JPWO2022032226A5 - - Google Patents

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本開示はさらに、配列番号81~83、および相同体またはその機能的バリアントを含むAAVrh74P3のタンパク質配列を提供する。
特定の事例では、AAVrh74キャプシドは、配列番号81に記載されるアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、rAAVベクターは、配列番号81に記載されるAAVrh74 VPのアミノ酸配列と、例えば、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、または89%、より一般的には90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%またはそれ以上同一な配列を含む、または本質的にからなる、またはさらになるポリペプチドを含む。一部の実施形態では、rAAVベクターは、配列番号82に記載されるアミノ酸配列と、例えば、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、または89%、より一般的には90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%またはそれ以上同一な配列を含む、または本質的にからなる、またはさらになるポリペプチドを含む。一部の実施形態では、rAAVベクターは、配列番号83に記載されるアミノ酸配列と、例えば、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、または89%、より一般的には90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%またはそれ以上同一な配列を含む、または本質的にからなる、またはさらになるポリペプチドを含む。

Claims (34)

  1. 発現カセット、および
    任意で、隣接するアデノ随伴ウイルス(AAV)逆位末端反復(ITR)
    を含む、ポリヌクレオチドであって、
    プロモーターに動作可能に連結された、プラコフィリン-2(PKP2)またはその機能的バリアントをコードするポリヌクレオチド配列
    を含む、前記ポリヌクレオチド。
  2. 前記プロモーターが、心臓特異的プロモーター、筋特異的プロモーター、かつ/または心筋細胞特異的プロモーターである、請求項1に記載のポリヌクレオチド。
  3. (i)前記プロモーターがミオシン重鎖クレアチンキナーゼ7(MHCK7)プロモーターである、
    (ii)前記プロモーターがMHCK7プロモーターであり、該MHCK7プロモーターが、配列番号31と少なくとも75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%、もしくは100%の同一性を共有する、
    (iii)前記プロモーターが心筋トロポニンT(hTNNT2)プロモーターである、
    (iv)前記プロモーターがhTNNT2プロモーターであり、該hTNNT2プロモーターが、配列番号33と少なくとも75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%、もしくは100%の同一性を共有する、または
    (v)前記プロモーターが、ユビキタスプロモーター、任意でCMVプロモーターもしくはCAGプロモーターである、
    請求項1または2に記載のポリヌクレオチド。
  4. 前記プロモーターがhTNNT2プロモーターであり、かつ前記発現カセットが、心筋トロポニンT(hTNNT2)遺伝子のエクソン1を含み、
    任意で、hTNNT2プロモーターおよびエクソン1が一緒に、配列番号32と少なくとも75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%の同一性を共有する、
    請求項1~のいずれか一項に記載のポリヌクレオチド。
  5. (i)前記発現カセットがポリAシグナルもしくはヒト成長ホルモン(hGH)ポリAであるポリAシグナルを含む、
    (ii)前記発現カセットが、ウッドチャック肝炎ウイルス転写後調節エレメント(WPRE)、任意でWPRE(x)を含む、かつ/または
    (iii)前記発現カセットが、5’および3’の逆位末端反復(ITR)によって隣接されている、
    請求項1~のいずれか一項に記載のポリヌクレオチド。
  6. 前記プラコフィリン-2(PKP2)またはその機能的バリアントがPKP2、機能的PKP2、および/またはヒトPKP2である、請求項1~のいずれか一項に記載のポリヌクレオチド。
  7. (i)前記PKP2がPKP2アイソフォームAである、
    (ii)前記PKP2が、PKP2アイソフォームAであり、配列番号1と少なくとも75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%、もしくは100%の同一性を共有する、
    (iii)前記PKP2がPKP2アイソフォームBである、または
    (iv)前記PKP2が、PKP2アイソフォームBであり、配列番号2と少なくとも75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%、もしくは100%の同一性を共有する、
    請求項に記載のポリヌクレオチド。
  8. (i)PKP2をコードする前記ポリヌクレオチド配列が、ヒトPKP2ポリヌクレオチドである、かつ/または
    (ii)PKP2をコードする前記ポリヌクレオチド配列が、配列番号3もしくは4と、少なくとも75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%、もしくは100%の同一性を共有する、
    請求項1~のいずれか一項に記載のポリヌクレオチド。
  9. (i)少なくとも約4.0kb、少なくとも約4.1kb、少なくとも約4.2kb、少なくとも約4.3kb、少なくとも約4.4kb、もしくは少なくとも約4.5kbを含む、
    (ii)最大で約4.1kb、最大で約4.2kb、最大で約4.3kb、最大で約4.4kb、最大で約4.5kb、もしくは最大で約4.6kbを含む、
    (iii)4.0kb~4.6kb、4.0kb~4.5kb、もしくは4.0kb~4.4kbを含む、または
    (iv)4.0kb~4.3kb、4.0kb~4.2kb、もしくは4.0kb~4.1kbを含む、
    請求項1~のいずれか一項に記載のポリヌクレオチド。
  10. 前記PKP2またはその機能的バリアントが、少なくとも800個または少なくとも830個のアミノ酸を含む、請求項1~のいずれか一項に記載のポリヌクレオチド。
  11. 配列番号8~15のいずれか一つと少なくとも75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%の同一性を共有する、請求項1~10のいずれか一項に記載のポリヌクレオチド。
  12. 前記発現カセットが、5’および3’のITRによって隣接されており、 ITRがAAV2 ITRであかつ/または
    ITRが、配列番号20~26のいずれか一つと少なくとも75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%、もしくは100%の同一性を共有する、
    請求項5~11のいずれか一項に記載のポリヌクレオチド。
  13. 請求項1~12のいずれか一項に記載のポリヌクレオチドを含む、遺伝子治療ベクター。
  14. 前記遺伝子治療ベクターが組換えアデノ随伴ウイルス(rAAV)ベクターである、請求項13に記載のベクター。
  15. (i)前記rAAVベクターがAAV9、AAVrh10、AAV6、もしくはAAVrh74またはその機能的バリアントである、あるいは
    (ii)前記rAAVベクターが、配列番号77、79、78、もしくは80のいずれか一つと90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、もしくは100%の同一性を共有するキャプシドタンパク質を含む、
    請求項14に記載のベクター。
  16. 請求項13~15のいずれか一項に記載のベクターを含む、医薬組成物。
  17. 請求項13~15のいずれか一項に記載のベクターを含む、対象において疾患または障害を治療および/または予防するための医薬組成物
  18. 前記疾患または障害が心障害、心筋症、不整脈源性右室心筋症(ARVC)、肥大型心筋症、拡張型心筋症、心不全、または心筋の線維脂肪性浸潤によって特徴付けられる疾患もしくは障害である、請求項17に記載の医薬組成物
  19. 前記対象が哺乳動物、霊長類、および/またはヒトである、請求項17または18に記載の医薬組成物
  20. (i)前記対象がPKP2遺伝子に変異を有する、かつ/または
    (ii)前記対象が、配列番号2の配列を有するヒトPKP2をコードするヒトPKP2遺伝子に対して、Arg490Trp、Asp26Asn、Thr50_Val51SerfsX60、Arg79X、Tyr86X、Gln133X、Val406SerfsX3、Tyr616X、Trp676X、Cys796Arg、Cys796E、Tyr807X、Glu62Lys、S688P、Trp848X、Y86X、V406X、Y616X、W848X、およびY807Xから選択されるアミノ酸置換を引き起こす変異を有する、
    請求項17~19のいずれか一項に記載の医薬組成物
  21. 静脈内注射、心臓内注射、心臓内注入、および/または心臓カテーテル法により投与される、請求項17~20のいずれか一項に記載の医薬組成物
  22. 前記医薬組成物の投与が、PKP2発現を少なくとも約5%、少なくとも約30%、少なくとも約70%、約5%~約10%、約30%~約50%、約50%~約70%、または約70%~約100%増加させる、請求項17~21のいずれか一項に記載の医薬組成物
  23. 前記疾患または障害が、前記対象のPKP2の機能喪失に関連するかもしくはそれにより引き起こされる、または前記対象のPKP2の機能獲得に関連するかもしくはそれにより引き起こされる、請求項17~22のいずれか一項に記載の医薬組成物
  24. 約1×1011ベクターゲノムから約1×1013ベクターゲノムのベクター、約1×1012ベクターゲノムから約1×1014ベクターゲノムのベクター、または約1×1013ベクターゲノムから約1×1015ベクターゲノムのベクターが、前記対象に投与されるように用いられる、請求項17~23のいずれか一項に記載の医薬組成物
  25. 請求項13~15のいずれか一項に記載のベクターまたは請求項16~24のいずれか一項に記載の医薬組成物および任意で使用説明書を含む、キット。
  26. 配列番号12~15および89~92のいずれか一つまたは配列番号8~11および93~96のいずれか一つと少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%の同一性を共有するポリヌクレオチド配列を含む、ポリヌクレオチド。
  27. 請求項26に記載のポリヌクレオチドを含む、遺伝子治療ベクター。
  28. 前記遺伝子治療ベクターが組換えアデノ随伴ウイルス(rAAV)ベクターである、請求項27に記載のベクター。
  29. 前記rAAVベクターがAAV9ベクターまたはAAVrh74ベクターである、請求項28に記載のベクター。
  30. 請求項27~29のいずれか一項に記載のベクターを含む、PKP2遺伝子に変異を有すると特定された対象において心障害を治療および/または予防するための医薬組成物
  31. 前記心障害が、心不全、または任意で不整脈源性右室心筋症(ARVC)、肥大型心筋症、もしくは拡張型心筋症である心筋症である、請求項30に記載の医薬組成物
  32. 前記対象が哺乳動物である、請求項30または31に記載の医薬組成物
  33. 静脈内注射、心臓内注射、心臓内注入、および/または心臓カテーテル法により投与される、請求項30~32のいずれか一項に記載の医薬組成物
  34. (i)左心室駆出率(LVEF%)の減少を、PKP2遺伝子に変異を有すると特定された未治療の対象において観察された減少と比較して任意で約50%、約60%、約70%、約80%、約90%、もしくは約100%、防止もしくは低減する、
    (ii)左心室短縮率(FS%)の減少を、PKP2遺伝子に変異を有すると特定された未治療の対象において観察された減少と比較して任意で約50%、約60%、約70%、約80%、約90%、もしくは約100%、防止もしくは低減する、
    (iii)平方ミリメートル単位の右心室面積(RV面積(mm2))の増加を、PKP2遺伝子に変異を有すると特定された未治療の対象において観察された増加と比較して任意で約50%、約60%、約70%、約80%、約90%、もしくは約100%、防止もしくは低減する、
    (iv)毎秒ミリメートル単位の右心室速度時間積分(RV VTI(mm/秒))の減少を、PKP2遺伝子に変異を有すると特定された未治療の対象において観察された減少と比較して任意で約50%、約60%、約70%、約80%、約90%、もしくは約100%、防止もしくは低減する、かつ/または
    (v)左心室もしくは右心室の線維症の増加を、PKP2遺伝子に変異を有すると特定された未治療の対象において観察された増加と比較して任意で約50%、約60%、約70%、約80%、約90%、もしくは約100%、防止もしくは低減する、
    請求項30~33のいずれか一項に記載の医薬組成物
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