JP5292570B2 - 新規マレイミド誘導体 - Google Patents
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Description
上記発明の好ましい態様によれば、R1が式(A)で表わされる基であり、R2が水素原子であり、X1及びX2が水素原子である上記化合物又はその塩が提供される。
例1:化合物4の合成
化合物4の合成スキームを以下に示した。
2-ニトロベンズアルデヒド(0.61 g, 4.0 mmol)と2,4-ジメチルピロール (0.76 g, 8.0 mmol)を350 mLのジクロロメタンに溶かした。アルゴン雰囲気下で数滴のトリフルオロ酢酸を加え、室温で一晩遮光して攪拌した。薄層クロマトグラフィー(展開溶媒; ジクロロメタン, アルミナ)で原料消失を確認し、DDQ (2,3−ジクロロ−5,6−ジシアノベンゾキノン, 0.91 g, 4.0 mmol)のジクロロメタン溶液150 mLを加えた。室温で20分攪拌後、反応液を水で3回、飽和食塩水で1回洗浄した。洗浄した水層をジクロロメタンで抽出し、もとのジクロロメタン層とあわせて無水硫酸マグネシウムで乾燥した。減圧濃縮後、残留物をアルミナカラムクロマトグラフィー (展開溶媒; ジクロロメタン)で精製した。得られた褐色の固体を、200 mLのトルエンに溶かし、DIEA(ジイソプロピルエチルアミン) 5 mL を加え、さらにアルゴン雰囲気下でBF3-OEt2(三フッ化ホウ素−ジエチルエーテル錯体)5 mL を加えて室温で30分間攪拌した。反応終了後、反応液を水で3回、飽和食塩水で1回洗浄した。水層を酢酸エチルで1回抽出し、全ての有機層を合わせて、無水硫酸ナトリウムで乾燥した。減圧濃縮後、残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィー (展開溶媒; n-ヘキサン/ジクロロメタン= 1/1)で精製し、赤色固体の化合物1を得た(0.9 g, 収率 61 %)。1H-NMR(300MHz, CDCl3) δ 1.36(6H, s), 2.56(6H, s), 5.99(2H, s), 7.47(1H, d, J=7.5Hz), 7.70(1H, t, J=7.5Hz), 7.79(1H, t, J=7.5Hz), 8.19(1H, d, J=7.5Hz).
MS(EI+)369[M]+.
Anal. Calcd for C19H18BF2N3O2, C, 61.81%;H, 4.91%;N, 11.38% Found, C, 61.87%;H, 5.13%;N, 11.41%.
化合物1 (0.7 g, 1.9 mmol ) をジクロロメタン 50 mL に溶かし、メタノール250 mLを加えた。10% Pd/C(20 mg) を加え、水素雰囲気下、室温で一晩遮光して撹拌した。薄層クロマトグラフィー(展開溶媒; ジクロロメタン, シリカゲル)で原料消失を確認後、10% Pd/Cをろ過して除いた。減圧濃縮後、残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィー (展開溶媒; ジクロロメタン )で精製し、橙色固体の化合物2を得た(93 mg, 収率 14 %)。
1H-NMR(300MHz, CDCl3)δ 1.55(6H, s), 2.56(6H, s), 3.73(2H, s), 5.99(2H, s), 6.75(1H, d, J=7.5Hz), 6.87(1H, t, J=7.5Hz), 7.00(1H, dd, J=7.5, 1.4Hz), 7.23(1H, dd, J=7.5, 1.4Hz).
MS(EI+)339[M]+.
化合物2(546 mg, 1.6 mmol) と無水マレイン酸(188 mg, 1.9 mmol ) を酢酸200 mL に溶かし、遮光して室温で3時間30分撹拌した。薄層クロマトグラフィー(展開溶媒; ジクロロメタン/メタノール=19/1, シリカゲル) で原料消失を確認した後、反応液を減圧濃縮した。残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィー (展開溶媒; ジクロロメタン/メタノール=19/1)で精製し、橙色固体の化合物3を得た(761 mg, 収率 定量的)。
1H-NMR(300MHz, CDCl3) δ 1.42(6H, s), 2.54(6H, s), 6.02(2H, s), 6.25(1H, d, J=13.0Hz), 6.35(1H, d, J=13.0Hz), 7.29(1H, dd, J=8.0Hz, 1.7Hz), 7.40(1H, td, J=8.0, 1.7Hz), 7.58(1H, td, J=8.0Hz, 1.7Hz), 8.23(1H, br), 8.33(1H, dd, J=1.7Hz, 8.0Hz).
MS(ESI+) 460,[M+Na]+.
化合物3 (672 mg, 1.5 mmol ) と酢酸ナトリウム(139 mg, 1.7 mmol ) に無水酢酸200 mL を加え遮光し、80 ℃にて一晩撹拌した。薄層クロマトグラフィー(展開溶媒; ジクロロメタン/メタノール=19/1, シリカゲル) で原料消失を確認後、反応液を減圧濃縮した。残留物をジクロロメタンに溶解し、ジクロロメタン層を水で3回、飽和食塩水で1回洗浄した。水層をジクロロメタンで抽出し、もとのジクロロメタン層とあわせて無水硫酸マグネシウムで乾燥した。減圧濃縮後、残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィー (展開溶媒; ジクロロメタン)で精製し、橙色固体の化合物4を得た(483 mg, 収率 75 %)。
融点:257.8-258.3℃.
1H-NMR(300MHz, CDCl3)δ 1.57(6H, s), 2.50(6H, s), 5.96(2H, s), 6.64(2H, s), 7.32-7.39(1H, m), 7.45-7.51(1H, m), 7.57-7.65(2H, m).
13C-NMR(75MHz,CDCl3)δ 14.5, 14.7, 121.4, 129.8, 130.2, 130.5, 130.8, 130.9, 131.1, 134.0, 135.0, 136.5, 143.9, 155.9, 169.4
HRMS(ESI+) Calcd for [M+Na]+, 442.1514, Found:442.1518
IR(KBr, cm-1) 478, 686, 716, 831, 980, 1084, 1157, 1194, 1306, 1389, 1508, 1543, 1719
Anal. Calcd for C23H20BF2N3O2, C, 65.89%;H, 4.81%;N, 10.02% Found, C, 65.79%;H, 4.94%;N, 9.94%
化合物7の合成スキームを以下に示した。
2,6−ジニトロベンズアルデヒド(0.78 g, 4.0 mmol)と2,4−ジメチルピロール (0.76 g, 8.0 mmol)を300 mLのジクロロメタンに溶解し、アルゴン雰囲気下で数滴のトリフルオロ酢酸を加え、室温で6時間30分遮光して攪拌した。薄層クロマトグラフィー(展開溶媒; ジクロロメタン, アルミナ)で原料消失を確認し、DDQ (1.0 g, 4.4 mmol)のジクロロメタン溶液150 mLを加えた。室温で20分攪拌後、反応液を水で二回洗浄した。洗浄した水層はジクロロメタンで抽出し、もとのジクロロメタン層とあわせて無水硫酸マグネシウムで乾燥した。減圧濃縮後、残留物をアルミナカラムクロマトグラフィー (展開溶媒; ジクロロメタン)で精製した。
得られた褐色の固体を酢酸30mLに溶解し、濃塩酸100mLと塩化スズ二水和物16gを水10mLに溶解したものを加え、80℃で2時間遮光して撹拌した。反応液を室温に戻した後、10Nの水酸化ナトリウム水溶液で中和し、ブフナー漏斗でろ過した。ろ液はジクロロメタンで抽出し、ろ別された固体はジクロロメタンでよく洗浄し、全てのジクロロメタン層を合わせて無水硫酸マグネシウムで乾燥した。減圧濃縮後、得られた褐色の固体を、150 mLのトルエンに溶かし、DIEA 6 mL を加え、さらにアルゴン雰囲気下でBF3-OEt2 6 mL を加えて室温で30分間攪拌した。反応終了後、反応液を水で3回、飽和食塩水で1回洗浄した。水層を酢酸エチルで1回抽出し、全ての有機層を合わせて無水硫酸ナトリウムで乾燥した。減圧濃縮後、残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(展開溶媒; ジクロロメタン )で精製し、赤色固体の化合物5を得た(52mg, 収率 4 %)。
1H NMR(300MHz, CDCl3) δ 1.74(6H, s), 2.55(6H, s), 3.59(4H, br), 6.00(2H, s), 6.19(2H, d, J=7.9Hz), 7.01(1H, t, J=7.9Hz).
MS(ESI+) 335,[M-F]+.
化合物5(50 mg, 0.15 mmol ) と無水マレイン酸(30 mg, 0.33 mmol ) を酢酸30 mL 中、遮光して室温で3時間撹拌した。薄層クロマトグラフィー(展開溶媒; ジクロロメタン/メタノール=19/1, シリカゲル) で原料消失を確認し反応液を減圧濃縮した。残留物をクロロホルムに懸濁し、3Gのグラスフィルターでろ別し、橙色固体の化合物6を得た(19 mg, 収率 23%)。
1H NMR(300MHz, CDCl3) δ 1.55(6H, s), 2.48(6H, s), 6.08(2H, s), 6.22(2H, d, J=12.6Hz), 6.46(2H, d, J=12.6Hz), 7.72(1H, t, J=7.0Hz), 8.03(2H, d, J=7.0Hz).
MS(ESI-) 549,[M-H]-.
化合物6(19 mg, 0.03 mmol) と酢酸ナトリウム(5 mg, 0.06 mmol ) を無水酢酸30 mL に加え、遮光して80 ℃にて一晩撹拌した。薄層クロマトグラフィー(展開溶媒; ジクロロメタン, シリカゲル) で原料消失を確認し、反応液を減圧濃縮した。残留物をジクロロメタンに溶解し、水で3回、飽和食塩水で1回洗浄した。洗浄した水層はジクロロメタンで抽出し、もとのジクロロメタン層とあわせて無水硫酸マグネシウムで乾燥した。減圧濃縮後、残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィー (展開溶媒; ジクロロメタン )で精製し、橙色固体の化合物7を得た(8.7 mg, 収率 50 %)。
1H NMR(300MHz, CDCl3) δ 1.71(6H, s), 2.46(6H, s), 5.94(2H, s), 6.67(4H, s), 7.49(2H, d, J=7.9Hz), 7.74(1H, t, J=7.9Hz).
MS(ESI+) 515,[M+H]+.
化合物4とアセトン、ブタノン、シクロヘキサノンとのマイケル付加反応により化合物8−10を合成した。
化合物4(22 mg, 50μmol)とL-プロリン(3mg, 25μmol)をジメチルスルホキシド0.5mLに溶解した。アセトン 1mL を加えて、反応バイアルを密封し、3日間室温で遮光して撹拌した。反応液をジクロロメタン 50 mL で希釈し、水で3回、飽和食塩水で1回洗浄し、無水硫酸マグネシウムで乾燥した。減圧濃縮後、残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィー (展開溶媒; ジクロロメタン)で精製し、橙色固体の化合物8を得た(12 mg, 収率 51 %)。
HRMS(ESI+) Calcd for [M-F]+, 472.2208, Found, 472.2248.
化合物4(4.2 mg, 10μmol)とL-プロリン(0.2mg, 2μmol)をジメチルスルホキシド0.5mLに溶解した。ブタノン1.5mL を加えて、反応バイアルを密封し、4日間室温で遮光して撹拌した。反応液をジクロロメタン 50 mL で希釈し、水で3回、飽和食塩水で1回洗浄し、無水硫酸マグネシウムで乾燥した。減圧濃縮後、残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィー (展開溶媒; ジクロロメタン )で精製し、橙色固体の化合物9を得た(1.4 mg, 収率 33 %)。
HRMS(ESI+) Calcd for [M-F]+, 498.2364, Found, 498.2357.
化合物4(4.2 mg, 10μmol)とL-プロリン(0.2mg, 2μmol)をジメチルスルホキシド0.5mLに溶解した。シクロヘキサノン1.5mL を加えて、反応バイアルを密封し、4日間室温で遮光して撹拌した。反応液をジクロロメタン50 mL で希釈し、水で3回、飽和食塩水で1回洗浄し、無水硫酸マグネシウムで乾燥した。減圧濃縮後、残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィー (展開溶媒; ジクロロメタン )で精製し、橙色オイルの化合物10を得た(88 mg)。
HRMS(ESI+) Calcd for [M+Na]+, 500.1933, Found, 500.1940.
マイケル付加反応により合成した化合物8、9、10および化合物4の各種溶媒中での蛍光量子収率を日立蛍光分光光度計F-4500を用いて測定した。H2O(pH7.4)はナトリウムリン酸緩衝液(0.1 mol/L )によってpHを調節した。0.1 mol/L 水酸化ナトリウム水溶液中でのフルオレセインの蛍光量子収率を0.85として、各溶媒中での蛍光量子収率を算出した。結果を表1に示す。各溶媒中で化合物4は0.062以下の低い蛍光量子収率でありごく僅かにしか蛍光を発しない。一方、化合物8、9、10は0.6以上の高い蛍光量子収率を持ち非常に強い蛍光を発する。従って、反応溶媒の種類に関係なく実質的に無蛍光であった本発明の化合物4が、求核剤とのマイケル付加反応の結果、強い蛍光を発するマイケル付加物を与えることが確認された。
以下の反応条件により化合物4とアセトンとのマイケル付加反応触媒及び溶媒のハイスループットスクリーニングを行なった。
溶媒:2.7 mL
触媒:0.02 mmol/L
化合物4:0.1 mmol/L
アセトン:0.3 mL
反応時間:24時間
反応は密閉されたバイアル中、室温で行い、反応終了後、反応液をジメチルスルホキシドで10倍希釈し、LS50B蛍光分光光度計 (Perkin Elmer:励起波長505nm、蛍光波長525nm)を用いて蛍光強度を測定した。得られた蛍光強度は、各収率における化合物の組成(すなわち各収率における化合物4と化合物8の組成)の蛍光強度をジメチルスルホキシド中で測定して得た図1の検量線により反応収率に変換した。結果を図2に示す。種々の触媒及び溶媒を用いたマイケル付加反応の反応収率を蛍光強度の測定のみから求めることができ、本発明の化合物4を用いてマイケル付加反応の触媒及び溶媒等の反応条件を効率的にスクリーニングできることが確認された。
3 mL用の蛍光セル中で1 mmol/Lの化合物7DMSO溶液3 μLを0.1 mol/L ナトリウムリン酸緩衝液(pH = 7.4) 3 mlで希釈し,1 μmol/L の化合物7溶液を調製した(DMSO終濃度0.1%).日立蛍光分光光度計F-4500を用い、温度37℃、励起波長518nm、蛍光波長537nmに設定し、蛍光強度の測定を開始した。測定開始後10 秒の時に、1 mmol/LのN−アセチルシステイン(NAC)又はAc-AECACRA-OH、Ac-AECAACRA-OHペプチド(N末端はアセチル基(Ac),C末端はカルボキシル基,アミノ酸は一文字表記)の0.1% TFA水溶液3 μl(1 等量)、又は6 μL(2 等量)を添加し、添加後40秒(測定開始後50秒)までの蛍光強度を測定した。結果を図3に示す。化合物7にチオール基を一つ有するNACを2等量を添加してもほとんど蛍光強度の上昇は認められないが、同一分子内にチオール基を2つ有するAc-AECACRA-OH及びAc-AECAACRA-OHペプチドを添加すると大きな蛍光強度増加が認められた。すなわち、本発明の化合物7を用いることにより同一分子内に近接した2 残基のシステインを有するペプチドやタンパク質などに対して可視光励起が可能な蛍光タグを高選択的に導入できることが示された。
触媒の種類を例5の試験よりも増やして、化合物4とアセトンとのマイケル付加反応触媒及び溶媒のハイスループットスクリーニングを行なった。
溶媒:2.7 mL
触媒:0.02 mmol/L
化合物4:0.1 mmol/L
アセトン:0.3 mL
反応時間:24 時間
例5と同様に反応は密閉されたバイアル中、室温で行い、反応終了後、反応液をジメチルスルホキシドで10倍希釈し、LS50B蛍光分光光度計 (Perkin Elmer:励起波長505nm、蛍光波長525nm)を用いて蛍光強度を測定した。得られた蛍光強度は、各収率における化合物の組成(すなわち各収率における化合物4と化合物8の組成)の蛍光強度をジメチルスルホキシド中で測定して得た図1の検量線により反応収率に変換した。図4に示した結果のとおり、溶媒がジメチルホルムアミドで触媒がプロリンの時に最も反応収率が高く、次いで溶媒がジメチルホルムアミドで触媒がメチオニン、溶媒がジメチルスルホキシドで触媒がプロリンの時に反応収率が高かった。例5よりもさらに多くの触媒及び溶媒を用いたマイケル付加反応の反応収率を蛍光強度の測定のみから求めることができ、本発明の化合物4を用いてマイケル付加反応の触媒及び溶媒等の反応条件を多種類かつ効率的にスクリーニングできることが確認された。
例5および例7の試験において相対的に高い収率を示したプロリンについて、プロリンおよびその誘導体を触媒とし、溶媒にジメチルホルムアミドおよびジメチルスルホキシドを用い、例7と同様の反応条件で反応時間を0、24、48、72時間と変化させて化学反応の進行の追跡を行った。結果を図5に示す。
本発明の化合物4を用いてマイケル付加反応の反応収率の時間変化を蛍光強度の測定により追跡できることが確認された。
化合物4とNACとのマイケル付加反応により化合物11を合成した。
HRMS(ESI-) Calcd for [M-H]-,581.1842,Found,581.1877.
化合物4及び化合物11 の0.1 mol/Lのナトリウムリン酸緩衝液(pH2.1、3.1、4.1、5.1、6.0、7.0、7.4、7.9、8.8)、中での蛍光量子収率を日立蛍光分光光度計F-4500を用いて測定した。0.1 mol/L 水酸化ナトリウム水溶液中でのフルオレセインの蛍光量子収率を0.85として、各緩衝液中での蛍光量子収率を算出した。結果を表2に示す。実質的に無蛍光であった本発明の化合物4が、チオール基を有する化合物であるNACとの反応により、強い蛍光を発する反応生成物11を与え、化合物4および反応生成物11の蛍光強度がpHにより影響を受けないことが確認された。
3 mL用の蛍光セル中で1 mmol/Lの化合物4ジメチルスルホキシド溶液3 μLを0.1 mol/L ナトリウムリン酸緩衝液(pH 7.4) 3 mlで希釈し,1 μmol/L の化合物4溶液を調製した(ジメチルスルホキシド終濃度0.1%)。日立蛍光分光光度計F-4500を用い、室温、励起波長505nm、蛍光波長520nmに設定し、蛍光強度の測定を開始した。測定開始後10 秒の時に、1 mmol/Lおよび10 mmol/LのNAC又は還元型グルタチオン(GSH) のジメチルスルホキシド 溶液3 μLを添加し、添加後1190秒(測定開始後1200秒)までの蛍光強度を測定した。結果を図6に示す。
さらに、1 mmol/LのNACを加える実験についてはpH4およびpH9のナトリウムリン酸緩衝液中でも行った。結果を図7に示す。本発明の化合物4を用いることにより、NAC、GSHといったチオール基を有する化合物に対して可視光励起が可能な蛍光タグを導入できることが示された。
Claims (2)
- 下記の一般式(I):
- システイン残基を有するアミノ酸、ペプチド、又はタンパク質の標識のために用いる請求項1に記載の化合物又はその塩。
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