JPWO2016076364A1 - 基質特異性が向上したフラビン結合型グルコースデヒドロゲナーゼ - Google Patents

基質特異性が向上したフラビン結合型グルコースデヒドロゲナーゼ Download PDF

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Abstract

D−グルコースに対する基質特異性が高く、D−キシロースへの反応性が低減したフラビン結合型グルコースデヒドロゲナーゼを提供する。Mucor属由来のフラビン結合型グルコースデヒドロゲナーゼの42位、83位、174位、367位、385位、386位、391位、460位、461位、467位および468位に対応する位置で1つまたはそれ以上のアミノ酸残基の置換を有するフラビン結合型グルコースデヒドロゲナーゼ。グルコースセンサー等の、多量の酵素を搭載した条件下で使用する場合においても、D−キシロースが共存したときの影響を受けにくく、D−グルコース量を正確に測定することができる。

Description

本発明は、基質特異性が向上したフラビン結合型グルコースデヒドロゲナーゼ、その遺伝子および組換え体DNA、並びに基質特異性が向上したフラビン結合型グルコースデヒドロゲナーゼの製造法に関する。
血中グルコース濃度(血糖値)は、糖尿病の重要なマーカーである。糖尿病患者が自己の血糖値を管理するための装置としては、電気化学的バイオセンサを用いた自己血糖測定(Self Monitoring of Blood Glucose:SMBG)機器が広く利用されている。SMBG機器に用いられるバイオセンサには、従来、グルコースオキシダーゼ(GOD)等のD−グルコースを基質とする酵素が利用されている。しかしながら、GODは酸素を電子受容体とするという特性を備えているため、GODを用いたSMBG機器では、測定サンプル中の溶存酸素が測定値に影響を与え、正確な測定値が得られない場合が起こりうる。
一方、D−グルコースを基質とするが、酸素を電子受容体としない別の酵素として、各種のグルコースデヒドロゲナーゼ(以下、GDH)が知られている。具体的には、ニコチンアミドジヌクレオチド(NAD)やニコチンアミドジヌクレオチドリン酸(NADP)を補酵素とするタイプのGDH(NAD(P)−GDH)や、ピロロキノリンキノン(PQQ)を補酵素とするGDH(PQQ−GDH)が見出されており、SMBG機器のバイオセンサに使用されている。しかしながら、NAD(P)−GDHは、酵素の安定性が乏しく、かつ、補酵素の添加が必要という問題を有し、また、PQQ−GDHは基質特異性が低く、測定対象であるD−グルコース以外にも、マルトース、D−ガラクトースおよびD−キシロースなどの糖化合物に対して作用してしまうため、測定サンプル中のD−グルコース以外の糖化合物が測定値に影響し、正確な測定値が得られないという問題点が存在する。
近年、PQQ−GDHをバイオセンサとして用いたSMBG機器を用いて、輸液投与を受けていた糖尿病患者の血糖値を測定する際に、PQQ−GDHが輸液中に含まれるマルトースにも作用して、実際の血糖値よりも高い測定値が得られ、この値に基づく処置が原因となって患者が低血糖等を発症した例が報告されている。また、同様の事象はガラクトース負荷試験およびキシロース吸収試験を実施中の患者にも起こり得ることも判明している(例えば、非特許文献1参照)。これを受け、厚生労働省医薬食品局は、D−グルコース溶液に各糖類を添加した場合における血糖測定値への影響を調査する目的で交差反応性試験を行ったところ、600mg/dLのマルトース、300mg/dLのD−ガラクトース、あるいは、200mg/dLのD−キシロース添加を行った場合には、PQQ−GDH法を用いた血糖測定キットの測定値は、実際のD−グルコース濃度より2.5〜3倍ほど高い値を示すことがわかった。すなわち、測定試料中に存在し得るマルトース、D−ガラクトース、D−キシロースにより測定値が不正確になることが判明し、このような測定誤差の原因となる糖化合物の影響を受けず、D−グルコースを特異的に測定可能な基質特異性の高いGDHの開発が切に望まれている。
上記のような背景の下、上記以外の補酵素を利用するタイプのGDHが着目されるようになってきている。例えば、非特許文献2〜5にはAspergillus oryzae由来のGDHについての報告があり、例えば、特許文献1〜3にはAspergillus属由来のフラビンアデニンジヌクレオチド(FAD)を補酵素とする、フラビン結合型グルコースデヒドロゲナーゼ(以下、FAD−GDH)が開示されている。
しかし、上記の酵素は、D−グルコースではない1種または数種の糖化合物に対して反応性が低いという特性を示すものの、マルトース、D−ガラクトース、D−キシロースのいずれに対しても反応性が十分に低いという特性を有してはいない。これらに対して、出願人は、ケカビの一種であるムコール(Mucor)属から見出されたFAD−GDHが、マルトース、D−ガラクトース、D−キシロースのいずれに対しても反応性が十分に低いという優れた特性を有することを見出している(例えば、特許文献4参照)。また、このGDHを用いれば、一定濃度範囲のマルトース、D−ガラクトース、D−キシロースが存在する条件下においても、それらの糖化合物による影響を受けることなくD−グルコース濃度を正確に測定することが可能であることを確認している(例えば、特許文献4参照)。このような優れた基質特異性は、Mucor属由来FAD−GDHの実用上の優位性を示す大きな特徴である。
一方で、自己血糖測定における利便性をより向上させるために、測定感度のさらなる向上による測定時間短縮化や、測定系のさらなる小スケール化、必要とされる測定サンプルの少量化等が継続的に追求されている。例えば、測定感度を向上させるための一手段としては、グルコースセンサー上に搭載するグルコース測定酵素の量を増加させることも想定される。しかしながら、このような使用法において予測される、多量の酵素が存在する条件下では、前述のMucor属由来FAD−GDHを用いた場合においても、一定濃度以上で存在するマルトースやD−キシロースへの反応性が若干ながら確認され、D−グルコース以外の糖化合物に対する反応性を低下させる取り組みにおいては、依然として改善の余地が存在する。
FAD−GDHの基質特異性を向上させることを目的として、既存のFAD−GDHを改変する試みとしては、Aspergillus属由来FAD−GDHに対してアミノ酸置換を導入することによりD−キシロースに対する作用性が低減したFAD−GDH改変体を得る方法が開示されている(例えば、特許文献5〜6参照)。しかしながら、Aspergillus属由来FAD−GDHは、天然型のMucor属由来FAD−GDHと比べてD−キシロースへの反応性がかなり高く、これまでに開示されているAspergillus属由来FAD−GDH改変体をもってしても、その基質特異性は十分であるとは言い難い。また、特許文献7では、Mucor属由来FAD−GDHに対してアミノ酸置換を導入することによりD−キシロース及びマルトースに対する作用性が低減したFAD−GDH改変体を得る方法が開示されているが、さらなる高い特異性を付与する試みは継続的に求められている。
一方で、高い比活性を持ったグルコース測定酵素はグルコースセンサー上に搭載するグルコース測定酵素の量を減らすことができるため、測定感度のさらなる向上による測定時間短縮化や、測定系のさらなる小スケール化、必要とされる測定サンプルの少量化等に有効であると考えられることから、比活性を維持したまま高い等異性を持つ酵素が求められている。
特開2007−289148号公報 特許第4494978号公報 国際公開第07/139013号 特許第4648993号公報 特開2008−237210号公報 国際公開第09/084616号 国際公開第13/065770号
医薬品・医療用具等安全性情報206号(Pharmaceuticals and Medical Devices Safety Information No.206)、2004年10月、厚生労働省医薬食品局 Studies on the glucose dehydrogenase of Aspergillus oryzae. I. Induction of its synthesis by p−benzoquinone and hydroquinone, T. C. Bak, and R. Sato, Biochim. Biophys. Acta, 139, 265−276 (1967). Studies on the glucose dehydrogenase of Aspergillus oryzae. II. Purification and physical and chemical properties, T.C. Bak, Biochim. Biophys. Acta, 139, 277−293 (1967). Studies on the glucose dehydrogenase of Aspergillus oryzae. III. General enzymatic properties, T.C. Bak, Biochim. Biophys. Acta, 146, 317−327 (1967). Studies on the glucose dehydrogenase of Aspergillus oryzae. IV. Histidyl residue as an active site, T.C. Bak, and R. Sato, Biochim. Biophys. Acta, 146, 328−335 (1967).
本発明では、D−グルコースに対する基質特異性に優れ、D−グルコース以外の糖化合物、例えば、D−キシロースやマルトース等に作用しにくく、D−グルコースの測定に用いたときに、これらのD−グルコース以外の糖化合物が共存したときにも影響を受けにくい新規なFAD−GDHを提供することを課題とする。
本発明者らは、前記課題解決のために鋭意研究を重ねた結果、Mucor属由来FAD−GDHにおける特定のアミノ酸残基を置換することによって得られる改変型FAD−GDHが、D−グルコースに対する特異性に優れ、D−キシロースやマルトースに作用しにくく、これらのD−グルコース以外の糖化合物が共存したときの影響を受けにくいことを見出し、本発明を完成した。
すなわち、本発明は以下の通りである。
(1) 配列番号1で示されるアミノ酸配列、または該アミノ酸配列と70%以上同一なアミノ酸配列、又は該アミノ酸配列において1もしくは数個アミノ酸が欠失、置換もしくは付加されたアミノ酸配列を有し、
配列番号1記載のアミノ酸配列における42位のアラニンに対応する位置、
配列番号1記載のアミノ酸配列における83位のバリンに対応する位置、
配列番号1記載のアミノ酸配列における174位のセリンに対応する位置、
配列番号1記載のアミノ酸配列における367位のスレオニンに対応する位置、
配列番号1記載のアミノ酸配列における385位のアラニンに対応する位置、
配列番号1記載のアミノ酸配列における386位のスレオニンに対応する位置、
配列番号1記載のアミノ酸配列における391位のロイシンに対応する位置、
配列番号1記載のアミノ酸配列における460位のフェニルアラニンに対応する位置、
配列番号1記載のアミノ酸配列における461位のスレオニンに対応する位置、
配列番号1記載のアミノ酸配列における467位のセリンに対応する位置、および配列番号1記載のアミノ酸配列における468位のグリシンに対応する位置よりなる群から選択されるアミノ酸に対応する位置で1つまたはそれ以上のアミノ酸置換を有し、前記置換を行う前と比較して、D−グルコースへの反応性に対するD−キシロースへの反応性の割合(Xyl/Glc(%))が低減していることを特徴とする、フラビン結合型グルコースデヒドロゲナーゼ。
(2) 配列番号1で示されるアミノ酸配列、または該アミノ酸配列と90%以上同一なアミノ酸配列、又は該アミノ酸配列において1もしくは数個アミノ酸が欠失、置換もしくは付加されたアミノ酸配列に対応する位置のアミノ酸が、
配列番号1記載のアミノ酸配列における42位のアラニンに対応する位置のアミノ酸がグリシンであるか、
配列番号1記載のアミノ酸配列における83位のバリンに対応する位置のアミノ酸がアラニン、グリシンのいずれかであるか、
配列番号1記載のアミノ酸配列における174位のセリンに対応する位置のアミノ酸がプロリン、ロイシンのいずれかであるか、
配列番号1記載のアミノ酸配列における367位のスレオニンに対応する位置のアミノ酸がアラニン、セリン、アスパラギンのいずれかであるか、
配列番号1記載のアミノ酸配列における385位のアラニンに対応する位置のアミノ酸が、スレオニン、アスパラギン酸、アルギニンのいずれかであるか、
配列番号1記載のアミノ酸配列における386位のスレオニンに対応する位置のアミノ酸がバリン、イソロイシン、グリシン、ロイシン、グルタミン酸、グルタミン、アスパラギン、セリンのいずれかであるか、
配列番号1記載のアミノ酸配列における391位のロイシンに対応する位置のアミノ酸がバリンであるか、
配列番号1記載のアミノ酸配列における460位のフェニルアラニンに対応する位置のアミノ酸がチロシン、ロイシンのいずれかであるか、
配列番号1記載のアミノ酸配列における461位のスレオニンに対応する位置のアミノ酸がメチオニン、フェニルアラニン、グリシン、アスパラギン酸、システインのいずれかであるか、
配列番号1記載のアミノ酸配列における467位のセリンに対応する位置のアミノ酸がロイシン、メチオニン、イソロイシン、バリン、アスパラギン酸、グルタミン酸のいずれかであるか、
または配列番号1記載のアミノ酸配列における468位のグリシンに対応する位置のアミノ酸がスレオニンであるフラビン結合型グルコースデヒドロゲナーゼ。
(3) D−グルコースへの反応性に対するD−キシロースへの反応性の割合(Xyl/Glc(%))が、前記の置換を導入する前と比較して10%以上低減していることを特徴とする(1)又は(2)記載のフラビン結合型グルコースデヒドロゲナーゼ。
(4) (1)〜(3)のいずれかに記載のフラビン結合型グルコースデヒドロゲナーゼをコードするフラビン結合型グルコースデヒドロゲナーゼ遺伝子。
(5) (4)記載のフラビン結合型グルコースデヒドロゲナーゼ遺伝子を含む組換えベクター。
(6) (5)記載の組換え体ベクターを含む宿主細胞。
(7) フラビン結合型グルコースデヒドロゲナーゼを製造する方法であり、以下の工程を含む方法:
(a)(6)に記載の宿主細胞を培養する工程、
(b)前記宿主細胞中に含まれるフラビン結合型グルコースデヒドロゲナーゼ
遺伝子を発現させる工程、
(c)前記培養物からフラビン結合型グルコースデヒドロゲナーゼを単離する工程。
(8) (1)〜(3)に記載のフラビン結合型グルコースデヒドロゲナーゼを用いることを特徴とするグルコース測定方法。
(9) (1)〜(3)に記載のフラビン結合型グルコースデヒドロゲナーゼを含むグルコースアッセイキット。
(10) (1)〜(3)に記載のフラビン結合型グルコースデヒドロゲナーゼを含むグルコースセンサー。
本発明によれば、比活性を維持し、かつD−キシロースおよび/またはマルトースへの反応性が低減した、基質特異性に優れたFAD−GDHを提供することができる。
(本発明のFAD−GDHの作用原理および活性測定法)
本発明のFAD−GDHは、公知の野生型または変異型FAD−GDH同様、電子受容体存在下でD−グルコースの水酸基を酸化してグルコノ−δ−ラクトンを生成する反応を触媒する。
本発明のFAD−GDHの活性は、この作用原理を利用し、例えば、電子受容体としてフェナジンメトサルフェート(PMS)および2,6−ジクロロインドフェノール(DCIP)を用いた以下の測定系を用いて測定することができる。
(反応1) D−グルコ−ス + PMS(酸化型)
→ D−グルコノ−δ−ラクトン + PMS(還元型)
(反応2) PMS(還元型) + DCIP(酸化型)
→ PMS(酸化型) + DCIP(還元型)
具体的には、まず、(反応1)において、D−グルコースの酸化に伴い、PMS(還元型)が生成する。そして、続いて進行する(反応2)により、PMS(還元型)が酸化されるのに伴ってDCIPが還元される。この「DCIP(酸化型)」の消失度合を波長600nmにおける吸光度の変化量として検知し、この変化量に基づいて酵素活性を求めることができる。
具体的には、フラビン結合型GDHの活性は、以下の手順に従って測定することができる。50mM リン酸緩衝液(pH6.5) 2.05mL、1M D−グルコース溶液 0.6mLおよび2mM DCIP溶液 0.15mLを混合し、37℃で5分間保温する。次いで、15mM PMS溶液 0.1mLおよび酵素サンプル溶液0.1mLを添加し、反応を開始する。反応開始時、および、経時的な吸光度を測定し、酵素反応の進行に伴う600nmにおける吸光度の1分間あたりの減少量(ΔA600)を求め、次式に従いフラビン結合型GDH活性を算出する。この際、フラビン結合型GDH活性は、37℃において濃度200mMのD−グルコース存在下で1分間に1μmolのDCIPを還元する酵素量を1Uと定義する。
Figure 2016076364
なお、式中の3.0は反応試薬+酵素試薬の液量(mL)、16.3は本活性測定条件におけるミリモル分子吸光係数(cm/μmol)、0.1は酵素溶液の液量(mL)、1.0はセルの光路長(cm)、ΔA600blankは10mM 酢酸緩衝液(pH5.0)を酵素サンプル溶液の代わりに添加して反応開始した場合の600nmにおける吸光度の1分間あたりの減少量、dfは希釈倍数を表す。
(本発明のFAD−GDHのアミノ酸配列)
本発明のFAD−GDHは、配列番号1で示されるアミノ酸配列、または該アミノ酸配列と同一性の高い、例えば、好ましくは70%以上、より好ましくは75%以上、より好ましくは80%以上、より好ましくは85%以上、さらに好ましくは90%以上、最も好ましくは95%以上同一なアミノ酸配列、または該アミノ酸配列において1もしくは数個のアミノ酸が欠失、置換もしくは付加されたアミノ酸配列からなり、配列番号1記載のアミノ酸配列における42位に相当する位置、83位に相当する位置、174位に相当する位置、367位に相当する位置、385位に相当する位置、386位に相当する位置、391位に相当する位置、460位に相当する位置、461位に相当する位置、467位に相当する位置、および468位に相当する位置に相当する位置から選択される位置のアミノ酸に対応する位置で1つまたはそれ以上のアミノ酸置換を有することを特徴とする。
好ましくは、本発明のFAD−GDHにおける、上述の42位に相当する位置でのアミノ酸置換とは、42位に相当する位置のアラニンがグリシンに置換される置換であり、上述の83位に相当する位置でのアミノ酸置換とは、83位に相当する位置のバリンがアラニン、グリシンのいずれかに置換される置換であり、上述の174位に相当する位置でのアミノ酸置換とは、174位に相当する位置のセリンがプロリン、ロイシンのいずれかに置換される置換であり、上述の367位に相当する位置でのアミノ酸置換とは、367位に相当する位置のスレオニンがアラニン、セリン、アスパラギンのいずれかに置換される置換であり、上述の385位に相当する位置でのアミノ酸置換とは、385位に相当する位置のスレオニンがアラニン、アスパラギン酸、アルギニンのいずれかに置換される置換であり、上述の386位に相当する位置でのアミノ酸置換とは、386位に相当する位置のスレオニンがバリン、イソロイシン、グリシン、ロイシン、グルタミン酸、グルタミン、アスパラギン、セリンのいずれかに置換される置換であり、上述の391位に相当する位置でのアミノ酸置換とは、391位に相当する位置のロイシンがバリンに置換される置換であり、上述の460位に相当する位置でのアミノ酸置換とは、460位に相当する位置のフェニルアラニンがチロシン、ロイシンのいずれかに置換される置換であり、上述の461位に相当する位置でのアミノ酸置換とは、461位に相当する位置のスレオニンがメチオニン、フェニルアラニン、グリシン、アスパラギン酸、システインのいずれかに置換される置換であるか、上述の467位に相当する位置でのアミノ酸置換とは、467位に相当する位置のセリンがロイシン、メチオニン、イソロイシン、バリン、アスパラギン酸、グルタミン酸のいずれかに置換される置換であり、上述の468位に相当する位置でのアミノ酸置換とは、468位に相当する位置のグリシンがスレオニンに置換される置換である。
本発明のFAD−GDHの中で、さらに好ましいものの例として、上記のような置換を複数組み合わせて有する多重変異体が挙げられる。例えば、上記のような置換を2箇所組み合わせて有する2重変異体、3箇組み合わせて有する3重変異体、さらに多数の変異を組み合わせて有する多重変異体が本発明に包含される。このような変異の蓄積により、D−キシロースおよび/またはマルトースへの作用性がさらに低減したFAD−GDHを作出することができる。
また、上記のような多重変異体を作出するにあたっては、上述の各種の置換以外の位置における置換を組み合わせることもできる。このような置換の位置は、単独で置換を導入した場合には、上述の置換部位におけるもののように顕著な効果を奏さないものであっても、上述の置換部位と組み合わせて導入することによって、相乗的に効果を奏するものであり得る。
また、本発明のFAD−GDHには、上述のような、D−キシロースやマルトースに作用しにくいという変異のほかに、熱安定性を向上させる変異や、比活性を向上させる変異や、pHや特定の物質などへの耐性を向上させる効果などのような、別種の効果を奏することを目的とした公知の変異を任意に組み合わせてもよい。このような別種の変異を組み合わせた場合であっても、本発明の効果を発揮し得るものである限り、それらのFAD−GDHは本発明に包含される。
後述のとおり、本発明のFAD−GDHは、例えば、まず任意の方法で、配列番号1のアミノ酸配列に近いアミノ酸配列をコードする遺伝子を入手し、配列番号1の所定の位置と同等の位置におけるいずれかの位置においてアミノ酸置換を導入することにより得ることもできる。
目的とするアミノ酸置換導入方法としては、例えばランダムに変異を導入する方法あるいは想定した位置に部位特異的変異を導入する方法が挙げられる。前者の方法としては、エラープローンPCR法(Techniques,1,11−15,(1989))や、増殖の際、プラスミドの複製にエラーを起こしやすく、改変を生じやすいXL1−Redコンピテントセル(STRATAGENE社製)を用いる方法等がある。また、後者の方法として、目的とするタンパク質の結晶構造解析により立体構造を構築し、その情報をもとに目的の効果を付与すると予想されるアミノ酸を選択し、市販のQuick Change Site Directed Mutagenesis Kit(STRATAGENE社製)等により部位特異的変異を導入する方法がある。あるいは、後者の方法として、目的とするタンパク質と相同性の高い公知のタンパク質の立体構造を用いて、目的の効果を付与すると予想されるアミノ酸を選択し、部位特異的変異を導入する方法もある。
また、ここでいう、例えば、「配列番号1のアミノ酸配列と同等の位置」とは、配列番号1のアミノ酸配列と、配列番号1と相同性(好ましくは80%以上、より好ましくは85%以上、さらに好ましくは90%以上、最も好ましくは95%以上)を持つアミノ酸配列を有する他のFAD−GDHとをアラインさせた場合に、そのアラインメントにおける同一の位置を意味する。なお、アミノ酸配列の相同性は、GENETYX−Mac(Software Development社製)のマキシマムマッチングやサーチホモロジー等のプログラム、又はDNASIS Pro(日立ソフト社製)のマキシマムマッチングやマルチプルアライメント等のプログラムにより計算することができる。
「アミノ酸に対応する位置」を特定する方法としては、例えばリップマン−パーソン法等の公知のアルゴリズムを用いてアミノ酸配列を比較し、FAD−GDHのアミノ酸配列中に存在する保存アミノ酸残基に最大の相同性を与えることにより行うことができる。FAD−GDHのアミノ酸配列をこのような方法で整列させることにより、アミノ酸配列中にある挿入、欠失にかかわらず、相同アミノ酸残基の各FAD−GDH配列における配列中の位置を決めることが可能である。相同位置は、三次元構造中で同位置に存在すると考えられ、対象となるFAD−GDHの基質特異性に関して類似した効果を有することが推定できる。
本発明のFAD−GDHには、上記の同一性の範囲内で各種のバリエーションが想定されるが、各種FAD−GDHの酵素科学的性質が本明細書に記載する本発明のFAD―GDHと同様である限り、それらは全て本発明のFAG−GDHに含まれ得る。このようなアミノ酸配列を有するFAD−GDHは、基質特異性が高く、かつ、D−グルコース以外の糖化合物、例えば、D−キシロースやマルトース等が共存したときにも影響を受けにくく、産業上有用である。
また、本発明のFAD−GDHにおいては、上述の42位に相当する位置でのアミノ酸置換とは、42位に相当する位置のアラニンがグリシンに置換される置換であり、上述の83位に相当する位置でのアミノ酸置換とは、83位に相当する位置のバリンがアラニン、グリシンのいずれかであること、または、174位に相当する位置でのアミノ酸置換とは、174位に相当する位置のセリンがプロリン、ロイシンのいずれかであること、または、367位に相当する位置でのアミノ酸置換とは、367位に相当する位置のスレオニンがアラニン、セリン、アスパラギンのいずれかであること、または、385位に相当する位置でのアミノ酸置換とは、385位に相当する位置のスレオニンがアラニン、アスパラギン酸、アルギニンのいずれかであること、または、386位に相当する位置でのアミノ酸置換とは、386位に相当する位置のスレオニンがバリン、イソロイシン、グリシン、ロイシン、グルタミン酸、グルタミン、アスパラギン、セリンのいずれかであること、または、391位に相当する位置でのアミノ酸置換とは、391位に相当する位置のロイシンがバリンであること、または、460位に相当する位置でのアミノ酸置換とは、460位に相当する位置のフェニルアラニンがチロシン、ロイシンのいずれかであること、または、461位に相当する位置でのアミノ酸置換とは、461位に相当する位置のスレオニンがメチオニン、フェニルアラニン、グリシン、アスパラギン酸、システインのいずれかであること、467位に相当する位置でのアミノ酸置換とは、467位に相当する位置のセリンがロイシン、メチオニン、イソロイシン、バリン、アスパラギン酸、グルタミン酸のいずれかであること、または、468位に相当する位置でのアミノ酸置換とは、468位に相当する位置のグリシンがスレオニンであることが重要なのであって、それが人為的な置換操作によるものか否かは重要でない。例えば、上記の位置のアミノ酸が本発明で所望される残基とは元々異なっているタンパク質を出発物質として、そこに公知の技術を用いて所望の置換を導入していく場合であれば、これらの所望されるアミノ残基は置換により導入される。一方、公知のペプチド全合成により所望のタンパク質を入手する場合、または、所望のアミノ酸配列を有するタンパク質をコードするように遺伝子配列を全合成し、これに基づき所望のタンパク質を入手する場合、あるいは、天然型として見出されたものの中に元々そのような配列を有するものがあった場合等には、人為的な置換という工程を経ることなく、本発明のFAD−GDHを得ることができる。
(本発明のFAD−GDHにおける基質特異性の向上)
本発明のFAD−GDHは、高い基質特異性を有することを特徴とする。具体的には、本発明のFAD−GDHは、本発明者らが先に見出した特許第4648993号公報に記載のケカビ由来FAD−GDHと同様に、マルトース、D−ガラクトース、D−キシロースに対する反応性が極めて低いことを特徴とする。具体的には、D−グルコースに対する反応性を100%とした場合に、マルトース、D−ガラクトースおよびD−キシロースに対する反応性がいずれも2%以下であることを特徴とする。本発明に用いるFAD−GDHは、このような高い基質特異性を有するため、マルトースを含む輸液の投与を受けている患者や、ガラクトース負荷試験およびキシロース吸収試験を実施中の患者の試料についても、測定試料に含まれるマルトース、D−ガラクトース、D−キシロース等の糖化合物の影響を受けることなく、正確にD−グルコース量を測定することが可能となる。さらに、本発明のFAD−GDHは、特許第4648993号公報に記載のケカビ由来FAD−GDHと比較して、さらに高いD−グルコースに対する基質特異性を有するものであるため、一層の産業上の有用性が期待される。
また、本発明のFAD−GDHは、上述のようにD−グルコースの代わりにマルトース、D−ガラクトース、D−キシロース等の糖化合物を基質として測定を行った際の測定値が非常に低く、さらに、マルトース、D−ガラクトース、D−キシロース等の糖化合物が夾雑する条件下でも正確にD−グルコースを測定できることが好ましい。具体的には、それらの夾雑糖化合物が存在しない条件でのD−グルコースに対する反応性を100%とした場合に、夾雑糖化合物としてマルトース、D−ガラクトース、D−キシロースから選択される1以上が存在する場合の測定値が96%〜103%であり、夾雑糖化合物としてマルトース、D−ガラクトースおよびD−キシロースの3種が同時に存在する場合でも、測定値が96%〜104%であることが好ましい。
このような特性を有するFAD−GDHを用いた場合には、測定試料中にマルトースやD−ガラクトース、D−キシロースが存在している状況でも、D−グルコース量を正確に測定することが可能である。
各種のFAD−GDHが有する酵素化学的性質は、酵素の諸性質を特定するための公知の手法、例えば、以下の実施例に記載の方法を用いて調べることができる。酵素の諸性質は、各種のFAD−GDHを生産する微生物の培養液や、精製工程の途中段階において、ある程度調べることもでき、より詳細には、精製酵素を用いて調べることができる。
本発明の改変型FAD−GDHは、前述の活性測定方法に基づく反応条件下で、D−グルコースへの反応性に対する同モル濃度のD−キシロースへの反応性の割合(Xyl/Glc(%))および/または、D−グルコースへの反応性に対する同モル濃度のマルトースへの反応性の割合(Mal/Glc(%))が、アミノ酸置換を導入する前と比較して低減している、好ましくは20%以上、より好ましくは30%以上、さらに好ましくは40%以上、最も好ましくは50%以上低減していることを特徴とする。
本発明のFAD−GDHは、Xyl/Glc(%)またはMal/Glc(%)のいずれか片方のみがアミノ酸置換を導入する前のFAD−GDHと比べて好ましい程度に低減していてもよく、あるいは、その両方が、好ましい程度に低減していてもよい。両方の基質に対する反応性がいずれも低減しているものであれば、より好ましい。
また、上述のように、本発明のFAD−GDHは、元々D−グルコースに対する基質特異性が優れた酵素であるため、通常の空腹時血糖値(≦126mg/dL[7mM])と同程度のモル濃度のD−キシロース及びマルトースを用いて行う反応性の測定においては、その共存の影響を示唆する測定値がほとんど検出されないことが想定される。そこで、本発明のFAD−GDHにおけるD−キシロースおよびマルトースへの反応性を測定する際には、例えば、200mM等の過剰量の濃度でD−キシロースおよび/またはマルトースを共存させた条件下で、同モル濃度のD−グルコースへの反応性が2U/ml以上、好ましくは5U/ml以上、より好ましくは10U/ml以上である多量の酵素液を用いて測定を行うことが好ましい。このような条件で測定を行うことにより、グルコースセンサー上に多量の酵素を搭載した際と同等な条件を想定した、共存物質の影響を検討することができる。
なお、D−グルコースへの反応性に対する同モル濃度のD−キシロースへの反応性の割合(Xyl/Glc(%))、および、D−グルコースへの反応性に対する同モル濃度のマルトースへの反応性の割合(Mal/Glc(%))は、形質転換体の種類やその培養条件、あるいは酵素活性測定条件等によって異なるため、同一の条件下において、アミノ酸置換導入前後のそれぞれの値を比べる必要がある。
(本発明のFAD−GDHの由来となる天然型FAD−GDHの例)
本発明のFAD−GDHは、公知のFAD−GDHを改変することにより取得することもできる。公知のFAD−GDHの由来微生物の好適な例としては、ケカビ亜門、好ましくはケカビ綱、より好ましくはケカビ目、さらに好ましくはケカビ科に分類される微生物を挙げることができる。具体的には、ムコール(Mucor)属、アブシジア(Absidia)属、アクチノムコール(Actinomucor)属、シルシネラ(Circinella)属由来のFAD−GDH等が挙げられる。
Mucor属に分類される微生物であって、具体的な好ましい微生物の例としては、Mucor prainii、Mucor javanicus、Mucor circinelloides f. circinelloides、Mucor guilliermondii、Mucor hiemalis f. silvaticus、Mucor subtilissimus、Mucor dimorphosporus等が挙げられる。より具体的には、特許文献5に記載のMucor prainii、Mucor javanicus、Mucor circinelloides f. circinelloides、Mucor guilliermondii NBRC9403、Mucor hiemalis f. silvaticus NBRC6754、Mucor subtilissimus NBRC6338、Mucor RD056860、Mucor dimorphosporus NBRC5395等が挙げられる。Absidia属に分類される微生物であって、具体的な好ましい微生物の例としては、Absidia cylindrospora、Absidia hyalosporaを挙げることができる。より具体的には、特許文献5に記載のAbsidia cylindrospora、Absidia hyalosporaを挙げることができる。Actinomucor属に分類される微生物であって、具体的な好ましい微生物の例としては、Actinomucor elegansを挙げることができる。より具体的には、特許文献5に記載のActinomucor elegansを挙げることができる。Circinella属に分類される微生物であって、具体的な好ましい微生物の例としては、Circinella minor、Circinella mucoroides、Circinella muscae、Circinella rigida、Circinella simplex、Circinella umbellataを挙げることができる。より具体的には、Circinella minor NBRC6448、Circinella mucoroides NBRC4453、Circinella muscae NBRC6410、Circinella rigida NBRC6411、Circinella simplex NBRC6412、Circinella umbellata NBRC4452、Circinella umbellata NBRC5842、Circinella RD055423及びCircinella RD055422を挙げることができる。なお、NBRC菌株およびRD菌株はNBRC(独立行政法人製品評価技術基盤機構 バイオテクノロジーセンター)の保管菌株である。
(本発明のFAD−GDHをコードする遺伝子の取得)
本発明のFAD−GDHを効率よく取得するためには、遺伝子工学的手法を利用するのが好ましい。本発明のFAD−GDHをコードする遺伝子(以下、FAD−GDH遺伝子)を取得するには、通常一般的に用いられている遺伝子のクローニング方法を用いればよい。例えば、公知のFAD−GDHを出発物質とし、それを改変することにより本発明のFAD−GDHを取得するには、FAD−GDH生産能を有する公知の微生物菌体や種々の細胞から、常法、例えば、Current Protocols in Molecular Biology (WILEY Interscience,1989)記載の方法により、染色体DNA又はmRNAを抽出することができる。さらにmRNAを鋳型としてcDNAを合成することができる。このようにして得られた染色体DNA又はcDNAを用いて、染色体DNA又はcDNAのライブラリーを作製することができる。
次いで、公知のFAD−GDHのアミノ酸配列情報に基づき、適当なプローブDNAを合成して、これを用いて染色体DNA又はcDNAのライブラリーから基質特異性の高いFAD−GDH遺伝子を選抜する方法、あるいは、上記アミノ酸配列に基づき、適当なプライマーDNAを作製して、5’RACE法や3’RACE法などの適当なポリメラーゼ連鎖反応(PCR法)により、基質特異性の高いFAD−GDHをコードする目的の遺伝子断片を含むDNAを増幅させ、これらのDNA断片を連結させて、目的のFAD−GDH遺伝子の全長を含むDNAを得ることもできる。
公知のFAD−GDHを出発物質として、本発明の基質特異性が高いFAD−GDHを取得する方法として、出発物質であるFAD−GDHをコードする遺伝子に変異を導入し、各種の変異遺伝子から発現されるFAD−GDHの酵素科学的性質を指標に選択を行う方法を採用し得る。
出発物質であるFAD−GDH遺伝子の変異処理は、企図する変異形態に応じた、公知の任意の方法で行うことができる。すなわち、FAD−GDH遺伝子あるいは当該遺伝子の組み込まれた組換え体DNAと変異原となる薬剤とを接触・作用させる方法;紫外線照射法;遺伝子工学的手法;又は蛋白質工学的手法を駆使する方法等を広く用いることができる。
上記変異処理に用いられる変異原となる薬剤としては、例えば、ヒドロキシルアミン、N−メチル−N’−ニトロ−N−ニトロソグアニジン、亜硝酸、亜硫酸、ヒドラジン、蟻酸、若しくは5−ブロモウラシル等を挙げることができる。
この接触・作用の諸条件は、用いる薬剤の種類等に応じた条件を採ることが可能であり、現実に所望の変異をMucor属由来FAD−GDH遺伝子において惹起することができる限り特に限定されない。通常、好ましくは0.5〜12Mの上記薬剤濃度において、20〜80℃の反応温度下で10分間以上、好ましくは10〜180分間接触・作用させることで、所望の変異を惹起可能である。紫外線照射を行う場合においても、上記の通り常法に従い行うことができる(現代化学、p24〜30、1989年6月号)。
蛋白質工学的手法を駆使する方法としては、一般的に、Site−Specific Mutagenesisとして知られる手法を用いることができる。例えば、Kramer法 (Nucleic Acids Res.,12,9441(1984):Methods Enzymol.,154,350(1987):Gene,37,73(1985))、Eckstein法(Nucleic Acids Res.,13,8749(1985):Nucleic Acids Res.,13,8765(1985):Nucleic Acids Res,14,9679(1986))、Kunkel法(Proc. Natl. Acid. Sci. U.S.A.,82,488(1985):Methods Enzymol.,154,367(1987))等が挙げられる。DNA中の塩基配列を変換する具体的な方法としては、例えば市販のキット(Transformer Mutagenesis Kit;Clonetech社, EXOIII/Mung Bean Deletion Kit;Stratagene製, Quick Change Site Directed Mutagenesis Kit;Stratagene製など)の利用が挙げられる。
また、一般的なポリメラーゼチェインリアクション(Polymerase Chain Reaction)として知られる手法を用いることもできる(Technique,1,11(1989))。
なお、上記遺伝子改変法の他に、有機合成法又は酵素合成法により、直接所望の基質特異性の高い改変FAD−GDH遺伝子を合成することもできる。
上記のような任意の方法により選択された本発明のFAD−GDH遺伝子のDNA塩基配列の決定または確認を行う場合には、例えば、マルチキャピラリーDNA解析システムCEQ2000(ベックマン・コールター社製)等を用いれば良い。
(本発明のFAD−GDH遺伝子が挿入されたベクターおよび宿主細胞)
上述のように得られた本発明のFAD−GDH遺伝子を、常法により、バクテリオファージ、コスミド、又は原核細胞若しくは真核細胞の形質転換に用いられるプラスミド等のベクターに組み込み、各々のベクターに対応する宿主細胞を常法により、形質転換又は形質導入をすることができる。
原核宿主細胞の一例としては、エシェリシア属に属する微生物、例えば大腸菌K−12株、エシェリヒア・コリーBL21(DE3)、エシェリヒア・コリーJM109、エシェリヒア・コリーDH5α、エシェリヒア・コリーW3110、エシェリヒア・コリーC600等(いずれもタカラバイオ社製)が挙げられる。それらを形質転換し、または、それらに形質導入して、DNAが導入された宿主細胞(形質転換体)を得る。こうした宿主細胞に組み換えベクターを移入する方法としては、例えば宿主細胞がエシェリヒア・コリーに属する微生物の場合には、カルシウムイオンの存在下で組み換えDNAの移入を行う方法などを採用することができる、更にエレクトロポレーション法を用いても良い。更には市販のコンピテントセル(例えばECOS Competent エシェリヒア・コリーBL21(DE3);ニッポンジーン製)を用いても良い。
真核宿主細胞の一例としては、酵母が挙げられる。酵母に分類される微生物としては、例えば、チゴサッカロマイセス(Zygosaccharomyces)属、サッカロマイセス(Saccharomyces)属、ピキア(Pichia)属、カンジダ(Candida)属などに属する酵母が挙げられる。挿入遺伝子には、形質転換された細胞を選択することを可能にするためのマーカー遺伝子が含まれていてもよい。マーカー遺伝子としては、例えば、URA3、TRP1のような、宿主の栄養要求性を相補する遺伝子等が挙げられる。また、挿入遺伝子は、宿主細胞中で本発明の遺伝子を発現することのできるプロモーター又はその他の制御配列(例えば、エンハンサー配列、ターミネーター配列、ポリアデニル化配列等)を含むことが望ましい。プロモーターとしては、具体的には、例えば、GAL1プロモーター、ADH1プロモーター等が挙げられる。酵母への形質転換方法としては、公知の方法、例えば、酢酸リチウムを用いる方法(MethodsMol. Cell. Biol., 5, 255−269(1995))やエレクトロポレーション(J Microbiol Methods 55 (2003)481−484)等を好適に用いることができるが、これに限定されず、スフェロプラスト法やガラスビーズ法等を含む各種任意の手法を用いて形質転換を行えば良い。
真核宿主細胞の他の例としては、アスペルギルス(Aspergillus)属やトリコデルマ(Tricoderma)属のようなカビ細胞が挙げられる。挿入遺伝子は、宿主細胞中で本発明の遺伝子を発現することのできるプロモーター(例えばtef1プロモーター)及びその他の制御配列(例えば、分泌シグナル配列、エンハンサー配列、ターミネーター配列、ポリアデニル化配列等)を含むことが望ましい。また、挿入遺伝子には、形質転換された細胞を選択することを可能にするためのマーカー遺伝子、例えばniaD、pyrGが含まれていても良い。さらに、挿入遺伝子には、任意の染色体部位へ挿入するための相同組換え領域が含まれていても良い。糸状菌への形質転換方法としては、公知の方法、例えば、プロトプラスト化した後ポリエチレングリコール及び塩化カルシウムを用いる方法(Mol. Gen. Genet., 218, 99−104(1989))を好適に用いることができる。
(本発明のFAD−GDHの製造)
本発明のFAD−GDHは、上述のように取得した本発明のFAD−GDHを生産する宿主細胞を培養し、前記宿主細胞中に含まれるフラビン結合型グルコースデヒドロゲナーゼ遺伝子を発現させ、次いで、前記培養物からフラビン結合型グルコースデヒドロゲナーゼを単離することにより、製造すればよい。
上記真核宿主細胞を培養するためには、例えば、Saccharomyces cerevisiaeの培養において広く用いられているYPD(バクトペプトン 2%,バクトイースト・エクストラクト 1%,グルコース 2%)液体培地を好適に用いることができると考えられるが、その他にも、添加することにより本発明に用いるフラビン結合型GDHの製造量を向上させることができる栄養源や成分があれば、単独で、あるいは組み合わせてそれらを添加してもよい。
培地に使用する炭素源としては、同化可能な炭素化合物であればよく、例えばグルコース、デンプン加水分解物、グリセリン、フラクトース、糖蜜などが挙げられる。窒素源としては、利用可能な窒素化合物であればよく、例えば、酵母エキス、ペプトン、肉エキス、コーンスチープリカー、大豆粉、マルツエキス、アミノ酸、硫酸アンモニウム、硝酸アンモニウムなどが挙げられる。無機物としては、例えば、食塩、塩化カリウム、硫酸マグネシウム、塩化マンガン、硫酸第1鉄、リン酸第1カリウム、リン酸第2カリウム、炭酸ナトリウム、塩化カルシウムなどの種々の塩が挙げられる。その他、必要に応じてビタミン類、消泡剤などを添加してもよい。
上記原核宿主細胞を培養する培地としては、例えば、酵母エキス、トリプトン、ペプトン、肉エキス、コーンスティープリカーあるいは大豆若しくは小麦ふすまの浸出液等の1種以上の窒素源に、塩化ナトリウム、リン酸第1カリウム、リン酸第2カリウム、硫酸マグネシウム、塩化マグネシウム、塩化第2鉄、硫酸第2鉄あるいは硫酸マンガン等の無機塩類の1種以上を添加し、さらに必要により糖質原料、ビタミン等を適宜添加したものが用いられる。
培養条件は、培養する微生物により異なっても良いが、例えば、培地の初発pHは、pH5〜10に調整し、培養温度は、20〜40℃、培養時間は、15〜25時間、1〜2日間、あるいは10〜50時間等、適宜設定することができ、通気撹拌深部培養、振盪培養、静地培養などにより実施する。
例えば、チゴサッカロマイセス属の酵母を培養する場合の培地および培養条件の一例として、バクトペプトン 2%,バクトイースト・エクストラクト 1%,グルコース 2%の培地を用いた、30℃、200rpmで24時間の振盪が挙げられる。例えば、エシェリヒア・コリーの培養は、10〜42℃の培養温度、好ましくは25℃前後の培養温度で4〜24時間、さらに好ましくは25℃前後の培養温度で4〜8時間、通気攪拌深部培養、振盪培養、静置培養等により実施すればよい。
培養終了後、該培養物あるいは培養菌体内部からフラビン結合型GDHを採取するには、通常の酵素の採取手段を用いることができる。
上記酵素が菌体内に存在する場合には、培養物から、例えば、濾過、遠心分離などの操作により菌体を分離し、この菌体から酵素を採取するのが好ましい。例えば、超音波破砕機、フレンチプレス、ダイノミルなどの、通常の破壊手段を用いて菌体を破壊する方法、リゾチームなどの細胞壁溶解酵素を用いて菌体細胞壁を溶解する方法、トリトンX−100などの界面活性剤を用いて菌体から酵素を抽出する方法などを単独または組み合わせて採用することができる。
上記酵素が菌体外に存在する場合には、例えば、濾過、遠心分離などの操作により菌体を分離し、上清を回収すればよい。次いで、濾過または遠心分離などにより不溶物を取りのぞき、酵素抽出液を得る。得られた抽出液から、フラビン結合型GDHを、必要に応じて単離、精製するには、必要により核酸を除去したのち、これに硫酸アンモニウム、アルコール、アセトンなどを添加して分画し、沈殿物を採取し、本発明のFAD−GDHの粗酵素を得ることができる。
本発明のFAD−GDHの粗酵素を、公知の任意の手段を用いてさらに精製することもできる。精製された酵素標品を得るには、例えば、セファデックス、ウルトロゲル若しくはバイオゲル等を用いるゲル濾過法;イオン交換体を用いる吸着溶出法;ポリアクリルアミドゲル等を用いる電気泳動法;ヒドロキシアパタイトを用いる吸着溶出法;蔗糖密度勾配遠心法等の沈降法;アフィニティクロマトグラフィー法;分子ふるい膜若しくは中空糸膜等を用いる分画法等を適宜選択し、又はこれらを組み合わせて実施することにより、精製された本発明のFAD−GDH酵素標品を得ることができる。
(本発明のFAD−GDHを用いたD−グルコース測定方法)
本発明はまた、本発明のFAD−GDHを含むグルコースアッセイキットを開示し、例えば、このようなグルコースアッセイキットを用いることにより、本発明のFAD−GDHを用いて血中のD−グルコース(血糖値)を測定することができる。
本発明のグルコースアッセイキットは、本発明に従う改変型FAD−GDHを、少なくとも1回のアッセイに十分な量で含む。典型的には、本発明のグルコースアッセイキットは、本発明の改変型FAD−GDHに加えて、アッセイに必要な緩衝液、メディエーター、キャリブレーションカーブ作製のためのD−グルコース標準溶液、ならびに使用の指針を含む。本発明に従う改変型FAD−GDHは種々の形態で、例えば、凍結乾燥された試薬として、または適切な保存溶液中の溶液として提供することができる。
D−グルコース濃度の測定は、比色式グルコースアッセイキットの場合は、例えば、以下のように行うことができる。グルコースアッセイキットの反応層にはFAD−GDH、電子受容体、そして反応促進剤としてN−(2−アセトアミド)イミド2酢酸(ADA)、ビス(2−ヒドロキシエチル)イミノトリス(ヒドロキシメチル)メタン(Bis−Tris)、炭酸ナトリウムおよびイミダゾールからなる群より選ばれる1以上の物質を含む液状もしくは固体状の組成物を保持させておく。ここで、必要に応じてpH緩衝剤、発色試薬を添加する。ここにD−グルコースを含む試料を加え、一定時間反応させる。この間、還元により退色する電子受容体もしくは電子受容体より電子を受け取ることによって重合し生成する色素の最大吸収波長に相当する吸光度をモニタリングする。レート法であれば、吸光度の時間あたりの変化率から、エンドポイント法であれば、試料中のD−グルコースがすべて酸化された時点までの吸光度変化から、予め標準濃度のD−グルコース溶液を用いて作製したキャリブレーションカーブを元にして、試料中のD−グルコース濃度を算出することができる。
この方法において使用できるメディエーター及び発色試薬としては、たとえば2,6−ジクロロフェノールインドフェノール(DCIP)を電子受容体として添加し、600nmにおける吸光度の減少をモニタリングすることでD−グルコースの定量が可能である。また、電子受容体としてフェナジンメトサルフェート(PMS)を、さらに発色試薬としてニトロテトラゾリウムブルー(NTB)を加え、570nm吸光度を測定することにより生成するジホルマザンの量を決定し、D−グルコース濃度を算出することが可能である。なお、いうまでもなく、使用する電子受容体および発色試薬はこれらに限定されない。
(本発明のFAD−GDHを含むグルコースセンサー)
本発明はまた、本発明のFAD−GDHを用いるグルコースセンサーを開示する。電極としては、カーボン電極、金電極、白金電極などを用い、この電極上に本発明の酵素を固定化する。固定化方法としては、架橋試薬を用いる方法、高分子マトリックス中に封入する方法、透析膜で被覆する方法、光架橋性ポリマー、導電性ポリマー、酸化還元ポリマーなどがあり、あるいはフェロセンあるいはその誘導体に代表される電子メディエーターとともにポリマー中に固定あるいは電極上に吸着固定してもよく、またこれらを組み合わせて用いてもよい。典型的には、グルタルアルデヒドを用いて本発明の改変型FAD−GDHをカーボン電極上に固定化した後、アミン基を有する試薬で処理してグルタルアルデヒドをブロッキングする。
D−グルコース濃度の測定は、以下のようにして行うことができる。恒温セルに緩衝液を入れ、一定温度に維持する。メディエーターとしては、フェリシアン化カリウム、フェナジンメトサルフェートなどを用いることができる。作用電極として本発明の改変型FAD−GDHを固定化した電極を用い、対極(例えば白金電極)および参照電極(例えばAg/AgCl電極)を用いる。カーボン電極に一定の電圧を印加して、電流が定常になった後、D−グルコースを含む試料を加えて電流の増加を測定する。標準濃度のD−グルコース溶液により作製したキャリブレーションカーブに従い、試料中のD−グルコース濃度を計算することができる。
具体的な一例としては、グラッシーカーボン(GC)電極に本発明の1.5UのFAD−GDHを固定化し、D−グルコース濃度に対する応答電流値を測定する。電解セル中に、50mM リン酸カリウム緩衝液(pH6.0)1.8ml、及び、1M ヘキサシアノ鉄(III)酸カリウム(フェリシアン化カリウム)水溶液0.2mlを添加する。GC電極をポテンショスタットBAS100B/W(BAS製)に接続し、37℃で溶液を撹拌し、銀−塩化銀参照電極に対して+500mVを印加する。これらの系に1M D−D−グルコース溶液を終濃度が5、10、20、30、40、50mMになるよう添加し、添加ごとに定常状態の電流値を測定する。この電流値を既知のD−グルコース濃度(5、10、20、30、40、50mM)に対してプロットし、検量線が作成する。これより本発明のFAD結合型グルコース脱水素酵素を使用した酵素固定化電極でD−グルコースの定量が可能となる。
本発明のFAD−GDHは、従来のMucor属由来FAD−GDHと比較した場合でも、基質特異性が優れているために、特に、上記のようなグルコースセンサーに対し応用する場合に、優れた効果を奏することが期待される。グルコースセンサーにおいては、液状試薬キット等に応用する場合と比較して、より多量の酵素を搭載する特殊な条件下で酵素反応が行われることが想定され、このような条件下では、共存物質の影響を低減する必要性が特に高いことが求められるためである。
以下、実施例により、本発明をさらに具体的に説明する。ただし、本発明の技術的範囲は、それらの例により何ら限定されるものではない。
本発明において、改変型FAD−GDHの基質特異性および熱安定性の評価は、特に記載がない限り、以下の試験例の方法に従い行った。
[試験例]
(1)各種の改変型FAD−GDHを発現する酵母形質転換体の作製
特許文献7に記載の方法に準じ、配列番号2のMucor prainii由来FAD−GDH遺伝子(野生型MpGDH遺伝子)をコードする組換え体プラスミド(pYES2C−Mp(野生型))を取得した。
得られた組換え体プラスミドpYE2C−Mpを鋳型として、各アミノ酸置換導入用の合成ヌクレオチド、KOD−Plus−(東洋紡績社製)を用い、以下の条件でPCR反応を行った。
すなわち、10×KOD−Plus−緩衝液を5μl、dNTPが各2mMになるよう調製されたdNTPs混合溶液を5μl、25mMのMgSO溶液を2μl、鋳型となるpYE2C−Mpを50ng、上記合成オリゴヌクレオチドをそれぞれ15pmol、KOD−Plus−を1Unit加えて、滅菌水により全量を50μlとして「反応液」を調製した。サーマルサイクラー(エッペンドルフ社製)を用いて、調製した反応液を94℃で2分間インキュベートし、続いて、「94℃、15秒」−「55℃、30秒」−「68℃、8分」のサイクルを30回繰り返した。
上記処理後の反応液の一部を1.0%アガロースゲルで電気泳動し、約8kbpのDNAが特異的に増幅されていることを確認した。増幅されたDNAを、制限酵素DpnI(New England Biolabs社製)で処理後、添付のプロトコールに従って、大腸菌JM109株(ニッポンジーン社製)のコンピテントセルに混合することにより形質転換を行った。次いで、取得した形質転換体をそれぞれLB−amp寒天培地に塗布し、培養を行った。生育したコロニーをLB−amp液体培地に接種して振とう培養し、GenElute Plasmid Miniprep Kit(sigma社製)を用いて、添付のプロトコールに従って、約8kbpの増幅されたDNAを含む各種のプラスミドDNA(例えば、実施例1におけるpYE2C−Mp−V83A、pYE2C−Mp−V83G等)を単離した。次いで、これらの各種プラスミドDNA中のMpGDH遺伝子をコードするDNAの塩基配列を、マルチキャピラリーDNA解析システムCEQ2000(ベックマン・コールター社製)を用いて決定し、それぞれの配列において、配列番号1記載のアミノ酸配列における所定の位置のアミノ酸が置換されていることを確認した。このようにして、所定のアミノ酸が置換された改変型MpGDHをコードする酵母発現用ベクターpYE2C−Mp(改変型、例えば、実施例1におけるpYE2C−Mp−V83A、pYE2C−Mp−V83G等)を取得した。
その後、S.cerevisiae用形質転換キット(Invitrogen社製)を用いて、pYE2C−Mp(野生型)、および各種変異が導入されたpYES2C−Mp(改変型、例えば、実施例1におけるpYE2C−Mp−V83A、pYE2C−Mp−V83G等)をInv−Sc株(Invitrogen社製)に形質転換することにより、野生型MpGDHを発現する酵母形質転換体Sc−Mp(野生型)株、および各種の改変型MpGDHを発現する酵母形質転換株Sc−Mp(改変型、例えば、実施例1におけるSc−Mp−V83A、Sc−Mp−V83G等)株をそれぞれ取得した。
(2)基質特異性評価
酵母形質転換体Sc−Mp(野生型)、および、各種の酵母形質転換体Sc−Mp(改変型、例えば、実施例1におけるSc−Mp−V83A、Sc−Mp−V83G等)を、各々、5mLの前培養用液体培地「0.67%(w/v)アミノ酸不含有イーストニトロゲンベース(BD)、0.192%(w/v)ウラシル不含有酵母合成ドロップアウト培地用添加物(sigma社製)、2.0%(w/v)ラフィノース」中で、30℃にて24時間培養した。その後、前培養液1mLを4mLの本培養用液体培地「0.67%(w/v)アミノ酸不含有イーストニトロゲンベース、0.192%(w/v)ウラシル不含有酵母合成ドロップアウト培地用添加物、2.5%(w/v)D−ガラクトース、0.75%(w/v)ラフィノース」に加えて、30℃で16時間培養する。この培養液を遠心分離(10,000×g、4℃、3分間)により菌体と培養上清に分離し、培養上清液を基質特異性の評価に用いた。
具体的には、上述の活性測定法の基質をD−グルコースから同モル濃度のD−キシロースとした系に変えてそれぞれの基質に対する活性を測定した。そして、これらの値から、「D−グルコースへの反応性に対するD−キシロースへの反応性の割合(Xyl/Glc(%))」を算出した。
Sc−Mp(野生型)株にて発現させた野生型MpGDHの(Xyl/Glc(%))は1.47%であった。このような基質特異性は、従来知られたその他のFAD-GDHと比較しても非常に優れており、測定目的物質であるD−グルコースを精度よく測定できることが期待される。
また、各種変異体における部位特異的変異導入前のMucor属由来FAD−GDHにおけるXyl/Glc(%)の値を100%とした時に部位特異的変異導入後の改変型FAD−GDHが示す相対的な基質特異性を表す「Xyl/Glc比率」を算出した。「Xyl/Glc比率が100を下回る改変型FAD−GDHにおいては、部位特異的変異導入前のFAD−GDHと比較して、D−キシロースへの反応性が低下し、基質特異性が高まっていることを示し、その度合は、数値が小さくなるほど大きい。
(3)比活性評価
酵母形質転換体Sc−Mp(野生型)、および、各種の酵母形質転換体Sc−Mp(改変型、例えば、実施例2におけるSc−Mp−T367A、Sc−Mp−A385T等)を、各々、10mLの前培養用液体培地「0.67%(w/v)アミノ酸不含有イーストニトロゲンベース(BD)、0.192%(w/v)ウラシル不含有酵母合成ドロップアウト培地用添加物(sigma社製)、2.0%(w/v)ラフィノース」中で、30℃にて24時間培養した。その後、前培養液10mLを40mLの本培養用液体培地「0.67%(w/v)アミノ酸不含有イーストニトロゲンベース、0.192%(w/v)ウラシル不含有酵母合成ドロップアウト培地用添加物、2.5%(w/v)D−ガラクトース、0.75%(w/v)ラフィノース」に加えて、30℃で14時間培養した。この培養液を遠心分離(10,000×g、4℃、3分間)により菌体と培養上清に分離し、培養上清液にGDH活性があることを確認し、以下の操作に用いた。
回収した評価対象のFAD−GDHを含む培養上清液を遠心式フィルターユニット(Amicon Ultra−15 30K、MERCK MILLIPORE社製)により濃縮後、20mMのリン酸カリウム緩衝液(pH6.0)に置換した。
次に、回収した濃縮液を、150mMの塩化ナトリウムを含む20mMリン酸カリウム緩衝液(pH6.0)で予め平衡化したSuperdex 200 10/300GL(GEヘルスケアバイオサイエンス社製)のカラムにかけ、活性画分を回収することで精製酵素を取得した。
精製した酵素の比活性は、280nmにおける吸光度(A280)あたりの活性(U/A280)として、上述のGDH活性測定法を用いて測定した。そして、野生型MpGDHの比活性を100とした際の改変型MpGDHにおける「相対比活性」を算出した。相対比活性が100よりあまり小さくないとき、その改変型MpGDHは比活性が大幅に低くなっていないことがわかる。
[実施例1]
(各種改変型MpGDHの調製と基質特異性評価)
上記試験例で記述した方法に従って、pYE2C−Mp(野生型)を鋳型プラスミドとして、表1に示した配列番号の合成ヌクレオチドの組み合わせでPCR反応を行った。次いで、増幅されたDNAを含むベクターを用いて大腸菌JM109株を形質転換し、生育したコロニーが保持するプラスミドDNA中のMpGDHをコードするDNAの塩基配列決定を行うことにより、配列番号1に記載のアミノ酸配列の83位のバリンがアラニンに、42位のアラニンがグリシンに、83位のバリンがグリシンに、174位のセリンがプロリンに、174位のセリンがロイシンに、367位のスレオニンがアラニンに、367位のスレオニンがセリンに、367位のスレオニンがアスパラギンに、385位のアラニンがスレオニンに、385位のアラニンがアスパラギン酸に、385位のアラニンがアルギニンに、386位のスレオニンがバリンに、386位のスレオニンがイソロイシンに、386位のスレオニンがグリシンに、386位のスレオニンがロイシンに、386位のスレオニンがグルタミン酸に、386位のスレオニンがグルタミンに、386位のスレオニンがアスパラギンに、386位のスレオニンがセリンに、391位のロイシンがバリンに、460位のフェニルアラニンがチロシンに、460位のフェニルアラニンがロイシンに、461位のスレオニンがメチオニンに、461位のスレオニンがフェニルアラニンに、461位のスレオニンがグリシンに、461位のスレオニンがアスパラギン酸に、461位のスレオニンがシステインに、467位のセリンがロイシンに、467位のセリンがメチオニンに、467位のセリンがイソロイシンに、467位のセリンがバリンに、467位のセリンがアスパラギン酸に、467位のセリンがグルタミン酸に、468位のグリシンがスレオニンに置換された組換え体プラスミドであるpYE2C−Mp−A42G、pYE2C−Mp−V83A、pYE2C−Mp−V83G、pYE2C−Mp−S174P、pYE2C−Mp−S174L、pYE2C−Mp−T367A、pYE2C−Mp−T367S、pYE2C−Mp−T367N、pYE2C−Mp−A385T、pYE2C−Mp−A385D、pYE2C−Mp−A385R、pYE2C−Mp−T386V、pYE2C−Mp−T386I、pYE2C−Mp−T386G、pYE2C−Mp−T386L、pYE2C−Mp−T386E、pYE2C−Mp−T386Q、pYE2C−Mp−T386N、pYE2C−Mp−T386S、pYE2C−Mp−L391V、pYE2C−Mp−F460Y、pYE2C−Mp−F460L、pYE2C−Mp−T461M、pYE2C−Mp−T461F、pYE2C−Mp−T461G、pYE2C−Mp−T461D、pYE2C−Mp−T461C、pYE2C−Mp−S467L、pYE2C−Mp−S467M、pYE2C−Mp−S467I、pYE2C−Mp−S467V、pYE2C−Mp−S467D、pYE2C−Mp−S467E、pYE2C−Mp−G468Tをそれぞれ取得した。
次いで、部位特異的変異を導入した上述の各種改変型MpGDHをコードする組換え体プラスミドpYE2C−Mp−A42G、pYE2C−Mp−V83A、pYE2C−Mp−V83G、pYE2C−Mp−S174P、pYE2C−Mp−S174L、pYE2C−Mp−T367A、pYE2C−Mp−T367S、pYE2C−Mp−T367N、pYE2C−Mp−A385T、pYE2C−Mp−A385D、pYE2C−Mp−A385R、pYE2C−Mp−T386V、pYE2C−Mp−T386I、pYE2C−Mp−T386G、pYE2C−Mp−T386L、pYE2C−Mp−T386E、pYE2C−Mp−T386Q、pYE2C−Mp−T386N、pYE2C−Mp−T386S、pYE2C−Mp−L391V、pYE2C−Mp−F460Y、pYE2C−Mp−F460L、pYE2C−Mp−T461M、pYE2C−Mp−T461F、pYE2C−Mp−T461G、pYE2C−Mp−T461D、pYE2C−Mp−T461C、pYE2C−Mp−S467L、pYE2C−Mp−S467M、pYE2C−Mp−S467I、pYE2C−Mp−S467V、pYE2C−Mp−S467D、pYE2C−Mp−S467E、pYE2C−Mp−G468Tを用いて、試験例(2)の項目に従って、Inv−Sc株の形質転換及び取得された形質転換株(Sc−Mp−A42G、Sc−Mp−V83A、Sc−Mp−V83G、Sc−Mp−S174P、Sc−Mp−S174L、Sc−Mp−T367A、Sc−Mp−T367S、Sc−Mp−T367N、Sc−Mp−A385T、Sc−Mp−A385D、Sc−Mp−A385R、Sc−Mp−T386V、Sc−Mp−T386I、Sc−Mp−T386G、Sc−Mp−T386L、Sc−Mp−T386E、Sc−Mp−T386Q、Sc−Mp−T386N、Sc−Mp−T386S、Sc−Mp−L391V、Sc−Mp−F460Y、Sc−Mp−F460L、Sc−Mp−T461M、Sc−Mp−T461F、Sc−Mp−T461G、Sc−Mp−T461D、Sc−Mp−T461C、Sc−Mp−S467L、Sc−Mp−S467M、Sc−Mp−S467I、Sc−Mp−S467V、Sc−Mp−S467D、Sc−Mp−S467E、Sc−Mp−G468T、)の培養を行い、培養上清中のGDH活性を測定した。
続いて、GDH活性が確認された上述の各種変異体の培養上清を用いて、上記の試験例(2)の項目の手順に基づき、D−グルコースへの反応性に対するD−キシロースへの反応性の割合「Xyl/Glc(%)」及び「Xyl/Glc比率」を測定した。
なお、例えば、表1において、「V83A」は83位のV(Val)をA(Ala)に置換することを意味する。
Figure 2016076364
表1に示すとおり、配列番号1の野生型MpGDHに対する42位、83位、174位、367位、385位、386位、391位、460位、461位、467位、または468位への部位特異的変異導入、具体的には、A42G、V83A、V83G、S174P、S174L、T367A、T367S、T367N、A385T、A385D、A385R、T386V、T386I、T386G、T386L、T386E、T386Q、T386N、T386S、L391V、F460Y、F460L、T461M、T461F、T461G、T461D、T461C、S467L、S467M、S467I、S467V、S467D、S467E、G468Tの部位特異的変異を導入することにより、FAD−GDHのキシロースへの反応性が低下することが確認された。
[実施例2]
(各種改変型MpGDHにおける比活性の評価)
実施例1で取得した変異体A42G、T367A、A385T、T386S、F460Y、S467V、S467D、S467Eの比活性を測定した。試験例(3)で記述した方法に従って、pYE2C−Mp(野生型)を鋳型プラスミドとして、表2に示した配列番号の合成ヌクレオチドの組み合わせでPCR反応を行った。次いで、増幅されたDNAを含むベクターを用いて大腸菌JM109株を形質転換し、生育したコロニーが保持するプラスミドDNA中のMpGDHをコードするDNAの塩基配列決定を行うことにより、配列番号1に記載のアミノ酸配列の367位のスレオニンがアラニンに、385位のアラニンがスレオニンに、386位のスレオニンがセリンに、460位のフェニルアラニンがチロシンに、467位のセリンがバリンに、467位のセリンがアスパラギン酸に、467位のセリンがグルタミン酸に置換された組換え体プラスミドであるpYE2C−Mp−A42G、pYE2C−Mp−T367A、pYE2C−Mp−A385T、pYE2C−Mp−T386S、pYE2C−Mp−F460Y、pYE2C−Mp−S467V、pYE2C−Mp−S467D、pYE2C−Mp−S467Eをそれぞれ取得した。
次いで、部位特異的変異を導入した上述の各種改変型MpGDHをコードする組換え体プラスミドpYE2C−Mp−A42G、pYE2C−Mp−T367A、pYE2C−Mp−A385T、pYE2C−Mp−T386S、pYE2C−Mp−F460Y、pYE2C−Mp−S467V、pYE2C−Mp−S467D、pYE2C−Mp−S467Eを用いて、試験例(3)の項目に従って、Inv−Sc株の形質転換及び取得された形質転換株(Sc−Mp−A42G、Sc−Mp−T367A、Sc−Mp−A385T、Sc−Mp−T386S、Sc−Mp−F460Y、Sc−Mp−S467D、Sc−Mp−S467E)の培養を行い、培養上清中のGDH活性を測定した。
続いて、GDH活性が確認された上述の各種変異体の培養上清を用いて、上記の試験例(2)の項目の手順に基づき、D−グルコースへの反応性に対するD−キシロースへの反応性の割合「Xyl/Glc(%)」及び「Xyl/Glc比率」を測定した。
続いて、GDH活性が確認された上述の各種変異体の培養上清を用いて、上記の試験例(3)の項目の手順に基づき、精製を行った上、精製した酵素の比活性を測定し「相対比活性」を計算した。
比較例として特許文献7記載のpYE2C−Mp−L121M、pYE2C−Mp−W123V、pYE2C−Mp−S612C、pYE2C−Mp−W569Yを試験例(1)の項目に従ってInv−Sc株の形質転換及び取得された形質転換株(Sc−Mp−L121、Sc−Mp−W123V、Sc−Mp−S612C、Sc−Mp−W569Y)の培養を行い、培養上清のGDH活性を測定した。
続いて、GDH活性が確認された上述の各種変異体の培養上清を用いて試験例(2)の項目の手順に基づき、D−グルコースへの反応性に対するD−キシロースへの反応性の割合「Xyl/Glc(%)」及び「Xyl/Glc比率」を測定した。
続いて、GDH活性が確認された上述の各種変異体の培養上清を用いて、上記の試験例(3)の項目の手順に基づき、精製を行った上、精製した酵素の「相対比活性(%)」を測定した。
比較例はいずれも基質特異性は34〜64%と低くなっているものの、相対比活性が60%程度であった。一方、本発明酵素は比活性65%以上を維持したまま、基質特異性が1割以上向上している。
Figure 2016076364
[実施例3]
(各種改変型MrdGDHの調製と基質特異性評価)
特開2013−176363号公報において、MpGDHと73%の同一性を有する、配列番号56のMucor RD056860由来のGDH(以下、MrdGDH)の配列情報が公開されている。そこで、実施例1で見出したアミノ酸置換をMrdGDHに導入することで、同様にキシロースへの反応性が低減するかどうかを以下のように検証することにした。まず、配列番号56のアミノ酸をコードし、組み換え発現用にコドンを改変した配列番号57の塩基配列を全合成により取得した。これを鋳型として、配列番号58、59の合成ヌクレオチド、Prime STAR Max DNAポリメラーゼ(TaKaRa社製)を用い、添付のプロトコールに従ってPCR反応を行った。PCR反応液を1.0%アガロースゲルで電気泳動し、RECOCHIP(TakaRa社製)を用いて、約2kbの「インサート用DNA断片」を精製した。また、Saccharomyces cerevisiaeの発現用プラスミドpYES2/CT(Invitrogen社製)を制限酵素KpnI(New EnglandBiolabs社製)で処理し、制限酵素処理後の反応液を1.0%アガロースゲルで電気泳動し、RECOCHIP(TakaRa社製)を用いて、約6kbの「ベクター用DNA断片」を精製した。続いて、In−Fusion HD Cloning Kit(Clontech社製)を用いて添付のプロトコールに従って、精製した「インサート用DNA断片」および「ベクター用DNA断片」を連結し、GAL1プロモーター下でMpGDHを発現するための組換え体プラスミドpYE2C−Mrdを作製した。次に、上記試験例で記述した方法と同様にして、pYE2C−Mrd(野生型)を鋳型プラスミドとして、表3に示した配列番号の合成ヌクレオチドの組み合わせでPCR反応を行った。なお、MrdGDHにおけるMpGDHに対応する位置はWEB上のマルチプルアライメントプログラムClustalW(http://www.genome.jp/tools/clustalw/)を利用して決定した。これにより、MpGDHにおける386位のスレオニン、467位のセリンに対応する位置は、MrdGDHではそれぞれ383位のスレオニン、464位のスレオニンであった。次いで、増幅されたDNAを含むベクターを用いて大腸菌JM109株を形質転換し、生育したコロニーが保持するプラスミドDNA中のMrdGDHをコードするDNAの塩基配列決定を行うことにより、配列番号56に記載のアミノ酸配列の383位のスレオニンがセリンに、383位のスレオニンがアスパラギンに、464位のスレオニンがアスパラギン酸に、464位のスレオニンがグルタミン酸に置換された組換え体プラスミドであるpYE2C−Mrd−T383S、pYE2C−Mrd−T383N、pYE2C−Mrd−T464D、pYE2C−Mrd−T464Eをそれぞれ取得した。
次いで、部位特異的変異を導入した上述の各種改変型MrdGDHをコードする組換え体プラスミドpYE2C−Mrd−T383S、pYE2C−Mrd−T383N、pYE2C−Mrd−T464D、pYE2C−Mrd−T464Eを用いて、試験例(2)の項目に従って、Inv−Sc株の形質転換及び取得された形質転換株(Sc−Mrd−T383S、Sc−Mrd−T383N、Sc−Mrd−T464D、Sc−Mrd−T464E)の培養を行い、培養上清中のGDH活性を測定した。
続いて、GDH活性が確認された上述の各種変異体の培養上清を用いて、上記の試験例(2)の項目の手順に基づき、D−グルコースへの反応性に対するD−キシロースへの反応性の割合「Xyl/Glc(%)」及び「Xyl/Glc比率」を測定した。
Figure 2016076364
表3に示すとおり、配列番号56の野生型MrdGDHに対する383位、464位への部位特異的変異導入、具体的には、T383S、T383N、T464D、T464Eの部位特異的変異を導入することにより、MpGDHと同様にキシロースへの反応性が低下することが確認された。
また、上述のMrdGDHの変異体(T383S、T464D)の培養上清を用いて、上記の試験例(3)の項目の手順に基づき、精製した酵素の比活性を測定し「相対比活性」を計算した。その結果、T383S、T464Dの相対比活性はそれぞれ100%、123%であり、これらの変異はMrdGDHにおいても比活性を低下させることなく、キシロースへの反応性を低下させるために非常に有効であることがわかった。
以上のように、本発明のFAD−GDHは、比活性を維持しつつ、D−グルコースへの基質特異性が十分に高いため、D−キシロース等のD−グルコース以外の糖化合物を多量に含有する条件下で試料中のD−グルコースを測定する場合や、酵素濃度の濃い条件下においても、D−グルコース濃度を正確に測定ができ、例えば、グルコースセンサーへの応用等において、従来のFAD−GDHを用いた場合に比べて、より高精度かつ高感度な測定が可能になることが期待される。

Claims (10)

  1. 配列番号1で示されるアミノ酸配列、または該アミノ酸配列と70%以上同一なアミノ酸配列、又は該アミノ酸配列において1もしくは数個アミノ酸が欠失、置換もしくは付加されたアミノ酸配列を有し、
    配列番号1記載のアミノ酸配列における42位のアラニンに対応する位置、
    配列番号1記載のアミノ酸配列における83位のバリンに対応する位置、
    配列番号1記載のアミノ酸配列における174位のセリンに対応する位置、
    配列番号1記載のアミノ酸配列における367位のスレオニンに対応する位置、
    配列番号1記載のアミノ酸配列における385位のアラニンに対応する位置、
    配列番号1記載のアミノ酸配列における386位のスレオニンに対応する位置、
    配列番号1記載のアミノ酸配列における391位のロイシンに対応する位置、
    配列番号1記載のアミノ酸配列における460位のフェニルアラニンに対応する位置、
    配列番号1記載のアミノ酸配列における461位のスレオニンに対応する位置、
    配列番号1記載のアミノ酸配列における467位のセリンに対応する位置、および配列番号1記載のアミノ酸配列における468位のグリシンに対応する位置よりなる群から選択されるアミノ酸に対応する位置で1つまたはそれ以上のアミノ酸置換を有し、前記置換を行う前と比較して、D−グルコースへの反応性に対するD−キシロースへの反応性の割合(Xyl/Glc(%))が低減していることを特徴とする、フラビン結合型グルコースデヒドロゲナーゼ。
  2. 配列番号1で示されるアミノ酸配列、または該アミノ酸配列と90%以上同一なアミノ酸配列、又は該アミノ酸配列において1もしくは数個アミノ酸が欠失、置換もしくは付加されたアミノ酸配列に対応する位置のアミノ酸が、
    配列番号1記載のアミノ酸配列における42位のアラニンに対応する位置のアミノ酸がグリシンであるか、
    配列番号1記載のアミノ酸配列における83位のバリンに対応する位置のアミノ酸がアラニン、グリシンのいずれかであるか、
    配列番号1記載のアミノ酸配列における174位のセリンに対応する位置のアミノ酸がプロリン、ロイシンのいずれかであるか、
    配列番号1記載のアミノ酸配列における367位のスレオニンに対応する位置のアミノ酸がアラニン、セリン、アスパラギンのいずれかであるか、
    配列番号1記載のアミノ酸配列における385位のアラニンに対応する位置のアミノ酸が、スレオニン、アスパラギン酸、アルギニンのいずれかであるか、
    配列番号1記載のアミノ酸配列における386位のスレオニンに対応する位置のアミノ酸がバリン、イソロイシン、グリシン、ロイシン、グルタミン酸、グルタミン、アスパラギン、セリンのいずれかであるか、
    配列番号1記載のアミノ酸配列における391位のロイシンに対応する位置のアミノ酸がバリンであるか、
    配列番号1記載のアミノ酸配列における460位のフェニルアラニンに対応する位置のアミノ酸がチロシン、ロイシンのいずれかであるか、
    配列番号1記載のアミノ酸配列における461位のスレオニンに対応する位置のアミノ酸がメチオニン、フェニルアラニン、グリシン、アスパラギン酸、システインのいずれかであるか、
    配列番号1記載のアミノ酸配列における467位のセリンに対応する位置のアミノ酸がロイシン、メチオニン、イソロイシン、バリン、アスパラギン酸、グルタミン酸のいずれかであるか、
    または配列番号1記載のアミノ酸配列における468位のグリシンに対応する位置のアミノ酸がスレオニンであるフラビン結合型グルコースデヒドロゲナーゼ。
  3. D−グルコースへの反応性に対するD−キシロースへの反応性の割合(Xyl/Glc(%))が、前記の置換を導入する前と比較して10%以上低減していることを特徴とする請求項1又は2記載のフラビン結合型グルコースデヒドロゲナーゼ。
  4. 請求項1〜3のいずれかに記載のフラビン結合型グルコースデヒドロゲナーゼをコードするフラビン結合型グルコースデヒドロゲナーゼ遺伝子。
  5. 請求項4記載のフラビン結合型グルコースデヒドロゲナーゼ遺伝子を含む組換えベクター。
  6. 請求項5記載の組換え体ベクターを含む宿主細胞。
  7. フラビン結合型グルコースデヒドロゲナーゼを製造する方法であり、以下の工程を含む方法:
    (a)請求項6に記載の宿主細胞を培養する工程、
    (b)前記宿主細胞中に含まれるフラビン結合型グルコースデヒドロゲナーゼ
    遺伝子を発現させる工程、
    (c)前記培養物からフラビン結合型グルコースデヒドロゲナーゼを単離する工程。
  8. 請求項1〜3に記載のフラビン結合型グルコースデヒドロゲナーゼを用いることを特徴とするグルコース測定方法。
  9. 請求項1〜3に記載のフラビン結合型グルコースデヒドロゲナーゼを含むグルコースアッセイキット。
  10. 請求項1〜3に記載のフラビン結合型グルコースデヒドロゲナーゼを含むグルコースセンサー。
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Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US11046993B2 (en) * 2015-10-30 2021-06-29 Kikkoman Corporation Glucose dehydrogenase having modified electron transfer properties, and glucose measurement method

Families Citing this family (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2019022083A1 (ja) * 2017-07-24 2019-01-31 国立研究開発法人理化学研究所 デカルボキシラーゼ、及びそれを用いた不飽和炭化水素化合物の製造方法
JP2021078354A (ja) 2018-03-08 2021-05-27 有限会社アルティザイム・インターナショナル フラビンアデニンジヌクレオチドグルコース脱水素酵素とシトクロム分子との融合タンパク質

Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2013022074A1 (ja) * 2011-08-11 2013-02-14 東洋紡株式会社 新規なグルコース脱水素酵素
WO2013065623A1 (ja) * 2011-10-31 2013-05-10 東洋紡株式会社 新規なグルコース脱水素酵素
WO2013065770A1 (ja) * 2011-11-02 2013-05-10 キッコーマン株式会社 基質特異性が向上したフラビン結合型グルコースデヒドロゲナーゼ

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* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP6526572B2 (ja) * 2013-12-27 2019-06-05 キッコーマン株式会社 熱安定性が向上したフラビン結合型グルコースデヒドロゲナーゼ

Patent Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2013022074A1 (ja) * 2011-08-11 2013-02-14 東洋紡株式会社 新規なグルコース脱水素酵素
WO2013065623A1 (ja) * 2011-10-31 2013-05-10 東洋紡株式会社 新規なグルコース脱水素酵素
WO2013065770A1 (ja) * 2011-11-02 2013-05-10 キッコーマン株式会社 基質特異性が向上したフラビン結合型グルコースデヒドロゲナーゼ

Non-Patent Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
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DATABASE UNIPROTKB[ONLINE], ACCESSION NO.S2J876, 18-09-2013 UPLOADED, [RETRIEVED ON 04-01-2016], RET, JPN6016001335, ISSN: 0004283186 *

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US11046993B2 (en) * 2015-10-30 2021-06-29 Kikkoman Corporation Glucose dehydrogenase having modified electron transfer properties, and glucose measurement method

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