RU2004120769A - Олигонуклеотид, контролирующий область гибридизации, и его применение - Google Patents
Олигонуклеотид, контролирующий область гибридизации, и его применение Download PDFInfo
- Publication number
- RU2004120769A RU2004120769A RU2004120769/13A RU2004120769A RU2004120769A RU 2004120769 A RU2004120769 A RU 2004120769A RU 2004120769/13 A RU2004120769/13 A RU 2004120769/13A RU 2004120769 A RU2004120769 A RU 2004120769A RU 2004120769 A RU2004120769 A RU 2004120769A
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- oligonucleotide
- nucleotide sequence
- hybridization
- hybridizing region
- specified
- Prior art date
Links
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6809—Methods for determination or identification of nucleic acids involving differential detection
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6844—Nucleic acid amplification reactions
- C12Q1/686—Polymerase chain reaction [PCR]
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2525/00—Reactions involving modified oligonucleotides, nucleic acids, or nucleotides
- C12Q2525/10—Modifications characterised by
- C12Q2525/101—Modifications characterised by incorporating non-naturally occurring nucleotides, e.g. inosine
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2525/00—Reactions involving modified oligonucleotides, nucleic acids, or nucleotides
- C12Q2525/10—Modifications characterised by
- C12Q2525/155—Modifications characterised by incorporating/generating a new priming site
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2525/00—Reactions involving modified oligonucleotides, nucleic acids, or nucleotides
- C12Q2525/10—Modifications characterised by
- C12Q2525/161—Modifications characterised by incorporating target specific and non-target specific sites
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2531/00—Reactions of nucleic acids characterised by
- C12Q2531/10—Reactions of nucleic acids characterised by the purpose being amplify/increase the copy number of target nucleic acid
- C12Q2531/113—PCR
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2539/00—Reactions characterised by analysis of gene expression or genome comparison
- C12Q2539/10—The purpose being sequence identification by analysis of gene expression or genome comparison characterised by
- C12Q2539/113—Differential Display Analysis [DDA]
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Zoology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Immunology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Claims (36)
1. Олигонуклеотид для анализа нуклеотидной последовательности-мишени в образце нуклеиновой кислоты посредством гибридизации, причем указанный олигонуклеотид имеет следующую общую структуру:
5’-Хр-Yq-Zr-3’ или 5’-Zr-Yq-Xp-3’
где Хр представляет собой первую гибридизующуюся область, имеющую специфическую гибридизующуюся нуклеотидную последовательность, по существу комплементарную нуклеотидной последовательности-мишени в указанном образце нуклеиновой кислоты, для гибридизации с ней; Yq представляет собой регуляторную область, содержащую по меньшей мере два универсальных основания или неразличаемых аналога оснований; Zr представляет собой вторую гибридизующуюся область, имеющую предварительно выбранную произвольную нуклеотидную последовательность; p, q и r означают количество нуклеотидов; и Х, Y и Z означают дезоксирибонуклеотид или рибонуклеотид.
2. Олигонуклеотид по п.1, который участвует в двух отдельных гибридизациях в виде первой и второй гибридизаций, где указанная первая гибридизующаяся область используется в качестве сайта специфической гибридизации в первой гибридизации, а указанная вторая гибридизующаяся область служит в качестве универсального гибридизующегося сайта во второй гибридизации.
3. Олигонуклеотид по п.1, где указанная регуляторная область способна контролировать гибридизующуюся область указанного олигонуклеотида.
4. Олигонуклеотид по п.1, где указанное универсальное основание или неразличаемый аналог основания могут образовывать пары оснований с каждым из природных оснований ДНК/РНК с незначительным различением между указанными природными основаниями ДНК/РНК.
5. Олигонуклеотид по п.4, где указанное универсальное основание или неразличаемый аналог основания выбран из группы, состоящей из дезоксиинозина, инозина, 7-деаза-2’-дезоксиинозина, 2-аза-2’-дезоксиинозина, 2’-ОМе-инозина, 2’-F-инозина, дезокси-3-нитропиррола, 3-нитропиррола, 2’-ОМе-3-нитропиррола, 2’-F-3-нитропиррола, 1-(2’-дезокси-бета-D-рибофуранозил)-3-нитропиррола, дезокси-5-нитроиндола, 5-нитроиндола, 2’-ОМе-5-нитроиндола, 2’-F-5-нитроиндола, дезокси-4-нитробензимидазола, 4-нитробензимидазола, дезокси-4-аминобензимидазола, 4-аминобензимидазола, дезоксинебуларина, 2’-F-небуларина, 2’-F-4-нитробензимидазола, ПНК-5-нитроиндола, ПНК-небуларина, ПНК-инозина, ПНК-4-нитробензимидазола, ПНК-3-нитропиррола, морфолино-5-нитроиндола, морфолинонебуларина, морфолиноинозина, морфолино-4-нитробензимидазола, морфолино-3-нитропиррола, фосфорамидат-5-нитроиндола, фосфорамидатнебуларина, фосфорамидатинозина, фосфорамидат-4-нитробензимидазола, фосфорамидат-3-нитропиррола, 2’-О-метоксиэтилинозина, 2’-О-метоксиэтилнебуларина, 2’-О-метоксиэтил-5-нитроиндола, 2’-О-метоксиэтил-4-нитробензимидазола, 2’-О-метоксиэтил-3-нитропиррола и их комбинаций.
6. Олигонуклеотид по п.5, где указанным универсальным основанием или неразличаемым аналогом основания является дезоксиинозин, 1-(2’-дезокси-бета-D-рибофуранозил)-3-нитропиррол или 5-нитроиндол.
7. Олигонуклеотид по п.1, где указанная регуляторная область содержит смежные универсальные основания или неразличаемые аналоги оснований.
8. Олигонуклеотид по п.1, где указанный дезоксирибонуклеотид является природно встречающимся dNMP, модифицированным нуклеотидом и неприродным нуклеотидом.
9. Олигонуклеотид по п.1, где р представляет собой целое число от 6 до 100.
10. Олигонуклеотид по п.1, где q представляет по меньшей мере 3.
11. Олигонуклеотид по п.10, где q составляет по меньшей мере 4.
12. Олигонуклеотид по п.10, где q представляет собой целое число от 2 до 15.
13. Олигонуклеотид по п.1, где r представляет собой целое число от 15 до 100.
14. Олигонуклеотид по п.1, где вторая гибридизующаяся область имеет предварительно выбранную произвольную нуклеотидную последовательность, по существу некомплементарную любому сайту в указанном образце нуклеиновой кислоты.
15. Олигонуклеотид по п.1, который иммобилизован на нерастворимом носителе.
16. Набор для проведения гибридизации, где указанный набор содержит олигонуклеотид по любому из пп.1-15.
17. Способ обнаружения присутствия нуклеотидной последовательности-мишени в образце нуклеиновой кислоты посредством гибридизации, где указанный способ предусматривает стадии
(а) выполнения первой гибридизации с использованием первого олигонуклеотида по любому из пп.1-15, имеющего в его первой гибридизующейся области специфическую гибридизующуюся нуклеотидную последовательность, по существу комплементарную указанной нуклеотидной последовательности-мишени, для гибридизации с ней в условиях, в которых указанная первая гибридизующаяся область указанного первого олигонуклеотида должна гибридизоваться с указанной нуклеотидной последовательностью-мишенью; и
(b) детектирования присутствия или отсутствия указанной нуклеотидной последовательности-мишени, по существу комплементарной указанной первой гибридизующейся области указанного первого олигонуклеотида, в указанном образце нуклеиновой кислоты посредством сигнала, свидетельствующего о гибридизации между указанной нуклеотидной последовательностью-мишенью и указанной первой гибридизующейся областью.
18. Способ по п.17, где указанный способ дополнительно предусматривает стадии
(с) выполнения второй гибридизации с использованием второго олигонуклеотида, имеющего нуклеотидную последовательность, по существу комплементарную указанной второй гибридизующейся области указанного первого олигонуклеотида, используемого на стадии (а), для гибридизации с ней в условиях, при которых указанный второй олигонуклеотид должен гибридизоваться с последовательностью указанной второй гибридизующейся области указанного первого олигонуклеотида; и (d) детектирования сигнала, свидетельствующего о гибридизации между указанной второй гибридизующейся областью указанного первого олигонуклеотида и указанным вторым олигонуклеотидом, так что подтверждается, что присутствие или отсутствие указанного сигнала стадии (b) должно быть приписано только гибридизации между указанной нуклеотидной последовательностью-мишенью и указанной первой гибридизующейся областью указанного первого олигонуклеотида.
19. Способ идентификации нуклеотидной вариации в нуклеотидной последовательности-мишени в образце нуклеиновой кислоты, где указанный способ предусматривает стадии
(а) выполнения первой гибридизации с использованием первого олигонуклеотида по любому из пп.1-15, имеющего в его первой гибридизующейся области специфическую гибридизующуюся нуклеотидную последовательность, по существу комплементарную указанной нуклеотидной последовательности-мишени указанному образцу нуклеиновой кислоты, для гибридизации с ней в условиях, в которых указанная первая гибридизующаяся область указанного первого олигонуклеотида должна гибридизоваться с указанной нуклеотидной последовательностью-мишенью указанного образца нуклеиновой кислоты, где каждая из указанной последовательности первого олигонуклеотида и указанной нуклеотидной последовательности-мишени содержит находящееся под вопросом положение, соответствующее указанной нуклеотидной вариации, посредством чего указанный первый олигонуклеотид, включающий в себя нуклеотидную вариацию, гибридизуется с указанной нуклеотидной последовательностью-мишенью, когда указанное находящееся под вопросом положение занято нуклеотидом указанного первого олигонуклеотида, комплементарным соответствующему ему нуклеотиду указанной нуклеотидной последовательности-мишени; и
(b) идентификации указанной нуклеотидной вариации в указанной нуклеотидной последовательности-мишени указанного образца нуклеиновой кислоты путем детектирования сигнала, свидетельствующего о гибридизации между указанной нуклеотидной последовательностью-мишенью и указанной первой гибридизующейся областью указанного первого олигонуклеотида.
20. Способ по п.19, где указанный способ дополнительно предусматривает стадии
(с) выполнения второй гибридизации с использованием второго олигонуклеотида, имеющего нуклеотидную последовательность, по существу комплементарную указанной второй гибридизующейся области указанного первого олигонуклеотида, используемого на стадии (а), для гибридизации с ней в условиях, при которых указанный второй олигонуклеотид должен гибридизоваться с указанной последовательностью второй гибридизующейся области указанного первого олигонуклеотида; и (d) детектирования сигнала, свидетельствующего о гибридизации между указанной второй гибридизующейся областью указанного первого олигонуклеотида и указанным вторым олигонуклеотидом так, что подтверждается, что присутствие или отсутствие указанного сигнала стадии (b) должно быть приписано только гибридизации между указанной нуклеотидной последовательностью-мишенью и указанной первой гибридизующейся областью указанного первого олигонуклеотида.
21. Способ по п.17 или 19, где указанная регуляторная область указанного первого олигонуклеотида может ограничивать гибридизующуюся область указанного первого олигонуклеотида с указанной нуклеотидной последовательностью-мишенью указанной первой гибридизующейся области.
22. Способ по п.17 или 19, где указанная регуляторная область указанного первого олигонуклеотида ответственна за повышение специфичности гибридизации указанной первой гибридизующейся области указанного первого олигонуклеотида.
23. Способ по п.19, где указанная нуклеиновая кислота в пробе является коротким нуклеотидным сегментом, включающим в себя нуклеотидную вариацию, которую получают путем амплификации соответствующей нуклеотидной последовательности указанного короткого нуклеотидного сегмента.
24. Способ по п.19, где указанный образец нуклеиновой кислоты является более чем одним коротким нуклеотидным сегментом-мишенью, каждый из которых включает в себя нуклеотидную вариацию, которую получают путем амплификации соответствующей нуклеотидной последовательности более чем одного короткого нуклеотидного сегмента.
25. Способ по п.19, где указанная нуклеотидная вариация является полиморфизмом единственного основания или точковой мутацией.
26. Способ по п.19, где указанная нуклеотидная вариация содержится в нуклеиновой кислоте человека.
27. Способ по п.19, где указанная нуклеотидная вариация содержится в нуклеиновой кислоте организма, который может вызывать инфекционное заболевание.
28. Способ по п.19, где указанная первая гибридизующаяся область указанного первого олигонуклеотида, используемого на стадии (а), содержит находящееся под вопросом положение, занимаемое нуклеотидом, комплементарным соответствующему нуклеотиду, который соответствует нуклеотидной вариации.
29. Способ по п.19, где указанное находящееся под вопросом положение указанного первого олигонуклеотида, используемого на стадии (а), находится в центре его первой гибридизующейся области.
30. Способ по п.19, где указанная первая гибридизующаяся область указанного первого олигонуклеотида, используемого на стадии (а), имеет длину от 8 до 30 нуклеотидов.
31. Способ по п.30, где указанная первая гибридизующаяся область указанного первого олигонуклеотида, используемого на стадии (а), имеет длину от 10 до 15 нуклеотидов.
32. Способ по п.19, где указанная находящаяся под вопросом область указанного первого олигонуклеотида, используемого на стадии (а), находится в пределах приблизительно 10 оснований от 3’-концевого нуклеотида указанного первого олигонуклеотида.
33. Способ по п.32, где указанная находящаяся под вопросом область указанного первого олигонуклеотида, используемого на стадии (а), находится в пределах приблизительно 6 оснований от 3’-концевого нуклеотида указанного первого олигонуклеотида.
34. Способ по п.33, где указанная находящаяся под вопросом область указанного первого олигонуклеотида, используемого на стадии (а), находится в положениях 4 и 6 от 3’-концевого нуклеотида указанного первого олигонуклеотида.
35. Способ по п.19, где указанный первый олигонуклеотид, используемый на стадии (а), имеет в своей первой гибридизующейся области по меньшей мере один нуклеотид искусственного ошибочного спаривания по существу смежный с указанным находящимся под вопросом положением указанного первого олигонуклеотида, где указанный нуклеотид ошибочного спаривания содержит универсальное основание или неразличаемый аналог основания.
36. Набор для идентификации нуклеотидной вариации в нуклеиновой кислоте-мишени образца нуклеиновой кислоты, который содержит олигонуклеотид или набор олигонуклеотидов, указанных в любом из пп.19-37.
Applications Claiming Priority (4)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
PCT/KR2001/002133 WO2003050304A1 (en) | 2001-12-08 | 2001-12-08 | Annealing control primer system for regulating primer annealing specificity and its applications |
KRPCT/KR01/02133 | 2001-12-08 | ||
KRPCT/KR02/00816 | 2002-05-01 | ||
PCT/KR2002/000816 WO2003093509A1 (en) | 2002-05-01 | 2002-05-01 | Methods and compositions for improving specificity of pcr amplication |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
RU2004120769A true RU2004120769A (ru) | 2005-04-20 |
Family
ID=19198489
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
RU2004120769/13A RU2004120769A (ru) | 2001-12-08 | 2002-11-04 | Олигонуклеотид, контролирующий область гибридизации, и его применение |
Country Status (9)
Country | Link |
---|---|
US (1) | US20030152925A1 (ru) |
JP (2) | JP4263612B2 (ru) |
KR (1) | KR100649165B1 (ru) |
AU (1) | AU2002222737A1 (ru) |
CA (1) | CA2469383A1 (ru) |
IL (1) | IL162317A0 (ru) |
NZ (1) | NZ533221A (ru) |
RU (1) | RU2004120769A (ru) |
WO (1) | WO2003050304A1 (ru) |
Families Citing this family (26)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN1280422C (zh) * | 2004-08-26 | 2006-10-18 | 北京博奥生物芯片有限责任公司 | 一种不对称pcr扩增方法及其应用 |
US20060188910A1 (en) * | 2005-02-18 | 2006-08-24 | Applera Corporation | Compositions, methods, and kits for analyzing DNA methylation |
US8211899B2 (en) * | 2005-08-30 | 2012-07-03 | Inter-University Research Institute Corporation National Institute Of Natural Sciences | Artificial nucleic acid bases and their use in base pairing natural nucleic acid bases |
JP5409005B2 (ja) * | 2005-10-27 | 2014-02-05 | ロゼッタ インファーマティックス エルエルシー | 非ランダムプライマーを用いる核酸増幅 |
WO2007067907A1 (en) | 2005-12-06 | 2007-06-14 | Ambion, Inc. | Reverse transcription primers and methods of design |
KR100860619B1 (ko) * | 2006-02-23 | 2008-09-29 | 주식회사 씨젠 | 성인성 질환 유발 병원체 핵산 검출용올리고뉴클레오타이드 |
ES2400805T3 (es) * | 2006-05-04 | 2013-04-12 | Seegene, Inc. | Método para amplificar una secuencia de ADN desconocida adyacente a una secuencia conocida |
JP5340167B2 (ja) | 2006-12-21 | 2013-11-13 | ジェン−プロウブ インコーポレイテッド | 核酸増幅のための方法および組成物 |
EP1978104A1 (en) * | 2007-04-03 | 2008-10-08 | Freie Universität Berlin | A method for the quantitative analysis of RNA molecules in a sample |
KR100987352B1 (ko) | 2008-04-15 | 2010-10-12 | 주식회사 인트론바이오테크놀로지 | 비특이 증폭을 감소시킬 수 있는 pcr용 프라이머 및이를 이용한 pcr 방법 |
EP2376659B1 (en) | 2008-12-17 | 2015-12-02 | Life Technologies Corporation | Methods, compositions, and kits for detecting allelic variants |
CN103911428B (zh) | 2009-03-27 | 2016-02-24 | 生命技术公司 | 用于检测等位基因变体的方法、组合物和试剂盒 |
JP5687414B2 (ja) | 2009-04-20 | 2015-03-18 | オリンパス株式会社 | 多型の識別方法 |
EP3150619B1 (en) * | 2009-05-21 | 2019-09-18 | Siemens Healthcare Diagnostics Inc. | Universal tags with non-natural nucleobases |
CA2766391C (en) | 2009-07-01 | 2021-04-20 | Gen-Probe Incorporated | Methods and compositions for multiplex nucleic acid amplification |
EP2475777A4 (en) * | 2009-09-11 | 2013-03-06 | Nugen Technologies Inc | COMPOSITIONS AND METHODS FOR COMPLETE TRANSCRIPTOMAL ANALYSIS |
MY157586A (en) * | 2011-09-14 | 2016-06-16 | Ngk Insulators Ltd | Method for detecting target nucleic acid |
EP2839039B1 (en) | 2012-04-18 | 2017-06-07 | F. Hoffmann-La Roche AG | Hev assay |
KR101525495B1 (ko) * | 2013-11-15 | 2015-06-03 | (주)다이오진 | 덤벨 구조 올리고뉴클레오티드, 이를 포함한 핵산 증폭용 프라이머 및 이를 이용한 핵산 증폭 방법 |
KR101723207B1 (ko) * | 2015-01-29 | 2017-04-05 | (주)다이오진 | 덤벨 구조의 올리고뉴클레오티드 및 이를 이용한 유전자 변이 검출 방법 |
US20180073082A1 (en) * | 2015-02-25 | 2018-03-15 | Diogene Co., Ltd | Dumbbell-structure oligonucleotide, nucleic acid amplification primer comprising same, and nucleic acid amplification method using same |
CN104845967B (zh) * | 2015-04-15 | 2020-12-11 | 苏州新海生物科技股份有限公司 | 寡聚核苷酸片段及使用其的选择性扩增目标核酸序列变异体的方法及应用 |
US10344336B2 (en) | 2015-06-09 | 2019-07-09 | Life Technologies Corporation | Methods, systems, compositions, kits, apparatus and computer-readable media for molecular tagging |
KR101961642B1 (ko) | 2016-04-25 | 2019-03-25 | (주)진매트릭스 | 절단된 상보적인 태그 절편을 이용한 표적 핵산 서열 검출 방법 및 그 조성물 |
EP3682025A1 (en) * | 2017-09-14 | 2020-07-22 | H. Hoffnabb-La Roche Ag | Novel method for generating circular single-stranded dna libraries |
KR101856205B1 (ko) * | 2017-11-16 | 2018-06-20 | 제노플랜코리아 주식회사 | 핵산의 대립형질 특이적 프라이머 및 이를 이용한 유전형 판별 방법 |
Family Cites Families (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO1993005175A1 (en) * | 1991-09-11 | 1993-03-18 | Medical Research Council | Improvements in oligonucleotide primers and probes |
WO1993014217A1 (en) * | 1992-01-10 | 1993-07-22 | Life Technologies, Inc. | Use of predetermined nucleotides having altered base pairing characteristics in the amplification of nucleic acid molecules |
WO2001023618A2 (en) * | 1999-09-30 | 2001-04-05 | Qiagen Genomics, Inc. | Compositions and methods for reducing oligonucleotide hybridization and priming specificity |
-
2001
- 2001-12-08 AU AU2002222737A patent/AU2002222737A1/en not_active Abandoned
- 2001-12-08 WO PCT/KR2001/002133 patent/WO2003050304A1/en not_active Application Discontinuation
- 2001-12-14 US US10/014,496 patent/US20030152925A1/en not_active Abandoned
-
2002
- 2002-09-19 JP JP2003551326A patent/JP4263612B2/ja not_active Expired - Lifetime
- 2002-09-19 KR KR1020047008441A patent/KR100649165B1/ko active IP Right Grant
- 2002-09-19 IL IL16231702A patent/IL162317A0/xx unknown
- 2002-11-04 NZ NZ533221A patent/NZ533221A/en unknown
- 2002-11-04 RU RU2004120769/13A patent/RU2004120769A/ru not_active Application Discontinuation
- 2002-11-04 CA CA002469383A patent/CA2469383A1/en not_active Abandoned
- 2002-11-04 JP JP2003551327A patent/JP2005522190A/ja active Pending
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
KR100649165B1 (ko) | 2006-11-24 |
US20030152925A1 (en) | 2003-08-14 |
JP2005511096A (ja) | 2005-04-28 |
JP2005522190A (ja) | 2005-07-28 |
AU2002222737A1 (en) | 2003-06-23 |
CA2469383A1 (en) | 2003-06-19 |
NZ533221A (en) | 2006-01-27 |
KR20050028904A (ko) | 2005-03-23 |
IL162317A0 (en) | 2005-11-20 |
JP4263612B2 (ja) | 2009-05-13 |
WO2003050304A1 (en) | 2003-06-19 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
RU2004120769A (ru) | Олигонуклеотид, контролирующий область гибридизации, и его применение | |
RU2400538C2 (ru) | Олигонуклеотид с двойственной специфичностью и способы, в которых он используется | |
US20030082576A1 (en) | High throughput polymorphism screening | |
CA2468754A1 (en) | Annealing control primer and its uses | |
WO2001092572A1 (fr) | Ensemble et procede de determination du type de hla | |
CN101142325A (zh) | 制备用于分析的多核苷酸的方法 | |
KR101110013B1 (ko) | 서열 내에 어베이직 부분을 포함하는 pcr 증폭용프라이머 | |
EP2366803A3 (en) | Compositions and methods for detecting west nile virus | |
CA2528577A1 (en) | Methods and compositions for whole genome amplification and genotyping | |
RU2012125961A (ru) | Растения сои, устойчивой к гербицидам, и способы их идентификации | |
JP2009521223A5 (ru) | ||
ATE501269T1 (de) | Detektion von genmutationen mittels lna primer | |
JP2008237139A (ja) | メチレンテトラヒドロ葉酸還元酵素(mthfr)の遺伝子型を検出するための核酸プライマーセット及び核酸プローブ | |
CN103898199A (zh) | 一种高通量核酸分析方法及其应用 | |
JP4490988B2 (ja) | 血清アミロイドa1(saa1)の遺伝子型を検出するための核酸プライマーセット、キット、及び該プライマーセットを用いた検出方法 | |
WO2003051901A3 (en) | Pseudonucleotide comprising an intercalator | |
US20100092972A1 (en) | Assay for gene expression | |
CN103320514B (zh) | 一种检测邻近snp的多重pcr方法 | |
JP4410269B2 (ja) | N−アセチルトランスフェラーゼ2(nat2)の遺伝子型を検出するための核酸プライマーセット、キット、及び該プライマーセットを用いた検出方法 | |
JP2020530270A (ja) | ゲノム再編成検出のための配列決定方法 | |
RU2001114072A (ru) | Диагностический анализ | |
RU2005100511A (ru) | Идентификация олигонуклеотидов для захвата, выявления и количественного определения нуклеиновой кислоты вируса гепатита а | |
CA2456138A1 (en) | Ratio-based oligonucleotide probe selection | |
WO1992007948A1 (en) | Compositions and methods for analyzing genomic variation | |
US8691508B2 (en) | Concurrent analysis of multiple patient samples using solid phase addressable multiplex test with high signal-to-noise ratio |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
FA92 | Acknowledgement of application withdrawn (lack of supplementary materials submitted) |
Effective date: 20070124 |