JP2024023205A - スペーシングリンカー基を有する超明色ダイマーまたはポリマー染料 - Google Patents
スペーシングリンカー基を有する超明色ダイマーまたはポリマー染料 Download PDFInfo
- Publication number
- JP2024023205A JP2024023205A JP2023186400A JP2023186400A JP2024023205A JP 2024023205 A JP2024023205 A JP 2024023205A JP 2023186400 A JP2023186400 A JP 2023186400A JP 2023186400 A JP2023186400 A JP 2023186400A JP 2024023205 A JP2024023205 A JP 2024023205A
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- compound
- occurrence
- independently
- compound according
- linker
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Pending
Links
- 125000005647 linker group Chemical group 0.000 title claims description 189
- 229920000642 polymer Polymers 0.000 title claims description 19
- 239000000539 dimer Substances 0.000 title description 4
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 claims abstract description 701
- 238000000034 method Methods 0.000 claims abstract description 148
- 150000003839 salts Chemical class 0.000 claims abstract description 31
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 claims abstract description 15
- 239000012491 analyte Substances 0.000 claims description 173
- -1 alkoxyalkyl ether Chemical compound 0.000 claims description 126
- 239000007787 solid Substances 0.000 claims description 103
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 claims description 102
- 230000008685 targeting Effects 0.000 claims description 99
- 239000000975 dye Substances 0.000 claims description 98
- RTZKZFJDLAIYFH-UHFFFAOYSA-N ether Substances CCOCC RTZKZFJDLAIYFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 86
- 125000002947 alkylene group Chemical group 0.000 claims description 70
- 239000007850 fluorescent dye Substances 0.000 claims description 66
- 125000004474 heteroalkylene group Chemical group 0.000 claims description 65
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 claims description 64
- 125000000217 alkyl group Chemical group 0.000 claims description 61
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 claims description 56
- 150000002148 esters Chemical class 0.000 claims description 47
- 125000003545 alkoxy group Chemical group 0.000 claims description 42
- 125000000524 functional group Chemical group 0.000 claims description 40
- 150000001345 alkine derivatives Chemical class 0.000 claims description 38
- YBJHBAHKTGYVGT-ZKWXMUAHSA-N (+)-Biotin Chemical compound N1C(=O)N[C@@H]2[C@H](CCCCC(=O)O)SC[C@@H]21 YBJHBAHKTGYVGT-ZKWXMUAHSA-N 0.000 claims description 34
- XYFCBTPGUUZFHI-UHFFFAOYSA-N Phosphine Chemical compound P XYFCBTPGUUZFHI-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 34
- 239000011324 bead Substances 0.000 claims description 34
- 150000001336 alkenes Chemical class 0.000 claims description 33
- 150000005215 alkyl ethers Chemical class 0.000 claims description 33
- 150000001540 azides Chemical class 0.000 claims description 32
- 229910052760 oxygen Inorganic materials 0.000 claims description 32
- 239000002777 nucleoside Substances 0.000 claims description 30
- 150000003833 nucleoside derivatives Chemical class 0.000 claims description 30
- 229910052717 sulfur Inorganic materials 0.000 claims description 30
- 125000003118 aryl group Chemical group 0.000 claims description 29
- 125000005842 heteroatom Chemical group 0.000 claims description 29
- 125000001072 heteroaryl group Chemical group 0.000 claims description 28
- 238000002156 mixing Methods 0.000 claims description 25
- 125000003396 thiol group Chemical group [H]S* 0.000 claims description 25
- 230000000007 visual effect Effects 0.000 claims description 25
- BWGNESOTFCXPMA-UHFFFAOYSA-N Dihydrogen disulfide Chemical compound SS BWGNESOTFCXPMA-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 24
- 125000004450 alkenylene group Chemical group 0.000 claims description 24
- 125000004419 alkynylene group Chemical group 0.000 claims description 24
- 230000021615 conjugation Effects 0.000 claims description 24
- 239000000203 mixture Substances 0.000 claims description 24
- CSHWQDPOILHKBI-UHFFFAOYSA-N peryrene Natural products C1=CC(C2=CC=CC=3C2=C2C=CC=3)=C3C2=CC=CC3=C1 CSHWQDPOILHKBI-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 24
- 239000011203 carbon fibre reinforced carbon Substances 0.000 claims description 22
- 238000000684 flow cytometry Methods 0.000 claims description 22
- 125000000623 heterocyclic group Chemical group 0.000 claims description 22
- 229910052757 nitrogen Inorganic materials 0.000 claims description 22
- 102000005962 receptors Human genes 0.000 claims description 22
- 230000004044 response Effects 0.000 claims description 22
- 238000010186 staining Methods 0.000 claims description 22
- 150000002540 isothiocyanates Chemical class 0.000 claims description 21
- 150000001412 amines Chemical class 0.000 claims description 19
- 125000004429 atom Chemical group 0.000 claims description 19
- 125000004404 heteroalkyl group Chemical group 0.000 claims description 18
- 230000003287 optical effect Effects 0.000 claims description 18
- 229910019142 PO4 Inorganic materials 0.000 claims description 17
- DZBUGLKDJFMEHC-UHFFFAOYSA-N acridine Chemical compound C1=CC=CC2=CC3=CC=CC=C3N=C21 DZBUGLKDJFMEHC-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 17
- 229960002685 biotin Drugs 0.000 claims description 17
- 235000020958 biotin Nutrition 0.000 claims description 17
- 239000011616 biotin Substances 0.000 claims description 17
- 125000002080 perylenyl group Chemical group C1(=CC=C2C=CC=C3C4=CC=CC5=CC=CC(C1=C23)=C45)* 0.000 claims description 17
- 229910000073 phosphorus hydride Inorganic materials 0.000 claims description 17
- 150000003461 sulfonyl halides Chemical class 0.000 claims description 17
- NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-K phosphate Chemical compound [O-]P([O-])([O-])=O NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-K 0.000 claims description 16
- 239000010452 phosphate Substances 0.000 claims description 16
- 239000002464 receptor antagonist Substances 0.000 claims description 16
- 229940044551 receptor antagonist Drugs 0.000 claims description 16
- RYYWUUFWQRZTIU-UHFFFAOYSA-K thiophosphate Chemical compound [O-]P([O-])([O-])=S RYYWUUFWQRZTIU-UHFFFAOYSA-K 0.000 claims description 16
- 108010001857 Cell Surface Receptors Proteins 0.000 claims description 15
- 239000002253 acid Substances 0.000 claims description 15
- BBEAQIROQSPTKN-UHFFFAOYSA-N pyrene Chemical compound C1=CC=C2C=CC3=CC=CC4=CC=C1C2=C43 BBEAQIROQSPTKN-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 15
- 150000001408 amides Chemical class 0.000 claims description 14
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 claims description 14
- 150000003536 tetrazoles Chemical class 0.000 claims description 14
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 claims description 13
- 238000001514 detection method Methods 0.000 claims description 13
- 125000001425 triazolyl group Chemical group 0.000 claims description 13
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 claims description 12
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 claims description 12
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 claims description 12
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 claims description 12
- 125000002924 primary amino group Chemical group [H]N([H])* 0.000 claims description 12
- UMGDCJDMYOKAJW-UHFFFAOYSA-N thiourea Chemical compound NC(N)=S UMGDCJDMYOKAJW-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 12
- 108091023037 Aptamer Proteins 0.000 claims description 11
- 102000003886 Glycoproteins Human genes 0.000 claims description 11
- 108090000288 Glycoproteins Proteins 0.000 claims description 11
- 102000029797 Prion Human genes 0.000 claims description 11
- 108091000054 Prion Proteins 0.000 claims description 11
- 238000006352 cycloaddition reaction Methods 0.000 claims description 11
- 150000001993 dienes Chemical class 0.000 claims description 11
- 230000005284 excitation Effects 0.000 claims description 11
- 150000002463 imidates Chemical class 0.000 claims description 11
- 238000002372 labelling Methods 0.000 claims description 11
- 239000003446 ligand Substances 0.000 claims description 11
- 230000000269 nucleophilic effect Effects 0.000 claims description 11
- 125000000464 thioxo group Chemical group S=* 0.000 claims description 11
- 125000002915 carbonyl group Chemical group [*:2]C([*:1])=O 0.000 claims description 10
- WDECIBYCCFPHNR-UHFFFAOYSA-N chrysene Chemical compound C1=CC=CC2=CC=C3C4=CC=CC=C4C=CC3=C21 WDECIBYCCFPHNR-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 10
- GVEPBJHOBDJJJI-UHFFFAOYSA-N fluoranthrene Natural products C1=CC(C2=CC=CC=C22)=C3C2=CC=CC3=C1 GVEPBJHOBDJJJI-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 10
- 150000002500 ions Chemical class 0.000 claims description 10
- 150000001266 acyl halides Chemical class 0.000 claims description 9
- 150000007857 hydrazones Chemical class 0.000 claims description 9
- 150000002576 ketones Chemical class 0.000 claims description 9
- 125000005439 maleimidyl group Chemical group C1(C=CC(N1*)=O)=O 0.000 claims description 9
- 150000002825 nitriles Chemical class 0.000 claims description 9
- 150000002923 oximes Chemical class 0.000 claims description 9
- 150000002924 oxiranes Chemical class 0.000 claims description 9
- 125000001997 phenyl group Chemical group [H]C1=C([H])C([H])=C(*)C([H])=C1[H] 0.000 claims description 9
- 150000004713 phosphodiesters Chemical group 0.000 claims description 9
- 150000007970 thio esters Chemical class 0.000 claims description 9
- 125000003161 (C1-C6) alkylene group Chemical group 0.000 claims description 8
- VPUGDVKSAQVFFS-UHFFFAOYSA-N coronene Chemical compound C1=C(C2=C34)C=CC3=CC=C(C=C3)C4=C4C3=CC=C(C=C3)C4=C2C3=C1 VPUGDVKSAQVFFS-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 8
- ZYGHJZDHTFUPRJ-UHFFFAOYSA-N coumarin Chemical compound C1=CC=C2OC(=O)C=CC2=C1 ZYGHJZDHTFUPRJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 8
- 150000004820 halides Chemical class 0.000 claims description 8
- 229960002317 succinimide Drugs 0.000 claims description 8
- 150000004905 tetrazines Chemical class 0.000 claims description 8
- 125000001730 thiiranyl group Chemical group 0.000 claims description 8
- QGKMIGUHVLGJBR-UHFFFAOYSA-M (4z)-1-(3-methylbutyl)-4-[[1-(3-methylbutyl)quinolin-1-ium-4-yl]methylidene]quinoline;iodide Chemical compound [I-].C12=CC=CC=C2N(CCC(C)C)C=CC1=CC1=CC=[N+](CCC(C)C)C2=CC=CC=C12 QGKMIGUHVLGJBR-UHFFFAOYSA-M 0.000 claims description 7
- 229920003171 Poly (ethylene oxide) Polymers 0.000 claims description 7
- 125000004405 heteroalkoxy group Chemical group 0.000 claims description 7
- IAYPIBMASNFSPL-UHFFFAOYSA-N Ethylene oxide Chemical group C1CO1 IAYPIBMASNFSPL-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 6
- 125000004183 alkoxy alkyl group Chemical group 0.000 claims description 6
- 125000002843 carboxylic acid group Chemical group 0.000 claims description 6
- 150000002019 disulfides Chemical class 0.000 claims description 6
- IHXWECHPYNPJRR-UHFFFAOYSA-N 3-hydroxycyclobut-2-en-1-one Chemical compound OC1=CC(=O)C1 IHXWECHPYNPJRR-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 5
- NOWKCMXCCJGMRR-UHFFFAOYSA-N Aziridine Chemical compound C1CN1 NOWKCMXCCJGMRR-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 5
- PEEHTFAAVSWFBL-UHFFFAOYSA-N Maleimide Chemical compound O=C1NC(=O)C=C1 PEEHTFAAVSWFBL-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 5
- NRCMAYZCPIVABH-UHFFFAOYSA-N Quinacridone Chemical compound N1C2=CC=CC=C2C(=O)C2=C1C=C1C(=O)C3=CC=CC=C3NC1=C2 NRCMAYZCPIVABH-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 5
- DPOPAJRDYZGTIR-UHFFFAOYSA-N Tetrazine Chemical compound C1=CN=NN=N1 DPOPAJRDYZGTIR-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 5
- XSQUKJJJFZCRTK-UHFFFAOYSA-N Urea Natural products NC(N)=O XSQUKJJJFZCRTK-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 5
- SQDFHQJTAWCFIB-UHFFFAOYSA-N n-methylidenehydroxylamine Chemical compound ON=C SQDFHQJTAWCFIB-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 5
- XJKSTNDFUHDPQJ-UHFFFAOYSA-N 1,4-diphenylbenzene Chemical group C1=CC=CC=C1C1=CC=C(C=2C=CC=CC=2)C=C1 XJKSTNDFUHDPQJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- VEPOHXYIFQMVHW-XOZOLZJESA-N 2,3-dihydroxybutanedioic acid (2S,3S)-3,4-dimethyl-2-phenylmorpholine Chemical compound OC(C(O)C(O)=O)C(O)=O.C[C@H]1[C@@H](OCCN1C)c1ccccc1 VEPOHXYIFQMVHW-XOZOLZJESA-N 0.000 claims description 4
- 150000003923 2,5-pyrrolediones Chemical class 0.000 claims description 4
- BZTDTCNHAFUJOG-UHFFFAOYSA-N 6-carboxyfluorescein Chemical compound C12=CC=C(O)C=C2OC2=CC(O)=CC=C2C11OC(=O)C2=CC=C(C(=O)O)C=C21 BZTDTCNHAFUJOG-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- FMMWHPNWAFZXNH-UHFFFAOYSA-N Benz[a]pyrene Chemical compound C1=C2C3=CC=CC=C3C=C(C=C3)C2=C2C3=CC=CC2=C1 FMMWHPNWAFZXNH-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- PCNDJXKNXGMECE-UHFFFAOYSA-N Phenazine Natural products C1=CC=CC2=NC3=CC=CC=C3N=C21 PCNDJXKNXGMECE-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- 229920004933 Terylene® Polymers 0.000 claims description 4
- DGEZNRSVGBDHLK-UHFFFAOYSA-N [1,10]phenanthroline Chemical compound C1=CN=C2C3=NC=CC=C3C=CC2=C1 DGEZNRSVGBDHLK-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- 150000001541 aziridines Chemical class 0.000 claims description 4
- DMLAVOWQYNRWNQ-UHFFFAOYSA-N azobenzene Chemical compound C1=CC=CC=C1N=NC1=CC=CC=C1 DMLAVOWQYNRWNQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- 235000001671 coumarin Nutrition 0.000 claims description 4
- 229960000956 coumarin Drugs 0.000 claims description 4
- OKZIUSOJQLYFSE-UHFFFAOYSA-N difluoroboron Chemical compound F[B]F OKZIUSOJQLYFSE-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- OVTCUIZCVUGJHS-UHFFFAOYSA-N dipyrrin Chemical compound C=1C=CNC=1C=C1C=CC=N1 OVTCUIZCVUGJHS-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- WZYNTGFFWDNWGG-UHFFFAOYSA-N n,n-dimethyl-2-(2-phenylethenyl)aniline Chemical compound CN(C)C1=CC=CC=C1C=CC1=CC=CC=C1 WZYNTGFFWDNWGG-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- 239000001048 orange dye Substances 0.000 claims description 4
- 229930184652 p-Terphenyl Natural products 0.000 claims description 4
- 239000005020 polyethylene terephthalate Substances 0.000 claims description 4
- 150000004032 porphyrins Chemical class 0.000 claims description 4
- HSSLDCABUXLXKM-UHFFFAOYSA-N resorufin Chemical compound C1=CC(=O)C=C2OC3=CC(O)=CC=C3N=C21 HSSLDCABUXLXKM-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- YYMBJDOZVAITBP-UHFFFAOYSA-N rubrene Chemical compound C1=CC=CC=C1C(C1=C(C=2C=CC=CC=2)C2=CC=CC=C2C(C=2C=CC=CC=2)=C11)=C(C=CC=C2)C2=C1C1=CC=CC=C1 YYMBJDOZVAITBP-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- 229910052707 ruthenium Inorganic materials 0.000 claims description 4
- ACOJCCLIDPZYJC-UHFFFAOYSA-M thiazole orange Chemical compound CC1=CC=C(S([O-])(=O)=O)C=C1.C1=CC=C2C(C=C3N(C4=CC=CC=C4S3)C)=CC=[N+](C)C2=C1 ACOJCCLIDPZYJC-UHFFFAOYSA-M 0.000 claims description 4
- 238000012546 transfer Methods 0.000 claims description 4
- WSZBYXQREMPYLP-UHFFFAOYSA-N 9-ethynylanthracene Chemical compound C1=CC=C2C(C#C)=C(C=CC=C3)C3=CC2=C1 WSZBYXQREMPYLP-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 3
- 125000000852 azido group Chemical group *N=[N+]=[N-] 0.000 claims description 3
- 150000001735 carboxylic acids Chemical class 0.000 claims description 2
- 102000006240 membrane receptors Human genes 0.000 claims 4
- 150000001299 aldehydes Chemical class 0.000 claims 2
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 abstract description 18
- 238000004040 coloring Methods 0.000 abstract 3
- PXIPVTKHYLBLMZ-UHFFFAOYSA-N Sodium azide Chemical compound [Na+].[N-]=[N+]=[N-] PXIPVTKHYLBLMZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 40
- 229940127174 UCHT1 Drugs 0.000 description 31
- 239000008280 blood Substances 0.000 description 30
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 description 29
- 108091003079 Bovine Serum Albumin Proteins 0.000 description 27
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 27
- 239000012591 Dulbecco’s Phosphate Buffered Saline Substances 0.000 description 24
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 23
- DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N Glycine Chemical compound NCC(O)=O DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 18
- 108020003175 receptors Proteins 0.000 description 18
- 125000004043 oxo group Chemical group O=* 0.000 description 16
- 150000008300 phosphoramidites Chemical class 0.000 description 16
- WEVYAHXRMPXWCK-UHFFFAOYSA-N Acetonitrile Chemical compound CC#N WEVYAHXRMPXWCK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 15
- 239000012981 Hank's balanced salt solution Substances 0.000 description 15
- 238000002835 absorbance Methods 0.000 description 15
- 229910052799 carbon Inorganic materials 0.000 description 15
- 125000004432 carbon atom Chemical group C* 0.000 description 15
- 239000012091 fetal bovine serum Substances 0.000 description 15
- IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N nitrogen Substances N#N IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 15
- 230000009871 nonspecific binding Effects 0.000 description 15
- 235000021317 phosphate Nutrition 0.000 description 15
- 230000027455 binding Effects 0.000 description 14
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 14
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 14
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 13
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 description 13
- 125000004122 cyclic group Chemical group 0.000 description 13
- 125000004435 hydrogen atom Chemical group [H]* 0.000 description 13
- 239000011734 sodium Substances 0.000 description 13
- OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N Carbon Chemical compound [C] OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 12
- ZMANZCXQSJIPKH-UHFFFAOYSA-N Triethylamine Chemical compound CCN(CC)CC ZMANZCXQSJIPKH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 12
- 238000007792 addition Methods 0.000 description 12
- 229940098773 bovine serum albumin Drugs 0.000 description 12
- 102000000844 Cell Surface Receptors Human genes 0.000 description 11
- 235000001014 amino acid Nutrition 0.000 description 11
- 125000006239 protecting group Chemical group 0.000 description 11
- 125000001424 substituent group Chemical group 0.000 description 11
- 238000010790 dilution Methods 0.000 description 10
- 239000012895 dilution Substances 0.000 description 10
- GNBHRKFJIUUOQI-UHFFFAOYSA-N fluorescein Chemical group O1C(=O)C2=CC=CC=C2C21C1=CC=C(O)C=C1OC1=CC(O)=CC=C21 GNBHRKFJIUUOQI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 10
- 229940127121 immunoconjugate Drugs 0.000 description 10
- 239000000047 product Substances 0.000 description 10
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 10
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 10
- YMWUJEATGCHHMB-UHFFFAOYSA-N Dichloromethane Chemical compound ClCCl YMWUJEATGCHHMB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 9
- 239000004471 Glycine Substances 0.000 description 9
- 239000002585 base Substances 0.000 description 9
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 9
- 230000000052 comparative effect Effects 0.000 description 9
- 125000002485 formyl group Chemical group [H]C(*)=O 0.000 description 9
- 125000002887 hydroxy group Chemical group [H]O* 0.000 description 9
- 150000003254 radicals Chemical group 0.000 description 9
- 238000000611 regression analysis Methods 0.000 description 9
- 210000003819 peripheral blood mononuclear cell Anatomy 0.000 description 8
- 102000017420 CD3 protein, epsilon/gamma/delta subunit Human genes 0.000 description 7
- 229940126062 Compound A Drugs 0.000 description 7
- NLDMNSXOCDLTTB-UHFFFAOYSA-N Heterophylliin A Natural products O1C2COC(=O)C3=CC(O)=C(O)C(O)=C3C3=C(O)C(O)=C(O)C=C3C(=O)OC2C(OC(=O)C=2C=C(O)C(O)=C(O)C=2)C(O)C1OC(=O)C1=CC(O)=C(O)C(O)=C1 NLDMNSXOCDLTTB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 7
- 125000002837 carbocyclic group Chemical group 0.000 description 7
- 229910052739 hydrogen Inorganic materials 0.000 description 7
- 239000001257 hydrogen Substances 0.000 description 7
- 239000000543 intermediate Substances 0.000 description 7
- QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N Acetic acid Chemical compound CC(O)=O QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- NLXLAEXVIDQMFP-UHFFFAOYSA-N Ammonia chloride Chemical compound [NH4+].[Cl-] NLXLAEXVIDQMFP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- UHOVQNZJYSORNB-UHFFFAOYSA-N Benzene Chemical compound C1=CC=CC=C1 UHOVQNZJYSORNB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- UFWIBTONFRDIAS-UHFFFAOYSA-N Naphthalene Chemical compound C1=CC=CC2=CC=CC=C21 UFWIBTONFRDIAS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 239000004743 Polypropylene Substances 0.000 description 6
- JUJWROOIHBZHMG-UHFFFAOYSA-N Pyridine Chemical compound C1=CC=NC=C1 JUJWROOIHBZHMG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- IQFYYKKMVGJFEH-XLPZGREQSA-N Thymidine Chemical compound O=C1NC(=O)C(C)=CN1[C@@H]1O[C@H](CO)[C@@H](O)C1 IQFYYKKMVGJFEH-XLPZGREQSA-N 0.000 description 6
- MWPLVEDNUUSJAV-UHFFFAOYSA-N anthracene Chemical compound C1=CC=CC2=CC3=CC=CC=C3C=C21 MWPLVEDNUUSJAV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- QVGXLLKOCUKJST-UHFFFAOYSA-N atomic oxygen Chemical group [O] QVGXLLKOCUKJST-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 125000000753 cycloalkyl group Chemical group 0.000 description 6
- JXTHNDFMNIQAHM-UHFFFAOYSA-N dichloroacetic acid Chemical compound OC(=O)C(Cl)Cl JXTHNDFMNIQAHM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 6
- 210000001616 monocyte Anatomy 0.000 description 6
- 239000001301 oxygen Chemical group 0.000 description 6
- 229920001155 polypropylene Polymers 0.000 description 6
- 238000010791 quenching Methods 0.000 description 6
- 230000000171 quenching effect Effects 0.000 description 6
- 239000012453 solvate Substances 0.000 description 6
- LYCAIKOWRPUZTN-UHFFFAOYSA-N Ethylene glycol Chemical group OCCO LYCAIKOWRPUZTN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 239000002202 Polyethylene glycol Substances 0.000 description 5
- 125000002619 bicyclic group Chemical group 0.000 description 5
- 230000009089 cytolysis Effects 0.000 description 5
- 238000011156 evaluation Methods 0.000 description 5
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 5
- 238000002189 fluorescence spectrum Methods 0.000 description 5
- 239000011859 microparticle Substances 0.000 description 5
- 230000002093 peripheral effect Effects 0.000 description 5
- 229910052698 phosphorus Inorganic materials 0.000 description 5
- 229920001223 polyethylene glycol Polymers 0.000 description 5
- 239000002243 precursor Substances 0.000 description 5
- 238000000926 separation method Methods 0.000 description 5
- 239000002904 solvent Substances 0.000 description 5
- HZAXFHJVJLSVMW-UHFFFAOYSA-N 2-Aminoethan-1-ol Chemical compound NCCO HZAXFHJVJLSVMW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 238000005698 Diels-Alder reaction Methods 0.000 description 4
- KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N EDTA Chemical compound OC(=O)CN(CC(O)=O)CCN(CC(O)=O)CC(O)=O KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 description 4
- NINIDFKCEFEMDL-UHFFFAOYSA-N Sulfur Chemical group [S] NINIDFKCEFEMDL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 125000003282 alkyl amino group Chemical group 0.000 description 4
- 239000000427 antigen Substances 0.000 description 4
- 108091007433 antigens Proteins 0.000 description 4
- 102000036639 antigens Human genes 0.000 description 4
- 125000003710 aryl alkyl group Chemical group 0.000 description 4
- 230000008033 biological extinction Effects 0.000 description 4
- 210000000601 blood cell Anatomy 0.000 description 4
- RYYVLZVUVIJVGH-UHFFFAOYSA-N caffeine Chemical compound CN1C(=O)N(C)C(=O)C2=C1N=CN2C RYYVLZVUVIJVGH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 230000008878 coupling Effects 0.000 description 4
- 238000010168 coupling process Methods 0.000 description 4
- 238000005859 coupling reaction Methods 0.000 description 4
- 125000001033 ether group Chemical group 0.000 description 4
- MHMNJMPURVTYEJ-UHFFFAOYSA-N fluorescein-5-isothiocyanate Chemical compound O1C(=O)C2=CC(N=C=S)=CC=C2C21C1=CC=C(O)C=C1OC1=CC(O)=CC=C21 MHMNJMPURVTYEJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 238000002866 fluorescence resonance energy transfer Methods 0.000 description 4
- 150000002430 hydrocarbons Chemical group 0.000 description 4
- 229910052740 iodine Inorganic materials 0.000 description 4
- 210000000265 leukocyte Anatomy 0.000 description 4
- 239000012139 lysis buffer Substances 0.000 description 4
- 125000002950 monocyclic group Chemical group 0.000 description 4
- 238000006384 oligomerization reaction Methods 0.000 description 4
- 150000007530 organic bases Chemical class 0.000 description 4
- 229920000768 polyamine Polymers 0.000 description 4
- 230000009257 reactivity Effects 0.000 description 4
- 239000007790 solid phase Substances 0.000 description 4
- 238000003860 storage Methods 0.000 description 4
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 description 4
- 239000011593 sulfur Chemical group 0.000 description 4
- 239000006228 supernatant Substances 0.000 description 4
- 238000000954 titration curve Methods 0.000 description 4
- GETQZCLCWQTVFV-UHFFFAOYSA-N trimethylamine Chemical compound CN(C)C GETQZCLCWQTVFV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 238000005406 washing Methods 0.000 description 4
- ZCYVEMRRCGMTRW-UHFFFAOYSA-N 7553-56-2 Chemical compound [I] ZCYVEMRRCGMTRW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- HBAQYPYDRFILMT-UHFFFAOYSA-N 8-[3-(1-cyclopropylpyrazol-4-yl)-1H-pyrazolo[4,3-d]pyrimidin-5-yl]-3-methyl-3,8-diazabicyclo[3.2.1]octan-2-one Chemical class C1(CC1)N1N=CC(=C1)C1=NNC2=C1N=C(N=C2)N1C2C(N(CC1CC2)C)=O HBAQYPYDRFILMT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- WFDIJRYMOXRFFG-UHFFFAOYSA-N Acetic anhydride Chemical compound CC(=O)OC(C)=O WFDIJRYMOXRFFG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- QGZKDVFQNNGYKY-UHFFFAOYSA-N Ammonia Chemical compound N QGZKDVFQNNGYKY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 230000006820 DNA synthesis Effects 0.000 description 3
- IAZDPXIOMUYVGZ-UHFFFAOYSA-N Dimethylsulphoxide Chemical compound CS(C)=O IAZDPXIOMUYVGZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N Ethanol Chemical compound CCO LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- DGAQECJNVWCQMB-PUAWFVPOSA-M Ilexoside XXIX Chemical compound C[C@@H]1CC[C@@]2(CC[C@@]3(C(=CC[C@H]4[C@]3(CC[C@@H]5[C@@]4(CC[C@@H](C5(C)C)OS(=O)(=O)[O-])C)C)[C@@H]2[C@]1(C)O)C)C(=O)O[C@H]6[C@@H]([C@H]([C@@H]([C@H](O6)CO)O)O)O.[Na+] DGAQECJNVWCQMB-PUAWFVPOSA-M 0.000 description 3
- NQTADLQHYWFPDB-UHFFFAOYSA-N N-Hydroxysuccinimide Chemical class ON1C(=O)CCC1=O NQTADLQHYWFPDB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- MUBZPKHOEPUJKR-UHFFFAOYSA-N Oxalic acid Chemical compound OC(=O)C(O)=O MUBZPKHOEPUJKR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 239000004793 Polystyrene Substances 0.000 description 3
- OFOBLEOULBTSOW-UHFFFAOYSA-N Propanedioic acid Natural products OC(=O)CC(O)=O OFOBLEOULBTSOW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- YXFVVABEGXRONW-UHFFFAOYSA-N Toluene Chemical compound CC1=CC=CC=C1 YXFVVABEGXRONW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N [3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-hydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl [5-(6-aminopurin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] hydrogen phosphate Polymers Cc1cn(C2CC(OP(O)(=O)OCC3OC(CC3OP(O)(=O)OCC3OC(CC3O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)C(COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3CO)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)O2)c(=O)[nH]c1=O JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 230000004913 activation Effects 0.000 description 3
- 235000019270 ammonium chloride Nutrition 0.000 description 3
- 238000003556 assay Methods 0.000 description 3
- 125000003178 carboxy group Chemical group [H]OC(*)=O 0.000 description 3
- 150000001732 carboxylic acid derivatives Chemical class 0.000 description 3
- 239000000460 chlorine Substances 0.000 description 3
- KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-N citric acid Chemical compound OC(=O)CC(O)(C(O)=O)CC(O)=O KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 239000005289 controlled pore glass Substances 0.000 description 3
- 238000007796 conventional method Methods 0.000 description 3
- 230000002255 enzymatic effect Effects 0.000 description 3
- 125000004185 ester group Chemical group 0.000 description 3
- 125000005678 ethenylene group Chemical group [H]C([*:1])=C([H])[*:2] 0.000 description 3
- 229910052731 fluorine Inorganic materials 0.000 description 3
- 210000003714 granulocyte Anatomy 0.000 description 3
- 238000003384 imaging method Methods 0.000 description 3
- 150000003949 imides Chemical group 0.000 description 3
- 125000001841 imino group Chemical group [H]N=* 0.000 description 3
- 150000007529 inorganic bases Chemical class 0.000 description 3
- 239000011630 iodine Substances 0.000 description 3
- 239000006166 lysate Substances 0.000 description 3
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 3
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 3
- 239000000178 monomer Substances 0.000 description 3
- 230000001338 necrotic effect Effects 0.000 description 3
- QJGQUHMNIGDVPM-UHFFFAOYSA-N nitrogen group Chemical group [N] QJGQUHMNIGDVPM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 230000003647 oxidation Effects 0.000 description 3
- 238000007254 oxidation reaction Methods 0.000 description 3
- 239000002245 particle Substances 0.000 description 3
- 125000002467 phosphate group Chemical group [H]OP(=O)(O[H])O[*] 0.000 description 3
- 108091033319 polynucleotide Proteins 0.000 description 3
- 102000040430 polynucleotide Human genes 0.000 description 3
- 239000002157 polynucleotide Substances 0.000 description 3
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 description 3
- 229920002223 polystyrene Polymers 0.000 description 3
- 230000008569 process Effects 0.000 description 3
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 description 3
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 description 3
- 125000006410 propenylene group Chemical group 0.000 description 3
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 description 3
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 3
- UMJSCPRVCHMLSP-UHFFFAOYSA-N pyridine Natural products COC1=CC=CN=C1 UMJSCPRVCHMLSP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 239000011541 reaction mixture Substances 0.000 description 3
- 230000009467 reduction Effects 0.000 description 3
- 125000006413 ring segment Chemical group 0.000 description 3
- 238000012216 screening Methods 0.000 description 3
- 229910052708 sodium Inorganic materials 0.000 description 3
- 125000006850 spacer group Chemical group 0.000 description 3
- 238000001228 spectrum Methods 0.000 description 3
- 125000004434 sulfur atom Chemical group 0.000 description 3
- 125000004001 thioalkyl group Chemical group 0.000 description 3
- ZIBGPFATKBEMQZ-UHFFFAOYSA-N triethylene glycol Chemical compound OCCOCCOCCO ZIBGPFATKBEMQZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 239000003643 water by type Substances 0.000 description 3
- YBYIRNPNPLQARY-UHFFFAOYSA-N 1H-indene Chemical compound C1=CC=C2CC=CC2=C1 YBYIRNPNPLQARY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- WXTMDXOMEHJXQO-UHFFFAOYSA-N 2,5-dihydroxybenzoic acid Chemical compound OC(=O)C1=CC(O)=CC=C1O WXTMDXOMEHJXQO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- QCXJEYYXVJIFCE-UHFFFAOYSA-N 4-acetamidobenzoic acid Chemical compound CC(=O)NC1=CC=C(C(O)=O)C=C1 QCXJEYYXVJIFCE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- KDCGOANMDULRCW-UHFFFAOYSA-N 7H-purine Chemical compound N1=CNC2=NC=NC2=C1 KDCGOANMDULRCW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- CIWBSHSKHKDKBQ-JLAZNSOCSA-N Ascorbic acid Chemical compound OC[C@H](O)[C@H]1OC(=O)C(O)=C1O CIWBSHSKHKDKBQ-JLAZNSOCSA-N 0.000 description 2
- BPYKTIZUTYGOLE-IFADSCNNSA-N Bilirubin Chemical compound N1C(=O)C(C)=C(C=C)\C1=C\C1=C(C)C(CCC(O)=O)=C(CC2=C(C(C)=C(\C=C/3C(=C(C=C)C(=O)N\3)C)N2)CCC(O)=O)N1 BPYKTIZUTYGOLE-IFADSCNNSA-N 0.000 description 2
- KAKZBPTYRLMSJV-UHFFFAOYSA-N Butadiene Chemical compound C=CC=C KAKZBPTYRLMSJV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- OYPRJOBELJOOCE-UHFFFAOYSA-N Calcium Chemical compound [Ca] OYPRJOBELJOOCE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- RGHNJXZEOKUKBD-SQOUGZDYSA-N D-gluconic acid Chemical compound OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)C(O)=O RGHNJXZEOKUKBD-SQOUGZDYSA-N 0.000 description 2
- XBPCUCUWBYBCDP-UHFFFAOYSA-N Dicyclohexylamine Chemical compound C1CCCCC1NC1CCCCC1 XBPCUCUWBYBCDP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- VZCYOOQTPOCHFL-OWOJBTEDSA-N Fumaric acid Chemical compound OC(=O)\C=C\C(O)=O VZCYOOQTPOCHFL-OWOJBTEDSA-N 0.000 description 2
- DSLZVSRJTYRBFB-UHFFFAOYSA-N Galactaric acid Natural products OC(=O)C(O)C(O)C(O)C(O)C(O)=O DSLZVSRJTYRBFB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- AEMRFAOFKBGASW-UHFFFAOYSA-N Glycolic acid Chemical compound OCC(O)=O AEMRFAOFKBGASW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- NYHBQMYGNKIUIF-UUOKFMHZSA-N Guanosine Chemical compound C1=NC=2C(=O)NC(N)=NC=2N1[C@@H]1O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@H]1O NYHBQMYGNKIUIF-UUOKFMHZSA-N 0.000 description 2
- 238000006736 Huisgen cycloaddition reaction Methods 0.000 description 2
- VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-N Hydrochloric acid Chemical compound Cl VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- XEEYBQQBJWHFJM-UHFFFAOYSA-N Iron Chemical compound [Fe] XEEYBQQBJWHFJM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- LPHGQDQBBGAPDZ-UHFFFAOYSA-N Isocaffeine Natural products CN1C(=O)N(C)C(=O)C2=C1N(C)C=N2 LPHGQDQBBGAPDZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- FYYHWMGAXLPEAU-UHFFFAOYSA-N Magnesium Chemical compound [Mg] FYYHWMGAXLPEAU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- AFVFQIVMOAPDHO-UHFFFAOYSA-N Methanesulfonic acid Chemical compound CS(O)(=O)=O AFVFQIVMOAPDHO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- JGFZNNIVVJXRND-UHFFFAOYSA-N N,N-Diisopropylethylamine (DIPEA) Chemical compound CCN(C(C)C)C(C)C JGFZNNIVVJXRND-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- QIAFMBKCNZACKA-UHFFFAOYSA-N N-benzoylglycine Chemical compound OC(=O)CNC(=O)C1=CC=CC=C1 QIAFMBKCNZACKA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- UEEJHVSXFDXPFK-UHFFFAOYSA-N N-dimethylaminoethanol Chemical compound CN(C)CCO UEEJHVSXFDXPFK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 description 2
- PVNIIMVLHYAWGP-UHFFFAOYSA-N Niacin Chemical compound OC(=O)C1=CC=CN=C1 PVNIIMVLHYAWGP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-N Phosphoric acid Chemical compound OP(O)(O)=O NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- OAICVXFJPJFONN-UHFFFAOYSA-N Phosphorus Chemical compound [P] OAICVXFJPJFONN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- GLUUGHFHXGJENI-UHFFFAOYSA-N Piperazine Chemical compound C1CNCCN1 GLUUGHFHXGJENI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- NQRYJNQNLNOLGT-UHFFFAOYSA-N Piperidine Chemical compound C1CCNCC1 NQRYJNQNLNOLGT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- LCTONWCANYUPML-UHFFFAOYSA-N Pyruvic acid Chemical compound CC(=O)C(O)=O LCTONWCANYUPML-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- QAOWNCQODCNURD-UHFFFAOYSA-N Sulfuric acid Chemical compound OS(O)(=O)=O QAOWNCQODCNURD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 210000001744 T-lymphocyte Anatomy 0.000 description 2
- PZBFGYYEXUXCOF-UHFFFAOYSA-N TCEP Chemical compound OC(=O)CCP(CCC(O)=O)CCC(O)=O PZBFGYYEXUXCOF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- WYURNTSHIVDZCO-UHFFFAOYSA-N Tetrahydrofuran Chemical compound C1CCOC1 WYURNTSHIVDZCO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- RYYWUUFWQRZTIU-UHFFFAOYSA-N Thiophosphoric acid Chemical group OP(O)(S)=O RYYWUUFWQRZTIU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- DTQVDTLACAAQTR-UHFFFAOYSA-N Trifluoroacetic acid Chemical compound OC(=O)C(F)(F)F DTQVDTLACAAQTR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- DRTQHJPVMGBUCF-XVFCMESISA-N Uridine Chemical compound O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1N1C(=O)NC(=O)C=C1 DRTQHJPVMGBUCF-XVFCMESISA-N 0.000 description 2
- 238000010958 [3+2] cycloaddition reaction Methods 0.000 description 2
- 238000010521 absorption reaction Methods 0.000 description 2
- 239000012190 activator Substances 0.000 description 2
- OIRDTQYFTABQOQ-KQYNXXCUSA-N adenosine Chemical compound C1=NC=2C(N)=NC=NC=2N1[C@@H]1O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@H]1O OIRDTQYFTABQOQ-KQYNXXCUSA-N 0.000 description 2
- WNLRTRBMVRJNCN-UHFFFAOYSA-N adipic acid Chemical compound OC(=O)CCCCC(O)=O WNLRTRBMVRJNCN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 125000003158 alcohol group Chemical group 0.000 description 2
- 125000005011 alkyl ether group Chemical group 0.000 description 2
- 125000000129 anionic group Chemical group 0.000 description 2
- 150000001454 anthracenes Chemical class 0.000 description 2
- 125000006615 aromatic heterocyclic group Chemical group 0.000 description 2
- CUFNKYGDVFVPHO-UHFFFAOYSA-N azulene Chemical compound C1=CC=CC2=CC=CC2=C1 CUFNKYGDVFVPHO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000008901 benefit Effects 0.000 description 2
- 125000002047 benzodioxolyl group Chemical group O1OC(C2=C1C=CC=C2)* 0.000 description 2
- 125000000499 benzofuranyl group Chemical group O1C(=CC2=C1C=CC=C2)* 0.000 description 2
- WPYMKLBDIGXBTP-UHFFFAOYSA-N benzoic acid Chemical compound OC(=O)C1=CC=CC=C1 WPYMKLBDIGXBTP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 125000001164 benzothiazolyl group Chemical group S1C(=NC2=C1C=CC=C2)* 0.000 description 2
- 125000004541 benzoxazolyl group Chemical group O1C(=NC2=C1C=CC=C2)* 0.000 description 2
- 230000005540 biological transmission Effects 0.000 description 2
- 239000000090 biomarker Substances 0.000 description 2
- 229960001948 caffeine Drugs 0.000 description 2
- VJEONQKOZGKCAK-UHFFFAOYSA-N caffeine Natural products CN1C(=O)N(C)C(=O)C2=C1C=CN2C VJEONQKOZGKCAK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000011575 calcium Substances 0.000 description 2
- 229910052791 calcium Inorganic materials 0.000 description 2
- 201000011510 cancer Diseases 0.000 description 2
- 238000006555 catalytic reaction Methods 0.000 description 2
- 150000001768 cations Chemical class 0.000 description 2
- 230000001413 cellular effect Effects 0.000 description 2
- 238000005119 centrifugation Methods 0.000 description 2
- 238000012512 characterization method Methods 0.000 description 2
- 229910052801 chlorine Inorganic materials 0.000 description 2
- OEYIOHPDSNJKLS-UHFFFAOYSA-N choline Chemical compound C[N+](C)(C)CCO OEYIOHPDSNJKLS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229960001231 choline Drugs 0.000 description 2
- 239000003086 colorant Substances 0.000 description 2
- 238000004132 cross linking Methods 0.000 description 2
- 125000004093 cyano group Chemical group *C#N 0.000 description 2
- 125000001316 cycloalkyl alkyl group Chemical group 0.000 description 2
- OPTASPLRGRRNAP-UHFFFAOYSA-N cytosine Chemical compound NC=1C=CNC(=O)N=1 OPTASPLRGRRNAP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- GHVNFZFCNZKVNT-UHFFFAOYSA-N decanoic acid Chemical compound CCCCCCCCCC(O)=O GHVNFZFCNZKVNT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229960005215 dichloroacetic acid Drugs 0.000 description 2
- HPNMFZURTQLUMO-UHFFFAOYSA-N diethylamine Chemical compound CCNCC HPNMFZURTQLUMO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- XBDQKXXYIPTUBI-UHFFFAOYSA-N dimethylselenoniopropionate Natural products CCC(O)=O XBDQKXXYIPTUBI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 2
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 2
- 238000006073 displacement reaction Methods 0.000 description 2
- POULHZVOKOAJMA-UHFFFAOYSA-N dodecanoic acid Chemical compound CCCCCCCCCCCC(O)=O POULHZVOKOAJMA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000009977 dual effect Effects 0.000 description 2
- 238000001962 electrophoresis Methods 0.000 description 2
- 238000000295 emission spectrum Methods 0.000 description 2
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 2
- 210000003743 erythrocyte Anatomy 0.000 description 2
- 125000001495 ethyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])([H])* 0.000 description 2
- 239000012458 free base Substances 0.000 description 2
- DSLZVSRJTYRBFB-DUHBMQHGSA-N galactaric acid Chemical compound OC(=O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)C(O)=O DSLZVSRJTYRBFB-DUHBMQHGSA-N 0.000 description 2
- 239000000499 gel Substances 0.000 description 2
- KWIUHFFTVRNATP-UHFFFAOYSA-N glycine betaine Chemical compound C[N+](C)(C)CC([O-])=O KWIUHFFTVRNATP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 125000001188 haloalkyl group Chemical group 0.000 description 2
- 125000005843 halogen group Chemical group 0.000 description 2
- 238000010438 heat treatment Methods 0.000 description 2
- 125000004446 heteroarylalkyl group Chemical group 0.000 description 2
- 125000004415 heterocyclylalkyl group Chemical group 0.000 description 2
- IPCSVZSSVZVIGE-UHFFFAOYSA-N hexadecanoic acid Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCC(O)=O IPCSVZSSVZVIGE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- FUZZWVXGSFPDMH-UHFFFAOYSA-N hexanoic acid Chemical compound CCCCCC(O)=O FUZZWVXGSFPDMH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000005556 hormone Substances 0.000 description 2
- 229940088597 hormone Drugs 0.000 description 2
- PQNFLJBBNBOBRQ-UHFFFAOYSA-N indane Chemical compound C1=CC=C2CCCC2=C1 PQNFLJBBNBOBRQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 125000003453 indazolyl group Chemical group N1N=C(C2=C1C=CC=C2)* 0.000 description 2
- SUMDYPCJJOFFON-UHFFFAOYSA-N isethionic acid Chemical compound OCCS(O)(=O)=O SUMDYPCJJOFFON-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- KQNPFQTWMSNSAP-UHFFFAOYSA-N isobutyric acid Chemical compound CC(C)C(O)=O KQNPFQTWMSNSAP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000002955 isolation Methods 0.000 description 2
- JJWLVOIRVHMVIS-UHFFFAOYSA-N isopropylamine Chemical compound CC(C)N JJWLVOIRVHMVIS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- JVTAAEKCZFNVCJ-UHFFFAOYSA-N lactic acid Chemical compound CC(O)C(O)=O JVTAAEKCZFNVCJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 210000004698 lymphocyte Anatomy 0.000 description 2
- 239000011777 magnesium Substances 0.000 description 2
- 229910052749 magnesium Inorganic materials 0.000 description 2
- 238000004949 mass spectrometry Methods 0.000 description 2
- 239000000463 material Substances 0.000 description 2
- 230000007246 mechanism Effects 0.000 description 2
- BDAGIHXWWSANSR-UHFFFAOYSA-N methanoic acid Natural products OC=O BDAGIHXWWSANSR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 125000002496 methyl group Chemical group [H]C([H])([H])* 0.000 description 2
- 239000003607 modifier Substances 0.000 description 2
- XTEGVFVZDVNBPF-UHFFFAOYSA-N naphthalene-1,5-disulfonic acid Chemical compound C1=CC=C2C(S(=O)(=O)O)=CC=CC2=C1S(O)(=O)=O XTEGVFVZDVNBPF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 150000002790 naphthalenes Chemical class 0.000 description 2
- 239000013642 negative control Substances 0.000 description 2
- 125000004433 nitrogen atom Chemical group N* 0.000 description 2
- WWZKQHOCKIZLMA-UHFFFAOYSA-N octanoic acid Chemical compound CCCCCCCC(O)=O WWZKQHOCKIZLMA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- PXQPEWDEAKTCGB-UHFFFAOYSA-N orotic acid Chemical compound OC(=O)C1=CC(=O)NC(=O)N1 PXQPEWDEAKTCGB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000012071 phase Substances 0.000 description 2
- YNPNZTXNASCQKK-UHFFFAOYSA-N phenanthrene Chemical compound C1=CC=C2C3=CC=CC=C3C=CC2=C1 YNPNZTXNASCQKK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- NMHMNPHRMNGLLB-UHFFFAOYSA-N phloretic acid Chemical compound OC(=O)CCC1=CC=C(O)C=C1 NMHMNPHRMNGLLB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- SXADIBFZNXBEGI-UHFFFAOYSA-N phosphoramidous acid Chemical group NP(O)O SXADIBFZNXBEGI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000011574 phosphorus Substances 0.000 description 2
- 150000003141 primary amines Chemical class 0.000 description 2
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 2
- 125000004076 pyridyl group Chemical group 0.000 description 2
- 125000000168 pyrrolyl group Chemical group 0.000 description 2
- 230000005855 radiation Effects 0.000 description 2
- 239000011347 resin Substances 0.000 description 2
- 229920005989 resin Polymers 0.000 description 2
- 230000002441 reversible effect Effects 0.000 description 2
- YGSDEFSMJLZEOE-UHFFFAOYSA-N salicylic acid Chemical compound OC(=O)C1=CC=CC=C1O YGSDEFSMJLZEOE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- CXMXRPHRNRROMY-UHFFFAOYSA-N sebacic acid Chemical compound OC(=O)CCCCCCCCC(O)=O CXMXRPHRNRROMY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000013207 serial dilution Methods 0.000 description 2
- 239000012064 sodium phosphate buffer Substances 0.000 description 2
- 238000010532 solid phase synthesis reaction Methods 0.000 description 2
- 230000003595 spectral effect Effects 0.000 description 2
- 238000010561 standard procedure Methods 0.000 description 2
- 239000007858 starting material Substances 0.000 description 2
- 125000000547 substituted alkyl group Chemical group 0.000 description 2
- 238000004885 tandem mass spectrometry Methods 0.000 description 2
- 125000001412 tetrahydropyranyl group Chemical group 0.000 description 2
- MPLHNVLQVRSVEE-UHFFFAOYSA-N texas red Chemical compound [O-]S(=O)(=O)C1=CC(S(Cl)(=O)=O)=CC=C1C(C1=CC=2CCCN3CCCC(C=23)=C1O1)=C2C1=C(CCC1)C3=[N+]1CCCC3=C2 MPLHNVLQVRSVEE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- YAPQBXQYLJRXSA-UHFFFAOYSA-N theobromine Chemical compound CN1C(=O)NC(=O)C2=C1N=CN2C YAPQBXQYLJRXSA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 125000001544 thienyl group Chemical group 0.000 description 2
- ZMZDMBWJUHKJPS-UHFFFAOYSA-N thiocyanic acid Chemical compound SC#N ZMZDMBWJUHKJPS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 150000003573 thiols Chemical group 0.000 description 2
- 125000004568 thiomorpholinyl group Chemical group 0.000 description 2
- JOXIMZWYDAKGHI-UHFFFAOYSA-N toluene-4-sulfonic acid Chemical compound CC1=CC=C(S(O)(=O)=O)C=C1 JOXIMZWYDAKGHI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- VZCYOOQTPOCHFL-UHFFFAOYSA-N trans-butenedioic acid Natural products OC(=O)C=CC(O)=O VZCYOOQTPOCHFL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 125000004665 trialkylsilyl group Chemical group 0.000 description 2
- 150000003852 triazoles Chemical class 0.000 description 2
- QBYIENPQHBMVBV-HFEGYEGKSA-N (2R)-2-hydroxy-2-phenylacetic acid Chemical compound O[C@@H](C(O)=O)c1ccccc1.O[C@@H](C(O)=O)c1ccccc1 QBYIENPQHBMVBV-HFEGYEGKSA-N 0.000 description 1
- WRIDQFICGBMAFQ-UHFFFAOYSA-N (E)-8-Octadecenoic acid Natural products CCCCCCCCCC=CCCCCCCC(O)=O WRIDQFICGBMAFQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- MIOPJNTWMNEORI-GMSGAONNSA-N (S)-camphorsulfonic acid Chemical compound C1C[C@@]2(CS(O)(=O)=O)C(=O)C[C@@H]1C2(C)C MIOPJNTWMNEORI-GMSGAONNSA-N 0.000 description 1
- BJEPYKJPYRNKOW-REOHCLBHSA-N (S)-malic acid Chemical compound OC(=O)[C@@H](O)CC(O)=O BJEPYKJPYRNKOW-REOHCLBHSA-N 0.000 description 1
- DQXKOHDUMJLXKH-PHEQNACWSA-N (e)-n-[2-[2-[[(e)-oct-2-enoyl]amino]ethyldisulfanyl]ethyl]oct-2-enamide Chemical compound CCCCC\C=C\C(=O)NCCSSCCNC(=O)\C=C\CCCCC DQXKOHDUMJLXKH-PHEQNACWSA-N 0.000 description 1
- WBYWAXJHAXSJNI-VOTSOKGWSA-M .beta-Phenylacrylic acid Natural products [O-]C(=O)\C=C\C1=CC=CC=C1 WBYWAXJHAXSJNI-VOTSOKGWSA-M 0.000 description 1
- BYEAHWXPCBROCE-UHFFFAOYSA-N 1,1,1,3,3,3-hexafluoropropan-2-ol Chemical compound FC(F)(F)C(O)C(F)(F)F BYEAHWXPCBROCE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000005988 1,1-dioxo-thiomorpholinyl group Chemical group 0.000 description 1
- SLLFVLKNXABYGI-UHFFFAOYSA-N 1,2,3-benzoxadiazole Chemical compound C1=CC=C2ON=NC2=C1 SLLFVLKNXABYGI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000005877 1,4-benzodioxanyl group Chemical group 0.000 description 1
- VXNZUUAINFGPBY-UHFFFAOYSA-N 1-Butene Chemical group CCC=C VXNZUUAINFGPBY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- RVRLFABOQXZUJX-UHFFFAOYSA-N 1-[1-(2,5-dioxopyrrol-1-yl)ethyl]pyrrole-2,5-dione Chemical compound O=C1C=CC(=O)N1C(C)N1C(=O)C=CC1=O RVRLFABOQXZUJX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- JBWYRBLDOOOJEU-UHFFFAOYSA-N 1-[chloro-(4-methoxyphenyl)-phenylmethyl]-4-methoxybenzene Chemical compound C1=CC(OC)=CC=C1C(Cl)(C=1C=CC(OC)=CC=1)C1=CC=CC=C1 JBWYRBLDOOOJEU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- JFLSOKIMYBSASW-UHFFFAOYSA-N 1-chloro-2-[chloro(diphenyl)methyl]benzene Chemical compound ClC1=CC=CC=C1C(Cl)(C=1C=CC=CC=1)C1=CC=CC=C1 JFLSOKIMYBSASW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- SJJCQDRGABAVBB-UHFFFAOYSA-N 1-hydroxy-2-naphthoic acid Chemical compound C1=CC=CC2=C(O)C(C(=O)O)=CC=C21 SJJCQDRGABAVBB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- RTBFRGCFXZNCOE-UHFFFAOYSA-N 1-methylsulfonylpiperidin-4-one Chemical compound CS(=O)(=O)N1CCC(=O)CC1 RTBFRGCFXZNCOE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000005987 1-oxo-thiomorpholinyl group Chemical group 0.000 description 1
- FRPZMMHWLSIFAZ-UHFFFAOYSA-N 10-undecenoic acid Chemical compound OC(=O)CCCCCCCCC=C FRPZMMHWLSIFAZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- VGIRNWJSIRVFRT-UHFFFAOYSA-N 2',7'-difluorofluorescein Chemical compound OC(=O)C1=CC=CC=C1C1=C2C=C(F)C(=O)C=C2OC2=CC(O)=C(F)C=C21 VGIRNWJSIRVFRT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- VWFRSNKRTNUMET-UHFFFAOYSA-N 2-[3-(dimethylamino)-6-dimethylazaniumylidenexanthen-9-yl]-5-(2,5-dioxopyrrolidin-1-yl)oxycarbonylbenzoate Chemical compound C=12C=CC(=[N+](C)C)C=C2OC2=CC(N(C)C)=CC=C2C=1C(C(=C1)C([O-])=O)=CC=C1C(=O)ON1C(=O)CCC1=O VWFRSNKRTNUMET-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- MSWZFWKMSRAUBD-IVMDWMLBSA-N 2-amino-2-deoxy-D-glucopyranose Chemical compound N[C@H]1C(O)O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@@H]1O MSWZFWKMSRAUBD-IVMDWMLBSA-N 0.000 description 1
- KMEMIMRPZGDOMG-UHFFFAOYSA-N 2-cyanoethoxyphosphonamidous acid Chemical compound NP(O)OCCC#N KMEMIMRPZGDOMG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000001731 2-cyanoethyl group Chemical class [H]C([H])(*)C([H])([H])C#N 0.000 description 1
- BFSVOASYOCHEOV-UHFFFAOYSA-N 2-diethylaminoethanol Chemical compound CCN(CC)CCO BFSVOASYOCHEOV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229940013085 2-diethylaminoethanol Drugs 0.000 description 1
- 125000003229 2-methylhexyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])(C([H])([H])[H])C([H])([H])* 0.000 description 1
- 125000006088 2-oxoazepinyl group Chemical group 0.000 description 1
- KPGXRSRHYNQIFN-UHFFFAOYSA-N 2-oxoglutaric acid Chemical compound OC(=O)CCC(=O)C(O)=O KPGXRSRHYNQIFN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000004638 2-oxopiperazinyl group Chemical group O=C1N(CCNC1)* 0.000 description 1
- 125000004637 2-oxopiperidinyl group Chemical group O=C1N(CCCC1)* 0.000 description 1
- MPPQGYCZBNURDG-UHFFFAOYSA-N 2-propionyl-6-dimethylaminonaphthalene Chemical compound C1=C(N(C)C)C=CC2=CC(C(=O)CC)=CC=C21 MPPQGYCZBNURDG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- BNBQQYFXBLBYJK-UHFFFAOYSA-N 2-pyridin-2-yl-1,3-oxazole Chemical compound C1=COC(C=2N=CC=CC=2)=N1 BNBQQYFXBLBYJK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- LQJBNNIYVWPHFW-UHFFFAOYSA-N 20:1omega9c fatty acid Natural products CCCCCCCCCCC=CCCCCCCCC(O)=O LQJBNNIYVWPHFW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- QWTBDIBOOIAZEF-UHFFFAOYSA-N 3-[chloro-[di(propan-2-yl)amino]phosphanyl]oxypropanenitrile Chemical compound CC(C)N(C(C)C)P(Cl)OCCC#N QWTBDIBOOIAZEF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- BMYNFMYTOJXKLE-UHFFFAOYSA-N 3-azaniumyl-2-hydroxypropanoate Chemical compound NCC(O)C(O)=O BMYNFMYTOJXKLE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- UOQHWNPVNXSDDO-UHFFFAOYSA-N 3-bromoimidazo[1,2-a]pyridine-6-carbonitrile Chemical compound C1=CC(C#N)=CN2C(Br)=CN=C21 UOQHWNPVNXSDDO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000003469 3-methylhexyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])(C([H])([H])[H])C([H])([H])C([H])([H])* 0.000 description 1
- OSWFIVFLDKOXQC-UHFFFAOYSA-N 4-(3-methoxyphenyl)aniline Chemical compound COC1=CC=CC(C=2C=CC(N)=CC=2)=C1 OSWFIVFLDKOXQC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- WUBBRNOQWQTFEX-UHFFFAOYSA-N 4-aminosalicylic acid Chemical compound NC1=CC=C(C(O)=O)C(O)=C1 WUBBRNOQWQTFEX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- UWAUSMGZOHPBJJ-UHFFFAOYSA-N 4-nitro-1,2,3-benzoxadiazole Chemical compound [O-][N+](=O)C1=CC=CC2=C1N=NO2 UWAUSMGZOHPBJJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000005986 4-piperidonyl group Chemical group 0.000 description 1
- YMZMTOFQCVHHFB-UHFFFAOYSA-N 5-carboxytetramethylrhodamine Chemical compound C=12C=CC(N(C)C)=CC2=[O+]C2=CC(N(C)C)=CC=C2C=1C1=CC=C(C(O)=O)C=C1C([O-])=O YMZMTOFQCVHHFB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- ODHCTXKNWHHXJC-VKHMYHEASA-N 5-oxo-L-proline Chemical compound OC(=O)[C@@H]1CCC(=O)N1 ODHCTXKNWHHXJC-VKHMYHEASA-N 0.000 description 1
- QSBYPNXLFMSGKH-UHFFFAOYSA-N 9-Heptadecensaeure Natural products CCCCCCCC=CCCCCCCCC(O)=O QSBYPNXLFMSGKH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000012099 Alexa Fluor family Substances 0.000 description 1
- QGZKDVFQNNGYKY-UHFFFAOYSA-O Ammonium Chemical compound [NH4+] QGZKDVFQNNGYKY-UHFFFAOYSA-O 0.000 description 1
- VHUUQVKOLVNVRT-UHFFFAOYSA-N Ammonium hydroxide Chemical compound [NH4+].[OH-] VHUUQVKOLVNVRT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000004475 Arginine Substances 0.000 description 1
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 description 1
- 239000005711 Benzoic acid Substances 0.000 description 1
- DWRXFEITVBNRMK-UHFFFAOYSA-N Beta-D-1-Arabinofuranosylthymine Natural products O=C1NC(=O)C(C)=CN1C1C(O)C(O)C(CO)O1 DWRXFEITVBNRMK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- VGMQBHDFQOIZDD-UHFFFAOYSA-N C(#N)CC[P]N(C(C)C)C(C)C Chemical compound C(#N)CC[P]N(C(C)C)C(C)C VGMQBHDFQOIZDD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000002126 C01EB10 - Adenosine Substances 0.000 description 1
- LSPHULWDVZXLIL-UHFFFAOYSA-N Camphoric acid Natural products CC1(C)C(C(O)=O)CCC1(C)C(O)=O LSPHULWDVZXLIL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000283707 Capra Species 0.000 description 1
- 239000005632 Capric acid (CAS 334-48-5) Substances 0.000 description 1
- 239000005635 Caprylic acid (CAS 124-07-2) Substances 0.000 description 1
- ZAMOUSCENKQFHK-UHFFFAOYSA-N Chlorine atom Chemical compound [Cl] ZAMOUSCENKQFHK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- WBYWAXJHAXSJNI-SREVYHEPSA-N Cinnamic acid Chemical compound OC(=O)\C=C/C1=CC=CC=C1 WBYWAXJHAXSJNI-SREVYHEPSA-N 0.000 description 1
- RYGMFSIKBFXOCR-UHFFFAOYSA-N Copper Chemical compound [Cu] RYGMFSIKBFXOCR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- MIKUYHXYGGJMLM-GIMIYPNGSA-N Crotonoside Natural products C1=NC2=C(N)NC(=O)N=C2N1[C@H]1O[C@@H](CO)[C@H](O)[C@@H]1O MIKUYHXYGGJMLM-GIMIYPNGSA-N 0.000 description 1
- RGHNJXZEOKUKBD-UHFFFAOYSA-N D-gluconic acid Natural products OCC(O)C(O)C(O)C(O)C(O)=O RGHNJXZEOKUKBD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- NYHBQMYGNKIUIF-UHFFFAOYSA-N D-guanosine Natural products C1=2NC(N)=NC(=O)C=2N=CN1C1OC(CO)C(O)C1O NYHBQMYGNKIUIF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000012129 DRAQ7 reagent Substances 0.000 description 1
- FEWJPZIEWOKRBE-JCYAYHJZSA-N Dextrotartaric acid Chemical compound OC(=O)[C@H](O)[C@@H](O)C(O)=O FEWJPZIEWOKRBE-JCYAYHJZSA-N 0.000 description 1
- QXNVGIXVLWOKEQ-UHFFFAOYSA-N Disodium Chemical class [Na][Na] QXNVGIXVLWOKEQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- PIICEJLVQHRZGT-UHFFFAOYSA-N Ethylenediamine Chemical compound NCCN PIICEJLVQHRZGT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- PXGOKWXKJXAPGV-UHFFFAOYSA-N Fluorine Chemical compound FF PXGOKWXKJXAPGV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- IAJILQKETJEXLJ-UHFFFAOYSA-N Galacturonsaeure Natural products O=CC(O)C(O)C(O)C(O)C(O)=O IAJILQKETJEXLJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- WHUUTDBJXJRKMK-UHFFFAOYSA-N Glutamic acid Natural products OC(=O)C(N)CCC(O)=O WHUUTDBJXJRKMK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102000006947 Histones Human genes 0.000 description 1
- 108010033040 Histones Proteins 0.000 description 1
- ODKSFYDXXFIFQN-BYPYZUCNSA-P L-argininium(2+) Chemical compound NC(=[NH2+])NCCC[C@H]([NH3+])C(O)=O ODKSFYDXXFIFQN-BYPYZUCNSA-P 0.000 description 1
- CKLJMWTZIZZHCS-REOHCLBHSA-N L-aspartic acid Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O CKLJMWTZIZZHCS-REOHCLBHSA-N 0.000 description 1
- WHUUTDBJXJRKMK-VKHMYHEASA-N L-glutamic acid Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O WHUUTDBJXJRKMK-VKHMYHEASA-N 0.000 description 1
- HNDVDQJCIGZPNO-YFKPBYRVSA-N L-histidine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CN=CN1 HNDVDQJCIGZPNO-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 1
- KDXKERNSBIXSRK-YFKPBYRVSA-N L-lysine Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 1
- 239000005639 Lauric acid Substances 0.000 description 1
- WHXSMMKQMYFTQS-UHFFFAOYSA-N Lithium Chemical compound [Li] WHXSMMKQMYFTQS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N Lysine Natural products NCCCCC(N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000004472 Lysine Substances 0.000 description 1
- 102000018697 Membrane Proteins Human genes 0.000 description 1
- 108010052285 Membrane Proteins Proteins 0.000 description 1
- HTLZVHNRZJPSMI-UHFFFAOYSA-N N-ethylpiperidine Chemical compound CCN1CCCCC1 HTLZVHNRZJPSMI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- MBBZMMPHUWSWHV-BDVNFPICSA-N N-methylglucamine Chemical compound CNC[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O)CO MBBZMMPHUWSWHV-BDVNFPICSA-N 0.000 description 1
- 150000001204 N-oxides Chemical group 0.000 description 1
- GRYLNZFGIOXLOG-UHFFFAOYSA-N Nitric acid Chemical compound O[N+]([O-])=O GRYLNZFGIOXLOG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- JCXJVPUVTGWSNB-UHFFFAOYSA-N Nitrogen dioxide Chemical compound O=[N]=O JCXJVPUVTGWSNB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108020004711 Nucleic Acid Probes Proteins 0.000 description 1
- 108091005461 Nucleic proteins Proteins 0.000 description 1
- 239000005642 Oleic acid Substances 0.000 description 1
- ZQPPMHVWECSIRJ-UHFFFAOYSA-N Oleic acid Natural products CCCCCCCCC=CCCCCCCCC(O)=O ZQPPMHVWECSIRJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 235000021314 Palmitic acid Nutrition 0.000 description 1
- 229930040373 Paraformaldehyde Natural products 0.000 description 1
- ZLMJMSJWJFRBEC-UHFFFAOYSA-N Potassium Chemical compound [K] ZLMJMSJWJFRBEC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- WDVSHHCDHLJJJR-UHFFFAOYSA-N Proflavine Chemical compound C1=CC(N)=CC2=NC3=CC(N)=CC=C3C=C21 WDVSHHCDHLJJJR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102100039641 Protein MFI Human genes 0.000 description 1
- ODHCTXKNWHHXJC-GSVOUGTGSA-N Pyroglutamic acid Natural products OC(=O)[C@H]1CCC(=O)N1 ODHCTXKNWHHXJC-GSVOUGTGSA-N 0.000 description 1
- IWYDHOAUDWTVEP-UHFFFAOYSA-N R-2-phenyl-2-hydroxyacetic acid Natural products OC(=O)C(O)C1=CC=CC=C1 IWYDHOAUDWTVEP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- XUIMIQQOPSSXEZ-UHFFFAOYSA-N Silicon Chemical group [Si] XUIMIQQOPSSXEZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 235000021355 Stearic acid Nutrition 0.000 description 1
- KDYFGRWQOYBRFD-UHFFFAOYSA-N Succinic acid Natural products OC(=O)CCC(O)=O KDYFGRWQOYBRFD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000006069 Suzuki reaction reaction Methods 0.000 description 1
- FEWJPZIEWOKRBE-UHFFFAOYSA-N Tartaric acid Natural products [H+].[H+].[O-]C(=O)C(O)C(O)C([O-])=O FEWJPZIEWOKRBE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- GSEJCLTVZPLZKY-UHFFFAOYSA-N Triethanolamine Chemical compound OCCN(CCO)CCO GSEJCLTVZPLZKY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- SLGBZMMZGDRARJ-UHFFFAOYSA-N Triphenylene Natural products C1=CC=C2C3=CC=CC=C3C3=CC=CC=C3C2=C1 SLGBZMMZGDRARJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000700605 Viruses Species 0.000 description 1
- 239000003875 Wang resin Substances 0.000 description 1
- HCHKCACWOHOZIP-UHFFFAOYSA-N Zinc Chemical compound [Zn] HCHKCACWOHOZIP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- NERFNHBZJXXFGY-UHFFFAOYSA-N [4-[(4-methylphenyl)methoxy]phenyl]methanol Chemical compound C1=CC(C)=CC=C1COC1=CC=C(CO)C=C1 NERFNHBZJXXFGY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- ZHAFUINZIZIXFC-UHFFFAOYSA-N [9-(dimethylamino)-10-methylbenzo[a]phenoxazin-5-ylidene]azanium;chloride Chemical compound [Cl-].O1C2=CC(=[NH2+])C3=CC=CC=C3C2=NC2=C1C=C(N(C)C)C(C)=C2 ZHAFUINZIZIXFC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000000862 absorption spectrum Methods 0.000 description 1
- 125000004054 acenaphthylenyl group Chemical group C1(=CC2=CC=CC3=CC=CC1=C23)* 0.000 description 1
- SQFPKRNUGBRTAR-UHFFFAOYSA-N acephenanthrylene Chemical group C1=CC(C=C2)=C3C2=CC2=CC=CC=C2C3=C1 SQFPKRNUGBRTAR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- HXGDTGSAIMULJN-UHFFFAOYSA-N acetnaphthylene Natural products C1=CC(C=C2)=C3C2=CC=CC3=C1 HXGDTGSAIMULJN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- ODHCTXKNWHHXJC-UHFFFAOYSA-N acide pyroglutamique Natural products OC(=O)C1CCC(=O)N1 ODHCTXKNWHHXJC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- DPKHZNPWBDQZCN-UHFFFAOYSA-N acridine orange free base Chemical compound C1=CC(N(C)C)=CC2=NC3=CC(N(C)C)=CC=C3C=C21 DPKHZNPWBDQZCN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- BGLGAKMTYHWWKW-UHFFFAOYSA-N acridine yellow Chemical compound [H+].[Cl-].CC1=C(N)C=C2N=C(C=C(C(C)=C3)N)C3=CC2=C1 BGLGAKMTYHWWKW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 150000001251 acridines Chemical class 0.000 description 1
- 125000000641 acridinyl group Chemical group C1(=CC=CC2=NC3=CC=CC=C3C=C12)* 0.000 description 1
- 150000001260 acyclic compounds Chemical class 0.000 description 1
- 125000005073 adamantyl group Chemical group C12(CC3CC(CC(C1)C3)C2)* 0.000 description 1
- 229960005305 adenosine Drugs 0.000 description 1
- 239000001361 adipic acid Substances 0.000 description 1
- 235000011037 adipic acid Nutrition 0.000 description 1
- 229960000250 adipic acid Drugs 0.000 description 1
- 230000032683 aging Effects 0.000 description 1
- IAJILQKETJEXLJ-QTBDOELSSA-N aldehydo-D-glucuronic acid Chemical compound O=C[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O)C(O)=O IAJILQKETJEXLJ-QTBDOELSSA-N 0.000 description 1
- 235000010443 alginic acid Nutrition 0.000 description 1
- 239000000783 alginic acid Substances 0.000 description 1
- 229920000615 alginic acid Polymers 0.000 description 1
- 229960001126 alginic acid Drugs 0.000 description 1
- 150000004781 alginic acids Chemical class 0.000 description 1
- 150000003973 alkyl amines Chemical group 0.000 description 1
- 125000005107 alkyl diaryl silyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000000304 alkynyl group Chemical group 0.000 description 1
- HSFWRNGVRCDJHI-UHFFFAOYSA-N alpha-acetylene Natural products C#C HSFWRNGVRCDJHI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- AWUCVROLDVIAJX-UHFFFAOYSA-N alpha-glycerophosphate Natural products OCC(O)COP(O)(O)=O AWUCVROLDVIAJX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- BJEPYKJPYRNKOW-UHFFFAOYSA-N alpha-hydroxysuccinic acid Natural products OC(=O)C(O)CC(O)=O BJEPYKJPYRNKOW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229910000147 aluminium phosphate Inorganic materials 0.000 description 1
- 229960004909 aminosalicylic acid Drugs 0.000 description 1
- 229910021529 ammonia Inorganic materials 0.000 description 1
- 230000003321 amplification Effects 0.000 description 1
- JFCQEDHGNNZCLN-UHFFFAOYSA-N anhydrous glutaric acid Natural products OC(=O)CCCC(O)=O JFCQEDHGNNZCLN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 150000004056 anthraquinones Chemical class 0.000 description 1
- 229940027998 antiseptic and disinfectant acridine derivative Drugs 0.000 description 1
- 230000001640 apoptogenic effect Effects 0.000 description 1
- 230000006907 apoptotic process Effects 0.000 description 1
- ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N arginine Natural products OC(=O)C(N)CCCNC(N)=N ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 150000004982 aromatic amines Chemical group 0.000 description 1
- 150000001491 aromatic compounds Chemical class 0.000 description 1
- 125000001769 aryl amino group Chemical group 0.000 description 1
- 125000004104 aryloxy group Chemical group 0.000 description 1
- KNNXFYIMEYKHBZ-UHFFFAOYSA-N as-indacene Chemical compound C1=CC2=CC=CC2=C2C=CC=C21 KNNXFYIMEYKHBZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 235000010323 ascorbic acid Nutrition 0.000 description 1
- 239000011668 ascorbic acid Substances 0.000 description 1
- 229960005070 ascorbic acid Drugs 0.000 description 1
- 235000003704 aspartic acid Nutrition 0.000 description 1
- 229960005261 aspartic acid Drugs 0.000 description 1
- JPIYZTWMUGTEHX-UHFFFAOYSA-N auramine O free base Chemical compound C1=CC(N(C)C)=CC=C1C(=N)C1=CC=C(N(C)C)C=C1 JPIYZTWMUGTEHX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000002785 azepinyl group Chemical group 0.000 description 1
- IVRMZWNICZWHMI-UHFFFAOYSA-N azide group Chemical group [N-]=[N+]=[N-] IVRMZWNICZWHMI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000000987 azo dye Substances 0.000 description 1
- 210000003719 b-lymphocyte Anatomy 0.000 description 1
- 235000013405 beer Nutrition 0.000 description 1
- JUHORIMYRDESRB-UHFFFAOYSA-N benzathine Chemical compound C=1C=CC=CC=1CNCCNCC1=CC=CC=C1 JUHORIMYRDESRB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- SRSXLGNVWSONIS-UHFFFAOYSA-N benzenesulfonic acid Chemical compound OS(=O)(=O)C1=CC=CC=C1 SRSXLGNVWSONIS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229940092714 benzenesulfonic acid Drugs 0.000 description 1
- 125000003785 benzimidazolyl group Chemical group N1=C(NC2=C1C=CC=C2)* 0.000 description 1
- 125000005870 benzindolyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000005605 benzo group Chemical group 0.000 description 1
- 125000005875 benzo[b][1,4]dioxepinyl group Chemical group 0.000 description 1
- 235000010233 benzoic acid Nutrition 0.000 description 1
- 229960004365 benzoic acid Drugs 0.000 description 1
- 125000005878 benzonaphthofuranyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000004619 benzopyranyl group Chemical group O1C(C=CC2=C1C=CC=C2)* 0.000 description 1
- 125000005874 benzothiadiazolyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000003354 benzotriazolyl group Chemical group N1N=NC2=C1C=CC=C2* 0.000 description 1
- 125000001797 benzyl group Chemical group [H]C1=C([H])C([H])=C(C([H])=C1[H])C([H])([H])* 0.000 description 1
- 125000001584 benzyloxycarbonyl group Chemical group C(=O)(OCC1=CC=CC=C1)* 0.000 description 1
- MSWZFWKMSRAUBD-UHFFFAOYSA-N beta-D-galactosamine Natural products NC1C(O)OC(CO)C(O)C1O MSWZFWKMSRAUBD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- IQFYYKKMVGJFEH-UHFFFAOYSA-N beta-L-thymidine Natural products O=C1NC(=O)C(C)=CN1C1OC(CO)C(O)C1 IQFYYKKMVGJFEH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- DRTQHJPVMGBUCF-PSQAKQOGSA-N beta-L-uridine Natural products O[C@H]1[C@@H](O)[C@H](CO)O[C@@H]1N1C(=O)NC(=O)C=C1 DRTQHJPVMGBUCF-PSQAKQOGSA-N 0.000 description 1
- OQFSQFPPLPISGP-UHFFFAOYSA-N beta-carboxyaspartic acid Natural products OC(=O)C(N)C(C(O)=O)C(O)=O OQFSQFPPLPISGP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229960003237 betaine Drugs 0.000 description 1
- 238000004061 bleaching Methods 0.000 description 1
- 239000002981 blocking agent Substances 0.000 description 1
- 230000000903 blocking effect Effects 0.000 description 1
- 229910052794 bromium Inorganic materials 0.000 description 1
- 125000001246 bromo group Chemical group Br* 0.000 description 1
- KDYFGRWQOYBRFD-NUQCWPJISA-N butanedioic acid Chemical compound O[14C](=O)CC[14C](O)=O KDYFGRWQOYBRFD-NUQCWPJISA-N 0.000 description 1
- 125000000484 butyl group Chemical group [H]C([*])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- LSPHULWDVZXLIL-QUBYGPBYSA-N camphoric acid Chemical compound CC1(C)[C@H](C(O)=O)CC[C@]1(C)C(O)=O LSPHULWDVZXLIL-QUBYGPBYSA-N 0.000 description 1
- KHAVLLBUVKBTBG-UHFFFAOYSA-N caproleic acid Natural products OC(=O)CCCCCCCC=C KHAVLLBUVKBTBG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000004202 carbamide Substances 0.000 description 1
- 125000000609 carbazolyl group Chemical group C1(=CC=CC=2C3=CC=CC=C3NC12)* 0.000 description 1
- 150000001720 carbohydrates Chemical class 0.000 description 1
- 235000014633 carbohydrates Nutrition 0.000 description 1
- BVKZGUZCCUSVTD-UHFFFAOYSA-N carbonic acid Chemical compound OC(O)=O BVKZGUZCCUSVTD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000005626 carbonium group Chemical group 0.000 description 1
- 230000015556 catabolic process Effects 0.000 description 1
- 230000006037 cell lysis Effects 0.000 description 1
- 210000000170 cell membrane Anatomy 0.000 description 1
- 239000006285 cell suspension Substances 0.000 description 1
- 230000003833 cell viability Effects 0.000 description 1
- 210000003850 cellular structure Anatomy 0.000 description 1
- 230000008859 change Effects 0.000 description 1
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 description 1
- 239000012069 chiral reagent Substances 0.000 description 1
- FOCAUTSVDIKZOP-UHFFFAOYSA-N chloroacetic acid Chemical compound OC(=O)CCl FOCAUTSVDIKZOP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229940106681 chloroacetic acid Drugs 0.000 description 1
- 238000004587 chromatography analysis Methods 0.000 description 1
- 235000013985 cinnamic acid Nutrition 0.000 description 1
- 229930016911 cinnamic acid Natural products 0.000 description 1
- 125000000259 cinnolinyl group Chemical group N1=NC(=CC2=CC=CC=C12)* 0.000 description 1
- 238000005352 clarification Methods 0.000 description 1
- 238000004737 colorimetric analysis Methods 0.000 description 1
- 238000010668 complexation reaction Methods 0.000 description 1
- JNGZXGGOCLZBFB-IVCQMTBJSA-N compound E Chemical compound N([C@@H](C)C(=O)N[C@@H]1C(N(C)C2=CC=CC=C2C(C=2C=CC=CC=2)=N1)=O)C(=O)CC1=CC(F)=CC(F)=C1 JNGZXGGOCLZBFB-IVCQMTBJSA-N 0.000 description 1
- 239000002872 contrast media Substances 0.000 description 1
- 229910052802 copper Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000010949 copper Substances 0.000 description 1
- 150000004775 coumarins Chemical class 0.000 description 1
- 239000013078 crystal Substances 0.000 description 1
- 238000002425 crystallisation Methods 0.000 description 1
- 230000008025 crystallization Effects 0.000 description 1
- 239000000625 cyclamic acid and its Na and Ca salt Substances 0.000 description 1
- 150000001923 cyclic compounds Chemical class 0.000 description 1
- 125000001995 cyclobutyl group Chemical group [H]C1([H])C([H])([H])C([H])(*)C1([H])[H] 0.000 description 1
- OJOSABWCUVCSTQ-UHFFFAOYSA-N cyclohepta-2,4,6-trienylium Chemical compound C1=CC=C[CH+]=C[CH]1 OJOSABWCUVCSTQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000000582 cycloheptyl group Chemical group [H]C1([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])(*)C([H])([H])C1([H])[H] 0.000 description 1
- 125000000113 cyclohexyl group Chemical group [H]C1([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])(*)C([H])([H])C1([H])[H] 0.000 description 1
- HCAJEUSONLESMK-UHFFFAOYSA-N cyclohexylsulfamic acid Chemical compound OS(=O)(=O)NC1CCCCC1 HCAJEUSONLESMK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000000640 cyclooctyl group Chemical group [H]C1([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])(*)C([H])([H])C([H])([H])C1([H])[H] 0.000 description 1
- 125000001511 cyclopentyl group Chemical group [H]C1([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])(*)C1([H])[H] 0.000 description 1
- 125000001559 cyclopropyl group Chemical group [H]C1([H])C([H])([H])C1([H])* 0.000 description 1
- 229940104302 cytosine Drugs 0.000 description 1
- 125000001295 dansyl group Chemical group [H]C1=C([H])C(N(C([H])([H])[H])C([H])([H])[H])=C2C([H])=C([H])C([H])=C(C2=C1[H])S(*)(=O)=O 0.000 description 1
- 238000007405 data analysis Methods 0.000 description 1
- 229960002887 deanol Drugs 0.000 description 1
- 125000005507 decahydroisoquinolyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000004855 decalinyl group Chemical group C1(CCCC2CCCCC12)* 0.000 description 1
- 238000006731 degradation reaction Methods 0.000 description 1
- 230000001419 dependent effect Effects 0.000 description 1
- 238000010511 deprotection reaction Methods 0.000 description 1
- 238000011033 desalting Methods 0.000 description 1
- 238000011161 development Methods 0.000 description 1
- 230000018109 developmental process Effects 0.000 description 1
- 238000010586 diagram Methods 0.000 description 1
- 125000005265 dialkylamine group Chemical group 0.000 description 1
- 125000005105 dialkylarylsilyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000005266 diarylamine group Chemical group 0.000 description 1
- 125000005509 dibenzothiophenyl group Chemical group 0.000 description 1
- ZBCBWPMODOFKDW-UHFFFAOYSA-N diethanolamine Chemical compound OCCNCCO ZBCBWPMODOFKDW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 150000004683 dihydrates Chemical class 0.000 description 1
- 230000000447 dimerizing effect Effects 0.000 description 1
- 150000005125 dioxazines Chemical class 0.000 description 1
- 125000005879 dioxolanyl group Chemical group 0.000 description 1
- 238000009826 distribution Methods 0.000 description 1
- 125000002228 disulfide group Chemical group 0.000 description 1
- MOTZDAYCYVMXPC-UHFFFAOYSA-N dodecyl hydrogen sulfate Chemical compound CCCCCCCCCCCCOS(O)(=O)=O MOTZDAYCYVMXPC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229940043264 dodecyl sulfate Drugs 0.000 description 1
- 239000003814 drug Substances 0.000 description 1
- 238000002330 electrospray ionisation mass spectrometry Methods 0.000 description 1
- 150000002081 enamines Chemical group 0.000 description 1
- YQGOJNYOYNNSMM-UHFFFAOYSA-N eosin Chemical compound [Na+].OC(=O)C1=CC=CC=C1C1=C2C=C(Br)C(=O)C(Br)=C2OC2=C(Br)C(O)=C(Br)C=C21 YQGOJNYOYNNSMM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- AFAXGSQYZLGZPG-UHFFFAOYSA-N ethanedisulfonic acid Chemical compound OS(=O)(=O)CCS(O)(=O)=O AFAXGSQYZLGZPG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- CCIVGXIOQKPBKL-UHFFFAOYSA-M ethanesulfonate Chemical compound CCS([O-])(=O)=O CCIVGXIOQKPBKL-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- ZOOODBUHSVUZEM-UHFFFAOYSA-N ethoxymethanedithioic acid Chemical compound CCOC(S)=S ZOOODBUHSVUZEM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000002534 ethynyl group Chemical group [H]C#C* 0.000 description 1
- 239000000284 extract Substances 0.000 description 1
- 238000001914 filtration Methods 0.000 description 1
- RMBPEFMHABBEKP-UHFFFAOYSA-N fluorene Chemical compound C1=CC=C2C3=C[CH]C=CC3=CC2=C1 RMBPEFMHABBEKP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000001506 fluorescence spectroscopy Methods 0.000 description 1
- 239000011737 fluorine Substances 0.000 description 1
- 125000001153 fluoro group Chemical group F* 0.000 description 1
- 235000019253 formic acid Nutrition 0.000 description 1
- 238000009472 formulation Methods 0.000 description 1
- 238000001640 fractional crystallisation Methods 0.000 description 1
- 230000008014 freezing Effects 0.000 description 1
- 238000007710 freezing Methods 0.000 description 1
- 239000012595 freezing medium Substances 0.000 description 1
- 239000001530 fumaric acid Substances 0.000 description 1
- 125000003844 furanonyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000002541 furyl group Chemical group 0.000 description 1
- 239000007789 gas Substances 0.000 description 1
- 238000007429 general method Methods 0.000 description 1
- 229960005219 gentisic acid Drugs 0.000 description 1
- 239000011521 glass Substances 0.000 description 1
- 239000000174 gluconic acid Substances 0.000 description 1
- 235000012208 gluconic acid Nutrition 0.000 description 1
- 229960002442 glucosamine Drugs 0.000 description 1
- 229940097043 glucuronic acid Drugs 0.000 description 1
- 239000004220 glutamic acid Substances 0.000 description 1
- 235000013922 glutamic acid Nutrition 0.000 description 1
- 125000003827 glycol group Chemical group 0.000 description 1
- 125000002795 guanidino group Chemical group C(N)(=N)N* 0.000 description 1
- 229940029575 guanosine Drugs 0.000 description 1
- 229940093915 gynecological organic acid Drugs 0.000 description 1
- 229910052736 halogen Inorganic materials 0.000 description 1
- 150000002367 halogens Chemical group 0.000 description 1
- 238000003306 harvesting Methods 0.000 description 1
- 201000005787 hematologic cancer Diseases 0.000 description 1
- 208000024200 hematopoietic and lymphoid system neoplasm Diseases 0.000 description 1
- IIRDTKBZINWQAW-UHFFFAOYSA-N hexaethylene glycol Chemical group OCCOCCOCCOCCOCCOCCO IIRDTKBZINWQAW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- HNDVDQJCIGZPNO-UHFFFAOYSA-N histidine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CN=CN1 HNDVDQJCIGZPNO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 description 1
- XGIHQYAWBCFNPY-AZOCGYLKSA-N hydrabamine Chemical compound C([C@@H]12)CC3=CC(C(C)C)=CC=C3[C@@]2(C)CCC[C@@]1(C)CNCCNC[C@@]1(C)[C@@H]2CCC3=CC(C(C)C)=CC=C3[C@@]2(C)CCC1 XGIHQYAWBCFNPY-AZOCGYLKSA-N 0.000 description 1
- 150000004677 hydrates Chemical class 0.000 description 1
- BHEPBYXIRTUNPN-UHFFFAOYSA-N hydridophosphorus(.) (triplet) Chemical group [PH] BHEPBYXIRTUNPN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000007062 hydrolysis Effects 0.000 description 1
- 238000006460 hydrolysis reaction Methods 0.000 description 1
- 125000002632 imidazolidinyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000002636 imidazolinyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000002883 imidazolyl group Chemical group 0.000 description 1
- 238000003018 immunoassay Methods 0.000 description 1
- 230000006872 improvement Effects 0.000 description 1
- 238000011534 incubation Methods 0.000 description 1
- 125000003387 indolinyl group Chemical group N1(CCC2=CC=CC=C12)* 0.000 description 1
- 125000003406 indolizinyl group Chemical group C=1(C=CN2C=CC=CC12)* 0.000 description 1
- 125000001041 indolyl group Chemical group 0.000 description 1
- 238000001802 infusion Methods 0.000 description 1
- 230000003993 interaction Effects 0.000 description 1
- 239000003456 ion exchange resin Substances 0.000 description 1
- 229920003303 ion-exchange polymer Polymers 0.000 description 1
- 229910052742 iron Inorganic materials 0.000 description 1
- 230000002427 irreversible effect Effects 0.000 description 1
- 239000012948 isocyanate Chemical class 0.000 description 1
- 150000002513 isocyanates Chemical class 0.000 description 1
- 125000004594 isoindolinyl group Chemical group C1(NCC2=CC=CC=C12)* 0.000 description 1
- 125000000904 isoindolyl group Chemical group C=1(NC=C2C=CC=CC12)* 0.000 description 1
- QXJSBBXBKPUZAA-UHFFFAOYSA-N isooleic acid Natural products CCCCCCCC=CCCCCCCCCC(O)=O QXJSBBXBKPUZAA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000001449 isopropyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])(*)C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- 125000002183 isoquinolinyl group Chemical group C1(=NC=CC2=CC=CC=C12)* 0.000 description 1
- 125000005956 isoquinolyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000004628 isothiazolidinyl group Chemical group S1N(CCC1)* 0.000 description 1
- 125000001786 isothiazolyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000003965 isoxazolidinyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000000842 isoxazolyl group Chemical group 0.000 description 1
- 239000004310 lactic acid Substances 0.000 description 1
- 235000014655 lactic acid Nutrition 0.000 description 1
- 229940099563 lactobionic acid Drugs 0.000 description 1
- 238000004895 liquid chromatography mass spectrometry Methods 0.000 description 1
- 229910052744 lithium Inorganic materials 0.000 description 1
- 238000004020 luminiscence type Methods 0.000 description 1
- 230000002934 lysing effect Effects 0.000 description 1
- FDZZZRQASAIRJF-UHFFFAOYSA-M malachite green Chemical compound [Cl-].C1=CC(N(C)C)=CC=C1C(C=1C=CC=CC=1)=C1C=CC(=[N+](C)C)C=C1 FDZZZRQASAIRJF-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 229940107698 malachite green Drugs 0.000 description 1
- VZCYOOQTPOCHFL-UPHRSURJSA-N maleic acid Chemical compound OC(=O)\C=C/C(O)=O VZCYOOQTPOCHFL-UPHRSURJSA-N 0.000 description 1
- 239000011976 maleic acid Substances 0.000 description 1
- 239000001630 malic acid Substances 0.000 description 1
- 235000011090 malic acid Nutrition 0.000 description 1
- 229960002510 mandelic acid Drugs 0.000 description 1
- 239000011159 matrix material Substances 0.000 description 1
- 238000005259 measurement Methods 0.000 description 1
- DZVCFNFOPIZQKX-LTHRDKTGSA-M merocyanine Chemical compound [Na+].O=C1N(CCCC)C(=O)N(CCCC)C(=O)C1=C\C=C\C=C/1N(CCCS([O-])(=O)=O)C2=CC=CC=C2O\1 DZVCFNFOPIZQKX-LTHRDKTGSA-M 0.000 description 1
- 230000006609 metabolic stress Effects 0.000 description 1
- 229940098779 methanesulfonic acid Drugs 0.000 description 1
- WBYWAXJHAXSJNI-UHFFFAOYSA-N methyl p-hydroxycinnamate Natural products OC(=O)C=CC1=CC=CC=C1 WBYWAXJHAXSJNI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000003278 mimic effect Effects 0.000 description 1
- 150000007522 mineralic acids Chemical class 0.000 description 1
- 150000004682 monohydrates Chemical class 0.000 description 1
- 125000002757 morpholinyl group Chemical group 0.000 description 1
- SHXOKQKTZJXHHR-UHFFFAOYSA-N n,n-diethyl-5-iminobenzo[a]phenoxazin-9-amine;hydrochloride Chemical compound [Cl-].C1=CC=C2C3=NC4=CC=C(N(CC)CC)C=C4OC3=CC(=[NH2+])C2=C1 SHXOKQKTZJXHHR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- WQEPLUUGTLDZJY-UHFFFAOYSA-N n-Pentadecanoic acid Natural products CCCCCCCCCCCCCCC(O)=O WQEPLUUGTLDZJY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000004108 n-butyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])* 0.000 description 1
- 125000000740 n-pentyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])* 0.000 description 1
- 125000004123 n-propyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])* 0.000 description 1
- KVBGVZZKJNLNJU-UHFFFAOYSA-N naphthalene-2-sulfonic acid Chemical compound C1=CC=CC2=CC(S(=O)(=O)O)=CC=C21 KVBGVZZKJNLNJU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000004593 naphthyridinyl group Chemical group N1=C(C=CC2=CC=CN=C12)* 0.000 description 1
- 210000000440 neutrophil Anatomy 0.000 description 1
- 229960003512 nicotinic acid Drugs 0.000 description 1
- 235000001968 nicotinic acid Nutrition 0.000 description 1
- 239000011664 nicotinic acid Substances 0.000 description 1
- VOFUROIFQGPCGE-UHFFFAOYSA-N nile red Chemical compound C1=CC=C2C3=NC4=CC=C(N(CC)CC)C=C4OC3=CC(=O)C2=C1 VOFUROIFQGPCGE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229910017604 nitric acid Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000012299 nitrogen atmosphere Substances 0.000 description 1
- 125000006574 non-aromatic ring group Chemical group 0.000 description 1
- 125000002868 norbornyl group Chemical group C12(CCC(CC1)C2)* 0.000 description 1
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 description 1
- 239000002853 nucleic acid probe Substances 0.000 description 1
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 description 1
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 description 1
- NIHNNTQXNPWCJQ-UHFFFAOYSA-N o-biphenylenemethane Natural products C1=CC=C2CC3=CC=CC=C3C2=C1 NIHNNTQXNPWCJQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- QIQXTHQIDYTFRH-UHFFFAOYSA-N octadecanoic acid Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCCCC(O)=O QIQXTHQIDYTFRH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- OQCDKBAXFALNLD-UHFFFAOYSA-N octadecanoic acid Natural products CCCCCCCC(C)CCCCCCCCC(O)=O OQCDKBAXFALNLD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000005060 octahydroindolyl group Chemical group N1(CCC2CCCCC12)* 0.000 description 1
- 125000005061 octahydroisoindolyl group Chemical group C1(NCC2CCCCC12)* 0.000 description 1
- 229960002446 octanoic acid Drugs 0.000 description 1
- ZQPPMHVWECSIRJ-KTKRTIGZSA-N oleic acid Chemical compound CCCCCCCC\C=C/CCCCCCCC(O)=O ZQPPMHVWECSIRJ-KTKRTIGZSA-N 0.000 description 1
- 229960002969 oleic acid Drugs 0.000 description 1
- 238000002515 oligonucleotide synthesis Methods 0.000 description 1
- 238000000424 optical density measurement Methods 0.000 description 1
- 150000007524 organic acids Chemical class 0.000 description 1
- 235000005985 organic acids Nutrition 0.000 description 1
- 239000003960 organic solvent Substances 0.000 description 1
- 229960005010 orotic acid Drugs 0.000 description 1
- 150000004866 oxadiazoles Chemical class 0.000 description 1
- 125000001715 oxadiazolyl group Chemical group 0.000 description 1
- 235000006408 oxalic acid Nutrition 0.000 description 1
- 229940116315 oxalic acid Drugs 0.000 description 1
- GHTWDWCFRFTBRB-UHFFFAOYSA-M oxazine-170 Chemical compound [O-]Cl(=O)(=O)=O.N1=C2C3=CC=CC=C3C(NCC)=CC2=[O+]C2=C1C=C(C)C(N(C)CC)=C2 GHTWDWCFRFTBRB-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 150000004893 oxazines Chemical class 0.000 description 1
- 125000000160 oxazolidinyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000002971 oxazolyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000000466 oxiranyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000005476 oxopyrrolidinyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000004430 oxygen atom Chemical group O* 0.000 description 1
- 229940098695 palmitic acid Drugs 0.000 description 1
- WLJNZVDCPSBLRP-UHFFFAOYSA-N pamoic acid Chemical compound C1=CC=C2C(CC=3C4=CC=CC=C4C=C(C=3O)C(=O)O)=C(O)C(C(O)=O)=CC2=C1 WLJNZVDCPSBLRP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- FJKROLUGYXJWQN-UHFFFAOYSA-N papa-hydroxy-benzoic acid Natural products OC(=O)C1=CC=C(O)C=C1 FJKROLUGYXJWQN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229920002866 paraformaldehyde Polymers 0.000 description 1
- 235000019371 penicillin G benzathine Nutrition 0.000 description 1
- 239000007793 ph indicator Substances 0.000 description 1
- NQFOGDIWKQWFMN-UHFFFAOYSA-N phenalene Chemical compound C1=CC([CH]C=C2)=C3C2=CC=CC3=C1 NQFOGDIWKQWFMN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000001791 phenazinyl group Chemical group C1(=CC=CC2=NC3=CC=CC=C3N=C12)* 0.000 description 1
- 125000001484 phenothiazinyl group Chemical group C1(=CC=CC=2SC3=CC=CC=C3NC12)* 0.000 description 1
- 125000001644 phenoxazinyl group Chemical group C1(=CC=CC=2OC3=CC=CC=C3NC12)* 0.000 description 1
- UYWQUFXKFGHYNT-UHFFFAOYSA-N phenylmethyl ester of formic acid Natural products O=COCC1=CC=CC=C1 UYWQUFXKFGHYNT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000002953 phosphate buffered saline Substances 0.000 description 1
- UEZVMMHDMIWARA-UHFFFAOYSA-M phosphonate Chemical group [O-]P(=O)=O UEZVMMHDMIWARA-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 150000003013 phosphoric acid derivatives Chemical class 0.000 description 1
- 125000004437 phosphorous atom Chemical group 0.000 description 1
- 238000006552 photochemical reaction Methods 0.000 description 1
- 125000004592 phthalazinyl group Chemical group C1(=NN=CC2=CC=CC=C12)* 0.000 description 1
- 239000000049 pigment Substances 0.000 description 1
- 125000004193 piperazinyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000003386 piperidinyl group Chemical group 0.000 description 1
- DIJNSQQKNIVDPV-UHFFFAOYSA-N pleiadene Chemical compound C1=C2[CH]C=CC=C2C=C2C=CC=C3[C]2C1=CC=C3 DIJNSQQKNIVDPV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000003367 polycyclic group Chemical group 0.000 description 1
- 239000002952 polymeric resin Substances 0.000 description 1
- 230000000379 polymerizing effect Effects 0.000 description 1
- 239000013641 positive control Substances 0.000 description 1
- 239000011591 potassium Substances 0.000 description 1
- 229910052700 potassium Inorganic materials 0.000 description 1
- WSHYKIAQCMIPTB-UHFFFAOYSA-M potassium;2-oxo-3-(3-oxo-1-phenylbutyl)chromen-4-olate Chemical compound [K+].[O-]C=1C2=CC=CC=C2OC(=O)C=1C(CC(=O)C)C1=CC=CC=C1 WSHYKIAQCMIPTB-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 150000003138 primary alcohols Chemical class 0.000 description 1
- MFDFERRIHVXMIY-UHFFFAOYSA-N procaine Chemical compound CCN(CC)CCOC(=O)C1=CC=C(N)C=C1 MFDFERRIHVXMIY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229960004919 procaine Drugs 0.000 description 1
- 229960000286 proflavine Drugs 0.000 description 1
- 235000019260 propionic acid Nutrition 0.000 description 1
- 125000001436 propyl group Chemical group [H]C([*])([H])C([H])([H])C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- LVTJOONKWUXEFR-FZRMHRINSA-N protoneodioscin Natural products O(C[C@@H](CC[C@]1(O)[C@H](C)[C@@H]2[C@]3(C)[C@H]([C@H]4[C@@H]([C@]5(C)C(=CC4)C[C@@H](O[C@@H]4[C@H](O[C@H]6[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](O)[C@H](C)O6)[C@@H](O)[C@H](O[C@H]6[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](O)[C@H](C)O6)[C@H](CO)O4)CC5)CC3)C[C@@H]2O1)C)[C@H]1[C@H](O)[C@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1 LVTJOONKWUXEFR-FZRMHRINSA-N 0.000 description 1
- 125000001042 pteridinyl group Chemical group N1=C(N=CC2=NC=CN=C12)* 0.000 description 1
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 1
- 125000000561 purinyl group Chemical group N1=C(N=C2N=CNC2=C1)* 0.000 description 1
- 125000003373 pyrazinyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000003072 pyrazolidinyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000003226 pyrazolyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000005581 pyrene group Chemical group 0.000 description 1
- 150000003220 pyrenes Chemical class 0.000 description 1
- 125000002098 pyridazinyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000000714 pyrimidinyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000000719 pyrrolidinyl group Chemical group 0.000 description 1
- 229940107700 pyruvic acid Drugs 0.000 description 1
- 239000010453 quartz Substances 0.000 description 1
- 125000002294 quinazolinyl group Chemical group N1=C(N=CC2=CC=CC=C12)* 0.000 description 1
- IUVKMZGDUIUOCP-BTNSXGMBSA-N quinbolone Chemical compound O([C@H]1CC[C@H]2[C@H]3[C@@H]([C@]4(C=CC(=O)C=C4CC3)C)CC[C@@]21C)C1=CCCC1 IUVKMZGDUIUOCP-BTNSXGMBSA-N 0.000 description 1
- 125000002943 quinolinyl group Chemical group N1=C(C=CC2=CC=CC=C12)* 0.000 description 1
- 125000001567 quinoxalinyl group Chemical group N1=C(C=NC2=CC=CC=C12)* 0.000 description 1
- 125000004621 quinuclidinyl group Chemical group N12C(CC(CC1)CC2)* 0.000 description 1
- 239000002994 raw material Substances 0.000 description 1
- 238000006722 reduction reaction Methods 0.000 description 1
- 238000011160 research Methods 0.000 description 1
- PYWVYCXTNDRMGF-UHFFFAOYSA-N rhodamine B Chemical compound [Cl-].C=12C=CC(=[N+](CC)CC)C=C2OC2=CC(N(CC)CC)=CC=C2C=1C1=CC=CC=C1C(O)=O PYWVYCXTNDRMGF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- WEMQMWWWCBYPOV-UHFFFAOYSA-N s-indacene Chemical compound C=1C2=CC=CC2=CC2=CC=CC2=1 WEMQMWWWCBYPOV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229960004889 salicylic acid Drugs 0.000 description 1
- 229920006395 saturated elastomer Polymers 0.000 description 1
- 229940116353 sebacic acid Drugs 0.000 description 1
- 150000003333 secondary alcohols Chemical class 0.000 description 1
- 150000003335 secondary amines Chemical class 0.000 description 1
- 238000011896 sensitive detection Methods 0.000 description 1
- 230000035945 sensitivity Effects 0.000 description 1
- VYPSYNLAJGMNEJ-UHFFFAOYSA-N silicon dioxide Inorganic materials O=[Si]=O VYPSYNLAJGMNEJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 150000003384 small molecules Chemical class 0.000 description 1
- AWUCVROLDVIAJX-GSVOUGTGSA-N sn-glycerol 3-phosphate Chemical compound OC[C@@H](O)COP(O)(O)=O AWUCVROLDVIAJX-GSVOUGTGSA-N 0.000 description 1
- 241000894007 species Species 0.000 description 1
- 230000009870 specific binding Effects 0.000 description 1
- 238000010183 spectrum analysis Methods 0.000 description 1
- 239000008117 stearic acid Substances 0.000 description 1
- 229960004274 stearic acid Drugs 0.000 description 1
- 239000000758 substrate Substances 0.000 description 1
- 235000000346 sugar Nutrition 0.000 description 1
- 150000008163 sugars Chemical group 0.000 description 1
- LNQMAGOUQKHYNT-UHFFFAOYSA-N sulfanylidenemethylidenehydrazine Chemical compound NN=C=S LNQMAGOUQKHYNT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- DIORMHZUUKOISG-UHFFFAOYSA-N sulfoformic acid Chemical compound OC(=O)S(O)(=O)=O DIORMHZUUKOISG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 150000003457 sulfones Chemical group 0.000 description 1
- 125000000472 sulfonyl group Chemical group *S(*)(=O)=O 0.000 description 1
- 125000003375 sulfoxide group Chemical group 0.000 description 1
- 238000001356 surgical procedure Methods 0.000 description 1
- 238000001308 synthesis method Methods 0.000 description 1
- 229920003002 synthetic resin Polymers 0.000 description 1
- 235000002906 tartaric acid Nutrition 0.000 description 1
- 239000011975 tartaric acid Substances 0.000 description 1
- 229960001367 tartaric acid Drugs 0.000 description 1
- 230000002123 temporal effect Effects 0.000 description 1
- 125000000999 tert-butyl group Chemical group [H]C([H])([H])C(*)(C([H])([H])[H])C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- ILMRJRBKQSSXGY-UHFFFAOYSA-N tert-butyl(dimethyl)silicon Chemical group C[Si](C)C(C)(C)C ILMRJRBKQSSXGY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 150000003512 tertiary amines Chemical class 0.000 description 1
- 150000004685 tetrahydrates Chemical class 0.000 description 1
- 125000003718 tetrahydrofuranyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000000147 tetrahydroquinolinyl group Chemical group N1(CCCC2=CC=CC=C12)* 0.000 description 1
- 125000003831 tetrazolyl group Chemical group 0.000 description 1
- 229960004559 theobromine Drugs 0.000 description 1
- 229940124597 therapeutic agent Drugs 0.000 description 1
- 125000001113 thiadiazolyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000001984 thiazolidinyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000000335 thiazolyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000005985 thienyl[1,3]dithianyl group Chemical group 0.000 description 1
- VOVUARRWDCVURC-UHFFFAOYSA-N thiirane Chemical class C1CS1 VOVUARRWDCVURC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- JOUDBUYBGJYFFP-FOCLMDBBSA-N thioindigo Chemical compound S\1C2=CC=CC=C2C(=O)C/1=C1/C(=O)C2=CC=CC=C2S1 JOUDBUYBGJYFFP-FOCLMDBBSA-N 0.000 description 1
- 229940104230 thymidine Drugs 0.000 description 1
- 238000004448 titration Methods 0.000 description 1
- 150000003613 toluenes Chemical class 0.000 description 1
- 239000003053 toxin Substances 0.000 description 1
- 231100000765 toxin Toxicity 0.000 description 1
- 108700012359 toxins Proteins 0.000 description 1
- 125000005106 triarylsilyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000004306 triazinyl group Chemical group 0.000 description 1
- 150000004684 trihydrates Chemical class 0.000 description 1
- 125000000026 trimethylsilyl group Chemical group [H]C([H])([H])[Si]([*])(C([H])([H])[H])C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- 125000005580 triphenylene group Chemical group 0.000 description 1
- YFTHZRPMJXBUME-UHFFFAOYSA-N tripropylamine Chemical compound CCCN(CCC)CCC YFTHZRPMJXBUME-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- LENZDBCJOHFCAS-UHFFFAOYSA-N tris Chemical compound OCC(N)(CO)CO LENZDBCJOHFCAS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000005455 trithianyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000002221 trityl group Chemical group [H]C1=C([H])C([H])=C([H])C([H])=C1C([*])(C1=C(C(=C(C(=C1[H])[H])[H])[H])[H])C1=C([H])C([H])=C([H])C([H])=C1[H] 0.000 description 1
- 229960004418 trolamine Drugs 0.000 description 1
- 229960000281 trometamol Drugs 0.000 description 1
- 238000001195 ultra high performance liquid chromatography Methods 0.000 description 1
- 238000000870 ultraviolet spectroscopy Methods 0.000 description 1
- 229960002703 undecylenic acid Drugs 0.000 description 1
- DRTQHJPVMGBUCF-UHFFFAOYSA-N uracil arabinoside Natural products OC1C(O)C(CO)OC1N1C(=O)NC(=O)C=C1 DRTQHJPVMGBUCF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229940045145 uridine Drugs 0.000 description 1
- 230000035899 viability Effects 0.000 description 1
- 238000001429 visible spectrum Methods 0.000 description 1
- 239000011534 wash buffer Substances 0.000 description 1
- 239000012991 xanthate Substances 0.000 description 1
- 125000001834 xanthenyl group Chemical class C1=CC=CC=2OC3=CC=CC=C3C(C12)* 0.000 description 1
- 239000011701 zinc Substances 0.000 description 1
- 229910052725 zinc Inorganic materials 0.000 description 1
Images
Classifications
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/58—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving labelled substances
- G01N33/582—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving labelled substances with fluorescent label
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07F—ACYCLIC, CARBOCYCLIC OR HETEROCYCLIC COMPOUNDS CONTAINING ELEMENTS OTHER THAN CARBON, HYDROGEN, HALOGEN, OXYGEN, NITROGEN, SULFUR, SELENIUM OR TELLURIUM
- C07F9/00—Compounds containing elements of Groups 5 or 15 of the Periodic Table
- C07F9/02—Phosphorus compounds
- C07F9/06—Phosphorus compounds without P—C bonds
- C07F9/08—Esters of oxyacids of phosphorus
- C07F9/09—Esters of phosphoric acids
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07F—ACYCLIC, CARBOCYCLIC OR HETEROCYCLIC COMPOUNDS CONTAINING ELEMENTS OTHER THAN CARBON, HYDROGEN, HALOGEN, OXYGEN, NITROGEN, SULFUR, SELENIUM OR TELLURIUM
- C07F9/00—Compounds containing elements of Groups 5 or 15 of the Periodic Table
- C07F9/02—Phosphorus compounds
- C07F9/06—Phosphorus compounds without P—C bonds
- C07F9/08—Esters of oxyacids of phosphorus
- C07F9/09—Esters of phosphoric acids
- C07F9/091—Esters of phosphoric acids with hydroxyalkyl compounds with further substituents on alkyl
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07F—ACYCLIC, CARBOCYCLIC OR HETEROCYCLIC COMPOUNDS CONTAINING ELEMENTS OTHER THAN CARBON, HYDROGEN, HALOGEN, OXYGEN, NITROGEN, SULFUR, SELENIUM OR TELLURIUM
- C07F9/00—Compounds containing elements of Groups 5 or 15 of the Periodic Table
- C07F9/02—Phosphorus compounds
- C07F9/06—Phosphorus compounds without P—C bonds
- C07F9/08—Esters of oxyacids of phosphorus
- C07F9/09—Esters of phosphoric acids
- C07F9/098—Esters of polyphosphoric acids or anhydrides
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07F—ACYCLIC, CARBOCYCLIC OR HETEROCYCLIC COMPOUNDS CONTAINING ELEMENTS OTHER THAN CARBON, HYDROGEN, HALOGEN, OXYGEN, NITROGEN, SULFUR, SELENIUM OR TELLURIUM
- C07F9/00—Compounds containing elements of Groups 5 or 15 of the Periodic Table
- C07F9/02—Phosphorus compounds
- C07F9/547—Heterocyclic compounds, e.g. containing phosphorus as a ring hetero atom
- C07F9/553—Heterocyclic compounds, e.g. containing phosphorus as a ring hetero atom having one nitrogen atom as the only ring hetero atom
- C07F9/572—Five-membered rings
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07F—ACYCLIC, CARBOCYCLIC OR HETEROCYCLIC COMPOUNDS CONTAINING ELEMENTS OTHER THAN CARBON, HYDROGEN, HALOGEN, OXYGEN, NITROGEN, SULFUR, SELENIUM OR TELLURIUM
- C07F9/00—Compounds containing elements of Groups 5 or 15 of the Periodic Table
- C07F9/02—Phosphorus compounds
- C07F9/547—Heterocyclic compounds, e.g. containing phosphorus as a ring hetero atom
- C07F9/553—Heterocyclic compounds, e.g. containing phosphorus as a ring hetero atom having one nitrogen atom as the only ring hetero atom
- C07F9/576—Six-membered rings
- C07F9/5765—Six-membered rings condensed with carbocyclic rings or carbocyclic ring systems
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07F—ACYCLIC, CARBOCYCLIC OR HETEROCYCLIC COMPOUNDS CONTAINING ELEMENTS OTHER THAN CARBON, HYDROGEN, HALOGEN, OXYGEN, NITROGEN, SULFUR, SELENIUM OR TELLURIUM
- C07F9/00—Compounds containing elements of Groups 5 or 15 of the Periodic Table
- C07F9/02—Phosphorus compounds
- C07F9/547—Heterocyclic compounds, e.g. containing phosphorus as a ring hetero atom
- C07F9/6558—Heterocyclic compounds, e.g. containing phosphorus as a ring hetero atom containing at least two different or differently substituted hetero rings neither condensed among themselves nor condensed with a common carbocyclic ring or ring system
- C07F9/65583—Heterocyclic compounds, e.g. containing phosphorus as a ring hetero atom containing at least two different or differently substituted hetero rings neither condensed among themselves nor condensed with a common carbocyclic ring or ring system each of the hetero rings containing nitrogen as ring hetero atom
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07F—ACYCLIC, CARBOCYCLIC OR HETEROCYCLIC COMPOUNDS CONTAINING ELEMENTS OTHER THAN CARBON, HYDROGEN, HALOGEN, OXYGEN, NITROGEN, SULFUR, SELENIUM OR TELLURIUM
- C07F9/00—Compounds containing elements of Groups 5 or 15 of the Periodic Table
- C07F9/02—Phosphorus compounds
- C07F9/547—Heterocyclic compounds, e.g. containing phosphorus as a ring hetero atom
- C07F9/6558—Heterocyclic compounds, e.g. containing phosphorus as a ring hetero atom containing at least two different or differently substituted hetero rings neither condensed among themselves nor condensed with a common carbocyclic ring or ring system
- C07F9/65586—Heterocyclic compounds, e.g. containing phosphorus as a ring hetero atom containing at least two different or differently substituted hetero rings neither condensed among themselves nor condensed with a common carbocyclic ring or ring system at least one of the hetero rings does not contain nitrogen as ring hetero atom
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07F—ACYCLIC, CARBOCYCLIC OR HETEROCYCLIC COMPOUNDS CONTAINING ELEMENTS OTHER THAN CARBON, HYDROGEN, HALOGEN, OXYGEN, NITROGEN, SULFUR, SELENIUM OR TELLURIUM
- C07F9/00—Compounds containing elements of Groups 5 or 15 of the Periodic Table
- C07F9/02—Phosphorus compounds
- C07F9/547—Heterocyclic compounds, e.g. containing phosphorus as a ring hetero atom
- C07F9/6561—Heterocyclic compounds, e.g. containing phosphorus as a ring hetero atom containing systems of two or more relevant hetero rings condensed among themselves or condensed with a common carbocyclic ring or ring system, with or without other non-condensed hetero rings
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C09—DYES; PAINTS; POLISHES; NATURAL RESINS; ADHESIVES; COMPOSITIONS NOT OTHERWISE PROVIDED FOR; APPLICATIONS OF MATERIALS NOT OTHERWISE PROVIDED FOR
- C09B—ORGANIC DYES OR CLOSELY-RELATED COMPOUNDS FOR PRODUCING DYES, e.g. PIGMENTS; MORDANTS; LAKES
- C09B11/00—Diaryl- or thriarylmethane dyes
- C09B11/04—Diaryl- or thriarylmethane dyes derived from triarylmethanes, i.e. central C-atom is substituted by amino, cyano, alkyl
- C09B11/26—Triarylmethane dyes in which at least one of the aromatic nuclei is heterocyclic
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C09—DYES; PAINTS; POLISHES; NATURAL RESINS; ADHESIVES; COMPOSITIONS NOT OTHERWISE PROVIDED FOR; APPLICATIONS OF MATERIALS NOT OTHERWISE PROVIDED FOR
- C09B—ORGANIC DYES OR CLOSELY-RELATED COMPOUNDS FOR PRODUCING DYES, e.g. PIGMENTS; MORDANTS; LAKES
- C09B3/00—Dyes with an anthracene nucleus condensed with one or more carbocyclic rings
- C09B3/14—Perylene derivatives
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C09—DYES; PAINTS; POLISHES; NATURAL RESINS; ADHESIVES; COMPOSITIONS NOT OTHERWISE PROVIDED FOR; APPLICATIONS OF MATERIALS NOT OTHERWISE PROVIDED FOR
- C09B—ORGANIC DYES OR CLOSELY-RELATED COMPOUNDS FOR PRODUCING DYES, e.g. PIGMENTS; MORDANTS; LAKES
- C09B69/00—Dyes not provided for by a single group of this subclass
- C09B69/10—Polymeric dyes; Reaction products of dyes with monomers or with macromolecular compounds
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C09—DYES; PAINTS; POLISHES; NATURAL RESINS; ADHESIVES; COMPOSITIONS NOT OTHERWISE PROVIDED FOR; APPLICATIONS OF MATERIALS NOT OTHERWISE PROVIDED FOR
- C09B—ORGANIC DYES OR CLOSELY-RELATED COMPOUNDS FOR PRODUCING DYES, e.g. PIGMENTS; MORDANTS; LAKES
- C09B69/00—Dyes not provided for by a single group of this subclass
- C09B69/10—Polymeric dyes; Reaction products of dyes with monomers or with macromolecular compounds
- C09B69/101—Polymeric dyes; Reaction products of dyes with monomers or with macromolecular compounds containing an anthracene dye
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C09—DYES; PAINTS; POLISHES; NATURAL RESINS; ADHESIVES; COMPOSITIONS NOT OTHERWISE PROVIDED FOR; APPLICATIONS OF MATERIALS NOT OTHERWISE PROVIDED FOR
- C09B—ORGANIC DYES OR CLOSELY-RELATED COMPOUNDS FOR PRODUCING DYES, e.g. PIGMENTS; MORDANTS; LAKES
- C09B69/00—Dyes not provided for by a single group of this subclass
- C09B69/10—Polymeric dyes; Reaction products of dyes with monomers or with macromolecular compounds
- C09B69/101—Polymeric dyes; Reaction products of dyes with monomers or with macromolecular compounds containing an anthracene dye
- C09B69/102—Polymeric dyes; Reaction products of dyes with monomers or with macromolecular compounds containing an anthracene dye containing a perylene dye
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C09—DYES; PAINTS; POLISHES; NATURAL RESINS; ADHESIVES; COMPOSITIONS NOT OTHERWISE PROVIDED FOR; APPLICATIONS OF MATERIALS NOT OTHERWISE PROVIDED FOR
- C09B—ORGANIC DYES OR CLOSELY-RELATED COMPOUNDS FOR PRODUCING DYES, e.g. PIGMENTS; MORDANTS; LAKES
- C09B69/00—Dyes not provided for by a single group of this subclass
- C09B69/10—Polymeric dyes; Reaction products of dyes with monomers or with macromolecular compounds
- C09B69/103—Polymeric dyes; Reaction products of dyes with monomers or with macromolecular compounds containing a diaryl- or triarylmethane dye
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C09—DYES; PAINTS; POLISHES; NATURAL RESINS; ADHESIVES; COMPOSITIONS NOT OTHERWISE PROVIDED FOR; APPLICATIONS OF MATERIALS NOT OTHERWISE PROVIDED FOR
- C09B—ORGANIC DYES OR CLOSELY-RELATED COMPOUNDS FOR PRODUCING DYES, e.g. PIGMENTS; MORDANTS; LAKES
- C09B69/00—Dyes not provided for by a single group of this subclass
- C09B69/10—Polymeric dyes; Reaction products of dyes with monomers or with macromolecular compounds
- C09B69/109—Polymeric dyes; Reaction products of dyes with monomers or with macromolecular compounds containing other specific dyes
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C09—DYES; PAINTS; POLISHES; NATURAL RESINS; ADHESIVES; COMPOSITIONS NOT OTHERWISE PROVIDED FOR; APPLICATIONS OF MATERIALS NOT OTHERWISE PROVIDED FOR
- C09K—MATERIALS FOR MISCELLANEOUS APPLICATIONS, NOT PROVIDED FOR ELSEWHERE
- C09K11/00—Luminescent, e.g. electroluminescent, chemiluminescent materials
- C09K11/06—Luminescent, e.g. electroluminescent, chemiluminescent materials containing organic luminescent materials
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/52—Use of compounds or compositions for colorimetric, spectrophotometric or fluorometric investigation, e.g. use of reagent paper and including single- and multilayer analytical elements
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
- G01N33/531—Production of immunochemical test materials
- G01N33/532—Production of labelled immunochemicals
- G01N33/533—Production of labelled immunochemicals with fluorescent label
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07F—ACYCLIC, CARBOCYCLIC OR HETEROCYCLIC COMPOUNDS CONTAINING ELEMENTS OTHER THAN CARBON, HYDROGEN, HALOGEN, OXYGEN, NITROGEN, SULFUR, SELENIUM OR TELLURIUM
- C07F9/00—Compounds containing elements of Groups 5 or 15 of the Periodic Table
- C07F9/02—Phosphorus compounds
- C07F9/06—Phosphorus compounds without P—C bonds
- C07F9/08—Esters of oxyacids of phosphorus
- C07F9/09—Esters of phosphoric acids
- C07F9/094—Esters of phosphoric acids with arylalkanols
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Immunology (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Hematology (AREA)
- Urology & Nephrology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Food Science & Technology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- General Physics & Mathematics (AREA)
- Pathology (AREA)
- Materials Engineering (AREA)
- Investigating, Analyzing Materials By Fluorescence Or Luminescence (AREA)
- Plural Heterocyclic Compounds (AREA)
- Addition Polymer Or Copolymer, Post-Treatments, Or Chemical Modifications (AREA)
- Nitrogen And Oxygen Or Sulfur-Condensed Heterocyclic Ring Systems (AREA)
- Pyrane Compounds (AREA)
- Nitrogen Condensed Heterocyclic Rings (AREA)
- Investigating Or Analysing Materials By The Use Of Chemical Reactions (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Luminescent Compositions (AREA)
- Paints Or Removers (AREA)
- Heterocyclic Carbon Compounds Containing A Hetero Ring Having Oxygen Or Sulfur (AREA)
- Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)
- Investigating Or Analysing Materials By Optical Means (AREA)
Abstract
【課題】蛍光染料または有色染料として有用な化合物を提供する。【解決手段】蛍光染料または有色染料として有用な化合物が開示される。上記化合物は、以下の構造(I)TIFF2024023205000146.tif3274またはその立体異性体、互変異性体または塩を有する。このような化合物の調製および使用と関連する方法もまた、提供される。本発明は一般に、剛性のスペーシング基を有するダイマーおよびポリマーの蛍光染料または有色染料、ならびにそれらの調製法および種々の分析法における使用に関する。【選択図】図4
Description
(背景)
(分野)
本発明は一般に、剛性のスペーシング基を有するダイマーおよびポリマーの蛍光染料または有色染料、ならびにそれらの調製法および種々の分析法における使用に関する。
(分野)
本発明は一般に、剛性のスペーシング基を有するダイマーおよびポリマーの蛍光染料または有色染料、ならびにそれらの調製法および種々の分析法における使用に関する。
(関連技術の説明)
蛍光染料および/または有色染料は、高感度検出試薬が望ましい用途に特に適していることが公知である。サンプル中の特定の成分または構成要素を優先的に標識し得る染料は、研究者がその特定の成分または構成要素の存在、量および/または位置を決定することを可能にする。さらに、多様な環境での空間的および時間的分布に関して、特定の系がモニターされ得る。
蛍光染料および/または有色染料は、高感度検出試薬が望ましい用途に特に適していることが公知である。サンプル中の特定の成分または構成要素を優先的に標識し得る染料は、研究者がその特定の成分または構成要素の存在、量および/または位置を決定することを可能にする。さらに、多様な環境での空間的および時間的分布に関して、特定の系がモニターされ得る。
蛍光法および比色法は、化学および生物学において極めて広く行き渡っている。これらの方法は、生体分子の存在、構造、距離、配向、錯体形成(complexation)および/または位置に関する有用な情報を与える。さらに、時間分解法は、ダイナミクスおよびキネティクスの測定においてますます使用されている。結果として、生体分子(例えば、核酸およびタンパク質)の蛍光または色による標識に関する多くのストラテジーが開発されてきた。生体分子の分析は、代表的には、水性環境において起こるので、焦点は、水溶性の染料の開発および使用に当てられている。
高度な蛍光染料または有色染料は、このような染料の使用がシグナル対ノイズ比を増大させかつ他の関連する利益を提供するので望ましい。よって、既知の蛍光部分および/または有色部分からのシグナルを増大させる試みがなされてきた。例えば、2もしくはこれより多くの蛍光部分および/または有色部分を含むダイマーおよびポリマーの化合物は、このような化合物がより明るい染料を生じることを期待して調製されてきた。しかし、分子内蛍光クエンチングの結果として、公知のダイマーおよびポリマーの染料は、明度の望ましい増大を達成していなかった。
従って、増大したモルあたりの明度を有する水溶性染料が当該分野で必要である。理想的には、このような染料および生体マーカーは、強く有色であるかまたは蛍光性であるべきであり、種々の色および蛍光波長において利用可能であるべきである。本発明は、この必要性を満たしかつさらなる関連の利点を提供する。
(簡単な要旨)
簡潔には、本発明の実施形態は一般に、分析物分子(例えば、生体分子)の視覚的検出を可能にする水溶性の、蛍光および/または有色の染料および/またはプローブとして有用な化合物、ならびにそれらの調製のための試薬に関する。上記染料を使用して分析物分子を視覚的に検出するための方法もまた、記載される。
簡潔には、本発明の実施形態は一般に、分析物分子(例えば、生体分子)の視覚的検出を可能にする水溶性の、蛍光および/または有色の染料および/またはプローブとして有用な化合物、ならびにそれらの調製のための試薬に関する。上記染料を使用して分析物分子を視覚的に検出するための方法もまた、記載される。
本開示の染料の実施形態は、リンカー(「L4」)によって共有結合的に連結される2もしくはこれより多くの蛍光部分および/または有色部分を含む。ダイマーおよび/またはポリマーの染料の以前の報告とは対照的に、本発明の染料は、その対応するモノマー染料化合物より有意に明るい。理論によって拘束されることは望まないが、このリンカー部分が、分子内蛍光クエンチングが低減および/または排除されるために十分な空間的距離を、上記蛍光部分および/または有色部分の間に提供すると考えられる。
本発明の実施形態の水溶性の蛍光染料または有色染料は、強く有色および/または蛍光性であり、目視または他の手段によって容易に観察され得る。いくつかの実施形態において、上記化合物は、事前の照射または化学的もしくは酵素的活性化なしに観察され得る。本明細書で記載されるように、上記染料の適切な選択によって、種々の色の視覚的に検出可能な分析物分子が、得られ得る。
一実施形態において、以下の構造(I)を有する化合物:
またはその立体異性体、互変異性体もしくは塩が提供され、ここでR1、R2、R3、R4、R5、L1、L2、L3、L4、M、mおよびnは、本明細書で定義されるとおりである。構造(I)の化合物は、多くの適用(種々の分析法における蛍光染料および/または有色染料としての使用が挙げられる)における有用性が見出される。
別の実施形態において、サンプルを染色するための方法が提供され、上記方法は、上記サンプルに、構造(I)の化合物を、上記サンプルが適切な波長で照射される場合に光学的応答を生成するために十分な量で添加する工程を包含する。
さらに他の実施形態において、本開示は、分析物分子を視覚的に検出するための方法を提供し、上記方法は、
(a)構造(I)の化合物を提供する工程;および
(b)上記化合物をその視覚的特性によって検出する工程
を包含する。
(a)構造(I)の化合物を提供する工程;および
(b)上記化合物をその視覚的特性によって検出する工程
を包含する。
他の開示される方法は、生体分子を視覚的に検出するための方法を包含し、上記方法は、
(a)構造(I)の化合物と1もしくはこれより多くの生体分子とを混合する工程;および
(b)上記化合物をその視覚的特性によって検出する工程
を包含する。
(a)構造(I)の化合物と1もしくはこれより多くの生体分子とを混合する工程;および
(b)上記化合物をその視覚的特性によって検出する工程
を包含する。
他の実施形態は、分析物を視覚的に検出するための方法を提供し、上記方法は、
(a)R2またはR3は、上記分析物に対する特異性を有する標的化部分への共有結合を含むリンカーを含む本明細書で開示されるとおりの化合物を提供する工程;
(b)上記化合物および上記分析物を混合し、それによって、上記標的化部分および上記分析物を会合させる工程;ならびに
(c)上記化合物をその視覚的特性によって検出する工程、
を包含する。
(a)R2またはR3は、上記分析物に対する特異性を有する標的化部分への共有結合を含むリンカーを含む本明細書で開示されるとおりの化合物を提供する工程;
(b)上記化合物および上記分析物を混合し、それによって、上記標的化部分および上記分析物を会合させる工程;ならびに
(c)上記化合物をその視覚的特性によって検出する工程、
を包含する。
他の実施形態は、構造(I)の化合物および1もしくはこれより多くの分析物分子、例えば生体分子を含む組成物に関する。上記1もしくはこれより多くの生体分子の検出のための分析法におけるこのような組成物の使用もまた、提供される。
いくつかの他の異なる実施形態において、構造(II):
の化合物、またはその立体異性体、塩もしくは互変異性体が提供され、ここでR1、R2、R3、R4、R5、L1a、L2、L3、L4、G、mおよびnは、本明細書で定義されるとおりである。構造(II)の化合物は、多くの適用(構造(I)の蛍光染料および/または有色染料を調製するための中間体としての使用が挙げられる)において有用性が見出される。
さらに他の実施形態において、分析物分子を標識するための方法が提供され、上記方法は、
(a)R2またはR3は、QまたはQへの共有結合を含むリンカーである構造(II)の化合物と、上記分析物分子とを混合する工程;
(b)上記化合物および上記分析物分子の結合体を形成する工程;ならびに
(c)上記結合体と式M-L1b-G′の化合物とを反応させ、それによって、GおよびG′の反応によって少なくとも1個の共有結合を形成する工程、
を包含し、ここでR2、R3、Q、GおよびM-L1b-G′は、本明細書で定義されるとおりである。
(a)R2またはR3は、QまたはQへの共有結合を含むリンカーである構造(II)の化合物と、上記分析物分子とを混合する工程;
(b)上記化合物および上記分析物分子の結合体を形成する工程;ならびに
(c)上記結合体と式M-L1b-G′の化合物とを反応させ、それによって、GおよびG′の反応によって少なくとも1個の共有結合を形成する工程、
を包含し、ここでR2、R3、Q、GおよびM-L1b-G′は、本明細書で定義されるとおりである。
いくつかの異なる実施形態において、分析物分子を標識するための別の方法が提供され、上記方法は、
(a)R2またはR3は、QまたはQへの共有結合を含むリンカーである構造(II)の化合物と、式M-L1b-G′の化合物とを混合し、それによって、GおよびG′の反応によって少なくとも1個の共有結合を形成する工程;ならびに
(b)工程(A)の生成物と上記分析物分子とを反応させ、それによって、工程(A)の生成物および上記分析物分子の結合体を形成する工程、
を包含し、ここでR2、R3、Q、GおよびM-L1b-G′は、本明細書で定義されるとおりである。
(a)R2またはR3は、QまたはQへの共有結合を含むリンカーである構造(II)の化合物と、式M-L1b-G′の化合物とを混合し、それによって、GおよびG′の反応によって少なくとも1個の共有結合を形成する工程;ならびに
(b)工程(A)の生成物と上記分析物分子とを反応させ、それによって、工程(A)の生成物および上記分析物分子の結合体を形成する工程、
を包含し、ここでR2、R3、Q、GおよびM-L1b-G′は、本明細書で定義されるとおりである。
より異なる実施形態において、構造(I)の化合物を調製するための方法が提供され、上記方法は、構造(II)の化合物と式M-L1b-G′の化合物とを混合し、それによって、GおよびG′の反応によって少なくとも1個の共有結合を形成する工程を包含し、ここでGおよびM-L1b-G′は、本明細書で定義されるとおりである。
さらにより多くの実施形態は、Y個の蛍光部分Mを含む蛍光化合物に関し、ここで上記蛍光化合物は、所定の波長の紫外線での励起の際に、同じ波長の紫外線での励起の際の1個のM部分のピーク蛍光発光よりY倍の少なくとも85%のピーク蛍光発光を有し、そしてここでYは、2またはこれより大きな整数である。
本発明のこれらおよび他の局面は、以下の詳細な説明を参照すれば明らかになる。
図面において、同一の参照番号は、類似の要素を同定する。図面の中の要素のサイズおよび相対的位置は、必ずしも同一縮尺で書かれておらず、これら要素のうちのいくつかは、図面の読みやすさを改善するために、自由裁量によって拡大されかつ配置されている。さらに、書かれているとおりの要素の特定の形状は、その特定の要素の実際の形状に関して何らかの情報を知らせる意図はなく、図面の中で認識しやすくするために選択されているに過ぎない。
(詳細な説明)
以下の説明において、ある種の具体的詳細が、本発明の種々の実施形態の完全な理解を提供するために示される。しかし、当業者は、これら詳細なしに本発明が実施され得ることを理解する。
以下の説明において、ある種の具体的詳細が、本発明の種々の実施形態の完全な理解を提供するために示される。しかし、当業者は、これら詳細なしに本発明が実施され得ることを理解する。
状況が別段要求しなければ、本明細書および特許請求の範囲全体を通じて、文言「含む、包含する(comprise)」ならびにそのバリエーション(例えば、「含む、包含する(comprises)」および「含む、包含する(comprising)」)は、開放系の包括的な意味で、すなわち、「が挙げられるが、これらに限定されない」として解釈されるべきである。
本明細書全体を通じて「一実施形態(one embodiment)」または「ある実施形態(an embodiment)」への言及は、上記実施形態と関連して記載される特定の特徴、構造、または特性が、本発明の少なくとも1つの実施形態に含まれることを意味する。従って、本明細書全体を通じて種々の箇所での語句「一実施形態において」または「ある実施形態において」の存在は、必ずしも全てが、同じ実施形態に言及しているわけではない。さらに、特定の特徴、構造、または特性は、1もしくはこれより多くの実施形態において任意の適切な様式で組み合わせられ得る。
「アミノ」とは、-NH2基をいう。
「カルボキシ」とは、-CO2H基をいう。
「シアノ」とは、-CN基をいう。
「ホルミル」とは、-C(=O)H基をいう。
「ヒドロキシ」または「ヒドロキシル」とは、-OH基をいう。
「イミノ」とは、=NH基をいう。
「ニトロ」とは、-NO2基をいう。
「オキソ」とは、=O置換基をいう。
「スルフヒドリル」とは、-SH基をいう。
「チオキソ」とは、=S基をいう。
「アルキル」とは、炭素原子および水素原子のみからなり、不飽和を含まず、1~12個の炭素原子(C1-C12アルキル)、1~8個の炭素原子(C1-C8アルキル)または1~6個の炭素原子(C1-C6アルキル)を有し、そして単結合によって分子の残部に結合される直鎖状または分枝状の炭化水素鎖の基(例えば、メチル、エチル、n-プロピル、1-メチルエチル(イソ-プロピル)、n-ブチル、n-ペンチル、1,1-ジメチルエチル(t-ブチル)、3-メチルヘキシル、2-メチルヘキシルなど)をいう。本明細書で別段具体的に述べられなければ、アルキル基は、必要に応じて置換される。
「アルキレン」または「アルキレン鎖」とは、分子の残部をラジカル基に連結し、炭素および水素のみからなり、不飽和を含まず、そして1~12個の炭素原子を有する直鎖状または分枝状の二価の炭化水素鎖(例えば、メチレン、エチレン、プロピレン、n-ブチレン、エテニレン、プロペニレン、n-ブテニレン、プロピニレン、n-ブチニレンなど)をいう。上記アルキレン鎖は、単結合を介して分子の残部に結合され、単結合を介してラジカル基に結合される。分子の残部へのまたはラジカル基への上記アルキレン鎖の結合点は、上記鎖の中の1個の炭素または任意の2個の炭素を介し得る。本明細書で別段具体的に述べられなければ、アルキレンは、必要に応じて置換される。
「アルケニレン」または「アルケニレン鎖」とは、分子の残部をラジカル基に連結し、炭素および水素のみからなり、少なくとも1個の炭素-炭素二重結合を含み、そして2~12個の炭素原子を有する直鎖状または分枝状の二価の炭化水素鎖(例えば、エテニレン、プロペニレン、n-ブテニレンなど)をいう。アルケニレン鎖は、単結合を介して分子の残部に結合され、二重結合または単結合を介してラジカル基に結合される。分子の残部へのおよびラジカル基へのアルケニレン鎖の結合点は、その鎖中の1個の炭素または任意の2個の炭素を介し得る。本明細書で別段具体的に述べられなければ、アルケニレンは、必要に応じて置換される。
「アルキニレン」または「アルキニレン鎖」とは、分子の残部をラジカル基に連結し、炭素および水素のみからなり、少なくとも1個の炭素-炭素三重結合を含み、そして2~12個の炭素原子を有する直鎖状または分枝状の二価の炭化水素鎖(例えば、エテニレン、プロペニレン、n-ブテニレンなど)をいう。アルキニレン鎖は、単結合を介して分子の残部に結合され、二重結合または単結合を介してラジカル基に結合される。分子の残部へのおよびラジカル基へのアルキニレン鎖の結合点は、その鎖中の1個の炭素または任意の2個の炭素を介し得る。本明細書で別段具体的に述べられなければ、アルキニレンは、必要に応じて置換される。
「アルキルエーテル」とは、上記で定義されるとおりの任意のアルキル基であって、ここで少なくとも1個の炭素-炭素結合が炭素-酸素結合で置き換わっているものをいう。この炭素-酸素結合は、末端部分に(アルコキシ基の中にあるように)あってもよいし、炭素酸素結合は、内部に(すなわち、C-O-C)あってもよい。アルキルエーテルは、少なくとも1個の炭素酸素結合を含むが、1個より多く含んでいてもよい。例えば、ポリエチレングリコール(PEG)は、アルキルエーテルの意味の中に含まれる。本明細書で別段具体的に述べられなければ、アルキルエーテル基は、必要に応じて置換される。例えば、いくつかの実施形態において、アルキルエーテルは、アルコールまたは-OP(=Ra)(Rb)Rcで置換され、ここでRa、RbおよびRcの各々は、構造(I)の化合物について定義される通りである。
「アルコキシ」とは、式-ORaであって、ここでRaは、1~12個の炭素原子を含む上記で定義されるとおりのアルキル基である基をいう。本明細書で別段具体的に述べられなければ、アルコキシ基は、必要に応じて置換される。
「アルコキシアルキルエーテル」とは、式-ORaRb(ここでRaは、1~12個の炭素原子を含む上記で定義されるとおりのアルキレン基であり、Rbは、本明細書で定義されるとおりのアルキルエーテル基である)の基をいう。本明細書で別段具体的に述べられなければ、アルコキシアルキルエーテル基は、必要に応じて置換され、例えば、アルコールまたは-OP(=Ra)(Rb)Rcで置換され、ここでRa、RbおよびRcの各々は、構造(I)の化合物について定義されるとおりである。
「ヘテロアルキル」とは、アルキル基内にまたはアルキル基の末端に、少なくとも1個のヘテロ原子(例えば、N、O、PまたはS)を含むアルキル基(上記で定義されるとおり)をいう。いくつかの実施形態において、ヘテロ原子は、アルキル基内にある(すなわち、ヘテロアルキルは、少なくとも1個の炭素-[ヘテロ原子]x-炭素結合を含み、ここでxは、1、2または3である)。他の実施形態において、ヘテロ原子は、アルキル基の末端にあるので、アルキル基を分子の残部へと結合するように働く(例えば、M1-H-A(ここでM1は、その分子の一部であり、Hは、ヘテロ原子であり、Aは、アルキル基である))。本明細書中で別段具体的に述べられなければ、ヘテロアルキル基は、必要に応じて置換される。例示的なヘテロアルキル基としては、エチレンオキシド(例えば、ポリエチレンオキシド)(必要に応じて、ホスホジステル結合のようなリン-酸素結合を含む)が挙げられる。
「ヘテロアルコキシ」とは、式-ORa(ここでRaは、1~12個の炭素原子を含む上記で定義されるとおりのヘテロアルキル基である)の基をいう。本明細書中で別段具体的に述べられなければ、ヘテロアルコキシ基は、必要に応じて置換される。
「ヘテロアルキレン」とは、少なくとも1個のヘテロ原子(例えば、N、O、PまたはS)を、アルキレン鎖内またはアルキレン鎖の末端に含む、上で定義されたようなアルキレン基をいう。いくつかの実施形態において、上記ヘテロ原子は、アルキレン鎖の中にある(すなわち、上記ヘテロアルキレンは、少なくとも1個の炭素-[ヘテロ原子]-炭素結合を含み、ここでxは1、2または3である)。他の実施形態において、上記ヘテロ原子は、アルキレンの末端にあり、従って、上記アルキレンを分子の残部に結合するように働く(例えば、M1-H-A-M2、ここでM1およびM2は、分子の一部であり、Hは、ヘテロ原子であり、Aは、アルキレンである)。本明細書で別段具体的に述べられなければ、ヘテロアルキレン基は、必要に応じて置換される。例示的なヘテロアルキレン基は、エチレンオキシド(例えば、ポリエチレンオキシド)および以下で図示される「C」連結基:
を含む。
上記C-リンカーのマルチマーは、ヘテロアルキレンリンカーの種々の実施形態に含まれる。
「ヘテロアルケニレン」は、少なくとも1個の炭素-炭素二重結合を含むヘテロアルキレン(上記で定義されるとおり)である。本明細書で別段具体的に述べられなければ、ヘテロアルケニレン基は、必要に応じて置換される。
「ヘテロアルキニレン」とは、少なくとも1個の炭素-炭素三重結合を含むヘテロアルキレンである。本明細書で別段具体的に述べられなければ、ヘテロアルキニレン基は、必要に応じて置換される。
「ヘテロ原子リンカー」に関して「ヘテロ原子(の)」とは、1個もしくはこれより多くのヘテロ原子からなるリンカー基をいう。例示的なヘテロ原子リンカーは、O、N、PおよびSからなる群より選択される1個の原子、および複数のヘテロ原子を含む(例えば、式-P(O-)(=O)O-または-OP(O-)(=O)O-ならびにそのマルチマーおよび組み合わせを有するリンカー)。
「ホスフェート」とは、-OP(=O)(Ra)Rb基であって、ここでRaは、OH、O-またはORcであり;そしてRbは、OH、O-、ORc、チオホスフェート基またはさらなるホスフェート基であり、ここでRcは、対イオン(例えば、Na+など)であるものをいう。
「ホスホアルキル」とは、-OP(=O)(Ra)Rb基であって、ここでRaは、OH、O-またはORcであり;そしてRbは、-Oアルキルであり、ここでRcは、対イオン(例えば、Na+など)であるものをいう。本明細書で別段具体的に述べられなければ、ホスホアルキル基は、必要に応じて置換される。例えば、ある種の実施形態において、ホスホアルキル基の中の上記-Oアルキル部分は、ヒドロキシル、アミノ、スルフヒドリル、ホスフェート、チオホスフェート、ホスホアルキル、チオホスホアルキル、ホスホアルキルエーテル、チオホスホアルキルエーテルまたは-OP(=Ra)(Rb)Rcのうちの1個もしくはこれより多くで必要に応じて置換され、ここでRa、RbおよびRcの各々は、構造(I)の化合物について定義されるとおりである。
「ホスホアルキルエーテル」とは、-OP(=O)(Ra)Rb基であって、ここでRaは、OH、O-またはORcであり;そしてRbは、-Oアルキルエーテルであり、ここでRcは、対イオン(例えば、Na+など)であるものをいう。本明細書で別段具体的に述べられなければ、ホスホアルキルエーテル基は、必要に応じて置換される。例えば、ある種の実施形態において、ホスホアルキルエーテル基の中の-Oアルキルエーテル部分は、ヒドロキシル、アミノ、スルフヒドリル、ホスフェート、チオホスフェート、ホスホアルキル、チオホスホアルキル、ホスホアルキルエーテル、チオホスホアルキルエーテルまたは-OP(=Ra)(Rb)Rcのうちの1個もしくはこれより多くで必要に応じて置換され、ここでRa、RbおよびRcの各々は、構造(I)の化合物について定義されるとおりである。
「チオホスフェート」とは、-OP(=Ra)(Rb)Rc基であって、ここでRaは、OまたはSであり;Rbは、OH、O-、S-、ORdまたはSRdであり;そしてRcは、OH、SH、O-、S-、ORd、SRd、ホスフェート基またはさらなるチオホスフェート基であり、ここでRdは、対イオン(例えば、Na+など)であり、そしてただし:i)Raは、Sであり;ii)Rbは、S-またはSRdであり;iii)Rcは、SH、S-またはSRdであるか;あるいはiv) i)、ii)および/またはiii)の組み合わせであるものをいう。
「チオホスホアルキル」とは、-OP(=Ra)(Rb)Rc基であって、ここでRaは、OまたはSであり;Rbは、OH、O-、S-、ORdまたはSRdであり;そしてRcは、-Oアルキルであり、ここでRdは、対イオン(例えば、Na+など)であり、そしてただし:i)Raは、Sであるか、ii)Rbは、S-もしくはSRdであるか;またはiii)Raは、Sであり、そしてRbは、S-もしくはSRdであるものをいう。本明細書で別段具体的に述べられなければ、チオホスホアルキル基は、必要に応じて置換される。例えば、ある種の実施形態において、チオホスホアルキル基の中の-Oアルキル部分は、ヒドロキシル、アミノ、スルフヒドリル、ホスフェート、チオホスフェート、ホスホアルキル、チオホスホアルキル、ホスホアルキルエーテル、チオホスホアルキルエーテルまたは-OP(=Ra)(Rb)Rcのうちの1個もしくはこれより多くで必要に応じて置換され、ここでRa、RbおよびRcの各々は、構造(I)の化合物について定義されるとおりである。
「チオホスホアルキルエーテル」とは、-OP(=Ra)(Rb)Rc基であって、ここでRaは、OまたはSであり、Rbは、OH、O-、S-、ORdまたはSRdであり;そしてRcは、-Oアルキルエーテルであり、ここでRdは、対イオン(例えば、Na+など)であり、そしてただし:i)Raは、Sであるか、ii)Rbは、S-もしくはSRdであるか;またはiii)Raは、Sであり、そしてRbは、S-もしくはSRdであるものをいう。本明細書で別段具体的に述べられなければ、チオホスホアルキルエーテル基は、必要に応じて置換される。例えば、ある種の実施形態において、チオホスホアルキル基の中の-Oアルキルエーテル部分は、ヒドロキシル、アミノ、スルフヒドリル、ホスフェート、チオホスフェート、ホスホアルキル、チオホスホアルキル、ホスホアルキルエーテル、チオホスホアルキルエーテルまたは-OP(=Ra)(Rb)Rcのうちの1個もしくはこれより多くで必要に応じて置換され、ここでRa、RbおよびRcの各々は、構造(I)の化合物について定義されるとおりである。
「炭素環式」とは、3~18個の炭素原子を含む安定な3~18員の芳香族または非芳香族の環をいう。本明細書で別段具体的に述べられなければ、炭素環式環は、縮合環系もしくは架橋環系を含み得、部分的にまたは完全に不飽和であり得る単環式、二環式、三環式または四環式の環系であり得る。非芳香族カルボシクリルラジカルとしては、シクロアルキルが挙げられる一方で、芳香族カルボシクリルラジカルは、アリールが挙げられる。本明細書で別段具体的に述べられなければ、炭素環式基は、必要に応じて置換される。
「シクロアルキル」とは、縮合環系もしくは架橋環系を含み得、3~15個の炭素原子を有し、好ましくは、3~10個の炭素原子を有し、そして飽和または不飽和であり、単結合によって分子の残部に結合される安定な非芳香族の単環式または多環式の炭素環式環をいう。単環式シクロアルキル(cyclocalkyl)としては、例えば、シクロプロピル、シクロブチル、シクロペンチル、シクロヘキシル、シクロヘプチル、およびシクロオクチルが挙げられる。多環式シクロアルキルとしては、例えば、アダマンチル、ノルボルニル、デカリニル、7,7-ジメチル-ビシクロ-[2.2.1]ヘプタニルなどが挙げられる。本明細書で別段具体的に述べられなければ、シクロアルキル基は、必要に応じて置換される。
「アリール」とは、少なくとも1個の炭素環式芳香環を含む環系をいう。いくつかの実施形態において、アリールは、6~18個の炭素原子を含む。このアリール環は、縮合環系もしくは架橋環系を含み得る単環式、二環式、三環式または四環式の環系であり得る。アリールとしては、以下が挙げられるが、これらに限定されない:アセアントリレン、アセナフチレン、アセフェナントリレン、アントラセン、アズレン、ベンゼン、クリセン、フルオランテン、フルオレン、as-インダセン、s-インダセン、インダン、インデン、ナフタレン、フェナレン、フェナントレン、プレイアデン、ピレン、およびトリフェニレンに由来するアリール。本明細書で別段具体的に述べられなければ、アリール基は、必要に応じて置換される。
「複素環式」とは、1~12個の炭素原子ならびに窒素、酸素および硫黄からなる群より選択される1~6個のヘテロ原子を含む安定な3~18員の芳香族または非芳香族の環をいう。本明細書で別段具体的に述べられなければ、上記複素環式環は、縮合環系もしくは架橋環系を含み得、上記複素環式環の中の窒素、炭素または硫黄原子は、必要に応じて酸化され得;窒素原子は、必要に応じて四級化され得;そして上記複素環式環は、部分的にまたは完全に不飽和であり得る単環式、二環式、三環式または四環式の環系であり得る。芳香族複素環式環の例は、ヘテロアリールの定義の中で以下に列挙される(すなわち、ヘテロアリールは、複素環式の部分セットである)。非芳香族複素環式環の例としては、以下が挙げられるが、これらに限定されない:ジオキソラニル、チエニル[1,3]ジチアニル、デカヒドロイソキノリル、イミダゾリニル、イミダゾリジニル、イソチアゾリジニル、イソオキサゾリジニル、モルホリニル、オクタヒドロインドリル、オクタヒドロイソインドリル、2-オキソピペラジニル、2-オキソピペリジニル、2-オキソピロリジニル、オキサゾリジニル、ピペリジニル、ピペラジニル、4-ピペリドニル、ピロリジニル、ピラゾリジニル、ピラゾロピリミジニル、キヌクリジニル、チアゾリジニル、テトラヒドロフリル、トリオキサニル、トリチアニル、トリアジナニル(triazinanyl)、テトラヒドロピラニル、チオモルホリニル、チアモルホリニル、1-オキソ-チオモルホリニル、および1,1-ジオキソ-チオモルホリニル。本明細書で別段具体的に述べられなければ、複素環式基は、必要に応じて置換される。
「ヘテロアリール」とは、1~13個の炭素原子、窒素、酸素および硫黄からなる群より選択される1~6個のヘテロ原子、ならびに少なくとも1個の芳香環を含む5~14員の環系をいう。本発明のある種の実施形態の目的に関して、ヘテロアリールラジカルは、縮合環系もしくは架橋環系を含み得;上記ヘテロアリールラジカルの中の窒素、炭素または硫黄原子は、必要に応じて酸化され得;上記窒素原子は、必要に応じて四級化され得る単環式、二環式、三環式または四環式の環系であり得る。例としては、以下が挙げられるが、これらに限定されない:アゼピニル、アクリジニル、ベンゾイミダゾリル、ベンズチアゾリル、ベンゾインドリル、ベンゾジオキソリル、ベンゾフラニル、ベンゾオキサゾリル、ベンゾチアゾリル、ベンゾチアジアゾリル、ベンゾ[b][1,4]ジオキセピニル、1,4-ベンゾジオキサニル、ベンゾナフトフラニル、ベンゾオキサゾリル、ベンゾジオキソリル、ベンゾジオキシニル、ベンゾピラニル、ベンゾピラノニル、ベンゾフラニル、ベンゾフラノニル、ベンゾチエニル(ベンゾチオフェニル)、ベンゾトリアゾリル、ベンゾ[4,6]イミダゾ[1,2-a]ピリジニル、ベンゾオキサゾリノニル、ベンゾイミダゾールチオニル、カルバゾリル、シンノリニル、ジベンゾフラニル、ジベンゾチオフェニル、フラニル、フラノニル、イソチアゾリル、イミダゾリル、インダゾリル、インドリル、インダゾリル、イソインドリル、インドリニル、イソインドリニル、イソキノリル、インドリジニル、イソオキサゾリル、ナフチリジニル、オキサジアゾリル、2-オキソアゼピニル、オキサゾリル、オキシラニル、1-オキシドピリジニル、1-オキシドピリミジニル、1-オキシドピラジニル、1-オキシドピリダジニル、1-フェニル-1H-ピロリル、フェナジニル、フェノチアジニル、フェノキサジニル、フタラジニル、プテリジニル、プテリジノニル、プリニル、ピロリル、ピラゾリル、ピリジニル、ピリジノニル、ピラジニル、ピリミジニル、ピリミジノニル(pryrimidinonyl)、ピリダジニル、ピロリル、ピリド[2,3-d]ピリミジノニル、キナゾリニル、キナゾリノニル、キノキサリニル、キノキサリノニル、キノリニル、イソキノリニル、テトラヒドロキノリニル、チアゾリル、チアジアゾリル、チエノ[3,2-d]ピリミジン-4-オニル、チエノ[2,3-d]ピリミジン-4-オニル、トリアゾリル、テトラゾリル、トリアジニル、およびチオフェニル(すなわち、チエニル)。本明細書で別段具体的に述べられなければ、ヘテロアリール基は、必要に応じて置換される。
「縮合された」とは、少なくとも2個の環を含み、ここでこの2個の環が少なくとも1個の共通環原子、例えば、2個の共通環原子を共有する環系をいう。縮合環がヘテロシクリル環またはヘテロアリール環である場合、その共通環原子は、炭素または窒素であり得る。縮合環は、二環式、三環式、四環式などを含む。
本明細書で使用される用語「置換された」とは、上記基のうちのいずれか(例えば、アルキル、アルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、ヘテロアルケニレン、ヘテロアルキニレン、アルコキシ、アルキルエーテル、アルコキシアルキルエーテル、ヘテロアルキル、ヘテロアルコキシ、ホスホアルキル、ホスホアルキルエーテル、チオホスホアルキル、チオホスホアルキルエーテル、炭素環式、シクロアルキル、アリール、複素環式および/またはヘテロアリール)であって、ここで少なくとも1個の水素原子(例えば、1個、2個、3個または全ての水素原子)が、非水素原子(例えば、以下が挙げられるが、これらに限定されない:F、Cl、Br、およびIのようなハロゲン原子;ヒドロキシル基、アルコキシ基、およびエステル基のような基の中の酸素原子;チオール基、チオアルキル基、スルホン基、スルホニル基、およびスルホキシド基のような基の中の硫黄原子;アミン、アミド、アルキルアミン、ジアルキルアミン、アリールアミン、アルキルアリールアミン、ジアリールアミン、N-オキシド、イミド、およびエナミンのような基の中の窒素原子;トリアルキルシリル基、ジアルキルアリールシリル基、アルキルジアリールシリル基、およびトリアリールシリル基のような基の中のケイ素原子;ならびに種々の他の基の中の他のヘテロ原子)への結合によって置き換えられることを意味する。「置換された」とはまた、1個もしくはこれより多くの水素原子が、ヘテロ原子(例えば、オキソ、カルボニル、カルボキシル、およびエステル基の中の酸素;ならびにイミン、オキシム、ヒドラゾンおよびニトリルのような基の中の窒素)へのより高次の結合(例えば、二重結合または三重結合)によって置き換えられる上記の基のうちのいずれかを意味する。例えば、「置換された」は、1個もしくはこれより多くの水素原子が-NRgRh、-NRgC(=O)Rh、-NRgC(=O)NRgRh、-NRgC(=O)ORh、-NRgSO2Rh、-OC(=O)NRgRh、-ORg、-SRg、-SORg、-SO2Rg、-OSO2Rg、-SO2ORg、=NSO2Rg、および-SO2NRgRhで置き換えられる上記の基のうちのいずれかを含む。「置換された」はまた、1個もしくはこれより多くの水素原子が-C(=O)Rg、-C(=O)ORg、-C(=O)NRgRh、-CH2SO2Rg、-CH2SO2NRgRhで置き換えられる上記基のうちのいずれかを意味する。前述において、RgおよびRhは、同じであるかまたは異なっており、そして独立して、水素、アルキル、アルコキシ、アルキルアミノ、チオアルキル、アリール、アラルキル、シクロアルキル、シクロアルキルアルキル、ハロアルキル、ヘテロシクリル、N-ヘテロシクリル、ヘテロシクリルアルキル、ヘテロアリール、N-ヘテロアリールおよび/またはヘテロアリールアルキルである。「置換された」とは、1個もしくはこれより多くの水素原子がアミノ、シアノ、ヒドロキシル、イミノ、ニトロ、オキソ、チオキソ、ハロ、アルキル、アルコキシ、アルキルアミノ、チオアルキル、アリール、アラルキル、シクロアルキル、シクロアルキルアルキル、ハロアルキル、ヘテロシクリル、N-ヘテロシクリル、ヘテロシクリルアルキル、ヘテロアリール、N-ヘテロアリールおよび/またはヘテロアリールアルキル基への結合によって置き換えられる上記の基のうちのいずれかをさらに意味する。いくつかの実施形態において、選択肢的置換基は、-OP(=Ra)(Rb)Rcであり、ここでRa、RbおよびRcの各々は、構造(I)の化合物について定義されるとおりである。さらに、前述の置換基の各々はまた、上記の置換基のうちの1個もしくはこれより多くで必要に応じて置換され得る。
「共役」とは、1つのp軌道と別のp軌道とが、間に挟まるσ結合を横断して重なり合っていることをいう。共役は、環式または非環式の化合物で起こり得る。「共役度」とは、少なくとも1つのp軌道と別のp軌道とが間に挟まっているシグマ結合を横断して重なり合っていることをいう。例えば、1,3-ブタジエンは、1の共役度を有する一方で、ベンゼンおよび他の芳香族化合物は、代表的には、多重の共役度を有する。蛍光および有色化合物は、代表的には、少なくとも1の共役度を含む。
「蛍光(性)(fluorescent)」とは、特定の周波数の光を吸収し、異なる周波数の光を発することができる分子をいう。蛍光(fluorescence)は、当業者に周知である。
「有色(の)(colored)」とは、有色のスペクトル内の光(すなわち、赤、黄、青など)を吸収する分子をいう。
「リンカー」とは、分子の一部をその同じ分子の別の部分にまたは異なる分子、部分もしくは固体支持体(例えば、微粒子)に接続する、少なくとも1個の原子(例えば、炭素、酸素、窒素、硫黄、リンおよびこれらの組み合わせ)の連続する鎖に言及する。リンカーは、共有結合または他の手段(例えば、イオン結合または水素結合相互作用)を介して上記分子を接続し得る。
用語「生体分子」とは、種々の生物学的物質のうちのいずれか(核酸、炭水化物、アミノ酸、ポリペプチド、糖タンパク質、ホルモン、アプタマーおよびこれらの混合物が挙げられる)をいう。より具体的には、この用語は、RNA、DNA、オリゴヌクレオチド、改変または誘導体化されたヌクレオチド、酵素、レセプター、プリオン、レセプターリガンド(ホルモンを含む)、抗体、抗原、および毒素、ならびに細菌、ウイルス、血球、および組織細胞が挙げられるが、これらに限定されないことが意図される。本発明の視覚的に検出可能な生体分子(例えば、生体分子が連結されている構造(I)の化合物)は、本明細書でさらに記載されるように、生体分子と化合物(これは、上記生体分子上のアミノ、ヒドロキシ、カルボキシル、またはスルフヒドリル基のような任意の利用可能な原子または官能基を介して上記化合物への生体分子の結合を可能にする反応性基を有する)とを接触させることによって調製される。
「反応性基」とは、第2の反応性基(例えば、「相補的反応性基」)と反応して、1個もしくはこれより多くの共有結合を、例えば、置換、酸化、還元、付加または環化付加反応により形成し得る部分である。例示的な反応性基は、表1に提供され、例えば、求核性基、求電子性基、ジエン、ジエノフィル、アルデヒド、オキシム、ヒドラゾン、アルキン、アミン、アジド、アシルアジド、アシルハライド、ニトリル、ニトロン、スルフヒドリル、ジスルフィド、スルホニルハライド、イソチオシアネート、イミドエステル、活性化エステル、ケトン、α,β-不飽和カルボニル、アルケン、マレイミド、α-ハロイミド、エポキシド、アジリジン、テトラジン、テトラゾール、ホスフィン、ビオチン、チイランなどが挙げられる。
用語「視覚的」および「視覚的に検出可能な」とは、事前の照射、または化学的活性化もしくは酵素的活性化なしで、目視によって観察可能である物質に言及するために、本明細書で使用される。このような視覚的に検出可能な物質は、約300~約900nmの範囲に及ぶスペクトルの領域にある光を吸収し、発する。好ましくは、このような物質は、強く有色であり、好ましくは、少なくとも約40,000、より好ましくは、少なくとも約50,000、さらにより好ましくは、少なくとも約60,000、なおさらにより好ましくは、少なくとも約70,000、および最も好ましくは、少なくとも約80,000M-1cm-1のモル吸光係数を有する。本発明の化合物は、裸眼で、または光学ベースの検出デバイス(吸光分光光度計、透過型光学顕微鏡(transmission light microscope)、デジタルカメラおよびスキャナが挙げられるが、これらに限定されない)の助けを借りて観察することによって検出され得る。視覚的に検出可能な物質は、可視スペクトルの中の光を発するおよび/または吸収するものに限定されない。紫外線(UV)領域(約10nm~約400nm)、赤外線(IR)領域(約700nm~約1mm)の中の光を発するおよび/または吸収する物質、ならびに電磁スペクトルの他の領域において発するおよび/または吸収する物質はまた、「視覚的に検出可能な」物質の範囲内に含まれる。
本発明の実施形態の目的のために、用語「光安定性視覚的染料(photostable visible dye)」とは、本明細書上記で定義されるように、視覚的に検出可能であり、そして光に曝露した際に、顕著に変化も分解もしない化学部分に言及する。好ましくは、上記光安定性視覚的染料は、少なくとも1時間光に曝された後に、顕著な漂白も分解も示さない。より好ましくは、上記視覚的染料は、少なくとも12時間、さらにより好ましくは、少なくとも24時間、さらになおより好ましくは、少なくとも1週間、および最も好ましくは、少なくとも1ヶ月間光に曝した後に安定である。本発明の化合物および方法における使用に適した光安定性視覚的染料の非限定的例としては、アゾ染料、チオインディゴ染料、キナクリドン顔料、ジオキサジン、フタロシアニン、ペリノン、ジケトピロロピロール、キノフタロン、およびトルアリーカルボニウム(truarycarbonium)が挙げられる。
本明細書で使用される場合、用語「ペリレン誘導体」とは、視覚的に検出可能である任意の置換されたペリレンを含むことが意図される。しかし、この用語は、ペリレン自体を含むことは意図されない。用語「アントラセン誘導体」、「ナフタレン誘導体」、および「ピレン誘導体」が、同様に使用される。いくつかの好ましい実施形態において、誘導体(例えば、ペリレン、ピレン、アントラセンまたはナフタレンの誘導体)は、ペリレン、アントラセン、ナフタレン、またはピレンのイミド、ビスイミドまたはヒドラザムイミド(hydrazamimide)誘導体である。
本発明の種々の実施形態の視覚的に検出可能な分子は、特定の分析物(例えば、生体分子)の存在、位置、または量を決定する必要がある広く種々の分析用途(例えば、生化学的および生物医学的用途)に有用である。従って、別の局面において、本発明は、生体分子を視覚的に検出するための方法を提供し、上記方法は、(a)生物学的系に、生体分子に連結された構造(I)の化合物を含む視覚的に検出可能な生体分子を提供する工程;および(b)上記生体分子をその視覚的特性によって検出する工程を包含する。本発明の目的のために、語句「生体分子をその視覚的特性によって検出する」とは、生体分子が、照射または化学的もしくは酵素的活性化なしに、裸眼で、または光学ベースの検出デバイス(吸光分光光度計、透過型光学顕微鏡、デジタルカメラおよびスキャナが挙げられるが、これらに限定されない)の助けを借りて観察されることを意味する。デンシトメーターは、存在する視覚的に検出可能な生体分子の量を定量するために使用され得る。例えば、2つのサンプル中の上記生体分子の相対的量は、相対的光学密度を測定することによって決定され得る。1生体分子あたりの染料分子の化学量論が既知でありかつ上記染料分子の吸光係数が既知である場合、上記生体分子の絶対濃度もまた、光学密度の測定から決定され得る。本明細書で使用される場合、用語「生物学的系」は、視覚的に検出可能な生体分子に加えて、1もしくはこれより多くの生体分子を含む任意の溶液または混合物をいうために使用される。このような生物学的系の非限定的例としては、細胞、細胞抽出物、組織サンプル、電気泳動ゲル、アッセイ混合物、およびハイブリダイゼーション反応混合物が挙げられる。
「固体支持体」とは、分子の固相支持のための当該分野で公知の任意の固体基材をいい、例えば、「微粒子」とは、本発明の化合物への結合に有用な多くの小さな粒子のうちのいずれか(ガラスビーズ、磁性ビーズ、ポリマービーズ、非ポリマービーズなどが挙げられるが、これらに限定されない)をいう。ある種の実施形態において、微粒子は、ポリスチレンビーズを含む。
「固体支持体残基(solid support reside)」とは、分子が固体支持体から切断される場合に、その分子に結合されたままである官能基をいう。固体支持体残基(solid support residue)は、当該分野で公知であり、固体支持体の構造および固体支持体にその分子を連結する基に基づいて容易に得られ得る。
「標的化部分」とは、特定の標的(例えば、分析物分子)と選択的に結合するかまたは会合する部分である。「選択的に」結合または会合するとは、標的化部分が他の標的と比較して所望の標的と優先的に会合するかまたは結合することを意味する。いくつかの実施形態において、本明細書で開示される化合物は、化合物を目的の分析物(すなわち、標的化部分の標的)と選択的に結合させるかまたは会合させ、従ってその分析物の検出を可能にするという目的のために、その標的化部分への連結を含む。例示的な標的化部分としては、抗体、抗原、核酸配列、酵素、タンパク質、細胞表面レセプターアンタゴニストなどが挙げられるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態において、上記標的化部分は、抗体のような、細胞上にまたは細胞中にある標的特徴(例えば、細胞膜または他の細胞構造上にある標的特徴)と選択的に結合するかまたは会合し、従って、目的の細胞の検出を可能にする部分である。所望の分析物と選択的に結合するかまたは会合する低分子はまた、ある種の実施形態において標的化部分として企図される。当業者は、種々の実施形態において有用である他の分析物および相当する標的化部分を理解する。
「塩基対合部分」とは、相補的な複素環式部分と水素結合(例えば、ワトソン-クリック塩基対合)を介してハイブリダイズし得る複素環式部分をいう。塩基対合部分は、天然および非天然の塩基を含む。塩基対合部分の非限定的例は、RNA塩基およびDNA塩基(例えば、アデノシン、グアノシン、チミジン、シトシンおよびウリジンならびにこれらのアナログ)である。
本明細書で開示される本発明の実施形態はまた、1個もしくはこれより多くの原子が異なる原子質量または質量数を有する原子によって置き換わることによって、同位体標識されている構造(I)または(II)の全ての化合物を包含することが意味される。開示される化合物に組み込まれ得る同位体の例としては、水素、炭素、窒素、酸素、リン、フッ素、塩素、およびヨウ素の同位体(例えば、それぞれ、2H、3H、11C、13C、14C、13N、15N、15O、17O、18O、31P、32P、35S、18F、36Cl、123I、および125I)が挙げられる。
構造(I)または(II)の同位体標識された化合物は一般に、当業者に公知の従来技術によって、または以下でおよび以下の実施例において記載されるものに類似のプロセスによって、以前に使用されていた標識されていない試薬の代わりに適切な同位体標識された試薬を使用して調製され得る。
「安定な化合物」および「安定な構造」とは、反応混合物から有用な純度への単離および有効な治療剤への製剤化に耐えるように十分に強い化合物を示すことが意味される。
「選択肢的な(optional)」または「必要に応じて(optionally)」とは、その後に記載される事象または状況が起こっても起こらなくてもよいこと、ならびにその記載が上記事象または状況が起こる場合およびそれが起こらない場合を含むことを意味する。例えば、「必要に応じて置換されたアルキル」とは、そのアルキル基が置換されていてもされていなくてもよいこと、ならびにその記載が、置換されたアルキル基および置換を有しないアルキル基の両方を含むことを意味する。
「塩」とは、酸付加塩および塩基付加塩の両方を包含する。
「酸付加塩」とは、無機酸(例えば、塩酸、臭化水素酸、硫酸、硝酸、リン酸などが挙げられるが、これらに限定されない)および有機酸(例えば、酢酸、2,2-ジクロロ酢酸、アジピン酸、アルギン酸、アスコルビン酸、アスパラギン酸、ベンゼンスルホン酸、安息香酸、4-アセトアミド安息香酸、カンファー酸、カンファー-10-スルホン酸、カプリン酸、カプロン酸、カプリル酸、炭酸、ケイ皮酸、クエン酸、シクラミン酸、ドデシル硫酸、エタン-1,2-ジスルホン酸、エタンスルホン酸、2-ヒドロキシエタンスルホン酸、ギ酸、フマル酸、ガラクタル酸、ゲンチジン酸、グルコヘプトン酸、グルコン酸、グルクロン酸、グルタミン酸、グルタル酸、2-オキソ-グルタル酸、グリセロリン酸、グリコール酸、馬尿酸、イソ酪酸、乳酸、ラクトビオン酸、ラウリン酸、マレイン酸、リンゴ酸、マロン酸、マンデル酸、メタンスルホン酸、ムチン酸、ナフタレン-1,5-ジスルホン酸、ナフタレン-2-スルホン酸、1-ヒドロキシ-2-ナフトエ酸、ニコチン酸、オレイン酸、オロト酸、シュウ酸、パルミチン酸、パモ酸、プロピオン酸、ピログルタミン酸、ピルビン酸、サリチル酸、4-アミノサリチル酸、セバシン酸、ステアリン酸、コハク酸、酒石酸、チオシアン酸、p-トルエンスルホン酸、トリフルオロ酢酸、ウンデシレン酸などが挙げられるが、これらに限定されない)と形成される塩をいう。
「塩基付加塩」とは、遊離酸に無機塩基または有機塩基を添加することから調製される塩をいう。無機塩基に由来する塩としては、ナトリウム、カリウム、リチウム、アンモニウム、カルシウム、マグネシウム、鉄、亜鉛、銅、マンガン、アルミニウムの塩などが挙げられるが、これらに限定されない。有機塩基に由来する塩としては、以下が挙げられるが、これらに限定されない:一級、二級、および三級アミン、置換されたアミン(天然に存在する置換されたアミン、環式アミンおよび塩基性イオン交換樹脂(例えば、アンモニア、イソプロピルアミン、トリメチルアミン、ジエチルアミン、トリエチルアミン、トリプロピルアミン、ジエタノールアミン、エタノールアミン、デアノール、2-ジメチルアミノエタノール、2-ジエチルアミノエタノール、ジシクロヘキシルアミン、リジン、アルギニン、ヒスチジン、カフェイン、プロカイン、ヒドラバミン、コリン、ベタイン、ベネタミン、ベンザチン、エチレンジアミン、グルコサミン、メチルグルカミン、テオブロミン、トリエタノールアミン、トロメタミン、プリン、ピペラジン、ピペリジン、N-エチルピペリジン、ポリアミン樹脂など)が挙げられる)の塩。特に好ましい有機塩基は、イソプロピルアミン、ジエチルアミン、エタノールアミン、トリメチルアミン、ジシクロヘキシルアミン、コリンおよびカフェインである。
結晶化は、本明細書中に記載される化合物の溶媒和物を生じ得る。本発明の実施形態は、記載される化合物の全ての溶媒和物を包含する。本明細書で使用される場合、用語「溶媒和物」とは、1分子もしくはこれより多くの本発明の化合物と、1分子もしくはこれより多くの溶媒とを含む凝集物をいう。上記溶媒は水であり得、この場合、この溶媒和物は水和物であり得る。あるいは、上記溶媒は、有機溶媒であり得る。従って、本発明の化合物は、水和物(一水和物、二水和物、半水和物、セスキ水和物、三水和物、四水和物などが挙げられる)ならびにその対応する溶媒和形態として存在し得る。本発明の化合物は、真の溶媒和物であり得る一方で、他の場合には、本発明の化合物は、偶発の水もしくは別の溶媒を保持しているに過ぎなくてもよいし、水と何らかの偶発の溶媒との混合物であってもよい。
本発明の化合物の実施形態(例えば、構造IもしくはIIの化合物)またはそれらの塩、互変異性体もしくは溶媒和物は、1もしくはこれより多くの不斉中心を含み得、従って、エナンチオマー、ジアステレオマー、および絶対立体化学の点から、(R)-もしくは(S)-として、またはアミノ酸に関しては(D)-もしくは(L)-として定義され得る他の立体異性形態を生じ得る。本発明の実施形態は、全てのこのような考えられる異性体、ならびにそれらのラセミ形態および光学的に純粋な形態を含むことが意味される。光学的に活性な(+)および(-)、(R)-および(S)-、または(D)-および(L)-異性体は、キラルシントンもしくはキラル試薬を使用して調製され得るか、または従来技術(例えば、クロマトグラフィーおよび分別結晶化)を使用して分離され得る。個々のエナンチオマーの調製/単離のための従来技術としては、適切な光学的に純粋な前駆体からのキラル合成、あるいは例えば、キラル高圧液体クロマトグラフィー(HPLC)を使用するラセミ混合物(または塩もしくは誘導体のラセミ混合物)の分離が挙げられる。本明細書で記載される化合物がオレフィン性二重結合または他の幾何的非対称性の中心を含み、そして別段特定されなければ、上記化合物がEおよびZ両方の幾何異性体を含むことは、意図される。同様に、全ての互変異性形態がまた、含まれることが意図される。
「立体異性体」とは、同じ結合によって結合されるが、交換可能ではない異なる三次元構造を有する同じ原子から構成される化合物をいう。本発明は、種々の立体異性体およびその混合物を企図し、分子が互いに重ね合わせることができない鏡像である2つの立体異性体をいう「エナンチオマー」を含む。
「互変異性体」とは、分子の1つの原子からその同じ分子の別の原子へのプロトンシフトに言及する。本発明は、任意の上記化合物の互変異性体を含む。上記化合物の種々の互変異性形態は、当業者によって容易に導き出される。
本明細書で使用される化学的命名法プロトコルおよび構造図は、ACD/Name Version 9.07ソフトウェアプログラムおよび/またはChemDraw Ultra Version 11.0ソフトウェア命名プログラム(CambridgeSoft)を使用するI.U.P.A.C.命名法体系の改変形態である。当業者が精通する一般名もまた、使用される。
上記のように、本発明の一実施形態において、種々の分析法において蛍光染料および/または有色染料として有用な化合物が提供される。他の実施形態において、蛍光染料および/または有色染料として有用な化合物の調製のための合成中間体として有用な化合物が提供される。一般論として、本発明の実施形態は、蛍光部分および/または有色部分のダイマーおよびより高次のポリマーに関する。蛍光部分および/または有色部分は、連結部分によって連結される。理論によって拘束されることは望まないが、上記リンカーが、分子内クエンチングが低減または排除され、従って、より高いモル「明度」(例えば、高蛍光発光)を有する染料化合物を生じるように、蛍光部分および/または有色部分の間で十分な空間的距離を維持する一助となると考えられる。
よって、いくつかの実施形態において、化合物は、以下の構造(A):
を有し、ここでLは、分子内クエンチングが低減または排除されるように、1個もしくはこれより多くの(例えば、各々の)M基の間での空間的分離を維持するために十分なリンカーであり、R1、R2、R3、L1、L2、L3およびnは、構造(I)に関して定義されるとおりである。構造(A)のいくつかの実施形態において、Lは、1個またはこれより多くのエチレングリコールまたはポリエチレングリコール部分を含むリンカーである。
他の実施形態において、以下の構造(I):
を有する化合物、またはその立体異性体、塩もしくは互変異性体が提供され、ここで:
Mは、各存在において、独立して、2個またはこれより多くの炭素-炭素二重結合および少なくとも1の共役度を含む部分であり;
L1は、各存在において、独立して、i)選択肢的なアルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、ヘテロアルケニレン、ヘテロアルキニレンもしくはヘテロ原子リンカー;またはii)2個の相補的反応性基の反応によって形成できる官能基を含むリンカー、のいずれかであり;
L2およびL3は、各存在において、独立して、選択肢的なアルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、ヘテロアルケニレン、ヘテロアルキニレンもしくはヘテロ原子リンカーであり;
L4は、各存在において、独立して、長さが3原子より大きいヘテロアルキレン、ヘテロアルケニレンまたはヘテロアルキニレンリンカーであり、ここで上記ヘテロアルキレン、ヘテロアルケニレンおよびヘテロアルキニレンリンカーの中のヘテロ原子は、O、NおよびSから選択され;
R1は、各存在において、独立して、H、アルキルまたはアルコキシであり;
R2およびR3は、各々独立して、H、OH、SH、アルキル、アルコキシ、アルキルエーテル、ヘテロアルキル、-OP(=Ra)(Rb)Rc、QまたはL’であり;
R4は、各存在において、独立して、OH、SH、O-、S-、ORdまたはSRdであり;
R5は、各存在において、独立して、オキソ、チオキソまたは非存在であり;
Raは、OまたはSであり;
Rbは、OH、SH、O-、S-、ORdまたはSRdであり;
Rcは、OH、SH、O-、S-、ORd、OL’、SRd、アルキル、アルコキシ、ヘテロアルキル、ヘテロアルコキシ、アルキルエーテル、アルコキシアルキルエーテル、ホスフェート、チオホスフェート、ホスホアルキル、チオホスホアルキル、ホスホアルキルエーテルまたはチオホスホアルキルエーテルであり;
Rdは、対イオンであり;
Qは、各存在において、独立して、分析物分子、標的化部分、固体支持体または相補的反応性基Q′と共有結合を形成できる反応性基またはその保護されたアナログを含む部分であり;
L’は、各存在において、独立して、Qへの共有結合を含むリンカー、標的化部分への共有結合を含むリンカー、分析物分子への共有結合を含むリンカー、固体支持体への共有結合を含むリンカー、固体支持体残基への共有結合を含むリンカー、ヌクレオシドへの共有結合を含むリンカーまたは構造(I)のさらなる化合物への共有結合を含むリンカーであり;
mは、各存在において、独立して、0またはこれより大きな整数であるが、ただしmの少なくとも1個の存在は、1またはこれより大きな整数であり;そして
nは、1またはこれより大きな整数である。
Mは、各存在において、独立して、2個またはこれより多くの炭素-炭素二重結合および少なくとも1の共役度を含む部分であり;
L1は、各存在において、独立して、i)選択肢的なアルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、ヘテロアルケニレン、ヘテロアルキニレンもしくはヘテロ原子リンカー;またはii)2個の相補的反応性基の反応によって形成できる官能基を含むリンカー、のいずれかであり;
L2およびL3は、各存在において、独立して、選択肢的なアルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、ヘテロアルケニレン、ヘテロアルキニレンもしくはヘテロ原子リンカーであり;
L4は、各存在において、独立して、長さが3原子より大きいヘテロアルキレン、ヘテロアルケニレンまたはヘテロアルキニレンリンカーであり、ここで上記ヘテロアルキレン、ヘテロアルケニレンおよびヘテロアルキニレンリンカーの中のヘテロ原子は、O、NおよびSから選択され;
R1は、各存在において、独立して、H、アルキルまたはアルコキシであり;
R2およびR3は、各々独立して、H、OH、SH、アルキル、アルコキシ、アルキルエーテル、ヘテロアルキル、-OP(=Ra)(Rb)Rc、QまたはL’であり;
R4は、各存在において、独立して、OH、SH、O-、S-、ORdまたはSRdであり;
R5は、各存在において、独立して、オキソ、チオキソまたは非存在であり;
Raは、OまたはSであり;
Rbは、OH、SH、O-、S-、ORdまたはSRdであり;
Rcは、OH、SH、O-、S-、ORd、OL’、SRd、アルキル、アルコキシ、ヘテロアルキル、ヘテロアルコキシ、アルキルエーテル、アルコキシアルキルエーテル、ホスフェート、チオホスフェート、ホスホアルキル、チオホスホアルキル、ホスホアルキルエーテルまたはチオホスホアルキルエーテルであり;
Rdは、対イオンであり;
Qは、各存在において、独立して、分析物分子、標的化部分、固体支持体または相補的反応性基Q′と共有結合を形成できる反応性基またはその保護されたアナログを含む部分であり;
L’は、各存在において、独立して、Qへの共有結合を含むリンカー、標的化部分への共有結合を含むリンカー、分析物分子への共有結合を含むリンカー、固体支持体への共有結合を含むリンカー、固体支持体残基への共有結合を含むリンカー、ヌクレオシドへの共有結合を含むリンカーまたは構造(I)のさらなる化合物への共有結合を含むリンカーであり;
mは、各存在において、独立して、0またはこれより大きな整数であるが、ただしmの少なくとも1個の存在は、1またはこれより大きな整数であり;そして
nは、1またはこれより大きな整数である。
構造(I)の化合物の異なる実施形態において:
Mは、各存在において、独立して、2個またはこれより多くの炭素-炭素二重結合および少なくとも1の共役度を含む部分であり;
L1は、各存在において、独立して、i)選択肢的なアルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、ヘテロアルケニレン、ヘテロアルキニレンもしくはヘテロ原子リンカー;またはii)2個の相補的反応性基の反応によって形成できる官能基を含むリンカー、のいずれかであり;
L2およびL3は、各存在において、独立して、選択肢的なアルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、ヘテロアルケニレン、ヘテロアルキニレンもしくはヘテロ原子リンカーであり;
L4は、各存在において、独立して、長さが3原子より大きいヘテロアルキレン、ヘテロアルケニレンまたはヘテロアルキニレンリンカーであり、ここで上記ヘテロアルキレン、ヘテロアルケニレンおよびヘテロアルキニレンリンカーの中のヘテロ原子は、O、NおよびSから選択され;
R1は、各存在において、独立して、H、アルキルまたはアルコキシであり;
R2およびR3は、各々独立して、H、OH、SH、アルキル、アルコキシ、アルキルエーテル、-OP(=Ra)(Rb)Rc、Q、Qへの共有結合を含むリンカー、分析物分子への共有結合を含むリンカー、固体支持体への共有結合を含むリンカーまたは構造(I)のさらなる化合物への共有結合を含むリンカーであり、ここで:Raは、OまたはSであり;Rbは、OH、SH、O-、S-、ORdまたはSRdであり;Rcは、OH、SH、O-、S-、ORd、SRd、アルキル、アルコキシ、アルキルエーテル、アルコキシアルキルエーテル、ホスフェート、チオホスフェート、ホスホアルキル、チオホスホアルキル、ホスホアルキルエーテルまたはチオホスホアルキルエーテルであり;そしてRdは、対イオンであり;
R4は、各存在において、独立して、OH、SH、O-、S-、ORdまたはSRdであり;
R5は、各存在において、独立して、オキソ、チオキソまたは非存在であり;
Qは、各存在において、独立して、分析物分子、固体支持体または相補的反応性基Q′と共有結合を形成できる反応性基を含む部分であり;
mは、各存在において、独立して、0またはこれより大きな整数であるが、ただしmの少なくとも1個の存在は、1またはこれより大きな整数であり;そして
nは、1またはこれより大きな整数である。
Mは、各存在において、独立して、2個またはこれより多くの炭素-炭素二重結合および少なくとも1の共役度を含む部分であり;
L1は、各存在において、独立して、i)選択肢的なアルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、ヘテロアルケニレン、ヘテロアルキニレンもしくはヘテロ原子リンカー;またはii)2個の相補的反応性基の反応によって形成できる官能基を含むリンカー、のいずれかであり;
L2およびL3は、各存在において、独立して、選択肢的なアルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、ヘテロアルケニレン、ヘテロアルキニレンもしくはヘテロ原子リンカーであり;
L4は、各存在において、独立して、長さが3原子より大きいヘテロアルキレン、ヘテロアルケニレンまたはヘテロアルキニレンリンカーであり、ここで上記ヘテロアルキレン、ヘテロアルケニレンおよびヘテロアルキニレンリンカーの中のヘテロ原子は、O、NおよびSから選択され;
R1は、各存在において、独立して、H、アルキルまたはアルコキシであり;
R2およびR3は、各々独立して、H、OH、SH、アルキル、アルコキシ、アルキルエーテル、-OP(=Ra)(Rb)Rc、Q、Qへの共有結合を含むリンカー、分析物分子への共有結合を含むリンカー、固体支持体への共有結合を含むリンカーまたは構造(I)のさらなる化合物への共有結合を含むリンカーであり、ここで:Raは、OまたはSであり;Rbは、OH、SH、O-、S-、ORdまたはSRdであり;Rcは、OH、SH、O-、S-、ORd、SRd、アルキル、アルコキシ、アルキルエーテル、アルコキシアルキルエーテル、ホスフェート、チオホスフェート、ホスホアルキル、チオホスホアルキル、ホスホアルキルエーテルまたはチオホスホアルキルエーテルであり;そしてRdは、対イオンであり;
R4は、各存在において、独立して、OH、SH、O-、S-、ORdまたはSRdであり;
R5は、各存在において、独立して、オキソ、チオキソまたは非存在であり;
Qは、各存在において、独立して、分析物分子、固体支持体または相補的反応性基Q′と共有結合を形成できる反応性基を含む部分であり;
mは、各存在において、独立して、0またはこれより大きな整数であるが、ただしmの少なくとも1個の存在は、1またはこれより大きな整数であり;そして
nは、1またはこれより大きな整数である。
構造(I)の化合物中の種々のリンカーおよび置換基(例えば、M、Q、R1、R2、R3、Rc、L1、L2、L3およびL4)は、1もしくはこれより多くの置換基で必要に応じて置換される。例えば、いくつかの実施形態において、選択肢的な置換基は、構造(I)の化合物の水溶性または他の特性を最適化するために選択される。ある種の実施形態において、構造(I)の化合物中の各アルキル、アルコキシ、アルキルエーテル、アルコキシアルキルエーテル、ホスホアルキル、チオホスホアルキル、ホスホアルキルエーテルおよびチオホスホアルキルエーテルは、ヒドロキシル、アルコキシ、アルキルエーテル、アルコキシアルキルエーテル、スルフヒドリル、アミノ、アルキルアミノ、カルボキシル、ホスフェート、チオホスフェート、ホスホアルキル、チオホスホアルキル、ホスホアルキルエーテルおよびチオホスホアルキルエーテルからなる群より選択される1個もしくはこれより多くの置換基で必要に応じて置換される。ある種の実施形態において、その選択肢的置換基は、-OP(=Ra)(Rb)Rcであり、ここでRa、RbおよびRcは、構造(I)の化合物について定義されるとおりである。
いくつかの実施形態において、L1は、各存在において、独立して、選択肢的なアルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、ヘテロアルケニレン、ヘテロアルキニレンもしくはヘテロ原子リンカーである。他の実施形態において、L1は、各存在において、独立して、2個の相補的反応性基、例えばQ基の反応によって形成できる官能基を含むリンカーである。
いくつかの実施形態において、L4は、各存在において、独立して、ヘテロアルキレンリンカーである。他のより具体的な実施形態において、L4は、各存在において、独立して、アルキレンオキシドリンカーである。例えば、いくつかの実施形態において、L4は、ポリエチレンオキシドであり、上記化合物は、以下の構造(IA):
を有し、ここでzは、2~100の整数である。(IA)のいくつかの実施形態において、zは、2~30、例えば、約20~25の整数、または約23である。いくつかの実施形態において、zは、2~10、例えば、3~6の整数である。いくつかの実施形態において、zは、3である。いくつかの実施形態において、zは、4である。いくつかの実施形態において、zは、5である。いくつかの実施形態において、zは、6である。
選択肢的なリンカーL1は、化合物の残部へのM部分の結合点として使用され得る。例えば、いくつかの実施形態において、構造(I)の化合物への合成前駆体が調製され、M部分は、当該分野で公知の任意の数の容易な方法(例えば、「クリック化学」といわれる方法)を使用して、その合成前駆体に結合される。この目的のために、迅速でありかつ実質的に不可逆性である任意の反応は、Mをその合成前駆体に結合して、構造(I)の化合物を形成するために使用され得る。例示的な反応としては、トリアゾールを形成するアジドおよびアルキンの銅触媒性の反応(ヒュスゲン1,3-双極環化付加反応)、ジエンおよびジエノフィルの反応(ディールス-アルダー)、歪み促進性アルキン-ニトロン環化付加(strain-promoted alkyne-nitrone cycloaddition)、歪みアルケンと、アジド、テトラジンまたはテトラゾールの反応、アルケンおよびアジドの[3+2]環化付加、アルケンおよびテトラジン逆電子要請型ディールス-アルダー、アルケンおよびテトラゾール光化学反応、ならびに種々の置換反応(例えば、求電子性原子に対する求核攻撃による脱離基の置換)が挙げられる。例示的な置換反応は、アミンと以下:活性化エステル;N-ヒドロキシスクシンイミドエステル;イソシアネート;イソチオシアネート(isothioscyanate)などとの反応を含む。いくつかの実施形態において、L1を形成する反応は、水性環境の中で行われ得る。
よって、いくつかの実施形態において、L1は、各存在において、2個の相補的反応性基の反応によって形成し得る官能基、たとえば、前述の「クリック」反応のうちの1つの生成物である官能基、を含むリンカーである。種々の実施形態において、L1の少なくとも1個の存在に関して、官能基は、アルデヒド、オキシム、ヒドラゾン、アルキン、アミン、アジド、アシルアジド、アシルハライド、ニトリル、ニトロン、スルフヒドリル、ジスルフィド、スルホニルハライド、イソチオシアネート、イミドエステル、活性化エステル(例えば、N-ヒドロキシスクシンイミドエステル)、ケトン、α,β-不飽和カルボニル、アルケン、マレイミド、α-ハロイミド、エポキシド、アジリジン、テトラジン、テトラゾール、ホスフィン、ビオチンまたはチイラン官能基と、相補的反応性基との反応によって形成され得る。例えば、アミンとN-ヒドロキシスクシンイミドエステルまたはイソチオシアネートとの反応。
他の実施形態において、L1の少なくとも1個の存在に関して、官能基は、アルキンおよびアジドの反応によって形成され得る。他の実施形態において、L1の少なくとも1個の存在に関して、官能基は、アミン(例えば、一級アミン)およびN-ヒドロキシスクシンイミドエステルまたはイソチオシアネートの反応によって形成され得る。
より多くの実施形態において、L1の少なくとも1個の存在に関して、官能基は、アルケン、エステル、アミド、チオエステル、ジスルフィド、カルボン酸基、複素環式またはヘテロアリール基を含む。より多くの実施形態において、L1の少なくとも1個の存在に関して、官能基は、アルケン、エステル、アミド、チオエステル、チオウレア、ジスルフィド、炭素環式、複素環式またはヘテロアリール基を含む。他の実施形態において、官能基は、アミドまたはチオウレアを含む。いくつかのより具体的な実施形態において、L1の少なくとも1個の存在に関して、L1は、トリアゾリル官能基を含むリンカーである。一方で他の実施形態において、L1の少なくとも1個の存在に関して、L1は、アミドまたはチオウレア官能基を含むリンカーである。
前述のものの種々の実施形態において、L1aもしくはL1b、または両方が、非存在である。他の実施形態において、L1aもしくはL1b、または両方が存在する。
いくつかの実施形態において、L1aおよびL1bは、存在する場合、各々独立して、アルキレンまたはヘテロアルキレンである。例えば、いくつかの実施形態において、L1aおよびL1bは、存在する場合、独立して、以下の構造:
構造(I)のさらに他の異なる実施形態において、L1は、各存在において、独立して、選択肢的なアルキレンまたはヘテロアルキレンリンカーである。ある種の実施形態において、L1は、以下の構造:
のうちの1つを有する。
より多くの実施形態において、L2およびL3は、各存在において、独立して、C1-C6アルキレン、C2-C6アルケニレンまたはC2-C6アルキニレンである。例えば、いくつかの実施形態において、化合物は、以下の構造(IB):
を有し、ここで:
x1、x2、x3およびx4は、各存在において、独立して、0~6の整数であり;そして
zは、2~100の整数、例えば、3~6の整数である。
x1、x2、x3およびx4は、各存在において、独立して、0~6の整数であり;そして
zは、2~100の整数、例えば、3~6の整数である。
構造(IB)の化合物のある種の実施形態において、x1、x2、x3またはx4のうちの少なくとも1個の存在は、1である。他の実施形態において、x1、x2、x3およびx4は、各存在において、各々1である。他の実施形態において、x1およびx3は、各存在において、各々0である。いくつかの実施形態において、x2およびx4は、各存在において、各々1である。さらに他の実施形態において、x1およびx3は、各存在において、各々0であり、x2およびx4は、各存在において、各々1である。
構造(IB)の化合物のいくつかのより具体的な実施形態において、L1は、各存在において、独立して、トリアゾリル官能基を含む。構造(IB)の化合物のいくつかの他の具体的な実施形態において、L1は、各存在において、独立して、アミドまたはチオウレア官能基を含む。構造(IB)の化合物の他の実施形態において、L1は、各存在において、独立して、選択肢的なアルキレンまたはヘテロアルキレンリンカーである。
構造(I)の化合物のうちのいずれかのさらに他の実施形態において、R4は、各存在において、独立して、OH、O-またはORdである。「ORd」および「SRd」は、カチオンと会合したO-およびS-をいうことが意図されることは、理解される。例えば、ホスフェート基の二ナトリウム塩は、
として表され得、ここでRdは、ナトリウム(Na+)である。
構造(I)の化合物のうちのいずれかの他の実施形態において、R5は、各存在において、オキソである。
前述の化合物のうちのいずれかのいくつかの異なる実施形態において、R1は、Hである。
他の種々の実施形態において、R2およびR3は、各々独立して、OHまたは-OP(=Ra)(Rb)Rcである。いくつかの異なる実施形態において、R2またはR3は、OHまたは-OP(=Ra)(Rb)Rcであり、R2またはR3の他方は、QまたはQへの共有結合を含むリンカーである。
構造(I)の前述の化合物のうちのいずれかのさらにより異なる実施形態において、R2およびR3は、各々独立して、-OP(=Ra)(Rb)Rcである。これらの実施形態のうちのいくつかにおいて、Rcは、OL’である。
他の実施形態において、R2およびR3は、各々独立して、-OP(=Ra)(Rb)OL’であり、L’は、Q、標的化部分、分析物(例えば、分析物分子)、固体支持体、固体支持体残基、ヌクレオシドまたは構造(I)のさらなる化合物への、アルキレンまたはヘテロアルキレンリンカーである。
リンカーL’は、Q、標的化部分、分析物(例えば、分析物分子)、固体支持体、固体支持体残基、ヌクレオシドまたは構造(I)のさらなる化合物を、構造(I)の化合物に結合させるために適した任意のリンカーであり得る。有利なことには、ある種の実施形態は、化合物の水溶性を増大または最適化するために選択されるL’部分の使用を含む。ある種の実施形態において、L’は、ヘテロアルキレン部分である。いくつかの他のある種の実施形態において、L’は、アルキレンオキシドもしくはホスホジエステル部分、またはこれらの組み合わせを含む。
ある種の実施形態において、L’は、以下の構造:
を有し、ここで:
m”およびn”は、独立して、1~10の整数であり;
Reは、H、電子対または対イオンであり;
L”は、Reもしくは直接結合であるか、またはQ、標的化部分、分析物(例えば、分析物分子)、固体支持体、固体支持体残基、ヌクレオシドもしくは構造(I)のさらなる化合物への、連結である。
m”およびn”は、独立して、1~10の整数であり;
Reは、H、電子対または対イオンであり;
L”は、Reもしくは直接結合であるか、またはQ、標的化部分、分析物(例えば、分析物分子)、固体支持体、固体支持体残基、ヌクレオシドもしくは構造(I)のさらなる化合物への、連結である。
いくつかの実施形態において、m”は、4~10の整数、例えば、4、6または10である。他の実施形態において、n”は、3~6の整数、例えば、3、4、5または6である。
いくつかの他の実施形態において、L”は、アルキレンまたはヘテロアルキレン部分である。いくつかの他のある種の実施形態において、L”は、アルキレンオキシド、ホスホジエステル部分、スルフヒドリル、ジスルフィドもしくはマレイミド部分、またはこれらの組み合わせを含む。
前述の実施形態のうちのある種のものにおいて、標的化部分は、抗体または細胞表面レセプターアンタゴニストである。
構造(I)の化合物のある種の実施形態は、オリゴヌクレオチドの調製に関して当該分野で公知のものに類似である固相合成法に従って調製され得る。よって、いくつかの実施形態において、L’は、固体支持体、固体支持体残基またはヌクレオシドへの連結である。活性化デオキシチミジン(dT)基を含む固体支持体は、容易に入手可能であり、いくつかの実施形態において、構造(I)の化合物の調製のための出発物質として使用され得る。よって、いくつかの実施形態において、R2またはR3は、以下の構造:
当業者は、上記で示されるdT基が合成のしやすさおよび経済効率のみのために含まれ、必須ではないことを理解する。他の固体支持体が使用され得、そしてL’に存在する異なるヌクレオシドまたは固体支持体残基を生じるか、あるいはそのヌクレオシドまたは固体支持体残基は、合成後に除去または改変され得る。
なお他の実施形態において、Qは、各存在において、独立して、分析物分子または固体支持体と共有結合を形成し得る反応性基を含む部分である。他の実施形態において、Qは、各存在において、独立して、相補的反応性基Q′と共有結合を形成し得る反応性基を含む部分である。例えば、いくつかの実施形態において、Q′は、構造(I)のさらなる化合物上に(例えば、R2位またはR3位に)存在し、QおよびQ′は、構造(I)の化合物および構造(I)のさらなる化合物の反応が構造(I)の化合物の共有結合したダイマーを生じるように、相補的反応性基を含む。構造(I)のマルチマー化合物はまた、類似の様式で調製され得、本発明の実施形態の範囲内に含まれる。
Q基のタイプおよび構造(I)の化合物の残部へのQ基の接続は、Qが、所望の結合を形成するために適切な反応性を有することを条件として、限定されない。
ある種の実施形態において、Qは、水性条件下で加水分解を受けにくい部分であるが、分析物分子または固体支持体上の対応する基(例えば、アミン、アジドまたはアルキン)と結合を形成するために十分に反応性である。
構造(I)の化合物のある種の実施形態は、生体結合反応の分野において一般に使用されるQ基を含む。例えば、いくつかの実施形態において、Qは、求核性反応性基、求電子性反応性基もしくは環化付加反応性基を含む。いくつかのより具体的な実施形態において、Qは、スルフヒドリル、ジスルフィド、活性化エステル、イソチオシアネート、アジド、アルキン、アルケン、ジエン、ジエノフィル、酸ハライド、スルホニルハライド、ホスフィン、α-ハロアミド、ビオチン、アミノもしくはマレイミド官能基を含む。いくつかの実施形態において、上記活性化エステルは、N-スクシンイミドエステル、イミドエステルまたはポリフルオロフェニルエステルである。他の実施形態において、上記アルキンは、アルキルアジドまたはアシルアジドである。
Q基は、便宜的に、貯蔵安定性または他の所望の特性を増大するために保護された形態で提供され得、次いで、その保護基は、例えば、標的化部分または分析物との結合体化のために適時に除去され得る。よって、Q基は、反応性基の「保護された形態」を含み、これらとしては、上記でまたは以下の表1に記載される反応性基のうちのいずれかが挙げられる。Qの「保護された形態」とは、所定の反応条件下で、Qと比較してより低い反応性を有するが、好ましくは、構造(I)の化合物の他の部分を分解もせず、その部分と反応もしない条件下で、Qに変換され得る部分をいう。当業者は、特定のQならびに所望の最終用途および貯蔵条件に基づいて、Qの適切な保護された形態を導き得る。例えば、QがSHである場合、Qの保護された形態は、一般に公知の技術および試薬を使用してSH部分を現すために還元され得るジスルフィドを含む。
QがSHであるいくつかの実施形態において、このSH部分は、例えば構造(I)の別の化合物上の別のスルフヒドリル基とジスルフィド結合を形成する傾向にあることに注意するべきである。よって、いくつかの実施形態は、ジスルフィドダイマーの形態にあり、このジスルフィド結合がSH Q基に由来する構造(I)の化合物を含む。
また、ある種の実施形態の範囲内に含まれるのは、R2およびR3のうちの一方または両方が、構造(I)のさらなる化合物への連結を含む、構造(I)の化合物である。例えば、R2およびR3のうちの一方または両方は、-OP(=Ra)(Rb)Rcであり、Rcは、OL’であり、そしてL’は、構造(I)のさらなる化合物への共有結合を含むリンカーである。このような化合物は、例えば、約10個の「M」部分(すなわち、n=9)を有し、構造(I)の第2の化合物上の相補的Q’基との反応に適切な「Q」を有する構造(I)の第1の化合物を調製することによって、調製され得る。このようにして、任意の数の「M」部分(例えば、100個またはこれより多く)を有する構造(I)の化合物は、各モノマーを連続的にカップリングする必要性なしに調製され得る。構造(I)のこのような化合物の例示的実施形態は、以下の構造(I’):
を有し、ここで:
R1、R2、R3、R4、R5、L1、L2、L3、L4、M、mおよびnの各存在は、独立して、構造(I)の化合物に関して定義されるとおりであり;
L”は、Q部分と相当するQ’部分との反応から生じる官能基を含むリンカーであり;そして
αは、1より大きな、例えば、1~100、または1~10の整数である。
R1、R2、R3、R4、R5、L1、L2、L3、L4、M、mおよびnの各存在は、独立して、構造(I)の化合物に関して定義されるとおりであり;
L”は、Q部分と相当するQ’部分との反応から生じる官能基を含むリンカーであり;そして
αは、1より大きな、例えば、1~100、または1~10の整数である。
構造(I’)の例示的化合物は、実施例5に提供される。構造(I’)の他の化合物は、当業者によって、例えば、本明細書で提供される構造(I)の化合物をダイマー化またはポリマー化することによって、導かれ得る。
他の実施形態において、そのQ部分は、ジスルフィド部分として便宜上マスクされる(例えば、保護される)。その部分は、後に、所望の分析物分子または標的化部分に結合するために、還元されて、活性化Q部分を提供し得る。例えば、そのQ部分は、以下の構造:
を有するジスルフィドとしてマスクされ得、ここでRは、必要に応じて置換されたアルキル基である。例えば、いくつかの実施形態において、Qは、以下の構造:
を有するジスルフィド部分として提供され、ここでnは、1~10の整数、例えば、6である。
いくつかの他の実施形態において、R2またはR3のうちの一方は、OHまたは-OP(=Ra)(Rb)Rcであり、かつR2またはR3のうちの他方は、分析物分子への共有結合を含むリンカーまたは固体支持体への共有結合を含むリンカーである。例えば、いくつかの実施形態において、上記分析物分子は、核酸、アミノ酸またはこれらのポリマーである。他の実施形態において、上記分析物分子は、酵素、レセプター、レセプターリガンド、抗体、糖タンパク質、アプタマーまたはプリオンである。さらに異なる実施形態において、上記固体支持体は、ポリマービーズまたは非ポリマービーズである。
mについての値は、所望の蛍光および/または色の強度に基づいて選択され得る別の変数である。いくつかの実施形態において、mは、各存在において、独立して、1~10の整数である。他の実施形態において、mは、各存在において、独立して、1~5の整数、例えば、1、2、3、4または5である。
他の実施形態において、mは、各存在において、独立して、2より大きな整数であり、zは、3~10の整数であり、例えば、いくつかの実施形態では、mは、各存在において、独立して、2より大きな整数(例えば、3、4、5または6)であり、そしてzは、3~6の整数である。
蛍光強度はまた、nの種々の値の選択によって整調され得る。ある種の実施形態において、nは、1~100の整数である。他の実施形態において、nは、1~10の整数である。いくつかの実施形態において、nは、1である。いくつかの実施形態において、nは、2である。いくつかの実施形態において、nは、3である。いくつかの実施形態において、nは、4である。いくつかの実施形態において、nは、5である。いくつかの実施形態において、nは、6である。いくつかの実施形態において、nは、7である。いくつかの実施形態において、nは、8である。いくつかの実施形態において、nは、9である。いくつかの実施形態において、nは、10である。
Mは、所望の光学的特性に基づいて、例えば、所望の色および/または蛍光発光波長に基づいて選択される。いくつかの実施形態において、Mは、各存在において同じである;しかし、Mの各存在が同一のMである必要はないことに注意することは重要であり、ある種の実施形態は、Mが各存在において同じでない化合物を含む。例えば、いくつかの実施形態において、各Mは、同じではなく、異なるM部分は、蛍光共鳴エネルギー移動(FRET)法における使用のための吸光度および/または発光を有するように選択される。例えば、いくつかの実施形態において、その異なるM部分は、1つの波長における放射線の吸光度が、FRET機構によって異なる波長における放射線の発光を引き起こすように選択される。例示的なM部分は、所望の最終用途に基づいて、当業者によって適切に選択され得る。FRET法の例示的なM部分としては、フルオレセインおよび5-TAMRA(5-カルボキシテトラメチルローダミン,スクシンイミジルエステル)染料が挙げられる。
Mは、M上の任意の位置(すなわち、原子)から分子の残部に結合され得る。当業者は、Mを分子の残部に結合する手段を認識する。例示的な方法は、本明細書中に記載される「クリック」反応を含む。
いくつかの実施形態において、Mは、蛍光部分または有色部分である。任意の蛍光部分および/または有色部分が使用され得、例えば、当該分野で公知でありかつ比色アッセイ、UVアッセイ、および/または蛍光アッセイにおいて代表的に使用されるものが、使用され得る。本発明の種々の実施形態において有用なM部分の例としては、以下が挙げられるが、これらに限定されない:キサンテン誘導体(例えば、フルオレセイン、ローダミン、オレゴングリーン、エオシンまたはテキサスレッド);シアニン誘導体(例えば、シアニン、インドカルボシアニン、オキサカルボシアニン、チアカルボシアニンまたはメロシアニン);スクアライン誘導体および環置換されたスクアライン(Seta、SeTau、およびSquare染料が挙げられる);ナフタレン誘導体(例えば、ダンシルおよびプロダン誘導体);クマリン誘導体;オキサジアゾール誘導体(例えば、ピリジルオキサゾール、ニトロベンゾオキサジアゾールまたはベンゾオキサジアゾール);アントラセン誘導体(例えば、アントラキノン(DRAQ5、DRAQ7およびCyTRAKオレンジが挙げられる));ピレン誘導体(例えば、カスケードブルー);オキサジン誘導体(例えば、ナイルレッド、ナイルブルー、クレシルバイオレット、オキサジン170);アクリジン誘導体(例えば、プロフラビン、アクリジンオレンジ、アクリジンイエロー);アリールメチン誘導体:オーラミン、クリスタルバイオレット、マラカイトグリーン;ならびにテトラピロール誘導体(例えば、ポルフィン、フタロシアニンまたはビリルビン)。他の例示的なM部分としては、以下が挙げられる:シアニン染料、キサンテート染料(例えば、Hex、Vic、Nedd、JoeまたはTet);Yakimaイエロー;Redmondレッド;tamra;テキサスレッドおよびalexa fluor(登録商標)染料。
前述のうちのいずれかのさらに他の実施形態において、Mは、3個もしくはこれより多くのアリールもしくはヘテロアリール環、またはこれらの組み合わせ、例えば、4個もしくはこれより多くのアリールもしくはヘテロアリール環、またはこれらの組み合わせ、あるいはさらには5個もしくはこれより多くのアリールもしくはヘテロアリール環、またはこれらの組み合わせを含む。いくつかの実施形態において、Mは、6個のアリールまたはヘテロアリール環、またはこれらの組み合わせを含む。さらなる実施形態において、上記環は縮合される。例えば、いくつかの実施形態において、Mは、3個もしくはこれより多くの縮合環、4個もしくはこれより多くの縮合環、5個もしくはこれより多くの縮合環、またはさらには6個もしくはこれより多くの縮合環を含む。
いくつかの実施形態において、Mは、環式である。例えば、いくつかの実施形態において、Mは、炭素環式である。他の実施形態において、Mは、複素環式である。前述のうちのさらに他の実施形態において、Mは、各存在において、独立して、アリール部分を含む。これら実施形態のうちのいくつかにおいて、上記アリール部分は、多環式である。他のより具体的な実施形態において、上記アリール部分は、縮合多環式アリール部分であり、例えば、これは、少なくとも3個、少なくとも4個、またはさらには4個より多くのアリール環を含み得る。
構造(I)、(IA)、(IB)または(I’)の前述の化合物のうちのいずれかの他の実施形態において、Mは、各存在において、独立して、少なくとも1個のヘテロ原子を含む。例えば、いくつかの実施形態において、上記ヘテロ原子は、窒素、酸素または硫黄である。
前述のうちのいずれかのさらにより多くの実施形態において、Mは、各存在において、独立して、少なくとも1個の置換基を含む。例えば、いくつかの実施形態において、上記置換基は、フルオロ、クロロ、ブロモ、ヨード、アミノ、アルキルアミノ、アリールアミノ、ヒドロキシ、スルフヒドリル、アルコキシ、アリールオキシ、フェニル、アリール、メチル、エチル、プロピル、ブチル、イソプロピル、t-ブチル、カルボキシ、スルホネート、アミド、またはホルミル基である。
前述のうちのいくつかのさらにより具体的な実施形態において、Mは、各存在において、独立して、ジメチルアミノスチルベン、キナクリドン、フルオロフェニル-ジメチル-BODIPY、his-フルオロフェニル-BODIPY、アクリジン、テリレン、セキシフェニル、ポルフィリン、ベンゾピレン、(フルオロフェニル-ジメチル-ジフルオロボラ-ジアザ-インダセン)フェニル、(ビス-フルオロフェニル-ジフルオロボラ-ジアザ-インダセン)フェニル、クアテルフェニル、ビ-ベンゾチアゾール、ター-ベンゾチアゾール、ビ-ナフチル、ビ-アントラシル、スクアライン、スクアリリウム、9,10-エチニルアントラセンまたはター-ナフチル部分である。他の実施形態において、Mは、各存在において、独立して、p-ターフェニル、ペリレン、アゾベンゼン、フェナジン、フェナントロリン、アクリジン、チオキサントレン、クリセン、ルブレン、コロネン、シアニン、ペリレンイミド、もしくはペリレンアミドまたはその誘導体である。さらにより多くの実施形態において、Mは、各存在において、独立して、クマリン染料、レゾルフィン染料、ジピロメテンボロンジフルオリド染料、ルテニウムビピリジル染料、エネルギー移動染料、チアゾールオレンジ染料、ポリメチンまたはN-アリール-1,8-ナフタルイミド染料である。
前述のうちのいずれかのさらにより多くの実施形態において、Mは、各存在において同じである。他の実施形態において、各Mは、異なる。さらにより多くの実施形態において、1個もしくはこれより多くのMは、同じであるか、または1個もしくはこれより多くのMは、異なる。
カルボン酸基を含むM部分は、上記でアニオン形態(CO2
-)で示されるが、当業者は、これが、pHに依存して変わり、そのプロトン化形態(CO2H)が種々の実施形態において含まれることを理解する。
いくつかの具体的実施形態において、上記化合物は、表2から選択される化合物である。表2の中の化合物は、実施例に記載される手順に従って調製し、それらが何であるかを質量分析法によって確認した。
*TBD=未決定
表2において、および本出願全体を通じて使用される場合、R2、R3、m、nおよびL′は、別段示されなければ、構造(I)の化合物に関して提供される定義を有し、F、F′およびF′′は、それぞれ、以下の構造:
を有するフルオレセイン部分をいう。
「dT」とは、以下の構造:
をいう。
「dT」とは、以下の構造:
いくつかの実施形態は、標的化部分(例えば、抗体)に結合体化される表2に提供される具体的化合物を含め、前述の化合物のうちのいずれかを含む。
本開示は、一般に、先の公知の化合物に対して増大した蛍光発光を有する化合物を提供する。よって、ある種の実施形態は、Y個の蛍光部分Mを含む蛍光化合物に関し、ここで上記蛍光化合物は、所定の波長の紫外線での励起の際に、同じ波長の紫外線での励起の際の1個のM部分のピーク蛍光発光よりY倍の少なくとも85%のピーク蛍光発光を有し、ここでYは、2またはこれより大きな整数である。蛍光化合物は、紫外線のような光での励起の際に、蛍光シグナルを発する化合物を含む。
いくつかの実施形態において、上記蛍光化合物は、1個のM部分のピーク蛍光発光よりY倍の少なくとも90%、Y倍の95%、Y倍の97%、またはY倍の99%のピーク蛍光発光を有する。
いくつかの実施形態において、Yは、2~100の整数、例えば、2~10である。
より具体的な実施形態において、上記蛍光化合物は、独立して、以下の構造:
のうちの1つを有する、Y個のM部分を含み、ここで
は、上記蛍光化合物への結合点を示し、上記1個のM部分は、以下の構造:
を有する。
他の実施形態において、ピーク蛍光発光は、約500~約550nmの範囲に及ぶ波長にある。
さらにより多くの実施形態において、上記蛍光化合物は、少なくとも1個のエチレンオキシド部分を含む。
請求項のいずれか1項に記載の蛍光化合物および分析物を含む組成物もまた、提供される。
本開示の化合物は、「整調可能」であり、これは、前述の化合物のうちのいずれかにおいて変数を適切に選択することによって、当業者は、所望のおよび/または所定のモル蛍光(モル明度)を有する化合物に到達し得ることを意味する。上記化合物の整調可能性は、特定のアッセイにおいて、または目的の特定の分析物を同定するために使用するために、使用者が所望の蛍光および/または色を有する化合物に容易に到達することを可能にする。全ての変数は上記化合物のモル蛍光に対して影響を有し得るが、M、L4、mおよびnの適切な選択は、上記化合物のモル蛍光において重要な役割を果たすと考えられる。よって、一実施形態において、所望のモル蛍光を有する化合物を得るための方法が提供され、上記方法は、既知の蛍光を有するM部分を選択する工程、このM部分を含む構造(I)の化合物を調製する工程、およびL4、mおよびnに関して適切な変数を選択して、所望のモル蛍光を達成する工程を包含する。
ある種の実施形態においてモル蛍光は、親発蛍光団(例えば、モノマー)の蛍光発光に対しての倍数増加または減少の点で表され得る。いくつかの実施形態において、本発明の化合物のモル蛍光は、上記親発蛍光団に対して1.1×、1.5×、2×、3×、4×、5×、6×、7×、8×、9×、10×またはさらにはより高い。種々の実施形態は、L4、mおよびnの適切な選択によって、親発蛍光団に対して蛍光の所望の倍数増加を有する化合物を調製することを包含する。
例証を容易にするために、リン部分(例えば、ホスフェートなど)を含む種々の化合物は、アニオン状態(例えば、-OPO(OH)O-、-OPO3
2-)で示される。当業者は、その電荷がpHに依存し、荷電していない(例えば、プロトン化または塩(例えば、ナトリウムもしくは他のカチオン))形態がまた、本発明の実施形態の範囲に含まれることを容易に理解する。
前述の化合物のうちのいずれかおよび1もしくはこれより多くの分析物分子(例えば、生体分子)を含む組成物は、種々の他の実施形態において提供される。いくつかの実施形態において、上記1もしくはより多くの分析物分子の検出のための分析方法でのこのような組成物の使用がまた、提供される。
さらに他の実施形態において、上記化合物は、種々の分析法において有用である。例えば、ある種の実施形態において、本開示は、サンプルを染色するための方法を提供し、上記方法は、上記サンプルに構造(I)の化合物(例えば、ここでR2またはR3のうちの一方は、分析物分子(例えば、生体分子)または微粒子への共有結合を含むリンカーであり、かつR2またはR3のうちの他方は、H、OH、アルキル、アルコキシ、アルキルエーテルまたは-OP(=Ra)(Rb)Rcである)を、上記サンプルが適切な波長で照射される場合に光学的応答を生じるために十分な量で添加する工程を包含する。
前述の方法のうちのいくつかの実施形態において、R2は、分析物分子(例えば、生体分子)への共有結合を含むリンカーである。例えば、核酸、アミノ酸またはこれらのポリマー(例えば、ポリヌクレオチドまたはポリペプチド)。さらにより多くの実施形態において、上記生体分子は、酵素、レセプター、レセプターリガンド、抗体、糖タンパク質、アプタマーまたはプリオンである。
前述の方法のうちのさらに他の実施形態において、R2、固体支持体(例えば、微粒子)への共有結合を含むリンカーである。例えば、いくつかの実施形態において、上記微粒子は、ポリマービーズまたは非ポリマービーズである。
さらにより多くの実施形態において、上記光学的応答は、蛍光応答である。
他の実施形態において、上記サンプルは、細胞を含み、いくつかの実施形態は、フローサイトメトリーによって上記細胞を観察する工程をさらに含む。
さらにより多くの実施形態において、上記方法は、上記蛍光応答を、検出可能に異なる光学的特性を有する第2の発蛍光団のものから区別する工程をさらに包含する。
他の実施形態において、本開示は、分析物分子(例えば、生体分子)を視覚的に検出するための方法を提供し、上記方法は、
(a)構造(I)の化合物(例えば、ここでR2またはR3のうちの一方は、上記分析物分子への共有結合を含むリンカーであり、かつR2またはR3のうちの他方は、H、OH、アルキル、アルコキシ、アルキルエーテルまたは-OP(=Ra)(Rb)Rcである)を提供する工程;および
(b)上記化合物をその視覚的特性によって検出する工程
を包含する。
(a)構造(I)の化合物(例えば、ここでR2またはR3のうちの一方は、上記分析物分子への共有結合を含むリンカーであり、かつR2またはR3のうちの他方は、H、OH、アルキル、アルコキシ、アルキルエーテルまたは-OP(=Ra)(Rb)Rcである)を提供する工程;および
(b)上記化合物をその視覚的特性によって検出する工程
を包含する。
いくつかの実施形態において、上記分析物分子は、核酸、アミノ酸またはこれらのポリマー(例えば、ポリヌクレオチドまたはポリペプチド)である。さらにより多くの実施形態において、上記分析物分子は、酵素、レセプター、レセプターリガンド、抗体、糖タンパク質、アプタマーまたはプリオンである。
他の実施形態において、分析物分子(例えば、生体分子)を視覚的に検出するための方法が提供され、上記方法は、
(a)前述の化合物のうちのいずれかと1もしくはこれより多くの分析物分子とを混合する工程;および
(b)上記化合物をその視覚的特性によって検出する工程
を包含する。
(a)前述の化合物のうちのいずれかと1もしくはこれより多くの分析物分子とを混合する工程;および
(b)上記化合物をその視覚的特性によって検出する工程
を包含する。
他の実施形態において、分析物分子を視覚的に検出するための方法が提供され、上記方法は、
(a)R2またはR3はQまたはQへの共有結合を含むリンカーである請求項1に記載の化合物と、上記分析物分子とを混合する工程;
(b)上記化合物および上記分析物分子の結合体を形成する工程;ならびに
(c)上記結合体を、その視覚的特性によって検出する工程、
を包含する。
(a)R2またはR3はQまたはQへの共有結合を含むリンカーである請求項1に記載の化合物と、上記分析物分子とを混合する工程;
(b)上記化合物および上記分析物分子の結合体を形成する工程;ならびに
(c)上記結合体を、その視覚的特性によって検出する工程、
を包含する。
他の例示的方法は、分析物を検出するための方法を包含し、上記方法は、
(a)R2またはR3は、分析物に対する特異性を有する標的化部分への共有結合を含むリンカーを含む構造(I)の化合物を提供する工程;
(b)上記化合物および上記分析物を混合し、それによって、上記標的化部分および上記分析物を会合させる工程;ならびに
(c)上記化合物を、例えば、その視覚的または蛍光特性によって検出する工程、
を包含する。
(a)R2またはR3は、分析物に対する特異性を有する標的化部分への共有結合を含むリンカーを含む構造(I)の化合物を提供する工程;
(b)上記化合物および上記分析物を混合し、それによって、上記標的化部分および上記分析物を会合させる工程;ならびに
(c)上記化合物を、例えば、その視覚的または蛍光特性によって検出する工程、
を包含する。
前述の方法のある種の実施形態において、分析物は、粒子(例えば、細胞)であり、上記方法は、フローサイトメトリーの使用を含む。例えば、上記化合物は、所望の細胞と選択的に会合させ、従って、任意の数の技術(例えば、視覚的または蛍光検出)によって上記細胞を検出可能にするための標的化部分(例えば、抗体)を提供される。適切な抗体は、所望の最終用途に依存して、当業者によって選択され得る。ある種の実施形態における使用のための例示的な抗体としては、UCHT1およびMOPC-21が挙げられる。
本発明の化合物の実施形態は、従って、任意の数の方法において有用性が見出され、有用性としては、以下が挙げられるが、これらに限定されない:細胞計数;細胞ソーティング;生体マーカー検出;アポトーシスを定量する;細胞生存性を決定する;細胞表面抗原を同定する;全DNAおよび/またはRNA含有量を決定する;特異的核酸配列を(例えば、核酸プローブとして)同定する;および疾患(例えば、血液のがん)を診断する。
上記の方法に加えて、構造(I)の化合物の実施形態は、種々の学問分野および方法における有用性(以下が挙げられるが、これらに限定されない:がん組織および他の組織の同定のための内視鏡検査手順における画像化;単一細胞および/または単一分子分析法、例えば、増幅がほぼないかもしくは全くないポリヌクレオチドの検出;例えば、がん細胞に優先的に結合する抗体もしくは糖または他の部分などの標的部分を構造(I)の化合物に含めることによるがんの画像化;手術手順における画像化;種々の疾患の同定のためのヒストンの結合;例えば、構造(I)の化合物におけるM部分を活性薬物部分で置き換えることによる薬物送達;ならびに/あるいは例えば、種々の叢および/または生物への構造(I)の化合物の優先的結合による歯科作業および他の手順における造影剤)が見出される。
構造(I)の化合物のうちの任意の実施形態(上で示されるとおり)ならびに構造(I)の化合物においてR1、R2、R3、R4、R5、L’、L1、L2、L3、L4、M、mおよび/またはnの変数について本明細書で示される任意の具体的選択(上で示されるとおり)は、独立して、構造(I)の化合物の他の実施形態および/または変数と組み合わされて、上では具体的には示されない本発明の実施形態を形成し得ることは理解される。さらに、選択肢のリストが、特定の実施形態および/または請求項における任意の特定のR1、R2、R3、R4、R5、L’、L1、L2、L3、L4、M、mおよび/またはnの変数に関して列挙される場合において、各個々の選択は、上記特定の実施形態および/または請求項から削除され得ること、ならびにその残りの選択の列挙は、本発明の範囲内にあると考えられることは、理解される。
本明細書において、示される式の置換基および/または変数の組み合わせは、このような寄与が安定な化合物を生じる場合にのみ許容可能であることは、理解される。
本明細書で記載されるプロセスにおいて、中間体化合物の官能基が、適切な保護基によって保護される必要があり得ることはまた、当業者によって認識される。このような官能基としては、ヒドロキシ、アミノ、メルカプトおよびカルボン酸が挙げられる。ヒドロキシの適切な保護基としては、トリアルキルシリルまたはジアリールアルキルシリル(例えば、t-ブチルジメチルシリル、t-ブチルジフェニルシリルまたはトリメチルシリル)、テトラヒドロピラニル、ベンジルなどが挙げられる。アミノ、アミジノおよびグアニジノの適切な保護基としては、t-ブトキシカルボニル、ベンジルオキシカルボニルなどが挙げられる。メルカプトの適切な保護基としては、-C(O)-R”(ここでR”は、アルキル、アリールまたはアリールアルキルである)、p-メトキシベンジル、トリチルなどが挙げられる。カルボン酸の適切な保護基としては、アルキル、アリールまたはアリールアルキルエステルが挙げられる。保護基は、当業者に公知でありかつ本明細書で記載されるとおりである標準的技術に従って付加または除去され得る。保護基の使用は、Green, T.W. and P.G.M. Wutz、Protective Groups in Organic Synthesis(1999)、3rd Ed., Wileyに詳細に記載される。当業者が認識するように、上記保護基はまた、ポリマー樹脂(例えば、Wang樹脂、Rink樹脂または2-クロロトリチル-クロリド樹脂)であり得る。
さらに、遊離塩基または酸形態で存在する全ての本発明の化合物は、当業者に公知の方法による適切な無機塩基もしくは有機塩基または無機酸もしくは有機酸での処理によって、それらの塩に変換され得る。本発明の化合物の塩は、標準的技術によってそれらの遊離塩基形態または遊離酸形態へと変換され得る。
以下の反応スキームは、本発明の化合物を作製するための例示的方法を例証する。当業者がこれら化合物を類似の方法によってまたは当業者に公知の他の方法を組み合わせることによって作製する能力があり得ることは、理解される。当業者が以下に記載されるのと類似の様式で、適切な出発構成要素を使用し、必要な場合には、合成のパラメーターを改変することによって、以下で具体的に例証されない構造(I)の他の化合物を作製し得ることもまた、理解される。一般に、出発構成要素は、Sigma Aldrich、Lancaster Synthesis, Inc.、Maybridge、Matrix Scientific、TCI、およびFluorochem USAなどのような供給源から得られ得るか、または当業者に公知の出典に従って合成され得る(例えば、Advanced Organic Chemistry: Reactions, Mechanisms, and Structure、5th edition(Wiley, December 2000)を参照のこと)か、または本発明において記載されるとおり調製され得る。
反応スキームI
反応スキームI
反応スキームIは、構造(I)の化合物(ここでR1、L2、L3およびMは、上記で定義されるとおりであり、R2およびR3は、上記で定義されるとおりであるかまたはこれらの保護された改変体であり、そしてLは選択肢的なリンカーである)の調製のために有用な中間体を調製するための例示的方法を例証する。反応スキーム1を参照すると、構造aの化合物は、購入され得るかまたは当業者に周知の方法によって調製され得る。M-X(ここでxは、ブロモのようなハロゲンである)との、当該分野で公知の鈴木カップリング条件下での反応は、構造bの化合物を生じる。構造bの化合物を、以下で記載されるように構造(I)の化合物の調製のために使用し得る。
反応スキームII
反応スキームII
反応スキームIIは、構造(I)の化合物の調製に有用な中間体を調製するための代替法を例証する。反応スキームII(ここでR1、L1、L2、L3、GおよびMは上記で定義されるとおりであり、そしてR2およびR3は、上記で定義されるとおりであるかまたはその保護された改変体である)を参照すると、構造cの化合物(これは、購入され得るかまたは周知の技術によって調製され得る)をM-G’と反応させて、構造dの化合物を得る。ここでGおよびG’は、相補的反応性を有する官能基(すなわち、反応して共有結合を形成する官能基)を表す。G’は、Mへのペンダントであり得るかまたはMの構造的骨格の一部であり得る。GおよびG’は、任意の数の本明細書中に記載される官能基、例えば、それぞれアルキンおよびアジド、それぞれアミンおよび活性化エステル、またはそれぞれアミンおよびイソチオシアネート、などであり得る。
構造(I)の化合物は、周知の自動化DNA合成条件下での以下の構造(e):
を有するホスホロアミダイト化合物(ここでAは、本明細書で定義されるとおりであり、各Lは、独立して、選択肢的なリンカーである)との反応によって、構造bまたはdのうちの一方から調製され得る。
DNA合成法は、当該分野で周知である。簡潔には、2個のアルコール基(例えば、上記の中間体bまたはdの中のR2およびR3)は、それぞれ、ジメトキシトリチル(DMT)基および2-シアノエチル-N,N-ジイソプロピルアミノホスホロアミダイト基で官能化される。上記ホスホロアミダイト基は、代表的には、テトラゾールのような活性化因子の存在下でアルコール基にカップリングされ、続いて、ヨウ素でリン原子の酸化が行われる。上記ジメトキシトリチル基は、酸(例えば、クロロ酢酸)で除去されて、遊離アルコールを露出させ得、これは、ホスホロアミダイト基と反応させられ得る。この2-シアノエチル基は、水性アンモニアでの処理によるオリゴマー化の後に除去され得る。
上記オリゴマー化方法において使用されるホスホロアミダイトの調製もまた、当該分野で周知である。例えば、一級アルコール(例えば、R3)は、DMT-Clとの反応によって、DMT基として保護され得る。次いで、二級アルコール(例えば、R2)は、2-シアノエチルN,N-ジイソプロピルクロロホスホロアミダイトのような適切な試薬との反応によってホスホロアミダイトとして官能化される。ホスホロアミダイトの調製およびそれらのオリゴマー化の方法は、当該分野で周知であり、実施例の中でより詳細に記載される。
構造(I)の化合物は、上記の周知のホスホロアミダイト化学に従って、中間体bまたはdおよびeのオリゴマー化によって調製される。mおよびn個の反復ユニットの所望の数が、ホスホロアミダイトカップリングを所望の回数反復することによって、その分子へと組み込まれる。構造(II)の化合物が、以下に記載されるように、類似の方法によって調製され得ることは、理解される。
種々の他の実施形態において、構造(I)の化合物の調製に有用な化合物が提供される。それらの化合物は、モノマー、ダイマーおよび/またはオリゴマーの形態において上記のように調製され得、次いで、M部分は、構造(I)の化合物を形成するために、任意の回数の合成方法論(例えば、上記の「クリック」反応)を介してその化合物に共有結合され得る。よって、種々の実施形態において、以下の構造(II):
を有する化合物またはその立体異性体、塩もしくは互変異性体が提供され、ここで:
Gは、各存在において、独立して、相補的反応性基と共有結合を形成できる反応性基またはその保護されたアナログを含む部分であり;
L1a、L2およびL3は、各存在において、独立して、選択肢的なアルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、ヘテロアルケニレン、ヘテロアルキニレンもしくはヘテロ原子リンカーであり;
L4は、各存在において、独立して、長さが3原子より大きいヘテロアルキレン、ヘテロアルケニレンまたはヘテロアルキニレンリンカーであり、ここで上記ヘテロアルキレン、ヘテロアルケニレンおよびヘテロアルキニレンリンカーの中のヘテロ原子は、O、NおよびSから選択され;
R1は、各存在において、独立して、H、アルキルまたはアルコキシであり;
R2およびR3は、各々独立して、H、OH、SH、アルキル、アルコキシ、アルキルエーテル、ヘテロアルキル、-OP(=Ra)(Rb)Rc、QまたはL’であり;
R4は、各存在において、独立して、OH、SH、O-、S-、ORdまたはSRdであり;
R5は、各存在において、独立して、オキソ、チオキソまたは非存在であり;
Raは、OまたはSであり;
Rbは、OH、SH、O-、S-、ORdまたはSRdであり;
Rcは、OH、SH、O-、S-、ORd、OL’、SRd、アルキル、アルコキシ、アルキルエーテル、アルコキシアルキルエーテル、ホスフェート、チオホスフェート、ホスホアルキル、チオホスホアルキル、ホスホアルキルエーテルまたはチオホスホアルキルエーテルであり;
Rdは、対イオンであり;
Qは、各存在において、独立して、分析物分子、標的化部分、固体支持体または相補的反応性基Q′と共有結合を形成できる反応性基またはその保護されたアナログを含む部分であり;
L’は、各存在において、独立して、Qへの共有結合を含むリンカー、標的化部分への共有結合を含むリンカー、分析物分子への共有結合を含むリンカー、固体支持体への共有結合を含むリンカー、固体支持体残基への共有結合を含むリンカー、ヌクレオシドへの共有結合を含むリンカーまたは構造(II)のさらなる化合物への共有結合を含むリンカーであり;
mは、各存在において、独立して、0またはこれより大きな整数であるが、ただしmの少なくとも1個の存在は、1またはこれより大きな整数であり;そして
nは、1またはこれより大きな整数である。
Gは、各存在において、独立して、相補的反応性基と共有結合を形成できる反応性基またはその保護されたアナログを含む部分であり;
L1a、L2およびL3は、各存在において、独立して、選択肢的なアルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、ヘテロアルケニレン、ヘテロアルキニレンもしくはヘテロ原子リンカーであり;
L4は、各存在において、独立して、長さが3原子より大きいヘテロアルキレン、ヘテロアルケニレンまたはヘテロアルキニレンリンカーであり、ここで上記ヘテロアルキレン、ヘテロアルケニレンおよびヘテロアルキニレンリンカーの中のヘテロ原子は、O、NおよびSから選択され;
R1は、各存在において、独立して、H、アルキルまたはアルコキシであり;
R2およびR3は、各々独立して、H、OH、SH、アルキル、アルコキシ、アルキルエーテル、ヘテロアルキル、-OP(=Ra)(Rb)Rc、QまたはL’であり;
R4は、各存在において、独立して、OH、SH、O-、S-、ORdまたはSRdであり;
R5は、各存在において、独立して、オキソ、チオキソまたは非存在であり;
Raは、OまたはSであり;
Rbは、OH、SH、O-、S-、ORdまたはSRdであり;
Rcは、OH、SH、O-、S-、ORd、OL’、SRd、アルキル、アルコキシ、アルキルエーテル、アルコキシアルキルエーテル、ホスフェート、チオホスフェート、ホスホアルキル、チオホスホアルキル、ホスホアルキルエーテルまたはチオホスホアルキルエーテルであり;
Rdは、対イオンであり;
Qは、各存在において、独立して、分析物分子、標的化部分、固体支持体または相補的反応性基Q′と共有結合を形成できる反応性基またはその保護されたアナログを含む部分であり;
L’は、各存在において、独立して、Qへの共有結合を含むリンカー、標的化部分への共有結合を含むリンカー、分析物分子への共有結合を含むリンカー、固体支持体への共有結合を含むリンカー、固体支持体残基への共有結合を含むリンカー、ヌクレオシドへの共有結合を含むリンカーまたは構造(II)のさらなる化合物への共有結合を含むリンカーであり;
mは、各存在において、独立して、0またはこれより大きな整数であるが、ただしmの少なくとも1個の存在は、1またはこれより大きな整数であり;そして
nは、1またはこれより大きな整数である。
構造(II)の他の実施形態において:
Gは、各存在において、独立して、相補的反応性基と共有結合を形成できる反応性基を含む部分であり;
L1a、L2およびL3は、各存在において、独立して、選択肢的なアルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、ヘテロアルケニレン、ヘテロアルキニレンもしくはヘテロ原子リンカーであり;
L4は、各存在において、独立して、長さが3原子より大きいヘテロアルキレン、ヘテロアルケニレンまたはヘテロアルキニレンリンカーであり、ここで上記ヘテロアルキレン、ヘテロアルケニレンおよびヘテロアルキニレンリンカーの中のヘテロ原子は、O、NおよびSから選択され;
R1は、各存在において、独立して、H、アルキルまたはアルコキシであり;
R2およびR3は、各々独立して、H、OH、SH、アルキル、アルコキシ、アルキルエーテル、-OP(=Ra)(Rb)Rc、Q、Qへの共有結合を含むリンカー、分析物分子への共有結合を含むリンカー、固体支持体への共有結合を含むリンカーまたは構造(II)のさらなる化合物への共有結合を含むリンカーであり、ここで:Raは、OまたはSであり;Rbは、OH、SH、O-、S-、ORdまたはSRdであり;Rcは、OH、SH、O-、S-、ORd、SRd、アルキル、アルコキシ、アルキルエーテル、アルコキシアルキルエーテル、ホスフェート、チオホスフェート、ホスホアルキル、チオホスホアルキル、ホスホアルキルエーテルまたはチオホスホアルキルエーテルであり;そしてRdは、対イオンであり;
R4は、各存在において、独立して、OH、SH、O-、S-、ORdまたはSRdであり;
R5は、各存在において、独立して、オキソ、チオキソまたは非存在であり;
Qは、各存在において、独立して、分析物分子、固体支持体または相補的反応性基Q′と共有結合を形成できる反応性基を含む部分であり;
mは、各存在において、独立して、0またはこれより大きな整数であるが、ただしmの少なくとも1個の存在は、1またはこれより大きな整数であり;そして
nは、1またはこれより大きな整数である。
Gは、各存在において、独立して、相補的反応性基と共有結合を形成できる反応性基を含む部分であり;
L1a、L2およびL3は、各存在において、独立して、選択肢的なアルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、ヘテロアルケニレン、ヘテロアルキニレンもしくはヘテロ原子リンカーであり;
L4は、各存在において、独立して、長さが3原子より大きいヘテロアルキレン、ヘテロアルケニレンまたはヘテロアルキニレンリンカーであり、ここで上記ヘテロアルキレン、ヘテロアルケニレンおよびヘテロアルキニレンリンカーの中のヘテロ原子は、O、NおよびSから選択され;
R1は、各存在において、独立して、H、アルキルまたはアルコキシであり;
R2およびR3は、各々独立して、H、OH、SH、アルキル、アルコキシ、アルキルエーテル、-OP(=Ra)(Rb)Rc、Q、Qへの共有結合を含むリンカー、分析物分子への共有結合を含むリンカー、固体支持体への共有結合を含むリンカーまたは構造(II)のさらなる化合物への共有結合を含むリンカーであり、ここで:Raは、OまたはSであり;Rbは、OH、SH、O-、S-、ORdまたはSRdであり;Rcは、OH、SH、O-、S-、ORd、SRd、アルキル、アルコキシ、アルキルエーテル、アルコキシアルキルエーテル、ホスフェート、チオホスフェート、ホスホアルキル、チオホスホアルキル、ホスホアルキルエーテルまたはチオホスホアルキルエーテルであり;そしてRdは、対イオンであり;
R4は、各存在において、独立して、OH、SH、O-、S-、ORdまたはSRdであり;
R5は、各存在において、独立して、オキソ、チオキソまたは非存在であり;
Qは、各存在において、独立して、分析物分子、固体支持体または相補的反応性基Q′と共有結合を形成できる反応性基を含む部分であり;
mは、各存在において、独立して、0またはこれより大きな整数であるが、ただしmの少なくとも1個の存在は、1またはこれより大きな整数であり;そして
nは、1またはこれより大きな整数である。
構造(II)の化合物中のG部分は、M部分上の相補的基と共有結合を形成するための適切な反応性基を有する基を含む任意の部分から選択され得る。例示的な実施形態において、そのG部分は、本明細書で記載されるQ部分のうちのいずれか(表1に提供される具体例が挙げられる)から選択され得る。いくつかの実施形態において、Gは、各存在において、独立して、トリアゾールを形成するアジドおよびアルキンの銅触媒性反応(ヒュスゲン1,3-双極環化付加反応)、ジエンおよびジエノフィルの反応(ディールス-アルダー)、歪み促進性アルキン-ニトロン環化付加、歪みアルケンと、アジド、テトラジンまたはテトラゾールの反応、アルケンおよびアジドの[3+2]環化付加、アルケンおよびテトラジン逆電子要請型ディールス-アルダー、アルケンおよびテトラゾール光化学反応、ならびに種々の置換反応(例えば、求電子性原子に対する求核攻撃による脱離基の置換)が挙げられる反応に適切な部分を含む。
いくつかの実施形態において、Gは、各存在において、独立して、アルデヒド、オキシム、ヒドラゾン、アルキン、アミン、アジド、アシルアジド、アシルハライド、ニトリル、ニトロン、スルフヒドリル、ジスルフィド、スルホニルハライド、イソチオシアネート、イミドエステル、活性化エステル、ケトン、α,β-不飽和カルボニル、アルケン、マレイミド、α-ハロイミド、エポキシド、アジリジン、テトラジン、テトラゾール、ホスフィン、ビオチンまたはチイラン官能基を含む部分である。
他の実施形態において、Gは、各存在において、独立して、アルキンまたはアジド基を含む。他の実施形態において、Gは、各存在において、独立して、アミノ、イソチオシアネートまたは活性化エステル基を含む。異なる実施形態において、Gは、各存在において、独立して、相補的反応性基との反応に際して、アルケン、エステル、アミド、チオエステル、ジスルフィド、カルボン酸基、複素環式またはヘテロアリール基を含む官能基を形成し得る反応性基を含む。例えば、いくつかの実施形態において、ヘテロアリールは、トリアゾリルである。
構造(II)の化合物の種々の他の実施形態において、L2およびL3は、各存在において、独立して、C1-C6アルキレン、C2-C6アルケニレンまたはC2-C6アルキニレンである。
構造(II)の他の実施形態において、各L1aは、非存在である。他の実施形態において、各L1aは存在し、例えば、L1aは、各存在において、独立して、ヘテロアルキレンである。ある種の実施形態において、L1aは、以下の構造:
を有する。
構造(IIA)の化合物の種々の実施形態において、x1、x2、x3またはx4のうちの少なくとも1個の存在は、1である。他の実施形態において、x1、x2、x3およびx4は、各存在において、各々1である。他の実施形態において、x1およびx3は、各存在において、各々0である。いくつかの実施形態において、x2およびx4は、各存在において、各々1である。さらに他の実施形態において、x1およびx3は、各存在において、各々0であり、x2およびx4は、各存在において、各々1である。
構造(II)または(IIA)の化合物のいくつかの他の実施形態において、L4は、各存在において、独立して、ヘテロアルキレンリンカーである。他のより具体的な実施形態において、L4は、各存在において、独立して、アルキレンオキシドリンカーである。例えば、いくつかの実施形態において、L4は、ポリエチレンオキシドであり、その化合物は、以下の構造(IB):
を有し、ここでzは、2~100の整数、例えば、3~6の整数である。
他の実施形態において、R4は、各存在において、独立して、OH、O-またはORdであり、異なる実施形態において、R5は、各存在において、オキソである。
構造(II)または(IIa)の前述の化合物のうちのいずれかのいくつかの異なる実施形態において、R1は、Hである。
構造(II)の化合物の他の種々の実施形態において、R2およびR3は、各々独立して、OHまたは-OP(=Ra)(Rb)Rcである。いくつかの異なる実施形態において、R2またはR3は、OHまたは-OP(=Ra)(Rb)Rcであり、R2またはR3の他方は、QまたはQへの共有結合を含むリンカーである。
構造(II)の前述の化合物のうちのいずれかのさらにより異なる実施形態において、R2およびR3は、各々独立して、-OP(=Ra)(Rb)Rcである。これらの実施形態のうちのいくつかにおいて、Rcは、OL’である。
構造(II)の他の実施形態において、R2およびR3は、各々独立して、-OP(=Ra)(Rb)OL’であり、L’は、Q、標的化部分、分析物(例えば、分析物分子)、固体支持体、固体支持体残基、ヌクレオシドまたは構造(II)のさらなる化合物への、ヘテロアルキレンリンカーである。
リンカーL’は、Q、標的化部分、分析物(例えば、分析物分子)、固体支持体、固体支持体残基、ヌクレオシドまたは構造(II)のさらなる化合物を、構造(II)の化合物に結合するために適した任意のリンカーであり得る。有利なことには、ある種の実施形態は、化合物の水溶性を増大または最適化するために選択されるL’部分の使用を含む。いくつかのある種の実施形態において、L’は、アルキレンオキシドもしくはホスホジエステル部分、またはこれらの組み合わせを含む。
ある種の実施形態において、L’は、以下の構造:
を有し、ここで:
m”およびn”は、独立して、1~10の整数であり;
Reは、H、電子対または対イオンであり;
L”は、Reもしくは直接結合であるか、またはQ、標的化部分、分析物(例えば、分析物分子)、固体支持体、固体支持体残基、ヌクレオシドまたは構造(II)のさらなる化合物への、連結である。
m”およびn”は、独立して、1~10の整数であり;
Reは、H、電子対または対イオンであり;
L”は、Reもしくは直接結合であるか、またはQ、標的化部分、分析物(例えば、分析物分子)、固体支持体、固体支持体残基、ヌクレオシドまたは構造(II)のさらなる化合物への、連結である。
前述の実施形態のうちのある種のものにおいて、標的化部分は、抗体または細胞表面レセプターアンタゴニストである。
構造(II)の化合物のある種の実施形態は、オリゴヌクレオチドの調製に関して当該分野で公知のものに類似である固相合成法に従って調製され得る。よって、いくつかの実施形態において、L’は、固体支持体、固体支持体残基またはヌクレオシドへの連結である。活性化デオキシチミジン(dT)基を含む固体支持体は、容易に入手可能であり、いくつかの実施形態において、構造(II)の化合物の調製のための出発物質として使用され得る。よって、いくつかの実施形態において、R2またはR3は、以下の構造:
構造(II)の化合物のさらに他の実施形態において、Qは、各存在において、独立して、分析物分子または固体支持体と共有結合を形成し得る反応性基を含む部分である。他の実施形態において、Qは、各存在において、独立して、相補的反応性基Q′と共有結合を形成し得る反応性基を含む部分である。例えば、いくつかの実施形態において、Q′は、構造(II)のさらなる化合物の上に(例えば、R2位またはR3位に)存在し、QおよびQ′は、構造(II)の化合物および構造(II)のさらなる化合物の反応が、構造(II)の化合物の共有結合されたダイマーを生じるように、相補的反応性基を含む。構造(II)のマルチマー化合物はまた、類似の様式で調製され得、本発明の実施形態の範囲内に含まれる。
Q基のタイプおよび構造(II)の化合物の残部へのQ基の結合性は、Qが、所望の結合を形成するために適切な反応性を有する部分を含むことを条件として、限定されない。
構造(II)の化合物のある種の実施形態において、Qは、水性条件下で加水分解されにくいが、分析物分子または固体支持体上の対応する基(例えば、アミン、アジドまたはアルキン)との結合を形成するために十分に反応性である部分である。
構造(II)の化合物のある種の実施形態は、生体接合反応の分野において一般に使用されるQ基を含む。例えば、いくつかの実施形態において、Qは、求核性反応性基、求電子性反応性基または環化付加反応性基を含む。いくつかのより具体的な実施形態において、Qは、スルフヒドリル、ジスルフィド、活性化エステル、イソチオシアネート、アジド、アルキン、アルケン、ジエン、ジエノフィル、酸ハライド、スルホニルハライド、ホスフィン、α-ハロアミド、ビオチン、アミノまたはマレイミド官能基を含む。いくつかの実施形態において、活性化エステルは、N-スクシンイミドエステル、イミドエステルまたはポリフルオロフェニルエステルである。他の実施形態において、アルキンは、アルキルアジドまたはアシルアジドである。
構造(II)の化合物の例示的なQ部分は、上記の表Iに提供される。
構造(I)の化合物と同様に、QはSHである構造(II)の化合物のいくつかの実施形態において、SH部分は、構造(II)の別の化合物上の別のスルフヒドリル基とジスルフィド結合を形成する傾向にある。よって、いくつかの実施形態は、ジスルフィドダイマーの形態にある構造(II)の化合物を含み、そのジスルフィド結合は、SH Q基に由来する。
構造(II)の化合物のいくつかの他の実施形態において、R2またはR3のうちの一方は、OHまたは-OP(=Ra)(Rb)Rcであり、R2またはR3のうちの他方は、分析物への共有結合を含むリンカー、標的化部分への共有結合を含むリンカー、または固体支持体への共有結合を含むリンカーである。例えば、いくつかの実施形態において、分析物分子は、核酸、アミノ酸またはこれらのポリマーである。他の実施形態において、分析物は、酵素、レセプター、レセプターリガンド、抗体、糖タンパク質、アプタマーまたはプリオンである。いくつかの実施形態において、標的化部分は、抗体または細胞表面レセプターアンタゴニストである。さらに異なる実施形態において、固体支持体は、ポリマービーズまたは非ポリマービーズである。
構造(II)の化合物の他の実施形態において、mは、各存在において、独立して、1~10の整数である。例えば、いくつかの実施形態において、mは、各存在において、独立して、1~5の整数、例えば、1、2、3、4または5である。いくつかの実施形態において、mは、1である。いくつかの実施形態において、mは、2である。いくつかの実施形態において、mは、3である。いくつかの実施形態において、mは、4である。いくつかの実施形態において、mは、5である。
構造(II)の化合物のなお異なる実施形態において、nは、1~100の整数である。例えば、いくつかの実施形態において、nは、1~10の整数である。いくつかの実施形態において、nは、1である。いくつかの実施形態において、nは、2である。いくつかの実施形態において、nは、3である。いくつかの実施形態において、nは、4である。いくつかの実施形態において、nは、5である。いくつかの実施形態において、nは、6である。いくつかの実施形態において、nは、7である。いくつかの実施形態において、nは、8である。いくつかの実施形態において、nは、9である。いくつかの実施形態において、nは、10である。
種々の実施形態において、表3の化合物の中のGは、アルキニル(例えば、エチニル)である。他の実施形態において、表3の化合物の中のGは、アジドである。他の実施形態において、表3の化合物の中のGは、アミノ(NH2)である。他の実施形態において、表3の化合物の中のGは、イソチオシアネートである。他の実施形態において、表3の化合物の中のGは、活性化エステル(例えば、N-ヒドロキシスクシンイミドのエステル)である。
構造(II)の化合物は、種々の方法において使用され得、例えば、実施形態では、分析物(例えば、分析物分子)、または標的化部分を標識するための方法が提供され、上記方法は、
(a)R2またはR3はQまたはQへの共有結合を含むリンカーである構造(I)の記載される化合物のうちのいずれかと、上記分析物分子とを混合する工程;
(b)上記化合物および上記分析物分子の結合体を形成する工程;ならびに
(c)上記結合体と式M-L1b-G′の化合物とを反応させ、それによって、少なくとも1個のGおよび少なくとも1個のG′の反応によって少なくとも1個の共有結合を形成する工程、
を包含し、ここで:
Mは、2個またはこれより多くの炭素-炭素二重結合および少なくとも1の共役度を含む部分であり;
L1bは、選択肢的なアルキレン、ヘテロアルキレンまたはヘテロ原子リンカーであり;そして
G′は、Gに対する相補的反応性基である。
異なる実施形態は、分析物、例えば、分析物分子または標的化部分を標識するための方法であり、上記方法は、
(a)R2またはR3はQまたはQへの共有結合を含むリンカーである本明細書で開示される構造(II)の化合物のうちのいずれかと、式M-L1b-G′の化合物とを混合し、それによって、GおよびG′の反応によって少なくとも1個の共有結合を形成する工程;ならびに
(b)工程(A)の生成物と上記分析物または標的化部分とを反応させ、それによって、工程(A)の生成物および上記分析物分子の結合体を形成する工程、
を包含し、ここで:
Mは、2個またはこれより多くの炭素-炭素二重結合および少なくとも1の共役度を含む部分であり;
L1bは、選択肢的なアルキレン、ヘテロアルキレンまたはヘテロ原子リンカーであり;そして
G′は、Gに対する相補的反応性リンカーである。
(a)R2またはR3はQまたはQへの共有結合を含むリンカーである構造(I)の記載される化合物のうちのいずれかと、上記分析物分子とを混合する工程;
(b)上記化合物および上記分析物分子の結合体を形成する工程;ならびに
(c)上記結合体と式M-L1b-G′の化合物とを反応させ、それによって、少なくとも1個のGおよび少なくとも1個のG′の反応によって少なくとも1個の共有結合を形成する工程、
を包含し、ここで:
Mは、2個またはこれより多くの炭素-炭素二重結合および少なくとも1の共役度を含む部分であり;
L1bは、選択肢的なアルキレン、ヘテロアルキレンまたはヘテロ原子リンカーであり;そして
G′は、Gに対する相補的反応性基である。
異なる実施形態は、分析物、例えば、分析物分子または標的化部分を標識するための方法であり、上記方法は、
(a)R2またはR3はQまたはQへの共有結合を含むリンカーである本明細書で開示される構造(II)の化合物のうちのいずれかと、式M-L1b-G′の化合物とを混合し、それによって、GおよびG′の反応によって少なくとも1個の共有結合を形成する工程;ならびに
(b)工程(A)の生成物と上記分析物または標的化部分とを反応させ、それによって、工程(A)の生成物および上記分析物分子の結合体を形成する工程、
を包含し、ここで:
Mは、2個またはこれより多くの炭素-炭素二重結合および少なくとも1の共役度を含む部分であり;
L1bは、選択肢的なアルキレン、ヘテロアルキレンまたはヘテロ原子リンカーであり;そして
G′は、Gに対する相補的反応性リンカーである。
さらに、上記で注記されるように、構造(II)の化合物は、構造(I)の化合物を調製するために有用である。よって、一実施形態において、構造(I)の化合物を調製するための方法が提供され、上記方法は、構造(II)の化合物と式M-L1b-G′の化合物とを混合し、それによって、GおよびG′の反応によって少なくとも1個の共有結合を形成する工程を包含し、ここで:
Mは、2個またはこれより多くの炭素-炭素二重結合および少なくとも1の共役度を含む部分であり;
L1bは、選択肢的なアルキレン、ヘテロアルキレンまたはヘテロ原子リンカーであり;そして
G′は、Gに対する相補的反応性リンカーである。
Mは、2個またはこれより多くの炭素-炭素二重結合および少なくとも1の共役度を含む部分であり;
L1bは、選択肢的なアルキレン、ヘテロアルキレンまたはヘテロ原子リンカーであり;そして
G′は、Gに対する相補的反応性リンカーである。
以下の実施例は、例証目的で提供されるのであって、限定目的で提供されるのではない。
一般的方法
質量分析を、Waters/Micromass QuattroマイクロMS/MSシステムで(MSのみモードで)、MassLynx 4.1獲得ソフトウェアを使用して行った。染料に関してLC/MSに使用した移動相は、100mM 1,1,1,3,3,3-ヘキサフルオロ-2-プロパノール(HFIP)、8.6mM トリエチルアミン(TEA)、pH8であった。ホスホロアミダイトおよび前駆体分子をまた、アセトニトリル/水移動相勾配を使用して、45℃において保持した2.1mm×50mm Acquity BEH-C18カラムを備えたWaters Acquity UHPLCシステムを使用して、分析した。モノマー中間体の分子量を、Waters/Micromass Quattro micro MS/MSシステム(MSのみモードで)でのトロピリウムカチオン注入増強イオン化(tropylium cation infusion enhanced ionization)を使用して得た。励起および発光プロフィール実験を、Cary Eclipse分光光度計で記録した。
質量分析を、Waters/Micromass QuattroマイクロMS/MSシステムで(MSのみモードで)、MassLynx 4.1獲得ソフトウェアを使用して行った。染料に関してLC/MSに使用した移動相は、100mM 1,1,1,3,3,3-ヘキサフルオロ-2-プロパノール(HFIP)、8.6mM トリエチルアミン(TEA)、pH8であった。ホスホロアミダイトおよび前駆体分子をまた、アセトニトリル/水移動相勾配を使用して、45℃において保持した2.1mm×50mm Acquity BEH-C18カラムを備えたWaters Acquity UHPLCシステムを使用して、分析した。モノマー中間体の分子量を、Waters/Micromass Quattro micro MS/MSシステム(MSのみモードで)でのトロピリウムカチオン注入増強イオン化(tropylium cation infusion enhanced ionization)を使用して得た。励起および発光プロフィール実験を、Cary Eclipse分光光度計で記録した。
全ての反応を、別段述べられなければ、窒素雰囲気下でオーブン乾燥したガラス器具の中で行った。市販のDNA合成試薬を、Glen Research(Sterling, VA)から購入した。無水ピリジン、トルエン、ジクロロメタン、ジイソプロピルエチルアミン、トリエチルアミン、酢酸、ピリジン、およびTHFを、Aldrichから購入した。全ての他の化学物質を、AldrichまたはTCIから購入し、さらに精製せずにそのまま使用した。
実施例1
エチレングリコールスペーサーを有する染料の合成
エチレンオキシドリンカーを有する化合物を、以下のように調製した:
エチレングリコールスペーサーを有する染料の合成
エチレンオキシドリンカーを有する化合物を、以下のように調製した:
オリゴフルオロシド(oligofluoroside)構築物(すなわち、構造(I)の化合物)を、1μmolスケールで、Applied Biosystems 394 DNA/RNA合成機で合成し、3’-ホスフェート基または3’-S2-(CH2)6-OH基または本明細書で記載される他の基のうちのいずれかを有した。合成を、CPGビーズまたはポリスチレン固体支持体上で、標準的なホスホロアミダイト化学(phopshoporamadite chemistry)を使用して直接実施した。そのオリゴフルオロシドを、3’から5’方向に、標準的固相DNA法および標準的なβ-シアノエチルホスホロアミダイト化学を使用したカップリングで合成した。フルオロシドホスホロアミダイトおよびスペーサー(例えば、ヘキサエチルオキシ-グリコールホスホロアミダイト、トリエチルオキシ-グリコールホスホロアミダイト、ポリエチレングリコールホスホロアミダイト)およびリンカー(例えば、5’-アミノ-モディファイアーホスホロアミダイトおよびチオール-モディファイアーS2ホスホロアミダイト)を、アセトニトリル中に溶解して、0.1M溶液を作製し、以下の合成サイクルを使用して、連続順序で添加した:1)ジクロロメタン中でのジクロロ酢酸での5’-ジメトキシトリチル保護基の除去、2)アセトニトリル中で活性化因子での次のホスホロアミダイトとのカップリング、3)ヨウ素/ピリジン/水で安定なP(v)を形成するためのP(III)の酸化、および4)無水酢酸/1-メチルイミダゾール(1-methylimidizole)/アセトニトリルでの任意の未反応5’-ヒドロキシル基のキャップ形成。合成サイクルを、全長オリゴフルオロシド構築物がアセンブリされるまで反復した。鎖アセンブリの最後に、上記モノメトキシトリチル(MMT)基またはジメトキシトリチル(DMT)基を、ジクロロメタン中のジクロロ酢酸で除去した。
その化合物を、ラベル付きエッペンドルフチューブの中で0.2μmolスケールにおいて、孔制御ガラス(controlled-pore glass)(CPG)支持体上に提供した。400μLの20~30% NH4OHを添加し、穏やかに混合した。開いたチューブを、55℃において約5分間、または過剰なガスが放出されるまで置き、次いで、チューブをきつく閉め、2時間(±15分)インキュベートした。チューブを、加熱ブロックから取り出し、室温に達するようにし、続いて、13,400RPMで30秒間の遠心分離を行って、その上清および固体を固めた。上清を注意深く除去し、ラベル付きチューブに入れ、次いで、150μLアセトニトリルを添加して、支持体を洗浄した。洗浄物をそのチューブに添加した後、それらを、乾燥するまで40℃のCentriVap装置の中に入れた。
その生成物を、ESI-MS(表2を参照のこと)、UV吸光度、および蛍光分光法によって特徴付けた。
実施例2
化合物のスペクトル試験
化合物のスペクトル試験
乾燥させた化合物を、150μLの0.1M Na2CO3緩衝液中で再構成して、約1mMストックを作製した。その濃ストックを、0.1×PBS中で50×希釈し、NanoDrop UV分光計で分析して、吸光度記録を得た。吸光度記録を、吸光係数(各FAMユニットに関して75,000M-1 cm-1)およびベールの法則とともに使用して、そのストックの実際の濃度を決定した。
その計算したストック濃度から、約4mLの5μM溶液を、0.1M Na2CO3(pH9)中で作製し、1×1cm石英キュベット中、300nm~700nmのスペクトル範囲を使用してCary 60 UV分光計で分析して、全体の吸光度をその群に対して計測した。これらの5μM溶液から、第2の希釈物を、Cary Eclipse蛍光光度計でのスペクトル分析のために50nMまたは25nMのいずれかで(同様に、0.1M Na2CO3(pH9)中に)作製した。励起を494nmで設定し、発光スペクトルを、499nmから700nmまで集めた。
図1および図2は、構造(I)の代表的化合物および比較化合物(「化合物A」)のUV吸光度を提供する。図1および図2に認められるように、2個のフルオレセイン部分を含む構造(I)の代表的化合物のUV吸光係数は、化合物Aのもののおよそ2倍である。
構造(I)の代表的化合物の蛍光発光スペクトルも決定し、化合物Aの発光スペクトルと比較した。図3および図4のデータによって示されるように、構造(I)の代表的化合物の蛍光発光は、化合物Aより高く、その発光は、トリエチレングリコールまたはヘキサエチレングリコールユニットの数が増大するにつれて増大する。理論によって拘束されることは望まないが、蛍光発光におけるこの予測外の増大は、L4によって提供される空間的距離と関連した内部クエンチングの減少に関連すると考えられる。
化合物I-10および化合物I-11を試験して、化合物のUV吸光度および蛍光発光に対するM部分の数の効果を決定した。図5は、5μmにおいて、1個のM部分を有する比較化合物(「化合物B」)に対して化合物I-10および化合物I-11のUV吸光度を比較するデータを提供する。5uMでは、化合物B(これは1個のFAMユニットを含む)は、0.43AUにおいて吸収した。その一方で化合物I-10(3個のFAMユニット)は、1.17AUにおいて吸収し、化合物I-11(5個のFAMユニット)は、2.00AUにおいて吸収した。
25nMでの化合物I-10、化合物I-11および化合物Bの蛍光発光スペクトルは、図6に示される。クエンチするよりむしろ(空間的により近くのFAMユニットがクエンチするように)、化合物I-10および化合物I-11は、化合物Bの値と比較して、それぞれ2.5×および4.3×増大した発光応答を示した。
実施例3
比較蛍光発光応答
比較蛍光発光応答
R2およびR3が化合物I-3に関して定義されるとおりであり、mが1~9まで変動する、化合物「HEG」、「TEG」、「C2」、「C3」、「C4」および「C6」を調製し、それらの蛍光発光スペクトルを決定した。結果を図7に示す。そのデータは、本発明の実施形態に従う化合物(すなわち、HEGおよびTEG)が、他の染料化合物に対して反復スペーサー部分が少ない(すなわち、mの値が低い)ものの、蛍光発光が増大したことを示す。
図8は、化合物Aに対して、「HEG」化合物(ここでmは、1、2または3である)の蛍光発光を比較するデータを提供する(50nM、pH=9)。そのデータは、mが2より大きい場合に、化合物Aに対して、HEGの蛍光発光の増大を示す。
実施例4
代表的化合物の調製
代表的化合物の調製
化合物I-29、化合物I-32および代表的アナログを調製し、L4が長いリンカー(約1,000ダルトンPEG)である化合物が、より短いL4リンカーを有するが複数の反復を有する(すなわち、mは1より大きい)化合物に類似の特性を有するか否かを決定するために試験した。図9は、化合物I-60、化合物I-46および化合物BのUV吸光度データを提供する。そのデータは、長いL4リンカーを有する化合物が、より短いリンカーの複数の反復を有する化合物のものに類似のUV吸光度を有し、両方の化合物がコントロール化合物Bに対して増大した吸光度を有することを示す。
実施例5
99マー染料の調製
99マー染料の調製
33個のフルオレセイン部分を有する化合物I-42を、本明細書で記載されるとおりの標準的固相オリゴヌクレオチド技術を使用して調製した。I-42(以下のスキームの中で「A」によって表される)を、以下で図示および記載されるようにトリマー化して、99マー染料を形成した。
200μLポリプロピレンチューブの中に、リン酸ナトリウム緩衝液(3.5μL、100mM、pH=6.5)およびI-42ビス-ジスルフィドの溶液(5.5μL、水中0.18mM)を入れた。これに、トリス(2-カルボキシエチル)ホスフィンの溶液(TCEP、1.0μL、水中10mM)を添加した。そのチューブのふたを閉め、ボルテックスにかけ、室温において2時間インキュベートさせた。その混合物を、micro Zeba Spin脱塩カラム(Pierce,カタログ番号89877)を通して脱塩した。その脱塩した溶液を、リン酸ナトリウム緩衝液(2.0μL、500mM、pH=7.2)およびビスマレイミドエタンのDMSO溶液(BMOE、1.0μL、0.25mM)で処理し、一晩、室温においてインキュベートした。その反応混合物を、水(100μL)で希釈し、PAGEによって分析した(図10、Invitrogen EC6875、10% TBE-尿素ゲル、180V一定、最高MW種の分離が完了したところで電気泳動を停止し、UV照射によって可視化した(365nm))。
任意の望ましい数の染料部分を有する他のオリゴマー染料を、類似の様式で調製する。
実施例6
一般的なフローサイトメトリー法
一般的なフローサイトメトリー法
別段示されなければ、以下の一般的手順を、以下の実施例全体において使用した。
全血の溶解:
緩衝化塩化アンモニウム法。生細胞を染色するために、エチレンジアミン四酢酸(EDTA)抗凝固化処理正常ヒト血液を、塩化アンモニウム溶液(ACK)、15mL血液 対 35mL溶解液で、15分間、室温(RT)においてまとめて溶解した。その細胞を、50%ハンクス平衡化塩類溶液(HBSS)および0.02%アジ化ナトリウムを含む50% 1%ウシ胎仔血清(FBS)1×ダルベッコのリン酸緩衝化生理食塩水(DPBS)で2回洗浄した。次いで、その細胞を、ドナー血漿中で100μL/試験/0.1~1×10e6へと再懸濁した。血漿中の細胞を、ポリプロピレン96ウェルHTSプレートにおいて、100μLの1%ウシ血清アルブミン(BSA)、および0.02%アジ化ナトリウムを含む1×DPBSのVfのために、予め希釈した抗体へと添加した。45分間、RTにおいてインキュベートした後、その細胞を、50% HBSSおよび0.02%アジ化ナトリウムを含む50%-1% FBS 1×DPBSで2回洗浄した。
緩衝化塩化アンモニウム法。生細胞を染色するために、エチレンジアミン四酢酸(EDTA)抗凝固化処理正常ヒト血液を、塩化アンモニウム溶液(ACK)、15mL血液 対 35mL溶解液で、15分間、室温(RT)においてまとめて溶解した。その細胞を、50%ハンクス平衡化塩類溶液(HBSS)および0.02%アジ化ナトリウムを含む50% 1%ウシ胎仔血清(FBS)1×ダルベッコのリン酸緩衝化生理食塩水(DPBS)で2回洗浄した。次いで、その細胞を、ドナー血漿中で100μL/試験/0.1~1×10e6へと再懸濁した。血漿中の細胞を、ポリプロピレン96ウェルHTSプレートにおいて、100μLの1%ウシ血清アルブミン(BSA)、および0.02%アジ化ナトリウムを含む1×DPBSのVfのために、予め希釈した抗体へと添加した。45分間、RTにおいてインキュベートした後、その細胞を、50% HBSSおよび0.02%アジ化ナトリウムを含む50%-1% FBS 1×DPBSで2回洗浄した。
溶解/固定法。血液を、1.0mL RBC溶解溶液(塩化アンモニウム)、100~15mL血液 対 35mL溶解液で、15分間、RTにおいて溶解した。次いで、その細胞を、50% HBSSおよび0.02%アジ化ナトリウムを含む50%-1% FBS 1×DPBSで2回洗浄した。次いで、細胞を、ドナー血漿中で100μL/試験/1×10e6へと再懸濁した。予め希釈した抗体を、100μLの1% BSA、および0.02%アジ化ナトリウムを含む1×DPBS中に添加した。100μL細胞を、96ウェルポリプロピレンHTSプレートへと添加した(合計200μLの試験サイズ)。45分間、RTにおいてインキュベートした後、その細胞を、50% HBSS、および0.02%アジ化ナトリウムを含む50% 1% FBS 1×DPBSで2回洗浄した。
抗体結合体の調製:
抗体結合体を、以下の構造:
を有するQ部分を含む構造(I)の化合物と所望の抗体とを反応させることによって調製した。その化合物および抗体は、従って、抗体上のSと、Q部分との反応によって結合体化して、以下の連結構造を形成した:
抗体結合体を、以下の構造:
抗体結合体は、抗体名の後に化合物番号をつけて示される。例えば、UCHT1-I-45は、化合物I-45とUCHT1抗体との間で形成される結合体を示す。参照される化合物番号が、表2において上記のQ部分を含まない場合、そのQ部分が導入され、その結合体が、そのQ部分を有する得られる化合物から調製されたことは理解される。
結合体の希釈:
抗体を、RTにした。その抗体結合体を、細胞染色緩衝液(1×DPBS、1% BSA、0.02%アジ化ナトリウム)中で0.1~540nMの範囲の濃度(1試験あたり8.0μgもしくはこれより少ない)へと希釈した。いくつかの例では、各サンプルの段階希釈を細胞染色緩衝液中で269nM抗体において開始し、その抗体希釈物を、使用するまで遮光して維持した。他の実験では、希釈を、4.0μg抗体/試験サイズにおいて開始し、試験サイズは、100~200μLの範囲に及んだ。力価測定を、2倍または4倍希釈物で行って、結合曲線を生成した。場合によっては、8.0μgまたは2.0μg/試験サイズを、希釈シリーズにおける第1のウェルの中で使用した。
抗体を、RTにした。その抗体結合体を、細胞染色緩衝液(1×DPBS、1% BSA、0.02%アジ化ナトリウム)中で0.1~540nMの範囲の濃度(1試験あたり8.0μgもしくはこれより少ない)へと希釈した。いくつかの例では、各サンプルの段階希釈を細胞染色緩衝液中で269nM抗体において開始し、その抗体希釈物を、使用するまで遮光して維持した。他の実験では、希釈を、4.0μg抗体/試験サイズにおいて開始し、試験サイズは、100~200μLの範囲に及んだ。力価測定を、2倍または4倍希釈物で行って、結合曲線を生成した。場合によっては、8.0μgまたは2.0μg/試験サイズを、希釈シリーズにおける第1のウェルの中で使用した。
結合体でのフローサイトメトリー:
物理的特徴付けの後、その結合体を活性および機能性(抗体結合親和性および染料の明度)について試験し、参照抗体染色と比較した。次いで、分離能の質を、フローサイトメーターを使用して、自己蛍光性陰性コントロールおよび他の非特異的結合との比較において明度を検討することによって決定した。マウスIgG1,kアイソタイプコントロールMOPC-21結合体の広範な研究は、I-45を試験する場合に含めなかった。なぜならMOPC-21非特異的結合は、先の試験においてUCHT1-化合物CおよびUCHT1-I-45の試験の間に特徴付けたからである。そのI-45結合体を、Jurkat T細胞、Ramos B細胞、およびヒト血液または末梢血単核細胞(PBMC)中の白血球の不均質集団に対して、およびポリスチレンヤギ抗マウスIg被覆ビーズを使用して試験した。全血スクリーニングは、UCHT1 I-45およびそのアナログを試験するために最も慣用的であった。新たな構築物を形成した場合に、架橋研究を行った。さらなるフローサイトメトリー法を、結合体(UCHT1-I-56、I-48、I-49、I-16、およびI-21B)を試験する場合に使用し、大部分の研究においてSony Biotechnologyの抗体結合体参照(UCHT1-FITC)および以前に特徴付けた重要な架橋参照(例えば、UCHT1-I-45、UCHT1-I-49)と比較した。
物理的特徴付けの後、その結合体を活性および機能性(抗体結合親和性および染料の明度)について試験し、参照抗体染色と比較した。次いで、分離能の質を、フローサイトメーターを使用して、自己蛍光性陰性コントロールおよび他の非特異的結合との比較において明度を検討することによって決定した。マウスIgG1,kアイソタイプコントロールMOPC-21結合体の広範な研究は、I-45を試験する場合に含めなかった。なぜならMOPC-21非特異的結合は、先の試験においてUCHT1-化合物CおよびUCHT1-I-45の試験の間に特徴付けたからである。そのI-45結合体を、Jurkat T細胞、Ramos B細胞、およびヒト血液または末梢血単核細胞(PBMC)中の白血球の不均質集団に対して、およびポリスチレンヤギ抗マウスIg被覆ビーズを使用して試験した。全血スクリーニングは、UCHT1 I-45およびそのアナログを試験するために最も慣用的であった。新たな構築物を形成した場合に、架橋研究を行った。さらなるフローサイトメトリー法を、結合体(UCHT1-I-56、I-48、I-49、I-16、およびI-21B)を試験する場合に使用し、大部分の研究においてSony Biotechnologyの抗体結合体参照(UCHT1-FITC)および以前に特徴付けた重要な架橋参照(例えば、UCHT1-I-45、UCHT1-I-49)と比較した。
遊離染料フローサイトメトリーの実施:
分子および物理的な特徴付けの後、その染料をまた、参照染料着色と比較して、細胞に対する潜在的親和性に関して試験した。染料は、細胞プローブとしても機能しかつ細胞物質に結合する可能性を有するので、染料は、具体的な特性を確認するために、高濃度(>100nM~10,000nM)において血液に対して広くスクリーニングされ得る。次いで、予測されるかまたは予測外のオフターゲット結合を、自己蛍光性陰性コントロール、および他の染料コントロールとの比較において、フローサイトメーターを使用して、希釈の際に明度および線形性を評価することによって定性化した。化合物D(化合物C遊離染料、しかし官能化されていない)の研究は、染料の明るいオフターゲット結合の陽性コントロールであり、結合体形態にあるときに以前に特徴付けされている。そのI-45染料を、細胞を溶解および固定溶液で処理する場合に、および血液を寝かせる場合、またはPBMC単球集団に適用される場合に、ヒト血液中の白血球の不均質集団に対して試験した。親和性をランク付けする架橋研究(化合物D、I-45、I-49、およびI-16)を、化合物Dを特徴付ける場合に、非常に初期の研究からの染料を含めながら、染料ロット比較のために行った。
分子および物理的な特徴付けの後、その染料をまた、参照染料着色と比較して、細胞に対する潜在的親和性に関して試験した。染料は、細胞プローブとしても機能しかつ細胞物質に結合する可能性を有するので、染料は、具体的な特性を確認するために、高濃度(>100nM~10,000nM)において血液に対して広くスクリーニングされ得る。次いで、予測されるかまたは予測外のオフターゲット結合を、自己蛍光性陰性コントロール、および他の染料コントロールとの比較において、フローサイトメーターを使用して、希釈の際に明度および線形性を評価することによって定性化した。化合物D(化合物C遊離染料、しかし官能化されていない)の研究は、染料の明るいオフターゲット結合の陽性コントロールであり、結合体形態にあるときに以前に特徴付けされている。そのI-45染料を、細胞を溶解および固定溶液で処理する場合に、および血液を寝かせる場合、またはPBMC単球集団に適用される場合に、ヒト血液中の白血球の不均質集団に対して試験した。親和性をランク付けする架橋研究(化合物D、I-45、I-49、およびI-16)を、化合物Dを特徴付ける場合に、非常に初期の研究からの染料を含めながら、染料ロット比較のために行った。
フローサイトメトリーの作業フロー:
細胞を培養し、染料スクリーニングもしくはオフターゲット結合の代謝ストレスの視覚的徴候に関して観察した(データは示さず)か、または新鮮な健康な細胞を、結合体スクリーニングのために使用した。細胞を周期的に計数して、細胞密度をチェックした(1×10e5および1×10e6生細胞/mL)。染色緩衝液(DPBS、0.1% BSA、0.02%アジ化ナトリウム)中に細胞を採取する前に、抗体結合体を希釈した(好ましくは、プレートまたはチューブの中で)。80~85%の生存性範囲を有する細胞を使用した。その細胞を、細胞を遠心分離および緩衝液で洗浄することによって2回洗浄して、pHインジケーターを除去し、FBS中に含まれるIgおよび他のタンパク質で細胞をブロックした。細胞密度を、染色緩衝液中で試験サイズへと調節した。その細胞をプレートした(1ウェルあたり1試験)か、または染料(予め希釈)をプレートの中の細胞に適用した。次いで、その細胞を45分間、23℃でインキュベートした。その細胞を、細胞を遠心分離および洗浄緩衝液で洗浄することによって2回洗浄し、次いで、プレートを吸引した。その細胞を、獲得緩衝液中に再懸濁した。5000個の無傷の細胞を、フローサイトメトリーによって獲得した。
細胞を培養し、染料スクリーニングもしくはオフターゲット結合の代謝ストレスの視覚的徴候に関して観察した(データは示さず)か、または新鮮な健康な細胞を、結合体スクリーニングのために使用した。細胞を周期的に計数して、細胞密度をチェックした(1×10e5および1×10e6生細胞/mL)。染色緩衝液(DPBS、0.1% BSA、0.02%アジ化ナトリウム)中に細胞を採取する前に、抗体結合体を希釈した(好ましくは、プレートまたはチューブの中で)。80~85%の生存性範囲を有する細胞を使用した。その細胞を、細胞を遠心分離および緩衝液で洗浄することによって2回洗浄して、pHインジケーターを除去し、FBS中に含まれるIgおよび他のタンパク質で細胞をブロックした。細胞密度を、染色緩衝液中で試験サイズへと調節した。その細胞をプレートした(1ウェルあたり1試験)か、または染料(予め希釈)をプレートの中の細胞に適用した。次いで、その細胞を45分間、23℃でインキュベートした。その細胞を、細胞を遠心分離および洗浄緩衝液で洗浄することによって2回洗浄し、次いで、プレートを吸引した。その細胞を、獲得緩衝液中に再懸濁した。5000個の無傷の細胞を、フローサイトメトリーによって獲得した。
その染料の蛍光を、525/50バンドパスフィルタを使用して検出されるピーク発光(521nM)でのフローサイトメトリーによって488nMブルーレーザー線によって検出した。少なくとも1500個の無傷の細胞(獲得目標は、3000~5000個の無傷の細胞)を、フローサイトメトリーによって獲得し、分析して、細胞調製物に存在する生細胞を同定した。
データ分析法:
記述統計。EC-800ソフトウェアは、ユーザーが各サンプル獲得に関する多くの統計データを集めることを可能にする。FL1-Aチャネルにおける平均またはメジアン蛍光強度(MFI)を、フローサイトメトリーによってインターロゲートされている場合、およびノイズを検討する場合に、抗体-染料試薬の明度を測定するために使用した。他の統計を評価して、染料特徴および試薬の全体的な質(メジアンシグナル-対-ノイズおよび絶対蛍光(メジアンまたは幾何平均)を含む)を決定した。
記述統計。EC-800ソフトウェアは、ユーザーが各サンプル獲得に関する多くの統計データを集めることを可能にする。FL1-Aチャネルにおける平均またはメジアン蛍光強度(MFI)を、フローサイトメトリーによってインターロゲートされている場合、およびノイズを検討する場合に、抗体-染料試薬の明度を測定するために使用した。他の統計を評価して、染料特徴および試薬の全体的な質(メジアンシグナル-対-ノイズおよび絶対蛍光(メジアンまたは幾何平均)を含む)を決定した。
ヒストグラム。フローサイトメトリー事象を、前方 対 側方散乱(細胞容積 対 細胞粒度(cell granularity))に対してサイズによってゲート制御した。次いで、それらの細胞を、平均蛍光強度(MFI)に関して515nmでの蛍光発光によってゲート制御した。その集めたデータは、蛍光強度(x軸上に対数スケールで表される)に対してy軸上に事象の数としてプロットされる二重パラメーターヒストグラムとして表される。そのデータは、親和性曲線、または相対蛍光強度のヒストグラムによってまとめられ得る。
結合曲線。MFIを選択した。なぜならMFIは、FCMによってインターロゲートされている場合に抗体-染料試薬の明度を最良に測定するパラメーターであるからであり、これは、幾何平均、メジアン、または平均として表され得、絶対蛍光測定値を表し得る。比較のために、ノイズが高度に特徴付けられ得る場合、シグナル-対-ノイズ比を、MFI,S/Nとして報告する。実施例7、実施例8および実施例14において、濃度に対するUCHT1-化合物C結合体のMFIを、試薬の結合曲線を示すために示す。
二変量二重パラメーターヒストグラム。いくつかの場合には、FCM事象を、定性出力を検討するためにゲート制御しなかった。そしてデータは、染料蛍光に対する細胞粒度(SSC)によって表される。この方法は、全血中で回収された全ての集団の全体的評価を可能にする。
実施例7
熱ストレスを与えたJurkat T細胞の壊死集団およびアポトーシス集団を使用する非特異的およびオフターゲット結合に関する染料の評価
熱ストレスを与えたJurkat T細胞の壊死集団およびアポトーシス集団を使用する非特異的およびオフターゲット結合に関する染料の評価
Jurkat細胞を、アメリカンタイプカルチャーコレクション(ATCC)によって提供される説明書に従って培養し、生きたまま採取し、熱ストレスを与え、2~3回洗浄し、結合体抗体で染色した。染色を、細胞を予め希釈した染料および予め希釈した結合体化抗体に適用し、インキュベートし、洗浄し、次いで、フローサイトメトリーによって獲得することによって行った。その死細胞および壊死細胞集団(獲得した細胞のうちの約10%)を、蛍光シグナルに関して評価した。その結果を図11に示す。図11に示されるように、蛍光は、10×I-47、5×化合物E、5×I-44、3×化合物F、および3×I-43と比較して、10×化合物D遊離染料においてより高いと観察される。
実施例8
蛍光強度に関する結合体の評価:UCHT1-化合物G 対 UCHT1-I-51
蛍光強度に関する結合体の評価:UCHT1-化合物G 対 UCHT1-I-51
生きているJurkat細胞を、ATCCによって提供される説明書に従って培養し、採取し、次いで、23℃に設定した温度制御遠心分離機の中で、約225 RCFにおいて6分間で回収した。その上清を除去した。次いで、その細胞を、細胞懸濁緩衝液(カルシウムおよびマグネシウムを含まない1×DPBS、1.0% FBS、0.02%アジ化ナトリウム、pH7.2)中で2回洗浄した。2回目の洗浄後に、その細胞を遠心分離にかけ、その上清を除去し、その細胞(約5×105生細胞/サンプル)を試験サイズ(最終容積100μL)へと再懸濁した。細胞を、抗体染料結合体溶液とともに45分間、RTにおいてインキュベートした。インキュベーション後、サンプルを2回洗浄し、次いで、獲得緩衝液中で懸濁した。
データを獲得し、SONY EC-800 FCMで評価し、図12に示されるように、相対蛍光の幾何平均に対する抗体タンパク質のnMをプロットした。認められ得るように、MOPC-21-化合物Gは、非特異的結合を有するが、両方の結合体が、FITC参照より4~5倍明るい。この実施例はまた、MOPC21-I-51がUCHT1-化合物G結合体と比較して(これらの標識上染料(DOL)レベルにおいて)低下した非特異的結合を示すことを示す。
実施例9
不均質細胞サンプルおよび末梢全血細胞におけるCD3発現の評価(特異性および分離能)
不均質細胞サンプルおよび末梢全血細胞におけるCD3発現の評価(特異性および分離能)
全血を、正常ドナーから、輸送および短期間の貯蔵のためのEDTA安定化サンプルチューブへと採血した。血液を、ACK、15mL血液 対 35mL溶解液で15分間、RTにおいて溶解した。その細胞を、50%ハンクス平衡化塩類溶液(HBSS)および0.02%アジ化ナトリウムを含む50%-1% FBS 1×DPBSで2回洗浄した。その細胞を、ドナー血漿中で100μL/試験/1×10e6へと再懸濁した。抗体を、100μL 1% BSAおよび0.02%アジ化ナトリウムを含む1×DPBS中で予め希釈し、ポリプロピレン96ウェルHTSプレートにおいて100μL細胞に添加した(全200μL試験サイズ)。その細胞を、45分間、RTにおいてインキュベートし、50% HBSSおよび0.02%アジ化ナトリウムを含む50%-1% FBS 1×DPBSで2回洗浄し、0.02%アジ化ナトリウムを含む1% FBS 1×DPBS中で再懸濁した。
図13は、I-51結合体および化合物G参照抗体の比較を示す。図13において、その細胞形態(SSC-Lin)は、FL1-Aチャネルにおいて検出される染料発光とともに二重パラメーターヒストグラムに示される。これは、細胞(主に、好中球および単球)の不均質集団に対する化合物G結合体の非特異的結合(NSB)を示す。その一方で、I-51結合体は、NSBを示さない。溶解した全血中のUCHT1-化合物GのNSBは、CD3への結合のために利用可能な抗体を効果的に減少させる。
図14は、UCHT1-I-51、UCHT1 BB515、およびUCHT1-FITCの比較を示す。UCHT1-I-51は、UCHT1-FITCより6倍明るい。
実施例10
等価な蛍光色素分子(MEF)の標準曲線と比較したCD3の発現レベル
溶解した全血を使用して、高抗原密度CD3発現を、蛍光強度結果によって可視化し、MEF値を概算するために、6ピーク(または8ピーク)ビーズ蛍光出力(Sony Biotech,カタログ番号AE700520)と比較した。UCHT1-FITC(参照として使用)、UCHT1-化合物G、およびUCHT1-I-51、ならびにUCHT1-BB515(さらなる参照結合体として使用)を、標準物質を使用する同じ実験において比較した。6ピークビーズは、6種の異なる蛍光強度の3.8ミクロンビーズの混合物からなり、これを使用して、機器の線形性および感度を検証し、所定のプロトコルにおいて並行して作動させた場合のMEFを概算した。
図15は、MEF標準曲線と比較したCD3の発現レベルを示す。認められ得るように、I-51は、参照よりおよそ6倍明るく、化合物Gは、約2倍程度明るい。示される濃度範囲は、133nMおよびそれ未満である。比較として、図13が、溶解した全血中でのUCHT1-化合物Gの非特異的結合は、CD3への結合のために利用可能な抗体を効果的に減少させたことを示すことに注意のこと。
実施例11
FITCおよびI-56結合体に対するUCHT1 I-16画分の比較
FITCおよびI-56結合体に対するUCHT1 I-16画分の比較
ビーズを予め処理し(ボルテックスにかけて超音波処理)、洗浄し、ビーズ数を、予備実験において決定されるように、2×C希釈に較正して、獲得を最適化しかつ線形飽和曲線を目標にした。ビーズを、抗体結合体とともにインキュベートし、洗浄し、次いで、フローサイトメトリーによって獲得した。BSA溶液(1×DPBS中に0.1%)を、ビーズの希釈、洗浄および獲得のために使用した。その抗体を、96ウェルポリプロピレンプレート中で1番目のウェル中に200μL容積中4.0μgで出発して1% BSA染色緩衝液中で予め希釈し、次いで、少なくとも8希釈(2倍)で各々のその後のウェル中で100μLを連続希釈した。次いで、徹底的にボルテックスしたビーズ(2×Cで)を添加し、100μLのビーズを、各ウェル中の100μLの抗体に添加した。そのビーズを、20分間、RTにおいてインキュベートし、洗浄し、フローサイトメトリーによって獲得した。
その結果を図16に示す。DOL約3.0でのUCHT1-I-16は、理論上の最大値にほぼ等しかった。図17に示されるように、類似の実験を行って、UCTH1-I-16と、より長い鎖(tether)を有する架橋参照であるUCHT1-I-56との間で示される親和性曲線の差異を強調した。
実施例12
UCHT1 I-56(10×)およびUCHT1 I-53(6×)と比較したUCHT1 I-51様アナログであるUCHT1 I-16
UCHT1 I-56(10×)およびUCHT1 I-53(6×)と比較したUCHT1 I-51様アナログであるUCHT1 I-16
末梢WBCを、溶解緩衝液(緩衝化ACK)で20分間、25℃において、ゆっくりと振盪しながら処理し、次いで、遠心分離し、その溶解緩衝液を除去した。その細胞を、HBSS(pH7.2)で1回洗浄し、次いで、0.5% FBS、および0.02%アジ化ナトリウムを含む1×HBSS(pH7.2)で洗浄し、染色緩衝液(1×DPBS、1% BSA、0.02%アジ化ナトリウム(Ph7.2))中で再懸濁した。次いで、細胞を、予め希釈した結合体化抗体に適用し、40分間、23~25℃において遮光してインキュベートした。
図18は、UCHT1-I-51様アナログであるUCHT1-I-16と、UCHT1-I-56(10×)およびUCHT1-I-53(6×)との比較を示す。
実施例13
UCHT1 I-56(10×)およびUCHT1 I-53(6×)と比較したUCHT1 I-51様アナログであるUCHT1 I-16
UCHT1 I-56(10×)およびUCHT1 I-53(6×)と比較したUCHT1 I-51様アナログであるUCHT1 I-16
抗体を、フローサイトメトリーによって特異的結合および蛍光分離能に関して評価した。Jurkat細胞を、ATCCによって提供される説明書に従って培養し、生きたまま採取した。細胞を、予め希釈した結合体化抗体に適用した場合に、染色を行い、20~40分間インキュベートし、洗浄し、次いで、フローサイトメトリーによって獲得した。そのUCHT1-I-51様アナログであるUCHT1-I-16を、UCHT1-I-56(10×)およびUCHT1-I-53(6×)と比較した。その結果を図19に示す。
実施例14
回帰分析によるUCHT1結合体分離能の比較
回帰分析によるUCHT1結合体分離能の比較
細胞を、末梢全血から単離し、凍結緩衝液中で凍結した。細胞を融解し、静置し、自己由来血漿で処理して、FcRをブロックし、全血環境を模倣し、2~3回洗浄し、次いで、全血を使用する場合と同様に、結合体で染色した。ビーズを予め較正して、獲得を最適化および抗体染色における飽和を目標にした。ビーズを、抗体結合体とともにインキュベートし、洗浄し、次いで、フローサイトメトリーによって獲得した。
UCHT1-I-16およびUCHT1-I-49を試験した場合に生成したデータに対して回帰分析を行って、結合体化の間の等価性を示した。その結果を図20に示す。
実施例15
全血中での原料染料のI-49およびI-16親和性試験
全血中での原料染料のI-49およびI-16親和性試験
3つの集団、単球、顆粒球、およびリンパ球におけるバックグラウンドを評価するために、全血を染色、溶解、固定、および洗浄する方法を使用して、過剰の染料の存在下での等価性試験において染料をスクリーニングした。全血に存在する顆粒球を、分析のための主要標的として選択した。リンパ球および単球もまた研究したが、回帰グラフではデータは示さない。
原料染料を、過剰に(最初の力価測定を10,000nMで出発する)、その2つのほぼ同一の構築物の間の非特異的結合差を強調して定性化もするために、抗体結合体を存在させることなく、使用した。末梢WBCを、溶解緩衝液(緩衝化ACK)で、20分間、25℃においてゆっくりと振盪しながら処理し、遠心分離し、溶解緩衝液を除去した。赤血球溶解および固定溶液を、その染料および細胞に適用し、次いで、その細胞を、HBSS(pH7.2)で1回洗浄し、次いで、0.5% FBSおよび0.02%アジ化ナトリウムを含む1×HBSS(pH7.2)で洗浄し、次いで、染色緩衝液(1×DPBS、1% BSA、0.02%アジ化ナトリウム(pH7.2))中に再懸濁した。
その相対的MFIデータを、濃度をマッチさせた回帰分析によって比較して、原料のI-45とI-16との間の一致および/または類似性のレベルを示した。この試験において、I-45およびI-16は、バックグラウンドのほぼ等価なレベルを有することが見出される。染料スクリーニングからの同じデータを使用して、このI-45アナログ(I-49およびI-16)を、力価測定曲線全体およびコントロールを調べる場合に、互いに重ね合わせる。参照のために含まれるコントロールのMFIの間に入るI-45アナログは、化合物D(10×)、ならびにより長いアルキレンスペーサー基を有する2種のアナログ化合物D(アナログiおよびii)であった。I-49は、I-16より僅かに高いバックグラウンドを有し、I-16バックグラウンドは、I-45に非常に類似している。その10×発蛍光団構築物は、非特異的結合において6×よりも暗く、その10×分子の非特異的結合特性を減少させながら、さらなる発蛍光団を適合させる骨格調節の有効性を示す。その結果を図21A~21Cに示す。図21Aは、I-16とI-45との間の相関を示す。図21Bは、力価曲線重ね合わせを示し、参照と比較した;そして図21Cは、化合物DおよびI-45を比較する、バックグラウンドFLおよび細胞形態を示す例示の定性的データを示す。
実施例16
固定し、72時間貯蔵した血球におけるUCHT1-I-21BおよびUCHT1-I-16の比較
固定し、72時間貯蔵した血球におけるUCHT1-I-21BおよびUCHT1-I-16の比較
全血を、正常ドナーから、輸送および短期間の貯蔵のためのEDTA安定化サンプルチューブへと採血した。その血液を、抗体での染色の前または後のいずれかに、溶解剤で処理した。その細胞を、ACK、15mL血液 対 35mL溶解液で15分、RTにおいて溶解し、次いで、50% HBSS、および0.02%アジ化ナトリウムを含む50% 1% FBS 1×DPBSで2回洗浄した。その細胞を、ドナー血漿中で100μL/試験/1×10e6へと再懸濁した。100μL 1% BSAおよび0.02%アジ化ナトリウムを含む1×DPBS中で予め希釈した抗体を、100μL細胞へと添加し、次いで、これを96ウェルHTSポリプロピレンプレートへと添加した(全200μL試験サイズ)。その細胞を45分間、RTでインキュベートした後、その細胞を、50% HBSS+0.02%アジ化ナトリウムを含む50% 1% FBS 1×DPBSで2回洗浄した。次いで、その細胞を、0.02%アジ化ナトリウムを含む1% FBS 1×DPBS中に再懸濁した。その細胞をもう1回洗浄し、200μL/ウェルにおいて2%パラホルムアルデヒド中で固定し、1×DPBSで1回洗浄し、72時間、2~8℃において貯蔵し、1×DPBSを使用してもう1回洗浄し、次いで、1×DPBS中0.1% BSAを使用して獲得した。
結合体の分離能を、参照であるUCHT1-FITCと、および3.0のDOLに関して理論上の明度と比較した。新たな構築物UCHT1-I-21Bは、DOLがこの方法において3.0である場合に、理論上のものと最良に適合し、UCHT1-FITCより7倍明るい。図22に示されるように、親和性曲線は、ヒストグラムとして、FL1-Aチャネルにおいて検出される化合物発光とともに示される。
非特異的結合の評価を、顆粒球の蛍光を測定することによって完了した。図23は、UCHT1-I-21B、UCHT1-I-16、および参照であるUCHT1-FITCのオフターゲット非特異的結合の蛍光強度の比較を示す。UCHT1-I-21Bの全ての画分および複製物は、試験に含まれる他の構築物およびFITC参照より低いバックグラウンドを示す。回帰分析を、図24に示されるように、相関および相対的親和性を検討するためにデータに適用したところ、UCHT1-I-21BがUCHT1-I-16と線形関係を有しないことが決定された。
実施例17
Jurkat細胞モデルおよび単純な2点力価を使用するUCHT1 I-21B
Jurkat細胞モデルおよび単純な2点力価を使用するUCHT1 I-21B
実施例16に類似して、UCHT1 I-21Bの試験を、抗体の1試験あたり2.0マイクログラムおよび0.125マイクログラムの単純な2点力価において行った。Jurkat細胞を、ATCCによって提供される説明書に従って培養し、生きたまま採取するかまたは熱ストレスを与え、2~3回洗浄し、次いで、結合体抗体で染色した。細胞を、予め希釈した結合体化抗体に適用した場合に染色を行い、インキュベートし、洗浄し、次いで、フローサイトメトリーによって獲得した。
図25に示されるように、UCHT1-I-21Bは、予測されるように、UCHT1-I-51と比較して低い濃度でより高い親和性を示す。実際のシグナル 対 ノイズは、0.125マイクログラム/試験の飽和未満のCで理論上のものを超え、UCHT1-I-51より優れている。
実施例18
PBMCを使用する血漿干渉研究におけるUCHT1 化合物GおよびUCHT1 I-51の比較
PBMCを使用する血漿干渉研究におけるUCHT1 化合物GおよびUCHT1 I-51の比較
PBMCおよび自己由来血漿を、末梢全血から以前に単離し、次いで、凍結培地中で凍結した。細胞を融解し、短時間静置し、2回または3回洗浄し、次いで、全血から新たに単離したかのように結合体抗体で、自己由来血漿で、または抗体染色の間に存在するHBSSで染色した。
UCHT1-化合物Gは、単球と相互作用して、活性化および不活性化ドナー血漿の存在下、ならびに2.5%グリシンの添加の存在下で蛍光事象を形成した。図26Aは、0%グリシンの添加から生じるデータを示し、図26Bは、2.5%グリシンの添加から生じるデータを示す。双性イオンアミノ酸であるグリシンは、天然のポリアミンに対する親和性、天然のポリアミンとのアミド結合、または天然のポリアミンによるブロックの代理としてイムノアッセイにおいて役割を果たし、従って、生細胞の染色システムにおいて他の試薬の効果を誇張またはブロックする。PBMCに再導入した血漿は、(1)補体(compliment)とともに、正常レベルで存在する血小板を活性化するか、または(2)大部分の血小板を除去するための(血漿の補体および他の因子の両方の)加熱、濾過、および遠心分離によって不活性化されるかのいずれかである。その不活性化された血漿は、ブロッキング薬剤としてより機能し、一方で、活性化している血漿は、高い干渉を有すると予測される。
この研究は、血液が移動され、血漿が存在するか、残っているか、希釈されるか、または洗い流される場合に、全血において考えられる効果の範囲を模倣する。化合物CおよびI-45は、予測されるとおりの挙動における明瞭な差異を示す。これは、バックグラウンド結合における減少およびI-45に対する構造的改変による活性の明瞭な改善を裏付ける。一般に、UCHT1-I-51バックグラウンドは、化合物Gとの比較において制限されている一方で、存在する場合のグリシンは、I-51のバックグラウンド染色を僅かに増強し、UCHT1-化合物Gのバックグラウンドを、特に、不活性化血漿および希釈なしの(neat)コントロールにおいて抑制することが観察される。全体的に、UCHT1-化合物Gは、より高い単球バックグラウンドを有する。
実施例19
ホスホロアミダイトおよび化合物の調製
ホスホロアミダイトおよび化合物の調製
例示的化合物を、標準的固相オリゴヌクレオチド合成プロトコルおよび以下の構造:
(これをChemGenes(カタログ番号CLP-9780)から購入した)
を有するフルオレセイン含有ホスホロアミダイトを使用して調製した。
を有するフルオレセイン含有ホスホロアミダイトを使用して調製した。
最終の脱保護は、所望のF’’部分を生じる。他の市販のホスホロアミダイト試薬を、その化合物の種々の部分を導入するために適切である場合に使用した。以下の構造:
を有するQ部分を、
と遊離スルフヒドリルとの反応によって導入した。他のQ部分を、当業者の知識に従って同様にして導入する。
代表的な実施形態としては、以下のものが挙げられるが、これらに限定されない:
実施形態1。以下の構造(I):
を有する化合物、またはその立体異性体、塩もしくは互変異性体であって、ここで:
Mは、各存在において、独立して、2個またはこれより多くの炭素-炭素二重結合および少なくとも1の共役度を含む部分であり;
L1は、各存在において、独立して、i)選択肢的なアルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、ヘテロアルケニレン、ヘテロアルキニレンもしくはヘテロ原子リンカー;またはii)2個の相補的反応性基の反応によって形成できる官能基を含むリンカー、のいずれかであり;
L2およびL3は、各存在において、独立して、選択肢的なアルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、ヘテロアルケニレン、ヘテロアルキニレンもしくはヘテロ原子リンカーであり;
L4は、各存在において、独立して、長さが3原子より大きいヘテロアルキレン、ヘテロアルケニレンまたはヘテロアルキニレンリンカーであり、ここで該ヘテロアルキレン、ヘテロアルケニレンおよびヘテロアルキニレンリンカー中のヘテロ原子は、O、NおよびSから選択され;
R1は、各存在において、独立して、H、アルキルまたはアルコキシであり;
R2およびR3は、各々独立して、H、OH、SH、アルキル、アルコキシ、アルキルエーテル、ヘテロアルキル、-OP(=Ra)(Rb)Rc、Q、もしくはその保護された形態、またはL’であり;
R4は、各存在において、独立して、OH、SH、O-、S-、ORdまたはSRdであり;
R5は、各存在において、独立して、オキソ、チオキソまたは非存在であり;
Raは、OまたはSであり;
Rbは、OH、SH、O-、S-、ORdまたはSRdであり;
Rcは、OH、SH、O-、S-、ORd、OL’、SRd、アルキル、アルコキシ、ヘテロアルキル、ヘテロアルコキシ、アルキルエーテル、アルコキシアルキルエーテル、ホスフェート、チオホスフェート、ホスホアルキル、チオホスホアルキル、ホスホアルキルエーテルまたはチオホスホアルキルエーテルであり;
Rdは、対イオンであり;
Qは、各存在において、独立して、分析物分子、標的化部分、固体支持体または相補的反応性基Q′と共有結合を形成できる反応性基またはその保護された形態を含む部分であり;
L’は、各存在において、独立して、Qへの共有結合を含むリンカー、標的化部分への共有結合を含むリンカー、分析物分子への共有結合を含むリンカー、固体支持体への共有結合を含むリンカー、固体支持体残基への共有結合を含むリンカー、ヌクレオシドへの共有結合を含むリンカーまたは構造(I)のさらなる化合物への共有結合を含むリンカーであり;
mは、各存在において、独立して、0またはこれより大きな整数であるが、ただしmの少なくとも1個の存在は、1またはこれより大きな整数であり;そして
nは、1またはこれより大きな整数である、
化合物、またはその立体異性体、塩もしくは互変異性体。
Mは、各存在において、独立して、2個またはこれより多くの炭素-炭素二重結合および少なくとも1の共役度を含む部分であり;
L1は、各存在において、独立して、i)選択肢的なアルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、ヘテロアルケニレン、ヘテロアルキニレンもしくはヘテロ原子リンカー;またはii)2個の相補的反応性基の反応によって形成できる官能基を含むリンカー、のいずれかであり;
L2およびL3は、各存在において、独立して、選択肢的なアルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、ヘテロアルケニレン、ヘテロアルキニレンもしくはヘテロ原子リンカーであり;
L4は、各存在において、独立して、長さが3原子より大きいヘテロアルキレン、ヘテロアルケニレンまたはヘテロアルキニレンリンカーであり、ここで該ヘテロアルキレン、ヘテロアルケニレンおよびヘテロアルキニレンリンカー中のヘテロ原子は、O、NおよびSから選択され;
R1は、各存在において、独立して、H、アルキルまたはアルコキシであり;
R2およびR3は、各々独立して、H、OH、SH、アルキル、アルコキシ、アルキルエーテル、ヘテロアルキル、-OP(=Ra)(Rb)Rc、Q、もしくはその保護された形態、またはL’であり;
R4は、各存在において、独立して、OH、SH、O-、S-、ORdまたはSRdであり;
R5は、各存在において、独立して、オキソ、チオキソまたは非存在であり;
Raは、OまたはSであり;
Rbは、OH、SH、O-、S-、ORdまたはSRdであり;
Rcは、OH、SH、O-、S-、ORd、OL’、SRd、アルキル、アルコキシ、ヘテロアルキル、ヘテロアルコキシ、アルキルエーテル、アルコキシアルキルエーテル、ホスフェート、チオホスフェート、ホスホアルキル、チオホスホアルキル、ホスホアルキルエーテルまたはチオホスホアルキルエーテルであり;
Rdは、対イオンであり;
Qは、各存在において、独立して、分析物分子、標的化部分、固体支持体または相補的反応性基Q′と共有結合を形成できる反応性基またはその保護された形態を含む部分であり;
L’は、各存在において、独立して、Qへの共有結合を含むリンカー、標的化部分への共有結合を含むリンカー、分析物分子への共有結合を含むリンカー、固体支持体への共有結合を含むリンカー、固体支持体残基への共有結合を含むリンカー、ヌクレオシドへの共有結合を含むリンカーまたは構造(I)のさらなる化合物への共有結合を含むリンカーであり;
mは、各存在において、独立して、0またはこれより大きな整数であるが、ただしmの少なくとも1個の存在は、1またはこれより大きな整数であり;そして
nは、1またはこれより大きな整数である、
化合物、またはその立体異性体、塩もしくは互変異性体。
実施形態2。L4は、各存在において、独立して、ヘテロアルキレンリンカーである、実施形態1に記載の化合物。
実施形態3。L4は、各存在において、独立して、アルキレンオキシドリンカーである、実施形態2に記載の化合物。
実施形態5。zは、3~6の整数である、実施形態4に記載の化合物。
実施形態6。L1は、各存在において、2個の相補的反応性基の反応によって形成できる官能基を含むリンカーである、実施形態1~5のいずれか1つに記載の化合物。
実施形態7。L1の少なくとも1個の存在に関して、前記官能基は、アルデヒド、オキシム、ヒドラゾン、アルキン、アミン、アジド、アシルアジド、アシルハライド、ニトリル、ニトロン、スルフヒドリル、ジスルフィド、スルホニルハライド、イソチオシアネート、イミドエステル、活性化エステル、ケトン、α,β-不飽和カルボニル、アルケン、マレイミド、α-ハロイミド、エポキシド、アジリジン、テトラジン、テトラゾール、ホスフィン、ビオチンまたはチイラン官能基と、相補的反応性基との反応によって形成できる、実施形態6に記載の化合物。
実施形態8。L1の少なくとも1個の存在に関して、前記官能基は、アルキンおよびアジドの反応によって形成できる、実施形態6に記載の化合物。
実施形態9。L1の少なくとも1個の存在に関して、前記官能基は、アルケン、エステル、アミド、チオエステル、チオウレア、ジスルフィド、カルボン酸、複素環式またはヘテロアリール基を含む、実施形態6に記載の化合物。
実施形態10。L1の少なくとも1個の存在に関して、L1は、トリアゾリル官能基を含むリンカーである、実施形態6に記載の化合物。
実施形態13。L1aもしくはL1b、または両方は、非存在である、実施形態11~12のいずれか1つに記載の化合物。
実施形態14。L1aもしくはL1b、または両方は、存在する、実施形態11~12のいずれか1つに記載の化合物。
実施形態15。L1aおよびL1bは、存在する場合、各々独立して、アルキレンまたはヘテロアルキレンである、実施形態14に記載の化合物。
実施形態17。L1は、各存在において、独立して、選択肢的なアルキレンまたはヘテロアルキレンリンカーである、実施形態1~5のいずれか1つに記載の化合物。
実施形態18。L2およびL3は、各存在において、独立して、C1-C6アルキレン、C2-C6アルケニレンまたはC2-C6アルキニレンである、実施形態1~17のいずれか1つに記載の化合物。
実施形態19。前記化合物は、以下の構造(IB):
を有し、ここで:
x1、x2、x3およびx4は、各存在において、独立して、0~6の整数であり、そして
zは、2~100の整数である、
実施形態1~18のいずれか1つに記載の化合物。
x1、x2、x3およびx4は、各存在において、独立して、0~6の整数であり、そして
zは、2~100の整数である、
実施形態1~18のいずれか1つに記載の化合物。
実施形態20。x1、x2、x3またはx4のうちの少なくとも1個の存在は、1である、実施形態19に記載の化合物。
実施形態21。x1、x2、x3およびx4は、各存在において、各々1である、実施形態19または20に記載の化合物。
実施形態22。L1は、各存在において、独立して、トリアゾリル官能基を含む、実施形態19~21のいずれか1つに記載の化合物。
実施形態23。L1は、各存在において、独立して、選択肢的なアルキレンまたはヘテロアルキレンリンカーである、実施形態19~21のいずれか1つに記載の化合物。
実施形態24。R4は、各存在において、独立して、OH、O-またはORdである、実施形態1~23のいずれか1つに記載の化合物。
実施形態25。R5は、各存在において、オキソである、実施形態1~24のいずれか1つに記載の化合物。
実施形態26。R1は、各存在において、Hである、実施形態1~25のいずれか1つに記載の化合物。
実施形態27。R2およびR3は、各々独立して、OHまたは-OP(=Ra)(Rb)Rcである、実施形態1~26のいずれか1つに記載の化合物。
実施形態28。R2またはR3のうちの一方は、OHまたは-OP(=Ra)(Rb)Rcであり、R2またはR3のうちの他方は、QまたはQへの共有結合を含むリンカーである、実施形態1~26のいずれか1つに記載の化合物。
実施形態29。R2およびR3は、各々独立して、-OP(=Ra)(Rb)Rcである、実施形態1~26のいずれか1つに記載の化合物。
実施形態30。Rcは、OL’である、実施形態29に記載の化合物。
実施形態31。L’は、Q、標的化部分、分析物分子、固体支持体、固体支持体残基、ヌクレオシドまたは構造(I)のさらなる化合物への、ヘテロアルキレンリンカーである、実施形態30に記載の化合物。
実施形態32。L’は、アルキレンオキシドもしくはホスホジエステル部分、またはこれらの組み合わせを含む、実施形態31に記載の化合物。
実施形態33。L’は、以下の構造:
を有し、ここで:
m”およびn”は、独立して、1~10の整数であり;
Reは、H、電子対または対イオンであり;
L”は、Reもしくは直接結合であるか、またはQ、標的化部分、分析物分子、固体支持体、固体支持体残基、ヌクレオシドもしくは構造(I)のさらなる化合物への、連結である、
実施形態32に記載の化合物。
m”およびn”は、独立して、1~10の整数であり;
Reは、H、電子対または対イオンであり;
L”は、Reもしくは直接結合であるか、またはQ、標的化部分、分析物分子、固体支持体、固体支持体残基、ヌクレオシドもしくは構造(I)のさらなる化合物への、連結である、
実施形態32に記載の化合物。
実施形態34。前記標的化部分は、抗体または細胞表面レセプターアンタゴニストである、実施形態29~33に記載の化合物。
実施形態37。Qは、求核性反応性基、求電子性反応性基または環化付加反応性基を含む、実施形態1~26または28~33のいずれか1つに記載の化合物。
実施形態38。Qは、スルフヒドリル、ジスルフィド、活性化エステル、イソチオシアネート、アジド、アルキン、アルケン、ジエン、ジエノフィル、酸ハライド、スルホニルハライド、ホスフィン、α-ハロアミド、ビオチン、アミノまたはマレイミド官能基を含む、実施形態37に記載の化合物。
実施形態39。前記活性化エステルは、N-スクシンイミドエステル、イミドエステルまたはポリフルオロフェニルエステルである、実施形態38に記載の化合物。
実施形態40。前記アルキンは、アルキルアジドまたはアシルアジドである、実施形態38に記載の化合物。
実施形態41。Qは、表1から選択される部分を含む、実施形態1~33のいずれか1つに記載の化合物。
実施形態42。R2またはR3のうちの一方は、OHまたは-OP(=Ra)(Rb)Rcであり、R2またはR3のうちの他方は、分析物分子への共有結合を含むリンカー、標的化部分への共有結合を含むリンカー、または固体支持体への共有結合を含むリンカーである、実施形態1~26のいずれか1つに記載の化合物。
実施形態43。前記分析物分子は、核酸、アミノ酸またはこれらのポリマーである、実施形態42に記載の化合物。
実施形態44。前記分析物分子は、酵素、レセプター、レセプターリガンド、抗体、糖タンパク質、アプタマーまたはプリオンである、実施形態42に記載の化合物。
実施形態45。前記標的化部分は、抗体または細胞表面レセプターアンタゴニストである、実施形態42に記載の化合物。
実施形態46。前記固体支持体は、ポリマービーズまたは非ポリマービーズである、実施形態42に記載の化合物。
実施形態47。mは、各存在において、独立して、1~10の整数である、実施形態1~46のいずれか1つに記載の化合物。
実施形態48。mは、各存在において、独立して、1~5の整数である、実施形態1~46のいずれか1つに記載の化合物。
実施形態49。nは、1~100の整数である、実施形態1~48のいずれか1つに記載の化合物。
実施形態50。nは、1~10の整数である、実施形態1~48のいずれか1つに記載の化合物。
実施形態51。Mは、各存在において、独立して、4個もしくはこれより多くのアリールもしくはヘテロアリール環、またはこれらの組み合わせを含む部分である、実施形態1~50のいずれか1つに記載の化合物。
実施形態52。Mは、各存在において、独立して、蛍光性または有色である、実施形態1~51のいずれか1つに記載の化合物。
実施形態53。Mは、蛍光性である、実施形態52に記載の化合物。
実施形態54。Mは、各存在において、独立して、少なくとも4個の縮合環を含む縮合多環式アリール部分を含む、実施形態1~53のいずれか1つに記載の化合物。
実施形態55。Mは、各存在において、独立して、ジメチルアミノスチルベン、キナクリドン、フルオロフェニル-ジメチル-BODIPY、his-フルオロフェニル-BODIPY、アクリジン、テリレン、セキシフェニル、ポルフィリン、ベンゾピレン、(フルオロフェニル-ジメチル-ジフルオロボラ-ジアザ-インダセン)フェニル、(ビス-フルオロフェニル-ジフルオロボラ-ジアザ-インダセン)フェニル、クアテルフェニル、ビ-ベンゾチアゾール、ター-ベンゾチアゾール、ビ-ナフチル、ビ-アントラシル、スクアライン、スクアリリウム、9,10-エチニルアントラセンまたはター-ナフチル部分である、実施形態1~54のいずれか1つに記載の化合物。
実施形態56。Mは、各存在において、独立して、p-ターフェニル、ペリレン、アゾベンゼン、フェナジン、フェナントロリン、アクリジン、チオキサントレン、クリセン、ルブレン、コロネン、シアニン、ペリレンイミド、もしくはペリレンアミドまたはその誘導体である、実施形態1~54のいずれか1つに記載の化合物。
実施形態57。Mは、各存在において、独立して、クマリン染料、レゾルフィン染料、ジピロメテンボロンジフルオリド染料、ルテニウムビピリジル染料、エネルギー移動染料、チアゾールオレンジ染料、ポリメチンまたはN-アリール-1,8-ナフタルイミド染料である、実施形態1~54のいずれか1つに記載の化合物。
実施形態58。Mは、各存在において、独立して、ピレン、ペリレン、ペリレンモノイミドもしくは6-FAMまたはその誘導体である、実施形態1~54のいずれか1つに記載の化合物。
実施形態60。表2から選択される化合物。
実施形態61。サンプルを染色するための方法であって、該方法は、該サンプルに、実施形態1~60のいずれか1つに記載の化合物を、該サンプルが適切な波長で照射される場合に光学的応答を生じるために十分な量で添加する工程を包含する方法。
実施形態62。前記光学的応答は、蛍光応答である、実施形態61に記載の方法。
実施形態63。前記サンプルは、細胞を含む、実施形態61~62のいずれか1つに記載の方法。
実施形態64。前記細胞をフローサイトメトリーによって観察する工程をさらに包含する、実施形態63に記載の方法。
実施形態65。前記蛍光応答を、検出可能に異なる光学的特性を有する第2の発蛍光団の蛍光応答から区別する工程をさらに包含する、実施形態62に記載の方法。
実施形態66。分析物分子を視覚的に検出するための方法であって、該方法は、
(a)R2またはR3は、該分析物分子への共有結合を含むリンカーである実施形態1の化合物を提供する工程;および
(b)該化合物をその視覚的特性によって検出する工程、
を包含する方法。
(a)R2またはR3は、該分析物分子への共有結合を含むリンカーである実施形態1の化合物を提供する工程;および
(b)該化合物をその視覚的特性によって検出する工程、
を包含する方法。
実施形態67。分析物分子を視覚的に検出するための方法であって、該方法は、
(a)R2またはR3は、QまたはQへの共有結合を含むリンカーである実施形態1に記載の化合物と、該分析物分子とを混合する工程;
(b)該化合物および該分析物分子の結合体を形成する工程;ならびに
(c)該結合体をその視覚的特性によって検出する工程、
を包含する方法。
(a)R2またはR3は、QまたはQへの共有結合を含むリンカーである実施形態1に記載の化合物と、該分析物分子とを混合する工程;
(b)該化合物および該分析物分子の結合体を形成する工程;ならびに
(c)該結合体をその視覚的特性によって検出する工程、
を包含する方法。
実施形態68。分析物を視覚的に検出するための方法であって、該方法は、
(a)R2またはR3は、該分析物分子に対する特異性を有する標的化部分への共有結合を含むリンカーを含む実施形態1~36のいずれか1つに記載の化合物を提供する工程;
(b)該化合物および該分析物を混合し、それによって、該標的化部分および該分析物を会合させる工程;ならびに
(c)該化合物をその視覚的特性によって検出する工程、
を包含する方法。
(a)R2またはR3は、該分析物分子に対する特異性を有する標的化部分への共有結合を含むリンカーを含む実施形態1~36のいずれか1つに記載の化合物を提供する工程;
(b)該化合物および該分析物を混合し、それによって、該標的化部分および該分析物を会合させる工程;ならびに
(c)該化合物をその視覚的特性によって検出する工程、
を包含する方法。
実施形態69。実施形態1~60のいずれか1つに記載の化合物および1もしくはこれより多くの分析物分子を含む、組成物。
実施形態70。前記1もしくはこれより多くの分析物分子の検出のための分析方法における実施形態69に記載の組成物の使用。
実施形態71。以下の構造(II):
を有する化合物、またはその立体異性体、塩もしくは互変異性体であって、ここで:
Gは、各存在において、独立して、相補的反応性基と共有結合を形成できる反応性基またはその保護されたアナログを含む部分であり;
L1a、L2およびL3は、各存在において、独立して、選択肢的なアルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、ヘテロアルケニレン、ヘテロアルキニレンもしくはヘテロ原子リンカーであり;
L4は、各存在において、独立して、長さが3原子より大きいヘテロアルキレン、ヘテロアルケニレンまたはヘテロアルキニレンリンカーであり、ここで該ヘテロアルキレン、ヘテロアルケニレンおよびヘテロアルキニレンリンカー中のヘテロ原子は、O、NおよびSから選択され;
R1は、各存在において、独立して、H、アルキルまたはアルコキシであり;
R2およびR3は、各々独立して、H、OH、SH、アルキル、アルコキシ、アルキルエーテル、ヘテロアルキル、-OP(=Ra)(Rb)Rc、QまたはL’であり;
R4は、各存在において、独立して、OH、SH、O-、S-、ORdまたはSRdであり;
R5は、各存在において、独立して、オキソ、チオキソまたは非存在であり;
Raは、OまたはSであり;
Rbは、OH、SH、O-、S-、ORdまたはSRdであり;
Rcは、OH、SH、O-、S-、ORd、OL’、SRd、アルキル、アルコキシ、アルキルエーテル、アルコキシアルキルエーテル、ホスフェート、チオホスフェート、ホスホアルキル、チオホスホアルキル、ホスホアルキルエーテルまたはチオホスホアルキルエーテルであり;
Rdは、対イオンであり;
Qは、各存在において、独立して、分析物分子、標的化部分、固体支持体もしくは相補的反応性基Q′と共有結合を形成できる反応性基またはその保護されたアナログを含む部分であり;
L’は、各存在において、独立して、Qへの共有結合を含むリンカー、標的化部分への共有結合を含むリンカー、分析物分子への共有結合を含むリンカー、固体支持体への共有結合を含むリンカー、固体支持体残基への共有結合を含むリンカー、ヌクレオシドへの共有結合を含むリンカーまたは構造(II)のさらなる化合物への共有結合を含むリンカーであり;
mは、各存在において、独立して、0またはこれより大きな整数であるが、ただしmの少なくとも1個の存在は、1またはこれより大きな整数であり;そして
nは、1またはこれより大きな整数である、
化合物、またはその立体異性体、塩もしくは互変異性体。
Gは、各存在において、独立して、相補的反応性基と共有結合を形成できる反応性基またはその保護されたアナログを含む部分であり;
L1a、L2およびL3は、各存在において、独立して、選択肢的なアルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、ヘテロアルケニレン、ヘテロアルキニレンもしくはヘテロ原子リンカーであり;
L4は、各存在において、独立して、長さが3原子より大きいヘテロアルキレン、ヘテロアルケニレンまたはヘテロアルキニレンリンカーであり、ここで該ヘテロアルキレン、ヘテロアルケニレンおよびヘテロアルキニレンリンカー中のヘテロ原子は、O、NおよびSから選択され;
R1は、各存在において、独立して、H、アルキルまたはアルコキシであり;
R2およびR3は、各々独立して、H、OH、SH、アルキル、アルコキシ、アルキルエーテル、ヘテロアルキル、-OP(=Ra)(Rb)Rc、QまたはL’であり;
R4は、各存在において、独立して、OH、SH、O-、S-、ORdまたはSRdであり;
R5は、各存在において、独立して、オキソ、チオキソまたは非存在であり;
Raは、OまたはSであり;
Rbは、OH、SH、O-、S-、ORdまたはSRdであり;
Rcは、OH、SH、O-、S-、ORd、OL’、SRd、アルキル、アルコキシ、アルキルエーテル、アルコキシアルキルエーテル、ホスフェート、チオホスフェート、ホスホアルキル、チオホスホアルキル、ホスホアルキルエーテルまたはチオホスホアルキルエーテルであり;
Rdは、対イオンであり;
Qは、各存在において、独立して、分析物分子、標的化部分、固体支持体もしくは相補的反応性基Q′と共有結合を形成できる反応性基またはその保護されたアナログを含む部分であり;
L’は、各存在において、独立して、Qへの共有結合を含むリンカー、標的化部分への共有結合を含むリンカー、分析物分子への共有結合を含むリンカー、固体支持体への共有結合を含むリンカー、固体支持体残基への共有結合を含むリンカー、ヌクレオシドへの共有結合を含むリンカーまたは構造(II)のさらなる化合物への共有結合を含むリンカーであり;
mは、各存在において、独立して、0またはこれより大きな整数であるが、ただしmの少なくとも1個の存在は、1またはこれより大きな整数であり;そして
nは、1またはこれより大きな整数である、
化合物、またはその立体異性体、塩もしくは互変異性体。
実施形態72。Gは、各存在において、独立して、アルデヒド、オキシム、ヒドラゾン、アルキン、アミン、アジド、アシルアジド、アシルハライド、ニトリル、ニトロン、スルフヒドリル、ジスルフィド、スルホニルハライド、イソチオシアネート、イミドエステル、活性化エステル、ケトン、α,β-不飽和カルボニル、アルケン、マレイミド、α-ハロイミド、エポキシド、アジリジン、テトラジン、テトラゾール、ホスフィン、ビオチンまたはチイラン官能基を含む、実施形態71に記載の化合物。
実施形態73。Gは、各存在において、独立して、アルキンまたはアジド基を含む、実施形態71に記載の化合物。
実施形態74。Gは、各存在において、独立して、前記相補的反応性基との反応に際して、アルケン、エステル、アミド、チオエステル、ジスルフィド、カルボン酸基、複素環式またはヘテロアリール基を含む官能基を形成できる反応性基を含む、実施形態71に記載の化合物。
実施形態75。前記ヘテロアリールは、トリアゾリルである、実施形態74に記載の化合物。
実施形態76。L2およびL3は、各存在において、独立して、C1-C6アルキレン、C2-C6アルケニレンまたはC2-C6アルキニレンである、実施形態71~75のいずれか1つに記載の化合物。
実施形態78。各L1aは、非存在である、実施形態71~77のいずれか1つに記載の化合物。
実施形態79。各L1aは、存在する、実施形態71~77のいずれか1つに記載の化合物。
実施形態80。L1aは、各存在において、独立して、ヘテロアルキレンである、実施形態79に記載の化合物。
実施形態83。x1、x2、x3またはx4のうちの少なくとも1個の存在は、1である、実施形態77~82のいずれか1つに記載の化合物。
実施形態84。x1、x2、x3およびx4は、各存在において、各々1である、実施形態77~83のいずれか1つに記載の化合物。
実施形態85。L4は、実施形態2~5のいずれか1項に定義されるとおりである、実施形態71~84のいずれか1つに記載の化合物。
実施形態86。R4は、各存在において、独立して、OH、O-またはORdである、実施形態71~85のいずれか1つに記載の化合物。
実施形態87。R5は、各存在において、オキソである、実施形態71~86のいずれか1つに記載の化合物。
実施形態88。R1は、Hである、実施形態71~87のいずれか1つに記載の化合物。
実施形態89。R2およびR3は、各々独立して、OHまたは-OP(=Ra)(Rb)Rcである、実施形態71~88のいずれか1つに記載の化合物。
実施形態90。R2またはR3のうちの一方は、OHまたは-OP(=Ra)(Rb)Rcであり、R2またはR3のうちの他方は、QまたはQへの共有結合を含むリンカーである、実施形態71~88のいずれか1つに記載の化合物。
実施形態91。R2およびR3は、各々独立して、-OP(=Ra)(Rb)Rcである、実施形態71~88のいずれか1つに記載の化合物。
実施形態92。Rcは、OL’である、実施形態91に記載の化合物。
実施形態93。L’は、Q、標的化部分、分析物分子、固体支持体、固体支持体残基、ヌクレオシドまたは構造(I)のさらなる化合物、に対するヘテロアルキレンリンカーである、実施形態92に記載の化合物。
実施形態94。L’は、アルキレンオキシドもしくはホスホジエステル部分、またはこれらの組み合わせを含む、実施形態93に記載の化合物。
実施形態95。L’は、以下の構造:
を有し、ここで:
m”およびn”は、独立して、1~10の整数であり;
Reは、H、電子対または対イオンであり;
L”は、Reもしくは直接結合であるか、またはQ、標的化部分、分析物分子、固体支持体、固体支持体残基、ヌクレオシドもしくは構造(I)のさらなる化合物への、連結である、実施形態94に記載の化合物。
m”およびn”は、独立して、1~10の整数であり;
Reは、H、電子対または対イオンであり;
L”は、Reもしくは直接結合であるか、またはQ、標的化部分、分析物分子、固体支持体、固体支持体残基、ヌクレオシドもしくは構造(I)のさらなる化合物への、連結である、実施形態94に記載の化合物。
実施形態96。前記標的化部分は、抗体または細胞表面レセプターアンタゴニストである、実施形態91~95に記載の化合物。
実施形態99。Qは、求核性反応性基、求電子性反応性基または環化付加反応性基を含む、実施形態71~98のいずれか1つに記載の化合物。
実施形態100。Qは、スルフヒドリル、ジスルフィド、活性化エステル、イソチオシアネート、アジド、アルキン、アルケン、ジエン、ジエノフィル、酸ハライド、スルホニルハライド、ホスフィン、α-ハロアミド、ビオチン、アミノまたはマレイミド官能基を含む、実施形態99に記載の化合物。
実施形態101。前記活性化エステルは、N-スクシンイミドエステル、イミドエステルまたはポリフルオロフェニルエステルである、実施形態100に記載の化合物。
実施形態102。前記アルキンは、アルキルアジドまたはアシルアジドである、実施形態100に記載の化合物。
実施形態103。Qは、表1から選択される部分である、実施形態71~98のいずれか1つに記載の化合物。
実施形態104。R2またはR3のうちの一方は、OHまたは-OP(=Ra)(Rb)Rcであり、R2またはR3のうちの他方は、分析物分子への共有結合を含むリンカー、標的化部分への共有結合を含むリンカー、または固体支持体への共有結合を含むリンカーである、実施形態61~88のいずれか1つに記載の化合物。
実施形態105。前記分析物分子は、核酸、アミノ酸またはこれらのポリマーである、実施形態104に記載の化合物。
実施形態106。前記分析物分子は、酵素、レセプター、レセプターリガンド、抗体、糖タンパク質、アプタマーまたはプリオンである、実施形態104に記載の化合物。
実施形態107。前記標的化部分は、抗体または細胞表面レセプターアンタゴニストである、実施形態104に記載の化合物。
実施形態108。前記固体支持体は、ポリマービーズまたは非ポリマービーズである、実施形態104に記載の化合物。
実施形態109。mは、各存在において、独立して、1~10の整数である、実施形態71~108のいずれか1つに記載の化合物。
実施形態110。mは、各存在において、独立して、1~5の整数である、実施形態71~108のいずれか1つに記載の化合物。
実施形態111。nは、1~100の整数である、実施形態71~110のいずれか1つに記載の化合物。
実施形態112。nは、1~10の整数である、実施形態71~110のいずれか1つに記載の化合物。
実施形態113。表3から選択される化合物。
実施形態114。分析物分子または標的化部分を標識するための方法であって、該方法は、
(a)R2またはR3は、QまたはQへの共有結合を含むリンカーである実施形態71に記載の化合物と、該分析物分子または該標的化部分とを混合する工程;
(b)該化合物および該分析物分子または該標的化部分の結合体を形成する工程;ならびに
(c)該結合体と式M-L1b-G′の化合物とを反応させて、それによって、少なくとも1個のGおよび少なくとも1個のG′の反応によって少なくとも1個の共有結合を形成する工程、
を包含し、ここで:
Mは、2個またはこれより多くの炭素-炭素二重結合および少なくとも1の共役度を含む部分であり;
L1bは、選択肢的なアルキレン、ヘテロアルキレンまたはヘテロ原子リンカーであり;そして
G′は、Gに対する相補的反応性基である、
方法。
(a)R2またはR3は、QまたはQへの共有結合を含むリンカーである実施形態71に記載の化合物と、該分析物分子または該標的化部分とを混合する工程;
(b)該化合物および該分析物分子または該標的化部分の結合体を形成する工程;ならびに
(c)該結合体と式M-L1b-G′の化合物とを反応させて、それによって、少なくとも1個のGおよび少なくとも1個のG′の反応によって少なくとも1個の共有結合を形成する工程、
を包含し、ここで:
Mは、2個またはこれより多くの炭素-炭素二重結合および少なくとも1の共役度を含む部分であり;
L1bは、選択肢的なアルキレン、ヘテロアルキレンまたはヘテロ原子リンカーであり;そして
G′は、Gに対する相補的反応性基である、
方法。
実施形態115。分析物分子または標的化部分を標識するための方法であって、該方法は、
(a)R2またはR3は、QまたはQへの共有結合を含むリンカーである実施形態71に記載の化合物と、式M-L1b-G′の化合物とを混合し、それによって、GおよびG′の反応によって少なくとも1個の共有結合を形成する工程;ならびに
(b)工程(A)の生成物と該分析物分子または標的化部分とを反応させ、それによって、工程(A)の生成物および該分析物分子または標的化部分の結合体を形成する工程、を包含し、ここで:
Mは、2個またはこれより多くの炭素-炭素二重結合および少なくとも1の共役度を含む部分であり;
L1bは、選択肢的なアルキレン、ヘテロアルキレンまたはヘテロ原子リンカーであり;そして
G′は、Gに対する相補的反応性基である、
方法。
(a)R2またはR3は、QまたはQへの共有結合を含むリンカーである実施形態71に記載の化合物と、式M-L1b-G′の化合物とを混合し、それによって、GおよびG′の反応によって少なくとも1個の共有結合を形成する工程;ならびに
(b)工程(A)の生成物と該分析物分子または標的化部分とを反応させ、それによって、工程(A)の生成物および該分析物分子または標的化部分の結合体を形成する工程、を包含し、ここで:
Mは、2個またはこれより多くの炭素-炭素二重結合および少なくとも1の共役度を含む部分であり;
L1bは、選択肢的なアルキレン、ヘテロアルキレンまたはヘテロ原子リンカーであり;そして
G′は、Gに対する相補的反応性基である、
方法。
実施形態116。実施形態1に記載の化合物を調製するための方法であって、該方法は、実施形態71に記載の化合物と式M-L1b-G′の化合物とを混合し、それによって、GおよびG′の反応によって少なくとも1個の共有結合を形成する工程を包含し、ここで:
Mは、2個またはこれより多くの炭素-炭素二重結合および少なくとも1の共役度を含む部分であり;
L1bは、選択肢的なアルキレン、ヘテロアルキレンまたはヘテロ原子リンカーであり;そして
G′は、Gに対する相補的反応性基である、
方法。
Mは、2個またはこれより多くの炭素-炭素二重結合および少なくとも1の共役度を含む部分であり;
L1bは、選択肢的なアルキレン、ヘテロアルキレンまたはヘテロ原子リンカーであり;そして
G′は、Gに対する相補的反応性基である、
方法。
実施形態117。Y個の蛍光部分Mを含む蛍光化合物であって、ここで該蛍光化合物は、所定の波長の紫外線での励起の際に、同じ波長の紫外線での励起の際の1個のM部分のピーク蛍光発光よりY倍の少なくとも85%のピーク蛍光発光を有し、ここでYは、2またはこれより大きな整数である、蛍光化合物。
実施形態118。1個のM部分のピーク蛍光発光よりY倍の少なくとも90%のピーク蛍光発光を有する、実施形態117に記載の蛍光化合物。
実施形態119。1個のM部分のピーク蛍光発光よりY倍の少なくとも95%のピーク蛍光発光を有する、実施形態117に記載の蛍光化合物。
実施形態120。1個のM部分のピーク蛍光発光よりY倍の少なくとも97%のピーク蛍光発光を有する、実施形態117に記載の蛍光化合物。
実施形態121。1個のM部分のピーク蛍光発光よりY倍の少なくとも99%のピーク蛍光発光を有する、実施形態117に記載の蛍光化合物。
実施形態122。Yは、2~100の整数である、実施形態117~121のいずれか1つに記載の蛍光化合物。
実施形態123。Yは、2~10の整数である、実施形態117~121のいずれか1つに記載の蛍光化合物。
実施形態126。前記蛍光化合物は、独立して、以下の構造:
のうちの1つを有するY個のM部分を含み、ここで
は、該蛍光化合物への結合点を示し、そして前記1個のM部分は、以下の構造:
を有する、実施形態117~123のいずれか1つに記載の蛍光化合物。
実施形態127。前記ピーク蛍光発光は、約500~約550nmの範囲に及ぶ波長にある、実施形態117~126のいずれか1つに記載の蛍光化合物。
実施形態128。前記蛍光化合物は、少なくとも1個のエチレンオキシド部分を含む、実施形態117~127のいずれか1つに記載の蛍光化合物。
実施形態129。実施形態117~128のいずれか1つに記載の蛍光化合物および分析物を含む、組成物。
本明細書において言及される米国特許、米国特許出願公開、米国特許出願、外国特許、外国特許出願および非特許刊行物の全ては、本記載と矛盾しない程度までそれらの全体において本明細書に参考として援用される。
前述から、本発明の具体的実施形態が例証目的のために本明細書で記載されてきたものの、本発明の趣旨および範囲から逸脱することなく、種々の改変がなされ得ることは認識される。よって、本発明は、添付の特許請求の範囲による場合を除いて限定されない。
前述から、本発明の具体的実施形態が例証目的のために本明細書で記載されてきたものの、本発明の趣旨および範囲から逸脱することなく、種々の改変がなされ得ることは認識される。よって、本発明は、添付の特許請求の範囲による場合を除いて限定されない。
本発明のまた別の態様は、以下のとおりであってもよい。
〔1〕
以下の構造(I):
を有する化合物、またはその立体異性体、塩もしくは互変異性体であって、ここで:
Mは、各存在において、独立して、2個またはこれより多くの炭素-炭素二重結合および少なくとも1の共役度を含む部分であり;
L 1 は、各存在において、独立して、i)選択肢的なアルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、ヘテロアルケニレン、ヘテロアルキニレンもしくはヘテロ原子リンカー;またはii)2個の相補的反応性基の反応によって形成できる官能基を含むリンカー、のいずれかであり;
L 2 およびL 3 は、各存在において、独立して、選択肢的なアルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、ヘテロアルケニレン、ヘテロアルキニレンもしくはヘテロ原子リンカーであり;
L 4 は、各存在において、独立して、長さが3原子より大きいヘテロアルキレン、ヘテロアルケニレンまたはヘテロアルキニレンリンカーであり、ここで該ヘテロアルキレン、ヘテロアルケニレンおよびヘテロアルキニレンリンカー中のヘテロ原子は、O、NおよびSから選択され;
R 1 は、各存在において、独立して、H、アルキルまたはアルコキシであり;
R 2 およびR 3 は、各々独立して、H、OH、SH、アルキル、アルコキシ、アルキルエーテル、ヘテロアルキル、-OP(=R a )(R b )R c 、Q、もしくはその保護された形態、またはL’であり;
R 4 は、各存在において、独立して、OH、SH、O - 、S - 、OR d またはSR d であり;
R 5 は、各存在において、独立して、オキソ、チオキソまたは非存在であり;
R a は、OまたはSであり;
R b は、OH、SH、O - 、S - 、OR d またはSR d であり;
R c は、OH、SH、O - 、S - 、OR d 、OL’、SR d 、アルキル、アルコキシ、ヘテロアルキル、ヘテロアルコキシ、アルキルエーテル、アルコキシアルキルエーテル、ホスフェート、チオホスフェート、ホスホアルキル、チオホスホアルキル、ホスホアルキルエーテルまたはチオホスホアルキルエーテルであり;
R d は、対イオンであり;
Qは、各存在において、独立して、分析物分子、標的化部分、固体支持体または相補的反応性基Q′と共有結合を形成できる反応性基またはその保護された形態を含む部分であり;
L’は、各存在において、独立して、Qへの共有結合を含むリンカー、標的化部分への共有結合を含むリンカー、分析物分子への共有結合を含むリンカー、固体支持体への共有結合を含むリンカー、固体支持体残基への共有結合を含むリンカー、ヌクレオシドへの共有結合を含むリンカーまたは構造(I)のさらなる化合物への共有結合を含むリンカーであり;
mは、各存在において、独立して、0またはこれより大きな整数であるが、ただしmの少なくとも1個の存在は、1またはこれより大きな整数であり;そして
nは、1またはこれより大きな整数である、
化合物、またはその立体異性体、塩もしくは互変異性体。
〔2〕
L 4 は、各存在において、独立して、ヘテロアルキレンリンカーである、前記〔1〕に記載の化合物。
〔3〕
L 4 は、各存在において、独立して、アルキレンオキシドリンカーである、前記〔2〕に記載の化合物。
〔4〕
L 4 は、ポリエチレンオキシドであり、前記化合物は、以下の構造(IA):
を有し、ここでzは、2~100の整数である、前記〔1〕に記載の化合物。
〔5〕
zは、3~6の整数である、前記〔4〕に記載の化合物。
〔6〕
L 1 は、各存在において、2個の相補的反応性基の反応によって形成できる官能基を含むリンカーである、前記〔1〕に記載の化合物。
〔7〕
L 1 の少なくとも1個の存在に関して、前記官能基は、アルデヒド、オキシム、ヒドラゾン、アルキン、アミン、アジド、アシルアジド、アシルハライド、ニトリル、ニトロン、スルフヒドリル、ジスルフィド、スルホニルハライド、イソチオシアネート、イミドエステル、活性化エステル、ケトン、α,β-不飽和カルボニル、アルケン、マレイミド、α-ハロイミド、エポキシド、アジリジン、テトラジン、テトラゾール、ホスフィン、ビオチンまたはチイラン官能基と、相補的反応性基との反応によって形成できる、前記〔6〕に記載の化合物。
〔8〕
L 1 の少なくとも1個の存在に関して、前記官能基は、アルキンおよびアジドの反応によって形成できる、前記〔6〕に記載の化合物。
〔9〕
L 1 の少なくとも1個の存在に関して、前記官能基は、アルケン、エステル、アミド、チオエステル、チオウレア、ジスルフィド、カルボン酸、複素環式またはヘテロアリール基を含む、前記〔6〕に記載の化合物。
〔10〕
L 1 の少なくとも1個の存在に関して、L 1 は、トリアゾリル官能基を含むリンカーである、前記〔6〕に記載の化合物。
〔11〕
L 1 の少なくとも1個の存在に関して、L 1 -Mは、以下の構造:
を有し、ここでL
1a
およびL
1b
は、各々独立して、選択肢的なリンカーである、前記〔6〕に記載の化合物。
〔12〕
L 1 の少なくとも1個の存在に関して、L 1 -Mは、以下の構造:
を有し、ここでL
1a
およびL
1b
は、各々独立して、選択肢的なリンカーである、前記〔6〕に記載の化合物。
〔13〕
L 1a もしくはL 1b 、または両方は、非存在である、前記〔11〕に記載の化合物。
〔14〕
L 1a もしくはL 1b 、または両方は、存在する、前記〔11〕に記載の化合物。
〔15〕
L 1a およびL 1b は、存在する場合、各々独立して、アルキレンまたはヘテロアルキレンである、前記〔14〕に記載の化合物。
〔16〕
L 1a およびL 1b は、存在する場合、独立して、以下の構造:
のうちの1つを有する、前記〔14〕に記載の化合物。
〔17〕
L 1 は、各存在において、独立して、選択肢的なアルキレンまたはヘテロアルキレンリンカーである、前記〔1〕に記載の化合物。
〔18〕
L 2 およびL 3 は、各存在において、独立して、C 1 -C 6 アルキレン、C 2 -C 6 アルケニレンまたはC 2 -C 6 アルキニレンである、前記〔1〕に記載の化合物。
〔19〕
前記化合物は、以下の構造(IB):
を有し、ここで:
x 1 、x 2 、x 3 およびx 4 は、各存在において、独立して、0~6の整数であり、そして
zは、2~100の整数である、
前記〔1〕に記載の化合物。
〔20〕
x 1 、x 2 、x 3 またはx 4 のうちの少なくとも1個の存在は、1である、前記〔19〕に記載の化合物。
〔21〕
x 1 、x 2 、x 3 およびx 4 は、各存在において、各々1である、前記〔19〕に記載の化合物。
〔22〕
L 1 は、各存在において、独立して、トリアゾリル官能基を含む、前記〔19〕に記載の化合物。
〔23〕
L 1 は、各存在において、独立して、選択肢的なアルキレンまたはヘテロアルキレンリンカーである、前記〔19〕に記載の化合物。
〔24〕
R 4 は、各存在において、独立して、OH、O - またはOR d である、前記〔1〕に記載の化合物。
〔25〕
R 5 は、各存在において、オキソである、前記〔1〕に記載の化合物。
〔26〕
R 1 は、各存在において、Hである、前記〔1〕に記載の化合物。
〔27〕
R 2 およびR 3 は、各々独立して、OHまたは-OP(=R a )(R b )R c である、前記〔1〕に記載の化合物。
〔28〕
R 2 またはR 3 のうちの一方は、OHまたは-OP(=R a )(R b )R c であり、R 2 またはR 3 のうちの他方は、QまたはQへの共有結合を含むリンカーである、前記〔1〕に記載の化合物。
〔29〕
R 2 およびR 3 は、各々独立して、-OP(=R a )(R b )R c である、前記〔1〕に記載の化合物。
〔30〕
R c は、OL’である、前記〔29〕に記載の化合物。
〔31〕
L’は、Q、標的化部分、分析物分子、固体支持体、固体支持体残基、ヌクレオシドまたは構造(I)のさらなる化合物への、ヘテロアルキレンリンカーである、前記〔30〕に記載の化合物。
〔32〕
L’は、アルキレンオキシドもしくはホスホジエステル部分、またはこれらの組み合わせを含む、前記〔31〕に記載の化合物。
〔33〕
L’は、以下の構造:
を有し、ここで:
m”およびn”は、独立して、1~10の整数であり;
R e は、H、電子対または対イオンであり;
L”は、R e もしくは直接結合であるか、またはQ、標的化部分、分析物分子、固体支持体、固体支持体残基、ヌクレオシドもしくは構造(I)のさらなる化合物への、連結である、
前記〔32〕に記載の化合物。
〔34〕
前記標的化部分は、抗体または細胞表面レセプターアンタゴニストである、前記〔31〕に記載の化合物。
〔35〕
R 2 またはR 3 は、以下の構造:
のうちの1つを有する、前記〔29〕に記載の化合物。
〔36〕
R 2 またはR 3 は、以下の構造:
を有する、前記〔29〕に記載の化合物。
〔37〕
Qは、求核性反応性基、求電子性反応性基または環化付加反応性基を含む、前記〔1〕に記載の化合物。
〔38〕
Qは、スルフヒドリル、ジスルフィド、活性化エステル、イソチオシアネート、アジド、アルキン、アルケン、ジエン、ジエノフィル、酸ハライド、スルホニルハライド、ホスフィン、α-ハロアミド、ビオチン、アミノまたはマレイミド官能基を含む、前記〔37〕に記載の化合物。
〔39〕
前記活性化エステルは、N-スクシンイミドエステル、イミドエステルまたはポリフルオロフェニルエステルである、前記〔38〕に記載の化合物。
〔40〕
前記アルキンは、アルキルアジドまたはアシルアジドである、前記〔38〕に記載の化合物。
〔41〕
Qは、表1から選択される部分を含む、前記〔1〕に記載の化合物。
〔42〕
R 2 またはR 3 のうちの一方は、OHまたは-OP(=R a )(R b )R c であり、R 2 またはR 3 のうちの他方は、分析物分子への共有結合を含むリンカー、標的化部分への共有結合を含むリンカー、または固体支持体への共有結合を含むリンカーである、前記〔1〕に記載の化合物。
〔43〕
前記分析物分子は、核酸、アミノ酸またはこれらのポリマーである、前記〔42〕に記載の化合物。
〔44〕
前記分析物分子は、酵素、レセプター、レセプターリガンド、抗体、糖タンパク質、アプタマーまたはプリオンである、前記〔42〕に記載の化合物。
〔45〕
前記標的化部分は、抗体または細胞表面レセプターアンタゴニストである、前記〔42〕に記載の化合物。
〔46〕
前記固体支持体は、ポリマービーズまたは非ポリマービーズである、前記〔42〕に記載の化合物。
〔47〕
mは、各存在において、独立して、1~10の整数である、前記〔1〕に記載の化合物。
〔48〕
mは、各存在において、独立して、1~5の整数である、前記〔1〕に記載の化合物。
〔49〕
nは、1~100の整数である、前記〔1〕に記載の化合物。
〔50〕
nは、1~10の整数である、前記〔1〕に記載の化合物。
〔51〕
Mは、各存在において、独立して、4個もしくはこれより多くのアリールもしくはヘテロアリール環、またはこれらの組み合わせを含む部分である、前記〔1〕に記載の化合物。
〔52〕
Mは、各存在において、独立して、蛍光性または有色である、前記〔1〕に記載の化合物。
〔53〕
Mは、蛍光性である、前記〔52〕に記載の化合物。
〔54〕
Mは、各存在において、独立して、少なくとも4個の縮合環を含む縮合多環式アリール部分を含む、前記〔1〕に記載の化合物。
〔55〕
Mは、各存在において、独立して、ジメチルアミノスチルベン、キナクリドン、フルオロフェニル-ジメチル-BODIPY、his-フルオロフェニル-BODIPY、アクリジン、テリレン、セキシフェニル、ポルフィリン、ベンゾピレン、(フルオロフェニル-ジメチル-ジフルオロボラ-ジアザ-インダセン)フェニル、(ビス-フルオロフェニル-ジフルオロボラ-ジアザ-インダセン)フェニル、クアテルフェニル、ビ-ベンゾチアゾール、ター-ベンゾチアゾール、ビ-ナフチル、ビ-アントラシル、スクアライン、スクアリリウム、9,10-エチニルアントラセンまたはター-ナフチル部分である、前記〔1〕に記載の化合物。
〔56〕
Mは、各存在において、独立して、p-ターフェニル、ペリレン、アゾベンゼン、フェナジン、フェナントロリン、アクリジン、チオキサントレン、クリセン、ルブレン、コロネン、シアニン、ペリレンイミド、もしくはペリレンアミドまたはその誘導体である、前記〔1〕に記載の化合物。
〔57〕
Mは、各存在において、独立して、クマリン染料、レゾルフィン染料、ジピロメテンボロンジフルオリド染料、ルテニウムビピリジル染料、エネルギー移動染料、チアゾールオレンジ染料、ポリメチンまたはN-アリール-1,8-ナフタルイミド染料である、前記〔1〕に記載の化合物。
〔58〕
Mは、各存在において、独立して、ピレン、ペリレン、ペリレンモノイミドもしくは6-FAMまたはその誘導体である、前記〔1〕に記載の化合物。
〔59〕
Mは、各存在において、独立して、以下の構造:
のうちの1つを有する、前記〔1〕に記載の化合物。
〔60〕
表2から選択される化合物。
〔61〕
サンプルを染色するための方法であって、該方法は、該サンプルに、前記〔1〕に記載の化合物を、該サンプルが適切な波長で照射される場合に光学的応答を生じるために十分な量で添加する工程を包含する方法。
〔62〕
前記光学的応答は、蛍光応答である、前記〔61〕に記載の方法。
〔63〕
前記サンプルは、細胞を含む、前記〔61〕に記載の方法。
〔64〕
前記細胞をフローサイトメトリーによって観察する工程をさらに包含する、前記〔63〕に記載の方法。
〔65〕
前記蛍光応答を、検出可能に異なる光学的特性を有する第2の発蛍光団の蛍光応答から区別する工程をさらに包含する、前記〔62〕に記載の方法。
〔66〕
分析物分子を視覚的に検出するための方法であって、該方法は、
(a)R 2 またはR 3 は、該分析物分子への共有結合を含むリンカーである前記〔1〕の化合物を提供する工程;および
(b)該化合物をその視覚的特性によって検出する工程、
を包含する方法。
〔67〕
分析物分子を視覚的に検出するための方法であって、該方法は、
(a)R 2 またはR 3 は、QまたはQへの共有結合を含むリンカーである前記〔1〕に記載の化合物と、該分析物分子とを混合する工程;
(b)該化合物および該分析物分子の結合体を形成する工程;ならびに
(c)該結合体をその視覚的特性によって検出する工程、
を包含する方法。
〔68〕
分析物を視覚的に検出するための方法であって、該方法は、
(a)R 2 またはR 3 は、該分析物分子に対する特異性を有する標的化部分への共有結合を含むリンカーを含む前記〔1〕に記載の化合物を提供する工程;
(b)該化合物および該分析物を混合し、それによって、該標的化部分および該分析物を会合させる工程;ならびに
(c)該化合物をその視覚的特性によって検出する工程、
を包含する方法。
〔69〕
前記〔1〕に記載の化合物および1もしくはこれより多くの分析物分子を含む、組成物。
〔70〕
前記1もしくはこれより多くの分析物分子の検出のための分析方法における前記〔69〕に記載の組成物の使用。
〔71〕
以下の構造(II):
を有する化合物、またはその立体異性体、塩もしくは互変異性体であって、ここで:
Gは、各存在において、独立して、相補的反応性基と共有結合を形成できる反応性基またはその保護されたアナログを含む部分であり;
L 1a 、L 2 およびL 3 は、各存在において、独立して、選択肢的なアルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、ヘテロアルケニレン、ヘテロアルキニレンもしくはヘテロ原子リンカーであり;
L 4 は、各存在において、独立して、長さが3原子より大きいヘテロアルキレン、ヘテロアルケニレンまたはヘテロアルキニレンリンカーであり、ここで該ヘテロアルキレン、ヘテロアルケニレンおよびヘテロアルキニレンリンカー中のヘテロ原子は、O、NおよびSから選択され;
R 1 は、各存在において、独立して、H、アルキルまたはアルコキシであり;
R 2 およびR 3 は、各々独立して、H、OH、SH、アルキル、アルコキシ、アルキルエーテル、ヘテロアルキル、-OP(=R a )(R b )R c 、QまたはL’であり;
R 4 は、各存在において、独立して、OH、SH、O - 、S - 、OR d またはSR d であり;
R 5 は、各存在において、独立して、オキソ、チオキソまたは非存在であり;
R a は、OまたはSであり;
R b は、OH、SH、O - 、S - 、OR d またはSR d であり;
R c は、OH、SH、O - 、S - 、OR d 、OL’、SR d 、アルキル、アルコキシ、アルキルエーテル、アルコキシアルキルエーテル、ホスフェート、チオホスフェート、ホスホアルキル、チオホスホアルキル、ホスホアルキルエーテルまたはチオホスホアルキルエーテルであり;
R d は、対イオンであり;
Qは、各存在において、独立して、分析物分子、標的化部分、固体支持体もしくは相補的反応性基Q′と共有結合を形成できる反応性基またはその保護されたアナログを含む部分であり;
L’は、各存在において、独立して、Qへの共有結合を含むリンカー、標的化部分への共有結合を含むリンカー、分析物分子への共有結合を含むリンカー、固体支持体への共有結合を含むリンカー、固体支持体残基への共有結合を含むリンカー、ヌクレオシドへの共有結合を含むリンカーまたは構造(II)のさらなる化合物への共有結合を含むリンカーであり;
mは、各存在において、独立して、0またはこれより大きな整数であるが、ただしmの少なくとも1個の存在は、1またはこれより大きな整数であり;そして
nは、1またはこれより大きな整数である、
化合物、またはその立体異性体、塩もしくは互変異性体。
〔72〕
Gは、各存在において、独立して、アルデヒド、オキシム、ヒドラゾン、アルキン、アミン、アジド、アシルアジド、アシルハライド、ニトリル、ニトロン、スルフヒドリル、ジスルフィド、スルホニルハライド、イソチオシアネート、イミドエステル、活性化エステル、ケトン、α,β-不飽和カルボニル、アルケン、マレイミド、α-ハロイミド、エポキシド、アジリジン、テトラジン、テトラゾール、ホスフィン、ビオチンまたはチイラン官能基を含む、前記〔71〕に記載の化合物。
〔73〕
Gは、各存在において、独立して、アルキンまたはアジド基を含む、前記〔71〕に記載の化合物。
〔74〕
Gは、各存在において、独立して、前記相補的反応性基との反応に際して、アルケン、エステル、アミド、チオエステル、ジスルフィド、カルボン酸基、複素環式またはヘテロアリール基を含む官能基を形成できる反応性基を含む、前記〔71〕に記載の化合物。
〔75〕
前記ヘテロアリールは、トリアゾリルである、前記〔74〕に記載の化合物。
〔76〕
L 2 およびL 3 は、各存在において、独立して、C 1 -C 6 アルキレン、C 2 -C 6 アルケニレンまたはC 2 -C 6 アルキニレンである、前記〔71〕に記載の化合物。
〔77〕
前記化合物は、以下の構造(IIA):
を有し、ここで:
x 1 、x 2 、x 3 およびx 4 は、各存在において、独立して、0~6の整数である、
前記〔71〕に記載の化合物。
〔78〕
各L 1a は、非存在である、前記〔71〕に記載の化合物。
〔79〕
各L 1a は、存在する、前記〔71〕に記載の化合物。
〔80〕
L 1a は、各存在において、独立して、ヘテロアルキレンである、前記〔79〕に記載の化合物。
〔81〕
L 1a は、以下の構造:
を有する、前記〔80〕に記載の化合物。
〔82〕
Gは、各存在において、独立して、
である、前記〔81〕に記載の化合物。
〔83〕
x 1 、x 2 、x 3 またはx 4 のうちの少なくとも1個の存在は、1である、前記〔77〕に記載の化合物。
〔84〕
x 1 、x 2 、x 3 およびx 4 は、各存在において、各々1である、前記〔77〕に記載の化合物。
〔85〕
L 4 は、前記〔2〕~〔5〕のいずれか1項に定義されるとおりである、前記〔71〕に記載の化合物。
〔86〕
R 4 は、各存在において、独立して、OH、O - またはOR d である、前記〔71〕に記載の化合物。
〔87〕
R 5 は、各存在において、オキソである、前記〔71〕に記載の化合物。
〔88〕
R 1 は、Hである、前記〔71〕に記載の化合物。
〔89〕
R 2 およびR 3 は、各々独立して、OHまたは-OP(=R a )(R b )R c である、前記〔71〕に記載の化合物。
〔90〕
R 2 またはR 3 のうちの一方は、OHまたは-OP(=R a )(R b )R c であり、R 2 またはR 3 のうちの他方は、QまたはQへの共有結合を含むリンカーである、前記〔71〕に記載の化合物。
〔91〕
R 2 およびR 3 は、各々独立して、-OP(=R a )(R b )R c である、前記〔71〕に記載の化合物。
〔92〕
R c は、OL’である、前記〔91〕に記載の化合物。
〔93〕
L’は、Q、標的化部分、分析物分子、固体支持体、固体支持体残基、ヌクレオシドまたは構造(I)のさらなる化合物、に対するヘテロアルキレンリンカーである、前記〔92〕に記載の化合物。
〔94〕
L’は、アルキレンオキシドもしくはホスホジエステル部分、またはこれらの組み合わせを含む、前記〔93〕に記載の化合物。
〔95〕
L’は、以下の構造:
を有し、ここで:
m”およびn”は、独立して、1~10の整数であり;
R e は、H、電子対または対イオンであり;
L”は、R e もしくは直接結合であるか、またはQ、標的化部分、分析物分子、固体支持体、固体支持体残基、ヌクレオシドもしくは構造(I)のさらなる化合物への、連結である、前記〔94〕に記載の化合物。
〔96〕
前記標的化部分は、抗体または細胞表面レセプターアンタゴニストである、前記〔91〕に記載の化合物。
〔97〕
R 2 またはR 3 は、以下の構造:
のうちの1つを有する、前記〔91〕に記載の化合物。
〔98〕
R 2 またはR 3 は、以下の構造:
を有する、前記〔91〕に記載の化合物。
〔99〕
Qは、求核性反応性基、求電子性反応性基または環化付加反応性基を含む、前記〔71〕に記載の化合物。
〔100〕
Qは、スルフヒドリル、ジスルフィド、活性化エステル、イソチオシアネート、アジド、アルキン、アルケン、ジエン、ジエノフィル、酸ハライド、スルホニルハライド、ホスフィン、α-ハロアミド、ビオチン、アミノまたはマレイミド官能基を含む、前記〔99〕に記載の化合物。
〔101〕
前記活性化エステルは、N-スクシンイミドエステル、イミドエステルまたはポリフルオロフェニルエステルである、前記〔100〕に記載の化合物。
〔102〕
前記アルキンは、アルキルアジドまたはアシルアジドである、前記〔100〕に記載の化合物。
〔103〕
Qは、表1から選択される部分である、前記〔71〕に記載の化合物。
〔104〕
R 2 またはR 3 のうちの一方は、OHまたは-OP(=R a )(R b )R c であり、R 2 またはR 3 のうちの他方は、分析物分子への共有結合を含むリンカー、標的化部分への共有結合を含むリンカー、または固体支持体への共有結合を含むリンカーである、前記〔71〕に記載の化合物。
〔105〕
前記分析物分子は、核酸、アミノ酸またはこれらのポリマーである、前記〔104〕に記載の化合物。
〔106〕
前記分析物分子は、酵素、レセプター、レセプターリガンド、抗体、糖タンパク質、アプタマーまたはプリオンである、前記〔104〕に記載の化合物。
〔107〕
前記標的化部分は、抗体または細胞表面レセプターアンタゴニストである、前記〔104〕に記載の化合物。
〔108〕
前記固体支持体は、ポリマービーズまたは非ポリマービーズである、前記〔104〕に記載の化合物。
〔109〕
mは、各存在において、独立して、1~10の整数である、前記〔71〕に記載の化合物。
〔110〕
mは、各存在において、独立して、1~5の整数である、前記〔71〕に記載の化合物。
〔111〕
nは、1~100の整数である、前記〔71〕に記載の化合物。
〔112〕
nは、1~10の整数である、前記〔71〕に記載の化合物。
〔113〕
表3から選択される化合物。
〔114〕
分析物分子または標的化部分を標識するための方法であって、該方法は、
(a)R 2 またはR 3 は、QまたはQへの共有結合を含むリンカーである前記〔71〕に記載の化合物と、該分析物分子または該標的化部分とを混合する工程;
(b)該化合物および該分析物分子または該標的化部分の結合体を形成する工程;ならびに
(c)該結合体と式M-L 1b -G′の化合物とを反応させて、それによって、少なくとも1個のGおよび少なくとも1個のG′の反応によって少なくとも1個の共有結合を形成する工程、
を包含し、ここで:
Mは、2個またはこれより多くの炭素-炭素二重結合および少なくとも1の共役度を含む部分であり;
L 1b は、選択肢的なアルキレン、ヘテロアルキレンまたはヘテロ原子リンカーであり;そして
G′は、Gに対する相補的反応性基である、
方法。
〔115〕
分析物分子または標的化部分を標識するための方法であって、該方法は、
(a)R 2 またはR 3 は、QまたはQへの共有結合を含むリンカーである前記〔71〕に記載の化合物と、式M-L 1b -G′の化合物とを混合し、それによって、GおよびG′の反応によって少なくとも1個の共有結合を形成する工程;ならびに
(b)工程(A)の生成物と該分析物分子または標的化部分とを反応させ、それによって、工程(A)の生成物および該分析物分子または標的化部分の結合体を形成する工程、を包含し、ここで:
Mは、2個またはこれより多くの炭素-炭素二重結合および少なくとも1の共役度を含む部分であり;
L 1b は、選択肢的なアルキレン、ヘテロアルキレンまたはヘテロ原子リンカーであり;そして
G′は、Gに対する相補的反応性基である、
方法。
〔116〕
前記〔1〕に記載の化合物を調製するための方法であって、該方法は、前記〔71〕に記載の化合物と式M-L 1b -G′の化合物とを混合し、それによって、GおよびG′の反応によって少なくとも1個の共有結合を形成する工程を包含し、ここで:
Mは、2個またはこれより多くの炭素-炭素二重結合および少なくとも1の共役度を含む部分であり;
L 1b は、選択肢的なアルキレン、ヘテロアルキレンまたはヘテロ原子リンカーであり;そして
G′は、Gに対する相補的反応性基である、
方法。
〔117〕
Y個の蛍光部分Mを含む蛍光化合物であって、ここで該蛍光化合物は、所定の波長の紫外線での励起の際に、同じ波長の紫外線での励起の際の1個のM部分のピーク蛍光発光よりY倍の少なくとも85%のピーク蛍光発光を有し、ここでYは、2またはこれより大きな整数である、蛍光化合物。
〔118〕
1個のM部分のピーク蛍光発光よりY倍の少なくとも90%のピーク蛍光発光を有する、前記〔117〕に記載の蛍光化合物。
〔119〕
1個のM部分のピーク蛍光発光よりY倍の少なくとも95%のピーク蛍光発光を有する、前記〔117〕に記載の蛍光化合物。
〔120〕
1個のM部分のピーク蛍光発光よりY倍の少なくとも97%のピーク蛍光発光を有する、前記〔117〕に記載の蛍光化合物。
〔121〕
1個のM部分のピーク蛍光発光よりY倍の少なくとも99%のピーク蛍光発光を有する、前記〔117〕に記載の蛍光化合物。
〔122〕
Yは、2~100の整数である、前記〔117〕に記載の蛍光化合物。
〔123〕
Yは、2~10の整数である、前記〔117〕に記載の蛍光化合物。
〔124〕
前記Y個のM部分は、独立して、以下の構造:
のうちの1つを有し、ここで
は、前記蛍光化合物への結合点を示す、前記〔117〕に記載の蛍光化合物。
〔125〕
前記1個のM部分は、独立して、以下の構造:
のうちの1つを有する、前記〔117〕に記載の蛍光化合物。
〔126〕
前記蛍光化合物は、独立して、以下の構造:
のうちの1つを有するY個のM部分を含み、ここで
は、該蛍光化合物への結合点を示し、そして前記1個のM部分は、以下の構造:
を有する、前記〔117〕に記載の蛍光化合物。
〔127〕
前記ピーク蛍光発光は、約500~約550nmの範囲に及ぶ波長にある、前記〔117〕に記載の蛍光化合物。
〔128〕
前記蛍光化合物は、少なくとも1個のエチレンオキシド部分を含む、前記〔117〕に記載の蛍光化合物。
〔129〕
前記〔117〕に記載の蛍光化合物および分析物を含む、組成物。
本発明のまた別の態様は、以下のとおりであってもよい。
〔1〕
以下の構造(I):
Mは、各存在において、独立して、2個またはこれより多くの炭素-炭素二重結合および少なくとも1の共役度を含む部分であり;
L 1 は、各存在において、独立して、i)選択肢的なアルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、ヘテロアルケニレン、ヘテロアルキニレンもしくはヘテロ原子リンカー;またはii)2個の相補的反応性基の反応によって形成できる官能基を含むリンカー、のいずれかであり;
L 2 およびL 3 は、各存在において、独立して、選択肢的なアルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、ヘテロアルケニレン、ヘテロアルキニレンもしくはヘテロ原子リンカーであり;
L 4 は、各存在において、独立して、長さが3原子より大きいヘテロアルキレン、ヘテロアルケニレンまたはヘテロアルキニレンリンカーであり、ここで該ヘテロアルキレン、ヘテロアルケニレンおよびヘテロアルキニレンリンカー中のヘテロ原子は、O、NおよびSから選択され;
R 1 は、各存在において、独立して、H、アルキルまたはアルコキシであり;
R 2 およびR 3 は、各々独立して、H、OH、SH、アルキル、アルコキシ、アルキルエーテル、ヘテロアルキル、-OP(=R a )(R b )R c 、Q、もしくはその保護された形態、またはL’であり;
R 4 は、各存在において、独立して、OH、SH、O - 、S - 、OR d またはSR d であり;
R 5 は、各存在において、独立して、オキソ、チオキソまたは非存在であり;
R a は、OまたはSであり;
R b は、OH、SH、O - 、S - 、OR d またはSR d であり;
R c は、OH、SH、O - 、S - 、OR d 、OL’、SR d 、アルキル、アルコキシ、ヘテロアルキル、ヘテロアルコキシ、アルキルエーテル、アルコキシアルキルエーテル、ホスフェート、チオホスフェート、ホスホアルキル、チオホスホアルキル、ホスホアルキルエーテルまたはチオホスホアルキルエーテルであり;
R d は、対イオンであり;
Qは、各存在において、独立して、分析物分子、標的化部分、固体支持体または相補的反応性基Q′と共有結合を形成できる反応性基またはその保護された形態を含む部分であり;
L’は、各存在において、独立して、Qへの共有結合を含むリンカー、標的化部分への共有結合を含むリンカー、分析物分子への共有結合を含むリンカー、固体支持体への共有結合を含むリンカー、固体支持体残基への共有結合を含むリンカー、ヌクレオシドへの共有結合を含むリンカーまたは構造(I)のさらなる化合物への共有結合を含むリンカーであり;
mは、各存在において、独立して、0またはこれより大きな整数であるが、ただしmの少なくとも1個の存在は、1またはこれより大きな整数であり;そして
nは、1またはこれより大きな整数である、
化合物、またはその立体異性体、塩もしくは互変異性体。
〔2〕
L 4 は、各存在において、独立して、ヘテロアルキレンリンカーである、前記〔1〕に記載の化合物。
〔3〕
L 4 は、各存在において、独立して、アルキレンオキシドリンカーである、前記〔2〕に記載の化合物。
〔4〕
L 4 は、ポリエチレンオキシドであり、前記化合物は、以下の構造(IA):
〔5〕
zは、3~6の整数である、前記〔4〕に記載の化合物。
〔6〕
L 1 は、各存在において、2個の相補的反応性基の反応によって形成できる官能基を含むリンカーである、前記〔1〕に記載の化合物。
〔7〕
L 1 の少なくとも1個の存在に関して、前記官能基は、アルデヒド、オキシム、ヒドラゾン、アルキン、アミン、アジド、アシルアジド、アシルハライド、ニトリル、ニトロン、スルフヒドリル、ジスルフィド、スルホニルハライド、イソチオシアネート、イミドエステル、活性化エステル、ケトン、α,β-不飽和カルボニル、アルケン、マレイミド、α-ハロイミド、エポキシド、アジリジン、テトラジン、テトラゾール、ホスフィン、ビオチンまたはチイラン官能基と、相補的反応性基との反応によって形成できる、前記〔6〕に記載の化合物。
〔8〕
L 1 の少なくとも1個の存在に関して、前記官能基は、アルキンおよびアジドの反応によって形成できる、前記〔6〕に記載の化合物。
〔9〕
L 1 の少なくとも1個の存在に関して、前記官能基は、アルケン、エステル、アミド、チオエステル、チオウレア、ジスルフィド、カルボン酸、複素環式またはヘテロアリール基を含む、前記〔6〕に記載の化合物。
〔10〕
L 1 の少なくとも1個の存在に関して、L 1 は、トリアゾリル官能基を含むリンカーである、前記〔6〕に記載の化合物。
〔11〕
L 1 の少なくとも1個の存在に関して、L 1 -Mは、以下の構造:
〔12〕
L 1 の少なくとも1個の存在に関して、L 1 -Mは、以下の構造:
〔13〕
L 1a もしくはL 1b 、または両方は、非存在である、前記〔11〕に記載の化合物。
〔14〕
L 1a もしくはL 1b 、または両方は、存在する、前記〔11〕に記載の化合物。
〔15〕
L 1a およびL 1b は、存在する場合、各々独立して、アルキレンまたはヘテロアルキレンである、前記〔14〕に記載の化合物。
〔16〕
L 1a およびL 1b は、存在する場合、独立して、以下の構造:
〔17〕
L 1 は、各存在において、独立して、選択肢的なアルキレンまたはヘテロアルキレンリンカーである、前記〔1〕に記載の化合物。
〔18〕
L 2 およびL 3 は、各存在において、独立して、C 1 -C 6 アルキレン、C 2 -C 6 アルケニレンまたはC 2 -C 6 アルキニレンである、前記〔1〕に記載の化合物。
〔19〕
前記化合物は、以下の構造(IB):
x 1 、x 2 、x 3 およびx 4 は、各存在において、独立して、0~6の整数であり、そして
zは、2~100の整数である、
前記〔1〕に記載の化合物。
〔20〕
x 1 、x 2 、x 3 またはx 4 のうちの少なくとも1個の存在は、1である、前記〔19〕に記載の化合物。
〔21〕
x 1 、x 2 、x 3 およびx 4 は、各存在において、各々1である、前記〔19〕に記載の化合物。
〔22〕
L 1 は、各存在において、独立して、トリアゾリル官能基を含む、前記〔19〕に記載の化合物。
〔23〕
L 1 は、各存在において、独立して、選択肢的なアルキレンまたはヘテロアルキレンリンカーである、前記〔19〕に記載の化合物。
〔24〕
R 4 は、各存在において、独立して、OH、O - またはOR d である、前記〔1〕に記載の化合物。
〔25〕
R 5 は、各存在において、オキソである、前記〔1〕に記載の化合物。
〔26〕
R 1 は、各存在において、Hである、前記〔1〕に記載の化合物。
〔27〕
R 2 およびR 3 は、各々独立して、OHまたは-OP(=R a )(R b )R c である、前記〔1〕に記載の化合物。
〔28〕
R 2 またはR 3 のうちの一方は、OHまたは-OP(=R a )(R b )R c であり、R 2 またはR 3 のうちの他方は、QまたはQへの共有結合を含むリンカーである、前記〔1〕に記載の化合物。
〔29〕
R 2 およびR 3 は、各々独立して、-OP(=R a )(R b )R c である、前記〔1〕に記載の化合物。
〔30〕
R c は、OL’である、前記〔29〕に記載の化合物。
〔31〕
L’は、Q、標的化部分、分析物分子、固体支持体、固体支持体残基、ヌクレオシドまたは構造(I)のさらなる化合物への、ヘテロアルキレンリンカーである、前記〔30〕に記載の化合物。
〔32〕
L’は、アルキレンオキシドもしくはホスホジエステル部分、またはこれらの組み合わせを含む、前記〔31〕に記載の化合物。
〔33〕
L’は、以下の構造:
m”およびn”は、独立して、1~10の整数であり;
R e は、H、電子対または対イオンであり;
L”は、R e もしくは直接結合であるか、またはQ、標的化部分、分析物分子、固体支持体、固体支持体残基、ヌクレオシドもしくは構造(I)のさらなる化合物への、連結である、
前記〔32〕に記載の化合物。
〔34〕
前記標的化部分は、抗体または細胞表面レセプターアンタゴニストである、前記〔31〕に記載の化合物。
〔35〕
R 2 またはR 3 は、以下の構造:
〔36〕
R 2 またはR 3 は、以下の構造:
〔37〕
Qは、求核性反応性基、求電子性反応性基または環化付加反応性基を含む、前記〔1〕に記載の化合物。
〔38〕
Qは、スルフヒドリル、ジスルフィド、活性化エステル、イソチオシアネート、アジド、アルキン、アルケン、ジエン、ジエノフィル、酸ハライド、スルホニルハライド、ホスフィン、α-ハロアミド、ビオチン、アミノまたはマレイミド官能基を含む、前記〔37〕に記載の化合物。
〔39〕
前記活性化エステルは、N-スクシンイミドエステル、イミドエステルまたはポリフルオロフェニルエステルである、前記〔38〕に記載の化合物。
〔40〕
前記アルキンは、アルキルアジドまたはアシルアジドである、前記〔38〕に記載の化合物。
〔41〕
Qは、表1から選択される部分を含む、前記〔1〕に記載の化合物。
〔42〕
R 2 またはR 3 のうちの一方は、OHまたは-OP(=R a )(R b )R c であり、R 2 またはR 3 のうちの他方は、分析物分子への共有結合を含むリンカー、標的化部分への共有結合を含むリンカー、または固体支持体への共有結合を含むリンカーである、前記〔1〕に記載の化合物。
〔43〕
前記分析物分子は、核酸、アミノ酸またはこれらのポリマーである、前記〔42〕に記載の化合物。
〔44〕
前記分析物分子は、酵素、レセプター、レセプターリガンド、抗体、糖タンパク質、アプタマーまたはプリオンである、前記〔42〕に記載の化合物。
〔45〕
前記標的化部分は、抗体または細胞表面レセプターアンタゴニストである、前記〔42〕に記載の化合物。
〔46〕
前記固体支持体は、ポリマービーズまたは非ポリマービーズである、前記〔42〕に記載の化合物。
〔47〕
mは、各存在において、独立して、1~10の整数である、前記〔1〕に記載の化合物。
〔48〕
mは、各存在において、独立して、1~5の整数である、前記〔1〕に記載の化合物。
〔49〕
nは、1~100の整数である、前記〔1〕に記載の化合物。
〔50〕
nは、1~10の整数である、前記〔1〕に記載の化合物。
〔51〕
Mは、各存在において、独立して、4個もしくはこれより多くのアリールもしくはヘテロアリール環、またはこれらの組み合わせを含む部分である、前記〔1〕に記載の化合物。
〔52〕
Mは、各存在において、独立して、蛍光性または有色である、前記〔1〕に記載の化合物。
〔53〕
Mは、蛍光性である、前記〔52〕に記載の化合物。
〔54〕
Mは、各存在において、独立して、少なくとも4個の縮合環を含む縮合多環式アリール部分を含む、前記〔1〕に記載の化合物。
〔55〕
Mは、各存在において、独立して、ジメチルアミノスチルベン、キナクリドン、フルオロフェニル-ジメチル-BODIPY、his-フルオロフェニル-BODIPY、アクリジン、テリレン、セキシフェニル、ポルフィリン、ベンゾピレン、(フルオロフェニル-ジメチル-ジフルオロボラ-ジアザ-インダセン)フェニル、(ビス-フルオロフェニル-ジフルオロボラ-ジアザ-インダセン)フェニル、クアテルフェニル、ビ-ベンゾチアゾール、ター-ベンゾチアゾール、ビ-ナフチル、ビ-アントラシル、スクアライン、スクアリリウム、9,10-エチニルアントラセンまたはター-ナフチル部分である、前記〔1〕に記載の化合物。
〔56〕
Mは、各存在において、独立して、p-ターフェニル、ペリレン、アゾベンゼン、フェナジン、フェナントロリン、アクリジン、チオキサントレン、クリセン、ルブレン、コロネン、シアニン、ペリレンイミド、もしくはペリレンアミドまたはその誘導体である、前記〔1〕に記載の化合物。
〔57〕
Mは、各存在において、独立して、クマリン染料、レゾルフィン染料、ジピロメテンボロンジフルオリド染料、ルテニウムビピリジル染料、エネルギー移動染料、チアゾールオレンジ染料、ポリメチンまたはN-アリール-1,8-ナフタルイミド染料である、前記〔1〕に記載の化合物。
〔58〕
Mは、各存在において、独立して、ピレン、ペリレン、ペリレンモノイミドもしくは6-FAMまたはその誘導体である、前記〔1〕に記載の化合物。
〔59〕
Mは、各存在において、独立して、以下の構造:
〔60〕
表2から選択される化合物。
〔61〕
サンプルを染色するための方法であって、該方法は、該サンプルに、前記〔1〕に記載の化合物を、該サンプルが適切な波長で照射される場合に光学的応答を生じるために十分な量で添加する工程を包含する方法。
〔62〕
前記光学的応答は、蛍光応答である、前記〔61〕に記載の方法。
〔63〕
前記サンプルは、細胞を含む、前記〔61〕に記載の方法。
〔64〕
前記細胞をフローサイトメトリーによって観察する工程をさらに包含する、前記〔63〕に記載の方法。
〔65〕
前記蛍光応答を、検出可能に異なる光学的特性を有する第2の発蛍光団の蛍光応答から区別する工程をさらに包含する、前記〔62〕に記載の方法。
〔66〕
分析物分子を視覚的に検出するための方法であって、該方法は、
(a)R 2 またはR 3 は、該分析物分子への共有結合を含むリンカーである前記〔1〕の化合物を提供する工程;および
(b)該化合物をその視覚的特性によって検出する工程、
を包含する方法。
〔67〕
分析物分子を視覚的に検出するための方法であって、該方法は、
(a)R 2 またはR 3 は、QまたはQへの共有結合を含むリンカーである前記〔1〕に記載の化合物と、該分析物分子とを混合する工程;
(b)該化合物および該分析物分子の結合体を形成する工程;ならびに
(c)該結合体をその視覚的特性によって検出する工程、
を包含する方法。
〔68〕
分析物を視覚的に検出するための方法であって、該方法は、
(a)R 2 またはR 3 は、該分析物分子に対する特異性を有する標的化部分への共有結合を含むリンカーを含む前記〔1〕に記載の化合物を提供する工程;
(b)該化合物および該分析物を混合し、それによって、該標的化部分および該分析物を会合させる工程;ならびに
(c)該化合物をその視覚的特性によって検出する工程、
を包含する方法。
〔69〕
前記〔1〕に記載の化合物および1もしくはこれより多くの分析物分子を含む、組成物。
〔70〕
前記1もしくはこれより多くの分析物分子の検出のための分析方法における前記〔69〕に記載の組成物の使用。
〔71〕
以下の構造(II):
Gは、各存在において、独立して、相補的反応性基と共有結合を形成できる反応性基またはその保護されたアナログを含む部分であり;
L 1a 、L 2 およびL 3 は、各存在において、独立して、選択肢的なアルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、ヘテロアルケニレン、ヘテロアルキニレンもしくはヘテロ原子リンカーであり;
L 4 は、各存在において、独立して、長さが3原子より大きいヘテロアルキレン、ヘテロアルケニレンまたはヘテロアルキニレンリンカーであり、ここで該ヘテロアルキレン、ヘテロアルケニレンおよびヘテロアルキニレンリンカー中のヘテロ原子は、O、NおよびSから選択され;
R 1 は、各存在において、独立して、H、アルキルまたはアルコキシであり;
R 2 およびR 3 は、各々独立して、H、OH、SH、アルキル、アルコキシ、アルキルエーテル、ヘテロアルキル、-OP(=R a )(R b )R c 、QまたはL’であり;
R 4 は、各存在において、独立して、OH、SH、O - 、S - 、OR d またはSR d であり;
R 5 は、各存在において、独立して、オキソ、チオキソまたは非存在であり;
R a は、OまたはSであり;
R b は、OH、SH、O - 、S - 、OR d またはSR d であり;
R c は、OH、SH、O - 、S - 、OR d 、OL’、SR d 、アルキル、アルコキシ、アルキルエーテル、アルコキシアルキルエーテル、ホスフェート、チオホスフェート、ホスホアルキル、チオホスホアルキル、ホスホアルキルエーテルまたはチオホスホアルキルエーテルであり;
R d は、対イオンであり;
Qは、各存在において、独立して、分析物分子、標的化部分、固体支持体もしくは相補的反応性基Q′と共有結合を形成できる反応性基またはその保護されたアナログを含む部分であり;
L’は、各存在において、独立して、Qへの共有結合を含むリンカー、標的化部分への共有結合を含むリンカー、分析物分子への共有結合を含むリンカー、固体支持体への共有結合を含むリンカー、固体支持体残基への共有結合を含むリンカー、ヌクレオシドへの共有結合を含むリンカーまたは構造(II)のさらなる化合物への共有結合を含むリンカーであり;
mは、各存在において、独立して、0またはこれより大きな整数であるが、ただしmの少なくとも1個の存在は、1またはこれより大きな整数であり;そして
nは、1またはこれより大きな整数である、
化合物、またはその立体異性体、塩もしくは互変異性体。
〔72〕
Gは、各存在において、独立して、アルデヒド、オキシム、ヒドラゾン、アルキン、アミン、アジド、アシルアジド、アシルハライド、ニトリル、ニトロン、スルフヒドリル、ジスルフィド、スルホニルハライド、イソチオシアネート、イミドエステル、活性化エステル、ケトン、α,β-不飽和カルボニル、アルケン、マレイミド、α-ハロイミド、エポキシド、アジリジン、テトラジン、テトラゾール、ホスフィン、ビオチンまたはチイラン官能基を含む、前記〔71〕に記載の化合物。
〔73〕
Gは、各存在において、独立して、アルキンまたはアジド基を含む、前記〔71〕に記載の化合物。
〔74〕
Gは、各存在において、独立して、前記相補的反応性基との反応に際して、アルケン、エステル、アミド、チオエステル、ジスルフィド、カルボン酸基、複素環式またはヘテロアリール基を含む官能基を形成できる反応性基を含む、前記〔71〕に記載の化合物。
〔75〕
前記ヘテロアリールは、トリアゾリルである、前記〔74〕に記載の化合物。
〔76〕
L 2 およびL 3 は、各存在において、独立して、C 1 -C 6 アルキレン、C 2 -C 6 アルケニレンまたはC 2 -C 6 アルキニレンである、前記〔71〕に記載の化合物。
〔77〕
前記化合物は、以下の構造(IIA):
x 1 、x 2 、x 3 およびx 4 は、各存在において、独立して、0~6の整数である、
前記〔71〕に記載の化合物。
〔78〕
各L 1a は、非存在である、前記〔71〕に記載の化合物。
〔79〕
各L 1a は、存在する、前記〔71〕に記載の化合物。
〔80〕
L 1a は、各存在において、独立して、ヘテロアルキレンである、前記〔79〕に記載の化合物。
〔81〕
L 1a は、以下の構造:
〔82〕
Gは、各存在において、独立して、
〔83〕
x 1 、x 2 、x 3 またはx 4 のうちの少なくとも1個の存在は、1である、前記〔77〕に記載の化合物。
〔84〕
x 1 、x 2 、x 3 およびx 4 は、各存在において、各々1である、前記〔77〕に記載の化合物。
〔85〕
L 4 は、前記〔2〕~〔5〕のいずれか1項に定義されるとおりである、前記〔71〕に記載の化合物。
〔86〕
R 4 は、各存在において、独立して、OH、O - またはOR d である、前記〔71〕に記載の化合物。
〔87〕
R 5 は、各存在において、オキソである、前記〔71〕に記載の化合物。
〔88〕
R 1 は、Hである、前記〔71〕に記載の化合物。
〔89〕
R 2 およびR 3 は、各々独立して、OHまたは-OP(=R a )(R b )R c である、前記〔71〕に記載の化合物。
〔90〕
R 2 またはR 3 のうちの一方は、OHまたは-OP(=R a )(R b )R c であり、R 2 またはR 3 のうちの他方は、QまたはQへの共有結合を含むリンカーである、前記〔71〕に記載の化合物。
〔91〕
R 2 およびR 3 は、各々独立して、-OP(=R a )(R b )R c である、前記〔71〕に記載の化合物。
〔92〕
R c は、OL’である、前記〔91〕に記載の化合物。
〔93〕
L’は、Q、標的化部分、分析物分子、固体支持体、固体支持体残基、ヌクレオシドまたは構造(I)のさらなる化合物、に対するヘテロアルキレンリンカーである、前記〔92〕に記載の化合物。
〔94〕
L’は、アルキレンオキシドもしくはホスホジエステル部分、またはこれらの組み合わせを含む、前記〔93〕に記載の化合物。
〔95〕
L’は、以下の構造:
m”およびn”は、独立して、1~10の整数であり;
R e は、H、電子対または対イオンであり;
L”は、R e もしくは直接結合であるか、またはQ、標的化部分、分析物分子、固体支持体、固体支持体残基、ヌクレオシドもしくは構造(I)のさらなる化合物への、連結である、前記〔94〕に記載の化合物。
〔96〕
前記標的化部分は、抗体または細胞表面レセプターアンタゴニストである、前記〔91〕に記載の化合物。
〔97〕
R 2 またはR 3 は、以下の構造:
〔98〕
R 2 またはR 3 は、以下の構造:
〔99〕
Qは、求核性反応性基、求電子性反応性基または環化付加反応性基を含む、前記〔71〕に記載の化合物。
〔100〕
Qは、スルフヒドリル、ジスルフィド、活性化エステル、イソチオシアネート、アジド、アルキン、アルケン、ジエン、ジエノフィル、酸ハライド、スルホニルハライド、ホスフィン、α-ハロアミド、ビオチン、アミノまたはマレイミド官能基を含む、前記〔99〕に記載の化合物。
〔101〕
前記活性化エステルは、N-スクシンイミドエステル、イミドエステルまたはポリフルオロフェニルエステルである、前記〔100〕に記載の化合物。
〔102〕
前記アルキンは、アルキルアジドまたはアシルアジドである、前記〔100〕に記載の化合物。
〔103〕
Qは、表1から選択される部分である、前記〔71〕に記載の化合物。
〔104〕
R 2 またはR 3 のうちの一方は、OHまたは-OP(=R a )(R b )R c であり、R 2 またはR 3 のうちの他方は、分析物分子への共有結合を含むリンカー、標的化部分への共有結合を含むリンカー、または固体支持体への共有結合を含むリンカーである、前記〔71〕に記載の化合物。
〔105〕
前記分析物分子は、核酸、アミノ酸またはこれらのポリマーである、前記〔104〕に記載の化合物。
〔106〕
前記分析物分子は、酵素、レセプター、レセプターリガンド、抗体、糖タンパク質、アプタマーまたはプリオンである、前記〔104〕に記載の化合物。
〔107〕
前記標的化部分は、抗体または細胞表面レセプターアンタゴニストである、前記〔104〕に記載の化合物。
〔108〕
前記固体支持体は、ポリマービーズまたは非ポリマービーズである、前記〔104〕に記載の化合物。
〔109〕
mは、各存在において、独立して、1~10の整数である、前記〔71〕に記載の化合物。
〔110〕
mは、各存在において、独立して、1~5の整数である、前記〔71〕に記載の化合物。
〔111〕
nは、1~100の整数である、前記〔71〕に記載の化合物。
〔112〕
nは、1~10の整数である、前記〔71〕に記載の化合物。
〔113〕
表3から選択される化合物。
〔114〕
分析物分子または標的化部分を標識するための方法であって、該方法は、
(a)R 2 またはR 3 は、QまたはQへの共有結合を含むリンカーである前記〔71〕に記載の化合物と、該分析物分子または該標的化部分とを混合する工程;
(b)該化合物および該分析物分子または該標的化部分の結合体を形成する工程;ならびに
(c)該結合体と式M-L 1b -G′の化合物とを反応させて、それによって、少なくとも1個のGおよび少なくとも1個のG′の反応によって少なくとも1個の共有結合を形成する工程、
を包含し、ここで:
Mは、2個またはこれより多くの炭素-炭素二重結合および少なくとも1の共役度を含む部分であり;
L 1b は、選択肢的なアルキレン、ヘテロアルキレンまたはヘテロ原子リンカーであり;そして
G′は、Gに対する相補的反応性基である、
方法。
〔115〕
分析物分子または標的化部分を標識するための方法であって、該方法は、
(a)R 2 またはR 3 は、QまたはQへの共有結合を含むリンカーである前記〔71〕に記載の化合物と、式M-L 1b -G′の化合物とを混合し、それによって、GおよびG′の反応によって少なくとも1個の共有結合を形成する工程;ならびに
(b)工程(A)の生成物と該分析物分子または標的化部分とを反応させ、それによって、工程(A)の生成物および該分析物分子または標的化部分の結合体を形成する工程、を包含し、ここで:
Mは、2個またはこれより多くの炭素-炭素二重結合および少なくとも1の共役度を含む部分であり;
L 1b は、選択肢的なアルキレン、ヘテロアルキレンまたはヘテロ原子リンカーであり;そして
G′は、Gに対する相補的反応性基である、
方法。
〔116〕
前記〔1〕に記載の化合物を調製するための方法であって、該方法は、前記〔71〕に記載の化合物と式M-L 1b -G′の化合物とを混合し、それによって、GおよびG′の反応によって少なくとも1個の共有結合を形成する工程を包含し、ここで:
Mは、2個またはこれより多くの炭素-炭素二重結合および少なくとも1の共役度を含む部分であり;
L 1b は、選択肢的なアルキレン、ヘテロアルキレンまたはヘテロ原子リンカーであり;そして
G′は、Gに対する相補的反応性基である、
方法。
〔117〕
Y個の蛍光部分Mを含む蛍光化合物であって、ここで該蛍光化合物は、所定の波長の紫外線での励起の際に、同じ波長の紫外線での励起の際の1個のM部分のピーク蛍光発光よりY倍の少なくとも85%のピーク蛍光発光を有し、ここでYは、2またはこれより大きな整数である、蛍光化合物。
〔118〕
1個のM部分のピーク蛍光発光よりY倍の少なくとも90%のピーク蛍光発光を有する、前記〔117〕に記載の蛍光化合物。
〔119〕
1個のM部分のピーク蛍光発光よりY倍の少なくとも95%のピーク蛍光発光を有する、前記〔117〕に記載の蛍光化合物。
〔120〕
1個のM部分のピーク蛍光発光よりY倍の少なくとも97%のピーク蛍光発光を有する、前記〔117〕に記載の蛍光化合物。
〔121〕
1個のM部分のピーク蛍光発光よりY倍の少なくとも99%のピーク蛍光発光を有する、前記〔117〕に記載の蛍光化合物。
〔122〕
Yは、2~100の整数である、前記〔117〕に記載の蛍光化合物。
〔123〕
Yは、2~10の整数である、前記〔117〕に記載の蛍光化合物。
〔124〕
前記Y個のM部分は、独立して、以下の構造:
〔125〕
前記1個のM部分は、独立して、以下の構造:
〔126〕
前記蛍光化合物は、独立して、以下の構造:
〔127〕
前記ピーク蛍光発光は、約500~約550nmの範囲に及ぶ波長にある、前記〔117〕に記載の蛍光化合物。
〔128〕
前記蛍光化合物は、少なくとも1個のエチレンオキシド部分を含む、前記〔117〕に記載の蛍光化合物。
〔129〕
前記〔117〕に記載の蛍光化合物および分析物を含む、組成物。
Claims (129)
- 以下の構造(I):
Mは、各存在において、独立して、2個またはこれより多くの炭素-炭素二重結合および少なくとも1の共役度を含む部分であり;
L1は、各存在において、独立して、i)選択肢的なアルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、ヘテロアルケニレン、ヘテロアルキニレンもしくはヘテロ原子リンカー;またはii)2個の相補的反応性基の反応によって形成できる官能基を含むリンカー、のいずれかであり;
L2およびL3は、各存在において、独立して、選択肢的なアルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、ヘテロアルケニレン、ヘテロアルキニレンもしくはヘテロ原子リンカーであり;
L4は、各存在において、独立して、長さが3原子より大きいヘテロアルキレン、ヘテロアルケニレンまたはヘテロアルキニレンリンカーであり、ここで該ヘテロアルキレン、ヘテロアルケニレンおよびヘテロアルキニレンリンカー中のヘテロ原子は、O、NおよびSから選択され;
R1は、各存在において、独立して、H、アルキルまたはアルコキシであり;
R2およびR3は、各々独立して、H、OH、SH、アルキル、アルコキシ、アルキルエーテル、ヘテロアルキル、-OP(=Ra)(Rb)Rc、Q、もしくはその保護された形態、またはL’であり;
R4は、各存在において、独立して、OH、SH、O-、S-、ORdまたはSRdであり;
R5は、各存在において、独立して、オキソ、チオキソまたは非存在であり;
Raは、OまたはSであり;
Rbは、OH、SH、O-、S-、ORdまたはSRdであり;
Rcは、OH、SH、O-、S-、ORd、OL’、SRd、アルキル、アルコキシ、ヘテロアルキル、ヘテロアルコキシ、アルキルエーテル、アルコキシアルキルエーテル、ホスフェート、チオホスフェート、ホスホアルキル、チオホスホアルキル、ホスホアルキルエーテルまたはチオホスホアルキルエーテルであり;
Rdは、対イオンであり;
Qは、各存在において、独立して、分析物分子、標的化部分、固体支持体または相補的反応性基Q′と共有結合を形成できる反応性基またはその保護された形態を含む部分であり;
L’は、各存在において、独立して、Qへの共有結合を含むリンカー、標的化部分への共有結合を含むリンカー、分析物分子への共有結合を含むリンカー、固体支持体への共有結合を含むリンカー、固体支持体残基への共有結合を含むリンカー、ヌクレオシドへの共有結合を含むリンカーまたは構造(I)のさらなる化合物への共有結合を含むリンカーであり;
mは、各存在において、独立して、0またはこれより大きな整数であるが、ただしmの少なくとも1個の存在は、1またはこれより大きな整数であり;そして
nは、1またはこれより大きな整数である、
化合物、またはその立体異性体、塩もしくは互変異性体。 - L4は、各存在において、独立して、ヘテロアルキレンリンカーである、請求項1に記載の化合物。
- L4は、各存在において、独立して、アルキレンオキシドリンカーである、請求項2に記載の化合物。
- zは、3~6の整数である、請求項4に記載の化合物。
- L1は、各存在において、2個の相補的反応性基の反応によって形成できる官能基を含むリンカーである、請求項1に記載の化合物。
- L1の少なくとも1個の存在に関して、前記官能基は、アルデヒド、オキシム、ヒドラゾン、アルキン、アミン、アジド、アシルアジド、アシルハライド、ニトリル、ニトロン、スルフヒドリル、ジスルフィド、スルホニルハライド、イソチオシアネート、イミドエステル、活性化エステル、ケトン、α,β-不飽和カルボニル、アルケン、マレイミド、α-ハロイミド、エポキシド、アジリジン、テトラジン、テトラゾール、ホスフィン、ビオチンまたはチイラン官能基と、相補的反応性基との反応によって形成できる、請求項6に記載の化合物。
- L1の少なくとも1個の存在に関して、前記官能基は、アルキンおよびアジドの反応によって形成できる、請求項6に記載の化合物。
- L1の少なくとも1個の存在に関して、前記官能基は、アルケン、エステル、アミド、チオエステル、チオウレア、ジスルフィド、カルボン酸、複素環式またはヘテロアリール基を含む、請求項6に記載の化合物。
- L1の少なくとも1個の存在に関して、L1は、トリアゾリル官能基を含むリンカーである、請求項6に記載の化合物。
- L1aもしくはL1b、または両方は、非存在である、請求項11に記載の化合物。
- L1aもしくはL1b、または両方は、存在する、請求項11に記載の化合物。
- L1aおよびL1bは、存在する場合、各々独立して、アルキレンまたはヘテロアルキレンである、請求項14に記載の化合物。
- L1は、各存在において、独立して、選択肢的なアルキレンまたはヘテロアルキレンリンカーである、請求項1に記載の化合物。
- L2およびL3は、各存在において、独立して、C1-C6アルキレン、C2-C6アルケニレンまたはC2-C6アルキニレンである、請求項1に記載の化合物。
- x1、x2、x3またはx4のうちの少なくとも1個の存在は、1である、請求項19に記載の化合物。
- x1、x2、x3およびx4は、各存在において、各々1である、請求項19に記載の化合物。
- L1は、各存在において、独立して、トリアゾリル官能基を含む、請求項19に記載の化合物。
- L1は、各存在において、独立して、選択肢的なアルキレンまたはヘテロアルキレンリンカーである、請求項19に記載の化合物。
- R4は、各存在において、独立して、OH、O-またはORdである、請求項1に記載の化合物。
- R5は、各存在において、オキソである、請求項1に記載の化合物。
- R1は、各存在において、Hである、請求項1に記載の化合物。
- R2およびR3は、各々独立して、OHまたは-OP(=Ra)(Rb)Rcである、請求項1に記載の化合物。
- R2またはR3のうちの一方は、OHまたは-OP(=Ra)(Rb)Rcであり、R2またはR3のうちの他方は、QまたはQへの共有結合を含むリンカーである、請求項1に記載の化合物。
- R2およびR3は、各々独立して、-OP(=Ra)(Rb)Rcである、請求項1に記載の化合物。
- Rcは、OL’である、請求項29に記載の化合物。
- L’は、Q、標的化部分、分析物分子、固体支持体、固体支持体残基、ヌクレオシドまたは構造(I)のさらなる化合物への、ヘテロアルキレンリンカーである、請求項30に記載の化合物。
- L’は、アルキレンオキシドもしくはホスホジエステル部分、またはこれらの組み合わせを含む、請求項31に記載の化合物。
- 前記標的化部分は、抗体または細胞表面レセプターアンタゴニストである、請求項31に記載の化合物。
- Qは、求核性反応性基、求電子性反応性基または環化付加反応性基を含む、請求項1に記載の化合物。
- Qは、スルフヒドリル、ジスルフィド、活性化エステル、イソチオシアネート、アジド、アルキン、アルケン、ジエン、ジエノフィル、酸ハライド、スルホニルハライド、ホスフィン、α-ハロアミド、ビオチン、アミノまたはマレイミド官能基を含む、請求項37に記載の化合物。
- 前記活性化エステルは、N-スクシンイミドエステル、イミドエステルまたはポリフルオロフェニルエステルである、請求項38に記載の化合物。
- 前記アルキンは、アルキルアジドまたはアシルアジドである、請求項38に記載の化合物。
- Qは、表1から選択される部分を含む、請求項1に記載の化合物。
- R2またはR3のうちの一方は、OHまたは-OP(=Ra)(Rb)Rcであり、R2またはR3のうちの他方は、分析物分子への共有結合を含むリンカー、標的化部分への共有結合を含むリンカー、または固体支持体への共有結合を含むリンカーである、請求項1に記載の化合物。
- 前記分析物分子は、核酸、アミノ酸またはこれらのポリマーである、請求項42に記載の化合物。
- 前記分析物分子は、酵素、レセプター、レセプターリガンド、抗体、糖タンパク質、アプタマーまたはプリオンである、請求項42に記載の化合物。
- 前記標的化部分は、抗体または細胞表面レセプターアンタゴニストである、請求項42に記載の化合物。
- 前記固体支持体は、ポリマービーズまたは非ポリマービーズである、請求項42に記載の化合物。
- mは、各存在において、独立して、1~10の整数である、請求項1に記載の化合物。
- mは、各存在において、独立して、1~5の整数である、請求項1に記載の化合物。
- nは、1~100の整数である、請求項1に記載の化合物。
- nは、1~10の整数である、請求項1に記載の化合物。
- Mは、各存在において、独立して、4個もしくはこれより多くのアリールもしくはヘテロアリール環、またはこれらの組み合わせを含む部分である、請求項1に記載の化合物。
- Mは、各存在において、独立して、蛍光性または有色である、請求項1に記載の化合物。
- Mは、蛍光性である、請求項52に記載の化合物。
- Mは、各存在において、独立して、少なくとも4個の縮合環を含む縮合多環式アリール部分を含む、請求項1に記載の化合物。
- Mは、各存在において、独立して、ジメチルアミノスチルベン、キナクリドン、フルオロフェニル-ジメチル-BODIPY、his-フルオロフェニル-BODIPY、アクリジン、テリレン、セキシフェニル、ポルフィリン、ベンゾピレン、(フルオロフェニル-ジメチル-ジフルオロボラ-ジアザ-インダセン)フェニル、(ビス-フルオロフェニル-ジフルオロボラ-ジアザ-インダセン)フェニル、クアテルフェニル、ビ-ベンゾチアゾール、ター-ベンゾチアゾール、ビ-ナフチル、ビ-アントラシル、スクアライン、スクアリリウム、9,10-エチニルアントラセンまたはター-ナフチル部分である、請求項1に記載の化合物。
- Mは、各存在において、独立して、p-ターフェニル、ペリレン、アゾベンゼン、フェナジン、フェナントロリン、アクリジン、チオキサントレン、クリセン、ルブレン、コロネン、シアニン、ペリレンイミド、もしくはペリレンアミドまたはその誘導体である、請求項1に記載の化合物。
- Mは、各存在において、独立して、クマリン染料、レゾルフィン染料、ジピロメテンボロンジフルオリド染料、ルテニウムビピリジル染料、エネルギー移動染料、チアゾールオレンジ染料、ポリメチンまたはN-アリール-1,8-ナフタルイミド染料である、請求項1に記載の化合物。
- Mは、各存在において、独立して、ピレン、ペリレン、ペリレンモノイミドもしくは6-FAMまたはその誘導体である、請求項1に記載の化合物。
- 表2から選択される化合物。
- サンプルを染色するための方法であって、該方法は、該サンプルに、請求項1に記載の化合物を、該サンプルが適切な波長で照射される場合に光学的応答を生じるために十分な量で添加する工程を包含する方法。
- 前記光学的応答は、蛍光応答である、請求項61に記載の方法。
- 前記サンプルは、細胞を含む、請求項61に記載の方法。
- 前記細胞をフローサイトメトリーによって観察する工程をさらに包含する、請求項63に記載の方法。
- 前記蛍光応答を、検出可能に異なる光学的特性を有する第2の発蛍光団の蛍光応答から区別する工程をさらに包含する、請求項62に記載の方法。
- 分析物分子を視覚的に検出するための方法であって、該方法は、
(a)R2またはR3は、該分析物分子への共有結合を含むリンカーである請求項1の化合物を提供する工程;および
(b)該化合物をその視覚的特性によって検出する工程、
を包含する方法。 - 分析物分子を視覚的に検出するための方法であって、該方法は、
(a)R2またはR3は、QまたはQへの共有結合を含むリンカーである請求項1に記載の化合物と、該分析物分子とを混合する工程;
(b)該化合物および該分析物分子の結合体を形成する工程;ならびに
(c)該結合体をその視覚的特性によって検出する工程、
を包含する方法。 - 分析物を視覚的に検出するための方法であって、該方法は、
(a)R2またはR3は、該分析物分子に対する特異性を有する標的化部分への共有結合を含むリンカーを含む請求項1に記載の化合物を提供する工程;
(b)該化合物および該分析物を混合し、それによって、該標的化部分および該分析物を会合させる工程;ならびに
(c)該化合物をその視覚的特性によって検出する工程、
を包含する方法。 - 請求項1に記載の化合物および1もしくはこれより多くの分析物分子を含む、組成物。
- 前記1もしくはこれより多くの分析物分子の検出のための分析方法における請求項69に記載の組成物の使用。
- 以下の構造(II):
Gは、各存在において、独立して、相補的反応性基と共有結合を形成できる反応性基またはその保護されたアナログを含む部分であり;
L1a、L2およびL3は、各存在において、独立して、選択肢的なアルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、ヘテロアルケニレン、ヘテロアルキニレンもしくはヘテロ原子リンカーであり;
L4は、各存在において、独立して、長さが3原子より大きいヘテロアルキレン、ヘテロアルケニレンまたはヘテロアルキニレンリンカーであり、ここで該ヘテロアルキレン、ヘテロアルケニレンおよびヘテロアルキニレンリンカー中のヘテロ原子は、O、NおよびSから選択され;
R1は、各存在において、独立して、H、アルキルまたはアルコキシであり;
R2およびR3は、各々独立して、H、OH、SH、アルキル、アルコキシ、アルキルエーテル、ヘテロアルキル、-OP(=Ra)(Rb)Rc、QまたはL’であり;
R4は、各存在において、独立して、OH、SH、O-、S-、ORdまたはSRdであり;
R5は、各存在において、独立して、オキソ、チオキソまたは非存在であり;
Raは、OまたはSであり;
Rbは、OH、SH、O-、S-、ORdまたはSRdであり;
Rcは、OH、SH、O-、S-、ORd、OL’、SRd、アルキル、アルコキシ、アルキルエーテル、アルコキシアルキルエーテル、ホスフェート、チオホスフェート、ホスホアルキル、チオホスホアルキル、ホスホアルキルエーテルまたはチオホスホアルキルエーテルであり;
Rdは、対イオンであり;
Qは、各存在において、独立して、分析物分子、標的化部分、固体支持体もしくは相補的反応性基Q′と共有結合を形成できる反応性基またはその保護されたアナログを含む部分であり;
L’は、各存在において、独立して、Qへの共有結合を含むリンカー、標的化部分への共有結合を含むリンカー、分析物分子への共有結合を含むリンカー、固体支持体への共有結合を含むリンカー、固体支持体残基への共有結合を含むリンカー、ヌクレオシドへの共有結合を含むリンカーまたは構造(II)のさらなる化合物への共有結合を含むリンカーであり;
mは、各存在において、独立して、0またはこれより大きな整数であるが、ただしmの少なくとも1個の存在は、1またはこれより大きな整数であり;そして
nは、1またはこれより大きな整数である、
化合物、またはその立体異性体、塩もしくは互変異性体。 - Gは、各存在において、独立して、アルデヒド、オキシム、ヒドラゾン、アルキン、アミン、アジド、アシルアジド、アシルハライド、ニトリル、ニトロン、スルフヒドリル、ジスルフィド、スルホニルハライド、イソチオシアネート、イミドエステル、活性化エステル、ケトン、α,β-不飽和カルボニル、アルケン、マレイミド、α-ハロイミド、エポキシド、アジリジン、テトラジン、テトラゾール、ホスフィン、ビオチンまたはチイラン官能基を含む、請求項71に記載の化合物。
- Gは、各存在において、独立して、アルキンまたはアジド基を含む、請求項71に記載の化合物。
- Gは、各存在において、独立して、前記相補的反応性基との反応に際して、アルケン、エステル、アミド、チオエステル、ジスルフィド、カルボン酸基、複素環式またはヘテロアリール基を含む官能基を形成できる反応性基を含む、請求項71に記載の化合物。
- 前記ヘテロアリールは、トリアゾリルである、請求項74に記載の化合物。
- L2およびL3は、各存在において、独立して、C1-C6アルキレン、C2-C6アルケニレンまたはC2-C6アルキニレンである、請求項71に記載の化合物。
- 各L1aは、非存在である、請求項71に記載の化合物。
- 各L1aは、存在する、請求項71に記載の化合物。
- L1aは、各存在において、独立して、ヘテロアルキレンである、請求項79に記載の化合物。
- x1、x2、x3またはx4のうちの少なくとも1個の存在は、1である、請求項77に記載の化合物。
- x1、x2、x3およびx4は、各存在において、各々1である、請求項77に記載の化合物。
- L4は、請求項2~5のいずれか1項に定義されるとおりである、請求項71に記載の化合物。
- R4は、各存在において、独立して、OH、O-またはORdである、請求項71に記載の化合物。
- R5は、各存在において、オキソである、請求項71に記載の化合物。
- R1は、Hである、請求項71に記載の化合物。
- R2およびR3は、各々独立して、OHまたは-OP(=Ra)(Rb)Rcである、請求項71に記載の化合物。
- R2またはR3のうちの一方は、OHまたは-OP(=Ra)(Rb)Rcであり、R2またはR3のうちの他方は、QまたはQへの共有結合を含むリンカーである、請求項71に記載の化合物。
- R2およびR3は、各々独立して、-OP(=Ra)(Rb)Rcである、請求項71に記載の化合物。
- Rcは、OL’である、請求項91に記載の化合物。
- L’は、Q、標的化部分、分析物分子、固体支持体、固体支持体残基、ヌクレオシドまたは構造(I)のさらなる化合物、に対するヘテロアルキレンリンカーである、請求項92に記載の化合物。
- L’は、アルキレンオキシドもしくはホスホジエステル部分、またはこれらの組み合わせを含む、請求項93に記載の化合物。
- 前記標的化部分は、抗体または細胞表面レセプターアンタゴニストである、請求項91に記載の化合物。
- Qは、求核性反応性基、求電子性反応性基または環化付加反応性基を含む、請求項71に記載の化合物。
- Qは、スルフヒドリル、ジスルフィド、活性化エステル、イソチオシアネート、アジド、アルキン、アルケン、ジエン、ジエノフィル、酸ハライド、スルホニルハライド、ホスフィン、α-ハロアミド、ビオチン、アミノまたはマレイミド官能基を含む、請求項99に記載の化合物。
- 前記活性化エステルは、N-スクシンイミドエステル、イミドエステルまたはポリフルオロフェニルエステルである、請求項100に記載の化合物。
- 前記アルキンは、アルキルアジドまたはアシルアジドである、請求項100に記載の化合物。
- Qは、表1から選択される部分である、請求項71に記載の化合物。
- R2またはR3のうちの一方は、OHまたは-OP(=Ra)(Rb)Rcであり、R2またはR3のうちの他方は、分析物分子への共有結合を含むリンカー、標的化部分への共有結合を含むリンカー、または固体支持体への共有結合を含むリンカーである、請求項71に記載の化合物。
- 前記分析物分子は、核酸、アミノ酸またはこれらのポリマーである、請求項104に記載の化合物。
- 前記分析物分子は、酵素、レセプター、レセプターリガンド、抗体、糖タンパク質、アプタマーまたはプリオンである、請求項104に記載の化合物。
- 前記標的化部分は、抗体または細胞表面レセプターアンタゴニストである、請求項104に記載の化合物。
- 前記固体支持体は、ポリマービーズまたは非ポリマービーズである、請求項104に記載の化合物。
- mは、各存在において、独立して、1~10の整数である、請求項71に記載の化合物。
- mは、各存在において、独立して、1~5の整数である、請求項71に記載の化合物。
- nは、1~100の整数である、請求項71に記載の化合物。
- nは、1~10の整数である、請求項71に記載の化合物。
- 表3から選択される化合物。
- 分析物分子または標的化部分を標識するための方法であって、該方法は、
(a)R2またはR3は、QまたはQへの共有結合を含むリンカーである請求項71に記載の化合物と、該分析物分子または該標的化部分とを混合する工程;
(b)該化合物および該分析物分子または該標的化部分の結合体を形成する工程;ならびに
(c)該結合体と式M-L1b-G′の化合物とを反応させて、それによって、少なくとも1個のGおよび少なくとも1個のG′の反応によって少なくとも1個の共有結合を形成する工程、
を包含し、ここで:
Mは、2個またはこれより多くの炭素-炭素二重結合および少なくとも1の共役度を含む部分であり;
L1bは、選択肢的なアルキレン、ヘテロアルキレンまたはヘテロ原子リンカーであり;そして
G′は、Gに対する相補的反応性基である、
方法。 - 分析物分子または標的化部分を標識するための方法であって、該方法は、
(a)R2またはR3は、QまたはQへの共有結合を含むリンカーである請求項71に記載の化合物と、式M-L1b-G′の化合物とを混合し、それによって、GおよびG′の反応によって少なくとも1個の共有結合を形成する工程;ならびに
(b)工程(A)の生成物と該分析物分子または標的化部分とを反応させ、それによって、工程(A)の生成物および該分析物分子または標的化部分の結合体を形成する工程、を包含し、ここで:
Mは、2個またはこれより多くの炭素-炭素二重結合および少なくとも1の共役度を含む部分であり;
L1bは、選択肢的なアルキレン、ヘテロアルキレンまたはヘテロ原子リンカーであり;そして
G′は、Gに対する相補的反応性基である、
方法。 - 請求項1に記載の化合物を調製するための方法であって、該方法は、請求項71に記載の化合物と式M-L1b-G′の化合物とを混合し、それによって、GおよびG′の反応によって少なくとも1個の共有結合を形成する工程を包含し、ここで:
Mは、2個またはこれより多くの炭素-炭素二重結合および少なくとも1の共役度を含む部分であり;
L1bは、選択肢的なアルキレン、ヘテロアルキレンまたはヘテロ原子リンカーであり;そして
G′は、Gに対する相補的反応性基である、
方法。 - Y個の蛍光部分Mを含む蛍光化合物であって、ここで該蛍光化合物は、所定の波長の紫外線での励起の際に、同じ波長の紫外線での励起の際の1個のM部分のピーク蛍光発光よりY倍の少なくとも85%のピーク蛍光発光を有し、ここでYは、2またはこれより大きな整数である、蛍光化合物。
- 1個のM部分のピーク蛍光発光よりY倍の少なくとも90%のピーク蛍光発光を有する、請求項117に記載の蛍光化合物。
- 1個のM部分のピーク蛍光発光よりY倍の少なくとも95%のピーク蛍光発光を有する、請求項117に記載の蛍光化合物。
- 1個のM部分のピーク蛍光発光よりY倍の少なくとも97%のピーク蛍光発光を有する、請求項117に記載の蛍光化合物。
- 1個のM部分のピーク蛍光発光よりY倍の少なくとも99%のピーク蛍光発光を有する、請求項117に記載の蛍光化合物。
- Yは、2~100の整数である、請求項117に記載の蛍光化合物。
- Yは、2~10の整数である、請求項117に記載の蛍光化合物。
- 前記ピーク蛍光発光は、約500~約550nmの範囲に及ぶ波長にある、請求項117に記載の蛍光化合物。
- 前記蛍光化合物は、少なくとも1個のエチレンオキシド部分を含む、請求項117に記載の蛍光化合物。
- 請求項117に記載の蛍光化合物および分析物を含む、組成物。
Applications Claiming Priority (5)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US201662318935P | 2016-04-06 | 2016-04-06 | |
US62/318,935 | 2016-04-06 | ||
PCT/US2017/026451 WO2017177065A2 (en) | 2016-04-06 | 2017-04-06 | Ultra bright dimeric or polymeric dyes with spacing linker groups |
JP2018552185A JP7069033B2 (ja) | 2016-04-06 | 2017-04-06 | スペーシングリンカー基を有する超明色ダイマーまたはポリマー染料 |
JP2022075863A JP7432123B2 (ja) | 2016-04-06 | 2022-05-02 | スペーシングリンカー基を有する超明色ダイマーまたはポリマー染料 |
Related Parent Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2022075863A Division JP7432123B2 (ja) | 2016-04-06 | 2022-05-02 | スペーシングリンカー基を有する超明色ダイマーまたはポリマー染料 |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JP2024023205A true JP2024023205A (ja) | 2024-02-21 |
Family
ID=58610016
Family Applications (3)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2018552185A Active JP7069033B2 (ja) | 2016-04-06 | 2017-04-06 | スペーシングリンカー基を有する超明色ダイマーまたはポリマー染料 |
JP2022075863A Active JP7432123B2 (ja) | 2016-04-06 | 2022-05-02 | スペーシングリンカー基を有する超明色ダイマーまたはポリマー染料 |
JP2023186400A Pending JP2024023205A (ja) | 2016-04-06 | 2023-10-31 | スペーシングリンカー基を有する超明色ダイマーまたはポリマー染料 |
Family Applications Before (2)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2018552185A Active JP7069033B2 (ja) | 2016-04-06 | 2017-04-06 | スペーシングリンカー基を有する超明色ダイマーまたはポリマー染料 |
JP2022075863A Active JP7432123B2 (ja) | 2016-04-06 | 2022-05-02 | スペーシングリンカー基を有する超明色ダイマーまたはポリマー染料 |
Country Status (9)
Country | Link |
---|---|
US (5) | US9851359B2 (ja) |
EP (1) | EP3440136A2 (ja) |
JP (3) | JP7069033B2 (ja) |
KR (2) | KR20230066645A (ja) |
CN (1) | CN109153860B (ja) |
AU (3) | AU2017248165B2 (ja) |
CA (1) | CA3019951A1 (ja) |
RU (2) | RU2021124058A (ja) |
WO (1) | WO2017177065A2 (ja) |
Families Citing this family (29)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP6190534B2 (ja) | 2013-08-22 | 2017-08-30 | ソニー株式会社 | 水溶性蛍光染料又は有色染料及びその使用方法 |
EP3094687B1 (en) | 2014-01-16 | 2020-02-12 | Sony Corporation | Water soluble fluorescent or colored dyes |
WO2016138457A1 (en) | 2015-02-26 | 2016-09-01 | Sony Corporation | Phenylethynylnaphthalene dyes and methods for their use |
US11827661B2 (en) | 2015-02-26 | 2023-11-28 | Sony Group Corporation | Water soluble fluorescent or colored dyes comprising conjugating groups |
JP6849599B2 (ja) | 2015-05-11 | 2021-03-24 | ソニー株式会社 | 超明色ダイマーまたはポリマー染料 |
JP7145079B2 (ja) | 2016-04-01 | 2022-09-30 | ソニーグループ株式会社 | 剛性のスペーシング基を有する超明色ダイマーまたはポリマー染料 |
BR112018070164B1 (pt) | 2016-04-01 | 2022-09-27 | Sony Corporation Of America | Corantes diméricos ou poliméricos ultrabrilhantes |
US9851359B2 (en) | 2016-04-06 | 2017-12-26 | Sony Corporation Of America | Ultra bright dimeric or polymeric dyes with spacing linker groups |
EP3455299B1 (en) | 2016-05-10 | 2024-01-17 | Sony Group Corporation | Compositions comprising a polymeric dye and a cyclodextrin and uses thereof |
EP3455238A1 (en) | 2016-05-10 | 2019-03-20 | Sony Corporation | Ultra bright polymeric dyes with peptide backbones |
WO2017197144A1 (en) | 2016-05-11 | 2017-11-16 | Sony Corporation | Ultra bright dimeric or polymeric dyes |
US11377563B2 (en) | 2016-06-06 | 2022-07-05 | Sony Corporation | Ionic polymers comprising fluorescent or colored reporter groups |
EP3491071A1 (en) | 2016-07-29 | 2019-06-05 | Sony Corporation | Ultra bright dimeric or polymeric dyes and methods for preparation of the same |
JP7270254B2 (ja) | 2017-06-16 | 2023-05-10 | デューク ユニバーシティ | 改善された標識検出、演算、検体感知、および調整可能な乱数生成のための共鳴体ネットワーク |
CN111315415A (zh) | 2017-10-05 | 2020-06-19 | 索尼公司 | 可编程的聚合药物 |
JP2021503450A (ja) | 2017-11-16 | 2021-02-12 | ソニー株式会社 | プログラム可能なポリマー薬 |
EP3737417A1 (en) * | 2018-01-12 | 2020-11-18 | Sony Corporation | Phosphoalkyl ribose polymers comprising biologically active compounds |
EP4137818A1 (en) * | 2018-03-19 | 2023-02-22 | Sony Group Corporation | Use of divalent metals for enhancement of fluorescent signals |
WO2019182766A1 (en) * | 2018-03-21 | 2019-09-26 | Sony Corporation | Polymeric tandem dyes with linker groups |
EP3775052B1 (en) | 2018-03-30 | 2024-06-05 | Becton, Dickinson and Company | Water-soluble polymeric dyes having pendant chromophores |
JP2021529194A (ja) * | 2018-06-27 | 2021-10-28 | ソニーグループ株式会社 | デオキシリボースを含むリンカー基を有するポリマー色素 |
KR20210032434A (ko) * | 2018-07-13 | 2021-03-24 | 소니 주식회사 | 유기인산염 단위를 포함하는 백본을 갖는 중합체성 염료 |
WO2020210694A1 (en) * | 2019-04-11 | 2020-10-15 | Sony Corporation | Programmable polymeric drugs |
WO2021062176A2 (en) | 2019-09-26 | 2021-04-01 | Sony Corporation | Polymeric tandem dyes with linker groups |
EP4038081A1 (en) | 2019-09-30 | 2022-08-10 | Sony Group Corporation | Nucleotide probes |
US20240092820A1 (en) | 2020-11-25 | 2024-03-21 | Sony Group Corporation | Polymer dyes |
JP2023552448A (ja) | 2020-12-07 | 2023-12-15 | ソニーグループ株式会社 | 二量体色素又はポリマー色素における輝度を増強するためのスペーシングリンカー基の設計 |
WO2023242661A2 (en) | 2022-06-15 | 2023-12-21 | Sony Group Corporation | Polymeric tandem dyes with spacing linker groups |
WO2023242662A2 (en) | 2022-06-15 | 2023-12-21 | Sony Group Corporation | Polymeric tandem dyes with spacing linker groups |
Family Cites Families (117)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US4450305A (en) | 1982-10-25 | 1984-05-22 | American Cyanamid Company | Poly(ethyleneoxy)-substituted-9,10-bis(phenylethynyl)anthracenes |
US4476229A (en) | 1982-11-08 | 1984-10-09 | Abbott Laboratories | Substituted carboxyfluoresceins |
SU1121931A1 (ru) | 1983-01-10 | 1988-04-15 | Институт Биологической Химии Ан Бсср | Конъюгаты тиреоидных гормонов с альбумином дл выработки антител к тиреоидным гормонам у животных |
US5268486A (en) | 1986-04-18 | 1993-12-07 | Carnegie-Mellon Unversity | Method for labeling and detecting materials employing arylsulfonate cyanine dyes |
US5053054A (en) | 1988-09-12 | 1991-10-01 | Ortho Pharmaceutical Corporation | Methods and reagents for staining intracellular components |
US5318894A (en) | 1990-01-30 | 1994-06-07 | Miles Inc. | Composition, device and method of assaying for peroxidatively active substances |
US6365730B1 (en) | 1990-06-19 | 2002-04-02 | Gene Shears Pty. Limited | DNA-Armed ribozymes and minizymes |
JPH04282391A (ja) | 1991-03-08 | 1992-10-07 | Fujisawa Pharmaceut Co Ltd | エタノールアミン誘導体およびその製造法 |
EP0605655B1 (en) | 1991-09-16 | 1997-05-07 | Molecular Probes, Inc. | Dimers of unsymmetrical cyanine dyes |
US5565322A (en) | 1991-11-07 | 1996-10-15 | Nanogen, Inc. | Hybridization of polynucleotides conjugated with chromophores and fluorophores to generate donor-to donor energy transfer system |
EP0648193B1 (de) | 1992-07-03 | 1998-02-04 | BL Patentverwaltungs-und Vertriebs GmbH | Anordnung und verfahren zum reinigen von abwasser |
JPH09500411A (ja) | 1993-07-13 | 1997-01-14 | アボツト・ラボラトリーズ | 蛍光性ポリマー標識された接合体および中間体 |
US6171859B1 (en) | 1994-03-30 | 2001-01-09 | Mitokor | Method of targeting conjugate molecules to mitochondria |
US6218108B1 (en) | 1997-05-16 | 2001-04-17 | Research Corporation Technologies, Inc. | Nucleoside analogs with polycyclic aromatic groups attached, methods of synthesis and uses therefor |
DE19717904A1 (de) | 1997-04-23 | 1998-10-29 | Diagnostikforschung Inst | Säurelabile und enzymatisch spaltbare Farbstoffkonstrukte zur Diagnostik mit Nahinfrarotlicht und zur Therapie |
US6716452B1 (en) | 2000-08-22 | 2004-04-06 | New River Pharmaceuticals Inc. | Active agent delivery systems and methods for protecting and administering active agents |
US7060708B2 (en) | 1999-03-10 | 2006-06-13 | New River Pharmaceuticals Inc. | Active agent delivery systems and methods for protecting and administering active agents |
US6627400B1 (en) | 1999-04-30 | 2003-09-30 | Aclara Biosciences, Inc. | Multiplexed measurement of membrane protein populations |
US6514700B1 (en) | 1999-04-30 | 2003-02-04 | Aclara Biosciences, Inc. | Nucleic acid detection using degradation of a tagged sequence |
US6479650B1 (en) | 1999-12-14 | 2002-11-12 | Research Corporation Technologies, Inc. | Fluorescent nucleoside analogs and combinatorial fluorophore arrays comprising same |
EP1266222A2 (en) | 2000-03-14 | 2002-12-18 | Genigma Corporation | Visually detectable dye labelled biomolecules for analysis |
WO2001091725A2 (en) | 2000-05-31 | 2001-12-06 | Univ Johns Hopkins | Biologically useful polyphosphates |
US20020099013A1 (en) | 2000-11-14 | 2002-07-25 | Thomas Piccariello | Active agent delivery systems and methods for protecting and administering active agents |
EP1322785A4 (en) | 2000-09-11 | 2005-11-09 | Univ Columbia | COMBINATION FLUORESCENCE ENERGY TRANSFER INDICATORS AND USES THEREOF |
CA2424454C (en) | 2000-09-19 | 2010-07-20 | Li-Cor, Inc. | Cyanine dyes |
US6448407B1 (en) | 2000-11-01 | 2002-09-10 | Pe Corporation (Ny) | Atropisomers of asymmetric xanthene fluorescent dyes and methods of DNA sequencing and fragment analysis |
US8394813B2 (en) | 2000-11-14 | 2013-03-12 | Shire Llc | Active agent delivery systems and methods for protecting and administering active agents |
US8323903B2 (en) | 2001-10-12 | 2012-12-04 | Life Technologies Corporation | Antibody complexes and methods for immunolabeling |
JP3813890B2 (ja) | 2002-03-22 | 2006-08-23 | 富士写真フイルム株式会社 | 3層レジストプロセス用中間層材料組成物及びそれを用いたパターン形成方法 |
AU2003262833A1 (en) | 2002-08-23 | 2004-03-11 | The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University | Fluorescent glycosides and methods for their use |
KR20050055717A (ko) | 2002-08-26 | 2005-06-13 | 더 리전츠 오브 더 유니버시티 오브 캘리포니아 | 집광 다발색단을 사용하여 폴리뉴클레오티드를 검출 및 분석하기 위한 방법 및 조성물 |
US20040138467A1 (en) | 2002-11-26 | 2004-07-15 | French Roger Harquail | Aromatic and aromatic/heteroaromatic molecular structures with controllable electron conducting properties |
US7759459B2 (en) | 2003-01-10 | 2010-07-20 | Albert Einstein College Of Medicine Of Yeshiva University | Fluorescent assays for protein kinases |
US7238792B2 (en) | 2003-03-18 | 2007-07-03 | Washington State University Research Foundation | Foldable polymers as probes |
US7172907B2 (en) | 2003-03-21 | 2007-02-06 | Ge Healthcare Bio-Sciences Corp. | Cyanine dye labelling reagents with meso-substitution |
CN101076537B (zh) | 2003-11-19 | 2012-07-04 | 阿莱洛吉克生物科学公司 | 标记有多个荧光团的寡核苷酸 |
WO2005064336A1 (en) | 2003-12-09 | 2005-07-14 | Molecular Probes, Inc. | Pyrenyloxysulfonic acid fluorescent agents |
JP4584986B2 (ja) | 2004-04-27 | 2010-11-24 | アルニラム ファーマスーティカルズ インコーポレイテッド | 2−アリールプロピル部分を含む1本鎖及び2本鎖オリゴヌクレオチド |
US7671218B2 (en) | 2004-08-13 | 2010-03-02 | Elitech Holdings B.V. | Phosphonate fluorescent dyes and conjugates |
WO2006031851A1 (en) | 2004-09-14 | 2006-03-23 | Applera Corporation | Multi-chromophoric quencher constructs for use in high sensitivity energy transfer probes |
US8153706B2 (en) | 2004-10-25 | 2012-04-10 | Hewlett-Packard Development Company, L.P. | Polymeric colorants having pigment and dye components and corresponding ink compositions |
DE602004007007T2 (de) | 2004-11-09 | 2008-02-21 | Ipagsa Industrial, SL., Rubi | Thermisch reaktive, nah-infrarot absorbierende Polymere und ihre Verwendung in wärmeempfindlichen lithographischen Druckplatten |
EP1838752B1 (en) | 2005-01-10 | 2017-10-04 | The Regents of The University of California | Cationic conjugated polymers suitable for strand-specific polynucleotide detection in homogeneous and solid state assays |
WO2006099050A2 (en) | 2005-03-09 | 2006-09-21 | Cepheid | Polar dyes |
US8227621B2 (en) | 2005-06-30 | 2012-07-24 | Li-Cor, Inc. | Cyanine dyes and methods of use |
JP2009510198A (ja) | 2005-09-26 | 2009-03-12 | インヴィトロジェン コーポレーション | 紫色レーザー励起性色素及びその使用方法 |
WO2007068618A1 (en) | 2005-12-12 | 2007-06-21 | Ciba Holding Inc. | Organic semiconductors and their manufacture |
US20070148094A1 (en) | 2005-12-22 | 2007-06-28 | Uzgiris Egidijus E | Polymeric imaging agents and medical imaging methods |
US20100039684A1 (en) | 2006-08-12 | 2010-02-18 | Kolb Eric S | Sensitizer dyes for photoacid generating systems using short visible wavelengths |
WO2008044695A1 (fr) | 2006-10-12 | 2008-04-17 | Idemitsu Kosan Co., Ltd. | Dispositif de transistor organique à couche mince et transistor organique à couche mince émetteur de lumière |
EP2727965B1 (en) | 2006-10-27 | 2019-03-06 | Life Technologies Corporation | FLUOROGENIC pH SENSITIVE DYES AND THEIR METHOD OF USE |
US8053588B2 (en) | 2007-03-07 | 2011-11-08 | Kabushiki Kaisha Toyota Chuo Kenkyusho | Organosilane compound and organosilica obtained therefrom |
US9556210B2 (en) | 2007-04-23 | 2017-01-31 | Sabag-Rfa Ltd. | System for delivering therapeutic agents into living cells and cells nuclei |
ES2516827T3 (es) | 2007-04-23 | 2014-10-31 | Deliversir Ltd | Un sistema para entregar agentes terapéuticos a células vivas y núcleos de células |
US9156865B2 (en) | 2007-04-23 | 2015-10-13 | Deliversir Ltd | System for delivering therapeutic agents into living cells and cells nuclei |
US7976585B2 (en) | 2007-05-11 | 2011-07-12 | BASF SE Ludwigshafen | Polymeric dyes |
TWI409280B (zh) | 2007-07-31 | 2013-09-21 | American Dye Source Inc | 聚合物染料、塗覆層組合物及熱微影印刷板 |
GB2456298A (en) | 2008-01-07 | 2009-07-15 | Anthony Ian Newman | Electroluminescent materials comprising oxidation resistant fluorenes |
JP5467366B2 (ja) | 2008-03-10 | 2014-04-09 | 国立大学法人 東京大学 | 非荷電性親水性ブロック及び側鎖の一部に疎水性基が導入されたカチオン性のポリアミノ酸ブロックを含んでなる共重合体、その使用 |
CN102083850B (zh) | 2008-04-21 | 2015-08-12 | 加利福尼亚大学董事会 | 选择性高亲和力多齿配体及其制备方法 |
JPWO2010026957A1 (ja) | 2008-09-03 | 2012-02-02 | 国立大学法人富山大学 | 水溶性ロタキサン型蛍光色素および蛍光性有機分子 |
US8354515B2 (en) | 2008-11-14 | 2013-01-15 | Japan Science And Technology Agency | Oligonucleotide derivative, labeling agent and use for labeling agent |
US8802738B2 (en) | 2008-12-12 | 2014-08-12 | University Of Massachusetts | Polyesters with grafted zwitterions |
US9400273B1 (en) | 2009-12-09 | 2016-07-26 | Life Technologies Corporation | 7-hydroxycoumarin-based cell-tracking reagents |
US9221759B2 (en) | 2010-01-13 | 2015-12-29 | Rutgers, The State University Of New Jersey | Fluorophore chelated lanthanide luminescent probes with improved quantum efficiency |
JP2013528665A (ja) | 2010-03-26 | 2013-07-11 | メルサナ セラピューティックス, インコーポレイテッド | ポリヌクレオチドの送達のための修飾ポリマー、その製造方法、およびその使用方法 |
EP2577309B1 (en) | 2010-05-25 | 2016-11-23 | Carnegie Mellon University | Targeted probes of cellular physiology |
CN102971283A (zh) | 2010-07-08 | 2013-03-13 | 旭硝子株式会社 | 含氟芳香族化合物、有机半导体材料和有机薄膜器件 |
EP2651448B1 (en) | 2010-12-13 | 2018-11-28 | QuiaPEG Pharmaceuticals AB | Water-soluble, non-peptidic, non-nucleotidic phosphoramidate functionalized polymers |
EP2769226B1 (en) | 2011-07-15 | 2017-05-24 | Medtronic Minimed, Inc. | Combinations of fluorphores and pyridinium boronic acid quenchers for use in analyte sensors |
US20130059343A1 (en) * | 2011-09-06 | 2013-03-07 | Li-Cor, Inc. | Nucleotide derivatives |
US10390754B2 (en) * | 2012-01-24 | 2019-08-27 | Siemens Healthcare Gmbh | Method and system for motion estimation model for cardiac and respiratory motion compensation |
US9085761B1 (en) * | 2012-06-14 | 2015-07-21 | Affymetrix, Inc. | Methods and compositions for amplification of nucleic acids |
US9932578B2 (en) | 2012-09-12 | 2018-04-03 | Quark Pharmaceuticals, Inc. | Double-stranded oligonucleotide molecules to P53 and methods of use thereof |
WO2014055253A1 (en) | 2012-10-04 | 2014-04-10 | The General Hospital Corporation | Methods of synthesizing and using peg-like fluorochromes |
CN104918639B (zh) | 2012-10-22 | 2018-01-26 | 萨拜格Rfa公司 | 用于将治疗剂递送到活细胞和细胞核中的系统 |
WO2014102803A1 (en) | 2012-12-31 | 2014-07-03 | Yeda Research And Development Co. Ltd. | Molecular sensor and methods of use thereof |
US9545447B2 (en) | 2013-01-04 | 2017-01-17 | The Texas A&M University System | Polymer-drug systems |
WO2014159392A1 (en) | 2013-03-14 | 2014-10-02 | Dana-Farber Cancer Institute, Inc. | Bromodomain binding reagents and uses thereof |
WO2014147642A1 (en) | 2013-03-19 | 2014-09-25 | Council Of Scientific & Industrial Research | Substituted fluoranthene-7-carbonitriles as fluorescent dyes for cell imaging applications |
ES2708996T3 (es) | 2013-08-22 | 2019-04-12 | Zp Opco Inc | Formulaciones estables de péptido glucagón |
JP6190534B2 (ja) | 2013-08-22 | 2017-08-30 | ソニー株式会社 | 水溶性蛍光染料又は有色染料及びその使用方法 |
US10406246B2 (en) | 2013-10-17 | 2019-09-10 | Deutsches Kresbsforschungszentrum | Double-labeled probe for molecular imaging and use thereof |
WO2015060722A1 (en) | 2013-10-24 | 2015-04-30 | Uniqure Ip B.V. | Aav-5 pseudotyped vector for gene therapy for neurological diseases |
WO2015068697A1 (ja) | 2013-11-11 | 2015-05-14 | オリンパスメディカルシステムズ株式会社 | 処置システム |
CN105829427A (zh) | 2013-12-06 | 2016-08-03 | 蒙诺苏尔有限公司 | 用于水溶性膜的荧光示踪剂、相关方法和相关物品 |
EP3094687B1 (en) | 2014-01-16 | 2020-02-12 | Sony Corporation | Water soluble fluorescent or colored dyes |
JP6374172B2 (ja) | 2014-01-31 | 2018-08-15 | 富士フイルム株式会社 | 着色組成物、およびこれを用いた硬化膜、カラーフィルタ、パターン形成方法、カラーフィルタの製造方法、固体撮像素子、画像表示装置ならびに染料多量体 |
CN106456814B (zh) | 2014-03-11 | 2020-07-21 | 史赛克公司 | 带有用于监视容器内的环境的电池供电的传感器模块的消毒容器 |
US10709791B2 (en) | 2014-11-12 | 2020-07-14 | University Of Washington | Stabilized polymeric carriers for therapeutic agent delivery |
EP3218414A1 (en) | 2014-11-14 | 2017-09-20 | Angiochem Inc. | Conjugates including an antibody moiety, a polypeptide that traverses the blood-brain barrier, and a cytotoxin |
WO2016138457A1 (en) | 2015-02-26 | 2016-09-01 | Sony Corporation | Phenylethynylnaphthalene dyes and methods for their use |
US11827661B2 (en) | 2015-02-26 | 2023-11-28 | Sony Group Corporation | Water soluble fluorescent or colored dyes comprising conjugating groups |
CN114989636A (zh) | 2015-03-12 | 2022-09-02 | 贝克顿·迪金森公司 | 聚合物bodipy染料及其使用方法 |
JP6849599B2 (ja) * | 2015-05-11 | 2021-03-24 | ソニー株式会社 | 超明色ダイマーまたはポリマー染料 |
US9670318B2 (en) | 2015-05-28 | 2017-06-06 | Miltenyi Biotec Gmbh | Bright fluorochromes based on multimerization of fluorescent dyes |
US9913992B2 (en) | 2015-12-22 | 2018-03-13 | Colgate-Palmolive Company | Oral treatment device |
JP7145079B2 (ja) | 2016-04-01 | 2022-09-30 | ソニーグループ株式会社 | 剛性のスペーシング基を有する超明色ダイマーまたはポリマー染料 |
BR112018070164B1 (pt) | 2016-04-01 | 2022-09-27 | Sony Corporation Of America | Corantes diméricos ou poliméricos ultrabrilhantes |
US9851359B2 (en) | 2016-04-06 | 2017-12-26 | Sony Corporation Of America | Ultra bright dimeric or polymeric dyes with spacing linker groups |
EP3455238A1 (en) | 2016-05-10 | 2019-03-20 | Sony Corporation | Ultra bright polymeric dyes with peptide backbones |
EP3455299B1 (en) | 2016-05-10 | 2024-01-17 | Sony Group Corporation | Compositions comprising a polymeric dye and a cyclodextrin and uses thereof |
WO2017197144A1 (en) | 2016-05-11 | 2017-11-16 | Sony Corporation | Ultra bright dimeric or polymeric dyes |
US11377563B2 (en) | 2016-06-06 | 2022-07-05 | Sony Corporation | Ionic polymers comprising fluorescent or colored reporter groups |
EP3491071A1 (en) | 2016-07-29 | 2019-06-05 | Sony Corporation | Ultra bright dimeric or polymeric dyes and methods for preparation of the same |
GB2554666B (en) | 2016-09-30 | 2019-12-18 | Sumitomo Chemical Co | Composite Particle |
US20200222554A1 (en) | 2017-10-05 | 2020-07-16 | Sony Corporation | Programmable dendritic drugs |
CN111315415A (zh) | 2017-10-05 | 2020-06-19 | 索尼公司 | 可编程的聚合药物 |
US20200360526A1 (en) | 2018-01-12 | 2020-11-19 | Sony Corporation | Phosphoalkyl polymers comprising biologically active compounds |
CN111565756A (zh) | 2018-01-12 | 2020-08-21 | 索尼公司 | 包含生物活性化合物的具有刚性间隔基团的聚合物 |
EP3737417A1 (en) | 2018-01-12 | 2020-11-18 | Sony Corporation | Phosphoalkyl ribose polymers comprising biologically active compounds |
EP4137818A1 (en) * | 2018-03-19 | 2023-02-22 | Sony Group Corporation | Use of divalent metals for enhancement of fluorescent signals |
WO2019182766A1 (en) * | 2018-03-21 | 2019-09-26 | Sony Corporation | Polymeric tandem dyes with linker groups |
JP2022526014A (ja) | 2019-04-11 | 2022-05-20 | ソニーグループ株式会社 | プログラム可能なポリマー薬 |
US20220168433A1 (en) | 2019-04-11 | 2022-06-02 | Sony Group Corporation | Programmable polymeric drugs |
WO2020210694A1 (en) | 2019-04-11 | 2020-10-15 | Sony Corporation | Programmable polymeric drugs |
WO2021062176A2 (en) * | 2019-09-26 | 2021-04-01 | Sony Corporation | Polymeric tandem dyes with linker groups |
-
2017
- 2017-04-06 US US15/481,378 patent/US9851359B2/en active Active
- 2017-04-06 CN CN201780029475.5A patent/CN109153860B/zh active Active
- 2017-04-06 KR KR1020237014579A patent/KR20230066645A/ko not_active Application Discontinuation
- 2017-04-06 EP EP17719097.2A patent/EP3440136A2/en active Pending
- 2017-04-06 RU RU2021124058A patent/RU2021124058A/ru unknown
- 2017-04-06 JP JP2018552185A patent/JP7069033B2/ja active Active
- 2017-04-06 KR KR1020187032251A patent/KR20180133890A/ko not_active Application Discontinuation
- 2017-04-06 AU AU2017248165A patent/AU2017248165B2/en active Active
- 2017-04-06 CA CA3019951A patent/CA3019951A1/en active Pending
- 2017-04-06 RU RU2018138590A patent/RU2753706C2/ru active
- 2017-04-06 WO PCT/US2017/026451 patent/WO2017177065A2/en active Application Filing
- 2017-11-01 US US15/801,035 patent/US10866244B2/en active Active
-
2020
- 2020-05-20 US US16/879,572 patent/US10989715B2/en active Active
- 2020-12-14 US US17/121,596 patent/US20210096135A1/en active Pending
-
2021
- 2021-11-09 AU AU2021266230A patent/AU2021266230B2/en active Active
-
2022
- 2022-05-02 JP JP2022075863A patent/JP7432123B2/ja active Active
- 2022-10-04 US US17/959,857 patent/US20230129481A1/en active Pending
-
2023
- 2023-10-31 JP JP2023186400A patent/JP2024023205A/ja active Pending
-
2024
- 2024-04-05 AU AU2024202205A patent/AU2024202205A1/en active Pending
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
US20200284798A1 (en) | 2020-09-10 |
JP2022115953A (ja) | 2022-08-09 |
AU2024202205A1 (en) | 2024-05-02 |
WO2017177065A2 (en) | 2017-10-12 |
US20180164322A1 (en) | 2018-06-14 |
AU2017248165B2 (en) | 2021-08-26 |
US9851359B2 (en) | 2017-12-26 |
US10866244B2 (en) | 2020-12-15 |
RU2018138590A3 (ja) | 2021-01-18 |
US20170292957A1 (en) | 2017-10-12 |
JP2019516821A (ja) | 2019-06-20 |
AU2017248165A1 (en) | 2018-10-11 |
KR20230066645A (ko) | 2023-05-16 |
CN109153860A (zh) | 2019-01-04 |
RU2021124058A (ru) | 2021-09-10 |
US20230129481A1 (en) | 2023-04-27 |
CN109153860B (zh) | 2021-04-23 |
EP3440136A2 (en) | 2019-02-13 |
AU2021266230B2 (en) | 2024-01-18 |
JP7432123B2 (ja) | 2024-02-16 |
RU2018138590A (ru) | 2020-05-19 |
AU2021266230A1 (en) | 2021-12-02 |
KR20180133890A (ko) | 2018-12-17 |
BR112018070533A2 (pt) | 2019-02-12 |
US10989715B2 (en) | 2021-04-27 |
WO2017177065A3 (en) | 2017-11-09 |
RU2753706C2 (ru) | 2021-08-20 |
CA3019951A1 (en) | 2017-10-12 |
JP7069033B2 (ja) | 2022-05-17 |
US20210096135A1 (en) | 2021-04-01 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
JP7432123B2 (ja) | スペーシングリンカー基を有する超明色ダイマーまたはポリマー染料 | |
US20240210408A1 (en) | Use of divalent metals for enhancement of fluorescent signals | |
JP7312929B2 (ja) | 超明色二量体またはポリマー色素およびその調製のための方法 | |
JP2019522066A (ja) | ポリマー染料およびシクロデキストリンを含む組成物、ならびにその使用 | |
JP2019523787A (ja) | 蛍光または有色レポーター基を含むイオン性ポリマー | |
KR20210032434A (ko) | 유기인산염 단위를 포함하는 백본을 갖는 중합체성 염료 | |
WO2023242661A2 (en) | Polymeric tandem dyes with spacing linker groups | |
WO2023242662A2 (en) | Polymeric tandem dyes with spacing linker groups | |
JP2023552448A (ja) | 二量体色素又はポリマー色素における輝度を増強するためのスペーシングリンカー基の設計 | |
BR112018070533B1 (pt) | Corantes diméricos ou poliméricos ultrabrilhantes com grupos agentes de ligação espaçadores | |
CN117280043A (zh) | 用于二聚物或聚合物染料中亮度增强的间隔连接基设计 |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20231128 |
|
A621 | Written request for application examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621 Effective date: 20231128 |