JP6933562B2 - 架橋モデルの生成システム、方法及びプログラム - Google Patents
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Description
複数のポリマー粒子が直鎖状又は分岐状に連なる複数のポリマーモデルと、複数の架橋剤粒子と、を有し、ポリマーモデルと架橋剤粒子とが結合した架橋モデルを生成するシステムであって、
予め設定された解析条件に基づいて分子動力学計算を行い、所定のタイミングで互いに所定距離以内にあるポリマー粒子と架橋剤粒子とを、前記ポリマー粒子に設定された架橋確率で結合させる反応処理を繰り返し実行する反応処理実行部と、
ポリマー粒子と既に結合している架橋剤粒子に対して、次の反応処理で用いる条件に、結合可能条件及び結合不可条件のいずれかを設定する結合条件設定部と、を備え、
前記結合可能条件は、架橋剤粒子を結合可能とし、且つ、当該架橋剤粒子に結合したポリマー粒子を中心とする所定数のポリマー粒子を結合不可能とする条件であり、
前記結合不可条件は、架橋剤粒子及び当該架橋剤粒子に結合したポリマー粒子を結合不可とする条件である。
結合可能条件を設定することで、既に結合した架橋剤粒子が他のポリマー粒子に結合することができ、一つの架橋剤粒子が複数のポリマー粒子に結合するように反応処理を継続することができる。
結合不可条件を設定することで、架橋剤粒子が結合したポリマー粒子に近い位置にあるポリマー粒子に他の架橋剤粒子が結合でき、ポリマーモデルにおいて架橋剤粒子が結合可能な箇所を十分に確保でき、適切な物理量を発現させるための粒子の結合を増大可能となる。
したがって、煩わしい設定をしなくても分子内ループ構造が生成されることを抑制し、適切な物理量を発現させるための粒子の結合を増大させることが可能となる。
本実施形態のシステムは、分子動力学計算により粘弾性を算出するために利用される、分子動力学計算用の架橋モデルを生成するシステム(装置)である。架橋モデルは、例えば硫黄などの架橋剤と、高分子とを架橋したゴムが挙げられる。架橋剤は、架橋剤粒子として表現され、高分子は、複数のポリマーモデルが直鎖状又は分岐状に連なったポリマーモデルとして表現される。
なお、本実施形態では、複数の粒子が直列接続された直鎖状のモデルを例に挙げているが、これに限定されない。例えば、分岐を有する分岐状のモデルでもよい。
上記システム1を用いて架橋モデルを生成する方法について図3を用いて説明する。
fix BOND all bond/create 1000 2 3 1.1 prob 0.8 123 iparam 3 4 jparam 2 4
ここでは、各粒子に識別子を付与している。識別子「2」はポリマー粒子2を意味し、識別子「3」は架橋剤粒子3を意味する。このコマンドでは、解析上で所定時間(1000ステップ)経過したときに、識別子「2」であるポリマー粒子2と、識別子「3」である架橋剤粒子3との結合について、所定距離を1.1とし、第1架橋確率T1は0.8としている。iparamの次の3はポリマー粒子の最大結合数、4は反応後の識別子を表す。つまり、識別子「2」であるポリマー粒子2は、結合数が3になると識別子「4」と変化し、架橋反応の対象から外れる。また、jparamの次の2は架橋財粒子の最大結合数、4は反応後の識別子を表す。識別子「3」である架橋粒子3は、結合数が2になると識別子「4」と変化し、架橋反応の対象から外れる。
100個のポリマー粒子2が連なった100個のポリマーモデルに対して、1600個の架橋剤粒子3を全て結合させるとした。
図4(a)に示すように、全ての全ポリマー粒子が架橋剤粒子3と同じ確率で反応するように同一確率に設定し、架橋モデルを生成した。
図4(b)に示すように、非特許文献1の記載に基づき、ポリマーモデルにおいて分子鎖の末端から1つ飛ばしで架橋可能なポリマー粒子を設定し、その他の粒子を架橋不可能なポリマー粒子に設定し、架橋モデルを生成した。斜線で塗りつぶしたポリマー粒子2が結合不可であり、斜線で塗りつぶしていないポリマー粒子2は結合可能であることを示す。
本発明に述べる装置及び方法を用いて、架橋モデルを生成した。
よって、煩わしい設定をしなくても分子内ループ構造が生成されることを抑制し、適切な物理量を発現させることが可能となる。
複数のポリマー粒子2が直鎖状又は分岐状に連なる複数のポリマーモデルと、複数の架橋剤粒子3と、を有し、ポリマーモデルと架橋剤粒子3とが結合した架橋モデルを生成するシステムであって、
予め設定された解析条件に基づいて分子動力学計算を行い、所定のタイミングで互いに所定距離以内にあるポリマー粒子2と架橋剤粒子3とを、ポリマー粒子2に設定された架橋確率T1で結合させる反応処理を繰り返し実行する反応処理実行部11と、
ポリマー粒子2と既に結合している架橋剤粒子3に対して、次の反応処理で用いる条件に、結合可能条件及び結合不可条件のいずれかを設定する結合条件設定部12と、を備え、
結合可能条件は、架橋剤粒子3を結合可能とし、且つ、架橋剤粒子3に結合したポリマー粒子2aを中心とする所定数N1のポリマー粒子2bを結合不可能とする条件であり、
結合不可条件は、架橋剤粒子3及び架橋剤粒子3に結合したポリマー粒子2aを結合不可とする条件である。
複数のポリマー粒子2が直鎖状又は分岐状に連なる複数のポリマーモデルと、複数の架橋剤粒子3と、を有し、ポリマーモデルと架橋剤粒子3とが結合した架橋モデルを生成するシステムであって、
予め設定された解析条件に基づいて分子動力学計算を行い、所定のタイミングで互いに所定距離以内にあるポリマー粒子2と架橋剤粒子3とを、ポリマー粒子2に設定された架橋確率T1で結合させる反応処理を繰り返し実行するステップST2と、
ポリマー粒子2と既に結合している架橋剤粒子3に対して、次の反応処理で用いる条件に、結合可能条件及び結合不可条件のいずれかを設定するステップST3と、を含み、
結合可能条件は、架橋剤粒子3を結合可能とし、且つ、架橋剤粒子3に結合したポリマー粒子2aを中心とする所定数N1のポリマー粒子2bを結合不可能とする条件であり、
結合不可条件は、架橋剤粒子3及び架橋剤粒子3に結合したポリマー粒子2aを結合不可とする条件である。
結合可能条件を設定することで、既に結合した架橋剤粒子3が他のポリマー粒子2に結合することができ、一つの架橋剤粒子3が複数のポリマー粒子2に結合するように反応処理を継続することができる。
結合不可条件を設定することで、架橋剤粒子3が結合したポリマー粒子2aに近い位置にあるポリマー粒子に他の架橋剤粒子3が結合でき、ポリマーモデルにおいて架橋剤粒子3が結合可能な箇所を十分に確保でき、適切な物理量を発現させるための粒子の結合を増大可能となる。
したがって、煩わしい設定をしなくても分子内ループ構造が生成されることを抑制し、適切な物理量を発現させるための粒子の結合を増大させることが可能となる。
3…架橋剤粒子
11…反応処理実行部
12…結合条件設定部
Claims (7)
- 複数のポリマー粒子が直鎖状又は分岐状に連なる複数のポリマーモデルと、複数の架橋剤粒子と、を有し、ポリマーモデルと架橋剤粒子とが結合した架橋モデルを生成するシステムであって、
予め設定された解析条件に基づいて分子動力学計算を行い、所定のタイミングで互いに所定距離以内にあるポリマー粒子と架橋剤粒子とを、前記ポリマー粒子に設定された架橋確率で結合させる反応処理を繰り返し実行する反応処理実行部と、
ポリマー粒子と既に結合している架橋剤粒子に対して、次の反応処理で用いる条件に、結合可能条件及び結合不可条件のいずれかを設定する結合条件設定部と、を備え、
前記結合可能条件は、架橋剤粒子を結合可能とし、且つ、当該架橋剤粒子に結合したポリマー粒子を中心とする所定数のポリマー粒子を結合不可能とする条件であり、
前記結合不可条件は、架橋剤粒子及び当該架橋剤粒子に結合したポリマー粒子を結合不可とする条件である、架橋モデルの生成システム。 - 全ての架橋剤粒子が、一つの架橋剤粒子あたり所定数のポリマー粒子に結合するまで、前記結合条件の設定及び結合条件を用いた前記反応処理の実行を繰り返す、請求項1に記載のシステム。
- 前記結合条件設定部は、前記結合可能条件と前記結合不可条件とをランダムで設定する、請求項1又は2に記載のシステム。
- 複数のポリマー粒子が直鎖状又は分岐状に連なる複数のポリマーモデルと、複数の架橋剤粒子と、を有し、ポリマーモデルと架橋剤粒子とが結合した架橋モデルを、コンピュータが生成する方法であって、
予め設定された解析条件に基づいて分子動力学計算を行い、所定のタイミングで互いに所定距離以内にあるポリマー粒子と架橋剤粒子とを、前記ポリマー粒子に設定された架橋確率で結合させる反応処理を繰り返し実行するステップと、
ポリマー粒子と既に結合している架橋剤粒子に対して、次の反応処理で用いる条件に、結合可能条件及び結合不可条件のいずれかを設定するステップと、を含み、
前記結合可能条件は、架橋剤粒子を結合可能とし、且つ、当該架橋剤粒子に結合したポリマー粒子を中心とする所定数のポリマー粒子を結合不可能とする条件であり、
前記結合不可条件は、架橋剤粒子及び当該架橋剤粒子に結合したポリマー粒子を結合不可とする条件である、架橋モデルの生成方法。 - 全ての架橋剤粒子が、一つの架橋剤粒子あたり所定数のポリマー粒子に結合するまで、前記結合条件の設定及び結合条件を用いた前記反応処理の実行を繰り返す、請求項4に記載の方法。
- 前記結合可能条件及び前記結合不可条件のいずれかをランダムで設定する、請求項4又は5に記載の方法。
- 請求項4〜6のいずれかに記載の方法をコンピュータに実行させるプログラム。
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