JPH02283287A - アスペルギルス・ニゲルからのデオキシリボ核酸、組換え宿主微生物の製造法および機能的デオキシリボ核酸配列 - Google Patents
アスペルギルス・ニゲルからのデオキシリボ核酸、組換え宿主微生物の製造法および機能的デオキシリボ核酸配列Info
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- JPH02283287A JPH02283287A JP2064494A JP6449490A JPH02283287A JP H02283287 A JPH02283287 A JP H02283287A JP 2064494 A JP2064494 A JP 2064494A JP 6449490 A JP6449490 A JP 6449490A JP H02283287 A JPH02283287 A JP H02283287A
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Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Y—ENZYMES
- C12Y302/00—Hydrolases acting on glycosyl compounds, i.e. glycosylases (3.2)
- C12Y302/01—Glycosidases, i.e. enzymes hydrolysing O- and S-glycosyl compounds (3.2.1)
- C12Y302/01067—Galacturan 1,4-alpha-galacturonidase (3.2.1.67)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/14—Hydrolases (3)
- C12N9/16—Hydrolases (3) acting on ester bonds (3.1)
- C12N9/18—Carboxylic ester hydrolases (3.1.1)
-
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Abstract
(57)【要約】本公報は電子出願前の出願データであるた
め要約のデータは記録されません。
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Description
【発明の詳細な説明】
産業上の利用分野
本発明は、アスペルギルス・ニゲル(Aspergil
lus niger)からのデオキシリボ核酸の単離お
よび確認ならびに宿主微生物の場合にアスペルギルスに
由来するペクチナーゼを表現する方法に関する。
lus niger)からのデオキシリボ核酸の単離お
よび確認ならびに宿主微生物の場合にアスペルギルスに
由来するペクチナーゼを表現する方法に関する。
従来の技術
宿主微生物としてのアスペルギルス・オリザエ(Asp
ergillus oryzae)の場合に、例えばア
スペルギルス・ニゲルに由来する遺伝子を表現するため
の方法は、欧州特許出願公開第238023号明細書の
記載から公知である。この方法は、次の工程: a)遺伝子表現のためのDNA配列、形質転換細胞の選
択に適当なマーカー遺伝子ならびに表現すべき遺伝子で
あるDNA配列を含有する、宿主微生物としてのアスペ
ルギルス・オリザエのゲノム中に1回または数回組込む
t;めの能力を有する組換えDNAりa−ン化ベクター
系を用意し; b)使用されるマーカー遺伝子に関連して選択可能であ
るアスペルギルス・オリザエ宿主微生物を、(a)で用
意された組換えDNAクローン化ベクター系を用いて形
質転換し: C)形質転換されたアスペルギルス・オリザエ宿主微生
物を適当な栄養媒体中で増殖することを包含する。
ergillus oryzae)の場合に、例えばア
スペルギルス・ニゲルに由来する遺伝子を表現するため
の方法は、欧州特許出願公開第238023号明細書の
記載から公知である。この方法は、次の工程: a)遺伝子表現のためのDNA配列、形質転換細胞の選
択に適当なマーカー遺伝子ならびに表現すべき遺伝子で
あるDNA配列を含有する、宿主微生物としてのアスペ
ルギルス・オリザエのゲノム中に1回または数回組込む
t;めの能力を有する組換えDNAりa−ン化ベクター
系を用意し; b)使用されるマーカー遺伝子に関連して選択可能であ
るアスペルギルス・オリザエ宿主微生物を、(a)で用
意された組換えDNAクローン化ベクター系を用いて形
質転換し: C)形質転換されたアスペルギルス・オリザエ宿主微生
物を適当な栄養媒体中で増殖することを包含する。
公知方法よれば、特にアスペルギルス・ニゲルのゲノム
lこ由来しうるグルカミラーゼ、α−アミラーゼ、リパ
ーゼおよびプロテインナーゼを製造することができる。
lこ由来しうるグルカミラーゼ、α−アミラーゼ、リパ
ーゼおよびプロテインナーゼを製造することができる。
しかし、ペクチナーゼ、殊にPE型およびf’G型を製
造するための方法を使用する場合には、期待しt;程の
収率の改善を達成されないことが確認された。
造するための方法を使用する場合には、期待しt;程の
収率の改善を達成されないことが確認された。
発明が解決しようとする課題および課題を解決するため
の手段 本発明の課題は、アスペルギルス・ニゲルからのペクチ
ナーゼをも有利に表現することができる!つの方法を見
い出すことである。そのためには、それぞれのペクチナ
ーゼに対してデオキシリボ核酸を単離し、確認し、かつ
1つの表現系を組換え微生物の形状でペクチナーゼの取
得のために開発することが必要である。窓列なことに、
このことは、本発明によれば、宿主微生物としてアスペ
ルギルス・ニゲルまたハアスペルギルス・アワモリ(A
spergillus Awamori)種の糸状菌を
使用し、かつその上公知技術水準から知られた、例えば
特許請求の範囲に記載されたような作業方法を使用する
ことにより、上記公知方法を変更することによって変え
ることができる。
の手段 本発明の課題は、アスペルギルス・ニゲルからのペクチ
ナーゼをも有利に表現することができる!つの方法を見
い出すことである。そのためには、それぞれのペクチナ
ーゼに対してデオキシリボ核酸を単離し、確認し、かつ
1つの表現系を組換え微生物の形状でペクチナーゼの取
得のために開発することが必要である。窓列なことに、
このことは、本発明によれば、宿主微生物としてアスペ
ルギルス・ニゲルまたハアスペルギルス・アワモリ(A
spergillus Awamori)種の糸状菌を
使用し、かつその上公知技術水準から知られた、例えば
特許請求の範囲に記載されたような作業方法を使用する
ことにより、上記公知方法を変更することによって変え
ることができる。
ペクチナーゼの群には、ペクチンエステラーゼ(PE)
、解離するかまたは解離しないポリガラクツロナーゼ(
PG)およびペクチンートランスエリミナーゼ(PTE
)(これは、ペクチンリアーゼとも呼称される)が属す
る。有利には、PEまたは特に解離するPGを製造する
ための本発明による方法が使用される。アスペルギルス
・ニゲル種の工業的に使用可能な糸状菌の中で、卓越し
たペクチナーゼ形成体は、公知であり、シI;がってこ
のペクチナーゼ形成体のゲノムは、本発明方法にとって
適当なものである。このゲノムの生産性の上昇は、殊に
ペクチナーゼ遺伝子を数回宿主微生物のゲノム中に挿入
する場合には、本発明方法によって達成することができ
る。
、解離するかまたは解離しないポリガラクツロナーゼ(
PG)およびペクチンートランスエリミナーゼ(PTE
)(これは、ペクチンリアーゼとも呼称される)が属す
る。有利には、PEまたは特に解離するPGを製造する
ための本発明による方法が使用される。アスペルギルス
・ニゲル種の工業的に使用可能な糸状菌の中で、卓越し
たペクチナーゼ形成体は、公知であり、シI;がってこ
のペクチナーゼ形成体のゲノムは、本発明方法にとって
適当なものである。このゲノムの生産性の上昇は、殊に
ペクチナーゼ遺伝子を数回宿主微生物のゲノム中に挿入
する場合には、本発明方法によって達成することができ
る。
宿主微生物としては、アスペルギルス・ニゲル以外にア
スペルギルス・アワモリも適当である。本発明により遺
伝子修飾された糸状菌は、自体公知の方法で培地を設け
かつこの培地の濾液をペクチナーゼの生産のために後処
理することによって使用することができる。
スペルギルス・アワモリも適当である。本発明により遺
伝子修飾された糸状菌は、自体公知の方法で培地を設け
かつこの培地の濾液をペクチナーゼの生産のために後処
理することによって使用することができる。
実施例
例1:ボリガラクツロニダーゼ遺伝子の表現遺伝子供与
体としての菌株アスペルギルス・ニゲル DSM557
5を、コムギ糠4%、微粉砕しj;蕪葺の切片4%およ
び硫酸アンモニウム0.2%を有する30I2の発酵基
中で28°C1通気量IVVMおよび撹拌速度600
rpmで96時間培養した。
体としての菌株アスペルギルス・ニゲル DSM557
5を、コムギ糠4%、微粉砕しj;蕪葺の切片4%およ
び硫酸アンモニウム0.2%を有する30I2の発酵基
中で28°C1通気量IVVMおよび撹拌速度600
rpmで96時間培養した。
約3800ドルトンの分子量および約5.5の等電点を
有する発酵の間に形成されたポリガラクンロニダーゼ(
PG)の蛋白質配列を基礎にDSM5575のcDNA
バンク中の遺伝子を見い出すI;めのオリゴヌクレオチ
ドプローブを誘導するために、この酵素を培地上澄み液
から精製しt;。精製の間に、この酵素をレーム社(R
5hm)の1987年2月12日付けN o 、F R
−5−OiDの技術情報冊子に記載のポリガラクツロニ
ダーゼ(pc)単位の場合のこの酵素の活性度につき検
出し、ならびに280nmの際のUV吸収度につき検出
した。ポリガラクツロニダーゼ単位は、標準ペクチン溶
液の粘度を分析方法の標準的条件下にQ/v sp=
0.000015だけ減少させる酵素活性度によって定
義される。
有する発酵の間に形成されたポリガラクンロニダーゼ(
PG)の蛋白質配列を基礎にDSM5575のcDNA
バンク中の遺伝子を見い出すI;めのオリゴヌクレオチ
ドプローブを誘導するために、この酵素を培地上澄み液
から精製しt;。精製の間に、この酵素をレーム社(R
5hm)の1987年2月12日付けN o 、F R
−5−OiDの技術情報冊子に記載のポリガラクツロニ
ダーゼ(pc)単位の場合のこの酵素の活性度につき検
出し、ならびに280nmの際のUV吸収度につき検出
した。ポリガラクツロニダーゼ単位は、標準ペクチン溶
液の粘度を分析方法の標準的条件下にQ/v sp=
0.000015だけ減少させる酵素活性度によって定
義される。
そのために、発酵上澄み液をセファデックスG25コー
ス(■5aphadex G25 Coarse) (
Pharmacia社)により脱塩した。10ミリモル
の酢酸ナトリウム/酢酸塩緩衝液中でp H4,0の際
に7ラクトゲル TSK CM−650(■Frac
togel TSK CM−650) (Msrck社
)を用いて陽イオン交換クロマトグラフィーにより、P
Gを線状NaCQ勾配で約0.3モルで溶離した。
ス(■5aphadex G25 Coarse) (
Pharmacia社)により脱塩した。10ミリモル
の酢酸ナトリウム/酢酸塩緩衝液中でp H4,0の際
に7ラクトゲル TSK CM−650(■Frac
togel TSK CM−650) (Msrck社
)を用いて陽イオン交換クロマトグラフィーにより、P
Gを線状NaCQ勾配で約0.3モルで溶離した。
その上、ゲル濾過をセファクリル 5200(■5ep
hacryl 5200)(Pharmacia社)に
より行ない、改めて上記の記載と同じ条件下ではあるが
ゲル物質としてのファルマシア 七ノS(■Pharm
acia Mono S)を用いて行なう。最終的な精
製は、セファクリル 5200 (■5ephacry
+ 5200)およびスベローゼ12(■5upero
se 12)(Pharmacia社)により再び2回
ゲル濾過することによって行なわれた。
hacryl 5200)(Pharmacia社)に
より行ない、改めて上記の記載と同じ条件下ではあるが
ゲル物質としてのファルマシア 七ノS(■Pharm
acia Mono S)を用いて行なう。最終的な精
製は、セファクリル 5200 (■5ephacry
+ 5200)およびスベローゼ12(■5upero
se 12)(Pharmacia社)により再び2回
ゲル濾過することによって行なわれた。
精製した酵素から出発し、ブロムシアン、トリプシンお
よびブドウ球菌V8プロテアーゼを用いる分解によって
ペプチドを調製し、そのアミノ酸配列をガス相シークエ
ネーター(Applied Biosystems M
odel 470 A )の使用下に測定しt;。この
場合、ペプチドのオンライン検出を120 A H
PLCを用いて行なった。ブロムシアン分解をグロス(
E、Gro13)、Methods inEnzymo
logy 11 、238〜255の記載により行ない
、ペプチドの分離をHPLC逆相C4−カラム上でトリ
フルオロ酢酸/プロパツール/アセトニトリル勾配0.
1%中で実施しt;。
よびブドウ球菌V8プロテアーゼを用いる分解によって
ペプチドを調製し、そのアミノ酸配列をガス相シークエ
ネーター(Applied Biosystems M
odel 470 A )の使用下に測定しt;。この
場合、ペプチドのオンライン検出を120 A H
PLCを用いて行なった。ブロムシアン分解をグロス(
E、Gro13)、Methods inEnzymo
logy 11 、238〜255の記載により行ない
、ペプチドの分離をHPLC逆相C4−カラム上でトリ
フルオロ酢酸/プロパツール/アセトニトリル勾配0.
1%中で実施しt;。
トリプシン分解およびブドウ球菌V8プロテアーゼを用
いる分解をpH7,8で重炭酸アンモニウム20ミリモ
ル中で実施した。相応するペプチドを再び逆相HPLC
クロマトグラフィーによってCI8カラムを用いて分離
した。天然の蛋白質のN末端配列を直接に測定した。こ
のN末端配列は、次のとおりであった: G Iy−5er−Cys−Thr−Phe−Lys−
Thr−A 1a−A Ia−A 1a−A 1a−L
ys−A 1a−G Iy−Lys−A Ia−G I
y−Cys−Ser−Thr−+ 1e−Thr−Le
u−Asp−Asn−11e−G 1u−Va 1−P
ro−A la−ブロムシアン分解後に得られたペプチ
ド、CN7、の1つをオリゴヌクレオチドER13の合
成のだめのオリジナルとして使用した。ペプチドCN7
の場合のアミノ酸配列+ 1s−G In−G 1n−
Asp−Tyr−G luは、このアミノ酸の僅かに退
化した遺伝子コードのためにオリゴヌクレオチドの誘導
に適当である。オリゴヌクレオチドER13の場合にヌ
クレオチド配列を確定するために、アスペルギルス・ニ
ゲルからのグルフアミラーゼ遺伝子、ポエ/L/ (E
、Boel)他(1984)、EMBOJ、3.109
7〜1102、ならびにアスペルギルス・ニドウランス
(A、n1dulans)からのアセトアミダーゼ遺伝
子、コーリツク(C,M、Corrick)他、(19
87)、Gene5363〜71、の場合に最も頻繁に
使用されるコドンを基礎としていた。これら2つの遺伝
子の場合には、アスパラギン酸に対して明らかなコドン
優位性を測定することができなかったので、EH11の
場合に2つの可能なコドンが使用された。
いる分解をpH7,8で重炭酸アンモニウム20ミリモ
ル中で実施した。相応するペプチドを再び逆相HPLC
クロマトグラフィーによってCI8カラムを用いて分離
した。天然の蛋白質のN末端配列を直接に測定した。こ
のN末端配列は、次のとおりであった: G Iy−5er−Cys−Thr−Phe−Lys−
Thr−A 1a−A Ia−A 1a−A 1a−L
ys−A 1a−G Iy−Lys−A Ia−G I
y−Cys−Ser−Thr−+ 1e−Thr−Le
u−Asp−Asn−11e−G 1u−Va 1−P
ro−A la−ブロムシアン分解後に得られたペプチ
ド、CN7、の1つをオリゴヌクレオチドER13の合
成のだめのオリジナルとして使用した。ペプチドCN7
の場合のアミノ酸配列+ 1s−G In−G 1n−
Asp−Tyr−G luは、このアミノ酸の僅かに退
化した遺伝子コードのためにオリゴヌクレオチドの誘導
に適当である。オリゴヌクレオチドER13の場合にヌ
クレオチド配列を確定するために、アスペルギルス・ニ
ゲルからのグルフアミラーゼ遺伝子、ポエ/L/ (E
、Boel)他(1984)、EMBOJ、3.109
7〜1102、ならびにアスペルギルス・ニドウランス
(A、n1dulans)からのアセトアミダーゼ遺伝
子、コーリツク(C,M、Corrick)他、(19
87)、Gene5363〜71、の場合に最も頻繁に
使用されるコドンを基礎としていた。これら2つの遺伝
子の場合には、アスパラギン酸に対して明らかなコドン
優位性を測定することができなかったので、EH11の
場合に2つの可能なコドンが使用された。
CN7のアミノ酸配列:
5er−Gly−I 1e−Ser−^5p−Tyr−
GIy−Val−Val−I 1e−GIn−GIn−
Asp−Tyr−Glu−Asp−GlyLys EH11の合成のために選択されたアミノ酸配列: +1e−Gin−Gin−Asp−Tyr−Glu可能
なコドン: RNAに対して補足的なオリゴヌクレオチドER13の
配列: 3’ −TAG−CTC−GTC−CT 6−ATG−
CT−5’mRNAを調製するために、菌株DSM55
75を振盪フラスコ中でPG誘発される条件下でコムギ
糠2%、微粉砕した蕪臀の切片2%および栄養媒体とし
ての硫酸アンモニウム0.1%と一緒に往復揺動装置上
で28℃で96時間培養した。得られたミセルを導出し
、かつ直接に液体窒素中で低温凍結した。
GIy−Val−Val−I 1e−GIn−GIn−
Asp−Tyr−Glu−Asp−GlyLys EH11の合成のために選択されたアミノ酸配列: +1e−Gin−Gin−Asp−Tyr−Glu可能
なコドン: RNAに対して補足的なオリゴヌクレオチドER13の
配列: 3’ −TAG−CTC−GTC−CT 6−ATG−
CT−5’mRNAを調製するために、菌株DSM55
75を振盪フラスコ中でPG誘発される条件下でコムギ
糠2%、微粉砕した蕪臀の切片2%および栄養媒体とし
ての硫酸アンモニウム0.1%と一緒に往復揺動装置上
で28℃で96時間培養した。得られたミセルを導出し
、かつ直接に液体窒素中で低温凍結した。
RNAの調製は、マニアチス(1:、%1B1iati
s)他(1982) 、Co1d Sparing H
arbor Laboratory Press、Ne
w York、第196頁に記載のグアニジニウムイン
チオシアネート/C5CQ方法により行なわれた。こう
して得られた全RNAから、オリゴ(dT)−セルロー
スを用いるカラムクロマトグラフィーによってポリ(A
)”−mRNAの含量が増大した。ティラー(J、M、
Tal。
s)他(1982) 、Co1d Sparing H
arbor Laboratory Press、Ne
w York、第196頁に記載のグアニジニウムイン
チオシアネート/C5CQ方法により行なわれた。こう
して得られた全RNAから、オリゴ(dT)−セルロー
スを用いるカラムクロマトグラフィーによってポリ(A
)”−mRNAの含量が増大した。ティラー(J、M、
Tal。
rXI 979 ) 、Ann、Rev、Bioche
m、48 、681〜717゜ mRNAから、グブラー(U、Gubler)およびホ
フマン(B、J、Hoffmann)(1983) 、
G e ne25.263〜269の記載によりc D
NAを合成した。この場合には、mRNA約5μ9をM
−MLV逆転写酵素60 U (GIBCO−BRL
GmbH17514Eggensteln、西ドイツ国
)を用イテー重jJ c D N Aに書き換えた。−
重鎖c DNA400 ngからリボヌクレアーゼH0
,4U(GIBCO−BRL Gn+bH,7514E
ggenstein、西ドイツ国)、エシェリキア・コ
リ(E 、coli)−D N AポリメラーゼI
I OU (Boehringer Mannheia
s GmbHq 6800 )Jannhaim、西ド
イツ国)およびエシェリキア・コリーDNA−リガーゼ
(NewEngland Biolabs GmbHs
Schwalbach、西ドイツ国)の使用下に二重
鎖cDNA約450 ngを取得することができた。緩
衝液の組成およびヌクレオチド濃度は、グブラー(U、
Gublar)およびホフマン(B、J、Horian
nXl 983 ) 、G ene25.263〜26
9の方法に相応する。
m、48 、681〜717゜ mRNAから、グブラー(U、Gubler)およびホ
フマン(B、J、Hoffmann)(1983) 、
G e ne25.263〜269の記載によりc D
NAを合成した。この場合には、mRNA約5μ9をM
−MLV逆転写酵素60 U (GIBCO−BRL
GmbH17514Eggensteln、西ドイツ国
)を用イテー重jJ c D N Aに書き換えた。−
重鎖c DNA400 ngからリボヌクレアーゼH0
,4U(GIBCO−BRL Gn+bH,7514E
ggenstein、西ドイツ国)、エシェリキア・コ
リ(E 、coli)−D N AポリメラーゼI
I OU (Boehringer Mannheia
s GmbHq 6800 )Jannhaim、西ド
イツ国)およびエシェリキア・コリーDNA−リガーゼ
(NewEngland Biolabs GmbHs
Schwalbach、西ドイツ国)の使用下に二重
鎖cDNA約450 ngを取得することができた。緩
衝液の組成およびヌクレオチド濃度は、グブラー(U、
Gublar)およびホフマン(B、J、Horian
nXl 983 ) 、G ene25.263〜26
9の方法に相応する。
平らな末端の製造のために、cDNA末端をT4ポリメ
ラーゼ5 U (G[BCO−BRL GmbH,75
14Eggenstein、西ドイツ国)およびデオキ
シヌクレオシドトリホスフェート50μMを用いてグブ
ラー(U、Gubler) (1987) 、Meth
ods inEnzymo1ogy第152巻、第33
0頁〜第335頁の記載により充填した。cDNAの分
子を900bpの長さを越えて増大させるために、cD
NAをビオゲル(Biogel)A 50 mカラムに
より大きさに応じて分離しt;。Ikbpの長さを上廻
るcDNA分子を含有する両分を捕集した。cDNAを
dG分割したpUc9−ベクター(Pharmacia
LKB GmbH,7800Freiburg。
ラーゼ5 U (G[BCO−BRL GmbH,75
14Eggenstein、西ドイツ国)およびデオキ
シヌクレオシドトリホスフェート50μMを用いてグブ
ラー(U、Gubler) (1987) 、Meth
ods inEnzymo1ogy第152巻、第33
0頁〜第335頁の記載により充填した。cDNAの分
子を900bpの長さを越えて増大させるために、cD
NAをビオゲル(Biogel)A 50 mカラムに
より大きさに応じて分離しt;。Ikbpの長さを上廻
るcDNA分子を含有する両分を捕集した。cDNAを
dG分割したpUc9−ベクター(Pharmacia
LKB GmbH,7800Freiburg。
西ドイツ国)に挿入するために、1kbpの長さを1廻
る二重鎖cDNA 20ngをdCTPの104倍の
過剰量および末端転移酵素14゜7 U (GIBCO
−BRL GmbH,7514Eggenstein、
西ドイツ国)37℃で7分間40μaでの全容量でイン
キュベートし、マニアチス(Maniatis)他、(
1982) 、Co1d Sparing Habor
Laboratory Press、New Yor
ks第241頁、かつこうして単独重合体dC基を備え
た。
る二重鎖cDNA 20ngをdCTPの104倍の
過剰量および末端転移酵素14゜7 U (GIBCO
−BRL GmbH,7514Eggenstein、
西ドイツ国)37℃で7分間40μaでの全容量でイン
キュベートし、マニアチス(Maniatis)他、(
1982) 、Co1d Sparing Habor
Laboratory Press、New Yor
ks第241頁、かつこうして単独重合体dC基を備え
た。
このcDNA5n9をグブラー(U、Gubler)お
よびホフマン(B、J、HofmannXl 983
)、Gene25.263〜269の方法によりpUC
9ベクター中に挿入した。この組換えベクターの形質転
換は、適格なエシェリキア・コリDH5rTM細胞(G
IBCO−BRL GmbH,7514Eggenst
ein、西ドイツ国)中で製造元の記載により行なわれ
t;。こうして組換えクローンを包含するcDNAバン
クは、アスペルギルス・ニゲルDSM 5575によ
って得られた。
よびホフマン(B、J、HofmannXl 983
)、Gene25.263〜269の方法によりpUC
9ベクター中に挿入した。この組換えベクターの形質転
換は、適格なエシェリキア・コリDH5rTM細胞(G
IBCO−BRL GmbH,7514Eggenst
ein、西ドイツ国)中で製造元の記載により行なわれ
t;。こうして組換えクローンを包含するcDNAバン
クは、アスペルギルス・ニゲルDSM 5575によ
って得られた。
アスペルギルス・ニゲルcDNAバンクヲ(32)P標
識したオリゴヌクレオチドER13−緒にスクリーニン
グした。この場合、ハイブリッド形成は37℃で行なわ
れ;それぞれ37℃で30分間6倍のSSC緩衝液の存
在下、次に2倍のSSC緩衝液の存在下、SDS 1%
を有する2倍のSSC緩衝液の存在下、最後に001倍
のSSC緩衝液の存在下で洗浄した。ニトロセルロース
フィルターのオートラジオグラフィー処理の後、3つの
強度にハイブリッド形成すれるエシェリキア・コリのク
ローンを確認することができ、そのプラズミドは、制限
分析および部分的DNA配列決定の後に全部で3回の挿
入は同一であったことを示した。第1図には、制限分析
および形質転換細胞のPG−cDNAの配列決定図式が
表わされている。組換えプラズミドは、pPGlと呼称
される。PG−cDNAの完全なりNA配列の配列決定
は、サンガー(F、Sanger)他(1977) 、
Proc、Natl、Acad、Sci、USA74.
5463−5467の記載により母細胞配列プライマー
およびPG−特異的配列プライマーを用いて行なわれた
。得られたcDNA配列は、第1表に記載されている。
識したオリゴヌクレオチドER13−緒にスクリーニン
グした。この場合、ハイブリッド形成は37℃で行なわ
れ;それぞれ37℃で30分間6倍のSSC緩衝液の存
在下、次に2倍のSSC緩衝液の存在下、SDS 1%
を有する2倍のSSC緩衝液の存在下、最後に001倍
のSSC緩衝液の存在下で洗浄した。ニトロセルロース
フィルターのオートラジオグラフィー処理の後、3つの
強度にハイブリッド形成すれるエシェリキア・コリのク
ローンを確認することができ、そのプラズミドは、制限
分析および部分的DNA配列決定の後に全部で3回の挿
入は同一であったことを示した。第1図には、制限分析
および形質転換細胞のPG−cDNAの配列決定図式が
表わされている。組換えプラズミドは、pPGlと呼称
される。PG−cDNAの完全なりNA配列の配列決定
は、サンガー(F、Sanger)他(1977) 、
Proc、Natl、Acad、Sci、USA74.
5463−5467の記載により母細胞配列プライマー
およびPG−特異的配列プライマーを用いて行なわれた
。得られたcDNA配列は、第1表に記載されている。
cDNAから導出されたアミノ酸配列は、蛋白質の配列
決定により測定されたペプチド配列との最も著しい一致
を示した。
決定により測定されたペプチド配列との最も著しい一致
を示した。
アスペルギルスの表現のために必要とされる隣接領域を
有する7アージークローンをDSM5575の染色体D
NAから得るために、まず染色体DNAをハインズ(M
、J、Hynes)他(1983) 、Mo1. Ce
11.Biol、 3.1430〜1439に記載の方
法により単離した。このためにミセル約109を液体窒
素の下で磨砕し、かつトリフ、−HCff110ミリモ
ル、pH7,5、EDTA l ミリモルおよびSDS
3%への取り込み後にフェノールで抽出した。DNAの
後処理をブロテイナーゼにおよびRNアーゼAを用いる
処理によって行なった。得られた高分子量DNAを部分
的に5au3Aで加水分解し、かつサッカロース密度勾
配遠心分離によって大きさに応じて分取した。18〜2
2kbの大きさのDNA分子をB a m HI /
E c o RI加水分解し f二 E MB L
3 −D N A (Stratage
ne GmbH,6900Heidelbergs
西ドイツ国)中に挿入し、かつ試験管内に包装しI;。
有する7アージークローンをDSM5575の染色体D
NAから得るために、まず染色体DNAをハインズ(M
、J、Hynes)他(1983) 、Mo1. Ce
11.Biol、 3.1430〜1439に記載の方
法により単離した。このためにミセル約109を液体窒
素の下で磨砕し、かつトリフ、−HCff110ミリモ
ル、pH7,5、EDTA l ミリモルおよびSDS
3%への取り込み後にフェノールで抽出した。DNAの
後処理をブロテイナーゼにおよびRNアーゼAを用いる
処理によって行なった。得られた高分子量DNAを部分
的に5au3Aで加水分解し、かつサッカロース密度勾
配遠心分離によって大きさに応じて分取した。18〜2
2kbの大きさのDNA分子をB a m HI /
E c o RI加水分解し f二 E MB L
3 −D N A (Stratage
ne GmbH,6900Heidelbergs
西ドイツ国)中に挿入し、かつ試験管内に包装しI;。
包装抽出液を同様にストラタゲン社(Stratage
ne)から取り寄せた。
ne)から取り寄せた。
エシェリキア・コリ中の7アージ(Stratagen
eGn+bH)の増殖後、組換えクローン約70000
個を包括するファージバンクを設計することができた。
eGn+bH)の増殖後、組換えクローン約70000
個を包括するファージバンクを設計することができた。
7アージーDNAをハイボンド(Hybond)−N
−メンプラン(Amersham Corp、、Bra
unschveig)上に施与した後にpPGlからの
(32)P−標識された1、3−kbp−Ps t I
−断片と一緒にスクリーニングした。この場合、ハイブ
リッド形成は、65°Oで行なわれ;このフィルターを
それぞれ65℃で30分間宛2回SSC緩衝液中で洗浄
し、次いで2回SDS 1%を有するSSC緩衝液で洗
浄し、最後に0.1回Ssc緩衝液で洗浄した。組換え
EMBL3−ファージ約70000個から、多数のハイ
ブリッド形成りローンを得た。それらの中から、唯1つ
の再びハイブリッド形成【7た約6kbの大きさのHi
ndnl−7ラグメントをpUCl 9に再クローン化
し、かつエシェリキア・コリD H5aに形質転換した
。表現するのに必要とされる隣接配列を有する染色体P
G遺伝子を含有する生じるプラズミドは、pPG67と
呼称された。エシェリキア・コリDH5a pPG67
をDSMi::N o 、5553で寄託した。pPG
67の制限図は、第2図に示されている。構造遺伝子な
らびにpPG67からの隣接領域を含有するDNA配列
は、第2表に記載されている。
−メンプラン(Amersham Corp、、Bra
unschveig)上に施与した後にpPGlからの
(32)P−標識された1、3−kbp−Ps t I
−断片と一緒にスクリーニングした。この場合、ハイブ
リッド形成は、65°Oで行なわれ;このフィルターを
それぞれ65℃で30分間宛2回SSC緩衝液中で洗浄
し、次いで2回SDS 1%を有するSSC緩衝液で洗
浄し、最後に0.1回Ssc緩衝液で洗浄した。組換え
EMBL3−ファージ約70000個から、多数のハイ
ブリッド形成りローンを得た。それらの中から、唯1つ
の再びハイブリッド形成【7た約6kbの大きさのHi
ndnl−7ラグメントをpUCl 9に再クローン化
し、かつエシェリキア・コリD H5aに形質転換した
。表現するのに必要とされる隣接配列を有する染色体P
G遺伝子を含有する生じるプラズミドは、pPG67と
呼称された。エシェリキア・コリDH5a pPG67
をDSMi::N o 、5553で寄託した。pPG
67の制限図は、第2図に示されている。構造遺伝子な
らびにpPG67からの隣接領域を含有するDNA配列
は、第2表に記載されている。
菌株アスペルギルス・ニゲル DSM5575、アスペ
ルギルス・アワモリ DSM5574およびアスペルギ
ルス・オリザエ DSM5573を次の試験報告により
形質転換した。
ルギルス・アワモリ DSM5574およびアスペルギ
ルス・オリザエ DSM5573を次の試験報告により
形質転換した。
邪魔板を有するlQのエーレンマイヤーフラスコ中のツ
ァペクードックス(Czapek−Dox)一完全媒体
100mQ(酵母抽出液0.1%を有する0xoid
Czapek−Dox媒体)にそれぞれ真菌類の菌株の
胞子約107を接種し、37°Cで16時間往復揺動装
置上で1分間120回の転向の周期でインキュベートし
た。ミセルを祇フィルターにより取得し、かつ2回MP
緩衝液(M9SO41,2モル、N a H2F041
0ミリモル+1)H5,8)で洗浄した。湿ったミセル
約5gを邪魔板を有しないloOmffのエーレンマイ
ヤーフラスコ中のMP緩衝液15m12に引き取った。
ァペクードックス(Czapek−Dox)一完全媒体
100mQ(酵母抽出液0.1%を有する0xoid
Czapek−Dox媒体)にそれぞれ真菌類の菌株の
胞子約107を接種し、37°Cで16時間往復揺動装
置上で1分間120回の転向の周期でインキュベートし
た。ミセルを祇フィルターにより取得し、かつ2回MP
緩衝液(M9SO41,2モル、N a H2F041
0ミリモル+1)H5,8)で洗浄した。湿ったミセル
約5gを邪魔板を有しないloOmffのエーレンマイ
ヤーフラスコ中のMP緩衝液15m12に引き取った。
この懸濁液にノボザイム234(■Novozym 2
34)溶液600μQCMP緩衝液6m4中1g)およ
びβ−グルクロニダーゼ100μQ(Sign+a)を
添加し、この配合物を5分間水中で冷却した。引続き、
牛血清アルブミン溶液300μa(MP緩衝液4mQ中
0.29)を添加した。ミセルの原形質伴侶は、30°
Cで振盪板の直径12.5mmを有する水浴円形振盪装
置中で100rpilで行なわれる。原形質体化時間は
、DSM5575およびDSM5574の際に約3.5
〜4時間であり、DSM5573の場合には、約1.5
〜2時間である。原形質伴侶の状態は、鏡検法で制御さ
れた。
34)溶液600μQCMP緩衝液6m4中1g)およ
びβ−グルクロニダーゼ100μQ(Sign+a)を
添加し、この配合物を5分間水中で冷却した。引続き、
牛血清アルブミン溶液300μa(MP緩衝液4mQ中
0.29)を添加した。ミセルの原形質伴侶は、30°
Cで振盪板の直径12.5mmを有する水浴円形振盪装
置中で100rpilで行なわれる。原形質体化時間は
、DSM5575およびDSM5574の際に約3.5
〜4時間であり、DSM5573の場合には、約1.5
〜2時間である。原形質伴侶の状態は、鏡検法で制御さ
れた。
原形質体懸濁液をMP緩衝液で含浸したガラスウール−
フィルターを介して遠心分離小管中に与え、かつそれぞ
れ同容量のU緩衝液(ソルビトール600ミリモル、ト
リス100ミリモル/HCQ 1)H7,O)をその上
に入れた。20°Cおよび250gで10分間の遠心分
離の後、原形質体を2つの緩衝液の間の層から取り出し
た。次いで、得られた懸濁液を2つの容量の5Tlil
衝液(ソルビトール1.2モル、トリス10ミリモル/
HC(2pH7,5)と混合し、かつ20°Cで10分
間15009を遠心分離した。引続き、原形質体沈積物
をSTC緩衝液10mQ(ソルビトール1.2モル、ト
リス10ミリモル/HCl2 pH7,5、CaC(2
210ミリモル)中に引き取り、かつ再び20°Cおよ
び1500gで遠心分離した。この方法を繰返し、引続
きこの沈積物をSTC緩衝液1m12中に懸濁させt二
。
フィルターを介して遠心分離小管中に与え、かつそれぞ
れ同容量のU緩衝液(ソルビトール600ミリモル、ト
リス100ミリモル/HCQ 1)H7,O)をその上
に入れた。20°Cおよび250gで10分間の遠心分
離の後、原形質体を2つの緩衝液の間の層から取り出し
た。次いで、得られた懸濁液を2つの容量の5Tlil
衝液(ソルビトール1.2モル、トリス10ミリモル/
HC(2pH7,5)と混合し、かつ20°Cで10分
間15009を遠心分離した。引続き、原形質体沈積物
をSTC緩衝液10mQ(ソルビトール1.2モル、ト
リス10ミリモル/HCl2 pH7,5、CaC(2
210ミリモル)中に引き取り、かつ再び20°Cおよ
び1500gで遠心分離した。この方法を繰返し、引続
きこの沈積物をSTC緩衝液1m12中に懸濁させt二
。
プラスミドpPG67は形質転換すべきアスペルギルス
菌株に対する選択マーカーを有しないので、共形質転換
方法が使用された。そのために、アスペルギルス・ニゲ
ル DSM5575およびアスペルギルス・アワモリ
DSM5574には、これらの菌株の場合に表現可能な
ヒグロマイシン耐性遺伝子(ヒグロマイシンーホスホト
ランスフェラーゼ)を含有するプラスミドp A N
7−1 (Punt他、Gene56.117〜12
4)が使用された。共形質転換配合物1つ当りそれぞれ
pAN7−1 20μ9および同量のpPG67が使用
された。アスペルギルス・オリザエ DSM5573は
ヒグロマイシンBに対して自然の耐性を有しているので
、この菌株は、プラスミドp 3 S R2(Kell
yおよびHynas、 EMBOJournal 4.
475〜479)と共形質転換され、この場合このプラ
スミドp3SR2は、唯一の窒素源としてのアセトアミ
ドを有する最小媒体上での有利な成長による形質転換細
胞の選択をアセトアミダーゼ遺伝子の表現によって可能
にする。共形質転換配合物の場合には、それぞれp3s
R2040μgおよび同量のpPG67が使用された。
菌株に対する選択マーカーを有しないので、共形質転換
方法が使用された。そのために、アスペルギルス・ニゲ
ル DSM5575およびアスペルギルス・アワモリ
DSM5574には、これらの菌株の場合に表現可能な
ヒグロマイシン耐性遺伝子(ヒグロマイシンーホスホト
ランスフェラーゼ)を含有するプラスミドp A N
7−1 (Punt他、Gene56.117〜12
4)が使用された。共形質転換配合物1つ当りそれぞれ
pAN7−1 20μ9および同量のpPG67が使用
された。アスペルギルス・オリザエ DSM5573は
ヒグロマイシンBに対して自然の耐性を有しているので
、この菌株は、プラスミドp 3 S R2(Kell
yおよびHynas、 EMBOJournal 4.
475〜479)と共形質転換され、この場合このプラ
スミドp3SR2は、唯一の窒素源としてのアセトアミ
ドを有する最小媒体上での有利な成長による形質転換細
胞の選択をアセトアミダーゼ遺伝子の表現によって可能
にする。共形質転換配合物の場合には、それぞれp3s
R2040μgおよび同量のpPG67が使用された。
形質転換に使用されたDNAをTE緩衝液50μα(ト
リス10ミリモル/HcQpH7,5EDTA 1ミリ
モル)中に引き取っt;。対照配合物は、それぞれDN
AなしのTE緩衝液50μαを含有していたか、または
選択プラスミドpAN7−1もしくはp3SR2のみを
含有していl二。DNA溶液もしくはDNAなしのTE
緩衝液20μaをグロトプラステン懸濁液300μQに
添加し、かつ0℃で10分間インキュベートした。DN
A溶液もしくはDNAなしの緩衝液の再度の添加および
PEG溶液400μQ(Servaのポリエチレングリ
コール4000 60%、トリス1059モル/HC(
2pH7,5、CaCl2250ミリモル)の添加の後
、22°Cで5分間のインキュベートを行なった。引続
き、PEG溶液600μαを添加し、この配合物を22
℃でさらに20分間インキュベートした。
リス10ミリモル/HcQpH7,5EDTA 1ミリ
モル)中に引き取っt;。対照配合物は、それぞれDN
AなしのTE緩衝液50μαを含有していたか、または
選択プラスミドpAN7−1もしくはp3SR2のみを
含有していl二。DNA溶液もしくはDNAなしのTE
緩衝液20μaをグロトプラステン懸濁液300μQに
添加し、かつ0℃で10分間インキュベートした。DN
A溶液もしくはDNAなしの緩衝液の再度の添加および
PEG溶液400μQ(Servaのポリエチレングリ
コール4000 60%、トリス1059モル/HC(
2pH7,5、CaCl2250ミリモル)の添加の後
、22°Cで5分間のインキュベートを行なった。引続
き、PEG溶液600μαを添加し、この配合物を22
℃でさらに20分間インキュベートした。
ヒグロマイシンBの選択の場合には、配合物を77ペク
ードツクス(Czapek−Dox)寒天100mQ
(0xoid寒天No、l 1%を有する0xoid
)を、45℃液状に保持された浸透安定剤としてのサッ
カロース1モルと一緒に加え、かつそれぞれ10m(2
の分量でベトリ皿に分配した。37℃で16時間のイン
キュベートの後、同じ寒天ではあるがサッカロースなし
の上層10mQのヒグロマイシンB (Calbioc
hem)の添加は、200μg/mQの濃度で行なわれ
た。37°Cで2〜4日間さらにインキュベートを行な
った後、形質転換細胞は、明らかに背後での成長によっ
て寒天層中で取り除かれかつ対照配合物中には存在して
いない、寒天表面から突出しているカビのコロニーとし
て確認しかつ単離することができた。引続き、形質転換
細胞を2回ツァペクードックス(Czapek−Dox
)寒天上の1つのカビ通路上でヒグロマイシンB50μ
g/mQを用いて精製した。出発菌株DSM5575お
よびDSM5574は、この媒体上で成長しなかった。
ードツクス(Czapek−Dox)寒天100mQ
(0xoid寒天No、l 1%を有する0xoid
)を、45℃液状に保持された浸透安定剤としてのサッ
カロース1モルと一緒に加え、かつそれぞれ10m(2
の分量でベトリ皿に分配した。37℃で16時間のイン
キュベートの後、同じ寒天ではあるがサッカロースなし
の上層10mQのヒグロマイシンB (Calbioc
hem)の添加は、200μg/mQの濃度で行なわれ
た。37°Cで2〜4日間さらにインキュベートを行な
った後、形質転換細胞は、明らかに背後での成長によっ
て寒天層中で取り除かれかつ対照配合物中には存在して
いない、寒天表面から突出しているカビのコロニーとし
て確認しかつ単離することができた。引続き、形質転換
細胞を2回ツァペクードックス(Czapek−Dox
)寒天上の1つのカビ通路上でヒグロマイシンB50μ
g/mQを用いて精製した。出発菌株DSM5575お
よびDSM5574は、この媒体上で成長しなかった。
この形質転換速度は、DSM5575のpAN7−1
1μg当り形質転換細胞約10個でありかつDsM55
74のpAN7−I N1g当り形質転換細胞約20
ffllであった。
1μg当り形質転換細胞約10個でありかつDsM55
74のpAN7−I N1g当り形質転換細胞約20
ffllであった。
アセトアミダーゼの選択の場合には、形質転換配合物を
STC緩衝液で10mffに満たし、かつ20°Cおよ
び1500gで10分間遠心分離した。沈積物をSTC
緩衝液1m12中に再懸濁させ、引続き浸透安定剤とし
てのサッカロース1モルを有するアセトアミド最少寒天
9m(2と、45℃で混合した。この寒天を、背後での
成長を阻止するためにサッカロース1モルおよびC5C
(215ミリモルを存するアセトアミド最少寒天板上で
2mffの分量に分配した。6〜12日後に、形質転換
細胞を、明らかに背後の成長が取り除かれている強力に
成長するカビのコロニーとして確認しかつ単離すること
ができる。この形質転換細胞をC3CQおよびサッカロ
ースなしのアセトアミド−最少寒天上の1つのカビ通路
上で2回精製した。アセトアミド−最少栄養培地の組成
は、ケリー(Kslly)およびハインズ(Hynes
)による場合(上記参照)に相当する。アスさルギルス
・オリザエ DSM5573の形質転換速度は、p3S
R21μg当り形質転換細胞約2.5個である。
STC緩衝液で10mffに満たし、かつ20°Cおよ
び1500gで10分間遠心分離した。沈積物をSTC
緩衝液1m12中に再懸濁させ、引続き浸透安定剤とし
てのサッカロース1モルを有するアセトアミド最少寒天
9m(2と、45℃で混合した。この寒天を、背後での
成長を阻止するためにサッカロース1モルおよびC5C
(215ミリモルを存するアセトアミド最少寒天板上で
2mffの分量に分配した。6〜12日後に、形質転換
細胞を、明らかに背後の成長が取り除かれている強力に
成長するカビのコロニーとして確認しかつ単離すること
ができる。この形質転換細胞をC3CQおよびサッカロ
ースなしのアセトアミド−最少寒天上の1つのカビ通路
上で2回精製した。アセトアミド−最少栄養培地の組成
は、ケリー(Kslly)およびハインズ(Hynes
)による場合(上記参照)に相当する。アスさルギルス
・オリザエ DSM5573の形質転換速度は、p3S
R21μg当り形質転換細胞約2.5個である。
形質転換試験および対照配合物からそのつど50個の形
質転換細胞を振盪フラスコ中でPG生産性について試験
した。この場合には、ミセル培養の場合と同じ条件をm
RN A単離(上記参照)のために選択した。第3表
には、それぞれ最適の形質転換細胞1m12当りの単位
で培養上澄み液の場合に見い出されるPG活性度が記載
されている。出発菌株がPG生産性について少なくとも
2倍卓越しているクローン数で測定された共形質転換の
頻度が全部で3つの試験の場合に〉30%であるので、
最適のクローンは、少なくとも15個の形質転換細胞か
ら選択された。対照の配合物の場合には、形質転換細胞
は出発菌株の生産性を凌駕していないので、全部で50
の菌株には記載した値が当てはまる。
質転換細胞を振盪フラスコ中でPG生産性について試験
した。この場合には、ミセル培養の場合と同じ条件をm
RN A単離(上記参照)のために選択した。第3表
には、それぞれ最適の形質転換細胞1m12当りの単位
で培養上澄み液の場合に見い出されるPG活性度が記載
されている。出発菌株がPG生産性について少なくとも
2倍卓越しているクローン数で測定された共形質転換の
頻度が全部で3つの試験の場合に〉30%であるので、
最適のクローンは、少なくとも15個の形質転換細胞か
ら選択された。対照の配合物の場合には、形質転換細胞
は出発菌株の生産性を凌駕していないので、全部で50
の菌株には記載した値が当てはまる。
振盪フラスコの場合に試験毎に記載した変動に基づいて
、値の範囲は記載されている。
、値の範囲は記載されている。
それに応じて、最高の結果をアスペルギルスニゲルDS
M 5575(形質転換細胞NO67)の場合に24
0〜270PG単位/mQで得た。アスペルギルス・ア
ワモリDSM5574の場合(形質転換細胞No、12
)には、120〜150PG単位/ m Qで、20〜
30PG単位/m12を有するアスペルギルス・オリザ
より5M5573(形質転換細胞N o 、4 )の場
合よりも良好な結果が得られた。
M 5575(形質転換細胞NO67)の場合に24
0〜270PG単位/mQで得た。アスペルギルス・ア
ワモリDSM5574の場合(形質転換細胞No、12
)には、120〜150PG単位/ m Qで、20〜
30PG単位/m12を有するアスペルギルス・オリザ
より5M5573(形質転換細胞N o 、4 )の場
合よりも良好な結果が得られた。
次に、本発明を表につきさらに詳説する。
第1表には、アスペルギルスニゲルからのPG−cDN
Aのヌクレオチド配列およびこれから導出されたアミノ
酸配列が1つの略名コードで示されている。明らかに解
釈できる出発コドンおよび停止コドンは省略されている
。天然蛋白質のN末端の端部(アミノ酸1〜30)は特
徴付けられている。ペプチドCN7は、矢印によって示
されている。その中で下線を引いたアミノ酸は、オリゴ
ヌクレオチドER13の合成のためのオリジナルに使用
された。
Aのヌクレオチド配列およびこれから導出されたアミノ
酸配列が1つの略名コードで示されている。明らかに解
釈できる出発コドンおよび停止コドンは省略されている
。天然蛋白質のN末端の端部(アミノ酸1〜30)は特
徴付けられている。ペプチドCN7は、矢印によって示
されている。その中で下線を引いたアミノ酸は、オリゴ
ヌクレオチドER13の合成のためのオリジナルに使用
された。
第2表には、ブラズミドpPG67からの染色体PG遺
伝子のヌクレオチド配列およびこれから導出されたアミ
ノ酸配列が1つの略名コードで示されている。天然PG
のN−末端配列は下線が引かれている。更に、イントロ
ンlならびに出発コドンおよび停止コドンが示されてい
る。
伝子のヌクレオチド配列およびこれから導出されたアミ
ノ酸配列が1つの略名コードで示されている。天然PG
のN−末端配列は下線が引かれている。更に、イントロ
ンlならびに出発コドンおよび停止コドンが示されてい
る。
第3表には、培地の上澄み液中で見い出されたPG活性
度がそれぞれ最適の形質転換細胞1mQ当りの単位で示
されている。
度がそれぞれ最適の形質転換細胞1mQ当りの単位で示
されている。
1つの略名コードの場合に、次のコドンが使用されてい
る: A−アラニン、C−システィン、D−アスパラギン酸、
E−グルタミン酸、F−フェニルアラニンG−グリシン
、H−ヒスチジン、■−インロイシン、K−リシン、L
−ロイシン、M−メチオニン、N−アスパラギン、P−
プロリン、Q−’/)レタミン、R−アルギニン、S−
セリン、T−トレオニン、■−バリン、W−トリプトフ
ァン、Y−チロシン。
る: A−アラニン、C−システィン、D−アスパラギン酸、
E−グルタミン酸、F−フェニルアラニンG−グリシン
、H−ヒスチジン、■−インロイシン、K−リシン、L
−ロイシン、M−メチオニン、N−アスパラギン、P−
プロリン、Q−’/)レタミン、R−アルギニン、S−
セリン、T−トレオニン、■−バリン、W−トリプトフ
ァン、Y−チロシン。
第3表
!、アスペルギルス・ニゲル
DSM5575 (出発菌株)
約20〜3゜DSM5575 pAN7−1(形
質転換細胞1〜5o)約20−3020−30DS
pAN7−1/pPG67(形質転換細胞No、7)
約240−2702.7スベ
ルギルス・アワモリ DSM5574 (出発菌株)<l。
約20〜3゜DSM5575 pAN7−1(形
質転換細胞1〜5o)約20−3020−30DS
pAN7−1/pPG67(形質転換細胞No、7)
約240−2702.7スベ
ルギルス・アワモリ DSM5574 (出発菌株)<l。
DSM5574 pAN7−1(形質転換細胞1〜5
o) く1゜DSM5574 pAN7−1/
pPG67(形質転換細胞No、12)
約120−1503.7スベルギルス・オリ
ザよ り5M5573(出発菌株)<10 DSM5573 p3SR2(形質転換細胞1〜50
) <10DSM5574 p3SR2/p
PG67(形1jltiJa細胞N o 、 4 )
約20〜30例2:ペク
チネステラーゼ(P E)遺伝子の表現 菌株アスペルギルス中ニゲル DSM5575を、コム
ギ糠4%、微粉砕した蕪臂の切片4%およびisアンモ
ニウム0.2%を有する30Qの発酵基中で28℃、通
気量IVVMおよび撹拌速度600 rpmで96時間
培養した。
o) く1゜DSM5574 pAN7−1/
pPG67(形質転換細胞No、12)
約120−1503.7スベルギルス・オリ
ザよ り5M5573(出発菌株)<10 DSM5573 p3SR2(形質転換細胞1〜50
) <10DSM5574 p3SR2/p
PG67(形1jltiJa細胞N o 、 4 )
約20〜30例2:ペク
チネステラーゼ(P E)遺伝子の表現 菌株アスペルギルス中ニゲル DSM5575を、コム
ギ糠4%、微粉砕した蕪臂の切片4%およびisアンモ
ニウム0.2%を有する30Qの発酵基中で28℃、通
気量IVVMおよび撹拌速度600 rpmで96時間
培養した。
約43000ドルトンの分子量および約3゜6の等電点
を有する発酵の間に形成されたペクチネステラーゼ(P
E)の蛋白質配列を基礎にDSM5575のc r)
NAバンク中の遺伝子を見い出すためのオリゴヌクレオ
チドプローブを導出するために、この酵素を培地上澄み
液から精製した。精製の間に、この酵素をレーム社(R
Ohm)の1987年2月12日イ寸けNo、FR−5
−02−Dの技術情報冊子に記載のペクチネステラーゼ
(P E)単位の場合のこの酵素の活性度につき検出し
、ならびに280nmの際のUV吸吸収−つき検出した
。この方法は、ペクチンの分解の際に遊離したC0OH
基を一定のpH値の際にn / 10 N a OHで
滴定することに基づく。1%の0bi−ペクチン溶液(
純粋なリンゴペクチン、褐色のバンド、高度にエステル
化された、0bipekLin AG、 B15cho
fszell/Sehweiz)を使用した場合には、
分解曲線はn/10 NaOH2,5mf2の使用量
になるまで直線である。0bi−ペクチンの使用の際の
pH値は、4゜5である。活性度は、国際単位で記載さ
れている。
を有する発酵の間に形成されたペクチネステラーゼ(P
E)の蛋白質配列を基礎にDSM5575のc r)
NAバンク中の遺伝子を見い出すためのオリゴヌクレオ
チドプローブを導出するために、この酵素を培地上澄み
液から精製した。精製の間に、この酵素をレーム社(R
Ohm)の1987年2月12日イ寸けNo、FR−5
−02−Dの技術情報冊子に記載のペクチネステラーゼ
(P E)単位の場合のこの酵素の活性度につき検出し
、ならびに280nmの際のUV吸吸収−つき検出した
。この方法は、ペクチンの分解の際に遊離したC0OH
基を一定のpH値の際にn / 10 N a OHで
滴定することに基づく。1%の0bi−ペクチン溶液(
純粋なリンゴペクチン、褐色のバンド、高度にエステル
化された、0bipekLin AG、 B15cho
fszell/Sehweiz)を使用した場合には、
分解曲線はn/10 NaOH2,5mf2の使用量
になるまで直線である。0bi−ペクチンの使用の際の
pH値は、4゜5である。活性度は、国際単位で記載さ
れている。
発酵上澄み液をセファデックスG25コース(■5ep
hadex G25 Coarse) (Pharma
cia社)により脱塩した。1049モルのトリス/1
−rcQM衝液中でpH8,0の際に7ラクトゲル T
SK DEAE−650(■Fractogel T
SK DEAE650) CMerck社)を用いて陰
イオン交換クロマト、グラフィーにより、PEを線状N
aCQ勾配で約0.3モルで溶離しI;。その上、ゲル
濾過をセファクリル S 200 HR(@5epha
cryl 520OHRXPharmacia社)によ
り行ない、改めて陰イオン交換クロマトグラフィーを上
記の記載と同じ条件下ではあるが、ゲル物質としてのフ
ァルマシア モノQ(■Pharmacia Mono
Q)を用いて行なう。最終的な精製は、フェニル−セ
ファ0−ス CL 4 B (Phenyl−5ep
harose CL4BXPharmacia社)によ
って行なわれた。
hadex G25 Coarse) (Pharma
cia社)により脱塩した。1049モルのトリス/1
−rcQM衝液中でpH8,0の際に7ラクトゲル T
SK DEAE−650(■Fractogel T
SK DEAE650) CMerck社)を用いて陰
イオン交換クロマト、グラフィーにより、PEを線状N
aCQ勾配で約0.3モルで溶離しI;。その上、ゲル
濾過をセファクリル S 200 HR(@5epha
cryl 520OHRXPharmacia社)によ
り行ない、改めて陰イオン交換クロマトグラフィーを上
記の記載と同じ条件下ではあるが、ゲル物質としてのフ
ァルマシア モノQ(■Pharmacia Mono
Q)を用いて行なう。最終的な精製は、フェニル−セ
ファ0−ス CL 4 B (Phenyl−5ep
harose CL4BXPharmacia社)によ
って行なわれた。
精製した酵素から出発し、ブロムシアン、トリプシンお
よびブドウ球菌V8プロテアーゼを用いる分解によって
ペプチドを調製し、そのアミノ酸配列をガス相シークエ
ネータ−(Applied Biosystems M
ode+ 470 A )の使用下に測定した。この場
合、ペプチドのオンライン検出を120 A HP
LCを用いて行なった。ブロムシアン分解をグロス(E
、Grol’3Xl 967 )、Methods i
n Enzymology 1 ls 238〜25
5の記載により行ない、ペプチドの分離をHPLC逆相
C4−カラム上でトリフルオロ酢酸/プロパツール/ア
セトニトリル勾配o、i%中で実施した。トリプシン分
解およびブドウ球菌V8プロテアーゼを用いる分解をp
H7,8で重炭酸アンモニウム20ミリモル中で実施し
た。相応するペプチドを再び逆相HPLCクロマトグラ
フィーによってCI8カラムを用いて分離した。天然の
蛋白質のN末端配列を直接に測定した。このN末端配列
は、次のとおりであつls 二 A l a−Ser −A rg−Me t−Thr
−A Ia−Pro−5er−G 1y−A la−+
1 e−Va 1−Va l −A Ia−Lys−
5er−Gly−Gly−Asp−Tyr−Asp−T
hr−11a−5er−Ala−Ala−次のN−末端
アミノ酸配列を有する、典型的な分解の後に得られたペ
プチド、T2−21゜をオリゴヌクレオチドPE3の合
成のためのすリジナルとして使用した: T 2−21 : Thr−5er−Met−Thr−
Asp−Val−11e−Asn−His−Lau−G
ly−Trp−Thr−Glu−抛 遺伝子プローグPE3の補足的なヌクレオチド配列の合
成は、ボカージュ(S、L、Beaucage)および
カールサーズ(M、H,CaruthersX l 9
81 ) 、 Tetrahedron Latter
s22、l 859−1862によって開発されj;燐
アミシト方法により行なわれ、かつDNA−シンテタイ
ザー(Synthesizer)(Applied B
iosystems 380 AD N A 5y
nLhesizer、Ca1ifornia、USA)
を用いて行なわれた。コドンの選択は、アスペルギルス
・ニゲルからのグルコアミラーゼ遺伝子の公知のコドン
の優位性(E、Boel他、(1984) EMBOJ
、3.1097〜1102)により行なわれた。ヌクレ
オチド配列は、Met−Trpのアミノ酸範囲から導出
された。相応して、遺伝子プローブPE3の補足的なヌ
クレオチド配列が記載される。
よびブドウ球菌V8プロテアーゼを用いる分解によって
ペプチドを調製し、そのアミノ酸配列をガス相シークエ
ネータ−(Applied Biosystems M
ode+ 470 A )の使用下に測定した。この場
合、ペプチドのオンライン検出を120 A HP
LCを用いて行なった。ブロムシアン分解をグロス(E
、Grol’3Xl 967 )、Methods i
n Enzymology 1 ls 238〜25
5の記載により行ない、ペプチドの分離をHPLC逆相
C4−カラム上でトリフルオロ酢酸/プロパツール/ア
セトニトリル勾配o、i%中で実施した。トリプシン分
解およびブドウ球菌V8プロテアーゼを用いる分解をp
H7,8で重炭酸アンモニウム20ミリモル中で実施し
た。相応するペプチドを再び逆相HPLCクロマトグラ
フィーによってCI8カラムを用いて分離した。天然の
蛋白質のN末端配列を直接に測定した。このN末端配列
は、次のとおりであつls 二 A l a−Ser −A rg−Me t−Thr
−A Ia−Pro−5er−G 1y−A la−+
1 e−Va 1−Va l −A Ia−Lys−
5er−Gly−Gly−Asp−Tyr−Asp−T
hr−11a−5er−Ala−Ala−次のN−末端
アミノ酸配列を有する、典型的な分解の後に得られたペ
プチド、T2−21゜をオリゴヌクレオチドPE3の合
成のためのすリジナルとして使用した: T 2−21 : Thr−5er−Met−Thr−
Asp−Val−11e−Asn−His−Lau−G
ly−Trp−Thr−Glu−抛 遺伝子プローグPE3の補足的なヌクレオチド配列の合
成は、ボカージュ(S、L、Beaucage)および
カールサーズ(M、H,CaruthersX l 9
81 ) 、 Tetrahedron Latter
s22、l 859−1862によって開発されj;燐
アミシト方法により行なわれ、かつDNA−シンテタイ
ザー(Synthesizer)(Applied B
iosystems 380 AD N A 5y
nLhesizer、Ca1ifornia、USA)
を用いて行なわれた。コドンの選択は、アスペルギルス
・ニゲルからのグルコアミラーゼ遺伝子の公知のコドン
の優位性(E、Boel他、(1984) EMBOJ
、3.1097〜1102)により行なわれた。ヌクレ
オチド配列は、Met−Trpのアミノ酸範囲から導出
された。相応して、遺伝子プローブPE3の補足的なヌ
クレオチド配列が記載される。
P E 3 : 3 ’−TACTGG CTG CA
G TACTTG GTG GAG CCG ACCT
GG CTCACC−5’mRNAを調製するために、
菌株DSM5575を振撮フラスコ中でPE誘発する条
件下で栄養媒体としてのコムギ糠2%、微粉砕した14
1fの切片2%および硫酸アンモニウム0.1%と一緒
に往復揺動装置上で28°Cで96時間培養した。得ら
れたミセルを濾別し、かつ直接に液体窒素中で低温凍結
させた。
G TACTTG GTG GAG CCG ACCT
GG CTCACC−5’mRNAを調製するために、
菌株DSM5575を振撮フラスコ中でPE誘発する条
件下で栄養媒体としてのコムギ糠2%、微粉砕した14
1fの切片2%および硫酸アンモニウム0.1%と一緒
に往復揺動装置上で28°Cで96時間培養した。得ら
れたミセルを濾別し、かつ直接に液体窒素中で低温凍結
させた。
RNAの調製をチルウィン(Chirgwin)他、(
1979) 、BiochemisLryl 8.52
94〜529つの方法により実施した。全RNAからの
ポリ(A)“−RNAの単離は、オリゴ(dT)−セル
ロース親和性クロマトグラフィーによって行なわれた(
H,AvisおよびP、Leder(1972) 、P
roc、Natl、Acad、Sci、IJSA、 6
9.1408−1412): c DNA合成をグブラ
ー(U、Gubler)およびホフマン(B、J、Ho
rfmannXl 983 ) Gp、 n e 25
.263〜269、の方法により変更した。第1鎖の合
成のためには、50μQの反応容量でポリ(A)”RN
A l Opg、トリス−HC1250ミ’) %ル
、Mg(,425ミリモルpH8,3、KCQ75ミリ
モル、DTT10ミリモルdNTP1.Oミリモル(d
ATP、dCTP、dGTP、dTTPそれぞれ1゜0
ミリモル)、オリゴ10μy (d T 12−18
)およびM−MLV逆転写酵素2000 U (Gib
co−BRL GmbH7514Eggenstein
、BRD)を使用した。これを37℃で60分間インキ
ュベートした。引続き、フェノール化し、かつエタノー
ル沈澱を実施した。
1979) 、BiochemisLryl 8.52
94〜529つの方法により実施した。全RNAからの
ポリ(A)“−RNAの単離は、オリゴ(dT)−セル
ロース親和性クロマトグラフィーによって行なわれた(
H,AvisおよびP、Leder(1972) 、P
roc、Natl、Acad、Sci、IJSA、 6
9.1408−1412): c DNA合成をグブラ
ー(U、Gubler)およびホフマン(B、J、Ho
rfmannXl 983 ) Gp、 n e 25
.263〜269、の方法により変更した。第1鎖の合
成のためには、50μQの反応容量でポリ(A)”RN
A l Opg、トリス−HC1250ミ’) %ル
、Mg(,425ミリモルpH8,3、KCQ75ミリ
モル、DTT10ミリモルdNTP1.Oミリモル(d
ATP、dCTP、dGTP、dTTPそれぞれ1゜0
ミリモル)、オリゴ10μy (d T 12−18
)およびM−MLV逆転写酵素2000 U (Gib
co−BRL GmbH7514Eggenstein
、BRD)を使用した。これを37℃で60分間インキ
ュベートした。引続き、フェノール化し、かつエタノー
ル沈澱を実施した。
第2鎖のためには、RN A/D N Aハイブリッド
に100μαの反応容量で次の成分を添加した:RNア
ーゼH2U (Gibco−BRL GmbH,751
4Eggenstein、BRD)、エシェリキア・コ
リDNA−リガーゼl U (New England
Biolabs GmbH16231Schwalb
ach、BRD)、DNA−ポリメラーゼI 25
U (Boehringer Mannheim Gm
bll、 6 8 0 0 Mannheim、B
RD)、 ト リ ス −HC420ミ リ モ ル
、 pH7,5、KCl2100 ミ リ モ
ル、M gC1225ミ リ モル、 N A
D 2 5 u M、(N H4)2S041
00ミリモル、DTT l 059モル;B5A3μg
およびdNTP60マイクロモル(dATP、dCTP
、dGTP%dTTPそれぞれ60マイクロモル)。こ
の配合物を14°Cで1時間インキユベートシ、かつ引
続き20°Cで1時間インキュベートした。
に100μαの反応容量で次の成分を添加した:RNア
ーゼH2U (Gibco−BRL GmbH,751
4Eggenstein、BRD)、エシェリキア・コ
リDNA−リガーゼl U (New England
Biolabs GmbH16231Schwalb
ach、BRD)、DNA−ポリメラーゼI 25
U (Boehringer Mannheim Gm
bll、 6 8 0 0 Mannheim、B
RD)、 ト リ ス −HC420ミ リ モ ル
、 pH7,5、KCl2100 ミ リ モ
ル、M gC1225ミ リ モル、 N A
D 2 5 u M、(N H4)2S041
00ミリモル、DTT l 059モル;B5A3μg
およびdNTP60マイクロモル(dATP、dCTP
、dGTP%dTTPそれぞれ60マイクロモル)。こ
の配合物を14°Cで1時間インキユベートシ、かつ引
続き20°Cで1時間インキュベートした。
0.6−1.7kbの大きさのcDNA断片をバイオゲ
ル(Biogel)A 50 (100〜200メツシ
ユ)のカラムクロマトグラフィーによって単離し、この
場合Sma Iで線状化し、かつ脱ポスホリル化された
ブラズミドpUc18を挿入し、引続き適当なエシェリ
キア・コリDH5α細胞(D、Hanahan(198
5) : D、M、Glover(偏)D N Aクロ
ーニング: A practical approac
h第1巻、IRL Press 0xford、Eng
land、第109頁〜第135頁)に形質転換した。
ル(Biogel)A 50 (100〜200メツシ
ユ)のカラムクロマトグラフィーによって単離し、この
場合Sma Iで線状化し、かつ脱ポスホリル化された
ブラズミドpUc18を挿入し、引続き適当なエシェリ
キア・コリDH5α細胞(D、Hanahan(198
5) : D、M、Glover(偏)D N Aクロ
ーニング: A practical approac
h第1巻、IRL Press 0xford、Eng
land、第109頁〜第135頁)に形質転換した。
この方法でアスペルギルス・ニゲルDSM5575の約
10000個のクローンを包括するcDNAバンクを得
た。
10000個のクローンを包括するcDNAバンクを得
た。
cDNAクローンをニトロセルロースフィルター上に移
し、かつ(32)P標識された遺伝子プローブPE3を
用いて50℃で18時間ノ)イブリッド形成した。この
ハイブリッド形成に続いて、フィルターをそれぞれ68
℃で30分間SSC緩衝液で2回、5DSO,1%を有
するSSC緩衝液で2回およびSSC緩衝液で0゜2回
洗浄した。引続き、−70℃で48時間オートラジオグ
ラフィーを実施した。
し、かつ(32)P標識された遺伝子プローブPE3を
用いて50℃で18時間ノ)イブリッド形成した。この
ハイブリッド形成に続いて、フィルターをそれぞれ68
℃で30分間SSC緩衝液で2回、5DSO,1%を有
するSSC緩衝液で2回およびSSC緩衝液で0゜2回
洗浄した。引続き、−70℃で48時間オートラジオグ
ラフィーを実施した。
全部で38個の強力にハイブリッド形成するエシェリキ
ア・コリークローンを確認し、そのプラズミドをさらに
特性決定するために高速調製法(H,C,Birnbo
imおよびJ、Doly(1979)、 Nuclei
c Ac1ds Res、7.1513〜1523)に
より単離した。プラズミドーDNAをECoRIおよび
HindI[[で加水分解し、断片を電気泳動法により
分離し、かつ引続きサザンーハイブリッド形成を遺伝子
プローブPE3を用いて実施した。サザンープロット分
析法に基づき、0.6−1.2kbのcDNA挿入断片
を有する4個のクローンを選択し、かつ二重鎮状に配列
した。配列をサンガー(F、Sanger)他(197
7) 、Proc、Natl、Acad、Sci、US
A74.5463〜5467の方法によりは母細胞配列
プライマーおよびPE特異的プライマーの使用下に実施
した。4個のクローンの最も長いクローンの中、完全な
ヌクレオチド配列およびこれから誘導されるアミノ酸配
列は、第4表に記載されている。開いた読みラスターは
、993個のヌクレオチドを包含し、かつ331個のア
ミノ酸もしくは314個のアミノ酸のために蛋白質配列
から得られたN末端との一致によりコード化する。ブラ
ズミドは、p898の表記を有する(第3図)。cDN
Aから誘導されたアミノ酸配列は、位置72.275.
289.290および292で5個のアミノ酸にまで蛋
白質配列から定められたペプチド配列と一致する。残り
の3個のクローンは、600〜11001’Pilのヌ
クレオチドの長さを有し、かつ完全にクローンpB98
のDNA配列と一致する。
ア・コリークローンを確認し、そのプラズミドをさらに
特性決定するために高速調製法(H,C,Birnbo
imおよびJ、Doly(1979)、 Nuclei
c Ac1ds Res、7.1513〜1523)に
より単離した。プラズミドーDNAをECoRIおよび
HindI[[で加水分解し、断片を電気泳動法により
分離し、かつ引続きサザンーハイブリッド形成を遺伝子
プローブPE3を用いて実施した。サザンープロット分
析法に基づき、0.6−1.2kbのcDNA挿入断片
を有する4個のクローンを選択し、かつ二重鎮状に配列
した。配列をサンガー(F、Sanger)他(197
7) 、Proc、Natl、Acad、Sci、US
A74.5463〜5467の方法によりは母細胞配列
プライマーおよびPE特異的プライマーの使用下に実施
した。4個のクローンの最も長いクローンの中、完全な
ヌクレオチド配列およびこれから誘導されるアミノ酸配
列は、第4表に記載されている。開いた読みラスターは
、993個のヌクレオチドを包含し、かつ331個のア
ミノ酸もしくは314個のアミノ酸のために蛋白質配列
から得られたN末端との一致によりコード化する。ブラ
ズミドは、p898の表記を有する(第3図)。cDN
Aから誘導されたアミノ酸配列は、位置72.275.
289.290および292で5個のアミノ酸にまで蛋
白質配列から定められたペプチド配列と一致する。残り
の3個のクローンは、600〜11001’Pilのヌ
クレオチドの長さを有し、かつ完全にクローンpB98
のDNA配列と一致する。
表現のためにアスペルギルスの場合に6要とされる隣接
範囲を有するファージ−クローンをDSM5575の染
色体DNAから得るために差出たり染色体DNAをN、
J、Hynes他、(1983) 、Mo1.Ce11
.Biol、3. 1430−1439の方法により単
離した。このl;めに、ミセル約10gを液体窒素雰囲
気下で磨砕し、かっトリ ス − HCl210
ミ リ モ ル 、 pH7,5、EDTA
1ミリモルおよび5DS3%中に入れた後にフェノール
で抽出した。DNAの後精製は、プロティナーゼにおよ
びRNアーゼAを用いる処理によって行なわれた。得ら
れた高分子量DNAを部分的に5au3Aで加水分解し
、かつサッカロースの密度勾配−遠心分離によって大き
さに応じて分別した。大きさ18〜22kbのDNA分
子をB a m HI / E c o RI加水分解
し l:EMBLE 3−DNA (Stra
tagene GmbH。
範囲を有するファージ−クローンをDSM5575の染
色体DNAから得るために差出たり染色体DNAをN、
J、Hynes他、(1983) 、Mo1.Ce11
.Biol、3. 1430−1439の方法により単
離した。このl;めに、ミセル約10gを液体窒素雰囲
気下で磨砕し、かっトリ ス − HCl210
ミ リ モ ル 、 pH7,5、EDTA
1ミリモルおよび5DS3%中に入れた後にフェノール
で抽出した。DNAの後精製は、プロティナーゼにおよ
びRNアーゼAを用いる処理によって行なわれた。得ら
れた高分子量DNAを部分的に5au3Aで加水分解し
、かつサッカロースの密度勾配−遠心分離によって大き
さに応じて分別した。大きさ18〜22kbのDNA分
子をB a m HI / E c o RI加水分解
し l:EMBLE 3−DNA (Stra
tagene GmbH。
6900 Heidelberg、BRD)中で挿入
し、かつ試験管内に包装した。包装抽出液をStrat
ageneGmbH,6900Heidelberg、
BRDの上記製品によって販売されている。エシェリキ
ア・コリP 2392 (Stratagene Gm
bH,6900Heidelberg、BRD)中で7
アージを増殖させるために、約70000個の組換えク
ローンを包含するファージバンクを使用することができ
た。
し、かつ試験管内に包装した。包装抽出液をStrat
ageneGmbH,6900Heidelberg、
BRDの上記製品によって販売されている。エシェリキ
ア・コリP 2392 (Stratagene Gm
bH,6900Heidelberg、BRD)中で7
アージを増殖させるために、約70000個の組換えク
ローンを包含するファージバンクを使用することができ
た。
プラークハイブリッド形成のための放射性プローブとし
て、c DNA−クローンの1.2−に1)p−p:(
□RI/HindII[−断片を使用した0ハイブリツ
ド形成は、65℃で行なわれ:このフィルターをそのつ
と68℃で30分間SSC緩衝液で2回、次いで5DS
O,1%を有するSSC緩衝液で2回、最後にSSC緩
衝液で0.1回洗浄した。ハイブリッド形成および数回
の個別化の後、10個の陽性のクローンを確認すること
ができた。
て、c DNA−クローンの1.2−に1)p−p:(
□RI/HindII[−断片を使用した0ハイブリツ
ド形成は、65℃で行なわれ:このフィルターをそのつ
と68℃で30分間SSC緩衝液で2回、次いで5DS
O,1%を有するSSC緩衝液で2回、最後にSSC緩
衝液で0.1回洗浄した。ハイブリッド形成および数回
の個別化の後、10個の陽性のクローンを確認すること
ができた。
クローン35の7アージーDNAを調製し、かつHin
dlI[と−緒に加水分解した。このDNAは、サザン
ーハイブリッド形成の後にプラスの信号を約6.0kb
pで有した。Hind■断片をLMP−アガロースゲル
電気泳動を用いて単離し、pUc18に再クローン化し
、かつエシェリキア・コリDH5aに形質転換した。表
現に必要とされる隣接配列を有する完全な染色体PE遺
伝子を含有する生じるプラスミドは、pPE89と呼称
された。pPE89の制限酵素切断地図は、第4図に示
されている。pPE89からの構造ならびに隣接範囲を
有するDNA配列は、第5表に示されている。エシェリ
キア・コリoH5pPE89をDSMJ:寄託番号55
54で寄託した。
dlI[と−緒に加水分解した。このDNAは、サザン
ーハイブリッド形成の後にプラスの信号を約6.0kb
pで有した。Hind■断片をLMP−アガロースゲル
電気泳動を用いて単離し、pUc18に再クローン化し
、かつエシェリキア・コリDH5aに形質転換した。表
現に必要とされる隣接配列を有する完全な染色体PE遺
伝子を含有する生じるプラスミドは、pPE89と呼称
された。pPE89の制限酵素切断地図は、第4図に示
されている。pPE89からの構造ならびに隣接範囲を
有するDNA配列は、第5表に示されている。エシェリ
キア・コリoH5pPE89をDSMJ:寄託番号55
54で寄託した。
アスペルギルス・ニゲルDSM5575.7スペルギル
ス・アワモリDSM5574およびアスペルギルス・オ
リザよりSM5573に関する形質転換の試験報告。
ス・アワモリDSM5574およびアスペルギルス・オ
リザよりSM5573に関する形質転換の試験報告。
邪魔板を有するlQのエーレンマイヤーフラスコ中のチ
ャペック−ドックス−完全媒体(Czapek−Dox
−Komplett−Medium) l 00 m
Qをそれぞれの真菌類の菌株の胞子約107個を接種し
、毎分120回の転向の頻度を有する往復揺動装置上で
37°Cで16時間インキュベートした。ミセルを紙フ
ィルター上で取得し、かつ2回MP緩衝液(Mg504
1.2モル、NaH2PO410ミリモル、pH5,8
)で洗浄した。湿ったミセル約5gを邪魔板なしのlo
Om(2の工−レンマイヤーフラスコ中でMP緩衝液1
5m12中に入れた。この懸濁液にノボジム234([
F]Novozym234 )溶液600 μQ(Mp
緩衝液6mQ中1g)およびβ−グルクロニダーゼ10
0μQ (Sigma)を添加し、この配合物を5分間
氷冷却した。引続き、牛血清アルブミン溶液300 p
Q (M P緩衝液dmQ中0.2g)を添加した。
ャペック−ドックス−完全媒体(Czapek−Dox
−Komplett−Medium) l 00 m
Qをそれぞれの真菌類の菌株の胞子約107個を接種し
、毎分120回の転向の頻度を有する往復揺動装置上で
37°Cで16時間インキュベートした。ミセルを紙フ
ィルター上で取得し、かつ2回MP緩衝液(Mg504
1.2モル、NaH2PO410ミリモル、pH5,8
)で洗浄した。湿ったミセル約5gを邪魔板なしのlo
Om(2の工−レンマイヤーフラスコ中でMP緩衝液1
5m12中に入れた。この懸濁液にノボジム234([
F]Novozym234 )溶液600 μQ(Mp
緩衝液6mQ中1g)およびβ−グルクロニダーゼ10
0μQ (Sigma)を添加し、この配合物を5分間
氷冷却した。引続き、牛血清アルブミン溶液300 p
Q (M P緩衝液dmQ中0.2g)を添加した。
ミセルの原形質体形成は、振盪板の直径12.5mmを
有する水浴円形振盪装置中で10Q rpmで3060
で行なわれる。原形質体形成時間は、DSM5575お
よびDSM5574の場合に約3.5〜4時間であり、
かつDSM5573の場合には、約1.5〜2時間であ
る。
有する水浴円形振盪装置中で10Q rpmで3060
で行なわれる。原形質体形成時間は、DSM5575お
よびDSM5574の場合に約3.5〜4時間であり、
かつDSM5573の場合には、約1.5〜2時間であ
る。
原形質体形成の状態を鏡検法で制御した。原形質体形成
液をMP緩衝液で含浸したガラスウール−フィルターを
介して遠心分離小管中に与えかつそれぞれ同量のυ−緩
衝液(ソルビトール 6 0 0 ミ リ モ
ル 、 ト リ ス /HCl21 0
0 ミ リモル、pH7,0)で覆ツタ。20’
0おJ:び2500gで10分間の遠心分離の後、原形
質体を2つの緩衝液の間の層から取り出した。次に得ら
れた懸濁液を2つの容量の5TlsyR液(ソルビトー
ル1.2モル、トリス/HCffl Oミリモル、pH
7,5)と混合し、かつ20 ’Oおよび15009で
10分間遠心分離した。引続き、原形質体形成物をST
C緩衝液10mff(ソルビトール1.2モル、トリス
/HC(110ミリモル、p H7,5、CaCd21
0ミリモル)中に入れ、かつ再び20°Cおよび150
0gで遠心分離した。この方法を繰返し、引続き、沈降
物をSTC緩衝液中に再懸濁させた。
液をMP緩衝液で含浸したガラスウール−フィルターを
介して遠心分離小管中に与えかつそれぞれ同量のυ−緩
衝液(ソルビトール 6 0 0 ミ リ モ
ル 、 ト リ ス /HCl21 0
0 ミ リモル、pH7,0)で覆ツタ。20’
0おJ:び2500gで10分間の遠心分離の後、原形
質体を2つの緩衝液の間の層から取り出した。次に得ら
れた懸濁液を2つの容量の5TlsyR液(ソルビトー
ル1.2モル、トリス/HCffl Oミリモル、pH
7,5)と混合し、かつ20 ’Oおよび15009で
10分間遠心分離した。引続き、原形質体形成物をST
C緩衝液10mff(ソルビトール1.2モル、トリス
/HC(110ミリモル、p H7,5、CaCd21
0ミリモル)中に入れ、かつ再び20°Cおよび150
0gで遠心分離した。この方法を繰返し、引続き、沈降
物をSTC緩衝液中に再懸濁させた。
プラスミドpPE89は形質転換すべきアスペルギルス
菌株に対して選択マーカーを有しないので、共形質転換
の方法が使用された。このタメ、アスペルギルス・ニゲ
ルDSM5575およびアスペルギルス・アワモリDS
M5574のためには、この菌株において表現可能なヒ
グロマイシン耐性遺伝子(ヒグロマイシンーホスホ転移
酵素)を含有するプラスミドpAN71 (Punt
他、Gene56.117〜124)を使用した。共形
質転換配合物1つあたりそれぞれpAN7−120μ9
および同量のpPE89を使用した。アスペルギルス・
オリザより5M5573はヒグロマイシンBに対して天
然の耐性を有するので、この菌株は、プラスミドp3S
R2(Kellyj5よびHynes、EMBOJo
urna14.475〜479)と−緒に共形質転換さ
れ、形質転換細胞の1つの選択は、アセトアミダーゼ遺
伝子の表現による1つの窒素源としてのアセトアミドを
有する最小媒体に対して成長の優先を可能にする。共形
質転換配合物の場合には、それぞれp3SR240μ9
および同量のpPE89を使用した。
菌株に対して選択マーカーを有しないので、共形質転換
の方法が使用された。このタメ、アスペルギルス・ニゲ
ルDSM5575およびアスペルギルス・アワモリDS
M5574のためには、この菌株において表現可能なヒ
グロマイシン耐性遺伝子(ヒグロマイシンーホスホ転移
酵素)を含有するプラスミドpAN71 (Punt
他、Gene56.117〜124)を使用した。共形
質転換配合物1つあたりそれぞれpAN7−120μ9
および同量のpPE89を使用した。アスペルギルス・
オリザより5M5573はヒグロマイシンBに対して天
然の耐性を有するので、この菌株は、プラスミドp3S
R2(Kellyj5よびHynes、EMBOJo
urna14.475〜479)と−緒に共形質転換さ
れ、形質転換細胞の1つの選択は、アセトアミダーゼ遺
伝子の表現による1つの窒素源としてのアセトアミドを
有する最小媒体に対して成長の優先を可能にする。共形
質転換配合物の場合には、それぞれp3SR240μ9
および同量のpPE89を使用した。
形質転換に使用されたDNAをTE緩衝液50μCの容
量(トリス/)(Cffl Oミリモル、pH7,5、
EDTAIミリモル)中に入れた。
量(トリス/)(Cffl Oミリモル、pH7,5、
EDTAIミリモル)中に入れた。
対照配合物は、それぞれDNAなしのTE緩衝液50μ
Qを含有するかまたは選択プラスミドpAN7−1また
はp3SR2を含有していたDNA溶液またはDNAな
しのTE緩衝液20μQを原形質体感濁液300μQに
与え、がっ0℃で10分間インキュベートした。D N
A溶液またはDNAなしのTE溶液25μQの再度の
添加およびPEG溶液400 it Q (Serva
のポリエチレングリコール4000 60%、トリス/
HCl210ミリモル、pH7,5、CaCl22)の
添加の後、22℃で5分間のインキュベージ3ンを行な
った。 引続き、PEG溶液600μaを添加し、配合
物を22°Cでさらに20分間インキュベートした。
Qを含有するかまたは選択プラスミドpAN7−1また
はp3SR2を含有していたDNA溶液またはDNAな
しのTE緩衝液20μQを原形質体感濁液300μQに
与え、がっ0℃で10分間インキュベートした。D N
A溶液またはDNAなしのTE溶液25μQの再度の
添加およびPEG溶液400 it Q (Serva
のポリエチレングリコール4000 60%、トリス/
HCl210ミリモル、pH7,5、CaCl22)の
添加の後、22℃で5分間のインキュベージ3ンを行な
った。 引続き、PEG溶液600μaを添加し、配合
物を22°Cでさらに20分間インキュベートした。
ヒグロマイシンBの選択の場合には、配合物をチャペッ
ク−ドックス−寒天100m(+(オキソイド寒天No
、1 1%を有するオキソイド)中に、45℃で液状を
保持する浸透安定剤どしてのサッカa−21モルと一緒
に与え、がっそれぞれlomQの分量でベトリ皿中に分
配した。37“Cで16時間のインキュベーションの後
、ヒグロマイシンB (Calbiochem)の添加
は同量ではあるがサッカロースなしの上層10mQ中で
200μg/mQの濃度で行なわれた。
ク−ドックス−寒天100m(+(オキソイド寒天No
、1 1%を有するオキソイド)中に、45℃で液状を
保持する浸透安定剤どしてのサッカa−21モルと一緒
に与え、がっそれぞれlomQの分量でベトリ皿中に分
配した。37“Cで16時間のインキュベーションの後
、ヒグロマイシンB (Calbiochem)の添加
は同量ではあるがサッカロースなしの上層10mQ中で
200μg/mQの濃度で行なわれた。
37°Cで後形成してから2〜4日後に、形質転換細胞
は、明らかに寒天層中での背後の成長が際立ちかつ対照
配合物の場合には存在しなかった、寒天表面から突出す
るカビのコロニーとして確認することができ、かつ単離
することができた。引続き、形質転換細胞を2回ツァペ
クードンクス(Czapek−Dox)寒天上の1つの
カビ通路上でヒグロマイシン850μg/mQを用いて
精製した。出発菌株DSM5575およびDSM557
4は、この媒体上で成長しなかった。
は、明らかに寒天層中での背後の成長が際立ちかつ対照
配合物の場合には存在しなかった、寒天表面から突出す
るカビのコロニーとして確認することができ、かつ単離
することができた。引続き、形質転換細胞を2回ツァペ
クードンクス(Czapek−Dox)寒天上の1つの
カビ通路上でヒグロマイシン850μg/mQを用いて
精製した。出発菌株DSM5575およびDSM557
4は、この媒体上で成長しなかった。
コノ形質転換速度は、DSM5575のpAN7−11
μρ当り形質転換細胞約10個でありかつD S M
5574のpAN7−1 1μg当り形質転換細胞約2
0個であった。
μρ当り形質転換細胞約10個でありかつD S M
5574のpAN7−1 1μg当り形質転換細胞約2
0個であった。
アセトアミダーゼの選択の場合には、形質転換配合物を
STC緩衝液で10m(+に満だ、し、かつ20℃およ
びl 5009で10分間遠心分離した。沈積物をST
C緩衝緩衝液1中Q中懸濁させ、引続き浸透安定剤とし
てのサッカロース1モルを有するアセトアミド最少寒天
9m+2と、45℃で混合した。この寒天を、背後での
成長を阻止するためにサッカロース1モルおよびC5C
(215ミリモルを有するアセトアミド最少寒天板上に
2mQの分量で分配した。6〜12日後に、形質転換細
胞を、明らかに背後の成長が際立つ強力に成長するカビ
のコロニーとして確認しかつ単離することができる。こ
の形質転換細胞をC5C(+およびサッカロースなしの
アセトアミド−最少寒天上の1つのカビ通路上で2回精
製した。アセトアミド−最少栄養培地の組成は、ケリー
(Kelly)およびハインズ(Hynes)による場
合(上記参照)に相当する。アスペルギルス・オリザよ
り3M5573の形質転換速度は、p3SR21μg嘉
り形質転換速度約2.5@であった。
STC緩衝液で10m(+に満だ、し、かつ20℃およ
びl 5009で10分間遠心分離した。沈積物をST
C緩衝緩衝液1中Q中懸濁させ、引続き浸透安定剤とし
てのサッカロース1モルを有するアセトアミド最少寒天
9m+2と、45℃で混合した。この寒天を、背後での
成長を阻止するためにサッカロース1モルおよびC5C
(215ミリモルを有するアセトアミド最少寒天板上に
2mQの分量で分配した。6〜12日後に、形質転換細
胞を、明らかに背後の成長が際立つ強力に成長するカビ
のコロニーとして確認しかつ単離することができる。こ
の形質転換細胞をC5C(+およびサッカロースなしの
アセトアミド−最少寒天上の1つのカビ通路上で2回精
製した。アセトアミド−最少栄養培地の組成は、ケリー
(Kelly)およびハインズ(Hynes)による場
合(上記参照)に相当する。アスペルギルス・オリザよ
り3M5573の形質転換速度は、p3SR21μg嘉
り形質転換速度約2.5@であった。
形質転換試験および対照配合物からそのつど50個の形
質転換細胞を振盪フラスコ中でPE生産性について試験
した。この場合には、ミセル培養の場合と同じ条件をm
RNA単離(上記参照)のために選択した。第6表には
、それぞれ最適の形質転換細胞1m4当りの単位で培養
上澄み液の場合に見い出されるPE活性度が記載されて
いる。出発菌株がPE生産性について少なくとも2倍卓
越しているクローン数で測定された共形質転換の頻度が
全部で3つの試験の場合に〉30%であるので、最適の
クローンは、少なくとも15個の形質転換細胞から選択
された。対照の配合物の場合には、形質転換細胞は出発
菌株の生産性を凌駕していないので、全部で50の菌株
には記載した値が当てはまる。
質転換細胞を振盪フラスコ中でPE生産性について試験
した。この場合には、ミセル培養の場合と同じ条件をm
RNA単離(上記参照)のために選択した。第6表には
、それぞれ最適の形質転換細胞1m4当りの単位で培養
上澄み液の場合に見い出されるPE活性度が記載されて
いる。出発菌株がPE生産性について少なくとも2倍卓
越しているクローン数で測定された共形質転換の頻度が
全部で3つの試験の場合に〉30%であるので、最適の
クローンは、少なくとも15個の形質転換細胞から選択
された。対照の配合物の場合には、形質転換細胞は出発
菌株の生産性を凌駕していないので、全部で50の菌株
には記載した値が当てはまる。
振盪フラスコの場合に試験毎に記載した変動に基づいて
、値の範囲は記載されている。
、値の範囲は記載されている。
それに応じて、最高の結果をアスペルギルス;ゲルDS
M 5575(形質転換細胞N。
M 5575(形質転換細胞N。
、9)の場合に5.5〜6.5PE単位/mQで得た。
アスペルギルス・アワモリDSM5574の場合(形質
転換細胞No、i7)には、2.5〜3.OPE単位/
rn(2f、0.8〜1.OPE単位/ m Qを有す
るアスペルギルス・オリザより5M5573(形質転換
細胞No、42)の場合よりも良好な結果が得られた。
転換細胞No、i7)には、2.5〜3.OPE単位/
rn(2f、0.8〜1.OPE単位/ m Qを有す
るアスペルギルス・オリザより5M5573(形質転換
細胞No、42)の場合よりも良好な結果が得られた。
次に、本発明を表につきさらに詳説する。
第4表には、アスペルギルス・ニゲルがらのPE−cD
NAのヌクレオチド配列およびこれから導出されたアミ
ノ酸配列が1つの暗色コードで示されている。開いた読
みラスターの出発コドンおよび停止コドンならびに天然
の蛋白質のN末端(アミノ酸1〜26)およびPW3遺
伝子プローブが示されている。
NAのヌクレオチド配列およびこれから導出されたアミ
ノ酸配列が1つの暗色コードで示されている。開いた読
みラスターの出発コドンおよび停止コドンならびに天然
の蛋白質のN末端(アミノ酸1〜26)およびPW3遺
伝子プローブが示されている。
第5表には、ブラズミドpPE89からの染色体PE遺
伝子のヌクレオチド配列およびこれから導出されたアミ
ノ酸配列が1つの暗色コードで示されている。イントロ
ン1〜6ならびに停止コドンが示されている。
伝子のヌクレオチド配列およびこれから導出されたアミ
ノ酸配列が1つの暗色コードで示されている。イントロ
ン1〜6ならびに停止コドンが示されている。
第6表には、培地の上澄み液中で見い出されたPE活性
度がそれぞれ′lIk適の形質転換細胞1mQ当りの単
位で示されている。
度がそれぞれ′lIk適の形質転換細胞1mQ当りの単
位で示されている。
微生物DSM5553(エシェリキア・コリDH5αp
PG67)、DSM5554 (ニジx jl キ7
・’:2すDH5αpPE89)、DSM5573 (
アスペルギルス・オリザエRH30+ 1) 、DSM
5574 (アスペルギルス・アワモリRH3630’
)およびDSM5575 (アスペルギルス・ニゲルR
H5344)をブダペスト条約の規定に基づき1989
年9月29日のD S M (Deut、scheSa
mmlungvon Mikroorgar+isme
n und Zellkulturen GmbH,M
ascheroderWeg lb、D−3300Br
aunschweig)に寄託した。
PG67)、DSM5554 (ニジx jl キ7
・’:2すDH5αpPE89)、DSM5573 (
アスペルギルス・オリザエRH30+ 1) 、DSM
5574 (アスペルギルス・アワモリRH3630’
)およびDSM5575 (アスペルギルス・ニゲルR
H5344)をブダペスト条約の規定に基づき1989
年9月29日のD S M (Deut、scheSa
mmlungvon Mikroorgar+isme
n und Zellkulturen GmbH,M
ascheroderWeg lb、D−3300Br
aunschweig)に寄託した。
第4表:アスペルギルス・ニゲルからのペクチンエステ
ラーゼcDNAのヌクレオチド配列およびこれから誘導
されたアミノ酸配列。開いた読みラスターの出発コドン
および停止コドンは中断されている。
ラーゼcDNAのヌクレオチド配列およびこれから誘導
されたアミノ酸配列。開いた読みラスターの出発コドン
および停止コドンは中断されている。
第5表:アスペルギルス・ニゲルからの染色体ペクチン
エステラーゼ遺伝子のヌクレオチド配列およびこれから
誘導されt;アミノ酸配列第6表 PH単位/mQ l。
エステラーゼ遺伝子のヌクレオチド配列およびこれから
誘導されt;アミノ酸配列第6表 PH単位/mQ l。
アスペルギルス・ニゲル
DSM5575 (出発菌株)
約0.1〜0,2DSM5575pAN7−1 (形質
転換細胞150)約0,1〜0.2DSM5575pA
N7−1/pPE89(形質転換細胞No、9)
約5.5〜6.52゜ アスペルギルス・アワモリ DSM5574 (出発菌株) DSM5574pAN7−1 (形質転換細胞l−50
)DSM5571−50)DS/pPE89(形質転換
細胞No、17) <0.1 <0.1 約2.5〜3.0 3゜ アスペルギルス・オリザよ り5M5573(出発菌株) DSM5573p3SR2(形質転換細胞1−50)D
SM551−50)DS/pPE89(形質転換細胞N
o、42) <0.1 <o、i 約0.8〜1.0
約0.1〜0,2DSM5575pAN7−1 (形質
転換細胞150)約0,1〜0.2DSM5575pA
N7−1/pPE89(形質転換細胞No、9)
約5.5〜6.52゜ アスペルギルス・アワモリ DSM5574 (出発菌株) DSM5574pAN7−1 (形質転換細胞l−50
)DSM5571−50)DS/pPE89(形質転換
細胞No、17) <0.1 <0.1 約2.5〜3.0 3゜ アスペルギルス・オリザよ り5M5573(出発菌株) DSM5573p3SR2(形質転換細胞1−50)D
SM551−50)DS/pPE89(形質転換細胞N
o、42) <0.1 <o、i 約0.8〜1.0
第1図は、PG−cDNAの制限酵素切断地図および配
列図を示し、この場合矢印は、配列方向を表わし、かつ
配列は、母細胞プライマーおよびPG特異的ブンイマー
を用いて実施され第2図は、ブラズミドpPG67中に
隣接範囲を有する染色体PG遺伝子の制限酵素切断地図
を示し; 第3r1!iは、ペクチンエステラーゼc −D N
Aの制限酵素切断地図および配列図を示し、この場合配
列は、母細胞プライマーおよびPE特異的プライマーを
用いて実施され; 第4図は、グラズミドpPE89中に隣接範囲を有する
染色体PE遺伝子の制限酵素切断地図を示し、この場合
矢印は、二重鎖に配列された範囲および相応して配列方
向を表わし、かつ配列は、母細胞プライマーおよびPE
特異的プライマーを用いて実施された。
列図を示し、この場合矢印は、配列方向を表わし、かつ
配列は、母細胞プライマーおよびPG特異的ブンイマー
を用いて実施され第2図は、ブラズミドpPG67中に
隣接範囲を有する染色体PG遺伝子の制限酵素切断地図
を示し; 第3r1!iは、ペクチンエステラーゼc −D N
Aの制限酵素切断地図および配列図を示し、この場合配
列は、母細胞プライマーおよびPE特異的プライマーを
用いて実施され; 第4図は、グラズミドpPE89中に隣接範囲を有する
染色体PE遺伝子の制限酵素切断地図を示し、この場合
矢印は、二重鎖に配列された範囲および相応して配列方
向を表わし、かつ配列は、母細胞プライマーおよびPE
特異的プライマーを用いて実施された。
Claims (1)
- 【特許請求の範囲】 1、ヌクレオチド配列がポリガラクツロニダーゼまたは
ペクチネスチラーゼのコードを有するアスペルギルス・
ニゲルからのデオキシリボ核酸。 2、アスペルギルス・ニゲルからのポリガラクツロニダ
ーゼをコード化し、かつ次のヌクレオチド配列: 【遺伝子配列があります】 またはそれから誘導された、比較可能な性質を有するポ
リガラクツロニダーゼをコード化するヌクレオチド配列
を有する、請求項1記載のデオキシリボ核酸。 3、アスペルギルスニゲルからのペクチネスチラーゼを
コード化し、次のヌクレオチド配列: 【遺伝子配列があります】 またはそれから誘導された、比較可能な性質を有するペ
クチネスチラーゼをコード化するヌクレオチド配列を有
する、請求項1記載のデオキシリボ核酸。 4、アスペルギルス・ニゲルDSM5575に由来する
、請求項1、2または3に記載のデオキシリボ核酸。 5、アスペルギルス・ニゲルDSM5575からのポリ
ガラクツロニダーゼまたは比較可能な性質を有するポリ
ガラクツロニダーゼをコード化する、請求項2記載のデ
オキシリボ核酸。 6、アスペルギルス・ニゲルDSM5575からのペク
チネステラーゼまたは比較可能な性質を有するペクチネ
ステラーゼをコード化する、請求項3記載のデオキシリ
ボ核酸。 7、解離したポリガラクツロニダーゼをコード化する、
請求項1、2、4または5のいずれか1項に記載のデオ
キシリボ核酸。 8、アスペルギルスに由来するポリガラクツロニダーゼ
遺伝子またはペクチネステラーゼ遺伝子で形質転換され
ている組換え宿主微生物を、ポリガラクツロニダーゼ遺
伝子もしくはペクチネステラーゼ遺伝子ならびに表現の
ためにアスペルギルス中で必要とされる隣接デオキシリ
ボヌクレオチド配列を含有する組換えベクターをクーロ
ン化し、かつ組換えベクターを宿主微生物に形質転換す
ることによって製造する方法において、ポリガラクツロ
ニダーゼ遺伝子またはペクチネステラーゼ遺伝子として
アスペルギルス・ニゲルからのデオキシリボ核酸を使用
し、宿主微生物としてアスペルギルス・ニゲルまたはア
スペルギルス・アワモリの糸状菌を使用することを特徴
とする、組換え宿主微生物の製造法。 9、次の工程: (a)アスペルギルス・ニゲルをポリガラクツロニダー
ゼまたはペクチネステラーゼの誘導条件下に培養し、 (b)ポリガラクツロニダーゼまたはペクチネステラー
ゼを精製し、蛋白質を部分的に配列し、 (c)メッセンジャーリボ核酸を(a)で培養した細胞
から単離し、 (d)コピー−デオキシリボ核酸バンクを(c)からの
リボ核酸から用意し、 (e)(b)からの蛋白質配列から誘導されたオリゴデ
オキシリボヌクレオチドプローブを製造し、 (f)ポリガラクツロニダーゼ遺伝子またはペクチネス
テラーゼ遺伝子を含有するコピーデオキシリボ核酸をハ
イブリッド形成プローブとしての(e)からのオリゴデ
オキシリボヌクレオチドプローブの使用下にクローン化
し、(g)(a)で使用したアスペルギルス菌株の染色
体デオキシリボ核酸を含有する遺伝子バンクを用意し、 (h)染色体ポリガラクツロニダーゼ遺伝子またはペク
チネステラーゼ遺伝子ならびに表現のためにアスペルギ
ルスで必要とされる隣接デオキシリボヌクレオチド配列
を含有する(g)による遺伝子バンクからの組換えベク
ターを、ハイブリッド形成プローブとしての(f)から
のコピー−デオキシリボ核酸の使用下にクローン化し、 (i)ポリガラクツロニダーゼ遺伝子またはペクチネス
テラーゼ遺伝子ならびに表現のためにアスペルギルスで
必要とされる隣接デオキシリボヌクレオチド配列を1つ
のプラスミドに再クローン化し、 (k)アスペルギルス・ニゲル宿主微生物またはアスペ
ルギルス・アワモリ宿主微生物を(i)による組換えベ
クターを用いて共形質転換し、かつ宿主微生物の場合に
表現可能な選択マーカーを含有する第2のプラスミドを
共形質転換し (l)ポリガラクツロニダーゼまたはペクチネステラー
ゼの生産性が(a)で使用したアスペルギルス・ニゲル
の場合よりも高い、(k)からの共形質転換された菌株
を選択することを実施する、請求項8記載の方法。 10、デオキシリボ核酸がアスペルギルス・ニゲルから
のポリガラクツロニダーゼをコード化しかつ次のヌクレ
オチド配列: 【遺伝子配列があります】 またはそれから誘導された、比較可能な性質を有するポ
リガラクツロニダーゼをコード化するヌクレオチド配列
を有する、請求項8または9に記載の方法。 11、デオキシリボ核酸がアスペルギルス・ニゲルから
のペクチネステラーゼをコード化しかつ次のヌクレオチ
ド配列: 【遺伝子配列があります】 またはそれから誘導された、比較可能な性質を有するペ
クチネステラーゼをコード化するヌクレオチド配列を有
する、請求項8または9に記載の方法。 12、デオキシリボ核酸がアスペルギルス・ニゲルDS
M5575に由来する、請求項8 、9、10または11のいずれか1項に記載の方法。 13、デオキシリボ核酸がアスペルギルス・ニゲルDS
M5575からのポリガラクツロニ ダーゼをコード化する、請求項12記載の方法。 14、デオキシリボ核酸がアスペルギルス・ニゲルDS
M5575からのペクチネステラー ゼをコード化する、請求項12記載の方法。 15、宿主微生物として糸状菌の菌株アスペルギルス・
ニゲルDSM5575またはアスペ ルギルス・アワモリ5574を使用する、 請求項8から14までのいずれか1項に記載の方法。 16、ペクチナーゼ遺伝子を数回宿主微生物のゲノム中
に挿入する、請求項8から15までのいずれか1項に記
載の方法。 17、解離したポリガラクツロニダーゼをコード化する
デオキシリボ核酸を使用する、請求項8、9、10、1
2、13、15または16のいずれか1項に記載の方法
。 18、ポリガラクツロニダーゼまたはペクチネステラー
ゼを製造する方法において、請求項8から17までのい
ずれか1項の記載により得られた組換え宿主微生物を適
当な栄養媒体中で増殖させ、ポリガラクツロニダーゼま
たはペクチネステラーゼを自体公知の方法で単離するこ
とを特徴とする、ポリガラクツロニダーゼまたはペクチ
ネステラーゼの製造法。 19、解離したポリガラクツロニダーゼを得る、請求項
18記載の方法。 20、次のヌクレオチド配列: 【遺伝子配列があります】 または 【遺伝子配列があります】 を有するアスペルギルスの場合のポリペプチドを表現す
るのに適当な機能的デオキシリボ核酸配列。
Applications Claiming Priority (2)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
DE3908813A DE3908813A1 (de) | 1989-03-17 | 1989-03-17 | Verfahren zur expression eines aus aspergillus niger stammenden gens in einem aspergillus |
DE3908813.8 | 1989-03-17 |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JPH02283287A true JPH02283287A (ja) | 1990-11-20 |
Family
ID=6376595
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2064494A Pending JPH02283287A (ja) | 1989-03-17 | 1990-03-16 | アスペルギルス・ニゲルからのデオキシリボ核酸、組換え宿主微生物の製造法および機能的デオキシリボ核酸配列 |
Country Status (6)
Country | Link |
---|---|
EP (1) | EP0388593B1 (ja) |
JP (1) | JPH02283287A (ja) |
AT (1) | ATE136587T1 (ja) |
DE (2) | DE3908813A1 (ja) |
DK (1) | DK0388593T3 (ja) |
ES (1) | ES2087092T3 (ja) |
Families Citing this family (12)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
EP0421919A3 (en) * | 1989-09-02 | 1992-04-15 | Ciba-Geigy Ag | Polygalacturonase encoding fungal expression system |
DK42092D0 (ja) * | 1992-03-27 | 1992-03-27 | Novo Nordisk As | |
US5624834A (en) * | 1992-12-24 | 1997-04-29 | Gist-Brocades, B.V. | Cloning and expression of the exo-polygalacturonase gene from aspergillus |
DE69432073T2 (de) * | 1993-04-30 | 2004-01-22 | Novozymes A/S | Ein enzym mit pektin methylesteraseaktivität |
WO1997010727A1 (en) | 1995-09-22 | 1997-03-27 | Novo Nordisk A/S | Method for reducing the serum separation in a pectin containing aqueous mass |
CN1229495C (zh) * | 1996-02-21 | 2005-11-30 | 诺沃奇梅兹有限公司 | 具有果胶酯酶活性的酶 |
US7303917B2 (en) | 1998-03-20 | 2007-12-04 | Her Majesty The Queen In Right Of Canada As Represented By The Minister Of Agriculture And Agri-Food Eastern Cereal & Oilseed, Research Center | Modification of pollen coat protein composition |
AU6203099A (en) | 1998-09-18 | 2000-04-10 | Dsm N.V. | Aspergillus tubigensis polygalacturonase |
DE102008024778A1 (de) | 2008-05-23 | 2009-11-26 | Ab Enzymes Gmbh | Verwendung von pektinolytischen Enzymen zur Behandlung von Obst- und Gemüsemaische und Enzymsequenzen dazu |
US8765442B2 (en) | 2008-12-19 | 2014-07-01 | Dupont Nutrition Biosciences Aps | Process for production of an enzyme product |
TR201809053T4 (tr) | 2012-08-16 | 2018-07-23 | Bangladesh Jute Res Institute | Macrophomina phaseolina'dan elde edilen pektin parçalama enzimleri ve bunların kullanımları. |
CN107446903B (zh) * | 2017-09-13 | 2020-06-23 | 云南师范大学 | 一种具有3个最适pH的耐盐耐乙醇果胶酶及其基因 |
Family Cites Families (5)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
DE1805808C3 (de) * | 1968-10-29 | 1979-06-21 | Roehm Gmbh, 6100 Darmstadt | Mazerieren von Frucht- oder Gemüsemark |
DE3044455C1 (de) * | 1980-11-26 | 1982-07-08 | Röhm GmbH, 6100 Darmstadt | Herstellung von Pektinesterase |
CA1295563C (en) * | 1985-11-01 | 1992-02-11 | Robert T. Garvin | Production of active proteins containing cystine residues |
GB8626879D0 (en) * | 1986-11-11 | 1986-12-10 | Ici Plc | Dna |
DE3801005A1 (de) * | 1988-01-15 | 1989-07-27 | Roehm Gmbh | Verfahren zur herstellung eines macerierenden aspergillus-enzyms |
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1989
- 1989-03-17 DE DE3908813A patent/DE3908813A1/de not_active Withdrawn
-
1990
- 1990-01-24 DE DE59010266T patent/DE59010266D1/de not_active Expired - Fee Related
- 1990-01-24 DK DK90101399.5T patent/DK0388593T3/da active
- 1990-01-24 AT AT90101399T patent/ATE136587T1/de not_active IP Right Cessation
- 1990-01-24 EP EP90101399A patent/EP0388593B1/de not_active Expired - Lifetime
- 1990-01-24 ES ES90101399T patent/ES2087092T3/es not_active Expired - Lifetime
- 1990-03-16 JP JP2064494A patent/JPH02283287A/ja active Pending
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