JP2021036901A5 - - Google Patents
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Claims (23)
- 親野生型ヒトGタンパク質共役型受容体(GPCR)の変異体であって、
前記GPCRの変異体が、
(i)親野生型ヒトGPCRと比較して少なくとも1つの置換されたアミノ酸を有し、
(ii)特定の立体構造におけるその親GPCRと比較して、同じ特定の立体構造において増大した立体構造の熱安定性を有し、
前記特定の立体構造がアゴニスト立体構造又はアンタゴニスト立体構造であり、及び、
(iii)その親GPCRと比較して、結晶化しやすく、したがって、より構造決定に適している、親野生型ヒトGPCRの変異体。 - 親野生型ヒトGタンパク質共役型受容体(GPCR)と比較して少なくとも1つの置換されたアミノ酸を有し、及び、その親GPCRと比較して増大した立体構造の熱安定性を有する親野生型ヒトGPCRの変異体であって、変性条件下において、その親GPCRの特定の立体構造と同じ特定の立体構造の寿命が延長しており、及び、前記特定の立体構造がアゴニスト立体構造又はアンタゴニスト立体構造である、親野生型ヒトGPCRの変異体。
- (a)親GPCRの1つ又は複数の変異体を提供する工程、
(b)親GPCRが特定の立体構造にある際に前記親GPCRに結合するリガンドを選択する工程、
(c)熱の変性条件下におけるリガンド結合能の損失によって表わされるものとして変性を測定することによって、各GPCR変異体が、選択したリガンドの結合について親GPCRの立体構造の安定性と比較して、前記リガンドの結合について増大した立体構造の熱安定性を有するか否かを測定する工程、及び
(d)選択したリガンドの結合について親GPCRと比較して増大した立体構造の熱安定性を有する変異体を選択する工程
を含み、
工程(c)においてGPCRが備える前記特定の立体構造が、工程(b)において選択されるリガンドの分類に対応する、
方法によって製造される、特定の立体構造における親GPCRと比較して同じ特定の立体構造において増大した立体構造の熱安定性を有し、前記特定の立体構造がアゴニスト立体構造又はアンタゴニスト立体構造である、GPCR変異体。 - 前記1つ又は複数の変異体が、製造の方法の工程(c)の前に前記選択したリガンドに接触させられる、請求項3に記載のGPCR変異体。
- 熱変性条件下において、親GPCRの特定の立体構造と比較して同じ特定の立体構造の寿命が延長している、請求項3又は4に記載のGPCR変異体。
- 親GPCRと比較して、1個から10個の置換されたアミノ酸を含む、請求項3から5のいずれか一項に記載のGPCR変異体。
- 界面活性剤、カオトロピック剤、及び極端なpHのいずれか1つ又は複数から選択される変性条件下において増大した立体構造の安定性を有する、請求項3から6のいずれか一項に記載のGPCR変異体。
- その親よりも少なくとも1℃安定である増大した立体構造の熱安定性を有する、請求項3から7のいずれか一項に記載のGPCR変異体。
- アゴニスト又はアンタゴニスト立体構造の立体構造の熱安定性が増大している、請求項3から8のいずれか一項に記載のGPCR変異体。
- 完全なアゴニスト、部分的なアゴニスト、逆アゴニスト、及びアンタゴニストから選択されるリガンドであって、任意選択で蛍光標識又は放射標識されたリガンドの存在下で、親GPCRと比較して増大した立体構造の熱安定性を有する、請求項3から9のいずれか一項に記載のGPCR変異体。
- 前記GPCR変異体が、アデノシン受容体変異体、β−アドレナリン受容体変異体、ニューロテンシン受容体変異体、ムスカリン酸受容体変異体、5−ヒドロキシトリプタミン受容体変異体、アドレナリン受容体変異体、アナフィラトキシン受容体変異体、アンジオテンシン受容体変異体、アペリン受容体変異体、ボンベシン受容体変異体、ブラディキニン受容体変異体、カンナビノイド受容体変異体、ケモカイン受容体変異体、コレシストキニン受容体変異体、ドーパミン受容体変異体、エンドセリン受容体変異体、遊離脂肪酸受容体変異体、胆汁酸受容体変異体、ガラニン受容体変異体、モチリン受容体変異体、グレリン受容体変異体、糖タンパク質ホルモン受容体変異体、GnRH受容体変異体、ヒスタミン受容体変異体、KiSS1−由来ペプチド受容体変異体、ロイコトリエン及びリポキシン受容体変異体、リゾリン脂質受容体変異体、メラニン濃縮ホルモン受容体変異体、メラノコルチン受容体変異体、メラトニン受容体変異体、ニューロメジンU受容体変異体、神経ペプチド受容体変異体、N−ホルミルペプチドファミリー受容体変異体、ニコチン酸受容体変異体、オピオイド受容体変異体、オプシン様受容体変異体、オレキシン受容体変異体、P2Y受容体変異体、ペプチドP518受容体変異体、血小板活性化因子受容体変異体、プロキネチシン受容体変異体、プロラクチン放出ペプチド受容体変異体、プロスタノイド受容体変異体、プロテアーゼ活性化受容体変異体、リラキシン受容体変異体、ソマトスタチン受容体変異体、SPC/LPC受容体変異体、タチキニン受容体変異体、トレースアミノ受容体変異体、チロトロピン放出ホルモン受容体変異体、ユーロテンシン受容体変異体、バソプレッシン/オキシトシン受容体変異体、オーファンGPCR変異体、カルシトニン受容体変異体、コルチコトロピン放出因子受容体変異体、グルカゴン受容体変異体、パラチロイド受容体変異体、VIP/PACAP受容体変異体、LNB7TM受容体変異体、GABA受容体変異体、メタボトロピックグルタミン酸受容体変異体、及びカルシウムセンサー受容体変異体のいずれかである、請求項3から10のいずれか一項に記載のGPCR変異体。
- 前記GPCR変異体が、その親受容体と比較して、以下の(i)配列番号1に定義されたシチメンチョウβ−アドレナリン受容体の番号付けした位置:Ile 55, Gly 67, Arg 68, Val 89, Met 90, Gly 98, Ile 129, Ser 151, Val 160, Gln 194, Gly 197, Leu 221, Tyr 227, Arg 229, Val 230, Ala 234, Ala 282, Asp 322, Phe 327, Ala 334, 及びPhe 338、(ii)配列番号5に定義されたヒトアデノシンA 2a 受容体の番号付けした位置:Gly 114, Gly 118, Leu 167, Ala 184, Arg 199, Ala 203, Leu 208, Gln 210, Ser 213, Glu 219, Arg 220, Ser 223, Thr 224, Gln 226, Lys 227, His 230, Leu 241, Pro 260, Ser 263, Leu 267, Leu 272, Thr 279, Asn 284, Gln 311, Pro 313, 及びLys 315、(iii)配列番号9に定義されたラットニューロテンシン受容体の番号付けした位置:Ala 69, Leu 72, Ala 73, Ala 86, Ala 90, Ser 100, His 103, Ser 108, Leu 109, Leu 111, Asp 113, Ile 116, Ala 120, Asp 139, Phe 147, Ala 155, Val 165, Glu 166, Lys 176, Ala 177, Thr 179, Met 181, Ser 182, Arg 183, Phe 189, Leu 205, Thr 207, Gly 209, Gly 215, Val 229, Met 250, Ile 253, Leu 256, Ile 260, Asn 262, Val 268, Asn 270, Thr 279, Met 293, Thr 294, Gly 306, Leu 308, Val 309, Leu 310, Val 313, Phe 342, Asp 345, Tyr 349, Tyr 351
, Ala 356, Phe 358, Val 360, Ser 362, Asn 370, Ser 373, Phe 380, Ala 385, Cys 386, Pro 389, Gly 390, Trp 391, Arg 392, His 393, Arg 395, Lys 397, 及びPro 399、並びに(iv)配列番号12に定義されたムスカリン受容体の番号付けした位置:Leu 65, Met 145, Leu 399, Ile 383, 及びMet 384のいずれか1つ又は複数と対応する位置に少なくとも1つの異なるアミノ酸を有する、請求項3から10のいずれか一項に記載のGPCR変異体。 - (i)対応する野生型アドレナリン受容体と比較して、配列番号1に定義されたシチメンチョウβ−アドレナリン受容体の番号付けした以下の位置:Ile 55, Gly 67, Arg 68, Val 89, Met 90, Gly 98, Ile 129, Ser 151, Val 160, Gln 194, Gly 197, Leu 221, Tyr 227, Arg 229, Val 230, Ala 234, Ala 282, Asp 322, Phe 327, Ala 334, 及びPhe 338のいずれか1つ又は複数に対応する位置に異なるアミノ酸を有するβ−アドレナリン受容体変異体であるか;
(ii)対応する野生型アデノシン受容体と比較して、配列番号5に定義されたヒトアデノシンA 2a 受容体の番号付けした以下の位置:Gly 114, Gly 118, Leu 167, Ala 184, Arg 199, Ala 203, Leu 208, Gln 210, Ser 213, Glu 219, Arg 220, Ser 223, Thr 224, Gln 226, Lys 227, His 230, Leu 241, Pro 260, Ser 263, Leu 267, Leu 272, Thr 279, Asn 284, Gln 311, Pro 313, 及びLys 315のいずれか1つ又は複数に対応する位置に異なるアミノ酸を有するアデノシン受容体変異体であるか;
(iii)対応する野生型ニューロテンシン受容体と比較して、配列番号9に定義されたラットニューロテンシン受容体の番号付けした以下の位置:Ala 69, Leu 72, Ala 73, Ala 86, Ala 90, Ser 100, His 103, Ser 108, Leu 109, Leu 111, Asp 113, Ile 116, Ala 120, Asp 139, Phe 147, Ala 155, Val 165, Glu 166, Lys 176, Ala 177, Thr 179, Met 181, Ser 182, Arg 183, Phe 189, Leu 205, Thr 207, Gly 209, Gly 215, Val 229, Met 250, Ile 253, Leu 256, Ile 260, Asn 262, Val 268, Asn 270, Thr 279, Met 293, Thr 294, Gly 306, Leu 308, Val 309, Leu 310, Val 313, Phe 342, Asp 345, Tyr 349, Tyr 351, Ala 356, Phe 358, Val 360, Ser 362, Asn 370, Ser 373, Phe 380, Ala 385, Cys 386, Pro 389, Gly 390, Trp 391, Arg 392, His 393, Arg 395, Lys 397, 及びPro 399のいずれか1つ又は複数に対応する位置に異なるアミノ酸を有するニューロテンシン受容体変異体であるか;
(iv)対応する野生型ムスカリン受容体と比較して、配列番号12に定義されたヒトムスカリン受容体の番号付けした以下の位置:Leu 65, Met 145, Leu 399, Ile 383、及びMet 384のいずれか1つ又は複数に対応する位置に異なるアミノ酸を有するムスカリン受容体変異体である、請求項3から10のいずれか一項に記載のGPCR変異体。 - 請求項3から13のいずれか一項に記載のGPCR変異体をコードするポリヌクレオチド。
- 請求項14に記載のポリヌクレオチドを含む宿主細胞。
- 可溶化された形態であるか、他のタンパク質を実質的に含まないか、又は固体支持体に固定化されている、請求項3から13のいずれか一項に記載のGPCR変異体。
- 結晶化のための、リガンド結合スクリーニング又はアッセイ開発のような創薬のための、あるいはバイオセンサーとしての請求項3から13のいずれか一項に記載のGPCR変異体の使用。
- 前記GPCR変異体がヒトカンナビノイド受容体でない、請求項3から13および16のいずれか一項に記載のGPCR変異体、請求項14に記載のポリヌクレオチド、又は、請求項15に記載の宿主細胞。
- 前記GPCR変異体がヒトカンナビノイド受容体でない、請求項17に記載の使用。
- 請求項3から13、16および18のいずれか一項に記載のGPCR変異体の結晶化形態。
- 前記親GPCRが、天然のタンパク質を有するGPCR、天然のタンパク質の切断型、又は天然のタンパク質又はその断片に対する融合体、あるいは天然のタンパク質と比較して改変を含むGPCRであり、前記親GPCRが、リガンド結合能を保持する、請求項1から3のいずれか一項に記載のGPCR変異体。
- 親野生型ヒトGタンパク質共役型受容体(GPCR)と比較して少なくとも一つの置換されたアミノ酸を有する、親野生型ヒトGPCRの変異体であって、
GPCR変異体が、熱変性条件下で、親野生型ヒトGPCRのアゴニスト立体構造に対して寿命が延長したアゴニスト立体構造を有し、GPCR変異体が加熱される前にアゴニストと接触させられる場合、又は、GPCR変異体がアゴニストと接触させられる前に加熱される場合のいずれかにおいて、延長した寿命がアゴニストリガンド結合能の保持によって表されることによって、あるいは、
GPCR変異体が、熱変性条件下で、親野生型ヒトGPCRのアンタゴニスト立体構造に対して寿命が延長したアンタゴニスト立体構造を有し、GPCR変異体が加熱される前にアンタゴニストと接触させられる場合、又は、GPCR変異体がアンタゴニストと接触させられる前に加熱される場合のいずれかにおいて、延長した寿命がアンタゴニストリガンド結合能の保持によって表されることによって、
親野生型ヒトGPCRと比較して前記GPCR変異体が、増大した立体構造の熱安定性を有する、親野生型ヒトGPCRの変異体。 - 親野生型ヒトGタンパク質共役型受容体(GPCR)と比較して少なくとも一つの置換されたアミノ酸を有する、親野生型ヒトGPCRの変異体であって、
GPCR変異体が、熱変性条件下で、親野生型ヒトGPCRのアゴニスト立体構造に対して寿命が延長したアゴニスト立体構造を有し、GPCR変異体が加熱される前にアゴニストと接触させられる場合、又は、GPCR変異体がアゴニストと接触させられる前に加熱される場合のいずれかにおいて、延長した寿命がアゴニストリガンド結合能の保持によって表されることによって、あるいは、
GPCR変異体が、熱変性条件下で、親野生型ヒトGPCRのアンタゴニスト立体構造に対して寿命が延長したアンタゴニスト立体構造を有し、GPCR変異体が加熱される前にアンタゴニストと接触させられる場合、又は、GPCR変異体がアンタゴニストと接触させられる前に加熱される場合のいずれかにおいて、延長した寿命がアンタゴニストリガンド結合能の保持によって表されることによって、
親野生型ヒトGPCRと比較して前記GPCR変異体が、増大した立体構造の熱安定性を有し、
さらに、以下の工程:
(a)親GPCRの1つ又は複数の変異体を提供する工程、
(b)親GPCRが特定の立体構造にある際に前記親GPCRに結合する特定の分類のリガンドを選択する工程、
(c)熱変性条件下におけるリガンド結合能の損失によって表わされるものとして変性を測定することによって、各GPCR変異体が、選択したリガンドの結合について親GPCRの立体構造の熱安定性と比較して、前記リガンドの結合について増大した立体構造の熱安定性を有するか否かを測定する工程、及び
(d)選択したリガンドの結合について親GPCRと比較して増大した立体構造の熱安定性を有する変異体を選択する工程、
を含む方法であって、
工程(c)においてGPCRが備える前記特定の立体構造が、工程(b)において選択されるリガンドの分類に対応する方法によって得られうることによって特徴付けられる、GPCR変異体。
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