JP6491696B2 - 形質転換されたピキア・パストリス(Pichia pastoris)などの微生物における抗体などのマルチサブユニットタンパク質の高純度生産 - Google Patents
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-
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-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
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- C12P—FERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
- C12P21/00—Preparation of peptides or proteins
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K2317/00—Immunoglobulins specific features
- C07K2317/10—Immunoglobulins specific features characterized by their source of isolation or production
- C07K2317/14—Specific host cells or culture conditions, e.g. components, pH or temperature
Description
本願は、2011年8月19日に提出された「形質転換されたピキア・パストリスなどの微生物における抗体などのマルチサブユニットタンパク質の高力価および抗純度生産のための多重コピー戦略(MULTI-COPY STRATEGY FOR HIGH-TITER AND HIGH-PURITY PRODUCTION OF MULTI-SUBUNIT PROTEINS SUCH AS ANTIBODIES IN TRANSFORMED MICROBES SUCH AS
PICHIA PASTORIS)」という表題の米国特許仮出願番号第61/525,307号(代理人整理番号第67858.730200号)、2011年5月20日に提出された「抗CGRP組成物とその使用(ANTI-CGRP COMPOSITIONS AND USE THEREOF)」という表題の米国特許仮出願番号第61/488,660号(代理人整理番号第67858.730300号)、2011年6月14日に提出された「羞明の予防または抑制を、それを必要とする対象、特に、偏頭痛の患者において行うための抗CGRP抗体および抗体断片の使用(USE OF ANTI-CGRP ANTIBODIES AND ANTIBODY FRAGMENTS TO PREVENT OR INHIBIT PHOTOPHOBIA IN SUBJECTS IN NEED THEREOF, ESPECIALLY MIGRAINE SUFFERERS)」 という表題の米国特許仮出願番号第61/496,873号(代理人整理番号第67858.770000号)、および2011年6月14日に提出された「病気の対象において下痢症を治療するための抗CGRP抗体および抗体断片の使用、ならびにCGRPレベルを上昇させる治療(USE OF ANTI-CGRP ANTIBODIES AND ANTIBODY FRAGMENTS TO TREAT DIARRHEA IN SUBJECTS WITH DISEASES OR TREATMENTS THAT RESULT IN ELEVATED CGRP LEVELS)」 とい
う表題の米国特許仮出願番号第61/496,873号(代理人整理番号第67858.770000号)の利益を主張する。それらの仮出願のそれぞれは、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
本開示は、形質転換細胞において異種性タンパク質を生産するための方法に全般的に関する。本開示は、抗体および他のマルチサブユニットタンパク質を含む、マルチサブユニットタンパク質であって、分泌型または非分泌型でありうるものを、望まない副産物の生産を減少させたり、収量を上げたりしつつ生産する改良された方法を提供する。例示的な実施形態では、形質転換細胞は酵母、例えば、ピキア・パストリス(Pichia pastoris)または出芽酵母(Saccharomyces cerevisiae)などの酵母である。
のオルガネラ複合体である、真核細胞の分泌経路で起こる。
示した(図1〜6)。これらの3つの抗体は配列が異なるだけでなく、3つの異なる抗原を認識する。また、エタノールを急速大量投与することなく生産されると、それらの抗体のうちの2つが、3番目の抗体(図5)と比較してより大量のH1L1産物を含んだ(図1〜4)。より大量のH1L1産物を含むその2つの抗体は非正準的ジスルフィド架橋または追加的なジスルフィド架橋を有し、その3番目の抗体はそれらを有しない。図1、2および3に例示される抗体は可変軽鎖ドメインに追加の鎖内ジスルフィド架橋を有し、図4に例示される抗体はその重鎖に追加の鎖内ジスルフィド架橋を有する。過剰発現したタンパク質におけるジスルフィド架橋の存在が宿主において細胞内ストレスを高めることが文献中に報告されている(Gasser et al., Biotechnology and Bioengineering, Vol. 94, No. 2, pg. 353-61, June 5, 2006、Inan et al., Biotechnology And Bioengineering, Vol. 93, No. 4, pg. 771-78, March 5, 2006、 Li et al., Biochem Biophys Res Commun. 2010 November 19; 402(3): 519-524 を参照のこと)。このストレスの上昇は、追
加の鎖内ジスルフィド架橋を有する両方の抗体が「ボーラス無し」条件下でより低い生存率を有する図11、12および13に示されているように、生存率の低下を引き起こすこともできる。エタノールのボーラス添加は、したがって、生存率の上昇と純度の上昇を引き起こす。これは、特に複数のジスルフィド架橋を有する発現が難しいタンパク質を発現させているときに用いられ得る。
行われる前記の同じ方法と比べて、安定的なジスルフィド結合の形成を増強し得る。
と比べて、異常なグリコシル化を有する複合体の相対量を減少させ得る。
、撹拌の強度、ガス圧、供給される空気または他のガス混合物の流速、培養物の粘度、培養物の密度、供給される空気または他のガス混合物の酸素濃度、および温度のうちの1つ以上を制御することを含み得る。
。
含まなくてよい。1つの態様では、本開示は、マルチサブユニット複合体を作製する方法であって、前記のマルチサブユニット複合体を発現する真核細胞を含む培養物を生じる宿主細胞の培養、前記の培養物への大量のエタノールの添加、および前記のマルチサブユニット複合体を生産するための前記培養物の培養を含む方法を提供する。マルチサブユニット複合体は1つ以上のジスルフィド結合を含むことができ、それは抗体であり得る。
生産は発酵温度の上昇によっても増加し得る。同様に、エタノール濃度は、グルコース濃度の低下(例えば、グルコース供給速度の低下)により低下し得、酸素の利用可能性の上昇、撹拌強度の上昇(例えば、発酵槽の入力パワーの上昇)、発酵槽におけるガス圧の上昇、供給される空気または他のガス混合物の流速の上昇、培養物の粘度の低下、または供給される空気または他のガス混合物の酸素濃度の上昇(例えば、酸素供給が用いられている場合)により低下し得る。エタノール生産は発酵温度の低下によっても減少し得る。
inositovera)、オガタエア・ニトラトアベルサ(Ogataea nitratoaversa)、およびカンジダ・ボインドニイ(Candida boidnii)が含まれる。
ちのいずれかのFab1断片でなくてよい。さらなる例示的な実施形態では、所望のマルチサブユニット複合体は次の抗体、すなわち、Ab1‐NGF、Ab2‐NGF、Ab3‐NGF、Ab4‐NGF、Ab5‐NGF、Ab6‐NGF、Ab7‐NGF、Ab8‐NGF、Ab9‐NGF、Ab10‐NGF、Ab11‐NGF、Ab12‐NGF、Ab13‐NGF、Ab14‐NGF、Ab15‐NGF、Ab16‐NGF、Ab17‐NGF、Ab18‐NGF、Ab19‐NGF、Ab20‐NGF、またはAb21‐NGFのいずれかに含まれる相補性決定領域(CDR)のうちの少なくとも1つ、少なくとも2つ、少なくとも3つ、少なくとも4つ、少なくとも5つ、または少なくとも6つ全てを含有する抗体を含まなくてよく、かつ、NGFへの結合特異性を任意で有する。例えば、所望のマルチサブユニット複合体は、それぞれ配列番号51および401、ならびに/またはそれぞれ配列番号53および402、ならびに/またはそれぞれ配列番号405および406、ならびに/またはそれぞれ配列番号407および408の軽鎖ポリペプチド配列および重鎖ポリペプチド配列を含まなくてよい、またはそれらのポリペプチド配列から構成されなくてよい。さらなる例として、所望のマルチサブユニット複合体は配列番号55、56、57、58、59、および60のCDRのうちの少なくとも1つ、少なくとも2つ、少なくとも3つ、少なくとも4つ、少なくとも5つ、または少なくとも6つ全てを含有する抗体を含まなくてよく、かつ、NGFへの結合特異性を任意で有する。
and Optimization of Fed-Batch and Continuous Fermentations”を参照のこと。酸素
を追加した空気または追加していない空気などの酸素を含むガス混合物を培養物に供給す
ることができる。酵母培養物は、最少培地であり得る培地、選択薬剤を欠如し得る培地、および/または前もって形成されたアミノ酸または他の複雑な生体分子を欠如し得る培地で培養され得る。培地は(例えば、酵母抽出物や植物性ペプトンを含有する)複合培地でもあり得る。培地は窒素原(例えば、メチルアミンクロリド、硫酸アンモニウム、酵母抽出物、大豆ペプトン、他の植物性ペプトンなど)を含むことができる。例となる最少培地には最少ブドウ糖培地(MD)(1.34%酵母窒素ベース(YNB)(アミノ酸無し)、4×10-5%ビオチン、および2%グルコース)、緩衝最少グリセロール複合培地(
BMGY)(1%酵母抽出物、2%ペプトン、1%グリセロール、1.34%YNB(アミノ酸無し)、4×10-5%ビオチンおよび100mMリン酸カリウム(pH6.0)
)が含まれる。培地は1つ以上の塩(例えば、塩化ナトリウム、カルシウム塩、マグネシウム塩、およびリン酸塩)、緩衝液(例えば、リン酸カリウム緩衝液、トリス緩衝液、またはHEPES緩衝液)、ヌクレオシド(例えば、アデノシンおよびチミジン)、抗生物質(例えば、混入汚染物質の増殖を抑制したり、選択マーカーを維持したりするために添加される)、微量元素、およびグルコースまたは別のエネルギー源を含み得る。任意の追加物および置換物も、当業者に知られているだろう適切な濃度で含まれ得る。
を用いて最適化され得る。例えば、収量は、温度、pH、培地の組成(例えば、炭素源、炭素源の濃度、2つ以上の炭素源の混合物、窒素原および濃度、KH2PO4、K2HPO4、MgSO4、硫酸カリウム、クエン酸ナトリウム、硫酸カリウム、クエン酸ナトリウム;塩化コバルト、硫酸銅、ヨウ化ナトリウム、硫酸マンガン、モリブデン酸ナトリウム、ホウ酸、塩化亜鉛、硫酸(第一)鉄などの微量金属;ビオチン、イノシトール、チアミンなどのビタミン、ペプトン、酵母抽出物、カザミノ酸、尿素、リン酸アンモニウムまたは他のアンモニウムイオン、L‐アルギニン塩酸を含む塩および栄養素の濃度)、時間、培養物の密度、酸素投与、および収量に影響する他の要因を変化させることにより最適化され得る。例えば、所望のマルチサブユニット複合体の収量、発現や純度は、いくつかの例では、温度を所望の設定値、例えば、約17℃と約25℃の間など、約15℃と約30℃の間の設定値に維持することにより改善され得る)。理論によって限定されるつもりはないが、温度の制御が折畳みおよび翻訳後プロセッシングの経路を介して細胞内移送を助けたり、細胞性プロテアーゼの活性を低下させたりすることができるという仮説が立て
られている。同様に、所望のマルチサブユニット複合体の収量、発現や純度は、いくつかの例では、培地のpHを所望の設定値、例えば、pH4とpH7の間など、pH3からpH8の間の設定値に維持することにより改善され得る。
または誤って構築されているマルチサブユニット複合体のプロセッシングを増進させたりして、マルチサブユニット複合体の純度を改善する遺伝子発現の持続的な変化を引き起こし得るという仮説が立てられている。さらに、抗体純度の改善が培養物中の酵母の生存率の改善と相関したことが示されており、これに基づき、申請者らは、生存率の改善が(少なくとも部分的に)純度の改善の原因となり得るという仮説を立てるが、この理論は限定的であることを意図するものではない。
ットを含み得る、または1つ以上のコピーのそれぞれ異なるサブユニットを含み得る。
Methods in Molecular Biology. Humana Press, Totowa, N.J. に開示される。それらのそれぞれは全体の参照により組み込まれる。
の所望のマルチタンパク質複合体が抗体である場合、その発現はコロニーリフト法/イムノブロット法 (Wung et al. Biotechniques 21 808-812 (1996) やFACSにより確認されることもできる。
本発明は、記載される特定の方法論、プロトコル、細胞株、動物の種または属、および試薬に限定されることは無く、したがって変更可能であると理解されるものとする。本明細書において使用される用語は特定の実施形態の記述のみを目的としており、添付されている特許請求の範囲によってのみ限定される本発明の範囲を限定することはその用語に意図されていないことも理解されるものとする。
protein)」への言及は1つ以上のタンパク質および当業者に知られるその同等物を包含する、など。本明細書において使用される全ての技術用語および科学用語は、別途明確に指示されない限り、本発明が属する分野の当業者が一般的に理解するものと同じ意味を有する。
での添加を含み得る。別の例として、細胞はエタノールを含有する培地に、例えば、エタノールを含有する培地に細胞を含有する接種原を添加することにより加えられ得る。
る細胞。
ことが当技術分野において知られている。多くの適切である可能性がある分泌シグナルが当技術分野において知られており、そして、それらは、特定の異種性マルチサブユニット複合体の収率や純度に対するそれらの効果について容易に試験され得る。酵母および他の種の分泌型タンパク質に存在する分泌配列、ならびに遺伝子操作された分泌配列を含む、あらゆる分泌配列を使用する可能性が有り得る。利用され得る分泌配列の例には、ニワトリリゾチーム(CLY)シグナルペプチド(MRSLLILVLCFLPLAALG(配列番号414))、CLY‐L8(MRLLLLLLLLPLAALG(配列番号415))、出芽酵母インベルターゼ(SUC2)シグナルペプチド(MLLQAFLFLLAGFAAKISA(配列番号416))、MF‐α(プレプロ)(MRFPSIFTAVLFAASSALA−APVNTTTE−EGVSLEKR(配列番号417))、MF‐α(プレ)‐apv(MRFPSIFTAVLFAASSALA−APV(配列番号418))、MF‐α(プレ)‐apv‐SLEKR(MRFPSIFTAVLFAASSALA−APVSLEKR(配列番号419))、MF‐α(プレプロ)‐(EA)3(MRFPSIFTAVLFAASSALA−APVNTTTE−EGVSLEKR−EA
EAEA(配列番号420))、αFシグナルペプチド(MRFPSIFTAVLFAASSALA−APVNTTTE−DETAQIPAEAVIGYSDLEGDFDVAVLPFSNSTNNGLLFINTTIASIAAKE−EGVSLEKR(配列番号421))、KILM1シグナルペプチド(MTKPTQVLVRSVSILFFITLLHLVVALNDVAGPAETAPVSLLPR(配列番号422))、抑制型酸性ホスファターゼ(PHO1)シグナルペプチド(MFSPILSLEIILALATLQSVFA(配列番号423))、アスペルギルス・ニガー(A. niger)GOXシグナルペプチド(MQTLLVSSLVVSLAAALPHYIR(配列番号424))、シュワンニオミセス・オクシデンタリス(Schwanniomyces occidentalis)グルコアミラーゼ遺伝子(GAM1)シグナルペプチド(MIFLKLIKSIVIGLGLVSAIQA(配列番号425))、プロ配列を有するヒト血清アルブミン(HSA)シグナルペプチド(MKWVTFISLLFLFSSAYSRGVFRR(配列番号426))、プロ配列を有しないヒト血清アルブミン(HSA)シグナルペプチド(MKWVTFISLLFLFSSAYS(配列番号427))、ISNシグナルペプチド(MALWMRLLPLLALLALWGPDPAAA(配列番号428))、IFNシグナルペプチド(MKYTSYILAFQLCIVLGSLGCDLP(配列番号429))、HGHシグナルペプチド(MAADSQTPWLLTFSLLCLLWPQEPGA(配列番号430))、フィトヘマグルチニン(PHA)(MKKNRMMMMIWSVGVVWMLLLVGGSYG(配列番号431))、カイコリゾチーム(MQKLIIFALVVLCVGSEA(配列番号432))、ヒトリゾチーム(LYZ1)(MKALIVLGLVLLSVTVQG(配列番号433))、1型アクチビン受容体(MVDGVMILPVLIMIALPSPS(配列番号434))、アクチビンII型受容体(MGAAAKLAFAVFLISCSSG(配列番号435))、ピキア・パストリス(P. pastoris)免疫グロブリン結合タンパク質(PpBiP)(MLSLKPSWLTLAALMYAMLLVVVPFAKPVRA(配列番号436))、およびヒト抗体3D6軽鎖リーダー(MDMRVPAQLLGLLLLWLPGAKC(配列番号437))が挙げられる。 Hashimoto et al., Protein Engineering vol. 11
no. 2 pp.75-77, 1998、 Oka et al., Biosci Biotechnol Biochem. 1999 Nov; 63(11):1977-83、 Gellissen et al., FEMS Yeast Research 5 (2005) 1079-1096、 Ma et al., Hepatology. 2005 Dec;42(6):1355-63、 Raemaekers et al., Eur J Biochem. 1999 Oct 1;265(1):394-403、 Koganesawa et al., Protein Eng. (2001) 14 (9): 705-710、 Daly et al., Protein Expr Purif. 2006 Apr;46(2):456-67 、 Damasceno et al., Appl Microbiol Biotechnol (2007) 74:381-389、 および Felgenhauer et al., Nucleic Acids Res. 1990 Aug 25;18(16):4927 を参照のこと。それらの文献のそれぞれは、参照によ
りその全体が本明細書に組み込まれる)。マルチサブユニット複合体を、分泌シグナルに機能するように結合または融合せずに培地に分泌することもできる。例えば、いくつかの異種性ポリペプチドは、分泌シグナルに機能するように結合または融合せずともピキア・パストリス(P. pastoris)で発現すると培地に分泌されることが示されている。さらに、マルチサブユニット複合体は、当技術分野において公知の方法を用いて、(例えば、その複合体がほとんど分泌されない場合に、好ましくあり得る)宿主細胞から精製され得る。
泳動)、疎水性相互作用クロマトグラフィー(例えば、HPLC)、荷電(例えば、イオン交換クロマトグラフィー)、親和性(例えば、抗体の場合、プロテインA、プロテインGや所望の抗体が結合するエピトープへの結合)、および/またはグリコシル化状態(例えば、レクチン結合親和性により検出される)に基づいて精製され得る。所望のレベルの純度を得るために複数の精製ステップを実行することができる。例示的な実施形態では、所望のマルチサブユニット複合体は免疫グロブリン定常ドメインを含むことができ、そして、それは、プロテインA親和性またはプロテインG親和性、サイズ排除クロマトグラフィー、および(グリコシル化形態を除去するための)レクチンへの結合の欠如を用いて精製され得る。精製の際にタンパク質分解を抑制するために、任意で、フェニルメチルスルホニルフルオリド(PMSF)などのAプロテアーゼ阻害剤を添加してもよい。
込まれる。
1プロモーター (Menendez et al. (2003) Yeast 20(13):1097-108); グリセルアルデヒ
ド‐3‐リン酸デヒドロゲナーゼプロモーター (GAP) (Waterham et al. (1997) Gene 186(1):37-44); およびFLD1プロモーター (Shen et al. (1998) Gene 216(1):93-102) が挙げられる。GAPプロモーターは強力な構成的プロモーターであり、CUP1プロモーター、AOXプロモーターおよびFLD1プロモーターは誘導性である。それぞれの前述の参照文献は参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
ドロゲナーゼIIプロモーター、GAL4プロモーター、PHO3プロモーター、PHO5プロモーター、Pykプロモーター、およびキメラプロモーターが含まれる。さらに、哺乳類性プロモーター、昆虫性プロモーター、植物性プロモーター、爬虫類性プロモーター、両生類性プロモーター、ウイルス性プロモーター、鳥類性プロモーターなど、非酵母性プロモーターを本発明において使用することができる。最も典型的には、プロモーターは哺乳類性プロモーター(発現遺伝子にとって内在的である可能性が高い)を含み、または酵母系での効率的な転写をもたらす酵母性プロモーターもしくはウイルス性プロモーターを含むことが最も典型的である。
を、適切な場合では、抗生物質耐性(例えば、アンピシリンまたはゼオシンへの耐性)により選択する。その形質転換体に由来するプラスミドを調製し、制限エンドヌクレアーゼ消化により分析したり、塩基配列決定したりする。
る配列から構成されるハイブリッド配列であるように、その組換え部位に隣接するDNAセグメントが交換される。組換えはあらゆるトポロジーのDNAの間で起こり得る。それぞれの前述の参照文献は参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
S配列を使用することができる。任意で、IRES機能は遺伝的変更、例えば、eIF2キナーゼであるGCN2の恒常的発現を引き起こすことにより、または2つの開始tRNA(met)遺伝子が破壊されること(同上)を妨害することにより、強力化され得る。
occurring andibodies devoid of light chains, Nature. 1993 Jun. 3; 363(6428):446-8; Gill D S, et al., Biopharmaceutical drug discovery using novel protein scaffolds, Curr Opin Biotechnol. 2006 December; 17(6):653-8. Epub 2006 Oct. 19 を参照のこと。それぞれの前述の参照文献は参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
鎖遺伝子を含有するベクターからなるライブラリーを、増幅した免疫グロブリンcDNAの適切な断片を発現ベクターに挿入することにより作製する。重鎖遺伝子ライブラリーを軽鎖遺伝子ライブラリーと組み合わせることによってコンビナトリアルライブラリーを構築する。これにより、(抗体分子のFab断片または抗原結合断片に類似する)重鎖および軽鎖を共発現するクローンからなるライブラリーが生じる。これらの遺伝子を担持するベクターは宿主細胞に共形質移入される。形質移入された宿主で抗体遺伝子の合成が誘導されると、重鎖タンパク質および軽鎖タンパク質が自己会合して、抗原または免疫原を使用するスクリーニングによって検出され得る活性型抗体を形成する。
ことが必要である。これらの変更は、どのウサギ残基が親和性および活性を保存するために必要であるか特定するための実験により決定される。
EX、マススペクトロメトリー(任意で、遊離システインに質量シフトを生じさせる化学修飾を含む)、サイズ排除クロマトグラフィー、HPLC、光散乱の変化、および当技術分野において公知の他の任意の適切な方法を含む様々な方法で検出され得る。例えば、 The Protein Protocols Handbook 2002, Part V, 581-583, DOI: 10.1385/1-59259-169-8:581 を参照のこと。
cDNA、または天然の遺伝子とは異なるコドンを有する合成配列)である。対立遺伝子変異または天然に生じる変異事象は、本明細書において定義される異種性領域のDNAを生じさせない。
23,000ダルトンの分子量の2つの同一の軽ポリペプチド鎖(「軽鎖」)と53,000〜70,000の分子量の2つの同一の重鎖(「重鎖」)からなる。その4本の鎖はジスルフィド結合により「Y字型」配置に結合されており、その配置では、軽鎖が「Y字型」配置の口部から始まる重鎖を囲む。「Y字型」配置の「分岐」部分はFab領域と呼ばれており、「Y字型」配置の幹部分はFC領域と呼ばれている。アミノ酸配列の方向は、「Y字型」配置の頂点にあるN末端からそれぞれの鎖の底部にあるC末端へと推移する。N末端は、可変領域を誘発した抗原への特異性を有し、約100アミノ酸長であるその可変領域を有し、軽鎖と重鎖の間で、および抗体毎にわずかな変化が存在する。
の範囲ではその抗体の特異性(すなわち、それを誘発する抗原)によって変化しない定常領域に結合している。免疫グロブリン分子のクラスを決定する定常領域の5つの既知の主要クラスが存在する(IgG、IgM、IgA、IgDおよびIgEはγ重鎖定常領域、μ重鎖定常領域、α重鎖定常領域、δ重鎖定常領域、およびε重鎖定常領域に対応する)。定常領域またはクラスが、補体の活性化 (Kabat, E. A., Structural Concepts in Immunology and Immunochemistry, 2nd Ed., p. 413-436, Holt, Rinehart, Winston (1976))、 および他の細胞応答 (Andrews, D. W., et al., Clinical Immunobiology, pp 1-18,
W. B. Sanders (1980); Kohl, S., et al., Immunology, 48: 187 (1983))を含む、抗体の以後のエフェクター機能を決定し、一方、可変領域が、抗体が反応する抗原を決定する。軽鎖はκまたはλのどちらかとして分類される。各重鎖クラスはκ軽鎖かλ軽鎖のどちらかと対合され得る。免疫グロブリンがハイブリドーマかB細胞のどちらかによって作製されるとき、軽鎖および重鎖は互いに共有結合されており、2つの重鎖の「尾部」は共有ジスルフィド結合によって互いに結合されている。
表現にはKabatらによって定義される超可変領域 ("Sequences of Proteins of Immunological Interest," Kabat E., et al., US Dept. of Health and Human Services, 1983) または抗体の三次元構造中の超可変ループ (Chothia and Lesk, J Mol. Biol. 196 901-917 (1987)) が含まれる。各鎖中のCDRはフレームワーク領域によって極近傍に保
持され、他方の鎖のCDRと共に抗原結合部位の形成に寄与する。CDR内には、選択性決定領域(SDR)と説明されており、抗体抗原間相互作用においてCDRによって用いられる重要な接触残基を表す選択アミノ酸が存在する (Kashmiri, S., Methods, 36:25-34 (2005)) 。
of Immunological Interest, National Institutes of Health, Bethesda, Md., (1987)
を参照のこと)。これらの表現には、抗体の軽鎖と重鎖の可変領域内のCDR間に挿入
されているアミノ酸配列領域が含まれる。
ALVMTQTPSSVSAAVGGTVTINCQASQNIYSNLAWYQQRPGQRPKLLIYGASNLDAGVPSRFRGSGSGTEYTLTISDLECDDVGTYYCQSAFDSDSTENTFGGGTEVVVKR(配列番号1)。
ALVMTQTPSSVSAAVGGTVTINCQASQNIYSNLAWYQQRPGQRPKLLIYGASNLDAGVPSRFRGSGSGTEYTLTISDLECDDVGTYYCQSAFDSDSTENTFGGGTEVVVKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC(配列番号2)。
これらのポリペプチド配列の組合せを含む。本発明の別の実施形態では、本発明の抗体またはその断片は、上記のCDRのうちの1つ以上、可変重鎖配列および可変軽鎖配列、ならびに重鎖配列および軽鎖配列の(全てを包含する)組合せを含む、あるいはそれらの組合せからなる。
えば、酵母細胞(例えば、二倍体ピキア属などの二倍体酵母)および他の酵母株における発現により作製され得る。適切なピキア属の種にはピキア・パストリス(Pichia pastoris)が含まれるが、これに限定されない。
DIQMTQSPSTLSASVGDRVTITCQASQNIYSNLAWYQQKPGKAPKLLIYGASNLDAGVPSRFSGSGSGTEYTLTISSLQPDDFATYYCQSAFDSDSTENTFGGGTKVEIKR(配列番号11)。
DIQMTQSPSTLSASVGDRVTITCQASQNIYSNLAWYQQKPGKAPKLLIYGASNLDAGVPSRFSGSGSGTEYTLTISSLQPDDFATYYCQSAFDSDSTENTFGGGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC(配列番号12)。
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTVSSYAMSWVRQAPGKGLEWVGVITSIGSTVYASSAKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCARGYDDYDEMTYFNIWGQGTLVTVSS(配列番号13)。
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTVSSYAMSWVRQAPGKGLEWVGVITSIGSTVYASSAKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCARGYDDYDEMTYFNIWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKRVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYASTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHY
TQKSLSLSPGK(配列番号14)。
片は配列番号11の可変軽鎖配列および配列番号13の可変重鎖配列を含む。本発明のこの実施形態は、NGFへの結合特異性を保持したままでの、前記Fab中の配列番号11および/または配列番号13への付加、欠失およびそれらの変異体をさらに企図する。
AVLTQTPSPVSAAMGDTVTIKCQSSQSVYKNNYLSWYQQKPGQPPRLLIYDASNLPSGVPSRFSGSGSGTQFTLTISGVQCDDAATYYCLGDYDDDADNAFGGGTEVVVKR(配列番号21)。
QSVEESGGRLVTPGTPLTLTCTVSGFSLSSYVMIWVRQAPGKGLEYIGITWSAGTYYASWAKGRFTISKTSSTTVDLKITSPTTEDTATYFCAGGGGSIYDIWGPGTLVTVSS(配列番号23)。
SGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKRVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYASTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK(配列番号24)。
いはそれらからなり、本明細書に記載される生物学的活性のうちの少なくとも1つを有するAb3である。
DIQMTQSPSTLSASVGDRVTITCQSSQSVYKNNYLSWYQQKPGKAPKLLIYDASNLPSGVPSRFSGSGSGTEFTLTISSLQPDDFATYYCLGDYDDDADNAFGGGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC(配列番号32)。
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTVSSYVMIWVRQAPGKGLEYIGITWSAGTYYASSAKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCAGGGGSIYDIWGQGTLVTVSS(配列番号33)。
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTVSSYVMIWVRQAPGKGLEYIGITWSAGTYYASSAKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCAGGGGSIYDIWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKRVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYASTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK(配列番号34)。
AYDMTQTPASVEVAVGGTVTIKCQASQSIYSNLAWYQQRPGQPPKLLIYDASTLESGVPSRFKGSGSGTEYTLTISGVECADAASYYCQQGFTVSDIDNAFGGGTEVVVKR(配列番号41)。
AYDMTQTPASVEVAVGGTVTIKCQASQSIYSNLAWYQQRPGQPPKLLIYDASTLESGVPSRFKGSGSGTEYTLTISGVEC
ADAASYYCQQGFTVSDIDNAFGGGTEVVVKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC(配列番号42)。
QSVEESGGRLVTPGTPLTLTCTVSGFSLSNYAVGWVRQAPGKGLEWIGIIGRNGNTWYASWARGRFTISKTSTTVDLKITSPTSEDTATYFCARGYGRSVAYYVFNIWGPGTLVTVSS(配列番号43)。
QSVEESGGRLVTPGTPLTLTCTVSGFSLSNYAVGWVRQAPGKGLEWIGIIGRNGNTWYASWARGRFTISKTSTTVDLKITSPTSEDTATYFCARGYGRSVAYYVFNIWGPGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKRVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYASTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK(配列番号44)。
ペプチド配列のうちの1つ以上を含む、あるいはそれらのポリペプチド配列のうちの1つ以上からなる。
DIQMTQSPSTLSASVGDRVTITCQASQSIYSNLAWYQQKPGKAPKLLIYDASTLESGVPSRFSGSGSGTEYTLTISSLQPDDFATYYCQQGFTVSDIDNAFGGGTKVEIKR(配列番号51)。
DIQMTQSPSTLSASVGDRVTITCQASQSIYSNLAWYQQKPGKAPKLLIYDASTLESGVPSRFSGSGSGTEYTLTISSLQPDDFATYYCQQGFTVSDIDNAFGGGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC(配列番号52)。
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTVSNYAVGWVRQAPGKGLEWVGIIGRNGNTWYASSARGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCARGYGRSVAYYVFNIWGPGTLVTVSS(配列番号53)。
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTVSNYAVGWVRQAPGKGLEWVGIIGRNGNTWYASSARGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCARGYGRSVAYYVFNIWGPGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKRVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYASTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK(配列番号54)。
または予防のための抗体の断片も任意で企図する。本発明の1つの実施形態では、本発明の抗体断片は、配列番号51または配列番号52のポリペプチド配列を含む、あるいはそのポリペプチド配列からなる。本発明の別の実施形態では、本発明の抗体断片は、配列番号53または配列番号54のポリペプチド配列を含む、あるいはそのポリペプチド配列からなる。
ADVVMTQTPASVSQPVGGTVTIKCQASEDIYNLLAWYQQKPGQPPKLLIYSASTLASGVPSRFKGSGSGTEYTLTISGLECADAATYYCQNNYLVTTYGVAFGGGTEVVVKR(配列番号61)。
ADVVMTQTPASVSQPVGGTVTIKCQASEDIYNLLAWYQQKPGQPPKLLIYSASTLASGVPSRFKGSGSGTEYTLTISGLECADAATYYCQNNYLVTTYGVAFGGGTEVVVKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC(配列番号62)。
QEQLKESGGRLVTPGTPLTLTCTVSGFSLSSYAMIWVRQAPGKGLEYIGYIDTDTSAYYASWVKGRFTISRTSTTVDLKITSPTTEDTATYFCARSYAAYGGYPATFDPWGPGTLVTVSS(配列番号63)。
QEQLKESGGRLVTPGTPLTLTCTVSGFSLSSYAMIWVRQAPGKGLEYIGYIDTDTSAYYASWVKGRFTISRTSTTVDLKITSPTTEDTATYFCARSYAAYGGYPATFDPWGPGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKRVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYASTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK(配列番号64)。
列番号61の可変軽鎖配列もしくは配列番号62の軽鎖配列の相補性決定領域(CDR、すなわち超可変領域)に対応する配列番号65、配列番号66、および配列番号67のポリペプチド配列のうちの1つ以上、ならびに/または配列番号63の可変重鎖配列もしくは配列番号64の重鎖配列の相補性決定領域(CDR、すなわち超可変領域)に対応する配列番号68、配列番号69、および配列番号70のポリペプチド配列のうちの1つ以上、またはこれらのポリペプチド配列の組合せを含む抗体をさらに任意で企図する。本発明の別の実施形態では、本発明の抗体またはその断片は、上記のCDRのうちの1つ以上、可変重鎖配列および可変軽鎖配列、ならびに重鎖配列および軽鎖配列の(全てを包含する)組合せを含む、あるいはそれらの組合せからなる。
。
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCQASEDIYNLLAWYQQKPGKVPKLLIYSASTLASGVPSRFSGSGSGTDYTLTISSLQPEDVATYYCQNNYLVTTYGVAFGGGTKVEIKR(配列番号71)。
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCQASEDIYNLLAWYQQKPGKVPKLLIYSASTLASGVPSRFSGSGSGTDYTLTISSLQPEDVATYYCQNNYLVTTYGVAFGGGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC(配列番号72)。
QVQLVESGGGVVQPGRSLRLSCAASGFTFSSYAMIWVRQAPGKGLEYIGYIDTDTSAYYASSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMSSLRAEDTAVYYCARSYAAYGGYPATFDPWGQGTLVTVSS(配列番号73)。
QVQLVESGGGVVQPGRSLRLSCAASGFTFSSYAMIWVRQAPGKGLEYIGYIDTDTSAYYASSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMSSLRAEDTAVYYCARSYAAYGGYPATFDPWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGT
QTYICNVNHKPSNTKVDKRVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYASTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK(配列番号74)。
ちの少なくとも1つを有するAb8である。
AYDMTQTPASVSAAVGGTVTIKCQASENIGSYLAWYQQKPGQPPELLIYRASTLASGVPSRFKGSGSGTQFTLTISGVECADAATYYCQQGYNSENLDNAFGGGTEVVVKR(配列番号81)。
AYDMTQTPASVSAAVGGTVTIKCQASENIGSYLAWYQQKPGQPPELLIYRASTLASGVPSRFKGSGSGTQFTLTISGVECADAATYYCQQGYNSENLDNAFGGGTEVVVKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC(配列番号82)。
QSVEESGGRLVTPGTPLTLTCTVSGIDLSMYSMGWVRQAPGKGLEYIGWISYGGTAYYASWAKGRFTISKTSTTVELKITSPTIEDTATYFCARETPVNYYLDIWGQGTLVTVSS(配列番号
83)。
QSVEESGGRLVTPGTPLTLTCTVSGIDLSMYSMGWVRQAPGKGLEYIGWISYGGTAYYASWAKGRFTISKTSTTVELKITSPTIEDTATYFCARETPVNYYLDIWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKRVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYASTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK(配列番号84)。
形態では、NGFに対する結合特異性を有する抗体の断片は、次の抗体断片のうちの1つ、2つ、3つ、または全てを含むそれより多くを包含する、あるいはそれらからなる:配列番号81の可変軽鎖領域;配列番号83の可変重鎖領域;配列番号81の可変軽鎖領域の相補性決定領域(配列番号85、配列番号86、および配列番号87);および配列番号83の可変重鎖領域の相補性決定領域(配列番号88、配列番号89、および配列番号90)。
AYDMTQSPSSLSASVGDRVTITCQASENIGSYLAWYQQKPGKVPKLLIYRASTLASGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDVATYYCQQGYNSENLDNAFGGGTKVEIKR(配列番号91)。
AYDMTQSPSSLSASVGDRVTITCQASENIGSYLAWYQQKPGKVPKLLIYRASTLASGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDVATYYCQQGYNSENLDNAFGGGTKVEIKRTVAAPSVFI
FPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC(配列番号92)。
QVQLVESGGGVVQPGRSLRLSCAASGFTFSMYSMGWVRQAPGKGLEYIGWISYGGTAYYASSAKGRFTISRDNSKNTLYLQMSSLRAEDTAVYYCARETPVNYYLDIWGQGTLVTVSS(配列番号93)。
QVQLVESGGGVVQPGRSLRLSCAASGFTFSMYSMGWVRQAPGKGLEYIGWISYGGTAYYASSAKGRFTISRDNSKNTLYLQMSSLRAEDTAVYYCARETPVNYYLDIWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKRVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYASTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK(配列番号94)。
上を任意で含む、あるいはそれらのポリペプチド配列のうちの1つ以上から任意でなる。
AFELTQTPSSVEAAVGGTVTIKCQASQNIVTNLAWYQQKP
GQPPKLLIYGASTLASGVSSRFKGSGSGTQFTLTISDLECADAATYFCQSYDGFNSAGFGGGTEVVVKR(配列番号101)。
AFELTQTPSSVEAAVGGTVTIKCQASQNIVTNLAWYQQKPGQPPKLLIYGASTLASGVSSRFKGSGSGTQFTLTISDLECADAATYFCQSYDGFNSAGFGGGTEVVVKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC(配列番号102)。
QSLEESGGRLVTPGTPLTLTCTASGFSLSGYDMSWVRQAPGKGLEYIGLISYDGNTYYATWAKGRFTISKTSTTVDLKITSPTTEDTATYFCARSLYAGPNAGIGPFNIWGQGTLVTVSS(配列番号103)。
QSLEESGGRLVTPGTPLTLTCTASGFSLSGYDMSWVRQAPGKGLEYIGLISYDGNTYYATWAKGRFTISKTSTTVDLKITSPTTEDTATYFCARSLYAGPNAGIGPFNIWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKRVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYASTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK(配列番号104)。
結合特異性を有する抗体の断片も任意で企図する。本発明の1つの実施形態では、本発明の抗体断片は、配列番号101または配列番号102のポリペプチド配列を含む、あるいはそのポリペプチド配列からなる。本発明の別の選択的な実施形態では、本発明の抗体断片は、配列番号103または配列番号104のポリペプチド配列を含む、あるいはそのポリペプチド配列からなる。
s)が含まれるが、これに限定されない。
AFQMTQSPSSLSASVGDRVTITCQASQNIVTNLAWYQQKPGKVPKLLIYGASTLASGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDVATYYCQSYDGFNSAGFGGGTKVEIKR(配列番号111)。
AFQMTQSPSSLSASVGDRVTITCQASQNIVTNLAWYQQKPGKVPKLLIYGASTLASGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDVATYYCQSYDGFNSAGFGGGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC(配列番号112)。
QVQLVESGGGVVQPGRSLRLSCAASGFSLSGYDMSWVRQAPGKGLEWVGLISYDGNTYYATSAKGRFTISRDNSKNTLYLQMSSLRAEDTAVYYCARSLYAGPNAGIGPFNIWGQGTLVTVSS(配列番号113)。
QVQLVESGGGVVQPGRSLRLSCAASGFSLSGYDMSWVRQAPGKGLEWVGLISYDGNTYYATSAKGRFTISRDNSKNTLYLQMSSLRAEDTAVYYCARSLYAGPNAGIGPFNIWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKRVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYASTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK(配列番号114)。
はAb12と同一の、もしくは重複するエピトープに結合する別のFab断片もしくは一価抗体断片を含む。本発明のこの選択的な実施形態は、NGFへの結合特異性を保持したままでの、前記Fab中の配列番号111および/または配列番号113への付加、欠失およびそれらの変異体をさらに企図する。
AAVLTQTPSPVSAAVGGTVSISCQSSQNVYKNNYLSWYQQKPGQPPKLLIYKASTLASGVPSRFKGGGSGTDFTLTISDVQCDAAATYYCAGGYTSSSDNAFGGGTEVVVKR(配列番号121)。
AAVLTQTPSPVSAAVGGTVSISCQSSQNVYKNNYLSWYQQKPGQPPKLLIYKASTLASGVPSRFKGGGSGTDFTLTISDVQCDAAATYYCAGGYTSSSDNAFGGGTEVVVKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC(配列番号122)。
QSVEASGGRLVTPGTPLTLTCTASGFSLSTYWMSWVRQAPGKGLEWIGDIYFSNEETNYASWAKGRFTISKTSTTVDLNVISPTTEDTATYFCARGSPDVDIGIDMWGPGTLVTVSS(配列番号123)。
する:
QSVEASGGRLVTPGTPLTLTCTASGFSLSTYWMSWVRQAPGKGLEWIGDIYFSNEETNYASWAKGRFTISKTSTTVDLNVISPTTEDTATYFCARGSPDVDIGIDMWGPGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKRVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYASTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK(配列番号124)。
列番号121の可変軽鎖領域;配列番号123の可変重鎖領域;配列番号121の可変軽鎖領域の相補性決定領域(配列番号125、配列番号126、および配列番号127);および配列番号123の可変重鎖領域の相補性決定領域(配列番号128、配列番号129、および配列番号130)。
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCQSSQNVYKNNYLSWYQQKPGKVPKLLIYKASTLASGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDVATYYCAGGYTSSSDNAFGGGTKVEIKR(配列番号131)。
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCQSSQNVYKNNYLSWYQQKPGKVPKLLIYKASTLASGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDVATYYCAGGYTSSSDNAFGGGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQS
GNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC(配列番号132)。
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTVSTYWMSWVRQAPGKGLEWVGDIYFSNEETNYASSAKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCARGSPDVDIGIDMWGPGTLVTVSS(配列番号133)。
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTVSTYWMSWVRQAPGKGLEWVGDIYFSNEETNYASSAKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCARGSPDVDIGIDMWGPGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKRVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYASTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK(配列番号134)。
上から任意でなる。
の抗体を包含する。1つの実施形態では、本発明は、NGFに対する結合特異性を有し、以下に示される配列を含む可変軽鎖配列を有する、疼痛および疼痛を伴う健康状態の治療または予防のためのキメラ抗体を包含する:
AAVLTQTPSPVSAAVGDTVTIKCQSSQSVYKNNYLSWYQQKPGQPPKLLIYDASNLPSGVPSRFSGSGSGTQFTLTISGVQCDDAATYYCLGDYDDDTDNGFGGGTEVVVKR(配列番号141)。
QSVEESGGRLVTPGTPLTLTCTVSGIDLSSYAMIWVRQAPGKGLEYIGIIWSGGTYYATWAKGRFTISKTSTTVDLQITSPTTEDAATYFCAAGGGSIYDVWGPGTLVTVSS(配列番号143)。
、あるいはそれらの組合せからなる。
よび他の酵母株における発現により作製され得る。適切なピキア属の種にはピキア・パストリス(Pichia pastoris)が含まれるが、これに限定されない。
ALVMTQTPSSTSEPVGGTVTINCQASQNIGNDLSWYQQKPGQPPELLIYSTSKLATGVPKRFSGSRSGTQFTLTISDLECDDAATYYCLGVYSYISDDGNAFGGGTEVVVKR(配列番号151)。
ALVMTQTPSSTSEPVGGTVTINCQASQNIGNDLSWYQQKPGQPPELLIYSTSKLATGVPKRFSGSRSGTQFTLTISDLECDDAATYYCLGVYSYISDDGNAFGGGTEVVVKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC(配列番号152)。
QSVEEFGGRLVTPGTPLTLTCTVSGFSLNNYAMTWVRQAPGKGLEWIGIIGSIGTTYYASWAKGRFFISKTSTTVDLKIISPTTEDTATYFCARDAGVTVDGYGYYFNIWGPGTLVTVSS(配列番号153)。
QSVEEFGGRLVTPGTPLTLTCTVSGFSLNNYAMTWVRQAPGKGLEWIGIIGSIGTTYYASWAKGRFFISKTSTTVDLKIISPTTEDTATYFCARDAGVTVDGYGYYFNIWGPGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKRVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYASTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPV
LDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK(配列番号154)。
)を含む、あるいはそのFab断片からなる。抗体Ab16に関して、Fab断片は、配列番号151の可変軽鎖配列および配列番号153の可変重鎖配列を含み、またはAb16と同一、もしくは重複するエピトープに結合する別のFab断片もしくは二価もしくは一価の抗体断片を含む。本発明のこの実施形態は、NGFへの結合特異性を保持したままでの、前記Fab中の配列番号151および/または配列番号153への付加、欠失およびそれらの変異体をさらに企図する。
AIEMTQTPFSVSAAVGGTVTIKCQASQTISNYLAWYQQKPGQPPKLLIYGASNLESGVPSRFKGSGSGTQFTLTISDLECDDAATYYCQQGYTISNVDNNVFGGGTEVVVKR(配列番号161)。
AIEMTQTPFSVSAAVGGTVTIKCQASQTISNYLAWYQQKPGQPPKLLIYGASNLESGVPSRFKGSGSGTQFTLTISDLECDDAATYYCQQGYTISNVDNNVFGGGTEVVVKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC(配列番号162)。
QSLEESGGRLVTPGGSLTLTCAASGFSLTGYNLVWVRQAPGKGLEWIGFISYGDTTYYASWAKGRFTISKTSTTVTLTITDLQPSDTGTYFCARETANTYDYGIWGPGTLVTVSS(配列番号163)。
QSLEESGGRLVTPGGSLTLTCAASGFSLTGYNLVWVRQAPGKGLEWIGFISYGDTTYYASWAKGRFTISKTSTTVTLTITDLQPSDTGTYFCARETANTYDYGIWGPGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKRVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYASTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK(配列番号164)。
伴う健康状態の治療または予防のための抗体断片も任意で企図する。本発明の1つの実施形態では、NGFに対する結合特異性を有する、疼痛および疼痛を伴う健康状態の治療または予防のための抗体の断片は、次の抗体断片のうちの1つ、2つ、3つ、または全てを含むそれより多くを包含する、あるいはそれらからなる:配列番号161の可変軽鎖領域;配列番号163の可変重鎖領域;配列番号161の可変軽鎖領域の相補性決定領域(配列番号165、配列番号166、および配列番号167);および配列番号163の可変重鎖領域の相補性決定領域(配列番号168、配列番号169、および配列番号170)。
DIQMTQSPSTLSASVGDRVTITCQASQTISNYLAWYQQKPGKAPKLLIYGASNLESGVPSRFSGSGSGTEFTLTISSLQPDDFATYYCQQGYTISNVDNNVFGGGTKVEIKR(配列番号171)。
抗体も任意で包含する:
DIQMTQSPSTLSASVGDRVTITCQASQTISNYLAWYQQKPGKAPKLLIYGASNLESGVPSRFSGSGSGTEFTLTISSLQPDDFATYYCQQGYTISNVDNNVFGGGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC(配列番号172)。
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTVSGYNLVWVRQAPGKGLEWVGFISYGDTTYYASSAKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCARETANTYDYGIWGQGTLVTVSS(配列番号173)。
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTVSGYNLVWVRQAPGKGLEWVGFISYGDTTYYASSAKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCARETANTYDYGIWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKRVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYASTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK(配列番号174)。
NSAIDもしくはオピオイド系鎮痛剤と共同で治療する方法を任意で企図し、その中で抗体は、NGFに対する結合特異性を有するキメラ抗体であって、その抗体が例えば、以下に示されるように、Ab19もしくはその断片であり、またはNGFのTrkAとの結合およびNGFのp75との結合を阻害する治療的有効量でAb19と同一、もしくは重複するエピトープに結合する別の抗体もしくは抗体断片を含む、その抗体を包含する。1つの実施形態では、本発明は、NGFに対する結合特異性を有し、以下に示される配列を含む可変軽鎖配列を有する、疼痛および疼痛を伴う健康状態の治療または予防のためのキメラ抗体を包含する:
AAVLTQTPSPVSAAVGGTVSISCQSSQNVYKNNYLSWYQQKPGQPPKLLIYKASTLASGVPSRFKGSGSGTDFTLTISDVQCDAAATYYCAGGYSSSSDNAFGGGTEVVVKR(配列番号181)。
AAVLTQTPSPVSAAVGGTVSISCQSSQNVYKNNYLSWYQQKPGQPPKLLIYKASTLASGVPSRFKGSGSGTDFTLTISDVQCDAAATYYCAGGYSSSSDNAFGGGTEVVVKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC(配列番号182)。
QSVEASGGRLVMPGGSLTLTCTASGFSLSTYWMSWVRQAPGKGLEWIGDIYFSNEETNYATWAKGRFTISKTSTTVDLNVISPTTEDTATYFCARGSPDVEIAIDMWGQGTLVTVSS(配列番号183)。
QSVEASGGRLVMPGGSLTLTCTASGFSLSTYWMSWVRQAPGKGLEWIGDIYFSNEETNYATWAKGRFTISKTSTTVDLNVISPTTEDTATYFCARGSPDVEIAIDMWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKRVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYASTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK(配列番号184)。
187のポリペプチド配列のうちの1つ以上、ならびに/または配列番号183の可変重鎖配列もしくは配列番号184の重鎖配列の相補性決定領域(CDR、すなわち超可変領域)に対応する配列番号188、配列番号189、および配列番号190のポリペプチド配列のうちの1つ以上、またはこれらのポリペプチド配列の組合せを含む抗体をさらに任意で企図する。本発明の別の実施形態では、疼痛および疼痛を伴う健康状態の治療または予防のための本発明の抗体またはその断片は、上記のCDRのうちの1つ以上、可変重鎖配列および可変軽鎖配列、ならびに重鎖配列および軽鎖配列の(全てを包含する)組合せを含む、あるいはそれらの組合せからなる。
の、前記Fab中の配列番号181および/または配列番号183への付加、欠失およびそれらの変異体をさらに企図する。
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCQSSQNVYKNNYLSWYQQKPGKVPKLLIYKASTLASGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDVATYYCAGGYTSSSDNAFGGGTKVEIKR(配列番号191)。
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCQSSQNVYKNNYLSWYQQKPGKVPKLLIYKASTLASGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDVATYYCAGGYTSSSDNAFGGGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC(配列番号192)。
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTVSTYWMSWVRQAPGKGLEWVGDIYFSNEETNYATSAKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCARGSPDVEIAIDMWGQGTLVTVSS(配列番号193)。
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTVSTYWMSWVRQA
PGKGLEWVGDIYFSNEETNYATSAKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCARGSPDVEIAIDMWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKRVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYASTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK(配列番号194)。
および配列番号193の可変重鎖領域の相補性決定領域(配列番号198、配列番号199、および配列番号200)。
DIQMTQSPSTLSASVGDRVTITCQASQSIYSNLAWYQQKPGKAPKLLIYDASTLESGVPSRFSGSGSGTEYTLTISSLQPDDFATYYCQQGFTVSDIDNAFGGGTKVEIKR(配列番号51)。
DIQMTQSPSTLSASVGDRVTITCQASQSIYSNLAWYQQKPGKAPKLLIYDASTLESGVPSRFSGSGSGTEYTLTISSLQPDDFATYYCQQGFTVSDIDNAFGGGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC(配列番号401)。
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTVSNYAVGWVRQAPGKGLEWVGIIGRNGNTWYASSARGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCARGYGRSVAYYVFNIWGPGTLVTVSS(配列番号53)。
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTVSNYAVGWVRQAPGKGLEWVGIIGRNGNTWYASSARGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCARGYGRSVAYYVFNIWGPGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDARVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYASTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK(配列番号402)。
予防のための、NGFに対する結合特異性を有する抗体の断片は、配列番号53の可変重鎖配列または配列番号402の重鎖配列の相補性決定領域(CDR、すなわち超可変領域)に対応する配列番号58、配列番号59、および配列番号60のポリペプチド配列のうちの1つ以上を含む、あるいはそれらのポリペプチド配列のうちの1つ以上からなる。
NSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC(配列番号405)。
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTVSNYAVGWVRQAPGKGLEWVGIIGRNGNTWYASSARGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCARGYGRSVAYYVFNIWGPGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDARVEPKSCDKTH(配列番号406)。
号53の可変重鎖領域の相補性決定領域(配列番号58、配列番号59、および配列番号60)。
DIQMTQSPSTLSASVGDRVTITCQASQSIYSNLAWYQQKPGKAPKLLIYDASTLESGVPSRFSGSGSGTEYTLTISSLQPDDFATYYCQQGFTVSDIDNAFGGGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC(配列番号407)。
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTVSNYAVGWVRQAPGKGLEWVGIIGRNGNTWYASSARGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCARGYGRSVAYYVFNIWGPGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDARVEPKSCDKTH(配列番号408)。
本発明の抗体断片は、配列番号53または配列番号408のポリペプチド配列を含む、あるいはそのポリペプチド配列からなる。
pastoris)が含まれるが、これに限定されない。本発明の1つの実施形態では、抗体断片Fab2は、本明細書の実施例に記載されるプロトコルを用いてピキア・パストリス(Pichia pastoris)における発現により作製され得る。
定常重鎖ポリペプチド配列をさらに含む:
u)、ガリウム‐67(67Ga)、イットリウム‐88(88Y)、イットリウム‐90(90Y)、ヨウ素‐125(125I)、ヨウ素‐131(131I)、サマリウム‐153(153Sm)、ルテチウム‐177(177Lu)、レニウム‐186(186Re)またはレニウム‐188(188Re)などのβ放射体、およびアスタチン‐211(211At)、鉛‐212(212Pb)、ビスマス‐212(212Bi)もしくは‐213(213Bi)またはアクチニウム‐225(225Ac)などのα放射体が含まれる。
u)、ガリウム‐67(67Ga)、イットリウム‐88(88Y)、イットリウム‐90(90Y)、ヨウ素‐125(125I)、ヨウ素‐131(131I)、サマリウム‐153(153Sm)、ルテチウム‐177(177Lu)、レニウム‐186(186Re)またはレニウム‐188(188Re)などのβ放射体、およびアスタチン‐211(211At)、鉛‐212(212Pb)、ビスマス‐212(212Bi)もしくは‐213(213Bi)またはアクチニウム‐225(225Ac)などのα放射体が含まれる。
書に記載されるCDR配列のいずれかによる本明細書に記載される他のCDR配列のうちのいずれかの置換により生じる抗体をさらに企図する。
ヌクレオチド配列からなる:
AGCCTCTCCCTGTCTCCGGGTAAATGA(配列番号204)。
hia pastoris)が含まれるが、これに限定されない。
号214)。
れない。
するポリヌクレオチドは、配列番号21の軽鎖可変配列または配列番号22の軽鎖配列の相補性決定領域(CDR、すなわち超可変領域)をコードするポリヌクレオチドに対応する配列番号225、配列番号226、および配列番号227のポリヌクレオチド配列のうちの1つ以上を含む、あるいはそれらのポリヌクレオチド配列のうちの1つ以上からなる。
CTGGTACATACTACGCGAGCAGTGCGAAAGGCCGATTCACCATCTCCAGAGACAATTCCAAGAACACCCTGTATCTTCAAATGAACAGCCTGAGAGCTGAGGACACTGCTGTGTATTACTGTGCTGGAGGTGGTGGTAGTATCTATGATATTTGGGGCCAAGGGACCCTCGTCACCGTCTCGAGC(配列番号233)。
はそれらのポリヌクレオチド配列のうちの1つ以上からなる。
のTrkAとの結合およびNGFのp75との結合を阻害する、その抗体Ab5ポリペプチドを作製するための以下に示されるポリヌクレオチドの使用をさらに任意で対象とする。本発明は、NGFに対する結合特異性を有する、疼痛および疼痛を伴う健康状態の治療または予防のための抗体ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドをさらに対象とする。本発明の1つの実施形態では、本発明のポリヌクレオチドは、配列番号41の可変軽鎖ポリペプチド配列をコードする次のポリヌクレオチド配列を含む、あるいはそのポリヌクレオチド配列からなる:
AGTCCGACAAGCGAGGACACGGCCACATATTTCTGTGCCAGAGGATATGGCCGTAGTGTTGCTTATTACGTCTTTAACATCTGGGGCCCAGGCACCCTCGTCACCGTCTCGAGC(配列番号243)。
用をさらに任意で対象とする。本発明は、NGFに対する結合特異性を有する、疼痛および疼痛を伴う健康状態の治療または予防のためのポリペプチドをコードするポリヌクレオチドをさらに対象とする。本発明の1つの実施形態では、本発明のポリヌクレオチドは、配列番号51の可変軽鎖ポリペプチド配列をコードする次のポリヌクレオチド配列を含む、あるいはそのポリヌクレオチド配列からなる:
CTTTAACATCTGGGGCCCAGGGACCCTCGTCACCGTCTCGAGC(配列番号253)。
び疼痛を伴う健康状態の治療または予防のための抗体ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドをさらに対象とする。本発明の1つの実施形態では、本発明のポリヌクレオチドは、配列番号61の可変軽鎖ポリペプチド配列をコードする次のポリヌクレオチド配列を含む、あるいはそのポリヌクレオチド配列からなる:
(配列番号263)。
よび疼痛を伴う健康状態の治療または予防のための抗体断片をコードするポリヌクレオチドは、配列番号63の重鎖可変配列または配列番号64の重鎖配列の相補性決定領域(CDR、すなわち超可変領域)をコードするポリヌクレオチドに対応する配列番号268、配列番号269、および配列番号270のポリヌクレオチド配列のうちの1つ以上を含む、あるいはそれらのポリヌクレオチド配列のうちの1つ以上からなる。
本発明は、NGFに対する結合特異性を有する抗体Ab8ポリペプチドであって、個体において疼痛を治療する方法であり、前記の個体に抗体Ab8ポリペプチドを投与することを含む方法においてNGFのTrkAとの結合およびNGFのp75との結合を阻害する、その抗体Ab8ポリペプチドを作製するための以下に示されるポリヌクレオチドの使用をさらに任意で対象とする。本発明は、NGFに対する結合特異性を有する、疼痛および疼痛を伴う健康状態の治療または予防のための抗体ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドをさらに任意で対象とする。本発明の1つの実施形態では、本発明のポリヌクレ
オチドは、配列番号71の可変軽鎖ポリペプチド配列をコードする次のポリヌクレオチド配列を含む、あるいはそのポリヌクレオチド配列からなる:
DR、すなわち超可変領域)をコードするポリヌクレオチドに対応する配列番号278、配列番号279、および配列番号280のポリヌクレオチド配列のうちの1つ以上を含む、あるいはそれらのポリヌクレオチド配列のうちの1つ以上からなる。
配列を含む、あるいはそのポリヌクレオチド配列からなる:
ヌクレオチド配列からなる:
CTGTAGGAGACAGAGTCACCATCACTTGCCAGGCCAGTGAGAACATTGGTAGCTACTTAGCCTGGTATCAGCAGAAACCAGGGAAAGTCCCTAAGCTCCTGATCTATAGGGCTTCCACTCTGGCATCTGGGGTCCCATCTCGTTTCAGTGGCAGTGGATCTGGGACAGATTTCACTCTCACCATCAGCAGCCTGCAGCCTGAAGATGTTGCAACTTATTACTGTCAACAGGGTTACAATAGTGAGAATCTTGATAATGCTTTCGGCGGAGGAACCAAGGTGGAAATCAAACGT(配列番号291)。
めの抗体断片をコードするポリヌクレオチド配列のうちの1つ以上を含むポリヌクレオチド配列も任意で企図する。本発明の1つの実施形態では、NGFに対する結合特異性を有する、疼痛および疼痛を伴う健康状態の治療または予防のための抗体断片をコードするポリヌクレオチド抗体断片をコードする次のポリヌクレオチドのうちの1つ、2つ、3つ、または全てを含むそれより多くを包含する、あるいはそれらからなる:配列番号91の軽鎖可変配列をコードする配列番号291のポリヌクレオチド;配列番号92の軽鎖配列をコードする配列番号292のポリヌクレオチド;配列番号93の重鎖可変配列をコードする配列番号293のポリヌクレオチド;配列番号94の重鎖配列をコードする配列番号294のポリヌクレオチド;配列番号91の軽鎖可変配列または配列番号92の軽鎖配列の相補性決定領域をコードするポリヌクレオチド(配列番号295、配列番号296、および配列番号297);および配列番号93の重鎖可変配列または配列番号94の重鎖配列の相補性決定領域をコードするポリヌクレオチド(配列番号298、配列番号299、および配列番号300)。
GGGCAGCCTCCCAAGCTCCTGATCTATGGTGCATCCACTCTGGCATCTGGGGTCTCATCGCGGTTCAAAGGCAGTGGATCTGGGACACAGTTCACTCTCACCATCAGCGACCTGGAGTGTGCCGATGCTGCCACTTATTTCTGTCAGAGCTATGATGGTTTTAATAGTGCTGGGTTCGGCGGAGGGACCGAGGTGGTGGTCAAACGT(配列番号301)。
CCTCAGTGGCTACGACATGAGCTGGGTCCGCCAGGCTCCAGGAAAGGGGCTGGAATACATCGGACTCATTAGTTATGATGGTAACACATACTACGCGACCTGGGCGAAAGGCCGATTCACCATCTCCAAAACCTCGACCACGGTGGATCTGAAAATCACCAGTCCGACAACCGAGGACACGGCCACCTATTTCTGTGCCAGAAGTCTTTATGCTGGTCCTAATGCTGGTATCGGACCGTTTAACATCTGGGGCCAGGGGACCCTCGTCACCGTCTCGAGCGCCTCCACCAAGGGCCCATCGGTCTTCCCCCTGGCAcCCTCCTCCaAGAGCACCTCTGGGGGCACAGCGGCCCTGGGCTGCCTGGTCAAGGACTACTTCCCCGAACCGGTGACGGTGTCGTGGAACTCAGGCGCCCTGACCAGCGGCGTGCACACCTTCCCGGCTGTCCTACAGTCCTCAGGACTCTACTCCCTCAGCAGCGTGGTGACCGTGCCCTCCAGCAGCTTGGGCACCCAGACCTACATCTGCAACGTGAATCACAAGCCCAGCAACACCAAGGTGGACAAGAGAGTTGAGCCCAAATCTTGTGACAAAACTCACACATGCCCACCGTGCCCAGCACCTGAACTCCTGGGGGGACCGTCAGTCTTCCTCTTCCCCCCAAAACCCAAGGACACCCTCATGATCTCCCGGACCCCTGAGGTCACATGCGTGGTGGTGGACGTGAGCCACGAAGACCCTGAGGTCAAGTTCAACTGGTACGTGGACGGCGTGGAGGTGCATAATGCCAAGACAAAGCCGCGGGAGGAGCAGTACGCCAGCACGTACCGTGTGGTCAGCGTCCTCACCGTCCTGCACCAGGACTGGCTGAATGGCAAGGAGTACAAGTGCAAGGTCTCCAACAAAGCCCTCCCAGCCCCCATCGAGAAAACCATCTCCAAAGCCAAAGGGCAGCCCCGAGAACCACAGGTGTACACCCTGCCCCCATCCCGGGAGGAGATGACCAAGAACCAGGTCAGCCTGACCTGCCTGGTCAAAGGCTTCTATCCCAGCGACATCGCCGTGGAGTGGGAGAGCAATGGGCAGCCGGAGAACAACTACAAGACCACGCCTCCCGTGCTGGACTCCGACGGCTCCTTCTTCCTCTACAGCAAGCTCACCGTGGACAAGAGCAGGTGGCAGCAGGGGAACGTCTTCTCATGCTCCGTGATGCATGAGGCTCTGCACAACCACTACACGCAGAAGAGCCTCTCCCTGTCTCCGGGTAAATGA(配列番号304)。
ド配列も任意で企図する。本発明の1つの実施形態では、NGFに対する結合特異性を有する、疼痛および疼痛を伴う健康状態の治療または予防のための抗体断片をコードするポリヌクレオチド抗体断片をコードする次のポリヌクレオチドのうちの1つ、2つ、3つ、または全てを含むそれより多くを包含する、あるいはそれらからなる:配列番号101の軽鎖可変配列をコードする配列番号301のポリヌクレオチド;配列番号102の軽鎖配列をコードする配列番号302のポリヌクレオチド;配列番号103の重鎖可変配列をコードする配列番号303のポリヌクレオチド;配列番号104の重鎖配列をコードする配列番号304のポリヌクレオチド;配列番号101の軽鎖可変配列または配列番号102の軽鎖配列の相補性決定領域をコードするポリヌクレオチド(配列番号305、配列番号306、および配列番号307);および配列番号103の重鎖可変配列または配列番号104の重鎖配列の相補性決定領域をコードするポリヌクレオチド(配列番号308、配列番号309、および配列番号310)。
TGGCATCTGGGGTCCCATCTCGTTTCAGTGGCAGTGGATCTGGGACAGATTTCACTCTCACCATCAGCAGCCTGCAGCCTGAAGATGTTGCAACTTATTACTGTCAGAGCTATGATGGTTTCAATAGTGCTGGTTTCGGCGGAGGAACCAAGGTGGAAATCAAACGT(配列番号311)。
CCAGGCAAGGGACTGGAGTGGGTGGGACTCATTAGTTATGATGGTAACACATACTACGCGACCTCCGCGAAAGGCCGATTCACCATCTCCAGAGACAATTCCAAGAACACGCTGTACCTGCAAATGTCTAGCCTGAGAGCCGAGGACACGGCTGTGTATTACTGTGCTAGAAGTCTTTATGCTGGTCCTAATGCTGGTATCGGACCGTTTAACATCTGGGGCCAAGGTACCCTCGTCACCGTCTCGAGCGCCTCCACCAAGGGCCCATCGGTCTTCCCCCTGGCACCCTCCTCCAAGAGCACCTCTGGGGGCACAGCGGCCCTGGGCTGCCTGGTCAAGGACTACTTCCCCGAACCGGTGACGGTGTCGTGGAACTCAGGCGCCCTGACCAGCGGCGTGCACACCTTCCCGGCTGTCCTACAGTCCTCAGGACTCTACTCCCTCAGCAGCGTGGTGACCGTGCCCTCCAGCAGCTTGGGCACCCAGACCTACATCTGCAACGTGAATCACAAGCCCAGCAACACCAAGGTGGACAAGAGAGTTGAGCCCAAATCTTGTGACAAAACTCACACATGCCCACCGTGCCCAGCACCTGAACTCCTGGGGGGACCGTCAGTCTTCCTCTTCCCCCCAAAACCCAAGGACACCCTCATGATCTCCCGGACCCCTGAGGTCACATGCGTGGTGGTGGACGTGAGCCACGAAGACCCTGAGGTCAAGTTCAACTGGTACGTGGACGGCGTGGAGGTGCATAATGCCAAGACAAAGCCGCGGGAGGAGCAGTACGCCAGCACGTACCGTGTGGTCAGCGTCCTCACCGTCCTGCACCAGGACTGGCTGAATGGCAAGGAGTACAAGTGCAAGGTCTCCAACAAAGCCCTCCCAGCCCCCATCGAGAAAACCATCTCCAAAGCCAAAGGGCAGCCCCGAGAACCACAGGTGTACACCCTGCCCCCATCCCGGGAGGAGATGACCAAGAACCAGGTCAGCCTGACCTGCCTGGTCAAAGGCTTCTATCCCAGCGACATCGCCGTGGAGTGGGAGAGCAATGGGCAGCCGGAGAACAACTACAAGACCACGCCTCCCGTGCTGGACTCCGACGGCTCCTTCTTCCTCTACAGCAAGCTCACCGTGGACAAGAGCAGGTGGCAGCAGGGGAACGTCTTCTCATGCTCCGTGATGCATGAGGCTCTGCACAACCACTACACGCAGAAGAGCCTCTCCCTGTCTCCGGGTAAATGA(配列番号314)。
する、疼痛および疼痛を伴う健康状態の治療または予防のための抗体断片をコードするポリヌクレオチド抗体断片をコードする次のポリヌクレオチドのうちの1つ、2つ、3つ、または全てを含むそれより多くを包含する、あるいはそれらからなる:配列番号111の軽鎖可変配列をコードする配列番号311のポリヌクレオチド;配列番号112の軽鎖配列をコードする配列番号312のポリヌクレオチド;配列番号113の重鎖可変配列をコードする配列番号313のポリヌクレオチド;配列番号114の重鎖配列をコードする配列番号314のポリヌクレオチド;配列番号111の軽鎖可変配列または配列番号112の軽鎖配列の相補性決定領域をコードするポリヌクレオチド(配列番号315、配列番号316、および配列番号317);および配列番号113の重鎖可変配列または配列番号114の重鎖配列の相補性決定領域をコードするポリヌクレオチド(配列番号318、配列番号319、および配列番号320)。
TGGATCTGGGACAGATTTCACTCTCACCATCAGCGACGTGCAGTGTGACGCTGCTGCCACTTACTACTGTGCAGGCGGTTATACCAGTAGTAGTGATAATGCTTTCGGCGGAGGGACCGAGGTGGTGGTCAAACGT(配列番号321)。
ATGAAGAAACAAACTACGCGAGCTGGGCGAAAGGCCGATTTACCATCTCCAAAACCTCGACCACGGTGGATCTGAATGTCATCAGTCCGACAACCGAGGACACGGCCACCTATTTCTGTGCCAGAGGTTCTCCTGATGTTGATATTGGTATAGATATGTGGGGCCCGGGCACCCTCGTCACCGTCTCGAGCGCCTCCACCAAGGGCCCATCGGTCTTCCCCCTGGCACCCTCCTCCAAGAGCACCTCTGGGGGCACAGCGGCCCTGGGCTGCCTGGTCAAGGACTACTTCCCCGAACCGGTGACGGTGTCGTGGAACTCAGGCGCCCTGACCAGCGGCGTGCACACCTTCCCGGCTGTCCTACAGTCCTCAGGACTCTACTCCCTCAGCAGCGTGGTGACCGTGCCCTCCAGCAGCTTGGGCACCCAGACCTACATCTGCAACGTGAATCACAAGCCCAGCAACACCAAGGTGGACAAGAGAGTTGAGCCCAAATCTTGTGACAAAACTCACACATGCCCACCGTGCCCAGCACCTGAACTCCTGGGGGGACCGTCAGTCTTCCTCTTCCCCCCAAAACCCAAGGACACCCTCATGATCTCCCGGACCCCTGAGGTCACATGCGTGGTGGTGGACGTGAGCCACGAAGACCCTGAGGTCAAGTTCAACTGGTACGTGGACGGCGTGGAGGTGCATAATGCCAAGACAAAGCCGCGGGAGGAGCAGTACGCCAGCACGTACCGTGTGGTCAGCGTCCTCACCGTCCTGCACCAGGACTGGCTGAATGGCAAGGAGTACAAGTGCAAGGTCTCCAACAAAGCCCTCCCAGCCCCCATCGAGAAAACCATCTCCAAAGCCAAAGGGCAGCCCCGAGAACCACAGGTGTACACCCTGCCCCCATCCCGGGAGGAGATGACCAAGAACCAGGTCAGCCTGACCTGCCTGGTCAAAGGCTTCTATCCCAGCGACATCGCCGTGGAGTGGGAGAGCAATGGGCAGCCGGAGAACAACTACAAGACCACGCCTCCCGTGCTGGACTCCGACGGCTCCTTCTTCCTCTACAGCAAGCTCACCGTGGACAAGAGCAGGTGGCAGCAGGGGAACGTCTTCTCATGCTCCGTGATGCATGAGGCTCTGCACAACCACTACACGCAGAAGAGCCTCTCCCTGTCTCCGGGTAAATGA(配列番号324)。
または全てを含むそれより多くを包含する、あるいはそれらからなる:配列番号121の軽鎖可変配列をコードする配列番号321のポリヌクレオチド;配列番号122の軽鎖配列をコードする配列番号322のポリヌクレオチド;配列番号123の重鎖可変配列をコードする配列番号323のポリヌクレオチド;配列番号124の重鎖配列をコードする配列番号324のポリヌクレオチド;配列番号121の軽鎖可変配列または配列番号122の軽鎖配列の相補性決定領域をコードするポリヌクレオチド(配列番号325、配列番号326、および配列番号327);および配列番号123の重鎖可変配列または配列番号124の重鎖配列の相補性決定領域をコードするポリヌクレオチド(配列番号328、配列番号329、および配列番号330)。
ATACCAGTAGTAGTGATAATGCTTTCGGCGGAGGAACCAAGGTGGAAATCAAACGT(配列番号331)。
CTTCAAATGAACAGCCTGAGAGCTGAGGACACTGCTGTGTATTACTGTGCTAGAGGTTCTCCTGATGTTGATATTGGTATAGATATGTGGGGCCCAGGGACCCTCGTCACCGTCTCGAGCGCCTCCACCAAGGGCCCATCGGTCTTCCCCCTGGCACCCTCCTCCAAGAGCACCTCTGGGGGCACAGCGGCCCTGGGCTGCCTGGTCAAGGACTACTTCCCCGAACCGGTGACGGTGTCGTGGAACTCAGGCGCCCTGACCAGCGGCGTGCACACCTTCCCGGCTGTCCTACAGTCCTCAGGACTCTACTCCCTCAGCAGCGTGGTGACCGTGCCCTCCAGCAGCTTGGGCACCCAGACCTACATCTGCAACGTGAATCACAAGCCCAGCAACACCAAGGTGGACAAGAGAGTTGAGCCCAAATCTTGTGACAAAACTCACACATGCCCACCGTGCCCAGCACCTGAACTCCTGGGGGGACCGTCAGTCTTCCTCTTCCCCCCAAAACCCAAGGACACCCTCATGATCTCCCGGACCCCTGAGGTCACATGCGTGGTGGTGGACGTGAGCCACGAAGACCCTGAGGTCAAGTTCAACTGGTACGTGGACGGCGTGGAGGTGCATAATGCCAAGACAAAGCCGCGGGAGGAGCAGTACGCCAGCACGTACCGTGTGGTCAGCGTCCTCACCGTCCTGCACCAGGACTGGCTGAATGGCAAGGAGTACAAGTGCAAGGTCTCCAACAAAGCCCTCCCAGCCCCCATCGAGAAAACCATCTCCAAAGCCAAAGGGCAGCCCCGAGAACCACAGGTGTACACCCTGCCCCCATCCCGGGAGGAGATGACCAAGAACCAGGTCAGCCTGACCTGCCTGGTCAAAGGCTTCTATCCCAGCGACATCGCCGTGGAGTGGGAGAGCAATGGGCAGCCGGAGAACAACTACAAGACCACGCCTCCCGTGCTGGACTCCGACGGCTCCTTCTTCCTCTACAGCAAGCTCACCGTGGACAAGAGCAGGTGGCAGCAGGGGAACGTCTTCTCATGCTCCGTGATGCATGAGGCTCTGCACAACCACTACACGCAGAAGAGCCTCTCCCTGTCTCCGGGTAAATGA(配列番号334)。
軽鎖可変配列をコードする配列番号331のポリヌクレオチド;配列番号132の軽鎖配列をコードする配列番号332のポリヌクレオチド;配列番号133の重鎖可変配列をコードする配列番号333のポリヌクレオチド;配列番号134の重鎖配列をコードする配列番号334のポリヌクレオチド;配列番号131の軽鎖可変配列または配列番号132の軽鎖配列の相補性決定領域をコードするポリヌクレオチド(配列番号335、配列番号336、および配列番号337);および配列番号133の重鎖可変配列または配列番号134の重鎖配列の相補性決定領域をコードするポリヌクレオチド(配列番号338、配列番号339、および配列番号340)。
GGTGGTGGTCAAACGT(配列番号341)。
GGTCACCGTCTCGAGCGCCTCCACCAAGGGCCCATCGGTCTTCCCCCTGGCACCCTCCTCCAAGAGCACCTCTGGGGGCACAGCGGCCCTGGGCTGCCTGGTCAAGGACTACTTCCCCGAACCGGTGACGGTGTCGTGGAACTCAGGCGCCCTGACCAGCGGCGTGCACACCTTCCCGGCTGTCCTACAGTCCTCAGGACTCTACTCCCTCAGCAGCGTGGTGACCGTGCCCTCCAGCAGCTTGGGCACCCAGACCTACATCTGCAACGTGAATCACAAGCCCAGCAACACCAAGGTGGACAAGAGAGTTGAGCCCAAATCTTGTGACAAAACTCACACATGCCCACCGTGCCCAGCACCTGAACTCCTGGGGGGACCGTCAGTCTTCCTCTTCCCCCCAAAACCCAAGGACACCCTCATGATCTCCCGGACCCCTGAGGTCACATGCGTGGTGGTGGACGTGAGCCACGAAGACCCTGAGGTCAAGTTCAACTGGTACGTGGACGGCGTGGAGGTGCATAATGCCAAGACAAAGCCGCGGGAGGAGCAGTACGCCAGCACGTACCGTGTGGTCAGCGTCCTCACCGTCCTGCACCAGGACTGGCTGAATGGCAAGGAGTACAAGTGCAAGGTCTCCAACAAAGCCCTCCCAGCCCCCATCGAGAAAACCATCTCCAAAGCCAAAGGGCAGCCCCGAGAACCACAGGTGTACACCCTGCCCCCATCCCGGGAGGAGATGACCAAGAACCAGGTCAGCCTGACCTGCCTGGTCAAAGGCTTCTATCCCAGCGACATCGCCGTGGAGTGGGAGAGCAATGGGCAGCCGGAGAACAACTACAAGACCACGCCTCCCGTGCTGGACTCCGACGGCTCCTTCTTCCTCTACAGCAAGCTCACCGTGGACAAGAGCAGGTGGCAGCAGGGGAACGTCTTCTCATGCTCCGTGATGCATGAGGCTCTGCACAACCACTACACGCAGAAGAGCCTCTCCCTGTCTCCGGGTAAATGA(配列番号344)。
344のポリヌクレオチド;配列番号141の軽鎖可変配列または配列番号142の軽鎖配列の相補性決定領域をコードするポリヌクレオチド(配列番号345、配列番号346、および配列番号347);および配列番号143の重鎖可変配列または配列番号144の重鎖配列の相補性決定領域をコードするポリヌクレオチド(配列番号348、配列番号349、および配列番号350)。
GCCTCCACCAAGGGCCCATCGGTCTTCCCCCTGGCACCCTCCTCCAAGAGCACCTCTGGGGGCACAGCGGCCCTGGGCTGCCTGGTCAAGGACTACTTCCCCGAACCGGTGACGGTGTCGTGGAACTCAGGCGCCCTGACCAGCGGCGTGCACACCTTCCCGGCTGTCCTACAGTCCTCAGGACTCTACTCCCTCAGCAGCGTGGTGACCGTGCCCTCCAGCAGCTTGGGCACCCAGACCTACATCTGCAACGTGAATCACAAGCCCAGCAACACCAAGGTGGACAAGAGAGTTGAGCCCAAATCTTGTGACAAAACTCACACATGCCCACCGTGCCCAGCACCTGAACTCCTGGGGGGACCGTCAGTCTTCCTCTTCCCCCCAAAACCCAAGGACACCCTCATGATCTCCCGGACCCCTGAGGTCACATGCGTGGTGGTGGACGTGAGCCACGAAGACCCTGAGGTCAAGTTCAACTGGTACGTGGACGGCGTGGAGGTGCATAATGCCAAGACAAAGCCGCGGGAGGAGCAGTACGCCAGCACGTACCGTGTGGTCAGCGTCCTCACCGTCCTGCACCAGGACTGGCTGAATGGCAAGGAGTACAAGTGCAAGGTCTCCAACAAAGCCCTCCCAGCCCCCATCGAGAAAACCATCTCCAAAGCCAAAGGGCAGCCCCGAGAACCACAGGTGTACACCCTGCCCCCATCCCGGGAGGAGATGACCAAGAACCAGGTCAGCCTGACCTGCCTGGTCAAAGGCTTCTATCCCAGCGACATCGCCGTGGAGTGGGAGAGCAATGGGCAGCCGGAGAACAACTACAAGACCACGCCTCCCGTGCTGGACTCCGACGGCTCCTTCTTCCTCTACAGCAAGCTCACCGTGGACAAGAGCAGGTGGCAGCAGGGGAACGTCTTCTCATGCTCCGTGATGCATGAGGCTCTGCACAACCACTACACGCAGAAGAGCCTCTCCCTGTCTCCGGGTAAATGA(配列番号354)。
354のポリヌクレオチド;配列番号151の軽鎖可変配列または配列番号152の軽鎖配列の相補性決定領域をコードするポリヌクレオチド(配列番号355、配列番号356、および配列番号357);および配列番号153の重鎖可変配列または配列番号154の重鎖配列の相補性決定領域をコードするポリヌクレオチド(配列番号358、配列番号359、および配列番号360)。
CTGGGGGCACAGCGGCCCTGGGCTGCCTGGTCAAGGACTACTTCCCCGAACCGGTGACGGTGTCGTGGAACTCAGGCGCCCTGACCAGCGGCGTGCACACCTTCCCGGCTGTCCTACAGTCCTCAGGACTCTACTCCCTCAGCAGCGTGGTGACCGTGCCCTCCAGCAGCTTGGGCACCCAGACCTACATCTGCAACGTGAATCACAAGCCCAGCAACACCAAGGTGGACAAGAGAGTTGAGCCCAAATCTTGTGACAAAACTCACACATGCCCACCGTGCCCAGCACCTGAACTCCTGGGGGGACCGTCAGTCTTCCTCTTCCCCCCAAAACCCAAGGACACCCTCATGATCTCCCGGACCCCTGAGGTCACATGCGTGGTGGTGGACGTGAGCCACGAAGACCCTGAGGTCAAGTTCAACTGGTACGTGGACGGCGTGGAGGTGCATAATGCCAAGACAAAGCCGCGGGAGGAGCAGTACGCCAGCACGTACCGTGTGGTCAGCGTCCTCACCGTCCTGCACCAGGACTGGCTGAATGGCAAGGAGTACAAGTGCAAGGTCTCCAACAAAGCCCTCCCAGCCCCCATCGAGAAAACCATCTCCAAAGCCAAAGGGCAGCCCCGAGAACCACAGGTGTACACCCTGCCCCCATCCCGGGAGGAGATGACCAAGAACCAGGTCAGCCTGACCTGCCTGGTCAAAGGCTTCTATCCCAGCGACATCGCCGTGGAGTGGGAGAGCAATGGGCAGCCGGAGAACAACTACAAGACCACGCCTCCCGTGCTGGACTCCGACGGCTCCTTCTTCCTCTACAGCAAGCTCACCGTGGACAAGAGCAGGTGGCAGCAGGGGAACGTCTTCTCATGCTCCGTGATGCATGAGGCTCTGCACAACCACTACACGCAGAAGAGCCTCTCCCTGTCTCCGGGTAAATGA(配列番号364)。
366、および配列番号367);および配列番号163の重鎖可変配列または配列番号164の重鎖配列の相補性決定領域をコードするポリヌクレオチド(配列番号368、配列番号369、および配列番号370)。
TCAGGCGCCCTGACCAGCGGCGTGCACACCTTCCCGGCTGTCCTACAGTCCTCAGGACTCTACTCCCTCAGCAGCGTGGTGACCGTGCCCTCCAGCAGCTTGGGCACCCAGACCTACATCTGCAACGTGAATCACAAGCCCAGCAACACCAAGGTGGACAAGAGAGTTGAGCCCAAATCTTGTGACAAAACTCACACATGCCCACCGTGCCCAGCACCTGAACTCCTGGGGGGACCGTCAGTCTTCCTCTTCCCCCCAAAACCCAAGGACACCCTCATGATCTCCCGGACCCCTGAGGTCACATGCGTGGTGGTGGACGTGAGCCACGAAGACCCTGAGGTCAAGTTCAACTGGTACGTGGACGGCGTGGAGGTGCATAATGCCAAGACAAAGCCGCGGGAGGAGCAGTACGCCAGCACGTACCGTGTGGTCAGCGTCCTCACCGTCCTGCACCAGGACTGGCTGAATGGCAAGGAGTACAAGTGCAAGGTCTCCAACAAAGCCCTCCCAGCCCCCATCGAGAAAACCATCTCCAAAGCCAAAGGGCAGCCCCGAGAACCACAGGTGTACACCCTGCCCCCATCCCGGGAGGAGATGACCAAGAACCAGGTCAGCCTGACCTGCCTGGTCAAAGGCTTCTATCCCAGCGACATCGCCGTGGAGTGGGAGAGCAATGGGCAGCCGGAGAACAACTACAAGACCACGCCTCCCGTGCTGGACTCCGACGGCTCCTTCTTCCTCTACAGCAAGCTCACCGTGGACAAGAGCAGGTGGCAGCAGGGGAACGTCTTCTCATGCTCCGTGATGCATGAGGCTCTGCACAACCACTACACGCAGAAGAGCCTCTCCCTGTCTCCGGGTAAATGA(配列番号374)。
78、配列番号379、および配列番号380)。
TACAGTCCTCAGGACTCTACTCCCTCAGCAGCGTGGTGACCGTGCCCTCCAGCAGCTTGGGCACCCAGACCTACATCTGCAACGTGAATCACAAGCCCAGCAACACCAAGGTGGACAAGAGAGTTGAGCCCAAATCTTGTGACAAAACTCACACATGCCCACCGTGCCCAGCACCTGAACTCCTGGGGGGACCGTCAGTCTTCCTCTTCCCCCCAAAACCCAAGGACACCCTCATGATCTCCCGGACCCCTGAGGTCACATGCGTGGTGGTGGACGTGAGCCACGAAGACCCTGAGGTCAAGTTCAACTGGTACGTGGACGGCGTGGAGGTGCATAATGCCAAGACAAAGCCGCGGGAGGAGCAGTACGCCAGCACGTACCGTGTGGTCAGCGTCCTCACCGTCCTGCACCAGGACTGGCTGAATGGCAAGGAGTACAAGTGCAAGGTCTCCAACAAAGCCCTCCCAGCCCCCATCGAGAAAACCATCTCCAAAGCCAAAGGGCAGCCCCGAGAACCACAGGTGTACACCCTGCCCCCATCCCGGGAGGAGATGACCAAGAACCAGGTCAGCCTGACCTGCCTGGTCAAAGGCTTCTATCCCAGCGACATCGCCGTGGAGTGGGAGAGCAATGGGCAGCCGGAGAACAACTACAAGACCACGCCTCCCGTGCTGGACTCCGACGGCTCCTTCTTCCTCTACAGCAAGCTCACCGTGGACAAGAGCAGGTGGCAGCAGGGGAACGTCTTCTCATGCTCCGTGATGCATGAGGCTCTGCACAACCACTACACGCAGAAGAGCCTCTCCCTGTCTCCGGGTAAATGA(配列番号384)。
GAATGTTTATAAGAACAACTACTTATCCTGGTATCAGCAGAAACCAGGGAAAGTCCCTAAGCTCCTGATCTATAAGGCATCCACTCTGGCATCTGGGGTCCCATCTCGTTTCAGTGGCAGTGGATCTGGGACAGATTTCACTCTCACCATCAGCAGCCTGCAGCCTGAAGATGTTGCAACTTATTACTGTGCAGGCGGTTATACCAGTAGTAGTGATAATGCTTTCGGCGGAGGAACCAAGGTGGAAATCAAACGTACGGTAGCGGCCCCATCTGTCTTCATCTTCCCGCCATCTGATGAGCAGTTGAAATCTGGAACTGCCTCTGTTGTGTGCCTGCTGAATAACTTCTATCCCAGAGAGGCCAAAGTACAGTGGAAGGTGGATAACGCCCTCCAATCGGGTAACTCCCAGGAGAGTGTCACAGAGCAGGACAGCAAGGACAGCACCTACAGCCTCAGCAGCACCCTGACGCTGAGCAAAGCAGACTACGAGAAACACAAAGTCTACGCCTGCGAAGTCACCCATCAGGGCCTGAGCTCGCCCGTCACAAAGAGCTTCAACAGGGGAGAGTGTTAG(配列番号392)。
TACATCTGCAACGTGAATCACAAGCCCAGCAACACCAAGGTGGACAAGAGAGTTGAGCCCAAATCTTGTGACAAAACTCACACATGCCCACCGTGCCCAGCACCTGAACTCCTGGGGGGACCGTCAGTCTTCCTCTTCCCCCCAAAACCCAAGGACACCCTCATGATCTCCCGGACCCCTGAGGTCACATGCGTGGTGGTGGACGTGAGCCACGAAGACCCTGAGGTCAAGTTCAACTGGTACGTGGACGGCGTGGAGGTGCATAATGCCAAGACAAAGCCGCGGGAGGAGCAGTACGCCAGCACGTACCGTGTGGTCAGCGTCCTCACCGTCCTGCACCAGGACTGGCTGAATGGCAAGGAGTACAAGTGCAAGGTCTCCAACAAAGCCCTCCCAGCCCCCATCGAGAAAACCATCTCCAAAGCCAAAGGGCAGCCCCGAGAACCACAGGTGTACACCCTGCCCCCATCCCGGGAGGAGATGACCAAGAACCAGGTCAGCCTGACCTGCCTGGTCAAAGGCTTCTATCCCAGCGACATCGCCGTGGAGTGGGAGAGCAATGGGCAGCCGGAGAACAACTACAAGACCACGCCTCCCGTGCTGGACTCCGACGGCTCCTTCTTCCTCTACAGCAAGCTCACCGTGGACAAGAGCAGGTGGCAGCAGGGGAACGTCTTCTCATGCTCCGTGATGCATGAGGCTCTGCACAACCACTACACGCAGAAGAGCCTCTCCCTGTCTCCGGGTAAATGA(配列番号394)。
GGAAAAGCCCCTAAGCTCCTGATCTATGATGCATCCACTCTGGAATCTGGAGTCCCATCAAGGTTCAGCGGCAGTGGATCTGGGACAGAGTACACTCTCACCATCAGCAGCCTGCAGCCTGATGATTTTGCAACTTACTACTGCCAACAGGGTTTTACTGTTAGTGATATTGATAATGCTTTCGGCGGAGGAACCAAGGTGGAAATCAAACGTACGGTAGCGGCCCCATCTGTCTTCATCTTCCCGCCATCTGATGAGCAGTTGAAATCTGGAACTGCCTCTGTTGTGTGCCTGCTGAATAACTTCTATCCCAGAGAGGCCAAAGTACAGTGGAAGGTGGATAACGCCCTCCAATCGGGTAACTCCCAGGAGAGTGTCACAGAGCAGGACAGCAAGGACAGCACCTACAGCCTCAGCAGCACCCTGACGCTGAGCAAAGCAGACTACGAGAAACACAAAGTCTACGCCTGCGAAGTCACCCATCAGGGCCTGAGCTCGCCCGTCACAAAGAGCTTCAACAGGGGAGAGTGTTAG(配列番号403)。
AGGTGGACGCGAGAGTTGAGCCCAAATCTTGTGACAAAACTCACACATGCCCACCGTGCCCAGCACCTGAACTCCTGGGGGGACCGTCAGTCTTCCTCTTCCCCCCAAAACCCAAGGACACCCTCATGATCTCCCGGACCCCTGAGGTCACATGCGTGGTGGTGGACGTGAGCCACGAAGACCCTGAGGTCAAGTTCAACTGGTACGTGGACGGCGTGGAGGTGCATAATGCCAAGACAAAGCCGCGGGAGGAGCAGTACGCCAGCACGTACCGTGTGGTCAGCGTCCTCACCGTCCTGCACCAGGACTGGCTGAATGGCAAGGAGTACAAGTGCAAGGTCTCCAACAAAGCCCTCCCAGCCCCCATCGAGAAAACCATCTCCAAAGCCAAAGGGCAGCCCCGAGAACCACAGGTGTACACCCTGCCCCCATCCCGGGAGGAGATGACCAAGAACCAGGTCAGCCTGACCTGCCTGGTCAAAGGCTTCTATCCCAGCGACATCGCCGTGGAGTGGGAGAGCAATGGGCAGCCGGAGAACAACTACAAGACCACGCCTCCCGTGCTGGACTCCGACGGCTCCTTCTTCCTCTACAGCAAGCTCACCGTGGACAAGAGCAGGTGGCAGCAGGGGAACGTCTTCTCATGCTCCGTGATGCATGAGGCTCTGCACAACCACTACACGCAGAAGAGCCTCTCCCTGTCTCCGGGTAAATGA(配列番号404)。
合特異性を有するFab断片(抗原結合断片)をコードするポリヌクレオチドを含む、あるいはそのポリヌクレオチドからなる。抗体Ab21に関して、全長のAb21抗体をコードするポリヌクレオチドは、配列番号401の軽鎖配列をコードする配列番号403のポリヌクレオチドおよび配列番号402の重鎖配列をコードする配列番号404のポリヌクレオチドを含む、あるいはそれらのポリヌクレオチドからなる。
59、および配列番号260)。
に結合するポリペプチド、または疼痛および疼痛を伴う健康状態の治療もしくは予防のための抗NGF抗体に由来する少なくとも1つのCDRポリペプチドを含むポリペプチドを発現する別のポリヌクレオチド配列と併せて発現すると、前記の発現したポリペプチドがNGFに特異的に結合する、前記の少なくとも1つのCDRが配列番号1、3、11、13、21、23、31、33、41、43、51、53、61、63、71、73、81、83、91、93、101、103、111、113、121、123、131、133、141、143、151、153、161、163、171、173、181、183、191、193、401または配列番号403のVLポリペプチドまたはVHポリペプチドに含まれるCDRから選択される、そのポリペプチドを発現する単離ポリヌクレオチドを任意で対象とする。
接種原を作製するため、二倍体ピキア・パストリス(P. pastoris)を、次の栄養素から構成される培地(パーセンテージは重量/体積として表される)を使用して増殖させた:酵母抽出物3%、無水ブドウ糖2%、YNB1.34%、ビオチン0.004%および100mMリン酸カリウム(pH6.0)。ランL355、L357、L358、L359およびL360のための接種原培地は次の栄養素(パーセンテージは重量/体積として表される)から構成された:酵母抽出物3%、グリセロール2%、YNB1.34%、ビオチン0.004%、200mMリン酸カリウム(pH6.0)。その接種原を30℃と300rpmの浸透培養器で約24時間〜29時間増殖させた。その後、10%の接種原を、1Lの無菌成長培地を含む、2.5Lの作業体積を有するLabfors2.5L容器に添加した。成長培地は次の栄養素から構成された:硫酸カリウム18.2g/L、第一リン酸アンモニウム36.4g/L、リン酸水素二カリウム12.8g/L、硫酸マグネシウム七水和物3.72g/L、クエン酸ナトリウム二水和物10g/L、グリセロール40g/L、酵母抽出物30g/L、PTM1微量金属4.35mL/L、および消泡剤204 1.67mL/L。PTM1微量金属溶液は次の成分から構成された:硫酸銅六水和物6g/L、ヨウ化ナトリウム0.08g/L、硫酸マンガン一水和物3g/L、モリブデン酸ナトリウム二水和物0.2g/L、ホウ酸0.02g/L、塩化
コバルト0.5g/L、塩化亜鉛20g/L、硫酸(第一)鉄七水和物65g/L、ビオチン0.2g/L、および硫酸5mL/L。酵母株は、挿入された4ゲノムコピーの重鎖コード配列(配列番号441)および3コピーの軽鎖コード配列(配列番号440)からAb‐A抗体を発現するように操作された。重鎖遺伝子コピーはpGAP遺伝子座(3コピー)とHIS4 TT遺伝子座(1コピー)に挿入され、3コピーの軽鎖遺伝子はpGAP遺伝子座に挿入された。抗体鎖遺伝子コピーはそれぞれGAPプロモーターの制御下にある。バイオリアクター工程管理パラメータは次のように設定された:撹拌1000rpm、エアフロー1.35標準リットル/分、温度28℃およびpHは水酸化アンモニウムを使用して(6に)制御された。酸素補給は提供されなかった。
(登録商標)LDS試料緩衝液を使用して(全てInvitrogen社、カールスバード、カリフォルニア州より)、製造業者の使用説明書に従って実行された。その後、タンパク質をクマシーブルー染色により可視化した。還元試料は、試料が負荷前にNuPAGE(登録商標)試料還元剤(Invitrogen社、カールスバード、カリフォルニア州)を使用して、製造業者の使用説明書に従って還元されたことを除いて同様に処理された。
培養中のエタノールのボーラス添加の抗体純度への効果を判定するため、抗体Ab‐Aが、増殖期の末期および生産期の前に1%(10g/L)の終濃度までエタノールをボーラス投与して、または投与せずに酵母培養物から生産された。生産期は97時間(図1)、87時間(図2)、または86時間(図3)続いた。次に、各培養物により生産された抗体は培地から回収され、プロテインA親和性クロマトグラフィーにより精製された。
抗体Ab‐BおよびAb‐Cは、実施例1で説明された方法を用いて組換え技術で生産された。抗体Ab‐Cは、4コピーの重鎖コード配列(配列番号439)と3コピーの軽鎖コード配列(配列番号438)を含むように操作されている酵母株から発現した。試料をリアクターから回収し、抗体を含む培養上清をAb‐B抗体については総計で67時間(T67)または87時間(T87)の発酵時間、およびAb‐C抗体については総計で86時間(T86)の発酵時間の後に収集し、プロテインA親和性により精製し、そして、実施例1において説明されているようにSDS‐PAGEにより分析した。
抗体Ab‐B(図4)およびAb‐C(図5)が、増殖期の末期および生産期の前に1%の終濃度までエタノールをボーラス投与して、または投与せずに生産された。エタノールをボーラス添加せずに生産された抗体では、H1L1種すなわち半抗体種、およびH2L1種はそれぞれ顕著なバンドとして観察された(図4Aのライン6および7、図4Cのレーン6および7、図5Aのレーン5および6)。これらのバンドの強度は、エタノールのボーラス添加を用いて生産された培養物では非常に減少した(図4Aのレーン2〜3、図4Cのレーン2〜3、図5Aのレーン3)。還元条件下では、H1L1のバンドとH2L1のバンドは個々の重鎖および軽鎖に分離され、これらの種の正体は全長型の重鎖および軽鎖から構成されるものと確認された(図4B、4D、および5B;レーンの順序はそれぞれ図4A、4D、および5Aと同一である)。
組換え抗体Ab‐A、Ab‐B、およびAb‐Cが、実施例1および2において説明されているようにピキア・パストリス(P. pastoris)培養物から調製および精製された。抗体が、増殖期の末期および生産期の前に1(重量/体積)%の終濃度までエタノールをボーラス投与して、または投与せずに生産された。プロテインA精製した抗体調製物の純度を分析するため、サイズ排除高速液体クロマトグラフィー(SE‐HPLC)を用いた。簡単に説明すると、UV検出器付きのAgilent社(サンタクララ、カリフォルニア州)1200シリーズHPLCを使用した。試料の分離のため、東ソーバイオサイエンス社(キング・オブ・プロシア、ペンシルバニア州)のTSKゲルガードSWXL 6x40mmに連結されているTSKゲル3000SWXL 7.8x300mmカラムを使用した。100mMリン酸ナトリウム、200mM塩化ナトリウムpH6.5の溶液を0.5mL/minの流速の均一濃度モードで移動相として使用し、そして、UV215nmの吸光度をモニターした。試料の注入の前に、安定的な基線が達成されるまでカラムを平衡化した。移動相を用いて試料を1mg/mLの濃度にまで希釈し、そして、30μLの体積の試料を注入した。カラム性能をモニターするため、BioRad社(ハーキュリーズ、カリフォルニア州)ゲル濾過標準物質を使用した。
実施例1に記載されるAb‐A抗体調製物および同じ方法を用いて生産された他の調製物が酵母において発現し、プロテインA親和性により精製され、その後、純度がサイズ排除クロマトグラフィー(SEC)を用いて分析された。使用した条件下では、半抗体(H1L1)種は完全型抗体と共溶出し、このことは半抗体の対の間での非共有結合に起因すると考えられる。しかしながら、この方法は他の生産物関連変異体の純度を評価することができ、そのような複合体は異常な化学量論組成、断片、グリコシル化形態、および凝集体を有する。
マススペクトロメトリーが、様々な試料における、重鎖間ジスルフィド結合(通常、アミノ酸220と223に見出される)を欠く重鎖の相対量を検出するために使用された。
エッペンドルフチューブに250μgの各試料を添加した。適切な量(約450μL)の変性緩衝液(6Mグアニジン塩酸、1mM EDTA、0.25Mトリス、pH7.5)をそのチューブに添加して500μLの最終体積と0.5mg/mLの試料濃度を得た。各試料に20.5μLの2Mヨードアセトアミドを添加してあらゆる遊離システインをアルキル化した。その試料をボルテックスで混合し、その後、暗所で30±5分間室温で保温した。その後、消化緩衝液(0.1Mトリス塩酸、pH7.5)で平衡化してあったNAP‐5カラムを使用して試料を脱塩した。各試料溶液を別々の(平衡化してあった)カラムに添加し、カラムのベッドに進入させた。各カラムに1mLの消化緩衝液を添加し、溶出物をエッペンドルフチューブに収集した。約50μgの物質を含む等量のアリコットに試料を分割した(5つの200μLのアリコット)。アルキル化され、脱塩化されたアリコットは必要になるまで−20℃で保管された。各試料(アルキル化および脱塩化)の1つのアリコットをそれぞれの消化に使用した。それぞれの試料アリコットに0.5mg/mLのトリプシン溶液を、1:25(重量:重量)というトリプシン:タンパク質の比率で添加した(4μL)。全てのトリプシンチューブを37±2℃で4時間保温した。保温後、1μLのトリフルオロ酢酸を各チューブに添加して酵素消化を停止した。その後、試料を等量で2部に分割し、還元化および非還元化した。試料の半分は1MのDTTの存在下、37±2℃で1時間還元化された。還元化試料と非還元化試料の両方の内容物をHPLCバイアルに移し、分析のためにオートサンプラーに設置した。
上で論じた観察に基づき、申請者らは、75kDaのバンドはジスルフィド結合を介して互いに共有結合している1本の抗体重鎖と1本の抗体軽鎖を含む「半抗体」種であって、半抗体複合体の対が非共有結合して、完全型抗体(2本の重鎖と2本の軽鎖)と同じ化学量論組成を有するが、2本の重鎖の間にジスルフィド結合を欠く(「非結合重鎖」)複合体を形成することができると仮説を立てた。その仮説に基づき、75kDaのバンドの相対量は非結合重鎖の相対的な割合と相関すると予測され、その割合がトリプシン消化抗体試料のマススペクトロメトリー分析を用いて決定された。
培養生存率はCellometer(Nexcelom社)を使用して決定された。培養試料はPBSで希釈され、最終細胞数が1×107〜5×107細胞/mLの範囲内になる。次にその試料の半分をヨウ化プロピジウム(PI)染色の陽性対照として75℃、10分間の加熱条件で処理した。その後、非処理試料と処理試料をPIと混合した(20μLの試料に20μLのPIを加えた)。次に試料をスライドカセットに乗せ、蛍光を発しない細胞の数を数え、そして細胞の総数で除算することにより生存率を決定した。死んでいる細胞はヨウ化プロピジウムを取り込んでおり、蛍光を発しているので、陽性対照加熱殺滅試料は1%未満の細胞が生きていることを示すだろう。
細胞生存率が、実施例1および2に記載されるようにエタノールをボーラス添加して、またはボーラス添加せずに増殖された抗体産生培養物について決定された。上で説明されているように、Ab‐A抗体とAb‐B抗体の純度は酵母培養物へのエタノールのボーラス添加により大幅に改善した(実施例1〜2および図1〜4を参照のこと)。エタノールのボーラス添加はこれらの培養物の細胞生存率も改善した。Ab‐A抗体について生存率は平均して91.9%から97.2%まで改善し(図11)、一方、Ab‐B抗体について生存率は平均して84.8%から95.1%まで改善した(図12)。Ab‐C抗体はエタノールをボーラス添加しなくとも既に高純度であるため、エタノールのボーラス添加の結果生じるこの抗体の純度の改善はより控えめであった(実施例3および図5を参照のこと)。高細胞生存率がより高い抗体純度と相関したという観察と一致して、Ab‐C抗体培養物はエタノールのボーラス添加無しで高い細胞生存率(平均して95.8%)を示し、細胞生存率はエタノールのボーラス添加によってほとんど変化しなかった(96.8%)。
Ab‐A抗体が、エタノールのボーラス添加が5g/L(0.5(重量/体積)%)、10g/L(1(重量/体積)%)、または15g/L(1.5(重量/体積)%)であったことを除いて、実施例1で行われたように生産された。抗体試料は63時間と86時間で培地から精製され、プロテインA親和性により精製され、その後、純度が、実施例1で行われたように非還元SDS‐PAGEにより分析された。
抗体純度は、添加されたボーラス濃度(0.5(重量/体積)%と1.5(重量/体積)%の間)と無関係に、試験した両方の時点である63時間(図14A)と86時間(図14B)で同様に高かった。H1L1種とH2L1種の検出レベルは各培養物で同様に低かった。
Ab‐A抗体が、飢餓期の持続時間、すなわち、溶存酸素スパイク(培養物中の炭素源の消耗を示す)とエタノールのボーラス添加の間の時間が0時間か3時間のどちらかであったことを除いて、実施例1で行われたように生産された。抗体試料が培地から精製され、プロテインA親和性により精製され、その後、純度が、実施例1で行われたように非還元SDS‐PAGEにより分析された。
抗体純度は0時間と3時間の間の飢餓期の変化に無関係に同様に高かった(図15A、レーン5(0時間の飢餓)およびレーン6(3時間の飢餓)を比較されたい)。H1L1種とH2L1種の検出レベルは各培養物で同様に低かった。
Ab‐B抗体が、平衡化期間の持続時間、すなわち、エタノールのボーラス添加と培養物への供給物の添加の開始の間の時間が0分、30分、または60分であったことを除いて、実施例2で行われたように生産された。さらに、Ab‐B抗体を生産する酵母株は、4コピーの代わりに3コピーの軽鎖遺伝子を含有した。抗体試料が培地から精製され、プロテインA親和性により精製され、その後、純度が、実施例1で行われたように非還元SDS‐PAGEにより分析された。生存率も、実施例5において記載される方法を用いて
評価された。
抗体純度は0分または30分の平衡化期間では同様に高かった(図16Aのレーン7およびレーン8(0分の平衡化時間)およびレーン3(30分の平衡化時間))。しかしながら、H1L1種とH2L1種の検出レベルは60分の平衡化期間を有する培養物で上昇した(図16A、レーン5および6)。
照により本明細書に組み込まれる。
一態様において、本発明は以下であってもよい。
[態様1] マルチサブユニット複合体を生産する方法であって、
(a)前記のマルチサブユニット複合体のサブユニットの発現をもたらす遺伝子を含む真核細胞を含む培養物を提供すること、
(b)前記の培養物に大量のエタノールを急速に添加すること、および
(c)前記の培養物を培養して前記のマルチサブユニット複合体を生産すること、を含む前記方法。
[態様2] 前記のエタノールの急速大量投与が無い状態で行われる前記の同じ方法と比べて、前記のエタノールの急速大量投与が安定的なジスルフィド結合の形成を増強する、態様1に記載の方法。
[態様3] 前記のマルチサブユニット複合体が、少なくとも1つのジスルフィド結合を含む1つ以上のポリペプチドを含有する、態様1に記載の方法。
[態様4] 前記のマルチサブユニット複合体が抗体を含む、態様1に記載の方法。
[態様5] 前記のエタノールの急速大量投与が無い状態で行われる前記の同じ方法と比べて、1つ以上の生産物関連変異体の相対量を減少させる、態様1〜4のいずれか1項に記載の方法。
[態様6] 前記のエタノールの急速大量投与が無い状態で行われる前記の同じ方法と比べて、サイズ排除クロマトグラフィーまたはゲル電気泳動によって検出される見かけの分子量が前記の所望のマルチサブユニット複合体よりも大きい、または小さい生産物関連変異体の相対量を減少させる、態様1〜4のいずれか1項に記載の方法。
[態様7] 前記のエタノールの急速大量投与が無い状態で行われる前記の同じ方法と比べて、異常な化学量論組成を有する複合体の相対量を減少させる、態様1〜4のいずれか1項に記載の方法。
[態様8] 前記のエタノールの急速大量投与が無い状態で行われる前記の同じ方法と比べて、異常なジスルフィド結合を有する複合体の相対量を減少させる、態様1〜4のいずれか1項に記載の方法。
[態様9] 前記のエタノールの急速大量投与が無い状態で行われる前記の同じ方法と比べて、還元化システインを有する複合体の相対量を減少させる、態様1〜4のいずれか1項に記載の方法。
[態様10] 前記のエタノールの急速大量投与が無い状態で行われる前記の同じ方法と比べて、異常なグリコシル化を有する複合体の相対量を減少させる、態様1〜4のいずれか1項に記載の方法。
[態様11] 重鎖間ジスルフィド結合の形成または安定性を調節する、態様4に記載の方法。
[態様12] 軽鎖および重鎖を連結するジスルフィド結合の形成または安定性を調節する、態様4または11に記載の方法。
[態様13] 前記のエタノールの急速大量投与が無い状態で行われる前記の同じ方法と比べて、1つ以上の生産物関連変異体の相対量を減少させる、態様4または11〜12のいずれか1項に記載の方法。
[態様14] 前記の生産物関連変異体がH1L1生産物関連変異体、H2L1生産物関連変異体およびH4L4生産物関連変異体のうちの1つ以上を含む、態様13に記載の方法。
[態様15] 前記のエタノールの急速大量投与が無い状態で行われる前記の方法と比べて、前記の抗体の純度を上昇させる、態様4または11〜14のいずれか1項に記載の方法。
[態様16] ステップ(c)の前にステップ(b)が行われる、前述の態様のいずれか1項に記載の方法。
[態様17] ステップ(c)の後にステップ(b)が行われる、態様1〜15のいずれか1項に記載の方法。
[態様18] ステップ(c)と同時にステップ(b)が行われる、態様1〜15のいずれか1項に記載の方法。
[態様19] ステップ(b)により、前記の培養物中のエタノールの濃度が約0.01%(重量/体積)と約4%(重量/体積)の間になる、前述の態様のいずれか1項に記載の方法。
[態様20] ステップ(b)により、前記の培養物中のエタノールの濃度が約0.01%と約4%の間、約0.02%と約3.75%の間、約0.04%と約3.5%の間、約0.08%と約3.25%の間、約0.1%と約3%の間、約0.2%と約2.75%の間、約0.3%と約2.5%の間、約0.4%と約2.25%の間、約0.5%と約1.5%の間、約0.5%と約2%の間、約0.6%と約1.75%の間、約0.7%と約1.5%の間、または約0.8%と約1.25%の間になる、前述の態様のいずれか1項に記載の方法。
[態様21] ステップ(b)により、前記の培養物中のエタノールの濃度が少なくとも約0.01%、0.02%、0.03%、0.04%、0.05%、0.06%、0.07%、0.08%、0.09%、0.10%、0.2%、0.3%、0.4%、0.6%、0.6%、0.7%、0.8%または0.9%(重量/体積)になる、前述の態様のいずれか1項に記載の方法。
[態様22] ステップ(b)により、前記の培養物中のエタノールの濃度が多くても約4%、3.5%、3%、2.5%、2%、1.8%、1.6%、1.5%、1.4%、1.3%、1.2%、1.1%、1.0%、0.9%、0.8%、0.7%、0.6%、0.5%、0.4%、0.35%、0.3%、0.25%、0.2%、または0.15%(重量/体積)になる、前述の態様のいずれか1項に記載の方法。
[態様23] ステップ(b)が前記の培養物にエタノールを添加すること、前記の培養物にエタノールを含む担体を添加すること、エタノールを含む培地もしくは担体に前記の細胞を添加すること、または培地の一部を置き換えることを含む、前述の態様のいずれか1項に記載の方法。
[態様24] 前記の大量のエタノールが1分と20分の間の期間にわたって前記の培地に急速添加される、前述の態様のいずれか1項に記載の方法。
[態様25] ステップ(c)が前記の細胞に酸素を供給することを含む、前述の態様のいずれか1項に記載の方法。
[態様26] 前記の酸素の供給が前記の培養物を撹拌することを含む、態様25に記載の方法。
[態様27] 前記の酸素の供給が酸素を含むガス混合物と前記の培養物を接触させることを含む、態様25または26に記載の方法。
[態様28] ステップ(c)が炭素源を含む供給物を前記の培養物に添加することを含む、前述の態様のいずれか1項に記載の方法。
[態様29] 前記の供給物が少なくとも1つの発酵可能な炭素源を含む、態様28に記載の方法。
[態様30] 前記の供給物が、グルコース、エタノール、シトレート、ソルビトール、キシロース、トレハロース、アラビノース、ガラクトース、フルクトース、メリビオース、ラクトース、マルトース、ラムノース、リボース、マンノース、マンニトール、およびラフィノースのうちの1つ以上を含む、態様28に記載の方法。
[態様31] ステップ(c)の間に前記のエタノールの濃度を上限の設定値と下限の設定値の間に維持することをさらに含む、前述の態様のいずれか1項に記載の方法。
[態様32] 前記の下限の設定値が約0.01%、0.02%、0.03%、0.04%、0.05%、0.06%、0.07%、0.08%、0.09%、0.10%、0.2%、0.3%、0.4%、0.6%、0.6%、0.7%、0.8%、または0.9%(重量/体積)である、態様31に記載の方法。
[態様33] 前記の上限の設定値が約4%、3.5%、3%、2.5%、2%、1.8%、1.6%、1.5%、1.4%、1.3%、1.2%、1.1%、1.0%、0.9%、0.8%、0.7%、0.6%、0.5%、0.4%、0.35%、0.3%、0.25%、0.2%、または0.15%(重量/体積)である、態様31または32に記載の方法。
[態様34] 前記の上限の設定値が多くても約1.5%、1.4%、1.3、1.2%、または1.1%(重量/体積)である、態様31または32に記載の方法。
[態様35] ステップ(c)の間に前記のエタノールの濃度を設定値に維持することをさらに含む、態様1〜30のいずれか1項に記載の方法。
[態様36] 前記の設定値が約0.1%、0.2%、0.3%、0.4%、0.5%、0.6%、0.7%、0.8%、0.9%、01.%、01.1%、01.2%、01.3%、01.4%、または01.5%(重量/体積)である、態様35に記載の方法。
[態様37] ステップ(c)が前記の培養物中のエタノールの濃度を約0.01%と約4%の間、約0.02%と約3.75%の間、約0.04%と約3.5%の間、約0.08%と約3.25%の間、約0.1%と約3%の間、約0.2%と約2.75%の間、約0.3%と約2.5%の間、約0.4%と約2.25%の間、約0.5%と約2%の間、約0.6%と約1.75%の間、約0.7%と約1.5%の間、または約0.8%と約1.25%の間に維持することを含む、態様1〜30のいずれか1項に記載の方法。
[態様38] 前記の培養物中のエタノールの濃度が前記の細胞によるエタノールの生産を制御することにより、または前記の培養物へのエタノールの添加により維持される、態様21〜27のいずれか1項に記載の方法。
[態様39] エタノールの生産を制御するステップが、グルコースの濃度、酸素の利用可能性、撹拌の強度、ガス圧、供給される空気または他のガス混合物の流速、培養物の粘度、培養物の密度、供給される空気または他のガス混合物の酸素濃度、および温度のうちの1つ以上を制御することを含む、態様28に記載の方法。
[態様40] ステップ(a)とステップ(b)の間の時間が約72時間未満、約48時間未満、約24時間未満、約12時間未満、約9時間未満、約6時間未満、約5時間未満、約4時間未満、約3時間未満、約90分未満、約30分未満、約5分未満、または約1分未満である、前述の態様のいずれか1項に記載の方法。
[態様41] ステップ(b)とステップ(c)の間の時間が約10時間未満、約9時間未満、約8時間未満、約7時間未満、約6時間未満、約5時間未満、約4時間未満、約3時間未満、約2時間未満、約90分未満、約80分未満、約70分未満、約60分未満、約50分未満、約40分未満、約30分未満、約20分未満、約10分未満、約5分未満、または約1分未満である、前述の態様のいずれか1項に記載の方法。
[態様42] ステップ(a)の培養物が、前記の培養物に炭素源を添加すること、および前記の炭素源を消尽するまで前記の培養物を培養することにより生産される、前述の態様のいずれか1項に記載の方法。
[態様43] 前記の炭素源が、グリセロール、グルコース、エタノール、シトレート、ソルビトール、キシロース、トレハロース、アラビノース、ガラクトース、フルクトース、メリビオース、ラクトース、マルトース、ラムノース、リボース、マンノース、マンニトール、およびラフィノースのうちの1つ以上を含む、態様42に記載の方法。
[態様44] 前記の炭素源の消尽が前記の真核細胞の代謝活性の低下を検出することにより決定される、態様42または43に記載の方法。
[態様45] 前記の真核細胞の代謝活性の前記の低下が、前記の真核細胞による酸素消費の減少を検出することにより、前記の培養物におけるpHの上昇を検出することにより、前記の細胞の湿潤質量の安定化を検出することにより、または前記の培養物におけるアンモニアの濃度の上昇を検出することにより確認される、態様44に記載の方法。
[態様46] 前記の真核細胞による酸素消費の前記の減少が、前記の培養物中の溶存酸素の濃度の上昇を検出することにより確認される、態様45に記載の方法。
[態様47] 前記の真核細胞が酵母細胞を含む、前述の態様のいずれか1項に記載の方法。
[態様48] 前記の酵母細胞がメチロトローフ酵母を含む、態様47に記載の方法。
[態様49] 前記のメチロトローフ酵母がピキア属のメチロトローフ酵母である、態様48に記載の方法。
[態様50] 前記のピキア属のメチロトローフ酵母がピキア・パストリス(Pichia pastoris)である、態様49に記載の方法。
[態様51] 前記のピキア属のメチロトローフ酵母が、ピキア・アングスタ(Pichia angusta)、ピキア・グイレルモルディイ(Pichia guillermordii)、ピキア・メタノリカ(Pichia methanolica)、およびピキア・イノシトベラ(Pichia inositovera)からなる群より選択される、態様49に記載の方法。
[態様52] 前記のマルチサブユニット複合体の発現をもたらす前記の遺伝子が1つ以上のゲノム遺伝子座に組み込まれる、態様49に記載の方法。
[態様53] 前記のゲノム遺伝子座のうちの少なくとも1つが、pGAP遺伝子座、3’AOX TT遺伝子座、PpURA5遺伝子座、OCH1遺伝子座、AOX1遺伝子座、HIS4遺伝子座、GAP遺伝子座、pGAP遺伝子座、3’AOX TT遺伝子座、ARG遺伝子座、およびHIS4 TT遺伝子座からなる群より選択される、態様49に記載の方法。
[態様54] 前記のマルチサブユニット複合体のサブユニットをコードする遺伝子のうちの少なくとも1つが、誘導性プロモーターまたは構成的プロモーターの制御下で発現する、前述の態様のいずれか1項に記載の方法。
[態様55] 前記の誘導性プロモーターが、AOX1プロモーター、CUP1プロモーター、テトラサイクリン誘導性プロモーター、チアミン誘導性プロモーター、およびFLD1プロモーターからなる群より選択される、態様54に記載の方法。
[態様56] 前記のマルチサブユニット複合体のサブユニットをコードする遺伝子のうちの少なくとも1つが、CUP1プロモーター、AOX1プロモーター、ICL1プロモーター、グリセルアルデヒド‐3‐リン酸デヒドロゲナーゼ(GAP)プロモーター、FLD1プロモーター、ADH1プロモーター、アルコールデヒドロゲナーゼIIプロモーター、GAL4プロモーター、PHO3プロモーター、PHO5プロモーター、およびPykプロモーター、テトラサイクリン誘導性プロモーター、チアミン誘導性プロモーター、それらに由来するキメラプロモーター、酵母性プロモーター、哺乳類性プロモーター、昆虫性プロモーター、植物性プロモーター、爬虫類性プロモーター、両生類性プロモーター、ウイルス性プロモーター、および鳥類性プロモーターからなる群より選択されるプロモーターの制御下で発現する、前述の態様のいずれか1項に記載の方法。
[態様57] 前記の真核細胞が二倍体、四倍体細胞、または多倍数体である、前述の態様のいずれか1項に記載の方法。
[態様58] 前記の真核細胞または前記の培地から前記のマルチサブユニット複合体を精製することをさらに含む、前述の態様のいずれか1項に記載の方法。
[態様59] 前記のマルチサブユニット複合体が前記の真核細胞の細胞内成分、細胞質、核質、または膜から精製される、態様58に記載の方法。
[態様60] 前記の真核細胞が前記のマルチサブユニット複合体を前記の培地に分泌する、態様58に記載の方法。
[態様61] 前記のマルチサブユニット複合体が前記の培養物培地から精製される、態様60に記載の方法。
[態様62] 前記のマルチサブユニット複合体が一重特異性抗体または二重特異性抗体を含む、前述の態様のいずれか1項に記載の方法。
[態様63] 前記のマルチサブユニット複合体がヒト抗体、またはヒト化抗体、またはそれらの断片を含む、前述の態様のいずれか1項に記載の方法。
[態様64] 前記のヒト化抗体がマウス、ラット、ウサギ、ヤギ、ヒツジまたはウシ起源のものである、態様63に記載の方法。
[態様65] 前記のヒト化抗体がウサギ起源のものである、態様62に記載の方法。
[態様66] 前記のマルチサブユニット複合体が一価抗体、二価抗体、または多価抗体を含む、前述の態様のいずれか1項に記載の方法。
[態様67] 前記の抗体がプロテインA親和性および/またはプロテインG親和性により前記の培養物から精製される、態様4または態様61〜66のいずれか1項に記載の方法。
[態様68] 前記のマルチサブユニット複合体のサブユニットを前記の一団の前記の真核細胞のうちの少なくとも1つにおいて発現する遺伝子のうちの少なくとも1つが前記の真核細胞における発現のために最適化される、前述の態様のいずれか1項に記載の方法。
[態様69] 前記のマルチサブユニット複合体が抗体を含み、そして、前記の抗体の純度が、前記の真核細胞により生産される前記抗体であって、予測される見かけの流体力学半径を有する抗体複合体に含まれる、予測される分子量を有する抗体複合体に含まれる、および/または前記の抗体の標的に特異的に結合する前記抗体の割合を測定することにより評価される、前述の態様のいずれか1項に記載の方法。
[態様70] 前記のマルチサブユニット複合体が抗体を含み、前記の抗体の収量が、前記の真核細胞によって生産される抗体の量を、異常にグリコシル化されている、予測される見かけの流体力学半径を有する複合体以外の抗体複合体に含まれている、予測される分子量を有する抗体複合体に含まれる、および/または前記の抗体の標的に特異的に結合することに失敗するあらゆる生産物関連変異体を差し引いて決定することにより評価される、前述の態様のいずれか1項に記載の方法。
[態様71] 前記の抗体複合体の分子量が非還元SDS‐PAGEにより決定される、態様58または59に記載の方法。
[態様72] 前記のマルチサブユニット複合体が抗体を含み、前記の方法が前記の抗体を精製することをさらに含む、前述の態様のいずれか1項に記載の方法。
[態様73] 前記の培養物細胞が、少なくとも100mg/L、少なくとも150mg/L、少なくとも200mg/L、少なくとも250mg/L、少なくとも300mg/L、100mg/Lと300mg/Lの間、100mg/Lと500mg/Lの間、100mg/Lと1000mg/Lの間、少なくとも1000mg/L、少なくとも1250mg/リットル、少なくとも1500mg/リットル、少なくとも約1750mg/リットル、少なくとも約2000mg/リットル、少なくとも約10000mg/リットル、またはそれより多くの上清抗体力価を生ずる、前述の態様のいずれか1項に記載の方法。
[態様74] 前記のマルチサブユニット複合体の1つ以上のサブユニットが1つよりも多くの遺伝子コピーから発現する、前述の態様のいずれか1項に記載の方法。
[態様75] 前記のマルチサブユニット複合体が、抗体であって、前記の抗体の軽鎖をコードする遺伝子の1〜10コピーの間のコピーから、および前記の抗体の重鎖をコードする遺伝子の1〜10コピーから発現する前記の抗体を含む、前述の態様のいずれか1項に記載の方法。
[態様76] 前記のマルチサブユニット複合体を発現する遺伝子が前記の細胞のゲノムに組み込まれる、前述の態様のいずれか1項に記載の方法。
[態様77] 前記のマルチサブユニット複合体を発現する遺伝子が染色体外因子、プラスミド、または人工染色体に含まれる、態様1〜75のいずれか1項に記載の方法。
[態様78] 前記の細胞が、前記の抗体の軽鎖を発現する遺伝子のコピーを、前記の抗体の重鎖を発現する遺伝子のコピーよりも多く含む、態様76または77に記載の方法。
[態様79] 前記の細胞における前記の抗体の重鎖をコードする遺伝子のコピー数と前記の抗体の軽鎖をコードする遺伝子のコピー数のそれぞれが、2と2、2と3、3と3、3と4、3と5、4と3、4と4、4と5、4と6、5と4、5と5、5と6、または5と7である、態様76または76に記載の方法。
[態様80] 前記の細胞における前記の抗体の重鎖をコードする遺伝子のコピー数と前記の抗体の軽鎖をコードする遺伝子のコピー数のそれぞれが、2と1、3と1、4と1、5と1、6と1、7と1、8と1、9と1、10と1、1と2、2と2、3と2、4と2、5と2、6と2、7と2、8と2、9と2、10と2、1と3、2と3、3と3、4と3、5と3、6と3、7と3、8と3、9と3、10と3、1と4、2と4、3と4、4と4、5と4、6と4、7と4、8と4、9と4、10と4、1と5、2と5、3と5、4と5、5と5、6と5、7と5、8と5、9と5、10と5、1と6、2と6、3と6、4と6、5と6、6と6、7と6、8と6、9と6、10と6、1と7、2と7、3と7、4と7、5と7、6と7、7と7、8と7、9と7、10と7、1と8、2と8、3と8、4と8、5と8、6と8、7と8、8と8、9と8、10と8、1と9、2と9、3と9、4と9、5と9、6と9、7と9、8と9、9と9、10と9、1と10、2と10、3と10、4と10、5と10、6と10、7と10、8と10、9と10、10と10である、態様76または77に記載の方法。
[態様81] ステップ(c)の培養物が産生培地で培養される、前述の態様のいずれか1項に記載の方法。
[態様82] 前記の産生培地が最少培地である、態様81に記載の方法。
[態様83] 前記の最少培地が選択用薬剤を欠く、態様81に記載の方法。
[態様84] 前記の最少培地が前もって形成されたアミノ酸または他の複雑な生体分子を欠く、態様81に記載の方法。
[態様85] 前記の産生培地が複合培地である、態様81に記載の方法。
[態様86] 前記の複合培地が、酵母抽出物、大豆ペプトン、および他の植物性ペプトンのうちの1つ以上を含む、態様85に記載の方法。
[態様87] ステップ(c)の培養物が高細胞密度まで培養される、前述の態様のいずれか1項に記載の方法。
[態様88] 高細胞密度が少なくとも50g/Lである、態様87に記載の方法。
[態様89] 高細胞密度が少なくとも100g/Lである、態様87に記載の方法。
[態様90] 高細胞密度が少なくとも300g/Lである、態様87に記載の方法。
[態様91] 高細胞密度が少なくとも400g/Lである、態様87に記載の方法。
[態様92] 高細胞密度が少なくとも500g/Lである、態様87に記載の方法。
[態様93] 高細胞密度が少なくとも750g/Lである、態様87に記載の方法。
[態様94] 前記の酵母細胞が少なくとも20回の倍化の間培養され、そして、前記の酵母細胞が前記の少なくとも20回の倍化の後に前記のマルチサブユニット複合体の高レベルの発現を維持する、前述の態様のいずれか1項に記載の方法。
[態様95] ステップ(c)の細胞が少なくとも50回の倍化の間培養され、そして、前記の細胞が前記の少なくとも50回の倍化の後に前記のマルチサブユニット複合体の高レベルの発現を維持する、前述の態様のいずれか1項に記載の方法。
[態様96] ステップ(c)の細胞が少なくとも100回の倍化の間培養され、そして、前記の細胞が前記の少なくとも100回の倍化の後に前記のマルチサブユニット複合体の高レベルの発現を維持する、前述の態様のいずれか1項に記載の方法。
[態様97] 前記のマルチサブユニット複合体のうちの少なくとも1つのサブユニットが分泌シグナルを含む、前述の態様のいずれか1項に記載の方法。
[態様98] 前記のマルチサブユニット複合体が抗体を含む、態様97に記載の方法。
[態様99] 前記の分泌シグナルが、配列番号414〜437およびそれらの任意の組合せからなる群より選択される1つ以上のポリペプチドを含む、態様97または98に記載の方法または組成物。
[態様100] 前記のマルチサブユニット複合体が、2010年12月1日に提出された米国特許仮出願番号第61/418,832号、2011年12月1日に提出された国際特許出願番号第PCT/US11/62963号、2011年12月1日に提出された米国特許出願番号第13/309,295号、2011年12月1日に提出された米国特許出願番号第13/309,153号、2011年12月1日に提出された米国特許出願番号第13/308,665号、および2011年12月1日に提出された米国特許出願番号第13/308,831号に開示される抗体のうちのいずれでもない、前述の態様のいずれか1項に記載の方法。
[態様101] 前記のマルチサブユニット複合体がAb1‐NGF、Ab2‐NGF、Ab3‐NGF、Ab4‐NGF、Ab5‐NGF、Ab6‐NGF、Ab7‐NGF、Ab8‐NGF、Ab9‐NGF、Ab10‐NGF、Ab11‐NGF、Ab12‐NGF、Ab13‐NGF、Ab14‐NGF、Ab15‐NGF、Ab16‐NGF、Ab17‐NGF、Ab18‐NGF、Ab19‐NGF、Ab20‐NGF、およびAb21‐NGF、またはそれらのFab2断片もしくはFab1断片ではない、前述の態様のいずれか1項に記載の方法。
[態様102] 前記のマルチサブユニット複合体が、次の抗体、すなわち、Ab1‐NGF、Ab2‐NGF、Ab3‐NGF、Ab4‐NGF、Ab5‐NGF、Ab6‐NGF、Ab7‐NGF、Ab8‐NGF、Ab9‐NGF、Ab10‐NGF、Ab11‐NGF、Ab12‐NGF、Ab13‐NGF、Ab14‐NGF、Ab15‐NGF、Ab16‐NGF、Ab17‐NGF、Ab18‐NGF、Ab19‐NGF、Ab20‐NGF、またはAb21‐NGFのいずれかに含まれる相補性決定領域(CDR)のうちの少なくとも1つ、少なくとも2つ、少なくとも3つ、少なくとも4つ、少なくとも5つ、または少なくとも6つ全てを含まず、かつ、NGFへの結合特異性を任意で有する、前述の態様のいずれか1項に記載の方法。
[態様103] 前記のマルチサブユニット複合体が、それぞれ配列番号51および401の、それぞれ配列番号53および402の、それぞれ配列番号405および406の、ならびにそれぞれ配列番号407および408の軽鎖ポリペプチド配列および重鎖ポリペプチド配列を含まない、またはそれらのポリペプチド配列から構成されない、前述の態様のいずれか1項に記載の方法。
[態様104] 前記のマルチサブユニット複合体が、配列番号55、56、57、58、59、および60のCDRのうちの少なくとも1つ、少なくとも2つ、少なくとも3つ、少なくとも4つ、少なくとも5つ、または少なくとも6つ全てを含有する抗体を含まず、かつ、NGFへの結合特異性を任意で有する、前述の態様のいずれか1項に記載の方法。
[態様105] 前記のマルチサブユニット複合体が、明細書の「抗NGF抗体およびNGFへの結合活性を有するその結合断片」および「抗NGF抗体ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド」という表題の節において開示される抗体または抗体コード配列のうちのいずれも含まない、前述の態様のいずれか1項に記載の方法。
Claims (9)
- マルチサブユニットポリペプチドを生産する方法であって、
(a)前記のマルチサブユニットポリペプチドの発現をもたらす遺伝子を含むピキア・パストリス(Pichia pastoris)細胞を含む培養物を提供すること、
(b)単回のボーラス添加により前記の培養物にエタノールを添加して、前記の培養物におけるエタノール濃度を0.5%〜1.5%の間とすること、および、
(c)前記の培養物を培養して前記のマルチサブユニットポリペプチドを生産すること、
を含む、但し、前記のマルチサブユニットポリペプチドの発現をもたらす遺伝子は、アルコール誘導性プロモーターには機能可能に連結されていない;前記マルチサブユニットポリペプチドは完全長抗体ではなく;前記マルチサブユニットポリペプチドは複数のジスルフィド結合を含む、前記方法。 - 前記の培養方法は、前記のエタノールのボーラス添加が無い状態で行われる前記の同じ方法と比べて、1つ以上の生産物関連変異体の相対量を減少させる、請求項1に記載の方法。
- 前記のエタノールのボーラス添加が無い状態で行われる前記の同じ方法と比べて、サイズ排除クロマトグラフィーまたはゲル電気泳動によって検出される見かけの分子量が前記の所望のマルチサブユニットポリペプチドよりも大きい、または小さい生産物関連変異体の相対量を減少させる、請求項1または2に記載の方法。
- 前記のエタノールのボーラス添加が無い状態で行われる前記の同じ方法と比べて、異常な化学量論組成を有する生産物関連変異体の相対量を減少させる、請求項1または2に記載の方法。
- 前記のエタノールのボーラス添加が無い状態で行われる前記の同じ方法と比べて、異常なジスルフィド結合を有する生産物関連変異体の相対量を減少させる、請求項1または2に記載の方法。
- 前記のエタノールのボーラス添加が無い状態で行われる前記の同じ方法と比べて、還元化システインを有する生産物関連変異体の相対量を減少させる、請求項1または2に記載の方法。
- 前記のエタノールのボーラス添加が無い状態で行われる前記の同じ方法と比べて、異常なグリコシル化を有する生産物関連変異体の相対量を減少させる、請求項1または2に記載の方法。
- 前記のエタノールのボーラス添加が無い状態で行われる前記の同じ方法と比べて、1つ以上の生産物関連変異体の相対量を減少させる、請求項3に記載の方法。
- 前記のエタノールのボーラス添加が無い状態で行われる前記の同じ方法と比べて、前記のマルチサブユニットポリペプチドの純度を上昇させる、請求項3または8に記載の方法。
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