RU2218406C2 - МОДИФИЦИРОВАННАЯ Tn5-ТРАНСПОЗАЗА, НАБОР ДЛЯ ТРАНСПОЗИЦИИ, СПОСОБ ТРАНСПОЗИЦИИ, ФРАГМЕНТ ДНК И ГЕНЕТИЧЕСКАЯ КОНСТРУКЦИЯ МОБИЛЬНОЙ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ ДНК - Google Patents

МОДИФИЦИРОВАННАЯ Tn5-ТРАНСПОЗАЗА, НАБОР ДЛЯ ТРАНСПОЗИЦИИ, СПОСОБ ТРАНСПОЗИЦИИ, ФРАГМЕНТ ДНК И ГЕНЕТИЧЕСКАЯ КОНСТРУКЦИЯ МОБИЛЬНОЙ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ ДНК Download PDF

Info

Publication number
RU2218406C2
RU2218406C2 RU99107555/13A RU99107555A RU2218406C2 RU 2218406 C2 RU2218406 C2 RU 2218406C2 RU 99107555/13 A RU99107555/13 A RU 99107555/13A RU 99107555 A RU99107555 A RU 99107555A RU 2218406 C2 RU2218406 C2 RU 2218406C2
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
transposase
modified
nucleotide
dna
sequence
Prior art date
Application number
RU99107555/13A
Other languages
English (en)
Other versions
RU99107555A (ru
Inventor
Уилльям РЕЗНИКОФФ
Игор Юй ГОРИШИН
Хун ДЖОУ
Original Assignee
Висконсин Элумни Рисеч Фаундейшн
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Priority claimed from US08/814,877 external-priority patent/US5965443A/en
Application filed by Висконсин Элумни Рисеч Фаундейшн filed Critical Висконсин Элумни Рисеч Фаундейшн
Publication of RU99107555A publication Critical patent/RU99107555A/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2218406C2 publication Critical patent/RU2218406C2/ru

Links

Images

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/85—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for animal cells
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/87—Introduction of foreign genetic material using processes not otherwise provided for, e.g. co-transformation
    • C12N15/90—Stable introduction of foreign DNA into chromosome
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/14—Hydrolases (3)
    • C12N9/16—Hydrolases (3) acting on ester bonds (3.1)
    • C12N9/22—Ribonucleases RNAses, DNAses
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2800/00—Nucleic acids vectors
    • C12N2800/90—Vectors containing a transposable element

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Mycology (AREA)
  • Enzymes And Modification Thereof (AREA)
  • Control Of Eletrric Generators (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Power Steering Mechanism (AREA)
  • Measurement And Recording Of Electrical Phenomena And Electrical Characteristics Of The Living Body (AREA)
  • Apparatus For Disinfection Or Sterilisation (AREA)
  • Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
  • Superconductors And Manufacturing Methods Therefor (AREA)
  • Other Liquid Machine Or Engine Such As Wave Power Use (AREA)

Abstract

Изобретение относится к генетической инженерии. В заявке описан набор для транспозиции in vitro, включающий ДНК-донора, которая несет мобильный генетический элемент, фланкированный парой последовательностей-повторов внешних концов бактериального транспозона Tn5, ДНК-мишень, в которую мобильный генетический элемент может быть перенесен, и модифицированную Tn5-транспозазу. Представлена модифицированная Tn5-транспозаза, которая с меньшей вероятностью по сравнению с Tn5-транспозазой дикого типа принимает неактивную многомерную формулу. Модифицированная транспозаза имеет замену в положении 54, 372 Tn5-транспозазы дикого типа и необязательно в положении 56. Для транспозиции in vitro объединяют молекулу ДНК-донора с молекулой ДНК-мишени и с модифицированной Tn5-транспозазой. Описан фрагмент ДНК, кодирующий модифицированную Tn5-транспозазу. Генетическая конструкция мобильной последовательности ДНК включает на своих 5' и 3' концах фланкирующие последовательности 5'-CTGTCTCTTATACACATCT-3' или 5'-CTGTCTCTTATACAGATCT-3', совместимые с модифицированной Тn5 транспозазой. Изобретение позволяет увеличить скорость реакции транспозиции и отказаться от использования внешнего высокоэнергетического источника. 5 с. и 12 з.п. ф-лы, 8 ил., 2 табл.

Description

Текст описания в факсимильном виде (см. графическую часть).

Claims (19)

1. Модифицированная Тn5-транспозаза, которая включает замену в положении 54 Тn5-транспозазы дикого типа, которым обусловлено то, что модифицированная транспозаза связывается с большей авидностью с последовательностями-повторами внешнего конца Тn5, чем Тn5-транспозаза дикого типа, и замену в положении 372 Тn5-транспозазы дикого типа, которым обусловлено то, что модифицированная транспозаза с меньшей вероятностью по сравнению с транспозазой дикого типа принимает неактивную многомерную форму.
2. Модифицированная Тn5-транспозаза по п.1, отличающаяся тем, что замена в положении 54 представляет собой лизин.
3. Модифицированная Тn5-транспозаза по п.1 или 2, отличающаяся тем, что замена в положении 372 представляет собой пролин.
4. Модифицированная Тn5-транспозаза по любому из предыдущих пунктов, отличающаяся тем, что модифицированная транспозаза дополнительно включает мутацию, характеризующуюся заменой в положении 56 транспозазы дикого типа.
5. Модифицированная Тn5-транспозаза по п.4, отличающаяся тем, что замена в положении 56 представляет собой аланин.
6. Набор для транспозиции in vitro мобильной последовательности ДНК, включающий модифицированную Тn5-транспозазу по любому из предыдущих пунктов; молекулу ДНК-донора, включающую мобильную последовательность ДНК, причем последовательность ДНК фланкирована на своих 5'- и 3'-концах последовательностями-повторами внешнего конца, совместимыми с Тn5 транспозазой, и молекулу ДНК-мишени, в которую может переноситься мобильный генетический элемент.
7. Набор по п.6, отличающийся тем, что молекула ДНК-донора фланкирована на своих 5'- и 3'-концах фланкирующей последовательностью ДНК, которая состоит из 18 или 19 пар оснований и включает нуклеотид А в положении 10, нуклеотид Т в положении 11 и нуклеотид А в положении 12.
8. Набор по п.7, отличающийся тем, что фланкирующая последовательность включает нуклеотид в положении 4, выбранный из группы, включающей А или Т; нуклеотид в положении 15, выбранный из группы, включающей G или С; нуклеотид в положении 17, выбранный из группы, включающей А или Т; нуклеотид в положении 18, выбранный из группы, включающей G или С.
9. Набор по п.7 или 8, отличающийся тем, что фланкирующая последовательность имеет последовательность 5'-CTGTCTCTTATACACATCT-3' или 5'-CTGTCTCTTATACAGATCT-3'.
10. Способ транспозиции in vitro, включающий объединение молекулы ДНК-донора, которая включает мобильную представляющую интерес последовательность ДНК, фланкированную на своих 5'- и 3'-концах последовательностями-повторами внешнего конца, совместимыми с Тn5 транспозазой, с молекулой ДНК-мишени и с модифицированной Тn5-транспозазой по любому из пп.1-5.
11. Способ по п.10, отличающийся тем, что представляющая интерес последовательность ДНК фланкирована на своих 5'- и 3'-концах фланкирующей последовательностью ДНК, которая состоит из 18 или 19 пар оснований и включает нуклеотид А в положении 10, нуклеотид Т в положении 11 и нуклеотид А в положении 12.
12. Способ по п.11, отличающийся тем, что фланкирующая последовательность включает нуклеотид в положении 4, выбранный из группы, включающей А или Т; нуклеотид в положении 15, выбранный из группы, включающей G или С; нуклеотид в положении 17, выбранный из группы, включающей А или Т; нуклеотид в положении 18, выбранный из группы, включающей G или С.
13. Способ по п.11, отличающийся тем, что фланкирующая последовательность имеет последовательность 5'-CTGTCTCTTATACACATCT-3' или 5'-CTGTCTCTTATACAGATCT-3'.
14. Фрагмент ДНК, кодирующий модифицированную Тn5-транспозазу по любому из пп.1-5.
15. Фрагмент ДНК по п.14, отличающийся тем, что в Тn5-транспозазе в положении 54 присутствует остаток лизина, в положении 372 - остаток пролина.
16. Фрагмент ДНК по п.15, отличающийся тем, что имеет нуклеотидную последовательность, представленную в SEQ ID NO:1.
17. Генетическая конструкция мобильной последовательности ДНК, которая включает на своих 5'- и 3'-концах фланкирующие последовательности 5'-CTGTCTCTTATACACATCT-3' или 5'-CTGTCTCTTATACAGATCT-3', совместимые с модифицированной Тn5 транспозазой по п.1.
Приоритет по пунктам:
09.09.1996 по пп.1-6, 10, 14-16;
02.05.1997 по пп.7-9, 11-13, 17.
RU99107555/13A 1996-09-09 1997-09-09 МОДИФИЦИРОВАННАЯ Tn5-ТРАНСПОЗАЗА, НАБОР ДЛЯ ТРАНСПОЗИЦИИ, СПОСОБ ТРАНСПОЗИЦИИ, ФРАГМЕНТ ДНК И ГЕНЕТИЧЕСКАЯ КОНСТРУКЦИЯ МОБИЛЬНОЙ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ ДНК RU2218406C2 (ru)

Applications Claiming Priority (4)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US08/814,877 1996-09-09
US08/814,877 US5965443A (en) 1996-09-09 1996-09-09 System for in vitro transposition
US08/850,880 US5925545A (en) 1996-09-09 1997-05-02 System for in vitro transposition
US08/850,880 1997-05-02

Publications (2)

Publication Number Publication Date
RU99107555A RU99107555A (ru) 2001-04-27
RU2218406C2 true RU2218406C2 (ru) 2003-12-10

Family

ID=27123892

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU99107555/13A RU2218406C2 (ru) 1996-09-09 1997-09-09 МОДИФИЦИРОВАННАЯ Tn5-ТРАНСПОЗАЗА, НАБОР ДЛЯ ТРАНСПОЗИЦИИ, СПОСОБ ТРАНСПОЗИЦИИ, ФРАГМЕНТ ДНК И ГЕНЕТИЧЕСКАЯ КОНСТРУКЦИЯ МОБИЛЬНОЙ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ ДНК

Country Status (12)

Country Link
US (3) US5925545A (ru)
EP (1) EP0927258B1 (ru)
JP (1) JP4361971B2 (ru)
CN (1) CN1163605C (ru)
AT (1) ATE238422T1 (ru)
AU (1) AU732130B2 (ru)
CA (1) CA2265477C (ru)
DE (1) DE69721282T2 (ru)
ES (1) ES2195171T3 (ru)
PL (1) PL193220B1 (ru)
RU (1) RU2218406C2 (ru)
WO (1) WO1998010077A1 (ru)

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2735700C2 (ru) * 2015-03-11 2020-11-06 Борд Оф Риджентс, Дзе Юниверсити Оф Техас Систем Полипептиды транспозазы и их применение

Families Citing this family (105)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5925545A (en) * 1996-09-09 1999-07-20 Wisconsin Alumni Research Foundation System for in vitro transposition
US6022716A (en) 1998-04-10 2000-02-08 Genset Sa High throughput DNA sequencing vector
US6159736A (en) * 1998-09-23 2000-12-12 Wisconsin Alumni Research Foundation Method for making insertional mutations using a Tn5 synaptic complex
US6299850B1 (en) 1999-03-16 2001-10-09 The United States Of America As Represented By The Department Of Energy Carbon activation process for increased surface accessibility in electrochemical capacitors
US6562624B2 (en) 1999-03-17 2003-05-13 Paradigm Genetics, Inc. Methods and materials for the rapid and high volume production of a gene knock-out library in an organism
JP2003502015A (ja) * 1999-03-17 2003-01-21 パラダイム ジェネティックス、 インコーポレイテッド 生物中における遺伝子ノックアウトライブラリの迅速かつ大量産生のための方法類および素材類
US6818441B1 (en) * 1999-06-18 2004-11-16 Aventis Pharmaceuticals Inc. Vectors for improving cloning and expression in low copy number plasmids
US6406896B1 (en) * 1999-08-02 2002-06-18 Wisconsin Alumni Research Foundation Transposase enzyme and method for use
US7029842B2 (en) * 2000-04-07 2006-04-18 Novozymes A/S Signal sequence trapping
WO2002004629A2 (en) * 2000-07-07 2002-01-17 Maxygen, Inc. Molecular breeding of transposable elements
CA2431246A1 (en) * 2000-12-05 2002-06-13 Wisconsin Alumni Research Foundation Double transposition methods for manipulating nucleic acids
US7138267B1 (en) * 2001-04-04 2006-11-21 Epicentre Technologies Corporation Methods and compositions for amplifying DNA clone copy number
US7262056B2 (en) * 2001-11-08 2007-08-28 Mirus Bio Corporation Enhancing intermolecular integration of nucleic acids using integrator complexes
KR100459870B1 (ko) * 2002-02-22 2004-12-04 한국과학기술원 트랜스포존과 Cre/loxP 부위 특이적 재조합 방법을 이용하는 염색체의 특정부위가 제거된 미생물 변이주 제조방법
FI20020746A (fi) * 2002-04-18 2003-10-19 Finnzymes Oy Menetelmä ja materiaalit polypeptidien deleetiojohdannaisten tuottamiseksi
US20040235011A1 (en) * 2002-06-26 2004-11-25 Cooper Richard K. Production of multimeric proteins
US20040172667A1 (en) * 2002-06-26 2004-09-02 Cooper Richard K. Administration of transposon-based vectors to reproductive organs
US7527966B2 (en) * 2002-06-26 2009-05-05 Transgenrx, Inc. Gene regulation in transgenic animals using a transposon-based vector
US7316903B2 (en) * 2003-03-28 2008-01-08 United States Of America As Represented By The Department Of Health And Human Services Detection of nucleic acid sequence variations using phase Mu transposase
WO2004093645A2 (en) * 2003-04-17 2004-11-04 Wisconsin Alumni Research Foundation Tn5 transposase mutants and the use thereof
US8071364B2 (en) * 2003-12-24 2011-12-06 Transgenrx, Inc. Gene therapy using transposon-based vectors
US20050214838A1 (en) * 2004-03-10 2005-09-29 Waclaw Szybalski Methods for mapping and sequencing nucleic acids
WO2005100585A2 (en) 2004-03-30 2005-10-27 Epicentre Methods for obtaining directionally truncated polypeptides
US20060294606A1 (en) * 2004-05-18 2006-12-28 Istefo Moisyadi Tn5 transposase-mediated transgenesis
US7608434B2 (en) * 2004-08-04 2009-10-27 Wisconsin Alumni Research Foundation Mutated Tn5 transposase proteins and the use thereof
US8383345B2 (en) 2008-09-12 2013-02-26 University Of Washington Sequence tag directed subassembly of short sequencing reads into long sequencing reads
WO2010036979A2 (en) * 2008-09-25 2010-04-01 Transgenrx, Inc. Novel vectors for production of interferon
WO2010036976A2 (en) * 2008-09-25 2010-04-01 Transgenrx, Inc. Novel vectors for production of antibodies
US9157097B2 (en) * 2008-09-25 2015-10-13 Proteovec Holding, L.L.C. Vectors for production of growth hormone
US9080211B2 (en) 2008-10-24 2015-07-14 Epicentre Technologies Corporation Transposon end compositions and methods for modifying nucleic acids
EP2376517B1 (en) * 2008-10-24 2013-01-16 Epicentre Technologies Corporation Transposon end compositions and methods for modifying nucleic acids
WO2010118360A1 (en) * 2009-04-09 2010-10-14 The Board Of Supervisors Of Louisiana State University And Agricultural And Mechanical College Production of proteins using transposon-based vectors
PT2556171E (pt) 2010-04-05 2015-12-21 Prognosys Biosciences Inc Ensaios biológicos codificados espacialmente
US20190300945A1 (en) 2010-04-05 2019-10-03 Prognosys Biosciences, Inc. Spatially Encoded Biological Assays
US10787701B2 (en) 2010-04-05 2020-09-29 Prognosys Biosciences, Inc. Spatially encoded biological assays
WO2011159942A1 (en) 2010-06-18 2011-12-22 Illumina, Inc. Conformational probes and methods for sequencing nucleic acids
US8829171B2 (en) 2011-02-10 2014-09-09 Illumina, Inc. Linking sequence reads using paired code tags
US9074251B2 (en) 2011-02-10 2015-07-07 Illumina, Inc. Linking sequence reads using paired code tags
DK3037536T3 (da) 2011-01-28 2020-01-13 Illumina Inc Oligonukleotiderstatning for di-taggede og retnings biblioteker
WO2012106546A2 (en) 2011-02-02 2012-08-09 University Of Washington Through Its Center For Commercialization Massively parallel continguity mapping
GB201106254D0 (en) 2011-04-13 2011-05-25 Frisen Jonas Method and product
US20150284768A1 (en) * 2012-05-29 2015-10-08 The Johns Hopkins University Eukaryotic transposase mutants and transposon end compositions for modifying nucleic acids and methods for production and use in the generation of sequencing libraries
US9683230B2 (en) 2013-01-09 2017-06-20 Illumina Cambridge Limited Sample preparation on a solid support
CA3094792A1 (en) 2013-03-13 2014-09-18 Illumina, Inc. Methods and compositions for nucleic acid sequencing
US9879313B2 (en) 2013-06-25 2018-01-30 Prognosys Biosciences, Inc. Methods and systems for determining spatial patterns of biological targets in a sample
US10287622B2 (en) 2013-11-07 2019-05-14 Agilent Technologies, Inc. Plurality of transposase adapters for DNA manipulations
CN106414765A (zh) 2013-12-20 2017-02-15 Illumina公司 在片段化的基因组dna样品中保留基因组连接信息
ES2819277T3 (es) 2014-02-11 2021-04-15 Hoffmann La Roche Secuenciación dirigida y filtrado de UID
JP6490710B2 (ja) 2014-04-15 2019-03-27 イラミーナ インコーポレーテッド 改善された挿入配列バイアスおよび拡大されたｄｎａインプット許容差のための修正トランスポザーゼ
WO2015189636A1 (en) 2014-06-13 2015-12-17 Illumina Cambridge Limited Methods and compositions for preparing sequencing libraries
CN112430641A (zh) 2014-06-30 2021-03-02 亿明达股份有限公司 使用单侧转座的方法和组合物
BR112017007912A2 (pt) 2014-10-17 2018-01-23 Illumina Cambridge Limited transposon de preservação de contiguidade
EP3222717B1 (en) * 2014-11-18 2020-04-22 OriCiro Genomics, Inc. Method of amplifying circular dna
EP3259355B1 (en) 2015-02-20 2020-11-25 The Regents of the University of California Methods related to dna sequencing
CN113186256A (zh) 2015-04-10 2021-07-30 空间转录公司 生物样本的空间区别、多重核酸分析
US10156025B2 (en) 2015-05-04 2018-12-18 University Of South Carolina Monolithic heterogeneous single crystals with multiple regimes for solid state laser applications
US11453875B2 (en) 2015-05-28 2022-09-27 Illumina Cambridge Limited Surface-based tagmentation
WO2016196358A1 (en) 2015-05-29 2016-12-08 Epicentre Technologies Corporation Methods of analyzing nucleic acids
CN108026575B (zh) 2015-07-17 2022-08-19 哈佛学院董事及会员团体 扩增核酸序列的方法
PT3334841T (pt) 2015-08-12 2020-01-30 Cemm Forschungszentrum Fuer Molekulare Medizin Gmbh Métodos para estudar ácidos nucleicos
EP3485038B1 (en) 2016-07-12 2020-12-23 H. Hoffnabb-La Roche Ag Primer extension target enrichment
WO2018027048A1 (en) 2016-08-05 2018-02-08 Bio-Rad Laboratories, Inc. Second strand direct
US11021738B2 (en) 2016-12-19 2021-06-01 Bio-Rad Laboratories, Inc. Droplet tagging contiguity preserved tagmented DNA
CN106754811B (zh) * 2016-12-21 2019-05-14 南京诺唯赞生物科技有限公司 一种突变型Tn5转座酶及其制备方法和应用
CN108265101A (zh) * 2016-12-30 2018-07-10 天津强微特生物科技有限公司 一种快速稳定的Tn5转座酶酶活测定方法
AU2018225503A1 (en) 2017-02-21 2018-12-13 Illumina Cambridge Limited Tagmentation using immobilized transposomes with linkers
EP4060041B1 (en) 2017-09-25 2023-12-27 Fred Hutchinson Cancer Center High efficiency targeted in situ genome-wide profiling
WO2019084055A1 (en) 2017-10-23 2019-05-02 Massachusetts Institute Of Technology CLASSIFICATION OF GENETIC VARIATION FROM UNICELLULAR TRANSCRIPTOMS
EP3704247B1 (en) 2017-11-02 2023-01-04 Bio-Rad Laboratories, Inc. Transposase-based genomic analysis
EP3841202B1 (en) 2018-08-20 2023-10-04 Bio-Rad Laboratories, Inc. Nucleotide sequence generation by barcode bead-colocalization in partitions
CN113286893A (zh) 2018-08-28 2021-08-20 10X基因组学股份有限公司 生成阵列的方法
US11519033B2 (en) 2018-08-28 2022-12-06 10X Genomics, Inc. Method for transposase-mediated spatial tagging and analyzing genomic DNA in a biological sample
JP2022513561A (ja) 2018-11-30 2022-02-09 イルミナ インコーポレイテッド 単一アッセイを使用した複数の分析物の分析
EP3894590A2 (en) 2018-12-10 2021-10-20 10X Genomics, Inc. Methods of using master / copy arrays for spatial detection
US20220195507A1 (en) 2018-12-17 2022-06-23 Illumina, Inc. Methods and means for preparing a library for sequencing
US11649485B2 (en) 2019-01-06 2023-05-16 10X Genomics, Inc. Generating capture probes for spatial analysis
US11926867B2 (en) 2019-01-06 2024-03-12 10X Genomics, Inc. Generating capture probes for spatial analysis
WO2020243579A1 (en) 2019-05-30 2020-12-03 10X Genomics, Inc. Methods of detecting spatial heterogeneity of a biological sample
KR20220031539A (ko) 2019-07-12 2022-03-11 일루미나 케임브리지 리미티드 전기영동을 이용한 핵산 라이브러리 제조
EP4025708A1 (en) 2019-09-06 2022-07-13 CeMM - Forschungszentrum für Molekulare Medizin GmbH Method for sequencing rna oligonucleotides
EP4025711A2 (en) 2019-11-08 2022-07-13 10X Genomics, Inc. Enhancing specificity of analyte binding
FI3891300T3 (fi) 2019-12-23 2023-05-10 10X Genomics Inc Menetelmät spatiaalista analyysiä varten rna-templatoitua ligaatiota käyttäen
US11732299B2 (en) 2020-01-21 2023-08-22 10X Genomics, Inc. Spatial assays with perturbed cells
US11702693B2 (en) 2020-01-21 2023-07-18 10X Genomics, Inc. Methods for printing cells and generating arrays of barcoded cells
US11898205B2 (en) 2020-02-03 2024-02-13 10X Genomics, Inc. Increasing capture efficiency of spatial assays
US11732300B2 (en) 2020-02-05 2023-08-22 10X Genomics, Inc. Increasing efficiency of spatial analysis in a biological sample
US11891654B2 (en) 2020-02-24 2024-02-06 10X Genomics, Inc. Methods of making gene expression libraries
ES2965354T3 (es) 2020-04-22 2024-04-12 10X Genomics Inc Métodos para análisis espacial que usan eliminación de ARN elegido como diana
WO2021236929A1 (en) 2020-05-22 2021-11-25 10X Genomics, Inc. Simultaneous spatio-temporal measurement of gene expression and cellular activity
AU2021275906A1 (en) 2020-05-22 2022-12-22 10X Genomics, Inc. Spatial analysis to detect sequence variants
WO2021242834A1 (en) 2020-05-26 2021-12-02 10X Genomics, Inc. Method for resetting an array
WO2021252499A1 (en) 2020-06-08 2021-12-16 10X Genomics, Inc. Methods of determining a surgical margin and methods of use thereof
EP4165207A1 (en) 2020-06-10 2023-04-19 10X Genomics, Inc. Methods for determining a location of an analyte in a biological sample
AU2021294334A1 (en) 2020-06-25 2023-02-02 10X Genomics, Inc. Spatial analysis of DNA methylation
US11761038B1 (en) 2020-07-06 2023-09-19 10X Genomics, Inc. Methods for identifying a location of an RNA in a biological sample
US11926822B1 (en) 2020-09-23 2024-03-12 10X Genomics, Inc. Three-dimensional spatial analysis
US11827935B1 (en) 2020-11-19 2023-11-28 10X Genomics, Inc. Methods for spatial analysis using rolling circle amplification and detection probes
WO2022140028A1 (en) 2020-12-21 2022-06-30 10X Genomics, Inc. Methods, compositions, and systems for capturing probes and/or barcodes
AU2022212231A1 (en) 2021-01-29 2023-08-03 10X Genomics, Inc. Method for transposase mediated spatial tagging and analyzing genomic dna in a biological sample
WO2023034489A1 (en) 2021-09-01 2023-03-09 10X Genomics, Inc. Methods, compositions, and kits for blocking a capture probe on a spatial array
WO2023172514A1 (en) 2022-03-07 2023-09-14 Catamaran Bio, Inc. Engineered immune cell therapeutics targeted to her2 and methods of use thereof
WO2023225519A1 (en) 2022-05-17 2023-11-23 10X Genomics, Inc. Modified transposons, compositions and uses thereof
WO2023225095A1 (en) 2022-05-18 2023-11-23 Illumina Cambridge Limited Preparation of size-controlled nucleic acid fragments
CN114774411B (zh) * 2022-06-16 2022-10-21 序康医疗科技（苏州）有限公司 大片段dna环化连接方法
WO2024003332A1 (en) 2022-06-30 2024-01-04 F. Hoffmann-La Roche Ag Controlling for tagmentation sequencing library insert size using archaeal histone-like proteins

Family Cites Families (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5316946A (en) * 1987-10-05 1994-05-31 Washington University DNA transposon TN5SUPF in plasmid pBRG1310
US5925545A (en) * 1996-09-09 1999-07-20 Wisconsin Alumni Research Foundation System for in vitro transposition

Non-Patent Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
WEINREICH M. D. et al. Genes & Development. 8 (19), 1994, p.2363-2374. WIEGAND, TORSTEN W. et al. J. Bacteriol. 174 (4), 1992, p.1229-1239. WEINREICH M. D. et al. J. Mol.BioL, vol.241, 1993, p. 166-177. МАНИАТИС Г. и др. Методы генетической инженерии. Молекулярное клонирование. М.: Мир, 1984, с. 107-118. *

Cited By (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2735700C2 (ru) * 2015-03-11 2020-11-06 Борд Оф Риджентс, Дзе Юниверсити Оф Техас Систем Полипептиды транспозазы и их применение
US10883094B2 (en) 2015-03-11 2021-01-05 Board Of Regents, The University Of Texas System Transposase polypeptides and uses thereof
US11492604B2 (en) 2015-03-11 2022-11-08 Board Of Regents, The University Of Texas System Transposase polypeptides and uses thereof

Also Published As

Publication number Publication date
US5948622A (en) 1999-09-07
EP0927258A1 (en) 1999-07-07
US6437109B1 (en) 2002-08-20
ES2195171T3 (es) 2003-12-01
AU732130B2 (en) 2001-04-12
US5925545A (en) 1999-07-20
PL193220B1 (pl) 2007-01-31
JP4361971B2 (ja) 2009-11-11
ATE238422T1 (de) 2003-05-15
CA2265477C (en) 2007-03-20
DE69721282T2 (de) 2003-12-18
CN1163605C (zh) 2004-08-25
CA2265477A1 (en) 1998-03-12
CN1251135A (zh) 2000-04-19
EP0927258B1 (en) 2003-04-23
AU4262097A (en) 1998-03-26
JP2001507565A (ja) 2001-06-12
WO1998010077A1 (en) 1998-03-12
PL332145A1 (en) 1999-08-30
DE69721282D1 (de) 2003-05-28

Similar Documents

Publication Publication Date Title
RU2218406C2 (ru) МОДИФИЦИРОВАННАЯ Tn5-ТРАНСПОЗАЗА, НАБОР ДЛЯ ТРАНСПОЗИЦИИ, СПОСОБ ТРАНСПОЗИЦИИ, ФРАГМЕНТ ДНК И ГЕНЕТИЧЕСКАЯ КОНСТРУКЦИЯ МОБИЛЬНОЙ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ ДНК
Hinnebusch et al. Linear plasmids and chromosomes in bacteria
RU99107555A (ru) Система для транспозиции in vitro, на основе использовании модифицированной tn5-транспозазы
Green et al. In vitro complementation analysis localizes 23S rRNA posttranscriptional modifications that are required for Escherichia coli 50S ribosomal subunit assembly and function.
US20160362667A1 (en) CRISPR-Cas Compositions and Methods
Tomcsányi et al. Processing enzyme ribonuclease E specifically cleaves RNA I: an inhibitor of primer formation in plasmid DNA synthesis
RU2002105508A (ru) Мутантные ферменты Тn5-транспозазы и способ их применения
CN109666662A (zh) 新型ScCas12a在核酸检测方面的应用
ES2181900T3 (es) Clonacion recombinante in vitro usanto sitios de recombinacion por ingenieria genetica.
AR040710A1 (es) Evento de maiz pv-zmir 13 (mon863), plantas, composiciones y metodos para la deteccion del mismo
CN102301010A (zh) 闭合线状dna的制备
DK0805867T3 (da) DNA integration ved transposition
DK1210357T3 (da) Oligonukleotid-N3' -P5' -thiophosphoramidater: syntese og anvendelse deraf
JP2005529590A5 (ru)
AU7891498A (en) Flower organ-specific gene and its promoter sequence
Santosa Rapid extraction and purification of environmental DNA for molecular cloning applications and molecular diversity studies
Faure et al. Comparison of chaetognath mitochondrial genomes and phylogenetical implications
US8362203B2 (en) Non-natural peptides as models for the development of antibiotics
WO2003062417A1 (fr) Produit de ligation arn-adn, et utilisation correspondante
CN109913452A (zh) 用于靶向HBB RNA的gRNA及基于C2c2的HBB突变检测方法、检测试剂盒
CN114901303A (zh) 修饰的核酸内切酶和相关方法
Murphy et al. RNA isolation and fractionation with compaction agents
Dalby et al. The scrambled actin I gene in Uroleptus pisces
WO2019048881A1 (en) OLIGONUCLEOTIDES COMPRISING TRIAZOLE AND (PHOSPHORE) AMIDATE INTERNUCLEOSIDIC LINKS, PROCESS FOR PREPARING THEM AND USES THEREOF
WO2022059928A1 (ko) 신규의 개량된 염기 편집 또는 교정용 융합단백질 및 이의 용도