RU2011114904A - Способы разделения, характеристики и(или) индентификации микроорганизмов с помощью спектроскопии - Google Patents

Способы разделения, характеристики и(или) индентификации микроорганизмов с помощью спектроскопии Download PDF

Info

Publication number
RU2011114904A
RU2011114904A RU2011114904/28A RU2011114904A RU2011114904A RU 2011114904 A RU2011114904 A RU 2011114904A RU 2011114904/28 A RU2011114904/28 A RU 2011114904/28A RU 2011114904 A RU2011114904 A RU 2011114904A RU 2011114904 A RU2011114904 A RU 2011114904A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
microorganisms
spectroscopy
sample
microorganism
spectroscopic
Prior art date
Application number
RU2011114904/28A
Other languages
English (en)
Other versions
RU2531225C2 (ru
Inventor
Джон УОЛШ
Джонс ХЬЮМЕН
Турмен ТОРП
Бредфорд КЛЭЙ
Кристофер РОНСИК
Original Assignee
Биомерье, Инк.
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Биомерье, Инк. filed Critical Биомерье, Инк.
Publication of RU2011114904A publication Critical patent/RU2011114904A/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2531225C2 publication Critical patent/RU2531225C2/ru

Links

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/02—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving viable microorganisms
    • C12Q1/04—Determining presence or kind of microorganism; Use of selective media for testing antibiotics or bacteriocides; Compositions containing a chemical indicator therefor
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12M—APPARATUS FOR ENZYMOLOGY OR MICROBIOLOGY; APPARATUS FOR CULTURING MICROORGANISMS FOR PRODUCING BIOMASS, FOR GROWING CELLS OR FOR OBTAINING FERMENTATION OR METABOLIC PRODUCTS, i.e. BIOREACTORS OR FERMENTERS
    • C12M1/00—Apparatus for enzymology or microbiology
    • C12M1/12—Apparatus for enzymology or microbiology with sterilisation, filtration or dialysis means
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12M—APPARATUS FOR ENZYMOLOGY OR MICROBIOLOGY; APPARATUS FOR CULTURING MICROORGANISMS FOR PRODUCING BIOMASS, FOR GROWING CELLS OR FOR OBTAINING FERMENTATION OR METABOLIC PRODUCTS, i.e. BIOREACTORS OR FERMENTERS
    • C12M1/00—Apparatus for enzymology or microbiology
    • C12M1/34—Measuring or testing with condition measuring or sensing means, e.g. colony counters
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N21/00—Investigating or analysing materials by the use of optical means, i.e. using sub-millimetre waves, infrared, visible or ultraviolet light
    • G01N21/62—Systems in which the material investigated is excited whereby it emits light or causes a change in wavelength of the incident light
    • G01N21/63—Systems in which the material investigated is excited whereby it emits light or causes a change in wavelength of the incident light optically excited
    • G01N21/65—Raman scattering
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/68—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving proteins, peptides or amino acids
    • G01N33/6803—General methods of protein analysis not limited to specific proteins or families of proteins
    • G01N33/6848—Methods of protein analysis involving mass spectrometry
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N21/00—Investigating or analysing materials by the use of optical means, i.e. using sub-millimetre waves, infrared, visible or ultraviolet light
    • G01N21/17—Systems in which incident light is modified in accordance with the properties of the material investigated
    • G01N21/25—Colour; Spectral properties, i.e. comparison of effect of material on the light at two or more different wavelengths or wavelength bands
    • G01N21/31—Investigating relative effect of material at wavelengths characteristic of specific elements or molecules, e.g. atomic absorption spectrometry
    • G01N21/35—Investigating relative effect of material at wavelengths characteristic of specific elements or molecules, e.g. atomic absorption spectrometry using infrared light
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N21/00—Investigating or analysing materials by the use of optical means, i.e. using sub-millimetre waves, infrared, visible or ultraviolet light
    • G01N21/17—Systems in which incident light is modified in accordance with the properties of the material investigated
    • G01N21/25—Colour; Spectral properties, i.e. comparison of effect of material on the light at two or more different wavelengths or wavelength bands
    • G01N21/31—Investigating relative effect of material at wavelengths characteristic of specific elements or molecules, e.g. atomic absorption spectrometry
    • G01N21/35—Investigating relative effect of material at wavelengths characteristic of specific elements or molecules, e.g. atomic absorption spectrometry using infrared light
    • G01N21/3581—Investigating relative effect of material at wavelengths characteristic of specific elements or molecules, e.g. atomic absorption spectrometry using infrared light using far infrared light; using Terahertz radiation
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N21/00—Investigating or analysing materials by the use of optical means, i.e. using sub-millimetre waves, infrared, visible or ultraviolet light
    • G01N21/17—Systems in which incident light is modified in accordance with the properties of the material investigated
    • G01N21/25—Colour; Spectral properties, i.e. comparison of effect of material on the light at two or more different wavelengths or wavelength bands
    • G01N21/31—Investigating relative effect of material at wavelengths characteristic of specific elements or molecules, e.g. atomic absorption spectrometry
    • G01N21/35—Investigating relative effect of material at wavelengths characteristic of specific elements or molecules, e.g. atomic absorption spectrometry using infrared light
    • G01N21/359—Investigating relative effect of material at wavelengths characteristic of specific elements or molecules, e.g. atomic absorption spectrometry using infrared light using near infrared light
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N21/00—Investigating or analysing materials by the use of optical means, i.e. using sub-millimetre waves, infrared, visible or ultraviolet light
    • G01N21/17—Systems in which incident light is modified in accordance with the properties of the material investigated
    • G01N21/47—Scattering, i.e. diffuse reflection
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N21/00—Investigating or analysing materials by the use of optical means, i.e. using sub-millimetre waves, infrared, visible or ultraviolet light
    • G01N21/62—Systems in which the material investigated is excited whereby it emits light or causes a change in wavelength of the incident light
    • G01N21/63—Systems in which the material investigated is excited whereby it emits light or causes a change in wavelength of the incident light optically excited
    • G01N21/64—Fluorescence; Phosphorescence
    • Y—GENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
    • Y02—TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
    • Y02A—TECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE
    • Y02A50/00—TECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE in human health protection, e.g. against extreme weather
    • Y02A50/30—Against vector-borne diseases, e.g. mosquito-borne, fly-borne, tick-borne or waterborne diseases whose impact is exacerbated by climate change

Landscapes

  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Hematology (AREA)
  • Pathology (AREA)
  • Bioinformatics & Computational Biology (AREA)
  • General Physics & Mathematics (AREA)
  • Urology & Nephrology (AREA)
  • Toxicology (AREA)
  • Food Science & Technology (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Spectroscopy & Molecular Physics (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Sustainable Development (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
  • Investigating, Analyzing Materials By Fluorescence Or Luminescence (AREA)
  • Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)
  • Investigating Or Analysing Materials By The Use Of Chemical Reactions (AREA)
  • Investigating Or Analysing Materials By Optical Means (AREA)

Abstract

1. Способ характеристики и/или идентификации микроорганизма из тестируемого образца, включающий:(a) получение тестируемого образца, о котором известно, что он содержит или может содержать микроорганизмы;(b) селективный лизис клеток не микроорганизмов в тестируемом образце с получением лизированного образца;(c) разделение микроорганизмов от других компонентов лизированного образца с образованием изолированного образца микроорганизмов;(d) спектроскопическое исследование указанных изолированных микроорганизмов с получением спектроскопических измерений указанного микроорганизма и(e) характеристику и/или идентификацию указанного микроорганизма в изолированном образце путем сравнения спектроскопических измерений со снятыми спектроскопическими измерениями известных микроорганизмов или предсказанными спектроскопическими свойствами известных микроорганизмов.2. Способ по п.1, где стадии (с) и (d) осуществляют в герметично закрытом контейнере, и где стадия исследования (d) является неинвазивной.3. Способ по п.1, где спектроскопические измерения являются результатом флуоресцентной спектроскопии и рамановской спектроскопии.4. Способ по п.1, где спектроскопия выбрана из группы, состоящей из флуоресцентной спектроскопии, спектроскопии диффузного отражения, абсорбционной и трансмиссионной спектроскопии, инфракрасной спектроскопии, терагерцевой спектроскопии и любой их комбинации.5. Способ по п.4, где флуоресцентную спектроскопию измеряют во фронтальном режиме.6. Способ по п.1, где идентификация основана на собственной флуоресценции указанного микроорганизма.7. Способ по п.6, где спектроскопия включает определени

Claims (37)

1. Способ характеристики и/или идентификации микроорганизма из тестируемого образца, включающий:
(a) получение тестируемого образца, о котором известно, что он содержит или может содержать микроорганизмы;
(b) селективный лизис клеток не микроорганизмов в тестируемом образце с получением лизированного образца;
(c) разделение микроорганизмов от других компонентов лизированного образца с образованием изолированного образца микроорганизмов;
(d) спектроскопическое исследование указанных изолированных микроорганизмов с получением спектроскопических измерений указанного микроорганизма и
(e) характеристику и/или идентификацию указанного микроорганизма в изолированном образце путем сравнения спектроскопических измерений со снятыми спектроскопическими измерениями известных микроорганизмов или предсказанными спектроскопическими свойствами известных микроорганизмов.
2. Способ по п.1, где стадии (с) и (d) осуществляют в герметично закрытом контейнере, и где стадия исследования (d) является неинвазивной.
3. Способ по п.1, где спектроскопические измерения являются результатом флуоресцентной спектроскопии и рамановской спектроскопии.
4. Способ по п.1, где спектроскопия выбрана из группы, состоящей из флуоресцентной спектроскопии, спектроскопии диффузного отражения, абсорбционной и трансмиссионной спектроскопии, инфракрасной спектроскопии, терагерцевой спектроскопии и любой их комбинации.
5. Способ по п.4, где флуоресцентную спектроскопию измеряют во фронтальном режиме.
6. Способ по п.1, где идентификация основана на собственной флуоресценции указанного микроорганизма.
7. Способ по п.6, где спектроскопия включает определение матрицы возбуждения-испускания (ЕЕМ).
8. Способ по п.7, где ЕЕМ сравнивают с базой данных ЕЕМ известных микроорганизмов.
9. Способ по п.1, где указанные микроорганизмы характеризуют на основании одной или более чем одной фенотипической и/или морфологической характеристики.
10. Способ по п.1, где микроорганизмы характеризуют на основании одного или более чем одного измерения времени обнаружения, скорости роста, а также размера, формы, цвета и/или плотности осадка микроорганизма.
11. Способ по п.1, где указанные микроорганизмы характеризуют по одной или более чем одной модели классификации, выбранной из группы, состоящей из групп по Граму, клинических групп по Граму, терапевтических групп, функциональных групп и групп собственной естественной флуоресценции.
12. Способ по п.1, где микроорганизмы идентифицируют на уровне рода, на уровне вида или на уровне штамма.
13. Способ по п.1, где стадию селективного лизиса (b) осуществляют путем разрушения ультразвуком, осмотического шока, химической обработки или их комбинации.
14. Способ по п.1, где стадию селективного лизиса (b) осуществляют, используя раствор для лизиса, содержащий один или более чем один детергент.
15. Способ по п.14, где один или более чем один детергент выбран из группы, состоящей из Тритона® Х-100, Тритона® X-100-R, Тритона® Х-114, NP-40, Genapol® С-100, Genapol® Х-100, Igepal® CA 630, Ariasolve™ 200, Brij® 96/97, CHAPS, октил-пара-D-глюкопиранозида, сапонина, нонаэтиленгликоля монододецилового эфира (C12E9, полидоценол), додецилсульфата натрия, N-лаурилсаркозина, дезоксихолата натрия, желчных солей, гексадецилтриметиламмония бромида, SB3-10, SB3-12, амидосульфобетаина-14, C7BzO, Brij® 98, Brij® 58, Brij® 35, Твин® 80, Твин® 20, Pluronic® L64, Pluronic® P84, не детергентных сульфобетаинов (NDSB 201), амфиполов (PMAL-C8) и метил-β-циклодекстрина.
16. Способ по п.14, где указанный детергент представляет собой полиоксиэтиленовый детергент, включающий структуру С12-18/Е9-10.
17. Способ по п.16, где полиоксиэтиленовый детергент выбран из группы, состоящей из Brij® 97, Brij® 96V, Genapol® C-100, Genapol® X-100 и полидоценола.
18. Способ по п.14, где указанный раствор для лизиса дополнительно содержит один или более чем один фермент, который включает смесь одной или более чем одной протеиназы и одной или более чем одной нуклеазы.
19. Способ по п.14, где указанный раствор для лизиса содержит один или более чем один буферный агент.
20. Способ по п.1, где стадию разделения (с) осуществляют путем фильтрования, которое приводит в результате к изолированному образцу микроорганизма.
21. Способ по п.1, где лизированный образец наслаивают на градиент плотности в указанном контейнере, и где контейнер центрифугируют с образованием осадка микроорганизмов.
22. Способ по п.21, где градиент плотности включает одно или более чем одно из коллоидного кремнезема, йодированных контрастных агентов, сахарозы, иммерсионного масла для микроскопа, минерального масла, силиконового масла, фторсиликонового масла, силиконового геля, метризоата-фиколла®, диатризоата-декстрана, карбоксиметилцеллюлозы, гидроксипропилметилцеллюлозы, полиэтиленоксида (высокой молекулярной массы), Pluronic® F127, Pluronic® F68, полиакриловой кислоты, сшитого поливинилового спирта, сшитого поливинилпирролидина, сополимера метилового эфира ПЭГ и метакрилата, пектина, агарозы, ксантана, геллана, Phytagel®, сорбита, фиколла®, глицерина, декстрана, гликогена, хлорида цезия, перфторуглеродных жидкостей и/или гидрофторуглеродной жидкости.
23. Способ по п.1, где тестируемый образец представляет собой образец культуры, о которой известно, что она содержит микроорганизмы.
24. Способ характеристики и/или идентификации микроорганизма из гемокультуры, включающий:
(a) получение образца из гемокультуры, о которой известно, что она содержит или может содержать микроорганизмы;
(b) селективный лизис клеток не микроорганизмов в указанном образце с получением лизированного образца;
(c) наслаивание указанного лизированного образца на градиент плотности в герметичном контейнере;
(d) центрифугирование контейнера для разделения микроорганизмов от других компонентов указанного образца и образования осадка микроорганизмов;
(e) спектроскопическое исследование указанных изолированных микроорганизмов с получением спектроскопических измерений указанного микроорганизма и
(f) характеристику и/или идентификацию данного микроорганизма в изолированном образце путем сравнения спектроскопических измерений со снятыми спектроскопическими измерениями известных микроорганизмов или предсказанными спектроскопическими свойствами известных микроорганизмов.
25. Способ характеристики и/или идентификации микроорганизма, включающий:
(a) получение тестируемого образца, о котором известно, что он содержит или может содержать микроорганизмы;
(b) помещение указанного тестируемого образца в герметичный контейнер;
(c) разделение in situ микроорганизмов от других компонентов тестируемого образца с образованием изолированного образца микроорганизмов из микроорганизмов в указанном герметичном контейнере;
(d) спектроскопическое исследование указанных изолированных микроорганизмов in situ с получением спектроскопических измерений указанного микроорганизма и
(e) характеристику и/или идентификацию указанного микроорганизма в указанном изолированном образце путем сравнения спектроскопических измерений со снятыми спектроскопическими измерениями известных микроорганизмов или предсказанными спектроскопическими свойствами известных микроорганизмов.
26. Способ по п.1, где спектроскопические измерения являются результатом флуоресцентной спектроскопии и рамановской спектроскопии.
27. Способ по п.25, где спектроскопия выбрана из группы, состоящей из флуоресцентной спектроскопии, спектроскопии диффузного отражения, абсорбционной и трансмиссионной спектроскопии, инфракрасной спектроскопии, терагерцевой спектроскопии и любой их комбинации.
28. Способ по п.27, где идентификация основана на собственной флуоресценции указанного микроорганизма.
29. Способ по п.28, где спектроскопия включает определение матрицы возбуждения-испускания (ЕЕМ), и где указанную ЕЕМ сравнивают с базой данных ЕЕМ известных микроорганизмов.
30. Способ по п.25, где стадию разделения (с) осуществляют путем центрифугирования или фильтрования.
31. Способ по п.25, где образец наслаивают на градиент плотности в контейнере, и где контейнер центрифугируют с образованием осадка микроорганизмов.
32. Способ по п.25, где градиент плотности включает одно или более чем одно из коллоидного кремнезема, йодированных контрастных агентов, сахарозы, иммерсионного масла для микроскопа, минерального масла, силиконового масла, фторсиликонового масла, силиконового геля, метризоата-фиколла®, диатризоата-декстрана, карбоксиметилцеллюлозы, гидроксипропилметилцеллюлозы, полиэтиленоксида (высокой молекулярной массы), Pluronic® F127, Pluronic® F68, полиакриловой кислоты, сшитого поливинилового спирта, сшитого поливинилпирролидина, сополимера метилового эфира ПЭГ и метакрилата, пектина, агарозы, ксантана, геллана, Phytagel®, сорбита, фиколла®, глицерина, декстрана, гликогена, хлорида цезия, перфторуглеродных жидкостей и/или гидрофторуглеродной жидкости.
33. Способ по п.25, где указанные микроорганизмы характеризуют на основании одной или более чем одной фенотипической и/или морфологической характеристики.
34. Способ по п.25, где указанные микроорганизмы характеризуют на основании одного или более чем одного измерения времени обнаружения, скорости роста, а также размера, формы, цвета и/или плотности осадка микроорганизма.
35. Способ по п.25, где микроорганизмы характеризуют по одной или более чем одной модели классификации, выбранной из группы, состоящей из групп по Граму, клинических групп по Граму, терапевтических групп, функциональных групп и групп собственной естественной флуоресценции.
36. Способ по п.25, где микроорганизмы идентифицируют на уровне рода, на уровне вида или на уровне штамма.
37. Способ по п.25 где тестируемый образец представляет собой образец культуры, о которой известно, что она содержит микроорганизмы.
RU2011114904/10A 2008-10-31 2009-10-30 Способы идентификации микроорганизмов с помощью спектроскопии (варианты) RU2531225C2 (ru)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US11018708P 2008-10-31 2008-10-31
US61/110,187 2008-10-31
PCT/US2009/005893 WO2010062356A1 (en) 2008-10-31 2009-10-30 Methods for separation, characterization and/or identification of microorganisms using spectroscopy

Publications (2)

Publication Number Publication Date
RU2011114904A true RU2011114904A (ru) 2012-12-10
RU2531225C2 RU2531225C2 (ru) 2014-10-20

Family

ID=42542818

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2011114904/10A RU2531225C2 (ru) 2008-10-31 2009-10-30 Способы идентификации микроорганизмов с помощью спектроскопии (варианты)

Country Status (11)

Country Link
US (1) US8652800B2 (ru)
EP (1) EP2352992B1 (ru)
JP (1) JP2012507712A (ru)
KR (1) KR20110091717A (ru)
CN (1) CN102203588B (ru)
AU (1) AU2009320337B2 (ru)
BR (1) BRPI0919895B1 (ru)
CA (1) CA2740836C (ru)
MX (1) MX2011003982A (ru)
RU (1) RU2531225C2 (ru)
WO (1) WO2010062356A1 (ru)

Families Citing this family (50)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US20120077206A1 (en) 2003-07-12 2012-03-29 Accelr8 Technology Corporation Rapid Microbial Detection and Antimicrobial Susceptibility Testing
JP4773348B2 (ja) 2003-07-12 2011-09-14 アクセラー８ テクノロジー コーポレイション 高感度かつ迅速なバイオ検出法
SI1945632T1 (sl) 2005-11-08 2014-03-31 Vertex Pharmaceuticals Incorporated Heterocikliäśni modulatorji za prenaĺ alce z atp-vezavno kaseto
US8512975B2 (en) * 2008-07-24 2013-08-20 Biomerieux, Inc. Method for detection and characterization of a microorganism in a sample using time dependent spectroscopic measurements
US10167494B2 (en) * 2008-10-31 2019-01-01 Biomerieux, Inc. Method for detection, characterization and/or identification of microorganisms in a sealed container
EP2364447B1 (en) * 2008-10-31 2019-06-12 Biomerieux, Inc Method for the identification of microorganisms
AU2009320332B2 (en) * 2008-10-31 2014-07-31 Biomerieux, Inc. Methods for separation, characterization, and/or identification of microorganisms using raman spectroscopy
AU2009333848B2 (en) * 2008-12-16 2016-02-18 Biomerieux, Inc. Methods for the characterization of microorganisms on solid or semi-solid media
FR2942806B1 (fr) * 2009-03-03 2011-09-02 Assist Publ Hopitaux De Paris Procede d'identification de germes en milieu liquide
WO2010129779A1 (en) 2009-05-07 2010-11-11 Biomerieux, Inc. Methods for antimicrobial resistance determination
US20100291618A1 (en) 2009-05-15 2010-11-18 Biomerieux, Inc. Methods for rapid identification and/or characterization of a microbial agent in a sample
EP2333105A1 (en) * 2009-12-08 2011-06-15 Koninklijke Philips Electronics N.V. Selective lysis of cells
CA2795804C (en) 2010-04-07 2021-10-26 Vertex Pharmaceuticals Incorporated Pharmaceutical compositions of 3-(6-(1-(2,2-difluorobenzo[d][1,3]dioxol-5-yl) cyclopropanecarboxamido)-3-methylpyriodin-2-yl)benzoic acid and administration thereof
DE102010033105B4 (de) * 2010-08-02 2016-05-04 Bruker Daltonik Gmbh Massenspektrometrische Sepsisdiagnose ohne Blutkultur
WO2012083150A2 (en) 2010-12-17 2012-06-21 Biomerieux, Inc. Methods for the isolation, accumulation characterization and/or identification of microorganisms using a filtration and sample transfer device
ES2551922T3 (es) 2011-03-07 2015-11-24 Accelerate Diagnostics, Inc. Sistemas rápidos de purificación celular
US10254204B2 (en) 2011-03-07 2019-04-09 Accelerate Diagnostics, Inc. Membrane-assisted purification
US9863006B2 (en) 2011-06-06 2018-01-09 Biocartis Nv Selective lysis of cells by ionic surfactants
US10519482B2 (en) * 2012-02-29 2019-12-31 Becton, Dickinson And Company Formulations and process for isolating viable microorganisms from positive blood cultures
EP2648133A1 (fr) * 2012-04-04 2013-10-09 Biomerieux Identification de microorganismes par spectrometrie et classification structurée
FR3001464B1 (fr) * 2013-01-25 2016-02-26 Biomerieux Sa Procede d'isolement specifique d'acides nucleiques d'interet
US9677109B2 (en) 2013-03-15 2017-06-13 Accelerate Diagnostics, Inc. Rapid determination of microbial growth and antimicrobial susceptibility
DE102013022016B4 (de) 2013-12-20 2015-07-09 Bruker Daltonik Gmbh Mikroben-Identifizierung durch Massenspektrometrie und Infrarot-Spektrometrie
US20150324969A1 (en) * 2014-05-09 2015-11-12 Fluid Imaging Technologies, Inc. System and method for microorganism effectiveness analysis using particle imaging
CA2949732C (en) 2014-06-13 2023-01-17 Q-Linea Ab Method for detecting and characterising a microorganism
PT3221692T (pt) * 2014-11-18 2021-09-10 Vertex Pharma Processo de realização de testagem de alta produtividade por cromatografia líquida de alta eficiência
CN104655695B (zh) * 2015-02-11 2017-10-31 江南大学 一种检测革兰氏阴性菌信号分子的磁性分子印迹传感器
WO2016142825A1 (en) * 2015-03-06 2016-09-15 Pocared Diagnostics Ltd. Reagent-free identification of bacteria containing resistance genes using a rapid intrinsic fluorescence method
US10253355B2 (en) 2015-03-30 2019-04-09 Accelerate Diagnostics, Inc. Instrument and system for rapid microorganism identification and antimicrobial agent susceptibility testing
AU2016243656A1 (en) 2015-03-30 2017-11-09 Accelerate Diagnostics, Inc. Instrument and system for rapid microorganism identification and antimicrobial agent susceptibility testing
GB201507026D0 (en) 2015-04-24 2015-06-10 Linea Ab Q Medical sample transportation container
CN106198482B (zh) * 2015-05-04 2019-07-05 清华大学 基于拉曼光谱的检测保健品中是否添加有西药的方法
GB201511129D0 (en) 2015-06-24 2015-08-05 Linea Ab Q Method of determining antimicrobial susceptibility of a microorganism
JP2017090156A (ja) * 2015-11-06 2017-05-25 浜松ホトニクス株式会社 カビの生死判定方法及びカビの生死判定装置
GB2554767A (en) 2016-04-21 2018-04-11 Q Linea Ab Detecting and characterising a microorganism
GB201617713D0 (en) 2016-10-19 2016-11-30 Q-Linea Ab Method for recovering microbial cells
CN110325280B (zh) * 2017-01-25 2022-04-05 烟台澳斯邦生物工程有限公司 用于诊断目的的自动化样品处理的设备和方法
WO2018148498A1 (en) 2017-02-09 2018-08-16 Karcher North America, Inc. Floor cleaning device with disinfection capabilities
NL2019320B1 (en) * 2017-03-02 2018-09-21 Biosparq B V Diagnostic method and system for diagnosis
DE102017108278B4 (de) 2017-04-19 2019-03-07 Bruker Daltonik Gmbh Mikrobieller Teststandard für die Verwendung in der Infrarot-Spektrometrie
US11325117B2 (en) 2017-07-27 2022-05-10 Biomerieux, Inc. Centrifugally separating samples in a container having a seal and containing a plunger for opening the seal
FR3075824B1 (fr) 2017-12-21 2022-01-14 Biomerieux Sa Procede d'identification d'une levure ou d'une bacterie
CN109060674A (zh) * 2018-08-24 2018-12-21 张晓焦 微生物识别方法
CN109593676B (zh) * 2018-12-21 2023-04-07 江苏大学 一种用于酸菜发酵液中微生物分离的培养基及其制备方法
GB201919190D0 (en) * 2019-12-23 2020-02-05 Celltool Gmbh Identification of microbial contaminations or infections in liquid samples by raman spectroscopy
US11231324B2 (en) * 2020-02-13 2022-01-25 Kaiser Optical Systems Inc. Real-time monitoring of wine fermentation properties using Raman spectroscopy
DE102020105123B3 (de) * 2020-02-27 2021-07-01 Bruker Daltonik Gmbh Verfahren zum spektrometrischen Charakterisieren von Mikroorganismen
US20220011298A1 (en) * 2020-07-10 2022-01-13 Acutis Diagnostics, Inc. Methods and compositions for isolation and rapid detection of micro-organisms from blood and bodily fluids
EP4337260A1 (en) * 2021-05-14 2024-03-20 The Texas A&M University System A platform for the fast, label-free, automated evaluation of sterility and bioburden
CN117368470A (zh) * 2023-10-09 2024-01-09 南通如日纺织有限公司 一种纺织品抗菌检测与质量评估系统

Family Cites Families (43)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US3928139A (en) * 1973-02-12 1975-12-23 Wadley Res Inst & Blood Bank Detection of microbial pathogens
US3932222A (en) * 1974-12-20 1976-01-13 J. K. & Susie L. Wadley Research Institute And Blood Bank For isolating pathogenic microorganisms
US4038150A (en) * 1976-03-24 1977-07-26 J. K. And Susie L. Wadley Research Institute And Blood Bank Sample mixing and centrifugation apparatus
US4131512A (en) * 1976-11-05 1978-12-26 J. K. And Susie L. Wadley Research Institute And Blood Bank Method for detecting microbial pathogens employing a cushioning agent
US4212948A (en) * 1978-10-18 1980-07-15 J. K. And Susie L. Wadley Research Institute And Blood Bank Apparatus for detecting microbial pathogens employing a cushioning agent
US4410630A (en) * 1981-12-11 1983-10-18 The United States Of America As Represented By The Department Of Health And Human Services Lysis filtration culture chamber
US4693972A (en) * 1984-01-16 1987-09-15 Becton, Dickinson And Company Composition and method for rapid detection of microorganisms in clinical samples
US4829005A (en) * 1984-06-15 1989-05-09 Friedman Michael P Sedimentation filtration microorganism growth culture system
US4847198A (en) * 1987-10-07 1989-07-11 The Board Of Governors For Higher Education, State Of Rhode Island And Providence Plantations Detection and indentification of bacteria by means of ultra-violet excited resonance Raman spectra
ATE91023T1 (de) * 1987-12-01 1993-07-15 Biotope Inc Verfahren und vorrichtungen zur durchfuehrung von untersuchungen.
RU2054486C1 (ru) * 1992-09-01 1996-02-20 Валерий Георгиевич Петухов Способ идентификации микроорганизмов
US5474910A (en) * 1993-10-15 1995-12-12 Alfano; Robert R. Method and device for detecting biological molecules and/or microorganisms within a desired area or space
AU1946095A (en) * 1994-03-16 1995-10-03 Foss Electric A/S Novel method for the conditioning of liquid samples
US5599717A (en) * 1994-09-02 1997-02-04 Martin Marietta Energy Systems, Inc. Advanced synchronous luminescence system
JPH08145796A (ja) * 1994-11-25 1996-06-07 Hitachi Ltd 三次元スペクトル表示装置
FR2732037B1 (fr) * 1995-03-20 1997-05-30 Dbv Procede de detection de microorganismes par separation et culture sur un systeme gelifie, systeme gelifie et necessaire de dosage pour mettre en oeuvre ce procede, utilisation en microbiologie
DE19801661A1 (de) 1998-01-17 1999-07-22 Artus Ges Fuer Molekularbiolog Schnell-Detektionsverfahren für Organismen durch Längenbestimmung ausgewählter Nukleinsäurebereiche
JP2002505866A (ja) * 1998-03-10 2002-02-26 ラージ・スケール・プローティオーミックス・コーポレイション 微生物の検出および特性付与
US5948610A (en) * 1998-06-03 1999-09-07 University Of Maryland At Baltimore County Use of matrices comprising liquids and light absorbing particles for analysis of microorganisms by laser desorption mass spectrometry
US20020086289A1 (en) * 1999-06-15 2002-07-04 Don Straus Genomic profiling: a rapid method for testing a complex biological sample for the presence of many types of organisms
US6921817B1 (en) * 1999-08-05 2005-07-26 Ranjit Banerjee Methods for simultaneous isolation of biologically active transcription factors and DNA
WO2001092859A1 (en) * 2000-06-02 2001-12-06 Medicometrics Aps Method and system for classifying a biological sample
AU2001288762A1 (en) * 2000-09-08 2002-03-22 Large Scale Proteomics Corporation Detection and characterization of microorganisms
FR2829500B1 (fr) * 2001-09-13 2003-12-12 Hemosystem Procede de concentration et de detection de germes pathogenes a partir de produits sanguins et/ou de leurs derives et dispositif pour le mettre en oeuvre
US6780602B2 (en) * 2001-11-01 2004-08-24 Microbiosystems, Limited Partnership Taxonomic identification of pathogenic microorganisms and their toxic proteins
AU2002346615B2 (en) * 2001-12-03 2008-04-17 Seroptix, Inc. A method for identifying markers
US7428045B2 (en) * 2002-01-10 2008-09-23 Chemimage Corporation Raman spectral analysis of pathogens
US7186990B2 (en) * 2002-01-22 2007-03-06 Microbiosystems, Limited Partnership Method and apparatus for detecting and imaging the presence of biological materials
NZ538628A (en) 2002-08-12 2008-06-30 Dynavax Tech Corp Immunomodulatory compositions, methods of making, and methods of use thereof
US8688384B2 (en) * 2003-05-12 2014-04-01 River Diagnostics B.V. Automated characterization and classification of microorganisms
EP1692512B1 (en) * 2003-12-09 2012-09-05 bioMérieux, Inc. Methods for detecting bacterial pathogens
AU2005200670B2 (en) 2004-02-20 2007-05-03 F. Hoffmann-La Roche Ag Adsorption of nucleic acids to a solid phase
US7662562B2 (en) * 2004-08-10 2010-02-16 Becton, Dickinson And Company Method for rapid identification of microorganisms
US20070037135A1 (en) * 2005-08-08 2007-02-15 Barnes Russell H System and method for the identification and quantification of a biological sample suspended in a liquid
NZ542230A (en) 2005-09-05 2008-05-30 Veritide Ltd System for spore detection
JP4868879B2 (ja) * 2006-02-14 2012-02-01 三洋電機株式会社 細胞状態検出装置
JP4918281B2 (ja) * 2006-05-18 2012-04-18 シスメックス株式会社 尿中有形成分分析装置
WO2009011565A1 (en) 2007-07-17 2009-01-22 Erasmus University Medical Center Rotterdam Method for typing and identification of micro-organisms
EP2209904B1 (en) 2007-10-10 2017-03-01 Pocared Diagnostics Ltd. System for conducting the identification of bacteria in urine
US8280471B2 (en) * 2007-12-12 2012-10-02 Kimberly-Clark Worldwide, Inc. Fiber optic based detection of autofluorescent bacterial pathogens
MX336963B (es) 2008-02-19 2016-02-08 Becton Dickinson Co Sistemas y metodos de identificacion presuntiva de microorganismos tipo en un cultivo.
US9128058B2 (en) * 2008-10-31 2015-09-08 Biomerieux, Inc. Method for separation and characterization of microorganisms using identifier agents
KR20110091718A (ko) * 2008-10-31 2011-08-12 바이오메리욱스, 인코포레이티드. 질량 분석법을 이용하여 미생물을 분리하고/하거나 특성규명하고/하거나 동정하는 방법

Also Published As

Publication number Publication date
US8652800B2 (en) 2014-02-18
CA2740836C (en) 2017-03-21
AU2009320337B2 (en) 2014-07-31
CN102203588B (zh) 2015-03-18
WO2010062356A1 (en) 2010-06-03
CN102203588A (zh) 2011-09-28
AU2009320337A1 (en) 2010-06-03
KR20110091717A (ko) 2011-08-12
BRPI0919895A2 (pt) 2016-02-16
EP2352992A1 (en) 2011-08-10
JP2012507712A (ja) 2012-03-29
EP2352992B1 (en) 2020-04-22
US20100129858A1 (en) 2010-05-27
MX2011003982A (es) 2011-09-21
CA2740836A1 (en) 2010-06-03
BRPI0919895B1 (pt) 2019-08-13
RU2531225C2 (ru) 2014-10-20

Similar Documents

Publication Publication Date Title
RU2011114904A (ru) Способы разделения, характеристики и(или) индентификации микроорганизмов с помощью спектроскопии
RU2011114900A (ru) Способы разделения, характеристики и(или) идентификации микроорганизмов с помощью рамановской спектроскопии
RU2533252C2 (ru) Способы разделения и характеристики микроорганизмов с помощью идентификатора
JP6026581B2 (ja) ラマン分光法を使用した微生物の分離、キャラクタリゼーションおよび／または同定方法
JP2012507712A5 (ru)
Lewis et al. Morphologic and molecular evaluation of Chlamydia trachomatis growth in human endocervix reveals distinct growth patterns
US10167494B2 (en) Method for detection, characterization and/or identification of microorganisms in a sealed container
JP2012507283A5 (ru)
RU2011114901A (ru) Способы разделения, характеристики и(или) идентификации микроорганизмов с помощью масс-спектрометрии
Singh et al. Rapid diagnosis of intestinal parasitic protozoa, with a focus on Entamoeba histolytica
BRPI1015218B1 (pt) Métodos para determinar a resistência antimicrobiana
CN106323925A (zh) 一种检测真菌和皮肤寄生虫的荧光染色剂
Kuzehkanan et al. A sensitive and specific PCR based method for identification of Cryptosporidium Sp. using new primers from 18S ribosomal RNA
CN106244535A (zh) 孕妇外周血中胎儿游离dna的保存剂及其构成的真空采血管
Vyzantiadis et al. From the patient to the clinical mycology laboratory: how can we optimise microscopy and culture methods for mould identification?
Parija et al. Evaluation of lacto-phenol cotton blue (LPCB) for detection of Cryptosporidium, Cyclospora and Isospora in the wet mount preparation of stool
KR101483883B1 (ko) 세포 계수가 필요 없는 신규한 면역활성 측정방법
JP6182574B2 (ja) 分光法を使用した微生物の分離、キャラクタリゼーションおよび／または同定方法
CN107478477A (zh) 一种黄疸、溶血、脂血的血清处理方法
CN107177524A (zh) 一种人附红细胞体体外培养方法
Misra et al. Micro-Raman spectroscopy study of ALVAC virus infected chicken embryo cells
Salleh et al. An improved stool concentration procedure for the detection of Cryptosporidium oocysts in Orang Asli stool samples
CN109371014A (zh) 一种人血液样本的保存及rna提取方法
CN104498375A (zh) 一株具有内毒素吸附特性的耶氏酵母及其吸附特性研究方法

Legal Events

Date Code Title Description
HE9A Changing address for correspondence with an applicant
MM4A The patent is invalid due to non-payment of fees

Effective date: 20191031