JPH07509604A - 植物の過敏反応の誘導因子 - Google Patents

植物の過敏反応の誘導因子

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JPH07509604A
JPH07509604A JP6503402A JP50340294A JPH07509604A JP H07509604 A JPH07509604 A JP H07509604A JP 6503402 A JP6503402 A JP 6503402A JP 50340294 A JP50340294 A JP 50340294A JP H07509604 A JPH07509604 A JP H07509604A
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ヘ、シェン−ヤン
ラビィ、ロン
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Abstract

(57)【要約】本公報は電子出願前の出願データであるため要約のデータは記録されません。

Description

【発明の詳細な説明】 植物の過敏反応の誘導因子 本発明をなすに至った研究についての部分的支持は、合衆国農務省からの基金に より与えられた。従って合衆国政府は、35USC200以下参照の下、本発明 に対し、ある不動の権利を有する。
ヒト及び動物と同様に植物も細菌による傷害及び破壊を受ける。世界的基準で、 エルウィニア、シュードモナス及びキサントモナス属に分類される細菌は、細菌 性植物病原体によるほとんどの破壊に関与する。植物の多(の細菌性病気は、農 民に散発的基準で大きな破壊をもたらす。破壊は、冒された植物の死滅、外観破 損又は生産力減少に起因する。
植物の多くの細菌病原体は、それらが感染する植物への顕著な程度の特異性を示 す。例えばエルウィニア・アミロボラは、リンゴ、ナシ及びロサヶアエ族の関連 植物に感染する。他の植物は、E、アミロボラにさらされても病気にならない。
しかしながら、十分な細胞のEアミロボラが他の植物の葉組織に導入されると、 葉肉組織は数時間内に崩壊する。この崩壊は過敏反応(HR)と呼ばれており、 HRの間、細菌は崩壊組織内に範囲を定められ、結局死滅し、従って全体として 植物に大きな損害を与えないので、それは植物の防御反応と考えられる。
細胞性植物病原体がHR誘導能力を必要とする遺伝子は、過敏反応及び病原性に 対するhrp遺伝子と呼ばれ、又、病気を起こすために必要とされる。しかしな がら、hrp遺伝子の生成物並びにどのようにそれらがHRの誘導中、及び病気 の発展中に作用するかは、本発明前、未知の状態にあった。本発明はHRに見ら れる崩壊の原因であり、病気の発展に必要であるhrp遺伝子(誘導因子)の生 成物に関する。
細菌病原体とそれらの植物宿主との間の相互作用は、一般に二つのカテゴリー( 1)宿主植物での細胞内細菌生育、症状発展及び病気発展に導く適合性(病原体 宿主)並びに(2)進行性病気症状ではな(、起きる特別な型の不適合性相互作 用、過敏反応となる不適合(病原体非宿主)に分けられる。宿主植物での適合性 相互作用の間、細菌集団は劇的に増加し、進行性症状が起きる:不適合性相互作 用の間、細菌集団は増加せず、進行性症状は起きない。
高い植物の過敏反応は、不適合性病原体(他の植物でのみ病原性である微生物) を含む組織の急速な局部崩壊及び死滅により特徴付けられ、そして多くの細菌、 かび、線虫及びウィルスに対する植物の防御と関連する〔フィトパソゲニック・ プロカリオテ入 (M、S、マウント及びG、 H,ラシイ編集)アカデミツク ・プレス、ニューヨーク、pp149−177 (1982)参照〕。細菌によ る過敏反応の惹起は、タバコ葉の細胞内空間を107細胞/mlの不適合性病原 体で浸透したとき、1963年に初めて証明された。浸透領域は24−48時間 内に崩壊し、細菌増殖を支持するのをやめる〔ネイチャー199 : 299( 1963)参照〕。従って、HRでは病原体は局在し、さらなる生長を制限する 。
実験室でHRを証明するのに用いられる技術は、容易である。タバコ葉の細胞内 空間は、慣用のまっすぐな解剖針で葉に扇形集落をまず穿刺することにより浸透 する。次いで、細菌の0.1−0.5mlの細菌細胞懸濁液(通常10’−10 ”生存細胞/m1)を含むl+1容量シリンジ(針を有しない)を葉の一方の側 に対して穿刺で直接押しつける。葉の反対側に指を押しつけて葉を安定にし、穿 刺領域から液がもれるのを防ぐ一方、シリンジプランジャーをゆるやかに押しつ けて細菌呼局液を葉に導入する。浸透は、水浸漬領域が約1−4cm2葉に現れ ると成功したと考えられる。
過敏反応誘発の機構を説明するのに提案された普通の仮説は、植物細胞で特異レ セプターと反応する特異誘導因子の細菌による生成を含む。しかしながら、潜在 性病原体に対する本反応についての分子基底(遺伝子及び遺伝子生成物)は、H Rが1963年に初めて記載されて以来、植物病原体による研究が続けられてい るにもかかわらず、本発明前未知であった。
生理的及び遺伝的観察は、非宿主で過敏反応を誘導する同じ細菌因子が宿主での 病原性にも必要であることを示唆する。
過敏反応の誘導因子の生成は、幾つかのhrp遺伝子のクラスターにより調節さ れ、そしてそれは高度に保存され、又、多くの種の植物病原性細菌間でしばしば 相互交換可能である。個々の及び幾つかのhrp遺伝子は他のものによりクロー ンされて来たが、hrp遺伝子の機能的クラスターは、エルウィナ・アミロボラ 及びツユ−トモナス・ノリンが工からのみクローンされた。これらのクラスター は、非病原性細菌にタバコ及び他の葉での過敏反応を誘導する能力を与えること を示して来た〔モレキュラー・プラント−マイクローブ・インターラクションズ 4:132(1991)、ツヤ−ナル・オブ・バクテリオロジイ170.474 8(1988)及びビアー等、アトパンスズ・イン・モレキュラー・ジエネテイ クス・オブ・プラント−マイクローブ・インターラクンヨンズ(H,ヘネソク及 びり、 P、 S、パーマ編集)クルワー・アカデミツク・バブリソノヤーズ、 ボストン、pp53−60(1991)参照〕。
本発明によれば、誘導因子は、E コリDH5α(pCPP43)から初めて、 次いで、リンゴやナシのようなバラ科植物の腐ラン病として知られる病気を生ず る細菌、野生型法のE、アミロボラから分離、精製された。本発明によれば、名 称「バービン」はE、アミロボラ由来の過敏反応誘導因子に提案される。本誘導 因子は、多くの異なる植物病原性細菌により生成されるプロテナーゼ性(pro teinaccous) )(R誘導因子の族についての原型であると考えられ る。
従って、本発明の一局面は、細菌から分離された特異誘導因子蛋白が、非宿主植 物に適用したとき、蛋白を生成した細菌の生存細胞により惹起される反応と類似 の毒性反応を生ずることを記載することである。本発明の別の局面は、誘導因子 をコード化している遺伝子を分離し、記載することであり、それは正確に調節さ れた方法でその毒性効果を発揮する誘導因子蛋白を植物又は他の生物に生じさせ るのに用い得よう。
本発明の別の局面は、これらの蛋白を不活性化し、死滅し又はこれらと結合する 技術の計画及び開発を可能にするこれらの蛋白の特徴付は及び同定を提供するこ とである。本局面は、細菌の宿主植物に病気を生ずるためにそれらを生成する細 菌により同一蛋白が必要とされることが知られているので、必要とされる。蛋白 の毒性効果を中和することは、病気でのそれらの役割を中和し、植物の病気を減 少させる。
本発明のさらに別の局面は、これらの蛋白に対する抗体を発達させ、生成された 抗体を配列決定し、植物のゲノムに正しく挿入された場合に、植物に抗体を発現 させるであろう核酸配列を構築し、かくして細菌が植物に病気を生じさせるのを 防止することである。
本発明の一部分は、エルウィニア・アミロボラのhrp遺伝子クラスターの特異 hrp遺伝子の同定に基づく。その特異遺伝子は転写され、翻訳されて過敏反応 のそのプロテナーゼ性誘導因子を生じる。本発明の他蛋白は、エルウィニア、キ サントモナス及びEアミロボラ由来のHR誘導因子と類似の蛋白をコード化して いる/ニードモナス種からの同種遺伝子の同定を処理する。本発明の完成前、過 敏反応のプロテナーゼ性誘導因子の分離は報告されていない。従って、本発明の 他の部分は、過敏反応のプロテナーゼ性誘導因子の分離及び精製の技術の記載で ある。本発明の付加的部分は、バーピンの生成を増強するHR誘導因子蛋白をコ ード化している遺伝子の遺伝操作に関する。
従って、本発明の種々の部分及び局面は、リンゴ、ナシ及び他のバラ科植物の腐 ラン病の病原体、エルウィニア・アミロボラに対する予防を提供することに係る と要約しつる。加えて、本発明は広く、種々の植物の他の病気を起こすエルウィ ニア、シュードモナス及びキサントモナス属の細菌に対する予防を提供すること に係る。
本発明のよき理解を与えるために、本発明の記載に引用される細菌種、コスミド 及びプラスミドに関連する以下の用語を示す。
DH5α クローニングに通常通りに用いられるエセリシア・コリの実験棟、 Ea321 全てのミュータント及びクローンが誘導されたエルウィニア・アミ ロボラの野生型法、 Ba321T143 Hrp機能の回復のためのニスミドライブラリイ(pCP P9ベクター中)をスクリーンするのに用いたトランスポゾンTn5を含むミュ ータント。本スクリーニングの結果、ニスミドpcPP430の同定となった。
(本ミュータントはhrp遺伝子の一つに挿入を有し、hrpNはな(、挿入の 影響は、オペロンの変異誘発によりバーピンの発現を防止することである。) Ba321に49 バーピン生成の調節に含まれるhrp遺伝子に挿入されるT nlOミニkan )ランスポゾンを含むhrpミュータント。
Ba321T5 Tn5tacl無極トランスポゾンにより変異誘発されたhr pN遺伝子を含むhrpミュータント。(本Ea321のミュータントはバーピ ンをコード化している遺伝子に挿入を有する)。
pCP P 9 E、アミロボラのDNAのクローニングのために構築したコス ミドベクター。pcPP430のベクタ一部分。
pc P P 430 Ba321全hrp遺伝子クラスターを含む46.5k bのBa321DNAを含んでいるニスミド。本コスミドは、E。
コリにHRを惹起する能力を与え、Hrp表現型をE、アミロボラの全Hrpミ ュータントに回復する。hrpNが誘導されたクローン。
pcPP1084 pcPP430由来の1.3kbHindl[I断片を含ん でいるプラスミドで、それは全hrpN (1155塩基対)を含む。ベクター はp B 1uescript M 13.である。
pcPP50 マスイ等(バイオ/チクノロシイ、1984年1月pp81−8 5)のplNIII■3−A2を修飾することにより発達させたプラスミド。元 の断片は削除し、p B 1uescript由来の断片を挿入した。修飾を行 いバービン生成により適したベクターを産生させるようにした。
pcPP2139 E、:Iりで、バーピンの過生成(superproduc tion)となるプラスミド。pcPP430からpcPP50i:hrpN遺 伝子をクローニングすることにより構築される。
pBluescript M134 DNAのサブクローニング及び配列決定に 通常通りに用いられるプラスミド。クローン化DNAから蛋白のインビトロ発現 にも用いられる。
さらに、本明細書全般で用いられるこれらの及び他の用語は、モレキュラー・プ ラント−マイクローブ・インターラクンヨンズ4 (り) : 493(199 1)及びアトパンスズ・イン・モレキュラー・ジエネティクス・オブ・プラント ーマイクローブス・インターラクション1 : 53(1991)に見出しうる 。
E、コリDH5α(pcPP1084)及びE、アミロボラEa321はいずれ もメリーランド、ロックビルのアメリカン・タイプ・カルチャー・コレクション に寄託されている。これらの寄託番号は、それぞれATCC69021及びAT CC49947である。ATCC69021の寄託は、ブダペスト条約の下にな され、培養株は本条約の規定に従って入手することができるであろう。
本発明によるHR誘導因子及び遺伝子の同定、分離、精製及び特徴付けに関する 種々の局面は、以下の図面及び実施例からより明らかに理解でき、それらの全て は本発明を明瞭にする目的のために提供されるのであって、その範囲を限定する ためのものではない。
図1は、エルウィニア・アミロボラのhrpクラスターの制限エンドヌクレアー ゼマツプであり、そして 図2は、タバコ細胞浮遊培養の水浴溶液(bathing 5olution) のpHの変化を描く。
より詳しくは、図1はエルウィニア・アミロボラのhrpクラスターの制限エン ドヌクレアーゼマツプを示し、rEJはEcoRIを示し、rHJはHindI IIを示し、そしてrBJはE3amH13日部位を示す。斜線はHRを惹起し 、ナシに病原性である能力に対するそれらの効果を試験したトランスポゾン挿入 の位置を示す。
全ての示された挿入を伴うエルウィニア・アミロボラEa321(モレキュラー ・プラント−マイクローブ・インターラクションズ1 (3) :135(19 88)参照〕及びE、コリDH5α(pcPP430)の代謝活性細胞は、タバ コでの過敏反応を起こすことができない。全ての示された挿入により囲まれた部 分は、タバコ細胞浮遊培養のK”/H”交換反応の惹起にとっても必須である。
全ての示された挿入を含んでいるBa321の誘導体はナシに対し病原性でない 。
図2についてより詳しくは、コントロール値(付加なし)はグラフ作成前に引い た。白画角はバーピン(60nM)を示し、白丸はE、コリDH5α(pCP  P2S5)の細胞(5X 10’細細胞用1)を示し、黒画角はE、アミロボラ Ea321の細胞(5xlO’細胞/m1)を示し、三角はE、コリDH5(I E (pCPP430に49)の細胞(5X 10’細胞/ml)を示し、菱形 はE、アミロボラEa321に49の細胞(5X 10’細!/1111)を示 し、そして黒丸はE、コリDH5α(pCPP9)の細胞(5X10’細胞/m l)を示す。タバコ細胞浮遊培養は示された調製物と共に室温で振盪した。pH を示された間隔で測定した。タバコ葉でHRを惹起した全ての調製物もタバコ細 胞浮遊培養媒体中pH上昇を生じた。
実施例1 プラスミドpcPP430は、Ba321として我々の実験室で知られるE、ア ミロホラの野生型株のゲノムDNAのライブラリィから確認し、そしてアメリカ ン・タイプ・カルチャー・コレクションに49947として寄託されている。株 は、1978年1ニフレンチ・ナショナル・コレクション・オブ・フイトパソゲ ニツク・バクテリアから受理し、そこではそれは、CNFB1367として知ら れている。
ゲノムD N Aを既に記載された方法〔モレキュラー・プラント−マイクロー ブ・インターラクンヨンズ1 : 135 (1988)参照〕に従って分離し 、5au3Aで切断し、あらかじめBamHlで切断したpcPP9のコスミド ベクターに連結し、パッケージし、そしてEコリ株ED8767に移入した。得 られるニスミドは、ヘルパープラスミドpRK2013[バウアー、D、W、、 モレキュラー・ジエネテイクス・オブ・パソゲニシティ・オブ・エルウィニア・ アミ口ボラ:テクニクス、ツールズ・アンド・ゼア・アプリケーション、博士論 文、コーネル・ユニバーシティ、イサ力、NY(1988))の助けをかりて接 合により株に移動させた。
得られるライブラリィを希釈し、スペクチノマイシン及びカナマイシンを共に最 終濃度50μgm/mlを含む普通寒天のプレート上に塗布した。37℃で24 時間インキュベーション後、約500コロニーを含むプレートを、各コロニーの 直径が0.5−1.0mmであるときに選択した。これらのプレートからコロニ ーを、その上に領1mlの株Ea321T143のWP!濁液をあらかじめ塗布 した、ルリアーバータニ寒天(LA)を含むプレート上にレプリカスタンプした 。Ba321T143はBa321のTnlO誘発Hrp−ミュータント株であ る。それはナシ果実に病原性でなく、タバコ及び他の植物でHRを惹起しない。
それはテトラマイ7ン(10ugm/ml)をプラスしたルリアブロス中、O− D、 gzo= 1.3まで生育した。
LAプレートを5時間28℃でインキュベートし、これらのプレート上の増殖を 、グルコース2g/l、アスパラギン1.5 g/Lクエン酸ナトナトリウム0 5g/L Mg5045mg/l、ニコチン酸125g/l、(NH4)tsO 41g/l、K2HPO43,51g/l、KH2PO41,51g/l及び5 0mg/lスペクチノマイシン及び10mg/lテトラサイクリンを含む、エル ウィニア・アミロボラの生育用の最小培地にレプリカプレートした。本操作は、 Ba321のライブラリィの種々のニスミドを含んだBa321T143のトラ ンスコンシュガントを選択した。28℃で48時間のインキュベーション後、未 成熟なナシ果実の新しくカットした薄片をトランスコンシュガントの各薄片の表 面に押しつけてナシ薄片下方の全コロニーをナシ組織と接触させた。ナシ薄片を 上下逆にし、よく湿らせた紙タオルを並べたプラスチック箱中でインキュベート し、5日まで毎日、小滴の浸出液の存在を観察した。未熟ナシ果実は開花後約6 週間に、ピルス・コムニスcv。
バルトレトの木から採集した。果実は直径2〜4cmで、それらは使用するまで 0〜2℃で貯蔵した。本発明の本記載で用いた浸出液は、大部分が生存細菌細胞 からなる植物と細菌生成物の混合物である。
浸出液は50μg/++1スペクチノマイノン及び10 IIgm/mlテトラ サイクリンを含むE、アミロボラ最小培地のプレート上に希釈画線し、28℃で 2日間インキュベートし、そして個々のコロニーを無菌のようじでほぐし、Ea 最小寒天+50μg/mlスペクチノマイシン及び10μgm/テトラサイクリ ンの新しいプレート上で繁殖させて病原性を再び試験した。新たにカットしたナ シ果実組織をようじで突き刺し、試験すべき株で汚染した。ナシ果実に病気を生 じたこれらのコロニー由来のニスミドは、0.5アリコートのLB+DH5α、 Ea321 T 143path”トランスコンシュガント(病気を起こす能力 をEa321T143に与えたニスミドを含んているEa321T143の株) 及びpRK2013、ヘルパープラスミドの抗菌物質培養物を一液混合すること により、Ea321T143がらDH5αに移した。結合物を完全に混合し、遠 心し、そしてベレットを抗生物質を存在させることなく、150μmのLブロス に懸濁した。ペレットを完全に再び懸濁し、0.1m1滴をLAプレート上に置 き、塗布することなく寒天中にしみこま也次いでプレートを28℃で5時間イン キュベートした。インキュベーション後、斑点のある生育物を1mlの5mMリ ン酸カリウム緩衝液、pH6,5に再び懸濁し、0.1アリコートをL A + 50 ug/mlスベクチノマインン及び20℃1g/mlナリジクス酸のプレ ートに塗布し、次いでこれを37°Cで48時間インキュベートした。
同時にコロニーをLA+5Qμg/mlスペクチノマインン及びLA+Kmのプ レートにようじで移した。50μg/mlスペクチノマイノンプレート上でのみ 生育し、ヘルパープラスミドpRK2013(Km’)の損失を示すこれらのコ ロニーは、凍結により保存用に、そして、さらに研究するために選択した。
ナ/に病原性を回復させた同じニスミド、本明細書では以下のpcPP430と いう、もタバコでEa321T143の反応に影響を及ぼすがどうかを測定する ため、浮i液をタバコ葉扇形集落に浸透させた。EコリDH5αに維持されるp cPP430の効果を、タバコで試験した。株をルリアブロス+50μg/ml スペクチノマイシン中0Dazo 0.4 0.6 (約108cfu/ ml )に生育させた。
培養物を遠心しく12.OOOXg、1分間) 、5mMIJン酸緩II液pH 6,5元(7)容量中に再び懸濁し、タバコ葉に浸透させた。組織の崩壊が8時 間以内に起きた。
DH5α(単独)又はDH5α(pCPP9)の細胞をタバコ葉に浸透させた場 合、崩壊は観察されなかった。従って、我々は、Ea321の特異DNAを含ん でいるpcPP430がE、コリDH5αにHR反応を起こす能力を与え、そし てpcPP430は本反応に必要な全遺伝子を含んでいると結論付けた。
ニスミドpcPP430に含まれるE、アミロボラ由来のhrp遺伝子はエセリ シア・コリで特によ(発現する〔アドバンシズ・イン・モレキュラー・ジェネテ ィクス・オブ・プラント−マイクローブ・インターラクションズ、上掲;フィト バソロジイ79.1166(1989)及びモレキュラー・プラント−マイクロ ーブ・インターラクンヨンズ4 (5) : 493(1991)参照〕。通常 、Ea321にとってHRを惹起するのにdenova RNA及び蛋白合成が 必要である。しかしながら、E。
:llJ (pcPP430) 及びEa321 (pcPP430)は細菌性 転写又は翻訳インヒビター、例えばリファンピシン及びテトラサイクリンの存在 でHRを惹起する。これは、HR誘導因子が、タバコ葉が細菌で浸透される前に E、コリDH5α(pcPP430)の細胞中/上に存在したことを示す。
HR誘導因子の調査は、E、アミロボラEa321、Ea321 (pcPP4 30)又はE、コリDH5α(pcPP430)の細胞フリー培養上清でタバコ 葉を浸透させることにより始めた。上清は、対数期を送られ適当な抗生物質を含 むLBブロスに6株を生育させることにより生成させた(0. D、 s2o: 約1.0)。他の研究者等の経験〔フィトバソロジイ57 : 322(196 7)参照〕に基づいて、我々が期待したように過敏反応は起きなかった。
株Ea321 (pcPP430)は以下の方法により創生した。
実施例2 株Ea321、E、コリDH5α(pcPP430)及びE、)すDH5α(p RK2013)は、抗生物質はなく、それぞれ50μg/mlスペクチノマイシ ン又はKm5°を含有するLBブロスに一晩生育した。翌朝、Q、5mlアリコ ートの6株をミクロ遠心管中で混合し、2分間遠心し、0.15山1のルリアブ ロス(抗生物質なし)に再び懸濁した。0.1mlアリコートの本¥濁液をルリ ア寒天(抗生物質なし)上にスポットし、5時間28℃でインキュベートした。
本スポットからの生育物を1mlの5mMリン酸カリウム緩衝液、pH6,5に 再び懸濁し、0.1アリコートを50μg/mlスペクチノマイシンを含むE、 アミロボラ最小培地のプレート上に塗布し、pcPP430を含むEa321の 株を選択した。プレートを28℃で2〜3日インキュベートし、個々のコロニー を50℃1g/mlスペクチノマイシンを含む最小培地及びKm50を含む最小 培地に同時にようじで移した。50gg/mlスペクチノマイシンを含む培地に 生育した(pcPP430の選択を示す)がKmsoを含む培地に生育しなかっ た(ヘルパープラスミドpRK2013の欠損を示す)コロニーのみが、次の研 究用に選択された。
用いた全細菌の細胞フリー培養上清は過敏反応を惹起しなかったが、幾っがの細 胞の調製物は、新しい方法で12時間以内に強力な過敏反応を惹起した細胞フリ ーの調製物となり、それは調製物が作られた細菌細胞を全て代謝することにより 惹起したものと区別できなかった。過敏反応の誘導因子を実施例3に従って本細 胞フリー誘導因子(elicitor)調製物(CF E P)から分離し、精 製し、特徴付けた。
本発明によるE、コリ DH5α(pcPP430)由来のバービンを含有する CFEPの分離を以下の実施例に記載する。
実施例3 Eコリ DH5α(pcPP430)の細胞をルリアーベルタニ(LB)培地に 0D620=0.8まで生育させ、遠心により収集し、0.1mMフェニルメチ ルスルホニルフリオリド(PMSF)、セリンプロテアーゼインヒビターを含む 元の容量の1/10の5mM1ル・酸カリウム緩衝液、pH6,5再督濁した。
次いでソニケーター・ウルトラソニック・セル・ディスラブター(商標)(ハー ト・システムーウルトラソニクス)を用い、4の電気出力、40%の衝撃係数に セットしたパルサーサイクル時間で音波処理により細胞を崩壊した(これらの条 件下、1゜mlの細菌上清を氷上で10分間、音波処理した)。12,000x gで1時間遠心することにより残骸を音波処理物から除去したのち、上清液は0 .2u+孔径のメンブランフィルタ−を濾過して全ての残留する無傷の細胞を除 去した。得られる調製物は、約1;10の希釈でタバコ葉に過敏反応を惹起する ことができた。
CFEPはOD、□。=0.4の培養物由来の細胞内材料を含み、同一密度のE 、コリの生細胞が過敏反応の惹起に要した。
本発明によるバーピンの精製を以下の実施例に記載する。
実施例4 実施例3から得た調製物を用いる最初の試験は、HR惹起活性が熱安定性で性質 が蛋白様であることを示した。調製物は、既に記載された続く65℃−晩のイン キュベーションとしてタバコ葉の浸透により測定されたように、HR惹起活性を 維持した。しかしながら、PMSF以外は、セリンプロテアーゼインヒビターを 調製の間に加えると、全てのHR惹起活性は37℃3時間、又は4℃6〜8時間 に無くなり、プロナーゼE(シグマ)100μg/mlとの調製物のインキュベ ーションは、37601時間で、全ての惹起活性を失わせた。
誘導因子調製物の熱安定性の利点は、誘導因子をさらに精製する目的に用いられ た。実施例3の誘導因子調製物の沸騰水浴中10分間の保持、続(遠心による不 溶物質の除去ののち、ごく限られた数の蛋白だけが残った。44kDに対応する 一つのバンドが、加熱した実施例3調製物の5DS−ポリアクリルアミド(10 %5DS−PAGEゲルは提供者、ヘファー・サイエンティフィック・インスツ ルーメンツの指示に従って調製して用いた。ゲル中の蛋白を0.025%クーマ シープルーR−250で30分間染色し、50%メタノールと10%酢酸溶液で 脱色した)ゲル上の電気泳動後、顕著であった。この泳動性のバンドは、HR惹 起活性を有する全ての調製物に特異的に存在した。等電点電気泳動造粒ゲル床上 の、又はイオン交換クロマトグラフィによる、実施例3調製物の分割の結果、H Rて惹起活性を有するフラク/ヨンは、常に4.0ないし4.5plの分子の大 きさで44kDに相当する蛋白を含有した。
バーピンの続(精製を完了するため、幾つかの分離技術を実施例3に記載したよ うに調製したCFEPに適用した。各段階前に、CFEPは沸騰水浴中10分間 加熱し、25−30℃に冷却し、12.OOOXgで10分間遠心した。上清液 は維持し、0.2μm孔径の濾過膜(ミリボア、MF)を濾過した。
熱処理CFEPはアニオン交換樹脂(ワットマンDE−52)に乗せ、5+aM リン酸カリウム緩衝液、pH6,5中KCIの量を徐々に増加させながら溶出し た。
バーピンは90mM KCIを含有する緩衝液によりカラムから溶出した。バー ピンの存在は、最初の容量の50%まで濃縮したカラムから要素を有するタバコ 葉領域の浸透により測定した。さらにフラクションは標準的手順に従って5DS −PAC;Eゲルで電気泳動した。最終精製は高圧液体クロマトグラフィ(HP LC)により完了した。イオン交換クロマトグラフィにより精製した調製物は、 酢酸の添加によりpH2に調整し、次いで遠心により全ての沈澱を除き、逆相H PLCブレバックカラム(YMCAQ−303)に適用した。カラムは0.25 %v/vトリフルオロ酢酸にpH2で10−70%アセトリドニルの勾配によっ て溶出した。
蛋白の検出は、190nmないし300止の光の吸収によった。各125m1フ ラク/ヨンをタバコ葉領域の浸透によりHRを惹起する能力について試験した。
実施例3調製物の分割に用いた造粒ゲル床は、製造業者によって勧められた通り 、パイオーライト(商標)(バイオ−ラド・ラボラトリーズ)で調製した。pH 3−10の広範囲両性電解質(シグマ)を2%のスラリーの最終濃度で用いた。
電極溶液は、IM H3PO4(陰極)とIMNaOH(陽極)であった。
全てのHR惹起試料に存在する顕著な44kD蛋白(「バーピン」)バンドが惹 起活性を有するかどうかを測定するため、準備したSDSゲルの適切な未染色部 分をカットし、SDSを欠いた緩衝液で電解した。溶出蛋白(200#g/ll 1l)は、0.1mMフェニルメチルスルホニルフルオリドを含有する21の5 mMリン酸カリウム緩衝液、pH6,5に対し一晩透析した。濃度>500nM (主25μ植物の葉において、バーピンが過敏反応を惹起した。
続く実験は、バーピンがプロテアーゼ感受性、熱安定性で酸性であることを明ら かにした。プロテアーゼによるバーピンの処理は、HR惹起能力を失わせ、SD Sポリアクリルアミドゲルから44kD蛋白バンドを排除した。しかしながら、 バーピンは、100℃に10分間保持して酵素を不活性化したプロテアーゼとイ ンキュベートしても、調製物は惹起活性を維持した。活性プロテアーゼが浸透混 合物に存在すると、過敏反応は発達しなかった。しかしながら、活性又は熱不活 性化プロテアーゼによるタバコ葉の浸透は肉眼的症状とはならなかった。バーピ ンは、沸騰水浴中10分間加熱後、HR惹起活性を維持した。SDSゲルからの 精製バーピンは、慣用技術を用いる薄層等電点電気泳動ゲル上の分割によって測 定されるように4.3のpiを有した。
本発明によるバーピンの亜細胞位置は以下の実施例に記載される。
実施例5 微生物の細胞表面のバーピンの位置は、以下の観察により示唆された。(i)E 。
アミロボラEa321 (pcPP430)又はE,)すDH5α(pcPP4 30)の上清は、過敏反応を惹起せず、バーピンは媒体に分泌されないが細菌中 又は上に存在することを示した:(it)Ea321 (pcPP430)及び EjすDH5α(pcPP430)の全細胞を40及び80μg/mlのプロテ アーゼと、そして40μg/mlテトラサイクリンとそれぞれ37℃で5分間イ ンキュベートヨンし、バーピンの連続生成を停止後、細菌は過敏反応を惹起しな かった。プロテアーゼインヒビター、PMSFo.5mMを上記インキュベーシ ョン混合物中でインキュベートすると、細菌は過敏反応を惹起した.PMSFは 明らかにプロテアーゼによる不活性化からバーピンを保護した。(PMSF又は テトラサイクリンのみによるタバコ葉の浸透は、効果がなく、どの化合物もHR を生ずることに独立して機能しないことを示す);(ifi)プロテアーゼの量 を増加しながら細菌を処理すると、プロテアーゼ処理細胞由来の調製物が電気泳 動されたSDSゲルからバーピンの消失とよく相関する過敏反応を惹起する能力 を減じた〔表11 :Cb/>実施例3調製物の105. 0OOx g, 1 時間の遠心後、はとんどのHR惹起活性が上清液に見出されるが、膜安定剤、M gCh 30mMを音波処理前に加えると、はとんどの活性はペレットと関連し 、それは膜を含有する遠心した蛋白と関連する;そして(V)末者沸実施例3調 製物のゲルー浸透クロマトグラフィは、多分膿胞である非常な高分子ffi ( > 1 0’D)のフラクションと誘導因子との関連を示した;さらに(vi) 超遠心でのEa321 (pcPP430)の溶解細胞の分画(サイエンス2  3 3 : 1403(1985)参照)及びバーピン特異抗体との反応の結果 、細胞膜フラクションとの反応及び全細胞コントロールのみとなる。
前述の結果は、バーピンが細菌細胞表面又はその近くに位置すること及びそれは 不安定であることを示す。Ea321 (pcPP430)又はE,コリDH5 (Z(pcPP430)の細胞墾濁液は、転移インヒビターテトラサイクリン( 4 0ug/ml)の存在で、それぞれ0.5時間又は1時間よりも少しの間そ れらのHR惹起活性を維持する。さらに、一度細胞がHR惹起活性を失うと、バ ーピンは検出されなかった。しかしながら、プロテアーゼインヒビターPMS  F (0. 5+mM)が懸濁液に含有されると、細菌は2時間以上HR惹起活 性を維持し、同時にSDSゲルでその間ずっと少量のバーピンが検出された。等 しい細胞数を基にすると、バーピンを破壊し、過敏反応を防止するには、Ea3 21 (pcPP430)よりもE.コリDH5α(pcPP430)の方がよ り多くのプロテアーゼを必要とした。従って、蛋白分解に対するバーピンの感受 性は植物病原性細菌のHR惹起活性の短期生存性質のこれまでの観察〔サイエン ス2 4 5 : 1374(1989)参照〕を説明しうる。
以下の方法及び表1は、hrp遺伝子クラスターを含有するE.アミロボラEa 321由来のHR惹起活性のプロテアーゼ感受性についてのプロトコール及びそ の結果を描(。
E,アミロボラEa321 (pcPP430)(7)細胞をLB培地テ生育シ 、遠心により○. D. 620= 0. 6で収集した。次いで細胞を40μ g/mlテトラサイクリン含有5mMリン酸カリウム緩衝液、pH6.5の0. 1容量に再懸濁した。(表1に示すように)プロテアーゼを200111細胞懸 濁液に加え、37℃で5分間インキュベートし、続いて各混合物の100μmを タバコ葉に浸透させた。浸透後24時間に崩壊に気付いた。20μmの5×分留 緩衝液を80μm残留混残留色混合し、5分間沸騰し、次いでミクロ遠心で10 分間遠心し、10%5DS−PAGEゲルの各レーンに15μm負荷した。電気 泳動を20mAで2時間実施し、次いで0.025%クーマン−ブルーR−25 0で30分間染色し、そして50%メタノールと10%酢酸溶液で脱色した。L B培養物から生成した細胞フリーの上清を濾過滅菌し、次いでセントリブレブー 10(アミコン)により元の容量の1/10まで遠心した。高濃度のプロテアー ゼによる処理によりHR惹起活性が消失し、SDSゲルからバーピンバンド(4 4kD)が消えた。本プロトコールから得られたデータを以下の表に記録する。
表1 20gg 弱い + 80gg+0.5mM PMSF + −1−細胞フリーの上清 − 十二陽性反応 一二陰性反応 無傷のタバコ葉で過敏反応を惹起する細菌株の能力は、それらのタバコ細胞浮遊 培養でに’/H”交換反応を惹起する能力と強(関連する。E、アミロボラのh rp遺伝子クラスターの大部分かに’/H”交換反応の惹起に必要とされるので 、二つの反応は遺伝子に関連する。従って、タバコ細胞浮遊培養へのバーピンの 影響を、以下の実施例に従って試験した。
本発明によるバーピンの植物、植物細胞及び組織への影響を以下の実施例に記載 する。
実施例6 特別の調製品がHR惹起活性を有するかどうかを測定するため、我々は全細菌細 胞に用いたものと同様の技術を用いた〔モレキュラー・プラント−マイクローブ ・インターラクンヨンズ4 : 494 (1991)参照〕。タバコ植物にコ チアナ・タバクムし、“キサンチ”)を人工土壌ミックス中、90 100cm の高さに生育した。植物は浸透前く24時間に温室から研究室に移した。葉身の 浸透は解剖針で作った小孔を通る無針シリンジで行った。HRを示す、浸透領域 のコラスプは浸透24時間後に記録した。
5DS−PAGEにより検出されるように、44kD蛋白を含む全てのCFEP は、タバコ葉の浸透領域のコラスブを生じた。HPLCにより精製したバーピン (実施例4)は、≧500nM濃度でHRを惹起した。
タバコ細胞浮遊培養へのバーピンの影響を試験するため、4日経過のタバコ細胞 浮遊培養(=ニコチアナ・タバクムvar、サムスン)をコーネル大学のバイオ チクノロシイ・プログラムから得た。細胞懸濁液を単層の目のあらい編み方のチ ーズクロスで濾過して、11のビーカーに入れ、大きな凝集塊を除去した。タバ コ・アッセー・メディウム(ME 80.5mM、 マニh tし0.17M、  KzS 04 (2+11の0.25M保存溶液) 、CaCl2 (2ml の0.25M保存溶液)、高純度水996m1、lNNaOHによりpH6,0 に調整し、o、2gm孔径メンブランフィルタ−濾過〕を用い、単層のチーズク ロスを通して出来るだけ多くの細胞を洗浄した。
次いでこの洗浄、濾過懸濁液を1層のミラクロス(商標)(不織布)で内側を覆 った大きなロートにあけ、ミラクロス(商標)を満たした細胞をさらに200− 400mlのタバコ・アッセー・メディウムで静かに洗浄した。15gの湿潤細 胞を計量し、415m1のタバコ・アッセー・メディウムに静かに再懸濁した。
本懸濁液の20w1のアリコートをプラスチックのコニカルカップ(4cm最上 部直径、2゜5cm底直径、高さ4cm)に計量し、直ちに150rpm、 2 a111ストロークの回転振盪機に入れ、25±3℃に維持した。
細胞は、それらが約5.8のpHに達するまで平衡化した(通常20−30分) 。
この時点で、l+1の細菌懸濁液又は音波処理抽出物或はPMSFの20gg/ ml濃縮物、20μmを含有する0、5mlの精製蛋白を各タバコ細胞試料に加 えた。試料のpHをコーニングpHメーターで読み取り、O,IN NaOH( 又は必要ならば0.1N MCI)で、pH6に調整した。最初の読み取り後3 0分で二次読み取りを行った。続く全ての読み取りは、0時での読み取り後、6 時間まで1時間間隔で行った。全ての処理は、二回試験した。
細菌細胞懸濁液は、適切な抗菌剤を含むLBで一晩培養を行うことにより調製し 、次いで翌朝、株を0.20の○I)sz。に希釈した。培養物をODo、4ま で再濃度を有すると見積まれる。細胞を5000xgで遠心し、再懸濁して1m 1MES緩衝液pH6中、5倍濃度(Ea321及び誘導体について)及び10 0倍濃(E、コリ及び誘導体について)とした。この方法で約I X 10 ’ cfu/mlの細胞濃度に達した。1mlの細胞懸濁液を20国1タバコ細胞懸 濁液に添加したとき、アッセー用のcfu/mlの最終濃度はm1当り5X10 ’と見積まれた。
E、アミロボラの細胞は、タバコ細胞浮遊培養への細菌の添加後2−3時間遅れ て水浴溶液(bathing 5olution)のpH(K”/H”交換反応 の測定)を増した(図2参照)。逆に、ゼロ時間でバーピンの一回の添加は最初 の時間に水浴溶液のpHを速やかに増加させた。pHは続くインキュベーション の間、少し減少した。
インビトロでバーピンを生成しないE、アミロボラのミュータントは、K”/H “交換反応を惹起しなかった。E、アミロボラのクローンhrp遺伝子クラスタ ーに変異を含んでいるE、コリの株も交換反応を惹起しなかった。バーピンによ る交換反応及び過敏反応の惹起は、バーピンが細菌−植物相互作用に活性である という付加的証拠を与える。タバコ細胞培養へのバーピンの影響に関することれ らの研究からのデータは、図2に示す。
以下の実施例はE、コリDH572(+)CPP430)及びEa321から得 られるバーピンの比較を与える。
実施例7 バーピンがE、アミロボラにより生成されるがpcPP430の存在により刺激 されるEコリにより生成されないことを証明するため、細胞を音波処理前5時間 、l(R誘発培地でブレインキュベートした以外、E、コリDH5α(pCP  P 430)からその分離に用いたものと同じ技術を、E、アミロボラEa32 1に用いた。さらに、pcPP430のベクターを含むE、コリDH5α(pC PP9)をEコリDH5α(pcPP430)と同じ操作に付した。Ea321 から分離されたものと同じ分子量の分離された蛋白は、HR惹起能力を有した。
SDSポリアクリルアミドゲル上の44kDバンドの相対強度に基づき、E、ア ミロボラEa321は、細胞基準当り、EコリDH5α(pcPP430)の生 成するバーピンの量の約1/10を生成することが見積まれた。E、アミロボラ Ea321及びE、コリDH5α(pcPP430)からの誘導因子蛋白の性質 は同一であった。
44kD蛋白と関連した非プロテアーゼ感受性熱安定HR惹起活性がE、コIJ DH5α(pCPP9)から取った細胞フリー抽出物に見られた。
E、コリアミロボラバーピンの性質は、細菌が過敏反応を惹起できるという発見 の結果なされた幾つかの重要な生理的観察と一致する。細菌蛋白又はRNAの合 成の不適合病原体及びインヒビターを伴う植物組織の浸透は、de novo  RNA及び蛋白合成が必要であることを示す過敏反応を防止する〔フィトパソロ ジイ72 : 1513(1983)参照〕。細菌が希釈水寒天に浸透すると、 過敏反応は惹起せず、細菌と植物細胞との密接な接触が必要であることを示唆す る。前誘発細菌は、転移又は転写インヒビターが浸透すると、急速にHR惹起能 力を失う〔サイエンス245 : 1374(1989)参照〕。誘導因子が細 菌細胞表面の成分であるという続く証拠が、誘導因子は浸透植物組織に拡散性で ないこと、そして各誘発細胞は一つの植物細胞のみを死滅することの観察で見出 された。これらの観察により予言されるように、バーピンは細菌細胞表面と関連 し、その蛋白分解に対する極端な感受性のために、天然で不安定のように見える 。従って、バービン崩壊は、植物−細菌相互作用の発展を調節するのに重要であ ろう。
非病原表現型のhrpミュータントは、バーピンがE、アミロボラでの病原性の 一次決定子であることを示唆する。適合(宿主;疾病)及び非適合(非宿主:過 敏反応)相互作用でのバーピンの実質的役割についての基準は明らかでない。幾 つかの植物病原細菌の宿主範囲は、hrp”病原体に栽培品種特異不適合性を与 えることができるaW遺伝子により調節されることが認められた。avr遺伝子 生成物の生化学活性及び表現型発現に関するhrp遺伝子へのそれらの依存の基 準は、avrBがhrp遺伝子により調節されるけれども、未知である。バーピ ンの生成又は蓄積の調節は、同定可能な因子でもありうる。E、アミラボラのh rp遺伝子クラスターは、非宿主組織(タバコ)よりも、宿主組織(ナシ)で約 10倍低く発現する。
主要疾病決定因子は、腫瘍又は広範組織解離(それぞれ植物ホルモン及びペクチ ン酵素)を起こす植物病原細菌で確認されたが、宿主の限られた範囲での遅延壊 死を起こす細菌間の病原性に対する分子基準は未知である。これらの細菌の中に 、経済的に重要なシュードモナス・シリンガニ及びキサントモナス・カンペスト リス病原型がある。酵素を崩墳させる毒素及び植物細胞壁はこれらの病原因子の ビルレンスを増加しつるが、hrp遺伝子は宿主組織での細菌増殖及び疾病症状 の生成に絶対に必要である。
hrp遺伝子の保存〔レイビイ、R,J、、モレキュラー・スタブイス・オン・ バソゲニノティ・アンド^ビルレンス・ファクターズ・オン・エルウィニア・ア ミロボラ、M、S、テシス、コーネル・ユニバージティー(1991)参照〕は 、E、アミロボラバービンが広範な重要クラスの植物細菌疾病決定因子の原型で あることを示唆する。従って、バーピンの、又はその生成の妥当なバランスの分 裂は、穀物植物の広く行き渡った細菌疾病を調節する新たな試みであろう。バー ピンの作用のモードは、又、過敏反応の及び広い系列の微生物病原体に対する植 物の耐性の分子基準を明らかにする。
以下の実施例は、バーピンをコード化している遺伝子が位置したN末端アミノ酸 配列の決定についての記載を与える。
実施例8 hrpNと呼ばれる、バーピンをコード化している遺伝子を位置決定するため、 バーピン蛋白の部分のアミノ酸配列を決定した。実施例4のようにHPLCによ り精製したバーピンの試料(25ag)を用いた。42.5分で溶出するピーク に相当する逆相クロマトグラフィカラムからの溶出液の部分を、真空で乾燥近く まで蒸発させて、アセトニトリル溶媒を除去した。次いでフラクションをTE緩 衝液に溶解し、蛋白に存在する種々のアミノ酸の割合及びN末端から始まるアミ ノ酸の配列を決定する要望により、コーネル・ユニバージティー・バイオチクノ ロシイ・プログラムのプロティン・アナリシス・ラボラトリイに提出した。
これらの分析結果は、以下の表に示され、そこでは、バーピンの分析によるアミ ノ酸組成はDNA配列から提案されるアミノ酸組成とほとんど変わらない。
アルギニン 1.8 1.3 アスパラギン 7.0 アスパラギン酸 5.7 14.2 グルタミン酸 2.1 9.3 グリシン 22.0 22.0 ヒスチジン 0.8 < 1.0 イソロイシン 2.3 2.3 0イシン 10.6 10.9 リジン 4.7 5.2 メチオニン 6. O5,7 フエニルアラニン 1.6 2.0 プロリン 3.1 2.3 セリン 9.6 8.9 スレオニン 6.2 5.2 トリプトフアン 0.5 −−− チロシン 1.0 < 1.0 バリン 2.8 2.2 アミノ酸組成の決定に用いた方法は、S、 A、コーエン等、1984、アメリ カン・ラボシト9448頁による6N HCIによる蛋白の加水分解、続くアミ ノ酸残基の保護及び分解を含んだ。
本発明によるバーピンのN末端アミノ酸配列は、バンカピラーの方法〔メリーズ ・オン・プロティン・マイクロキャラクタライゼーション;ア・プラクティカル ・ハンドブック、ppg223−247、フマナ・プレス、クリフトン、ニュー シャーシー(1986)参照〕によって決定され、以下の通りである。
本発明による(上述のN末端アミノ酸配列を含む)バーピンの提案アミノ酸配列 は、 バーピンの部分アミノ酸配列は、バーピンのN末端の9ないし15アミノ酸をコ ード化しているものに対応する塩基でオリゴヌクレオチドプローブを構築するの に有用であった。幾つかのこれらのアミノ酸は幾っがの核酸コドンを有しうるの て、48倍変性オリゴヌクレオチドが標準的方法によって構築された。
バーピンのオリゴヌクレオチドプローブとのハイブリダイゼーションにょるバー ピンをコード化しているクローンの同定を以下の実施例に記載する。
実施例9 バーピンをコード化している構造遺伝子は、エルウィニア・アミロボラのDNA と、実施例8で構築したオリゴヌクレオチドプローブのハイブリダイゼーション により確認した。ニュミドpcPP430のEアミロボラのhrpクラスクーで クローンした特異的DNAを制限酵素BamH1により消化し、分離部分を制限 酵素HindI[[で消化した。D N A消化物は、標準的方法に従って、0 .7%アガロースで電気泳動し、エチジウムブロミドで染色し、ナイロン膜(イ モピロン)に移し、既に記載したオリゴヌクレオチドプローブとハイブリッド形 成した。プローブは、32p標識GTPを用いる放射活性リンで標識化した。
ハイブリダイゼーション及び膜のX OMatX線フィルム(コダック)への1 露並びにフィルムの現像に続き、1.3kb HinclI[[断片は、プロー ブに対する反応で最も強いハイブリダイゼー7ヨン/グナルを与えた。断片をp ブルースクリプトN113+ベクター(ストラタジーン)にサブクローンし、p cPP1084と名付けた。
本発明による抗バーピン抗体の生成を以下の実施例に記載する。
実施例1O 抗体を、バーピンの注射に反応してウサギに作らせた。高精製バービンの3つの 注射(それぞれ100.150及び50ug)を2−3適間隔で行った。8週間 後、抗血清を集め、IgGを硫酸アンモニウムで沈澱させ、音波処理E、コリD H5σ(pcPP9)溶解質で前吸収した。抗血清の特異性は、実施例7に記載 したようにHPLCにより精製したバーピンのウェスタンプロットの反応によっ て確認した。DH5α(pcpp430)由来の分解CFEPを含有するウェス タンプロットをハイプリント形成した場合、前免疫血清との反応は見られなかつ I;。
T7 RNAポリメラーゼ/プロモーター発現系でのhrpNの記述は、以下の 実施例に記載する 実施例11 1 、3 kbH1ndII+断片が完全hrp N遺伝子を含むことを確認す るI;め、T7SlOプロモーターの調節の下、1 、3 kbH1ndnl断 片を含む、プラスミドpGpl−2(プロ7−ゾイングス・ナシヨナル・アカデ ミイ・オン・サイエンシズU、S、A。
82 : 1074(1985)及びpcPP1084をE、コリDH5a又は Ea321に形質転換した。これら2つの適合プラスミドはT7発現系を構成す る。pGpl、−1及びpcPP1084を含有する細胞を、100ug/ml のアンビリンと50ug/mlのカナマイシンを含むLBに30°Cで生育した 。OD、、。−0,5で200μlの細胞を収集し、5mlのM9媒体〔サンプ ルツク、J、、E、F、フリッチ、T、マニアティス、モレキュラー・クローニ ング、ア・ラポラトリイ・マニュアル、第2版、コールド・スプリング・ハーバ −(1989))で洗浄した。最後に細胞を0601%の18アミノ酸(ンスチ ジン又はメチオニンなし)を補足した1、omlのM9媒体に再懸濁した。細胞 を30°Cで1時間、次いで42℃に変えて10分間振盪しながら(200rp m)生育した。リファンピシン(シグマR3501メタノール中20mg/ml 保存溶液)を200ug/ml最終濃度まで添加した。細胞を42°Cでさらに インキュベートし、次いで30℃に変えてさらに1時間インキュベートした。
細胞を10μCiの353メチオニンにより30℃で5分間、短時間標識した。
細胞を遠心し、50μmの「分解緩衝液」(60IIIMトリスーHCl、pH 6,8,1%SDS、1%2−メルカプトエタノール、10%グリセロール及び 0.01%ブロモフェノールブルー)に再懸濁した。試料を100℃で3分間加 熱し、20μlを10%SDS PAGEゲル上に置いた。(ホーファー・サイ エンティフィック・インスツルーメンツの指示に従い)マイティ・スモール(商 標)装置で15■A、2時間電気泳動後、ゲルを乾燥し、室温で2時間X線フィ ルムに爆露した。分子の大きさでバービンに相当する単一44kDバンドを、E 、コリDH5α及びEa321構造物から観察した。この系から発現した44k Dバンドは、ウサギに作られた抗バーピン抗体と反応した(実施例10)。本実 験は、1.3 kbHindm断片が44kDバーピン蛋白と暗号化する完全な 開いた読み枠を含むことを示す。
本発明によるhrpN遺伝子の核酸配列は、以下の実施例によって決定した。
実施例12 DNA配列決定分析はジデオキシ鎖終結法(サンガー1977、PNAS74: 5643−5667)により実施した。配列は万能プライマー又はT3プライマ ーのいずれかを用いることにより両ストランドから証明した。Kpnl及びpt +iにより1゜3kbHindI[I断片から産生されたサブクローンを配列決 定の鋳型として直接使用した。hrpNのヌクレオチド配列は遺伝子銀行に提出 され、受理番号M92994と付された。ヌクレオチド配列は以下に示す。
AAGCTxu℃ATGGCAαTyl’ TGAf工GT[GGa℃χ口■α νひOR75騎 50’rIATI’cAIJtA GAGGAATACG T LoAlG AGT CI’G AAT ACA AGrα刀930℃αス讃゛ 仄λN刀紙鑞MτππATCα℃α−゛α刀α℃135αEA AAT AAC GGG TrG C1℃GGr ACCAGr QII: CAG AAT C Cr GGG 17’/′I″1′C;σiT GGCMr T(ユ°CCA  C1”Gα石0追α℃α℃α−” MTCAA 219〜yT GAT AO: (J: AAT CAG CIGGCr GGC’EMy C1℃ACCαCA TG261Aπ; kK; ATG W& AGCAI’G A’l”GαCG Grαπα追CTG ATGα℃303Q?rG;C’ITA (A−E GG I’ +j−i、”l’l’A GGr AIVr G℃’1”LYE GGI ’ GGC代A35Q?L’ GK OG (jjL: GAA GjA UI G ’1亡GAACαU CIG AACら^゛rp:tc 3Bノ’l’I: A(UK GGr ’ltl; C1u AAL: A1.:G にIG GG CTCG AAA GGL: GらCAAL:4Qす AA;l’ NX ACT ’IX−A ACA ALA AAT TO:α: G CIG Q’iCCAG GCG (1;IG 4’/h GG[’ AI’rAAC’IcA ALG ’ICU (’Ak AACGA CGAI”ICCACL: ’tea GIL 51 JN:A GAT TC CN:C′ICA IJ’l’: ’lシNX: GACα:G 紙CM; C M5 GIG b5コCI’G AAG ATG ’1°1u AG: GAj j NIA A113 CAA AGL: CrG Tl’rαnGAl’ 5 9汲■ GQ;CAACAL’GGCNI:(AL;GG、、AGI”1(ズ:’1’C rGGGGGCAAGCJ’t;639讃X:CGAAαK GAG CAG  /Vに肛銹TA/六N仏α譜ω℃iCr 681(込jGCG (JG TCG  CCS C1u Alu GGI’ AIVI’ GGL” CI’G AG : GAG CIC723CITαCAACGGG GGA CL’G GGA  C&”LoGGr CAG GSCGGI’ AA’l’ GCI’ 765 GGCACG GGTCIT Gin GL71” “11:G1’Q; CI G GjCGGC八M GGGC1覧i 8(1’/α応α;CCrGAGCG GG Q:G GIG GACTACCAG CAG ’1°IA (fl’  AAC1149αI: Gl’G GGr ACCGG1’ ATCGGr k IG AAA GCG GGCATL’ CAG GCG 891CrG AA T Gkr NIC(Er AfX; (X: N追CACAGr TCA A CCCGr ’IQ’ 933TrCGI’CAM AAA GG: Gel’  CGGα’S A、’1’G 000 AAG GAA 紙GGI’ 9−/ bCAG Tic AffG GACCAG I/Vl’ CX:r GAG  GrG ITr GG: AAG CCG CAG l0F7TACCAG A AA Qfα刀GGI’ CAG GAG GIG PfA ACC(jG G ACAAA 1059’ICA高αスN端αスー入にAAGαスm′Gにχα込 A゛亀1101ACAαスα:c AGr mrx;CM; TICNCAM  m AAG GGC&良1143八’I’CAAA AGGQ:CATG GC G GGr GkL’ ACCC7−(: MCGGCAACCJG 1185 CAGCACαD GTG CCG GIG GITCrr CGC’1m G rA 170 A’1℃ccx 122−/1′GA T[おα工(i込1α工 A1゛貨端C,Aluに仄;GCAC’1’罠0〕^lゴ1270α莢ΩχDズ コTMGCr1′1287本配列で、バーピンにアミノ酸配列を供給するよう発 現される(停止コドンTAGを含む)開いた読み枠は以下の通りである。
ATG AGTロ6NぼNス<rαDCTGα詰α方πλに追にあ鑞42ffr  ’ICT ATCGGCGGrα刀αK GGA Nd゛AACαD TIG  C1℃GGI” 84AO:AGT′CG: CAG AATαテα追7石α παE AAT TCTα”kcn; 126α石CrG GG:GGCGGI ’ AAT CAA AAT GAT ACCGrCAAT CAG Glu  168GCT GGCTrA CrCAO: GGCAT’G ATG 1”l G A’lG eピIエコAGCNIG Krl; 210α℃αir GGr  GGG CrG k1’G GGCGGT’αCTCAαCGGr GGC1 ’LA 252GGI’MrGO:TIGGGI’Q”C’ICAGGrGGC CIGGコCGA/−αacLG294°LO,l/1IACα刀ctv AA CcziAtv ’x’uαE %L′’L’CG にIG AACAOG 3 36CtGαN ’1α; AAA GG:αんAAL坑゛に:c <rコAC A心Mζl’ 3’/ll′rα二α刀CIG GACCAGαU (、−Lu  GG(’ ATrMe TCA ACIE ’1(ECCAA 420MCG ACGAT TCCACC’KL GQ: ACA GAT ”ICCACC’ IcA GAC1圧462AGCGACCCG ja; CAG Cf1f’、  CIG CIOAAG A1℃11℃AGCGAG AIX 504A″rG  CAA AGCCIX; TTT GGI’ GATα刀CAA GAT G GCACXI: CAG GGC546AGr ’Ie u GGG GG:  AAG GAG CQE ACCGM GGCGAG CAG AAC58Bα ): IAT AAA AAA GGA GICACI’ CAT ■CrG  TCG CD: C[OA’rG 630GGr AATGGTC1℃AGC%  C1CCIT GGCAACGGG GGA (、TG QEA 612GG L′α’T CAG GGCGGr MTGCrGGCACG 田L’ CTr  GACGGr ’IcD 114″rCGC1’G GGCGGCAAA G GG CIG CGG GGCC罠AG:α追α:GGIG756GACiX:  (% % ”1’lA (LT AACGCCGrG GGI” ACCGG r ArCαπ798A1G AAA GCfS GGCATT CM; ωJ C(G AAT GKr AffCGGr ACG CAC84ON−uε埴1 °TCAACCα;l”ICrTic; G1℃AAT AAA GGCGAT  CGG 882α)S A1’G QTG AAG GAA 凪GGI’ C AG 770 ATG GACCAG IXT CCI’ 924GAG GI ′G L″fT GGCAAG CCG CAG TACCAG AAA CC CCOG GGr CAG 966GAG Gl’G MA ACCGAT G ACAAA ’IcA ’IGG GCA AAA GCA C1’G AGC 1001jAAGσ:A GAT GACGACαa AfG ACA GCA Cl: AGI’ ATG GAG CAG 1050’1’rCAACAAC :CAAG G[CA1℃kic AAA AGG CCCATG GCG G Gr 1092GAT ACCGGCAAcGGCMCCIG % CACGQ E GIG CCG G’l”G GIT 1134Crr CGC’IGG  GrA i’良ATG (XA ’IGA 1158大量のバーピンを生成する hrpN遺伝子の過剰発現を以下の実施例で示す。
実施例13 pcPP50と名付けられる新規プラスミドを、以下のようにバーピンの高発現 用に特に構築した。
発現ベクターplNml”−A2 (バイオ/チクノロシイ、81−85頁(1 984,1月)参照〕を修飾した。それを制限エンドヌクレアーゼXbal及び Hindn[で消化し、二つの断片とした。小さい方のDNA断片を排棄し、p  B 1uescript S K −ポリリンカーの部分(XbalないしH indn[)を置換した。これらの操作は、p■Nm目3−A2からリポソーム 結合部位と開始コドン(ATG)を除去し、それらを幾つかの有用なりローニン グ部位(Xbal、SpelSBamHl、Smal、Pstl、EcoRV、 Hindl[(、BamHl)で置換した。得られるベクター(pCP P 5 0)はhrpN遺伝子と共に用い、E、コリによるバーピンの超生成を促進した 。
hrpN (実施例7)を含有するプラスミド1084を制限エンドヌクレアー ゼHindll+で消化した。1.3kbHindlI[DNA断片をアガロー スから精製し、これもHindI[Iで消化し、アルカリホスホラターゼで処理 したpcPP50に連結した。
DNAをE、コリDH5αに形質転換した。幾つかの被転換体は、バービンの既 知可動性に一致する蛋白の生成用に5DS−ポリアクリルアミドゲル上でスクリ ーンした。pcPP2139と名付けられる一つのクローンは大量のバーピンを 生成した。
以下の操作に従って、大量のバーピンがE、コリDH5α(pcPP2139) に生成した。E、コリDH5α(pcPP2139)を、5g/lカザミノ酸と 40mg/lチアミンを補足したM9最小培地に生育させた。細菌は37°Cで さらに20時間生育した。バーピンは実施例3に従って細菌から分離した。
Eコ1JDH5α(pcPP2139)により生成されたバーピンは、タバコ葉 アッセーで活性であり、それは5DS−ポリアクリルアミドゲル上で同一分子量 を有し、EコリDH5α(pcPP430)により生成されたバーピンのように 抗バーピン抗血清(実施例10)と反応した。
希釈点タバコ葉アッセーで、E、コリDH5α(pcPP2139)から生成し たCFEPは1.:150希釈で検出可能な活性を有した。E、コリDH5α( pCpp2139)は1:20希釈までしか検出可能な活性を有しない。従って E。
:+すDH5e (pcPP2139)はE、D’JDH5σ(pcPP430 ) よ’)も少なくとも15@多くバーピンを生成した。調べた結果は以下の表 に表示する。
表2 E、コリ株由来 希釈 DH5α(pcPP430) + −−m−同様の結論が、二つの構成からのバ ービン調製物を含有する5DS−ポリアクリルアミドゲルの試験により導かれた 。
E、アミロボラでのhrpNの測定に加えて、そしてバーピンが多くの異なる植 物病原細菌により生成される一族の蛋白様HR誘導因子にとっての原型であると 信じられるので、hrpN同族体の同定をも以下のプロトコールに従って、エル ウィニア・クリサンテミ及びエルウィニア・ステワルティで行った。
実施例14 hrpNを含有する、pCPP1084由来の1.3kbHindl[lDNA 断片を、E。
クリサンテミ株由来のhrp遺伝子を含むことが既に示されている18コスミド に対する放射活性プローブとして用いた。一つのニスミド、pCPP2157は 、高厳格条件下(0,4xSSC,0,2%SDS、65℃で洗浄実施) 、h rpNクローンと強くハイブリッド形成した。ニスミドは次の分析に用いた。h rpNプローブとハイブリッド形成した、pcPP2157由来の800bpC 1al断片をpBluescript S K−にクローンし、pcPP214 0を得た。800bpC1al断片の一端の(ンーケナーゼバージョン2.0キ ット、U、S、バイオケミカルズを使用する)最初のDNA配列決定は、72% ヌクレオチド同一性で224ヌクレオチドの部分を示した。配列比較はFAST Aで行い、E、アミロボラhrpN (最高適合)ヌクレオチド1005ないし 1223に相当する。E、クリサンサミに関するヌクレオチド配列は、72%同 一性を示す。E、クリサンサミ配列は以下を有する。
同様のプロトコールを用い、pcPP1084由来の1.3kbHindlI[ DNa断片をE、ステワルティのDNAをプローブするのに用いた。DC283 株のゲノムDNA及びニスミドクローンpEs411のDNA Cコブリン等、 モル・プラント−マイクローブ・インターラクションズ5二266−268(1 992)参照〕をHindmで加水分解し、電気泳動し、そしてハイブリッド形 成した。両DNAFI製物由来の1 、8 kbH1ndl[[断片をプローブ とハイブリッド形成した。これらの結果は、EアミロボラのhrpNは、Eステ ワルティのhrpN様遺伝子と類似性を共通することを示す。
未発明による、植物の疾病の苛酷さの不活性化の二つの方法の効果は以下に記載 する。
実施例15 Eアミロホラ細ηととバーピンに特異的な抗血/lI(実施例10)又はノ1− ピンを崩壊させるプロテアーゼ(実施例7)との反応によるバーピンの不活性に よって、Eアミロホラにより起きるナシの病気が減少した。果実が直径3−4c oのときに集めた未成軌ナノ果実を表面消毒し、縦に半分に切り、湿らせた紙タ オルの上に置いた。果実の側面にナシノー−1コルク穴あけ具でウェルをがノド した(ビアS〜゛ メリーズ・イノ・フィトバクテリオロンイ、372”−37 5頁(1990)、クレメ〉トZ、ルドルフlく及びサンズ、D編集参照)。1 mlのEa321の培養液(2X 10 ’cfu/ml)を50111及び1 00ulの1:25希釈の抗バービン抗血清(実施例10)と混合し、5分後、 50111の混合液を各ナシ果実のウェルに入れた。同様に、Ea321の懸濁 液をプロテアーゼと混合し、ナシ果実のウェルに入れた。ナシを27℃でインキ ュベートし、3日間毎日観察した。コントロールは処理しない細胞と同じウサギ から取った免疫前血清と混合した細胞がらなった。結果を以下に表示する。
Ea321+プロテアーゼ(100ug/ml) 6/8Ea321+プロテア ーゼ(20C1+g/nl) 5/8Ea321+抗血清(50IIg/ml)  5/8Ea321+抗血m (100μg/ml) 5/8Ea321+免疫 前血清(100ffg/ml) 、 8/ 8* ホされたように処理したI  X 10”cfuのEa321を含有する50111を接種後64時間カット末 端で滲出を示している処理ナシ半分(8つから)の数。
プロテアーゼ又はバービン特異抗血清によるE、アミロボラの処理により感染し たナシ果実の数が減じた。E、アミロボラの生活力又は生育に影響することなく バーピンに影響を及ぼす二つの処理の上記した試験の効果は特にきびしかった。
抗血清又は酵素は処理細胞由来の子孫のバーピンと反応することが明らかでなか ったので、処理細胞に存在するバーピンのみが影響を及ぼし得た。本発明による 実際的な使用を想像する条件下で、抗バービン抗体は、抗バービン抗体又はプロ テアーゼをコード化している遺伝子と形質転換した植物により生成され、順番に これらは誘導因子にさらされた植物の疾病の苛酷さを防止又は減少する。又、感 染は上記実施例で用いたような約108とは反対に一般に少数の細胞により開始 するので、プロテアーゼ又は抗バーピン抗体によるリンゴ又はナシ樹木の開化処 理は、腐ラン病を大きく減少するようである。
従って、本発明を要約すると、バーピンは植物病原細菌(及び多分性の病原性微 生物)が、非宿主に過敏反応を惹起するが又は宿主に疾病を促進することを可能 にする蛋白因子の原型であるという強力な証拠がある。まず第一に、三つの属、 エルウィニア、シュードモナスおよびキサントモナスの株は、それらの各非宿主 植物の葉に接種すると、非常に類似の(視覚的に及び生理的に)過敏反応を惹起 する。この関連性は1963年に細菌により惹起した過敏反応の発見以来、報告 されて来た。さらに、全ての三つ属の細菌の株によるHRの惹起に必要な遺伝子 (同様にhrp遺伝子として引用される)も、宿主植物に対する病原性及び非宿 生植物での過敏反応の惹起に必要なものである。
植物病原細菌でのhrp遺伝子間の関連性は、ラビイ及びビアによる研究で示さ れた〔モレキュラー・プラント・マイクローブ・インターラクションズ5 :  (1992) l R,J ラビイ、モレキュラー・スタディズ・オン・バソゲ ニシティ・アンド・ビルレンス・ファクターズ・オン・エルウィニア・アミロボ ラ、M、S、テシス、コーネル・ユニバージティー、イサ力、NY1991)。
彼らは、DNAレベルで、Eアミロボラのhrp遺伝子クラスターとシュードモ ナス・シリンガニのhrpクラスターとの間の関連性並びにE、アミロボラのh rp遺伝子クラスターとE、ステワルティのits (水浸a)遺伝子クラスタ ーとの関連性を決定的に示した。他の研究者は種々のPノリンガエ病原型(特異 的且つ異なる植物に病原性のP、シリンガニの株)のhrp遺伝子間の著しい関 連性を証明した。さらに他の調査員は、キサントモナス・カンペストリスとP、 ソラナケアルムの株の遺伝子間の密接な関連性を証明した。従って、多数の植物 の病気を生ずる幾つかの属の植物病原細菌間の保存DNAにとって圧倒的証拠が ある。
本発明により、Eアミロボラのhrp遺伝子とE、クリサンテミの類似遺伝子の 間のDNA配列に有意な類似性も見られた。さらに、我々は、トウモロコシの厳 しい病原体、EステワルティのhrpNとゲノムDNAの間に強いハイブリダイ ゼーションを観察した。より詳しくは、hrpNとwts遺伝子クラスターの特 異的1゜8kbHindlI[断片の間のハイブリダイゼーションが観察された 。これは、ナツメヤ/について試練したエルウィニアの他の二つの種がhrpN 171似体を有することを示す。従って、本発明によるhrp様遺伝子生成物( 蛋白)に有意な類似性が期待できる。
さらに、E、アミロボラの多くのhrp遺伝子は、これらの遺伝子の変異の表現 型に基づき、バーピンのhrp遺伝子クラスターの部分とハイブリッド形成する 、シュードモナス・シリンガニのhrp遺伝子クラスターの一遺伝子は、種々の グラム陰性細菌の分泌物に含まれる蛋白と高アミノ酸類似性を有する蛋白を暗号 化する。
従って、シュードモナス、キサントモナス及びエルウィニアのhrp遺伝子の既 知の類似性は、三つの属の株により生成されるHR誘発因子がアミノ酸配列で、 又は少なくとも一般特性(蛋白)及び機能で類似するようであることを期待させ る強固な基準を与える。例えばhrpN ミュータントは、バーピンと類似に機 能する蛋白を暗号化する他の植物病原生物(例えば細菌、かび、線虫)由来の遺 伝子を、相補により確認するのに用いつる。そのような蛋白は、実質的に異なる 一次構造を有しつる(従って、DNAハイブリダイゼーション技術により検出す るのは困難であろう)けれども、これらの蛋白は、hrpN遺伝子を除き、機能 的であうたhrpクラスターを保有するE、アミロボラ又はE、コリにHRを惹 起する能力を回復するであろう。
本発明の範囲内の他の用途は、バーピン及び/又はパーピン生成株を植物バーピ ンレセプター及び/又はそれらの相互作用物質でシグナル形質導入通路に確認し 、そしてそれらのコード化遺伝子をクローンするのに用いることである。従って 、これは、植物病原体に対し改良耐性を有する遺伝子に設計された植物を生成す る目的で、バーピンレセプター(複数もあり)をコード化している植物遺伝子( 複数もあり)の構造又は発現を使用するために、病原性因子として、又は防御反 応の誘導因子として作用する(植物に依存して)バーピンの可能性を利用させる であろう。
本発明の範囲内のバーピンのさらに他の用途は、天然で又は組織培養で生育した 植物での二次代謝物生成の促進因子としてであろう。
さらに他の用途は、特異的トランスジェニック植物を開発するため植物遺伝子の プロモーターに特異的なバーピンをコード化している遺伝子の融合であろう。
植物遺伝子が「付けられる」と、バーピンは発現し、植物細胞は死滅する。幾つ かの適切な植物遺伝子プロモーター及びそれらの計画された用途は、(雄性不稔 植物の開発となる)花粉開発に含まれる遺伝子、かびによる感染に対する反応に 発現される遺伝子、例えばフェニルアラニンアンモニアリアーゼ及びカルコン合 成(植物細胞は死滅し、それによりかびの進行を制限し、植物をかび疾病に対し 耐性にする);及び(収穫を促進するため、hrp遺伝子の発現は落葉となる) 老化の発現に含まれる遺伝子を含む。
本発明の範囲内のバーピンのさらに他の用途は、化学化合物が反応するよう設計 され、それにより細菌バーピンが、それが疾病に必要であるから、特異的殺菌剤 標的を提供するのを不活性化する「標的分子」としてのバーピンの使用であろう 。
本発明に記載されるヌクレオチド及びアミノ酸の表示は以下の通りである。
配列表示 (1)一般情報 (i)出願人・ゾンーミン・ウェイ、ディピッド・W・バウアー、ステイーブン ・V°ビア、アラン・コルマー、シエンーヤン・へ及びロン・J・ラビイ (ロ)発明の名称 植物の過敏反応の誘導因子(i)配列の数:5 (2)配列IDN0+1についての情報:(1)配列特性 (A)長さ:15アミノ酸 (B)型、アミノ酸 (C)鎖の数・−末鎖 (D)トポロン−・直鎖状 (j)配列の種類:ペプチド (xi)配列記載配列E D N O: 1 :(2)配列IDN0:2につい ての情報・(1)配列特性 (A)長さ・385アミノ酸 (B)型二アミノ酸 (C)鎖の数ニー末鎖 (D)トポロノー:直鎖状 (ロ)配列の種類、ペプチド (\I)配列記載 配列IDN0:3・Arg Gln A5n Ala Gl y Lau Gly Gly Asn SI!r Ala Leu Gly I gu Gly(2)配列IDN0:3についての情報:(1)配列特性 (^)長さ+1287塩基対 (B)型 核酸 (C)鎖の数・−末鎖 (D)トポロン−0直鎖状 (ム)配列の種類・DNA (xi)配列記載:配列IDN○ 3゜AM;CLTCI■AIGGCACL1 ’f”rGAQE1’l鎚G1ffμx■ν1万l’E’l’GAA bO丁’ BTICATAA GAGGIIA’1ACG 1’l’ AIG AGr C rG AAT ACA AGI’ tX;l ’i’3C1uLχ二ζ讃゛1′ CAハ1AIGCンL八八丁1゛1XンrAIC肛G(ン1°(gコ(メメヒ: 1」5Gl”込AAT JVCG幻’1°% L:lG U;l’ 肛AGE’  03: CAG AAT(A、−1°Lids l ’/’/TAG GIE T GGCAAT TCP (M:A CI’G GGG (?1’G GQ; α℃αTr AAT CAA 219AAT GAT ACCG[CAAT C AG (?lG Gel’ GGC’1°iA C1℃AQ: GGCA’f’ G 261ATG ATG ATG ATG AG: Alu A1℃GG:  GGr GGI’αCC1113AffGαε303απα℃りαCGGrαC Tハαπ頽α℃1απα℃πス 345GGr GGCCI’G GGCGM  GGA C1u ’圓AAC回CIG AACGAT AIG 3B1’l’l Q C4GGT TCG CI’G AACACG CIGα1jlll: ’ ICI; AAAα℃αCAAC429MT ACCACT TCA ACA  ACA AA’l”l江CCG CrG GACCAG G$ CITE 47 1GGr ACT AACTCA ACG TQ: CM AACGACGAT  TCCNI:π:ffGGC513ACA GAT TCCACCTCA G ACTCCAG: GACCCG Al’G CAG CAG CIG 555 CrG AAG ATG TIX: AGCGAG A’lA ATG CAA  AGCC1℃慢Tα’;’r GAT 59’/GGG CAA GATGG CAO: CAG GGCAGr TCC1Crα℃α:CAAG CAG 6 39α)、; ACCGIVlt GGCGAG CAG AACωン圓」蔀■ 購αスGにACr 681GAT GCG CI’G TCG αEC(、TG  A゛m GGI’ AAT GGr CDG AGCCAG C1℃ 723 CrrαにAACGGG GGA CrG GGA ill;f、T GGr  GAG GGCGGr Mr GCr765αCACG GGr Crl’ G ACGGrTm TCG C1uα℃αCAAA GGG CIG 807α刀 GGCCTG AGCGGGα刀GI”G GACTX: CAG CAG T TA GGr AAC849αI: Gr’G GGr ACCGGr ATC GGr ATG AAA GQI; GGCATI’ CAG 1lff 89 1σI AkT CAT に℃GGr ACG CACNオCACAGE’ T CA KCOGr ’に:r 933Tic GrCAAT MA GG: G AT CGG αΣAIC; GCG AAG GAA ATCα社975Oi G TTCA’IG GACCAG W CC1’ GAG GrG TTr  GGCAAG CCG CAG 1017TACCAG AAA GGCCQI ; GGr CAG GAG GTG AAA ACCGAII’ GACAA A 1059に:CAAA X追α℃に毛αLαπ0σACCαCMCαENに C罠1185CAG CACGCG GrG COI:; GIG GIT C Tr CGCTGG m TTG Anu CCA 122’7(2)配列ID N0・4についての情報(1)配列特性 (^)長さ 1158塩基対 (B)型 核酸 (C)鎖の数 −末鎖 (D)トポロン−直鎖状 (j)配列の種類: D N 、A (\l)配列記載 配列IDN0.4 A’1らハfl’ C1′G All’ ACA岨1’Q妬C1らα込ω;もN I;Alu(〃42A’l’l”LL?r A’ICω−GUI’ Ciに L 圧■AAI’ AACGGG TIG CIX; (Ul’ 84k)、−AG r(JM Cj−f Ml’ d、’l°Lii; 〕’llj GGTGらC AA’l”101’ GCA(!ll; 12■ Csn GIG GQ: 豊ffl’ AAi’ LAA AAI” CAL’  ACCGrCkFc (AG (、’iu 16e+(’s:+’ CGンm rA C1k;鳩−CCi A’lLa KIG AIG J’NIG AII ’G AG、: AIG A゛lu@2HI (−λX艷田「島CIIjAII込藏圓l°αC’L’l’A■ン刀l°αん1 °LIA 252Gjl’ AAT GG:TAG印l′ciん1υバ刀l肛C 1Vα℃崗μ込C1tj 294’WコG AACGCG C1tコ JV’i U GAI’ A’lt; ’L’LA GSCGGL’ TCG CITこi  AAC/’iこQ :13゜ C1らGらこ1℃G AAA (XIこ0人: N’i AATACCAll; l”f’cA ACA ACA AAT 」’/kl’[’CCCf::G C rG CA: C1−J:s GL:G CIG Gjr ATr AACTC A 紡rICCCAA 42θAACG’j: GAユ° TCCAQQ ’1 ℃こ Uスl ACA CAT TCCACCTCA GAC’lu: 462 AlγGAI−CCG Alu CAG CAG C1tx CLu AAG  El ’1’■AGCGAn AIA b04A、iG□□□U仄CIG rr r田」゛弘I゛哩XM榔゛l゛σ℃傾:(λj匹 546AL”’i’ TCC ”K:r GGG GGCAAG CAG ccb ACCGAAαCGAG  (m AAC588αl: ’LAT AM AAAαa 母c <r cx’  ace CIG TCGαr CIG AIG 63nα:ir AAT G Gr C1u AGCCAG C1’CC1’r Glj: AAC(X;G  GGA CrG GGA 6’72GACTACCAG CAG TEA GG I’ NCαI: C1’CGGr ACCαn’ ICGGr 798AIG  MA GCG GGCATLoCAG GCG CrG AAT (AL’  ATCα7 ACG CAC84(IAGG CACAIJTICA 肛CGL ”lcr TTCGICAAI’ AAAαE Gk1’ (工6882(sJ s kLG Gas AAG GAA An℃GGr CAG TTCA1’G  GACCAG TJNr CCI’ 924GAG Gl’G TITαzm α1.G GAGTK: CAG AAA GGCαn GGr (% 966 GAG Gl’G AAA ACCGAT GACAAA ’1℃A TGG  GCA MA GCA C1’G AGC1008AAG CA GAT GA CGACGGA ATG ACA CCA GCCAGT ATG CAG C J’n 10501”lc; AACAAA GCCAAGαんATGAl’良 思AGGα:CA’lGα刀GGI’ 1092ap:roACCGGCAAC cz AACcra cprs rx ccr; a罠CCG GIG arc  1134σn′αCTGS G1:A ’I″rGATuαスπh usB( 2)配列IDN0・5についての情報・(1)配列特性 (^)長さ・222塩基対 (B)型 核酸 (C)鎖の数ニー末鎖 (D)トポロジー:直鎖状 (i)配列の種類: DNA (xi)配列記載・配列IDN0:5:従って、我々は我々の発明の好ましい実 施態様を示し記載したが、本発明は変更及び修飾が可能であることが理解される べきであり、そりゆえ我々は、記載された正確な用語に限定されることを望まず 、本発明を種々の用法及び条件に適用するためになされつるような変化と変更を 利用することを要望する。そのような変更及び修飾は、例えば(天然起源から誘 導された又は、合成的に製造された)本明細書に記載された誘導因子及びhrp N遺伝子に両方に、特に上記したものと実質的に類似な活性を生ずるよう機能す る構造的に類似の配列の置換を含む。従って、特に上記したこれらの配列の機能 を実質的に変更しない(DNA配列での)核酸の、又は(ペプチド配列での)ア ミノ酸の置換、削除、挿入又は付加による配列の変化は、本発明の範囲内にある と考えられる。それゆえ、そのような変化及び変更は、同等物の完全な範囲内に 、それゆえ、以下の請求の範囲の範囲内にあることを正当に意図する。
このように我々の発明、並びにそれをなし、そして用いる手段及び方法を、それ が関係し、又はそれが最も密接に関連する全ての当業者がそれをなし使用するよ うな完全、明確、簡潔且つ正確な用語で記載した。
FIG 2 時間(時) ■ フロントページの続き (5L) Int、 C1,6識別記号 庁内整理番号C07H21104B  8615−4CCO7K 14/21 8318−4H14/27 8318− 4H C12N 15109 ZNA C12P 21102 C9282−4B//CC12N 1/21 C12R1:19) (72)発明者 バウアー、ディピッド・ダブリュアメリカ合衆国14850  ニューヨーク、イサカ、ウェストビュー・レーン 137番(72)発明者 コ ールマー、アラン アメリカ合衆国14850 ニューヨーク、イサカ、レキシントン・ドライブ  139番I (72)発明者 へ、シェンーヤン アメリカ合衆国14850 ニューヨーク、イサカ、バッファロー・ストリート 612・イ一番 (72)発明者 ラビイ、ロン アメリカ合衆国14850 ニューヨーク、イサ力、エリショロー・ロード 1 122番

Claims (1)

  1. 【特許請求の範囲】 1.ATCC69021であるエセリシア・コリDH5α(pCPP1084) 。 2.植物の表面又は内部組織に適用すると、植物の過敏反応を誘導することがで きる分離ペプチド。 3.プロテアーゼ感受性、酸性で約44kDの分子の大きさ、約4.3のplを 有し、少なくとも1分間100℃で熱安定である、請求項2のペプチド。 4.エルウィニア、シュードモナス又はキサントモナスのhrpN遺伝子により 発現される誘導因子と機能的に類似である、請求項2のペプチド。 5.ペプチドがエルウィニア、シュードモナス又はキサントモナスの細胞表面と 関連している、請求項4のペプチド。 6. 【配列があります】付加、削除、置換及び挿入が385アミノ酸配列の生物活性 を阻害しないという規定をそなえた、少なくとも一つのアミノ酸付加を有する類 似配列、少なくとも一つのアミノ酸削除を有する類似配列、少なくとも一つのア ミノ酸置換を有する類似配列及び少なくとも一つのアミノ酸挿入を有する類似配 列、からなる群からの生物学的に活性なペプチド。 7.植物にハーピン誘導因子のインヒビターを与えること及び該インヒビターを ハーピン誘導因子と反応させることを含む、植物の病気又は過敏反応を改良する 方法。 8.インヒビターがプロテアーゼである、請求項7の方法。 9、インヒビターがハーピンに対する抗体である、請求項7の方法。 10.インヒビターが刺激に反応して遺伝的に発現する、請求項7の方法。 11.群 【配列があります】. 適当な宿主への配列の挿入用のベクターとの組合せで、付加、削除、置換及び挿 入がハーピンの生物学的発現を阻害しない規定をそなえた、少なくとも一つの核 酸付加を有する類似配列、少なくとも一つの核酸削除を有する類似配列、及び少 なくとも一つの核酸置換を有する類似配列、から選択された核酸配列からなるハ ーピンの発現を考慮する適当な宿主への挿入用の遺伝子。
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