JP2024009857A5 - - Google Patents

Claims (64)

1. 組換えアデノ随伴ウイルス（ｒＡＡＶ）ベクターであって、キャプシドとゲノムとを含み、前記キャプシドは、配列番号：４のアミノ酸配列を含むＶＰ１タンパクを含み、前記ゲノムは、ヒト第ＩＸ因子（ＦＩＸ）タンパクをコードする核酸配列を含み、前記コード配列は、天然のものではなく、その少なくとも７０％が配列番号：１０と同一であり、配列番号：１０によってコードされるヒトＦＩＸタンパクと同一のヒトＦＩＸタンパクをコードし、ヒトＦＩＸタンパクをコードする野生型核酸配列と比較して減少した数のＣｐＧジヌクレオチドを有し、任意選択的にイントロンによって分断される、組換えアデノ随伴ウイルス（ｒＡＡＶ）ベクター。
2. 前記ゲノムが、イントロン、発現制御因子、１つ以上のアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）逆方向末端反復（ＩＴＲ）およびフィラーポリヌクレオチド配列からなる群から選択される付加的配列をさらに含み、前記付加的配列が、任意選択的に、修飾されていない配列と比較して減少した数のＣｐＧジヌクレオチドを有するように修飾される、請求項１に記載のｒＡＡＶベクター。
3. 前記発現制御因子は、配列番号：１４に記載されている配列を含むエンハンサーを含む、請求項２に記載のｒＡＡＶベクター。
4. 前記発現制御因子は、配列番号：１５に記載されている配列を含むプロモーターを含む、請求項２に記載のｒＡＡＶベクター。
5. 前記１つ以上のＡＡＶ ＩＴＲの配列は、それぞれ配列番号：２６に由来するヌクレオチド１２～１４１またはヌクレオチド３５５７～３６８６を含む、請求項２に記載のｒＡＡＶベクター。
6. 前記発現制御因子が肝臓において発現を与える、請求項２に記載のｒＡＡＶベクター。
7. 前記イントロンが、ヒトＦＩＸタンパクをコードする前記配列中に存在するか、または前記発現制御因子が、ヒトＦＩＸタンパクをコードする前記配列に作用可能に連結されているか、または前記ＡＡＶ ＩＴＲが、前記ゲノムの５’末端もしくは３’末端に配置されているか、または前記フィラーポリヌクレオチド配列が、ヒトＦＩＸタンパクをコードする前記配列の５’末端もしくは３’末端に隣接する、請求項２に記載のｒＡＡＶベクター。
8. 前記発現制御因子が、ヒトα１－抗トリプシン（ｈＡＡＴ）遺伝子プロモーターもしくはその一部、またはアポリポタンパクＥ（ＡｐｏＥ）ＨＣＲ－１もしくはＨＣＲ－２エンハンサーもしくはその一部を含む、請求項７に記載のｒＡＡＶベクター。
9. ヒトＦＩＸタンパクをコードする前記配列が、ヒトＦＩＸをコードする天然の配列よりも１～５５個少ないＣｐＧジヌクレオチドを有する、請求項１に記載のｒＡＡＶベクター。
10. ヒトＦＩＸタンパクをコードする前記配列が、いかなるＣｐＧジヌクレオチドも含まない、請求項１に記載のｒＡＡＶベクター。
11. ヒトＦＩＸタンパクをコードする前記配列がイントロンによって分断されている、請求項１に記載のｒＡＡＶベクター。
12. ヒトＦＩＸタンパクをコードする前記配列が、配列番号：１０に対して８０％以上の同一性を有する配列を含む、請求項１に記載のｒＡＡＶベクター。
13. 組換えアデノ随伴ウイルス（ｒＡＡＶ）ベクターであって、キャプシドとゲノムとを含み、前記キャプシドは、配列番号：４のアミノ酸配列を含むＶＰ１タンパクを含み、前記ゲノムは、ヒト第ＩＸ因子（ＦＩＸ）タンパクをコードする核酸配列を含み、前記コード配列は、天然のものではなく、その少なくとも７０％が配列番号：１０と同一であり、配列番号：１０によってコードされるヒトＦＩＸタンパクと同一のヒトＦＩＸタンパクをコードし、任意選択的にイントロンによって分断される、組換えアデノ随伴ウイルス（ｒＡＡＶ）ベクター。
14. 前記イントロンが配列番号：１７に記載される配列を含む、請求項１または１３に記載のｒＡＡＶベクター。
15. ヒトＦＩＸをコードする前記配列の３’に位置するポリアデニル化配列をさらに含む、
    請求項１または１３に記載のｒＡＡＶベクター。
16. 前記ポリアデニル化配列は、すべてのＣｐＧジヌクレオチドを除去されている、請求項１５に記載のｒＡＡＶベクター。
17. 前記ゲノムが、ＡＡＶ１、ＡＡＶ２、ＡＡＶ３、ＡＡＶ４、ＡＡＶ５、ＡＡＶ６、ＡＡＶ７、ＡＡＶ８、ＡＡＶ９、ＡＡＶ１０、ＡＡＶ１１、Ｒｈ１０またはＲｈ７４のＡＡＶ血清型のいずれかのＩＴＲ配列をさらに含む、請求項１または１５に記載のｒＡＡＶベクター。
18. 請求項１または１７に記載のｒＡＡＶベクターを含む医薬組成物。
19. 空キャプシドＡＡＶをさらに含む、請求項１８に記載の医薬組成物。
20. 前記空キャプシドＡＡＶが、ＡＡＶ１、ＡＡＶ２、ＡＡＶ３、ＡＡＶ４、ＡＡＶ５、ＡＡＶ６、ＡＡＶ７、ＡＡＶ８、ＡＡＶ９、ＡＡＶ１０およびＡＡＶ１１の血清型ＡＡＶから選択されるか、または配列番号：４のアミノ酸配列を含むＶＰ１タンパクを含むＡＡＶキャプシドである、請求項１９に記載の医薬組成物。
21. 前記核酸を哺乳動物または前記哺乳動物の細胞に送達または導入するための、請求項１または１３に記載のｒＡＡＶベクターの使用。
22. 前記核酸配列によりコードされるＦＩＸタンパクの前記哺乳動物における発現のために、前記ＦＩＸタンパクを必要とする哺乳動物を治療するための、請求項１または１３に記載のｒＡＡＶベクターの使用。
23. 前記哺乳動物の細胞、組織または器官における前記ＦＩＸタンパクの発現のための、請求項２２に記載の使用。
24. 前記核酸のコード配列が配列番号：１０と少なくとも７５％同一である、請求項１または１３に記載のｒＡＡＶベクター。
25. 前記核酸のコード配列が配列番号：１０と少なくとも８０％同一である、請求項１または１３に記載のｒＡＡＶベクター。
26. 前記核酸のコード配列が配列番号：１０と少なくとも８５％同一である、請求項１または１３に記載のｒＡＡＶベクター。
27. 前記核酸のコード配列が配列番号：１０と少なくとも９０％同一である、請求項１または１３に記載のｒＡＡＶベクター。
28. 前記核酸のコード配列が配列番号：１０と少なくとも９５％同一である、請求項１または１３に記載のｒＡＡＶベクター。
29. 前記哺乳動物は血友病Ｂを有するヒトの患者である、請求項２２に記載の使用。
30. 前記核酸のコード配列が配列番号：１０と少なくとも９６％同一である、請求項１または１３に記載のｒＡＡＶベクター。
31. 前記核酸のコード配列が配列番号：１０と少なくとも９７％同一である、請求項１または１３に記載のｒＡＡＶベクター。
32. 前記核酸のコード配列が配列番号：１０と少なくとも９８％同一である、請求項１または１３に記載のｒＡＡＶベクター。
33. 前記核酸のコード配列が配列番号：１０と少なくとも９９％同一である、請求項１または１３に記載のｒＡＡＶベクター。
34. 血友病Ｂを治療するための組換えアデノ随伴ウイルス（ｒＡＡＶ）ベクターであって、
    前記ｒＡＡＶベクターはキャプシドとゲノムとを含み、
    前記キャプシドは配列番号：４のアミノ酸配列を有するＶＰ１タンパクを含み、
    前記ゲノムは一本鎖であり、５’から３’の順序で
    （ａ）第１のアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）逆方向末端反復（ＩＴＲ）と、
    （ｂ）アポリポタンパクＥ（ＡｐｏＥ）ＨＣＲ－１エンハンサーまたはその一部と、
    （ｃ）α１－抗トリプシン（ＡＡＴ）遺伝子プロモーターまたはその一部と、
    （ｄ）ヒト第ＩＸ因子（ＦＩＸ）Ｐａｄｕａ変異体をコードする配列を含む核酸であって、前記核酸のコード配列は、天然のものではなく、その少なくとも７０％が配列番号：１０と同一であり、配列番号：１０によってコードされるものと同一のヒトＦＩＸタンパクをコードし、任意選択的にイントロンによって分断される、核酸と、
    （ｅ）ポリアデニル化配列と、
    （ｆ）第２のＡＡＶ ＩＴＲ
    の因子を含む、組換えアデノ随伴ウイルス（ｒＡＡＶ）ベクター。
35. （ａ）前記第１のＡＡＶ ＩＴＲの核酸配列は、配列番号：２６のヌクレオチド１２～１４１を含み、
    （ｂ）前記ＡｐｏＥ ＨＣＲ－１エンハンサーの核酸配列は、配列番号：１２のヌクレオチド１５２～４７２を含み、
    （ｃ）前記ＡＡＴ遺伝子プロモーターの核酸配列は、配列番号：１２のヌクレオチド４８２～８７８を含み、
    （ｄ）ヒトＦＩＸ Ｐａｄｕａ変異体をコードする前記核酸の配列は、配列番号：１２のヌクレオチド９０８～３７３１からなり、
    （ｅ）前記ポリアデニル化配列の核酸配列は、配列番号：１２のヌクレオチド３８２０～４０４７を含み、
    （ｆ）前記第２のＡＡＶ ＩＴＲの核酸配列は、配列番号：２６のヌクレオチド３５５７～３６８６を含む、
    請求項３４に記載のｒＡＡＶベクター。
36. 前記ゲノムが、配列番号：１２のヌクレオチド１４２～４０９６に対応する核酸配列を含む、請求項３５に記載のｒＡＡＶベクター。
37. 血友病Ｂを有するヒトの患者を治療するための、請求項３４に記載の治療有効量のｒＡＡＶベクターの使用。
38. 前記ヒトの患者が重度の血友病Ｂの症状を有し、前記使用が、前記症状を重度から中等度または軽度の血友病Ｂの症状に軽減するのに有効である、請求項３７に記載の使用。
39. （ｉ）ヒト第ＩＸ因子（ＦＩＸ）タンパクをコードする配列を含む核酸であって、前記核酸のコード配列は、天然のものではなく、その少なくとも７０％が配列番号：１０と同一であり、配列番号：１０によってコードされるものと同一のヒトＦＩＸタンパクをコードし、任意選択的にイントロンによって分断される、核酸と、（ｉｉ）アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）Ｒｅｐタンパクと、（ｉｉｉ）配列番号：４のアミノ酸配列を含むＡＡＶキャプシドタンパクと、（ｉｖ）アデノウイルス・ヘルパー・タンパクとを含む、パッケージング細胞。
40. 配列番号：１２のヌクレオチド１４２～４０９６の配列を含む核酸をＡＡＶ粒子中にパッケージングすることを可能にする条件下で、請求項３９に記載のパッケージング細胞をインキュベートすることにより産生される組換えＡＡＶ（ｒＡＡＶ）ベクター。
41. 前記ｒＡＡＶベクターが分離または精製される、請求項４０に記載の方法によって産生されるｒＡＡＶベクター。
42. 組換えアデノ随伴ウイルス（ｒＡＡＶ）ベクターであって、キャプシドとゲノムとを含み、前記キャプシドは、配列番号：４のアミノ酸配列を含むＶＰ１タンパクを含み、前記ゲノムは、少なくとも１つのＡＡＶ逆方向末端反復（ＩＴＲ）と、ヒト第ＩＸ因子（ＦＩＸ）タンパクをコードする配列を含む核酸とを含み、前記核酸のコード配列は、天然のものではなく、その少なくとも９０％が配列番号：１０と同一であり、配列番号：１０によってコードされるヒトＦＩＸタンパクと同一のヒトＦＩＸタンパクをコードし、任意選択的にイントロンによって分断される、組換えアデノ随伴ウイルス（ｒＡＡＶ）ベクター。
43. 前記ゲノムは、ヒトＦＩＸタンパクをコードする前記配列と作用可能に連結した発現制御因子をさらに含む、請求項４２に記載のｒＡＡＶベクター。
44. 前記発現制御因子がプロモーターと、任意選択的にエンハンサーとを含む、請求項４３に記載のｒＡＡＶベクター。
45. 前記発現制御因子が組織特異的である、請求項４４に記載のｒＡＡＶベクター。
46. 前記発現制御因子が肝臓特異的である、請求項４５に記載のｒＡＡＶベクター。
47. 前記ゲノムはさらにポリヌクレオチドスタッファーを含む、請求項４４に記載のｒＡＡＶベクター。
48. 前記ゲノムはさらに転写ターミネーターを含む、請求項４４に記載のｒＡＡＶベクター。
49. 組換えアデノ随伴ウイルス（ｒＡＡＶ）ベクターであって、キャプシドとゲノムとを含み、前記キャプシドは、配列番号：４のアミノ酸配列を含むＶＰ１タンパクを含み、前記ゲノムは、ＡＡＶ逆方向末端反復（ＩＴＲ）と、ヒト第ＩＸ因子（ＦＩＸ）タンパクをコードする配列を含む核酸と作用可能に連結した肝臓特異的なエンハンサーおよびプロモーターとを含み、前記核酸のコード配列は、天然のものではなく、その少なくとも７０％が配列番号：１０と同一であり、配列番号：１０によってコードされるヒトＦＩＸタンパクと同一のヒトＦＩＸタンパクをコードし、任意選択的にイントロン、転写ターミネーター、および任意選択的に第２のＡＡＶ ＩＴＲによって分断される、組換えアデノ随伴ウイルス（ｒＡＡＶ）ベクター。
50. 前記第１のＡＡＶ ＩＴＲが前記ゲノムの５’末端または３’末端に位置し、前記第２
    のＡＡＶ ＩＴＲが存在する場合には当該第２のＡＡＶ ＩＴＲが前記ゲノムの反対側の末端に位置する、請求項４９に記載のｒＡＡＶベクター。
51. 前記ゲノムはさらにイントロンまたはポリヌクレオチドスタッファーを含む、請求項５０に記載のｒＡＡＶベクター。
52. 前記ゲノムは一本鎖ＤＮＡである、請求項５１に記載のｒＡＡＶベクター。
53. 前記イントロンが配列番号：１７に記載される核酸配列を含む、請求項５１に記載のｒＡＡＶベクター。
54. ヒトＦＩＸタンパクをコードする前記核酸の前記配列及びイントロンが配列番号：２５の核酸配列を含む、請求項５１に記載のｒＡＡＶベクター。
55. 前記プロモーターが、ヒトα１－抗トリプシン（ＡＡＴ）プロモーターもしくはその一部であり、前記エンハンサーが、アポリポタンパクＥ（ＡｐｏＥ）ＨＣＲ－１もしくはＨＣＲ－２エンハンサーもしくはその一部である、請求項４９に記載のｒＡＡＶベクター。
56. 前記エンハンサーが配列番号：１４の核酸配列を含む、請求項５５に記載のｒＡＡＶベクター。
57. 前記プロモーターが配列番号：１５の核酸配列を含む、請求項５５に記載のｒＡＡＶベクター。
58. 前記ＡＡＶ ＩＴＲはＡＡＶ２ ＩＴＲである、請求項４９に記載のｒＡＡＶベクター。
59. 血友病Ｂを治療するための組換えアデノ随伴ウイルス（ｒＡＡＶ）ベクターであって、
    前記ｒＡＡＶベクターはキャプシドとゲノムとを含み、
    前記キャプシドは配列番号：４のアミノ酸配列を有するＶＰ１タンパクを含み、
    前記ゲノムは
    （ａ）第１のＡＡＶ逆方向末端反復（ＩＴＲ）と、
    （ｂ）肝臓特異的なエンハンサーおよびプロモーターと、
    （ｃ）ヒト第ＩＸ因子（ＦＩＸ）Ｐａｄｕａ変異体をコードする核酸配列であって、前記核酸配列のコード配列は、天然のものではなく、その少なくとも７０％が配列番号：１０と同一であり、配列番号：１０によってコードされるものと同一のヒトＦＩＸタンパクをコードし、イントロンによって分断される、核酸配列と、
    （ｄ）ポリアデニル化配列と、
    （ｅ）第２のＡＡＶ ＩＴＲ
    の因子を含む、組換えアデノ随伴ウイルス（ｒＡＡＶ）ベクター。
60. 前記エンハンサーがアポリポタンパクＥ（ＡｐｏＥ）ＨＣＲ－１エンハンサーまたはその一部であり、前記プロモーターがヒトα１－抗トリプシン（ｈＡＡＴ）プロモーターまたはその一部であり、前記イントロンがｈＦＩＸイントロンＡまたはその一部であり、前記ポリアデニル化配列がｂＧＨポリＡ配列またはその一部である、請求項５９に記載のｒＡＡＶベクター。
61. （ａ）前記第１のＡＡＶ ＩＴＲの核酸配列は、配列番号：２６のヌクレオチド１２～１４１を含み、
    （ｂ）前記エンハンサーの核酸配列は、配列番号：１２のヌクレオチド１５２～４７２を含み、
    （ｃ）前記プロモーターの核酸配列は、配列番号：１２のヌクレオチド４８２～８７８を含み、
    （ｄ）ヒトＦＩＸをコードする前記核酸配列は、配列番号：１２のヌクレオチド９０８～９９５および２４３４～３７３１からなり、
    （ｅ）前記イントロンの核酸配列は、配列番号：１２のヌクレオチド９９６～２４３３を含み、
    （ｆ）前記ポリアデニル化配列の核酸配列は、配列番号：１２のヌクレオチド３８２０～４０４７を含み、
    （ｇ）前記第２のＡＡＶ ＩＴＲの核酸配列は、配列番号：２６のヌクレオチド３５５７～３６８６を含む、
    請求項５９に記載のｒＡＡＶベクター。
62. 前記ゲノムが、前記プロモーターの後、かつ前記コード配列の前に位置する５’ＵＴＲ
    と、前記コード配列の後、かつ前記ポリアデニル化配列の前に位置する３’ＵＴＲとをさらに含む、請求項５９に記載のｒＡＡＶベクター。
63. 前記５’ＵＴＲの核酸配列が配列番号：１２のヌクレオチド８７９～９０７を含み、前
    記３’ＵＴＲが配列番号：１２のヌクレオチド３７３２～３７７９を含む、請求項６２に記載のｒＡＡＶベクター。
64. 前記ゲノムが一本鎖ＤＮＡであり、その核酸配列が配列番号：１２のヌクレオチド１４２～４０９６を含む、請求項６３に記載のｒＡＡＶベクター。