JP7084637B2 - 細菌メタゲノム分析を通した前立腺疾患の診断方法 - Google Patents
細菌メタゲノム分析を通した前立腺疾患の診断方法 Download PDFInfo
- Publication number
- JP7084637B2 JP7084637B2 JP2019535312A JP2019535312A JP7084637B2 JP 7084637 B2 JP7084637 B2 JP 7084637B2 JP 2019535312 A JP2019535312 A JP 2019535312A JP 2019535312 A JP2019535312 A JP 2019535312A JP 7084637 B2 JP7084637 B2 JP 7084637B2
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- derived
- bacteria
- vesicles
- content
- bacterial
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Active
Links
Images
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
- C12Q1/6888—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms
- C12Q1/6895—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms for plants, fungi or algae
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
- C12Q1/6883—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
- C12Q1/6886—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material for cancer
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6806—Preparing nucleic acids for analysis, e.g. for polymerase chain reaction [PCR] assay
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6869—Methods for sequencing
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
- C12Q1/6888—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms
- C12Q1/689—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms for bacteria
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2531/00—Reactions of nucleic acids characterised by
- C12Q2531/10—Reactions of nucleic acids characterised by the purpose being amplify/increase the copy number of target nucleic acid
- C12Q2531/113—PCR
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/112—Disease subtyping, staging or classification
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Zoology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Immunology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Pathology (AREA)
- Hospice & Palliative Care (AREA)
- Oncology (AREA)
- Botany (AREA)
- Mycology (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Description
(a)被検体サンプルから分離した細胞外小胞からDNAを抽出する段階;
(b)前記抽出したDNAに対して配列番号1および配列番号2のプライマーペアを利用してPCRを行う段階;および
(c)前記PCR産物の配列分析を通して正常ヒトと前立腺癌患者由来サンプルで細菌由来細胞外小胞の含量増減を比較する段階;または
前記PCR産物の配列分析を通して前立腺肥大症患者と前立腺癌患者由来サンプルで細菌由来細胞外小胞の含量増減を比較する段階;または
前記PCR産物の配列分析を通して正常ヒトと前立腺肥大症患者由来サンプルで細菌由来細胞外小胞の含量増減を比較する段階。
(a)被検体サンプルから分離した細胞外小胞からDNAを抽出する段階;
(b)前記抽出したDNAに対して配列番号1および配列番号2のプライマーペアを利用してPCRを行う段階;および
(c)前記PCR産物の配列分析を通して正常ヒトと前立腺癌患者由来サンプルで細菌由来細胞外小胞の含量増減を比較する段階;または
前記PCR産物の配列分析を通して前立腺肥大症患者と前立腺癌患者由来サンプルで細菌由来細胞外小胞の含量増減を比較する段階;または
前記PCR産物の配列分析を通して正常ヒトと前立腺肥大症患者由来サンプルで細菌由来細胞外小胞の含量増減を比較する段階。
(a)被検体サンプルから分離した細胞外小胞からDNAを抽出する段階;
(b)前記抽出したDNAに対して配列番号1および配列番号2のプライマーペアを利用してPCRを行う段階;および
(c)前記PCR産物の配列分析を通して正常ヒトと前立腺癌患者由来サンプルで細菌由来細胞外小胞の含量増減を比較する段階;または
前記PCR産物の配列分析を通して前立腺肥大症患者と前立腺癌患者由来サンプルで細菌由来細胞外小胞の含量増減を比較する段階;または
前記PCR産物の配列分析を通して正常ヒトと前立腺肥大症患者由来サンプルで細菌由来細胞外小胞の含量増減を比較する段階。
(b)前記抽出したDNAに対して配列番号1および配列番号2のプライマーペアを利用してPCRを行う段階;および
(c)前記PCR産物の配列分析を通して正常ヒトと前立腺癌患者由来サンプルで細菌由来細胞外小胞の含量増減を比較する段階;または
前記PCR産物の配列分析を通して前立腺肥大症患者と前立腺癌患者由来サンプルで細菌由来細胞外小胞の含量増減を比較する段階;または
前記PCR産物の配列分析を通して正常ヒトと前立腺肥大症患者由来サンプルで細菌由来細胞外小胞の含量増減を比較する段階を含む前立腺疾患診断のための情報提供方法を提供する。
実施例1.腸内細菌および細菌由来小胞の体内吸収、分布、および排泄様相の分析
腸内細菌と細菌由来小胞が胃腸管を介して全身的に吸収されるかを評価するために、次のような方法で実験を行った。マウスの胃腸に蛍光で標識した腸内細菌と腸内細菌由来小胞をそれぞれ50μgの用量で胃腸管で投与し、0分、5分、3時間、6時間、12時間後に蛍光を測定した。マウス全体イメージを観察した結果、図1aに示したように、前記細菌(Bacteria)である場合には、全身的に吸収されないか、細菌由来小胞(EV)である場合には、投与後に5分に全身的に吸収され、投与3時間後には、膀胱に蛍光が濃く観察されて、小胞が泌尿器系に排泄されることが分かった。また、小胞は、投与12時間まで体内に存在することが分かった。
尿から小胞を分離し、DNAを抽出するために、まず、10mlチューブに尿を入れ、遠心分離(3,500×g、10min、4℃)を実施して浮遊物を沈めて上澄み液だけを回収した後、新しい10mlチューブに移した。0.22μmフィルターを使用して前記回収した上澄み液から細菌および異物を除去した後、セントリプレップチューブ(centrifugal filters 50kD)に移し、1,500×g、4℃で15分間遠心分離して50kDより小さい物質は捨て、10mlまで濃縮させた。再び0.22μmフィルターを使用してバクテリアおよび異物を除去した後、Type 90tiローターで150,000×g、4℃で3時間の間超高速遠心分離方法を使用して上澄み液を捨て、固まったペレット(pellet)を生理食塩水(PBS)で溶かして小胞を収得した。
前記実施例2の方法で遺伝子を抽出した後、前記表1に示した16S rDNAプライマーを使用してPCRを実施して遺伝子を増幅させ、シーケンシング(Illumina MiSeq sequencer)を行った。結果をStandard Flowgram Format(SFF)ファイルで出力し、GS FLX software(v2.9)を利用してSFFファイルをsequenceファイル(.fasta)とnucleotide quality scoreファイルに変換した後、リードの信用度評価を確認し、window(20 bps)平均base call accuracyが99%未満(Phred score<20)である部分を除去した。質が低い部分を除去した後、リードの長さが300bps以上であるものだけを利用し(Sickle version 1.33)、結果分析のために、Operational Taxonomy Unit(OTU)は、UCLUSTとUSEARCHを利用してシークエンス類似度によってクラスタリングを行った。具体的に、属(genus)は94%、科(family)は90%、目(order)は85%、綱(class)は80%、門(phylum)は75%シークエンス類似度を基準としてクラスタリングをし、各OTUの門、綱、目、科、属レベルの分類を行い、BLASTNとGreenGenesの16S DNAシークエンス データベース(108、453シークエンス)を利用して97%以上のシークエンス類似度を有するバクテリアを分析した(QIIME)。
前記実施例3の方法で、前立腺癌患者53人と年齢と性別をマッチングした正常ヒト159人の尿から小胞を分離した後、メタゲノムシーケンシングを行った。診断模型の開発は、まず、t-testで二つの群間のp値が0.05以下であり、二つの群間に2倍以上違いが生じる菌株を選定した後、logistic regression analysis方法で診断的性能指標であるAUC(area under curve)、敏感度、および特異度を算出した。
前記実施例3の方法で、前立腺癌患者53人と前立腺肥大症患者55人の尿から小胞を分離した後、メタゲノムシーケンシングを行った。診断模型の開発は、まず、t-testで二つの群間のp値が0.05以下であり、二つの群間に2倍以上違いが生じる菌株を選定した後、logistic regression analysis方法で診断的性能指標であるAUC(area under curve)、敏感度、および特異度を算出した。
前記実施例3の方法で、前立腺癌患者55人と正常ヒト159人の尿から小胞を分離した後、メタゲノムシーケンシングを行った。診断模型の開発は、まず、t-testで二つの群間のp値が0.05以下であり、二つの群間に2倍以上違いが生じる菌株を選定した後、logistic regression analysis方法で診断的性能指標であるAUC(area under curve)、敏感度、および特異度を算出した。
Claims (3)
- (a)被検体サンプルから分離した細胞外小胞からDNAを抽出する段階;
(b)前記抽出したDNAに対して配列番号1および配列番号2のプライマーペアを利用してPCRを行う段階;および
(c)前記PCR産物の配列分析を通して正常ヒトと被検体サンプルで細菌由来細胞外小胞の含量増減を比較して
正常ヒトに比べて被検体サンプルで、
アッカーマンシア属(Akkermansia)およびクレブシエラ(Klebsiella)属(genus)細菌由来小胞の含量が増加しており、アシネトバクター(Acinetobacter)およびリゾビウム(Rhizobium)属(genus)細菌由来小胞の含量が減少している場合、前立腺癌であると判定する段階;または
リューコノストック属(Leuconostoc)およびメタノブレウィバクテル(Methanobrevibacter)属(genus)細菌由来小胞の含量が増加しており、プロテウス(Proteus)およびリゾビウム(Rhizobium)属(genus)細菌由来小胞の含量が減少している場合、前立腺肥大症であると判定する段階を含み、
前記被検体サンプルは、小便であることを特徴とする、メタゲノム解析を通した前立腺癌または前立腺肥大症の判定のための情報提供方法。 - 前記段階(c)の正常ヒトと被検体サンプルで細菌由来細胞外小胞の含量増減を比較する段階で、
正常ヒトに比べて被検体サンプルで、
アッカーマンシア属(Akkermansia)およびクレブシエラ(Klebsiella)属(genus)細菌由来小胞の含量が増加しており、アシネトバクター(Acinetobacter)およびリゾビウム(Rhizobium)属(genus)細菌由来小胞の含量が減少しており;
ユーリ古細菌(Euryarchaeota)、ウェルコミクロビウム門(Verrucomicrobia)、ゲンマティモナス門(Gemmatimonadetes)、アキドバクテリア(Acidobacteria)、およびプランクトミケス門(Planctomycetes)よりなる群から選ばれる1種以上の門(phylum)細菌由来細胞外小胞、
メタノバクテリア(Methanobacteria)、ヴェルコミクロビウム綱(Verrucomicrobiae)、アシディミクロビウム綱(Acidimicrobiia)、スパルトバクテリア(Spartobacteria)、ゲンマティモナス綱(Gemmatimonadetes)、アキドバクテリウム綱(Acidobacteriia)、およびペドスパイラ(Pedosphaerae)よりなる群から選ばれる1種以上の綱(class)細菌由来細胞外小胞、
メタノバクテリア目(Methanobacteriales)、ヴェルコミクロビア目(Verrucomicrobiales)、粘液細菌目(Myxococcales)、アシディミクロビウム目(Acidimicrobiales)、クトニオバクター目(Chthoniobacterales)、アキドバクテリウム目(Acidobacteriales)、およびペドスパイラ目(Pedosphaerales)よりなる群から選ばれる1種以上の目(order)細菌由来細胞外小胞、
メタノバクテリアセエ(Methanobacteriaceae)、ヴェルコミクロビア科(Verrucomicrobiaceae)、リケネラセエ(Rikenellaceae)、ウィクセラセエ(Weeksellaceae)、ストレプトミセス科(Streptomycetaceae)、ヘリコバクター科(Helicobacteraceae)、クトニオバクター科(Chthoniobacteraceae)、およびコリバクテリアセアエ(Koribacteraceae)よりなる群から選ばれる1種以上の科(family)細菌由来細胞外小胞、または
フィーカリバクテリウム(Faecalibacterium)、カテニバクテリウム(Catenibacterium)、ロゼブリア(Roseburia)、メタノブレウィバクテル(Methanobrevibacter)、クロストリジウム(Clostridium)、クリセオバクテリウム(Chryseobacterium)、ハロモナス(Halomonas)、アグリゲイティバクター(Aggregatibacter)、ロドプラネス(Rhodoplanes)、サーモアネロバクテリウム(Thermoanaerobacterium)、カンジダタスコリパクター(Candidatus Koribacter)、およびフレキスピラ(Flexispira)よりなる群から選ばれる1種以上の属(genus)細菌由来細胞外小胞の含量が増加している場合;または
テネリクテス(Tenericutes)門(phylum)細菌由来細胞外小胞、
モリクテス綱(Mollicutes)綱(class)細菌由来細胞外小胞、
ストラメノパイル(Stramenopiles)、アルテロモナス目(Alteromonadales)、リケッチア目(Rickettsiales)、およびナイセリア目(Neisseriales)よりなる群から選ばれる1種以上の目(order)細菌由来細胞外小胞、
ペプトコッカス(Peptococcaceae)、エグジゴバクテリウム科(Exiguobacteraceae)、放線菌科(Actinomycetaceae)、セルロモナダシアエ(Cellulomonadaceae)、フソバクテリアセエ(Fusobacteriaceae)、ポルフィロモナダシアエ(Porphyromonadaceae)、フラボバクテリウム科(Flavobacteriaceae)、モラクセラ(Moraxellaceae)、およびナイセリアセエ(Neisseriaceae)よりなる群から選ばれる1種以上の科(family)細菌由来細胞外小胞、または
テトラジェノコッカス属(Tetragenococcus)、プロテウス(Proteus)、モーガネラ(Morganella)、エグジゴバクテリウム属(Exiguobacterium)、オリバクテリウム(Oribacterium)、ポルフィロモナス(Porphyromonas)、放線菌属(Actinomyces)、セルロモナス(Cellulomonas)、ジェオトガリコッカス(Jeotgalicoccus)、フソバクテリウム(Fusobacterium)、エンテロバクター(Enterobacter)、ナイセリア(Neisseria)、アドラークルーツィア(Adlercreutzia)、およびパラバクテロイデス(Parabacteroides)よりなる群から選ばれる1種以上の属(genus)細菌由来細胞外小胞の含量が減少している場合、前立腺癌であると判定することを特徴とする、請求項1に記載のメタゲノム解析を通した前立腺癌または前立腺肥大症の判定のための情報提供方法。 - 前記段階(c)の正常ヒトと被検体サンプルで細菌由来細胞外小胞の含量増減を比較する段階で、
正常ヒトに比べて被検体サンプルで、
リューコノストック属(Leuconostoc)およびメタノブレウィバクテル(Methanobrevibacter)属(genus)細菌由来小胞の含量が増加しており、プロテウス(Proteus)およびリゾビウム(Rhizobium)属(genus)細菌由来小胞の含量が減少しており;
ユーリ古細菌(Euryarchaeota)およびアキドバクテリア(Acidobacteria)よりなる群から選ばれる1種以上の門(phylum)細菌由来細胞外小胞、
メタノバクテリア(Methanobacteria)、およびアキドバクテリウム綱(Acidobacteriia)よりなる群から選ばれる1種以上の綱(class)細菌由来細胞外小胞、
メタノバクテリア目(Methanobacteriales)およびアキドバクテリウム目(Acidobacteriales)よりなる群から選ばれる1種以上の目(order)細菌由来細胞外小胞、
ルミノコッカセエ(Ruminococcaceae)、リケネラセエ(Rikenellaceae)、メタノバクテリアセエ(Methanobacteriaceae)、およびコリバクテリアセアエ(Koribacteraceae)よりなる群から選ばれる1種以上の科(family)細菌由来細胞外小胞、または
ハロモナス(Halomonas)、ルミノコッカス(Ruminococcus)、フィーカリバクテリウム(Faecalibacterium)、クレブシエラ(Klebsiella)、ロゼブリア(Roseburia)、ビロフィラ(Bilophila)、およびクロモハロバクタ一属(Chromohalobacter)よりなる群から選ばれる1種以上の属(genus)細菌由来細胞外小胞の含量が増加している場合;または
ストラメノパイル(Stramenopiles)、サプロスピラ目(Saprospirales)、およびシュードモナダーレス(Pseudomonadales)よりなる群から選ばれる1種以上の目(order)細菌由来細胞外小胞、
エグジゴバクテリウム科(Exiguobacteraceae)、フラボバクテリウム科(Flavobacteriaceae)、放線菌科(Actinomycetaceae)、およびモラクセラ(Moraxellaceae)よりなる群から選ばれる1種以上の科(family)細菌由来細胞外小胞、または
アシネトバクター(Acinetobacter)属(genus)細菌由来細胞外小胞の含量が減少している場合、前立腺肥大症であると判定することを特徴とする、請求項1に記載のメタゲノム解析を通した前立腺癌または前立腺肥大症の判定のための情報提供方法。
Applications Claiming Priority (5)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
KR20160181570 | 2016-12-28 | ||
KR10-2016-0181570 | 2016-12-28 | ||
KR1020170180014A KR101942197B1 (ko) | 2016-12-28 | 2017-12-26 | 세균 메타게놈 분석을 통한 전립선질환 진단 방법 |
KR10-2017-0180014 | 2017-12-26 | ||
PCT/KR2017/015576 WO2018124742A1 (ko) | 2016-12-28 | 2017-12-27 | 세균 메타게놈 분석을 통한 전립선질환 진단 방법 |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JP2020503863A JP2020503863A (ja) | 2020-02-06 |
JP7084637B2 true JP7084637B2 (ja) | 2022-06-15 |
Family
ID=62921281
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2019535312A Active JP7084637B2 (ja) | 2016-12-28 | 2017-12-27 | 細菌メタゲノム分析を通した前立腺疾患の診断方法 |
Country Status (5)
Country | Link |
---|---|
US (1) | US11708611B2 (ja) |
EP (1) | EP3564388B1 (ja) |
JP (1) | JP7084637B2 (ja) |
KR (1) | KR101942197B1 (ja) |
CN (1) | CN110418848A (ja) |
Families Citing this family (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2019139279A1 (ko) * | 2018-01-12 | 2019-07-18 | 주식회사 엠디헬스케어 | 모르가넬라 속 세균 유래 나노소포 및 이의 용도 |
KR102095355B1 (ko) * | 2018-01-12 | 2020-03-31 | 주식회사 엠디헬스케어 | 모르가넬라 속 세균 유래 나노소포 및 이의 용도 |
EP4388120A1 (en) * | 2021-08-17 | 2024-06-26 | Fondazione Per L'Istituto Oncologico Di Ricerca (IOR) | Commensal bacteria promote endocrine-resistance in prostate cancer via androgen biosynthesis |
Citations (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2013503857A (ja) | 2009-09-01 | 2013-02-04 | イオン メディックス インコーポレイテッド | 腸内共生細菌由来細胞外ベシクル、並びにこれを用いた疾病モデル、ワクチン、候補薬物探索方法及び診断方法 |
JP2013503858A (ja) | 2009-09-04 | 2013-02-04 | イオン メディックス インコーポレイテッド | グラム陽性細菌由来細胞外ベシクル及びその用途 |
WO2016099076A1 (ko) | 2014-12-16 | 2016-06-23 | 이화여자대학교 산학협력단 | 세균 유래의 나노소포체를 이용한 세균성 감염질환 원인균 동정방법 |
Family Cites Families (8)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
KR101970908B1 (ko) | 2008-02-01 | 2019-04-19 | 더 제너럴 하스피탈 코포레이션 | 의학적 질환 및 병태의 진단, 예후, 및 치료에 있어서 미세소포체의 용도 |
KR101128080B1 (ko) | 2009-12-23 | 2012-03-29 | 한국생명공학연구원 | 메타게놈 라이브러리 유래 효소활성의 탐색 방법 |
GB201412834D0 (en) * | 2014-07-18 | 2014-09-03 | Cancer Rec Tech Ltd | A method for detecting a genetic variant |
KR102599549B1 (ko) | 2014-11-28 | 2023-11-06 | 아나제닉스 아이피 리미티드 | 골드 키위 조성물과 준비 방법 및 그 사용 |
PL235777B1 (pl) * | 2015-07-10 | 2020-10-19 | Univ Jagiellonski | Startery, sposób i zestaw diagnostyczny do diagnozowania sepsy |
EP3385391A4 (en) * | 2015-11-30 | 2019-07-31 | DNA Chip Research Inc. | METHOD FOR EVALUATING THE EFFECTIVENESS OF TREATING MALIGNEM NEOPLASMA BY MEASURING THE AMOUNT OF CTDNA |
KR102011375B1 (ko) | 2017-06-30 | 2019-08-16 | 주식회사 엠디헬스케어 | 프로테우스 속 세균 유래 나노소포 및 이의 용도 |
WO2019004668A1 (ko) * | 2017-06-30 | 2019-01-03 | 주식회사 엠디헬스케어 | 프로테우스 속 세균 유래 나노소포 및 이의 용도 |
-
2017
- 2017-12-26 KR KR1020170180014A patent/KR101942197B1/ko active IP Right Grant
- 2017-12-27 JP JP2019535312A patent/JP7084637B2/ja active Active
- 2017-12-27 US US16/474,543 patent/US11708611B2/en active Active
- 2017-12-27 CN CN201780081402.0A patent/CN110418848A/zh active Pending
- 2017-12-27 EP EP17886869.1A patent/EP3564388B1/en active Active
Patent Citations (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2013503857A (ja) | 2009-09-01 | 2013-02-04 | イオン メディックス インコーポレイテッド | 腸内共生細菌由来細胞外ベシクル、並びにこれを用いた疾病モデル、ワクチン、候補薬物探索方法及び診断方法 |
JP2013503858A (ja) | 2009-09-04 | 2013-02-04 | イオン メディックス インコーポレイテッド | グラム陽性細菌由来細胞外ベシクル及びその用途 |
WO2016099076A1 (ko) | 2014-12-16 | 2016-06-23 | 이화여자대학교 산학협력단 | 세균 유래의 나노소포체를 이용한 세균성 감염질환 원인균 동정방법 |
Non-Patent Citations (5)
Title |
---|
Archives of Medical Science,2015年,Vol.11, No.2 ,pp.385-394 |
BMC Veterinary Research,2017年,13:65,pp.1-11 |
Experimental & Molecular Medicine,2016年,Vol.48, No.e208,pp.1-8 |
Frontiers in Microbiology,2016年,Vol.7, Article 1489,pp.1-7 |
Journal of Medical Virology,2014年,Vol.86,pp.2042-2048 |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
KR101942197B9 (ko) | 2023-06-09 |
EP3564388A4 (en) | 2020-09-02 |
JP2020503863A (ja) | 2020-02-06 |
US11708611B2 (en) | 2023-07-25 |
KR20180077067A (ko) | 2018-07-06 |
EP3564388B1 (en) | 2022-02-16 |
KR101942197B1 (ko) | 2019-01-24 |
US20220259663A1 (en) | 2022-08-18 |
EP3564388A1 (en) | 2019-11-06 |
CN110418848A (zh) | 2019-11-05 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
JP6994776B2 (ja) | 微生物メタゲノム分析を通した乳癌の診断方法 | |
JP6846833B2 (ja) | 細菌メタゲノム解析による胃癌診断方法 | |
JP6914551B2 (ja) | 細菌メタゲノム解析による肺癌診断方法 | |
JP6914554B2 (ja) | 細菌メタゲノム分析を通したパーキンソン病の診断方法 | |
JP6914552B2 (ja) | 細菌メタゲノム分析を通した大腸腫瘍の判定方法 | |
JP7116426B2 (ja) | 細菌メタゲノム分析を通したアルツハイマー型認知症の診断方法 | |
JP7089807B2 (ja) | 細菌メタゲノム分析を通した脳卒中の診断方法 | |
US12084721B2 (en) | Inflammatory bowel disease diagnostic method by means of bacterial metagenomic analysis | |
JP7084637B2 (ja) | 細菌メタゲノム分析を通した前立腺疾患の診断方法 | |
KR101940425B1 (ko) | 세균 메타게놈 분석을 통한 간질환 진단 방법 | |
JP7152053B2 (ja) | 細菌メタゲノム分析を通したうつ病の診断方法 | |
JP6993723B2 (ja) | 細菌メタゲノム分析を通した自閉症の診断方法 | |
US20200199655A1 (en) | Method for diagnosing ovarian cancer through microbial metagenome analysis | |
KR20180075401A (ko) | 미생물 메타게놈 분석을 통한 방광암 진단방법 | |
US11827939B2 (en) | Method for diagnosing cholangiocarcinoma via bacterial metagenomic analysis | |
KR101995231B1 (ko) | 세균 메타게놈 분석을 통한 췌장암 진단방법 | |
KR102007786B1 (ko) | 세균 메타게놈 분석을 통한 두경부암 진단방법 | |
JP7112125B2 (ja) | 細菌メタゲノム分析を通したリンパ腫の診断方法 |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
A621 | Written request for application examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621 Effective date: 20190823 |
|
A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20200917 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20201211 |
|
A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20210601 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20210826 |
|
A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20220119 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20220126 |
|
TRDD | Decision of grant or rejection written | ||
A01 | Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01 Effective date: 20220510 |
|
A61 | First payment of annual fees (during grant procedure) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A61 Effective date: 20220527 |
|
R150 | Certificate of patent or registration of utility model |
Ref document number: 7084637 Country of ref document: JP Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R150 |