KR20210119976A - 개선된 항체-올리고뉴클레오티드 접합체 - Google Patents
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Abstract
본 발명은 적어도 하나의 사포닌이 제공된 리간드-이펙터 모이어티 및 적어도 하나의 사포닌이 제공된 항체-이펙터 모이어티에 관한 것이다. 본 발명의 일 견지는 본 발명의 적어도 하나의 사포닌이 제공된 리간드-이펙터 모이어티 또는 적어도 하나의 사포닌이 제공된 항체-이펙터 모이어티를 포함하는 조성물이다. 본 발명은 또한 공유적으로 연결된 사포닌을 포함하는 항체-약물 접합체 및 공유적으로 연결된 사포닌을 포함하는 항체-올리고뉴클레오티드 접합체에 관한 것이다. 본 발명의 일 견지는 본 발명의 적어도 하나의 사포닌이 제공된 리간드-이펙터 모이어티 또는 적어도 하나의 사포닌이 제공된 항체-이펙터 모이어티를 포함하고, 선택적으로 약학적으로 허용가능한 부형제를 추가로 포함하는 약학적 조성물에 관한 것이다. 본 발명은 또한 의약으로 사용하기 위한, 하나 이상의 사포닌이 제공된 리간드-이펙터 모이어티 또는 적어도 하나의 사포닌이 제공된 항체-이펙터 모이어티에 관한 것이다. 본 발명은 또한 암의 치료 또는 예방에 사용하기 위한 본 발명의 적어도 하나의 사포닌이 제공된 리간드-이펙터 모이어티 또는 적어도 하나의 사포닌이 제공된 항체-이펙터 모이어티에 관한 것이다.
Description
본 발명은 적어도 하나의 사포닌이 제공된 리간드-이펙터 모이어티 및 적어도 하나의 사포닌이 제공된 항체-이펙터 모이어티, 예컨대 항체-약물 접합체 및 항체-올리고뉴클레오티드 접합체에 관한 것이다. 본 발명의 일 견지는 본 발명의 적어도 하나의 사포닌이 제공된 리간드-이펙터 모이어티 또는 적어도 하나의 사포닌이 제공된 항체-이펙터 모이어티를 포함하는 조성물이다. 본 발명은 또한 공유적으로 연결된 사포닌을 포함하는 항체-약물 접합체 및 공유적으로 연결된 사포닌을 포함하는 항체-올리고뉴클레오티드 접합체에 관한 것이다. 본 발명의 일 견지는 본 발명의 적어도 하나의 사포닌이 제공된 리간드-이펙터 모이어티 또는 적어도 하나의 사포닌이 제공된 항체-이펙터 모이어티를 포함하고, 선택적으로 약학적으로 허용가능한 부형제(excipient)를 추가로 포함하는 약학적 조성물에 관한 것이다. 본 발명은 또한 의약으로 사용하기 위한, 적어도 하나의 사포닌이 제공된 리간드-이펙터 모이어티 또는 적어도 하나의 사포닌이 제공된 항체-이펙터 모이어티에 관한 것이다. 본 발명은 또한 암의 치료 또는 예방에 사용하기 위한 적어도 본 발명의 하나의 사포닌이 제공된 리간드-이펙터 모이어티 또는 적어도 하나의 사포닌이 제공된 항체-이펙터 모이어티에 관한 것이다.
치료학적 생물학적 활성을 갖는 분자는 필요한 인간 환자에서 암과 같은 질환의 치료를 위한 효과적인 치료 약물로서 적용하기에 이론상 적합한 많은 경우가 있다. 전형적인 예는 소분자 생물학적 활성 모이어티이다. 그러나 현재 클리닉에서 사용되는 모든 잠재적 약물-유사(drug-like) 분자 및 치료제는, 모두는 아니라도 많은 것이 과다한 단점과 결함 중 적어도 하나의 근심이 있다. 인체에 투여 될 때, 치료 활성 분자는 치료될 질병 또는 건강 문제의 근본적인 견지에 대한 생물학적 활성에 추가하여 표적을 벗어난(off-target) 효과를 발휘할 수 있다. 이러한 표적을 벗어나 효과는 바람직하지 않으며 투여된 분자의 건강- 또는 심지어 생명을 위협하는 부작용을 유발할 위험이 있다. 많은 약물 유사 화합물 및 치료 모이어티가 3 상 임상 시험 또는 심지어 4 상 임상 시험 (시판 후 후속 조치)에 실패하는 것은 이러한 부작용의 발생이다. 따라서, 약물 분자의 치료 효과는 예를 들어, 무엇보다도 (1) 질병을 유발하는 생물학적 요인 또는 생물학적 과정에 대해 고도로 특이 적이어야 하고/하거나 (2) 충분히 안전하고/하거나, (3) 충분히 효능이 있고/있거나, (4) 비-병든 세포에 대한 표적을 벗어난 활성(off-target activity)이 거의 또는 전혀없이 병든 세포에 충분히 지시되어야(directed) 하고/하거나, (5) 충분히 시기 적절한 작용 방식 (예, 투여된 약물 분자는 특정 시간 프레임 내에 인간 환자의 표적 부위에 도달해야 하며 특정 시간 프레임 동안 표적 부위에 남아 있어야 한다)이어야 하며 및/또는 (6) 환자의 신체에서 충분히 오래 지속되는 치료 활성을 갖는, 소분자 치료제와 같은 약물 분자를 제공하려는 강한 욕구가 있다. 안타깝게도, 지금까지 위에서 설명한 많은 또는 심지어 모든 유익한 특성을 갖는 '이상적인' 치료제는 이미 오래 지속되고 집중적인 연구와 직면한 어려움과 결함을 개별적으로 해결된 여러 영역에서 이루어진 인상적인 진전에도 불구하고 환자에게 제공되지 않는다.
화학 요법은 암 치료를 위한 가장 중요한 치료 선택 사항 중 하나이다. 그러나, 건강한 조직에서 세포를 분할하는 것보다 암세포에 대한 특이성이 없기 때문에, 종종 낮은 치료 윈도우(therapeutic window)를 나타낸다. 모노클로날 항체의 발명은 정상 세포를 아끼면서(sparing), 암세포에 세포 독성제를 표적 전달하기 위한 메커니즘으로서 이들의 특이적 결합 특성의 이용 가능성을 제공하였다. 이는 항체-약물 접합체 (ADC)를 생성하기 위해 세포 독성 이펙터 (페이로드(payload) 또는 워헤드(warheads)라고도 함)를 항체에 화학적으로 접합(conjugation)함으로써 달성 할 수 있다. 전형적으로, 접합되지 않은 형태에서 제한된 치료 지수 (독성 용량 대 유효 용량을 비교하는 비율)를 가진 엠탄신(DM1)과 같은 매우 강력한 페이로드가 사용된다. 카드시클라(Kadcycla)로도 알려진, 트라스투주맙(trastuzumab)에 대한 DM1의 접합 (아도-트라스투주맙 엠탄신(ado-trastuzumab emtansine))은 원숭이에서 DM1의 허용 용량을 적어도 2배 향상시킨다. 지난 수십 년 동안, 치료 ADC를 개발하기 위해 엄청난 노력과 투자가 이루어졌다. 그러나, 유망한 전임상 데이터에도 불구하고, ADC를 임상에 도입하는 것은 여전히 어려운 일이다. 임상용으로 승인된 최초의 ADC는 2000년 재발성 급성 골수성 백혈병(AML)에 대한 젬투주맙 오조가미신(gemtuzumab ozogamicin)(마일로타그(Mylotarg), CD33 표적화, Pfizer/Wyeth)였다. 그러나, 마일로타그는 안전성 프로파일을 포함한 많은 우려로 인해 연방 의약품국 (FDA)의 요청으로 시장에서 철수되었다. 마일로타그로 치료받은 환자는 기존 화학 요법으로 치료받은 환자보다 사망하는 경우가 더 많았다. 마일로타그는 2017 년에 더 낮은 권장 용량, 화학 요법과의 조합 또는 자체적으로 다른 스케쥴, 및 새로운 환자 모집단으로 다시 시장에 출시되었다. 현재까지, 5가지의 ADC 만 임상용으로 승인되었으며, 약 55 가지의 ADC에 대한 임상개발이 중단되었다. 그러나, 관심은 여전히 높으며 현재 약 600개의 임상 시험에서 약 80 가지의 ADC가 여전히 임상개발 중이다.
일반적으로 환자가 견딜 수 없는 독성 페이로드를 사용할 가능성이 있음에도 불구하고, 낮은 치료 지수 (독성 용량 대 유효 용량을 비교하는 비율)는 임상개발에서 많은 ADC의 중단을 설명하는 주요 문제이며, 이는 정상 세포에 대한 표적-외 독성, 세포 독성제에 대한 저항성 발달 및 순환에서 약물의 조기 방출과 같은 여러 메커니즘에 기인할 수 있다. FDA의 ADC에 대한 체계적인 검토에 따르면, 대부분의 ADC의 독성 프로파일은 사용된 페이로드에 따라 분류될 수 있지만, 사용된 항체에는 따라 분류되지 않았으며, 이는 독성이 대부분 페이로드의 조기 방출에 의해 결정된다는 것을 제시한다. 중단된 약 55개의 ADC 중 적어도 23개는 저조한 치료 지수로 인한 것으로 추정된다. 예를 들어, 트라스투주맙 테시린 접합체 (ADCT-502, HER-2 표적화, ADC 치료제)의 개발은 아마도 HER2를 상당한 수준으로 발현하는 폐 조직에서 표적 내(on-target), 조직 외(off-tissue) 효과에 기인한, 좁은 치료 지수로 인하여 최근에 중단되었다. 또한, 3 상 시험에서 여러 ADC가 1 차 평가 변수의 누락으로 인하여 중단되었다. 예를 들어, 새로 진단된 교모세포종 환자에서 테스트된 데파투시주맙 마포도틴 접합체 (ABT-414, EGFR 표적화, AbbVie), 및 백금 내성 난소 암 환자에서 테스트된 미르베툭시맙 소라브탄신 접합체 (IMGN853, 엽산 수용체 알파(FRα) 표적화, ImmunoGen)에 대한 3 상 시험은 최근 중단되어 생존 혜택을 보이지 않는다. 일부 ADC의 임상적으로 사용되는 용량은 완전한 항암 활성에 충분하지 않을 수 있다는 점에 유의하는 것이 중요하다. 예를 들어, 아도-트라스투주맙 엠탄신은 인간에게서 3.6 mg/kg의 MTD이다. 유방암의 전임상 모델에서, 아도-트라스투주맙 엠탄신은 3mg/kg 이상의 용량 수준에서 종양 퇴화를 유도했지만, 15mg/kg에서 더 강력한 효능이 관찰되었다. 이는 임상적으로 투여된 용량에서, 아도-트라스투주맙 엠탄신이 이의 최대 잠재적 항종양 효과를 발휘하지 못할 수 있음을 제시한다.
ADC는 주로 항체, 페이로드와 같은 세포 독성 모이어티 및 링커로 구성된다. ADC의 각 구성 요소를 대상으로 기존 문제를 극복하기 위해 새로운 ADC의 디자인 및 개발에서 몇 가지 새로운 전략이 제안되고 수행되었다. 예를 들어, 항체 성분에 대한 적합한 항원 표적의 확인 및 검증에 의해, 종양에서 높은 발현 수준을 갖고 정상 조직에서는 발현이 거의 또는 전혀 없는 항원, 순환하는 ADC에 접근할 수 있도록 세포 표면에 존재하는 항원, 및 결합 후 ADC를 세포 내로 내재화(internalizing)할 수 있는 항원을 선택함으로써; 및 활성의 대체 메커니즘; 및 ADC의 용해도 및 약물-대-항체 비율 (DAR)의 향상 및 화학 요법제를 세포 밖으로 운반할 수 있는 단백질에 의해 유도된 내성을 극복하는 링커의 디자인 및 최적화; 더 많은 페이로드를 포함하여 DAR 비율을 향상시키고 항체를 선택 및 최적화하여 항체 균질성과개발 가능성을 개선한다. ADC의 기술개발 외에도, 새로운 임상 및 변형 전략(translational strategy)이 전개되어 치료 지수, 예컨대 분별 투여를 통한 투여 일정 변경을 극대화하고; 생물 분포 연구를 수행하고; 환자 선택을 최적화하고, 반응 신호를 조기에 포착하고, 반응의 기간과 깊이를 모니터링하고, 조합 연구에 정보를 제공하는 바이오마커를 포함한다.
임상 가능성이 있는 ADC의 예는 림프성 악성 종양 및 다발성 골수종에 대한 치료 선택 사항으로 평가되는, 브렌투시맙 베도틴, 이노투주맙 오조가미신, 목세 투모맙 파수도톡스 및 폴라투주맙 베도틴과 같은 ADC이다. (악성) B 세포에서 CD79b에 결합하는 폴라투주맙 베도틴 및 CD22에 결합하는 피나투주맙 베도틴은, 각각의 ADC가 CD20에 결합하는 모노클로날 항체인 공동 투여된 리툭시맙과 조합되고 페이로드가 제공되지 않는 임상 시험에서 테스트된다[B. Yu and D. Liu, Antibody-drug conjugates in clinical trials for lymphoid malignancies and multiple myeloma; Journal of Hematology & Oncology (2019) 12:94]. 이러한 예와 같은 모노클로날 항체의 조합은 앞서 언급한 ADC의 원하는 특성을 많이 또는 심지어 모두 조합하는 '마법의 총알'에 도달하려는 추가 접근법이며 시도이다.
한편 지난 수십 년 동안, 핵산 기반 치료제가 개발 중이다. 치료 핵산은 유전자 치료와 같은 접근법을 위해, 데옥시리보 핵산 (DNA) 또는 리보 핵산 (RNA), 안티센스 올리고뉴클레오티드 (ASO, AON) 및 짧은 간섭 RNA (siRNA), MicroRNA, 그리고 DNA 및 RNA 앱타머, RNA 간섭(RNAi)을 기반으로 할 수 있다. 이들 중 다수는 DNA 또는 RNA 발현을 억제함으로써 질병 관련 비정상 단백질의 발현을 방지하는 작용의 동일한 기본적인 기반을 공유한다. 가장 많은 수의 임상 시험이 유전자 치료 분야에서 수행되고 있으며, 전 세계적으로 거의 2600 건의 진행 중이거나 완료된 임상 시험이 진행되고 있지만 약 4% 만이 3 상 진입에 들어간다. 그 후, ASO를 사용한 임상 시험이 이어진다. ADC와 유사하게, 많은 수의 기술이 연구되고 있음에도 불구하고, 치료용 핵산은 임상개발 과정에서 두 가지 주요 문제를 공유한다; 세포로의 전달 및 표적-외(off-target) 영향. 예를 들어, ASO, 예컨대 펩티드 핵산 (PNA), 포스포라미데이트 모르폴리노 올리고머 (PMO), 잠금 핵산 (LNA, locked nucleic acid) 및 브리지 핵산 (BNA, bridged nucleic acid)은 특이적으로 표적 유전자, 특히 소분자 억제제 또는 중화 항체로 표적화하기 어려운 유전자를 억제하는 매력적인 전략으로 조사되고 있다. 현재, 헌팅턴 질환, 파킨슨 질환, 알츠하이머 질환, 근위축성 측삭 경화증과 같은 많은 신경 퇴화성 질환과 여러 암 단계에서 다양한 ASO의 효능이 연구되고 있다. 잠재적 치료제로 ASO를 적용하려면 표적 세포 및 조직의 세포질 및/또는 핵으로의 이들의 전달을 위한 안전하고 효과적인 방법이 필요하다. ASO의 임상적 관련성이 입증되었지만, 시험관 내 및 생체 내에서 비효율적인 세포 흡수는 ASO의 효능을 제한하고 치료용개발의 장벽이 되었다. 세포 흡수는 용량의 2% 미만일 수 있으므로 효과적이고 지속적인 결과를 위해서는 활성 부위에서 ASO 농도가 너무 낮다. 이는 결과적으로 오프 타겟 외 영향을 유도하는 투여 용량의 증가를 필요로 한다. 가장 일반적인 부작용은 보체 캐스케이드의 활성화, 응고 캐스케이드(clotting cascade)의 억제 및 면역 시스템의 톨-유사(toll-like) 수용체 매개 자극이다.
화학 요법제는 가장 일반적으로 소분자이지만, 그 효능은 심각한 타겟 외 사이드 독성뿐만 아니라 저조한 용해도, 빠른 제거 및 제한된 종양 노출로 인해 방해를 받는다. 폴리머-약물 접합체 (PDC)와 같은 스캐폴드-소분자 약물 접합체는 담체 스캐폴드(예, 폴리에틸렌 글리콜 (PEG))에 결합된 하나 이상의 소분자 약물 분자를 포함하는 약리학적 활성을 갖는 거대 분자 구성체이다.
이러한 접합 원리는 많은 관심을 끌었으며 수십 년 동안 조사 중에 있다. 전임상 또는 임상개발중인 대부분의 저분자 약물 접합체는 종양학적 적응증(oncological indication)을 위한 것이다. 그러나, 2014년에, 비종양학적 적응성인 만성 통증 환자의 오피오이드 유발 변비에 대해 암과 관련이 없는 최신 약물(모반틱(Movantik), 오피오이드 길항제 날록손의 PEG 올리고머 접합체, AstraZeneca) 만 승인되었다. 인간 대상체의 치료에 대한 약물-스캐폴드 접합체의 변형 적용은 지금까지 임상적 성공을 거의 제공하지 못했다. 예를 들어, PK1(N-(2-하이드록시프로필)메타크릴아미드(HPMA) 코폴리머 독소루비신; Pharmacia, Pfizer에 의해개발됨)은 뮤린 모델(murine model)에서 고형 종양과 백혈병 모두에서 뛰어난 항암 활성을 보였으며, 종양학적 징후에 대한 임상 조사 중이었다. 비특이적 독성의 현저한 감소와 인간에서의 약동학적(pharmacokinetics) 개선을 입증 했음에도 불구하고, 항암 효능의 개선은 환자에서 미미한 것으로 판명되었고, 그 결과 PK1의 추가개발이 중단되었다.
스캐폴드-소분자 약물 접합체의 실패는 적어도 부분적으로 종양 부위에서의 이의 저조한 축적에 기인한다. 예를 들어, 뮤린 모델에서 PK1은 건강한 조직 (간, 신장, 폐, 비장 및 심장)에서 보다 종양에 45-250배 더 높은 축적을 보였지만, 종양에서의 축적은 임상에서 일부 환자의 하위 그룹에서만 관찰되었다.
상기한 문제에 대한 잠재적인 해결 방안은 리포좀과 같은 약물 전달을 위한 나노 입자 시스템의 적용이다. 리포좀은 인지질이 물에 분산될 때 자발적으로 형성되는 하나 이상의 인지질 이중층으로 구성된 구형 소포이다. 인지질의 양친매성 특성은 자체 어셈블리, 에멀션화 및 습윤 특징의 특성을 제공하며, 이러한 특성은 신약 및 신약 전달 시스템의 설계에 사용될 수 있다. 리포좀 전달 시스템에서 캡슐화된 약물은 약물의 직접 투여에 비해, 약동학 및 약력학, 조직 표적화 특성, 감소된 독성 및 향상된 약물 활성에 대한 개선 및 제어와 같은 몇 가지 이점을 전달할 수 있다. 이러한 성공의 예는 임상용으로 승인된, 소분자 화학 요법제 독소루비신 (독실: 독소루비신의 페길화 리포좀-캡슐화된 형태; 마이오셋: 비-폐길화 리포좀 독소루비신이다.
따라서, 원하는 경우에, 비-전신적 사용(non-systemic use)에 적용할 수 있는 항종양 요법과 같은 약물 요법을 허용하는 해결 방안이 여전히 발견되어야 하며, 여기서 약물은 예를 들어 허용 가능한 안전성 프로파일, 적은 표적-외 활성, 충분한 효능, 환자의 신체로부터 충분히 낮은 제거율(clearance rate) 등을 갖는다.
본 발명에 의한 일 구현예에서, 첫번째 목표는 개선된 생물학적 활성 화합물 또는 이러한 개선된 생물학적 활성 화합물을 포함하는 조성물을 제공하는 것이다.
본 발명의 구현예의 여러 목적 중 하나는 소분자 치료 활성 화합물을 이를 필요로 하는 인간 환자에게 투여할 때 발생하는, 비특이성 문제에 대한 해결 방안을 제공하는 것이다. 본 발명의 구현예의 여러 목적 중 하나는 질환을 유발하는 생물학적 요인 또는 생물학적 과정에 대해 비-최적 특이성(non-optimal specificity)을 갖는 약물의 문제에 대한 해결 방안을 제공하는 것이다. 본 발명의 구현예의 여러 목적 중 하나는, 이를 필요로 하는 인간 환자에게 투여될 때 현재 약물의 불충분한 안전성 특징 문제에 대한 해결 방안을 제공하는 것이다. 본 발명의 구현예의 여러 목적 중 하나는, 이를 필요로 하는 인간 환자에게 투여될 때, 현재 약물이 원하는 것보다 덜 효과적이라는 문제에 대한 해결 방안을 제공하는 것이다. 본 발명의 구현예의 여러 목적 중 하나는, 이를 필요로 하는 인간 환자에게 투여될 때, 비-병든 세포에 대한 표적-외 활성이 거의 또는 전혀 없이 현재 약물이 질환에 걸린 세포에 충분히 지시되지 않는 문제에 대한 해결 방안을 제공하는 것이다. 본 발명의 구현예의 여러 목적 중 하나는, 이를 필요로 하는 인간 환자에게 투여될 때, 현재의 약물이 충분히 시기 적절한 작용 방식을 갖지 않는다는 문제에 대한 해결 방안(예, 투여된 약물 분자는 특정 시간 프레임 내에 인간 환자의 표적 부위에 도달해야 하며, 특정 시간 프레임 동안 표적 부위에 남아 있어야 한다)을 제공하는 것이다. 본 발명의 구현예의 여러 목적 중 하나는, 이를 필요로 하는 인간 환자에게 투여될 때, 현재 약물이 환자의 신체에서 충분히 오래 지속되는 치료 활성을 갖지 않는 문제에 대한 해결 방안을 제공하는 것이다.
본 발명의 구현예의 상기 목적 중 적어도 하나는 세포-표적화 모이어티 및 적어도 하나의 사포닌 및 적어도 하나의 이펙터 모이어티, 예컨대 단백질성 독소 및/또는 올리고뉴클레오티드, 예컨대 BNA을 포함하는 본 발명의 항체-약물 접합체(ADC) 또는 항체-올리고뉴클레오티드(AOC), 예컨대 항체-BNA 공유 복합체를 제공함으로써 달성되며, ADC 및/또는 AOC는 또한 본 발명에 따라 의약으로서 사용하기에 적합하다.
본 발명은 특정한 구현예에 대해 설명될 것이지만, 본 발명은 이에 제한되지 않고 청구 범위에 의해서만 제한된다. 본원에 기술된 발명의 구현예는 달리 명시되지 않는 한, 조합 및 협조하여 운용될 수 있다.
본 발명의 일 견지는 세포-표면 분자 표적화 분자 및 적어도 하나의 이펙터 모이어티를 포함하고 적어도 하나의 공유 결합된 사포닌을 추가로 포함하는 접합체에 관한 것이다.
일 구현예는 본 발명의 접합체로서, 여기서 적어도 하나의 사포닌은 위치 C-23에서 알데히드 작용(function)을 갖는 12,13-디하이드로올레아난 유형에 속하며, 선택적으로 사포닌의 C-3베타-OH 기에서 카보하이드레이트 치환체에 글루쿠론산 작용을 포함하는, 비스데스모시딕 트리테르펜 사포닌 및/또는 트리테르페노이드 사포닌 및/또는 집소필라(Gypsophila) 종 및/또는 사포나리아(Saponaria) 종 및/또는 아그로스템마(Agrostemma) 종 및/또는 퀼라자(Quillaja) 종, 예컨대 퀼라자 사포나리아(Quillaja saponaria) 중 임의의 하나 이상에서 분리된 사포닌이다.
일 구현예는 본 발명의 접합체로서, 여기서 적어도 하나의 사포닌은 단일의 특정한 사포닌이거나 또는 둘 이상의 다른 사포닌의 혼합물이다.
일 구현예는 본 발명의 접합체로서, 여기서 적어도 하나의 사포닌은 3.000 달톤 이하, 바람직하게는 2.500 달톤 이하, 보다 바람직하게는 2.300 달톤 이하, 가장 바람직하게는 2.000 달톤 이하, 예컨대 1.500 달톤-1.900 달톤의 분자 질량(molecular mass)을 갖는다.
일 구현예는 본 발명의 접합체로서, 여기서 적어도 하나의 사포닌은 표 A1 또는 스킴 I, SO1861, SA1657, GE1741, SA1641, QS-21, QS-21A, QS-21 A-api, QS-21 A-xyl, QS-21B, QS-21 B-api, QS-21 B-xyl, QS-7-xyl, QS-7-api, QS-17-api, QS-17-xyl, QS1861, QS1862, 퀼라자사포닌(Quillajasaponin), 사포늄 앨범(Saponinum album), QS-18, Quil-A, Gyp1, 집소사이드 A(gypsoside A), AG1, AG2, SO1542, SO1584, SO1658, SO1674, SO1832, 또는 이들의 임의의 입체 이성질체 및/또는 이들의 임의의 조합 중 하나 이상이며, 바람직하게는 사포닌은 SO1861 및/또는 GE1741 및/또는 SA1641 및/또는 QS-21 및/또는 퀼라익산 아글리콘 코어(quillaic acid aglycon core), C-3베타-OH기에 Gal-(1→2)-[Xyl-(1→3)]-GlcA 카보하이드레이트 치환체 및 C-28-OH기에 Glc-(1→3)-Xyl-(1→4)-Rha-(1→2)-[Xyl-(1→3)-4-OAc-Qui-(1→4)]-Fuc 카보하이드레이트 치환체를 갖는 사포닌이며 및/또는 3-O-베타-D-갈락토피라노실-(1→2)-[베타-D-자일로피라노실-(1→3)]-베타-D-글루쿠로노피라노실 퀼라익산 28-0-베타-D-글루코피라노실-(1→3)-베타-D-자일로피라노실-(1→4)-알파-L-람노피라노실-(1→2)-[베타-D-자일로피라노실-(1→3)-4-OAc-베타-D-퀴노보피라노실-(1→4)]-베타-D-푸코피라노사이드이며, 보다 바람직하게는 적어도 하나의 사포닌은 SO1861 및/또는 QS-21이다.
일 구현예는 본 발명의 접합체이며, 여기서 적어도 하나의 사포닌은 분자 질량이 적어도 1.500 달톤이고 C-3 위치에 제1 분지형 카보하이드레이트 측쇄를 가지며, 제1 분지형 카보하이드레이트 측쇄가 선택적으로 글루쿠론산을 함유하는, C-23 위치에 알데히드기를 함유하고 선택적으로 C-16 위치에 히드록실기를 함유하는 올레아난형(oleanan-type) 트리테르펜을 포함하는 비스데스모시딕 사포닌이며, 여기서 사포닌은 C-28 위치에 제2 분지형 카보하이드레이트 측쇄를 갖는 에스테르기를 함유하며, 제2 분지형 카보하이드레이트 사슬은 선택적으로 적어도 하나의 아세틸 잔기(residue), 예컨대 2개의 아세틸 잔기를 함유하고 및/또는 선택적으로 디옥시 카보하이드레이트를 포함하고 및/또는 선택적으로 퀴노보스를 포함하고 및/또는 선택적으로 글루코스를 포함하고 및/또는 선택적으로 4-메톡시신남산을 포함하고 및/또는 선택적으로 에스테르 결합을 통해 카보하이드레이트에 결합된 5-0-[5-0-Rha-(1→2)-Ara/Api-3,5-디하이드록시-6-메틸-옥타노일]-3,5-디하이드록시-6-메틸-옥탄산을 포함하며 및/또는 선택적으로 5-0-[5-0-Ara/Api-3,5-디하이드록시-6-메틸-옥타노일]-3,5-디하이드록시-6-메틸-옥탄산을 포함하는, 적어도 4개의 카보하이드레이트 유닛을 바람직하게 포함하며, 또는 여기서 적어도 하나의 사포닌은 QS-21 또는 QS-21A, QS-21 A-api, QS-21 A-xyl, QS-21B, QS-21 B-api, QS-21 B-xyl, QS-7-xyl, QS-7-api, QS-17-api, QS-17-xyl, QS-18, QS1861, 양성자화된 QS1861 (QS1862), Quil-A 중 임의의 하나 이상이다.
일 구현예는 본 발명의 접합체이며, 여기서 세포-표면 분자 표적화 분자는 세포-표면 분자에 대한 결합을 위한 단백질성 결합 분자 또는 단백질성 리간드 또는 리간드를 포함하거나 이로 구성된다.
일 구현예는 본 발명의 접합체이며, 여기서 세포-표면 분자 표적화 분자는 세포-표면 분자에 대한 결합을 위한 비-단백질성 리간드 및/또는 단백질성 리간드, 예컨대 EGF 또는 사이토카인을 포함하거나 이로 구성되며, 및/또는 면역 글로불린, 면역 글로불린의 적어도 하나의 결합 도메인, 및/또는 면역 글로불린의 적어도 하나의 결합 단편, 예컨대 항체, IgG, Vhh 도메인 또는 Vh 도메인을 포함하거나 이로 구성되는 분자, Fab, scFv, Fv, dAb, F(ab)2, Fcab 단편을 포함하거나 이로 구성되며, 이는 세포-표면 분자에 결합될 수 있다.
일 구현예는 본 발명의 접합체이며, 여기서 세포-표면 분자 표적화 분자는 종양-세포 표면 분자, 바람직하게는 종양-세포 수용체 예컨대 종양-세포 특이적 수용체, 보다 바람직하게는 CD71, CA125, EpCAM(17-1A), CD52, CEA, CD44v6, FAP, EGF-IR, 인테그린(integrin), 신데칸-1(syndecan-1), 혈관 인테그린 알파-V 베타-3(vascular integrin alpha-V beta-3), HER2, EGFR, CD20, CD22, 엽산 수용체 1(Folate receptor 1), CD146, CD56, CD19, CD138, CD27L 수용체, PSMA, CanAg, 인테그린-알파V, CA6, CD33, 메소텔린, 크립토, CD3, CD30, CD239, CD70, CD123, CD352, DLL3, CD25, ephrinA4, MUC1, Trop2, CEACAM5, CEACAM6, HER3, CD74, PTK7, Notch3, FGF2, C4.4A, FLT3, CD38, FGFR3, CD7, PD-L1, CTLA4, CD52, PDGFRA, VEGFR1, VEGFR2로부터 선택된 수용체, 바람직하게는 CD71, HER2 및 EGFR로 부터 선택된 수용체에 결합될 수 있다.
일 구현예는 본 발명의 접합체이며, 여기서 종양-세포 수용체는 본 발명의 세포-표면 분자 표적화 분자에 결합한 후에 종양 세포에 의해 내재화되거나, 또는 종양-세포 수용체는 본 발명의 접합체에 결합한 후에 종양 세포에 의해 내재화되며, 여기서 바람직하게는 종양-세포 수용체에 대한 접합체의 결합 및 세포-표면 분자 표적화 분자의 결합 후에 접합체와 종양-세포 수용체의 복합체가 예를 들어 엔도사이토시스를 통해 종양-세포 수용체-매개 내재화된다.
일 구현예는 본 발명의 접합체이며, 여기서 세포-표면 분자 표적화 분자는 모노클로날 항체 또는 이의 적어도 하나의 세포-표면 분자 결합 단편 또는 -도메인이거나 이를 포함하며, 바람직하게는 세툭시맙, 다라투무맙, 젬투주맙, 트라스투주맙, 파니투무맙, 브렌투시맙, 이노투주맙, 모세투모맙, 폴라투주맙, 오비누투주맙, IgG 유형의 OKT-9 항-CD71 모노클로날 항체, 페르투주맙, 리툭시맙, 오파투무맙, 허셉틴, 알렘투주맙, 피나투주맙, OKT-10 항-CD38 모노클로날 항체, 표 A2 또는 표 A3 또는 표 A4의 항체, 바람직하게는 세툭시맙 또는 트라스투주맙 또는 OKT-9, 또는 이의 적어도 하나의 세포-표면 분자 결합 단편 또는 -도메인 중 임의의 하나를 포함하거나 이로 구성된다.
일 구현예는 본 발명의 접합체이며, 여기서 적어도 하나의 이펙터 모이어티는 올리고뉴클레오티드, 핵산 및 제노 핵산 중 임의의 하나 이상, 바람직하게는 벡터, 유전자, 세포 자살 유도 트랜스진, 데옥시리보핵산 (DNA), 리보핵산 (RNA), 안티센스 올리고뉴클레오티드 (ASO, AON), 짧은 간섭 RNA (siRNA), 마이크로RNA (miRNA), DNA 앱타머, RNA 앱타머, mRNA, 미니-서클 DNA, 펩티드 핵산 (PNA), 포스포라미데이트 모르폴리노 올리고머 (PMO), 잠금 핵산 (LNA), 브리지 핵산 (BNA), 2'-디옥시-2'-플루오로아라비노 핵산 (FANA), 2'-O-메톡시에틸-RNA (MOE), 2'-O, 4'-아미노에틸렌 브리지 핵산, 3'-플루오로 헥시톨 핵산 (FHNA), 플라스미드, 글리콜 핵산 (GNA) 및 트레오스 핵산 (TNA) 또는 이의 유도체 중 임의의 하나 이상으로부터 선택된 것, 보다 바람직하게는 BNA, 예를 들어 HSP27 단백질 발현을 침묵시키는 BNA를 포함하거나 이로 구성된다.
일 구현예는 본 발명의 접합체이며, 여기서 적어도 하나의 이펙터 모이어티는 올리고뉴클레오티드, 핵산 및 제노 핵산 중 임의의 하나 이상, 바람직하게는 벡터, 유전자, 세포 자살 유도 트랜스진, 데옥시리보핵산 (DNA), 리보핵산 (RNA), 안티센스 올리고뉴클레오티드 (ASO, AON), 짧은 간섭 RNA (siRNA), 마이크로RNA (miRNA), DNA 앱타머, RNA 앱타머, mRNA, 미니-서클 DNA, 펩티드 핵산 (PNA), 포스포라미데이트 모르폴리노 올리고머 (PMO), 잠금 핵산 (LNA), 브리지 핵산 (BNA), 2'-디옥시-2'-플루오로아라비노 핵산 (FANA), 2'-O-메톡시에틸-RNA (MOE), 2'-O, 4'-아미노에틸렌 브리지 핵산, 3'-플루오로 헥시톨 핵산 (FHNA), 플라스미드, 글리콜 핵산 (GNA) 및 트레오스 핵산 (TNA) 또는 이의 유도체 중 임의의 하나 이상으로부터 선택된 것, 보다 바람직하게는 BNA, 예를 들어 HSP27 단백질 발현을 침묵시키는 BNA를 포함하거나 이로 구성되며, 적어도 하나의 이펙터 모이어티는 예를 들어, 두 가지의 다른 유전자를 침묵시키기 위한 2가지의 다른 (안티센스) 올리고뉴클레이티드이다.
일 구현예는 본 발명의 접합체이며, 여기서 적어도 하나의 이펙터 모이어티는 적어도 하나의 단백질성 분자, 바람직하게는 펩티드, 단백질, 효소, 예컨대 우레아제 및 Cre-재조합효소, 리보좀-불활성화 단백질, 표 A5로부터 선택된 단백질성 독소 중 임의의 하나 이상으로부터 선택된 것, 그리고 보다 바람직하게는 바이러스 독소, 예컨대 아폽틴; 박테리아 독소 예컨대 시가(Shiga) 독소, 시가-유사(Shiga-like) 독소, 슈도모나스 아에루기노사 엑소톡신(Pseudomonas aeruginosa exotoxin) (PE) 또는 PE의 엑소톡신 A, 전장 또는 절단된(truncated) 디프테리아 독소 (DT), 콜레라 독소; 곰팡이 독소(fungal toxin), 예컨대 알파-사르신; 리보좀-불활성화 단백질 및 2형 리보좀-불활성화 단백질의 A 체인, 예컨대 디안틴, 예를 들어, 디안틴-30 또는 디안틴-32, 사포린 예를 들어, 사포린-S3 또는 사포린-S6, 보우가닌 또는 보우가닌의 탈-면역화(de-immunized) 유도체 디보우가닌, 시가-유사 독소 A, 포크위드(pokeweed) 항바이러스 단백질, 리신(ricin), 리신 A 체인, 모데신, 모데신 A 체인, 아브린, 아브린 A 체인, 볼켄신, 볼켄신 A 체인, 비스쿠민, 비스쿠민 A 체인을 포함하는 식물 독소; 또는 동물 또는 인간 독소, 예컨대 개구리 RNase, 또는 인간으로부터의 안지오게닌, 또는 그랜자임 B, 또는 이의 임의의 단편 또는 유도체 중 임의의 하나 이상으로부터 선택되는 것을 포함하거나 이로 구성되며; 바람직하게는 단백질 독소가 디안틴 및/또는 사포린이다.
일 구현예는 본 발명의 접합체이며, 여기서 적어도 하나의 이펙터 모이어티는 적어도 하나의 페이로드, 바람직하게는 리보좀 표적화 독소(toxin targeting ribosomes), 연장 인자 표적화 독소(toxin targeting elongation factors), 튜불린 표적화 독소, DNA 표적화 독소, 및 RNA 표적화 독소 중 임의의 하나 이상, 보다 바람직하게는, 엠탄신, 파수도톡스, 메이탄시노이드 유도체 DM1, 메이탄시노이드 유도체 DM4, 모노메틸 아우리스타틴 E(MMAE, 베도틴), 모노메틸 아우리스타틴F(MMAF, 마포도틴), 칼리케아미신, N-아세틸-γ-칼리케아미신, 피롤로벤조디아제핀 (PBD) 다이머, 벤조디아제핀, CC-1065 유사체, 듀오카르마이신, 독소루비신, 파클리타셀, 도세타셀, 시스플라틴, 시클로포스파미드, 에토포사이드, 도세타셀, 5-플루오로우라실(5-FU), 미토산트론, 튜불리신, 인돌리노벤조디아제핀, AZ13599185, 크립토피신, 리조신, 메토트레세이트, 안트라사이클린, 캠토테신 유사체, SN-38, DX-8951f, 엑사테칸 메실레이트, 슈도모나스 아에루기노사(Pseudomonas aeruginosa) 엑소톡신(PE38)의 절단된 형태, 듀오카르마이신 유도체, 아마니틴, α-아마니틴, 스플라이세오스타틴, 타일란스타틴, 오조가미신, 테시린, 앰버스타틴269 및 소라브탄신, 또는 이의 유도체 중 임의의 하나 이상으로부터 선택된 것을 포함하거나 이로 구성된다.
일 구현예는 본 발명의 접합체이며, 여기서 적어도 하나의 이펙터 모이어티는 적어도 하나의 링커를 통해 세포-표면 분자 표적화 분자에 공유 결합되거나 또는 세포-표면 분자 표적화 분자에 직접 결합된다.
일 구현예는 본 발명의 접합체이며, 여기서 적어도 하나의 이펙터 모이어티는 세포-표면 분자 표적화 분자에 공유 결합되며, 이에 의해 항체-약물 접합체 젬투주맙 오조가미신, 브렌투시맙 베도틴, 트라스투주맙 엠탄신, 이노투주맙 오조가미신, 모세투모맙 파수도톡스 및 폴라투주맙 베도틴 및 표 A2 및 표 A3의 항체-약물 접합체 중 임의의 하나를 형성한다.
일 구현예는 본 발명의 접합체이며, 여기서 적어도 하나의 사포닌은 세포-표면 분자 표적화 분자, 바람직하게는 세포-표면 분자 표적화 분자의 아미노산 잔기에 사포닌의 알데히드 작용을 통해, 및/또는 적어도 하나의 이펙터 모이어티에 바람직하게는 적어도 하나의 이펙터 모이어티의 아미노산 잔기를 통해, 사포닌에서의 알데히드 작용, 바람직하게는 12,13-디하이드로올레아난 유형에 속하는 비스데스모시딕 트리테르펜 사포닌의 위치 C-23에서의 알데히드 작용을 통해 공유 결합된다.
일 구현예는 본 발명의 접합체이며, 여기서 적어도 하나의 사포닌에서의 알데히드 작용, 바람직하게는 적어도 하나의 사포닌의 위치 C-23에서의 알데히드 작용은 링커 N-ε-말레이미도카프로산 히드라지드에 공유 커플링되고, 이 링커는 티오-에테르 결합을 통해 세포-표면 분자 표적화 분자 및/또는 적어도 하나의 이펙터 모이어티의 설프하이드릴기(sulfhydryl group), 예컨대 시스테인의 설프하이드릴기에 공유 커플링된다.
일 구현예는 본 발명의 접합체이며, 여기서 적어도 하나의 사포닌은 위치 C-23에서 알데히드 작용을 갖는 12,13-디하이드로올레아난 유형에 속하며 사포닌의 C-3베타-OH기의 카보하이드레이트 치환체에 글루쿠론산 작용을 포함하는 비스데스모시딕 트리테르펜 사포닌이며, 여기서 사포닌은 글루쿠론산(glucuronic acid) 작용을 통해, 그리고 바람직하게 적어도 하나의 이펙터 모이어티의 아미노산 잔기를 통해 적어도 하나의 이펙터 모이어티 및/또는 세포-표면 분자 표적화 분자의 아미노산 잔기에 공유 결합된다.
일 구현예는 본 발명의 접합체이며, 여기서 적어도 하나의 사포닌의 C-3베타-OH기에서의 카보하이드레이트 치환체에서의 글루쿠론산 작용은 링커 1-[비스(디메틸아미노)메틸렌]-1H-1,2,3-트리아졸로[4,5-b]피리디늄 3-옥시드 헥사플루오로포스페이트에 공유 커플링되며, 이 링커는 아미드 결합을 통해 세포-표면 분자 표적화 분자 및/또는 적어도 하나의 이펙터 모이어티의 아민기, 예컨대 세포-표면 분자 표적화 분자 및/또는 적어도 하나의 이펙터 모이어티의 N-말단 또는 라이신의 아민기에 공유 커플링된다.
일 구현예는 본 발명의 접합체이며, 여기서 적어도 하나의 사포닌은 세포-표면 분자 표적화 분자 및/또는 적어도 하나의 이펙터 모이어티에 직접 또는 적어도 하나 링커 예컨대 2작용성 링커, 예를 들어, N-ε-말레이미도카프로산 히드라지드에 기초한 및/또는 1-[비스(디메틸아미노)메틸렌]-1H-1,2,3-트리아졸로[4,5-b]피리디늄 3-옥시드 헥사플루오로포스페이트에 기초한 2작용성 링커, 또는 3작용성 링커, 예컨대 스킴 II 및 구조 B의 3작용성 링커를 통해 공유 결합된다.
일 구현예는 본 발명의 접합체이며, 여기서 3작용성 링커는 적어도 하나의 사포닌이 공유 결합된 제2 화학기, 세포-표면 분자 표적화 분자에 대한 공유 결합을 위한 제3 화학기 및 적어도 하나의 이펙터 모이어티에 대한 공유 결합을 위한 제1 화학기를 포함하며, 바람직하게는 3작용성 링커는 스킴 II 및 구조 B의 3작용성 링커이다.
일 구현예는 본 발명의 접합체이며, 여기서 적어도 하나의 사포닌은 세포-표면 분자 표적화 분자 및 적어도 하나의 이펙터 모이어티에 3작용성 링커를 포함하는 적어도 하나의 링커를 통해 공유 결합되며, 3작용성 링커에 세포-표면 분자 표적화 분자 및 적어도 하나의 이펙터 모이어티 모두가 결합되고, 바람직하게는 3작용성 링커는 스킴 II 및 구조 B의 3작용성 링커이다.
일 구현예는 본 발명의 접합체이며, 여기서 적어도 하나의 링커는 적어도 하나의 절단 가능한(cleavable) 링커를 포함하며, 여기서 선택적으로 절단 가능한 링커는 산성, 환원성, 효소 또는 광-유도 조건 하에서 절단되며, 바람직하게는 절단 가능한 링커는 산성 조건 하에서 절단되는 히드라존 결합 또는 히드라지드 결합 및/또는 단백질 분해(proteolysis), 예를 들어 카셉신 B에 의한 단백질 분해에 민감한 결합, 및/또는 환원성 조건 하에서 절단에 민감한 결합, 예컨대 디설파이드 결합으로부터 선택되는 절단 가능한 결합을 포함한다.
일 구현예는 본 발명의 접합체이며, 여기서 적어도 하나의 링커는 적어도 하나의 절단 가능한 링커를 포함하며, 여기서 절단 가능한 링커는 포유류 세포, 바람직하게는 인간 세포의 엔도좀 및/또는 리소좀에 존재하는 산성 조건, 바람직하게는 pH 4.0-6.5, 그리고 보다 바람직하게는 pH ≤ 5.5 하에서 생체내(in vivo)에서 절단된다.
일 구현예는 본 발명의 접합체이며, 여기서 적어도 하나의 사포닌은 라이신 측쇄에 공유 결합되어 아미드 결합을 형성하고 및/또는 시스테인 측쇄에 공유 결합되어 티오-에테르 링키지 또는 디설파이드 결합을 형성하고, 여기서 라이신 및/또는 시스테인은 세포-표면 분자 표적화 분자에 의해 포함되고 및/또는 적어도 하나의 이펙터 모이어티에 의해 포함되며, 여기서 적어도 하나의 사포닌은 라이신 및/또는 시스테인에 직접 결합되거나, 선택적으로 절단 가능한 링커 및/또는 3작용성 링커, 예컨대 스킴 II 및 구조 B의 3작용성 링커를 포함하는 적어도 하나의 링커를 통해 결합된다.
일 구현예는 본 발명의 접합체이며, 여기서 링커는 N-ε-말레이미도카프로산 히드라지드에 기초한 및/또는 1-[비스(디메틸아미노)메틸렌]-1H-1,2,3-트리아졸로[4,5-b]피리디늄 3-옥시드 헥사플루오로포스페이트에 기초한 것, 3작용성 링커, 예컨대 스킴 II 및 구조 B의 3작용성 링커, 절단 가능한 링커이며, 및/또는 디설파이드 결합, 티오-에테르 결합, 아미드 결합, 히드라지드 결합 중 임의의 하나 이상을 포함한다.
일 구현예는 본 발명의 접합체이며, 여기서 적어도 하나의 사포닌은 세포-표면 분자 표적화 분자 및/또는 적어도 하나의 이펙터 모이어티에 적어도 하나 링커를 통해 공유 결합되며, 여기서 링커는 폴리머 또는 올리고머 구조를 포함하며 스캐폴드를 세포-표면 분자 표적화 분자 및/또는 적어도 하나의 이펙터 모이어티에 공유 커플링하기 위한 적어도 하나의 제4 화학기를 추가로 포함하는 스캐폴드이거나 이를 포함한다.
일 구현예는 본 발명의 접합체이며, 여기서 적어도 하나의 사포닌은 스캐폴드의 폴리머 또는 올리고머 구조에 절단 가능한 결합 및/또는 절단 불가능한 결합(non-cleavable bond)을 통해 공유 결합된다.
일 구현예는 본 발명의 접합체이며, 여기서 절단 가능한 결합은 산성 조건, 환원성 조건, 효소 조건 및 광-유도 조건 중 임의의 조건 하에서 절단되며, 바람직하게는 절단 가능한 결합은 산성 조건 하에서 절단되는 히드라존 결합 또는 히드라지드 결합 및/또는 단백질 분해(proteolysis), 예를 들어 카셉신 B에 의한 단백질 분해에 민감한 결합, 및/또는 환원성 조건 하에서 절단에 민감한 결합, 예컨대 디설파이드 결합을 포함한다.
일 구현예는 본 발명의 접합체이며, 여기서 절단 가능한 결합은 포유류 세포, 바람직하게는 인간 세포의 엔도좀 및/또는 리소좀에 존재하는 산성 조건, 바람직하게는 pH 4.0-6.5, 그리고 보다 바람직하게는 pH ≤ 5.5 하에서 생체내(in vivo)에서 절단된다.
일 구현예는 본 발명의 접합체이며, 여기서 적어도 하나의 사포닌은 이민 결합, 히드라존 결합, 히드라지드 결합, 옥심 결합, 1,3-디옥솔란 결합, 디설파이드 결합(disulphide bond), 티오-에테르 결합, 아미드 결합, 펩티드 결합 또는 에스테르 결합 중 임의의 하나 이상을 통해, 바람직하게는 적어도 하나 링커를 통해, 스캐폴드의 폴리머 또는 올리고머 구조에 공유 결합된다.
일 구현예는 본 발명의 접합체이며, 여기서 적어도 하나의 사포닌은 스캐폴드의 폴리머 또는 올리고머 구조에 이민 결합, 히드라존 결합, 및 히드라지드 결합 중 임의의 하나 이상을 통해 공유 결합되며, 이 결합은 바람직하게는 본 발명에 따라 절단될 수 있으며, 여기서 바람직하게는 적어도 하나의 사포닌은 스캐폴드의 폴리머 또는 올리고머 구조에 적어도 하나의 사포닌의 위치 C-23에서의 알데히드 작용을 통해 공유 결합된다.
일 구현예는 본 발명의 접합체이며, 여기서 적어도 하나의 사포닌의 위치 C-23에서의 알데히드 작용은 링커 N-ε-말레이미도카프로산 히드라지드에 공유 커플링되며, 이 링커는 스캐폴드의 폴리머 또는 올리고머 구조의 설프하이드릴기(sulfhydryl group), 예컨대 시스테인의 설프하이드릴기에 티오-에테르 결합을 통해 공유 커플링된다.
일 구현예는 본 발명의 접합체이며, 여기서 적어도 하나의 사포닌은 스캐폴드의 폴리머 또는 올리고머 구조에 아미드 결합을 통해 공유 결합되며, 여기서 바람직하게는 적어도 하나의 사포닌은 스캐폴드의 폴리머 또는 올리고머 구조에, 존재하는 경우에, 적어도 하나의 사포닌의 C-3베타-OH기에서의 카보하이드레이트 치환체에서의 글루쿠론산 작용을 통해 공유 결합된다.
일 구현예는 본 발명의 접합체이며, 여기서 적어도 하나의 사포닌의 C-3베타-OH기에서의 카보하이드레이트 치환체에서의 글루쿠론산 작용은 링커 1-[비스(디메틸아미노)메틸렌]-1H-1,2,3-트리아졸로[4,5-b]피리디늄 3-옥시드 헥사플루오로포스페이트에 공유 커플링되며, 이 링커는 아미드 결합을 통해 스캐폴드의 폴리머 또는 올리고머 구조의 아민기, 예컨대 스캐폴드의 폴리머 또는 올리고머 구조의 N-말단 또는 라이신의 아민기에 공유 커플링된다.
일 구현예는 본 발명의 접합체이며, 여기서 적어도 하나의 사포닌은 스캐폴드의 폴리머 또는 올리고머 구조에 공유 결합되며, 존재하는 경우에, 공유 결합에 적어도 하나의 사포닌의 위치 C-23에서의 알데히드 작용이 수반되고 및/또는 존재하는 경우에, 공유 결합에 적어도 하나의 사포닌의 C-3베타-OH기에서의 카보하이드레이트 치환체에서의 글루쿠론산 작용이 수반된다.
일 구현예는 본 발명의 접합체이며, 여기서 스캐폴드를 세포-표면 분자 표적화 분자 및/또는 적어도 하나의 이펙터 모이어티에 공유 커플링하기 위한 스캐폴드의 적어도 하나의 제4 화학기는 클릭 화학기이며, 바람직하게는 테트라진, 아지드, 알켄 또는 알킨, 또는 이들 기의 시클릭 유도체(cyclic derivative) 중 임의의 하나 이상으로부터 선택되며, 바람직하게는 아지드기이다.
일 구현예는 본 발명의 접합체이며, 여기서 스캐폴드의 폴리머 또는 올리고머 구조는 선형, 분지형 및/또는 고리형 폴리머, 올리고머, 덴드리머, 덴드론, 덴드론화 폴리머, 덴드론화 올리고머, DNA, 폴리펩티드, 폴리-라이신, 폴리에틸렌 글리콜, 또는 이들 폴리머 또는 올리고머 구조의 어셈블리를 포함하며, 이 어셈블리는 바람직하게는 공유 가교에 의해 구축된다.
일 구현예는 본 발명의 접합체이며, 여기서 적어도 하나의 사포닌은 정의된 수의 사포닌 또는 정의된 범위의 사포닌, 바람직하게는 1-128개의 사포닌 또는 적어도 2, 3, 4, 5, 6, 8, 10, 16, 32, 64 또는 128개의 사포닌, 또는 그 사이의 임의의 수의 사포닌, 예컨대 7, 9, 12개의 사포닌이다.
일 구현예는 본 발명의 접합체이며, 여기서 접합체는 적어도 하나의 이펙터 모이어티 및/또는 세포-표면 분자 표적화 분자의 아미노산 잔기에 직접 그리고 바람직하게는 적어도 하나의 이펙터 모이어티의 아미노산 잔기를 통해, 바람직하게는 시스테인 및/또는 라이신에 공유 결합되고 및/또는, 청구항 28 내지 40중 어느 한 항의 적어도 하나의 링커 및/또는 적어도 하나의 절단 가능한 링커 및/또는 적어도 하나의 폴리머 또는 올리고머 스캐폴드, 바람직하게는 1-8개의 이러한 스캐폴드 또는 2-4개의 이러한 스캐폴드를 통해 공유 결합되는, 하나 보다 많은 사포닌, 바람직하게는 2, 3, 4, 5, 6, 8, 10, 16, 32, 64 또는 1-100개의 사포닌, 또는 이들 사이의 임의의 수의 사포닌, 예컨대 7, 9, 12개의 사포닌을 포함하며, 여기서 1-32개의 사포닌, 바람직하게는 2, 3, 4, 5, 6, 8, 10, 16 또는 32개의 사포닌, 또는 이들 사이의 임의의 수의 사포닌, 예컨대 7, 9, 12개의 사포닌은 적어도 하나의 스캐폴드에 공유 결합된다.
일 구현예는 본 발명의 접합체이며, 여기서 적어도 하나의 사포닌은 세포-표면 분자 표적화 분자 및 적어도 하나의 이펙터 모이어티에 3 작용성 링커를 통해 공유 결합되며, 3 작용성 링커는 직접 또는 링커 예컨대 절단 가능한 링커 및/또는 폴리머 또는 올리고머 구조를 포함하는 스캐폴드를 통해 공유 결합된 적어도 하나의 사포닌을 갖는 제2 화학기 및 3 작용성 링커에 스캐폴드를 공유 커플링하기 위한 본 발명에 따른 제4 화학기를 포함하며, 3 작용성 링커는 세포-표면 분자 표적화 분자에 대한 공유 결합을 위한 제3 화학기를 추가로 포함하고 적어도 하나의 이펙터 모이어티에 대한 공유 결합을 위한 제1 화학기를 포함하며, 여기서 세포-표면 분자 표적화 분자는 제3 화학기에 결합되고 및/또는 적어도 하나의 이펙터 모이어티는 제1 화학기에 결합되고, 바람직하게는 제3 작용성 링커는 스킴 II 및 구조 B의 제3 작용성 링커이다.
본 발명의 일 견지는 본 발명의 접합체 및 선택적으로 약학적으로 허용가능한 부형제 및/또는 약학적으로 허용가능한 희석제를 포함하는 약학적 조성물에 관한 것이다.
본 발명의 일 견지는 의약으로 사용하기 위한 본 발명의 접합체, 또는 본 발명의 약학적 조성물에 관한 것이다.
본 발명의 일 견지는 암 또는 자가면역 질환의 치료 또는 방지(prevention)에 사용하기 위한 본 발명의 접합체 또는 본 발명의 약학적 조성물에 관한 것이다.
본 발명의 일 견지는 하기의 ADC 및 AOC 중 임의의 것, 및 이들의 반제품 접합체로서 이는 본 발명의 세포-표면 분자 표적화 분자 그리고 본 발명의 적어도 하나의 이펙터 분자를 포함하거나 본 발명의 적어도 하나의 사포닌을 포함하거나, 또는 이들 둘 모두를 포함한다:
항-EGFR 항체 - 사포닌;
항-EGFR 항체- 위치 C-23에서 알데히드 작용을 갖는 12,13-디히드로올레아난(12,13-dehydrooleanane)의 유형에 속하며, 선택적으로 상기 사포닌의 C-3베타-OH 기에서 카보하이드레이트 치환체에 글루쿠론산(glucuronic acid) 작용을 포함하는 비스데스모시딕 트리테르펜(bisdesmosidic triterpene) 사포닌 및/또는 트리테르페노이드 사포닌;
항-EGFR 항체 - SO1861;
항-EGFR 항체 - GE1741;
항-EGFR 항체 - SA1641;
항-EGFR 항체 - Quil-A;
항-EGFR 항체 - QS-21;
항-EGFR 항체 - 퀼라자 사포나리아의 수용성 사포닌 분획 중의 사포닌;
세툭시맙 - 사포닌;
세툭시맙 - 위치 C-23에서 알데히드 작용을 갖는 12,13-디히드로올레아난(12,13-dehydrooleanane)의 유형에 속하며, 선택적으로 상기 사포닌의 C-3베타-OH 기에서 카보하이드레이트 치환체에 글루쿠론산(glucuronic acid) 작용을 포함하는 비스데스모시딕 트리테르펜(bisdesmosidic triterpene) 사포닌 및/또는 트리테르페노이드 사포닌;
세툭시맙 - SO1861;
세툭시맙 - GE1741;
세툭시맙 - SA1641;
세툭시맙 - Quil-A;
세툭시맙 - QS-21;
세툭시맙 - 퀼라자 사포나리아의 수용성 사포닌 분획 중의 사포닌
항-HER2 항체 - 사포닌;
항-HER2 항체 - 위치 C-23에서 알데히드 작용을 갖는 12,13-디히드로올레아난(12,13-dehydrooleanane)의 유형에 속하며, 선택적으로 상기 사포닌의 C-3베타-OH 기에서 카보하이드레이트 치환체에 글루쿠론산(glucuronic acid) 작용을 포함하는 비스데스모시딕 트리테르펜(bisdesmosidic triterpene) 사포닌 및/또는 트리테르페노이드 사포닌;
항-HER2 항체 - SO1861;
항-HER2 항체 - GE1741;
항-HER2 항체 - SA1641;
항-HER2 항체 - Quil-A;
항-HER2 항체 - QS-21;
항-HER2 항체 - 퀼라자 사포나리아의 수용성 사포닌 분획 중의 사포닌;
트라스투주맙 - 사포닌;
트라스투주맙 - 위치 C-23에서 알데히드 작용을 갖는 12,13-디히드로올레아난(12,13-dehydrooleanane)의 유형에 속하며, 선택적으로 상기 사포닌의 C-3베타-OH 기에서 카보하이드레이트 치환체에 글루쿠론산(glucuronic acid) 작용을 포함하는 비스데스모시딕 트리테르펜(bisdesmosidic triterpene) 사포닌 및/또는 트리테르페노이드 사포닌;
트라스투주맙 - SO1861;
트라스투주맙 - GE1741;
트라스투주맙 - SA1641;
트라스투주맙 - Quil-A;
트라스투주맙 - QS-21;
트라스투주맙 - 퀼라자 사포나리아의 수용성 사포닌 분획 중의 사포닌;
항-CD71 항체 - 사포닌;
항-CD71 항체 - 위치 C-23에서 알데히드 작용을 갖는 12,13-디히드로올레아난(12,13-dehydrooleanane)의 유형에 속하며, 선택적으로 상기 사포닌의 C-3베타-OH 기에서 카보하이드레이트 치환체에 글루쿠론산(glucuronic acid) 작용을 포함하는 비스데스모시딕 트리테르펜(bisdesmosidic triterpene) 사포닌 및/또는 트리테르페노이드 사포닌;
항-CD71 항체 - SO1861;
항-CD71 항체 - GE1741;
항-CD71 항체 - SA1641;
항-CD71 항체 - Quil-A;
항-CD71 항체 - QS-21;
항-CD71 항체 - 퀼라자 사포나리아의 수용성 사포닌 분획 중의 사포닌;
OKT-9 - 사포닌;
OKT-9 - 위치 C-23에서 알데히드 작용을 갖는 12,13-디히드로올레아난(12,13-dehydrooleanane)의 유형에 속하며, 선택적으로 상기 사포닌의 C-3베타-OH 기에서 카보하이드레이트 치환체에 글루쿠론산(glucuronic acid) 작용을 포함하는 비스데스모시딕 트리테르펜(bisdesmosidic triterpene) 사포닌 및/또는 트리테르페노이드 사포닌;
OKT-9 - SO1861;
OKT-9 - GE1741;
OKT-9 - SA1641;
OKT-9 - Quil-A;
OKT-9 - QS-21;
OKT-9 - 퀼라자 사포나리아의 수용성 사포닌 분획 중의 사포닌;
항-EGFR 항체 - 올리고뉴클레오티드;
항-EGFR 항체 - 안티센스 올리고뉴클레오티드;
항-EGFR 항체 - siRNA;
항-EGFR 항체 - 안티센스 BNA;
항-EGFR 항체 - 안티센스 BNA(HSP27);
항-EGFR 항체 - 단백질성 독소;
항-EGFR 항체 - 리보좀 불활성화 단백질;
항-EGFR 항체 - 디안틴;
항-EGFR 항체 - 사포린;
세툭시맙 - 올리고뉴클레오티드;
세툭시맙 - 안티센스 올리고뉴클레오티드;
세툭시맙 - siRNA;
세툭시맙 - 안티센스 BNA;
세툭시맙 - 안티센스 BNA(HSP27);
세툭시맙 - 단백질성 독소;
세툭시맙 - 리보좀 불활성화 단백질;
세툭시맙 - 디안틴
세툭시맙 - 사포린;
항-HER2 항체 - 올리고뉴클레오티드;
항-HER2 항체 - 안티센스 올리고뉴클레오티드;
항-HER2 항체 - siRNA;
항-HER2 항체 - 안티센스 BNA;
항-HER2 항체 - 안티센스 BNA(HSP27);
항-HER2 항체 - 단백질성 독소;
항-HER2 항체 - 리보좀 불활성화 단백질;
항-HER2 항체 - 디안틴;
항-HER2 항체 - 사포린;
트라스투주맙 - 올리고뉴클레오티드;
트라스투주맙 - 안티센스 올리고뉴클레오티드;
트라스투주맙 - siRNA;
트라스투주맙 - 안티센스 BNA;
트라스투주맙 - 안티센스 BNA(HSP27);
트라스투주맙 - 단백질성 독소;
트라스투주맙 - 리보좀 불활성화 단백질;
트라스투주맙 - 디안틴;
트라스투주맙 - 사포린;
항-CD71 항체 - 올리고뉴클레오티드;
항-CD71 항체 - 안티센스 올리고뉴클레오티드;
항-CD71 항체 - siRNA;
항-CD71 항체 - 안티센스 BNA;
항-CD71 항체 - 안티센스 BNA(HSP27);
항-CD71 항체 - 단백질성 독소;
항-CD71 항체 - 리보좀 불활성화 단백질;
항-CD71 항체 - 디안틴;
항-CD71 항체 - 사포린;
OKT-9 - 올리고뉴클레오티드;
OKT-9 - 안티센스 올리고뉴클레오티드;
OKT-9 - siRNA;
OKT-9 - 안티센스 BNA;
OKT-9 - 안티센스 BNA(HSP27);
OKT-9 - 단백질성 독소;
OKT-9 - 리보좀 불활성화 단백질;
OKT-9 - 디안틴;
OKT-9 - 사포린;
항-EGFR 항체 (- 올리고뉴클레오티드)(- 사포닌), 여기서 올리고뉴클레오티드는 안티센스 올리고뉴클레오티드, siRNA, 안티센스 BNA, 및 안티센스 BNA(HSP27) 중 임의의 하나 이상이고, 그리고 여기서 사포닌은 위치 C-23에서 알데히드 작용을 갖는 12,13-디히드로올레아난(12,13-dehydrooleanane)의 유형에 속하며, 선택적으로 상기 사포닌의 C-3베타-OH 기에서 카보하이드레이트 치환체에 글루쿠론산(glucuronic acid) 작용을 포함하는 비스데스모시딕 트리테르펜(bisdesmosidic triterpene) 사포닌 및/또는 트리테르페노이드 사포닌, SO1861, GE1741, SA1641, Quil-A, QS-21, 및 퀼라자 사포나리아의 수용성 사포닌 분획 중의 사포닌 중 임의의 하나 이상이고, 여기서 항-EGFR 항체는 바람직하게 세툭시맙임;
항-EGFR 항체 (- 단백질성 독소)(- 사포닌), 여기서 단백질성 독소는 리보좀 불활성화 단백질, 디안틴 및 사포린 중 임의의 하나 이상이고, 그리고 여기서 사포닌은 위치 C-23에서 알데히드 작용을 갖는 12,13-디히드로올레아난(12,13-dehydrooleanane)의 유형에 속하며, 선택적으로 상기 사포닌의 C-3베타-OH 기에서 카보하이드레이트 치환체에 글루쿠론산(glucuronic acid) 작용을 포함하는 비스데스모시딕 트리테르펜(bisdesmosidic triterpene) 사포닌 및/또는 트리테르페노이드 사포닌, SO1861, GE1741, SA1641, Quil-A, QS-21, 및 퀼라자 사포나리아의 수용성 사포닌 분획 중의 사포닌 중 임의의 하나 이상이고, 여기서 항-EGFR 항체는 바람직하게 세툭시맙임;
항-HER2 항체 (- 올리고뉴클레오티드)(- 사포닌), 여기서 올리고뉴클레오티드는 안티센스 올리고뉴클레오티드, siRNA, 안티센스 BNA 및 안티센스 BNA(HSP27) 중 임의의 하나 이상이고, 그리고 여기서 사포닌은 위치 C-23에서 알데히드 작용을 갖는 12,13-디히드로올레아난(12,13-dehydrooleanane)의 유형에 속하며, 선택적으로 상기 사포닌의 C-3베타-OH 기에서 카보하이드레이트 치환체에 글루쿠론산(glucuronic acid) 작용을 포함하는 비스데스모시딕 트리테르펜(bisdesmosidic triterpene) 사포닌 및/또는 트리테르페노이드 사포닌, SO1861, GE1741, SA1641, Quil-A, QS-21, 및 퀼라자 사포나리아의 수용성 사포닌 분획 중의 사포닌 중 임의의 하나 이상이고, 여기서 항-HER2 항체는 바람직하게 트라스투주맙임;
항-HER2 항체 (- 단백질성 독소)(- 사포닌), 여기서 단백질성 독소는 리보좀 불활성화 단백질, 디안틴 및 사포린 중 임의의 하나 이상이고, 그리고 여기서 사포닌은 위치 C-23에서 알데히드 작용을 갖는 12,13-디히드로올레아난(12,13-dehydrooleanane)의 유형에 속하며, 선택적으로 상기 사포닌의 C-3베타-OH 기에서 카보하이드레이트 치환체에 글루쿠론산(glucuronic acid) 작용을 포함하는 비스데스모시딕 트리테르펜(bisdesmosidic triterpene) 사포닌 및/또는 트리테르페노이드 사포닌, SO1861, GE1741, SA1641, Quil-A, QS-21, 및 퀼라자 사포나리아의 수용성 사포닌 분획 중의 사포닌 중 임의의 하나 이상이고, 여기서 항-HER2 항체는 바람직하게 트라스투주맙임;
항-CD71 항체 (- 올리고뉴클레오티드)(- 사포닌), 여기서 올리고뉴클레오티드는 안티센스 올리고뉴클레오티드, siRNA, 안티센스 BNA, 및 안티센스 BNA(HSP27) 중 임의의 하나 이상이고, 그리고 여기서 사포닌은 위치 C-23에서 알데히드 작용을 갖는 12,13-디히드로올레아난(12,13-dehydrooleanane)의 유형에 속하며, 선택적으로 상기 사포닌의 C-3베타-OH 기에서 카보하이드레이트 치환체에 글루쿠론산(glucuronic acid) 작용을 포함하는 비스데스모시딕 트리테르펜(bisdesmosidic triterpene) 사포닌 및/또는 트리테르페노이드 사포닌, SO1861, GE1741, SA1641, Quil-A, QS-21, 및 퀼라자 사포나리아의 수용성 사포닌 분획 중의 사포닌 중 임의의 하나 이상이고, 여기서 항-CD71 항체는 바람직하게 OKT-9임; 그리고
항-CD71 항체 (- 단백질성 독소)(- 사포닌), 여기서 단백질성 독소는 리보좀 불활성화 단백질, 디안틴 및 사포린 중 임의의 하나 이상이고, 그리고 여기서 사포닌은 위치 C-23에서 알데히드 작용을 갖는 12,13-디히드로올레아난(12,13-dehydrooleanane)의 유형에 속하며, 선택적으로 상기 사포닌의 C-3베타-OH 기에서 카보하이드레이트 치환체에 글루쿠론산(glucuronic acid) 작용을 포함하는 비스데스모시딕 트리테르펜(bisdesmosidic triterpene) 사포닌 및/또는 트리테르페노이드 사포닌, SO1861, GE1741, SA1641, Quil-A, QS-21, 및 퀼라자 사포나리아의 수용성 사포닌 분획 중의 사포닌 중 임의의 하나 이상이고, 여기서 항-CD71 항체는 바람직하게 OKT-9임.
일 구현예는 본 발명의 반-제품 접합체(semi-finished conjugate) 또는 본 발명의 접합체이며, 여기서 세포-표면 분자 표적화 분자는 세툭시맙, 트라스투주맙, OKT-9로부터 선택되고, 및/또는 여기서 이펙터 모이어티는 디안틴, 사포린 및 안티센스 BNA(HSP27)로부터 선택되고, 및/또는 여기서 사포닌은 SO1861, GE1741, SA1641, Quil-A, QS-21, 및 퀼라자 사포나리아의 수용성 사포닌 분획 중의 사포닌으로부터 선택된다.
일 구현예는 본 발명에 따른 접합체이며, 여기서 세포-표면 분자 표적화 분자는 세툭시맙, 트라스투주맙, OKT-9로부터 선택되고, 및/또는 여기서 이펙터 모이어티는 디안틴, 사포린 및 안티센스 BNA(HSP27)로부터 선택되고, 및/또는 여기서 사포닌은 SO1861, GE1741, SA1641, Quil-A, QS-21, 및 퀼라자 사포나리아의 수용성 사포닌 분획 중의 사포닌으로부터 선택된다.
본 발명의 일 견지는 본 발명의 세포-표면 분자 표적화 분자를 포함하고, 본 발명의 적어도 하나의 이펙터 모이어티를 포함하고 및/또는 본 발명의 적어도 하나의 사포닌을 포함하는, 구조 C의 ADC 또는 AOC 또는 반제품 ADC 접합체 또는 반제품 AOC 접합체에 관한 것이다:
A(- S)b(- E)c
구조 C,
여기서 A는 세포-표면 분자 표적화 분자이고;
S는 사포닌이고;
E는 이펙터 분자이고;
b = 0-64, 바람직하게는 0, 1, 2, 3, 4, 8, 16, 32, 64 또는 그 사이의 임의의 정수 또는 분수이며;
c = 0-8, 바람직하게는 0, 1, 2, 3, 4, 6, 8 또는 그 사이의 임의의 정수 또는 분수이며;
여기서 S는 A 및/또는 E에 커플링되고(coupled), E는 A 및/또는 S에 커플링되고, 바람직하게 S는 A에 커플링되고, E는 A에 커플링된다.
일 구현예는 본 발명의 구조 C이며, 여기서 A는 세툭시맙과 같은 항-EGFR 항체, 트라스투주맙과 같은 항-HER2 항체, OKT-9와 같은 항-CD71 항체이며, 및/또는 여기서 S는 사포닌, C-23 위치에 알데히드 작용을 갖는 12,13-디히드로올레아난의 유형에 속하며, 선택적으로 상기 사포닌의 C-3베타-OH 기에서 카보하이드레이트 치환체에 글루쿠론산 작용을 포함하는 비스데스모시딕 트리테르펜 사포닌 및/또는 트리테르페노이드 사포닌, SO1861, GE1741, SA1641, Quil-A, QS-21, 및 퀼라자 사포나리아의 수용성 사포닌 분획 중의 사포닌 중 임의의 하나 이상이고, 및/또는 E는 올리고뉴클레오티드, 안티센스 올리고뉴클레오티드, siRNA, 안티센스 BNA 및 안티센스 BNA(HSP27) 중 임의의 하나 이상, 및/또는 단백질성 독소, 리보좀 불활성화 단백질, 디안틴 및 사포린 중 임의의 하나 이상이다.
일 구현예는 본 발명의 구조 C, 본 발명의 접합체 또는 본 발명의 반-제품 접합체이며, 여기서 존재하는 경우, 사포닌, 및/또는 존재하는 경우, 이펙터 분자는 적어도 하나의 링커, 예컨대 절단 가능한 링커를 통해, 및/또는 적어도 하나의 올리고머 또는 폴리머 스캐폴드, 예컨대 N-ε-말레이미도카프로산 히드라지드(EMCH) 숙신이미딜 3-(2-피리딜디티오)프로피오네이트 또는 3-(2-피리딜디티오)프로피온산 N-히드록시숙신이미드 에스테르(SPDP), 및 1-[비스(디메틸아미노)메틸렌]-1H-1,2,3-트리아졸로[4,5-b]피리디늄 3-옥시드 헥사플루오로포스페이트(HATU)에 기초한 링커, 및 예컨대 G4-덴드론과 같은 덴드론에 기초한 스캐폴드 또는 3-작용성 링커, 예컨대 스킴 II의 3-작용성 링커를 통해 공유 커플링되며, 및/또는 여기서 세포-표면 분자 표적화 분자의 적어도 라이신 측쇄 및/또는 시스테인 측쇄, 바람직하게는 이의 모노클로날 항체 또는 단편 또는 도메인은 사포닌 및/또는 이펙터 모이어티 및/또는 링커 및/또는 절단 가능한 링커 및/또는 스캐폴드와의 공유 결합에 관여하며, 여기서 바람직하게는 사포닌 및/또는 이펙터 모이어티는 세포-표면 분자 표적화 분자, 바람직하게는 항체에 공유 연결(link)되며, 여기서 공유 연결은 아미드 결합, 히드라존 결합, 디설파이드 결합을 포함하거나 이로 구성된다.
본 발명의 일 견지는 상기한 접합체, ADC, AOC, 반제품 ADC, 반제품 AOC의 임의의 것의 의약으로서의 용도에 관한 것이다.
본 발명의 일 견지는 상기한 접합체, ADC, AOC, 반제품 ADC, 반제품 AOC를 암 또는 자가면역 질환의 치료 또는 예방에 사용하기 위한 용도에 관한 것이다.
정의
용어 "링커"는 이의 표준적인 과학적 의미를 가지며, 본원에서는 분자 또는 원자를 다른 분자, 예를 들어 리간드 또는 이펙터 분자 또는 스캐폴드에 부착하는, 펩티드 결합을 통해 복합체화된 아미노산 잔기의 선형 스트레치 또는 화학적 모이어티를 지칭한다. 전형적으로 링커는 화학 결합으로 연결된 원자의 사슬을 포함한다. 당업계에 공지된 임의의 링커 분자 또는 링커 기술이 본 개시사항에 사용될 수 있다. 지시된 경우, 링커는 링커와의 공유 연결(covalent linkage) 또는 결합(bond)을 형성하기에 적합한 이러한 분자상의 화학기(chemical group)를 통해 분자를 공유 결합하기 위한 링커이다. 링커는 절단 불가능한(non-cleavable) 링커일 수 있으며, 예를 들어 링커는 생리학적 조건에서 안정하다. 링커는 예를 들어 절단 가능한(cleavable) 링커일 수 있으며, 예를 들어 링커는 효소의 존재 또는 특정 pH 범위 또는 값에서, 또는 생리학적 조건, 예컨대 후기 엔도좀(late endosomes)과 같은 엔도좀 및 인간 세포와 같은 포유류 세포의 리소좀에서의 세포내 조건과 같은 생리학적 조건 하에서 절단 가능하다. 본 개시사항의 문맥에서 사용될 수 있는 예시적인 링커는 N-ε-말레이미도카프로산 히드라지드(EMCH), 숙신이미딜 3-(2-피리딜디티오)프로피오네이트 또는 3-(2-피리딜디티오)프로피온산 N-히드록시숙신이미드 에스테르(SPDP) 및 1-[비스(디메틸아미노)메틸렌]-1H-1,2,3-트리아졸로 [4,5-b] 피리디늄 3-옥시드 헥사플루오로포스페이트(HATU)를 포함하지만 이에 제한되지 않는다.
용어 "3-작용성 링커"는 이의 표준적인 과학적 의미를 가지며, 본원에서는 3개의 분자 각각의 화학기를 통해 3개의 분자를 부착하는 링커를 지칭한다. 당업자는 본 개시사항 및 통상의 일반적인 지식에 기초하여 이러한 3-작용성 링커를 설계할 수 있다. 이러한 3-작용성 링커는, 예를 들어 티올-엔 반응을 수행하도록 티올기를 나타내는 표적화 리간드(targeting ligand)에 대한 접합에 사용될 수 있는 말레이미도기를 나타낼 수 있다. 또한, 3-작용성 링커는 아지도 함유 사포닌과 함께 소위 변형-촉진 알킨-아지드 고리화첨가(strain-promoted alkyne-azide ycloaddition)(SPAAC, 클릭 화학(click chemistry))를 수행하도록 디벤조시클로옥틴(DBCO) 기를 나타낼 수 있다. 마지막으로, 3-작용성 링커는 테트라진(Tz) 함유 이펙터 분자와 소위 역 전자 요구 다이엘-앨더(IEDDA, inverse electron demand Diels-Alder) 반응을 수행하는 트랜스-시클로옥텐(TCO) 기와 같은 제3 작용기를 획득할 수 있다. 당업자는 3-작용성 링커의 화학기가 3개 모두 동일하거나 상이할 수 있거나, 링커가 분자를 3-작용성 링커에 연결하기 위한 동일한 화학기 중 2개의 화학기를 포함할 수 있음을 알 수 있을 것이다. 3-작용성 링커 사이에 형성된 결합은 공유 또는 비공유일 수 있으며, 공유 결합이 바람직하다. 각각의 화학기를 통한 3-작용성 링커와 1개 또는 2개 또는 3개의 결합된 분자 사이에 형성된 결합은 인간 세포와 같은 포유류 세포의 리소좀 및 엔도좀과 같은 세포 내부의 산성 조건 하에서 절단 가능한 것과 같이 절단 가능한(불안정한) 결합일 수 있거나, 또는 절단 불가능한(non-cleavable) 결합일 수 있다. 물론, 3-작용성 링커는 공유 결합을 형성하기 위한 1개 또는 2개의 화학기를 포함할 수 있는 반면, 추가의 2개 또는 1개의 화학기(들)는 각각 비공유 결합을 형성하기 위한 것이다. 물론, 3-작용성 링커는 절단 가능한 결합을 형성하기 위한 1개 또는 2개의 화학기를 포함할 수 있는 반면, 추가의 2개 또는 1개의 화학기(들)는 각각 절단 불가능한 결합을 형성하기 위한 것이다.
용어 "절단 가능한 링커" 또는 "절단 가능한 결합"에 사용된 것과 같은 용어 "절단 가능한(cleavable)"은 이의 표준적인 과학적 의미를 가지며, 본원에서는 산성 조건, 환원성 조건, 효소 조건 또는 광-유도 조건 하에서 절단되는 것을 지칭한다. 예를 들어, 절단 가능한 링커는 산성 조건 하에서 절단될 수 있으며, 바람직하게는 상기 절단 가능한 링커는 포유류 세포, 바람직하게는 인간 세포의 엔도좀 및/또는 리소좀에 존재하는 산성 조건, 바람직하게는 pH 4.0 내지 6.5, 그리고 보다 바람직하게는 pH ≤ 5.5 하에서 생체 내 절단된다. 다른 예로서, 절단 가능한 링커는 효소, 예를 들어, 카텝신에 의해 절단될 수 있다. 더욱이, 환원성 조건 하에서 절단 가능한 공유 결합의 예는 디설파이드(disulphide) 결합이다.
올리고머 또는 폴리머 스캐폴드의 문맥에서 용어 "올리고머" 및 "폴리머"는 이의 표준적인 과학적 의미를 갖는다. 본원에서 폴리머는 서로 결합된 다수의 동일하거나 유사한 유닛(unit)으로부터 주로 또는 완전히 구축된(built up) 분자 구조를 갖는 물질을 지칭하며; 본원에서 올리고머는 분자가 상대적으로 적은 반복 유닛으로 구성된 폴리머를 지칭한다. 예를 들어, 5-10개 이하의 동일하거나 유사한 유닛(unit)을 포함하는 구조를 올리고머 구조라고 할 수 있고, 10-50개 모노머 유닛 이상을 포함하는 구조를 폴리머 구조라고 할 수 있고, 10개 모노머 유닛의 구조는 올리고머 또는 폴리머로 지칭될 수 있다.
용어 "결합 부위"는 표준적인 과학적 의미를 가지며, 본원에서는 다른 분자가 결합할 수 있는 분자상의 영역 또는 에피토프, 예를 들어, 단백질, DNA 또는 RNA를 지칭한다.
용어 "스캐폴드"는 표준적인 과학적 의미를 가지며, 본원에서는 하나 이상의 분자, 예를 들어 리간드 분자, 본 발명의 사포닌, 글리코시드, 이펙터 분자가 직접적으로 또는 절단 가능한 링커와 같은 링커를 통해 공유 결합될 수 있는 올리고머 또는 폴리머 템플레이트 또는 담체 또는 염기(염기 분자 또는 염기 구조)를 지칭한다. 스캐폴드는 폴리머, 올리고머, 덴드리머, 덴드론화 폴리머 또는 덴드론화 올리고머와 같은 구조적으로 정렬된 형성물(formation)을 가질 수 있거나 하이드로겔, 마이크로겔, 나노겔, 안정화된 폴리머 미셀 또는 리포좀과 같은 에셈블리된 폴리머 구조를 가질 수 있지만, 콜레스테롤/인지질 혼합물과 같은 모노머의 비공유 어셈블리로 구성되는 구조는 제외한다. 스캐폴드는 폴리머 또는 올리고머 구조, 예컨대 폴리- 또는 올리고(아민), 예를 들어 폴리에틸렌이민 및 폴리(아미도아민); 또는 폴리에틸렌 글리콜, 폴리- 또는 올리고(에스테르), 예컨대 폴리(락티드), 폴리(락탐), 폴리락티드-코-글리콜라이드 코폴리머와 같은 구조; 또는 폴리(덱스트린), 폴리- 또는 올리고당류, 예컨대 시클로덱스트린 또는 폴리덱스트로스; 또는 천연 및/또는 인공 폴리- 또는 올리고 아미노산, 예컨대 폴리-라이신 또는 펩티드 또는 단백질, DNA 올리고- 또는 폴리머, 안정화된 RNA 폴리머 또는 PNA(펩티드 핵산) 폴리머와 같은 구조를 포함할 수 있다. 바람직하게는, 폴리머 또는 올리고머 구조는 생체 적합성(biocompatible)이며, 여기서 생체 적합성은 폴리머 또는 올리고머 구조가 유기체에서 실질적인 급성 또는 만성 독성을 나타내지 않고 그대로 배설되거나 신체 대사에 의해 배설 및/또는 생리학적 화합물로 완전히 분해될 수 있음을 의미한다.
용어 "리간드"는 표준적인 과학적 의미를 가지며, 본원에서는 표적 세포, 예를 들어, 표적 암세포 또는 표적 자가-면역 세포에서 발현되는 표적 세포-표면 분자 또는 표적 세포-표면 수용체에 선택적으로 결합할 수 있는 임의의 분자 또는 분자들을 지칭한다. 리간드는 표적 세포상의 다른 항원 또는 수용체에 의해 포함된 에피토프에 결합할 수 있다. 바람직하게는, 세포-결합 리간드는 항체이다.
본원에 사용된 용어 "항체"는 가장 넓은 의미로 사용되며, 이는 IgG, IgM, IgE, IgA 또는 IgD(또는 이의 임의의 서브클래스) 클래스에 속하는 단백질로 정의 된 면역 글로불린(Ig), 또는 면역 글로불린의 기능적 결합 단편(functional binding fragment) 또는 결합 도메인을 지칭할 수 있다. 본 발명의 문맥에서, 면역 글로불린의 "결합 단편" 또는 "결합 도메인"은 이러한 모 면역 글로불린의 항원 결합 활성을 본질적으로 유지하는 모 면역 글로불린의 항원-결합 단편 또는 -도메인 또는 기타 유도체로 정의된다. 기능적 단편 및 기능적 도메인은, 항원에 대한 친화성이 모 면역 글로불린보다 낮더라도 본 발명의 의미에서 항체이다. 본 발명에 따른 "기능적 단편 및 -도메인"은 F(ab')2 단편, Fab'단편, Fab 단편, scFv, dsFv, 단일-도메인 항체(sdAb), 1가 IgG, scFv-Fc, 환원된 IgG(rIgG), 미니바디, 디아바디, 트리아바디, 테트라바디, Fc 융합 단백질, 나노바디, 가변 V 도메인, 예컨대 Vhh, Vh, 및 면역 글로불린 단편 및 도메인을 인식하는 다른 유형의 항원을 포함하나, 이에 제한되지 않는다. 단편 및 도메인은 CH1과 CL 도메인 사이에서 발생하는 분자간 디설파이드 상호 작용을 최소화하거나 완전히 제거하도록 조작될 수 있다. 기능적 단편 및 -도메인은 크기가 작기 때문에 더 큰 종양 침투의 이점을 제공한다. 또한 기능적 단편 또는 -도메인은 전체 면역 글로불린에 비해 종양 덩어리 전체에 더 고르게 분포될 수 있다.
본 발명의 항체 (면역 글로불린)는 2 작용성 또는 다작용성(multifunctional)일 수 있다. 예를 들어, 2 작용성 항체는 하나의 수용체 또는 항원에 대한 특이성을 갖는 한쪽 팔을 가지고 있는 반면 다른 팔은 다른 수용체 또는 항원을 인식한다. 대안적으로, 2 작용성 항체의 각각의 팔은 표적 세포의 동일한 수용체 또는 항원의 상이한 에피토프에 대한 특이성을 가질 수 있다.
본 발명의 항체 (면역 글로불린)는 폴리클로날 항체, 모노클로날 항체, 인간 항체, 인간화 항체, 키메라 항체, 재표면화 항체(resurfaced antibodies), 항-이디오유형 항체(anti-idiotypic antibodies), 마우스 항체, 랫트 항체, 랫트/마우스 하이브리드 항체, 라마 항체, 라마 중쇄(heavy-chain) 전용 항체, 중쇄 전용 항체 및 수의학 항체일 수 있으나 이에 제한되지는 않는다. 바람직하게는, 본 발명의 항체 (면역 글로불린)는 모노클로날 항체이다. 재표면화, 키메라, 인간화 및 완전 인간 항체는 또한 인간에서 면역원성을 유발할 가능성이 적기 때문에 보다 바람직하다. 본 발명의 ADC의 항체는 바람직하게는 암 세포, 자가 면역 세포, 병든 세포, 비정상 세포의 표면에서 발현된 항원에 특이적으로 결합하는 반면, 임의의 건강한 세포는 본질적으로 변하지 않은 상태로 남겨둔다 (예, 이러한 정상 세포에 결합하지 않음으로써, 또는 이러한 건강한 세포에 대한 수 및/또는 친화성이 더 적은 정도로 결합함으로써).
본 발명의 ADC에 사용될 수 있는 특정한 항체는 항-HER2 모노클로날 항체 예컨대 트라투주맙 및 페르투주맙, 항-CD20 모노클로날 항체 예컨대 리툭시맙, 오파투무맙, 토시투모맙 및 이부리투모맙, 항-CA125 모노클로날 항체 예컨대 오레고보맙, 항-EpCAM (17-1A) 모노클로날 항체 예컨대 에드레콜로맙, 항-EGFR 모노클로날 항체 예컨대 세툭시맙, 파니투무맙 및 니모투주맙, 항-CD30 모노클로날 항체 예컨대 브렌투시맙, 항-CD33 모노클로날 항체 예컨대 겜투주맙 및 huMy9-6, 항-혈관 인테그린 알파-v 베타-3 모노클로날 항체 예컨대 에타라시주맙, 항-CD52 모노클로날 항체 예컨대 알렘투주맙, 항-CD22 모노클로날 항체 예컨대 에프라투주맙, 항-CEA 모노클로날 항체 예컨대 라베투주맙, 항-CD44v6 모노클로날 항체 예컨대 비바투주맙, 항-FAP 모노클로날 항체 예컨대 시브로투주맙, 항-CD19 모노클로날 항체 예컨대 huB4, 항-CanAg 모노클로날 항체 예컨대 huC242, 항-CD56 모노클로날 항체 예컨대 huN901, 항-CD38 모노클로날 항체 예컨대 다라투무맙, 항-CA6 모노클로날 항체 예컨대 DS6, 항-IGF-IR 모노클로날 항체 예컨대 시수투무맙 및 3B7, 항-인테그린 모노클로날 항체 예컨대 CNTO 95, 및 항-신데칸-1 모노클로날 항체 예컨대 B-B4를 포함하지만, 이에 제한되지 않는다. 구현예는 Stemline의 단백질-독소 접합체이다: ELZONRISTM(tagraxofusp, SL-401)-ELZONRIS는 광범위한 악성 종양에 존재하는 표적인 인터루킨-3(IL-3) 수용체-α(CD123)에 대한 신규의 표적화된 요법이다.
표적 세포의 항원 또는 세포 수용체에 결합하는 항체 이외의 임의의 다른 분자도 본 발명의 리간드-약물 접합체용 세포-결합 리간드 및 본 발명에 따른 공유 결합된 사포닌이 제공되는 리간드로서 사용될 수 있다. 이들 리간드는 단백질, 폴리펩티드, 펩티드, 소분자를 포함하지만 이에 제한되지 않는다. 이러한 비-항체 리간드의 예는 인터페론 (예, IFN-α, IFN-β 및 IFN-γ), 트랜스페린, 렉틴, 표피(epidermal) 성장 인자(EGF) 및 EGF-유사 도메인, 가스트린-방출 펩티드 (GRP), 혈소판-유래 성장 인자 (PDGF), 형질 전환 성장 인자 (TGF), 우두(vaccinia) 성장 인자 (VGF), 인슐린 및 인슐린-유사 성장 인자 (IGF, 예, IGF-1 및 IGF-2), 기타 적합한 호르몬, 예컨대 티로트로핀 방출 호르몬 (TRH), 멜라닌 세포-자극 호르몬 (MSH), 스테로이드 호르몬 (예, 에스트로겐 및 안드로겐), 소마토스타틴, 림포카 인 (예, IL-2, IL-3, IL-4 및 IL-6), 집락 자극 인자 (CSF, 예, G-CSF, M-CSF 및 GM-CSF), 봄베신, 가스트린, Arg-Gly-Asp 또는 RGD, 앱타머 (예, AS-1411, GBI-10, HIV 당단백질에 대한 RNA 앱타머), 소분자 (예, 엽산, 아니사미드 페닐보론산), 비타민 (예, 비타민 D), 카보하이드레이트 (예, 히알루론산, 갈락토스)이다.
"이펙터 분자" 또는 "이펙터 모이어티" 또는 "페이로드"는 표준적인 과학적 의미를 가지며, 본 발명의 문맥에서 세포 내 이펙터 분자 표적과의 상호 작용에 의해 세포의 대사에 영향을 미치는 임의의 물질이며, 여기서 이 이펙터 분자 표적은 엔도사이틱(endocytic) 및 재순환(recycling) 경로의 소포(vesicle) 및 구획(compartment)의 루멘을 제외하지만, 이들 소포 및 구획의 막을 포함하는 세포 내부의 임의의 분자 또는 구조이다. 따라서 세포 내부의 상기 구조는 핵, 미토콘드리아, 엽록체, 소포체, 골지체, 기타 수송 소포, 원형질막의 내부 부분 및 사이토솔(cytosol)을 포함한다.
이펙터 분자 또는 -모이어티는 단백질성 독소, 약물, 폴리펩티드 또는 폴리뉴클레오티드와 같은 독소와 같은 약학적 활성 물질이다. 본 발명에서 약학적 활성 물질은 유기체, 바람직하게는 척추 동물, 보다 바람직하게는 비인간 대상체 또는 인간/대상체와 같은 포유류에서 유익한 결과를 달성하도록 사용되는 이펙터 분자 또는 -모이어티이다. 혜택은 질환 및/또는 증상 및/또는 건강 문제의 진단, 예후, 치료, 처치 및 방지(예방)를 포함한다. 약학적 활성 물질은 또한 바람직하지 않고 때로는 심지어 해로운 부작용 (임상 시험 중에 관찰되는 것과 같은 유해 사례)을 초래할 수도 있다. 이 경우, 약학적 활성 물질이 특정 경우에 적합한지 여부를 결정하기 위해 장단점을 고려해야 한다. 세포 내부에서 약학적 활성 물질의 효과가 전체적으로 유기체에 주로 유익한 경우, 세포를 표적 세포라고 한다. 세포 내부에서의 효과가 전체적으로 유기체에 주로 해로운 경우, 세포를 표적-외(off-target) 세포라고 한다. 세포 배양 및 바이오 반응기와 같은 인공 시스템에서, 표적 세포와 표적-외 세포는 목적에 따라 다르며 사용자에 의해 정의된다. 이펙터 분자 및 -모이어티의 예는 약물, 독소, 폴리펩티드 (예, 효소), 폴리뉴클레오티드 (비천연 아미노산 또는 핵산을 포함하는 폴리펩티드 및 폴리뉴클레오티드 포함) 및 이들의 임의 조합이다.
약물인 이펙터 분자 또는 이펙터 모이어티는 항암제, 항염증제 및 항감염제 (예, 항진균제, 항균제, 항기생충제, 항바이러스제)를 포함할 수 있지만 이에 제한되지 않는다. 바람직하게는, 본 발명의 약물 분자는 항암제 또는 항자가면역제이다. 적합한 항암제는 알킬화제, 대사길항제(antimetabolites), 방추독 식물(spindle poison plant) 알칼로이드, 세포 독성/항종양 항생제, 토포이소머라제 억제제, 광감작제 및 키나제 억제제를 포함하지만 이에 제한되지 않는다. 또한 "항암제"의 정의에 포함되는 것은: 예를 들어, (i) 종양에 대한 호르몬 작용을 조절하거나 억제하는 작용을 하는 항-호르몬제, 예컨대 항-에스트로겐 및 선택적 에스트로겐 수용체 조절제; (ii) 부신에서 에스트로겐 생산을 조절하는 효소 아로마타제를 억제하는 아로마타제 억제제; (iii) 항-안드로겐; (iv) 단백질 키나제 억제제; (v) 지질 키나제 억제제; (vi) 안티센스 올리고뉴클레오티드, 특히 비정상적인 세포 증식과 관련된 신호 전달 경로에서 유전자의 발현을 억제하는 것; (vii) VEGF 발현 억제제 및 HER2 발현 억제제와 같은 리보자임; (viii) 유전자 치료 백신과 같은 백신; 토포이소머라제1 억제제; (ix) 항-혈관형성제(anti-angiogenic agents); 및 상기한 것 중 임의의 것의 약학적으로 허용가능한 염, 산, 용매화물 및 유도체이다.
독소인 이펙터 분자 또는 -모이어티는 단백질성 독소 (예, 박테리아-유래 독소 및 식물-유래 독소), 튜불린 필라멘트 표적화 독소(toxins targeting tubulin filaments), DNA 표적화 독소, RNA 표적화 독소를 포함할 수 있지만 이에 제한되지는 않는다. 단백질성 독소의 예는 사포린, 디안틴, 리신(ricin), 모데신, 아브린, 볼켄신, 비스큐민, 시가 독소, 시가-유사 독소, 슈도모나스 엑소톡신 (PE, 엑소톡신 A로도 알려짐), 디프테리아 독소 (DT) 및 콜레라 독소이다. 튜불린 필라멘트-표적화 독소의 예는 메이탄시노이드 (예, DM1 및 DM4), 아우리스타틴 (예, 모노메틸 아우리스타틴 E (MMAE) 및 모노메틸 아우리스타틴 F (MMAF)), 톡소이드, 튜불리신, 크립토피신, 리족신이다. DNA-표적화 독소의 예는 칼리케아미신: N-아세틸-γ-칼리케아미신, CC-1065 유사체, 듀오카르마이신, 독소루비신, 메토트렉세이트, 벤조디아제핀, 캄프토테신 유사체 및 안트라사이클린이다. DNA-표적화 독소의 예는 아마니틴, 스플리세오스타틴 및 타이란스타틴이다. 본 발명에서 사용되는 독소는 세포를 죽이거나 비활성화시킬 수 있는 약학적 활성 물질로 정의된다. 바람직하게는, 표적화된 독소는 표적 세포에 대해서만 또는 적어도 우세하게 독성이지만 표적-외 세포에는 독성이 없는 독소이다. 표적화된 독소의 순 효과는 바람직하게는 유기체 전체에 유익하다.
폴리펩티드인 이펙터 분자 또는 -모이어티는 예를 들어 효소 대체, 유전자 조절 기능 또는 독소와 같은 상실된 기능을 회복하는, 예를 들어 폴리펩티드일 수 있다. 이펙터 분자로서 폴리펩티드의 예는 예를 들어 Cas9; 독소 (예, 사포린, 디안틴, 겔로닌, (디)보우가닌, 아그로스틴, 리신 (독소 A 체인(chain)); 포크위드(pokeweed) 항바이러스 단백질, 아폽틴, 디프테리아 독소, 슈도모나스 엑소톡신) 대사 효소 (예, 아르기니노숙시네이트 리아제, 아르기니노숙시네이트 합성효소(synthetase)), 응고 캐스케이드의 효소, 복구 효소; 세포 신호 전달을 위한 효소; 세포주기 조절 인자; 유전자 조절 인자 (NF-KB와 같은 전사 인자 또는 메티오닌 리프레서와 같은 유전자 리프레서)이다.
폴리뉴클레오티드인 이펙터 분자 또는 이펙터 모이어티는 예를 들어, 유전자 또는 단백질을 인코딩하는 오픈 리딩 프레임과 같은 코딩 정보를 포함하는 폴리뉴클레오티드일 수 있다. 이는 또한 조절 정보, 예를 들어, 프로모터 또는 조절 요소 결합 영역, 또는 마이크로 RNA를 코딩하는 서열을 포함할 수 있다. 이러한 폴리뉴클레오티드는 천연 및 인공 핵산을 포함할 수 있다. 인공 핵산은 예를 들어 펩티드 핵산 (PNA), 모노폴리노 및 잠금 핵산 (LNA, locked nucleic acid) 뿐만 아니라 글리콜 핵산 (GNA) 및 트레오스 핵산 (TNA)을 포함할 수 있다. 이들 각각은 분자 골격의 변화에 의해 자연 발생 DNA 또는 RNA와 구별된다. 이펙터 분자로서 뉴클레오티드의 예는 예를 들어 DNA: 단일 가닥 DNA (예, 아데닌 포스포리보실트랜스퍼라제에 대한 DNA); 선형 이중 가닥 DNA (예, 응고 인자(clotting factor) IX 유전자); 원형 이중 가닥 DNA (예, 플라스미드); RNA: mRNA (예, TAL 이펙터 분자 뉴클레아제), tRNA, rRNA, siRNA, miRNA, 안티센스 RNA; 안티센스 올리고뉴클레오티드 (ASO, AON, 예를 들어 PNA, PMO, LNA 및 BNA)이지만 이에 제한되지 않는다.
예를 들어 "단백질성 분자" 및 "단백질성 독소"에 사용된 용어 "단백질성(proteinaceous)"은 단일 mRNA로부터의 발현 생성물로 수득될 수 있는 적어도 여러 개의(a string of) 아미노산 잔기를 포함하는 분자 및 독소이다. 이러한 분자 또는 독소는 임의의 번역 후 변형(modification)의 결과로 임의의 번역 후 변형, N- 또는 O-연결 카보하이드레이트와 같은 카보하이드레이트, 디설파이드 결합, 인산화(phosphorylation), 황산염화(sulphatation) 등을 추가로 포함할 수 있으며 및/또는 화학적 변형(예, 예를 들어 아미노산 측쇄에 직접, 또는 단백질성 분자를 화학적으로 변형시키기 위해 분자에 (공유적으로) 결합된 및 단백질성 분자에 화학적으로 결합된 (공유적으로) 적어도 하나의 링커를 통한 이펙터 모이어티, 사포닌, 스캐폴드, 리간드 등의 연결)에 기인한 것과 같은 임의의 다른 변형을 추가로 포함할 수 있다. 용어 "단백질성"은 또한 이러한 분자의 어셈블리, 예를 들어, 호모다이머, 헤테로트라이며, 헤테로헥사머 또는 리보좀과 같은 복합 어셈블리를 또한 망라하고 포함한다.
예를 들어, "특이적 결합" 및 "종양 세포의 표면에 특이적으로 존재하거나 발현되는 수용체 또는 분자 표적" 등의 문맥에서 용어 "특이적" 및 "특이적으로"는 당해 분야에 공지된 통상의 과학적 의미를 가지며, 본원에서는 예를 들어, 제2 분자와 상이한 추가 분자에 대한 제1 분자의 임의의 추정 결합에 비하여 더 높은 친화도로 일어나는 제1 분자와 제2 분자의 결합 상호 작용, 또는 예를 들어, 발현 또는 건강한 세포와 같은 제2 유형의 세포에서 동일한 수용체 또는 분자 표적의 발현 정도에 비하여 종양 세포, 자가 면역 세포, 병든 세포, 비정상 세포와 같은 제1 유형의 세포 표면상의 세포-표면 수용체 또는 분자 표적의 더 높은 정도의 발현(예, 수용체 또는 분자 표적으로 수가 고려될 때)을 지칭하며, 여기서 제2 유형 세포에서의 발현은 종양 세포 등의 임의의 발현 정도에 비해 완전히 없거나 매우 낮을 수 있다. 또한, 예를 들어 "특이적 결합"에서 용어 "특이적"은 당업계에 공지된 통상의 과학적 의미를 가지며, 본원에서는 분자 간의 백그라운드 상호 작용보다 더 높은 결합 친화도로 다른 분자와 상호 작용할 수 있는 분자를 나타내는 의미를 갖는다. 유사하게, 용어 "특이성(specificity)"은 예를 들어 두 분자 간의 또는 세포와 분자 간의 상호 작용을 지칭하며, 이는 분자 간의 백그라운드 상호 작용보다 더 높은 결합 친화도를 갖는다. 면역 글로불린과 같은 결합 분자는 면역 글로불린의 면역 글로불린 가변 영역과 같은 이들의 결합 부위를 통해, 분자 간의 백그라운드 상호 작용보다 더 높은 결합 친화도로 에피토프, 세포-표면 수용체 등과 같은 분자의 결합 부위에 결합한다. 본 발명의 문맥에서, 백그라운드 상호 작용은 전형적으로 10E-4 M의 KD보다 낮은 친화도를 갖는 상호 작용이다. 유사하게, "특이적 결합 도메인"은 분자 간의 백그라운드 상호 작용보다 더 높은 결합 친화도로 에피토프, 세포-표면 수용체 등과 같은 분자상의 결합 부위에 우선적으로 결합하는 도메인이다. 본 발명의 문맥에서, "백그라운드 상호 작용"은 전형적으로 10E-4 M의 KD보다 낮은 친화도를 갖는 상호 작용이다. 바람직하게는, 특이적 결합 도메인은 약 10E-5 M의 KD 보다 높은 친화도로 결합한다.
용어 "결합(binding)"은 백그라운드 상호 작용과 구별될 수 있는 분자 간의 상호 작용으로 정의된다.
명세서 전반에서, 용어 "단편"은 단백질 도메인의 일부이거나 온전한 단백질 도메인을 구축하는 아미노산 서열을 지칭한다. 본 발명에 따른 결합 단편은, 예를 들 종양 세포와 같은 병든 세토의 표면 상의 세포-표면 수용체와 같은 각각의 표적에 대해 결합 특이성을 가져야 한다.
용어 "ADC" 또는 "항체-약물 접합체(antibody-drug conjugate)"는 당업자에게 공지된 표준적인 과학적 의미를 가지며, 본원에서는 예를 들어, 암 치료를 위한 표적화된 요법으로 설계된 생물약제학 약물의 부류를 지칭한다. 화학 요법과 달리, ADC는 건강한 세포를 아끼면서 종양 세포를 표적으로 하여 사멸하기 위한 것이다. ADC는 생물학적 활성 세포독성 (항암) 페이로드 또는 약물에 연결된 항체로 구성된다. ADC는 모노클로날 항체의 표적화 능력과 세포 독성 약물의 암-사멸 능력을 조합한다. 이들은 건강한 세포와 종양의 종양 세포와 같은 병든 조직을 구별하도록 설계된다.
용어 "사포늄 앨범(Saponinum album)"은 일반적인 의미를 가지며 본원에서는 집포필라 파니큘레이트(Gypsophila paniculata) 및 집포필라 아로스티(Gypsophila arostii)로 부터의 사포닌을 함유하는 Merck KGaA (Darmstadt, 독일)에서 생산된 사포닌의 혼합물을 지칭하며, SA1657 및 주로 SA1641을 함유한다.
용어 "퀼라자사포닌(Quillajasaponin)"은 이의 일반적인 의미를 가지며 본원에서는 퀼라자 사포나리아(Quillaja saponaria)의 사포닌 분획, 그리고 따라서, 주로 QS-18 및 QS-21을 포함하는 다른 모든 QS 사포닌에 대한 공급원을 지칭한다.
"QS-21" 또는 "QS21"은 표준적인 과학적 의미를 가지며 본원에서는 QS-21 A-apio (~ 63%), QS-21 A-xylo (~ 32%), QS-21 B-apio (~ 3.3%) 및 QS-21 B-xylo (~ 1.7%)의 혼합물을 지칭한다.
마찬가지로, "QS-21A"는 이의 표준적인 과학적 의미를 가지며 본원에서는 QS-21 A-apio (~ 65%)와 QS-21 A-xylo (~ 35%)의 혼합물을 지칭한다.
마찬가지로, "QS-21B"는 이의 표준적인 과학적 의미를 가지며 본원에서는 QS-21 B-apio (~ 65%)와 QS-21 B-xylo (~ 35%)의 혼합물을 지칭한다.
용어 "Quil-A"는 퀼라자 사포나리아에서 상업적으로 입수할 수 있는 반정제 추출물을 지칭하며 50가지 보다 많은 별개의 사포닌을 다양한 양으로 함유하며, 이들 중 다수는 QS-7, QS-17, QS18, QS-21에서 발견되는 C-3베타-OH기에 트리테르펜-트리사카라이드 하위 구조 Gal-(1→2)-[Xyl-(1→3)]-GlcA-를 포함한다. Quil-A에서 발견된 사포닌은 van Setten (1995), 표 2 [Dirk C. van Setten, Gerrit van de Werken, Gijsbert Zomer and Gideon F. A. Kersten, Glycosyl Compositions and Structural Characteristics of the Potential Immuno-adjuvant Active Saponins in the Quillaja saponaria Molina Extract Quil A, RAPID COMMUNICATIONS IN MASS SPECTROMETRY, VOL. 9,660-666 (1995)]에 열거되어 있다. Quil-A 및 또한 퀼라자사포닌은 퀼라자 사포나리아로 부터의 사포닌의 분획이며 둘 모두 내용(content)이 대부분 중복되는 다른 사포닌을 매우 다양하게 함유한다. 두 분획은 다른 정제 절차에 의해 얻어지므로 두 분획은 특정 조성이 다르다.
용어 "QS1861" 및 용어 "QS1862"는 QS-7 및 QS-7 api를 지칭한다. QS1861의 분자 질량(molecular mass)은 1861 달톤이고 QS1862의 분자 질량은 1862 달톤이다. QS1862는 Fleck 등 (2019)에, 표 1의 행 번호. 28 [Juliane Deise Fleck, Andresa Heemann Betti, Francini Pereira da Silva, Eduardo Artur Troian, Cristina Olivaro, Fernando Ferreira and Simone Gasparin Verza, Saponins from Quillaja saponaria and Quillaja brasiliensis: Particular Chemical Characteristics and Biological Activities, Molecules 2019, 24, 171; doi:10.3390/molecules24010171]에 기재되어 있다. 기재된 구조는 QS-7의 api-변종(variant) QS1862이다. 분자 질량은 글루쿠론산에서 양성자를 포함하는 공식 질량(formal mass)으로서 1862 달톤이다. 중성 pH에서, 분자는 탈양성자화된다. 음이온 모드에서 질량 분석법으로 측정할 때, 측정된 질량은 1861 달톤이다.
설명 및 청구 범위에서 용어 제1, 제2, 제3 등은 유사한 구성요소를 구별하기 위해 사용되며 반드시 순차적 또는 연대순을 설명하기 위해 사용되는 것은 아니다. 상기 용어는 적절한 상황 하에서 상호 교환 가능하다. 본 발명의 구현예는 본원에서 기술되거나 예시된 것과 다른 순서로 작동할 수 있다.
더욱이, "바람직한" 또는 "예" 또는 "예를 들어" 또는 "특히"로 언급되었지만, 다양일 구현예는 본 발명의 범위를 제한하는 것이 아니라 본 발명이 구현될 수 있는 예시적인 방식으로 해석되어야 한다.
청구 범위에 사용된 용어 "포함하는"은 이후에 열거된 구성요소 또는 단계로 제한되는 것으로 해석되어서는 안되며; 이는 다른 구성요소 또는 단계를 제외하지 않는다. 이는 언급된 대로 명시된 특징, 정수, 단계 또는 성분의 존재를 구체적으로 명시하는 것으로 해석되어야 하지만 하나 이상의 다른 특징, 정수, 단계 또는 성분 또는 이의 그룹의 존재 또는 추가를 배제하지는 않는다. 따라서, 표현 "A 및 B를 포함하는 약학적 조성물"의 범위는 성분 A 및 B로만 구성된 약학적 조성물로 제한되어서는 안되며, 오히려 본 발명과 관련하여, 약학적 조성물의 열거된 성분이 단지 A 및 B이며, 나아가 청구범위는 이들 성분의 등가물을 포함하는 것으로 해석되어야 한다. 유사하게, 표현 "단계 A 및 단계 B를 포함하는 방법"의 범위는 단계 A 및 B로만 구성된 방법으로 제한되어서는 안되며, 오히려 본 발명과 관련하여, 방법의 열거된 단계가 단지 A 및 B이며, 나아가 청구범위는 이들 단계의 등가물을 포함하는 것으로 해석되어야 한다.
또한, 부정 관사 "a" 또는 "an"에 의한 특징에 대한 언급은 문맥이 하나 그리고 특징 중 단지 하나만 있는 것이 요구되는 것이 명백하지 않는 한, 예를 들어, 성분, 부형제, 사포닌 등과 같은 특징이 하나 보다 많이 존재하는 가능성을 배제하지 않는다. 따라서 부정 관사 "a" 또는 "an"은 일반적으로 "적어도 하나"를 의미한다.
도 1: 종양 표적화된 단백질 독소 전달은 종양 함유 마우스(tumor bearing mice)에서 종양 부피 감소 및 종양 성장 억제를 초래한다. A) A431 종양 함유 마우스에서 세툭시맙-(Cys-L-SO1861)3,9(Lys-S-디안틴)2의 용량 증량(복강내, i.p.)은 대조군과 비교하여 종양 부피 감소를 나타낸다. B, C) A431 종양 함유 마우스에서 세툭시맙-(Cys-L-SO1861)3,9(Lys-L-디안틴)2의 용량 증량(복강내, i.p, (B) 또는 정맥내, i.v. (C))은 대조군과 비교하여 종양 성장 감소를 나타낸다.
도 2: 종양 함유 마우스에서 종양 표적화된 안티센스 BNA 올리고뉴클레오티드 전달 및 유전자 침묵. A431 종양 함유 마우스에서 30 mg/kg 세툭시맙-(Cys-L-SO1861)3,9(Lys-L-HSP27BNA)1,8은 대조군과 비교하여 유도된 효율적인 종양 표적화된 유전자 침묵을 나타낸다.
도 3: 종양 함유 마우스에서 종양 표적화된 안티센스 BNA 올리고뉴클레오티드 전달 및 유전자 침묵. A431 종양 함유 마우스에서 30 mg/kg 세툭시맙-Cys-(SO1861-L-3작용성 링커-L-HSP27BNA)3,7은 대조군과 비교하여 유도된 효율적인 종양 표적화된 유전자 침묵을 나타낸다.
도 4: 본 발명에 따른 암 세포에서의 HER2 또는 EGFR 표적화된 단백질 독소 전달 및 세포 사멸. A, B) SK-BR-3 세포 (HER2++) 및 MDA-MB-468 세포 (HER2-)에 대한 트라투주맙-(Cys-L-SO1861)3,8(Lys-L-디안틴)1,7 또는 트라투주맙-(Cys-L-SO1861)3,8(Lys-S-디안틴)1,7 처리 및 대조군. C, D) A431 세포 (EGFR++) 및 A2058 세포 (EGFR-)에 대한 세툭시맙-(Cys-L-SO1861)3,8(Lys-L-디안틴)1,7 또는 세툭시맙-(Cys-L-SO1861)3,8(Lys-S-디안틴)1,7 처리 및 대조군.
도 5: 본 발명에 따른 암 세포에서의 EGFR 표적화된 안티센스 BNA 올리고 전달 및 유전자 침묵. A, B) A431 세포 (EGFR++) 및 A2058 세포 (EGFR-)에 대한 세툭시맙-(Cys-L-SO1861)3,8(Lys-L-HSP27BNA)1,7 처리 및 대조군. 비고: 각 세포주의 표적 수용체 발현 데이터(FACS 분석에 의해 결정됨)는 표 23 참조.
도 6: 본 발명에 따른 암세포에서 HER2 표적화된 안티센스 BNA 올리고 전달 및 유전자 침묵. SK-BR-3 세포 (HER2++)에 대한 트라투주맙-(Cys-L-SO1861)3,8(Lys-L-HSP27BNA)3,5 처리 및 대조군. 비고: 각 세포주의 표적 수용체 발현 데이터(FACS 분석에 의해 결정됨)는 표 23 참조.
도 7: 본 발명에 따른 암세포에서 EGFR 표적화된 안티센스 BNA 올리고 전달 및 유전자 침묵. A, B) A431 세포 (EGFR++) 및 A2058 세포 (EGFR-)에 대한 세툭시맙-Cys-(SO1861-L-3작용성 링커-L-HSP27BNA)3,7 처리 및 대조군. 비고: 각 세포주의 표적 수용체 발현 데이터(FACS 분석에 의해 결정됨)는 표 23 참조.
도 8: 모든 세포주에 대한 대조군 처리. A-D) 트라투주맙 (A), 세툭시맙 (B), T-DM1, (C) 유리 독소: 사포린 및 디안틴 (D) 또는 비-세포 결합 IgG에 커플링된 사포린(D)이 나타낸 세포주 SK-BR-3, JIMT-1, MDA-MB-468, A431, CaSki, HeLa, A2058, BT-474로 처리된 경우의 세포 생존력. 비고: 각 세포주의 표적 수용체 발현 데이터(FACS 분석에 의해 결정됨)는 표 23 참조.
도 9:(S)n-(L)(E)개념: mAb-(SO1861) n (단백질 독소) n . 시스테인 잔기 (Cys)의 SO1861 및 라이신 잔기의 단백질 독소 (리보조말 불활성 단백질)는 모두 표적 세포로의 전달 및 내재화를 위해 동일한 항체(mAb)에 접합된다. 1) mAb-(Cys-L-SO1861)4(Lys-단백질 독소)2는 이의 상응하는 세포 표면 수용체에 결합하고, 2) 접합체의 수용체-매개 엔도사이토시스(endocytosis)가 일어나고, 3) 낮은 엔도리소조말(endolysosomal) pH 및 적절한 농도에서, SO1861이 활성화되어 엔도리소조말 탈출을 가능하게 하고, 4) 세포질(cytoplasm)로의 독소의 방출이 일어나고 5) 독소가 세포 사멸을 유도한다.
도 10: (S)n - (L)(E)개념: mAb-(SO1861) n (안티센스 BNA 올리고) n . 시스테인 잔기(Cys)의 SO1861 및 라이신 잔기의 안티센스 BNA 올리고 뉴클레오티드는 모두 표적 세포로의 전달 및 내재화를 위해 동일한 항체(mAb)에 접합된다. 1) mAb-(Cys-SO1861)4(Lys-BNA올리고)2는 이의 상응하는 세포 표면 수용체에 결합하고, 2) 두 접합체의 수용체-매개 엔도사이토시스가 일어나고, 3) 낮은 엔도리소조말 pH 및 적절한 농도에서, SO1861이 활성화되어 엔도리소조말 탈출을 가능하게 하고, 4) 세포질로의 BNA 올리고의 방출이 일어나고 5) 표적 유전자 침묵이 유도된다.
도 11: (S)n - (L)(E)개념: mAb-(SO1861-스캐폴드-안티센스 BNA 올리고) n . (SO1861-3작용성 링커-BNA올리고)n은 표적 세포로의 전달 및 내재화를 위해 항체(mAb)에 접합된다. 1) mAb-(SO1861-3작용성 링커-BNA올리고)4는 이의 상응하는 세포 표면 수용체에 결합하고, 2) 두 접합체의 수용체-매개 엔도사이토시스가 일어나고, 3) 낮은 엔도리소조말(endolysosomal) pH 및 적절한 농도에서, SO1861이 활성화되어 엔도리소조말 탈출을 가능하게 하고, 4) 세포질로의 BNA 올리고의 방출이 일어나고 5) 표적 유전자 침묵이 유도된다.
도 12: 항체-SO1861 접합 절차. 도시된 것은 식물 유래 사포닌 SO1861의 4개의 모이어티를 항체의 경쇄(light chain)에 있는 4개의 시스테인에 연결하는 커플링 반응이다. 첫째, IgG의 디설파이드 결합은 TCEP(트리스(2-카르복시에틸)포스핀)에 대한 노출의 영향으로 파괴되고; 둘째, 결합된 화학적 링커를 포함하는 사포닌 SO1861을 트리플루오로 아세트산과 함께 첨가하고, 4개의 사포닌 모이어티가 IgG에 연결된다. 절단 가능한 '접합이 준비된(ready to conjugate)' 사포닌을 제조하기 위해, SO1861의 알데히드기가 EMCH(ε-말레이미도카프로산 히드라지드) 링커와 반응되었다. EMCH의 히드라지드기는 SO1861의 알데히드와 산 절단 가능한 히드라존(hydrazone) 결합을 형성한다. 동시에 EMCH 링커는 티올(설프하이드릴기) 반응성인 말레이미드기를 제공하므로 IgG의 티올, 즉 리간드 모이어티에 접합될 수 있다. 이와 함께, 본 발명의 엔도좀 탈출 향상 접합체가 제공되며/되거나 본 발명의 제1 결합 분자가 제공된다.
도 13. SO1861-EMCH 합성
도 14. 덴드론-(-L-SO1861)4 합성
도 15. 덴드론-(-L-SO1861)8 합성
도 16. S0181-L-3 작용성 링커-L-HSP27BNA 합성
도 17. HSP27BNA-덴드론-(-L-S01861)4 합성
도 18. 덴드론(NEM)4 합성
도 19: 사포닌 링키지를 위한 4개의 아미노기 및 클릭 화학(click chemistry)을 위한 아지드기를 갖는 스캐폴드 전구체
도 20: 모델 스캐폴드에 대한 사포닌의 커플링에 대한 증거. 삽입된 도면은 커플링된 사포닌에 대한 이론적으로 예상되는 피크 및 강도(intensity) 분포를 나타낸다. LC-MS/ESI-MS에 의해 얻어진 실험 데이터는 m/z 758-760 Da에서 거의 정확하게 동일한 피크를 나타내며, 이는 성공적인 사포닌 커플링을 입증한다.
도 21: 표적화된 독소 디안틴-표피 성장 인자(디안틴-EGF)를 이용한 세포독성 분석. 미처리 세포를 1로 정규화하였다. 폴리머 구조(펜트리머(Pentrimer))는 디안틴-EGF 및 사포닌(SA1641)의 존재 또는 부재하에 세포 생존력에 영향을 미치지 않아 폴리머 구조의 내재적 세포독성(intrinsic cytotoxicity)이 없음을 나타낸다.클릭가능한 표적화된 독소(디안틴-EGF-알킨)는 현저히 감소된 활성을 가지며, 이는 독소 변형의 결과이지만 스캐폴드와 어떠한 관련도 갖지 않는다. 작용화된 폴리머 구조는 클릭되지 않은 표적화된 독소와 동일한 활성을 가지며, 이는 스캐폴드의 작용화가 이펙터 분자 활성을 손상시키지 않음을 나타낸다. 사포닌의 효과는 폴리머 구조의 존재 및 부재 하에서 동일하며, 이는 폴리머 구조가 2-성분 시스템에서 사포닌의 효능을 손상시키지 않음을 나타낸다.
도 22: (A) S01861 및 (B) S01861-EMCH(EMCH = N-ε-말레이미도카프로산 히드라지드)의 H-NMR 스펙트럼. (A) 9.43ppm에서의 피크(Ha)는 SO1861의 알데히드 프로톤에 대응한다. (B) 6.79ppm에서의 피크(Hc)는 SO1861-EMCH의 말레이미드 프로톤에 대응하고, 7.68ppm에서의 피크(Hb)는 히드라존 프로톤에 대응한다. 9.43ppm에서의 신호의 부재는 알데히드기의 정량적 전환을 나타낸다.
도 23: (A) SO1861-EMCH 및 (B) S01861-EMCH-메르캅토에탄올의 MALDI-TOF-MS 스펙트럼. (A) RP 모드: m/z 2124 Da ([M+K]+, 사포닌-EMCH), m/z 2109 Da ([M+K]+, SO1861-EMCH), m/z 2094 Da ([M+Na]+, SO1861-EMCH). (B) RP 모드: m/z 2193 Da ([M+K]+, 사포닌-EMCH-메르캅토에탄올), m/z 2185 Da ([M+K]+, SO1861-EMCH-메르캅토에탄올), m/z 2170 Da ([M+Na]+, SO1861-EMCH-메르캅토에탄올).
도 24: 폴리머 구조에 대한 엔도좀 탈출(endosomal escape) 향상 스포닌의 접합을 위한 하이라이트 표시된 화학기를 갖는 S01861 구조. 하이라이트 표시된 기는 알데히드(검은색 원), 카르복실산(점선 원), 알켄(점선 오각형), 및 알콜(점선 박스)이다. 알데히드기(화살표)는 화학 선택성 및 가역적 접합 반응에 가장 적합한 기이다.
도 25: (A) 안정하고 (B) 절단 가능한 '접합 준비된' 엔도좀 탈출 인핸서 사포닌을 제조하기 위한 전략.
도 26: 산성 조건 하에서 SO1861-EMCH의 히드라존 결합의 가수분해.
도 27: S01861-EMCH 구조. (A) 표준 분자 구조 및 (B) 3D 모델. 말레이미드기는 원으로 표시된다.
도 28: (A) S01861-EMCH 합성 스킴. 네가티브 리플렉터 모드에서 (B) S01861(m/z 1861 Da) 및 (C) SO1861-EMCH (m/z 2068 Da)의 MALDI-TOF-MS 스펙트럼. TFA: 트리플루오로아세트산, r.t: 실온, h: 시간, 및 MW: 분자량.
도 29: pH 3의 HCl 용액에서의 가수분해 전(A) 및 후(B)의 S01861-EMCH의 MALDI-TOF-MS 스펙트럼.
도 30: 임의의 아민-함유 폴리머 구조에 대한 SO1861-EMCH 접합의 반응 스킴.
도 31: (A) BSA-S01861(m/z 70.0 kDa, 72.1 kDa, 74.2 kDa) 및 (B) BSA(m/z 66.6 kDa)의 MALDI-TOF-MS 스펙트럼.
도 32: 시아닌 3 염료 표지된 폴리아미도아민(PAMAM) G5 덴드리머에 대한 (A) S01861-EMCH 및 (B) S01861-HATU(HATU = 1-[비스(디메틸아미노)메틸렌]-1H-1,2,3-트리아졸로[4,5-b]피리디늄 3-옥시드 헥사플루오로포스페이트)접합의 반응 스킴.
도 33: (B)에서부터 바닥(D)까지 SO1861-EMCH 공급 당량(equivalent)을 증가시킨 (A) Cy3-PAMAM,(B-D) Cy3-PAMAM-S01861의 MALDI-TOF-MS 스펙트럼. (B)는 PAMAM 당 부착된 5개의 S01861을 갖는 Cy3-PAMAM-S01861에 대응되고, (C)는 PAMAM 당 부착된 13개의 S01861을 갖는 Cy3-PAMAM-S01861에 대응되고, (D)는 PAMAM 당 부착된 51개의 S01861을 갖는 Cy3-PAMAM-S01861에 대응된다.
도 34: (A) S01861-EMCH이 5 당량(equivalent) 공급된 Cy3-PAMAM-SO1861 및 S01861-EMCH이 30 당량 공급된 Cy3-PAMAM-SO1861의 MALDI-TOF-MS 스펙트럼.
도 35: Cy3-PAMAM-NC-SO1861(NC = 안정한 결합("절단 불가능"))의 MALDI-TOF-MS 스펙트럼.
도 36: (B) Cy3-PAMAM-NC-SO1861-디벤조시클로옥틴(DBCO), (C) Cy3-PAMAM-(SO1861)5-DBCO, 및 (D) Cy3-PAMAM-(SO1861)27-DBCO의 (A) 반응 스킴 및 MALDI-TOF-MS 스펙트럼.
도 37: (A) 디안틴-EGF-Alexa488 및 (B) 디안틴-EGF-Alexa488-SS-PEG-N3의 반응 스킴. (C) 디안틴-EGF, (D) 디안틴-EGF-Alexa488, 및 (E) 디안틴-EGF-Alexa488-SS-PEG-N3의 MALDI-TOF-MS 스펙트럼; Alexa488: Alexa Fluor 488 염료.
도 38: (A) 디안틴-Alexa488 및 (B) 디안틴-Alexa488-SS-PEG-N3의 반응 스킴. (C) 디안틴, (D) 디안틴-Alexa488, 및 (E) 디안틴-Alexa488-SS-PEG-N3의 MALDI-TOF-MS 스펙트럼; Alexa488: Alexa Fluor 488 염료.
도 39: VersaDoc 이미징 시스템에서 수행된 SDS-PAGE 겔의 형광 이미지. M = 마커, P = Cy3-PAMAM-(SO1861)27-DBCO, D = 디안틴-EGF-Alexa488-SS-PEG-N3, C1 = Cy3-PAMAM-(SO1861)5-디안틴-EGF-Alexa488, C2 = Cy3-PAMAM-NC-SO1861-디안틴-EGF-Alexa488, 및 C3 = Cy3-PAMAM-(SO1861)27-디안틴-EGF-Alexa488.
도 40: (A) 환원성 아민화를 통한 Cy3-PAMAM-NC-SO1861의 합성 스킴. (B, 및 C) 각각의 MALDI-TOF-MS 스펙트럼.
도 41: 단량체로서 SO1861-EM0H, 중합 개시제로서 APS/TMEDA 시스템, 및 라디칼 켄쳐(Quencher)로서 아미노프로판티올을 사용한 폴리(S01861)의 생성을 위한 반응 스킴.
도 42: 폴리(S01861) 반응 배치의 MALDI-TOF-MS 스펙트럼. (A) 60℃에서 SO1861-EMCH, (B) 60℃에서 SO1861-EMCH + 11-3 당량 APS, (C) 60℃에서 SO1861-EMCH + 11-3 당량 APS/TMEDA.
도 43: DNA 접근법. 글리코시드 분자를 접합시키고 방출할 수 있는 DNA 기반 스캐폴드를 생성하기 위한 DNA-오리가미(origami)의 원리의 사용. 또한, DNA 스트랜드 중 하나는 작용화된 스캐폴드를 형성하기 위해 표적화된 독소에 대한 접합을 위해 사용될 수 있는 클릭 화학 모이어티를 획득한다. bp:염기쌍(base pair)
도 44: 폴리(펩티드-S01861) 접근법. 글리코시드 분자를 접합 및 방출할 수 있고 그 자체와 반응하여 폴리(펩티드-S01861) 구성물을 형성할 수 있는 펩티드 서열의 사용. 폴리(펩티드) 사슬 말단은 독소에 대한 접합에 사용될 수 있는 클릭 화학 모이어티(예, BCN-NHS 링커)로 추가로 변형될 수 있다.
도 45. (A) 천연(native) 펩티드, (B) 펩티드-S01861 접합체의 MALDI-TOF-MS 스펙트럼.
도 46. 보호된 아미노기를 갖는 G4-덴드론의 분자 구조.
도 47. 덴드론 기반 스캐폴드 및 작용성 스캐폴드의 생성을 위한 합성 스킴.
도 48. (A) G4-덴드론의 부분 염료 표지 및 탈보호에 대한 반응 스킴. (B) 탈보호되고 부분 염료 표지된 G4-덴드론의 MALDI-TOF-MS 스펙트럼.
도 49. (A) 22 공급 당량의 SO1861-EMCH, (B) 10 공급 당량의 SO1861-EMCH, 및 (C) 3 공급 당량의 SO1861-EMCH를 갖는 G4-덴드론-SO1861 스캐폴드의 MALDI-TOF-MS 스펙트럼.
도 50. (A) HeLa 세포의 FACS 분석에 의해 측정된 EGFR 세포 표면 발현으로 처리된 HeLa 세포의 세포 생존력 곡선(B, 표 19 참조), S01861 + 디안틴-EGF(Dia-EGF), SO1861 + 디안틴-EGF + 500 nM 클로로퀸, SO1861 + 디안틴-EGF + 500 nM PAMAM, SO1861 + 디안틴-EGF + 667 nM 덴드론으로 처리된 HeLa 세포의 세포 생존력, (C) SO1861 + 디안틴-EGF, SO1861 + 디안틴-EGF + 500 nM 클로로퀸, SO1861 + 디안틴-EGF + 500 nM PAMAM, SO1861 + 디안틴-EGF + 500 nM PAMAM-(SH)16, SO1861 + 디안틴-EGF + 500 nM PAMAM-(SH)65, SO1861 + 디안틴-EGF + 500 nM PAMAM-(SH)108 로 처리된 HeLa 세포의 세포 생존력 (D) SO1861 + 디안틴-EGF, SO1861 + 디안틴-EGF + 500 nM 클로로퀸, SO1861 + 디안틴-EGF + 500 nM PAMAM, SO1861 + 디안틴-EGF + 500 nM PAMAM-(mPEG)3, SO1861 + 디안틴-EGF + 500 nM PAMAM-(mPEG)8, SO1861 + 디안틴-EGF + 500 nM PAMAM-(mPEG)18으로 처리된 HeLa 세포의 세포 생존력.
도 51. (A) 티올화 시약(thiolation reagent) 2-이미노티올란을 사용한 PAMAM의 티올화의 반응 스킴. (B) 천연 PAMAM, (C) 티올화 PAMAM-(SH)16, (D) 티올화 PAMAM-(SH)65, 및 (E) 티올화 PAMAM-(SH)108의 MALDI-TOF-MS 스펙트럼.
도 52. (A) PEG화 시약(PEGylating reagent) mPEG2k-NHS를 사용한 PAMAM의 PEG화(PEGylation)의 반응 스킴. (B)천연 PAMAM, (C) PEG화 PAMAM-(mPEG2k)3, (D) PEG화 PAMAM-(mPEG2k)8, 및 (E) PEG화 PAMAM-(mPEG2k)18의 MALDI-TOF-MS 스펙트럼.
도 53: 임의의 원하는 이펙터 분자를 연결하기 위한 클릭 화학 기능을 갖는 베이직 스캐폴드. 사용자는 이펙터 분자에서 클릭 화학 위치의 위치 및 이펙터 분자의 추가적인 모든 특성, 예를 들어 선택적인 리간드의 선택 및 위치를 결정한다.
도 54: 사전-결합된(pre-bound) 이펙터 분자 및 임의의 원하는 리간드를 연결하기 위한 클릭 화학 기능을 갖는 작용화된 스캐폴드. 선택적으로, 엔도좀에 도달한 후 스캐폴드로부터 이펙터 분자를 방출하도록 pH-민감성 링키지가 제공될 수 있다.
도 2: 종양 함유 마우스에서 종양 표적화된 안티센스 BNA 올리고뉴클레오티드 전달 및 유전자 침묵. A431 종양 함유 마우스에서 30 mg/kg 세툭시맙-(Cys-L-SO1861)3,9(Lys-L-HSP27BNA)1,8은 대조군과 비교하여 유도된 효율적인 종양 표적화된 유전자 침묵을 나타낸다.
도 3: 종양 함유 마우스에서 종양 표적화된 안티센스 BNA 올리고뉴클레오티드 전달 및 유전자 침묵. A431 종양 함유 마우스에서 30 mg/kg 세툭시맙-Cys-(SO1861-L-3작용성 링커-L-HSP27BNA)3,7은 대조군과 비교하여 유도된 효율적인 종양 표적화된 유전자 침묵을 나타낸다.
도 4: 본 발명에 따른 암 세포에서의 HER2 또는 EGFR 표적화된 단백질 독소 전달 및 세포 사멸. A, B) SK-BR-3 세포 (HER2++) 및 MDA-MB-468 세포 (HER2-)에 대한 트라투주맙-(Cys-L-SO1861)3,8(Lys-L-디안틴)1,7 또는 트라투주맙-(Cys-L-SO1861)3,8(Lys-S-디안틴)1,7 처리 및 대조군. C, D) A431 세포 (EGFR++) 및 A2058 세포 (EGFR-)에 대한 세툭시맙-(Cys-L-SO1861)3,8(Lys-L-디안틴)1,7 또는 세툭시맙-(Cys-L-SO1861)3,8(Lys-S-디안틴)1,7 처리 및 대조군.
도 5: 본 발명에 따른 암 세포에서의 EGFR 표적화된 안티센스 BNA 올리고 전달 및 유전자 침묵. A, B) A431 세포 (EGFR++) 및 A2058 세포 (EGFR-)에 대한 세툭시맙-(Cys-L-SO1861)3,8(Lys-L-HSP27BNA)1,7 처리 및 대조군. 비고: 각 세포주의 표적 수용체 발현 데이터(FACS 분석에 의해 결정됨)는 표 23 참조.
도 6: 본 발명에 따른 암세포에서 HER2 표적화된 안티센스 BNA 올리고 전달 및 유전자 침묵. SK-BR-3 세포 (HER2++)에 대한 트라투주맙-(Cys-L-SO1861)3,8(Lys-L-HSP27BNA)3,5 처리 및 대조군. 비고: 각 세포주의 표적 수용체 발현 데이터(FACS 분석에 의해 결정됨)는 표 23 참조.
도 7: 본 발명에 따른 암세포에서 EGFR 표적화된 안티센스 BNA 올리고 전달 및 유전자 침묵. A, B) A431 세포 (EGFR++) 및 A2058 세포 (EGFR-)에 대한 세툭시맙-Cys-(SO1861-L-3작용성 링커-L-HSP27BNA)3,7 처리 및 대조군. 비고: 각 세포주의 표적 수용체 발현 데이터(FACS 분석에 의해 결정됨)는 표 23 참조.
도 8: 모든 세포주에 대한 대조군 처리. A-D) 트라투주맙 (A), 세툭시맙 (B), T-DM1, (C) 유리 독소: 사포린 및 디안틴 (D) 또는 비-세포 결합 IgG에 커플링된 사포린(D)이 나타낸 세포주 SK-BR-3, JIMT-1, MDA-MB-468, A431, CaSki, HeLa, A2058, BT-474로 처리된 경우의 세포 생존력. 비고: 각 세포주의 표적 수용체 발현 데이터(FACS 분석에 의해 결정됨)는 표 23 참조.
도 9:(S)n-(L)(E)개념: mAb-(SO1861) n (단백질 독소) n . 시스테인 잔기 (Cys)의 SO1861 및 라이신 잔기의 단백질 독소 (리보조말 불활성 단백질)는 모두 표적 세포로의 전달 및 내재화를 위해 동일한 항체(mAb)에 접합된다. 1) mAb-(Cys-L-SO1861)4(Lys-단백질 독소)2는 이의 상응하는 세포 표면 수용체에 결합하고, 2) 접합체의 수용체-매개 엔도사이토시스(endocytosis)가 일어나고, 3) 낮은 엔도리소조말(endolysosomal) pH 및 적절한 농도에서, SO1861이 활성화되어 엔도리소조말 탈출을 가능하게 하고, 4) 세포질(cytoplasm)로의 독소의 방출이 일어나고 5) 독소가 세포 사멸을 유도한다.
도 10: (S)n - (L)(E)개념: mAb-(SO1861) n (안티센스 BNA 올리고) n . 시스테인 잔기(Cys)의 SO1861 및 라이신 잔기의 안티센스 BNA 올리고 뉴클레오티드는 모두 표적 세포로의 전달 및 내재화를 위해 동일한 항체(mAb)에 접합된다. 1) mAb-(Cys-SO1861)4(Lys-BNA올리고)2는 이의 상응하는 세포 표면 수용체에 결합하고, 2) 두 접합체의 수용체-매개 엔도사이토시스가 일어나고, 3) 낮은 엔도리소조말 pH 및 적절한 농도에서, SO1861이 활성화되어 엔도리소조말 탈출을 가능하게 하고, 4) 세포질로의 BNA 올리고의 방출이 일어나고 5) 표적 유전자 침묵이 유도된다.
도 11: (S)n - (L)(E)개념: mAb-(SO1861-스캐폴드-안티센스 BNA 올리고) n . (SO1861-3작용성 링커-BNA올리고)n은 표적 세포로의 전달 및 내재화를 위해 항체(mAb)에 접합된다. 1) mAb-(SO1861-3작용성 링커-BNA올리고)4는 이의 상응하는 세포 표면 수용체에 결합하고, 2) 두 접합체의 수용체-매개 엔도사이토시스가 일어나고, 3) 낮은 엔도리소조말(endolysosomal) pH 및 적절한 농도에서, SO1861이 활성화되어 엔도리소조말 탈출을 가능하게 하고, 4) 세포질로의 BNA 올리고의 방출이 일어나고 5) 표적 유전자 침묵이 유도된다.
도 12: 항체-SO1861 접합 절차. 도시된 것은 식물 유래 사포닌 SO1861의 4개의 모이어티를 항체의 경쇄(light chain)에 있는 4개의 시스테인에 연결하는 커플링 반응이다. 첫째, IgG의 디설파이드 결합은 TCEP(트리스(2-카르복시에틸)포스핀)에 대한 노출의 영향으로 파괴되고; 둘째, 결합된 화학적 링커를 포함하는 사포닌 SO1861을 트리플루오로 아세트산과 함께 첨가하고, 4개의 사포닌 모이어티가 IgG에 연결된다. 절단 가능한 '접합이 준비된(ready to conjugate)' 사포닌을 제조하기 위해, SO1861의 알데히드기가 EMCH(ε-말레이미도카프로산 히드라지드) 링커와 반응되었다. EMCH의 히드라지드기는 SO1861의 알데히드와 산 절단 가능한 히드라존(hydrazone) 결합을 형성한다. 동시에 EMCH 링커는 티올(설프하이드릴기) 반응성인 말레이미드기를 제공하므로 IgG의 티올, 즉 리간드 모이어티에 접합될 수 있다. 이와 함께, 본 발명의 엔도좀 탈출 향상 접합체가 제공되며/되거나 본 발명의 제1 결합 분자가 제공된다.
도 13. SO1861-EMCH 합성
도 14. 덴드론-(-L-SO1861)4 합성
도 15. 덴드론-(-L-SO1861)8 합성
도 16. S0181-L-3 작용성 링커-L-HSP27BNA 합성
도 17. HSP27BNA-덴드론-(-L-S01861)4 합성
도 18. 덴드론(NEM)4 합성
도 19: 사포닌 링키지를 위한 4개의 아미노기 및 클릭 화학(click chemistry)을 위한 아지드기를 갖는 스캐폴드 전구체
도 20: 모델 스캐폴드에 대한 사포닌의 커플링에 대한 증거. 삽입된 도면은 커플링된 사포닌에 대한 이론적으로 예상되는 피크 및 강도(intensity) 분포를 나타낸다. LC-MS/ESI-MS에 의해 얻어진 실험 데이터는 m/z 758-760 Da에서 거의 정확하게 동일한 피크를 나타내며, 이는 성공적인 사포닌 커플링을 입증한다.
도 21: 표적화된 독소 디안틴-표피 성장 인자(디안틴-EGF)를 이용한 세포독성 분석. 미처리 세포를 1로 정규화하였다. 폴리머 구조(펜트리머(Pentrimer))는 디안틴-EGF 및 사포닌(SA1641)의 존재 또는 부재하에 세포 생존력에 영향을 미치지 않아 폴리머 구조의 내재적 세포독성(intrinsic cytotoxicity)이 없음을 나타낸다.클릭가능한 표적화된 독소(디안틴-EGF-알킨)는 현저히 감소된 활성을 가지며, 이는 독소 변형의 결과이지만 스캐폴드와 어떠한 관련도 갖지 않는다. 작용화된 폴리머 구조는 클릭되지 않은 표적화된 독소와 동일한 활성을 가지며, 이는 스캐폴드의 작용화가 이펙터 분자 활성을 손상시키지 않음을 나타낸다. 사포닌의 효과는 폴리머 구조의 존재 및 부재 하에서 동일하며, 이는 폴리머 구조가 2-성분 시스템에서 사포닌의 효능을 손상시키지 않음을 나타낸다.
도 22: (A) S01861 및 (B) S01861-EMCH(EMCH = N-ε-말레이미도카프로산 히드라지드)의 H-NMR 스펙트럼. (A) 9.43ppm에서의 피크(Ha)는 SO1861의 알데히드 프로톤에 대응한다. (B) 6.79ppm에서의 피크(Hc)는 SO1861-EMCH의 말레이미드 프로톤에 대응하고, 7.68ppm에서의 피크(Hb)는 히드라존 프로톤에 대응한다. 9.43ppm에서의 신호의 부재는 알데히드기의 정량적 전환을 나타낸다.
도 23: (A) SO1861-EMCH 및 (B) S01861-EMCH-메르캅토에탄올의 MALDI-TOF-MS 스펙트럼. (A) RP 모드: m/z 2124 Da ([M+K]+, 사포닌-EMCH), m/z 2109 Da ([M+K]+, SO1861-EMCH), m/z 2094 Da ([M+Na]+, SO1861-EMCH). (B) RP 모드: m/z 2193 Da ([M+K]+, 사포닌-EMCH-메르캅토에탄올), m/z 2185 Da ([M+K]+, SO1861-EMCH-메르캅토에탄올), m/z 2170 Da ([M+Na]+, SO1861-EMCH-메르캅토에탄올).
도 24: 폴리머 구조에 대한 엔도좀 탈출(endosomal escape) 향상 스포닌의 접합을 위한 하이라이트 표시된 화학기를 갖는 S01861 구조. 하이라이트 표시된 기는 알데히드(검은색 원), 카르복실산(점선 원), 알켄(점선 오각형), 및 알콜(점선 박스)이다. 알데히드기(화살표)는 화학 선택성 및 가역적 접합 반응에 가장 적합한 기이다.
도 25: (A) 안정하고 (B) 절단 가능한 '접합 준비된' 엔도좀 탈출 인핸서 사포닌을 제조하기 위한 전략.
도 26: 산성 조건 하에서 SO1861-EMCH의 히드라존 결합의 가수분해.
도 27: S01861-EMCH 구조. (A) 표준 분자 구조 및 (B) 3D 모델. 말레이미드기는 원으로 표시된다.
도 28: (A) S01861-EMCH 합성 스킴. 네가티브 리플렉터 모드에서 (B) S01861(m/z 1861 Da) 및 (C) SO1861-EMCH (m/z 2068 Da)의 MALDI-TOF-MS 스펙트럼. TFA: 트리플루오로아세트산, r.t: 실온, h: 시간, 및 MW: 분자량.
도 29: pH 3의 HCl 용액에서의 가수분해 전(A) 및 후(B)의 S01861-EMCH의 MALDI-TOF-MS 스펙트럼.
도 30: 임의의 아민-함유 폴리머 구조에 대한 SO1861-EMCH 접합의 반응 스킴.
도 31: (A) BSA-S01861(m/z 70.0 kDa, 72.1 kDa, 74.2 kDa) 및 (B) BSA(m/z 66.6 kDa)의 MALDI-TOF-MS 스펙트럼.
도 32: 시아닌 3 염료 표지된 폴리아미도아민(PAMAM) G5 덴드리머에 대한 (A) S01861-EMCH 및 (B) S01861-HATU(HATU = 1-[비스(디메틸아미노)메틸렌]-1H-1,2,3-트리아졸로[4,5-b]피리디늄 3-옥시드 헥사플루오로포스페이트)접합의 반응 스킴.
도 33: (B)에서부터 바닥(D)까지 SO1861-EMCH 공급 당량(equivalent)을 증가시킨 (A) Cy3-PAMAM,(B-D) Cy3-PAMAM-S01861의 MALDI-TOF-MS 스펙트럼. (B)는 PAMAM 당 부착된 5개의 S01861을 갖는 Cy3-PAMAM-S01861에 대응되고, (C)는 PAMAM 당 부착된 13개의 S01861을 갖는 Cy3-PAMAM-S01861에 대응되고, (D)는 PAMAM 당 부착된 51개의 S01861을 갖는 Cy3-PAMAM-S01861에 대응된다.
도 34: (A) S01861-EMCH이 5 당량(equivalent) 공급된 Cy3-PAMAM-SO1861 및 S01861-EMCH이 30 당량 공급된 Cy3-PAMAM-SO1861의 MALDI-TOF-MS 스펙트럼.
도 35: Cy3-PAMAM-NC-SO1861(NC = 안정한 결합("절단 불가능"))의 MALDI-TOF-MS 스펙트럼.
도 36: (B) Cy3-PAMAM-NC-SO1861-디벤조시클로옥틴(DBCO), (C) Cy3-PAMAM-(SO1861)5-DBCO, 및 (D) Cy3-PAMAM-(SO1861)27-DBCO의 (A) 반응 스킴 및 MALDI-TOF-MS 스펙트럼.
도 37: (A) 디안틴-EGF-Alexa488 및 (B) 디안틴-EGF-Alexa488-SS-PEG-N3의 반응 스킴. (C) 디안틴-EGF, (D) 디안틴-EGF-Alexa488, 및 (E) 디안틴-EGF-Alexa488-SS-PEG-N3의 MALDI-TOF-MS 스펙트럼; Alexa488: Alexa Fluor 488 염료.
도 38: (A) 디안틴-Alexa488 및 (B) 디안틴-Alexa488-SS-PEG-N3의 반응 스킴. (C) 디안틴, (D) 디안틴-Alexa488, 및 (E) 디안틴-Alexa488-SS-PEG-N3의 MALDI-TOF-MS 스펙트럼; Alexa488: Alexa Fluor 488 염료.
도 39: VersaDoc 이미징 시스템에서 수행된 SDS-PAGE 겔의 형광 이미지. M = 마커, P = Cy3-PAMAM-(SO1861)27-DBCO, D = 디안틴-EGF-Alexa488-SS-PEG-N3, C1 = Cy3-PAMAM-(SO1861)5-디안틴-EGF-Alexa488, C2 = Cy3-PAMAM-NC-SO1861-디안틴-EGF-Alexa488, 및 C3 = Cy3-PAMAM-(SO1861)27-디안틴-EGF-Alexa488.
도 40: (A) 환원성 아민화를 통한 Cy3-PAMAM-NC-SO1861의 합성 스킴. (B, 및 C) 각각의 MALDI-TOF-MS 스펙트럼.
도 41: 단량체로서 SO1861-EM0H, 중합 개시제로서 APS/TMEDA 시스템, 및 라디칼 켄쳐(Quencher)로서 아미노프로판티올을 사용한 폴리(S01861)의 생성을 위한 반응 스킴.
도 42: 폴리(S01861) 반응 배치의 MALDI-TOF-MS 스펙트럼. (A) 60℃에서 SO1861-EMCH, (B) 60℃에서 SO1861-EMCH + 11-3 당량 APS, (C) 60℃에서 SO1861-EMCH + 11-3 당량 APS/TMEDA.
도 43: DNA 접근법. 글리코시드 분자를 접합시키고 방출할 수 있는 DNA 기반 스캐폴드를 생성하기 위한 DNA-오리가미(origami)의 원리의 사용. 또한, DNA 스트랜드 중 하나는 작용화된 스캐폴드를 형성하기 위해 표적화된 독소에 대한 접합을 위해 사용될 수 있는 클릭 화학 모이어티를 획득한다. bp:염기쌍(base pair)
도 44: 폴리(펩티드-S01861) 접근법. 글리코시드 분자를 접합 및 방출할 수 있고 그 자체와 반응하여 폴리(펩티드-S01861) 구성물을 형성할 수 있는 펩티드 서열의 사용. 폴리(펩티드) 사슬 말단은 독소에 대한 접합에 사용될 수 있는 클릭 화학 모이어티(예, BCN-NHS 링커)로 추가로 변형될 수 있다.
도 45. (A) 천연(native) 펩티드, (B) 펩티드-S01861 접합체의 MALDI-TOF-MS 스펙트럼.
도 46. 보호된 아미노기를 갖는 G4-덴드론의 분자 구조.
도 47. 덴드론 기반 스캐폴드 및 작용성 스캐폴드의 생성을 위한 합성 스킴.
도 48. (A) G4-덴드론의 부분 염료 표지 및 탈보호에 대한 반응 스킴. (B) 탈보호되고 부분 염료 표지된 G4-덴드론의 MALDI-TOF-MS 스펙트럼.
도 49. (A) 22 공급 당량의 SO1861-EMCH, (B) 10 공급 당량의 SO1861-EMCH, 및 (C) 3 공급 당량의 SO1861-EMCH를 갖는 G4-덴드론-SO1861 스캐폴드의 MALDI-TOF-MS 스펙트럼.
도 50. (A) HeLa 세포의 FACS 분석에 의해 측정된 EGFR 세포 표면 발현으로 처리된 HeLa 세포의 세포 생존력 곡선(B, 표 19 참조), S01861 + 디안틴-EGF(Dia-EGF), SO1861 + 디안틴-EGF + 500 nM 클로로퀸, SO1861 + 디안틴-EGF + 500 nM PAMAM, SO1861 + 디안틴-EGF + 667 nM 덴드론으로 처리된 HeLa 세포의 세포 생존력, (C) SO1861 + 디안틴-EGF, SO1861 + 디안틴-EGF + 500 nM 클로로퀸, SO1861 + 디안틴-EGF + 500 nM PAMAM, SO1861 + 디안틴-EGF + 500 nM PAMAM-(SH)16, SO1861 + 디안틴-EGF + 500 nM PAMAM-(SH)65, SO1861 + 디안틴-EGF + 500 nM PAMAM-(SH)108 로 처리된 HeLa 세포의 세포 생존력 (D) SO1861 + 디안틴-EGF, SO1861 + 디안틴-EGF + 500 nM 클로로퀸, SO1861 + 디안틴-EGF + 500 nM PAMAM, SO1861 + 디안틴-EGF + 500 nM PAMAM-(mPEG)3, SO1861 + 디안틴-EGF + 500 nM PAMAM-(mPEG)8, SO1861 + 디안틴-EGF + 500 nM PAMAM-(mPEG)18으로 처리된 HeLa 세포의 세포 생존력.
도 51. (A) 티올화 시약(thiolation reagent) 2-이미노티올란을 사용한 PAMAM의 티올화의 반응 스킴. (B) 천연 PAMAM, (C) 티올화 PAMAM-(SH)16, (D) 티올화 PAMAM-(SH)65, 및 (E) 티올화 PAMAM-(SH)108의 MALDI-TOF-MS 스펙트럼.
도 52. (A) PEG화 시약(PEGylating reagent) mPEG2k-NHS를 사용한 PAMAM의 PEG화(PEGylation)의 반응 스킴. (B)천연 PAMAM, (C) PEG화 PAMAM-(mPEG2k)3, (D) PEG화 PAMAM-(mPEG2k)8, 및 (E) PEG화 PAMAM-(mPEG2k)18의 MALDI-TOF-MS 스펙트럼.
도 53: 임의의 원하는 이펙터 분자를 연결하기 위한 클릭 화학 기능을 갖는 베이직 스캐폴드. 사용자는 이펙터 분자에서 클릭 화학 위치의 위치 및 이펙터 분자의 추가적인 모든 특성, 예를 들어 선택적인 리간드의 선택 및 위치를 결정한다.
도 54: 사전-결합된(pre-bound) 이펙터 분자 및 임의의 원하는 리간드를 연결하기 위한 클릭 화학 기능을 갖는 작용화된 스캐폴드. 선택적으로, 엔도좀에 도달한 후 스캐폴드로부터 이펙터 분자를 방출하도록 pH-민감성 링키지가 제공될 수 있다.
생활성 분자가 작용하도록 하기 위하여, 분자는 이의 표적, 예를 들어 혈액 혈청에서, 세포 표면의 외부에서 또는 세포 또는 세포 소기관(organelle)의 내부에서, 이의 표적과 체결(engage)될 수 있어야 한다. 대부분의 모든 단백질-기반 표적화된 독소의 활성 모이어티는, 예를 들어, 이의 표적 조절 효과를 매개하기 위해 표적 세포의 사이토솔(cytosol)에 진입하여야 한다. 많은 컨스텔레이션(constellations)에서, (1) 표적화 모이어티(targeting moiety)가 저조하게 내재화(internalized)되고 세포의 외부에 결합된 채로 남아있기 때문에, (2) 내재화 후에 세포 표면으로 다시 재순환되거나 또는 (3) 엔도리소좀으로 수송되고 여기서 분해되기 때문에, 독소는 비효과적으로 남아 있게 된다. 이러한 기본적인 문제는 수십년 동안 알려져 있었으며, 500개를 넘는 표적화된 독소가 과거의 수십년동안 조사되었음에도 불구하고, 문제가 아직 해결되지 않았고, 심각한 독성에 대한 경고 라벨이 있음에도 불구하고, 몇 가지 항체-표적화된 단백질 독소만이 시장에 출시되었다. 모세투모맙 파슈도톡스-tdfk(LUMOXITI®, AstraZeneca Pharmaceuticals LP)는 현재까지 FDA에서 재발성 또는 불응성 털세포 백혈병(hairy cell leukemia)에 대해 승인을 받았다. 이러한 승인된 ADC 중 다른 것은 엘존리스(Elzonris), 온탁(Ontak)이다.
이러한 문제를 극복하기 위해, 소포체 내의 생합성 경로의 내인성 세포 막 수송 복합체(endogenous cellular membrane transport complexes)에 독소를 다시 보내기(redirect) 위한 접근법 및 엔도좀의 막 완전성(membrane integrity), 즉 세포에서의 엔도사이틱 경로(endocytic pathway)의 구획(compartment)을 파괴하거나 약화시키는 기술, 및 이에 따라 엔도좀 탈출(endosomal escape)을 용이하게 하는 기술을 포함하는 많은 전략이 기술되었다. 이는 리소조모트로픽 아민, 카르복실산 이오노포어(carboxylic ionophores), 칼슘 채널 안타고니스트, 바이러스, 박테리아, 식물, 동물, 사람 및 합성 기원의 다양한 세포-투과성 펩티드, 기타 유기 분자 및 광-유도 기술의 사용을 포함한다. 표적화된 독소의 효능은 전형적으로 세포 배양물에서 백- 또는 천-배, 예외적인 경우 백만-배 초과 증가됨에도 불구하고, 엔도좀 탈출 인핸서를 다른 물질과의 동시-투여해야 하는 요건은 추가적인 부작용, 표적 특이성의 손실, 치료 윈도우 및 세포 유형-의존적 변이를 결정하는 어려움을 포함하는 새로운 문제를 갖는다.
물리화학적 기술을 포함한 모든 전략은 막과 다소 직접적으로 상호작용하며 필수적으로 작은 화학적 분자, 2차 대사산물, 펩티드 및 단백질을 포함하는 인핸서 분자를 필요로 한다. 모든 이러한 물질의 일반적인 특징은 이들이 그 자체로 표적 세포-특이성이 아니고 표적화된 독소 이외의 다른 동역학(kinetics)으로 분배되는 것이다. 이는 현재의 접근법의 주요한 한 가지 결점이다.
본 발명은 특정한 구현예와 관련하여 기술될 것이지만, 본 발명은 이에 한정되지 않고 단지 청구범위에 의해서만 한정된다. 본원에 기술된 본 발명의 구현예는 달리 명시되지 않는 한, 조합 및 합동하여 작동할 수 있다.
본 발명이 몇몇 구현예에 관하여 기술되었지만, 대안, 변형, 치환 및 그 등가물은 본 명세서를 읽고, 도면 및 그래프를 연구함으로써 당업자에게 명백할 것이다. 본 발명은 예시된 구현예 의해 어떠한 방식으로도 한정되지 않는다. 첨부된 청구범위에 의해 규정된 범위를 벗어나지 않고 변형될 수 있다.
본 발명의 일 견지는 세포-표면 분자 표적화 분자 및 적어도 하나의 이펙터 모이어티를 포함하고 추가로 적어도 하나의 공유 결합된 사포닌을 포함하는 접합체에 관한 것이다.
본 발명자는 항체 약물 접합체 또는 항체-올리고뉴클레오티드 접합체와 같은 접합체의 치료 윈도우가, 접합체가 투여되는 종양-함유 포유류(마우스)에 투여될 때 증가한다는 것을 확립하였으며, 여기서 상기 접합체는 적어도 하나의 공유 결합된 사포닌을 포함한다. 본 발명의 접합체는 결합된, 바람직하게는 공유 결합된, 보다 바람직하게는 절단가능한 링커를 통해 결합된 사포닌과 같은 적어도 하나의 글리코시드를 갖는다. 사포닌은 아마도 이펙터 모이어티의 활성이 요구되는 사이토졸 내로 이펙터 모이어티의 엔도좀 탈출(endosomal escape)을 향상시킴으로써, 세포 표면 분자 표적화 분자에 결합된 이펙터 모이어티의 치료 효능을 증대시킨다. 이러한 방식으로, 이미 통상의 용량 보다 낮은 용량의 ADC 또는 AOC, 즉 본 발명의 접합체에서의 치료 효과가 사포닌을 표적화된 세포 근처, 표적화된 세포 및/또는 이의 내부에 도입함으로써, 사포닌(들)을 포함하는 접합체 존재의 영향 하에 확립되었다. 표적 세포는 예를 들어 병든 세포, 예컨대 종양 세포 또는 자가면역 세포 또는 B-세포 질병 관련 B-세포 등이다. 이펙터 모이어티는 예를 들어 ADC의 일부로서의 독소 또는 본 발명에 따른 AOC의 일부로서 올리고뉴클레오티드, 예컨대 안티센스 BNA이다.
일 구현예는 본 발명의 접합체로서, 여기서 적어도 하나의 사포닌은 위치 C-23에서 알데히드 작용(function)을 갖는 12,13-디하이드로올레아난 유형에 속하며, 선택적으로 사포닌의 C-3베타-OH 기에서 카보하이드레이트 치환체에 글루쿠론산 작용을 포함하는, 비스데스모시딕 트리테르펜 사포닌 및/또는 트리테르페노이드 사포닌 및/또는 집소필라(Gypsophila) 종 및/또는 사포나리아(Saponaria) 종 및/또는 아그로스템마(Agrostemma) 종 및/또는 퀼라자(Quillaja) 종, 예컨대 퀼라자 사포나리아(Quillaja saponaria) 중 임의의 하나 이상에서 분리된 사포닌이다.
일 구현예는 본 발명의 접합체로서, 여기서 적어도 하나의 사포닌은 단일의 특정한 사포닌이거나 또는 둘 이상의 다른 사포닌의 혼합물이다.
일 구현예는 본 발명의 접합체로서, 여기서 적어도 하나의 사포닌은 3.000 달톤 이하, 바람직하게는 2.500 달톤 이하, 보다 바람직하게는 2.300 달톤 이하, 가장 바람직하게는 2.000 달톤 이하, 예컨대 1.500 달톤-1.900 달톤의 분자 질량(molecular mass)을 갖는다.
일 구현예는 본 발명의 접합체로서, 여기서 적어도 하나의 사포닌은 표 A1 또는 스킴 I, SO1861, SA1657, GE1741, SA1641, QS-21, QS-21A, QS-21 A-api, QS-21 A-xyl, QS-21B, QS-21 B-api, QS-21 B-xyl, QS-7-xyl, QS-7-api, QS-17-api, QS-17-xyl, QS1861, QS1862, 퀼라자사포닌(Quillajasaponin), 사포늄 앨범(Saponinum album), QS-18, Quil-A, Gyp1, 집소사이드 A(gypsoside A), AG1, AG2, SO1542, SO1584, SO1658, SO1674, SO1832, 또는 이들의 임의의 입체 이성질체 및/또는 이들의 임의의 조합 중 하나 이상이며, 바람직하게는 사포닌은 SO1861 및/또는 GE1741 및/또는 SA1641 및/또는 QS-21 및/또는 퀼라익산 아글리콘 코어(quillaic acid aglycon core), C-3베타-OH기에 Gal-(1→2)-[Xyl-(1→3)]-GlcA 카보하이드레이트 치환체 및 C-28-OH기에 Glc-(1→3)-Xyl-(1→4)-Rha-(1→2)-[Xyl-(1→3)-4-OAc-Qui-(1→4)]-Fuc 카보하이드레이트 치환체를 갖는 사포닌이며 및/또는 3-O-베타-D-갈락토피라노실-(1→2)-[베타-D-자일로피라노실-(1→3)]-베타-D-글루쿠로노피라노실 퀼라익산 28-0-베타-D-글루코피라노실-(1→3)-베타-D-자일로피라노실-(1→4)-알파-L-람노피라노실-(1→2)-[베타-D-자일로피라노실-(1→3)-4-OAc-베타-D-퀴노보피라노실-(1→4)]-베타-D-푸코피라노사이드이며, 보다 바람직하게는 적어도 하나의 사포닌은 SO1861 및/또는 QS-21이다.
본 발명자는 본원에서 3작용성 링커, 예를 들어, 스킴 Ⅱ의 3작용성 링커를 통한, 또는 공유 결합된 사포닌을 포함하는 스캐폴드의 올리고머 또는 폴리머 구조를 통한 단백질 분자와 같은 세포-표면 분자 표적화 분자에 대한 퀼라자 사포나리아, QS-21, SA1641, SO1861, 표 A1, 스킴 I의 수용성 분획의 사포닌과 같은 사포닌의 공유 결합은, 접합체에서 공유 결합된 사포닌의 영향 하에, 접합체에 의해 포함되는 독소와 같은 이펙터 모이어티에 의해 발휘되는 개선된 세포 독성(toxicity)을 초래함을 개시한다.
일 구현예는 스킴 I의 구조 A의 사포닌의 표시된 구조적 특징 중 하나 또는 몇 가지 또는 모두를 포함하는 사포닌을 포함하는 본 발명의 접합체이며, 본 발명의 접합체, 및/또는 스킴 I의 임의의 하나 이상의 추가 사포닌으로부터 선택된 사포닌과 접촉된 세포의 엔도좀 존재하는 이펙터 모이어티에 대한 엔도좀 탈출 증진 활성시에, 구조 A의 사포닌은 '이상적인' 구조의 사포닌으로 지칭된다:
본 발명에 따라, 본 발명의 접합체에 의해 포함된 이펙터 분자의 엔도좀 탈출을 향상시키는 목적에 대하여 '이상적인' 구조를 갖는, 본 발명의 접합체에 의해 포함되는, 본 발명에 따른 세포-표면 분자 표적화 분자에 결합된 본 발명에 따른 사포닌과 같은 글리코시드는 스킴 I의 구조 A에 따른 비스데스모시딕 사포닌이고, 이는 적어도 1.500달톤의 분자 질량을 가지며, 그리고 C-3 위치에 제1 분지형 카보하이드레이트 측쇄를 가지며, 제1 분지형 카보하이드레이트 측쇄가 선택적으로 글루쿠론산을 함유하는, C-23 위치에 알데히드기를 그리고 선택적으로 C-16 위치에 히드록실기를 함유하는 올레아난형(oleanan-type) 트리테르펜을 포함하며, 여기서 사포닌은 C-28 위치에 제2 분지형 카보하이드레이트 측쇄를 갖는 에스테르기를 함유하며, 제2 분지형 카보하이드레이트 사슬은 선택적으로 적어도 하나의 아세틸 잔기, 예컨대 2개의 아세틸 잔기를 함유하고 및/또는 선택적으로 디옥시 카보하이드레이트를 포함하고 및/또는 선택적으로 퀴노보스를 포함하고 및/또는 선택적으로 글루코스를 포함하고 및/또는 선택적으로 4-메톡시신남산을 포함하고 및/또는 선택적으로 에스테르 결합을 통해 카보하이드레이트에 결합되는 5-0-[5-0-Rha-(1→2)-Ara/Api-3,5-디하이드록시-6-메틸-옥타노일]-3,5-디하이드록시-6-메틸-옥탄산을 포함하고 및/또는 선택적으로 5-0-[5-0-Ara/Api-3,5-디하이드록시-6-메틸-옥타노일]-3,5-디하이드록시-6-메틸-옥탄산을 포함하는, 적어도 4개의 카보하이드레이트 유닛을 바람직하게 포함한다.
SO1861은 퀴노보스에 단지 하나의 아세틸 잔기를 가지며, 그리고 부가적인 자일로오스를 갖는 점에서만 스킴 I에 나타낸 "이상적인 구조(ideal structure)," 구조 A와 상이하다. 이펙터 분자 또는 이펙터 모이어티의 엔도좀 탈출(endosomal escape)을 증진시키는 사포닌의 '이상적인 구조'는 바람직하게는 스킴 I의 구조 A를 갖는 사포닌이고, 엔도좀 탈출 증진 활성을 나타내는 사포닌은 스킴 I의 구조 A에 나타낸 구조적 특징 중 하나 이상을 갖는다. 임의의 이론에 구속되지 않고, 본 발명자는 스킴 I의 구조 A가 엔도좀 탈출 증진 활성에 "이상적인 사포닌" (및 최소 요건 사포닌이 아님)을 나타내는 것으로 믿으며, 이는 모든 구조(화학기)가 사이토솔 내의 이펙터 모이어티의 축적을 촉진하는 적어도 충분한 엔도좀 탈출 증진 활성으로 각각의 사포닌에 존재할 수 있거나 존재해야만 한다는 것을 의미하는 것은 아니며, 이는 일부 사포닌이 아실쇄(acyl chain)와 같은 다른 구조 요소(element)를 가질 수 있고, 및/또는 엔도좀 탈출 증진 활성을 나타내는 또 다른 사포닌의 경우, 당이 스킴 I에 나타낸 당과 상이할 수 있음을 의미한다. 예를 들어, QS-21 사포닌 및 퀼라자 사포나리아(Quillaja saponins; Quil-A)의 수용성 분획 중의 사포닌의 일부는 스킴 I의구조 A의 이상적인 구조가 고려될 경우에 C-28에서의 카보하이드레이트 변형(modification)이 상이하다: 예를 들어 QS-21에서 아실쇄의 존재. 퀼라자 사포나리아의 수용성 분획에서, QS-7, QS1862와 같은 사포닌은 이상적인 구조 A와 유사하며, SO1861과 유사하다.
일 구현예는 본 발명의 접합체이며, 여기서 적어도 하나의 사포닌은 분자 질량이 적어도 1.500 달톤이고 C-3 위치에 제1 분지형 카보하이드레이트 측쇄를 가지며, 제1 분지형 카보하이드레이트 측쇄가 선택적으로 글루쿠론산을 함유하는, C-23 위치에 알데히드기를 함유하고 선택적으로 C-16 위치에 히드록실기를 함유하는 올레아난형(oleanan-type) 트리테르펜을 포함하는 비스데스모시딕 사포닌이며, 여기서 사포닌은 C-28 위치에 제2 분지형 카보하이드레이트 측쇄를 갖는 에스테르기를 함유하며, 제2 분지형 카보하이드레이트 사슬은 선택적으로 적어도 하나의 아세틸 잔기(residue), 예컨대 2개의 아세틸 잔기를 함유하고 및/또는 선택적으로 디옥시 카보하이드레이트를 포함하고 및/또는 선택적으로 퀴노보스를 포함하고 및/또는 선택적으로 글루코스를 포함하고 및/또는 선택적으로 4-메톡시신남산을 포함하고 및/또는 선택적으로 에스테르 결합을 통해 카보하이드레이트에 결합된 5-0-[5-0-Rha-(1→2)-Ara/Api-3,5-디하이드록시-6-메틸-옥타노일]-3,5-디하이드록시-6-메틸-옥탄산을 포함하며 및/또는 선택적으로 5-0-[5-0-Ara/Api-3,5-디하이드록시-6-메틸-옥타노일]-3,5-디하이드록시-6-메틸-옥탄산을 포함하는, 적어도 4개의 카보하이드레이트 유닛을 바람직하게 포함하며, 또는 여기서 적어도 하나의 사포닌은 QS-21 또는 QS-21A, QS-21 A-api, QS-21 A-xyl, QS-21B, QS-21 B-api, QS-21 B-xyl, QS-7-xyl, QS-7-api, QS-17-api, QS-17-xyl, QS-18, QS1861, 양성자화된 QS1861 (QS1862), Quil-A 중 임의의 하나 이상이다.
표 A1 및 스킴 I 및 상기 구현예는 제2 분자(예, 독소, 올리고뉴클레오티드와 같은 이펙터 모이어티 또는 이펙터 분자)와 함께 유리 형태로 포유류 세포, 특히 인간 종양 세포에 접촉될 때 그의 엔도좀 탈출 증진 활성에 대해 확인된 일련의 사포닌을 요약한다. 또한 Boettger(2013)의 표 9 및 10에 열거된 이러한 엔도좀 탈출 향상 활성을 갖는 사포닌이 참조된다[Stefan Bottger, Untersuchungen zur synergistischen Zytotoxizitat zwischen Saponinen und Ribosomen inaktivierenden Proteinen Typ I, Dissertation zur Erlangung des akademischen Grades des Doktors der Naturwissenschaften (Dr. rer. nat.), eingereicht im Fachbereich Biologie, Chemie, Pharmazie der Freien Universitat Berlin, Tabelle 9, Tabelle 10, page 67-74]. 실제로, 인간 종양 세포를 사용한 세포-기반 바이오어세이에서, 본원에 기술된 표 A1에 표로 작성된 사포닌 및 스킴 I 및 본 발명의 다양일 구현예의 사포닌에 대해, 이들 사포닌의 영향 하에, 본 발명의 접합체의 일부인 경우, 접합체에 의해 포함된 핵산 및/또는 단백질 독소와 같은 독소(예, 표 A5에 열거된 하나 이상의 단백질 독소)와 같은 이펙터 모이어티가 아마도 (후기) 엔도좀 및 리소솜으로부터 세포내 방출을 통해 증가된 효율 및/또는 효능으로 사이토졸 내로 전달되는 것이 확립되었다. 즉, 본 발명의 접합체에 의해 결합된 이러한 이펙터 모이어티, 예를 들어, 핵산 및/또는 독소의 엔도좀 및/또는 리소솜 탈출은 사포닌이 없으면 덜 효율적이다.
놀랍게도, 본 발명자는 QS-21 및 이의 패밀리 구성원, QS-21A, QS-21 A-api, QS-21 A-xyl, QS-21B, QS-21 B-api, QS-21 B-xyl, QS-7-xyl, QS-7-api, QS-17-api, QS-17-xyl, QS1861, QS1862, QS-18 및 Quil-A를 포함하는 퀼라자 사포나리아로부터의 수용성 사포닌 분획이, 공유 접합체로서 접합체에 의해 포함되는, 이러한 QS-21 제조물(예, 퀼라자 사포나리아의 수용성 분획)에 포괄된 QS-21 및 이의 패밀리 구성원 사포닌과 같은 적어도 하나의 글리코시드 및 결합된 이펙터 모이어티와 함께, 모노클로날 항체(본 발명의 세포-표면 분자 표적화 분자)를 포함하는 공유 접합체의 형태로 포유류 종(인간)의 종양 세포에 투여되는 경우에 또한 모노클로날 항체에 결합된 핵산 또는 모노클로날 항체에 결합된 단백질 독소((단백질) 독소와 같은 공유 결합된 올리고뉴클레오티드 또는 페이로드를 포함하는 본 발명의 접합체의 예)의 시험관 내(in vitro)에서 생물학적 효과를 강화하는 능력을 나타냄을 입증하며, 여기서 이펙터 분자 및 글리코시드, 예를 들어 퀼라자 사포나리아의 사포닌 분획, QS-21, SO1861, SA1641, GE1741는 예를 들어 상기 세포-표면 분자 표적화 분자에 직접적으로 또는 링커를 통해 공유 결합되거나, 또는 직접적으로 또는 적어도 하나의 링커를 통해 폴리머 또는 올리고머 스캐폴드를 통해 공유 결합된다. 임의의 이론에 의해 구속되는 것은 아니며, 시험관내에서 퀼라자 사포나리아로부터 유래된 사포닌의 존재하에, 예를 들어 종양-세포 HSP27 발현의 안티센스 BNA 매개된 감소(HSP27 유전자 침묵)의 관찰된 자극 또는 강화작용(potentiation)은 사포닌에 의한 종양 세포에서의 인플라마솜(inflammasome)의 활성화와 (또한) 관련될 수 있으며, 이는 예를 들어 종양 세포 파이롭토시스(pyroptosis)를 초래한다. 본 발명자는, 접합체가 사포닌(들)이 동일한 (종양) 세포를 표적으로 하도록 사포닌을 포함하는 경우, 바이오-기반(bio-based) 세포 어세이에서 세포와 접촉시, 예를 들어 안티센스 BNA 또는 디안틴 또는 사포린에 접합된 본 발명의 세포-표면 분자 표적화 분자는 시험관내에서 임의의 항-종양 세포 활성을 적어도 나타내거나 항종양 세포 활성을 개선하지만, 반면 사포닌(들)이 없는 경우, 즉 연결된 사포닌(들)이 없는 기존 ADC 포맷에서는 종양 세포에 대한 그러한 활성이 관찰되지 않음을 확립하였다. 본 발명의 접합체에서 공유 결합된 사포닌의 존재는 접합체에서 이펙터 모이어티의 활성을 효율적으로 발휘하는데 필수적인 것으로 입증되었다.
QS-21, 및 또한 퀼라자 사포나리아로부터의 QS-21을 포함하는 수용성 사포닌 분획은 이미 오래전부터 알려져 있었으며, 이전에는 이의 면역 증강 능력에 대하여, 예를 들어 서브-유닛 백신에서 예를 들어, 보조제로서 집중적으로 적용되었다. 예를 들어, QS-21은 QS-21(Glaxo-Smith-Kline, MAGRIT trial, DERMA study)을 포함하는 보조제와 혼합된 서브-유닛 백신으로 백신접종된 인간 환자에서 2개의 3상 임상 시험에 적용되고, 여기서 서브-유닛은 MAGE-A3 단백질이고, 이는 구체적으로 종양 세포에 의해 발현되고 제시된다. 항-종양 백신접종은 QS-21로 증강되었고, 암 환자(흑색종; 비-소세포 폐암)의 무질환 생존 연장을 목적으로 하였다. 또한, QS-21은, 항암 백신 치료개발을 위해, HIV-1 감염에 대한 백신의 개발을 위해, B형 간염에 대한 백신의 개발에서, 및 Glaxo-Smith-Kline의 보조제 AS01 및 AS02를 포함하는 QS-21을 이용한 항-말라리아 백신 개발을 위해, 임상 시험에서 보조제로 테스트되었다. 이전 연구는 보조제(AS15; GSK)를 포함하는 QS-21 사포닌의 영향 하에서, 암 세포 표면에서 제시된 MAGE-A3 펩티드에 대해 유도된 면역 반응이 밝혀냈다. 본 발명자에게 놀랍게도, 퀼라자 사포나리아의 사포닌 분획, 및 이에 따라 유사한 QS-21(퀼라자 사포나리아의 수용성 사포닌 분획의 일부로서)이, 예를 들어 본 발명의 접합체(예, 리간드 EGF)에서 세포-표면 분자 표적화 분자(예, 리간드 EGF)에 결합된 단백질 독소(디안틴)와 같은 페이로드의 항종양 세포 활성을 증가시킨다.
본 발명의 접합체로 단일 세포-표면 분자를 표적화함으로써, 표적화된 세포의 세포질에서 및 내부에, 본 발명의 접합체에서 세포-표면 분자 표적화 분자에 결합된 사포닌 및 이펙터 모이어티의 전달, 세포 표면에 세포-표면 분자의 노출이 개선되며, 보다 구체적으로는 세포를 본 발명의 사포닌이 결여된, 따라서 세포-표적화된 사포닌(본 발명의 접합체)이 존재하지 않는 일반 ADC와만 접촉시키는 예에 비하여 개선된다. 접합체의 세포-표면 분자 표적화 분자에 의한 표적화를 위해 선택된 비정상 세포는 이상적으로는 세포-표면 분자 표적화 분자가 높은 정도로 결합할 수 있는 세포-표면 분자 상의 에피토프를 보유하고(즉, 예를 들어 건강한 세포에 대한 것과 같은 비-표적화된 세포 상의 발현 보다, 예를 들어, 종양 세포 또는 자가면역 세포에 대한 것과 같은 표적화된 세포 상의 표적화된 세포-표면 분자의 상대적으로 높은 발현) 및/또는 특히, 환자의 (이웃) 건강한 세포를 고려할 때 접합체의 세포-표면 분자 표적 분자의 결합을 위해 표적화된 세포-표면 분자의 에피토프를 노출한다. 바람직하게는, 본 발명의 접합체의 세포-표면 분자 표적화 분자에 의해 표적화된 세포-표면 분자는 건강한 세포에 비하여 표적화된 (병든, 종양) 세포 상에서 비교적 높게 및/또는 특이적으로 발현된다. 일 구현예는 본 발명의 접합체로서, 여기서 종양-세포 수용체와 같은 접합체의 세포-표면 분자 표적화 분자에 대한 표적 세포-표면 분자는, 건강한 (이웃) 세포 표면 상의 세포-표면 분자의 발현에 비교되는 경우에, 비교적 높은 정도로 또는 특이적으로 발현된다. 따라서, 표적화된 세포-표면 분자 상의 에피토프는 표적화된 병든 세포(diseased cell)에 대하여 이상적으로 독특하고, 표적화된 세포의 표면에 적어도 특이적으로 존재하고 노출된다. 표적화된 세포 상의 세포-표면 분자 상의 에피토프에 대한 본 발명의 접합체의 결합 후에 접합체 및 표적 세포-표면 분자의 복합체가 엔도사이토시스된다. 접합체는 표적으로 되어서는 안되는 건강한 세포와 비교하여 표적화된 세포에서 충분히 정도로 특이적으로 발현되거나 특유하게 발현되는 세포-표면 분자와의 결합 상호작용을 통해서만 표적 세포에 들어갈 수 있기 때문에, 접합체에 의해 포함된 치료 활성량의 이펙터 모이어티 및 사포닌의 축적은 표적 세포 내부에만 가능하며 표적화된 세포-표면 분자의 발현 수준이 특정 최소 발현 역치를 초과하는 경우에만 발생한다. 동시에, 접합체의 분자를 표적으로 하는 세포-표면 분자에 결합된 이펙터 모이어티가 공유 결합된 사포닌을 함유하는 매우 동일한 접합체의 존재 하에서만 그의 세포내(예: 세포독성 또는 유전자 침묵) 활성을 발휘할 수 있다는 사실 또한 예를 들어 이펙터 모이어티의 부정적이고 바람직하지 않은 부작용에 대한 보호를 제공하는 것으로 예를 들어, 공유 결합된 사포닌(들)이 없는 ADC에 대한 세포의 노출과 비교할 때, 건강한 세포 및 건강한 조직은 이펙터 모이어티에 의해 표적화되고 영향을 받지 않음을 의미한다. 즉, 접합체가 결합할 수 있는 노출된 세포-표면 분자의 발현이 충분히 낮거나 심지어 부재해도 이상적으로 접합체에 의해 포함된 사포닌의 영향 하에 이펙터 모이어티의 엔도좀 탈출을 초래할 양으로 접합체의 (비표적화된) 건강한 세포로의 진입을 허용하지 않는다. 본 발명에 따른 사포닌이 커플링된 ADC 또는 사포닌이 공유적으로 커플링된 AOC는, 사포닌이 커플링되지 않은 ADC 또는 AOC가 치료 요법에 적용되는 경우에 비하여 더 낮은 용량으로 사용될 수 있으므로, 사포닌이 커플링된 ADC 또는 사포닌이 커플링된 AOC가 건강한 세포에 낮은 정도로 도입되는 것은, 이미 예를 들어 종양 세포 및 자가면역 세포와 같은 표적 병든 세포의 표적화 및 사멸이 고려되는 경우에 원치 않는 부작용의 발생 위험이 더 낮다.
일 구현예는 본 발명의 접합체이며, 여기서 세포-표면 분자 표적화 분자는 세포-표면 분자에 대한 결합을 위한 단백질성 결합 분자 또는 단백질성 리간드 또는 리간드를 포함하거나 이로 구성된다.
일 구현예는 본 발명의 접합체이며, 여기서 세포-표면 분자 표적화 분자는 세포-표면 분자에 대한 결합을 위한 비-단백질성 리간드 및/또는 단백질성 리간드, 예컨대 EGF 또는 사이토카인을 포함하거나 이로 구성되며, 및/또는 면역 글로불린, 면역 글로불린의 적어도 하나의 결합 도메인, 및/또는 면역 글로불린의 적어도 하나의 결합 단편, 예컨대 항체, IgG, Vhh 도메인 또는 Vh 도메인을 포함하거나 이로 구성되는 분자, Fab, scFv, Fv, dAb, F(ab)2, Fcab 단편을 포함하거나 이로 구성되며, 이는 세포-표면 분자에 결합될 수 있다.
본 발명자는 이러한 면역글로불린, 이의 도메인, 리간드 등이 표적 세포 표면 분자에 결합하기 위한 결합 부위를 포함하는 접합체의 세포-표면 분자 표적화 분자로서 적용하기에 특히 적합하다는 것을 확립하였다. 예를 들어, 항체 및 항체의 결합 도메인은 세포 표면에 노출된 선택된 세포-표면 분자의 에피토프를 표적화하는데 적합하며, 그 결과 접합체 및 이에 따른 이펙터 모이어티 및 사포닌을 함께 표적화하여 접합체의 세포-표면 분자 표적화 분자에 의해 표적화된 세포-표면 분자를 발현하는 세포를 표적화한다. 유사하게, 표적 세포 상의 EGFR을 표적으로 하는 EGF와 같은 리간드는 접합체에서 세포-표면 분자 표적 분자로서 적용에 적합하다. 표적 세포 표면 분자의 에피토프를 결합하기 위한 세포-표면 분자 표적화 분자가 바람직하며, 이는 세포-표면 분자에 대한 접합체의 결합에 특이적이다. 항체 또는 이의 도메인 또는 결합 단편을 기반으로 하는 본 발명의 세포-표면 분자 표적화 분자는 예를 들어 병든 세포, 종양 세포, 자가면역 세포 등과 같은 표적화를 위해 선택된 세포의 선택된 세포-표면 분자 상의 선택된 에피토프에 대한 원하는 특이성을 제공한다. 따라서 (인간, 인간화, 키메라) 모노클로날 항체와 같은 항체 또는 결합 분자(단편, 도메인)를 기반으로 세포-표면 분자 표적화 분자가 본 발명의 접합체에 바람직하다.
일 구현예는 본 발명의 접합체이며, 여기서 세포-표면 분자 표적화 분자는 종양-세포 표면 분자, 바람직하게는 종양-세포 수용체 예컨대 종양-세포 특이적 수용체, 보다 바람직하게는 CD71, CA125, EpCAM(17-1A), CD52, CEA, CD44v6, FAP, EGF-IR, 인테그린(integrin), 신데칸-1(syndecan-1), 혈관 인테그린 알파-V 베타-3(vascular integrin alpha-V beta-3), HER2, EGFR, CD20, CD22, 엽산 수용체 1(Folate receptor 1), CD146, CD56, CD19, CD138, CD27L 수용체, PSMA, CanAg, 인테그린-알파V, CA6, CD33, 메소텔린, 크립토, CD3, CD30, CD239, CD70, CD123, CD352, DLL3, CD25, ephrinA4, MUC1, Trop2, CEACAM5, CEACAM6, HER3, CD74, PTK7, Notch3, FGF2, C4.4A, FLT3, CD38, FGFR3, CD7, PD-L1, CTLA4, CD52, PDGFRA, VEGFR1, VEGFR2로부터 선택된 수용체, 바람직하게는 CD71, HER2 및 EGFR로 부터 선택된 수용체에 결합될 수 있다. 이들 수용체는 본 발명의 접합체의 세포-표면 분자 표적화 분자가 결합할 수 있는 에피토프를 보유하는 분자의 바람직한 예이며, 이러한 분자는 접합체의 결합을 위해 선택된 표적 세포의 표면에서 충분히 특이적이거나 심지어 특유하게 발현되어, 수용체를 더 낮은 정도로 발현 및 노출하거나 세포 표면에 수용체를 노출시키지 않는 세포에 대한 접합체의 결합과 비교하여, 접합체는 상기 표적 세포에 특유하게 및/또는 특이적으로, 또는 적어도 우선적으로 및 적어도 더 큰 정도로 결합한다. 표적 세포는 예를 들어 비정상 세포, 종양 세포, 악성 세포, 병든 세포, 악성에 관여하는 B 세포, 자가면역 세포 등이다.
일 구현예는 본 발명의 접합체이며, 여기서 종양-세포 수용체는 본 발명의 세포-표면 분자 표적화 분자에 결합한 후에 종양 세포에 의해 내재화되거나, 또는 종양-세포 수용체는 본 발명의 접합체에 결합한 후에 종양 세포에 의해 내재화되며, 여기서 바람직하게는 종양-세포 수용체에 대한 접합체의 결합 및 세포-표면 분자 표적화 분자의 결합 후에 접합체와 종양-세포 수용체의 복합체가 예를 들어 엔도사이토시스를 통해 종양-세포 수용체-매개 내재화된다.
일 구현예는 본 발명의 접합체이며, 여기서 종양-세포 수용체는 결합시 종양 세포에 의해 내재화되고/되거나 내재화가 본 발명의 세포-표면 분자 표적화 분자에 대한 결합에 의해 유도되고, 또는 종양 세포 수용체는 본 발명의 접합체에 결합한 후 종양 세포에 의해 내재화되거나, 또는 접합체가 종양 세포 수용체에 결합할 때 및/또는 이로 인해 내재화되고, 바람직하게는 종양-세포 수용체에 대한 접합체의 결합 및 세포-표면 분자 표적화 분자의 결합은 접합체와 종양-세포 수용체의 복합체의 종양-세포 수용체-매개 내재화, 예를 들어 엔도사이토시스를 유도하고/하거나 초래한다.
동기화(synchronization)는 마우스에 대한 성공적인 전달 전략과 인간에서의 이의 응용에 대한 미싱 링크(missing link)이다. 실제로, 본 발명자는 유리 사포닌의 투여량 및 예를 들어, 사포닌이 커플링되지 않은 ADC의 투여량을 마우스에 개별적으로 투여하는 일련의 생체내 마우스 종양 모델에서, 유리 사포닌 존재 하에서 ADC로 처리되지 않은 대조군 동물에 비해, 지연된 종양 성장, 종양 퇴화(regression), 감소 및 더 느린 종양 성장과 같은 임의의 바람직한 항-종양 활성을 초래하지 않았다는 것을 확립하였다. 유리 사포닌을 다양한 투여 경로를 사용하여 그리고 ADC 투여 순간에 비해 유리 사포닌을 투여하는 다양한 시점(ADC 투여 전, 도중 및 후에 유리 사포닌 투여)을 사용하여 투여하였다. 생체내 종양 모델에서 시험된 ADC는 세툭시맙-디안틴(유리 S01861 함유), 또는 트라스투주맙-사포린(유리 S01861 함유)이었다. 유리 사포닌의 투여량을 변화시키는 것은 효과적인 항종양 활성을 제공하지 않았다. 언급된 ADC는 그 자체로 종양-함유 동물에 대해 어떠한 유익한 항-종양 효과를 가하지 않는 투여량으로 투여되었다. 놀랍게도, 본 발명자는 인간 종양 세포를 사용한 다양한 시험관내 포유류 세포-기반 바이오어세이에서 및/또는 다양한 생체내 동물 종양 모델에서 유익한 항-종양 활성이 본 발명에 따른 접합체로 세포 또는 동물을 처리함으로써 달성될 수 있음을 이제 확립하였다. 본 발명에 따른 스캐폴드를 선택적으로 포함하는 접합체 (하기 참조). 예를 들어 스캐폴드는 절단 가능한 또는 절단 불가능한 결합을 통해 공유 결합된 사포닌(예, S01861, QS-21)을 갖는, 및/또는 절단 불가능한 또는 절단 가능한 결합을 통해 공유 결합된 이펙터 모이어티(예, 디안틴, 유전자-침묵 안티센스 BNA(HSP27))를 갖는, 3-작용성 링커이며, 스캐폴드는 세툭시맙, 트라스투주맙, OKT-9와 같은 모노클로날 항체와 같은 접합체의 세포-표면 분자 표적화 분자에 공유 결합으로 연결되거나, 스캐폴드는 덴드론, 예를 들어, 4개의 사포닌 분자와 같은 4개의 모이어티가 결합할 수 있는 덴드론, 예를 들어 G4-덴드론, 또는 예를 들어 2개의 사포닌 및 2개의 이펙터 분자에 대한 결합을 위한 덴드론이며, 덴드론은 리간드, 항체 또는 이의 단편 또는 도메인과 같은 접합체의 세포-표면 분자 표적화 분자에 대한 (공유) 커플링을 위한 화학기를 포함한다. 예를 들어 단백질성 독소에 의해 발휘된 세포 독성이 고려될 때 또는 종양 세포에서 유전자 침묵이 고려될 때 생체내 및/또는 시험관내 항-종양 세포 활성을 나타내는, 본 발명에 따른 다양한 이러한 스캐폴드의 예시는 추가적인 구현예 및 실시예 항목을 참고할 수 있다.
임의의 이론에 의한 제한 없이, 유리 사포닌과 함께 ADC를 이용한 종양-함유 동물의 처리시 관찰된 실패를 고려한 관점에서, 예를 들어, 표적 세포, 예를 들어, 종양 세포 또는 자가면역 세포의 엔도사이틱 경로의 구획(compartment) 또는 소포체(vesicles)에서, 적어도 하나의 사포닌 및 이펙터 모이어티, 바람직하게는 독소 또는 올리고뉴클레오티드 모두의 존재를 동기화(synchronize)하는 것이 바람직하다. ADC 및 유리 사포닌(free saponin)으로, 생체내 시너지 효과를 얻기 위해, 후기 엔도좀 내에 상기 분자의 존재를 동기화하는 것은 본 발명자의 시도에 따라 유리하게 얻을 수 없었다. 일 견지에서, 본 발명은 바람직하게는 단일 접합체 분자에서 이펙터 모이어티 및 사포닌(들)을 조합(combinng)하는 것과 관련하여 적어도 다음의 문제를 해결한다: 임의의 이론에 의한 제한 없이, 예를 들어, (공유적으로) 특히 단일이고 절단 가능한, 보유 가능한 커플링에 사용될 수 있는 사포닌 내의 유일한 합당한 화학기가 엔도좀 탈출 활성에 요구된다. 예를 들어, 표 A1 및 스킴 I에 열거된 사포닌의 현저한 엔도좀 탈출 인핸서(enhancer) 효과가 10년이 넘게 알려져 있음에도 불구하고, 공지된 제한은 아마도 사포닌이, 면역-증강 보조 물질의 사용이 암시된 백신 요법에서의 사포닌의 적용 이외에, 임상 연구에서 약학적 활성 물질과 조합하여 사용되지 않은 가장 큰 이유일 것 같다. 예를 들어, 사포닌이 공유 결합된 본 발명의 접합체를 제공하는 것은 예를 들어, 여러 사포닌을 운반하는 스캐폴드와 관련하여, 이러한 어려움을 적어도 부분적으로 해결한다. 놀랍게도, 보조 성분으로서 사포닌을 포함하는 백신 접종 상황에서 이들의 면역 증진 활성을 위해 이전에 적용된 사포닌도, 이제 또한 시험관내 및 생체내 항-종양 활성을 위해, 본 발명의 접합체에 의해 포함된 세포-표면 분자 표적화 분자에 대한 (공유) 커플링에 적합하다.
일 구현예는 본 발명의 접합체이며, 여기서 세포-표면 분자 표적화 분자는 모노클로날 항체 또는 이의 적어도 하나의 세포-표면 분자 결합 단편 또는 -도메인이거나 이를 포함하며, 바람직하게는 세툭시맙, 다라투무맙, 젬투주맙, 트라스투주맙, 파니투무맙, 브렌투시맙, 이노투주맙, 모세투모맙, 폴라투주맙, 오비누투주맙, IgG 유형의 OKT-9 항-CD71 모노클로날 항체, 페르투주맙, 리툭시맙, 오파투무맙, 허셉틴, 알렘투주맙, 피나투주맙, OKT-10 항-CD38 모노클로날 항체, 표 A2 또는 표 A3 또는 표 A4의 항체 중 임의의 하나이며, 바람직하게는 세툭시맙 또는 트라스투주맙 또는 OKT-9, 또는 이의 적어도 하나의 세포-표면 분자 결합 단편 또는 -도메인을 포함하거나 이로 구성된다.
언급한 바와 같이, 본 발명의 접합체의 세포-표면 분자 표적화 분자로 세포-표면 분자를 표적화함으로써, 바로 동일한 표적화된 세포의 사이토졸 내부에서 그리고 내부에서 사포닌 및 이펙터 모이어티의 전달이 개선되고 보다 특이적이다. 접합체의 세포-표면 분자 표적화 분자에 의한 표적화를 위해 선택된 비정상 세포(aberrant cell)는, 환자의 (인접한) 건강한 세포를 고려할 때, 세포-표면 분자를 이상적으로 높은 정도로 및/또는 특이적으로 보유한다. 따라서, 표적화된 세포-표면 분자 상의 에피토프는 표적화된 병든 세포에 이상적으로 특유(unique)하고, 표적화된 세포의 표면에 적어도 특이적으로 존재하고 노출된다. 접합체의 결합 후에 접합체와 표적 세포-표면 분자의 복합체가 엔도사이토시스된다.
표 A2, A3 및 A4는 본 발명의 접합체의 세포-표면 분자 표적화 분자에 대한 에피토프를 포함하는 세포-표면 분자의 바람직한 예를 나열한다. 세포-표면 분자가 표적 세포 상에서 특이적으로 발현되는 경우, 바람직하게는 접합체의 세포-표면 분자에 대한 결합은 종양-세포 표면 분자를 노출시키는 종양 세포와 같은 원하는 표적 세포에 대한 접합체의 특이적 표적화를 초래하며, 반면에 세포-표면 분자를 발현하지 않거나 세포-표면 분자를 더 낮은 정도로 발현하는 건강한 세포와 같은 다른 세포는, 표적화된 (비정상) 세포 상의 세포-표면 분자(들)의 발현과 비교하여, 접합체에 의해 표적화되지 않거나 더 낮은 정도로만 표적화된다.
본 발명에서 약학적 활성 물질은 유기체, 바람직하게는 척추동물, 보다 바람직하게는 암 환자 또는 자가면역 환자와 같은 인간에서 유익한 결과를 달성하기 위해 사용되는 이펙터 모이어티이다. 혜택은 질환 및/또는 증상의 진단, 예후, 치료, 처리 및/또는 방지(prevention)를 포함한다. 약학적 활성 물질은 또한 원치 않는 유해한 부작용을 유발할 수 있다. 이 경우 약학적 활성 물질이 특정 경우에 적합한지 여부를 결정하기 위해 장단점이 고려되어야 한다. 세포 내부에서의 약학적 활성 물질의 효과가 전체 유기체에 대개 유익하면, 세포를 표적 세포라고 한다. 세포 내부에서의 효과가 전체 유기체에 대개 해롭우면, 그 세포를 표적-외 세포(off-target cell)라고 한다. 세포 배양물 및 생물 반응기(bioreactor)와 같은 인공 시스템에서, 표적 세포 및 표적-외 세포는 목적에 따라 다르며 사용자에 의해 정의된다.
폴리펩티드인 이펙터 모이어티는 예를 들어 효소 대체, 유전자 조절 기능 또는 독소와 같은 손실된 기능을 회복하는 예를 들어, 폴리펩티드일 수 있다.
일 구현예는 본 발명의 접합체이며, 여기서 적어도 하나의 이펙터 모이어티는 올리고뉴클레오티드, 핵산 및 제노 핵산 중 임의의 하나 이상, 바람직하게는 벡터, 유전자, 세포 자살 유도 트랜스진, 데옥시리보핵산 (DNA), 리보핵산 (RNA), 안티센스 올리고뉴클레오티드 (ASO, AON), 짧은 간섭 RNA (siRNA), 마이크로RNA (miRNA), DNA 앱타머, RNA 앱타머, mRNA, 미니-서클 DNA, 펩티드 핵산 (PNA), 포스포라미데이트 모르폴리노 올리고머 (PMO), 잠금 핵산 (LNA), 브리지 핵산 (BNA), 2'-디옥시-2'-플루오로아라비노 핵산 (FANA), 2'-O-메톡시에틸-RNA (MOE), 2'-O, 4'-아미노에틸렌 브리지 핵산, 3'-플루오로 헥시톨 핵산 (FHNA), 플라스미드, 글리콜 핵산 (GNA) 및 트레오스 핵산 (TNA) 또는 이의 유도체 중 임의의 하나 이상으로부터 선택된 것, 보다 바람직하게는 BNA, 예를 들어 HSP27 단백질 발현을 침묵시키는 BNA를 포함하거나 이로 구성된다.
본 발명자는, 종양 세포와 접촉되고, BNA 및 사포닌 모두가 항체(예, 세툭시맙)에 절단가능한 결합을 통해 커플링된, 본 발명의 공유 커플링된 안티센스 BNA 예컨대 BNA(HSP27)이 제공되고, 공유 커플링된 사포닌이 제공된 종양-세포 표적화 모노클로날 항체는, 대조군에 비하여 그리고 사포닌(SO1861, Quil-A)이 아닌 BNA만 함유하는 AOC에 비하여 생체내 종양에서 HSP27을 침묵시킬 수 있다는 것을 보여준다. 본 발명의 ADC-사포닌 접합체 또는 본 발명의 항체-올리고뉴클레오티드 접합체-사포닌 접합체(AOC-사포닌), 예컨대 항체-BNA-사포닌 접합체를 투여함으로써, 모노클로날 항체에 사포닌이 공유결합 되지 않은 ADC 또는 AOC만으로는 볼 수 없었던, ADC-사포닌 또는 AOC-사포닌에 대한 항-종양 세포 활성이 동일한 용량에서 부여된다. 주목할 만하게, 두 개의 별도의 접합체의 조합으로 사포닌이 공유 결합된 별도의 모노클로날 항체 및 AOC가, 대조군에 비하여 (비히클만 투여됨), 별도의 마우스 그룹의 종양-함유 마우스에 별도로 투여된 경우에, 종양 세포에서 HSP27 발현을 증가시킨다. 본 발명의 이펙터 모이어티를 포함하는 본 발명의 AOC-사포닌 접합체의 투여만이 대조군에 비해 감소된 HSP27 발현을 나타낸다. 안티센스 BNA(HSP27)는 문헌[Zhang et al. (2011) [Y Zhang, Z Qu, S Kim, V Shi, B Liao1, P Kraft, R Bandaru, Y Wu, LM Greenberger and ID Horak, Down-modulation of cancer targets using locked nucleic acid (LNA)-based antisense oligonucleotides without transfection, Gene Therapy (2011) 18, 326-333]에 따른 올리고 핵산 서열 5'-GGCacagccagtgGCG-3'을 갖는 BNA이었다. 주목할 만하게, 본 발명자가 아는 지식으로, BNA는 유리 핵산으로서 적용되도록 설계된다. 본 발명자는 이제, 유전자-침묵 활성이 종양-함유 동물의 종양 세포에서 시험관내 그리고 보다 중요하게는 생체내에서 보유되는 방식으로, 안티센스 BNA가 (비-)절단 가능한 링커를 통해 리간드 또는 항체와 공유 커플링될 수 있다는 것을 최초로 입증한다. BNA 기반 AOC를 제공하는 이러한 접근방식은 표적화된 BNA를 이를 필요로 하는 인간 (암)환자에게 투여하는 새로운 방식을 연다.
일 구현예는 본 발명의 접합체이며, 여기서 적어도 하나의 이펙터 모이어티는 적어도 하나의 단백질성 분자, 바람직하게는 펩티드, 단백질, 효소, 예컨대 우레아제 및 Cre-재조합효소, 리보좀-불활성화 단백질, 표 A5로부터 선택된 단백질 독소 중 임의의 하나 이상으로부터 선택된 것 그리고 보다 바람직하게는 바이러스 독소, 예컨대 아폽틴; 박테리아 독소, 예컨대 시가(Shiga) 독소, 시가-유사(Shiga-like) 독소, 슈도모나스 아에루기노사 엑소톡신(Pseudomonas aeruginosa exotoxin) (PE) 또는 PE의 엑소톡신 A, 전장 또는 절단된(truncated) 디프테리아 독소 (DT), 콜레라 독소; 곰팡이 독소, 예컨대 알파-사르신; 리보좀-불활성화 단백질 및 2형 리보좀-불활성화 단백질의 A 체인, 예컨대 디안틴, 예를 들어, 디안틴-30 또는 디안틴-32, 사포린 예를 들어, 사포린-S3 또는 사포린-S6, 보우가닌 또는 보우가닌의 탈-면역화(de-immunized) 유도체 디보우가닌, 시가-유사 독소 A, 포크위드(pokeweed) 항바이러스 단백질, 리신(ricin), 리신 A 체인, 모데신, 모데신 A 체인, 아브린, 아브린 A 체인, 볼켄신, 볼켄신 A 체인, 비스쿠민, 비스쿠민 A 체인을 포함하는 식물 독소; 또는 동물 또는 인간 독소, 예컨대 개구리 RNase, 또는 인간으로부터의 안지오게닌, 또는 그랜자임 B, 또는 이의 임의의 단편 또는 유도체 중 임의의 하나 이상으로부터 선택된 것을 포함하거나 이로 구성되며; 바람직하게는 단백질 독소가 디안틴 및/또는 사포린이다.
일 구현예는 본 발명의 접합체이며, 여기서 적어도 하나의 이펙터 모이어티는 적어도 하나의 페이로드, 바람직하게는 리보좀 표적화 독소(toxin targeting ribosome), 연장 인자 표적화 독소, 튜불린 표적화 독소, DNA 표적화 독소, 및 RNA 표적화 독소 중 임의의 하나 이상으로부터 선택되는 것, 보다 바람직하게는, 엠탄신, 파수도톡스, 메이탄시노이드 유도체 DM1, 메이탄시노이드 유도체 DM4, 모노메틸 아우리스타틴 E(MMAE, 베도틴), 모노메틸 아우리스타틴 F(MMAF, 마포도틴), 칼리케아미신, N-아세틸-γ-칼리케아미신, 피롤로벤조디아제핀 (PBD) 다이머, 벤조디아제핀, CC-1065 유사체(analogue), 듀오카르마이신, 독소루비신, 파클리타셀, 도세타셀, 시스플라틴, 시클로포스파미드, 에토포사이드, 도세타셀, 5-플루오로우라실(5-FU), 미토산트론, 튜불리신, 인돌리노벤조디아제핀, AZ13599185, 크립토피신, 리조신, 메토트레세이트, 안트라사이클린, 캠토테신 유사체, SN-38, DX-8951f, 엑사테칸 메실레이트, 슈도모나스 아에루기노사(Pseudomonas aeruginosa) 엑소톡신(PE38)의 절단된 형태, 듀오카르마이신 유도체, 아마니틴, α-아마니틴, 스플라이세오스타틴, 타일란스타틴, 오조가미신, 테시린, 앰버스타틴269 및 소라브탄신, 또는 이의 유도체 중 임의의 하나 이상으로부터 선택된 것을 포함하거나 이로 구성된다.
본 발명에 유용한 이펙터 모이어티는 바람직하게는 이의 효과를 발휘하기 위해 후기 엔도좀 탈출(late endosomal escape)에 의존한다. 일부 이펙터, 예컨대, 예를 들어 슈도모나스 엑소톡신(pseudomonas extoxin)은 "후기 엔도좀 단계(late endosomal stage)" 이전에 다른 소기관으로 경로변경(rerouted)되고, 따라서 본 발명에 따른 제2 단백질성 분자에 대한 커플링으로부터 일반적으로 이익을 얻지 못할 것이다. 그러나, 이러한 독소는, 예를 들어 경로변경을 담당하는 신호 펩티드를 제거함으로써 본 발명에 사용하도록 조정될 수 있다. 매우 독성이며, 세포 사멸을 위해 엔도좀을 탈출하는데 단지 하나의 분자만을 요구하는 특정 독소는 아미도 효력이 감소되도록 변형된다. 적어도 2개, 보다 바람직하게는 적어도 5개, 보다 바람직하게는 적어도 10개, 보다 바람직하게는 적어도 20개, 보다 바람직하게는 적어도 50개, 가장 바람직하게는 적어도 100개의 독소 분자가 엔도좀을 탈출하는 경우, 세포를 사멸시키는 독소를 사용하는 것이 바람직하다. 또한, 본 발명의 접합체는, 종양 세포 또는 자가-면역 세포와 같은 표적 세포에 결합된 이펙터 모이어티(들)을 포함하는 스캐폴드를 표적화하기 위해 공유 결합된 이펙터 모이어티(들)를 포함하는, 공유 접합된 작용화된 스캐폴드, 즉, 올리고머 또는 폴리머 스캐폴드 또는 3작용성 링커와 같은 스캐폴드를 포함한다. 또한, 표적-외 독성을 감소시키기 위해, 세포막 비투과성 소분자 독소가 세포막 투과성 독소에 비해 바람직한 이펙터 분자이다.
본 발명에서 사용되는 용어 "리간드"는 이의 일반적인 의미를 가지며, 바람직하게는 표적 세포의 세포 표면 상의 다른 분자 또는 구조에 결합할 수 있는 분자 또는 구조를 의미하며, 여기서 세포 표면 상의 분자 또는 구조는 엔도사이토시스될 될 수 있으며, 바람직하게는 표적-외 세포 상에 존재하지 않거나 덜 두드러진다. 바람직하게는, 세포 표면 상의 상기 분자 또는 구조는 구성적으로 엔도사이토시스(constitutively endocytosed)된다. 보다 바람직하게는, 본 발명에서 접합체 또는 보다 구체적으로는 세포-표면 분자 표적화 분자는 상기 분자 또는 구조에 결합된 후 표적 세포의 세포 표면 상의 상기 분자 또는 구조의 엔도사이토시스(endocytosis)를 유도한다. 이는 예를 들어, 다양한 암 세포의 표면 상에 존재하는, 표피 성장 인자 수용체(Epidermal Growth Factor Receptor, EGFR), HER2 및 CD71에 대한 경우이다. 구성적으로 엔도사이토시스되는 표적 세포의 세포 표면 상의 분자 또는 구조의 예는, 예를 들어, 클라우딘-1(Claudin-1) 또는 주요 조직 적합성 복합체 클래스 II 당단백질이다. 세포-표면 분자 표적화 분자는 예를 들어 항체, 성장 인자 또는 사이토카인일 수 있다. 본 발명의 접합체에서 독소를 본 발명의 세포-표면 분자 표적화 분자와 그리고 본 발명의 적어도 하나의 사포닌과 조합(combining)하는 것은 표적화된 독소를 생성하는 한 가지 가능성이다. 표적 세포에서만 발생하는 프로세스와 간섭하기 때문에, 표적 세포에만 독성이 있는 독소는 또한 표적화된 독소로 볼 수도 있다(표적-외 세포에서와 같이, 이는 이의 독성 작용, 예를 들어, 아폽틴(apoptin))을 발휘할 수 없다). 바람직하게는, 표적화된 독소는, (표적 세포에 대해서만 결합하고 엔도사이토시스됨으로) 표적 세포에서 활성이고 표적-외 세포에서는 활성이 아니도록 하기 위해, 세포-표면 분자 표적화 분자, 예컨대, 예를 들어 모노클로날 항체와 결합된 독소이다. 예를 들어, 이펙터 모이어티 및/또는 사포닌(들)을 포함하는 작용화된 스캐폴드를 포함하는 본 발명의 접합체에서, 세포-표면 분자 표적화 분자, 예컨대 모노클로날 항체는 이펙터 모이어티 및/또는 사포닌(들)을 스캐폴드를 통해 표적 세포로 안내한다. 내재화 후, 적어도 하나의 글리코시드, 바람직하게는 본 발명의 접합체에 의해 포함되는 사포닌은 이펙터 모이어티의 엔도좀 탈출을 매개한다. 사포닌은 전형적으로 표 A1 및 스킴 I에 열거된 사포닌이고, 바람직하게는 사포닌은 S01861 및/또는 QS-21, 및/또는 SA1641 및/또는 GE1741이다.
바람직하게는, 접합체에 의해 포함된 사포닌에 의해 효과가 강화되는 본 발명의 접합체에 의해 포함된 이펙터 모이어티는 접합체로부터 분리되며, 예를 들어, 엔도사이토시스될 때, 세포-표면 분자 표적화 분자로서 접합체에 존재하는 항체로부터 분리된다. 이는 예를 들어, 산성, 환원성, 효소적 또는 광유도 조건 하에서 끊어지는 절단 가능한 결합에 의해 달성될 수 있다.
일 구현예는 본 발명의 접합체이며, 여기서 적어도 하나의 이펙터 모이어티는 적어도 하나의 링커를 통해 세포-표면 분자 표적화 분자에 공유 결합되거나, 또는 세포-표면 분자 표적화 분자에 직접 결합된다.
일 구현예는 본 발명의 접합체이며, 여기서 적어도 하나의 이펙터 모이어티는 세포-표면 분자 표적화 분자에 공유 결합되며, 이에 의해 항체-약물 접합체 젬투주맙 오조가미신, 브렌투시맙 베도틴, 트라스투주맙 엠탄신, 이노투주맙 오조가미신, 모세투모맙 파수도톡스 및 폴라투주맙 베도틴 및 표 A2 및 표 A3의 항체-약물 접합체 중 임의의 하나를 형성한다.
일 구현예는 본 발명의 접합체이며, 여기서 적어도 하나의 사포닌은 세포-표면 분자 표적화 분자, 바람직하게는 세포-표면 분자 표적화 분자의 아미노산 잔기에 사포닌의 알데히드 작용을 통해, 및/또는 적어도 하나의 이펙터 모이어티에 바람직하게는 적어도 하나의 이펙터 모이어티의 아미노산 잔기를 통해, 사포닌에서의 알데히드 작용, 바람직하게는 12,13-디하이드로올레아난 유형에 속하는 비스데스모시딕 트리테르펜 사포닌의 위치 C-23에서의 알데히드 작용을 통해 공유 결합된다.
일 구현예는 본 발명의 접합체이며, 여기서 적어도 하나의 사포닌에서의 알데히드 작용, 바람직하게는 적어도 하나의 사포닌의 위치 C-23에서의 알데히드 작용은 링커 N-ε-말레이미도카프로산 히드라지드에 공유 커플링되고, 이 링커는 티오-에테르 결합을 통해 세포-표면 분자 표적화 분자 및/또는 적어도 하나의 이펙터 모이어티의 설프하이드릴기(sulfhydryl group), 예컨대 시스테인의 설프하이드릴기에 공유 커플링된다.
일 구현예는 본 발명의 접합체이며, 여기서 적어도 하나의 사포닌은 위치 C-23에서 알데히드 작용을 갖는 12,13-디하이드로올레아난 유형에 속하며 사포닌의 C-3베타-OH기의 카보하이드레이트 치환체에 글루쿠론산 작용을 포함하는 비스데스모시딕 트리테르펜 사포닌이며, 여기서 사포닌은 글루쿠론산(glucuronic acid) 작용을 통해, 그리고 바람직하게 적어도 하나의 이펙터 모이어티의 아미노산 잔기를 통해 적어도 하나의 이펙터 모이어티 및/또는 세포-표면 분자 표적화 분자의 아미노산 잔기에 공유 결합된다.
일 구현예는 본 발명의 접합체이며, 여기서 적어도 하나의 사포닌의 C-3베타-OH기에서의 카보하이드레이트 치환체에서의 글루쿠론산 작용은 링커 1-[비스(디메틸아미노)메틸렌]-1H-1,2,3-트리아졸로[4,5-b]피리디늄 3-옥시드 헥사플루오로포스페이트에 공유 커플링되며, 이 링커는 아미드 결합을 통해 적어도 하나의 이펙터 모이어티 및/또는 세포-표면 분자 표적화 분자의 아민기, 예컨대 적어도 하나의 이펙터 모이어티 및/또는 세포-표면 분자 표적화 분자의 N-말단 또는 라이신의 아민기에 공유 커플링된다.
일 구현예는 본 발명의 접합체이며, 여기서 적어도 하나의 사포닌은 세포-표면 분자 표적화 분자 및/또는 적어도 하나의 이펙터 모이어티에 직접 또는 적어도 하나 링커 예컨대 2작용성 링커, 예를 들어, N-ε-말레이미도카프로산 히드라지드에 기초한 및/또는 1-[비스(디메틸아미노)메틸렌]-1H-1,2,3-트리아졸로[4,5-b]피리디늄 3-옥시드 헥사플루오로포스페이트에 기초한 2작용성 링커, 또는 3작용성 링커, 예컨대 스킴 II 및 구조 B의 3작용성 링커를 통해 공유 결합된다.
일 구현예는 본 발명의 접합체이며, 여기서 3작용성 링커는 적어도 하나의 사포닌이 공유 결합된 제2 화학기, 세포-표면 분자 표적화 분자에 대한 공유 결합을 위한 제3 화학기 및 적어도 하나의 이펙터 모이어티에 대한 공유 결합을 위한 제1 화학기를 포함하며, 바람직하게는 3작용성 링커는 스킴 II 및 구조 B의 3작용성 링커이다.
일 구현예는 본 발명의 접합체이며, 여기서 적어도 하나의 사포닌은 세포-표면 분자 표적화 분자 및 적어도 하나의 이펙터 모이어티에 3작용성 링커를 포함하는 적어도 하나의 링커를 통해 공유 결합되며, 3작용성 링커에 세포-표면 분자 표적화 분자 및 적어도 하나의 이펙터 모이어티 모두가 결합되고, 바람직하게는 3작용성 링커는 스킴 II 및 구조 B의 3작용성 링커이다.
일 구현예는 본 발명의 스킴 Ⅱ 및 구조 B 및/또는 도 16의 3작용성 링커와 같은 본 발명의 3작용성 링커(tri-functional linker)이다.
일 구현예는 접합체, 예컨대 ADC 또는 AOC, 바람직하게는 본 발명의 적어도 하나의 사포닌을 포함하는 접합체, 본 발명에 따른 ADC-사포닌 접합체 및/또는 AOC-사포닌 접합체를 포함하는 접합체의 제조를 위한, 스킴 Ⅱ 및 구조 B의 3작용성 링커와 같은 본 발명에 따른 3작용성 링커의 용도이다.
일 구현예는 본 발명의 3작용성 링커를 포함하는 반제품(semi-finished product)이며, 여기서 본 발명에 따른 적어도 하나의 사포닌은 3작용성 링커에 공유 결합되고/거나 본 발명에 따른 하나 이상의 이펙터 모이어티는 직접적으로 또는 하나 이상의 링커를 통해 및/또는 본 발명의 적어도 하나의 올리고머 또는 폴리머 스캐폴드를 통해 3작용성 링커에 공유 결합되고, 여기서 링커는 바람직하게는 본 발명에 따른 절단 가능한 링커이고, 본 발명의 이펙터 모이어티는 바람직하게는 디안틴, 사포린 및/또는 바람직하게는 Quil-A, QS-21, QS-7, QS1861, SO1861, SA1641, GE1741 및 퀼라자 사포나리아의 수용성 사포닌 분획 중 임의의 하나 이상인 본 발명의 사포닌으로 부터 선택된 단백질 독소와 같은 독소이다.
일 구현예는 본 발명의 접합체이며, 여기서 적어도 하나의 링커는 적어도 하나의 절단 가능한(cleavable) 링커를 포함하며, 여기서 선택적으로 절단 가능한 링커는 산성, 환원성, 효소 또는 광-유도 조건 하에서 절단되며, 바람직하게는 절단 가능한 링커는 산성 조건 하에서 절단되는 히드라존 결합 또는 히드라지드 결합 및/또는 단백질 분해(proteolysis), 예를 들어 카셉신 B에 의해 단백질 분해에 민감한 결합, 및/또는 환원성 조건 하에서 절단에 민감한 결합, 예컨대 디설파이드 결합으로부터 선택되는 절단 가능한 결합을 포함한다.
일 구현예는 본 발명의 접합체이며, 여기서 적어도 하나의 링커는 적어도 하나의 절단 가능한 링커를 포함하며, 여기서 절단 가능한 링커는 포유류 세포, 바람직하게는 인간 세포의 엔도좀 및/또는 리소좀에 존재하는 산성 조건, 바람직하게는 pH 4.0-6.5, 그리고 보다 바람직하게는 pH ≤ 5.5 하에서 생체내(in vivo)에서 절단된다.
일 구현예는 본 발명의 접합체이며, 여기서 적어도 하나의 사포닌은 라이신 측쇄에 공유 결합되어 아미드 결합을 형성하고 및/또는 시스테인 측쇄에 공유 결합되어 티오-에테르 링키지 또는 디설파이드 결합을 형성하고, 여기서 라이신 및/또는 시스테인은 세포-표면 분자 표적화 분자에 의해 포함되고/되거나 적어도 하나의 이펙터 모이어티에 의해 포함되며, 여기서 적어도 하나의 사포닌은 라이신 및/또는 시스테인에 직접 결합되거나, 선택적으로 절단 가능한 링커 및/또는 3작용성 링커, 예컨대 스킴 Ⅱ 및 구조 B의 3작용성 링커를 포함하는 적어도 하나의 링커를 통해 결합된다.
일 구현예는 본 발명의 접합체이며, 여기서 링커는 N-ε-말레이미도카프로산 히드라지드에 기초한 및/또는 1-[비스(디메틸아미노)메틸렌]-1H-1,2,3-트리아졸로[4,5-b]피리디늄 3-옥시드 헥사플루오로포스페이트에 기초한 것, 3작용성 링커, 예컨대 스킴 Ⅱ 및 구조 B의 3작용성 링커, 절단 가능한 링커이며, 및/또는 디설파이드 결합, 티오-에테르 결합, 아미드 결합, 히드라지드 결합 중 임의의 하나 이상을 포함한다.
일 구현예는 본 발명의 접합체이며, 여기서 적어도 하나의 사포닌은 세포-표면 분자 표적화 분자 및/또는 적어도 하나의 이펙터 모이어티에 적어도 하나 링커를 통해 공유 결합되며, 여기서 링커는 폴리머 또는 올리고머 구조를 포함하며 스캐폴드를 세포-표면 분자 표적화 분자 및/또는 적어도 하나의 이펙터 모이어티에 공유 커플링하기 위한 적어도 하나의 제4 화학기를 추가로 포함하는 스캐폴드이거나 이를 포함한다.
일 구현예는 본 발명의 접합체이며, 여기서 적어도 하나의 사포닌은 스캐폴드의 폴리머 또는 올리고머 구조에 절단 가능한 결합 및/또는 절단 불가능한 결합(non-cleavable bond)을 통해 공유 결합된다.
일 구현예는 본 발명의 접합체이며, 여기서 절단 가능한 결합은 산성 조건, 환원성 조건, 효소 조건 및 광-유도 조건 중 임의의 조건 하에서 절단되며, 바람직하게는 절단 가능한 결합은 산성 조건 하에서 절단되는 히드라존 결합 또는 히드라지드 결합 및/또는 단백질 분해(proteolysis), 예를 들어 카셉신 B에 의한 단백질 분해에 민감한 결합, 및/또는 환원성 조건 하에서 절단에 민감한 결합, 예컨대 디설파이드 결합을 포함한다.
일 구현예는 본 발명의 접합체이며, 여기서 절단 가능한 결합은 포유류 세포, 바람직하게는 인간 세포의 엔도좀 및/또는 리소좀에 존재하는 산성 조건, 바람직하게는 pH 4.0-6.5, 그리고 보다 바람직하게는 pH ≤ 5.5 하에서 생체내(in vivo)에서 절단된다.
일 구현예는 본 발명의 접합체이며, 여기서 적어도 하나의 사포닌은 이민 결합, 히드라존 결합, 히드라지드 결합, 옥심 결합, 1,3-디옥솔란 결합, 디설파이드 결합(disulphide bond), 티오-에테르 결합, 아미드 결합, 펩티드 결합 또는 에스테르 결합 중 임의의 하나 이상을 통해, 바람직하게는 적어도 하나 링커를 통해, 스캐폴드의 폴리머 또는 올리고머 구조에 공유 결합된다.
일 구현예는 본 발명의 접합체이며, 여기서 적어도 하나의 사포닌은 스캐폴드의 폴리머 또는 올리고머 구조에 이민 결합, 히드라존 결합, 및 히드라지드 결합 중 임의의 하나 이상을 통해 공유 결합되며, 이 결합은 바람직하게는 본 발명에 따라 절단될 수 있으며, 여기서 바람직하게는 적어도 하나의 사포닌은 스캐폴드의 폴리머 또는 올리고머 구조에 적어도 하나의 사포닌의 위치 C-23에서의 알데히드 작용을 통해 공유 결합된다.
일 구현예는 본 발명의 접합체이며, 여기서 적어도 하나의 사포닌의 위치 C-23에서의 알데히드 작용은 링커 N-ε-말레이미도카프로산 히드라지드에 공유 커플링되며, 이 링커는 스캐폴드의 폴리머 또는 올리고머 구조의 설프하이드릴기(sulfhydryl group), 예컨대 시스테인의 설프하이드릴기에 티오-에테르 결합을 통해 공유 커플링된다.
일 구현예는 본 발명의 접합체이며, 여기서 적어도 하나의 사포닌은 스캐폴드의 폴리머 또는 올리고머 구조에 아미드 결합을 통해 공유 결합되며, 여기서 바람직하게는 적어도 하나의 사포닌은 스캐폴드의 폴리머 또는 올리고머 구조에, 존재하는 경우에, 적어도 하나의 사포닌의 C-3베타-OH기에서의 카보하이드레이트 치환체에서의 글루쿠론산 작용을 통해 공유 결합된다.
일 구현예는 본 발명의 접합체이며, 여기서 적어도 하나의 사포닌의 C-3베타-OH기에서의 카보하이드레이트 치환체에서의 글루쿠론산 작용은 링커 1-[비스(디메틸아미노)메틸렌]-1H-1,2,3-트리아졸로[4,5-b]피리디늄 3-옥시드 헥사플루오로포스페이트에 공유 커플링되며, 이 링커는 아미드 결합을 통해 스캐폴드의 폴리머 또는 올리고머 구조의 아민기, 예컨대 스캐폴드의 폴리머 또는 올리고머 구조의 N-말단 또는 라이신의 아민기에 공유 커플링된다.
일 구현예는 본 발명의 접합체이며, 여기서 적어도 하나의 사포닌은 스캐폴드의 폴리머 또는 올리고머 구조에 공유 결합되며, 존재하는 경우에, 공유 결합에 적어도 하나의 사포닌의 위치 C-23에서의 알데히드 작용이 수반되고 및/또는 존재하는 경우에, 공유 결합에 적어도 하나의 사포닌의 C-3베타-OH기에서의 카보하이드레이트 치환체에서의 글루쿠론산 작용이 수반된다.
일 구현예는 본 발명의 접합체이며, 여기서 스캐폴드를 세포-표면 분자 표적화 분자 및/또는 적어도 하나의 이펙터 모이어티에 공유 커플링하기 위한 스캐폴드의 적어도 하나의 제4 화학기는 클릭 화학기이며, 바람직하게는 테트라진, 아지드, 알켄 또는 알킨, 또는 이들 기의 시클릭 유도체(cyclic derivative) 중 임의의 하나 이상으로부터 선택되며, 바람직하게는 아지드기이다.
일 구현예는 본 발명의 접합체이며, 여기서 스캐폴드의 폴리머 또는 올리고머 구조는 선형, 분지형 및/또는 고리형 폴리머, 올리고머, 덴드리머, 덴드론, 덴드론화 폴리머, 덴드론화 올리고머, DNA, 폴리펩티드, 폴리-라이신, 폴리에틸렌 글리콜, 또는 이들 폴리머 또는 올리고머 구조의 어셈블리를 포함하며, 이 어셈블리는 바람직하게는 공유 가교에 의해 구축된다.
일 구현예는 본 발명의 접합체이며, 여기서 적어도 하나의 사포닌은 정의된 수의 사포닌 또는 정의된 범위의 사포닌, 바람직하게는 1-128개의 사포닌 또는 적어도 2, 3, 4, 5, 6, 8, 10, 16, 32, 64 또는 128개의 사포닌, 또는 그 사이의 임의의 수의 사포닌, 예컨대 7, 9, 12개의 사포닌이다.
일 구현예는 본 발명의 접합체이며, 여기서 접합체는 적어도 하나의 이펙터 모이어티 및/또는 세포-표면 분자 표적화 분자의 아미노산 잔기에 직접 그리고 바람직하게는 적어도 하나의 이펙터 모이어티의 아미노산 잔기를 통해, 바람직하게는 시스테인 및/또는 라이신에 공유 결합되고, 및/또는, 청구항 28 내지 40 중 어느 한 항의 적어도 하나의 링커 및/또는 적어도 하나의 절단 가능한 링커 및/또는 적어도 하나의 폴리머 또는 올리고머 스캐폴드, 바람직하게는 1-8개의 이러한 스캐폴드 또는 2-4개의 이러한 스캐폴드를 통해 공유 결합되는, 하나 보다 많은 사포닌, 바람직하게는 2, 3, 4, 5, 6, 8, 10, 16, 32, 64 또는 1-100개의 사포닌, 또는 이들 사이의 임의의 수의 사포닌, 예컨대 7, 9, 12개의 사포닌을 포함하며, 여기서 1-32개의 사포닌, 바람직하게는 2, 3, 4, 5, 6, 8, 10, 16 또는 32개의 사포닌, 또는 이들 사이의 임의의 수의 사포닌, 예컨대 7, 9, 12개의 사포닌은 적어도 하나의 스캐폴드에 공유 결합된다.
일 구현예는 본 발명의 접합체이며, 여기서 적어도 하나의 사포닌은 세포-표면 분자 표적화 분자 및 적어도 하나의 이펙터 모이어티에 3 작용성 링커를 통해 공유 결합되며, 3 작용성 링커는 직접 또는 링커 예컨대 절단 가능한 링커 및/또는 폴리머 또는 올리고머 구조를 포함하는 스캐폴드를 통해 공유 결합된 적어도 하나의 사포닌을 갖는 제2 화학기 및 3 작용성 링커에 스캐폴드를 공유 커플링하기 위한 본 발명에 따른 제4 화학기를 포함하며, 3 작용성 링커는 세포-표면 분자 표적화 분자에 대한 공유 결합을 위한 제3 화학기를 추가로 포함하고 적어도 하나의 이펙터 모이어티에 대한 공유 결합을 위한 제1 화학기를 포함하며, 여기서 세포-표면 분자 표적화 분자는 제3 화학기에 결합되고 및/또는 적어도 하나의 이펙터 모이어티는 제1 화학기에 결합되고, 바람직하게는 제3 작용성 링커는 스킴 Ⅱ 및 구조 B의 제3 작용성 링커이다.
본 발명에 따르면, 전형적으로 사포닌은 표 A1, 스킴 I에 열거된 사포닌이다. 사포닌이 히드라존 결합, 및/또는 히드라지드 결합, 및/또는 디설파이드 결합을 수반하여 세포-표면 분자 표적화 분자에 공유 커플링되는 경우(직접적으로 또는 간접적으로 이펙터 모이어티에 대한 제1 결합을 통해, 이펙터 모이어티는 세포-표면 분자 표적화 분자에 직접 커플링된다)에, 세포 내로의 진입 및 본 발명의 접합체의 세포-표면 분자 표적화 분자에 공유 결합된 이펙터 모이어티의 사이토솔 내부에의 축적이 고려되는 경우, 사포닌의 활성, 예를 들어, 세포 내부의 엔도좀 탈출 증진 활성에 유익한 것으로 입증되었다. 이러한 결합 유형은 포유류 세포, 예를 들어 인간 세포의 (후기) 엔도좀 및 리소좀 내부의 산성 조건 하에서, 및/또는 환원성 조건 하에서 쉽게 절단된다. 대안적으로, 본 발명자는 또한, 예를 들어, (후기) 엔도좀, 리소좀, 사이토솔과 같은 세포 내부의 생리학적 조건 하에서 쉽게 절단될 수 없는 결합을 통한 세포-표면 분자 표적화 분자에 대한 사포닌의 공유 커플링이 예를 들어, 핵산(예, BNA 침묵 HSP27)과 같은 이펙터 모이어티 및 사포린과 같은 단백질성 독소의 생물학적 효과에 대한 사포닌의 강화 활성에 또한 유익하다는 것을 입증한다. 이러한 결합의 예는 직접적으로 또는 (절단 가능한) 링커를 통해 및/또는 올리고머 또는 폴리머 스캐폴드를 통해 사포닌을 라이신 측쇄에 커플링하기 위한 아미드 결합이다. 청구범위를 포함하는 출원서 전체에 걸쳐, 본 발명의 접합체, 예를 들어, 링커를 통해 및/또는 히드라존 결합 또는 디설파이드 결합을 통한 스캐폴드를 통해 세포-표면 분자 표적화 분자에 커플링된 사포닌을 갖는 스캐폴드를 선택적으로 포함하는 접합체가 언급되는 경우에, 예를 들어, (후기) 엔도좀 및/또는 리소좀에서 이러한 결합 또는 링커의 절단의 문맥에서, 용어 '절단 가능한 링커', '절단 가능한 결합' 등은 또한 '불안정한 링커(labile linker)'('L') 및 '불안정한 결합(labile bond)'으로 지칭된다. 예를 들어, 도 2 및 도 3은 마우스에서 인간 종양의 생체내 HSP27 유전자 침묵을 나타낸다. 종양-함유 마우스는 본 발명에 따른 불안정한 링커(히드라존 결합)를 통해 결합된 사포닌을 갖는 모노클로날 항체로 구성된 본 발명의 접합체 및 디설파이드 결합을 통해 모노클로날 항체에 공유 커플링된, 종양 세포에서 HSP27 유전자를 침묵시키기 위한 안티센스 BNA로 처리되었다. 즉, 임의의 이론에 의한 제한없이, 히드라존 결합 및 디설파이드 결합은, 본 발명의 접합체가 예를 들어 엔도사이토시스에 의해 내재화되면, 세포 표면에서 표적화된 세포-표면 분자, 여기서는 EGFR 상에서 에피토프를 발현하는 표적화된 종양 세포의 (후기)엔도좀 및/또는 리소좀에서 절단된다. 상기 결합의 절단은 엔도좀 및/또는 리소좀으로부터의 BNA가 사이토솔 내로 진입하는 것이 고려될 경우, 사포닌의 엔도좀 탈출 증진 활성에 기여할 가능성이 있지만, 이러한 절단은 본 발명의 세툭시맙-S01861-BNA 접합체의 유전자 침묵 효과를 관찰하기에 위해 필수적인 것은 아니다.
당업자는 3-작용성 링커가 1개, 2개 또는 3개의 사포닌 모이어티를 공유 커플링하는데 적합한 본 발명의 스캐폴드임을 이해할 것이다. 1개 또는 2개의 사포닌 모이어티의 3-작용성 링커 공유 커플링이 바람직하다. 제2 및/또는 제3 결합 부위는 예를 들어 세포-표면 분자 표적화 분자와 같은 단백질성 리간드를 공유 커플링하는데 적합하다. 전형적인 단백질성 리간드는 세포 표면에서 EGFR을 발현하는 (종양)세포를 표적화하는 EGF, 및 종양 세포 또는 자가면역 세포를 표적화하는 사이토카인이다. 또한, 3-작용성 링커의 제2 또는 제3 결합 부위는 종양 세포 표면 분자, 바람직하게 종양-세포 특이적 분자, 보다 바람직하게 종양 세포의 표면에서 특이적으로 (과-)발현되는 종양 세포 수용체와 같은 세포 표면 분자에 대한 결합을 위한 면역 글로불린, 예컨대 모노클로날 항체, 즉, 세포-표면 분자 표적화 분자의 공유 커플링에 적합하다. 유사하게, 면역 글로불린, 또는 면역 글로불린의 결합 특이성을 포함하는 이의 임의의 단편(들) 및/또는 도메인(들)은 자가면역 세포의 표면에서 발현되는 수용체와 같은 세포 표면 분자에 대한 결합에 적합하다. 따라서, 일 구현에서, 본 발명의 접합체는 3-작용성 링커를 포함하며, 상기 링커는 공유 결합된 사포닌, 예를 들어, QS-21, SO1861 및 공유 결합된 세포-표면 분자 표적화 분자, 예컨대 종양 세포, 자가면역 세포, 병든 세포, 비정상 세포, 건강하지 않은 세포, B 세포 질환에 대한 (특이적) 결합을 위한 리간드 또는 항체와 같은 세포 표적화 모이어티를 포함하거나 이로 구성된다.
일 구현예는 스킴 Ⅱ에 따른, 스캐폴드 코어 구조체로서 올리고머 3작용성 링커를 포함하는 본 발명의 접합체이다:
여기서, 사포닌 및 이펙터 모이어티는 불안정한, 절단 가능한 히드라존 링커(산 민감성)를 통해 및/또는 결합을 포함하는 말레이미드를 통해 3작용성 링커 스캐폴드에 공유 결합되어 있는 반면, 항체와 같은 세포-표면 분자 표적화 분자에 대한 스캐폴드의 결합은 불안정한, 절단 가능한 히드라존 링커(산 민감성)를 통해 및/또는 1, 2, 3 또는 4개의 시스테인과 같은 결합 부위에서 시스테인과의 결합을 포함하는 말레이미드를 통해 확립되어, 구조 B를 형성한다:
1-4개의 스캐폴드가 단일의 세포-표면 분자 표적화 분자, 예를 들어 모노클로날 항체와 같은 항체에 공유 결합된다.
일 구현예는 본 발명의 접합체로서, 여기서 사포닌과 세포-표면 분자 표적화 분자 사이의 결합은 바람직하게는 pH 7.4에서 안정한 산-불안정성 결합을 통해 일어나며, 바람직하게 pH 6.5 미만, 보다 바람직하게는 pH 6.5 내지 5.0 사이에서 사포닌을 방출한다. 이는, 예를 들어,사포닌과 세포-표면 분자 표적화 분자를 연결하는 링커의 아미노기 및 사포닌의 알데히드기에 의해 형성된 이민을 통해 실현된다. pH-조건을 충족시키는 다른 화학적 결합이 또한 알데히드 커플링, 예를 들어, 상기 링커의 작용기로서 히드라지드 및 히드록실기를 각각 필요로 하는 특정 히드라존 또는 아세탈에 대해 사용될 수 있다. 결합이 절단 가능한 결합인 경우, 사포닌은 바람직하게는 알데히드 작용을 통해 또는 사포닌의 카르복실기 중 하나를 통해, 보다 바람직하게는 알데히드 작용, 바람직하게는 위치 23의 알데히드 작용을 통해 스캐폴드의 폴리머 또는 올리고머 구조에 부착된다. 대안적으로, 사포닌은 바람직하게는 사포닌의 카르복실산 작용을 통해 또는 알데히드 작용을 통해 스캐폴드의 폴리머 또는 올리고머 구조를 연결하는 링커를 통해 스캐폴드의 폴리머 또는 올리고먼 구조를 통해 세포-표면 분자 표적화 분자에 부착된다.
일 구현예는 본 발명의 세포-표면 분자 표적화 분자로서, 여기서 적어도 하나의 사포닌은 안정한 결합을 통해 세포-표면 분자 표적화 분자에 결합된다. 보다 바람직한 구현예에서, 사포닌과 세포-표면 분자 표적화 분자 사이의 안정한 결합은 바람직하게는 아미드 커플링 또는 아민 형성을 통해 일어난다. 이는 예를 들어 사포닌 및 세포-표면 분자 표적화 분자를 함께 연결하는 폴리머 또는 올리고머 스캐폴드 구조의 아미노기에 의한 카르보디이미드 매개 아미드 결합 형성, 및 사포닌의 활성화된 글루쿠론산기를 통해 실현된다. 안정한 결합 정의를 충족시키는 화학적 결합은 또한 예를 들어, 링커 또는 스캐폴드의 폴리머 또는 올리고머 구조의 작용기로서 일차 아미노기를 필요로 하는 환원성 아민화 후 유도된 특정 아민과 같은 알데히드 커플링에 사용될 수 있다. 결합이 안정한 결합인 경우, 사포닌은 바람직하게는 세포-표면 분자 표적화 분자에 추가로 연결된 스캐폴드 또는 링커, 사포닌의 카르복실기 중 하나를 통해 링커 또는 스캐폴드에 부착된다.
일 구현예는 본 발명의 접합체이며, 여기서 사포닌은 본 발명에 따른 스캐폴드를 통해 세포-표면 분자 표적화 분자에 커플링되고, 여기서 결합 부위에 대한 스캐폴드의 공유 커플링을 위한 화학기는 클릭 화학기(click chemistry group)이다.
일 구현예는 본 발명의 접합체이며, 여기서 사포닌은 본 발명에 따른 스캐폴드를 통해 세포-표면 분자 표적화 분자에 커플링되며, 여기서 클릭 화학기는 테트라진, 아지드, 알켄 또는 알킨, 또는 이들 기들 중 임의의 것의 사이클릭 유도체, 바람직하게는 아지드이다. 클릭 화학기는 클릭 화학에 적합한 기능적 화학기이며, 클릭 화학은 모듈식이며, 범위가 넓은 반응으로서 매우 높은 수율을 제공하며, 해롭지 않은 부산물만을 생성하며, 고 선택성을 제공하며, 다른 작용기에 비해 높은 용인성(tolerance)을 제공하며, 입체특이적인 것으로 정의된다. 요구되는 프로세스 특성은 간단한 반응 조건, 용이하게 이용가능한 출발 물질 및 시약, 용매의 불사용 또는 유순(benign)(예컨대 물)하거나 쉽게 제거되는 용매의 사용, 간단한 생성물 분리를 포함한다. 선택적으로 스캐폴드 또는 링커를 통해 본 발명의 접합체에서 세포-표면 분자 표적화 분자에 사포닌을 커플링하기 위한 클릭 화학기는 바람직하게는 테트라진, 아지드, 알켄 또는 알킨, 또는 이들의 반응성 유도체, 예컨대 메틸-테트라진 또는 말레이미드(알켄), 보다 바람직하게는 알킨, 또는 이들 기의 사이클릭 유도체, 예컨대 사이클로옥틴(cyclooctyne)(예, 아자-디벤조사이클로옥틴, 디플루오로시클로옥틴, 비사이클로[6.1.0]논-4-인, 디벤조사이클로옥틴)이다.
따라서, 본 발명에 따른 접합체는 적어도 하나의 사포닌을 포함한다. 이러한 맥락에서 "적어도 하나"는, 접합체가 하나의 사포닌 분자를 포함하지만, 몇개의 사포닌(예, 2, 3 또는 4개) 또는 다수의 사포닌(예, 10, 20 또는 100개)을 포함할 수도 있음을 의미한다. 적용에 따라, 접합체는 공유 결합된 사포닌을 갖는 공유 결합된 스캐폴드를 포함할 수 있으며, 여기서 스캐폴드는 정의된 수의 사포닌을 포함하도록 설계될 수 있다. 바람직하게는, 본 발명에 따른 접합체는 무작위의 수 보다는 규정된 수 또는 범위의 사포닌을 포함한다. 이는 특히 마케팅 인가(marketing authorization)와 관련하여 약물 개발에 유리하다. 이와 관련하여 규정된 수는 접합체가 사전에 규정된 수의 사포닌을 포함하는 것이 바람직함을 의미한다. 이는 예를 들어 부착시키기 위한 사포닌(들)에 대한 특정 수의 가능한 모이어티를 갖는 폴리머 구조를 포함하는 스캐폴드를 설계함으로써 달성된다. 이상적인 환경하에서, 이들 모이어티 모두는 사포닌 및 스캐폴드에 커플링되어, 사전에 규정된 수의 사포닌을 포함한다. 예를 들어, 2개, 4개, 8개, 16개, 32개, 64개 등의 사포닌을 포함하는 스캐폴드의 표준 세트를 제공하여 최적의 수가 사용자의 필요에 따라 사용자에 의해 용이하게 시험될 수 있도록 하는 것이 구상된다. 일 구현예는 본 발명의 스캐폴드를 포함하는 본 발명의 접합체이며, 여기서 사포닌은 규정된 범위로 존재하며, 예를 들어, 비-이상적인 상황 하에서, 폴리머 구조에 존재하는 모든 모이어티가 사포닌과 결합하는 것은 아니다. 이러한 범위는 예를 들어 스캐폴드 당 2-4개의 사포닌 분자, 스캐폴드 당 3-6개의 사포닌 분자, 스캐폴드 당 4-8 사포닌 분자, 스캐폴드 당 6-8개의 사포닌 분자, 스캐폴드 당 6-12개의 사포닌 분자 등일 수 있다. 이러한 경우, 본 발명에 따른 스캐폴드를 포함하는 접합체는 이에 따라 상기 범위가 2-4로 규정되는 경우 2, 3 또는 4개의 사포닌을 포함한다.
스캐폴드(scaffold)는 근본적으로 스캐폴드에 공유 결합된 사포닌의 유형과 독립적이며, 스캐폴드는 접합체에 후속적으로(순차적인 순서로) 공유 커플링된다. 따라서, 스캐폴드를 포함하는 접합체는 새로운 플랫폼 기술에 대한 기초(basis) 생성물이다. 적어도 하나의 공유 결합된 사포닌은 본 발명의 접합체에 의해 포함된 세포-표면 분자 표적화 분자에 결합된 이펙터 모이어티의 세포내 전달을 매개하기 때문에, 본 발명에 따른 스캐폴드 기술은 사포닌에 의한 제어된 세포내 이펙터 모이어티 전달을 매개하는 것으로 알려진 첫번째 시스템이다. 스캐폴드는 단일 및 규정된 위치에서 접합체에 의해 포함되는 세포-표면 분자 표적화 분자, 예를 들어 리간드, 항체 등과 및 사포닌(들)에 연결될 수 있는 최적화된 그리고 기능적으로 활성인 유닛(unit)를 제공한다.
일 구현예는 본 발명에 따른 스캐폴드를 포함하는 접합체이며, 여기서 폴리머 또는 올리고머 구조의 모노머의 수는 정확하게 규정된 수 또는 범위이다. 바람직하게는, 폴리머 또는 올리고머 구조는 구조, 예컨대 폴리(아민), 예를 들어, 폴리에틸렌이민 및 폴리(아미도아민), 또는 구조, 예컨대 폴리에틸렌 글리콜, 폴리(에스테르), 예컨대 폴리(락타이드), 폴리(락탐), 폴리락타이드-코-글리콜라이드 코폴리머, 폴리(덱스트린), 또는 펩티드 또는 단백질, 또는 구조, 예컨대 천연 및/또는 인공 폴리아미노산, 예를 들어, 선형, 분지형 또는 고리형 폴리머인 PNA(펩티드 핵산) 폴리머, 안정화된 RNA 폴리머, DNA 폴리머, 또는 폴리-라이신, 올리고머, 덴드리머, 덴드론, 덴드론화 폴리머, 덴드론화 올리고머 또는 이러한 구조의 어셈블리를 포함하며, 순수하거나 혼합된다. 바람직하게, 폴리머 또는 올리고머 구조는 생체적합성(biocompatible)이며, 여기서 생체적합성이란 폴리머 또는 올리고머 구조가 유기체에서 실질적인 급성 또는 만성 독성을 나타내지 않으며, 그대로 배설되거나 또는 신체 대사에 의해 완전히 분해되어 배설될 수 있고/있거나 생리학적 화합물로 분해될 수 있는 것을 의미한다. 어셈블리는 공유 가교 또는 비공유 결합 및/또는 인력(attraction)에 의해 구축될 수 있다. 따라서, 이들은 또한 나노겔, 마이크로겔 또는 하이드로겔을 형성할 수 있거나, 또는 이들은 담체, 예컨대 콜레스테롤 및/또는 인지질을 포함하는 입자-유사 구조, 무기 나노입자, 콜로이드, 리포좀, 미셀에 부착될 수 있다. 상기 폴리머 또는 올리고머 구조는 바람직하게는 글리코시드 분자 (및/또는 이펙터 분자 및/또는 담체 분자, 예컨대 리간드, 모노클로날 항체 또는 이의 단편)의 커플링을 위한 정확하게 규정된 수 또는 범위의 커플링 모이어티를 갖는다. 폴리머 또는 올리고머 구조에서의 정확하게 규정된 수 또는 범위의 커플링 모이어티의 바람직하게는 적어도 50%, 보다 바람직하게는 적어도 75%, 보다 바람직하게는 적어도 85%, 보다 바람직하게는 적어도 90%, 보다 바람직하게는 적어도 95%, 보다 바람직하게는 적어도 98%, 보다 바람직하게는 적어도 99%, 가장 바람직하게는 100%가 본 발명에 따른 스캐폴드의 글리코시드 분자에 의해 차지된다.
바람직하게, 덴드론은 포컬 포인트(focal point)라 불리는 나무(tree)의 기원에 단일의 화학적으로 어드레스할 수 있는(addressable) 기를 갖는 분지형의, 명확하게 정의된 나무 모양의(tree-like) 폴리머이다. 덴드리머(dendrimer)는 포컬 포인트에서 2개 이상의 덴드론이 연결된 것이다. 덴드론화 폴리머는 폴리머에 하나 이상의 덴드론의 포컬 포인트가 연결된 것이다. 바람직일 구현예에서, 본 발명에 따른 스캐폴드가 제공되며, 여기서 폴리머 또는 올리고머 구조는 선형, 분지형 또는 사이클릭 폴리머, 올리고머, 덴드리머, 덴드론, 덴드론화 폴리머(dendronized polymer), 덴드론화 올리고머 또는 이들 구조의 어셈블리를 순수 또는 혼합으로 포함하며, 여기서 어셈블리는 공유 가교 또는 비공유 인력에 의해 구축될 수 있고, 나노겔, 마이크로겔 또는 하이드로겔을 형성할 수 있고, 그리고 여기서, 바람직하게는, 폴리머는 폴리(아민)의 유도체, 예를 들어, 폴리에틸렌이민 및 폴리(아미도아민), 및 구조, 예컨대 폴리에틸렌 글리콜, 폴리(에스테르), 예컨대 폴리(락타이드), 폴리(락탐), 폴리락타이드-코-글리콜라이드 코폴리머, 및 폴리(덱스트린), 또는 구조 예컨대 천연 및/또는 인공 폴리아미노산, 예컨대 폴리-라이신, 또는 펩티드 또는 단백질, 또는 DNA 폴리머, 안정화된 RNA 폴리머 또는 PNA(펩티드 핵산) 폴리머이다. 바람직하게, 폴리머 또는 올리고머 구조는 생체적합성이다.
일 구현예는 본 발명에 따라 사용하기 위한 본 발명의 접합체이며, 여기서 접합체는 하나 보다 많은 공유 결합된 사포닌, 바람직하게는 2, 3, 4, 5, 6, 8, 10, 16, 32, 64, 128 또는 1-100개의 사포닌, 또는 이들 사이의 임의의 수의 사포닌, 예컨대 7, 9, 12개 또는 임의의 수로 포함한다.
일 구현예는 본 발명의 접합체이며, 여기서 적어도 하나의 사포닌은 본 발명에 따른 적어도 하나의 절단 가능한 링커를 통해 올리고머 또는 폴리머 스캐폴드의 폴리머 또는 올리고머 구조에 공유 결합된다.
일 구현예는 본 발명의 접합체이며, 여기서 접합체에서 상기 세포-표면 분자 표적화 분자의 아미노산 잔기에 대한 올리고머 또는 폴리머 스캐폴드의 공유 커플링을 위한, 올리고머 또는 폴리머 스캐폴드의 화학기는 클릭 화학기이고, 바람직하게는 테트라진, 아지드, 알켄 또는 알킨, 또는 이들 기의 사이클릭 유도체로부터 선택되고, 보다 바람직하게 상기 화학기는 아지드이다.
일 구현예는 본 발명의 접합체이며, 여기서 올리고머 또는 폴리머 스캐폴드의 폴리머 또는 올리고머 구조는 선형, 분지형 및/또는 시클릭 폴리머, 올리고머, 덴드리머, 덴드론, 덴드론화 폴리머, 덴드론화 올리고머, DNA, 폴리펩티드, 폴리-라이신, 폴리-에틸렌 글리콜, 또는 이들 폴리머 또는 올리고머 구조의 어셈블리를 포함하며, 이 어셈블리는 바람직하게는 공유 가교에 의해 구축된다.
본 발명자는 본 명세서에서 상기 어느 구현에 따른, 본 발명의 접합체에서 세포-표면 분자 표적화 분자에 대한 사포닌의, 바람직하게는 절단 가능한 결합 또는 링커를 통한, 공유 커플링이 상기 접합체에 의해 포함된 이펙터 모이어티의 활성의 효율적이고 세포-표적화된 강화작용을 제공함을 확인하였다. 모노클로날 항체와 같이, 접합체에서 세포-표면 분자 표적화 분자의 시스테인 측쇄 또는 라이신 측쇄에 사포닌을 직접적으로 또는 링커를 통해 커플링하는 것은, 또한, 이펙터 모이어티가 사포닌(들)이 또한 공유 결합된 바로 동일한 세포-표면 분자 표적화 분자를 사용하여 동일한 표적 세포로 전달되는 경우에, 표적 세포내에서 이펙터-모이어티 강화 작용 활성의 특이적이고 효율적인 전달의 유익한 방식인 것으로 입증되었다.
본 발명을 보다 상세하게 설명하기 위해, (임의의 이론에 의해 한정되는 것을 본 발명자들이 바라지 않음에도 불구하고) 물질의 세포 흡수의 프로세스 및 본 발명에 사용된 용어가 기술된다. 소포(vesicle) 버딩(budding)에 의한 세포내로의 세포외 물질의 흡수는 엔도사이토시스(endocytosis)라고 불린다. 상기 소포 버딩은 (1) 사이토졸 단백질 클라트린(cytosolic protein clathrin)에 의해 매개되는 수용체-의존성 리간드 흡수, (2) 콜레스테롤 결합 단백질 카베올린(caveolin)에 의해 매개되는 리피드-라프트(lipid-raft) 흡수(uptake), (3) 비특이적 유체 흡수(피노사이토시스), 또는 (4) 비특이적 입자 흡수(파고사이토시스)에 의해 특징지워질 수 있다. 소포 수송 및 물질 선별의 다음 세포 프로세스를 따르는 모든 유형의 엔도사이토시스는 엔도사이틱 경로(endocytic pathway)로 지칭된다. 엔도사이틱 경로는 복잡하고 완전히 이해되지 않는다. 임의의 이론에 구속되지 않고, 소기관(organelle)은 새로(de novo)로 형성될 수 있고, 엔도사이틱 경로를 따라 다음에 소기관으로 성숙될 수 있다. 그러나, 이제는 엔도사이틱 경로(endocytic pathway)가 소포성(vesicular) 트래픽에 의해 연결된 안정한 구획을 포함하는 것으로 가정된다. 구획(compartment)은 세포에 대한 필수 기능의 특정 세트에 특화된 복합, 다기능 막 소기관(organolle)이다. 소포(vesicle)는 과도적인 소기관(transient organelle)인 것으로 간주되고, 조성이 더 간단하고, 기존의 구획으로부터 버딩에 의해 새로(de novo) 형성하는 막-밀폐된 컨테이너로서 정의된다. 구획과 대조적으로, 소포는 생리적으로 비가역적인 일련의 생화학적 변화인 성숙을 겪을 수 있다. 초기 엔도좀 및 후기 엔도좀(late endosomes)은 엔도사이틱 경로에서 안정한 구획을 나타내지만, 일차 엔도사이틱 소포, 파고좀(phagosomes), 다소포체(multivesicular body)(또한 엔도좀 캐리어 소포(endosome carrier vesicles)라고도 함), 분비 그래뉼(secretory granules), 및 심지어 리소좀(solesomes)은 소포를 나타낸다. 클라트린-코팅된 피트(clathrin-coated pits)로부터 가장 두드러지게, 플라즈마막에서 발생하는 엔도사이틱 소포는 초기 엔도좀과 일차 융합되며, 이는 약 pH 6.5의 주요 분류 구획이다. 내재화된 카르고(cargo) 및 막의 대부분은 재순환 소포(재순환 경로)를 통해 원형질막으로 다시 재순환된다. 분해되어야 하는 성분은 다소포체(multivesicular body)를 통해 산성 후기 엔도좀(6 보다 낮은 pH)으로 수송된다. 리소좀은 성숙한 리소좀 효소를 저장할 수 있고, 필요한 경우 이들을 후기 엔도좀 구획에 전달할 수 있는 소포이다. 그 결과 형성된 소기관은 하이브리드 소기관 또는 엔도리소좀으로 불린다. 리소좀은 리소좀 재형성으로 지칭되는 프로세스에서 하이브리드 소기관을 버드 오프(bud off)시킨다. 후기 엔도좀, 리소좀 및 하이브리드 소기관은 매우 동역학적 소기관이며, 그들 사이의 구별은 종종 어렵다. 엔도사이토시스된(endocytosed) 분자의 분해는 엔도리소좀 또는 리소좀 내부에서 일어난다. 엔도좀 탈출은 엔도사이틱 경로로부터, 바람직하게는 클라트린-매개 엔도사이토시스로부터, 또는 사이토졸로의 재순환 경로로부터, 어느 종류의 구획 또는 소포의 내부강(inner lumen)으로부터의 물질의 능동적 또는 수동적 방출이다. 따라서, 엔도좀 탈출은 이들의 중간체 및 하이브리드 소기관을 포함하는 엔도좀, 엔도리소좀(endolysosome) 또는 리소좀으로부터의 방출을 포함하지만 이에 제한되지 않는다.
달리 구체적으로 명시되지 않는 한, 특히 본 발명의 사포닌과 같은 글리코시드 분자의 엔도좀 탈출 메커니즘에 관한 경우, 본원에 단어 "엔도좀" 또는 "엔도좀 탈출(endosomal escape)"이 사용될 때마다, 이는 또한 각각 엔도리소좀 및 리소좀, 그리고 엔도리소좀 및 리소좀으로부터의 탈출을 포함한다. 사이토졸에 진입 후, 상기 물질은 핵과 같은 다른 세포 유닛으로 이동할 수 있다.
정식 용어에서, 글리코시드는 당기가 이의 아노머(anomeric) 탄소를 통해 다른 기에 글리코시드 결합을 통해 결합된 임의의 분자이다. 본 발명의 맥락에서, 사포닌과 같은 글리코시드 분자는, 임의의 이론에 구속되지 않고, 특히 이펙터 모이어티의 엔도좀 탈출을 용이하게 함으로써, 이펙터 모이어티의 효과를 더욱 향상시킬 수 있는 그러한 분자이다. 임의의 이론에 의해 구속되지 않고, 글리코시드 분자(표 A1에 열거된 것들과 같은 사포닌)은 엔도사이틱 및 재순환 경로의 구획 및 소포의 막과 상호작용하고, 이들을 상기 이펙터 모이어티에 대해 누출되도록 하여, 증가된 엔도좀 탈출을 초래한다. 용어 "스캐폴드는 이펙터 모이어티의 엔도좀 탈출을 증가시킬 수 있다"는 것은 스캐폴드의 폴리머 또는 올리고머 구조를 통해 또는 세포-표면 분자 표적화 분자에 직접 또는 링커를 통해 커플링된 적어도 하나의 사포닌(글리코시드 분자)이, 두 분자 모두 엔도좀, 예를 들어, 후기 엔도좀에 있는 경우, 이펙터 모이어티의 엔도좀 탈출을 증가시킬 수 있음을 의미하며, 선택적으로 그리고 바람직하게 사포닌과 같은 적어도 하나의 글리코시드가 접합체에 의해 포함된 링커 또는 폴리머 또는 올리고머 구조로부터와 같은 접합체로부터, 예를 들어, 적어도 하나의 글리코시드(사포닌)와 접합체 사이의 절단 가능한 결합의 절단에 의해(예, 스캐폴드의 폴리머 또는 올리고머 구조를 통해 및/또는 링커를 통해) 방출된 후에, 이펙터 모이어티의 엔도좀 탈출을 증가시킬 수 있음을 의미한다. 본 발명에 따른 사포닌과 같은 적어도 하나의 글리코시드와 본 발명의 접합체의 세포-표면 분자 표적화 분자 사이의 결합, 선택적으로 링커 또는 스캐폴드를 통한, 결합이 "안정한 결합"일 수 있으나, 이는 이러한 결합이 예를 들어 효소에 의한 엔도좀에서 절단될 수 없다는 것을 의미하는 것은 아니다. 예를 들어, 글리코시드 또는 사포닌, 선택적으로 링커 또는 스캐폴드의 올리고머 또는 폴리머 구조의 일부와 함께 글리코시드 또는 사포닌은 남아있는 링커 단편 또는 올리고머 또는 폴리머 구조로부터 절단될 수 있다. 예를 들어, 프로테아제는 (단백질성) 링커 또는 단백질성 폴리머 구조, 예를 들어 알부민을 절단하고, 이에 의해 적어도 하나의 글리코시드, 사포닌을 방출시킬 수 있다. 그러나, 바람직하게는 글리코시드 분자 (바람직하게는 사포닌)는 활성 형태로 방출되며, 바람직하게는 선택적으로 링커 및/또는 올리고머 또는 폴리머 스캐폴드를 통해 접합체의 세포-표면 분자 표적화 분자에 커플링되기(결합되도록 제조되기) 전에 가지고 있었던 원래 형태로 방출되며; 따라서, 글리코시드(사포닌)는 이러한 절단 후에 그의 본래 구조를 가지거나, 또는 글리코시드(사포닌)는 이러한 절단 후, 이에 결합된 화학기 또는 링커(의 일부)를 가지며, 반면에 글리코시드 생물학적 활성 (사포닌 생물학적 활성), 예를 들어, 동일한 엔도좀 또는 리소좀에 존재하는 이펙터 모이어티에 대한 엔도좀/리소좀 탈출 증진 활성은, 글리코시드(사포닌)와 선택적으로 본 발명의 링커 및/또는 스캐폴드를 포함하는 세포-표면 분자 표적화 분자, 예를 들어 항체 사이의 결합의 상기 절단시 유지되거나 복원된다. 본 발명과 관련하여, 예를 들어 접합체에서 사포닌과 세포-표면 분자 표적화 분자의 아미노산 잔기, 링커, (스캐폴드의) 폴리머 또는 올리고머 구조, 리간드, (모노클로날) 면역글로불린 또는 이의 결합 도메인 또는 -단편, 및/또는 이펙터(이펙터 모이어티, 이펙터 분자) 사이의 결합과 관련된 용어 "안정한"은, 그 결합이 쉽게 파괴되지 않거나 또는 적어도 예를 들어 pH 차이, 염 농도, 또는 UV-광, 환원성 조건에 의해 쉽게 파괴되도록 설계되는 않는 것을 의미한다. 본 발명에 있어서, 예를 들어 사포닌과 세포-표면 분자 표적화 분자, 링커, 아미노산 잔기, 스캐폴드의 폴리머 또는 올리고머 구조, 리간드, 항체 및/또는 이펙터 사이의 결합과 관련하여 "절단 가능한(cleavable)"이란 용어는, 그 결합이 예를 들어, pH 차이, 염 농도, 환원성 조건 등에 의해 쉽게 파괴되도록 설계되는 것을 의미한다. 당업자는 이러한 절단 가능한 결합 및 이를 제조하는 방법을 잘 알고 있다.
본 발명 이전에 ADC 및 AOC를 시장에 도입하는 것의 주요 장애물 중 하나는 작은 치료 윈도우였다: ADC 또는 AOC의 치료 유효 투여량은 ADC로 환자의 치료시에 (수용할 수 없는) 부작용, 발달 및 영향 저해(hampering development and implication)를 수반한다. 본 발명의 접합체, 예컨대 ADC-사포닌 접합체 및 AOC-사포닌 접합체의 적용에 의해, 이제 하나 또는 다수의 글리코시드 분자(사포닌(들))를 페이로드를 운반하는 ADC와 함께 또는 본 발명에 따른 BNA와 같은 올리고뉴클레오티드와 접합된 (모노클로날) 항체와 함께 (표적) 세포로 가이드하는 것이 가능하게 되었다. 특히, 이전에는 ADC 또는 AOC의 이펙터 모이어티 또는 페이로드와 (단백질성) 세포-표면 분자 표적화 분자의 기타 접합체 및 이펙터 모이어티 당 (미리 규정된, 제어 가능한) 특정 수 또는 범위의 글리코시드 분자(사포닌)을 동시에 예컨대 세포의 엔도사이틱 경로를 통해서와 같이 세포의 사이토졸로 구체적으로 가이드하는 것이 불가능했었다.
본 발명에 의해 제공되는 해결방안은 본 발명의 접합체의 세포-표면 분자 표적화 분자에 적어도 하나의 사포닌의 공유 결합을 포함한다. 본 발명에 의해 제공되는 추가의 해결방안은 (먼저) 올리고머 또는 폴리머 스캐폴드를 사용하여 글리코시드 분자(사포닌)를 중합하고, 공유 결합된 사포닌의 클러스터를 갖는 본 발명의 접합체에 의해 포함되는 세포-표면 분자 표적화 분자를 제공하여, 예를 들어, 엔도사이토시스 후에, 사포닌의 작용 모드가 요구되는 세포내 부위에서, 하나 이상의 사포닌의 재-모노머화(re-monomerization)를 가능하게 한다. 이 문맥에서 "중합(polymerizes)"은 링커(linker)를 통해, 또는 직접적으로 또는 폴리머 또는 올리고머 구조를 통해 제1 단백질성 분자에 사포닌 분자의 가역적 및/또는 비가역적 다중 접합으로 스캐폴드를 형성하거나, 또는 (개질된) 사포닌의 가역적 및/또는 비가역적 다중 접합에 의해 폴리머 또는 올리고머 구조를 형성하여 스캐폴드를 형성하는 것을 의미한다. 이러한 맥락에서, "재-모노머화"는 예를 들어, 엔도사이토시스 후에, 접합체로부터, 접합체의 세포-표면 분자 표적화 분자에 대해 사포닌(들)을 결합하는 링커로부터 또는 스캐폴드로부터, 사포닌의 절단, 및 결합되지 않은 사포닌의 (본래의(native)) 화학적 상태를 다시 얻는 것을 의미하며, 이 결합되지 않은 사포닌은 부가적인 화학기, 예컨대 링커, 접합체의 아미노산 잔기 또는 스캐폴드에 결합하기 위한 화학기, 및/또는 알데히드기 또는 카르복실산기와 같은 사포닌의 화학기에 결합된 (화학적) 링커를 포함하거나 포함하지 않을 수 있다. 사포닌의 복잡한 케미스트리로 인하여, 예를 들어 스캐폴드 또는 다른 연결 링커에서 사포닌의 '중합' 및 예를 들어, 엔도사이토시스 후에, 세포내와 같이 원하는 위치에서, 이들의 '재-모노머화'는 도전적인 작업이었다. 특히, 링커 및 예를 들어 트리테페노이드 사포닌과 같은 접합체에 대한 공유 결합을 위한 공유 연결된 글리코시드를 포함하는 스캐폴드를 제공하기 위해 사용된 화학 반응(글리코시드의 중합)은 일반적으로 무수(water-free) 유기 용매에서 일어나지만, 사포닌 및 예를 들어 결합된 사포닌을 함유하기 위한 스캐폴드로서 적용된 생체적합성 폴리머는 수용성 분자이다. 개질(변형, modified)되지 않은 사포닌의 화학적 특성은 그 자체로서 중합가 더욱 불가능하게 되었으며, 이펙터 분자에 (직접적으로) 복수의 사포닌을 결합시키기 위한, 다른 가능한 해결방안은, 이펙터 분자(약물, 독소, 폴리펩티드 또는 폴리뉴클레오티드)가 전형적으로 충분한 결합 부위를 제공하지 못하며, 그리고 커플링 생성물은 상당히 이질적이며 그리고/또는 사포닌과 같은 생물학적으로 활성인 분자 및 예를 들어 펩티드, 독소, 핵산을 함께 커플링하는 것은 이러한 사포닌-함유 접합체에 함께 결합된 분자의 하나 또는 심지어 둘 모두의 활성에 영향을 주고 방해할 위험을 갖기 때문에, 매우 유망하지 않을 것으로 추정되었다. 또한, 본 발명의 접합체가 포함하는 이펙터 모이어티가, 예를 들어 ADC 또는 항체-올리고뉴클레오티드 접합체(AOC)에 대한 사포닌이 커플링되는 경우에, 이의 기능을 상실하는 상당한 위험이 있었다. 본 발명의 구현예는 이러한 결점 중 적어도 하나를 해결한다.
본 발명의 맥락에서, 이펙터 분자, 또는 이펙터 모이어티는 세포내 이펙터 분자 표적과의 상호작용에 의해 세포의 대사에 영향을 미치는 임의의 물질로서, 여기서 이 이펙터 분자 표적은 엔도사이틱 및 재순환 경로의 구획 및 소포의 루멘을 제외한, 하지만 이들 구획 및 소포의 막을 포함하는 세포내 임의의 분자 또는 구조이다. 따라서, 세포내 상기 구조는 핵, 미토콘드리아, 클로로플라스트(chloroplasts), 소포체, 골지체, 다른 운반 소포(transport vesicles), 플라즈마막의 내부 부분 및 사이토졸(cytosol)을 포함한다. 본 발명의 맥락에서 이펙터 모이어티의 사이토졸 전달은 바람직하게는 이펙터 모이어티가 또한 엔도좀 (및/또는 리소좀)을 탈출할 수 있으며, 이는 이전에 정의된 바와 같이 엔도리소좀 및 리소좀을 탈출하는 것을 포함하며, 바람직하게는 본원에 기재된 바와 같이 이펙터 모이어티 표적에 도달할 수 있음을 의미한다. 본 발명은 또한, 이펙터 모이어티가 본 발명의 접합체에 의해 포함되고, 사포닌이 접합체에 의해 포함되는 경우에, 본 발명의 사포닌과 같은 적어도 하나의 글리코시드 분자 및 이펙터 모이어티 모두를 미리-규정된 비율로 동시에 엔도좀으로 가져오는 역할을 하는 스캐폴드로 지칭되는 새로운 유형의 분자를 포함한다. 본 발명의 문맥에서, 스캐폴드의 폴리머 또는 올리고머 구조는 폴리머, 올리고머, 덴드리머, 덴드론화 폴리머, 또는 덴드론화 올리고머와 같은 구조적으로 정렬된 형태이거나, 또는 이는 하이드로젤, 마이크로겔, 나노겔, 안정화된 폴리머 미셀 또는 리포좀과 같은 어셈블리된(assembled) 폴리머 구조이지만, 콜레스테롤/인지질 혼합물과 같은 모노머의 비공유 어셈블리를 포함하여 구성된 구조를 제외한다. 용어 "폴리머, 올리고머, 덴드리머, 덴드론화 폴리머, 또는 덴드론화 올리고머"는 이들의 일반적인 의미를 갖는다. 특히, 폴리머는 함께 결합된 대다수의 동일하거나 유사한 유닛으로부터 주로 또는 완전하게 형성된 분자 구조를 갖는 물질이며, 올리고머는 분자가 비교적 적은 반복 유닛으로 구성된 폴리머이다. 각각, 폴리머 및 올리고머의 상기 정의에서 사용된 "다수(many)" 및 "몇몇(a few)"에 대한 하나의 특정 컷-오프(cut-off)에 대한 합의(consensus)는 없다. 그러나, 스캐폴드가 폴리머 또는 올리고머 구조, 또는 둘 모두를 포함할 수 있기 때문에, 함께 결합된 유사한 유닛의 수의 전체 범위는 이러한 구조, 즉 2개의 모노머 유닛 내지 100개의 모노머 유닛, 1000개의 모노머 유닛 및 보다 많은 모노머 유닛로 적용된다. 예를 들어, 5 이하의 구조를 포함하는 구조를 올리고머 구조로 지칭될 수 있는 반면, 50개의 모노머 유닛를 포함하는 구조는 폴리머 구조로 지칭될 수 있다. 10개의 모노머 유닛의 구조는 올리고머 또는 폴리머로 지칭될 수 있다. 본원에 정의된 스캐폴드는 본 발명의 사포닌과 같은 적어도 하나의 글리코시드 분자를 추가로 포함한다. 스캐폴드는 바람직하게 폴리머 또는 올리고머 구조, 예컨대 폴리- 또는 올리고(아민), 예를 들어, 폴리에틸렌이민 및 폴리(아미도아민), 및 생체적합성 구조, 예컨대 폴리에틸렌 글리콜, 폴리- 또는 올리고(에스테르), 예컨대 폴리(락티드), 폴리(락탐), 폴리락티드-코-글리코라이드 코폴리머, 및 폴리(덱스트린), 폴리- 또는 올리고사카라이드, 예컨대 시클로덱스트린 또는 폴리덱스트로즈, 및 폴리- 또는 올리고아미노산, 예컨대 폴리-라이신 또는 펩티드 또는 단백질, 또는 DNA 올리고- 또는 폴리머를 포함한다. 본원에 정의된 바와 같은 어셈블리된 폴리머 구조는 적어도 하나의 스캐폴드 및 선택적으로, 다른 개별 폴리머 또는 올리고머 구조를 포함한다. 상기 어셉블리의 다른 개별 폴리머 또는 올리고머 구조는 (a) 스캐폴드 (이에 따라 본 발명의 사포닌과 같은 적어도 하나의 글리코시드 분자를 포함), (b) 작용화된 스캐폴드 (이에 따라 사포닌과 같은 적어도 하나의 글리코시드 분자 및 적어도 하나의 이펙터 모이어티를 포함), (c) 적어도 하나의 이펙터 모이어티를 갖지만 본 발명의 사포닌과 같은 글리코시드 분자가 없는 폴리머 또는 올리고머 구조(예를 들어, 표 A1 참조)일 수 있다. 작용화된 어셈블리된 폴리머 구조는 (a) 적어도 하나의 작용화된 스캐폴드 또는 (b) 본 발명의 접합체의 세포-표면 분자 표적화 분자에 결합된 적어도 하나의 이펙터 모이이티 등을 포함하는 적어도 하나의 폴리머 구조 및 적어도 하나의 스캐폴드를 함유하는 어셈블리된 폴리머 구조이다. 상기 언급된 분자들 중 임의의 것을 포함하지 않는 (즉, 사포닌과 같은 글리코시드가 없는, 이펙터 모이어티가 없는) 어셈블리된 폴리머 구조내의 폴리머 또는 올리고먼 구조는 특히 어셈블리된 구조의 구조적 성분으로서 추가되며, 이는 어셈블리된 구조("접착제-유사(glue-like))"를 형성하거나 안정화시키는데 도움을 준다. 임의의 이론으로 구속되는 것은 아니나, 산성 환경은 글리코시드(사포닌)와 이펙터 모이어티 사이의 상승 작용(synergistic action)을 위한 전제조건(prerequisite)인 것으로 보인다.
하나 이상의 (절단가능한) 링커 및/또는 선택적으로 스캐폴드를 추가로 포함하거나 포함하지 않는 본 발명의 접합체가 산성 환경을 방해할 수 있고, 적어도 하나의 글리코시드(사포닌)의 엔도좀 탈출 기능을 저해할 수 있는지 여부는 실시예 12에 기재된 바와 같은 그리고 당해 기술분야에 알려진 바와 같은 어세이로 쉽게 결정될 수 있다. 저해는 "유도된 50% 세포 사멸에 필요한 글리코시드의 배량 증가(fold amount increases of glycoside necessary to induced 50% cell killing)"로서 기술된다. 스캐폴드(scaffold)는 적어도 양성 대조군으로서 클로로퀸(Chloroquine)을 사용할 경우 관찰되는 50% 세포 사멸을 얻는데 필요한 글리코시드 분자(사포닌)의 증가인 증가를 유도하지 않는 것이 바람직하다. 대안적으로, 그리고 바람직하게는, 하나 이상의 (절단 가능한) 링커 및/또는 선택적으로 스캐폴드를 추가로 포함하거나 포함하지 않는 사포닌을 포함하는 접합체는 50% 세포 사멸을 유도하는데 글리코시드 분자의 적어도 4배 증가를 초래하지 않으며, 보다 바람직하게 적어도 2배 증가를 초래하지 않는다. 배 증가(fold increase)는 본질적으로 실시예 12에 기재된 바와 같은 어세이로 측정되며, 여기서, 클로로퀸은 양성 대조군으로서, 50% 세포 사멸을 관찰하기 위한, 글리코시드 양, 바람직하게 사포닌 양의 2배 증가를 유도하며, 여기서 사포닌은 본 발명의 사포닌(표 A1, 스킴 I, 이전 구현예 참조) 중 임의의 하나 이상이다.
용어 "이펙터 모이어티의 효과의 개선 또는 향상(improving or enhancing an effect of an effector moiety)"은, 글리코시드 분자, 바람직하게는 본 발명의 사포닌이 이펙터 모이어티의 기능적 효능(예, 독소 또는 약물 또는 BNA와 같은 올리고뉴클레오티드의 치료 지수; 생명공학적 프로세스에서 개질제의 대사 효능; 세포 배양 연구 실험에서 유전자의 형질감염 효능)을, 바람직하게 이의 표적 체결(engagement)을 가능하게 하거나 향상시킴으로써, 증가시키는 것을 의미한다. 항원-특이적 면역 반응의 촉진, 연장, 또는 증강은 바람직하게는 포함되지 않는다. 치료 효능은 바람직하게는 더 낮은 투여량 및/또는 더 적은 부작용(side effect)으로 더 강한 치료 효과를 포함한다. "이펙터 모이어티의 효과 개선"은 또한 효과의 부족으로 사용될 수 없었던 (그리고 예를 들어, 이펙터 모이어티로 알려지지 않았던) 이펙터 모이어티가 본 발명과 조합하여 사용될 경우에 효과적이게 되는 것을 의미한다. 본 발명에 의해 제공되는 바와 같은, 이펙터 모이어티와 사포닌의 조합에 유익하거나 바람직하며 기여할 수 있는 임의의 다른 효과는 "개선된 효과"로 간주된다. 일 구현예에서, 결합된 사포닌(들)을 포함하며 그리고 본 발명의 접합체가 포함하는 스캐폴드는 의도된 및/또는 원하는 효과인 상기 접합체에 의해 포함된 이펙터 모이어티의 효과를 향상시킨다. 단백질성 스캐폴드에 결합된 사포닌을 포함하는 접합체의 경우, 이러한 스캐폴드의 단백질성 폴리머 구조는, 예를 들어 혈류내 콜로이드 삼투압에 대한 영향을 가질 수 있다. 이러한 효과가 접합체에 의해 포함되는 이러한 작용화된 스캐폴드의 의도된 또는 원하는 효과가 아니면, 스캐폴드의 단백질성 구조는 본 발명에 정의된 바와 같은 이펙터 모이어티가 아니다. 또는, 예를 들어, 결합된 사포닌을 운반하고 접합체에 의해 포함되는 DNA- 또는 RNA-기반 스캐폴드의 경우, 그 DNA 또는 RNA의 일부는 예를 들어 발현을 간섭함으로써 (의도되지 않은) 기능을 가질 수 있다. 이러한 간섭이 궁극적인 작용화된 스캐폴드의 의도된 또는 원하는 효과가 아니면, 스캐폴드의 DNA- 또는 RNA 폴리머 구조는 본 발명에 정의된 바와 같은 이펙터 모이어티가 아니다.
다수의 바람직한 특징은 본 발명의 접합체에 의해 포함되는 엔도좀 탈출 인핸서(endosomal escape enhancer), 즉, 글리코시드 또는 사포닌, 바람직하게는 본 발명에 따른 사포닌에 대하여 제형화될 수 있다: (1) 이들은 바람직하게는 독성이 아니고 면역 반응을 유발하지 않으며, (2) 이들은 바람직하게는 표적-외 세포로 이펙터 모이어티의 사이토졸 흡수를 매개하지 않으며, (3) 작용의 부위에서 이들의 존재는 바람직하게는 이펙터 모이어티의 존재와 동기화되며(synchronized), (4) 이들은 바람직하게는 생분해성 또는 배설 가능하며, (5) 이들은 바람직하게는 엔도좀 탈출 인핸서(endosomal escape enhancer)가 결합된 이펙터 분자의 생물학적 활성과 관련되지 않은 유기체의 생물학적 프로세스를 실질적으로 저해하지 않으며, 예를 들어 호르몬과 상호작용하지 않는다. 전술한 기준을 충족하는 본 발명의 사포닌과 같은 글리코시드 분자의 예는, 적어도 어느 정도로, 비스데스모시딕 트리테르펜, 바람직하게는 SO1861, SA1641, QS-21, GE1741 및 표 A1, 스킴 I의 사포닌과 같은 비스데스모시딕 트리테르펜 사포닌이다.
일 구현예는 본 발명의 항체-약물 접합체 또는 항체-올리고뉴클레오티드 접합체 또는 리간드-약물 접합체와 같은 본 발명의 접합체이며, 여기서 항체는 CD71, CA125, EpCAM(17-1A), CD52, CEA, CD44v6, FAP, EGF-IR, 인테그린, 신데칸-1, 혈관 인테그린 알파-V 베타-3, HER2, EGFR, CD20, CD22, 엽산 수용체 1, CD146, CD56, CD19, CD138, CD27L 수용체, PSMA, CanAg, 인테그린-알파V, CA6, CD33, 메소텔린, 크립토, CD3, CD30, CD239, CD70, CD123, CD352, DLL3, CD25, ephrinA4, MUC1, Trop2, CEACAM5, CEACAM6, HER3, CD74, PTK7, Notch3, FGF2, C4.4A, FLT3, CD38, FGFR3, CD7, PD-L1, CTLA4, CD52, PDGFRA, VEGFR1, VEGFR2, 바람직하게는 CD71, HER2, EGFR 중 임의의 것에 결합할 수 있으며, 및/또는 세툭시맙(cetuximab), 다라투무맙(daratumumab), 겜투주맙(gemtuzumab), 트라스투주맙(trastuzumab), 파니투무맙(panitumumab), 브렌툭시맙(brentuximab), 이노투주맙(inotuzumab), 목세투모맙(moxetumomab), 폴라투주맙(polatuzumab), 오비누투주맙(obinutuzumab), IgG 유형의 OKT-9 항-CD71 모노클로날 항체, 페르투주맙(pertuzumab), 리툭시맙(rituximab), 오파투무맙(ofatumumab), 허셉틴(Herceptin), 알렘투주맙(alemtuzumab), 피나투주맙(pinatuzumab), OKT-10 항-CD38 모노클로날 항체, 표 A2 또는 표 A3 또는 표 A4의 항체 중 임의의 하나, 바람직하게 세툭시맙(cetuximab) 또는 트라스투주맙(trastuzumab) 또는 OKT-9 또는 이의 적어도 하나의 종양-세포 수용체 결합-단편 및/또는 이의 적어도 하나의 종양-세포 수용체 결합 도메인인 이거나 이를 포함하며, 및/또는 여기서 항체-약물 접합체는 겜투주맙, 오조가마이신, 브렌툭시맙 베도틴, 트라스투주맙 엠탄신, 이노투주맙 오조가마이신, 모세투모맙 파수도톡스(Moxetumomab pasudotox) 및 폴라투주맙 베도틴 및 표 A2 및 표 A3의 항체-약물 접합체 중 임의의 하나를 포함하거나, 또는 여기서 리간드-약물 접합체는 EGF 또는 사이토카인과 같은 세포-표면 분자에 대한 결합을 위한 적어도 하나의 리간드를 포함한다.
전술한 바와 같이, 본 발명에 따른 접합체에 의해 포함된 적어도 하나의 사포닌은 본 발명에 정의된 바와 같이 적어도 현재의 그리고 새로운 이펙터 모이어티의 효능을 증가시킨다. 효능의 저하없이, 접합체에 의해 포함된 이펙터 모이어티의 투여량의 감소로 인해 잠재적인 부작용(potential side-effects)이 감소될 것이다. 따라서, 본 발명은 약제에 사용되거나 의약으로서 사용하기 위한 본 발명에 따른 접합체를 제공한다. 또한, 의약 제조를 위한 본 발명에 따른 접합체의 용도가 제공된다. 특히, 암 약제, 및 특히 고전적 화학요법 의약은 이들의 부작용으로 악명이 높다. 접합체에 의해 포함된 약학적으로 활성인 물질 및 바로 동일한 접합체 분자에 의해 포함된 사포닌 모두의 표적화 및 시간 및 위치의 동기화 때문에, 본 발명에 따른 치료 접합체는 의약으로서의 사용, 특히 암 치료 방법에서의 사용에 가치가 있다. 따라서, 본 발명은 암을 치료하는 방법에 사용하기 위한 본 발명에 따른 치료 접합체를 제공한다. 또한, 본 발명은 후천적 또는 선천적 장애, 특히 단발성 결핍증 장애(monogenic deficiency disorders)의 치료 방법에 사용하기 위한, 본 발명에 따른 치료 접합체를 제공한다. 따라서, 상기 치료 접합체는 적어도 하나의 사포닌 및 적어도 하나의 이펙터 모이어티를 포함한다. 따라서, 본 발명의 일 견지는 본 발명에 따른 치료 접합체에 관한 것으로, 여기서 접합체는 공유 결합된 이펙터 모이어티를 포함하며, 암 또는 자가-면역 질환의 치료 방법에 사용하기 위한 공유 결합된 사포닌을 포함한다.
약제에서 본 발명의 접합체의 추가적인 적용은, 불충분한 양 또는 불충분한 기능으로 세포내 효소를 생산하는 표적 세포에서의 세포내 효소의 대체이다. 이에 따른 질환은 유전성(hereditary)이거나 후천적일 수 있다. 대부분의 경우, 단지 증상적인 치료만이 가능하고, 많은 희귀 질환에 대해, 불충분한 치료 옵션은 관련 환자의 수명 단축을 초래한다. 이러한 질환의 예는 페닐케톤뇨증(phenylketonuria)이며, 이는 선천성 대사 오류로 아미노산 페닐알라닌의 대사 감소를 초래한다. 이 질환은 간 효소 페닐알라닌 히드록시라아제(hepatic enzyme phenylalanine hydroxylase)의 유전자의 돌연변이가 특징이다. 페닐케톤뇨증은 현재까지 치료 불가능하다. 그 발병률은 약 1:10,000으로, 알려진 가장 높은 발명률은 터키에서 1:2,600이다. 결합된 페닐알라닌 히드록시라제를 갖거나 페닐알라닌 히드록시라제를 인코딩하는 결합된 폴리뉴클레오티드를 갖는, 본 발명의 접합체에 의해 포함된 세포-표면 분자 표적화 분자, 바람직하게는 항체는 적합한 특이적 항체를 사용하여 간 세포(liver cell)를 표적하는데 사용될 수 있고, 간세포(hepatocyte)에서 결함 효소를 대체하는데 사용될 수 있다. 이는 대체(substitution) 또는 유전자 요법에 대한 본 발명에 따른 결합된 사포닌 및 이에 결합된 효소 또는 올리고뉴클레오티드를 포함하는 본 발명의 치료학적 접합체의 사용의 일 예이다. 바람직한 일 구현예에서, 유전자 치료 또는 대체 치료의 방법에 사용하기 위한 본 발명에 따른 치료 접합체가 제공된다.
본 발명의 접합체를 사용하여 이제 단일 성분의, 비-바이러스의 임상적으로 적용 가능한 유전자 전달 기술을 설계 및 제조하는 것이 가능하게 되었다. 예를 들어, 본 발명의 접합체는 비-바이러스 기반 유전자 전달 기술의 개발을 가능하게 하여 더 낮은 치료 용량으로 치료 효능을 향상시켜 환자의 건강을 개선시킨다. 본 발명의 접합체, 특히 (종양, 자가면역) 세포-표면 특이적 분자에 대한 결합을 위한 모노클로날 항체와 같은 공유 결합된 세포-표면 분자 표적화 분자를 포함하는 경우, 및 예를 들어, 이펙터 모이어티, 예컨대 올리고뉴클레오티드 예를 들어, BNA에 경우에, 본 발명의 접합체는 유전자 전달 분야에서 오랜 기간 지속되고 있는 주요 병목 현상을 극복, 즉 엔도좀 막을 가로질러 사이토졸/뉴클레오졸로 유전자 치료 제품의 효율적이고 안전하며 비용-효율적인 전달할 수 있다. 실제로, 유전자 요법은 광범위한 질환에서 미래의 고급 요법을 위한 가장 유망한 치료 옵션 중 하나이다. 성공적인 유전자 전달은 표적 세포의 인식뿐만 아니라 유전자의 사이토졸 및 뉴클레오졸 흡수를 필요로 한다. 비-바이러스 유전자 치료 분야의 주요 문제 중 하나는 환자에 대한 치료용 유전 물질의 비효율적이고 불충분한 안전한 전달이다.
따라서, 리간드 또는 바람직하게는 항체(이의 단편, 도메인)와 같은 세포-표적화 세포-표면 분자 표적화 분자를 포함하고 안티센스 BNA와 같은 올리고뉴클레오티드를 포함하는 본 발명의 접합체를 적용할 때, 본 발명자는 이제 유전자 전달 분야의 오랜 주요 병목 현상을 극복할 수 있게 하였다: 엔도좀 막을 가로질러 사이토졸/뉴클레오졸로 유전자 치료 제품의 안전한 전달. 본 발명의 접합체는 모든 공지된 유전 인자(genetic agent)를 사용하여 임의의 어드레스할 수 있는(addressable) 세포 유형을 표적화할 수 있도록 설계된 기술에 해당하며, 이에 의해 유전성 장애에 제한되지 않고 암 치료에 대한 더 우수한 환자 요법을 보장하고 따라서 대규모 환자 그룹에 중요하다. 본 발명의 접합체에 기초한 기술은, 표적화 리간드 또는 (모노클로날) (종양-세포 특이적) 항체와 같은 세포-표면 분자 표적화 분자 및 이펙터 모이어티, 본원에서 LNA 또는 BNA와 같은 이펙터 유전자에 대한, 표 A1 및 스킴 I의 사포닌 및 본 발명에 따른 임의의 구현예와 같은 엔도좀 탈출 증진제(EEE)에 대한 담체 역할을 하는 폴리머 또는 올리고머 스캐폴드를 포함할 수 있다. 예를 들어 세포-표적화 항체(단편) 및 BNA와 같은 올리고뉴클레오티드를 포함하는 본 발명의 접합체의 사용은 임의의 종류의 생물학적 거대분자를 사이토졸 및 핵내로 가져올 가능성이 있다. 새로운 표적화 리간드 및 모노클로날(인간, 인간화) 항체의 개발은 전 세계의 수많은 연구 그룹 및 회사에서 지속적인 조사 중이다. 암세포와 같은 병든 세포의 사이토졸 내 전달을 목표로 하는 올리고뉴클레오티드에 대해서도 동일하다. 따라서 본 발명의 접합체는 또한 현재 및 미래의 표적화 리간드 및 항체 및 현재 및 미래의 치료 올리고뉴클레오티드(및 단백질 독소와 같은 페이로드)가 연결되거나 또는 클릭 화학에 의해 본 발명의 올리고머 또는 폴리머 스캐폴드 모듈에 연결되어 맞춤형 약물 적용 및 조직 및 세포 표적화 기술 분야의 미래 개발을 가능하게 하는 분자 인터페이스(molecular interface)로서 제시된다. 본 발명의 접합체는 세포-표면 분자 표적화 분자로서 항체 및 리간드를 포함할 수 있다. 전 세계 유전자 치료제 시장은 빠르게 성장하고 있으며 암, 심혈관 질환, 파킨슨병, 알츠하이머, HIV 및 많은 희귀 (단일 유전(monogenetic)) 질환과 같은 광범위한 질환 영역에 대한 잠재적 치료를 포괄한다. 현재의 바이러스 벡터-기반 유전자 치료 기술은 안전성, 제조 실행 계획 및 관련 높은 비용과 같은 상당한 문제가 있다. 본 발명의 접합체는 현재의 바이러스 유전자 전달 기술에 대한 대안에 해당하는 기술 플랫폼에서의 사용할 수 있다. 따라서, 본 발명의 접합체는 암, 심혈관 질환, 파킨슨병, 알츠하이머병, HIV 감염 및 많은 희귀 (단일유전) 질환과 같은 질환에 대한 비-바이러스 유전자 치료를 개발하기 위한 접근법에서 구현하기에 적합하다. 본 발명의 접합체는 표적화된 안티센스 BNA를 기반으로 하는 것과 같은 비-바이러스 벡터 기반 유전자 치료제를 제조함으로써 항체-약물 접합체(ADC) 및 올리고뉴클레오티드-기반 치료제의 분야를 변형시키기 위한 신규 치료 개발에 적합하다. 본 발명의 접합체의 적용, 특히 항체 및 올리고뉴클레오티드, 예컨대 BNA 및 적어도 하나의 사포닌과의 공유 접합체에서의 본 발명의 접합체의 적용은 본 발명으로 인해 가능해진 많은 유익한 접근법 중 하나이다. 예를 들어, 본 발명의 접합체의 사용은 이제 포유류 세포의 엔도사이틱 경로를 이용할 수 있도록 한다. 엔도사이토시스는 치료제의 전달을 위해 이용되며, 여기서 본 발명의 접합체는 접합체에 의해 포함된 예를 들어, siRNA의 개선된 흡수 및 엔도좀 탈출에 기여한다. 본 발명의 접합체는 예를 들어, 페이로드, 올리고뉴클레오티드에 대한 전달 인핸서(delivery enhancer)로서 작용하는 소분자와 함께 적합하게 사용된다. 이와 함께, BNA와 같은 공유 커플링된 올리고뉴클레오티드를 함유하며, 리간드 및 바람직하게는 항체 (도메인 또는 단편)와 같은 공유 커플링된 세포 표적화 모이어티를 함유하고 본 발명의 사포닌을 함유하는 본 발명의 접합체는 현재의 엔도좀 탈출 인핸서 및 유전자 치료 제품에서 볼 수 있는, 두 가지 성분으로서의 이들의 적용과 관련한 현재의 문제에 대한 해결 방안을 제공하며, 본 발명의 이러한 접합체가 사포닌, 유전자 제품, BNA 및 (종양) 세포 표적화 모이어티, 예컨대 (모노클로날) 항체를 포함하는 단일-접합체 치료 분자이기 때문에, 치료 승인 및 임상 적용 가능성을 복잡하게 한다. 따라서, 본 발명은 엔도좀 탈출 인핸서(예, 표 A1, 스킴 I, 본 발명의 구현예의 글리코시드), 유전자 치료 제품(본 발명에 따른 올리고뉴클레오티드, 예컨대 BNA) 및 표적화 리간드 또는 항체(예를 들어, 표 A2, A3, A4, 본 발명의 구현예에 따른)가 모두 본 발명의 접합체에 의해 포함되는 비-바이러스 유전자 전달 기술을 제공한다. 따라서, 본 발명의 이러한 접합체는 광범위한 질환 및 대규모 환자 그룹에 대한 현재 및 미래의 거대분자 약물에 대한 치료 기회를 제공한다. 적어도 하나의 사포닌, 적어도 하나의 올리고뉴클레오티드 및 면역글로불린과 같은 적어도 하나의 특정 세포-표적화 모이어티를 포함하는 본 발명의 이러한 접합체의 적용으로, 엔도좀 탈출 인핸서 및 유전자 치료 제품을 별도로 적용하는 현재 방법에 대해 명백한 문제가 해결되며, 현재 방법은 두 화합물이 상호작용 부위에 동시에 존재하는 것을 보장하지 않는다. 이 문제는 이제 본 발명의 접합체를 사용함으로써 극복된다. 즉, 본 발명의 이러한 접합체는 두 화합물, 즉 사포닌 및 BNA와 같은 유전자 생성물의 동기화(시간 및 장소에서)가 증가된 비-바이러스 유전자 전달 기술을 제공한다.
유전자 요법은 낭포성 섬유증, 무도증, 헌팅턴병 또는 혈우병과 같은 유전성의, 이전에는 치료할 수 없는 질환에 도움이 될 수 있다. 그러나 현재 몇 가지 문제가 해결되지 않았다: 예를 들어, 치료 유전자는 신체의 특정 표적 세포에 정확하게 도달해야 합다. 반면에 치료 유전자는 표적화된 세포에 흡수되어야 하지만 치료 유전자는 파괴되어서는 안 된다. 현재의 유전자 치료 접근법은 바이러스를 유전자의 페리(ferry)로 사용한다. 그러나 이러한 절차는 상당한 위험을 수반하며 다른 생체 분자의 도입으로 이전될 수 없다. 일 구현예는 담체 분자로서 접합체에 의해 포함될 때 유전자의 전달을 허용할 뿐만 아니라 표적 세포 내로 도입될 상이한 치료적 생체분자의 전달을 허용하는 플랫폼 기술을 사용하기 위한 (식물-유래) 글리코시드를 포함하는 본 발명의 접합체이다. 따라서, 본 발명의 접합체는 낭포성 섬유증, 무도증, 헌팅턴병 또는 혈우병에 대한 핵산 기반 치료제 개발에 사용된다. 이와 함께, 본 발명의 접합체를 사용하여 낭포성 섬유증, 헌팅턴병 및 혈우병 환자를 비롯한 유전 질환 환자의 건강을 개선하기 위한 새로운 유전자 치료 전략을 사용할 수 있다. 본 발명의 일부로서, 단일 접합체에 모두 포함된 식물-유래 엔도좀 탈출 인핸서(글리코시드), 유전자 치료 생성물 및 표적화 리간드를 조합하는 비-바이러스성 유전자 전달 기술이 개발된다. 본 발명의 접합체에 기초하여 생성된 비-바이러스 유전자 요법은 현재 이용가능한 전략에 비해 더 낮은 투여량에서 약 40배 증가된 전달 효율을 나타낸다. 이와 함께, 본 발명의 접합체는 낭포성 섬유증 환자와 같은 결함 유전자의 복구 또는 교체와 같은 임상 적용 및 예를 들어 암세포를 파괴하기 위한 특정 유전자의 표적화된 전달에 사용하기 위한 것이다. 사실, 본 발명의 접합체는 낭포성 섬유증, 헌팅턴병 및 혈우병과 같은 유전적 결함에 의해 유발되고 현재 치료가 불가능한 임의의 질환에 대한 치료 요법에 적용하기에 적합하다. 본 발명의 접합체를 사용하는 유전자 요법은 두 가지 현재 문제를 극복하는데 도움이 된다: 첫째, 본 발명의 접합체를 사용하여 신체의 특정 표적 세포에 치료 유전자를 전달할 수 있고; 둘째, 예를 들어, 본 발명의 올리고머 또는 폴리머 스캐폴드를 사용하여 본 발명의 접합체에 모두 함께 공유 연결된, 사포닌(들), 올리고뉴클레오티드 생성물 및 표적화 세포에 결합하기 위한 항체와 같은 표적화 모이어티가 존재하기 때문에, 치료 유전자는 이들 세포의 내부로 들어가지만 파괴되지 않는다.
본 발명은 또한 암을 치료하는 방법을 제공하며, 상기 방법은 본 발명에 따른 치료적 접합체를 포함하는 의약을 이를 필요로 하는 환자에게 투여하고, 바람직하게는 상기 의약의 유효량을 이를 필요로 하는 환자, 바람직하게는 인간 암 환자에게 투여하는 것을 포함한다.
투여에 적합한 형태에 관한 고려 사항은 당업계에 공지되어 있으며 독성 효과, 용해도, 투여 경로 및 활성 유지를 포함한다. 예를 들어, 혈류에 주입된 약학적 조성물은 용해성이어야 한다.
적합한 투여 형태는 부분적으로 사용 또는 진입 경로, 예를 들어 경피 또는 주사에 의존한다. 이러한 투여 형태는 표적 세포가 다세포 숙주에 존재하는지 여부에 관계없이 화합물이 표적 세포에 도달하도록 해야 한다. 다른 인자는 당업계에 공지되어 있으며, 화합물 또는 조성물이 그의 효과를 발휘하는 것을 지연시키는 투여 형태 및 독성과 같은 고려 사항을 포함한다.
본 발명의 일 견지는 본 발명에 따른 엔도좀 탈출 증진 접합체를 함유하는 용기를 포함하는 키트에 관한 것이며, 상기 키트는 접합체를 사용하기 위한 설명서를 추가로 포함한다.
본 발명의 일부로서, 본 발명의 치료 접합체는 결합 분자 또는 결합 모이어티 및 사포닌의 공유 접합체(복합체)와 추가로 조합되거나, 또는 약학적 화합물, 항체 등과 추가로 조합되어, 2개 또는 심지어 3개 이상의 인핸서, 약학적 활성 성분 등을 포함하는 조성물, 예를 들어, 이펙터 분자와 복합화된 결합 모이어티와 조합되고, 추가로 선택적으로 사포닌에 연결되거나 연결되지 않고, 표적화 면역글로불린과 같은 리간드, 이의 도메인 또는 단펀에 커플링되거나 커플링되지 않는, 약제와 추가로 조합된, 본 발명의 접합체를 제공한다. 또한, 일 구현예는 본 발명의 치료 접합체이며, 여기서 세포-표면 분자 표적화 분자는 독소 또는 면역독소와 같은 2개 이상의 이펙터 모이어티와 함께 제공되며, 여기서 2개 이상의 이펙터 모이어티는 동일하거나 상이하다.
예시적인 구현예
일 구현예는 본 발명의 엔도좀 탈출 증진 접합체로서, 여기서 사포닌은 위치 23에 알데히드 작용을 갖는 12,13-디하이드로올레아난의 유형에 속하는 비스데스모시딕 트리테르펜 사포닌이고, 그리고 여기서 사포닌은 집소필라(Gypsophila) 또는 사포나리아(Saponaria) 종으로부터 분리된 사포닌이며, 보다 바람직하게 사포닌은 사포닌 SO1861 또는 이의 임의의 부분입체이성질체이다.
일 구현예는 본 발명의 엔도좀 탈출 증진 접합체로서, 여기서 세포-표면 분자 표적화 분자는 적어도 하나의 이펙터 모이어티가 이에 결합되어 있는 면역글로불린과 같은 적어도 하나의 리간드이다.
일 구현예는 본 발명의 엔도좀 탈출 증진 접합체로서, 여기서 세포-표면 분자 표적화 분자는 세포 표면 분자에 대한 결합을 위한 면역글로불린 또는 적어도 이의 결합 도메인이며, 여기서 바람직하게 세포 표면 분자는 HER2, EGFR, CD20, CD22, 엽산 수용체 1, CD146, CD56, CD19, CD138, CD27L, PSMA, CanAg, 인테그린-알파V, CA6, CD33, 메소텔린, 크립토(Cripto), CD3, CD30, CD33, CD239, CD70, CD123, CD352, DLL3, CD25, ephrinA4, MUC1, Trop2, CEACAM5, HER3, CD74, PTK7, Notch3, FGF2, C4.4A, FLT3, CD71 중 임의의 것으로부터 선택된다.
일 구현예는 본 발명의 엔도좀 탈출 증진 접합체로서, 여기서 링커는 절단 가능한 결합을 통해 사포닌에 커플링되고, 그리고 여기서 세포-표면 분자 표적화 분자는 면역글로불린이고, 여기서 바람직하게는 절단 가능한 결합은 산성, 환원성, 효소 또는 광-유도 조건 하에서 절단되고, 그리고 바람직하게는 절단 가능한 결합은 공유 결합, 바람직하게는 이민 결합, 히드라존 결합, 옥심 결합, 1,3-디옥솔란 결합 또는 에스테르 결합이며, 여기서 바람직하게 절단 가능한 결합은 디설파이드 결합(disulfide bond) 또는 펩티드 결합이다.
일 구현예는 본 발명의 엔도좀 탈출 증진 접합체로서, 여기서 사포닌 모이어티는 말단 사포닌, 바람직하게는 사포닌 SO1861이고, 링커는 사포닌을 본 발명의 접합체의 세포-표면 분자 표적화 분자에 공유 연결하는 화학적 링커이고, 그리고 세포-표면 분자 표적화 분자는 트라스투주맙 또는 세툭시맙과 같은 면역글로불린이며, 링커는 바람직하게 말단 사포닌 모이어티와 접합체에 의해 포함된 세포-표면 분자 표적화 분자 사이에 절단 가능한 결합을 제공한다.
일 구현예는 본 발명에 따른 접합체이며, 여기서 사포닌은 비스데스모시딕 트리테르펜이다.
일 구현예는 본 발명에 따른 접합체이며, 여기서 여기서 사포닌은 비스데스모시딕 트리테르펜 사포닌이다.
일 구현예는 본 발명에 따른 접합체이며, 여기서 사포닌은 위치 23에서 알데히드 작용을 갖는 12,13-디하이드로올레아난 유형에 속하는 비스데스모시딕 트리테르펜 사포닌이다.
일 구현예는 본 발명에 따른 접합체이며, 여기서 사포닌은 집소필라(Gypsophila) 또는 사포나리아(Saponaria) 종으로부터 분리될 수 있는 사포닌이다.
일 구현예는 본 발명에 따른 접합체이며, 여기서 사포닌은 S01861 또는 임의의 이의 부분입체이성질체이다.
일 구현예는 본 발명에 따른 접합체이며, 여기서 적어도 사포닌은 절단 가능한 결합을 통해 세포-표면 분자 표적화 분자(세포-표면 분자 상의 에피토프에 대한 결합 부위)에 결합되며, 여기서 바람직하게는 상기 절단 가능한 결합은 산성, 환원성, 효소 또는 광-유도 조건 하에서 절단되며, 그리고 여기서 절단 가능한 결합은 바람직하게는 디설파이드 결합 또는 펩티드 결합이다.
일 구현예는 본 발명에 따른 접합체이며, 여기서 절단 가능한 결합은 공유 결합, 바람직하게는 이민 결합, 히드라존 결합, 옥심 결합, 1,3-디옥솔란 결합 또는 에스테르 결합이다.
일 구현예는 본 발명에 따른 접합체이며, 여기서 엔도좀 탈출 증진 접합체는 규정된 수의 글리코시드 또는 규정된 범위를 포함한다.
일 구현예는 본 발명에 따른 접합체이며, 여기서 규정된 범위는 1-30개의 글리코시드(들), 바람직하게는 1-20개, 보다 바람직하게는 1-10개, 보다 바람직하게는 1-6개, 보다 바람직하게는 2-6개, 보다 바람직하게는 2-5개, 보다 바람직하게는 3-5개, 보다 바람직하게는 3-4개의 글리코시드이다.
일 구현예는 본 발명에 따른 접합체이며, 여기서, 이펙터 모이어티는 단백질성 독소와 같은 독소, 약물, 폴리펩티드 또는 폴리뉴클레오티드와 같은 약학적 활성 물질이다.
일 구현예는 본 발명에 따른 접합체이며, 여기서 표적 세포는 병든 세포 또는 질병-관련 세포, 바람직하게는 종양 세포 또는 종양-관련 세포(예, 종양 혈관 세포), 또는 면역 세포(예, T 조절 세포), 또는 자가면역 세포이다.
일 구현예는 본 발명에 따른 접합체이며, 여기서 적어도 하나의 이펙터 모이어티는 절단 가능한 결합을 통해 접합체에 의해 포함되는 세포-표면 분자 표적화 분자에 결합하며, 여기서 바람직하게는 상기 절단가능한 결합은 산성, 환원성, 효소 또는 광-유도 조건 하에서 절단되며, 및/또는 절단 가능한 결합은 디설파이드 결합 또는 펩티드 결합이다.
일 구현예는 본 발명에 따른 접합체이며, 여기서 사포닌은 이펙터 분자의 엔도좀 탈출을 증가시킬 수 있다.
일 구현예는 의약으로 사용하기 위한 본 발명에 따른 접합체이다.
일 구현예는 본 발명에 따른 접합체(이전의 구현예) 및 약학적으로 허용가능한 부형제를 포함하는 약학적 조성물이다.
일 구현예는 본 발명에 따른 약학적 조성물로서, 적어도 하나의 추가의 활성 약학적 성분, 예컨대 추가의 면역글로불린을 추가로 포함한다.
일 구현예는 암 또는 자가면역 질환의 치료 방법에 사용하기 위한, 본 발명에 따라 사용되는 접합체, 또는 본 발명에 따른 약학적 조성물이다.
일 구현예는 본 발명에 따른 접합체를 이를 필요로 하는 환자에게 투여하는 단계를 포함하는, 암 치료 방법이다.
일 구현예는 본 발명에 따른 약학적 조성물을 이를 필요로 하는 환자에게 투여하는 단계를 포함하는, 암 치료 방법이다.
일 구현예는 본 발명에 따른 엔도좀 탈출 증진 접합체를 함유하는 용기를 포함하는 키트로서, 상기 키트는 결합 분자를 사용하기 위한 설명서를 추가로 포함한다.
본 발명에 따른 적어도 하나의 사포닌을 포함하는 스캐폴드는 작용화된 ADC 또는 작용화된 AOC의 제조를 위한 반제품으로서 사용하기에 적합하며, 여기서 작용화된 ADC 또는 작용화된 OAC는 본 발명의 적어도 하나의 공유 커플링된 사포닌 및 본 발명의 적어도 하나의 이펙터 모이어티를 포함한다. 일 구현예는 본 발명의 스캐폴드에, 직접 또는 본 발명의 링커를 통해, 바람직하게 본 발명의 절단 가능한 링커를 통해 공유 결합된 독소 또는 올리고뉴클레오티드와 같은 본 발명의 페이로드 또는 이펙터 모이어티를 추가로 포함하는, 본 발명의 스캐폴드이다. 이러한 작용화된 스캐폴드는 스캐폴드가 공유 결합된 그리고 이펙터 모이어티가 결합된 상기 스캐폴드를 포함하는 ADC-사포닌 접합체 또는 AOC-사포닌 접합체 제조에 사용될 수 있다. 예를 들어, 이러한 작용화된 ADC 또는 OAC는, 예를 들어 본 발명에 따른 접합체의 시스테인 측쇄에 공유 커플링된, 예컨대 직접적으로 또는 (절단가능한) 링커를 통해, 예를 들어 리간드 또는 항체(단편)인 세포-표면 분자 표적화 분자에 공유 결합된, 2-4개의 사포닌을 포함하거나, 이러한 작용화된 ADC 또는 OAC는 G4-덴드론과 같은 덴드론을 포함하고, 덴드론은 이에 결합된 1-16개의 공유 커플링된 사포닌을 포함하고, 덴드론은 예를 들어 본 발명에 따른 접합체에 의해 포함된 세포-표면 분자 표적화 분자의 시스테인 측쇄 및/또는 라이신 측쇄에 공유 커플링된다.
본 발명의 일 견지는 본 발명의 접합체 및 선택적으로 약학적으로 허용가능한 부형제 및/또는 약학적으로 허용가능한 희석제를 포함하는 약학적 조성물에 관한 것이다.
본 발명의 일 견지는 의약으로서 사용하기 위한, 본 발명의 접합체에 관한 것이거나 또는 본 발명의 약학적 조성물에 관한 것이다.
본 발명의 일 견지는 암 또는 자가면역 질환의 치료 또는 방지에 사용하기 위한, 본 발명의 접합체에 관한 것이거나 또는 본 발명의 약학적 조성물에 관한 것이다.
본 발명은 어떤 방식으로든 본 발명을 제한하는 것으로 해석되어서는 안되는 하기 실시예에 의해 추가로 예시된다.
실시예
실시예 A - ADC와 조합된 본 발명의 접합체를 이용한 포유류 종양-함유 동물 치료는 생존 및 종양 퇴화를 일으킨다.
암컷 Balb/c 누드 마우스에 인간 A431 종양 세포의 현탁액을 피하 주사하였다. 마우스의 피부 아래에, 이종이식 동물 종양 모델에서 인간 표피암종(epidermal carcinoma)이 발달되었다. 종양 세포의 주입 후, 이종이식 종양이 약 170-180 ㎣의 크기로 발달되도록 하였다. A431 종양 세포는 다음과 같은 특징을 갖는다: 높은 EGFR 발현자, 중간 CD71 발현자, 낮은 HER2 발현자. A431 종양-세포 기반 종양 모델은 특히 종양이 빠르게 성장하므로 공격적인 모델이다.
표 A에, 대조군 마우스 및 종양-함유 마우스(tumor-bearing mice)의 치료 결과가 제시된다. 종양-함유 마우스는 이종이식 종양 상의 세포-표면 수용체인 인간 Her2/neu, 인간 EGFR 또는 인간 CD71에 대한 지시된 항체로 처리되었다. 세툭시맙은 사포닌 S01861과 공유 접합되었다. S01861에 링커 EMCH(N-ε-말레이미도카프로산 히드라지드)가 처음 제공되었으며, 이 EMCH는 카보닐(알데히드 또는 케톤; 여기서 사포닌의 위치 C-23에서 알데히드의 카보닐)에 대한 설프히드릴(항체의 환원된 시스테인)을 공유 접합하기 위한 말레이미드-및-히드라지드(maleimide-and-hydrazide) 가교제(crosslinker)이다. 사포닌-EMCH는 세툭시맙의 환원된 시스테인에 공유 커플링되어 EMCH와 시스테인 측쇄 사이에 공유 티오-에테르 결합을 형성하였다. ADC 트라스투주맙-사포린(공유 접합체) 및 안티-CD71 mAb(OKT-9, IgG)-사포린(공유 접합체)를 마우스에서 이들의 종양-공격 효능에 대해 테스트하였으며, ADC를 이용한 치료의 시작 후 시간에 따른 종양 부피로 측정되었다. ADC의 투여량은 종양 모델에서 서브-최적(sub-optimal)이었다. 즉, 이전의 실험으로부터, 종양-퇴화 또는 종양 성장의 저지가 관찰될 수 없었던 ADC의 서브-최적 투여량에서 확립되었다.
이러한 결과는 ADC 단독으로 종양-함유 마우스의 치료가 고려된 경우에 비효과적인 (종양 성장, 마우스의 사망이 방지되지 않음 (안락사)) 투여량에서 ADC와, 사포닌, 즉 SO1861에 공유 결합된 항체를 표적하는 종양-세포 특이적 수용체로 구성된 본 발명의 접합체의 조합 치료가, 단독으로 투여될 경우에 비효과적인(종양 성장, 마우스의 사망이 방지되지 않음(안락사)) 투여량으로 암으로 고통받는 마우스에 투여된 공유 접합체가 처리된 동물의 종양 퇴화 및 생존 연장(실험의 기간을 초과하여)으로 표현되는 효율적이고 효과적인 치료 요법을 제공한다는 것을 입증한다. 단독으로 투여될 경우 항-종양 활성을 갖지 않는 본 발명의 공유 결합된 사포닌-포함 접합체와 조합된 ADC의 서브-최적 투여량은, 이에 따라 암 환자에 대한 효과적인 치료 옵션을 제공하며, 여기서 ADC의 상대적인 낮은 투여량이 효과적이다. ADC의 투여량이 낮을 수록 부작용 위험이 적거나, 심지어 부작용이 전혀 없다. 또한, ADC의 효능이 고려될 때, 본 발명의 사포닌-함유 접합체의 촉진 효과(stimulatory effect)는, ADC 효능이 현재의 예가 입증된 바와 같이, 조합 요법 설정에서 개선되므로, 종양 환자 치료가 관련된 경우 종래 효능이 부족한 것으로 입증된 ADC가 새로운 관심과 가치를 얻을 수 있음을 보여준다. 이전에 인간 임상 설정에서 조사되었지만, 이후 추가의 임상 조사에서 철회된 일부 ADC에 대한 ADC를 요약한 표 A2 및 표 A3이 참조된다. 특히, 관찰된 효능 부족으로 인해 및/또는 허용 불가능한 유해 사례 발생으로 인해 임상 개발이 종료된 ADC는, 시험된 세툭시맙-사포닌과 같이 본 발명의 공유 결합된 사포닌-포함 접합체와 조합될 경우, 암 환자에 대하여 새로운 가치를 얻을 수 있는 ADC이다.
실시예 B - 엔도좀/리소좀 탈출 증진 활성을 갖는 QS-21을 포함하는 퀼라자 사포나리아의 사포닌 혼합물
스킴 I은 일련의 QS-21 사포닌의 공통 분자 구조를 나타낸다(부분적으로 다음 문헌에서 수정됨: Conrado Pedebos, Laercio Pol-Fachin, Ramon Pons, Cilaine V. Teixeira Hugo Verli, Atomic Model and Micelle Dynamics of QS-21 Saponin, Molecules 2014, 19, 3744-3760). 퀼라자 사포나리아로부터 얻어진 수용성 사포닌의 혼합물(Sigma-Aldrich, product No. S4521; Roth, Item No. 6857; InvivoGen, product 'Quil-A')이, 예를 들어, QS-21과 같은 혼합물에 존재하는 적어도 하나의 개별 사포닌의 엔도좀/리소좀 탈출 증진(enhancing) 특성에 기초하여, 또는 QS-21 및 QS-7과 같은 혼합물에 의해 포함되는 둘 이상의 사포닌의 조합에 기초하여, 본 발명의 엔도좀/리소좀 탈출 증진 접합체, 조성물, 조합에 적용될 수 있다.
본 발명자는 2,5 마이크로그램/ml 투여량의 퀼라자 사포나리아로부터의 사포닌 혼합물이, 세포-기반 바이오어세이에서 포유류 종양 세포로 테스트된 바와 같이, 디안틴의 엔도좀 탈출을 증진시킬 수 있음을 입증하였다. 세포에 노출된 이펙터 모이어티는 리간드 EGF:EGF-디안틴에 공유 커플링된 디안틴이었다. 시험된 세포는 유리 사포닌에 대해서는 종양 세포주 HeLa이었으며, 그리고 세툭시맙에 공유 커플링된 경우의 사포닌을 테스트하기 위해서는 A431, MDA-MB-468, CaSki 및 A2058이었다.
실시예 1
세툭시맙(인간 EGFR을 인식 및 결합하는 모노클로날 항체)에 S01861은 시스테인 잔기(Cys)를 통해 접합되고(불안정성), 디안틴(단백질 독소)은 라이신 잔기(Lys)를 통해 접합되어(안정성), 세툭시맙-(Cys-L-SO1861)3,9(Lys-S-디안틴)2이 생성되었다. 이 접합체는 A431 (EGFR++) 이종이식 마우스 종양 모델에서 도 9에 도시된 바와 같이 EGFR 종양 표적화된 세포 사멸에 대해 시험되었다. 종양이 ~150㎣의 크기에 도달한 12일째에 투여를 시작하고, 매 투여 후 종양 부피를 측정하였다. 마우스(n=3)를 12일째에 0.5 mg/kg; 15일째에 1 mg/kg 그리고 24일째에 1.5 mg/kg으로 세툭시맙-(Cys-L-SO1861)3,9(Lys-S-디안틴)2 또는 세툭시맙-(Lys-S-디안틴)1,6으로 치료(복강내; i.p.; 투여량 증가)하였다. 26일째에, 대조군에 비해, 세툭시맙-(Cys-L-SO1861)3,9(Lys-S-디안틴)2으로 처리된 종양 함유 마우스에서 종양 부피 감소가 관찰될 수 있었다(도 1A). 이는 항체-단백질 독소(안정성) 접합체에 대한 SO1861의 불안정성 접합이 종양 표적화된 항체-단백질 독소의 표적화된 치료 효능을 증진시켜, 보다 효과적인 종양 표적화된 치료를 유도할 수 있음을 보여준다.
다음으로, 세툭시맙(인간 EGFR을 인식 및 결합하는 모노클로날 항체)에 S01861은 시스테인 잔기(Cys)를 통해 접합되고(불안정성), 디안틴(단백질 독소)은 라이신 잔기(Lys)를 통해 접합되어(안정성), 세툭시맙-(Cys-L-SO1861)3,9(Lys-L-디안틴)2이 생성되었다. 이 접합체는 A431(EGFR++) 이종이식 마우스 종양 모델에서 도 9에 도시된 바와 같이 EGFR 종양 표적화된 세포 사멸에 대해 시험되었다. 종양이 ~150㎣의 크기에 도달한 12일째에 투여를 시작하고, 매 투여 후 종양 부피를 측정하였다. 마우스(n=3)를 12일째에 0.5 mg/kg; 15일째에 1 mg/kg 그리고 24일째에 1.5 mg/kg으로 세툭시맙-(Cys-L-SO1861)3,9(Lys-L-디안틴)2 또는 세툭시맙-(Lys-L-디안틴)1,6으로 치료(복강내; i.p.; 투여량 증가)하였다. 이는 35일 후에, 대조군에 비해, 세툭시맙-(Cys-L-SO1861)3,9(Lys-L-디안틴)2으로 처리된 종양 함유 마우스에서 종양 성장 억제가 나타났다(도 1B). 마우스(n=3)를 12일째에 0.5 mg/kg; 15일째에 1 mg/kg, 18일째에 2 mg/kg, 24일째에 2.5 mg/kg으로 본 발명에 따른 세툭시맙-(Cys-L-SO1861)3,9(Lys-L-디안틴)2으로 치료(정맥내; i.v.; 투여량 증가)한 경우에도 대조군에 비해 종양 성장 억제가 관찰될 수 있었다(데이터는 마우스 1마리에 대해 나타내었으며, 2마리는 치료 도중에 사망하였기 때문이다). 이는 항체-단백질 독소(불안정성) 접합체에 대한 SO1861의 불안정성 접합이 종양 표적화된 항체-단백질 독소의 표적화된 치료 효능을 증진시켜, 보다 효과적인 종양 표적화된 치료를 유도할 수 있음을 보여준다.
다음으로, 세툭시맙(인간 EGFR을 인식 및 결합하는 모노클로날 항체)에 S01861-EMCH는, DAR 3,9로, 시스테인 잔기(Cys)를 통해 접합되고, (암세포에서 온코-표적(onco-target) hsp27 mRNA의 분해를 표적 및 유도(유전자 침묵)하는) 안티센스 HSP27BNA 올리고 뉴클레오티드는, DAR 1,8로, 불안정한 (L) 링커를 통해 항체의 라이신 잔기(Lys)에 접합되어, 세툭시맙-(Cys-L-SO1861)3,9(Lys-L-HSP27BNA)1,8이 생성되었다. 세툭시맙-(Cys-L-SO1861)3,9(Lys-L-HSP27BNA)1,8는 A431 이종이식 '누드' 마우스 종양 모델에서 도 10에 도시된 바와 같이 본 발명에 따라 EGFR-매개 종양 표적화된 유전자 침묵에 대해 시험되었다. 종양이 ~150㎣의 크기에 도달한 12일째에 투여를 시작하고, HSP27 mRNA 발현을 측정하였다. 이를 위해, 1차 투여 후 72h에 종양 샘플을 수집하고, 세포 대조군 mRNA 발현 수준(레퍼런스 유전자)과 비교한 HSP27 유전자 발현 수준을 분석하였다. 30 mg/kg 세툭시맙-(Cys-L-SO1861)3,9(Lys-L-HSP27BNA)1,8로 치료한(복강내; i.p) 종양 함유 마우스(n=3)는 1 투여 후에, 세툭시맙-(Cys-L-SO1861)3,8 또는 세툭시맙-(Lys-L-HSP27BNA)1,5의 단일 투여에 비해 종양에서 HSP27 mRNA 발현의 40% 감소를 나타내었다(도 2). 비히클 대조군의 종양에 비해, 25% HSP27 유전자 발현의 감소가 관찰되었다. 이는 본 발명에 따른, 동일한 표적 항체에 대한 S01861 및 HSP27BNA의 접합체가 종양 함유 마우스의 고형 종양에서 치료 안티센스 올리고 뉴클레오티드의 SO1861-매개 증진된 세포질 전달을 효율적으로 유도하여, 종양 표적화된 유전자 침묵을 유도함을 보여주고 가능하게 한다.
또 다른 예에서, 3작용성 링커 스캐폴드는 SO1861-L-3작용성 링커-L-HSP27BNA를 생성하기 위해 한쪽 팔에 SO1861과 다른 쪽 팔에 HSP27BNA와의 접합을 위해 3개의 특이적 화학 말단기로 디자인 및 제조되었다. 다음으로, SO1861-L-3작용성 링커-L-HSP27BNA는 항-EGFR 항체인 세툭시맙(세툭시맙-Cys-(SO1861-L-3작용성 링커-L-HSP27BNA)3.7)의 시스테인 잔기(Cys)에 세 번째 팔과 접합되고, 도 11에 예시된 바와 같이 본 발명에 따라 EGFR-매개 종양 표적화된 유전자 침묵 활성에 대해 A431 이종이식 '누드' 마우스 종양 모델에서 시험되었다. 종양이 ~150㎣의 크기에 도달한 12일째에 투여를 시작하고, HSP27 mRNA 발현을 측정하였다. 이를 위해, 1차 투여 후 72h에 종양 샘플을 수집하고, 세포 대조군 mRNA 발현 수준(레퍼런스 유전자)과 비교한 HSP27 유전자 발현 수준을 분석하였다. 이는 30 mg/kg 세툭시맙-Cys-(SO1861-L-3작용성 링커-L-HSP27BNA)3.7의 1 투여가 25 mg/kg 세툭시맙-(Cys-L-SO1861)3,8 또는 25 mg/kg 세툭시맙-(Lys-L-HSP27BNA)4 단일 치료의 단일 투여에 비해 종양에서 HSP27 유전자 발현의 40% 감소를 일으키는 것으로 나타났다(도 3). 비히클 대조군 종양에 비해, 세툭시맙-Cys-(SO1861-L-3작용성 링커-L-HSP27BNA)3.7의 1 투여로 처리된 종양 함유 마우스에서 25% HSP27 유전자 발현의 감소가 관찰되었다. 이는 세툭시맙-Cys-(SO1861-L-3작용성 링커-L-HSP27BNA)3.7이 종양 함유 마우스의 고형 종양에서 치료 안티센스 올리고 뉴클레오티드의 SO1861-매개 증진된 세포질 전달을 효율적으로 유도하여, 생체내에서 종양 표적화된 유전자 침묵을 유도함을 보여주고 가능하게 한다.
실시예 2
본 발명에 따른 또 다른 예에서, SO1861(불안정) 및 단백질 독소, 디안틴(불안정 또는 안정)은 HER2 표적화 항체, 트라스투주맙에 접합되었다. 트라스투주맙-(Cys-L-SO1861)3,8(Lys-L-디안틴)1,7 또는 트라스투주맙-(Cys-L-SO1861)3,8(Lys-S-디안틴)1,7이 제조되고, 도 9에 도시된 바와 같이 SK-BR-3(HER2++) 및 MDA-MB-468 (HER2-) 세포에서 증진된 세포 사멸에 대해 시험되었다. 트라스투주맙-(Cys-L-SO1861)3,8(Lys-L-디안틴)1,7 (IC50= 0,8 nM) 및 트라스투주맙-(Cys-L-SO1861)3,8(Lys-S-디안틴)1,7 (IC50= 0,8 nM) 모두 SK-BR-3 세포(HER2++)의 세포 사멸을 효율적으로 유도한다(도 4A). 이는 트라스투주맙, 트라스투주맙-(Lys-L-디안틴)1,7, 트라스투주맙-(Lys-S-디안틴)1,7 또는 트라스투주맙-(L-SO1861)3,8 단독으로 처리된 SK-BR-3 세포에서는 관찰되지 않았다(도 4A). MDA-MB-468 세포(HER2-)에서, 본 발명에 따른 접합체 중 어느 것에 대해도 세포 사멸 활성이 관찰될 수 없었다(도 4B). 이것은 HER 표적화 항체-단백질 독소 접합체에 대한 SO1861의 접합이 표적 세포에서 단백질 독소의 SO1861-매개 증진된 세포질 전달을 효과적으로 유도하여, 표적 세포 사멸을 초래함을 보여준다.
본 발명에 따른 또 다른 예에서, SO1861(불안정) 및 단백질 독소, 디안틴(불안정 또는 안정)은 EGFR 표적화 항체, 세툭시맙에 접합되었다. 세툭시맙-(Cys-L-SO1861)3,9(Lys-L-디안틴)2 또는 세툭시맙-(Cys-L-SO1861)3,9(Lys-S-디안틴)2이 도 9에 도시된 바와 같이 A431 세포(EGFR++) 및 A2058 세포(EGFR-)에서 증진된 세포 사멸에 대해 시험되었다. 세툭시맙-(Cys-L-SO1861)3,9(Lys-L-디안틴)2 (IC50= 0,3 nM) 및 세툭시맙-(Cys-L-SO1861)3,8(Lys-S-디안틴)1,7 (IC50= 0,3 nM) 모두 세툭시맙-(Lys-L-디안틴)1,6 (IC50= 2pM), 세툭시맙-(Lys-S-디안틴)1,6 (IC5= 2pM) 단독에 비해 A431 세포(EGFR++)에서 증진된 세포 사멸을 나타내었다(도 4C). A2058 세포(EGFR-)에서, 본 발명에 따른 조합은 어떠한 세포 사멸 활성을 나타내지 않았다(IC50> 200nM; 도 4D). 이는 EGFR 표적화 항체-단백질 독소 접합체에 대한 SO1861의 접합이 표적 세포에서 단백질 독소의 SO1861-매개 세포질 전달을 효율적으로 증진시켜, 표적 세포 사멸을 증진시킨다는 것을 보여준다.
실시예 3
본 발명에 따른 또 다른 실시예에서, SO1861(불안정) 및 HSP27BNA 올리고(불안정)는 EGFR 표적화 항체, 세툭시맙에 접합되었다. 세툭시맙-(Cys-L-SO1861)3,8(Lys-L-HSP27BNA)3,8이 도 10에 도시된 바와 같이 본 발명에 따라 A431 세포(EGFR++) 및 A2058(EGFR-) 세포에서 증진된 HSP27 유전자 침묵에 대해 시험되었다. 세툭시맙-(Cys-L-SO1861)3,8(Lys-L-HSP27BNA)3,8은 세툭시맙, 세툭시맙-(Lys-L-HSP27BNA)3,9 또는 세툭시맙-(Cys-L-SO1861)3,8 단독에 비해 A431 세포(IC50= 3nM)에서 HSP27 유전자 침묵을 효율적으로 유도한다(도 5A). A2058 세포(EGFR-)에서는 세툭시맙-(Cys-L-SO1861)3,8(Lys-L-HSP27BNA)3,8로 처리된 경우에 유전자 침묵 활성이 관찰될 수 없었다(IC50> 100nM; 도 5B). 이는 본 발명에 따른 동일한 표적화 항체에 대한 SO1861 및 HSP27BNA의 접합이 표적 세포에서 치료 안티센스 올리고 뉴클레오티드의 SO1861-매개 증진된 세포질 전달을 효과적으로 유도하여, 표적화된 유전자 침묵을 유도함을 나타내고 가능하게 한다.
본 발명에 따른 또 다른 예에서, SO1861(불안정) 및 HSP27BNA 올리고(불안정)는 HER2 표적화 항체, 트라스투주맙에 접합되었다. 트라스투주맙-(Cys-L-SO1861)3,8(Lys-L-HSP27BNA)3,5은 도 10에 도시된 바와 같이 본 발명에 따라 SK-BR-3 세포(HER2++)에서 증진된 HSP27 유전자 침묵에 대해 시험되었다. 트라스투주맙-(Cys-L-SO1861)3,8(Lys-L-HSP27BNA)3,5는 트라스투주맙-(Lys-L-HSP27BNA)4,4 단독에 비해 SK-BR-3 세포(IC50= 9 nM)에서 HSP27 유전자 침묵을 효율적으로 유도한다(도 6). 이는 본 발명에 따른 HER2 표적화 항체에 대한 SO1861 및 HSP27BNA의 접합이 표적 세포에서 치료 안티센스 올리고 뉴클레오티드의 SO1861-매개 증진된 세포질 전달을 효과적으로 유도하여, 표적화된 유전자 침묵을 유도함을 나타내고 가능하게 한다.
또 다른 예에서, 세툭시맙-Cys-(SO1861-L-3작용성 링커-L-HSP27BNA)3,7은 도 11에 도시된 바와 같이 본 발명에 따른 A431(EGFR++) 및 A2058(EGFR-) 세포에서 증진된 HSP27 유전자 침묵에 대해 시험되었다. 세툭시맙-Cys-(SO1861-L-3작용성 링커-L-HSP27BNA)3,7은 세툭시맙-(Lys-L-HSP27BNA)4 또는 세툭시맙-(Cys-L-SO1861)3,7 단독에 비해 A431 세포(IC50= 2nM)에서 HSP27 유전자 침묵을 효율적으로 유도한다(도 7A). A2058 세포(EGFR-)에서 유전자 침묵 활성은 높은(> 80nM) 농도의 세툭시맙-Cys-(SO1861-L-3작용성 링커-L-HSP27BNA)3,7(IC50=100nM; 도 7B)에서만 관찰되었다. 이것은 높은 EGFR 발현 세포에서 세툭시맙-Cys-(SO1861-L-3작용성 링커-L-HSP27BNA)3,7이 표적 세포에서 치료 안티센스 올리고 뉴클레오티드의 SO1861-매개 증진된 세포질 전달을 효과적으로 유도하여, 표적화된 유전자 침묵을 유도함을 나타내고 가능하게 한다.
실시예 4
도 8A-D는 트라스투주맙(도 8A), 세툭시맙(도 8B) 또는 T-DM1(도 8C), 비접합 단백질 독소, 사포린, 디안틴 및 (비-세포 결합) IgG 항체에 접합된 사포린(도 8D)이 다양한 암 세포주 SK-BR-3, JIMT-1, MDA-MB-468, A431, CaSki, HeLa, A2058에 투여된 경우, 상대적인 세포 생존력을 나타낸다.
트라스투주맙과 세툭시맙은 대부분의 세포주에 노출되었을 때 세포 생존력(viability)에 영향을 미치지 않거나 거의 영향을 미치지 않으며, 트라스투주맙이 SK-BR-3 세포에 비교적 높은 농도로 노출되었을 때 HER2 성장 인자 수용체의 기능을 차단하여 세포 성장 억제에 약간의 영향을 미치며, 그리고 세툭시맙이 MDA-MB-468 세포에 비교적 높은 용량으로 노출될 때 EGFR 성장 인자 수용체의 기능을 차단하여 세포 성장 억제에 약간의 영향을 미친다.
TDM-1, 또는 아도-트라스투주맙 엠탄신은 이전에 허셉틴(Herceptin)(화학명: 트라스투주맙) 및 탁산 화학요법으로 치료받은 HER2-양성 전이성 유방암; 허셉틴 및 탁산(taxane) 화학요법으로 신보조(neoadjuvant)(수술 전) 치료 후 잔류 질환이 발견된 경우 수술 후 초기 HER2-양성 유방암 치료에 미 식품의약국에 의해 승인된 표적화된 치료이다. TDM-1은 허셉틴(트라스투주맙)과 화학요법 악제 엠탄신의 조합이다. 도 8C는 TDM-1이 >1000 pM 농도에서 시험된 모든 세포주에 대해 감소된 세포 생존력을 초래함을 보여준다.
시험된 세포주 상의 임의의 세포 표면 분자에 대한 친화도가 없는 대조군 IgG에 커플링된 독소 사포린 및 디안틴 및 유리 독소 사포린은 최대 100.000 pM의시험된 독소의 광범위한 농도에 걸쳐 세포 생존력 영향을 미치지 않거나 거의 영향을 미치지 않는다(도 8D).
실시예 5
덴드론(-L-S01861)
n
합성(도 13, 14, 15)
재료 및 방법
약어
DCM
디클로로메탄
DIPEA
N,N-디이소프로필에틸아민
DMF
N,N-디메틸포름아미드
EDCI.HCl
3-((에틸이미노)메틸렌아미노)-N,N-디메틸프로판-1-아미늄 클로라이드
EMCH.TFA
N-(ε-말레이미도카프로산)히드라지드, 트리플루오로아세트산염
min
분
r.t.
체류 시간(retention time)
TCEP
트리스(2-카르복시에틸)포스핀 하이드로클로라이드
Temp
온도
TFA
트리플루오로아세트산
THF
테트라하이드로퓨란
분석 방법
LC-MS 방법 1.
1
장치: Agilent 1200 Bin. 펌프: G1312A, 탈기기; 자동 샘플 주입기, ColCom, DAD: Agilent G1316A, 210, 220 및 220-320 nm, PDA: 210-320 nm, MSD: Agilent LC/MSD G6130B ESI, pos/neg 100-1000; ELSD Alltech 3300 가스 유속 1.5 ml/min, 가스 온도: 40℃; 컬럼: Waters XSelectTM CSH C18, 30×2.1mm, 3.5μm, 온도: 35℃, 유속: 1mL/min, 구배: t0 = 5% A, t1.6min = 98% A, t3min = 98% A, 사후 시간(Posttime): 1.3분, 용리제 A: 아세토니트릴 중 0.1% 포름산, 용리제 B: 물 중 0.1% 포름산.
LC-MS 방법 2.
2
장치: Agilent 1260 Bin. 펌프: G7112B, 멀티샘플러, Column Comp, DAD: Agilent G7115A, 210, 220 및 220-320 nm, PDA: 210-320 nm, MSD: Agilent LC/MSD G6130B ESI, 생성물의 분자량에 따른 질량 범위:
Apos/neg 100-1000
Bpos/neg 100-1400
; ELSD Alltech 3300 가스 유속 1.5 ml/min, 가스 온도: 40℃; 컬럼: Waters XSelectTM C18, 30×2.1mm, 3.5μm, 온도: 40℃, 유속: 1mL/min, 구배: t0 = 5% A, t1.6min = 98% A, t3min = 98% A, 사후 시간: 1.3분, 용리제 A: 아세토니트릴 중 0.1% 포름산, 용리제 B: 물 중 0.1% 포름산.
LC-MS 방법 3.
3
장치: Waters IClass; Bin. 펌프: UPIBSM, SM: SO가 있는 UPISMFTN; UPCMA, PDA: UPPDATC, 210-320nm, SQD: ACQ-SQD2 ESI, pos/neg 800-1500; ELSD: 가스압력 40psi, 드리프트 튜브 온도: 50℃; 컬럼: Waters XSelectTM CSH C18, 50×2.1mm, 2.5μm 온도: 25℃, 유속: 0.6mL/min, 구배: t0 = 5% A, t2.0min = 98% A, t2.7min = 98% A, 사후 시간: 0.3분, 용리제 A: 아세토니트릴, 용리제 B: 물 중 10mM 암모늄 비카보네이트(pH=9.5).
LC-MS 방법 4.
4
장치: Waters IClass; Bin. 펌프: UPIBSM, SM: SO가 있는 UPISMFTN; UPCMA, PDA: UPPDATC, 210-320nm, SQD: ACQ-SQD2 ESI, pos/neg 1500-2500; ELSD: 가스압력 40psi, 드리프트 튜브 온도: 50℃; 컬럼: Waters XSelectTM CSH C18, 50×2.1mm, 2.5μm 온도: 25℃, 유속: 0.6mL/min, 구배: t0 = 5% A, t2.0min = 60% A, t2.7min = 98% A, 사후 시간: 0.3분, 용리제 A: 아세토니트릴, 용리제 B: 물 중 10mM 암모늄 비카보네이트(pH=9.5).
LC-MS 방법 5.
5
장치: Waters IClass; Bin. 펌프: UPIBSM, SM: SO가 있는 UPISMFTN; UPCMA, PDA: UPPDATC, 210-320nm, SQD: ACQ-SQD2 ESI, 생성물의 분자량에 따른 질량 범위:
Apos/neg 1500-2500
Bneg 2000-3000
; ELSD: 가스 압력 40 psi, 드리프트 튜브 온도: 50℃; 컬럼: Acquity C18, 50×2.1mm, 1.7μm 온도: 60℃, 유속: 0.6 mL/min, 구배: t0 = 2% A, t5.0min = 50% A, t6.0min = 98% A, 사후 시간: 1.0분, 용리제 A: 아세토니트릴, 용리제 B: 물 중 10mM 암모늄 비카보네이트(pH=9.5).
제조방법
정제용(Preparative) MP-LC 방법 1,
1
기기 유형: Reveleris™ prep MPLC; 컬럼: Waters XSelectTM CSH C18(145×25 mm, 10μ); 유속: 40mL/분; 컬럼 온도: 실온; 용리제 A: 물 중 10mM 암모늄 비카보네이트(pH=9.0); 용리제 B: 물 중 99% 아세토니트릴 + 1% 10mM 암모늄 비카보네이트; 구배: t0min = 5% B, t1min = 5% B, t2min = 10% B, t17min = 50% B, t18min = 100% B, t23min = 100% B; 검출 UV: 210, 225, 285 nm.
정제용 MP-LC 방법 2,
2
기기 유형: Reveleris™ prep MPLC; 컬럼: Phenomenex LUNA C18(3)(150x25 mm, 10μ); 유속: 40mL/분; 컬럼 온도: 실온; 용리제 A: 물 중 0.1%(v/v) 포름산; 용리제 B: 아세토니트릴 중 0.1%(v/v) 포름산; 구배: t0min = 5% B, t1min = 5% B, t2min = 10% B, t17min = 50% B, t18min = 100% B, t23min = 100% B; 검출 UV: 210, 225, 285 nm.
정제용 MP-LC 방법 1,
3
MS 기기 유형: Agilent Technologies G6130B Quadrupole; HPLC 기기 유형: Agilent Technologies 1290 정제용(preparative) LC; 컬럼: Waters XSelectTM CSH(C18, 100×30mm, 10μ); 유속: 25ml/분; 컬럼 온도: 실온; 용리제 A: 100% 아세토니트릴; 용리제 B: 물 중 10mM 암모늄 비카보네이트 pH=9.0; 생성물의 극성에 따른 선형(lin.) 구배:
At0 = 20% A, t2min = 20% A, t8.5min = 60% A, t10min = 100% A, t13min = 100% A
Bt0 = 5% A, t2min = 5% A, t8.5min = 40% A, t10min = 100% A, t13min = 100% A
Ct0 = 10% A, t2min = 10% A, t8.5min = 50% A, t10min = 100% A, t13min = 100% A
; 검출: DAD(220-320 nm); 검출: MSD(ESI pos/neg) 질량 범위: 100 - 800; DAD 기반 분획 수집.
정제용 MP-LC 방법 2,
4
MS 기기 유형: Agilent Technologies G6130B Quadrupole; HPLC 기기 유형: Agilent Technologies 1290 정제용 LC; 컬럼: Waters XBridge Shield(C18, 150×19mm, 5μ); 유속: 25ml/분; 컬럼 온도: 실온; 용리제 A: 100% 아세토니트릴; 용리제 B: 물 중 10mM 암모늄 비카보네이트 pH=9.0; 선형 구배: t0 = 5% A, t2.5min = 5% A, t11min = 40% A, t13min = 100% A, t17min = 100% A; 검출: DAD(220-320 nm); 검출: MSD(ESI pos/neg) 질량 범위: 100 - 800; DAD 기반 분획 수집.
플래시 크로마토그래피
Grace Reveleris X2® C-815 플래시; 용매 전달 시스템: 자동 프라이밍 기능이 있는 3-피스톤 펌프, 단일 실행에서 최대 4개의 용매가 있는 4개의 독립 채널, 용매가 고갈되는 경우 자동-스위치 라인; 최대 펌프 유속 250mL/min; 최대 압력 50bar(725psi); 검출: UV 200-400nm, 최대 4개의 UV 신호 조합 및 전체 UV 범위의 스캔, ELSD; 컬럼 크기: 기기에서 4-330g, 루어(luer) 유형, 선택적인 홀더를 가진 750g 내지 최대 3000g.
S01861-EMCH 합성(도 13)
SO1861(121mg, 0.065mmol) 및 EMCH.TFA(110mg, 0.325mmol)에 메탄올(엑스트라 건조, 3.00mL) 및 TFA(0.020mL, 0.260mmol)를 첨가하였다. 반응 혼합물을 실온에서 교반하였다. 1.5시간 후, 반응 혼합물을 정제용 MP-LC로 처리하였다.1 생성물에 상응하는 분획을 즉시 함께 모으고, 동결시키고 밤새 동결건조하여, 표제 화합물(120 mg, 90%)을 백색의 플루피(fluffy) 고체로서 수득하였다. LC-MS 기준 순도 96%.
LRMS (m/z): 2069 [M-1]1-
LC-MS r.t. (min): 1.084
덴드론(-L-S01861)
4
합성(도 14)
중간체 1:
디-tert-부틸(((6-아지도헥사노일)아잔디일)비스(에탄-2,1-디일))디카바메이트
6-아지도헥사노익산(0.943g, 6.00mmol), EDCl.HCl(1.21g, 6.30mmol) 및 Oxyma Pure(0.938g, 6.60mmol)를 DMF(10.0mL)에 용해시키고, 그 혼합물을 5분 동안 교반하였다. 그 다음, DMF(5.00mL) 중의 디-tert-부틸(아잔디일비스(에탄-2,1-디일))디카바메이트(1.82g, 6.00mmol)의 용액을 첨가하고, 반응 혼합물을 실온에서 교반하였다. 5시간 후, 반응 혼합물을 진공에서 증발시키고 잔류물을 에틸 아세테이트(50mL)에 용해시켰다. 생성된 용액을 1N 포타슘 비설페이트 용액(50mL), 포화 소듐 비카보네이트 용액(2×50mL) 및 염수(50mL)로 세척하고, Na2SO4 상에서 건조하고, 여과하고, 진공에서 증발시켰다. 잔류물을 플래쉬 크로마토그래피(에틸 아세테이트 - 헵탄 구배, 10:90에서 100:0으로 증가)로 정제하여 표제 화합물(2.67 g, 100%)을 백색 고체로서 수득하였다. LC-MS에 기초한 순도 98%.
LRMS (m/z): 287/343/465 [M-155/M-99/M+23]1+
LC-MS r.t. (min): 2.022A
중간체 2:
N,N-비스(2-아미노에틸)- 6-아지도헥산아미드 디하이드로클로라이드
디-tert-부틸(((6-아지도헥사노일)아잔디일)비스(에탄-2,1-디일))디카바메이트(2.66 g, 6.00 mmol)에 이소프로판올 (5-6 N, 20.0 mL, 110 mmol) 중의 HCl을 첨가하고, 반응 혼합물을 실온에서 교반하였다. 4시간 후, 반응 혼합물을 진공에서 증발시키고, 생성된 조 생성물을 DCM(3×20mL)으로 공증발시켜 조(crude) 표제 생성물(1.49g, 79%)을 백색 고체로서 수득하였다.
LRMS (m/z): 243 [M+1]1+
중간체 3:
테트라-tert-부틸((5S,5'S)-((((6-아지도헥사노일)아잔디일)비스(에탄-2,1-디일))비스(아잔디일))비스(6-옥소헥산-6,1,5-트리일))테트라카바메이트
DMF(30.0mL) 및 DIPEA(2.62mL, 15.1mmol) 중 N,N-비스(2-아미노에틸)-6-아지도헥산아미드 디하이드로클로라이드(1.19g, 3.76mmol)의 용액에 Boc-Lys(Boc)-ONp(3.69g, 7.90mmol)을 첨가하고, 그 혼합물을 실온에서 밤새 교반하였다. 반응 혼합물을 진공하에서 증발시키고, 잔류물을 에틸 아세테이트(100mL)에 용해시켰다. 생성된 용액을 1N 포타슘 비설페이트 용액(100mL) 및 포화 소듐 비카보네이트 용액(5×100mL)으로 세척하고, Na2SO4 상에서 건조하고, 여과하고, 진공하에서 증발시켰다. 잔류물을 플래시 크로마토그래피(DCM-메탄올/DCM(1/9, v/v) 구배 100:0에서 0:100으로 상승)로 정제하여 표제 생성물(3.07 g, 91%)을 약간 황색을 띠는 고체로서 수득하였다. LC-MS에 기초한 순도 94%.
LRMS (m/z): 800/900/922 [M-99/M+1/M+23]1+
LC-MS r.t. (min): 2.172A
중간체 4:
4-니트로페닐 3-(아세틸티오)프로파노에이트
4-니트로페닐 트리플루오로아세테이트(5.17g, 22.0mmol) 및 3-(아세틸티오)프로피온산(2.96g, 20.0mmol)을 DCM(50.0mL)에 용해시켰다. 다음으로, DIPEA(6.97mL, 40.0mmol)를 첨가하고, 반응 혼합물을 실온에서 밤새 교반하였다. 반응 혼합물을 진공에서 증발시키고, 잔류물을 에틸 아세테이트(50mL)에 용해시켰다. 생성된 용액을 1N 포타슘 비설페이트 용액(50mL), 포화 소듐 비카보네이트 용액(5 x 50mL) 및 염수(50mL)로 세척하고, Na2SO4로 건조하고, 여과하고, 진공에서 증발시켰다. 잔류물을 플래쉬 크로마토그래피(DCM - 메탄올/DCM(1/9, v/v) 구배 100:0에서 0:100으로 증가)로 정제하여 약간 황색을 띠는 고체로서 표제 생성물(4.90g, 91%)을 수득하였다. LC-MS에 기초한 순도 99%.
LRMS (m/z): 292 [M+23]1+
LC-MS r.t. (min): 1.942A
중간체 5:
(S)-2,6-디아미노-N-(2-(6-아지도-N-(2-((S)-2,6-디아미노헥산아미도)에틸)헥산아미도)에틸)헥산아미드 테트라하이드로클로라이드
테트라-tert-부틸 ((5S,5'S)-((((6-아지도헥사노일)아잔디일)비스(에탄-2,1-디일))비스(아잔디일))비스(6-옥소헥산-6,1,5-트리일))테트라카바메이트(1.80g, 2.00mmol)를 이소프로판올(5-6N, 50.0ml, 275mmol) 중의 HCl에 용해시키고, 반응 혼합물을 실온에서 밤새 교반하였다. 반응 혼합물을 진공에서 증발시키고 생성된 조 생성물을 DCM(3 x 20 mL)로 공증발시켜 조 표제 생성물을 백색 고체로서 수득하였다.
LRMS (m/z): 250 [M+2]2+, 500 [M+1]1+
중간체 6:
(2S)-2,6-비스[3-(아세틸설파닐)프로판아미도]-N-[2-(6-아지도-N-{2-[(2S)-2,6-비스[3-(아세틸설파닐)프로판아미도]헥산아미도]에틸}헥산아미도)에틸]헥산아미드
DMF(30mL) 및 DIPEA(3.48mL, 20.0mmol) 중의 (S)-2,6-디아미노-N-(2-(6-아지도-N-(2-((S)-2,6-디아미노헥산아미도)에틸)헥산아미도)에틸)헥산아미드 테트라하이드로클로라이드(1.29g, 2.00mmol)의 용액에, 4-니트로페닐 3-(아세틸티오)프로파노에이트(2.26g, 8.40mmol)를 첨가하고, 반응 혼합물을 실온에서 주말 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 진공에서 증발시키고, 잔류물을 DCM/메탄올(95:5, v/v, 100mL)에 용해시켰다. 생성된 용액을 1N 포타슘 비설페이트 용액(100mL), 1N 소듐 히드록시드 용액(3 x 100mL) 및 염수(100mL)로 세척하고, Na2SO4 상에서 건조하고, 여과하고, 진공에서 증발시켰다. 잔류물을 플래쉬 크로마토그래피(DCM - 메탄올/DCM(1/9, v/v) 구배 100:0에서 0:100으로 증가)로 정제하여 표제 생성물(1.33g, 65%)을 백색 고체로서 수득하였다. LC-MS에서 1개의 탈보호된 티오아세테이트기를 갖는 생성물에 해당하는 m/z 값으로 불순물(15%)이 발견되었다. 워크업 중 또는 후에 불순물이 형성되었다. LC-MS에 기초한 순도 85%.
LRMS (m/z): 510 [M+2]2+, 1019/1041 [M+1/M+23]1+
LC-MS r.t. (min): 1.862B
중간체 7:
N,N'-((9S,19S)-14-(6-아미노헥사노일)-1-메르캅토-9-(3-메르캅토프로판아미도)-3,10,18-트리옥소-4,11,14,17-테트라아자트리코산-19,23-디일)비스(3-메르캅토프로판아미드)포르메이트
스캐폴드 2(102mg, 0.100mmol)를 메탄올(1.00ml)에 용해시켰다. 다음으로, 새로 준비된 1N 소듐 히드록시드 용액(0.440ml, 0.440mmol)을 첨가하고, 반응 혼합물을 실온에서 교반하였다. 30분 후, THF(0.500ml, 0.500mmol) 중의 1.0M 트리메틸포스핀 용액을 첨가하고, 생성된 혼합물을 실온에서 교반하였다. 30분 후, 반응 혼합물을 진공에서 증발시키고 메탄올(2 x 10mL)로 공-증발시켰다. 잔류물을 메탄올/물(9:1, v/v, 1.00 mL)의 혼합물에 용해시키고, 생성된 용액을 정제용 MP-LC에 적용하였다.2 생성물에 상응하는 분획을 즉시 함께 모으고, 동결하고, 밤새 동결건조시켜, 무색 점착성 오일로서 표제 화합물(75.6 mg, 87%)을 수득하였다. LC-MS에 기초한 순도 96%.
LRMS (m/z): 513 [M+2]2+, 825 [M+1]1+
LC-MS r.t. (min): 1.422A
중간체 8:
덴드론(-L-S01861)
4
-아민
N,N'-((9S,19S)-14-(6-아미노헥사노일)-1-메르캅토-9-(3-메르캅토프로판아미도)-3,10,18-트리옥소-4,11,14,17-테트라아자트리코산-19,23-디일)비스(3-메르캅토프로판아미드)포르메이트(2.73mg, 3.13μmol)를 20mM NH4HCO3와 0.5mM TCEP/아세토니트릴의 혼합물(3:1, v/v, 3.00mL)에 용해시켰다. 다음으로, SO1861-EMCH(29.2 mg, 0.014 mmol)를 첨가하고 반응 혼합물을 실온에서 교반하였다. 1.5시간 후, 반응 혼합물을 정제용 LC-MS에 적용하였다.3B 생성물에 상응하는 분획을 즉시 함께 모으고, 동결시키고 밤새 동결건조시켜 표제 화합물(12.3 mg, 43%)을 백색의 플루피 고체로서 수득하였다. LC-MS에 기초한 순도 97%.
LRMS (m/z): 1517 [M-6]6-, 1821 [M-5]5-, 2276 [M-4]4-
LC-MS r.t. (min): 4.395A
중간체 9:
덴드론(-L-S01861)
4
-아지드
덴드론(SO1861)4-아민(6.81mg, 0.748μmol) 및 2,5-디옥소피롤리딘-1-일 1-아지도-3,6,9,12-테트라옥사펜타데칸-15-오에이트(2.90mg, 7.48μmol)을 DMF(1.00 mL)에 용해하였다. 다음으로, DIPEA(1.302μL, 7.48μmol)를 첨가하고, 그 혼합물을 1분 동안 흔든 후 실온에서 방치하였다. 2시간 후, 반응 혼합물을 정제용 LC-MS에 적용하였다.3C 생성물에 상응하는 분획을 즉시 함께 모으고, 동결시키고 밤새 동결건조하여 표제 화합물(5.86 mg, 84%)을 백색의 플루피 고체로서 수득하였다. LC-MS에 기초한 순도 90%.
LRMS (m/z): 2344 [M-4]4-
LC-MS r.t. (min): 4.785B
중간체 10:
덴드론(-L-S01861)
4
-말레이미드1
덴드론(SO1861)4-아민(8.12 mg, 0.891 μmol) 및 2,5-디옥소피롤리딘-1-일 1-(2,5-디옥소-2,5-디하이드로-1H-피롤-1-일)-3,6,9,12-테트라옥사펜타데칸-15-오에이트(3.94mg, 8.91μmol)를 DMF(1.00mL)에 용해시켰다. 다음으로, DIPEA(1.55μL, 8.91μmol)를 첨가하고, 그 혼합물을 1분 동안 흔든 후 실온에서 방치하였다. 3시간 후, 반응 혼합물을 정제용 LC-MS에 적용하였다.3C 생성물에 상응하는 분획을 즉시 함께 모으고, 동결시키고 밤새 동결건조하여, 표제 화합물(6.76 mg, 80%)을 백색 플루피 고체로서 수득하였다. LC-MS에 기초한 순도 66%.
LRMS (m/z): 2358 [M-4]4-
LC-MS r.t. (min): 2.136C
중간체 11:
덴드론(-L-S01861)
4
-말레이미드2
스캐폴드 2(5.10mg, 5.00μmol)를 메탄올(100μL)에 용해하였다. 다음으로, 새로 제조한 1N 소듐 히드록시드 용액(22.0μL, 22.0μmol)을 첨가하고, 그 혼합물을 1분 동안 흔든 후 실온에서 방치하였다. 30분 후 THF(25.0μL, 25.0μmol) 중의 1.0M 트리메틸포스핀 용액을 첨가하고, 생성된 혼합물을 1분 동안 흔들고, 실온에 방치하였다. 30분 후, 반응 혼합물을 진공에서 증발시키고, 메탄올(2 x 5mL)로 공-증발시켰다. 생성된 잔류물을 20mM NH4HCO3와 0.5mM TCEP/아세토니트릴의 혼합물(3:1, v/v, 3.242mL)에 용해시켰다. 이 용액으로부터, 직접 1000 μL를 SO1861-EMCH(14.4 mg, 6.94 μmol, 스캐폴드 대비 4.5 equiv.)에 첨가하고, 그 혼합물을 1분간 흔든 후 실온에서 방치하였다. 10분 후, 반응 혼합물을 밤새 동결건조시켰다. 생성된 잔류물에 2,5-디옥소피롤리딘-1-일 3-(2-(2-(3-(2,5-디옥소-2h-피롤-1(5h)-일)프로판아미도)에톡시)에톡시)프로파노에이트(5.84 mg, 0.014 mmol) 및 DMF(1.00 mL)를 첨가하였다. 다음으로, DIPEA(2.39μL, 0.014mmol)를 첨가하고 현탁액을 1분간 흔들고 실온에서 방치하였다. 2시간 후, 반응 혼합물을 정제용 LC-MS에 적용하였다.3C 생성물에 상응하는 분획을 즉시 함께 모으고, 동결시키고 밤새 동결건조하여 표제 화합물(10.9 mg, 85%)을 백색 플루피 고체로서 수득하였다. LC-MS에 기초한 순도 80%.
LRMS (m/z): 2354 [M-4]4-
LC-MS r.t. (min): 4.165B
덴드론(-L-S01861)
8
합성(도 15)
중간체 1:
tert-부틸 N-[(1S)-1-{[(1S)-1-{[2-(6-아지도-N-{2-[(2S)-2,6-비스[(2S)- 2,6-비스({[(tert-부톡시)카보닐]아미노})헥산아미도]헥산아미도]에틸}헥산아미도)에틸]카바모일}-5-[(2S)-2,6-비스({[(tert-부톡시)카보닐]아미노})헥산아미도]펜틸]카바모일}-5-{[(tert-부톡시)카보닐]아미노}펜틸]카바메이트
(S)-2,6-디아미노-N-(2-(6-아지도-N-(2-((S)-2,6-디아미노헥산아미도)에틸)헥산아미도)에틸)헥산아미드 테트라하이드로클로라이드(964 mg, 1.50 mmol)를 DMF(25.0mL) 및 트리에틸아민(2.08mL, 15.0mmol)에 용해시켰다. 다음으로, Boc-Lys(Boc)-ONp(3.36g, 7.18mmol)를 첨가하고, 반응 혼합물을 실온에서 밤새 교반하였다. 반응 혼합물을 진공에서 증발시키고, 잔류물을 플래쉬 크로마토그래피(DCM - 메탄올/DCM(1/9, v/v) 구배 100:0에서 0:100으로 상승)에 의해 정제하여 백색 고체로서 표제 생성물(2.71g, 100%)을 수득하였다. LC-MS에 기초한 순도 97%.
LRMS (m/z): 807 [M-198]2+
LC-MS r.t. (min): 2.352B
중간체 2:
(2S,2'S)-N,N'-((5S,15S,22S)-22,26-디아미노-10-(6-아지도헥사노일)-15-((S)-2,6-디아미노헥산아미도)-6,14,21-트리옥소-7,10,13,20-테트라아자헥사코산-1,5-디일)비스(2,6-디아미노헥산아미드)옥타하이드로클로라이드
중간체 1(2.71g, 1.50mmol)을 이소프로판올(5-6N, 25.0ml, 138mmol) 중의 HCl에 용해시키고, 반응 혼합물을 실온에서 밤새 교반하였다. 다음으로, 반응 혼합물을 진공에서 증발시키고, 생성된 조 생성물을 DCM(3 x 20 mL)로 공-증발시켜 조 표제 생성물을 백색 고체로서 수득하였다.
LRMS (m/z): 203/254 [M-200/M+4]4+, 338 [M+3]3+, 507 [M+2]2+, 1012 [M+1]1+
중간체 3:
(2S)-2,6-비스[3-(아세틸설파닐)프로판아미도]-N-[(1S)-1-{[2-(6-아지도-N-{2-[(2S)-2,6-비스[(2S)-2,6-비스[3-(아세틸설파닐)프로판아미도]헥사아미도]헥산아미도]에틸}헥산아미도)에틸]카바모일}-5-[(2S)-2,6-비스[3-(아세틸설파닐)프로판아미도]헥산아미도]펜틸]헥산아미드
(2S,2'S)-N,N'-((5S,15S,22S)-22,26-디아미노-10-(6-아지도헥사노일)-15-((S)-2,6-디아미노헥산아미도)-6,14,21-트리옥소-7,10,13,20-테트라아자헥사코산-1,5-디일)비스(2,6-디아미노헥산아미드) 옥타하이드로클로라이드(300mg, 0.230mmol)에 DMF(20.0mL), 트리에틸아민(320μl, 2.30mmol) 및 4-니트로페닐 3-(아세틸티오)프로파노에이트(595mg, 2.21mmol)를 첨가하였다. 생성된 현탁액을 60℃에서 30분 동안 초음파 처리하고, 실온에서 밤새 교반되도록 두었다. 반응 혼합물을 진공에서 증발시키고, 잔류물을 먼저 플래시 크로마토그래피(DCM-메탄올/DCM(1/9, v/v) 구배 100:0에서 0:100으로 상승)를 수행하여, 정제한 다음, 정제용 MP-LC2에 적용하여, 백색 고체로서 표제 생성물(70 mg, 15%)을 얻었다. LC-MS에 기초한 순도 100%.
LRMS (m/z): 685 [M+3]3+
LC-MS r.t. (min): 1.912A
중간체 4:
(2S)-N-[(1S)-1-{[2-(6-아미노-N-{2-[(2S)-2,6-비스[(2S)-2,6-비스(3-설파닐프로판아미도)헥산아미도]헥산아미도]에틸}헥산아미도)에틸]카바모일}-5-[(2S)-2,6-비스(3-설파닐프로판아미도)헥산아미도]펜틸]-2,6-비스(3-설파닐프로판아미도)헥산아미드 포르메이트
스캐폴드 4(10.0mg, 4.87μmol)를 메탄올(200μL)에 용해하였다. 다음으로, 새로 제조한 1N 소듐 히드록시드 용액(42.9μL, 0.043mmol)을 첨가하고, 생성된 혼합물을 1분 동안 흔들고 실온에서 방치하였다. 30분 후 THF(24.4μL, 0.024mmol) 중의 1.0M 트리메틸포스핀 용액을 첨가하고, 생성된 혼합물을 1분 동안 흔들고 실온에서 방치하였다. 30분 후, 반응 혼합물을 물(1 mL)로 희석하고, 정제용 MP-LC에 직접 적용하였다.2 생성물에 상응하는 분획을 즉시 함께 모으고, 동결시키고 밤새 동결건조(lyophilized)하여, 백색의 플루피 고체로서 표제 화합물(4.02 mg, 48%)을 수득하였다.
LRMS (m/z): 564 [M+3]3+, 846 [M+2]2+
LC-MS r.t. (min): 1.542C
중간체 5:
덴드론(-L-S01861)
8
-아민
스캐폴드 5(0.52mg, 0.299μmol) 및 SO1861-EMCH(29.2mg, 0.014mmol)를 20mM NH4HCO3와 0.5mM TCEP/아세토니트릴의 혼합물(3:1, v/v, 1.00mL)에 용해시키고, 생성된 혼합물을 1분 동안 흔들고 실온에서 방치하였다. 30분 후 TCEP(0.30mg, 1.05μmol)를 첨가하고, 반응 혼합물을 1분 동안 흔들었다. 다음으로, 그 혼합물을 직접 정제용 LC-MS에 적용하였다.3B 생성물에 해당하는 분획을 즉시 함께 모으고, 동결시키고 밤새 동결 건조하여 백색 플루피 고체로서 표제 화합물(2.17 mg, 40%)을 얻었다. LC-MS에 기초한 순도 97%.
LRMS (m/z): 2282 [M-8]8-, 2607 [M-7]7-
LC-MS r.t. (min): 4.415A
실시예 6
SO1861-3작용성 링커-BNA올리고 합성(도 16)
재료 및 방법
3작용성 링커
3작용성 링커(DBCO, TCO, 말레이미드)는 Bio-Synthesis Inc.(Lewisville, Texas)에서 주문하였다.
HSP27BNA 올리고
HSP27BNA(-티올) 올리고(서열 5'-GGCacagccagtgGCG-3')(Zhang et al., 2011)는 Bio-synthesis Inc.(Lewisville, Texas)에서 구입하였다.
중간체 1:
SO1861-아지드
SO1861(60mg, 0.032mmol) 및 1-아지도-3,6,9,12-테트라옥사펜타데칸-15-히드라지드(39.3mg, 0.129mmol)에 메탄올(엑스트라 건조, 1.00mL) 및 TFA(9.86μl, 0.129 mmol)를 첨가하고, 반응 혼합물을 1분 동안 흔들고 실온에 두었다. 2시간 후, 반응 혼합물을 정제용 MP-LC로 처리하였다.1 생성물에 상응하는 분획을 즉시 함께 모으고, 동결시키고 밤새 동결건조시켜 표제 화합물(58.4 mg, 84%)을 백색 플루피 고체로서 수득하였다. LC-MS에 기초한 순도 100%.
LRMS (m/z): 2150 [M-1]1-
LC-MS r.t. (min): 1.103B
중간체 2:
SO1861-3작용성 링커
SO1861-아지드(45mg, 0.021mmol) 및 3작용성 링커(26.5mg, 0.022mmol)를 DMF(2.50mL)에 용해시키고, 생성된 혼합물을 1분 동안 흔들고 실온에서 방치하였다. 30분 후, 반응 혼합물을 정제용 LC-MS에 적용하였다.3C 생성물에 상응하는 분획을 즉시 함께 모으고, 동결시키고 밤새 동결건조시켜 표제 화합물(58.4 mg, 84%)을 백색 플루피 고체로서 수득하였다. LC-MS에 기초한 순도 89%.
LRMS (m/z): 1677 [M-2]2-
LC-MS r.t. (min): 2.546A
중간체 3:
(E)-1-(4-((2-(6-(2,5-디옥소-2,5-디하이드로-1H-피롤-1-일)헥사노일)히드라지닐리덴)메틸)벤즈아미도)-N-(4-(6-메틸-1,2,4,5-테트라진-3-일)벤질)-3,6,9,12-테트라옥사펜타데칸-15-아미드
1-(4-포르밀벤즈아미도)-N-(4-(6-메틸-1,2,4,5-테트라진-3-일)벤질)-3,6,9,12-테트라옥사펜타데칸-15-아미드(28.0 mg, 0.048 mmol) 및 EMCH.TFA(24.5 mg, 0.072 mmol)에 메탄올(엑스트라 건조, 2.00 mL) 및 TFA(11.1 μL, 0.145 mmol)를 첨가하고, 반응 혼합물을 50℃에서 교반하였다. 30분 후, 반응 혼합물을 진공에서 증발시키고 생성된 잔류물을 MP-LC에 의해 정제하였다.1 생성물에 상응하는 분획을 즉시 함께 모으고, 동결시키고 밤새 동결건조시켜 밝은 보라색 플루피 고체로서 표제 화합물(33.4 mg, 88%)을 수득하였다. LC-MS에 기초한 순도 92%.
LRMS (m/z): 394 [M+2]2+, 789 [M+1]1+
LC-MS r.t. (min): 1.287A
중간체 4:
메틸테트라진-BNA 올리고
HSP27 BNA 올리고 디설파이드(70.0mg, 0.012mmol)를 20mM NH4HCO3(20.0mL)에 용해시켰다. 다음으로, TCEP(14.3 mg, 0.050 mmol)를 첨가하고 반응 혼합물을 1분 동안 흔들고 실온에서 방치하였다. 반응 혼합물을 분자량 컷오프가 3000 Da(30분 동안 5000 x g)인 원심 필터를 사용하여 여과하였다. 다음으로, 2.5mM TCEP(20.0mL)와의 20mM NH4HCO3의 용액을 잔류 용액에 첨가하고, 생성된 혼합물을 위에서 설명한 동일한 조건에서 다시 여과 하였다. 잔류 용액을 20mM NH4HCO3(30.0mL)로 희석하고, 생성된 혼합물을 아세토니트릴(10.0mL) 중의 (E)-1-(4-((2-(6-(2,5-디옥소-2,5-디하이드로-1H-피롤-1-일)헥사노일)히드라진일리덴)메틸)벤즈아미도)-N-(4-(6-메틸-1,2,4,5-테트라진-3-일)벤질)-3,6,9,12-테트라옥사펜타데칸-15-아미드(14.8mg, 18.8μmol)의 용액에 첨가하였다. 반응 혼합물을 1분 동안 흔들고 실온에서 방치하였다. 30분 후 반응 혼합물을 동결하고 주말 동안 동결건조하여 분홍색의 플루피 고체로서 조 표제 생성물을 얻었다. 조 생성물에 20mM NH4HCO3(20.0mL) 용액을 첨가하고, 생성된 현탁액을 0.45μm 시린지 필터로 여과하였다. 여과액은 상기와 동일한 조건으로 원심 필터를 사용하여 여과하였다. 다음으로, 다시 20mM NH4HCO3 용액(20.0mL)을 잔류 용액에 첨가하고, 생성된 혼합물을 상기와 동일한 조건의 원심 필터를 사용하여 다시 여과하였다. 잔류 용액을 20mM NH4HCO3(20.0mL)로 희석하고, 생성된 혼합물을 밤새 동결건조하여 분홍색 플루피 고체로서 표제 생성물(90.0mg, 115%)을 수득하였다. LC-MS에 기초한 순도 91%.
LRMS (m/z): 1631 [M-4]4-, 2174 [M-3]3-
LC-MS r.t. (min): 0.737B
중간체 5:
SO1861-3작용성 링커-BNA 올리고
메틸테트라진-BNA 올리고(90.0 mg, 0.014 mmol) 및 SO1861-3작용성 링커(48.6 mg, 0.014 mmol)를 물/아세토니트릴의 혼합물(4:1, v/v, 12.0 mL)에 용해시켰다. 반응 혼합물을 1분 동안 흔들고 실온에서 방치하였다. 15분 후, 혼합물을 정제용 LC-MS에 적용하였다.4A 생성물에 상응하는 분획을 즉시 함께 모으고, 동결시키고 밤새 동결건조하여 표제 화합물(82.0 mg, 60%)을 백색의 플루피 고체로서 수득하였다. LC-MS에 기초한 순도 92%(2개의 피크는 모두 표제 화합물에 상응하는 m/z 값을 가짐).
LRMS (m/z): 1641 [M-6]6-, 1970 [M-5]5-
LC-MS r.t. (min): 3.24 and 3.406B
중간체 1:
SO1861-아지드
SO1861(60mg, 0.032mmol) 및 1-아지도-3,6,9,12-테트라옥사펜타데칸-15-히드라지드(39.3mg, 0.129mmol)에 메탄올(엑스트라 건조, 1.00mL) 및 TFA(9.86μl, 0.129 mmol)응 첨가하고, 반응 혼합물을 1분 동안 흔들고 실온에 두었다. 2시간 후, 반응 혼합물을 정제용 MP-LC로 처리하였다.1 생성물에 상응하는 분획을 즉시 함께 모으고, 동결시키고 밤새 동결건조시켜 표제 화합물(58.4 mg, 84%)을 백색 플루피 고체로서 수득하였다. LC-MS에 기초한 순도 100%.
LRMS (m/z): 2150 [M-1]1-
LC-MS r.t. (min): 1.103B
중간체 2:
SO1861-3작용성 링커
SO1861-아지드(45mg, 0.021mmol) 및 3작용성 링커(26.5mg, 0.022mmol)를 DMF(2.50mL)에 용해시키고, 생성된 혼합물을 1분 동안 흔들고 실온에서 방치하였다. 30분 후, 반응 혼합물을 정제용 LC-MS에 적용하였다.3C 생성물에 상응하는 분획을 즉시 함께 모으고, 동결시키고 밤새 동결건조시켜 표제 화합물(58.4 mg, 84%)을 백색 플루피 고체로서 수득하였다. LC-MS에 기초한 순도 89%.
LRMS (m/z): 1677 [M-2]2-
LC-MS r.t. (min): 2.546A
중간체 3:
(E)-1-(4-((2-(6-(2,5-디옥소-2,5-디하이드로-1H-피롤-1-일)헥사노일)히드라지닐리덴)메틸)벤즈아미도)-N-(4-(6-메틸-1,2,4,5-테트라진-3-일)벤질)-3,6,9,12-테트라옥사펜타데칸-15-아미드
1-(4-포르밀벤즈아미도)-N-(4-(6-메틸-1,2,4,5-테트라진-3-일)벤질)-3,6,9,12-테트라옥사펜타데칸-15-아미드(28.0 mg, 0.048 mmol) 및 EMCH.TFA(24.5 mg, 0.072 mmol)에 메탄올(엑스트라 건조, 2.00 mL) 및 TFA(11.1 μL, 0.145 mmol)를 첨가하고 반응 혼합물을 50℃에서 교반하였다. 30분 후, 반응 혼합물을 진공에서 증발시키고 생성된 잔류물을 MP-LC에 의해 정제하였다.1 생성물에 상응하는 분획을 즉시 함께 모으고, 동결시키고 밤새 동결건조시켜 밝은 보라색 플루피 고체로서 표제 화합물(33.4 mg, 88%)을 수득하였다. LC-MS에 기초한 순도 92%.
LRMS (m/z): 394 [M+2]2+, 789 [M+1]1+
LC-MS r.t. (min): 1.287A
중간체 4:
메틸테트라진-BNA 올리고
HSP27 BNA 올리고 디설파이드(70.0mg, 0.012mmol)를 20mM NH4HCO3(20.0mL)에 용해시켰다. 다음으로, TCEP(14.3 mg, 0.050 mmol)를 첨가하고 반응 혼합물을 1분 동안 흔들고 실온에서 방치하였다. 반응 혼합물을 분자량 컷오프가 3000 Da(30분 동안 5000 x g)인 원심 필터를 사용하여 여과하였다. 다음으로, 2.5mM TCEP(20.0mL)와의 20mM NH4HCO3의 용액을 잔류 용액에 첨가하고, 생성된 혼합물을 위에서 설명한 동일한 조건에서 다시 여과 하였다. 잔류 용액을 20mM NH4HCO3(30.0mL)로 희석하고, 생성된 혼합물을 아세토니트릴(10.0mL) 중의 (E)-1-(4-((2-(6-(2,5-디옥소-2,5-디하이드로-1H-피롤-1-일)헥사노일)히드라진일리덴)메틸)벤즈아미도)-N-(4-(6-메틸-1,2,4,5-테트라진-3-일)벤질)-3,6,9,12-테트라옥사펜타데칸-15-아미드(14.8mg, 18.8μmol)의 용액에 첨가하였다. 반응 혼합물을 1분 동안 흔들고 실온에서 방치하였다. 30분 후 반응 혼합물을 동결하고 주말 동안 동결건조하여 분홍색의 플루피 고체로서 조(crude) 표제 생성물을 얻었다. 조 생성물에 20mM NH4HCO3(20.0mL) 용액을 첨가하고 생성된 현탁액을 0.45μm 시린지 필터로 여과하였다. 여과액은 상기와 동일한 조건으로 원심 필터(centrifugal filter)를 이용하여 여과하였다. 다음으로, 다시 20mM NH4HCO3 용액(20.0mL)을 잔류 용액에 첨가하고, 생성된 혼합물을 상기와 동일한 조건의 원심 필터를 사용하여 다시 여과하였다. 잔류 용액을 20mM NH4HCO3(20.0mL)로 희석하고, 생성된 혼합물을 밤새 동결건조하여 분홍색 플루피 고체로서 표제 생성물(90.0mg, 115%)을 수득하였다. LC-MS에 기초한 순도 91%.
LRMS (m/z): 1631 [M-4]4-, 2174 [M-3]3-
LC-MS r.t. (min): 0.737B
중간체 5:
SO1861-3작용성 링커-BNA 올리고
메틸테트라진-BNA 올리고(90.0 mg, 0.014 mmol) 및 SO1861-3작용성 링커(48.6 mg, 0.014 mmol)를 물/아세토니트릴의 혼합물(4:1, v/v, 12.0 mL)에 용해시켰다. 반응 혼합물을 1분 동안 흔들고 실온에서 방치하였다. 15분 후, 혼합물을 정제용 LC-MS에 적용하였다.4A 생성물에 상응하는 분획을 즉시 함께 모으고, 동결시키고 밤새 동결건조하여 표제 화합물(82.0 mg, 60%)을 백색의 플루피 고체로서 수득하였다. LC-MS에 기초한 순도 92%(2개의 피크는 모두 표제 화합물에 상응하는 m/z 값을 가짐).
LRMS (m/z): 1641 [M-6]6-, 1970 [M-5]5-
LC-MS r.t. (min): 3.24 and 3.406B
실시예 7
S01861-BNA 올리고 접합
HSP27 BNA 올리고 디설파이드(1.10mg, 0.187μmol)를 1.0mM TCEP(500μL)가 포함된 20mM NH4HCO3에 용해시키고 혼합물을 1분 동안 흔들고 실온에서 방치하였다. 1시간 후, 반응 혼합물을 분자량 컷오프가 3000 Da(30분 동안 14000 x g)인 원심 필터를 사용하여 여과하였다. 잔류 용액을 1.0mM TCEP(500μL)가 포함된 20mM NH4HCO3로 희석하고 생성된 혼합물을 위에서 설명한 동일한 조건에서 다시 여과하였다. 잔류 용액을 20mM NH4HCO3/아세토니트릴(3:1, v/v, 1.00mL)로 희석하고 생성된 혼합물을 SO1861-EMCH(3.54mg, 0.375μmol)에 첨가했다. 반응 혼합물을 1분 동안 흔들고 실온에서 방치하였다. 10분 후, 반응 혼합물을 정제용 LC-MS에 적용하였다.4A 생성물에 상응하는 분획을 즉시 함께 모으고, 동결시키고 밤새 동결건조하여 표제 화합물(1.25 mg, 85%)을 백색 플루피 고체로서 수득하였다. LC-MS에 기초한 순도 100%.
LRMS (m/z): 1561 [M-5]5-, 1951 [M-4]4-
LC-MS r.t. (min): 2.466B
덴드로(S01861)
4
-BNA 올리고 접합(도 17)
HSP27 BNA 올리고 디설파이드(1.1mg, 0.187μmol)를 1.0mM TCEP(500μL)가 포함된 20mM NH4HCO3에 용해하고 혼합물을 1분 동안 흔들고 실온에서 방치했다. 1시간 후, 반응 혼합물을 분자량 컷오프가 3000 Da(30분 동안 14000 x g)인 원심 필터를 사용하여 여과하였다. 잔류 용액을 1.0mM TCEP(500μL)가 포함된 20mM NH4HCO3로 희석하고 생성된 혼합물을 위에서 설명한 동일한 조건에서 다시 여과하였다. 잔류 용액을 20mM NH4HCO3/아세토니트릴(3:1, v/v, 1.0mL)로 희석하고 생성된 혼합물을 덴드론(SO1861)4-말레이미드1(3.54mg, 0.375μmol)에 첨가했다. 반응 혼합물을 1분 동안 흔들고 실온에서 방치하였다. 10분 후, 반응 혼합물을 정제용 LC-MS에 적용하였다.4A 생성물에 상응하는 분획을 즉시 함께 모으고, 동결시키고 밤새 동결건조하여 표제 화합물(1.25 mg, 85%)을 백색 플루피 고체로서 수득하였다. LC-MS에 기초한 순도 94%
LRMS (m/z): 1896 [M-8]8-, 2167 [M-7]7-
LC-MS r.t. (min): 3.776B
덴드론(NEM)
4
합성(도 18)
벤질 비스(2-((S)-2,6-비스(3-메르캅토프로판아미도)헥산아미도)에틸)카바메이트(1.69 mg, 2.00 μmol) 및 N-에틸말레이미드(1.05 mg, 8.40 μmol)에 20 mM NH4HCO3/아세토니트릴의 혼합물(3:1, v/v, 2.00 mL)을 첨가하고, 반응 혼합물을 실온에서 교반하였다. 2시간 후, 반응 혼합물을 밤새 동결건조시켰다. 생성된 잔류 물을 정제용 LC-MS3A를 사용하여 정제하여 백색 플루피 고체로서 표제 화합물(1.53 mg, 57%)을 수득하였다. LC-MS에 기초한 순도 98%.
LRMS (m/z): 1346 [M+1]1+
LC-MS r.t. (min): 1.433A
실시예 8
A431 마우스 종양 마우스 모델 및 시험관내 및 생체내 유전자 침묵 연구
재료 및 방법
링커 올리고를 갖는 HSP27BNA(서열 5'-GGCacagccagtgGCG-3')(Zhang et al,2011)을 Bio-Synthesis Inc.(Lewisville, Texas)에서 구입하였다.
시험관내 RNA 분리 및 유전자 발현 분석
세포로부터 RNA를 분리하고 표준 프로토콜(Biorad)에 따라 분석하였다.
생체내 마우스 종양 모델
마우스 연구는 표준 프로토콜 및 절차에 따라 CrownBio(중국)에서 수행되었다. 모델: 암컷 BALB/c 누드 마우스의 피하 A431 인간 표피모양 암종 이종이식 모델. 종양 부피를 모니터링하고 유전자 침묵 분석을 위해 종양 샘플을 수집했다(하기 참조).
마우스에서 종양 샘플의 RNA 분리 및 유전자 발현 분석
제조업체의 지침에 따라 TriZol(Thermo Fisher)을 사용하여 종양에서 총 RNA를 분리했다. 분리된 RNA를 뉴클레아제가 없는 물(nuclease-free water, NFW)에 재현탁했다. RNA 샘플은 겔에서 RNA 무결성을 확인했다. cDNA를 준비하기 위해, 우선 100ng 총 RNA를 NFW에서 12.5μl의 최종 부피로 Random Hexamers(Qiagen; 최종 농도 2μM)와 혼합하고 70℃에서 5분 동안 변성시킨 후 즉시 얼음 위에서 냉각했다. 다음으로, 4μl 5xRT 버퍼(Promega), 0.4μl 25mM dNTP(Promega), 1μl 200U/μL MMLV RT-효소(Promega), 0.5μL 40U/μL RNAse 억제제(Promega) 및 1.6μL NFW으로 구성된 7.5μl의 cDNA 합성 혼합물이 첨되었다. 다음 cDNA 합성 프로토콜이 사용되었다: 1) 10분 25℃ 2) 60분 37℃ 3) 5분 85℃ 4) ∞ 4℃. 단일 qPCR 반응의 경우, 다음 혼합물이 준비되었다: 1μL cDNA, 0.05μL 정방향 프라이머(250μM), 0.05μL 역방향 프라이머(250μM), 8.9μl LNFW, 10μl SYBR Green(Bio-Rad). 다음 qPCR 프로토콜이 사용되었다: 1 사이클: 5분 95℃, 40 사이클: 15초 95℃ + 30초 60℃.
HSP27 유전자 발현은 2-(Ct HSP27 -GEOMEAN(Ct ref1;Ct ref2;Ct ref3;Ct ref4 ))를 사용하여 계산되었으며, 여기서 ref1, ref2, ref3 및 ref4는 종양 분석을 위한 레퍼런스 유전자 IMMT, EIF2S2, GUSB 및 UBC이다. 이 종양 샘플에 대해 가장 이상적이고 안정적인 레퍼런스 유전자를 선택하기 위해 테스트한 9개의 레퍼런스 유전자 중 GeNORM 분석의 성능을 기반으로 4개의 레퍼런스 유전자가 선택되었다. 이를 위해 qPCR 결과를 Qbase+ 소프트웨어 프로그램으로 가져와 두 가지 품질 측정값을 계산했다: 정규화된 레퍼런스 유전자 발현 수준의 변동 계수(coefficient of variation)(V); 및 geNorm 안정성 M-값(M)1. M<0.2 및 V<0.15인 레퍼런스 유전자는 매우 안정적인 것으로 간주된다. 이 분석을 기반으로 IMMT 및 EIF2S2가 가장 안정적인 레퍼런스 유전자로 선택되었다. 그러나, 정규화의 정확도를 더욱 향상시키기 위해 UBC 및 GUSB도 레퍼런스 유전자 그룹에 추가되었다. 각 샘플은 CFX96 Real-Time qPCR 기계(Bio-Rad)에서 기술 삼중(technical triplicate)으로 분석되었다.
실시예 9
접합체 합성
모노클로날 항체, S01861, QS 사포닌
트라스투주맙(Herceptin®), 세툭시맙(Erbitux®) 및 T-DM1(kadcaya®)을 제약회사(charlite, Berlin)으로부터 구입하였다. CD71 모노클로날 항체는 BioCell(Okt9,# BE0023)로부터 구입하였다. SO1861은 사포나리아 오피시날리스 L.(Saponaria officinalis L.)로부터 얻은 원료 식물 추출물로부터 Analyticon Discovery GmbH에 의해 분리 및 정제되었다. 퀼라자 사포나리아(Quillaja Saponaria) 사포닌 추출물(QSimix)은 구입하였다(Sigma Aldrich,# S4521).
재료
트라스투주맙(Tras, Herceptin®, Roche), 세툭시맙(Cet, Erbitux®, Merck KGaA), 트리스(2-카르복시에틸)포스핀 하이드로클로라이드(TCEP, 98%, Sigma-Aldrich), 5,5-디티오비스(2-니트로벤조산)(DTNB, Ellman's 시약, 99%, Sigma-Aldrich), Zeba™ Spin Desalting Columns(2mL, Thermo-Fisher), NuPAGE™ 4-12% Bis-Tris Protein Gels(Thermo-Fisher), NuPAGE™ MES SDS Running Buffer(Thermo-Fisher), Novex™ Sharp Pre-stained Protein Standard(Thermo-Fisher), PageBlue™ Protein Staining Solution(Thermo-Fischer), Pierce™ BCA Protein Assay Kit(Thermo-Fisher), N-에틸말레이미드(NEM, 98%, Sigma-Aldrich), 1,4-디티오트레이톨(DTT, 98%, Sigma-Aldrich), Sephadex G25(GE Healthcare), Sephadex G50 M(GE Healthcare), Superdex 200P(GE Healthcare), 이소프로필 알코올(IPA, 99.6%, VWR), 트리스(히드록시메틸)아미노메탄(Tris, 99%, Sigma-Aldrich), 트리스(히드록시메틸)아미노메탄 하이드로클로라이드(Tris.HCL, Sigma-Aldrich), L-히스티딘(99%, Sigma-Aldrich), D-(+)-트레할로스 디하이드레이트(99%, Sigma-Aldrich), 폴리에틸렌 글리콜 소르비탄 모노라우레이트(TWEEN 20, Sigma-Aldrich), Dulbecco 포스페이트-완충 염수(DPBS, Thermo-Fisher), 구아니딘 하이드로클로라이드(99%, Sigma-Aldrich), 에틸렌디아민테트라아세트산 디소듐염 디하이드레이트(EDTA-Na2, 99%, Sigma-Aldrich), 멸균 필터 0.2 μm 및 0.45 μm(Sartorius), 석신이미딜 4-(N-말레이미도메틸)시클로헥산-1-카르복실레이트(SMCC, Thermo-Fisher), 디안틴-Cys(Dia-Cys, 단일 C-말단 시스테인 작용을 갖는 디안틴 변종(Dianthin mutant), Proteogenix), Vivaspin T4 및 T15 농축기(Sartorius), Superdex 200PG(GE Healthcare), 테트라(에틸렌 글리콜)신이미딜 3-(2-피리딜디티오)프로피오네이트(PEG4-SPDP, Thermo-Fisher), HSP27 BNA 디설파이드 올리고뉴클레오티드(Biosynthesis), [O-(7-아자벤조트리아졸-1-일)-N,N,N,N-테트라메틸우로늄-헥사플루오르포스파트]([O-(7-Azabenzotriazol-1-yl)-N,N,N,N-tetramethyluronium-hexafluorphosphat])(HATU, 97%, Sigma-Aldrich), 디메틸 설폭사이드(DMSO, 99%, Sigma-Aldrich), N-(2-아미노에틸)말레이미드 트리플루오로아세테이트염(AEM, 98%, Sigma-Aldrich), L-시스테인(98.5%, Sigma-Aldrich), 탈이온수(DI)(Ultrapure Lab Water Systems (MilliQ, Merck)로부터 새로 취함), 니켈-니트릴로트리아세트산 아가로오스(Ni-NTA agarose, Protino), 글리신(99.5%, VWR), 5,5-디티오비스(2-니트로벤조산(Ellman's 시약, DTNB, 98%, Sigma-Aldrich), S-아세틸메르캅토석시닉 안하이드라이드 플루오레세인(SAMSA 시약, Invitrogen) 소듐 비카보네이트(99.7%, Sigma-Aldrich), 소듐 카보네이트(99.9%, Sigma-Aldrich), Sephadex G-25 수지를 갖는 PD MiniTrap 탈염 컬럼(GE Healthcare), PD10 G25 탈염 컬럼(GE Healthcare), 0.5, 2, 5 및 10mL의 Zeba 스핀 탈염 컬럼(Thermo-Fisher), Vivaspin 원심 필터(Centrifugal Filters) T4 10 kDa MWCO, T4 100 kDa MWCO 및 T15(Sartorius), Biosep s3000 aSEC 컬럼(Phenomenex), Vivacell Ultrafiltration Units 10 및 30 kDa MWCO(Sartorius), Nalgene Rapid-Flow 필터(Thermo-Fisher),
방법
MALDI-TOF-MS
MALDI-TOF(Matrix-assisted laser desorption/ionization time of flight) 스펙트럼은 MALDI-질량 분광계(Bruker Ultrafex III)에서 기록되었다. 전형적으로, 나노몰 내지 마이크로몰 범위의 MilliQ 물에 용해된 샘플은 아세토니트릴(MADLI-TOF-MS 시험됨, Sigma)/0.1% TFA(7:3 v/v)에 용해된 매트릭스로서 슈퍼-DHB(99%, Fluka) 또는 시나핀산(SA, 99%, Sigma-Aldrich)를 사용하여 건조-액적법을 통해 표적(MTP 384 표적 플레이트 연마된 강 T F, Bruker Daltons) 상에서 스포팅되었다. PepMix(Peptide Calibration Standard, Bruker Daltons) 또는 ProteoMass(Protein Calibration Standard, Sigma-Aldrich)가 보정 표준으로 사용되었다. RP 모드는 리플렉터 포지티브 모드를 나타낸다. RN 모드는 리플렉터 네거티브 모드를 나타낸다. LP 모드는 선형 포지티브 모드를 나타낸다.
투석
재생 셀룰로오스 막: MWCO = 1 및 2 kDa(Spectra/Por) 및 MWCO = 12-14 kDa(Carl Roth)를 사용하여 투석을 수행했다. 전형적으로, 투석은 1L의 용매로 24시간 동안 수행되었으며, 용매는 공정의 처음 6시간 후에 교환되었다.
동결건조
동결건조는 Alpha 1-2 LD plus(Martin Christ Gefriertrocknungsanlagen GmbH)에서 수행되었다. 전형적으로, 샘플을 액체 질소로 동결하고 고진공에서 동결 건조기에 넣었다.
UV-Vis
흡광도 측정은 Perkin Elmer Lambda 25 UV-Vis 또는 Thermo NanoDrop ND-2000 분광기(spectrometer)에서 200-750 nm의 스펙트럼 범위에서 수행되었다.
농도는 다음 매개변수를 사용하여 Thermo Nanodrop 2000 또는 Lambda 25 분광기를 사용하여 측정되었다:
트라스투주맙 OD280 = 1.5 (mg/ml)-1 cm-1
세툭시맙 OD280 = 1.4 (mg/ml)-1 cm-1
HSP27 올리고뉴클레오티드 OD260 = 153,000 M-1 cm-1; Rz260:280 = 1.819
Dia-Cys OD280 = 0.57 (mg/ml)-1 cm-1
PEG4-SPDP (PDT) OD343 = 8,080 M-1 cm-1
SAMSA-플루오레세인 OD495 = 64,500 M-1 cm-1; Rz280:495 = 0.232
Ellmans (TNB) OD412 = 14,150 M-1 cm-1
고정화 금속 이온 친화성 크로마토그래피(IMCA)
니켈-니트릴로트리아세트산(Ni-NTA) 크로마토그래피를 수행하여 히스티딘-태그된 단백질 및 단백질-접합체를 정제하였다. 간략하게, Ni-NTA 아가로오스(10mL)를 5mL 베드 부피에 대해 중력 흐름 컬럼으로 피펫으로 옮겼다. 수지를 20mL 탈이온수로 세척하고 5mL의 100mM NiSO4 용액으로 재충전했다. 수지를 5mL 탈이온수로 다시 5회 세척하고 DPBS로 5회 평형화시켰다. 단백질 용액을 4℃에서 30분 동안 회전하는 세척된 Ni-NTA 아가로오스와 함께 인큐베이션했다. 그 후, Ni-NTA 단백질 용액을 중력 흐름 컬럼으로 다시 피펫으로 옮겼다. 통과 흐름을 수집하고 수지를 5mL DPBS로 3회 세척했다. 그 다음, 고정된 샘플은 125mM, pH 8인 50mL에서 250mM, pH 8인 50mL로 이미다졸 농도를 증가시켜 용리되었다. 용리 분획을 PBS pH 7.4에 대해 투석하여 정제된 샘플을 얻었다.
크기 배제 크로마토그래피
크기 배제 크로마토그래피(SEC)를 AKTA 정제기 상에서 수행하였다. 샘플을 TBS/이소프로필 알코올 용액(85:15 v/v)으로 용리하는 Sephadex G50M 컬럼(10 x 40 cm)또는 Biosep SEC-S3000 컬럼 중 하나를 사용하여 SEC로 분석하였다. 샘플 순도는 추적 응집체 피크에 대한 항체 샘플 피크의 통합에 의해 측정되었다.
엘만 어세이(Ellman assay)
엘만 시험(또는 엘만 어세이)을 실시하여 분광광도법을 통해 샘플 중의 티올 농도를 정량적으로 측정하였다. 티올의 존재는 티올의 존재하에 엘만 시약으로부터 2-니트로-5-티오벤조에이트(TNB)의 화학량론적 방출을 통해 나타내었다. TNB는 412 nm에서의 흡수 최대값 및 버퍼링된 시스템에서의 OD412 = 14,150 M-1 cm-1의 흡광 계수를 획득한다. 간략하게, 포스페이트 버퍼(0.1M, 1 mM EDTA, pH 7.4) 중의 엘만 시약(5,5-디티오비스(2-니트로벤조산), DTNB) 0.5mg/mL 용액 2μL를 버퍼 중에 티올을 함유하는 샘플 20μL와 혼합하였다. 그 혼합물을 5초 동안 볼텍싱하였다(vortexed). 이어서, 412 nm에서의 UV-Vis 흡광도를 Thermo Nanodrop 2000 상에서 측정하여 TNB 농도 및 이에 따른 샘플의 티올 함량을 측정하였다.
디안틴 제조
디안틴은 박테리아 배양물에서 발현되었고, 그 단백질은 당업계에 공지된 통상적인 세포 배양 및 단백질 정제 단계에 따라 정제되었다.
사포린 접합체의 제조
맞춤형 트라스투주맙-사포린 세툭시맙-사포린, CD71mab-사포린 접합체는 Advanced Targeting Systems(San Diego, CA)에서 제조되고, 이로부터 구입되었다. IgG-사포린 및 사포린은 Advanced Targeting Systems으로부터 구입하였다.
항체-(Cys-덴드론-(L-SO1861)
n
)
n
합성
트라스투주맙 및 세툭시맙은 이하 "Ab"로 지칭된다. Ab는 Ab와 수지상 사포닌 사이에서 티올레-엔 Michael형 반응을 행하는 테트라(에틸렌 글리콜) 석신이미딜 3-(2-피리딜디티오)프로피오네이트(PEG4-SPDP) 링커를 통해 수지상(dendritic) 사포닌[덴드론-(L-SO1861)4-말레이미드]에 접합되었다. 절차는 세툭시맙-(S-덴드론-(L-SO1861)4)4에 대해 예시적으로 설명된다.
세툭시맙을 DPBS pH 7.5 버퍼로 탈염한 다음, 2.50 mg/ml로 노르말화하였다. Ab(9.19mg, 61nmol)의 분취물에 새로 준비된 PEG4-SPDP 용액(5.0mg/ml, 6.70몰 당량, 411nmol)의 분취물을 첨가하고, 혼합물을 간략히 볼텍싱한 다음 롤러-믹싱하면서 20℃에서 60분 동안 인큐베이션했다. 인큐베이션 후, 글리신(20mg/ml, 7.7μl)을 첨가하여 반응을 켄칭한 다음, TCEP(5.0mg/ml, SPDP 당 4.0몰 당량, 1.64μmol)를 첨가하여 SPDP 모이어티를 원위치에서 환원하였다. 이 혼합물을 롤러-믹싱으로 20℃에서 15분 동안 롤러-믹싱하였다. 생성된 Ab-SH를 제바(zeba) 스핀 탈염 컬럼을 사용하여 TBS pH 7.5로 겔 여과에 의해 정제하였다. Ab-SH는 UV-Vis 분석 및 엘만 어세이로 특성화되었다(티올 대 Ab 비율 = 5.4). 벌크 Ab-SH(7.41mg, 1.93mg/ml, 49nmol)에 DMSO 중의 새로 준비된 덴드론-(L-SO1861)4-말레이미드 용액(10mg/ml, Ab 당 8.0몰 당량, 0.4 μmol, 3.16 mg, 0.32 ml)의 분취물을 첨가하고, 혼합물을 간략히 볼텍싱한 다음 20℃에서 밤새 인큐베이트했다. 접합 반응 외에, 탈염된 Ab-SH(0.25 mg, 1.67 nmol)의 두 분취물을 접합 전에 제거하고, 각각 양성 및 음성 대조군으로서, NEM(Ab 당 8.0 몰 당량, 13.3 nmol, 0.25 mg/ml 용액 6.7 μl)또는 TBS pH 7.5 버퍼(6.7 μl)와 20℃에서 밤새 반응시켰다. (NEM 첨가 전) 18시간 동안 인큐베이션한 후, 조 접합체 혼합물을 간단히 원심분리하고 UV-Vis에 의한 분석을 위해 100㎕ 분취물을 제거하고, 양성 및 음성 대조군과 함께 엘만 어세이에 의해 특성화하여 덴드론-(L-SO1861)4 편입을 획득하였다. 벌크 Ab-덴드론-(L-SO1861)4 혼합물에 새로 준비된 NEM 용액(2.5mg/ml, 5.0몰 당량, 0.25μmol)의 분취물을 첨가하고, 그 혼합물을 DPBS pH 7.5로 용리하는 1.6 × 30cm Sephadex G50 컬럼으로 정제하여 정제된 세툭시맙-(S-덴드론-(L-SO1861)4)4 접합체를 얻었다. 생성물을 0.2μm로 여과하여 투명하게 한 다음, 비바스핀 T15 농축기(3,000g, 5분 간격, 5℃)를 사용하여 약 3 mg/ml로 조심스럽게 농축하여 최종 세툭시맙-(S-덴드론(L-SO1861)4)4 접합체를 수득하였다. 수율: 4.41mg, 48%. 덴드론-(L-SO1861)4 대 Ab 비율 = 4.4.
항체-(L-S01861)
n
(도 12에 예시된 바와 같음)
트라스투주맙, 세툭시맙은 이하 "Ab"로 지칭된다. Ab는 1, 2, 3, 4, 5 및 6의 DAR로 Michael형 티올-엔 접합 반응을 통해 사포닌 SO18161-EMCH에 접합되었다. SO1861-EMCH 분자는 이의 구조와 이의 말레이미드 작용 사이에 불안정한 (L) 히드라존 결합을 가져 사포닌과 Ab 사이에 불안정한 결합을 생성한다. 절차는 트라스투주맙-(L-SO1861)4에 대해 예시적으로 설명된다:
세툭시맙 용액(40mg, 8.0ml)에 Tris 농축물(127mg/ml, 1.05M), Tris.HCl 농축물(623mg/ml, 3.95M) 및 EDTA-Na2 농축물(95 mg/ml, 0.26M)을 각각 10㎕/ml 첨가하여 50mM TBS, 2.5mM EDTA 버퍼 pH 7.5를 얻었다.
네 부분으로 나누어진 세툭시맙(각각 9.73 mg, 4.864 mg/ml, 65 nmol)에 새로 준비된 TCEP 용액(0.5 - 2.0 mg/ml, 1.15 - 7.02 몰 당량, 75 - 455 nmol)의 분취물을 첨가하고, 그 혼합물을 간단히 볼텍싱한 다음 롤러-믹싱과 함께 20℃에서 300분 동안 인큐베이션했다. 인큐베이션 후 (SO1861-EMCH 첨가 전), Ab-SH의 약 1mg(0.210ml) 분취물을 각각의 혼합물에서 제거하고, 제바 스핀 탈염 컬럼을 사용하여 TBS pH 7.5로 겔 여과하여 정제했다. 이러한 분취물은 UV-Vis 분석 및 엘만 어세이로 특성화되었다(티올 대 Ab 비율 = 각각 2.0, 4.2, 5.9 및 6.8). 각각의 벌크 Ab-SH에 새로 준비된 SO1861-EMCH 용액(2 mg/ml, '티올' 당 1.3몰 당량, 0.15 - 0.61 μmol, 0.16 - 0.63 ml)의 분취물을 첨가하고, 혼합물을 간단히 볼텍싱한 다음 20℃에서 120분 동안 인큐베이션하였다. 각 접합 반응 외에, 각각 양성 및 음성 대조군으로서 탈염된 Ab-SH(0.25mg, 1.67nmol)의 두 분취물을 NEM('티올' 당 1.3몰 당량, 4.3~17.4nmol, 2.2~8.7μl의 0.25mg/ml 용액) 또는 TBS pH 7.5 버퍼(2.2 - 8.7 μl)와 20℃에서 120분간 반응시켰다. (NEM 첨가 전) 배양 후, Ab - SO1861-EMCH 혼합물의 0.200ml 분취물을 제거하고 제바 스핀 탈염 컬럼을 사용하여 TBS pH 7.5로 겔 여과하여 정제했다. 이 분취물은 UV-Vis로 특성화되었으며 양성 및 음성 대조군과 함께 엘만 어세이에 의해 특성화되어 SO1861-EMCH가 편입되었다. 벌크 Ab - SO1861-EMCH 혼합물에 새로 준비된 NEM 용액(2.5 mg/ml, 2.5 - 10 mole 당량, 0.15 - 0.58 μmol)의 분취물을 첨가하고 혼합물을 DPBS pH 7.5로 용리하는 제바 스핀 탈염 컬럼으로 정제하여 정제된 세툭시맙-(L-SO1861) 접합체를 수득하였다. 생물학적 평가를 위해 분배하기 전에 생성물을 2.5 mg/ml로 정규화하고(normalized) 0.2μm로 여과하였다.
항체-(S-S01861)
n
합성
S01861-S-Mal 합성
사포나리아 오피시날리스 L로부터의 SO1861(15.4mg, 8.28μmol) 및 HATU(140mg, 368μmol, 44.5몰 당량)를 자기 교반기가 구비된 20mL 유리 바이알에 고체로 넣고, 5mL DMSO를 첨가하여 물질을 용해시켰다. 용해된 혼합물을 실온에서 30분 동안 교반하였다. 30분 후, DMSO 중의 새로 준비된 AEM 용액(65mg, 256μmol, 31몰 당량) 1mL를 교반되고 있는 SO1861-HATU 혼합물에 첨가했다. 반응 혼합물을 실온에서 17시간 동안 교반하였다. 17시간 동안 교반한 후, 혼합물을 탈이온수로 희석하고 1kDa의 MWCO를 함유한 재생 셀룰로오스막 튜브(Spectra/Por 7)를 사용하여 탈이온수에 대해 24시간 동안 광범위하게 투석했다. 투석 후, 용액을 동결건조하여 백색 분말을 얻었다.
수율: 7.22mg(44%).
건조된 분취물은 MALDI-TOF-MS를 통한 특성화에 추가로 사용되었다.
MALDI-TOF-MS(RN 모드): m/z 1983 Da([M-H]-, SO1861-S-Mal 접합체), 2136 Da([M-H]-, 사포닌-S-Mal 접합체).
MALDI-TOF-MS(RP 모드): m/z 2007 Da([M + Na]+, SO1861-S-Mal 접합체), 2107 Da([M - Na]+, 사포닌-S-Mal 접합체).
말레이미드 작용성은 정제된 SO1861-S-Mal을 새로 준비된 L-시스테인 용액(1000몰 초과)과 혼합하고 m/z 2103 Da에서 시스테인-접합체를 생성하는 MALDI-TOF-MS에서 예상되는 질량 쉬프트를 관찰함으로써 확인되었다(도 x).
항체 접합
트라스투주맙 및 세툭시맙은 이하 "Ab"로 지칭된다. Ab는 Michael형 티올-엔 접합 반응을 통해 사포닌 SO18161-S-Mal에 접합되었다. 사포닌은 이의 구조와 이의 말레이미드 작용 사이에 안정한 (S) 아미드 결합을 가져 사포닌과 Ab 사이에 안정한 결합을 생성한다.
PBS(포스페이트 버퍼 염수)에 용해된 Ab 5mg을 제바 스핀 탈염 컬럼을 통해 트리스(히드록시메틸)-아미노메탄 버퍼 염수(TBS) pH 7.5로 버퍼 교환하고 3mg/mL의 농도로 정규화하였다. Ab에 새로 준비된 트리스(2-카르복시에틸)포스핀(TCEP) 용액(0.25mg/mL, 2.92몰 당량)의 분취물을 첨가하고, 혼합물을 간단히 볼텍싱한 다음, 20℃에서 90분 동안 인큐베이션했다. 그 후, 생성된 Ab-SH를 제바 스핀 탈염 컬럼을 사용하여 TBS pH 7.5로 겔 여과하여 정제하였다. 설프히드릴 함량을 확인하기 위해 엘만 어세이에 의해 분취물을 분석했다. 수득된 Ab-SH를 접합을 위한 단일 부분과 대조군을 위한 0.25mg의 2개 분취물로 분할하였다. AB-SH의 주된 부분(main portion)에 새로 준비된 SO1861-S-Mal 용액의 분취물(2 mg/mL, 설프히드릴 함량에 대해 2 몰 당량)을 첨가하고, 두 번째 대조군 분취물에 버퍼 TBS pH 7.5를 첨가했다. 각 혼합물을 간단히 볼텍싱한 다음 20℃에서 2시간 동안 인큐베이션했다. 그 후, 각각의 분취물을 엘만 어세이로 분석하여 대조군과 관련하여 접합체에 남아 있는 설프히드릴 함량을 확인했다. 제바 스핀 탈염 컬럼(zeba spin desalting column)에 의해 Dulbecco의 PBS pH 7.1로 겔 여과하여 정제한 후, Ab-S-SO1861을 얻었다. 접합체를 순도 %를 확인하기 위해 SEC에 의해 추가로 분석하였다.
트라스투주맙-(S-SO1861)4 샘플의 경우, 99% 순도로 측정되었다. 세툭시맙-(S-SO1861)4 샘플의 경우, 98.3% 순도로 측정되었다. 트라스투주맙-(S-SO1861)4(9.1mL) 및 세툭시맙-(S-SO1861)4(8.8mL)의 체류 부피는 유사한 것으로 나타났으며 비변형 Ab(예, IgG)와 일치한다.
항체-(L-HSP27 BNA)
n
DAR4로 PEG
4
-SPDP를 통한 트라스투주맙-(L-HSP27)
4
, 세툭시맙-(L-HSP27)
4
합성 및 DAR2로 PEG
4
-SPDP를 통한 세툭시맙-(L-HSP27)
2
합성
트라스투주맙, 세툭시맙은 이하 "Ab"로 지칭된다. Ab는 Ab와 HSP27 BNA 사이에 불안정한 (L) 디설파이드 결합을 형성하는 테트라(에틸렌 글리콜) 석신이미딜 3-(2-피리딜디티오)프로피오네이트(PEG4-SPDP) 링커를 통해 HSP27 BNA 디설파이드에 접합되었다. 절차는 트라스투주맙-(L-HSP27 BNA)4에 대해 예시적으로 설명된다:
HSP27 BNA 디설파이드 올리고(2.7mg, 470nmol, 6.10mg/ml)를 TCEP(10몰 당량, 4.7μmol, 1.34mg, 50mg/ml)와 20℃에서 롤러 믹싱하면서 30분 동안 반응시켰다. 그 후, 올리고-SH를 TBS pH 7.5로 용리하는 PD10 G25 탈염 컬럼으로 정제하고 즉시 사용하였다. 올리고-SH를 얻었다(2.48 mg, 90%, 1.24 mg/ml, SH 대 올리고 비율 = 0.8)
트라스투주맙(1.5 mg, 10.3 nmol, 2.50 mg/ml)을 DMSO(1 mg/ml) 중의 새로 준비된 PEG4-SPDP 용액(6.81 몰 당량, 70.1 nmol, 39 μg)의 분취물과 20℃에서 롤러 믹싱하면서 60분 동안 반응시켰다. 그 후, 반응을 글리신(TBS pH 7.5에서 새로 준비된 2 mg/ml 용액 15.1 ㎕)으로 켄칭한 다음, TBS pH 7.5로 용리하는 제바 탈염 컬럼을 통해 탈염하였다. 생성된 Tras-S-PEG4-SPDP의 분취물을 취해, UV-Vis 분석으로 시험했다. SPDP 편입은 TCEP를 사용하여 피리디일-2-티온(PDT)을 유리시키고 343 nm(SPDP 대 Ab 비율: 4)에서 UV-Vis 분석에 의해 측정되었다. 나머지 Tras-(S-PEG4-SPDP)4는 새로 준비된 HSP27 올리고뉴클레오티드(올리고-SH)의 분취물(8 몰 당량, 82.4 nmol, 1.24 mg/ml)과 반응되고 롤러 믹싱과 함께 20℃에서 밤새 인큐베이션했다. 17시간 후, 접합체를 UV-Vis 분석으로 분석하여 343 nm에서 피리디일-2-티온(PDT)의 치환에 의한 HSP27의 편입을 확인하였다. 조 접합체를 DPBS pH 7.5로 용리하는 1.6 x 33 cm Sephadex G50 컬럼을 사용하여 정제했다. 생성된 트라스투주맙-(L-HSP27)4를 단일 분획으로 얻었다. 수율: n.d.. 순도: 96%, HSP27 BNA 대 Ab 비율 = 4.4
항체-(L-HSP27 BNA-L-차단된(blocked))
n
트라스투주맙-(L-HSP27-L-차단된)
4
, 세툭시맙-(L-HSP27-L-차단된)
트라스투주맙 및 세툭시맙은 이하 "Ab"로 지칭된다. Ab는, 이후 "HSP27-Mal"로 지칭되는, HSP27 유도체를 함유하는 말레이미도(Mal)에 접합되었다. Ab는 Michael형 티올-엔 접합 반응을 통해 HSP27-Mal에 접합되었다. HSP17-Mal은 이의 구조와 이의 말레이미드 작용 사이에 불안정한 (L) 히드라존 결합을 가져 HSP27 BNA과 Ab 사이에 불안정한 결합을 생성한다. 절차는 트라스투주맙-(L-HSP27 BNA-L-차단)n에 대해 예시적으로 설명된다:
트라스투주맙을 탈이온수(DI)로 21mg/ml로 재구성한 다음 히스티딘 버퍼 pH 6을 사용하여 5mg/ml로 희석했다. 20mg(4.0ml) 분취물에 Tris 농축물(127mg /ml, 1.05M), Tris.HCl 농축물(623mg/ml, 3.95M) 및 EDTA-Na2 농축물(95mg/ml, 0.26M)을 각각 10 μl/ml 첨가하여 50mM TBS, 2.5mM EDTA 버퍼 pH 7.5를 얻었다. 트라스투주맙(20.30mg, 4.920mg/ml, 0.14μmol)에 새로 준비된 TCEP 용액(1.00mg/ml, 2.35몰 당량, 0.32μmol)의 분취물을 첨가하고, 혼합물을 잠시 볼텍싱한 다음 롤러 믹싱하면서 20℃에서 90분 동안 인큐베이션했다. 인큐베이션 후(HSP27-Mal 첨가 전), Ab-SH의 약 2mg(0.439ml) 분취물을 각 혼합물에서 제거하고, 제바 스핀 탈염 컬럼을 사용하여 TBS pH 7.5로 겔 여과하여 정제했다. 이 분취물은 UV-Vis 분석 및 엘만 어세이로 특성화되었다(티올 대 ab 비율 = 4.0). 벌크 Ab-SH(5.1mg, 35nmol)에 HSP27-Mal 유도체(TBS pH 7.5에서 새로 준비됨, 2mg/ml, '티올' 당 1.3몰 당량, 182nmol)의 분취물을 첨가하고, 혼합물을 짧게 볼텍싱시킨 다음 20℃에서 120분 동안 인큐베이션했다. 트라스투주맙 - HSP27 BNA 유도체 접합 반응 외에, 탈염된 Ab-SH(0.5mg, 3.3nmol)의 두 분취물을 각각 양성 및 음성 대조군으로서 NEM('티올' 당 1.3몰 당량, 17.3nmol, 0.25mg/ml 용액 6.7μl) 또는 TBS pH 7.5 버퍼(6.7μl)와 20℃에서 120분 동안 반응시켰다. 인큐베이션 후(NEM 첨가 전), Ab - HSP27 BNA 혼합물의 0.100ml 분취물을 제거하고 제바 스핀 탈염 컬럼을 사용하여 TBS pH 7.5로 겔 여과하여 정제했다. 이 분취물은 UV-Vis로 특성화되었으며 양성 및 음성 대조군과 함께 엘만 어세이로 특성화되어 HSP27가 편입되었다. 벌크 Ab - HSP27 혼합물에 새로 준비된 NEM 용액의 분취물(0.25 mg/ml, 2.5 mole 당량, 89 nmol)을 첨가하고 혼합물을 DPBS pH 7.5로 용리하는 1.6 × 30 cm Sephadex G50M을 사용한 겔 여과로 정제한 다음, 반복된 원심 여과 및 100KDa MWCO 농축기를 사용하여 세척하여 정제된 트라스투주맙-(L-HSP27-L-차단된)4 접합체를 얻었다. 생물학적 평가를 위해 분배하기 전에 생성물을 0.2μm로 여과하였다.
항체 -(Cys-3작용성 링커-(L-S01861)-(L-HSP27 BNA))
n
트라스투주맙-[S-Tri-(L-SO1861)-(L-HSP27)]
4
, 트라스투주맙-[S-Tri-(차단된)-(L-HSP27)]
4
, 세툭시맙-[S-Tri-(L-SO1861)-(L-HSP27)]
4
, 세툭시맙-[S-Tri-(차단된(L-HSP27)]
4
트라스투주맙 및 세툭시맙은 이하 "Ab"로 지칭된다. Ab는, 이후 "HSP27-Mal"로 지칭되는, HSP27 BNA 유도체를 함유하는 2개의 상이한 말레이미드(Mal)에 Michael형 티올-엔 반응을 통해 접합되었다. 이러한 HSP27-Mal 유도체는 즉: 1) Mal-3작용성 링커-(L-SO1861)-(L-HSP27), 2) Mal-3작용성 링커-(차단된)-(L-HSP27)이었다. 절차는 트라스투주맙-[S-3작용성 링커-(L-SO1861)-(L-HSP27 BNA)]4에 대해 예시적으로 설명된다:
트라스투주맙은 탈이온수(DI)로 21mg/ml로 재구성되고, 그 다음 히스티딘 버퍼 pH 6을 사용하여 5mg/ml로 희석되었다. 20mg(4.0ml) 분취물에 Tris 농축물(127mg /ml, 1.05M), Tris.HCl 농축물(623mg/ml, 3.95M) 및 EDTA-Na2 농축물95mg/ml, 0.26M)을 각각 10 μl/ml 첨가하여 50mM TBS, 2.5mM EDTA 버퍼 pH 7.5를 얻었다.
트라스투주맙(20.30mg, 4.920mg/ml, 0.14μmol)에 새로 준비된 TCEP 용액(1.00mg/ml, 2.35mol 당량(equivalent), 0.32μmol)의 분취물을 첨가하고, 혼합물을 잠시 볼텍싱한 다음 롤러 믹싱하면서 20℃에서 90분 동안 인큐베이션했다. 인큐베이션 후(구성물(construct) 추가 전), Ab-SH의 약 2mg(0.439ml) 분취물을 각 혼합물에서 제거하고, 제바 스핀 탈염 컬럼을 사용하여 TBS pH 7.5로 겔 여과하여 정제했다. 이러한 분취물은 UV-Vis 분석 및 엘만 어세이(티올 대 ab 비율 = 4.0)로 특성화되었다. 벌크 Ab-SH를 2개의 분취물(1.1 mg, 7.6 nmol 및 1.2 mg, 8.3 nmol)으로 분할하고, 각 분취물에 HSP27 BNA-Mal 유도체 1 - 2의 각각의 분취물(TBS pH 7.5에서 새로 준비됨, 2mg/ml, '티올' 당 1.3몰 당량, 40nmol 및 43nmol)을 첨가하고, 혼합물을 잠시 볼텍싱시킨 다음 20℃에서 120분 동안 인큐베이션했다. 트라스투주맙 - HSP27 BNA 유도체 2 접합 반응 외에도, 탈염된 Ab-SH(0.5mg, 3.3nmol)의 두 분취물을 각각 양성 및 음성 대조군으로서 NEM('티올' 당 1.3몰 당량, 17.3nmol, 0.25mg/ml 용액 6.7μl) 또는 TBS pH 7.5 버퍼(6.7μl)와 20℃에서 120분 동안 반응시켰다. 인큐베이션 후(NEM 첨가 전), Ab - 구성물 2 혼합물의 0.100ml 분취물을 제거하고, 제바 스핀 탈염 컬럼을 사용하여 TBS pH 7.5로 겔 여과하여 정제했다. 이 분취물은 UV-Vis로 특성화되고 양성 및 음성 대조군과 함께 엘만 어세이로 특성화되어 HSP27 BNA 유도체 2가 편입되었다. 각각의 벌크 Ab - 구성물 혼합물에 새로 준비된 NEM 용액(0.25 mg/ml, 2.5 mole 당량, 19 및 21 nmol)의 분취물을 첨가하고 혼합물을 DPBS pH 7.5로 용리하는 1.6 × 30 cm Sephadex G50M을 사용하여 겔 여과로 정제한 다음, 반복된 원심 여과 및 100KDa MWCO 농축기를 사용하여 세척하여 정제된 트라스투주맙 - 구성물 1 - 2 접합체를 얻었다. 생물학적 평가를 위해 분배하기 전에 생성물을 0.2μm로 여과하였다.
항체-(L-S01861)
n
-(L-HSP27 BNA)
n
DAR4로 PEG
4
-SPDP를 통한 트라스투주맙-(L-SO1861)
4
-(L-HSP27)
4
, 세툭시맙--(L-SO1861)
4
-(L-HSP27)
4
합성 DAR2로 PEG
4
-SPDP를 통한 세툭시맙--(L-SO1861)
4
-(L-HSP27)
2
(FBR703 STB17/7-8) 합성
트라스투주맙-(L-SO1861)4, 세툭시맙-(L-SO1861)4는 이하 "Ab"로 지칭된다. Ab는 HSP27 BNA 디설파이드에 Ab와 HSP27 BNA 사이에 불안정한 (L) 디설파이드 결합을 형성하는 테트라(에틸렌 글리콜) 석신이미딜 3-(2 피리딜디티오)프로피오네이트(PEG4-SPDP) 링커를 통해 접합되었다. 절차는 트라스투주맙-(L-SO1861)4-(L-HSP27)4에 대해 예시적으로 설명된다:
HSP27 BNA 디설파이드 올리고(2.7mg, 470nmol, 6.10mg/ml)를 TCEP(10몰 당량, 4.7μmol, 1.34mg, 50mg/ml)와 20℃에서 롤러 믹싱하면서 30분 동안 반응시켰다. 그 후, 올리고-SH를 TBS pH 7.5로 용리하는 PD10 G25 탈염 컬럼으로 정제하고 즉시 사용하였다. 올리고-SH를 얻었다(2.48 mg, 90%, 1.24 mg/ml, SH 대 올리고 비율 = 0.8).
트라스투주맙-(L-SO1861)4(1.3 mg, 8.7 nmol, 2.50 mg/ml)를 새로 준비된 DMSO(1 mg/ml) 중의 PEG4-SPDP 용액(9.26 mole 당량, 80.3 nmol, 45 μg)의 분취물과 롤러 믹싱하면서 20℃에서 60분 동안 반응시켰다. 그 후, 반응을 글리신(TBS pH 7.5에서 새로 준비된 2 mg/ml 용액 15.1 ㎕)으로 켄칭한 다음, TBS pH 7.5로 용리하는 제바 탈염 컬럼을 통해 탈염하였다. 생성된 Tras-(L-SO1861)-(L-PEG4-SPDP)의 분취물을 취해 UV-Vis 분석으로 시험하였다. SPDP 편입은 피리디일-2-티온(PDT)을 유리시키는 TCEP 및 343 nm에서 UV-Vis 분석(SPDP 대 Ab 비율 = 4)을 사용하여 측정했다. 나머지 Tras-(L-SO1861)-(L-PEG4-SPDP)를 새로 준비된 HSP27 올리고뉴클레오티드(올리고-SH)(8몰 당량, 54.8nmol, 0.32mg, 1.24mg/ml)의 분취물과 반응시키고 롤러 믹싱하면서 20℃에서 밤새 인큐베이션하였다. 17시간 후, 접합체를 UV-Vis 분석으로 분석하여 343 nm에서 피리디일-2-티온(PDT)의 치환에 의한 HSP27의 편입을 확인하였다. 조 접합체를 DPBS pH 7.5로 용리하는 1.6 x 33 cm Sephadex G50 컬럼을 사용하여 정제했다. 생성된 트라스투주맙-(L-SO1861)4-(L-HSP27 BNA)4를 단일 분획으로 얻었다. 수율: 0.47 mg, 45%(0.49 mg/ml), HSP27 대 Ab 비율 = 3.5
항체-(L-QS Mix)
n
트라스투주맙, 세툭시맙은 이하 "Ab"로 지칭된다. Ab는 Michael형 티올-엔 접합 반응을 통해 사포닌 QS Mix-EMCH에 접합되었다. 절차는 트라스투주맙-L-QS Mix에 대해 예시적으로 설명된다:
트라스투주맙("Ab", 600mg)을 탈이온수(DI)로 21mg/mL로 재구성한 다음, 새로 준비된 히스티딘 버퍼 pH 6(5mM 히스티딘 pH 6, 2% 트레할로스, 0.01% Tween 20)을 사용하여 5mg/mL로 희석하였다. Tris 농축물(127mg/mL, 1.05M), Tris.HCL 농축물(623mg/mL, 3.95M) 및 EDTA-Na2 농축물(95mg/ml, 0.26M)을 각각 10 μL/mL 첨가하여 50mM TBS, 2.5mM EDTA 버퍼 pH 7.5를 얻었다. 트라스투주맙(603.8 mg, 4.887 mg/mL, 4.0 μmol)에 새로 준비된 TCEP 용액(1 mg/mL, 2.35 mole 당량, 9.5 μmol, 2.72 mg)의 분취물을 첨가하고, 혼합물을 손으로 휘저어 혼합한 다음, 롤러 믹싱하면서 20℃에서 90분 인큐베이션하였다. 인큐베이션 후(QS Mix-EMCH 첨가 전), Ab-SH의 2mg(0.409mL) 분취물을 제거하고, 제바 스핀 탈염 컬럼을 사용하여 TBS pH 7.5로 겔 여과하여 정제했다. 이 분취물은 UV-Vis 분석 및 엘만 어세이로 특성화되었다. 벌크 Ab-SH에 새로 준비된 QS Mix-EMCH 용액(2mg/mL, 5.2몰 당량, 21μmol, 21.6mL)의 분취물을 첨가하고, 혼합물을 잠시 볼텍싱한 다음 20℃에서 120분 동안 인큐베이션했다. 접합 반응 외에, 탈염된 Ab-SH(0.5 mg, 0.134 mL, 3.33 nmol)의 두 분취물을 각각 양성 및 음성 대조군으로서 NEM(8.00 당량, 26.6 nmol, 3.3 μg, 13.3 μL의 0.25 mg/mL 용액) 또는 TBS pH 7.5 버퍼(13.3 μL)와 20℃에서 120분간 반응시켰다. 배양 후(NEM 첨가 전), QS Mix-EMCH 혼합물의 약 2 mg(0.481 mL) 분취물을 제거하고, 제바 스핀 탈염 컬럼을 사용하여 TBS pH 7.5로 겔 여과하여 정제했다. 이 분취물은 UV-Vis로 특성화되었으며 양성 및 음성 대조군과 함께 엘만 어세이로 특성화하여 QS Mix-EMCH가 편입되었다. 벌크 Ab - QS Mix-EMCH 혼합물에 새로 준비된 NEM 용액(2.5mg/mL, 5몰 당량, 20μmoL, 2.51mg)의 분취물을 첨가하고, 혼합물을 2-8℃에서 밤새 보관했다. 접합체를 DPBS pH 7.5로 용리하는 10 x 40cm Sephadex G50M 컬럼으로 정제하여 정제된 트라스투주맙-(L-QS Mix) 접합체를 얻었다. 생성물을 전체적으로 농축시킨 다음, 비바셀 100 농축기(2,000g, 4℃, 200분)를 사용하여 5mg/mL로 정규화하였다. 생성물을 0.2μm로 여과하고 생물학적 평가를 위해 분배하였다. 수율: n.d. QS Mix 대 Ab 비율 = 4.1.
항체-(L-HSP27BNA-L-S01861)
n
DAR4인 세툭시맙-(L-HSP27BNA-L-SO1861)
4
, 트라스투주맙-(L-HSP27BNA-L-SO1861)
4
,
트라스투주맙 및 세툭시맙은 이하 "Ab"로 지칭된다. Ab는 사포닌 SO1861 및 이후 "HSP27-Mal"로 지칭되는 HSP27 유도체를 함유하는 말레이미도(Mal)와 접합되었다. Ab는 Michael형 티올-엔 접합 반응을 통해 HSP27-Mal에 접합되었다. HSP17-Mal은 이의 구조와 이의 말레이미드 작용 사이에 불안정한 (L) 히드라존 결합을 가져 HSP27 BNA와 Ab 사이에 불안정한 결합을 생성한다. 절차는 트라스투주맙-(L-HSP27 BNA-L-SO1861)4에 대해 예시적으로 설명된다:
트라스투주맙을 탈이온수(DI)로 21mg/ml로 재구성한 다음, 히스티딘 버퍼 pH 6을 사용하여 5mg/ml로 희석했다. 20mg(4.0ml) 분취물에 Tris 농축물(127mg/ml, 1.05M), Tris.HCl 농축물(623mg/ml, 3.95M) 및 EDTA-Na2 농축물(95mg/ml, 0.26M)을 각각 10 μl/ml 첨가하여 50mM TBS, 2.5mM EDTA 버퍼 pH 7.5를 얻었다. 트라스투주맙(20.30mg, 4.920mg/ml, 0.14μmol)에 새로 준비된 TCEP 용액(1.00mg/ml, 2.35mol 당량, 0.32μmol)의 분취물을 첨가하고, 혼합물을 잠시 볼텍싱한 다음 롤러 믹싱하면서 20℃에서 90분 동안 인큐베이션했다. 인큐베이션 후(HSP27-Mal 첨가 전), Ab-SH의 약 2mg(0.439ml) 분취물을 각 혼합물에서 제거하고, 제바 스핀 탈염 컬럼을 사용하여 TBS pH 7.5로 겔 여과하여 정제했다. 이 분취물은 UV-Vis 분석 및 엘만 어세이로 특성화되었다(티올 대 ab 비율 = 4.0). 벌크 Ab-SH(4.7mg, 32nmol)에 HSP27-Mal 유도체(TBS pH 7.5에서 새로 준비됨, 2mg/ml, '티올' 당 1.3몰 당량, 166nmol)의 분취물을 첨가하고, 혼합물을 잠시 볼텍싱한 다음 20℃에서 120분 동안 인큐베이션하였다. 트라스투주맙 - HSP27 BNA 유도체 접합 반응 외에도 탈염된 Ab-SH(0.5mg, 3.3nmol)의 두 분취물을 각각 양성 및 음성 대조군으로서 NEM('티올' 당 1.3mole 당량, 17.3nmol, 0.25mg/ml 용액 6.7μl) 또는 TBS pH 7.5 버퍼(6.7 μL)와 20℃에서 120분간 반응시켰다. 인큐베이션 후(NEM 첨가 전), Ab - HSP27 BNA 혼합물의 0.100ml 분취물을 제거하고 제바 스핀 탈염 컬럼을 사용하여 TBS pH 7.5로 겔 여과하여 정제했다. 이 분취물은 UV-Vis로 특성화되었으며 양성 및 음성 대조군과 함께 엘만 어세이로 특성화되어 HSP27이 편입되었다. 벌크 Ab - HSP27 혼합물에 새로 준비된 NEM 용액(0.25 mg/ml, 2.5 mole 당량, 80 nmol)의 분취물을 첨가하고 혼합물을 DPBS pH 7.5로 용리하는 1.6 × 30 cm Sephadex G50M을 사용한 겔 여과로 정제하고, 반복된 원심 여과 및 100KDa MWCO 농축기를 사용하여 세척하여 정제된 트라스투주맙-(L-HSP27 BNA-L-SO1861)4 접합체를 얻었다. 생물학적 평가를 위해 분배하기 전에 생성물을 0.2μm로 여과하였다.
항체-(L-S01861)
n
-(S-디안틴)
n
DAR2로 SMCC를 통한 트라스투주맙-(L-S01861)
4
-(S-디안틴)
2
및 세툭시맙-(L-S01861)
4
-(S-디안틴)
2
합성
트라스투주맙-L-SO1861 및 세툭시맙-L-SO1861은 이하 "Ab"로 지칭된다. Ab는 석신이미딜 4-(N-말레이미도메틸)시클로헥산-1-카르복실레이트(SMCC) 링커를 통해 디안틴-Cys에 접합되어 Ab와 디안틴 사이에 안정한 (S) 아미드 결합을 제공한다. 절차는 트라스투주맙-(L-SO1861)4-(S-디안틴)2에 대해 예시적으로 설명된다:
디안틴-Cys(7.8 mg, 261 nmol, 0.78 mg/ml)를 TCEP(5 mol 당량, 1.31 μmol, 0.37 mg, 1 mg/ml)와 20℃에서 30분 동안 롤러 믹싱하면서 반응시켰다. 그 후, 단백질-SH를 TBS pH 7.5로 용리하는 제바 탈염 컬럼으로 정제하여 즉시 사용하였다. 단백질-SH를 얻었다(5.2 mg, 67%, 0.52 mg/ml, SH 대 단백질 비율 = 1 ± 0.1).
트라스투주맙-(L-SO1861)4(1.5mg, 10nmol, 2.50mg/ml)를 DMSO(0.5mg/ml) 중의 새로 준비된 SMCC 용액(4.83몰 당량, 48.3nmol, 16μg)의 분취물과 롤러 믹싱하면서 20℃에서 60분간 반응시켰다. 그 후, 반응을 글리신(TBS pH 7.5에서 새로 준비된 1 mg/ml 용액 18.1 ㎕)으로 켄칭한 다음, TBS pH 7.5로 용리하는 제바 탈염 컬럼을 통해 탈염하였다. 생성된 Tras-(L-SO1861)-(S-SMCC)(1.22mg, 8.1nmol, 2.03mg/ml)를 새로 환원된 디안틴-Cys(3.2몰 당량, 32.5nmol, 0.97mg, 0.52mg/ml)의 분취물과 반응시키고, 롤러 믹싱하면서 20℃에서 밤새 인큐베이션했다. 17시간 후, 접합체를 비바스핀 T4 농축기를 사용하여 ≤1 ml로 농축하고, DPBS pH 7.5로 용리하는 1.6 x 37 cm Superdex 200PG 컬럼을 사용하여 정제했다. 생성된 Tras-(L-SO1861)4-(S-디안틴)2 접합체는 고분자량(HMW)(0.36 mg, 30%, 0.34 mg/ml, 디안틴 대 Ab 비율 = 측정되지 않음) 및 저분자량(LMW)(0.49 mg, 40%, 0.30 mg/ml, 디안틴 대 Ab 비율 = 측정되지 않음) 분획으로서 획득되었다. 수율: n.d. 순도: 79.3%.
12. 항체-(S-디안틴)
n
DAR2로 SMCC를 통한 트라스투주맙-(S-디안틴)
2
, 세툭시맙-(S-디안틴)
2
합성
트라스투주맙 및 세툭시맙은 이하 "Ab"로 지칭된다. Ab는 석신이미딜 4-(N-말레이미도메틸)시클로헥산-1-카르복실레이트(SMCC) 링커를 통해 디안틴-Cys에 접합되어 Ab와 디안틴 사이에 안정한 (S) 아미드 결합을 제공한다. 절차는 트라스투주맙-(S-디안틴)2에 대해 예시적으로 설명된다:
디안틴-Cys(7.8 mg, 261 nmol, 0.78 mg/ml)를 TCEP(5 mol 당량, 1.31 μmol, 0.37 mg, 1 mg/ml)와 20℃에서 30분 동안 롤러 믹싱하면서 반응시켰다. 그 후, 단백질-SH를 TBS pH 7.5로 용리하는 제바 탈염 컬럼으로 정제하여 즉시 사용하였다. 단백질-SH를 얻었다(5.2 mg, 67%, 0.52 mg/ml, SH 대 단백질 비율 = 1 ± 0.1).
트라스투주맙(1.5mg, 10nmol, 2.50mg/ml)를 DMSO(0.5mg/ml) 중의 새로 준비된 SMCC 용액(3.16몰 당량, 31.6nmol)의 분취물과 롤러 믹싱하면서 20℃에서 60분간 반응시켰다. 그 후, 반응을 글리신(TBS pH 7.5에서 새로 준비된 1 mg/ml 용액 18.1 ㎕)으로 켄칭한 다음, TBS pH 7.5로 용리하는 제바 탈염 컬럼을 통해 탈염하였다. 생성된 Tras-(S-SMCC)(1.22mg, 8.1nmol, 2.03mg/ml)를 새로 환원된 디안틴-Cys(3.2몰 당량, 32.5nmol, 0.97mg, 0.52mg/ml)의 분취물과 반응시키고, 롤러 믹싱하면서 20℃에서 밤새 인큐베이션했다. 17시간 후, 접합체를 비바스핀 T4 농축기를 사용하여 ≤1 ml로 농축하고 DPBS pH 7.5로 용리하는 1.6 x 37 cm Superdex 200PG 컬럼을 사용하여 정제했다.
수율: n.d. 순도: 99%
항체-(L-S01861)
n
-(L-디안틴)
n
DAR2로 PEG
4
-SPDP를 통한 트라스투주맙-(L-S01861)
4
-(L-디안틴)
2
, 및 세툭시맙-(L-S01861)
4
-(L-디안틴)
2
합성
트라스투주맙-L-S01861, 및 세툭시맙-L-S01861은 이하 "Ab"라고 지칭한다. Ab는 디안틴-Cys에 Ab와 디안틴 사이에 불안정한 (L) 디설파이드 결합을 형성하는 테트라(에틸렌 글리콜) 석신이미딜 3-(2-피리딜디티오)프로피오네이트(PEG4-SPDP) 링커를 통해 접합되었다. 절차는 트라스투주맙-L-SO1861에 대해 예시적으로 설명된다:
디안틴-Cys(7.8 mg, 261 nmol, 0.78 mg/ml)를 TCEP(5 mol 당량, 1.31 μmol, 0.37 mg, 1 mg/ml)와 20℃에서 30분 동안 롤러 믹싱하면서 반응시켰다. 그 후, 단백질-SH를 TBS pH 7.5로 용리하는 제바 탈염 컬럼으로 정제하여 즉시 사용하였다. 단백질-SH를 얻었다(5.2 mg, 67%, 0.52 mg/ml, SH 대 단백질 비율 = 1 ± 0.1).
트라스투주맙-(L-S01861)4(0.75 mg, 5 nmol, 2.50 mg/ml)를 DMSO(1 mg/ml) 중의 새로 준비된 PEG4-SPDP 용액(4.95 몰 당량, 24.75 nmol, 14 μg)의 분취물과 20℃에서 롤러 믹싱하면서 60분 동안 반응시켰다. 이후, 반응물을 글리신(TBS pH 7.5 에서 새로 준비된 1 mg/ml 용액의 18.1μl)으로 켄칭시킨 후, TBS pH 7.5로 용리하는 제바 탈염 컬럼을 통해 탈염시켰다. 생성된 Tras-(L-S01861)-(S-PEG4-SPDP)의 분취물을 취하여 UV-Vis 분석에 의해 시험하였다. SPDP 편입은 피리디일-2-티온(PDT)을 유리시키는 TCEP 및 343 nm에서 UV-Vis 분석에 의해 측정하였다(SPDP 대 Ab 비 = 2.4). 나머지 Tras-(L-S01861)-(S-PEG4-SPDP)를 새로 준비된 디안틴-Cys(단백질-SH)(4 몰 당량, 20 nmol, 0.6 mg, 0.52 mg/ml)의 분취물과 반응시키고, 롤러 믹싱하면서 20℃에서 밤새 인큐베이션하였다. 17시간 후, 접합체의 분취물을 UV-Vis 분석에 의해 분석하여 PDT의 치환(displacement)에 의한 디안틴-Cys의 편입을 확인하였다. 그 후, 접합체를 비바스핀 T4 농축기를 사용하여 < 1 ml로 농축시키고, DPBS pH 7.5로 용리하는 1.6 x 37 cm Superdex 200PG 컬럼을 사용하여 정제했다. 디안틴 대 Ab 비율 = 2). 수율: n.d. 순도: 60.5%
항체-(L-디안틴)
n
DAR2로 PEG
4
-SPDP를 통한 트라스투주맙-(L-디안틴)
2
, 세툭시맙-(L-디안틴)
2
합성
트라스투주맙 및 세툭시맙은 이하 "Ab"라고 지칭한다. Ab는 디안틴-Cys에 Ab와 디안틴 사이에 불안정한 (L) 디설파이드 결합을 형성하는 테트라(에틸렌 글리콜) 석신이미딜 3-(2-피리딜디티오)프로피오네이트(PEG4-SPDP) 링커를 통해 접합되었다. 절차는 트라스투주맙-L-SO1861에 대해 예시적으로 설명된다:
디안틴-Cys(7.8 mg, 261 nmol, 0.78 mg/ml)를 TCEP(5 mol 당량, 1.31 μmol, 0.37 mg, 1 mg/ml)와 20℃에서 30분 동안 롤러 믹싱하면서 반응시켰다. 그 후, 단백질-SH를 TBS pH 7.5로 용리하는 제바 탈염 컬럼으로 정제하여 즉시 사용하였다. 단백질-SH를 얻었다(5.2 mg, 67%, 0.52 mg/ml, SH 대 단백질 비율 = 1 ± 0.1).
트라스투주맙(0.75 mg, 5 nmol, 2.50 mg/ml)를 DMSO(1 mg/ml) 중의 새로 준비된 PEG4-SPDP 용액(3.35 몰 당량, 16.75 nmol)의 분취물과 20℃에서 롤러 믹싱하면서 60분 동안 반응시켰다. 이후, 반응물을 글리신(TBS pH 7.5에서 새로 준비된 1 mg/ml 용액 18.1μl)으로 켄칭시킨 후, TBS pH 7.5로 용리시키는 제바 탈염 컬럼을 통해 탈염시켰다. 생성된 Tras-(S-PEG4-SPDP)의 분취물을 취하여 UV-Vis 분석에 의해 시험하였다. SPDP 편입은 피리디일-2-티온(PDT)을 유리시키는 TCEP 및 343 nm에서 UV-Vis 분석에 의해 측정하였다. 나머지 Tras-(S-PEG4-SPDP)를 새로 준비된 디안틴-Cys(단백질-SH)(4몰 당량, 20 nmol, 0.6 mg, 0.52 mg/ml)의 분취물과 반응시키고, 롤러 믹싱하면서 20℃에서 밤새 인큐베이션하였다. 17시간 후, 접합체의 분취물을 UV-Vis 분석에 의해 분석하여 PDT의 치환에 의한 디안틴-Cys의 편입을 확인하였다. 그 후, 접합체를 비바스핀 T4 농축기를 사용하여 < 1 ml로 농축시키고, DPBS pH 7.5로 용리하는 1.6 x 37 cm Superdex 200PG 컬럼을 사용하여 정제했다. 디안틴 대 Ab 비율 = 2). 수율: n.d. 순도: 67.7%
실시예 10
재료 및 방법
발명자의 현재 작업에서, 본 발명자는 쉬프(Schiff) 염기(이민)를 통한 사포닌 결합을 위한 4개의 분자 팔과 클릭 화학을 위한 하나의 팔로 구성된 모델 스캐폴드를 조사했다. 폴리머 구조(도 19)는 Iris Biotech GmbH(Marktredwitz, 독일)에서 구입한 1세대의 (즉, 반복된 분기 사이클의 수) 5가 폴리에틸렌 글리콜-기반 덴드리머이다. 사포닌(본 실시예에서 SA1641)은 Merck(Darmstadt, Germany)에서 입수한 사포늄 앨범(Saponinum album)으로 지칭되는 집소필라(Gypsophila) 종으로부터의 사포닌 복합 원료 추출물로부터 정제되었다. 분말 원료 추출물(2.5g)을 소듐 히드록시드(0.2g)로 물(100mL)에서 가수분해하였다. 그 용액을 40℃에서 20시간 동안 교반한 다음, pH 5.0에 도달할 때까지 빙초산(glacial acetic acid)을 보충하였다. 탄닌을 제거하기 위해, 분리 깔때기에서 30mL 부탄올과 함께 용액을 흔들었다. 수성상(aqueous phase)을 재포획하고 부탄올 추출을 2회 반복하였다. 부탄올 상에 무수 소듐 설페이트로 보충하고, 여과하고, 수집하였다. 부탄올을 증발시키고, 나머지 사포닌 분말을 20% 메탄올에 용해시켜 최종 농도 30 mg/mL로 만들었다. 짧은 초음파 처리 후, 고성능 액체 크로마토그래피(HPLC)로 다른 사포닌을 분리했다. 튜브(컬럼 제외)를 1.5mL/min의 유속으로 따뜻한 물(40℃)로 헹군 다음, 이소프로판올(100%)을 포함하는 Eurospher RP-C18-컬럼(5 μm, 250 × 8 mm)을 포함하였다. 사포닌을 컬럼에 적용하고, 메탄올 구배로 용리했다(0.01% 트리플루오로아세트산이 보충된 물에서 1.5mL/min으로 30분내 20% 메탄올에서 70% 메탄올로, 그 다음 추가 60분동안 70% 메탄올)(Sama et al., 2018). 분획의 분취물을 전자분무 이온화 질량 분석기(ESI-MS)로 이의 SA1641 함량에 대해 분석했다. 순수한 SA1641을 함유하는 분획을 수집하고 메탄올을 증발시켰다. 수용액을 드라이아이스를 사용하여 회전하는 둥근 바닥 플라스크에서 박막으로 동결시켰다. - 80℃에서 16시간 동안 보관한 후, 샘플을 동결건조했다. 본 발명에 정의된 스캐폴드를 생성하기 위해, 폴리머 구조(0.2mM) 및 SA1641(3.2mM)을 물(약 pH 8)에 용해시키고, 동일한 부피로 혼합하고 26℃에서 24시간 동안 흔들었다. 그런 다음 소듐 시아노보로하이드라이드(NaCNBH3; 0,1 M)를 SA1641에 대해 4배 몰 과량으로 첨가하고, 샘플을 추가로 24시간 동안 인큐베이션했다. 그런 다음 구조를 초고성능 액체 크로마토그래피(UPLC)/ESI-MS로 확인했다. 샘플을 RP-C4-컬럼에 적용하고, 메탄올 구배(0.01% 트리플루오로아세트산이 보충된 물에서 15분내 25% 메탄올에서 80% 메탄올로, 그 다음 추가 10분 동안 80% 메탄올)로 용리했다. 분획은 Waters Corporation의 LC-TOF(LC-time-of-flight) 질량 분석기를 사용하여 전자분무 이온화로 정확한 질량 측정을 위해 특별히 설계된 이온 소스인 LockSpray™를 사용하여 분석했다.
결과
도 20의 삽도(inset)는 동위원소 패턴 계산기인 enviPat Web 2.0으로 계산하여 얻은 이론적으로 예상되는 질량 스펙트럼을 보여준다. 패턴은 분자의 전하와 동위 원소의 자연 발생을 고려하며, 이는 단일 물질에 대해 1 보다 많은 피크가 예상되는 이유이다. UPLC/ESI-MS로 얻은 실험 데이터(도 20)는 m/z 758-760에서 예측한 것과 동일한 강도로 거의 정확히 동일한 피크를 보여 폴리머 구조로 성공적인 SA1641 커플링을 증명한다.
실시예 11
재료 및 방법
약학적 활성 물질의 예로서, 본 발명자는 표적화된 독소 디안틴-표피 성장 인자(디안틴-EGF)를 사용하였다. 플라스미드 His-디안틴-EGF-pET11d(Weng et al, 2009)(100ng)를 20μL Escherichia coli Rosetta™ 2(DE3) pLysS Competent Cells(Novagen, San Diego, CA, USA)에 첨가하였다. 세포를 열 충격(얼음에서 30분, 42℃에서 90초 및 얼음에서 1분)으로 형질전환시켰다. 그 후, 300 μL 리소제니 브로스(LB)를 첨가하고 현탁액을 200 rpm으로 흔들면서 37℃에서 1시간 동안 인큐베이션하였다. 50μg/mL 암피실린이 포함된 예열된 리소제니(lysogeny) 브로스 한천 플레이트에 100μl 박테리아 현탁액을 접종하고, 플레이트를 37℃에서 밤새 배양했다. 50μg/mL 암피실린이 포함된 리소제니 브로스(3mL)에 플레이트의 콜로니를 접종하고 박테리아를 37℃ 및 200rpm에서 8시간 동안 인큐베이션했다. 현탁액(50μL)을 50μg/mL 암피실린이 포함된 500mL의 리소제니 브로스에 첨가하고 37℃ 및 200rpm에서 밤새 인큐베이션했다. 이어서, 부피를 2.0 L로 스케일-업하고 파장 600 nm에서의 광학 밀도가 0.9에 도달할 때까지 동일한 조건에서 박테리아를 성장시켰다. 이후, 이소프로필 β-D-1-티오갈락토피라노사이드(IPTG)를 최종 농도 1mM으로 첨가하여 단백질 발현을 유도하였다. 단백질 발현은 37℃ 및 200rpm에서 3시간 동안 지속되었다. 마지막으로, 박테리아 현탁액을 5,000 x g 및 4℃에서 5분 동안 원심분리하고, 20mL PBS(137mM NaCl, 2.7mM KCl, 8.1mM Na2HPO4, 1.47mM KH2PO4)에 재현탁하고 사용할 때까지 -20℃에서 보관했다. 정제를 위해, 박테리아 현탁액을 해동하고 초음파 처리하여 용해시켰다. 용해물을 원심분리하고(15,800 x g, 4℃, 30분) 최종 농도 20mM로 이미다졸을 첨가했다. 상층액을 20mM 이미다졸의 존재 하에 4℃에서 30분 동안 연속적인 흔들임 하에 2mL의 Ni-니트릴로트리아세트산 아가로오스와 함께 인큐베이션하였다. 이어서, 그 물질을 20mL 컬럼에 붓고, 10mL 와시 버퍼(wash buffer)(50mM NaH2PO4, 300mM NaCl, 20mM 이미다졸)로 3회 세척하고, 와시 버퍼에서 증가하는 농도의 이미다졸의 10mL-부분(portion)(31, 65, 125 및 250mM)으로 디안틴-EGF를 용리하였다. 용리 분획(2mL)을 2.0L PBS에 대해 4℃에서 밤새 투석했다. 탈염된 디안틴-EGF를 Amicon® Ultra-15(10kDa)로 농축하고 단백질 농도를 정량화했다.
적절한 클릭 화학기를 디안틴-EGF에 도입하기 위해, 디안틴-EGF에 대해 언급된 8배 몰 과량의 알킨-PEG5-N-히드록시석신이미딜 에스테르를 디메틸 설폭사이드에 용해시키고, 9부피의 디안틴-EGF(0.2M NaH2PO4/Na2HPO4, pH 8에 1 mg)를 첨가하였다. 실온에서 4시간 동안 배양한 후, PD10 컬럼(GE-Healthcare, Freiburg, 독일)을 사용하여 결합되지 않은 알킨을 분리했다. 폴리머 구조를 갖는 클릭 화학은 구리(I)-촉매화된 알킨-아지드 고리화 첨가에 의해 수행되었다. 알킨-디안틴-EGF(0.02mM), 덴드리머(0.05mM), CuSO4(0.1mM), 트리스(3-히드록시프로필트리아졸릴메틸)아민(0.5mM) 및 소듐 아스코르베이트(5mM)을 0.1M NaH2PO4/Na2HPO4, pH 8에서, 실온에서 1시간 동안 부드러운 교반 하에 인큐베이션하였다. 그런 다음 PD10 컬럼을 사용하여 저 분자 질량 물질을 분리했다.
본 발명의 효능을 시험하기 위해, 본 발명자는 HER14 세포로 생존력 어세이를 수행하였다. 이들 세포는 인간 표피 성장 인자 수용체로 안정적으로 형질감염된 섬유아세포이며, 따라서 표적화된 독소 디안틴-EGF에 대한 표적 세포이다. HER14 세포(2,000개 세포/100μL/웰)를 96웰 세포 배양 플레이트의 웰에 파종하고, 37℃, 5% CO2 및 98% 습도에서 10% 소태아 혈청 및 1% 페니실린/스트렙토마이신이 보충된 DMEM 배지에서 24시간 동안 인큐베이션했다. 그런 다음 다른 테스트 물질(결과 및 도 21 참조)을 25μL의 부피로 3회 첨가하고, 배지 25μL를 추가로 보충했다. 72시간 인큐베이션 후, 30 μL 3-(4,5-디메틸티아졸-2-일)-2,5-디페닐테트라졸륨 브로마이드(물 중 0.5 mg/mL)를 웰당 첨가하고, 2시간 동안 인큐베이션했다. 그 후, 배지를 조심스럽게 제거하고, 10%(v/v) 이소프로판올, 5%(w/v) 소듐 도데실 설페이트 및 400mM HCl을 함유하는 수용액으로 교체하고, 5분 동안 인큐베이션하였다. 가용화된 포르마잔은 마이크로플레이트 판독기(Spectra MAX 340 PC, Molecular Devices, Sunnyvale, CA, USA)에서 570nM에서 광도 측정으로 정량화되었다. 처리되지 않은 세포는 1로 정규화되었고, 모든 샘플은 처리되지 않은 대조군으로 지칭되었다. 유의성은 언페어드 2-표본 t-검정(wo-sample t-test)에 의해 결정되었다.
결과
폴리머 구조, 본 실시예에서 펜타머 덴드리머(펜트리머)는 SA1641의 존재 또는 부재 모두에서 표적 세포에 어떠한 세포독성 효과도 갖지 않는다(도 27, 컬럼 2 및 3). 스캐폴드가 없는 경우, 표적화된 독소(디안틴-EGF)는 0.1nM 농도에서 최대 독성의 절반을 나타낸다(컬럼 4). SA1641의 존재하에서 동일한 농도는 엔도좀 탈출의 인핸서로 작용하는 SA1641의 일반적인 능력을 나타내는 모든 세포의 사멸을 초래한다(컬럼 5). 폴리머 구조의 존재는 SA1641의 존재 또는 부재 모두에서 디안틴-EGF의 독성에 영향을 미치지 않으며(컬럼 6 및 7), 이는 스캐폴드가 디안틴-EGF의 독성에 영향을 미치지 않음을 나타낸다. 클릭 화학을 통해 모델 폴리머 구조를 디안틴-EGF의 예시적인 약학적 활성 물질에 커플링하기 위해, 물질은 이전에 알킨기와 커플링되어야 했다. 이러한 변형의 결과, 디안틴-EGF는 다소의 활성을 잃었지만(각각 컬럼 8 및 9를 6 및 7과 비교), 비방향성(undirected) 알킨 변형은 본 발명의 아이디어에 영향을 미치지 않으며 향후 적용에서도 요구되지 않는다. 본 발명자는 독소의 약학적 활성 중심을 방해할 위험이 있는 테스트 목적으로만 알킨을 비방향성 방식으로 도입해야 했다. 약학적 활성 물질의 제조업체는 합성 중 클릭 위치를 물질의 활성이 영향이 받지 않은 상태로 유지되는 자신이 선택한 위치에서 물질에 직접 도입할 수 있다. 알킨으로 변형된 약학적 활성 물질을 폴리머 구조에 클릭했을 때 추가적인 활성 손실은 없었으며, 이는 폴리머 구조 자체가 독성이 없음을 나타낸다(컬럼 10 및 11).
실시예 12
재료
다음 화학물질을 구입하여 사용했다: 메탄올(MeOH, LiChrosolv, Merck), N-ε-말레이미도카프로산 히드라지드(EMCH, 95%, TCI Chemicals), 트리플루오로아세트산(TFA, 99.8%, Carl Roth), 2-메르캅토에탄올(98%, Sigma-Aldrich), 폴리(아미도아민)(PAMAM 덴드리머, 에틸렌디아민 코어, 제네레이션 5.0 용액, Sigma-Aldrich), 시아닌 3 카르복실산(Cy3-COOH, 95%, Lumiprobe), 1-[비스(디메틸아미노)메틸렌]-1H-1,2,3-트리아졸로[4,5-b]피리디늄 3-옥시드 헥사플루오로포스페이트, N-[(디메틸아미노)-1H-1,2,3-트리아졸로-[4,5-b]피리딘-1-일메틸렌]-N-메틸메탄아미늄 헥사플루오로포스페이트 N-옥사이드(HATU, 97%, Sigma-Aldrich), 소 혈청 알부민 분획 V(BSA, Carl Roth), 디메틸설폭사이드(DMSO, 99%, Carl Roth), 2-이미노티올란 하이드로클로라이드(98%, Sigma-Aldrich), 로다민 b(RhodB, 95%, Merck), Dulbecco의 포스페이트 버퍼 염수(Dulbecco's phosphate buffered saline)(PBS, Gibco), 염산(HCl, 37%, Merck), NHS-PEG13-DBCO(Click Chemistry Tools), Alexa Fluor™ 488 5-TFP(Thermo-Fischer), 아지도-PEG3-SS-NHS(Conju-Probe), 소듐 시아노보로하이드리드(NaCNBH3, 95%, Sigma-Aldrich), 암모늄 퍼설페이트(APS, 98%, Sigma-Aldrich), N,N,N',N'-테트라메틸에틸렌디아민(TMEDA, 99%, Sigma-Aldrich), 맞춤형 펩티드 SESDDAMFCDAMDESDSK(95%, PeptideSynthetics), 아지도-dPEG12-NHS(95%, Quanta Biodesign), PFd-G4-Azide-NH-BOC Dendron(G4-덴드론, 95%, Polymer Factory), Cyanin5-DBCO(Cy5-DBCO, 95%, Lumiprobe), 클로로포름(CHCl3, 99.5%, Sigma), Amicon Ultra 0.5mL 원심 필터(3kDa MWCO, Sigma), mPEG-SCM(mPEG2k-NHS, 95.6%, Creative PEG Works), Amicon Ultra 15mL 원심 필터(10kDa MWCO, Sigma).
방법
MALDI-TOF-MS
MALDI-TOF 스펙트럼은 MALDI-질량 분광계(Bruker Ultrafex III)에서 기록되었다. 전형적으로, 나노몰에서 마이크로몰 범위의 MilliQ 물에 용해된 샘플은 아세토니트릴(MADLI-TOF-MS 테스트됨, Sigma)/0.1% TFA(7:3 v/v)에 용해된 매트릭스로서 수퍼 DHB(99%, Fluka) 또는 시나핀산(sinapinic acid)(SA, 99%, Sigma-Aldrich)을 사용하여 건조 액적법을 통해 표적(MTP 384 표적 플레이트 연마된 강 T F, Bruker Dalton) 상에서 스포트되었다. PepMix(Peptide Calibration Standard, Bruker Daltons) 또는 ProteMass(Protein Calibration Standard, Sigma-Aldrich)가 보정 표준으로 사용되었다. RP 모드는 리플렉터 포지티브 모드를 나타낸다. RN 모드는 리플렉터 네거티브 모드를 나타낸다. LP 모드는 선형 포지티브 모드를 나타낸다.
H-NMR
1H NMR 분석은 Bruker 400MHz NMR 분광기를 사용하여 수행하였다. 측정 24시간 전에 0.8mL의 메탄올-D 4 (99%, Deutero)에 2mg의 샘플이 용해된 샘플 준비를 수행하였다.
UV-Vis
UV-Vis 측정은 200-750 nm의 스펙트럼 범위에서 NanoDrop ND-1000 분광기에서 수행되었다.
크기 배제 크로마토그래피
크기 배제 크로마토그래피(SEC)는 GE Healthcare의 Sephadex G 25 Superfine과 미리 충전된(prepacked) PD10 컬럼(GE Healthcare, Sephadex G 25 M)에서 수행되었다. 물질은 크로마토그래피를 수행하기 전에 각각의 용리액에서 팽창에 의해 활성화되었다.
투석
재생된 셀룰로오스 막: MWCO = 1 및 2 kDa(Spectra/Por) 및 MWCO = 12-14 kDa(Carl Roth)를 사용하여 투석을 수행했다. 전형적으로, 투석은 공정의 처음 6시간 후에 교환된 용매 1L로 24시간 동안 수행되었다.
동결건조
동결 건조는 Alpha 1-2 LD plus(Martin Christ Gefriertrocknungsanlagen GmbH)에서 수행되었다. 전형적으로, 샘플을 액체 질소로 동결하고 고진공에서 동결 건조기에 넣었다.
S01861-EMCH 합성
사포나리아 오피시날리스 L로부터의 SO1861(59mg, 31.7μmol) 및 EMCH(301mg, 888μmol)를 교반기가 구비된 둥근 플라스크에 넣고, 13mL 메탄올에 용해했다. TFA(400μL, cat.)를 용액에 첨가하고, 반응 혼합물을 RCT B 자기 교반기(IKA Labortechnik)에서 800rpm 및 실온에서 3시간 동안 교반했다. 3시간 동안 교반한 후, 혼합물을 MilliQ 물 또는 PBS로 희석하고, MWCO가 1kDa인 재생 셀룰로오스막 튜브(Spectra/Por 7)를 사용하여 MilliQ 물 또는 PBS에 대하여 24시간 동안 광범위하게 투석하였다. 투석 후, 용액을 동결건조하여 백색 분말을 얻었다. 수율 62.4mg(95%). 건조된 분취물은 1H NMR 및 MALDI-TOF-MS를 통한 특성화에 추가로 사용되었다.
1H NMR(400MHz, 메탄올-D 4 )(도 22A, SO1861): δ = 0.50-5.50(m, 사포닌 트리테르페노이드 및 당 백본 양성자), 9.43(1H, s, 사포닌의 알데히드 양성자, Ha).
1H NMR(400MHz, 메탄올-D 4 )(도 22B. SO1861-EMCH, PBS 워크업): δ = 0.50-5.50(m, 사포닌 트리테르페노이드 및 당 백본 양성자), 6.79(2H, s, 말레이미드 양성자, Hc), 7.62-7.68 (1H, m, 히드라존 양성자, Hb).
MALDI-TOF-MS(RP 모드)(도 23A): m/z 2124Da([M+K]+, 사포닌-EMCH), m/z 2109 Da([M+K]+, SO1861-EMCH), m/z 2094 Da([M+Na]+, SO1861-EMCH)
MALDI-TOF-MS(RN 모드)(도 28C): m/z 2275 Da([M-H]-, 사포닌-EMCH 접합체), 2244 Da([M-H]-, 사포닌-EMCH 접합체), 2222 Da([M-H]-, 사포닌-EMCH 접합체), 2178 Da([M-H]-, 사포닌-EMCH 접합체), 2144 Da([M-H]-, 사포닌-EMCH 접합체), 2122 Da([M-H]-, 사포닌-EMCH 접합체), 2092 Da([M-H]-, 사포닌-EMCH 접합체), 2070 Da([M-H]-, SO1861-EMCH), 2038 Da([M-H]-, SO1832-EMCH), 1936 Da([M-H]-, SO1730-EMCH), 1861 Da([M-H]-, SO1861).
SO1861-EMCH-메르캅토에탄올
SO1861-EMCH(0.1mg, 48nmol)에 200μL 메르캅토에탄올(18mg, 230μmol)을 첨가하고 용액을 ThermoMixer C(Eppendorf)에서 800rpm 및 실온에서 1시간 동안 흔들었다. 1시간 동안 흔든 후, 용액을 메탄올로 희석하고 MWCO가 1kDa인 재생 셀룰로오스 막 튜브(Spectra/Por 7)를 사용하여 메탄올에 대해 4시간 동안 광범위하게 투석했다. 투석 후, 분취물을 꺼내 MALDI-TOF-MS를 통해 분석했습니다.
MALDI-TOF-MS(도 23B)(RP 모드): m/z 2193 Da([M+K]+, SO1861-EMCH-메르캅토에탄올), m/z 2185 Da([M+K]+, SO1861-EMCH-메르캅토에탄올), m/z 2170 Da([M+Na]+, SO1861-EMCH-메르캅토에탄올).
BSA-S01861 합성
47μL PBS에 용해된 2-이미노티올란(231μg, 1.1μmol)을 200μL PBS 중의 BSA-RhodB 용액(10mg, 0.15μmol)에 첨가하고, 혼합물을 ThermoMixer C(Eppendorf)에서 800rpm 및 실온에서 40분간 흔들었다(shaken). 40분 동안 흔든 후, 반응 혼합물을 즉시 Sephadex G25 초미세 크기 배제 컬럼(16mL 컬럼 부피)을 통해 운행하고 100μL PBS에 용해된 SO1861-EMCH(1mg, 0.5μmol)를 수집된 BSA-SH 분획에 첨가했다. 반응 혼합물을 ThermoMixer C(Eppendorf)에서 800rpm 및 실온에서 12시간 동안 흔들었다. 12시간 동안 흔든 후, BSA-SO1861은 MWCO가 3kDa인 Amicon Ultra 15 필터를 통해 4,000rpm(15℃)에서 원심 여과를 사용하여 농축되었다. 접합체를 냉장고에 용액으로 보관하고 분석을 위해 분취물을 취했다. 수율: 미측정.
MALDI-TOF-MS(도 15A)(LP 모드): m/z 74.2kDa([M+H]+, 4 SO1861이 부착된 BSA-SO1861), 72.2kDa([M+H]+, 3 SO1861이 부착된 BSA-SO1861), 70.2 kDa([M+H]+, 2 SO1861이 부착된 BSA-SO1861), 37.0 kDa([M+H]2+, 4 SO1861이 부착된 BSA-SO1861), 35.9 kDa([M+H]2+, 3 SO1861이 부착된 BSA-SO1861), 34.7 kDa([M+H]2+, 2 SO1861이 부착된 BSA-SO1861).
Cy3-PAMAM
메탄올(30mg, 1.04μmol)에 용해된 720μL PAMAM을 250mL 둥근 플라스크에 넣고 회전 증발기(20mbar, 60℃)를 통해 메탄올을 제거했다. 나머지 PAMAM을 9mL DMSO에 용해시켰다. 0.5mL DMSO에 용해된 HATU(7.6mg, 20μmol)를 DMSO 중의 Cy3-COOH(0.6mg, 1.2μmol) 용액에 첨가하고 혼합물을 ThermoMixer C(Eppendorf)에서 실온에서 800rpm으로 1시간 동안 흔들었다. 1시간 동안 흔든 후, HATU-Cy3 용액을 교반되고 있는 PAMAM 용액에 첨가하고, 반응 혼합물을 실온에서 12시간 동안 교반하였다. 12시간 동안 교반한 후, 반응 혼합물을 MilliQ 물로 희석하고 MWCO가 2kDa인 재생 셀룰로오스막 튜브(Spectra/Por 6)를 사용하여 MilliQ 물에 대해 24시간 동안 광범위하게 투석했다. 투석 후, 접합체 용액의 부피는 회전 증발기(20mbar, 60℃)를 통해 감소되었고 농축된 접합체 용액은 Sephadex G25 초미세 크기 배제 컬럼(16mL 컬럼 부피)을 통해 운행되었다. 첫 번째 분획을 수집하고 동결건조하여 점성 분홍색 PAMAM-Cy3 접합체를 얻었다. PAMAM-Cy3 접합체 형성은 박층 크로마토그래피(메탄올/물, v/v 1:1) 상의 크로마토그래피 및 Sephadex G 25 초미세 컬럼 상에서 더 빠른 밴드의 출현에 의해 확인되었다. 수율 21.3mg(63%). UV-Vis 분광광도법에 의해 측정된 PAMAM 당 염료 몰비는 0.43이었다.
MALDI-TOF-MS(도 33A)(LP 모드): m/z 28.0kDa([M+H]+, Cy3-PAMAM).
Cy3-PAMAM-S01861 합성
절차는 Cy3-PAMAM-(SO1861)5에 대해 예시적으로 설명된다. 250 μL MilliQ 물에 용해된 2-이미노티올란(1 mg, 6.7 μmol)을 125 μL MilliQ 물 중의 PAMAM-Cy3 용액(0.5 mg, 17 nmol)에 첨가하고, 혼합물을 ThermoMixer C(Eppendorf)에서 800 rpm 및 실온에서 40분 동안 흔들었다. 40분 동안 흔든 후, 반응 혼합물을 즉시 Sephadex G25 초미세 크기 배제 컬럼(16mL 컬럼 부피)을 통해 운행하고 40μL MilliQ 물에 용해된 SO1861-EMCH(176μg, 85nmol)를 수집된 Cy3-PAMAM-SH 분획에 첨가하였다. 반응 혼합물을 ThermoMixer C(Eppendorf)에서 800rpm 및 실온에서 12시간 동안 흔들었다. 12시간 동안 흔든 후, 반응 혼합물을 MilliQ 물로 희석하고 MWCO가 12 - 14 kDa인 재생 셀룰로오스막 튜브(ZelluTrans, Carl Roth)를 사용하여 MilliQ 물에 대해 24시간 동안 광범위하게 투석했다. 투석 후, Cy3-PAMAM-SO1861 용액은 MWCO가 3kDa인 Amicon Ultra 15 필터를 통해 4000rpm(15℃)에서 원심 여과를 사용하여 농축되었다. 접합체를 냉장고에 용액으로 보관하고 분석을 위해 분취물을 취했다. 수율: 0.5mg(75%).
MALDI-TOF-MS 스펙트럼은 도 33 B-D 및 도 34에 도시하였다. Cy3-PAMAM-(SO1861)6의 MALDI-TOF-MS(도 33B)(LP 모드): m/z 38.4 kDa([M+H]+, Cy3-PAMAM-SO1861), 17.9 kDa([M+H]2+, Cy3-PAMAM-SO1861).
Cy3-PAMAM-(SO1861)5, Cy3-PAMAM-(SO1861)13, Cy3-PAMAM-(SO1861)51 및 Cy3-PAMAM-(SO1861)27의 합성은, 출발 물질 2-이미노티올란 및 SO1861-EMCH의 공급 당량에서만 상이하고, 위에서 설명한 방법을 통해 수행되었다. 출발 물질의 각 공급 당량 및 접합체의 각 질량(mass)은 표 15에 하이라이트 표시되어 있다.
Cy3-PAMAM-NC-S01861 합성
Cy3-PAMAM(0.5mg, 18nmol), SO1861(2.3mg, 1.24μmol) 및 HATU(64.6mg, 170μmol)를 200μL DMSO에 별도로 용해했다. SO1861 및 HATU 용액을 혼합하고 ThermoMixer C(Eppendorf)에서 800rpm 및 실온에서 20분 동안 흔들었다. 20분 동안 흔든 후, Cy3-PAMAM 용액을 흔들은 SO1861-HATU 용액에 첨가하고 반응 혼합물을 ThermoMixer C(Eppendorf)에서 800rpm 및 실온에서 12시간 동안 흔들었다. 12시간 동안 흔든 후, 반응 혼합물을 MilliQ 물로 희석하고 MWCO가 12-14kDa인 재생 셀룰로오스막 튜브(ZelluTrans, Carl Roth)를 사용하여 MilliQ 물에 대해 24시간 동안 광범위하게 투석했다. 투석 후 Cy3-PAMAM-NC-SO1861 용액은 MWCO가 3kDa인 Amicon Ultra 15 필터를 통해 4,000rpm(15℃)에서 원심 여과를 사용하여 농축되었다. Cy3-PAMAM-NC-(SO1861)17 접합체를 냉장고에 용액으로 보관하고 분석을 위해 분취물을 취했다. 수율: 0.77 mg(69%).
MALDI-TOF-MS(도 35)(LP 모드): m/z 62.3kDa([M+H]+, Cy3-PAMAM-NC-SO1861), 35.7kDa([M+H]2+, Cy3-PAMAM-NC-SO1861).
G4-덴드론 염료 표지 및 탈보호
PFd-G4-아지드-NH-BOC(G4-덴드론)(9.75mg, 2.11μmol)를 2mL 반응 튜브(Eppendorf)에 넣고 200μL DMSO에 용해했다. DMSO(1.72 μmol * mL-1, 170 nmol) 중의 Cy5-DBCO 용액 100 μL을 G4-덴드론 용액에 첨가하고 혼합물을 ThermoMixer C(Eppendorf)에서 실온 및 800 rpm으로 12시간 동안 흔들었다. 12시간 동안 흔든 후, 반응 혼합물을 MilliQ 물로 희석하고 MWCO가 1kDa인 재생 셀룰로오스막 튜브(Spectra/Por 7)를 사용하여 MilliQ 물에 대해 24시간 동안 광범위하게 투석했다. 투석 후 용액을 동결건조하여 청색 분말을 얻었다. 조 생성물을 동결건조로부터 얻은 대로 탈보호 단계에 사용하였다.
부분적으로 Cy5 표지된 동결건조된 G4-덴드론을 교반기가 구비된 50mL 둥근 플라스크에서 12mL CHCl3에 용해시켰다. 12mL TFA를 첨가하고 반응 혼합물을 RCT B 자기 교반기(IKA Labortechnik)에서 실온 및 800rpm에서 3시간 동안 교반했다. 3시간 동안 교반한 후, 회전 증발기(Heidolph WB 2000) 상에서 감압(50℃, 30mbar)하에 용매를 제거하였다. 증발 후, 배치를 MilliQ 물에 용해하고 PD10 크기 배제 컬럼을 통해 운행하였다. G4-덴드론 접합체 형성은 박층 크로마토그래피(메탄올/물, v/v 1:1) 상의 크로마토그래피 및 PD10 컬럼에서 더 빠른 밴드의 출현에 의해 확인되었다. 얻어진 크기 배제 크로마토그래피 분획을 동결건조하여 청색 분말을 얻었다.
수율 5.7mg(93%). UV-Vis 분광광도법에 의해 결정된 G4-덴드론 당 염료의 몰 비율은 0.012였다.
MALDI-TOF-MS(RP 모드) (도 32B): m/z 3956 Da([M+Na]+, Cy5-G4-덴드론 + PF6- 반대이온(counterion)), 3820 Da([M+Na]+, Cy5-G4-덴드론 - PF6- 반대이온), 3617 Da([M+H]+, G4-덴드론 불순물), 3017([M+H]+, G4-덴드론).
G4-덴드론-S01861 합성
절차는 가장 낮은 G4-덴드론 대 SO1861-EMCH 비율에 대한 예시로 설명된다. 300 μL MilliQ 물에 용해된 2-이미노티올란(2.65 mg, 19.2 μmol)을 252 μL MilliQ 물 중의 부분적으로 Cy5 표지된 G4-덴드론 용액(0.577 mg, 192 nmol)에 첨가하고 혼합물을 ThermoMixer C(Eppendorf)에서 실온에서 800 rpm에서 40분 동안 흔들었다. 40분 동안 흔든 후, 반응 혼합물을 즉시 PD10 크기 배제 컬럼을 통해 운행하고 100μL MilliQ 물에 용해된 SO1861-EMCH(1.19mg, 575nmol)를 수집된 G4-덴드론-SH 분획에 첨가했다. 반응 혼합물을 ThermoMixer C(Eppendorf)에서 800rpm 및 실온에서 12시간 동안 흔들었다. 12시간 동안 흔든 후, 반응 혼합물을 Amicon Ultra 원심 필터(3 kDa MWCO)를 사용한 원심 여과를 통해 농축했다. 접합체를 냉장고에 용액으로 보관하고 분석을 위해 분취물을 취했다. 수율: 90 nmol(47%).
MALDI-TOF-MS 스펙트럼은 도 33에 도시된다. G4-덴드론-SO1861의 MALDI-TOF-MS(도 33C)(LP 모드): m/z 10.19 kDa([M+H]+, Cy5-G4-덴드론-[SO1861]3), 9.27kDa([M+H]+, G4-덴드론-[SO1861]3), 7.92kDa([M+H]+, Cy5-G4-덴드론-[SO1861]2), 7.14kDa([M+H]+, G4-덴드론-[SO1861]2), 5.86kDa([M+H]+, Cy5-G4-덴드론-[SO1861]1), 5.07kDa([M+H]+, G4-덴드론-[SO1861]1).
다른 G4-덴드론-(SO1861)n 접합체의 합성은 출발 물질 SO1861-EMCH의 공급 당량이 상이한 것을 제외하고 위에서 설명한 방법을 통해 수행되었다. 출발 물질의 각 공급 당량 및 접합체의 각 질량은 표 16에 하이라이트 표시되어 있다.
PAMAM 티올화
절차는 가장 높은 PAMAM 대 2-이미노티올란 비율에 대해 예시적으로 설명된다. 30 μL 메탄올에 용해된 PAMAM(333 μg, 12.8 nmol) 용액에 128 μL MilliQ 물에 용해된 2-이미노티올란(0.53 mg, 3.84 μmol)을 첨가했다. 반응 혼합물을 ThermoMixer C(Eppendorf)에서 800rpm 및 실온에서 12시간 동안 흔들었다. 12시간 동안 흔든 후, 반응 혼합물을 15℃ 및 13500rpm에서 Amicon Ultra 원심 필터(3kDa MWCO)를 사용한 원심 여과를 통해 MilliQ 물로 4회 세척했다. 세척 후 샘플을 동결건조하여 백색 고체를 얻었다. 수율은 측정되지 않았다.
MALDI-TOF-MS 스펙트럼은 도 51에 도시된다. PAMAM-(SH)108의 MALDI-TOF-MS(도 51C)(LP 모드): m/z 41.5 kDa([M+H]+, PAMAM-[SH]108).
다른 PAMAM-이미노티올란 접합체의 합성은 출발 물질 2-이미노티올란의 공급 당량이 상이한 것을 제외하고 상기 기재된 방법을 통해 수행되었다. 가장 낮은 2-이미노티올란 공급 반응을 위해 Cy3-PAMAM이 사용되었다.
출발 물질의 각 공급 당량 및 접합체의 각 질량은 표 17에 하이라이트 표시되어 있다.
PAMAM PEG화(PEGylation)
절차는 가장 낮은 PAMAM 대 mPEG2k 비율에 대한 예시로 설명된다. 10 μL DMSO에 용해된 PAMAM(333 μg, 12.8 nmol) 용액에 13 μL DMSO에 용해된 mPEG2k-NHS(0.268 mg, 128 nmol)을 첨가했다. 반응 혼합물을 ThermoMixer C(Eppendorf)에서 800rpm 및 실온에서 12시간 동안 흔들었다. 12시간 동안 흔든 후, 반응 혼합물을 MilliQ 물로 희석하고 MWCO가 2kDa인 재생 셀룰로오스막 튜브(Spectra/Por 6)를 사용하여 MilliQ 물에 대해 24시간 동안 광범위하게 투석했다. 투석 후, 배치는 Amicon Ultra 15mL 원심 필터(10kDa MWCO)를 사용하여 원심 여과를 통해 농축되었다. 농축된 배치를 PD10 크기 배제 컬럼을 통해 운행한 후 동결건조하여 백색 플루피 분말을 얻었다. 수율은 측정되지 않았다.
MALDI-TOF-MS 스펙트럼은 도 52에 도시되어 있다. PAMAM-(mPEG2k)3의 MALDI-TOF-MS(도 52C)(LP 모드): m/z 33.46 kDa([M+H]+, PAMAM-[mPEG2k]3).
다른 PAMAM-mPEG2k 접합체의 합성은 상기 기술된 방법을 통해 수행되었으나, 출발 물질 mPEG2k-NHS의 공급 당량이 상이하다. 출발 물질의 각 공급 당량 및 접합체의 각 질량은 표 18에 하이라이트 표시되어 있다.
Cy3-PAMAM-S01861-DBCO 합성
절차는 Cy3-PAMAM-(SO1861)27-(DBCO)10에 대해 예시적으로 설명된다. Cy3-PAMAM-(SO1861)27(0.41 mg, 4.71 nmol)을 동결-프라이(freeze-fried)하고 100 μL DMSO에 용해시켰다. DMSO에 용해된 DBCO-PEG13-NHS 에스테르(0.197 mg, 188 nmol)를 Cy3-PAMAM-SO1861 용액에 첨가하고, 혼합물을 ThermoMixer C(Eppendorf)에서 800 rpm 및 실온에서 흔들었다. 3시간 동안 흔든 후, 반응 혼합물을 MilliQ 물로 희석하고 MWCO가 12-14kDa인 재생 셀룰로오스막 튜브(ZelluTrans, Carl Roth)를 사용하여 MilliQ 물에 대해 24시간 동안 광범위하게 투석했다. 투석 후 Cy3-PAMAM-SO1861-DBCO 용액은 MWCO가 3kDa인 Amicon Ultra 15 필터를 통해 4,000rpm(15℃)에서 원심 여과를 사용하여 농축되었다. 접합체를 냉장고에 용액으로 보관하고 분석을 위해 분취물을 취했다. 수율: 0.1mg(22%).
MALDI-TOF-MS(도 36D)(LP 모드): m/z 92.5 kDa([M+H]+, Cy3-PAMAM-SO1861-DBCO), 53.0 kDa([M+H]2+, Cy3-PAMAM-SO1861-DBCO).
Cy3-PAMAM-(SO1861)5-(DBCO)38 및 Cy3-PAMAM-(SO1861)27-(DBCO)10의 합성은 위에서 설명한 방법을 통해 수행되었다. 출발 물질의 각 공급 당량 및 접합체의 각 질량은 표 19에 하이라이트 표시되어 있다.
Cy3-PAMAM-NC-S01861-DBCO 합성
Cy3-PAMAM-NC-(SO1861)17(0.3 mg, 4.8 nmol)을 동결-프라이하고 100 μL DMSO에 용해시켰다. DMSO에 용해된 DBCO-PEG13-NHS 에스테르(0.202 mg, 194 nmol)를 Cy3-PAMAM-NC-SO1861 용액에 첨가하고 혼합물을 ThermoMixer C(Eppendorf)에서 800 rpm 및 실온에서 흔들었다. 3시간 동안 흔든 후, 반응 혼합물을 MilliQ 물로 희석하고 MWCO가 12-14kDa인 재생 셀룰로오스막 튜브(ZelluTrans, Carl Roth)를 사용하여 MilliQ 물에 대해 24시간 동안 광범위하게 투석했다. 투석 후 Cy3-PAMAM-SO1861-DBCO 용액은 MWCO가 3kDa인 Amicon Ultra 15 필터를 통해 4,000rpm(15℃)에서 원심 여과를 사용하여 농축되었다. 접합체를 냉장고에 용액으로 보관하고 분석을 위해 분취물을 취했다. 수율: 0.1mg(22%). 질량 분석은 PAMAM 분자당 30개의 DBCO 모이어티의 접합을 나타낸다.
MALDI-TOF-MS(도 36B)(LP 모드): m/z 93.2kDa([M+H]+, Cy3-PAMAM-NC-SO1861-DBCO), 49.6kDa([M+H]2+, Cy3-PAMAM-NC-SO1861-DBCO).
EGFD디안틴 및 디안틴 발현
플라스미드-DNA(His-디안틴-EGF-pET11d 또는 His-디안틴-pET11d)[20]를 화학적으로 컴피턴트한(competent) 대장균(Escherichia coli) NiCo21(DE3)(New England Biolabs®, Inc.)으로 형질전환시키고, 200 rpm에서 5시간 동안 37℃에서 50 μg/mL 암피실린이 보충된 3 mL 리소제니 브로스에서 성장시켰다. 이 박테리아를 사용하여 37℃에서 밤새 배양하기 위해 50μg/mL 암피실린이 보충된 500mL 리소제니 브로스에 접종했다. 이어서, 배양 부피를 2 L까지 스케일업하고 광학 밀도(A600)가 0.9가 될 때까지 박테리아를 성장시켰다. 단백질 발현은 1mM의 최종 농도로 이소프로필 β-D-1-티오갈락토피라노사이드(IPTG)를 첨가하여 유도되었다. 세포를 37℃ 및 200rpm에서 3시간 동안 추가로 성장시켰다. 원심분리(5분, 5,000g, 4℃) 후 세포 펠릿을 20mL 포스페이트 버퍼 염수(Ca2+ 및 Mg2+를 함유하는 Dulbecco의 PBS(phosphate-buffered saline, 포스페이트 버퍼 염수), pH 7.4)에 재현탁하고 -20℃에서 보관했다. 해동 후, 초음파 디바이스(Branson Sonifier 250, G. Heinemann)에 의해 단백질이 방출되었다. 용액을 원심분리하고(15,800×g, 30분, 4℃) 20mM 이미다졸 농도로 조정했다. 구성물은 N-말단 His-tag를 함유하였으며, 니켈 니트릴로트리아세트산 크로마토그래피(Ni-NTA Agarose, Qiagen, Hilden, Germany)에 의해 정제되었다. 이미다졸(20-250mM)로 용리한 후, 용리액을 소듐 도데실 설페이트 폴리아크릴아미드 겔 전기영동법(SDS-PAGE)(12%)으로 분석했다. 디안틴-EGF 또는 디안틴을 함유하는 분획을 4℃에서 2L 키틴 결합 도메인 버퍼(20mM 트리스(히드록시메틸)-아미노메탄/HCl, 500mM NaCl, 1mM EDTA, 0.1% Tween-20, pH 8.0)에 대해 투석했다. 키틴 컬럼 친화성 크로마토그래피에 의한 추가 정제는 Ni-NTA 아가로스에 대한 결합 활성을 갖는 박테리아 단백질을 제거하는데 사용되었다. 키틴 결합 도메인 버퍼로 용리한 후, 분획을 SDS-PAGE(12%)로 분석하였다. 디안틴-EGF 또는 디안틴을 함유하는 분획을 4℃에서 5L PBS에 대해 투석했다. 정제된 단백질은 Amicon 원심 필터 디바이스(10 kDa, Millipore, Eschborn, 독일)에 의해 농축되었다. 단백질 농도는 비신코닌산 어세이(Pierce, Rockford, USA)로 측정하였다.
디안틴-EGF-Alexa488 합성
PBS 중의 디안틴-EGF(240μg, 6.7nmol) 용액을 MWCO가 3kDa인 Amicon Ultra 15 필터에 넣고 4,000rpm 및 4℃에서 30분 동안 3회 원심분리했다. 각 사이클 후, Amicon 필터에 pH 9에서 0.1M 소듐 카보네이트 버퍼를 다시 채웠다. 세 번째 원심분리 사이클 후, 원심분리를 통해 부피가 0.5mL로 감소되었다. 디안틴-EGF 소듐 카보네이트 용액을 2 mL 반응 튜브에 넣고 10 μL DMSO에 용해된 Alexa Fluor™ 488 5-TFP(50 μg, 56 nmol)를 단백질 용액에 첨가했다. 혼합물을 ThermoMixer C(Eppendorf)에서 800rpm 및 실온에서 80분 동안 흔들었다. 흔든 후, 혼합물을 Sephadex G25 M 크기 배제 컬럼(GE Healthcare, PD10 컬럼)을 통해 운행했다. 디안틴-EGF-Alexa488 접합체를 냉장고에 pH 9에서 0.1M 소듐 카보네이트 버퍼 용액에 저장하고 분석을 위해 분취물을 취했다. 수율: 210μg(85%).
MALDI-TOF-MS(도 37D)(LP 모드): m/z 36.8kDa([M+H]+, 디안틴-EGF-Alexa488), m/z 33.6kDa([M+H]+, 디안틴-EGF-Alexa488), 18.8kDa([M+H]2+, 디안틴-EGF-Alexa488), 16.6kDa([M+H]2+, 디안틴-EGF-Alexa488).
디안틴-Alexa488 합성
PBS 중의 디안틴(184 μg, 6.2 nmol) 용액을 MWCO가 3 kDa인 Amicon Ultra 15 필터에 넣고 4,000 rpm 및 4℃에서 30분 동안 3회 원심분리했다. 각 사이클 후, Amicon 필터는 pH 9에서 0.1M 소듐 카보네이트 버퍼로 다시 채웠다. 세 번째 원심분리 사이클 후, 원심분리를 통해 부피가 0.5mL로 감소되었다. 디안틴 소듐 카보네이트 용액을 2mL 반응 튜브에 넣고 3.5μL DMSO에 용해된 Alexa Fluor™ 488 5-TFP(16.7μg, 19nmol)를 단백질 용액에 첨가했다. 혼합물을 ThermoMixer C(Eppendorf)에서 800 rpm 및 실온에서 80분 동안 흔들었다. 흔든 후, 혼합물을 Sephadex G25 M 크기 배제 컬럼(GE Healthcare, PD 10 컬럼)을 통해 운행했다. 디안틴-Alexa488 접합체를 냉장고에 pH 9에서 0.1M 소듐 카보네이트 버퍼 용액에 저장하고 분석을 위해 분취물을 취했다. 수율: 미측정
MALDI-TOF-MS(도 38D)(LP 모드): m/z 30.7 kDa([M+H]+, 디안틴-Alexa488).
디안틴-EGF-Alexa488-S-S-PEG-N
3
, 및 디안틴-EGF-Alexa488-PEG
12
-N
3
합성
절차는 디안틴-EGF-Alexa488-S-S-PEG-N3에 대해 예시적으로 설명된다. 디안틴-EGF-Alexa488(70μg, 1.9nmol) 소듐 카보네이트 용액을 2mL 반응 튜브에 넣고 9μL DMSO에 용해된 아지도-PEG3-S-S-NHS(120μg, 272nmol)를 단백질 용액에 첨가했다. 혼합물을 ThermoMixer C(Eppendorf)에서 12시간 동안 800rpm 및 15℃에서 흔들었다. 흔든 후, 반응 혼합물을 PBS로 희석하고 MWCO가 3kDa인 Amicon Ultra 15 필터를 사용하여 4,000rpm 및 4℃에서 원심 여과를 통해 PBS로 세척하였다.
수율: 54μg(70%).
MALDI-TOF-MS(도 37E)(LP 모드): m/z 40.8 kDa([M+H]+, 디안틴-EGF-알렉사488-S-S-PEG-N3), m/z 37.5 kDa([M+H]+, 디안틴-EGF-Alexa488-S-S-PEG-N3).
디안틴-EGF-Alexa488-S-S-PEG-N3, 및 디안틴-EGF-Alexa488-PEG12-N3의 합성은 상기 기술된 방법을 통해 수행되었지만 사용된 아지도-PEG 링커가 달랐다. 각각의 아지도-PEG 링커, 이들의 공급 당량, 및 접합체의 각각의 질량은 표 20에 하이라이트 표시되어 있다.
디안틴-Alexa488-S-S-PEG-N
3
디안틴-Alexa488(24.5μg, 0.8nmol) 소듐 카보네이트 용액을 2mL 반응 튜브에 넣고 9μL DMSO에 용해된 아지도-PEG3-S-S-NHS(34μg, 78nmol)를 단백질 용액에 첨가했다. 혼합물을 ThermoMixer C(Eppendorf)에서 12시간 동안 800rpm 및 15℃에서 흔들었다. 흔든 후, 반응 혼합물을 PBS로 희석하고 MWCO가 3kDa인 Amicon Ultra 15 필터를 사용하여 4,000rpm 및 4℃에서 원심 여과를 통해 PBS로 세척하였다.
수율: 10.3μg(39%).
MALDI-TOF-MS(도 38E)(LP 모드): m/z 32.9 kDa([M+H]+, 디안틴-Alexa488-S-S-PEG-N3).
Cy3-PAMAM-사포닌-독소 접합체 합성
절차는 Cy3-PAMAM-(SO1861)27-DBCO에 대해 예시적으로 설명된다. 1.5 mL 반응 튜브에서 MilliQ 물 중의 Cy3-PAMAM-(SO1861)27-DBCO(17 μg, 0.184 nmol) 용액을 PBS 중의 디안틴-EGF-Alexa488-SS-PEG3-N3(3.6 μg, 0.089 nmol) 용액과 혼합하고 반응 혼합물을 ThermoMixer C(Eppendorf)에서 2시간 동안 800rpm 및 15℃에서 흔들었다. 흔든 후, Molecular Imager® VersaDoc™ MP 4000 이미징 시스템(Bio-Rad)에서 SDS-PAGE 및 형광 이미징을 통한 분석을 위해 작은 분취물을 취했다(도 39).
Cy3-PAMAM-(SO1861)5-S-S-디안틴-EGF-Alexa488, Cy3-PAMAM-(SO1861)27-S-S-디안틴-EGF-Alexa488, Cy3-PAMAM-NC-(SO1861)17-S-S-디안틴-EGF-Alexa488, Cy3-PAMAM-NC-(SO1861)17-S-S-디안틴-Alexa488 및 Cy3-PAMAM-NC-(SO1861)17-디안틴-EGF-Alexa488의 합성은 위에서 설명한 방법을 통해 수행되었지만 사용된 PAMAM-사포닌-DBCO 배치, 사용된 아지도-독소 배치 및 이들의 공급 당량이 상이하였다. 출발 물질의 각 공급 당량은 표 21에 하이라이트 표시되어 있다.
환원적 아민화를 통한 Cy3-PAMAM-NC-S01861 합성
Cy3-PAMAM(0.19mg, 13nmol) 및 SO1861(0.73mg, 0.39μmol)을 pH 5의 200μL 0.1M 아세테이트 버퍼에 별도로 용해시켰다. SO1861 및 Cy3-PAMAM 용액을 혼합하고 ThermoMixer C(Eppendorf)에서 800rpm 및 실온에서 20분 동안 흔들었다. 20분 동안 흔든 후, NaCNBH3(5 mg, 81 μmol)를 흔든 반응 용액에 첨가하고 반응 혼합물을 ThermoMixer C(Eppendorf)에서 800 rpm 및 실온에서 12시간 동안 흔들었다. 12시간 동안 흔든(shaking) 후, 반응 혼합물을 MilliQ 물로 희석하고 MWCO가 12-14kDa인 재생 셀룰로오스막 튜브(ZelluTrans, Carl Roth)를 사용하여 MilliQ 물에 대해 24시간 동안 광범위하게 투석했다. 투석 후, Cy3-PAMAM-NC-SO1861 용액은 MWCO가 3kDa인 Amicon Ultra 15 필터를 통해 4,000rpm(15℃)에서 원심 여과를 사용하여 농축되었다. 접합체를 냉장고에 용액으로 보관하고 분석을 위해 분취물을 취했다. 수율: 미측정
MALDI-TOF-MS(도 40B, C)(LP 모드): m/z 88.7 kDa([M+H]+, Cy3-PAMAM-NC-SO1861), 49.2 kDa([M+H]2+, Cy3-PAMAM-NC-SO1861).
Cy3-PAMAM-NC-(SO1861)30 및 Cy3-PAMAM-NC-(SO1861)10의 합성은 위에서 설명한 방법을 통해 수행되었지만 그 후, 환원제 NaCNBH3를 반응 배치에 첨가한 시간이 상이하였다. 각각의 NaCNBH3 첨가 시간 및 접합체의 각 질량은 표 22에 하이라이트 표시되어 있다.
폴리(S01861)합성
SO1861-EMCH(0.13 mg, 63 nmol)를 30 μL 탈기된 MilliQ 물에 용해했다. 4 μL 탈기된 MilliQ 물에 용해된 APS(0.2 μg, 0.8 nmol)를 SO1861-EMCH 용액에 첨가하고 용액을 60℃에서 ThermoMixer C(Eppendorf)에 넣었다. 그런 다음, TMEDA(cat., 0.5μL)를 혼합물에 첨가하고 혼합물을 ThermoMixer C(Eppendorf)에서 800rpm 및 60℃에서 2시간 동안 흔들었다. 2시간 후, 질량 분석을 통한 분석을 위해 소량의 분취물을 취했다.
MALDI-TOF-MS(도 42C)(LP 모드): m/z 18.2kDa([M+H]+, 폴리(SO1861)9), 16.0kDa([M+H]+, 폴리(SO1861)8), 14.2kDa([M+H]+, 폴리(SO1861)7), 12.2kDa([M+H]+, 폴리(SO1861)6), 10.2kDa([M+H]+, 폴리(SO1861)5), 8.2kDa([M+H]+, 폴리(SO1861)4), 6.2kDa([M+H]+, 폴리(SO1861)3).
SO1861-EMCH 펩티드 커플링
서열 SESDDAMFCDAMDESDSK를 갖는 맞춤형 펩티드(0.6mg, 0.3μmol) 및 SO1861-EMCH(0.8mg, 0.39μmol)를 200μL PBS에 별도로 용해하였다. SO1861-EMCH 및 펩티드 용액을 혼합하고 ThermoMixer C(Eppendorf)에서 800rpm 및 실온에서 12시간 동안 흔들었다. 흔든 후, 분석을 위해 작은 분취물을 취하였다. 수율: 미측정
MALDI-TOF-MS(도 45B)(RN 모드): m/z 4.05kDa([M+H]-, 펩티드-SO1861), 3.92kDa([M+H]-, 펩티드-SO1730), 1.98kDa ([M+H]-, 펩티드), 1.86 kDa ([M+H]-, SO1861).
세포 생존력 어세이
처리 후 제조업체의 지침(CellTiter 96® AQueous One Solution Cell Proliferation Assay, Promega)에 따라 수행된 MTS-어세이에 의해 세포 생존력을 측정하기 전에 세포를 37℃에서 72시간 동안 인큐베이션하였다. 간략히, MTS 용액은 10% FBS(PAN-Biotech GmbH)가 보충된 페놀 레드(PAN-Biotech GmbH)가 없는 DMEM에서 20x 희석되었다. 세포를 웰당 200μL PBS로 1회 세척한 후, 100μL 희석된 MTS 용액을 웰당 첨가하였다. 플레이트를 37℃에서 대략 20-30분 동안 인큐베이션하였다. 이어서, Thermo Scientific Multiskan FC 플레이트 판독기(Thermo Scientific)에서 492 nm에서의 광학 밀도를 측정했다. 정량화를 위해, 미처리된 웰의 백그라운드 보정된 신호를 처리된 웰의 백그라운드 보정된 신호로 나누어, 미처리/처리된 세포의 비율을 계산하기 전에, '단지 배지만 있는(medium only)' 웰의 백그라운드 신호를 다른 모든 웰에서 차감했다.
FACS 분석
HeLa 세포를 10cm 디쉬에서 500,000 c/플레이트로 10% 송아지 태아 혈청(PAN-Biotech GmbH) 및 1% 페니실린/스트렙토마이신(PAN-Biotech GmbH)이 보충된 DMEM(PAN-Biotech GmbH)에 파종하고, 90%의 컨플루언시(confluency)에 도달할 때까지, 48시간 배양하였다(5% CO2, 37℃). 다음으로, 세포를 단일 세포로 트립신 처리하였다(TryplE Express, Gibco Thermo Scientific). 0.75 x 106 세포를 15mL 팔콘 튜브로 옮기고 원심분리했다(1,400rpm, 3분). 세포 펠렛이 잠긴 채로 상층액을 버렸다. 펠렛은 볼텍스 쉐이커에서 팔콘 튜브를 부드럽게 두드려서 해리되었고), 세포는 4mL의 차가운 PBS(Mg2+ 및 Ca2+ 프리, 2% FBS)로 세척되었다. 세척 후, 세포를 3mL의 차가운 PBS(Mg2+ 및 Ca2+ 프리, 2% FBS)에 재현탁하고, 3개의 둥근 바닥 FACS 튜브(1mL/튜브)에 균등하게 나누었다. 세포를 다시 원심분리하고, 200 μL 차가운 PBS(Mg2+ 및 Ca2+ 무함유, 2% FBS) 또는 195μL 차가운 PBS(Mg2+ 및 Ca2+ 무함유, 2% FBS)에 5μL 항체를 함유하는 200 μL 항체 용액에 재현탁했다. APC Mouse IgG1, k Isotype Ctrl FC(#400122, Biolegend)를 아이소타입 대조군으로 사용하였고, APC 항-인간 EGFR(#352906, Biolegend)을 사용하여 EGFR 수용체, HER2: APC 항-인간 CD340(erbB2/HER-2)(324408, Biolegend)를 염색하였다. CD71: APC 항-인간 CD71 #334108, Biolegend. 샘플을 튜브 롤러 믹서에서 4℃에서 30분 동안 인큐베이션했다. 그 후, 세포를 차가운 PBS(Mg2+ 및 Ca2+ 무함유, 2% FBS)로 3회 세척하고 PBS 중의 2% PFA 용액을 사용하여 실온에서 20분 동안 고정시켰다. 세포를 차가운 PBS로 2회 세척하고 FACS 분석을 위해 250-350 μL 차가운 PBS에 재현탁했다. 샘플은 BD FACSCanto II 유세포 분석 시스템(flow cytometry system)(BD Biosciences) 및 FlowJo 소프트웨어로 분석되었다.
결과
SO1861 분자에 대한 접합 반응에 사용 가능한 화학기들 고려하여, 4개의 화학기가 확인되었다. 도 24에 하이라이트 표시된 바와 같이, 당 잔기의 알코올과 디올, 트리테르페노이드 백본상의 알데히드기, 당 잔기 중 하나의 당 잔기상의 카르복실산(글루쿠론산), 및 트리테르페노이드 백본상의 알켄기.
확인된 각 화학기의 장단점의 견지에서(표 24), 가역적 접합 반응에는 알데히드 및 알코올기가 가장 적합하고, 비가역적/안정적 접합 반응에는 알켄 및 카르복실산(글루쿠론산)이 가장 적합한 기이다. 그러나, SO1861의 분자 구조내의 알데히드기가 알코올에 대한 가역적 접합 반응에 가장 적합하다. 이는 한편으로는, 화학 선택 반응(chemoselective reaction)이 되도록 하는 구조에 단지 하나의 알데히드가 존재하기 때문이다. 다른 한편으로, 알데히드는 아민, 히드라지드 및 히드록실아민과 같은 다양한 화학기와 가역적 접합 반응을 수행하여 이민, 히드라존 및 옥심과 같은 산-절단 가능한 모이어티를 형성할 수 있기 때문이다. 이 인자는 원하는 가역적 접합 반응에 대한 화학기에 대한 선택의 자유를 가능하게 한다. 반면, 알코올은 아세탈과 케탈의 형성을 통한 가역적 접합 반응의 좋은 후보이지만 글리코시드 구조(glycosidic structure)에 다량으로 존재하기 때문에 화학 선택성이 부족하다.
비가역적이고 안정적인 결합의 형성을 위해, 카르복시산은 펩티드 화학에 사용되는 일반적인 도구(예, 카르보디이미드 매개 아미드 형성을 통한 아민과의 반응)로 아미드 및 에스테르를 형성할 수 있기 때문에 가장 적합하다.
따라서, 엔도좀 탈출 증진 사포닌(SO1861과 같은)의 개발을 위해, SO1861에 존재하는 가장 적합한 화학기를 사용하여 절단-불가능 및 절단 가능한 '접합 준비가 된(ready to conjugate)' 사포닌(도 25)을 생성할 수 있는 방법론이 확립되었다.
절단 불가능한 '접합 준비가 된' 사포닌을 생산하기 위해, SO1861의 카르복실기는 펩티드 커플링 화학에 사용되는 시약을 통해 활성화되어 활성 에스테르(예, 1-[비스(디메틸아미노)메틸렌]-1H-1,2,3-트리아졸로[4,5-b]피리디늄 3-옥사이드 헥사플루오로포스페이트, HATU)를 생성한다. 생성된 SO1861의 활성 에스테르는 아민과 반응하여 안정한 아미드 결합 접합체를 형성할 수 있다(도 25A).
절단 가능한 '접합 준비가 된' 사포닌을 생산하기 위해, SO1861의 알데히드기가 EMCH(ε-말레이미도카프로산 히드라지드) 링커와 반응한다. EMCH의 히드라지드기는 SO1861의 알데히드와 산 절단 가능한 히드라존 결합을 형성한다. 동시에 EMCH 링커는 티올(설프히드릴기) 반응성인 말레이미드기를 제공하므로 티올에 접합될 수 있다(도 25B).
SO1861-EMCH의 말레이미드기는 pH 6.5-7.5 범위에서 수행될 때 티올 및 티올을 함유하는 폴리머 구조와 빠르고 특정한 Michael 첨가 반응을 수행한다(도 25 B). 또한, SO1861과 EMCH 사이의 산에 민감한 히드라존 링키지를 활용하여 산성 환경에서 스캐폴드로부터 사포닌 방출을 수행할 수 있다(도 26). 따라서 EMCH 링커는 pH 절단 전략과 폴리머 구조에 대한 접합 전략에 대한 필요성을 모두 충족한다.
폴리머 구조에 접합하기 위한 이상적인 EMCH 스페이서 길이와 관련하여, 컴퓨터 시뮬레이션(PerkinElmer, ChemBio3D, Ver. 13.0.0.3015)은 SO1861-EMCH상의 말레이미드기가 분자 주변에 위치하므로, 티올 함유 폴리머 구조에 접근할 수 있어야 함을 보여준다(도 27).
SO1861-EMCH를 합성하기 위해, SO1861상의 알데히드기를 EMCH로 전환할 수 있는 전략이 개발되었다(도 28A). SO1861-EMCH 접합체는 핵 자기 공명 분광법(재료 및 방법 섹션, 도 22B 참조) 및 도 28B 및 28C, 도 23A에 나타낸 바와 같이 MALDI-TOF-MS(matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry)을 통해 분리되고 성공적으로 특성화되었다.
히드라존 결합의 pH 의존적 가수분해를 테스트하기 위해, SO1861-EMCH는 pH 3의 HCl 용액에 용해되었고, MALDI-TOF-MS 스펙트럼은 두 개의 다른 시점에서 기록되었다(도 29). 도 29A 및 29B에서 볼 수 있듯이, SO1861-EMCH에 해당하는 m/z 2070 Da에서 피크의 명확한 감소 경향은 도 29B에서 볼 수 있다. SO1861은 가수분해 중에 생성되기 때문에 m/z 1861 Da에서 피크의 증가가 기록되었으며, 이는 m/z 2070 Da에서 감소하는 경향을 동반하였다. 이러한 결과는 히드라존 결합이 가수분해에 반응하고 SO1861상에 부착되더라도 절단된다는 것을 보여준다.
SO1861-EMCH를 폴리머 구조에 접합하기 위해, 폴리머 구조의 접근 가능한 아민은 2-이미노티올란 시약의 도움으로 티올로 전환된다. 폴리머 구조상에 생성된 유리(free) 티올은 SO1861-EMCH의 말레이미드기에 티올-엔 Michael 유형 첨가에 대한 친핵체로 작용한다(도 30). 이 개발된 방법론은 SO1861-EMCH를 임의의 사용 가능한 폴리머 구조에 접합하는데 적합하며, 이는 접근 가능한 아민기를 얻고, 또한 각각, 폴리머 구조에 따라 접합된 SO1861 분자의 수를 제어할 수 있도록 한다.
폴리머 구조에 대한 '접합 준비가 된 사포닌'의 접합에 대한 개념의 첫 번째 증거는 단백질의 아민인 소 혈청 알부민(BSA)을 사용하여 획득되었다(폴리 아미노산 스캐폴드 예). 접합 후, 질량 분석은 m/z ~ 70, ~ 72 및 ~ 74 kDa에서 BSA-SO1861의 해당 피크를 얻었다(도 31A). m/z 66kDa로 검출된 BSA 질량과 비교하여(도 31B), 얻어진 BSA-SO1861의 질량은 BSA 당 2, 3, 및 4개의 SO1861 분자로 구성된 BSA-SO1861 접합체의 혼합물에 해당한다.
다음의 폴리머 구조에 대한 '접합 준비가 된 사포닌'의 접합에 대한 개념의 증명은 아민 함유 5세대(G5) 덴드리머 폴리(아미도아민)(공유 커플링된 적색-형광 염료(Cy3)이 있는 PAMAM)을 사용하여 획득되었다. PAMAM-Cy3는 SO1861-EMCH 및 SO1861-HATU 모두에 대한 접합을 위한 폴리머 구조로 활용되었으며, SO1861을 폴리머 구조에 접합하기 위한 모델로 사용되었다(도 32).
Cy3-PAMAM의 모든 접근 가능한 아민기는 Cy3-PAMAM 아민 당 3배 과량의 2-이미노티올란을 사용하여 티올로 전환된 후, SO1861-EMCH와 반응되었다. SO1861-EMCH의 3가지 다른 공급 당량(5, 20 및 57)이 3개의 반응 배치에 사용되었다. 반응 후, MALDI-TOF-MS에서 기록된 Cy3-PAMAM-SO1861 접합체의 질량은 SO1861-EMCH 공급이 증가함에 따라 해당 질량의 증가를 보여준다(도 33). 세 가지 다른 공급물은 도 33B-D에 나타낸 바와 같이 PAMAM 덴드리머 당 부착된 6, 13 및 51 SO1861 분자에 해당하는 Cy3-PAMAM-SO1861 접합체에 대해 얻어진 질량 m/z 38.4 kDa, m/z 53.9 kDa 및 m/z 133.8 kDa에 해당한다.
다른 반응에서, SO1861-EMCH와의 반응 전에 특정 수의 PAMAM 아민만이 티올로 전환되었다. 여기서, 2-이미노티올란의 두 가지 다른 공급 당량(8 및 32)과 SO1861-EMCH의 두 가지 다른 공급 당량(5 및 30)을 각각 사용했다. 반응 후, MALDI-TOF-MS에서 Cy3-PAMAM-SO1861 접합체의 각 스펙트럼은 도 34에 나타낸 바와 같이 m/z 37.7 kDa(SO1861-EMCH의 5 공급 당량) 및 m/z 87.0 kDa(SO1861-EMCH의 30 공급 당량)에서 피크를 나타낸다. m/z 37.7 kDa 및 m/z 87.0 kDa에서 얻어진 질량은 5 및 30 SO1861 분자가 부착된 Cy3-PAMAM-SO1861 접합체에 해당하며, 이 방법으로 SO1861-EMCH의 거의 모든 공급물이 접합되었음을 입증한다.
비-pH-절단성(non-pH-cleavable) 사포닌 접합체의 생성을 위해, SO1861의 카르복실산을 HATU로 활성화한 다음, Cy3-PAMAM의 아민과 반응시켜 Cy3-PAMAM과 SO1861 사이에 결합된 pH 안정 아미드를 형성하였다. 생성된 접합체의 질량은 MALDI-TOF-MS를 통해 PAMAM 당 17.5 SO1861 분자가 부착된 Cy3-PAMAM-NC-SO1861(NC = 절단 불가능) 접합체에 해당하는 m/z 62.3kDa의 질량을 갖는 것으로 검출되었다(도 32B, 도 35).
다음으로, 사포닌 접합된 스캐폴드는 작용화된 스캐폴드를 얻기 위해 소위 스트레인-촉진(strain-promoted) 알킨-아지드 고리화 첨가(strain-promoted alkyne-azide cycloaddition, SPAAC, 클릭 화학)를 통해 표적화된 치료제(예, 표적화된 독소)에 대한 가능한 접합을 위한 연결 지점에 접합되었다. 이 반응을 위해, Cy3-PAMAM-SO1861(도 36C, D) 및 Cy3-PAMAM-NC-SO1861(도 36B)을 접합체 표면에 스트레인드(strained) 알킨을 생성하는 이종이작용성 NHS-PEG13-DBCO 링커에 접합시켰다(도 36A). 링커의 NHS(N 히드록시석신이미드) 모이어티는 스캐폴드와 링커 사이에 아미드 결합을 형성하는 PAMAM-사포닌 접합체의 나머지 아민과 반응하였다. 접합체에서 생성된 DBCO(디벤조시클로옥틴) 모이어티는 표적화된 치료제에서 상응하는 아지드와 함께 SPAAC를 수행할 수 있다.
디안틴-EGF는 모델 표적화된 독소 역할을 하며, 디안틴은 비표적화된 독소 역할을 하였다. 두 독소 모두 염료의 테트라플루오로페닐 에스테르(TFP) 유도체를 사용하여 Alexa Fluor™ 488로 표지되었다. 그런 다음, 염료 표지된 단백질을 이종이작용성 NHS-SS-PEG3-아지드 링커에 접합시켜 PAMAM-사포닌 접합체에 대한 SPAAC에 대한 상응하는 화학적 모이어티를 얻었다. Maldi-TOF-MS 측정은 디안틴-EGF 분자 당 1개의 Alexa Fluor™ 488 염료 및 9개의 NHS-SS-PEG3-아지드 분자가 부착되었음을 보여주었다(도 37, 도 38). 또한, Alexa Fluor™ 488 표지된 디안틴-EGF는 디설파이드 결합이 결여되어 비-독소-절단성(non-toxin-cleavable) 구성물을 생성하는 이종이작용성 NHS-PEG12-아지드 링커에 접합되었다.
Cy3-PAMAM-NC-SO1861-DBCO 및 Cy3-PAMAM-SO1861-DBCO 접합체를 Alexa Fluor™ 488 표지된 아지도-독소와 반응시켜 스트레인-촉진 알킨-아지드 고리화 첨가를 수행했다. 반응 제제(reacting agent) 간의 접합은 겔 전기영동 후 폴리아크릴아미드 겔 상의 독소에만 부착된 Alexa Fluor™ 488의 형광 신호 및 겔 전기영동과 PAMAM 폴리머에만 부착된 Cy3의 형광 신호의 공-편재화(co-localization)을 통해 표시되었다(도 39).
PAMAM 덴드리머에 대한 대체 폴리머 구조로서, 초점에 16개의 작용성 아미노 말단기 및 아지도기를 갖는 G4-덴드론(PFd-G4-Azide-NH-BOC, Polymer Factory)이 SO1861에 대한 접합에 사용되었다(도 46). 덴드리머보다 덴드론을 사용하는 이점은 덴드론 구조가 나타나는 초점이다. 이 초점(focal point)을 사용하면 직교 클릭 작용으로 사후 변형 없이 표적화된 독소에 직접 접합되도록 할 수 있다(도 47). 도 47에서 볼 수 있듯이, 덴드론에 대해 PAMAM 덴드리머에 대해 기술한 것과 동일한 방법론이 적용되었다. 간략하게, 부분 염료 표지 및 탈보호(도 48) 후, 덴드론의 아미노기는 티올화 시약 2-이미노티올란을 사용하여 티올로 전환된 후 SO1861-EMCH에 접합되었다. SO1861-EMCH에 대한 접합을 위해, SO1861-EMCH의 3가지 다른 공급 당량이 사용되었다. 덴드론-SO1861 접합체를 MALDI-TOF-MS를 통해 분석했다. 예상대로, 덴드론 분자당 1 및 2 SO1861 분자의 접합체 종은, 3 및 10의 낮은 SO1861-EMCH 공급 당량을 사용할 때 얻어졌다(도 49B, C). 덴드론 분자당 22의 SO1861-EMCH 분자의 공급 당량을 사용하는 경우, 덴드론당 최대 9 SO1861 분자의 더 높은 덴드론-SO1861 접합체 종을 얻었다(도 49A). 추가 실험에서, 사포닌 작용화된 덴드론은 이의 초점을 통해 표적화된 독소에 접합되어 작용화된 스캐폴드를 생성할 것이며, 생물학적으로 평가될 것이다.
이전의 실시예는 측정된 양의 SO1861 분자 또는 기타 엔도좀 탈출 인핸서 분자를 폴리머 구조에 접합하여 표적화된 독소와 같은 치료 물질의 세포질 전달을 증진할 수 있도록 하는 방법론이 개발되었음을 보여준다.
폴리머 구조에 대한 SO1861의 다른 접합 방법론을 추가로 테스트하기 위해, 환원성 아민화 경로가 사용되었다. 이를 위해, SO1861의 알데히드기는 이민 결합을 형성하는 PAMAM 아민에 직접 접합되었다. 이민 결합 형성 후에 SO1861과 PAMAM 사이에 pH-안정한 아민 결합을 형성하는 환원제 소듐 시아노보로하이드라이드의 첨가를 통한 환원 아민화 단계가 수행된다(도 40A). EMCH 및 HATU 접근 방식과 유사하게, 이 방법론은 도 40B, C에 나타낸 바와 같이 폴리머당 접합된 사포닌의 수를 제어할 수 있게 한다. 여기서, PAMAM-사포닌 접합체가 생성되어 PAMAM당 10개(도 40B) 및 30개(도 40C)의 SO1861 분자를 얻었다.
논의된 폴리머 및 단백질 접근법 중 SO1861 스캐폴드의 개발을 위한 또 다른 접근법은 폴리(SO1861) 접근법이다. 이 접근법의 아이디어는 SO1861을 방출하는 pH에 민감한 절단 가능한 결합을 갖는 SO1861 분자로만 구성된 폴리머를 생성하는 것이다. 또한, 폴리(SO1861)는 독소 및 바이오폴리머에 대한 접합 반응을 수행할 수 있어야 한다. 이 접근법의 주요 목표는 가능한 한 간단하고 비용 효율적으로 유지하는 것이다. 산 절단 가능한 SO1861의 생성을 위한 프로토콜이 이미 개발되었기 때문에(SO1861-EMCH 접근법), SO1861을 추가로 변형하거나 SO1861 분자상의 다른 접합 부위를 식별(identifying)하지 않고 중합 개시제의 간단한 첨가를 통해 SO1861-EMCH를 중합하는 것이 가능한지를 알아보는 것은 흥미로울 것이다. 과거에, 여러 논문에서 말레이미드기의 이중 결합을 공격하여 말레이미드의 이중 결합을 따라 라디칼 중합을 개시하는 라디칼 개시제를 사용하는 말레이미드기의 중합이 논의되었다(29-31). SO1861-EMCH는 이의 구조에서 말레이미드기를 나타내기 때문에, 이 기는 라디칼 중합 반응에 대해 잠재적으로 탐구되어 산 절단 가능한 작용을 갖는 폴리(SO1861)를 산출할 수 있다. 중합 반응이 합리적인 반응 시간을 갖는다면, 생성된 SO1861 폴리머는 반응을 켄칭할 뿐만 아니라 독소 또는 바이오폴리머 접합을 위한 작용기를 생성하는 라디칼 켄처로 켄칭될 수 있다. 이러한 반응 스킴은 도 41에 도시되어 있다. 여기에서 암모늄 퍼설페이트(APS) 및 테트라메틸에틸렌디아민(TMEDA)의 시스템은 라디칼 발생제로서 예시적인 방식으로 나타내어지며, 아미노프로판티올은 모델 라디칼 켄쳐 역할을 한다. 아미노프로판티올을 예시적인 켄쳐로 사용하면, 생성된 아민기는 클릭가능한 기로 특이적으로 추가로 변형되거나 폴리(SO1861)를 독소에 직접 접합하는 데 사용될 수 있다.
자유 라디칼 중합에서, 반응 조건은 폴리머 특성과 반응 결과에 큰 영향을 미친다. 예를 들어, 온도, 단량체 농도 및 개시제 농도는 폴리머를 형성하는 데 중요한 역할을 하며, 원하는 폴리머 특성에 따라 미세 조정되어야 한다. 라디칼 중합은 일반적으로 50℃ 초과의 온도에서 수행되기 때문에, 첫 번째 반응은 60℃의 온도에서 수행된다. SO1861-EMCH 중합이 자발적으로 시작될 수 있는지 그리고 APS와 TMEDA가 중합도에 영향을 미치는지 알아보는 것은 흥미로웠다. 따라서, 동일한 SO1861-EMCH 농도를 사용하여 세 가지 반응이 수행되었지만 APS/TMEDA 조성이 상이하였다. 첫 번째 반응에서는 SO1861-EMCH만 3시간 동안 60℃까지 가열되었으며, 두 번째 반응에서는 SO1861-EMCH 및 APS가 포함되었으며, 세 번째 반응에서는 SO1861-EMCH, APS 및 TMEDA가 포함되었다. (이 실험의 경우 재료 및 방법 섹션 "폴리(SO1861) 합성"에 언급된 것과 동일한 양과 농도의 출발 물질이 사용되었다.) 배치는 도 42A-C에 나타낸 바와 같이 MALDI-TOF-MS를 통해 분석되었다. 흥미롭게도 SO1861-EMCH는 60℃까지 가열될 때 자발적으로 2, 3, 4, 5, 및 6 SO1861 분자로 구성된 올리고머를 형성하기 시작하는 것으로 나타났다(도 42A). 동일한 온도에서 11-3 당량 APS의 첨가는 이러한 경향에 영향을 미치지 않았다(도 42B). 그러나, APS/TMEDA의 개시제 시스템을 사용할 경우, 18.2kDa의 분자량을 갖는 최대 9 SO1861 분자의 SO1861 올리고머를 검출할 수 있었다(도 42C). 또한, 올리고머에 대해 얻은 피크는 도 42A 및 42B의 피크와 비교하여 훨씬 더 크게 보였으며, 이는 이 반응에 대한 SO1861-EMCH의 더 높은 소비를 나타낸다.
반응 조건을 추가로 미세 조정하기 위해, 2,2'-아조비스[2-메틸-N-(2-히드록시에틸)프로피온아미드] 및 아조비스이소부티로니트릴과 같은 아조 개시제와 같은 다른 개시제가 시험될 뿐만 아니라, 제어된 라디칼 중합(원자-이동 라디칼-중합(atom-transfer radical-polymerization), 가역적 첨가-단편화 연쇄 이동(reversible addition-fragmentation chain transfer) 등)과 같은 다른 중합 기술이 시험될 것이다. 더욱이, EMCH의 대체물로서 다른 히드라지드 링커가 말레이미드기보다 라디칼 중합에 더 적합한 작용기(예컨대 아크릴 또는 아크롤리올 잔기)를 얻는 것으로 간주될 수 있다.
SO1861 스캐폴드 개발을 위한 또 다른 접근 방식은 DNA 접근법이다. 이 접근법의 아이디어는 소위 DNA-오리가미(Kolb et al, 2004; Bird et al, 1988)의 개념을 활용하는 것이다. 사포닌을 접합하기 위한 폴리머 또는 어셈블리된 폴리머 구조로서의 DNA-오리가미는 안정성, 확장성, 생성된 DNA-사포닌 스캐폴드의 최종 크기 및 형상의 정밀한 제어를 포함하는 여러 고유한 이점을 제공할 수 있다. 이러한 DNA 나노캐리어는 천연 DNA를 포함하여 구성되어 있기 때문에, 생체 적합성이 있고, 살아있는 세포에 독성을 나타내지 않으며, 내부 세포 구획으로부터 카르고(cargo)를 용이하게 방출할 수 있다. 이러한 구조의 다중원자가(multivalency)는 형광단(fluorophore) 및 독소와 같은 다양한 페이로드에 대한 미세 조정 표적화 성능 및 고용량을 추가로 허용할 수 있다. 따라서, 이 접근법에서 DNA 가닥은 3' 및 5' 말단 각각에 화학적 작용기를 제공하고, 구성물의 최종 형태를 제어할 수 있도록 하는 서열의 특정한 원하는 영역에서만 혼성화할 수 있는 것으로 확인된다. 화학기는 예를 들어, 이미 개발된 SO1861-EMCH와 3' 및 5' DNA 가닥 중 하나에 있는 티올기 사이의 티올-엔 반응을 통해 사포닌을 커플링하기 위해 사용되어야 한다. 상보적인 DNA 가닥은 표적화된 독소에 커플링하는 데 사용할 수 있는 클릭 작용기를 제공할 수 있다. 개념은 도 43에 도시되어 있다.
사포닌을 결합 및 방출할 수 있고, 중합되어 큰 폴리(펩티드) 유사 구조를 형성할 수 있는 DNA 가닥 대신에 특정 펩티드 서열을 사용하여 유사한 접근 방식을 생각할 수 있다. 이 접근법에서, SO1861-EMCH 분자의 계산된 크기에 맞는 길이를 갖고, 서열 중간에 시스테인 잔기를 제공하고, N-말단 및 C-말단 모두에 아민기가 존재하는 펩티드 서열을 확인하고 구입하였다. 시스테인 잔기는 SO1861-EMCH의 말레이미드기와 시스테인 잔기의 티올기의 티올-엔 반응을 통해 SO1861-EMCH를 접합하는 데 사용할 수 있다. 2개의 아민기는 도 44에 나타낸 바와 같이 적절한 가교제를 사용하여 펩티드-SO1861 접합체를 중합하기 위해 이용될 수 있다.
접합 연구는 맞춤형 펩티드(서열: SESDDAMFCDAMDESDSK)에 대한 SO1861-EMCH의 접합이 성공적이었음을 보여주었다. MALDI-TOF-MS를 통해 서열 중간에 말레이미드 반응성 시스테인을 함유하는 단백질 및 이의 SO1861-EMCH에 대한 접합을 분석하였다(도 45). MALDI-TOF-MS 스펙트럼은 m/z 4053 Da에서 펩티드-SO1861 접합체에 대한 예상 피크 및 SO1730의 해당 사포닌-EMCH의 펩티드-SO1861 접합체인 m/z 3821 Da에서 추가 피크를 나타낸다. SO1861-EMCH가 약간 과량(1.3당량) 사용되었고, 반응 후 SO1861-EMCH 피크가 검출되지 않았기 때문에, 접합이 정량적이라고 가정할 수 있다. 펩티드-SO1861의 첫 번째 중합 반응을 시작하기 위해, 디석신이미딜 타르트레이트가 아민 반응성 가교제로 사용될 것이다.
SO1861의 엔도좀 탈출 증진 특성은 낮은 엔도좀 pH(< pH5)에서만 노출되기 때문에, 스캐폴드 또는 작용화된 스캐폴드는 엔도좀의 산성화(acidification)를 방해하여 SO1861의 활성을 차단할 수 있는 화학기를 포함하지 않아야 한다.
G5 PAMAM(128개의 1차 아민 및 약 126개의 3차 아민) 및 G4-덴드론(16개의 1차 아민)의 폴리머 구조를 함유하는 아민을, 이들 분자가 SO1861의 엔도좀 탈출 증진 능력을 억제하는지 측정하기 위해 테스트하였다. HeLa 세포에서 디안틴-EGF 및 다양한 SO1861 농도의 조합으로 PAMAM(네이티브(native) 또는 티올화) 또는 덴드론(네이티브)의 공동 투여 실험을 수행했다. 엔도좀 산성화 억제에 대한 대조군으로 클로로퀸을 사용하였다.
HeLa 세포는 충분한 EGFR 세포 표면 수준을 나타낸다(도 50A). '네이티브(native)' PAMAM 및 클로로퀸 모두 표적화된 독소의 SO1861-매개 엔도좀 탈출 및 Hela 세포에서 후속 세포 사멸을 억제하는 것으로 관찰되었다(도 50B). 500nM에서의 PAMAM은 엔도좀 산성화 억제제인 클로로퀸과 동일한 정도로 억제하지만, 667nM 덴드론은 전혀 효과가 없다. '네이티브' PAMAM의 억제 활성이 PAMAM의 아미노기의 이용가능성으로 인한 것인지 추가로 알아보기 위해, PAMAM의 1차 아미노기는 2-이미노티올란과의 반응을 통해 부분적으로 티올화되어(도 51), 결과적으로 128개 중 16개(도 51C), 65/128(도 51D) 및 108/128(도 51E)의 1차 아민을 차단하였다. 65개 및 108개 1차 아민의 티올화는 SO1861-매개 엔도좀 탈출의 억제를 극복하는 반면, 최대 16개 아민기의 티올화는 표적화된 독소의 SO1861-매개 엔도좀 탈출의 억제 효과를 여전히 나타내는 것으로 관찰된다(도 50C). PAMAM의 1차 아미노기는 또한 mPEG2k-NHS(도 52)와의 반응을 통해 부분적으로 PEG화되어(PEGylated), 결과적으로 128개 중 3개(도 52C), 8/128(도 52D) 및 18/128(도 52E)의 1차 아민을 차단하였다. PEG화에 의한 단 3개의 1차 아민 차단은 이미 SO1861-매개 엔도좀 탈출 억제를 역전시키기에 충분하다(도 51D). PEG화는 충분한 수준에 도달하면, 전체 분자를 차단할 수 있는 수화층(hydration layer)을 도입하는 것으로 알려져 있으므로, PEG화의 차폐 효과는 전환된 소수의 아민을 초과하여 확장될 가능성이 높다.
이러한 결과는 PAMAM과 같은 폴리머 구조상에 특정 수의 유리 아미노기가 존재가 엔도좀 산성화를 차단할 수 있으며, 따라서 SO1861 또는 다른 글리코시드의 엔도좀 탈출 활성을 억제할 수 있음을 보여준다. G4-덴드론에 대해 나타낸 바와 같이, 아미노기의 수가 적거나, 티올화(thiolation) 또는 PEG화와 같이 아미노기가 차폐된 경우, 억제 효과가 역전(reverse)된다.
참고문헌
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SEQUENCE LISTING
<110> Sapreme Technologies B.V.
Charite- UNIVERSITATSMEDIZIN BERLIN
<120> IMPROVED ANTIBODY-OLIGONUCLEOTIDE CONJUGATE
<130> P6086387PCT
<140> PCT/EP2019/084242
<141> 2019-12-09
<160> 12
<170> PatentIn version 3.5
<210> 1
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<212> DNA
<213> Antisense BNA (HSP27) oligo nucleic acid sequence
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ggcacagcca gtggcg 16
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<212> DNA
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<213> Customized peptide
<400> 12
Ser Glu Ser Asp Asp Ala Met Phe Cys Asp Ala Met Asp Glu Ser Asp
1 5 10 15
Ser Lys
Claims (45)
- 세포-표면 분자 표적화 분자 및 적어도 하나의 이펙터 모이어티를 포함하고 적어도 하나의 공유 결합된 사포닌을 추가로 포함하는 접합체.
- 제1항에 있어서,
상기 적어도 하나의 사포닌은 위치 C-23에서 알데히드 작용(function)을 갖는 12,13-디하이드로올레아난 유형에 속하며, 선택적으로 사포닌의 C-3베타-OH 기에서 카보하이드레이트 치환체에 글루쿠론산 작용을 포함하는, 비스데스모시딕 트리테르펜 사포닌 및/또는 트리테르페노이드 사포닌 및/또는 집소필라(Gypsophila) 종 및/또는 사포나리아(Saponaria) 종 및/또는 아그로스템마(Agrostemma) 종 및/또는 퀼라자(Quillaja) 종, 예컨대 퀼라자 사포나리아(Quillaja saponaria) 중 임의의 하나 이상에서 분리된 사포닌인, 접합체. - 제1항 또는 제2항에 있어서,
상기 적어도 하나의 사포닌은 단일의 특정한 사포닌이거나 또는 둘 이상의 다른 사포닌의 혼합물인, 접합체. - 제1항 내지 제3항 중 어느 한 항에 있어서,
상기 적어도 하나의 사포닌은 3.000 달톤 이하, 바람직하게는 2.500 달톤 이하, 보다 바람직하게는 2.300 달톤 이하, 가장 바람직하게는 2.000 달톤 이하, 예컨대 1.500 달톤-1.900 달톤의 분자 질량(molecular mass)을 갖는, 접합체. - 제1항 내지 제4항 중 어느 한 항에 있어서,
상기 적어도 하나의 사포닌은 표 A1 또는 스킴 I, SO1861, SA1657, GE1741, SA1641, QS-21, QS-21A, QS-21 A-api, QS-21 A-xyl, QS-21B, QS-21 B-api, QS-21 B-xyl, QS-7-xyl, QS-7-api, QS-17-api, QS-17-xyl, QS1861, QS1862, 퀼라자사포닌(Quillajasaponin), 사포늄 앨범(Saponinum album), QS-18, Quil-A, Gyp1, 집소사이드 A(gypsoside A), AG1, AG2, SO1542, SO1584, SO1658, SO1674, SO1832, 또는 이들의 임의의 입체 이성질체 및/또는 이들의 임의의 조합 중 하나 이상이며, 바람직하게는 상기 사포닌은 SO1861 및/또는 GE1741 및/또는 SA1641 및/또는 QS-21 및/또는 퀼라익산 아글리콘 코어(quillaic acid aglycon core), C-3베타-OH기에 Gal-(1→2)-[Xyl-(1→3)]-GlcA 카보하이드레이트 치환체 및 C-28-OH기에 Glc-(1→3)-Xyl-(1→4)-Rha-(1→2)-[Xyl-(1→3)-4-OAc-Qui-(1→4)]-Fuc 카보하이드레이트 치환체를 갖는 사포닌이며 및/또는 3-O-베타-D-갈락토피라노실-(1→2)-[베타-D-자일로피라노실-(1→3)]-베타-D-글루쿠로노피라노실 퀼라익산 28-0-베타-D-글루코피라노실-(1→3)-베타-D-자일로피라노실-(1→4)-알파-L-람노피라노실-(1→2)-[베타-D-자일로피라노실-(1→3)-4-OAc-베타-D-퀴노보피라노실-(1→4)]-베타-D-푸코피라노사이드이며, 보다 바람직하게는 적어도 하나의 사포닌은 SO1861 및/또는 QS-21인, 접합체. - 제1항 내지 제5항 중 어느 한 항에 있어서,
상기 적어도 하나의 사포닌은 분자 질량이 적어도 1.500 달톤이고 C-3 위치에 제1 분지형 카보하이드레이트 측쇄를 가지며, 제1 분지형 카보하이드레이트 측쇄가 선택적으로 글루쿠론산을 함유하는, C-23 위치에 알데히드기를 함유하고 선택적으로 C-16 위치에 히드록실기를 함유하는 올레아난형(oleanan-type) 트리테르펜을 포함하는 비스데스모시딕 사포닌이며, 여기서 사포닌은 C-28 위치에 제2 분지형 카보하이드레이트 측쇄를 갖는 에스테르기를 함유하며, 제2 분지형 카보하이드레이트 사슬은 선택적으로 적어도 하나의 아세틸 잔기(residue), 예컨대 2개의 아세틸 잔기를 함유하고 및/또는 선택적으로 디옥시 카보하이드레이트를 포함하고 및/또는 선택적으로 퀴노보스를 포함하고 및/또는 선택적으로 글루코스를 포함하고 및/또는 선택적으로 4-메톡시신남산을 포함하고 및/또는 선택적으로 에스테르 결합을 통해 카보하이드레이트에 결합된 5-0-[5-0-Rha-(1→2)-Ara/Api-3,5-디하이드록시-6-메틸-옥타노일]-3,5-디하이드록시-6-메틸-옥탄산을 포함하며 및/또는 선택적으로 5-0-[5-0-Ara/Api-3,5-디하이드록시-6-메틸-옥타노일]-3,5-디하이드록시-6-메틸-옥탄산을 포함하는, 적어도 4개의 카보하이드레이트 유닛을 바람직하게 포함하며, 또는 여기서 적어도 하나의 사포닌은 QS-21 또는 QS-21A, QS-21 A-api, QS-21 A-xyl, QS-21B, QS-21 B-api, QS-21 B-xyl, QS-7-xyl, QS-7-api, QS-17-api, QS-17-xyl, QS-18, QS1861, 양성자화된 QS1861 (QS1862), Quil-A 중 임의의 하나 이상인, 접합체. - 제1항 내지 제6항 중 어느 한 항에 있어서,
상기 세포-표면 분자 표적화 분자는 상기 세포-표면 분자에 대한 결합을 위한 단백질성 결합 분자 또는 단백질성 리간드 또는 리간드를 포함하거나 이로 구성되는, 접합체. - 제1항 내지 제7항 중 어느 한 항에 있어서,
상기 세포-표면 분자 표적화 분자는 세포-표면 분자에 대한 결합을 위한 비-단백질성 리간드 및/또는 단백질성 리간드, 예컨대 EGF 또는 사이토카인을 포함하거나 이로 구성되며, 및/또는 면역 글로불린, 면역 글로불린의 적어도 하나의 결합 도메인, 및/또는 면역 글로불린의 적어도 하나의 결합 단편, 예컨대 항체, IgG, Vhh 도메인 또는 Vh 도메인을 포함하거나 이로 구성되는 분자, Fab, scFv, Fv, dAb, F(ab)2, Fcab 단편을 포함하거나 이로 구성되며, 이는 세포-표면 분자에 결합될 수 있는, 접합체. - 제1항 내지 제8항 중 어느 한 항에 있어서,
상기 세포-표면 분자 표적화 분자는 종양-세포 표면 분자, 바람직하게는 종양-세포 수용체 예컨대 종양-세포 특이적 수용체, 보다 바람직하게는 CD71, CA125, EpCAM(17-1A), CD52, CEA, CD44v6, FAP, EGF-IR, 인테그린(integrin), 신데칸-1(syndecan-1), 혈관 인테그린 알파-V 베타-3(vascular integrin alpha-V beta-3), HER2, EGFR, CD20, CD22, 엽산 수용체 1(Folate receptor 1), CD146, CD56, CD19, CD138, CD27L 수용체, PSMA, CanAg, 인테그린-알파V, CA6, CD33, 메소텔린, 크립토, CD3, CD30, CD239, CD70, CD123, CD352, DLL3, CD25, ephrinA4, MUC1, Trop2, CEACAM5, CEACAM6, HER3, CD74, PTK7, Notch3, FGF2, C4.4A, FLT3, CD38, FGFR3, CD7, PD-L1, CTLA4, CD52, PDGFRA, VEGFR1, VEGFR2로부터 선택된 수용체, 바람직하게는 CD71, HER2 및 EGFR로 부터 선택된 수용체에 결합될 수 있는, 접합체. - 제9항에 있어서,
상기 종양-세포 수용체는 제1항 및 제7항 내지 제9항 중 어느 한 항의 세포-표면 분자 표적화 분자 및 제1항 내지 제9항 중 어느 한 항의 접합체에 결합한 후에 종양 세포에 의해 내재화되며, 바람직하게는 종양-세포 수용체에 대한 접합체의 결합 후에 접합체와 종양-세포 수용체의 복합체가 예를 들어 엔도사이토시스를 통해 종양-세포 수용체-매개 내재화되는, 접합체. - 제1항 내지 제10항 중 어느 한 항에 있어서,
상기 세포-표면 분자 표적화 분자는 모노클로날 항체 또는 이의 적어도 하나의 세포-표면 분자 결합 단편 또는 -도메인이거나 이를 포함하며, 바람직하게는 세툭시맙, 다라투무맙, 젬투주맙, 트라스투주맙, 파니투무맙, 브렌투시맙, 이노투주맙, 모세투모맙, 폴라투주맙, 오비누투주맙, IgG 유형의 OKT-9 항-CD71 모노클로날 항체, 페르투주맙, 리툭시맙, 오파투무맙, 허셉틴, 알렘투주맙, 피나투주맙, OKT-10 항-CD38 모노클로날 항체, 표 A2 또는 표 A3 또는 표 A4의 항체, 바람직하게는 세툭시맙 또는 트라스투주맙 또는 OKT-9, 또는 이의 적어도 하나의 세포-표면 분자 결합 단편 또는 -도메인 중 임의의 하나를 포함하거나 이로 구성되는, 접합체. - 제1항 내지 제11항 중 어느 한 항에 있어서,
상기 적어도 하나의 이펙터 모이어티는 올리고뉴클레오티드, 핵산 및 제노 핵산 중 임의의 하나 이상, 바람직하게는 벡터, 유전자, 세포 자살 유도 트랜스진, 데옥시리보핵산 (DNA), 리보핵산 (RNA), 안티센스 올리고뉴클레오티드 (ASO, AON), 짧은 간섭 RNA (siRNA), 마이크로RNA (miRNA), DNA 앱타머, RNA 앱타머, mRNA, 미니-서클 DNA, 펩티드 핵산 (PNA), 포스포라미데이트 모르폴리노 올리고머 (PMO), 잠금 핵산 (LNA), 브리지 핵산 (BNA), 2'-디옥시-2'-플루오로아라비노 핵산 (FANA), 2'-O-메톡시에틸-RNA (MOE), 2'-O, 4'-아미노에틸렌 브리지 핵산, 3'-플루오로 헥시톨 핵산 (FHNA), 플라스미드, 글리콜 핵산 (GNA) 및 트레오스 핵산 (TNA) 또는 이의 유도체 중 임의의 하나 이상으로부터 선택된 것, 보다 바람직하게는 BNA, 예를 들어 HSP27 단백질 발현을 침묵시키는 BNA를 포함하거나 이로 구성되는, 접합체. - 제1항 내지 제12항 중 어느 한 항에 있어서,
상기 적어도 하나의 이펙터 모이어티는 적어도 하나의 단백질성 분자, 바람직하게는 펩티드, 단백질, 효소, 예컨대 우레아제 및 Cre-재조합효소, 리보좀-불활성화 단백질, 표 A5로부터 선택된 단백질성 독소 중 임의의 하나 이상으로부터 선택된 것, 그리고 보다 바람직하게는 바이러스 독소, 예컨대 아폽틴; 박테리아 독소 예컨대 시가(Shiga) 독소, 시가-유사(Shiga-like) 독소, 슈도모나스 아에루기노사 엑소톡신(Pseudomonas aeruginosa exotoxin) (PE) 또는 PE의 엑소톡신 A, 전장 또는 절단된(truncated) 디프테리아 독소 (DT), 콜레라 독소; 곰팡이 독소(fungal toxin), 예컨대 알파-사르신; 리보좀-불활성화 단백질 및 2형 리보좀-불활성화 단백질의 A 체인, 예컨대 디안틴, 예를 들어, 디안틴-30 또는 디안틴-32, 사포린 예를 들어, 사포린-S3 또는 사포린-S6, 보우가닌 또는 보우가닌의 탈-면역화(de-immunized) 유도체 디보우가닌, 시가-유사 독소 A, 포크위드(pokeweed) 항바이러스 단백질, 리신(ricin), 리신 A 체인, 모데신, 모데신 A 체인, 아브린, 아브린 A 체인, 볼켄신, 볼켄신 A 체인, 비스쿠민, 비스쿠민 A 체인을 포함하는 식물 독소; 또는 동물 또는 인간 독소, 예컨대 개구리 RNase, 또는 인간으로부터의 안지오게닌, 또는 그랜자임 B, 또는 이의 임의의 단편 또는 유도체 중 임의의 하나 이상으로부터 선택되는 것을 포함하거나 이로 구성되며; 바람직하게는 단백질 독소가 디안틴 및/또는 사포린인, 접합체. - 제1항 내지 제13항 중 어느 한 항에 있어서,
상기 적어도 하나의 이펙터 모이어티는 적어도 하나의 페이로드, 바람직하게는 리보좀 표적화 독소(toxin targeting ribosomes), 연장 인자 표적화 독소(toxin targeting elongation factors), 튜불린 표적화 독소, DNA 표적화 독소, 및 RNA 표적화 독소 중 임의의 하나 이상으로부터 선택된 것, 보다 바람직하게는, 엠탄신, 파수도톡스, 메이탄시노이드 유도체 DM1, 메이탄시노이드 유도체 DM4, 모노메틸 아우리스타틴 E(MMAE, 베도틴), 모노메틸 아우리스타틴F(MMAF, 마포도틴), 칼리케아미신, N-아세틸-γ-칼리케아미신, 피롤로벤조디아제핀 (PBD) 다이머, 벤조디아제핀, CC-1065 유사체, 듀오카르마이신, 독소루비신, 파클리타셀, 도세타셀, 시스플라틴, 시클로포스파미드, 에토포사이드, 도세타셀, 5-플루오로우라실(5-FU), 미토산트론, 튜불리신, 인돌리노벤조디아제핀, AZ13599185, 크립토피신, 리조신, 메토트레세이트, 안트라사이클린, 캠토테신 유사체, SN-38, DX-8951f, 엑사테칸 메실레이트, 슈도모나스 아에루기노사(Pseudomonas aeruginosa) 엑소톡신(PE38)의 절단된 형태, 듀오카르마이신 유도체, 아마니틴, α-아마니틴, 스플라이세오스타틴, 타일란스타틴, 오조가미신, 테시린, 앰버스타틴269 및 소라브탄신, 또는 이의 유도체 중 임의의 하나 이상으로부터 선택된 것을 포함하거나 이로 구성되는, 접합체. - 제1항 내지 제14항 중 어느 한 항에 있어서,
상기 적어도 하나의 이펙터 모이어티는 적어도 하나의 링커를 통해 세포-표면 분자 표적화 분자에 공유 결합되거나 또는 세포-표면 분자 표적화 분자에 직접 결합되는, 접합체. - 제1항 내지 제15항 중 어느 한 항에 있어서,
상기 적어도 하나의 이펙터 모이어티는 세포-표면 분자 표적화 분자에 공유 결합되며, 이에 의해 항체-약물 접합체 젬투주맙 오조가미신, 브렌투시맙 베도틴, 트라스투주맙 엠탄신, 이노투주맙 오조가미신, 모세투모맙 파수도톡스 및 폴라투주맙 베도틴 및 표 A2 및 표 A3의 항체-약물 접합체 중 임의의 하나를 형성하는, 접합체. - 제1항 내지 제16항 중 어느 한 항에 있어서,
상기 적어도 하나의 사포닌은 세포-표면 분자 표적화 분자, 바람직하게는 세포-표면 분자 표적화 분자의 아미노산 잔기에 사포닌의 알데히드 작용을 통해, 및/또는 적어도 하나의 이펙터 모이어티에 바람직하게는 적어도 하나의 이펙터 모이어티의 아미노산 잔기를 통해, 사포닌에서의 알데히드 작용, 바람직하게는 12,13-디하이드로올레아난 유형에 속하는 비스데스모시딕 트리테르펜 사포닌의 위치 C-23에서의 알데히드 작용을 통해 공유 결합되는, 접합체. - 제17항에 있어서,
상기 적어도 하나의 사포닌에서의 알데히드 작용, 바람직하게는 적어도 하나의 사포닌의 위치 C-23에서의 알데히드 작용은 링커 N-ε-말레이미도카프로산 히드라지드에 공유 커플링되고, 이 링커는 티오-에테르 결합을 통해 세포-표면 분자 표적화 분자 및/또는 적어도 하나의 이펙터 모이어티의 설프하이드릴기(sulfhydryl group), 예컨대 시스테인의 설프하이드릴기에 공유 커플링되는, 접합체. - 제1항 내지 제19항 중 어느 한 항에 있어서,
상기 적어도 하나의 사포닌은 위치 C-23에서 알데히드 작용을 갖는 12,13-디하이드로올레아난 유형에 속하며 사포닌의 C-3베타-OH기의 카보하이드레이트 치환체에 글루쿠론산 작용을 포함하는 비스데스모시딕 트리테르펜 사포닌이며, 여기서 사포닌은 글루쿠론산(glucuronic acid) 작용을 통해, 그리고 바람직하게 적어도 하나의 이펙터 모이어티의 아미노산 잔기를 통해 적어도 하나의 이펙터 모이어티 및/또는 세포-표면 분자 표적화 분자의 아미노산 잔기에 공유 결합되는, 접합체. - 제18항에 있어서,
상기 적어도 하나의 사포닌의 C-3베타-OH기에서의 카보하이드레이트 치환체에서의 글루쿠론산 작용은 링커 1-[비스(디메틸아미노)메틸렌]-1H-1,2,3-트리아졸로[4,5-b]피리디늄 3-옥시드 헥사플루오로포스페이트에 공유 커플링되며, 이 링커는 아미드 결합을 통해 세포-표면 분자 표적화 분자 및/또는 적어도 하나의 이펙터 모이어티의 아민기, 예컨대 세포-표면 분자 표적화 분자 및/또는 적어도 하나의 이펙터 모이어티의 N-말단 또는 라이신의 아민기에 공유 커플링되는, 접합체. - 제1항 내지 제20항 중 어느 한 항에 있어서,
상기 적어도 하나의 사포닌은 세포-표면 분자 표적화 분자 및/또는 적어도 하나의 이펙터 모이어티에 직접 또는 적어도 하나 링커 예컨대 2작용성 링커, 예를 들어, N-ε-말레이미도카프로산 히드라지드에 기초한 및/또는 1-[비스(디메틸아미노)메틸렌]-1H-1,2,3-트리아졸로[4,5-b]피리디늄 3-옥시드 헥사플루오로포스페이트에 기초한 2작용성 링커, 또는 3작용성 링커, 예컨대 스킴 II 및 구조 B의 3작용성 링커를 통해 공유 결합되는, 접합체. - 제21항에 있어서,
상기 3작용성 링커는 적어도 하나의 사포닌이 공유 결합된 제2 화학기, 세포-표면 분자 표적화 분자에 대한 공유 결합을 위한 제3 화학기 및 적어도 하나의 이펙터 모이어티에 대한 공유 결합을 위한 제1 화학기를 포함하며, 바람직하게는 3작용성 링커는 스킴 II 및 구조 B의 3작용성 링커인, 접합체. - 제1항 내지 제18항 중 어느 한 항에 있어서,
상기 적어도 하나의 사포닌은 세포-표면 분자 표적화 분자 및 적어도 하나의 이펙터 모이어티에 3작용성 링커를 포함하는 적어도 하나의 링커를 통해 공유 결합되며, 3작용성 링커에 세포-표면 분자 표적화 분자 및 적어도 하나의 이펙터 모이어티 모두가 결합되고, 바람직하게는 3작용성 링커는 스킴 II 및 구조 B의 3작용성 링커인, 접합체. - 제18항, 및 제20항 내지 제23항 중 어느 한 항에 있어서,
상기 적어도 하나의 링커는 적어도 하나의 절단 가능한(cleavable) 링커를 포함하며, 여기서 선택적으로 상기 절단 가능한 링커는 산성, 환원성, 효소 또는 광-유도 조건 하에서 절단되며, 바람직하게는 절단 가능한 링커는 산성 조건 하에서 절단되는 히드라존 결합 또는 히드라지드 결합 및/또는 단백질 분해(proteolysis), 예를 들어 카셉신 B에 의한 단백질 분해에 민감한 결합, 및/또는 환원성 조건 하에서 절단에 민감한 결합, 예컨대 디설파이드 결합으로부터 선택되는 절단 가능한 결합을 포함하는, 접합체. - 제18항, 및 제20항 내지 제24항 중 어느 한 항에 있어서,
상기 적어도 하나의 링커는 적어도 하나의 절단 가능한 링커를 포함하며, 여기서 상기 절단 가능한 링커는 포유류 세포, 바람직하게는 인간 세포의 엔도좀 및/또는 리소좀에 존재하는 산성 조건, 바람직하게는 pH 4.0-6.5, 그리고 보다 바람직하게는 pH ≤ 5.5 하에서 생체내(in vivo)에서 절단되는, 접합체. - 제1항 내지 제25항 중 어느 한 항에 있어서,
상기 적어도 하나의 사포닌은 라이신 측쇄에 공유 결합되어 아미드 결합을 형성하고 및/또는 시스테인 측쇄에 공유 결합되어 티오-에테르 링키지 또는 디설파이드 결합을 형성하고, 여기서 라이신 및/또는 시스테인은 세포-표면 분자 표적화 분자에 의해 포함되고 및/또는 적어도 하나의 이펙터 모이어티에 의해 포함되며, 여기서 적어도 하나의 사포닌은 라이신 및/또는 시스테인에 직접 결합되거나, 선택적으로 절단 가능한 링커 및/또는 3작용성 링커, 예컨대 스킴 Ⅱ 및 구조 B의 3작용성 링커를 포함하는 적어도 하나의 링커를 통해 결합되는, 접합체. - 제26항에 있어서,
상기 링커는 N-ε-말레이미도카프로산 히드라지드에 기초한 및/또는 1-[비스(디메틸아미노)메틸렌]-1H-1,2,3-트리아졸로[4,5-b]피리디늄 3-옥시드 헥사플루오로포스페이트에 기초한 것, 3작용성 링커, 예컨대 스킴 II 및 구조 B의 3작용성 링커, 절단 가능한 링커이며, 및/또는 디설파이드 결합, 티오-에테르 결합, 아미드 결합, 히드라지드 결합 중 임의의 하나 이상을 포함하는, 접합체. - 제1항 내지 제27항 중 어느 한 항에 있어서,
상기 적어도 하나의 사포닌은 세포-표면 분자 표적화 분자 및/또는 적어도 하나의 이펙터 모이어티에 적어도 하나 링커를 통해 공유 결합되며, 여기서 링커는 폴리머 또는 올리고머 구조를 포함하며, 스캐폴드를 세포-표면 분자 표적화 분자 및/또는 적어도 하나의 이펙터 모이어티에 공유 커플링하기 위한 적어도 하나의 제4 화학기를 추가로 포함하는 스캐폴드이거나 이를 포함하는, 접합체. - 제28에 있어서,
상기 적어도 하나의 사포닌은 스캐폴드의 폴리머 또는 올리고머 구조에 절단 가능한 결합 및/또는 절단 불가능한 결합(non-cleavable bond)을 통해 공유 결합되는, 접합체. - 제29항에 있어서,
상기 절단 가능한 결합은 산성 조건, 환원성 조건, 효소 조건 및 광-유도 조건 중 임의의 조건 하에서 절단되며, 바람직하게는 절단 가능한 결합은 산성 조건 하에서 절단되는 히드라존 결합 또는 히드라지드 결합 및/또는 단백질 분해(proteolysis), 예를 들어 카셉신 B에 의한 단백질 분해에 민감한 결합, 및/또는 환원성 조건 하에서 절단에 민감한 결합, 예컨대 디설파이드 결합을 포함하는, 접합체. - 제29항 또는 제30항에 있어서,
상기 절단 가능한 결합은 포유류 세포, 바람직하게는 인간 세포의 엔도좀 및/또는 리소좀에 존재하는 산성 조건, 바람직하게는 pH 4.0-6.5, 그리고 보다 바람직하게는 pH ≤ 5.5 하에서 생체내(in vivo)에서 절단되는, 접합체. - 제28항 내지 제31항 중 어느 한 항에 있어서,
상기 적어도 하나의 사포닌은 스캐폴드의 폴리머 또는 올리고머 구조에 이민 결합, 히드라존 결합, 히드라지드 결합, 옥심 결합, 1,3-디옥솔란 결합, 디설파이드 결합(disulphide bond), 티오-에테르 결합, 아미드 결합, 펩티드 결합 또는 에스테르 결합 중 임의의 하나 이상을 통해, 바람직하게는 적어도 하나 링커를 통해 공유 결합되는, 접합체. - 제28항 내지 제31항 중 어느 한 항에 있어서,
상기 적어도 하나의 사포닌은 스캐폴드의 폴리머 또는 올리고머 구조에 이민 결합, 히드라존 결합, 및 히드라지드 결합 중 임의의 하나 이상을 통해 공유 결합되며, 이 결합은 바람직하게는 제29항 내지 제31항 중 어느 한 항에 따라 절단될 수 있으며, 여기서 바람직하게는 적어도 하나의 사포닌은 스캐폴드의 폴리머 또는 올리고머 구조에 적어도 하나의 사포닌의 위치 C-23에서의 알데히드 작용을 통해 공유 결합되는, 접합체. - 제33항에 있어서,
상기 적어도 하나의 사포닌의 위치 C-23에서의 알데히드 작용은 링커 N-ε-말레이미도카프로산 히드라지드에 공유 커플링되며, 이 링커는 스캐폴드의 폴리머 또는 올리고머 구조의 설프하이드릴기(sulfhydryl group), 예컨대 시스테인의 설프하이드릴기에 티오-에테르 결합을 통해 공유 커플링되는, 접합체. - 제28항 내지 제31항 중 어느 한 항에 있어서,
상기 적어도 하나의 사포닌은 스캐폴드의 폴리머 또는 올리고머 구조에 아미드 결합을 통해 공유 결합되며, 여기서 바람직하게는 적어도 하나의 사포닌은 스캐폴드의 폴리머 또는 올리고머 구조에, 존재하는 경우에, 적어도 하나의 사포닌의 C-3베타-OH기에서의 카보하이드레이트 치환체에서의 글루쿠론산 작용을 통해 공유 결합되는, 접합체. - 제35항에 있어서,
상기 적어도 하나의 사포닌의 C-3베타-OH기에서의 카보하이드레이트 치환체에서의 글루쿠론산 작용은 링커 1-[비스(디메틸아미노)메틸렌]-1H-1,2,3-트리아졸로[4,5-b]피리디늄 3-옥시드 헥사플루오로포스페이트에 공유 커플링되며, 이 링커는 아미드 결합을 통해 스캐폴드의 폴리머 또는 올리고머 구조의 아민기, 예컨대 스캐폴드의 폴리머 또는 올리고머 구조의 N-말단 또는 라이신의 아민기에 공유 커플링되는, 접합체. - 제28항 내지 제36항 중 어느 한 항에 있어서,
상기 적어도 하나의 사포닌은 스캐폴드의 폴리머 또는 올리고머 구조에 공유 결합되며, 존재하는 경우에, 공유 결합에 적어도 하나의 사포닌의 위치 C-23에서의 알데히드 작용이 수반되고, 및/또는 존재하는 경우에, 공유 결합에 적어도 하나의 사포닌의 C-3베타-OH기에서의 카보하이드레이트 치환체에서의 글루쿠론산 작용이 수반되는, 접합체. - 제28항 내지 제37항 중 어느 한 항에 있어서,
상기 스캐폴드를 세포-표면 분자 표적화 분자 및/또는 적어도 하나의 이펙터 모이어티에 공유 커플링하기 위한 스캐폴드의 적어도 하나의 제4 화학기는 클릭 화학기이며, 바람직하게는 테트라진, 아지드, 알켄 또는 알킨, 또는 이들 기의 시클릭 유도체(cyclic derivative) 중 임의의 하나 이상으로부터 선택되며, 바람직하게는 아지드기인, 접합체. - 제28항 내지 제38항 중 어느 한 항에 있어서,
상기 스캐폴드의 폴리머 또는 올리고머 구조는 선형, 분지형 및/또는 고리형 폴리머, 올리고머, 덴드리머, 덴드론, 덴드론화 폴리머, 덴드론화 올리고머, DNA, 폴리펩티드, 폴리-라이신, 폴리에틸렌 글리콜, 또는 이들 폴리머 또는 올리고머 구조의 어셈블리를 포함하며, 이 어셈블리는 바람직하게는 공유 가교에 의해 구축되는, 접합체. - 제1항 내지 제39항 중 어느 한 항에 있어서,
상기 적어도 하나의 사포닌은 정의된 수의 사포닌 또는 정의된 범위의 사포닌, 바람직하게는 1-128개의 사포닌 또는 적어도 2, 3, 4, 5, 6, 8, 10, 16, 32, 64 또는 128개의 사포닌, 또는 그 사이의 임의의 수의 사포닌, 예컨대 7, 9, 12개의 사포닌인, 접합체. - 제1항 내지 제40항 중 어느 한 항에 있어서,
상기 접합체는 적어도 하나의 이펙터 모이어티 및/또는 세포-표면 분자 표적화 분자의 아미노산 잔기에 직접 그리고 바람직하게는 적어도 하나의 이펙터 모이어티의 아미노산 잔기를 통해, 바람직하게는 시스테인 및/또는 라이신에 공유 결합되고 및/또는, 청구항 28 내지 40중 어느 한 항의 적어도 하나의 링커 및/또는 적어도 하나의 절단 가능한 링커 및/또는 적어도 하나의 폴리머 또는 올리고머 스캐폴드, 바람직하게는 1-8개의 이러한 스캐폴드 또는 2-4개의 이러한 스캐폴드를 통해 공유 결합되는, 하나 보다 많은 사포닌, 바람직하게는 2, 3, 4, 5, 6, 8, 10, 16, 32, 64 또는 1-100개의 사포닌, 또는 이들 사이의 임의의 수의 사포닌, 예컨대 7, 9, 12개의 사포닌을 포함하며, 여기서 1-32개의 사포닌, 바람직하게는 2, 3, 4, 5, 6, 8, 10, 16 또는 32개의 사포닌, 또는 이들 사이의 임의의 수의 사포닌, 예컨대 7, 9, 12개의 사포닌은 적어도 하나의 스캐폴드에 공유 결합되는, 접합체. - 제1항 내지 제41항 중 어느 한 항에 있어서,
상기 적어도 하나의 사포닌은 세포-표면 분자 표적화 분자 및 적어도 하나의 이펙터 모이어티에 3 작용성 링커를 통해 공유 결합되며, 상기 3 작용성 링커는 직접 또는 링커 예컨대 절단 가능한 링커 및/또는 폴리머 또는 올리고머 구조를 포함하는 스캐폴드를 통해 공유 결합된 적어도 하나의 사포닌을 갖는 제2 화학기 및 3 작용성 링커에 스캐폴드를 공유 커플링하기 위한 제28항 내지 제41항 중 어느 한 항에 따른 제4 화학기를 포함하며, 3 작용성 링커는 세포-표면 분자 표적화 분자에 대한 공유 결합을 위한 제3 화학기를 추가로 포함하고 적어도 하나의 이펙터 모이어티에 대한 공유 결합을 위한 제1 화학기를 포함하며, 여기서 세포-표면 분자 표적화 분자는 제3 화학기에 결합되고 및/또는 적어도 하나의 이펙터 모이어티는 제1 화학기에 결합되고, 바람직하게는 제3 작용성 링커는 스킴 II 및 구조 B의 제3 작용성 링커인, 접합체. - 제1항 내지 제42항 중 어느 한 항의 접합체 및 선택적으로 약학적으로 허용가능한 부형제 및/또는 약학적으로 허용가능한 희석제를 포함하는 약학적 조성물.
- 의약으로 사용하기 위한 제1항 내지 제42항 중 어느 한 항의 접합체 또는 제43항의 약학적 조성물.
- 암 또는 자가면역 질환의 치료 또는 방지(prevention)에 사용하기 위한 제1항 내지 제42항 또는 제44항 중 어느 한 항의 접합체 또는 제43항 또는 제44항의 약학적 조성물.
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