JPWO2020140975A5 - - Google Patents
Download PDFInfo
- Publication number
- JPWO2020140975A5 JPWO2020140975A5 JP2021538800A JP2021538800A JPWO2020140975A5 JP WO2020140975 A5 JPWO2020140975 A5 JP WO2020140975A5 JP 2021538800 A JP2021538800 A JP 2021538800A JP 2021538800 A JP2021538800 A JP 2021538800A JP WO2020140975 A5 JPWO2020140975 A5 JP WO2020140975A5
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- urine sample
- composition
- concentration
- subject
- storage
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Pending
Links
- 210000002700 Urine Anatomy 0.000 claims description 92
- 239000000203 mixture Substances 0.000 claims description 51
- QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N acetic acid Chemical compound CC(O)=O QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 38
- KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N edta Chemical group OC(=O)CN(CC(O)=O)CCN(CC(O)=O)CC(O)=O KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 27
- 239000002122 magnetic nanoparticle Substances 0.000 claims description 25
- 229920003013 deoxyribonucleic acid Polymers 0.000 claims description 21
- 239000000243 solution Substances 0.000 claims description 21
- 239000011534 wash buffer Substances 0.000 claims description 21
- LENZDBCJOHFCAS-UHFFFAOYSA-N 2-amino-2-(hydroxymethyl)propane-1,3-diol Chemical compound OCC(N)(CO)CO LENZDBCJOHFCAS-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 20
- LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N ethanol Chemical compound CCO LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 18
- 230000002934 lysing Effects 0.000 claims description 17
- ZJYYHGLJYGJLLN-UHFFFAOYSA-N Guanidinium thiocyanate Chemical compound SC#N.NC(N)=N ZJYYHGLJYGJLLN-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 16
- 239000002738 chelating agent Substances 0.000 claims description 16
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 claims description 15
- 239000003945 anionic surfactant Substances 0.000 claims description 14
- 239000006179 pH buffering agent Substances 0.000 claims description 14
- 150000003839 salts Chemical class 0.000 claims description 13
- VMHLLURERBWHNL-UHFFFAOYSA-M sodium acetate Chemical compound [Na+].CC([O-])=O VMHLLURERBWHNL-UHFFFAOYSA-M 0.000 claims description 12
- 239000001632 sodium acetate Substances 0.000 claims description 12
- 235000017281 sodium acetate Nutrition 0.000 claims description 12
- 239000004094 surface-active agent Substances 0.000 claims description 11
- WSFSSNUMVMOOMR-UHFFFAOYSA-N formaldehyde Chemical compound O=C WSFSSNUMVMOOMR-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 10
- 241000700605 Viruses Species 0.000 claims description 9
- 239000012491 analyte Substances 0.000 claims description 9
- KFZMGEQAYNKOFK-UHFFFAOYSA-N iso-propanol Chemical compound CC(C)O KFZMGEQAYNKOFK-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 9
- 238000005406 washing Methods 0.000 claims description 9
- 102000033147 ERVK-25 Human genes 0.000 claims description 8
- 108091005771 Peptidases Proteins 0.000 claims description 8
- 239000004365 Protease Substances 0.000 claims description 8
- 239000012149 elution buffer Substances 0.000 claims description 8
- 241000701806 Human papillomavirus Species 0.000 claims description 7
- 229920004890 Triton X-100 Polymers 0.000 claims description 6
- 244000052613 viral pathogens Species 0.000 claims description 6
- YHBHQYRDAVETGQ-UHFFFAOYSA-N Triton X 100 Chemical compound CC(C)(C)CC(C)(C)C1=CC=C(OCCCCCCCCCCO)C=C1 YHBHQYRDAVETGQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 5
- 239000000834 fixative Substances 0.000 claims description 5
- 230000002335 preservative Effects 0.000 claims description 5
- 239000003755 preservative agent Substances 0.000 claims description 5
- 150000003385 sodium Chemical group 0.000 claims description 5
- 229910052708 sodium Inorganic materials 0.000 claims description 5
- 239000011734 sodium Substances 0.000 claims description 5
- QAOWNCQODCNURD-UHFFFAOYSA-L sulfate Chemical compound [O-]S([O-])(=O)=O QAOWNCQODCNURD-UHFFFAOYSA-L 0.000 claims description 5
- 239000002253 acid Substances 0.000 claims description 4
- 238000004090 dissolution Methods 0.000 claims description 4
- MOTZDAYCYVMXPC-UHFFFAOYSA-N dodecyl hydrogen sulfate Chemical compound CCCCCCCCCCCCOS(O)(=O)=O MOTZDAYCYVMXPC-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- 239000007984 Tris EDTA buffer Substances 0.000 claims description 3
- ILXAOQAXSHVHTM-UHFFFAOYSA-M sodium;2-amino-2-(hydroxymethyl)propane-1,3-diol;chloride Chemical compound [Na+].[Cl-].OCC(N)(CO)CO ILXAOQAXSHVHTM-UHFFFAOYSA-M 0.000 claims description 3
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 claims description 2
- 108010067770 Endopeptidase K Proteins 0.000 description 5
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 4
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 3
- 238000006011 modification reaction Methods 0.000 description 3
- 159000000000 sodium salts Chemical group 0.000 description 3
- 229910004298 SiO 2 Inorganic materials 0.000 description 2
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 2
- 239000011258 core-shell material Substances 0.000 description 2
- 239000006174 pH buffer Substances 0.000 description 2
- 239000002244 precipitate Substances 0.000 description 2
- 238000000605 extraction Methods 0.000 description 1
- 238000010438 heat treatment Methods 0.000 description 1
- 238000007885 magnetic separation Methods 0.000 description 1
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 description 1
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 description 1
- 239000006228 supernatant Substances 0.000 description 1
Description
本開示のある特定の実施形態は、以下の実施例にさらに記載される。これらの実施例は、例示のみによって与えられることが理解されるべきである。上記の考察及びこれらの実施例から、当業者は、本質的な特質を確認することができ、その趣旨及び範囲から逸脱することなく、本発明の実施形態の種々の変更及び修正を行い、種々の使用及び条件に適合させることができる。したがって、本明細書に示され、記載されるものに加えて、本発明の実施形態の種々の修正は、前述の説明から当業者には明白であろう。そのような修正はまた、添付の特許請求の範囲内にあるように意図される。
本開示は、例えば、以下に関する。
[1]
対象から得られる尿試料を保存するための組成物であって、前記組成物が、pH緩衝剤、キレート剤、及び界面活性剤を含む、前記組成物。
[2]
前記pH緩衝剤が、前記組成物のpHを、事前選択された範囲内に調整するように構成される、前記[1]に記載の組成物。
[3]
前記pH緩衝剤が、酢酸及び酢酸の塩を含む、前記[1]に記載の組成物。
[4]
前記酢酸の塩が、酢酸ナトリウムである、前記[3]に記載の組成物。
[5]
pHの前記事前選択された範囲が、約5.0~6.5である、前記[2]に記載の組成物。
[6]
前記組成物の前記pHが、約6.0である、前記[5]に記載の組成物。
[7]
前記酢酸ナトリウムが、約0.5~1.0mol/Lの濃度を有する、前記[4]に記載の組成物。
[8]
前記キレート剤が、アミノポリカルボン酸である、前記[1]に記載の組成物。
[9]
前記キレート剤が、エチレンジアミン四酢酸(EDTA)である、前記[8]に記載の組成物。
[10]
前記EDTAが、約10~25mmol/Lの濃度を有する、前記[8]に記載の組成物。
[11]
前記界面活性剤が、陰イオン界面活性剤である、前記[1]に記載の組成物。
[12]
前記陰イオン界面活性剤が、ドデシル水素スルファートの塩である、前記[11]に記載の組成物。
[13]
前記塩が、ナトリウム塩であり、前記陰イオン界面活性剤が、ドセシル硫酸ナトリウム(SDS)である、前記[11]に記載の組成物。
[14]
前記SDSが、約5%~10%(m/v)の濃度を有する、前記[1]に記載の組成物。
[15]
前記組成物が、防腐剤、細胞固定剤、またはホルムアルデヒド消光剤を含有しない、前記[1]に記載の組成物。
[16]
保存のための処理された尿試料であって、前記処理された尿試料が、対象から収集された尿試料、pH緩衝剤、キレート剤、及び界面活性剤を含む、前記処理された尿試料。
[17]
前記pH緩衝剤が、組成物のpHを、事前選択された範囲内に調整するように構成される、前記[16]に記載の保存のための処理された尿試料。
[18]
前記pH緩衝剤が、酢酸及び酢酸の塩を含む、前記[16]に記載の保存のための処理された尿試料。
[19]
前記酢酸の塩が、酢酸ナトリウムである、前記[18]に記載の保存のための処理された尿試料。
[20]
pHの前記事前選択された範囲が、約5.0~6.5である、前記[17]に記載の保存のための処理された尿試料。
[21]
前記組成物の前記pHが、約6.0である、前記[20]に記載の保存のための処理された尿試料。
[22]
前記処理された尿試料中の前記酢酸ナトリウムが、約0.05~0.1mol/Lの濃度を有する、前記[19]に記載の保存のための処理された尿試料。
[23]
前記キレート剤が、アミノポリカルボン酸である、前記[1]に記載の保存のための処理された尿試料。
[24]
前記キレート剤が、エチレンジアミン四酢酸(EDTA)である、前記[23]に記載の保存のための処理された尿試料。
[25]
前記EDTAが、約1~2.5mmol/Lの濃度を有する、前記[24]に記載の保存のための処理された尿試料。
[26]
前記界面活性剤が、陰イオン界面活性剤である、前記[16]に記載の保存のための処理された尿試料。
[27]
前記陰イオン界面活性剤が、ドデシル水素スルファートの塩である、前記[26]に記載の保存のための処理された尿試料。
[28]
前記塩が、ナトリウム塩であり、前記陰イオン界面活性剤が、ドセシル硫酸ナトリウム(SDS)である、前記[26]に記載の保存のための処理された尿試料。
[29]
前記SDSが、約0.5%~1.5%(m/v)の濃度を有する、前記[16]に記載の保存のための処理された尿試料。
[30]
前記処理された尿試料が、防腐剤、細胞固定剤、またはホルムアルデヒド消光剤を含有しない、前記[16]に記載の処理された尿試料。
[31]
保存のための処理された尿試料を生成するための方法であって、対象から収集された尿試料を、pH緩衝剤、キレート剤、及び界面活性剤と、または前記[1]~[15]のいずれか一項に記載の組成物と、混合することを含む、前記方法。
[32]
前記pH緩衝剤が、酢酸及び酢酸ナトリウムを含む、前記[31]に記載の方法。
[33]
前記処理された尿試料中の前記酢酸ナトリウムが、約0.05~0.1mol/Lの濃度を有する、前記[32]に記載の方法。
[34]
前記キレート剤が、EDTAである、前記[31]に記載の方法。
[35]
前記処理された尿試料中の前記EDTAが、約1~2.5mmol/Lの濃度を有する、前記[34]に記載の方法。
[36]
前記界面活性剤が、SDSである、前記[31]に記載の方法。
[37]
前記処理された尿試料中の前記SDSが、約0.5%~1.5%(m/v)の濃度を有する、前記[36]に記載の方法。
[38]
対象から収集された尿試料を保存するための方法であって、前記対象から収集された前記尿試料を、pH緩衝剤、キレート剤、及び界面活性剤と混合して、保存の準備ができた尿試料を生成することを含む、前記方法。
[39]
前記pH緩衝剤、前記キレート剤、及び前記界面活性剤が、それらが前記対象から収集された前記尿試料と混合される前に、混合物で提供される、前記[38]に記載の方法。
[40]
前記pH緩衝剤が、組成物のpHを、事前選択された範囲内に調整するように構成される、前記[39]に記載の方法。
[41]
前記pH緩衝剤が、酢酸及び酢酸の塩を含む、前記[38]に記載の方法。
[42]
前記酢酸の塩が、酢酸ナトリウムである、前記[41]に記載の方法。
[43]
pHの前記事前選択された範囲が、約5.0~6.5である、前記[40]に記載の方法。
[44]
前記組成物の前記pHが、約6.0である、前記[43]に記載の方法。
[45]
前記保存の準備ができた尿試料中の前記酢酸ナトリウムが、約0.05~0.1mol/Lの濃度を有する、前記[42]に記載の方法。
[46]
前記キレート剤が、アミノポリカルボン酸である、前記[38]に記載の方法。
[47]
前記キレート剤が、エチレンジアミン四酢酸(EDTA)である、前記[46]に記載の方法。
[48]
前記保存の準備ができた尿試料中の前記EDTAが、約1~2.5mmol/Lの濃度を有する、前記[47]に記載の方法。
[49]
前記界面活性剤が、陰イオン界面活性剤である、前記[38]に記載の方法。
[50]
前記陰イオン界面活性剤が、ドデシル水素スルファートの塩である、前記[49]に記載の方法。
[51]
前記塩が、ナトリウム塩であり、前記陰イオン界面活性剤が、ドセシル硫酸ナトリウム(SDS)である、前記[50]に記載の方法。
[52]
前記保存の準備ができた尿試料中の前記SDSが、約0.5%~1.5%(m/v)の濃度を有する、前記[51]に記載の方法。
[53]
前記保存の準備ができた尿試料が、防腐剤、細胞固定剤、またはホルムアルデヒド消光剤を含有しない、前記[38]に記載の方法。
[54]
前記対象から収集された前記尿試料が、前記対象の細胞及び少なくとも1つのウイルス病原体を含有し、前記細胞及び前記ウイルス病原体の両方が、前記尿試料が保存の準備ができた後に溶解される、前記[38]に記載の方法。
[55]
前記ウイルス病原体が、ヒトパピローマウイルス(HPV)である、前記[54]に記載の方法。
[56]
前記保存の準備ができた尿試料を、4℃で保存することを含む、前記[38]に記載の方法。
[57]
前記保存の準備ができた尿試料を、室温で保存することを含む、前記[38]に記載の方法。
[58]
前記尿試料中のDNA含有量が、15日~30日の保存期間後に安定している、前記[56]に記載の方法。
[59]
前記尿試料中のDNA含有量が、1週間~2週間の保存期間後に安定している、前記[57]に記載の方法。
[60]
対象から収集された尿試料中の1つ以上の分析物の存在または不在を検出するための方法であって、前記方法が、前記[16]~[30]のいずれか一項に記載の処理された尿試料を使用することを含む、前記方法。
[61]
前記分析物が、ウイルスである、前記[60]に記載の方法。
[62]
前記ウイルスが、HPVである、前記[61]に記載の方法。
[63]
前記分析物の前記検出が、前記ウイルスのDNAを検出することを含む、前記[61]に記載の方法。
[64]
対象の尿試料からDNAを抽出するためのキットであって、前記キットが、溶解溶液、磁性ナノ粒子、プロテアーゼ、第1の洗浄緩衝剤、第2の洗浄緩衝剤、溶出緩衝剤、またはそれらの任意の組み合わせを含む、前記キット。
[65]
前記溶解溶液が、グアニジウムイソチオシアネート、Triton X 100、Tris-HCl、EDTA、またはそれらの任意の組み合わせを含む、前記[64]に記載のキット。
[66]
前記グアニジウムイソチオシアネートが、約2~6Mの濃度を有するか、前記Triton X-100が、約1~5%の濃度を有するか、前記Tris-HClが、約20~50mMの濃度を有するか、前記溶解溶液が、約6.5のpHを有するか、前記EDTAが、約10~50mMの濃度を有するか、またはそれらの任意の組み合わせである、前記[65]に記載のキット。
[67]
前記溶解溶液が、グアニジウムイソチオシアネート、Triton X-100、Tris-HCl、及びEDTAを含む、前記[66]に記載のキット。
[68]
前記溶解溶液が、イソプロパノールをさらに含む、前記[66]に記載のキット。
[69]
イソプロパノールの用量が、約50%~200%(v/v)である、前記[68]に記載のキット。
[70]
前記グアニジウムイソチオシアネートが、約1~2Mの濃度を有するか、前記Triton X-100が、約1~2%の濃度を有するか、前記Tris-HClが、約5~10mMの濃度を有するか、前記溶解溶液が、約6~7のpHを有するか、前記EDTAが、約3~5mMの濃度を有するか、前記イソプロパノールが、前記溶解溶液の約50%~80%の体積を有するか、またはそれらの任意の組み合わせである、前記[69]に記載のキット。
[71]
前記磁性ナノ粒子が、内側コア層及び外側シェル層を有し、前記内側コア層が、コアシェル型磁性ナノ粒子で構成され、前記外側シェル層が、SiO 2 で構成される、前記[64]に記載のキット。
[72]
前記磁性ナノ粒子が、約100~1000nmの直径、及び約50mg/mlの濃度を有する、前記[71]に記載のキット。
[73]
前記磁性ナノ粒子が、約10~20μLの体積を有する、前記[72]に記載のキット。
[74]
前記第1の洗浄緩衝剤が、グアニジウムイソチオシアネート、Tris-HCl、NaCl、及びエタノールを含む、前記[64]に記載のキット。
[75]
前記グアニジウムイソチオシアネートが、約50mMの濃度を有する、前記[74]に記載のキット。
[76]
前記Tris-HClが、約20~50mMの濃度を有する、前記[74]に記載のキット。
[77]
前記第1の洗浄緩衝剤が、約5.0のpHを有する、前記[76]に記載のキット。
[78]
前記NaClが、約50~200mMの濃度を有する、前記[74]に記載のキット。
[79]
前記エタノールが、約40%~60%(v/v)の濃度を有する、前記[74]に記載のキット。
[80]
前記第2の洗浄緩衝剤が、Tris-HCl及びエタノールを含む、前記[64]に記載のキット。
[81]
前記第2の洗浄緩衝剤中の前記Tris-HClが、約10~50mMの濃度を有し、前記第2の洗浄緩衝剤が、約6.0のpHを有する、前記[80]に記載のキット。
[82]
前記エタノールが、約70%~80%(v/v)の濃度を有する、前記[80]に記載のキット。
[83]
前記溶出緩衝剤が、約8.0のpHを有するTris-EDTA緩衝剤である、前記[64]に記載のキット。
[84]
前記プロテアーゼが、プロテアーゼKである、前記[64]に記載のキット。
[85]
前記プロテアーゼKが、約10~20mg/mlの濃度を有する、前記[84]に記載のキット。
[86]
前記プロテアーゼKが、約2.5~25μgの用量を有する、前記[85]に記載のキット。
[87]
対象の尿試料からDNAを抽出するための方法であって、前記[64]~[86]のいずれか一項に記載のキットを使用することを含む、前記方法。
[88]
対象の尿試料からDNAを抽出するための方法であって、
(1)前記尿試料を磁性ナノ粒子及びプロテアーゼと接触させて、前処理された尿試料を生成することと、
(2)ステップ(1)で得られた前記前処理された尿試料を、溶解溶液に溶解して、溶解した尿試料を生成することと、
(3)ステップ(2)で得られた前記磁性ナノ粒子を、第1の洗浄緩衝剤で洗浄することと、
(4)ステップ(3)で得られた前記磁性ナノ粒子を、第2の洗浄緩衝剤で洗浄することと、
(5)ステップ(4)で得られた前記尿試料中の前記磁性ナノ粒子を収集することと、
(6)ステップ(5)で得られた前記収集された磁性ナノ粒子からDNAを溶出緩衝剤で洗い流して、抽出されたDNAを得ることと、を含む、前記方法。
[89]
前記溶解溶液が、グアニジウムイソチオシアネート、Triton X-100、Tris-HCl、EDTA、及びイソプロパノールを含み、
前記グアニジウムイソチオシアネートが、約1~2Mの濃度を有し、
前記Triton X 100が、約1~2%の濃度を有し、
前記Tris-HClが、約5~10mMの濃度を有し、前記溶解溶液が、約6~7のpHを有し、
前記EDTAが、約3~5mMの濃度を有し、
かつ
前記イソプロパノールが、前記溶解溶液の約50%~80%(v/v)の体積を有する、前記[88]に記載の方法。
[90]
前記磁性ナノ粒子が、内側コア層及び外側シェル層を有し、前記内側コア層が、コアシェル型磁性ナノ粒子で構成され、前記外側シェル層が、SiO 2 で構成され、前記磁性ナノ粒子が、100~1000nmの直径、及び約50mg/mlの濃度を有する、前記[88]に記載の方法。
[91]
前記第1の洗浄緩衝剤が、グアニジウムイソチオシアネート、Tris-HCl、NaCl、及びエタノールを含み、
前記グアニジウムイソチオシアネートが、約50~100mMの濃度を有し、
前記Tris-HClが、約20~50mMの濃度を有し、前記第1の洗浄緩衝剤が、約5.0のpHを有し、
前記NaClが、約50~200mMの濃度を有し、
前記エタノールが、約40%~60%(v/v)の濃度を有する、前記[88]に記載の方法。
[92]
前記第2の洗浄緩衝剤が、Tris-HCl及びエタノールを含み、
前記第2の洗浄緩衝剤中の前記Tris-HClが、約10~50mMの濃度を有し、
前記第2の洗浄緩衝剤が、約6.0のpHを有し、かつ
前記エタノールが、約70%~80%(v/v)の濃度を有する、前記[88]に記載の方法。
[93]
前記溶出緩衝剤が、約8.0のpHを有するTris-EDTA緩衝剤である、前記[88]に記載の方法。
[94]
前記プロテアーゼが、プロテアーゼKであり、前記プロテアーゼKが、約10~20mg/mlの濃度を有する、前記[88]に記載の方法。
[95]
ステップ(1)が、
(a)前記尿試料を、前記磁性ナノ粒子と接触させて、混合物を形成することと、
(b)前記混合物を遠心分離するか、または磁性分離デバイスを利用して、沈殿物及び上清を生成することと、
(c)前記沈殿物を前記プロテアーゼと接触させて、反応系を生成することと、
(d)前記反応系を、好適な条件下で事前に決定された時間加熱することと、を含む、前記[88]に記載の方法。
[96]
ステップ(3)、(4)、及び/または(6)が、磁性フレームまたは自動核酸抽出機器を使用することを含む、前記[88]に記載の方法。
[97]
対象から収集された尿試料中の分析物の存在または不在を検出するための方法であって、前記方法が、前記[85]または[86]に記載のキットを使用して、前記尿試料から抽出されたDNAを使用することを含む、前記方法。
[98]
前記分析物が、ウイルスである、前記[97]に記載の方法。
[99]
前記ウイルスが、HPVである、前記[98]に記載の方法。
[100]
前記分析物の前記検出が、前記ウイルスのDNAを検出することを含む、前記[98]に記載の方法。
[101]
対象から収集された尿試料中の分析物の存在または不在を検出するための方法であって、前記方法が、
(1)前記[16]~[30]のいずれか一項に記載の処理された尿試料を使用すること、ならびに
(2)前記処理された尿試料からDNAを抽出することであって、
(a)前記尿試料を磁性ナノ粒子及びプロテアーゼと接触させて、前処理された尿試料を生成することと、
(b)ステップ(a)で得られた前記前処理された尿試料を、溶解溶液に溶解して、溶解した尿試料を生成することと、
(c)ステップ(b)で得られた前記磁性ナノ粒子を、第1の洗浄緩衝剤で洗浄することと、
(d)ステップ(c)で得られた前記磁性ナノ粒子を、第2の洗浄緩衝剤で洗浄することと、
(e)ステップ(d)で得られた前記尿試料中の前記磁性ナノ粒子を収集することと、
(f)ステップ(e)で得られた前記収集された磁性ナノ粒子からDNAを溶出緩衝剤で洗い流して、抽出DNAを得ることと、を含む、前記抽出することを含む、前記方法。
[102]
前記溶解溶液が、グアニジウムイソチオシアネート、Triton X-100、Tris-HCl、EDTA、及びイソプロパノールを含み、
前記グアニジウムイソチオシアネートが、約1~2Mの濃度を有し、
前記Triton X 100が、約1~2%の濃度を有し、
前記Tris-HClが、約5~10mMの濃度を有し、前記溶解溶液が、約6~7のpHを有し、
前記EDTAが、約3~5mMの濃度を有し、
かつ
前記イソプロパノールが、前記溶解溶液の約50%~80%(v/v)の体積を有する、前記[101]に記載の方法。
本開示は、例えば、以下に関する。
[1]
対象から得られる尿試料を保存するための組成物であって、前記組成物が、pH緩衝剤、キレート剤、及び界面活性剤を含む、前記組成物。
[2]
前記pH緩衝剤が、前記組成物のpHを、事前選択された範囲内に調整するように構成される、前記[1]に記載の組成物。
[3]
前記pH緩衝剤が、酢酸及び酢酸の塩を含む、前記[1]に記載の組成物。
[4]
前記酢酸の塩が、酢酸ナトリウムである、前記[3]に記載の組成物。
[5]
pHの前記事前選択された範囲が、約5.0~6.5である、前記[2]に記載の組成物。
[6]
前記組成物の前記pHが、約6.0である、前記[5]に記載の組成物。
[7]
前記酢酸ナトリウムが、約0.5~1.0mol/Lの濃度を有する、前記[4]に記載の組成物。
[8]
前記キレート剤が、アミノポリカルボン酸である、前記[1]に記載の組成物。
[9]
前記キレート剤が、エチレンジアミン四酢酸(EDTA)である、前記[8]に記載の組成物。
[10]
前記EDTAが、約10~25mmol/Lの濃度を有する、前記[8]に記載の組成物。
[11]
前記界面活性剤が、陰イオン界面活性剤である、前記[1]に記載の組成物。
[12]
前記陰イオン界面活性剤が、ドデシル水素スルファートの塩である、前記[11]に記載の組成物。
[13]
前記塩が、ナトリウム塩であり、前記陰イオン界面活性剤が、ドセシル硫酸ナトリウム(SDS)である、前記[11]に記載の組成物。
[14]
前記SDSが、約5%~10%(m/v)の濃度を有する、前記[1]に記載の組成物。
[15]
前記組成物が、防腐剤、細胞固定剤、またはホルムアルデヒド消光剤を含有しない、前記[1]に記載の組成物。
[16]
保存のための処理された尿試料であって、前記処理された尿試料が、対象から収集された尿試料、pH緩衝剤、キレート剤、及び界面活性剤を含む、前記処理された尿試料。
[17]
前記pH緩衝剤が、組成物のpHを、事前選択された範囲内に調整するように構成される、前記[16]に記載の保存のための処理された尿試料。
[18]
前記pH緩衝剤が、酢酸及び酢酸の塩を含む、前記[16]に記載の保存のための処理された尿試料。
[19]
前記酢酸の塩が、酢酸ナトリウムである、前記[18]に記載の保存のための処理された尿試料。
[20]
pHの前記事前選択された範囲が、約5.0~6.5である、前記[17]に記載の保存のための処理された尿試料。
[21]
前記組成物の前記pHが、約6.0である、前記[20]に記載の保存のための処理された尿試料。
[22]
前記処理された尿試料中の前記酢酸ナトリウムが、約0.05~0.1mol/Lの濃度を有する、前記[19]に記載の保存のための処理された尿試料。
[23]
前記キレート剤が、アミノポリカルボン酸である、前記[1]に記載の保存のための処理された尿試料。
[24]
前記キレート剤が、エチレンジアミン四酢酸(EDTA)である、前記[23]に記載の保存のための処理された尿試料。
[25]
前記EDTAが、約1~2.5mmol/Lの濃度を有する、前記[24]に記載の保存のための処理された尿試料。
[26]
前記界面活性剤が、陰イオン界面活性剤である、前記[16]に記載の保存のための処理された尿試料。
[27]
前記陰イオン界面活性剤が、ドデシル水素スルファートの塩である、前記[26]に記載の保存のための処理された尿試料。
[28]
前記塩が、ナトリウム塩であり、前記陰イオン界面活性剤が、ドセシル硫酸ナトリウム(SDS)である、前記[26]に記載の保存のための処理された尿試料。
[29]
前記SDSが、約0.5%~1.5%(m/v)の濃度を有する、前記[16]に記載の保存のための処理された尿試料。
[30]
前記処理された尿試料が、防腐剤、細胞固定剤、またはホルムアルデヒド消光剤を含有しない、前記[16]に記載の処理された尿試料。
[31]
保存のための処理された尿試料を生成するための方法であって、対象から収集された尿試料を、pH緩衝剤、キレート剤、及び界面活性剤と、または前記[1]~[15]のいずれか一項に記載の組成物と、混合することを含む、前記方法。
[32]
前記pH緩衝剤が、酢酸及び酢酸ナトリウムを含む、前記[31]に記載の方法。
[33]
前記処理された尿試料中の前記酢酸ナトリウムが、約0.05~0.1mol/Lの濃度を有する、前記[32]に記載の方法。
[34]
前記キレート剤が、EDTAである、前記[31]に記載の方法。
[35]
前記処理された尿試料中の前記EDTAが、約1~2.5mmol/Lの濃度を有する、前記[34]に記載の方法。
[36]
前記界面活性剤が、SDSである、前記[31]に記載の方法。
[37]
前記処理された尿試料中の前記SDSが、約0.5%~1.5%(m/v)の濃度を有する、前記[36]に記載の方法。
[38]
対象から収集された尿試料を保存するための方法であって、前記対象から収集された前記尿試料を、pH緩衝剤、キレート剤、及び界面活性剤と混合して、保存の準備ができた尿試料を生成することを含む、前記方法。
[39]
前記pH緩衝剤、前記キレート剤、及び前記界面活性剤が、それらが前記対象から収集された前記尿試料と混合される前に、混合物で提供される、前記[38]に記載の方法。
[40]
前記pH緩衝剤が、組成物のpHを、事前選択された範囲内に調整するように構成される、前記[39]に記載の方法。
[41]
前記pH緩衝剤が、酢酸及び酢酸の塩を含む、前記[38]に記載の方法。
[42]
前記酢酸の塩が、酢酸ナトリウムである、前記[41]に記載の方法。
[43]
pHの前記事前選択された範囲が、約5.0~6.5である、前記[40]に記載の方法。
[44]
前記組成物の前記pHが、約6.0である、前記[43]に記載の方法。
[45]
前記保存の準備ができた尿試料中の前記酢酸ナトリウムが、約0.05~0.1mol/Lの濃度を有する、前記[42]に記載の方法。
[46]
前記キレート剤が、アミノポリカルボン酸である、前記[38]に記載の方法。
[47]
前記キレート剤が、エチレンジアミン四酢酸(EDTA)である、前記[46]に記載の方法。
[48]
前記保存の準備ができた尿試料中の前記EDTAが、約1~2.5mmol/Lの濃度を有する、前記[47]に記載の方法。
[49]
前記界面活性剤が、陰イオン界面活性剤である、前記[38]に記載の方法。
[50]
前記陰イオン界面活性剤が、ドデシル水素スルファートの塩である、前記[49]に記載の方法。
[51]
前記塩が、ナトリウム塩であり、前記陰イオン界面活性剤が、ドセシル硫酸ナトリウム(SDS)である、前記[50]に記載の方法。
[52]
前記保存の準備ができた尿試料中の前記SDSが、約0.5%~1.5%(m/v)の濃度を有する、前記[51]に記載の方法。
[53]
前記保存の準備ができた尿試料が、防腐剤、細胞固定剤、またはホルムアルデヒド消光剤を含有しない、前記[38]に記載の方法。
[54]
前記対象から収集された前記尿試料が、前記対象の細胞及び少なくとも1つのウイルス病原体を含有し、前記細胞及び前記ウイルス病原体の両方が、前記尿試料が保存の準備ができた後に溶解される、前記[38]に記載の方法。
[55]
前記ウイルス病原体が、ヒトパピローマウイルス(HPV)である、前記[54]に記載の方法。
[56]
前記保存の準備ができた尿試料を、4℃で保存することを含む、前記[38]に記載の方法。
[57]
前記保存の準備ができた尿試料を、室温で保存することを含む、前記[38]に記載の方法。
[58]
前記尿試料中のDNA含有量が、15日~30日の保存期間後に安定している、前記[56]に記載の方法。
[59]
前記尿試料中のDNA含有量が、1週間~2週間の保存期間後に安定している、前記[57]に記載の方法。
[60]
対象から収集された尿試料中の1つ以上の分析物の存在または不在を検出するための方法であって、前記方法が、前記[16]~[30]のいずれか一項に記載の処理された尿試料を使用することを含む、前記方法。
[61]
前記分析物が、ウイルスである、前記[60]に記載の方法。
[62]
前記ウイルスが、HPVである、前記[61]に記載の方法。
[63]
前記分析物の前記検出が、前記ウイルスのDNAを検出することを含む、前記[61]に記載の方法。
[64]
対象の尿試料からDNAを抽出するためのキットであって、前記キットが、溶解溶液、磁性ナノ粒子、プロテアーゼ、第1の洗浄緩衝剤、第2の洗浄緩衝剤、溶出緩衝剤、またはそれらの任意の組み合わせを含む、前記キット。
[65]
前記溶解溶液が、グアニジウムイソチオシアネート、Triton X 100、Tris-HCl、EDTA、またはそれらの任意の組み合わせを含む、前記[64]に記載のキット。
[66]
前記グアニジウムイソチオシアネートが、約2~6Mの濃度を有するか、前記Triton X-100が、約1~5%の濃度を有するか、前記Tris-HClが、約20~50mMの濃度を有するか、前記溶解溶液が、約6.5のpHを有するか、前記EDTAが、約10~50mMの濃度を有するか、またはそれらの任意の組み合わせである、前記[65]に記載のキット。
[67]
前記溶解溶液が、グアニジウムイソチオシアネート、Triton X-100、Tris-HCl、及びEDTAを含む、前記[66]に記載のキット。
[68]
前記溶解溶液が、イソプロパノールをさらに含む、前記[66]に記載のキット。
[69]
イソプロパノールの用量が、約50%~200%(v/v)である、前記[68]に記載のキット。
[70]
前記グアニジウムイソチオシアネートが、約1~2Mの濃度を有するか、前記Triton X-100が、約1~2%の濃度を有するか、前記Tris-HClが、約5~10mMの濃度を有するか、前記溶解溶液が、約6~7のpHを有するか、前記EDTAが、約3~5mMの濃度を有するか、前記イソプロパノールが、前記溶解溶液の約50%~80%の体積を有するか、またはそれらの任意の組み合わせである、前記[69]に記載のキット。
[71]
前記磁性ナノ粒子が、内側コア層及び外側シェル層を有し、前記内側コア層が、コアシェル型磁性ナノ粒子で構成され、前記外側シェル層が、SiO 2 で構成される、前記[64]に記載のキット。
[72]
前記磁性ナノ粒子が、約100~1000nmの直径、及び約50mg/mlの濃度を有する、前記[71]に記載のキット。
[73]
前記磁性ナノ粒子が、約10~20μLの体積を有する、前記[72]に記載のキット。
[74]
前記第1の洗浄緩衝剤が、グアニジウムイソチオシアネート、Tris-HCl、NaCl、及びエタノールを含む、前記[64]に記載のキット。
[75]
前記グアニジウムイソチオシアネートが、約50mMの濃度を有する、前記[74]に記載のキット。
[76]
前記Tris-HClが、約20~50mMの濃度を有する、前記[74]に記載のキット。
[77]
前記第1の洗浄緩衝剤が、約5.0のpHを有する、前記[76]に記載のキット。
[78]
前記NaClが、約50~200mMの濃度を有する、前記[74]に記載のキット。
[79]
前記エタノールが、約40%~60%(v/v)の濃度を有する、前記[74]に記載のキット。
[80]
前記第2の洗浄緩衝剤が、Tris-HCl及びエタノールを含む、前記[64]に記載のキット。
[81]
前記第2の洗浄緩衝剤中の前記Tris-HClが、約10~50mMの濃度を有し、前記第2の洗浄緩衝剤が、約6.0のpHを有する、前記[80]に記載のキット。
[82]
前記エタノールが、約70%~80%(v/v)の濃度を有する、前記[80]に記載のキット。
[83]
前記溶出緩衝剤が、約8.0のpHを有するTris-EDTA緩衝剤である、前記[64]に記載のキット。
[84]
前記プロテアーゼが、プロテアーゼKである、前記[64]に記載のキット。
[85]
前記プロテアーゼKが、約10~20mg/mlの濃度を有する、前記[84]に記載のキット。
[86]
前記プロテアーゼKが、約2.5~25μgの用量を有する、前記[85]に記載のキット。
[87]
対象の尿試料からDNAを抽出するための方法であって、前記[64]~[86]のいずれか一項に記載のキットを使用することを含む、前記方法。
[88]
対象の尿試料からDNAを抽出するための方法であって、
(1)前記尿試料を磁性ナノ粒子及びプロテアーゼと接触させて、前処理された尿試料を生成することと、
(2)ステップ(1)で得られた前記前処理された尿試料を、溶解溶液に溶解して、溶解した尿試料を生成することと、
(3)ステップ(2)で得られた前記磁性ナノ粒子を、第1の洗浄緩衝剤で洗浄することと、
(4)ステップ(3)で得られた前記磁性ナノ粒子を、第2の洗浄緩衝剤で洗浄することと、
(5)ステップ(4)で得られた前記尿試料中の前記磁性ナノ粒子を収集することと、
(6)ステップ(5)で得られた前記収集された磁性ナノ粒子からDNAを溶出緩衝剤で洗い流して、抽出されたDNAを得ることと、を含む、前記方法。
[89]
前記溶解溶液が、グアニジウムイソチオシアネート、Triton X-100、Tris-HCl、EDTA、及びイソプロパノールを含み、
前記グアニジウムイソチオシアネートが、約1~2Mの濃度を有し、
前記Triton X 100が、約1~2%の濃度を有し、
前記Tris-HClが、約5~10mMの濃度を有し、前記溶解溶液が、約6~7のpHを有し、
前記EDTAが、約3~5mMの濃度を有し、
かつ
前記イソプロパノールが、前記溶解溶液の約50%~80%(v/v)の体積を有する、前記[88]に記載の方法。
[90]
前記磁性ナノ粒子が、内側コア層及び外側シェル層を有し、前記内側コア層が、コアシェル型磁性ナノ粒子で構成され、前記外側シェル層が、SiO 2 で構成され、前記磁性ナノ粒子が、100~1000nmの直径、及び約50mg/mlの濃度を有する、前記[88]に記載の方法。
[91]
前記第1の洗浄緩衝剤が、グアニジウムイソチオシアネート、Tris-HCl、NaCl、及びエタノールを含み、
前記グアニジウムイソチオシアネートが、約50~100mMの濃度を有し、
前記Tris-HClが、約20~50mMの濃度を有し、前記第1の洗浄緩衝剤が、約5.0のpHを有し、
前記NaClが、約50~200mMの濃度を有し、
前記エタノールが、約40%~60%(v/v)の濃度を有する、前記[88]に記載の方法。
[92]
前記第2の洗浄緩衝剤が、Tris-HCl及びエタノールを含み、
前記第2の洗浄緩衝剤中の前記Tris-HClが、約10~50mMの濃度を有し、
前記第2の洗浄緩衝剤が、約6.0のpHを有し、かつ
前記エタノールが、約70%~80%(v/v)の濃度を有する、前記[88]に記載の方法。
[93]
前記溶出緩衝剤が、約8.0のpHを有するTris-EDTA緩衝剤である、前記[88]に記載の方法。
[94]
前記プロテアーゼが、プロテアーゼKであり、前記プロテアーゼKが、約10~20mg/mlの濃度を有する、前記[88]に記載の方法。
[95]
ステップ(1)が、
(a)前記尿試料を、前記磁性ナノ粒子と接触させて、混合物を形成することと、
(b)前記混合物を遠心分離するか、または磁性分離デバイスを利用して、沈殿物及び上清を生成することと、
(c)前記沈殿物を前記プロテアーゼと接触させて、反応系を生成することと、
(d)前記反応系を、好適な条件下で事前に決定された時間加熱することと、を含む、前記[88]に記載の方法。
[96]
ステップ(3)、(4)、及び/または(6)が、磁性フレームまたは自動核酸抽出機器を使用することを含む、前記[88]に記載の方法。
[97]
対象から収集された尿試料中の分析物の存在または不在を検出するための方法であって、前記方法が、前記[85]または[86]に記載のキットを使用して、前記尿試料から抽出されたDNAを使用することを含む、前記方法。
[98]
前記分析物が、ウイルスである、前記[97]に記載の方法。
[99]
前記ウイルスが、HPVである、前記[98]に記載の方法。
[100]
前記分析物の前記検出が、前記ウイルスのDNAを検出することを含む、前記[98]に記載の方法。
[101]
対象から収集された尿試料中の分析物の存在または不在を検出するための方法であって、前記方法が、
(1)前記[16]~[30]のいずれか一項に記載の処理された尿試料を使用すること、ならびに
(2)前記処理された尿試料からDNAを抽出することであって、
(a)前記尿試料を磁性ナノ粒子及びプロテアーゼと接触させて、前処理された尿試料を生成することと、
(b)ステップ(a)で得られた前記前処理された尿試料を、溶解溶液に溶解して、溶解した尿試料を生成することと、
(c)ステップ(b)で得られた前記磁性ナノ粒子を、第1の洗浄緩衝剤で洗浄することと、
(d)ステップ(c)で得られた前記磁性ナノ粒子を、第2の洗浄緩衝剤で洗浄することと、
(e)ステップ(d)で得られた前記尿試料中の前記磁性ナノ粒子を収集することと、
(f)ステップ(e)で得られた前記収集された磁性ナノ粒子からDNAを溶出緩衝剤で洗い流して、抽出DNAを得ることと、を含む、前記抽出することを含む、前記方法。
[102]
前記溶解溶液が、グアニジウムイソチオシアネート、Triton X-100、Tris-HCl、EDTA、及びイソプロパノールを含み、
前記グアニジウムイソチオシアネートが、約1~2Mの濃度を有し、
前記Triton X 100が、約1~2%の濃度を有し、
前記Tris-HClが、約5~10mMの濃度を有し、前記溶解溶液が、約6~7のpHを有し、
前記EDTAが、約3~5mMの濃度を有し、
かつ
前記イソプロパノールが、前記溶解溶液の約50%~80%(v/v)の体積を有する、前記[101]に記載の方法。
Claims (31)
- 対象から得られる尿試料を保存するための組成物であって、前記組成物が、pH緩衝剤、キレート剤、及び界面活性剤を含み、前記pH緩衝剤が前記組成物のpHを約5.0~6.5に調整するように構成され、前記キレート剤がアミノポリカルボン酸であり、前記界面活性剤が陰イオン界面活性剤である、前記組成物。
- 前記pH緩衝剤が、酢酸及び酢酸の塩を含む、請求項1に記載の組成物。
- 前記酢酸の塩が、酢酸ナトリウムである、請求項2に記載の組成物。
- 前記組成物の前記pHが、約6.0である、請求項1に記載の組成物。
- 前記酢酸ナトリウムが、約0.5~1.0mol/Lの濃度を有する、請求項3に記載の組成物。
- 前記キレート剤が、エチレンジアミン四酢酸(EDTA)である、請求項1に記載の組成物。
- 前記EDTAが、約10~25mmol/Lの濃度を有する、請求項6に記載の組成物。
- 前記陰イオン界面活性剤が、ドデシル水素スルファートの塩である、請求項1に記載の組成物。
- 前記陰イオン界面活性剤が、ドセシル硫酸ナトリウム(SDS)である、請求項8に記載の組成物。
- 前記SDSが、約5%~10%(m/v)の濃度を有する、請求項9に記載の組成物。
- 前記組成物が、防腐剤、細胞固定剤、またはホルムアルデヒド消光剤を含有しない、請求項1に記載の組成物。
- 保存のための処理された尿試料であって、前記処理された尿試料が、対象から収集された尿試料、及び請求項1~11のいずれかに記載の組成物を含む、前記処理された尿試料。
- 前記pH緩衝剤が酢酸及び酢酸ナトリウムを含み、前記処理された尿試料中の前記酢酸ナトリウムが、約0.05~0.1mol/Lの濃度を有する、請求項12に記載の保存のための処理された尿試料。
- 前記キレート剤がEDTAであり、前記EDTAが、約1~2.5mmol/Lの濃度を有する、請求項12または13に記載の保存のための処理された尿試料。
- 前記陰イオン界面活性剤がドセシル硫酸ナトリウム(SDS)であり、前記SDSが、約0.5%~1.5%(m/v)の濃度を有する、請求項12~15のいずれかに記載の保存のための処理された尿試料。
- 前記処理された尿試料が、防腐剤、細胞固定剤、またはホルムアルデヒド消光剤を含有しない、請求項12~15のいずれかに記載の処理された尿試料。
- 保存のための処理された尿試料を生成するための方法であって、対象から収集された尿試料を、請求項1~11のいずれか一項に記載の組成物と、混合することを含む、前記方法。
- 対象から収集された尿試料を保存するための方法であって、前記対象から収集された前記尿試料を、請求項1~11のいずれか一項に記載の組成物と混合することを含む、前記方法。
- 前記対象から収集された前記尿試料が、前記対象の細胞及び少なくとも1つのウイルス病原体を含有し、前記細胞及び前記ウイルス病原体の両方が、前記尿試料が保存の準備ができた後に溶解される、請求項18に記載の方法。
- 前記ウイルス病原体が、ヒトパピローマウイルス(HPV)である、請求項19に記載の方法。
- 前記保存の準備ができた尿試料を、4℃で保存することを含み、前記尿試料中のDNA含有量が、15日~30日の保存期間後に安定している、請求項19に記載の方法。
- 前記保存の準備ができた尿試料を、室温で保存することを含み、前記尿試料中のDNA含有量が1週間~2週間の保存期間後に安定している、請求項19に記載の方法。
- 対象から収集された尿試料中の1つ以上の分析物の存在または不在を検出するための方法であって、前記方法が、請求項12~16のいずれか一項に記載の処理された尿試料を使用することを含む、前記方法。
- 前記分析物が、ウイルスである、請求項23に記載の方法。
- 前記ウイルスが、HPVである、請求項24に記載の方法。
- 前記分析物の前記検出が、前記ウイルスのDNAを検出することを含む、請求項24に記載の方法。
- 対象の尿試料からDNAを抽出するためのキットであって、前記キットが、溶解溶液、磁性ナノ粒子、プロテアーゼ、第1の洗浄緩衝剤、第2の洗浄緩衝剤、溶出緩衝剤、またはそれらの任意の組み合わせを含む、前記キット。
- (a)前記溶解溶液が、グアニジウムイソチオシアネート、Triton X 100、Tris-HCl、EDTA、またはそれらの任意の組み合わせを含み、
(b)第1の洗浄緩衝剤が、グアニジウムイソチオシアネート、Tris-HCl、NaClおよびエタノールを含み、および/または
(c)溶出緩衝剤が、Tris-EDTA緩衝剤である、請求項27に記載のキット。 - 対象の尿試料からDNAを抽出するための方法であって、請求項27または28に記載のキットを使用することを含む、前記方法。
- 対象から収集された尿試料中の分析物の存在または不在を検出するための方法であって、前記方法が、
(1)請求項12~16のいずれか一項に記載の処理された尿試料を使用すること、ならびに
(2)前記処理された尿試料からDNAを抽出することであって、
(a)前記尿試料を磁性ナノ粒子及びプロテアーゼと接触させて、前処理された尿試料を生成することと、
(b)ステップ(a)で得られた前記前処理された尿試料を、溶解溶液に溶解して、溶解した尿試料を生成することと、
(c)ステップ(b)で得られた前記磁性ナノ粒子を、第1の洗浄緩衝剤で洗浄することと、
(d)ステップ(c)で得られた前記磁性ナノ粒子を、第2の洗浄緩衝剤で洗浄することと、
(e)ステップ(d)で得られた前記尿試料中の前記磁性ナノ粒子を収集することと、
(f)ステップ(e)で得られた前記収集された磁性ナノ粒子からDNAを溶出緩衝剤で洗い流して、抽出DNAを得ることと、を含む、前記抽出することを含む、前記方法。 - 前記溶解溶液が、グアニジウムイソチオシアネート、Triton X-100、Tris-HCl、EDTA、及びイソプロパノールを含み、
前記グアニジウムイソチオシアネートが、約1~2Mの濃度を有し、
前記Triton X 100が、約1~2%の濃度を有し、
前記Tris-HClが、約5~10mMの濃度を有し、前記溶解溶液が、約6~7のpHを有し、
前記EDTAが、約3~5mMの濃度を有し、
かつ
前記イソプロパノールが、前記溶解溶液の約50%~80%(v/v)の体積を有する、請求項30に記載の方法。
Applications Claiming Priority (3)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
CNPCT/CN2019/070276 | 2019-01-03 | ||
CN2019070276 | 2019-01-03 | ||
PCT/CN2020/070292 WO2020140975A1 (en) | 2019-01-03 | 2020-01-03 | Compositions and methods for urine sample storage and dna extraction |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JP2022516175A JP2022516175A (ja) | 2022-02-24 |
JPWO2020140975A5 true JPWO2020140975A5 (ja) | 2023-01-19 |
Family
ID=71407294
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2021538800A Pending JP2022516175A (ja) | 2019-01-03 | 2020-01-03 | 尿試料保存及びdna抽出のための組成物ならびに方法 |
Country Status (11)
Country | Link |
---|---|
US (1) | US20220081705A1 (ja) |
EP (1) | EP3906319A4 (ja) |
JP (1) | JP2022516175A (ja) |
KR (1) | KR20210111250A (ja) |
CN (1) | CN111902545A (ja) |
AU (1) | AU2020205015A1 (ja) |
BR (1) | BR112021012224A2 (ja) |
CA (1) | CA3119928A1 (ja) |
SG (1) | SG11202106788UA (ja) |
TW (2) | TWI766225B (ja) |
WO (1) | WO2020140975A1 (ja) |
Families Citing this family (9)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US20230348888A1 (en) * | 2020-05-04 | 2023-11-02 | Mcmaster University | Molecular transport for viral agents |
CN114574486B (zh) * | 2020-12-01 | 2024-04-16 | 中国科学院大连化学物理研究所 | 作用于OPLAH的siRNA、DNA及构建物和应用 |
CN112592961A (zh) * | 2021-01-07 | 2021-04-02 | 山东科硕生物技术有限公司 | 一种核酸样本保存液及其制备方法和应用 |
US20220315992A1 (en) * | 2021-04-06 | 2022-10-06 | ID Match, LLC | Method for identification of urine drug testing sample |
CN115521996A (zh) * | 2021-10-25 | 2022-12-27 | 杭州诺辉健康科技有限公司 | 用于鼻咽癌诊断的试剂和方法 |
CN114959111A (zh) * | 2022-05-07 | 2022-08-30 | 英科新创(苏州)生物科技有限公司 | 用于快速检测猫瘟病毒的试剂或试剂盒、其应用及检测方法 |
CN114875022B (zh) * | 2022-05-31 | 2024-01-19 | 圣湘生物科技股份有限公司 | 尿液保存液、保存方法和尿液保存管 |
CN115901401B (zh) * | 2023-01-09 | 2023-05-26 | 深圳市森盈生物科技有限公司 | 一种p16免疫细胞化学染色试剂盒及染色方法 |
CN116891849B (zh) * | 2023-09-11 | 2023-11-17 | 成都斯马特科技有限公司 | 一种快速从鼻咽拭子中提取核酸的试剂盒及提取方法 |
Family Cites Families (14)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
EP1510577A1 (en) * | 2003-08-29 | 2005-03-02 | Qiagen GmbH | Method for magnetic bead isolation of nucleic acids |
JP2008509226A (ja) * | 2004-05-24 | 2008-03-27 | ジェンボールト コーポレイション | 回収可能な形式での安定なタンパク質保管および安定な核酸保管 |
CN101861164B (zh) * | 2007-08-09 | 2014-12-10 | 西尔万医药有限公司 | 朊病毒蛋白相关疾病的治疗 |
US8105840B2 (en) * | 2007-09-27 | 2012-01-31 | Niigata University | Urine pretreatment agent for urinary protein quantitation, urine pretreatment method, and urinary protein quantitation method |
US9480966B2 (en) * | 2012-04-30 | 2016-11-01 | General Electric Company | Substrates and methods for collection, stabilization and elution of biomolecules |
CN105368820A (zh) * | 2015-12-22 | 2016-03-02 | 南京先进激光技术研究院 | 一种基于磁珠法的全血dna提取试剂盒及其应用 |
CN105506129B (zh) * | 2016-01-01 | 2019-03-15 | 广州邦德盛生物科技有限公司 | 一种rna类样本保存稀释液及其制备 |
CN106754880A (zh) * | 2016-12-26 | 2017-05-31 | 广州和实生物技术有限公司 | 尿液核酸快速提取试剂盒 |
CN106967712B (zh) * | 2017-05-12 | 2020-08-07 | 广州和实生物技术有限公司 | 粪便dna快速提取试剂盒 |
CN107058296B (zh) * | 2017-05-27 | 2018-09-25 | 山东森芃生物科技有限公司 | 土壤尿液dna提取试剂盒及方法 |
CN107267500A (zh) * | 2017-07-17 | 2017-10-20 | 北京安必奇生物科技有限公司 | 一种游离dna保存液及其制备方法和应用 |
CN109022417A (zh) * | 2018-08-13 | 2018-12-18 | 益善生物技术股份有限公司 | 一种磁珠法核酸提取转化试剂盒及其使用方法 |
CN110283818A (zh) * | 2019-07-31 | 2019-09-27 | 杭州艾迪康医学检验中心有限公司 | 一种磁珠法提取血浆游离dna的试剂盒和方法 |
CN110699429B (zh) * | 2019-11-25 | 2023-04-07 | 宁波艾捷康宁生物科技有限公司 | 一种尿液dna提取保存液、尿液保存管、提取试剂盒和提取方法 |
-
2020
- 2020-01-03 KR KR1020217019241A patent/KR20210111250A/ko not_active Application Discontinuation
- 2020-01-03 TW TW109100210A patent/TWI766225B/zh active
- 2020-01-03 BR BR112021012224-9A patent/BR112021012224A2/pt unknown
- 2020-01-03 JP JP2021538800A patent/JP2022516175A/ja active Pending
- 2020-01-03 EP EP20736063.7A patent/EP3906319A4/en active Pending
- 2020-01-03 US US17/420,444 patent/US20220081705A1/en active Pending
- 2020-01-03 WO PCT/CN2020/070292 patent/WO2020140975A1/en unknown
- 2020-01-03 CA CA3119928A patent/CA3119928A1/en active Pending
- 2020-01-03 SG SG11202106788UA patent/SG11202106788UA/en unknown
- 2020-01-03 TW TW111118874A patent/TW202233846A/zh unknown
- 2020-01-03 AU AU2020205015A patent/AU2020205015A1/en active Pending
- 2020-01-03 CN CN202080000356.9A patent/CN111902545A/zh active Pending
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
WO2021258735A1 (zh) | 一种病毒保存液 | |
DE69734263T2 (de) | Verfahren zur Isolierung von Ribonucleinsäuren. | |
Bean Jr et al. | Primary transcription of the influenza virus genome in permissive cells | |
AU2009278915B2 (en) | Isolation of nucleic acid | |
JPWO2020140975A5 (ja) | ||
US9487550B2 (en) | Method of isolating purified RNA with reduced DNA contaminations | |
JPH0515373A (ja) | ヒトゲノムdnaの抽出および精製方法 | |
CN113462683B (zh) | 适用于多种样本核酸提取的无醇清洗液及核酸提取试剂盒 | |
CN112226432B (zh) | 一种磁珠法快速核酸提取试剂盒及其应用 | |
CN109504678A (zh) | 基于磁珠法进行核酸提取的试剂盒及应用 | |
EP3904532A1 (en) | Nucleic acid extraction composition, reagent and kit containing the same and use thereof | |
CN110257368A (zh) | 从含有游离核酸的样品中分离游离核酸的方法和系统 | |
Sorg et al. | Detection of Borna disease virus RNA in formalin-fixed, paraffin-embedded brain tissues by nested PCR | |
CN114621948A (zh) | 一种高效核酸提取试剂盒及其使用方法 | |
WO2020156049A1 (zh) | 一种提取液及其在保存组织或细胞、提取rna中的应用 | |
Abulafia et al. | Control of late simian virus 40 transcription by the attenuation mechanism and transcriptionally active ternary complexes are associated with the nuclear matrix | |
CN102206630A (zh) | 一种土壤和沉积物总dna提取方法及提取试剂盒 | |
CN103421764B (zh) | 一种真菌病毒双链rna快速提取试剂盒及其应用 | |
JP2007516729A5 (ja) | ||
Hart | Infectivity measurements of partially degraded tobacco mosaic virus | |
US20030003534A1 (en) | Methods and compositions for extracting proteins from cells | |
CN105296470A (zh) | 一种阿胶及其衍生产品高纯度dna的提取试剂盒及其提取方法 | |
RU2021122929A (ru) | Композиции и способы хранения образцов мочи и выделения днк | |
CN106929484A (zh) | 一种乙型肝炎病毒基因组dna的5‑乙炔基‑2’脱氧尿嘧啶核苷的标记和检测方法 | |
CN114657231A (zh) | 一种带磁珠进行荧光定量pcr检测的快速dna提取试剂盒及其提取方法 |