JP4118348B2 - Gキャプ安定化したオリゴヌクレオチド - Google Patents

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Description

【0001】
【発明の背景】
アンチセンスオリゴヌクレオチド(AO)、三重らせん形成オリゴヌクレオチド(TFO)およびセンスオリゴヌクレオチドは、イン・ビトロおよびイン・ビボのいずれにおいても多数の系における遺伝子発現の特異的な阻害剤であることが明らかになっている(Uhlmann & Peyman, Chem. Rev., 1990, 90, 543;
Milliganら, J. Med. Chem., 1993, 36, 1923; Stein & Cheng, Science, 1993, 261, 1004; Bielinski ら, Science, 1990, 250, 997)。
【0002】
天然に存在するホスホジエステルオリゴヌクレオチド(PO)を用いる際の主要な問題点の一つは、細胞中および細胞培地中のいずれにおいても様々な核溶解活性によってそれらが速やかに分解してしまうことである。オリゴヌクレオチドを安定化させるため、多種多様な化学修飾が用いられてきた。この技術の状況についての総説は、例えばUhlmann & Peyman、上記文献、およびP.D. Cook (Anti-sense Research and Application, CrookeおよびLebleu監修、第9章、149頁以降、CRC Press Boca Raton, 1993年)によって提供されている。核溶解性分解に対する安定化は、リン酸ブリッジ、糖構造成分またはヌクレオチド塩基を修飾または置換することによって、またはオリゴヌクレオチドの糖−リン酸主鎖を置換することによって行なうことができる。リン酸ブリッジは核溶解性攻撃の中心であるので、ヌクレオシド間ブリッジの多数の修飾が特に記載されている。最も頻繁に用いられるヌクレアーゼ耐性のヌクレオシド間ブリッジは、ホスホロチオエート(PS)、メチルホスホネート(MeP)およびホスホルアミデート(PA)ブリッジである。例えばTangら[Nucl. Acids Res., 21: 2729, 1993]に記載されているようなヘアピンまたは自己安定化したオリゴヌクレオチドは、安定化のもう一つのオプションを表わしている。
【0003】
アンチセンス技術における特別な問題点は、オリゴヌクレオチドによる細胞透過が不十分なことが多いことである。この状況を改良する目的で、多数の化学修飾も同様に用いられている。Uhlmann & Peymann (上記文献)およびP.D. Cook (上記文献)は、当該技術分野の状況が記載されている。これらの修飾は、取り分け、オリゴヌクレオチドの5′または3′末端における親油性結合基および主鎖の中性またはイオン性修飾、並びにペントフラノシル環の2′の修飾を含んでいる。Hughes[Antisense Research and Development, 4: 211, 1994]は、10−マー(mer) ホモ−Gホスホロチオエートの細胞取り込み(cell uptake) は、10−マー・ホモ−T、AまたはCのオリゴマー性ホスホロチオエートの細胞取り込みより2の因子(factor)だけ高いことを示している。
【0004】
Blackburne[Nature, 350: 569, 1991]は、Gの高いオリゴヌクレオチドによって仮定することができる構造を記載している。Na+またはK+の存在では、G残基を含む少なくとも4個の短いセグメントを有するGの高いオリゴヌクレオチドは、安定化要素としてのいわゆるGカルテット(G quartets)を含む分子内構造を形成することができ、これらのカルテットはフーグステン型塩基対によって1平面で結合されている4個のグアニン残基を有する。いくつかのこのような要素は一方が他方の上に配置される。しばしば、オリゴヌクレオチドは短すぎて、このような分子内構造を形成することができない。これらの場合には、Gカルテット構造は、2個の別個なオリゴヌクレオチドの会合によって形成することができる。
【0005】
極めて単純な選択は、ヌクレアーゼ耐性および細胞透過に関して、未修飾または修飾した(修飾の性質、4頁以後を参照されたい)オリゴヌクレオチドを有意に改良して、それらの活性をすなわち1〜10個のグアニンによって3′および/または5′末端においてオリゴヌクレオチドを伸張することによって実質的に改良することが見いだされている。
【0006】
【発明の概要】
意外なことには、新規なオリゴヌクレオチドも、解離または凝集する傾向を示す。それらは、2個以上のオリゴヌクレオチドの会合によってGカルテット構造も形成することができる。このような構造は、エキソヌクレアーゼ分解を防止し、細胞中への取り込みが増加する。会合した構造は「遊離」のオリゴヌクレオチドと常に平衡になっているので、十分な量の「遊離」のオリゴヌクレオチドも常に翻訳または転写を制御するのに利用可能なものであるべきである。
【0007】
本発明は、下記の式を有するオリゴヌクレオチドに関する。
5′−(CAP)−(Oligo)−(CAP)−3′
(式中、
(Oligo)は、長さが10〜40ヌクレオチドのヌクレオチド配列、例えば、
ACACCCAATTCTGAAAATGG (I)
AGGTCCCTGTTCGGGCGCCA (II)
GTCGACACCCAATTCTGAAAATGGATAA (III)
GCTATGTCGACACCCAATTCTGAAA (IV)
GTCGCTGTCTCCGCTTCTTCTTCCTG (V)
GTCTCCGCTTCTTCTTCCTGCCATAGG (VI)
GCGGGGCTCCATGGGGGTCG (VII)
CAGCTGCAACCCAGC (VIII)
GGCTGCTGGAGCGGGGCACAC (IX)
AACGTTGAGGGGCAT (X)
GTGCCGGGGTCTTCGGGC (XI)
GGAGAACATCATGGTCGAAAG (XII)
CCCGAGAACATCATGGTCGAAG (XIII)
GGGAAAGCCCGGCAAGGGG (XIV)
CACCCGCCTTGGCCTCCCAC (XV)
GGGACTCCGGCGCAGCGC (XVI)
GGCAAACTTTCTTTTCCTCC (XVII)
GGGAAGGAGGAGGATGAGG (XVIII)
GGCAGTCATCCAGCTTCGGAG (XIX)
GCAGTAAGCATCCATATC (XX)
CCCCCACCACTTCCCCTCTC (XXI)
CTCCCCCACCACTTCCCCTC (XXII)
GCTGGGAGCCATAGCGAGG (XXIII)
ACTGCTGCCTCTTGTCTCAGG (XXIV)
CAATCAATGACTTCAAGAGTTC (XXV)
GGTCCCTGTTCGGGCGCCA (XXVI)
GTGCCGGGGTCTTCGGG (XXVII)
GGAGGATGCTGAGGAGG (XXVIII)
GGAGGATGCTGAGG (XXIX)
CAGGAGGATGCTGAGGAGG (XXX)
GGCTGCCATGGTCCC (XXXI)
TCATGGTGTCCTTTGCAGCC (XXXII)
TCATGGTGTCCTTTGCAG (XXXIII) または
AAGTTCATGGTTTCGG (XXXIV)
であり、
CAPはGmであり、但しmは0〜10、好ましくは2〜6、特に好ましくは3〜5、極めて好ましくは4の整数であり、分子中に含まれる2個のCAPは互いに独立に定義することができ、かつmが5′または3′末端で0であり、Oligo配列の末端がグアニンによって形成されない場合には異なるものでなければならない)
【0008】
【発明の具体的説明】
オリゴヌクレオチドの(Oligo)が5′または3′末端で1個以上のグアニンで終わる場合には、CAPがG(m-n) であり、但しmが上記に定義した通りでありかつnがオリゴヌクレオチド(Oligo)の5′または3′末端において自然に存在するグアニンの数であり、かつ(m−n)は好ましくは2〜6であり、特に好ましくは3〜5であり、極めて好ましくは4であるものが有利であることがある。
【0009】
この方法に適合したオリゴヌクレオチドは、未修飾であってもまたは修飾されていてもよく、下記のような変形が可能である。
【0010】
a) 3′および/または5′リン酸ジエステルブリッジの、例えばホスホロチオエート、ホスホロジチオエート、(NR1R2)−ホスホルアミデート、ボラノホスフェート、ホスフェート(C1〜C21)−O−アルキルエステル、ホスフェート[(C6〜C12)アリール−(C1〜C21)−O−アルキル]エステル、2,2,2−トリクロロジメチルエチルホスホネート、(C1〜C8)アルキルホスホネート、または(C6〜C12)アリールホスホネートブリッジによる完全なまたは部分的置換、
ホスホロチオエート、ホスホロジチオエート、(NR1R2)−ホスホルアミデート、ホスフェート=O−メチルエステル、ホスフェート=O−エチルエステル、ホスフェート=O−イソプロピルエステル、メチルホスホネート、またはフェニルホスホネートブリッジによる置換が好ましい。ホスホロチオエート、ホスホロジチオエート、またはメチルホスホネートブリッジによる置換が特に好ましい。ホスホロチオエートブリッジによる置換が極めて好ましい。
【0011】
R1およびR2は、互いに独立に、水素であるか、または(C1〜C18)−アルキル、(C6〜C20)−アリール、(C6〜C14)−アリール−(C1〜C8)−アルキルまたは−(CH2)c−[NH(CH2)c]d−NR3R3であり、但しcは2〜6の整数であり、dは0〜6の整数であり、R3は、互いに独立に、水素であるか、または(C1〜C6)−アルキルまたは(C1〜C4)−アルコキシ−(C1〜C6)−アルキルであり、R1およびR2は、好ましくは水素、(C1〜C8)−アルキルまたはメトキシエチル、特に好ましくは水素、(C1〜C4)−アルキルまたはメトキシエチルである。R1およびR2は、それらが結合している窒素原子と一緒になって、更にO、SおよびNの群からもう一つのヘテロ原子を含むことができる5〜6員の複素環を形成することもできる。
1、2または3個のリン酸ジエステルブリッジは、5′末端および/または3′末端、好ましくは5′末端および3′末端で置換されているのが好ましい。リン酸ジエステルブリッジの置換は、ピリミジン位置でも行なわれるのが好ましい。
【0012】
b) 3′または5′リン酸ジエステルブリッジの、「デホスホ」ブリッジによる[例えば、Uhlmann およびPeyman「Methods in Molecular Biology」、第20巻、「Protocols for Oligonucleotides and Analogs」、S. Agrawal監修、Humana Press、Totowa、1993年、第16章、355頁以後を参照されたい]、例えばホルムアセタール、3′−チオホルムアセタール、メチルヒドロキシルアミン、オキシム、メチレンジメチルヒドラゾ、ジメチレンスルホン、またはシリル基による、完全なまたは部分的置換。ホルムアセタールおよび3′−チオホルムアセタールによる置換が好ましい。
【0013】
1、2または3個のリン酸ジエステルブリッジは、5′末端および/または3′末端、好ましくは5′末端および3′末端で置換されているのが好ましい。リン酸ジエステルブリッジの置換は、ピリミジン位置でも行なわれるのが好ましい。
【0014】
c) 糖リン酸主鎖の、例えば「モルホリノヌクレオシド」オリゴマー[E.P.Stirchakら、Nucleic Acids Res., 17: 6129, 1989]、またはペプチド核酸(PNA′s)[P.E. Nielsenら、Bioconj. Chem., 5: 3, 1994]、またはドイツ国特許出願第P44 08 528.1号明細書に記載されているようなPNA/DNAハイブリッドによる完全なまたは部分的置換。
d) β−D−2′−デオキシリボースの、例えばα−D−2′−デオキシリボース、L−2′−デオキシリボース、2′−F−2′−デオキシリボース、2′−O−(C1〜C6)アルキルリボース、2′−O−(C2〜C6)アルケニルリボース、2′−NH2−2′−デオキシリボース、β−D−キシロフラノース、α−アラビノフラノース、2,4−ジデオキシ−β−D−エリスロヘキソピラノース、および炭素環式[例えばFroehler, J. Am. Chem. Soc., 114: 8320, 1992]および開鎖糖類似体[例えばVandendriessche ら、Tetrahedron, 49: 7223, 1993 ]、およびビシクロ糖類似体[例えばM. Tarkov ら、Helv. Chim. Acta., 76: 481, 1993]による完全なまたは部分的置換。
【0015】
2′−F−2′−デオキシリボース、2′−O−(C1〜C6)アルキルリボース、2′−O−(C2〜C6)アルケニルリボース、または2′−NH2−2′−デオキシリボースによる置換が好ましい。
2′−F−2′−デオキシリボース、2′−O−(C1〜C4)アルキルリボース、2′−O−(C2〜C4)アルケニルリボース、または2′−NH2−2′−デオキシリボースによる置換が特に好ましい。
2′−O−メチルリボース、2′−O−アリルリボース、2′−O−ブチルリボースによる置換が極めて好ましい。
好ましくは、1、2または3個のリボース単位は、5′末端および/または3′末端、好ましくは5′末端および3′末端で置換されている。リボース単位の置換は、ピリミジン位置でも行なわれるのが好ましい。
【0016】
e) 天然のヌクレオシド塩基の、例えば5−(ヒドロキシメチル)ウラシル、5−アミノウラシル、シュードウラシル、ジヒドロウラシル、5−(C1〜C6)−アルキル−ウラシル、5−(C2〜C6)−アルケニル−ウラシル、5−(C2〜C6)−アルキニル−ウラシル、5−(C1〜C6)−アルキル−シトシン、5−(C2〜C6)−アルケニル−シトシン、5−(C2〜C6)−アルキニル−シトシン、5−フルオロウラシル、5−フルオロシトシン、5−クロロウラシル、5−クロロシトシン、5−ブロモウラシル、5−ブロモシトシン、または7−デアザ−7−置換プリンによる完全なまたは部分的置換。
【0017】
5−(C1〜C6)−アルキル−ウラシル、5−(C2〜C6)−アルケニル−ウラシル、5−(C2〜C6)−アルキニル−ウラシル、5−(C1〜C6)−アルキル−シトシン、5−(C2〜C6)−アルケニル−シトシン、5−(C2〜C6)−アルキニル−シトシン、5−フルオロウラシル、5−フルオロシトシン、5−クロロウラシル、5−クロロシトシン、5−ブロモウラシル、5−ブロモシトシン、または7−デアザ−7−アルキニル、好ましくはヘキシニル置換プリン、7−デアザ−7−メチル−置換プリンまたは7−デアザ−7−臭素置換プリンによる置換が好ましい。
5−(C3〜C6)−アルキル−ウラシル、5−(C2〜C6)−アルケニル−ウラシル、5−(C2〜C6)−アルキニル−ウラシル、5−(C1〜C6)−アルキル−シトシン、5−(C2〜C6)−アルケニル−シトシン、または5−(C2〜C6)−アルキニル−シトシンによる置換が特に好ましい。5−ヘキシニルシトシン、5−ヘキシニルウラシル、5−ヘキシニルシトシン、5−プロピニルウラシル、または5−プロピニルシトシンによる置換が、極めて好ましい。ヌクレオシド塩基は、CAP領域では置換されない。
【0018】
上記の修飾のうち、群a)、b)、c)およびd)に挙げられたものが特に好ましく、特に群a)およびd)に挙げられたもの、取り分け群a)に挙げられたものが特に好ましい。
【0019】
また、新規なオリゴヌクレオチドは、アンチセンスオリゴヌクレオチドまたは三重らせん形成オリゴヌクレオチドの特性(例えば細胞透過、ヌクレアーゼ分解、標的RNA/DNAに対する親和性、および薬物動態)に好ましい影響を与える分子と、例えば3′または5′末端で、結合(または復合化)することができる。例えば、ポリリシン、ピレン、アクリジン、フェナジンおよびフェナントリジンのような挿入剤、フルオレセインのような蛍光化合物、プソラレンおよびアジドプロフラビンのような架橋剤、(C12〜C20)−アルキルのような親油性分子、1,2−ジヘキサデシル−rac−グリセロールのような脂質、コレステロールまたはテストステロンのようなステロイド、ビタミンEのようなビタミン、ポリエチレンまたはオリゴエチレングリコール、(C12〜C18)−アルキル−リン酸ジエステル、および−O−CH2−CH(OH)−O−(C12〜C18)−アルキルとの複合体である。(C12〜C20)−アルキルのような親油性分子、コレステロールまたはテストステロンのようなステロイド、ポリエチレングリコールまたはオリゴエチレングリコール、ビタミンE、ピレンのような挿入剤、(C14〜C18)−アルキル−リン酸ジエステル、および−O−CH2−CH(OH)−O−(C12〜C18)−アルキルとの抱合体が好ましい。当業者であれば、このようなオリゴヌクレオチド複合体の製造に精通している(例えば、Uhlmann & Peyman, Chem. Rev., 90: 543, 1990; M. Manoharan 著「Antisense Research and Applications 」、Crooke and Lebleu 監修、CRC Press, Boca Raton, 1993 年、第17章、303頁以後、EP0552766A2号明細書を参照されたい)。
【0020】
更に、新規なオリゴヌクレオチドは、3′および/または5′末端において3′−3′および5′−5′逆位を有することができる[例えば、M. Koga ら、J. Org. Chem., 56: 3757, 1991 に記載されている]。
【0021】
本発明は、当業者に知られている方法、特に化学合成、を用いて新規化合物を製造する方法、医薬の製造のための新規化合物の使用、および新規オリゴヌクレオチドを生理学的に許容可能な賦形剤および適宜好適な添加剤および/または補助物質と混合することを含んでなる医薬の製造法にも関する。
【0022】
極めて一般的な方法では、本発明は、治療上有効なオリゴヌクレオチドの使用において、少なくとも1種類の非末端ピリミジンヌクレオシドを修飾して、医薬組成物を製造することにも敷衍される。一般的には、治療上有効なオリゴヌクレオチドは、アンチセンスオリゴヌクレオチド、三重らせん形成オリゴヌクレオチドアプタマー(例えば、タンパク質またはレセプターのような特定の標的分子に結合できるRNAまたはDNA分子(例えば、L.C. Bock ら、Nature, 355: 564, 1992))、またはリボザイム(触媒RNA、例えばCastanettoら、Critical Rev. Eukar. Gene Expr., 2: 331, 1992 を参照されたい)、特にアンチセンスオリゴヌクレオチド、を意味するものと理解される。
【0023】
更に、本発明は、少なくとも1種類の末端の修飾されたピリミジンヌクレオシドを、例えば生物学的試料中の特定の二本鎖または一本鎖核酸分子の存在または非存在、または量を検出するための診断薬として有するオリゴヌクレオチドの使用にも関する。
【0024】
本発明による使用には、オリゴヌクレオチドは、長さが約6〜60、好ましくは約10〜40、特に約12〜31のヌクレオチドを有する。或いは、上記の好ましい範囲、修飾および/または復合化も、本発明に当てはまる。
【0025】
本発明の医薬組成物を用いて、例えばHIV、HSV−1、HSV−2、インフルエンザ、VSV、B型肝炎、またはパピローマウイルスなどのウイルスによって引き起こされる疾患の治療を行なうことができる。
【0026】
これらの標的に有効な新規なアンチセンスオリゴヌクレオチドの例は、下記の通りである。
a) HIVに対して、例えば
5′−G*G*G*GACACCCAATTCTGAAAATG*G*G*G−3′、または
5′−G*G*G*GACACC*CAAT*TC*TGAAAATG*G*G*G−3′、または
5′−G*G*G*GACAC*C*CAATTCTGAAAATG*G*G*G−3′
(1)
【0027】
5′−G*G*G*AGGT*CC*C*TGT*T*CGGGCGC*CAG*G*G*G−3′、または
5′−G*G*G*AGGT*CC*C*TG*TT*CGGGCGC*C*A*G*G*G*G−3′
(2)
【0028】
5′−G*G*G*GT*CC*C*TGT*T*CGGGCGC*C*A*G*G*G*G−3′
(26)
【0029】
5′−G*G*GGT*CGA*CAC*CCAAT*TC*TGAAAAT*GGAT*A*A−3′、または
5′−G*G*GGT*CGA*CAC*C*CAAT*TC*TGAAAAT*GGAT*A*A−3′、または
5′−G*G*GGT*CGA*CAC*C*CAAT*TC*TGAAAAT*GGA*T*A*A−3′、または
5′−G*G*GT*C*GA*CAC*C*CAAT*T*C*TGAAAAT*GGA*T*A*A−3′
(3)
【0030】
5′−G*C*TATGT*CGA*CACC*CAAT*T*C*T*GAAAG*G*G*G−3′、または
5′−G*C*TAT*GT*CGA*CACC*CAAT*T*C*T*GAAAG*G*G*G−3′、または
5′−G*C*TAT*GT*CGACAC*CC*AAT*TC*TGAAAG*G*G*G−3′、または
5′−G*C*TAT*GT*CGAC*AC*CC*AAT*TC*TGAAAG*G*G*G−3′、または
5′−G*C*TATGT*CGACAC*CC*AAT*TC*TGAAAG*G*G−3′
(4)
【0031】
5′−G*T*CGC*TGTC*T*C*CGCT*TCTTCTTCC*TG*G*G*G、または
5′−G*T*CGC*TGTC*T*C*CGCT*TCTTCTTCC*TGG*G*G*G、または
5′−G*T*CGC*TGTC*T*C*CGCT*TCTTCTTCC*TGG*G*G*G*G
(5)
【0032】
5′−G*T*C*TC*CGCT*TC*TT*CT*TC*CTGC*CATAGG*G*G*G、または
5′−G*T*C*TC*CGCT*TC*TT*CT*TC*CTGC*CATAG*G*G*G
(6)
【0033】
b) HSV−1に対して、例えば
5′−G*C*GGGGCTCC*ATGGGGGT*C*G*G*G−3′、または
5′−G*G*C*GGGGC*TCCA*TGGGGGT*C*G−3′
(7)
【0034】
5′−G*G*G*GAGGAT*GC*T*GAGGAGG*G*G*G、または
5′−G*G*G*GAGGAT*GC*T*GAGGAGG*G*G
(28)
【0035】
5′−G*G*G*GGAGGAT*GC*TGAGG*G*G*G、または
5′−G*G*GGAGGAT*GC*TGAGG*G*G*G
(29)
【0036】
5′−G*G*G*CAGGAGGAT*GC*T*GAGGAGG*G*G*G、または
5′−G*G*G*G*CAGGAGGAT*GC*T*GAGGAGG*G*G*G
(30)
【0037】
ここに挙げたアラビア数字は、前に挙げたローマ数字に関するものであり、ここに上げたオリゴヌクレオチドは更に新規なCAPを備えている。
【0038】
配列において、ホスホロチオエートブリッジ(P=S)によって置換されたリン酸ジエステル結合には、星印(*)を付けた。
【0039】
本発明の医薬品は、例えば癌または再狭窄の治療にも好適である。例えば、癌の発生または成長に関与する標的に関するオリゴヌクレオチド配列を、これに関して用いることができる。これらの標的の例には、下記のようなものが挙げられる。
【0040】
1) 例えば、c−myc、N−myc、c−myb、c−fos、c−fos/jun、PCNAおよびp120などの核腫瘍タンパク質、
2) 例えば、EJ−ras、c−Ha−ras、N−ras、rrg、bcl−2、cdc−2、c−raf−1、c−mos、csrc、およびc−ablなどの細胞質/膜関連腫瘍タンパク質、
3) 例えば、EGFレセプター、c−erbA、レチノイドレセプター、タンパク質キナーゼ制御サブユニット、およびc−fmsなどの細胞レセプター、
4) 例えば、CSF−1、IL−6、IL−1a、IL−1b、IL−2、IL−4、bFGF、ミエロブラスチン、フィブロネクチン、およびVEGF(脈管内皮成長因子)などのサイトカイン、成長因子および細胞外マトリックス。
【0041】
これらの標的に対して有効な新規なアンチセンスオリゴヌクレオチドの例としては、下記のようなものが挙げられる。
a) c−Ha−rasに対して、例えば
5′−G*G*G*GCAGC*TG*CAAC*C*CAG*CG*G*G*G−3′、または
5′−G*G*G*CAGC*TG*CAAC*C*CAG*CG*G*G*G−3′、または
5′−G*G*G*G*C*A*G*C*T*G*C*A*A*C*C*C*A*G*C*G*G*G*G−3′、または
(8)
【0042】
b) c−myc、例えば
5′−G*G*G*GC*TGC*TGGAG*CGGGG*CAC*A*C−3′、または
5′−G*G*G*GC*TGC*TGGAG*CGGGG*CAC*A*C*G*G*G*G−3′、または
5′−G*G*G*G*C*T*G*C*T*G*G*A*G*C*G*G*G*G*C*A*C*A*C*−3′、または
(9)
【0043】
5′−G*G*G*GAA*CGT*TGAGGGGC*A*T−3′、または
5′−G*G*G*GAA*CGT*TGAGGGGC*A*TG*G*G*G−3′、または
(10)
【0044】
c) c−myb、例えば
5′−G*G*G*GT*GC*CGGGGT*C*T*TCGG*G*C−3′、または
5′−G*G*G*GT*GC*CGGGGT*C*T*TCGG*G*CG*G*G*G−3′、または
(11)
【0045】
5′−G*G*G*GT*GC*C*GGGGT*CT*T*CGG*G*G*G−3′、または
5′−G*G*G*GT*GC*C*GGGGT*CT*T*CGG*G*G*G−3′、または
(27)
【0046】
d) c−fos、例えば
5′−G*G*G*GGAGAAC*AT*CAT*GGT*CGAA*A*G−3′、または
5′−G*G*G*GGAGAAC*AT*CAT*GGT*CGAAAG*G*G*G−3′、または
5′−G*G*G*GAGAAC*AT*CAT*GGT*CGAAAG*G*G*G−3′、または
5′−G*G*AGAAC*A*T*CAT*GGT*CGAA*A*G*G*G*G*G−3′、または
(12)
【0047】
5′−C*C*C*GAGAA*CAT*CAT*GGT*CGA*A*G*G*G*G*G−3′、または
(13)
【0048】
5′−G*G*GGAAAGC*C*CGG*CAAGG*G*G*G−3′、または
5′−G*G*G*GGAAAGC*CC*GGC*AAGG*G*G*G−3′、
(14)
【0049】
e) p120、例えば
5′−C*A*C*CC*GC*CT*TGGCCT*CC*CA*CGG*G*G*G−3′、または
5′−C*A*C*CC*GC*CT*TGGC*CT*CC*CA*CGG*G*G−3′、または
(15)
【0050】
f) EGFレセプター、例えば
5′−G*G*G*GAC*T*C*CGG*CG*CAGC*G*C−3′、または
5′−G*G*G*GAC*T*C*CGG*CG*CAGC*G*CG*G*G*G−3′、または
5′−G*G*GGGAC*T*C*CGG*CG*CAGC*G*CGG*G*G−3′、または
(16)
【0051】
5′−G*G*G*GCAAACT*T*TCTT*T*TCCT*C*C−3′、または
5′−G*G*G*GCAAACT*T*TCTT*T*TCCT*C*CGG*G*G−3′、または
(17)
【0052】
g) p53腫瘍抑制剤、例えば
5′−G*G*GGGAAGGAGGAGGAT*GA*G*G−3′、または
5′−G*G*GGGAAGGAGGAGGAT*GAGGG*G*G−3′、または
(18)
【0053】
5′−G*G*G*G*CAGT*CAT*C*CAGC*TT*CGG*A*G−3′、または
5′−G*G*GG*CAGT*CAT*C*CAGC*TT*CGGAG*G*G*G−3′、または
(19)
【0054】
h) bFGF、例えば
5′−G*G*GGC*TGCCA*TGGT*C*C*C−3′
5′−G*G*G*GC*TGCCA*TGGT*CC*CG*G*G*G−3′
(31)
【0055】
i) VEGF、例えば
5′−G*G*G*GAAGT*T*CA*TGGT*T*TCG*G*G*G−3′
(34)
【0056】
本発明の医薬組成物は、例えばインテグリンまたは細胞−細胞付着レセプター、例えばVLA−4、VLA−2、ICAMまたはELAMによって影響される疾病を治療するのにも好適である。
【0057】
これらの標的に有効な新規なアンチセンスオリゴヌクレオチドの例としては、下記のようなものが挙げられる。
a) VLA−4、例えば
5′−G*G*G*GC*AG*TAAGC*AT*C*CAT*A*T*C−3′、または
5′−G*G*G*GC*AG*TAAGC*AT*C*CAT*AT*CG*G*G*G−3′、または
(20)
【0058】
b) ICAM、例えば
5′−G*G*G*G*C*C*CCCAC*CACT*T*C*CCCTC*T*C−3′、または
5′−C*C*C*CCAC*CACT*T*C*CCCT*C*T*C*G*G*G*G−3′、または
5′−G*G*G*G*C*C*C*CCAC*CACT*T*C*CCCT*C*T*C*G*G*G*G−3′、または
(21)
【0059】
5′−G*G*G*C*T*C*CCCCAC*CACT*TCCC*C*T*C*G*G*G*G−3′、または
5′−G*G*C*T*C*CCCCAC*CACT*TCCC*C*T*C*G*G*G*G−3′、または
(22)
【0060】
5′−G*G*G*G*C*TGGGAGC*CA*TAG*CGA*G*G−3′、または
5′−G*G*G*G*C*TGGGAGC*CA*TAG*CGA*G*G*G*G−3′、または
5′−G*G*GG*C*TGGGAG*C*CA*TAG*CGAGG*G*G*G−3′、または
(23)
【0061】
c) ELAM−1、例えば
5′−A*C*TGC*TGC*CT*CT*TGT*CT*CA*G*G*G*G−3′、または
5′−G*G*G*GAC*TGC*TGC*CT*CT*TGT*CT*CAGG*G*G−3′、または
(24)
【0062】
5′−G*G*G*GC*AAT*CAAT*GAC*TT*CAAGAGT*T*C−3′、または
5′−C*A*ATCAAT*GAC*TT*CAAGAGT*T*CGG*G*G−3′
(25)
【0063】
本発明の医薬組成物は、例えばTNF−αのような因子によって引き起こされる疾病の治療にも好適である。
【0064】
これらの標的に対して有効な新規なアンチセンスオリゴヌクレオチドの例としては、下記のようなものが挙げられる。
a)TNF−α
5′−G*G*G*GTCATGG*TGTC*CT*TTGCA*G*C*C、
5′−G*G*G*GT*CA*TGG*TGTC*CT*T*TG*CAGC*CG*G*G*G、
5′−G*G*G*GT*CA*TGG*TGTC*CT*T*TG*CAGC*CGG*G*G*G、または
(32)
【0065】
5′−G*G*G*GT*CA*TGG*TGTC*CT*T*TG*CAGG*G*G*G、
5′−T*C*A*TGG*TG*TC*CT*T*TG*CAGG*G*G*G
(33)
【0066】
上に述べたことは、例示用オリゴヌクレオチドの番号付けおよび星印に関して該当する。新規オリゴヌクレオチドを用いて、少なくとも前記の総ての疾病に対する1つの診断薬を製造することもできる。
【0067】
医薬組成物は、例えば錠剤、コーティングした錠剤、硬質または軟質ゼラチンカプセル、溶液、エマルジョンまたは懸濁液の形態で経口投与することができる医薬製剤の形態で用いることができる。それらは、例えば座薬の形態で直腸に、または例えば注射用溶液の形態で非経口的に投与することもできる。医薬製剤を製造するため、これらの化合物を、治療上不活性な、有機および無機賦形剤に配合することができる。このような錠剤、コーティングした錠剤および硬質ゼラチンカプセル用の賦形剤の例は、ラクトース、コーンスターチまたはその誘導体、獣脂酸およびステアリン酸、またはそれらの塩である。溶液を製造するのに好適な賦形剤は、水、ポリオール、スクロース、転化糖およびグルコースである。注射溶液に好適な賦形剤は、水、アルコール、ポリオール、グリセロールおよび植物油である。座薬に好適な賦形剤は、植物および硬化油、ワックス、脂肪および半液体状ポリオールである。医薬製剤は、防腐剤、溶媒、安定剤、湿潤剤、乳化剤、甘味料、染料、香味料、浸透圧を変化させるための塩、緩衝剤、コーティング剤、酸化防止剤、および場合によっては他の治療活性を有する化合物を含むこともできる。
【0068】
経口投与および注射が好ましい。注射には、アンチセンスオリゴヌクレオチドは液体溶液、好ましくは生理学的に許容可能な緩衝液、例えばハンクス溶液またはリンゲル溶液中で処方される。しかしながら、アンチセンスオリゴヌクレオチドを固形状で処方して、使用前に溶解または懸濁することもできる。全身投与に好ましい投与量は、体重1kgおよび1日当たり約0.01mg〜約50mgである。
【0069】
【実施例】
下記の実施例は、本発明を更に詳細に説明するためのものである。表1は、HSV−1に対するイン・ビトロ活性を試験したオリゴヌクレオチドを示している。オリゴヌクレオチド4は、Mannら(Bioconj. Chem., 3: 554, 1992)に記載されているように、5′末端に[4−(1−ピレニル)ブタニル]ホスホジエステルを導入することによって修飾されている。新規なオリゴヌクレオチドは、9μM(実施例1および4)程度、または3μM(実施例2および3)の最小阻止濃度でも効果を発揮する。
【0070】
実施例1 オリゴヌクレオチド合成
未修飾のオリゴヌクレオチドを、自動DNA合成装置(Applied Biosystems、380Bまたは394型)上で、標準的ホスホルアミダイト化学を用いて、ヨウ素で酸化して合成した。混合ホスホロチオエートおよびホスホジエステルオリゴヌクレオチドにホスホロチオエートブリッジを導入するため、ヨウ素(Applied Biosystems User Bulletin 65)を用いる代わりにTETD(テトラエチルチウラムジスルフィド)を用いて酸化を行なった。固形支持体(CPGまたはTentagel)から開裂して、55℃で濃NH3を用いて18時間保護基を除去した後、オリゴヌクレオチドを最初にブタノール沈澱(Sawadogo, Van Dyke, Nucl. Acids Res., 19: 674, 1991)によって精製した。次に、エタノール2.5容量部を含む0.5M NaCl溶液から沈澱させることによってナトリウム塩を得た。
【0071】
オリゴヌクレオチドは、下記の方法によって分析した。
a) 20%アクリルアミド、8M尿素、45mMトリス−ボレート緩衝液、pH7.0、中での分析的ゲル電気泳動、および/または
b) HPLC分析:Waters GenPak FAX、グラディエントCH3CN(400ml)、H2O(1.6リットル)、NaH2PO4(3.1g)、NaCl(175.3g)、pH6.8(NaClに関して1.5M)の後、CH3CN(400ml)、H2O(1.6リットル)、NaH2PO4(3.1g)、NaCl(11.7g)、pH6.8(NaClに関して0.1M)、および/または
c) 毛細管ゲル電気泳動、Beckmann毛細管eCAPTM、U100Pゲルカラム、長さ65cm、内径100mm、窓 一端から15cm、緩衝液140μM トリス、360mMホウ酸、7M尿素、および/または
d) エレクトロスプレーマススペクトル分析法
オリゴヌクレオチドの分析を行なったところ、それらのそれぞれの純度は90%を上回った。
【0072】
実施例2 ヘルペスウイルスに対する試験物質のイン・ビトロでの抗ウイルス活性の検討
ヒトに対して病原性を有する各種のヘルペスウイルスに対する試験物質の抗ウイルス活性を、細胞培養試験系で検討する。
実験のため、血清含有ダルベッコMEM(5%ウシ胎児血清(FCS))中のサル腎細胞(Vero, 2×105/ml)を96穴マイクロタイタープレートに播種し、5%CO2雰囲気中で37℃24時間インキュベーションする。次に、血清含有培地を吸引除去し、細胞を無血清ダルベッコMEMで2回洗浄する。
【0073】
試験物質をH2Oで600μMの濃度に希釈し、溶液を−18℃で保存する。試験のため、ダルベッコ最小必須培地(MEM)中で更に希釈段階を行なう。個々の試験物質希釈物のそれぞれ100μlを無血清ダルベッコMEM(−FCS)100μlと共に、洗浄済み細胞に加える。37℃および5%CO2中で3時間インキュベーションした後、細胞ローン(cell lawn) が3日以内に完全に破壊される濃度の単純ヘルペスウイルス1型(ATCC VR733、HSV−1 F株)または単純ヘルペスウイルス2型(ATCC VR734、HSV−2 G株)に、細胞を感染させる。HSV−1の場合には、感染強度は500プラーク形成単位(PFU)/ウェルであり、HSV−2の場合には、感染強度は350PFU/ウェルである。次に、実験混合物は、100U/mlのペニシリンGおよび100mg/リットルのストレプトマイシンを補足したMEM中80μM〜0.04μMの濃度の試験物質を含む。総ての実験は、コントロールは別として2回測定を行ない、コントロールはプレート当たり8回行なう。
【0074】
実験混合物を、37℃で、5%CO2中で17時間インキュベーションする。全部で20時間のインキュベーション時間の後、試験物質の細胞毒性を、細胞培養物の顕微鏡観察によって測定する。上記の実験条件下で顕微鏡的に認められる細胞の損傷を全く引き起こさない最高製剤濃度を、最大耐用用量(MTD)と呼ぶ。
【0075】
次に、FCSを4%の最終濃度にFCSを加え、プレートを37℃で、5%CO2中で更に55時間インキュベーションする。このとき、未処理の感染コントロールは、完全に展開した細胞障害効果(CPE)を示す。細胞培養物を顕微鏡観察した後、Finterの生体染色法(1966年)によりニュートラル・レッドで染色する。試験物質の抗ウイルス活性は、ウイルスによる細胞障害効果から細胞を30〜60%保護するのに要する最小阻止濃度(MIC)として定義される。
【0076】
第1表:細胞培養物中のHSV−1に対する各種の修飾アンチセンスオリゴヌクレオチドの活性。
【表1】
Figure 0004118348
ホスホロチオエートブリッジ(P=S)によって置換されたホスホジエステル結合を、配列中で*で標識した。MIC=最小阻止濃度、MTD=最大耐用用量、Py=ピレン。

Claims (15)

  1. 下記の式を有するオリゴヌクレオチド。
    5′−(CAP)−(Oligo)−(CAP)−3′
    (式中、
    (Oligo)は、標的配列に相補的な14〜40ヌクレオチド長のヌクレオチド配列であり、
    CAPはGmであり、但しmは3である)
  2. Oligo部分のヌクレオチド配列が、DNAの転写または対応するmRNAの翻訳に重要な遺伝子の領域に由来する、請求項1に記載のオリゴヌクレオチド。
  3. (Oligo)が
    ACACCCAATTCTGAAAATGG (I)
    AGGTCCCTGTTCGGGCGCCA (II)
    GTCGACACCCAATTCTGAAAATGGATAA (III)
    GCTATGTCGACACCCAATTCTGAAA (IV)
    GTCGCTGTCTCCGCTTCTTCTTCCTG (V)
    GTCTCCGCTTCTTCTTCCTGCCATAGG (VI)
    GCGGGGCTCCATGGGGGTCG (VII)
    CAGCTGCAACCCAGC (VIII)
    GGCTGCTGGAGCGGGGCACAC (IX)
    AACGTTGAGGGGCAT (X)
    GTGCCGGGGTCTTCGGGC (XI)
    GGAGAACATCATGGTCGAAAG (XII)
    CCCGAGAACATCATGGTCGAAG (XIII)
    GGGAAAGCCCGGCAAGGGG (XIV)
    CACCCGCCTTGGCCTCCCAC (XV)
    GGGACTCCGGCGCAGCGC (XVI)
    GGCAAACTTTCTTTTCCTCC (XVII)
    GGGAAGGAGGAGGATGAGG (XVIII)
    GGCAGTCATCCAGCTTCGGAG (XIX)
    GCAGTAAGCATCCATATC (XX)
    CCCCCACCACTTCCCCTCTC (XXI)
    CTCCCCCACCACTTCCCCTC (XXII)
    GCTGGGAGCCATAGCGAGG (XXIII)
    ACTGCTGCCTCTTGTCTCAGG (XXIV)
    CAATCAATGACTTCAAGAGTTC (XXV)
    GGTCCCTGTTCGGGCGCCA (XXVI)
    GTGCCGGGGTCTTCGGG (XXVII)
    GGAGGATGCTGAGGAGG (XXVIII)
    GGAGGATGCTGAGG (XXIX)
    CAGGAGGATGCTGAGGAGG (XXX)
    GGCTGCCATGGTCCC (XXXI)
    TCATGGTGTCCTTTGCAGCC (XXXII)
    TCATGGTGTCCTTTGCAG (XXXIII) または
    AAGTTCATGGTTTCGG (XXXIV)
    である、請求項1または2に記載のオリゴヌクレオチド。
  4. 配列C*A*GGAGGAT*−GC*T*−GAGGA*G*G(*は、ホスホロチオエートブリッジ(P=S)によって置換されたリン酸ジエステル結合を表す)を有する、請求項1または2に記載のオリゴヌクレオチド。
  5. オリゴヌクレオチドが修飾されている、請求項1〜3のいずれか一項に記載のオリゴヌクレオチド。
  6. 2〜10個の非末端ピリミジンヌクレオシドが修飾されている、請求項5に記載のオリゴヌクレオチド。
  7. オリゴヌクレオチドが、5′−末端および/または3′−末端ヌクレオチドで修飾されている、請求項6に記載のオリゴヌクレオチド。
  8. 互いに結合している少なくとも1〜4個のヌクレオチドの1個以上の基が修飾されていない、請求項5〜7のいずれか一項に記載のオリゴヌクレオチド。
  9. 修飾が、
    (a) 3′および/または5′リン酸ジエステルブリッジの完全なまたは部分的置換、および/または
    (b) 3′または5′リン酸ジエステルブリッジの「デホスホ」ブリッジによる完全なまたは部分的置換、および/または
    (c) 糖ホスフェート主鎖の完全なまたは部分的置換、および/または
    (d) β−D−2′−デオキシリボース単位の完全なまたは部分的置換、および/または
    (e) 天然のヌクレオシド塩基の完全なまたは部分的置換
    として定義される、請求項5〜8のいずれか一項に記載のオリゴヌクレオチド。
  10. 修飾が、
    (a) ホスホロチオエート、ホスホロジチオエート、(NR1R2)−ホスホルアミデート、ボラノホスフェート、ホスフェート−(C1〜C21)−O−アルキルエステル、ホスフェート−[(C6〜C12)アリール−(C1〜C21)−O−アルキル]エステル、2,2,2−トリクロロジメチルエチルホスホネート、(C1〜C8)−アルキルホスホネートまたは(C6〜C12)−アリールホスホネートブリッジであり、
    但しR1およびR2は、互いに独立に、水素、または(C1〜C18)−アルキル、(C6〜C20)−アリール、(C6〜C14)−アリール−(C1〜C8)−アルキル、または−(CH2)c−[NH(CH2)c]d−NR3R3であり、cは2〜6の整数であり、dは0〜6の整数であり、R3は互いに独立に、水素、(C1〜C6)−アルキルまたは(C1〜C4)−アルコキシ−C1〜C6−アルキルであるか、またはR1およびR2は、それらが結合している窒素原子と一緒になって、群O、SおよびNから選択されるもう一つのヘテロ原子を更に有することができる5〜6員の複素環を形成し、
    (b) ホルムアセタール、3′−チオホルムアセタール、メチルヒドロキシルアミン、オキシム、メチレンジメチルヒドラゾ、ジメチレンスルホン、またはシリル基、
    (c) 「モルホリノヌクレオチド」−オリゴマー、
    (d) α−D−2′−デオキシリボース、L−2′−デオキシリボース、2′−F−2′−デオキシリボース、2′−O−(C1〜C6)アルキル−リボース、2′−O−(C2〜C6)アルケニル−リボース、2′−NH2−2′−デオキシリボース、β−D−キシロフラノース、α−アラビノフラノース、2,4−ジデオキシ−β−D−エリスロヘキソピラノース、または炭素環状、開放鎖状または二環式糖類似物、
    (e) 5−(ヒドロキシメチル)ウラシル、5−アミノウラシル、シュードウラシル、ジヒドロウラシル、5−(C1〜C6)アルキル−ウラシル、5−(C2〜C6)アルケニル−ウラシル、5−(C2〜C6)−アルキニル−ウラシル、5−(C1〜C6)−アルキル−シトシン、5−(C2〜C6)−アルケニル−シトシン、5−(C2〜C6)−アルキニル−シトシン、5−フルオロウラシル、5−フルオロシトシン、5−クロロウラシル、5−クロロシトシン、5−ブロモウラシル、または5−ブロモシトシンであって、
    ヌクレオシド塩基がCAP領域で置換されていないもの、
    として定義される、請求項9に記載のオリゴヌクレオチド。
  11. 5′末端および/または3′末端において、ポリリシン;挿入剤;蛍光化合物;架橋剤;親油性分子;脂質;ステロイド;ビタミン;およびポリエチレングリコールまたはオリゴエチレングリコール;(C12〜C18)−アルキル−ホスフェートジエステルまたは−O−CH2−CH(OH)−O−(C12〜C18)−アルキルから選択される分子に結合している、請求項1〜10のいずれか一項に記載のオリゴヌクレオチド。
  12. 5′末端および/または3′末端において、3′−3′逆位および/または5′−5′逆位を含む、請求項1〜11のいずれか一項に記載のオリゴヌクレオチド。
  13. 化学的に合成することを特徴とする、請求項1〜12のいずれか一項に記載のオリゴヌクレオチドの製造法。
  14. ウイルスによって引き起こされる疾病の治療、癌または再狭窄の治療、またはインテグリンもしくは細胞−細胞付着レセプターによって影響されまたは拡散性因子によって引き起こされる疾病の治療用医薬組成物を製造するための、請求項1〜12のいずれか一項に記載のオリゴヌクレオチドの使用。
  15. ウイルスによって引き起こされる疾病、癌または再狭窄、またはインテグリンもしくは細胞−細胞付着レセプターによって影響されまたは拡散性因子によって引き起こされる疾病の診断薬を製造するための、請求項1〜12のいずれか一項に記載のオリゴヌクレオチドの使用。
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