RU2011114900A - Способы разделения, характеристики и(или) идентификации микроорганизмов с помощью рамановской спектроскопии - Google Patents

Способы разделения, характеристики и(или) идентификации микроорганизмов с помощью рамановской спектроскопии Download PDF

Info

Publication number
RU2011114900A
RU2011114900A RU2011114900/10A RU2011114900A RU2011114900A RU 2011114900 A RU2011114900 A RU 2011114900A RU 2011114900/10 A RU2011114900/10 A RU 2011114900/10A RU 2011114900 A RU2011114900 A RU 2011114900A RU 2011114900 A RU2011114900 A RU 2011114900A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
microorganisms
raman spectroscopy
sample
microorganism
isolated
Prior art date
Application number
RU2011114900/10A
Other languages
English (en)
Other versions
RU2541775C2 (ru
Inventor
Бредфорд КЛЭЙ
Джонс ХЬЮМЕН
Джон УОЛШ
Турмен ТОРП
Кристофер РОНСИК
Original Assignee
Биомерьё, Инк.
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Биомерьё, Инк. filed Critical Биомерьё, Инк.
Publication of RU2011114900A publication Critical patent/RU2011114900A/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2541775C2 publication Critical patent/RU2541775C2/ru

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/02Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving viable microorganisms
    • C12Q1/04Determining presence or kind of microorganism; Use of selective media for testing antibiotics or bacteriocides; Compositions containing a chemical indicator therefor
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12MAPPARATUS FOR ENZYMOLOGY OR MICROBIOLOGY; APPARATUS FOR CULTURING MICROORGANISMS FOR PRODUCING BIOMASS, FOR GROWING CELLS OR FOR OBTAINING FERMENTATION OR METABOLIC PRODUCTS, i.e. BIOREACTORS OR FERMENTERS
    • C12M1/00Apparatus for enzymology or microbiology
    • C12M1/34Measuring or testing with condition measuring or sensing means, e.g. colony counters
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N21/00Investigating or analysing materials by the use of optical means, i.e. using sub-millimetre waves, infrared, visible or ultraviolet light
    • G01N21/62Systems in which the material investigated is excited whereby it emits light or causes a change in wavelength of the incident light
    • G01N21/63Systems in which the material investigated is excited whereby it emits light or causes a change in wavelength of the incident light optically excited
    • G01N21/64Fluorescence; Phosphorescence
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N21/00Investigating or analysing materials by the use of optical means, i.e. using sub-millimetre waves, infrared, visible or ultraviolet light
    • G01N21/62Systems in which the material investigated is excited whereby it emits light or causes a change in wavelength of the incident light
    • G01N21/63Systems in which the material investigated is excited whereby it emits light or causes a change in wavelength of the incident light optically excited
    • G01N21/65Raman scattering
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/68Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving proteins, peptides or amino acids
    • G01N33/6803General methods of protein analysis not limited to specific proteins or families of proteins
    • G01N33/6848Methods of protein analysis involving mass spectrometry
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N21/00Investigating or analysing materials by the use of optical means, i.e. using sub-millimetre waves, infrared, visible or ultraviolet light
    • G01N21/17Systems in which incident light is modified in accordance with the properties of the material investigated
    • G01N21/25Colour; Spectral properties, i.e. comparison of effect of material on the light at two or more different wavelengths or wavelength bands
    • G01N21/31Investigating relative effect of material at wavelengths characteristic of specific elements or molecules, e.g. atomic absorption spectrometry
    • G01N21/35Investigating relative effect of material at wavelengths characteristic of specific elements or molecules, e.g. atomic absorption spectrometry using infrared light
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N21/00Investigating or analysing materials by the use of optical means, i.e. using sub-millimetre waves, infrared, visible or ultraviolet light
    • G01N21/17Systems in which incident light is modified in accordance with the properties of the material investigated
    • G01N21/25Colour; Spectral properties, i.e. comparison of effect of material on the light at two or more different wavelengths or wavelength bands
    • G01N21/31Investigating relative effect of material at wavelengths characteristic of specific elements or molecules, e.g. atomic absorption spectrometry
    • G01N21/35Investigating relative effect of material at wavelengths characteristic of specific elements or molecules, e.g. atomic absorption spectrometry using infrared light
    • G01N21/3581Investigating relative effect of material at wavelengths characteristic of specific elements or molecules, e.g. atomic absorption spectrometry using infrared light using far infrared light; using Terahertz radiation
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N21/00Investigating or analysing materials by the use of optical means, i.e. using sub-millimetre waves, infrared, visible or ultraviolet light
    • G01N21/17Systems in which incident light is modified in accordance with the properties of the material investigated
    • G01N21/25Colour; Spectral properties, i.e. comparison of effect of material on the light at two or more different wavelengths or wavelength bands
    • G01N21/31Investigating relative effect of material at wavelengths characteristic of specific elements or molecules, e.g. atomic absorption spectrometry
    • G01N21/35Investigating relative effect of material at wavelengths characteristic of specific elements or molecules, e.g. atomic absorption spectrometry using infrared light
    • G01N21/359Investigating relative effect of material at wavelengths characteristic of specific elements or molecules, e.g. atomic absorption spectrometry using infrared light using near infrared light
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N21/00Investigating or analysing materials by the use of optical means, i.e. using sub-millimetre waves, infrared, visible or ultraviolet light
    • G01N21/17Systems in which incident light is modified in accordance with the properties of the material investigated
    • G01N21/47Scattering, i.e. diffuse reflection

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Pathology (AREA)
  • General Physics & Mathematics (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Spectroscopy & Molecular Physics (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Hematology (AREA)
  • Bioinformatics & Computational Biology (AREA)
  • Urology & Nephrology (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Toxicology (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Food Science & Technology (AREA)
  • Sustainable Development (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
  • Investigating, Analyzing Materials By Fluorescence Or Luminescence (AREA)

Abstract

1. Способ характеристики и/или идентификации микроорганизма из тестируемого образца, включающий:(a) получение тестируемого образца, о котором известно, что он содержит или может содержать микроорганизмы;(b) селективный лизис клеток не микроорганизмов в тестируемом образце с получением лизированного образца;(c) разделение микроорганизмов от других компонентов указанного лизированного образца с образованием изолированного образца микроорганизмов;(d) исследование изолированных микроорганизмов с использованием одного или более чем одного метода рамановской спектроскопии с получением спектроскопических измерений данного микроорганизма и(e) характеристику и/или идентификацию данного микроорганизма в изолированном образце путем сравнения спектроскопических измерений со снятыми спектроскопическими измерениями известных микроорганизмов или предсказанными спектроскопическими свойствами известных микроорганизмов.2. Способ по п.1, где стадии (с) и (d) осуществляют в герметично закрытом контейнере, и где стадия исследования (d) является неинвазивной.3. Способ по п.1, где метод рамановской спектроскопии выбран из группы, состоящей из рамановской спектроскопии, конфокальной рамановской спектроскопии, рамановской спектроскопии, усиленной поверхностью, рамановской спектроскопии с пространственным смещением, резонансной рамановской спектроскопии, трансмиссионной рамановской спектроскопии и любой их комбинации.4. Способ по п.1, где микроорганизмы характеризуют на основании одной или более чем одной фенотипической и/или морфологической характеристики.5. Способ по п.1, где микроорганизмы характеризуют на основани�

Claims (26)

1. Способ характеристики и/или идентификации микроорганизма из тестируемого образца, включающий:
(a) получение тестируемого образца, о котором известно, что он содержит или может содержать микроорганизмы;
(b) селективный лизис клеток не микроорганизмов в тестируемом образце с получением лизированного образца;
(c) разделение микроорганизмов от других компонентов указанного лизированного образца с образованием изолированного образца микроорганизмов;
(d) исследование изолированных микроорганизмов с использованием одного или более чем одного метода рамановской спектроскопии с получением спектроскопических измерений данного микроорганизма и
(e) характеристику и/или идентификацию данного микроорганизма в изолированном образце путем сравнения спектроскопических измерений со снятыми спектроскопическими измерениями известных микроорганизмов или предсказанными спектроскопическими свойствами известных микроорганизмов.
2. Способ по п.1, где стадии (с) и (d) осуществляют в герметично закрытом контейнере, и где стадия исследования (d) является неинвазивной.
3. Способ по п.1, где метод рамановской спектроскопии выбран из группы, состоящей из рамановской спектроскопии, конфокальной рамановской спектроскопии, рамановской спектроскопии, усиленной поверхностью, рамановской спектроскопии с пространственным смещением, резонансной рамановской спектроскопии, трансмиссионной рамановской спектроскопии и любой их комбинации.
4. Способ по п.1, где микроорганизмы характеризуют на основании одной или более чем одной фенотипической и/или морфологической характеристики.
5. Способ по п.1, где микроорганизмы характеризуют на основании одного или более чем одного измерения времени обнаружения, скорости роста, а также размера, формы, цвета и/или плотности осадка микроорганизма.
6. Способ по п.1, где микроорганизмы характеризуют по одной или более чем одной модели классификации, выбранной из группы, состоящей из групп по Граму, клинических групп по Граму, терапевтических групп и функциональных групп.
7. Способ по п.1, где микроорганизмы идентифицируют на уровне рода, на уровне вида или на уровне штамма.
8. Способ по п.1, где стадию селективного лизиса (b) осуществляют, используя раствор для лизиса, содержащий один или более чем один детергент.
9. Способ по п.8, где один или более чем один детергент выбран из группы, состоящей из Тритона® Х-100, Тритона® X-100-R, Тритона® Х-114, NP-40, Genapol® С-100, Genapol® Х-100, Igepal® CA 630, Arlasolve™200, Brij® 96/97, CHAPS, октил-D-глюкопиранозида, сапонина, нонаэтиленгликоля монододецилового эфира (C12E9, полидоценол), додецилсульфата натрия, N-лаурилсаркозина, деоксихолата натрия, желчных солей, гексадецилтриметиламмония бромида, SB3-10, SB3-12, амидосульфобетаина-14, C7BzO, Brij® 98, Brij® 58, Brij® 35, Твин® 80, Твин® 20, Pluronic® L64, Pluronic® P84, не детергентных сульфобетаинов (NDSB 201), амфиполов (PMAL-C8) и метил-β-циклодекстрина.
10. Способ по п.8, где указанный детергент представляет собой полиоксиэтиленовый детергент, включающий структуру C12-18/E9-10.
11. Способ по п.10, где указанный полиоксиэтиленовый детергент выбран из группы, состоящей из Brij® 97, Brij®96V, Genapol® С-100, Genapol® Х-100 и полидоценола.
12. Способ по п.8, где раствор для лизиса дополнительно содержит один или более чем один фермент, который включает смесь одной или более чем одной протеиназы и одной или более чем одной нуклеазы.
13. Способ по п.8, где раствор для лизиса содержит один или более чем один буферный агент.
14. Способ по п.1, где лизированный образец наслаивают на градиент плотности в указанном контейнере, и где указанный контейнер центрифугируют с образованием осадка микроорганизмов.
15. Способ по п.14, где указанный градиент плотности выбран из группы, состоящей из коллоидного кремнезема, йодированных контрастных агентов, сахарозы, иммерсионного масла для микроскопа, минерального масла, силиконового масла, фторсиликонового масла, силиконового геля, метризоата-фиколла®, диатризоата-декстрана, карбоксиметилцеллюлозы, гидроксипропилметилцеллюлозы, полиэтиленоксида (высокой молекулярной массы), Pluronic® F127, Pluronic® F68, полиакриловой кислоты, сшитого поливинилового спирта, сшитого поливинилпирролидина, сополимера метилового эфира ПЭГ и метакрилата, пектина, агарозы, ксантана, геллана, Phytagel®, сорбита, фиколла®, глицерина, декстрана, гликогена, хлорида цезия, перфторуглеродных жидкостей и/или гидрофторуглеродной жидкости и их комбинаций.
16. Способ по п.1, где тестируемый образец представляет собой образец культуры, о которой известно, что она содержит микроорганизмы.
17. Способ характеристики и/или идентификации микроорганизма из гемокультуры, включающий:
(a) получение образца из гемокультуры, о которой известно, что она содержит или может содержать микроорганизмы;
(b) селективный лизис клеток не микроорганизмов в образце с получением лизированного образца;
(c) наслаивание лизированного образца на градиент плотности в герметичном контейнере;
(d) центрифугирование контейнера для разделения микроорганизмов от других компонентов указанного образца и образования осадка микроорганизмов;
(e) спектроскопическое исследование изолированных микроорганизмов in situ с использованием одного или более чем одного метода рамановской спектроскопии с получением спектроскопических измерений данного микроорганизма; и
(f) характеристику и/или идентификацию указанного микроорганизма в изолированном образце путем сравнения спектроскопических измерений со снятыми спектроскопическими измерениями известных микроорганизмов или предсказанными спектроскопическими свойствами известных микроорганизмов.
18. Способ характеристики и/или идентификации микроорганизма, включающий:
(a) получение тестируемого образца, о котором известно, что он содержит или может содержать микроорганизмы;
(b) помещение указанного тестируемого образца в герметичный контейнер;
(c) разделение микроорганизмов in situ от других компонентов указанного тестируемого образца с образованием изолированного образца микроорганизмов из микроорганизмов в указанном герметичном контейнере;
(d) спектроскопическое исследование изолированных микроорганизмов in situ с использованием одного или более чем одного метода рамановской спектроскопии с получением спектроскопических измерений указанного микроорганизма; и
(e) характеристику и/или идентификацию указанного микроорганизма в изолированном образце путем сравнения спектроскопических измерений со снятыми спектроскопическими измерениями известных микроорганизмов или предсказанными спектроскопическими свойствами известных микроорганизмов.
19. Способ по п.18, где указанный метод рамановской спектроскопии выбран из группы, состоящей из рамановской спектроскопии, конфокальной рамановской спектроскопии, рамановской спектроскопии, усиленной поверхностью, рамановской спектроскопии с пространственным смещением, резонансной рамановской спектроскопии, трансмиссионной рамановской спектроскопии и любой их комбинации.
20. Способ по п.18, где указанные микроорганизмы характеризуют на основании одной или более чем одной фенотипической и/или морфологической характеристики.
21. Способ по п.18, где микроорганизмы характеризуют на основании одного или более чем одного измерения времени обнаружения, скорости роста, а также размера, формы, цвета и/или плотности осадка микроорганизма.
22. Способ по п.18, где микроорганизмы характеризуют по одной или более чем одной модели классификации, выбранной из группы, состоящей из групп по Граму, клинических групп по Граму, терапевтических групп и функциональных групп.
23. Способ по п.18, где указанные микроорганизмы идентифицируют на уровне рода, на уровне вида или на уровне штамма.
24. Способ по п.18, где указанный образец наслаивают на градиент плотности в контейнере, и где указанный контейнер центрифугируют с образованием осадка микроорганизмов.
25. Способ по п.18, где указанный градиент плотности включает одно или более чем одно из коллоидного кремнезема, йодированных контрастных агентов, сахарозы, иммерсионного масла для микроскопа, минерального масла, силиконового масла, фторсиликонового масла, силиконового геля, метризоата-фиколла®, диатризоата-декстрана, карбоксиметилцеллюлозы, гидроксипропилметилцеллюлозы, полиэтиленоксида (высокой молекулярной массы), Pluronic® F127, Pluronic® F68, полиакриловой кислоты, сшитого поливинилового спирта, сшитого поливинилпирролидина, сополимера метилового эфира ПЭГ и метакрилата, пектина, агарозы, ксантана, геллана, Phytagel®, сорбита, фиколла®, глицерина, декстрана, гликогена, хлорида цезия, перфторуглеродных жидкостей и/или гидрофторуглеродной жидкости.
26. Способ по п.18, где тестируемый образец представляет собой образец культуры, о которой известно, что она содержит микроорганизмы.
RU2011114900/10A 2008-10-31 2009-10-30 Способ идентификации микроорганизмов из тестируемого образца гемокультуры RU2541775C2 (ru)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US11018708P 2008-10-31 2008-10-31
US61/110,187 2008-10-31
PCT/US2009/005886 WO2010062351A1 (en) 2008-10-31 2009-10-30 Methods for separation, characterization, and/or identification of microorganisms using raman spectroscopy

Publications (2)

Publication Number Publication Date
RU2011114900A true RU2011114900A (ru) 2012-12-10
RU2541775C2 RU2541775C2 (ru) 2015-02-20

Family

ID=42542822

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2011114900/10A RU2541775C2 (ru) 2008-10-31 2009-10-30 Способ идентификации микроорганизмов из тестируемого образца гемокультуры

Country Status (11)

Country Link
US (1) US20100136609A1 (ru)
EP (1) EP2361377B1 (ru)
JP (1) JP2012507283A (ru)
KR (1) KR20110095277A (ru)
CN (1) CN102272585B (ru)
AU (1) AU2009320332B2 (ru)
BR (1) BRPI0919861A2 (ru)
CA (1) CA2741036C (ru)
MX (1) MX2011004106A (ru)
RU (1) RU2541775C2 (ru)
WO (1) WO2010062351A1 (ru)

Families Citing this family (46)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US8795628B2 (en) * 2007-05-04 2014-08-05 The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University Molecular imaging of living subjects using Raman spectroscopy and labeled Raman nanoparticles
US8512975B2 (en) * 2008-07-24 2013-08-20 Biomerieux, Inc. Method for detection and characterization of a microorganism in a sample using time dependent spectroscopic measurements
MX2011004169A (es) * 2008-10-31 2011-09-27 Bio Merieux Inc Metodos para la separacion y caracterizacion de microorganismos utilizando agentes identificadores.
FR2942806B1 (fr) * 2009-03-03 2011-09-02 Assist Publ Hopitaux De Paris Procede d'identification de germes en milieu liquide
EP2333105A1 (en) * 2009-12-08 2011-06-15 Koninklijke Philips Electronics N.V. Selective lysis of cells
EP2439536A1 (en) 2010-10-01 2012-04-11 Nederlandse Organisatie voor toegepast- natuurwetenschappelijk onderzoek TNO New classification method for spectral data
CN103201616B (zh) 2010-11-05 2015-11-25 弗·哈夫曼-拉罗切有限公司 原料的光谱指纹识别
WO2013101262A1 (en) * 2011-02-28 2013-07-04 Waters Technologies Corporation Spectroscopic sample inspection for automated chromatography
BR112013028625A2 (pt) * 2011-06-06 2017-01-24 Biocartis Sa lise seletiva de células através de tensoativos iônicos
DE112012003756B4 (de) * 2011-09-08 2022-03-10 Thermo Electron Scientific Instruments Llc Optisches Emissions- und Transmissionsspektrometer
EA033790B1 (ru) * 2011-12-19 2019-11-26 Opticul Diagnostics Ltd Способ спектрального обнаружения и идентификации микроорганизмов в культуре
WO2014014353A1 (en) 2012-07-18 2014-01-23 Nederlandse Organisatie Voor Toegepast-Natuurwetenschappelijk Onderzoek Tno New classification method for spectral data
FR3009387B1 (fr) * 2013-07-31 2016-11-18 Biomerieux Sa Procede et dispositif d'analyse d'un echantillon biologique
CN103499560B (zh) * 2013-09-29 2015-08-05 浙江大学 一种结合拉曼光谱技术和谱峰比值法的藻种鉴别方法
DE102014003386B4 (de) 2014-03-07 2016-06-23 Celltool Gmbh Verfahren und Vorrichtung zur Qualitätskontrolle eines Blutprodukts
JP6113908B2 (ja) * 2014-03-14 2017-04-12 株式会社東芝 分子検出装置および方法
JP2017512999A (ja) * 2014-03-25 2017-05-25 マルバーン インストゥルメンツ リミテッド 液相に分散したタンパク質のラマン分光法による構造調査
CN104165879B (zh) * 2014-08-19 2016-08-17 中国科学院微生物研究所 用于鉴定军团菌毒力的方法
JP6325423B2 (ja) * 2014-10-10 2018-05-16 アズビル株式会社 液中蛍光検出装置及び液中の蛍光の検出方法
CN108351362B (zh) * 2015-05-28 2021-12-31 Bd科斯特公司 获取和制备用于鉴定和抗生素敏感性试验的微生物样品的自动化方法和系统
FR3044415B1 (fr) * 2015-11-27 2017-12-01 Biomerieux Sa Procede de determination de la reaction d'un microorganisme a son exposition a un antibiotique
CN105441546B (zh) * 2015-12-18 2019-03-22 上海交通大学 基于fish的厌氧消化发酵液中产甲烷菌群的检测方法
CN106770150A (zh) * 2016-05-19 2017-05-31 王桂文 一种快速定量单个微孢子虫孢子海藻糖浓度的方法
AU2017314217A1 (en) * 2016-08-19 2019-03-28 Monash University Spectroscopic systems and methods for the identification and quantification of pathogens
CN108342447B (zh) * 2017-01-22 2021-10-15 中国科学院青岛生物能源与过程研究所 一种筛选与已知菌株表型相似的菌株的方法
KR20240024370A (ko) 2017-07-27 2024-02-23 바이오메리욱스, 인코포레이티드. 격리 튜브
CN107561058B (zh) * 2017-09-12 2020-11-17 青岛啤酒股份有限公司 一种工业Lager酵母菌株风味物质代谢相似性评价方法
CN107703291A (zh) * 2017-11-23 2018-02-16 中山市创艺生化工程有限公司 用于发光免疫分析法的浓缩缓冲液及其制备方法
FR3075825B1 (fr) 2017-12-21 2022-01-21 Biomerieux Sa Procede et systeme d'identificationdu type de gram d'une bacterie
FR3075824B1 (fr) * 2017-12-21 2022-01-14 Biomerieux Sa Procede d'identification d'une levure ou d'une bacterie
CN108226127B (zh) * 2017-12-26 2021-04-06 深圳国际旅行卫生保健中心 测定疟原虫含量的方法和检测疟原虫含量的系统
CN108827936B (zh) * 2018-06-15 2024-03-08 何坚 一种血液培养报阳检测装置与方法
BR112020024296A2 (pt) 2018-08-27 2021-03-09 Regeneron Pharmaceuticals, Inc. Métodos para produção de um intermediário de purificação de proteína concentrado, para monitoramento e controle dos atributos de qualidade críticos em um intermediário de purificação de proteína e para monitorar e controlar os níveis de excipientes no fluido de cultura de células colhido e/ou intermediário de purificação de proteína, e, intermediário de purificação de proteína
EP3953686A4 (en) * 2019-04-09 2022-12-21 Agency for Science, Technology and Research LABEL-FREE DETECTION OF MYCOBACTERIA USING SURFACE-ENHANCED RAMAN SPECTROSCOPY
CN110628762A (zh) * 2019-10-14 2019-12-31 杭州同创越诚基因科技有限公司 一种基于纳米磁珠的核酸提取方法及应用
CN110849866B (zh) * 2019-11-29 2023-01-17 中国人民解放军军事科学院军事医学研究院 一种利用拉曼散射鉴别新生隐球菌和格特隐球菌的方法
RU2739758C1 (ru) * 2020-03-05 2020-12-28 Федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный медицинский исследовательский центр гематологии" Министерства здравоохранения Российской Федерации (ФГБУ "НМИЦ гематологии" Минздрава России) Способ идентификации Candida spp. и других дрожжеподобных грибов из положительной гемокультуры методом матричной лазерной десорбционной ионизационной времяпролетной масс-спектрометрии (MALDI-TOF MS) у больных с инфекцией кровотока
KR102382101B1 (ko) * 2021-07-20 2022-04-04 주식회사 지에프퍼멘텍 미생물 발효에 의한 단백질 생산 공정을 제어하는 방법 및 장치
CN113390853B (zh) * 2021-07-21 2023-04-07 中国科学院苏州生物医学工程技术研究所 利用拉曼光谱鉴别细菌和真菌的方法及系统
KR102413155B1 (ko) * 2021-10-14 2022-06-24 주식회사 휴피트 패혈증 진단용 이산화탄소 비색 센서 기반의 미생물 생장배지
CN114216837B (zh) * 2021-11-16 2023-09-29 北京工业大学 联合流式细胞分选和拉曼技术对Tetrasphaera亚群胞内代谢物测定的方法
CN114216894B (zh) * 2022-01-10 2022-10-18 北京工业大学 基于表面增强拉曼光谱技术快速鉴定土壤中木霉菌的方法
KR102485512B1 (ko) * 2022-03-28 2023-01-06 주식회사 지에프퍼멘텍 미생물 발효에 의한 테트라아세틸파이토스핑고신 생산 공정을 제어하는 방법 및 장치
CN115950871B (zh) * 2022-09-23 2023-12-15 北京蓝晶微生物科技有限公司 聚羟基脂肪酸酯含量的检测方法、装置、系统、设备
WO2024084461A1 (en) * 2022-10-21 2024-04-25 Janssen Research & Development, Llc Methods and systems for microbial detection using raman spectroscopy
CN116130004B (zh) * 2023-01-06 2024-05-24 成都侣康科技有限公司 一种抗菌肽的鉴定处理方法和系统

Family Cites Families (32)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US3928139A (en) * 1973-02-12 1975-12-23 Wadley Res Inst & Blood Bank Detection of microbial pathogens
US3932222A (en) * 1974-12-20 1976-01-13 J. K. & Susie L. Wadley Research Institute And Blood Bank For isolating pathogenic microorganisms
US4038150A (en) * 1976-03-24 1977-07-26 J. K. And Susie L. Wadley Research Institute And Blood Bank Sample mixing and centrifugation apparatus
US4131512A (en) * 1976-11-05 1978-12-26 J. K. And Susie L. Wadley Research Institute And Blood Bank Method for detecting microbial pathogens employing a cushioning agent
US4212948A (en) * 1978-10-18 1980-07-15 J. K. And Susie L. Wadley Research Institute And Blood Bank Apparatus for detecting microbial pathogens employing a cushioning agent
US4410630A (en) * 1981-12-11 1983-10-18 The United States Of America As Represented By The Department Of Health And Human Services Lysis filtration culture chamber
US4693972A (en) * 1984-01-16 1987-09-15 Becton, Dickinson And Company Composition and method for rapid detection of microorganisms in clinical samples
US4829005A (en) * 1984-06-15 1989-05-09 Friedman Michael P Sedimentation filtration microorganism growth culture system
US4847198A (en) * 1987-10-07 1989-07-11 The Board Of Governors For Higher Education, State Of Rhode Island And Providence Plantations Detection and indentification of bacteria by means of ultra-violet excited resonance Raman spectra
US5474910A (en) * 1993-10-15 1995-12-12 Alfano; Robert R. Method and device for detecting biological molecules and/or microorganisms within a desired area or space
JP3406608B2 (ja) * 1994-03-16 2003-05-12 フォス エレクトリック アクティーゼルスカブ 液体サンプルのコンディショニングのための新しい方法
US5599717A (en) * 1994-09-02 1997-02-04 Martin Marietta Energy Systems, Inc. Advanced synchronous luminescence system
FR2732037B1 (fr) * 1995-03-20 1997-05-30 Dbv Procede de detection de microorganismes par separation et culture sur un systeme gelifie, systeme gelifie et necessaire de dosage pour mettre en oeuvre ce procede, utilisation en microbiologie
WO1999046047A2 (en) * 1998-03-10 1999-09-16 Large Scale Proteomics Corporation Detection and characterization of microorganisms
US5948610A (en) * 1998-06-03 1999-09-07 University Of Maryland At Baltimore County Use of matrices comprising liquids and light absorbing particles for analysis of microorganisms by laser desorption mass spectrometry
US20020086289A1 (en) * 1999-06-15 2002-07-04 Don Straus Genomic profiling: a rapid method for testing a complex biological sample for the presence of many types of organisms
EP1198597A1 (de) * 1999-07-22 2002-04-24 Artus Gesellschaft Für Molekularbiologische Diagnostik und Entwicklung MbH. Verfahren zum speziesspezifischen nachweis von organismen
JP2003535330A (ja) * 2000-06-02 2003-11-25 メディコメトリクス アンパーツゼルスカブ 生物試料の分類のための方法及びシステム
FR2829500B1 (fr) * 2001-09-13 2003-12-12 Hemosystem Procede de concentration et de detection de germes pathogenes a partir de produits sanguins et/ou de leurs derives et dispositif pour le mettre en oeuvre
US6780602B2 (en) * 2001-11-01 2004-08-24 Microbiosystems, Limited Partnership Taxonomic identification of pathogenic microorganisms and their toxic proteins
WO2003048396A1 (en) * 2001-12-03 2003-06-12 Seroptix, Inc. A method for identifying markers
US7428045B2 (en) * 2002-01-10 2008-09-23 Chemimage Corporation Raman spectral analysis of pathogens
US7186990B2 (en) * 2002-01-22 2007-03-06 Microbiosystems, Limited Partnership Method and apparatus for detecting and imaging the presence of biological materials
US8688384B2 (en) * 2003-05-12 2014-04-01 River Diagnostics B.V. Automated characterization and classification of microorganisms
EP1692512B1 (en) * 2003-12-09 2012-09-05 bioMérieux, Inc. Methods for detecting bacterial pathogens
US7662562B2 (en) * 2004-08-10 2010-02-16 Becton, Dickinson And Company Method for rapid identification of microorganisms
US20070037135A1 (en) * 2005-08-08 2007-02-15 Barnes Russell H System and method for the identification and quantification of a biological sample suspended in a liquid
JP4918281B2 (ja) * 2006-05-18 2012-04-18 シスメックス株式会社 尿中有形成分分析装置
US7542132B2 (en) * 2006-07-31 2009-06-02 Applied Materials, Inc. Raman spectroscopy as integrated chemical metrology
US8280471B2 (en) * 2007-12-12 2012-10-02 Kimberly-Clark Worldwide, Inc. Fiber optic based detection of autofluorescent bacterial pathogens
WO2010062353A1 (en) * 2008-10-31 2010-06-03 Biomerieux, Inc. Separation device for use in the separation, characterization and/or identification of microorganisms
EP2352992B1 (en) * 2008-10-31 2020-04-22 bioMerieux, Inc. Methods for identification of microorganisms using spectroscopy

Also Published As

Publication number Publication date
CN102272585A (zh) 2011-12-07
CA2741036C (en) 2018-01-09
CN102272585B (zh) 2015-10-07
AU2009320332B2 (en) 2014-07-31
AU2009320332A1 (en) 2010-06-03
US20100136609A1 (en) 2010-06-03
BRPI0919861A2 (pt) 2017-04-04
JP2012507283A (ja) 2012-03-29
EP2361377A1 (en) 2011-08-31
RU2541775C2 (ru) 2015-02-20
KR20110095277A (ko) 2011-08-24
CA2741036A1 (en) 2010-06-03
WO2010062351A1 (en) 2010-06-03
MX2011004106A (es) 2011-08-15
EP2361377B1 (en) 2018-01-31

Similar Documents

Publication Publication Date Title
RU2011114900A (ru) Способы разделения, характеристики и(или) идентификации микроорганизмов с помощью рамановской спектроскопии
RU2011114904A (ru) Способы разделения, характеристики и(или) индентификации микроорганизмов с помощью спектроскопии
RU2011114901A (ru) Способы разделения, характеристики и(или) идентификации микроорганизмов с помощью масс-спектрометрии
JP2012507283A5 (ru)
RU2011114902A (ru) Способы разделения и характеристики микроорганизмов с помощью идентификатора
CN110095608B (zh) 基于磁性分离和dna自组装的肿瘤外泌体纳米荧光传感器
Alves et al. Candida albicans promotes invasion and colonisation of Candida glabrata in a reconstituted human vaginal epithelium
JP6026581B2 (ja) ラマン分光法を使用した微生物の分離、キャラクタリゼーションおよび/または同定方法
Wang et al. Upper gastrointestinal microbiota and digestive diseases
JP2012507712A5 (ru)
Walker et al. A coverslip-based technique for evaluating Staphylococcus aureus biofilm formation on human plasma
Vyzantiadis et al. From the patient to the clinical mycology laboratory: how can we optimise microscopy and culture methods for mould identification?
CN107250346A (zh) 细胞保存液及其利用、以及细胞保存液的制造方法
Peerboom et al. Binding kinetics and lateral mobility of HSV-1 on end-grafted sulfated glycosaminoglycans
JP2007524843A (ja) 保存溶液における標的の検出方法
Stanisce et al. Differential cellular composition of human palatine and pharyngeal tonsils
Zhang et al. Study bacteria–host interactions using intestinal organoids
Parija et al. Evaluation of lacto-phenol cotton blue (LPCB) for detection of Cryptosporidium, Cyclospora and Isospora in the wet mount preparation of stool
Shao et al. Lab-scale preparations of Candida albicans and dual Candida albicans–Candida glabrata biofilms on the surface of medical-grade polyvinyl chloride (PVC) perfusion tube using a modified gravity-supported free-flow biofilm incubator (GS-FFBI)
CN106596941A (zh) 一种检测前列腺癌循环肿瘤细胞的检测方法
Guarner Detection of Microorganisms in Granulomas That Have Been Formalin‐Fixed: Review of the Literature Regarding Use of Molecular Methods
Matera et al. Increase of Vascular Endothelial Growth Factor and Decrease of MCP‐1 and Some Updated Epidemiology Aspects of Cystic Echinococcosis Human Cases in Calabria Region
TWI618931B (zh) 使用細胞增殖法之循環腫瘤細胞的檢測、分離取得方法
CN105695384A (zh) 表达红色荧光蛋白的重组沙门氏菌及其构建方法
Kopitar et al. Specific T cell responses to Helicobacter pylori predict successful eradication therapy

Legal Events

Date Code Title Description
HE9A Changing address for correspondence with an applicant
MM4A The patent is invalid due to non-payment of fees

Effective date: 20191031