KR102623817B1 - 매실, 살구 또는 이들의 교잡종을 구별하기 위한 핵 게놈 서열 기반 분자마커 및 이의 용도 - Google Patents
매실, 살구 또는 이들의 교잡종을 구별하기 위한 핵 게놈 서열 기반 분자마커 및 이의 용도 Download PDFInfo
- Publication number
- KR102623817B1 KR102623817B1 KR1020210160943A KR20210160943A KR102623817B1 KR 102623817 B1 KR102623817 B1 KR 102623817B1 KR 1020210160943 A KR1020210160943 A KR 1020210160943A KR 20210160943 A KR20210160943 A KR 20210160943A KR 102623817 B1 KR102623817 B1 KR 102623817B1
- Authority
- KR
- South Korea
- Prior art keywords
- plum
- prunus
- apricot
- hybrid
- armeniaca
- Prior art date
Links
- 235000009827 Prunus armeniaca Nutrition 0.000 title claims abstract description 77
- 244000018633 Prunus armeniaca Species 0.000 title claims abstract description 77
- 235000011158 Prunus mume Nutrition 0.000 title claims description 13
- 244000018795 Prunus mume Species 0.000 title claims description 13
- 239000003147 molecular marker Substances 0.000 title abstract description 6
- 235000010094 aprium Nutrition 0.000 title description 2
- 230000003321 amplification Effects 0.000 claims description 25
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 claims description 25
- 238000000034 method Methods 0.000 claims description 17
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 claims description 12
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 claims description 10
- 239000000203 mixture Substances 0.000 claims description 9
- 238000005259 measurement Methods 0.000 claims description 7
- 238000001502 gel electrophoresis Methods 0.000 claims description 5
- 238000000018 DNA microarray Methods 0.000 claims description 2
- 238000001514 detection method Methods 0.000 claims description 2
- 235000021018 plums Nutrition 0.000 abstract description 28
- 241000894007 species Species 0.000 abstract description 8
- 235000013305 food Nutrition 0.000 abstract description 2
- 241000411851 herbal medicine Species 0.000 abstract description 2
- 238000002156 mixing Methods 0.000 abstract description 2
- 230000002265 prevention Effects 0.000 abstract description 2
- 239000002994 raw material Substances 0.000 abstract description 2
- 238000003752 polymerase chain reaction Methods 0.000 description 19
- 239000000047 product Substances 0.000 description 15
- 235000013399 edible fruits Nutrition 0.000 description 8
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 description 6
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 description 6
- 238000002372 labelling Methods 0.000 description 5
- 239000003550 marker Substances 0.000 description 5
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 description 5
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 description 5
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 description 5
- 241000196324 Embryophyta Species 0.000 description 4
- 238000012217 deletion Methods 0.000 description 4
- 230000037430 deletion Effects 0.000 description 4
- 238000011161 development Methods 0.000 description 4
- 230000018109 developmental process Effects 0.000 description 4
- 238000003780 insertion Methods 0.000 description 4
- 230000037431 insertion Effects 0.000 description 4
- 239000000463 material Substances 0.000 description 4
- 238000005251 capillar electrophoresis Methods 0.000 description 3
- KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-N citric acid Chemical compound OC(=O)CC(O)(C(O)=O)CC(O)=O KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 3
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 3
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 3
- CIWBSHSKHKDKBQ-JLAZNSOCSA-N Ascorbic acid Chemical compound OC[C@H](O)[C@H]1OC(=O)C(O)=C1O CIWBSHSKHKDKBQ-JLAZNSOCSA-N 0.000 description 2
- IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N Atomic nitrogen Chemical compound N#N IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 235000004789 Rosa xanthina Nutrition 0.000 description 2
- 241000220222 Rosaceae Species 0.000 description 2
- 239000011543 agarose gel Substances 0.000 description 2
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 2
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 2
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 description 2
- 238000001962 electrophoresis Methods 0.000 description 2
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 2
- 239000007850 fluorescent dye Substances 0.000 description 2
- 238000001215 fluorescent labelling Methods 0.000 description 2
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 description 2
- 238000000691 measurement method Methods 0.000 description 2
- 238000007481 next generation sequencing Methods 0.000 description 2
- 230000004044 response Effects 0.000 description 2
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 2
- KZJWDPNRJALLNS-VPUBHVLGSA-N (-)-beta-Sitosterol Natural products O[C@@H]1CC=2[C@@](C)([C@@H]3[C@H]([C@H]4[C@@](C)([C@H]([C@H](CC[C@@H](C(C)C)CC)C)CC4)CC3)CC=2)CC1 KZJWDPNRJALLNS-VPUBHVLGSA-N 0.000 description 1
- CSVWWLUMXNHWSU-UHFFFAOYSA-N (22E)-(24xi)-24-ethyl-5alpha-cholest-22-en-3beta-ol Natural products C1CC2CC(O)CCC2(C)C2C1C1CCC(C(C)C=CC(CC)C(C)C)C1(C)CC2 CSVWWLUMXNHWSU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- BJEPYKJPYRNKOW-REOHCLBHSA-N (S)-malic acid Chemical compound OC(=O)[C@@H](O)CC(O)=O BJEPYKJPYRNKOW-REOHCLBHSA-N 0.000 description 1
- FPIPGXGPPPQFEQ-UHFFFAOYSA-N 13-cis retinol Natural products OCC=C(C)C=CC=C(C)C=CC1=C(C)CCCC1(C)C FPIPGXGPPPQFEQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- KLEXDBGYSOIREE-UHFFFAOYSA-N 24xi-n-propylcholesterol Natural products C1C=C2CC(O)CCC2(C)C2C1C1CCC(C(C)CCC(CCC)C(C)C)C1(C)CC2 KLEXDBGYSOIREE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- HRPVXLWXLXDGHG-UHFFFAOYSA-N Acrylamide Chemical compound NC(=O)C=C HRPVXLWXLXDGHG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- LZZYPRNAOMGNLH-UHFFFAOYSA-M Cetrimonium bromide Chemical compound [Br-].CCCCCCCCCCCCCCCC[N+](C)(C)C LZZYPRNAOMGNLH-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- LPZCCMIISIBREI-MTFRKTCUSA-N Citrostadienol Natural products CC=C(CC[C@@H](C)[C@H]1CC[C@H]2C3=CC[C@H]4[C@H](C)[C@@H](O)CC[C@]4(C)[C@H]3CC[C@]12C)C(C)C LPZCCMIISIBREI-MTFRKTCUSA-N 0.000 description 1
- 206010010774 Constipation Diseases 0.000 description 1
- ZZZCUOFIHGPKAK-UHFFFAOYSA-N D-erythro-ascorbic acid Natural products OCC1OC(=O)C(O)=C1O ZZZCUOFIHGPKAK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000004544 DNA amplification Effects 0.000 description 1
- 238000007400 DNA extraction Methods 0.000 description 1
- 102000016928 DNA-directed DNA polymerase Human genes 0.000 description 1
- 108010014303 DNA-directed DNA polymerase Proteins 0.000 description 1
- ARVGMISWLZPBCH-UHFFFAOYSA-N Dehydro-beta-sitosterol Natural products C1C(O)CCC2(C)C(CCC3(C(C(C)CCC(CC)C(C)C)CCC33)C)C3=CC=C21 ARVGMISWLZPBCH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108091092584 GDNA Proteins 0.000 description 1
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 description 1
- 238000012408 PCR amplification Methods 0.000 description 1
- 108091093037 Peptide nucleic acid Proteins 0.000 description 1
- 108010066717 Q beta Replicase Proteins 0.000 description 1
- KDYFGRWQOYBRFD-UHFFFAOYSA-N Succinic acid Natural products OC(=O)CCC(O)=O KDYFGRWQOYBRFD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- FPIPGXGPPPQFEQ-BOOMUCAASA-N Vitamin A Natural products OC/C=C(/C)\C=C\C=C(\C)/C=C/C1=C(C)CCCC1(C)C FPIPGXGPPPQFEQ-BOOMUCAASA-N 0.000 description 1
- 229930003268 Vitamin C Natural products 0.000 description 1
- JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N [3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-hydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl [5-(6-aminopurin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] hydrogen phosphate Polymers Cc1cn(C2CC(OP(O)(=O)OCC3OC(CC3OP(O)(=O)OCC3OC(CC3O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)C(COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3CO)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)O2)c(=O)[nH]c1=O JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000000246 agarose gel electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 230000032683 aging Effects 0.000 description 1
- OENHQHLEOONYIE-UKMVMLAPSA-N all-trans beta-carotene Natural products CC=1CCCC(C)(C)C=1/C=C/C(/C)=C/C=C/C(/C)=C/C=C/C=C(C)C=CC=C(C)C=CC1=C(C)CCCC1(C)C OENHQHLEOONYIE-UKMVMLAPSA-N 0.000 description 1
- FPIPGXGPPPQFEQ-OVSJKPMPSA-N all-trans-retinol Chemical compound OC\C=C(/C)\C=C\C=C(/C)\C=C\C1=C(C)CCCC1(C)C FPIPGXGPPPQFEQ-OVSJKPMPSA-N 0.000 description 1
- BJEPYKJPYRNKOW-UHFFFAOYSA-N alpha-hydroxysuccinic acid Natural products OC(=O)C(O)CC(O)=O BJEPYKJPYRNKOW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000000954 anitussive effect Effects 0.000 description 1
- 238000000137 annealing Methods 0.000 description 1
- 230000001754 anti-pyretic effect Effects 0.000 description 1
- 229940124584 antitussives Drugs 0.000 description 1
- 230000008901 benefit Effects 0.000 description 1
- MJVXAPPOFPTTCA-UHFFFAOYSA-N beta-Sistosterol Natural products CCC(CCC(C)C1CCC2C3CC=C4C(C)C(O)CCC4(C)C3CCC12C)C(C)C MJVXAPPOFPTTCA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- LGJMUZUPVCAVPU-UHFFFAOYSA-N beta-Sitostanol Natural products C1CC2CC(O)CCC2(C)C2C1C1CCC(C(C)CCC(CC)C(C)C)C1(C)CC2 LGJMUZUPVCAVPU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- TUPZEYHYWIEDIH-WAIFQNFQSA-N beta-carotene Natural products CC(=C/C=C/C=C(C)/C=C/C=C(C)/C=C/C1=C(C)CCCC1(C)C)C=CC=C(/C)C=CC2=CCCCC2(C)C TUPZEYHYWIEDIH-WAIFQNFQSA-N 0.000 description 1
- 235000013734 beta-carotene Nutrition 0.000 description 1
- 239000011648 beta-carotene Substances 0.000 description 1
- NJKOMDUNNDKEAI-UHFFFAOYSA-N beta-sitosterol Natural products CCC(CCC(C)C1CCC2(C)C3CC=C4CC(O)CCC4C3CCC12C)C(C)C NJKOMDUNNDKEAI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229960002747 betacarotene Drugs 0.000 description 1
- 238000010170 biological method Methods 0.000 description 1
- 230000037237 body shape Effects 0.000 description 1
- KDYFGRWQOYBRFD-NUQCWPJISA-N butanedioic acid Chemical compound O[14C](=O)CC[14C](O)=O KDYFGRWQOYBRFD-NUQCWPJISA-N 0.000 description 1
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 description 1
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 description 1
- 239000012141 concentrate Substances 0.000 description 1
- 238000001816 cooling Methods 0.000 description 1
- 238000004925 denaturation Methods 0.000 description 1
- 230000036425 denaturation Effects 0.000 description 1
- 235000015872 dietary supplement Nutrition 0.000 description 1
- ZZVUWRFHKOJYTH-UHFFFAOYSA-N diphenhydramine Chemical compound C=1C=CC=CC=1C(OCCN(C)C)C1=CC=CC=C1 ZZVUWRFHKOJYTH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 1
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 1
- 238000006073 displacement reaction Methods 0.000 description 1
- 239000012153 distilled water Substances 0.000 description 1
- 235000011869 dried fruits Nutrition 0.000 description 1
- 239000003814 drug Substances 0.000 description 1
- 235000021038 drupes Nutrition 0.000 description 1
- 201000006549 dyspepsia Diseases 0.000 description 1
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 1
- 230000007613 environmental effect Effects 0.000 description 1
- 239000003172 expectorant agent Substances 0.000 description 1
- 230000003419 expectorant effect Effects 0.000 description 1
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 1
- 238000000605 extraction Methods 0.000 description 1
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 1
- 230000036541 health Effects 0.000 description 1
- 239000004615 ingredient Substances 0.000 description 1
- 230000000977 initiatory effect Effects 0.000 description 1
- 229910052500 inorganic mineral Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000000138 intercalating agent Substances 0.000 description 1
- 235000015094 jam Nutrition 0.000 description 1
- 238000007834 ligase chain reaction Methods 0.000 description 1
- 230000003908 liver function Effects 0.000 description 1
- 239000001630 malic acid Substances 0.000 description 1
- 235000011090 malic acid Nutrition 0.000 description 1
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 description 1
- 239000011707 mineral Substances 0.000 description 1
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 1
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 1
- 230000000877 morphologic effect Effects 0.000 description 1
- 239000004570 mortar (masonry) Substances 0.000 description 1
- 229910052757 nitrogen Inorganic materials 0.000 description 1
- 150000007524 organic acids Chemical class 0.000 description 1
- 235000005985 organic acids Nutrition 0.000 description 1
- 229940124595 oriental medicine Drugs 0.000 description 1
- 235000020098 plum wine Nutrition 0.000 description 1
- 102000054765 polymorphisms of proteins Human genes 0.000 description 1
- 108091033319 polynucleotide Proteins 0.000 description 1
- 102000040430 polynucleotide Human genes 0.000 description 1
- 239000002157 polynucleotide Substances 0.000 description 1
- 238000012257 pre-denaturation Methods 0.000 description 1
- 235000013324 preserved food Nutrition 0.000 description 1
- 238000010298 pulverizing process Methods 0.000 description 1
- 230000002285 radioactive effect Effects 0.000 description 1
- 239000012857 radioactive material Substances 0.000 description 1
- 239000011541 reaction mixture Substances 0.000 description 1
- 238000010839 reverse transcription Methods 0.000 description 1
- 231100000241 scar Toxicity 0.000 description 1
- KZJWDPNRJALLNS-VJSFXXLFSA-N sitosterol Chemical compound C1C=C2C[C@@H](O)CC[C@]2(C)[C@@H]2[C@@H]1[C@@H]1CC[C@H]([C@H](C)CC[C@@H](CC)C(C)C)[C@@]1(C)CC2 KZJWDPNRJALLNS-VJSFXXLFSA-N 0.000 description 1
- 229950005143 sitosterol Drugs 0.000 description 1
- NLQLSVXGSXCXFE-UHFFFAOYSA-N sitosterol Natural products CC=C(/CCC(C)C1CC2C3=CCC4C(C)C(O)CCC4(C)C3CCC2(C)C1)C(C)C NLQLSVXGSXCXFE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 235000015500 sitosterol Nutrition 0.000 description 1
- RYYWUUFWQRZTIU-UHFFFAOYSA-K thiophosphate Chemical compound [O-]P([O-])([O-])=S RYYWUUFWQRZTIU-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 1
- 238000013518 transcription Methods 0.000 description 1
- 230000035897 transcription Effects 0.000 description 1
- 235000019155 vitamin A Nutrition 0.000 description 1
- 239000011719 vitamin A Substances 0.000 description 1
- 235000019154 vitamin C Nutrition 0.000 description 1
- 239000011718 vitamin C Substances 0.000 description 1
- 229940045997 vitamin a Drugs 0.000 description 1
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Chemical compound O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- OENHQHLEOONYIE-JLTXGRSLSA-N β-Carotene Chemical compound CC=1CCCC(C)(C)C=1\C=C\C(\C)=C\C=C\C(\C)=C\C=C\C=C(/C)\C=C\C=C(/C)\C=C\C1=C(C)CCCC1(C)C OENHQHLEOONYIE-JLTXGRSLSA-N 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
- C12Q1/6888—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms
- C12Q1/6895—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms for plants, fungi or algae
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/13—Plant traits
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Zoology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Immunology (AREA)
- Mycology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Botany (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Abstract
본 발명은 매실, 살구 또는 이들의 교잡종을 구별하기 위한 핵 게놈 서열 기반 분자마커 및 이의 용도에 관한 것으로, 본 발명의 프라이머 세트는 국내에서 식품 및 한약재로 사용되고 있는 매실과 살구를 정확하게 구별할 수 있으므로, 매실과 살구의 재배 및 원료 혼용 방지에 대한 지표로서 유용하게 활용될 수 있다.
Description
본 발명은 매실, 살구 또는 이들의 교잡종을 구별하기 위한 핵 게놈 서열 기반 분자마커 및 이의 용도에 관한 것이다.
매실(Prunus mume; Japanese apricot, plum)은 장미과에 속하는 낙엽활엽교목 형태로, 매화나무의 핵과를 매실이라 부른다. 원산지는 중국 사천성으로 알려져 있으며 한국, 중국 및 일본 등에 널리 분포되어 있고 국내의 매실 주산지로는 전남 광양시 순천시와 경남 하동군 등이 있다. 매실은 숙신산(succinic acid), 시트르산(citric acid), 말산(malic acid) 등의 유기산을 포함하여 시토스테롤(sitosterol)과 같은 무기질을 내포하고 있으며 소화불량 해소, 피로 회복, 해열 작용 및 비타민C가 풍부하여 3000년전부터 건강보조 식품이나 약재로도 많이 사용되어 왔다. 특히 2015년 한해 매실의 2829톤이 농축액, 매실 절임, 매실주 등 많은 부분에서 가공되어 이용되었으며 간 기능 개선, 성인병 예방, 변비 예방 등 다양한 효능이 보고되었다.
살구(Prunus armeniaca; apricot)는 장미과에 속하는 목본류 형태로, 원산지는 동부아시아이고 국내를 포함하여 중국, 일본, 유럽 등 넓게 분포되어 있다. 살구에는 β-카로틴(carotene) 등의 성분들이 포함되어 있고, 이는 체내에서 비타민A로 전환되어 눈 건강에 좋고 노화 예방에도 효과적이다. 살구는 독특한 향이 있어 신선한 상태로 이용되거나 통조림, 잼, 건과 등으로 가공되기도 하며, 씨는 행인이라고 하여 한방에서는 진해 거담약으로 널리 이용되고 있다.
매실과 살구는 과실 및 수체 모양이 매우 유사할 뿐만 아니라 아주 가까운 근연종으로 상호교잡이 가능하여 잡종 품종들이 많기 때문에, 매실의 출하기가 되면 매실 과실과 매우 유사한 미숙 상태의 살구 과실이 매실로 둔갑되어 농산물의 유통질서를 어지럽히고 있는 실정이다. 따라서, 매실과 살구 과실을 명확히 구분하는 것이 필요하지만, 종래에는 과실 내의 핵 모양, 핵 표면의 홈, 구멍 모양 등의 식물 형태적 특성을 이용해서 매실과 살구를 구분했기 때문에 전문가가 아니면 그 구분이 어려웠다. 또한 매실과 살구의 중간계통들에 대한 종 판별은 더욱 어려워서 이들 종을 명확하게 구별할 수 있는 DNA 표지의 개발이 절실히 요구되고 있다.
최근 분자생물학 분야의 급진적인 발전과 더불어 식물의 속, 종간 또는 종 내 품종 간 분류에 분자생물학적인 방법들이 다양하게 사용되고 있으며, 이를 위해 DNA 수준에서 유전자원의 다양성 연구를 가능하게 하는 다양한 DNA 마커들이 개발되고 있다. 분자생물학 수준에서의 DNA 분석에 의한 감별은 양적 수준과 더불어 다수의 특성을 파악할 수 있으며 환경의 영향을 배제할 수 있는 장점이 있다. 근래에 발달한 차세대염기서열분석(next generation sequencing, NGS) 기술을 통해 DNA 정보를 비교하여 차이점을 찾아내고, 이를 활용한 분자마커 개발은 매실, 살구 또는 이들의 교잡종의 정확한 구별을 가능하게 한다. 유전체 정보에 근거한 여러 가지 형태의 분자마커 중 InDel(Insertion/Deletion) 마커는 PCR(polymerase chain reaction) 기술을 이용하여 다형성을 검출하는 방법으로 비교적 간단한 방법으로 신속한 결과를 얻을 수 있는 방법이다. InDel 마커는 염기서열에서 삽입(insertion)되거나 결실(deletion)된 염기서열의 차이를 이용하는 것으로 종간뿐만 아니라 종내에서도 다양한 유전형으로 존재하여 품종 구분에 적합한 분자마커이다.
한편, 한국공개특허 제2005-0106967호에 '매실과 살구 과실을 구분하는 방법 및 이를 위한 SCAR 표지 프라이머'가 개시되어 있으나, 본 발명의 매실, 살구 또는 이들의 교잡종을 구별하기 위한 핵 게놈 서열 기반 분자마커 및 이의 용도에 대해서는 기재된 바가 없다.
본 발명은 상기와 같은 요구에 의해 도출된 것으로서, 본 발명자는 매실(Prunus mume), 살구(Prunus armeniaca) 및 매실과 살구의 잡종 개체 간의 게놈 염기서열을 비교하여 핵 게놈 내 Prude_001688 유전자(NCBI accession No. AP019297) 영역에서 InDel(insertion/deletion) 다형성을 보이는 염기서열에 기반한 분자마커를 개발하였다. 또한, 상기 InDel 분자마커를 증폭할 수 있는 프라이머 세트를 제작하여 PCR을 수행한 결과, 본 발명의 프라이머 세트가 매실, 살구 및 이들의 잡종 개체를 정확하게 각각 구별할 수 있음을 확인함으로써, 본 발명을 완성하였다.
본 발명은 상기와 같은 요구에 의해 도출된 것으로서, 본 발명자는 서열번호 1 및 2의 올리고뉴클레오티드 프라이머 세트를 포함하는 매실(Prunus mume), 살구(Prunus armeniaca) 또는 매실과 살구의 교잡종 구별용 프라이머 세트 조성물을 제공한다.
또한, 본 발명은 상기 프라이머 세트 조성물을 포함하는 매실, 살구 또는 매실과 살구의 교잡종 구별용 키트를 제공한다.
또한, 본 발명은 매실 또는 살구 시료로부터 게놈 DNA를 분리하는 단계; 상기 분리된 게놈 DNA를 주형으로 하고, 상기 프라이머 세트 조성물을 이용하여 증폭 반응을 수행하여 표적 서열을 증폭하는 단계; 및 상기 증폭 단계의 산물을 검출하는 단계;를 포함하는 매실, 살구 또는 매실과 살구의 교잡종을 구별하는 방법을 제공한다.
본 발명의 프라이머 세트를 이용하면 국내에서 식품 및 한약재로 사용되고 있는 매실, 살구 또는 이들의 교잡종을 정확하게 구별할 수 있으므로, 매실과 살구의 재배 및 원료 혼용 방지에 대한 지표로서 유용하게 활용될 수 있을 것이다.
도 1은 본 발명의 InDel 다형성 기반 프라이머 세트(표 2)를 이용하여 매실, 살구 및 이들의 교잡종 개체들을 대상으로 PCR을 수행한 결과이다.
본 발명의 목적을 달성하기 위하여, 본 발명은 서열번호 1 및 2의 올리고뉴클레오티드 프라이머 세트를 포함하는 매실(Prunus mume), 살구(Prunus armeniaca) 또는 매실과 살구의 교잡종 구별용 프라이머 세트 조성물을 제공한다.
본 발명의 상기 프라이머는 각 프라이머의 서열 길이에 따라 서열번호 1 및 2의 서열 내의 15개 이상, 16개 이상, 17개 이상, 18개 이상, 19개 이상의 연속 뉴클레오드티드의 절편으로 이루어진 올리고뉴클레오티드를 포함할 수 있다. 예를 들면, 서열번호 1의 프라이머(20개 올리고뉴클레오티드)는 서열번호 1의 서열 내의 17개 이상, 18개 이상, 19개 이상의 연속 뉴클레오티드의 절편으로 이루어진 올리고뉴클레오티드를 포함할 수 있다. 또한, 상기 프라이머는 증폭 부위에 결합할 수 있는, 서열번호 1 및 2의 각 염기서열에서 부가, 결실 또는 치환된 서열도 포함할 수 있다. 상기 서열번호 중 홀수 번호의 올리고뉴클레오티드 프라이머는 정방향 프라이머이며, 짝수 번호의 올리고뉴클레오티드 프라이머는 역방향 프라이머이다.
본 발명에 있어서, "프라이머"는 카피하려는 핵산 가닥에 상보적인 단일 가닥 올리고뉴클레오티드 서열을 말하며, 프라이머 연장 산물의 합성을 위한 개시점으로서 작용할 수 있다. 상기 프라이머의 길이 및 서열은 연장 산물의 합성을 시작하도록 허용해야 한다. 프라이머의 구체적인 길이 및 서열은 요구되는 DNA 또는 RNA 표적의 복합도(complexity)뿐만 아니라 온도 및 이온 강도와 같은 프라이머 이용 조건에 의존할 것이다.
본 명세서에 있어서, 프라이머로서 이용된 올리고뉴클레오티드는 뉴클레오티드 유사체(analogue), 예를 들면, 포스포로티오에이트(phosphorothioate), 알킬포스포로티오에이트 또는 펩티드 핵산(peptide nucleic acid)를 포함할 수 있거나 또는 삽입 물질(intercalating agent)를 포함할 수 있다.
본 발명의 프라이머 세트는 매실, 살구 및 매실과 살구의 교잡종 개체 간에 InDel(insetion/deletion) 다형성을 보이는 영역을 증폭시키기 위해 제작된 것으로, 상기 InDel 다형성을 보이는 서열은 서열번호 3으로 이루어질 수 있으나, 이에 제한되지 않는다.
상기 서열번호 3은 삽입(insetion) 부위의 염기서열을 포함하는 다형성 뉴클레오티드이다. InDel 다형성이란 폴리뉴클레오티드 서열 중에 일부가 중간에 더해지거나 없어져 품종 혹은 종간에 길이 차이가 생긴 경우를 포함하는 서열을 말한다. 상기 다형성 뉴클레오티드 서열은 DNA 또는 RNA가 될 수 있다. 상기 InDel 다형성 염기 정보는 표 1에 나타내었으며, 본 발명에 따른 InDel 다형성은 매실, 살구 및 매실과 살구의 교잡종 개체의 핵 염기서열에서 Prude_001688 유전자 영역에 위치하는 것으로 확인되었다.
본 발명은 또한, 상기 프라이머 세트 조성물을 포함하는 매실, 살구 또는 매실과 살구의 교잡종 구별용 키트를 제공한다.
본 발명의 일 구현 예에 있어서, 상기 키트는 증폭 반응을 수행하기 위한 시약을 추가로 포함할 수 있고, 상기 증폭 반응을 수행하기 위한 시약은 DNA 폴리머라제, dNTPs 및 버퍼를 포함할 수 있으나, 이에 제한되지 않는다.
본 발명의 일 구현 예에 있어서, 상기 키트는 또한 최적의 반응 수행 조건을 기재한 사용자 안내서를 추가로 포함할 수 있다. 안내서는 키트 사용법, 예를 들면, 역전사 완충액 및 PCR 완충액 제조 방법, 제시되는 반응 조건 등을 설명하는 인쇄물이다. 안내서는 팜플렛 또는 전단지 형태의 안내 책자, 키트에 부착된 라벨, 및 키트를 포함하는 패키지의 표면상에 설명을 포함한다. 또한, 안내서는 인터넷과 같이 전기 매체를 통해 공개되거나 제공되는 정보를 포함한다.
본 발명은 또한,
매실 또는 살구 시료로부터 게놈 DNA를 분리하는 단계;
상기 분리된 게놈 DNA를 주형으로 하고, 상기 서열번호 1 및 2의 올리고뉴클레오티드 프라이머 세트를 이용하여 증폭 반응을 수행하여 표적 서열을 증폭하는 단계; 및
상기 증폭 단계의 산물을 검출하는 단계;를 포함하는 매실, 살구 또는 매실과 살구의 교잡종을 구별하는 방법을 제공한다.
본 발명의 방법은 매실 또는 살구 시료에서 게놈 DNA를 분리하는 단계를 포함한다. 상기 게놈 DNA를 분리하는 방법은 당업계에 공지된 방법을 이용할 수 있으며, 예를 들면, CTAB 방법을 이용할수도 있고, Wizard prep 키트(Promega 사)를 이용할 수도 있다. 상기 분리된 게놈 DNA를 주형으로 하고, 본 발명의 일 실시예에 따른 올리고뉴클레오티드 프라이머 세트를 프라이머로 이용하여 증폭 반응을 수행하여 표적 서열을 증폭할 수 있다. 표적 핵산을 증폭하는 방법은 중합효소연쇄반응(polymerase chain reaction; PCR), 리가아제 연쇄반응(ligase chain reaction), 핵산 서열 기재 증폭(nucleic acid sequence-based amplification), 전사 기재 증폭시스템(transcription-based amplification system), 가닥 치환 증폭(strand displacement amplification) 또는 Qβ 복제효소(replicase)를 통한 증폭 또는 당업계에 알려진 핵산 분자를 증폭하기 위한 임의의 기타 적당한 방법이 있다. 이 중에서, PCR이란 중합효소를 이용하여 표적 핵산에 특이적으로 결합하는 프라이머 쌍으로부터 표적 핵산을 증폭하는 방법이다. 이러한 PCR 방법은 당업계에 잘 알려져 있으며, 상업적으로 이용가능한 키트를 이용할 수도 있다.
본 발명의 일 구현 예에 있어서, 상기 증폭된 표적 서열은 검출가능한 표지 물질로 표지될 수 있다. 상기 표지 물질은 형광, 인광 또는 방사성을 발하는 물질일 수 있으나, 이에 제한되지 않는다. 바람직하게는, 상기 표지 물질은 Cy-5 또는 Cy-3이다. 표적 서열의 증폭시 프라이머의 5'-말단에 Cy-5 또는 Cy-3를 표지하여 PCR을 수행하면 표적 서열이 검출가능한 형광 표지 물질로 표지될 수 있다. 또한, 방사성 물질을 이용한 표지는 PCR 수행시 32P 또는 35S 등과 같은 방사성 동위원소를 PCR 반응액에 첨가하면 증폭 산물이 합성되면서 방사성이 증폭 산물에 혼입되어 증폭 산물이 방사성으로 표지될 수 있다. 표적 서열을 증폭하기 위해 이용된 올리고뉴클레오티드 프라이머 세트는 전술한 것과 같다.
본 발명의 일 구현 예에 있어서, 상기 매실, 살구 또는 매실과 살구의 교잡종을 구별하는 방법은 상기 증폭 단계의 산물을 검출하는 단계를 포함하며, 상기 증폭 단계 산물의 검출은 DNA 칩, 겔 전기영동, 모세관 전기영동, 방사성 측정, 형광 측정 또는 인광 측정을 통해 수행될 수 있으나, 이에 제한되지 않는다. 증폭 산물을 검출하는 방법 중의 하나로서, 모세관 전기영동을 수행할 수 있다. 모세관 전기영동은 예를 들면, ABi Sequencer를 이용할 수 있다. 또한, 겔 전기영동을 수행할 수 있으며, 겔 전기영동은 증폭 산물의 크기에 따라 아가로스 겔 전기영동 또는 아크릴아미드 겔 전기영동을 이용할 수 있다. 또한, 형광 측정 방법은 프라이머의 5'-말단에 Cy-5 또는 Cy-3를 표지하여 PCR을 수행하면 표적 서열이 검출가능한 형광 표지 물질로 표지되며, 이렇게 표지된 형광은 형광 측정기를 이용하여 측정할 수 있다. 또한, 방사성 측정 방법은 PCR 수행시 32P 또는 35S 등과 같은 방사성 동위원소를 PCR 반응액에 첨가하여 증폭 산물을 표지한 후, 방사성 측정기구, 예를 들면, 가이거 계수기(Geiger counter) 또는 액체섬광계수기(liquid scintillation counter)를 이용하여 방사성을 측정할 수 있다.
이하, 본 발명을 실시예를 통해서 상세하게 설명한다. 하기의 특정한 예시 및 실시예는 발명의 일부 구현예를 포함하는 것으로 모든 구현예를 포함하고 있지는 않다는 점에 유의해야 한다. 본 명세서에 의해 개시되는 발명의 내용은 여기에서 설명되는 특정 실시예로 제한되지 않고, 본 발명이 속한 기술 분야에 있어 통상의 기술자가 다양하게 구현할 수 있다는 것을 포함하는 것은 자명하다. 따라서 본 명세서에 개시된 발명의 내용은 여기에 기재된 특정 실시예로 제한되지 않으며, 이에 대한 변형 및 다른 구현예들도 청구범위 내에 포함되는 것으로 이해되어야 한다.
재료 및 방법
1. 매실, 살구 및 이들의 교잡종 유전자원 수집 및 DNA 추출
본 실험에 사용된 매실 12개체, 살구 4개체 및 매실과 살구의 교잡종 개체 8개체, 총 24개체(청주, 강릉, 과천, 함양에서 수집)의 게놈 DNA는 액체질소를 이용하여 어린 잎 시료를 급속 냉각하고 막자사발로 분쇄한 후 plant gDNA Extraction kit(Biomedic)를 이용하여 추출하였다.
2. InDel 마커 개발
매실 12개체, 살구 4개체 및 매실과 살구의 교잡종 8개체의 게놈 염기서열을 CLC Main Workbewnch 프로그램(version 20)을 통해 비교·분석하여, 매실 핵 게놈의 Prudu_001688 유전자(NCBI accession No. AP019297) 영역에서 94 bp의 염기서열이 삽입된 것을 확인하였고(표 1), 상기 InDel 다형성을 증폭하기 위한 프라이머 세트를 제작하였다(표 2). 프라이머 세트는 최대 길이, 최소 길이, 증폭 산물의 크기, 온도, GC 비율 등의 조건을 조절하여 제작되었다.
| GGTATGTTTTGCGCCATT GCATTACCCTTATTTCTTTATGTGACTGAGAACATTAAGCTATGCCAAAATTTTGTTGTCAGTAAAACTTTTTTATTTTATTATTACCAACCTGATCTGAGTCCAAGGTATNTGGTTTATTGGTTGAGAGTTCATCATTCCTCATAGTCTGTGAATAGAAACCTGCTAATATGATAACATTACTAGGCTTGCAAACATTGATCAGGAGTGAGTTGAATTTTTAAATATATGAAGTTTGATACTGTCTCAATGTAAAAT AGGTGAAAGGTATGCAAG (서열번호 3) |
굵은 글씨체 및 밑줄 : 프라이머 위치.
밑줄 : 94 bp의 염기서열이 삽입된 위치.
| 프라이머 명칭 | 서열(5'→3') (서열번호) |
| NC-InDel-19_Fwd | GGTATGTTTTGCGCCATT (1) |
| NC-InDel-19_Rev | CTTGCATACCTTTCACCT (2) |
3. PCR을 이용한 DNA 증폭
상기 추출된 매실, 살구 또는 매실과 살구 교잡종의 게놈 DNA를 10 ng/㎕로 희석하여 DNA 1 ㎕(DNA 10 ng), InDel marker 2 ㎕(forward primer 1 ㎕, reverse primer 1 ㎕), Taq mixture 10 ㎕ 및 증류수 7 ㎕를 혼합하여 총 20 ㎕의 PCR 반응 혼합물을 만들었다. PCR은 전변성(pre-denaturation) 95℃ 3분; 변성(denaturation) 95℃ 30초, 결합(annealing) 52℃ 30초, 신장(extension) 72℃ 1분의 과정을 총 35회 반복; 최종 신장(final extension) 72℃ 10분 조건으로 수행하였다. PCR 증폭 산물은 3% 아가로스 겔에서 전기영동하여 확인하였다.
실시예. 본 발명의 InDel 마커를 이용한 매실과 살구의 구별
매실, 살구 및 매실과 살구의 교잡종 간의 InDel 다형성에 기반하여 제작된 상기 표 2의 프라이머 세트를 이용하여 매실 12개체, 살구 4개체 및 매실과 살구의 교잡종 8개체들의 DNA 시료를 주형으로 하여 PCR을 수행한 후 아가로스 겔에 전기영동하여 다형성 패턴 분석을 수행하였다.
그 결과, 매실 개체에서는 294 bp 크기의 밴드를 확인하였고, 살구 개체에서는 200 bp 크기의 밴드를 확인하였으며, 매실과 살구의 교잡종 개체에서는 294 bp와 200 bp 크기의 밴드를 모두 확인하였다(도 1). 이를 통해, 본 발명의 InDel 다형성에 기반한 프라이머 세트는 매실, 살구 또는 이들의 교잡종을 정확하게 각각 구별하는 것이 가능함을 알 수 있었다.
<110> Chungbuk National University Industry-Academic Cooperation Foundation
<120> Molecular marker based on nuclear genome sequence for
discriminating Prunus mume, Prunus armeniaca or hybrid of Prunus
mume and Prunus armeniaca and uses thereof
<130> PN21391
<160> 3
<170> KoPatentIn 3.0
<210> 1
<211> 18
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 1
ggtatgtttt gcgccatt 18
<210> 2
<211> 18
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer
<400> 2
cttgcatacc tttcacct 18
<210> 3
<211> 294
<212> DNA
<213> Unknown
<220>
<223> Prunus mume
<400> 3
ggtatgtttt gcgccattgc attaccctta tttctttatg tgactgagaa cattaagcta 60
tgccaaaatt ttgttgtcag taaaactttt ttattttatt attaccaacc tgatctgagt 120
ccaaggtatn tggtttattg gttgagagtt catcattcct catagtctgt gaatagaaac 180
ctgctaatat gataacatta ctaggcttgc aaacattgat caggagtgag ttgaattttt 240
aaatatatga agtttgatac tgtctcaatg taaaataggt gaaaggtatg caag 294
Claims (4)
- 서열번호 1 및 2의 올리고뉴클레오티드 프라이머 세트를 포함하는 매실(Prunus mume), 살구(Prunus armeniaca) 또는 매실과 살구의 교잡종 구별용 프라이머 세트 조성물.
- 제1항의 프라이머 세트 조성물을 포함하는 매실(Prunus mume), 살구(Prunus armeniaca) 또는 매실과 살구의 교잡종 구별용 키트.
- 매실 또는 살구 시료로부터 게놈 DNA를 분리하는 단계;
상기 분리된 게놈 DNA를 주형으로 하고, 제1항의 프라이머 세트 조성물을 이용하여 증폭 반응을 수행하여 표적 서열을 증폭하는 단계; 및
상기 증폭 단계의 산물을 검출하는 단계;를 포함하는 매실(Prunus mume), 살구(Prunus armeniaca) 또는 매실과 살구의 교잡종을 구별하는 방법. - 제3항에 있어서, 상기 증폭 단계의 산물의 검출은 DNA 칩, 겔 전기영동, 방사성 측정, 형광 측정 또는 인광 측정을 통해 수행되는 것을 특징으로 하는 매실과 살구를 구별하는 방법.
Priority Applications (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| KR1020210160943A KR102623817B1 (ko) | 2021-11-22 | 2021-11-22 | 매실, 살구 또는 이들의 교잡종을 구별하기 위한 핵 게놈 서열 기반 분자마커 및 이의 용도 |
Applications Claiming Priority (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| KR1020210160943A KR102623817B1 (ko) | 2021-11-22 | 2021-11-22 | 매실, 살구 또는 이들의 교잡종을 구별하기 위한 핵 게놈 서열 기반 분자마커 및 이의 용도 |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| KR20230074891A KR20230074891A (ko) | 2023-05-31 |
| KR102623817B1 true KR102623817B1 (ko) | 2024-01-12 |
Family
ID=86543568
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| KR1020210160943A KR102623817B1 (ko) | 2021-11-22 | 2021-11-22 | 매실, 살구 또는 이들의 교잡종을 구별하기 위한 핵 게놈 서열 기반 분자마커 및 이의 용도 |
Country Status (1)
| Country | Link |
|---|---|
| KR (1) | KR102623817B1 (ko) |
Family Cites Families (2)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| KR20050106967A (ko) * | 2004-05-07 | 2005-11-11 | 대한민국(관리부서:농촌진흥청) | 매실과 살구 과실을 구분하는 방법 및 이를 위한 ｓｃａｒ표지 프라이머 |
| KR101229271B1 (ko) * | 2010-11-19 | 2013-02-04 | 공주대학교 산학협력단 | Ｓｓｒ 마커를 이용한 한국 재래종 매실 품종 판별 방법 |
-
2021
- 2021-11-22 KR KR1020210160943A patent/KR102623817B1/ko active IP Right Grant
Non-Patent Citations (1)
| Title |
|---|
| Karim Sorkheh 등, BMC Res. Notes.,9:336, 2016. |
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| KR20230074891A (ko) | 2023-05-31 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| KR101954673B1 (ko) | 더덕 품종 구별을 위한 분자마커 및 이의 용도 | |
| KR101331740B1 (ko) | 작약에서 유래된 ｓｓｒ 프라이머 및 이의 용도 | |
| KR20140039866A (ko) | 참외 계통 또는 품종의 구별을 위한 ｓｓｒ 프라이머 세트 및 이들의 용도 | |
| KR102634293B1 (ko) | 오미자 '청순' 품종을 구별하기 위한 미토콘드리아 게놈 서열 기반 분자마커 및 이의 용도 | |
| KR101804120B1 (ko) | 알로에 베라, 알로에 사포나리아 및 알로에 생장의 엽록체 게놈 및 핵 리보솜 dna 서열의 완전 해독 기반 종 식별 마커와 프라이머 세트 및 이의 용도 | |
| KR102009712B1 (ko) | 대추 복조 품종 판별용 프라이머 세트 및 이의 용도 | |
| KR102010279B1 (ko) | 더덕 속에서 더덕 종을 구별하기 위한 분자마커 및 이의 용도 | |
| KR101912933B1 (ko) | 더덕과 잔대 구별을 위한 분자마커와 프라이머 세트 및 이의 용도 | |
| KR102212054B1 (ko) | 오미자 종을 구별하기 위한 엽록체 게놈 서열 기반 분자마커 및 이의 용도 | |
| KR102332688B1 (ko) | 인삼 '선향' 품종을 구별하기 위한 핵 게놈 서열 기반 분자마커 및 이의 용도 | |
| KR102332689B1 (ko) | 인삼 '금진' 및 '선향' 품종을 구별하기 위한 미토콘드리아 게놈 서열 기반 분자마커 및 이의 용도 | |
| KR102335806B1 (ko) | 대추 산조 품종을 구별하기 위한 엽록체 게놈 서열 기반 분자마커 및 이의 용도 | |
| KR102623817B1 (ko) | 매실, 살구 또는 이들의 교잡종을 구별하기 위한 핵 게놈 서열 기반 분자마커 및 이의 용도 | |
| KR102286875B1 (ko) | 무측지 수박 품종을 구별하기 위한 분자마커 및 이의 용도 | |
| KR102286871B1 (ko) | 무측지 수박 품종을 구별하기 위한 분자마커 및 이의 용도 | |
| KR102174274B1 (ko) | 대추 품종 '보은'과 '추석'을 판별하기 위한 분자마커 및 이의 용도 | |
| KR102623818B1 (ko) | 매실과 살구를 구별하기 위한 엽록체 게놈 서열 기반 분자마커 및 이의 용도 | |
| KR101766274B1 (ko) | 초위성체 마커를 이용한 블루베리 품종식별 방법 | |
| KR102174019B1 (ko) | 더덕과 만삼을 구별하기 위한 엽록체 서열 기반 분자마커 및 이의 용도 | |
| KR102135173B1 (ko) | 초위성체 마커를 이용한 모감주나무의 개체 식별 방법 | |
| KR102370010B1 (ko) | 국내 대추 품종과 일본 대추 품종을 구별하기 위한 엽록체 게놈 서열 기반 분자마커 및 이의 용도 | |
| KR101357497B1 (ko) | 맥문아재비 속에서 유래된 ｅｓｔ-ｓｓｒ 프라이머 및 이의 용도 | |
| KR101993289B1 (ko) | 들깨 잎의 보라색 판별용 분자마커 및 이의 용도 | |
| KR102151225B1 (ko) | 국내 재래종 도라지를 구별하기 위한 핵 게놈 서열 기반 분자마커 및 이의 용도 | |
| KR102586234B1 (ko) | 복숭아 숙기 구분용 프라이머 세트 및 이를 이용한 구분방법 |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| E701 | Decision to grant or registration of patent right | ||
| GRNT | Written decision to grant |