JP3102944B2 - L−フェニルアラニル−tRNAシンテターゼ変異体、その製造法および非タンパク質誘発性アミノ酸のペプチドまたはタンパク質へのインビボでの組込みのためのその使用 - Google Patents

L−フェニルアラニル−tRNAシンテターゼ変異体、その製造法および非タンパク質誘発性アミノ酸のペプチドまたはタンパク質へのインビボでの組込みのためのその使用

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Description

【発明の詳細な説明】
【0001】本発明は、遺伝子工学によって生じた修飾
により基質選択性が変化した微生物に由来するL−フェ
ニルアラニル−tRNAシンテターゼ、およびその製造
および非タンパク質誘発性(non-proteinogenous)アミノ
酸のペプチドまたはタンパク質へのインビボでの組込み
のための使用に関する。
【0002】本発明の主題は、ピーター・カスト(Peter
Kast)博士の論文の形で1991年8月22日に公表さ
れた(分子レベルでの大腸菌フェニルアラニル−tRN
Aシンテターゼの研究:フェニルアラニン特異性決定因
子の同定および遺伝子工学、並びに緩和特異性変異体の
可能な応用(Investigations on Escherichia coliPheny
lalanyl-tRNA Synthetase at the Molecular Level: Id
entification andGenetic Engineering of a Phenylala
nine Specificity Determinant and Possible Applicat
ion of a Relaxed Specificity Mutant);ETH論文番
号9468号、ETH チューリッヒ、1991年、お
よびピー・カスト(P. Kast)ら、(1991年)J. Mo
l. Biol., 222, 99-124頁)。
【0003】L−フェニルアラニル−tRNAシンテタ
ーゼ(E)は、次のような反応工程を触媒する。 E+Phe+ATP←−→(E−Phe−AMP)+PP (E−Phe−AMP)+tRNAPhe ←−→Phe−tRNAPhe +AMP+ E
【0004】大腸菌(E. coli) K12由来のL−フェニ
ルアラニル−tRNAシンテターゼは四次構造αβ
を有する。今日までの研究により、tRNAPhe 結合部
位は酵素の大きなβサブユニット上に配置され、L−フ
ェニルアラニンおよびATP結合決定基は恐らく小さな
αサブユニット上に配置されていることが明らかになっ
ている。触媒的活性中心は、これらのサブユニットの接
触点に配置されているものと考えられる。
【0005】大腸菌(E. coli) K12、ネズミチフス菌
(Salmonella typhimurium)、枯草菌(Bacillus subtili
s) 、好熱菌(Thermus thermophilus)、およびSaccharom
yces cerevisiae(ミトコンドリア)由来のL−フェニ
ルアラニル−tRNAシンテターゼのαサブユニットの
アミノ酸配列は、C−末端の配列がかなり類似してい
る。
【0006】対照的に、酵母細胞質由来の酵素のαサブ
ユニットと、大腸菌K12および前記の微生物由来の酵
素のαサブユニットのアミノ酸の類似性は、余り明確で
はない。例えば、グリシン残基は酵母の細胞質由来の酵
素のアミノ酸位置458に位置しているのに対し、アラ
ニン残基は、酵母ミトコンドリアまたは細菌性のL−フ
ェニルアラニル−tRNAシンテターゼ由来の酵素の対
応する位置(例えば、大腸菌K12由来の酵素のαサブ
ユニットの位置294)にそれぞれ存在している。
【0007】大腸菌K12及び酵母の細胞質由来の既知
のL−フェニルアラニル−tRNAシンテターゼは、天
然のL−フェニルアラニンだけでなく、非天然アミノ酸
のp−F−L−フェニルアラニンをも移すことも知られ
ている。しかしながら、この非タンパク質誘導性アミノ
酸の転位は天然のL−フェニルアラニンの転位ほど顕著
に効率的には起こらない[エイチ・ジェイ・ガビアス
(H.J. Gabius) ら、(1983年)、Biochemistry, 2
2, 2331-2339 、およびピーター・カスト(Peter Kas
t)、ETHチューリッヒ、ETH論文番号9468号、
1991年]。パラ位がハロゲン化された他のL−フェ
ニルアラニン残基またはその誘導体の転位は、今日まで
観察されていない。
【0008】オペロンコードL−フェニルアラニル−t
RNAシンテターゼは、既に大腸菌K12から単離され
ている。この酵素の関連したαおよびβサブユニット
は、遺伝子pheSおよびpheTによってコードされ
る。本発明の範囲内の大腸菌K12のpheS遺伝子の
DNA配列分析は、ジー・ファイアット(G. Fayat)らに
よって公表されたデーターと対比してGCT(L−アラ
ニン)コドンの代わりにヌクレオチド位置220〜22
2におけるCGT(L−アルギニン)コドンであること
が明らかになった(1983年、J. Mol. Biol., 171,
239-261 )。
【0009】非タンパク質誘発性アミノ酸のタンパク質
またはペプチド活性物質への組込み、例えば、p−F−
L−フェニルアラニンのアンギオテンシンIIまたはブ
ラジキニンへのインビトロでの組込み(ダブリュ・エイ
チ・ヴィーン(W.H. Vine) ら、1973, Biochemistry, 1
2, 1630-1637 )L−2−アミノヘキサン酸のヒト表皮
成長因子(エイチ・コイド(H. Koide)ら、1988, Proc.
Natl. Acad.Sci. USA, 1988, 85, 6237-6241)または他
のタンパク質へのインビボでの組込みによってその特
性、例えばその生物学的活性、毒性、安定性、溶解性ま
たは吸収性を変化させ且つタンパク質分解性の分解を防
止することができる。
【0010】今日までのところ、非タンパク質誘導性ア
ミノ酸のタンパク質またはペプチド活性物質へのインビ
ボ組込みの利用可能性は全く変わらないままであったの
であり、すなわち高い基質特異性によって一般的に区別
され、それ故基質としての非タンパク質誘導性のアミノ
酸を受容する微生物由来の天然のアミノアシル−tRN
Aシンテターゼはごくわずかしか利用されずまたは全く
利用されない。
【0011】大腸菌(E. coli) K12、ネズミチフス菌
(Salmonella typhimurium)、好熱菌(Thermus thermophi
lus)、枯草菌(Bacillus subtilis) および酵母ミトコン
ドリア(Saccharomyces cerevisiae)由来のL−フェニ
ルアラニル−tRNAシンテターゼのαサブユニットに
おけるC−末端アミノ酸配列:Gly,Phe|Tr
p,Ala,Phe,Gly,Met|Leu,Gl
y中の保存されたアラニン残基()をグリシン残基で
置きかえることによって、L−フェニルアラニル−tR
NAシンテターゼの基質選択性が広くなることを意外に
も見出した。
【0012】したがって、本発明は、 1. 配列Gly,Phe|Trp,Ala,Ph
e,Gly,Met|Leu,Gly中の保存されたア
ラニン残基()がDNA水準での修飾によってグリシ
ンに変化している、L−フェニルアラニル−tRNAシ
ンテターゼ; 2. 1に記載のL−フェニルアラニル−tRNAシン
テターゼをコードするDNAまたはRNA配列; 3. 1.に記載のL−フェニルアラニル−tRNAシ
ンテターゼを含む細胞または微生物; 4. 変化したL‐フェニルアラニル‐tRNAシンテ
ターゼの製造法; 5. 非タンパク質誘導性アミノ酸のペプチドまたはタ
ンパク質へのインビボ組込みのための変化したL−フェ
ニルアラニル−tRNAシンテターゼの使用、に関す
る。
【0013】本発明を、以下において詳細に説明する。
本発明を更に請求項の内容によって定義する。
【0014】総ての遺伝子工学的操作は、ジェイ・サム
ブルック(J. Sambrook)ら(分子クローニング(Molecul
ar Cloning) 、コールド・スプリング・ハーバー・ラボ
ラトリー(Cold Spring Harbor Laboratory) 、1989
年)に指示されている手順にしたがって行った。
【0015】微生物由来のL−フェニルアラニル−tR
NAシンテターゼの遺伝子(PheRS遺伝子) の遺伝子工学
的修飾:下記の微生物由来のL−フェニルアラニル−t
RNAシンテターゼのαサブユニットをコードする遺伝
子のクローニングは、既に記載されている:大腸菌(E.
coli) K12(ジー・ファイアット(G. Fayat)ら、198
3, J. Mol. Biol., 171,239-261 )、ネズミチフス菌
(Salmonella typhimurium)および好熱菌(Thermusthermo
philus) (ピー・カスト(P. Kast)1991 、博士論文、E
THチューリッヒ、ETH番号9468号)、枯草菌(B
acillus subtilis) (エイ・エイ・ブラケージ(A.A. Br
akhage) ら、1990, Biochemie, 72, 725-734; - 正誤
表、1991,Biochemie, 73,127 )および酵母(ミトコン
ドリア)(ティー・ジェイ・ケルナー(T.J. Koerner)
ら、1987, J. Biol. Chem., 262, 3690-3696)。
【0016】記載されている単離されたシンテターゼ遺
伝子またはそれから誘導されるオリゴデオキシヌクレオ
チドは、他の微生物に由来するシンテターゼ遺伝子の単
離およびクローニングのためのDNAハイブリダイゼー
ションにおけるプローブとして用いることができる。
【0017】遺伝子工学によって生じたDNAレベルで
の修飾により、L−フェニルアラニル−tRNAシンテ
ターゼ遺伝子の配列Gly,Phe|Trp,Al
,Phe,Gly,Met|Leu,Gly中の保
存されたアラニン残基()がグリシンに変化する。
【0018】この保存された配列内部には、種によって
は、フェニルアラニンまたはトリプトファン残基(Ph
e|Trp)またはメチオニンまたはロイシン残基(M
et|Leu)があることが見出されている。
【0019】最終的にはアラニン残基をグリシン残基に
よって置換する目的の遺伝子工学的修飾のために、各種
の当業者に既知の方法を用いることができる(ジェイ・
サムブルック(J. Sambrook) ら、1988年)。ケイ・
エル・ナカマエ(K.L. Nakamaye) ら、1986, Nucl. Acid
s Res., 14, 9679-9698 頁の方法を用いるのが好まし
い。このためには、単離されたL−フェニルアラニル−
tRNAシンテターゼ遺伝子を、一本鎖DNAを調製す
ることができる好適なベクター(例えば、pBules
criptKS(+)ベクター、pBLS、ストラタ
ジーン(Stratagene)、ハイデルベルク、ドイツ)中に再
クローニングする。これらのベクター中にクローニング
されたシンテターゼ遺伝子の配向は、下記のオリゴデオ
キシヌクレオチドがそれぞれの場合に形成される一本鎖
DNAに結合するように選択される。
【0020】シンテターゼ遺伝子を含むプラスミドの一
本鎖DNAは、ヘルパーファージ(例えば、VCSM1
3、ストラタジーン(Stratagene)、ハイデルベルク、ド
イツ)を用いる重感染によって、宿主株(例えば、大腸
菌TG1、アメルシャム・ブッフラー(Amersham Buchle
r)、ブラウンシュバイク、ドイツ)中で調製され、微生
物について下に示される合成の20マー(mer) のオリゴ
デオキシヌクレオチドの1種類またはそれ以上を用いて
突然変異誘発に用いられる: 1. 大腸菌K12: 5′CTGGTTTCGGCTTCGGGATG3′お
よび/または 5′CTGGTTTCGGTTTCGGGATG3′お
よび/または 5′CTGGTTTCGGATTCGGGATG3′お
よび/または 5′CTGGTTTCGGGTTCGGGATG3′ 2. ネズミチフス菌: 5′CTGGCTTCGGTTTTGGTATG3′お
よび/または 5′CTGGCTTCGGCTTTGGTATG3′お
よび/または 5′CTGGCTTCGGATTTGGTATG3′お
よび/または 5′CTGGCTTCGGGTTTGGTATG3′ 3. 枯草菌: 5′AGGGCTTCGGATTCGGAATG3′お
よび/または 5′AGGGCTTCGGTTTCGGAATG3′お
よび/または 5′AGGGCTTCGGCTTCGGAATG3′お
よび/または 5′AGGGCTTCGGGTTCGGAATG3′ 4. 好熱菌: 5′ACGGCTTCGGCTTCGGGCTC3′お
よび/または 5′ACGGCTTCGGATTCGGGCTC3′お
よび/または 5′ACGGCTTCGGTTTCGGGCTC3′お
よび/または 5′ACGGCTTCGGGTTCGGGCTC3′ 5. 酵母ミトコンドリア: 5′TTGGGTGGGGTTTTGGCTTG3′お
よび/または 5′TTGGGTGGGGATTTGGCTTG3′お
よび/または 5′TTGGGTGGGGCTTTGGCTTG3′お
よび/または 5′TTGGGTGGGGGTTTGGCTTG3′。
【0021】オリゴデオキシヌクレオチドは、(例え
ば、アプライド・バイオシステムス(Applied Biosystem
s)380B型DNA合成装置を用いて)ホスフォルアミ
ダイト法によって合成される。
【0022】例えば、エフ・サンガー(F. Sanger) らの
方法(1977年)によるDNA配列決定法を用いて、
L−フェニルアラニル−tRNAシンテターゼ遺伝子に
おけるグリシンコドンによるアラニンコドンの置換が起
こったかどうかをチェックする。
【0023】生成する変化したシンテターゼ遺伝子は、
相同組換えによって、細菌性株[ビー・アール・ボッフ
ナー(B.R. Bochner)ら(1980年)、J. Bacteriol.,
143, 926-933 頁およびエス・シー・ウィナンス(S.C.
Winans) ら、(1985年)、J. Bacteriol., 161, 12
19-1221 頁]の染色体に組込まれ、またはベクター(例
えば、組換え体大腸菌K12 DSM4416およびA
TCC37161由来のpHE3)中に再クローニング
され、且つ非タンパク質誘発性アミノ酸のペプチドまた
はタンパク質(標的ペプチドまたはタンパク質)中への
インビボ組込みに用いられる。プラスミドpHE3を含
む大腸菌株は、p−F−L−フェニルアラニンに感受性
である。
【0024】組換え体とは、細菌性または酵母の株が1
種類またはそれ以上のプラスミドを有することを意味し
ている。パラ位がハロゲン化されたL−フェニルアラニ
ンおよびその誘導体は、非タンパク質誘発性(non-prote
inogenous)アミノ酸として定義される。ハロゲン化は、
置換基である塩素、フッ素、臭素またはヨウ素によって
行うことができる。
【0025】遺伝子工学によって改質されたL−フェニ
ルアラニル−tRNAシンテターゼの非タンパク質誘発
性アミノ酸のペプチドまたはタンパク質へのインビボ組
込みのための使用:微生物、好ましくは大腸菌K12
は、非タンパク質誘発性アミノ酸、好ましくはバラ位が
ハロゲン化されたL−フェニルアラニンまたはその誘導
体、例えば3,4−ジ−F−Lフェニルアラニン、p−
F−L−フェニルアラニン、p−Cl−L−フェニルア
ラニン、p−Br−L−フェニルアラニン、p−I−L
−フェニルアラニンを、ペプチドまたはタンパク質[エ
ス・ジョセフソン(S. Josephson)ら(1988年)、Tr
ends Biotechnol., 6, 218-224頁]、例えばヒルジン
(欧州特許第171024号明細書)、ミニプロインシ
ュリン(欧州特許第034778号明細書)およびヒル
ジン誘導体(欧州特許第448093号明細書)中、コ
ロニー刺激因子、例えばh−GM−CSF(欧州特許第
228018号明細書)中、インターフェロンα(欧州
特許第164069号明細書)およびγ(欧州特許第4
27633号明細書)中、ヒト線維芽細胞インターフェ
ロン(英国特許第2069504号明細書)およびヒト
白血球インターフェロン(欧州特許第34307号明細
書)中、およびインターロイキン−2(欧州特許第16
3249号明細書)およびニシンカルシトニンI(欧州
特許第261552号明細書)中へのインビボ組込みの
ための宿主細胞として用いられる。大腸菌K12 HB
101(ATCC33694)または大腸菌K12 R
R28(ATCC35111またはDSM4415)を
用いるのが極めて好ましい。
【0026】宿主細胞は、改質したL−フェニルアラニ
ル−tRNAシンテターゼ遺伝子および標的ペプチドま
たはタンパク質をコードする標的遺伝子を常に含まなけ
ればならない。大腸菌K12由来の改質したシンテター
ゼ遺伝子pheS−Gly294および誘発可能な標的
遺伝子は、好ましくは宿主株、極めて好ましくは大腸菌
K12中でIPTG(イソプロピルβ−チオガラクトシ
ド)によって誘発可能であるミニプロインシュリン融合
タンパク質に用いられる。例えばヒルジン(欧州特許第
17 1024号明細書)、ミニプロインシュリン(欧
州特許第034778号明細書)、ヒルジン誘導体(欧
州特許第44 8093号明細書)のような他の標的タ
ンパク質の遺伝子、例えばh−GM−CSF(欧州特許
第228018号明細書)、インターフェロンα(欧州
特許第164069号明細書)およびγ(欧州特許第4
27633号明細書)、ヒト線維芽細胞インターフェロ
ン(英国特許第2069 504号明細書)、ヒト白血
球インターフェロン(欧州特許第34307号明細書)
およびインターロイキン−2(欧州特許第163249
号明細書)およびニシンカルシトニンI(欧州特許第2
61552号明細書)のようなコロニー刺激因子の遺伝
子を用いることもできる。ミニプロインシュリン融合タ
ンパク質遺伝子の調製は、欧州特許第034778号明
細書に記載されている。
【0027】修飾したシンテターゼ遺伝子は、染色体中
または宿主細胞のプラスミドに含まれていることができ
る。修飾したシンテターゼ遺伝子は、好ましくは組換え
大腸菌K12 DSM4416またはATCC3716
1株由来のプラスミドpHE3に配置されている。この
目的のために、プラスミドpHE3に配置されたwtシ
ンテターゼ遺伝子(wt=野生型)は、当業者に知られ
ている方法を用いて修飾したシンテターゼ遺伝子で置換
する。
【0028】非タンパク質誘発性アミノ酸のタンパク質
またはペプチド中へのインビボ組込みには、第一のプラ
スミド(例えば、大腸菌DSM4416またはATCC
37161由来のpHE3、前記を参照されたい)上に
改変したL−フェニルアラニル−tRNAシンテターゼ
遺伝子を含み且つ第一のプラスミドと適合性の第二のプ
ラスミド上にクローニングして誘発可能な標的遺伝子を
有する大腸菌K12宿主株を用いるのが好ましい。2つ
のプラスミドは適合性であり、2つの異なる耐性遺伝
子、好ましくはクロラムフェニコールおよびアンピシリ
ン耐性遺伝子を有する。
【0029】前記の微生物、好ましくは大腸菌K12
HB101(ATCC33694)を、グルコース、チ
ロシン、トリプトファン、チアミンおよび適当な抗生物
質(例えば、クロラムフェニコールおよびアンピシリ
ン)並びに必要なアミノ酸(例えば、L−プロリンおよ
びL−ロイシン)と37℃で混合した最少培地中で振盪
する。後期指数期に到達したならば、1種類またはそれ
以上の非タンパク質誘発性アミノ酸とIPTG(イソプ
ロピルβ−チオガラクトシド)を誘発剤として加え、微
生物を37℃で更に3〜6時間振盪する。細胞内部に産
生され且つ非タンパク質誘発性アミノ酸残基を含む融合
タンパク質を通常の方法によって単離することができ、
標的タンパク質を既知の処理法によって得ることができ
る。
【0030】非タンパク質誘発性アミノ酸の標的タンパ
ク質中への組込みを最適にするために、他のコントロー
ル配列を用いて各種の調節系と結合させることも可能で
ある。
【0031】例えば、プラスミド(例えば、pUC1
8、ベーリンガー・マンハイム(Boehringer Mannheim)
、ドイツ)上に配置された標的遺伝子の転写は、(例
えば、プラスミドpTZ18RまたはpTZMR、ファ
ルマシア・エルケービー・バイオテクノロジー(Pharmac
ia LKB Biotechnology) 、ウプサラ、スェーデン由来
の)T7プロモーターによって起こすことができる。転
写は更に、(例えば、プラスミドpYEJ001、ファ
ルマシア・エルケービー・バイオテクノロジー(Pharmac
ia LKB Biotechnology) 由来の)タンデムに配置された
2つのlacオペレーター要素および(例えば、ファル
マシア・エルケービー・バイオテクノロジー(Pharmacia
LKB Biotechnology) 製プラスミドpPl−λ、由来
の)λプロモーター−オペレーター系によって制御され
るアンチセンスRNAによって調節することもできる。
アンチセンスRNAの転写は、合成または天然のターミ
ネーター(合成:例えば、trp転写ターミネーター;
天然:例えば、ファルマシア・エルケービー・バイオテ
クノロジー(Pharmacia LKB Biotechnology) 製プラスミ
ドpKK223−3由来のrrn BT)によっ
て停止する。
【0032】lacIリプレッサー遺伝子は、例え
ば、プラスミドpGEX−2T(ファルマシア・エルケ
ービー・バイオテクノロジー(Pharmacia LKB Biotechno
logy))またはプラスミドpIK10(欧州特許出願第
034778号明細書)から単離される。
【0033】アンチセンスRNA(ティー・ツリモト
(T. Tsurimoto)ら、(1982), Mol. Gen. Genet., 187, 7
9-86頁)の転写に重要なλcItsリプレッサー遺伝子
は、大腸菌ATCC37161またはDSM4416由
来のpHE3のような第二の適合するプラスミド上に配
置することができる。これにより、同時に同じプラスミ
ド(例えば、ファルマシア・エルケービー・バイオテク
ノロジー(Pharmacia LKBBiotechnology)製のプラスミド
pPL−λ由来のnutL、N、TL1)上に配置された
ターミネーター/アンチターミネーター要素およびT7
RNAポリメラーゼ遺伝子(ビー・エイ・モファット
(B. A. Moffatt) ら、(1984), J. Mol.Biol., 173, 265
-269 頁;エス・ターボー(S. Tabor)ら、(1985), Proc.
Natl.Acad. Sci. USA, 82, 1074-1078 頁;エフ・ダ
ブリュ・シュトディエール(F.W.Studier), (1990), Me
thods Enzymol., 185, 60-89頁)の転写が、上流のλプ
ロモーター−オペレーター系(OL L )の助けによっ
て、制御される。ターミネーター(例えば、ファルマシ
ア・エルケービー・バイオテクノロジー(PharmaciaLKB
Biotechnology)製のプラスミドpKK223−3由来
のrrnBT1 2 ターミネーター)は、このOL L
系の上流である。
【0034】DNAレベルで改変したL−フェニルアラ
ニル−tRNAシンテターゼ遺伝子は、染色体上または
非タンパク質誘発性アミノ酸のインビボ組込みのための
第二のプラスミド(例えばp−F−L−Pheまたはp
−Cl−L−Phe)上に存在することができる。
【0035】改変シンテターゼ遺伝子(pheS−Gl
y294)がプラスミド上にあるときには、宿主株は、
染色体をコードし、温度感受性を有する(エル・アイド
リック(L. Eidlic) ら、(1965), J. Bacteriol., 89, 7
06-711頁;エム・コマー(M.Comer)ら、(1976), J. Bac
teriol., 127, 923-932 頁)または天然(wt)の、ま
たはp−F−L−フェニルアラニン−耐性L−フェニル
アラニル−tRNAシンテターゼを有することができ
る。
【0036】L−フェニルアラニンの生合成をコードす
る遺伝子(例えば、pheA)における突然変異誘発に
よって、非タンパク質誘発性アミノ酸の標的タンパク質
への組込みを増加することも可能である。大腸菌K12
株RR28 ATCC35111(p−F−L−Phe
−耐性)を、大腸菌K12株HB101ATCC336
94の代わりに2つのプラスミド(改変pheS遺伝子
を有するプラスミドおよび誘導可能な標的遺伝子を有す
るプラスミド)の宿主として用いることも可能である。
これにより、組換え大腸菌株を、前記のプラスミドのひ
とつで改変pheS遺伝子の発現が抑制によって防止さ
れるかぎり基質類似体p−F−L−フェニルアラニンの
存在下でさえ培養することができる。相同組換えのため
の遺伝子(例えば、recA遺伝子)および細菌性制限
系の遺伝子(例えば、hsdR遺伝子)の突然変異が、
組換え大腸菌K12株の調製および安定性に好ましい。
標的タンパク質の安定性は、細菌性プロテアーゼ系の遺
伝子(lon、clpA、dnaJ、ompTおよびr
poH遺伝子)の突然変異によって増加させることがで
きる。
【0037】第一および第二のプラスミドを、大腸菌K
12株に用いて、非タンパク質誘発性アミノ酸をペプチ
ドまたはタンパク質に組込むことができる。結果は、組
換え大腸菌株となる。組換え株が温度感受性遺伝子、例
えばpheAts、pheStsまたはλcItsリプレッサ
ー遺伝子を含むときには、微生物は最初は28℃で最少
培地で培養される。OD550 が1であるときには、温度
を42℃まで上昇させ、数分(5〜40分)後に標的遺
伝子の発現のための誘導物質(たとえばIPTG)と非
タンパク質誘発性アミノ酸を添加する。
【0038】標的遺伝子の発現をT7プロモーターによ
って行うときには、誘導物質を加えるときにリファンピ
シン200μg/mlを培養液を追加して加える。この
後に42℃で3〜6時間振盪を行う。この時間が経過し
た後、細胞を回収して、標的タンパク質を単離する。
【0039】単離法は、天然のL−フェニルアラニンを
含む標的タンパク質について記載されており、これに対
応してパラ位がハロゲン化された1個またはそれ以上の
L−フェニルアラニン残基を含む標的タンパク質または
その誘導体について用いられるようになっている。この
単離法は、例えば微生物によって分泌されるタンパク
質、ヒルジン(欧州特許第448093号明細書)、お
よび融合タンパク質インターフェロンα(欧州特許第1
64069号明細書)、γ(欧州特許第427633号
明細書)、ミニプロインシュリン(欧州特許第0347
78号明細書)、ニシンカルシトニンI(欧州特許第2
6 1552号明細書)およびGM−CSF(欧州特許
第2280 18号明細書)について記載されている。
組換え株が温度感受性遺伝子を含まないときには、この
株は37℃で培養され、その後の手順は前記の通りであ
る。
【0040】例1 大腸菌K12のL−フェニルアラニル−tRNAシンテ
ターゼ遺伝子(Phe S) の指向性突然変異誘発 プラスミド(pHE3)を、大腸菌ATCC37161
からアルカリ性分解および塩化セシウム密度勾配遠心分
離(ジェイ・サムブルック(J. Sambrook) ら、1989
年)によって単離する。大腸菌K12由来の野生型ph
eS遺伝子を含む1138bpのDdeI/HindI
Iフラグメントを、0.8%アガロースゲルからの電気
溶出によってプラスミドpHE3から溶出する(ジェイ
・サムブルック(J. Sambrook) ら、1989年)。2種
類の下記のオリゴデオキシヌクレオチドを合成し(Appli
ed Biosystems DNA シンセサイザー380B型) 、ジェ
イ・サムブルック(J. Sambrook) ら(1989年)によ
って記載された方法でアデノシン5′−トリホスフェー
ト(ATP)およびポリヌクレオチドキナーゼ(ベーリ
ンガー・マンハイム(Boehringer Mannheim) 、マンハイ
ム(Mannheim)、ドイツ)を用いて5′−ヒドロキシル末
端をホスホリル化する。オリゴデオキシヌクレオチド1 : 5′GACCCCGGGACCAAAATGGCAAGTAAAATAGCCT GATGGGATAGGCTC3′オリゴデオキシヌクレオチド2 : 5′TTAGAGCCTATCCCATCAGGCTATTTTACTTGCC ATTTTGGTCCCGGGGTC3′ 2種類のオリゴデオキシヌクレオチド1および2のそれ
ぞれ5μgを混合して、80℃に加熱し、室温で放置す
ることによって徐々に冷却する。
【0041】この方法でハイブリッド形成したオリゴデ
オキシヌクレオチド1および2を、pHE3から単離さ
れた1138bpDdeI/HindIIフラグメント
にT4DNAリガーゼ(ベーリンガー・マンハイム(Boe
hringer Mannheim) 、マンハイム(Mannheim)、ドイツ)
を用いて連結した後、制限エンドヌクレアーゼSmaI
およびHindII(ベーリンガー・マンハイム(Boehr
inger Mannheim) )で開裂する。大腸菌K12由来の野
生型pheS遺伝子を含む生成する1181bpのSm
aI/HindIIフラグメントを、SmaIで線状化
し脱ホスホリル化したベクターpBLSに、T4DNA
リガーゼを用いて連結する。pBluescript
KS(+)ベクターpBLSは、ジェイ・エム・ショー
ト(J.M. Short)ら、(1988), Nucl Acids Res., 16, 758
3-7600頁によって記載されており、ストラタジーン(Str
atagene)、ハイデルベルク、ドイツから得られる。リガ
ーゼ混合物を、大腸菌K12株TG1(アメルシャム・
ブッフラー(Amersham Buchler)、ブラウンシュヴァイ
ク、ドイツ)のコンピテントな細胞中に形質転換する
(ジェイ・サムブルック(J. Sambrook) ら、1989
年)。生成するアンピシリン耐性クローンのプラスミド
DNAを単離して、AatIIおよびBamHIで処理
する。326bpBamHI/AatIIフラグメント
を有するプラスミドは、pKSB1−Wと呼ばれる。プ
ラスミドpKSB2−Wは、0.867kbのBamH
I/AatIIフラグメントを有する。
【0042】突然変異誘発のために、プラスミドpKS
B2−Wの一本鎖DNAを、宿主株TG1をストラタジ
ーン(Stratagene)、ハイデルベルク、ドイツから入手す
ることができるヘルパーファージVCSM13で重感染
させた後、ストラタジーンによって推奨される方法によ
って調製する。
【0043】配列5′CTGGTTTCGGCTTCG
GGATG3′の20マーのオリゴデオキシヌクレオチ
ドをアプライド・バイオシステムス(Applied Biosystem
s)DNAシンセサイザー(380B型)を用いて指向性
突然変異誘発のプライマーとして調製し、12%(重量
/容量)ポリアクリルアミドゲル上で分画した後ゲルか
ら単離する。
【0044】プラスミドpKSB2−Wの一本鎖DNA
の、単離された20マーのオリゴデオキシヌクレオチド
(前記参照)による指向性突然変異誘発は、アメルシャ
ム・ブッフラー(Amersham Buchler)、ブラウンシュヴァ
イク、ドイツから入手可能なインビトロ突然変異誘発系
を用いて、ケイ・エル・ナカマエ(K.L. Nakamaye) ら、
(1986) Nucl. Acids Res., 14, 9679-9698に記載の方法
により、アメルシャム・ブッフラー(Amersham Buchler)
の詳細なプロトコールにしたがって行う。
【0045】生成する大腸菌TG1クローンからの一本
鎖DNAを前記のように単離して、ジデオキシ法(エフ
・サンガー(F. Sanger) ら、(1977), Proc. Natl. Aca
d.Sci. USA, 74, 5463-5467 頁)によって配列決定する
DNAに用いる。ベーリンガー・マンハイム(Boehringe
r Mannheim) 、マンハイム(Mannheim)、ドイツから得ら
れたM13配列決定キットおよびデュポン・ドゥ・ネモ
ール(Du Pont deNemours)、バード・ホンブルク・ドイ
ツ製のデオキシアデノシン5′−(α−チオ)トリホス
フェート(35S)(1300Ci/mmol)を、これ
に用いる。生成する一本鎖プラスミドのDNA配列決定
に用いられるプライマーは、配列5′GCAGATTC
GCTTCCG3′の合成された15マーのオリゴデオ
キシヌクレオチドである。プラスミドpKSB2−M4
Gは、位置880〜882に大腸菌K12の野生型ph
eS遺伝子中に存在するGCC(アラニン)コドンの代
わりにGGC(グリシン)コドンを含んでいる。
【0046】例2 p−F−L−フェニルアラニンのミニプロインシュリン
融合タンパク質への組込みのための、改変されたL−フ
ェニルアラニル−tRNAシンテターゼ遺伝子の使用 プラスミドpKSB2−M4Gの174bpのAatI
I/BstBIフラグメントを単離し、プラスミドpK
SB1−Wの単離した3964bpのAatII/Bs
tBIフラグメントに連結し、大腸菌TG1に形質転換
する。881位が変化したpheS(Gly294)遺
伝子を有するプラスミドpKSB1−M4Gを、生成す
るアンピシリン耐性クローンから単離する。
【0047】pACYC184にクローニングされた野
生型pheS遺伝子を含むプラスミドpHE3は、アル
カリ性分解および塩化セシウム密度勾配遠心分離(ジェ
イ・サムブルック(J. Sambrook) ら、1989年)によ
って大腸菌ATCC37161から得られる。326b
pのAatII/BamHIフラグメントをプラスミド
pKSB1−M4Gから得て、ベクターpHE3の単離
された3760bpのAatII/BamHIフラグメ
ントに連結する。リガーゼ混合物を大腸菌K12 RR
28(ATCC35111)株のコンピテントな細胞中
に形質転換する。プラスミドpHE3−M4Gを、生成
するクロラムフェニコール耐性クローンから単離する。
【0048】欧州特許出願第034 778号明細書に
記載のプラスミドpIK10は、ヒトミニプロインシュ
リンに融合したヒトインターロイキン−2のアミノ酸残
基を含む融合タンパク質をコードする。ミニプロインシ
ュリンは、中心のCペプチドの代わりにアルギニン残基
を有する。プラスミドpIK10およびpHE3−M4
Gを、大腸菌K12 HB101 ATCC33694
のコンピテントな細胞中に形質転換する。一つの生成す
るクロラムフェニコール−およびアンピシリン−耐性形
質転換体(M4G)を用いて、p−F−L−フェニルア
ラニン(フルカ・ヒェミー(Fluka Chemie)、ブッフス、
スイス)のミニプロインシュリン融合タンパク質中へイ
ンビボ組込みを行う。このために、2種類のプラスミド
pHE3−M4GおよびpIK10を含む組換え体株M
4Gを、最少培地(100ミリモルKHPO、50
ミリモルNaHPO、12ミリモル(NH
、1ミリモルMgSO、0.1ミリモルCaCl
、1ミリモルL−トリプトファン、1ミリモル−チロ
シン、50μg/mlのL−ロイシンおよび50μg/
mlのL−プロリン、0.4%D−グルコース、5μg
/mlのチアミン、150μg/mlのアンピシリンお
よび20μg/mlのクロラムフェニコール)中で37
℃で培養する。
【0049】吸光度(OD550 )が1.0になったなら
ば、1ミリモルIPTG(イソプロピルβ−チオガラク
トシド)および2ミリモルp−F−L−フェニルアラニ
ン(フルカ・ヒェミー(Fluka Chemie)、ブッフス、スイ
ス)を加える。37℃で3時間振盪した後、細胞を回収
して、p−F−L−フェニルアラニン残基を含むヒトイ
ンシュリンを欧州特許出願第034 778号明細書に
記載の方法で形成した融合タンパク質から単離する。
【0050】例3 p−Cl−L−フェニルアラニンのミニプロインシュリ
ン融合タンパク質中への組込みのための改変pheS
(Gly294)の使用 例2と同様にして製造した組換え大腸菌M4G株を37
℃で最少培地(例2を参照されたい)中で吸光度(OD
550 )が1.0になるまで培養する。1ミリモルIPT
Gおよび2ミリモルp−Cl−L−フェニルアラニン
(フルカ・ヒェミー(Fluka Chemie)、ブッフス、スイ
ス)を加えた後、更に37℃で3時間振盪する。p−C
l−L−フェニルアラニン残基を有するヒトインシュリ
ンは、欧州特許第034778号明細書に記載の方法に
よって細胞からの形成された融合タンパク質から得られ
る。
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.7 識別記号 FI C12R 1:19) (C12N 9/00 C12R 1:19) (58)調査した分野(Int.Cl.7,DB名) C12N 15/00 - 15/90 C12N 1/00 - 1/38 C12N 9/00 - 9/99 A61K 31/00 - 48/00 BIOSIS(DIALOG) CA(STN) MEDLINE(STN) REGISTRY(STN) WPI(DIALOG)

Claims (11)

    (57)【特許請求の範囲】
  1. 【請求項1】配列Gly,Phe|Trp,Ala
    Phe,Gly,Met|Leu,Gly中の保存され
    たアラニン残基()がDNA水準での修飾によってグ
    リシンに変化している、L−フェニルアラニル−tRN
    Aシンテターゼ。
  2. 【請求項2】細菌および酵母ミトコンドリア由来の、請
    求項1に記載のL−フェニルアラニル−tRNAシンテ
    ターゼ。
  3. 【請求項3】大腸菌K12、Salmonella typhimurium、
    Thermus thermophilus、BacillussubtilisおよびSaccha
    romyces cerevisiae(ミトコンドリア)由来の、請求項
    1に記載のL−フェニルアラニル−tRNAシンテター
    ゼ。
  4. 【請求項4】請求項1、2または3のいずれか1項に記
    載のL−フェニルアラニル−tRNAシンテターゼをコ
    ードするDNAまたはRNA配列。
  5. 【請求項5】請求項4に記載のDNAまたはRNA配列
    を含むプラスミドまたはベクター。
  6. 【請求項6】請求項5に記載のプラスミドまたはベクタ
    ーで形質転換した細胞または微生物。
  7. 【請求項7】請求項6に記載の微生物としての大腸菌K
    12ATCC33694またはATCC35111。
  8. 【請求項8】請求項1〜3のいずれか1項に記載の修飾
    L−フェニルアラニル−tRNAシンテターゼの製造法
    であって、(a) C−末端のL−フェニルアラニル−t
    RNAシンテターゼ配列:Gly,Phe|Trp,A
    la,Phe,Gly,Met|Leu,Gly中の
    保存されたアラニン残基()を突然変異誘発によって
    グリシン残基に修飾し、(b) 修飾されたL−フェニル
    アラニル−tRNAシンテターゼ遺伝子を、ベクター、
    特に組換え大腸菌K12 DSM4416またはATC
    C37161株由来のpHE3に再クローニングし、ま
    たは修飾されたL−フェニルアラニル−tRNAシンテ
    ターゼ遺伝子を微生物、特に大腸菌K12 ATCC3
    3694、ATCC35111またはDSM4415の
    染色体に組込み、(c) パラ位がハロゲン化されたL−
    フェニルアラニンまたはその誘導体、特に3,4−ジ−
    F−L−フェニルアラニン、p−F−L−フェニルアラ
    ニン、p−Cl−L−フェニルアラニンまたはp−Br
    −L−フェニルアラニンおよび/またはp−I−L−フ
    ェニルアラニンを添加した後、標的遺伝子、特にヒルジ
    ン、ヒルジン誘導体、ミニプロインシュリン、コロニー
    刺激因子、インターフェロンα、インターフェロンγ、
    白血球または腺維芽細胞由来のインターフェロン、イン
    ターロイキン−2およびニシンカルシトニンIを含む融
    合タンパク質の遺伝子の誘導の後、パラ位がハロゲン化
    されたL−フェニルアラニンまたはその誘導体を、微生
    物、特に大腸菌K12 ATCC33694、ATCC
    35111またはDSM4415を培養することによっ
    て標的タンパク質中に組込み、(d) 標的タンパク質、
    特にヒルジン、ミニプロインシュリン、コロニー刺激因
    子、インターフェロン、インターロイキン−2およびカ
    ルシトニンIを単離して、精製する、工程を有する方
    法。
  9. 【請求項9】修飾されたL−フェニルアラニル−tRN
    Aシンテターゼが、細菌およびSaccharomyces cerevisi
    ae(ミトコンドリア)に由来する、請求項8に記載の方
    法。
  10. 【請求項10】修飾されたL−フェニルアラニル−tR
    NAシンテターゼが、大腸菌K12、Salmonella typhi
    murium、Thermus thermo-philus 、Bacillus subtilis
    に由来する、請求項8に記載の方法。
  11. 【請求項11】請求項1に記載されたL−フェニルアラ
    ニル−tRNAシンテターゼを含んでなる、非タンパク質
    誘発性アミノ酸のペプチドまたはタンパク質中へのイン
    ビボでの組込みのための薬剤。
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