RU2423528C2 - Новые растения кукурузы - Google Patents

Новые растения кукурузы Download PDF

Info

Publication number
RU2423528C2
RU2423528C2 RU2009131322/10A RU2009131322A RU2423528C2 RU 2423528 C2 RU2423528 C2 RU 2423528C2 RU 2009131322/10 A RU2009131322/10 A RU 2009131322/10A RU 2009131322 A RU2009131322 A RU 2009131322A RU 2423528 C2 RU2423528 C2 RU 2423528C2
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
marker
linked
identifying
seq
pair
Prior art date
Application number
RU2009131322/10A
Other languages
English (en)
Other versions
RU2009131322A (ru
Inventor
Мишель РАГО (FR)
Мишель РАГО
Дени ЛЕСПИНАСС (FR)
Дени ЛЕСПИНАСС
Жан-Поль МЮЛЛЕР (FR)
Жан-Поль МЮЛЛЕР
Паскаль ДЕЛАЖ (FR)
Паскаль ДЕЛАЖ
Original Assignee
Зингента Партисипейшнс Аг
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Зингента Партисипейшнс Аг filed Critical Зингента Партисипейшнс Аг
Publication of RU2009131322A publication Critical patent/RU2009131322A/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2423528C2 publication Critical patent/RU2423528C2/ru

Links

Images

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
    • C12Q1/6888—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms
    • C12Q1/6895—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms for plants, fungi or algae
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A01—AGRICULTURE; FORESTRY; ANIMAL HUSBANDRY; HUNTING; TRAPPING; FISHING
    • A01H—NEW PLANTS OR NON-TRANSGENIC PROCESSES FOR OBTAINING THEM; PLANT REPRODUCTION BY TISSUE CULTURE TECHNIQUES
    • A01H5/00—Angiosperms, i.e. flowering plants, characterised by their plant parts; Angiosperms characterised otherwise than by their botanic taxonomy
    • A01H5/10—Seeds
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A01—AGRICULTURE; FORESTRY; ANIMAL HUSBANDRY; HUNTING; TRAPPING; FISHING
    • A01H—NEW PLANTS OR NON-TRANSGENIC PROCESSES FOR OBTAINING THEM; PLANT REPRODUCTION BY TISSUE CULTURE TECHNIQUES
    • A01H6/00—Angiosperms, i.e. flowering plants, characterised by their botanic taxonomy
    • A01H6/46—Gramineae or Poaceae, e.g. ryegrass, rice, wheat or maize
    • A01H6/4684—Zea mays [maize]
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/13—Plant traits
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/156—Polymorphic or mutational markers
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/16—Primer sets for multiplex assays

Landscapes

  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Botany (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Environmental Sciences (AREA)
  • Developmental Biology & Embryology (AREA)
  • Physiology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Mycology (AREA)
  • Natural Medicines & Medicinal Plants (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
  • Breeding Of Plants And Reproduction By Means Of Culturing (AREA)

Abstract

При селекции по маркерам в идиоплазму кукурузы вводят набор аллелей, связанных с локусами количественных признаков (QTL), вносящими вклад в экспрессию ряда фенотипических признаков, представляющих экономический интерес. Признаки выбирают из урожайности по зерну, влажности зерна при сборе, раннего и позднего прикорневого полегания, стеблевого полегания, частоты головни обыкновенной, частоты вызванного Fusarium загнивания початков (фузариоза початков), устойчивости к Sulcotrione и строения метелки. Изобретение также касается способа получения таких растений, а также способов анализа и скрининга для идентификации растений с требуемым профилем аллелей. 8 н. и 25 з.п. ф-лы, 1 ил., 19 табл.

Description

Текст описания приведен в факсимильном виде.
Figure 00000001
Figure 00000002
Figure 00000003
Figure 00000004
Figure 00000005
Figure 00000006
Figure 00000007
Figure 00000008
Figure 00000009
Figure 00000010
Figure 00000011
Figure 00000012
Figure 00000013
Figure 00000014
Figure 00000015
Figure 00000016
Figure 00000017
Figure 00000018
Figure 00000019
Figure 00000020
Figure 00000021
Figure 00000022
Figure 00000023
Figure 00000024
Figure 00000025
Figure 00000026
Figure 00000027
Figure 00000028
Figure 00000029
Figure 00000030
Figure 00000031
Figure 00000032
Figure 00000033
Figure 00000034
Figure 00000035
Figure 00000036
Figure 00000037
Figure 00000038
Figure 00000039
Figure 00000040
Figure 00000041
Figure 00000042
Figure 00000043
Figure 00000044
Figure 00000045
Figure 00000046
Figure 00000047
Figure 00000048
Figure 00000049
Figure 00000050
Figure 00000051
Figure 00000052
Figure 00000053
Figure 00000054
Figure 00000055
Figure 00000056
Figure 00000057
Figure 00000058
Figure 00000059
Figure 00000060
Figure 00000061
Figure 00000062
Figure 00000063
Figure 00000064
Figure 00000065
Figure 00000066
Figure 00000067
Figure 00000068
Figure 00000069
Figure 00000070
Figure 00000071
Figure 00000072
Figure 00000073
Figure 00000074
Figure 00000075
Figure 00000076
Figure 00000077
Figure 00000078
Figure 00000079
Figure 00000080
Figure 00000081
Figure 00000082
Figure 00000083
Figure 00000084
Figure 00000085
Figure 00000086
Figure 00000087
Figure 00000088
Figure 00000089
Figure 00000090
Figure 00000091
Figure 00000092
Figure 00000093
Figure 00000094
Figure 00000095
Figure 00000096
Figure 00000097
Figure 00000098
Figure 00000099
Figure 00000100
Figure 00000101
Figure 00000102
Figure 00000103
Figure 00000104
Figure 00000105
Figure 00000106
Figure 00000107
Figure 00000108
Figure 00000109
Figure 00000110
Figure 00000111
Figure 00000112
Figure 00000113
Figure 00000114
Figure 00000115
Figure 00000116
Figure 00000117
Figure 00000118
Figure 00000119
Figure 00000120
Figure 00000121
Figure 00000122
Figure 00000123
Figure 00000124
Figure 00000125
Figure 00000126
Figure 00000127
Figure 00000128
Figure 00000129

Claims (33)

1. Растение кукурузы, содержащее ядерный геном, включающий набор благоприятных аллелей по соответствующему набору из по меньшей мере 14 локусов QTL, каждый из которых вносит вклад в фенотипический признак урожайности по зерну, причем:
а) каждый локус QTL генетически сцеплен по меньшей мере с одним маркерным локусом, выбранным из группы локусов, характеризующихся по меньшей мере одной парой сцепленных маркеров, каждый из которых можно идентифицировать при помощи пары олигонуклеотидных праймеров для ПЦР, состоящей из прямого праймера и обратного праймера, имеющих нуклеотидные последовательности, приведенные в:
SEQ ID NO: 59/60 и 77/78, соответственно, идентифицирующих пару маркеров, сцепленных с QTL1;
SEQ ID NO: 77/78 и 27/28, соответственно, идентифицирующих пару маркеров, сцепленных с QTL2;
SEQ ID NO: 47/48 и 75/76, соответственно, идентифицирующих пару маркеров, сцепленных с QTL3;
SEQ ID NO: 65/66 и 9/10, соответственно, идентифицирующих пару маркеров, сцепленных с QTL4;
SEQ ID NO: 69/70 и 13/14, соответственно, идентифицирующих пару маркеров, сцепленных с QTL5;
SEQ ID NO: 73/74 и 25/26, соответственно, идентифицирующих пару маркеров, сцепленных с QTL6;
SEQ ID NO: 35/36 и 63/64, соответственно, идентифицирующих пару маркеров, сцепленных с QTL7;
SEQ ID NO: 35/36 и 63/64, соответственно, идентифицирующих пару маркеров, сцепленных с QTL8;
SEQ ID NO: 35/36 и 63/64, соответственно, идентифицирующих пару маркеров, сцепленных с QTL9;
SEQ ID NO: 41/42 и 49/50, соответственно, идентифицирующих пару маркеров, сцепленных с QTL10;
SEQ ID NO: 49/50 и 61/62, соответственно, идентифицирующих пару маркеров, сцепленных с QTL11;
SEQ ID NO: 17/18 и 51/52, соответственно, идентифицирующих пару маркеров, сцепленных с QTL12;
SEQ ID NO: 51/52 и 19/20, соответственно, идентифицирующих пару маркеров, сцепленных с QTL13; и
SEQ ID NO: 29 и 30, идентифицирующих маркер, сцепленный с QTL14; и
b) каждая аллель в соответствующем локусе QTL определяется по продукту ПЦР-амплификации, который, по существу, идентичен соответствующему продукту амплификации благоприятной аллели, указанной в табл.А, который может быть получен из инбредных линий М3047/1 (NCIMB 41459) и М3047/2 (NCIMB 41460) при реакции ПЦР с помощью пары праймеров, идентифицированных в пункте а).
2. Растение кукурузы по п.1, содержащее полный набор благоприятных аллелей по соответствующим 14 локусам QTL.
3. Растение кукурузы по п.1, у которого:
локусы QTL 1-4 локализуются на хромосоме 1,
локусы QTL 5 и 6 локализуются на хромосоме 2,
локусы QTL 7-9 локализуются на хромосоме 4,
локусы QTL 10-13 локализуются на хромосоме 5,
локус QTL 14 локализуется на хромосоме 7.
4. Растение кукурузы по любому из пп.1-3, дополнительно включающее 11 QTL, которые вносят вклад во влажность зерна, которые картируются в локусах на хромосомах 1, 2, 3, 4, 5, 7 и 8, причем каждая аллель в соответствующем QTL определяется по меньшей мере по одной маркерной аллели в указанном, по меньшей мере, одном маркерном локусе, сцепленном с QTL, причем маркерная аллель характеризуется продуктом ПЦР-амплификации с соответствующей парой олигонуклеотидных праймеров, приведенной в таблице В, причем продукт амплификации, по существу, идентичен соответствующему продукту амплификации благоприятной аллели, указанной в таблицах A-G, который может быть получен из инбредных линий М3047/1 (NCIMB 41459) и М3047/2 (NCIMB 41460) при реакции ПЦР с помощью идентичной пары праймеров.
5. Растение кукурузы по п.4, у которого для QTL, вносящих вклад во влажность зерна:
а) каждый локус QTL генетически сцеплен по меньшей мере с одним маркерным локусом, который характеризуется по меньшей мере одной парой сцепленных маркеров, каждый из которых можно идентифицировать при помощи пары олигонуклеотидных праймеров для ПЦР, состоящей из прямого праймера и обратного праймера, имеющих нуклеотидные последовательности, приведенные в:
SEQ ID NO: 23/24 и 3/4, соответственно, идентифицирующих пару маркеров, сцепленных с QTL1;
SEQ ID NO: 65/66 и 9/10, соответственно, идентифицирующих пару маркеров, сцепленных с QTL2;
SEQ ID NO: 69/70 и 13/14, соответственно, идентифицирующих пару маркеров, сцепленных с QTL3;
SEQ ID NO: 71/72 и 53/54, соответственно, идентифицирующих пару маркеров, сцепленных с QTL4;
SEQ ID NO: 53/54 и 57/58, соответственно, идентифицирующих пару маркеров, сцепленных с QTL5;
SEQ ID NO: 43/44, идентифицирующих маркер, сцепленный с QTL6;
SEQ ID NO: 5/6 и 37/38, соответственно, идентифицирующих пару маркеров, сцепленных с QTL7;
SEQ ID NO: 21/22 и 33/34, соответственно, идентифицирующих пару маркеров, сцепленных с QTL8;
SEQ ID NO: 31/32 и 39/40, соответственно, идентифицирующих пару маркеров, сцепленных с QTL9;
SEQ ID NO: 29/30, идентифицирующих маркер, сцепленный с QTL10;
SEQ ID NO: 67/68, идентифицирующих маркер, сцепленный с QTL11; и
b) каждая аллель в соответствующем локусе QTL определяется по продукту ПЦР-амплификации, который, по существу, идентичен соответствующему продукту амплификации благоприятной аллели, указанной в табл.В, который может быть получен из инбредных линий М3047/1 (NCIMB 41459) и М3047/2 (NCIMB 41460) при реакции ПЦР с помощью пары праймеров, идентифицированных в пункте а).
6. Растение кукурузы по п.5, у которого:
локусы QTL 1 и 2 локализуются на хромосоме 1,
локусы QTL 3-5 локализуются на хромосоме 2,
локус QTL 6 локализуется на хромосоме 3,
локус QTL 7 локализуется на хромосоме 4,
локус QTL 8 локализуется на хромосоме 5,
локусы QTL 9 и 10 локализуются на хромосоме 7, и
локус QTL 11 локализуется на хромосоме 8.
7. Растение кукурузы по п.6, содержащее полный набор благоприятных аллелей по соответствующему набору из 11 локусов QTL, вносящих вклад в фенотипический признак влажности зерна при сборе.
8. Растение кукурузы по любому из пп.1-3, содержащее по меньшей мере один дополнительный набор благоприятных аллелей по соответствующим локусам QTL, вносящим вклад в прикорневое и стеблевое полегание, причем эти QTL генетически сцеплены по меньшей мере с одним дополнительным маркерным локусом, выбранным из группы маркерных локусов, характеризующихся по меньшей мере одной парой сцепленных маркеров, каждый из которых можно идентифицировать при помощи пары олигонуклеотидных праймеров для ПЦР, состоящей из прямого праймера и обратного праймера, имеющих нуклеотидные последовательности, приведенные в:
SEQ ID NO: 3/4 и 59/60, соответственно, идентифицирующих пару маркеров, сцепленных с QTL1;
SEQ ID NO: 27/28 и 47/48, соответственно, идентифицирующих пару маркеров, сцепленных с QTL2;
SEQ ID NO: 45/46, идентифицирующих маркер, сцепленный с QTL3.
9. Растение кукурузы по п.8, у которого локусы QTL 1, 2 и 3 локализуются на хромосоме 1.
10. Растение кукурузы по любому из пп.1-3, содержащее по меньшей мере один дополнительный благоприятный аллель по соответствующему локусу QTL, вносящему вклад в частоту головни обыкновенной, причем QTL генетически сцеплен по меньшей мере с одним дополнительным маркерным локусом, характеризующимся по меньшей мере одной парой сцепленных маркеров, каждый из которых можно идентифицировать при помощи пары олигонуклеотидных праймеров для ПЦР, состоящей из прямого праймера и обратного праймера, имеющих нуклеотидные последовательности, приведенные в SEQ ID NO: 11/12, идентифицирующих маркер, сцепленный с QTL1.
11. Растение кукурузы по п.10, у которого локус QTL1 локализуется на хромосоме 3.
12. Растение кукурузы по любому из пп.1-3, содержащее по меньшей мере один дополнительный набор благоприятных аллелей по соответствующим локусам QTL, вносящим вклад в строение метелки, причем эти QTL генетически сцеплены по меньшей мере с одним дополнительным маркерным локусом, выбранным из группы маркерных локусов, характеризующихся по меньшей мере одной парой сцепленных маркеров, каждый из которых можно идентифицировать при помощи пары олигонуклеотидных праймеров для ПЦР, состоящей из прямого праймера и обратного праймера, имеющих нуклеотидные последовательности, приведенные в:
SEQ ID NO: 11/12, идентифицирующих маркер, сцепленный с QTL1;
SEQ ID NO: 55/56, идентифицирующих маркер, сцепленный с QTL2;
SEQ ID NO: 31/32 и 39/40, соответственно, идентифицирующих пару маркеров, сцепленных с QTL3;
SEQ ID NO: 81/82 и 7/8, соответственно, идентифицирующих пару маркеров, сцепленных с QTL4.
13. Растение кукурузы по п.12, у которого:
локус QTL1 локализуется на хромосоме 3,
локус QTL2 локализуется на хромосоме 6,
локус QTL3 локализуется на хромосоме 7, а
локус QTL4 локализуется на хромосоме 9.
14. Растение кукурузы по любому из пп.1-3, содержащее по меньшей мере один дополнительный набор благоприятных аллелей по соответствующим локусам QTL, вносящим вклад в устойчивость к Sulcotrione, причем эти QTL генетически сцеплены по меньшей мере с одним дополнительным маркерным локусом, выбранным из группы маркерных локусов, характеризующихся по меньшей мере одной парой сцепленных маркеров, каждый из которых можно идентифицировать при помощи пары олигонуклеотидных праймеров для ПЦР, состоящей из прямого праймера и обратного праймера, имеющих нуклеотидные последовательности, приведенные в:
SEQ ID NO: 43/44, идентифицирующих маркер, сцепленный с QTL1;
SEQ ID NO: 81/82 и 7/8, соответственно, идентифицирующих пару маркеров, сцепленных с QTL2.
15. Растение кукурузы по п.14, у которого:
локус QTL1 локализуется на хромосоме 3, а
локус QTL2 локализуется на хромосоме 9.
16. Растение кукурузы по любому из пп.1-3, содержащее по меньшей мере один дополнительный набор благоприятных аллелей по соответствующим локусам QTL, вносящим вклад в устойчивость к фузариозу початков, причем эти QTL генетически сцеплены по меньшей мере с одним дополнительным маркерным локусом, выбранным из группы маркерных локусов, характеризующихся по меньшей мере одной парой сцепленных маркеров, каждый из которых можно идентифицировать при помощи пары олигонуклеотидных праймеров для ПЦР, состоящей из прямого праймера и обратного праймера, имеющих нуклеотидные последовательности, приведенные в:
SEQ ID NO: 1/2 и 79/80, соответственно, идентифицирующих пару маркеров, сцепленных с QTL1;
SEQ ID NO: 79/80 и 15/16, соответственно, идентифицирующих пару маркеров, сцепленных с QTL2.
17. Растение кукурузы по п.16, у которого локусы QTL 1 и 2 локализуются на хромосоме 5.
18. Растение кукурузы по любому из пп.1-3, которое всегда содержит наиболее благоприятную аллель в маркерных локусах, сцепленных с QTL, и/или проявляют показатель LOT, приведенный в табл.A-G.
19. Растение кукурузы по п.18, которое содержит по меньшей мере одну копию наиболее благоприятной аллели в каждом локусе.
20. Растение кукурузы по п.1, которое является инбредным растением.
21. Растение кукурузы по п.1, которое является гибридом, в особенности F1-гибридом от однократного скрещивания.
22. Растение кукурузы по п.1, у которого по меньшей мере часть указанных локусов QTL получена из инбредных линий кукурузы М3047/2 и М3047/1, соответственно, депонированных в NCIMB под номерами доступа NCIMB 41460 и NCIMB 41459.
23. Растительный материал, в том числе части растений, семена растений и продукты переработки кукурузы, в частности зерна и зернышки кукурузы, получаемые из растений по любому из пп.1-22.
24. Продукты переработки кукурузы, в частности зерна и зернышки кукурузы, получаемые из растения по любому из пп.1-22.
25. Набор маркеров, включающий пары олигонуклеотидных праймеров для ПЦР, состоящие из прямого праймера и обратного праймера, способные идентифицировать маркер, сцепленный с локусом QTL, вносящим вклад в урожайность по зерну, причем эти праймеры имеют нуклеотидные последовательности, приведенные в:
SEQ ID NO: 59/60 и 77/78, соответственно, идентифицирующих пару маркеров, сцепленных с QTL1;
SEQ ID NO: 77/78 и 27/28, соответственно, идентифицирующих пару маркеров, сцепленных с QTL2;
SEQ ID NO: 47/48 и 75/76, соответственно, идентифицирующих пару маркеров, сцепленных с QTL3;
SEQ ID NO: 65/66 и 9/10, соответственно, идентифицирующих пару маркеров, сцепленных с QTL4;
SEQ ID NO: 69/70 и 13/14, соответственно, идентифицирующих пару маркеров, сцепленных с QTL5;
SEQ ID NO: 73/74 и 25/26, соответственно, идентифицирующих пару маркеров, сцепленных с QTL6;
SEQ ID NO: 35/36 и 63/64, соответственно, идентифицирующих пару маркеров, сцепленных с QTL7;
SEQ ID NO: 35/36 и 63/64, соответственно, идентифицирующих пару маркеров, сцепленных с QTL8;
SEQ ID NO: 35/36 и 63/64, соответственно, идентифицирующих пару маркеров, сцепленных с QTL9;
SEQ ID NO: 41/42 и 49/50, соответственно, идентифицирующих пару маркеров, сцепленных с QTL10;
SEQ ID NO: 49/50 и 61/62, соответственно, идентифицирующих пару маркеров, сцепленных с QTL11;
SEQ ID NO: 17/18 и 51/52, соответственно, идентифицирующих пару маркеров, сцепленных с QTL12;
SEQ ID NO: 51/52 и 19/20, соответственно, идентифицирующих пару маркеров, сцепленных с QTL13;
SEQ ID NO: 29 и 30, идентифицирующих маркер, сцепленный с QTL14;
причем эти праймеры при реакции ПЦР дают продукт амплификации, проявляющий такой молекулярный вес или нуклеотидную последовательность, которые, по существу, идентичны таковым у соответствующего продукта ПЦР-амплификации, который может быть получен из инбредных линий М3047/1 (NCIMB 41459) и М3047/2 (NCIMB 41460) при реакции ПЦР с помощью идентичной пары праймеров.
26. Набор маркеров по п.25, дополнительно включающий пару олигонуклеотидных праймеров для ПЦР, состоящую из прямого праймера и обратного праймера, способных идентифицировать маркер, сцепленный с локусом QTL, вносящим вклад во влажность зерна при сборе, причем эти праймеры имеют нуклеотидные последовательности, приведенные в:
SEQ ID NO: 23/24 и 3/4, соответственно, идентифицирующих пару маркеров, сцепленных с QTL1;
SEQ ID NO: 65/66 и 9/10, соответственно, идентифицирующих пару маркеров, сцепленных с QTL2;
SEQ ID NO: 69/70 и 13/14, соответственно, идентифицирующих пару маркеров, сцепленных с QTL3;
SEQ ID NO: 71/72 и 53/54, соответственно, идентифицирующих пару маркеров, сцепленных с QTL4;
SEQ ID NO: 53/54 и 57/58, соответственно, идентифицирующих пару маркеров, сцепленных с QTL5;
SEQ ID NO: 43/44, идентифицирующих маркер, сцепленный с QTL6;
SEQ ID NO: 5/6 и 37/38, соответственно, идентифицирующих пару маркеров, сцепленных с QTL7;
SEQ ID NO: 21/22 и 33/34, соответственно, идентифицирующих пару маркеров, сцепленных с QTL8;
SEQ ID NO: 31/32 и 39/40, соответственно, идентифицирующих пару маркеров, сцепленных с QTL9;
SEQ ID NO: 29/30, идентифицирующих маркер, сцепленный с QTL10;
SEQ ID NO: 67/68, идентифицирующих маркер, сцепленный с QTL11;
причем эти праймеры при реакции ПЦР дают продукт амплификации, имеющий такой молекулярный вес или нуклеотидную последовательность, которые, по существу, идентичны таковым у соответствующего продукта ПЦР-амплификации, который может быть получен из инбредных линий М3047/1 (NCIMB 41459) и М3047/2 (NCIMB 41460) при реакции ПЦР с помощью идентичной пары праймеров.
27. Способ идентификации растения кукурузы, содержащего множество наиболее благоприятных аллелей в маркерных локусах, сцепленных с соответствующими локусами QTL, который включает следующие стадии:
i) получения растительного материала из исследуемых растений или популяции растений и экстрагирования ДНК из данного материала;
ii) анализа образца ДНК, полученного на стадии i), чтобы определить имеющиеся аллельные варианты по маркерным локусам, генетически сцепленным с соответствующим QTL, вносящим вклад в фенотипический признак, выбранный из группы урожайности по зерну и влажности зерна при сборе, путем:
а) применения набора маркеров по п.25 или 26 при реакции ПЦР-амплификации;
b) идентификации маркерных аллелей путем определения молекулярных весов и/или нуклеотидных последовательностей продуктов ПЦР-амплификации, полученных на стадии а);
c) сравнения определенных на стадии b) молекулярных весов и/или нуклеотидных последовательностей продуктов ПЦР-амплификации с молекулярными весами и/или нуклеотидными последовательностями соответствующих продуктов ПЦР-амплификации, полученных из инбредных линий М3047/1 (NCIMB 41459) и М3047/2 (NCIMB 41460) при реакции ПЦР с помощью идентичного набора пар праймеров, применявшихся на стадии а), и идентификации продуктов ПЦР с, по существу, идентичными молекулярными весами и/или нуклеотидными последовательностями;
iii) идентификации и отбора растения или растений с требуемым профилем по данным анализа маркеров, в частности растения или растений, содержащих множество наиболее благоприятных аллелей в маркерных локусах, сцепленных с соответствующими локусами QTL.
28. Способ получения растения, который включает стадии:
a) скрещивания двух или более родительских растений, из которых по меньшей мере одно представляет собой растение по любому из пп.1-22 или растение, идентифицированное способом по п.27;
b) скрининга потомства от скрещивания, произведенного на стадии а), на наличие растения, содержащего в своем геноме весь набор наиболее благоприятных аллелей по соответствующему набору локусов QTL по меньшей мере от одного из родительских растений, путем:
i. получения растительного материала из растения-потомка и экстрагирования ДНК из данного материала;
ii. анализа образца ДНК, полученного на стадии i), чтобы определить имеющиеся аллельные варианты по маркерным локусам, генетически сцепленным с соответствующими локусами QTL, при помощи набора маркеров по п.25 или 26 при реакции ПЦР-амплификации;
iii. идентификации маркерных аллелей путем определения молекулярных весов и/или нуклеотидных последовательностей продуктов ПЦР-амплификации, полученных на стадии ii);
c) сравнения определенных на стадии iii) молекулярных весов и/или нуклеотидных последовательностей продуктов ПЦР-амплификации с молекулярными весами и/или нуклеотидными последовательностями соответствующих продуктов ПЦР-амплификации, полученных из инбредных линий М3047/1 (NCIMB 41459) и М3047/2 (NCIMB 41460) при реакции ПЦР с помощью идентичного набора пар праймеров, применявшихся на стадии ii), и идентификации продуктов ПЦР с, по существу, идентичными молекулярными весами и/или нуклеотидными последовательностями;
d) идентификации и отбора растения или растений с требуемым профилем по данным анализа маркеров.
29. Способ по п.28, в котором на стадии а) одно из родительских растений имеет генетический фон, представленный инбредной линией кукурузы М3047/1 (NCIMB 41459) или М3047/2 (NCIMB 41460).
30. Способ по п.28 или 29, в котором оба родительских растения, используемые при скрещивании на стадии а), являются инбредными.
31. Способ по п.30, в котором скрещивание на стадии а) производится между двумя родительскими растениями, имеющими генетический фон, представленный инбредными линиями кукурузы М3047/1 (NCIMB 41459) и М3047/2 (NCIMB 41460).
32. Гибрид, полученный способом по любому из пп.28-31.
33. Способ применения набора маркеров-нуклеиновых кислот по п.25 или 26 при селекции по маркерам для внедрения набора аллелей, связанных с соответствующим набором локусов QTL, в идиоплазму кукурузы, не содержащую данного набора аллелей, причем данные аллели вносят вклад в фенотипический признак урожайности по зерну сам по себе или в комбинации с влажностью зерна при сборе.
RU2009131322/10A 2007-01-18 2008-01-18 Новые растения кукурузы RU2423528C2 (ru)

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
EP07290066.5 2007-01-18
EP07290066A EP1947198A1 (en) 2007-01-18 2007-01-18 Maize plants characterised by quantitative trait loci (QTL)

Publications (2)

Publication Number Publication Date
RU2009131322A RU2009131322A (ru) 2011-02-27
RU2423528C2 true RU2423528C2 (ru) 2011-07-10

Family

ID=38115496

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2009131322/10A RU2423528C2 (ru) 2007-01-18 2008-01-18 Новые растения кукурузы

Country Status (7)

Country Link
US (3) US20100138950A1 (ru)
EP (2) EP1947198A1 (ru)
JP (1) JP2010516236A (ru)
CA (1) CA2674804A1 (ru)
RU (1) RU2423528C2 (ru)
UA (2) UA98132C2 (ru)
WO (1) WO2008087208A2 (ru)

Families Citing this family (19)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP2008220269A (ja) * 2007-03-13 2008-09-25 Japan Grassland Farming Forage Seed Association トウモロコシ種子中の脂肪含量関連遺伝子座に連鎖するｄｎａマーカーを検出するプライマーセット及びその使用
US8900808B2 (en) 2008-07-15 2014-12-02 E.I. Du Pont De Nemours And Company Genetic loci associated with mechanical stalk strength in maize
CA2755552C (en) 2009-04-13 2019-09-03 E. I. Du Pont De Nemours And Company Genetic loci associated with fusarium ear mold resistance in maize
US9060477B2 (en) * 2010-01-26 2015-06-23 E I Du Pont De Nemours And Company Genetic LOCI on maize chromosomes 3 and 4 that are associated with fusarium ear mold resistance
JP2012115242A (ja) 2010-12-03 2012-06-21 Toyota Motor Corp サトウキビの茎中糖度関連マーカーとその利用
JP5653957B2 (ja) 2011-04-28 2015-01-14 トヨタ自動車株式会社 サトウキビ属植物の黒穂病抵抗性関連マーカーとその利用
JP2013198453A (ja) 2012-03-26 2013-10-03 Toyota Motor Corp サトウキビ野生種ゲノムに由来する茎長関連マーカーとその利用
JP6253132B2 (ja) 2013-09-09 2017-12-27 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構 イチゴ属植物の炭疽病抵抗性関連マーカーとその利用
US10045493B2 (en) * 2014-08-19 2018-08-14 Monsanto Technology Llc Stabilization of pollen production in maize
CA2956473C (en) 2014-09-23 2023-04-11 E. I. Du Pont De Nemours And Company Compositions and methods for selecting maize plants with increased ear weight and increased yield
CN105821140B (zh) * 2016-05-17 2019-07-09 河南农业大学 控制玉米单倍体自然加倍qtl连锁的分子标记及其应用
US11445692B2 (en) 2017-05-15 2022-09-20 Equi-Nom Ltd. Quantitative trait loci (QTL) associated with shatter resistant capsules in sesame and uses thereof
WO2020009113A1 (ja) 2018-07-03 2020-01-09 トヨタ自動車株式会社 サトウキビ属植物の黒穂病抵抗性関連マーカーとその利用
JP7161727B2 (ja) 2018-07-03 2022-10-27 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構 サトウキビ属植物の黒穂病抵抗性関連マーカーとその利用
CN109545280B (zh) * 2018-12-05 2022-12-06 中国科学院西北高原生物研究所 一种西北春小麦全基因组关联分析方法
CN109880930A (zh) * 2019-04-10 2019-06-14 广西大学 一种水稻耐冷主效QTL qCTS12的分子标记及其鉴定方法和应用
CN111719012A (zh) * 2020-06-29 2020-09-29 吉林省农业科学院 鉴定玉米籽粒脱水速率基因型的dCAPS分子标记引物对及应用
US11730133B2 (en) 2020-10-21 2023-08-22 Equi-Nom Ltd High yield sesame
US11395470B1 (en) 2021-09-14 2022-07-26 Equi-Nom Ltd. Sesame with high oil content and/or high yield

Family Cites Families (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
ZA982250B (en) * 1997-03-24 1999-09-17 Du Pont A method to identify and breed corn with increased kernel oil concentration.
EP1042507B1 (en) * 1997-12-22 2008-04-09 Pioneer-Hi-Bred International, Inc. Qtl mapping in plant breeding populations
BR0312609A (pt) * 2002-07-11 2005-07-26 Monsanto Technolgoy Llc Plantas de grão com alto rendimento com proteìna de semente mais óleo aumentados

Non-Patent Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
THEORETICAL AND APPLIED GENETICS (2002), 105: 440-448. THEORETICAL AND APPLIED GENETICS (2003), 107: 798-805. *

Also Published As

Publication number Publication date
US20150089685A1 (en) 2015-03-26
US20110154528A1 (en) 2011-06-23
UA98132C2 (ru) 2012-04-25
WO2008087208A3 (en) 2009-01-15
CA2674804A1 (en) 2008-07-24
EP1947198A1 (en) 2008-07-23
JP2010516236A (ja) 2010-05-20
RU2009131322A (ru) 2011-02-27
WO2008087208A2 (en) 2008-07-24
UA104413C2 (ru) 2014-02-10
US20100138950A1 (en) 2010-06-03
EP2121982A2 (en) 2009-11-25

Similar Documents

Publication Publication Date Title
RU2423528C2 (ru) Новые растения кукурузы
Liu et al. QTL mapping of domestication-related traits in soybean (Glycine max)
US11032986B2 (en) Methods of creating drought tolerant corn plants using markers linked to cold shock domain-containing proteins and compositions thereof
US10470385B2 (en) Methods and compositions for producing watermelon plants with selected seed sizes
CN104735970A (zh) 用于小麦中各种性状的分子标记及其使用方法
Stępień et al. Assessing genetic diversity of Polish wheat (Triticum aestivum) varieties using microsatellite markers
CN111719012A (zh) 鉴定玉米籽粒脱水速率基因型的dCAPS分子标记引物对及应用
Kurniasih et al. Characterization of Indonesian pigmented rice (Oryza sativa) based on morphology and Single Nucleotide Polymorphisms
Blackburn et al. QTL mapping using GBS and SSR genotyping reveals genomic regions controlling wheat coleoptile length and seedling emergence
UA126564C2 (uk) Спосіб ідентифікації та/або відбору рослини маїсу, яка виявляє підвищену стійкість до сірої плямистості листя
KR101699149B1 (ko) 수박의 과형 구별용 dna 마커
KR101822995B1 (ko) 쥬빌리계 수박 호피 무늬 형질 선발용 dna 마커
Minsart et al. Set up of simple sequence repeat markers and first investigation of the genetic diversity of West-African watermelon (Citrullus lanatus ssp. vulgaris oleaginous type)
KR20100117170A (ko) 배추의 유전자적 다중대립인자 웅성불임 유전자 Ｍｓ의 마커 및 이의 용도
US10517242B1 (en) Disease resistance alleles in soybean
Mahdy et al. Date palm genetic identification and improvement utilizing molecular markers and DNA barcoding
RU2010133904A (ru) Растения кукурузы, отличающиеся локусами количественных признаков qtl
US10172305B2 (en) Diagnostic molecular markers for seed lot purity traits in soybeans
WO2015174825A1 (en) Method of predicting or determining plant phenotypes in oil palm
Babayeva et al. Application of DNA markers in determination of fusarium resistance and genetic diversity in chickpea
KR100882142B1 (ko) 벼의 수량성 증진에 관여하는 고밀도 양적형질 유전자 지도
Nawaz et al. Estimation of genetic diversity in wheat using DNA markers
Iseghohi et al. Assessment of genetic diversity of selected cowpea landraces from Nigeria based on simple sequence repeat markers
KR101125745B1 (ko) 분자 표지를 이용한 보리 품종 식별 방법
CN116855592B (zh) 基于a583g snp位点鉴定、筛选或控制小麦千粒重的方法