.935991 L0C641814 1570754 0.00479 BS69; BRAMl; 1CC111056; RP11-486H9.1 Hs.292265 10771 6330010 0.00479 MCEMP1; MGC132456 NM.174918 Hs.432413 199675 " 4290465 0.00479 MGC24665 刚丨52308 MC3C24665 Hs.347524 116028 ~ 1770468 0.00478 STAT4 NM 003151 STAT4 信號轉導子及轉錄活化子4 Hs. 80642 6775 2000386 0.00478 RALGEF2; KIAA0351; RALGPS1A; RP13-225021.1 NM_014636 基元之RalGEFl Hs. 432842 9649 473054S 0.00474 FU13154 NM_024S98 C16orf57 染色體 16開放閱讀框架57 Hs.588873 79650 3370041 0.00473 L13; MGC13061 NM.032322 RNF135 環指蛋白 135 Hs.29874 5900040 0.00472 BX092531 _ 轉錄基因座 Hs. 150808 1260047 0.0047 RNF88; TRIM5a NM 033092 TRIM5 含三聨基元5 85363 " 3130392 0.00469 XM_946270 HIP1R 抗衰老關鍵蛋白抗逋5 Hs. 332708 Hs.397638 11091 ZMYND11「含辞指MYND域11」 FHLN5 染色《19開放閲讀框架59 染色體16開放閱頡框架75 RALGPS1具有PH域及SH3結合 84282 Hs.370515 SART2硫酸皮膚素表構酶 2760484 0.00469 DSEPI; SART2 29940 5860021 0.00464 SWAN; KIAA0765; HRIHFB2091 NH.006047 RHH12 RNA結合基元蛋白 12 Hs.246413 10137 6280273 0.00461 CLECSF10; dectin-2 NM 〇〇1〇〇7〇33 CLEC6A「C型凝集素域家族6 ,成 gAj Hs. 591147 93978 3=·妖朱 1 埤糸秩ο 珉《aj 5270500 0.00461 CJJM3; PSK-J3; MGC14458 NM 000075 0X4 細胞週期素-依賴性激酶4 1019 1510220 0.00461 ZAP; ZC3H2; FLB6421; ZC3HDC2; FU13288; MGC48898; DKFZp686F2052; I*FZp686H1869· DKFZp686019171 NM_024625 ZC3HAV1「鋅指CCCH型,抗病毒 1」 Hs. 133512 * 6270382 0.00461 Lmiit2; NTNG1; KIAA0625; KIAA1857; MC3C21884; bA479K20.1 NM 032536 ---- Hs,163642 84628 ' 4490653 0.00461 P51; P71; ZER6; KIAA1339 NM_170686 ZNF398 鋅指蛋白398 57541 270730 0.00461 ΙΟΒ-】 NM.004848 Clorf38 染色體 1 開放閱讀框架38 Hs. 10649 9473 110674 0.00456 CGI65; CIA30; CGI-65 NM_016013 _ΑΠ「NADH去氫酶(泛醌)1 a 子複合物,組裝因子1」 Hs. 106529 51103 5270390 0.00456 C7orfl2; FU21213; FLJ21879; FLJ41901; NBLA04196 含 CAS1 域 1 Hs. 260041 64921 6660521 0.00456 IP; ΑΤΡΙ; ATPIP; MGC1167; M0C8898 Hs.590908 93974 5720647 0.00454 MLTNB; FKSG34; MADDAM NM_033274 Hs.483944 8728 " 2260082 0.00454 2350202 0.00452 SIAT7F; ST6GALNACVI; RP11-203J24.3 NM 013443 ST6GALNAC6 「ST6(a-N-乙醢基經胺基-23-β·半乳糖基-1,3>N-乙醯基胺基半乳糖苷0^6·唾液酸基轉移酶6 J Hs.109672 30815 既013352
Hs.486292
Hs .95577 轴突生長誘向因子G2 Hs.654721 NM_178191 ADAM19 NM_022900 NBLA04196 ATPIF1 ATPase抑制因子i 金屬肽酶域19 (πκΐΐτώβ) 1780348 0.00452 BRMS2; MRPS4; C15orfl2; FU10968; DKFZp586L0118 NM 018285 「MP3,U3小核仁核糖核蛋白,同源物(酵母)」Hs.513043 ^ 55272 IMP3 5720546 0.00452 FLI38860 AK096179 C7orf40染色體7開放閱讀框架40
Hs.25892 6590451 0.00452 刚_194441 BTO3A1 580537 0.00452 BIMP3; CARMA1; MGC133069 NM_032415 CARD11 「卡斯蛋白酶募集域家族,成員u」 141281.doc 141- 201022492
Hs.648101 84433 5130767 0.00451 ΜΑΠΗ3; JV15-2; Smad 3: HSPC193; HsT17436; MGC60396; DKFZP586N0721; MCFZp686J10186 NM.005902 SMAD3 SMAD 家滅成 M3 Hs. 36915 4088 ............ 鋅指蛋白337 Hs.661684 26152 漸進式細胞死亡2樣 150095 0.00449 ZNF337 NM 015655 ZNF337 1440450 0.00449 MGC13096 NM 032346 MGC13096 84306 1410142 0.00449 CIB; MC3C15429 NM.032750 AKID14B 84836 1440546 0.00449 FU40994 NIL002080 OOT2 粒線體(天冬胺酸轉胺酶2)J Hs.599470 2480048 0.00449 GNG10 NM_001017998 GNG10 Hs.534196 2790 110538 0.00449 XM.370899 L0C642432 940246 0.00449 MGC45871 NM_182705 FAM101B Hs.591203 359845 ' 2120524 0.00449 MQC125369; RPU-48C7.1 NM.015537 26012 430132 0.00449 NKLAM; FLJ90005 NM_153341 I®DC3 6200376 0.00448 1-8D NM_006435 IFITM2 Hs.174195 10581 1500411 0.00448 YC1; MSSP; SCS2; MSSP-1; «SSP-2; HSSP-3; MGC3331; MGC15146 rRNA結合基元,單鏈相互作用蛋白1」 Hs.470412 5550735 0.00448 NRF; ITBA4 NK.017544 NKRF NF-κΒ抑制因子 55922 r _ 3940731 0.00448 OIAS; IFI-4; OIASI hM_001032409 0AS1 寡腺苷酸合成酶1,4〇/46kDaj Hs.524760 4938 S550767 0.00448 GCH; DYT5; CTPCHl; GT?-CH-1 NM_000161 GCH1 GT? 環水解酶 1 (多巴反應性肌張力障礙) Hs.86724 2643 4730397 0.00448 CD32; FCG2; FcOR; CD32A; 0)w32; F03R2; IGFR2; FOS2A1; MGC23887; MGC30032 F0GR2A「IgG之Fc片段,低親和力Ha,受® ^ Hs.352642 2212 4210424 0.00447 BG205162 轉錄基因座 Hs.633719 5080022 0.00446 B7DC; Btdc; jPDL2: CD273; PD-L2; PDCD1L2; MGC142238; MQC142240; bA574F11.2 PDCD1UG2 漸進式細跑死亡1配饵* 2 Hs.53227? 80380 5130709 〜 1050750 含自水解酶域14B 「麵胺酸草醯乙酸轉胺酶2, 2806
Hs.515344 Hs.420796 烏嘌呤核苷酸結合蛋白(G蛋白),Y10j 「具有序列相似性之家族101,成員Β」 鼻胚 LHRH 因子 Hs .455336 含 IBR 域3 Hs.591504 127544 干擾素誘導性跨膜蛋白2 (1.8D) NM_002897 RBMS1 5937 Hs.437084 NHL021642 NM_〇25239 LTBR 1 5550333 ( 4接子, 0.00446 HPF2 NM_〇〇3428 ZNF84 鋅指蛋白 84 Hs.654730 7637 LT-p-RHLnK55n ^-002342 0.00443 LAB; NTAL; WOT5; WBSCR5; HSPC046; WBSCR15 成員2」 7462 50681 0.00443 L-H2; ASGP-R; CLBC4H2; Hs.1259 NM.080914 Hs.654440 433 t A 5910427 0.00443 PHB NM.002634 PHB 阻抑素 NM.022040 LAT2 「T細胞家族之活化 ASGR2 去唾液酸醣蛋白受« 2 Hs.514303 5245 2140402 0.00443 AD021; AD036; FU38155; DKF^434L142 NM 016613 Hs.567498 51313 1780592 0.00443 BF508745 轉錄基因座 Hs.678303 840470 0.00443 K12 NM.003004 SECTH1 分泌及跨膜 1 Hs.558009 6398 2070750 0.00443 RNF84; MGC:39780 NM.004619 TRAF5 TOF 受體-相關因子5 Hs,523930 7188 6100670 0.00443 U0C389541; MGC163425; MGC163431 NM.001008395 L0C389541 類似於0G14977-PA Hs.406520 389541 4010364 0.00442 SCC-112; PIG54; FLJ41012; KIAA0648; MGC13I948; MGC161503; WCFZp686B19246 NM 015200 SCT-112 SOC-112 蛋白 Hs.331431 23244 一 NSL016586 MBIP MAP3K12 C4orflS 染色饉4開放閱讀框架is 290253 0.00442 MBIP 51562 770639 0.00442 MGC99572; DKFZp6S6G1699 MJ„000997 6167 4590678 0.00437 BHC80; BM-006; KIAA1696 NM.016621 51317 6900747 0.00437 MGD0442 NM」)01715 BLK 640 2490170 0.00436 RVB2; BCP51; TIP48; CGI-46; TIP49B Hs.515846 10856 1050240 0.00436 ASP; FU25776 NRL031916 R0PN1L 1440382 0.00435 UBC7 NM.182688 UBE2G2 Hs.529420 7327 3890544 0,00435 MGC1022; FU20552; MGC14317 NM.194460 結合抑制蛋白1 Hs. 368647 RPL37 核糖«蛋白 L37 Hs.80545 Hff21A PHD 指蛋白 21A Hs,502458 B淋巴酪骇酸激酶 Hs. 146591 NIL006666 RUVBL2 RuvB-樣2 (大腸桿菌) 精子特異性蛋白1樣 Hs ,381089 83853 「泛素-接合酵E2G2 (UBC7同源物,酵母)」 RNF126 環指蛋白 126 Hs,69554 55658 3710368 0.00434 KAP1; TF1B; RNF96; TIF1B; FU29029 N»L〇05762 HUM28 含三聯基元 Hs.467408 10155 5810184 0.00433 SLF2; SGA72M; CHRUSYT; KIAA1597; M0C1O2768 NM.206930 SYU2 突觸結合蛋白樣2 Hs, 369520 54843 2000634 0.00433 HUFI-2; FU20248; FU22683; aCFZp434H2035 NML017724 LRRFIP2 (在FLII中)相互作用蛋白2 Hs.475319 9209 2640364 0.00432 XM.934138 K1M0748 6980520 0.00432 XM.941966 L0C652500 「 5670437 0.00428 FU10534; KIAA1401; IIGC131829 »1^018128 TSR1「TSR1,20SrRNA累積,同源物(嚎酒酵母) 白胺酸富集重複 141281.doc 142- 201022492
Hs.388170 bA465L10.6 NM 020967 3830709 0.00428 CIA; 57727 ΚΪΑΑ1641 MU 99185 Hs.557550 ~ 6650161 0.00425 IL-1; IL1F2; 3553 5890291 0.00425 MYM; FLJ23151; FLJ43753; RP11-181E22.4 Hs.471243 79830 核受體輔活化子5
Hs.654991 520747 0.00426 XM—944061 2060154 0.00426 B23; NBi; MGC104254 NPM1「核仁填酸蛋白(核仁罐蛋白B23,numatrin)」 IL1B 「介白素1,pj Hs. 126256 ΝΜ_024772 ZMYH1 「辞指,MYM型 1」 1780332 0.00424 SDY; DM); HPS7; My031; FLJ30031; IIGC20210; DKFZP564KI92 NM 183041 imigpi 異連蛋白結合蛋白1 Hs.571〗48 84062 " Dri 「蛋白璘酸酯酶3 (先前2B),催化次單元,
4869 IL1-BETA NMJJ00576 130167 0.00424 CALNA3 NM_(X)560S γ 同功異型物 J Hs.655661 — 5533 730458 0.00424 PURL; R3AMS; FGARAT; KIAA0361 NM_012393 (FGAR醢胺基轉移酶) Hs,573976 _ 5198 840475 0.00423 MPP1; KRMP1; MPP-1; DKFZp434B0435; DKFZp434P0810 M-相磷蛋白 1 Hs.240 9585 4180356 0.00423 SRK; STD; TZK; ZAP-70 NM.207519 ZAP70 Hs.234569 7535 ~ 6520204 0.00423 PAPD3 NM 001009881 ZCCHC11 23318 4230039 0.00423 p85; ASPP1; KIAA0771; p53BP2#
PFAS NMJ315316 Hs.436113 NM 018284 0.00422 FLJ10961; DKFZp686E0974; Hs.656774 2635 5340722 0.00422 MGC32104 NM 144684 ZWF480 7000767 0.00422 SRB; Cctd; MGC126164; MGC126I65 NM.006430 Hs.421509 10575 2810132 0.00422 SYS; SARS; SERS; SARSM; SerHSmt; mtScrRS; 「絲胺醯基-tRNA合成酶2,粒線«」 Hs.652115 4890678 0.00422 NM.173501 C16orf52 630746 0.00422 TAPBPR; TAPBP-R; FU10143 NM 018009 Hs.504597 55080 4070195 0.00422 C13orf32; FU30046; MGC131899 NMJ44595 Hs.349955 122060 1470360 0.00422 p40; GPR69A mjX)605S LAfCLl LanC Hs.13351 10314 3130711 0.00422 FLJ14239; FU32057; FU45606; KIAA1291 l«L〇20750 57510 7050682 0.00422 RDC1; CMK0R1; GPR159 NM_020311 CMKORI Hs.471751 57007 FPR1 甲醯基肽受體1 BCL9 B細胞CII7淋巴瘤9 磷酸核糖基甲敏基甘胺脒合成酶 NMJH6195 _SM ζ·Μ (TCR)相關蛋白激酶7〇kDa 「含鋅指,CCHC域 11」 Hs.655407 蛋白磷酸酯酶1,調節 烏苷酸結合蛋白3 PPP1R13B 23368 GBP3 鋅指蛋白 480 Hs · 147025 147657 CCT4「含TCP1,次單元4⑻之伴侣蛋白」 隱 NM—017827 SARS2 TAPBPL TAP結合蛋白樣 FLH0(M6 「SLAIN基元家族,成員1」 羊毛硫抗生素合成酶組份C樣1 (細g) XP05 輸出蛋白 5 Hs. 203206 趨化激素(C-X·基元)受艏7 10343 0.00422 FPR; FMLP MK.002029 6940685 0.00422 US; MGC131591 NM.004326 _ 5390243 0.00422 NR1D2 XM.940036 NR1D2 「核受«子鵁1 厂紐£),点員2 :同物異名:RVR、BD73 EAR-lr、Hs.37288 ; Rev^eib^ ;智人核受體子族 1,組D,成員2 (NR1D2),mRNA^j
Hs.4152(»S'753 4610307 0.00422 0.00422 B18; SUE21; PRED34 NMJ Hs.208358 59271 " 0.00422 APRIL; CD256; TAIL2; mLA: 058187 C21orf63 配位濮;UNQ383/PK0715 Hs.54673 ❿ 3060682 0.00422 APRIL; CD256; TALL2; 「肢瘤壞死因子(配位體)超家族,成員13」 2260392 0.00422 PTDOll; C6orf73 ϊ«„014051 Ί1_14Α 跨膜蛋白 14Α 28978 一 1940059 0.00422 L0C136143 ΧΜ.069734 L0C136143 136143 4590458 0.00422 NM^016947 C6orf4S 1510224 0.00422 NHP2; NHP2P ί%_017838 KM2 Hs.27222 55651 4250458 0.00422 L0C284393 XM_209178 L0C284393 284393 3840368 0,00422 H2B.h; H2B/h; H2BFH; H2BFN; dJ221C16.8 NM 003523 Hs.534369 8344 染色《21開放閱讀框架63 嘗SF13 Hs.94896 類似於核糖«蛋白L18 鄹2088 RNASELl; RNASai Hs.12013 FLJ33200 NM 032048 「核仁蛋白家族A,成異2 (H/ACA小核仁RNP)」 類似於核糖體蛋白L10 HIST1H2^ 「組蛋白叢集1,H2be」 ABCE1 「ATP-結合卡匣, 彈性蛋白微原嫉維界面2 「v-rel網狀内皮增殖病毒致癌基因同源物B,B細胞中κ NM 002940 6059 EMILIN2 2360148 0.00422 RLI; OABP; ABC38; RNS4I; 子族E(OABP),成貝1」 10070 0.00422 FOAP-10; EMILIN-2; Hs.532815 84034 50504 0.00421 I-REL NM_006509 輕多肽基因強化子之核因子3 (禽類)」 540397 0.0042 LZT-Hs2; MGC126565; MGC138428; DKFZp781L10106 NM_020342 (鋅轉運饉),成810」 Hs.650158 57181 1470709 0.00418 BSG; ESG1; GRG1 W_005077 TI£1 「轉導素樣分裂強化子 1 (E(spl)同琢物 Hs.197320 7088 3170719 0.00417 KLP; ΟΓΓ2; ΟΙΓ2Α; OfT2A]; HMSNII; FLJ23699; KIAA0591; KIAA1448; MGC134844
Hs.654402 5971 SLC39A10「可溶載饉家族39 6450523 ^AK024852
Hs.97858 「OM: 23095 FU21199 fis,
純系 COL00235J 果蠅)J WL183416 Hs.34558 141281.doc -143- 201022492 MRNA; cDNA DKFZp586K1922 (來自純系 DKFZp586K1922) NM^005531 IFI16 「干擾素γ«Ι導性蛋白16 J REC ML000629 1FNAR1「干擾素(a、β及Ω)受體 1」 祕L015044 GGA2 「高爾基體相關,含γ銜接蛋白耳, ABCF2 SYTL3 「清道夫受《Β類,成員2j NM.012264 C22orf5 1010523 0.00413 ALU0204 Hs.193784 60482 0.00413 PYHIN2; IRXJIP1; MCXS466 Hs.380250 3428 3190437 0.00411 AVP; IFRC; IFNAR; IFNffi; IFN Hs.529400 3454 6270364 0.00411 VEAR; FLJ20966; KIAA1080 _ ARF結合蛋白2j Hs.460336 ~ 23062 2810382 0.00411 ABC28; M-ABC1; HUSSY-18; EST133090; IXFZp58«1823 「ATP-結合卡匣,子族F (J3CN20),及^2」 Hs.654958 2480600 0.00411 SLP3; Mt3C105130; MQC1118883; MGC118884; MGC118885 突觸結合蛋白樣3 Hs. 436977 94120 1980491 0.00411 CD36L2; HLCffeS; LIMPII; SR-BII ML005506 SCARB2 Hs.349656 950 240731 0.00409 FM08; HS506A; DKFZP586A1024; I*FZp686N1150; DKFZp686F07174 染色艘22開放閱讀框架5 Hs. 182626 25829 6350468 0,00408 ZAK; AZK; MLT; MRK; MLK7; MLIK; ralklak NMe016653 ZAK 含不育α基元及白胺酸拉鏈之 激酶 AZK Hs.444451 51776 BTBD15 NNL007189 10061 NM 001009991 5570753 0.00408 BIBD15; HSPC063; MGC26123; MGC57431; MGC60348; MGC88058 NM 014155 含辞指及 BIB 域 44 Hs. 178499 29068 _ 1090050 0.00408 XM.940945 L0C651726 160682 0.00408 RSE1; SAP130; SF3 3bl3〇; STAF130; KIAA0017 Hs.514435 23450 NMJH2426 次單元3,130kDa」 6660193 0.00408 RPW NM.000968 — 4280332 0.00408 DDX24 NM.020414 DDX24 57062 · 4070138 0.00408 NS; E2IG3; C77032; MGC800 娜_014366 GWL3 Hs.313544 26354 7330037 0.00408 FU21148 NM.024860 SETO6 4260446 0.00408 mill; DRIL3; ΈΆΙ(Μί; E2FBP1 NM 005224 Hs.501296 1820 6400647 0.00408 NM 016285 KLF12 5220600 0.00408 XAP4; H0IL1; RBCK2; WF5A· Z 含RanBP-型及C3HC^型鋅指1 2510070 0.00408 LIN2 NM 003688 CASK Hs.495984 8573 7560673 0.00408 HGK5; HLK3; PCN3; HPCN3; KV1.3; HUKIII NM.002232 混合器-相關子族,成員3j HsTl69948 5390059 0.00408 KIAA1948; MGC45380 NM 133466 ZNF545 284406 4260661 0.00408 ozrfl; ZFP260 NMJ01012756 3Φ260 3310594 0.00408 CD85; LIR9; CD85F; ILT11; LILRB7 NM.181986 SF3B3 1"剪接因子3b, 核糖艎蛋白L4 Hs.644628 DEAD (Asp-Glu-AU-Asp) S多肽 6124
Hs.510328 烏嘌呤核苷酸結合蛋白樣3 (核仁) 含 SET 域 6 Hs. 592060 79918 ARID3A AT富集相互作用域3A (BRIGHT樣) C20orfl8; UBCE7IP3 湖_006462 C20orfl8 Hs.247280 10616 鈣/鈣調蛋白-依賴性絲胺酸蛋白激晦(MAGUK家族) KCNA3「奸電壓閘控通道, 3738 鋅指蛋白545 Hs.558734 辞指蛋白 260 Hs. 18103 339324 LILRA5 參 「白血球免疫球蛋白樣受艟,子族A (具有ΊΜ域),成員5」 3990747 0,00408 dJ18601.1 NM„033318 L0C91689 Hs.306083 91689 7100039 0,00408 KIAA0218; MGC126819; MGC126825 NM 014760 TATDN2 Hs.47540〗 9797 一 1030487 0,00408 BOCT; BOIT; NGALR; hBOIT NM 016609 (有機陽離子轉運«),成員17」 Hs.373498 5550746 0,00408 MGC29816 NM_152272 CHHP7 " 1580364 0.00407 LAP; CklM; aiH NM:007166 PICALM Hs.163893 8301 5130017 0.00406 KRS1; MST2; FLI90748 NM__006281 5870047 0.00406 NMi〇04030 IRF7 4010300 0.00406 APC1; MCPR; TSG24 NM^022662 Hs.436527 64682 3400292 0.00406 PSG13; PSG14; MGC22484 M.002785 Hs.646353 5680 一 5870221 0.00406 p44; MTAP44 NM 006417 IFI44 10561 5960187 0,00404 BICD NM_001714 BICD1 - 636 " 2710097 0.00403 19A; CS1; CD319; CRACC NM„02118l 57823 5340475 0.00403 HPP1; A-116A10.1 NM.003905 Hs.460978 8883 ;GP3B; GPIV; CHDS7; PASIV; SCARB3 N6L001001548 CD36 CD36 分子 Hs.120949 948 1340338 0.00403 MGC57346; MGC57346 XMJ77476 «57346 假定LOC401884 Hs.654930 401884 6040634 0.00403 XMJ42594 L0C652878 6480170 0.00403 NRAGE; DLXIN^l 湖L001005333 MAGED1 「黑色素瘤抗原家族D,1」 Hs.5258 9500 2600168 0.00403 ZCW4; ZCWCC2; FLJ11565; dJ75H8.2 ^024657 M0RC4 M0RC 家族CW-型鋅指4 79710
Hs,631592 353514 染色體22開放閱讀框架32 含TalDDN酶域2 SLC22A17 「可溶載體家族22 51310 「CHMP家族,成員7」 Hs.5019 91782 磷脂醞肌醇結合内涵蛋白組裝蛋白 STK3「絲胺酸/蘇胺酸激酶3 (STE20同源物,酵母)」Q ANAPC1 後期促進複合物次單元1 PSGU 妊娠特異性β-l-醣蛋白11 干擾素誘導性蛋白44 Hs.82316 -尾D同源物1 (果蠅) SLAMF7 SLAM家族成貝7
Hs.505202 Hs.517265 APPBP1 類濺粉β前驅饉蛋白結合蛋白1 141281.doc -144- 201022492 C6orfl08 染色艘6開放閱讀框架1〇8 展苷-胞苷激酶1樣1 Hs. 504998 7160164 0.00403 RCL; dJ330M21.3; RP3-330M21.3 ^199184 Hs.109752 10591 5870392 0.00403 UCK1L; URKL1 NM 017859 UCKL1 54963 " 4120673 0.00402 XM 929209 LOC653723 3370440 0.004 V; RASGRPfhRasGRPl; MGC129998; MCT129999; CALDAG-GEFI; CALDAG-GEFII RASGRP1 RAS烏苷酸釋放蛋白1 (鈣及DAG調節) Hs_ 591127 4850424 0.00399 HELjG; RAY1; SEN4; TSG7; ETS7q; FAM4A1; IKFZp76202113 NM.018412 抑制致瘤性7 Hs. 368131 7982 5490286 0.00399 FLJ39531 NM.207445 FLJ39531 400360 5130162 0.00398 TCPML2; TTRP-ML2; FLJ36691 NH 153259 255231 一 5550044 0.00398 LBA1; KIAA0342 XM.940627 LBA1 6130239 0.00398 S(K1 NM 005627 " SGK 6446 — 50100 0.00398 AlDC; ALffll; PUMB1; ALDHll; RALDH1;, FLJ39531 蛋白 MOOW2黏脂蛋白2 狼瘡性雎抗原1 血清/糖皮質激素調節激酶 NM_005739 10125 ST7 Hs.376109 Hs.591446 9881 Hs.510078 ❿ NM_000689 Η-El; MGC2318 216 (Mffl「輸卵管細胞醣蛋白1 ALDH1A1 120kDa (黏蛋白9, 1043 調節突觸膜胞吐3 RPL22 核糖逋蛋白 L22 Hs.515329 NM_005546 ITK IL2誘導性Τ細胞激峰 「DPH4,JJJ3同源物(釀酒酵母)」 Hs. 187269 NM.005935 AFF1 rAF4/FMR2 成員8」 「路去氩酶1家族,成員AIj 5690131 0.00397 BGP; OGP; MU 輸卵管素)J Hs.1154 5016 4610047 0.00396 CDW52 m 001803 510768 0.00395 NIM3; RIM3; KIAA0237 Hs.654808 9783 6980082 0.00395 ΕΑΡ; HBP15; HBP15/L22 6146 7650561 0.0039 EMT; LYK; PSCTK2; MGC126257; MGC126258 Hs 558348 3102 5910437 0.0039 JJJ3; ZCSL3 NM.181706 ZCSL3 120526 3130070 0.0039 AF4; AF-4; ΜΙ; MLLT2; AF4-MLL; MLL/AF4; MGC134969 家族,成員1」 Hs.480190 4299 6650717 0.00389 TATi; FU32714 NJL052961 SLC26AS 「可溶載體家族26 116369 7100398 0.00388 FU20287; bA208F1.2; RP11-208F1.2 NM 017746 TEX10 Hs.494648 54881 ' 7100193 0.00387 JM23; MRX9; Sffil; TOf7; CDLIV; MRX44 HM.012280 FISJ1 Hs.23170 24140 1110112 0.00387 FU22170; MC3C133331 XM.938283 C17orf68 68 80169 6100064 0.00386 HNRNP; JKTEP; JK1BP2; laAUFl NM.031372 HNRTOL 異源核 核糖核蛋白D樣 Hs. 527105 9987 5720228 0,00386 DDX30; FLJ11214; KIAA0S90 ML014966 MX30 DEAH (Asp-Glu-Ma-His> 盒多肽30 Hs.517948 22907 4730632 0.00386 H2B/S; H2BFT; H2BFAiii; MGC131989 NM.080593 HIST1H2BK 「组蛋白叢集 1, Hs.437275 85236 5310767 0.00386 Rsc8; BAF170; CRA0C2 NM 003075 SMARCC2 「SWI/SNF相翮,基質相關,染多誓* 肌動蛋白依賴性調節子,子族c,成員2」 Hs.236030 6601 670196 0.00386 CBX7 ΝΜ.175709 CBX7 染色盒同源物7 Hs.356416 23492 1740136 0.00386 ICH-3; MGC141966; ICEREL-III; ICE(rel)3II NM_004347 CAJa>5 「卡斯蛋白兹5, 細胞凋亡-相關半胱胺酸肽酶j Hs.213327 838 ' ^ 2810154 0.00382 ACYPE NM^203488 ACYP1 「雄基磷酸酯酶1,紅血球(共用)型」 Hs.18573 620019 0.00382 CDA1; CDAI; CDA-I; PR01295; codanin NM.138477 CDAN1「先天性紅血球生成募常性 貧血,I型」 Hs.599232 146059 990543 0.00381 FLJ25067; RP4-784N16.1 NM_152504 FU25067 染色體20開放閱讀框架 196 Hs.529340 149840 4070129 0.00381 PGRP: TAG7; PGRPS; PGLYRP; PGRP-S; TTJFSF3L; MGC126894; MGC126896 Mi (»5091 PGLYRP1 肽聚醣識別矣白 1 Hs. 137583 8993 ~ CHIT5 NMl〇02557 CD52 CD52 分子 NM.014747 R1MS3 NMJ)00983
Hs.276770 華丸表現10 FtsJ同源物1 (大腸桿菌) 染色想17開放閲讀框架 1710471 0.00381 ELF; SPTB2; βΞρΙΙ
Hs.503178 5570674 0,0038 5910291 0.0038 23059 * 4640044 0,0038 6711 FKBP133; KIAA0674 23307 FU13297; KIAA0643 NM.003128 XM_936355 NM 024793 BCL5; LAZ3; BCL6A; ZNF51; ZBTB27 Hs.478588 604 2480092 0.0038 MC3CA; MCC-B; FLJ25545; DKFZp686B20267 Hs.47649 56922 5420767 0,00379 SPF45; MC3C14439 NM^032905 RBK17 84991 650240 0.00378 MAD5; MXD5; FLJ12634; KIAA0518 XM.939296 23269 ~ 630491 0,00378 GU2; CHJB; MGC3199; RH-II/GuB NM_024045 Hs.522984 79009 ~ 630711 0.00377 P0; L10E; RPPO; PRLP0; MGC8S175; MC3CU1226 「核糖體蛋白,大型,P〇」
SPTOI1 KIAA0674 αϋΑΡΙ NMJ38931 NM.020166 RNA 「▲影蛋白,β,非-紅A球1」 「FK506結合蛋白15,133kDa」 凝聚素相關蛋白1 Hs. 155995 BCL6 B細胞CLL/淋巴瘤6(辞指蛋白51) MCCC1甲基巴豆釀基-輔酵A叛化峰1 (α) 結合基元蛋白17 Hs. 498548 MGA MAX基因相關 DDX50 DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp)盒多肽50 W«_00i002 RPLP0 141281.doc •145- 201022492
Hs.546285 6175 6590343 0.00375 CAB2; PP1498; AGLA546; MGC9753 Hs,462971 93210 4780022 0.00373 RP35; SEMB: SEMAB; CDRD10; FLJ12287; RP11-54H19.2 NM 022367 「sema域,免疫球蛋白域(Ig),跨膜域(TM)及短細胞質域(軸突導向因子)-4A」 Hs.408846 64218 ZNF589 辞指蛋白589 Hs. 172602 retSIXl ML004753 DHRS3 去 ϋ 醢/ϋ 9249 CD38 NHJ81504 5295 NM 033419 PERLD1 含perl樣域1
SEMA4A 3170468 0.00373 SZF1 WJ.016089 3840170 0.00373 SDR1; RDH17; Rsdrl; Hs.289347 2070332 0.00373 T10 i«L〇〇1775 6590020 0.00371 GRB1; p85-a … Hs·132225 ML004753 CD38分子 PIK3R1 51385 去氩酶/還原酶(SDR家族)成員 Hs,479214 952 「球酸肌醇〜3-激酶,調節次單元1 (p85a)」 NM_012387 PADI4 5310653 0.0)369 PAD; PDI4; PDI5; PADI5 Hs.522969 23569 580292 0.00369 FU36386 NM.020347 Hs.30824 54585 6220674 0.00369 LAK; ARL7 NM_(M)5737 10123 6590564 0.00369 TC2; D22S676; D22S750 NM.000355 Hs.417948 6948 4120086 0.00369 MGC104312; MGC163287; DKFZP566J091 Hs.567598 81606 4220246 0.00369 L0C643790 X&L927071 LOC643790 Hs.447529 643790 2320326 0.00368 qkf; MORF; M0Z2; FU90335; KIAA0383; querkopf; DKFZp313G1618 MYST組蛋白乙醢*轉移酶(單核細胞白血病)4 Hs.35758 23522 5340725 0.00368 (mi; MGC70821 ML001907 CIHL 胰凝乳蛋白酶樣 5820397 0.00368 II; HVR1; RDC1; VIPR; VIK5; VAPC1; VPAC1; FLJ41949; PACAP-R-2 腸血管活性肽受«1 Hs. 348500 7433 4670114 0.00368 FAIM1 煳 001033030 FAIM Fas細胞凋亡抑制分子 55179 LZTFL1 「狀基精胺酸去亞胺酶,IV型j
ARL4C ADP-核糖基化因子樣4C 白胺酸拉鏈轉錄因子樣1 Hs.655990 TCN2 NMJJ30915 轉鈷胺素II;巨紅血球性貧血 L册肢芽及心臟發育同源物(小鼠) 高移動族核小«結合域1假基因 NM.012330
Hs.654546 NH 004624 MYST4 1506 virai
Hs.173438
Sic0·00368 ^ 6370025 0.00368 ST1C37; PASKIN; KIAA0135; OCFZP4340051; DKFZp686P2031 含PAS域之絲胺酸/蘇胺酸激酶 Hs. 397891 23178 610465 0.00368 KLP; ΟΠ2\ OfT2A; ΟΓΓ2Α1; HIBNII; FU23699; KIAA0591; KIAA1448 KIF1B联動蛋白家族成具IB Hs.97858 23095 1010136 0.00367 HSPA6 ^002155 HS>A6 熱休克70kDa蛋白6 (HSP70B·) 3310 3120292 0.00366 CDA01; MS4A6; 4SPAN3; CD20L3; MST090; MSTP090 ; 4SPAN3.2; MGC22650; MGC131944 NJL015148
PASK PAS MGC134844 NM.015074
Hs.654614 ?GSGAli ^ mi〇5873 RGS19 MS4A6A 290386 10287 6590706 0.00366 XNL928670 4730386 0.00365 JC7; NUOKS; FLJ21480
Hs.523702 64231 G-蛋白信號轉導之調節子19 NMJ52851 Hs.422336 NM.004867 L0C645656 NM.022731 Hs.632458
ITO2A 核酪蛋白激酶及細胞週期素-依賴性激酶受質1 整合膜蛋白2A Hs. 17109 4040259 0.00365 E25A; mCDlh 9452 1190575 0.00364 KIAK0002; MGC102758 NM 001759 CCND2 細胞週期素D2 Hs.376071 780544 0.00363 FLT3LG NM 001459 FLT3LG fras 相關酪胺酸激酶3配位體 Hs.428 1430521 0.00362 BAP; REA; p22; Bap37; BCAP37; PNAS-I41; M(3C117268 NM„(K)7273 PHB2 阻抑素 2 Hs. 504620 11331 1230575 0.00362 C5orf31; FU20796; MGC24679 NMJ81705 L0C90624 Lyrm7 同源物(小鼠) Hs. 115467 90624 站议贫饱也 2630411 0.00357 AW241552 轉錄基因座 Hs · 564W7 7160544 0.00357 NM_001009607 L0C92017 ^ 4010437 0.00357 STF1; STFA NM 005213 CSTA 半胱胺酸蛋白酶抑制素A Hs.518198 1980397 0.00357 DKFZp762C143 NBL173469 UBB2Q2 泛素-接合酶E2Q (推定)2 Hs.23033 92912 6650020 0.00357 AM 撇_001124 ADM 腎上腺髓質素 Hs.441047 133 1710138 0.00357 NM:003444 ZNF154 4920364 0.00357 NED06; Csa-19 Ml 007104 RPL10A 核糖饉蛋白Llpa Hs.546269 4480646 0.00357 FU22589; dJl42L7.2 NM_016262 TOBE1 「微管蛋白,εΐ」 51175 894 2323 1475 4736 Hs.34851
PILRA 2490189 0.00356 FDF03 NM.013439 29992 4610167 0.00356 KAIS0-L1; KIAA1538 Hs.35096 57659 6400397 0.00356 LYP; SAP; XLP; DSHP; EBVS; IMD5; NM 020899 配對免疫球蛋白樣2型受體a 含鋅指及BTB域4
Hs .444407 MTCPl 部肯氏病(Duncan'sdisease)(森巴增生症候群)」 6770142 0.00349 1®-ηιη23; KIAA0S16; C371H6.2 NMJ)02513 Hs. 514065 4832 290026 0.00349 BX098869 轉錄基因座 4260541 0.00349 CDC46; MGC5315; P1-CDC46 NHL006739 Hs.517582 4174 ΝΜ·002351 Hs·349094 NME3
MCMS SH2D1A 4068 「非-轉移細胞3 蛋白ία, 所表現蛋白」 Hs.687694 微小染色體維持複合物組份5 141281.doc • 146 201022492 LYAR Lyl抗體反應性同源物(小鼠) J4ZU154 ZLYAR; FLJ20425 NM.017816 55646 3400372 0.00349 FBX21; FLJ90233; KIAA0875; MGC26682; DKFZp434G058 NM 015002 Hs.159699 23014 6650484 0,00348 ASGPR; CLEC4H1; Hs.12056 NM.001671 ASGR1 Hs.12056 432 6860392 0.00348 ETS-1; EWSR2; FU10768 NM.005238 ETS1 v-ets 骨髓成紅血細胞增多症病毒E26致癌基因 同源物 1 (禽類) Hs.369438 2113 ΓΛ 5860075 0.00348 Η2Α; H2A/q; H2AFQ; MGC74460; H2A-GL101 NM.003517 HIST2H2AC 「組蛋白叢集2,H2acJ Hs .408067 8338 , β ^ 60086 0.00348 MGC40499; PRAT4B ΝΜ.152755 MGC40499 與Tk4相關之蛋白 Hs.632293 245812 3130634 0.00348 CHC1L NM_001268 RCBTB2 含染色逋凝集之調節子(RCC1)及BIB (ΡΟΖ)域的蛋白2 ~ Hs.657385 1102 4180465 0.00348 TRFP; FU20727; EKFZp686C13257 WL017944 Hs.577256 55031 FU22662
Hs.425427 FBX021 F盒蛋白21 去嗜液酸醣蛋白受饉1 Ν〇24829 风L015888 泛素特異性肽蘇47 假定蛋白 FLJ22662 Hs. 131933 鉤同源物1 (果蠅) Hs.378836 核糖體生物發生調節因子同源物 USP47 5260438 0.00348 FU22662 * 79887 1780280 0.00348 ΪΚ1; MGC10642 51361 6280750 0.00348 KIAA0112 NM.015169 • (釀酒酵母) Hs.71827 23212 4490026 0.00348 RPUS NM 007209 PPL35 5290050 0.00348 1012146 Md„004512 IL11RA 3590 5820176 0.00348 L0C552891 NM.004125 552891 5130367 0.00348 BM717151 _ 純系in-B-EJ0-ahk-gd8-CMn 5·, nRNA序列.」 赢 1850152 0.00347 JAB; CIS1; SSI1; TIP3; CISH1; SSI-1; S0CS-1 NM_003745 S0CS1 細胞激素信號轉導之 W 抑制子 1 Hs,50640 8651 2650201 0.00347 钺538337 CDNA 純系 IMAGE:5267398 Hs.658811 1070189 0.00347 PHTF NM.006608 PHTF1 推定同源異漤結構域轉錄因子 1 Hs,655S24 10745 4210427 0.00347 KALI; MBA; KALIb; Lyl08; NTB-A; SF2000; MGC104953 bW_052931 SLAMF6 SLAM 家族成員 6 Hs.492348 114836 ' MGC34705; OCFZp586D0624 m 015627 UMAP1 Hs.5W911 26119 " CLYBL r檸樣酸解離酶眯 Hs.655642 171425 I晰4 「1职4* ϋ3小核仁核糖核奎白,同源物(酵母)j 4040050 0,00347 ARH; ARH1; ARH2; FHCB1; FH 低密度脂蛋白受體接附蛋白1 3180392 0.00345 αΒ; bA134015.1 NM.206808 MGC19606 NH„033416 6380598 0.00345 _ Hs.91579 92856 2140307 0.00344 L0C283666 AL832164 283666 NMJ303 6 30 NM 二004925 NM.002467 Η〇αα RRS1 RRS1 核糖«蛋白L35 「介白素11受想
Hs,182825 aj 11224 Hs.591088
L0C552891 假定蛋白 L0C552891 Hs_ 534196 「UI-E-EJ0-ahk-2-l8-0-Ul.r2 UI-E-EJ0 智人cDNA 假定蛋白LOC283666 Hs.560343 ❿ 過JM匕物酶饉生物發生因子3 Hs.7277 S504 水通道*白 3 (Gill血型) Hs.234642 360 v-oiyc败細胞組織增殖病毒致癌基因同源物(禽類) 7200465 0.00344 TRG18 2060106 0.00342 GIL 7320056 0.00341 c-Myc Hs.202453 4609 6330414 0.00341 NM.014792 KIAA0125 6580563 0.0034〗 PP384; FLJ21945 N1L025203 FU21945 Hs.24624 80304 3710435 0.00341 AP2REP; AP-2rep; HSPC122 NM.007249 11278 ' 6280133 0.00341 FLJ22435; FU43947; FLJ46567; KIAA1491; bA176F3.5 泛素相關蛋白2 Hs. 493739 55833 1410427 0.00341 5PTase; MGC65156; MGC71303 NM.005540 INPP5B 「肌醇聚磷酸-5-磷酸酯酶,75kDa」 Hs.449942 3633 6980435 0.0034 Tl; LHJ1 NM_014207 CD5 CD5分子 Hs.58685 921 650019 0.0034 6PGD NM.002631 PGD 磷酸葡萄糖酸去氩酶 Hs.464071 510326 0.00338 HPIP NM„020524 ------- Hs.505806 57326 5050047 0.00338 E21G5; HGTD-P 26355 4200148 0.00338 XM.378421 u m Λ , 、 2100100 0.00338 FCGR2A XM.938849 FCGR2A 1 IgG之Fc片 & ’ 低親和力Da ’ 受體(CD32) 同物異名:CD32, FCG2、FcGRT CD32A,CDw32, FCGR2, IGFR2, FCGR2A1,MK:23887, MGC30032; 1设之智人Fc片段,低親和力Ila,受體(CD32) (FCGR2A) · mRNA J 6350201 0.00337 RAB24 NM.130781 RAB24 「RAB24,RAS致癌基因家族成員j Hs.16258 53917 2260035 0.00337 UP; UPP; UPASE; UDRPASE NM 181597 UPP1 尿苷磷酸化酶 1 Hs,488240 7378
PEX3 AQP3 MYC KLF12 染色體2開放閱讀框架44 Kruppe丨樣因子 12 Hs.373857 NM_〇I8449 UBAP2 PBXIP1 NM 014367
CSorf2S 5226 前B細胞白血病同源盒相互作用蛋白1 染色體3開放閱讀框架28 Hs. 584881 3800181 0.00337 PR Hs.440263 :;BUD32; Nori-2; Hori-2p; dJ101A2; C20orf64 NMJ33550 112858 FU22724; FU37717; MGC87036; DKFZp666P1710 870138 0.00337 FF20; WDR29; FU22724; FU37717; MGC87 精子相關抗原16 Hs. 602792 79582 5900520 0.00337 RTS; TYMSAS; RTS β ; HSRTS β ; RTS a NM.017512 1P53RK TP53調節激酶 NM.001025436 SPAG16 EN0SF1烯醇化酶超家族成員1 141281.doc 147· 201022492
Hs.369762 55556 2940184 0.00337 FAM31A; FLJ38464; KIAA160S; RP11-230L22.3 NM.024820 Hs.655834 57706 4570553 0.00337 AK6; FIX; AK3L1; AKL3L; AKL3L1 NM_016282 AK3 50808 2060092 0.00334 IRE1; IRE1P; FU30999; !«K:163277; MGC163279 NM_152461 Hs.133982 2081 1110575 0.00334 ABLIM; LIMAB1; LIMATIN; MC5C1224; FU14564; KIAA0059; DKFZp781D0148 ^.006720 ABLIM1 肌動蛋白結合LIM蛋白1 Hs.«8236 3983 4830435 0.00334 GI008; RPMS13; HRP-S13; MRP-S26; NY-BR-87; C20orfl93; dJ534B8.3 NM_0308ll 粒線«核糖«蛋白S26 Hs. 18946 64949 2190035 0,00334 CD32: FCX32; FcGR; CD32A; CDw32; F0GR2; IGFR2; FCGR2A1; MGC23887; MGC30032 FCGR2A rIgG之Fc>i 祓,低親和力na,受體(CD32)J Hs.352642 2212 1470669 0.00333 C12orf7; DKFZp68601689 NM_182608 ANKRD33 錨蛋白重複域33 341405 2750750 0.00333 KIAA0295 NM.015042 ZNF609 鋅指蛋白609 Hs.595451 23060 5870220 0.00333 SPNR: MGC3405; FU11307; FU14223; FLJ14984; MGC21529; DKFZp434N214 NM.018387 STRBP 精細®核周RNA結合蛋白 Hs.287659 55342 270021 0.00333 KIAA0665; Rabl 1-FIP3 NM_014700 RAmiFIP3 RAB11 家族相互作用蛋白3 (II類) Hs.531642 9727 6480725 0.00332 祖;PKC.L; PRKCL; MGC5363; MGC26269; nPKC-eta NM_006255 PRKCH 「蛋白激酶C’ eta」 Hs. 333907 5583 1230463 0.00332 M-RIP; RH0IP3; pll®ip; K1AA0864 NM_201274 M-RIP 肌凝蛋白磷睃酯酶彻 相互作用蛋白 Hs. 46^341 23164 5260494 0.00332 P3GalT6 NM_080605 B3GALT6「UDP-Gal: pGalp 1,3-半乳糖基轉移酶多肽6」 Hs.284284 126792 60451 0.00332 bA207C16.3 NM 024896 KIAA181S KIAA1815 Hs.591078 79956 20154 0.00332 SEP2; SEPT2; KIAA0T28; MGC16619; MGC20339; RP5-876A24.2 NM 145799 6-Scp 胞裂蛋白6 Hs. 496666 23157 _ 1430386 0.00332 RH>2; RWP20; HSPC0Q4 M 015918 P(F5「前驅想5之加工,核糖核酸外切酶P/MRP次單Λ (釀酒酵母)」 Hs.279913 ' 51367 「 3990328 0.00332 Μα; MPa; CLEC6; CLEC-6; CLECSF8; MC3C40078 NM_080387 CLEC4D「C型凝集素域家族4 成貝 D」 Hs.351811 338339 2260685 0.00332 L0C388564 XM.938054 L0C388564 由BC052596支援之假定基因 388564 5310220 0.00332 XM.927165 L0C642770 „ Λ ^ _ 5130725 0.00332 FU22002 NM_024838 THNSL1 蘇胺酸合成酶樣1(細菌) Hs.645274 79896 3290242 0.00332 FU21749; MGC149891 NM_025124 FLJ21749 跨膜蛋白 134 Hs.288761 80194 „ ^ ^ , 7380328 0.00332 TIR8; MGCU0992 NM 021805 SIGIRR 單鏈免疫球蛋白及toll介白素1 受饉(TIR)域 Hs.501624 59307 5960739 0.00332 D13080 「T細胞受體〇tA|J片段,部分cds,純系WADM36A」 Hs.551340 1980519 0.00332 SIP; PCSK8; SKI-1; KIAA0091; MGC138711; MGC138712 NM„201268 册TPS1 「膜結合轉錄因子肽酶,位點1J Hs.75890 8720 5080674 0.00332 PF20; WDR29; FU22724; FU37717; MGC87036; DKFZp666P1710 NM_001025436 SPAG16 精子相關抗原16 Hs. 602792 79582 7610546 0.00331 MAGI; GPAT3; AGPAT8; MGC11324 NMJ332717 轉移-相關蛋白 Hs.99196 84803 3S00253 0.00329 XM.932678 L0C387841 6560167 0.00329 100151162 BX647087 3610703 0.00329 P2YE; M0C50878 ΝΜ_178129 ΡΜδ Hs.111377 286530 2030673 0.00328 ΧΜ 498474 4040438 0.00327 PRSI; PRS I; KIAA0967 NM_002764 PRPS1 Hs.56 5631 ~ r 4730156 0.00327 RAB24 t«l.l30781 RAB24 「RAB24, RAS致癌基因家族成員J Hs. 16258 53917 6510161 0.00326 VODI; IFI41; IFI75; FU22835 NH_004510 SP110 SP110 核體蛋白 Hs.145150 3431 5270661 0.00323 HS1-2; LAKI2; H1PS1-2; MGC26249: HGC111112 NM_007011 AH1D2 含自水解酶域2 Hs. 122337 11057 5090047 0.00323 ACAS2L; AccCS2L; FU45659; MGC33843 NM_032501 短鐽家族成員1 Hs.529353 84532 4210008 0.00323 Hied; MDA5; MDA-5; IDM19; MGC133047 M«_022168 Hs.163173 64135 6580189 0.00323 L0C649821 XM.942212 U0C649821 (CAG-ISL 7) 649821 2140156 0.00321 MCP; TLX; MIC10; TRA2.10; MGC26544 NM_153826 Hs.510402 4179 2470292 0.00321 HMIC; MANIC; MAN1A3; pp6318 N»L〇2〇379 MAN1C1 Hs. 197043 57134 r 5550435 0.00321 AS160; DKFZp779C0666 煳 014832 TBC1D4 「TBC1 域家族,成員 9882 DENND1A 含DENN/MADD域ΙΑ 腺苷酸激酶3 Hs. 493362 ERN1核信號轉導之内質網1 MRPS26 NM_021642 Hs.433492 HMFN0839 肺癌 假定蛋白 L0C151162 Hs.4988 151162 「嘌呤能受«Ρ2Υ,G-蛋白偶合,8」 磷酸核糖基焦磷酸合成酶1 ACSS1 釅基·〇〇Α合成酶 1FIH1干擾素誘導性解螺旋酶C域1 類似於60S核糖體蛋白L14 CD46 「CD46分子,補逋绸節蛋白」 「甘露糖苷酶,α,類1C,成員1」 Hs.210891 I41281.doc -148- 201022492 2140593 0.00321 OT743148 50743 0.00321 BX114247 3360364 0.00321 ZCT3; ZCWCT1 MI.014941 22880 4390201 0.0)321 4.IB; DALI; DAL-1; FU37633; KIAA0987 Hs.213394 23136 FU12953 NM_032118 FU11061; FU13244; MGC71S59 5700403 0.0032 7150634 0.0032 4649 1450551 0.0032 9310 4540082 0.0032 f#?) 0,0032
Hs* 102572 轉錄基因座 Hs. 655978 1I0RC2 MORC家族CW型鋅指2
Hs,555918
Mf 012307 EFB41L3 紅血球膜蛋白帶4,1樣3 WR54 WD 重複域 54 Hs .643480 84058 NM_006901 MY09A myosin IXA Hs.546268 HZF6; 2FP93; ANF270; ZNF270 NMJ04234 ZNF235 PCL3; MGC23929; MGC131698; MGC149712; MGC149713 NM^015651 參 鋅指蛋白235 Hs·298089 PHF19 Hfl)指蛋白 19 含硫氧還蛋白域3
Hs.460124 26147 SPTRX2 NM 016616 HNDC3 51314 " E6; FABGL; RING2; H2-KE6; D6S2245E; dJ1033B10.9 Hs.415058 7923 顺-015991 C1QA 「補«組份1,q亞組份 NME8: CILD6; Hs.13- J4079 3130019 0.00319 KE6; FABG; I l^drcJxysteroid(i7-$)去氬_ 8 NM 014234 HSD17B8 P〇370 0.00319 C1QA ΝΜ_ϋ15991 C1QA 「補艘組份 1,qS組份,A鏈」 HS.632379 712 870196 0.00319 XM_942165 L0C652624 596076S 0.00319 GTRAP48; ΚΪΑΑ0380; HE-RHOGEF; DKFZp667F1223 烏嘌呤核苷酸交換因子(GEF) 11 Hs.516954 6560292 0.00318 ΒΧΠ6726 轉錄基因座 5810044 0.00318 XM 930236 L0C653496 7050711 0.00318 KIAA1979 XM_375646 ZNF525 4010563 0.00317 DLM1; DLM-1; C20orfl83 NM 030776 ZBP1 81030 — 990224 0.00317 A1U; UBIN; Clorf6 NM 020131 6510102 0.00317 P0GF4; RNF51; MGC12685 NM"〇05180 Hs.496613 648 " 2480402 0.00317 LAT3; LAT-2; y+LAT-2; KIAA0245; DKFZp686K15246 (陽離子型胺基酸轉運體,y+系統),成員6」 6760154 0.00317 L12; CSIG; PBK1; MGC138433; MK142259; DKF2P564M182 含核糖體 LI 域 1 Hs,401842 26156 780086 0.00317 DRS1; ACBD2; HCA88; dJ1013A10.3 NIL006117 Hs.15250 10455 4590019 0.00317 KIAA0355 NM.014686 KIAA0355 KIAA0355 7150521 0.003Ϊ7 cent-b; HSA272195 蒯 018404 OTITA2「矢車菊答 *** sa 460608 0.00317 BAFF; BLYS; CD257; TALLl; ΤΉΑΝΚ; ZIWF4; TAll-1; IWFS^O; TWSF13B 「腫瘤壞死因子(配位體)超家族,成員13b」 5390398 0.00317 KIAA0014 NM 014665 LRRC14 9684 " 7650615 0.00316 XM 372780 L0C391045 870148 0.00314 FAD104; PR04979; FLJ23399; MGC10002; FNDC3B 含纖維結合蛋白m型域3B 70161 0.00314 ΡΪΡ1; ΡΤ0Ρ; TPP1; Tim NM 022914 Hs.78019 65057 " 1050315 0.00314 NM —022837 0BFC2A 2140653 0.00314 Βα9-2; DLNB11 NM 182557 BCL9L 283149 " 4260280 0.00314 ALFY; ZFYVE25; KIAA0993; f*X:16461 NM 014991 WFY3 Hs.480116 23001 " 5890333 0.00314 ΑΜΙΉ2; AMPHL; SH3P9; MGC10367; M(FZp547F068 NM 139348 Hs.193163 274 --- NM.001549 .47338 3437 ΝΜ·014784 9826 Hs.561105 ARHGEF11
Rho z,sir白2?hs.麵l觀广8 BMI1¾¾ 指致 SI3739 56893 NM.003983 SLC7A6「可溶載«家族7 Hs.653193 9057 NM_015659 RSL1D1 PBCI「過氡化物酶想1^02-烯醮基-CoA異構酶」 〇2」
Hs.330073
Hs.514063 9710 δ BAFF MI_(K)6573 Hs.525157 10673 含白胺酸富集重複14 Hs.459391 Υνπβ2421: DiCFZp762K137; DKFZp686Dl4170 NM 022763 Hs.159430 64778 ' ACD 腎上腺發育不良同源物(小鼠) B細胞CLL/淋巴瘤9樣 ®Hs.193163 274 RIG-G;CIG·49;獅·41
Hs.414740 含WD重複及FYVE域3 BIN1 橋連整合因子1 IFIT3 3985 3840475 0.00311 LIMK2 NM.005569 LIMK2 域激峰2 Hs.474596 6450711 0.00311 XM.941125 L0C649447 460754 0.00311 NM.212530 CDC25B 7570148 0.00311 XH.936503 L0C648164 4290601 0.0031 DKFZp547M2010 NM_173078 SLITRK4 139065 " 4220564 0.00309 HF1B; SPR-1; MGC130008; MGC130009 NM 003112 SP4 Sp4 轉錄因子 Hs.88013 6671 " 10546 0.00309 WDI; IFI41; IFI75; FU22835 NM 080424 Hs.145150 3431 " 1260681 0.00309 FLJ20035; FU10787 NMJH7631 FU20035 Hs.591710 55601 4670315 0.00309 LIMK2 NM 001031801 LIMK2 5890022 0.00309 MPP10; MPPlOP NM_005791 HsT656208 10199 4200538 0.00309 p97; HC56; HCAP1; HHRF-1; DKFZP434B131; OCFZP434D174 NM 015721 (核細胞器)相關蛋白4 Hs.499620 50628 " 2360538 0.00306 AI0L0S; ZNFN1A3 NM_IS3231 ZNFN1A3 家族辞指3 (鋅指樣轉錄因子) bLIT及NTRK#家族,成貝4j
Hs.272284 SP110 SP110核饉蛋白 假定蛋白FLJ20035 Hs.474596 3985 Μ相磷蛋白10 (U3小核仁核糖核蛋白) GEMIN4 gem
Hs.444388 141281.doc 149- 201022492 22806 6420672 0.00305 CCD; AML3; CCD1; 0SF2; CBFA1; PEA2aA; PEBP2A1; P^P2A2; PEBP2aA; PEBP2aAl; MGC120022; MGC120023 NM_001024630 RUNX2 runt 相關轉錄因子2 _ Hs.535845 860 423Q541 0.00305 MSAP; c86fus NM_002451 tfTAP 甲基硫腺嘌呤磷酸化酶 Hs. 193268 4507 6620674 0.00305 CC3; TIP30;. RJ26963 NM 006410 HTATIP2「HIV-1 Tat 相互作用蛋白2 , 30kDa」 Hs.90753 10553 " n 2100075 0.00304 ZNP399; FU13153 NM 024786 ZDHHC11 「含鋅指,DHHC型11J Hs. 659832 79844 ' 1170400 0.00304 CIO; GRCC10 NMJ38425 C12orf57 染色體 12開放閱讀框架57 Hs.591045 113246 ™PPC6A 轉運蛋白顆粒複合物6A TPM2 原肌球蛋白2 (p) Hs.300772 金屬肽酶抑制子2 Hs. 633514 NM_001400 EDG1 Hs.154210 1901 SF3A1 「努接因子3a,次單元1 1980424 0.00304 TRS33; HSPC289; MGC2650 NM 024108 Hs.466929 79090 6270020 0.00304 DAI; TMSB; AMCD1 NM 003289 7169 ~ 5260088 0.00304 CSC-21K M«_003255 TIMP2 TIMP 7077 6960736 0.00303 ECGF1; EDG-1; S1PR1; CHHX51; D1S3362 「内皮分化,鞘脂G-蛋白-偶合受體,1」 2140364 0.00303 PRP21; PRPF21; SAP114; SF3A120 NM_001005409 120kDaJ Hs.406277 10291 2760452 0.00301 BII; CACH6; Cav2.3; CACNL1A6 NM_000721 CACNA1E 「鈣通道,電位依賴性, R型,αΙΕ次單元」 Hs.437444 777 2060592 0.00301 PI; ΑΙΑ; ΑΑΤ; ΡΙ1; Α1ΑΤ; MGC9222; PR02275; MGC23330 ΝΜ_001002236 SSPINA1 [钱萨暖肽酵抑制子,分枝Α 〇1抗蛋白酶,抗胰蛋白酶),成員1」 ' Hs.525557 5265 2640576 0.¢)0299 SMG; SMGA; SAMD4; Smaug; Smaugl; KIAA1053; DKFZp434H0350 NM 015589 SA>fl54A 含不育 α基元域 4A Hs.98259 23034 " :>ΑΜϋ4Α 540762 0.00298 FU25416; FU13936 NMJ45018 FU25416 假定蛋白 PLJ25416 Hs.165607 220042 1190241 0.00296 Til; SRBC NM_001767 CD2 CD2分子 Hs.523500 914 3830338 0.00296 MYH; MGC4416 NJL012222 MUTYH mutY同源物乙大腸桴菌)Hs,271353 4810592 0.00296 VEGFB ML938483 VEGFB 「血昝内皮生長?---- VEGFL;智人血營内皮生長(VEGFB)· mRM.j 3450452 0.00296 ΊΗ1; NELF-C; NEIP-D; HSPC130 51497 2370524 0.00296 TSG6 NM 007115 TNFAIP6 Hs.437322 7130 2760438 0.00296 L0C441246 XM 496890 L0C441246 130110 0,00296 FU44620; DKFZp313B2137 NM 001012969 A] 161823 ~ 580072 0.00296 NM 001012479 GRN 6560474 0.00296 FLJ32452 Nftt144576 COQ10A 93058 3180139 0.00294 ACC2; ACCB; HAOC275 NM.001093 AGO Hs 234898 32 7570196 0.00294 AILIM; 03278; MGC39850 NM.012092 I COS 誘導性 T 細胞協同刺激子 6960725 0.00294 FP977; FLI12270; MGC11230 NMJ530581 WDR59 WD 重複域59 3180064 0.00294 XM 939885 U0C6S0799 7320368 0.00294 MDA20; FLJ27455 NM.000984 RPL23A 核糖艘蛋白 L23a Hs.419463 2070131 0.00294 L9mt NM„031420 HRPL9 -----------各 65005 2940092 0.00294 MDIG; N052; MINA53: FLJ14393; DKFZp76201912 Hs.655935 84864 3370100 0.00294 Yo; CDR62 NM 001802 CDR2 62kDaJ Hs.513430 1039 7330154 0.00294 MGC12536; MGC14804 NM_032330 CAPNS2 84290 " 3420735 0.00294 JADE2; KIAA0239 NM^01528S PHF15 PHD 5720008 0.00294 NM.017835 C21orf59 2970360 0.00294 HEI10; C14orfl8 NM 021178 0CNB1IP1 57820 2690609 0.00294 ACHAP; C6orf82; MGC111154 NM 001014433 C 大腸桿菌) Hs.520070 51596 " 990630 0.00294 TCF-1; MGC47735 NM^201633 TXF7 Hs. 573153 69¾ 5090367 0.00294 DCHJ; UDG; UNG1; HIGW; ««15; DKF&78IL1143 Hs.191334 7374 60280 0.00293 T3E; TCRE ^000733 CD3E 「CD3e 分子 Hs,3003 916 Γ Λ 5670274 0.00293 CGI2-1; AP0L1II NHL030644 AP0L3 「脂蛋白元L , 3」 Hs 474737 430021 0.00293 IRG2; IFI60; IFIT4; ISG60; RIG-G; CIG-49; GARG-49 NM_〇01549 ' IFIT3 具有三角形四肽重複之干擾素誘導性蛋白3 Hs. 47338 3437 NH_198976 :生長因子B ;同物異名 TOIL ΊΉ1樣(果蠅) 「腔瘤壞死因子α誘導性蛋白6 J hCG1983332 Hs.568313 腺苷去胺酶樣 輔昧Q10同源物A (釀酒酵母) 4595 :VRF, Hs.517148 粒線體核糖«蛋白L9_ NM.032778 441246 Hs.533913 Hs.4096 乙86基-輔酶A叛化梅β Hs. 56247 Hs.280951 6147 Hs.288936 MINA MYC誘導之核抗原 「小腦退化相關蛋白2 , 「約蛋白酶,小次單元2」 指蛋白 15 Hs. 483419 細胞週期素B1相互作用蛋白1 COTA cutA二償陽離子耐受同源物 「轉錄因子7 (T細胞特異性,HMG-盒)」 NM_0809ll UNG尿鳴咬-DNA糖基化梅 (CD3*TCR複合物)」 80833
Hs.660027 23338 Hs.107003 141281.doc 150- 201022492 movsi 0.00293 SELS; SELX; MSRB1; HSPC270; NGC3344 Hs.655346 51734 5570309 0.00293 ACS4; FACU; LACS4; MRX63; *ffiX68 長鏈家族成員4 Hs. 268785 2182 6590678 0.00293 E14 NM 002519 NPAT 「核I 白 4863 1^,016332 SEPX1 「场蛋白X,1」 NM_004458 ACSL4 醯基-CoA合成酶 共濟失調毛細血管擴張基因座」 Hs. 171061 NM 005356 ❿ ❹ 淋巴細胞-特異性蛋白酪胺暖激酶 2230661 0.00292 Π16; p561ck; pp581ck Hs.470627 3932 7560093 0.00291 MGC78522 Μί_(ΚΧ)637 GSR 麵跋甘肽還原酶 Hs 271510 〇936 3840376 0.00291 RIG-I; FU13599; DKFZp434Jllll; DKFZp686N19181 NM 014314 DDX58 DEAD (Asp-Gltt-Ala-Asp)盒多肽58 Hs. 190622 23586 _ 3290682 0.00291 D15Wsu75e; MCK138384; DJ347H13.4 NM 015704 D15Wsu75e Chrl5,韋恩州立大學75,表現j Hs.570455 ' 27351 5420301 0.00291 SLAM; CD150; CDwl50 NM.003037 SLAHF1 Hs.523660 6504 6660300 0.00291 OS1; FU10358; K1AA0838; KCFZp686015ll9 Hs.116448 2744 1690097 0.00289 PU10300; FU23575 1^.018051 WQR60 55112 ' 5310136 0.00289 hly9; raLY9; 0)229; SLAMF3 NM_001033667 4063 2100114 0.00287 Bif-1; 031-61; KIAA0491; dJ612B15.2 NM 016009 相關蛋白 B1 Hs. 136309 51100 一 5700343 0.(X)287 CS1; CS-1; KRAP; SPAG13; FLJ45996; KIAA1927; DKFZp31301039: DKFZp779G0129 SSFA2 精子特異性抗原2 Hs.591602 6744 1030731 0.00287 MC3C3207 ΝΜ^001031727 MGC3207 r 假定蛋白 MGC3207 Hs.439370 84245 6200551 0.00286 BQ438671 ----------............加川 顯3 IMAGE:6102595 raRNA 序列.」 6900593 0.00286 ATOAP; MGC29646 NM_020350 Hs.464438 57085 2570463 0.00286 Ραΐ; ΚΙΑΑ0908 ΝΜ.016297 51449 _ 4590035 0.00286 LAP; PEPS; ΙΑΡΈΡ 51056 2490273 0.00286 RDH13 NM„138412 112724 5490379 0.00284 TIPA; T2BP; MGC20791 Hs.310640 92610 7550452 0.00284 RPA5; RPA39; RPA40; RPAC1; RP3-337H4.4 NM 004875 30kDaJ Hs.584839 9533 ' 3990639 0.00284 IL23A X00437 「介白素23,α次單元pl9J 1230706 0,00283 PP17; T1P47; MGC2012; mi!17 NM 005817 M6PRBP! Hs.140452 10226 " 150497 0.00282 TATI; FU32714 NM 052961 SLC26A8 「可溶載鱧家族26,成員8」 116369 5700494 0.00282 GAPIII; MGC46517; MC3C47588; GAP1IP4BP NM 007368 RASA3 RAS p21 Hs 655219 22821 — £1¾^.00282 丨0¾ IP15 ^-021034 IFI™3 千擾素講導性跨膜蛋白3(1-8U> 3290192 0,00282 STX3A NM_004177 STX3A 突觸融合蛋白3 Hs. 180711 6809 10101S6 0.002S2 FLJ21S02 NM_024644 C14orf 169 染多播光 垃 Hs. 509916 79697 这“— 永框呆ib» 1190142 0.00282 BG434868 轉錄基因座 Hs.443123 7550446 0.00282 MQC23980; RP11-27J8.2 NM_145005 C9orf72 染色體9開放閲讀框架72 Hs.493639 203228 5220315 0.00282 CLEC2C ΝΜ_00Π81 CD69 CD69分子 Hs.208854 969 150592 0.00282 MGC104312; MGC163287; DKFZP566J091 NM_030915 LBH 肢芽及心臟發育同琢物(小氣) Hs .567598 81606 4040095 0.0028 RNF88; TRIM5a NM.033092 TOIM5 含三聯基元5 Hs 370515 85363 ’ 59006«) 0.0028 L0C644511 XM 934381 D0C644511 類似於核糗«蛋白L13a Hs.632083 644511 5900338 0.0028 NFX2; MGC20369; DKFZp779G24l6 NM 147133 NFX1 「核轉錄因子,X-盒结合 1j Hs.413074 4799 ,, 6420079 0.0028 DKF2j)761P0423; pragmin XM 291277 IKFZp761P0423 之大鼠 pragma之同源物 Hs.657673 157285 1170475 0.00279 0)39; ATPDase; FLJ40921; FU40959; NTH)ase-l; DKFZp686D194; DKFZp686I093 ENTPD1 外核苷三磷酸二磷睃水解酶1 Hs.655892 953 4220026 0.00278 CRE-BPA Ifll_001011666 CREB5 cAMP 反應元件結合蛋白5 9586 6330370 0.00278 FU23506 024833 ZNF671 鋅指蛋白671 Hs. 180402 7200639 0.00277 SIT; MCSC125908; 1*^125909; MQC125910; RP11-331F9.5 NM_014450 SIT1 閾值調節絝膜轉白接附子1 Hs.88012 27240 7560162 0.00276 CA-VB; MGC39962 NM_007220 CA5B r破酸酐酶vb ,粒線饉」 11238 湖一015907 RDH13 NM 052864
LCK 「DNA片段, 信號轉導淋巴細胞活化分子家族成員1 NIL014905 GLS 麩胺醯胺酶 WD 重複域60 Hs.389945 LY9 淋巴細胞抗原9 Hs. 403857 SI3GLB1 SH3·域GRB2樣鈣離子通道 NM_006751 假定蛋白 MGC3207 Hs.439370 rA($NC0URT_7908292 NIH_MGC_82 智人cDNA純系 ΑΟΙΒΑΡ血管緊張素Π受«-相關蛋白 PCY0X1異戊二烯基半胱胺酸氧化酶1 Hs. 591572 IAP3 白胺酸胺基肽酶3 Hs.570791 視黃醇去氫酶13 (所有反式/9-順式) Hs.327631 T1FA 具有又頭相關域之TRAF-相互作用蛋白 P0LR1C 「聚合酶(RNA) I多肽C, Hs.654496 甘露糖-δ-碟酸受《結合蛋白1 Hs.435836 蛋白活化子3 NM.001776 Hs.437075 79891 信號轉導 Hs.653287 141281.doc 151 - 201022492 2760092 0.00276 T0S0 ΜΛ_〇〇5449 9214 4900424 0.00276 TRA@ AY375451 3870328 0.00276 TTC37; MGC32587 刚 _014639 1710273 0.00276 PFK2; IPFK2 NW_004566 FAIM3 Fas細胞凋亡抑制分子3
Hs. 58831 T細胞受體α基因座 ΚΙΑΑ0372 ΚΙΑΑ0372 PFKFB3 Hs.195471 5209
Hs.74647 Hs.482868 9652 ZNF559 鋅指蛋白559 Hs.655107 含捲曲螺旋域66 Hs. 476399 SDCCAG33 teashirt 家族鋅指 1 選擇蛋白配位饉相互作用子細胞質-1 染色體22開放閱讀框架29 84527 3400209 0.00276 DKFZp686C0433 285331 2120403 0.00276 TSH1; NY-OO-33; SDC3CAG33 Hs.284217 10194 1980338 0.00274 SLIC1; MGC35578 NM.182854 Hs.460777 124460 2470392 0.00274 FLJ21125 NM_024627 Hs. 105642 79680 r 5050241 0.00274 PRKCT; MGC1265U; MGCM1919; nPKC-θ NM_006257 P_ 「蛋白激酶C,Θ」 Hs.498570 5588 4730215 0.00274 GRASP-1; KIAA1167; MGC126593; MGC126595; CKFZp434P0630 NM_020137 GRIPAP1 GRIP! 相關蛋白 1 Hs. 109929 56850 5960519 0.00274 VCIP135; FU23132; KIAA1850; DKFZp686G038 含纈路肽蛋白(p97)/p47複合物相互作用蛋白1 4560709 0.00274 PTD017; S18amt; C6orfl4; HSPC183; MRPS18-2 MRPS18B粒線體核糖鱧蛋白S18B Hs.655329 430682 0.00274 C1QB NM_000491 C1QB Hs.8986 713 4570019 0.00272 TPARL; TMPT27 NM.018475 TPARL 55858 ^ ^ . Λ 4040609 0.00272 Lffii-H; TRG-5 NM.002300 LDHB 乳糖去氫酶B Hs·446149 3945 7610196 0.00272 APTli CD95; FAS1; APO-1; FASTM; ALPSIA; 1NFRSF6 NMJ52871 FAS「Fas (TNF受艘超家族 成員 6)J Hs,244139 355 7560470 0.00272 CHD5; RIGB; KIAA1335 NM.032221 CHD6 Hs.371979 84181 2060564 0,00272 L0C492311 NM 001007189 L0C492311 Hs.200938 492311 6020280 0.00272 IW; EAT; MaiL; WaiS; M3C1839; MGC104264 (BCL2相關) Hs 632486 4170 130553 0.00271 SOP1; SKAP55 NM.003726 SCAP1 src激峰相關磷蛋白 1 8631 6200273 0.0027 BRESI1; MGC29634 NM.033255 EPSTI1 上皮基質相互作用 1 (乳房) Hs.546467 94240 NM_001012506 CCDC66 NM_005786 SLIC1 FLI21125 NM 025054 VOPIP1 Hs:632066 80124 人類 S18a; ·Ρβ18-2; DKFZp564H0223 NM 014046 28973 " 「補體组份1,q亞組份,B錢」 跨膜蛋白165
Hs.479766 染色質結構域解螺旋游DNA結合蛋白6 類似於牛feA調節蛋白 NM_021960 MCLi骨髓細胞白血病序列1 Hs.316933 含WW域E3泛素蛋白連接酶1 ML007013 AIP5; Tiull; hSDRPl; DKFZp434D21ll Hs.655189 11059 3310377 0.00269 PA26; SEST1; MGC138241; MGC142129; RP11-787I22.1 Hs.591336 27244 6960746 0,00269 IAN4; IAN5; IMAP3; hIAN5; HIMAP3; IAN4L1; FLJ11296 IMAP 家族成員 5」 Hs .647079 55340 1090332 0.00269 NA1C; CIRHIN; ΊΈΧ292; FLJ14728; KIAAL988 NMJJ32830 艏染色艎隱性 1A (ciihin)j Hs.461113 84916 6480010 0,00268 EC45; RPL10; RPLY10; RPYL10; FU26304; MGC88603 NM_00294S Hs.381219 6138 3120735 0.00268 BLT1; BLTO; P2Y7; GKU6; LTBR1; P2RY7; CMKRL1; LTB4RI NM 181657 白三烯素 B4 受® Hs.655431 1241 ~ 5890717 0.00268 MGC26847 NM.145006 SUSD3 含sushi域3 203328 6220070 0.00268 FLI34389 NM_152649 MLKL 混合譜系激峰域樣 197259 3840414 0.00268 MAL NM 002371 MAL 「ma卜 T細胞分化蛋白」 4118 3610184 0.00268 CYPH; CVP-20; MGC5016; USA-CYP; SnuCyp-20 (親環素 H) Hs, 256639 10465 1780079 0.00267 HGAL; QCkTl; MGC40441 NM^001008756 GCET2 Hs,49614 257144 5560113 0.00265 PPM2; TYW4; MGC9534; KIAA0547 NM„014793 Hs.200596 9836 130138 0.00265 RDGBB; RDGBB1; RDGB-β NM 181671 Hs.591185 26207 580332 0.00265 FLJ11164; FLJ20975 NM 01B346 RSAD1 Hs.8033 55316 1240209 0.00265 (TSD; CLN10; MGC2311 hffiL〇01909 CTSD 840750 0.00265 MYL; RNF71; ΪΨ8675; TRIM19 NM_033238 5371 ' 5260500 0.00265 HUFI-2; HJ20248; FU22683; 0〇5Ζρ434Η2035 (在FLU中)相互作用蛋白2 Hs.475319 9209 840253 0.00265 C15; onzin N&UH6619 PLAC8 胎盤-特異性8 1300180 0,0027 WKP1 NM.014454 NM.018384 CIRH1A RPL15 SESNl sestrin 1 GWAP5「GTTPase, 「硬化症, 核糖體蛋白L15 LTB4R Hs.88417 Hs.119878 Hs·80395 PPIH肽基鯆胺醯異構酵Η 生發中心表現轉錄物2 白胺酸羰基平基轉移晦2 「磷脂醢肌酵轉移蛋白,細胞質1」 含基團S-腺苷甲硫胺酸域1 怒产蛋白酶D Hs. 654447 1509 PML 前髄細胞性白血病 Hs. 526464 NM.006347 L〇m PITPNC1 NM-006309 LSRFIP2 白胺酸富集重複 Hs.546392 51316 14I281.doc 152- 201022492
4260142 0.00264 PBP; HCNP; PEBP; RKIP NM_002567 PEBP1 Hs.433863 5037 " 20601 0.00264 FLJ12118; DKFZp667A2315; DKFZp686G08243 NM_024537 合或酶2,ft赛體 定Hs.508725 79587 ΑΡΧ; ΑΡΕΙ; APEN; APEX; HAP1; REF1; REF-1 NM_080649 Hs. 73*722 32B 广·” 510603 0.00261 TIFIA; MGC104238; DKFZp566E104 轉錄因子同源物(釀酒酵母) 670041 0.0026 1L23A CR596519 3400504 0.00259 IMPD2; IMPEH-II NM 000884 Hs.654400 3615 " 2230152 0.00259 SATB1 NM 002971 SATB1
磷脂醢6醇胺結合蛋白1 FLJ12118 「半胱胺醯基-tRNA APEXl .APEX 核酸酶 NM_〇18427 RRN3 Hs.460078 54700 「>白杀23,α次單元pl9」 1酬2 IMP (單磷酸肌苷)去氩酶2
KRN3 RNA聚合酶I
Hs.654496 T Hs.517717 6304 ISG-54K NM 001547 IFIT2 Hs.437609 3433 FU20280 染色體4開放M讀框架30
5270402 0.00258 FU20280; MGC126765; ICC126767 NM 017741 Hs.655841 54876 ~ 2370576 0.00258 EX33; GPCR4 NH 020370 53g3j 一 KI^8* K1AA1085> RPIM55N3.2; I^^86Cim〇; DKFZp686M04132 NM_015296 D0CK9 胞質分裂之奉獻基因9 6480390 0.00258 Mi_032318 HIATL2 3190129 0.00257 FU90167 NU 138341 89894 ~ 2690682 0.00252 TOR; RORG; RZRG; NR1F3; MGC129539 m 001001523 Hs.256022 6097 ' 6620431 0.00252 IP3R3; FU36205 ΝΜ_002224 ITPR3 「脱龄 1 4 5-=述餘夺被 Hs.65758 3710 肌砰一辦敌文瑕 7650554 0.0025 ^FERILI; UMD2B; FLJ00175; FLJ90168 NH_003494 DYSF OTR84 G蛋白偶和受體84
Hs.306199 TKeill6 跨膜蛋白116
Hs.506815
RORC RAR-相關孤兒受體C 3型」 「^sferiin 肢帶肌肉萎縮症2B (體染色體隱性)」 Hs.252180 2470243 0.0025 HIST2H2AB NM 175065 HIST2H2AB 317772 _ 1340368 0.0025 XM_929431 IOC644039 4150739 0,0025^^4; ΑΡ02; CD261; HGC9365; TRAILR1; TBAILS-1 NM 003844 「腫士邊死因李受®超家族,成員10a」 Hs.591834 8797 6980100 0.0025 TM54 NM_024081 PRRG4 Hs.471695 " 79056 sen54; SEN54L; FU37147 NM_207346 Hs *655875 283989 SUN2; KIAA0668; MGC133055; MGC133056 NM 015374 Hs.517622 25777 ' 6280754 0.00248 CD172g; SIRPB2; SIRP-B2; bA77C3.1; SIRPy NM 080816 Hs.590883 55423 ' 5390349 0.00248 LIMK2 NM_00103180l LIMK2 LIM 域激酶2 2970437 0.00248 TIU; SLS1; FU10052; MGC126430; MO:126431 Hs.604542 7100 1010064 0.00248 BAL2; KIAA1268 NM 017554 PARP14 Hs.518203 54625 " 3850010 0.00248 XM_939880 U0C65O795 4210564 0.00248 CD26; ADA^; ADCP2; IffPIV; TP103 刚 001935 DPP4 (CD26,腺苷去胺酶複合蛋白2)」 HsT368912 1803 ^480243 0.00248 ; MGC138597 軋〇咖73 CD3G 「c〇3g分子,γ (CD3.TCR;a 合物 2190273 0.00248 AI349750 「ta96c03.xlNCI_CGAP_Lu26智人cDNA純系0^(^:2051908 31.mRNA序列」 8291 「組蛋白叢集2 H2ab」
WR^lOA
Hs.664173 7380411 0.0025 5570750 0.0025 脯胺酸富集Gla (G-叛基麩胺酸)4 (跨膜) TSEN54 traJA剪接核酸内切酶54同源物(醸酒酵母) UNC84B unc-84 同源物B (線蟲) SIRPB2信號-調節蛋白γ
Hs.474596 NM.003268 TLR5 391受想 5 「多聚(ADP-核糖)聚合鴯家族,成員14」 「二肽基-肽酶4 .024620 ZNF329 鋅指蛋白 329 Hs.458377 79673 IL-lra3; ICIL-1RA; M0C1043O NM.173842 IL1RN 介白紊 1 3557 NMI N-myc(及§JAT)相互作用子 Hs.54483 9111 Hs 348609 84875 _032789 PARP10 「多聚(ADP-核糖)聚合酶家族,成員10」 5270465 0.0024S XM 933970 L0C646849 6290097 0.00248 SAT; DC21;~KFSD; SSAT; SSAT-1 NM 002970 Nl-乙醮基轉移酶1 Hs. 28491 6303 ~ 4850192 0.00248 TP120 NM 006725 CB6 CD6 分子 Hs.643167 923 3830041 0.00248 IRG2; IFI60; IFIT4; ISG60; RIG-G; CIG-49; GARG-49 NM_001031683 IFIT3 具有三角形四肽重複之千擾素誘導性蛋白3 Hs. 47338 3437 1820692 0.00248 L0C387867 XM_939738 L0C387867 類似於40S核糖體蛋白 SA (p40> (34/67 kDa層黏連蛋白受«)(結庵癌層黏連蛋-結合蛋白)(NEM/ICHW)(多桀物抗性相關蛋3878&7
3170132 0.00248 FU12586 NM_C 4060674 0.00248 IRAP; IL1F3; IL1RAT 受饉拮抗子 Hs. 81134 5870673 0.00248 NMI NM 004688 3310725 0.00248 FU14464 ' NM SAT 牙精胺/精胺 1740341 0.00248 XAF1; BIRC4BP; HSXIAPAF1 NM.199139 Hs.441975 54739 6250347 0.00248 FU33226; 1190004M21Rik Νβ 138300 PYG02 90780 一 2470440 0.00248 FU34238; ΚΙΑΑ0716; M0C134911; MGC134912 ΒΙΚΜΒΡ ΧΙΑΡ相關因子·1 尾肢同源物2 (果蠅) Hs.533597 AK055497 DOOM胞質分裂之奉獻基因4 141281.doc 153 - 201022492 9732 130523 0.00243 MGC2616; MRP-S12; JKP-S34 Hs.157160 65993 2970672 0.00248 ΝΟΗΜΑ; DKFZP434A1315; RP11-363I22.1 Hs.298312 84072 6660709 0.00248 CR3A; M01A; CDUB; MAC-1; MAC1A; MGC117044 '—.… ~* ' Hs. 172631 NHL023936 MRPS34 NM.032132 粒線艎核糖體蛋白S34 HGRMAD1 含HORMA 域 1 ITGAM 「整合素,αΜ ΝΜ.000632 3684 腎胚細胞痛過度表現基因 介白素-1受體-相關激酶3 (補體紐份3受《3次單元)」 6420367 0.00248 0CN3; * ' Hs.235935 4856 1430762 0.00248 ASRT5 Hs.369265 7000537 0.00248 1710427 0.00248 840687 0.00248 FUS2; 24142 3120612 0.00248 OGI-3 染色質修飾蛋白5 3290253 0.00248 P2X7; MOC20089 NM_002562 Hs.507102 5027 1260750 0.00248 DA572426 7200681 0.00247 KIAA1618 XM.941239 6510309 0.00247 RPL13A Μί_0Ι2423 ~ RPL13A 10370 0.00247 C1GALT; Τ-蚤成酶 棚_020 醣蛋白-Ν-乙醯半乳糖胺半乳糖泰轉移酶,1」 3710148 0.00247 USH1D; RKJ0233; FU36499; KIAA1774; KIAA18I2; MGC102761; DKFZp434P2350 NM_052836 GDH23 鈣黏著蛋白樣 23 Hs. 656032 64072 6330121 0.00246 NU 138699 L0C93622 Γ 6960569 0.00245 RabSlO; MG51488 NM_004794 RAB33A 「RAB33A , RAS致癌基因家族成員j 9363 " 5340162^0.00245 HRX; TRX1; ALL-1; CSXC7; HISX1; MLL1A; MLL/GAS7 1«_005933 MLL 或混合系白jfa·病(三空腔結構蛋白同源物,果蜗)j Hs.258855 4297 430291 0.00242 TSH2; ZABC2; ZNF218; 0VC10-2; C20orfl7; RLJ33887; EKFZp686K2480 NM.173485 teashirt 家族辞指2 Hs.473117 128553 " 1190520 0.00239 RPML3; MRP-L3; HSPC262; MGC4810 ML032478 Hs.442609 64978 2810451 0.00239 AfMP; FLI2372I NM.016255 FAM8A1 Hs.95260 51439 2710669 0.00239 CGI-59; CGI-74; FUlCte57 NH 016019 Hs.370475 51631 ' 5870474 0.00239 LP2642; NT5C2L1; C6orf200; MGC24302; MGC131837 Hs.520341 221294 ^ 4200180 0.00239 GRG; ESP1; GRG5; TLE5; AES-1; AES-2 Mil_198969 AES 胺基末端分裂強化子 Hs.515053 166 N0VH; IGFBP9 NM_002514 NOV ^ IRAKM; IRAK-M 11213 NM_007199 IRAK3 XM 942669 L0C654194 XM 941758 U0C652332 FUS-2; HYAL3 NRL012191 NAT6 PNAS-2; C9orf83 ;赃177; SNF7DC2 Hs.635313 51510 P2RX7 Ν-乙醯基轉移酶6 Hs. 129910 NM.016410 CHMP5 「嘌呤能受艘P2X,配位體閘控離子通道,7」 Hs.600936 轉錄基因座 KIAA1618 KIAA1618 57714 核糖饉蛋白 L13a Hs. 523185 23521 56 C1GALT1 「核心1合成酶, Hs.592180 56913
Hs.654356 「骨髓/淋巴 ZNF218 MRPL38 粒線«核糖«蛋白L38 「具有序列相似性之家族8,成員Alj LUC7L2 UJC7樣2 (醸酒酵母) NMJ 52729 NT5DC1含5’ -核苷酸酶域1 6130014 0.00239 AP4; RIP60; ZNF464; Zfp464 29803 2030168 0.00239 XHL935305 L0C646276 3140246 0,00239 Μ 033111 L0C88523 5810592 0.00239 KRM1; KREMEN; FCREMEttl; FLI31863 NM^.153379 Hs.229335 83999 4640402 0.00237 IPO-B; MNS0D; Mn-SOD NM^000636 S0D2 Hs.487046 6648 4490445 0.00237 CD170; 0BBP2; CD33L2; 0B-BP2; SIGLEC-5 NM.003830 Hs.310333 8778 6860246 0.00237 ATP-BL NM.004913 C16orf7 染色«16開放閲讀框架7 9605 4260082 0.00237 Nnpl; RRP1; KIAA0179 NMJ)15056 KIAA0179 Hs.654727 23076 7320408 0.00236 BDG29; BDG-29; MGC14139; MGC126527 NM.015144 ZC3CHC14 Hs.156231 23174 2350056 0.00236 XM.944165 LOC648249 r 6580452 0.00236 BRI3BP XM:941876 BRI3HP 「BRI3結合蛋白;同物異名 子宮頸癌1原致癌基因-結合蛋白;子宮頸癌致癌基因結合蛋白;智人BRI3結合蛋“ (BRBBP) , mKNA.」 NM_001149 ANK3 「销蛋白3,朗維結(錨蛋白G)j 鋅指蛋白200 Hs.632222 反應性元件結合蛋白5 粒線«核糖體蛋白S9 1660403 0.00236 FU45464; ANKYRIN-0 Hs 499725 288 6290458 0.00236 MGC45293 NM_198088 160132 0,00236 CRE-BPA NH_182898 CREB5 9586 3870181 0,00236 RPMS9 NM.182640 MRPS9 NM 014374
ZNF200 cAMP REPIN1 KREMEN1 複製啟動蛋白1
Hs.647086 含krii^le之跨联蛋白1 「超氧化物歧化酶2,粒線翁」 SIGLEC5 唾液酸結合Ig樣凝集素5 Hs.164410 核糖體RNA加工1 「含辞指,CCHC域14」 KG19、BNAS 卜 HCCR-2 ; 7752 Hs.437075 64965 4560274 0.00236 K0X2; K0X31; ZNFUB: FLJ23327; MGC129696 NMJM36955 Hs.499453 7582 ^ 5720129 0.00236 AY726563 純系華丸609 mRNA序列 1440612 0.00234 KRI41; KRERiEN; i(REMEMl; FU31863 NMJ53379 KREMEN1 含: Hs.229335 83999
Hs.590900 ZNF11B 鋅指蛋白33B , Hs.660574 kringle之跨膜蛋白1 141281.doc 154· 201022492 520360 0.00234 DJ462023.2; RP3-462023.3; DKFZp686E22155 Hs.523442 571S5 6280168 0.00234 NEH2; HWC2832; MQC4505; FU31644 NM 145043 Hs.293818 252969 2360367 0.00234 PURI; PURa ; PUR-α NM_005859 H] Hs.443121 5813 ~ g60327 0.00234 APC8 NM_004661 CDC23 細胞分裂週期23同源物(釀酒酵母) Hs.153546 §ΐ&ΜΙ^ΝΙ|:Α914: CA〇B: ^.^?05〇"〇; ^14: 6〇B8AG; ^387 軋002965 2320070 0,00234 MEP; CATL; CTSL; FLI31037 NM.145918 CTSL 组織蛋白酶 LI Hs.418123 4010358 0.00234 VMP1; DKFZP566I133 NM_030938 TMEM49 跨膜蛋白 49 Hs.444569 81671 ' 270341 0.00234 睾素-2 NMJJ14767 SP0CK2 「spare/骨連蛋白,cwcv及kazal樣域蛋白聚糖 (#+) 2j Hs.523009 9806 770484 0.00234 p23; p25; p35; CDK5R; Nffi5A; CDK5P35; MGC33831; p35nck5a m 003885 CDK5R1 「,·一 & *· u a μ u (^35)」 Hs.500015 8851 ~ 2¾ ITPKB 「肌醇1,4,5-三磷酸3-激酶B」 IFI35 干擾素誘導性蛋白35
NM_020448 NPAL3 含 NIPA樣域 3 NEIL2 nei樣2(大勝桿菌) 嘌呤-富集元件結合蛋白A 7100646 0.00234 IP3K; PIG37; IP3K-B Η Hs.528087 3707 1780484 0.00234 IFP35; FLJ21753 NM_005533 3430 840201 0.00234 C7orf32; ATP6V0E2L NM.145230 ATP6V0E2L 「ATPase,H+轉運VO次革元e2」 Hs.556998 155066 干 6550397 0.00232 FU38451; MGC117233; MGC119731 NM.175872 FLJ38451 辞指蛋白792 2690025 0.00232 FU13150; RP11-163M2.4 NM.024813 Clorf82 Hs.444421 79871 290538 0,00232 CIA; (ΧϊΙ-98; HSPC146; DKFZP547E2110 NM 014034 1 同溽物A 醸酒#母) Hs.292316 25842 6520605 0.00232 HGlt; MGC17330; hHGFL(S) NM 052880 MGC17330 相互# 用蛋白 1 Hs .26670 113791 ' ^69^09 ^.J0231 KE04; KTO4;^FH1; £.^€1^69; RP11-316M21.1 NH.006459 830327 0.00224 NMi〇01018021 ffiJCl 4060100 0.00224 PERB11.2 NM_005931 MICE MHCI類多肽相關序列B Hs.211580 4277 4900524 0*00224 ΚΥΝϋ NM.003937 KYNU 犬尿胺酸酶(L·犬尿胺酸水解酶) 8942 1030039 0.00224 H2A; H2A.2; H2A/0; H2A/q; H2AFO; H2a-615; ΗΙ8ΠΗ2ΑΑ NM 003516 「組蛋白龙集2,H2aa3」 Hs.530461 8337 ' 1500«7 0^0224 6122 3610048 0.00224 Π; ICH-2; Mihl/TX; ICEREL-II; ICE(rel)II m 033306 CASP4 細胞凋亡相關半胱胺酸肽酶」 Hs.138378 837 " IS24IS2)24 m K5ii6 S4 泛素特異性肽酶mu·烏嘌吟 3?lS« *W224 TS11 NM_133436 ASNS 天冬醯胺合成酶 Hs.489207 440 IGFR1 NM_000566 FCC®1A 「Ig〇之 Fc片段, TARBP-B; MGC104284 NM_001033853 RPL3
Hs.632258
染色體1開放閱讀框架82 ASF1A ASFI 抗沉默功能 磷酸肌醇-3-激酶 SPFH1 ER 核糖體蛋白L3
Hs.470126 HIST2H2AA Hs.119598 「卡斯蛋白酶4 4900630 0.00224 CD64; FCRI: CD64A; 高親和力la,受體(CD64)」 Hs.77424 2209 「 6130669 0.00224 LMP2; RING12; MGC70470 NM_002800 PSMB9「蛋白酶體(前體,巨蛋白因子)次單元 β盤,9 (大多功能肽酶2)」 Hs.654585 5698 4210576 0.00ί24 PAF53; PRAF1; FLJ13390; FLJ13970; RP11-405L18.3 NM 022490 53kDa」 Hs. 591087 64425 ®I 多肽E,53kDa 2490278 0.00224 S'iinnR η 0Ω9.7Α PRAF1「聚合酶(RNA) 鋅指蛋白 91 Hs. 654471 7644 染色體5開放閱讀框架29 核織層蛋白Hs. 89497 C9orfl27染色體9開放閲讀框架127 HTF10 ML003430 ZNF91 5340128 0.00224 FU33641; MGC70478" NM.152687 29 Hs.547697 202309 4900048 0.00224 LMN; ADLD; UW2; UINB; MGCm419 4001 1050064 0.00224 NGX6; NAG-5; MGC120460; RP11-112J3.10 Hs.493808 51754 1780427 0.00224 NM016285 KLF12 730747 0.00224 FLJ22344 NM_001002796 MCIP1 79772 ~ 4640379 0.00224 ZSF; MTF-1; MGC23036 NM_005955 Hs.471991 4520 r 1440196 0.00224 FCER1G NM_004106 FCER1G 「IgE之Fc片段,高親和力I,受體;γ多肽j Hs .433300 2207 3800280 0.00224 L14; RL14; hRL14; CTG-B33; MGC88594; aG-ISL-7 NM_003973 RPL14 核糖體蛋白 L14 Hs.446522 9045 3390349 0.00224 XM_934176 L0C91561 4220474 0.00224 ACF1; WALpl: hACFl; WCRF180; FLJ14383; DKFZP586E0518 NM_013448 BAZ1A 「與鋅指域相鄰之溴域,lAj Hs.509140 11T77 , 5090315 0.00224 DDX21; N0H6I NMJH9082 DDX56 DEAD (Asp-G丨u-A丨a-Asp)盒多肽56 Hs.654762 54606 FU33641 NM.005573 NM 016446 MTF1 「多個C2域,跨膜1j 金屑調節轉錄因子1
Hs.655087 141281.doc -155- 201022492 5550307 0.00224 FLI38968; dJ299FlLl Hs.502208 120534 70468 0.00224 FU25663; FU35732; NYD-SP28 Hs.512805 85478
6400537 0.00224 44M2.4; FU4172S; MGC48972:[ 巔泛^:化谬飾缺陷1,龛成3 (馨酒畚母 4860603 0.00224 SRPSOX; α〇β16; SR-PS0X
Hs.651206 58191 4920041 0.00224 BACH1 染色體11開放閱讀框架46 含捲曲螺旋域65 ^§3「DCN1,清選蛋 C-X-C基元)配位艘16 「BTB及CMC同源1,驗性白胺酸拉鏈轉錄:因子1」 ΖΗΓΒ20 含鋅指及BTB域20 「清道夫受體F類, 151636 mj523i6 Cllorf46 NM.033124 CCDC65 DKF2p68600290 NM.022059 NM 173475 S激化激素邗79 NM_001011545 BACH1 Hs.154276 571 40L0075 0.00224 HOF; DPZF; 0DA-8S; ZNF288; DKFZp566F123 NM 015642 Hs.655108 26137 2570136 0.00224 SRHC; KIAA0149; MGC4773S NM_J45350 SCARF1 MIj Hs.647430 8578 Λ ^ 00 0.00224 BBAP NM.138287 IJTOL異硫氟酸螢光素標記3樣(果繩)Hs.518201 3420471 0.00224 CD75- SIAT1; ST6GalI; MQC48859; ST6Gal I NM 173217 ST6GAL1 「ST6 p·半轧糖胺α么6-唾液酸基楗移酶b Hs.207459 6480 7380241 0.00224 H3/b; H3FB lC〇〇3530 HIST1H3D 8351 4810364 0.00224 FU22457; RP5-1180E21.2 NM.024901 DENND2D 含DENN/MADD域2D 79961 1010750 0.00224 SIN; RPC5 NWL018119 P0LR3E (80kD) Hs.460298 55718 70376 0.00224 CR6; H)IT2; GRP17; GADD45y NM.006705 Hs.9701 10912 ~ 「組蛋白叢集1,H3dj 670180 0.00224 FU39275; M0C131926 MH.021035 2WFX1 Hs.371794 57169 2710528 0.00224 1ISTP006; FU10983 NM_018290 PGH2 55276 2260148 0.00224 NRP2 NJL006159 6200408 0.00224 NM.001010914 7400703 0.00224 EF1B; EEF1B; EEF1B1 Hs.421608 1933 4040671 0.00224 GPA34; MGC44287; dJ889N!5.1; 1700062D20Rik — -白域 1 Hs.177164 340547 CUorf58; FLJ20371 NM.017791 C14orf58 員 2j Hs. 509966 55640 49726; NY-REN-58 NM.016122 C3CDC41 Hs. 279209 5Π34 6220746 0.00224 SID1; SID-1; FU20174; B830021K4Rjk 3940184 0,00224 HL9; ILT5; LIR3; CD85A: LIR-3; MGC138403 NM 0068< 「白金球免焱球蛋白樣受體,丰族B (杀肴TM及ΓΠΜ域),克貪3」 47|0M0^M^CH)^N0X2; GP91-1; GP91M)X; GP91-PTOX NIL〇〇〇3^ 1M273 0^0217^x32; ΜΑ: NELL2 NEL 樣2 (雞) LOC400986 NM.001959 EBF1B2
Hs. 532144 Hs.557850 聚合酶(RNA) ΙΠ (DNA引導)多肽E GADD45G「生長抑制及DNA損傷誘導性,γ」 「含鋅指,NFX1型1」 葡萄糖靖酸變位酶2 Hs. 23363 Hs.505326 4753 真核轉譯延伸因子1β2 NM_182607 VSIG1 ❹
「貓白血病病毒子組C 含捲曲螺旋域41
Hs.403933 114907 2710551 0.00217 2190653 0.00213 IRAP; 受體拮抗子 )j Hs·292356 MAFbx; FLI32424; MQC33610 NM. 148177536 ;64 CYBB FBHm LILRB3 Hs.631592 11025 「細胞色素1>245, F·盒蛋白32 XM.943094 L0C162073 IL1F3; IL1RA; IL-lra3; ICIL-1RA; MGC10430 NNL173842 Hs.81134 3557 MGC142294; MGC142296
IL1RN 580270 0.00213 B7-H; B7HI; PDL1; PD-L1; PD0)1L1; PDCD1LG1; Φ274 CD274 分子 Hs .521989 29126 5690093 0.00213 CCK; RICK; RIP2; CARD3; GIG30; CARDIAK 絲胺酸-蘇胺酸激酶2 Hs. 103755 8767 4490187 0,00213 FLJ381U NIL003818 CDS2 Hs.472027 8760 7380292 0*00213 L0C284672 XNL208234 5820167 0,00212 mB3\ BMZF-3 N(L〇〇5773 4230167 0.00211 S001L; MGC125823; MGC125825 同源物2 (酵母) Hs · 65叨57 9997 3290019 0.00209 MGa3L66 NM„152735 221504 4040379 0.00206 ACDP3; FU20018; DKFZp434I1016 26505 169^28 0.00202 FLI90431; KIAA0446; RP11-54H19.3 6760577 0.002 2350719 0.002 Hs.448879 2640554 0.002 Hs.370503 110598 0.002 2350196 0.002 4640484 0.002 4560128 0.002 Hs.95835
Hs.532375 XM 932470 141281.doc 介白素1 NM_014143 受體-相互作用 CDP-二醯基甘油合成酶(磷脂酸胞苷醢基轉移酶)& _⑺极7 . 284672 ^ Hs.596242 10172 SCO細胞色杀氧化酶缺乏 含鋅指及BTB域9 Hs.591805 細胞週期素M3 Hs. 643430 「可溶載體家族25, NM.003821 RIPK2 L0C284672 , HCG2028557 ZNF256鋅指蛋白256 NM.005138 SC02 9673 L0C644869 ZBTB9 N〇i7623 OW3 NMJU4655 KIAA0446 L0C388344 XM.371023 388344 ADAP; PRO0823; SLAP-130 NM.199335 2533 XM 945192 UOC649049 ΗΡΑ; HPR1; HSB1; HRSE1 NMJJ06665 -----~B7; mil NM.004099 M)7; EPB7 MC3C45416; DKFZp686C03164 132299 L0C388344 類似於核糖體蛋白L13 FYB FYN 結合蛋白(FYB-120/130) NM-001014446 0CIAD2 含OCIA域2 156· 201022492 ❹ 「蛋白酪胺酸磷酸酯酶 υ·υυζ LPAP; CD45-AP; MGC138602; MGC138603 _ __ C·相關蛋白」 2490291 0.002 XM.928705 LOC653658 520487 0.002 XMI942152 U0C652616 Α 4560133 0.002 ΑΝΧ3 ΝΜ:005139 ΑΝΧΑ3 鈣依賴性磷脂結合蛋白A3 Hs,480042 3800450 0,002 CAS; CSE1; XP02; MGC117283; MGC130036; MGC130037 NM 001316 染色體隔離1樣(蜂母) Hs,90073 1434 ~ 2630189 0.002 FFA2R; (PR43 NHL005306 FFAR2 游離脂肪酸受艘2 2867 4640452 0.002 PARP9 … 5820092 _ Hs.381220 44Ϊ168 70639 0,002 DKFZp43 你 127 NM_032265 ZMYND15 84225 2970240 0.002 ATP· 5670544 _ 5050768 0.00197 GAB1; CDC9TL1; MGC40420 NMJ80476 CDC91L1 Hs.253319 12§869 6650274 0.00196 BX110640 轉錄基因座 2320619 0.00195 ATPID; KIAA1137; DKFZp434M0219 NMJ20452 Hs.435700 57198 70605 0.00194 UM\ IDP; PICD NM_005896 Hs.593422 3417 ' 7320162 0.00194 MGC20461 NM 020530 3930041 0.00194 AA600238 3360484 0.00193 CD317 剛JJ04335 BST2 684 3390458 0.0019 IRKK; KIRI.3; KIR4.2; MGC13584 Hs.411299 770364 0.00187 IFK28 m 022147 RTP4 64108 — , 940100 0.00187 LTA4H MUJ00895 LTA4H 白三稀素A4水解酶 Hs 524648 4048 ^3^46 0.00187 tamo; C16〇rf76; MGC26885 NJU52339 MGC26885 精子备生 DJZUU/Z I «體型 陶JX)5608 Hs.155975 PIPRCAP 5790
306 CSE1L
0.002 BAL; BALI; FU26637; FU41418; MGC: 「多聚(ADP-核糖j聚合酶寥族,成員9」 0.002 RP1-93H18.5 NM 001010919 L0C CSE1 Hs.248056 _J)31458 7868; DKFZp666M)8lO; DKFZp686MI5238 Hs.518200 83666 UXM41168 「具有序列相似性之家族26,成員Fj W0 0.002 APT2; PSF2: ABCl^ ABCB3; RING11; D6S217E •結合卡匣,子族B (MDR^AP)」 Hs·502 6891 544 0.00199 XM_928387 U0C653610 「含鋅指 NM.000544 MYND型15」 TAP2
Hs.47223 「轉運馥2, 「磷脂醯肌醇多醣錨生物合成,U類」
Hs.624313 「ATPase,
IDH1 OSM 成員2」 ,可溶」 ίΜ 制瘤 轉錄基因座 骨ί ΝΜ.002243 3772 ΑΤΡ8Β2「ATPase,I類,8Β型 異檸檬酸去氫酶1 (NADP+) 素 M Hs. 248156 5008 Hs.634483 隨基質細胞抗原2 Hs.118110 KCNJ15「内向整流鉀通道,子族J,成員15」 受艘(化學感受)轉運蛋白4 Hs.43388 124044 4890458 0.00184 L0C130074; MGC87527 N«_001009993 L0C130074 p20 Hs.534679 130074 1170735 0.00182 FU32191 NHU44689 ' 160279 0.00182 NW56 NM_006392 N0L5A 10528 5220193 0,00182 GBA 湖_001005741 GBA Hs.282997 7150564 0.00182 SUV3 Nftl„003171 SUPV3L1 6832 1030041 0.0018] CLAN; IPAF; CL^l; CLANA; CLANB; C 广NLR家族,含CAfeb域4」 Hs·574741 5870376 0.00181 APOL-II NMJ45637 AP0L2 r 册卩420 a ,令辞指委白420枇.444992 核仁蛋白5A (56kDa具有KKEO)重複〉 「葡糖苷酶,β ;酸(包括葡糖神經醯胺酶)j 「varl 3樣之抑制子1 (醸酒酵母)」 Hs. 106469 CARD12; CLR2.1 NM.021209 CARD12 147923 Hs.376064 CLANC; CLAND; 「 58484 「「脂蛋白元L,2」 如.474740 23780 AK000019 「OTA RJ20012 fis,純系ADKA03438」 Hs.675409 WDR82; MST107; MSTP107; PR02730; PR034047 NM 025222 _1〗3 跨膜 Hs. 194110 80335 ~ Mm;〇rdl6; J^ ^6i&NPHP6; ^HllAg; FLJ13615; FU21979; KIAA0373 CX3I75; mtTFB; CGI-75 NM 016020 TFB1M 51106 LOC255809 XM_930239 UOC255S09
2470370 0.00181 6510647 0.0018 2750017 0.0018 NM„025114 620202 0.0018 Hs.279908 4900114 0.0018 255809 5090403 0.0018 GSE; CD152; CTLA-4; IDDM12; CS.IAC3 NM_005214 CTLA4 細胞毒性T_淋巴細胞-相關蛋白4 Hs. 247824 1493 6040259 0.0018 MUM-l; HSPC211; FU14868; RJ22283; MGC131891; MGC163315 NM 032853 MUM1 黑色素瘤相關抗厚C突變)1 Hs.515016 84939 _ _ 1470008 0.0018 TOl; LAM1; LNHR; LSEL; CD62L; 3LAM-1; LYAM1; Leu-8; PLNHR; hLHRc; LECAM1; Lvam-1 NM 0006^ Hs·82848 _ 1018 NCF1A; NOX02: p47phox; SH3PXD1A NMJ 80184 「轉錄因子B1 假定 L0C255809 粒線艎」 Hs.440535 SELL 270754 0.OOf 1230538 0.0018 NCF1A; N0X02: (慢性肉f腫病,體赛色體1 6960204 0.0018 FU34389 197259 1010242 0.0018 MGC20410 NM_138456 Hs.124840 116071 37S0747 0.00179 C0P1; OF; PSHJDO-ICE NM.052889 Mice Hs. 348365 114769 3S30341 0.00179 A211C6.1 NM 020424 57149 " 4250017 0.00179 CBS1; MSRB; PILB; CBS-1; CGM31; 甲硫胺酸亞礙還原酶B2 Hs.461420 22921 FOXOIA o47phox; ;JNM_1S2649 FOXOIA W0265 Hs.647047 BATF2 00P1 L0C57149 M«:26104 叉頭盒 0「1 Hs,37〇666 2308 ^61 「嗜中性白血球胞質因子1, 混合譜系激酶域樣 Hs. 119878 _鹼性白胺酸拉鏈轉錄因子,ATF樣2」 卡斯蛋白晦-1顯性陰性抑制子 含LYR基元 1 Hs.185489 NMJM2228 MSRB2 141281.doc -157- 201022492 5690632 0.00179 _ ^1|2^^0U8 Hff; BGPl'BGPI NM.001024912 NM_016735 LIUK1 CEACAM1 Hs.512682 634 MLP1; MACMARaS NM.023009 4860086 0.00178 F52; MLP; 65108 SCaMC-3 i23j J2\m Hs.501624 ' 59307 70762 ' 0.00178 APOL; APO-L; APOL-I NM.145343 8542 6270128 0.00)78 1¾ IMM; l^AP: #p39; CD154; CD40L; HIGM1; T-BAM; 1NFSF5; hCD4〇L CD40LG 吧1)45疤位馥(TNl7^家族,成員5,高度症候群)j Hs.592244 3370162 0.00178 Tp44; MGC138290 l^_006139 CD28 通8分子 -------- 4480433 0.00178 ISGF-3; STAT91; M(Kp686B04100 NM 007315 STAT1 91kDaj Hs.642990 1820367 0.00178 RHBDL5; RHm)L6; FU22341 Hs.464157 79651 3800072 0,00178 FU20429 NM_017817 55647 2750730 0,00178 TRB2; GS3955 NM_021643 28951 1450291 0.00178 ADCADl; RSRFC4; RSRFC9 i®i_005587 4205 _ 5490181 0.00178 XM.496783 L0C441114 2710301 0.00178 ATA1; NAT2; SAT1; mil NK.030674 Hs.654875 81539 1110215 0.00178 MBC2; KIAA0747 NM_015292 FAM62A Hs.632729 23344 6550010 0.00178 XM.496657 NM_006: 癌胚抗原相關細胞黏附分子1 MARCKSL1 MARCKS 樣 1 Hs. 75061 5820634 0.00178 APC2; MCSC2: MGC2615; ^ 0.00178AP0L; 7400482 0.00178 VRK2 NM 024103 SLC25A23 可冷載體豕族25 ' Hs.356231 79085 SI6IRR 單鏈免疫球蛋白及toll介白素1 AP0L1 S!〇01005498 RAB20 TOIB2 「脂蛋白元L,Li Hs.114309 ML000074 959 940 「信號轉導子及轉錄活化子1 扁菱形蛋白5同源物2 (果繩)
Hs.591629 RHH)F2 「RAB20,RAS致癌基因家族成員」 Hs.5〇872〇 tribb丨es 同源物2 (果绳) Hs.652175 MEF2A 心肌細胞強化子因子2A Hs .268675 SLC38A1 「可溶载體家族38,成員1」 「具有序列相似性之家族62(含C2域),成員Aj 痘療相關激酶2 4390575 0.00178 C1IN; C1NH; HAE1; HAE2; C1INH NM G(C1#制子),4息1久也#性水腫,邊得悻 130289_0.00178 KIAA〇i〇6; EKFZp781E0375 NILM5779 NERF-2; NERF-1A; NERF-1B; NERF-la,bj Hs.656593 1998 MGC12821; MC3C42356; DGK-α NM„2i
Hs.631890 7444 .000062 SERPING1 「絲胺酸肽酶抑制子,分枝 j Hs.384598 710 ----- 脂肪瘤HMGIC融合搭配物樣2 ELF2 E74樣因子2 「二睡基甘油激酶, _ LHFPL2 Hs.79299 10184 ~ ' 2810326 0,00178 r0J32; NERF; fets歲#錄因子) 6550390 0.00178 DAGK; DAGK1; a80kDa」 Hs. 524488 1606 2100333 0,00178 TACTILE; MGC22596; DKFZp667E2122 10225 6100112 0.00178 AD021; AD036; FLJ38155; DKFZp434L142 Hs,567498 51313 6620465 0.00178 MSTP030; MGC117339 NM 000969 6125 3060626 0.00178 AAG6; PKCA; PRKACA; MGC129900; MQC129901; PKC-a 「多白激,cu Hs.531704 5578 20110 0.00178 RIG-B; UBCH8; MGC40331 NM 〇i Hs.425777 9246 " 2350739 0.00178 VRF; VEGFL NM_〇〇3377 VBGFB 7423 5490070 0.00178 P400; CAGH32; TTiRC12; FU42018; FLJ45U5; DKFZP434I225 NM.015409 結奋蛋白〆00 Hs.654919 57634 人十士《 -丨^以 5420215 0.00178 UEFl; DRIF2; C7orf6; FU39885; KIAA2005 NM 152703 SAMD9L 含不育a基兀*域9樣 Hs 489118 219285 4760010 0.00178 CABIN1; CAIN; KIAA0330 NM 012295 CABIN1 鈣調磷酸酶結合蛋白 1 23523 1030398 0.00178 ATV; NBS; NBS1; AT-V1; AT-V2; FLJ10155; MQC87362 Hs.492208 4683 450037 0.00178 hly9; n»LY9; CD229; SLAMF3 NM 002348 LY9 4063 — 3140195 0-00178 HDR; MGC2346; MC3C5199; MGC5445 NM_002051 GATA3 2625 ' 4920121 0.00178 T14; S152; Tp55; 1NFRSF7; MGC20393 NM.001242 939 830551 0.00178 MGC39900 XM.936687 MGC39900 「假定蛋白MGC39900 ;智人假定蛋白 MGC39900 (MGC39900), n^NA.J ~ 1820735 0.00178 FU38158; MGC102978: DKFZp313K0436; DKFZp434N2030; DKFZp686L04169 NM 001009894
NM.006874 201554 DG NM_198196 WL016613 RH-5 UBE2L6
CD96 CD96 分子 Hs. 142023 C4orfl8染色體4開放閲讀框架18 核糖艘蛋白L5 Hs.532359 NO02737 mCA 泛素接合酶E2L 6 血管内皮生長因子B Hs.78781 EP400 E1A NM.001024688 NBN 淋巴細胞抗原9 GATA結合蛋白3 TNFRSF7 0)27 分子
Hs.517478 斷蛋白 Hs.403857 Hs.524134 Hs.355307 C12orf29 染色體12開藏閱讀框架29 Hs. 591009 3460039 0.00178 H3.1; H3/d; H3FD NM 003532 HIST1H3E Hs.443021 8353 270 0.00178 mm; GAH)45B; DKFZP566B133 NML015675 μ Λ Hs.110571 4616 30178 RIG-B; UBCH8; MGC40331 NM.004223 UBE2L6 Hs.425777 9246 281Q270 0.00譯導性,|」 4490592 0.00 91298 「組蛋白叢集1,H3e」 GAIB45B 「生長抑制及DNA損傷 泛素接合酶E2L 6 141281.doc -158- 201022492 7320291 0.00178 VRL2; TRP12; VRL-2; VROAC; 0TRPC4; VR-OAC NM_)47204 「瞬時受體潛在陽離子通道,子族V,成員4」 Hs.506713 3130541 0.00178 L0C440737 XM_496446 L0C440737 Hs.591528 440737 ~ 3420343 0.00178 FLJ26450; H_267D11.1 NM.207311 CCDC64 67700956〇.00178 NmSc NMJ06636 MTHFD2 「亞甲基四氩葉酸去氫酶(依賴性)2, 甲醖基四氫葉暖環水解酶」 Hs.469030 10797 7050139 0.00178 ISGF-3; STAT91; DKFZp686B04100 M«„139266 STAT1 「信號轉導子及轉錄活化子 1, 1190279 0.00178 TX; ICH-2; Mihl/TX; KHffiL-II; ICE(rel)II NM_〇33306 CASP4 「卡斯蛋白酶4, 細胞凋亡-相關半胱胺酸肽酶j Hs.138378 837 「人[* ,心 2640156 0.00178 OtLl; TOCR; WSX1; IL27R; zcytorl NM.004843 IL27RA 1介白素27受髏,α」 Hs.132781 9466 6940246 0.00178 IL23A H97723 「介白素23,α次單元pl9j Hs.654496 2490440 0.00178 RALB NM_002881 KALB v-ra丨猴白血病病毒致癌基因同源物B (ras相關;GTP結合蛋白) Hs.469820 5899 770095 0.00178 NS3TP2; FU21313 NM_023927 GRAMD3 ^GRAMJs8,3 Hs.363558 1710286 0.00178 MFNG M«_002405 MFNG MFNG 0-岩藻糖基肽 3-β·Ν-乙醯基葡糖胺轉移酶 Hs.517603 4242 5900592 0.00178 INPP5H; KIAA0348; MGC44422 NM 003898 8871 ~ 2650113 0.00178 FLJ23713; FLJ33918; Mt-GrpE#2; QKFZp451C205 NM 152407 GRPEL2 「GroE;l*2 粒線體(大腸桿菌)j Hs.511816 134266 P 6270358 0.00178 XM_942473 L0C650901 4560114 0.00178 C20656 轉錄*因座 Hs.537991 6100010 0.00178 C»P1; (X)P; PSEUDO-ICE NM 052889 00P1 假-ICE Hs, 348365 114769 , ^ 6370678 0.00178 BX102143 轉錄基因座 6350274 0.00178 MLKL XM.936963 MLKL 智人混合譜系激酶域樣(MLKL),mRNA」 3120520 0.00178 HVLP; MGC10029 NM 031311 CPVL m贫王诼j Hc 545Q4 ns, 4230133 0.0017S EBI2 NJL〇〇495) 一 EB12埃潑斯坦-巴爾病毒誘導之基因2 (淋巴細胞-特異性G蛋白偶合受雄) TRPV4 59341 類似於60S核糖體蛋白L35 含播曲螺旋域64 SYNJ2 突觸伸蛋白2 Hs.434494 卡斯蛋白酶-1顯性陰性抑制子 「 λ ^ ^ Hs,661440 「混合譜系激酶域樣;同物異名 「羧基肽酶,卵黃發生樣」 FLJ34389 ;
Hs.784 ΝΜ_〇〇1613 1880 ACTA2 「肌動蛋白’ <ι2,平滑肌,主動麻j Hs.500483 430338 0.00178 ACTSA 59 4540414 0.00175 KE3; HKE3; KE-3; D6S218E; MGC117351; MQC126835; MGC126837 核糖饉蛋白S丨8 Hs. 627414 6222 5860189 0.00172 HSPC163 NM 014184 CNIH4 29097 5860753 0.00172 DKFZp686G0786 NM_198460 Hs.254338 163351 ' 2630747 0.00172 IL-15; MGC9721 NM_172174 IL15 ,「曰京 13 Hs.654378 36〇n 6220450 0.00172 RDHL; RDH15; RETSDR8; 3a-HSD NM.005771 DHRS9 (SDR家族)成員 9 Hs. 179608 10170 選原酶 10592 0.00172 PLA2G4; MGC126350; cPLA2-a NM.024420 HA2G4A 「填脂兹a2 , ΐ胞質,鈣-依頼性)j Hs.497200 5321 r &IVA S960717 0.00172 PI 13; ISGF-3; STAT113^59816 NM.005419 STAT2「信號轉導子及轉錄活化子2,113心」 3460041 0.00172 JAK2 NM.004972 ' JAK2 詹納斯氏激酶2 (蛋白路玻緩激味) 同源物4(果场) NM-022551 RPS18
Hs.445890 「烏苷致結合蛋白家族,成員6」 3717
Hs.656213 _ NM.139013 4040672 0.00172 EJ16; PROIECTIN NM_20L… 一" ν,Hs 278*m 966 1710768 0.00172 ΑΡΤΙ; PSF1; ABC17; ABCB2; RING4; TAP1N; D6S114E; FLJ26666; FLJ4150O· TAPI*nimM ηΛΛ^ TH轉《藓結令卡, g§i02NNM-000593 含 TRAF-ΦΙ 滅祕.1 Hs.5148 ^干擾素γ誘導性蛋白3〇j SLC6A12 「可溶載體家族6 Hs.437174 6539 墙酸肌醇-3-激鷗接附蛋白丄 4810255 0.00172 FLN29 NM_006700 TRAFD1 含TRAF-型辞指域l 10906 1770672 0.00172 GILT; IP30; IFI-30; MGC32056 Hs.14623 10437 70369 0.00172 BGT1; BGT-1; FLJ38727 NM_003044 (神經傳遞質轉運《,甜菜驗/GABA),成員Γ2」 1820491 0.00172 BCAP; RP11-34E5.3 NMJ52309 Hs.310456 118788 " NH.006332 IFI30 PIK3AP1 6900341 0.00172 NT3; Gp95 NM 002959 S0RT1 4290435 0.00172 DKFZp761E198; PP1030 1« 138368 91056 _ 20328 0.00172 FHL4; HLH4; HPLH4 NM_003764 2450100 0.00172 FU39838 NM_020437 ~ ASPHD2 Hs.567547 57168 " 1260048 0.00172 FN5 NM 020179 FN5 ΙΚΚρ?6?Ε198 &S5i?ii98 蛋白6272
Hs.591957 Hs. 118958 含天冬胺酸β-羥化峰 染色濮11開放閱讀框架75 Hs.438064 STX11突觸融合蛋白u 141281.doc •159- 201022492 56935 3780326 0.00172 GBP2 NML004120 GBP2 Hs.386567 2634 4050040 0.00172 ffiEK; KP12; LMR2; cprk; KPI-2; AATYK2; KIAA1079 NH.0H916 Hs.444179 22853 CSBP1; CSBW; CSPB1; PRKMH^ffiKMlS; SAPK2A; p38o 6770072 0. ΟΟΠ2 FLJ32761; MGC126671; bA330011.1 ^^11^330011,1 NM3182755 ZNF438 Hs.660642 220929 ' 5670100 0.00172 LPCAT2; PU20481; LysoPAFAT; DKFZp686H221l2 NM 017839 AYTL1 Hs.460857 54947 ~ r 140<3605 0.00172 Rsc6p; BAF60C; CRACD3; MGC111010 NM 003078 SHARCD3「SWI/SNF相關,基質相關 _ ' Hs.647067 6604 TAP2 「轉運《2, 環水解酶1 「烏苷酸結合蛋白2 um(2 干擾素誘導性J lenrar絡胺酸激峰2 NM.001315 鋅指蛋白438 醯基轉移酶樣1 0-00172 Rsc6p; BAF60C: α 染色質之肌動蛋白依籟性調節丰,子族a,成員3」 1780528 0.00172 APT2; PSF2; ABC18; ABCB3; RI ATP-結合卡匣,子族B (MDRZTAP)j 6250743 0.00172 GCH; DYTS; GTPCHl; GTP-Ol-1 (多Γ ------- '
Hs.502 6891 ^______________________ ML001024024 巴反應性肌張力障礙) Hs. 86724 26?3 2070575 0.00172 G24; MRHL56; FLJ14902 NM 171846 LACIB 114294 ~ 6960441 0.00172 SLO-β; hslo-β ; Κ(ν〇Α)β Ml 004137 子族Μ,β成員1」 _ 3990626 0.00172 IL7R XM 937367 CD127抗原;介白素7受體aft ;智 NMJ18833 GCH1 GTP 「醞胺酶' K(MB1
Hs.410388 「奸大電導鈣-活化通道, Hs.484099 3779 IL7R 「介白素7受艎;同物異名:CD127、CDW127、IL^TR^a 人介白素7受體(IL7R),mRNAj 1024430 9050 NM,006682 FLJ90777 26509 3460523 0.00172 MAYP; MGC34175 Hs.567384 5820008 0.00172 T49; pT49 2360292 0.00172 MYOF; FU36571; Hs.655278 3290286 0.00172 SSi(; SEPM; 5910762 0.00172 10577 6380338 0.00172 「脂蛋白元L, 6j Hs.257352 80830 650113 0.00172 PBX4 Ml 0252« PBX4 2750242 0.00172 TPA1; FU10826; KIAA1612 Hs.231883 2070673 0.00172 LPL1; APT-1; LYSOPLA 10434 3Π0092 0.00172 PICT1; PICT-1 NM_〇15710 Hs.421907 29997 4040360 0.00172 13 NM_015379 BRI3 2070239 0.00172 XM_936627 L0C647572 7210747 0.00172 SEK; HEK8; TYR01 NM_004438 2680400 0.00172 KIAA1632 BX094382 PSTHP2脯胺酸-絲胺酸-蘇胺酸磷酸酯酶相互作用蛋白2 FGL2 血纖蛋白原樣 2 Hs. 520989 10875 NM_013451 咖 「fer-1樣3,myoferlin (線蟲)」 SQi(; Smt; MGC40246 NM 080430 HB1; NP-C2; M0C1333 NH:006432 APOL-VIi FU38562; FLJ90164; MGC5 SELM「 硒蛋白 M Hs.55940 iflPC2「尼-皮二氏病丨Niemann-Pick) MGC57495; DKFZp667M075 NM_〇3〇641 140606 Pick),C2型」Hs.433222 AP0L6 前-B細胞白血病同源盒4 Hs,466257 80714 NMJJ8233 QGF0D1含2-氧化戊二酸鹽及鐵依賴性加氡酹域1 溶血磷脂酶f NM_006330 LYPU1 GLTSCR2 腦蛋白13
Hs.435850 神經膠質瘤腫瘤抑制子候選區基因2 Hs.567438 25798 2043 KIM0823 ^-015568
Hs.45719 NMJH6257 1850072 0.00172 HLP4; I^CFZp761G122 51440 4180274 0.00172 AK026751 6270241 0.00172 MGC24837 m 014587 30812 7040020 0.00172 LMP7; D6S216; RING10; D6S216H; MGC1491 β型,8 Γ大多功能肽酶7)j 7560082 0.00172 TEL2; TBLB; ΤΉ--2 NM.016135 Hs.272398 51513 ' 1190452 0.00172 FBG2; FBS2; FBX6; Fbx6b NM.018438 FK(06 150196 0.00172 B6TPI; KIAA0440; DKFZp686G1344 NM 015556 HPHA4 SPH 受體 A4 Hs.371218 KIAA1632 Hs.514843 ^^16B 「蛋白磷酸酯酶1, HPCAU 海馬鈣蛋白樣4 FLJ23098 fis,純系LNG07440」 SQXS SRY (性別決定區γ)—盒8 ^1.004159
Hs.524688 Hs.306876 Hs.243678 PSMB8「蛋白酶體(前饉 ^ Hs. 180062 5696 ETV7 ets變異基因7 (TEL2致癌基因) 巨蛋白因子) 信號誘導之增生相關1樣1 Hs. 654657 2850500 0.00172 Mpa2 NM„052941 GBP4 6370041 0.00172 DCRR1; RNF105; T7RDJII; DKFZp686M0150 Hs.368214 7267 1850093 0.00172 TL2; AP02L; 0)253; TRAIL; Apo-2L (配位逋)超家族,成員10」 Hs.478275 4760730 0.()0172 MY0BREVIN ML006634 VAMP5 Hs.172684 10791 380041 0.00172 EEIG1; C9orfl32; MGC50853; bA203J24.7 成貝 A」 Hs.568044 7160296 0.00L72 NFBP; ALO-4; KIAA0185 剛一014976 22984 1430164 0.00172 Bffl5; BGP1; BGPI NM.001712 CEACAM1 Hs.512682 4920719 0.00172 RW94; STAF50; GPSTAF50 M.006074 10346 6250538 0.00172 NM_080417 4-Sep 織白1
Hs.464419 26270 Ο
26037 烏苷睃結合蛋白4 NM.003316 TTC
Hs.409925 115361 ar10 ΝΜ.203305 399665 PDCD11 634 TRIM22 三角形四肽重複域3 TOFSF10 「腫瘤壞死因子 囊泡相關膜蛋白5 (肌短蛋白) C9orfl32「具有序列相似性之家族1〇2, 漸進式細胞死亡11 Hs, 239499 癌胜抗原-相關細胞黏附分子1 (膽汁醣蛋白) 含三聯基元22 Hs.501778 141281.doc -160- 201022492 υ.υυι/^ GEP; GP88; PEPI; PGRN; PCDGF NM_002087 2896 3190133 0.00172 ISGF-3; STAT91; DKFZp6S6B04100 NM.139266 91kDa」 Hs.642990 6772 7150176 0.00172 ATX1; HAH1; MGC1384S3; MGC138455 NH.004045 (酵母) Hs.i25213 475 7570079 0.00172 CD127; CDW127; IL-7R-a NM 002185 IL7R 3575 4150551 0.00172 APG3; APG3L; PC3-96; FU22125; MGC15201; I^FZp564M1178 NM 0224RR Hs.477126 64422 ~ M/NEI; ELANH2 M»„030666 SERPINB1 Hs.381167 1992 ______ DBP Hs.414480 1628 7550445^0.00172 GPR9;. IP10; MigR; CD182; CD183; Mig-R; CKR-L2; CMKAR3; IP10-R m 001504 4150551 0.00172 APG3; APG3L; PC3-96; 自艎呑噬相關3同源物(釀酒酵母) 4040221 0.00172 El; LEI; PI2; MNEI;] 抑制子,分枝B (卵白蛋白),成員1」 2350142 0.00172 DABP NM.001352 GRN STAT1 顆粒«蛋白 Hs.514220 「信娩轉導子及轉錄活化子1, ATOX1 A1X1抗氧化蛋白1同源物 介白素7受體 Hs. 591742 ATG3 ATG3 「絲胺酸肽酶 白蛋白啟動子(白蛋白1>盒)結合蛋白之〇位點 — C03 色胺醢基-tRNA合成酶 Hs .497599 含 gasdermin 域 1 Hs. 118983 「脯胺酸,麩胺酸及白胺酸富集蛋白1」 5341 Hs.277937 ~'Hs'198252 610291 0.00172 IFI53; IFP53; γ-2 NM 213646 7453 _ 4900504 0.00172 DF5L; FKSG10; FU12150 NM 024736 79792 5870598 0.00172 HMX3; MNAR; P160 fftl_014389 Hs.513883 27043 _ 1260040 0.00172 P47; FLJ27168 NM_002664 PLEK 血小板-白細胞C激酶受皙如 4fiR5Un 5810167 0.00172 XR 000992 LOC400759 «s.4t>s»4U 5310369 0.00172 TOYP2 NM_002104 GZMK 顆粒梅K (顆粒酶3 ;類胰蛋白酶n) 1500180 0.00172 FLJ22344 NM_001002796 MCTP1 「多個C2域,跨膜 1」 6200603 0.00172 G24; MRPL56; FU14902 NM.171846 LACIB 「醯胺峰,β」 4490129 0.00172 CGI-44 ΝΜ_021199 SQRDL 疏醚醌還原酶樣(酵母) 58472 4200543 0.00172 MGC22805 NM_144590 ANKRD22 錯蛋白重複域22 溫403 0.00172 HXK3: HKIII NM_002115 HK3 己糖激酶3 (白細胞) 1010343 0.00172 SSA; R052; SSA1; RNF81 NM_003141 TEIM21 含三聯基元 21 Hs.532357 7150403 0.00172 LMP7; D6S216; RING10; D6S216E; MGC1491 NM_148919 PSMB8 「蛋白酶體(前體, 「李声艘(侖敢,巨蛋白因子)4單元,β型,8 (大多4能酶7)」 Hs. 180062 5696 、/"Jf 激夢2 %物異名:既8, RIPK7, 總)(¾¾56386)(想1色想顯性,8;在類風濕性關節炎中增加17; n η〇Ατι . γόαπιι · πτ mu ηΎηηαη FU14466 — - ____ 2833 WARS GS1M)C1 PELF1
Hs.655087 Hs.410388 Hs.511251 Hs.217484 Hs.411695 3120414 0.00172 CRACM1; FU14466 NM 032790 Hs.55148 84876 ' 1500377 0.00172 PA28B; REG β ; ΡΑ28β NM_002818 活化子次单元2 (ΡΑ28β)」 Hs.434081 5721 1050300 0.00172 Trif; HSD34; RNF36 BC031266 TCIM69 含三聯基元69 140691 5810471 0.00172 DRAM; FU11259 NM 018370 Hs.525634 55332 ~ 2570356 0.00172 RHBDL5; RHBDL6; FLJ22341 Hs.464157 79651 © 6550739 0.00172 ICE; P45; IL1BC NM_033294 CAS] (介白素1,β,轉化酶)」 Hs.2490 834 3420630 0.00172 HPK1 NM 007181 MAP4K1 Hs.95424 11184 ~ 5080056 0.00172 FU10379 NM 018079 FU10379 55133 ~ 2650215 0.00172 GBP1 NM_002053 GBP1 67kDa」 Hs.62661 2633 1470242 0.00172 TOF1; FBiS-1; ZFYVE17 NM 020830 Hs.368359 57590 2360598 0.00172 RNF88; TRlM5a NM 033034 85363 " 6380731 0.00172 CW-1; TCTEL1; tctex-1; MGC111571 Hs.445999 6993 6520576 0.00172 MAR; IRF-l NM 002198 IRF1 3659 ~ 6980474 0.00172 MD-2 NM_015364 LY96 5820475 0.00172 MGC125976 " NM 002690 POLB 5423 ' 150703 0.00172 ATF3 Md 001030287 ATF3 4920243 0.00172 CD157 004334 683 一 FU11259 NM.024599 CASP1 BST1 141281.doc -161 跨膜蛋白142A 「蛋白酶« (前想,巨蛋白因子) Hs.489254 損傷調節自體吞嗔調節子 扁菱形蛋白5同源物2 (果缚) 細胞凋亡-相關半胱胺狡肽酶 有絲分裂原活化蛋白激酶1 S1RNA 結合域 1 Hs. 14229 「烏苷敗結合蛋白1,千擾素誘導性,67kDaJ 含WD重複及FYVE域1 含三聯基元5 Hs. 370515 DYNLT1「動力蛋白,輕鏈,Tctex型1」 干擾素調節因子1 Hs.436061 PSME2 RHBDF2 卡斯蛋白酶1 TOFY1 TCIM5 NM 006519 淋巴細胞抗原96 Hs. 660766 23643 「聚合酶(DNA引導)β」 活化轉錄因子3 骨髄基質細胞抗原1
Hs.654484
Hs.460 467 Hs.169998 201022492
7320484 0.00172 FLJ44613; (ALPHAJII-SPKnEIN
非紅血球1 (〇·胞襯蛋白)」 Hs.372331 540112 0.00172 ACS3; FACL3; PR02194 Nii_004457 Hs.655772 2181 6020327 0.00172 CEB NM 004781 Vj Hs.66708 9341 450544 0.00172 VHR ΜΛ.004090 Di (痘瘡病毒磷酸曄酶VH1-相關)Hs. 181046 3060360 0.00172 RG; FU26672; KIAA0856 M NNL003127 6709 ACSL3 VAMP3 DUSP3 SPTAN1 「血影蚤白’ 〇, 醯基-CoA合成酶長鏈家族成員3 囊泡相關膜蛋白3(缩織蛋白) 雙特異性磷酸酯酶3 1845 NMJJ15263 3190452 0.00172 FU39370 ϊ^„152400 ' Hs.23439 132720 2260133 0.00172 GKi; GKD NM„000167 580494 0.00172 XM 3736S4 2190609 0.00172 OSCAR; PIGR3; MGC33613 126014 3470184 0.00172 INCA ^001007232 INCA Hs.44102 440068 4120100 0.00172 AK3; AK4 NM 001005353 AK3L1 205 5560273 0.00172 CD85; ILT2; LIR1; MIR7; CD85J; LIR-1; MIR-7; FU37515 球免疫球蛋自樣受族BC具:ΤΓΜΑΓΠΜ^Ο ’成貝1」 4260278 0.00172 ACATE2; (Χ3Μ6; ITT-ACT48 Μ«„001033583 ΑΟΟΤ9 23597 6130594 0.00172 CD87; UPAR; URKR NM„001005376 PLAUR Hs.466871 5329 4540138 0,00172 (BP-5 NM.052942 GBP5 270768 0.00172 L0C440731 XIL933693 440731 2480577 0.00172 NSE2; BO!P101 NMJ74911 Hs.124951 157638 6040639 0.00172 PYHIN4 Ml_004833 AIM2 DMXL2 Dmx 樣 2 染色謂框架S312 FU39370 GK 甘油激酶 Hs.1466 2710 NM.130771 OSCAR 破骨細胞-相關受艘 Hs.347655 抑制卡斯蛋白酶幕集域(CARD)蛋白 腺苷酸激酶3樣1 Hs. 10862 m 006669 LILRB1 ~ Hs.667388 醯基-CoA硫 S§ 酶 9 Hs · 298885 「織維溶酶原活化子,尿激酶受艘」 烏苷暖結合蛋白5 Hs. 513726 115362 LOC440731 假定 L0C44O731 Hs. 18U56 3710379 0.00172 PYHIN4 NMJW4833 CD87; UPAR; URKR Hs.466871 5329
不存在於黑色素瘤中2 ML001005376 PUUR 「具有序列相似性之家族84,成貝B」 Hs.281898 9447 「纖維溶峰原活化子,尿激酶受想」 141281.doc 162-

Claims (1)

  1. 201022492 七、申請專利範圓: 1. 一種用於區分疑受結核分枝桿菌⑽州⑽心… c«/ 〇 s &)感染之患者的活動性與潛伏性結核分枝捍菌感染 之方法’該方法包含: • 自该患者之全血樣品獲得基因表現資料集(dataset); • 須’!定-或多個區分受感染患者與非感染個體之轉錄基 因表現模組的差異表現,其中該資料集展示與匹配之非 感染個體相比’該__或多個轉錄基因表現模組中聚核皆 ® 酸量之聚合變化(aggregate change);及 基於忒-或多個區別活動性與潛伏性感染之轉錄基因 表現模組來區分活動性與潛伏性結核分枝桿菌(TB)感 2·如μ求項1之方法’其進_步包含使用該測定之比較基 因產物資訊來制定診斷之步驟。 月求項1之方法,其進一步包含使用該測定之比較基 因產物資訊來制定預後之步驟。 求項1之方法,其進—步包含使用該 因產物資訊來制定治療計劃之步驟。 較基 5 _如請求項]> *, .^ 法’其進—步包含區分患有潛伏性TB之 患者與活動性TB患者之步驟。 6 ·如清求項1 > 士 法’其中該模組包含模組Ml.2、Ml.3、 Μ 1.4 ^ \/f 1 ^ .、Μ1.8、Μ2·1、Μ2.4、Μ2.8、Μ3.1、 Μ3·2、Μ3.3、M3 4、ΐνη 之資料集則貞測活動性肺部感染 3Α Μ3·6、Μ3·7、Μ3.8 或 Μ3.9 中基因 141281.doc 201022492 7·如印求項1之方法,其中該模組包含模組μι.5、Μ2.1、 Μ2·6、1〇、Μ3.2或Μ3.3中基因之資料集以偵測潛伏 性感染。 士叫求項1之方法,其中以下基因在活動性肺部感染中 下調· Ct)3、CTLA-4、CD28、ZAP-70、IL-7R、CD2、 SLAM、CCR7及 GATA-3。 9. 如叫求項1之方法’其中圖9之表現圖譜(profile)指示活 動性肺部感染。 10. 如請求項}之方法,其中圖10之表現圖譜指示潛伏性感 ^ 染。 如。月求項1之方法,其中模組M3.4、M3.6、M3.7、M3.8 及M3.9中基因之不足表現(underexpressi〇n)指示活動性 感染。 12. 如請求項丨之方法,其中模組M31中基因之過度表現指 示活動性感染。 13. 如凊求項i之方法,其進一步包含藉由測定在分枝桿菌 以外之感染中周邊it液單核細胞或全血過度表現之模組 ® M2.2、M2.3及Μ3·5中之基因表現來區分TB感染與其他 細菌感染之步驟。 . 14 ·如明求項1之方法,其進一步包含使用以下模組中之兩 者或兩者以上區分潛伏性及活動性TB患者之血液中差異 及相反(reciprocal)轉錄特徵(signatures)的步驟:對於活 動性肺部感染為 M1.3、M1.4、M1.5、M1.8、M2.1、 M2.4、M2.8、M3.1、M3.2、M3.3、M3.4、M3.6、 141281.doc -2 - 201022492 M3·7、M3.8 或 M3.9,對协 *既也 η λ/Γ〇 , ’於潛伙性感染為模組Ml.5、 .、M2,6、M2.10、M32_33。 15. 16. • 17. 18. 19.
    如請求項1之方沐,甘士上 Α 八相對於健康患者,在活動性肺 = 調之基因係選自表7Α、表-、表71、表- 項1之方法,其中相對於健康患者,在活動性肺 ™染中下調之基因係選自表7Β、表%、表Μ、表 7F、表7G、表7Η、矣7Τ 主, 表7L、表7Μ、表7Ν、表7〇及表7ρ。 如請求項1之方法’其中相對於健康患者,在潛伏性ΤΒ 感染中上調之基因係選自表8Ββ 如請求項1之方法,其中相對於健康患者,在潛伏性ΤΒ 感染中下調之基因係選自表8Α、表8C、表犯、表犯及 表8F 〇 一種用於區分疑受結核分枝桿菌感染之患者的活動性與 潛伏性結核分枝桿菌感染之方法,該方法包含: /得自患有活動性結核分枝桿g感染之第-臨床組獲 付之第-基因表現資料集、自潛伏性結核分枝桿菌感染 患者之第二臨床組獲得之第二基因表現資料集、及自非 感染個體之臨床組獲得之第三基因表現資料集; 產生包含第一資料集、第二資料集及第三資料集之任 兩者之間的基因差異表現之基因叢(gene cluster)資料 集;及 測疋私示潛伏性感染、活動性感染或健康之獨特表現/ 表示模式(pattern)。 141281.doc 201022492 20·如請求項19之方法,其中各臨床組係分成表6之119種基 因之各獨特表現/表示模式。 21. 如請求項19之方法,其中比較該第一資料集與該第三資 料集之值,自其扣除來自該第三資料集之資料集的值。 22. 如請求項19之方法,其中比較該第二資料集與該第三資 料集之值,自其扣除來自該第三資料集之資料集的值。 23. 如請求項19之方法,其進一步包含比較兩個不同資料集 之值及扣除剩餘資料集之值以區分患有潛伏性感染之患 者、患有活動性感染之患者及非感染個體之步驟。 24. 如請求項19之方法,其進一步包含使用該測定之比較基 因產物資訊來制定診斷或預後之步驟。 25. 如請求項19之方法,其進一步包含使用該測定之比較基 因產物資訊來制定治療計劃之步驟。 26. 如請求項19之方法,其進一步包含區分患有潛伏性ΤΒ之 患者與活動性ΤΒ患者之步驟。 27. 如請求項19之方法,其進一步包含測定以下基因之表現 量:ST3GAL6、PAD14、TNFRSF12A、VAMP3、BR 13、RGS19、PILRA、NCF1、LOC652616、PLAUR(CD 87)、SIGLEC5、B3GALT7、IBRDC3(NKLAM)、ALOX 5AP(FLAP)、MMP9、ANPEP(APN)、NALP12、CSF2 RA、IL6R(CD126)、RASGRP4、TNFSF14(CD258)、 NCF4、HK2、ARID3A、PGLYRPl(PGRP),該等基因在 潛伏性TB患者之血液中不足表現/不足表示,但在健康 個體或活動性TB患者之血液中並非如此。 141281.doc 201022492 2 8.如請求項19之方法,其進一步包含測定以下基因之表現 量:ABCG1、SREBF1、RBP7(CRBP4)、C22orf5、 FAM101B、S100P、LOC649377、UBTD1、PSTPIP-1、 RENBP、PGM2、SULF2、FAM7A1、HOM-TES-103、 NDUFAF1 ' CES1、CYP27A1、FLJ33641、GPR177、 MID1IP1(MIG-12)、PSD4、SF3A1、NOV(CCN3)、SGK (SGK1)、CDK5R1、LOC642035,該等基因在健康對照 個體之血液中過度表現/過度表示,但在潛伏性TB患者 之血液中不足表現/不足表示,在活動性TB患者之血液 中不足表現/不足表示。 29. 如請求項19之方法,其進一步包含測定以下基因之表現 量:ARSG、LOC284757、MDM4、CRNKL1、IL8、 LOC389541、CD300LB、NIN、PHKG2、HIP1,該等基 因在健康個體之血液中過度表現/過度表示,在潛伏性與 活動性TB患者之血液中不足表現/不足表示。 30. 如請求項19之方法,其進一步包含測定以下基因之表現 量:PSMB8(LMP7)、APOL6、GBP2、GBP5、GBP4、 ATF3、GCH1、VAMP5、WARS、LIMK1、NPC2、IL-15、LMTK2、STX11(FHL4),該等基因在活動性TB之血 液中過度表現/過度表示,在潛伏性TB患者及健康對照 個體之血液中不足表現/不足表示。 31. 如請求項19之方法,其進一步包含測定以下基因之表現 量:FLJ11259(DRAM)、JAK2、GSDMDC1(DF5L) (FKSG10)、 SIPAIL1、[2680400](KIAA1632)、ACTA2 (ACTSA)、 141281.doc 201022492 KCNMBl(SLO-P),該等基因在活動性TB患者之血液中 過度表現/過度表示,在潛伏性ΤΒ患者及健康對照個體 之血液中不足表現/不足表示。 32.如請求項19之方法,其進一步包含測定以下基因之表現 量:SPTANI、KIAAD179(Nnpl)(RRPl)、FAM84B (NSE2)、 SELM ' IL27RA、MRPS34、[6940246](IL 23A)、 PRKCA(PKCA)、CCDC41、CD52(CDW52)、[3890241] (ZN404)、MCCC1(MCCA/B)、SOX8、SYNJ 2、 FLJ21127、FHIT,該等基因在活動性TB患者之血液中不 足表現/不足表示,但在潛伏性TB患者或健康對照個體 之jk液中並非如此。 33·如請求項19之方法,其進一步包含測定以下基因之表現 量:CDKLl(p42)、MICALCL、MBNL3、RHD、ST7 (RAY1)、PPR3R1、[360739](PIP5K2A)、AMFR、FLJ 22471、CRAT(CATl)、PLA2G4C、ACOT7(ACT) (ACH1)、 RNF182、KLRC3(NKG2E)、HLA-DPB1,該等基因在健 康對照個體之血液中不足表現/不足表示,在潛伏性TB 患者之血液中過度表覌/過度表示,在活動性TB患者之 血液中過度表現/過度表示。 34. —種用於區分疑受結核分枝桿菌感染之患者的活動性與 潛伏性結核分枝桿菌感染之方法,該方法包含: 自全血樣品獲得基因表現資料集; 將該基因表現資料集分類為一或多個轉錄基因表現模 組;及 141281.doc 201022492 對該一或多個區分活動性與潛伏性結核分枝桿菌感染 之轉錄基因表現模組之差異表現繪製圖譜(mapping),藉 此區分活動性與潛伏性結核分枝桿菌感染。 35.如請求項34之方法,其中該資料集包含TRIM基因。 3 6.如請求項34之方法,其中該資料集包含TRIM基因, TRIM 5、6、19(PML)、21、22、25、68在活動性肺部 TB中過度表示/表現。 37.如請求項34之方法,其中該資料集包含TRIM基因, ❶ TRIM 28、32、5 1、52、68在活動性肺部TB中不足表示/ 表現。 3 8. —種在疑受結核分枝桿菌感染之患者中診斷患有活動性 及潛伏性結核分枝桿菌感染之患者的方法,該方法包含 偵測一或多個區分受感染患者與非感染患者全血所獲得 之轉錄基因表現模組之差異表現,其中全血展示與匹配 之非感染患者相比,該一或多個轉錄基因表現模組中聚 核苷酸量之聚合變化,藉此區分活動性與潛伏性結核分 枝桿菌感染。 39.如印求項38之方法,其進一步包含使用該測定之比較基 因產物資訊來制定診斷之步驟。 4〇·如叫求項38之方法,其進一步包含使用該測定之比較基 因產物資訊來制定預後之步驟。 .如-月求項38之方法’其進_步包含使用該測定之比較基 因產物資訊來制定治療計劃之步驟。 月求項38之方法,其中該模組包含模組Ml.2、Ml.3、 141281-doc 201022492 .4 Ml.5、M1·8、M2.1、M2.4、Μ2·8、M3.1、 .2 M3.3、M3.4、Μ3·ό、M3.7、M3.8 或 M3.9 中基因 之資料集以偵測活動性肺部感染。 43. 44. 45. 46. 47. 48. 49. 50. «•月求項38之方法,其中該模組包含模組Ml $、Μ2」、 M2· 1 〇、M3.2或M3.3中基因之資料集以偵測潛伏 性感染。 如明求項38之方法,其中以下基因在活動性肺部感染中 下調.CD3、CTLA-4、CD28、ZAP-70、IL-7R、CD2、 SLAM、CCR7及 GATA-3。 如β求項38之方法,其中圖9之模組的表現圖譜診斷活 動性肺部感染。 如吻求項38之方法,其中圖1〇之模組的表現圖譜診斷潛 伏性感染。 如清求項38之方法,其中模組M3.4、M3.6、M3.7、 Μ3.8及M3.9中基因之不足表現指示活動性感染。 如凊求項38之方法,其中模組M31中基因之過度表現指 示活動性感染。 如明求項38之方法,其進一步包含藉由測定在分枝桿菌 以外之感染中周邊血液單核細胞或全血過度表現之模組 Μ2·2、M2.3及M3.5中之基因表現來區分TB感染與其他 細菌感染之步驟。 如請求項38之方法,其進一步包含使用以下模組中之兩 者或兩者以上區分潛伏性及活動性TB患者之血液中之差 異且相反轉錄特徵的步驟:對於活動性肺部感染為 141281.doc 201022492 M1.3、M1.4、M1.5、M1.8、M2.1、M2.4、M2.8、 M3.1、M3.2、M3.3、M3.4、M3.6、M3.7、M3.8 或 Μ3.9 ’對於潛伏性感染為模組Μ1.5、Μ2.1、Μ2.6、 Μ2.10、Μ3.2或 Μ3.3。 5 1 · —種用於在疑受結核分枝桿菌感染之患者中診斷患有活 動性及潛伏性結核分枝桿菌感染之患者的套組,該套組 包含: 一種基因表現偵測器,其用於自該患者獲得基因表現 Φ 資料集;及 種處理器,其能夠比較該基因表現與區分受感染串、 者與非感染患者全血所獲得之預定基因模組資料集,其 中全血展示與匹配之非感染患者相比,該一或多個轉錄 基因表現模組中聚核苷酸量之聚合變化,藉此區分活動 性與潛伏性結核分枝桿菌感染。 52. —種診斷患有活動性及潛伏性結核分枝桿菌感染之患者 的系統,其包含:
    來自該患者之基因表現資料集;及 -種處理器,其能夠比較該基因表現與區分受感染患 者與非感染患者全血所獲得之預定基因模組資料集,其 中全血展示與匹配之非感染患者相比,該一或多個轉錄 基因表現模組中聚核苷酸量之聚合變化,藉此區分活動 性與潛伏性結核分枝㈣感染’其中該等模組係選自: 對於活動性肺部感染為Μ1.3、Μ1.4、Μ。、MU、 M3.2、M3.3、M3.4、 M2.1、M2.4、M2.8、M3.1 141281.doc 201022492 M3.6、M3.7、M3.8或M3.9,對於潛伏性感染為模組 M1.5、M2.1、Μ2·6、M2.10、M3.2或 M3.3。 141281.doc -10·
TW098121444A 2008-06-25 2009-06-25 Blood transcriptional signature of mycobacterium tuberculosis infection TW201022492A (en)

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US7572808P 2008-06-25 2008-06-25

Publications (1)

Publication Number Publication Date
TW201022492A true TW201022492A (en) 2010-06-16

Family

ID=41445303

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
TW098121444A TW201022492A (en) 2008-06-25 2009-06-25 Blood transcriptional signature of mycobacterium tuberculosis infection

Country Status (17)

Country Link
US (1) US20110196614A1 (zh)
EP (1) EP2300823A4 (zh)
JP (1) JP2011526152A (zh)
KR (1) KR20110036590A (zh)
CN (1) CN102150043A (zh)
AP (1) AP2011005546A0 (zh)
AU (1) AU2009262112A1 (zh)
CA (1) CA2729000A1 (zh)
EA (1) EA201170088A1 (zh)
IL (1) IL210121A0 (zh)
MX (1) MX2010014556A (zh)
NZ (1) NZ590341A (zh)
PE (1) PE20110386A1 (zh)
SG (1) SG182951A1 (zh)
TW (1) TW201022492A (zh)
WO (1) WO2009158521A2 (zh)
ZA (1) ZA201009307B (zh)

Families Citing this family (72)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US20110129817A1 (en) * 2009-11-30 2011-06-02 Baylor Research Institute Blood transcriptional signature of active versus latent mycobacterium tuberculosis infection
US8691510B2 (en) 2008-11-07 2014-04-08 Sequenta, Inc. Sequence analysis of complex amplicons
US9528160B2 (en) 2008-11-07 2016-12-27 Adaptive Biotechnolgies Corp. Rare clonotypes and uses thereof
US9506119B2 (en) 2008-11-07 2016-11-29 Adaptive Biotechnologies Corp. Method of sequence determination using sequence tags
US8628927B2 (en) 2008-11-07 2014-01-14 Sequenta, Inc. Monitoring health and disease status using clonotype profiles
US8748103B2 (en) 2008-11-07 2014-06-10 Sequenta, Inc. Monitoring health and disease status using clonotype profiles
US9365901B2 (en) 2008-11-07 2016-06-14 Adaptive Biotechnologies Corp. Monitoring immunoglobulin heavy chain evolution in B-cell acute lymphoblastic leukemia
GB2497007B (en) 2008-11-07 2013-08-07 Sequenta Inc Methods of monitoring disease conditions by analysis of the full repertoire of the V-D junction or D-J junction sequences of an individual
WO2010083456A1 (en) 2009-01-15 2010-07-22 Imdaptive Inc. Adaptive immunity profiling and methods for generation of monoclonal antibodies
SG176691A1 (en) 2009-06-25 2012-01-30 Hutchinson Fred Cancer Res Method of measuring adaptive immunity
US9043160B1 (en) 2009-11-09 2015-05-26 Sequenta, Inc. Method of determining clonotypes and clonotype profiles
US9709565B2 (en) 2010-04-21 2017-07-18 Memed Diagnostics Ltd. Signatures and determinants for distinguishing between a bacterial and viral infection and methods of use thereof
US10385475B2 (en) 2011-09-12 2019-08-20 Adaptive Biotechnologies Corp. Random array sequencing of low-complexity libraries
EP2768982A4 (en) 2011-10-21 2015-06-03 Adaptive Biotechnologies Corp QUANTIFICATION OF ADAPTIVE IMMUNOCELL GENOMES IN A COMPLEX MIX OF CELLS
AU2012347460B2 (en) 2011-12-09 2017-05-25 Adaptive Biotechnologies Corporation Diagnosis of lymphoid malignancies and minimal residual disease detection
US9499865B2 (en) 2011-12-13 2016-11-22 Adaptive Biotechnologies Corp. Detection and measurement of tissue-infiltrating lymphocytes
CN104272111B (zh) * 2012-01-27 2017-10-03 豌豆属植物研究所股份公司 检测结核的方法
KR102145677B1 (ko) * 2012-02-03 2020-08-18 캘리포니아 인스티튜트 오브 테크놀로지 다중화된 생화학적 분석에서의 시그널 인코딩 및 디코딩
WO2013117746A1 (en) 2012-02-09 2013-08-15 Memed Diagnostics Ltd. Signatures and determinants for diagnosing infections and methods of use thereof
JP6302847B2 (ja) 2012-03-05 2018-03-28 アダプティヴ バイオテクノロジーズ コーポレーション 頻度が一致したサブユニットからの、対をなす免疫受容体鎖の決定
WO2013138497A1 (en) * 2012-03-13 2013-09-19 Baylor Research Institute Early detection of tuberculosis treatment response
CA2867481A1 (en) 2012-04-13 2013-10-17 Somalogic, Inc. Tuberculosis biomarkers and uses thereof
KR101621643B1 (ko) 2012-05-08 2016-05-16 어댑티브 바이오테크놀로지스 코포레이션 다중 pcr 반응에서 증폭 바이어스를 측정 및 교정하기 위한 조성물 및 방법
GB201211158D0 (en) * 2012-06-22 2012-08-08 Univ Nottingham Trent Biomarkers and uses thereof
GB201213567D0 (en) * 2012-07-31 2012-09-12 Proteinlogic Ltd Biomarkers
JP6449160B2 (ja) 2012-10-01 2019-01-09 アダプティブ バイオテクノロジーズ コーポレイション 適応免疫受容体多様性およびクローン性特性決定による免疫能力評価関連出願の相互参照
EP2914740B1 (en) * 2012-10-30 2017-09-13 Imperial Innovations Ltd Method of detecting active tuberculosis in children in the presence of a co-morbidity
WO2014093872A1 (en) * 2012-12-13 2014-06-19 Baylor Research Institute Blood transcriptional signatures of active pulmonary tuberculosis and sarcoidosis
US20160017424A1 (en) * 2013-02-25 2016-01-21 The Research Foundation Of State University Of New York Collection of probes for autistic spectrum disorders and their use
WO2014133855A1 (en) 2013-02-28 2014-09-04 Caprion Proteomics Inc. Tuberculosis biomarkers and uses thereof
US9708657B2 (en) 2013-07-01 2017-07-18 Adaptive Biotechnologies Corp. Method for generating clonotype profiles using sequence tags
GB201315748D0 (en) 2013-09-04 2013-10-16 Imp Innovations Ltd Biological methods and materials for use therein
GB201401603D0 (en) 2014-01-30 2014-03-19 Proteinlogic Ltd Biomarkers
EP3114240B1 (en) 2014-03-05 2019-07-24 Adaptive Biotechnologies Corporation Methods using randomer-containing synthetic molecules
US10066265B2 (en) 2014-04-01 2018-09-04 Adaptive Biotechnologies Corp. Determining antigen-specific t-cells
RU2016144359A (ru) * 2014-04-15 2018-05-15 Стелленбос Юниверсити Способ диагностики туберкулезного менингита
ES2777529T3 (es) 2014-04-17 2020-08-05 Adaptive Biotechnologies Corp Cuantificación de genomas de células inmunitarias adaptativas en una mezcla compleja de células
GB201408100D0 (en) * 2014-05-07 2014-06-18 Sec Dep For Health The Detection method
CN111624346A (zh) 2014-08-14 2020-09-04 米密德诊断学有限公司 用于预测及/或决定预后的套组
CN107076745A (zh) * 2014-08-29 2017-08-18 贝克顿·迪金森公司 在受试者中获得结核病评价的方法和组合物
US20170234873A1 (en) 2014-10-14 2017-08-17 Memed Diagnostics Ltd. Signatures and determinants for diagnosing infections in non-human subjects and methods of use thereof
EP3715455A1 (en) 2014-10-29 2020-09-30 Adaptive Biotechnologies Corp. Highly-multiplexed simultaneous detection of nucleic acids encoding paired adaptive immune receptor heterodimers from many samples
US10246701B2 (en) 2014-11-14 2019-04-02 Adaptive Biotechnologies Corp. Multiplexed digital quantitation of rearranged lymphoid receptors in a complex mixture
CA2968543C (en) 2014-11-25 2024-04-02 Adaptive Biotechnologies Corporation Characterization of adaptive immune response to vaccination or infection using immune repertoire sequencing
CN104459129A (zh) * 2015-01-05 2015-03-25 复旦大学附属华山医院 一种鉴别活动性与潜伏性结核分枝杆菌感染的诊断试剂盒
ES2858306T3 (es) 2015-02-24 2021-09-30 Adaptive Biotechnologies Corp Método para determinar el estado de HLA mediante secuenciación del repertorio inmunitario
EP3277294B1 (en) 2015-04-01 2024-05-15 Adaptive Biotechnologies Corp. Method of identifying human compatible t cell receptors specific for an antigenic target
KR20170027258A (ko) 2015-09-01 2017-03-09 제이더블유바이오사이언스 주식회사 트립토파닐 티알엔에이 합성효소를 이용한 패혈증의 진단용 조성물과 진단 마커 검출 방법
WO2017066641A1 (en) * 2015-10-14 2017-04-20 The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University Methods for diagnosis of tuberculosis
CN108699583B (zh) 2016-03-03 2022-11-01 米密德诊断学有限公司 用于区分细菌和病毒感染的rna决定子
CN107312823A (zh) * 2016-04-26 2017-11-03 安徽祥升生物科技有限公司 一种tnfrsf12a基因的实时荧光pcr检测试剂盒
AU2017277666B2 (en) * 2016-06-08 2023-07-27 University Of Iowa Research Foundation Compositions and methods for detecting predisposition to cardiovascular disease
CN109804245B (zh) 2016-07-10 2022-10-25 米密德诊断学有限公司 感染的早期诊断
EP4141448A1 (en) 2016-07-10 2023-03-01 MeMed Diagnostics Ltd. Protein signatures for distinguishing between bacterial and viral infections
US10428325B1 (en) 2016-09-21 2019-10-01 Adaptive Biotechnologies Corporation Identification of antigen-specific B cell receptors
WO2018060998A1 (en) 2016-09-29 2018-04-05 Memed Diagnostics Ltd. Methods of prognosis and treatment
WO2018060999A1 (en) 2016-09-29 2018-04-05 Memed Diagnostics Ltd. Methods of risk assessment and disease classification
JP6306124B2 (ja) * 2016-11-01 2018-04-04 国立大学法人高知大学 結核検査用バイオマーカー
US10209260B2 (en) 2017-07-05 2019-02-19 Memed Diagnostics Ltd. Signatures and determinants for diagnosing infections and methods of use thereof
CN107267659B (zh) * 2017-08-21 2020-10-16 首都医科大学附属北京胸科医院 检测trim基因和/或蛋白水平的产品的用途
CN107653313B (zh) * 2017-09-12 2021-07-09 首都医科大学附属北京胸科医院 Retn和klk1在作为结核病检测标志物中的应用
CN107523626B (zh) * 2017-09-21 2021-04-13 顾万君 一组用于活动性肺结核无创诊断的外周血基因标记物
CN109609614B (zh) * 2017-09-30 2022-07-15 首都医科大学附属北京胸科医院 检测trim2、trim4、trim32和/或trim46基因或蛋白产品的用途
CN107653315B (zh) * 2017-10-16 2020-06-05 苏州大学附属第一医院 lncRNAs作为活动性肺结核病特异性标志物的应用
US11254980B1 (en) 2017-11-29 2022-02-22 Adaptive Biotechnologies Corporation Methods of profiling targeted polynucleotides while mitigating sequencing depth requirements
CN108387745B (zh) * 2018-03-02 2020-12-15 首都医科大学附属北京胸科医院 Cd4+t淋巴细胞特征蛋白在鉴定潜伏结核感染和活动性肺结核中的应用
CN108828235A (zh) * 2018-08-23 2018-11-16 中国人民解放军第三〇九医院 Pglyrp1蛋白作为标志物在诊断活动性结核病中的应用
CN109061191B (zh) * 2018-08-23 2021-08-24 中国人民解放军第三〇九医院 S100p蛋白作为标志物在诊断活动性结核病中的应用
CN111172269B (zh) * 2019-12-13 2022-12-16 南方医科大学 一种检测calm2基因表达水平的试剂的应用
CN112725434B (zh) * 2021-01-20 2022-05-03 首都医科大学附属北京胸科医院 一种利福平耐药结核病分子标志物、检测试剂及其应用
WO2022238515A1 (en) * 2021-05-11 2022-11-17 University College Dublin, Rna markers for tuberculosis and methods of detecting thereof
CN113817776A (zh) * 2021-10-25 2021-12-21 中国人民解放军军事科学院军事医学研究院 Gbp2在调控间充质干细胞成骨分化中的用途

Family Cites Families (10)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US6627198B2 (en) * 1997-03-13 2003-09-30 Corixa Corporation Fusion proteins of Mycobacterium tuberculosis antigens and their uses
US20020086289A1 (en) * 1999-06-15 2002-07-04 Don Straus Genomic profiling: a rapid method for testing a complex biological sample for the presence of many types of organisms
US6713257B2 (en) * 2000-08-25 2004-03-30 Rosetta Inpharmatics Llc Gene discovery using microarrays
AU2002314358C1 (en) * 2001-07-04 2009-03-26 The Secretary Of State For Health Mycobacterial antigens expressed during latency
KR20030028059A (ko) * 2001-09-27 2003-04-08 (주)시로텍코리아 항-결핵균 항체를 포함하는 결핵균 항원 진단키트
AU2003241055A1 (en) * 2002-06-20 2004-01-06 Glaxo Group Limited Surrogate markers for the determination of the disease status of an individual infected by mycobacterium tuberculosis
US20040157220A1 (en) * 2003-02-10 2004-08-12 Purnima Kurnool Methods and apparatus for sample tracking
US20070231816A1 (en) * 2005-12-09 2007-10-04 Baylor Research Institute Module-Level Analysis of Peripheral Blood Leukocyte Transcriptional Profiles
PT2128612E (pt) * 2006-09-05 2011-07-06 Hvidovre Hospital Monitorização imunológica baseada em ip-10
CN101196526A (zh) * 2006-12-06 2008-06-11 许洋 一种结核快速诊断的质谱分析试剂盒和方法

Also Published As

Publication number Publication date
SG182951A1 (en) 2012-08-30
US20110196614A1 (en) 2011-08-11
EP2300823A2 (en) 2011-03-30
AP2011005546A0 (en) 2011-02-28
NZ590341A (en) 2012-07-27
CN102150043A (zh) 2011-08-10
EA201170088A1 (ru) 2011-10-31
PE20110386A1 (es) 2011-07-03
EP2300823A4 (en) 2012-03-14
CA2729000A1 (en) 2009-12-30
MX2010014556A (es) 2011-07-28
JP2011526152A (ja) 2011-10-06
WO2009158521A3 (en) 2010-05-14
WO2009158521A2 (en) 2009-12-30
IL210121A0 (en) 2011-02-28
ZA201009307B (en) 2012-10-31
KR20110036590A (ko) 2011-04-07
AU2009262112A1 (en) 2009-12-30

Similar Documents

Publication Publication Date Title
TW201022492A (en) Blood transcriptional signature of mycobacterium tuberculosis infection
US11913075B2 (en) Methods and compositions for detecting and modulating an immunotherapy resistance gene signature in cancer
US20230381231A1 (en) Compositions for cancer treatment and methods and uses for cancer treatment and prognosis
US20200347456A1 (en) Methods and compositions for detecting and modulating an immunotherapy resistance gene signature in cancer
Hu et al. SARS-CoV regulates immune function-related gene expression in human monocytic cells
US6905827B2 (en) Methods and compositions for diagnosing or monitoring auto immune and chronic inflammatory diseases
Gao et al. Transcriptome analysis of porcine PBMCs after in vitro stimulation by LPS or PMA/ionomycin using an expression array targeting the pig immune response
AU2010325179B2 (en) Blood transcriptional signature of active versus latent Mycobacterium tuberculosis infection
US20150315643A1 (en) Blood transcriptional signatures of active pulmonary tuberculosis and sarcoidosis
US20170349950A1 (en) T cell balance gene expression, compositions of matters and methods of use thereof
Lawlor et al. Single cell analysis of blood mononuclear cells stimulated through either LPS or anti-CD3 and anti-CD28
US11630103B2 (en) Product and methods useful for modulating and evaluating immune responses
Ibrahim et al. Inflammatory gene networks in term human decidual cells define a potential signature for cytokine-mediated parturition
Jiang et al. Transcriptome analysis provides insights into molecular immune mechanisms of rabbitfish, Siganus oramin against Cryptocaryon irritans infection
US11249081B2 (en) Methods for the identification, targeting and isolation of human dendritic cell (DC) precursors “pre-DC” and their uses thereof
US20220154282A1 (en) Detection means, compositions and methods for modulating synovial sarcoma cells
Lu et al. The identification of candidate biomarkers and pathways in atherosclerosis by integrated bioinformatics analysis
Ou et al. Transcription profiles of the responses of chicken bursae of Fabricius to IBDV in different timing phases
JP2021126107A (ja) 膵癌・胆道系癌の化学療法剤の奏効性予測マーカー、及びそれに対応する奏効性予測キット
Lim et al. Gene expression responses to Zika virus infection in peripheral blood mononuclear cells from pregnant and non‐pregnant women
US11815509B2 (en) Cell line and uses thereof
Pushparaj Translational interest of immune profiling
US20090191540A1 (en) Markers for Viral Infections and Other Inflammatory Responses
US20240132976A1 (en) Methods of stratifying and treating coronavirus infection
US20240132964A1 (en) Methods of predicting multisystem inflammatory syndrome (mis-c) with severe myocarditis in subjects suffering from a sars-cov2 infection or disease severity following sars-cov-2 infection or myocarditis post-vaccination against sars-cov-2