JPWO2017037829A1 - 高分子化合物の定量分析方法及び該定量分析のためのデータ処理装置 - Google Patents
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Abstract
Description
a)分析対象である又は分析対象として想定される高分子化合物について、該化合物由来でイオン価数が相違する複数のプリカーサイオン及び共通である一つのプロダクトイオンを対象とした複数のMRM測定によってそれぞれ得られた複数のマスクロマトグラムに現れるピークの面積を合計した合算値を算出するピーク情報取得ステップと、
b)前記ピーク情報取得ステップで得られた合算値を利用して、分析対象である又は分析対象として想定される高分子化合物の定量演算を行う定量ステップと、
を有することを特徴としている。
a)分析対象である又は分析対象として想定される高分子化合物について、該化合物由来でイオン価数が相違する複数のプリカーサイオン及び共通である一つのプロダクトイオンを対象とした複数のMRM測定によってそれぞれ得られた複数のマスクロマトグラムに現れるピークの面積を合計した合算値を算出するピーク情報取得部と、
b)前記ピーク情報取得部で得られた合算値を利用して、分析対象である又は分析対象として想定される高分子化合物の定量演算を行う定量処理部と、
を備えることを特徴としている。
例えば、N−結合型糖ペプチドや2−アミノピリジン等により標識された標識N−結合型糖鎖では、N−結合型糖鎖のコア構造(3Hex-2HexNac)に由来する、質量電荷比m/zが138であるプロダクトイオンを共通のプロダクトイオンとすればよい(特許文献1参照)。また、1−フェニル−3−メチル−5−ピラゾロン(1-phenyl-3-Methyl-5-pyrazolone=PMP)により標識されたPMP標識O−結合型糖鎖では、開裂によって優先的に脱離する完全体であるPMP由来の、質量電荷比m/zが175であるプロダクトイオンを共通のプロダクトイオンとすればよい。
前記試料は糖鎖又は糖ペプチドの混合物であり、
前記ピーク情報取得部は、前記試料に含まれる複数の糖鎖又は糖ペプチドの合算値を取得し、
前記定量処理部は、前記ピーク情報取得部で得られた任意の糖鎖又は糖ペプチドに対する合算値と、前記試料に含まれる複数の糖鎖又は糖ペプチドの合算値を合計した合計値とに基づいて、前記任意の糖鎖又は糖ペプチドの存在量比を求め、
前記定量処理部で得られた任意の糖鎖又は糖ペプチドの存在量比を表示部の画面上にグラフ形式又は表形式で提示する定量結果提示部、をさらに備える構成とするとよい。
図1は、本発明に係るデータ処理装置を含む、本実施例の定量分析装置の概略構成図である。
具体的には、分析者が入力部4で所定の操作を行うと、測定対象設定部300は様々な糖鎖の構造のリストを表示部5の画面上に表示する。分析者はそのリストの中から試料に含まれていると想定される複数の糖鎖構造を選択し、それぞれについて複数のイオン価数を入力する。糖鎖構造毎に質量は既知であるから、プリカーサm/z計算部301は、その質量と入力されたイオン価数とから、糖鎖構造毎に、該糖鎖由来のイオンの質量電荷比をプリカーサイオン質量電荷比として算出する。
例えば図4の例では、紐付け情報に基づいて、価数3、4の二つのMRMトランジションに対するマスクロマトグラムが同一の糖鎖由来であることが判明する。そこで、その二つのマスクロマトグラムにおいてそれぞれ求まるピーク面積を合計し、ピーク面積の合算値を求める。図5に示した例でも同様である。
20…液体クロマトグラフ
21…タンデム四重極型質量分析装置
3…制御・処理部
31…分析制御部
32…データ収集部
33…データ記憶部
34…クロマトグラム作成部
35…ピーク面積算出部
300…測定対象設定部
301…プリカーサm/z計算部
302…測定条件設定部
303…多価イオン情報ファイル作成部
304…多価イオン情報ファイル記憶部
305…メソッドファイル作成部
306…メソッドファイル記憶部
310…多価イオン定量演算部
311…ピーク面積合算部
312…定量値算出部
313…定量出力情報作成部
4…入力部
5…表示部
Claims (7)
- MS/MS分析が可能である質量分析装置を利用して試料中の高分子化合物を定量する定量分析方法であって、
a)分析対象である又は分析対象として想定される高分子化合物について、該化合物由来でイオン価数が相違する複数のプリカーサイオン及び共通である一つのプロダクトイオンを対象とした複数のMRM測定によってそれぞれ得られた複数のマスクロマトグラムに現れるピークの面積を合計した合算値を算出するピーク情報取得ステップと、
b)前記ピーク情報取得ステップで得られた合算値を利用して、分析対象である又は分析対象として想定される高分子化合物の定量演算を行う定量ステップと、
を有することを特徴とする高分子化合物の定量分析方法。 - 請求項1に記載の高分子化合物の定量分析方法であって、
前記高分子化合物は糖鎖又は糖ペプチドであることを特徴とする高分子化合物の定量分析方法。 - 請求項2に記載の高分子化合物の定量分析方法であって、
前記試料は糖鎖又は糖ペプチドの混合物であり、
前記ピーク情報取得ステップでは、前記試料に含まれる複数の糖鎖又は糖ペプチドの合算値を取得し、
前記定量ステップでは、前記ピーク情報取得ステップで得られた任意の糖鎖又は糖ペプチドに対する合算値と、前記試料に含まれる複数の糖鎖又は糖ペプチドの合算値を合計した合計値とに基づいて、前記任意の糖鎖又は糖ペプチドの存在量比を求め、
前記定量ステップで得られた任意の糖鎖又は糖ペプチドの存在量比を表示部の画面上にグラフ形式又は表形式で提示する定量結果提示ステップをさらに有することを特徴とする高分子化合物の定量分析方法。 - 請求項1〜3のいずれか1項に記載の高分子化合物の定量分析方法であって、
前記質量分析装置の前段に液体クロマトグラフを接続した液体クロマトグラフ質量分析装置を用いて試料中の高分子化合物を測定することを特徴とする高分子化合物の定量分析方法。 - MS/MS分析が可能である質量分析装置を用いて得られたデータに基づいて試料中の高分子化合物を定量するデータ処理装置であって、
a)分析対象である又は分析対象として想定される高分子化合物について、該化合物由来でイオン価数が相違する複数のプリカーサイオン及び共通である一つのプロダクトイオンを対象とした複数のMRM測定によってそれぞれ得られた複数のマスクロマトグラムに現れるピークの面積を合計した合算値を算出するピーク情報取得部と、
b)前記ピーク情報取得部で得られた合算値を利用して、分析対象である又は分析対象として想定される高分子化合物の定量演算を行う定量処理部と、
を備えることを特徴とするデータ処理装置。 - 請求項5に記載のデータ処理装置であって、
前記高分子化合物は糖鎖又は糖ペプチドであることを特徴とするデータ処理装置。 - 請求項6に記載のデータ処理装置であって、
前記試料は糖鎖又は糖ペプチドの混合物であり、
前記ピーク情報取得部は、前記試料に含まれる複数の糖鎖又は糖ペプチドの合算値を取得し、
前記定量処理部は、前記ピーク情報取得部で得られた任意の糖鎖又は糖ペプチドに対する合算値と、前記試料に含まれる複数の糖鎖又は糖ペプチドの合算値を合計した合計値とに基づいて、前記任意の糖鎖又は糖ペプチドの存在量比を求め、
前記定量処理部で得られた任意の糖鎖又は糖ペプチドの存在量比を表示部の画面上にグラフ形式又は表形式で提示する定量結果提示部、をさらに備えることを特徴とするデータ処理装置。
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