RU2010133904A - Растения кукурузы, отличающиеся локусами количественных признаков qtl - Google Patents

Растения кукурузы, отличающиеся локусами количественных признаков qtl Download PDF

Info

Publication number
RU2010133904A
RU2010133904A RU2010133904/10A RU2010133904A RU2010133904A RU 2010133904 A RU2010133904 A RU 2010133904A RU 2010133904/10 A RU2010133904/10 A RU 2010133904/10A RU 2010133904 A RU2010133904 A RU 2010133904A RU 2010133904 A RU2010133904 A RU 2010133904A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
line
deposited under
number ncimb
qtl
corn plant
Prior art date
Application number
RU2010133904/10A
Other languages
English (en)
Other versions
RU2560599C2 (ru
Inventor
Мишель РАГОТ (FR)
Мишель РАГОТ
Денис ЛЕСПИНАСС (FR)
Денис ЛЕСПИНАСС
Жан-Поль МЮЛЛЕ (FR)
Жан-Поль МЮЛЛЕ
Паскаль ДЕЛАЖ (FR)
Паскаль ДЕЛАЖ
Original Assignee
Зингента Партисипейшнс Аг (Ch)
Зингента Партисипейшнс Аг
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Priority claimed from PCT/EP2008/050576 external-priority patent/WO2008087208A2/en
Application filed by Зингента Партисипейшнс Аг (Ch), Зингента Партисипейшнс Аг filed Critical Зингента Партисипейшнс Аг (Ch)
Publication of RU2010133904A publication Critical patent/RU2010133904A/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2560599C2 publication Critical patent/RU2560599C2/ru

Links

Classifications

    • AHUMAN NECESSITIES
    • A01AGRICULTURE; FORESTRY; ANIMAL HUSBANDRY; HUNTING; TRAPPING; FISHING
    • A01HNEW PLANTS OR NON-TRANSGENIC PROCESSES FOR OBTAINING THEM; PLANT REPRODUCTION BY TISSUE CULTURE TECHNIQUES
    • A01H1/00Processes for modifying genotypes ; Plants characterised by associated natural traits
    • A01H1/04Processes of selection involving genotypic or phenotypic markers; Methods of using phenotypic markers for selection
    • A01H1/045Processes of selection involving genotypic or phenotypic markers; Methods of using phenotypic markers for selection using molecular markers
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A01AGRICULTURE; FORESTRY; ANIMAL HUSBANDRY; HUNTING; TRAPPING; FISHING
    • A01HNEW PLANTS OR NON-TRANSGENIC PROCESSES FOR OBTAINING THEM; PLANT REPRODUCTION BY TISSUE CULTURE TECHNIQUES
    • A01H5/00Angiosperms, i.e. flowering plants, characterised by their plant parts; Angiosperms characterised otherwise than by their botanic taxonomy
    • A01H5/10Seeds
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A01AGRICULTURE; FORESTRY; ANIMAL HUSBANDRY; HUNTING; TRAPPING; FISHING
    • A01HNEW PLANTS OR NON-TRANSGENIC PROCESSES FOR OBTAINING THEM; PLANT REPRODUCTION BY TISSUE CULTURE TECHNIQUES
    • A01H6/00Angiosperms, i.e. flowering plants, characterised by their botanic taxonomy
    • A01H6/46Gramineae or Poaceae, e.g. ryegrass, rice, wheat or maize
    • A01H6/4684Zea mays [maize]
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6876Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
    • C12Q1/6888Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms
    • C12Q1/6895Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms for plants, fungi or algae
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/13Plant traits
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/156Polymorphic or mutational markers
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/172Haplotypes
    • YGENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
    • Y02TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
    • Y02ATECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE
    • Y02A40/00Adaptation technologies in agriculture, forestry, livestock or agroalimentary production
    • Y02A40/10Adaptation technologies in agriculture, forestry, livestock or agroalimentary production in agriculture

Landscapes

  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Botany (AREA)
  • Environmental Sciences (AREA)
  • Developmental Biology & Embryology (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Physiology (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Natural Medicines & Medicinal Plants (AREA)
  • Spectroscopy & Molecular Physics (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Mycology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
  • Breeding Of Plants And Reproduction By Means Of Culturing (AREA)

Abstract

1. Растение кукурузы, включающее набор аллелей из соответствующего набора QTL, каждый из которых вносит вклад в фенотипический признак урожая зерна, причем указанный набор аллелей обоюдно комплементарен набору аллелей, имеющихся в линии Zea mays, выбранной из группы, состоящей из линии NP1902, депонированной под номером NCIMB 41577, линии NP1941, депонированной под номером NCIMB 41576, и линии NPNW0351, депонированной под номером NCIMB 41578, в частности обоюдно комплементарный набор представлен в таблице J. ! 2. Растение кукурузы по п.1, включающее ядерный геном, содержащий набор благоприятных аллелей из соответствующего набора из по меньшей мере 13 локусов QTL, каждый из которых вносит вклад в фенотипический признак урожайности по зерну. ! 3. Растение кукурузы по п.2, которое имеет аллельную QTL композицию Zea mays линии NP1902, депонированной под номером NCIMB 41577, или Zea mays линии NP1941, депонированной под номером NCIMB 41576. ! 4. Растение кукурузы по п.1, содержащее полный набор благоприятных аллелей по соответствующим 14 локусам QTL. ! 5. Растение кукурузы по п.4, которое в связи с урожаем зерна обладает аллельной QTL композицией линии Zea mays NPNW0351, депонированной под номером NCIMB 41578. ! 6. Растение кукурузы, включающее набор аллелей из соответствующего набора QTL, каждый из которых вносит вклад в фенотипический признак влажности зерна, которые обоюдно комплементарны набору аллелей, имеющихся в линии Zea mays, выбранной из группы, состоящей из линии NP1902, депонированной под номером NCIMB 41577, линии NP1941 депонированной под номером NCIMB 41576, и линии NPNW0351, депонированной под номером NCIMB 41578, в частности обоюдно комплементарный набор аллелей, показанных в таблице J. ! 7. Растение кукурузы по п.6, с�

Claims (23)

1. Растение кукурузы, включающее набор аллелей из соответствующего набора QTL, каждый из которых вносит вклад в фенотипический признак урожая зерна, причем указанный набор аллелей обоюдно комплементарен набору аллелей, имеющихся в линии Zea mays, выбранной из группы, состоящей из линии NP1902, депонированной под номером NCIMB 41577, линии NP1941, депонированной под номером NCIMB 41576, и линии NPNW0351, депонированной под номером NCIMB 41578, в частности обоюдно комплементарный набор представлен в таблице J.
2. Растение кукурузы по п.1, включающее ядерный геном, содержащий набор благоприятных аллелей из соответствующего набора из по меньшей мере 13 локусов QTL, каждый из которых вносит вклад в фенотипический признак урожайности по зерну.
3. Растение кукурузы по п.2, которое имеет аллельную QTL композицию Zea mays линии NP1902, депонированной под номером NCIMB 41577, или Zea mays линии NP1941, депонированной под номером NCIMB 41576.
4. Растение кукурузы по п.1, содержащее полный набор благоприятных аллелей по соответствующим 14 локусам QTL.
5. Растение кукурузы по п.4, которое в связи с урожаем зерна обладает аллельной QTL композицией линии Zea mays NPNW0351, депонированной под номером NCIMB 41578.
6. Растение кукурузы, включающее набор аллелей из соответствующего набора QTL, каждый из которых вносит вклад в фенотипический признак влажности зерна, которые обоюдно комплементарны набору аллелей, имеющихся в линии Zea mays, выбранной из группы, состоящей из линии NP1902, депонированной под номером NCIMB 41577, линии NP1941 депонированной под номером NCIMB 41576, и линии NPNW0351, депонированной под номером NCIMB 41578, в частности обоюдно комплементарный набор аллелей, показанных в таблице J.
7. Растение кукурузы по п.6, содержащее ядерный геном, включающий набор благоприятных аллелей из соответствующего набора из по меньшей мере 7 локусов QTL, каждый из которых вносит вклад в фенотипический признак влажности зерна при сборе урожая.
8. Растение кукурузы по п.6, содержащее ядерный геном, включающий набор благоприятных аллелей из соответствующего набора из по меньшей мере 9 локусов QTL, каждый из которых вносит вклад в фенотипический признак влажности зерна при сборе урожая.
9. Растение кукурузы по п.8, которое обладает аллельной QTL композицией линии Zea mays NPNW0351, депонированной под номером NCIMB 41578, или линии Zea mays NP1902, депонированной под номером NCIMB 41577.
10. Растение кукурузы по п.6 с ядерным геномом, включающим набор благоприятных аллелей из соответствующего набора по меньшей мере 10 QTL, каждый из которых вносит вклад в фенотипический признак влажности зерна при сборе урожая.
11. Растение кукурузы по п.10, которое имеет по признаку влажности зерна аллельную QTL композицию линии Zea mays NP1941, депонированной под номером NCIMB NCIMB 41576.
12. Растение кукурузы по п.10, которое имеет по признакам урожая зерна и влажности зерна, соответственно, аллельную QTL композицию линии Zea mays NP1902, депонированной под номером NCIMB 41577 и показанной в табл.J.
13. Растение кукурузы по п.1 или 6, которое содержит по меньшей мере одну копию наиболее благоприятной аллели в каждом локусе.
14. Растение кукурузы по п.1 или 6, которое является инбредным растением.
15. Растение кукурузы по п.1 или 6, которое является гибридным растением.
16. Растение кукурузы по п.15, которое является F1-гибридом от однократного скрещивания.
17. Растительный материал, в том числе части растений, семена растений и продукты переработки кукурузы, в частности зерна и зернышки кукурузы, получаемые из растений по любому из пп.1-16.
18. Продукты переработки кукурузы, в частности зерна и зернышки кукурузы, получаемые из растений по любому из пп.1-17.
19. Способ получения растения, который включает стадии:
а) скрещивания двух или более родительских растений, из которых по меньшей мере одно представляет собой растение по любому из пп.1-18;
б) скрининга потомства от скрещивания, полученного на стадии а), на наличие растения, содержащего в своем геноме весь набор наиболее благоприятных аллелей из соответствующего набора локусов QTL по меньшей мере от одного из родительских растений, путем:
i. получения растительного материала растения-потомка и экстрагирования ДНК из данного материала;
ii. анализа образца ДНК, полученного на стадии i), чтобы определить имеющиеся аллельные варианты по маркерным локусам, генетически сцепленным с соответствующими локусами QTL, при помощи набора маркеров по любому из пп.32-35 в реакции ПЦР-амплификации;
iii. идентификации маркерного аллеля путем определения молекулярных весов и/или нуклеотидных последовательностей продуктов ПЦР-амплификации, полученных на стадии ii);
в) сравнения молекулярных весов и/или нуклеотидных последовательностей продуктов ПЦР-амплификации, определенных на стадии iii), с молекулярными весами и/или нуклеотидными последовательностями соответствующих продуктов ПЦР-амплификации, полученных из инбредной линии NP1902, депонированной под номером NCIMB 41577; линии NP1941, депонированной под номером NCIMB 41576, и линии NPNW0351, депонированной под номером NCIMB 41578, в ПЦР реакции с идентичным набором пар праймеров, используемых на стадии ii), и идентификации тех продуктов ПЦР, которые имеют в значительной степени идентичные молекулярные массы и/или нуклеотидные последовательности;
г) идентификации и отбора растения или растений с требуемым профилем по данным анализа маркеров.
20. Способ по п.19, причем на стадии а) одно из родительских растений является растением, которое имеет генетическую основу, например представленную инбредной линией кукурузы, выбранной из группы, состоящей из линии NP1902, депонированной под номером NCIMB 41577, линии NP1941, депонированной под номером NCIMB 41576, и линии NPNW0351, депонированной под номером NCIMB 41578.
21. Способ по п.19, в котором указанную инбредную линию используют в качестве мужского родителя.
22. Способ по одному из пп.19-21 для получения гибридов.
23. Гибридное растение, получаемое способом по одному из пп.19-22.
RU2010133904/10A 2008-01-18 2008-07-24 Растения кукурузы, отличающиеся локусам количественных признаков qtl RU2560599C2 (ru)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
PCT/EP2008/050576 WO2008087208A2 (en) 2007-01-18 2008-01-18 Maize plants characterised by quantitative trait loci (qtl)
EPPCT/EP2008/050576 2008-01-18
PCT/EP2008/059756 WO2009089928A1 (en) 2008-01-18 2008-07-24 Maize plants characterised by quantitative trait loci (qtl)

Publications (2)

Publication Number Publication Date
RU2010133904A true RU2010133904A (ru) 2012-02-27
RU2560599C2 RU2560599C2 (ru) 2015-08-20

Family

ID=39876722

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2010133904/10A RU2560599C2 (ru) 2008-01-18 2008-07-24 Растения кукурузы, отличающиеся локусам количественных признаков qtl

Country Status (5)

Country Link
EP (1) EP2242850B1 (ru)
JP (1) JP2011509663A (ru)
CA (1) CA2711633A1 (ru)
RU (1) RU2560599C2 (ru)
WO (1) WO2009089928A1 (ru)

Families Citing this family (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US8900808B2 (en) 2008-07-15 2014-12-02 E.I. Du Pont De Nemours And Company Genetic loci associated with mechanical stalk strength in maize
MX2019007238A (es) 2016-12-21 2019-09-06 Syngenta Participations Ag Sandia de floracion prolifica.
RU2726427C1 (ru) * 2019-10-16 2020-07-14 Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования "Кубанский государственный аграрный университет имени И.Т. Трубилина" Способ идентификации ДНК ткани медведя (Ursus) в сухих кормах и мясных полуфабрикатах
CN113846178B (zh) * 2021-10-15 2022-12-06 上海市农业科学院 一种与甜玉米籽粒大小主效qtl紧密连锁的snp分子标记及其应用

Family Cites Families (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
ZA982250B (en) * 1997-03-24 1999-09-17 Du Pont A method to identify and breed corn with increased kernel oil concentration.
US6399855B1 (en) * 1997-12-22 2002-06-04 Pioneer Hi-Bred International, Inc. QTL mapping in plant breeding populations
RU2268946C2 (ru) * 2000-07-17 2006-01-27 Хе Мэджести Дзе Квин Ин Райт Оф Кэнада Эз Рипризентид Бай Дзе Министер Оф Эгрикалча Энд Эгри-Фуд Метод разработки генома, основанный на картировании, для идентификации локусов регуляции уровня генных транскриптов и продуктов

Also Published As

Publication number Publication date
WO2009089928A1 (en) 2009-07-23
EP2242850B1 (en) 2020-03-04
EP2242850A1 (en) 2010-10-27
RU2560599C2 (ru) 2015-08-20
CA2711633A1 (en) 2009-07-23
JP2011509663A (ja) 2011-03-31

Similar Documents

Publication Publication Date Title
RU2423528C2 (ru) Новые растения кукурузы
CN108779459B (zh) 棉花全基因组snp芯片及其应用
Skøt et al. An association mapping approach to identify flowering time genes in natural populations of Lolium perenne (L.)
CN108411028B (zh) 水稻耐盐基因skc1基因内特异snp共显性分子标记引物及应用
Jermstad et al. Comparative mapping in Pinus: sugar pine (Pinus lambertiana Dougl.) and loblolly pine (Pinus taeda L.)
EP3180723A1 (en) High throughput method of screening a population for members comprising mutation(s) in a target sequence using alignment-free sequence analysis
KR20180077873A (ko) 수박 분자마커이용여교잡 선발용 snp 마커
RU2010133904A (ru) Растения кукурузы, отличающиеся локусами количественных признаков qtl
Rajendran et al. DNA fingerprinting and estimation of genetic diversity among hybrid rice parental lines (Oryza sativa L.) using simple sequence repeats (SSR) markers
US20130040826A1 (en) Methods for trait mapping in plants
KR101699149B1 (ko) 수박의 과형 구별용 dna 마커
JP2011509663A5 (ru)
Alam et al. Genetic diversity analysis of rice (Oryza sativa L.) landraces through RAPD markers.
CN110453007B (zh) 一种用于红三叶遗传多样性分析的ssr引物组及其应用
US10172305B2 (en) Diagnostic molecular markers for seed lot purity traits in soybeans
US10513743B2 (en) Molecular markers associated with chloride tolerant soybeans
CN111647677A (zh) 与小麦籽粒灌浆速率QTL QGfr.sicau-6D紧密连锁的分子标记及应用
Fussi et al. Molecular differentiation of Turkish and Common hazels (Corylus colurna L. and Corylus avellana L.) using multiplexed nuclear microsatellite markers.
Johnsiul et al. Preliminary Evaluation on The SNP Markers for The Malaysian Commercial Cocoa Clones
LU500540B1 (fr) Molecular markers closely linked with a major qtl for kernel length in maize and the application thereof
CN112970579B (zh) 高油玉米材料的选育方法
Lee et al. Application of indica–japonica single-nucleotide polymorphism markers for diversity analysis of Oryza AA genome species
KR101125745B1 (ko) 분자 표지를 이용한 보리 품종 식별 방법
Vasumathy et al. Phenotypic and Genotypic Examination of Orphan Rice Landraces
Boukare et al. Genetic diversity of a collection of Solanum macrocarpon from Burkina Faso revealed by microsatellite markers