JP2021061851A - がんワクチン - Google Patents

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Abstract

【課題】がん免疫療法において使用するための、(a)単離の免疫原性TAAポリペプチド(すなわち、免疫原性MUC1ポリペプチド、免疫原性MSLNポリペプチドおよび免疫原性TERTポリペプチド)、(b)1つまたは複数の免疫原性TAAポリペプチドをコードする単離の核酸分子、(c)免疫原性TAAポリペプチドまたは免疫原性TAAポリペプチドをコードする単離の核酸分子を含むワクチン組成物、ならびに(d)当該ポリペプチド、核酸分子および組成物を提供する。【解決手段】免疫原性MUC1ポリペプチドをコードする少なくとも1つのヌクレオチド配列、免疫原性TERTポリペプチドをコードする少なくとも1つのヌクレオチド配列、免疫原性MSLNポリペプチドをコードする少なくとも1つのヌクレオチド配列のうち、いずれか2つの配列を含む核酸分子含む多抗原構築物。【選択図】なし

Description

関連出願の参照
本出願は、2016年1月19日出願の米国仮特許出願第62/280,636号および2016年11月8日出願の米国仮特許出願第62/419,190号に対する優先権を主張している。上記の出願のそれぞれの内容全体が、参照により本明細書に組み込まれている。
本発明は一般に、免疫療法、とりわけ、新生物による障害を治療または予防するためのワクチンおよび方法に関する。
全世界において、がんが、死亡の主要な原因である。がんは、多様な臓器、例として、膵臓、卵巣、乳房、肺、結腸および直腸において生じ得る。米国においては、膵臓がんは、がん死亡の4番目に多い原因である。膵臓がんは、膵臓の外分泌または内分泌構成要素において生じ得る。外分泌系がんは、(1)群を抜いて最も一般的なタイプである、膵臓腺癌、(2)外分泌系膵臓がんの5%に相当する、腺房細胞癌、(3)膵臓がんの1%を占める、嚢胞腺癌、ならびに(4)その他の希少な形態のがん、例として、膵芽腫、腺扁平上皮癌、印環細胞癌、肝様癌、膠様細胞癌、未分化癌、および破骨細胞様巨細胞を有する未分化癌を含む。
卵巣がんは、女性の間のがんの約3%を占めるが、女性の生殖器系のいずれのその他のがんよりも多くの死亡を引き起こす。卵巣がんは、(1)上皮性がん、例として、上皮性卵巣癌、(2)生殖細胞がん、例として、未熟奇形腫、および(3)間質がん、例として、顆粒膜細胞腫を含む。
乳がんは、アメリカ人女性の間で2番目に多いがんであり、女性におけるがん死亡の第2の主要な原因である。乳がんを、ホルモン受容体およびHER2/neuの状況に基づいて、例として、(1)ホルモン受容体陽性がん(この場合、がん細胞が、エストロゲン受容体またはプロゲステロン受容体のいずれかを含有する)、(2)ホルモン受容体陰性がん(この場合、がん細胞は、エストロゲン受容体およびプロゲステロン受容体のいずれも有しない)、(3)HER2/neu陽性(この場合、がんが、過剰なHER2/neuタンパク質またはHER2/neu遺伝子の余分なコピーを有する)、(4)HER2/neu陰性がん(この場合、がんは、過剰なHER2/neuを有しない)、(5)三種陰性がん(この場合、乳がん細胞は、エストロゲン受容体、ノルプロゲステロン受容体および過剰なHER2のいずれも有しない)、ならびに(6)三種陽性がん(この場合、がんが、エストロゲン受容体陽性であり、プロゲステロン受容体陽性であり、多過ぎるHER2を有する)に分類することができる。
肺がんは、全てのがん死亡の4分の1超を占め、群を抜いて、男性および女性の両方におけるがん死亡の主要な原因である。肺がんの最も一般的なタイプが、非小細胞肺がん(NSCLC)であり、これは、肺がんの約85%〜90%を占める。NSCLCは、いくつかのサブタイプ、例として、扁平上皮細胞(類表皮)癌、腺癌、大細胞(未分化)癌、腺扁平上皮癌および肉腫様癌にさらに分類することができる。肺がんの2番目に多いタイプは、小細胞肺がん(SCLC)であり、これは、全ての肺がんの約10%〜15%を占める。
結腸直腸がん(CRC)は、米国では男性および女性の両方を組み合わせると、がん関連死亡の第2の主要な原因となる。腺癌が、CRCの最も一般的なタイプであり、これは、結腸直腸がんの95%超を占める。CRCのその他のあまり一般的ではないタイプは、カルチノイド腫瘍、胃腸管間質腫瘍(GIST)、リンパ腫および肉腫を含む。
胃がんは、世界における、がん関連死亡の3番目に多い原因である。胃がんは、依然として治癒が困難であり、その理由は、主として、ほとんどの患者が進行性疾患を提示するからである。現時点の米国では、胃がんは、15番目に多いがんである。胃がんの約90〜95%は、腺癌であり、その他のあまり一般的ではないタイプは、リンパ腫(4%)、GIST、およびカルチノイド腫瘍(3%)を含む。
一部の循環がんおよび固形がんの管理においては、がん管理の従来レジメンが成功している。しかし、多くのタイプのがんは、従来のアプローチに対して抵抗性である。近年、がんのための免疫療法、特に、がんワクチンおよび抗体療法が探索されている。がん免疫療法の1つのアプローチは、標的のがん細胞上の腫瘍関連抗原(TAA)に対して活性な全身免疫応答を生成するために、免疫原を投与することを伴う。多数の腫瘍関連抗原が同定されるに至り、これらの抗原のうちの多くが、がんの治療または予防のための、ウイルス、細菌、タンパク質、ペプチドまたはDNAに基づくワクチンとして探索されてきたが、これまでのほとんどの臨床治験は、治療のための製品をもたらすことができないでいる。したがって、がんの治療または予防において使用することができる免疫原が必要とされている。
本開示は、がん免疫療法において使用するための、腫瘍関連抗原MUC1、メソテリンおよびTERTに由来する免疫原、ならびにそのような免疫原を含む組成物に関する。
ヒトムチン1(MUC1;エピシアリン、PEM、H23Ag、EMA、CA15−3およびMCAとしてもまた公知である)は、単層上皮および腺上皮の頂端膜側上に発現する多型性の膜貫通糖タンパク質である。MUC1遺伝子は、シグナルペプチド配列を含む、単一のポリペプチド鎖の前駆体をコードする。翻訳の直後に、シグナルペプチド配列は除去され、MUC1前駆体の残りの部分は、2つのペプチド断片、すなわち、より長いN末端サブユニット(MUC1−NまたはMUC1α)およびより短いC末端サブユニット(MUC1−CまたはMUC1β)にさらに切断(cleave)される。成熟したMUC1は、MUC1−NおよびMUC1−Cを含み、これらは、安定な水素結合を介して結び付いている。MUC1−Nは、細胞外ドメインであり、20個のアミノ酸残基の可変数タンデムリピート(VNTR)を25〜125個含有する。MUC1−Cは、(およそ53個のアミノ酸の)短い細胞外領域、(およそ28個のアミノ酸の)膜貫通ドメイン、および(およそ72個のアミノ酸の)細胞質内テールを含有する。MUC1の細胞質内テール(MUC1−CT)は、高度に保存されているセリン残基およびチロシン残基を含有し、これらの残基は、増殖因子受容体および細胞内キナーゼによりリン酸化される。ヒトMUC1は、異なるタイプの、MUC1のRNAの代替のスプライシングの結果生じる複数のアイソフォームとして存在する。完全長のヒトMUC1アイソフォーム1タンパク質前駆体のアミノ酸配列(アイソフォーム1、Uniprot P15941−1)を、配列番号1として提供する(「MUC1アイソフォーム1参照ポリペプチド」)。これまでに、ヒトMUC1の少なくとも16個のその他のアイソフォームが報告されており(Uniprot P15941−2〜P15941−17)、これらは、アイソフォーム1の配列と比較すると、多様な挿入、欠失または置換を含む。これらのアイソフォームは、アイソフォーム2、3、4、5、6、Y、8、9、F、Y−LSP、S2、M6、ZD、T10、E2およびJ13として公知である(それぞれ、Uniprot P15941−2〜P15941−17)。完全長のヒトMUC1アイソフォーム1前駆体タンパク質は、1255個のアミノ酸からなり、これは、アミノ酸1〜23に、シグナルペプチド配列を含む。成熟したMUC1タンパク質のMUC1−NおよびMUC1−Cドメインはそれぞれ、アミノ酸24〜1097および1098〜1255からなる。
メソテリン(MSLNとしてもまた公知である)は、胸膜、腹膜および心膜を裏打ちする細胞の表面上に存在する膜結合型糖タンパク質であり、中皮腫、卵巣および膵臓腺癌を含めた、いくつかのヒト腫瘍において過剰発現する。メソテリン遺伝子は、71キロダルトン(kDa)の前駆体タンパク質をコードし、このタンパク質はプロセシングされて、40kDaのメソテリンタンパク質および分泌型の巨核球増強因子(MPF)タンパク質になる(Changら、Proc Natl Acad Sci USA(1996)93:136〜40)。MSLN遺伝子の代替のスプライシングの結果、少なくとも4つのメソテリンアイソフォームが生じる。アイソフォーム1(Uniprot Q13421−1)、アイソフォーム2(Uniprot Q13421−3)、アイソフォーム3(Uniprot Q13421−2)およびアイソフォーム4(Uniprot Q13421−4)のアミノ酸配列が、Uniprot(www.uniprot.org)において入手可能である。完全長のヒトMSLNアイソフォーム2前駆体タンパク質のアミノ酸配列(Uniprot識別子 Q13421−3)は、622個のアミノ酸からなり、配列番号2として提供する(「メソテリン前駆体アイソフォーム2参照ポリペプチド」)。MSLNの細胞質内部分は、配列番号2のアミノ酸残基37〜597を含む。アイソフォーム2は、MSLNの主要な形態である。アイソフォーム1は、630個のアミノ酸からなり、アイソフォーム2とは、アイソフォーム2の配列の409位において8つのアミノ酸(PQAPRRPL)の挿入を有することによって異なる。アイソフォーム2と比較すると、アイソフォーム3は、(アイソフォーム2の593〜622位において)代替のC末端を有し、一方、アイソフォーム4は、アミノ酸44の欠失を有する。アイソフォーム2は、最初に、622個のアミノ酸の前駆体として翻訳され、これは、N末端においてシグナルペプチド配列(アミノ酸1〜36)を含み、C末端においてGPIアンカー配列を含む。シグナルペプチド配列およびGPIアンカー配列は、切断(cleave)され除かれて、成熟したメソテリンとなり得る。
テロメラーゼ逆転写酵素(またはTERT)は、テロメラーゼの触媒性の構成要素であり、これは、テロメア反復TTAGGGの添加によりテロメア末端を維持することに関与するリボ核タンパク質ポリメラーゼである。TERTに加えて、テロメラーゼはまた、RNA構成要素も含み、これは、テロメア反復のための鋳型として働く。ヒトTERT遺伝子は、1132個のアミノ酸のタンパク質をコードする。ヒトTERTのいくつかのアイソフォームが存在し、それらは、代替のスプライシングの結果生じる。アイソフォーム1、アイソフォーム2、アイソフォーム3およびアイソフォーム4のアミノ酸配列が、Uniprot(<www.uniprot.org>)において入手可能である(それぞれ、Uniprot識別子 O14746−1、O14746−2、O14746−3およびO14746−4)。また、本明細書では、ヒト完全長TERTアイソフォーム1タンパク質のアミノ酸配列(アイソフォーム1、Genbank AAD30037、Uniprot O14746−1)も、配列番号3として提供する(「TERTアイソフォーム1参照ポリペプチド」)。TERTアイソフォーム1(O14746−1)と比較すると、アイソフォーム2(O14746−2)は、アミノ酸764〜807の交換(STLTDLQPYM...LNEASSGLFD−>LRPVPGDPAG...AGRAAPAFGG)およびC末端のアミノ酸808〜1132の欠失を有し、アイソフォーム3(O14746−3)は、アミノ酸885〜947の欠失を有し、アイソフォーム4(O14746−4)は、アミノ酸711〜722および808〜1132の欠失、ならびにアミノ酸764〜807の交換(STLTDLQPYM...LNEASSGLFD−>LRPVPGDPAG...AGRAAPAFGG)を有する。
いくつかの態様では、本開示は、がんを治療するために、MUC1、MSLNおよびTERTに由来する、単離の免疫原性ポリペプチドを提供し、本開示は、例えば、in vivoで(例えば、ヒトを含めた、動物において)免疫応答を惹起するのに、またはワクチン中の構成要素として使用するのに有用である。
その他の態様では、本開示は、本開示が提供する免疫原性ポリペプチドをコードする核酸分子を提供する。いくつかの実施形態では、本開示は、多抗原核酸構築物を提供し、それぞれの構築物が、2または3つ以上の免疫原性ポリペプチドをコードする。
本開示はまた、本発明の1つまたは複数の核酸分子を含有するベクターも提供する。ベクターは、核酸分子がコードする免疫原性TAAポリペプチドをクローニングするかまたは発現させるのに、または組成物、例として、ワクチン中の核酸分子を、宿主細胞または宿主動物もしくはヒトに送達するのに有用である。
いくつかのさらなる態様では、本開示は、1つもしくは複数の免疫原性TAAポリペプチド、免疫原性TAAポリペプチドをコードする単離の核酸分子、または免疫原性TAAポリペプチドをコードする核酸分子を含有するベクターもしくはプラスミドを含む組成物を提供する。いくつかの実施形態では、組成物は、哺乳動物、例として、マウス、イヌ、サルまたはヒトにおいてTAAに対する免疫応答を惹起するのに有用な免疫原性組成物である。いくつかの実施形態では、組成物は、哺乳動物、例として、ヒトを免疫化するのに、異常な細胞増殖を阻害するのに、がんの発生に対する保護をもたらすのに(予防としての使用に)、またはTAAの過剰発現と関連がある障害、例として、がん、特に、膵臓がん、卵巣がんおよび三種陰性乳がんを治療するのに(治療薬としての使用に)有用なワクチン組成物である。
さらなるその他の態様では、本開示は、本明細書上記に記載した免疫原性TAAポリペプチド、単離の核酸分子、および免疫原性TAAポリペプチドまたは単離の核酸分子を含む組成物を使用する方法を提供する。いくつかの実施形態では、本開示は、哺乳動物、特に、ヒトにおいてTAAに対する免疫応答を惹起する方法であって、標的のTAAに対して免疫原性である、本発明が提供するポリペプチドの有効量、そのような免疫原性ポリペプチドをコードする単離の核酸分子の有効量、またはそのような免疫原性TAAポリペプチドもしくはそのような免疫原性TAAポリペプチドをコードする単離の核酸分子を含む組成物を哺乳動物に投与するステップを含む方法を提供する。ポリペプチドワクチンまたは核酸ワクチンは、1つまたは複数のアジュバントまたは免疫調節剤と一緒に使用することができる。
A.定義
用語「アジュバント」は、ワクチン免疫原が惹起する免疫応答の増強、加速または延長をもたらすことが可能である物質を指す。
用語「アゴニスト」は、別の分子(例として、受容体)の活性を促進する(誘発する、引き起こす、増強する、または増加させる)物質を指す。アゴニストという用語は、受容体に結合する物質、および受容体には結合しないが、受容体の機能を促進する物質を包含する。
用語「アンタゴニスト」または「阻害剤」は、別の分子、または受容体の生物学的活性を部分的または完全に遮断する、阻害する、または中和する物質を指す。
用語「併用投与」は、治療期間の間に2つ以上の薬剤を同じ対象に投与することを指す。2つ以上の薬剤を、単一製剤中に包含し、したがって、同時に投与することができる。代わって、2つ以上の薬剤を、物理的に別個の製剤とし、別個に、対象に順次または同時に投与することもできる。用語「同時に投与する」または「同時投与」は、第1の薬剤の投与と第2の薬剤の投与とが相互に時間的にオーバーラップすることを意味し、一方、用語「順次に投与する」または「順次投与」は、第1の薬剤の投与と第2の薬剤の投与とが相互に時間的にオーバーラップしないことを意味する。
用語「細胞質の」または「細胞質内の」は、特定のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を、宿主細胞により発現させると、発現させたポリペプチドは、宿主細胞の内側に保持されることが予測されることを意味する。
用語「縮重バリアント」は、塩基の置換を有するが、同じポリペプチドをコードする核酸配列を指す。
用語「有効量」は、哺乳動物において所望の効果を引き起こすのに十分である、哺乳動物に投与する量を指す。
所与のポリペプチドの「断片」という用語は、所与のポリペプチドよりも短く、所与のポリペプチドの配列と100%の同一性を共有するポリペプチドを指す。
免疫原性TAAポリペプチドの「機能性バリアント」という用語は、参照免疫原性TAAポリペプチドのアミノ酸の数の90%〜110%を含み、参照TAAポリペプチドのアミノ酸配列に対して、100%よりも低いが、95%よりも高い同一性を有し、参照免疫原性TAAポリペプチドと同じまたはそれに類似する免疫原性特性を保有するポリペプチドを指す。
用語「同一」は、ヌクレオチドまたはアミノ酸のぴったり同じ配列をそれぞれ共有する、2つ以上の核酸、または2つ以上のポリペプチドを指す。用語「パーセント同一性」は、2つ以上の核酸またはポリペプチド間の類似性のレベルを記載する。2つの配列をバイオインフォマティクスソフトウエアにより整列させる場合、配列間でぴったり一致するヌクレオチド/アミノ酸の数に100を掛け、ギャップを含む、整列させる領域の長さで割ることによって、「パーセント同一性」を計算する。例えば、整列させると、10個のミスマッチを示す、100アミノ酸長の2つのポリペプチドは、90%同一である。
用語「免疫エフェクター細胞増強剤」または「IEC増強剤」は、哺乳動物の1つまたは複数のタイプの免疫エフェクター細胞の数、質および/または機能を増加させるおよび/または増強することが可能な物質を指す。免疫エフェクター細胞の例として、細胞溶解性CD8T細胞、CD4T細胞、NK細胞およびB細胞が挙げられる。
用語「免疫調節剤」は、哺乳動物の自然免疫系、液性免疫系または細胞性免疫系の任意の構成要素の働きまたは機能を変化させる(例えば、阻害する、減少させる、増加させる、増強する、または刺激する)ことが可能な物質を指す。したがって、用語「免疫調節剤」は、本明細書の定義に従う「免疫エフェクター細胞増強剤」および本明細書の定義に従う「免疫抑制細胞阻害剤」、ならびに哺乳動物の免疫系の任意のその他の構成要素に影響を及ぼす物質を包含する。
用語「免疫応答」は、宿主脊椎動物の免疫系による、特定の物質(例として、抗原または免疫原)に対する検出可能な任意の応答を指し、それらとして、これらに限定されないが、自然免疫応答(例えば、トール様受容体シグナル伝達カスケードの活性化)、細胞媒介型免疫応答(例えば、T細胞、例として、抗原特異的T細胞、および免疫系の非特異的細胞が媒介する応答)、ならびに液性免疫応答(例えば、B細胞が媒介する応答、例として、血漿、リンパ液および/または組織液内への抗体の生成および分泌)が挙げられる。免疫応答の例には、トール様受容体活性化の変化(例えば、増加)、リンホカイン(例えば、サイトカイン(例えば、Th1、Th2もしくはTh17型サイトカイン)またはケモカイン)の発現または分泌、マクロファージの活性化、樹状細胞の活性化、T細胞(例えば、CD4+またはCD8+T細胞)の活性化、NK細胞の活性化、B細胞の活性化(例えば、抗体の生成および/または分泌)、免疫原(例えば、抗原、免疫原性ポリペプチド)のMHC分子への結合、細胞傷害性Tリンパ球(「CTL」)応答の誘発、B細胞応答(例えば、抗体産生)の誘発、ならびに免疫系の細胞(例えば、T細胞およびB細胞)の拡大増殖(例えば、細胞集団の成長)、ならびに抗原提示細胞による抗原のプロセシングおよび提示の増加が含まれる。用語「免疫応答」はまた、in vitroで、脊椎動物の免疫系の1つまたは複数の構成要素が、特定の物質(例として、抗原または免疫原)に対する、任意の検出可能な応答も包含する。
用語「免疫原」は、免疫原性である物質を指す。
用語「免疫原性」は、物質が、哺乳動物(例として、ヒト)への投与時に、単独であってもまたは担体に連結している場合であっても、哺乳動物において、アジュバントの存在下または非存在下で、免疫応答を引き起こす、惹起する、刺激する、もしくは誘発する、または特定の抗原に対する既存の免疫応答を改善する、増強する、増加させる、もしくは延長する能力を指す。
用語「免疫原性組成物」は、免疫原性である組成物を指す。
用語「免疫原性MUC1ポリペプチド」は、ヒトネイティブMUC1タンパク質に対して、またはヒトネイティブMUC1タンパク質を発現する細胞に対して、免疫原性であるポリペプチドを指す。このポリペプチドは、ヒトネイティブMUC1タンパク質のアミノ酸配列と同じアミノ酸配列を有する場合、またはヒトネイティブMUC1タンパク質のアミノ酸配列と比較すると、1つもしくは複数の突然変異を呈する場合がある。
用語「免疫原性MSLNポリペプチド」は、ヒトネイティブMSLNタンパク質に対して、またはヒトネイティブMSLNタンパク質を発現する細胞に対して、免疫原性であるポリペプチドを指す。このポリペプチドは、ヒトネイティブMSLNタンパク質のアミノ酸配列と同じアミノ酸配列を有する場合、またはヒトネイティブMSLNタンパク質のアミノ酸配列と比較すると、1つもしくは複数の突然変異を呈する場合がある。
用語「免疫原性TERTポリペプチド」は、ヒトネイティブTERTタンパク質に対して、またはヒトネイティブTERTタンパク質を発現する細胞に対して、免疫原性であるポリペプチドを指す。このポリペプチドは、ヒトネイティブTERTタンパク質のアミノ酸配列と同じアミノ酸配列を有する場合、またはヒトネイティブTERTタンパク質のアミノ酸配列と比較すると、1つまたは複数の突然変異を呈する場合がある。
用語「免疫原性TAAポリペプチド」は、本明細書上記の定義にそれぞれ従う、「免疫原性MSLNポリペプチド」、「免疫原性MUC1ポリペプチド」または「免疫原性TERTポリペプチド」を指す。
用語「免疫原性MUC1核酸分子」は、本明細書の定義に従う「免疫原性MUC1ポリペプチド」をコードする核酸分子を指す。
用語「免疫原性MSLN核酸分子」は、本明細書の定義に従う「免疫原性MSLNポリペプチド」をコードする核酸分子を指す。
用語「免疫原性TERT核酸分子」は、本明細書の定義に従う「免疫原性TERTポリペプチド」をコードする核酸分子を指す。
用語「免疫原性TAA核酸分子」は、本明細書上記の定義に従う「免疫原性MUC1ポリペプチド」、「免疫原性MSLNポリペプチド」または「免疫原性TERTポリペプチド」をコードする核酸分子を指す。
用語「免疫抑制細胞阻害剤」または「ISC阻害剤」は、哺乳動物の免疫抑制細胞の数および/または機能を低下させるおよび/または抑制することが可能な物質を指す。免疫抑制細胞の例として、調節性T細胞(「Treg」)、骨髄由来サプレッサー細胞および腫瘍関連マクロファージが挙げられる。
用語「哺乳動物」は、哺乳綱の任意の動物種を指す。哺乳動物の例として、ヒト;非ヒト霊長類、例として、サル;実験動物、例として、ラット、マウス、モルモット;家畜、例として、ネコ、イヌ、ウサギ、ウシ、ヒツジ、ヤギ、ウマおよびブタ;ならびに捕獲野生動物、例として、ライオン、トラ、ゾウ等が挙げられる。
用語「膜結合型」は、特定のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を、宿主細胞により発現させると、発現させたポリペプチドと細胞の膜とが結合する、つながる、または別の形で結び付くことを意味する。
用語「新生物による障害」は、細胞が異常に速くかつ無制御の速度で増殖し、その速度は、周囲の正常組織の速度を上回り、周囲の正常組織の速度との協調性がない状態を指す。これは通常、「腫瘍」として公知の固体病変または塊に至る。この用語は、良性および悪性の新生物による障害を包含する。用語「悪性の新生物による障害」は、本開示では用語「がん」と交換可能に使用し、腫瘍細胞の体内のその他の場所に広がる(「転移」として公知の)能力を特徴とする、新生物による障害を指す。用語「良性の新生物による障害」は、腫瘍細胞が転移する能力を欠く、新生物による障害を指す。
用語「突然変異」は、参照タンパク質またはポリペプチドのアミノ酸配列と比較する場合の、タンパク質またはポリペプチドのアミノ酸配列中のアミノ酸残基の欠失、付加または置換を指す。
用語「作動可能に連結する」は、記載する構成要素が、それらの意図する様式で機能することを可能にする関係にある並置を指す。導入遺伝子に「作動可能に連結している」制御配列は、導入遺伝子の発現が制御配列に適合する条件下で達成されるようにライゲーションが行われている。
用語「医薬組成物」は、所望の生理学的、薬理学的または治療的作用を惹起するために対象(例えば、ヒト患者)に投与するのに適切な固体または液体組成物を指す。医薬組成物は、1つまたは複数の活性成分を含有することに加えて、1つまたは複数の薬学的に許容できる賦形剤も含有することができる。
用語「薬学的に許容できる賦形剤」は、免疫原性組成物、医薬組成物またはワクチン組成物中の、活性成分(例えば、抗原、抗原をコードする核酸、免疫調節剤またはアジュバント)以外の物質であって、活性成分に適合し、組成物を投与する対象において顕著な、都合の悪い効果を引き起こすことがない物質を指す。
用語「ペプチド」、「ポリペプチド」および「タンパク質」は、本明細書では交換可能に使用し、任意の長さの高分子形態のアミノ酸、および改変されたポリペプチド骨格を有するポリペプチドを指し、前者のアミノ酸には、コードアミノ酸および非コードアミノ酸、化学的もしくは生化学的に改変されたアミノ酸、または誘導体化されたアミノ酸が含まれ得る。
用語「予防」または「予防する」は、(a)障害が生じないようにすること、または(b)障害の発症もしくは障害の症状の発症を遅延させることを指す。
ポリペプチドの文脈での用語「分泌型」は、ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を、宿主細胞により発現させると、発現させたポリペプチドが、宿主細胞外に分泌されることを意味する。
免疫調節剤、例として、タンパク質キナーゼ阻害剤の量を記載するために使用する場合の用語「最適以下用量」は、免疫調節剤を単独で患者に投与する場合に、治療している疾患に対して所望の治療効果をもたらすのに必要な最小量を下回る、免疫調節剤の用量を指す。
用語「対象」は、ヒトまたは非ヒト哺乳動物を指す。
用語「治療している」、「治療」または「治療する」は、障害を無効にすること、障害の重症度を低下させること、または障害の症状の重症度もしくは発生頻度を低下させることを指す。
用語「腫瘍関連抗原」または「TAA」は、腫瘍細胞が特異的に発現するか、または腫瘍細胞が、同じ組織型の非腫瘍細胞よりも高い頻度もしくは密度で発現する抗原を指す。腫瘍関連抗原は、宿主が通例発現しない抗原である場合、宿主が通例発現する分子において、突然変異している、切断されている、誤って折り畳まれている、もしくは別の点で異常が顕在化している分子である場合、通例発現する分子と同一であるが、異常に高いレベルで発現する分子である場合、または異常である状況もしくは環境で発現する分子である場合がある。腫瘍関連抗原は、例えば、タンパク質もしくはタンパク質断片、複合炭水化物、ガングリオシド、ハプテン、核酸、またはこれらの任意の組合せ、それとも、その他の生物学的分子であり得る。
用語「ワクチン」は、哺乳動物(例として、ヒト)に投与して、特定の1つまたは複数の抗原に対する保護的な免疫応答を惹起するための免疫原性組成物を指す。ワクチンの主要な活性成分は、免疫原(複数可)である。
用語「ベクター」は、宿主細胞内に外来核酸分子を輸送または移入することが可能である、核酸分子または改変された微生物を指す。外来核酸分子は、「挿入体」または「導入遺伝子」と呼ぶ。ベクターは一般に、挿入体、およびベクターの骨格として働くより大きな配列からなる。ベクターの構造または起源に基づくと、主要なタイプのベクターには、プラスミドベクター、コスミドベクター、ファージベクター(例として、ラムダファージ)、ウイルスベクター(例として、アデノウイルスベクター)、人工染色体、および細菌ベクターが含まれる。
B.免疫原性腫瘍関連抗原(TAA)ポリペプチド
いくつかの態様では、本開示は、単離の免疫原性MUC1ポリペプチド、単離のTERTポリペプチドおよび単離のMSLNポリペプチドを提供し、これらは、例えば、in vivoで(例えば、ヒトを含めた、動物において)もしくはin vitroで免疫応答を惹起するのに、エフェクターT細胞を活性化させるのに、またはMUC1、TERTおよびMSLNに特異的な抗体をそれぞれ生成するのに、または、がん、例として、膵臓がん、卵巣がん、および乳がん、特に、三種陰性乳がんを治療するために、ワクチン中の構成要素として使用するのに有用である。
これらの免疫原性TAAポリペプチドは、本開示に照らして、当技術分野で公知の方法により調製することができる。免疫応答を惹起するポリペプチドの能力を、in vitroでのアッセイまたはin vivoでのアッセイにおいて測定することができる。免疫応答を惹起するポリペプチドまたはDNA構築物の能力を決定するためのin vitroでのアッセイは、当技術分野で公知である。そのようなin vitroでのアッセイの1つの例が、開示が本出願に組み込まれている米国特許第7,387,882号の記載に従う、T細胞応答を刺激するポリペプチドまたはポリペプチドを発現する核酸の能力の測定である。このアッセイの方法は、(1)培養物中の抗原提示細胞を抗原と接触させるステップであって、それにより、抗原提示細胞が抗原を取り込みプロセシングすることで1つまたは複数のプロセシングされた抗原を産生することができる、ステップと、(2)T細胞がプロセシングされた抗原のうちの1つまたは複数に応答するのに十分な条件下で、抗原提示細胞をT細胞と接触させるステップと、(3)T細胞がプロセシングされた抗原のうちの1つまたは複数に応答するかどうかを決定するステップとを含む。使用するT細胞は、CD8T細胞またはCD4T細胞であり得る。T細胞応答は、1つまたは複数のサイトカイン、例として、インターフェロン−ガンマおよびインターロイキン−2の放出、ならびに抗原提示細胞(腫瘍細胞)の溶解を測定することによって決定することができる。B細胞応答は、抗体の産生を測定することによって決定することができる。
B−1.免疫原性MUC1ポリペプチド
一態様では、本開示は、ヒトネイティブMUC1に由来する、単離の免疫原性MUC1ポリペプチドを提供し、この場合、MUC1ポリペプチドは、ヒトネイティブMUC1タンパク質に対して導入された1つまたは複数の突然変異を呈する。突然変異の例として、MUC1タンパク質のVNTR領域中の20個のアミノ酸のタンデムリピートの全部ではないが一部の欠失、シグナルペプチド配列の全体的または部分的な欠失、およびMUC1アイソフォーム中に見出される非コンセンサスアミノ酸配列のアミノ酸の欠失が挙げられる。したがって、いくつかの実施形態では、本開示が提供する免疫原性MUC1ポリペプチドは、(1)ヒトMUC1タンパク質の20個のアミノ酸のタンデムリピート3〜30個のアミノ酸配列、および(2)VNTR領域に隣接する、ヒトMUC1タンパク質のアミノ酸配列を含む。いくつかの特定の実施形態では、免疫原性MUC1ポリペプチドは、(1)ヒトMUC1のタンデムリピート5〜25個のアミノ酸配列、および(2)VNTR領域に隣接する、ヒトMUC1タンパク質のアミノ酸配列を含む。いくつかのさらなる実施形態では、免疫原性MUC1ポリペプチドは、細胞質内形態(または「cMUC1」)をとる。用語「細胞質内形態」は、ヒトネイティブMUC1タンパク質の分泌配列(アミノ酸1〜23;「シグナルペプチド配列」としてもまた公知である)を全体的または部分的に欠く免疫原性MUC1ポリペプチドを指す。分泌配列が細胞中で発現すると、ポリペプチドは分泌経路に入るが、この事象は、分泌配列のアミノ酸の欠失により阻止されることが予測される。いくつかのその他の実施形態では、免疫原性MUC1ポリペプチドは、MUC1の膜結合形態のアミノ酸配列を含む。
本開示が提供する免疫原性MUC1ポリペプチドは、当技術分野で公知であるかまたは将来発見されるヒトMUC1アイソフォームのうちのいずれかのアミノ酸配列に由来、それから構築または調製することができ、それらとして、例えば、Uniprotのアイソフォーム1、2、3、4、5、6、Y、8、9、F、Y−LSP、S2、M6、ZD、T10、E2およびJ13(それぞれ、Uniprot P15941−1〜P15941−17)が挙げられる。いくつかの実施形態では、免疫原性MUC1ポリペプチドは、ヒトMUC1アイソフォーム1の部分であるアミノ酸配列を含み、ヒトMUC1アイソフォーム1のアミノ酸配列を、配列番号1に記載する。具体的な実施形態では、免疫原性MUC1ポリペプチドは、配列番号1のアミノ酸配列のアミノ酸24〜225および1098〜1255を含む。別の具体的な実施形態では、免疫原性MUC1ポリペプチドは、配列番号1のアミノ酸配列のアミノ酸22〜225および946〜1255を含む。いくつかのその他の具体的な実施形態では、免疫原性MUC1ポリペプチドは、
(1)配列番号8のアミノ酸配列(プラスミド1027のポリペプチド)、
(2)配列番号8のアミノ酸4〜537を含むアミノ酸配列、
(3)配列番号8のアミノ酸24〜537を含むアミノ酸配列、
(4)配列番号16のアミノ酸配列(プラスミド1197のポリペプチド)、
(5)配列番号16のアミノ酸4〜517を含むアミノ酸配列、および
(6)配列番号16のアミノ酸4〜517を含むアミノ酸配列であって、配列番号16中、513位におけるアミノ酸がTであるアミノ酸配列
からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むか、またはそれらのアミノ酸配列からなる。
いくつかの具体的な実施形態では、免疫原性MUC1ポリペプチドは、配列番号8(プラスミド1027のポリペプチド)または配列番号16(プラスミド1197のポリペプチド)のアミノ酸配列を含む。
B−2.免疫原性MSLNポリペプチド
一態様では、本開示は、単離の免疫原性MSLNポリペプチドを提供し、これらのポリペプチドは、ヒトMSLN前駆体に、MSLN前駆体のシグナルペプチド配列の一部または全体の欠失により由来する。したがって、免疫原性MSLNポリペプチドは、ネイティブなヒトMSLN前駆体のアミノ酸配列を含み、この場合、MSLN前駆体のシグナルペプチド配列の部分または全体が存在しない。いくつかの実施形態ではまた、免疫原性MSLNポリペプチド中、ネイティブなヒトMSLNのGPIアンカー配列(すなわち、配列番号2のアミノ酸598〜622)の部分または全体が存在しない。本明細書で使用する場合、用語「ヒトMSLN」は、任意のヒトMSLNアイソフォーム、例として、アイソフォーム1、2、3または4を包含する。いくつかの特定の実施形態では、ヒトMSLNは、ヒトMSLNアイソフォーム2である。
いくつかの特定の実施形態では、単離の免疫原性MSLNポリペプチドは、
1)配列番号2のアミノ酸配列のアミノ酸37〜597を含むか、またはそれらのアミノ酸からなるポリペプチド、
2)配列番号2のアミノ酸配列のアミノ酸37〜597からなるアミノ酸配列と少なくとも90%、95%、98%または99%同一であるアミノ酸配列を含むポリペプチド、
3)配列番号6のアミノ酸配列もしくは配列番号6のアミノ酸配列のアミノ酸4〜564を含むか、またはそれらのアミノ酸配列もしくはそれらのアミノ酸からなるポリペプチド、および
4)配列番号6のアミノ酸配列(「プラスミド1103のポリペプチド」)に対して、少なくとも93%〜99%、94%〜98%または94%〜97%の同一性を有するアミノ酸配列を含むポリペプチド
からなる群から選択される。
B−3.免疫原性TERTポリペプチド
別の態様では、本開示は、単離の免疫原性TERTポリペプチドを提供し、これらのポリペプチドは、ヒトTERTタンパク質に、TERTタンパク質の最大600個のN末端アミノ酸の欠失により由来する。したがって、いくつかの実施形態では、免疫原性TERTポリペプチドは、配列番号3に記載するTERTアイソフォーム1のアミノ酸配列を含み、この場合、TERTアイソフォーム1のアミノ酸配列のN末端(アミノ末端)に由来する最大約600個のアミノ酸が存在しない。免疫原性TERTポリペプチド中、TERTアイソフォーム1のN末端に由来する600個までの任意の数のアミノ酸が存在しなくてよい。例えば、免疫原性TERTポリペプチドにおいて、配列番号3のTERTアイソフォーム1の1位から、50位、100位、150位、200位、245位、300位、350位、400位、450位、500位、550位または600位までのN末端アミノ酸が存在しなくてよい。したがって、本開示が提供する免疫原性TERTポリペプチドは、配列番号3のアミノ酸51〜1132、101〜1132、151〜1132、201〜1132、251〜1132、301〜1132、351〜1132、401〜1132、451〜1132、501〜1132または551〜1132を含むことができる。免疫原性TERTポリペプチドはまた、その他のTERTアイソフォームから構築することもできる。しかし、ポリペプチドを、C末端が切断されているTERTアイソフォームから構築する場合には、好ましくは、より少数のアミノ酸をN末端から欠失させることができる。
いくつかのさらなる実施形態では、免疫原性TERTポリペプチドは、TERTの触媒性ドメインを不活性化する、アミノ酸の1つまたは複数の突然変異をさらに含む。アミノ酸のそのような突然変異の例として、配列番号3の712位におけるアスパラギン酸のアラニンによる置換(D712A)、および配列番号3の713位におけるバリンのイソロイシンによる置換(V713I)が挙げられる。いくつかの実施形態では、免疫原性TERTポリペプチドは、突然変異D712AおよびV713Iの両方を含む。
いくつかの具体的な実施形態では、本開示は、
1)配列番号10のアミノ酸配列もしくは配列番号10(「プラスミド1112のポリペプチド」)のアミノ酸2〜892を含むポリペプチド、またはこれらのポリペプチドの機能性バリアント、
2)配列番号14のアミノ酸配列もしくは配列番号14(「プラスミド1326のポリペプチド」)のアミノ酸3〜789を含むポリペプチド、またはこれらのポリペプチドの機能性バリアント、および
3)配列番号12のアミノ酸配列もしくは配列番号12(「プラスミド1330のポリペプチド」)のアミノ酸4〜591を含むポリペプチド、またはこれらのポリペプチドの機能性バリアント
からなる群から選択される免疫原性TERTポリペプチドを提供する。
C.免疫原性TAAポリペプチドをコードする核酸分子
いくつかの態様では、本開示は、それぞれが、本開示が提供する1、2または3つ以上の別個の免疫原性TAAポリペプチドをコードする核酸分子を提供する。核酸分子は、デオキシリボヌクレオチド(DNA)またはリボヌクレオチド(RNA)であり得る。したがって、核酸分子は、本明細書に開示するヌクレオチド配列を含むことができ、この場合、チミジン(T)はまた、ウラシル(U)であってもよく、このことは、DNAとRNAとの間の化学構造の差を反映する。核酸分子は、改変形態であっても、一本鎖もしくは二本鎖形態であっても、または直鎖もしくは環状形態であってもよい。核酸分子は、本開示に照らして、当技術分野で公知の方法を使用して調製することができる。
C−1.単一抗原構築物
一態様では、本開示は、単離の核酸分子を提供し、この分子は、本開示が提供する単一免疫原性MUC1ポリペプチド、単一免疫原性MSLNポリペプチドまたは単一免疫原性TERTポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む。1つの免疫原性TAAポリペプチド、例として、免疫原性MUC1ポリペプチド、免疫原性MSLNポリペプチドまたは免疫原性TERTのみをコードする核酸分子もまた、本明細書では「単一抗原構築物」と呼ぶ。
C−1a.MUC1単一抗原構築物
いくつかの実施形態では、本開示は、本開示で提供する免疫原性MUC1ポリペプチドをコードする単離の核酸分子を提供する。核酸分子がコードする免疫原性MUC1ポリペプチドは、細胞質内形態(もしくはcMUC1)または膜結合形態(もしくはmMUC1)をとることができる。用語「膜結合形態」は、宿主細胞によりコード核酸から発現させると、宿主の細胞膜に結合する、つながる、または別の形で結び付く免疫原性MUC1ポリペプチドを指す。
いくつかの具体的な実施形態では、本開示が提供する単離の核酸分子は、
(1)配列番号8のアミノ酸配列(プラスミド1027のポリペプチド)を含む免疫原性MUC1ポリペプチド、
(2)配列番号8のアミノ酸4〜537を含む免疫原性MUC1ポリペプチド、
(3)配列番号8のアミノ酸24〜537を含む免疫原性MUC1ポリペプチド、
(4)配列番号16のアミノ酸配列(プラスミド1197のポリペプチド)を含む免疫原性MUC1ポリペプチド、
(5)配列番号16のアミノ酸4〜517を含む免疫原性MUC1ポリペプチド、
(6)配列番号16のアミノ酸4〜517を含む免疫原性MUC1ポリペプチドであって、513位におけるアミノ酸がTである免疫原性MUC1ポリペプチド、ならびに
(7)配列番号1のアミノ酸24〜225および946〜1255を含む免疫原性MUC1ポリペプチドからなる群から選択される免疫原性MUC1ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む。
いくつかのその他の具体的な実施形態では、本開示が提供する単離の核酸分子は、
(1)配列番号7のヌクレオチド配列(プラスミド1027)、
(2)配列番号7のヌクレオチド10〜1611を含むヌクレオチド配列、
(3)配列番号15(プラスミド1197)のヌクレオチド配列、および
(4)配列番号15のヌクレオチド10〜1551を含むヌクレオチド配列
からなる群から選択されるヌクレオチド配列またはその縮重バリアントを含む。
C−1b.MSLN単一抗原構築物
いくつかの実施形態では、本開示は、本開示で提供する免疫原性MSLNポリペプチドをコードする単離の核酸分子を提供する。
いくつかの特定の実施形態では、単離の核酸分子は、
1)配列番号2のアミノ酸配列のアミノ酸37〜597を含むか、またはそれらのアミノ酸からなる免疫原性MSLNポリペプチド、
2)配列番号2のアミノ酸配列のアミノ酸37〜597からなるアミノ酸配列と少なくとも90%、95%、98%または99%同一であるアミノ酸配列を含む免疫原性MSLNポリペプチド、
3)配列番号6のアミノ酸配列を含むか、またはそれらのアミノ酸配列からなる免疫原性MSLNポリペプチド、および
4)配列番号6のアミノ酸配列(「プラスミド1103のポリペプチド」)に対して、少なくとも93%〜99%、94%〜98%または94%〜97%の同一性を有するアミノ酸配列を含む免疫原性MSLNポリペプチド
からなる群から選択される免疫原性MSLNポリペプチドをコードする。
いくつかのその他の具体的な実施形態では、本開示が提供する単離の核酸分子は、
(1)配列番号5のヌクレオチド配列、および
(2)配列番号5のヌクレオチド10〜1692を含むヌクレオチド配列
からなる群から選択されるヌクレオチド配列またはその縮重バリアントを含む。
C−1c.TERT単一抗原構築物
いくつかのその他の実施形態では、本開示は、本開示で提供する免疫原性TERTポリペプチドをコードする単離の核酸分子を提供する。
本開示が提供する核酸がコードする免疫原性TERTポリペプチドは、TERTアイソフォーム1のアミノ酸配列のN末端に由来する最大600個のアミノ酸の欠失を含有することができる。一般に、免疫原性TERTポリペプチドは、TERTタンパク質のN末端からより少数のアミノ酸が欠失している場合に、より強力な免疫原性を保有することを予測することができる。TERTタンパク質から欠失させることができるN末端アミノ酸の数は、どのようにポリペプチドをコードする核酸分子を使用または送達しようとするかに基づいて決定することができる。例えば、核酸分子を、特定のウイルスベクターを使用して送達しようとする場合、使用するベクターの能力に基づいて、欠失を決定することができる。
いくつかの実施形態では、核酸分子がコードする免疫原性TERTポリペプチドは、TERTの触媒性ドメインを不活性化する、アミノ酸の1つまたは複数の突然変異を含む。アミノ酸のそのような突然変異の例として、配列番号3の712位におけるアスパラギン酸のアラニンによる置換(D712A)、および配列番号3の713位におけるバリンのイソロイシンによる置換(V713I)が挙げられる。いくつかの実施形態では、免疫原性TERTポリペプチドは、突然変異D712AおよびV713Iの両方を含む。
いくつかの具体的な実施形態では、単離の核酸分子は、
(1)配列番号10のアミノ酸配列もしくは配列番号10(「プラスミド1112のポリペプチド」)のアミノ酸2〜892を含む免疫原性TERTポリペプチド、またはこれらのポリペプチドの機能性バリアント、
(2)配列番号14のアミノ酸配列もしくは配列番号14(「プラスミド1326のポリペプチド」)のアミノ酸3〜789を含む免疫原性TERTポリペプチド、またはこれらのポリペプチドの機能性バリアント、および
(3)配列番号12のアミノ酸配列もしくは配列番号12(「プラスミド1330のポリペプチド」)のアミノ酸4〜591を含む免疫原性TERTポリペプチド、またはこれらのポリペプチドの機能性バリアント
からなる群から選択される免疫原性TERTポリペプチドをコードする。
いくつかの特定の実施形態では、単離の核酸分子は、
(1)配列番号9のヌクレオチド配列(TERT240)、
(2)配列番号9のヌクレオチド4〜2679を含むヌクレオチド配列、
(3)配列番号11のヌクレオチド配列(TERT541)、
(4)配列番号11のヌクレオチド10〜1782を含むヌクレオチド配列、
(5)配列番号13のヌクレオチド配列(TERT342)、および
(6)配列番号13のヌクレオチド7〜2373を含むヌクレオチド配列
からなる群から選択されるヌクレオチド配列またはその縮重バリアントを含む。
C−2.多抗原構築物
別の態様では、本開示は、それぞれが、2または3つ以上の異なる免疫原性TAAポリペプチドをコードする核酸分子を提供する。本開示ではまた、2つ以上の免疫原性TAAポリペプチドをコードする核酸分子を、「多抗原構築物」、「多抗原ワクチン」、「多抗原プラスミド」等とも呼ぶ。本開示ではまた、2つの異なる免疫原性TAAポリペプチドをコードする核酸分子を、「二重抗原構築物」、「二重抗原ワクチン」または「二重抗原プラスミド」等とも呼ぶ。本開示ではまた、3つの異なる免疫原性TAAポリペプチドをコードする核酸分子を、「三重抗原構築物」、「三重抗原ワクチン」または「三重抗原プラスミド」とも呼ぶ。
本開示が提供する多抗原構築物は、本開示に照らして、当技術分野で公知の多様な技法を使用して調製することができる。例えば、多抗原構築物は、単一のプラスミド内に複数の独立のプロモーターを組み込むことによって構築することができる(Huang,Y.、Z.Chenら(2008)、「Design,construction,and characterization of a dual−promoter multigenic DNA vaccine directed against an HIV−1 subtype C/B’ recombinant」、J Acquir Immune Defic Syndr、47(4):403〜411;Xu,K.、Z.Y.Lingら(2011)、「Broad humoral and cellular immunity elicited by a bivalent DNA vaccine encoding HA and NP genes from an H5N1 virus」、Viral Immunol、24(1):45〜56)。プラスミドは、複数の発現カセットを担持するように遺伝子工学により作製することができ、発現カセットはそれぞれ、a)エンハンサーエレメントがあってもまたはなくても、RNAポリメラーゼ依存性の転写を開始するための真核生物プロモーター、b)標的抗原をコードする遺伝子、およびc)転写ターミネーター配列からなる。プラスミドが、トランスフェクトされた細胞の核に送達されると、転写が、各プロモーターから開始されて、別個のmRNAの産生が生じ、各mRNAが、標的抗原のうちの1つをコードする。mRNAは、独立に翻訳され、それにより、所望の抗原が産生される。
また、本開示が提供する多抗原構築物は、ウイルスの2Aペプチドの使用を通して構築することもできる(Szymczak,A.L.およびD.A.Vignali(2005)、「Development of 2A peptide−based strategies in the design of multicistronic vectors」、Expert Opin Biol Ther、5(5):627〜638;de Felipe,P.、G.A.Lukeら(2006)、「E unum pluribus: multiple proteins from a self−processing polyprotein」、Trends Biotechnol、24(2):68〜75;Luke,G.A.、P.de Felipeら、(2008)、「Occurrence, function and evolutionary origins of ‘2A−like’ sequences in virus genomes」、J Gen Virol、89(Pt4):1036〜1042;Ibrahimi,A.、G.Vande Veldeら(2009)、「Highly efficient multicistronic lentiviral vectors with peptide 2A sequences」、Hum Gene Ther、20(8):845〜860;Kim,J.H.、S.R.Leeら(2011)、「High cleavage efficiency of a 2A peptide derived from porcine teschovirus−1 in human cell lines,zebrafish and mice」、PLoS One、6(4):e18556)。これらのペプチドは、切断(cleavage)カセットまたはCHYSEL(シス作用性ヒドロラーゼエレメント)ともまた呼ばれ、およそ20アミノ酸長であり、高度に保存されているカルボキシ末端D−V/I−EXNPGPモチーフを有する(表19)。これらのペプチドは、自然界においては稀であり、最も一般的には、口蹄疫ウイルス(Foot−and−mouth disease virus)(FMDV)、ウマ鼻炎Aウイルス(Equine rhinitis A virus)(ERAV)、ウマ鼻炎Bウイルス(Equine rhinitis B virus)(ERBV)、脳心筋炎ウイルス(Encephalomyocarditis virus)(EMCV)、ブタテッショウウイルス(Porcine teschovirus)(PTV)、およびゾセア・アシグナウイルス(Thosea asigna virus)(TAV)等のウイルス中に見出される(Luke,G.A.、P.de Felipeら(2008)、「Occurrence, function and evolutionary origins of ‘2A−like’ sequences in virus genomes」、J Gen Virol、89(Pt4):1036〜1042)。2Aに基づく多抗原発現戦略では、複数の標的抗原をコードする遺伝子を、単一のオープンリーディングフレーム中に一緒にして連結し、遺伝子は、ウイルスの2Aペプチドをコードする配列により分離されている。オープンリーディングフレーム全体を、単一のプロモーターおよびターミネーターを有するベクター中にクローニングすることができる。構築物が宿主細胞に送達されると、複数の抗原をコードするmRNAが転写され、単一のポリタンパク質として翻訳される。2Aペプチドの翻訳の間に、リボゾームが、C末端のグリシンとプロリンとの間の結合を読み飛ばす。リボゾームによる読飛ばしが、同時翻訳における自己触媒性の「切断(cleavage)」のように作用し、2Aペプチドの上流のペプチド配列を、下流のペプチド配列から放出させる。2つのタンパク質抗原間への2Aペプチドの組込みにより、上流のポリペプチドのC末端上への約20個のアミノ酸の付加、および下流のタンパク質のN末端への1つのアミノ酸(プロリン)の付加が生じ得る。この方法の改作では、偏在するプロテアーゼにより、上流のタンパク質からカセットが切断(cleave)されるように、プロテアーゼ切断(cleavage)部位を、2AカセットのN末端に組み込むことができる(Fang,J.、S.Yiら(2007)、「An antibody delivery system for regulated expression of therapeutic levels of monoclonal antibodies in vivo」、Mol Ther、15(6):1153〜1159)。
本開示が提供する多抗原構築物を構築するための別の戦略は、配列内リボゾーム進入部位またはIRESの使用を伴う。配列内リボゾーム進入部位は、特定のRNA分子の5’非翻訳領域中に見出されるRNAエレメントである(Bonnal,S.、C.Boutonnetら(2003)、「IRESdb:the Internal Ribosome Entry Site database」、Nucleic Acids Res、31(1):427〜428)。それらは、真核生物のリボゾームをRNAに引き付けて、下流のオープンリーディングフレームの翻訳を容易にする。通常の細胞性7−メチルグアノシンキャップ依存性翻訳とは異なり、IRES媒介型翻訳は、RNA分子内部の遠くのAUGコドンから開始することができる。この極めて効率的なプロセスを活用して、多シストロン性の発現ベクター中で使用することができる(Bochkov,Y.A.およびA.C.Palmenberg(2006)、「Translational efficiency of EMCV IRES in bicistronic vectors is dependent upon IRES sequence and gene location」、Biotechniques、41(3):283〜284、286、288)。典型的には、ベクター内に、2つの導入遺伝子を、IRESにより隔てられた2つの別個のオープンリーディングフレームとして、プロモーターと転写ターミネーターとの間に挿入する。構築物が宿主細胞に送達されると、両方の導入遺伝子をコードする単一の長い転写物が転写される。第1のORFが、従来のキャップ依存性の様式で翻訳されて、IRESの上流の終止コドンで終結する。第2のORFは、IRESを使用するキャップ非依存性の様式で翻訳される。このようにして、2つの独立のタンパク質が、単一の発現カセットを有するベクターから転写された単一のmRNAから産生され得る。
いくつかの態様では、本開示は、2つのコードヌクレオチド配列を含む二重抗原構築物を提供し、この場合、コードヌクレオチド配列のそれぞれが、個別の免疫原性TAAポリペプチドをコードする。そのような二重抗原構築物の構造を、式(I)に示す:
TAA1−スペーサー1−TAA2(I)
{式(I)中、
(i)TAA1およびTAA2は、ヌクレオチド配列であり、それぞれが、免疫原性MUC1ポリペプチド、免疫原性MSLNポリペプチドおよび免疫原性TERTポリペプチドからなる群から選択される免疫原性TAAポリペプチドをコードし、この場合、TAA1とTAA2とは、異なる免疫原性TAAポリペプチドをコードし、
(ii)スペーサー1は、スペーサーのヌクレオチド配列であり、存在しない場合がある}。
いくつかの実施形態では、本開示は、式(I)の二重抗原構築物を提供し、この場合、式(I)中、TAA1は、免疫原性MUC1ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列であり、TAA2は、免疫原性MSLNポリペプチドまたは免疫原性TERTポリペプチドをコードするヌクレオチド配列である。
いくつかのその他の実施形態では、本開示は、式(I)の二重抗原構築物を提供し、この場合、式(I)中、TAA1は、免疫原性MSLNポリペプチドをコードするヌクレオチド配列であり、TAA2は、免疫原性MUC1ポリペプチドまたは免疫原性TERTポリペプチドをコードするヌクレオチド配列である。
いくつかのさらなる実施形態では、本開示は、式(I)の二重抗原構築物を提供し、この場合、式(I)中、TAA1は、免疫原性TERTポリペプチドをコードするヌクレオチド配列であり、TAA2は、免疫原性MUC1ポリペプチドまたは免疫原性MSLNポリペプチドをコードするヌクレオチド配列である。
いくつかの具体的な実施形態では、本開示は、
(1)MUC1−2A−TERT(II)
(2)MUC1−2A−MSLN(III)
(3)MSLN−2A−TERT(IV)
(4)MSLN−2A−MUC1(V)
(5)TERT−2A−MSLN(VI)
(6)TERT−2A−MUC1(VII)
{式(II)〜(VII)のそれぞれにおいて、(i)MUC1、MSLNおよびTERTはそれぞれ、免疫原性MUC1ポリペプチド、免疫原性MSLNポリペプチドおよび免疫原性TERTポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を表し、(ii)2Aは、2Aペプチドをコードするヌクレオチド配列である}
からなる群から選択される式の二重抗原構築物を提供する。
いくつかのその他の態様では、本開示は、3つのコードヌクレオチド配列を含む三重抗原構築物を提供し、この場合、コードヌクレオチド配列のそれぞれが、異なる個別の免疫原性TAAポリペプチドを発現する。三重抗原構築物の構造を、式(VIII)に示す:
TAA1−スペーサー1−TAA2−スペーサー2−TAA3(VIII)
{式(VIII)中、
(i)TAA1、TAA2およびTAA3はそれぞれ、免疫原性MUC1ポリペプチド、免疫原性MSLNポリペプチドおよび免疫原性TERTポリペプチドからなる群から選択される免疫原性TAAポリペプチドをコードするヌクレオチド配列であり、この場合、TAA1、TAA2およびTAA3は、異なる免疫原性TAAポリペプチドをコードし、
(ii)スペーサー1およびスペーサー2はそれぞれ、スペーサーのヌクレオチド配列であり、この場合、(a)スペーサー1とスペーサー2とは、同じまたは異なる場合があり、(b)スペーサー1が存在しない場合もあれば、またはスペーサー2が存在しない場合もあれば、またはスペーサー1およびスペーサー2の両方が存在しない場合もある}。
用語「スペーサーのヌクレオチド配列」は、本開示で使用する場合、核酸分子のオープンリーディングフレーム中の2つのコード配列または導入遺伝子間に挿入されており、核酸分子からの2つの別個の遺伝子産物の同時発現または翻訳を可能にするように機能するヌクレオチド配列を指す。本開示が提供する多抗原構築物中で使用することができるスペーサーのヌクレオチド配列の例として、真核生物プロモーター、2Aペプチドをコードするヌクレオチド配列、および配列内リボゾーム進入部位(IRES)が挙げられる。2Aペプチドの例として、口蹄疫ウイルス(foot−and−mouth disease virus)の2Aペプチド(FMD2A)、ウマ鼻炎Aウイルス(equine rhinitis A virus)の2Aペプチド(ERA2A)、ウマ鼻炎Bウイルス(Equine rhinitis B virus)の2Aペプチド(ERB2A)、脳心筋炎ウイルス(encephalomyocarditis virus)の2Aペプチド(EMC2A)、ブタテッショウウイルス(porcine teschovirus)の2Aペプチド(PT2A)、およびゾセア・アシグナ(Thosea asigna)ウイルスの2Aペプチド(T2A)が挙げられる。これらの2Aペプチドの配列を、表19に提供する。
いくつかの実施形態では、スペーサー1およびスペーサー2は、独立に、2Aペプチドをコードするヌクレオチド配列であるか、またはGGSGGをコードするヌクレオチド配列である。
いくつかの実施形態では、本開示は、式(VIII)の三重抗原構築物を提供し、この場合、式(VIII)中、(i)TAA1は、免疫原性MUC1ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列であり、(ii)TAA2は、免疫原性MSLNポリペプチドをコードするヌクレオチド配列であり、(iii)TAA3は、免疫原性TERTポリペプチドをコードするヌクレオチド配列である。
いくつかのその他の実施形態では、本開示は、式(VIII)の三重抗原構築物を提供し、この場合、式(VIII)中、(i)TAA1は、免疫原性MUC1ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列であり、(ii)TAA2は、免疫原性TERTポリペプチドをコードするヌクレオチド配列であり、(iii)TAA3は、免疫原性MSLNポリペプチドをコードするヌクレオチド配列である。
いくつかのその他の実施形態では、本開示は、式(VIII)の三重抗原構築物を提供し、この場合、式(VIII)中、(i)TAA1は、免疫原性MSLNポリペプチドをコードするヌクレオチド配列であり、(ii)TAA2は、免疫原性TERTポリペプチドをコードするヌクレオチド配列であり、(iii)TAA3は、免疫原性MUC1ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列である。
いくつかのその他の実施形態では、本開示は、式(VIII)の三重抗原構築物を提供し、この場合、式(VIII)中、(i)TAA1は、免疫原性MSLNポリペプチドをコードするヌクレオチド配列であり、(ii)TAA2は、免疫原性MUC1ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列であり、(iii)TAA3は、免疫原性TERTポリペプチドをコードするヌクレオチド配列である。
いくつかの具体的な実施形態では、本開示は、
(1)MUC1−2A−MSLN−2A−TERT(IX)
(2)MUC1−2A−TERT−2A−MSLN(X)
(3)MSLN−2A−MUC1−2A−TERT(XI)
(4)MSLN−2A−TERT−2A−MUC1(XII)
(5)TERT−2A−MUC1−2A−MSLN(XIII)
(6)TERT−2A−MSLN−2A−MUC1(XIV)
{式(IX)〜(XIV)のそれぞれにおいて、(i)MUC1、MSLNおよびTERTはそれぞれ、免疫原性MUC1ポリペプチド、免疫原性MSLNポリペプチドおよび免疫原性TERTポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を表し、(ii)2Aは、2Aペプチドをコードするヌクレオチド配列である}
からなる群から選択される式の三重抗原構築物を提供する。
多抗原構築物がコードする免疫原性MSLNポリペプチドは、完全長のMSLNタンパク質、またはその断片、例として、細胞質内、分泌型もしくは膜結合型断片であり得る。いくつかの実施形態では、多抗原構築物は、
1)配列番号2のアミノ酸配列のアミノ酸37〜597を含むか、またはそれらのアミノ酸からなるポリペプチド、
2)配列番号2のアミノ酸配列のアミノ酸37〜597からなるアミノ酸配列と少なくとも90%、95%、98%または99%同一であるアミノ酸配列を含むポリペプチド、
3)配列番号6のアミノ酸配列もしくは配列番号6のアミノ酸配列のアミノ酸4〜564を含むか、またはそれらのアミノ酸配列もしくはそれらのアミノ酸からなるポリペプチド、および
4)配列番号8のアミノ酸配列(「プラスミド1103のポリペプチド」)に対して、少なくとも93%〜99%、94%〜98%または94%〜97%の同一性を有するアミノ酸配列を含むポリペプチド
からなる群から選択される免疫原性MSLNポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む。
いくつかの特定の実施形態では、多抗原構築物は、配列番号5のヌクレオチド配列またはその縮重バリアントを含む。
多抗原構築物がコードする免疫原性MUC1ポリペプチドは、(1)ヒトMUC1タンパク質の20個のアミノ酸のタンデムリピート3〜30個のアミノ酸配列、および(2)VNTR領域に隣接する、ヒトMUC1タンパク質のアミノ酸配列を含むことができる。いくつかの実施形態では、多抗原構築物は、免疫原性MUC1ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含み、この場合、免疫原性MUC1ポリペプチドは、
(1)配列番号8のアミノ酸配列(プラスミド1027のポリペプチド)、
(2)配列番号8のアミノ酸4〜537を含むアミノ酸配列、
(3)配列番号8のアミノ酸24〜537を含むアミノ酸配列、
(4)配列番号16のアミノ酸配列(プラスミド1197のポリペプチド)、
(5)配列番号16のアミノ酸4〜517を含むアミノ酸配列、および
(6)513位におけるアミノ酸がTであるという条件の、配列番号16のアミノ酸4〜517を含むアミノ酸配列
からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むか、またはそれらのアミノ酸配列からなる。
いくつかの特定の実施形態では、多抗原構築物は、配列番号7のヌクレオチド配列、配列番号15のヌクレオチド配列、または配列番号7もしくは15のヌクレオチド配列の縮重バリアントを含む。
多抗原構築物がコードする免疫原性TERTポリペプチドは、完全長のタンパク質または任意の切断型の形態であり得る。完全長のTERTタンパク質は、切断型の形態よりも強力な免疫応答を生成することが予測される。しかし、構築物を送達するために選ばれた特定のベクターによっては、ベクターが、完全なTERTタンパク質をコードする遺伝子を担持する能力を有しない場合がある。したがって、導入遺伝子が特定のベクター内に納まるように、当該タンパク質から、いくつかのアミノ酸の欠失を作製することができる。TERTタンパク質配列中、アミノ酸の欠失は、N末端から作製してもよく、C末端から作製してもよく、またはどこで作製してもよい。核局在化シグナルを除去し、それにより、当該ポリペプチドを細胞質内ポリペプチドとし、抗原のプロセシング/提示の細胞機構へのアクセスを増加させるために、追加の欠失を作製することもできる。いくつかの実施形態では、免疫原性TERTポリペプチドにおいて、TERTタンパク質のN末端から200、300、400、500または600位までのアミノ酸が存在しない。TERTの触媒性ドメインを不活性化するために、追加のアミノ酸の突然変異を導入することもできる。そのような突然変異の例として、D712AおよびV713Tが挙げられる。
いくつかのさらなる実施形態では、多抗原構築物は、免疫原性TERTポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含み、この場合、免疫原性TERTポリペプチドは、
1)配列番号10のアミノ酸配列(「プラスミド1112のポリペプチド」;TERT240)、
2)配列番号12のアミノ酸配列(「プラスミド1330のポリペプチド」;TERT541)、および
3)配列番号14のアミノ酸配列(「プラスミド1326のポリペプチド」;TERT343)
からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むか、またはそれらのアミノ酸配列からなる。
いくつかの特定の実施形態では、多抗原構築物は、配列番号9、11もしくは13のヌクレオチド配列、または配列番号9、11もしくは13のヌクレオチド配列の縮重バリアントを含む。
いくつかの特定の実施形態では、本開示は、免疫原性MUC1ポリペプチドおよび免疫原性MSLNポリペプチドをコードする二重抗原構築物を提供し、この構築物は、
(1)配列番号18、20、22または24のアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列、
(2)配列番号17、19、21または23のヌクレオチド配列、および
(3)配列番号17、19、21または23のヌクレオチド配列の縮重バリアント
からなる群から選択されるヌクレオチド配列を含む。
いくつかのその他の特定の実施形態では、本開示は、免疫原性MUC1ポリペプチドおよび免疫原性TERTポリペプチドをコードする二重抗原構築物を提供し、この構築物は、
(1)配列番号26、28、30、32または34のアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列、
(2)配列番号25、27、29、31または33のヌクレオチド配列、および
(3)配列番号25、27、29、31または33のヌクレオチド配列の縮重バリアント
からなる群から選択されるヌクレオチド配列を含む。
いくつかのその他の特定の実施形態では、本開示は、免疫原性MSLNポリペプチドおよび免疫原性TERTポリペプチドをコードする二重抗原構築物を提供し、この構築物は、
(1)配列番号36、38、40または42のアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列、
(2)配列番号35、37、39または41のヌクレオチド配列、および
(3)配列番号35、37、39または41のヌクレオチド配列の縮重バリアント
からなる群から選択されるヌクレオチド配列を含む。
いくつかのその他の特定の実施形態では、本開示は、免疫原性MUC1ポリペプチド、免疫原性MSLNポリペプチドおよび免疫原性TERTポリペプチドをコードする三重抗原構築物を提供し、この構築物は、
(1)配列番号44、46、48、50、52、54、56、58、60、62、64または66のアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列、
(2)配列番号43、45、47、49、51、53、55、57、59、61、63または65のヌクレオチド配列、および
(3)配列番号43、45、47、49、51、53、55、57、59、61、63または65のヌクレオチド配列の縮重バリアント
からなる群から選択されるヌクレオチド配列を含む。
D.免疫原性TAAポリペプチドをコードする核酸分子を含有するベクター
本発明の別の態様は、単一抗原構築物、二重抗原構築物、三重抗原構築物およびその他の多抗原構築物を含めた、本開示が提供する核酸分子のうちのいずれかの1つまたは複数を含有するベクターに関する。ベクターは、核酸分子がコードする免疫原性TAAポリペプチドをクローニングする、もしくは発現させるのに、または組成物、例として、ワクチン中の核酸分子を、宿主細胞、もしくは宿主動物、例として、ヒトに送達するのに有用である。いくつかの特定の実施形態では、ベクターは、免疫原性MUC1ポリペプチド、免疫原性MSLNポリペプチドおよび免疫原性TERTポリペプチドをコードする三重抗原構築物を含み、この場合、三重抗原構築物は、
(1)配列番号44、46、48、50、52、54、56、58、60、62、64または66のアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列、
(2)配列番号43、45、47、49、51、53、55、57、59、61、63または65のヌクレオチド配列、および
(3)配列番号43、45、47、49、51、53、55、57、59、61、63または65のヌクレオチド配列の縮重バリアント
からなる群から選択されるヌクレオチド配列を含む。
多種多様なベクター、例として、プラスミドベクター、コスミドベクター、ファージベクターおよびウイルスベクターを、本発明の核酸分子を含有し、発現するように調製することができる。
いくつかの実施形態では、本開示は、本発明の核酸分子を含有するプラスミドに基づくベクターを提供する。適切なプラスミドベクターの例として、pBR325、pUC18、pSKF、pET23DおよびpGB−2が挙げられる。プラスミドベクターのその他の例、およびそのようなベクターを構築する方法が、米国特許第5,580,859号、第5,589,466号、第5,688,688号、第5,814,482号および第5,580,859号に記載されている。
その他の実施形態では、本発明は、ウイルス、例として、レトロウイルス、アルファウイルスおよびアデノウイルスから構築されるベクターを提供する。レトロウイルスベクターの例が、米国特許第5,219,740号、第5,716,613号、第5,851,529号、第5,591,624号、第5,716,826号、第5,716,832号および第5,817,491号に記載されている。アルファウイルスから生成することができるベクターの代表的な例が、米国特許第5,091,309号および第5,217,879号、第5,843,723号および第5,789,245号に記載されている。
いくつかの特定の実施形態では、本開示は、非ヒト霊長類アデノウイルス、例として、サルアデノウイルスに由来するアデノウイルスベクターを提供する。そのようなアデノウイルスベクターの例、およびそれらの調製が、PCT出願公開WO2005/071093およびWO2010/086189に記載されており、それらには、サルアデノウイルス、例として、ChAd3、ChAd4、ChAd5、ChAd7、ChAd8、ChAd9、ChAd10、ChAd11、ChAd16、ChAd17、ChAd19、ChAd20、ChAd22、ChAd24、ChAd26、ChAd30、ChAd31、ChAd37、ChAd38、ChAd44、ChAd63、ChAd68、ChAd82、ChAd55、ChAd73、ChAd83、ChAd146、ChAd147、PanAd1、Pan Ad2およびPan Ad3から構築される非複製性ベクター、ならびにサルアデノウイルスAd4またはAd7から構築される複製コンピテントなベクターが含まれる。サルアデノウイルスからアデノウイルスベクターを構築する場合には、E1A、E1B、E2A、E2B、E3およびE4から選択される、ウイルスのゲノム領域に由来する初期遺伝子のうちの1つまたは複数を、欠失させるか、または欠失もしくは突然変異により非機能性にすることが好ましい。特定の実施形態では、ベクターを、ChAd3またはChAd68から構築する。また、適切なベクターを、その他のウイルス、例として、(1)ポックスウイルス(pox virus)、例として、カナリアポックスウイルス(canary pox virus)またはワクシニアウイルス(vaccinia virus)(Fisher−Hochら、PNAS、86:317〜321、1989;Flexnerら、Ann.N.Y.Acad.Sci.、569:86〜103、1989;Flexnerら、Vaccine、8:17〜21、1990;米国特許第4,603,112号、第4,769,330号および第5,017,487号;WO89/01973)、(2)SV40(Mulliganら、Nature、277:108〜114、1979)、(3)ヘルペス(herpes)(Kit、Adv.Exp.Med.Biol.、215:219〜236、1989;米国特許第5,288,641号);ならびに(4)レンチウイルス(lentivirus)、例として、HIV(Poznansky、J.Virol.、65:532〜536、1991)から生成することもできる。
ベクターを構築する方法は、当技術分野で周知である。発現ベクターは典型的には、発現させようとする核酸配列に作動可能に連結している1つまたは複数の制御エレメントを含む。用語「制御エレメント」はまとめて、プロモーター領域、ポリアデニル化シグナル、転写終結配列、上流の調節ドメイン、複製開始点、配列内リボゾーム進入部位(「IRES」)、エンハンサー等を指し、まとめると、これらにより、レシピエント細胞中で、コード配列の複製、転写および翻訳がもたらされる。選択されたコード配列が、妥当な宿主細胞中で複製、転写および翻訳されることが可能である限り、これらの制御エレメントの全てが常に存在する必要はない。制御エレメントは、当業者に公知のいくつかの要因、例として、具体的な宿主細胞、およびその他のベクター構成要素の供給源または構造に基づいて選択される。免疫原性TAAポリペプチドの発現を増強するために、コザック配列を、免疫原性TAAポリペプチドをコードする配列の上流に提供することができる。脊椎動物については、公知のコザック配列は、(GCC)NCCATGGであり、この場合、Nは、AまたはGであり、GCCが、保存されている程度は低い。使用することができる例示的なコザック配列として、GAACATGG、ACCAUGGおよびACCATGGが挙げられる。
E.免疫原性TAAポリペプチドを含む組成物(ポリペプチド組成物)
別の態様では、本開示は、ポリペプチド組成物を提供し、これらは、本開示が提供する、1つまたは複数の単離の免疫原性TAAポリペプチドを含む(「ポリペプチド組成物」)。いくつかの実施形態では、ポリペプチド組成物は、哺乳動物、例として、マウス、イヌ、非ヒト霊長類またはヒトにおいて、TAAタンパク質に対する免疫応答を惹起するのに有用な免疫原性組成物である。いくつかのその他の実施形態では、ポリペプチド組成物は、ヒトに投与するための医薬組成物である。さらなるその他の実施形態では、ポリペプチド組成物は、哺乳動物、例として、ヒトを免疫化するのに、異常な細胞増殖を阻害するのに、がんの発生に対する保護をもたらすのに(予防としての使用に)、またはTAAの過剰発現と関連がある障害、例として、がんを治療するのに(治療薬としての使用に)有用なワクチン組成物である。
本開示が提供するポリペプチド組成物は、単一のタイプの免疫原性TAAポリペプチド、例として、免疫原性MSLNポリペプチド、免疫原性MUC1ポリペプチドまたは免疫原性TERTポリペプチドを含有することができる。組成物はまた、2つ以上の異なるタイプの免疫原性TAAポリペプチドの組合せを含有することもできる。例えば、ポリペプチド組成物は、免疫原性TAAポリペプチドを、以下の組合せ、すなわち、
1)免疫原性MSLNポリペプチドおよび免疫原性MUC1ポリペプチド、
2)免疫原性MSLNポリペプチドおよびTERTポリペプチド、または
3)免疫原性MSLNポリペプチド、免疫原性MUC1ポリペプチドおよびTERTポリペプチド
のうちのいずれかで含有することができる。
いくつかの実施形態では、本開示が提供するポリペプチド組成物、例として、免疫原性組成物、医薬組成物またはワクチン組成物は、薬学的に許容できる賦形剤をさらに含む。免疫原性、医薬またはワクチン組成物に適切な、薬学的に許容できる賦形剤は、当技術分野で公知である。組成物中で使用することができる適切な賦形剤の例として、生体適合性の油、例として、ナタネ油、ヒマワリ油、落花生油、綿実油、ホホバ油、スクワラン、スクアレン;生理食塩水溶液、保存剤および浸透圧制御剤、担体ガス、pH制御剤、有機溶媒、疎水性の薬剤、酵素阻害剤、水吸収性ポリマー、界面活性剤、吸収促進剤、pH改変物質、ならびに抗酸化剤が挙げられる。
組成物、特に、免疫原性組成物またはワクチン組成物中の免疫原性TAAポリペプチドは、レシピエントに投与するために、担体に連結する、担体にコンジュゲート化する、または別の方法により担体内に組み込むことができる。用語「担体」は、免疫原性ポリペプチドをレシピエント(例えば、患者)に送達するために、免疫原性ポリペプチドが、つながるか、または別の形で結び付くことができる物質または構造を指す。担体自体が免疫原性である場合がある。担体の例として、免疫原性ポリペプチド、免疫CpGアイランド、キーホールリンペットヘモシアニン(KLH)、破傷風トキソイド(TT)、コレラ毒素サブユニットB(CTB)、細菌もしくは細菌ゴースト、リポソーム、キトソーム、ビロソーム、マイクロスフェア、樹状細胞、またはそれらの同類が挙げられる。1つまたは複数の免疫原性TAAポリペプチド分子を、単一の担体分子に連結することができる。免疫原性ポリペプチドを担体に連結するための方法は、当技術分野で公知である。
本開示が提供するワクチン組成物または免疫原性組成物は、1つまたは複数の免疫調節剤またはアジュバントと併用してかまたは組み合わせて使用することができる。免疫調節剤またはアジュバントは、ワクチン組成物もしくは免疫原性組成物とは別個に製剤化してもよく、または同じ組成物製剤の部分であってもよい。したがって、いくつかの実施形態では、本開示は、1つまたは複数の免疫調節剤またはアジュバントをさらに含むワクチン組成物を提供する。免疫調節剤およびアジュバントの例を、本明細書下記に提供する。
免疫原性およびワクチン組成物を含めた、ポリペプチド組成物は、任意の適切な投与剤型、例として、液体の剤型(例えば、液剤、懸濁剤または乳濁液)および固体の剤型(例えば、カプセル剤、錠剤または散剤)に、当業者に公知の方法により調製することができる。
F.免疫原性TAA核酸分子を含む組成物(核酸組成物)
本開示はまた、核酸組成物も提供し、これらは、本開示が提供する単離の核酸分子またはベクターを含む(「核酸組成物」)。核酸組成物は、in vitro、またはヒトを含めた、哺乳動物においてin vivoで、TAAタンパク質に対する免疫応答を惹起するのに有用である。いくつかの実施形態では、核酸組成物は、免疫原性組成物または医薬組成物である。
いくつかの特定の実施形態では、核酸組成物は、(1)異常な細胞増殖を阻害して、がんの発生に対する保護をもたらす(予防として使用する)ため、(2)TAAの過剰発現と関連があるがんを治療する(治療薬として使用する)ため、または(3)特定のヒトTAA、例として、MSLN、MUC1もしくはTERTに対する免疫応答を惹起するために、ヒトに投与するためのDNAワクチン組成物である。組成物中の核酸分子は、「裸」の核酸分子、すなわち、単に、トランスフェクションまたは発現を促進するエレメントを含有しない、単離のDNAの形態であり得る。代わって、組成物中の核酸分子は、ベクター、例として、プラスミドベクターまたはウイルスベクター内に組み込まれる。
本開示が提供する核酸組成物は、それぞれが、1つのタイプの免疫原性TAAポリペプチド、例として、免疫原性MSLNポリペプチド、免疫原性MUC1ポリペプチドまたは免疫原性TERTポリペプチドのみをコードする個別の、単離の核酸分子を含むことができる。
核酸組成物は、2つ以上のタイプの免疫原性TAAポリペプチドをコードする多抗原構築物を含むことができる。例えば、多抗原構築物は、以下の組合せ、すなわち、
(1)免疫原性MSLNポリペプチドおよび免疫原性MUC1ポリペプチド、
(2)免疫原性MSLNポリペプチドおよび免疫原性TERTポリペプチド、
(3)免疫原性MUC1ポリペプチドおよび免疫原性TERTポリペプチド、ならびに
(4)免疫原性MSLNポリペプチド、免疫原性MUC1ポリペプチドおよび免疫原性TERTポリペプチド
のうちのいずれかの、2つ以上の免疫原性TAAポリペプチドをコードすることができる。
いくつかの特定の実施形態では、本開示が提供する組成物は、
(1)配列番号18、20、22または24;26、28、30、32または34;36、38、30、40または42のアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列、
(2)配列番号17、19、21または23;25、27、29、31または33;35、37、39または41のヌクレオチド配列、および
(3)配列番号17、19、21または23;25、27、29、31または33;35、37、39または41のヌクレオチド配列の縮重バリアント
からなる群から選択されるヌクレオチド配列を含む二重抗原構築物を含む。
いくつかのその他の特定の実施形態では、本開示が提供する組成物は、
(1)配列番号44、46、48、50、52、54、56、58、60、62、64または66のアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列、
(2)配列番号43、45、47、49、51、53、55、57、59、61、63または65のヌクレオチド配列、および
(3)配列番号43、45、47、49、51、53、55、57、59、61、63または65のヌクレオチド配列の縮重バリアント
からなる群から選択されるヌクレオチド配列を含む三重抗原構築物を含む。
核酸組成物、例として、医薬組成物またはDNAワクチン組成物は、薬学的に許容できる賦形剤をさらに含むことができる。DNAワクチン組成物を含めた、核酸組成物に適切な、薬学的に許容できる賦形剤は、当業者に周知である。そのような賦形剤は、水性または非水性の液体、懸濁液および乳濁液であり得る。非水性の賦形剤の例として、プロピレングリコール、ポリエチレングリコール、植物油、例として、オリーブ油、および注射用有機エステル、例として、エチルオレエートが挙げられる。水性の賦形剤の例として、生理食塩水および緩衝性媒体を含めて、水、アルコール/水の溶液、乳濁液または懸濁液が挙げられる。適切な賦形剤にはまた、ポリヌクレオチド分子の細胞への取込みを支援する薬剤も含まれる。そのような薬剤の例が、(i)細胞透過性を改変する化学物質、例として、ブピバカイン、(ii)ポリヌクレオチドを封入するためのリポソームもしくはウイルス粒子、または(iii)自体がポリヌクレオチドと結び付くカチオン性脂質もしくはシリカ;金もしくはタングステン微小粒子である。アニオン性および中性リポソームは、当技術分野で周知であり(リポソームを作製するための方法の詳細な記載については、例えば、Liposomes:A Practical Approach、RPC New Ed、IRL press(1990)を参照されたい)、ポリヌクレオチドを含めた、広い範囲の産物を送達するのに有用である。カチオン性脂質もまた、当技術分野で公知であり、一般に、遺伝子を送達するために使用される。そのような脂質には、Lipofectin(商標)が含まれ、また、それらは、DOTMA(N−[1−(2,3−ジオレイルオキシ)プロピル]−N,N,N−トリメチルアンモニウムクロリド)、DOTAP(1,2−bis(オレイルオキシ)−3(トリメチルアンモニオ)プロパン)、DDAB(ジメチルジオクタデシル−アンモニウムブロミド)、DOGS(ジオクタデシルアミドログリシルスペルミン)、およびコレステロール誘導体、例として、DCChol(3beta−(N−(N’,N’−ジメチルアミノメタン)−カルバモイル)コレステロール)としても公知である。これらのカチオン性脂質についての記載を、EP187,702、WO90/11092、米国特許第5,283,185号、WO91/15501、WO95/26356および米国特許第5,527,928号に見出すことができる。本開示が提供する核酸ワクチンと共に使用することができる特定の有用なカチオン性脂質製剤が、VAXFECTINであり、これは、カチオン性脂質(GAP−DMORIE)と中性リン脂質(DPyPE)との混合物であり、これらは、水性ビヒクル中で組み合わせると、自己集合して、リポソームを形成する。好ましくは、遺伝子を送達するためのカチオン性脂質は、例えば、WO90/11092の記載に従って、中性脂質、例として、DOPE(ジオレイルホスファチジルエタノールアミン)と合わせて使用する。さらに、核酸構築物、例として、DNA構築物はまた、非イオン性ブロックコポリマー、例として、CRL1005を用いて製剤化することもできる。
本開示が提供する核酸ワクチン組成物または免疫原性組成物は、1つまたは複数の免疫調節剤と併用してまたは組み合わせて使用することができる。本開示が提供する核酸ワクチン組成物または免疫原性組成物はまた、1つまたは複数のアジュバントと併用してまたは組み合わせて使用することもできる。さらに、本開示が提供する核酸ワクチン組成物または免疫原性組成物は、1つまたは複数の免疫調節剤および1つまたは複数のアジュバントと併用してまたは組み合わせて使用することもできる。免疫調節剤またはアジュバントは、核酸組成物とは別個に製剤化してもよく、または同じ組成物製剤の部分であってもよい。したがって、いくつかの実施形態では、本開示は、1つもしくは複数の免疫調節剤および/または1つもしくは複数のアジュバントをさらに含む核酸ワクチン組成物を提供する。免疫調節剤およびアジュバントの例を、本明細書下記に提供する。
ワクチン組成物を含めた、核酸組成物は、任意の適切な投与剤型、例として、液体の剤型(例えば、液剤、懸濁剤または乳濁液)および固体の剤型(例えば、カプセル剤、錠剤または散剤)に、当業者に公知の方法により調製することができる。
G.免疫原性TAAポリペプチド、免疫原性TAA核酸分子および免疫原性TAA組成物の使用
その他の態様では、本開示は、本明細書上記に記載した免疫原性TAAのポリペプチド、単離の核酸分子および組成物を使用する方法を提供する。
一態様では、本開示は、哺乳動物、特に、ヒトにおいてTAAに対する免疫応答を惹起する方法であって、(1)標的のTAAに対して免疫原性である免疫原性TAAポリペプチド、(2)1つもしくは複数の免疫原性TAAポリペプチドをコードする単離の核酸分子、(3)1つもしくは複数の免疫原性TAAポリペプチドを含む組成物、または(4)1つもしくは複数の免疫原性TAAポリペプチドをコードする単離の核酸分子を含む組成物を、有効量で哺乳動物に投与するステップを含む方法を提供する。いくつかの実施形態では、本開示は、ヒトにおいてMSLNに対する免疫応答を惹起する方法であって、本開示が提供する免疫原性MSLN組成物の有効量をヒトに投与するステップを含む方法を提供し、この場合、免疫原性MSLN組成物は、(1)免疫原性MSLNポリペプチド、(2)免疫原性MSLNポリペプチドをコードする単離の核酸分子、(3)免疫原性MSLNポリペプチドを含む組成物、または(4)免疫原性MSLNポリペプチドをコードする単離の核酸分子を含む組成物から選択される。いくつかのその他の実施形態では、本開示は、ヒトにおいてMUC1に対する免疫応答を惹起する方法であって、本開示が提供する免疫原性MUC1組成物の有効量をヒトに投与するステップを含む方法を提供し、この場合、免疫原性MUC1組成物は、(1)免疫原性MUC1ポリペプチド、(2)免疫原性MUC1ポリペプチドをコードする単離の核酸分子、(3)免疫原性MUC1ポリペプチドを含む組成物、または(4)免疫原性MUC1ポリペプチドをコードする単離の核酸分子を含む組成物から選択される。いくつかの実施形態では、本開示は、ヒトにおいてTERTに対する免疫応答を惹起する方法であって、本開示が提供する免疫原性TERT組成物の有効量をヒトに投与するステップを含む方法を提供し、この場合、免疫原性TERT組成物は、(1)免疫原性TERTポリペプチド、(2)免疫原性TERTポリペプチドをコードする単離の核酸分子、(3)免疫原性TERTポリペプチドを含む組成物、または(4)免疫原性TERTポリペプチドをコードする単離の核酸分子を含む組成物から選択される。
別の態様では、本開示は、ヒトにおいて異常な細胞増殖を阻害する方法を提供し、この場合、異常な細胞増殖は、TAAの過剰発現と関連がある。方法は、過剰発現されたTAAに対して免疫原性である、本開示が提供する免疫原性TAA組成物の有効量をヒトに投与するステップを含む。免疫原性TAA組成物は、(1)免疫原性TAAポリペプチド、(2)1つもしくは複数の免疫原性TAAポリペプチドをコードする単離の核酸分子、(3)免疫原性TAAポリペプチドを含む組成物、または(4)1つもしくは複数の免疫原性TAAポリペプチドをコードする単離の核酸分子を含む組成物であり得る。異常な細胞増殖は、ヒトの任意の臓器または組織、例として、乳房、胃、卵巣、肺、膀胱、大腸(例えば、結腸および直腸)、腎臓、膵臓、ならびに前立腺にあり得る。いくつかの実施形態では、方法は、乳房、卵巣、膵臓、結腸、肺、胃および直腸における異常な細胞増殖を阻害するための方法である。
別の態様では、本開示は、ヒトにおいてがんを治療する方法を提供し、この場合、がんは、TAAの過剰発現と関連がある。方法は、過剰発現されたTAAに対する免疫応答を惹起することが可能な、免疫原性TAA組成物の有効量をヒトに投与するステップを含む。免疫原性TAA組成物は、(1)免疫原性TAAポリペプチド、(2)1つもしくは複数の免疫原性TAAポリペプチドをコードする単離の核酸分子、(3)免疫原性TAAポリペプチドを含む組成物、または(4)1つもしくは複数の免疫原性TAAポリペプチドをコードする単離の核酸分子を含む組成物であり得る。
いくつかの実施形態では、本開示は、ヒトにおいてがんを治療する方法であって、本明細書上記で提供した核酸組成物の有効量をヒトに投与するステップを含む方法を提供する。組成物中の核酸は、1つの特定の免疫原性TAAポリペプチド、例として、免疫原性MSLNポリペプチド、免疫原性MUC1ポリペプチドまたは免疫原性TERTポリペプチドのみをコードする単一抗原構築物であり得る。組成物中の核酸はまた、2または3つ以上の異なる免疫原性TAAポリペプチドをコードする多抗原構築物であり得る。
いくつかの具体的な実施形態では、本開示は、ヒトにおいてがんを治療する方法であって、二重抗原構築物を含む組成物の有効量をヒトに投与するステップを含む方法を提供する。二重抗原構築物は、(1)免疫原性MSLNポリペプチドおよび免疫原性MUC1ポリペプチド、(2)免疫原性MSLNポリペプチドおよび免疫原性TERTポリペプチド、(3)免疫原性TERTポリペプチドおよび免疫原性MUC1ポリペプチドから選択される、任意の2つの異なる免疫原性TAAポリペプチドをコードすることができる。
いくつかのその他の具体的な実施形態では、本開示は、ヒトにおいてがんを治療する方法を提供し、この場合、がんは、MUC1、MSLNおよびTERTから選択される1つまたは複数のTAAの過剰発現と関連があり、この方法は、免疫原性MSLNポリペプチド、免疫原性MUC1ポリペプチドおよび免疫原性TERTポリペプチドをコードする三重抗原構築物を含む組成物の有効量をヒトに投与するステップを含む。
腫瘍関連抗原MUC1、MSLNおよび/またはTERTを過剰発現する任意のがんを、本開示が提供する方法により治療することができる。がんの例として、乳がん、卵巣がん、肺がん(例として、小細胞肺がんおよび非小細胞肺がん)、結腸直腸がん、胃がん、ならびに膵臓がんが挙げられる。いくつかの特定の実施形態では、本開示は、ヒトにおいてがんを治療する方法を提供し、この方法は、三重抗原構築物を含む組成物の有効量をヒトに投与するステップを含み、この場合、がんは、(1)乳がん、例として、三種陰性(トリプルネガティブ)乳がん、(2)膵臓がん、例として、膵管腺癌、または(3)卵巣がん、例として、卵巣腺癌である。
ポリペプチドおよび核酸組成物を、いくつかの適切な、当技術分野で公知の方法により、ヒトを含めた、動物に投与することができる。適切な方法の例として、(1)筋肉内、皮内、表皮内または皮下投与、(2)経口投与、ならびに(3)外用適用(例として、眼、鼻腔内および膣内への適用)が挙げられる。使用することができる、核酸ワクチン組成物の皮内または表皮内投与の1つの特定の方法が、PowderMedにより市販されている粒子媒介型表皮送達(Particle Mediated Epidermal Delivery)(PMED(商標))によるワクチン送達デバイスを使用する遺伝子銃送達である。PMEDは、ワクチンを動物またはヒトに投与する無針の方法である。PMEDシステムでは、微小金粒子上にDNAを沈殿させ、次いで、これらの粒子を、ヘリウムガスにより表皮内に高圧噴霧する。DNAをコートした金粒子が、表皮のAPCおよび角化細胞に送達され、これらの細胞の核内に入ると、DNAが、金を離れて溶出し、転写活性となって、コードタンパク質を産生する。核酸ワクチンを筋肉内投与するための1つの特定の方法が、電気穿孔である。電気穿孔は、制御された電気パルスを使用して、細胞膜中に一時的な細孔を生み出し、このことにより、筋肉内注射された核酸ワクチンの細胞への取込みが容易になる。CpGを、核酸ワクチンと組み合わせて使用する場合には、CpGと核酸ワクチンとを、1つの製剤中に合剤として製剤化することができ、この製剤を、電気穿孔により筋肉内投与する。
本開示が提供する所与の方法において投与しようとする組成物中の免疫原性TAAポリペプチドまたは免疫原性TAAポリペプチドをコードする核酸の有効量は、当業者が容易に決定することができ、いくつかの要因に依存するであろう。がん、例として、膵臓がん、卵巣がんおよび乳がんを治療する方法において、免疫原性TAAポリペプチドまたは免疫原性TAA核酸の有効量を決定する際に検討することができる要因として、これらに限定されないが、(1)対象の免疫状態および健康を含めた、治療しようとする対象、(2)治療しようとするがんの重症度または段階、(3)使用するかまたは発現させる特定の免疫原性TAAポリペプチド、(4)所望される保護または治療の程度、(5)投与方法およびスケジュール、ならびに(6)使用するその他の治療剤(例として、アジュバントまたは免疫調節剤)が挙げられる。多抗原ワクチン組成物を含めた、核酸ワクチン組成物の場合、製剤化および送達の方法は、有効な免疫応答を惹起するのに必要な核酸の用量を決定するための主要な要因に属する。例えば、核酸の有効量は、核酸ワクチン組成物を、水性液剤として製剤化し、針による皮下注射または空気圧を用いる注入により投与する場合には、2μg/投与〜10mg/投与の範囲であり得、一方、核酸を、コートされた金製ビーズとして調製し、遺伝子銃技術を使用して送達する場合には、わずか16ng/投与〜16μg/投与が必要となり得る。電気穿孔による核酸ワクチンについての用量範囲は一般に、0.5〜10mg/投与の範囲である。電気穿孔により、核酸ワクチンを、合剤中でCpGと一緒に投与する場合には、核酸ワクチンの用量は、0.5〜5mg/投与の範囲であり得、CpGの用量は典型的には、0.05mg〜5mg/投与の範囲であり、例として、1人当たり、0.05、0.2、0.6または1.2mg/投与である。
本発明の核酸またはポリペプチドのワクチン組成物を、プライム−ブースト戦略において使用して、ロバストなかつ長期にわたる免疫応答を誘発することができる。同じ免疫原性構築物の反復注射に基づく、プライムおよびブーストを行うワクチン接種プロトコールは、周知である。一般に、第1の投与は、保護的な免疫をもたらすことができないが、免疫系を「プライムする」に過ぎない。第2または第3の投与(「ブースト」)の後に、保護的な免疫応答が発生する。ブーストは、従来の技法に従って行い、経験により、投与スケジュール、投与経路、選ばれたアジュバント、用量、および別のワクチンと共に投与する場合に可能な配列の観点からさらに最適化することもできる。一実施形態では、本発明の核酸またはポリペプチドのワクチンは、同じワクチンを複数回投与で動物に投与する、従来の同形的プライム−ブースト戦略において使用される。別の実施形態では、核酸またはポリペプチドのワクチン組成物は、同じ抗原を含有する異なるタイプのワクチンを所定の時間間隔で投与する、異形的プライム−ブーストワクチン接種において使用される。例えば、核酸構築物を、初回投与(「プライム」)では、プラスミドの形態で投与し、その後の投与(「ブースト」)では、ベクターの部分として投与することができ、逆もまたしかりである。
本開示のポリペプチドまたは核酸ワクチンの組成物は、1つまたは複数のアジュバントと一緒に使用することができる。適切なアジュバントの例として、(1)水中油型乳濁液の製剤(その他の特定の免疫賦活剤、例として、ムラミルポリペプチドまたは細菌細胞壁構成要素を有する場合または有しない場合がある)、例として、(a)MF59(商標)(PCT公開第WO90/14837号;Vaccine design:the subunit and adjuvant approach、Chapter 10、PowellおよびNewman編、Plenum Press、1995)(5%のスクアレン、0.5%のTween80(ポリオキシエチレンソルビタンモノ−オレエート)および0.5%のSpan85(ソルビタントリオレエート)を含有し、顕微溶液化装置を使用してサブミクロン粒子に製剤化されている)、(b)SAF(10%のスクアレン、0.4%のTween80、5%のpluronicブロックポリマーL121およびthr−MDPを含有し、顕微溶液化して、サブミクロン乳濁液になされているか、またはボルテックスして、より大きな粒子サイズの乳濁液を生成している)、さらに、(c)RIBI(商標)アジュバントシステム(RAS)(Ribi Immunochem、Hamilton、MT)(2%のスクアレン、0.2%のTween80、ならびに1つまたは複数の細菌細胞壁構成要素、例として、モノホスホリルリピドA(MPL)、トレハロースジミコール酸(TDM)および細胞壁骨格(CWS)を含有する)、(2)サポニンアジュバント、例として、QS21、STIMULON(商標)(Cambridge Bioscience、Worcester、MA)、Abisco(登録商標)(Isconova、スウェーデン)またはIscomatrix(登録商標)(Commonwealth Serum Laboratories、オーストラリア);(3)完全フロイントアジュバント(CFA)および不完全フロイントアジュバント(IFA);(4)サイトカイン、例として、インターロイキン(例えば、IL−1、IL−2、IL−4、IL−5、IL−6、IL−7、IL−12(PTC公開第WO99/44636号)等)、インターフェロン(例えば、ガンマインターフェロン)、マクロファージコロニー刺激因子(M−CSF)および腫瘍壊死因子(TNF);(5)モノホスホリルリピドA(MPL)または3−O−脱アシル化MPL(3dMPL)、(WO00/56358);(6)3dMPLの、QS21および/または水中油型乳濁液との組合せ(EP−A−0835318、EP−A−0735898、EP−A−0761231);(7)CpGモチーフを含む、すなわち、少なくとも1つのCGジヌクレオチドを含有するオリゴヌクレオチド(この場合、シトシンは非メチル化されている)(WO98/40100、WO98/55495、WO98/37919およびWO98/52581);(8)ポリオキシエチレンエーテルまたはポリオキシエチレンエステル(WO99/52549);(9)オクトキシノールと組み合わせたポリオキシエチレンソルビタンエステル界面活性剤(WO01/21207)、または少なくとも1つの追加の非イオン性界面活性剤、例として、オクトキシノールと組み合わせたポリオキシエチレンアルキルエーテルもしくはエステルの界面活性剤(WO01/21152);(10)サポニンおよび免疫賦活性オリゴヌクレオチド(例えば、CpGオリゴヌクレオチド)(WO00/62800);(11)アルミニウム塩(ミョウバン)を含めた、金属塩、例として、リン酸アルミニウムおよび水酸化アルミニウム;(12)サポニンおよび水中油型乳濁液(WO99/11241);ならびに(13)サポニン(例えば、QS21)、3dMPLおよびIM2の組合せ(WO98/57659)が挙げられる。
さらに、哺乳動物においてがんを含めた、新生物による障害を治療するために、本開示が提供する、ワクチン組成物を含めた、ポリペプチド組成物または核酸組成物は、1つまたは複数の免疫調節剤と組み合わせて投与することもできる。免疫調節剤は、免疫抑制細胞阻害剤(ISC阻害剤)または免疫エフェクター細胞増強剤(IEC増強剤)であり得る。さらに、1つまたは複数のISC阻害剤を、1つまたは複数のIEC増強剤と組み合わせて使用することもできる。免疫調節剤は、(1)静脈内、筋肉内等の全身投与または経口投与、および(2)局所投与、例として、皮内および皮下投与を含めた、任意の適切な方法および経路により投与することができる。妥当または適切な場合には、一般に、局所投与が、全身投与に比して好ましい。いずれの免疫調節剤の局所投与も、医薬品の局所投与に適切である、哺乳動物の身体の任意の場所において実施することができるが、これらの免疫調節剤は、ワクチンが流入するリンパ節に密接に近接する局所で投与するのがより好ましい。
組成物、例として、ワクチンは、使用する免疫調節剤のいずれかまたは全部と、同時または順次に投与することができる。同様に、2つ以上の免疫調節剤を使用する場合も、それらを相互に、同時または順次に投与することができる。いくつかの実施形態では、ワクチンを、1つの免疫調節剤に関しては、(例えば、混合物として)同時に投与するが、1つまたは複数の追加の免疫調節剤に関しては、順次に投与する。ワクチンと免疫調節剤との併用投与は、ワクチンおよび少なくとも1つの免疫調節剤を投与し、その結果、抗原と免疫調節剤とを同時に投与しないにもかかわらず、それぞれが、投与部位、例として、ワクチンが流入するリンパ節に同時に存在する場合を含むことができる。ワクチンと免疫調節剤との併用投与はまた、ワクチンまたは免疫調節剤が、投与部位から浄化されるが、浄化されたワクチンまたは免疫調節剤の、細胞への少なくとも1つの作用が、投与部位、例として、ワクチンが流入するリンパ節で、少なくとも、1つまたは複数の追加の免疫調節剤を当該投与部位に投与するまで持続する場合も含むことができる。核酸ワクチンを、CpGと組み合わせて投与する場合では、ワクチンとCpGとを、単一製剤中に含有させ、任意の適切な方法により一緒に投与することができる。いくつかの実施形態では、合剤(混合物)中の核酸ワクチンおよびCpGを、電気穿孔と組み合わせた筋肉内注射により投与する。
いくつかの実施形態では、ポリペプチド組成物または核酸組成物と組み合わせて使用する免疫調節剤は、ISC阻害剤である。
ISC阻害剤の例として、(1)タンパク質キナーゼ阻害剤、例として、イマチニブ、ソラフェニブ、ラパチニブ、BIRB−796およびAZD−1152、AMG706、Zactima(ZD6474)、MP−412、ソラフェニブ(BAY43−9006)、ダサチニブ、CEP−701(lestaurtinib)、XL647、XL999、Tykerb(ラパチニブ)、MLN518(CT53518として以前から公知)、PKC412、ST1571、AEE788、OSI−930、OSI−817、スニチニブリンゴ酸塩(SUTENT)、アキシチニブ(AG−013736)、エルロチニブ、ゲフィチニブ、アキシチニブ、ボスチニブ、テムシロリムス、ならびにニロチニブ(AMN107)。いくつかの特定の実施形態では、チロシンキナーゼ阻害剤は、スニチニブ、ソラフェニブ、またはスニチニブもしくはソラフェニブの薬学的に許容できる塩もしくは誘導体(例として、リンゴ酸塩もしくはトシル化物);(2)シクロオキシゲナーゼ−2(COX−2)阻害剤、例として、セレコキシブおよびロフェコキシブ;(3)ホスホジエステラーゼ5型(PDE5)阻害剤、例として、avanafil、lodenafil、mirodenafil、シルデナフィル、タダラフィル、バルデナフィル、udenafilおよびzaprinastが挙げられるPDE5阻害剤の例、(4)DNA架橋剤、例として、シクロホスファミドである。
いくつかの実施形態では、ポリペプチド組成物または核酸組成物と組み合わせて使用する免疫調節剤は、IEC増強剤である。2つ以上のIEC増強剤を、一緒に使用することができる。
使用することができるIEC増強剤の例として、(1)TNFRアゴニスト、例として、OX40のアゴニスト、4−1BBのアゴニスト(例として、BMS−663513)、GITRのアゴニスト(例として、TRX518)およびCD40のアゴニスト(例として、CD40作動性の抗体);(2)CTLA−4阻害剤、例として、イピリムマブおよびトレメリムマブ;(3)TLRアゴニスト、例として、CpG7909(5’TCGTCGTTTTGTCGTTTTGTCGTT3’)、CpG24555(5’TCGTCGTTTTTCGGTGCTTTT3’(CpG24555)およびCpG10103(5’TCGTCGTTTTTCGGTCGTTTT3’);(4)プログラム細胞死(programmed cell death)タンパク質1(PD−1)阻害剤、例として、ニボルマブおよびペムブロリズマブ;ならびに(5)PD−L1阻害剤、例として、アテゾリズマブ、デュルバルマブおよびvelumab;さらに、(6)IDO1阻害剤が挙げられる。
いくつかの実施形態では、IEC増強剤は、CD40アゴニスト抗体であり、これは、ヒトの、ヒト化のまたはヒト部分を有するキメラの抗CD40抗体であり得る。具体的なCD40アゴニスト抗体の例として、G28−5、mAb89、EA−5またはS2C6モノクローナル抗体、およびCP870,893が挙げられる。CP−870,893は、抗腫瘍療法として臨床的に検討されてきた完全ヒトCD40作動性モノクローナル抗体(mAb)である。CP870,893の構造および調製が、WO2003041070に開示されている(この開示内では、当該抗体は「21.4.1」と同定されており、当該抗体の重鎖および軽鎖のアミノ酸配列をそれぞれ、配列番号40および配列番号41に記載する)。CP−870,893は、本開示の組成物と組み合わせて使用するには、任意の適切な経路、例として、皮内、皮下または筋肉内注射により投与することができる。CP870893の有効量は一般に、0.01〜0.25mg/kgの範囲である。いくつかの実施形態では、CP870893は、0.05〜0.1mg/kgの量で投与する。
いくつかのその他の実施形態では、IEC増強剤は、CTLA−4阻害剤、例として、イピリムマブおよびトレメリムマブである。イピリムマブ(MEX−010またはMDX−101としてもまた公知である)は、YERVOYとして市販されており、ヒト抗ヒトCTLA−4抗体である。イピリムマブはまた、そのCAS登録番号477202−00−9により参照することができ、PTC公開第WO01/14424号では、抗体10DIとして開示されている。トレメリムマブ(CP−675,206としてもまた公知である)は、完全ヒトIgG2モノクローナル抗体であり、CAS番号745013−59−6を有する。トレメリムマブは、米国特許第6,682,736号に開示されており、この特許は、その全体が参照により本明細書に組み込まれており、この抗体は、この開示内では抗体11.2.1と同定されており、その重鎖および軽鎖のアミノ酸配列をそれぞれ、配列番号42および43に記載する。トレメリムマブは、本開示が提供する組成物と組み合わせて使用するには、局所、特に、皮内または皮下に投与することができる。皮内または皮下に投与するトレメリムマブの有効量は典型的には、1人当たり5〜200mg/投与の範囲である。いくつかの実施形態では、トレメリムマブの有効量は、1人当たり10〜150mg/投与の範囲である。いくつかの特定の実施形態では、トレメリムマブの有効量は、1人当たり約10、25、50、75、100、125、150、175または200mg/投与である。
いくつかのその他の実施形態では、免疫調節剤は、PD−1阻害剤またはPD−L1阻害剤、例として、ニボルマブ、ペムブロリズマブ、RN888(抗PD−1抗体)、アテゾリズマブ(Roche製のPD−L1特異的mAb)、デュルバルマブ(Astra Zeneca製のPD−L1特異的mAb)およびアベルマブ(Merck製のPD−L1特異的mAb)である。(Okazaki Tら、International Immunology(2007);19,7:813〜824;Sunshine Jら、Curr Opin Pharmacol.、2015 Aug;23:32〜8)。
その他の実施形態では、本開示は、抗がんワクチンを含めた、ワクチンとの免疫調節剤の使用を提供し、この場合、免疫調節剤は、インドールアミン2,3−ジオキシゲナーゼ1(「IDO1」としてもまた公知である)の阻害剤である。IDO1は、抑制表現型に対する免疫細胞の機能を調節することが見出され、したがって、腫瘍の、宿主の免疫監視からの回避を部分的に担うと考えられた。この酵素は、必須アミノ酸トリプトファンを、キヌレニンおよびその他の代謝産物に分解する。これらの代謝産物およびトリプトファン不足から、エフェクターT細胞の機能の抑制および調節性T細胞の分化の増大が生じることが見出された。IDO1阻害剤は、大型の分子、例として、抗体であっても、または低分子、例として、化合物であってもよい。
いくつかの特定の実施形態では、本開示が提供するポリペプチド組成物または核酸組成物を、WO2010/005958に開示されている、1,2,5−オキサジアゾール誘導体IDO1阻害剤と組み合わせて使用する。具体的な1,2,5−オキサジアゾール誘導体IDO1阻害剤の例として、以下の化合物、すなわち、
4−({2−[(アミノスルホニル)アミノ]エチル}アミノ)−N−(3−ブロモ−4−フルオロフェニル)−N’−ヒドロキシ−1,2,5−オキサジアゾール−3−カルボキシイミドアミド、
4−({2[(アミノスルホニル)アミノ]エチル}アミノ)−N−(3−クロロ−4−フルオロフェニル)−N’−ヒドロキシ−1,2,5−オキサジアゾール3−カルボキシイミドアミド、
4−({2[(アミノスルホニル)アミノ]エチル}アミノ)−N−[4−フルオロ−3−(トリフルオロメチル)フェニル]−N’−ヒドロキシ−1,2,5オキサジアゾール−3−カルボキシイミドアミド、
4−({2[(アミノスルホニル)アミノ]エチル}アミノ)−N’−ヒドロキシ−N−[3−(トリフルオロメチル)フェニル]−1,2,5オキサジアゾール−3−カルボキシイミドアミド、
4−({2[(アミノスルホニル)アミノ]エチル}アミノ)−N−(3−シアノ−4−フルオロフェニル)−N’−ヒドロキシ−1,2,5−オキサジアゾール3−カルボキシイミドアミド、
4−({2[(アミノスルホニル)アミノ]エチル}アミノ)−N−[(4−ブロモ−2−フリル)メチル]−N’−ヒドロキシ−1,2,5オキサジアゾール−3−カルボキシイミドアミド、または
4−({2[(アミノスルホニル)アミノ]エチル}アミノ)−N−[(4−クロロ−2−フリル)メチル]−N’−ヒドロキシ−1,2,5オキサジアゾール−3−カルボキシイミドアミド
が挙げられる。
1,2,5−オキサジアゾール誘導体IDO1阻害剤は典型的には、1日当たり1または2回経口投与し、経口投与による有効量は一般に、患者1人当たり25mg〜1000mg/投与の範囲にあり、例として、25mg、50mg、100mg、200mg、300mg、400mg、500mg、600mg、700mg、800mgまたは1000mgである。特定の実施形態では、本開示が提供するポリペプチド組成物または核酸組成物を、25mgまたは50mg/投与で1日当たり2回経口投与する4−({2−[(アミノスルホニル)アミノ]エチル}アミノ)−N−(3−ブロモ−4−フルオロフェニル)−N’−ヒドロキシ−1,2,5−オキサジアゾール−3−カルボキシイミドアミドと組み合わせて使用する。1,2,5−オキサジアゾール誘導体は、全体が参照により本明細書に組み込まれている米国特許第8,088,803号の記載に従って合成することができる。
いくつかのその他の具体的な実施形態では、本開示が提供するポリペプチド組成物または核酸組成物を、WO2015/173764に開示されているピロリジン−2,5−ジオン誘導体IDO1阻害剤と組み合わせて使用する。具体的なピロリジン−2,5−ジオン誘導体阻害剤の例として、以下の化合物、すなわち、
3−(5−フルオロ−1H−インドール−3−イル)ピロリジン−2,5−ジオン、
(3−H)−3−(5−フルオロ−1H−インドール−3−イル)ピロリジン−2,5−ジオン、
(−)−(R)−3−(5−フルオロ−1H−インドール−3−イル)ピロリジン−2,5−ジオン、
3−(1H−インドール−3−イル)ピロリジン−2,5−ジオン、
(−)−(R)−3−(1H−インドール−3−イル)ピロリジン−2,5−ジオン、
3−(5−クロロ−1H−インドール−3−イル)ピロリジン−2,5−ジオン、
(−)−(R)−3−(5−クロロ−1H−インドール−3−イル)ピロリジン−2,5−ジオン、
3−(5−ブロモ−1H−インドール−3−イル)ピロリジン−2,5−ジオン、
3−(5,6−ジフルオロ−1H−インドール−3−イル)ピロリジン−2,5−ジオン、および
3−(6−クロロ−1H−インドール−3−イル)ピロリジン−2,5−ジオン
が挙げられる。
ピロリジン−2,5−ジオン誘導体IDO1阻害剤は典型的には、1日当たり1または2回経口投与し、経口投与による有効量は一般に、患者1人当たり50mg〜1000mg/投与の範囲であり、例として、125mg、250mg、500mg、750mgまたは1000mgである。特定の実施形態では、本開示が提供するポリペプチド組成物または核酸組成物を、患者1人当たり125〜100mg/投与で1日当たり1回経口投与する3−(5−フルオロ−1H−インドール−3−イル)ピロリジン−2,5−ジオンと組み合わせて使用する。ピロリジン−2,5−ジオン誘導体は、全体が参照により本明細書に組み込まれている米国特許出願公開第US2015329525号の記載に従って合成することができる。
H.実施例
本発明の特定の実施形態を例証するために、以下の実施例を提供する。いかなる場合であっても、これらの実施例が本発明の範囲を制限すると解釈してはならない。上記の論述およびこれらの実施例から、当業者は、本発明の必須の特徴を確認することができ、本発明を多様な使用法および条件に適応させるために、本発明の精神および範囲から逸脱することなく、本発明の多様な変化形態および改変形態を作製することができる。
(実施例1)
単一抗原構築物、二重抗原構築物および三重抗原構築物の構築
実施例1により、単一抗原構築物、二重抗原構築物および三重抗原構築物の構築を例証する。別段の言及がない限り、MUC1タンパク質、MSLNタンパク質およびTERTタンパク質のアミノ酸の位置または残基への言及はそれぞれ、配列番号1に記載する、ヒトMUC1アイソフォーム1前駆体タンパク質のアミノ酸配列、配列番号2に記載する、ヒトメソテリン(MSLN)アイソフォーム2前駆体タンパク質のアミノ酸配列、および配列番号3に記載する、ヒトTERTアイソフォーム1前駆体タンパク質のアミノ酸配列を指す。
1A.単一抗原構築物
プラスミド1027(MUC1)。プラスミド1027を、遺伝子合成および制限断片の交換の技法を使用して生成した。5×タンデムリピートVNTR領域を有するヒトMUC1のアミノ酸配列を、遺伝子の最適化および合成のためにGeneArtに送った。ポリペプチドをコードする遺伝子を、発現について最適化し、合成し、クローニングした。MUC−1のオープンリーディングフレームを、GeneArtベクターからNheIおよびBglIIを用いる消化により切り出し、同様に消化したプラスミドpPJV7563内に挿入した。プラスミド1027のオープンリーディングフレーム(ORF)のヌクレオチド配列を、配列番号7に記載する。プラスミド1027がコードするアミノ酸配列を、配列番号8に記載する。
プラスミド1103(cMSLN)。プラスミド1103を、PCRおよび制限断片の交換の技法を使用して構築した。最初に、プラスミド1084から、PCRにより、プライマー、すなわち、MSLN34およびMSLN598を用いて、メソテリン前駆体のアミノ酸37〜597をコードする遺伝子を増幅して、アンプリコンの5’および3’末端においてそれぞれ、NheI制限部位およびBglII制限部位の付加を得た。アンプリコンを、NheIおよびBgl IIを用いて消化し、同様に消化したプラスミドpPJV7563内に挿入した。プラスミド1103のオープンリーディングフレームのヌクレオチド配列を、配列番号5に記載する。プラスミド1103がコードするアミノ酸配列を、配列番号6に記載する。
プラスミド1112(TERT240)。プラスミド1112を、PCRおよびシームレスクローニングの技法を使用して構築した。最初に、プラスミド1065から、PCRにより、プライマー、すなわち、f pmed TERT241Gおよびr TERT co# pMedを用いて、TERTのアミノ酸241〜1132をコードする遺伝子を増幅した。アンプリコンを、シームレスクローニングにより、pPJV7563のNhe I部位/Bgl II部位中にクローニングした。プラスミド1112のオープンリーディングフレームのヌクレオチド配列を、配列番号9に記載する。プラスミド1112がコードするアミノ酸配列を、配列番号10に記載する。
プラスミド1197(cMUC1)。プラスミド1197を、PCRおよびシームレスクローニングの技法を使用して構築した。最初に、プラスミド1027から、PCRにより、プライマー、すなわち、ID1197FおよびID1197Rを用いて、MUC1のアミノ酸22〜225、946〜1255をコードする遺伝子を増幅した。アンプリコンを、シームレスクローニングにより、pPJV7563のNhe I部位/Bgl II部位中にクローニングした。プラスミド1197のオープンリーディングフレームのヌクレオチド配列を、配列番号15に記載する。プラスミド1197がコードするアミノ酸配列を、配列番号16に記載する。
プラスミド1326(TERT343)。プラスミド1326を、PCRおよびシームレスクローニングの技法を使用して構築した。最初に、プラスミド1112から、PCRにより、プライマー、すなわち、TertΔ343−FおよびTert−Rを用いて、TERTのアミノ酸344〜1132をコードする遺伝子を増幅した。アンプリコンを、シームレスクローニングにより、pPJV7563のNhe I部位/Bgl II部位中にクローニングした。プラスミド1326のオープンリーディングフレームのヌクレオチド配列を、配列番号13に記載する。プラスミド1326がコードするアミノ酸配列を、配列番号14に記載する。
プラスミド1330(TERT541)。プラスミド1330を、PCRおよびシームレスクローニングの技法を使用して構築した。最初に、プラスミド1112から、PCRにより、プライマー、すなわち、TertΔ541−FおよびTert−Rを用いて、TERTのアミノ酸542〜1132をコードする遺伝子を増幅した。アンプリコンを、シームレスクローニングにより、pPJV7563のNhe I部位/Bgl II部位中にクローニングした。プラスミド1330のオープンリーディングフレームのヌクレオチド配列を、配列番号11に記載する。プラスミド1330がコードするアミノ酸配列を、配列番号12に記載する。
1B.二重抗原構築物
プラスミド1158(cMSLN−PT2A−Muc1)。プラスミド1158を、PCRおよびシームレスクローニングの技法を使用して構築した。最初に、PCRにより、プラスミド1103から、プライマー、すなわち、f pmed Nhe cMSLNおよびr PTV2A Bamh cMSLNを用いて、メソテリン前駆体のアミノ酸37〜597をコードする遺伝子を増幅した。PCRにより、プラスミド1027から、プライマー、すなわち、f1 PTV2A Muc、f2 PTV2Aおよびr pmed Bgl Mucを用いて、ヒトMucin−1のアミノ酸2〜225、946〜1255をコードする遺伝子を増幅した。PCRにより、cMSLNの3’末端およびMuc1の5’末端においてオーバーラップするPTV2A配列の付加を得た。アンプリコンを一緒にして混合し、シームレスクローニングにより、pPJV7563のNhe I部位/Bgl II部位中にクローニングした。プラスミド1158のオープンリーディングフレームのヌクレオチド配列を、配列番号23に記載する。プラスミド1158がコードするアミノ酸配列を、配列番号24に記載する。
プラスミド1159(Muc1−PT2A−cMSLN)。プラスミド1159を、PCRおよびシームレスクローニングの技法を使用して構築した。最初に、PCRにより、プラスミド1103から、プライマー、すなわち、f1 PTV2A cMSLN、f2 PTV2Aおよびr pmed Bgl cMSLNを用いて、メソテリン前駆体のアミノ酸37〜597をコードする遺伝子を増幅した。PCRにより、プラスミド1027から、プライマー、すなわち、f pmed Nhe Mucおよびr PTV2A Bamh Mucを用いて、ヒトMucin−1のアミノ酸2〜225、946〜1255をコードする遺伝子を増幅した。PCRにより、cMSLNの5’末端およびMuc1の3’末端においてオーバーラップするPTV2A配列の付加を得た。アンプリコンを一緒にして混合し、シームレスクローニングにより、pPJV7563のNhe I部位/Bgl II部位中にクローニングした。プラスミド1159のオープンリーディングフレームのヌクレオチド配列を、配列番号21に記載する。プラスミド1159がコードするアミノ酸配列を、配列番号22に記載する。
プラスミド1269(Muc1−Ter240)。プラスミド1269を、PCRおよびシームレスクローニングの技法を使用して構築した。最初に、PCRにより、プラスミド1112から、プライマー、すなわち、f tg link Ter240およびr pmed Bgl Ter240を用いて、ヒトテロメラーゼのアミノ酸241〜1132をコードする遺伝子を増幅した。PCRにより、プラスミド1027から、プライマー、すなわち、f pmed Nhe Mucおよびr link mucを用いて、ヒトMucin−1のアミノ酸2〜225、946〜1255をコードする遺伝子を増幅した。PCRにより、Tertの5’末端およびMuc1の3’末端においてオーバーラップするGGSGGリンカーの付加を得た。アンプリコンを一緒にして混合し、シームレスクローニングにより、pPJV7563のNhe I部位/Bgl II部位中にクローニングした。プラスミド1269のオープンリーディングフレームのヌクレオチド配列を、配列番号25に記載する。プラスミド1269がコードするアミノ酸配列を、配列番号26に記載する。
プラスミド1270(Muc1−ERB2A−Ter240)。プラスミド1270を、PCRおよびシームレスクローニングの技法を使用して構築した。最初に、PCRにより、プラスミド1112から、プライマー、すなわち、f2 ERBV2A、f1 ERBV2A Ter240およびr pmed Bgl Ter240を用いて、ヒトテロメラーゼのアミノ酸241〜1132をコードする遺伝子を増幅した。PCRにより、プラスミド1027から、プライマー、すなわち、f pmed Nhe Mucおよびr ERB2A Bamh Mucを用いて、ヒトMucin−1のアミノ酸2〜225、946〜1255をコードする遺伝子を増幅した。PCRにより、Tertの5’末端およびMuc1の3’末端においてオーバーラップするERBV2A配列の付加を得た。アンプリコンを一緒にして混合し、シームレスクローニングにより、pPJV7563のNhe I部位/Bgl II部位中にクローニングした。プラスミド1270のオープンリーディングフレームのヌクレオチド配列を、配列番号27に記載する。プラスミド1270がコードするアミノ酸配列を、配列番号28に記載する。
プラスミド1271(Ter240−ERB2A−Muc1)。プラスミド1271を、PCRおよびシームレスクローニングの技法を使用して構築した。最初に、PCRにより、プラスミド1112から、プライマー、すなわち、f pmed Nhe Ter240およびr ERB2A Bamh Ter240を用いて、ヒトテロメラーゼのアミノ酸241〜1132をコードする遺伝子を増幅した。PCRにより、プラスミド1027から、プライマー、すなわち、f2 ERBV2A、f1 ERBV2A Mucおよびr pmed Bgl Mucを用いて、ヒトMucin−1のアミノ酸2〜225、946〜1255をコードする遺伝子を増幅した。PCRにより、Tertの3’末端およびMuc1の5’末端においてオーバーラップするERBV2A配列の付加を得た。アンプリコンを一緒にして混合し、シームレスクローニングにより、pPJV7563のNhe I部位/Bgl II部位中にクローニングした。プラスミド1271のオープンリーディングフレームのヌクレオチド配列を、配列番号29に記載する。プラスミド1271がコードするアミノ酸配列を、配列番号30に記載する。
プラスミド1272(Ter240−T2A−cMSLN)。プラスミド1272を、PCRおよびシームレスクローニングの技法を使用して構築した。最初に、PCRにより、プラスミド1112から、プライマー、すなわち、f pmed Nhe Ter240およびr T2A Tert240を用いて、ヒトテロメラーゼのアミノ酸241〜1132をコードする遺伝子を増幅した。PCRにより、プラスミド1103から、プライマー、すなわち、f2 T2A、f1 T2A cMSLNおよびr pmed Bgl cMSLNを用いて、メソテリン前駆体のアミノ酸37〜597をコードする遺伝子を増幅した。PCRにより、Tertの3’末端およびcMSLNの5’末端においてオーバーラップするTAV2A配列の付加を得た。アンプリコンを一緒にして混合し、シームレスクローニングにより、pPJV7563のNhe I部位/Bgl II部位中にクローニングした。プラスミド1272のオープンリーディングフレームのヌクレオチド配列を、配列番号35に記載する。プラスミド1272がコードするアミノ酸配列を、配列番号36に記載する。
プラスミド1273(Tert240−cMSLN)。プラスミド1273を、PCRおよびシームレスクローニングの技法を使用して構築した。最初に、PCRにより、プラスミド1112から、プライマー、すなわち、f pmed Nhe Ter240およびr link Tert240を用いて、ヒトテロメラーゼのアミノ酸241〜1132をコードする遺伝子を増幅した。PCRにより、プラスミド1103から、プライマー、すなわち、f tert ink cMSLNおよびr pmed Bgl cMSLNを用いて、メソテリン前駆体のアミノ酸37〜597をコードする遺伝子を増幅した。PCRにより、Tertの3’末端およびcMSLNの5’末端においてオーバーラップするGGSGGリンカーの付加を得た。アンプリコンを一緒にして混合し、シームレスクローニングにより、pPJV7563のNhe I部位/Bgl II部位中にクローニングした。プラスミド1273のオープンリーディングフレームのヌクレオチド配列を、配列番号37に記載する。プラスミド1273がコードするアミノ酸配列を、配列番号38に記載する。
プラスミド1274(cMSLN−T2A−Tert240)。プラスミド1274を、PCRおよびシームレスクローニングの技法を使用して構築した。最初に、PCRにより、プラスミド1112から、プライマー、すなわち、f2 T2A、f1 T2A Tert240およびr pmed Bgl Ter240を用いて、ヒトテロメラーゼのアミノ酸241〜1132をコードする遺伝子を増幅した。PCRにより、プラスミド1103から、プライマー、すなわち、f pmed Nhe cMSLNおよびr T2A Bamh cMSLNを用いて、メソテリン前駆体のアミノ酸37〜597をコードする遺伝子を増幅した。PCRにより、Tertの5’末端およびcMSLNの3’末端においてオーバーラップするTAV2A配列の付加を得た。アンプリコンを一緒にして混合し、シームレスクローニングにより、pPJV7563のNhe I部位/Bgl II部位中にクローニングした。プラスミド1274のオープンリーディングフレームのヌクレオチド配列を、配列番号39に記載する。プラスミド1274がコードするアミノ酸配列を、配列番号40に記載する。
プラスミド1275(cMSLN−Tert240)。プラスミド1275を、PCRおよびシームレスクローニングの技法を使用して構築した。最初に、PCRにより、プラスミド1112から、プライマー、すなわち、f tg link Ter240およびr pmed Bgl Ter240を用いて、ヒトテロメラーゼのアミノ酸241〜1132をコードする遺伝子を増幅した。PCRにより、プラスミド1103から、プライマー、すなわち、f pmed Nhe cMSLNおよびr link cMSLNを用いて、メソテリン前駆体のアミノ酸37〜597をコードする遺伝子を増幅した。PCRにより、Tertの5’末端およびcMSLNの3’末端においてオーバーラップするGGSGGリンカーの付加を得た。アンプリコンを一緒にして混合し、シームレスクローニングにより、pPJV7563のNhe I部位/Bgl II部位中にクローニングした。プラスミド1275のオープンリーディングフレームのヌクレオチド配列を、配列番号41に記載する。プラスミド1275がコードするアミノ酸配列を、配列番号42に記載する。
プラスミド1286(cMuc1−ERB2A−Tert240)。プラスミド1286を、PCRおよびシームレスクローニングの技法を使用して構築した。最初に、PCRにより、プラスミド1112から、プライマー、すなわち、f2 ERBV2A、f1 ERBV2A Ter240およびr pmed Bgl Ter240を用いて、ヒトテロメラーゼのアミノ酸241〜1132をコードする遺伝子を増幅した。PCRにより、プラスミド1197から、プライマー、すなわち、f pmed Nhe cytMucおよびr ERB2A Bamh Mucを用いて、ヒトMucin−1のアミノ酸22〜225、946〜1255をコードする遺伝子を増幅した。PCRにより、Tertの5’末端およびMuc1の3’末端においてオーバーラップするERBV2A配列の付加を得た。アンプリコンを一緒にして混合し、シームレスクローニングにより、pPJV7563のNhe I部位/Bgl II部位中にクローニングした。プラスミド1286のオープンリーディングフレームのヌクレオチド配列を、配列番号31に記載する。プラスミド1286がコードするアミノ酸配列を、配列番号32に記載する。
プラスミド1287(Tert240−ERB2A−cMuc1)。プラスミド1287を、PCRおよびシームレスクローニングの技法を使用して構築した。最初に、PCRにより、プラスミド1112から、プライマー、すなわち、f pmed Nhe Ter240およびr ERB2A Bamh Ter240を用いて、ヒトテロメラーゼのアミノ酸241〜1132をコードする遺伝子を増幅した。PCRにより、プラスミド1197から、プライマー、すなわち、f2 ERBV2A、f1 ERBV2A cMucおよびr pmed Bgl Mucを用いて、ヒトMucin−1のアミノ酸22〜225、946〜1255をコードする遺伝子を増幅した。PCRにより、Tertの3’末端およびMuc1の5’末端においてオーバーラップするERBV2A配列の付加を得た。アンプリコンを一緒にして混合し、シームレスクローニングにより、pPJV7563のNhe I部位/Bgl II部位中にクローニングした。プラスミド1287のオープンリーディングフレームのヌクレオチド配列を、配列番号33に記載する。プラスミド1287がコードするアミノ酸配列を、配列番号34に記載する。
プラスミド1313(Muc1−EMC2A−cMSLN)。プラスミド1313を、PCRおよびシームレスクローニングの技法を使用して構築した。最初に、PCRにより、プラスミド1103から、プライマー、すなわち、EMCV_cMSLN_F−33、EMCV2A_F−34およびpMED_cMSLN_R−37を用いて、メソテリン前駆体のアミノ酸37〜597をコードする遺伝子を増幅した。PCRにより、プラスミド1027から、プライマー、すなわち、pMED_MUC1_F−31、EMCV2A_R−36およびEMCV_Muc1_R−35を用いて、ヒトMucin−1のアミノ酸2〜225、946〜1255をコードする遺伝子を増幅した。PCRにより、cMSLNの5’末端およびMuc1の3’末端においてオーバーラップするEMCV2A配列の付加を得た。アンプリコンを一緒にして混合し、シームレスクローニングにより、pPJV7563のNhe I部位/Bgl II部位中にクローニングした。プラスミド1313のオープンリーディングフレームのヌクレオチド配列を、配列番号19に記載する。プラスミド1313がコードするアミノ酸配列を、配列番号20に記載する。
プラスミド1316(cMSLN−EMC2A−Muc1)。プラスミド1316を、PCRおよびシームレスクローニングの技法を使用して構築した。最初に、PCRにより、プラスミド1103から、プライマー、すなわち、f pmed Nhe cMSLNおよびr EM2A Bamh cMSLNを用いて、ヒトメソテリン前駆体のアミノ酸37〜597をコードする遺伝子を増幅した。PCRにより、プラスミド1027から、プライマー、すなわち、f1 EM2A Muc、f2 EMCV2Aおよびr pmed Bgl Mucを用いて、ヒトMucin−1のアミノ酸2〜225、946〜1255をコードする遺伝子を増幅した。PCRにより、cMSLNの3’末端およびMuc1の5’末端においてオーバーラップするEMCV2A配列の付加を得た。アンプリコンを一緒にして混合し、シームレスクローニングにより、pPJV7563のNhe I部位/Bgl II部位中にクローニングした。プラスミド1316のオープンリーディングフレームのヌクレオチド配列を、配列番号17に記載する。プラスミド1316がコードするアミノ酸配列を、配列番号18に記載する。
1C.三重抗原構築物
プラスミド1317(Muc1−EMC2A−cMSLN−T2A−Tert240)。プラスミド1317を、PCRおよびシームレスクローニングの技法を使用して構築した。最初に、PCRにより、プラスミド1313から、プライマー、すなわち、f pmed Nhe Mucおよびr MSLN 1051−1033を用いて、ヒトMucin−1のアミノ酸2〜225、946〜1255、EMCV2Aペプチドおよびメソテリン前駆体のアミノ末端の半分をコードする遺伝子を増幅した。PCRにより、プラスミド1274から、プライマー、すなわち、f MSLN 1028−1051およびr pmed Bgl Ter240を用いて、メソテリン前駆体のカルボキシ末端の半分、TAV2Aペプチドおよびヒトテロメラーゼのアミノ酸241〜1132をコードする遺伝子を増幅した。部分的にオーバーラップするアンプリコンを、Dpn Iを用いて消化し、一緒にして混合し、シームレスクローニングにより、pPJV7563のNhe I部位/Bgl II部位中にクローニングした。プラスミド1317のオープンリーディングフレームのヌクレオチド配列を、配列番号43に記載する。プラスミド1317がコードするアミノ酸配列を、配列番号44に記載する。
プラスミド1318(Muc1−ERB2A−Tert240−T2A−cMSLN)。プラスミド1318を、PCRおよびシームレスクローニングの技法を使用して構築した。最初に、PCRにより、プラスミド1270から、プライマー、すなわち、f pmed Nhe Mucおよびr tert 1602−1579を用いて、ヒトMucin−1のアミノ酸2〜225、946〜1255、ERBV2Aペプチドおよびヒトテロメラーゼのアミノ末端の半分をコードする遺伝子を増幅した。PCRにより、プラスミド1272から、プライマー、すなわち、f tert 1584−1607およびr pmed Bgl cMSLNを用いて、テロメラーゼのカルボキシ末端の半分、TAV2Aペプチドおよびヒトメソテリン前駆体のアミノ酸37〜597をコードする遺伝子を増幅した。部分的にオーバーラップするアンプリコンを、Dpn Iを用いて消化し、一緒にして混合し、シームレスクローニングにより、pPJV7563のNhe I部位/Bgl II部位中にクローニングした。プラスミド1318のオープンリーディングフレームのヌクレオチド配列を、配列番号45に記載する。プラスミド1318がコードするアミノ酸配列を、配列番号46に記載する。
プラスミド1319(cMSLN−EMC2A−Muc1−ERB2A−Tert240)。プラスミド1319を、PCRおよびシームレスクローニングの技法を使用して構築した。最初に、PCRにより、プラスミド1316から、プライマー、すなわち、f pmed Nhe cMSLNおよびr muc 986−963を用いて、ヒトメソテリン前駆体のアミノ酸37〜597、EMCV2AペプチドおよびヒトMucin−1のアミノ末端の半分をコードする遺伝子を増幅した。PCRにより、プラスミド1270から、プライマー、すなわち、f Muc 960−983およびr pmed Bgl Ter240を用いて、Mucin−1のカルボキシ末端の半分、ERBV2Aペプチドおよびヒトテロメラーゼのアミノ酸241〜1132をコードする遺伝子を増幅した。部分的にオーバーラップするアンプリコンを、Dpn Iを用いて消化し、一緒にして混合し、シームレスクローニングにより、pPJV7563のNhe I部位/Bgl II部位中にクローニングした。プラスミド1319のオープンリーディングフレームのヌクレオチド配列を、配列番号47に記載する。プラスミド1319がコードするアミノ酸配列を、配列番号48に記載する。
プラスミド1320(cMSLN−T2A−Tert240−ERB2A−Muc1)。プラスミド1320を、PCRおよびシームレスクローニングの技法を使用して構築した。最初に、PCRにより、プラスミド1274から、プライマー、すなわち、f pmed Nhe cMSLNおよびr tert 1602−1579を用いて、ヒトメソテリン前駆体のアミノ酸37〜597、TAV2Aペプチドおよびヒトテロメラーゼのアミノ末端の半分をコードする遺伝子を増幅した。PCRにより、プラスミド1271から、プライマー、すなわち、f tert 1584−1607およびr pmed Bgl Mucを用いて、テロメラーゼのカルボキシ末端の半分、ERBV2AペプチドおよびヒトMucin−1のアミノ酸2〜225、946〜1255をコードする遺伝子を増幅した。部分的にオーバーラップするアンプリコンを、Dpn Iを用いて消化し、一緒にして混合し、シームレスクローニングにより、pPJV7563のNhe I部位/Bgl II部位中にクローニングした。プラスミド1320のオープンリーディングフレームのヌクレオチド配列を、配列番号49に記載する。プラスミド1320がコードするアミノ酸配列を、配列番号50に記載する。
プラスミド1321(Tert240−T2A−cMSLN−EMC2A−Muc1)。プラスミド1321を、PCRおよびシームレスクローニングの技法を使用して構築した。最初に、PCRにより、プラスミド1112から、プライマー、すなわち、f pmed Nhe Ter240およびr tert 1602−1579を用いて、ヒトテロメラーゼのアミノ末端の半分をコードする遺伝子を増幅した。PCRにより、プラスミド1272から、プライマー、すなわち、f tert 1584−1607およびr MSLN 1051−1033を用いて、テロメラーゼのカルボキシ末端の半分、TAV2Aペプチドおよびヒトメソテリン前駆体のアミノ末端の半分をコードする遺伝子を増幅した。PCRにより、プラスミド1316から、プライマー、すなわち、f MSLN 1028−1051およびr pmed Bgl Mucを用いて、ヒトメソテリン前駆体のカルボキシ末端の半分、EMCV2AペプチドおよびヒトMucin−1のアミノ酸2〜225、946〜1255をコードする遺伝子を増幅した。3つの部分的にオーバーラップするアンプリコンを一緒にして混合し、シームレスクローニングにより、pPJV7563のNhe I部位/Bgl II部位中にクローニングした。プラスミド1321のオープンリーディングフレームのヌクレオチド配列を、配列番号51に記載する。プラスミド1321がコードするアミノ酸配列を、配列番号52に記載する。
プラスミド1322(Tert240−ERB2A−Muc1−EMC2A−cMSLN)。プラスミド1322を、PCRおよびシームレスクローニングの技法を使用して構築した。最初に、PCRにより、プラスミド1271から、プライマー、すなわち、f pmed Nhe Ter240およびr muc 986−963を用いて、ヒトテロメラーゼのアミノ酸241〜1132、ERBV2AペプチドおよびヒトMucin−1のアミノ末端の半分をコードする遺伝子を増幅した。PCRにより、プラスミド1313から、プライマー、すなわち、f Muc 960−983およびr pmed Bgl cMSLNを用いて、Mucin−1のカルボキシ末端の半分、EMCV2Aペプチドおよびヒトメソテリン前駆体のアミノ酸37〜597をコードする遺伝子を増幅した。部分的にオーバーラップするアンプリコンを、Dpn Iを用いて消化し、一緒にして混合し、シームレスクローニングにより、pPJV7563のNhe I部位/Bgl II部位中にクローニングした。プラスミド1322のオープンリーディングフレームのヌクレオチド配列を、配列番号53に記載する。プラスミド1322がコードするアミノ酸配列を、配列番号54に記載する。
プラスミド1351(Muc1−EMC2A−cMSLN−T2A−Tert541)。プラスミド1351を、PCRおよびシームレスクローニングの技法を使用して構築した。最初に、PCRにより、プラスミド1313から、プライマー、すなわち、f pmed Nhe Mucおよびr T2A Bamh cMSLNを用いて、ヒトMucin−1のアミノ酸2〜225、946〜1255、EMCV2Aペプチドおよびヒトメソテリン前駆体をコードする遺伝子を増幅した。PCRにより、プラスミド1330から、プライマー、すなわち、f1 T2A Tert d541、f2 T2Aおよびr pmed Bgl Ter240を用いて、TAV2Aペプチドおよびヒトテロメラーゼのアミノ酸541〜1132をコードする遺伝子を増幅した。部分的にオーバーラップするアンプリコンを、Dpn Iを用いて消化し、一緒にして混合し、シームレスクローニングにより、pPJV7563のNhe I部位/Bgl II部位中にクローニングした。プラスミド1351のオープンリーディングフレームのヌクレオチド配列を、配列番号55に記載する。プラスミド1351がコードするアミノ酸配列を、配列番号56に記載する。
プラスミド1352(cMSLN−EMC2A−Muc1−ERB2A−Tert541)。プラスミド1352を、PCRおよびシームレスクローニングの技法を使用して構築した。最初に、PCRにより、プラスミド1316から、プライマー、すなわち、f pmed Nhe cMSLNおよびr ERB2A Bamh Mucを用いて、ヒトメソテリン前駆体のアミノ酸37〜597、EMCV2AペプチドおよびヒトMucin−1をコードする遺伝子を増幅した。PCRにより、プラスミド1330から、プライマー、すなわち、f1 ERBV2A Tert d541、f2 ERBV2Aおよびr pmed Bgl Ter240を用いて、ERBV2Aペプチドおよびヒトテロメラーゼのアミノ酸541〜1132をコードする遺伝子を増幅した。部分的にオーバーラップするアンプリコンを、Dpn Iを用いて消化し、一緒にして混合し、シームレスクローニングにより、pPJV7563のNhe I部位/Bgl II部位中にクローニングした。プラスミド1352のオープンリーディングフレームのヌクレオチド配列を、配列番号57に記載する。プラスミド1352がコードするアミノ酸配列を、配列番号58に記載する。
プラスミド1353(cMSLN−T2A−Tert541−ERB2A−Muc1)。プラスミド1353を、PCRおよびシームレスクローニングの技法を使用して構築した。最初に、PCRにより、プラスミド1103から、プライマー、すなわち、f pmed Nhe cMSLN、r2 T2Aおよびr T2A Bamh cMSLNを用いて、ヒトメソテリン前駆体のアミノ酸37〜597をコードする遺伝子を増幅した。PCRにより、プラスミド1271から、プライマー、すなわち、f1 T2A Tert d541およびr pmed Bgl Mucを用いて、TAV2Aペプチド、ヒトテロメラーゼのアミノ酸541〜1132、ERBV2AペプチドおよびヒトMucin−1のアミノ酸2〜225、946〜1255をコードする遺伝子を増幅した。部分的にオーバーラップするアンプリコンを、Dpn Iを用いて消化し、一緒にして混合し、シームレスクローニングにより、pPJV7563のNhe I部位/Bgl II部位中にクローニングした。プラスミド1353のオープンリーディングフレームのヌクレオチド配列を、配列番号59に記載する。プラスミド1353がコードするアミノ酸配列を、配列番号60に記載する。
プラスミド1354(Muc1−EMC2A−cMSLN−T2A−Tert342)。プラスミド1354を、PCRおよびシームレスクローニングの技法を使用して構築した。最初に、PCRにより、プラスミド1313から、プライマー、すなわち、f pmed Nhe Mucおよびr T2A Bamh cMSLNを用いて、ヒトMucin−1のアミノ酸2〜225、946〜1255、EMCV2Aペプチドおよびヒトメソテリン前駆体をコードする遺伝子を増幅した。PCRにより、プラスミド1326から、プライマー、すなわち、f1 T2A Tert d342、f2 T2Aおよびr pmed Bgl Ter240を用いて、TAV2Aペプチドおよびヒトテロメラーゼのアミノ酸342〜1132をコードする遺伝子を増幅した。部分的にオーバーラップするアンプリコンを、Dpn Iを用いて消化し、一緒にして混合し、シームレスクローニングにより、pPJV7563のNhe I部位/Bgl II部位中にクローニングした。プラスミド1354のオープンリーディングフレームのヌクレオチド配列を、配列番号61に記載する。プラスミド1354がコードするアミノ酸配列を、配列番号62に記載する。
プラスミド1355(cMSLN−EMC2A−Muc1−ERB2A−Tert342)。プラスミド1355を、PCRおよびシームレスクローニングの技法を使用して構築した。最初に、PCRにより、プラスミド1316から、プライマー、すなわち、f pmed Nhe cMSLNおよびr ERB2A Bamh Mucを用いて、ヒトメソテリン前駆体のアミノ酸37〜597、EMCV2AペプチドおよびヒトMucin−1をコードする遺伝子を増幅した。PCRにより、プラスミド1326から、プライマー、すなわち、f1 ERBV2A Ter d342、f2 ERBV2Aおよびr pmed Bgl Ter240を用いて、ERBV2Aペプチドおよびヒトテロメラーゼのアミノ酸342〜1132をコードする遺伝子を増幅した。部分的にオーバーラップするアンプリコンを、Dpn Iを用いて消化し、一緒にして混合し、シームレスクローニングにより、pPJV7563のNhe I部位/Bgl II部位中にクローニングした。プラスミド1355のオープンリーディングフレームのヌクレオチド配列を、配列番号63に記載する。プラスミド1355がコードするアミノ酸配列を、配列番号64に記載する。
プラスミド1356(cMSLN−T2A−Tert342−ERB2A−Muc1)。プラスミド1356を、PCRおよびシームレスクローニングの技法を使用して構築した。最初に、PCRにより、プラスミド1103から、プライマー、すなわち、f pmed Nhe cMSLN、r2 T2Aおよびr T2A Bamh cMSLNを用いて、ヒトメソテリン前駆体のアミノ酸37〜597をコードする遺伝子を増幅した。PCRにより、プラスミド1271から、プライマー、すなわち、f1 T2A Tert d342およびr pmed Bgl Mucを用いて、TAV2Aペプチド、ヒトテロメラーゼのアミノ酸342〜1132、ERBV2AペプチドおよびヒトMucin−1のアミノ酸2〜225、946〜1255をコードする遺伝子を増幅した。部分的にオーバーラップするアンプリコンを、Dpn Iを用いて消化し、一緒にして混合し、シームレスクローニングにより、pPJV7563のNhe I部位/Bgl II部位中にクローニングした。結果として得られたクローン第3番が、意図しない一塩基変異を含有した。突然変異を矯正するために、クローン第3番を鋳型として使用して、PCRおよびシームレスクローニングを反復した。PCRにより、クローン第3番から、プライマー、すなわち、f pmed Nhe cMSLNおよびr tert 1602−1579を用いて、ヒトメソテリン前駆体のアミノ酸37〜597、TAV2Aペプチドおよびヒトテロメラーゼのアミノ末端の半分をコードする遺伝子を増幅した。PCRにより、クローン第3番から、プライマー、すなわち、f tert 1584−1607およびr pmed Bgl Mucを用いて、テロメラーゼのカルボキシ末端の半分、ERBV2AペプチドおよびヒトMucin−1のアミノ酸2〜225、946〜1255をコードする遺伝子を増幅した。部分的にオーバーラップするアンプリコンを、Dpn Iを用いて消化し、一緒にして混合し、シームレスクローニングにより、pPJV7563のNhe I部位/Bgl II部位中にクローニングした。プラスミド1356のオープンリーディングフレームのヌクレオチド配列を、配列番号65に記載する。プラスミド1356がコードするアミノ酸配列を、配列番号66に記載する。
1D.ベクターの構築
単一抗原構築物または多抗原構築物を発現させるためのベクターを、チンパンジーアデノウイルスAd68のゲノム配列から構築した。3つのバージョンの、導入遺伝子を有しないAdC68骨格(「空ベクター」と呼ばれる)を、in silicoで設計した。ベクターは、ウイルスを複製不全にし、導入遺伝子を挿入する余地を生み出すための、ウイルス内に遺伝子工学により作製したE1およびE3の欠失の程度においてのみ異なった。ベクターAdC68WおよびAdC68Xは、国際特許出願WO2015/063647A1に記載された。塩基456〜3256および27476〜31831の欠失を担持するベクターAdC68Yは、AdC68Xに比して生育特性の改善を示し、AdC68Wよりも高い導入遺伝子運搬能力を有するように遺伝子工学により作製した。3つの空ベクターは全て、in vitroでのオリゴ合成、およびその後の、大腸菌(Escherichia coli)(E.coli)および酵母中での組換え媒介型中間体アセンブリ(recombination−mediated intermediate assembly)を利用する多段階プロセスにおいて生化学的に合成した。PCRにより、実施例に記載したプラスミドから、多様な免疫原性TAAポリペプチドをコードするオープンリーディングフレームを増幅した。次いで、オープンリーディングフレームを、空ベクターのバクミド内に挿入した。組換えウイルスのゲノムを、バクミドから、PacIを用いる消化により放出させ、直鎖状の核酸を、E1補完接着性HEK293細胞株内にトランスフェクトした。目に見える細胞変性効果およびアデノウイルスの増殖巣の形成に基づいて、凍結/解凍を複数回行って、細胞からウイルスを放出させることによって、培養物を収集した。標準的な技法により、ウイルスを増幅および精製した。
(実施例2)
免疫原性MUC1の単一抗原構築物の免疫原性
HLA−A2/DR1マウスにおける研究
研究デザイン。12匹の雌雄混合HLA−A2/DR1マウスを、(配列番号8の膜結合型免疫原性MUC1ポリペプチドをコードする)DNA構築物プラスミド1027、または(配列番号16の細胞質免疫原性MUC1ポリペプチドをコードする)プラスミド1197を用いて、PMED法を使用して、第0日にプライムし、第14日にブーストした。第21日に、マウスを屠殺し、脾細胞を、インターフェロン−ガンマ(IFN−γ)エリスポット(ELISpot)および細胞内サイトカイン染色(ICS)アッセイにおいて、MUC1特異的細胞免疫原性について評価した。
粒子媒介型表皮送達(PMED)。PMEDは、核酸ワクチンを動物またはヒトに投与する無針の方法である。PMEDシステムでは、微小金粒子上にDNAを沈殿させ、次いで、これらの粒子を、ヘリウムガスにより表皮内に高圧噴霧する。ND10は、単回使用デバイスであり、金粒子を送達するために、内部シリンダーからの加圧ヘリウムを使用し、X15は、反復使用送達デバイスであり、金粒子を送達するために、高圧ホースを介してX15に接続されている外部ヘリウムタンクを使用する。これらのデバイスの両方を研究において使用して、MUC1のDNAプラスミドを送達した。金粒子の直径は通常、1〜3μmであり、1mgの金粒子当たり、2μgの抗原DNAプラスミドを含有するように、粒子を製剤化した。(Sharpe,M.ら:P.Protection of mice from H5N1 influenza challenge by prophylactic DNA vaccination using particle mediated epidermal delivery、Vaccine、2007、25(34):6392〜98;Roberts LKら:Clinical safety and efficacy of a powdered Hepatitis B nucleic acid vaccine delivered to the epidermis by a commercial prototype device、Vaccine、2005;23(40):4867〜78)。
IFN−γELISpotアッセイ。IFN−γELISpotプレート中で、個々の動物から得られた脾細胞を、個別のAg特異的ペプチド(各ペプチドについて、2〜10μg/ml、2.5〜5×10個の細胞/ウエル)、または(11個のアミノ酸がオーバーラップし、Ag特異的アミノ酸配列全体を包含する)15アミノ酸長のAg特異的ペプチドのプール(各ペプチドについて、2〜5μg/ml、1.25〜5×10個の細胞/ウエル)と三つ組で共インキュベートした(ペプチドのプールの表(表18)、および表15〜17もまた参照されたい)。製造元の使用説明に従って、プレートを、37℃、5%のCOで約16時間インキュベートし、次いで、洗浄し、展開した。CTLリーダーを用いて、IFN−γスポット形成細胞(SFC)の数を計数した。三つ組の平均を計算し、ペプチドを含有しない陰性対照のウエルの応答を減じた。次いで、SFCのカウント数を正規化して、1×10個の脾細胞当たりの応答を記載した。表中の抗原特異的応答は、Ag特異的ペプチドまたはAg特異的ペプチドのプールに対する応答の総和を表す。
ICSアッセイ。U底96ウエルプレート型組織培養プレート中で、個々の動物から得られた脾細胞を、H−2b拘束性、HLA−A2拘束性もしくはHLA−A24拘束性Ag特異的ペプチド(各ペプチドについて、5〜10μg/ml、1〜2×10個の脾細胞/ウエル)、または(11個のアミノ酸がオーバーラップし、Ag特異的アミノ酸配列全体を包含する)15アミノ酸長のAg特異的ペプチドのプール(各ペプチドについて、2〜5μg/ml、1〜2×10個の脾細胞/ウエル)と共インキュベートした(ペプチドのプールの表(表18)、および表15〜17もまた参照されたい)。プレートを、37℃、5%のCOで約16時間インキュベートした。次いで、細胞を、CD8T細胞からの細胞内IFN−γの発現を検出するために染色し、固定した。フローサイトメーター上で、細胞を捕らえた。各動物について、データを、ペプチドを含有しない陰性対照のウエル中で得られた応答を減じた後の、ペプチドAg特異的またはペプチドプールAg特異的IFN−γCD8T細胞の頻度として提示した。
サンドイッチELISAアッセイ。標準的なサンドイッチELISAアッセイを、Tecan Evo、Biomek FxおよびBioTek405Select TS自動装置を使用して行った。384ウエルマイクロプレート(平坦なウエル、高い結合性)を、1×PBS中の1.0μg/mLのヒトMUC1タンパク質またはヒトMSLNタンパク質(抗原)を用いて、25μl/ウエルでコートし、4℃で一晩インキュベートした。翌朝、プレートを、0.05%のTween20を有するPBS(PBS−T)中の5%のFBSを用いて、RTで1時間ブロックした。96U底ウエルプレート中のPBS−T中で、マウス血清を、1/100の開始希釈度に調製した。Tecan Evoにより、PBS−T中で、9つの希釈度増加点にわたり、1/2対数段階希釈を行い、続いて、96ウエルプレートから、25μl/ウエルの希釈した血清を、384ウエルプレートにスタンプした。384ウエルプレートを、振とう器上、600RPMにて、RTで1時間インキュベートし、次いで、BioTek EL405Select TSプレート洗浄機を使用して、プレートを、PBS−T中で4回洗浄した。二次マウス抗IgG−HRP抗体を妥当な希釈度に希釈し、Biomek Fxにより、384ウエルプレート内に、25μl/ウエルでスタンプし、振とう器上、600RPMにて、RTで1時間インキュベートし、続いて、洗浄を5回反復した。Biomek Fxを使用して、プレートを、25μl/ウエルのRT TMB基質でスタンプし、暗所にて、RTで30分間インキュベートし、続いて、25μl/ウエルの酸、すなわち、1NのHSOをスタンプして、酵素反応を停止した。Molecular DevicesのSpectramax340PC/384Plus上で、プレートを、450nmの波長で読み取った。データを、1.0のODにおける計算タイターとして報告し、検出限界は99.0であった。各プレート中で、市販の抗原特異的モノクローナル抗体を、陽性対照として使用して、プレート間で変動する性能を追跡し、無関係なワクチンを接種したマウスの血清を、陰性対照として使用し、PBS−Tのみのウエルを使用して、非特異的結合のバックグランドをモニターした。表中のタイターは、個々の動物から惹起された抗原特異的IgGのタイターを表す。
結果。表1に、MUC1ペプチドライブラリーに由来するペプチドのプール(表15および18もまた参照されたい)またはMUC1ペプチドのaa516〜530それぞれと共に培養したHLA−A2/DR1脾細胞から得られたELISpotおよびICSのデータを示す。第3列中の数は、MUC1ペプチドのプールを用いる再刺激およびバックグランドの減算の後の、(IFN−γスポットの数)/(10個の脾細胞)を表す。第4列中の数は、MUC1ペプチドのaa516〜530を用いる再刺激およびバックグランドの減算の後の、IFN−γであるCD8T細胞の頻度を表す。陽性の応答を、>100のSFC、および>0.05%のIFN−γCD8T細胞の頻度を有する場合と定義する。表1に示すように、上記の実施例1Aに記載した完全長膜結合型MUC1構築物(プラスミド1027)および細胞質MUC1構築物(プラスミド1197)を用いて作製した免疫原性MUC1ポリペプチドは、HLA−A2拘束性MUC1ペプチドのaa516〜530に特異的なCD8T細胞応答を含めた、MUC1特異的T細胞応答を誘発することが可能である。細胞質MUC1抗原のフォーマットが、最も強力なT細胞応答を誘発した。重要なことに、MUC1ペプチドのaa516〜530に対するがん患者に由来するT細胞応答が、in vitroでの抗腫瘍性の効能と相関することが示されており(Jochems Cら、Cancer Immunol Immunother(2014)、63:161〜174)、このことは、この特定のエピトープに対する細胞性応答を高めることの重要性を実証している。
Figure 2021061851
HLA−A24マウスにおける研究
研究デザイン。雌雄混合HLA−A24マウスを、DNA構築物プラスミド1027を用いて、PMED投与により、第0日にプライムし、第14、28および42日にブーストした。第21日に、マウスを屠殺し、脾細胞を、MUC1特異的細胞免疫原性について評価した(ELISpot)。
結果。表2に、MUC1ペプチドライブラリーに由来するペプチドのプールと共に培養したHLA−A24脾細胞から得られたELISpotのデータを示す(ペプチドのプールの表(表18)、および表15もまた参照されたい)。第3列中の数は、MUC1ペプチドのプールを用いる再刺激およびバックグランドの減算の後の、(IFN−γスポットの数)/(10個の脾細胞)を表す。肉太の書体で示す数は、少なくとも1つの試験したペプチドのプールが、多過ぎて計数できなかったことを示し、したがって、本当の数値は、少なくとも記述した値である。陽性の応答を、>100のSFCを有する場合と定義する。表2に示すように、膜結合型MUC1構築物は、MUC1特異的細胞性応答を誘発することが可能である。
Figure 2021061851
サルにおける研究
研究デザイン。14頭の中国産カニクイマカクザルを、細胞質MUC1抗原(プラスミド1197)または完全長膜結合型MUC1抗原(プラスミド1027)をコードするAdC68Wアデノウイルスベクターを用いて、2×1011個のウイルス粒子で、両側筋肉内注射(合計1mL)によりプライムした。29日後に、電気穿孔により両側筋肉内送達する(合計2mL)、細胞質MUC1抗原または完全長膜結合型MUC1抗原をコードするDNAを用いて、動物をブーストした。抗CTLA−4を、第1日(32mg)および第29日(50mg)に皮下投与した。最後の免疫化から14日後に、動物から採血し、MUC1に特異的な細胞性応答(ELISpot、ICS)および液性応答(ELISA)をそれぞれ評価するために、PBMCおよび血清を単離した。
NHP特異的免疫アッセイ。
ELISpotアッセイ。IFN−γELISpotプレート中で、個々の動物から得られたPBMCを、(11個のアミノ酸がオーバーラップし、Ag特異的アミノ酸配列全体を包含する)15アミノ酸長のAg特異的ペプチドのプール(各ペプチドについて、2μg/ml、4×10個の細胞/ウエル)と二つ組で共インキュベートした(ペプチドのプールの表(表18)、および表15〜17もまた参照されたい)。製造元の使用説明に従って、プレートを、37℃、5%のCOで約16時間インキュベートし、次いで、洗浄し、展開した。CTLリーダーを用いて、IFN−γスポット形成細胞(SFC)の数を計数した。二つ組の平均を計算し、ペプチドを含有しない陰性対照のウエルの応答を減じた。次いで、SFCのカウント数を正規化して、1×10個のPBMC当たりの応答を記載した。表中の抗原特異的応答は、Ag特異的ペプチドのプールに対する応答の総和を表す。
ICSアッセイ。U底96ウエルプレート型組織培養プレート中で、個々の動物から得られたPBMCを、(11個のアミノ酸がオーバーラップし、ネイティブ完全長MUC1アミノ酸配列全体を包含する)15アミノ酸長のMUC1ペプチドのプール(表15を参照されたい)(各ペプチドについて、2μg/ml、1.5〜2×10個のPBMC/ウエル)と共インキュベートする。プレートを、37℃、5%のCOで約16時間インキュベートし、次いで、CD8T細胞からの細胞内IFN−γの発現を検出するために染色した。固定の後に、フローサイトメーター上で、細胞を捕らえた。結果を、個々の動物について、ペプチドを含有しない陰性対照のウエル中で得られた応答を減じ、1×10個のCD8T細胞に対して正規化した後の、MUC1、MSLNまたはTERTに特異的なIFN−γCD8T細胞の数として提示する。
サンドイッチELISAアッセイ。標準的なサンドイッチELISAアッセイを、Tecan Evo、Biomek FxおよびBioTek405Select TS自動装置を使用して行った。384ウエルマイクロプレート(平坦なウエル、高い結合性)を、1×PBS中の1.0μg/mLのヒトMUC1タンパク質またはヒトMSLNタンパク質(抗原)を用いて、25μl/ウエルでコートし、4℃で一晩インキュベートした。翌朝、プレートを、0.05%のTween20を有するPBS(PBS−T)中の5%のFBSを用いて、RTで1時間ブロックした。96U底ウエルプレート中のPBS−T中で、中国産カニクイマカクザル(Chinese cynomolgus macaques)から得られた血清を、1/100の開始希釈度に調製した。Tecan Evoにより、PBS−T中で、9つの希釈度増加点にわたり、1/2対数段階希釈を行い、続いて、96ウエルプレートから、25μl/ウエルの希釈した血清を、384ウエルプレートにスタンプした。384ウエルプレートを、振とう器上、600RPMにて、RTで1時間インキュベートし、次いで、BioTek EL405Select TSプレート洗浄機を使用して、プレートを、PBS−T中で4回洗浄した。カニクイザルIgGと交差反応する二次アカゲザル抗IgG−HRP抗体を、妥当な希釈度に希釈し、Biomek Fxにより、384ウエルプレート内に、25μl/ウエルでスタンプし、振とう器上、600RPMにて、RTで1時間インキュベートし、続いて、洗浄を5回反復した。Biomek Fxを使用して、プレートを、25μl/ウエルのRT TMB基質でスタンプし、暗所にて、RTで30分間インキュベートし、続いて、25μl/ウエルの酸、すなわち、1NのHSOをスタンプして、酵素反応を停止した。Molecular DevicesのSpectramax340PC/384Plus上で、プレートを、450nmの波長で読み取った。データを、1.0のODにおける計算タイターとして報告し、検出限界は99.0であった。各プレート中で、市販の抗原特異的モノクローナル抗体を、陽性対照として使用して、プレート間で変動する性能を追跡し、無関係なワクチンを接種したマウスの血清を、陰性対照として使用し、PBS−Tのみのウエルを使用して、非特異的結合のバックグランドをモニターした。表中のタイターは、個々の動物から惹起された抗原特異的IgGのタイターを表す。
結果。表3に、MUC1ペプチドライブラリーに由来するペプチドのプールと共に培養した中国産カニクイマカクザルのPBMCから得られたELISpotおよびICSのデータ(ペプチドのプールの表(表18)、および表15もまた参照されたい)、ならびに中国産カニクイマカクザルの血清から得られたELISAのデータを示す。第3列中の数は、MUC1ペプチドのプールを用いる再刺激およびバックグランドの減算の後の、(IFN−γスポットの数)/(10個のPBMC)を表す。第4列中の数は、MUC1ペプチドのプールを用いる再刺激およびバックグランドの減算の後の、(IFN−γCD8T細胞の数)/(10個のCD8T細胞)を表す。第5列中の数は、抗MUC1IgGタイター(光学密度(O.D)=1、検出限界(L.O.D)=99.0)を表す。陽性の応答を、>50のSFC、>50個である、(IFN−γCD8T細胞)/(1×10個のCD8T細胞)、および>99のIgGタイターを有する場合と定義する。表3に示すように、細胞質MUC1構築物(1197)およびネイティブ完全長膜結合型MUC1構築物(1027)を用いて作製した免疫原性MUC1ポリペプチドは、MUC1に特異的なTおよびB細胞応答を誘発することが可能である。ネイティブ完全長膜結合型MUC1構築物(1027)は、全般的に最良の、MUC1に特異的な細胞性および液性応答を誘発することが示された。
Figure 2021061851
(実施例3)
MSLN単一抗原構築物の免疫原性
Pasteur(HLA−A2/DR1)マウスにおける免疫応答研究
研究デザイン。12匹の雌HLA−A2/DR1マウスを、膜結合型MSLN抗原(プラスミド1084)または細胞質MSLN抗原(プラスミド1103)をコードするAdC68Wアデノウイルスベクターを用いて、1×1010個のウイルス粒子で、筋肉内注射(50μl)によりプライムした。28日後に、動物を、免疫原性MSLNポリペプチドをコードするDNA単一抗原構築物を用いて、実施例2の記載に従ってPMED法を使用してブーストした。7日後に、IFN−γELISpotおよびICSアッセイにおいて、抗原特異的T細胞応答を測定した。
結果。表4に、MSLNペプチドライブラリーに由来するペプチドのプール(ペプチドのプールの表(表18)、および表16もまた参照されたい)またはMSLNペプチドのaa50〜64、aa102〜116およびaa542〜556それぞれと共に培養したHLA−A2/DR1脾細胞から得られたELISpotおよびICSのデータを示す。第3列中の数は、MSLNペプチドのプールを用いる再刺激およびバックグランドの減算の後の、(IFN−γスポットの数)/(10個の脾細胞)を表す。第4列中の数は、MSLNペプチドのaa50〜64、aa102〜116およびaa542〜556を用いる再刺激ならびにバックグランドの減算の後の、IFN−γであるCD8T細胞の頻度を表す。陽性の応答を、>100のSFC、および>0.05%のIFN−γCD8T細胞の頻度を有する場合と定義する。表4に示すように、上記の実施例1Aに記載した膜結合型MSLN構築物(1084)および細胞質MSLN構築物(1103)を用いて作製した免疫原性MSLNポリペプチドは、MSLN特異的T細胞応答を誘発することが可能である。細胞質MSLN抗原のフォーマットが、最も強力なMSLN特異的T細胞応答を誘発した。
Figure 2021061851
HLA A24マウスにおける免疫応答研究
研究デザイン。12匹の雌雄混合HLA−A24マウスを、各ワクチン接種の間に2週間の間隔を置くプライム/ブースト/ブースト/ブーストのレジメンにおいて、膜結合型MSLN DNA構築物(1084)または細胞質MSLN DNA構築物(1103)を用いて、PMED法を使用して免疫化した。最後の免疫化から7日後に、IFN−γELISpotおよびICSアッセイにおいて、MSLN特異的T細胞応答を測定した。
結果。表5に、MSLNペプチドライブラリーに由来するペプチドのプール(ペプチドのプールの表(表18)、および表16もまた参照されたい)またはMSLNペプチドのaa130〜144およびaa230〜244それぞれと共に培養したHLA−A24脾細胞から得られたELISpotおよびICSのデータを示す。第3列中の数は、MSLNペプチドのプールを用いる再刺激およびバックグランドの減算の後の、(IFN−γスポットの数)/(10個の脾細胞)を表す。第4列中の数は、MSLNペプチドのaa130〜144およびaa230〜244を用いる再刺激ならびにバックグランドの減算の後の、IFN−γであるCD8T細胞の頻度を表す。陽性の応答を、>100のSFC、および>0.05%のIFN−γCD8T細胞の頻度を有する場合と定義する。表5に示すように、膜結合型MSLN構築物(1084)および細胞質MSLN構築物(1103)を用いてもたらした免疫原性MSLNポリペプチドは、MSLN特異的T細胞応答を誘発することが可能である。細胞質MSLN抗原のフォーマットが、最も強力なMSLN特異的T細胞応答を誘発した。
Figure 2021061851
サルにおける免疫応答研究
研究デザイン。14頭の中国産カニクイマカクザルを、膜結合型MSLN抗原(プラスミド1084)または細胞質MSLN抗原(プラスミド1103)をコードするAdC68Wアデノウイルスベクターを用いて、2×1011個のウイルス粒子で、両側筋肉内注射(合計1mL)によりプライムした。29日後に、電気穿孔により両側筋肉内送達する(合計2mL)、膜結合型MSLN抗原をコードするDNA(1084)または細胞質MSLN抗原をコードするDNA(1103)を用いて、動物をブーストした。抗CTLA−4を、第1日(32mg)および第29日(50mg)に皮下投与した。最後の免疫化から14日後に、動物から採血し、MSLNに特異的な細胞性応答(ELISpot、ICS)および液性応答(ELISA)をそれぞれ評価するために、PBMCおよび血清を単離した。
結果。表6に、MSLNペプチドライブラリーに由来するペプチドのプール(ペプチドのプールの表(表18)、および表16もまた参照されたい)と共に培養した中国産カニクイマカクザルのPBMCから得られたELISpotおよびICSのデータ、ならびに中国産カニクイマカクザルの血清から得られたELISAのデータを示す。第3列中の数は、MSLNペプチドのプールを用いる再刺激およびバックグランドの減算の後の、(IFN−γスポットの数)/(10個の脾細胞)を表す。第4列中の数は、MSLNペプチドのプールを用いる再刺激およびバックグランドの減算の後の、(IFN−γCD8T細胞の数)/(10個のCD8T細胞)を表す。第5列中の数は、抗MSLN IgGタイター(光学密度(O.D)=1、検出限界(L.O.D)=99.0)を表す。陽性の応答を、>50のSFC、>50個である、(IFN−γCD8T細胞)/(1×10個のCD8T細胞)、および>99のIgGタイターを有する場合と定義する。表6に示すように、膜結合型MSLN構築物(1084)および細胞質MSLN構築物(1103)を用いて作製した免疫原性MSLNポリペプチドは、MSLNに特異的なTおよびB細胞応答を誘発することが可能である。細胞質内MSLN構築物(プラスミド1103)は、最も強力なMSLN特異的細胞性応答を誘発することが示され、対照的に、膜結合型MSLN構築物(プラスミド1084)は、最も強力なMSLN特異的液性応答を誘発することが示された。
Figure 2021061851
(実施例4)
TERT単一抗原構築物の免疫原性
Pasteurマウスにおける免疫応答研究
研究デザイン。6匹の雌雄混合HLA−A2/DR1マウスを、切断型(Δ240)細胞質免疫原性TERTポリペプチド(プラスミド1112)をコードするAdC68Wアデノウイルスベクターを用いて、1×1010個のウイルス粒子で、筋肉内注射(50μl)によりプライムした。28日後に、電気穿孔により両側に送達する(2×20μl)、切断型(Δ240)細胞質TERT抗原をコードするDNA(プラスミド1112)50μgを用いて、動物を筋肉内からブーストした。7日後に、IFN−γELISpotおよびICSアッセイにおいて、抗原特異的T細胞応答を測定した。
結果。表7に、TERTペプチドライブラリーに由来するペプチドのプール(ペプチドのプールの表(表18)、および表17もまた参照されたい)またはTERTペプチドのaa861〜875それぞれと共に培養したHLA−A2/DR1脾細胞から得られたELISpotおよびICSのデータを示す。第3列中の数は、TERTペプチドのプールを用いる再刺激およびバックグランドの減算の後の、(IFN−γスポットの数)/(10個の脾細胞)を表す。第4列中の数は、TERTペプチドのaa861〜875を用いる再刺激およびバックグランドの減算の後の、IFN−γであるCD8T細胞の頻度を表す。陽性の応答を、>100のSFC、および>0.05%のIFN−γCD8T細胞の頻度を有する場合と定義する。表7に示すように、上記の実施例1Aに記載した切断型(Δ240)細胞質TERT構築物を用いて作製した免疫原性TERTポリペプチドは、HLA−A2拘束性TERT特異的CD8T細胞応答を誘発することが可能である。
Figure 2021061851
HLA A24マウスにおける免疫応答研究
研究デザイン。8匹の雌雄混合HLA−A24マウスを、切断型(Δ240)細胞質TERT抗原(プラスミド1112)をコードするAdC68Wアデノウイルスベクターを用いて、総数1×1010個のウイルス粒子で、両側筋肉内注射(各前脛骨筋内へ50μl)によりプライムした。14日後に、電気穿孔により両側に送達する(2×20μl)、切断型(Δ240)細胞質TERT抗原をコードするDNA(プラスミド1112)50μgを用いて、動物を筋肉内からブーストした。7日後に、IFN−γELISpotおよびICSアッセイにおいて、抗原特異的T細胞応答を測定した。
結果。表8に、TERTペプチドライブラリーに由来するペプチドのプール(ペプチドのプールの表(表18)、および表17もまた参照されたい)またはTERTペプチドのaa841〜855それぞれと共に培養したHLA−A24脾細胞から得られたIFN−γELISpotおよびICSのデータを示す。第3列中の数は、TERTペプチドのプールを用いる再刺激およびバックグランドの減算の後の、(IFN−γスポットの数)/(10個の脾細胞)を表す。第4列中の数は、TERTペプチドのaa841〜855を用いる再刺激およびバックグランドの減算の後の、IFN−γであるCD8T細胞の頻度を表す。肉太の書体で示す数は、少なくとも1つの試験したペプチドのプールが、多過ぎて計数できなかったことを示し、したがって、本当の数値は、少なくとも記述した値である。陽性の応答を、>100のSFC、および>0.1%のIFN−γCD8T細胞の頻度を有する場合と定義する。表8に示すように、切断型(Δ240)細胞質TERT構築物(1112)を用いて作製した免疫原性TERTポリペプチドは、HLA−A24拘束性TERT特異的CD8T細胞応答を誘発することが可能である。
Figure 2021061851
サルにおける免疫応答研究
研究デザイン。8頭の中国産カニクイマカクザルを、切断型(Δ240)細胞質TERT抗原(プラスミド1112)をコードするAdC68Wアデノウイルスベクターを用いて、2×1011個のウイルス粒子で、両側筋肉内注射(合計1mL)によりプライムした。30日および64日後に、電気穿孔により両側筋肉内送達する(合計2mL)、切断型(Δ240)細胞質TERT抗原をコードするDNA(プラスミド1112)を用いて、動物をブーストした。抗CTLA−4を、第1日(32mg)、第31日(50mg)および第65日(75mg)に皮下投与した。最後の免疫化から14日後に、動物から採血し、TERT特異的細胞性応答を評価する(ELISpot、ICS)ために、PBMCを単離した。
結果。表9に、TERTペプチドライブラリーに由来するペプチドのプール(ペプチドのプールの表(表18)、および表17もまた参照されたい)と共に培養した中国産カニクイマカクザルのPBMCから得られたELISpotおよびICSのデータを示す。第3列中の数は、TERTペプチドのプールを用いる再刺激およびバックグランドの減算の後の、(IFN−γスポットの数)/(10個の脾細胞)を表す。第4列中の数は、TERTペプチドのプールを用いる再刺激およびバックグランドの減算の後の、(IFN−γCD8T細胞の数)/(10個のCD8T細胞)を表す。陽性の応答を、>50のSFC、および>50個である、(IFN−γCD8T細胞)/(1×10個のCD8T細胞)を有する場合と定義する。表9に示すように、切断型(Δ240)細胞質TERT構築物(プラスミド1112)を用いて作製した免疫原性TERTポリペプチドは、TERT特異的T細胞応答を誘発することが可能である。
Figure 2021061851
(実施例5)
二重抗原構築物の免疫原性
サルにおける免疫応答研究
研究デザイン。24頭の中国産カニクイマカクザルを、ヒトネイティブ完全長膜結合型MUC1抗原(MUC1)およびヒト切断型(Δ240)細胞質TERT抗原(TERTΔ240)をコードする二重抗原型アデノウイルスAdC68Wベクターを用いて、2×1011個のウイルス粒子で、両側筋肉内注射(合計1mL)によりプライムした。30日および64日後に、電気穿孔により両側筋肉内送達する(合計2mL)、同じ2つの抗原をコードする二重抗原DNA構築物(プラスミド1270、1271および1269)を用いて、動物をブーストした。抗CTLA−4を、第1日(32mg)、第31日(50mg)および第65日(75mg)に皮下投与した。最後の免疫化から14日後に、動物から採血し、MUC1およびTERTに特異的な細胞性応答(ELISpot、ICS)ならびにMUC1特異的液性応答(ELISA)をそれぞれ評価するために、PBMCならびに血清を単離した。両方の抗原を同時発現する、全部で3種の異なる二重抗原ワクチン構築物、すなわち、a)MUC1−2A−TERTΔ240(プラスミド1270)、すなわち、2Aペプチドにより連結されているMUC1およびTERTをコードする、AdC68WベクターおよびDNAプラスミド、b)TERTΔ240−2A−MUC1(プラスミド1271)、すなわち、2Aペプチドにより連結されているTERTおよびMUC1をコードする、AdC68WベクターおよびDNAプラスミド、c)MUC1−TERTΔ240(プラスミド1269)、すなわち、MUC1−TERTの融合タンパク質をコードする、AdC68WベクターおよびDNAプラスミドを評価した(構築物の表もまた参照されたい)。
結果。表10に、MUC1ペプチドライブラリーおよびTERTペプチドライブラリーに由来するペプチドのプール(ペプチドのプールの表(表18)、ならびに表15および17もまた参照されたい)と共に培養した中国産カニクイマカクザルのPBMCから得られたELISpotおよびICSのデータ、ならびに中国産カニクイマカクザルの血清から得られたELISAのデータを示す。陽性の応答を、>50のSFC、>50個である、(IFN−γCD8T細胞)/(1×10個のCD8T細胞)、および>99のIgGタイターを有する場合と定義する。第3列および第6列中の数はそれぞれ、MUC1およびTERTのペプチドのプールを用いる再刺激ならびにバックグランドの減算の後の、(IFN−γスポットの数)/(10個の脾細胞)を表す。肉太の書体で示す数は、少なくとも1つの試験したペプチドのプールが、多過ぎて計数できなかったことを示し、したがって、本当の数値は、少なくとも記述した値である。第4列および第7列中の数はそれぞれ、MUC1ペプチドのプールおよびTERTペプチドのプールを用いる再刺激ならびにバックグランドの減算の後の、(IFN−γCD8T細胞の数)/(10個のCD8T細胞)を表す。第5列中の数は、抗MUC1IgGタイター(光学密度(O.D)=1、検出限界(L.O.D)=99.0)を表す。表10に示すように、MUC1およびTERTを発現する二重抗原構築物(プラスミド1270、1271および1269)を用いて作製した免疫原性MUC1ポリペプチドおよび免疫原性TERTポリペプチドは、MUC1およびTERTに特異的なT細胞応答ならびにMUC1特異的B細胞応答を誘発することが可能である。MUC1−TERTの融合タンパク質をコードする二重抗原構築物1269は、最も強力な全般的MUC1特異的細胞性応答を誘発することが示され、対照的に、二重抗原構築物プラスミド1271(TERT−2A−MUC1)は、最も強力な全般的TERT特異的細胞性応答を誘発することが示された。3つの二重抗原構築物は全て、同等のMUC1特異的液性応答を誘発することが示された。
Figure 2021061851
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(実施例6)
三重抗原構築物の免疫原性
実施例6は、ヒトネイティブ完全長膜結合型MUC1抗原(MUC1)、ヒト細胞質MSLN抗原(cMSLN)およびヒト切断型(Δ240)細胞質TERT抗原(TERTΔ240またはTERTΔ541)を発現する三重抗原型アデノウイルスおよび三重抗原核酸ワクチン構築物の、3つのコードがん抗原全てに対する、Agに特異的なTおよびB細胞応答を惹起する能力を例証する。
C57BL/6Jマウスにおける、電気穿孔を使用する免疫応答研究
研究デザイン。48匹の雌C57BL/6Jマウスを、ヒトMUC1、cMSLNおよびTERTΔ240をコードする三重抗原DNA構築物を用いて免疫化した。各ワクチン接種の間に2週間の間隔を置くプライム/ブーストのレジメンにおいて、三重抗原DNAワクチン(100μg)を、同時電気穿孔を用いて、(各前脛骨筋内に)両側筋肉内送達した(合計20μl)。最後の免疫化から7日後に、MUC1、MSLNおよびTERTに特異的な細胞性応答ならびにMUC1およびMSLNに特異的な液性応答をそれぞれ、IFN−γELISpotアッセイならびにELISAアッセイにおいて測定した。2Aペプチドにより連結されている3つの抗原全てをコードする、全部で6つの異なる三重抗原DNA構築物を以下の通り使用した:MUC1−2A−cMSLN−2A−TERTΔ240(プラスミド1317)、MUC1−2A−TERTΔ240−2A−cMSLN(プラスミド1318)、cMSLN−2A−MUC1−2A−TERTΔ240(プラスミド1319)、cMSLN−2A−TERTΔ240−2A−MUC1(プラスミド1320)、TERTΔ240−2A−cMSLN−2A−MUC1(プラスミド1321)、TERTΔ240−2A−MUC1−2A−cMSLN(プラスミド1322)(構築物の表もまた参照されたい)。
結果。表11に、MUC1、MSLNおよびTERTのペプチドライブラリーに由来するペプチドのプール(ペプチドのプールの表(表18)、および表15〜17もまた参照されたい)と共に培養したC57BL/6J脾細胞から得られたELISpotのデータ、およびC57BL/6Jマウス血清から得られたELISAのデータを示す。陽性の応答を、>100のSFC、および>99のIgGタイターを有する場合と定義する。第3列、第5列および第7列中の数はそれぞれ、MUC1、MSLNおよびTERTのペプチドのプールを用いる再刺激ならびにバックグランドの減算の後の、(IFN−γスポットの数)/(10個の脾細胞)を表す。肉太の書体で示す数は、少なくとも1つの試験したペプチドのプールが、多過ぎて計数できなかったことを示し、したがって、本当の数値は、少なくとも記述した値である。第4列および第6列中の数はそれぞれ、抗MUC1IgGタイターおよび抗MSLN IgGタイター(光学密度(O.D)=1、検出限界(L.O.D)=99.0)を表す。表11に示すように、MUC1、MSLNおよびTERTを発現する三重抗原構築物を用いて作製した免疫原性MUC1ポリペプチド、免疫原性MSLNポリペプチドおよび免疫原性TERTポリペプチドは、3つの抗原全てに対するT細胞応答およびMUC1に対するB細胞応答を誘発することが可能であり、対照的に、三重抗原構築物プラスミド1317、1318および1322のみが、MSLNに対するB細胞応答を誘発することが可能である。
Figure 2021061851
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C57BL/6Jマウスにおける、アデノウイルスベクターを使用する免疫応答研究
研究デザイン。36匹の雌C57BL/6Jマウスを、ヒトMUC1、cMSLN、およびTERTΔ240またはTERTΔ541をコードする三重抗原型アデノウイルスベクターを用いて、1×1010個のウイルス粒子で、筋肉内注射(50μl)によりプライムした。28日後に、同時電気穿孔を用いて(各前脛骨筋内に)両側筋肉内送達する(合計20μl)、三重抗原DNA構築物(50μg)を用いて、動物をブーストした。最後の免疫化から7日後に、MUC1、MSLNおよびTERTに特異的な細胞性応答ならびにMUC1およびMSLNに特異的な液性応答をそれぞれ、IFN−γELISpotおよびICSアッセイならびにELISAアッセイにおいて測定した。全部で、2Aペプチドにより連結されているMUC1、cMSLNおよびTERTΔ240をコードする、3種の三重抗原型アデノウイルスおよび三重抗原DNA構築物、ならびに2Aペプチドにより連結されているMUC1、cMSLNおよびTERTΔ541をコードする、3種の三重抗原型アデノウイルスおよび三重抗原DNA構築物を以下の通り使用した:MUC1−2A−cMSLN−2A−TERTΔ240(プラスミド1317)、cMSLN−2A−MUC1−2A−TERTΔ240(プラスミド1319)、cMSLN−2A−TERTΔ240−2A−MUC1(プラスミド1320);およびMUC1−2A−cMSLN−2A−TERTΔ541(プラスミド1351)、cMSLN−2A−MUC1−2A−TERTΔ541(プラスミド1352)、cMSLN−2A−TERTΔ541−2A−MUC1(プラスミド1353)(構築物の表もまた参照されたい)。
結果。表12に、MUC1、MSLNおよびTERTのペプチドライブラリーに由来するペプチドのプール(ペプチドのプールの表(表18)、および表15〜17もまた参照されたい)と共に培養したC57BL/6J脾細胞から得られたELISpotのデータ、TERTペプチドのaa1025〜1039と共に培養したC57BL/6J脾細胞から得られたICSのデータ、およびC57BL/6Jマウス血清から得られたELISAのデータを示す。陽性の応答を、>100のSFC、>0.1%のIFN−γCD8T細胞の頻度、および>99のIgGタイターを有する場合と定義する。第3列、第5列および第7列中の数はそれぞれ、MUC1、MSLNおよびTERTのペプチドのプールを用いる再刺激ならびにバックグランドの減算の後の、(IFN−γスポットの数)/(10個の脾細胞)を表す。肉太の書体で示す数は、少なくとも1つの試験したペプチドのプールが、多過ぎて計数できなかったことを示し、したがって、本当の数値は、少なくとも記述した値である。第8列中の数は、TERT特異的ペプチドであるTERTのaa1025〜1039を用いる再刺激およびバックグランドの減算の後の、(IFN−γCD8T細胞の数)/(10個のCD8T細胞)を表す。第4列および第6列中の数はそれぞれ、抗MUC1IgGタイターおよび抗MSLN IgGタイター(光学密度(O.D)=1、検出限界(L.O.D)=99.0)を表す。表12に示すように、MUC1、MSLNおよびTERTを発現する三重抗原構築物を用いて作製した免疫原性MUC1ポリペプチド、免疫原性MSLNポリペプチドおよび免疫原性TERTポリペプチドは、3つの抗原全てに対するT細胞応答およびMUC1に対するB細胞応答を誘発することが可能であり、対照的に、三重抗原構築物1317および1351のみが、MSLNに対するB細胞応答を誘発することが可能である。
Figure 2021061851
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HLA−A24マウスにおける免疫応答研究
研究デザイン。8匹の雌雄混合HLA−A24マウスを、ヒトMUC1、cMSLNおよびTERTΔ240をコードするアデノウイルスAdC68Y三重抗原構築物(プラスミド1317;MUC1−2A−cMSLN−2A−TERTΔ240)を用いて、1×1010個のウイルス粒子で、筋肉内注射(各前脛骨筋内へ50μl)によりプライムした。14日後に、(同時電気穿孔を用いて各前脛骨筋内に送達する)(20μl)、同じ3つの抗原をコードする三重抗原DNA構築物(プラスミド1317)50μgを用いて、動物を筋肉内からブーストした。最後の免疫化から7日後に、IFN−γELISpotアッセイにおいて、HLA−A24拘束性MUC1特異的細胞性応答を測定した。
結果。表13に、MUC1ペプチドのaa524〜532と共に培養したHLA−A24脾細胞から得られたELISpotのデータを示す。陽性の応答を、>50のSFCを有する場合と定義する。第3列中の数は、MUC1ペプチドのaa524〜532を用いる再刺激およびバックグランドの減算の後の、(IFN−γスポットの数)/(10個の脾細胞)を表す。表13に示すように、MUC1、MSLNおよびTERTを発現する三重抗原構築物1317を用いて作製した免疫原性MUC1ポリペプチドは、HLA−A24拘束性MUC1ペプチドのaa524〜532に特異的なCD8T細胞応答を誘発することが可能である。重要なことに、この特定のMUC1ペプチドに対してがん患者から得られたT細胞応答が、in vitroでの抗腫瘍性の効能と相関することが示されており(Jochems Cら、Cancer Immunol Immunother(2014)63:161〜174)、このことは、この特定のエピトープに対する細胞性応答を高めることの重要性を実証している。
Figure 2021061851
サルにおける免疫応答研究
研究デザイン。24頭の中国産カニクイマカクザルを、ヒトネイティブ完全長膜結合型MUC1(MUC1)抗原、ヒト細胞質内MSLN(cMSLN)抗原およびヒト切断型(Δ240)細胞質TERT(TERTΔ240)抗原をコードするAdC68Yアデノウイルスベクターを用いて、2×1011個のウイルス粒子で、両側筋肉内注射(合計1mL)によりプライムした。28日および56日後に、電気穿孔により両側筋肉内送達する(合計2mL)、同じ3つの抗原をコードするDNAを用いて、動物をブーストした。抗CTLA−4を、第1日(32mg)、第29日(50mg)および第57日(75mg)に皮下投与した。最後の免疫化から21日後に、動物から採血し、MUC1、MSLNおよびTERTに特異的な細胞性応答(ELISpot、ICS)ならびにMUC1およびMSLNに特異的な液性応答(ELISA)をそれぞれ評価するために、PBMCならびに血清を単離した。2Aペプチドにより連結されているMUC1、cMSLNおよびTERTΔ240をコードする、全部で3種の三重抗原型アデノウイルスおよび三重抗原DNA構築物、すなわち、MUC1−2A−cMSLN−2A−TERTΔ240(プラスミド1317)、cMSLN−2A−MUC1−2A−TERTΔ240(プラスミド1319)、およびcMSLN−2A−TERTΔ240−2A−MUC1(プラスミド1320)を評価した。
結果。表14A、表14Bおよび表14Cに、MUC1、MSLNおよびTERTのペプチドライブラリーに由来するペプチドのプール(ペプチドのプールの表(表18)、および表15〜17もまた参照されたい)と共に培養した中国産カニクイマカクザルのPBMCから得られたELISpotおよびICSのデータ、ならびに中国産カニクイマカクザルの血清から得られたELISAのデータを示す。陽性の応答を、>50のSFC、>50個である、(IFN−γCD8T細胞)/(1×10個のCD8T細胞)、および>99のIgGタイターを有する場合と定義する。第3列、第6列および第9列中の数はそれぞれ、MUC1、MSLNおよびTERTのペプチドのプールを用いる再刺激ならびにバックグランドの減算の後の、(IFN−γスポットの数)/(10個の脾細胞)を表す。肉太の書体で示す数は、少なくとも1つの試験したペプチドのプールが、多過ぎて計数できなかったことを示し、したがって、本当の数値は、少なくとも記述した値である。第4列、第7列および第10列中の数はそれぞれ、MUC1、MSLNおよびTERTのペプチドのプールを用いる再刺激ならびにバックグランドの減算の後の、(IFN−γCD8T細胞の数)/(10個のCD8T細胞)を表す。第5列および第8列中の数はそれぞれ、抗MUC1IgGタイターおよび抗MSLN IgGタイター(光学密度(O.D)=1、検出限界(L.O.D)=99.0)を表す。表14に示すように、MUC1、MSLNおよびTERTを発現する三重Ag構築物を用いて作製した免疫原性MUC1ポリペプチド、免疫原性MSLNポリペプチドおよび免疫原性TERTポリペプチドは、3つの抗原全てに対する細胞性応答およびMUC1に対する液性応答を誘発することが可能である。しかし、三重抗原構築物1317のみが、顕著なMSLN特異的B細胞応答を誘発することが可能である。
Figure 2021061851
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(実施例7)
ワクチンと免疫調節剤との組合せ
抗がんワクチンを、抗細胞傷害性Tリンパ球抗原(CTLA4)抗体および/またはインドールアミン2,3−ジオキシゲナーゼ1(IDO1)阻害剤と組み合わせて投与した場合の、腫瘍成長阻害効果の増強を例証するために、以下の実施例を提供する。
研究手順。
研究の第0日に、BALB−neuTマウスに、TUBO腫瘍細胞を皮下注射により移植した。研究の第7日から、マウスに、200mg/Kgの3−(5−フルオロ−1H−インドール−3−イル)ピロリジン−2,5−ジオン(IDO1阻害剤)またはビヒクルを、経口経管栄養を使用して1日2回投与した。比較群は、研究の第7日以降ビヒクルを投与するシャムであった。研究の第10日に、充当したマウスを、ラットHER2(rHER2)を発現するように遺伝子工学により作製したアデノウイルスベクター(rHER2ワクチン)またはrHER2導入遺伝子を欠くベクター(対照ワクチン)の1×1010個のウイルス粒子を用いて、筋肉内注射により免疫化した。続いて、250μgの抗CTLA4抗体(CTLA−4に対するマウスモノクローナル抗体、クローン9D9)またはIgG2アイソタイプの対照のモノクローナル抗体を、アデノウイルスベクターを注射した部位からの流入があるリンパ節に密接に近接する皮下に注射した。その後、マウスを、100μgのrHER2をコードするDNAプラスミド(rHER2ワクチン)またはrHER2導入遺伝子を欠くDNAプラスミド(対照ワクチン)を用いて、電気穿孔により2週間に1回免疫化した。DNAプラスミドの投与に続いて、250μgの抗CTLA4抗体を、DNAプラスミドを注射した部位からの流入があるリンパ節に密接に近接する皮下に注射した。腫瘍の進行を追跡するために、研究全体を通して、皮下の腫瘍体積を週2回測定した。皮下の腫瘍体積が2000mm3に達した動物または疾患の不可逆的な徴候を呈した動物を安楽死させた。
結果。
各治療群における個々の動物の皮下の腫瘍体積を、表20−A〜表20−Hに提示する。
抗CTLA4抗体単独を用いて治療したマウスにおいても、IDO1阻害剤単独を用いて治療したマウスにおいても、腫瘍の成長速度に対する効果は観察されなかった。しかし、rHER2ワクチン単独を用いて治療した動物のうちのいくつかにおいて、より緩慢な成長速度が観察された。抗CTLA4抗体と組み合わせたrHER2ワクチンを用いて治療したマウス、およびIDO1阻害剤と組み合わせたrHER2ワクチンを用いて治療したマウスは、対応する対照の動物と比較して、腫瘍の成長速度の低下を示した。腫瘍の成長阻害は、rHER2ワクチン、抗CTLA4抗体およびIDO1阻害剤を用いて治療したマウスにおいて最も目覚しかった。
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生の配列表
配列番号1.MUC1アイソフォーム1タンパク質(参照ポリペプチド;Uniprot P15941−1)(ヒト)
MTPGTQSPFFLLLLLTVLTVVTGSGHASSTPGGEKETSATQRSSVPSSTEKNAVSMTSSVLSSHSPGSGSSTTQGQDVTLAPATEPASGSAATWGQDVTSVPVTRPALGSTTPPAHDVTSAPDNKPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDNRPALGSTAPPVHNVTSASGSASGSASTLVHNGTSARATTTPASKSTPFSIPSHHSDTPTTLASHSTKTDASSTHHSSVPPLTSSNHSTSPQLSTGVSFFFLSFHISNLQFNSSLEDPSTDYYQELQRDISEMFLQIYKQGGFLGLSNIKFRPGSVVVQLTLAFREGTINVHDVETQFNQYKTEAASRYNLTISDVSVSDVPFPFSAQSGAGVPGWGIALLVLVCVLVALAIVYLIALAVCQCRRKNYGQLDIFPARDTYHPMSEYPTYHTHGRYVPPSSTDRSPYEKVSAGNGGSSLSYTNPAVAATSANL
配列番号2.メソテリンアイソフォーム2前駆体タンパク質(参照ポリペプチド;Uniprot Q13421−3)(ヒト)
MALPTARPLLGSCGTPALGSLLFLLFSLGWVQPSRTLAGETGQEAAPLDGVLANPPNISSLSPRQLLGFPCAEVSGLSTERVRELAVALAQKNVKLSTEQLRCLAHRLSEPPEDLDALPLDLLLFLNPDAFSGPQACTRFFSRITKANVDLLPRGAPERQRLLPAALACWGVRGSLLSEADVRALGGLACDLPGRFVAESAEVLLPRLVSCPGPLDQDQQEAARAALQGGGPPYGPPSTWSVSTMDALRGLLPVLGQPIIRSIPQGIVAAWRQRSSRDPSWRQPERTILRPRFRREVEKTACPSGKKAREIDESLIFYKKWELEACVDAALLATQMDRVNAIPFTYEQLDVLKHKLDELYPQGYPESVIQHLGYLFLKMSPEDIRKWNVTSLETLKALLEVNKGHEMSPQVATLIDRFVKGRGQLDKDTLDTLTAFYPGYLCSLSPEELSSVPPSSIWAVRPQDLDTCDPRQLDVLYPKARLAFQNMNGSEYFVKIQSFLGGAPTEDLKALSQQNVSMDLATFMKLRTDAVLPLTVAEVQKLLGPHVEGLKAEERHRPVRDWILRQRQDDLDTLGLGLQGGIPNGYLVLDLSMQEALSGTPCLLGPGPVLTVLALLLASTLA
配列番号3.TERTアイソフォーム1タンパク質(参照ポリペプチド;Genbank AAD30037、Uniprot O14746−1)(ヒト)
MPRAPRCRAVRSLLRSHYREVLPLATFVRRLGPQGWRLVQRGDPAAFRALVAQCLVCVPWDARPPPAAPSFRQVSCLKELVARVLQRLCERGAKNVLAFGFALLDGARGGPPEAFTTSVRSYLPNTVTDALRGSGAWGLLLRRVGDDVLVHLLARCALFVLVAPSCAYQVCGPPLYQLGAATQARPPPHASGPRRRLGCERAWNHSVREAGVPLGLPAPGARRRGGSASRSLPLPKRPRRGAAPEPERTPVGQGSWAHPGRTRGPSDRGFCVVSPARPAEEATSLEGALSGTRHSHPSVGRQHHAGPPSTSRPPRPWDTPCPPVYAETKHFLYSSGDKEQLRPSFLLSSLRPSLTGARRLVETIFLGSRPWMPGTPRRLPRLPQRYWQMRPLFLELLGNHAQCPYGVLLKTHCPLRAAVTPAAGVCAREKPQGSVAAPEEEDTDPRRLVQLLRQHSSPWQVYGFVRACLRRLVPPGLWGSRHNERRFLRNTKKFISLGKHAKLSLQELTWKMSVRDCAWLRRSPGVGCVPAAEHRLREEILAKFLHWLMSVYVVELLRSFFYVTETTFQKNRLFFYRKSVWSKLQSIGIRQHLKRVQLRELSEAEVRQHREARPALLTSRLRFIPKPDGLRPIVNMDYVVGARTFRREKRAERLTSRVKALFSVLNYERARRPGLLGASVLGLDDIHRAWRTFVLRVRAQDPPPELYFVKVDVTGAYDTIPQDRLTEVIASIIKPQNTYCVRRYAVVQKAAHGHVRKAFKSHVSTLTDLQPYMRQFVAHLQETSPLRDAVVIEQSSSLNEASSGLFDVFLRFMCHHAVRIRGKSYVQCQGIPQGSILSTLLCSLCYGDMENKLFAGIRRDGLLLRLVDDFLLVTPHLTHAKTFLRTLVRGVPEYGCVVNLRKTVVNFPVEDEALGGTAFVQMPAHGLFPWCGLLLDTRTLEVQSDYSSYARTSIRASLTFNRGFKAGRNMRRKLFGVLRLKCHSLFLDLQVNSLQTVCTNIYKILLLQAYRFHACVLQLPFHQQVWKNPTFFLRVISDTASLCYSILKAKNAGMSLGAKGAAGPLPSEAVQWLCHQAFLLKLTRHRVTYVPLLGSLRTAQTQLSRKLPGTTLTALEAAANPALPSDFKTILD
配列番号4.AdC68Y、空
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配列番号5.プラスミド1103のORF(cMSLN)
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配列番号6.プラスミド1103のポリペプチド(cMSLN)
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配列番号7.プラスミド1027のORF(MUC1)
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配列番号8.プラスミド1027のポリペプチド(537 aa)(MUC1)
MASTPGTQSPFFLLLLLTVLTVVTGSGHASSTPGGEKETSATQRSSVPSSTEKNAVSMTSSVLSSHSPGSGSSTTQGQDVTLAPATEPASGSAATWGQDVTSVPVTRPALGSTTPPAHDVTSAPDNKPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPALGSTAPPVHNVTSASGSASGSASTLVHNGTSARATTTPASKSTPFSIPSHHSDTPTTLASHSTKTDASSTHHSSVPPLTSSNHSTSPQLSTGVSFFFLSFHISNLQFNSSLEDPSTDYYQELQRDISEMFLQIYKQGGFLGLSNIKFRPGSVVVQLTLAFREGTINVHDVETQFNQYKTEAASRYNLTISDVSVSDVPFPFSAQSGAGVPGWGIALLVLVCVLVALAIVYLIALAVCQCRRKNYGQLDIFPARDTYHPMSEYPTYHTHGRYVPPSSTDRSPYEKVSAGNGGSSLSYTNPAVAAASANL
配列番号9.プラスミド1112のORF(TERT240)
atgggagctgccccggagccggagaggacccccgttggccagggatcgtgggcccatccgggacgcaccaggggaccatccgacaggggattctgtgtggtgtcaccggccaggccagcagaagaggcaaccagcctcgagggagcgttgtctggaaccagacattcccacccgtcggtgggccggcagcaccacgcgggaccaccgtccacttccagaccgccacggccatgggacaccccttgcccgcctgtgtatgccgagactaaacacttcctgtactcatccggagacaaggaacagcttcggccgtccttcctcctgtcgtcgctcagaccgagcctgaccggagcacgcagattggtggaaactatcttccttgggtcacgtccgtggatgccaggtaccccacggcgcctcccgcgcctcccacagagatactggcagatgcggcctctgttcctggaattgctgggaaaccacgctcagtgcccgtacggagtcctgctcaagactcactgccctctgagggcggcggtcactccggcggccggagtgtgcgcacgggagaagccccagggaagcgtggcagctccggaagaggaggacaccgatccgcgccgcctcgtgcaacttctgcgccagcactcctcgccctggcaagtctacgggttcgtccgcgcctgcctgcgccgcctggtgccgcctgggctctggggttcccggcataacgagcgccgcttcctgagaaatactaagaagtttatctcacttggaaaacatgccaagttgtcgctgcaagaactcacgtggaagatgtcagtccgcgattgcgcctggctgcgccgctcgccgggcgtcgggtgtgttccagctgcagaacaccgcctgagagaagaaattctggccaaatttctgcattggctgatgtcagtgtacgtggtcgagctgctgcgctcctttttctacgtcactgagactacctttcaaaagaaccgcctgttcttctaccgcaaatctgtgtggagcaagctgcagtcaatcggcattcgccagcatctgaagagggtgcagctgcgggaactttccgaggcagaagtccgccagcaccgggaggcccggccggcgcttctcacgtcgcgtctgagattcatcccaaagcccgacgggctgaggcctatcgtcaacatggattacgtcgtgggcgctcgcacctttcgccgtgaaaagcgggccgaacgcttgacctcacgggtgaaggccctcttctccgtgctgaactacgagagagcaagacggcctggcctgctgggagcttcggtgctgggactggacgatatccaccgggcttggcggacctttgttctccgggtgagagcccaagaccctccgccggaactgtacttcgtgaaggtggcgatcaccggagcctatgatactattccgcaagatcgactcaccgaagtcatcgcctcgatcatcaaaccgcagaacacttactgcgtcaggcggtacgccgtggtccagaaggccgcgcatggccacgtgagaaaggcgttcaagtcgcacgtgtccactctcaccgacctccagccttacatgaggcaattcgttgcgcatttgcaagagacttcgcccctgagagatgcggtggtcatcgagcagagctccagcctgaacgaagcgagcagcggtctgtttgacgtgttcctccgcttcatgtgtcatcacgcggtgcgaatcaggggaaaatcatacgtgcagtgccagggaatcccacaaggcagcattctgtcgactctcttgtgttccctttgctacggcgatatggaaaacaagctgttcgctgggatcagacgggacgggttgctgctcagactggtggacgacttcctgctggtgactccgcacctcactcacgccaaaacctttctccgcactctggtgaggggagtgccagaatacggctgtgtggtcaatctccggaaaactgtggtgaatttccctgtcgaggatgaggcactcggaggaaccgcatttgtccaaatgccagcacatggcctgttcccatggtgcggtctgctgctggacacccgaactcttgaagtgcagtccgactactccagctatgcccggacgagcatccgcgccagcctcactttcaatcgcggctttaaggccggacgaaacatgcgcagaaagcttttcggagtcctccggcttaaatgccattcgctctttctcgatctccaagtcaattcgctgcagaccgtgtgcacgaacatctacaagatcctgctgctccaagcctaccggttccacgcttgcgtgcttcagctgccgtttcaccaacaggtgtggaagaacccgaccttctttctgcgggtcattagcgatactgcctccctgtgttactcaatcctcaaggcaaagaacgccggaatgtcgctgggtgcgaaaggagccgcgggacctcttcctagcgaagcggtgcagtggctctgccaccaggctttcctcctgaagctgaccaggcacagagtgacctacgtcccgctgctgggctcgctgcgcactgcacagacccagctgtctagaaaactccccggcaccaccctgaccgctctggaagccgccgccaacccagcattgccgtcagatttcaagaccatcttggac
配列番号10.プラスミド1112のポリペプチド(TERT240)
MGAAPEPERTPVGQGSWAHPGRTRGPSDRGFCVVSPARPAEEATSLEGALSGTRHSHPSVGRQHHAGPPSTSRPPRPWDTPCPPVYAETKHFLYSSGDKEQLRPSFLLSSLRPSLTGARRLVETIFLGSRPWMPGTPRRLPRLPQRYWQMRPLFLELLGNHAQCPYGVLLKTHCPLRAAVTPAAGVCAREKPQGSVAAPEEEDTDPRRLVQLLRQHSSPWQVYGFVRACLRRLVPPGLWGSRHNERRFLRNTKKFISLGKHAKLSLQELTWKMSVRDCAWLRRSPGVGCVPAAEHRLREEILAKFLHWLMSVYVVELLRSFFYVTETTFQKNRLFFYRKSVWSKLQSIGIRQHLKRVQLRELSEAEVRQHREARPALLTSRLRFIPKPDGLRPIVNMDYVVGARTFRREKRAERLTSRVKALFSVLNYERARRPGLLGASVLGLDDIHRAWRTFVLRVRAQDPPPELYFVKVAITGAYDTIPQDRLTEVIASIIKPQNTYCVRRYAVVQKAAHGHVRKAFKSHVSTLTDLQPYMRQFVAHLQETSPLRDAVVIEQSSSLNEASSGLFDVFLRFMCHHAVRIRGKSYVQCQGIPQGSILSTLLCSLCYGDMENKLFAGIRRDGLLLRLVDDFLLVTPHLTHAKTFLRTLVRGVPEYGCVVNLRKTVVNFPVEDEALGGTAFVQMPAHGLFPWCGLLLDTRTLEVQSDYSSYARTSIRASLTFNRGFKAGRNMRRKLFGVLRLKCHSLFLDLQVNSLQTVCTNIYKILLLQAYRFHACVLQLPFHQQVWKNPTFFLRVISDTASLCYSILKAKNAGMSLGAKGAAGPLPSEAVQWLCHQAFLLKLTRHRVTYVPLLGSLRTAQTQLSRKLPGTTLTALEAAANPALPSDFKTILD
配列番号11.プラスミド1330のORF(TERT541)
atggctagcgccaaatttctgcattggctgatgtcagtgtacgtggtcgagctgctgcgctcctttttctacgtcactgagactacctttcaaaagaaccgcctgttcttctaccgcaaatctgtgtggagcaagctgcagtcaatcggcattcgccagcatctgaagagggtgcagctgcgggaactttccgaggcagaagtccgccagcaccgggaggcccggccggcgcttctcacgtcgcgtctgagattcatcccaaagcccgacgggctgaggcctatcgtcaacatggattacgtcgtgggcgctcgcacctttcgccgtgaaaagcgggccgaacgcttgacctcacgggtgaaggccctcttctccgtgctgaactacgagagagcaagacggcctggcctgctgggagcttcggtgctgggactggacgatatccaccgggcttggcggacctttgttctccgggtgagagcccaagaccctccgccggaactgtacttcgtgaaggtggcgatcaccggagcctatgatactattccgcaagatcgactcaccgaagtcatcgcctcgatcatcaaaccgcagaacacttactgcgtcaggcggtacgccgtggtccagaaggccgcgcatggccacgtgagaaaggcgttcaagtcgcacgtgtccactctcaccgacctccagccttacatgaggcaattcgttgcgcatttgcaagagacttcgcccctgagagatgcggtggtcatcgagcagagctccagcctgaacgaagcgagcagcggtctgtttgacgtgttcctccgcttcatgtgtcatcacgcggtgcgaatcaggggaaaatcatacgtgcagtgccagggaatcccacaaggcagcattctgtcgactctcttgtgttccctttgctacggcgatatggaaaacaagctgttcgctgggatcagacgggacgggttgctgctcagactggtggacgacttcctgctggtgactccgcacctcactcacgccaaaacctttctccgcactctggtgaggggagtgccagaatacggctgtgtggtcaatctccggaaaactgtggtgaatttccctgtcgaggatgaggcactcggaggaaccgcatttgtccaaatgccagcacatggcctgttcccatggtgcggtctgctgctggacacccgaactcttgaagtgcagtccgactactccagctatgcccggacgagcatccgcgccagcctcactttcaatcgcggctttaaggccggacgaaacatgcgcagaaagcttttcggagtcctccggcttaaatgccattcgctctttctcgatctccaagtcaattcgctgcagaccgtgtgcacgaacatctacaagatcctgctgctccaagcctaccggttccacgcttgcgtgcttcagctgccgtttcaccaacaggtgtggaagaacccgaccttctttctgcgggtcattagcgatactgcctccctgtgttactcaatcctcaaggcaaagaacgccggaatgtcgctgggtgcgaaaggagccgcgggacctcttcctagcgaagcggtgcagtggctctgccaccaggctttcctcctgaagctgaccaggcacagagtgacctacgtcccgctgctgggctcgctgcgcactgcacagacccagctgtctagaaaactccccggcaccaccctgaccgctctggaagccgccgccaacccagcattgccgtcagatttcaagaccatcttggac
配列番号12.プラスミド1330のポリペプチド(TERT541)
MASAKFLHWLMSVYVVELLRSFFYVTETTFQKNRLFFYRKSVWSKLQSIGIRQHLKRVQLRELSEAEVRQHREARPALLTSRLRFIPKPDGLRPIVNMDYVVGARTFRREKRAERLTSRVKALFSVLNYERARRPGLLGASVLGLDDIHRAWRTFVLRVRAQDPPPELYFVKVAITGAYDTIPQDRLTEVIASIIKPQNTYCVRRYAVVQKAAHGHVRKAFKSHVSTLTDLQPYMRQFVAHLQETSPLRDAVVIEQSSSLNEASSGLFDVFLRFMCHHAVRIRGKSYVQCQGIPQGSILSTLLCSLCYGDMENKLFAGIRRDGLLLRLVDDFLLVTPHLTHAKTFLRTLVRGVPEYGCVVNLRKTVVNFPVEDEALGGTAFVQMPAHGLFPWCGLLLDTRTLEVQSDYSSYARTSIRASLTFNRGFKAGRNMRRKLFGVLRLKCHSLFLDLQVNSLQTVCTNIYKILLLQAYRFHACVLQLPFHQQVWKNPTFFLRVISDTASLCYSILKAKNAGMSLGAKGAAGPLPSEAVQWLCHQAFLLKLTRHRVTYVPLLGSLRTAQTQLSRKLPGTTLTALEAAANPALPSDFKTILD
配列番号13.プラスミド1326のORF(TERT343)
atggctagcttcctcctgtcgtcgctcagaccgagcctgaccggagcacgcagattggtggaaactatcttccttgggtcacgtccgtggatgccaggtaccccacggcgcctcccgcgcctcccacagagatactggcagatgcggcctctgttcctggaattgctgggaaaccacgctcagtgcccgtacggagtcctgctcaagactcactgccctctgagggcggcggtcactccggcggccggagtgtgcgcacgggagaagccccagggaagcgtggcagctccggaagaggaggacaccgatccgcgccgcctcgtgcaacttctgcgccagcactcctcgccctggcaagtctacgggttcgtccgcgcctgcctgcgccgcctggtgccgcctgggctctggggttcccggcataacgagcgccgcttcctgagaaatactaagaagtttatctcacttggaaaacatgccaagttgtcgctgcaagaactcacgtggaagatgtcagtccgcgattgcgcctggctgcgccgctcgccgggcgtcgggtgtgttccagctgcagaacaccgcctgagagaagaaattctggccaaatttctgcattggctgatgtcagtgtacgtggtcgagctgctgcgctcctttttctacgtcactgagactacctttcaaaagaaccgcctgttcttctaccgcaaatctgtgtggagcaagctgcagtcaatcggcattcgccagcatctgaagagggtgcagctgcgggaactttccgaggcagaagtccgccagcaccgggaggcccggccggcgcttctcacgtcgcgtctgagattcatcccaaagcccgacgggctgaggcctatcgtcaacatggattacgtcgtgggcgctcgcacctttcgccgtgaaaagcgggccgaacgcttgacctcacgggtgaaggccctcttctccgtgctgaactacgagagagcaagacggcctggcctgctgggagcttcggtgctgggactggacgatatccaccgggcttggcggacctttgttctccgggtgagagcccaagaccctccgccggaactgtacttcgtgaaggtggcgatcaccggagcctatgatactattccgcaagatcgactcaccgaagtcatcgcctcgatcatcaaaccgcagaacacttactgcgtcaggcggtacgccgtggtccagaaggccgcgcatggccacgtgagaaaggcgttcaagtcgcacgtgtccactctcaccgacctccagccttacatgaggcaattcgttgcgcatttgcaagagacttcgcccctgagagatgcggtggtcatcgagcagagctccagcctgaacgaagcgagcagcggtctgtttgacgtgttcctccgcttcatgtgtcatcacgcggtgcgaatcaggggaaaatcatacgtgcagtgccagggaatcccacaaggcagcattctgtcgactctcttgtgttccctttgctacggcgatatggaaaacaagctgttcgctgggatcagacgggacgggttgctgctcagactggtggacgacttcctgctggtgactccgcacctcactcacgccaaaacctttctccgcactctggtgaggggagtgccagaatacggctgtgtggtcaatctccggaaaactgtggtgaatttccctgtcgaggatgaggcactcggaggaaccgcatttgtccaaatgccagcacatggcctgttcccatggtgcggtctgctgctggacacccgaactcttgaagtgcagtccgactactccagctatgcccggacgagcatccgcgccagcctcactttcaatcgcggctttaaggccggacgaaacatgcgcagaaagcttttcggagtcctccggcttaaatgccattcgctctttctcgatctccaagtcaattcgctgcagaccgtgtgcacgaacatctacaagatcctgctgctccaagcctaccggttccacgcttgcgtgcttcagctgccgtttcaccaacaggtgtggaagaacccgaccttctttctgcgggtcattagcgatactgcctccctgtgttactcaatcctcaaggcaaagaacgccggaatgtcgctgggtgcgaaaggagccgcgggacctcttcctagcgaagcggtgcagtggctctgccaccaggctttcctcctgaagctgaccaggcacagagtgacctacgtcccgctgctgggctcgctgcgcactgcacagacccagctgtctagaaaactccccggcaccaccctgaccgctctggaagccgccgccaacccagcattgccgtcagatttcaagaccatcttggac
配列番号14.プラスミド1326のポリペプチド(TERT343)
MASFLLSSLRPSLTGARRLVETIFLGSRPWMPGTPRRLPRLPQRYWQMRPLFLELLGNHAQCPYGVLLKTHCPLRAAVTPAAGVCAREKPQGSVAAPEEEDTDPRRLVQLLRQHSSPWQVYGFVRACLRRLVPPGLWGSRHNERRFLRNTKKFISLGKHAKLSLQELTWKMSVRDCAWLRRSPGVGCVPAAEHRLREEILAKFLHWLMSVYVVELLRSFFYVTETTFQKNRLFFYRKSVWSKLQSIGIRQHLKRVQLRELSEAEVRQHREARPALLTSRLRFIPKPDGLRPIVNMDYVVGARTFRREKRAERLTSRVKALFSVLNYERARRPGLLGASVLGLDDIHRAWRTFVLRVRAQDPPPELYFVKVAITGAYDTIPQDRLTEVIASIIKPQNTYCVRRYAVVQKAAHGHVRKAFKSHVSTLTDLQPYMRQFVAHLQETSPLRDAVVIEQSSSLNEASSGLFDVFLRFMCHHAVRIRGKSYVQCQGIPQGSILSTLLCSLCYGDMENKLFAGIRRDGLLLRLVDDFLLVTPHLTHAKTFLRTLVRGVPEYGCVVNLRKTVVNFPVEDEALGGTAFVQMPAHGLFPWCGLLLDTRTLEVQSDYSSYARTSIRASLTFNRGFKAGRNMRRKLFGVLRLKCHSLFLDLQVNSLQTVCTNIYKILLLQAYRFHACVLQLPFHQQVWKNPTFFLRVISDTASLCYSILKAKNAGMSLGAKGAAGPLPSEAVQWLCHQAFLLKLTRHRVTYVPLLGSLRTAQTQLSRKLPGTTLTALEAAANPALPSDFKTILD
配列番号15.プラスミド1197のORF(cMUC1)
atggctagcacaggctctggccacgccagctctacacctggcggcgagaaagagacaagcgccacccagagaagcagcgtgccaagcagcaccgagaagaacgccgtgtccatgaccagctccgtgctgagcagccactctcctggcagcggcagcagcacaacacagggccaggatgtgacactggcccctgccacagaacctgcctctggatctgccgccacctggggacaggacgtgacaagcgtgccagtgaccagacctgccctgggctctacaacaccccctgcccacgatgtgaccagcgcccctgataacaagcctgcccctggaagcacagcccctccagctcatggcgtgacctctgccccagataccagaccagccccaggatctacagccccacccgcacacggcgtgacaagtgcccctgacacaagacccgctccaggctctactgctcctcctgcccatggcgtgacaagcgctcccgatacaaggccagctcctggctccacagcaccaccagcacatggcgtgacatcagctcccgacactagacctgctcccggatcaaccgctccaccagctcacggcgtgaccagcgcacctgataccagacctgctctgggaagcaccgcccctcccgtgcacaatgtgacatctgcttccggcagcgccagcggctctgcctctacactggtgcacaacggcaccagcgccagagccacaacaaccccagccagcaagagcacccccttcagcatccctagccaccacagcgacacccctaccacactggccagccactccaccaagaccgatgcctctagcacccaccactccagcgtgccccctctgaccagcagcaaccacagcacaagcccccagctgtctaccggcgtctcattcttctttctgtccttccacatcagcaacctgcagttcaacagcagcctggaagatcccagcaccgactactaccaggaactgcagcgggatatcagcgagatgttcctgcaaatctacaagcagggcggcttcctgggcctgagcaacatcaagttcagacccggcagcgtggtggtgcagctgaccctggctttccgggaaggcaccatcaacgtgcacgacgtggaaacccagttcaaccagtacaagaccgaggccgccagccggtacaacctgaccatctccgatgtgtccgtgtccgacgtgcccttcccattctctgcccagtctggcgcaggcgtgccaggatggggaattgctctgctggtgctcgtgtgcgtgctggtggccctggccatcgtgtatctgattgccctggccgtgtgccagtgccggcggaagaattacggccagctggacatcttccccgccagagacacctaccaccccatgagcgagtaccccacataccacacccacggcagatacgtgccacccagctccaccgacagatccccctacgagaaagtgtctgccggcaacggcggcagctccctgagctacacaaatcctgccgtggccgctgcctccgccaacctg
配列番号16.プラスミド1197のポリペプチド)(cMUC1)
MASTGSGHASSTPGGEKETSATQRSSVPSSTEKNAVSMTSSVLSSHSPGSGSSTTQGQDVTLAPATEPASGSAATWGQDVTSVPVTRPALGSTTPPAHDVTSAPDNKPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPALGSTAPPVHNVTSASGSASGSASTLVHNGTSARATTTPASKSTPFSIPSHHSDTPTTLASHSTKTDASSTHHSSVPPLTSSNHSTSPQLSTGVSFFFLSFHISNLQFNSSLEDPSTDYYQELQRDISEMFLQIYKQGGFLGLSNIKFRPGSVVVQLTLAFREGTINVHDVETQFNQYKTEAASRYNLTISDVSVSDVPFPFSAQSGAGVPGWGIALLVLVCVLVALAIVYLIALAVCQCRRKNYGQLDIFPARDTYHPMSEYPTYHTHGRYVPPSSTDRSPYEKVSAGNGGSSLSYTNPAVAAASANL
配列番号17.プラスミド1316のORF
atggctagcctggctggcgagacaggacaggaagccgctcctctggacggcgtgctggccaaccctcccaatatcagcagcctgagccccagacagctgctgggattcccttgtgccgaggtgtccggcctgagcacagagagagtgcgggaactggctgtggccctggcccagaaaaacgtgaagctgagcaccgagcagctgcggtgcctggcccacagactgtctgagcctcccgaggatctggacgccctgcctctggatctgctgctgttcctgaaccccgacgccttcagcggacctcaggcctgcacccggttcttcagcagaatcaccaaggccaacgtggacctgctgcccagaggcgcccctgagagacagagactgctgcctgctgctctggcctgttggggagtgcggggctctctgctgtctgaagctgatgtgcgggccctgggaggcctggcttgtgatctgcctggaagattcgtggccgagagcgccgaagtgctgctgcctagactggtgtcctgtcccggccctctggaccaggatcagcaggaagctgccagagctgctctgcagggcggaggccctccttatggacctcctagcacttggagcgtgtccaccatggatgccctgaggggcctgctgccagtgctgggccagcctatcatcagatccatcccacagggcatcgtggccgcctggcggcagagaagctctagagatccctcttggcggcagcccgagcggacaatcctgcggcccaggtttcggagagaggtggaaaagaccgcctgcccctctggcaagaaggccagagagatcgacgagagcctgatcttctacaagaagtgggagctggaagcctgcgtggacgccgctctgctggccacccagatggacagagtgaacgccatccccttcacctatgagcagctggacgtgctgaagcacaagctggatgagctgtacccccagggctaccccgagagcgtgatccagcacctgggctacctgtttctgaagatgagccccgaggacatccggaagtggaacgtgaccagcctggaaaccctgaaggccctgctggaagtgaacaagggccacgagatgtccccccaggtggccacactgatcgacagattcgtgaagggcagaggccagctggacaaggacaccctggatacactgaccgccttctaccccggctatctgtgcagcctgtcccccgaggaactgagcagcgtgccacctagctctatctgggctgtgcggccccaggacctggatacctgcgatcctagacagctggatgtgctgtatcccaaggcccggctggccttccagaacatgaacggcagcgagtacttcgtgaagatccagtccttcctgggcggagcccctaccgaggacctgaaagctctgagccagcagaacgtgtccatggatctggccacctttatgaagctgcggaccgacgccgtgctgcctctgacagtggctgaggtgcagaaactgctgggcccccatgtggaagggctgaaggccgaagaacggcacagacccgtgcgcgactggatcctgaggcagagacaggatgacctggacacactgggcctgggactgcaggggggcatccctaatggctacctggtgctggacctgagcatgcaggaagccctgggatccggcagaatcttcaacgcccactacgccggctacttcgccgacctgctgatccacgacatcgagacaaaccctggccccacccctggaacccagagccccttcttccttctgctgctgctgaccgtgctgactgtcgtgacaggctctggccacgccagctctacacctggcggcgagaaagagacaagcgccacccagagaagcagcgtgccaagcagcaccgagaagaacgccgtgtccatgaccagctccgtgctgagcagccactctcctggcagcggcagcagcacaacacagggccaggatgtgacactggcccctgccacagaacctgcctctggatctgccgccacctggggacaggacgtgacaagcgtgccagtgaccagacctgccctgggctctacaacaccccctgcccacgatgtgaccagcgcccctgataacaagcctgcccctggaagcacagcccctccagctcatggcgtgacctctgccccagataccagaccagccccaggatctacagccccacccgcacacggcgtgacaagtgcccctgacacaagacccgctccaggctctactgctcctcctgcccatggcgtgacaagcgctcccgatacaaggccagctcctggctccacagcaccaccagcacatggcgtgacatcagctcccgacactagacctgctcccggatcaaccgctccaccagctcacggcgtgaccagcgcacctgataccagacctgctctgggaagcaccgcccctcccgtgcacaatgtgacatctgcttccggcagcgccagcggctctgcctctacactggtgcacaacggcaccagcgccagagccacaacaaccccagccagcaagagcacccccttcagcatccctagccaccacagcgacacccctaccacactggccagccactccaccaagaccgatgcctctagcacccaccactccagcgtgccccctctgaccagcagcaaccacagcacaagcccccagctgtctaccggcgtctcattcttctttctgtccttccacatcagcaacctgcagttcaacagcagcctggaagatcccagcaccgactactaccaggaactgcagcgggatatcagcgagatgttcctgcaaatctacaagcagggcggcttcctgggcctgagcaacatcaagttcagacccggcagcgtggtggtgcagctgaccctggctttccgggaaggcaccatcaacgtgcacgacgtggaaacccagttcaaccagtacaagaccgaggccgccagccggtacaacctgaccatctccgatgtgtccgtgtccgacgtgcccttcccattctctgcccagtctggcgcaggcgtgccaggatggggaattgctctgctggtgctcgtgtgcgtgctggtggccctggccatcgtgtatctgattgccctggccgtgtgccagtgccggcggaagaattacggccagctggacatcttccccgccagagacacctaccaccccatgagcgagtaccccacataccacacccacggcagatacgtgccacccagctccaccgacagatccccctacgagaaagtgtctgccggcaacggcggcagctccctgagctacacaaatcctgccgtggccgctgcctccgccaacctg
配列番号18.プラスミド1316のポリペプチド
MASLAGETGQEAAPLDGVLANPPNISSLSPRQLLGFPCAEVSGLSTERVRELAVALAQKNVKLSTEQLRCLAHRLSEPPEDLDALPLDLLLFLNPDAFSGPQACTRFFSRITKANVDLLPRGAPERQRLLPAALACWGVRGSLLSEADVRALGGLACDLPGRFVAESAEVLLPRLVSCPGPLDQDQQEAARAALQGGGPPYGPPSTWSVSTMDALRGLLPVLGQPIIRSIPQGIVAAWRQRSSRDPSWRQPERTILRPRFRREVEKTACPSGKKAREIDESLIFYKKWELEACVDAALLATQMDRVNAIPFTYEQLDVLKHKLDELYPQGYPESVIQHLGYLFLKMSPEDIRKWNVTSLETLKALLEVNKGHEMSPQVATLIDRFVKGRGQLDKDTLDTLTAFYPGYLCSLSPEELSSVPPSSIWAVRPQDLDTCDPRQLDVLYPKARLAFQNMNGSEYFVKIQSFLGGAPTEDLKALSQQNVSMDLATFMKLRTDAVLPLTVAEVQKLLGPHVEGLKAEERHRPVRDWILRQRQDDLDTLGLGLQGGIPNGYLVLDLSMQEALGSGRIFNAHYAGYFADLLIHDIETNPGPTPGTQSPFFLLLLLTVLTVVTGSGHASSTPGGEKETSATQRSSVPSSTEKNAVSMTSSVLSSHSPGSGSSTTQGQDVTLAPATEPASGSAATWGQDVTSVPVTRPALGSTTPPAHDVTSAPDNKPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPALGSTAPPVHNVTSASGSASGSASTLVHNGTSARATTTPASKSTPFSIPSHHSDTPTTLASHSTKTDASSTHHSSVPPLTSSNHSTSPQLSTGVSFFFLSFHISNLQFNSSLEDPSTDYYQELQRDISEMFLQIYKQGGFLGLSNIKFRPGSVVVQLTLAFREGTINVHDVETQFNQYKTEAASRYNLTISDVSVSDVPFPFSAQSGAGVPGWGIALLVLVCVLVALAIVYLIALAVCQCRRKNYGQLDIFPARDTYHPMSEYPTYHTHGRYVPPSSTDRSPYEKVSAGNGGSSLSYTNPAVAAASANL
配列番号19.プラスミド1313のORF
atggctagcacccctggaacccagagccccttcttccttctgctgctgctgaccgtgctgactgtcgtgacaggctctggccacgccagctctacacctggcggcgagaaagagacaagcgccacccagagaagcagcgtgccaagcagcaccgagaagaacgccgtgtccatgaccagctccgtgctgagcagccactctcctggcagcggcagcagcacaacacagggccaggatgtgacactggcccctgccacagaacctgcctctggatctgccgccacctggggacaggacgtgacaagcgtgccagtgaccagacctgccctgggctctacaacaccccctgcccacgatgtgaccagcgcccctgataacaagcctgcccctggaagcacagcccctccagctcatggcgtgacctctgccccagataccagaccagccccaggatctacagccccacccgcacacggcgtgacaagtgcccctgacacaagacccgctccaggctctactgctcctcctgcccatggcgtgacaagcgctcccgatacaaggccagctcctggctccacagcaccaccagcacatggcgtgacatcagctcccgacactagacctgctcccggatcaaccgctccaccagctcacggcgtgaccagcgcacctgataccagacctgctctgggaagcaccgcccctcccgtgcacaatgtgacatctgcttccggcagcgccagcggctctgcctctacactggtgcacaacggcaccagcgccagagccacaacaaccccagccagcaagagcacccccttcagcatccctagccaccacagcgacacccctaccacactggccagccactccaccaagaccgatgcctctagcacccaccactccagcgtgccccctctgaccagcagcaaccacagcacaagcccccagctgtctaccggcgtctcattcttctttctgtccttccacatcagcaacctgcagttcaacagcagcctggaagatcccagcaccgactactaccaggaactgcagcgggatatcagcgagatgttcctgcaaatctacaagcagggcggcttcctgggcctgagcaacatcaagttcagacccggcagcgtggtggtgcagctgaccctggctttccgggaaggcaccatcaacgtgcacgacgtggaaacccagttcaaccagtacaagaccgaggccgccagccggtacaacctgaccatctccgatgtgtccgtgtccgacgtgcccttcccattctctgcccagtctggcgcaggcgtgccaggatggggaattgctctgctggtgctcgtgtgcgtgctggtggccctggccatcgtgtatctgattgccctggccgtgtgccagtgccggcggaagaattacggccagctggacatcttccccgccagagacacctaccaccccatgagcgagtaccccacataccacacccacggcagatacgtgccacccagctccaccgacagatccccctacgagaaagtgtctgccggcaacggcggcagctccctgagctacacaaatcctgccgtggccgctgcctccgccaacctgggatccggcagaatcttcaacgcccactacgccggctacttcgccgacctgctgatccacgacatcgagacaaaccctggccccctggctggcgagacaggacaggaagccgctcctctggacggcgtgctggccaaccctcccaatatcagcagcctgagccccagacagctgctgggattcccttgtgccgaggtgtccggcctgagcacagagagagtgcgggaactggctgtggccctggcccagaaaaacgtgaagctgagcaccgagcagctgcggtgcctggcccacagactgtctgagcctcccgaggatctggacgccctgcctctggatctgctgctgttcctgaaccccgacgccttcagcggacctcaggcctgcacccggttcttcagcagaatcaccaaggccaacgtggacctgctgcccagaggcgcccctgagagacagagactgctgcctgctgctctggcctgttggggagtgcggggctctctgctgtctgaagctgatgtgcgggccctgggaggcctggcttgtgatctgcctggaagattcgtggccgagagcgccgaagtgctgctgcctagactggtgtcctgtcccggccctctggaccaggatcagcaggaagctgccagagctgctctgcagggcggaggccctccttatggacctcctagcacttggagcgtgtccaccatggatgccctgaggggcctgctgccagtgctgggccagcctatcatcagatccatcccacagggcatcgtggccgcctggcggcagagaagctctagagatccctcttggcggcagcccgagcggacaatcctgcggcccaggtttcggagagaggtggaaaagaccgcctgcccctctggcaagaaggccagagagatcgacgagagcctgatcttctacaagaagtgggagctggaagcctgcgtggacgccgctctgctggccacccagatggacagagtgaacgccatccccttcacctatgagcagctggacgtgctgaagcacaagctggatgagctgtacccccagggctaccccgagagcgtgatccagcacctgggctacctgtttctgaagatgagccccgaggacatccggaagtggaacgtgaccagcctggaaaccctgaaggccctgctggaagtgaacaagggccacgagatgtccccccaggtggccacactgatcgacagattcgtgaagggcagaggccagctggacaaggacaccctggatacactgaccgccttctaccccggctatctgtgcagcctgtcccccgaggaactgagcagcgtgccacctagctctatctgggctgtgcggccccaggacctggatacctgcgatcctagacagctggatgtgctgtatcccaaggcccggctggccttccagaacatgaacggcagcgagtacttcgtgaagatccagtccttcctgggcggagcccctaccgaggacctgaaagctctgagccagcagaacgtgtccatggatctggccacctttatgaagctgcggaccgacgccgtgctgcctctgacagtggctgaggtgcagaaactgctgggcccccatgtggaagggctgaaggccgaagaacggcacagacccgtgcgcgactggatcctgaggcagagacaggatgacctggacacactgggcctgggactgcaggggggcatccctaatggctacctggtgctggacctgagcatgcaggaagccctg
配列番号20.プラスミド1313のポリペプチド
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配列番号21.プラスミド1159のORF
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配列番号22.プラスミド1159のポリペプチド
MASTPGTQSPFFLLLLLTVLTVVTGSGHASSTPGGEKETSATQRSSVPSSTEKNAVSMTSSVLSSHSPGSGSSTTQGQDVTLAPATEPASGSAATWGQDVTSVPVTRPALGSTTPPAHDVTSAPDNKPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPALGSTAPPVHNVTSASGSASGSASTLVHNGTSARATTTPASKSTPFSIPSHHSDTPTTLASHSTKTDASSTHHSSVPPLTSSNHSTSPQLSTGVSFFFLSFHISNLQFNSSLEDPSTDYYQELQRDISEMFLQIYKQGGFLGLSNIKFRPGSVVVQLTLAFREGTINVHDVETQFNQYKTEAASRYNLTISDVSVSDVPFPFSAQSGAGVPGWGIALLVLVCVLVALAIVYLIALAVCQCRRKNYGQLDIFPARDTYHPMSEYPTYHTHGRYVPPSSTDRSPYEKVSAGNGGSSLSYTNPAVAAASANLGSGATNFSLLKQAGDVEENPGPLAGETGQEAAPLDGVLANPPNISSLSPRQLLGFPCAEVSGLSTERVRELAVALAQKNVKLSTEQLRCLAHRLSEPPEDLDALPLDLLLFLNPDAFSGPQACTRFFSRITKANVDLLPRGAPERQRLLPAALACWGVRGSLLSEADVRALGGLACDLPGRFVAESAEVLLPRLVSCPGPLDQDQQEAARAALQGGGPPYGPPSTWSVSTMDALRGLLPVLGQPIIRSIPQGIVAAWRQRSSRDPSWRQPERTILRPRFRREVEKTACPSGKKAREIDESLIFYKKWELEACVDAALLATQMDRVNAIPFTYEQLDVLKHKLDELYPQGYPESVIQHLGYLFLKMSPEDIRKWNVTSLETLKALLEVNKGHEMSPQVATLIDRFVKGRGQLDKDTLDTLTAFYPGYLCSLSPEELSSVPPSSIWAVRPQDLDTCDPRQLDVLYPKARLAFQNMNGSEYFVKIQSFLGGAPTEDLKALSQQNVSMDLATFMKLRTDAVLPLTVAEVQKLLGPHVEGLKAEERHRPVRDWILRQRQDDLDTLGLGLQGGIPNGYLVLDLSMQEAL
配列番号23.プラスミド1158のORF
atggctagcctggctggcgagacaggacaggaagccgctcctctggacggcgtgctggccaaccctcccaatatcagcagcctgagccccagacagctgctgggattcccttgtgccgaggtgtccggcctgagcacagagagagtgcgggaactggctgtggccctggcccagaaaaacgtgaagctgagcaccgagcagctgcggtgcctggcccacagactgtctgagcctcccgaggatctggacgccctgcctctggatctgctgctgttcctgaaccccgacgccttcagcggacctcaggcctgcacccggttcttcagcagaatcaccaaggccaacgtggacctgctgcccagaggcgcccctgagagacagagactgctgcctgctgctctggcctgttggggagtgcggggctctctgctgtctgaagctgatgtgcgggccctgggaggcctggcttgtgatctgcctggaagattcgtggccgagagcgccgaagtgctgctgcctagactggtgtcctgtcccggccctctggaccaggatcagcaggaagctgccagagctgctctgcagggcggaggccctccttatggacctcctagcacttggagcgtgtccaccatggatgccctgaggggcctgctgccagtgctgggccagcctatcatcagatccatcccacagggcatcgtggccgcctggcggcagagaagctctagagatccctcttggcggcagcccgagcggacaatcctgcggcccaggtttcggagagaggtggaaaagaccgcctgcccctctggcaagaaggccagagagatcgacgagagcctgatcttctacaagaagtgggagctggaagcctgcgtggacgccgctctgctggccacccagatggacagagtgaacgccatccccttcacctatgagcagctggacgtgctgaagcacaagctggatgagctgtacccccagggctaccccgagagcgtgatccagcacctgggctacctgtttctgaagatgagccccgaggacatccggaagtggaacgtgaccagcctggaaaccctgaaggccctgctggaagtgaacaagggccacgagatgtccccccaggtggccacactgatcgacagattcgtgaagggcagaggccagctggacaaggacaccctggatacactgaccgccttctaccccggctatctgtgcagcctgtcccccgaggaactgagcagcgtgccacctagctctatctgggctgtgcggccccaggacctggatacctgcgatcctagacagctggatgtgctgtatcccaaggcccggctggccttccagaacatgaacggcagcgagtacttcgtgaagatccagtccttcctgggcggagcccctaccgaggacctgaaagctctgagccagcagaacgtgtccatggatctggccacctttatgaagctgcggaccgacgccgtgctgcctctgacagtggctgaggtgcagaaactgctgggcccccatgtggaagggctgaaggccgaagaacggcacagacccgtgcgcgactggatcctgaggcagagacaggatgacctggacacactgggcctgggactgcaggggggcatccctaatggctacctggtgctggacctgagcatgcaggaagccctgggatccggcgccaccaatttcagcctgctgaaacaggccggcgacgtggaagagaaccctggccctacccctggaacccagagccccttcttccttctgctgctgctgaccgtgctgactgtcgtgacaggctctggccacgccagctctacacctggcggcgagaaagagacaagcgccacccagagaagcagcgtgccaagcagcaccgagaagaacgccgtgtccatgaccagctccgtgctgagcagccactctcctggcagcggcagcagcacaacacagggccaggatgtgacactggcccctgccacagaacctgcctctggatctgccgccacctggggacaggacgtgacaagcgtgccagtgaccagacctgccctgggctctacaacaccccctgcccacgatgtgaccagcgcccctgataacaagcctgcccctggaagcacagcccctccagctcatggcgtgacctctgccccagataccagaccagccccaggatctacagccccacccgcacacggcgtgacaagtgcccctgacacaagacccgctccaggctctactgctcctcctgcccatggcgtgacaagcgctcccgatacaaggccagctcctggctccacagcaccaccagcacatggcgtgacatcagctcccgacactagacctgctcccggatcaaccgctccaccagctcacggcgtgaccagcgcacctgataccagacctgctctgggaagcaccgcccctcccgtgcacaatgtgacatctgcttccggcagcgccagcggctctgcctctacactggtgcacaacggcaccagcgccagagccacaacaaccccagccagcaagagcacccccttcagcatccctagccaccacagcgacacccctaccacactggccagccactccaccaagaccgatgcctctagcacccaccactccagcgtgccccctctgaccagcagcaaccacagcacaagcccccagctgtctaccggcgtctcattcttctttctgtccttccacatcagcaacctgcagttcaacagcagcctggaagatcccagcaccgactactaccaggaactgcagcgggatatcagcgagatgttcctgcaaatctacaagcagggcggcttcctgggcctgagcaacatcaagttcagacccggcagcgtggtggtgcagctgaccctggctttccgggaaggcaccatcaacgtgcacgacgtggaaacccagttcaaccagtacaagaccgaggccgccagccggtacaacctgaccatctccgatgtgtccgtgtccgacgtgcccttcccattctctgcccagtctggcgcaggcgtgccaggatggggaattgctctgctggtgctcgtgtgcgtgctggtggccctggccatcgtgtatctgattgccctggccgtgtgccagtgccggcggaagaattacggccagctggacatcttccccgccagagacacctaccaccccatgagcgagtaccccacataccacacccacggcagatacgtgccacccagctccaccgacagatccccctacgagaaagtgtctgccggcaacggcggcagctccctgagctacacaaatcctgccgtggccgctgcctccgccaacctg
配列番号24.プラスミド1158のポリペプチド
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配列番号25.プラスミド1269のORF
atggctagcacccctggaacccagagccccttcttccttctgctgctgctgaccgtgctgactgtcgtgacaggctctggccacgccagctctacacctggcggcgagaaagagacaagcgccacccagagaagcagcgtgccaagcagcaccgagaagaacgccgtgtccatgaccagctccgtgctgagcagccactctcctggcagcggcagcagcacaacacagggccaggatgtgacactggcccctgccacagaacctgcctctggatctgccgccacctggggacaggacgtgacaagcgtgccagtgaccagacctgccctgggctctacaacaccccctgcccacgatgtgaccagcgcccctgataacaagcctgcccctggaagcacagcccctccagctcatggcgtgacctctgccccagataccagaccagccccaggatctacagccccacccgcacacggcgtgacaagtgcccctgacacaagacccgctccaggctctactgctcctcctgcccatggcgtgacaagcgctcccgatacaaggccagctcctggctccacagcaccaccagcacatggcgtgacatcagctcccgacactagacctgctcccggatcaaccgctccaccagctcacggcgtgaccagcgcacctgataccagacctgctctgggaagcaccgcccctcccgtgcacaatgtgacatctgcttccggcagcgccagcggctctgcctctacactggtgcacaacggcaccagcgccagagccacaacaaccccagccagcaagagcacccccttcagcatccctagccaccacagcgacacccctaccacactggccagccactccaccaagaccgatgcctctagcacccaccactccagcgtgccccctctgaccagcagcaaccacagcacaagcccccagctgtctaccggcgtctcattcttctttctgtccttccacatcagcaacctgcagttcaacagcagcctggaagatcccagcaccgactactaccaggaactgcagcgggatatcagcgagatgttcctgcaaatctacaagcagggcggcttcctgggcctgagcaacatcaagttcagacccggcagcgtggtggtgcagctgaccctggctttccgggaaggcaccatcaacgtgcacgacgtggaaacccagttcaaccagtacaagaccgaggccgccagccggtacaacctgaccatctccgatgtgtccgtgtccgacgtgcccttcccattctctgcccagtctggcgcaggcgtgccaggatggggaattgctctgctggtgctcgtgtgcgtgctggtggccctggccatcgtgtatctgattgccctggccgtgtgccagtgccggcggaagaattacggccagctggacatcttccccgccagagacacctaccaccccatgagcgagtaccccacataccacacccacggcagatacgtgccacccagctccaccgacagatccccctacgagaaagtgtctgccggcaacggcggcagctccctgagctacacaaatcctgccgtggccgctgcctccgccaacctgggaggctccggcggaggagctgccccggagccggagaggacccccgttggccagggatcgtgggcccatccgggacgcaccaggggaccatccgacaggggattctgtgtggtgtcaccggccaggccagcagaagaggcaaccagcctcgagggagcgttgtctggaaccagacattcccacccgtcggtgggccggcagcaccacgcgggaccaccgtccacttccagaccgccacggccatgggacaccccttgcccgcctgtgtatgccgagactaaacacttcctgtactcatccggagacaaggaacagcttcggccgtccttcctcctgtcgtcgctcagaccgagcctgaccggagcacgcagattggtggaaactatcttccttgggtcacgtccgtggatgccaggtaccccacggcgcctcccgcgcctcccacagagatactggcagatgcggcctctgttcctggaattgctgggaaaccacgctcagtgcccgtacggagtcctgctcaagactcactgccctctgagggcggcggtcactccggcggccggagtgtgcgcacgggagaagccccagggaagcgtggcagctccggaagaggaggacaccgatccgcgccgcctcgtgcaacttctgcgccagcactcctcgccctggcaagtctacgggttcgtccgcgcctgcctgcgccgcctggtgccgcctgggctctggggttcccggcataacgagcgccgcttcctgagaaatactaagaagtttatctcacttggaaaacatgccaagttgtcgctgcaagaactcacgtggaagatgtcagtccgcgattgcgcctggctgcgccgctcgccgggcgtcgggtgtgttccagctgcagaacaccgcctgagagaagaaattctggccaaatttctgcattggctgatgtcagtgtacgtggtcgagctgctgcgctcctttttctacgtcactgagactacctttcaaaagaaccgcctgttcttctaccgcaaatctgtgtggagcaagctgcagtcaatcggcattcgccagcatctgaagagggtgcagctgcgggaactttccgaggcagaagtccgccagcaccgggaggcccggccggcgcttctcacgtcgcgtctgagattcatcccaaagcccgacgggctgaggcctatcgtcaacatggattacgtcgtgggcgctcgcacctttcgccgtgaaaagcgggccgaacgcttgacctcacgggtgaaggccctcttctccgtgctgaactacgagagagcaagacggcctggcctgctgggagcttcggtgctgggactggacgatatccaccgggcttggcggacctttgttctccgggtgagagcccaagaccctccgccggaactgtacttcgtgaaggtggcgatcaccggagcctatgatactattccgcaagatcgactcaccgaagtcatcgcctcgatcatcaaaccgcagaacacttactgcgtcaggcggtacgccgtggtccagaaggccgcgcatggccacgtgagaaaggcgttcaagtcgcacgtgtccactctcaccgacctccagccttacatgaggcaattcgttgcgcatttgcaagagacttcgcccctgagagatgcggtggtcatcgagcagagctccagcctgaacgaagcgagcagcggtctgtttgacgtgttcctccgcttcatgtgtcatcacgcggtgcgaatcaggggaaaatcatacgtgcagtgccagggaatcccacaaggcagcattctgtcgactctcttgtgttccctttgctacggcgatatggaaaacaagctgttcgctgggatcagacgggacgggttgctgctcagactggtggacgacttcctgctggtgactccgcacctcactcacgccaaaacctttctccgcactctggtgaggggagtgccagaatacggctgtgtggtcaatctccggaaaactgtggtgaatttccctgtcgaggatgaggcactcggaggaaccgcatttgtccaaatgccagcacatggcctgttcccatggtgcggtctgctgctggacacccgaactcttgaagtgcagtccgactactccagctatgcccggacgagcatccgcgccagcctcactttcaatcgcggctttaaggccggacgaaacatgcgcagaaagcttttcggagtcctccggcttaaatgccattcgctctttctcgatctccaagtcaattcgctgcagaccgtgtgcacgaacatctacaagatcctgctgctccaagcctaccggttccacgcttgcgtgcttcagctgccgtttcaccaacaggtgtggaagaacccgaccttctttctgcgggtcattagcgatactgcctccctgtgttactcaatcctcaaggcaaagaacgccggaatgtcgctgggtgcgaaaggagccgcgggacctcttcctagcgaagcggtgcagtggctctgccaccaggctttcctcctgaagctgaccaggcacagagtgacctacgtcccgctgctgggctcgctgcgcactgcacagacccagctgtctagaaaactccccggcaccaccctgaccgctctggaagccgccgccaacccagcattgccgtcagatttcaagaccatcttggac
配列番号26.プラスミド1269のポリペプチド
MASTPGTQSPFFLLLLLTVLTVVTGSGHASSTPGGEKETSATQRSSVPSSTEKNAVSMTSSVLSSHSPGSGSSTTQGQDVTLAPATEPASGSAATWGQDVTSVPVTRPALGSTTPPAHDVTSAPDNKPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPALGSTAPPVHNVTSASGSASGSASTLVHNGTSARATTTPASKSTPFSIPSHHSDTPTTLASHSTKTDASSTHHSSVPPLTSSNHSTSPQLSTGVSFFFLSFHISNLQFNSSLEDPSTDYYQELQRDISEMFLQIYKQGGFLGLSNIKFRPGSVVVQLTLAFREGTINVHDVETQFNQYKTEAASRYNLTISDVSVSDVPFPFSAQSGAGVPGWGIALLVLVCVLVALAIVYLIALAVCQCRRKNYGQLDIFPARDTYHPMSEYPTYHTHGRYVPPSSTDRSPYEKVSAGNGGSSLSYTNPAVAAASANLGGSGGGAAPEPERTPVGQGSWAHPGRTRGPSDRGFCVVSPARPAEEATSLEGALSGTRHSHPSVGRQHHAGPPSTSRPPRPWDTPCPPVYAETKHFLYSSGDKEQLRPSFLLSSLRPSLTGARRLVETIFLGSRPWMPGTPRRLPRLPQRYWQMRPLFLELLGNHAQCPYGVLLKTHCPLRAAVTPAAGVCAREKPQGSVAAPEEEDTDPRRLVQLLRQHSSPWQVYGFVRACLRRLVPPGLWGSRHNERRFLRNTKKFISLGKHAKLSLQELTWKMSVRDCAWLRRSPGVGCVPAAEHRLREEILAKFLHWLMSVYVVELLRSFFYVTETTFQKNRLFFYRKSVWSKLQSIGIRQHLKRVQLRELSEAEVRQHREARPALLTSRLRFIPKPDGLRPIVNMDYVVGARTFRREKRAERLTSRVKALFSVLNYERARRPGLLGASVLGLDDIHRAWRTFVLRVRAQDPPPELYFVKVAITGAYDTIPQDRLTEVIASIIKPQNTYCVRRYAVVQKAAHGHVRKAFKSHVSTLTDLQPYMRQFVAHLQETSPLRDAVVIEQSSSLNEASSGLFDVFLRFMCHHAVRIRGKSYVQCQGIPQGSILSTLLCSLCYGDMENKLFAGIRRDGLLLRLVDDFLLVTPHLTHAKTFLRTLVRGVPEYGCVVNLRKTVVNFPVEDEALGGTAFVQMPAHGLFPWCGLLLDTRTLEVQSDYSSYARTSIRASLTFNRGFKAGRNMRRKLFGVLRLKCHSLFLDLQVNSLQTVCTNIYKILLLQAYRFHACVLQLPFHQQVWKNPTFFLRVISDTASLCYSILKAKNAGMSLGAKGAAGPLPSEAVQWLCHQAFLLKLTRHRVTYVPLLGSLRTAQTQLSRKLPGTTLTALEAAANPALPSDFKTILD
配列番号27.プラスミド1270のORF
atggctagcacccctggaacccagagccccttcttccttctgctgctgctgaccgtgctgactgtcgtgacaggctctggccacgccagctctacacctggcggcgagaaagagacaagcgccacccagagaagcagcgtgccaagcagcaccgagaagaacgccgtgtccatgaccagctccgtgctgagcagccactctcctggcagcggcagcagcacaacacagggccaggatgtgacactggcccctgccacagaacctgcctctggatctgccgccacctggggacaggacgtgacaagcgtgccagtgaccagacctgccctgggctctacaacaccccctgcccacgatgtgaccagcgcccctgataacaagcctgcccctggaagcacagcccctccagctcatggcgtgacctctgccccagataccagaccagccccaggatctacagccccacccgcacacggcgtgacaagtgcccctgacacaagacccgctccaggctctactgctcctcctgcccatggcgtgacaagcgctcccgatacaaggccagctcctggctccacagcaccaccagcacatggcgtgacatcagctcccgacactagacctgctcccggatcaaccgctccaccagctcacggcgtgaccagcgcacctgataccagacctgctctgggaagcaccgcccctcccgtgcacaatgtgacatctgcttccggcagcgccagcggctctgcctctacactggtgcacaacggcaccagcgccagagccacaacaaccccagccagcaagagcacccccttcagcatccctagccaccacagcgacacccctaccacactggccagccactccaccaagaccgatgcctctagcacccaccactccagcgtgccccctctgaccagcagcaaccacagcacaagcccccagctgtctaccggcgtctcattcttctttctgtccttccacatcagcaacctgcagttcaacagcagcctggaagatcccagcaccgactactaccaggaactgcagcgggatatcagcgagatgttcctgcaaatctacaagcagggcggcttcctgggcctgagcaacatcaagttcagacccggcagcgtggtggtgcagctgaccctggctttccgggaaggcaccatcaacgtgcacgacgtggaaacccagttcaaccagtacaagaccgaggccgccagccggtacaacctgaccatctccgatgtgtccgtgtccgacgtgcccttcccattctctgcccagtctggcgcaggcgtgccaggatggggaattgctctgctggtgctcgtgtgcgtgctggtggccctggccatcgtgtatctgattgccctggccgtgtgccagtgccggcggaagaattacggccagctggacatcttccccgccagagacacctaccaccccatgagcgagtaccccacataccacacccacggcagatacgtgccacccagctccaccgacagatccccctacgagaaagtgtctgccggcaacggcggcagctccctgagctacacaaatcctgccgtggccgctgcctccgccaacctgggatccggcacaatcctgtctgagggcgccaccaacttcagcctgctgaaactggccggcgacgtggaactgaaccctggccctggagctgccccggagccggagaggacccccgttggccagggatcgtgggcccatccgggacgcaccaggggaccatccgacaggggattctgtgtggtgtcaccggccaggccagcagaagaggcaaccagcctcgagggagcgttgtctggaaccagacattcccacccgtcggtgggccggcagcaccacgcgggaccaccgtccacttccagaccgccacggccatgggacaccccttgcccgcctgtgtatgccgagactaaacacttcctgtactcatccggagacaaggaacagcttcggccgtccttcctcctgtcgtcgctcagaccgagcctgaccggagcacgcagattggtggaaactatcttccttgggtcacgtccgtggatgccaggtaccccacggcgcctcccgcgcctcccacagagatactggcagatgcggcctctgttcctggaattgctgggaaaccacgctcagtgcccgtacggagtcctgctcaagactcactgccctctgagggcggcggtcactccggcggccggagtgtgcgcacgggagaagccccagggaagcgtggcagctccggaagaggaggacaccgatccgcgccgcctcgtgcaacttctgcgccagcactcctcgccctggcaagtctacgggttcgtccgcgcctgcctgcgccgcctggtgccgcctgggctctggggttcccggcataacgagcgccgcttcctgagaaatactaagaagtttatctcacttggaaaacatgccaagttgtcgctgcaagaactcacgtggaagatgtcagtccgcgattgcgcctggctgcgccgctcgccgggcgtcgggtgtgttccagctgcagaacaccgcctgagagaagaaattctggccaaatttctgcattggctgatgtcagtgtacgtggtcgagctgctgcgctcctttttctacgtcactgagactacctttcaaaagaaccgcctgttcttctaccgcaaatctgtgtggagcaagctgcagtcaatcggcattcgccagcatctgaagagggtgcagctgcgggaactttccgaggcagaagtccgccagcaccgggaggcccggccggcgcttctcacgtcgcgtctgagattcatcccaaagcccgacgggctgaggcctatcgtcaacatggattacgtcgtgggcgctcgcacctttcgccgtgaaaagcgggccgaacgcttgacctcacgggtgaaggccctcttctccgtgctgaactacgagagagcaagacggcctggcctgctgggagcttcggtgctgggactggacgatatccaccgggcttggcggacctttgttctccgggtgagagcccaagaccctccgccggaactgtacttcgtgaaggtggcgatcaccggagcctatgatactattccgcaagatcgactcaccgaagtcatcgcctcgatcatcaaaccgcagaacacttactgcgtcaggcggtacgccgtggtccagaaggccgcgcatggccacgtgagaaaggcgttcaagtcgcacgtgtccactctcaccgacctccagccttacatgaggcaattcgttgcgcatttgcaagagacttcgcccctgagagatgcggtggtcatcgagcagagctccagcctgaacgaagcgagcagcggtctgtttgacgtgttcctccgcttcatgtgtcatcacgcggtgcgaatcaggggaaaatcatacgtgcagtgccagggaatcccacaaggcagcattctgtcgactctcttgtgttccctttgctacggcgatatggaaaacaagctgttcgctgggatcagacgggacgggttgctgctcagactggtggacgacttcctgctggtgactccgcacctcactcacgccaaaacctttctccgcactctggtgaggggagtgccagaatacggctgtgtggtcaatctccggaaaactgtggtgaatttccctgtcgaggatgaggcactcggaggaaccgcatttgtccaaatgccagcacatggcctgttcccatggtgcggtctgctgctggacacccgaactcttgaagtgcagtccgactactccagctatgcccggacgagcatccgcgccagcctcactttcaatcgcggctttaaggccggacgaaacatgcgcagaaagcttttcggagtcctccggcttaaatgccattcgctctttctcgatctccaagtcaattcgctgcagaccgtgtgcacgaacatctacaagatcctgctgctccaagcctaccggttccacgcttgcgtgcttcagctgccgtttcaccaacaggtgtggaagaacccgaccttctttctgcgggtcattagcgatactgcctccctgtgttactcaatcctcaaggcaaagaacgccggaatgtcgctgggtgcgaaaggagccgcgggacctcttcctagcgaagcggtgcagtggctctgccaccaggctttcctcctgaagctgaccaggcacagagtgacctacgtcccgctgctgggctcgctgcgcactgcacagacccagctgtctagaaaactccccggcaccaccctgaccgctctggaagccgccgccaacccagcattgccgtcagatttcaagaccatcttggac
配列番号28.プラスミド1270のポリペプチド
MASTPGTQSPFFLLLLLTVLTVVTGSGHASSTPGGEKETSATQRSSVPSSTEKNAVSMTSSVLSSHSPGSGSSTTQGQDVTLAPATEPASGSAATWGQDVTSVPVTRPALGSTTPPAHDVTSAPDNKPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPALGSTAPPVHNVTSASGSASGSASTLVHNGTSARATTTPASKSTPFSIPSHHSDTPTTLASHSTKTDASSTHHSSVPPLTSSNHSTSPQLSTGVSFFFLSFHISNLQFNSSLEDPSTDYYQELQRDISEMFLQIYKQGGFLGLSNIKFRPGSVVVQLTLAFREGTINVHDVETQFNQYKTEAASRYNLTISDVSVSDVPFPFSAQSGAGVPGWGIALLVLVCVLVALAIVYLIALAVCQCRRKNYGQLDIFPARDTYHPMSEYPTYHTHGRYVPPSSTDRSPYEKVSAGNGGSSLSYTNPAVAAASANLGSGTILSEGATNFSLLKLAGDVELNPGPGAAPEPERTPVGQGSWAHPGRTRGPSDRGFCVVSPARPAEEATSLEGALSGTRHSHPSVGRQHHAGPPSTSRPPRPWDTPCPPVYAETKHFLYSSGDKEQLRPSFLLSSLRPSLTGARRLVETIFLGSRPWMPGTPRRLPRLPQRYWQMRPLFLELLGNHAQCPYGVLLKTHCPLRAAVTPAAGVCAREKPQGSVAAPEEEDTDPRRLVQLLRQHSSPWQVYGFVRACLRRLVPPGLWGSRHNERRFLRNTKKFISLGKHAKLSLQELTWKMSVRDCAWLRRSPGVGCVPAAEHRLREEILAKFLHWLMSVYVVELLRSFFYVTETTFQKNRLFFYRKSVWSKLQSIGIRQHLKRVQLRELSEAEVRQHREARPALLTSRLRFIPKPDGLRPIVNMDYVVGARTFRREKRAERLTSRVKALFSVLNYERARRPGLLGASVLGLDDIHRAWRTFVLRVRAQDPPPELYFVKVAITGAYDTIPQDRLTEVIASIIKPQNTYCVRRYAVVQKAAHGHVRKAFKSHVSTLTDLQPYMRQFVAHLQETSPLRDAVVIEQSSSLNEASSGLFDVFLRFMCHHAVRIRGKSYVQCQGIPQGSILSTLLCSLCYGDMENKLFAGIRRDGLLLRLVDDFLLVTPHLTHAKTFLRTLVRGVPEYGCVVNLRKTVVNFPVEDEALGGTAFVQMPAHGLFPWCGLLLDTRTLEVQSDYSSYARTSIRASLTFNRGFKAGRNMRRKLFGVLRLKCHSLFLDLQVNSLQTVCTNIYKILLLQAYRFHACVLQLPFHQQVWKNPTFFLRVISDTASLCYSILKAKNAGMSLGAKGAAGPLPSEAVQWLCHQAFLLKLTRHRVTYVPLLGSLRTAQTQLSRKLPGTTLTALEAAANPALPSDFKTILD
配列番号29.プラスミド1271のORF
atggctagcggagctgccccggagccggagaggacccccgttggccagggatcgtgggcccatccgggacgcaccaggggaccatccgacaggggattctgtgtggtgtcaccggccaggccagcagaagaggcaaccagcctcgagggagcgttgtctggaaccagacattcccacccgtcggtgggccggcagcaccacgcgggaccaccgtccacttccagaccgccacggccatgggacaccccttgcccgcctgtgtatgccgagactaaacacttcctgtactcatccggagacaaggaacagcttcggccgtccttcctcctgtcgtcgctcagaccgagcctgaccggagcacgcagattggtggaaactatcttccttgggtcacgtccgtggatgccaggtaccccacggcgcctcccgcgcctcccacagagatactggcagatgcggcctctgttcctggaattgctgggaaaccacgctcagtgcccgtacggagtcctgctcaagactcactgccctctgagggcggcggtcactccggcggccggagtgtgcgcacgggagaagccccagggaagcgtggcagctccggaagaggaggacaccgatccgcgccgcctcgtgcaacttctgcgccagcactcctcgccctggcaagtctacgggttcgtccgcgcctgcctgcgccgcctggtgccgcctgggctctggggttcccggcataacgagcgccgcttcctgagaaatactaagaagtttatctcacttggaaaacatgccaagttgtcgctgcaagaactcacgtggaagatgtcagtccgcgattgcgcctggctgcgccgctcgccgggcgtcgggtgtgttccagctgcagaacaccgcctgagagaagaaattctggccaaatttctgcattggctgatgtcagtgtacgtggtcgagctgctgcgctcctttttctacgtcactgagactacctttcaaaagaaccgcctgttcttctaccgcaaatctgtgtggagcaagctgcagtcaatcggcattcgccagcatctgaagagggtgcagctgcgggaactttccgaggcagaagtccgccagcaccgggaggcccggccggcgcttctcacgtcgcgtctgagattcatcccaaagcccgacgggctgaggcctatcgtcaacatggattacgtcgtgggcgctcgcacctttcgccgtgaaaagcgggccgaacgcttgacctcacgggtgaaggccctcttctccgtgctgaactacgagagagcaagacggcctggcctgctgggagcttcggtgctgggactggacgatatccaccgggcttggcggacctttgttctccgggtgagagcccaagaccctccgccggaactgtacttcgtgaaggtggcgatcaccggagcctatgatactattccgcaagatcgactcaccgaagtcatcgcctcgatcatcaaaccgcagaacacttactgcgtcaggcggtacgccgtggtccagaaggccgcgcatggccacgtgagaaaggcgttcaagtcgcacgtgtccactctcaccgacctccagccttacatgaggcaattcgttgcgcatttgcaagagacttcgcccctgagagatgcggtggtcatcgagcagagctccagcctgaacgaagcgagcagcggtctgtttgacgtgttcctccgcttcatgtgtcatcacgcggtgcgaatcaggggaaaatcatacgtgcagtgccagggaatcccacaaggcagcattctgtcgactctcttgtgttccctttgctacggcgatatggaaaacaagctgttcgctgggatcagacgggacgggttgctgctcagactggtggacgacttcctgctggtgactccgcacctcactcacgccaaaacctttctccgcactctggtgaggggagtgccagaatacggctgtgtggtcaatctccggaaaactgtggtgaatttccctgtcgaggatgaggcactcggaggaaccgcatttgtccaaatgccagcacatggcctgttcccatggtgcggtctgctgctggacacccgaactcttgaagtgcagtccgactactccagctatgcccggacgagcatccgcgccagcctcactttcaatcgcggctttaaggccggacgaaacatgcgcagaaagcttttcggagtcctccggcttaaatgccattcgctctttctcgatctccaagtcaattcgctgcagaccgtgtgcacgaacatctacaagatcctgctgctccaagcctaccggttccacgcttgcgtgcttcagctgccgtttcaccaacaggtgtggaagaacccgaccttctttctgcgggtcattagcgatactgcctccctgtgttactcaatcctcaaggcaaagaacgccggaatgtcgctgggtgcgaaaggagccgcgggacctcttcctagcgaagcggtgcagtggctctgccaccaggctttcctcctgaagctgaccaggcacagagtgacctacgtcccgctgctgggctcgctgcgcactgcacagacccagctgtctagaaaactccccggcaccaccctgaccgctctggaagccgccgccaacccagcattgccgtcagatttcaagaccatcttggacggatccggcacaatcctgtctgagggcgccaccaacttcagcctgctgaaactggccggcgacgtggaactgaaccctggccctacccctggaacccagagccccttcttccttctgctgctgctgaccgtgctgactgtcgtgacaggctctggccacgccagctctacacctggcggcgagaaagagacaagcgccacccagagaagcagcgtgccaagcagcaccgagaagaacgccgtgtccatgaccagctccgtgctgagcagccactctcctggcagcggcagcagcacaacacagggccaggatgtgacactggcccctgccacagaacctgcctctggatctgccgccacctggggacaggacgtgacaagcgtgccagtgaccagacctgccctgggctctacaacaccccctgcccacgatgtgaccagcgcccctgataacaagcctgcccctggaagcacagcccctccagctcatggcgtgacctctgccccagataccagaccagccccaggatctacagccccacccgcacacggcgtgacaagtgcccctgacacaagacccgctccaggctctactgctcctcctgcccatggcgtgacaagcgctcccgatacaaggccagctcctggctccacagcaccaccagcacatggcgtgacatcagctcccgacactagacctgctcccggatcaaccgctccaccagctcacggcgtgaccagcgcacctgataccagacctgctctgggaagcaccgcccctcccgtgcacaatgtgacatctgcttccggcagcgccagcggctctgcctctacactggtgcacaacggcaccagcgccagagccacaacaaccccagccagcaagagcacccccttcagcatccctagccaccacagcgacacccctaccacactggccagccactccaccaagaccgatgcctctagcacccaccactccagcgtgccccctctgaccagcagcaaccacagcacaagcccccagctgtctaccggcgtctcattcttctttctgtccttccacatcagcaacctgcagttcaacagcagcctggaagatcccagcaccgactactaccaggaactgcagcgggatatcagcgagatgttcctgcaaatctacaagcagggcggcttcctgggcctgagcaacatcaagttcagacccggcagcgtggtggtgcagctgaccctggctttccgggaaggcaccatcaacgtgcacgacgtggaaacccagttcaaccagtacaagaccgaggccgccagccggtacaacctgaccatctccgatgtgtccgtgtccgacgtgcccttcccattctctgcccagtctggcgcaggcgtgccaggatggggaattgctctgctggtgctcgtgtgcgtgctggtggccctggccatcgtgtatctgattgccctggccgtgtgccagtgccggcggaagaattacggccagctggacatcttccccgccagagacacctaccaccccatgagcgagtaccccacataccacacccacggcagatacgtgccacccagctccaccgacagatccccctacgagaaagtgtctgccggcaacggcggcagctccctgagctacacaaatcctgccgtggccgctgcctccgccaacctg
配列番号30.プラスミド1271のポリペプチド
MASGAAPEPERTPVGQGSWAHPGRTRGPSDRGFCVVSPARPAEEATSLEGALSGTRHSHPSVGRQHHAGPPSTSRPPRPWDTPCPPVYAETKHFLYSSGDKEQLRPSFLLSSLRPSLTGARRLVETIFLGSRPWMPGTPRRLPRLPQRYWQMRPLFLELLGNHAQCPYGVLLKTHCPLRAAVTPAAGVCAREKPQGSVAAPEEEDTDPRRLVQLLRQHSSPWQVYGFVRACLRRLVPPGLWGSRHNERRFLRNTKKFISLGKHAKLSLQELTWKMSVRDCAWLRRSPGVGCVPAAEHRLREEILAKFLHWLMSVYVVELLRSFFYVTETTFQKNRLFFYRKSVWSKLQSIGIRQHLKRVQLRELSEAEVRQHREARPALLTSRLRFIPKPDGLRPIVNMDYVVGARTFRREKRAERLTSRVKALFSVLNYERARRPGLLGASVLGLDDIHRAWRTFVLRVRAQDPPPELYFVKVAITGAYDTIPQDRLTEVIASIIKPQNTYCVRRYAVVQKAAHGHVRKAFKSHVSTLTDLQPYMRQFVAHLQETSPLRDAVVIEQSSSLNEASSGLFDVFLRFMCHHAVRIRGKSYVQCQGIPQGSILSTLLCSLCYGDMENKLFAGIRRDGLLLRLVDDFLLVTPHLTHAKTFLRTLVRGVPEYGCVVNLRKTVVNFPVEDEALGGTAFVQMPAHGLFPWCGLLLDTRTLEVQSDYSSYARTSIRASLTFNRGFKAGRNMRRKLFGVLRLKCHSLFLDLQVNSLQTVCTNIYKILLLQAYRFHACVLQLPFHQQVWKNPTFFLRVISDTASLCYSILKAKNAGMSLGAKGAAGPLPSEAVQWLCHQAFLLKLTRHRVTYVPLLGSLRTAQTQLSRKLPGTTLTALEAAANPALPSDFKTILDGSGTILSEGATNFSLLKLAGDVELNPGPTPGTQSPFFLLLLLTVLTVVTGSGHASSTPGGEKETSATQRSSVPSSTEKNAVSMTSSVLSSHSPGSGSSTTQGQDVTLAPATEPASGSAATWGQDVTSVPVTRPALGSTTPPAHDVTSAPDNKPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPALGSTAPPVHNVTSASGSASGSASTLVHNGTSARATTTPASKSTPFSIPSHHSDTPTTLASHSTKTDASSTHHSSVPPLTSSNHSTSPQLSTGVSFFFLSFHISNLQFNSSLEDPSTDYYQELQRDISEMFLQIYKQGGFLGLSNIKFRPGSVVVQLTLAFREGTINVHDVETQFNQYKTEAASRYNLTISDVSVSDVPFPFSAQSGAGVPGWGIALLVLVCVLVALAIVYLIALAVCQCRRKNYGQLDIFPARDTYHPMSEYPTYHTHGRYVPPSSTDRSPYEKVSAGNGGSSLSYTNPAVAAASANL
配列番号31.プラスミド1286のORF
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配列番号32.プラスミド1286のポリペプチド
MASTGSGHASSTPGGEKETSATQRSSVPSSTEKNAVSMTSSVLSSHSPGSGSSTTQGQDVTLAPATEPASGSAATWGQDVTSVPVTRPALGSTTPPAHDVTSAPDNKPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPALGSTAPPVHNVTSASGSASGSASTLVHNGTSARATTTPASKSTPFSIPSHHSDTPTTLASHSTKTDASSTHHSSVPPLTSSNHSTSPQLSTGVSFFFLSFHISNLQFNSSLEDPSTDYYQELQRDISEMFLQIYKQGGFLGLSNIKFRPGSVVVQLTLAFREGTINVHDVETQFNQYKTEAASRYNLTISDVSVSDVPFPFSAQSGAGVPGWGIALLVLVCVLVALAIVYLIALAVCQCRRKNYGQLDIFPARDTYHPMSEYPTYHTHGRYVPPSSTDRSPYEKVSAGNGGSSLSYTNPAVAAASANLGSGTILSEGATNFSLLKLAGDVELNPGPGAAPEPERTPVGQGSWAHPGRTRGPSDRGFCVVSPARPAEEATSLEGALSGTRHSHPSVGRQHHAGPPSTSRPPRPWDTPCPPVYAETKHFLYSSGDKEQLRPSFLLSSLRPSLTGARRLVETIFLGSRPWMPGTPRRLPRLPQRYWQMRPLFLELLGNHAQCPYGVLLKTHCPLRAAVTPAAGVCAREKPQGSVAAPEEEDTDPRRLVQLLRQHSSPWQVYGFVRACLRRLVPPGLWGSRHNERRFLRNTKKFISLGKHAKLSLQELTWKMSVRDCAWLRRSPGVGCVPAAEHRLREEILAKFLHWLMSVYVVELLRSFFYVTETTFQKNRLFFYRKSVWSKLQSIGIRQHLKRVQLRELSEAEVRQHREARPALLTSRLRFIPKPDGLRPIVNMDYVVGARTFRREKRAERLTSRVKALFSVLNYERARRPGLLGASVLGLDDIHRAWRTFVLRVRAQDPPPELYFVKVAITGAYDTIPQDRLTEVIASIIKPQNTYCVRRYAVVQKAAHGHVRKAFKSHVSTLTDLQPYMRQFVAHLQETSPLRDAVVIEQSSSLNEASSGLFDVFLRFMCHHAVRIRGKSYVQCQGIPQGSILSTLLCSLCYGDMENKLFAGIRRDGLLLRLVDDFLLVTPHLTHAKTFLRTLVRGVPEYGCVVNLRKTVVNFPVEDEALGGTAFVQMPAHGLFPWCGLLLDTRTLEVQSDYSSYARTSIRASLTFNRGFKAGRNMRRKLFGVLRLKCHSLFLDLQVNSLQTVCTNIYKILLLQAYRFHACVLQLPFHQQVWKNPTFFLRVISDTASLCYSILKAKNAGMSLGAKGAAGPLPSEAVQWLCHQAFLLKLTRHRVTYVPLLGSLRTAQTQLSRKLPGTTLTALEAAANPALPSDFKTILD
配列番号33.プラスミド1287のORF
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配列番号34.プラスミド1287のポリペプチド
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配列番号35.プラスミド1272のORF
atggctagcggagctgccccggagccggagaggacccccgttggccagggatcgtgggcccatccgggacgcaccaggggaccatccgacaggggattctgtgtggtgtcaccggccaggccagcagaagaggcaaccagcctcgagggagcgttgtctggaaccagacattcccacccgtcggtgggccggcagcaccacgcgggaccaccgtccacttccagaccgccacggccatgggacaccccttgcccgcctgtgtatgccgagactaaacacttcctgtactcatccggagacaaggaacagcttcggccgtccttcctcctgtcgtcgctcagaccgagcctgaccggagcacgcagattggtggaaactatcttccttgggtcacgtccgtggatgccaggtaccccacggcgcctcccgcgcctcccacagagatactggcagatgcggcctctgttcctggaattgctgggaaaccacgctcagtgcccgtacggagtcctgctcaagactcactgccctctgagggcggcggtcactccggcggccggagtgtgcgcacgggagaagccccagggaagcgtggcagctccggaagaggaggacaccgatccgcgccgcctcgtgcaacttctgcgccagcactcctcgccctggcaagtctacgggttcgtccgcgcctgcctgcgccgcctggtgccgcctgggctctggggttcccggcataacgagcgccgcttcctgagaaatactaagaagtttatctcacttggaaaacatgccaagttgtcgctgcaagaactcacgtggaagatgtcagtccgcgattgcgcctggctgcgccgctcgccgggcgtcgggtgtgttccagctgcagaacaccgcctgagagaagaaattctggccaaatttctgcattggctgatgtcagtgtacgtggtcgagctgctgcgctcctttttctacgtcactgagactacctttcaaaagaaccgcctgttcttctaccgcaaatctgtgtggagcaagctgcagtcaatcggcattcgccagcatctgaagagggtgcagctgcgggaactttccgaggcagaagtccgccagcaccgggaggcccggccggcgcttctcacgtcgcgtctgagattcatcccaaagcccgacgggctgaggcctatcgtcaacatggattacgtcgtgggcgctcgcacctttcgccgtgaaaagcgggccgaacgcttgacctcacgggtgaaggccctcttctccgtgctgaactacgagagagcaagacggcctggcctgctgggagcttcggtgctgggactggacgatatccaccgggcttggcggacctttgttctccgggtgagagcccaagaccctccgccggaactgtacttcgtgaaggtggcgatcaccggagcctatgatactattccgcaagatcgactcaccgaagtcatcgcctcgatcatcaaaccgcagaacacttactgcgtcaggcggtacgccgtggtccagaaggccgcgcatggccacgtgagaaaggcgttcaagtcgcacgtgtccactctcaccgacctccagccttacatgaggcaattcgttgcgcatttgcaagagacttcgcccctgagagatgcggtggtcatcgagcagagctccagcctgaacgaagcgagcagcggtctgtttgacgtgttcctccgcttcatgtgtcatcacgcggtgcgaatcaggggaaaatcatacgtgcagtgccagggaatcccacaaggcagcattctgtcgactctcttgtgttccctttgctacggcgatatggaaaacaagctgttcgctgggatcagacgggacgggttgctgctcagactggtggacgacttcctgctggtgactccgcacctcactcacgccaaaacctttctccgcactctggtgaggggagtgccagaatacggctgtgtggtcaatctccggaaaactgtggtgaatttccctgtcgaggatgaggcactcggaggaaccgcatttgtccaaatgccagcacatggcctgttcccatggtgcggtctgctgctggacacccgaactcttgaagtgcagtccgactactccagctatgcccggacgagcatccgcgccagcctcactttcaatcgcggctttaaggccggacgaaacatgcgcagaaagcttttcggagtcctccggcttaaatgccattcgctctttctcgatctccaagtcaattcgctgcagaccgtgtgcacgaacatctacaagatcctgctgctccaagcctaccggttccacgcttgcgtgcttcagctgccgtttcaccaacaggtgtggaagaacccgaccttctttctgcgggtcattagcgatactgcctccctgtgttactcaatcctcaaggcaaagaacgccggaatgtcgctgggtgcgaaaggagccgcgggacctcttcctagcgaagcggtgcagtggctctgccaccaggctttcctcctgaagctgaccaggcacagagtgacctacgtcccgctgctgggctcgctgcgcactgcacagacccagctgtctagaaaactccccggcaccaccctgaccgctctggaagccgccgccaacccagcattgccgtcagatttcaagaccatcttggacggatccggcgagggcagaggcagcctgctgacatgtggcgacgtggaagagaaccctggccccctggctggcgagacaggacaggaagccgctcctctggacggcgtgctggccaaccctcccaatatcagcagcctgagccccagacagctgctgggattcccttgtgccgaggtgtccggcctgagcacagagagagtgcgggaactggctgtggccctggcccagaaaaacgtgaagctgagcaccgagcagctgcggtgcctggcccacagactgtctgagcctcccgaggatctggacgccctgcctctggatctgctgctgttcctgaaccccgacgccttcagcggacctcaggcctgcacccggttcttcagcagaatcaccaaggccaacgtggacctgctgcccagaggcgcccctgagagacagagactgctgcctgctgctctggcctgttggggagtgcggggctctctgctgtctgaagctgatgtgcgggccctgggaggcctggcttgtgatctgcctggaagattcgtggccgagagcgccgaagtgctgctgcctagactggtgtcctgtcccggccctctggaccaggatcagcaggaagctgccagagctgctctgcagggcggaggccctccttatggacctcctagcacttggagcgtgtccaccatggatgccctgaggggcctgctgccagtgctgggccagcctatcatcagatccatcccacagggcatcgtggccgcctggcggcagagaagctctagagatccctcttggcggcagcccgagcggacaatcctgcggcccaggtttcggagagaggtggaaaagaccgcctgcccctctggcaagaaggccagagagatcgacgagagcctgatcttctacaagaagtgggagctggaagcctgcgtggacgccgctctgctggccacccagatggacagagtgaacgccatccccttcacctatgagcagctggacgtgctgaagcacaagctggatgagctgtacccccagggctaccccgagagcgtgatccagcacctgggctacctgtttctgaagatgagccccgaggacatccggaagtggaacgtgaccagcctggaaaccctgaaggccctgctggaagtgaacaagggccacgagatgtccccccaggtggccacactgatcgacagattcgtgaagggcagaggccagctggacaaggacaccctggatacactgaccgccttctaccccggctatctgtgcagcctgtcccccgaggaactgagcagcgtgccacctagctctatctgggctgtgcggccccaggacctggatacctgcgatcctagacagctggatgtgctgtatcccaaggcccggctggccttccagaacatgaacggcagcgagtacttcgtgaagatccagtccttcctgggcggagcccctaccgaggacctgaaagctctgagccagcagaacgtgtccatggatctggccacctttatgaagctgcggaccgacgccgtgctgcctctgacagtggctgaggtgcagaaactgctgggcccccatgtggaagggctgaaggccgaagaacggcacagacccgtgcgcgactggatcctgaggcagagacaggatgacctggacacactgggcctgggactgcaggggggcatccctaatggctacctggtgctggacctgagcatgcaggaagccctg
配列番号36.プラスミド1272のポリペプチド
MASGAAPEPERTPVGQGSWAHPGRTRGPSDRGFCVVSPARPAEEATSLEGALSGTRHSHPSVGRQHHAGPPSTSRPPRPWDTPCPPVYAETKHFLYSSGDKEQLRPSFLLSSLRPSLTGARRLVETIFLGSRPWMPGTPRRLPRLPQRYWQMRPLFLELLGNHAQCPYGVLLKTHCPLRAAVTPAAGVCAREKPQGSVAAPEEEDTDPRRLVQLLRQHSSPWQVYGFVRACLRRLVPPGLWGSRHNERRFLRNTKKFISLGKHAKLSLQELTWKMSVRDCAWLRRSPGVGCVPAAEHRLREEILAKFLHWLMSVYVVELLRSFFYVTETTFQKNRLFFYRKSVWSKLQSIGIRQHLKRVQLRELSEAEVRQHREARPALLTSRLRFIPKPDGLRPIVNMDYVVGARTFRREKRAERLTSRVKALFSVLNYERARRPGLLGASVLGLDDIHRAWRTFVLRVRAQDPPPELYFVKVAITGAYDTIPQDRLTEVIASIIKPQNTYCVRRYAVVQKAAHGHVRKAFKSHVSTLTDLQPYMRQFVAHLQETSPLRDAVVIEQSSSLNEASSGLFDVFLRFMCHHAVRIRGKSYVQCQGIPQGSILSTLLCSLCYGDMENKLFAGIRRDGLLLRLVDDFLLVTPHLTHAKTFLRTLVRGVPEYGCVVNLRKTVVNFPVEDEALGGTAFVQMPAHGLFPWCGLLLDTRTLEVQSDYSSYARTSIRASLTFNRGFKAGRNMRRKLFGVLRLKCHSLFLDLQVNSLQTVCTNIYKILLLQAYRFHACVLQLPFHQQVWKNPTFFLRVISDTASLCYSILKAKNAGMSLGAKGAAGPLPSEAVQWLCHQAFLLKLTRHRVTYVPLLGSLRTAQTQLSRKLPGTTLTALEAAANPALPSDFKTILDGSGEGRGSLLTCGDVEENPGPLAGETGQEAAPLDGVLANPPNISSLSPRQLLGFPCAEVSGLSTERVRELAVALAQKNVKLSTEQLRCLAHRLSEPPEDLDALPLDLLLFLNPDAFSGPQACTRFFSRITKANVDLLPRGAPERQRLLPAALACWGVRGSLLSEADVRALGGLACDLPGRFVAESAEVLLPRLVSCPGPLDQDQQEAARAALQGGGPPYGPPSTWSVSTMDALRGLLPVLGQPIIRSIPQGIVAAWRQRSSRDPSWRQPERTILRPRFRREVEKTACPSGKKAREIDESLIFYKKWELEACVDAALLATQMDRVNAIPFTYEQLDVLKHKLDELYPQGYPESVIQHLGYLFLKMSPEDIRKWNVTSLETLKALLEVNKGHEMSPQVATLIDRFVKGRGQLDKDTLDTLTAFYPGYLCSLSPEELSSVPPSSIWAVRPQDLDTCDPRQLDVLYPKARLAFQNMNGSEYFVKIQSFLGGAPTEDLKALSQQNVSMDLATFMKLRTDAVLPLTVAEVQKLLGPHVEGLKAEERHRPVRDWILRQRQDDLDTLGLGLQGGIPNGYLVLDLSMQEAL
配列番号37.プラスミド1273のORF
atggctagcggagctgccccggagccggagaggacccccgttggccagggatcgtgggcccatccgggacgcaccaggggaccatccgacaggggattctgtgtggtgtcaccggccaggccagcagaagaggcaaccagcctcgagggagcgttgtctggaaccagacattcccacccgtcggtgggccggcagcaccacgcgggaccaccgtccacttccagaccgccacggccatgggacaccccttgcccgcctgtgtatgccgagactaaacacttcctgtactcatccggagacaaggaacagcttcggccgtccttcctcctgtcgtcgctcagaccgagcctgaccggagcacgcagattggtggaaactatcttccttgggtcacgtccgtggatgccaggtaccccacggcgcctcccgcgcctcccacagagatactggcagatgcggcctctgttcctggaattgctgggaaaccacgctcagtgcccgtacggagtcctgctcaagactcactgccctctgagggcggcggtcactccggcggccggagtgtgcgcacgggagaagccccagggaagcgtggcagctccggaagaggaggacaccgatccgcgccgcctcgtgcaacttctgcgccagcactcctcgccctggcaagtctacgggttcgtccgcgcctgcctgcgccgcctggtgccgcctgggctctggggttcccggcataacgagcgccgcttcctgagaaatactaagaagtttatctcacttggaaaacatgccaagttgtcgctgcaagaactcacgtggaagatgtcagtccgcgattgcgcctggctgcgccgctcgccgggcgtcgggtgtgttccagctgcagaacaccgcctgagagaagaaattctggccaaatttctgcattggctgatgtcagtgtacgtggtcgagctgctgcgctcctttttctacgtcactgagactacctttcaaaagaaccgcctgttcttctaccgcaaatctgtgtggagcaagctgcagtcaatcggcattcgccagcatctgaagagggtgcagctgcgggaactttccgaggcagaagtccgccagcaccgggaggcccggccggcgcttctcacgtcgcgtctgagattcatcccaaagcccgacgggctgaggcctatcgtcaacatggattacgtcgtgggcgctcgcacctttcgccgtgaaaagcgggccgaacgcttgacctcacgggtgaaggccctcttctccgtgctgaactacgagagagcaagacggcctggcctgctgggagcttcggtgctgggactggacgatatccaccgggcttggcggacctttgttctccgggtgagagcccaagaccctccgccggaactgtacttcgtgaaggtggcgatcaccggagcctatgatactattccgcaagatcgactcaccgaagtcatcgcctcgatcatcaaaccgcagaacacttactgcgtcaggcggtacgccgtggtccagaaggccgcgcatggccacgtgagaaaggcgttcaagtcgcacgtgtccactctcaccgacctccagccttacatgaggcaattcgttgcgcatttgcaagagacttcgcccctgagagatgcggtggtcatcgagcagagctccagcctgaacgaagcgagcagcggtctgtttgacgtgttcctccgcttcatgtgtcatcacgcggtgcgaatcaggggaaaatcatacgtgcagtgccagggaatcccacaaggcagcattctgtcgactctcttgtgttccctttgctacggcgatatggaaaacaagctgttcgctgggatcagacgggacgggttgctgctcagactggtggacgacttcctgctggtgactccgcacctcactcacgccaaaacctttctccgcactctggtgaggggagtgccagaatacggctgtgtggtcaatctccggaaaactgtggtgaatttccctgtcgaggatgaggcactcggaggaaccgcatttgtccaaatgccagcacatggcctgttcccatggtgcggtctgctgctggacacccgaactcttgaagtgcagtccgactactccagctatgcccggacgagcatccgcgccagcctcactttcaatcgcggctttaaggccggacgaaacatgcgcagaaagcttttcggagtcctccggcttaaatgccattcgctctttctcgatctccaagtcaattcgctgcagaccgtgtgcacgaacatctacaagatcctgctgctccaagcctaccggttccacgcttgcgtgcttcagctgccgtttcaccaacaggtgtggaagaacccgaccttctttctgcgggtcattagcgatactgcctccctgtgttactcaatcctcaaggcaaagaacgccggaatgtcgctgggtgcgaaaggagccgcgggacctcttcctagcgaagcggtgcagtggctctgccaccaggctttcctcctgaagctgaccaggcacagagtgacctacgtcccgctgctgggctcgctgcgcactgcacagacccagctgtctagaaaactccccggcaccaccctgaccgctctggaagccgccgccaacccagcattgccgtcagatttcaagaccatcttggacggaggctccggcggactggctggcgagacaggacaggaagccgctcctctggacggcgtgctggccaaccctcccaatatcagcagcctgagccccagacagctgctgggattcccttgtgccgaggtgtccggcctgagcacagagagagtgcgggaactggctgtggccctggcccagaaaaacgtgaagctgagcaccgagcagctgcggtgcctggcccacagactgtctgagcctcccgaggatctggacgccctgcctctggatctgctgctgttcctgaaccccgacgccttcagcggacctcaggcctgcacccggttcttcagcagaatcaccaaggccaacgtggacctgctgcccagaggcgcccctgagagacagagactgctgcctgctgctctggcctgttggggagtgcggggctctctgctgtctgaagctgatgtgcgggccctgggaggcctggcttgtgatctgcctggaagattcgtggccgagagcgccgaagtgctgctgcctagactggtgtcctgtcccggccctctggaccaggatcagcaggaagctgccagagctgctctgcagggcggaggccctccttatggacctcctagcacttggagcgtgtccaccatggatgccctgaggggcctgctgccagtgctgggccagcctatcatcagatccatcccacagggcatcgtggccgcctggcggcagagaagctctagagatccctcttggcggcagcccgagcggacaatcctgcggcccaggtttcggagagaggtggaaaagaccgcctgcccctctggcaagaaggccagagagatcgacgagagcctgatcttctacaagaagtgggagctggaagcctgcgtggacgccgctctgctggccacccagatggacagagtgaacgccatccccttcacctatgagcagctggacgtgctgaagcacaagctggatgagctgtacccccagggctaccccgagagcgtgatccagcacctgggctacctgtttctgaagatgagccccgaggacatccggaagtggaacgtgaccagcctggaaaccctgaaggccctgctggaagtgaacaagggccacgagatgtccccccaggtggccacactgatcgacagattcgtgaagggcagaggccagctggacaaggacaccctggatacactgaccgccttctaccccggctatctgtgcagcctgtcccccgaggaactgagcagcgtgccacctagctctatctgggctgtgcggccccaggacctggatacctgcgatcctagacagctggatgtgctgtatcccaaggcccggctggccttccagaacatgaacggcagcgagtacttcgtgaagatccagtccttcctgggcggagcccctaccgaggacctgaaagctctgagccagcagaacgtgtccatggatctggccacctttatgaagctgcggaccgacgccgtgctgcctctgacagtggctgaggtgcagaaactgctgggcccccatgtggaagggctgaaggccgaagaacggcacagacccgtgcgcgactggatcctgaggcagagacaggatgacctggacacactgggcctgggactgcaggggggcatccctaatggctacctggtgctggacctgagcatgcaggaagccctg
配列番号38.プラスミド1273のポリペプチド
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配列番号39.プラスミド1274のORF
atggctagcctggctggcgagacaggacaggaagccgctcctctggacggcgtgctggccaaccctcccaatatcagcagcctgagccccagacagctgctgggattcccttgtgccgaggtgtccggcctgagcacagagagagtgcgggaactggctgtggccctggcccagaaaaacgtgaagctgagcaccgagcagctgcggtgcctggcccacagactgtctgagcctcccgaggatctggacgccctgcctctggatctgctgctgttcctgaaccccgacgccttcagcggacctcaggcctgcacccggttcttcagcagaatcaccaaggccaacgtggacctgctgcccagaggcgcccctgagagacagagactgctgcctgctgctctggcctgttggggagtgcggggctctctgctgtctgaagctgatgtgcgggccctgggaggcctggcttgtgatctgcctggaagattcgtggccgagagcgccgaagtgctgctgcctagactggtgtcctgtcccggccctctggaccaggatcagcaggaagctgccagagctgctctgcagggcggaggccctccttatggacctcctagcacttggagcgtgtccaccatggatgccctgaggggcctgctgccagtgctgggccagcctatcatcagatccatcccacagggcatcgtggccgcctggcggcagagaagctctagagatccctcttggcggcagcccgagcggacaatcctgcggcccaggtttcggagagaggtggaaaagaccgcctgcccctctggcaagaaggccagagagatcgacgagagcctgatcttctacaagaagtgggagctggaagcctgcgtggacgccgctctgctggccacccagatggacagagtgaacgccatccccttcacctatgagcagctggacgtgctgaagcacaagctggatgagctgtacccccagggctaccccgagagcgtgatccagcacctgggctacctgtttctgaagatgagccccgaggacatccggaagtggaacgtgaccagcctggaaaccctgaaggccctgctggaagtgaacaagggccacgagatgtccccccaggtggccacactgatcgacagattcgtgaagggcagaggccagctggacaaggacaccctggatacactgaccgccttctaccccggctatctgtgcagcctgtcccccgaggaactgagcagcgtgccacctagctctatctgggctgtgcggccccaggacctggatacctgcgatcctagacagctggatgtgctgtatcccaaggcccggctggccttccagaacatgaacggcagcgagtacttcgtgaagatccagtccttcctgggcggagcccctaccgaggacctgaaagctctgagccagcagaacgtgtccatggatctggccacctttatgaagctgcggaccgacgccgtgctgcctctgacagtggctgaggtgcagaaactgctgggcccccatgtggaagggctgaaggccgaagaacggcacagacccgtgcgcgactggatcctgaggcagagacaggatgacctggacacactgggcctgggactgcaggggggcatccctaatggctacctggtgctggacctgagcatgcaggaagccctgggatccggcgagggcagaggcagcctgctgacatgtggcgacgtggaagagaaccctggccccggagctgccccggagccggagaggacccccgttggccagggatcgtgggcccatccgggacgcaccaggggaccatccgacaggggattctgtgtggtgtcaccggccaggccagcagaagaggcaaccagcctcgagggagcgttgtctggaaccagacattcccacccgtcggtgggccggcagcaccacgcgggaccaccgtccacttccagaccgccacggccatgggacaccccttgcccgcctgtgtatgccgagactaaacacttcctgtactcatccggagacaaggaacagcttcggccgtccttcctcctgtcgtcgctcagaccgagcctgaccggagcacgcagattggtggaaactatcttccttgggtcacgtccgtggatgccaggtaccccacggcgcctcccgcgcctcccacagagatactggcagatgcggcctctgttcctggaattgctgggaaaccacgctcagtgcccgtacggagtcctgctcaagactcactgccctctgagggcggcggtcactccggcggccggagtgtgcgcacgggagaagccccagggaagcgtggcagctccggaagaggaggacaccgatccgcgccgcctcgtgcaacttctgcgccagcactcctcgccctggcaagtctacgggttcgtccgcgcctgcctgcgccgcctggtgccgcctgggctctggggttcccggcataacgagcgccgcttcctgagaaatactaagaagtttatctcacttggaaaacatgccaagttgtcgctgcaagaactcacgtggaagatgtcagtccgcgattgcgcctggctgcgccgctcgccgggcgtcgggtgtgttccagctgcagaacaccgcctgagagaagaaattctggccaaatttctgcattggctgatgtcagtgtacgtggtcgagctgctgcgctcctttttctacgtcactgagactacctttcaaaagaaccgcctgttcttctaccgcaaatctgtgtggagcaagctgcagtcaatcggcattcgccagcatctgaagagggtgcagctgcgggaactttccgaggcagaagtccgccagcaccgggaggcccggccggcgcttctcacgtcgcgtctgagattcatcccaaagcccgacgggctgaggcctatcgtcaacatggattacgtcgtgggcgctcgcacctttcgccgtgaaaagcgggccgaacgcttgacctcacgggtgaaggccctcttctccgtgctgaactacgagagagcaagacggcctggcctgctgggagcttcggtgctgggactggacgatatccaccgggcttggcggacctttgttctccgggtgagagcccaagaccctccgccggaactgtacttcgtgaaggtggcgatcaccggagcctatgatactattccgcaagatcgactcaccgaagtcatcgcctcgatcatcaaaccgcagaacacttactgcgtcaggcggtacgccgtggtccagaaggccgcgcatggccacgtgagaaaggcgttcaagtcgcacgtgtccactctcaccgacctccagccttacatgaggcaattcgttgcgcatttgcaagagacttcgcccctgagagatgcggtggtcatcgagcagagctccagcctgaacgaagcgagcagcggtctgtttgacgtgttcctccgcttcatgtgtcatcacgcggtgcgaatcaggggaaaatcatacgtgcagtgccagggaatcccacaaggcagcattctgtcgactctcttgtgttccctttgctacggcgatatggaaaacaagctgttcgctgggatcagacgggacgggttgctgctcagactggtggacgacttcctgctggtgactccgcacctcactcacgccaaaacctttctccgcactctggtgaggggagtgccagaatacggctgtgtggtcaatctccggaaaactgtggtgaatttccctgtcgaggatgaggcactcggaggaaccgcatttgtccaaatgccagcacatggcctgttcccatggtgcggtctgctgctggacacccgaactcttgaagtgcagtccgactactccagctatgcccggacgagcatccgcgccagcctcactttcaatcgcggctttaaggccggacgaaacatgcgcagaaagcttttcggagtcctccggcttaaatgccattcgctctttctcgatctccaagtcaattcgctgcagaccgtgtgcacgaacatctacaagatcctgctgctccaagcctaccggttccacgcttgcgtgcttcagctgccgtttcaccaacaggtgtggaagaacccgaccttctttctgcgggtcattagcgatactgcctccctgtgttactcaatcctcaaggcaaagaacgccggaatgtcgctgggtgcgaaaggagccgcgggacctcttcctagcgaagcggtgcagtggctctgccaccaggctttcctcctgaagctgaccaggcacagagtgacctacgtcccgctgctgggctcgctgcgcactgcacagacccagctgtctagaaaactccccggcaccaccctgaccgctctggaagccgccgccaacccagcattgccgtcagatttcaagaccatcttggac
配列番号40.プラスミド1274のポリペプチド
MASLAGETGQEAAPLDGVLANPPNISSLSPRQLLGFPCAEVSGLSTERVRELAVALAQKNVKLSTEQLRCLAHRLSEPPEDLDALPLDLLLFLNPDAFSGPQACTRFFSRITKANVDLLPRGAPERQRLLPAALACWGVRGSLLSEADVRALGGLACDLPGRFVAESAEVLLPRLVSCPGPLDQDQQEAARAALQGGGPPYGPPSTWSVSTMDALRGLLPVLGQPIIRSIPQGIVAAWRQRSSRDPSWRQPERTILRPRFRREVEKTACPSGKKAREIDESLIFYKKWELEACVDAALLATQMDRVNAIPFTYEQLDVLKHKLDELYPQGYPESVIQHLGYLFLKMSPEDIRKWNVTSLETLKALLEVNKGHEMSPQVATLIDRFVKGRGQLDKDTLDTLTAFYPGYLCSLSPEELSSVPPSSIWAVRPQDLDTCDPRQLDVLYPKARLAFQNMNGSEYFVKIQSFLGGAPTEDLKALSQQNVSMDLATFMKLRTDAVLPLTVAEVQKLLGPHVEGLKAEERHRPVRDWILRQRQDDLDTLGLGLQGGIPNGYLVLDLSMQEALGSGEGRGSLLTCGDVEENPGPGAAPEPERTPVGQGSWAHPGRTRGPSDRGFCVVSPARPAEEATSLEGALSGTRHSHPSVGRQHHAGPPSTSRPPRPWDTPCPPVYAETKHFLYSSGDKEQLRPSFLLSSLRPSLTGARRLVETIFLGSRPWMPGTPRRLPRLPQRYWQMRPLFLELLGNHAQCPYGVLLKTHCPLRAAVTPAAGVCAREKPQGSVAAPEEEDTDPRRLVQLLRQHSSPWQVYGFVRACLRRLVPPGLWGSRHNERRFLRNTKKFISLGKHAKLSLQELTWKMSVRDCAWLRRSPGVGCVPAAEHRLREEILAKFLHWLMSVYVVELLRSFFYVTETTFQKNRLFFYRKSVWSKLQSIGIRQHLKRVQLRELSEAEVRQHREARPALLTSRLRFIPKPDGLRPIVNMDYVVGARTFRREKRAERLTSRVKALFSVLNYERARRPGLLGASVLGLDDIHRAWRTFVLRVRAQDPPPELYFVKVAITGAYDTIPQDRLTEVIASIIKPQNTYCVRRYAVVQKAAHGHVRKAFKSHVSTLTDLQPYMRQFVAHLQETSPLRDAVVIEQSSSLNEASSGLFDVFLRFMCHHAVRIRGKSYVQCQGIPQGSILSTLLCSLCYGDMENKLFAGIRRDGLLLRLVDDFLLVTPHLTHAKTFLRTLVRGVPEYGCVVNLRKTVVNFPVEDEALGGTAFVQMPAHGLFPWCGLLLDTRTLEVQSDYSSYARTSIRASLTFNRGFKAGRNMRRKLFGVLRLKCHSLFLDLQVNSLQTVCTNIYKILLLQAYRFHACVLQLPFHQQVWKNPTFFLRVISDTASLCYSILKAKNAGMSLGAKGAAGPLPSEAVQWLCHQAFLLKLTRHRVTYVPLLGSLRTAQTQLSRKLPGTTLTALEAAANPALPSDFKTILD
配列番号41.プラスミド1275のORF
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配列番号42.プラスミド1275のポリペプチド
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配列番号43.プラスミド1317のORF
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配列番号44.プラスミド1317のポリペプチド
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配列番号45.プラスミド1318のORF
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配列番号46.プラスミド1318のポリペプチド
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配列番号47.プラスミド1319のORF
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配列番号48.プラスミド1319のポリペプチド
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配列番号49.プラスミド1320のORF
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配列番号50.プラスミド1320のポリペプチド
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配列番号51.プラスミド1321のORF
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配列番号52.プラスミド1321のポリペプチド
MASGAAPEPERTPVGQGSWAHPGRTRGPSDRGFCVVSPARPAEEATSLEGALSGTRHSHPSVGRQHHAGPPSTSRPPRPWDTPCPPVYAETKHFLYSSGDKEQLRPSFLLSSLRPSLTGARRLVETIFLGSRPWMPGTPRRLPRLPQRYWQMRPLFLELLGNHAQCPYGVLLKTHCPLRAAVTPAAGVCAREKPQGSVAAPEEEDTDPRRLVQLLRQHSSPWQVYGFVRACLRRLVPPGLWGSRHNERRFLRNTKKFISLGKHAKLSLQELTWKMSVRDCAWLRRSPGVGCVPAAEHRLREEILAKFLHWLMSVYVVELLRSFFYVTETTFQKNRLFFYRKSVWSKLQSIGIRQHLKRVQLRELSEAEVRQHREARPALLTSRLRFIPKPDGLRPIVNMDYVVGARTFRREKRAERLTSRVKALFSVLNYERARRPGLLGASVLGLDDIHRAWRTFVLRVRAQDPPPELYFVKVAITGAYDTIPQDRLTEVIASIIKPQNTYCVRRYAVVQKAAHGHVRKAFKSHVSTLTDLQPYMRQFVAHLQETSPLRDAVVIEQSSSLNEASSGLFDVFLRFMCHHAVRIRGKSYVQCQGIPQGSILSTLLCSLCYGDMENKLFAGIRRDGLLLRLVDDFLLVTPHLTHAKTFLRTLVRGVPEYGCVVNLRKTVVNFPVEDEALGGTAFVQMPAHGLFPWCGLLLDTRTLEVQSDYSSYARTSIRASLTFNRGFKAGRNMRRKLFGVLRLKCHSLFLDLQVNSLQTVCTNIYKILLLQAYRFHACVLQLPFHQQVWKNPTFFLRVISDTASLCYSILKAKNAGMSLGAKGAAGPLPSEAVQWLCHQAFLLKLTRHRVTYVPLLGSLRTAQTQLSRKLPGTTLTALEAAANPALPSDFKTILDGSGEGRGSLLTCGDVEENPGPLAGETGQEAAPLDGVLANPPNISSLSPRQLLGFPCAEVSGLSTERVRELAVALAQKNVKLSTEQLRCLAHRLSEPPEDLDALPLDLLLFLNPDAFSGPQACTRFFSRITKANVDLLPRGAPERQRLLPAALACWGVRGSLLSEADVRALGGLACDLPGRFVAESAEVLLPRLVSCPGPLDQDQQEAARAALQGGGPPYGPPSTWSVSTMDALRGLLPVLGQPIIRSIPQGIVAAWRQRSSRDPSWRQPERTILRPRFRREVEKTACPSGKKAREIDESLIFYKKWELEACVDAALLATQMDRVNAIPFTYEQLDVLKHKLDELYPQGYPESVIQHLGYLFLKMSPEDIRKWNVTSLETLKALLEVNKGHEMSPQVATLIDRFVKGRGQLDKDTLDTLTAFYPGYLCSLSPEELSSVPPSSIWAVRPQDLDTCDPRQLDVLYPKARLAFQNMNGSEYFVKIQSFLGGAPTEDLKALSQQNVSMDLATFMKLRTDAVLPLTVAEVQKLLGPHVEGLKAEERHRPVRDWILRQRQDDLDTLGLGLQGGIPNGYLVLDLSMQEALGSGRIFNAHYAGYFADLLIHDIETNPGPTPGTQSPFFLLLLLTVLTVVTGSGHASSTPGGEKETSATQRSSVPSSTEKNAVSMTSSVLSSHSPGSGSSTTQGQDVTLAPATEPASGSAATWGQDVTSVPVTRPALGSTTPPAHDVTSAPDNKPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPALGSTAPPVHNVTSASGSASGSASTLVHNGTSARATTTPASKSTPFSIPSHHSDTPTTLASHSTKTDASSTHHSSVPPLTSSNHSTSPQLSTGVSFFFLSFHISNLQFNSSLEDPSTDYYQELQRDISEMFLQIYKQGGFLGLSNIKFRPGSVVVQLTLAFREGTINVHDVETQFNQYKTEAASRYNLTISDVSVSDVPFPFSAQSGAGVPGWGIALLVLVCVLVALAIVYLIALAVCQCRRKNYGQLDIFPARDTYHPMSEYPTYHTHGRYVPPSSTDRSPYEKVSAGNGGSSLSYTNPAVAAASANL
配列番号53.プラスミド1322のORF
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配列番号54.プラスミド1322のポリペプチド
MASGAAPEPERTPVGQGSWAHPGRTRGPSDRGFCVVSPARPAEEATSLEGALSGTRHSHPSVGRQHHAGPPSTSRPPRPWDTPCPPVYAETKHFLYSSGDKEQLRPSFLLSSLRPSLTGARRLVETIFLGSRPWMPGTPRRLPRLPQRYWQMRPLFLELLGNHAQCPYGVLLKTHCPLRAAVTPAAGVCAREKPQGSVAAPEEEDTDPRRLVQLLRQHSSPWQVYGFVRACLRRLVPPGLWGSRHNERRFLRNTKKFISLGKHAKLSLQELTWKMSVRDCAWLRRSPGVGCVPAAEHRLREEILAKFLHWLMSVYVVELLRSFFYVTETTFQKNRLFFYRKSVWSKLQSIGIRQHLKRVQLRELSEAEVRQHREARPALLTSRLRFIPKPDGLRPIVNMDYVVGARTFRREKRAERLTSRVKALFSVLNYERARRPGLLGASVLGLDDIHRAWRTFVLRVRAQDPPPELYFVKVAITGAYDTIPQDRLTEVIASIIKPQNTYCVRRYAVVQKAAHGHVRKAFKSHVSTLTDLQPYMRQFVAHLQETSPLRDAVVIEQSSSLNEASSGLFDVFLRFMCHHAVRIRGKSYVQCQGIPQGSILSTLLCSLCYGDMENKLFAGIRRDGLLLRLVDDFLLVTPHLTHAKTFLRTLVRGVPEYGCVVNLRKTVVNFPVEDEALGGTAFVQMPAHGLFPWCGLLLDTRTLEVQSDYSSYARTSIRASLTFNRGFKAGRNMRRKLFGVLRLKCHSLFLDLQVNSLQTVCTNIYKILLLQAYRFHACVLQLPFHQQVWKNPTFFLRVISDTASLCYSILKAKNAGMSLGAKGAAGPLPSEAVQWLCHQAFLLKLTRHRVTYVPLLGSLRTAQTQLSRKLPGTTLTALEAAANPALPSDFKTILDGSGTILSEGATNFSLLKLAGDVELNPGPTPGTQSPFFLLLLLTVLTVVTGSGHASSTPGGEKETSATQRSSVPSSTEKNAVSMTSSVLSSHSPGSGSSTTQGQDVTLAPATEPASGSAATWGQDVTSVPVTRPALGSTTPPAHDVTSAPDNKPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPALGSTAPPVHNVTSASGSASGSASTLVHNGTSARATTTPASKSTPFSIPSHHSDTPTTLASHSTKTDASSTHHSSVPPLTSSNHSTSPQLSTGVSFFFLSFHISNLQFNSSLEDPSTDYYQELQRDISEMFLQIYKQGGFLGLSNIKFRPGSVVVQLTLAFREGTINVHDVETQFNQYKTEAASRYNLTISDVSVSDVPFPFSAQSGAGVPGWGIALLVLVCVLVALAIVYLIALAVCQCRRKNYGQLDIFPARDTYHPMSEYPTYHTHGRYVPPSSTDRSPYEKVSAGNGGSSLSYTNPAVAAASANLGSGRIFNAHYAGYFADLLIHDIETNPGPLAGETGQEAAPLDGVLANPPNISSLSPRQLLGFPCAEVSGLSTERVRELAVALAQKNVKLSTEQLRCLAHRLSEPPEDLDALPLDLLLFLNPDAFSGPQACTRFFSRITKANVDLLPRGAPERQRLLPAALACWGVRGSLLSEADVRALGGLACDLPGRFVAESAEVLLPRLVSCPGPLDQDQQEAARAALQGGGPPYGPPSTWSVSTMDALRGLLPVLGQPIIRSIPQGIVAAWRQRSSRDPSWRQPERTILRPRFRREVEKTACPSGKKAREIDESLIFYKKWELEACVDAALLATQMDRVNAIPFTYEQLDVLKHKLDELYPQGYPESVIQHLGYLFLKMSPEDIRKWNVTSLETLKALLEVNKGHEMSPQVATLIDRFVKGRGQLDKDTLDTLTAFYPGYLCSLSPEELSSVPPSSIWAVRPQDLDTCDPRQLDVLYPKARLAFQNMNGSEYFVKIQSFLGGAPTEDLKALSQQNVSMDLATFMKLRTDAVLPLTVAEVQKLLGPHVEGLKAEERHRPVRDWILRQRQDDLDTLGLGLQGGIPNGYLVLDLSMQEAL
配列番号55.プラスミド1351のORF
atggctagcacccctggaacccagagccccttcttccttctgctgctgctgaccgtgctgactgtcgtgacaggctctggccacgccagctctacacctggcggcgagaaagagacaagcgccacccagagaagcagcgtgccaagcagcaccgagaagaacgccgtgtccatgaccagctccgtgctgagcagccactctcctggcagcggcagcagcacaacacagggccaggatgtgacactggcccctgccacagaacctgcctctggatctgccgccacctggggacaggacgtgacaagcgtgccagtgaccagacctgccctgggctctacaacaccccctgcccacgatgtgaccagcgcccctgataacaagcctgcccctggaagcacagcccctccagctcatggcgtgacctctgccccagataccagaccagccccaggatctacagccccacccgcacacggcgtgacaagtgcccctgacacaagacccgctccaggctctactgctcctcctgcccatggcgtgacaagcgctcccgatacaaggccagctcctggctccacagcaccaccagcacatggcgtgacatcagctcccgacactagacctgctcccggatcaaccgctccaccagctcacggcgtgaccagcgcacctgataccagacctgctctgggaagcaccgcccctcccgtgcacaatgtgacatctgcttccggcagcgccagcggctctgcctctacactggtgcacaacggcaccagcgccagagccacaacaaccccagccagcaagagcacccccttcagcatccctagccaccacagcgacacccctaccacactggccagccactccaccaagaccgatgcctctagcacccaccactccagcgtgccccctctgaccagcagcaaccacagcacaagcccccagctgtctaccggcgtctcattcttctttctgtccttccacatcagcaacctgcagttcaacagcagcctggaagatcccagcaccgactactaccaggaactgcagcgggatatcagcgagatgttcctgcaaatctacaagcagggcggcttcctgggcctgagcaacatcaagttcagacccggcagcgtggtggtgcagctgaccctggctttccgggaaggcaccatcaacgtgcacgacgtggaaacccagttcaaccagtacaagaccgaggccgccagccggtacaacctgaccatctccgatgtgtccgtgtccgacgtgcccttcccattctctgcccagtctggcgcaggcgtgccaggatggggaattgctctgctggtgctcgtgtgcgtgctggtggccctggccatcgtgtatctgattgccctggccgtgtgccagtgccggcggaagaattacggccagctggacatcttccccgccagagacacctaccaccccatgagcgagtaccccacataccacacccacggcagatacgtgccacccagctccaccgacagatccccctacgagaaagtgtctgccggcaacggcggcagctccctgagctacacaaatcctgccgtggccgctgcctccgccaacctgggatccggcagaatcttcaacgcccactacgccggctacttcgccgacctgctgatccacgacatcgagacaaaccctggccccctggctggcgagacaggacaggaagccgctcctctggacggcgtgctggccaaccctcccaatatcagcagcctgagccccagacagctgctgggattcccttgtgccgaggtgtccggcctgagcacagagagagtgcgggaactggctgtggccctggcccagaaaaacgtgaagctgagcaccgagcagctgcggtgcctggcccacagactgtctgagcctcccgaggatctggacgccctgcctctggatctgctgctgttcctgaaccccgacgccttcagcggacctcaggcctgcacccggttcttcagcagaatcaccaaggccaacgtggacctgctgcccagaggcgcccctgagagacagagactgctgcctgctgctctggcctgttggggagtgcggggctctctgctgtctgaagctgatgtgcgggccctgggaggcctggcttgtgatctgcctggaagattcgtggccgagagcgccgaagtgctgctgcctagactggtgtcctgtcccggccctctggaccaggatcagcaggaagctgccagagctgctctgcagggcggaggccctccttatggacctcctagcacttggagcgtgtccaccatggatgccctgaggggcctgctgccagtgctgggccagcctatcatcagatccatcccacagggcatcgtggccgcctggcggcagagaagctctagagatccctcttggcggcagcccgagcggacaatcctgcggcccaggtttcggagagaggtggaaaagaccgcctgcccctctggcaagaaggccagagagatcgacgagagcctgatcttctacaagaagtgggagctggaagcctgcgtggacgccgctctgctggccacccagatggacagagtgaacgccatccccttcacctatgagcagctggacgtgctgaagcacaagctggatgagctgtacccccagggctaccccgagagcgtgatccagcacctgggctacctgtttctgaagatgagccccgaggacatccggaagtggaacgtgaccagcctggaaaccctgaaggccctgctggaagtgaacaagggccacgagatgtccccccaggtggccacactgatcgacagattcgtgaagggcagaggccagctggacaaggacaccctggatacactgaccgccttctaccccggctatctgtgcagcctgtcccccgaggaactgagcagcgtgccacctagctctatctgggctgtgcggccccaggacctggatacctgcgatcctagacagctggatgtgctgtatcccaaggcccggctggccttccagaacatgaacggcagcgagtacttcgtgaagatccagtccttcctgggcggagcccctaccgaggacctgaaagctctgagccagcagaacgtgtccatggatctggccacctttatgaagctgcggaccgacgccgtgctgcctctgacagtggctgaggtgcagaaactgctgggcccccatgtggaagggctgaaggccgaagaacggcacagacccgtgcgcgactggatcctgaggcagagacaggatgacctggacacactgggcctgggactgcaggggggcatccctaatggctacctggtgctggacctgagcatgcaggaagccctgggatccggcgagggcagaggcagcctgctgacatgtggcgacgtggaagagaaccctggccccgccaaatttctgcattggctgatgtcagtgtacgtggtcgagctgctgcgctcctttttctacgtcactgagactacctttcaaaagaaccgcctgttcttctaccgcaaatctgtgtggagcaagctgcagtcaatcggcattcgccagcatctgaagagggtgcagctgcgggaactttccgaggcagaagtccgccagcaccgggaggcccggccggcgcttctcacgtcgcgtctgagattcatcccaaagcccgacgggctgaggcctatcgtcaacatggattacgtcgtgggcgctcgcacctttcgccgtgaaaagcgggccgaacgcttgacctcacgggtgaaggccctcttctccgtgctgaactacgagagagcaagacggcctggcctgctgggagcttcggtgctgggactggacgatatccaccgggcttggcggacctttgttctccgggtgagagcccaagaccctccgccggaactgtacttcgtgaaggtggcgatcaccggagcctatgatactattccgcaagatcgactcaccgaagtcatcgcctcgatcatcaaaccgcagaacacttactgcgtcaggcggtacgccgtggtccagaaggccgcgcatggccacgtgagaaaggcgttcaagtcgcacgtgtccactctcaccgacctccagccttacatgaggcaattcgttgcgcatttgcaagagacttcgcccctgagagatgcggtggtcatcgagcagagctccagcctgaacgaagcgagcagcggtctgtttgacgtgttcctccgcttcatgtgtcatcacgcggtgcgaatcaggggaaaatcatacgtgcagtgccagggaatcccacaaggcagcattctgtcgactctcttgtgttccctttgctacggcgatatggaaaacaagctgttcgctgggatcagacgggacgggttgctgctcagactggtggacgacttcctgctggtgactccgcacctcactcacgccaaaacctttctccgcactctggtgaggggagtgccagaatacggctgtgtggtcaatctccggaaaactgtggtgaatttccctgtcgaggatgaggcactcggaggaaccgcatttgtccaaatgccagcacatggcctgttcccatggtgcggtctgctgctggacacccgaactcttgaagtgcagtccgactactccagctatgcccggacgagcatccgcgccagcctcactttcaatcgcggctttaaggccggacgaaacatgcgcagaaagcttttcggagtcctccggcttaaatgccattcgctctttctcgatctccaagtcaattcgctgcagaccgtgtgcacgaacatctacaagatcctgctgctccaagcctaccggttccacgcttgcgtgcttcagctgccgtttcaccaacaggtgtggaagaacccgaccttctttctgcgggtcattagcgatactgcctccctgtgttactcaatcctcaaggcaaagaacgccggaatgtcgctgggtgcgaaaggagc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cagctgtctagaaaactccccggcaccaccctgaccgctctggaagccgccgccaacccagcattgccgtcagatttcaagaccatcttggac
配列番号56.プラスミド1351のポリペプチド
MASTPGTQSPFFLLLLLTVLTVVTGSGHASSTPGGEKETSATQRSSVPSSTEKNAVSMTSSVLSSHSPGSGSSTTQGQDVTLAPATEPASGSAATWGQDVTSVPVTRPALGSTTPPAHDVTSAPDNKPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPALGSTAPPVHNVTSASGSASGSASTLVHNGTSARATTTPASKSTPFSIPSHHSDTPTTLASHSTKTDASSTHHSSVPPLTSSNHSTSPQLSTGVSFFFLSFHISNLQFNSSLEDPSTDYYQELQRDISEMFLQIYKQGGFLGLSNIKFRPGSVVVQLTLAFREGTINVHDVETQFNQYKTEAASRYNLTISDVSVSDVPFPFSAQSGAGVPGWGIALLVLVCVLVALAIVYLIALAVCQCRRKNYGQLDIFPARDTYHPMSEYPTYHTHGRYVPPSSTDRSPYEKVSAGNGGSSLSYTNPAVAAASANLGSGRIFNAHYAGYFADLLIHDIETNPGPLAGETGQEAAPLDGVLANPPNISSLSPRQLLGFPCAEVSGLSTERVRELAVALAQKNVKLSTEQLRCLAHRLSEPPEDLDALPLDLLLFLNPDAFSGPQACTRFFSRITKANVDLLPRGAPERQRLLPAALACWGVRGSLLSEADVRALGGLACDLPGRFVAESAEVLLPRLVSCPGPLDQDQQEAARAALQGGGPPYGPPSTWSVSTMDALRGLLPVLGQPIIRSIPQGIVAAWRQRSSRDPSWRQPERTILRPRFRREVEKTACPSGKKAREIDESLIFYKKWELEACVDAALLATQMDRVNAIPFTYEQLDVLKHKLDELYPQGYPESVIQHLGYLFLKMSPEDIRKWNVTSLETLKALLEVNKGHEMSPQVATLIDRFVKGRGQLDKDTLDTLTAFYPGYLCSLSPEELSSVPPSSIWAVRPQDLDTCDPRQLDVLYPKARLAFQNMNGSEYFVKIQSFLGGAPTEDLKALSQQNVSMDLATFMKLRTDAVLPLTVAEVQKLLGPHVEGLKAEERHRPVRDWILRQRQDDLDTLGLGLQGGIPNGYLVLDLSMQEALGSGEGRGSLLTCGDVEENPGPAKFLHWLMSVYVVELLRSFFYVTETTFQKNRLFFYRKSVWSKLQSIGIRQHLKRVQLRELSEAEVRQHREARPALLTSRLRFIPKPDGLRPIVNMDYVVGARTFRREKRAERLTSRVKALFSVLNYERARRPGLLGASVLGLDDIHRAWRTFVLRVRAQDPPPELYFVKVAITGAYDTIPQDRLTEVIASIIKPQNTYCVRRYAVVQKAAHGHVRKAFKSHVSTLTDLQPYMRQFVAHLQETSPLRDAVVIEQSSSLNEASSGLFDVFLRFMCHHAVRIRGKSYVQCQGIPQGSILSTLLCSLCYGDMENKLFAGIRRDGLLLRLVDDFLLVTPHLTHAKTFLRTLVRGVPEYGCVVNLRKTVVNFPVEDEALGGTAFVQMPAHGLFPWCGLLLDTRTLEVQSDYSSYARTSIRASLTFNRGFKAGRNMRRKLFGVLRLKCHSLFLDLQVNSLQTVCTNIYKILLLQAYRFHACVLQLPFHQQVWKNPTFFLRVISDTASLCYSILKAKNAGMSLGAKGAAGPLPSEAVQWLCHQAFLLKLTRHRVTYVPLLGSLRTAQTQLSRKLPGTTLTALEAAANPALPSDFKTILD
配列番号57.プラスミド1352のORF
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tcgctgcgcactgcacagacccagctgtctagaaaactccccggcaccaccctgaccgctctggaagccgccgccaacccagcattgccgtcagatttcaagaccatcttggac
配列番号58.プラスミド1352のポリペプチド
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配列番号59.プラスミド1353のORF
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gacagatccccctacgagaaagtgtctgccggcaacggcggcagctccctgagctacacaaatcctgccgtggccgctgcctccgccaacctg
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配列番号61.プラスミド1354のORF
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配列番号62.プラスミド1354のポリペプチド
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配列番号63.プラスミド1355のORF
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配列番号64.プラスミド1355のポリペプチド
MASLAGETGQEAAPLDGVLANPPNISSLSPRQLLGFPCAEVSGLSTERVRELAVALAQKNVKLSTEQLRCLAHRLSEPPEDLDALPLDLLLFLNPDAFSGPQACTRFFSRITKANVDLLPRGAPERQRLLPAALACWGVRGSLLSEADVRALGGLACDLPGRFVAESAEVLLPRLVSCPGPLDQDQQEAARAALQGGGPPYGPPSTWSVSTMDALRGLLPVLGQPIIRSIPQGIVAAWRQRSSRDPSWRQPERTILRPRFRREVEKTACPSGKKAREIDESLIFYKKWELEACVDAALLATQMDRVNAIPFTYEQLDVLKHKLDELYPQGYPESVIQHLGYLFLKMSPEDIRKWNVTSLETLKALLEVNKGHEMSPQVATLIDRFVKGRGQLDKDTLDTLTAFYPGYLCSLSPEELSSVPPSSIWAVRPQDLDTCDPRQLDVLYPKARLAFQNMNGSEYFVKIQSFLGGAPTEDLKALSQQNVSMDLATFMKLRTDAVLPLTVAEVQKLLGPHVEGLKAEERHRPVRDWILRQRQDDLDTLGLGLQGGIPNGYLVLDLSMQEALGSGRIFNAHYAGYFADLLIHDIETNPGPTPGTQSPFFLLLLLTVLTVVTGSGHASSTPGGEKETSATQRSSVPSSTEKNAVSMTSSVLSSHSPGSGSSTTQGQDVTLAPATEPASGSAATWGQDVTSVPVTRPALGSTTPPAHDVTSAPDNKPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPALGSTAPPVHNVTSASGSASGSASTLVHNGTSARATTTPASKSTPFSIPSHHSDTPTTLASHSTKTDASSTHHSSVPPLTSSNHSTSPQLSTGVSFFFLSFHISNLQFNSSLEDPSTDYYQELQRDISEMFLQIYKQGGFLGLSNIKFRPGSVVVQLTLAFREGTINVHDVETQFNQYKTEAASRYNLTISDVSVSDVPFPFSAQSGAGVPGWGIALLVLVCVLVALAIVYLIALAVCQCRRKNYGQLDIFPARDTYHPMSEYPTYHTHGRYVPPSSTDRSPYEKVSAGNGGSSLSYTNPAVAAASANLGSGTILSEGATNFSLLKLAGDVELNPGPSFLLSSLRPSLTGARRLVETIFLGSRPWMPGTPRRLPRLPQRYWQMRPLFLELLGNHAQCPYGVLLKTHCPLRAAVTPAAGVCAREKPQGSVAAPEEEDTDPRRLVQLLRQHSSPWQVYGFVRACLRRLVPPGLWGSRHNERRFLRNTKKFISLGKHAKLSLQELTWKMSVRDCAWLRRSPGVGCVPAAEHRLREEILAKFLHWLMSVYVVELLRSFFYVTETTFQKNRLFFYRKSVWSKLQSIGIRQHLKRVQLRELSEAEVRQHREARPALLTSRLRFIPKPDGLRPIVNMDYVVGARTFRREKRAERLTSRVKALFSVLNYERARRPGLLGASVLGLDDIHRAWRTFVLRVRAQDPPPELYFVKVAITGAYDTIPQDRLTEVIASIIKPQNTYCVRRYAVVQKAAHGHVRKAFKSHVSTLTDLQPYMRQFVAHLQETSPLRDAVVIEQSSSLNEASSGLFDVFLRFMCHHAVRIRGKSYVQCQGIPQGSILSTLLCSLCYGDMENKLFAGIRRDGLLLRLVDDFLLVTPHLTHAKTFLRTLVRGVPEYGCVVNLRKTVVNFPVEDEALGGTAFVQMPAHGLFPWCGLLLDTRTLEVQSDYSSYARTSIRASLTFNRGFKAGRNMRRKLFGVLRLKCHSLFLDLQVNSLQTVCTNIYKILLLQAYRFHACVLQLPFHQQVWKNPTFFLRVISDTASLCYSILKAKNAGMSLGAKGAAGPLPSEAVQWLCHQAFLLKLTRHRVTYVPLLGSLRTAQTQLSRKLPGTTLTALEAAANPALPSDFKTILD
配列番号65.プラスミド1356のORF
atggctagcctggctggcgagacaggacaggaagccgctcctctggacggcgtgctggccaaccctcccaatatcagcagcctgagccccagacagctgctgggattcccttgtgccgaggtgtccggcctgagcacagagagagtgcgggaactggctgtggccctggcccagaaaaacgtgaagctgagcaccgagcagctgcggtgcctggcccacagactgtctgagcctcccgaggatctggacgccctgcctctggatctgctgctgttcctgaaccccgacgccttcagcggacctcaggcctgcacccggttcttcagcagaatcaccaaggccaacgtggacctgctgcccagaggcgcccctgagagacagagactgctgcctgctgctctggcctgttggggagtgcggggctctctgctgtctgaagctgatgtgcgggccctgggaggcctggcttgtgatctgcctggaagattcgtggccgagagcgccgaagtgctgctgcctagactggtgtcctgtcccggccctctggaccaggatcagcaggaagctgccagagctgctctgcagggcggaggccctccttatggacctcctagcacttggagcgtgtccaccatggatgccctgaggggcctgctgccagtgctgggccagcctatcatcagatccatcccacagggcatcgtggccgcctggcggcagagaagctctagagatccctcttggcggcagcccgagcggacaatcctgcggcccaggtttcggagagaggtggaaaagaccgcctgcccctctggcaagaaggccagagagatcgacgagagcctgatcttctacaagaagtgggagctggaagcctgcgtggacgccgctctgctggccacccagatggacagagtgaacgccatccccttcacctatgagcagctggacgtgctgaagcacaagctggatgagctgtacccccagggctaccccgagagcgtgatccagcacctgggctacctgtttctgaagatgagccccgaggacatccggaagtggaacgtgaccagcctggaaaccctgaaggccctgctggaagtgaacaagggccacgagatgtccccccaggtggccacactgatcgacagattcgtgaagggcagaggccagctggacaaggacaccctggatacactgaccgccttctaccccggctatctgtgcagcctgtcccccgaggaactgagcagcgtgccacctagctctatctgggctgtgcggccccaggacctggatacctgcgatcctagacagctggatgtgctgtatcccaaggcccggctggccttccagaacatgaacggcagcgagtacttcgtgaagatccagtccttcctgggcggagcccctaccgaggacctgaaagctctgagccagcagaacgtgtccatggatctggccacctttatgaagctgcggaccgacgccgtgctgcctctgacagtggctgaggtgcagaaactgctgggcccccatgtggaagggctgaaggccgaagaacggcacagacccgtgcgcgactggatcctgaggcagagacaggatgacctggacacactgggcctgggactgcaggggggcatccctaatggctacctggtgctggacctgagcatgcaggaagccctgggatccggcgagggcagaggcagcctgctgacatgtggcgacgtggaagagaaccctggccccagcttcctcctgtcgtcgctcagaccgagcctgaccggagcacgcagattggtggaaactatcttccttgggtcacgtccgtggatgccaggtaccccacggcgcctcccgcgcctcccacagagatactggcagatgcggcctctgttcctggaattgctgggaaaccacgctcagtgcccgtacggagtcctgctcaagactcactgccctctgagggcggcggtcactccggcggccggagtgtgcgcacgggagaagccccagggaagcgtggcagctccggaagaggaggacaccgatccgcgccgcctcgtgcaacttctgcgccagcactcctcgccctggcaagtctacgggttcgtccgcgcctgcctgcgccgcctggtgccgcctgggctctggggttcccggcataacgagcgccgcttcctgagaaatactaagaagtttatctcacttggaaaacatgccaagttgtcgctgcaagaactcacgtggaagatgtcagtccgcgattgcgcctggctgcgccgctcgccgggcgtcgggtgtgttccagctgcagaacaccgcctgagagaagaaattctggccaaatttctgcattggctgatgtcagtgtacgtggtcgagctgctgcgctcctttttctacgtcactgagactacctttcaaaagaaccgcctgttcttctaccgcaaatctgtgtggagcaagctgcagtcaatcggcattcgccagcatctgaagagggtgcagctgcgggaactttccgaggcagaagtccgccagcaccgggaggcccggccggcgcttctcacgtcgcgtctgagattcatcccaaagcccgacgggctgaggcctatcgtcaacatggattacgtcgtgggcgctcgcacctttcgccgtgaaaagcgggccgaacgcttgacctcacgggtgaaggccctcttctccgtgctgaactacgagagagcaagacggcctggcctgctgggagcttcggtgctgggactggacgatatccaccgggcttggcggacctttgttctccgggtgagagcccaagaccctccgccggaactgtacttcgtgaaggtggcgatcaccggagcctatgatactattccgcaagatcgactcaccgaagtcatcgcctcgatcatcaaaccgcagaacacttactgcgtcaggcggtacgccgtggtccagaaggccgcgcatggccacgtgagaaaggcgttcaagtcgcacgtgtccactctcaccgacctccagccttacatgaggcaattcgttgcgcatttgcaagagacttcgcccctgagagatgcggtggtcatcgagcagagctccagcctgaacgaagcgagcagcggtctgtttgacgtgttcctccgcttcatgtgtcatcacgcggtgcgaatcaggggaaaatcatacgtgcagtgccagggaatcccacaaggcagcattctgtcgactctcttgtgttccctttgctacggcgatatggaaaacaagctgttcgctgggatcagacgggacgggttgctgctcagactggtggacgacttcctgctggtgactccgcacctcactcacgccaaaacctttctccgcactctggtgaggggagtgccagaatacggctgtgtggtcaatctccggaaaactgtggtgaatttccctgtcgaggatgaggcactcggaggaaccgcatttgtccaaatgccagcacatggcctgttcccatggtgcggtctgctgctggacacccgaactcttgaagtgcagtccgactactccagctatgcccggacgagcatccgcgccagcctcactttcaatcgcggctttaaggccggacgaaacatgcgcagaaagcttttcggagtcctccggcttaaatgccattcgctctttctcgatctccaagtcaattcgctgcagaccgtgtgcacgaacatctacaagatcctgctgctccaagcctaccggttccacgcttgcgtgcttcagctgccgtttcaccaacaggtgtggaagaacccgaccttctttctgcgggtcattagcgatactgcctccctgtgttactcaatcctcaaggcaaagaacgccggaatgtcgctgggtgcgaaaggagccgcgggacctcttcctagcgaagcggtgcagtggctctgccaccaggctttcctcctgaagctgaccaggcacagagtgacctacgtcccgctgctgggctcgctgcgcactgcacagacccagctgtctagaaaactccccggcaccaccctgaccgctctggaagccgccgccaacccagcattgccgtcagatttcaagaccatcttggacggatccggcacaatcctgtctgagggcgccaccaacttcagcctgctgaaactggccggcgacgtggaactgaaccctggccctacccctggaacccagagccccttcttccttctgctgctgctgaccgtgctgactgtcgtgacaggctctggccacgccagctctacacctggcggcgagaaagagacaagcgccacccagagaagcagcgtgccaagcagcaccgagaagaacgccgtgtccatgaccagctccgtgctgagcagccactctcctggcagcggcagcagcacaacacagggccaggatgtgacactggcccctgccacagaacctgcctctggatctgccgccacctggggacaggacgtgacaagcgtgccagtgaccagacctgccctgggctctacaacaccccctgcccacgatgtgaccagcgcccctgataacaagcctgcccctggaagcacagcccctccagctcatggcgtgacctctgccccagataccagaccagccccaggatctacagccccacccgcacacggcgtgacaagtgcccctgacacaagacccgctccaggctctactgctcctcctgcccatggcgtgacaagcgctcccgatacaaggccagctcctggctccacagcaccaccagcacatggcgtgacatcagctcccgacactagacctgctcccggatcaaccgctccaccagctcacggcgtgaccagcgcacctgataccagacctgctctgggaagcaccgcccctcccgtgcacaatgtgacatctgcttccggcagcgccagcggctctgcctctacactggtgcacaacggcaccagcgccagagccacaacaaccccagccagcaagagcacccccttcagcatccctagccaccacagcgacacccctaccacactggccagccactccaccaagaccgatgcctctagcacccaccactccagcgtgccccctctgacc
agcagcaaccacagcacaagcccccagctgtctaccggcgtctcattcttctttctgtccttccacatcagcaacctgcagttcaacagcagcctggaagatcccagcaccgactactaccaggaactgcagcgggatatcagcgagatgttcctgcaaatctacaagcagggcggcttcctgggcctgagcaacatcaagttcagacccggcagcgtggtggtgcagctgaccctggctttccgggaaggcaccatcaacgtgcacgacgtggaaacccagttcaaccagtacaagaccgaggccgccagccggtacaacctgaccatctccgatgtgtccgtgtccgacgtgcccttcccattctctgcccagtctggcgcaggcgtgccaggatggggaattgctctgctggtgctcgtgtgcgtgctggtggccctggccatcgtgtatctgattgccctggccgtgtgccagtgccggcggaagaattacggccagctggacatcttccccgccagagacacctaccaccccatgagcgagtaccccacataccacacccacggcagatacgtgccacccagctccaccgacagatccccctacgagaaagtgtctgccggcaacggcggcagctccctgagctacacaaatcctgccgtggccgctgcctccgccaacctg
配列番号66.プラスミド1356のポリペプチド
MASLAGETGQEAAPLDGVLANPPNISSLSPRQLLGFPCAEVSGLSTERVRELAVALAQKNVKLSTEQLRCLAHRLSEPPEDLDALPLDLLLFLNPDAFSGPQACTRFFSRITKANVDLLPRGAPERQRLLPAALACWGVRGSLLSEADVRALGGLACDLPGRFVAESAEVLLPRLVSCPGPLDQDQQEAARAALQGGGPPYGPPSTWSVSTMDALRGLLPVLGQPIIRSIPQGIVAAWRQRSSRDPSWRQPERTILRPRFRREVEKTACPSGKKAREIDESLIFYKKWELEACVDAALLATQMDRVNAIPFTYEQLDVLKHKLDELYPQGYPESVIQHLGYLFLKMSPEDIRKWNVTSLETLKALLEVNKGHEMSPQVATLIDRFVKGRGQLDKDTLDTLTAFYPGYLCSLSPEELSSVPPSSIWAVRPQDLDTCDPRQLDVLYPKARLAFQNMNGSEYFVKIQSFLGGAPTEDLKALSQQNVSMDLATFMKLRTDAVLPLTVAEVQKLLGPHVEGLKAEERHRPVRDWILRQRQDDLDTLGLGLQGGIPNGYLVLDLSMQEALGSGEGRGSLLTCGDVEENPGPSFLLSSLRPSLTGARRLVETIFLGSRPWMPGTPRRLPRLPQRYWQMRPLFLELLGNHAQCPYGVLLKTHCPLRAAVTPAAGVCAREKPQGSVAAPEEEDTDPRRLVQLLRQHSSPWQVYGFVRACLRRLVPPGLWGSRHNERRFLRNTKKFISLGKHAKLSLQELTWKMSVRDCAWLRRSPGVGCVPAAEHRLREEILAKFLHWLMSVYVVELLRSFFYVTETTFQKNRLFFYRKSVWSKLQSIGIRQHLKRVQLRELSEAEVRQHREARPALLTSRLRFIPKPDGLRPIVNMDYVVGARTFRREKRAERLTSRVKALFSVLNYERARRPGLLGASVLGLDDIHRAWRTFVLRVRAQDPPPELYFVKVAITGAYDTIPQDRLTEVIASIIKPQNTYCVRRYAVVQKAAHGHVRKAFKSHVSTLTDLQPYMRQFVAHLQETSPLRDAVVIEQSSSLNEASSGLFDVFLRFMCHHAVRIRGKSYVQCQGIPQGSILSTLLCSLCYGDMENKLFAGIRRDGLLLRLVDDFLLVTPHLTHAKTFLRTLVRGVPEYGCVVNLRKTVVNFPVEDEALGGTAFVQMPAHGLFPWCGLLLDTRTLEVQSDYSSYARTSIRASLTFNRGFKAGRNMRRKLFGVLRLKCHSLFLDLQVNSLQTVCTNIYKILLLQAYRFHACVLQLPFHQQVWKNPTFFLRVISDTASLCYSILKAKNAGMSLGAKGAAGPLPSEAVQWLCHQAFLLKLTRHRVTYVPLLGSLRTAQTQLSRKLPGTTLTALEAAANPALPSDFKTILDGSGTILSEGATNFSLLKLAGDVELNPGPTPGTQSPFFLLLLLTVLTVVTGSGHASSTPGGEKETSATQRSSVPSSTEKNAVSMTSSVLSSHSPGSGSSTTQGQDVTLAPATEPASGSAATWGQDVTSVPVTRPALGSTTPPAHDVTSAPDNKPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPAPGSTAPPAHGVTSAPDTRPALGSTAPPVHNVTSASGSASGSASTLVHNGTSARATTTPASKSTPFSIPSHHSDTPTTLASHSTKTDASSTHHSSVPPLTSSNHSTSPQLSTGVSFFFLSFHISNLQFNSSLEDPSTDYYQELQRDISEMFLQIYKQGGFLGLSNIKFRPGSVVVQLTLAFREGTINVHDVETQFNQYKTEAASRYNLTISDVSVSDVPFPFSAQSGAGVPGWGIALLVLVCVLVALAIVYLIALAVCQCRRKNYGQLDIFPARDTYHPMSEYPTYHTHGRYVPPSSTDRSPYEKVSAGNGGSSLSYTNPAVAAASANL
2Aペプチド(配列番号67〜74):
2Aペプチドは全て、核酸配列GGATCCGGCがコードするグリシン−セリン−グリシン(GSG)リンカーから始まる。
配列番号67.脳心筋炎ウイルス(Encephalomyocarditis virus)(EMCV)の2Aのヌクレオチド配列:
ggatccggcagaatcttcaacgcccactacgccggctacttcgccgacctgctgatccacgacatcgagacaaaccctggcccc
配列番号68.脳心筋炎ウイルス(Encephalomyocarditis virus)(EMCV)の2Aのアミノ酸配列:
GSGRIFNAHYAGYFADLLIHDIETNPGP
配列番号69.ゾセア・アシグナ(Thosea asigna)ウイルス(TAV)の2Aのヌクレオチド配列:
ggatccggcgagggcagaggcagcctgctgacatgtggcgacgtggaagagaaccctggcccc
配列番号70.ゾセア・アシグナ(Thosea asigna)ウイルス(TAV)の2Aのアミノ酸配列:
GSGEGRGSLLTCGDVEENPGP
配列番号71.ウマ鼻炎Bウイルス(Equine rhinitis B virus)(ERBV)の2Aのヌクレオチド配列:
ggatccggcacaatcctgtctgagggcgccaccaacttcagcctgctgaaactggccggcgacgtggaactgaaccctggccct
配列番号72.ウマ鼻炎Bウイルス(Equine rhinitis B virus)(ERBV)の2Aのアミノ酸配列:
GSGTILSEGATNFSLLKLAGDVELNPGP
配列番号73.ブタテッショウウイルス(Porcine teschovirus)(PTV)の2Aのヌクレオチド配列:
ggatccggcgccaccaatttcagcctgctgaaacaggccggcgacgtggaagagaaccctggccct
配列番号74.ブタテッショウウイルス(Porcine teschovirus)(PTV)の2Aのアミノ酸配列:
GSGATNFSLLKQAGDVEENPGP
Figure 2021061851
Figure 2021061851
Figure 2021061851

Claims (1)

  1. (i)免疫原性MUC1ポリペプチドをコードする少なくとも1つのヌクレオチド配列および免疫原性TERTポリペプチドをコードする少なくとも1つのヌクレオチド配列を含む核酸分子、
    (ii)免疫原性MUC1ポリペプチドをコードする少なくとも1つのヌクレオチド配列および免疫原性MSLNポリペプチドをコードする少なくとも1つのヌクレオチド配列を含む核酸分子、ならびに
    (iii)免疫原性TERTポリペプチドをコードする少なくとも1つのヌクレオチド配列および免疫原性MSLNポリペプチドをコードする少なくとも1つのヌクレオチド配列を含む核酸分子
    からなる群から選択される核酸分子を含む多抗原構築物。
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