JP3087575B2 - ヘプタプレニル二リン酸合成酵素およびそれをコードするdna - Google Patents
ヘプタプレニル二リン酸合成酵素およびそれをコードするdnaInfo
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Description
ーモフィラス(Bacillus stearothe
rmophilus)由来のヘプタプレニル二リン酸
(以下、「HDP」と略記する場合がある)合成酵素、
該酵素をコードするDNA、該DNAを含んで成る発現
ベクター、該発現ベクターにより形質転換された宿主、
該宿主によるヘプタプレニル二リン酸合成酵素の製造方
法、並びに前記酵素又は前記宿主を用いてのヘプタプレ
ニル二リン酸の製造方法に関する。
酸と1分子のファルネシル二リン酸の縮合により生じ、
プレニルキノン等のイソプレノイドの重要な生合成中間
体である。HDP合成酵素の存在は、バシルス・ズブチ
リス(Bacillus subtilis)(J.B
iol.Chem.255,p4539−4543(1
980))など一部の微生物において知られているが、
そのアミノ酸配列やそれをコードする遺伝子の塩基配列
は知られていない。
遺伝子としては、ファルネシル二リン酸合成酵素をコー
ドする遺伝子(J.Biol.Chem.265,p4
607−4614(1990))、及びゲラニルゲラニ
ル二リン酸合成酵素をコードする遺伝子(Proc.N
atl.Acad.Sci.USA,89 p6761
−6764)が知られている。しかしながら、それらが
ホモダイマーであるのに対して、バシルス・ズブチリス
のHDP合成酵素はヘテロダイマーであり(FEBS
Letl.161,257−260(1983))であ
り、前二者と後者の間のアミノ酸配列の相同性について
は全く情報が存在しない。
存在が知られていなかった、バシラス・ステアロサーモ
フィラス由来のHDP合成酵素、該酵素をコードするD
NA、及び該DNAを用いて該HDP合成酵素を組換え
生産する方法、等を提供しようとするものである。
題を解決するため、既知のプレニルトランスフェラーゼ
の配列の一部を使用し、PCR法で幾つかの遺伝子断片
を得、それをプローブとして用いて近傍の遺伝子領域を
クローニングし、発現した活性を測定することにより、
初めてバシラス・ステアロサーモフィラス由来のHDP
合成酵素遺伝子のクローニングに成功し、本発明を完成
させた。
ミノ酸Metから220位のアミノ酸Glyまでのアミ
ノ酸配列又はこのアミノ酸配列に対して1〜少数個のア
ミノ酸が置換、欠失又は付加されているアミノ酸配列を
有するペプチド、配列番号:2の1位のアミノ酸Met
から234位のアミノ酸Argまでのアミノ酸配列又は
このアミノ酸配列に対して1〜少数個のアミノ酸が置
換、欠失又は付加されているアミノ酸配列を有するペプ
チド、及び配列番号:3の1位のアミノ酸Valから3
23位のアミノ酸Tyrまでのアミノ酸配列又はこのア
ミノ酸配列に対して1〜少数個のアミノ酸が置換、欠失
又は付加されているアミノ酸配列を有するペプチドを含
んで成り、ヘプタプレニル二リン酸合成酵素活性を有す
るバシラス・ステアロサーモフィラス由来の蛋白質を提
供する。
ミノ酸Metから220位のアミノ酸Glyまでのアミ
ノ酸配列又はこのアミノ酸配列に対して1〜少数個のア
ミノ酸が置換、欠失又は付加されたアミノ酸配列を有す
るバシラス・ステアロサーモフィラス由来のペプチドを
提供する。本発明はまた、配列番号:3の1位のアミノ
酸Valから323位のアミノ酸Tyrまでのアミノ酸
配列又はこのアミノ酸配列に対して1〜少数個のアミノ
酸が置換、欠失又は付加されているアミノ酸配列を有す
るバシラス・ステアロサーモフィラス由来のペプチドを
提供する。
ノ酸Metから220位のアミノ酸Glyまでのアミノ
酸配列又はこのアミノ酸配列に対して1〜少数個のアミ
ノ酸が置換、欠失もしくは付加されているアミノ酸配列
を有するペプチド、及び配列番号:3の1位のアミノ酸
Valから323位のアミノ酸Tyrまでのアミノ酸配
列又はこのアミノ酸配列に対して1〜少数個のアミノ酸
が置換、欠失もしくは付加されているアミノ酸配列を有
するペプチド、を含んで成り、ヘプタプレニル二リン酸
合成酵素活性を有するバチラス・ステアロサーモフィラ
ス由来の蛋白質を提供する。
ミノ酸Metから220位のアミノ酸Glyまでのアミ
ノ酸配列又はこのアミノ酸配列に対して1〜少数個のア
ミノ酸が置換、欠失もしくは付加されているアミノ酸配
列を有するペプチド、及び配列番号:2の1位のアミノ
酸Metから234位のアミノ酸Argまでのアミノ酸
配列又はこのアミノ酸配列に対して1〜少数個のアミノ
酸が置換、欠失もしくは付加されているアミノ酸配列を
有するペプチド、を含んで成り、ヘプタプレニル二リン
酸合成酵素活性を有するバチラス・ステアロサーモフィ
ラス由来の蛋白質を提供する。
酸Metから234位のアミノ酸Argまでのアミノ酸
配列又はこのアミノ酸配列に対して1〜少数個のアミノ
酸が置換、欠失もしくは付加されているアミノ酸配列を
有するペプチド、及び配列番号:3の1位のアミノ酸V
alから323位のアミノ酸Tyrまでのアミノ酸配列
又はこのアミノ酸配列に対して1〜少数個のアミノ酸が
置換、欠失もしくは付加されているアミノ酸配列を有す
るペプチド、を含んで成り、ヘプタプレニル二リン酸合
成酵素活性を有するバチラス・ステアロサーモフィラス
由来の蛋白質を提供する。
ペプチドをコードするDNAを提供する。本発明はさら
に、前記のDNAを含んで成る発現ベクターを提供す
る。本発明はまた、前記発現ベクターにより形質転換さ
れた宿主を提供する。本発明はさらに、前記宿主を培養
し、該培養物からヘプタプレニル二リン酸合成酵素を採
取することを特徴とするヘプタプレニル二リン酸合成酵
素の製造方法を提供する。
し、該培養物からヘプタプレニル二リン酸を採取するこ
とを特徴とする、ヘプタプレニル二リン酸の製造方法を
提供する。本発明はさらに、前記の酵素を基質と反応せ
しめることによるヘプタプレニル二リン酸の製造方法を
提供する。
らクローニングされ、ヘプタプレニル二リン酸合成酵素
活性を発現するDNAの塩基配列のオープンリーデイン
グフレーム部分を配列番号:1〜3に示す。3個のオー
プンリーデイングフレーム(ORF)が存在する。第一
のオープンリーデイングフレーム(ORFI)は配列番
号:1において1位のアミノ酸MetをコードするAT
Gから始まり220位のGlyをコードするGGGで終
ると推定される。しかしながら、19位のアミノ酸Me
tをコードするATG,20位のアミノ酸Metをコー
ドするATG又は22位のアミノ酸Metをコードする
ATGから始まる可能性もある。
RFII)は配列番号:2の1位のアミノ酸Metをコー
ドするATGから始まり、234位のアミノ酸Argを
コードするCGGで終ると推定される。但し、このOR
FIIはアミノ酸番号:23のMetをコードするATG
から始まる可能性もある。第三のオープンリーデイング
フレーム(ORFIII )は配列番号:3の1位のアミノ
酸ValをコードするGTGから始まり、323位のア
ミノ酸TyrをコードするTATで終ると推定される。
しかしながら、このORFIII は4のアミノ酸Metを
コードするATG又は9位のアミノ酸Metをコードす
るATGから始まる可能性もある。
を含むDNAにおいては、ORFIの3′−末端の翻訳
終止コドンTAGとORFIIの翻訳開始コドンATG
(Met)の間にはヌクレオチドAACGが存在し、O
RFIIの翻訳終止コドンTGAとORFIII の翻訳開始
コドンGTG(Val)の間にはヌクレオチドGTTA
AGが存在する。
限酵素で切断し、各々のオープンリーデイングフレーム
に分けて別々に発現させたところ、全長DNAの発現生
成物が最も強いヘプタプレニル二リン酸合成酵素活性を
発現した。しかし、ORFIとORFIII とによりコー
ドされるペプチドもヘプタプレニル二リン酸合成酵素活
性を発現した。従って、本発明の1つの態様によれば、
ORFI,ORFII及びOFFIII のすべてを含んで成
るDNA、及びそれによりコードされているペプチドか
ら成るヘプタプレニル二リン酸合成酵素、並びにその製
造方法を提供する。
んで成り、完全な形でのORFIIを含まないDNA、及
びこのDNAにより発現される、ヘプタプレニル二リン
酸合成酵素活性を有するペプチド、並びにその製造方法
を提供する。発明はさらにORFIとORFII、又はO
RFIIとORFIIIを含んで成り完全な形での他のOR
Fを含まないDNA、及びこれにより発現されるペプチ
ド、並びにその製造方法を提供する。
品種によって少数のアミノ酸が異なる場合があり、また
天然突然変異により少数のアミノ酸が異る場合がある。
さらに、アミノ酸配列を人為的に変異させても生来の酵
素の活性を維持する場合がある。従って、本発明は、配
列番号:1〜3に示されるアミノ酸配列を有するペプチ
ド数の他に、配列番号:1〜3に示されるアミノ酸配列
に対して1又は少数個、例えば5個まで、又は10個ま
でのアミノ酸が置換、欠失及び/又は付加により変化し
ているアミノ酸配列を有し、なお生来の機能を果すこと
ができるペプチド類をも包含する。
チドをコードするDNA、及び変異したペプチドの製造
方法を提供する。本発明のDNAは、実施例に詳細に説
明するごとく、バチラス・ステアロサーモフィラスから
クローニングすることができる。また、ORFI,OR
FII及びORFIII の内の1個のみ又はこのすべて、あ
るいはORFIとORFIII 、ORFIとORFII、又
はORFIIとORFIII を含み完全な形での他のORF
を含まないDNAは、目的とするORF内を切断せず、
その外側、例えば他のORF内を切断する制限酵素を用
いて全長DNAを切断することにより得られる。また、
変異させたペプチドをコードするDNAは、例えば変異
誘発プライマーを用いての部位特定変異誘発法により得
ることができる。
酸配列が定まれば、それをコードする適当な塩基配列を
決定することができ、常用のDNA合成法によりDNA
を化学合成することもできる。特に、本発明の個々のO
RFは特別に長いものではなく、常用のDNA合成法に
より当業者が容易に合成することができる。本発明はま
た、前記のごときDNAを含んで成る発現ベクター、該
発現ベクターにより形質転換された宿主、及びこれらの
宿主を用いての本発明の酵素又はペプチドの製造方法を
提供する。
配列等を含有するが、これらは宿主により異る。宿主と
しては、原核性生物、例えば細菌、例えば大腸菌、バチ
ラス属細菌、例えばバチラス・ズブチリス(Bacil
lus subtilis)、真核性微生物、例えば真
菌、例えば酵母、例えばサッカロミセス(Saccha
romyces)属に属すサッカロミセス・セレビシエ
ー(S.cerevisiae)、糸状菌、例えばアス
ペルギルス(Aspergillus)属のアスペルギ
ルス・オリゼー(A.oryzae)、アスペルギルス
・ニガー(A.niger)、動物細胞、例えばカイコ
の培養細胞、高等動物の培養細胞、例えばCHO細胞、
等が挙げられる。また植物を宿主とすることも可能であ
る。
発明のDNAにより形質転換した宿主を培養することに
より、培養物中にヘプタプレニル二リン酸を蓄積するこ
とができ、これを採取することによりヘプタプレニル二
リン酸を製造することができる。本発明によればまた、
本発明の方法により製造したHDP合成酵素を基質イソ
ペンテニル二リン酸及びファルネシル二リン酸に作用さ
せることによってもヘプタプレニル二リン酸を製造する
ことができる。
DNAからmRNAを転写する過程とmRNAからタン
パク質を翻訳する過程など遺伝子の発現調節機能がある
ことが知られている。mRNAの合成を調節するプロモ
ーター配列として、天然に存在する配列(たとえばla
c,trp,bla,lpp,PL ,PR ,ter,T
3,T7など)以外にも、それらの変異体(例えばla
cUV5)や天然にあるプロモーター配列を人工的に融
合した(例えばtac,trcなど)配列が知られてお
り、本発明にも使用できる。
調節する配列として、リボソームバインディングサイト
(GAGGおよびその類似配列)配列と開始コドンであ
るATGまでの距離が重要であることは既知である。ま
た、3′側に転写終了を指令するターミネーター(例え
ば、rrnBT1 T2 を含むベクターがファルマシア社
から市販されている)が組換え体でのタンパク質合成効
率に影響する事はよく知られている。
用できるベクターとしては、市販のものをそのまま用い
るか、または目的に応じて誘導した各種のベクターを挙
げることができる。例えば、pMB1由来のrepli
conを持つpBR322,pBR327,pKK22
3−3,pKK233−2,pTrc99等や、コピー
数が向上するように改変したpUC18,pUC19,
pUC118,pUC119,pHSG298,pHS
G396等、またp15A由来のrepliconを持
つpACYC177やpACYC184等、さらにはp
SC101やColE1やR1やF因子などに由来する
プラスミドが挙げられる。
M13ファージのようなウイルスベクターやトランスポ
ゾンによっても遺伝子導入が可能である。大腸菌以外の
微生物への遺伝子導入では、pUB110(Sigma
社から販売)やpHY300PLK(宝酒造より販売)
などによるBacillus属への遺伝子導入が知られ
ている。これらベクターについてはMolecular
cloning(J.Sambrook,E.F.F
ritsch,T.Maniatis著Cold Sp
ring Harbor Laboratory Pr
ess発行)やCloning Vector(P.
H.Pouwels,B.E.Enger・Valk,
W.J.Brammar著Elsevier発行)や各
社カタログに記載されている。
販売)は、選択マーカーのアンピシリン耐性遺伝子以外
に、プロモーター及び制御遺伝子としてPtrc及びl
acIq 、リボソームバインディングサイトとしてAG
GAという配列、ターミネーターとしてrrnBT1 T
2 を持ち、HDP合成酵素遺伝子の発現調節機能を持
つ、好ましいベクターとして挙げられる。
コードするDNA断片および必要により前記酵素の遺伝
子を発現調節する機能を有するDNA断片の組み込み
は、適当な制限酵素とリガーゼを用いる既知方法で行う
ことができ、具体的には後述の方法に従うのが都合よ
い。こうして作製される発明のプラスミドの具体的なも
のとしてはpTL6が挙げられる。
きる微生物としてはエシェリヒアコリー(Escher
ichia coli)、バチルス(Bacillu
s)属などに属する微生物も利用することができる。こ
の形質転換も常法、たとえばMolecular cl
oning(J.Sambrook,E.F.Frit
sch,T.Maniatis著Cold Sprin
g Harbor Laboratory Press
発行)やDNA Cloning Vol.I〜III
(D.M.Glover編IRL PRESS発行)な
どに記載された、CaCl2 法やプロトプラスト法によ
り行うことができる。
のとしては、pTL6/JM109が挙げられる。これ
らの形質転換体または組換え微生物細胞は、通常大腸菌
の培養に用いられる培地で培養すると、ヘプタプレニル
二リン酸(HDP)を菌体内に蓄積する。菌体からのH
DPの採取は、菌体を物理的または適当な細胞溶解性酵
素の存在する環境下で処理して溶菌した後、細胞破砕物
を除去し、次いで、酵素の一般的な単離精製方法によっ
て行うことができる。
ることが好ましく、また物理的処理には超音波を用いる
ことが好ましい。また55℃程度の熱処理をすることに
より、多くの大腸菌由来のタンパク質は不溶性の沈澱と
して除去できる。酵素の単離精製には、ゲル濾過・イオ
ン交換・疎水性・逆相・アフィニティーなどの各種クロ
マトグラフィー処理や限外濾過法などを単独または組み
合わせて行えばよい。
の安定化を図るための安定剤として、たとえば、β−メ
ルカプトエタノールやジチオスレイトールなどの還元
剤、PMSFやBSAなどのプロテアーゼへの保護剤、
マグネシウムなどの金属イオンを処理液に共存させても
よい。前記HDP合成酵素活性は、たとえば次のように
測定できるので、その酵素の単離・精製は、後述の実施
例1のf)で使用するアッセイ用反応液を用いて、その
酵素活性を確認しながら進めることが推奨できる。
質転換体の調製法の1例を記載するが、本発明の範囲は
これに限定されるものではない。実施例1 実験法は主として前述のMolecular clon
ingとDNA Cloningと宝酒造のカタログに
従った。酵素は主に宝酒造から購入した物を用いた。用
いたバチラス ステアロサーモフィラスはアメリカン
タイプ カルチャー コレクション(American
Type Culture Collection:
ATCC)に登録されている公知の菌株である。本研究
にはATCC 10149株をもちいた。
染色体DNAの調製 LB培地(1%Trypton,0.5%Yeast
extract,1%NaCl)で55℃で培養し、集
菌した。Lysis bufferに懸濁後、リゾチー
ム(Sigma社製ニワトリ卵白由来)を10mg/mlに
なるように加えた。溶菌後、1/10量の1MTris
・HCl(pH8.0)、1/10量の10%SDS、1
/50量の5MNaClを加えた。Proteinas
eK(Sigma社製)を10mg/mlになるように加
え、50℃に加温した。
後、遠心して除蛋白を行った。遠心上清を広口ピペット
でビーカーにとり、2.5倍量のエタノールを静かに重
層後、ガラス棒で染色体DNAを巻きとった。TE(1
0mMTris・HCl(pH8.0)、1mMEDT
A)に溶解後、RNaseA(Sigma社製)処理、
ProteinaseK処理、フェノール処理後、2.
5倍量のエタノールを静かに重層し、ガラス棒で染色体
DNAを巻きとった。70%エタノールで洗浄後、TE
に溶解し、以下の実験に用いた。
アミノ酸配列における保存領域をもとに合成DNAプラ
イマーP1(配列番号:4)、P2(配列番号:5)、
P4(配列番号:6)、P6(配列番号:7)、P8
(配列番号:8)、P9(配列番号:9)、P10(配
列番号:10)、P11(配列番号:11)、P12
(配列番号:12)及び、P13(配列番号:13)を
作製した。
定分解し、合成DNAP1とP4、P1とP6、P1と
P8、P2とP4、P2とP6、P2とP8、P9とP
11、P9とP4、P9とP6、P9とP8、P9とP
13、P1とP11、P2とP11、P12とP4、P
12とP6、P12とP8、P12とP13、P1とP
13、P2とP13、P10とP4、P10とP6、P
10とP8、P10とP13の組み合わせでPCR(p
olymerase chain reaction)
を行った。
を、プラスミドpUC118(宝酒造から購入)のHi
ncII分解物とT4DNAリガーゼで連結し、大腸菌J
M109を形質転換した。アルカリSDS法でプラスミ
ドを調製し、27クローンをアプライドバイオシステム
373A蛍光DNAシーケンサーでDNA配列を解析し
た。その中の1つをpCR64とした。
のクローニング c−1) pCR64の制限酵素KpnI,HindII
I 分解物約500b.p.のDNA断片を、DIG D
NA Labeling Kit(BOEHRINGE
R MANNHEIMから購入)を用いてDIGで標識
した。方法はキットの手順書に従った。
プローブを用いてサザンハイブリダイゼーションを行っ
たところ、約3kb.p.の位置にバンドが検出され
た。そこで、3kb.p.程度のDNA断片をアガロー
ス電気泳動で分画し、T4DNAポリメラーゼで処理し
た。プラスミドpUC18のSmaI分解物とT4DN
Aリガーゼで連結し、大腸菌JM109を形質転換し
た。
ラリーをスクリーニングした。DIG DNA Det
ection Kit(BOEHRINGERMANN
HEIMから購入)を用いて検出し、プラスミドpAC
2を得た。方法はキットの手順書に従った。挿入遺伝子
約2.5kb.p.のDNA配列の解析をアプライドバ
イオシステム373A蛍光シーケンサーで行った。
プライマーP64−4(配列番号:14)とM13 P
rimer RV(宝酒造から購入)でc−2)の遺伝
子ライブラリーをPCRした。増幅産物をpT7Blu
e T−Vector(Novagenから購入)に挿
入してpPR2を得た。 e)pAC2とpPR2の連結 pAC2及びpPR2のBamHI分解物、それぞれ約
1kb.p.と5kb.p.のDNA断片を連結してp
TL6を得た。
/mlのアンピシリンを含むLB培地50mlで一晩培養
後、集菌した。4mlのLysis bufferに懸濁
し、超音波で菌体を破砕した。55℃に1時間加温し、
大腸菌由来のプレニルトランスフェラーゼを失活させ、
遠心分離で大腸菌由来の変性タンパク質を除き、アッセ
イに用いた。アッセイ用反応液を1時間あるいは14時
間55℃で反応させた。反応液を1−ブタノールで抽出
し、液体シンチレーションカウンターで放射活性を測定
した。
反応させた時の1−ブタノール抽出物を加水分解し、薄
層クロマトグラフィー(TLC)で分析した。その結
果、生成したイソプレノイドはヘプタプレニル二リン酸
であると同定され、pTL6はヘプタプレニル二リン酸
合成酵素の遺伝子を含むことが判明した(図2)。さら
に、アリル性基質Primerに対する特異性を下記の
アッセイ系(表3)にて検討した結果、(all−E)
ファルネシル二リン酸及び(all−E)ゲラニルゲラ
ニル二リン酸で特に酵素活性が認められたが、ジメチル
アリル二リン酸、ゲラニル二リン酸、(2Z,6E)フ
ァルネシル二リン酸、(2Z,6E,10E)ゲラニル
ゲラニル二リン酸、(2Z,6E,10E,14E)フ
ァルネシルゲラニル二リン酸は好ましい基質ではなかっ
た(表4)。
ゼおよび55℃で活性のあるプレニルトランスフェラー
ゼを持っていない。pTL6で形質転換した大腸菌はヘ
プタプレニル二リン酸を合成することができるようにな
った。また、55℃で活性があることから、pTL6が
コードしているバチラス ステアロサーモフィラス由来
のプレニルトランスフェラーゼは非常に熱に安定である
ことがここに示された。また、組換え体が安定なヘプタ
プレニル二リン酸の製造に有効であることがここに示さ
れた。
合成酵素遺伝子の特定 pTL6は約3kb.p.の挿入遺伝子を持ち、その中
に3つのORFを含んでいた。pTL6を制限酵素で切
断してORFIの欠失したプラスミドpTLD9、OR
FIIの欠失したプラスミドpTLD17、及びORFII
I の欠失したプラスミドpTLD7を作製し、イソプレ
ノイド合成酵素活性を測定したところ、pTL6,pT
LD9、及びpTLD17に活性が見られた。pTL6
及びpTLD17の反応生成物の1−ブタノール抽出物
を加水分解し、TLCで分析し、生成したイソプレノイ
ドはヘプタプレニル二リン酸であることを確認した。
ーモフィラス由来のヘプタプレニル二リン酸合成酵素を
コードするDNA配列が提供される。このようなDNA
配列を発現ベクターに組み込み、適当な大腸菌を形質転
換した組換え微生物細胞は、安全なヘプタプレニル二リ
ン酸合成活性物質及びヘプタプレニル二リン酸を生産す
る。この効果は、従来技術文献に未載のバチラス ステ
アロサーモフィラス染色体から前記DNA配列を調製す
ることによって得られる。
llus stearothermophilus) 配列: ATG CTC GAT GGC GCT TCA ACG GCG CCG AGT GAG GCG GAG CGG TGC 45 Met Leu Asp Gly Ala Ser Thr Ala Pro Ser Glu Ala Glu Arg Cys 5 10 15 ATC ATC GCC ATG ATG CTC ATG CAG ATC GCC CTT GAT ACC CAC GAT 90 Ile Ile Ala Met Met Leu Met Gln Ile Ala Leu Asp Thr His Asp 20 25 30 GAG GTG ACA GAT GAC GGC GGC GAC TTG CGG GCG CGG CAG CTT GTC 135 Glu Val Thr Asp Asp Gly Gly Asp Leu Arg Ala Arg Gln Leu Val 35 40 45 GTC CTG GCC GGC GAC TTG TAC AGC GGG CTG TAC TAT GAG TTG TTG 180 Val Leu Ala Gly Asp Leu Tyr Ser Gly Leu Tyr Tyr Glu Leu Leu 50 55 60 GCG CGT TCG GGC GAA ACG GCG CTC ATC CGC TCG TTC GCC GAG GCG 225 Ala Arg Ser Gly Glu Thr Ala Leu Ile Arg Ser Phe Ala Glu Ala 65 70 75 GTC CGC GAT ATT AAC GAG CAA AAA GTG CGG CTT TAC GAA AAA AAA 270 Val Arg Asp Ile Asn Glu Gln Lys Val Arg Leu Tyr Glu Lys Lys 80 85 90 GTA GAG CGG ATC GAG TCG TTG TTT GCG GCG GTC GGC ACG ATC GAA 315 Val Glu Arg Ile Glu Ser Leu Phe Ala Ala Val Gly Thr Ile Glu 95 100 105 TCG GCG TTG CTT GTC AAG CTC GCC GAC CGC ATG GCG GCG CCG CAG 360 Ser Ala Leu Leu Val Lys Leu Ala Asp Arg Met Ala Ala Pro Gln 110 115 120 TGG GGG CAG TTT GCC TAT TCG TAT TTG CTG ATG CGG CGC CTG CTG 405 Trp Gly Gln Phe Ala Tyr Ser Tyr Leu Leu Met Arg Arg Leu Leu 125 130 135 CTC GAG CAG GAA GCG TTC ATC CGC ACG GGA GCT TCG GTG CTC TTT 450 Leu Glu Gln Glu Ala Phe Ile Arg Thr Gly Ala Ser Val Leu Phe 140 145 150 GAG CAA ATG GCG CAA ATC GCG TTC CCG CGC GCG GAA ACG TTG ACG 495 Glu Gln Met Ala Gln Ile Ala Phe Pro Arg Ala Glu Thr Leu Thr 155 160 165 AAA GAG CAA AAG CGG CAT TTG CTC CGC TTT TGC CGC CGC TAT ATC 540 Lys Glu Gln Lys Arg His Leu Leu Arg Phe Cys Arg Arg Tyr Ile 170 175 180 GAC GGC TGC CGG GAG GCG CTG TTT GCG GCG AAA CTG CCG GTC AAC 585 Asp Gly Cys Arg Glu Ala Leu Phe Ala Ala Lys Leu Pro Val Asn 185 190 195 GGC CTG CTG CAG CTC CGC GTG GCC GTG CTT TCC GGC GGG TTT CAA 630 Gly Leu Leu Gln Leu Arg Val Ala Val Leu Ser Gly Gly Phe Gln 200 205 210 GCC ATC GCC AAA AAG ACG GTG GAA GAA GGG TAG 663 Ala Ile Ala Lys Lys Thr Val Glu Glu Gly *** 215 220
llus stearothermophilus) 配列: ATG CGT CAA TCG AAA GAA GAG CGA GTC CAT CGC GTA TTT GAA AAC 45 Met Arg Gln Ser Lys Glu Glu Arg Val His Arg Val Phe Glu Asn 5 10 15 ATT TCT GCG CAT TAT GAC CGG ATG AAC TCC GTC ATC AGC TTC CGC 90 Ile Ser Ala His Tyr Asp Arg Met Asn Ser Val Ile Ser Phe Arg 20 25 30 CGC CAC TTG AAG TGG CGC AAA GAC GTG ATG CGG CGG ATG AAT GTG 135 Arg His Leu Lys Trp Arg Lys Asp Val Met Arg Arg Met Asn Val 35 40 45 CAA AAA GGC AAA AAA GCG CTC GAT GTG TGC TGT GGG ACG GCT GAC 180 Gln Lys Gly Lys Lys Ala Leu Asp Val Cys Cys Gly Thr Ala Asp 50 55 60 TGG ACG ATC GCC TTG GCG GAG GCG GTC GGT CCG GAA GGG AAA GTG 225 Trp Thr Ile Ala Leu Ala Glu Ala Val Gly Pro Glu Gly Lys Val 65 70 75 TAC GGC CTT GAT TTC AGC GAA AAC ATG CTG AAA GTC GGC GAA CAG 270 Tyr Gly Leu Asp Phe Ser Glu Asn Met Leu Lys Val Gly Glu Gln 80 85 90 AAG GTA AAA GCG CGC GGG TTG CAT AAT GTG AAG CTC ATT CAC GGC 315 Lys Val Lys Ala Arg Gly Leu His Asn Val Lys Leu Ile His Gly 95 100 105 AAT GCG ATG CAG CTG CCG TTT CCT GAC AAT TCG TTC GAT TAT GTG 360 Asn Ala Met Gln Leu Pro Phe Pro Asp Asn Ser Phe Asp Tyr Val 110 115 120 ACG ATC GGC TTC GGT TTG CGC AAC GTC CCT GAC TAT ATG ACC GTG 405 Thr Ile Gly Phe Gly Leu Arg Asn Val Pro Asp Tyr Met Thr Val 125 130 135 CTT AAG GAA ATG CAC CGG GTG ACG AAG CCG GGC GGC ATA ACC GTC 450 Leu Lys Glu Met His Arg Val Thr Lys Pro Gly Gly Ile Thr Val 140 145 150 TGC CTG GAA ACG TCG CAG CCG ACG CTG TTC GGG TTT CGC CAG CTT 495 Cys Leu Glu Thr Ser Gln Pro Thr Leu Phe Gly Phe Arg Gln Leu 155 160 165 TAC TAT TTT TAC TTC CGG TTT ATT ATG CCG CTG TTT GGC AAG CTG 540 Tyr Tyr Phe Tyr Phe Arg Phe Ile Met Pro Leu Phe Gly Lys Leu 170 175 180 CTG GCG AAA AGC TAT GAG GAG TAC TCG TGG CTG CAG GAA TCG GCG 585 Leu Ala Lys Ser Tyr Glu Glu Tyr Ser Trp Leu Gln Glu Ser Ala 185 190 195 CGC GAG TTT CCG GGG CGG GAC GAG CTG GCC GAG ATG TTC CGC GCC 630 Arg Glu Phe Pro Gly Arg Asp Glu Leu Ala Glu Met Phe Arg Ala 200 205 210 GCC GGT TTT GTC GAT GTC GAG GTC AAA CCG TAC ACG TTT GGC GTG 675 Ala Gly Phe Val Asp Val Glu Val Lys Pro Tyr Thr Phe Gly Val 215 220 225 GCG GCG ATG CAC TTG GGC TAT AAA CGG TGA 705 Ala Ala Met His Leu Gly Tyr Lys Arg *** 230
llus stearothermophilus) 配列: GTG AAC AAC ATG AAG TTA AAG GCG ATG TAT TCG TTT TTA AGC GAT 45 Val Asn Asn Met Lys Leu Lys Ala Met Tyr Ser Phe Leu Ser Asp 5 10 15 GAT TTA GCG GCG GTC GAA GAG GAG CTT GAG CGG GCG GTT CAG TCG 90 Asp Leu Ala Ala Val Glu Glu Glu Leu Glu Arg Ala Val Gln Ser 20 25 30 GAA TAC GGG CCG CTT GGG GAA GCG GCG CTC CAT CTG TTG CAG GCG 135 Glu Tyr Gly Pro Leu Gly Glu Ala Ala Leu His Leu Leu Gln Ala 35 40 45 GGC GGA AAG CGG ATC CGT CCC GTT TTT GTC TTG CTT GCC GCC CGC 180 Gly Gly Lys Arg Ile Arg Pro Val Phe Val Leu Leu Ala Ala Arg 50 55 60 TTC GGC CAA TAT GAC CTT GAG CGG ATG AAG CAT GTT GCC GTT GCG 225 Phe Gly Gln Tyr Asp Leu Glu Arg Met Lys His Val Ala Val Ala 65 70 75 CTC GAG CTC ATT CAT ATG GCT TCG CTC GTC CAC GAC GAT GTG ATC 270 Leu Glu Leu Ile His Met Ala Ser Leu Val His Asp Asp Val Ile 80 85 90 GAC GAC GCC GAT TTG CGC CGC GGC CGG CCG ACG ATC AAG GCG AAA 315 Asp Asp Ala Asp Leu Arg Arg Gly Arg Pro Thr Ile Lys Ala Lys 95 100 105 TGG AGC AAC CGG TTC GCC ATG TAC ACA GGG GAT TAT TTG TTT GCC 360 Trp Ser Asn Arg Phe Ala Met Tyr Thr Gly Asp Tyr Leu Phe Ala 110 115 120 CGC TCG CTC GAA CGG ATG GCG GAG CTC GGC AAC CCG CGC GCC CAT 405 Arg Ser Leu Glu Arg Met Ala Glu Leu Gly Asn Pro Arg Ala His 125 130 135 CAA GTG TTG GCG AAA ACG ATC GTG GAA GTG TGC CGC GGG GAA ATT 450 Gln Val Leu Ala Lys Thr Ile Val Glu Val Cys Arg Gly Glu Ile 140 145 150 GAG CAA ATT AAA GAC AAG TAC CGG TTT GAT CAG CCG CTG CGC ACG 495 Glu Gln Ile Lys Asp Lys Tyr Arg Phe Asp Gln Pro Leu Arg Thr 155 160 165 TAT TTG CGG CGC ATC CGT CGG AAA ACG GCG CTG CTC ATC GCC GCG 540 Tyr Leu Arg Arg Ile Arg Arg Lys Thr Ala Leu Leu Ile Ala Ala 170 175 180 AGC TGC CAG CTT GGC GCC CTC GCT GCC GGC GCG CCG GAG CCG ATT 585 Ser Cys Gln Leu Gly Ala Leu Ala Ala Gly Ala Pro Glu Pro Ile 185 190 195 GTG AAG CGG CTG TAC TGG TTC GGC CAT TAT GTC GGC ATG TCG TTT 630 Val Lys Arg Leu Tyr Trp Phe Gly His Tyr Val Gly Met Ser Phe 200 205 210 CAA ATT ACC GAC GAC ATT CTC GAT TTC ACT GGG ACG GAG GAA CAG 675 Gln Ile Thr Asp Asp Ile Leu Asp Phe Thr Gly Thr Glu Glu Gln 215 220 225 CTC GGC AAA CCG GCC GGA AGC GAC TTG CTA CAA GGA AAC GTC ACC 720 Leu Gly Lys Pro Ala Gly Ser Asp Leu Leu Gln Gly Asn Val Thr 230 235 240 CTT CCT GTG CTG TAT GCC TTG AGC GAT GAG CGG GTG AAG GCG GCC 765 Leu Pro Val Leu Tyr Ala Leu Ser Asp Glu Arg Val Lys Ala Ala 245 250 255 ATT GCA GCT GTC GGT CCG GAA ACG GAC GTT GCG GAA ATG GCG GCG 810 Ile Ala Ala Val Gly Pro Glu Thr Asp Val Ala Glu Met Ala Ala 260 265 270 GTC ATT TCC GCC ATT AAG CGG ACG GAC GCC ATT GAG CGG TCG TAT 855 Val Ile Ser Ala Ile Lys Arg Thr Asp Ala Ile Glu Arg Ser Tyr 275 280 285 GCG TTA AGC GAC CGT TAC CTT GAC AAG GCG CTT CAC CTT CTT GAC 900 Ala Leu Ser Asp Arg Tyr Leu Asp Lys Ala Leu His Leu Leu Asp 290 295 300 GGA CTG CCG ATG AAT GAG GCG CGC GGC CTG TTG CGC GAC CTC GCC 945 Gly Leu Pro Met Asn Glu Ala Arg Gly Leu Leu Arg Asp Leu Ala 305 310 315 CTT TAC ATC GGG AAA AGG GAT TAT TAA 972 Leu Tyr Ile Gly Lys Arg Asp Tyr *** 320
L6,pTLD9,pTLD17、及びpTLD7の位
置的関係及び制限酵素地図である。
が触媒した反応の生成物をTLCで解析した図である。
Claims (19)
- 【請求項1】 配列番号:1の1位のアミノ酸Metか
ら220位のアミノ酸Glyまでのアミノ酸配列又はこ
のアミノ酸配列に対して1〜少数個のアミノ酸が置換、
欠失又は付加されているアミノ酸配列を有するペプチ
ド、配列番号:2の1位のアミノ酸Metから234位
のアミノ酸Argまでのアミノ酸配列又はこのアミノ酸
配列に対して1〜少数個のアミノ酸が置換、欠失又は付
加されているアミノ酸配列を有するペプチド、及び配列
番号:3の1位のアミノ酸Valから323位のアミノ
酸Tyrまでのアミノ酸配列又はこのアミノ酸配列に対
して1〜少数個のアミノ酸が置換、欠失又は付加されて
いるアミノ酸配列を有するペプチドを含んで成り、ヘプ
タプレニル二リン酸合成酵素活性を有するバチラス・ス
テアロサーモフィラス(Bacillus stear
othermophilus)由来の蛋白質。 - 【請求項2】 配列番号:1の1位のアミノ酸Metか
ら220位のアミノ酸Glyまでのアミノ酸配列又はこ
のアミノ酸配列に対して1〜少数個のアミノ酸が置換、
欠失又は付加されているアミノ酸配列を有するバチラス
・ステアロサーモフィラス由来のペプチド。 - 【請求項3】 配列番号:3の1位のアミノ酸Valか
ら323位のアミノ酸Tyrまでのアミノ酸配列又はこ
のアミノ酸配列に対して1〜少数個のアミノ酸が置換、
欠失又は付加されているアミノ酸配列を有するバチラス
・ステアロサーモフィラス由来のペプチド。 - 【請求項4】 配列番号:1の1位のアミノ酸Metか
ら220位のアミノ酸Glyまでのアミノ酸配列又はこ
のアミノ酸配列に対して1〜少数個のアミノ酸が置換、
欠失もしくは付加されているアミノ酸配列を有するペプ
チド、及び配列番号:3の1位のアミノ酸Valから3
23位のアミノ酸Tyrまでのアミノ酸配列又はこのア
ミノ酸配列に対して1〜少数個のアミノ酸が置換、欠失
もしくは付加されているアミノ酸配列を有するペプチ
ド、を含んで成り、ヘプタプレニル二リン酸合成酵素活
性を有するバチラス・ステアロサーモフィラス由来の蛋
白質。 - 【請求項5】 配列番号:1の1位のアミノ酸Metか
ら220位のアミノ酸Glyまでのアミノ酸配列又はこ
のアミノ酸配列に対して1〜少数個のアミノ酸が置換、
欠失もしくは付加されているアミノ酸配列を有するペプ
チド、及び配列番号:2の1位のアミノ酸Metから2
34位のアミノ酸Argまでのアミノ酸配列又はこのア
ミノ酸配列に対して1〜少数個のアミノ酸が置換、欠失
もしくは付加されているアミノ酸配列を有するペプチ
ド、を含んで成るバチラス・ステアロサーモフィラス由
来の蛋白質。 - 【請求項6】 配列番号:2の1位のアミノ酸Metか
ら234位のアミノ酸Argまでのアミノ酸配列又はこ
のアミノ酸配列に対して1〜少数個のアミノ酸が置換、
欠失もしくは付加されているアミノ酸配列を有するペプ
チド、及び配列番号:3の1位のアミノ酸Valから3
23位のアミノ酸Tyrまでのアミノ酸配列又はこのア
ミノ酸配列に対して1〜少数個のアミノ酸が置換、欠失
もしくは付加されているアミノ酸配列を有するペプチ
ド、を含んで成るバチラス・ステアロサーモフィラス由
来の蛋白質。 - 【請求項7】 請求項1に記載の3個のペプチドをコー
ドする塩基配列を含むDNA。 - 【請求項8】 請求項2に記載のペプチドをコードする
DNA。 - 【請求項9】 請求項3に記載のペプチドをコードする
DNA。 - 【請求項10】 請求項4に記載の2個のペプチドをコ
ードするDNA。 - 【請求項11】 請求項5に記載の2個のペプチドをコ
ードするDNA。 - 【請求項12】 請求項6に記載の2個のペプチドをコ
ードするDNA。 - 【請求項13】 請求項7〜12のいずれか1項に記載
のDNAを含んで成る発現ベクター。 - 【請求項14】 請求項13に記載の発現ベクターによ
り形質転換された宿主。 - 【請求項15】 前記宿主が細菌である請求項14に記
載の宿主。 - 【請求項16】 前記宿主がエシェリヒア(Esche
richia)である、請求項15に記載の宿主。 - 【請求項17】 請求項14〜16のいずれか1項に記
載の宿主を培養し、該培養物からヘプタプレニル二リン
酸合成酵素活性を有するペプチド又はその関連ペプチド
を採取することを特徴とする、ヘプタプレニル二リン酸
合成酵素活性を有するペプチド又はその関連ペプチドの
製造方法。 - 【請求項18】 請求項14〜16のいずれか1項に記
載の宿主を培養し、該培養物からヘプタプレニル二リン
酸を採取することを特徴とする、ヘプタプレニル二リン
酸の製造方法。 - 【請求項19】 請求項1又は2に記載のヘプタプレニ
ル二リン酸合成酵素又はそれを含有するものを基質イソ
ペンテニル二リン酸、ファルネシル二リン酸、ゲラニル
ゲラニル二リン酸、ファルネシルゲラニル二リン酸又は
ヘキサプレニル二リン酸に作用させることを特徴とする
ヘプタプレニル二リン酸の製造方法。
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FEBS LETTERS,Vol.161,No.2,(1983),p.257−260 |
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